FI100407B

FI100407B - DNA-HPV, vilket kan användas diagnostiskt

Info

Publication number: FI100407B
Application number: FI870366A
Authority: FI
Inventors: Sylvie Beaudenon; Odile Croissant; Gerard Orth; Dina Kremsdorf
Original assignee: Hoffmann La Roche
Priority date: 1986-01-31
Filing date: 1987-01-28
Publication date: 1997-11-28
Also published as: JPS62248492A; DK52987D0; EP0235004A3; JP2716120B2; DK52987A; EP0235004B1; DE3786357T2; DE3786357D1; FR2593828B2; DK176083B1; FR2593828A2; FI870366A0; FI870366A; EP0235004A2; ES2056833T3; ATE91157T1

Claims

1. DNA-HPV, vilket kan användas diagnostiskt och vars storlek varierar mellan ca. 7000 - ca. 8000 baspar och vilket motsvarar DNA-HPV, vilket erhälls 5 frän papillomavirus, vars kännetecken är HPV39 (IP5) och vars DNA är deponerat i C.N.C.M.-inrättningen under depositionsnummer 1-507, eller frän papillomavirus, vars kännetecken är HPV42 (IP6) och vars DNA är deponerat i C.N.C.M.-inrättningen under depositions- 10 nummer 1-508, eller ett diagnostiskt användbart fragment av ett dyli'kt DNA-HPV.

2. DNA-fragment enligt patentkrav 1, kän-netecknat därav, att fragmentet motsvarar ge-nerna El, E6, E7, LI eller L2 av nämnda DNA-HPV eller 15 fragmentet motsvarar ett fragment som kodar ett inter-geniskt omrade av nämnda DNA-HPV.

3. Rekombinant-DNA, kännetecknat därav, att rekombinant-DNA innehäller DNA-HPV enligt patentkrav 1 eller fragmentet enligt patentkrav 2.

4. DNA fragment eller rekombinant-DNA enligt patentkrav 1, 2 eller 3 att användas som sond vid bes-tämning av DNA-HPV.

5. Sammansättn-ing, vilken innehäller en blandning av DNA-HPV att användas för bestämning av i 25 ett biologiskt prov varande papillomavirus, k ä n -netecknad därav, att blandningen innehäller ett • · DNA-HPV enligt patentkrav 1 tillsammans med ett eller .. flera olika DNA-HPV. • · • (

6. DNA-HPV24; 7) ätminstone en av DNA-HPV 34 (32) och 36 (IP4); 25 8) DNA-HPV32 (31);

6. Sammansättning enligt patentkrav 5, • · 30 k ä n n e t e c k n a d därav, att sammansättningen : innehäller en blandning av DNA-HPV 33 (IP2); 39 (IP5) ; 42 (IP 6) ; 6; 11; 16; 18; 32 (31); 35.

7. Sammansättning enligt patentkrav 5, kännetecknad därav, att sammansättningen '· 35 innehäller DNA-HPV42 (IP6) blandat med DNA-HPV6 eller med DNA-HPVll eller med en blandning av dessa. Il 100407

8. Förfarande för framställning av en DNA-HPV sond, vid vilket förfarande en vektor klonas i en spe-cifik värd, säsom i en prokariotisk mikro-organism, vilken vektor först har modifierats genom att förena 5 in vitro DNA-HPV eller dess DNA fragment och en lämplig vektor för producerande av rekombinantvektorn, vilken innehäller frän viruset erhället hela DNA-HPV eller DNA fragmentet pa ett sädant ställe i vektorn, att vektorn förmar klonas i värden, och tas tillvara 10 och renas samt vid behov, det erhällna klonade rekom-binant DNA marks, kännetecknad därav, att som DNA-HPV eller DNA-fragment används DNA-HPV enligt pa-tentkrav 1 eller DNA fragment enligt patentkrav 2.

9. DNA-HPV34 (32), < : : ‘ ' kännetecknad därav, att kitten dessutom in nehäller tvä andra grupper (10 och 11), vilka respek- • · • ’ tive bildas av följande: V* · 30 10) DNA-HPV39 (IP5) ensamt eller blandat med ätminsto- . ne ett av DNA-HPV 16, 18 och 33 (IP2) ; och • « ♦ ,···. 11) DNA-HPV42 (IP6) ensamt eller blandat med ätminsto- • * *<* ne ett av DNA-HPV 6 eller 11, varvid DNA i de 11 grupperna väljs sä, att de avviker 35 frän varandra under alla tillfällen och även dä, när var och en av de 11 grupperna är begränsad tili endast en av ifrägavarande grupp bildande DNA. 100407

9. Kit, vilket innehäller nio grupper av son-15 der eller blandningar av sonder (1 - 9), vilka respek- tive bildas av följande: 1) ätminstone DNA-HPV2d; 2) ätminstone en av DNA-HPV 20b, 28 och 29; 3) ätminstone en av DNA-HPV 17 och 24; 20 4} ätminstone en av DNA-HPV 14, 15, 17, 19, 20, 21, 22, 23 och 36 (IP4); : 5) ätminstone en av DNA-HPV 15 och 17;

10. DNA-HPV39 (IP5) ensamt eller blandat med ätminstone en av DNA-HPV 16, 18 och 33 (IP2); och 25 11) DNA-HPV 42 (IP6) ensamt eller blandat med ätmins- . tone en av DNA-HPV 6 och 11, i : : • · varvid DNA i de 11 grupperna väljs sä, att de avviker frän varandra under alla tillfällen och även dä, när • « l var och en av de 11 grupperna är begränsad tili endast ·.· ; 30 en av ifrägavarande grupp bildande DNA och . .·. varvid beroende pä en möjligen mellan nägon av dessa • · · • blandningar och ett DNA-preparat, vilket erhälls frän *’ if rägavarande patient, skeende hybridisation, sonderna .1 möjliggör att förekomsten av nägon av följande sjukdo- ’·/·; 35 mar eller sannolikheten att insjukna i dem kan uppskattas: 1. epidermal- och slemhinnevärtor (speciellt värtor II 100407 och fotsulevärtor), differentialdiagnos av epidermodysplasia verruci formis; 2. ytvartor eller epidermal- eller slemhinnevärtors 5 mellanformer, intraepitelialneoplasier och epidermalkancer, differentialdiagnos av epidermodysplasia verruci formis; 3. epidermodysplasia verruciformis, intraepitelialne 10 oplasier och epidermalkancer; 4. epidermodysplasia verruciformis; 5. epidermodysplasia verruciformis; 6. epidermodysplasia verruciformis; 7. epidermodysplasia verruciformis epidermalkancer, 15 intraepitelialneoplasier och epidermalkancer; 8. oral härd-epitelial hyperplasi; differentialdiag nos av oral epitelialneoplasia; 9. intraepitelialneoplasier och epidermalkancer; 10. gentialneoplacier och livmoderhalskancer; och 20 11 - kondylom, papillom.

10. Kit for in vitro dif ferentialdiagnos av olika värt- och hyperplasiatyper, vilka typers progno-ser varierar frän värtornas godartade värtformer till former, vilka sannolikt förändras till intraepiteliala 5 neoplasier samt till hud- och slemhinnecancer, varvid kitten innehäller nio grupper (1 - 9) av rekombinant-sonder innehällande DNA-inserter av papillomavirus, vilka grupper var för sig är framställda frän: 1) ätminstone en av DNA-HPV 1, 2d och 4; 10 2) ätminstone en av DNA-HPV 3, 10a, 10b, 28 och 29; 3) ätminstone en. av DNA-HPV 5, 17a och 24; 4) ätminstone en av DNA-HPV 5, 8, 12, 14a, 14b, 19, 20, 21, 22, 23 och 36 (IP4); 5) ätminstone en av DNA-HPV 9, 15, 17a och 17b; 15 6) DNA-HPV 24; 7) ätminstone en av DNA-HPV 5, 8, 14b, 34 (32) och 36 (IP4); 8) ätminstone en av DNA-HPV 13 och 32 (31); 9) ätminstone en av DNA-HPV 34 (32) och 36 (IP4); 20 kännetecknad därav, att kitten dessutom innehäller andra grupper (10 och 11) vilka är framställda frän följande:

11. Förfarande för pävisande och identi-fierande av i ett biologiskt prov ingäende papillomavirus, kännetecknat därav, att en hybridisa-tionsbestämning utförs genom att använda enligt pa-25 tentkrav 1 definierat DNA-HPV, DNA-fragment enligt patentkrav 2 eller rekombinant-DNA enligt patentkrav 3 ' ’ eller nägon av sammansättningarna enligt nägot av pa- tentkraven 5 - 7 , och pävisande av de ur biologiska • " prov erhällna DNA-HPV, vilka deltar i hybridisationen. • · · 5. ; 30

12. Förfarande enligt patentkrav 11, vilket « . .·. används för pävisande av risk för kancer i livmoder- .···. haisen in vitro, kännetecknat därav, att det • · använda DNA-HPV, DNA fragmentet eller rekombinant-DNA erhällits frän HPV39 (IP5). 35

13. Förfarande enligt patentkrav 11, vilket används för pävisande av risk för kancer i gentialom-rädet in vitro, kännetecknat därav, att den 100407 använda sammansättningen är en sammansättning enligt patentkrav 6.

14. Förfarande enligt patentkrav 11, vilket används för pävisande av godartade papillomavirusin- 5 fektioner in vitro, kännetecknat darav, att det använda DNA-HPV, DNA fragmentet eller rekombinant-DNA har erhällits frän HPV42 (IP6).

15. Förfarande enligt patentkrav 11, vilket används för pävisande av godartade papillomavirusin- 10 fektioner in vitro, kännetecknat därav, att den använda sammansättningen är en sammansättning enligt patentkrav 7. • · * : : • · i « < · » 4 • · « « « • · · • · · • · · II