ES2350254T3 - Procedimiento para la detección de la actividad in vivo de la neurotripsina, uso del procedimiento y uso del fragmento c-terminal de 22kda de la agrina como biomarcador en el diagnóstico y el control de trastornos relacionados con la neurotripsina. - Google Patents

Procedimiento para la detección de la actividad in vivo de la neurotripsina, uso del procedimiento y uso del fragmento c-terminal de 22kda de la agrina como biomarcador en el diagnóstico y el control de trastornos relacionados con la neurotripsina. Download PDF

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Abstract

Procedimiento para la detección de la actividad in vivo de la neurotripsina, en el que se mide la cantidad del fragmento de 22 kDa de la agrina en una muestra tomada de un paciente, y se usa la cantidad medida del fragmento de 22 kDa de la agrina en la muestra para calcular la actividad de la neurotripsina, siendo la muestra sangre u orina.

Description

Procedimiento para la detección de la actividad in vivo de la neurotripsina, uso del procedimiento y uso del fragmento C-terminal de 22 kDa de la agrina como biomarcador en el diagnóstico y el control de trastornos relacionados con la neurotripsina.
Campo de la invención
La invención se refiere a un procedimiento para la detección de la actividad in vivo de la neurotripsina, al uso de dicho procedimiento y al uso del fragmento C-terminal de 22 kDa de la agrina como biomarcador en diferentes aplicaciones diagnósticas o clínicas, todas directa o indirectamente relacionadas con la actividad de la enzima neurotripsina.
Los biomarcadores informan sobre fenómenos biológicos en curso durante una enfermedad o tratamiento. Un biomarcador se define como cualquier característica que puede ser medida y evaluada objetivamente como indicador de un proceso biológico normal o patológico o de una respuesta farmacológica a una intervención terapéutica. Distintos tipos de biomarcadores informan sobre características moleculares, parámetros fisiológicos (por ejemplo, presión arterial, frecuencia cardiaca), o proporcionan información a través de imágenes. Importantemente, proporcionan información sobre una "consecuencia": por ejemplo, sobre el resultado de un mecanismo molecular, celular o fisiológico, sobre un beneficio terapéutico o sobre el riesgo de una intervención terapéutica. Los biomarcadores útiles deberían satisfacer dos criterios, deben estar asociados con los mecanismos biológicos en curso durante una enfermedad o tratamiento, y se deben correlacionar estadísticamente con las consecuencias clínicas.
La neurotripsina es una serina proteasa de tipo tripsina. Muestra una composición de dominio única (Proba y col., 1998). Está formada por un segmento básico rico en prolina, un dominio kringle, cuatro dominios tipo secuestrante ricos en cisteína (scavenger receptor cysteine-rich, SRCR), y un dominio de proteasa.
La neurotripsina se expresa predominantemente en las neuronas de la corteza cerebral, el hipocampo y la amígdala (Gschwend y col., 1997). Mediante inmunoelectromicroscopía se localizó la neurotripsina en la membrana presináptica y la zona presináptica activa tanto de las sinapsis asimétricas (excitatorias) como de las sinapsis simétricas (inhibidoras) (Molinari y col., 2002).
La neurotripsina juega un importante papel en los trastornos neuropsiquiátricos, así como en trastornos fuera del sistema nervioso.
Recientemente se identificó la neurotripsina como una causa de una forma autosómica recesiva grave de retraso mental (Molinari y col., 2002). Los individuos que padecen retraso mental dependiente de neurotripsina muestran una delección de 4 pb en el 7º exón del gen de la neurotripsina, que da como resultado una proteína más corta que carece de dominio catalítico. El fenotipo fisiopatológico y la edad de aparición de la enfermedad en los individuos afectados caracteriza a la neurotripsina como un regulador de las funciones sinápticas de adaptación, tal como la reorganización de las sinapsis durante las etapas tardías del neurodesarrollo y la plasticidad sináptica del adulto. Tras un desarrollo psicomotor normal en los primeros 18 meses, los individuos afectados mostraban los primeros signos de retraso mental cuando tenían alrededor de 2 años de edad. Esto indica que la función de la neurotripsina es crucial en las etapas tardías del desarrollo cerebral, como por ejemplo para las funciones sinápticas de adaptación requeridas para establecer y/o mantener las funciones cognitivas superiores.
En el documento WO2006/103261 se muestra que la sobreexpresión de la neurotripsina en motoneuronas de ratones transgénicos da como resultado una degeneración de la unión neuromuscular, que a su vez provoca la muerte de las fibras musculares desnervadas. La pérdida de fibra muscular es característica del tipo de atrofia muscular encontrada en los ancianos humanos, denominada sarcopenia. Por lo tanto, se ha postulado que la inhibición de la neurotripsina podría tener un efecto beneficioso sobre la desnervación de la fibra muscular dependiente de la edad, la pérdida de fibra muscular y la atrofia musculoesquelética.
Datos adicionales (Aimes y col., 2005) sugieren un potencial papel de las serina proteasas, como la neurotripsina, en la función vascular y la angiogénesis.
En vista del papel central de la neurotripsina en el metabolismo, es deseable determinar y controlar las alteraciones relacionadas con la neurotripsina en pacientes, o evaluar el efecto de los medicamentos sobre el estado de la neurotripsina in vivo, respectivamente.
Resumen de la invención
Los inventores han averiguado que el objeto de la invención puede realizarse mediante un procedimiento según la reivindicación 1, en el que se mide el fragmento de 22 kDa de la agrina en sangre u orina con objeto de determinar la actividad in vivo de la neurotripsina, y mediante el uso de dicho procedimiento según la reivindicación 3 para el diagnóstico y el control de las alteraciones relacionadas con la neurotripsina. La invención cubre adicionalmente el uso del fragmento de 22 kDa de la agrina como biomarcador especial según la reivindicación 8.
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Una reivindicación independiente adicional está dirigida al uso del fragmento de 22 kDa de la agrina como biomarcador en estudios clínicos o preclínicos para establecer el efecto de las sustancias sobre la actividad de la neurotripsina.
Las formas de realización preferidas de la invención se abordan en las reivindicaciones secundarias.
Breve descripción de las figuras
La Fig. 1 muestra la secuencia proteica de la agrina humana (ID. SEC. Nº: 1). La longitud completa del precursor sin procesar es de 2.045 aminoácidos. En la porción de secuencia mostrada están marcadas las posiciones de los sitios de escisión \alpha y \beta. Adicionalmente se marcan algunas subsecuencias mencionadas en los ejemplos. La secuencia del fragmento de 22 kDa de la agrina se muestra en negrita.
La Fig. 2A es una representación esquemática de la organización del dominio de la agrina y la localización de sus sitios de escisión dependientes de neurotripsina. La agrina tiene una masa proteica nuclear de aproximadamente 220 kDa. Es una proteína multidominio formada por 9 dominios FS (de tipo folistatina, follistatin-like), 2 dominios LE (de tipo laminina-EGF, laminin-EGF-like), un dominio SEA (enterocinasa de proteína de esperma y agrina, sperm protein enterokinase and agrin), 4 dominios EG (de tipo factor de crecimiento epidérmico, epidermal growth factor-like) y 3 dominios LG (globulares de laminina, laminin globular). A ambos lados del dominio SEA se encuentra una región SIT (rica en serina/treonina, serine/threonine-rich).
La agrina existe en varias isoformas, por ejemplo, una isoforma es secretada con un dominio de agrina N-terminal (NtA) y un tipo de isoforma H transmembranal con un segmento transmembranal N-terminal (TM) que asegura su anclaje en la membrana plasmática. Variantes de corte y empalme de la fracción C-terminal: un inserto de 4 aminoácidos en el sitio A/y, y los tres diferentes insertos en el sitio B/z formado por 8, 11 ó 19 (8+11) aminoácidos. La neurotripsina escinde la agrina en dos sitios. Un sitio (denominado sitio \alpha) está localizado entre la arginina 1102 (R1102) y la alanina 1103 (A1103). El otro sitio (denominado sitio \beta) está localizado entre la lisina 1859 (K1859) y la serina 1860 (S1860). Los números de aminoácidos se refieren a la agrina secretada (variante de corte y empalme A0B0) del ortólogo humano (UniProtKB/Swiss-Prot O00468). De nuevo, la escisión por la neurotripsina genera un fragmento N-terminal en los intervalos de 110-400 kDa (debido a niveles diferenciales de carbohidratos), un fragmento intermedio de aproximadamente 90 kDa y un fragmento C-terminal de 22 kDa.
La Fig. 2B muestra cómo la neurotripsina escinde la agrina in vitro. Análisis por inmunotransferencia Western de células HeLa transfectadas simultáneamene con combinaciones de agrina unida membrana (+), neurotripsina natural (wt), neurotripsina inactiva (S/A), y pcDNA3.1 vacío (-). Se analizaron los sobrenadantes (S) y los lisados celulares (cell lysates, CL) con anticuerpos anti-agrina dirigidos contra el C-terminal de la agrina. Panel superior: la transfección de la agrina sola dio como resultado una señal por encima de 250 kDa en el lisado celular. Tras la transfección simultánea con neurotripsina natural, la agrina completa se escindió, dando como resultado fragmentos que se desarrollaban a 22, 90 y 110 kDa en el sobrenadante. No se encontró escisión tras la transfección simultánea con neurotripsina inactiva. Panel inferior: control de la expresión de la neurotripsina con anticuerpos contra neurotripsina.
La Fig. 3 muestra la estructura del dominio de la agrina transmembranal. Se indican las secuencias de los sitios de escisión \alpha y \beta y los fragmentos C-terminal resultantes de la escisión por la neurotripsina. TM, segmento transmembranal; FS, repetición rica en cisteína similar a la folistatina; LE, dominio de laminina de tipo EGF; SIT, región rica en serina/treonina; SEA, proteína de esperma, enterocinasa y dominio de agrina; EG, dominio de tipo del factor de crecimiento epidérmico (epidermal growth factor, EGF; LG, dominio globular de laminina; círculos individuales, sitios de glucosilación unidos por N; círculos múltiples, sitios de fijación de glucano.
La Fig. 4 muestra que la neurotripsina escinde la agrina in vivo. Análisis mediante inmunotransferencia Western de tejido procedente de ratones normales para neurotripsina (wild-type, wt) y deficientes en neurotripsina (KO). El producto de escisión de la agrina de 90 kDa se detectó en cerebro, riñón y pulmón de los ratones normales, pero estaba ausente en los deficientes en neurotripsina. Se obtuvieron resultados similares para el fragmento de agrina de 22 kDa excepto para el pulmón. Se usó \beta-actina como control de carga.
Las Figs. 5A, B muestran que la estimulación química de la potenciación a largo plazo induce un aumento en la actividad proteolítica de la neurotripsina.
La Fig. 5A es una inmunotransferencia Western de la agrina (panel superior) y de la \beta-actina (panel inferior) en cortes de hipocampo sin estimulación (No Stim) y estimulados mediante la combinación de picrotoxina, forskolina y rolipram (PFR). La intensidad de la señal del fragmento de 90 kDa de la agrina escindido por la neurotripsina en el hipocampo estimulado mediante PFR es más intensa que en el control no estimulado.
La Fig. 5B muestra la proporción de la intensidad de la señal del fragmento de 90 kDa de la agrina normalizada mediante la intensidad de la señal de la \beta-actina. La media de las intensidades de señal en los controles no estimulados se estableció en 1. Tres experimentos independientes mostraron un significativo incremento del 30% del fragmento de agrina mediante estimulación con PFR en comparación con los controles no estimulados (p < 0,05 mediante la prueba de la t de Student).
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La Fig. 6 muestra cómo la estimulación química de la potenciación a largo plazo aumenta el número de filopodios de una forma dependiente de la neurotripsina.
El histograma muestra el número de filopodios (Fil) por 1 \mum de dendritas apicales secundarias (Dend) de neuronas piramidales CA1 del hipocampo en cuatro condiciones diferentes. En ratones naturales (w.t.), la estimulación mediante una combinación de picrotoxina, forskolina y rolipram (PFR) indujo un aumento significativo en el número de filopodios en comparación con los controles no estimulados (No Stim; p < 0,01 mediante la prueba de la t de Student). Por el contrario, los ratones deficientes en neurotripsina (ntd) no mostraron un cambio significativo en el número de filopodios mediante la estimulación con PFR.
La Fig. 7 es un histograma que muestra el número de filopodios (Fil) por 1 \mum de dendritas apicales secundarias (Dend) de neuronas piramidales CA1 del hipocampo en ratones deficientes en neurotripsina (ntd). La estimulación sólo con PFR (PFR) no indujo un aumento significativo en el número de filopodios en comparación con los controles no estimulados (No Stim). La administración simultánea de picrotoxina, forskolina y rolipram (PFR) y el fragmento de 22 kDa (PFR + 22 kDa) rescató el aumento inducido por la estimulación química en el número de filopodios (p < 0,001 frente a No Stim y PFR mediante la prueba de la t de Student). Además, un fragmento de 22 kDa sin estimulación con PFR (22 kD frag) también indujo un aumento significativo en el número de filopodios (p < 0,001 frente a No Stim mediante la prueba de la t de Student). Por lo tanto, el fragmento de 22 kDa de la agrina induce un aumento en el número de filopodios en ratones deficientes en neurotripsina.
La Fig. 8A es un análisis mediante inmunotransferencia Western de un homogeneizado cerebral de un ratón natural (+/+) y un ratón deficiente en neurotripsina (-/-). Nótese que el fragmento de 22 kDa de la agrina sólo se detecta en el ratón natural. Esto indica que el fragmento de 22 Da es, de hecho, el resultado de la escisión dependiente de neurotripsina de la agrina.
La Fig. 8B es una inmunotransferencia Western de suero sanguíneo de un ratón natural (+/+), un ratón homocigótico deficiente en neurotripsina (-/-) y un ratón heterocigótico deficiente en neurotripsina (+/-). Se muestra que el fragmento de 22 kDa de la agrina sólo está presente en ratones que expresan una neurotripsina funcional (+/+ y +/-). Adicionalmente, a partir de ambas Figs. 8 A, B, es evidente que el fragmento de 22 kDa de la agrina está presente en el homogeneizado cerebral y en la sangre del ratón.
La Fig.9A es una inmunotransferencia Western de muestras de LCR de seres humanos en unos intervalos de edades de entre 1 mes y 86 años. En cada carril se analizaron 10 \mul de LCR humano. Se usó un gel de gradiente de SDS-PAGE (NuPAGE, 4-12%) disponible comercialmente. La inmunodetección se realizó con el anticuerpo R139 contra el fragmento de 22 kDa de la agrina. Dado el elevado nivel de expresión de la neurotoxicidad durante el desarrollo neural, el fragmento de 22 kDa de la agrina dependiente de la neurotripsina es más abundante a las edades de 2 y 9 meses.
La Fig 9B es un análisis mediante CL/EM del fragmento de 22 kDa hallado en LCR humano. La secuencia presentada comprende el fragmento de 22 kDa y los cinco aminoácidos que preceden al sitio de escisión \beta (ID. SEC. Nº: 2). Las muestras de LCR de varios individuos se agruparon, y sus proteínas se separaron cromatográficamente con objeto de enriquecerlas en el fragmento de 22 kDa identificado mediante inmunotransferencia Western. La fracción enriquecida en el fragmento de 22 kDa se cortó a partir de un gel de SDS-PAGE y se sometió a un análisis mediante CL/ESI/EM/EM. Se identificaron dos péptidos, péptido #1 (ID. SEC. Nº: 3) y #2 (ID. SEC. Nº: 4). Ambos estaban localizados en el fragmento de 22 kDa de la agrina.
Ambas Figs. 9A, B muestran que el fragmento de 22 kDa de la agrina puede ser detectado en líquido cefalorraquídeo (LCR) humano.
La Fig. 10 es una inmunotransferencia Western de suero sanguíneo humano tratada cromatográficamente que muestra una fuerte banda inmunorreactiva para el fragmento de 22 kDa de la agrina. La confirmación final de su identidad requerirá un análisis mediante EM, no obstante, los actuales resultados son una fuerte muestra de prueba de que el fragmento de 22 kDa de la agrina puede ser hallado en suero sanguíneo humano.
Descripción
El fragmento C-terminal de 22 kDa del proteoglucano agrina usado en el procedimiento de la invención y como biomarcador, es un producto generado de forma natural por la escisión proteolítica de la agrina por su única enzima de tratamiento, la neurotripsina.
La agrina es una molécula bien caracterizada (Bezakova y col., 2003; Sanes y Lichtman, 2001). Tiene una masa proteica nuclear de aproximadamente 220 kDa. La agrina existe en diversas isoformas y variantes de empalme.
Según se ilustra en la Fig. 2A, la agrina es escindida por la serín-proteasa neurotripsina en dos sitios homólogos, denominados sitios de escisión \alpha y \beta. La escisión de la agrina por la neurotripsina resultante de la expresión simultánea de las dos proteínas en células HeLa libera tres fragmentos de agrina en el sobrenadante del cultivo (Ejemplo 1 y Fig. 1B). El fragmento de 22 kDa se extiende desde el sitio de escisión \beta hasta el C-terminal de la agrina. El fragmento de 90 kDa abarca desde el sitio de escisión \alpha al \beta, mientras que el fragmento de 110 kDa se extiende desde el sitio de escisión \alpha hasta el C-terminal, y por lo tanto, es el resultado de la escisión incompleta en el sitio \beta. El fragmento N-terminal permanece en las células y es probablemente degradado rápidamente mediante endocitosis.
Ambos sitios de escisión fueron identificados inequívocamente y se encontró que eran homólogos y estaban conservados en la evolución (Ejemplo 2).
El término fragmento de 22 kDa de la agrina, si se usa en esta solicitud, abarca desde el sitio de escisión \beta hasta el C-terminal de la agrina, y debe englobar todas las diferentes isoformas y variantes de empalme del fragmento que aparece in vivo. En algunas publicaciones, el dominio C-terminal de laminina G (LG3) de la agrina se denomina fragmento de 20 kDa. La proteína denotada mediante este término es estructuralmente equivalente al fragmento usado según la invención, pero ha sido generada artificialmente como una proteína recombinante correspondiente al dominio LG del C-terminal de la agrina para el propósito de ensayar su función. Por el contrario, es un aspecto esencial que el dominio LG del C-terminal de la agrina esté separado de forma natural del resto de la molécula de agrina mediante una escisión proteolítica dependiente de neurotripsina. Sólo después de la escisión proteolítica en el denominado sitio de escisión \beta, el fragmento de 22 kDa de la agrina se hace móvil y se transloca desde el sitio de su generación hacia el líquido cefalorraquídeo o la sangre, donde puede ser detectado según unos procedimientos de detección establecidos, y sirve por lo tanto como biomarcador.
A partir del documento WO2006/103261 mencionado anteriormente se conoce un procedimiento de ensayo para determinar el efecto de sustancias inhibidoras sobre la actividad de la neurotripsina. Un protocolo típico del procedimiento conocido estipula que la sustancia inhibidora es incubada junto con la neurotripsina y la agrina, y la cantidad de escisión de la agrina se determina en base a la medida de los fragmentos generados por la actividad proteolítica de la neurotripsina.
El procedimiento conocido se refiere a un ensayo enzimático in vitro con un número limitado de compañeros de reacción. Dado que la situación in vivo es bastante más compleja, no podría esperarse que un fragmento especial de la agrina también pudiera encontrarse en el LCR o la sangre y usarse como un biomarcador in vivo, con objeto de informar sobre la actividad in vivo de la neurotripsina en el cerebro y en tejidos extraneurales, respectivamente. En primer lugar, a partir de la escisión in vitro de una proteína o un péptido, no puede concluirse que la escisión también se produce in vivo. La escisión in vitro es una reacción experimental artificial. Se consigue juntando la enzima proteolítica y una proteína en un tubo de ensayo e incubándolos para permitir que se produzca la reacción de escisión. La escisión in vivo de una proteína o péptido requiere, por el contrario, que esté localizado simutáneamente con una enzima proteolítica dada en el espacio y del tiempo, con objeto de que la reacción tenga lugar. Por ejemplo, puede demostrarse in vitro que la agrina puede ser escindida por la serín-proteasa pancreática tripsina. Sin embargo, la tripsina no puede escindir la agrina in vivo, porque la agrina no está localizada simultáneamente in vivo con la tripsina. Los inventores hallaron que la inactivación selectiva de la neurotripsina mediante reconocimiento génico abole completamente la escisión de la agrina (Ejemplo 3). Esto indica que sólo la neurotripsina puede escindir a la agrina in vivo, mientras que otras serín-proteasas de tipo tripsina, tales como la tripsina, que pueden escindir la agrina in vitro, no escinden la agrina in vivo. En segundo lugar, incluso a partir del hecho de que se encuentra una escisión in vivo de la agrina por la neurotripsina en tejido homogeneizado, no puede predecirse si se encontrará un fragmento dependiente de neurotripsina de la agrina en el LCR o la sangre. En el LCR y en sangre, la agrina completa y el fragmento de 90 kDa sólo se encuentran en cantidades despreciables. La neurotripsina no es detectable en el LCR ni en la sangre. Por lo tanto, la escisión de la agrina por la neurotripsina no se produce ni en el LCR ni en la sangre, sino en el interior de los tejidos neurales y no neurales en los que la agrina y la neurotripsina se encuentran sobre las superficies celulares o en la matriz extracelular. Por lo tanto, la presencia del fragmento de 22 kDa en LCR y en sangre es definitivamente una observación sin precedentes y no trivial. Como apoyo de esta conclusión, puede mencionarse que ni el fragmento N-terminal ni el fragmento intermedio de 90 kDa de la agrina aparecieron en el LCR ni en la sangre tras su generación por la neurotripsina. Por lo tanto, de los tres fragmentos de agrina que son generados por la actividad proteolítica de la neurotripsina, sólo el fragmento de 22 kDa es translocado eficientemente al LCR y la sangre, mientras que los otros dos fragmentos no lo son.
La presencia del fragmento de 22 kDa de la agrina en el LCR y en la sangre refleja el nivel de actividad de la neurotripsina en el cerebro y en tejidos no neurales, respectivamente.
Con respecto a la actividad de la neurotripsina en el cerebro, los inventores fueron los primeros en demostrar que los homogeneizados cerebrales de ratones naturales contienen el fragmento de 22 kDa de la agrina, que por el contrario no se encuentra en homogeneizados cerebrales de ratones deficientes en neurotripsina (Ejemplo 3). Adicionalmente, los inventores fueron capaces de demostrar la presencia del fragmento de 22 kDa de la agrina en preparaciones de sinapsis aisladas, denominadas sinaptosomas. Esta observación indica que el fragmento cerebral de 22 kDa de la agrina se origina en la sinapsis, donde la neurotripsina es secretada y se encuentra con la agrina en el espacio extracelular. Tras la escisión local de la agrina en la sinapsis o en las proximidades de la sinapsis, el fragmento de 22 kDa se transloca selectivamente al LCR. Por lo tanto, el nivel del fragmento de 22 kDa de la agrina en el LCR informa sobre la actividad de la neurotripsina en las sinapsis del SNC.
Con respecto a la actividad de la neurotripsina en tejidos no neurales, los inventores mostraron que la neurotripsina es expresada en el riñón y el pulmón, y que la escisión de la agrina dependiente de la neurotripsina en el riñón y el pulmón genera fragmentos de agrina de 90 kDa y 22 kDa. Dado que tanto el riñón como el pulmón son tejidos altamente vascularizados, es muy probable que al menos el fragmento de 22 kDa de la agrina que se encuentra en la sangre proceda del riñón y/o el pulmón. Por lo tanto, el nivel del fragmento de 22 kDa hallado en la sangre informa sobre la actividad de la neurotripsina en el riñón y/o el pulmón.
Una fracción del fragmento de 22 kDa de la agrina encontrada en la sangre se origina muy probablemente en la unión neuromuscular. Los inventores encontraron que la neurotripsina derivada de motoneuronas que es transportada a lo largo de los nervios motores hacia los músculos esqueléticos escinde la agrina en la unión neuromuscular. El fragmento de 22 kDa de la agrina que es liberado en la unión neuromuscular se transloca muy probablemente a la sangre. Por lo tanto, el nivel del fragmento de 22 kDa de la agrina hallado en la sangre también informa sobre la actividad de la neurotripsina en la unión neuromuscular.
La evaluación de la actividad de la neurotripsina en el cerebro o en tejidos extraneurales mediante la medición de los niveles del fragmento de 22 kDa de la agrina en el LCR y en la sangre, respectivamente, permite extraer conclusiones sobre los estados fisiológicos o patológicos dependientes de la neurotripsina.
Los inventores reconocieron la neurotripsina como un promotor de la plasticidad sináptica en el SNC. Demostraron que la promoción de la plasticidad sináptica por la neurotripsina depende de la escisión de la agrina, dando como resultado la generación y liberación del fragmento C-terminal de 22 kDa (Ejemplo 4). A su vez, el fragmento de 22 kDa tiene una actividad estimulante de las sinapsis y, por tanto, promotora de la plasticidad. Usando un sistema modelo experimental basado en cortes de tejido de hipocampo, los inventores averiguaron que la promoción de los filopodios tras la inducción de una potenciación a largo plazo era abolida en los ratones deficientes en neurotripsina (Ejemplo 5). También averiguaron que el fragmento de 22 kDa generado por la neurotripsina mediante la escisión de la agrina es decisivo en la promoción dependiente de neurotripsina de la plasticidad sináptica mediante el aumento en el número de filopodios dendríticos (Ejemplo 6). Los filopodios dendríticos son precursores de las sinapsis. El aumento en los filopodios dendríticos promueve la reorganización de los circuitos sinápticos en el SNC. Experimentos con hipocampos de ratones deficientes en neurotripsina mostraron que sin la generación dependiente de neurotripsina del fragmento de 22 kDa de la agrina, la promoción dependiente de la actividad de los filopodios dendríticos no es funcional. Por lo tanto, en un modelo animal podría establecerse una conexión directa entre el estado patológico dependiente de la neurotripsina y el fragmento de 22 kDa de la agrina. Esta observación se corresponde en ratones con la observación hecha en individuos humanos deficientes en neurotripsina, lo que indica que la plasticidad sináptica adaptable no es funcional sin la neurotripsina, y que da como resultado una importante deficiencia en las funciones cerebrales superiores (cognitivas), denominado también retraso mental (Molinari y col., 2002). Por lo tanto, el control de la actividad de la neurotripsina en las sinapsis mediante la medición del fragmento de 22 kDa de la agrina en el LCR permite el diagnóstico de desregulaciones de funciones sinápticas dependientes de la neurotripsina, tales como la plasticidad sináptica dependiente de la neurotripsina.
En experimentos adicionales se demostró que el fragmento de 22 kDa de la agrina puede detectarse en la sangre o en el LCR de ratones, así como de pacientes humanos. Los anticuerpos para la detección del fragmento de 22 kDa de la agrina se generan produciendo en primer lugar el fragmento recombinante de 22 kDa de la agrina (Ejemplo 7) y usándolo después en uno cualquiera de los procedimientos usados habitualmente para la producción de anticuerpos (Ejemplo 8).
Usando los anticuerpos contra el fragmento de 22 kDa de la agrina, se demostró su presencia en homogeneizado cerebral y sanguíneo del ratón (Ejemplo 9), así como en LCR (Ejemplo 10) y en sangre (Ejemplo 11) humanos. Esto hace que el fragmento sea un biomarcador adecuado para aplicaciones rutinarias.
Consecuentemente, la invención engloba un procedimiento para determinar la actividad in vivo de la neurotripsina midiendo la cantidad del fragmento de 22 kDa de la agrina en la muestra de un paciente. Mediante el uso de este procedimiento pueden diagnosticarse o controlarse trastornos relacionados con la neurotripsina, y en general el fragmento puede usarse como biomarcador para todos los trastornos relacionados con la neurotripsina.
Algunos trastornos pueden ser especialmente enfermedades causadas por la desregulación de la neurotripsina, donde el término "desregulación" no sólo engloba a procesos reguladores a nivel genético, sino que también puede reflejar procesos metabólicos que influyen en la actividad de la neurotripsina.
En un Ejemplo preferido, se usa el fragmento de agrina como biomarcador de enfermedades o alteraciones del sistema neural o neuromuscular relacionadas con la neurotripsina, tales como el retraso mental dependiente de neurotripsina y la sarcopenia, la atrofia musculoesquelética de ancianos, respectivamente.
El fragmento de 22 kDa de la agrina puede usarse para diagnosticar los trastornos o las enfermedades mencionadas. Aparte del diagnóstico, también es posible usar el biomarcador en cuestión para controlar la tendencia o el proceso de una enfermedad relacionada con la neurotripsina.
Según se mencionó anteriormente, parece que puede relacionarse una amplia variedad de enfermedades o trastornos con la enzima neurotripsina o su actividad. Una metodología terapéutica importante es, por lo tanto, encontrar sustancias que influyan, especialmente que inhiban, la actividad de la neurotripsina in vivo. También en este contexto, es decir, en estudios clínicos o preclínicos realizados para determinar la posible aplicabilidad de sustancias, como por ejemplo, un inhibidor de la neurotripsina, puede usarse el fragmento de 22 kDa de la agrina como biomarcador. El diseño de dichos estudios no representa un problema para una persona experta en la materia. Es adecuado cualquier diseño que permita la medición in vivo del fragmento de 22 kDa de la agrina en pacientes que son tratados con diferentes sustancias elegidas por su posible acción sobre la neurotripsina.
Una ventaja importante al usar el fragmento de 22 kDa de la agrina como biomarcador es que este fragmento puede ser detectado en sangre o en LCR, siendo ambos fluidos corporales que pueden analizarse de forma rutinarias. La detección del fragmento puede realizarse mediante procedimientos habituales conocidos en la materia, tales como ELISA, técnicas de inmunotransferencia (inmunotransferencia Western), RIA, citometría de flujo, polarización de fluorescencia, aglutinación en látex, ensayo de flujo lateral, ensayo inmunocromatográfico, inmunochips, inmunoensayos de tiras reactivas o tecnología basada en perlas, en combinación con cualquier otro procedimiento (por ejemplo, quimioluminiscencia, Luminex), por citar sólo algunos ejemplos.
Una ventaja importante de trabajar con sangre o con LCR es que el fragmento de 22 kDa de la agrina sólo se libera tras la escisión proteolítica por la neurotripsina en los tejidos mencionados. La molécula de agrina completa no está, o sólo está presente en una cantidad despreciable, en sangre o en LCR, por lo que la detección del fragmento en sangre puede realizarse con anticuerpos que no deben diferenciar necesariamente entre la agrina completa y su fragmento de 22 kDa.
Los anticuerpos u otros tipos de proteínas de unión específicas que se unen selectivamente al fragmento de 22 kDa de la agrina, pueden generarse mediante cualquiera de las técnicas conocidas en la materia (Roque y col., 2004; Gill y Damle, 2006). Preferiblemente se generan anticuerpos naturales o recombinantes u otras proteínas de unión específicas mediante el uso del fragmento de 22 kDa de la agrina o una porción del mismo, preparados mediante técnicas recombinantes o mediante síntesis química como un objetivo.
El fragmento de 22 kDa de la agrina, según se define en la presente invención, es el fragmento de 22 kDa de la agrina humana de la ID. SEC. Nº: 12, que adicionalmente puede contener los insertos de aminoácidos 8, 11 ó 19 (8 + 11) de las isoformas de la agrina en el sitio B/z. En la agrina humana, el sitio B/z está localizado en el dominio LG3, entre los aminoácidos Ser1884 y G1u1885 (Fig. 1 y UniProtKB/Swiss-Prot O00468). Las secuencias insertadas pueden ser ELANEIPV (B/z 8; ID. SEC. Nº: 13), PETLDSGALHS (B/z 11; ID. SEC. Nº: 14) o ELANEIPVPETLDSGALHS (B/z 19; ID. SEC. Nº: 15). En la presente revelación, el término fragmento de 22 kDa de la agrina también incluye variantes de la proteína definidas por la ID. SEC. Nº: 12 o las correspondientes isoformas con 8, 11 ó 19 aminoácidos adicionales, en el que uno o más, en particular uno, dos, tres o cuatro aminoácidos, son sustituidos por otros aminoácidos, y/o en la que hasta dos aminoácidos son eliminados, bien en el C-terminal o bien en el N-terminal, o en el que se añaden hasta 30 aminoácidos en el N-terminal. Dichos aminoácidos adicionales en el N-terminal están presentes, por ejemplo, debido al procedimiento de preparación mediante síntesis recombinante y expresión en células adecuadas. Un ejemplo de dicha proteína bajo la definición de fragmento de 22 kDa de la agrina es la proteína preparada según el Ejemplo 7 de la ID. SEC. Nº: 12, que adicionalmente contiene una etiqueta 8 x His con un conector de glicina-serina (GS) para simplificar la purificación, y cuatro aminoácidos adicionales en el extremo N-terminal. Las proteínas que son glucosiladas o modificadas de otro modo durante su expresión en células eucariotas u otras también están incluidas en la presente definición de fragmento de 22 kDa de la agrina.
Los anticuerpos u otras proteínas de unión dirigidos contra el fragmento de 22 kDa de la agrina también pueden generarse usando únicamente una porción del fragmento de 22 kDa de la agrina, por ejemplo, un péptido de 18 aminoácidos con una secuencia tomada a partir de la secuencia del fragmento de 22 kDa de la agrina.
Adicionalmente, está cubierto por la invención que un fragmento de 22 kDa de la agrina preparado mediante técnicas recombinantes se use como referencia en el procedimiento según la reivindicación 1 como referencia.
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Ejemplos Ejemplo 1 La transfección simultánea de la agrina con neurotripsina en células eucariotas da como resultado la escisión de la agrina en dos sitios
Para ensayar la agrina como sustrato de la neurotripsina se transfectaron células HeLa con la isoforma transmembranal de agrina de rata (x4y8) sola o junto con la neurotripsina natural (wt) o una forma inactiva de neurotripsina (S/A), en la que el sitio activo Ser estaba mutado a Ala.
Para la expresión de la neurotripsina se insertó la región codificante de la neurotripsina humana completa
(CAA04816) en el vector pcDNA3.1 (Invitrogen). Se generó una neurotripsina catalíticamente inactiva (S/A) mutando la Ser_{825} a Ala mediante una PCR de extensión por solapamiento. Para la expresión de la agrina completa unida a membrana se insertó la secuencia codificante que varía desde la Met_{1} hasta la Pro_{1948} de agrina de rata (P25304, isoforma 4, variante de corte y empalme y4z8) en el pcDNA3.1. Las células HeLa se cultivaron hasta una confluencia del 60-80% en placas de cultivo de 12 pocillos (Corning) con DMEM complementado con FCS al 10% (Biochrom). Se usó polietilenimina (PEI) como reactivo de transfección según se describe en Baldi y col., 2005. La mezcla de transfección se retiró 4-6 h después de la transfección lavándola una vez con disolución salina tamponada con fosfato (phosphate-buffered saline, PBS). Después de 48 h en DMEM sin FCS, el medio se recogió y las células se lisaron en NaCl 150 mM, EDTA 0,5 mM, glicerol al 10%, Triton-X-100 al 1% en Tris-HCl 20 mM, pH 7,4. Para el análisis de los productos de escisión, se separaron los sobrenadantes y los lisados celulares en un gel NuPAGE al 4-12% (Invitrogen) y se analizaron mediante inmunodetección.
En los lisados de las células transfectadas con agrina sola se detectó una mancha por encima de 250 kDa, característica de la agrina completa, en las inmunotransferencias Western con anticuerpos dirigidos contra su fracción C-terminal (Fig. 2A). También se encontró la misma señal en los lisados de células transfectadas simultáneamene con neurotripsina inactiva. Cuando se transfectó simultáneamente neurotripsina natural con agrina, no se encontró señal de la agrina en el lisado celular. Sin embargo se encontraron nuevas bandas de 110, 90 y 22 kDa en el sobrenadante del cultivo. Ninguno de estos fragmentos de agrina se encontró en los sobrenadantes de las transfecciones simultáneas con la forma inactiva de la neurotripsina. En su conjunto, estos resultados demuestran que la neurotripsina proteolíticamente activa escindió la agrina, dando como resultado la liberación de tres fragmentos C-terminales al sobrenadante del cultivo.
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Ejemplo 2 Los dos sitios de escisión de la agrina dependientes de neurotripsina son homólogos y están conservados evolutivamente
Para determinar los sitios de escisión de la agrina dependientes de neurotripsina, se expresó simultáneamente la neurotripsina en células HEK293T bien con una forma transmembranal completa de agrina de rata (variante de corte y empalme y4z8) o bien con el fragmento C-terminal de la agrina que comprende los dominios LG2, EG4 y LG3, usando una transfección PEI (Baldi y col., 2005). Después de 3 días se recogieron los sobrenadantes. Para la purificación del fragmento de 90 kDa, se cargó 1 l de sobrenadante de células transfectadas con la agrina completa en una columna de heparina sefarosa CL-6B (GE Healthcare) equilibrada con NaCl 150 mM en Tris-HCl 20 mM, pH 7,5. Las proteínas se eluyeron en un gradiente desde 150 mM hasta 1 M de NaCl en Tris-HCl 20 mM, pH 7,5. El fragmento de 22 kDa se purificó a través de su StrepTag C-terminal a partir de 24 ml de medio de células transfectadas con el fragmento C-terminal de la agrina con una columna StrepTactin (IBA), según las recomendaciones del fabricante. Para la secuenciación N-terminal mediante degradación de Edman, las muestras de péptidos se separaron en geles NuPAGE al 4-12%, se electrotransfirieron sobre una membrana PVDF y se analizaron con un secuenciador Procise 492 cLC (Applied Biosystems) en el Functional Genomics Center Zurich.
De este modo, se encontraron las secuencias N-terminales ASCYN SPLGCCSDGK (ID. SEC. Nº: 5) para el fragmento de 90 kDa y SVGDLETLAF (ID. SEC. Nº: 6) para el fragmento de 22 kDa. Por lo tanto, un sitio de escisión está localizado entre el primer segmento SIT y el dominio SEA, C-terminalmente de la Arg_{995} en la secuencia PIER-ASCY (ID. SEC. Nº: 7; Fig. 3); el segundo sitio de escisión estaba localizado entre los dominios cuarto de tipo EGF-like y LG3, C-terminalmente de la Lys_{1754} en la secuencia LVEK-SVGD (ID. SEC. Nº: 8, Fig. 3). Los números de aminoácidos se refieren a la agrina de rata anclada a membrana (P25304; variante de corte y empalme x4y0). Los inventores denominaron el enlace escísil entre R_{995} y A_{996} como sitio de escisión \alpha, y el enlace escísil entre K_{1754} y S_{1755} como sitio de escisión \beta.
Una alineación (Tabla 1) de las dos secuencias de escisión de la agrina de rata con los correspondientes segmentos de varias especies de vertebrados mostró una estricta conservación de los aminoácidos flanqueantes de los sitios de escisión.
TABLA 1
1
Alineación de las secuencias de agrina de diferentes especies. Para comparar los residuos de aminoácidos que rodean el desenlace escísil de los sitios de escisión \alpha y \beta, los inventores usaron la terminología de Schechter y Berger (1967). P1 denota el residuo N-terminal y P1' el C-terminal implicados en el enlace escísil. Los residuos flanqueantes en la dirección N-terminal se denotan como P2, P3, ... Pn, los residuos flanqueantes en la dirección C-terminal se denotan como P2', P3', ... Pn'.
Como se desprende de la Tabla 1, el sitio \alpha tenía una Arg estrictamente conservada en P1 y una Glu en P2. El sitio \beta tenía una Lys estrictamente conservada en P1 y una Glu en P2. Los residuos en la posición P3 eran más variables, mientras que los residuos predominantemente apolares se encontraron en P4 de ambos sitios. En el lado C-terminal del enlace escísil, los residuos P1' y P2' están bien conservados en cada sitio, predominantemente con una secuencia Ala-Ser en el sitio \alpha y una secuencia Ser-Ala en el sitio \beta. Se encontraron residuos bien conservados pero distintos en P3' y P4' de los dos sitios.
En resumen, las secuencias consenso de los sitios \alpha y \beta muestran un perfil idéntico, con una estricta conservación del residuo P1 y P2, una ocupación variable de la posición P3 y un alto grado de conservación en P4, P1', P2' y P3'. El perfil general de las secuencias consenso individuales de los sitios \alpha y \beta se mantiene cuando se genera una secuencia consenso combinada de los dos sitios de escisión (Tabla 2), confirmando la homología entre las secuencias de escisión individuales en los sitios \alpha y \beta.
TABLA 2
2
Secuencia consenso que combina los sitios de escisión \alpha y \beta.
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Ejemplo 3 La escisión de la agrina dependiente de neurotripsina se produce in vivo y no se encuentra en ratones deficientes en neurotripsina
Los inventores investigaron diferentes tejidos procedentes de ratones naturales y deficientes en neurotripsina para buscar la presencia de fragmentos de agrina. Se aislaron cerebro, pulmón y riñón a partir de ratones naturales y deficientes en tripsina de 10 días de edad. Se homogeneizó aproximadamente 1 g de cada tejido con un homogeneizador Potter en 1 ml de tampón de lisis (sacarosa 320 mM, HEPES 5 mM, pH 7,4) que contenía una mezcla de inhibidores de proteasa (Sigma). Se analizaron los lisados celulares (40 \mug de riñón, 80 \mug de cerebro/pulmón) para buscar la expresión de la neurotripsina y la escisión de la agrina usando inmunotransferencia. Se sondeó la \beta-actina en la membrana desnuda del inmunotransferido de agrina. Como se muestra en la Fig. 4, se detectó una fuerte inmunorreactividad para la agrina completa en cerebro, riñón y pulmón de los ratones naturales. En estos tejidos también encontraron los inventores el producto de escisión de 90 kDa de la agrina. El producto de escisión de 22 kDa era fácilmente detectable en cerebro y riñón, pero estaba ausente en el pulmón. En ratones deficientes en neurotripsina no había inmunorreactividad para la agrina detectable a 22 kDa o a 90 kDa. Estos resultados demuestran que la escisión de la agrina por la neurotripsina se produce in vivo, y, adicionalmente, la ausencia de productos de escisión en ratones deficientes en neurotripsina indica que la escisión de la agrina depende estrictamente de la neurotripsina.
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Ejemplo 4 La inducción de la potenciación a largo plazo (long-term potentiation, LTP) da como resultado un aumento en la actividad proteolítica de la neurotripsina en tejidos del SNC, dando como resultado la generación de fragmentos de agrina, incluyendo el fragmento de 22 kDa
El efecto de una actividad neural de tipo aprendizaje sobre la actividad proteolítica de la neurotripsina es demostrado mediante la inducción de la potenciación a largo plazo (LTP) en cortes tisulares de la región CA1 del hipocampo. Actualmente, la LTP es la correlación más ampliamente aceptada entre aprendizaje y memoria a nivel celular, molecular y electrofisiológico (Martin y col., 2000). Para maximizar el número de sinapsis que participan en la LTP se usó un protocolo químico para la inducción de la LTP (Otmakhov y col., 2004) con una combinación de picrotoxina (50 \muM), forskolina (50 \muM), y rolipram (0,1 \muM). La combinación de estos compuestos induce una fuerte LTP que dura varias horas sin requerir ninguna estimulación eléctrica.
Para preparar los cortes de hipocampo, el hipocampo, junto con la corteza cerebral adyacente, se diseccionan rápidamente a partir de ratones C57BL/6 de 4-5 semanas de edad, y después se cortan verticalmente en el eje largo del hipocampo en cortes de 400 \mum de espesor usando un cortador tisular mecánico Mcllwain (The Micide Laboratory Engineering Co. Ltd.). Los cortes se transfieren a líquido cefalorraquídeo artificial (LCRA) sin calcio (NaCl 120 mM, KCl 3 mM, NaH_{2}PO_{4} 1,2 mM, NaHCO_{3} 23 mM, glucosa 11 mM, MgCl_{2} 2,4 mM) oxigenado mediante 95% de O_{2}/5% de CO_{2}, y se incuban durante una hora a temperatura ambiente, con objeto de proporcionar el tiempo suficiente para que el tejido cerebral se recupere de las lesiones de la disección. Después de una preincubación, los cortes se incuban en LCRA con calcio durante 20 minutos (NaCl 120 mM, KCl 3 mM, NaH_{2}PO_{4} 1,2 mM, NaHCO_{3} 23 mM, glucosa 11 mM, CaCl_{2} 4 mM). Entonces se induce una LTP química en el corte mediante incubación con una combinación de picrotoxina 50 \muM, forskolina 50 \muM y rolipram 0,1 \muM (estimulación PFR) durante 16 minutos.
Para examinar la actividad proteolítica de la neurotripsina en los cortes, se evalúa el tratamiento proteolítico de su sustrato, la agrina, mediante inmunotransferencia Western. Inmediatamente después de la estimulación con PFR, los cortes se homogeneizaron en Triton X-100 al 1%, sacarosa 0,32 M, EDTA 0,5 mM, HEPES 5 mM, pH 7,4. Los desechos se eliminan mediante centrifugación (16.000 x g durante 30 minutos a 4ºC). Las proteínas del sobrenadante (75 \mug de proteína) se separan electroforéticamente en gel de SDS-poliacrilamida al 10%, y después se electrotransfieren a una membrana de PVDF. Subsiguientemente, la membrana se sumerge en metanol durante 10 segundos y se seca para bloquear. Después del bloqueo, la membrana se incuba con un anticuerpo policlonal anti-agrina de conejo purificado por afinidad (R132; 1 \mug/ml) diluido en disolución salina tamponada con Tris (Tris-buffered saline, TBS; NaCl 0,15 M, Tris-HCl 10 mM, pH 8,0,) que contiene un 0,1% de Tween-20 (TTBS). El R132 reconoce el fragmento intermedio de 90 kDa de la agrina que es generado mediante la escisión de la agrina en los sitios \alpha y \beta por la neurotripsina. Después de lavar 3 veces durante 10 minutos con TTBS, la membrana se incuba hasta el día siguiente a 4ºC en TTBS que contiene un anticuerpo anti-IgG de conejo conjugado con peroxidasa (Sigma; diluido 1:10.000), después se lava 3 veces con TTBS y una vez con TBS. Subsiguientemente, la membrana se sumerge en sustrato quimioluminiscente (CHEMIGLOW; Alpha Innotech Corporation) durante 5 minutos para visualizar el fragmento de agrina. La señal quimioluminiscente se detectó con un Chemilmager (Alpha Biotech).
Según se muestra en la Figura 5A, la cantidad del fragmento de 90 kDa de la agrina dependiente de neurotripsina aumenta mediante la estimulación con PFR (PFR) en comparación con el control no estimulado (No Stim). Este aumento es estadísticamente significativo, según se determina mediante la prueba de la t de Student (3 experimentos de inmunotransferencia independientes usando muestras diferentes; p < 0,05; Figura 5B). Este resultado indica que la estimulación mediante PFR induce un aumento en la actividad proteolítica dependiente de la neurotripsina. El aumento en la cantidad del fragmento de 90 kDa de la agrina también indica un aumento del fragmento de 22 kDa, el fragmento C-terminal de la agrina, porque el fragmento de 90 kDa de la agrina no puede generarse sin la generación del fragmento de 22 kDa.
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Ejemplo 5 El aumento inducido por la actividad en la actividad proteolítica de la neurotripsina, y la resultante generación del fragmento de 22 kDa de la agrina en tejidos del SNC, da como resultado un aumento en el número de filopodios dendríticos
Para permitir la investigación de los filopodios dendríticos se cruzó una línea de ratones transgénicos que expresan la proteína fluorescente verde (GFP) o la proteína fluorescente verde dirigida a membrana (mGFP) en neuronas individuales bajo el control del promotor Thy-1, con una línea de ratones deficientes en neurotripsina. Los ratones transgénicos que expresaban la GFP o la mGFP se generan según se describió previamente (Feng y col., 2000; De Paola y col., 2003). Los ratones deficientes en neurotripsina que expresan la GFP o la mGFP se generan cruzando ratones deficientes en neurotripsina con ratones transgénicos que expresan la GFP o la mGFP en neuronas individuales. Los ratones homocigóticos deficientes en neurotripsina que sobreexpresan la mGFP y los correspondientes ratones naturales que sobreexpresan la mGFP se usan en el análisis siguiente a la edad de 5-6 semanas.
Se prepararon cortes agudos de hipocampo y se estimularon mediante PFR según se describe en el Ejemplo 4. Inmediatamente después del periodo de estimulación, los cortes se fijan mediante incubación en paraformaldehído al 4%, sacarosa al 4%, disolución salina tamponada con fosfato (PBS) 0,1 M, pH 7,4, hasta el día siguiente a 4ºC. Después de lavar con PBS, los cortes se montan en el portaobjetos y se cubren con el cubreobjetos con medio de montaje Vectashield (Vector Laboratory Inc.). Las señales fluorescentes de las dendritas apicales secundarias de las neuronas piramidales CA1 del hipocampo que expresan la mGFP se observan usando un microscopio confocal (Leica), y se recogen series de imágenes a unos intervalos de 0,1221 \mum. A partir de éstas se reconstruyen imágenes tridimensionales usando el modo Surpass Volume del programa informático de tratamiento de imágenes Imaris (Bitplane AG). El número de filopodios dendríticos se cuenta manualmente para una longitud de 30-40 \mum a lo largo de 12-20 dendritas independientes, inspeccionando las imágenes tridimensionales en todas direcciones. Los filopodios dendríticos son identificados según los siguientes criterios morfológicos: 1) una protrusión en la membrana dendrítica se categoriza como filopodio si su longitud es de al menos dos veces la longitud media de las crestas en la misma dendrita; 2) la proporción entre el diámetro de la cabeza y el diámetro del cuello es menor de 1,2:1, y 3) la proporción entre la longitud del filopodio y el diámetro del cuello es mayor de 3:1 (Grutzendler y col., 2002).
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Los resultados indican que, bajo una estimulación con PFR, el número de filopodios dendríticos en el hipocampo de ratones naturales (WT) aumenta en comparación con los controles no estimulados. El análisis estadístico usando datos de 12-20 dendritas independientes muestra un aumento significativo en el número de filopodios mediante la estimulación PFR (p < 0,01 mediante la prueba de la t de Student; Figura 6). Por el contrario, la estimulación química con PFR no altera el número de filopodios en los ratones deficientes en neurotripsina (ntd) (Figura 6). Esto indica que la neurotripsina es necesaria para el aumento en el número de filopodios impulsado por la actividad. En resumen, estos resultados indican que el aumento en la actividad proteolítica de la neurotripsina en las neuronas del SNC da como resultado un aumento en el número de filopodios dendríticos.
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Ejemplo 6 La administración del fragmento de 22 kDa de la agrina a neuronas del SNC da como resultado un aumento en el número de filopodios dendríticos
El fragmento de 22 kDa, el fragmento C-terminal de la agrina, es generado de forma natural por la actividad proteolítica de la neurotripsina en el sitio de escisión \beta de la agrina. El fragmento recombinante de 22 kDa de la agrina es producido según se describe en el Ejemplo 7). Para investigar si la generación del fragmento de 22 kDa por la neurotripsina está implicada en el aumento impulsado por la actividad en el número de filopodios dendríticos, se cuentan los filopodios a lo largo de las dendritas de las neuronas del hipocampo CA1 en cortes agudos tratados con el fragmento de 22 kDa de ratones homocigóticos deficientes en neurotripsina que expresan la GFP o la mGFP en neuronas individuales. Los ratones deficientes en neurotripsina son generados según se describe en el Ejemplo 9. Los ratones transgénicos que expresan la GFP o la mGFP son generados según se describió previamente (Feng y col., 2000; De Paola y col., 2003). Los ratones deficientes en neurotripsina que expresan la GFP o la mGFP son generados mediante el cruce de ratones deficientes en neurotripsina con ratones transgénicos que expresan la GFP o la mGFP en neuronas individuales. Se preparan cortes agudos de hipocampo a partir de ratones deficientes en neurotripsina que sobreexpresan la mGFP, según se describe en el Ejemplo 4. Estos cortes se dividen en 4 grupos con objeto de someterlos a 4 condiciones de estimulación diferentes: sin estimulación (No Stim), incubación con PFR (PFR), incubación con el fragmento de 22 kDa y con PFR (22 kDa frag + PFR) e incubación con el fragmento de 22 kDa (22 kDa frag). Las condiciones experimentales designadas como 22 kDa frag y 22 kDa frag + PFR contienen el fragmento de 22 kDa humano, de rata o de ratón (preparado según se describe en el Ejemplo 7) a una concentración de 22 nM en LCRA oxigenado. Inmediatamente después del periodo de estimulación (16 minutos), los cortes se fijan, se montan sobre portaobjetos y se toman imágenes en serie a 0,1221 \mum a partir de dendritas apicales secundarias de neuronas que expresan la GFP mediante microscopía confocal, según se describe en el Ejemplo 5. Los filopodios se cuentan en 14-20 dendritas apicales secundarias (cada una de 30-40 \mum de largo) de neuronas piramidales CA1 tras la reconstrucción de las imágenes tridimensionales con el programa informático de tratamiento de imágenes
Imaris.
Según se muestra en la Figura 7, el aumento en el número de filopodios dendríticos tras la estimulación con PFR se pierde en ratones deficientes en neurotripsina (este efecto también se mostró en el Ejemplo 5 y en la Figura 6). Sin embargo, la adición del fragmento de 22 kDa al PFR restablece el aumento en el número de filopodios en cortes de hipocampo procedentes de ratones deficientes en neurotripsina hasta el mismo nivel al encontrado con PFR en ratones naturales (p < 0,001 mediante la prueba de la t de Student). Esto demuestra que el aumento impulsado por la actividad en los filopodios es dependiente de la generación del fragmento de 22 kDa mediante la escisión proteolítica dependiente de neurotripsina a partir de la agrina (lo que no sucede en ratones deficientes en neurotripsina). Adicionalmente, la administración de 22 nM de fragmento de 22 kDa humano recombinante purificado solo (sin PFR) induce un aumento significativo en los filopodios en ausencia de inducción química de la LTP mediante PFR. El efecto inductor de filopodios del fragmento de 22 kDa también se observa en ausencia de los estímulos inductores de la LTP, lo que indica que el fragmento de 22 kDa es un mediador de flujo descendiente del efecto inductor de los filopodios de la LTP. En resumen, estos resultados indican que el fragmento de 22 kDa actúa como un inductor de los
filopodios.
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Ejemplo 7 Clonación, expresión y purificación del fragmento C-terminal de 22 kDa de la agrina humana
Se usa BAC DNA con número de acceso BC007649, con la región 3' del ADNc de agrina humana como inserto, para generar un fragmento de ADN que codifica para el último dominio LG de la agrina mediante amplificación por PCR. Los cebadores de PCR usados son
(ID. SEC. Nº: 9) 5'-GCG CGA GTT AAC CAC CAT CAC CAT CAC CAT CAC CAT TCA GCG GGG GAC GTG GAT ACC TTG GC-3', introduciendo un sitio HpaI (5' humanC), y
(ID. SEC. Nº: 10) 5'-TTA CCT GCG GCC GCT CAT GGG GTG GGG CAG GGC CGC AGC TC-3', introduciendo un sitio Nod (3' humanC).
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Usando esta estrategia se inserta la secuencia de ADN que codifica para una etiqueta 8 x His N-terminal. El producto de la PCR resultante es escindido con las enzimas de restricción NotI y HpaI (en negrita en las secuencias de nucleótidos) y clonado en el vector pEAK8 que contiene la secuencia codificante para el péptido de señalización del corte de la calsintenina-1 humana con las mismas enzimas de restricción. El fragmento constructo resultante pEAK8-22-kDa contiene la región codificante de la secuencia de señalización de la calsintenina-1 humana, así como la señal de secreción del fragmento de 22 kDa. La clonación, así como la amplificación del plásmido se realiza en E. coli. Para la síntesis proteica eucariota, se transfectan células HEK 293T usando el procedimiento del fosfato cálcico. Durante la traducción en las células HEK 293T, el péptido de señalización es escindido. La proteína secretada resultante tiene una secuencia en la que la secuencia líder ARVNHHHHHH HH (ID. SEC. Nº: 11) está conectada al N-terminal de la secuencia obtenida mediante la escisión de la agrina dependiente de la neurotripsina en el sitio \beta que comprende el dominio LG 3 y el C-terminal de la agrina de la ID. SEC. Nº: 12.
SAGDVDTLAFD GRTFVEYLNA VTESEKALQS NHFELSLRTE
ATQGLVLWSG KATERADYVA LAIVDGHLQL SYNLGSQPVV LRSTVPVNTN
RWLRVVAHRE QREGSLQVGN EAPVTGSSPL GATQLDTDGA LWLGGLPELP VGPALPKAYG TGFVG
CLRDV VVGRHPLHLL EDAVTKPELR PCPTP
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Este polipéptido tiene una masa molecular de aproximadamente 20 kDa sin la etiqueta N-terminal ARVN-8 x His. La masa total incluyendo la etiqueta es de aproximadamente 21,5 kDa.
Para la producción de proteínas se cultivaron las células HEK 293T hasta una confluencia del 80% en siete placas de cultivo de 500 cm^{2} (Corning) con 100 ml de medio DMEM (GIBCO) complementado con FCS al 10% cada uno. Para la transfección se equilibran 35 ml de CaCl_{2} 500 mM y 35 ml de tampón HBS (HEPES 50 mM, NaCl 140 mM, Na_{2}HPO_{4} 1,5 mM, pH 7,1) hasta la temperatura ambiente. Se añaden dos mg de ADN de constructo de expresión del fragmento pEAK8-22-kDa a la disolución de CaCl_{2} y se mezclan con el tampón HBS. La mezcla de transfección se incuba a temperatura ambiente durante 30 min. Para la transfección de una placa de 500 cm^{2} de células HEK, se añaden gota a gota al cultivo 10 ml de la mezcla de transfección y se incuba durante 4 h a 37ºC. Entonces la mezcla de transfección se extrae lavando una vez con PBS y añadiendo medio DMEM sin FCS. Después de 60 h se recoge el medio condicionado y se filtra usando un filtro Steritop 0,22 \mum (Millipore). El sobrenadante se dializa frente a Tris-HCl 20 mM, NaCl 400 mM, pH 8,5, y se somete a una purificación por IMAC usando una columna Ni-NTA (10 ml HisSelect, Sigma-Aldrich) en un sistema de cromatografía líquida BioLogic (Biorad). El medio condicionado y dializado se carga con una tasa de flujo de 5 ml/min, la columna se lava con 20 CV de Tris-HCl 20 mM, NaCl 400 mM, pH 8,5. Para la elución se usa un gradiente lineal desde 0 hasta 250 mM de imidazol en tampón de lavado para 10 volúmenes de columna. Las fracciones que contienen el fragmento recombinante puro de 22 kDa se agrupan, se concentran con un concentrador rotacional de 15 ml (Millipore) y el tampón se intercambia con una columna NAP 25 (Pharmacia) a MOPS 10 mM, NaCl 100 mM, pH 7,5. La proteína purificada se congela en nitrógeno líquido y se almacena a -80ºC. El fragmento de 22 kDa generado de este modo contiene una etiqueta 8 x His N-terminal seguida por los residuos P' del sitio de escisión \beta y el C-terminal natural de la agrina.
De forma similar, se clona, expresa y purifica un fragmento recombinante de 22 kDa de agrina de rata o ratón que comprende la misma estructura de dominio.
También es posible construir un fragmento de 22 kDa con otras etiquetas o una variante sin etiquetas del fragmento de 22 kDa con técnicas de clonación estándar. La expresión se consigue en sistemas celulares eucariotas o procariotas estándar, y la purificación de la proteína deseada se consigue mediante cromatografía líquida estándar o mediante replegamiento a partir de cuerpos de inclusión.
Para generar un fragmento de 22 kDa que sea idéntico a la forma encontrada in vivo, se omite la etiqueta de His N-terminal y se genera el fragmento de 22 kDa a partir de cualquier tipo de ADNc que codifique para un fragmento C-terminal de la agrina que comprenda el dominio LG3 y el sitio de escisión \beta de la agrina (por ejemplo, la agrina completa o el fragmento de 44 kDa C-terminal) mediante digestión con neurotripsina in vitro o durante la expresión de la agrina o del fragmento de 44-kDa de la agrina. El fragmento de 22 kDa se purifica según se describió anteriormente.
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Ejemplo 8 Generación de anticuerpos policlonales contra el fragmento de 22 kDa de la agrina
Se generan anticuerpos policlonales contra el dominio LG3 de la agrina inmunizado conejos con 50 \mug de dominio LG3 de agrina de rata. El anticuerpo resultante es útil para la detección de la agrina completa humana, de ratón o de rata, así como para la detección de los fragmentos de agrina que contienen el dominio LG3 de la agrina.
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Ejemplo 9 El fragmento de 22 kDa de la agrina puede detectarse en homogeneizado cerebral y sangre del ratón
Los inventores investigaron la presencia de los fragmentos de agrina en la fracción soluble de homogeneizados cerebrales y en el suero sanguíneo del ratón. Para la detección los inventores usaron anticuerpos específicos purificados mediante afinidad generados en el laboratorio de los inventores contra el fragmento de 90 kDa y el fragmento de 22 kDa. El fragmento de 22 kDa podría ser fácilmente detectado en las inmunotransferencias Western de ambos homogeneizados cerebrales y en el suero sanguíneo (Fig. 8). Los homogeneizados cerebrales incluidos de los ratones homocigóticos deficientes en neurotripsina (-/- en la Fig. 8, A y B) no contenían el fragmento de 22 kDa, mientras que la forma heterocigótica de los ratones deficientes en neurotripsina (+/- en la Fig. 8B) mostraba el fragmento de 22 kDa a un nivel reducido. Conjuntamente, estos resultados indican que el fragmento de 22 kDa detectado mediante inmunotransferencia Western es debido a la acción de la neurotripsina, y que puede ser detectado en la fracción soluble del homogeneizado cerebral, así como en el suero sanguíneo.
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Ejemplo 10 El fragmento de 22 kDa de la agrina se encuentra en LCR humano
También los inventores ensayaron muestras humanas, es decir, orina, sangre y líquido cefalorraquídeo, para investigar la presencia de fragmentos de agrina dependientes de neurotripsina. Hasta el momento los inventores no habían hallado ninguna evidencia de la presencia del fragmento de 110 kDa o de 90 kDa en ninguno de los fluidos corporales. Sin embargo, encontraron el fragmento de 22 kDa tanto en el líquido cefalorraquídeo como en el suero sanguíneo.
Según se muestra en la Fig. 9A, se encontró una señal inmunorreactiva para el fragmento de 22 kDa de la agrina en todas las edades ensayadas, que variaban desde un niño de un mes, pasando por etapas adicionales del desarrollo y la edad adulta, hasta el LCR de una mujer de 86 años. Según se esperaba en base al patrón de expresión temporal de la neurotripsina, con un pico de expresión durante el desarrollo postnatal temprano, los inventores encontraron la mayor cantidad del fragmento de 22 kDa de la agrina en el LCR de niños de 2 y 9 meses de edad. Interesantemente, se encontró un nivel claramente elevado del fragmento de 22 kDa de la mujer de 86 años. Sin embargo, definitivamente tendrán que medirse más muestras con objeto de extraer conclusiones sobre la relevancia biológica o fisiopatológica de esta observación.
Para verificar la identidad de la banda inmunorreactiva de 22 kDa, los inventores aislaron la proteína subyacente a partir del líquido cefalorraquídeo y la sometieron a un análisis mediante CL/ESI/EM/EM. Con el propósito de identificar inequívocamente la proteína en base a su secuencia peptídica parcial, se fragmentó mediante una digestión tríptica. Entonces los fragmentos resultantes se separaron mediante cromatografía líquida y se sometieron a un análisis mediante EM/EM. Según se muestra en la Fig. 9B, se detectaron dos péptidos que se correspondían exactamente con la secuencia de aminoácidos de los primeros 27 aminoácidos (péptido #1 que comprende 13 aminoácidos (ID. SEC. Nº: 3); péptido #2 que comprende 14 aminoácidos (ID. SEC. Nº: 4)) del fragmento de 22 kDa de la agrina humana. Ambos péptidos terminaban en un aminoácido básico, lo que confirmaba su naturaleza tríptica. El péptido #1 comienza en el sitio de escisión \beta de la agrina dependiente de la neurotripsina. No se encontró ningún péptido ubicado fuera de los márgenes del fragmento de 22 kDa de la agrina. Conjuntamente, estos resultados confirman la identidad de la banda inmunorreactiva de 22 kDa encontrada en inmunotransferencias Western como el fragmento de 22 kDa de la agrina dependiente de la neurotripsina. Estos resultados señalan al LCR como el compartimento informador para el control de la actividad de la neurotripsina en el cerebro.
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Ejemplo 11 El fragmento de 22 kDa de la agrina puede detectarse en sangre humana
La búsqueda de fragmentos de la agrina dependientes de neurotripsina también se extendió a muestras extraneurales. Según se muestra en la Fig. 10, la inmunotransferencia Western de suero sanguíneo humano mostró una clara banda inmunorreactiva. Sin embargo, la señal detectada en suero sanguíneo era menos intensa que la encontrada en el LCR. Para una detección inequívoca se requirió una separación cromatográfica y un enriquecimiento diferencial de las proteínas séricas para revelar una señal (flecha en la Fig. 10). El trabajo que se está realizando actualmente aspira a la validación estructural de la identidad de la banda inmunorreactiva de 22 kDa como un derivado de la agrina. Suponiendo una confirmación con éxito, el suero sanguíneo también se usará como un compartimento informador para el control de la neurotripsina in vivo. Los datos cuantitativos sobre el fragmento de 22 kDa en suero sanguíneo permitirán extraer conclusiones sobre la actividad de la neurotripsina en la unión neuromuscular y en tejido extraneural, tal como el riñón y el pulmón.
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Universität Zürich
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<120> Procedimiento para la detección de la actividad de la neurotripsina in vivo, uso del procedimiento ....
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<130> 04398
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<160> 15
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<170> PatentIn version 3.1
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<210> 1
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<211> 2045
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 1
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<210> 2
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<211> 191
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<213> Homo sapiens
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11
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<210> 4
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<211> 14
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<212> PRT
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<213> Rattus rattus
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<400> 6
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<400> 7
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<212> PRT
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<213> Rattus rattus
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16
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<210> 9
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<211> 62
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Cebador
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<400> 9
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<210> 10
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<211> 41
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Cebador
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<400> 10
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<210> 11
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<211> 12
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Etiqueta de His
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<400> 11
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<210> 12
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<211> 186
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 12
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Inserto de aminoácido
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<211> 11
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Inserto de aminoácido
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<400> 14
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Claims (12)

1. Procedimiento para la detección de la actividad in vivo de la neurotripsina, en el que se mide la cantidad del fragmento de 22 kDa de la agrina en una muestra tomada de un paciente, y se usa la cantidad medida del fragmento de 22 kDa de la agrina en la muestra para calcular la actividad de la neurotripsina, siendo la muestra sangre u orina.
2. Procedimiento según la reivindicación 1, en el que se usa un fragmento de 22 kDa de la agrina preparado mediante técnicas recombinantes, como referencia.
3. Uso del procedimiento según la reivindicación 1 para el diagnóstico y el control de trastornos relacionados con la neurotripsina.
4. Uso según la reivindicación 3 para el diagnóstico y el control de enfermedades causadas por la desregulación de la neurotripsina.
5. Uso según la reivindicación 3 ó 4 para el diagnóstico y el control de enfermedades y trastornos relacionados con la neurotripsina del sistema neural y neuromuscular.
6. Uso según la reivindicación 3 ó 4 para el diagnóstico y el control de enfermedades y trastornos relacionados con la neurotripsina de sistemas no neurales, especialmente el riñón y el pulmón.
7. Uso del procedimiento según la reivindicación 1 en estudios clínicos o preclínicos para establecer el efecto de sustancias sobre la actividad de la neurotripsina.
8. Uso del fragmento de 22 kDa de la agrina, detectado en sangre u orina en una muestra tomada de un paciente, como biomarcador para trastornos relacionados con la neurotripsina.
9. Uso según la reivindicación 8 para el diagnóstico y el control de enfermedades causadas por la desregulación de la neurotripsina.
10. Uso según la reivindicación 8 ó 9 para el diagnóstico y el control de enfermedades y trastornos relacionados con la neurotripsina del sistema neuronal y neuromuscular.
11. Uso según la reivindicación 8 ó 9 para el diagnóstico y el control de enfermedades y trastornos relacionados con la neurotripsina de sistemas no neurales.
12. Uso del fragmento de 22 kDa de la agrina, detectado en sangre u orina en una muestra tomada de un paciente, como biomarcador en estudios clínicos o preclínicos para establecer el efecto de sustancias sobre la actividad de la neurotripsina.
ES07009398T 2007-05-10 2007-05-10 Procedimiento para la detección de la actividad in vivo de la neurotripsina, uso del procedimiento y uso del fragmento c-terminal de 22kda de la agrina como biomarcador en el diagnóstico y el control de trastornos relacionados con la neurotripsina. Active ES2350254T3 (es)

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