FI118102B - Informationskontrollsystem för kontroll av arbetsflöjden - Google Patents

Informationskontrollsystem för kontroll av arbetsflöjden Download PDF

Info

Publication number
FI118102B
FI118102B FI20045040A FI20045040A FI118102B FI 118102 B FI118102 B FI 118102B FI 20045040 A FI20045040 A FI 20045040A FI 20045040 A FI20045040 A FI 20045040A FI 118102 B FI118102 B FI 118102B
Authority
FI
Finland
Prior art keywords
tool
workflow
data
input
output
Prior art date
Application number
FI20045040A
Other languages
English (en)
Finnish (fi)
Other versions
FI20045040A (sv
FI20045040A0 (sv
Inventor
Pertteli Varpela
Meelis Kolmer
Tarmo Pellikka
Original Assignee
Medicel Oy
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from FI20031020A external-priority patent/FI117988B/sv
Application filed by Medicel Oy filed Critical Medicel Oy
Priority to FI20045040A priority Critical patent/FI118102B/sv
Publication of FI20045040A0 publication Critical patent/FI20045040A0/sv
Priority to CA002531131A priority patent/CA2531131A1/en
Priority to PCT/FI2004/000424 priority patent/WO2005003999A1/en
Priority to RU2005141111/09A priority patent/RU2005141111A/ru
Priority to EP04103140A priority patent/EP1494156A3/en
Priority to AU2004254729A priority patent/AU2004254729A1/en
Priority to JP2006516238A priority patent/JP2007520773A/ja
Priority to US10/883,043 priority patent/US20050021877A1/en
Publication of FI20045040A publication Critical patent/FI20045040A/sv
Publication of FI118102B publication Critical patent/FI118102B/sv
Application granted granted Critical

Links

Classifications

    • G—PHYSICS
    • G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06Q—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR ADMINISTRATIVE, COMMERCIAL, FINANCIAL, MANAGERIAL OR SUPERVISORY PURPOSES; SYSTEMS OR METHODS SPECIALLY ADAPTED FOR ADMINISTRATIVE, COMMERCIAL, FINANCIAL, MANAGERIAL OR SUPERVISORY PURPOSES, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR
    • G06Q10/00—Administration; Management
    • G06Q10/10—Office automation; Time management
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B50/00—ICT programming tools or database systems specially adapted for bioinformatics
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B50/00—ICT programming tools or database systems specially adapted for bioinformatics
    • G16B50/10—Ontologies; Annotations
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B50/00—ICT programming tools or database systems specially adapted for bioinformatics
    • G16B50/20—Heterogeneous data integration
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B50/00—ICT programming tools or database systems specially adapted for bioinformatics
    • G16B50/30—Data warehousing; Computing architectures

Landscapes

  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Theoretical Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Medical Informatics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Evolutionary Biology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Databases & Information Systems (AREA)
  • Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
  • Bioethics (AREA)
  • Business, Economics & Management (AREA)
  • Strategic Management (AREA)
  • Entrepreneurship & Innovation (AREA)
  • Human Resources & Organizations (AREA)
  • Data Mining & Analysis (AREA)
  • Economics (AREA)
  • Marketing (AREA)
  • Operations Research (AREA)
  • Quality & Reliability (AREA)
  • Tourism & Hospitality (AREA)
  • General Business, Economics & Management (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Management, Administration, Business Operations System, And Electronic Commerce (AREA)

Claims (12)

1. Informationsadministreringssystem [=”IMS”] för administrering av arbetsflöden, där varje arbetsflöde definierar en ordnad grupp med en eller flera databehandlingsuppgifter som hänför sig till information (200), känneteck-5 n at av att IMS omfattar ett arbetsflödesadministreringsorgan som omfattar: - en dataenhetstypdefinition (1214) för var och en av flera dataen-hetstyper, där varje dataenhetstypdefinition hänför sig till datans syntax och semantik; - en dataenhetsdefinition (1214) för var och en av flera dataenheter 10 (202, 1250), där varje dataenhet hänför sig till en specifik dataenhetstyp (1214) och innehaller en delgrupp av nämnda information (200); - en verktygsdefinitiön (1208) för vart och ett av flera verktyg (1254), i där varje verktyg förmar exekvera en delgrupp av databehandlingsuppgifterna; - en eller flera verktygsservrar (1222, 1420) för exekvering av verkty- 15 gen; - en grupp verktygsinmatningslänkare (1210) och verktygsutmat- 4 ningslänkare (1212), varav var och en länkar en verktygsinmatning respektive verktygsutmatning till en specifik dataenhetstyp; - en arbetsflödesdefinition (1202, 1202’) för var och en av flera ar-20 betsflöden, där varje arbetsflödesdefinition omfattar: ·\..ϊ i) en eller flera arbetsflödesinmatningsdefinitioner (1204, 1204’), var- *:* av var och en indikerar en eller flera dataenheter säsom en arbetsflödesinmat- • t·* :*·*: ning (1250); * * * : ii) en eller flera arbetsflödesutmatningsdefinitioner (1206, 1206’), «·· I ^ .:. 25 varav var och en indikerar en eller flera dataenheter sasom en arbetsflödesut- matning (1260); *** där arbetsflödesinmatningsdefinitionerna (1204, 1204’) och arbets- ,. flödesutmatningsdefinitionerna (1206, 1206’) gemensamt definierar ett dataflö- • · '4 desnät (1252-1258) frän arbetsflödesinmatning (1250) till arbetsflödesutmatning 30 (1260) via en eller flera instanser (1254) av verktygsdefinitioner (1208). l..:
2. Informationsadministreringssystem enligt patentkrav 1, känne- • · *·;♦* tecknat av att arbetsflödesdefinitionen omfattar en hierarki (1203), där ett moderarbetsflöde omfattar flera barnarbetsflöden. * * · i i
* * " 3. Informationsadministreringssystem enligt patentkrav 1, känne- 42 118102 <6!1 tecknat av att det omfattar en verktygsserverlänkare (1224) för varje kombi-nation av en verktygsdefinition och en server.
4. Informationsadministreringssystem enligt patentkrav 1, känne-tecknat av att det omfattar ett grafiskt användargränssnitt (1300) för att i 5 gensvar pä en inmatning frän en användare skapa en visuell presentation av dataflödesnätet (1252 - 1258).
5. Informationsadministreringssystem enligt patentkrav 1, känne-tecknat av att det grafiska användargränssnittet omfattar en rutin för att au-tomatiskt skapa en arbetsflödesinmatning eller -utmatning (1204, 1204’, 1206, 10 1206’) i gensvar pä en användares ätgärd att sammankoppla en ikon för en da- taenhet med en ikon för ett verktyg.
6. Informationsadministreringssystem enligt patentkrav 1, känne-tecknat av att det omfattar en länkare (1230) för att definiera strukturerade dataenheter.
7. Informationsadministreringssystem enligt patentkrav 6, kä n n e- tecknat av att ätminstone nägra av de strukturerade dataenheterna omfattar datagrupper (610, 620), varav var och en omfattar: - en variabelvärdematris (614, 624) som innehäller variabelvärden ·***: ordnade i rader och kolumner; ·· · . < ·:. 20 - en radbeskrivningslista (612, 623) pä ett variabelbeskrivningsspräk .·*·. (30) för att beskriva raderna i variabelvärdematrisen; • · ;*.*·*. - en kolumnbeskrivningslista (612, 622) pä ett variabelbeskrivnings- * * ♦ ** Y sprak (30) för att beskriva kolumnerna i variabelvärdematrisen; och \\\: - en beskrivning av gemensamma faktorer (611, 621) pä ett variabel- * · **·♦’ 25 beskrivningsspräk (30) för att beskriva de gemensamma faktorerna för alla vär- den i variabelvärdematrisen.
#· • · • ·· * .··*. 8. Informationsadministreringssystem enligt patentkrav 1, känne- *·* tecknat av att det omfattar: '· ”· - en dataenhetslistdefinition (1226) för att definiera flera dataenheter 30 säsom arbetsflödesinmatningar och/eller-utmatningar; och ·*·., - en rutin för att använda ett verktyg för att behandla nämnda flera : dataenheter separat, men korrelera respektive inmatning med respektive ut matning. 118102 43
9. Informationsadministreringssystem enligt patentkrav 1, känne-tecknat av att det omfattar en eller flera konfigurationsfiler (1600), varav var och en omfattar: en inmatningsdel (1620, 1630) för att definiera en verktygsinmat- 5 ningslänkare (1210); och en utmatningsdel (1640) för att definiera en verktygsutmatningslän-kare (1210).
10. Informationsadministreringssystem enligt patentkrav 9, känne-tecknat av att atminstone en konfigurationsfil (1600) även omfattar en op- 10 tionsdel (1650-1670) för att definiera inmatningsparametrar för att styra ätminstone ett verktygs funktion.
11. Informationsadministreringssystem enligt patentkrav 10, ί kännetecknat av att det omfattar en installeringsrutin för att automatiskt skapa atminstone en del av dataenhetstypdefinitionerna (1214), 15 verktygsdefinitionerna (1208), verktygsinmatningslänkama (1210), verktygsutmatningslänkarna (1212) och options- och avslutningskoderna (1238, 1239) genom att använda dataenhetsdefinitioner och verktygsdefinitioner i nämnda atminstone en konfigurationsfil (1600).
12. Informationsadministreringssystem enligt nägot av patentkraven *··.; 20 9-11, kännetecknat av att nämnda ätminstone en konfigurationsfil är en ^ extendible markup language-fil. ··· • e.·.·· • « • · ··· ···:-•·· ♦ *·· »>·· ··' ♦ · • · · i • ·· . • · • · ··· • · · ···.; * 1 ··· ' ' • 1 • 1 *·· * • · • · • ·· « ♦ * · · ··♦·· • 1
FI20045040A 2003-07-04 2004-02-16 Informationskontrollsystem för kontroll av arbetsflöjden FI118102B (sv)

Priority Applications (8)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FI20045040A FI118102B (sv) 2003-07-04 2004-02-16 Informationskontrollsystem för kontroll av arbetsflöjden
US10/883,043 US20050021877A1 (en) 2003-07-04 2004-07-02 Information management system for managing workflows
RU2005141111/09A RU2005141111A (ru) 2003-07-04 2004-07-02 Система управления биохимической информацией
PCT/FI2004/000424 WO2005003999A1 (en) 2003-07-04 2004-07-02 Information management system for biochemical information
CA002531131A CA2531131A1 (en) 2003-07-04 2004-07-02 Information management system for biochemical information
EP04103140A EP1494156A3 (en) 2003-07-04 2004-07-02 Information management system for managing workflows
AU2004254729A AU2004254729A1 (en) 2003-07-04 2004-07-02 Information management system for biochemical information
JP2006516238A JP2007520773A (ja) 2003-07-04 2004-07-02 生化学情報のための情報管理システム

Applications Claiming Priority (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FI20031020A FI117988B (sv) 2003-07-04 2003-07-04 Informationsförvaltningssystem för biokemisk information
FI20031020 2003-07-04
FI20045040A FI118102B (sv) 2003-07-04 2004-02-16 Informationskontrollsystem för kontroll av arbetsflöjden
FI20045040 2004-02-16

Publications (3)

Publication Number Publication Date
FI20045040A0 FI20045040A0 (sv) 2004-02-16
FI20045040A FI20045040A (sv) 2005-01-05
FI118102B true FI118102B (sv) 2007-06-29

Family

ID=33436175

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
FI20045040A FI118102B (sv) 2003-07-04 2004-02-16 Informationskontrollsystem för kontroll av arbetsflöjden

Country Status (3)

Country Link
US (1) US20050021877A1 (sv)
EP (1) EP1494156A3 (sv)
FI (1) FI118102B (sv)

Families Citing this family (26)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7539625B2 (en) * 2004-03-17 2009-05-26 Schlumberger Technology Corporation Method and apparatus and program storage device including an integrated well planning workflow control system with process dependencies
US20080235055A1 (en) * 2003-07-17 2008-09-25 Scott Mattingly Laboratory instrumentation information management and control network
JP4625337B2 (ja) * 2004-02-23 2011-02-02 株式会社リコー プロセス管理装置、プロセス管理方法及びプロセス管理プログラム
US7496887B2 (en) * 2005-03-01 2009-02-24 International Business Machines Corporation Integration of data management operations into a workflow system
US7499906B2 (en) * 2005-09-05 2009-03-03 International Business Machines Corporation Method and apparatus for optimization in workflow management systems
US20070143736A1 (en) * 2005-12-09 2007-06-21 Microsystems Technology, Inc. Workflow Development Platform
US20070219843A1 (en) * 2006-03-14 2007-09-20 Keeler Jesse M Method and apparatus for providing work flows used to resolve alarm conditions detected in a system
US8250583B2 (en) * 2006-12-04 2012-08-21 International Business Machines Corporation Workflow processing system and method with federated database system support
US7739243B2 (en) * 2007-08-01 2010-06-15 International Business Machines Corporation System and method for dynamically configuring a multiplatform computing environment
US20090183187A1 (en) * 2008-01-16 2009-07-16 Lazar Borissov Providing Command Line Interface Using a Remote Interface
US8984390B2 (en) 2008-09-15 2015-03-17 Palantir Technologies, Inc. One-click sharing for screenshots and related documents
US20100192077A1 (en) * 2009-01-26 2010-07-29 Raytheon Company Parent/Child Control System for a Workflow Automation Tool
US20100299631A1 (en) * 2009-05-22 2010-11-25 Weihsiung William Chow Prompt for User Input on All Workflow Activities Before Workflow Execution
CN102812465B (zh) * 2010-03-08 2016-04-20 皇家飞利浦电子股份有限公司 包括高效剂量计算的剂量计算任务的安排
US8797342B2 (en) * 2010-09-10 2014-08-05 Siemens Aktiengesellschaft Method for visual project modeling
US8732574B2 (en) 2011-08-25 2014-05-20 Palantir Technologies, Inc. System and method for parameterizing documents for automatic workflow generation
WO2013096842A2 (en) * 2011-12-21 2013-06-27 Life Technologies Corporation Methods and systems for in silico experimental designing and performing a biological workflow
CN102707944A (zh) * 2012-04-13 2012-10-03 华为技术有限公司 用户界面的生成显示方法及用户界面设备
US9348677B2 (en) 2012-10-22 2016-05-24 Palantir Technologies Inc. System and method for batch evaluation programs
US8868486B2 (en) 2013-03-15 2014-10-21 Palantir Technologies Inc. Time-sensitive cube
US8909656B2 (en) 2013-03-15 2014-12-09 Palantir Technologies Inc. Filter chains with associated multipath views for exploring large data sets
US9105000B1 (en) 2013-12-10 2015-08-11 Palantir Technologies Inc. Aggregating data from a plurality of data sources
US8924429B1 (en) 2014-03-18 2014-12-30 Palantir Technologies Inc. Determining and extracting changed data from a data source
US20160232470A1 (en) * 2015-02-05 2016-08-11 Keguo Zhou Automated Generation of Process Flow Charts
JP6764115B2 (ja) * 2017-01-31 2020-09-30 富士通株式会社 表示プログラム、表示方法および表示装置
CN109685453B (zh) * 2018-12-07 2023-07-04 中交第二公路勘察设计研究院有限公司 智能识别工作流有效路径的方法

Family Cites Families (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5734837A (en) * 1994-01-14 1998-03-31 Action Technologies, Inc. Method and apparatus for building business process applications in terms of its workflows
US6430538B1 (en) * 1998-04-30 2002-08-06 Enterworks Workflow management system, method and medium with personal subflows
JP2003528358A (ja) * 1998-08-24 2003-09-24 富士通株式会社 ワークフローシステムおよび方法
US6505249B1 (en) * 1999-12-28 2003-01-07 Bellsouth Intellectual Property Corporation Method for optimizing end-to-end processing performance by selecting optimal values after running benchmarks repeatedly with different values
US7788631B2 (en) * 2000-02-24 2010-08-31 General Dynamics Advanced Information Systems, Inc. Process automation system
US6509974B1 (en) * 2000-05-17 2003-01-21 Heidelberger Druckmaschinen Ag Automated job creation for job preparation
US20020178252A1 (en) * 2001-05-08 2002-11-28 Narad Networks, Inc. Extensible service provisioning engine
US20020194154A1 (en) * 2001-06-05 2002-12-19 Levy Joshua Lerner Systems, methods and computer program products for integrating biological/chemical databases using aliases

Also Published As

Publication number Publication date
FI20045040A (sv) 2005-01-05
EP1494156A2 (en) 2005-01-05
FI20045040A0 (sv) 2004-02-16
EP1494156A3 (en) 2008-07-16
US20050021877A1 (en) 2005-01-27

Similar Documents

Publication Publication Date Title
FI118102B (sv) Informationskontrollsystem för kontroll av arbetsflöjden
Lacroix et al. Bioinformatics: managing scientific data
Cline et al. Integration of biological networks and gene expression data using Cytoscape
Monteiro et al. Temporal logic patterns for querying dynamic models of cellular interaction networks
Brohée et al. Network Analysis Tools: from biological networks to clusters and pathways
US20020178185A1 (en) Database model, tools and methods for organizing information across external information objects
US7383234B2 (en) Extensible data mining framework
WO2001069239A1 (en) System and method for simulating cellular biochemical pathways
US20050010369A1 (en) Information management system for biochemical information
FI118101B (sv) Informationsförvaltningssystem för biokemisk information
Ducasse et al. The moose reengineering environment
Bistarelli et al. On representing biological systems through multiset rewriting
FI117988B (sv) Informationsförvaltningssystem för biokemisk information
FI118063B (sv) Informationsförvaltningssystem för biokemialisk information
FI117068B (sv) Informationsförvaltningssystem för biokemisk information
Mou et al. Visual life sciences workflow design using distributed and heterogeneous resources
Romanel et al. The beta workbench
WO2005003999A1 (en) Information management system for biochemical information
Mou et al. Implementing computational biology pipelines using VisFlow
Idrissi et al. Context analysis for semantic mapping of data sources using a multi-strategy machine learning approach
Schoof et al. The PlaNet consortium: a network of European plant databases connecting plant genome data in an integrated biological knowledge resource
Roux-Rouquié et al. Metamodel and modeling language: towards an Unified Modeling Language (UML) profile for systems biology
Bada et al. GOAT: the gene ontology annotation tool
Garces Adaptation and evaluation of generic model matching strategies
Fukuda et al. A pathway editor for literature-based knowledge curation

Legal Events

Date Code Title Description
FG Patent granted

Ref document number: 118102

Country of ref document: FI

MM Patent lapsed