ES2449941T3 - Procedimiento y kit para la determinación de metabolitos en muestras de manchas de sangre seca - Google Patents

Procedimiento y kit para la determinación de metabolitos en muestras de manchas de sangre seca Download PDF

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Abstract

Un procedimiento para la determinación analítica, mediante EM, de Adenosina y Desoxiadenosina a partir de unamuestra de sangre seca, comprendiendo dicho procedimiento la extracción de Adenosina y Desoxiadenosina enunas condiciones que permiten la extracción simultánea de otros metabolitos tales como aminoácidos, carnitina libreo acilcarnitinas, estando dicho procedimiento caracterizado por el uso de una mezcla de extracción que comprendeuna mezcla de agua y un monoalcohol C1-3 de cadena lineal o ramificada en el que el agua está presente al menosal 10 % v/v.

Description

Procedimiento y kit para la determinación de metabolitos en muestras de manchas de sangre seca
5 Campo de la invención
[0001] La presente invención se refiere a un procedimiento y a un kit para la determinación de metabolitos en muestras de manchas de sangre seca (como las tarjetas de Guthrie), en particular dichos metabolitos incluyen también aquellos debidos a un defecto en la desaminasa de adenosina (ADA) o a un defecto en la fosforilasa de nucleósidos de purina (PNP).
Antecedentes
[0002] La inmunodeficiencia combinada grave (SCID) es un grupo de enfermedades graves que afectan al sistema
15 inmunitario. Los niños con SCID nacen sanos pero mueren por una infección grave recurrente en la infancia salvo que se proporcione una terapia adecuada. Desafortunadamente, la mayoría de los niños con SCID no son identificados en el periodo previo a la infección: el diagnóstico se hipotetiza habitualmente cuando se produce una infección grave. Sin embargo, en ese momento, aunque se inicia una intervención terapéutica correcta, ya puede haber daños presentes debidos a una infección grave (tales como meningitis, encefalitis, neumonía grave) y las secuelas permanentes pueden ser una importante carga tanto para los pacientes como para la familia y la sociedad.
[0003] El SCID debido a un defecto en la desaminasa de adenosina (ADA) o en la fosforilasa de nucleósidos de purina (PNP) es un trastorno hereditario en el metabolismo de la purina. La deficiencia genética de la enzima natural de purina ADA da como resultado unos grados variables de inmunodeficiencia que varían entre una
25 inmunodeficiencia combinada grave de inicio neonatal hasta una inmunodeficiencia de inicio tardío que puede determinar una afectación grave de la función pulmonar en adolescentes o en adultos.
[0004] En su forma típica, la ausencia de la enzima ADA permite la acumulación de metabolitos tóxicos resultantes por un lado de un grave defecto del sistema inmunitario, y por otro lado, de un daño permanente de otros órganos y sistemas tales como el cerebro o el hígado. En estos casos, la SCID-ADA es mortal en los primeros meses de vida si no se trata, y está asociada con graves secuelas si se trata tarde.
[0005] También se ha descrito una ADA-SCID de inicio tardío. En estos casos, los pacientes experimentan infecciones graves recurrentes y enfermedad pulmonar crónica durante la infancia o la adolescencia. Las
35 consecuencias clínicas del defecto en la PNP son muy similares.
[0006] En ambos casos, el transplante de células madre hematopoyéticas es curativo, pero depende de una buena compatibilidad con el donante. La terapia de sustitución enzimática está disponible y determina la eliminación de los metabolitos tóxicos y una buena reconstitución del sistema inmunitario. La terapia génica también es una opción para los pacientes. En cualquier caso, cualquiera que sea la terapia elegida, debería comenzar lo más pronto posible tras el nacimiento con objeto de obtener un buen efecto terapéutico. Por lo tanto, los procedimientos diagnósticos que permitan la realización de un diagnóstico seguro en los primeros días de vida son extremadamente importantes.
[0007] El diagnóstico temprano de la deficiencia en ADA es necesario porque las terapias oportunas (trasplante de
45 células madre, terapia de sustitución enzimática) pueden ser curativas, mientras que la enfermedad es rápidamente mortal si no se trata. El diagnóstico se puede realizar buscando la actividad enzimática de la ADA o la acumulación de metabolitos debida a la deficiencia en la ADA. La evaluación de la actividad de la ADA es compleja y a menudo puede aportar unos resultados engañosos: de hecho, se puede encontrar un defecto grave en la actividad de la ADA en sujetos con una función inmunitaria absolutamente normal, debido a que la actividad residual variable de la ADA expresada en células distintas a las células inmunitarias puede ser suficiente para mantener una función inmunitaria correcta. Por esta razón, la dosis de metabolitos es absolutamente obligatoria para conseguir el diagnóstico de la inmunodeficiencia debida a una deficiencia en ADA o en PNP. Además, la dosificación de metabolitos permite monitorizar la reducción de su actividad tóxica tras el comienzo de la terapia de sustitución enzimática.
55 [0008] La medición de los metabolitos de purina y de pirimidina presenta problemas complejos para las separaciones. Se usan diferentes procedimientos para la medición en la práctica clínica, que varían desde una HPLC hasta una cromatografía en capa fina. Otros procedimientos incluyen una electroforesis capilar e incluso una HPLC en fase inversa con espectrometría de masas en tándem con ionización por electronebulización.
[0009] Sin embargo, todos estos procedimientos se aplican sobre muestras de orina y se usan cuando ya se ha formulado una sospecha clínica de inmunodeficiencia debido al inicio de infecciones graves. Existe un serio inconveniente en los procedimientos, dado que los niños afectados deberían ser diagnosticados antes del inicio de las infecciones para maximizar la oportunidad de un tratamiento que les salve la vida. Los antecedentes familiares pueden ayudar a realizar un diagnóstico temprano, pero los datos obtenidos en los estados unidos muestran que
65 únicamente el 18 % de los pacientes afectados tienen unos antecedentes familiares positivos. El número es probablemente incluso menor en Italia, donde la mayoría de las familias únicamente tienen un hijo.
[0010] El uso de la espectrometría de masas (EM) en los laboratorios clínicos ha aumentado mucho al comienzo del siglo XXI. Este desarrollo es debido obviamente a los grandes avances en las aplicaciones de la espectrometría de masas en los últimos quince años. La espectrometría de masas permite una medición muy rápida de diferentes metabolitos en diferentes muestras biológicas mediante el uso de manchas en papel de filtro o directamente en
5 diferentes fluidos biológicos. Debido a su elevada sensibilidad, esta técnica se puede usar para los análisis cualitativos y cuantitativos de muchos analitos tales como purinas y pirimidinas, aminoácidos y acilcarnitinas, homocisteína, ácido orótico, succinilacetona etc., con los estándares internos apropiados.
[0011] La EM se usa ampliamente para el análisis de metabolitos procedentes de manchas de sangre seca tomadas
10 al nacer (tarjetas de Guthrie), pero entre los metabolitos detectados, aquellos debidos a una deficiencia en la ADA no son detectados porque los procedimientos de extracción no son eficaces. El procedimiento clásico usado habitualmente para un cribado ampliado del recién nacido se realiza mediante el uso de un monoalcohol C1-3 de cadena lineal o ramificada (preferiblemente metanol) (Millington DS, y col., J Inherit Metab Dis. 1990; 13 (3): 321 - 4; Donald H. y col. Clin. Chem., noviembre de 2003; 49: 1797 - 1817; la Marca G. y col., Rapid Commun Mass
15 Spectrom. 2003; 17 (23): 2688 - 92).
[0012] El propósito de la presente invención es proporcionar un procedimiento analítico que podría permitir también la determinación de metabolitos de purina y de pirimidina (incluyendo, en particular, metabolitos por una deficiencia en ADA o en PNP) junto con la determinación de otros metabolitos que se determinan habitualmente en el cribado
20 de metabolitos, especialmente los cribados realizados en manchas de sangre seca tomadas al nacer.
Definiciones y abreviaturas
[0013]
25 ADA: desaminasa de adenosina Ado: adenosina D-Ado: desoxiadenosina EM: espectrometría de masas
30 PNP: fosforilasa de nucleósidos de purina SCID: inmunodeficiencia combinada grave
Sumario de la invención
35 [0014] El objeto de la presente invención es un procedimiento capaz de individualizar, mediante una EM, con una elevada sensibilidad y especificidad, metabolitos de purina y de pirimidina (incluyendo especialmente metabolitos por una deficiencia en ADA o en PNP) procedentes de sangre seca. El procedimiento descrito en este documento puede usarse para extraer Adenosina y Desoxiadenosina a partir de una muestra de sangre seca en unas condiciones que permiten extraer simultáneamente otros metabolitos, tales como otras purinas y pirimidinas, aminoácidos, carnitina
40 libre o acilcarnitinas. El procedimiento de la invención se caracteriza por el uso de una mezcla de extracción que comprende una mezcla de agua y un monoalcohol C1-3 de cadena lineal o ramificada (preferiblemente metanol) en la que hay presente agua al menos al 10 % v/v. El procedimiento puede usarse, junto con otros cribados neonatales, sobre manchas de sangre seca, preferiblemente absorbidas en una tarjeta, y más preferiblemente en tarjetas de Guthrie, incluso más preferiblemente en las tarjetas de Gurthie obtenidas en el ll - IV día de vida, o durante la terapia
45 de sustitución enzimática (para monitorizar la eficacia de la terapia).
[0015] El procedimiento es fiable y reproducible, fácil de realizar y proporciona una respuesta definitiva en poco tiempo (1 - 2 días). El procedimiento permite evitar unas condiciones de extracción molestas (tales como una extremada acidez y elevada temperatura).
50 [0016] Por primera vez se ofrece la posibilidad de obtener el diagnóstico de ADA-SCID al nacer, antes del inicio de una enfermedad infecciosa. El diagnóstico temprano de la SCID permite tratar a los pacientes afectados muy pronto, de forma que se eviten las graves complicaciones debidas a una enfermedad infecciosa que se esperan siempre en el seguimiento de los pacientes inmunodeficientes. Los costes humanos y monetarios de una hospitalización
55 prolongada, un cuidado intensivo y una muerte temprana que son el resultado de un retraso en el diagnóstico de una SCID, podrían evitarse diagnosticando el paciente afectado al nacer mediante el procedimiento descrito en este documento.
[0017] Un objeto adicional de la invención es un kit según se define en las reivindicaciones. Los kits son útiles para
60 preparar muestras para la detección y/o la medición (mediante el uso de espectrometría de masas en tándem) de Adenosina y Desoxiadenosina junto con otros múltiples analitos (por ejemplo, otras purinas y pirimidinas, aminoácidos, carnitina libre y acilcarnitina) en una muestra de sangre seca.
Breve descripción de los dibujos
[0018]
5 La Fig. 1 muestra un barrido de pérdida neutra de m/z 46 en el que se detectan varios aminoácidos en la misma muestra (panel B) y un barrido precursor de m/z 85 en el que se detectan varias acilcarnitinas en la muestra (panel A); en la muestra también había presentes estándares internos, análogos de isótopos pesados estables de Adenosina y Desoxiadenosina (Panel C).
Descripción detallada
[0019] La divulgación presenta procedimientos para la extracción de Adenosina y Desoxiadenosina junto con uno o más analitos adicionales (por ejemplo, otras purinas y pirimidinas, aminoácidos, acilcarnitinas y carnitina libre) de la muestra en una única etapa, de forma que las concentraciones de Adenosina y Desoxiadenosina y de uno o más
15 analitos adicionales (por ejemplo, otras purinas y pirimidinas, aminoácidos, carnitina libre y acilcarnitinas) en el extracto reflejen sus respectivas concentraciones en la muestra.
[0020] Después de la extracción, la presencia o la cantidad de Adenosina y Desoxiadenosina puede ser determinada junto con uno o más analitos adicionales (por ejemplo, carnitina libre, acilcarnitinas y aminoácidos) mediante el uso de espectrometría de masas (por ejemplo, espectrometría de masas en tándem).
[0021] El procedimiento puede incluir poner en contacto una muestra con una disolución de extracción que contiene un monoalcohol C 1-3 de cadena lineal o ramificada (por ejemplo, metanol, etanol, propanol o isopropanol) y agua.
25 [0022] La Adenosina y la Desoxiadenosina no son solubles en alcohol absoluto ni en una disolución que contenga menos de un 10 % de agua. Para extraer (liberar) la Adenosina y la Desoxiadenosina junto con uno o más analitos adicionales de una muestra (por ejemplo, una muestra biológica tal como una mancha de sangre) en una única etapa, la muestra puede ponerse en contacto con una disolución de extracción que contiene un monoalcohol C 1-3 de cadena lineal o ramificada (por ejemplo, metanol, etanol, propanol o isopropanol) con al menos un 10 % de agua.
[0023] Preferiblemente, el procedimiento de la invención se realiza añadiendo la disolución de extracción en dos etapas: en la primera etapa se pone en contacto la muestra con un monoalcohol C 1 -3 de cadena lineal o ramificada que se corresponde con el 100-x % v/v del volumen final; en la siguiente segunda etapa se añade a la muestra agua, que se corresponde con el x % v/v del volumen final v/v; en el que x es el porcentaje de agua en v/v, que varía 35 desde el 10 hasta el 90 %. Preferiblemente, la disolución de extracción contiene un 30 - 50 % v/v de agua; más preferiblemente, la mejor condición analítica se obtiene cuando una disolución de extracción contiene un 60 % de metanol y un 40 % de agua. Además, se obtiene el máximo rendimiento para la extracción de Adenosina y de Desoxiadenosina cuando la adición de la disolución de extracción se realiza en las dos siguientes etapas: en la primera etapa se pone en contacto la muestra con metanol que se corresponde con un 60 % v/v del volumen final. En la siguiente segunda etapa se añade a la muestra agua que se corresponde con un 40 % v/v del volumen final. La primera etapa fijaba proteínas, péptidos y hemoglobina a la celulosa de la tarjeta de Guthrie, reduciendo sistemáticamente su extracción. Las proteínas, los péptidos y la hemoglobina podían ser una interferencia relevante en el análisis por espectroscopia de masas. El procedimiento también puede incluir poner en contacto la muestra directamente con una disolución de extracción que contiene metanol y agua al 60/40 v/v. Pero en este caso la
45 concentración de agua debe ser tal que la disolución de extracción reconstituya algunas de las proteínas y los péptidos, mientras que al mismo tiempo disuelva otros analitos (por ejemplo, Adenosina,
[0024] Desoxiadenosina, acilcarnitinas, carnitina libre y aminoácidos) presentes en la muestra. La disolución de extracción también puede contener un ácido orgánico, tal como ácido acético y/o fórmico, a una concentración de 1 5 mM (preferiblemente de 2,5 - 3,5 mM).
[0025] La disolución de extracción también puede contener, opcionalmente, uno o más estándares internos para, por ejemplo, aminoácidos, carnitina libre, acilcarnitinas y Adenosina y Desoxiadenosina, a unas concentraciones conocidas.
55 [0026] La mezcla de muestra puede incubarse entonces durante un periodo predeterminado de tiempo de al menos 15 minutos (y preferiblemente de no más de 120 minutos) para permitir la extracción de aminoácidos, carnitina libre y acilcarnitinas, así como la extracción de Adenosina y Desoxiadenosina.
[0027] Entonces el extracto puede ser transferido a un pocillo sin usar de una placa de microtitulación, y después las muestras se analizan mediante espectrometría de masas en tándem, opcionalmente con la ayuda de un dispositivo de manipulación de líquidos para la inyección de la muestra.
[0028] Entonces se establecen los ajustes instrumentales en el espectrómetro de masas en tándem para detectar
65 los respectivos metabolitos de interés (aminoácidos, acilcarnitinas, carnitina libre y Adenosina y Desoxiadenosina), así como sus correspondientes estándares internos de forma múltiple.
[0029] Los analitos adicionales que pueden ser detectados y/o medidos junto con Adenosina y Desoxiadenosina incluyen, por ejemplo, alanina, arginina, citrulina, glicina, leucina, metionina, ornitina, fenilalanina, prolina, tirosina, valina, y acilcarnitinas tales como libre, Acetilo, Acrililo, Propionilo, Butirilo, Tiglilo, Isovalerilo, 3-OH-butirilo, Hexenoílo, Hexanoílo, 3-OH-Isovalerilo, Heptanoílo, Octenoílo, Octanoílo, Nonanoílo, Malonilo, Decatrienoílo,
5 Decadienoílo, Decenoílo, Decanoílo, Metilmalonilo, Glutarilo, 3-OH-Decanoílo, Dodecenoílo, Dodecanoílo, Deshiroadipilo, Adipilo, 3-OH-Dodecanoílo, Tetradecadienoílo, Tetradecenoílo, Miristoílo, Deshidrosuberilo, Suberilo, 3-OH-Tetradecanoílo, Hexadecenoílo, Palmitoílo, Deshidrosabacilo, Sebacilo, 3-OH-Hexadecanoílo, Linoleílo, Oleílo, Estearoílo. Otras purinas y pirimidinas incluyen, pero no se limitan a, Uracilo, Citosina, Timina, Adenina, Guanina, Uridina, Citidina, Timidina, Guanosina, Hipoxantina, Desoxiguanosina, Desoxiinosina, Desoxiuridina, 5-OH-Meuracilo, AICAR (Aminoimidazol-4-carboxamida ribótido), Dihidrouracilo, p-Alanina, Inosina, ácido Úrico, ácido Orótico, ácido p-Aminoisobutírico, Dihidrotimina, Ureidopropionato, Xantina, SAICAr (Succinil-aminoimidazol-4carboxamida ribósido) y Succinil-adenosina.
Espectrometría de masas
15 [0030] La espectrometría de masas en tándem puede usarse para detectar y/o medir Adenosina y Desoxiadenosina y uno o más analitos adicionales (por ejemplo, carnitina libre, acilcarnitinas y aminoácidos) en una muestra (por ejemplo, una muestra biológica). En la espectrometría de masas en tándem se conectan en serie dos analizadores de masas a través de una célula de colisión. El primer analizador de masas (primer cuadrupolo) se usa para seleccionar un ión de interés (por ejemplo, un ión con una proporción entre masa y carga en particular (m/z)). Los iones seleccionados se transfieren entonces a una célula de colisión donde son fragmentados mediante colisiones con un gas inerte (por ejemplo, nitrógeno o helio o argón). Este proceso se denomina disociación activada por colisión (CAD) y se realiza en la célula de colisión del espectrómetro de masas. Una vez que los iones precursores se han fragmentado, se usa el segundo analizador de masas (tercer cuadrupolo) bien para barrer y detectar todos
25 los iones producto producidos, o bien para seleccionar y detectar fragmentos de iones en particular.
[0031] Según se detalla en los Ejemplos anexos, se usó la espectrometría de masas en tándem para ionizar las moléculas precursoras de Adenosina y Desoxiadenosina y varios aminoácidos, fragmentar los iones y detectar picos específicos que son indicativos de la presencia de estas moléculas en la muestra. La detección mediante espectrometría de masas en tándem puede llevarse a cabo de varias formas. En un tipo de espectrometría de masas en tándem (realizada habitualmente con espectrómetros de masas en tándem de cuadrupolo triple) los iones que se fragmentan para producir los iones (fragmento) productos habituales pueden ser detectados como una clase mediante la realización de un "barrido de iones precursores", en el que mediante la selección de una masa apropiada para la fragmentación habitual en la célula de colisión, todos los iones que producen los iones fragmento 35 comunes son detectados. Este tipo de barrido se puede usar para detectar las acilcarnitinas en una muestra (y a un precursor de barrido de m/z 85). En una forma diferente de la espectrometría de masas en tándem, los iones que se fragmentan para producir una pérdida neutra común pueden ser detectados como una clase mediante la realización del denominado barrido de pérdida neutra, en el que, estableciendo una compensación de masa apropiada igual a la pérdida neutra común entre el primer y el tercer cuadrupolo, todos los iones que se fragmentan para producir la pérdida neutra especificada son detectados. Este tipo de barrido se realiza para detectar aminoácidos en una muestra (pérdida neutra de m/z 46 si los analitos de la muestra extraída eran ésteres no butilados). La Fig. 1 muestra un barrido de pérdida neutra de m/z 46 en el que se detectaron varios aminoácidos procedentes de la misma muestra y un barrido precursor de m/z 85 en el que se detectaron varias acilcarnitinas en la muestra. En otro tipo más de espectrometría de masas en tándem, conocido como monitorización de reacción múltiple (MRM), se
45 selecciona un ión precursor de interés en el primer cuadrupolo, se fragmenta en la célula de colisión y se selecciona un ión fragmento específico resultante de la activación por colisión en el tercer cuadrupolo, y finalmente se detecta.
[0032] El primer y el tercer cuadrupolo se fijan para que seleccionen respectivamente los correspondientes pares de iones precursores y fragmentos de interés para una cantidad predeterminada de tiempo (unos pocos milisegundos). Si se requiere la detección de analitos adicionales, pueden introducirse transiciones de detección adicionales en el experimento. Los datos de todas las transiciones de masas seleccionadas pueden ser adquiridos secuencialmente para obtener la información deseada. La detección y la cuantificación de Adenosina y de Desoxiadenosina en una mezcla pueden obtenerse empleando la transición de masa específica para cada uno de estos compuestos como sigue: para la Adenosina: primer cuadrupolo fijado para seleccionar y transmitir el ión precursor a m/z 268, tercer
55 cuadrupolo fijado para seleccionar y trasmitir el ión producto específico a m/z 136 (transición 1 de MRM); para la Desoxiadenosina: primer cuadrupolo fijado para seleccionar y transmitir el ión precursor a m/z 252, tercer cuadrupolo fijado para seleccionar y trasmitir el ión producto específico a m/z 136 (transición 2 de MRM). Estas dos transiciones de MRM pueden ser medidas secuencialmente a partir de la misma muestra durante una cantidad predeterminada de tiempo para detectar la presencia y/o la concentración de una mezcla de estos compuestos en dicha muestra.
[0033] A la muestra se pueden añadir estándares internos estables de isótopos marcados para Adenosina y, mediante lo que puede llevarse a cabo la cuantificación de Adenosina y de Desoxiadenosina, y por lo tanto de las propias Adenosina y Desoxiadenosina. Dichos marcajes de Adenosina y Desoxiadenosina derivatizadas con isótopos estables da como resultado un desplazamiento de la masa, mientras se conservan unas propiedades 65 fisicoquímicas muy similares entre los compuestos marcados y no marcados. Generalmente se pueden añadir uno o más estándares internos a una concentración conocida a una muestra para permitir la cuantificación del analito de interés (por ejemplo, Adenosina y Desoxiadenosina). Por ejemplo, para una muestra analizada mediante el uso de espectrometría de masas en tándem, se puede usar la proporción entre las señales producidas por la Adenosina y la Desoxiadenosina y su correspondiente estándar interno para determinar las cantidades de este compuesto en la muestra. El estándar interno también puede añadirse para distinguir las moléculas naturales (endógenas). Al igual 5 que anteriormente, los estándares internos pueden prepararse en una disolución de extracción antes de mezclar una muestra (por ejemplo, una muestra de sangre) con la disolución de extracción. Alternativamente, los estándares internos pueden añadirse a la mezcla en cualquier etapa de la preparación de la muestra que asegure que estos estándares internos no serán eliminados de la mezcla durante el procesado de la muestra (por ejemplo, después de una extracción líquido-líquido o de una extracción en fase sólida). Los estándares internos para un analito de interés (u otras moléculas, por ejemplo, las biomoléculas descritas en este documento) detectados por un procedimiento descrito en este documento pueden ser cualquier modificación o análogo de esa molécula analito que sea detectable mediante espectrometría de masas. Un estándar interno es detectable por separado de la molécula gracias a sus características físicas únicas, tales como una masa o una proporción entre masa y carga únicas. Un estándar interno usado habitualmente en espectrometría de masas es una forma estable marcada isotópicamente o un derivado 15 químico de un analito de interés (por ejemplo, si el analito es Adenosina y Desoxiadenosina, el estándar interno puede ser Adenosina y Desoxiadenosina marcadas isotópicamente). Lo mismo para los analitos adicionales descritos en este documento y referidos como aminoácidos y acilcarnitinas. Por ejemplo, pueden usarse análogos marcados con isótopos estables para cuantificar el correspondiente analito de interés mediante el uso de la técnica conocida como espectrometría de masas por dilución de isótopos, en la que el analito y los estándares internos son procesados en la misma muestra. Los estándares internos pueden ser diseñados de forma que 1) el marcaje provoque un desplazamiento en la masa de al menos 1 unidad de masa, y 2) ninguno de los marcadores del isótopo estable estén ubicados en sitios lábiles, para evitar un intercambio. Los marcadores pueden ser 2H (D), 15N, 13C u 18O en cualquier combinación. La ubicación real de los marcadores en la molécula puede variar siempre que se cumpla el prerrequisito 2 (anterior). Además, también se puede usar la posición de los marcadores y el potencial
25 cambio en la masa de los iones fragmento para confirmar la separación entre el estándar interno y los analitos. Algunos ejemplos de potenciales estándares internos útiles en los procedimientos descritos en este documento incluyen, pero no se limitan a, un marcaje isotópico de: Adenosina y Desoxiadenosina (por ejemplo, Ribosina-1-13C-Adenosina y 13C5 Desoxiadenosina), carnitina, acilcarnitina o un aminoácido (por ejemplo, fenilalanina, citrulina, ácido glutámico). La detección del estándar interno marcado específico en una mezcla puede obtenerse empleando la transición de masa específica para cada uno de estos compuestos como sigue: para Ribosina-1-13C-Adenosina: primer cuadrupolo fijado para seleccionar y transmitir el ión precursor a m/z 269, tercer cuadrupolo fijado para seleccionar y transmitir el ión producto específico a m/z 136 (transición 3 de MRM); para 13C5 Desoxiadenosina: primer cuadrupolo fijado para seleccionar y transmitir el ión precursor a m/z 257, tercer cuadrupolo fijado para seleccionar y transmitir el ión producto específico a m/z 136 (transición 4 de MRM).
Muestras
[0034] Las muestras adecuadas para los procedimientos descritos en este documento incluyen sangre seca absorbida sobre un papel o un sustrato polimérico.
Validación del procedimiento
[0035] Se han obtenido tres pares de manchas de sangre seca (tarjetas de Guthrie) a partir de tres pacientes con SCID-ADA procedentes de aquellas almacenadas en el Neonatal Screening Center de la región de Tuscany. Todos
45 los pacientes habían sido diagnosticados en el primer año de vida mediante el uso de procedimientos convencionales con orina o con muestras sanguíneas obtenidas mediante punción venosa. El diagnóstico fue confirmado mediante el uso de un análisis genético del ADN. Todos los padres de los 3 pacientes resultaron ser portadores de la mutación génica asociada con la SCID-ADA.
[0036] El procedimiento descrito en la presente invención permitió la detección de metabolitos tóxicos de la ADA en los 3 casos, con un análisis cuantitativo. Los niveles de los metabolitos tóxicos eran 10.000 - 30.000 veces mayores que los niveles encontrados en sujetos normales. El procedimiento también se aplicó a 5.000 manchas de sangre seca procedentes de sujetos sanos. En ninguna de ellas se encontró un aumento en el nivel de metabolitos tóxicos de la ADA. En resumen, los resultados obtenidos con el procedimiento de la invención demostraron que la SCID
55 ADA puede ser diagnosticada con la mayor sensibilidad (100 %) y especificidad (100 %) a partir de manchas de sangre seca tomadas al nacer a través de un espectrómetro de masas de cuadrupolo triple con una fuente TurbolonSpray.
[0037] Por lo tanto, la tecnología descrita en este documento es aplicable al cribado, el diagnóstico, el pronóstico, la terapia de monitorización y de cumplimiento, y a cualquier otra aplicación en la que es útil la determinación de la presencia o de la cantidad de conjuntos de dos o más biomoléculas, tales como Adenosina y Desoxiadenosina y una
o más de un aminoácido, carnitina libre o una acilcarnitina.
Kits
65 [0038] En este documento también se proporcionan kits según se definen en las reivindicaciones, útiles para la
preparación de las muestras para la detección y/o la medición (mediante el uso de espectrometría de masas en tándem) de Adenosina y Desoxiadenosina junto con otros múltiples analitos (por ejemplo, otras purinas y pirimidinas, aminoácidos, carnitina libre y acilcarnitina) en una muestra de sangre seca. Los kits incluyen uno o más estándares internos y/o controles para su uso en el subsiguiente análisis por espectrometría de masas según se define en las 5 reivindicaciones. Por ejemplo, los kits pueden incluir Adenosina y Desoxiadenosina como control y una forma
13C5
derivatizada (por ejemplo, marcada con un isótopo) de Ribosina-1-13C-Adenosina y de Desoxiadenosina) marcada como un estándar interno. La Adenosina y la Desoxiadenosina y/o la Adenosina y la Desoxiadenosina derivatizadas pueden proporcionarse cada una en el kit en forma líquida o seca (por ejemplo, liofilizada). La Adenosina y la Desoxiadenosina pueden proporcionarse en una cantidad de 0,1 - 5 mmol. Los kits pueden incluir Adenosina y Desoxiadenosina en un recipiente que contiene uno o más controles o estándares internos adicionales. Por ejemplo, el kit puede incluir un recipiente con un control de Adenosina y la Desoxiadenosina, uno o más controles de aminoácidos y uno o más controles de carnitina (por ejemplo, carnitina libre y acilcarnitinas).
[0039] Una o más de las disoluciones contenidas en el kit pueden almacenarse, por ejemplo, en viales de vidrio
15 silanizado. Uno o más de los componentes del kit puede almacenarse en un recipiente que evite o minimice la pérdida de material o la evaporación de disolvente. Por ejemplo, el recipiente puede estar precintado con un tapón.
[0040] Los kits pueden incluir, por ejemplo, manchas de sangre seca útiles como control. Por ejemplo, la mancha de sangre seca puede estar enriquecida con uno o más analitos (por ejemplo, uno o más analitos a unas concentraciones conocidas) tales como Adenosina y Desoxiadenosina, uno o más aminoácidos, carnitina libre o una
o más acilcarnitinas.
[0041] Los kits también pueden incluir, opcionalmente, una disolución de extracción tal como cualquiera de las disoluciones de extracción descritas en este documento. La disolución de extracción puede contener un
25 monoalcohol C 1-3 lineal o ramificado con al menos un 25 % de agua. Los kits también pueden incluir una o más disoluciones disolvente que contienen, por ejemplo, acetonitrilo o isopropanol. Las disoluciones disolvente también pueden contener agua, por ejemplo, una disolución disolvente contiene un 80 % de acetonitrilo y un 20 % de agua.
SECCIÓN EXPERIMENTAL
Ejemplos
Ejemplo 1
35 [0042] Se prepararon manchas de sangre estándar de referencia (sangre completa) mediante el uso de sangre completa agrupada obtenida a partir de 5 sujetos. La sangre fue procesada mediante el ajuste de la concentración de hemoglobina a 17 mg/dl y la adición de Adenosina y Desoxiadenosina a la sangre a unas concentraciones conocidas. La sangre procesada fue dispensada en tarjetas de papel de filtro para formar manchas de sangre sobre la matriz de papel de filtro. Cada mancha de sangre fue generada mediante la dispensación de 25 μl de sangre procesada. Las manchas de sangre se dejaron secar durante una noche.
[0043] Se perforó un pequeño disco de 3,2 mm de una mancha de sangre seca y se depositó en un pocillo de una placa de micropocillos. La muestra se extrajo dispensando 200 μl de una disolución de extracción que consistía en una mezcla de metanol y agua a una proporción volumétrica relativa aproximada de un 60 % de metanol y un 40 %
45 de agua. También había presentes estándares internos, análogos de isótopos pesados estables de Adenosina y Desoxiadenosina en la disolución de extracción. Los estándares internos incluidos en la disolución están indicados en el barrido de la espectrometría de masas en tándem mostrado en la Fig. 1.
Ejemplo 2.
[0044] Se prepararon manchas de sangre estándar de referencia (sangre completa) mediante el uso de sangre completa agrupada obtenida a partir de 5 sujetos. La sangre fue procesada mediante el ajuste de la concentración de hemoglobina a 17 mg/dl y la adición a la sangre de varios aminoácidos, carnitina, acilcarnitinas y Adenosina y Desoxiadenosina a unas concentraciones conocidas. La sangre procesada fue dispensada en tarjetas de papel de
55 filtro para formar manchas de sangre sobre la matriz de papel de filtro. Cada mancha de sangre fue generada mediante la dispensación de 25 μl de sangre procesada. Las manchas de sangre se dejaron secar durante una noche.
[0045] Se perforó un pequeño disco de 3,2 mm de una mancha de sangre seca y se depositó en un pocillo de una placa de micropocillos. La muestra se extrajo dispensando 200 μl de una disolución de extracción que consistía en una mezcla de metanol y agua a una proporción volumétrica relativa aproximada de un 60 % de metanol y un 40 % de agua. También había presentes estándares internos (análogos de isótopos pesados estables de los analitos de interés) para diversos aminoácidos, carnitina, acilcarnitinas y Adenosina y Desoxiadenosina en la disolución de extracción. La muestra extraída se inyectó en un espectrómetro de masas en tándem con cuadrupolo de 65 electronebulización triple con la ayuda de un dispositivo de manipulación de líquidos automatizado. Los datos de los espectros de masas de los aminoácidos se adquirieron mediante un barrido de pérdida neutra de 46 Da. Los datos
de los espectros de masas para la Adenosina y Desoxiadenosina se adquirieron mediante una monitorización de reacción múltiple. La definición de cada uno de los analitos puede encontrarse en la Tabla 1). El porcentaje de recuperación de cada analito se determinó mediante la comparación con un estándar interno para cada analito.
5 [0046] La imprecisión del ensayo se determinó analizando las muestras descritas en la tabla 1. Cada análisis de la muestra consistió en funciones por sextuplicado de cada muestra, que fueron procesadas y medidas según se describe en el Ejemplo 2. El estudio incluía seis de dichos análisis al día durante un total de seis días. Con esta información se determinaron los siguientes componentes de imprecisión: en el análisis, entre análisis en el día y entre días, a partir de lo que se determinó la imprecisión total. Los resultados de los análisis de imprecisión de 10 Adenosina y Desoxiadenosina se muestran en la Tabla 2.
[0047] Estos datos demuestran que los procedimientos descritos en este documento se pueden usar para extraer y cuantificar simultáneamente Adenosina y Desoxiadenosina, aminoácidos, carnitina, acilcarnitinas, mediante el uso de espectrometría de masas en tándem. 15 Tabla 1
Nombre del compuesto
Símbolo [M + H]+ Masa butilada
Purinas
Adenosina
Ado 268,2
Desoxiadenosina
D-Ado 252,2
Aminoácidos
Alanina
Ala 90,0 146,1
Aloisoleucina
Allo-lle 132,1 188,2
Arginina
Arg 175,1 231,2
Ácido argininosuccínico
Asa 291,1 459,3
Asparagina
Asn 133,1 189,1
Ácido aspártico
Asp 134,0 246,2
beta-Alanina
90,0 146,1
Citrulina
Cit 176,1 232,2
Ácido glutámico
Glu 148,1 260,2
Glutamina
Gin 147,1 203,1
Glicina
Gly 76,0 132,1
Histidina
His 156,1 212,1
Hidroxiprolina
HO-Pro 132,1 188,1
Isoleucina
lle 132,1 188,2
Leucina
Leu 132,1 188,2
Lisina
Lys 147,1 203,2
Metionina
Met 150,1 206,1
Ornitina
Orn 133,1 189,2
Fenilalanina
Phe 166,1 222,2
Prolina
Pro 116,1 172,1
Ácido piroglutámico
130,0 186,1
Tirosina
Tyr 182,1 238,1
Valina
Val 118,1 174,2
Aminoácidos
Succinilacetona
SA 155,1 211,2
Ácido formiminoglutámico
Figlu 231,2 287,2
Homocitrulina
Hcit 190,1 246,2
Hawkinsina
Hawk 348,3 404,4
Ácido deltaaminolevulínico
D-AL 122,1 188,1
Acilcarnitinas
Libre
CO 162,1 218,2
Acetil
C2 204,1 260,2
Acrilil
C3:1 216,1 272,2
Propionil
C3 218,1 274,2
Butiril
C4 232,2 288,2
Tiglil
C5:1 244,2 300,2
Isovaleril
C5 246,2 302,2
3-OH-butiril
C4-OH 248,1 304,2
Hexenoil
C6:1 258,2 314,2
Hexanoil
C6 260,2 316,3
3-OH-lsovaleril
C5-OH 262,2 318,2
Heptanoil
C7 274,2 330,3
Octenoil
C8:1 286,2 342,3
Octanoil
C8 288,2 344,3
Nonanoil
C9 302,2 358,3
Malonil
C3DC 248,1 360,2
Decatrienoil
C10:3 310,2 366,3
Decadienoil
C10:2 312,2 368,3
Decenoil
C10:1 314,2 370,3
Decanoil
C10 316,2 372,3
Metilmalonil
C4DC 262,1 374,3
Glutaril
C5DC 276,1 388,3
3-OH-Decanoil
C10-OH 332,2 388,3
Dodecenoil
C12:1 342,3 398,3
Dodecanoil
C12 344,3 400,3
Deshiroadipil
C6:1 DC 288,1 400,3
Adipil
C6DC 290,2 402,3
3-OH-Dodecanoil
C12-OH 360,3 416,3
Tetradecadienoil
C14:2 368,3 424,3
Tetradecenoil
C14:1 370,3 426,4
Miristoil
C14 372,3 428,4
Deshidrosuberil
C8:1 DC 316,2 428,3
Suberil
C8DC 318,2 430,3
3-OH-Tetradecanoil
C14-OH 388,3 444,4
Hexadecenoil
C16:1 398,3 454,4
Palmitoil
C16 400,3 456,4
Deshidrosebacil
C10:1DC 344,2 456,3
Sebacil
C10DC 346,2 458,4
3-OH-Hexadecanoil
C16-OH 416,3 472,4
Linoleil
C18:2 424,3 480,4
Oleil
C18:1 426,4 482,4
Estearoil
C18 428,4 484,4
Tabla 2
Metabolito investigado
Adición nmoles/l Precisión intradía (n = 6) % Precisión interdía (n = 6) % Lecturas promediadas Moles/l Precisión n = 6
Adenosina
0 0 0,0 0,0
Adenosina
33 3,5 3,1 34,0 103,1
Adenosina
165 4,9 3,7 158,0 95,8
Adenosina
330 7,8 6,0 336,2 101,9
Adenosina
3300 3,8 4,8 3299,7 100,0
Adenosina
6600 2,1 2,6 6594,2 99,9
Adenosina
9900 2,3 2,0 9899,9 100,0
Desoxiadenosina
0 0 0,0 0,0
Desoxiadenosina
33 19,6 16,9 32,8 92,9
Desoxiadenosina
165 6,6 4,8 169,6 100,3
Desoxiadenosina
330 5,2 3,6 325,4 100,6
Desoxiadenosina
3300 5,6 6,7 3300,2 100,3
Desoxiadenosina
6600 3,4 3,4 6599,2 100,0
Desoxiadenosina
9900 3,1 3,1 9904,9 100,0

Claims (10)

  1. REIVINDICACIONES
    1. Un procedimiento para la determinación analítica, mediante EM, de Adenosina y Desoxiadenosina a partir de una
    muestra de sangre seca, comprendiendo dicho procedimiento la extracción de Adenosina y Desoxiadenosina en 5 unas condiciones que permiten la extracción simultánea de otros metabolitos tales como aminoácidos, carnitina libre
    o acilcarnitinas, estando dicho procedimiento caracterizado por el uso de una mezcla de extracción que comprende una mezcla de agua y un monoalcohol C1-3 de cadena lineal o ramificada en el que el agua está presente al menos al 10 % v/v.
    10 2. Procedimiento de acuerdo con la reivindicación 1 que se realiza añadiendo la mezcla de extracción en dos etapas: en la primera etapa se pone en contacto la muestra con el monoalcohol C 1-3 de cadena lineal o ramificada que se corresponde con el 100-x % v/v del volumen final; en la siguiente segunda etapa se añade a la muestra agua, que se corresponde con el x % v/v del volumen final; donde x es el porcentaje de agua en v/v que varía desde el 10 hasta el 90 %.
  2. 3.
    Procedimiento de acuerdo con la reivindicación 1 en el que dicho monoalcohol es metanol.
  3. 4.
    Procedimiento de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 - 3 en el que dicha mezcla de extracción
    contiene un 30 - 50 % v/v de agua. 20
  4. 5. Procedimiento de acuerdo con las reivindicaciones 3 y 4 en el que la mezcla de extracción contiene un 60 % v/v de metanol y un 40 % v/v de agua.
  5. 6. Procedimiento de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 - 5 en el que la disolución de extracción 25 también contiene un ácido orgánico a una concentración de 1 - 5 mM.
  6. 7. Procedimiento de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 -6 en el que la mezcla de extracción contiene uno o más estándares internos, por ejemplo, para aminoácidos, carnitina libre, acilcarnitinas y Adenosina y Desoxiadenosina, a unas concentraciones conocidas.
  7. 8. Un procedimiento de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 - 7 en el que después de la extracción puede determinarse la presencia o la cantidad de Adenosina y Desoxiadenosina junto con uno o más analitos adicionales (por ejemplo, carnitina libre, acilcarnitinas y aminoácidos) mediante el uso de espectrometría de masas (por ejemplo, espectrometría de masas en tándem).
  8. 9. Un kit adecuado para el procedimiento de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1 - 8 para la preparación de muestras para la detección y/o la medición, mediante el uso de espectrometría de masas en tándem, de Adenosina y Desoxiadenosina junto con otros múltiples analitos en una muestra de sangre seca; comprendiendo dicho kit:
    -
    al menos un recipiente que contiene como control Adenosina y Desoxiadenosina y uno o más aminoácidos, carnitina libre, o una o más acilcarnitinas o más analitos como controles adicionales o estándares internos;
    -
    al menos un recipiente que contiene una mezcla de extracción que comprende una mezcla de agua y un
    monoalcohol C1-3 de cadena lineal o ramificada en el que el agua está presente al menos al 10 % v/v. 45
  9. 10. Kit de acuerdo con la reivindicación 9 en el que hay comprendida adicionalmente al menos una mancha de sangre seca útil como control, en el que dicha mancha de sangre seca está enriquecida con Adenosina y Desoxiadenosina, uno o más aminoácidos, carnitina libre o una o más acilcarnitinas o más analitos, a unas concentraciones conocidas.
  10. 11. Un procedimiento para el diagnóstico de la SCID a partir de manchas de sangre seca, preferiblemente en tarjetas de Guthrie obtenidas en el ll - IV día de vida, o para monitorizar la eficacia de la terapia durante una terapia de sustitución enzimática, comprendiendo dicho procedimiento el procedimiento de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 - 8 o el uso de un kit de acuerdo con la reivindicación 9.
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