HUT78069A - Keratinocita növekedési faktor analógok - Google Patents

Keratinocita növekedési faktor analógok Download PDF

Info

Publication number
HUT78069A
HUT78069A HU9901325A HU9901325A HUT78069A HU T78069 A HUT78069 A HU T78069A HU 9901325 A HU9901325 A HU 9901325A HU 9901325 A HU9901325 A HU 9901325A HU T78069 A HUT78069 A HU T78069A
Authority
HU
Hungary
Prior art keywords
lys
kgf
seq
asn
glu
Prior art date
Application number
HU9901325A
Other languages
English (en)
Inventor
Tsutomu Arakawa
Bao-Lu Chen
Original Assignee
Amgen Inc.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Amgen Inc. filed Critical Amgen Inc.
Publication of HUT78069A publication Critical patent/HUT78069A/hu

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/475Growth factors; Growth regulators
    • C07K14/50Fibroblast growth factor [FGF]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • A61P1/02Stomatological preparations, e.g. drugs for caries, aphtae, periodontitis
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • A61P1/04Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system for ulcers, gastritis or reflux esophagitis, e.g. antacids, inhibitors of acid secretion, mucosal protectants
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • A61P1/16Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system for liver or gallbladder disorders, e.g. hepatoprotective agents, cholagogues, litholytics
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P11/00Drugs for disorders of the respiratory system
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P17/00Drugs for dermatological disorders
    • A61P17/02Drugs for dermatological disorders for treating wounds, ulcers, burns, scars, keloids, or the like
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P17/00Drugs for dermatological disorders
    • A61P17/14Drugs for dermatological disorders for baldness or alopecia
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P27/00Drugs for disorders of the senses
    • A61P27/02Ophthalmic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P27/00Drugs for disorders of the senses
    • A61P27/16Otologicals
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P29/00Non-central analgesic, antipyretic or antiinflammatory agents, e.g. antirheumatic agents; Non-steroidal antiinflammatory drugs [NSAID]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P3/00Drugs for disorders of the metabolism
    • A61P3/08Drugs for disorders of the metabolism for glucose homeostasis
    • A61P3/10Drugs for disorders of the metabolism for glucose homeostasis for hyperglycaemia, e.g. antidiabetics
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Diabetes (AREA)
  • Dermatology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Ophthalmology & Optometry (AREA)
  • Pain & Pain Management (AREA)
  • Rheumatology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Endocrinology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Obesity (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Pulmonology (AREA)
  • Emergency Medicine (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Acyclic And Carbocyclic Compounds In Medicinal Compositions (AREA)

Description

A jelen találmány tárgyát rekombináns DNS technológia és protein engineering képezi. Pontosabban, rekombináns DNS technológiát alkalmazunk a keratinocita növekedési faktor (KGF), amely egy a nem-fibroblaszt epiteliális sejtnövekedésnek egy potens mitogénje, polipeptid analógjainak előállítására, amely analógok a kiindulási KGF-hez viszonyítva fokozott stabilitással rendelkeznek.
A szövetgenerálás és regenerálás komplex folyamatát számos fehérjefaktor befolyásolja, amelyeket lágyszövet növekedési faktoroknak neveznek. Ezeket a molekulákat általában egy sejttípus bocsátja ki, és úgy működnek, hogy befolyásolják más sejttípusok szaporodását [Rubin és mtsai: Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 86, 802-806 (1989)] . Néhány lágyszövet növekedési faktort bizonyos sejttípusok bocsátanak ki, és befolyásolják a többsejtes szervezetek érésében szerepet játszó reagáló sejtek szaporodását, differenciálódását és/vagy érését [ Finch és mtsai: Science 245, 752-755 (1989)] . A fejlődő szervezetekben játszott szerepük mellett néhányan fontosak az érettebb rendszerek folyamatos egészségében és fenntartásában. Például az emlősökben számos olyan rendszer van, ahol a sejtekben gyors anyagcsere játszódik le. Ilyen rendszer például a bőr és az emésztőrendszer, amelyek mind epiteliális sejteket tartalmaznak. A lágyszövet növekedési faktoroknak ebbe a csoportjába tartozik a fibroblaszt növekedési faktorok (FGF-ek) egy fehérjecsaládja.
Jelenleg nyolc ismert tagja van az FGF családnak, amelyeknek a primer szerkezete rokonságot mutat: bázikus fíbroblaszt növekedési faktor, bFGF [Abraham és mtsai: EMBO J. 5_, 2523-2528 (1986)]; savas fibroblaszt növekedési faktor, aFGF [ Jaye és mtsai: Science 233, 541-545 (1986)] ; int-2 géntermék, ínt-2 [ Dickson és Peters: Natúré 326, 833 (1987)] ; hst/KGF [Delli-Bovi és mtsai: Cell 50, 729-737 (1987); Yoshida és mtsai: Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 84, 7305-7309 (1987)]; FGF-5 [Zhan és mtsai: Mól. Cell. Biology 8,
3487-3495 (1988)] ; FGF-β [ Marics és mtsai: Oncogene 4_, 335-340 (1989)]; keratinocita növekedési faktor [Finch és mtsai:
Science 24, 752-755 (1989)] ; és a hisactophilin [ Habazzettl és mtsai: Natúré 359, 855-858 (1992)] .
A fehérjék FGF családjában a keratinocita növekedési faktor (KGF) egy különleges effektora a mesenchyma szövetekből származó, nem-fibroblaszt epiteliális (különösen keratinocita) sejtszaporodásnak. A természetes KGF szakkifejezés jelentése egy természetes humán (hKGF) vagy rekombináns (rKGF) polipeptid (szignálszekvenciával vagy anélkül·), amit a 2. számú szekvencián bemutatott aminosav szekvencia jellemez, vagy annak egy alléi variánsa. (Hacsak külön nem jelezzük, akkor a leírásban ismertetett molekuláknál az aminosavak számozása megfelel a természetes molekula érett formájának (azaz mínusz a szignálszekvencia), amit a 2. számú szekvencián a 32-194-es aminosavakkal lehet leírni.
A természetes KGF-et természetes humán forrásokból lehet izolálni (hKGF), vagy rekombináns DNS technikákkal lehet előállítani (rKGF) [ Finch és mtsai: Science 245, 752-755 (1989);
Rubin és mtsai: Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 8 6, 802-806 (1989); Ron és mtsai: Journal of
Biological Chemistry 268 (4), 2984-2988 (1993); Yan és mtsai: In vitro Cell. Dev. Bioi. 27A, 437-438 (1991)] .
Az közismert, hogy a természetes KGF viszonylag instabil vizes közegben, és kémiai valamint fizikai lebomláson megy át, ami a biológiai aktivitás elvesztését eredményezi a processzálás és tárolás során [Chen és mtsai: Pharmaceutical
Research 11, 1582-1589 (1994) ] . A természetes KGF hajlamos az aggregációra magasabb hőmérsékleten, és inaktiválódik savas körülmények között [Rubin és mtsai: Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 86, 802-806 (1989)] . A természetes KGF vizes oldatban való aggregálódása szintén inaktivált fehérjét eredményez. Ez azért előnytelen, mivel az aktivitás elvesztése gyakorlatilag értelmetlenné teszi a természetes KGF fehérjék vizes készítményeinek hosszú ideig való tárolását, vagy a fehérje hosszabb ideig tartó beadását. Emellett az különösen problematikus, ha gyógyászati készítményeket készítünk, mivel az aggregálódott fehérjékről ismertté vált, hogy immunogének [ Cleland és mtsai: Crit. Rév. Therapeutic Drug Carrier Systems 10, 307-377 (1993); Robbins és mtsai: Diabetes 36, 838-845 (1987); Pínckard és mtsai: Clin. Exp. Immunoi. 2, 331-340 (1967)] .
Rekombináns DNS technológiát alkalmaznak az FGF család különböző tagjai szekvenciájának módosítására. Az aFGF-et és a bFGF-et például úgy módosították, hogy helyettesítették vagy kivágták a pozitívan töltött csoportokat, amelyek lényegesek a heparinkötéshez, a heparínon levő semleges vagy negatívan töltött aminosavakhoz való kapcsolódás révén. Leírták, hogy a módosított molekulák csökkent heparinkötő aktivitást eredményeztek. Ezért azt a következtetést vonták le, hogy a heparin vagy heparin-szerű molekulák által a beteg szervezetéből kivont módosított molekulák mennyisége csökkenni fog, ezzel megnő a hatékonyságuk, mivel több FGF éri el a megcélzott receptorát (EP 0 298 723) .
»·· ···♦
Ahhoz, hogy megpróbáljuk a természetes KGF egy vagy több jellemzőjének a megjavítását vagy másképpen való megváltoztatását, protein engineeringet alkalmazunk. A rekombináns DNS technológiát alkalmaztuk a természetes KGF szekvenciáinak módosítására. Ron és munkatársai leírtak módosított KGF polipeptideket, amelyeknek az N-terminálisáról 3, 8, 27 vagy 49 aminosavat kivágtak [Ron és mtsai: Journal of Biological Chemistry 268 (4) , 2984-2988 (1993.)] . Azok a fehérjék, amelyekről 3, 8 vagy 27 aminosav hiányzott, megtartották a heparinkötő képességüket, a többiek nem. Emellett azokról a peptidekről, amelyekről 3 és 8 aminosav hiányzott, leírták, hogy teljesen aktívak maradtak, míg az a forma, amelyikről 27 csoport hiányzott, 10-20-szor volt kevésbé mitogén, és az a forma, amelyről 38 vagy 49 aminosav hiányzott, egyáltalán nem rendelkezett mitogén aktivitással. A módosított KGF polipeptid stabilitását nem tárgyalták, illetve más módon sem közölték.
A publikált 90/08771 számú PCT bejelentésben is leírták, hogy kiméra fehérje keletkezik, amikor a természetes KGF érett formája első 40 N-terminális aminosavát kombinálták az aFGF Cterminális részével (körülbelül 140 aminosav). A kiméráról leírták, hogy a KGF-hez hasonlóan a keratinocitákat célozza meg, de nincs meg a heparin-érzékenysége, ami jellemző az aFGFre, de nem jellemző a KGF-re. A kiméra stabilitását nem tárgyalták, illetve más módon sem közölték.
Tehát a szakirodalomban nem írtak le olyan módosított KGF molekulát, amelynek jelentősen fokozott stabilitása van a természetes KGF-hez viszonyítva. Emellett a szakirodalomban nem ,> * közöltek elegendő információt vagy bizonyítékot arra, hogy ésszerűen várható legyen olyan KGF molekulák generálása, amelyek ezekkel a kívánatos jellemzőkkel rendelkeznek.
Jelenleg nem lehetséges egy fehérje tulajdonságainak megjósolása, ha csak a primer szerkezetét ismerjük. Például az aFGF mitogén aktivitása jelentősen megnő heparin jelenlétében, de a bFGF mitogén aktivitása heparin jelenlétében csak minimális mennyiségben nő meg, annak ellenére, hogy a heparin erősen kötődik a bFGF-hez [ Burgess és Maciag: Annu. Rév. Biochem. 58, 575-606 (1989); Schreiber és mtsai: Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 82, 6138-6142 (1985); Gospodarowicz és Cheng: J. Cell Physiol. 128, 475-485 (1986); PCT 90/00418] . Ezzel szemben a BALB/MK sejtek timidin beépítése gátlódik, ha a KGF mellett heparint is teszünk a tenyésztő közegbe.
Általában bármilyen aminosav-cserének a fehérje biológiai aktivitására gyakorolt hatása számos faktortól függ, beleértve a fehérje háromdimenziós szerkezetét, valamint attól, hogy a módosítások a fehérje elsődleges szerkezetében a receptorkötésért felelős régióban játszódnak le. Mivel a természetes KGF-nek sem a háromdimenziós szerkezetét, sem a primer szerkezet receptorkötésért felelős régióját nem közölték, ezért a szakirodalomban található ismeret nem teszi lehetővé az aminosav-cseréknek a természetes KGF-re gyakorolt hatásának általánosítását, az aminosav-módosításoknak az általánosan jellemzett fehérjékre gyakorolt hatása alapján.
A jelen találmány tárgyát polipeptid molekuláknak olyan analógjai képezik, amelyek fokozott stabilitással rendelkeznek (azaz ha tipikus pH-η, hőmérsékleti és/vagy tárolási körülmények között tartják) a természetes KGF-hez viszonyítva.
A jelen találmány tárgyát a KGF új, biológiailag aktív analógjai képezik. A jelen találmány szempontjából a KGF szakkifejezés jelentése lehet a természetes KGF, valamint egy olyan peptid-szekvenciával rendelkező fehérje, amely lényegében megegyezik a természetes KGF peptid-szekvenciájával, amely megtartja a természetes KGF biológiai aktivitását, vagy annak egy részét, különösen a fibroblaszt epiteliális sejtszaporodást. Az egy olyan peptid-szekvenciával rendelkező fehérje, amely lényegében megegyezik a természetes KGF peptidszekvenciájával szakkifejezés alatt egy olyan peptid-szekvenciát értünk, amely megtartja a 2. számú szekvencia Arg41, Gin43,
T 55 T 95 T 128 - 137 „, 138 T „139 - „144 T ,„147 „.152
Lys , Lys , Lys , Asn , Gin , Lys , Arg , Lys , Gin ,
Lys153 és Thr154 csoportjainak megfelelő csoportokat, és amit egy olyan DNS szekvencia kódol, amely képes az 1. számú szekvencia 201-684-es nukleotidjai között levő szekvenciával hibridizálódni, előnyösen szigorú hibridizálási körülmények között.
Két aminosav szekvencia között a megfelelő aminosav pozíciót úgy határozhatjuk meg, hogy a két szekvenciát úgy illesztjük egymáshoz, hogy maximalizáljuk az illeszkedéseket, beleértve az N-terminális és/vagy a C-terminális eltolását, ha szükséges, akkor lukak bevitelét és/vagy a jelölt molekulában inszertként jelenlevő csoportok kivágását. Adatbázis kutatások, szekvencia-elemzések és manipulációk végezhetők az egyik jól • · .; · • ·· ····· • ···· · · ···· ···
.........
► ismert szekvencia-homológia/azonosság pásztázó algoritmus programmal [ Pearson és Lipman: Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 85, 2444-2448 (1988) ; Altschul és mtsai: J.Mol.Bíol. 215, 403-410 (1990); Lipman és Pearson:
Science 222, 1435 (1985); Devereux és mtsai: Nucleic Acids
Research 12, 387-395 (1984)] .
A hibridizáció összefüggésében a szigorú körülmények a sókoncentráció, a szerves oldószerek és egyéb paraméterek szigorú, kombinált körülményei, amiket általában a hibridizációs reakciókban szabályoznak. A szigorú hibridizációs körülményekre egy példa lehet a következő: hibridizáció 4 x SSC-ben 62-67 °C-on, ezt követi a mosás 0,1 x SSC-ben 62-67 °C-on, körülbelül egy óra hosszat. Egy másik változat a szigorú hibridizációs körülményekre a hibridizáció 45-55 % formamid, 4 x
SSC-ben 40-45 °C-on [Sambrook és mtsai: Molecular Cloning: A
Laboratory Manual, 387-389. old.; Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, N.Y. (1989)] .
Tehát a fehérjék közé tartoznak az allél-variációk vagy aminosav deléció(k), helyettesítés(ek), vagy inszerciók, beleértve a természetes KGF fragmenseit, kiméra vagy hibrid molekulákat. A KGF-re példák lehetnek azok a fehérjék, amelyekben a 2. számú szekvencia Cys1 és Cys15 csoportjait helyettesítettük vagy kivágtuk, és a kapott molekulának megnőtt a kiindulási molekulához viszonyított stabilitása (lásd az 1995. július 7-én benyújtott 08/487,825 számú Amerikai Egyesült Államok-beli szabadalmi bejelentést). A leírt molekulák a következők:
C (1,15)S, azaz egy olyan KGF, amelyben az 1-es és 15-ös pozí• · · • · · · · « cióban levő ciszteincsoportot szerinnel helyettesítjük; ΔΝ15ΔΝ24, azaz az olyan KGF-ek, amelyekből a természetes KGF Nterminálisának első 15-24 aminosavából valamelyik aminosavat kivágtuk; AN3/C(15)S, azaz egy olyan KGF, amelyből a természetes KGF N-terminálisának első 3 aminosavát kivágtuk, majd a 15ös pozícióban levő ciszteint szerinre cseréltük; ΔΝ3/Ο(15)-, azaz egy olyan KGF, amelyből a természetes KGF N-terminálisának első 3 aminosavát kivágtuk, és a 15-ös pozícióban levő ciszteint is kivágtuk; AN8/C(15)S, azaz egy olyan KGF, amelyből a természetes KGF N-terminálisának első 8 aminosavát kivágtuk, majd a 15-ös pozícióban levő ciszteint szerinre cseréltük; ΔΝ8/Ο(15)-, azaz egy olyan KGF, amelyből a természetes KGF Nterminálisának első 8 aminosavát kivágtuk, és a 15-ös pozícióban levő ciszteint is kivágtuk; C (1,15,40)S, azaz egy olyan KGF, amelyből a természetes KGF-nek az 1-es, 15-ös és 40-es pozícióban levő ciszteint szerinre cseréltük; C(1,15,102)S, azaz egy olyan KGF, amelyből a természetes KGF-nek az 1-es, 15ös és 102-es pozícióban levő ciszteint szerinre cseréltük;
C(1, 15,106)S, azaz egy olyan KGF, amelyből a természetes KGFnek az 1-es, 15-ös és 106-os pozícióban levő ciszteint szerinre cseréltük.
Egyéb KGF analógok lehetnek például azok a fehérjék, amelyeket úgy állítunk elő, hogy legalább egy, magasabb hurokképző képességgel rendelkező aminosavval helyettesítünk egy aminosavat a természetes KGF Asn115-His116-Tyr117-Asn118-Thr119 hurokképző régiójában (lásd az 1994. október 13-án benyújtott, • · ► ’ 10
08/323,473 számú Amerikai Egyesült Államok-beli szabadalmi bejelentést), és feltétlenül ide tartozik a H(116)G, azaz egy olyan KGF analóg, amelyben a természetes KGF 116-os pozíciójában levő hisztidint glicinre cseréltük.
A találmány tárgyát képezik továbbá azok a fehérjék, amelyekben a természetes KGF 123-133-as régiójában (azaz a 2. számú szekvencia 154-164-es aminosavai) egy vagy több aminosavat helyettesítettünk, kivágtunk vagy beszúrtunk; ezeknek a fehérjéknek agonista vagy antagonista aktivitásuk lehet.
Meglepő felfedezésünk volt, hogy ha egy KGF molekulában (azaz a kiindulási molekulában) a semleges vagy negatív töltésű aminosavakat pozitívabban töltött csoportokra cseréljük (azaz a negatív töltésű csoportokat semleges vagy pozitív töltésű csoportra cseréljük, vagy a semleges csoportokat pozitív töltésű csoportokra cseréljük), akkor a kapott KGF analógnak megnő a kiindulási molekulához viszonyított stabilitása. Előnyösen, amellett, hogy megnőtt a stabilitásuk, a találmány tárgyát képezik azok az analógok, amelyek szintén teljes biológiai aktivitással rendelkeznek (azaz legalább lényegében hasonló receptorkötéssel vagy affinitással), a természetes KGF-fel összehasonlítva .
A találmány tárgyát képezik továbbá a KGF különböző biológiailag aktív polipeptid analógjait kódoló tisztított és izolált nukleinsav molekulák. Az egyik megvalósítási mód szerint ezek a nukleinsav molekulák biológiailag működőképes plazmid vagy virális vektorokba klónozott DNS molekulákat tartalmaznak. Egy másik megvalósítási mód szerint a nukleinsav • · · · · · ·· • ···» · · ·♦·· *·· ··»· · ·· ♦ · konstrukciókat arra használhatjuk, hogy stabilan transzformáljunk velük egy prokarióta vagy eukarióta gazdasejtet. Egy másik megvalósítási mód szerint a találmány tárgya eljárás, amelyben egy nukleinsav molekulával stabilan transzformált prokarióta (előnyösen Escheríchia coli) vagy egy eukarióta gazdasejtet növesztünk megfelelő tápláló körülmények között, olyan módon, hogy az lehetővé tegye a KGF analóg expresszióját.
Az expresszió után a kapott rekombináns polipeptidet izolálhatjuk és tisztíthatjuk.
A találmány tárgyát képezik továbbá azok a gyógyászati készítmények, amelyek egy KGF analógból terápiásán hatékony mennyiséget valamint egy elfogadható gyógyászati hordozót tartalmaznak. Ezek a készítmények jól használhatók epiteliális betegségekben és sérülésekben szenvedő betegek kezelésére.
A találmány tárgyát képezik továbbá az epiteliális sejtnövekedést serkentő módszerek, amelyek során egy betegnek egy KGF analógból terápiásán hatékony mennyiséget adunk be. Az egyik megvalósítási mód szerint a nem-fibroblaszt epiteliális sejtek azok a sejtek, amelyeknek a szaporodását serkentjük. Ilyen epiteliális sejtek lehetnek a különböző adnexálís sejtek, hasnyálmirigy sejtek, májsejtek és a nyálkahártya epitélium a légző- és gasztrointesztinális rendszerben.
Az alábbiakban röviden ismertetjük a mellékelt ábrákat.
Az 1. ábrán a természetes KGF nukleotid (1. számú szekvencia) és aminosav (2. számú szekvencia) szekvenciája látható (a természetes KGF érett formáját kódoló nukleotidokat az 1. számú ·
·« · · ··*· b * · « · · β » ·»« » • · * szekvencia 201-684-es bázisai mutatják, és a KGF érett formáját a 2. számú szekvencia 32-192-es aminosav csoportjai mutatják).
A 2A., 2B. és 2C. ábrákon a pCFM1156, pCFMl656 és pCFM3102 plazmidok térképei láthatók.
A 3. ábrán az RSH-KGF konstrukció nukleotid (3. számú szekvencia) és aminosav (4. számú szekvencia) szekvenciáját láthatjuk.
A 4. ábrán a KGF plazmádban levő konstrukció nukleotid (5. számú szekvencia) és aminosav (6. számú szekvencia) szekvenciáját mutatja.
Az 5. ábrán a kémiai úton szintetizált oligonukleotidok láthatók (6. számú oligonukleotidtól a 11. számú oligonukleotidig, azaz a 12-17. számú szekvenciák), amiket arra lehet használni, hogy a KGF plazmidban levő konstrukció Kpnl és EcoRI hasítási helye között levő DNS szekvenciát (a 6. számú szekvencia 46-85-ös aminosav pozíciói között) helyettesítsük, ezzel előállítva a KGF (dsd) plazmidban levő konstrukciót.
A 6. ábrán a kémiai úton szintetizált oligonukleotidok láthatók (a 12. számú oligonukleotidtól a 24. számú oligonukleotidig; azaz 18-30. számú szekvenciák), amiket a KGF készítéséhez használunk (kodonokra optimalizálva).
A 7. ábrán az R(144)Q, egy olyan KGF analóg, amelyben a természetes KGF 144-es aminosav pozíciójában levő arginínt glutaminnal helyettesítjük, nukleotid (31. számú szekvencia) és aminosav (32. számú szekvencia) szekvenciája látható.
A 8. ábrán a C(1,15)S/R(144)E, azaz egy olyan KGF analóg, amelyben a természetes KGF 15-ös aminosav pozíciójában levő <* * «·· ciszteint szerinre cseréltük, a 144-es aminosav pozíciójában levő arginint glutaminsavval helyettesítettük nukleotid (33.
számú szekvencia) és aminosav (34. számú szekvencia) szekvenciáját mutatjuk be.
A 9. ábrán a C(1,15)S/R(144)Q, azaz egy olyan KGF analóg, amelyben a természetes KGF 15-ös aminosav pozíciójában levő ciszteint szerinre cseréltük, a 144-es aminosav pozíciójában levő arginint glutaminnal helyettesítettük nukleotid (35. számú szekvencia) és aminosav (36. számú szekvencia) szekvenciáját mutatjuk be.
A 10. ábrán a ÁN23/R(144)Q, azaz egy olyan KGF analóg, amelyből a természetes KGF N-terminálisa első 23 aminosavát kivágtuk, és a 144-es aminosav pozíciójában levő arginint glutamin cseréltük, nukleotid (37. számú szekvencia) és aminosav (38. számú szekvencia) szekvenciáját mutatjuk be.
A 11. ábrán a megmaradó oldódó fehérje mennyisége látható, méretkizárásos HPLC-vel meghatározva, a 37 °C-on végzett inkubálás idejének függvényében ábrázolva.
A 12. ábrán a becsült olvadáspont hőmérséklet (Tm) látható, a pH függvényében, a természetes KGF, a C(1,15)S/R(144)Q és a C(1,15)S/R(144)E esetében.
A 13. ábrán a R(144)Q mitogén aktivitásának tipikus profilját láthatjuk, amit úgy mérhetünk meg, hogy mérjük a [3H] -timidin beépülését a DNS szintézis során, a természetes KGF-fel kapott standard görbével összehasonlítva.
A 14. ábrán a AN23/R(144)Q mitogén aktivitásának tipikus profilját láthatjuk, amit úgy mérhetünk meg, hogy mérjük a ··«« 9
9999 9999 [3H]-timidin beépülését a DNS szintézis során, a természetes KGF-fel kapott standard görbével összehasonlítva.
A 15. ábrán a C(1,15)S/R(144)Q mitogén aktivitásának tipikus profilját láthatjuk, amit úgy mérhetünk meg, hogy mérjük a [ 3HJ -timidin beépülését a DNS szintézis során, a természetes KGF-fel kapott standard görbével összehasonlítva.
A 16. ábrán a C(1,15)S/R(144)E mitogén aktivitásának tipikus profilját láthatjuk, amit úgy mérhetünk meg, hogy mérjük a [3H] -timidin beépülését a DNS szintézis során, a természetes KGF-fel kapott standard görbével összehasonlítva.
A 17. ábrán a ΔΝ23/Ν(137)E, azaz egy olyan KGF analóg, amelyből az N-terminális első 23 aminosavát kivágtuk, és amelyben a természetes KGF 137-es pozíciójában levő aszparagint glutaminra cseréltük, nukleotid (41. számú szekvencia) és aminosav (42. számú szekvencia) szekvenciáit látjuk.
A 18. ábrán a ΔΝ23/Κ(139)E, azaz egy olyan KGF analóg, amelyből az N-terminális első 23 aminosavát kivágtuk, és amelyben a természetes KGF 139-es pozíciójában levő lizint glutaminsavra cseréljük, nukleotid (43. számú szekvencia) és aminosav (44. számú szekvencia) szekvenciáit látjuk.
A 19. ábrán a ΔΝ23/Κ(139)Q, azaz egy olyan KGF analóg, amelyből az N-terminális első 23 aminosavát kivágtuk, és amelyben a természetes KGF 139-es pozíciójában levő lizint glutaminra cseréljük, nukleotid (45. számú szekvencia) és aminosav (46. számú szekvencia) szekvenciáit látjuk.
A 20. ábrán a ΔΝ23/Ε(144)A, azaz egy olyan KGF analóg, amelyből az N-terminális első 23 aminosavát kivágjuk, és • · • · · · , 15 fe* amelyben a természetes KGF 144-es pozíciójában levő arginint alaninra cseréljük, nukleotid (47. számú szekvencia) és aminosav (48. számú szekvencia) szekvenciáit látjuk.
A 21. ábrán a AN23/R(144)L, azaz egy olyan KGF analóg, amelyből az N-terminális első 23 aminosavát kivágtuk, és amelyben a természetes KGF 144-es pozíciójában levő arginint leucinra cseréljük, nukleotid (49. számú szekvencia) és aminosav (50. számú szekvencia) szekvenciáit látjuk.
A 22. ábrán a ΔΝ23/Κ (147)E, azaz egy olyan KGF analóg, amelyből az N-terminális első 23 aminosavát kivágtuk, és amelyben a természetes KGF 147-es pozíciójában levő lizint glutaminsavra cseréljük, nukleotid (51. számú szekvencia) és aminosav (52. számú szekvencia) szekvenciáit látjuk.
A 23. ábrán a ΔΝ23/Κ(147)Q, azaz egy olyan KGF analóg, amelyből az N-terminális első 23 aminosavát kivágtuk, és amelyben a természetes KGF 147-es pozíciójában levő lizint glutaminra cseréljük, nukleotid (53. számú szekvencia) és aminosav (54. számú szekvencia) szekvenciáit látjuk.
A 24. ábrán a ΔΝ23/Κ(147)E, azaz egy olyan KGF analóg, amelyből az N-terminális első 23 aminosavát kivágtuk, és amelyben a természetes KGF 147-es pozíciójában levő lizint glutaminsavra cseréljük, nukleotid (55. számú szekvencia) és aminosav (56. számú szekvencia) szekvenciáit látjuk.
A 25. ábrán a ΔΝ23/Κ(153)Q, azaz egy olyan KGF analóg, amelyből az N-terminális első 23 aminosavát kivágtuk, és amelyben a természetes KGF 153-as pozíciójában levő lizint glu16
.... · · ··;· ··;·
......
taminra cseréljük, nukleotid (57. számú szekvencia) és aminosav (58. számú szekvencia) szekvenciáit látjuk.
A 26. ábrán a ΔΝ23/Κ(153)E, azaz egy olyan KGF analóg, amelyből az N-terminális első 23 aminosavát kivágtuk, és amelyben a természetes KGF 153-as pozíciójában levő lizint glutaminsavra cseréljük, nukleotid (59. számú szekvencia) és aminosav (60. számú szekvencia) szekvenciáit látjuk.
A jelen találmány tárgyát új KGF analógok képezik. A KGF analógokat úgy állítjuk elő, hogy egy vagy több specifikus, pozitívan töltött csoportot eltávolítunk a KGF-ből, vagy mással helyettesítünk.
A KGF analógok, egyéb tulajdonságaik mellett fokozott stabilitással rendelkeznek a számos különböző tisztítási és/vagy tárolási körülmény között legalább egynél. Például a KGF analógokat általában nagyobb kitermeléssel lehet tisztítani oldható, megfelelő térszerkezetű fehérje formájában. Emellett, ha az anyagot egyszer már tisztítottuk, akkor stabilabb lesz a pH, a hőmérséklet, stb. változásokra, a kiindulási molekulával összehasonlítva. Amint az alább következő Példák részben ismertetjük (a 144-es pozícióban levő arginint glutamínnal vagy glutaminsavval helyettesítve [R(144)Q és R(144)E] , néhány esetben az N-terminálison is módosítva), a természetes KGF-fel összehasonlítva (1) 35-37,2 nappal megnő a tárolási felezési idő 37 °C-on, (2) 7,5-9,5%-kal magasabb az olvadáspont a természetes térszerkezet hőmérsékletemelkedés hatására történő elvesztésénél, és (3) egy pH-tartományban megnő a Tm érték.
Jóllehet nem kötődünk elméletekhez, az R(144)Q és az R(144)E fokozott stabilitásának valószínűleg az az oka, hogy bázikus csoportok egy csoportjának csökken a töltéssűrűsége, ami heparin távollétében a szerkezetéből következően instabil, a töltéstaszítás miatt. Az alább ismertetett eredmények azt sugallják, hogy a 144-es pozícióban levő arginin egy bFGF-ben levő csoportnak felel meg, Röntgen-krisztallográfiás meghatározás alapján, amiről azt közölték, hogy bázikus csoportok között vagy közelében található, amelyek befolyásolják a heparin-kötődést [ Ago és mtsai: Journal of Biochemistry 110, 360-363 (1991); Eriksson és mtsai: Protein Science 2, 1274-1284 (1993)] .
A természetes KGF 46 töltött csoportot tartalmaz, amelyek közül 27-nek van pozitív töltése. A KGF analógokkal kapott eredmények fényében a természetes KGF primer szekvenciájának összehasonlítása a bFGF primer szekvenciájával azt sugallja, hogy a 27 pozitív töltésű csoport közül néhány egy ahhoz hasonló tömörülést alkot, mint ami a bFGF tercier struktúrájában található. Az ilyen csoportoknak a fehérje háromdimenziós szerkezetében való elhelyezkedésétől függően, ezeknek a tömörülő csoportoknak egy vagy több negatív töltésű vagy semleges aminosavval való helyettesítése megváltoztathatja a szomszédos csoportok elektrosztatikus kölcsönhatásait, és így jól használható lehet arra, hogy fokozott stabilitást érjünk el.
Tehát az alábbiakban ismertetett R(144)Q analóg mellett egyéb analógokat is megfontolás tárgyává teszünk a talál··· · · • · • · · mányban. A továbbiakban a KGF analóg vagy a KGP polipeptid analógja szakkifejezés töltésükben megváltoztatott polipeptideket jelent, amelyekből a 41-154-es aminosavakat (a 2. számú szekvencia 72-185-ös aminosavai), különösen beleértve a 123133-as aminosavakat (a 2. számú szekvencia 154-164-es aminosavait) kivágjuk vagy helyettesítjük egy semleges csoporttal vagy negatívan töltött csoporttal, amiket úgy választunk meg, hogy a fehérjének csökkentsük a pozitív töltését. A módozz 41 sításhoz előnyben részesített csoportok a következők: Arg , Gin , Lys , Lys , Lys , Asn , Gin , Lys , Arg , Lys , Gin152, Lys153 és Thr154, amelyek közül előnyben részesítjük a Gin138, Lys139, Arg144, Lys147, Gin152 vagy Lys153-as csoportokat, és ezek közül az Arg144-et részesítjük leginkább előnyben. A helyettesítéshez előnyben részesített csoportok közé tartozik a glutamínsav, az aszparaginsav, a glutamin, az aszparagin, a glicin, az alanin, a valin, a leucin, az izoleucin, a szerin és a treonín, amelyek közül leginkább a glutaminsavat, glutamint, aszparaginsavat, aszparagint és alanint részesítjük előnyben.
Minden módosításnak az a célja, hogy minimalizálja a töltéstaszítást a molekula tercier szerkezetében; legelőnyösebb, ha az analóg a kiindulási molekulához viszonyítva fokozott stabilitással rendelkezik. Nyilvánvaló, hogy a deléciók vagy helyettesítések száma nem lehet olyan nagy, illetve nem tehetjük meg egymáshoz szoros közelségben levő aminosavakkal, hogy töltéstaszítást generáljunk két negatívan töltött csoport között.
Ha a KGF analógokat biológiai módszerekkel, azaz a termékek sejtben való expressziójával állítjuk elő, szemben a szilárd fázisú szintézissel, vagy a természetes termékek proteolitikus vagy enzimatikus emésztésével, stb., az ilyen polipeptideket kódoló polipeptidek egy vagy több nukleotidban különböznek a természetes KGF nukleinsav szekvenciájától. Az ilyen nukleotidok expresszálhatók, és a kapott polipeptidet a számos rekombináns technika közül bármelyikkel tisztíthatjuk, amelyek a szakterületen jártas szakember számára jól ismertek.
A KGF analógokat vagy azok egy részét kódoló DNS szekvenciák közé tartozhatnak egyebek között azok, amelyekbe beépítettük az expresszióhoz a kiválasztott gazdasejtek által előnyben részesített kodonokat (azaz például az Escherichia coli expressziós kodonokat); restrikciós enzimek hasítási helyeit, valamint további kezdő, lezáró vagy intermedier nukleotid szekvenciákat (azaz például egy indító metionin aminosav csoportot Escherichia coli sejtekben való expresszióhoz), hogy ezzel megkönnyítsük könnyen expresszálódó vektorok készítését.
A jelen találmány tárgyát képezik a polipeptidek expresszálásában alkalmazható rekombináns molekulák vagy vektorok.
Ezek a vektorok lehetnek DNS vagy RNS vektorok, és lehetnek cirkulárisak, lineárisak, egyszálúak vagy kétszálúak, lehetnek természetben előfordulóak vagy számos komponensből összeállítottak, amely komponensek lehetnek természetesek vagy szintetikusak.
··· » · , 20
Az ilyen expressziós vektorokra számos példa létezik. A vektorok komponenseit, azaz például a replikonokat, szelekciós géneket, fokozókat, promotereket és hasonlókat előállíthatjuk természetes forrásokból vagy ismert eljárásokkal szintetizálhatjuk. A jelen találmányban jól használható expressziós vektorok mindegyik esetben tartalmaznak legalább egy expressziós kontroll elemet, funkcionálisan hozzákapcsolva a KGF polipeptid analógot kódoló, beszúrt nukleinsav molekulához. Ez a kontroll elem felelős a polipeptid találmány szerinti nukleinsav molekulákról való expressziójának szabályozásáért. A jól használható kontroll elemek közé tartozik például a lac rendszer, a trp rendszer, a λ fágból származó operátorok és promoterek, egy glikolitikus élesztő' promoter, az élesztő savas foszfatáz génből származó promoter, egy élesztő a-mating faktor és az adenovírusból, Epstein-Barr vírusból, polióma vírusból és majomvírusból, valamint különböző retrovírusokból származó kontroll elemek. Azonban számos egyéb, a szakirodalomban jól ismert, prokarióta és eukarióta expresszióhoz használható vektor és kontroll elem használható a jelen találmány gyakorlatában.
Az alkalmas prokarióta klónozó vektorok közé tartoznak az Escherichía coli plazmidok (azaz például pBR322, colEl, pUC és az F-faktor), az előnyben részesített plazmid a pCFM1156 (ATCC 69702), a pCFMl656 (ATCC 69576) és a pCFM3102 (az alább következő Példák részben ismertetjük). Más, az emlős, rovar, élesztő, gomba és bakteriális expresszióban használható ismert vektor, amelyeknek számos típusa ismert, szintén jól hasz21 nálható erre a célra. Ezeknek a vektoroknak a megfelelő gazdagejtekbe való transzfekciója eredményezheti a KGF analóg polipeptid expresszióját.
A jelen találmányban jól használható mikroorganizmus lehet prokarióta vagy eukarióta. A megfelelő prokarióta gazdaszervezetek közé tartoznak a különböző Escheríchia coli (azaz például
FM5, HB101, DH5cc, DH10 és MC1016) , Pseudomonas, Bacíllus és
Streptomyces törzsek, amelyek közül az Escheríchia coli törzseket részesítjük előnyben. Az alkalmas eukarióta gazdasejtek közé tartoznak az élesztők és egyéb gombák, a rovarsejtek, növényi sejtek és állati sejtek, azaz például a COS (úgymint a COS-1 és COS-1) és CV-1 majomsejt vonalak, Swiss, Balb-c vagy NIH sejtekből származó 3T3 vonalak, HeLa és L-929 egérsejtek, valamint CHO, BHK vagy HaK hörcsögsejtek. Az alkalmazott gazdaszervezettől függően a jelen találmány szerint előállított rekombináns polipeptidek lehetnek emlős vagy egyéb eukarióta szénhidrátokkal glikozilezve, vagy lehetnek glikozilezetlenek.
A előnyben részesített előállítási módszer számos különböző faktortól és megfontolástól függően változik; egy adott helyzetben az optimális előállítási eljárás nyilvánvaló a szakterületen jártas szakember számára, minimális kísérleti munka elvégzése után. A kapott expressziós terméket azután közel homogenitásig tisztítjuk, a szakterületen ismert eljárások alkalmazásával. Egy prokarióta sejt termékének tipikus tisztítási eljárása magában foglalja a sejtfalak feltörését magas nyomással vagy egyéb eszközökkel, centrifugálás alkalmazását a , 22 sejttörmelék eltávolítására, majd ioncserélő kromatográfia alkalmazását a felülúszóra vagy szűrletre, és végezetül hidrofób kölcsönhatáson alapuló kromatográfia alkalmazását. Ha az analógot oldhatatlan formában expresszáljuk, akkor egy másik tisztítási technika magában foglalja azt a lépést, hogy először oldatba visszük az analógokat tartalmazó zárványtesteket, majd helyreállítjuk a fehérje térszerkezetét, és végezetül hidrofób kölcsönhatáson alapuló kromatográfiát alkalmazunk. A tisztítási technikákat ismertetik az 1994. október 13-án benyújtott 08/323,339 számú Amerikai Egyesült Államok-beli bejelentésben. A 08/323,339 számú Amerikai Egyesült Államok-beli szabadalmi bejelentésben leírnak egy eljárást egy keratinocita növekedési faktor tisztítására, ami a következő lépésekből áll: (a) KGF-et tartalmazó oldatot állítunk elő; (b) az (a) pontban kapott oldatból a KGF-et egy kationcserélő gyantára kötjük ki; (c) a KGF-et eluáló oldattal eluáljuk a kationcserélő gyantáról; (d) a (c) pontból származó eluátumot vagy átbocsátjuk egy megfelelő molekulasúly kizárásos hordozón, vagy hidrofób kölcsönhatáson alapuló kromatográfiát végzünk a (c) pontban kapott eluátum oldattal; és (e) kinyerjük a molekulasúly kizárásos hordozón vagy hidrofób kölcsönhatáson alapuló kromatográfiával kapott
KGF-et.
Az analógokat természetesen gyorsan átvizsgálhatjuk, hogy megbecsüljük a fizikai tulajdonságaikat. A Példák részben számos jól ismert stabilitás esszét mutatunk be, jóllehet az analóg vizsgálatára használt specifikus esszé természete nem kritikus. Emellett a biológiai aktivitás szintje (azaz a recep23 torkötés és/vagy affinitás, mitogén, sejtszaporodási és/vagy in vivő aktivitás) is vizsgálható, számos különböző teszt alkalmazásával, amelyek közül néhányat a Példák részben mutatunk be. Számos vizsgálat jól ismert, és arra használhatjuk, hogy gyorsan megvizsgáljuk, rendelkeznek-e elfogadható biológiai aktivitással vagy sem. Egy ilyen vizsgálatban specifikusan vizsgáljuk a KGF analógoknak azt a képességét, hogy mennyire képesek kötődni a KGF receptorhoz (KGFR) , a 125I-KGF-fel versengve [ Bottaro és mtsai: Journal of Biological Chemistry 265, 12767-12770 (1990); Ron és mtsai: Journal of Biological Chemistry 268, 2984-2988 (1993)] . Egy másik módszer a KGFR/KGF analóg kölcsönhatások vizsgálatára magában foglalja különböző technikák alkalmazását, azaz például a valós idejű biospecifikus kölcsönhatás elemzést (BIA) [Felder és mtsai: Molecular & Cellular Biology 13, 1449-1455 (1993)] . Emellett egy mitogén vizsgálat is használható arra, hogy vizsgáljuk a KGF analógoknak azt a tulajdonságát, hogy mennyire képesek serkenteni a DNS szintézisét [Rubin és mtsai: Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 86, 802-806 (1989)] . Végezetül sejtszaporodási esszék is használhatók arra, hogy vizsgáljuk a KGF analógoknak azt a képességét, mennyire képesek serkenteni a sejtszaporodást [ Falco és mtsai: Oncogene 2_, 573578 (1988)] . Az előzőkben említett esszé-rendszerek bármelyikét alkalmazva a KGF analógok biológiai aktivitása gyorsan átvizsgálható.
A KGF analógok tovább módosíthatók, hogy olyan további kémiai egységeket tartalmazzanak, amelyek általában nem képezik
részét a pepiidnek. Az ilyen derivatizált egységek fokozhatják a KGF analóg oldékonyságát, abszorpcióját, biológiai felezési idejét és hasonlókat. Az egységek emellett eliminálhatják vagy gyengíthetik a fehérje nemkívánt mellékhatását és egyéb hasonló hatásuk is lehet. Az ilyen hatások kiváltására alkalmas egységeket leírnak a szakirodalomban [Remington's Pharmaceutical Sciences, 18. kiadás, Mack Publishíng Co.,
Easton, PA (1990)] . Kovalens módosításokat vihetünk be a molekulába, a peptid megcélzott aminosav csoportjait egy szerves származékképző ágenssel reagáltatjuk, amely képes reagálni a kiválasztott oldalláncokkal vagy terminális csoportokkal [T.E. Creighton: Proteins: Structure and Molecule Propertíes; W.H. Freeman & Co., San Francisco, 79-86. old. (1983)] . A polietilénglikol (PEG) egy ilyen kémiai egység, amit a terápiás fehérjetermékek készítésére lehet használni. Néhány fehérje esetében a polietilénglikol kapcsolásáról kimutatták, hogy megvéd a proteolízissel szemben [ Sada és mtsai: J. Fermentation Bioengineering 71, 137-139 (1991)] , és bizonyos polietilénglikol egységek kapcsolási módszerei is ismertek [Davis és mtsai: Non-Immunogenic Polypeptides, 4,179,337 számú Amerikai Egyesült Államok-beli szabadalmi bejelentés, kibocsátva 1979. december 18-án; Royer: Modifying Enzimes with Polyethylene Glycol and Product Produced Thereby, 4,002,531 számú Amerikai Egyesült Államok-beli szabadalmi bejelentés, kibocsátva 1977. január 11-én] . A kérdésről összefoglaló is jelent meg a szakirodalomban [ Abuchowski és mtsai: Enzymes and Drugs, 367-382. old. ín: Enzymes as Drugs, szerk.; Holcerberg és Roberts • *··· (1981)] . A polietilénglikol esetében számos különböző eszközt használnak a polietilénglikolnak a fehérjéhez való kapcsolására. Általában a polietilénglikol molekulákat a fehérjéhez egy, a fehérjén levő reaktív csoporton keresztül kapcsolják a fehérjéhez. Az ilyen kapcsoláshoz jól használhatók a lizincsoportokon vagy az N-terminálison található aminocsoportok. Például Royer azt állítja, hogy reduktív alkilezés használható polietilénglikol molekuláknak egy enzimhez való kapcsolására [Royer: Modifying Enzimes with Polyethylene Glycol and Product Produced Thereby, 4,002,531 számú Amerikai Egyesült Államok-beli szabadalmi bejelentés, kibocsátva 1977. január 11-én] . Wright azt állítja, hogy a szabad aminocsoportokkal rendelkező peptideket és szerves vegyületeket a PEG vagy rokon vízoldékony szerves polimerek imidát származékával lehet módosítani [Wright: PEG Imidates and Protein Derivatives Thereof, EP 0 539 167, publikálva 1993. április 28-án] . Shaw szabadalmi bejelentésében azt írja le, hogy a fehérjékben levő lizincsoportok módosíthatók a polietilénglikol molekuláknak a kapcsolása céljából, a reaktív aminocsoportokon keresztül [Shaw, 4,904,584 számú Amerikai Egyesült Államok-beli szabadalmi bejelentés, kibocsátva 1990. február 27-én] .
Egy megvalósítási mód szerint a jelen találmány tárgya egy gyógyászati készítmény egydózisos beadási egysége, amit biztonságosan be lehet adni parenterálisan vagy orálisan, a betegségnek egy melegvérű állatban (azaz például emberben) való kezelésére. Az ilyen gyógyászati készítmény lehet líofílezett • · ·«· · · vagy egyéb módon dehidratált terápiás vagy diagnosztikai készítmény, amit fiziológiásán elfogadható oldószer hozzáadásával helyre lehet állítani. Az oldószer lehet bármilyen közeg, azaz például steril víz, fizológiás sóoldat, glükózoldat vagy egyéb vizes szénhidrát (azaz például poliolok, úgymint mannát, xilit vagy glicerin), amely képes feloldani a szárított készítményt, amely kompatibilis a kiválasztott beadási úttal, és ami nem zavarja a hatóanyagot és a használt helyreállító stabilizálószert. Egy specifikus megvalósítási mód szerint a találmány tárgyát egy egydózisos beadási egység előállítására alkalmas kit képezi. A kit tartalmaz egy első tartóedényt, amelyben a szárított fehérje van, valamint egy második tartóedényt, amelyben egy vizes készítmény van, amely egy helyreállítási stabilizálószert tartalmaz. Az oldatban levő fehérje koncentrációja, az egyes tartóedényekbe töltött oldat térfogata, valamint a tartóedények kapacitása (egymással kapcsolatban levő paraméterek, amelyek megfelelően módosíthatók, a végső kiszerelésben levő hatóanyag kívánt koncentrációjától függően), amik a szakterületen jártas szakember számára ismert széles tartományon belül változhatnak.
A találmány szerinti KGF analógok jól használhatók terápiás és diagnosztikai ágensekként, valamint kutatási ágensekként. Tehát a KGF analógok használhatók in vitro és/vagy in vivő diagnosztikai vizsgálatokban, amelyekben egy szövetvagy szervmintában határozzuk meg a KGF mennyiségét, illetve használhatók KGFR-t expresszáló sejtek meghatározására és/vagy izolálására [ Bottaro és mtsai: Journal of Biological Chemistry • · ···· ·
·.·· >···· , ···· · · ···· ♦·;· .··· ♦ ·· λ 27 *
265, 12767-12770 (1990); Ron és mtsai: Journal of Biological
Chemistry 268, 2984-2988 (1993)] . A szövetek vagy szervek vizsgálatakor I-KGF analóg eseteben kevesebb KGFR-hez kötődő 125 radioaktivitás lesz, ha a I-KGF analóggal kapott standardizált kötési görbével hasonlítjuk össze, a jelzetlen természetes KGF-nek a KGFR-hez való kötődése következtében.
125
Hasonlóképpen, a I-KGF analóg arra is használható, hogy kimutassuk a KGFR jelenlétét különböző sejttípusokban.
A találmány tárgyát képezi a KGF analógok alkalmazása a peptid elleni ellenanyagok előállításában, amely ellenanyagok kötődnek a természetes KGF-hez. Ebben a megvalósítási módban az ellenanyagok monoklonális vagy poliklonális eredetűek, és egy KGF analóg felhasználásával állítjuk elő. A kapott ellenanyagok főleg a természetes KGF-hez kötődnek, előnyösen akkor, ha a fehérje természetes (biológiailag aktív konformációjában) van. Ezek az ellenanyagok használhatók a természetes KGF kimutatására vagy tisztítására.
A találmány tárgyát képezi emellett a KGF analógok alkalmazása terápiás alkalmazhatósággal rendelkező, nagy affinitású vagy kis affinitású KGF-kötő molekulák felfedezésében, amiket például a KGF hatékony bejuttatására, vagy a KGF aktivitás hatékony inhibitoraként lehet használni. A KGF analógok hőstabilitása fontos az ilyen kötő molekulák fiziológiás körülmények között (azaz 37 °C-on) való azonosításában, mivel a KGFhez való affinitásuk erősen hőmérsékletfüggő, és nem jósolható meg a 4 °C-on megfigyelt affinitásukból.
• •·· · • · *··» , 28 < * «
Az in vivő alkalmazások során a KGF analógokat adalékanyagokkal formulázhatjuk. Az ilyen adalékanyagok közé tartoznak a pufferek, hordozók, stabilizálószerek, töltőanyagok, konzerválószerek, tonicitást beállító szerek, antioxidánsok és hasonlók (azaz például a viszkozitást beállító szerek vagy töltőanyagok). A specifikus adalékanyagok kiválasztása függ a tárolási formától (azaz attól, hogy folyékony vagy liofilezett formában tároljuk), valamint a KGF analóg beadási módjától. A megfelelő kiszerelési módok, amelyek ismertek a szakterületen, megtalálhatók a szakirodalomban [Remington's Pharmaceutical Sciences, 18. kiadás, Mack Publishing Co., Easton, PA (1990)] .
A KGF analógok terápiásán hatékony mennyiségben alkalmazhatók olyan szövetekre, amelyeket specifikusan az jellemez, hogy sérült, vagy klínikailag elégtelen számú nem-fibroblaszt epitélium sejtekkel rendelkezik. Mivel a KGF kötődik a heparinhoz, ezért valószínű, hogy a heparin, a heparin-szulfát, a heparin-szerű glikozaminoglikánok, amelyek az extracelluláris környezetben találhatók, in vivő köthetik a KGF-et. Ebből következik, hogy a csökkent heparinkötő aktivitással rendelkező KGF analógoknak megnő az aktivitásuk, mivel több KGF éri el a célpontját, és a heparin vagy heparin-szerű vegyületek nem szűrik ki az extracelluláris környezetből. Ezek az analógok jobban használhatók terápiásán, mivel egy adott KGF kisebb dózisaira van szükség egy kezelésben.
A KGF analógok terápiásán hatékony mennyiségben alkalmazhatók olyan szövetekre, amelyeket specifikusan az jellemez, • Σ * Λ · · · · ,· *.ϊ· · · ···· ··;
hogy sérült, vagy klinikailag elégtelen számú nem-fibroblaszt epitélium sejtekkel rendelkeznek. Azok a területek, amelyekre a KGF analógok sikeresen alkalmazhatók, a következők, anélkül, hogy ezekre korlátoznánk magunkat: az adnexális struktúrák, azaz például a hajhagymák, izzadságmirigyek és faggyúmirigyek serkentése, szaporítása és differenciálódása égési sérülésekben, vagy egyéb, teljes mélységű sérülésekben szenvedő betegek kezelésében; az epidermolysis bullosa (az epidermisznek az alatta levő dermiszhez való tapadásának hibája, ami gyakran súlyos betegségeket okozó nyílt, fájdalmas hólyagok megjelenését eredményezi) által okozott léziók felgyorsult reepítelizációja; a kemoterápia által indukált szőrhullás megelőzése és férfias típusú kopaszság kezelése, vagy a haj progresszív elvesztése férfiakban és nőkben; gyomor- és nyombélfekélyek kezelése; gyulladásos bélbetegségek, azaz például a Crohn féle betegség (ami elsődlegesen a vékonybelet érinti) és a fekélyes kolítisz (ami elsődlegesen a vastagbelet érinti) kezelése; a béltoxicitás megakadályozása vagy csökkentése sugárzásos vagy kemoterápiás kezelések során (azaz például előkezelés és/vagy utókezelés), amely kezeléseket vagy citoprotektív hatás vagy regeneráció, vagy mindkettő kiváltására használnak; nyálka termelésének indukálása az emésztőrendszerben; a ΙΙ-es típusú pneumociták szaporodásának és differenciálódásának indukálása, ami segíthet betegségek kezelésében vagy megelőzésében, mint például a fiatal gyermekek hyalin membrán megbetegedésében (azaz például gyermek légzési nehézség tünetek és bronchopulmonáris fejlődési bronchopulmonáris és tünetek * · rf « · • · · · ···· ···<
• · rendellenesség); a bronchioláris és/vagy alveoláris epitélium szaporodásának és differenciálódásának serkentése belégzési sérülések (beleértve a magas oxigénkoncentrációt) miatt fellépő akut vagy krónikus tüdőkárosodás vagy tüdőelégtelenség esetében, emfizéma, tüdőkárosító kemoterápiás szerek alkalmazása, ventilátor sérülés vagy egyéb tüdőkárosító körülmények között; a máj működésének fokozására, máj zsugorodás, akut virális hepatitisz és/vagy a májnak okozott mérgezés által okozott heveny májkárosodás esetében; szaruhártya sejtek regenerálódásának indukálása, például a szaruhártya horzsolódása esetében; az epiteliális sejtregenerálódás indukciója progresszív gumi betegség kezelésére; dobhártya epiteliális sejtek regenerálódásának indukciója a dobhártya károsodásának kezelésére és a cukorbetegség fellépésének megakadályozására vagy kezelésére, vagy a hasnyálmirigy szigetsejtek transzplantációjának beállításánál adalékanyagként.
A nem-fibroblaszt epiteliális sejtek szaporodását igénylő betegnek egy KGF analógból hatékony mennyiséget adunk be. A hatékony mennyiség jelentése a KGF analógnak az a mennyisége, ami ahhoz szükséges, hogy kiváltsuk a kívánt választ a kezelt betegben, és ezért általában a kezelőorvos határozza meg. A beadott KGF analóg mennyiségét befolyásoló faktorok közé tartozik a beteg kora és általános kondíciója, a kezelendő betegség, stb. A tipikus dózisok 0,001 mg/testsúlykilogramm és 500 mg/testsúlykilogramm között változnak.
A KGF analógot melegvérű állatoknak (azaz például embereknek) biztonságosan beadhatjuk parenterálisan (azaz IV,
ΙΤ, ΙΜ, SC vagy IP utakon), orálisan vagy topikálisan. A KGF analógot használhatjuk egyszeri beadással, vagy ismételten is beadhatjuk, a betegségtől és a beteg állapotától függően. Néhány esetben a KGF analógot más terápiát kísérő anyagként is beadhatjuk, illetve beadhatjuk egyéb gyógyászati készítményekkel együtt.
Az alábbi példákat a jelen találmány teljes illusztrálása céljából adjuk meg. Az nyilvánvaló, hogy az ismertetett eljárások módosíthatók, anélkül, hogy eltérnénk a találmány szellemétől.
PÉLDÁK
Az alábbi példákban ismertetett eljárásokban szereplő standard módszereket vagy megfelelő alternatív módszereket megtalálhatjuk a molekuláris biológia széles körben ismert kézikönyveiben [ Sambrook és mtsai: Molecular Cloning: A Laboratory Manual; Cold Spring Harbor Press, Cold Spríng Harbor, N.Y. (1989); Current Protocols in Molecular Piology, szerk.: Ausubel és mtsai, Greene Publíshing és WileyInterscience: New York (1990)] .
1. Példa
A KGF-et és KGF analógokat kódoló DNS készítése
A teljes hosszúságú humán KGF gén (ami a természetes KGF szekvenciájával rendelkező polipeptidet kódol) klónozását elvégeztük egy állati sejtből származó RNS-en végzett polimeráz láncreakcióval (PCR), illetve kémiailag szintetizált *
(Escherichía coli-ra optimalizált kodon) oligonukleotidokon végzett PCR reakcióval. Mindegyik eljárást ismertetjük az alábbiakban.
Azokból a sejtekből, amelyekről ismert, hogy előállítják a polipeptidet, RNS-t izolálunk, majd ezen PCR amplifikálást végzünk. Először az AG1523A humán fibroblaszt sejtvonalból származó sejteket (amikhez a Humán Genetic Mutant Cell Culture Repository Institute Fór Medicel Research, Camden, New Jersey, jóvoltából jutottunk hozzá) guanidium-izotiocianáttal elroncsoljuk, majd extraháljuk [Chomyzinski és mtsai: Anal. Biochem. 172, 156 (1987)] . Standard reverz transzkriptáz protokollt használva az össz-RNS-re, előállítjuk a KGF cDNS-t. A KGF gén PCR (PCR#1) amplifikálását a KGF cDNS-t templátként alkalmazva végezzük el, primerként az 1. számú és 2. számú oligonukleotidot használva, amelyek a KGF gén közvetlen 3' és 5' szomszédságában levő DNS szekvenciákat kódolják [ Model 9600 thermocycler (Perkin-Elmer Cetus, Norwalk, CT) ,· 28 ciklus, mindegyik ciklus a következő lépésekből áll: egy perc 94 °C-on a denaturáláshoz, két perc 60 °C-on az illeszkedéshez, majd három perc 72 °C-on a hosszabbításhoz] . A PCR#1 terméknek egy kis alikvot részét használjuk azután templátként egy második KGF PCR (PCR#2) amplifikáláshoz, amiben az előzőkkel azonos ciklusokat alkalmazunk, azzal az eltéréssel, hogy illeszkedési hőmérsékletként 50 °C-t használunk. A KGF gén expressziós klónozásához hálós PCR primereket használunk arra, hogy kényelmesen használható restrikciós hasítási helyeket hozzunk létre a KGF gén végein. A 3. számú és 4. számú oligonukleotidot hasz»··« · • · „ .· :.:. . » ···» ···· náljuk a PCR#2-ből származó KGF DNS termék módosítására, hogy Miül és BamHI restrikciós hasítási helyeket vigyünk be a gén 3' és 5' végére (PCR#3; 30 ciklus; az egyes ciklusokban alkalmazott lépések: egy perc 94 °C-on a denaturáláshoz, két perc 60 °C-on az illeszkedéshez, és három perc 72 °C-on a meghosszabbodáshoz) . Ezt a DNS-t azután Miül és BamHI restrikciós endonukleázokkal hasítjuk, fenollal extraháljuk, majd etanollal kicsapjuk. Azután szuszpendáljuk, majd T4 ligázzal egy pCFMH56 plazmidba (2A. ábra) ligáljuk, amely tartalmaz egy RSH szignálszekvenciát, ezzel előállítva az RSH-KGF konstrukciót (3. ábra) .
A ligálás termékét Escherichia coli FM5 törzsbe (ATCC: 53911) transzformáljuk [ Hanahan: J.Mól.Bioi. 166, 557 (1983)] , majd LB+kanamicín lemezre szélesztjük 28 °C-on. Számos transzformánst választunk ki, majd kis folyadéktenyészetekben szaporítjuk, amelyek 20 pg/ml kanamicint tartalmaznak. Az RSH-KGF plazmidot izoláljuk az egyes tenyészetek sejtjeiből, majd a DNS-t megszekvenáljuk. Mivel a KGF gén belsejében van egy Ndel hasítási hely, ezért nem lehet a természetes génszekvenciát közvetlenül a kívánt expressziós vektorba klónozni, amely a zárójelbe tett Ndel és BamHI hasítási helyeket tartalmazza. Ezt háromutas ligálással érjük el. Az RSH-KGF plazmidot a BsmI és SstI egyedi restrikciós hasítási helyeken elvágjuk, majd egy 1%-os agaróz gélen végzett elektroforézis után izolálunk egy körülbelül 3 kilobázispár méretű DNS fragmenst (amely a KGF gén
3' végét tartalmazza). PCR-t végzünk (PCR#4) a PCR#3-ra leírt körülmények között, azzal az eltéréssel, hogy a 3. számú oligo·· · ··*· ί · t · · * · • » ···· ···· nukleotid helyett az 5. számú oligonukleotidot használjuk. A PCR-rel kapott DNS terméket azután Ndel és BsmI restrikciós endonukleázzal hasítjuk, majd 4%-os agaróz gélen végzett gélelektroforézis után egy 311 bázispár méretű DNS fragmenst izolálunk. A ligálás harmadik darabja a pCFM1156 plazmádnak egy
I, 8 kilobázispár méretű darabja, amit Ndel és SstI restrikciós enzimekkel vágtunk ki, ezt egy 1%-os agaróz gélen végzett gélelektroforézis után izoláltuk. Az előzőkben ismertetett ligálást (T4 ligázzal), transzformálást, kanamicin szelekciót és DNS szekvenálást követően kiválasztunk egy olyan kiónt, amely tartalmazza a 4. ábrán látható konstrukciót és a KGF jelű plazmidot. Egy belső riboszómális kötőhely miatt, amely csonkított termékeket eredményez, az egyedi KpnI és EcoRI hasítási helyek közötti KGF DNS szekvenciát kémiai úton szintetizált oligonukleotidokkal (6. számú oligonukleotidtól a
II. számú oligonukleotidig) helyettesítjük, hogy minimalizáljuk a belső starthely használatát (5. ábra).
1. számú oligonukleotid (7. számú szekvencia):
5' -CAATGACCTAGGAGTAACAATCAAC-3'
2. számú oligonukleotid (8. számú szekvencia):
5' -AAAACAAACATAAATGCACAAGTCCA-3'’
3. számú oligonukleotid (9. számú szekvencia):
5' - AC AACGCGTGCAATGACATGACTCCA- 3'
4. számú oligonukleotid (10. számú szekvencia):
5' -ACAGGATCCTATTAAGTTATTGCCATAGGAA-3'
5. számú oligonukleotid (11. számú szekvencia):
5' -ACACATATGTGCAATGACATGACTCCA-3'
6. számú oligonukleotid (12. számú szekvencia):
5' -CTGCGTATCGACAAACGCGGCAAAGTCAAGGGCACCC-3'
7. számú oligonukleotid (13. számú szekvencia):
5' -AAGAGATGAAAAACAACTACAATATTATGGAAATCCGTACTGTT-3'
8. számú oligonukleotid (14. számú szekvencia):
5' -GCTGTTGGTATCGTTGCAATCAAAGGTGTTGAATCTG-3'
9. számú oligonukleotid (15. számú szekvencia):
TCTTGGGTGCCCTTGACTTTGCCGCGTTTGTCGATACGCAGGTAC-3'·
10. számú oligonukleotid (16. számú szekvencia):
5' -ACAGCAACAGTACGGATTTCCATAATATTGTAGTTGTTTTTCATC-3'
11. számú oligonukleotid (17. számú szekvencia):
5' -AATTCAGATTCAACACCTTTGATTGCAACGATACCA-3'
Az oligonukleotidokat T4 polinukleotid kinázzal foszforilezzük, majd hővel denaturáljuk. Azután hagyjuk, hogy az egyszálú (ss) olígonukleotidokkétszálú DNS fragmenseket képezzenek, oly módon, hogy hagyjuk hogy a hőmérséklet lassan szobahőmérsékletre csökkenjen. Ezután T4 ligázt használunk arra, hogy mind a belső oligonukleotid tapadó végeit mind a teljes kétszálú oligonukleotid fragmenst kovalens kötéssel a KpnI és EcoRI restrikciós enzimekkel emésztett KGF plazmádhoz kössük. Az új plazmid jelzése KGF(dsd).
Egy olyan KGF gént készítünk PCR amplifikálással, a kémiailag szintetizált 12-24. számú oligonukleotidok felhasználásával, amelynek a kodonjai teljesen Escherichia coli-ra vannak optimalizálva.
12. számú oligonukleotid (18. számú szekvencia):
5' -AGTTTTGATCTAGAAGGAGG-3'
13. számú oligonukleotid (19. számú szekvencia):
5' -TCAAAACTGGATCCTATTAA-3'
14. számú oligonukleotid (20. számú szekvencia):
5' -AGTTTTGATCTAGAAGGAGGAATAACATATGTGCAACGACATG
ACTCCGGAACAGATGGCTACCAACGTTAACTGCTCCAGCCCGGAACGT-3'
15. számú oligonukleotid (21. számú szekvencia):
5' -CACACCCGTAGCTACGACTACATGGAAGGTGGTGACATCCGT
GTTCGTCGTCTGTTCTGCCGTACCCAGTGGTACCTGCGTATCGACAAA-3'
16. számú oligonukleotid (22. számú szekvencia):
5' -CGTGGTAAAGTTAAAGGTACCCAGGAAATGAAAAACAACTACAACATC
ATGGAAATCCGTACTGTTGCTGTTGGTATCGTTGCAATCAAA-3'
17. számú oligonukleotid (23. számú szekvencia):
5' -GGTGTTGAATCTGAATTCTACCTGGCAATGAACAAAGAAGGTAAACT
GTACGCAAAAAAATGCAACGAAGACTGCAACTTCAAAGAA-3'
18. számú oligonukleotid (24. számú szekvencia):
5' -CTGATCCTGGAAAACCACTACAACACCTACGCATCTGCTAAATGGAC
CCACAACGGTGGTGAAATGTTCGTTGCTCTGAACCAGAAAGGT-3'
19. számú oligonukleotid (25. számú szekvencia):
5' -ATCCCGGTTCGTGGTAAAAAAACCAAAAAAGAACAGAAAACCGCTC
ACTTCCTGCCGATGGCAATCACTTAATAGGATCCAGTTTTGA-3'
20. számú oligonukleotid (26. számú szekvencia):
5' -TACGGGTGTGACGTTCCGGG-3'
21. számú oligonukleotid (27. számú szekvencia):
5' -CTTTACCACGTTTGTCGATA-3'
22. számú oligonukleotid (28. számú szekvencia):
5' -ATTCAACACCTTTGATTGCA-3'
23. számú oligonukleotid (29. számú szekvencia):
5' -CCAGGATCAGTTCTTTGAAG-3'
24. számú oligonukleotid (30. számú szekvencia):
5' -GAACCGGGATACCTTTCTGG-3'
A 12-24. számú oligonukleotidokat úgy terveztük meg, hogy a természetes KGF-et kódoló teljes DNS szekvenciát oligonukleotidok képezik, vagy a Watson vagy a Crick szálról, és PCR amplifikálással a kívánt kétszálú DNS szekvenciát kapjuk (6. ábra) [ PCR#5, Model 9600 thermocycler, Perkin-Elmer Cetus; 21 ciklus, mindegyik ciklus a következő lépésekből áll: 31 másodperc 94 °C-on denaturáláshoz, 31 másodperc 50 °C-on illesztéshez, és 31 másodperc 73 °C-on a meghosszabbodáshoz; a 21 ciklust követően a PCR-t egy végső, hét percig tartó hosszabbítási lépéssel zárjuk le] . PCR amplifikálás után a DNS fragmenst Xbal és BamHI restrikciós enzimekkel emésztjük, majd az 521 bázispár méretű fragmenst a pCFM1156 expressziós plazmádba ligáljuk, amit előzőleg ugyanazokkal az enzimekkel hasítottunk. A PCR#5-ben külső printerekként (100 pmol/100 μΐ rxn) a 12. számú és 13. számú oligonukleotidot, valamint 1 μ1/100 μΐ rxn KGF templátot használjuk, ami a 14-19. számú oligonukleotidokkal végzett ligálásból származik (T4 ligázzal) (a 15-19. számú oligonukleotidokat foszforilezzük T4 polinukleotid kinázzal), a 20-24. számú oligonukleotidokat használva sávsegítő oligonukleotidokként [ Jayaraman és mtsai: Biotechniques 12, 392 (1992)] a ligáláshoz. A végső konstrukció jelzése KGF(optimalizált kodonok).
Az alábbiakban ismertetett összes KGF kodon részben a
KGF(dsd)-ben, részben a KGF(optimalizált kodonok)-bán található DNS szekvenciákból, vagy a kettő kombinációjából áll. A szekvenciákat a továbbiakban tovább módosítjuk a DNS szekvenciákban található megfelelő restrikciós hasítási helyekbe olyan szekvenciák beépítésével, amelyek az adott KGF analóg aminosavait kódolják, és amelyeket úgy állítottunk elő, hogy egy vagy több, a DNS fragmensek szintézisére használt technikák közül egyet vagy többet használunk. Bármelyik analóg teljes mértékben előállítható az előzőkben ismertetett technikák alkalmazásával.
Ahol ez alkalmazható volt, ott az Escherichia coli kodonokra optimalizált oligonukleotidokat használtuk, jóllehet az Escherichia coli-za optimalizált kodonok részben vagy teljes egészben való jelenléte bármelyik vizsgált génben nem növelte szignifikánsan a tenyésztett bakteriális sejtekben előállított fehérje mennyiségét. A 7-10. és 17-26. ábrákon KGF analóg nukleotid- és aminosav szekvencia konstrukciókat mutatunk be:
R(144)Q (7. ábra); C(1,15)S/R(144)E (8. ábra); C(1,15)S/R(144)Q (9. ábra); AN23R(144)Q (10. ábra); ΔΝ23/Ν(137)Ε (17. ábra);
ΔΝ23/Κ(139)Ε (18. ábra); AN23/K(139)Q (19. ábra); AN23/R(144)A (20. ábra); AN23/R(144)L (21. ábra); ΔΝ23/Κ(147)Ε (22. ábra);
ΔΝ23/Κ(147)ζ) (23. ábra); ΔΝ23/Κ(153)Ε (24. ábra); AN23/K(153)Q (25. ábra) és ΔΝ23/<2 (152 ) E/K (153) E (26. ábra). Mindegyik ismertetett KGF analógnak igazoltuk a DNS szekvenciáját.
• * · · ·
2. Példa
Előállítás Escherichia colí-ban
Három különböző expressziós plazmidot használunk a KGF analóg gének klónozásában. Ezek a következők: pCFMH56 (ATCC# 69702), pCFM1656 (ATCC# 69576), és pCFM3102 (2A., 2B. és 2C.
ábrák). A p3102 plazmid a pCFM1656 plazmádból származik, egy sorozat helyspecifikus báziscserét hajtva végre PCR átfedő oligonukleotid mutagenezissel. A BglII hasítási hellyel (pCFM1656 plazmid 180# bázispár) kezdve közvetlenül a plazmid replikációs promoterétől (PcopB) 5' irányban, az elvégzett báziscserék a következők:
PCFM1656 bp# bp a pCFM!656-ban
# 204 T/A
# 428 A/T
# 509 G/C
# 617 - -
# 637 G/C
# 978 T/A
# 992 G/C
#1002 A/T
#1005 C/G
#1026 A/T
#1045 C/G
#1176 G/C
#1464 G/C
#2026 G/C
#2186 C/G
#2479 A/T
#2498-2501 AGTC TCAC
#2641-2647 TCCGAGC AGGCTC
#3441 G/C
#3452 G/C
#3649 A/T
#4556 - -
(39 . számú szekvencia)
(40 . számú szekvencia)
Megváltoztatott bázispárok a pCFM3102-ben C/G G/C A/T két G/C bp beszúrása T/A C/G A/T C/G T/A T/A T/A T/A T/A bp deléció T/A T/A GTCA CAGT bp deléció
A/T
A/T
T/A bázispárok beszúrása 5' -GAGCTCACTAGTGTCGACCTGCAG-3'
3' -CTCGAGTGATCACAGCTGGACGTC-5'
Amint az az előzőkből látható, a pCFM1156, pCFM1656 és pCFM3102 plazmidok nagyon hasonlítanak egymásra, és számos azonos restrikciós hasítási helyet tartalmaznak, A plazmidot egyszerűség! szempontok alapján választottuk ki, és a vektor ···· » · ····»*·· ♦· • ·· ···· ···
DNS komponensei könnyen megváltoztathatók az új konstrukcióknak megfelelően. Az összes klónozáshoz az Escherichia coli FM5 törzset használjuk (ATCC: 53911), és a transzformációkat vagy Hanahan módszerével, [ Hanahan: J.Mól.Bioi. 166, 557 (1983)] , vagy elektroelúcióval végezzük, egy Gene Pulser transzfekciós berendezést használva erre a célra (BioRad Laboratories, Inc.,
Hercules, CA) , a gyártó előírásai szerint.
Először kismennyiségű frissen tenyésztett inokulummal kezdünk, amit a három pCFM vektor közül az egyikben levő kívánt konstrukciót hordozó rekombináns Escherichia coli klónból készítünk. Az inokulumot úgy állítjuk elő, hogy a megfelelő törzs mélyhűtött glicerines tenyészetéből 0,1 ml-t viszünk át egy kétliteres lombikba, ami 500 ml Luria táptalajt tartalmaz. A tenyészetet 16 óra hosszat rázatjuk 30 °C-on, majd a tenyészetet egy 15 literes fermentorba visszük át, ami 8 liter steril táptalajt tartalmaz [ Tsai és mtsai: J. Industrial Microbiol. 2, 181-187 (198)] .
A rátáplálásos fermentáció az 1. számú táptalaj beadásával indul [Tsai és mtsai: J. Industrial Microbiol. 2, 181-187 (1987)] . Amikor az OD600 eléri a 35-ös értéket, akkor a kívánt KGF analóg expresszióját azzal indukáljuk, hogy a tenyészet hőmérsékletét gyorsan megemeljük 37 °C-ra, két óra hosszat itt tartjuk, majd 42 °C-ra emeljük, hogy denaturáljuk a Cl represszort. Az 1. számú táptalaj adagolását leállítjuk és megkezdjük 300 ml/óra sebességgel a 2. számú táptalaj adagolását. A 2. számú táptalaj összetétele: 175 g/l triptikáz/pepton, 87,5 g/l élesztőkivonat és 260 g/l glükóz.
*?· ··..
Egy óra hosszat 42 °C-on tartjuk, majd. a tenyészet hőmérsékletét 36 °C-ra csökkentjük, és ezt a hőmérsékletet tartjuk további 6 óra hosszat.
A fermentációt leállítjuk, majd a sejteket centrifugálással 1 literes centrifugapalackokba tett műanyag zacskókba gyűjtjük. A sejteket centrifugálással ülepítjük (400/perc, 60 perc), majd a felülúszókat eltávolítjuk, és a sejttömeget -90 °C-ra hűtjük.
A különböző KGF analógok Escherichia coli-ban való expresszióját követően a természetes KGF, C(1,15)S/R(144)E, C(1,15)S/R(144)Q és ÁN23/R(144)Q fehérjéket az alábbi eljárással tisztítjuk. A nagy sejtsűrűségű fermentációból származó sejttömeget 4 °C-on szuszpendáljuk 0,2 mol/1 nátrium-klorid, 20 mmol/1 nátriumfoszfát (pH=7,5) összetételű oldatban, 10-20 (tömeg/térfogat)%-os oldat formájában, megfelelő keverő alkalmazásával. A szuszpendált sejteket azután feltárjuk, az oldatot háromszor átbocsátva egy homogenizálón (APV Gaulin, Inc., Everett, MA) . A kifolyó homogenizátumot 4-8 °C-ra hűtjük, megfelelő hőcserélővel. A törmeléket azután eltávolítjuk, oly módon, hogy, hogy a lizátumot egy J-6B centrifugában (Beckman Instruments, Inc., Brea, CA) , egy JS 4.2 rotorral 4200/perc fordulatszámmal, 30-60 percig 4°C-on centrifugáljuk. A felülúszókat azután óvatosan dekantáljuk, majd egy korábban elkészített 450 ml-es (5x23 cm) oszlopba töltött Sepharose Fást Flow gyantára (Pharmacia, Piscataway, NJ) töltjük, amit 0,2 mol/1 nátrium-klorid, 20 mmol/1 nátriumfoszfát (pH=7,5) össze• ♦·*· · · · · · · ···· ♦ ..· ···· ··*· • · tételű oldattal hoztunk egyensúlyba 4 °C-on. Ezután az oszlopot öt oszloptérfogatnyi (2250 ml) oldattal (0,4 mol/1 nátrium-
klorid, 20 mmol/1 nátriumfoszfát, pH=7,5; ι mossuk 4 °C-on. A
kapott fehérjét eluáljuk, az oszlopot 5 liter 0,5 mol/1
nátrium- klorid, 20 mmol/1 nátriumfoszfát (pH=7,5) összetételű
oldattal mosva. 50 ml-es frakciókat szedünk, és az elfolyó
oldat A280 értékét folyamatosan ellenőrizzük. Azután 14%-os gélen SDS-PAGE-val elemezzük azokat a frakciókat, amelyekről az A280 érték alapján kiderült, hogy eluált anyagot tartalmaznak, ezzel igazolva, hogy a keresett polipeptid jelen van.
Ezután a számunkra érdekes fehérjéket tartalmazó frakciókat egyesítjük, majd azonos térfogatú desztillált vizet adunk hozzá. A hígított mintát azután egy korábban elkészített 450 ml térfogatú (5 x 23 cm) Sepharose Fast-Flow oszlopra visszük, amit előzőleg 0,4 mol/1 nátrium-klorid, 20 mmol/1 nátriumfoszfát (pH=6,8) oldattal hoztunk egyensúlyba 4 °C-on. Az oszlopot azután 2250 ml térfogatú, 0,4 mol/1 nátrium-klorid, 20 mmol/1 nátriumfoszfát (pH=6,8) összetételű oldattal mossuk, majd a fehérjét 20 oszloptérfogatnyi lineáris gradienssel eluáljuk (a gradiens összetétele 0,4 mol/1 nátrium-klorid, 20 mmol/1 nátriumfoszfát (pH=6,8)-tól 0,6 mol/1 nátrium-klorid, 20 mmol/1 nátriumfoszfát (pH=6,8) között változik). Ismét 50 ml-es frakciókat szedünk, az elfolyó oldatot folyamatosan ellenőrizve az A280 alapján. Azután a fehérjéket tartalmazó frakciókat (14%-os SDS-PAGE-val meghatározva) egyesítjük, majd egy YM-10 membránon (10000-es vágási érték) keresztül 30-40 ml-re kon44 centráljuk 350 ml-es kevertetett cellában (Amicon, Inc., Mayberry, MA).
A koncentrátumot azután egy korábban elkészített, 1300 ml (4,4 x 85 cm) térfogatú oszlopba töltött Superdex-75 gyantára (Pharmacia) töltjük, amit oszloppufferrel hoztunk egyensúlyba. Az oszloppuffer összetétele: lxPBS (Dulbecco féle foszfáttal puffereit sóoldat, D-PBS, kalcium- és magnézium-mentes), vagy 0,15 mo/1 nátrium-klorid, 20 mmol/1 nátriumfoszfát (pH=7,0). Miután hagytuk a mintát az oszlopon futni, a fehérjét eluáljuk a gélszűrő anyagról, az oszloppuffért használva erre a célra. Ezután 10 ml-es frakciókat szedünk, majd az analógot tartalmazó frakciókat (14%-os SDS-PAGE alapján meghatározva) egyesítjük. Tipikus esetben a fehérje-koncentráció körülbelül 5-10 mg a kapott egyesített oldatban. Az összes előzőleg említett eljárást 4-8 °C-on hajtjuk végre, hacsak külön nem említjük.
Elemzés
Az elemzést Escherichia coli-ból származó, természetes KGF; R(144)Q; C(1,15)S/R(144)E; C(1,15)S/R(144)Q és
ÁN23/R(144)Q mintákkal végezzük.
Konformációs stabilitás
A polipeptideket a tárolási stabilitásuk, a hőmérsékletváltozás hatására lejátszódó térszerkezet-változás hőmérséklete (Tro) , és a széles pH-tartományban mérhető stabilitásuk alapján hasolítjuk össze.
.:7. ί·:· í s.:.:
A természetes KGF, az R(144)Q, a C(1,15)S/R(144)Q, a
C(1,15)S/R(144)e és a AN23/R(144)Q analógoknak azt a képességét is vizsgáljuk, hogy megakadályozzák a magas hőmérsékleten való aggregációt. 0,5 mg/ml fehérjét tartalmazó mintákat készítünk D-PBS-ben. Az egyes mintákból 0,5 ml-t osztunk szét alikvot részekre 3 ml-es, 1-es típusú üvegküvettában. A küvettákat gumidugókkal zárjuk le, majd 13 mm-es lepattanó alumínium pecséteket préselünk rájuk. Ezeket a küvettákat azután egy 37 °C-os inkubátorba tesszük. A küvettákat előre meghatározott időpontokban kivesszük, és vizsgáljuk, hogy mennyi az oldható fehérje veszteség bennük. A látható csapadékot az egyes minták 250 μΙ-es alikvot részének egy 0,22 μιη-es Spin-X™ szűrőegységen (Costar, Cambridge, MA) át való centrifugálásával távolítjuk el. A megszűrt oldatban levő oldható fehérjét azután méretkizárásos HPLC-vel elemezzük. Az oldható fehérje mennyiségét a HPLC csúcs területének integrálásával határozzuk meg, majd az eredményeket a 37 °C-on való inkubálás idejének függvényében ábrázoljuk. Az eredményeket a
11. ábrán mutatjuk be.
Azután megbecsüljük az oldható, monomer fehérje veszteségének felezési idejét. Az 1. táblázatban a megmaradt oldható KGF felezési idejét láthatjuk, ezeknek a fehérjéknek 37
C-on való tárolása után.
1. Táblázat
Az oldható, monomer fehérjék vesztségének felezési ideje
Fehérj e t1/2 (nap)
természetes KGF 0, 6
R(144)Q 4,1
.C(1,15)S/R(144)Q 13,3
ÁN23/R(144)Q 22,3
C(1,15)S/R(144)E 38,0
Amint az a fenti 1. táblázatból és a 11. ábráról látható, a természetes KGF aggregálódik leggyorsabban, az oldhatóság felezési ideje 0,6 nap. Az R(144)Q felezési ideje 4,1 napra emelkedett. A C(1,15)S/R(144)Q, a ÁN23/R(144)Q és a C(1,15)S/R(144)E analógok lényegesen nagyobb felezési idővel rendelkeznek, azaz 13,3, 22,3 és 38 nappal.
A természetes térszerkezet elvesztése a hőmérsékletemelés hatására
A természetes térszerkezet hőmérsékletemelkedés hatására való elvesztését cirkuláris dikroizmussal (CD) vizsgáljuk 230 nm-en, egy J-720™ spektropolarimétert használva (Jasco, Inc., Easton, MD), amit egy PTC-343 Peltier-típusú hőmérséklet-szabályozó rendszerrel szereltünk fel. A CD elemzéshez 0,1 mg/ml elemzendő polipeptidet tartalmazó mintákat készítünk D-PBS-ben (Life Technologies, Inc., Grand Island, NY). Mindegyik mintából körülbelül 2,5 ml-t teszünk egy 10 mm-es úthosszú Suprasil™ kvarc (Heraeus Quarzschmelze, GmbH, Hanau, Németország) fluoreszcencia cellába (Hellma Cells, Inc., Jamaica, NY). A cellákat azután a spektropolariméterben levő Peltier-típusú hőmérséklet-szabályozó rendszerbe tesszük. A természetes térszerkezet hőmérsékletemelkedés hatására való elvesztését 50 °C/óra sebességgel vizsgáljuk. A térszerkezet elvesztésének jelzésére az ellipticitás változását követjük 230 nm-en. Az egyes minta Tra értékét úgy becsüljük meg, hogy azonosítjuk azt a hőmérsékletet, amelynél az oldatban levő fehérjék 50%-a elvesztette a természetes térszerkezetét [ Biophysical Chemistry; szerk.: Cantor és Schímmel; W.H. Freeman and Co., San Francisco (1980)] . A három fehérje becsült Tm értékét a 2. táblázatban mutatjuk be.
. Táblázat
Becsült olvadási hőmérsékletek
Fehérje Tm (°C)
természetes KGF 54,0
R(144)Q 61,5
C(l, 15) S/R(144)Q 62,5
ÁN23/R(144)Q 63,0
C(1,15)S/R(144)E 63,5
Amint ezek az eredmények mutatják, az R(144)Q-nak 7 °Cszal magasabb a Tm értéke a természetes KGF-hez viszonyítva. Az R(144)Q-t C(1,15)S/R(144)Q-ra vagy ÁN23-ra cserélve további egy fokkal nőtt a Tm értéke, és több mint 8 °C-szal magasabb • · · · mint a természetes KGF-é. Emellett a C(1,15)S/R(144)E Tm értéke több mint 9 °C-szal magasabb mint a természetes KGF-é. Tehát ha egy pozitívan töltött csoportot (Arg) a 144-es pozícióban egy semleges vagy negatívan töltött aminosavra cserélünk, akkor ez lényegesen stabilizálja a polipeptidet.
A C(1, 15)S/R(144)Q és a C(1,15)S/R(144)E savstabilitását is összehasonlítjuk a természetes KGF savstabilitásával, a DPBS ρΗ-ját különböző értékekre állítva be, tömény sósavat vagy nátríum-hidroxidot adva hozzá. Körülbelül 2,35 ml, különböző pH-jú D-PBS-t keverünk össze 100 μΐ, 2,45 mg/ml KGF fehérjével egy kvarc cellában. Ezekben a mintákban a fehérje természetes térszerkezetét a hőmérséklet emelésével megbontjuk, 50 °C/óra sebességgel, majd CD-vel követjük 230 nm-en. A 12. ábrán a Tmet a természetes KGF, a C (1,15)S/R(144)Q és a C(1,15)S/R(144)E pH-jának függvényében mutatjuk be. A vizsgált pH-tartományban a C (1,15)S/R(144)Q-nak és a C (1,15)S/R(144)E-nek mindig magasabb a Tm értéke mint a természetes KGF-nek.
In vitro biológiai aktivitás
Az R(144)Q, a ÁN23/R(144)Q, a C(1,15)S/R(144)Q és a
C(1,15)S/R(144)E in vitro mitogén aktivitását is meghatározzuk a fehérje-koncentráció függvényében, valamint meghatározuk a maximális koncentráció felét, a Balb/MK sejtek [ 3H] -timidinfelvétele alapján [Rubin és mtsai: Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 86, 802-806 (1989)] .
·»· ·
Az egyes KGF analógok koncentrációját általában az ismert standard természetes KGF-hez viszonyítva határozzuk meg, egy in vitro biológiai esszét használva. Azután mindegyik KGF analógot meghigítjuk és vizsgáljuk a biológiai aktivitását, egy Balb/MK mitogén esszét használva. A mintákat először egy biológiai vizsgáló közegben hígítjuk, ami 50%, a felhasználó által készített Eagle féle MEM-et, 50%, a felhasználó által készített F12-t, 5 μρ/ιηΐ transzferrint, 5 ng/ml nátrium-szelenitet,
0,0005% HSA-t és 0,005% Tween 20-at tartalmaz. A KGF mintákat azután Falcon primeria 96-lukas lemezekre visszük, amiket Balb/MK sejtekkel oltunk be. Mérjük a [ 3H] -beépülését a DNS szintézise során, majd bevitt természetes KGF koncentrációvá alakítjuk, természetes KGF standard görbével összehasonlítva. Az eredményeket a 13-16. ábrán mutatjuk be. Amint az a 13-16. ábrákról látható, mindegyik KGF analógnak van mitogén aktivitása .
Az alábbiakban ismertetjük a leírásban szereplő szekvenciák listáját.
A SZEKVENCIÁK JEGYZÉKE (1) ÁLTALÁNOS INFORMÁCIÓ:
(i) BENYÚJTÓ: Amgen Inc.
(ii) A TALÁLMÁNY CÍME: Keratinocita növekedési faktor analógok (iii) A SZEKVENCIÁK SZÁMA: 60 (iv) LEVELEZÉSI CÍM:
(A) CÍMZETT: Amgen Inc.
(B) UTCA: 1840 DeHavilland Drive (C) VÁROS: Thousand Oaks (D) ÁLLAM: Kalifornia (E) ORSZÁG: USA (v) SZÁMÍTÓGÉPES FORMA:
(A) A HORDOZÓ TÍPUSA: FLOPPY LEMEZ
(B) SZÁMÍTÓGÉP: IBM PC KOMPATIBILIS
(C) OPERÁCIÓS RENDSZER : PC-DOS/MS-DOS
(D) PROGRAM: PATENTIN RELEASE #1.0, VERSION #1.30
(vi) A JELENLEGI BENYÚJTÁS ADATAI:
(A) A BENYÚJTÁS SORSZÁMA: PCT/US95/13075 (B) A BENYÚJTÁS IDŐPONTJA: 1995. október 12.
(C) OSZTÁLYOZÁS:
(vii) A KORÁBBI BENYÚJTÁS ADATAI:
(A) A BENYÚJTÁS SORSZÁMA: US 08/487,825 (B) A BENYÚJTÁS IDŐPONTJA: 1995. június 7. (vii) A KORÁBBI BENYÚJTÁS ADATAI:
(A) A BENYÚJTÁS SORSZÁMA: US 08/323,337 (B) A BENYÚJTÁS IDŐPONTJA: 1994. október 13.
« · • ·*·· *··· (viii) ÜGYVIVŐ/ÜGYNÖK INFORMÁCIÓ:
(A)
NÉV: Zindrick, Thomas D.
(B) (C)
REGISZTRÁCIÓS SZÁM: 32,185
REFERENCIA/LAJSTROMSZÁM: A-316B
1. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 862 bázispár (B) Típus:nukleinsav (C) Száltípus:ismeretlen (D) Topológia:ismeretlen (ii) A molekula típusa:cDNS (xi) A szekvencia leírása: 1. számú szekvencia
CAATCTACAA TTCACAGATA GGAAGAGGTC AATGACCTAG GAGTAACAAT CAACTCAAGA 60
TTCATTTTCA TTATGTTATT CATGAACACC CGGAGCACTA CACTATAATG CACAAATGGA 120
TACTGACATG GATCCTGCCA ACTTTGCTCT ACAGATCATG CTTTCACATT ATCTGTCTAG 180
TGGGTACTAT ATCTTTAGCT TGCAATGACA TGACTCCAGA GCAAATGGCT ACAAATGTGA 240
ACTGTTCCAG CCCTGAGCGA CACACAAGAA GTTATGATTA CATGGAAGGA GGGGATATAA 300
GAGTGAGAAG ACTCTTCTGT CGAACACAGT GGTACCTGAG GATCGATAAA AGAGGCAAAG 360
TAAAAGGGAC CCAAGAGATG AAGAATAATT ACAATATCAT GGAAATCAGG ACAGTGGCAG 420
TTGGAATTGT GGCAATCAAA GGGGTGGAAA GTGAATTCTA TCTTGCAATG AACAAGGAAG 480
GAAAACTCTA TGCAAAGAAA GAATGCAATG AAGATTGTAA CTTCAAAGAA CTAATTCTGG 540
AAAACCATTA CAACACATAT GCATCAGCTA AATGGACACA CAACGGAGGG GAAATGTTTG 600
TTGCCTTAAA TCAAAAGGGG ATTCCTGTAA GAGGAAAAAA AACGAAGAAA GAACAAAAAA 660
CAGCCCACTT TCTTCCTATG GCAATAACTT AATTGCATAT GGTATATAAA GAACCCAGTT 720
CCAGCAGGGA GATTTCTTTA AGTGGACTGT TTTCTTTCTT CTCAAAATTT TCTTTCCTTT 780
TATTTTTTAG TAATCAAGAA AGGCTGGAAA AACTACTGAA AAACTGATCA AGCTGGACTT 840
GTGCATTTAT GTTTGTTTTA AG
862 ·**» ·*»# * ·
2. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 194 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: fehérje (xi) A szekvencia leírása: 2. számú szekvencia
Met His Lys Trp Ile Leu Thr Trp Ile Leu Pro Thr Leu Leu Tyr Arg
10 15
Ser Cys Phe His Ile Ile Cys Leu Val Gly Thr Ile Ser Leu Ala Cys
25 30
Asn Asp Met Thr Pro Glu Gin Met Ala Thr Asn Val Asn Cys Ser Ser
40 45
Pro Glu Arg His Thr Arg Ser Tyr Asp Tyr Met Glu Gly Gly Asp Ile
55 60
Arg Val Arg Arg Leu Phe Cys Arg Thr Gin Trp Tyr Leu Arg Ile Asp 65 70 75 80
Lys Arg Gly Lys Val Lys Gly Thr Gin Glu Met Lys Asn Asn Tyr Asn 85 90 95
Ile Met Glu Ile Arg Thr Val Ala Val Gly Ile Val Ala Ile Lys Gly
100 105 110
Val Glu Ser Glu Phe Tyr Leu Ala Met Asn Lys Glu Gly Lys Leu Tyr
115
120
125
Alá Lys 130 Lys Glu Cys Asn Glu 135 Asp Cys Asn Phe Lys 140 Glu Leu Ile Leu
Glu Asn His Tyr Asn Thr Tyr Alá Ser Alá Lys Trp Thr His Asn Gly
145 150 155 160
Gly Glu Met Phe Val Alá Leu Asn Gin Lys Gly Ile Pro Val Arg Gly
165 170 175
Lys Lys Thr Lys Lys Glu Gin Lys Thr Alá His Phe Leu Pro Met Alá
180 185 190
Ile Thr
3 . számú sz ekvenciavázlat
(i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 595 bázispár
(B) Típus: nukleinsav
(C) Száltípus: ismeretlen
(D) Topológia: ismeretlen
(ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 3. számú szekvencia
ATCGATTTGA TTCTAGAAGG AGGAATAACA TATGAAAAAG CGCGCACGTG CTATCGCCAT 60
TGCTGTGGCT CTGGCAGGTT TCGCAACTAG TGCACACGCG TGCAATGACA TGACTCCAGA 120
GCAAATGGCT ACAAATGTGA ACTGTTCCAG CCCTGAGCGA CACACAAGAA GTTATGATTA 180
CATGGAAGGA GGGGATATAA GAGTGAGAAG ACTCTTCTGT CGAACACAGT GGTACCTGAG 240
GATCGATAAA AGAGGCAAAG TAAAAGGGAC CCAAGAGATG AAGAATAATT ACAATATCAT 300
GGAAATCAGG ACAGTGGCAG TTGGAATTGT GGCAATCAAA GGGGTGGAAA GTGAATTCTA 360
TCTTGCAATG AACAAGGAAG GAAAACTCTA TGCAAAGAAA GAATGCAATG AAGATTGTAA 420
CTTCAAAGAA CTAATTCTGG AAAACCATTA CAACACATAT GCATCAGCTA AATGGACACA 480
CAACGGAGGG GAAATGTTTG TTGCCTTAAA TCAAAAGGGG ATTCCTGTAA GAGGAAAAAA 540
AACGAAGAAA GAACAAAAAA CAGCCCACTT TCTTCCTATG GCAATAACTT AATAG
595 i
í
4. számú szekvenciavázlat j
I (i) A szekvencia jellemzői: | í
(A) Hossz: 186 aminosav | i
(B) Típus: aminosav ' (C) Száltípus: ismeretien [ (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: fehérje (xi) A szekvencia leírása: 4. számú szekvencia
Met Lys Lys Arg Alá Arg Alá Ile Alá Ile Alá Val Alá Leu Alá Gly
10 15
Phe Alá Thr Ser Alá His Alá Cys Asn Asp Met Thr Pro Glu Gin Met
25 30
Alá Thr Asn Val Asn Cys Ser Ser Pro Glu Arg His Thr Arg Ser Tyr
40 45
Asp Tyr Met Glu Gly Gly Asp Ile Arg Val Arg Arg Leu Phe Cys Arg
55 60
Thr Gin Trp Tyr Leu Arg Ile Asp Lys Arg Gly Lys Val Lys Gly Thr 65 70 75 80
Gin Glu Met Lys Asn Asn Tyr Asn Ile Met Glu Ile Arg Thr Val Alá
90 95
Val Gly Ile Val Alá Ile Lys Gly Val Glu Ser Glu Phe Tyr Leu Alá
100 105 110
Met Asn Lys Glu Gly Lys Leu Tyr Alá Lys Lys Glu Cys Asn Glu Asp
115 120 125 «·ί.
Cys Asn Phe Lys Glu Leu Ile Leu Glu Asn His Tyr Asn Thr Tyr Ala
130 135 140
Ser Ala Lys Trp Thr His Asn Gly Gly Glu Met Phe Val Ala Leu Asn
145 150 155 160
Gin Lys Gly Ile Pro Val Arg Gly Lys Lys Thr Lys Lys Glu Gin Lys
165 170 175
Thr Ala His Phe Leu Pro Met Ala Ile Thr
180 185
5 . számú sz ekvenciavázlat
(i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 499 bázispár
(B) Típus: nukleinsav
(C) Száltípus: ismeretlen
(D) Topológia: ismeretlen
(ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 5. számú szekvencia
TATGTGCAAT GACATGACTC CAGAGCAAAT GGCTACAAAT GTGAACTGTT CCAGCCCTGA 60
GCGACACACA AGAAGTTATG ATTACATGGA AGGAGGGGAT ATAAGAGTGA GAAGACTCTT 120
CTGTCGAACA CAGTGGTACC TGAGGATCGA TAAAAGAGGC AAAGTAAAAG GGACCCAAGA 180
GATGAAGAAT AATTACAATA TCATGGAAAT CAGGACAGTG GCAGTTGGAA TTGTGGCAAT 240
CAAAGGGGTG GAAAGTGAAT TCTATCTTGC AATGAACAAG GAAGGAAAAC TCTATGCAAA 300
GAAAGAATGC AATGAAGATT GTAACTTCAA AGAACTAATT CTGGAAAACC ATTACAACAC 360
ATATGCATCA GCTAAATGGA CACACAACGG AGGGGAAATG TTTGTTGCCT TAAATCAAAA 420
GGGGATTCCT GTAAGAGGAA AAAAAACGAA GAAAGAACAA AAAACAGCCC ACTTTCTTCC 480
TATGGCAATA ACTTAATAG
499 • » • ••fc ·*»·-
56
6. számú szekvenciavázlat
(i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 164 aminosav
(B) Típus: aminosav
(C) Száltípus: ismeretlen
(D) Topológia: ismeretlen
(ii) A molekula típusa: fehérje
(xi) A szekvencia leírása: 6. számú szekvencia
Met Cys Asn Asp Met Thr Pro Glu Gin Met Ala Thr Asn Val Asn Cys
1 5 10 15
Ser Ser Pro Glu Arg His Thr Arg Ser Tyr Asp Tyr Met Glu Gly Gly
20 25 30
Asp Ile Arg Val Arg Arg Leu Phe Cys Arg Thr Gin Trp Tyr Leu Arg
35 40 45
Ile Asp Lys Arg Gly Lys Val Lys Gly Thr Gin Glu Met Lys Asn Asn
50 55 60
Tyr Asn Ile Met Glu Ile Arg Thr Val Ala Val Gly Ile Val Ala Ile
65 70 75 80
Lys Gly Val Glu Ser Glu Phe Tyr Leu Ala Met Asn Lys Glu Gly Lys
85 90 95
Leu Tyr Ala Lys Lys Glu Cys Asn Glu Asp Cys Asn Phe Lys Glu Leu
100 105 110
Ile Leu Glu Asn His Tyr Asn Thr Tyr Ala Ser Ala Lys Trp Thr His
115
120
125 57 I
Asn Gly Gly Glu Met Phe Val Alá Leu Asn Gin Lys Gly Ile Pro Val f $
130 135 140 | i
<
i i
Arg Gly Lya Lys Thr Lys Lys Glu Gin Lys Thr Alá His Phe Leu Pro
145 150 155 160 j
Met Alá Ile Thr
7. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 25 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 7. számú szekvencia
CAATGACCTA GGAGTAACAA TCAAC 25
8. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 26 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 8. számú szekvencia
AAAACAAACA TAAATGCACA AGTCCA
• ·
9. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 26 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 9. számú szekvencia
ACAACGCGTG CAATGACATG ACTCCA 26
10. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 31 bázíspár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 10. számú szekvencia
ACAGGATCCT ATTAAGTTAT TGCCATAGGA A 31
11. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 27 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 11. számú szekvencia I i
ACACATATGT GCAATGACAT GACTCCA 27 <
i f
í
j.
12. számú szekvenciavázlat í (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 37 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 12. számú szekvencia
CTGCGTATCG ACAAACGCGG CAAAGTCAAG GGCACCC 37
13. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 44 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 13. számú szekvencia
AAGAGATGAA AAACAACTAC AATATTATGG AAATCCGTAC TGTT
14. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 37 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 14. számú szekvencia
GCTGTTGGTA TCGTTGCAAT CAAAGGTGTT GAATCTG 37
15. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 45 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 15. számú szekvencia
TCTTGGGTGC CCTTGACTTT GCCGCGTTTG TCGATACGCA GGTAC 45 í
I ι
i i
16. számú szekvenciaváziat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 45 bázíspár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS a
f (xi) A szekvencia leírása: 16. számú szekvencia
ACAGCAACAG TACGGATTTC CATAATATTG TAGTTGTTTT TCATC 45 (i) (Ü) (xi)
AATTCAGATT
17. számú szekvenciavázlat
A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 36 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen A molekula típusa: cDNS
A szekvencia leírása: 17. számú szekvenc
CAACACCTTT GATTGCAACG ATACCA ia
18. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 20 bázíspár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 18. számú szekvencia
AGTTTTGATC TAGAAGGAGG • · : **·: :
• · · *·· · • ···· « · · ·
19. számú szekvenciavázlat ?
i (i) A szekvencia jellemzői: ) (
(A) Hossz: 20 bázispár j (
(B) Típus: nukleinsav ι (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 19. számú szekvencia
TCAAAACTGG ATCCTATTAA 20
20. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 91 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS· (xi) A szekvencia leírása: 20. számú szekvencia
AGTTTTGATC TAGAAGGAGG AATAACATAT GTGCAACGAC ATGACTCCGG AACAGATGGC 60
TACCAACGTT AACTGCTCCA GCCCGGAACG T 91
21. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 90 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS • · ···· »·· · ···· (xi) A szekvencia leírása: 21. számú szekvencia ( i
CACACCCGTA GCTACGACTA CATGGAAGGT GGTGACATCC GTGTTCGTCG TCTGTTCTGC 60 f i
CGTACCCAGT GGTACCTGCG TATCGACAAA 90 ?
22. számú szekvenciavázlat (i) (ü) (xi)
CGTGGTAAAG
ACTGTTGCTG
A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 90 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen A molekula típusa: cDNS
A szekvencia leírása: 22. számú szekvencia
TTAAAGGTAC CCAGGAAATG AAAAACAACT ACAACATCAT GGAAATCCGT
TTGGTATCGT TGCAATCAAA
23. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(ii) (xi)
GGTGTTGAAT
GAATGCAACG (A) Hossz: 90 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen A molekula típusa: cDNS
A szekvencia leírása: 23. számú szekvencia
CTGAATTCTA CCTGGCAATG AACAAAGAAG GTAAACTGTA CGCAAAAAAA
AAGACTGCAA CTTCAAAGAA
24. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 90 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 24. számú szekvencia
CTGATCCGGG AAAACCACTA CAACACCTAC GCATCTGCTA AATGGACCCA CAACGGTGGT 60
GAAATGTTCG TTGCTCTGAA CCAGAAAGGT 90
25. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 88 bázíspár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 25. számú szekvencia
ATCCCGGTTC GTGGTAAAAA AACCAAAAAA GAACAGAAAA CCGCTCACTT CCTGCCGATG 60
GCAATCACTT AATAGGATCC AGTTTTGA 99
26. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen ···· « •··· ···* számú szekvencia (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 26.
TACGGGTGTG ACGTTCCGGG
27. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 27. számú szekvencia
CTTTACCACG TTTGTCGATA 20
28. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(Ά) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 28. számú szekvencia
ATTCAACACC TTTGATTC-CA
0 * » · · · • 66
29. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 29. számú szekvencia
CCAGGATCAG TTCTTTGAAG 20
30. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) Ά szekvencia leírása: 30. számú szekvencia
GAACCGGGAT ACCTTTCTGG 20
31. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 495 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS ·· · ·
(xi) A szekvencia leírása: 31. számú szekvencia
ATGTGCAATG ATATGACTCC TGAACAAATG GCTACCAATG TCAACTGTTC CTCTCCGGAG 60
CGCCACACCC GGAGTTACGA TTACATGGAA GGTGGGGATA TTCGCGTACG TCGTCTGTTC 120
TGCCGTACCC AGTGGTACCT GCGTATCGAC AAACGCGGCA AAGTCAAGGG CACCCAAGAG 180
ATGAAAAACA ACTACAATAT TATGGAAATC CGTACTGTTG CTGTTGGTAT CGTTGCAATC 240
AAAGGTGTTG AATCTGAATT CTATCTTGCA ATGAACAAGG AAGGAAAACT CTATGCAAAG 300
AAAGAATGCA ATGAAGATTG TAACTTCAAA GAACTAATTC TGGAAAACCA TTACAACACA 360
TATGCATCTG CTAAATGGAC CCACAACGGT GGTGAAATGT TCGTTGCTCT GAACCAGAAA 420
GGTATCCCTG TTCAAGGTAA GAAAACCAAG AAAGAACAGA AAACCGCTCA CTTCCTGCCG 480
ATGGCAATCA CTTAA 495
32. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 164 aminosav
(B) Típus : aminosav
(C) Száltípus: ismeretlen
(D) Topológia: ismeretlen
(ii) A molekula típusa: fehérje (xi) A szekvencia leírása: 32. számú szekvencia
Met Cys Asn Asp Met Thr Pro Glu Gin Met Alá Thr Asn Val Asn Cys
10 15
Ser Ser Pro Glu Arg His Thr Arg Ser Tyr Asp Tyr Met Glu Gly Gly
25 30
Asp Ile Arg Val Arg Arg Leu Phe Cys Arg Thr Gin Trp Tyr Leu Arg
40 45
Ile Asp Lyz Arg Gly Lys Val..Lys Gly Thr Gin Glu Met Lys Asn Asn
55 60
Tyr Aan Ile Met Glu Ile Arg Thr Val Alá Val Gly Ile Val Alá Ile
70 75 80
Lys Gly Val Glu Ser Glu Phe Tyr Leu Alá Met Asn Lys Glu Gly Lys
90 95
Leu Tyr Alá Lys Lys Glu Cys Asn Glu Asp Cys Asn Phe Lys Glu Leu
100 105 110
Ile Leu Glu Asn His Tyr Asn Thr Tyr Alá Ser Alá Lys Trp Thr His
115 120 125
Asn Gly Gly Glu Met Phe Val Alá Leu Asn Gin Lys Gly Ile Pro Val
130 135 140
Gin Gly Lys Lys Thr Lys Lys Glu Gin Lys Thr Alá His Phe Leu Pro
145 150 155 160
Met Alá Ile Thr
33. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 495 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 33. számú szekvencia
ATGTCTAATG ATATGACTCC GGAACAGATG GCTACCAACG TTAACTCCTC CTCCCCC-GAA 60
CGTCACACGC GTTCCTACGA CTACATGGAA GGTGGTGACA TCCGCGTACG TCGTCTGTTC 120
TGCCGTACCC AGTC-GTACCT GCGTATCGAC AAACGCGGCA AAGTCAAGGG CACCCAAGAG 180 • 3
ATGAAAAACA ACTACAATAT TATGGAAATC CGTACTGTTG CTGTTGGTAT
AAAGGTGTTG AATCTGAATT CTATCTTGCA ATGAACAAGG AAGGAAAACT
AAAGAATGCA ATGAAGATTG TAACTTCAAA GAACTAATTC TGGAAAACCA
TATGCATCTG CTAAATGGAC CCACAACGGT GGTGAAATGT TCGTTGCTCT
GGTATCCCTG TTGAAGGTAA GAAAACCAAG AAAGAACAGA AAACCGCTGA
ATGGCAATCA CTTAA
CGTTGCAATC 2 40
CTATGCAAAG 3 00
TTACAACACA 3 60
GAACCAGAAA 4 20
C1 TCCTGCcij 4 80
4 95
34. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 164 aminosav
(B) Típus: aminosav
(C) S záltípus: ismeretlen
(D) Topológia: ismeretlen
(ii) A molekula típusa: fehérje (xi) A szekvencia leírása: 34. számú szekvencia
Met Ser Asn Asp Met Thr Pro Glu Gin Met Alá Thr Asn Val Asn Ser
10 15
Ser Ser Pro Glu Arg His Thr Arg Ser Tyr Asp Tyr Met Glu Gly Gly
25 30
Asp Ile Arg Val Arg Arg Leu Phe Cys Arg Thr Gin Trp Tyr Leu Arg
40 45
Ile Asp Lys Arg Gly Lys Val Lys Gly Thr Gin Glu Met Lys Asn Asn
55 60
Tyr Asn Ile Met Glu Ile Arg Thr Val Alá Val Gly Ile Val Alá Ile
70 75 80
....... · • · · · · • · · *. i , ····· ·· ···· · ·«
Lys Gly Val Glu Ser Glu Phe Tyr Leu Ala Met Asn Lys Glu Gly Lys
90 95
Leu Tyr Ala Lys Lys Glu Cys Asn Glu Asp Cys Asn Phe Lys Glu Leu
100 105 110
Ile Leu Glu Asn His Tyr Asn Thr Tyr Ala Ser Ala Lys Trp Thr His
115 120 125
Asn Gly Gly Glu Met Phe Val Ala Leu Asn Gin Lys Gly Ile Pro Val
130 135 140
Glu Gly Lys Lys Thr Lys Lys Glu Gin Lys Thr Ala His Phe Leu Pro
145 150 155 160
Met Ala Ile The
35. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 495 bázispár
(B) Típus: nukleinsav
(C) Száltípus: ismeretlen
(D) Topológia: ismeretlen
(ü) (xi)
ATGTCTAATG
CGTCACACGC
TGCCGTACCC
ATGAAAAACA
AAAGGTGTTG
A molekula
A szekvencia
ATATGACTCC
GTTCCTACGA
AGTGGTACCT
ACTACAATAT
AATCTGAATT típusa:
cDNS leírása: 35.
GGAACAGATG
CTACATGGAA
GCGTATCGAC
TATGGAAATC
CTATCTTGCA számú szekvencia
GCTACCAACG
GGTGGTGACA
AAACGCGGCA
CGTACTGTTG
ATGAACAAGG
TTAACTCCTC
TCCGCGTACG
AAGTCAAGGG
CTGTTGGTAT
AAGGAAAACT
CT.CCCCGGAA
TCGTCTGTTC
CACCCAAGAG
CGTTGCAATC
CTATGCAAAG
AAAGAATGCA ATGAAGATTG TAACTTCAAA GAACTAATTC TGGAAAACCA TTACAACACA 360
·· · ·
TATGCATCTG CTAAATGGAC CCACAACGGT GGTGAAATGT TCGTTGCTCT GAACCAGAAA 420
GGTATCCCTG TTCAAGGTAA GAAAACCAAG AAAGAACAGA AAACCGCTCA CTTCCTGCCG 480
ATGGCAATCA CTTAA 495
36. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 164 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltipus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (íi) A molekula típusa: fehérje (xi) A szekvencia leírása: 36. számú szekvencia
Met Ser Asn Asp Met Thr Pro Glu Gin Met Alá Thr Asn Val Asn Ser
5 10 15
Ser Ser Pro Glu Arg His Thr Arg Ser Tyr Asp Tyr Met Glu Gly Gly
25 30
Asp Ile Arg Val Arg Arg Leu Phe Cys Arg Thr Gin Trp Tyr Leu Arg
40 45
Ile Asp Lys Arg Gly Lys Val Lys Gly Thr Gin Glu Met Lys Asn Asn
55 60
Tyr Asn Ile Met Glu Ile Arg Thr Val Alá Val Gly Ile Val Alá Ile
70 75 80
Lys Gly Val Glu Ser Glu Phe Tyr Leu Alá Met Asn Lys Glu Gly Lys 85 90 95
• · ·· • · · · • ·*·· ····
Leu Tyr Ala Lys Lys Glu Cys Asn Glu Asp Cys Asn Phe Lys Glu Leu
100 105 110
Ile Leu Glu Asn His Tyr Asn Thr Tyr Ala Ser Ala Lys Trp Thr His
115 120 125
Asn Gly Gly Glu Met Phe Val Ala Leu Asn Gin Lys Gly Ile Pro Val
130 135 140
Gin Gly Lys Lys Thr Lys Lys Glu Gin Lys Thr Ala His Phe Leu Pro
145 150 155 160
Met Ala Ile Thr
37. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 426 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 37. számú szekvencia
ATGTCCTACG ACTACATGGA AGGTGGTGAC ATCCGCGTAC GTCGTCTGTT CTGCCGTACC 60
CAGTGGTACC TGCGTATCGA CAAACC-CGGC AAAGTCAAGG GCACCCAAGA GATGAAAAAC 120
AACTACAATA TTATGGAAAT CCGTACTGTT GCTGTTGGTA TCGTTGCAAT CAAAGGTGTT 180
GAATCTGAAT TCTATCTTGC AATGAACAAG GAAGGAAAAC TCTATGCAAA GAAAGAATGC 240
AATGAAGATT GTAACTTCAA AGAACTAATT CTGGAAAACC ATTACAACAC ATATGGATCT 300
GCTAAATGGA CCCACAACGG TGGTGAAATG TTCGTTGCTC TGAACCAGAA AGGTATCCCT 360
GTTCAAGGTA AGAAAACCAA GAAAGAACAG AAAACCGCTC ACTTCCTGCC GATGGCAATC 420
ACTTAA ··· · · • ·
38. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 141 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: fehérje (xi) A szekvencia leírása: 38. számú szekvencia
Met 1 Ser Tyr Asp Tyr 5 Met Glu Gly Gly Asp 10 Ile Arg Val Arg Arg 15 Leu
Phe Cys Arg Thr Gin Trp Tyr Leu Arg Ile Asp Lys Arg Gly Lys Val
20 25 30
Lys Gly Thr Gin Glu Me t Lys Asn Asn Tyr Asn Ile Met Glu T 1 Q Arg
35 40 45
Thr Val Alá Val Gly Ile Val Alá Ile Lys Gly Val Glu Ser Glu Phe
50 55- 60
Tyr Leu Alá Met Asn Lys Glu Gly Lys Leu Tyr Alá Lys Lys Glu Cys
65 70 75 80
Asn Glu Asp Cys Asn Phe Lys Glu Leu Ile Leu Glu Asn His Tyr Asn
85 90 95
Thr Tyr Alá Ser Alá Lys Trp Thr His Asn Gly Gly Glu Met Phe Val
100 105 110 ·· · · « • ·
Als Leu Asn 115 Gin Lys Gly Ile Pro 120 Val Gin Gly Lys Lys 125
Glu Gin Lys Thr Alá His Phe Leu Pro Met Alá Ile Thr
130 135 140
39. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 24 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 39. számú szekvencia
GAGCTCACTA GTGTCGACCT GCAG 24
40. számú szekvenciavázlat (í) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 24 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 40. számú szekvencia
CTGCAGGTCG ACACTAGTGA GCTC
41. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 426 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 41. számú szekvencia
ATGTCCTACG ACTACATGGA AGGTGGTGAC ATCCC-CGTAC GTCGTCTGTT CTGCCGTACC 60
CAGTGGTACC TGCGTATCGA CAAACGCGGC AAAGTCAAGG GCACCCAAGA GATGAAAAAC 120
AACTACAATA TTATGGAAAT CCGTACTGTT GCTGTTGGTA TCGTTGCAAT CAAAGGTGTT 180
GAATCTGAAT TCTACCTGGC AATGAACAAA GAAGGTAAAC TGTACGCAAA AAAAGAATGC 240
AACGAAGACT GCAACTTCAxA AGAACTGATC CTGGAAAACC ACTACAACAC CTACGCATCT 300
GCTAAATGGA CCCACAACGG TGGTGAAATG TTCGTTGCTC TGGAACAGAA AGGTATCCCT 360
GTTCGTGGTA AGAAAACCAA GAAAGAACAG AAAACCGCTC AGTTCüfGCC GATGGCAATC 42 0
ACTTAA ' 426
42. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 141 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: fehérje (xi) A szekvencia leírása: 42. számú szekvencia
Met Ser Tyr Asp Tyr Met Glu Gly Gly Asp Ile Arg Val Arg Arg Leu
5 10 15
Phe Cys Arg Thr Gin Trp Tyr Leu Arg Ile Asp Lys Arg Gly Lys Val
Lys Gly Thr Gin Glu Met Lys Asn Asn Tyr Asn Ile Met Glu He Arg
40 45
Thr Val Alá Val Gly Ile Val Alá Ile Lys Gly Val Glu Ser Glu Phe
55 60
Tyr Leu Alá Met Asn Lys Giu Gly Lys Leu Tyr Alá Lys Lys Glu Cys
70 75 80
Asn Glu Asp Cys Asn Phe Lys Glu Leu Ile Leu Glu Asn His Tyr Asn
90 95
Thr Tyr Alá Ser Alá Lys Trp Thr His Asn Gly Gly Glu Met Phe Val
100 105 110
Alá Leu Giu Gin Lys Gly Ile Pro Val Arg Gly Lys Lys Thr Lys Lys
115 120 125
Glu Gin Lys Thr Alá His Phe Leu Pro Met Alá Ile Thr
130 135 140
43. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 426 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 43. számú szekvencia
ATGTCCTACG ACTACATGGA AGGTGGTGAC ATCCGCGTAC GTCGTCTGTT CTGCCGTACC 60
CAGTGGTACC TGCGTATCGA CAAACGCGGC AAAGTCAAGG GCACCCAAGA GATGAAAAAC 120
AACTACAATA TTATGGAAAT CCGTACTGTT GCTGTTGGTA TCGTTGCAAT CAAAGGTGTT 180
GAATCTGAAT TCTACCTGGC AATGAACAAA GAAGGTAAAC TGTACGCAAA AAAAGAATGC 240
AACGAAGACT GCAACTTCAA AGAACTGATC CTGGAAAACC ACTACAACAC CTACGCATCT 300
GCTAAATGGA CCCACAACGG TGGTGAAATG TTCGTTGCTC TGAACCAGGA AGGTATCCCT 3 60
GTTCGTGGTA AGAAAACCAA GAAAGAACAG AAAACCGCTC ACTTCCTGCC GATGGCAATC 420
ACTTAA 426
44. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 141 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: fehérj .(xi) A szekvencia leírása: 44. számú szekvencia
Met Ser Tyr Asp Tyr Met Glu Gly Gly Asp Ile Arg Val Arg Arg Leu
10 15
Phe Cys Arg Thr Gin Trp Tyr Leu Arg Ile Asp Lys Arg Gly Lys Val
25 30
Lys Gly Thr Gin Glu Met Lys Asn Asn Tyr Asn Ile Met Glu Ile Arg
40 45 Thr Val Alá Val Gly Ile Val Alá Ile Lys Gly Val Glu Ser Glu Phe
Tyr Leu Alá Met Asn Lys Glu Gly Lys Leu Tyr Alá Lys Lys Glu Cys
70 75 80
Asn Glu Asp Cys Asn Phe Lys Glu Leu Ile Leu Glu Asn His Tyr Asn
90 95
Thr Tyr Alá Ser Alá Lys Trp Thr His Asn Gly Gly Glu Met Phe Val
100 105 110
Alá Leu Asn Gin Glu Gly Ile Pro Val Arg Gly Lys Lys Thr Lys Lys
115 120 125
Glu Gin Lys Thr Alá His Phe Leu Pro Met Alá Ile Thr
130 135 140
45. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 426 bázispár
(B) Típus: nukleinsav
(C) Száltípus: ismeretlen
(D) Topológia: ismeretlen
(ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 45. számú szekvencia
ATGTCCTACG ACTACATGGA AGGTGGTGAC ATCCGCGTAC GTCGTCTGTT CTGCCGTACC 60
CAGTGGTACC TGCGTATCGA CAAACGCGGC AAAGTCAAGG GCACCCAAGA GATGAAAAAC 120
AACTACAATA TTATGGAAAT CCGTACTGTT GCTGTTGGTA TCGTTGCAAT CAAAGGTGTT 180
GAATCTGAAT TCTACCTGGC AATGAACAAA GAAGGTAAAC TGTACGCAAA AAAAGAATGC 240
AACGAAGACT GCAACTTCAA AGAACTGATC CTGGAAAACC ACTACAACAC CTACGCATCT 300
GCTAAATGGA CCCACAACGG TGGTGAAATG TTCGTTGCTC TGAACCAGCA AGGTATCCCT 360
GTTCGTGGTA AGAAAACCAA GAAAGAACAG AAAACCGCTC ACTTCCTGCC GATGGCAATC 420
ACTTAA
426 tt»·
46. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 141 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: fehérje (xi) A szekvencia leírása: 46. számú szekvencia
Met Ser Tyr Asp Tyr Met Glu Gly
5
Phe Cys Arg Thr Gin Trp Tyr Leu
Lys Gly Thr Gin Glu Met Lys Asn
5 4 0
Thr Val Alá Val Gly Ile Val Alá
55
Tyr Leu Alá Met Asn Lys Glu Gly
70
Asn Glu Asp Cys Asn Phe Lys Glu
Thr Tyr Alá Ser Alá Lys Trp Thr
Gly Asp Ile Arg Val Arg Arg Leu
15
Arg Ile Asp Lys Arg Gly Lys Val
30
Asn Tyr Asn Ile Met Glu He Arg
Ile Lys Gly Val Glu Ser Glu Phe
Lys Leu Tyr Alá Lys Lys Glu Cys
80
Leu Ile Leu Glu Asn His Tyr Asn
95
His Asn Gly Gly Glu Met Phe Val
100
105
110 • ·»· »··· ··«·
Alá Leu Asn 115 Gin Gin Gly He Pro 120 Val Arg Gly Lys Lys Thr Lys Lys 125
Glu Gin Lys Thr Alá His Phe Leu Pro Met Alá Ile Thr
130 135 140
47. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 426 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 47. számú szekvencia
ATGTCCTACG ACTACATGGA AGGTGGTGAC ATCCGCGTAC GTCGTCTGTT CTGCCGTACC 60
CAGTGGTACC TGGGTATCGA CAAALGCoGC AAAGTCAAGG GCACCCAAGA GATGAAAAAC 120
AACTACAATA TTATGGAAAT CCGTACTGTT GCTGTTGGTA TCGTTGCAAT CAAAGGTGTT 180
GAATCTGAAT TCTACCTGGC AATGAACAAA GAAGGTAAAC TGTACGCAAA AAAAGAATGC 240
AACGAAGACT GCAACTTCAA AGAACTGATC CTGGAAAACC ACTACAACAC CTACGCATCT 300
GCTAAATGGA CCCACAACC-G TGGTGAAATG TTCGTTGCTC TGAACCAGAA AGGTATCCCT 360
GTTGCTGGTA AGAAAACCAA GAAAGAACAG AAAACCGCTC ACTTCCTGCC GATGGCAATC 420
ACTTAA 426
48. számú szekvencíaváziat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 141 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: fehérje ··· · · •' · · · · * • ·· »···· » ···· · · ···· ···· ···· · ·· ’ 81 (xi) A szekvencia leírása: 48. számú szekvencia
Met Ser Tyr Asp Tyr Met Glu Gly Gly Asp Ile Arg Val Arg Arg Leu
10 15
Phe Cys Arg Thr Gin Trp Tyr Leu Arg Ile Asp Lys Arg Gly Lys Val
25 30
Lys Gly Thr Gin Glu Met Lys Asn Asn Tyr Asn Ile Met Glu Ile Arg
40 45
Thr Val Alá Val Gly Ile Val Alá ile Lys Gly Val Glu Ser Glu Phe
55 60
Tyr Leu Alá Met Asn Lys Glu Gly Lys Leu Tyr Alá Lys Lys Glu Cys
70 75 80
Asn Glu Asp Cys Asn Phe Lys Glu Leu Ile Leu Glu Asn His Tyr Asn
90 95
Thr Tyr Alá Ser Alá Lys Trp Thr His Asn Gly Gly Glu Met Phe Val
100 105 110
Alá Leu Asn Gin Lys Gly Ile Pro Val Alá Gly Lys Lys Thr Lys Lys
115 120 125
Glu Gin Lys Thr Alá His Phe Leu Pro Met Alá Ile Thr
130
135
140
49. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 426 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 49. számú szekvencia
ATGTCCTACG ACTACATGC-A AGGTGGTGAC ATCCGCGTAC GTCGTCTGTT CTGCCGTACC 60
CAGTGGTACC TGCGTATCGA CAAACGCGGC AAAGTCAAGG GCACCCAAGA GATGAAAAAc 120
AACTACAATA TTATGGAAAT CCGTACTGTT GCTGTTGGTA TCGTTGCAAT CAAAGGTGTT 18 0
GAATCTGAAT TCTACCTGGC AATGAACAAA GAAGGTAAAC TGTACGCAAA AAAAGAATGC 2 4 0
AACGAAGACT GCAACTTCAA AGAACTGATC CTGGAAAACC ACTACAACAC CTACGCATCT 30 0
GCTAAATGGA CCCACAACGG TGGTGAAATG TTCGTTGCTC TGAACCAGAA AGGTATCCCT 3 60
GTTCTGGGTA AGAAAACCAA GAAAGAACAG AAAACCGCTC ACTTCCTGCC GATGGCAATC 4 2 0
ACTTAA 426
50. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 141 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: fehérje (xi) A szekvencia leírása: 50. számú szekvencia
Met Ser Tyr Asp Tyr Met Glu Gly Gly Asp Ile Arg Val Arg Arg Leu
10 15
Phe Cys Arg Thr
Gin Trp Tyr
Leu Arg
Ile Asp Lys Arg Gly Lys Val ·« · ·· · · ····
Lys Gly Thr Gin Glu Met Lys Asn Asn Tyr Asn Ile Met Glu Ile Arg
40 45
Thr Val Alá Val Gly Ile Val Alá Ile Lys Gly Val Glu Ser Glu Phe
55 60
Tyr Leu Alá Met Asn Lys Glu Gly Lys Leu Tyr Alá Lys Lys Glu Cys
70 75 80
Asn Glu Asp Cys Asn Phe Lys Glu Leu Ile Leu Glu Asn His Tyr Asn
90 95
Thr Tyr Alá Ser Alá Lys Trp Thr His Asn Gly Gly Glu Met Phe Val 100 105 110
Alá Leu Asn Gin Lys Gly Ile Pro Val Leu Gly Lys Lys Thr Lys Lys
115 120 125
Glu Gin Lys Thr Alá His Phe Leu Pro Met Alá Ile Thr
130 135 140
51. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 425 bázispár
(B) Típus: nukleinsav
(C) Száltípus: ismeretlen
(D) Topológia: ismeretlen
(ii) A molekula típusa: cDNS ·»· ·
Λ. · * k · · · · · !· · . »··· ·*·· (xi) A szekvencia leírása: 51. számú szekvencia
ATGTCCTACG ACTACATGGA AGGTGGTGAC ATCCGCGTAC C-TCGTCTGTT CTGCCGTACC 60
CAGTGGTACC TGCGTATCGA CAAACGCGGC AAAGTCAAGG C-CACCCAAGA GATGAAAAAC 120
AACTACAATA TTATGGAAAT CCGTACTGTT GCTGTTGGTA TCGTTGCAAT CAAAGGTGTT 180
GAATCTGAAT TCTACCTGGC AATGAACAAA GAAGGTAAAC TGTACGCAAA AAAAGAATGC 240
AACGAAGACT GCAACTTCAA AGAACTGATC CTGGAAAACC ACTACAACAC CTACGCATCT 300
GCTAAATGGA CCCACAACGG TGGTGAAATG TTCGTTGCTC TGAACCAGAA AGGTATTCCT 360
GTTCGTGGTA AGGAAACCAA GAAAGAACAG AAAACCGCTC ACTTCCTGCC GATGGCAATC 420
ACTTAA 426
52. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 141 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 52. számú szekvencia
Met Ser Tyr Asp Tyr Met Glu Gly Gly Asp Ile Arg Val Arg Arg Leu
Phe Cys Arg Thr Glr. Trp Tyr Leu Arg Ile Asp Lys Arg Gly Lys Val
25 30
Lys Gly Thr Gin Glu Met Lys Asn Asn Tyr Asn Ile Met Glu Ile Arg
40 45
Thr Val Alá Val Gly Ile Val Alá Ile Lys Gly Val Glu Ser Glu Phe
Tyr Leu Alá Met Asn Lys Glu Gly Lys Leu Tyr Alá Lys Lys Glu Cys
65 70 7 5 80
Asn Glu Asp Cys Asn Phe Lys Glu Leu Ile Leu Glu Asn His Tyr Asn
85 90 95
Thr Tyr Alá Ser Alá Lys Trp Thr His Asn Gly Gly Glu Met Phe Val
100 105 110
Alá Leu Asn Gin Lys Gly I le Pro Val Arg Gly Lys Glu Thr Lys Lys
115 120 125
Glu Gin Lys Thr Alá His Phe Leu Pro Met Alá Ile Thr
130 1 3 5 140
LT, 3. s z ámú s zekvenciavázlat
(i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 426 bázispár
(B) Típus : nukleinsav
(C) Száltípus: ismeretlen
(D) Topológia: ismeretlen
(ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 53. számú szekvencia
ATGTCCTACG ACTACATGGA AGGTGGTGAC ATCCGCGTAC GTCGTCTGTT CTGCCGTACC 60
CAGTGGTACC TGCGTATCGA CAAACGCGGC AAAGTCAAGG GCACCCAAGA GATGAAAAAC 120
AACTACAATA TTATGGAAAT CCGTACTGTT GCTGTTGGTA TCGTTGCAAT CAAAGGTGTT 180
GAATCTGAAT TCTACCTGGC AATGAACAAA GAAGGTAAAC TGTACGCAAA AAAAGAATGC 240
AACGAAGACT GCAACTTCAA AGAACTGATC CTGGAAAACC ACTACAACAC CTACGCATCT 300
GCTAAATGGA CCCACAACGG TGGTGAAATG TTCGTTGCTC TGAACCAGAA AGGTATCCCT 360
GTTCGTGGTA AGCAAACCAA GAAAGAACAG AAAACCGCTC ACTTCCTGCC GATGGCAATC 420
ACTTAA
426 ···» » · • · * ♦ · * · «··« ···· ··<« · ** * * ‘ 86
54. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 141 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: fehérje (xi) A szekvencia leírása: 54. számú szekvencia
Met Ser Tyr Asp Tyr Met Glu Gly Gly Asp Ile Arg Val Arg Arg Leu
5 10 15
Phe Cys Arg Thr Gin Trp Tyr Leu Arg Ile Asp Lys Arg Gly Lys Val
25 30
Lys Gly Thr Gin Glu Met Lys Asn Asn Tyr Asn Ile Met Glu Ile Arg
40 45
Thr Val Alá Val Gly Ile Val Alá Ile Lys Gly Val Glu Ser Glu Phe
55 60
Tyr Leu Alá Met Asn Lys Glu Gly Lys Leu Tyr Alá Lys Lys Glu Cys
70 75 80
Asn Glu Asp Cys Asn Phe Lys Glu Leu Ile Leu Glu Asn His Tyr Asn
90 95
Thr Tyr Alá Ser Alá Lys Trp Thr His Asn Gly Gly Glu Met Phe Val
100 105 110
Alá Leu Asn Gin Lys Gly Ile Pro Val Arg Gly Lys Gin Thr Lys Lys
115
120
125 . · ···« ««··
Glu Gin Lys Thr Alá His Phe Leu Pro Met Alá Ile Thr
130 135 140
55. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(Ά) Hossz: 426 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 55. számú sze :kvencia
ATGTCCTACG ACTACATGGA AGGTGGTGAC ATCCGCGTAC GTCGTCTGTT CTGCCGTACC 60
CAGTGGTACC TGCGTATCGA CAAACGCGGC AAAGTCAAGG GCACCCAAGA GATGAAAAAC 12 0
AACTACAATA TTATGGAAAT CCGTACTGTT GCTGTTGGTA TCGTTGCAAT CAAAGGTGTT 180
GAATCTGAAT TCTACCTGGC AATGAACAAA GAAGGTAAAC TGTACGCAAA AAAAGAATGC 240
AACGAAGACT GCAACTTCAA AGAACTGATC CTGGAAAACC ACTACAACAC CTACGCATCT 30 0
GCTAAATGGA CCCACAACGG TGGTGAAATG TTCGTTGCTC TGAACCAGAA AGGTATCCCT 360
GTTCGTGGTA AGAAAACCAA GAAAGAACAG GAAACCGCTC ACTTCCTGCC GATGGCAATC 420
ACTTAA 426
56. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 141 aminosav
(B) Típus: aminosav
(C) Száltípus: ismeretlen
(D) Topológia: ismeretlen
(ii) A molekula típusa: fehérje (xi) A szekvencia leírása: 55. számú szekvencia
Met 1 Phe Ser Cys Tyr Arg Asp Thr 20 Tyr 5 Gin Met Trp Glu Tyr Gly Leu Gly Arg 25 Asp 10 Ile Ile Asp Arg Lys Val Arg Arg Gly 30 Arg 15 Lys Leu Val
Lys Gly Thr Gin Glu Me t Lys Asn Asn Tyr Asn Ile Met Glu Ile Arg
35 40 45
Thr Val Alá Val Gly Ile Val Alá Ile Lys Gly Val Glu Ser Glu Phe
50 55 60
Tyr Leu Alá Me t Asn Lys G1 u G1 y Lys Leu Tyr Alá Lys Lys Glu Cys
6 5 70 75 8 0
Asn Glu Asp C y s Asn Phe Lj y s G1 u Leu I le L 3 ii Glu Asn His Tyr Asn
8 5 90 95
Thr Tyr Alá Ser Alá Lys Trp Thr His Asn Gly Gly Glu Met Phe Val
100 105 110
Alá Leu Asn Gin Lys Gly Ile Pro Val Arg Gly Lys Lys Thr Lys Lys
115 120 125
Glu Gin Glu Thr Alá His Phe Leu Pro Met Alá Ile Thr
130
135
140
57. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 426 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 57. számú szekvencia
ATGTCCTACG ACTACATGGA AGGTGGTGAC ATCCGCGTAC GTCGTCTGTT CTGCCGTACC 60
CAGTGGTACC TGCGTATCGA CAAACGCGGC AAAGTCAAGG GCACCCAAGA GATGAAAAAC 12 0
AACTACAATA TTATGGAAAT CCGTACTGTT GCTGTTGGTA TCGTTGCAAT CAAAGGTGTT 180
GAATCTGAAT TCTACCTGGC AATGAACAAA GAAGGTAAAC TGTACGCAAA AAAAGAATGC 240
AACGAAGACT GCAACTTCAA AGAACTGATC CTGGAAAACC ACTACAACAC CTACGCATCT 300
GCTAAATGGA CCCACAACGG TGGTGAAATG TTCGTTGCTC TGAACCAGAA AGGTATCCCT 360
G í i. CG i G G i A AGAAAACCAA GAAAGAACAG CAAACCGCTC ACTTCCTGCC GATGGCAATC 420
ACTTAA 426
58. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 141 aminosav (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: ismeretlen (D) Topológia: ismeretlen (ii) A molekula típusa: fehérje (xi) A szekvencia leírása: 58. számú szekvencia
Met Ser Tyr Asp Tyr Met Glu Gly Gly Asp Ile Arg Val Arg Arg Leu
5 10 15
Phe Cys Arg Thr Gin Trp Tyr Leu Arg Ile Asp Lys Arg Gly Lys Val
Lys Gly Thr 35 Gin Glu Met Lys Asn 40 Asn Tyr As n Ile Met 45 Glu Ile Arg
Thr Val Alá Val Gly Ile Val Alá Ile Lys Gly Val Glu Ser Glu Phe
50 55 60
Tyr Leu Alá Met Asn Lys Glu Gly Lys Leu Tyr Alá Lys Lys Glu Cys
65 70 75 8 0
Asn Glu Asp Cys Asn Phe Lys Glu Leu Ile Leu Glu Asn His Tyr Asn
85 90 95
Thr Tyr Alá Ser Alá Lys Trp Thr His Asn Gly Gly Glu Met Phe Val
1 0 0 105 110
Alá Leu A s n Gin Lys Gly Γ ] g Pro Val Arg G -1 y Lys Lys Thr Lys Lys
115 120 125
G1 u Gin Gin Thr Alá His Phe Leu Pro Met Alá Ile Thr
130 135 140
59. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 426 bázispár
(B) Típus: nukleinsav
(C) S záltípus: ismeretlen
(D) Topológia: ismeretlen
(ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 59. számú szekvencia
ATGTCCTACG ACTACATGGA AGGTGGTGAC ATCCGCGTAC GTCGTCTGTT CTGCCC-TACC 60
CAGTGGTACC TGCGTATCGA CAAACGCGGC AAAGTCAAGG GCACCCAAGA GATGAAAAAC 120
AACTACAATA TTATGGAAAT CCGTACTGTT GCTGTTGGTA TCGTTGCAAT CAAAGGTGTT 180
GAATCTGAAT TCTACCTGGC AATGAACAAA GAAGGTAAAC TGTACGCAAA AAAAGAATGC 240
AACGAAGACT GCAACTTCAA AGAACTGATC CTGGAAAACC ACTACAACAC CTACGCATCT 30C
GCTAAATGGA CCCACAACGG TGGTGAAATG TTCGTTGCTC TGAACCAGAA AGGTATCCCT 3 60
GTTCGTGGTA AGAAAACCAA GAAAGAAGAG GAAACCGCTC ACTTCCTGCC GATGGCAATC 42 0
ACTTAA 4 2 6
60. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 141 aminosav
(B) Típus: aminosav
(C) S záltípus: ismeretlen
(D) Topológia: ismeretlen
(ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 60. számú szekvencia
Met Ser Tyr Asp Tyr Met Glu Gly Gly Asp Ile Arg Val Arg Arg Leu
10 15
Phe Cys Arg Thr Gin Trp Tyr Leu Arg Ile Asp Lys Arg Gly Lys Val
25 30
Lys Gly Thr Gin Glu Met Lys Asn Asn Tyr Asn He Met Glu ile Arg
40 45
Thr Val Alá Val Gly Ile Val Alá Ile Lys Gly Val Glu Ser Glu Phe • « ···· ···· * ···· ···· ’ 92
Tyr Leu Ala Met Asn Lys Glu Gly Lys Leu Tyr Ala Lys Lys Glu Cys
70 75 80
Asn Glu Asp Cys Asn Phe Lys Glu Leu Ile Leu Glu Asn His Tyr Asn
90 95
Thr Tyr Ala Ser Ala Lys Trp Thr His Asn Gly Gly Glu Met Phe Val
100 105 110
Ala Leu Asn Gin Lys Gly Ile Pro Val Arg Gly Lys Lys Thr Lys Lys
115 120 125
Glu Glu Glu Thr Ala His Phe Leu Pro Met Ala Ile Thr

Claims (16)

1. A természetes KGF-nek egy polipeptid analógja, amelyben töltésváltozást hozunk létre, azáltal, hogy a 2. ábrán látható 41-154-es aminosavai közül (a 2. számú szekvencia
72-185-ös aminosavai) egyet vagy többet kicserélünk
2. Az 1. igénypont szerinti polipeptid analóg, amelyben a kivágott vagy helyettesített aminosavakat a következő csoportból választjuk: Arg , Gin , Lys , Lys , Lys , Asn ,
Gin , Lys , Arg , Lys , Gin , Lys es Thr
3. Az 1 . igénypont szerinti polipeptid analóg, amit a következő csoportból választhatunk: R(144)Q, C(1,15)S/R(144)Ε, C(í,15)S/R(144)Q és AN23/R(144)Q.
4. Gyógyászati készítmény, amely terápiásán hatásos mennyiséget tartalmaz az 1. igénypont szerinti polipeptid analógból, valamint tartalmaz egy gyógyászatilag elfogadható hordozót.
5. Gyógyászati készítmény, amely terápiásán hatásos mennyiséget tartalmaz az 1. igénypont szerinti liofilezett polipeptid analógból.
6. A 4. igénypont szerinti gyógyászati készítmény, amely tartalmaz még egy gyógyászatilag elfogadható hordozót is.
7. Egy nukleinsav molekula, ami lehet DNS és RNS is, amely nukleinsav molekula a természetes KGF-nek egy olyan polipeptíd analógját kódolja, amelyben töltésváltozás történik, azáltal, hogy a 2. ábrán látható 41-154-es aminosav csoportok ·*· (72-185-ös aminosavak a 2. számú szekvencián) közül egyet vagy többet kivágunk vagy helyettesítünk.
8. A 7. igénypont szerinti nukleinsav molekula, amelynél a kivágott vagy helyettesített aminosavat a következő csoportból választjuk: Arg , Gin , Lys , Lys , Lys , Asn , Gin ,
Lys139, Arg144, Lys147, Glnlji, Lys153 és Thr154.
9. A 7. igénypont szerinti nukleinsav molekula, amelynél a polipeptid analógot az alábbi csoportból választjuk: R(144)Q,
C(1,15)S/R(144)Q, C(1,15)S/R(144)E és ΔΝ23/R(144)Q.
10. Egy biológiailag működőképes plazmid vagy virális vektor, amely a 7. igénypont szerinti nukleinsav molekulát tartalmaz .
11. Egy prokarióta vagy eukarióta gazdasejt, amely stabilan transzformálva vagy transzfektálva van egy, a 8. igénypont szerinti, biológiailag működőképes vektorral.
12. A 11. igénypont szerinti prokarióta gazdasejt, ami
Escherichía coli.
13. A 11. igénypont szerinti eukarióta gazdasejt, ami egy emlős sejt.
14. A 12. igénypont szerinti eukarióta gazdasejt, ami egy aranyhörcsög petefészeksejt.
15. Eljárás egy KGF polipeptid analógjának előállítására azzal jellemezve, hogy egy, a 7. igénypont szerinti nukleinsav molekulával stabilan transzformált eukarióta vagy prokarióta gazdasejtet megfelelő körülmények között szaporítunk, oly módon, hogy a kódolt polipeptid analóg expresszálódjon, majd izoláljuk az így előállított polipeptid analógot.
• ·
16. Eljárás nem-fibroblaszt epiteliális sejtek termelődésének serkentésére, azzal jellemezve, hogy ezeket a sejteket érintkezésbe hozzuk egy 1. igénypont szerinti KGF polipeptid analóg hatásos mennyiségével.
HU9901325A 1994-10-13 1995-10-12 Keratinocita növekedési faktor analógok HUT78069A (hu)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US32333794A 1994-10-13 1994-10-13
US48782595A 1995-06-07 1995-06-07

Publications (1)

Publication Number Publication Date
HUT78069A true HUT78069A (hu) 1999-08-30

Family

ID=26983900

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
HU9901325A HUT78069A (hu) 1994-10-13 1995-10-12 Keratinocita növekedési faktor analógok

Country Status (14)

Country Link
EP (1) EP0785950B1 (hu)
JP (2) JP4422210B2 (hu)
AT (1) ATE237634T1 (hu)
AU (1) AU3893195A (hu)
CA (1) CA2202390C (hu)
DE (1) DE69530404T2 (hu)
DK (1) DK0785950T3 (hu)
ES (1) ES2196088T3 (hu)
HU (1) HUT78069A (hu)
MX (1) MX9702665A (hu)
NO (1) NO971621L (hu)
PT (1) PT785950E (hu)
SI (1) SI0785950T1 (hu)
WO (1) WO1996011951A2 (hu)

Families Citing this family (16)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1995001434A1 (en) 1993-06-29 1995-01-12 Chiron Corporation A truncated keratinocyte growth factor (kgf) having increased biological activity
US7084119B2 (en) 1993-06-29 2006-08-01 Chiron Corporation Truncated keratinocyte growth factor (KGF) having increased biological activity
DE69530599T2 (de) * 1994-10-13 2003-11-13 Amgen Inc., Thousand Oaks Methode zur reinigung von keratinocyten-wachstumsfaktoren
US6693077B1 (en) 1995-02-14 2004-02-17 Human Genome Sciences, Inc. Keratinocyte growth factor-2
US6077692A (en) 1995-02-14 2000-06-20 Human Genome Sciences, Inc. Keratinocyte growth factor-2
US7232667B2 (en) 1995-02-14 2007-06-19 Human Genome Sciences, Inc. Keratinocyte growth factor-2 polynucleotides
AU720232B2 (en) 1996-07-19 2000-05-25 Amgen, Inc. Analogs of cationic proteins
US6743422B1 (en) 1996-10-15 2004-06-01 Amgen, Inc. Keratinocyte growth factor-2 products
SI0935652T1 (en) * 1996-10-15 2004-06-30 Amgen Inc. Keratinocyte growth factor-2 products
DE69728415T2 (de) * 1996-10-15 2004-08-12 Amgen Inc., Thousand Oaks Produkte des keratinocyten-wachstumsfaktors 2 (kgf-2)
US6869927B1 (en) 1997-12-22 2005-03-22 Human Genome Sciences, Inc. Keratinocyte growth factor-2 formulations
EP1041996A4 (en) * 1997-12-22 2003-05-14 Human Genome Sciences Inc KERATINOCYTE GROWTH FACTOR-2 FORMULATIONS
US6248725B1 (en) 1999-02-23 2001-06-19 Amgen, Inc. Combinations and methods for promoting in vivo liver cell proliferation and enhancing in vivo liver-directed gene transduction
PL374269A1 (en) 2001-08-21 2005-10-03 Chiron Corporation Kgf polypeptide compositions
JP5201992B2 (ja) 2004-12-15 2013-06-05 バイオビトラム・アクテイエボラーグ(パブリツク) ケラチノサイト増殖因子の治療用製剤
KR20230127721A (ko) * 2022-02-25 2023-09-01 한국해양과학기술원 온도안정성을 향상시킨 fgf7 폴리펩타이드 및 그 용도

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1990008771A1 (en) * 1989-01-31 1990-08-09 Rubin Jeffrey S Dna encoding a growth factor specific for epithelial cells
EP0730651B1 (en) * 1993-09-24 2005-07-06 Wyeth Holdings Corporation Surface loop structural analogues of fibroblast growth factors

Also Published As

Publication number Publication date
ATE237634T1 (de) 2003-05-15
WO1996011951A2 (en) 1996-04-25
WO1996011951A3 (en) 1996-12-12
MX9702665A (es) 1997-07-31
JP2000511762A (ja) 2000-09-12
EP0785950A2 (en) 1997-07-30
ES2196088T3 (es) 2003-12-16
CA2202390A1 (en) 1996-04-25
DK0785950T3 (da) 2003-07-28
DE69530404T2 (de) 2003-11-13
SI0785950T1 (en) 2003-08-31
NO971621L (no) 1997-06-12
EP0785950B1 (en) 2003-04-16
JP2007020575A (ja) 2007-02-01
NO971621D0 (no) 1997-04-09
PT785950E (pt) 2003-09-30
AU3893195A (en) 1996-05-06
JP4422210B2 (ja) 2010-02-24
DE69530404D1 (de) 2003-05-22
CA2202390C (en) 2005-05-17

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP2007020575A (ja) ケラチノサイト増殖因子アナログ
JP4426646B2 (ja) 表皮ケラチン細胞成長因子の類縁体
US6737404B2 (en) Methods of using analogs of human basic fibroblast growth factor mutated at one or more of the positions glutamate 89, aspartate 101 or leucine 137
US6191106B1 (en) Muteins of epidermal growth factor exhibiting enhanced binding at low pH
JPH05306297A (ja) 新規なハイブリド形質転換成長因子
HU220584B1 (hu) A keratinocita növekedési faktorok tisztítására szolgáló módszer
EP1248844B1 (en) Analogs of human basic fibroblast growth factor
CZ98097A3 (en) Acid fibroblast growth factor analogs exhibiting increased stability and biological activity
US20080200378A1 (en) KGF polypeptide compositions
CA2002210C (en) Expression and processing of authentic fgf&#39;s in yeast
AU745815B2 (en) Analogs of keratinocyte growth factor, nucleic acids encoding such analogs, processes of making and methods of using
RU2198180C2 (ru) Аналог природного фактора роста кератиноцитов (варианты), фармацевтическая композиция, рекомбинантная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая аналог, экспрессионный вектор, штамм e.coli, трансформированный вектором, способ получения аналога и способ стимулирования образования нефибробластных эпителиальных клеток
CN1169732A (zh) 角质细胞生长因子类似物
MXPA97002481A (en) Method for the purification of growth factors of queratinoci

Legal Events

Date Code Title Description
DFD9 Temporary protection cancelled due to non-payment of fee