JP2000516478A

JP2000516478A - Ｖｅｇｆ−ｂ／受容体複合体およびその利用方法

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Publication number: JP2000516478A
Application number: JP10528986A
Authority: JP
Inventors: コルペライネン，エイヤ; グンジ，ユウジ; アリタロ，カリ; オロフソン，ビルギッタ; エリクソン，ウルフ
Original assignee: ルードヴィッヒ・インスティテュート・フォア・キャンサー・リサーチ; ヘルシンキ・ユニバーシティ・ライセンシング・リミテッド・オイ
Priority date: 1996-12-20
Filing date: 1997-12-19
Publication date: 2000-12-12
Also published as: EP0960334A1; AU5613698A; ZA9711456B; WO1998028621A1; CA2274675A1; AU742779B2

Abstract

(57)【要約】血管内皮増殖因子−Ｂ（ＶＥＧＦ−Ｂ）とＦｌｔ−１チロシンキナーゼ受容体とからなる複合体、および、そのようなＶＥＧＦ−Ｂ／Ｆｌｔ−１複合体の、ＶＥＧＦ−Ｂについての、または、細胞表面受容体に対してＶＥＧＦ−Ｂと実質的に同じ結合アフィニティーを有するとして特徴づけられるＶＥＧＦ−Ｂアナログについての、アッセイにおける利用方法、および／またはＶＥＧＦ−Ｂ−媒介細胞応答を促進または拮抗することにおける利用方法；そしてそのようなＶＥＧＦ−Ｂ／Ｆｌｔ−１複合体に対する、抗体などの特異的結合パートナーが開示される。

Description

【発明の詳細な説明】ＶＥＧＦ−Ｂ／受容体複合体およびその利用方法発明の背景本発明は、血管内皮増殖因子−Ｂ（ＶＥＧＦ−Ｂ）とＦｌｔ−１受容体とからなる複合体、そのような複合体を利用してＶＥＧＦ−Ｂ−媒介細胞応答を誘導または拮抗させる方法、ＶＥＧＦ−Ｂおよび／またはＶＥＧＦ−Ｂアナログを同定するためのアッセイキット、そして、ＶＥＧＦ−Ｂ／Ｆｌｔ−１複合体に結合する、抗体などの単離結合パートナーに関する。血管内皮増殖因子(ＶＥＧＦまたはＶＥＧＦ−Ａ；血管透過（性）因子、即ちＶＰＦ、と称されることもある)は、ＰＤＧＦファミリーの血管形成の（angioge nic）増殖因子である。それは、その効果を２つの内皮の受容体チロシンキナーゼ(ＲＴＫ)、即ち、Ｆｌｔ−１(ＶＥＧＦＲ−１としても知られる)[シブヤ(Shib uya)他，Oncogene，5:519-524(1990);デ．フリース（de Vries）他，Science，2 55:989-991(1992)]およびＦｌｋ−１／ＫＤＲ（ＶＥＧＦＲ−２としても知られる）［マシューズ（Matthews）他，Proc．Natl．Acad．Sci．USA，88:9026-30(1 991);ターマン（Terman）他，Biochem.Biopphys.Res.Comm.，187:1579-86(1992) ;ミロア（Millauer）他，Ce11，72:835-46(1993)]を介して発揮する。これらの受容体は、内皮細胞増殖および分化の制御および成熟した内皮の機能の維持において中心的な役割を果たしていると考えられる[シャラビー（Shalaby）他，Natu re，376:62-66(1995);フォン（Fong）他，Nature，376:66-70(1995)]。ＶＥＧＦおよびその高アフィニティーの受容体であるＦｌｔ−１およびＫＤＲ／Ｆｌｋ− １は、血管系の形成と維持のため、そして、生理学的および病理学的な血管新生の両方のために必要とされる。胎盤増殖因子(ＰｌＧＦ)[マリオーネ(Maglione)他,Proc.Natl.Acad.Scl.USA,8 8:9267-71(1991)]は、Ｆｌｔ−１ＲＴＫに対するもう一つのリガンドである[ パーク（Park）他，J．Biol.Chem.，269:25646-54(1994)]。それもまたＰＤＧＦファミリーのメンバーであり、ＶＥＧＦに構造的に関連しているが、その生物学的機能は、現在はよく理解されていない。ＶＥＧＦ−Ｂは、オロフソン(Olofsson)他,"Vascular endothelial growth fa ctor B，a novel growth factor for endothelial cells"，Proc．Natl．Acad．Sci． USA，93:2576-81(1996)において記載されている、明確な内皮細胞に対する増殖因子である。それは、ＶＥＧＦおよびＰＩＧＦと同様にＰＤＧＦファミリーの増殖因子のメンバーであり、それは、それらと、分子のホモ−およびヘテロ−二量体化にかかわるジスルフィド結合を形成する保存されたシステイン残基のパターンを含む、相当な構造類似性を共有している。にもかかわらず、ＶＥＧＦ−Ｂは、ＶＥＧＦとはおよそ４０から４５パーセントの配列類似度しか示さず、ＰＩＧＦとはおよそ３０パーセントの配列類似度しか示さない。ＶＥＧＦ−Ｂは、様々な組織においてＶＥＧＦと共発現(co-express)していることが判明しており、特に心臓および骨格筋組織において豊富である。それは、内皮細胞の有糸分裂と増殖を促進し、そして内皮組織増殖および血管新生における役割を果たしていると考えられる。ＶＥＧＦ−Ｂは、イン・ヴィトロとイン・ヴィヴォとの両方で、低濃度のＶＥＧＦの分裂促進活性を増強している可能性がある。本発明は、ＶＥＧＦ−Ｂは、Ｆｌｔ−１受容体チロシンキナーゼの細胞外ドメインに結合する能力を有し、有用な細胞応答を媒介する、および／または、望ましくない生物学的活性を拮抗する（アンタゴナイズする）、生理活性複合体を形成することができるという発見に基づくものである。本明細書中、ＶＥＧＦ−Ｂのアミノ酸配列と称するものは、エリクソン(Eriks son)他,の公表されたＰＣＴ出願第ＷＯ９６／２６７３６において記載されたヒトＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆の配列（Genbankデータベース登録番号Ｕ５２８１９）のことを指す。Ｆｌｔ−１のアミノ酸またはヌクレオチド配列と称するものは、シブヤ（Shibuya）他，Oncogene，5:519(1990)によって記載された配列（EMBLデータベース登録番号Ｘ５１６０２）を指す。Ｆｌｔ−１受容体またはそのアナログに対する、ＶＥＧＦ−Ｂおよび／またはＶＥＧＦ−Ｂアナログの結合アフィニティーは、リー（Lee）他，Proc．Natl．Acad．Sci.，93:1988(1996)に記載の手法に従ってテストしている。内皮細胞増殖をアッセイするための有用な方法は、オロフソン（Olofsson）他，Proc．Natl．Acad．Scl．USA，93:2576-81(1996)において記載されている。本発明の１つの好適な側面によると、本発明は、細胞表面受容体に対してＶＥＧＦ−Ｂと実質的に同じ結合アフィニティーを有するＶＥＧＦ−Ｂアナログを同定する方法であって、前記方法は以下の工程：（ａ）（ｉ）Ｆｌｔ−１の残基１−３４７によって規定されるアミノ酸配列、または、そのＶＥＧＦ−Ｂ−特異的受容体アナログからなるポリペプチド鎖；（ｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ −１の残基１−３４７と少なくとも３０％のアミノ酸アイデンティティを共有するポリペプチド鎖；および、（ｉｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ−１のヌクレオチド１−１２９３によって規定される配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によってコードされるポリペプチド鎖：からなるグループから選択される受容体タンパク質を含有するサンプルを提供する工程；（ｂ）工程（ａ）の前記サンプルを、候補ＶＥＧＦ−Ｂアナログと接触させる工程；および（ｃ）前記候補VＥＧＦ−Ｂアナログと、工程（ａ）の受容体タンパク質との間の特異的な結合を検出する工程：を有するＶＥＧＦ−Ｂアナログを同定する方法に関する。ＶＥＧＦ−Ｂの細胞表面受容体への結合は、受容体へのＶＥＧＦ−Ｂダイマーの結合が関与しており、それによって受容体の二量体化およびその受容体の自己リン酸化が引き起こされ、その後細胞内シグナル伝達および、適当な環境においては血管新生などの細胞応答が引き起こされると考えられている。受容体タンパク質を含有するサンプルは、例えば、自然に受容体を発現する細胞の培養上清(条件培養液conditioned-medium)において自然に産生された可溶性のＦｌｔ受容体とすることができる。組織サンプルまたはタンパク分解性の現象によって細胞から自然に流れ出た組織液も、受容体サンプルとして使用することができる。本発明のこの側面によって同定されたＶＥＧＦ−Ｂアナログは、例えばタンパク質またはペプチドまたはＤＮＡやＲＮＡなどの非−タンパク性の化合物などの、小分子であってよい。アナログには、毒素または薬物または放射性同位体をタグ付加され、腫瘍における内皮細胞上に発現されアップレギュレートされたＦｌｔ− １を標的化することができるような、ＶＥＧＦ−Ｂまたは誘導体（限定されるものではないが、ＶＥＧＦ−Ｂモノマーまたはダイマーのフラグメントを含む）も含まれうる。そのような分子は、腫瘍-誘導性の血管新生または乾癬または網膜症などの、望ましくないＶＥＧＦ−Ｂ誘導性の細胞応答を拮抗または阻害するのに有用である可能性がある。これはKim et al.，Nature，362(6243):841-44(199 3)またはアイエロ（Aieilo）他，New England Journal of Medicine，331(22):1 480-87(1994)によって記載されているような技術と類似の技術によって行われる。ＶＥＧＦ−Ｂ／Ｆｌｔ−１複合体を単離する１つの手法には、Ｆｌｔ−１受容体と免疫グロブリンＧ（ＩｇＧ）との融合タンパク質を用い、それに続いてセファロースＡへの結合を使用することが含まれる。セファロースＡを使用する代わりとして、イオン交換クロマトグラフィー、ゲル濾過、またはアフィニティークロマトグラフィーの使用が含まれる。受容体／ＩｇＧ融合タンパク質を含む培養上清は、ＶＥＧＦ−ＢリガンドまたはそのアナログのいずれかをコードするＤＮＡでトランスフェクトされた細胞からか、または、自然にリガンドを発現する細胞からの培養上清と、あるいは、候補リガンドアナログを含有する溶液と、相互作用させることができる。本発明の他の好適な側面によると、本発明は、細胞表面受容体に対して、ＶＥＧＦ−Ｂと実質的に同じ結合アフィニティーを有するＶＥＧＦ−Ｂアナログを同定する方法であって、前記方法は以下の工程：（ａ）（ｉ）Ｆｌｔ−１の残基１−３４７によって規定されるアミノ酸配列、または、そのＶＥＧＦ−Ｂ−特異的受容体アナログからなるポリペプチド鎖；（ｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ −１の残基１−３４７と少なくとも３０％のアミノ酸アイデンティティを共有するポリペプチド鎖；および、（ｉｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ−１のヌクレオチド１−１２９３によって規定される配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によってコードされるポリペプチド鎖：からなるグループから選択される、ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有する表面受容体タンパク質を発現する細胞を含有するサンプルを提供する工程；（ｂ）前記細胞を、候補ＶＥＧＦ−Ｂアナログと接触させる工程、および（ｃ）ＶＥＧＦ−Ｂ−媒介細胞応答の誘導を検出する工程：を有するＶＥＧＦ−Ｂアナログを同定する方法に関する。そのような検出可能な細胞応答の例としては、内皮細胞増殖、血管新生、受容体のチロシンリン酸化、および細胞の遊走が含まれる。細胞表面受容体タンパク質を発現する細胞は、受容体を自然に発現する細胞でもよく、あるいは受容体が発現するように受容体をトランスフェクトされた細胞でもよい。そのような細胞の培養からの培養上清を、セファロースＡカラムまたはマトリックスに通して受容体を固定化することができ、または、それらをＥＬＩＳＡテストの形態で、セルロースディスクに固定化するか、プラスチック上に吸収させることができる。そして、リガンドを発現する細胞からの培養上清を含む第２の溶液を、そのように固定化された受容体上に通す。所望の場合には、ラジオアッセイ技術による結合したリガンドの量の測定を容易にするためにリガンドを放射性標識することができる。そのようなアッセイは、Ｆｌｔ−１受容体の過剰発現に関わる条件についてスクリーニングするために利用可能である。それは即ち、コントロールと比較して結合した放射能の増加を検出することによって行われる。この方法は、競合するＶＥＧＦ−Ｂアナログの存在をスクリーニングするためにも利用可能である。それは即ち、コントロールと比較して結合した放射能の減少を検出することによって行われ、結合した放射能の減少は、テストにおいて用いられた放射性標識されたＶＥＧＦ−Ｂリガンドと、非−放射性の推定アナログとの間の競合を示すものである。別法として、前述のアッセイを逆にして、ＶＥＧＦ−Ｂリガンドまたは候補アナログを固定化し、そして固定化したリガンドと、受容体を発現する細胞からの培養上清を接触させてもよい。本発明の更に別の側面によると、本発明は、サンプル中のＶＥＧＦ−Ｂまたは候補ＶＥＧＦ−Ｂアナログを同定するためのキットであって、前記キットが、（ａ）サンプルを受け入れるのに適しており、そして、以下の（ｉ）（ｉｉ）（ｉｉｉ）からなるグループから選択される受容体タンパク質を含有する、容器：（ｉ）Ｆｌｔ−１の残基１−３４７によって規定されるアミノ酸配列、または、そのＶＥＧＦ−Ｂ−特異的受容体アナログからなるポリペプチド鎖；（ｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ −１の残基１−３４７と少なくとも３０％のアミノ酸アイデンティティを共有するポリペプチド鎖；および、（ｉｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ−１のヌクレオチド１−１２９３によって規定される配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によってコードされるポリペプチド鎖；および、（ｂ）ＶＥＧＦ−Ｂまたは候補ＶＥＧＦ−Ｂアナログと、前記容器に含有される前記受容体タンパク質との相互作用を検出するための手段：を有し、ここで前記ＶＥＧＦ−Ｂまたは候補ＶＥＧＦ−Ｂアナログは前記容器に受け入れられるサンプルの部分を構成するものである、サンプル中のＶＥＧＦ− Ｂまたは候補ＶＥＧＦ−Ｂアナログを同定するためのキットに関する。検出手段は例えば、ＶＥＧＦ−ＢまたはＶＥＧＦ−Ｂアナログと、前記受容体タンパク質との特異的結合相互作用を検出するための手段、または、ＶＥＧＦ−Ｂ誘導性細胞応答の誘導を検出するための手段からなるものとすることができる。本発明の更に別の側面は、２つの分子からなる単離リガンド−受容体複合体であって、１つは、前記リガンドを規定し、ＶＥＧＦ−Ｂの少なくともアミノ酸１ −１１５またはその受容体−結合アナログを含むものであり、そして、第２は、前記受容体を規定し、（ｉ）Ｆｌｔ−１の残基１−３４７によって規定されるアミノ酸配列、または、そのＶＥＧＦ−Ｂ−特異的受容体アナログからなるポリペプチド鎖；（ｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ −１の残基１−３４７と少なくとも３０％のアミノ酸アイデンティティを共有するポリペプチド鎖；（ｉｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ−１のヌクレオチド１−１２９３によって規定される配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によってコードされるポリペプチド鎖：からなるグループから選択されるものである、単離リガンド−受容体複合体に関する。好ましくは前記リガンドはＶＥＧＦ−Ｂであり、前記受容体はＶＥＧＦ−ＡおよびＰＩＧＦに対しても結合アフィニティーを有するＦｌｔ−１受容体である。リガンドまたは複合体の単離および精製は、ハーロウ（Harlow）他,Antibodie s,a Laboratory Manual，Cold Spring Harbor Laboratory Press(1988)および／またはマーシャック（Marshak）他,Strategies for Protein Purification and Characterization，Cold Spring Harbor Laboratory Press(1996)などの標準的な参考文献において記載されている技術に従って、モノクローナル抗体を使用した免疫親和性精製などの通常の手法によって行うことができる。個々のリガンドまたは複合体に対する好適な抗体は、通常の技術によって作成することができる。無細胞の(cell-free)複合体は、イン・ヴィヴォまたはイン・ヴィトロにおいて、細胞表面受容体へのＶＥＧＦ−Ｂの結合を競合するために、または、リガンド結合後の細胞−結合受容体の二量体化を妨げるために、利用することができる。そのような無細胞の複合体は、例えば可溶性ＦＬＴ（ｓＦＬＴ）などの少なくとも１つの受容体分子、および、ＶＥＧＦ−Ｂダイマー分子、ＶＥＧＦ−Ｂアナログダイマー分子、または混合ＶＥＧＦ−Ｂ／ＶＥＧＦ−Ｂアナログダイマー分子を含むものとする。それは、ダイマーのうち１分子は複合体内の受容体分子に結合することができるように、ダイマーの第２の分子は、細胞表面受容体への結合に利用可能な遊離の結合部位を有するようにするためである。リガンド−受容体複合体上のエピトープに対して特異的結合アフィニティーを有する単離結合パートナーであって、前記複合体は、（ｉ）Ｆｌｔ−１の残基１−３４７によって規定されるアミノ酸配列、または、そのＶＥＧＦ−Ｂ−特異的受容体アナログからなるポリペプチド鎖；（ｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ − １の残基１−３４７と少なくとも３０％のアミノ酸アイデンティティを共有するポリペプチド鎖；または、（ｉｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ−１のヌクレオチド１−１２９３によって規定される配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によってコードされるポリペプチド鎖：によって規定される細胞表面受容体のリガンド結合ドメインと特異的結合相互作用にある、ＶＥＧＦ−Ｂタンパク質またはそのアナログを有するものであり、ここで、前記結合パートナーは、複合体を形成していないＶＥＧＦ−ＢまたはＶＥＧＦ−Ｂアナログに対しては実質的に結合アフィニティーを有さないものである、単離結合パートナーを提供することも本発明の１つの側面である。好ましくは、前記結合パートナーは、前記細胞表面受容体タンパク質またはその受容体アナログの複合体を形成していない形態に対しても実質的に結合アフィニティーを有さないものである。前記結合パートナーは、そのような増殖因子／受容体複合体と反応するか、またはそれを認識する抗体とすることができる。ポリクローナル抗体またはモノクローナル抗体のいずれも使用することができるが、モノクローナル抗体が好適である。そのような抗体は、受容体またはリガンドのいずれかの単独に結合するものをスクリ−ニングして除くというような、標準的技術によって作成することができる。本発明の更なる側面は、上述の方法によって得られた、ＶＥＧＦ−Ｂアナログの、（ｉ）細胞表面受容体へのＶＥＧＦ−Ｂの結合を拮抗すること、または（ｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂ-媒介細胞応答の誘導を拮抗すること、のための使用に関する。好適なＶＥＧＦ−Ｂアナログは、（ｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有する細胞表面受容体の、リガンド結合ドメイン、または、（ｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂまたはその受容体−結合アナログの、受容体結合ドメイン、に対して結合特異性を有する抗体からなる。ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有する細胞表面受容体のリガンド結合ドメインは、望ましくは、Ｆｌｔ−１の残基１−３４７と少なくとも３０％、好ましくは少なくとも３５％のアミノ酸アイデンティティを示すものであり、特に好ましくはそれに対応するものである。ＶＥＧＦ−Ｂアナログの、受容体結合ドメインは、望ましくはＶＥＧＦ−Ｂのアミノ酸残基１−１１５と少なくとも５０％、好ましくは少なくとも６５％の配列アイデンティティを示すものであり、特に好ましくはそれに対応するものである。本発明の更に別の側面は、（ｉ）Ｆｌｔ−１の残基１−３４７によって規定されるアミノ酸配列、または、そのＶＥＧＦ−Ｂ−特異的受容体アナログからなるポリペプチド鎖；（ｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ −１の残基１−３４７と少なくとも３０％のアミノ酸アイデンティティを共有するポリペプチド鎖；または、（ｉｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ−１のヌクレオチド１−１２９３によって規定される配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によってコードされるポリペプチド鎖：からなるグループから選択される受容体タンパク質の、（ａ）細胞表面受容体へのＶＥＧＦ−Ｂ結合、または、（ｂ）ＶＥＧＦ−Ｂ−媒介細胞応答の誘導、を拮抗するための方法における使用に関する。前記ボリペプチド鎖は、ＶＥＧＦ−Ｂについて細胞表面受容体と競合し、有効なＶＥＧＦ−Ｂを拘束し、それによって、効果的にそれ（ＶＥＧＦ−Ｂ）が細胞表面受容体と相互作用し、ＶＥＧＦ−Ｂ−媒介細胞応答を誘導するのを妨げる。好適なペプチド鎖は、ケンダル(Kendall)他,Proc.Natl.Acad.Scl.,90:10705-709 (1993)に記載されている、前記受容体の可溶性形態のもの（ｓＦＬＴ）とすることができる。さらに、細胞表面受容体へのＶＥＧＦ−Ｂ結合を拮抗するための方法を提供することも本発明の１つの側面である。この方法は、Ｆｌｔ−１の残基１−３４７によって規定されるアミノ酸配列またはそのＶＥＧＦ−Ｂ受容体結合配列バリアントに対して結合特異性を有するタンパク質を提供する工程を有し、ここで、前記タンパク質はＶＥＧＦ−Ｂの残基１−１１５と少なくとも５０％、好ましくは少なくとも６５％のアミノ酸配列アイデンティティを有し、したがって前記タンパク質は、前記細胞表面受容体を発現する細胞を与えられた場合、前記受容体と特異的に相互作用する能力を有し、それによって前記受容体へのＶＥＧＦ−Ｂ結合を実質的に阻害するものである。前記タンパク質は、望ましくは前述の方法のいずれかによって得られたＶＥＧＦ−Ｂアナログとするとよい。本発明の更なる側面によると、そのような増殖因子／受容体複合体を含む医薬調製物が提供される。本発明の更に別の側面において、Ｆｌｔ−１細胞表面受容体の過剰発現によって特徴づけられる疾病状態を治療するための方法が提供され、前記方法は、前記疾病状態を患う患者に、受容体−結合に有効な量の、ＶＥＧＦ−Ｂまたは前述の方法のいずれかによって得られたＶＥＧＦ−Ｂアナログを投与することからなる。前記の受容体タンパク質が、Ｆｌｔ−１の残基１−３４７以外のボリペプチド鎖からなるにもかかわらず、ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを示すような場合、それは、Ｆｌｔ−１の残基１−３４７と、少なくとも３０％、望ましくは少なくとも３５％、好ましくは少なくとも６５％、特に好ましくは少なくとも９０％、そしてさらに好ましくは少なくとも９５％のアミノ酸アイデンティティを示すべきである。有用なＶＥＧＦ−Ｂアナログは、ＶＥＧＦ−Ｂと、少なくとも５０％、好ましくは少なくとも６５％、特に好ましくは少なくとも９０％、そしてさらに好ましくは少なくとも９５％の配列アイデンティティを示すべきである。図面の簡単な説明本発明を例示的な実施例を参照して以下に更に詳細に記載する。その結果は以下の添付の図面に図示される：図１は、ヒトＶＥＧＦおよびＶＥＧＦ−Ｂに対する発現ベクターでそれぞれトランスフェクトされた２９３ＥＢＮＡ細胞からの培養上清で刺激された、Ｆｌｔ −１を発現するＮＩＨ３Ｔ３細胞からの、Ｆｌｔ−１免疫沈殿(immunoprecipita tes)の、抗−ＰＴｙｒでプローブされたウェスタンブロットである；図２（ａ）および（ｂ）はそれぞれ、³⁵Ｓ−メチオニン標識されたマウスＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆の、Ｆｌｔ−１−ＩｇＦｃ融合タンパク質への結合を示す、ＳＤＳ −ＰＡＧＥ電気泳動ゲルを、長時間および短時間露光したものである；図３は、ＶＥＧＦ₁₆₅、ＶＥＧＦ−Ｂ₁₆₇、ＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆および、ＶＥＧＦ −Ｃの、可溶性ＶＥＧＦＲ−１、ＶＥＧＦＲ−２およびＶＥＧＦＲ−３への結合の、ＳＤＳ−ＰＡＧＥ分析である；図４は、ＮＩＨ３Ｔ３Ｆｌｔ−１細胞を用いた、ｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆によるＶＥＧＦＲ−１／Ｆｌｔ−１からの、[¹²⁵Ｉ]−ｈＶＥＧＦ₁₆₅の置換のグラフである；図５は、ｍＶＥＧＦ₁₆₄による、ＮＩＨ−ＶＥＧＦＲ−１／Ｆｌｔ−１上での競合のグラフである；図６は、過剰のＶＥＧＦ₁₆₅による、可溶性のＶＥＧＦＲ−１からのＶＥＧＦ −Ｂ₁₆₇およびＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆の置換を示す；図７は、ＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆のタンパク分解性プロセシングを示すＳＤＳ−ＰＡＧＥ分析である；図８は、ＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆のプラスミン消化を示すＳＤＳ−ＰＡＧＥ分析である；図９は、突然変異(mutational)分析および可溶性ＶＥＧＦＲ−１への受容体結合エピトープ突然変異体(mutant)の結合について用いたＶＥＧＦ−Ｂ₁₆₇の突然変異(mutation)を示す模式図である；図１０ａから１０ｃは、ＶＥＧＦ−Ｂのシステイン突然変異のＳＤＳ−ＰＡＧＥ分析を示す；図１１は、１０μｇ／ｍｌのヘパリンの存在下で標識したＶＥＧＦ−Ｂ₁₆₇の突然変異体のＳＤＳ−ＰＡＧＥ分析を示す；図１２は、５０ｎｇ／ｍｌのｈＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆の存在下でインキュベートしたウシ微小血管内皮（ＢＭＥ）細胞からのＲＮＡのノザンブロット分析を示す；そして、図１３ａおよび１３ｂは、ｈＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆の存在下でインキュベートしたＢＭＥ細胞から調製した細胞抽出液の酵素電気泳動（ザイモグラフzymographic ）分析および逆酵素電気泳動分析を示す。一般的方法細胞培養および材料：Ｓｆ−９細胞は、懸濁増殖のために０．１％ｐｌｕｒｏｎｉｃｆ−６８を追加したＳｆ−９００ＩＩＳＦＭ(Gibco BRL，Life Technologies)中に維持した。ＨｉｇｈＦｌｖｅ細胞(Invitrogen)は、Ｅｘ−ｃｅｌｌ４００培地(JHR B ioscience UK)中に維持した。２９３−ＥＢＮＡ、ＣＯＳ−７、２９３−Ｔ、およびＮＩＨ３Ｔ３−Ｆｌｔ− １細胞[サワノ（Sawano）他，Cell Growth ＆ Differentiation 7，213-21(1996 )]は、１０％ウシ胎児血清（ＦＣＳ）を追加したダルベッコ最少基本培地（ＤＭＥＭ）中で培養した。ＮＩＨ３Ｔ３−Ｆｌｔ−１は、２００μｇ／ｍｌのネオマイシンを用いて継続的な選抜下に保った。ウシ副腎皮質−由来微小血管内皮（ＢＭＥ）細胞は、１．５％のゼラチンでコーティングした組織培養フラスコ上で、１５％ドナーウシ血清を追加した、ＭＥＭ，アルファ修飾(Gibco AG，Basel，Switzerland)中で培養した。ＰＡＥ−ＫＤＲ細胞[ウォルテンベーガー(Waltenberger)他,J.Biol.Chem.,269 :26988-95(1994)]は、１０％ＦＣＳを含むＨａｍ’ｓＦ１２培地で培養した。受容体Ｉｇ−融合(fusions)および発現ベクターの構築：ａ）ｐＩｇ−ＶＥＧＦＲ−１ヒトＩｇＧ１Ｆｃに融合したＶＥＧＦＲ−１の最初の５つのＩｇ−様ドメインをコードする発現プラスミドｐＩｇ−ＶＥＧＦＲ−１を、ｐＬＴＲＦｌｔ１からのＨｉｎｄＩＩＩフラグメント（ＶＥＧＦＲ−１のアミノ酸１−５４９をコードするもの）を、ｐｌｇｐｌｕｓベクター(Ingenius)に結合することによって構築した。クローニングに先だって、ｐＩｇｐｌｕｓベクターをＸｈｏＩおよびＸｂａＩで消化し、平滑末端化し、融合タンパク質産生のために正しい読み枠とするために、再結合した。ｂ）ｓｐＩｇ−ＶＥＧＦＲ−２ｓｐＩｇ−ＶＥＧＦＲ−２コンストラクトのために、ＶＥＧＦＲ−２の最初の４つのＩｇ−様ドメインをコードするｃＤＮＡを、ヒト胎児肺ｃＤＮＡライブラリー(Clontech)をテンプレートとして用いてボリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）によって増幅した。プライマーは、５’−ａｔｇｇｔａｃｃｃｃｃａｇｇｃｔｃａｇｃａｔａｃａａａａａｇａｃ− ３’（配列番号１）および５’−ｇｃｇｔｃｔａｇａｇｇｇｔｇｇｇａｃａｔａｃａｃａａｃｃａｇ−３’ （配列番号２）を用い、そして増幅されたフラグメントはＫｐｎ−１およびＸｂａ−１で切断してｓｉｇｎａｌｐＩｇベクター(Ingenius)の対応する部位にクローニングした。ｃ）ｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆ｐＦＡＳＴＢＡＣ１ｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆ｃＤＮＡ[オロフソン（Olofsson）他，J．Biol．Chem．271 :19310-19317(1996)]をＥｃｏＲＩによって切断し、ｐＦＡＳＴＢＡＣ１(Gibco BRL Life TechnoLogies)にサブクローニングした。（Ｈｉｓ）₆タグ（およびエンテロキナーゼ部位）を、シグナル配列を欠いたＮ−末端に導入した。これは、テンプレートとしてｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆ｐＳＧ５を用い、プライマーとして、５’−ａｔｃｇａｇａｔｃｔｔｃａｔｃａｃｃａｔｃａｃｃａｔｃａｃｇｇａｇａｔｇａｃｇａｔｇａｃａａａｃｃｔｇｔｇｔｃｃｃａｇｔｔｔ−３’（配列番号３）および５’−ｃａａｇｇｇｃｇｇｇｇｃｔｔａｇａｇａｔｃｔａｇｃｔ−３’（配列番号４）（両者ともＢｇｌＩＩ部位を含む）を用いた、ＰＣＲを使用して行った。増幅されたフラグメントはＢｇｌＩＩで切断してｐＡｃＧＰ６７Ａ(Pharmingen，U.S.A .)の、ＧＰ−６７のシグナル配列とインフレームとなるようにＢａｍＨＩ部位にクローニングした。ｄ）ｈＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆ｐＰＩＣ−９ｈＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆をフォワードプライマー、５’−ｇｇａａｔｔｃｃｃｃｇｃｃｃａｇｇｃｃｃｃｔｇｔｃ−３’（配列番号５）およびリバースプライマー、５’−ｇｇａａｔｔｃａａｔｇａｔｇａｔｇａｔｇａｔｇａｔｇａｇｃｃｃｃｇｃｃｃｔｔｇｇｃ−３’（配列番号６）を用いたＰＣＲにより増幅した。Ｃ−末端に（Ｈｉｓ）₆タグを含む増幅産物をｐＰＩＣ−９(Invitrogen)のＥｃｏＲＩ部位にα接合因子シグナル配列とインフレームになるようにクローニングした。すべての配列の確実性をシークエンシングによって立証した。タンパク質発現および精製：Ｓｆ９およびＨｉｇｈＦｉｖｅ細胞を用いたバキュロウイルスでの産生のために、ｍＶＥＧＦ−Ｂ組換えプラークを精製および増幅し[サマーズ(Summers)他 ,Tex．Agric．Exp．Stn．Bull．1555:1-57(1988)]、そして対応する発現したタンパク質、およびピチア属パストリス(Pichia pastoris)（ＧＳ１１５系統）によって発現したｈＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆とをＮｉ−ＮＴＡＳｕｐｅｒｆｌｏｗ樹脂( Qiagen)を用いて精製した。定量的なイムノブロットのために、感染した昆虫細胞からの培地を、スタンダードとして１−３０ｎｇの精製されたｍ（Ｈｉｓ）₆ＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆とともに、還元１２％ＳＤＳ−ＰＡＧＥで泳動し、ｍ（Ｈｉｓ）₆ＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆に対するアフィニティー精製した抗体でブロットした。トランスフェクション、免疫沈降および可溶性受容体結合：２９３−Ｔ細胞またはＣＯＳ−７細胞を、リン酸カルシウム沈殿を用いて、ｈＶＥＧＦ₁₆₅ｐＳＧ５、ｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₆₇ｐＳＧ５、ｍＶＥＧＦ−Ｂ_kEx1-5ｐＳＧ５、ｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆ｐＳＧ５、ＶＥＧＦＲ−１ｐＩｇおよびＶＥＧＦＲ −２ｐＩｇでトランスフェクトした。ＶＥＧＦＲ−３ＥＣ−ＩｇｐＲＥＰ７（ドオクター・カトリ・パジュソーラ（Dr．Katri Pajusola）から入手）およびｈＶＥＧＦ−Ｃ△Ｎ△Ｃ（Ｈｉｓ）₆ｐＲＥＰ７[ヨウコフ(Joukov)他，EMBO J．16:3898-911(1997)]を同様に２９３−ＥＢＮＡ細胞で発現させた。トランスフェクションの４８時間後、増殖因子を発現する細胞を、１００μＣｉ／ｍｌのＰｒｏｍｉｘＴＭＬ−３５Ｓ(Amersham)で、５−６時間代謝的に標識し( 別に指定されていない場合)、そして培地を収集した。指示されている場合は、ヘパリン（１０または５０μｇ／ｍｌ）を標識培地に添加した。代謝的に標識された培地を(ＶＥＧＦトランスフェクションからの場合以外)、２μｇ／ｍｌのＶＥＧＦ抗体ＭＡＢ２９３(R&D Systems)を用いて、内因性に発現しているＶＥＧＦおよびヘテロダイマーを２時間免疫除去(immuno-depleted)した。可溶性の受容体については、トランスフェクションの４８時間後、培地を、０．１％のＢＳＡを含むＤＭＥＭによって交換し、そしてさらに１２時間インキュベートした。受容体−Ｉｇ融合（場合によっては量を、ＣｏｌｌｏｉｄａｌＣｏｍａｓｓｉｅ(Novex，San Diego)で染色した１０％ＳＤＳ−ＰＡＧＥで定量した）および偽(mock)トランスフェクトした細胞からの等量の培地を、プロテイン−Ａ−セファロースに吸収させた。代謝的に標識した増殖因子は、受容体Ｉｇ融合とともに＋４℃で３時間インキュベートし、氷冷結合バッファー（ＰＢＳ０．５％ＢＳＡ）０．０２％Ｔｗｅｅｎ２０および１ｍＭＰＭＳＦ）で３回、そして１ｍＭＰＭＳＦを含むＰＢＳで２回洗浄した。抗体の作成：ウサギを、標準的手法により、精製したｍ（Ｈｉｓ）₆ＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆で免疫し、その結果得られた抗血清を収集した。ｍＶＥＧＦ−ＢＮ−末端ペプチドに対する抗血清を［オロフソン（Olofsson）他，J．Biol．Chem．271:19310-19317 (1996)］に記載されているようにして作成した。抗血清を、ＣＮＢｒ−活性化セファロースＣＬ−４Ｂ(Pharmacia)に共有結合したｍ（Ｈｉｓ）₆ＶＥＧＦ−Ｂ₁₈ ₆ に対してアフィニティー精製した。例１手法：ヒトＦｌｔ−１受容体タンパク質を発現するＮＩＨ３Ｔ３細胞の培養物を、まずＤＭＥＭ中の０．５％ウシ胎児血清（ＦＣＳ）にて２４時間飢餓させた。細胞を次にｐＲＥＰ７−ｈＶＥＧＦ−ＡまたはｐＲＥＰ７−ｈＶＥＧＦ−Ｂ₁₆₇でそれぞれトランスフェクトしておいた２９３ＥＢＮＡ細胞の培養からの培養上清中にて３７℃で５分間刺激した。ｐＲＥＰ７単独でトランスフェクトされた２９３ＥＢＮＡ細胞からの培養上清をネガティブコントロール（偽；Mock）として用いた。すべての培養上清は、１μｇ／ｍｌのヘパリンを含有していた。刺激後、細胞を０．１ｍＭのオルトバナジウム酸ナトリウムを含有する氷冷ＰＢＳ中ですすぎ、そして２ｍＭのオルトバナジウム酸ナトリウム、１ｍｇ／ｍｌのアプロチニン、および１ｍＭのＰＭＳＦを含有するＲＩＰＡバッファー中で溶解した。可溶化液を超音波処理し、遠心分離によって不純物を取り除き、そして抗−ｆｌｔ−１抗体である、ＳＣ３１６(Santa Cruz)とともに氷上で２時間インキュベートした。その結果得られた免疫性の複合体を、プロテインＡ−セファロースビーズでの沈降によって収集した。免疫沈殿物(immunoprecipitates)を溶解バッファーで３回洗浄し、６％ＳＤＳＰＡＧＥでの電気泳動によって分離し、そしてニトロセルロースフィルターにトランスファーした。フィルターを西洋ワサビペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）−結合(conjugated)抗−ホスホチロシン抗体ＲＣ２ＯＨ(Trans duction Labs)でプローブし、免疫反応性をＥＣＬ(Amersham)によって検出した。抗-ホスホチロシン抗体は、Ｆｌｔ−１上のリン酸化されたチロシンを認識し、そしてＦｌｔ−１受容体の自己リン酸化の観察を可能とするものであった。結果：ＶＥＧＦベクター、空の(empty)ベクターまたはヒトＶＥＧＦ−Ｂ₁₆₇ｐＲＥＰ７ベクターでトランスフェクトされた２９３ＥＢＮＡ細胞からのヘパリンを追加した培養上清で刺激された、Ｆｌｔ−１を発現するＮＩＨ３Ｔ３細胞から免疫沈降されたＦｌｔ−１の、抗−ＰＴｙｒでプローブしたウェスタンブロットである、添付の図１から理解されるように、幾分弱いがしかし陽性であるチロシンリン酸化されたバンドが、ＶＥＧＦ−ＡとＶＥＧＦ−Ｂとの両方について観察され、これはこれらリガンドが両方ともＦ１ｔ−１の自己リン酸化を引き起こすことを示している。対照的に、図の真ん中の偽(−)レーンでは自己リン酸化はみられない。このデータは、ヒトＶＥＧＦ−ＢがＦｌｔ−１受容体に結合し、その自己リン酸化を誘導するということを示している。これは、Ｆｌｔ−１が、ヒトＶＥＧＦ −Ｂ₁₆₇に対する受容体でもあるということを示すものである。例２手法：受容体ＩｇＧ融合タンパク質：Ｆｌｔ−１の最初の３つの免疫グロブリン（Ｉｇ）ループをコードするｃＤＮＡをヒトＩｇＧ重鎖のＦｃ領域へとスプライスしてつなぎ、そしてベクターｐＲＥＰ７(Invitrogen)にクローニングし、プラスミドｐＲＥＰ７Ｆｌｔ−１−ＩｇＦｃを作成した。同様にしてｐＲＥＰ７ＫＤＲ−ＩｇＦｃを構築した。この実験で用いたＦｌｔ−１−ＩｇＦｃおよびＫＤＲ−ＩｇＦｃｃＤＮＡは、ｐＢＪＦｌｔＫＴ３と称されるプラスミドコンストラクトからのＲＴ−ＰＣＲ産物であった。結果として得られたプラスミドを用いてリン酸カルシウム法によって、２９３ＥＢＮＡ細胞をトランスフェクトし、その結果得られる培養上清をトランスフェクションの４８時間後に収集した。³⁵ Ｓ−標識したｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆の受容体ＩｇＧ沈降：マウスＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆をコードするプラスミドｐＳＪ５(Stratagene)（ｐＳＪ５ＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆）をエレクトロポレーションによりＣＯＳ細胞にトランスフェクトし、そして細胞を³⁵Ｓ−メチオニンおよび³⁵Ｓ−システインで１０時間標識した。³⁵Ｓ−標識されたｈＶＥＧＦ−Ａ１６Ｓを受容体結合についてのポジティブコントロールとして用い、これはｐＲＥＰ７ＶＥＧＦ−Ａでトランスフェクトした２９３ＥＢＮA細胞で産生され、上述のようにして標識されたものである。Ｆｌｔ−１−ＩｇＦｃまたはＫＤＲ−ＩｇＦｃを含有する培養上清約１ｍｌを、プロテイン−Ａセファロースの５０％のスラリー４０μｌとともに連続的に撹拌しながら４℃で１時間インキュベートした。偽(mock)−トランスフェクトした細胞からの培養上清をネガティブコントロールとして用いた。プロテイン− Ａセファロースビーズを遠心分離によって収集し、結合バッファー（ＰＢＳ、０．５％ＢＳＡ、０．０２％Ｔｗｅｅｎ２０、１μｇ／ｍｌヘパリン）中で、³⁵Ｓ−標識されたｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆またはＶＥＧＦ（−Ａ）を含有する１ｍｌの培養上清とともにおだやかに撹拌しながら室温で３時間インキュベートした。プロテイン−Ａセファロースビーズを遠心分離によって収集し、氷冷結合バッファーで２回、２０ｍＭｔｒｉｓｐＨ７．５で１回洗浄し、ＳＤＳサンプルバッファー中でボイルし、１０％ＰＡＧＥで電気泳動した。結果：結果を図２（ａ）および（ｂ）に示す。これはそれぞれ、ＳＤＳ−ＰＡＧＥゲルを、長時間および短時間露光したものである。図において、レーン１は免疫沈降されたマウスＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆を示す；レーン２はＦｌｔ−１−Ｉｇ、ｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆を示す；レーン３はＦｌｔ−１−Ｉｇ、偽(mock)を示す；レーン４は偽、ｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆を示す；レーン５はＫＤＲ−Ｉｇ、ｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆ を示す；レーン６はＫＤＲ−Ｉｇ、偽を示す。ＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆がＦｌｔ−１に対するリガンドであるか否かを判定するために、この因子に対するｃＤＮＡを含有するプラスミド、およびＶＥＧＦ（−Ａ）をコードするプラスミド、または発現ベクターのみを哺乳類の細胞にトランスフェクトし、タンパク質を³⁵Ｓアミノ酸で標識した。これらの細胞からの培養上清を、プロテイン−Ａセファロースビーズに結合したＦｌｔ−１−ＩｇＦｃまたはＫＤＲ−ＩｇＦｃで沈降させた。３２ｋＤａのバンド[図２（ａ）の上の矢印によって示される]が、Ｆｌｔ−１−ＩｇＦｃによってＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆培養上清から沈降した。免疫沈降されたＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆と共−移動するこのバンドは、偽トランスフェクトされた細胞のＦｌｔ−１−ＩｇＦｃ沈降においては見られず、ＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆のプロテイン−Ａセファロースのみによる沈降でも見られなかった。この３２ｋＤａのバンドのわずかな沈降がＫＤＲ−ＩｇＦｃによっても見られた。これらのデータは明らかにマウスＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆と、ヒトＦｌｔ−１受容体の間で複合体が形成されることを示すものである。また、図２（ａ）および（ｂ）から理解されるように、Ｆｌｔ−１−ＩｇＦｃおよびＫＤＲ−ＩｇＦｃの両方によってさらなるより低分子量の種が沈降しているが、これら３つのバンドは偽トランスフェクトされた細胞の培養上清においても見られ、ＣＯＳ細胞によって産生された内在性の因子、おそらくはＶＥＧＦ（−Ａ）を表すものであると考えられる。これらの中で、括線(brackets)の矢印によって示すバンドも、ＶＥＧＦ−Ｂ関連物質を部分的に表すものである可能性がある。例３ＶＥＧＦＲ−１，−２および／または−３へのＶＥＧＦ−Ｂの結合のテスト：ＶＥＧＦ−ＢがＶＥＧＦＲ−１，−２または−３に対するリガンドであるかどうかを判定するために、ＶＥＧＦ₁₆₅、ｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₆₇、ｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆ 、またはＶＥＧＦ−Ｃに対する発現プラスミドで２９３−Ｔ細胞をトランスフェクトし、タンパク質をＶＥＧＦ₁₆₅とｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₆₇については５０μｇ／ｍｌのヘパリンの存在下で代謝的に標識し、培地を収集した。ＶＥＧＦトランスフェクション以外のすべてからの培養上清から、内在性のＶＥＧＦおよびＶＥＧＦ／ＶＥＧＦ−Ｂヘテロダイマーを事前に除き(preclear)、そしてそれぞれのタンパク質を、特異的抗体によって免疫沈降するか、またはプロテインＡ−セファロース（ＰＡＳ）に結合した、Ｆｌｔ−１の最初の５つのＩｇ−様ドメインを含む可溶性受容体Ｉｇ融合タンパク質に結合させた。沈降したリガンドを還元条件下でのＳＤＳ−ＰＡＧＥによって分析した。およそ５０ｎｇの可溶性受容体をそれぞれのリガンドの沈降のために用いた。図３に示すように、両方のＶＥＧＦ−ＢスプライスアイソフォームがＶＥＧＦＲ−１に特異的に結合したが、ＶＥＧＦＲ−２または-３には結合しなかった。ＶＥＧＦＲ−２およびＶＥＧＦＲ−３受容体の機能性をそれぞれＶＥＧＦおよびＶＥＧＦ−Ｃとの結合テストによって確認した。このテストは、ＶＥＧＦ−ＢはＶＥＧＦＲ−１／Ｆｌｔ−１に特異的に結合することを示し、それがＶＥＧＦおよびＰｌＧＦに続いて第３番目に同定されたＶＥＧＦＲ−１に対するリガンドであることを示している。３２ｋＤと１６ｋＤの２つのバンドが、特異的抗体およびＶＥＧＦＲ−１によってｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆の培養上清から沈降した。３２ｋＤのバンドはｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆の糖修飾（グリコシル化）された分泌形態に対応する[オロフソン（Ol ofsson）他，J．Biol．Chem．271:19310-19317(1996)]。１６ｋＤの形態はおそらく後で詳細に記載する、タンパク分解性プロセシングの産物である。例４ＶＥＧＦ−Ｂ／ＶＥＧＦＲ−１結合のさらなる調査：細胞表面上に発現するＶＥＧＦＲ−１に対するＶＥＧＦ−Ｂの結合能力について、ＮＩＨ３Ｔ３−Ｆｌｔ１細胞を使用して調査した。可溶性受容体から得られたデータと一致して、ｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆−感染ＨｉｇｈＦｉｖｅ細胞からの培養上清は、図４に示すようにＮＩＨ３Ｔ３−Ｆｌｔ１に対する¹²⁵Ｉ−ＶＥＧＦの結合について競合したが、偽(mock)感染ＨｉｇｈＦｉｖｅ細胞は競合しなかった。定量的なイムノブロットを用いて評価したｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆についての最大半減（half-maximum）阻害濃度は３ｎｇ／ｍｌであり、それに比べて組換えｍＶＥＧＦ₁₆₄は、１．５ｎｇ／ｍｌの最大半減阻害濃度で、ヨウ素化されたｈＶＥＧＦ₁₆₅と競合した（図４および図５）。ＰＡＥ−ＫＤＲ細胞については競合は観察されなかったので、この効果はＶＥＧＦＲ−１に特異的なものであった。したがって、ＶＥＧＦ₁₂₁と同様に、ＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆は、ＶＥＧＦ₁₆₅においてみられるＣ−末端の塩基性残基を有さないが、それにもかかわらずそれはＮＩＨ３Ｔ３−Ｆｌｔ１細胞上のＶＥＧＦＲ−１と結合することが明らかである。ＶＥＧＦ−Ｂはまた、５つのＩｇ−様ドメインを含むＶＥＧＦＲ−１Ｉｇ−融合と同様に、ＶＥＧＦＲ−１の３つのＮ−末端Ｉｇ-様ドメインを含むＶＥＧＦＲ−１Ｉｇ−融合（残基１−３４７）にも良好に結合することが判明した。凝集およびタンパク質の安定性の問題により、精製されたＨｉｓ−タグ付加されたＶＥＧＦ−Ｂ（ヒトおよびマウス（Ｈｉｓ）₆ＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆、そしてマウスおよびヒト（Ｈｉｓ）₆ＶＥＧＦ−Ｂのエキソン１−５を含むＣ−末端欠失(de letion)突然変異体）は、高濃度においてしかヨウ素化されたＶＥＧＦと、ＶＥＧＦＲ−１結合について競合しなかった。例５ＶＥＧＦ競合研究：トランスフェクトされた２９３−Ｔ細胞において発現したｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₆₇ およびｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆を標識培地中においてｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₆₇について１０μ ｇ／ｍｌのヘパリンを用いたという違い以外は、結合テストにおいて記載したように、標識および事前に除去(preclear)した。指示された場合は、２μｇの組換えｈＶＥＧＦ₁₆₅を非放射性のコンペティターとして結合反応に添加した。等量の、代謝的に標識された因子を、可溶性ＶＥＧＦＲ−１に結合させるか、または、アフィニティー精製したＮ−末端ペプチドＶＥＧＦ−Ｂ抗体で２時間免疫沈降し、そして氷冷１０ｍＭＴｒｉｓ−ＨＣｌｐＨ８．０、１％ＴｒｉｔｏｎＸ−１００、２５ｍＭＥＤＴＡ、１ｍＭＰＭＳＦで２回、１ｍＭＰＭＳＦを含有するＰＢＳで２回洗浄した。沈殿物（沈降物）を、１５％ＳＤＳ−ＰＡＧＥによって分析した。図６に示すように、これら２つの形態のＶＥＧＦＲ−１に対する結合およびｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₆₇のＶＥＧＦＲ−１に対する結合は、過剰のｒｈＶＥＧＦによって消失し、これによって、ＶＥＧＦ−ＢのＶＥＧＦＲ−１に対する結合が過剰のＶＥＧＦによって競合されうるということが示された。このテストの結果は、相互作用の特異性を確認するとともに、ＶＥＧＦとＶＥＧＦ −Ｂに対する受容体の相互作用部位はオーバーラップしているか、部分的にオーバーラップしているか、または少なくとも近接しているはずであるということを示唆するものであった。例６細胞表面受容体に対する結合についての競合：競合アッセイのために、ＨｉｇｈＦｉｖｅ細胞を自然の（native）ｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆に対する組換えウイルス（ｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆ｐＦＡＳＴＢＡＣ１）および偽(mock)ウイルスで感染し、培地を感染の４８時間後に回収し、すぐに使用するかまたは−７０℃で凍結した。組換えｍＶＥＧＦ₁₆₄（ドクター・ハーバート・ウェイク（Dr．Herbert Weich ）から入手）またはｈＶＥＧＦ₁₆₅(R&D systems or Peprotech)を、Ｉｏｄｏ− Ｇｅｎ試薬(Pierce)を用いて¹²⁵Ｉで標識し、ＰＤ−１０カラム(Pharmacia)でのゲル濾過によって精製した。ｍＶＥＧＦおよびｈＶＥＧＦについての比放射能は、それぞれ２．２ｘ１０⁵ｃｐｍ／ｎｇおよび１．０ｘ１０⁵ｃｐｍ／ｎｇであった。結合分析のためにＰＡＥ−ＫＤＲおよびＮＩＨ３Ｔ３−Ｆｌｔ１細胞を、０．２％ゼラチンでコーティングした２４穴プレートに播き、集密するまで培養し、氷冷結合バッファー（ＰＡＥ−ＫＤＲについては、Ｈａｍ’ｓＦ１２、０．５ｍｇ／ｍｌＢＳＡ、１０ｍＭＨｅｐｅｓｐＨ７．４、そしてＮＩＨ３Ｔ３Ｆｌｔ１については、ＤＭＥＭ、０．５ｍｇ／ｍｌＢＳＡ、１０ｍＭＨｅｐｅｓｐＨ７．４）で２回洗浄し、そして増加量の標識されていないＶＥＧＦまたはＶＥＧＦ−Ｂまたは偽(mock)感染された昆虫細胞からの培地を含有する結合バッファー中で、０．５ｎｇ／ｍｌの[¹²⁵Ｉ]−ＶＥＧＦとともに三通り(tripli cate)でインキュベートした。＋４℃での２時間のインキュベーション後、細胞を氷冷結合バッファーで３回、そして０．５ｍｇ／ｍｌＢＳＡを含有するＰＢＳで２回、洗浄し、そして０．５ＭＮａＯＨ中で溶解した。可溶化した放射能をガンマカウンターを用いて測定した。図４は、ＮＩＨ３Ｔ３Ｆｌｔ−１細胞を用いた、ｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆による、ＶＥＧＦＲ−１／Ｆｌｔ１からの[¹²⁵Ｉ] −ｈＶＥＧＦ₁₆₅の置換を示す。図５はｍＶＥＧＦ₁₆₄による、ＮＩＨ−ＶＥＧＦＲ−１／Ｆｌｔ−１上での競合を示す。類似したテストにおいて、ｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆はＰＡＥ−ＫＤＲ細胞上でＶＥＧＦＲ−２について[¹²⁵Ｉ]−ＶＥＧＦと競合しないことが判明した。精製した組換え（Ｈｉｓ）₆ＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆を用いた競合分析は、タンパク質の小部分しか生物学的に活性ではないということを示唆するものであった。というのは、自然の（native）（シグナル配列を有する）精製されていないＶＥＧＦ −Ｂ₁₈₆の方が、ＶＥＧＦＲ−１結合についてはるかに効果的にヨウ素化されたＶＥＧＦと競合したからである。例７ＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆のタンパク分解性プロセシング：ＣＯＳ細胞で発現したｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆は、Ｏ−結合型グリコシル化によって修飾され、見かけの分子量が、細胞内形態においては２５ｋＤａであるものから分泌形態においては３２ｋＤａへと増加する。上述のように、２９３−Ｔ細胞においてｍＶＥＧＦＢ₁₈₆を発現させた場合、３２ｋＤａの形態に加えてより速く移動する形態の１６ｋＤａのバンドがみられた。このバンドはＣＯＳ細胞からの培養上清においても、細胞が長時間標識された場合には観察された。以下のテストは、２９３−Ｔ細胞において発現した、ｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆によって形成されるダイマーの、移動およびｓＶＥＧＦＲ−１に結合する能力を、ｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₆₇およびＣ−末端切断形態(truncated form)であるｍＶＥＧＦ−Ｂ_kEx1-5のものと比較するために行ったものである。Ｃ−末端Ｋｅｍｐｔｉｄｅモチーフ[モハンライ（Mohanraj）他，Protein Expression & Purification，8:175-82(1996)]を含むｍＶＥＧＦ−Ｂエキソン１−５突然変異体（ｍＶＥＧＦ−Ｂ_kEx1-5ｐＳＧ５）は、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）によって作成した。ＶＥＧＦ−Ｂ_kEx1-5、ＶＥＧＦ−Ｂ₁₆₇およびＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆は２９３−Ｔ細胞において発現させた。細胞を代謝的に標識した。偽(mock)トランスフェクトした細胞およびＶＥＧＦ−Ｂ₁₆₇でトランスフェクトした細胞を、１０μｇ／ｍｌのヘパリンの存在下で標識した。収集した培地からＶＥＧＦおよびヘテロダイマーを事前に除き(preclear)、そしてアフィニティー精製したＮ−末端ＶＥＧＦ− Ｂペプチド抗体で免疫沈降させるか、またはＶＥＧＦＲ−１に結合させた。結合したリガンドを非還元条件下でのＳＤＳ−ＰＡＧＥによって分析した。結果を図７に示す。ｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆は、最も短い３４ｋＤａ、中間形態の４８ｋＤａ、および全長形態の６０ｋＤａの、３種類のダイマーポリペプチドとして移動することが理解される。３４ｋＤａのバンドはｍＶＥＧＦ−Ｂ_kEx1-5よりわずかに遅く移動し、これは推定切断部位がよりＣ−末端側、おそらくは翻訳されるエキソン６Ａ [オロフソン（Olofsson）他，J．Biol．Chem．271:19310-19317(1996)]の最初の部分にあるということを示している。テストは明らかに、長い方のＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆アイソフォームがタンパク分解性プロセシングを受けた結果、ＶＥＧＦＲ−１に対する受容体結合エピトープを含むより短い形態が生じるということを示している。ＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆のこのタンパク分解性プロセシングの機能的側面は、完全には理解されていない。ＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆アイソフォームは、細胞からすぐに分泌されるので、タンパク分解性プロセシングはこのタンパク質の放出またはアベイラビリティ（有効性）を制御するようなものではないと考えられる。図７から理解されるように、免疫沈降された形態と受容体結合形態のＶＥＧＦ −Ｂシグナルを比較した相対強度は、シグナルの強度は、ダイマーにおけるプロセシングされたサブユニットのレベルと相関していると考えられるということを示している。したがって、それはプロセシングによって受容体へのアフィニティーが増加するということを示唆している。４８ｋＤａのバンドはプロセシングされたモノマー（１６ｋＤａ）および全長のモノマー（３２ｋＤａ）との間で形成されるダイマーからなると考えられる。３４ｋＤａのバンドはプロセシングされたそれぞれ１６ｋＤａのモノマーの間で形成されるダイマーからなる。ＶＥＧＦ −Ｂのプロセシングによって生じた１６ｋＤａアナログを含むこれらのダイマーはともに、２つの全長３２ｋＤａモノマーからなる〜６ＯｋＤａダイマーよりもＶＥＧＦＲ−１受容体に対して良好に結合するということは重要である。例８プラスミン切断：ＣＯＳ細胞で発現した全長形態のＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆が、プラスミンの添加によって切断されるのか、そしてこれがＶＥＧＦＲ−１結合に影響するのかを判断するために以下のテストを行った。これは血管新生プロセスにおいて基底膜分解の部位における生理的メカニズムである可能性がある。ＣＯＳ−７細胞をｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆でトランスフェクトし、７５分間代謝的に標識し、そして収集した培地からＶＥＧＦおよびヘテロダイマーを事前に除去 (preclear)した。次に培地を０．１Ｕ／ｍｌのプラスミン(Boehringer Mannheim )とともに３７℃で、０，５，１５，３０，および６０分間、インキュベートした。反応を１ｍＭＰＭＳＦと０．１カゼインユニットのアプロチニンとを添加することによって停止させた。培地をアフィニティー精製したＮ−ペプチドＶＥＧＦ−Ｂ抗体で免疫沈降するとともに、ＶＥＧＦＲ−１Ｉｇに結合させた。沈降したタンパク質を還元条件下でのＳＤＳ−ＰＡＧＥによって分析した。結果を図８に示す。全長形態のものの量が減少するに伴って、１５ｋＤａのフラグメントが現れ、続いて１２ｋＤａの第２のフラグメントが現れた。従って、プラスミン切断は実際に起こっているが、前述のＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆の内因性タンパク分解性プロセシングと同一のフラグメントは生じていないようである。にもかかわらず、このＮ−末端フラグメントはｓＶＥＧＦＲ−１と相互作用する能力を完全に有するものであり、これは、プラスミンのようなプロテアーゼに対して抵抗性のＮ−末端フラグメントに、受容体結合エピトープが含まれるという点において、ＶＥＧＦ−ＢはＶＥＧＦと類似しているということを示唆するものである。例９受容体エピトープの変異解析：結晶構造決定およびＶＥＧＦについてのＶＥＧＦＲ−２エピトープのマッピングにより、多数のホットスポットアミノ酸残基が指摘された。リガンド−受容体相互作用のために最も重要な残基は、Ｉｌｅ−４６，Ｉｌｅ−８３，Ｇｌｕ−６４，Ｐｈｅ−１７，Ｇｌｎ−７９，Ｐｒｏ−８５，Ｉｌｅ−４３およびＬｙｓ− ８４である[ミュラー（Muller）他，Proc．Natl．Acad．Sci．USA 94:7192-7(19 97)]。これらの残基がどの程度ＶＥＧＦＲ−１結合に関与しているかはあまり明らかにされていない。荷電アミノ酸からアラニンへのスキャン突然変異誘発(sca n mutagenesis)[カイト（Keyt）他，J．Biol．Chem.，271:5638-5646(1996)]により、ＶＥＧＦにおけるＶＥＧＦＲ−１結合エピトープには、酸性残基の広がり（Ａｓｐ−６３，Ｇｌｕ−６４およびＧｌｕ−６７）が含まれるということが提唱された。これらのアミノ酸残基はＶＥＧＦ−Ｂにおいて保存されており(Ａｓｐ−６３，Ａｓｐ−６４およびＧｌｕ−６７)、ＰＩＧＦではより低い程度で保存されている。ＶＥＧＦとＶＥＧＦ−Ｂとの間で保存されており、ＶＥＧＦ／ＶＥＧＦＲ−１結合に関係しているこれら酸性アミノ酸残基が、ＶＥＧＦ−Ｂ／ＶＥＧＦＲ−１結合についても主要な決定要因であるかを分析するために、Ａｓｐ６３，Ａｓｐ６４およびＧｌｕ６７をアラニンへと突然変異させた。突然変異の模式図を図９に図示する。これは、野生型ＶＥＧＦ−Ｂ形態と、種々の突然変異体を説明する概略図である。ＶＥＧＦ−Ｂ₁₆₇の推定受容体エピトープ突然変異体を、トランスフェクトした２９３−Ｔ細胞において発現させ、５０μｇ／ｍｌのヘパリンの存在下で代謝的に標識した。ＶＥＧＦ−Ｂホモダイマーについて研究するために、内在性のＶＥＧＦおよび、ＶＥＧＦと過剰発現したＶＥＧＦ−Ｂによって形成されたＶＥＧＦヘテロダイマーを、ＶＥＧＦ抗体（R&D Systemsから入手したＭＡＢ２９３）で免疫除去した。ＶＥＧＦ−Ｂ突然変異体をアフィニティー精製したＮ−末端ペプチド抗体で免疫沈降させるか、または可溶性ＶＥＧＦＲ−１Ｉｇに結合させた。沈殿物（沈降物）を還元条件下でのＳＤＳ−ＰＡＧＥによって分析した。結果によると、最初の２つの酸性残基の突然変異も、３つのすべての酸性アミノ酸残基の突然変異も、ＶＥＧＦＲ−１に対するＶＥＧＦ−Ｂの結合を阻止しなかったということが明らかとなった。したがって、３つのすべての荷電したアミノ酸のアラニンへの突然変異、または最初の２つだけの荷電したアミノ酸残基のアラニンへの突然変異のいずれかに基づくこのデータは、保存された酸性残基は、ＶＥＧＦＲ−１に対するＶＥＧＦ−Ｂの結合に主要な寄与を与えるものではないということを示すものである。例１０ＶＥＧＦ−Ｂ₁₆₇における保存されたシステインの変異解析：ＶＥＧＦ−Ｂのダイマー形成に対する保存されたシステインの寄与を調べるため、そして非−対応(anti-parallel)共有結合性ＶＥＧＦダイマーモデルに基づく構造予測をテストするために、システイン−５１（Ｃｙｓ２）およびシステイン−６０（Ｃｙｓ４）をセリン残基へと突然変異させた。ｍＶＥＧＦ−Ｂ₁₆₇ｐＳＧ５におけるシステインからセリンへの突然変異体は、Ｍ１３に基づく、ヘルパーファージＭ１３ＫＯ７[ヴィエラ（Viera）他，Methods Enzymol.，153:3-11 (1987)]およびｄｕｔ^- ｕｎｇ^- 大腸菌株ＲＺ１０３２[クンケル(Kunkel)他， Methods Enzymol.,154:367-382(1987)]を用いたインヴィトロ−本鎖突然変異誘発によって作成した。突然変異は、単一(single)突然変異体（Ｃ２ＳおよびＣ４Ｓ）および二重(double)突然変異体（Ｃ２Ｓ，Ｃ４Ｓ）の両方について行った。突然変異の模式図は、図９に示す。突然変異体および野生型ＶＥＧＦ−Ｂ₁₆₇を２９３−Ｔ細胞において、単独で、または、共−トランスフェクション(co-transfection)として異なる組合せにおいて発現させ、代謝的に標識し、そして培地からＶＥＧＦおよびヘテロダイマーを事前に除去(preclear)した。結果を図１０ａ−ｃに示す。培地をアフィニティー精製したＮ−末端ＶＥＧＦ−Ｂ抗体で免疫沈降させ、非還元条件下（図１０ａ）および還元条件下（図１０ｂ）の両方で分析したか、あるいは、可溶性ＶＥＧＦＲ −１Ｉｇに結合させた(図１０ｃ)。図１０ｂから理解されるように、すべての突然変異体はほぼ同じ量発現していた。ＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆は、おそらく２つのスプライスバリアントにおいて同一のＣ −末端領域において、切断されるということが判明し、それはエキソン１−５によってコードされ、受容体結合エピトープとともにシステインノットを含むものである。野生型ＶＥＧＦ−Ｂ₁₆₇は非還元条件下で４２ｋＤａと４６ｋＤａの２本のバンドとして移動するが、４６ｋＤａの形態のみがＶＥＧＦＲ−１に結合する能力があった(図２Ａおよび３Ｃを比較されたい)。４２ｋＤａのバンドは異常なジスルフィド架橋によって結合したダイマーに対応すると考えられる。というのはこれらの２重のバンドは、ＶＥＧＦ−Ｂ₁₆₇のＣ−末端部分においてみられるさらなる８つのシステインを欠いている、ＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆、またはＶＥＧＦ −Ｂ_kEX1-5においては見られないからである。単一突然変異体Ｃ４Ｓからは、モノマーが生じた。ＶＥＧＦＲ−１に結合することができない、４２ｋＤａのバンドとして移動するダイマーもいくらか観察された。驚くべきことに、Ｃ２Ｓ突然変異体は、部分的にモノマーを生じたが、受容体結合能力のあるダイマーを形成することができた。単一突然変異体の共トランスフェクション（Ｃ２Ｓ＋Ｃ４Ｓ）により、４６ｋＤａのバンドの量が増加して受容体結合を回復し、これは二量体化の欠損が、ＶＥＧＦの場合と同様に突然変異していないシステイン間のジスルフィド結合の確立によって補完されうるということを示している[ポトジェンス（Potgens）他， J．Biol．Chem.269:32879-85(1994)]。単一突然変異体と二重突然変異体との共トランスフェクションによっては補完は起こらなかった。ＶＥＧＦ−Ｂ₁₆₇突然変異体のうちいくつかを上述のようにして発現させ、細胞を１０μｇ／ｍｌのヘパリンの存在下で標識した。収集した培地をＶＥＧＦＲ −１Ｉｇとともにインキュベートし、結合したリガンドを非還元条件下でのＳＤＳ−ＰＡＧＥにかけた。結果を図１１に示す。Ｃ４Ｓ突然変異体と二重突然変異体Ｃ２ＳＣ４Ｓは、可溶性受容体とモノマーとの相互作用によって説明可能な、残された(residual)受容体結合を示したということが理解される。従って、ＶＥＧＦ−Ｂダイマーの形成に寄与する保存されたシステインの変異解析は、ＶＥＧＦとＰＤＧＦとの構造的保存を示すものである。例１１ＶＥＧＦ−Ｂに対する生物学的応答：ウシＶＥＧＦＲ−１配列に基づく特異的プライマーを用いたＲＴ−ＰＣＲ分析は、ＶＥＧＦＲ−１ｍＲＮＡはウシ副腎皮質由来微小血管内皮（ＢＭＥ）およびウシ大動脈内皮（ＢＡＥ）細胞によって発現しているということを示している。内皮細胞上でのＶＥＧＦ−Ｂに対する生物学的応答を調べるために、５０ｎｇ／ｍｌのｈＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆の存在下でインキュベートしたＢＭＥ細胞のコンフルエントな単層から調製したトータル細胞ＲＮＡを５μｇ／レーン含む、複製フィルターを、[³²Ｐ]−標識したｃＲＮＡプローブとハイブリダイズさせた。ＢＭＥ細胞[フリエ（Furie）他，J．Ce11Biol.，98:1033-41(1984)]を、１５％ドナー子ウシ血清を追加したＭＥＭアルファ修飾(Gibco AG，Basal，Switzer1and)中で、１．５％のゼラチンでコーティングした組織培養フラスコにて培養した。２４時間前に新鮮な完全培地を添加しておいたＢＭＥ細胞のコンフルエントな単層にサイトカインを添加した。トータル細胞ＲＮＡをＴｒｉｚｏｌ試薬(Life Tech nologies AG，Basal,Switzerland)を用いて０，１，３，９，２４および４８時間後に調製した。ノーザンブロット、ｕｖ−クロスリンクおよびフィルターのメチレンブルー染色、インヴィトロ転写、ハイブリダイゼーション、およびハイブリダイゼーション後の洗浄を[ペッパー（Pepper）他，J．Cell Biol.，111:743- 55(1990)]に記載されているようにして行った。³²Ｐ-標識したｃＲＮＡプローブは、ウシｕ−ＰＡ[クラッツシュマール（Kratzschmar）他，Gene，125:177-83(1 993)]、ヒトｔ−ｐＡ[フィッシャー（Fisher）他，J．Biol．Chem.，260:11223- 30(1985)]およびウシＰＡＩ−１[ペッパー（Pepper）他，J．Cell Biol.，111:7 43-55(1990)]のｃＤＮＡから[ポエパー（Pepper）他，J.CellBiol.，111:743-55 (1990);ペッパー（Pepper）他，J.Cell Biol.，122:673-84(1993)]に記載されているようにして調製した。結果を図１２に示す。ローディングしたＲＮＡの整合性(integrity)および均一性をトランスファーとクロスリンクの後、メチレンブルーでフィルターを染色することにより判定した（図の下方のパネル）；２８Ｓおよび１８ＳリボゾームＲＮＡが示されている。ノーザンブロット分析は、ＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆（５０ｎｇ／ｍｌ）が、ＢＭＥ細胞におけるウロキナーゼ型プラスミノーゲン活性化因子（ｕ−ＰＡ）およびプラスミノーゲン活性化因子阻害剤１（ＰＡＩ−１）のｍＲＮＡの定常状態レベルを増加させるということを示すものであった。すなわち、このテストは、内皮細胞がＰＡＩ−１ｍＲＮＡおよびｕ−ＰＡｍＲＮＡを誘導することによって、ＶＥＧＦ−Ｂに応答するということを示すものであった。したがって、ＶＥＧＦ− Ｂの内皮細胞上のその受容体への結合は、ｕ−ＰＡおよびPＡＩ−１の活性を刺激し、それは細胞外基質分解および細胞接着および遊走の重要なモジュレーターである。例１２酵素電気泳動法（ザイモグラフィzymography）および逆酵素電気泳動法：濃度０，１，３，１０，３０および１００ｎｇ／ｍｌのｈＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆、濃度３０ｎｇ／ｍｌのＶＥＧＦ、または濃度３０ｎｇ／ｍｌの組換えヒトｂＦＧＦ（ドクター・ピー・サルミエントス（Dr.P．Sarmientos）から入手した１５５アミノ酸形態）の存在下でインキュベートしたＢＭＥ細胞から調製した細胞抽出物を以下のように酵素電気泳動法（ザイモグラフィ）および逆酵素電気泳動法（リバースザイモグラフィ）にかけた。３５ｍｍのゼラチンコーティングした組織培養シャーレ中のＢＭE細胞のコンフルエントな単層を、無血清培地で２回洗浄し、そしてトラジロール（２００ＫＩＵ／ｍｌ）を含有する無血清培地にサイトカインを添加した。１５時間のインキュベート時間の後、細胞抽出物を調製し、ヴァッサーリ（Vassalli）他,J.Exp.Med.,159:1653-68(1984)およびペッパー（P epper）他，J.CellBiol.,111:743-55(1990)に記載されているように酵素電気泳動法（ザイモグラフィ）および逆酵素電気泳動法（リバースザイモグラフィ）によって分析した。結果は、図１３ａ−ｂに示され、これは、ＢＭＥ細胞において組換えｈＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆が、ｕ−ＰＡおよびＰＡＩ−１活性を増大させることを示す。図１３ａは酵素電気泳動（ザイモグラフzymographic）分析を示し、図１３ｂはＢＭＥ細胞からの細胞抽出液の逆酵素電気泳動(reversezy mography)分析を示す。ＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆がＢＭＥ細胞において、ｕ−ＰＡおよびＰＡＩ−１活性の用量依存的増大を誘導することが理解される。コントロールとして用いたＶＥＧＦによるＰＡＩ−１活性の誘導が明らかにみられないということは、ＶＥＧＦに誘導されたｔＰＡとの複合体へとＰＡＩ−１が迅速に捕捉されることを反映している。この複合体はＶＥＧＦ−処理された細胞の培養上清の酵素電気泳動法（ザイモグラフィ）によって観察される。ＶＥＧＦとは対照的に[ペッパー（Pepper）他，Biophys．Res．CoMun .，189:824-31(1992)]、ＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆は、ｔ−ＰA活性を増大させなかった。このテストにより、内皮細胞はｕ−ＰＡおよびＰＡＩ−１の合成の増加とその結果として起こるタンパク質活性の増加によってＶＥＧＦ−Ｂに対して応答していることが示された。しかし、ｕ−ＰＡの誘導のカイネティクス（９時間後に誘導され４８時間まで持続する）と比べて、ＰＡＩ−１の誘導のカイネティクスは、より迅速であり(１時間以内)、そしてより一過性であった(３時間で最大効果が観察される)。これはｂＦＧＦおよびＶＥＧＦについて観察されたこと[ペッパー（Pepper）他，J．CellBiol.,111:743-55(1990);ペッパー（Pepper）他,Biochem .Biophys.Res.Commun.,181，902-906(1991);マンドリオッタ（Mandriota）他，J ．Biol．Chem.，270:9709-16(1995)]と一致する。例１１および１２は、組換えｈＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆は、ＢＭＥ細胞においてｕ− ＰＡおよびＰＡＩ−１ｍＲＮＡの定常状態レベルを増加させることを示している。同様のテストにおいて、ＢＡＥ細胞においてもＶＥＧＦ−Ｂ₁₈₆はＰＡＩ− １ｍＲＮＡを誘導したが、ｕ−ＰＡｍＲＮＡは誘導しなかった。有用性Ｆｌｔ−１チロシンキナーゼ受容体と、ＶＥＧＦ−Ｂおよび／またはＶＥＧＦ −Ｂアナログとの間の複合体形成は、Ｆｌｔ−１受容体の過剰発現によって特徴づけられる疾病状態の治療として利用可能であり、その治療は、そのような疾病状態を患う患者に、Ｆｌｔ−１受容体に結合するのに、または受容体を拮抗するのに有効な量のＶＥＧＦ−ＢまたはＶＥＧＦ−Ｂアナログを投与することによって行われる。Ｆｌｔ−１受容体の過剰発現によって特徴づけられるそのような疾病状態の一例としては、血管内皮腫が挙げられる。Ｆｌｔ−１受容体は、種々の腫瘍によっても過剰発現される[ウォーレン（Warren）他，J.Clin．Invest.,95(4):1789-97(1 995);ハトヴァ（Hatva）他，Amer.J.Pathology,146(2):368-78(1995)]。ＶＥＧＦＲ−１と、ＶＥＧＦ−ＢまたはＶＥＧＦ−Ｂアナログとの間の複合体形成は、Ｆｌｔ−１受容体の過少発現(underexpression)によって特徴づけられる状態を治療するのにも利用可能である。そのような状態は、正常な成人の内皮または血管形成の増加を必要とする状態を含むものとすることができる。所与の場合において投与される量は、患者の特性および疾病状態の性質に依存するであろうが、ルーチン的な実験によって当業者によって判定できるものであろう。ＶＥＧＦ−ＢまたはＶＥＧＦ−Ｂアナログは、静脈内にまたは従来ＶＥＧＦまたはＦＧＦのターゲット送達について用いられてきたシステムと類似のターゲット送達システム手段によって投与することが適切であろう。そのようなシステムの例としては、プラスミドの形態でのＤＮＡの使用[アイスナー（Isner）他，La ncet,348:370(1996)]または組換えアデノウイルスの使用[ジョルダーノ(Giordan o)他,NatureMedicine，2:534-39(1996)]が含まれる。ＶＥＧＦ−ＢはＶＥＧＦについて記載されている方法[バウタース（Bauters）他，The American Physiolog ical Society,pp H1263-271(1994);アサハラ（Asahara）他，Circulation，91:2 793(1995)]に類似の技術によってタンパク質の形態において、または不完全へルペスウイルス(defectiveherpesvirus)の使用[メスリ（Mesri）他,Circulation R esearch,76:161(1995)]によっても提供することができる。小分子のＶＥＧＦ− Ｂアナログは、経口的に投与することができる。皮下の、または、腹腔内の注入等のその他の標準的な送達方法も、利用することができる。ＶＥＧＦ−Ｂタンパク質／Ｆｌｔ−１受容体複合体は、抗体の生成にも利用することができる。抗体は、ポリクローナル抗体であってもモノクローナル抗体であってもよい。一般的に、従来の抗体生成技術を用いてＶＥＧＦ−Ｂ／Ｆｌｔ− １複合体に対する抗体を生成することができる。例えば、組換えＤＮA発現によって得られた融合タンパク質の免疫化によって、特異的モノクローナル抗体を作成することができる。キメラおよびヒト化抗体、およびＶＥＧＦ−Ｂ／受容体複合体に対する抗体フラグメントはともに、明らかに本発明の枠内に含まれると考えられる。特に、標識されたモノクローナル抗体は、Ｆｌｔ−１受容体の過剰発現または過少発現によって特徴づけられる医学上の状態についてスクリ−ニングするのに有用であろう。そのような状態の例としては、例えば血管内皮腫等の、血管またはリンパ管の内皮細胞の腫瘍が挙げられる。本発明による診断／予知手段の１つの好適な実施態様において、抗体、増殖因子、または受容体のいずれかを標識し、そしてこれら３つの内１つを基質に結合させ、そうすることによって、抗体−複合体相互作用を、抗体と増殖因子／受容体複合体との間の結合後、基質に付着した標識の量を測定することによって明らかにすることができる。本発明の特に好適な実施態様において、診断／予知手段を通常のＥＬＩＳＡキットとして提供することができる。前述の記載および諸例は、単に本発明を例示するためのものであって、限定する意図はない。本発明の精神および本質を組み込んだ記載された実施態様の改変は、当業者にとってなし得るものであるから、本発明は、以下の請求の範囲およびその均等物の枠内に含まれるすべての変形を幅広く含有するように解釈されるべきである。以下の参考文献は、技術的背景情報を提供するものであり、参考文献として本出願にその内容を合体させる。

【手続補正書】特許法第１８４条の８第１項【提出日】平成１１年２月１日（１９９９．２．１）【補正内容】請求の範囲１．ＶＥＧＦ−Ｂ細胞表面受容体に対して結合アフィニティーを有するＶＥＧＦ−Ｂアナログを同定する方法であって、前記方法は以下の工程：（ａ）（ｉ）Ｆｌｔ−１の残基１−３４７によって規定されるアミノ酸配列、または、そのＶＥＧＦ−Ｂ−特異的受容体アナログからなるポリペプチド鎖；（ｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ −１の残基１−３４７と少なくとも３０％のアミノ酸アイデンティティを共有するポリペプチド鎖；および、（ｉｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ−１のヌクレオチド１−１２９３によって規定される配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によってコードされるポリペプチド鎖：からなるグループから選択される受容体タンパク質を含有するサンプルを提供する工程；（ｂ）工程（ａ）の前記サンプルを、ＶＥＧＦ−Ｂとは異なるが、ＶＥＧＦ− Ｂのアミノ酸１−１１５と少なくとも５０％同一の(identical)アミノ酸配列を有する候補VＥＧＦ−Ｂアナログと接触させる工程；および（ｃ）前記候補VＥＧＦ−Ｂアナログと、工程（ａ）の受容体タンパク質との間の特異的な結合を検出する工程：を有するＶＥＧＦ−Ｂアナログを同定する方法。２．ＶＥＧＦ−Ｂ細胞表面受容体に対して結合アフィニティーを有するＶＥＧＦ−Ｂアナログを同定する方法であって、前記方法は以下の工程：（ａ）（ｉ）Ｆ１ｔ−１の残基１−３４７によつて規定されるアミノ酸配列、または、そのＶＥＧＦ−Ｂ−特異的受容体アナログからなるポリペプチド鎖；（ｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ −１の残基１−３４７と少なくとも３０％のアミノ酸アイデンティティを共有するポリペプチド鎖：および、（ｉｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ−１のヌクレオチド１−１２９３によって規定される配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によってコードされるボリペプチド鎖：からなるグループから選択される、ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有する表面受容体タンパク質を発現する細胞を含有するサンプルを提供する工程；（ｂ）前記細胞を、ＶＥＧＦ−Ｂとは異なるが、ＶＥＧＦ−Ｂのアミノ酸１− １１５と少なくとも５０％同一の(identical)アミノ酸配列を有する候補ＶＥＧＦ−Ｂアナログと接触させる工程、および（ｃ）ＶＥＧＦ−Ｂ−媒介細胞応答の誘導を検出する工程：を有するＶＥＧＦ−Ｂアナログを同定する方法。３．前記工程（ｃ）において検出されるＶＥＧＦ−Ｂ−媒介細胞応答が、内皮細胞増殖である、請求項２の方法。４．前記VＥＧＦ−Ｂ−媒介細胞応答が、血管新生である、請求項２の方法。５．２つの分子からなる単離リガンド−受容体複合体であって、前記分子の１つは、前記リガンドを規定し、ＶＥＧＦ−Ｂの少なくともアミノ酸１−１１５、または、ＶＥＧＦ−Ｂのアミノ酸１−１１５と少なくとも５０％のアミノ酸配列アイデンティティを有するＶＥＧＦ−Ｂの受容体−結合アナログ、または、受容体−結合アミノ酸配列バリアント、または、その異種の（xenogeneic）ホモログ、を含むものであり、そして、前記分子の第２は、前記受容体を規定し、（ｉ）Ｆｌｔ−１の残基１−３４７によって規定されるアミノ酸配列、または、そのＶＥＧＦ−Ｂ−特異的受容体アナログからなるボリペプチド鎖；（ｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ− １の残基１−３４７と少なくとも３０％のアミノ酸アイデンティティを共有するポリペプチド鎖；（ｉｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ − １のヌクレオチド１−１２９３によって規定される配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によってコードされるポリペプチド鎖：からなるグループから選択されるものである、単離リガンド−受容体複合体。６．前記受容体が、ＶＥＧＦに対しても結合アフィニティーを有する、請求項５の複合体。７．（ｉ）細胞表面受容体へのＶＥＧＦ−Ｂの結合を拮抗すること、または（ｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂ−媒介細胞応答の誘導を拮抗すること、のための方法における、請求項１または２の方法によって得られた、ＶＥＧＦ− Ｂアナログの使用。８．前記ＶＥＧＦ−Ｂアナログが、Ｆｌｔ−１のアミノ酸１−３４７によって規定される細胞表面受容体、または、そのＶＥＧＦ−Ｂ−特異的受容体アナログの、リガンド結合ドメインに対して結合特異性を有する抗体からなる、請求項７の使用。９．（ｉ）Ｆｌｔ−１の残基１−３４７によって規定されるアミノ酸配列、または、そのＶＥＧＦ−Ｂ−特異的受容体アナログからなるポリペプチド鎖；（ｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ− １の残基１−３４７と少なくとも３０％のアミノ酸アイデンティティを共有するポリペプチド鎖；または、（ｉｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ −１のヌクレオチド１−１２９３によって規定される配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によってコードされるボリペプチド鎖：からなるグループから選択される受容体タンパク質の、（ａ）細胞表面受容体へのＶＥＧＦ−Ｂ結合、または、（ｂ）ＶＥＧＦ−Ｂ−媒介細胞応答の誘導、を拮抗するための方法における使用。１０．細胞表面受容体へのＶＥＧＦ−Ｂ結合を拮抗するための方法であって、前記方法は、Ｆｌｔ−１の残基１−３４７によって規定されるアミノ酸配列またはそのＶＥＧＦ−Ｂ受容体結合配列バリアントに対して結合特異性を有するタンパク質を提供する工程を有し、前記タンパク質はＶＥＧＦ−Ｂの残基１−１１５と少なくとも５０％のアミノ酸配列アイデンティティを有し、したがって前記タンパク質は、前記細胞表面受容体を発現する細胞を与えられた場合、前記受容体と特異的に相互作用する能力を有し、それによって前記受容体へのＶＥＧＦ−Ｂ結合を実質的に阻害するものである、細胞表面受容体へのＶＥＧＦ−Ｂ結合を拮抗するための方法。１１．前記タンパク質が、請求項１または２の方法によって得られたＶＥＧＦ− Ｂアナログである、請求項９の方法。１２．Ｆｌｔ−１細胞表面受容体の過剰発現によって特徴づけられる疾病状態を治療する方法であって、前記方法は、前記疾病状態を患う患者に、受容体−結合に有効な量のＶＥＧＦ−Ｂアンタゴニストを投与することからなり、ここで前記ＶＥＧＦ−Ｂアンタゴニストは、請求項１または２の方法によって得られたＶＥＧＦ−ＢアナログまたはＶＥＧＦ−Ｂに対する抗体を含むものである、Ｆｌｔ− １細胞表面受容体の過剰発現によって特徴づけられる疾病状態を治療する方法。１３．Ｆ１ｔ−１細胞表面受容体の過少発現(underexpression)によって特徴づけられる状態を治療する方法であって、前記方法は、前記状態にある患者に、受容体−結合に有効な量のＶＥＧＦ−ＢまたはＶＥＧＦ−Ｂアゴニストを投与することからなり、前記ＶＥＧＦ−Ｂアゴニストは、請求項１または２の方法によって得られたＶＥＧＦ−Ｂアナログを含むものである、Ｆｌｔ−１細胞表面受容体の過少発現によって特徴づけられる状態を治療する方法。１４．ＶＥＧＦ−Ｂのタンパク分解性プロセシングによって生じる受容体−結合１６ｋＤａフラグメント、ＶＥＧＦ−Ｂのプラスミン消化によって生じる受容体 − 結合フラグメント、Ｃ−末端Ｋｅｍｐｔｉｄｅモチーフを含有する受容体−結合エキソン１−５ミュータントフラグメント、および前記受容体−結合フラグメントの少なくとも１っを含むダイマーからなるグループから選択される、ＶＥＧＦ −Ｂアナログ。１５．２つのＶＥＧＦ−Ｂのタンパク分解性プロセシングによって得られる１６ｋＤａ受容体-結合フラグメントからなるダイマーからなる、請求項１４のＶＥＧＦ−Ｂアナログ。１６．全長ＶＥＧＦ−ＢモノマーとＶＥＧＦ−Ｂのタンパク分解性プロセシングによって得られる１６ｋＤａ受容体−結合フラグメントからなるダイマーである、請求項１４のＶＥＧＦ−Ｂアナログ。１７．請求項１４のＶＥＧＦ−Ｂアナログをコードするポリヌクレオチド。

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.⁷ 識別記号ＦＩテーマコート゛(参考）Ａ６１Ｐ 9/00 Ａ６１Ｐ 35/00 35/00 43/00 １１１ 43/00 １１１Ｃ０７Ｋ 14/485 Ｃ０７Ｋ 14/485 14/71 14/71 19/00 19/00 Ｇ０１Ｎ 33/53 ＳＧ０１Ｎ 33/53 33/566 33/566 Ｃ１２Ｐ 21/02 Ｃ // Ｃ１２Ｐ 21/02 Ａ６１Ｋ 37/02 (72)発明者グンジ，ユウジフィンランド国エフアイエヌ―00290 ヘルシンキトペリウクセンカトゥ 32 エイチ５ (72)発明者アリタロ，カリフィンランド国エフアイエヌ―02100 エスポーナイイリキンティエ４エイ (72)発明者オロフソン，ビルギッタスウェーデン国エス―117 ストックホルムホルンスガタン 106 ３ティアール (72)発明者エリクソン，ウルフスウェーデン国エス―746 34 バルスタヘーゲルヴェーゲン 27

Claims

【特許請求の範囲】１．ＶＥＧＦ−Ｂアナログを同定する方法であって、前記アナログは細胞表面受容体に対して、ＶＥＧＦ−Ｂと実質的に同じ結合アフィニティーを有するとして特徴づけられるものであり、前記方法は以下の工程：（ａ）（ｉ）Ｆｌｔ−１の残基１−３４７によって規定されるアミノ酸配列、または、そのＶＥＧＦ−Ｂ−特異的受容体アナログからなるポリペプチド鎖；（ｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ −１の残基１−３４７と少なくとも３０％のアミノ酸アイデンティティを共有するポリペプチド鎖；および、（ｉｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆ１ｔ−１のヌクレオチド１−１２９３によって規定される配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によってコードされるボリペプチド鎖：からなるグループから選択される受容体タンパク質を含有するサンプルを提供する工程；（ｂ）工程（ａ）の前記サンプルを、候補ＶＥＧＦ−Ｂアナログと接触させる工程;および（ｃ）前記候補ＶＥＧＦ−Ｂアナログと、工程（ａ）の受容体タンパク質との間の特異的な結合を検出する工程：を有するＶＥＧＦ−Ｂアナログを同定する方法。２．ＶＥＧＦ−Ｂアナログを同定する方法であって、前記アナログは細胞表面受容体に対して、ＶＥＧＦ−Ｂと実質的に同じ結合アフィニティーを有するとして特徴づけられるものであり、前記方法は以下の工程：（ａ）（ｉ）Ｆｌｔ−１の残基１−３４７によって規定されるアミノ酸配列、または、そのＶＥＧＦ−Ｂ−特異的受容体アナログからなるポリペプチド鎖；（ｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ −１の残基１−３４７と少なくとも３０％のアミノ酸アイデンティティを共有するポリペプチド鎖；および、（ｉｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ−１のヌクレオチド１−１２９３によって規定される配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によってコードされるポリペプチド鎖：からなるグループから選択される、ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有する表面受容体タンパク質を発現する細胞を含有するサンプルを提供する工程；（ｂ）前記細胞を、候補ＶＥＧＦ−Ｂアナログと接触させる工程、および（ｃ）ＶＥＧＦ−Ｂ−媒介細胞応答の誘導を検出する工程：を有するＶＥＧＦ−Ｂアナログを同定する方法。３．前記工程（ｃ）において検出されるＶＥＧＦ−Ｂ−媒介細胞応答が、内皮細胞増殖である、請求項２の方法。４．前記VＥＧＦ−Ｂ−媒介細胞応答が、血管新生である、請求項２の方法。５．サンプル中のＶＥＧＦ−Ｂまたは候補ＶＥＧＦ−Ｂアナログを同定するためのキットであって、前記キットが、（ａ）サンプルを受け入れるのに適しており、そして、以下の（ｉ）（ｉｉ）（ｉｉｉ）からなるグループから選択される受容体タンパク質を含有する、容器：（ｉ）Ｆｌｔ−１の残基１−３４７によって規定されるアミノ酸配列、または、そのＶＥＧＦ−Ｂ−特異的受容体アナログからなるポリペプチド鎖；（ｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ −１の残基１−３４７と少なくとも３０％のアミノ酸アイデンティティを共有するポリペプチド鎖；および、（ｉｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ−１のヌクレオチド１−１２９３によって規定される配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によってコードされるポリペプチド鎖；および、（ｂ）ＶＥＧＦ−Ｂまたは候補ＶＥＧＦ−Ｂアナログと、前記容器に含有される前記受容体タンパク質との相互作用を検出するための手段：を有し、前記ＶＥＧＦ−Ｂまたは候補ＶＥＧＦ−Ｂアナログは前記容器に受け入れられるサンプルの部分を構成するものである、サンプル中のＶＥＧＦ−Ｂまたは候補ＶＥＧＦ−Ｂアナログを同定するためのキット。６．前記検出手段が、ＶＥＧＦ−ＢまたはＶＥＧＦ−Ｂアナログと、前記受容体タンパク質との特異的結合相互作用を検出するための手段からなる、請求項５のキット。７．前記検出手段が、ＶＥＧＦ−Ｂ−媒介細胞応答の誘導を検出するための手段からなる、請求項５のキット。８．２つの分子からなる単離リガンド−受容体複合体であって、前記分子の１つは、前記リガンドを規定し、ＶＥＧＦ−Ｂの少なくともアミノ酸１−１１５またはその受容体−結合アナログを含むものであり、そして、前記分子の第２は、前記受容体を規定し、（ｉ）Ｆｌｔ−１の残基１−３４７によって規定されるアミノ酸配列、または、そのＶＥＧＦ−Ｂ−特異的受容体アナログからなるポリペプチド鎖；（ｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ− １の残基１−３４７と少なくとも３０％のアミノ酸アイデンティティを共有するポリペプチド鎖；（ｉｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ −１のヌクレオチド1−１２９３によって規定される配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によってコードされるポリペプチド鎖：からなるグループから選択されるものである、単離リガンドー受容体複合体。９．前記受容体が、ＶＥＧＦに対しても結合アフィニティーを有する、請求項８の複合体。１０．前記リガンドが、ＶＥＧＦ−Ｂ、または、ＶＥＧＦ−Ｂのアミノ酸１−１１５と少なくとも５０％のアミノ酸配列アイデンティティを有するＶＥＧＦ−Ｂアナログ、または、受容体−結合アミノ酸配列バリアント、または、その異種の（xenogeneic）ホモログ、である、請求項８の複合体。１１．リガンド−受容体複合体上のエピトープに対して特異的結合アフィニティーを有する単離結合パートナーであって、前記複合体は、（ｉ）Ｆｌｔ−１の残基１−３４７によつて規定されるアミノ酸配列、または、そのＶＥＧＦ−Ｂ−特異的受容体アナログからなるポリペプチド鎖；（ｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ− １の残基１−３４７と少なくとも３０％のアミノ酸アイデンティティを共有するポリペプチド鎖；または、（ｉｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ −１のヌクレオチド１−１２９３によって規定される配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によってコードされるボリペプチド鎖：によって規定される細胞表面受容体のリガンド結合ドメインと特異的結合相互作用にある、ＶＥＧＦ−Ｂタンパク質またはそのアナログを有するものであり、前記結合パートナーは、複合体を形成していないＶＥＧＦ−ＢまたはＶＥＧＦ −Ｂアナログに対しては実質的に結合アフィニティーを有さないものである、単離結合パートナー。１２．前記結合パートナーが、前記細胞表面受容体タンパク質またはその受容体アナログの複合体を形成していない形態に対しては実質的に結合アフィニティーを有さないものである、請求項１１の単離結合パートナー。１３．前記結合パートナーが、抗体である、請求項１１の結合パートナー。１４．前記結合パートナーが、モノクローナル抗体である、請求項１３の結合パートナー。１５．前記結合パートナーが、ポリクローナル抗体である、請求項１３の結合パートナー。１６．（ｉ）細胞表面受容体へのＶＥＧＦ−Ｂの結合を拮抗すること、または（ｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂ-媒介細胞応答の誘導を拮抗すること、のための方法における、請求項１または２の方法によって得られた、ＶＥＧＦ− Ｂアナログの使用。１７．前記ＶＥＧＦ−Ｂアナログが、（ｉ）Ｆｌｔ−１のアミノ酸１−３４７によって規定される細胞表面受容体、または、そのＶＥＧＦ−Ｂ−特異的受容体アナログの、リガンド結合ドメイン、または、（ｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂのアミノ酸１−１１５によって表されるＶＥＧＦ−Ｂの、または、その受容体−結合アナログの、受容体結合ドメイン、に対して結合特異性を有する抗体からなる、請求項１６の使用。１８．（ｉ）Ｆｌｔ−１の残基１−３４７によって規定されるアミノ酸配列、または、そのＶＥＧＦ−Ｂ−特異的受容体アナログからなるポリペプチド鎖；（ｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ− １の残基１−３４７と少なくとも３０％のアミノ酸アイデンティティを共有するポリペプチド鎖；または、（ｉｉｉ）ＶＥＧＦ−Ｂに対して結合アフィニティーを有し、そして、Ｆｌｔ −１のヌクレオチド１−１２９３によって規定される配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によってコードされるボリペプチド鎖：からなるグループから選択される受容体タンパク質の、（ａ）細胞表面受容体へのＶＥＧＦ−Ｂ結合、または、（ｂ）ＶＥＧＦ−Ｂ−媒介細胞応答の誘導、を拮抗するための方法における使用。１９．細胞表面受容体へのＶＥＧＦ−Ｂ結合を拮抗するための方法であって、前記方法は、Ｆｌｔ−１の残基１−３４７によって規定されるアミノ酸配列またはそのＶＥＧＦ−Ｂ受容体結合配列バリアントに対して結合特異性を有するタンパク質を提供する工程を有し、前記タンパク質はＶＥＧＦ−Ｂの残基１−１１５と少なくとも５０％のアミノ酸配列アイデンティティを有し、したがって前記タンパク質は、前記細胞表面受容体を発現する細胞を与えられた場合、前記受容体と特異的に相互作用する能力を有し、それによって前記受容体へのＶＥＧＦ−Ｂ結合を実質的に阻害するものである、細胞表面受容体へのＶＥＧＦ−Ｂ結合を拮抗するための方法。２０．前記タンパク質が、請求項１または２の方法によって得られたＶＥＧＦ− Ｂアナログである、請求項１８の方法。２１．Ｆｌｔ−１細胞表面受容体の過剰発現によって特徴づけられる疾病状態を治療する方法であって、前記方法は、前記疾病状態を患う患者に、受容体−結合に有効な量のＶＥＧＦ−Ｂアンタゴニストを投与することからなり、ここで前記ＶＥＧＦ−Ｂアンタゴニストは、請求項１または２の方法によって得られたＶＥＧＦ−ＢアナログまたはＶＥＧＦ−Ｂに対する抗体を含むものである、Ｆｌｔ− １細胞表面受容体の過剰発現によって特徴づけられる疾病状態を治療する方法。２２．Ｆｌｔ−１細胞表面受容体の過少発現(underexpression)によって特徴づけられる状態を治療する方法であって、前記方法は、前記状態にある患者に、受容体−結合に有効な量のＶＥＧＦ−ＢまたはＶＥＧＦ−Ｂアゴニストを投与することからなり、前記ＶＥＧＦ−Ｂアゴニストは、請求項１または２の方法によって得られたＶＥＧＦ−Ｂアナログを含むものである、Ｆｌｔ−１細胞表面受容体の過少発現によって特徴づけられる状態を治療する方法。２３．ＶＥＧＦ−ＢのＶＥＧＦＲ−１結合フラグメントを含む、ＶＥＧＦ−Ｂアナログ。２４．前記アナログが、ＶＥＧＦ−Ｂのタンパク分解性プロセシングによって生じる受容体−結合１６ｋＤａフラグメント、ＶＥＧＦ−Ｂのプラスミン消化によって生じる受容体−結合フラグメント、Ｃ−末端Ｋｅｍｐｔｉｄｅモチーフを含有する受容体−結合エキソン１−５ミュータントフラグメント、および前記受容体−結合フラグメントの少なくとも１つを含むダイマーからなるグループから選択される、請求項２３のＶＥＧＦ−Ｂアナログ。２５．２つのＶＥＧＦ−Ｂのタンパク分解性プロセシングによって得られる１６ｋＤａ受容体-結合フラグメントからなるダイマーからなる、請求項２３のＶＥＧＦ−Ｂアナログ。２６．全長ＶＥＧＦ−ＢモノマーとＶＥＧＦ−Ｂのタンパク分解性プロセシングによって得られる１６ｋＤａ受容体−結合フラグメントからなるダイマーである、請求項２３のＶＥＧＦ−Ｂアナログ。２７．請求項２４のＶＥＧＦ−Ｂアナログをコードするポリヌクレオチド。