FI120912B - Primers och sonder för amplifiering och detektering av CMV-nukleinsyra - Google Patents

Primers och sonder för amplifiering och detektering av CMV-nukleinsyra Download PDF

Info

Publication number
FI120912B
FI120912B FI961678A FI961678A FI120912B FI 120912 B FI120912 B FI 120912B FI 961678 A FI961678 A FI 961678A FI 961678 A FI961678 A FI 961678A FI 120912 B FI120912 B FI 120912B
Authority
FI
Finland
Prior art keywords
sequence
nucleic acid
primer
mrna
amplification
Prior art date
Application number
FI961678A
Other languages
English (en)
Finnish (fi)
Other versions
FI961678A (sv
FI961678A0 (sv
Inventor
Peter Theodorus Gera Sillekens
Eveline Catharina A Timmermans
Original Assignee
Akzo Nobel Nv
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Akzo Nobel Nv filed Critical Akzo Nobel Nv
Publication of FI961678A publication Critical patent/FI961678A/sv
Publication of FI961678A0 publication Critical patent/FI961678A0/sv
Application granted granted Critical
Publication of FI120912B publication Critical patent/FI120912B/sv

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/70—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/70—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
    • C12Q1/701—Specific hybridization probes
    • C12Q1/705—Specific hybridization probes for herpetoviridae, e.g. herpes simplex, varicella zoster
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/70—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
    • C12Q1/701—Specific hybridization probes

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Claims (10)

1. Förfarande för diagnos av symptomatisk CMV-sjukdom, kännetecknat av att man detekterar in vitro 5 närvaron av mRNA som kodar för sent strukturellt protein pp67 av humant cytomegalovirus i ett blodprov taget frän en individ som misstänks bära pä nämnda sjukdom, varvid metoden omfattar följande steg där man: - amplifierar en mä1sekvens inom nämnda mRNA genom 10 att använda ett primerpar som förmär reagera specifikt med nämnda malsekvens och lämpliga amplifieringsreagens, varvid nämnda primerpar är designat för att passa variation mellan stammarna, - bringar provet, som eventuellt innehäller ampli-15 fierad nukleinsyra, att reagera med en märkt nukleinsy- rasond som har en sekvens som är komplementär till en del av mälsekvensen, - detekterar hybrider som bildats mellan malsekvens en och sonden. 20 2. Förf arande enligt patentkrav 1, känneteck nat av att mRNA amplifieras genom att använda amplifika-tionsteknik som baserar sig pä transkription.
3. Förf arande enligt patentkrav 2, kännetecknat av att amplifikationstekniken är NASBA.
4. Oligonukleotid, kännetecknad av att den motsvarar en del av en nukleinsyrasekvens som kodar för HCMV-pp67, varvid nämnda oligonukleotid är 10 - 35 nukleo-tid läng och innhäller minst ett fragment pä 10 nukleoti-der av sekvensen: 30 5'-GGGTCGATTCGAGACCGA-3 ' , 5'-GGGTCGATTCAGACTGA-3' 5 ' - GACCTGATATCCCTCCATATA- 3 ' eller dess komplementära sekvens.
5. Oligonukleotid enligt patentkrav 4, känne-35 tecknad av att den är kopplad till en promotorsekvens.
6. Primerset, kännetecknat av att det är av-sett för amplifiering av en mälsekvens som är belägen inom HCMV-pp67-sekvensen, vilket set innehäller en primer som bestär av nukleinsyrasekvensen: 5 5'-GGGTCGATTCGAGACCGA-31 kopplad tili en promotorsekvens och en andra primer som bestär av nukleinsyrasekvensen 5'-GACCTGATATCCCTCCATATA-3'.
7. Primerset, kännetecknat av att det är av-sett för amplifiering av en mälsekvens som är belägen inom
10 HCMV-pp67-sekvensen, vilket set innehäller en primer som bestär av nukleinsyrasekvensen: 5'-GGGTCGATTCAGACTGA-3' kopplad tili en promotorsekvens och en andra primer som bestär av nukleinsyrasekvensen 5'-GACCTGATATCCCTCCATATA-3'.
8. Användning av vilken som heist av oligonukleoti- derna enligt patentkrav 4 som primer i förfarandet enligt patentkrav 1.
9. Användning av en oligonukleotid som bestär av sekvensen 5'-GGATTCGGACTTTCCGTTCGA-3' utrustad med en de- 20 tekterbar märkning som sond i förfarandet enligt patentkrav 1.
10. Testkit för diagnos av HCMV-sjukdom, kännetecknat av att det innehäller: - en eller flera primerset enligt patentkrav 6 25 och/eller 7, - en oligonukleotid som innehäller en nukleinsyra-sekvens som är komplementär tili ätminstone en del av den amplifierade nukleinsyrasekvens som definieras av nämnda primerset, försedd med en detekterbar märkning.
FI961678A 1994-08-18 1996-04-17 Primers och sonder för amplifiering och detektering av CMV-nukleinsyra FI120912B (sv)

Applications Claiming Priority (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP94202360 1994-08-18
EP94202360 1994-08-18
EP9503295 1995-08-18
PCT/EP1995/003295 WO1996006191A2 (en) 1994-08-18 1995-08-18 Primers and probes for the amplification and detection of cmv nucleic acid

Publications (3)

Publication Number Publication Date
FI961678A FI961678A (sv) 1996-04-17
FI961678A0 FI961678A0 (sv) 1996-04-17
FI120912B true FI120912B (sv) 2010-04-30

Family

ID=8217105

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
FI961678A FI120912B (sv) 1994-08-18 1996-04-17 Primers och sonder för amplifiering och detektering av CMV-nukleinsyra

Country Status (12)

Country Link
EP (1) EP0729518B1 (sv)
JP (1) JPH09504182A (sv)
KR (1) KR100399715B1 (sv)
AT (1) ATE209691T1 (sv)
AU (1) AU707317B2 (sv)
CA (1) CA2172142C (sv)
DE (1) DE69524199T2 (sv)
DK (1) DK0729518T3 (sv)
ES (1) ES2169146T3 (sv)
FI (1) FI120912B (sv)
PT (1) PT729518E (sv)
WO (1) WO1996006191A2 (sv)

Families Citing this family (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ZA981491B (en) * 1997-02-28 1998-08-20 Akzo Nobel Nv Oligonucleotides that can be used in the amplification and detection of cmv nucleic acid
EP1049809B1 (en) * 1998-01-23 2006-10-25 bioMerieux B.V. EF-Tu mRNA AS A MARKER FOR VIABILITY OF BACTERIA
US6967016B2 (en) 2000-12-04 2005-11-22 Primagen Holding B.V. Method of determining therapeutic activity and/or possible side-effects of a medicament
EP1211323A1 (en) * 2000-12-04 2002-06-05 Amsterdam Support Diagnostics B.V. Tests based on nucleic acids of endosymbiont cellular organelles
EP2663658B1 (en) 2011-01-12 2017-10-25 Abbott Molecular Inc. Materials and method for detecting cytomegalovirus (cmv)

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CA1340807C (en) * 1988-02-24 1999-11-02 Lawrence T. Malek Nucleic acid amplification process
WO1993013227A1 (en) * 1991-12-23 1993-07-08 Chiron Corporation Cmv probes for use in solution phase sandwich hybridization assays
EP0586011A2 (en) * 1992-08-28 1994-03-09 Eastman Kodak Company Methods for production and amplification of nucleic acids

Also Published As

Publication number Publication date
FI961678A (sv) 1996-04-17
CA2172142A1 (en) 1996-02-29
DK0729518T3 (da) 2002-03-18
DE69524199D1 (de) 2002-01-10
AU707317B2 (en) 1999-07-08
WO1996006191A3 (en) 1996-03-14
CA2172142C (en) 2010-01-12
WO1996006191A2 (en) 1996-02-29
EP0729518A1 (en) 1996-09-04
PT729518E (pt) 2002-05-31
KR100399715B1 (ko) 2003-12-18
KR960705062A (ko) 1996-10-09
FI961678A0 (sv) 1996-04-17
EP0729518B1 (en) 2001-11-28
ES2169146T3 (es) 2002-07-01
DE69524199T2 (de) 2002-05-02
AU3346995A (en) 1996-03-14
JPH09504182A (ja) 1997-04-28
ATE209691T1 (de) 2001-12-15

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Ali et al. Simultaneous detection of multiple viruses based on chemiluminescence and magnetic separation
JP2005511030A (ja) 核酸の増幅方法
CA2246238A1 (en) A method for the amplification and detection of a nucleic acid fragment of interest
CA2422956A1 (en) Compositions and methods for detecting human immunodeficiency virus 2 (hiv-2)
Lunel et al. Comparative study of conventional and novel strategies for the detection of hepatitis C virus RNA in serum: amplicor, branched-DNA, NASBA and in-house PCR
US6333150B1 (en) Isothermal transcription based assay for the detection and genotyping of dengue virus
PL209415B1 (pl) Mieszanina starterów do amplifikacji, jej zastosowanie, sposób wykrywania genotypów HPV i zestaw odczynników do wykrywania i typowania HPV
US6306602B1 (en) Oligonucleotides that can be used in the amplification and detection of CMV nucleic acid
US5876937A (en) Method for determining the integrity of nucleic acid
US20100216117A1 (en) Oligonucleotides, use, method of detection and kit for diagnosing the presence of the chikungunya virus e1 gene
FI120912B (sv) Primers och sonder för amplifiering och detektering av CMV-nukleinsyra
US10053742B2 (en) Compositions and methods for detecting HEV nucleic acid
US7074561B2 (en) Isothermal amplification based assay for the detection and quantitation of alpha-fetoprotein mRNA
CA2281793C (en) Oligonucleotides that can be used in the amplification and detection of cmv nucleuc acid
USH1825H (en) Isothermal transcription based assay for the detection of HTLV I and HTLV II RNA
JP5164850B2 (ja) インフルエンザａウイルスのｈ５及びｎ１遺伝子の存在を診断するためのオリゴヌクレオチド、その使用、検出方法及びキット
US20240110252A1 (en) Compositions and Kits for Rapid Detection of SARS-CoV-2 and Methods of Production and Use Thereof
Loens et al. Nucleic acid sequence-based amplification
KR20230022540A (ko) A형 간염바이러스의 검출 및 정량 방법
JPH04311400A (ja) ヒトサイトメガロウイルス検出用プローブ

Legal Events

Date Code Title Description
FG Patent granted

Ref document number: 120912

Country of ref document: FI

MA Patent expired