HRP20192007T1 - Oligonukleotid za liječenje pacijenata s muskularnom distrofijom - Google Patents

Oligonukleotid za liječenje pacijenata s muskularnom distrofijom Download PDF

Info

Publication number
HRP20192007T1
HRP20192007T1 HRP20192007TT HRP20192007T HRP20192007T1 HR P20192007 T1 HRP20192007 T1 HR P20192007T1 HR P20192007T T HRP20192007T T HR P20192007TT HR P20192007 T HRP20192007 T HR P20192007T HR P20192007 T1 HRP20192007 T1 HR P20192007T1
Authority
HR
Croatia
Prior art keywords
exon
seq
nucleotides
region
length
Prior art date
Application number
HRP20192007TT
Other languages
English (en)
Inventor
Judith Christina Theodora Van Deutekom
Original Assignee
Biomarin Technologies B.V.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from PCT/NL2013/050487 external-priority patent/WO2014007620A2/en
Application filed by Biomarin Technologies B.V. filed Critical Biomarin Technologies B.V.
Publication of HRP20192007T1 publication Critical patent/HRP20192007T1/hr

Links

Landscapes

  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Claims (17)

1. Postupak za modeliranje oligonukleotida za proizvodnju funkcionalnog ili semi-funkcionalnog proteina, pri čemu spomenuti postupak sadrži sljedeće korake: (a) identificiranje unutar-okvirne kombinacije prvog i drugog eksona u istoj pre-mRNA, pri čemu regija spomenutog drugog eksona ima barem 50 % podudarnosti s regijom spomenutog prvog eksona; (b) modeliranje oligonukleotida koji je sposoban vezati se na spomenutu regiju spomenutog prvog eksona i spomenutu regiju spomenutog drugog eksona; (c) pri čemu spomenuto vezanje rezultira preskakanjem spomenutog prvog i spomenutog drugog eksona, poželjno preskakanjem multi-eksonskog raspona koji počinje sa spomenutim prvim eksonom i obuhvaća jedan ili više eksona prisutnih između spomenutog prvog i spomenutog drugog eksona i u krajnjem slučaju preskakanjem kompletnog raspona eksona između spomenutog prvog i spomenutog drugog eksona, i (d) pri čemu spomenuti postupak vodi do oligonukleotida.
2. Postupak prema zahtjevu 1, pri čemu je oligonukleotid sposoban vezati se na dio regije unutar prvog eksona i na dio regije unutar druge regije.
3. Postupak prema zahtjevu 1 ili 2, pri čemu je vezanje spomenutog oligonukleotida sposobno uplesti se sa barem jednom regulatornom sekvencom spajanja u spomenutim regijama spomenutog prvog i drugog eksona i/ili sa sekundarnom strukturom koja obuhvaća barem spomenuti prvi i/ili spomenuti drugi ekson u spomenutoj pre-mRNA, poželjno, pri čemu spomenuta regulatorna sekvenca spajanja sadrži eksonski pojačivač spajanja (ESE), sekvencu prepoznavanja eksona (ERS) i/ili vezno mjesto za serin-arginin (SR) protein.
4. Postupak prema bilo kojem od zahtjeva 1 do 3, pri čemu je oligonukleotid sposoban izazvati preskakanje kompletnog raspona eksona između spomenutog prvog i spomenutog drugog eksona.
5. Postupak prema bilo kojem od zahtjeva 1 do 4, pri čemu spomenuti oligonukleotid sadrži 10 do 40 nukleotida.
6. Postupak prema bilo kojem od zahtjeva 1 do 5, pri čemu spomenuti oligonukleotid sadrži barem jednu modifikaciju u usporedbi s prirodnim ribonukleotid- ili deoksiribonukleotid-zasnovanim oligonukleotidom, poželjnije (a) barem jednu modifikaciju baze, poželjno odabranu od 2-tiouracila, 2-tiotimina, 5-metilcitozina, 5-metiluracila, timina, 2,6-diaminopurina, poželjnije odabranu od 5-metilpirimidina i 2,6-diaminopurina; i/ili (b) barem jednu modifikaciju šećera, poželjno odabranu od 2'-O-metila, 2'-O-(2-metoksi)etila, 2'-O-deoksi (DNA), 2'-F, morfolina, premoštenog nukleotida ili BNA, ili oligonukleotid sadrži oboje premoštene nukleotide i 2'-deoksi modificirane nukleotide (BNA/DNA miksmeri), poželjnije modifikacija šećera je 2'-O-metil; i/ili (c) barem jednu modifikaciju osnovice, poželjno odabranu od fosforotioata ili fosforodiamidata, poželjnije modifikacija osnovice je fosforotioat.
7. Postupak prema bilo kojem od zahtjeva 1 do 6, pri čemu spomenuti oligonukleotid sadrži jednu ili više skupina konjugata, izborno zaštićenih, odabranih iz skupine koja se sastoji od peptida, proteina, ugljikohidrata, lijekova, ciljnih dijelova, dijelova koji poboljšavaju unos, dijelova koji poboljšavaju topljivost, dijelova koji poboljšavaju farmakodinamiku, dijelova koji poboljšavaju farmakokinetiku, polimera, derivata etilen glikola, vitamina, lipida, dijelova polifluoralkila, steroida, kolesterola, fluorescentnih dijelova, reporter molekula, radioaktivno označenih dijelova i njihovih kombinacija, vezanih direktno ili preko divalentnog ili multivalentnog veznika, na terminal ili interni ostatak.
8. Postupak prema bilo kojem od zahtjeva 1 do 7, pri čemu spomenuti prvi i drugi ekson su odabrani od eksona 10, 18, 30, 8, 9, 11, 13, 19, 22, 23, 34, 40, 42, 44, 45, 47, 51, 53, 55, 56, 57 ili 60 od distrofin pre-mRNA.
9. Postupak prema bilo kojem od zahtjeva 1 do 7, pri čemu spomenuti prvi ekson je ekson 10 i spomenuti drugi ekson je ekson 12, 13, 14, 15, 16, 18, 20, 22, 23, 25, 26, 27, 28, 29 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 44, 46, 47, 48 ,49, 51, 53, 55, 57, 59 ili 60.
10. Postupak prema zahtjevu 8 ili 9, pri čemu je oligonukleotid sposoban izazvati preskakanje distrofin eksona 10 do 18, eksona 10 do 30, eksona 10 do 42, eksona 10 do 47, eksona 10 do 57, eksona 10 do 60, eksona 8 do 19, eksona 9 do 22, eksona 9 do 30, eksona 11 do 23, eksona 13 do 30, eksona 23 do 42, eksona 34 do 53, eksona 40 do 53, eksona 44 do 56, eksona 45 do 51, eksona 45 do 53, eksona 45 do 55, eksona 45 do 60 i/ili eksona 56 do 60.
11. Antiosjetni oligonukleotid koji se može dobiti postupkom prema bilo kojem od zahtjeva 1 do 10, pri čemu je spomenuti nukleotid sposoban vezati se na regiju unutar prvog eksona i regiju unutar drugog eksona, pri čemu regija spomenutog drugog eksona ima barem 50 % podudarnosti sa spomenutom regijom spomenutog prvog eksona, pri čemu spomenuti prvi i spomenuti drugi eksoni su unutar iste distrofin pre-mRNA u spomenutom subjektu, pri čemu je spomenuto vezanje spomenutog oligonukleotida sposobno uplesti se sa barem jednom regulatornom sekvencom spajanja u spomenutim regijama spomenutog prvog i drugog eksona i/ili sa sekundarnom strukturom koja obuhvaća barem spomenuti prvi i/ili spomenuti drugi ekson u spomenutoj pre-mRNA, pri čemu spomenuta regulatorna sekvenca spajanja sadrži eksonski pojačivač spajanja (ESE), sekvencu prepoznavanja eksona (ERS) i/ili vezno mjesto za serin-arginin (SR) protein, ili i/ili pri čemu spomenuto vezanje spomenutog oligonukleotida rezultira preskakanjem spomenutog prvog eksona i spomenutog drugog eksona, poželjno preskakanjem multi-eksonskog raspona koji počinje sa spomenutim prvim eksonom i obuhvaća jedan ili više eksona prisutnih između spomenutog prvog i spomenutog drugog eksona i u krajnjem slučaju preskakanjem kompletnog raspona eksona između spomenutog prvog i spomenutog drugog eksona, pri čemu se dobiva unutar-okvirni prijepis koji omogućuje proizvodnju funkcionalnog ili semi-funkcionalnog distrofina i pri čemu spomenuta sekvenca oligonukleotida nije dio koktela ili kombinacija dviju ili više različitih sekvenci oligonukleotida moguće povezanih sa jednim ili više veznika, pri čemu su spomenuti prvi i drugi ekson definirani kako slijedi: - prvi ekson je ekson 10 i drugi ekson je 18, - prvi ekson je ekson 10 i drugi ekson je 30, - prvi ekson je ekson 10 i drugi ekson je 42, - prvi ekson je ekson 10 i drugi ekson je 47, - prvi ekson je ekson 10 i drugi ekson je 57, ili - prvi ekson je ekson 10 i drugi ekson je 60.
12. Oligonukleotid prema zahtjevu 11, pri čemu: - regija eksona 10 sadrži ili se sastoji od SEQ ID NO: 109 i regija eksona 18 sadrži ili se sastoji od SEQ ID NO: 110 kada spomenuti prvi ekson je ekson 10 i spomenuti drugi ekson je ekson 18; - regija eksona 10 sadrži ili se sastoji od SEQ ID NO: 1766 i regija eksona 18 sadrži ili se sastoji od SEQ ID NO: 1767 kada spomenuti prvi ekson je ekson 10 i spomenuti drugi ekson je ekson 18; - regija eksona 10 sadrži ili se sastoji od SEQ ID NO: 1768 i regija eksona 18 sadrži ili se sastoji od SEQ ID NO: 1769 kada spomenuti prvi ekson je ekson 10 i spomenuti drugi ekson je ekson 18; - regija eksona 10 sadrži ili se sastoji od SEQ ID NO: 127 i regija eksona 30 sadrži ili se sastoji od SEQ ID NO: 128 kada spomenuti prvi ekson je ekson 10 i spomenuti drugi ekson je ekson 30; - regija eksona 10 sadrži ili se sastoji od SEQ ID NO: 1772 i regija eksona 30 sadrži ili se sastoji od SEQ ID NO: 1773 kada spomenuti prvi ekson je ekson 10 i spomenuti drugi ekson je ekson 30; - regija eksona 10 sadrži ili se sastoji od SEQ ID NO: 151 i regija eksona 42 sadrži ili se sastoji od SEQ ID NO: 152 kada spomenuti prvi ekson je ekson 10 i spomenuti drugi ekson je ekson 42; - regija eksona 10 sadrži ili se sastoji od SEQ ID NO: 157 i regija eksona 47 sadrži ili se sastoji od SEQ ID NO: 158 kada spomenuti prvi ekson je ekson 10 i spomenuti drugi ekson je ekson 47; - regija eksona 10 sadrži ili se sastoji od SEQ ID NO: 169 i regija eksona 57 sadrži ili se sastoji od SEQ ID NO: 170 kada spomenuti prvi ekson je ekson 10 i spomenuti drugi ekson je ekson 57; ili - regija eksona 10 sadrži ili se sastoji od SEQ ID NO: 173 i regija eksona 60 sadrži ili se sastoji od SEQ ID NO: 174 kada spomenuti prvi ekson je ekson 10 i spomenuti drugi ekson je ekson 60.
13. Oligonukleotid prema zahtjevu 11 ili 12, koji sadrži osnovnu sekvencu kako je definirano u bilo kojoj od SEQ ID NO:1673-1681, 1684-1686, 1688, 1689, 1778, 1780-1787, 1812-1851 ili 1884-1891, te ima dužinu, koja je definirana brojem nukleotida prisutnih u spomenutoj osnovnoj sekvenci ili koji je 1, 2, 3, 4 ili 5 nukleotida duži.
14. Oligonukleotid prema bilo kojem od zahtjeva 11 do 13, koji sadrži dio osnovne sekvence kako je definirano u bilo kojoj od SEQ ID NO: 1673-1681, 1684-1686, 1688, 1689, 1778, 1780-1787, 1812-1851 ili 1884-1891 pri čemu spomenuti dio odgovara osnovnoj sekvenci kako je definirano u bilo kojoj od spomenutih sekvenci 1, 2, 3, 4 ili 5 nukleotida manje nego je definirano u spomenutoj osnovnoj sekvenci.
15. Oligonukleotid prema zahtjevu 14, koji sadrži: (a) osnovna sekvenca kako je definirano u bilo kojoj od SEQ ID NO: 1679 do 1681, 1778, 1812, 1813, 1884 do 1886, 1890 ili 1891, te koja ima dužinu od 25, 26, 27, 28, 29 ili 30 nukleotida ili SEQ ID NO: 1814 te koja ima dužinu od 26, 27, 28, 29 ili 30 nukleotida; ili (b) osnovna sekvenca kako je definirano u SEQ ID NO: 1688, 1689 ili 1839 do 1844, te koja ima dužinu od 26, 27, 28, 29 ili 30 nukleotida; ili (c) osnovna sekvenca kako je definirano u SEQ ID NO: 1673 ili 1674 te koja ima dužinu od 25, 26, 27, 28, 29 ili 30 nukleotida; ili (d) osnovna sekvenca kako je definirano u SEQ ID NO: 1675 ili 1676 te koja ima dužinu od 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 ili 30 nukleotida; ili (e) osnovna sekvenca kako je definirano u SEQ ID NO: 1677 ili 1678 te koja ima dužinu od 25, 26, 27, 28, 29 ili 30 nukleotida; ili (f) osnovna sekvenca kako je definirano u bilo kojoj od SEQ ID NO: 1684 do 1686 te koja ima dužinu od 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 ili 30 nukleotida; ili (g) osnovna sekvenca kako je definirano u bilo kojoj od SEQ ID NO: 1815 do 1819 te koja ima dužinu od 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 ili 30 nukleotida, ili (h) osnovna sekvenca kako je definirano u bilo kojoj od SEQ ID NO: 1820, 1824, te koja ima dužinu od 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 ili 30 nukleotida, ili (i) osnovna sekvenca kako je definirano u bilo kojoj od SEQ ID NO: 1826, 1780, 1782, 1832 te koja ima dužinu od 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 ili 30 nukleotida, ili (j) osnovna sekvenca kako je definirano u bilo kojoj od SEQ ID NO: 1821, 1825 te koja ima dužinu od 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 ili 30 nukleotida, ili (k) osnovna sekvenca kako je definirano u bilo kojoj od SEQ ID NO: 1822 te koja ima dužinu od 24, 25, 26, 27, 28, 29 ili 30 nukleotida, ili (l) osnovna sekvenca kako je definirano u bilo kojoj od SEQ ID NO: 1823, 1781, 1829, 1830, 1831 te koja ima dužinu od 25, 26, 27, 28, 29 ili 30 nukleotida, ili (m) osnovna sekvenca kako je definirano u bilo kojoj od SEQ ID NO: 1783, 1833, 1834, 1835 te koja ima dužinu od 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 ili 30 nukleotida, ili (n) osnovna sekvenca kako je definirano u bilo kojoj od SEQ ID NO: 1887 te koja ima dužinu od 24, 25, 26, 27, 28, 29 ili 30 nukleotida, ili (o) osnovna sekvenca kako je definirano u bilo kojoj od SEQ ID NO: 1888 ili 1889 te koja ima dužinu od 26, 27, 28, 29 ili 30 nukleotida, ili (p) osnovna sekvenca kako je definirano u SEQ ID NO: 1827 te koja ima dužinu od 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 ili 30 nukleotida, ili (q) osnovna sekvenca kako je definirano u SEQ ID NO: 1828 te koja ima dužinu od 25, 26, 27, 28, 29 ili 30 nukleotida, ili (r) osnovna sekvenca kako je definirano u bilo kojoj od SEQ ID NO: 1784, 1836 te koja ima dužinu od 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 ili 30 nukleotida, ili (s) osnovna sekvenca kako je definirano u bilo kojoj od SEQ ID NO: 1786, 1838 te koja ima dužinu od 25, 26, 27, 28, 29 ili 30 nukleotida, ili (t) osnovna sekvenca kako je definirano u bilo kojoj od SEQ ID NO: 1780 te koja ima dužinu od 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 ili 30 nukleotida, ili (u) osnovna sekvenca kako je definirano u bilo kojoj od SEQ ID NO: 1785, 1837 te koja ima dužinu od 25, 26, 27, 28, 29 ili 30 nukleotida, ili (v) osnovna sekvenca kako je definirano u bilo kojoj od SEQ ID NO: 1845, 1846, 1847, 1848 te koja ima dužinu od 24, 25, 26, 27, 28, 29 ili 30 nukleotida, ili (w) osnovna sekvenca kako je definirano u bilo kojoj od SEQ ID NO: 1849, 1850 te koja ima dužinu od 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 ili 30 nukleotida, ili (x) osnovna sekvenca kako je definirano u bilo kojoj od SEQ ID NO: 1787, 1851 te koja ima dužinu od 26, 27, 28, 29 ili 30 nukleotida.
16. Oligonukleotid prema bilo kojem od zahtjeva 11-15, za uporabu kao lijek za sprječavanje, odgađanje, ublažavanje i/ili liječenje bolesti u subjektu.
17. Pripravak koji sadrži jedan pojedini oligonukleotid prema bilo kojem od zahtjeva 11-15 i izborno dalje sadrži farmaceutski prihvatljivi nosač, razrjeđivač, pomoćnu tvar, sol, adjuvans i/ili otapalo, poželjno pri čemu spomenuti pripravak sadrži dva ili više identičnih oligonukleotida kako je definirano u bilo kojem od zahtjeva 11 do 15 povezanih pomoću protuiona, poželjno kalcija, poželjnije pri čemu spomenuti pripravak je za uporabu kao lijek za sprječavanje, odgađanje, ublažavanje i/ili liječenje DMD ili BMD u subjektu.
HRP20192007TT 2012-07-03 2019-11-06 Oligonukleotid za liječenje pacijenata s muskularnom distrofijom HRP20192007T1 (hr)

Applications Claiming Priority (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201261667517P 2012-07-03 2012-07-03
EP12174781 2012-07-03
PCT/NL2013/050487 WO2014007620A2 (en) 2012-07-03 2013-07-03 Oligonucleotide for the treatment of muscular dystrophy patients
EP13739847.5A EP2870246B1 (en) 2012-07-03 2013-07-03 Oligonucleotide for the treatment of muscular dystrophy patients

Publications (1)

Publication Number Publication Date
HRP20192007T1 true HRP20192007T1 (hr) 2020-02-07

Family

ID=65522559

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
HRP20192007TT HRP20192007T1 (hr) 2012-07-03 2019-11-06 Oligonukleotid za liječenje pacijenata s muskularnom distrofijom

Country Status (4)

Country Link
JP (2) JP6870891B2 (hr)
DK (1) DK2870246T3 (hr)
ES (1) ES2758982T3 (hr)
HR (1) HRP20192007T1 (hr)

Family Cites Families (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US9078911B2 (en) * 2011-02-08 2015-07-14 The Charlotte-Mecklenburg Hospital Authority Antisense oligonucleotides

Also Published As

Publication number Publication date
DK2870246T3 (da) 2019-11-25
ES2758982T3 (es) 2020-05-07
JP2019030330A (ja) 2019-02-28
JP2021105049A (ja) 2021-07-26
JP6870891B2 (ja) 2021-05-12

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2015103227A (ru) Олигонуклеотид для лечения пациентов с мышечной дистрофией
US20230020192A1 (en) Compounds and methods for modulating c90rf72
JP7317029B2 (ja) 修飾化合物及びその使用
JP6440170B2 (ja) キメラ一本鎖アンチセンスポリヌクレオチドおよび二本鎖アンチセンス剤
EP2791335B1 (en) Chimeric double-stranded nucleic acid
EP2760477B1 (en) Di-aliphatic substituted pegylated lipids
CA2764609C (en) Improved cationic lipid of formula i
AU2014259953B2 (en) Compounds and methods for enhanced cellular uptake
ES2724853T3 (es) Conjugados de oligonucleótidos
HRP20160025T1 (hr) Sredstva i metode za rješavanje mišiä†nih poremeä†aja
HRP20160078T1 (hr) METODE I SREDSTVA ZA UČINKOVITO PRESKAKANJE EKSONA 45 U pre-mRNA DUCHENNE MIŠIĆNE DISTROFIJE
RU2022107926A (ru) Олигонуклеотиды, производящие переключение или модулирование сплайсинга пре-рнк и содержащие бициклические каркасные фрагменты, с улучшенными характеристиками для лечения генетических заболеваний
AU2015346042A1 (en) Compounds and methods for the modulation of proteins
CA3220821A1 (en) Novel lipids and compositions for the delivery of therapeutics
JP2018528783A (ja) コンジュゲートアンチセンス化合物及びその使用
KR20180136006A (ko) Pcsk9 를 표적화하는 안티센스 올리고머 및 접합체
WO2012016188A2 (en) Methods and compositions for delivery of active agents
JP2016523548A (ja) 成長ホルモン受容体のモジュレータ
JP7291418B2 (ja) Pcsk9を標的としたアンチセンス核酸
JP2021526017A (ja) 筋ジストロフィーに対するエクソンスキッピングオリゴマーコンジュゲート
JP2018518148A (ja) ミオスタチンにおけるアンチセンスに誘導されるエクソンの排除
JP2013537404A5 (hr)
WO2017188898A1 (en) G-quadruplex-containing antisense oligonucleotides
HRP20192007T1 (hr) Oligonukleotid za liječenje pacijenata s muskularnom distrofijom
JP7211933B2 (ja) 転写プロセシングの調節のための化合物及び方法