ES2777652T3 - Modulación de la actividad de proneurotrofinas - Google Patents

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Abstract

Un anticuerpo dirigido contra la parte extracelular de la sortilina y capaz de inhibir la unión de una proneurotrofina a un sitio de unión en el receptor sortilina, en donde el anticuerpo se dirige contra una secuencia que consiste en RGGRIFRSSDFAKNF para uso en el tratamiento de los trastornos neurodegenerativos.

Description

DESCRIPCIÓN
Modulación de la actividad de proneurotrofinas
Campo de la invención
La presente invención se refiere a un anticuerpo dirigido contra la parte extracelular de la sortilina y capaz de inhibir la unión de una proneurotrofina a un sitio de unión en el receptor sortilina, en donde el anticuerpo se dirige contra una secuencia que consiste en RGGRIFRSSDFAKNF para uso en el tratamiento de los trastornos neurodegenerativos.
Antecedentes de la invención
La familia de las neurotrofinas
Las neurotrofinas son hormonas peptídicas dímeras. El primer miembro de la familia de las neurotrofinas que se descubrió fue el factor de crecimiento nervioso (NGF, del inglés “nerve growth factor”), que desempeña un papel importante en procesos tales como el desarrollo de neuronas sensoriales y simpáticas del sistema nervioso periférico (Levi-Montalcini, R. y Angeleeti, P.U., Physiol. Rev. 48, 534-569 (1968)). El siguiente miembro de la familia de las neurotrofinas que se aisló fue el factor neurotrófico derivado del cerebro (BDNF, del inglés “brain-derived neurotrophic factor”), también conocido como neurotrofina-2 (NT-2), cuya secuencia fue publicada por Leibrock, J. et al. en 1989 (Nature 341, 149-152). En 1990, varios grupos identificaron un factor neurotrófico originalmente denominado factor neuronal (NF, del inglés “neuronal factor”), que ahora se conoce como neurotrofina-3 (NT-3) (Ernfors et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87, 5454-5458 (1990); Hohn et al., Nature 344, 339; Mai-sonpierre et al., Science 247, 1446; Rosenthal et al., Neuron 4, 767; Jones y Reichardt, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87, 8060-8064; Kaisho et al., FEBS Lett. 266, 187). Las neurotrofinas 4 y 5 se añadieron después a la familia (Neuron 6, 845-858 (1991); Berkmeier, L. R. et al., Neuron 7, 857-866 (1991); Ip et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89, 3060-3064 (1992)). Los efectos de las neurotrofinas dependen de sus niveles de disponibilidad, la afinidad de su unión a receptores transmembranales y las cascadas de señalización aguas abajo que se estimulan después de la activación del receptor.
Receptores de la familia de las neurotrofinas
De una manera similar a otros factores de crecimiento polipeptídicos, las neurotrofinas influyen en sus células diana a través de interacciones con receptores de la superficie celular. Según los conocimientos actuales, las neurotrofinas se unen a dos tipos de receptores discretos que se pueden distinguir farmacológicamente: los receptores de neurotrofinas Trk y p75NTR. p75NTR es un miembro de la familia de receptores Fas/factor de necrosis tumoral (TNF), y puede interaccionar con todos los miembros mamíferos de la familia de neurotrofinas con afinidades iguales (Rodríguez-Tebar et al. 1990, Neuron 4:487-492; Barker y Murphy, 1992, Mol. Cell. Biochem. 100:1-15). Las células que expresan TrkA, un receptor de tirosina cinasa identificado originalmente como un oncogén humano (Mltin-Zanca et al., Nature 319:743-748) se unen únicamente a NGF y muestran una cinética de disociación significativamente más lenta (Jing et al. 1992, Neurol. 9:1067-1079; Loeb y Greene, 1993, Neuroscience 13: 2919-2929). El BDNF se une solamente al receptor TrkB, pero NT-3 se puede unir a los tres receptores Trk (A, B y C), con preferencia a TrkC. NT-4/5 se puede unir tanto a TrkA como a TrkB (Ip et al. PNAS 89: 3060-3064; Klein et al. Neuron 9:947-956). NT-7 no interacciona con TrkB o TrkC, pero sin embargo puede inducir la fosforilación de tirosina de TrkA, indicando una especificidad de receptor similar a la de NGF (Nilsson et al., FEBS Lett (1998) Mar 13; 424(3):285-90). La NT-6 recombinante purificada también tiene un espectro de acciones similares a NGF pero con una potencia inferior (Gotz et al., Nature (1994) Nov 17; 372(6503):266-9).
La familia de las neurotrofinas: proteínas precursoras
La biología de la familia de las neurotrofinas es compleja: las neurotrofinas se sintetizan intracelularmente como proteínas precursoras de 30-35 kDa, que contienen un péptido señal, un prodominio y sitios de glicosilación. Durante el procesamiento, las proteínas precursoras también se escinden en un sitio de escisión dibásico a través de la furina, una proteasa de serina dependiente de calcio y otros miembros de la familia de convertasas de prohormonas, dentro del aparato de Golgi. El producto C-terminal de esta escisión de 12-14 kDa es la neurotrofina madura, biológicamente activa (Seidah et al., Biochem. J. (1996) 314:951-960).
Funciones clínicamente relevantes de la familia de las neurotrofinas
Las neurotrofinas tienen un interés clínico ya que desempeñan un papel importante en la supervivencia y la diferenciación de las células neuronales (Thoenen 1991, Trends Neurosci. 14: 165-170; Raffioni et al. 1991, Ann. Rev. Biochem. 62:823-850; Chao, 1992, Neuron 9:583-593; Barbacid 1993, Oncogene 8:2033-2042). Los receptores Trk transmiten señales que favorecen la supervivencia neuronal, mientras que p75NTR puede inducir la apoptosis neuronal, así como la supervivencia neuronal en función de la coexpresión de Trk (Miller et al., Cell. Mol. Life Sci.
58:1045-1053 (2001)). Ciertamente, se ha demostrado que la activación de los receptores TrkA puede neutralizar el efecto proapoptótico de p75NTR en algunos tejidos pero no en todos (Yoon et al., J. Neurosci. (1998) 18:3273-3281; Volosin et al., J. Neurosci. (2006) 26:7756-7766).
Se ha demostrado que los propéptidos de las neurotrofinas tienen funciones biológicas importantes: al menos tres proteínas precursoras de neurotrofinas, proNGF, proBDNF y proNT-3 y sus productos homólogos proteolíticamente procesados y maduros, NGF, BDNF, NT-3, activan de forma diferencial respuestas celulares pro- y anti-apoptóticas, a través de una activación preferencial de los receptores p75NTR y Trk, respectivamente - teniendo pro-NGF una afinidad incrementada hacia los receptores p75NTR y una afinidad reducida hacia los receptores Trk, en relación con las formas maduras de NGF. De hecho, se ha demostrado que pro-NGF induce la apoptosis dependiente de p75NTR en neuronas cultivadas con una activación mínima de la diferenciación o la supervivencia mediada por TrkA (Lee et al., Science (2001), 294:1945-1948).
Además, las neurotrofinas tienen un interés clínico, ya que se sabe que tanto la regulación al alza de las neurotrofinas como el aumento de la expresión de p75NTR tienen lugar en condiciones patológicas e inflamatorias, especialmente después de una lesión nerviosa y daño en el sistema vascular. De hecho, Soilu-Hanninen et al. han demostrado que las funciones proapoptóticas de p75NTR están directamente implicadas en la apoptosis inducida por lesión (Soilu-Hanninen et al., J. Neurosci. 19:4824-4838 (1999)). Recientemente, también se ha demostrado que proNGF induce la muerte mediada por p75 de oligodendrocitos y neuronas corticoespinales, después de una lesión de la médula espinal (Beatty et al., Neuron (2002), vol. 36, págs. 375-386; Giehl et al., Proc. Acad. Sci. USA (2004), vol. 101, págs. 6226-30) y la muerte de neuronas del proencéfalo basal como respuesta a convulsiones inducidas por ácido caínico (Volosin et al., J. Neuroscience (2006), vol. 26, págs. 7756- 7766).
Se ha presentado la hipótesis de que un desequilibrio entre el precursor y la forma madura de los factores neurotróficos es responsable de la degeneración de poblaciones neuronales selectivas, como ocurre en la enfermedad de Parkinson, la enfermedad de Alzheimer y la esclerosis lateral amiotrófica, y que la aplicación de un factor neurotrófico correspondiente podría evitar la degeneración neuronal [Appel, S. H., "A unifying hypothesis for the cause of amyotrophic lateral sclerosis, parkinsonism, and Alzheimer's disease", Ann. Neurol. 10:499-505 (1981), Cunello C y Bruno M.A., Neurochem. Res. (2007) 32:1041-45].
Otra razón para el interés en dirigirse a las vías de las neurotrofinas para una terapia, es que los estudios han proporcionado evidencias consistentes de la participación de las neurotrofinas en la depresión y la acción antidepresiva (Duman et al. Arch Gen Psychiatry (1997) 54: 597-606); por ejemplo, la infusión de BDNF en el hipocampo ha producido un efecto antidepresivo en dos modelos de comportamiento de la depresión (Shirayama et al. (2002), J Neurosci 22(8):3251-3261). Además, se ha encontrado que un solo polimorfismo de nucleótidos en el gen bdnf que conduce a una sustitución de valina (Val) por metionina (Met) en el codón 66 en el prodominio (BDNFMet), estaba asociado con una mayor susceptibilidad en los seres humanos heterocigotos hacia el polimorfismo, trastornos neurosiquiátricos incluyendo la enfermedad de Alzheimer, la enfermedad de Parkinson, la depresión y el trastorno bipolar (Chen et al., J. Neuroscience (2005), vol. 25:6156-6166; Kuipers y Bramham Curr. Opin. Drug Discov. Devel. (2006) 9(5):580-6; Bath y Lee, Cogn. Affect. Behav. Neurosci. (2006) 1:79-85). Además, los seres humanos heterocigotos para BDNFMet han mostrado tener alteraciones de la memoria (Egan et al., Cell (2003) 1 vol. 112, págs. 257-269).
La familia de receptores con dominio Vps10p
La sortilina (o NTR-3 o GP95), es un receptor de membrana de tipo I que se expresa en una serie de tejidos, incluyendo el cerebro, la espina dorsal, los testículos y el músculo esquelético (Petersen et al., J. Biol. Chem., 272: 3599-3605 (1997); Herman-Borgmeyer et al., Mol. Brain Res., 65: 216-219 (1999)). La sortilina pertenece a una familia de receptores que comprenden sortilina, SorLA (Jacobsen et al., J. Biol. Chem., 271: 31379-31383 (1996)), SorCS1, SorCS2 y SorCS3. Todos los receptores de esta familia comparten la característica estructural de un dominio N-terminal de aproximadamente 600 aminoácidos con una fuerte semejanza a cada uno de los dos dominios que constituyen la porción luminal del receptor de clasificación de levadura Vps10p (Marcusson, E.G. et al., Cell, 77: 579-586 (1994)). El dominio Vps10p comprende un segmento C-terminal que contiene 10 cisteínas conservadas y un pro-péptido N-terminal de 40-80 aminoácidos.
En la sortilina, el propéptido muestra una elevada afinidad de la unión con el receptor totalmente procesado. La prevención de una escisión del propéptido inhibe esencialmente la unión del ligando a la sortilina, lo que indica que el propéptido impide estéricamente que los ligandos tengan acceso a sus sitios de unión sobre el receptor (Petersen et al., EMBO J., 18: 595-604, 1999).
Se han conseguido algunos progresos en el entendimiento de la función de esta familia: existen evidencias que sugieren que la sortilina contiene al menos motivos YXXO y de dileucina, que conforman señales potentes para la clasificación en endosomas y Golgi (Nielsen et al., EMBO 20(9):2180-2190). Es probable que los otros miembros de la familia también puedan ser útiles en una función de "clasificación" similar, no inferior porque todos muestran homología con Vps10p, el receptor de clasificación para la carboxipeptidasa Y (CPY) en levaduras. Solo una pequeña proporción de los receptores sortilina están presentes sobre la superficie celular (Mazella et al., J. Biol. Chem. (1998) 273, 26273-26276; Morris et al. J. Biol. Chem. (1998) 273: 3582-3587), aunque la expresión sobre la membrana superficial se puede regular al alza mediante estímulos que incluyen insulina en adipocitos 3T3-L1 (Morris et al. J. Biol. Chem. (1998) 273:3582-3587) y neurotensina en neuronas embrionarias (Chabry et al., J. Biol. Chem. (1993), 286: 17138-17144).
Inhibición de la actividad proneurotrofina: el estado actual de la técnica
Ciertamente, el entendimiento actual de las funciones biológicas de las neurotrofinas hace que la familia de las neurotrofinas sea una diana atractiva para la intervención terapéutica, y se conocen algunos métodos para la modulación de la actividad de las neurotrofinas:
Mehar M et al., Eur. J. Neruosci. (2006) 24:1575-1580 y Massa S.M. et al., J. Neurosci. (2006), 26:5288-5300, describen cómo p75 se puede utilizar como una diana de fármaco para interferir con la inducción de la muerte después de la unión del ligando (por ejemplo, proNGF) a p75.
El documento WO 2004/056385 describe métodos generales para inhibir la unión entre los receptores con dominio Vps10-P y neurotrofinas/proneurotrofinas, pero no describe el sitio de unión específico.
Compendio de la invención
Los presentes inventores han identificado ahora el sitio de unión de las proneurotrofinas sobre el receptor sortilina. La presente descripción proporciona agentes que son capaces de inhibir la actividad de una o varias proneurotrofinas en un animal y métodos para el tratamiento de una enfermedad o trastorno en un individuo mediante la inhibición de la actividad de la neurotrofina. Por consiguiente, en un aspecto la presente descripción se refiere a un método para inhibir la actividad de al menos una proneurotrofina en un animal, que comprende administrar a dicho animal una cantidad suficiente de un agente capaz de
(i) unirse a un receptor de la familia de receptores con dominio Vps10p y/o
(ii) interferir en la unión entre un receptor de la familia de receptores con dominio Vps10p y una proneurotrofina y/o
(iii) disminuir la expresión de un receptor de la familia de receptores con dominio Vps10p.
En un aspecto adicional, la descripción proporciona agentes que impiden la interacción física entre p75NTR y sortilina. Otro aspecto de la presente descripción se refiere a un método o uso de al menos un agente capaz de disminuir la actividad de los receptores con dominio Vps10p en la preparación de un medicamento para tratar y/o prevenir y/o mejorar enfermedades, trastornos y degeneración neurológicos, de neuropsiquiatría y/u oculares, obesidad, diabetes, dolor y/o nocicepción en un animal.
También se describen métodos para el escrutinio de agentes capaces de modular la actividad proneurotrofina y agentes seleccionados que emplean estos métodos de escrutinio, ya que son métodos para determinar el efecto de un agente sobre una o varias proneurotrofinas en las células. La presente descripción también se refiere a métodos para modular el transporte de una o varias proneurotrofinas.
También se describen composiciones farmacéuticas que comprenden los agentes y su uso para prevenir, tratar y/o aliviar enfermedades relacionadas con la proneurotrofina.
Descripción detallada de la invención
Definiciones
El término inhibición, tal y como se utiliza en el presente documento, se refiere a la prevención de la unión entre dos o más componentes. En la presente invención, se proporcionan anticuerpos capaces de inhibir la unión entre un receptor con dominio Vps10p y una proneurotrofina.
El término "unión", tal como se emplea en la presente memoria, se refiere a la atracción o unión temporal o de mayor duración entre dos o más restos entre sí, mediada por fuerzas físicas tales como, por ejemplo, interacciones electrostáticas, interacciones hidrofóbicas, interacciones dipolo-dipolo y enlaces de hidrógeno. La expresión "interacción hidrofóbica", tal como se usa en la presente memoria, se refiere a cualquier interacción que se produce entre componentes esencialmente no polares (hidrofóbicos) localizados dentro de sus respectivos alcances de atracción en un entorno polar (por ejemplo, agua). Tal como se usa en la presente memoria, el alcance de la atracción está en una escala de aproximadamente 100 nm. Un tipo particular de interacción hidrofóbica es la ejercida por las "fuerzas de Van der Waals", es decir, las fuerzas de atracción entre moléculas no polares que se contabilizan por mecánica cuántica. Las fuerzas de Van der Waals generalmente se asocian con momentos dipolares puntuales, inducidos por moléculas colindantes y que implican cambios en la distribución electrónica. La expresión "enlace de hidrógeno", tal como se usa en esta memoria, se refiere a una fuerza de atracción, o un puente, que puede producirse entre un átomo de hidrógeno que está enlazado covalentemente con un átomo electronegativo, por ejemplo, oxígeno, azufre o nitrógeno, y otro átomo electronegativo. El enlace de hidrógeno puede tener lugar entre un átomo de hidrógeno de una primera molécula y un átomo electronegativo de una segunda molécula (enlace de hidrógeno intermolecular). También el enlace de hidrógeno se puede producir entre un átomo de hidrógeno y un átomo electronegativo, en donde ambos están contenidos en una sola molécula (enlace de
hidrógeno intramolecular). La expresión "interacción electrostática", tal como se usa en la presente memoria, se
refiere a cualquier interacción que se produce entre componentes cargados, moléculas o iones, debida a fuerzas de
atracción que aparecen cuando los componentes con carga eléctrica opuesta se ven atraídos entre sí. Los ejemplos
incluyen, aunque sin limitación: interacciones iónicas, interacciones covalentes, interacciones entre un ion y un
dipolo (ion y molécula polar), interacciones entre dos dipolos (cargas parciales de moléculas polares), enlaces de
hidrógeno y enlaces de dispersión de London (dipolos inducidos de moléculas polarizables). Por tanto, por ejemplo,
una "interacción iónica" o una "interacción electrostática" se refiere a la atracción entre una primera molécula
cargada positivamente y una segunda molécula cargada negativamente. Las interacciones iónicas o electrostáticas
incluyen, por ejemplo, la atracción entre un agente bioactivo cargado negativamente (ejemplos relevantes en esta
invención). La expresión "interacción dipolo-dipolo", tal como se usa en esta memoria, se refiere a la atracción que
se puede producir entre dos o más moléculas polares. Por tanto, "interacción dipolo-dipolo" se refiere a la atracción
del extremo no cargado parcialmente positivo de una primera molécula polar con el extremo no cargado
parcialmente negativo de una segunda molécula polar. Las "interacciones dipolo-dipolo" también se refieren a
enlaces de hidrógeno intermoleculares.
Equivalentes funcionales y variantes de polinucleótidos que codifican un modulador de la actividad de
proneurotrofina y polipéptidos que comprenden un modulador de la actividad de proneurotrofina de este tipo: en la
presente memoria "equivalentes funcionales" y "variantes" se usan indistintamente en esta memoria. En un aspecto
de la descripción, también se proporcionan variantes de un modulador de la actividad de proneurotrofina y variantes
de fragmentos del mismo. Cuando son polipéptidos, las variantes se determinan en base a su grado de identidad o a
su homología con una secuencia de aminoácidos predeterminada, siendo dicha secuencia de aminoácidos
predeterminada una de SEQ ID NO: modulador de la actividad de proneurotrofina o, cuando la variante es un
fragmento, un fragmento de cualquiera de las secuencias de aminoácido mencionadas anteriormente,
respectivamente.
El término inhibición de la unión entre una proneurotrofina y un receptor sortilina, tal y como se emplea en este
documento, se refiere a un método para proporcionar un agente capaz de evitar la unión de una proneurotrofina con
un receptor sortilina y, en particular, la unión a una parte del receptor sortilina que consiste en
RGGRIFRSSDFAKNF.
Por consiguiente, las variantes preferiblemente presentan al menos un 70% de identidad de secuencia, por ejemplo,
al menos un 72% de identidad de secuencia, por ejemplo, al menos un 75% de identidad de secuencia, por ejemplo,
al menos un 80% de identidad de secuencia, tal como al menos un 85% de identidad de secuencia, por ejemplo, al
menos un 90% de identidad de secuencia, tal como al menos un 91% de identidad de secuencia, por ejemplo, a menos un 91% de identidad
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secuencia, tal como al menos un
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de identidad de secuencia, por ejemplo, a menos un 93% de identidad
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secuencia, tal como al menos un
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de identidad de secuencia, por ejemplo, a menos un 95% de identidad de secuencia, tal como al menos un 96% de identidad de secuencia, por ejemplo, a menos un 97% de identidad de secuencia, tal como al menos un 98% de identidad de secuencia, por ejemplo, un
99% de identidad de secuencia con cualquiera de las secuencias predeterminadas.
La identidad de secuencia se determina en una realización utilizando fragmentos de péptidos de modulador de la
actividad de proneurotrofina que comprenden al menos 25 aminoácidos contiguos y que tienen una secuencia de
aminoácidos que es idéntica en al menos un 80%, tal como un 85%, por ejemplo, un 90%, tal como un 95%, por
ejemplo, un 99%, a la secuencia de aminoácidos de cualquiera de los fragmentos de sortilina descritos en la
presente memoria, en donde el porcentaje de identidad se determina mediante los algoritmos GAP, BESTFIT o
FASTA en el paquete de programas informáticos Wisconsin Genetics versión 7.0, usando los pesos de huecos por
defecto.
Las siguientes expresiones se usan para describir las relaciones de secuencia entre dos o más polinucleótidos:
"secuencia predeterminada", "ventana de comparación", "identidad de secuencia", "porcentaje de identidad de
secuencia" e "identidad sustancial".
Una "secuencia predeterminada" es una secuencia definida, usada como base para una comparación de
secuencias; una secuencia predeterminada puede ser un subconjunto de una secuencia de mayor tamaño, por
ejemplo, como un segmento de una secuencia de ADN de longitud completa o de un gen, dada en un listado de
secuencias, tal como una secuencia de polinucleótido de SEQ ID NO: 1, o puede comprender una secuencia
completa de ADN o génica. Generalmente, una secuencia predeterminada tiene al menos 20 nucleótidos de
longitud, frecuentemente al menos 25 nucleótidos de longitud y de ordinario al menos 50 nucleótidos de longitud.
Puesto que dos polinucleótidos pueden comprender cada uno (1) una secuencia (es decir, una porción de la
secuencia de polinucleótido completa) que es similar entre los dos polinucleótidos, y (2) pueden comprender además
una secuencia que es divergente entre los dos polinucleótidos, las comparaciones de secuencia entre dos (o más)
polinucleótidos se llevan a cabo típicamente comparando secuencias de los dos polinucleótidos en una "ventana de
comparación" para identificar y comparar regiones locales de similitud de secuencia. Una "ventana de comparación",
tal como se usa en la presente memoria, se refiere a un segmento conceptual de al menos 20 posiciones de
nucleótidos contiguos, en donde una secuencia de polinucleótido se puede comparar con una secuencia predeterminada de al menos 20 nucleótidos contiguos y en donde la porción de la secuencia de polinucleótido en la ventana de comparación puede comprender adiciones o deleciones (es decir, huecos) del 20 por ciento o menos, en comparación con la secuencia predeterminada (que no comprende adiciones o deleciones) para un alineamiento óptimo de las dos secuencias.
Un alineamiento óptimo de secuencias para alinear una ventana de comparación se puede realizar mediante el algoritmo de homología local de Smith y Waterman (1981) Adv. Appl. Math. 2: 482, mediante el algoritmo de alineamiento de homología de Needleman y Wunsch (1970) J. Mol. Biol. 48: 443, mediante el método de búsqueda de similitud de Pearson y Lipman (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. (U.S.A.) 85: 2444, mediante implementaciones informatizadas de estos algoritmos (GAP, BESTFIT, FASTA y TFASTA en el paquete de programas informáticos de Wisconsin Genetics versión 7.0, Genetics Computer Group, 575 Science Dr., Madison, Wis) o mediante inspección, y se selecciona el mejor alineamiento (es decir, el que produce el mayor porcentaje de homología en la ventana de comparación) generado por los diversos métodos.
La expresión "identidad de secuencia" significa que dos secuencias de polinucleótidos son idénticas (es decir, en una base nucleótido a nucleótido) en la ventana de comparación. La expresión "porcentaje de identidad de secuencia" se calcula comparando dos secuencias alineadas óptimamente en la ventana de comparación, determinando el número de posiciones en las se da una base de ácido nucleico idéntica (por ejemplo, A, T, C, G, U o I) en ambas secuencias, para proporcionar el número de posiciones coincidentes, dividiendo el número de posiciones coincidentes entre el número total de posiciones en la ventana de comparación (es decir, el tamaño de la ventana) y multiplicando el resultado por 100 para obtener el porcentaje de identidad de secuencia. La expresión "identidad sustancial" tal como se usa en la presente memoria, indica una característica de una secuencia de polinucleótido, en donde el polinucleótido comprende una secuencia que tiene al menos un 85 por ciento de identidad de secuencia, preferiblemente al menos del 90 al 95 por ciento de identidad de secuencia, más habitualmente al menos un 99 por ciento de identidad de secuencia, en comparación con una secuencia predeterminada en una ventana de comparación de al menos 20 posiciones de nucleótidos, frecuentemente en una ventana de al menos 25-50 nucleótidos, en donde el porcentaje de identidad de secuencia se calcula comparando la secuencia predeterminada con la secuencia de polinucleótido que puede incluir deleciones o adiciones con un total del 20 por ciento o menos de la secuencia predeterminada en la ventana de comparación. La secuencia predeterminada puede ser un subconjunto de una secuencia de mayor tamaño, como un segmento de la secuencia del polinucleótido de longitud completa de la secuencia de sortilina.
Tal y como se aplica a los polipéptidos, un grado de identidad de secuencias de aminoácido es una función del número de aminoácidos idénticos en posiciones compartidas por las secuencias de aminoácido. Un grado de homología o de similitud de secuencias de aminoácidos es una función del número de aminoácidos, es decir, está relacionado con la estructura, en posiciones compartidas por las secuencias de aminoácidos.
Una secuencia "no relacionada" o "no homóloga" comparte menos del 40% de identidad, aunque preferiblemente menos del 25% de identidad, con una de las secuencias de polipéptido de modulador de la actividad de proneurotrofina de la presente descripción. La expresión "identidad sustancial" significa que dos secuencias de péptidos, cuando están alineadas de manera óptima, tal como mediante los programas GAP o BESTFIT usando pesos de hueco por defecto, comparten al menos un 80% de identidad de secuencia, preferiblemente al menos un 90 por ciento de identidad de secuencia, más preferiblemente al menos un 95 por ciento de identidad de secuencia o más (por ejemplo, 99 por ciento de identidad de secuencia). Preferiblemente, las posiciones de residuos que no son idénticas difieren en sustituciones conservadoras de aminoácidos.
Las sustituciones conservadoras de aminoácidos se refieren a la posibilidad de intercambiar residuos que tiene cadenas laterales similares. Por ejemplo, un grupo de aminoácidos que tiene cadenas laterales alifáticas es glicina, alanina, valina, leucina e isoleucina; un grupo de aminoácidos que tiene cadenas laterales alifáticas de hidroxilo es serina y treonina; un grupo de aminoácidos que tiene cadenas laterales que contienen amidas es asparagina y glutamina; un grupo de aminoácidos que tiene cadenas laterales aromáticas es fenilalanina, tirosina y triptófano; un grupo de aminoácidos que tiene cadenas laterales básicas es lisina, arginina e histidina; y un grupo de aminoácidos que tiene cadenas laterales que contienen azufre es cisteína y metionina. Los grupos preferidos de sustitución conservadora de aminoácidos son: valina-leucina-isoleucina, fenilalanina-tirosina, lisina-arginina, alanina-valina y asparagina-glutamina.
Adicionalmente, también se determinan variantes en base a un número predeterminado de sustituciones conservadoras de aminoácidos, tal como se define en la presente memoria más adelante. Tal como se usa en esta memoria, una sustitución conservadora de aminoácidos se refiere a la sustitución de un aminoácido (dentro de un grupo de aminoácidos predeterminado) por otro aminoácido (dentro del mismo grupo), en donde los aminoácidos muestran características similares o sustancialmente similares.
Dentro del significado de la expresión "sustitución conservadora de aminoácidos", tal como se aplica en esta memoria, un aminoácido puede estar sustituido por otro dentro de los grupos de aminoácidos indicados en esta memoria a continuación:
i) Aminoácidos que tienen cadenas laterales polares (Asp, Glu, Lys, Arg, His, Asn, Gln, Ser, Thr, Tyr y Cys). ii) Aminoácidos que tienen cadenas laterales no polares (Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Phe, Trp, Pro y Met).
iii) Aminoácidos que tienen cadenas laterales alifáticas (Gly, Ala, Val, Leu, Ile).
iv) Aminoácidos que tienen cadenas laterales cíclicas (Phe, Tyr, Trp, His, Pro).
v) Aminoácidos que tienen cadenas laterales aromáticas (Phe, Tyr, Trp).
vi) Aminoácidos que tienen cadenas laterales ácidas (Asp, Glu).
vii) Aminoácidos que tienen cadenas laterales básicas (Lys, Arg, His).
viii) Aminoácidos que tienen cadenas laterales de amida (Asn, Gln).
ix) Aminoácidos que tienen cadenas laterales hidroxi (Ser, Thr).
x) Aminoácidos que tienen cadenas laterales que contienen azufre (Cys, Met).
xi) Aminoácidos neutros ligeramente hidrofóbicos (Pro, Ala, Gly, Ser, Thr).
xii) Aminoácidos ácidos hidrofílicos (Gln, Asn, Glu, Asp), y
xiii) Aminoácidos hidrofóbicos (Leu, Ile, Val).
Por consiguiente, una variante o un fragmento de la misma puede comprender, dentro de la misma variante de la secuencia o fragmentos de la misma, o entre diferentes variantes de la secuencia o fragmentos de la misma, al menos una sustitución, tal como una pluralidad de sustituciones introducidas independientemente unas respecto a las otras.
Es evidente a partir de lo descrito anteriormente que la misma variante o un fragmento de la misma puede comprender más de una sustitución conservadora de aminoácido entre más de un grupo de aminoácidos conservadores tal como se han definido en esta memoria anteriormente.
La adición o deleción de al menos un aminoácido puede ser una adición o deleción desde preferiblemente 2 a 250 aminoácidos, tal como de 10 a 20 aminoácidos, por ejemplo, de 20 a 30 aminoácidos, tal como de 40 a 50 aminoácidos. Sin embargo, dentro de la presente descripción también se contemplan adiciones o deleciones de más de 50 aminoácidos, tal como adiciones de 50 a 100 aminoácidos, la adición de 100 a 150 aminoácidos, la adición de 150-250 aminoácidos. La deleción y/o la adición pueden ser - independientemente una de la otra - una deleción y/o una adición dentro de una secuencia y/o al final de una secuencia.
Los fragmentos de polipéptido de acuerdo con la presente descripción, incluyendo cualquier equivalente funcional de los mismos, pueden comprender menos de 250 residuos de aminoácido, tal como menos de 240 residuos de aminoácido, por ejemplo, menos de 225 residuos de aminoácido, tal como menos de 200 residuos de aminoácido, por ejemplo, menos de 180 residuos de aminoácidos, tal como menos de 160 residuos de aminoácido, por ejemplo, menos de 150 residuos de aminoácido, tal como menos de 140 residuos de aminoácido, por ejemplo, menos de 130 residuos de aminoácido, tal como menos de 120 residuos de aminoácido, por ejemplo, menos de 110 residuos de aminoácido, tal como menos de 100 residuos de aminoácido, por ejemplo, menos de 90 residuos de aminoácido, tal como menos de 85 residuos de aminoácido, por ejemplo, menos de 80 residuos de aminoácido, tal como menos de 75 residuos de aminoácido, por ejemplo, menos de 70 residuos de aminoácido, tal como menos de 65 residuos de aminoácido, por ejemplo, menos de 60 residuos de aminoácido, tal como menos de 55 residuos de aminoácido, por ejemplo, menos de 50 residuos de aminoácido.
"Equivalencia funcional", tal como se usa en la presente descripción, se establece de acuerdo con una realización preferida mediante una referencia a la funcionalidad correspondiente de un fragmento predeterminado de la secuencia.
Debe entenderse que los equivalentes o variantes funcionales de un modulador de la actividad de proneurotrofina presentan secuencias de aminoácidos que difieren gradualmente de la secuencia de modulador de la actividad de proneurotrofina predeterminada preferida, así como el número y el alcance de las inserciones, deleciones y sustituciones que incluyen un aumento de las sustituciones conservadoras. Esta diferencia se mide como una reducción de la homología entre la secuencia predeterminada preferida y el fragmento o el equivalente funcional. Todos los fragmentos o equivalentes funcionales de modulador de la actividad de proneurotrofina se incluyen dentro del alcance de esta descripción, independientemente del grado de homología que muestren con respecto a las respectivas secuencias de modulador de la actividad de proneurotrofina predeterminadas, descritas en esta memoria. La razón de esto es que algunas regiones del modulador de la actividad de proneurotrofina tienen mayor probabilidad de ser fácilmente mutables, o capaces de estar completamente delecionadas, sin ningún efecto significativo sobre la actividad de unión del fragmento resultante.
Una variante funcional obtenida mediante sustitución puede presentar claramente alguna forma o grado de actividad de modulador de la actividad de proneurotrofina natural, y aun así ser menos homóloga, si se sustituyen los residuos que contienen cadenas laterales de aminoácido funcionalmente similares. En este sentido, funcionalmente similar se refiere a características dominantes de las cadenas laterales, tal como ser hidrofóbicas, básicas, neutras o ácidas, o la presencia o ausencia de masa estérica. Por consiguiente, el grado de identidad no es una medida principal de que un fragmento sea una variante o un equivalente funcional de un fragmento predeterminado preferido.
La homología entre secuencias de aminoácidos se puede calcular usando matrices de puntuación bien conocidas, tales como una cualquiera entre BLOSUM 30, BLOSUM 40, BLOSUM 45, BLOSUM 50, BLOSUM 55, BLOSUM 60, BLOSUM 62, BLOSUM 65, BLOSUM 70, BLOSUM 75, BLOSUM 80, BLOSUM 85 y BLOSUM 90.
Los fragmentos que comparten homología con fragmentos descritos en la presente memoria, respectivamente, deben considerarse dentro del alcance de la presente descripción cuando tienen preferiblemente al menos aproximadamente un 90 por ciento de homología, por ejemplo, al menos un 92 por ciento de homología, tal como al menos un 94 por ciento de homología, por ejemplo, al menos un 95 por ciento de homología, tal como al menos un 96 por ciento de homología, por ejemplo, al menos un 97 por ciento de homología, tal como al menos un 98 por ciento de homología, por ejemplo, al menos un 99 por ciento de homología con dichas secuencias de fragmentos predeterminadas, respectivamente. De acuerdo con un aspecto, los porcentajes de homología se refieren a porcentajes de identidad.
Otros factores adicionales que se pueden tomar en consideración cuando se determina una equivalencia funcional según el significado empleado en la presente memoria son: i) la capacidad de antisueros para detectar un fragmento de modulador de la actividad de proneurotrofina o ii) la capacidad del fragmento de modulador de la actividad de proneurotrofina funcionalmente equivalente para competir con el correspondiente modulador de la actividad de proneurotrofina en un ensayo. Un método para determinar una secuencia de aminoácidos inmunogénicamente activos dentro de una secuencia de aminoácidos conocida, ha sido descrito por Geysen en el documento de Patente de EE.UU. n25.595.915.
Un método adicional adecuadamente adaptable para determinar la estructura y las relaciones funcionales de fragmentos peptídicos se describe en el documento de Patente de EE.UU. n° 6.013.478. Asimismo, los expertos en la técnica también conocen métodos para evaluar la unión de una secuencia de aminoácidos a un resto receptor.
Además de las sustituciones conservadoras introducidas en cualquier posición de un modulador de la actividad de proneurotrofina predeterminado preferido, o de un fragmento del mismo, también puede ser deseable introducir sustituciones no conservadoras en una posición cualquiera, o en varias de dicho modulador de la actividad de proneurotrofina.
Una sustitución no conservadora que conduce a la formación de un fragmento funcionalmente equivalente de un modulador de la actividad de proneurotrofina, por ejemplo, i) diferiría sustancialmente en la polaridad, por ejemplo, un residuo con una cadena lateral no polar (Ala, Leu, Pro, Trp, Val, Ile, Leu, Phe o Met) sustituido por un residuo con una cadena lateral polar tal como Gly, Ser, Thr, Cys, Tyr, Asn o Gln, o por un aminoácido cargado tal como Asp, Glu, Arg o Lys, o sustituyendo un residuo cargado o polar por uno no polar; y/o ii) diferiría sustancialmente en su efecto sobre la orientación de la cadena principal del polipéptido, tal como una sustitución de o por Pro o Gly por otro residuo; y/o iii) diferiría sustancialmente en la carga eléctrica, por ejemplo, una sustitución de un residuo cargado negativamente tal como Glu o Asp por un residuo cargado positivamente tal como Lys, His o Arg (y viceversa); y/o iv) diferiría sustancialmente en la masa estérica, por ejemplo, una sustitución de un residuo voluminosos tal como His, T rp, Phe o Tyr por uno que tenga una cadena lateral menor, por ejemplo, Ala, Gly o Ser (y viceversa).
Las variantes obtenidas mediante sustitución de aminoácidos pueden prepararse, en una realización preferida, en base a los valores de hidrofobicidad e hidrofilicidad y a la similitud relativa de los sustituyentes de cadena lateral de los aminoácidos, que incluyen la carga, el tamaño y similares. Los ejemplos de sustituciones de aminoácidos que toman en consideración varias de las anteriores características, son bien conocidos por los expertos en la técnica e incluyen: arginina y lisina; glutamato y aspartato; serina y treonina; glutamina y asparagina; y valina, leucina e isoleucina.
Además de las variantes descritas en la presente memoria, se pueden formular variantes estéricamente similares para imitar las porciones clave de la estructura de la variante y así dichos compuestos también pueden usarse de la misma manera que las variantes de la descripción. Esto puede lograrse mediante técnicas de modelización y diseño químico, conocidas por los expertos en la técnica.
En un aspecto adicional, la presente descripción se refiere a variantes funcionales que comprenden aminoácidos sustituidos que presentan valores hidrofílicos o índices hidropáticos que están en el intervalo de /-4,9, por ejemplo, dentro del intervalo de /-4,7, tal como dentro del intervalo de /-4,5, por ejemplo, dentro del intervalo de /-4,3, tal como dentro del intervalo de /-4,1, por ejemplo, dentro del intervalo de /-3,9, tal como dentro del intervalo de /-3,7, por ejemplo, dentro del intervalo de /-3,5, tal como dentro del intervalo de /-3,3, por ejemplo, dentro del intervalo de /-3,1, tal como dentro del intervalo de /-2,9, por ejemplo, dentro del intervalo de /-2,7, tal como dentro del intervalo de /-2,5, por ejemplo, dentro del intervalo de /-2,3, tal como dentro del intervalo de /-2,1, por ejemplo, dentro del intervalo de /-2,0, tal como dentro del intervalo de /-1,8, por ejemplo, dentro del intervalo de /-1,6, tal como dentro del intervalo de /-1,5, por ejemplo, dentro del intervalo de /-1,4, tal como dentro del intervalo de /-1,3, por ejemplo, dentro del intervalo de /-1,2, tal como dentro del intervalo de /-1,1, por ejemplo, dentro del intervalo de /-1,0, tal como dentro del intervalo de /-0,9, por ejemplo, dentro del intervalo de /-0,8, tal como dentro del intervalo de /-0,7, por ejemplo, dentro del intervalo de /-0,6, tal como dentro del intervalo de /-0,5, por ejemplo, dentro del intervalo de /-0,4, tal como dentro del intervalo de /-0,3, por ejemplo, dentro del intervalo de /-0,25, tal como dentro del intervalo de /-0,2 del valor del aminoácido que ha sustituido.
La importancia de los índices hidrofílico e hidropático de los aminoácidos a la hora de conferir una función biológica interactiva a una proteína, es bien conocida en la técnica (Kyte y Doolittle, 1982, y Hopp, documento de Patente de EE.UU. n24.554.101).
Los valores de índice hidropático de los aminoácidos tal como se usan en la presente memoria son: isoleucina (+4,5); valina (+4,2); leucina (+3,8); fenilalanina (+2,8); cisteína/cistina (+2,5); metionina (+1,9); alanina (+1,8); glicina (-0,4); treonina (-0,7); serina (-0,8); triptófano (-0,9); tirosina (-1,3); prolina (-1,6); histidina (-3,2); glutamato (-3,5); glutamina (-3,5); aspartato (-3,5); asparagina (-3,5); lisina (-3,9) y arginina (-4,5) (Kyte y Doolittle, 1982).
Los valores de hidrofilicidad de aminoácidos son: arginina (+3,0); lisina (+3,0); aspartato (+3,0 -,1); glutamato (+3,0 -,1); serina (+0,3); asparagina (+0,2); glutamina (+0,2); glicina (0); treonina (-0,4); prolina (-0,5 -,1); alanina (-0,5); histidina (-0,5); cisteína (-1,0); metionina (-1,3); valina (-1,5); leucina (-1,8); isoleucina (-1,8); tirosina (-2,3); fenilalanina (-2,5); triptófano (-3,4) (documento de Patente de EE.UU. n° 4.554.101).
Además de los compuestos de peptidilo descritos en esta memoria, se pueden formular compuestos estéricamente similares para imitar las porciones clave de la estructura peptídica y tales compuestos también se pueden emplear de la misma manera que los péptidos descritos de la descripción.
Esto se puede lograr empleando técnicas de modelización y de diseño químico, conocidas por los expertos en la técnica. Por ejemplo, se puede emplear la esterificación y otras alquilaciones para modificar el extremo amino de, por ejemplo, una cadena peptídica principal de di-arginina, para imitar una estructura de tetrapéptido.
Los péptidos con alquilaciones N-terminales y esterificaciones C-terminales también se incluyen dentro de la presente descripción. Los equivalentes funcionales también comprenden conjugados glicosilados y covalentes o agregados, formados con los mismos, o con otros, fragmentos de modulador de la actividad de proneurotrofina y/o moléculas de modulador de la actividad de proneurotrofina, incluyendo dímeros o restos químicos funcionales no relacionados. Tales equivalentes funcionales se preparan mediante la unión de funcionalidades a grupos presentes en el fragmento, que incluyen uno o ambos extremos N y C, empleando medios conocidos en la técnica.
Por tanto, los equivalentes funcionales pueden comprender fragmentos conjugados con ésteres o amidas alifáticas o de acilo de los extremos carboxilo, alquilaminas o residuos que contengan cadenas laterales de carboxilo, por ejemplo, conjugadas con alquilaminas en residuos de ácido aspártico; derivados de O-acilo de residuos que contengan grupos hidroxilo y derivados de N-acilo de los aminoácidos amino-terminales o de residuos que contengan grupos amino, por ejemplo, conjugados con fMet-Leu-Phe o proteínas inmunogénicas. Los derivados de los grupos acilo se seleccionan a partir del grupo de restos alquilo (que incluyen alquilos C3 a C10 normales), formando de este modo especies de alcanoilo, y compuestos carbocíclicos o heterocíclicos, formando de este modo especies de aroilo. Los grupos reactivos preferiblemente son compuestos difuncionales conocidos de por sí para uso en la reticulación de proteínas en matrices insolubles a través de grupos laterales reactivos.
Los equivalentes funcionales covalentes o agregativos y los derivados de los mismos son útiles como reactivos en inmunoensayos o para procedimientos de purificación por afinidad. Por ejemplo, un fragmento de modulador de la actividad de proneurotrofina de acuerdo con la presente descripción, se puede insolubilizar mediante un enlace covalente a Sefarosa activada con bromuro de cianógeno, empleando métodos conocidos de por sí, o adsorberse a superficies de poliolefinas, con reticulación de glutaraldehído o no, para uso en un ensayo o en una purificación de anticuerpos de modulador de la actividad anti-neurotrofina o en receptores de la superficie celular. Los fragmentos también se pueden marcar con un grupo detectable, por ejemplo, pueden estar radioyodados mediante el procedimiento de cloramina T, ligados covalentemente a quelatos de tierras raras o conjugados con otro resto fluorescente para uso, por ejemplo, en ensayos diagnósticos.
La mutagénesis de un fragmento predeterminado preferido de modulador de la actividad de proneurotrofina se puede llevar a cabo realizando inserciones de aminoácidos, normalmente en el orden de aproximadamente 1 a 10 residuos de aminoácidos, preferiblemente desde aproximadamente 1 a 5 residuos de aminoácidos, o deleciones desde aproximadamente 1 a 10 residuos, tal como desde aproximadamente 2 a 5 residuos.
En una realización, el fragmento de modulador de la actividad de proneurotrofina se sintetiza mediante síntesis automatizada. Se puede emplear cualquiera de las técnicas en fase sólida disponibles comercialmente, tal como el método de síntesis en fase sólida de Merrifield, en el que los aminoácidos se añaden secuencialmente a una cadena de aminoácidos en crecimiento (véase Merrifield, J. Am. Chem. Soc. 85:2149-2146, 1963).
El equipo para la síntesis automatizada de polipéptidos está disponible comercialmente a partir de suministradores tales como Applied Biosystems, Inc. de Foster City, California, y se puede manejar de forma general según las instrucciones del fabricante. La síntesis en fase sólida permitirá la incorporación de sustituciones de aminoácidos deseables en cualquier fragmento de modulador de la actividad de proneurotrofina. Debe entenderse que las sustituciones, deleciones, inserciones o cualquier subcombinación de las mismas se pueden combinar para alcanzar una secuencia final de un equivalente funcional. Debe entenderse que las inserciones incluyen fusiones aminoterminales y/o carboxi-terminales, por ejemplo, con una proteína o un vehículo hidrofóbico o inmunogénico, tal como cualquier polipéptido o estructura de soporte capaz de actuar como vehículo.
También se proporcionan oligómeros que incluyen dímeros que incluyen homodímeros y heterodímeros de fragmentos de modulador de la actividad de proneurotrofina. Los equivalentes funcionales y las variantes de modulador de la actividad de proneurotrofina se pueden producir como homodímeros o heterodímeros con otras secuencias de aminoácido o con secuencias naturales de modulador de la actividad de proneurotrofina. Los heterodímeros incluyen dímeros que contienen fragmentos de modulador de la actividad de proneurotrofina inmunorreactivos, así como fragmentos de modulador de la actividad de proneurotrofina que no necesitan tener o ejercer ninguna actividad biológica.
Los fragmentos de modulador de la actividad de proneurotrofina se pueden sintetizar tanto in vitro como in vivo. El método para la síntesis in vitro es bien conocido, y los métodos que son adecuados o adecuadamente adaptables a la síntesis in vivo de modulador de la actividad de proneurotrofina también se describen en la técnica anterior. Cuando se sintetizan in vivo, una célula hospedadora se transforma con vectores que contienen ADN que codifica modulador de la actividad de proneurotrofina o un fragmento del mismo. Un vector se define como una estructura artificial de ácido nucleico replicable. Los vectores se usan para mediar en la expresión del modulador de la actividad de proneurotrofina. Un vector de expresión es una estructura artificial de ADN replicable en la que una secuencia de ácido nucleico que codifica el fragmento predeterminado de modulador de la actividad de proneurotrofina, o cualquier equivalente funcional del mismo que pueda expresarse in vivo, se liga funcionalmente a secuencias de control adecuadas, capaces de efectuar la expresión del fragmento o del equivalente en un hospedador adecuado. Tales secuencias de control son bien conocidas en la técnica.
Los cultivos de células obtenidas a partir de organismos multicelulares representan células hospedadoras preferidas. En principio, cualquier cultivo de células eucarióticas superiores es factible, tanto de cultivos de vertebrados como de invertebrados. Los ejemplos de líneas celulares hospedadoras útiles son células VERO y HeLa, líneas celulares de ovario de hámster chino (CHO) y líneas celulares WI38, BHK, COS-7, 293 y MDCK. Las células hospedadoras preferidas son células eucarióticas que se sabe que sintetizan modulador de la actividad de proneurotrofina endógeno. Los cultivos de tales células hospedadoras se pueden aislar y emplear como una fuente del fragmento, o usar en métodos terapéuticos de tratamiento, que incluyen métodos terapéuticos dirigidos a promocionar o inhibir un estado de crecimiento, o a métodos diagnósticos llevados a cabo en un organismo humano o animal.
Agente farmacéutico: las expresiones "agente farmacéutico" o "fármaco" o "medicamento" se refieren a cualquier agente terapéutico o profiláctico que se puede usar en el tratamiento (que incluye la prevención, el diagnóstico, el alivio o la cura) de un malestar, aflicción, afección, enfermedad o lesión en un paciente. Los determinantes genéticos, péptidos, polipéptidos y polinucleótidos útiles terapéuticamente se pueden incluir dentro del significado de la expresión producto farmacéutico o fármaco. Tal como se define en esta memoria, un "agente terapéutico", "agente farmacéutico" o "fármaco" o "medicamento" es un tipo de agente bioactivo.
La expresión "agente bioactivo" tal como se emplea en la presente memoria, se refiere a cualquier sustancia que se pueda usar en relación con una aplicación que sea terapéutica o de diagnóstico, tal como por ejemplo, en métodos para diagnosticar la presencia o ausencia de una enfermedad en un paciente y/o métodos para el tratamiento de una enfermedad en un paciente. "Agente bioactivo" se refiere a sustancias que son capaces de ejercer un efecto biológico in vitro y/o in vivo. Los agentes bioactivos pueden ser neutros, cargados negativa o positivamente. Los agentes bioactivos adecuados incluyen, por ejemplo, profármacos, agentes de diagnóstico, agentes terapéuticos, agentes farmacéuticos, fármacos, agentes de aporte de oxígeno, sustitutos sanguíneos, moléculas orgánicas sintéticas, polipéptidos, péptidos, vitaminas, esteroides, análogos de esteroides y determinantes genéticos, que incluyen nucleósidos, nucleótidos y polinucleótidos.
Tratamiento: el término "tratamiento" tal como se usa en la presente memoria, se refiere a un método que implica una terapia que incluye la cirugía de una afección clínica en un individuo que incluye un organismo humano o animal. La terapia puede ser profiláctica, paliativa o curativa, es decir, que reduce el riesgo de adquirir una enfermedad.
ARN antisentido: una molécula de ARN capaz de causar el silenciamiento de un gen mediante la unión específica a una molécula de ARNm de interés.
ADN antisentido: una molécula de ADN capaz de causar el silenciamiento de un gen mediante la unión específica a una molécula de ARNm de interés.
siARN: "ARN de interferencia pequeño" (del inglés "small interfering RNA") es una molécula de ARN de cadena doble, corta (frecuentemente, aunque sin restricción, de menos de 30 nucleótidos de longitud) capaz de causar el silenciamiento específico de un gen en células de mamífero.
''Silenciamiento'' de un gen: un proceso que conduce a una expresión reducida de genes endógenos. El silenciamiento génico preferiblemente es el resultado de una reducción post-transcripcional de la expresión génica. Regulación al alza de la expresión: un proceso que conduce a un aumento de la expresión de genes, preferiblemente de genes endógenos.
In vitro/in vivo: los términos se usan con su significado normal.
Polipéptido: el término “polipéptido” tal como se usa en la presente memoria, se refiere a una molécula que comprende al menos dos aminoácidos. Los aminoácidos pueden ser naturales o sintéticos. "Oligopéptidos" se define en la presente memoria como polipéptidos que tienen una longitud no superior a 100 aminoácidos. El término "polipéptido" también se entiende que incluye proteínas, es decir, biomoléculas funcionales que comprenden al menos un polipéptido; cuando comprenden al menos dos polipéptidos, éstos pueden formar complejos, estar unidos covalentemente o pueden estar unidos no covalentemente. Los polipéptidos en una proteína pueden estar glicosilados y/o lipidados y/o comprender grupos prostéticos.
"Polinucleótido", tal como se emplea en la presente memoria, se refiere a una molécula que comprende al menos dos ácidos nucleicos. Los ácidos nucleicos pueden existir de forma natural o pueden estar modificados, tal como ácidos nucleicos cerrados (LNA, del inglés "locked nucleic acids"), o ácidos nucleicos peptídicos (PNA, del inglés "peptide nucleic acids"). Polinucleótido, tal como se usa en la presente memoria, generalmente pertenece a:
i) un polinucleótido que comprende una secuencia codificante predeterminada, o
ii) un polinucleótido que codifica una secuencia de aminoácidos predeterminada, o
iii) un polinucleótido que codifica un fragmento de un polipéptido codificado por polinucleótidos (i) o (ii), en donde dicho fragmento tiene al menos una actividad predeterminada como la especificada en la presente memoria; y
iv) un polinucleótido cuya cadena complementaria se hibrida en condiciones restrictivas con un polinucleótido como el definido en una cualquiera de (i), (ii) y (iii), y que codifica un polipéptido, o un fragmento del mismo, que tiene al menos una actividad predeterminada como la especificada en la presente memoria; y
v) un polinucleótido que comprende una secuencia de nucleótidos que está degenerada respecto a la secuencia de nucleótidos de los polinucleótidos (iii) o (iv); o la cadena complementaria de un polinucleótido de este tipo.
Un "anticuerpo purificado" es un anticuerpo en el que al menos el 60 por ciento en peso está exento de polipéptidos y moléculas orgánicas naturales con las que se asocia de forma natural. Preferiblemente, la preparación comprende un anticuerpo en una cantidad de al menos el 75 por ciento en peso, más preferiblemente de al menos el 90 por ciento en peso, y aún más preferiblemente de al menos el 99 por ciento en peso.
Descripción detallada
Los presentes inventores han identificado que las proneurotrofinas se unen al receptor sortilina de la familia de receptores con dominio Vps10p, lo que da como resultado una apoptosis cuando se forma un complejo ternario con la unión conjunta de p75NTR.
Por consiguiente, la presente descripción se refiere a la modulación de la actividad de al menos una proneurotrofina. Sin pretender establecer una teoría, se cree que la familia de receptores con dominio Vps10p está implicada en uno o varios de los siguientes mecanismos relativos a las proneurotrofinas:
- Transporte retrógrado, que incluye la captación de proneurotrofina y p75NTR.
- Transporte dentro de rutas biosintéticas, que incluye la clasificación de proneurotrofina y el transporte desde la red de Golgi.
- Liberación de proneurotrofinas.
- Señalización, que incluye la modulación del transporte celular y la señalización mediante formación de complejos ternarios con p75 y proneurotrofina.
Por lo tanto, un aspecto de la presente descripción es un método para modular la actividad de al menos una proneurotrofina en una única célula o un organismo, incluyendo un animal, que comprende administrar a dicho animal una cantidad suficiente de un agente capaz de unirse a un receptor de la familia de receptores con dominio Vps10p o capaz de interferir en la unión entre un receptor de la familia de receptores con dominio Vps10p y una proneurotrofina.
Receptores de la familia de receptores con dominio Vps10p
La expresión "receptor de la familia Vps10p" se refiere a una familia de receptores que se caracteriza por tener un dominio Vps10p N-terminal; dicha familia con dominio Vpsp10p comprende SorLA, sortilina, SorCS1, SorCS2 o SorCS3. En una realización de la presente invención, se puede usar cualquiera de los receptores de la familia con dominio Vps10p; más preferiblemente, el receptor comprende el dominio Vps10p, el módulo 10CC, un segmento transmembranal, así como un segmento citoplásmico que media en la clasificación celular y en la internalización, así como en la unión de adaptadores citoplásmicos que afectan a la señalización celular. En particular, el receptor usado es sortilina.
Neurotrofinas/proneurotrofinas
El término "neurotrofina", tal como se usa en la presente memoria, se refiere a cualquier miembro de la familia de las neurotrofinas, comprendiendo dicha familia de neurotrofinas el factor de crecimiento neural (NGF), el factor neurotrófico derivado del cerebro (BDNF), la neurotrofina-3 (NT-3) y la neurotrofina-4/5 (NT-4/5). En un aspecto, se puede usar cualquier miembro de la familia de las neurotrofinas; sin embargo, se prefiere que la neurotrofina sea NGF o BDNF.
El término "proneurotrofina", tal como se usa en la presente memoria, se puede referir a cualquier familia de proneurotrofinas, que comprende un prodominio ligado funcionalmente a la neurotrofina madura correspondiente, en donde dicha familia de proneurotrofinas comprende pro-NGF, pro-BDNF, pro-NT-3 y pro-NT-4/5. Se puede usar cualquier proneurotrofina, sin embargo se prefiere que la proneurotrofina sea pro-NGF o pro-BDNF.
Inhibición de la actividad de proneurotrofina
Las expresiones "actividad mediada por neurotrofina", "actividad de una neurotrofina" o "actividad de proneurotrofina" se refieren a una actividad biológica que normalmente se ve favorecida, tanto directa como indirectamente, en presencia de una neurotrofina o una proneurotrofina. Las actividades de proneurotrofina incluyen, aunque sin restricción, la activación diferencial de respuestas celulares tanto pro-apoptóticas como anti-apoptóticas, a través de la activación preferencial de receptores p75NTR o TrkA, respectivamente. Se ha propuesto la hipótesis de que la carencia de factores neurotróficos es responsable de la degeneración de poblaciones neuronales selectivas, ya que se produce en la enfermedad de Parkinson, la enfermedad de Alzheimer y la esclerosis lateral amiotrófica. En aspectos preferidos descritos, una o varias de estas actividades de proneurotrofina(s) están inhibidas directa o indirectamente mediante la administración de un agente a un animal.
Los términos "inhibición" o "inhibido" se refieren a cualquier disminución de la actividad biológica de un agente bioactivo, por ejemplo, una proneurotrofina. En un aspecto de la descripción, una inhibición de este tipo se refiere a una disminución de la unión de una proneurotrofina a un receptor con dominio Vps10p, especialmente la unión de un pro-NGF o un pro-BDNF a un receptor sortilina. La eficacia del efecto inhibidor de agentes se puede medir mediante experimentos de inhibición competitiva usando BIAcore (resonancia de plasmón superficial).
Agentes capaces de inhibir la unión de una proneurotrofina a un receptor con dominio Vps10p
En un aspecto preferido, se administra un agente al animal, siendo capaz dicho agente de inhibir la unión entre un receptor de la familia de receptores con dominio Vps10p y una proneurotrofina.
En otro aspecto igualmente preferido, el agente es capaz de unirse a un receptor de la familia de receptores con dominio Vps10p y/o proneurotrofina, interfiriendo de ese modo con la actividad de una proneurotrofina, ya sea directa o indirectamente.
El agente capaz de mostrar uno o varios de los efectos mencionados anteriormente puede ser cualquier tipo de agente, por ejemplo, el agente se puede seleccionar a partir del grupo que comprende proteínas, péptidos, polipéptidos o moléculas orgánicas. En una realización preferida, el agente es un anticuerpo, un compuesto o un polipéptido, y el agente es lo más preferiblemente un polipéptido o una molécula orgánica. Dichos agentes se pueden unir a cualquiera de las siguientes secuencias:
Sortilina: RIFRSSDFAKNF
SorLA: YLWITFDFCNTL
SorCS1: SLLISSDEGATY
SorCS2: SLFLSADEGATF
SorCS3: SILISSDEGATY
Los agentes de la descripción inhiben la unión de una proneurotrofina a las secuencias anteriores, evitando de este modo que el complejo binario proneurotrofina:receptor con dominio Vps10p lleve a cabo una actividad biológica o fisiológicamente relevante, por lo que los agentes se pueden usar para prevenir enfermedades y trastornos como se especifica en esta memoria a continuación.
En un aspecto particularmente preferido, el agente que se administra al animal es capaz de inhibir la unión de una proneurotrofina a un receptor sortilina, inhibiendo de este modo la actividad del receptor, dicha actividad puede ser, pero no se limita a, una o varias de las siguientes:
i) clasificación celular del receptor
ii) unión al receptor directa o indirectamente poniendo en contacto el ligando con otros receptores, tales como los receptores p75 y Trk
iii) señalización del receptor sortilina
En un aspecto el agente es capaz de inhibir la unión de una proneurotrofina a un receptor de la familia de receptores con dominio Vps10p. Tal inhibición puede ser debida, por ejemplo, a la unión del agente a la proneurotrofina y/o al receptor con dominio Vps10p, tal como el receptor sortilina.
En un aspecto el agente es un fragmento o una variante del dominio Vps10p del receptor sortilina, siendo dicho fragmento o variante capaz de unirse al prodominio de una proneurotrofina o a un fragmento o una variante del mismo. En particular, el agente incluye, pero no se limita a los fragmentos FANKNFV, RIFR y RIFRSSDF como se muestra en la figura 17 que describe el análisis de la longitud del prodominio-BDNF que se une a péptidos de sortilina. Cualquier fragmento o variante capaz de unirse a una proneurotrofina se incluye en el presente documento. Este dominio se denomina en esta memoria el motivo que se une a proneurotrofina con dominio Vps10p. Los péptidos pueden tener al menos 3 residuos de longitud, tal como 5 residuos de longitud, tal como 7 residuos de longitud, tal como 10 residuos de longitud, tal como 13 residuos de longitud, tal como 15 residuos de longitud, tal como 20 residuos de longitud, tal como 25 residuos de longitud, tal como 30 residuos de longitud, tal como 35 residuos de longitud, tal como 40 residuos de longitud, tal como 50 residuos de longitud, tal como 60 residuos de longitud, tal como 70 residuos de longitud, tal como 80 residuos de longitud, tal como al menos 90 residuos de longitud, tal como 100 residuos de longitud, tal como 125 restos de longitud, tales como 150 residuos de longitud, tal como 175 restos de longitud, tal como 200 residuos R196 tal y como se hace el recuento usando pre-prosortilina (se corresponde a R163 para prosortilina) de una manera que conserva la capacidad de unirse a BDNF, puede estar sustituido con cualquiera entre F, G, H, I, L, N, P, Q, T, V, W o Y, y preferiblemente está sustituido con F, H, I, L, V, W o Y. I197, tal y como se hace el recuento usando pre-prosortilina (se corresponde a I164 para prosortilina) está preferiblemente sustituido, por lo tanto, con A, F, G, H, P, R, S, T, V o Y; F198, tal y como se hace el recuento usando pre-prosortilina (se corresponde a F165 para prosortilina) está preferiblemente sustituido con I, L, R o W; R199, tal y como se hace el recuento usando pre-prosortilina (se corresponde a R166 para proSortilina) está preferiblemente sustituido con A, D, F, G, H, I, L, S, T, V, W o Y; F203, tal y como se hace el recuento usando preprosortilina (se corresponde a F170 para prosortilina) está preferiblemente sustituido con L, P o R; A204, tal y como se hace el recuento usando pre-prosortilina (se corresponde a A171 para prosortilina) está preferiblemente sustituido con D, E, G, H, I, K, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W o Y; K205, tal y como se hace el recuento usando pre-prosortilina (se corresponde a K172 para prosortilina) está preferiblemente sustituido con A, F, G, H, I, L, M, N, P, Q, R, S, T, V, W o Y; N206, tal y como se hace el recuento usando pre-prosortilina (se corresponde a N173 para prosortilina) está preferiblemente sustituido con A, F, G, H, I, K, L, M, P, Q, R, S, T o V; y F207, tal y como se hace el recuento usando pre-prosortilina (se corresponde a F174 para prosortilina) está preferiblemente sustituido con H, I, K, L, N, P, Q, R o V. Cualquiera de estas sustituciones se puede realizar de forma aislada o en combinación con cualquiera de las otras sustituciones preferidas o cualquiera de los otros métodos para generar variantes, como se han mencionado en el presente documento.
En otra realización, el agente es capaz de unirse al receptor. El agente se puede unir a cualquier parte del receptor relevante para inhibir la unión de la neurotrofina. En consecuencia, el agente puede ser capaz de inhibir la unión de dicha neurotrofina o dicha proneurotrofina a un receptor de la familia de receptores con dominio Vps10p mediante la unión a una parte intracelular del receptor.
Un objeto de la descripción es proporcionar agentes que solos o ayudados por un agente/formulación farmacéutica, son capaces de cruzar la barrera hematoencefálica.
Un ejemplo de un agente según la invención es un anticuerpo dirigido contra una parte extracelular del receptor como se define en las reivindicaciones adjuntas. En una realización incluso aún más preferida, el anticuerpo está purificado.
En particular, el anticuerpo se dirige contra una posición en este motivo, de manera que el anticuerpo bloquea estéricamente la unión de la proneurotrofina con el receptor.
La neurotensina y los moduladores del sistema de neurotensina se unen a receptores con dominio Vps10-p, por ejemplo, el receptor sortilina o fragmentos de los mismos, evitando de este modo que cualquier ligando normal y/o natural se una a sortilina, actuando así como antagonistas de las neurotrofinas que, de otra manera, interaccionarían con sortilina y los fragmentos descritos en este documento de la misma. Además, dicha neurotensina y moduladores del sistema de neurotensina se pueden unir a un sitio de unión alternativo del receptor sortilina, induciendo cambios conformacionales que afectan a la afinidad de la unión entre neurotrofinas y sortilina de una manera antagónica. Dicha neurotensina y moduladores del sistema de neurotensina son capaces preferiblemente de cruzar la barrera hematoencefálica, y de los receptores con dominio Vps10p se unen preferiblemente a sortilina. En todavía una realización preferida, la neurotensina y los moduladores del sistema de neurotensina no tienen ninguna afinidad de unión significativa o efectos adversos después de la unión con otros receptores con dominio Vps10p o de hecho otros receptores distintos de sortilina.
Los receptores con dominio Vps10p, especialmente sortilina, identificada inicialmente como receptor de neurotensina 3 (NTR-3), tienen especificidad de sustrato que se solapa parcialmente con los receptores de neurotensina 1 y 2 (NTR-1 y NTR-2), uniéndose ambos a NT(1-13) con alta afinidad. Además, una serie de moduladores del sistema de neurotensina son ligandos conocidos de NTR-1 y NTR-2. Ejemplos de los mismos son PD-156425 de la estructura:
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y los compuestos SR-142948A, SR-48692, UK-73093 y L-737631.
Por derivados se entienden compuestos que conservan una parte sustancial y/o significativa de la estructura de los compuestos mencionados, pero que están sustituidos de manera diferente, es decir, que comprenden otros sustituyentes. Los derivados pueden ser también moléculas que son capaces de interaccionar de la misma manera que el compuesto de origen, es decir, interaccionan con los mismos residuos sobre el receptor con dominio Vps10p. Ejemplos de tales sustituyentes comprenden y no se limitan a: grupos alicíclicos: la expresión "grupo alicíclico" significa un grupo hidrocarburo cíclico que tiene propiedades parecidas a las de los grupos alifáticos. Grupos alifáticos: en el contexto de la presente descripción, la expresión "grupo alifático" significa un grupo hidrocarburo saturado o insaturado, lineal o ramificado. Esta expresión se usa para incluir grupos alquilo, alquenilo y alquinilo, por ejemplo. Grupos alquilo: la expresión "grupo alquilo" significa un grupo hidrocarburo saturado, lineal o ramificado que incluye, por ejemplo, metilo, etilo, isopropilo, t-butilo, heptilo, dodecilo, octadecilo, amilo, 2-etilhexilo y similares. Grupos alquenilo: la expresión "grupo alquenilo" significa un grupo hidrocarburo insaturado, lineal o ramificado con uno o varios dobles enlaces carbono-carbono, tal como un grupo vinilo. Grupos alquinilo: la expresión "grupo alquinilo" significa un grupo hidrocarburo insaturado, lineal o ramificado con uno o varios triples enlaces carbonocarbono; anfífilos: sustancia que contiene grupos tanto polares y solubles en agua como no polares insolubles en agua. Grupo aromático: la expresión "grupo aromático" o "grupo arilo" significa un grupo hidrocarbonado aromático, monocíclico o policíclico. Grupos cíclicos: la expresión "grupo cíclico" significa un grupo hidrocarburo de anillo cerrado que se clasifica como un grupo alicíclico, grupo aromático o grupo heterocíclico. Cicloalquenilos: significa un radical carbocíclico monovalente insaturado que consiste en uno, dos o tres anillos, de tres a ocho carbonos por anillo, que puede estar opcionalmente sustituido con uno o dos sustituyentes, seleccionados a partir del grupo que consiste en hidroxi, ciano, alquenilo inferior, alcoxi inferior, haloalcoxi inferior, alqueniltio, halo, haloalquenilo, hidroxialquenilo, nitro, alcoxicarbonenilo, amino, alquenilamino, alquenilsulfonilo, arilsulfonilo, alquenilaminosulfonilo, arilaminosulfonilo, alquilsulfonilamino, arilsulfonilamino, alquenilaminocarbonilo, arilaminocarbonilo, alquenilcarbonilamino y arilcarbonilamino. Cicloalquilos: significan un radical carbocíclico monovalente saturado, que consiste en uno, dos o tres anillos, de tres a ocho carbonos por anillo, que pueden estar opcionalmente sustituidos con uno o dos sustituyentes seleccionados a partir del grupo que consiste en hidroxi, ciano, alquilo inferior, alcoxi inferior, haloalcoxi inferior, alquiltio, halo, haloalquilo, hidroxialquilo, nitro, alcoxicarbonilo, amino, alquilamino, alquilsulfonilo, arilsulfonilo, alquilaminosulfonilo, arilaminosulfonilo, alquilsulfonilamino, arilsulfonilamino, alquilaminocarbonilo, arilaminocarbonilo, alquilcarbonilamino y arilcarbonilamino. Grupos catiónicos: un grupo químico capaz de actuar como un donante de protones cuando un compuesto que comprende el grupo químico se disuelve en un disolvente, preferiblemente cuando se disuelve en agua. En general, un "Grupo" / Resto / sustituto se entiende bien en esta área técnica, y no solo se tolera un alto grado de sustitución, sino que frecuentemente es recomendable. Se prevé una sustitución en los materiales de la presente descripción.
Como un modo de simplificar la exposición y la descripción de cierta terminología utilizada en toda esta solicitud, los términos "grupo" y "resto" se usan para diferenciar entre especies químicas que permiten una sustitución o que pueden estar sustituidas y las que no lo permiten o no se pueden sustituir de ese modo. Por lo tanto, cuando se emplea el término "grupo" para describir un sustituyente químico, el material químico descrito incluye el grupo no sustituido y ese grupo con átomos de O, N o S, por ejemplo, en la cadena, así como grupos carbonilo u otra sustitución convencional. Cuando el término "resto" se utiliza para describir un compuesto químico o un sustituyente, únicamente se pretende incluir un material químico no sustituido. Por ejemplo, la expresión "grupo alquilo" se entiende que incluye no solo sustituyentes puros de alquilo hidrocarbonado, de cadena abierta, saturados, tales como metilo, etilo, propilo, t-butilo y similares, sino también sustituyentes de alquilo que son portadores de sustituyentes adicionales conocidos en la técnica, tal como hidroxi, alcoxi, alquilsulfonilo, átomos de halógeno, ciano, nitro, amino, carboxilo, etc. Por lo tanto, "grupo alquilo" incluye grupos éter, haloalquilos, nitroalquilos, carboxialquilos, hidroxialquilos, sulfoalquilos, etc. Por otra parte, la expresión "resto alquilo" se limita a la inclusión de sustituyentes puros de alquilo hidrocarbonado, de cadena abierta saturados, tales como metilo, etilo, propilo, t-butilo y similares. Las mismas definiciones se aplican a "grupo alquenilo" y "resto alquenilo"; a "grupo alquinilo" y "resto alquinilo"; a "grupo cíclico" y "resto cíclico; a "grupo alicíclico" y "resto alicíclico"; a "grupo aromático" o a "grupo arilo" y a "resto aromático" o "resto arilo"', así como a "grupo heterocíclico" y "resto heterocíclico". Grupo heterocíclico: la expresión '"grupo heterocíclico"' significa un hidrocarburo de anillo cerrado en el que uno o varios de los átomos en el anillo es un elemento distinto de carbono (por ejemplo, nitrógeno, oxígeno, azufre, etc.). Heterociclilo significa un radical cíclico monovalente saturado, que consiste en uno a dos anillos, de tres a ocho átomos por anillo, que incorpora uno o dos heteroátomos en el anillo (seleccionados entre N, O o S(O)0-2, y que pueden estar opcionalmente sustituidos con uno o dos sustituyentes, seleccionados a partir del grupo que consiste en hidroxilo, oxo, ciano, alquilo inferior, alcoxi inferior, haloalcoxi inferior, alquiltio, halo, haloalquilo, hidroxialquilo, nitro, alcoxicarbonilo, amino, alquilamino, alquilsulfonilo, arilsulfonilo, alquilaminosulfonilo, arilaminosulfonilo, alquilsulfonilamino, arilsulfonilamino, alquilaminocarbonilo, arilaminocarbonilo, alquilcarbonilamino o arilcarbonilamino. Heteroarilo significa un radical cíclico aromático monovalente que tiene de uno a tres anillos, de cuatro a ocho átomos por anillo, que incorpora uno o dos heteroátomos (seleccionados entre nitrógeno, oxígeno o azufre) en el anillo que opcionalmente puede estar sustituido con uno o dos sustituyentes seleccionados a partir del grupo que consiste en hidroxi, ciano, alquilo inferior, alcoxi inferior, haloalcoxi inferior, alquiltio, halo, haloalquilo, hidroxialquilo, nitro, alcoxicarbonilo, amino, alquilamino, alquilsulfonilo, arilsulfonilo, alquilaminosulfonilo, arilaminosulfonilo, alquilsulfonilamino, arilsulfonilamino, alquilaminocarbonilo, arilaminocarbonilo, alquilcarbonilamino y arilcarbonilamino. Alquilo inferior sustituido significa un alquilo inferior que tiene de uno a tres sustituyentes seleccionados a partir del grupo que consiste en hidroxilo, alcoxi, amino, amido, carboxilo, acilo, halógeno, ciano, nitro y tiol. Variantes, fragmentos o péptidos que comprenden los péptidos moduladores del sistema de neurotensina se pueden generar mediante sustitución conservadora de aminoácidos, tal y como se ha definido anteriormente o mediante la inclusión y/o sustitución de cualquiera de los residuos por cualquier aminoácido de origen natural L- o D­ o cualquier derivado de aminoácido sintético. Además, los enlaces entre los residuos en los aminoácidos mencionados se pueden alterar formando enlaces no amida ligados a péptidos de aminoácidos.
Los compuestos SR-142948A, SR-48692, UK-73093 y L-737631 y derivados o variantes de los mismos, son agentes de la presente descripción. Los agentes preferidos son SR-48692, NT-69L y CGX-1160 y/o variantes de los mismos. En otro aspecto preferido, el agente es capaz de unirse a una parte intracelular del receptor y/o a la parte transmembranal de un receptor de la familia de receptores con dominio Vps10p. En particular, el agente puede ser capaz de unirse a la parte citoplásmica del receptor de la familia de receptores con dominio Vps10p, tal como a una parte de sortilina.
En particular, la unión de un agente a las partes intracelulares o transmembranales del receptor puede conducir a una modulación de la actividad de la proneurotrofina a través de una modulación del transporte de al menos una proneurotrofina hacia fuera, hacia dentro o en el interior de células que expresan el receptor de la familia de receptores con dominio Vps10p, tal como se describe más adelante.
En otro aspecto preferido, el agente es capaz de modular la expresión de un receptor de la familia de receptores con dominio Vps10p y con ello de interferir en la actividad de al menos una proneurotrofina. La modulación puede ser bien una inhibición o bien una estimulación de la expresión. Los métodos preferidos para modular la expresión del receptor incluyen, aunque sin restricción:
(i) Bloquear o inhibir la actividad de los productos de traducción de uno o varios genes del receptor con dominio Vps10p y/o uno o varios derivados de los mismos, mediante la inhibición de la traducción de ARNm o la activación transcripcional usando ácidos nucleicos antisentido.
(ii) Inactivar el ARNm mediante ribozimas dirigidas a los ARNms que codifican uno o varios genes del receptor con dominio Vps10p y/o uno o varios derivados de los mismos.
(iii) Inhibición de los productos de traducción presentes intracelularmente de los genes del receptor con dominio Vps10p mediante la administración de moléculas que imitan dianas de los productos de traducción de uno o varios genes del receptor con dominio Vps10p y/o uno o varios derivados de los mismos, compitiendo con ello con sus dianas naturales.
(iv) Estimular la expresión de uno o varios genes del receptor con dominio Vps10p y/o uno o varios derivados de los mismos, por ejemplo, en una realización preferida se administra un agente a las células in vitro o in vivo.
Tal agente puede actuar específicamente o no específicamente. También es posible activar genes responsables de un crecimiento adicional de tejido diferenciado mediante la introducción de uno o varios genes del receptor con dominio Vps10p y/o uno o varios derivados de los mismos en las respectivas células y tejidos mediante terapia génica. Para este fin, las respectivas secuencias de ácido nucleico pueden ponerse bajo el control de un promotor fuerte, que opcionalmente se puede activar y desactivar con la administración de un estímulo a la célula/tejido.
(v) Estimular la expresión de uno o varios genes del receptor con dominio Vps10p y/o uno o varios derivados de los mismos mediante la administración directa a la respectiva célula/tejido de un producto de traducción, bien un péptido o bien una proteína, que se ha obtenido a partir de uno o varios genes de receptor con dominio Vps10p y/o uno o varios derivados de los mismos. Debido al bajo peso molecular de cualquiera de los productos de traducción mencionados anteriormente, estos péptidos/proteínas pueden aplicarse fácilmente a la célula, por ejemplo, usando sistemas de administración mediante encapsulación.
El cambio en el nivel de expresión del receptor de la familia de receptores con dominio Vps10p puede determinarse usando métodos conocidos por los expertos en la técnica, que incluyen, aunque sin restricción: matrices o micromatrices de ADN (Brazma y Vilo, FeBS Lett., 2000, 480, 17-24; Celis, et al., FEBS Lett., 2000, 480, 2-16), SAGE (análisis en serie de expresión génica) (Madden et al., Drug Discov. Today, 2000, 5, 415-425), READS (amplificación de enzimas de restricción de ADNc digeridos) (Prashar y Weissman, Methods Enzymol., 1999, 303, 258-72), TOGA (análisis de expresión génica total) (Sutcliffe et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2000, 97, 1976-81), sistemas de proteínas y proteómica (Celis et al., FEBS Lett., 2000, 480, 2-16; Jungblut et al., Electrophoresis, 1999, 20, 2100-10), secuenciación de marcadores de secuencia expresada (EST) (Celis et al., FEBS Lett., 2000, 480, 2­ 16; Larsson et al., J. Biotechnol., 2000, 80, 143-57), huella génica de ARN sustractiva (SuRF) (Fuchs et al., Anal. Biochem., 2000, 286, 91-98; Larson et al., Cytometr y, 2000, 41, 203-208), clonación sustractiva, visualización diferencial (DD) (Jurecic y Belmont, Curr. Opin. Microbiol., 2000, 3, 316-21), hibridación genómica comparativa (Carulli et al., J. Cell Biochem. Suppl., 1998, 31, 286-96), técnicas FISH (hibridación fluorescente in situ) (Going y Gusterson, Eur. J. Cancer, 1999, 35, 1895-904) y métodos de espectrometría de masas (revisados en To, Comb. Chem. High Throughput Screen, 2000, 3, 235-41).
Métodos para tratar una enfermedad o un trastorno
Se describe además en la presente memoria, un método para tratar una enfermedad o un trastorno en un individuo. Dicho método comprende administrar a dicho individuo, en un vehículo farmacéuticamente aceptable, una cantidad suficiente de un agente capaz de interferir con la unión entre un receptor de la familia de receptores con dominio Vps10p y una proneurotrofina. Por "cantidad suficiente" en el presente documento se entiende una dosis que produce los efectos terapéuticos para los cuales se administra. La dosis exacta dependerá del trastorno a tratar, y será averiguada por un experto en la técnica usando técnicas conocidas. En general, el agente se administra a un animal en una cantidad desde 1 pg/kg a aproximadamente 100 mg/kg por día. Además, como se conoce en la técnica, pueden ser necesarios ajustes para la edad, así como el peso corporal, la salud general, el sexo, la dieta, el tiempo de administración, la interacción con fármacos y la gravedad de la enfermedad, y se determinarán con una experimentación de rutina por los expertos en la técnica.
Los agentes de la presente descripción son considerados útiles para la promoción del desarrollo, el mantenimiento o la regeneración de neuronas in vitro e in vivo, incluyendo neuronas centrales (cerebro y espina dorsal), periféricas (neuronas simpáticas, parasimpáticas, sensoriales y entéricas) y motoras. Por consiguiente, los agentes se pueden utilizar en métodos para el tratamiento de una variedad de enfermedades, trastornos y degeneración neurológicos. En una realización preferida, las formulaciones se administran a un paciente para tratar trastornos neurales. Por "trastornos neurales" se entiende en esta memoria trastornos del sistema nervioso central y/o periférico que estén asociados a una degeneración o daño neuronal. Los ejemplos específicos de trastornos neurales incluyen, aunque sin limitación, la enfermedad de Alzheimer, la enfermedad de Parkinson, la corea de Huntington, el ictus, eLa , neuropatías periféricas y otras afecciones que se caracterizan por necrosis o pérdida de neuronas, tanto de neuronas centrales como periféricas o motoras, además de tratar nervios dañados debido a un traumatismo, quemaduras, disfunción o lesión renal, disfunción o lesión pancreática, disfunción o lesión pulmonar, lesión en tejidos adiposos y efectos tóxicos de agentes quimioterapéuticos usados para tratar el cáncer o el SIDA. Por ejemplo, las neuropatías periféricas asociadas a determinadas afecciones, tales como las neuropatías asociadas con la diabetes, el SIDA o la quimioterapia, pueden tratarse usando las formulaciones de la presente descripción.
En diversos aspectos, se administran agentes a pacientes en los que el sistema nervioso ha sido dañado por traumatismo, cirugía, ictus, isquemia, infección, enfermedad metabólica, deficiencia nutricional, cáncer o agentes tóxicos, para favorecer la supervivencia o el crecimiento de las neuronas, o en cualquier afección que es tratable con NGF, NT-3, BDNF o NT4-5. Por ejemplo, los agentes se pueden utilizar para favorecer la supervivencia o el crecimiento de neuronas motoras que están dañadas por traumatismo o cirugía. También, los agentes se pueden utilizar para tratar trastornos de neuronas motoras, tales como esclerosis lateral amiotrófica (enfermedad de Lou Gehrig), parálisis de Bell y varias afecciones que implican atrofia muscular espinal, o parálisis. Los agentes se pueden utilizar para tratar trastornos neurodegenerativos humanos, tales como la enfermedad de Alzheimer, la enfermedad de Parkinson, la epilepsia, la esclerosis múltiple, la enfermedad de Huntington, el síndrome de Down, la sordera nerviosa y la enfermedad de Meniere. Las neurotrofinas son esenciales para la salud y el bienestar del sistema nervioso. Por ejemplo, NGF (factor de crecimiento nervioso), BDNF (factor neurotrófico derivado del cerebro), NT-3 (neurotrofina-3) y NT-4 (neurotrofina-4) también median en actividades de orden superior adicionales, tales como el aprendizaje, la memoria y el comportamiento, además de sus funciones establecidas para la supervivencia celular. Por lo tanto, los agentes de la presente descripción se pueden utilizar como potenciadores cognitivos, para mejorar el aprendizaje, especialmente en pacientes que padecen demencias o traumatismos. La enfermedad de Alzheimer, que ha sido identificada por los “National Institutes of Aging” por representar más del 50% de las demencias en los ancianos, es también la cuarta o quinta causa principal de muerte en los estadounidenses mayores de 65 años de edad. Cuatro millones de estadounidenses, el 40% de los estadounidenses mayores de 85 años (el segmento de crecimiento más rápido de la población estadounidense), tienen la enfermedad de Alzheimer. El veinticinco por ciento de todos los pacientes con la enfermedad de Parkinson también padecen una demencia de tipo enfermedad de Alzheimer. Y en aproximadamente el 15% de los pacientes con demencia, la enfermedad de Alzheimer y la demencia multiinfarto coexisten. La tercera causa más común de demencia, tras la enfermedad de Alzheimer y la demencia vascular, es la pérdida cognitiva debida a una enfermedad cerebral orgánica relacionada directamente con el alcoholismo, que se da en aproximadamente el 10% de los alcohólicos. Sin embargo, la anomalía más consistente para la enfermedad de Alzheimer, así como para la demencia vascular y la pérdida cognitiva debida a enfermedad cerebral orgánica relacionada con el alcoholismo, es la degeneración del sistema colinérgico procedente del cerebro anterior basal (BF, del inglés "basal forebrain") y dirigida al códex y al hipocampo (Bigl et al. en Brain Cholinergic Systems, M. Steriade y D. Biesold, compiladores, Oxford University Press, Oxford, pág. 364-386 (1990)). Y existe una serie de otros sistemas neurotransmisores afectados por la enfermedad de Alzheimer (Davies Med. Res. Rev. 3: 221 (1983)). Sin embargo, la pérdida cognitiva, relacionada por ejemplo, con la degeneración del sistema neurotransmisor colinérgico, no está limitada a individuos que padecen demencia. También se ha observado en adultos por lo demás sanos y en ratas. Los estudios que comparan el grado de pérdida de capacidad de aprendizaje con el grado de reducción del flujo sanguíneo cerebral cortical en ratas maduras, muestran una buena correlación (Berman et al. Neurobiol. Aging 9:691 (1988)). En el alcoholismo crónico, la enfermedad cerebral orgánica resultante, como la enfermedad de Alzheimer o el envejecimiento normal, también se caracteriza por reducciones difusas del flujo sanguíneo cerebral cortical en aquellas regiones del cerebro de las que surgen las neuronas colinérgicas (cerebro anterior basal) y en las que se proyectan (córtex cerebral) (Lofti et al., Cerebrovasc. and Brain Metab. Rev 1:2 (1989)). Tales demencias se pueden tratar mediante la administración de agentes de la presente descripción.
Es un objeto de la presente descripción utilizar los agentes de la misma para tratar la esclerosis múltiple. Los agentes se pueden usar solos o en combinación con otros medicamentos. Ejemplos de tales compuestos incluyen y no se limitan a: interferón beta (por ejemplo, beta-1a y/o beta-1b), acetato de glatiramer (Copaxone, una mezcla de polipéptidos que puede proteger importantes proteínas de la mielina mediante su sustitución como diana del ataque del sistema inmune), mitoxantrona y natalizumab (Tysabri), corticosteroides y anticuerpos monoclonales.
Además, los agentes de la presente descripción se pueden emplear en el tratamiento de lesiones de la médula espinal y/o en combinación con otro tratamiento aplicado después de lesiones de la médula espinal. Ejemplos actuales de tales agentes incluyen y no se limitan al fármaco esteroide metilprednisolona, administrado al cabo de las primeras 8 horas después de la lesión para reducir el daño a las células nerviosas.
Además, los agentes de la presente descripción se pueden usar en el tratamiento de la enfermedad de Parkinson (PD) y o en combinación con otros medicamentos administrados en el tratamiento de la enfermedad de Parkinson; tales agentes incluyen y no se limitan a: levodopa, carbidopa, benserazida, talcopone, entacapona, mucuna pruriens, agonistas de dopamina tales como bromocriptina, pergolida, pramipexol, ropinirol, cabergolina, apomorfina y lisurida, inhibidores de MAO-B tales como selegilina y rasagilina. Además otros tratamientos no farmacológicos, tales como intervenciones quirúrgicas, terapia del habla y ejercicio físico han mostrado ser moderadamente eficaces y el agente se puede emplear también en combinación con estos métodos de terapia. Además, los agentes se pueden usar en combinación con métodos que emplean terapia génica y/o celular, tales como la implantación de células modificadas genéticamente para producir dopamina o células madre que se transforman en células productoras de dopamina, o los agentes se pueden utilizar en combinación con una infusión de GDNF (factor neurotrófico derivado de la glía). Esto implica la infusión de GDNF en los ganglios basales usando catéteres implantados quirúrgicamente. Además, el tratamiento con agentes neuroprotectores tales como fármacos apoptóticos (CEP 1347 y CTCT346), lazaroides, agentes bioenergéticos y/o antiglutamatérgicos, en combinación con los agentes descritos anteriormente en este documento, están dentro del alcance de la presente descripción.
En aún otro aspecto, los agentes se pueden usar en el tratamiento del ictus. Además, los agentes se pueden utilizar en combinación con medicamentos empleados en el tratamiento del ictus, tales como medicamentos antiplaquetarios (por ejemplo, aspirina, clopidogrel y dipiridamol) o una medicación anticoagulante tal como warfarina o el activador del plasminógeno tisular, tPA. El método para despejar un vaso sanguíneo bloqueado mediante una trombectomía mecánica, también se puede usar en combinación con agentes de la presente descripción.
Además, los agentes de la presente descripción se utilizan preferentemente para tratar la neuropatía, y especialmente la neuropatía periférica. "Neuropatía periférica" se refiere a un trastorno que afecta al sistema nervioso periférico, que se manifiesta frecuentemente como una combinación de disfunciones neurales motoras, sensoriales, sensomotoras o autónomas. La amplia variedad de morfologías mostradas por las neuropatías periféricas pueden atribuirse cada una de forma inequívoca a un igualmente amplio número de causas. Por ejemplo, las neuropatías periféricas pueden adquirirse genéticamente, pueden ser el resultado de una enfermedad sistémica o pueden estar inducidas por un agente tóxico. Los ejemplos incluyen, aunque sin limitación, neuropatía periférica diabética, neuropatía sensomotora distal o neuropatías autónomas tales como una movilidad reducida del tracto gastrointestinal o atonía de la vejiga urinaria. Los ejemplos de neuropatías asociadas a enfermedades sistémicas incluyen el síndrome post-polio o la neuropatía asociada a SIDA; los ejemplos de neuropatías hereditarias incluyen la enfermedad de Charcot-Marie-Tooth, la enfermedad de Refsum, la betalipoproteinemia, la enfermedad de Tangier, la enfermedad de Krabbe, la leucodistrofia metacrómica, el síndrome de Down, la enfermedad de Fabry y el síndrome de Dejerine-Sottas; y los ejemplos de neuropatías causadas por un agente tóxico incluyen aquellas causadas por el tratamiento con un agente quimioterapéutico tal como vincristina, cisplatino, metotrexato o 3'-azido-3'-desoxitimidina.
Además, la degeneración neuronal, tal y como se observa en el envejecimiento o la senescencia, es un objeto de la presente descripción. La senescencia es la combinación de procesos de deterioro que siguen al período de desarrollo de un organismo y se caracteriza generalmente por una capacidad en disminución para responder al estrés, aumento del desequilibrio homeostático y mayor riesgo de enfermedad. El envejecimiento en sí mismo es considerado por algunos gerontólogos como una "enfermedad" que puede ser curable. De acuerdo con este punto de vista, el envejecimiento es una acumulación de daños a macromoléculas, células, tejidos y órganos, por lo tanto, unas tecnologías de reparación bioquímicas y moleculares avanzadas pueden ser capaces de contrarrestar los daños causados por la senescencia. Los agentes de la presente descripción se pueden utilizar en métodos para la protección y/o la prevención del daño inducido por senescencia, especialmente la degeneración neuronal debida a la senescencia. En una realización preferida, las formulaciones de la presente descripción se administran a un paciente para tratar una degeneración neuronal relacionada con la senescencia.
Dentro del alcance de la presente descripción se encuentra el proporcionar un agente para el tratamiento, la prevención y/o la mejora de trastornos neuropsiquiátricos. Algunas de las afecciones mencionadas a continuación también pueden ser denominadas enfermedades neuronales. Las enfermedades y trastornos neuropsiquiátricos se pueden dividir en tres grupos principales: trastornos del pensamiento/psicóticos (es difícil para la gente separar lo que es real de lo que no es, por ejemplo, esquizofrenia), trastornos del estado de ánimo (afectan a cómo se siente una persona, por ejemplo, muy triste o desesperada. Si un trastorno del estado de ánimo se vuelve grave, puede parecer que sea un trastorno del pensamiento, por ejemplo, un trastorno bipolar y trastornos depresivos), trastornos de ansiedad (hacen que una persona se sienta abrumadoramente ansiosa y temerosa, por ejemplo, trastorno de angustia y trastorno obsesivo-compulsivo (OCD)). Los ejemplos de trastornos neuropsiquiátricos incluyen cualquier enfermedad o trastorno neuropsiquiátrico tal como, pero no limitados a: esquizofrenia, trastorno bipolar, depresión, manía, dependencia y abuso de sustancias (por ejemplo, dependencia del alcohol), depresión, trastorno bipolar, enfermedad de Alzheimer, enfermedad de Parkinson, trastornos psicóticos, esquizofrenia, trastorno esquizoafectivo, trastornos de ansiedad, trastorno de estrés postraumático, trastorno obsesivo-compulsivo, trastorno límite de la personalidad, trastorno esquizotípico de la personalidad, trastorno de la personalidad por evitación y trastorno antisocial de la personalidad. La patogénesis de la esquizofrenia puede atribuirse a una alteración del desarrollo temprano del tejido cerebral. La acumulación de datos preclínicos y clínicos indica que las disfunciones de las neurotrofinas, especialmente el factor de crecimiento nervioso (NGF), el factor neurotrófico derivado del cerebro (BDNF) y la neurotrofina-3 (NT-3) pueden contribuir a una alteración del desarrollo cerebral, neuroplasticidad y "desconexión" sináptica que conducen al síndrome esquizofrénico. Además, existen varias líneas de evidencia que apoyan un papel de las neurotrofinas y proneurotrofinas en el tratamiento de la depresión, el estrés crónico y el abuso de sustancias. Una mejora en el apoyo neurotrófico y un aumento asociado de la plasticidad y la función sinápticas puede ser la base de una eficacia antidepresiva. Por tanto, enfermedades neuropsiquiátricas y trastornos tales como la esquizofrenia, la depresión, el estrés crónico y el abuso de sustancias se pueden tratar, prevenir o mejorar mediante la administración de los agentes descritos en este documento.
Otros trastornos, enfermedades y afecciones degenerativas en un mamífero que se pueden tratar con una cantidad terapéuticamente eficaz de uno o varios agentes, son enfermedades, trastornos y degeneraciones del ojo. Las afecciones de este tipo que son de especial interés, se pueden dividir en cuatro categorías: enfermedades maculares adquiridas (AMD), enfermedades vasculares de la retina, desprendimiento de retina y distrofias hereditarias del fondo de ojo. Preferiblemente, los trastornos son enfermedades maculares adquiridas tales como degeneración macular exodativa y no exodativa relacionada con la edad, enfermedades vasculares de la retina tales como retinoplasia diabética y coágulos de sangre en el ojo, y distrofias hereditarias del fondo de ojo tal como Leber. Otros trastornos se relacionan específicamente con la senescencia del ojo que, de acuerdo con la mayoría de los procesos anatómicos y fisiológicos, se debe a un deterioro gradual. Los agentes son útiles en la prevención o la mejora de afecciones patológicas del ojo.
Además, el dolor y la nocicepción son indicaciones de relevancia para los agentes. El dolor es, y la nocicepción puede ser, una sensación desagradable, que varía en intensidad desde leve, pasando por grave hasta indescriptible. Cuando el dolor es una sensación subjetiva, la nocicepción es un acontecimiento fisiológico medible que puede ocurrir sin que se sienta dolor. El dolor fisiológico se puede clasificar de acuerdo con el origen y sus neuronas relacionadas que detectan el dolor (nociceptores) en el dolor cutáneo, dolor somático, dolor visceral, dolor de miembro fantasma y dolor neuropático. El dolor cutáneo es causado por una lesión en la piel o tejidos superficiales. El dolor somático se origina en los ligamentos, los tendones, los huesos, los vasos sanguíneos e incluso los propios nervios. El dolor visceral se origina en las vísceras del cuerpo, o en los órganos. El dolor del miembro fantasma es la sensación de dolor de una extremidad que se ha perdido o de la cual una persona ya no recibe señales físicas. El dolor neuropático, o "neuralgia", pueden ocurrir como resultado de una lesión o enfermedad en el propio tejido nervioso.
El dolor y/o las nocicepciones pueden surgir debido a diferentes causas, una causa principal es un traumatismo. Un traumatismo se puede producir también en cualquier parte del cuerpo, y cualquier traumatismo que causa dolor o nocicepción está dentro del alcance de la presente descripción. Otros ejemplos de dolor y nocicepciones incluyen pero no se limitan a: Relacionadas con cabeza y cuello: Mandíbula - arteritis temporal (grave); Oído - otitis media (muy común, especialmente en los niños), otitis externa; Ojos - glaucoma; Cabeza - migraña, cefalea de tensión, cefalea en racimos, cáncer, aneurisma cerebral, sinusitis, meningitis, dolor de cuello - IM (atípico); Tórax: Espalda -cáncer; Mama - perimenstrual, cáncer; Pecho - IM (común y fatal), ERGE (muy común), pancreatitis, hernia de hiato, disección aórtica (rara), embolia pulmonar (más frecuentemente asintomática), costocondritis, Hombro - colecistitis (lado derecho), MSK (musculoesquelético); Abdomen: Abdominal - cuadrante superior derecho e izquierdo - úlcera péptica, gastroenteritis, hepatitis, pancreatitis, colecistitis, IM (atípico), aneurisma aórtico abdominal, cáncer gástrico, cuadrante inferior izquierdo y derecho - apendicitis (grave), embarazo ectópico (grave/solo mujeres), enfermedad inflamatoria pélvica (solo mujeres), diverticulitis (común en ancianos), urolitiasis (cálculos renales), pielonefritis, cáncer (cáncer colorrectal más común); Espalda: Espalda - MSK (tensión muscular), cáncer, hernia de disco espinal, enfermedad degenerativa del disco, coxis (coccidinia); Extremidades: Brazo - IM (clásicamente el izquierdo, a veces bilateral), MSK; Pierna - trombosis venosa profunda, enfermedad vascular periférica (claudicación), MSK, hernia de disco espinal, ciática; Articulaciones: Articulaciones pequeñas de forma clásica - osteoartritis (común en ancianos), artritis reumatoide, lupus eritematoso sistémico, gota, seudogota; Articulaciones grandes de forma clásica (cadera, rodilla) - osteoartritis (común en ancianos), artritis séptica, hemartrosis; Espalda de forma clásica - espondilitis anquilosante, enfermedad inflamatoria del intestino; Otros - artritis psoriásica, síndrome de Reiter. Los agentes se pueden emplear como analgésicos o agentes analgésicos para tratar y/o aliviar cualquiera de los tipos anteriores de dolor y/o nocicepciones.
Por otra parte, la obesidad es una indicación de relevancia para los agentes de la presente descripción. La obesidad es una afección en la que la reserva natural de energía, almacenada en el tejido adiposo de los seres humanos y otros mamíferos, se incrementa hasta un punto en que es un factor de riesgo para ciertas afecciones de la salud o aumento de la mortalidad. Se ha mostrado que un peso corporal excesivo predispone a diversas enfermedades, especialmente enfermedades cardiovasculares, apnea del sueño, osteoartritis y diabetes mellitus no dependiente de insulina. La obesidad es el mayor contribuyente a la diabetes de tipo 2. La diabetes de tipo 2 es un trastorno metabólico que está causado por una resistencia a la insulina y una carencia relativa de insulina e hiperglucemia crónica. Está aumentando rápidamente a nivel mundial y se estima que aumentará de acuerdo con las tendencias epidémicas. Un gen del receptor con dominio Vps10p se ha asociado recientemente con la diabetes de tipo 2 en ratón y rata. Otros tipos de diabetes de tipo 1 y la diabetes gestacional (GDM) que se produce durante el embarazo y otros tipos. El tipo 1 está causado por una destrucción autoinmune de las células productoras de insulina. Es un objeto de la presente descripción proporcionar agentes para el tratamiento de la obesidad, la diabetes de tipo 1, 2, GDM y los trastornos relacionados con la diabetes.
Además de la diabetes, la obesidad también aumenta el riesgo de infarto de miocardio debido a una aterosclerosis que es un objetivo de los agentes de la presente descripción.
Por consiguiente, se proporciona un método para tratar, prevenir y/o mejorar un trastorno, una enfermedad o una degeneración relacionada con la proneurotrofina en un mamífero que comprende administrar al mamífero una cantidad terapéuticamente eficaz de uno o varios agentes de la presente descripción. Estas enfermedades, trastornos o afecciones degenerativas relacionadas con la proneurotrofina, pueden ser cualquiera de las afecciones anteriores, tales como trastornos neuronales, degeneración neuronal, trastornos y enfermedades neuropsiquiátricas, senescencia, dolor y nocicepción, enfermedades, trastornos o degeneración oculares, obesidad y enfermedades relacionadas con la obesidad y diabetes. El dolor tal y como se emplea anteriormente en el presente documento, se refiere al dolor periférico. Las enfermedades oculares tal y como se emplean en el presente documento, se refieren a enfermedades de la retina, trastornos y degeneración de la retina.
Cualquiera de los agentes descritos en esta memoria se pueden emplear solos o combinados entre sí. Los agentes, por lo tanto, se pueden administrar simultáneamente o en sucesión. El agente además se puede emplear solo o en combinación junto con un segundo ingrediente activo. Estos segundos ingredientes activos pueden ser para el tratamiento de cualquiera de las enfermedades o trastornos mencionados en este documento, o se pueden utilizar para otros fines.
También se describe en el presente documento un kit de partes, en donde el kit incluye al menos un agente o una composición farmacéutica tal como se describe en el presente documento, un medio para la administración de dicha vacuna y las instrucciones sobre cómo hacerlo. El kit puede incluir múltiples dosificaciones del mismo agente y/o composición farmacéutica o varios agentes diferentes y/o composiciones farmacéuticas. En una realización preferida, el kit de partes comprende adicionalmente un segundo ingrediente activo.
Métodos de administración
Los agentes usados en los métodos de la presente descripción se administran generalmente a un animal en forma de una composición farmacéutica adecuada. De acuerdo con ello, la presente descripción se refiere también a una composición farmacéutica que comprende un agente tal como se define en esta memoria. Tales composiciones contienen típicamente el agente y un vehículo farmacéuticamente aceptable. Tal y como se usa en este documento, la expresión "vehículo farmacéuticamente aceptable" se entiende que incluye cualquiera y todos los disolventes, medios de dispersión, recubrimientos, agentes antibacterianos y antifúngicos, agentes isotónicos y retardadores de la absorción y similares, compatibles con la administración farmacéutica. El uso de tales medios y agentes para sustancias farmacéuticamente activas es bien conocido en la técnica. Excepto en la medida en que cualquier medio o agente convencional sea incompatible con el agente, está contemplado su uso en las composiciones. También se pueden incorporar en las composiciones compuestos activos suplementarios.
Una composición farmacéutica se formula para que sea compatible con su vía de administración prevista. Los ejemplos de vías adecuadas de administración incluyen la administración parenteral, por ejemplo, intravenosa, intradérmica, subcutánea, oral (por ejemplo, inhalación), transdérmica (tópica), transmucosal y rectal. Las soluciones o suspensiones usadas para la aplicación parenteral, intradérmica o subcutánea pueden incluir los siguientes componentes: un diluyente estéril tal como agua para inyección, solución salina, aceites fijos, polietilenglicoles, glicerina, propilenglicol u otros disolventes sintéticos; agentes antibacterianos tales como alcohol bencílico o metil parabenos; antioxidantes tales como ácido ascórbico o bisulfito de sodio; agentes quelantes tales como ácido etilendiaminotetraacético; tampones tales como acetatos, citratos o fosfatos y agentes para el ajuste de la tonicidad tales como cloruro sódico o dextrosa. El pH se puede ajustar con ácidos o bases, tales como ácido clorhídrico o hidróxido de sodio. La preparación parenteral puede incluirse en ampollas, jeringas desechables o viales de múltiples dosis, fabricados en vidrio o plástico.
Las composiciones farmacéuticas adecuadas para uso inyectable incluyen soluciones acuosas estériles (solubles en agua) o dispersiones y polvos estériles para la preparación extemporánea de soluciones o dispersiones inyectables estériles. Para la administración intravenosa, los vehículos adecuados incluyen solución salina fisiológica, agua bacteriostática, Cremophor EL.TM. (BASF, Parsippany, N.J.) o solución salina tamponada con fosfato (PBS). En todos los casos, la composición debe ser estéril y debe ser fluida en la medida en que se pueda inyectar fácilmente. Debe ser estable en las condiciones de fabricación y almacenamiento y debe estar protegida contra la acción contaminante de microorganismos tales como bacterias y hongos. El vehículo puede ser un disolvente o un medio de dispersión que contiene, por ejemplo, agua, etanol, poliol (por ejemplo, glicerol, propilenglicol y polietilenglicol líquido, y similares), y mezclas adecuadas de los mismos. La fluidez apropiada se puede mantener, por ejemplo, mediante el uso de un recubrimiento tal como lecitina, mediante el mantenimiento del tamaño de partícula requerido en el caso de dispersión y mediante el uso de tensioactivos. Una prevención de la acción de microorganismos se puede conseguir mediante diversos agentes antibacterianos y antifúngicos, por ejemplo, parabenos, clorobutanol, fenol, ácido ascórbico, timerosal y similares. En muchos casos, será preferible incluir agentes isotónicos en la composición, por ejemplo, azúcares, polialcoholes tales como manitol, sorbitol, cloruro de sodio. Una absorción prolongada de las composiciones inyectables se puede provocar incluyendo en la composición un agente que retrase la absorción, por ejemplo, monoestearato de aluminio y gelatina.
Las soluciones inyectables estériles se pueden preparar incorporando el agente en la cantidad requerida en un disolvente apropiado, con uno o una combinación de ingredientes mencionados anteriormente, según se requiera, seguido de esterilización por filtración. Generalmente, las dispersiones se preparan incorporando el agente en un vehículo estéril que contiene un medio de dispersión básico y los otros ingredientes requeridos a partir de los mencionados anteriormente. En el caso de polvos estériles para la preparación de soluciones inyectables estériles, los métodos preferidos de preparación son el secado al vacío y la liofilización que produce un polvo del ingrediente activo más cualquier ingrediente adicional deseado a partir de una solución del mismo previamente esterilizada por filtración.
Las composiciones orales generalmente incluyen un diluyente inerte o un vehículo comestible. Se pueden incluir en cápsulas de gelatina o comprimir en comprimidos. Para los fines de una administración terapéutica oral, el agente se puede incorporar con excipientes y usar en forma de comprimidos, trociscos o cápsulas, las composiciones orales también se pueden preparar usando un vehículo fluido para uso como un enjuague bucal, en donde el compuesto en el vehículo fluido se aplica oralmente y se agita y se expectora o se traga. Los agentes de unión farmacéuticamente compatibles, y/o los materiales adyuvantes se pueden incluir como parte de la composición. Los comprimidos, las píldoras, las cápsulas, los trociscos y similares pueden contener cualquiera de los siguientes ingredientes o compuestos de una naturaleza similar: un aglutinante tal como celulosa microcristalina, goma de tragacanto o gelatina; un excipiente tal como almidón o lactosa, un agente desintegrante tal como ácido algínico, Primogel o almidón de maíz; un lubricante tal como estearato de magnesio o Sterotes; un agente deslizante tal como dióxido de silicio coloidal; un agente edulcorante tal como sacarosa o sacarina; o un agente aromatizante tal como menta, salicilato de metilo o aroma de naranja.
Para la administración mediante inhalación, los compuestos se administran en forma de una pulverización en aerosol desde un recipiente o dispensador presurizado que contiene un propelente adecuado, por ejemplo, un gas tal como dióxido de carbono, o un nebulizador.
La administración sistémica también puede ser por vía transmucosal o transdérmica. Para la administración transmucosal o transdérmica, los agentes penetrantes apropiados para que la barrera sea permeada, se utilizan en la formulación. Tales agentes penetrantes son generalmente conocidos en la técnica, e incluyen, por ejemplo, para la administración transmucosal, detergentes, sales biliares y derivados de ácido fusídico. La administración transmucosal se puede lograr a través del uso de pulverizaciones nasales o supositorios. Para la administración transdérmica, los compuestos activos se formulan en forma de pomadas, bálsamos, geles o cremas, como se conoce generalmente en la técnica.
El agente también se puede preparar en forma de supositorios (por ejemplo, con bases de supositorio convencionales, tales como manteca de cacao y otros glicéridos) o enemas de retención para la administración rectal.
En una realización, el agente se prepara con vehículos que protegerán el compuesto frente a una eliminación rápida desde el organismo cuerpo, tal como una formulación de liberación controlada, que incluye implantes y sistemas de administración microencapsulados. Se pueden emplear polímeros biodegradables, biocompatibles, tales como acetato de etilen vinilo, polianhídridos, poli(ácido glicólico), colágeno, poliortoésteres y poli(ácido láctico). Los métodos para la preparación de tales formulaciones serán evidentes para los expertos en la técnica. Los materiales también se pueden obtener comercialmente a partir de Alza Corporation y Nova Pharmaceuticals, Inc. Las suspensiones liposómicas (que incluyen liposomas dirigidos a células infectadas con anticuerpos monoclonales para antígenos virales) también se pueden utilizar como vehículos farmacéuticamente aceptables. Estas se pueden preparar según métodos conocidos por los expertos en la técnica, por ejemplo, tal y como se describe en el documento de Patente de los Estados Unidos n° 4.522.811.
Es especialmente ventajoso formular las composiciones orales o parenterales en forma de dosificación unitaria para facilitar la administración y la uniformidad de la dosificación. La forma de dosificación unitaria, tal y como se usa en el presente documento, se refiere a unidades físicamente discretas, adecuadas como dosificaciones unitarias para el sujeto que se va a tratar; conteniendo cada unidad una cantidad predeterminada de compuesto activo, calculada para producir el efecto terapéutico deseado en asociación con el vehículo farmacéutico requerido. La especificación de las formas de dosificación unitaria está dictada y depende directamente de las características únicas del compuesto activo y del efecto terapéutico particular que se va a conseguir, y las limitaciones inherentes en la técnica de elaboración de un compuesto activo de este tipo para el tratamiento de individuos.
La toxicidad y la eficacia terapéutica de tales compuestos se pueden determinar mediante procedimientos farmacéuticos convencionales en cultivos celulares o animales experimentales, por ejemplo, para determinar la DL50 (la dosis letal para el 50% de la población) y la DE50 (la dosis terapéuticamente eficaz en el 50% de la población). La relación de dosis entre los efectos tóxicos y terapéuticos es el índice terapéutico y se puede expresar como la relación DL50/DE50. Se prefieren los agentes que muestran índices terapéuticos elevados. Aunque se pueden usar agentes que muestran efectos secundarios tóxicos, se debe tener cuidado para diseñar un sistema de administración que dirija tales agentes al sitio del tejido afectado, con el fin de minimizar el daño potencial a otras células y, de este modo, reducir los efectos secundarios.
Los datos obtenidos a partir de los ensayos de cultivos celulares y estudios animales, se pueden usar para formular un intervalo de dosificación para uso en seres humanos. La dosificación de tales compuestos se encuentra preferiblemente dentro de un intervalo de concentraciones circulantes que incluye la DE50 con poca o ninguna toxicidad. La dosificación puede variar dentro de este intervalo dependiendo de la forma de dosificación empleada y la vía de administración utilizada. Para cualquier agente usado en el método de la descripción, la dosis terapéuticamente eficaz se puede estimar inicialmente a partir de ensayos de cultivos celulares. Una dosis se puede formular en modelos animales para conseguir un intervalo de concentración circulante en plasma que incluye la CI50 (es decir, la concentración del agente del ensayo que logra una inhibición máxima media de los síntomas) como se determina en cultivos celulares. Tal información se puede usar para determinar con mayor precisión las dosis útiles en seres humanos. Los niveles en plasma se pueden medir, por ejemplo, mediante cromatografía líquida de alto rendimiento. Con respecto a la inhibición de sortilina, se emplean 10-20 gmol de neurotensina para inhibir la sortilina en un cultivo celular.
Las composiciones farmacéuticas se pueden incluir en un recipiente, un envase o un dispensador junto con instrucciones para la administración.
Los agentes se pueden insertar adicionalmente en vectores y usarse en terapia génica. Los vectores de terapia génica se pueden administrar a un sujeto mediante, por ejemplo, inyección intravenosa, administración local (véase el documento de Patente de Estados Unidos n° 5.328.470) o mediante inyección estereotáctica (véase, por ejemplo, Chen et al. (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 91:3054-3057). La preparación farmacéutica del vector de terapia génica puede incluir el vector de terapia génica en un diluyente aceptable, o puede comprender una matriz de liberación lenta en la que está incluido el vehículo de administración de genes. Alternativamente, cuando el vector de administración génica completo se puede producir de forma intacta a partir de células recombinantes, por ejemplo, vectores retrovirales, la preparación farmacéutica puede incluir una o varias células que producen el sistema de administración génica.
Los vectores adecuados para uso en terapia génica son conocidos en la técnica. Por ejemplo, los vectores derivados de adenovirus se pueden utilizar. El genoma de un adenovirus se puede manipular de tal manera que codifique y exprese un producto génico de interés pero que se inactiva en términos de su capacidad para replicarse en un ciclo de vida viral lítico normal. Véase, por ejemplo, Berkner et al. (1988) BioTechniques 6:616; Rosenfeld et al. (1991) Science 252:431-434; y Rosenfeld et al. (1992) Cell 68:143-155. Los vectores adenovíricos adecuados, obtenidos a partir de la cepa de adenovirus Ad tipo 5 dl324 u otras cepas de adenovirus (por ejemplo, Ad2, Ad3, Ad7, etc.) son bien conocidos por los expertos en la técnica. Los adenovirus recombinantes pueden ser ventajosos en ciertas circunstancias en las que no son capaces de infectar células que no se dividen. Además, la partícula de virus es relativamente estable y susceptible de purificación y concentración, y como anteriormente, se puede modificar con el fin de afectar al espectro de infectividad. Además, el ADN adenovírico introducido (y el ADN extraño contenido en el mismo) no está integrado en el genoma de una célula hospedadora sino que permanece episomal, evitando de este modo problemas potenciales que pueden tener lugar como resultado de una mutagénesis por inserción, en situaciones en las que el ADN introducido se integra en el genoma del hospedador (por ejemplo, ADN retrovírico). Por otra parte, la capacidad portadora del genoma adenovírico para ADN extraño es grande (hasta 8 kilobases), en relación con otros vectores de administración de genes (Berkner et al. citado anteriormente; Haj-Ahmand y Graham (1986) J. Virol. 57:267). En la mayoría de los vectores adenovíricos con una replicación defectuosa que están actualmente en uso y, por lo tanto, están favorecidos, se delecionan genes completos o partes de los genes virales E1 y E3, pero se conserva tanto como un 80% del material genético adenovírico (véase, por ejemplo, Jones et al. (1979) Cell 16:683.; Berkner et al., supra; y Graham et al. en Methods in Molecular Biology, E.J. Murray, compilador (Humana, Clifton, NJ, 1991) vol. 7, págs. 109-127). La expresión del gen de interés comprendido en la molécula de ácido nucleico, puede estar bajo el control, por ejemplo, del promotor E1A, el promotor tardío principal (MLP) y secuencias líder asociadas, el promotor E3, o secuencias añadidas de manera exógena.
Aún otro sistema de vector viral útil para la administración de los agentes, es el virus adenoasociado (VAA). El virus adenoasociado es un virus defectuoso natural que requiere otro virus, tal como un adenovirus o un virus del herpes, como virus auxiliar para una replicación eficaz y un ciclo de vida productivo. (Para una revisión, véase Muzyczka et al. Curr. Topics in Micro. and Immunol. (1992) 158:97-129). Los virus adenoasociados muestran una alta frecuencia de integración estable (véase, por ejemplo, Flotte et al. (1992) Am. J. Respir. Cell. Mol. Biol. 7:349-356; Samulski et al. (1989) J. Virol. 63:3822-3828; y McLaughlin et al. (1989) J. Virol. 62:1963-1973). Los vectores que contienen tan solo 300 pares de bases de VAA se pueden empaquetar y se pueden integrar. El espacio para ADN exógeno se limita a aproximadamente 4,5 kb. Un vector VAA tal como el descrito en Tratschin et al. (1985) Mol. Cell. Biol.
5:3251-3260 se puede emplear para introducir ADN en linfocitos T. Una variedad de ácidos nucleicos se han introducido en diferentes tipos de células usando vectores VAA (véase, por ejemplo, Hermonat et al. (1984) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:6466-6470; Tratschin et al. (1985) Mol. Cell. Biol. 4:2072-2081; Wondisford et al. (1988) Mol. Endocrinol. 2:32-39; Tratschin et al. (1984) J. Virol. 51:611-619; y Flotte et al. (1993) J. Biol. Chem. 268:3781-3790). Otros sistemas de vectores virales que pueden ser útiles para la administración de los agentes, se obtienen a partir de virus herpes, virus vaccinia y varios virus de ARN.
Debe entenderse que tales tratamientos también pueden comprender la administración de más de un agente, en cuyo caso los agentes se pueden administrar bien de forma concurrente y/o por separado.
Animales
En un aspecto de la presente descripción, los agentes capaces de inhibir la unión entre una proneurotrofina y un receptor con dominio Vps10p se administran a un animal. Dicho animal es preferiblemente cualquier animal que exprese una proteína de la familia de proneurotrofinas, más preferiblemente un mamífero, más preferiblemente un animal doméstico y lo más preferiblemente un ser humano.
Métodos para el escrutinio de un compuesto que altera la unión de al menos una proneurotrofina con un receptor de la familia de receptores con dominio Vps10p
También se describe en el presente documento un método in vitro para el escrutinio de un compuesto que altera la unión de al menos una proneurotrofina con un receptor de la familia de receptores con dominio Vps10p, comprendiendo dicho método preferiblemente las etapas de:
a) proporcionar un ensayo para medir la unión de una proneurotrofina con el sitio de unión del receptor sortilina, b) añadir el compuesto que se va a analizar al ensayo, y
c) determinar la cantidad de proneurotrofina unida al receptor de la familia de receptores con dominio Vps10p, y d) comparar la cantidad determinada en la etapa c) con una cantidad medida en ausencia del compuesto que se va a someter ensayo,
e) en donde una diferencia en las dos cantidades identifica un compuesto que altera la unión de las proneurotrofinas con el receptor de la familia de receptores con dominio Vps10p.
En una realización preferida de este método de escrutinio, la proneurotrofina se puede seleccionar a partir de pro-NGF, pro-BDNF, pro-NT-3 o pro-NT-4/5. Más preferiblemente, la proneurotrofina es pro-NGF o pro-BDNF. En una realización preferida de este método de escrutinio, el receptor se selecciona a partir de SorLA, sortilina, SorCSI, SorCS3 o SorCS2. Incluso más preferiblemente, el receptor es sortilina. En otra realización del método de escrutinio, la proneurotrofina es capaz de unirse a una parte extracelular del receptor. En una realización, el receptor puede ser un receptor que se expresa en una célula, dentro de la membrana plasmática y/o se presenta sobre una membrana plasmática. La célula usada en el método de escrutinio se puede seleccionar preferiblemente a partir de cultivos primarios de células neuronales, líneas celulares obtenidas a partir de neuronas, células transfectadas capaces de expresar el receptor de la familia de receptores con dominio Vps10p, neuronas periféricas y neuronas centrales. Preferiblemente, las células son líneas celulares inmortalizadas.
Los ensayos que se pueden emplear para medir la unión de una proneurotrofina a un receptor de la familia de receptores con dominio Vps10p, son bien conocidos por los expertos en la técnica e incluyen, pero no se limitan a, ensayos de dos híbridos de levadura, métodos de unión competitiva, tales como RIAs, ELISAs y otros similares. Otros ensayos son la transferencia de energía de resonancia de fluorescencia (FRET), la resonancia de plasmón superficial (Biacore), los ensayos de transferencia Western, la inmunohistoquímica. Los resultados de los estudios de unión pueden analizarse usando cualquier representación gráfica convencional de los datos de la unión, tal como el análisis de Scatchard (Scatchard, Ann. NY Acad. Sci., 51:660-672 [1949]; Goodwin et al., Cell, 73:447-456 [1993]), y otros similares.
Además se proporciona en esta memoria un método para determinar el efecto de un agente sobre la actividad de proneurotrofinas en células que presentan un receptor de la familia de receptores con dominio Vps10p. Dicho método comprende las etapas de:
b) administrar dicho agente a un mamífero que expresa el receptor,
c) medir la actividad de las proneurotrofinas en dicho mamífero,
d) comparar la medición de la etapa b) con una medición obtenida en ausencia del compuesto que está siendo evaluado,
e) en donde la diferencia entre las dos mediciones identifica el efecto de dicho agente sobre la actividad de las proneurotrofinas sobre células que presentan receptores de la familia de receptores con dominio Vps10p. El mamífero puede expresar el receptor de forma natural o puede estar transfectado con el gen natural del receptor. La actividad de dichas proneurotrofinas en dicho mamífero puede medirse mediante una o varias de las siguientes mediciones:
a) medir el nivel de expresión de un gen diana de respuesta a neurotrofina, tal como ARNm o proteína en tejidos del mamífero,
b) medir el nivel de expresión de un receptor tal como se ha definido en la presente memoria, como ARNm o proteína en tejidos del mamífero,
c) medir la unión o el transporte mediados por el receptor, de proneurotrofinas unidas al receptor,
d) medir la captación de proneurotrofinas al interior de las células de dicho mamífero,
e) medir la transducción de señales desde dicho receptor o un receptor relacionado en células de dicho mamífero.
El receptor relacionado puede ser el receptor p75 o el receptor TrkA.
En una realización preferida de dicho método, el método comprende además la administración de dicho agente a un mamífero que carece de la expresión de dicho receptor. Dicho mamífero que carece de la expresión de dicho receptor puede carecer únicamente de la expresión de dicho receptor en uno o varios tejidos seleccionados, y/o puede presentar un nivel reducido de expresión de dicho receptor.
Los métodos para medir la expresión de ARNm o proteína del receptor en los tejidos del mamífero son bien conocidos por los expertos en la técnica y se han descrito con anterioridad. Los métodos para medir la unión o el transporte mediados por el receptor, de neurotrofinas y/o proneurotrofinas unidas al receptor, también son conocidos por los expertos en la técnica: dichos métodos incluyen, aunque sin restricción, el escrutinio de dos híbridos de levadura, el escrutinio de RTM de Biacore, la reticulación UV y la inmunoprecipitación.
Los métodos para medir la captación de proneurotrofinas en células de un mamífero también son bien conocidos por los expertos en la técnica: dichos métodos incluyen, aunque sin restricción, un método en el que la captación de proneurotrofina se mide en células que presentan el receptor y en células que no presentan el receptor. La proneurotrofina está marcada preferiblemente, por ejemplo, de forma radioactiva o fluorescente.
Además se proporciona un método para modular el transporte de al menos una neurotrofina y/o proneurotrofina fuera de, o hacia el interior de una línea celular o neurona de un animal, comprendiendo dicho método la administración a dicho animal de una cantidad suficiente de un agente capaz de unirse a un receptor de la familia de receptores con dominio Vps10p. Dicha modulación puede comprender un aumento del transporte anterógrado de la neurotrofina y/o la proneurotrofina en la neurona. La modulación puede comprender de forma alternativa un descenso del transporte anterógrado de la neurotrofina y/o la proneurotrofina en la neurona. En otra realización preferida, la modulación comprende un aumento del transporte retrógrado de la neurotrofina y/o la proneurotrofina en la neurona. En otra realización preferida, la modulación comprende un descenso del transporte retrógrado de la neurotrofina y/o la proneurotrofina en la neurona. La modulación puede llevarse a cabo mediante un agente, tal y como se ha descrito anteriormente.
Bancos de agentes
Se pueden emplear bancos de compuestos para escrutar agentes capaces de inhibir la unión entre un receptor con dominio Vps10p y una proneurotrofina.
Tal y como se usa en este documento, el término "banco" se refiere a una colección de entidades moleculares o compuestos de ensayo también denominados en esta memoria "miembros del banco".
En aspectos descritos preferidos, el banco es un banco combinatorio. Ejemplos no limitantes de bancos combinatorios que se pueden utilizar y métodos para producir tales bancos se proporcionan en: Comprehensive Survey of Combinatorial Library Synthesis: 1998 Roland E. Dolle y Kingsley H. Nelson, Jr. J. Comb. Chem., 1999, págs. 235 - 282; Comprehensive Survey of Combinatorial Library Synthesis: 1999 Roland E. Dolle J. Comb. Chem., 2000, págs. 383 - 433; Comprehensive Survey of Combinatorial Library Synthesis: 2000 Roland E. Dolle J. Comb. Chem., 2001, págs. 477 - 517; Comprehensive Survey of Combinatorial Library Synthesis: 2001 Roland E. Dolle J. Comb. Chem., 2002, págs. 369 - 418 y Comprehensive Survey of Combinatorial Library Synthesis: 2002 Roland E. Dolle J. Comb. Chem., 2003, págs. 693 - 753. La persona experta apreciará que estos protocolos se pueden adaptar fácilmente a las necesidades específicas de un aspecto descrito particular.
En una realización, estas entidades moleculares pueden ser oligómeros naturales (oligómeros de elementos básicos que se producen en la naturaleza) tales como péptidos, glicopéptidos, lipopéptidos, ácidos nucleicos (ADN o ARN) u oligosacáridos. A modo de ejemplo, un oligómero natural puede ser cualquier péptido que consiste en un aminoácido de origen natural, incluso si dicho péptido comprende una secuencia que no está presente en la naturaleza. Los bancos pueden comprender diferentes oligómeros naturales o los bancos pueden comprender solo un tipo de oligómero natural, por ejemplo, el banco puede ser un banco de péptidos. En otra realización, pueden ser oligómeros no naturales (oligómeros que comprenden uno o varios elementos básicos que no están presentes en la naturaleza) tales como péptidos, glicopéptidos, ácidos nucleicos (ADN o ARN) u oligosacáridos modificados químicamente, y similares. Dicha modificación química puede ser, por ejemplo, el uso de elementos básicos no naturales conectados por el enlace natural que une las unidades (por ejemplo, un enlace péptido amida), el uso de elementos básicos naturales con unidades enlazantes modificadas (por ejemplo, oligoureas como se describe en Boeijen et al, 2001, J. Org. Chem., 66: 8454-8462; oligosulfonamidas como se describe en Monnee et al, 2000, Tetrahedron Lett., 41: 7991 -95), o combinaciones de las mismas (por ejemplo, amidas de estatina como se describe en Dolle et al, 2000, J. Comb. Chem., 2: 716-31). Los oligómeros no naturales preferidos incluyen oligómeros que comprenden elementos básicos no naturales conectados entre sí por una unión con enlaces de origen natural. Dichos oligómeros, por lo tanto, pueden comprender una mezcla de elementos básicos de origen natural y no natural unidos entre sí por enlaces de origen natural. A modo de ejemplo, el oligómero puede comprender aminoácidos de origen natural y elementos básicos no naturales unidos por enlaces peptídicos, p. ej., PNA o LNA. Por tanto, en un aspecto, los oligómeros preferidos comprenden aminoácidos modificados o miméticos de aminoácidos. Otros oligómeros no naturales preferidos incluyen, por ejemplo, oligoureas, poliazatidas, oligómeros con enlaces C-C aromáticos y oligómeros con enlaces C-N aromáticos. Todavía otros oligómeros preferidos comprenden una mezcla de elementos básicos naturales y no naturales y enlaces de unión naturales y no naturales. Por ejemplo, el oligómero no natural puede ser cualquiera de los oligómeros mencionados en revisiones recientes, véanse: Graven et al., 2001, J. Comb. Chem., 3: 441-52; St. Hilaire et al., 2000, Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 39: 1162-79; James, 2001, Curr. Opin. Pharmacol., 1: 540-6; Marcaurelle et al., 2002, Curr. Opin. Chem. Biol., 6: 289-96; Breinbauer et al., 2002, Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 41: 2879-90. Los bancos también pueden comprender oligómeros cíclicos, por ejemplo, oligómeros naturales cíclicos, tales como péptidos cíclicos u oligómeros no naturales cíclicos. En ciertas realizaciones, puede ser ventajoso usar los bancos de oligómeros cíclicos debido a la estructura rígida. Esto puede dar como resultado una selectividad y afinidad mayores.
En aún otra realización, las entidades moleculares pueden comprender moléculas no oligoméricas tales como peptidomiméticos u otras moléculas orgánicas pequeñas. Los peptidomiméticos son compuestos que imitan la acción de un mensajero peptídico, tales como peptidomiméticos bicíclicos de tiazolidina lactama de L-propil-L-leucilglicinamida (Khalil et al., 1999, J. Med. Chem., 42: 2977-87). En una realización preferida, el banco comprende o, incluso más preferiblemente, consiste en moléculas orgánicas pequeñas. Las moléculas orgánicas pequeñas son compuestos no oligoméricos de menos de aproximadamente 600 unidades de masa que contienen cualquiera entre una variedad de posibles grupos funcionales y son el producto de una síntesis química, o se aíslan de la naturaleza, o se aíslan de la naturaleza y a continuación se modifican químicamente, e incluyen, por ejemplo, inhibidores de cinasa basados en urea de Bayer (Smith et al., 2001, Bioorg. Med. Chem. Lett., 11: 2775-78). Los compuestos orgánicos pequeños se pueden seleccionar, por ejemplo, a partir del grupo que consiste en alcoholes, éteres, ácidos carboxílicos, ariloxi, aciloxi, tiol, alquiltio, ariltio, heteroariltio, sulfonilo, sulfoxi, amino, alquilamino, dialquilamino, acilamino, diacilamino, alcoxicarbonilamino, amidas, alquilo, alquilo ramificado, arilo, heteroarilo, nitro, ciano, halógeno, sililoxi, ceto, heterociclos, sistemas de anillos fusionados, heterociclos fusionados y mezclas de los mismos, en donde cada uno de los mencionados anteriormente puede estar sustituido independientemente en cada posición, con uno o varios grupos seleccionados a partir del grupo que consiste en -H, -OH, -SH, halógeno, carboxilo, carbonilo, alcoxi, ariloxi, aciloxi, alquiltio, ariltio, heteroariltio, sulfonilo, sulfoxi, amino, alquilamino, dialquilamino, acilamino, diacilamino, alcoxicarbonilamino, amidas, alquilo, arilo, heteroarilo, nitro, ciano, halógeno, sililoxi, ceto, heterociclos, sistemas de anillos fusionados y heterociclos fusionados.
Ejemplos no limitantes de bancos de moléculas orgánicas pequeñas que se pueden utilizar y métodos para producirlos se pueden encontrar, por ejemplo, en las revisiones de Thompson et al., 1996, Chem. Rev., 96: 555-600; Al-Obeidi et al., 1998, Mol. Biotechnol., 9: 205-23; Nefzi et al., 2001, Biopolymers, 60: 212-9; Dolle, 2002, J. Comb. Chem., 4: 369-418.
Los bancos pueden comprender al menos 20, tal como al menos 100, por ejemplo, al menos 1000, tal como al menos 10.000, por ejemplo, al menos 100.000, tal como al menos 1.000.000 de compuestos de ensayo diferentes. Preferiblemente, los bancos comprenden el intervalo de 20 a 107, más preferiblemente de 50 a 7.000.000, aún más preferiblemente de 100 a 5.000.000, aún más preferentemente de 250 a 2.000.000 de compuestos diferentes. En un aspecto muy preferido, los bancos comprenden el intervalo de 1000 a 20.000, tal como en el intervalo de 20.000 a 200.000 compuestos de ensayo diferentes. En aspectos preferidos, el banco comprende el intervalo de 10.000 a 1.000.000 compuestos de ensayo diferentes.
La selección de un banco apropiado depende del aspecto específica descrito. Por ejemplo, un banco totalmente al azar, diseñado para contener diversos compuestos en gran medida, se puede usar para el escrutinio de agentes. Una ventaja de este enfoque es que el resultado del escrutinio no está predispuesto de ninguna manera específica. Alternativamente, un banco dirigido más pequeño (de cientos a miles de compuestos) se puede utilizar, por ejemplo, partiendo de un compuesto o compuestos conocidos, y proporcionando numerosas variaciones de estos compuestos conocidos para el escrutinio deseado. Alternativamente, un banco más pequeño dirigido, de compuestos que imitan un compuesto conocido por inhibir la unión entre una proneurotrofina y un receptor con dominio Vps-10p, tal como un receptor sortilina, se puede preparar, por ejemplo, usando un diseño asistido por ordenador, seguido de síntesis química. El banco más pequeño dirigido también puede comprender moléculas aleatorias.
También se describen en este documento métodos de síntesis de bancos de compuestos de ensayo, en donde dichos bancos son en particular útiles para escrutar agentes capaces de inhibir la unión entre una proneurotrofina y un receptor sortilina, o cualquier fragmento o variante de dicho receptor.
Los bancos se pueden emplear según el método de escrutinio general descrito en el ejemplo 5. Mediante la utilización de un robot de pipeteado, el método permite el escrutinio de bancos muy grandes para identificar agentes capaces de inhibir la unión entre proneurotrofinas y sortilina. Los agentes pueden ser cualquier agente de acuerdo con la presente invención.
Ejemplos
Ejemplo 1 - Materiales y proteínas
Para obtener formas marcadas de los prodominios de neurotrofina para una detección facilitada en el análisis de manchas, las estructuras artificiales se prepararon para cada proteína permitiendo la adición de marcadores S-péptido y poli-histidina N-terminales. El ADNc molde para NGF y BDNF humano eran clones de ATCC, utilizados para la generación de fragmentos que abarcaban los residuos Glu1-Arg102 de NGF y Ala1-Arg110 de BDNF, utilizando las parejas de cebadores 5’GGTATTGAGGGTCGCGAACCACACTCAGAGAGCAATGTCCC3’, 3’GGGGGAAGTTGTCCTGAGTGTCCTCGTTCGCCACTCCGAGATTGAGAGGAG A5’ y 5’GGTATTGAGGGTCGCGCCCCCATGAAAGAAGCAAACATCCGAGG3’, 3GACGTTTGTACAGGTACTCCCAGGCCGCGACTCCGAGATTGAGAGGAGA5’ con salientes compatibles para la clonación independiente de la ligación en el vector pET-30 Xa/LIC de Novagen (n° de catálogo 70073-3) y la amplificación utilizando ADN polimerasa Phusion y siguiendo el protocolo tal y como lo proporcionaba el fabricante. Las proteínas se expresaron en la cepa BL21/DE3 de E. coli, se extrajeron de manera eficaz a partir de los cuerpos de inclusión bacterianos, utilizando el reactivo Bugbuster de Novagen (n° de catálogo 70921) con benzonasa añadida (Novagen, n° de catálogo 70750), y se purificaron mediante cromatografía de afinidad en Ni2+-NTA convencional en NaCI 500 mM, imidazol 5 mM y Tris-HCl 20 mM, pH 8,0. La elución de proteínas se realizó en tampón complementado con EDTA 20 mM. La verificación de las versiones marcadas intactas de pro-dominio-NGF y pro-dominio-BDNF se llevó a cabo mediante un análisis de SDS-PAGE, seguido por tinción con Coomassie o transferencia Western, usando un anticuerpo contra el marcador histidina de Sigma (H-1029) y anticuerpo secundario anti-ratón conjugado con HRP de Calbiochem (n° de catálogo 401207) o, alternativamente, mediante la unión directa de S-proteína conjugada con HRP de Novagen (n° de catálogo 69047-3). Para la producción del ectodominio de sortilina, una estructura artificial que abarcaba la región codificante completa de la parte N-terminal de sortilina humana, incluyendo el péptido señal endógeno y seguida por un marcador de polihistidina C-terminal insertado en el vector pCEP-Pu, fue amablemente proporcionada por D. Militz, Berlin. El ADN se transfirió a células EBNA293 que se seleccionaron mediante G418 (Gibco n° de catálogo 10131-027, 300 pg/ml) y puromicina de Sigma (P8833 n° de catálogo, 1 pg/ml) antes de recoger las proteínas desde el medio condicionado durante 48 h, y se utilizó para la purificación mediante la aplicación a Ni2+-NTA Sefarosa. La cadena polipeptídica de sortilina recombinante secretada que abarcaba el dominio extracelular completo de sortilina humana, termina de este modo en Ser725 (+AMIEGRGVGHHHHHH que contiene el sitio de fXa y el marcador poli-histidina). La calidad de la proteína se sometió a ensayo mediante tinción con plata del análisis SDS-PAGE. Los péptidos para estudios de unión y competencia se sintetizaron internamente o en Eurogentec.
Ejemplo 2 - Análisis por resonancia de plasmón superficial
La determinación de una unión directa del ligando con la proteína inmovilizada se realizó en un instrumento Biacore2000 (Biacore, Suecia) usando CaHBS como tampón de desplazamiento estándar (HEPES 10 mM, pH 7,4, NaCl 140 mM, CaCl2 2 mM, EGTA 1 mM y 0,005% de Tween-20). Un chip biosensor de Biacore (CM5, n° de catálogo BR-1000-14) se activó usando el método NHS/EDC como describe el proveedor, seguido por recubrimiento con sortilina hasta una densidad de proteína de 79 fmol/mm2, y se utilizó para mediciones de afinidad de los pro­ dominios recombinantes de NGF y BDNF. La regeneración de la celda de flujo después de cada ciclo del experimento de unión a ligando se realizó mediante dos pulsos de 10 uL de tampón de regeneración (glicina-HCl 10 mM, pH 4,0, NaCl 500 mM, EDTA 20 mM y 0,005% de Tween-20) y una sola inyección de 0,001% de SDS. El ajuste de los sensogramas para las estimaciones de afinidad se realizó utilizando la versión 3.1 de Biaevaluation.
Siguiendo protocolos similares, la inmovilización de pro-dom-NGF o pro-dom-BDNF también se llevó a cabo sobre un chip biosensor CM5, utilizando el kit de acoplamiento NHS/EDC de acuerdo con las instrucciones del fabricante (Biacore, Suecia), proporcionando densidades superficiales similares de proteína inmovilizada (~300 fmol/mm2). Los péptidos purificados se aplicaron al chip a concentraciones crecientes para verificar la unión directa de los dominios proneurotróficos a péptidos lineales de sortilina. Este chip se utilizó posteriormente para examinar la unión del dominio de sortilina de tipo silvestre 390 nM en tampón CaHBS, con un flujo de 5 uL/min que, en ausencia de cualquier péptido que compite, daba una señal de ~300 UR. Para la competencia que utiliza 300 uM del péptido, solamente se puede unir 1/3 de la sortilina a pro-dom-BDNF inmovilizado (que muestra ~66% de inhibición en el péptido).
Ejemplo 3 - Preparación de la membrana de celulosa
Los bancos de péptidos se generaron para todos los miembros de la familia de genes del receptor con dominio Vps10p o variaciones de péptidos específicos, en términos de sustitución o la longitud de los péptidos que se unen a sortilina identificados. Se utilizó un total de 2181 péptidos para la representación de la familia de genes de sortilina, que se correspondían con 273 péptidos para sortilina (código de acceso: CAA66904), 734 péptidos para SorLA (código de acceso: NP_003096), 389 péptidos para SorCS1 (código de acceso: NP_001013049), 382 péptidos para sorCS2 (código de acceso: Q96PQ0) y 403 péptidos para SorCS3 (código de acceso: CAI64579), con un solapamiento de 13 aminoácidos entre los 16 meros.
Un soporte de celulosa se prepara como una membrana de éter de amino-hidroxipropil-celulosa modificada en N, y todas las rondas de síntesis comienzan con la definición de la mancha mediante éster de 9-fluorenil-metoxicarbonilp-alanina-pentafluorofenilo que crea un enlazador de alanina entre el péptido y la membrana. A continuación, siguió una síntesis lineal automatizada de adición gradual de los diferentes aminoácidos protegidos en su extremo amino terminal mediante 9-fluorenil-metoxicarbonilo y una protección adecuada de la cadena lateral para la cadena peptídica en crecimiento. El patrón de desprotección, activación y acoplamiento continuó hasta que se produjeron péptidos de 16 meros, lo que dio como resultado una matriz distribuida de forma equitativa de péptidos anclados covalentemente al soporte de celulosa en su extremo C-terminal y un extremo libre N-terminal. La membrana se bloqueó finalmente en tampón de bloqueo de Sigma (n° de catálogo B6429) diluido en TBS y se complementó con 5% de sacarosa (Merck, n° de catálogo K32055087422) durante 2 h, antes de que el banco de péptidos predefinido estuviera listo para el análisis de unión a ligando.
Ejemplo 4 - Estudios de unión de los péptidos unidos a celulosa
Los bancos unidos a la membrana se incubaron con pro-dominios combinados marcados con S-péptido y polihistidina (10 pg/ml) en tampón de bloqueo durante una noche a 4°C, seguido de una segunda incubación con 1 pg/ml de S-proteína conjugada con HRP de Novagen (n° de catálogo 69047-3) también en tampón de bloqueo pero durante 3 h a temperatura ambiente. Posteriormente, la membrana se lavó tres veces durante 10 minutos con TBS antes de que la caracterización cuantitativa de ligando unido se llevara a cabo utilizando el sustrato de quimioluminiscencia UptiLight de Uptima (n° de catálogo UP99619A) y el instrumento Lumil-Mager de Roche Diagnostics, que proporcionaba intensidades de la señal de las manchas en unidades de luz Boehringer (BLUs). Alternativamente, la detección del ligando unido se realizó mediante un ensayo inmunoquímico, en donde un anticuerpo contra el marcador histidina era de Sigma (H-1029) y el anticuerpo secundario anti-ratón conjugado con HRP era de Calbiochem (n° de catálogo 401207). Las incubaciones siguieron a procedimientos estándar de transferencia Western y detección de manchas como anteriormente.
El método de análisis por sustitución y análisis de la longitud para identificar los residuos de aminoácidos únicos individuales y para determinar la secuencia peptídica mínima, respectivamente, para una unión eficaz de las prodominio-neurotrofinas con el péptido de sortilina, seguida de protocolos similares como para el ensayo inicial de unión del ligando a la membrana con manchas.
Ejemplo 5 - Ensayo de radioligando
La sortilina recombinante (38 pmol) se marca con [125I] usando el reactivo de yodación lodogen de Pierce (n° de catálogo 28600) hasta una actividad específica de ~5 x 1018 cpm/mol de sortilina. El pro-dom-NGF (o pro-dom-BDNF) recubre pocillos de microtitulación Maxisorp de Nunc (n° de catálogo 439454) mediante incubación durante 16 horas a 4°C en NaHCÜ350 mM, pH 9,6. Después del bloqueo usando 5% de albúmina de suero bovino (Sigma, n° de catálogo A9647) durante 2 h a temperatura ambiente, los pocillos se lavan tres veces con tampón MB (HEPES 10 mM, pH 7,4, NaCl 140 mM, CaCl22 mM y MgCl21 mM) antes de la incubación con 125I-sortilina, permitiendo una unión total de ~2.000 cpm/pocillo y cantidades variables de concentraciones de péptido competitivo se llevan a cabo durante 16 horas a 4°C en tampón MB complementado con 2% de albúmina de suero bovino. Después de lavados con tampón MB, la radiactividad unida se libera mediante la adición de 10% de SDS. La unión no específica del trazador a los pocillos recubiertos solamente con albúmina de suero bovino, se determina y se resta de los valores determinados en los experimentos de unión. El ajuste de los datos a las ecuaciones de unión utilizando el programa informático Prism de GraphPad, versión 4, produce la estimación de las constantes CI50.
Ejemplo 6 - Investigación de las propiedades antagonistas
Investigación de las propiedades del péptido como un antagonista in vivo de la unión de proneurotrofina a sortilina en un modelo animal de lesiones nerviosas en el cerebro de rata.
i) Determinación de los valores de CI50 para el péptido de longitud completa, así como péptidos más pequeños tal y como se identifican a partir de nuestro análisis de la longitud reciente, ilustran que los péptidos de 4-meros (por ejemplo, RIFR) se unen muy fuertemente a los pro-dominios de pro-NGF y pro-BDNF. Esto se realiza ya sea mediante:
ia) un marcado con 125I de sortilina y ensayos de competencia en estado sólido usando pro-dominio-NGF/BDNF inmovilizado en pocillos de microtitulación de Maxisorb, seguido de estudios de competencia, utilizando un aumento de los niveles de los diversos péptidos con el fin de comparar las propiedades inhibidoras.
ib) el uso de un análisis de resonancia de plasmón superficial para series de concentraciones de los diversos péptidos similares a los resultados mostrados para una sola concentración de péptido A2.
ii) Ensayo de la influencia de los residuos esenciales, identificados por el análisis de sustitución por su contribución a la unión a proneurotrofina. Usando el sistema de expresión EBNA293 para la producción recombinante del ectodominio de sortilina (el gel teñido con plata se incluyó en una de las figuras), los mutantes con residuos aislados de alanina del dominio de sortilina se producen actualmente usando mutagénesis dirigida al sitio. Los 7 mutantes siguientes se han sometido a ensayo: R160A, R163A, F165A, R166A, F170A, K172A, F174A numerados según se ha especificado para la prosortilina en la descripción de la secuencia. Debido a la presencia indicada de dos sitios de unión dentro de esta región de sortilina, podría ser necesaria la producción de mutantes dobles, triples, etc. para verificar el sitio de unión en el contexto de todo el dominio Vps10p de sortilina.
iii) Siempre que sea posible identificar los residuos de (ii), esenciales para la interacción entre sortilina y el pro­ dominio de pro-NGF/BDNF, se realizará la preparación de vectores de expresión (en pcDNA3.1/Invitrogen) para la proteína de sortilina de longitud completa que es portadora de tales mutaciones. El uso de estas estructuras artificiales (junto con p75NTR) para la transfección de células, debe producir células insensibles a la muerte celular mediada por pro-NGF, en comparación con la sortilina de tipo silvestre, ya que se interrumpe esta vía.
iv) Aplicación de los péptidos (o derivados de los mismos) al sistema de cultivo de células para la muerte celular neuronal, para verificar que los péptidos funcionan como inhibidores funcionales.
v) Siempre que se pueda llevar a cabo la identificación de inhibidores con éxito, se podrían utilizar para experimentos de rescate en experimentos de lesiones nerviosas para el cerebro de rata.
Ejemplo 7 - Estudios de unión en mutantes dirigidos al sitio
La mutagénesis dirigida al sitio se realizó para todos los residuos importantes dentro de la secuencia peptídica, tal como se ha identificado mediante el análisis por sustitución en el método de manchas, usando como plantilla el vector de expresión pCepPU para la sortilina. Las estructuras artificiales mutantes generadas de este modo se utilizaron junto con las células HEK293 para producir mutantes de residuos individuales del dominio luminal de sortilina marcado con his, para obtener las proteínas R163A, F165A, R166A, F170A, K172A y F174A, numeradas de acuerdo con prosortilina como se ha especificado en la descripción de la secuencia. Como una proteína de control, el mutante R160A situado en el extremo N-terminal de la secuencia de reconocimiento, se produjo con el fin de tener una proteína con una afinidad inalterada hacia el prodominio de NGF.
Después de la purificación mediante cromatografía Ni2+-NTA convencional, cada mutante de sortilina se inmovilizó con una densidad de superficie similar sobre chips CM5 de Biacore. La unión se sometió a ensayo utilizando una serie de concentraciones de la proteína de fusión con pro-dominio de GST-NGF previamente descrita (Nykj^r et al., Nature 2004), que es capaz de producir una mayor respuesta utilizando el sistema de SPR a baja concentración. Por lo tanto, la serie de concentraciones de 10, 20, 30, 40, y 50 nM de GST-prodominio de nGf se aplicó a cada superficie del chip, y los datos se ajustaron a un modelo de unión 1:1 usando el programa informático BIAevaluation estándar. Los sensogramas representativos se presentan en la Fig. 21, y los parámetros de la unión se proporcionan en la Tabla 1 a continuación.
Tabla 1: R163IFRSSDFAKNF174
Los parámetros cinéticos para la reacción de unión de GST-pro-dom-NGF (analizada a concentraciones de 10-50 nM) con mutantes de sortilina, son tal como se presentan en la Figura 21. Las curvas de unión se ajustaron usando el programa informático BIAevaluation 3.1, mostrando que todos los mutantes de residuos individuales producidos muestran una afinidad similar hacia el dominio de proneurotrofina, como lo hace el receptor no mutado, aunque las variantes F170A y F174A se unen con una capacidad inferior como se observa desde la parte inferior de las lecturas en las curvas en la figura 21. La numeración está de acuerdo con la prosortilina, como se ha especificado en la descripción de la secuencia.
Figure imgf000028_0001
* estos dos mutantes muestran una reducción de la capacidad de unión - pero una afinidad similar.
Como se describe en los experimentos de análisis de la longitud, el péptido parece que es portador de dos motivos de unión independientes, uno formado por RIFR y otro por FAKNF, ya que los péptidos pequeños RIFRSSDF y FAKNFVQTD muestran una unión eficaz del pro-dominio-NGF y el pro-dominio-BDNF en el análisis de manchas. Este modelo se ve apoyado además por los datos anteriores en el análisis por sustitución, en donde se observó un efecto más fuerte después de la mutación, cuando se empleaban péptidos que contenían solo uno de los motivos de unión, en comparación con mutantes que incluían ambos motivos. En consecuencia, se decidió "eliminar" un motivo entero antes de la sustitución dentro del segundo motivo y poder observar cómo influirían en la unión del ligando. Se produjo una variante de sortilina que contenía sustituciones cuádruples (R163A, F165A, R166A y F170A) en un procedimiento similar, usando células HEK293 tal y como se aplicaron para los mutantes de residuos individuales. Se observó que esta proteína se secretaba en el medio de las células HEK293, lo que demuestra que el mutante quatro todavía era capaz de plegarse en forma de una proteína soluble.
Para determinar la capacidad de unión del ligando, la proteína quatro se acopló en paralelo con la sortilina de tipo silvestre en un nuevo chip de Biacore, y la unión de GST-pro-NGF se midió de una manera similar al análisis de mutantes de residuos individuales (Fig. 21). Se encontró una afinidad muy reducida hacia la unión al dominio de proneurotrofina, apoyando la conclusión de que un sitio de unión importante para los ligandos está contenido en el péptido RGGRIFRSSDFAKNF.
La unión de otros ligandos, tales como neurotensina y el propio pro-péptido de sortilina, se puede someter a ensayo de una manera análoga a cómo se ha descrito anteriormente en el presente documento.
Ejemplo 8 - Identificación de sitios de unión de proneurotrofina sobre el receptor sortilina
Para identificar antagonistas del sitio de unión al pro-dominio de neurotrofina en la sortilina (es decir, el péptido RGGRIFRSSDFAKNF), se realizó el siguiente conjunto de experimentos:
El marcado de pro-NGF y pro-dom-NGF se realiza usando el método de IODOGEN y 125I de Amersham Biosciences. Las células HEK293 se transfectan con el vector de expresión de sortilina usando el reactivo de transfección HIFECT para optimizar la eficacia. 24 horas después de la transfección, las células se incuban a 4°C durante 2 horas antes de aplicar un radio-ligando durante 16 horas a 4°C en HEPES 10 mM, pH 7,4, NaCl 150 mM, CaCl22 mM y MgCl21 mM, tanto en ausencia como en presencia de antagonistas candidatos. La unión del ligando a sortilina se determina como la radiactividad asociada a las células. En un experimento similar llevado a cabo a 37°C, medimos la cantidad de ligando degradado como cuentas secretadas en los medios celulares en un período de tiempo de 16 horas. La capacidad de los antagonistas candidatos para proteger frente a una apoptosis inducida por pro-NGF, se lleva a cabo como se ha descrito (Jansen et al., Nature Neurosci., 2007).
La purificación del dominio extracelular de sortilina marcada con His se realiza como se ha descrito en otro lugar, y se acopla a perlas de centelleo con formación de imágenes PS SPA con quelato de níquel (marcador His), de acuerdo con el protocolo del fabricante (GE Healthcare Life Sciences).
Un ensayo homogéneo individual en pocillos utilizado para la cuantificación directa de la actividad de unión a 125I-pro-NGF o 125I-pro-dom-NGF inducida por el agonista candidato o inducida de forma inversa, para los receptores acoplados a las perlas de centelleo, se lleva a cabo siguiendo las pautas siguientes, como se proporciona en GE Healthcare Life Sciences.
Las propiedades antagonistas se someten a ensayo en experimentos de competencia utilizando un ensayo de proximidad de centelleo en una configuración inversa. El prodominio de NGF fusionado a GST (descrito en Nykj^r, Nature, 2007) está acoplado a perlas de centelleo inmovilizadas con glutatión (GE Healthcare Life Sciences) y la inhibición se determina utilizando un dominio extracelular de sortilina intacta radiomarcada con 125I-RGGRIFRSSDFAKNF o marcada con 125I, que se une a las perlas mediante antagonistas candidatos como se ha descrito anteriormente.
Los antagonistas que se unen directamente al motivo RGGRIFRSSDFAKNF (como tales moléculas es muy probable que interfieran con la interacción del ligando particular y sortilina intacta) se identifican. El péptido es sintetizado por Eurogentec, Lieja, Bélgica, y se inmoviliza en un chip sensor BIAcore CM5 (n° de catálogo BR-1000-14) utilizando el kit de acoplamiento de NHS/EDC (Biacore, Suecia). Las propiedades de unión de las moléculas candidatas se evalúan mediante el escrutinio de su unión al receptor/péptido con diversas concentraciones en HEPES 10 mM, pH 7,4, NaCl 150 mM, CaCl22 mM, 0,005% de Tween-20 como tampón de ejecución.

Claims (2)

REIVINDICACIONES
1. Un anticuerpo dirigido contra la parte extracelular de la sortilina y capaz de inhibir la unión de una proneurotrofina a un sitio de unión en el receptor sortilina, en donde el anticuerpo se dirige contra una secuencia que consiste en RGGRIFRSSDFAKNF para uso en el tratamiento de los trastornos neurodegenerativos.
2. Un anticuerpo según la reivindicación 1, para uso en el tratamiento de la enfermedad de Alzheimer, enfermedad de Parkinson y corea de Huntington.
ES17150769T 2006-12-21 2007-12-21 Modulación de la actividad de proneurotrofinas Active ES2777652T3 (es)

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