ES2333312T3 - Diagnostico de la enfermedad de alzheimer por analisis de polimorfismos del gen il-10. - Google Patents

Diagnostico de la enfermedad de alzheimer por analisis de polimorfismos del gen il-10. Download PDF

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Abstract

Un método para determinar la existencia de una predisposición a la enfermedad de Alzheimer, comprendiendo el método analizar in vitro una muestra que lleva ADN tomada a partir de un sujeto animal para determinar las variantes alélicas presentes en uno o más de los loci de SNP en las posiciones -1082, -819 y -592 del gen que codifica IL-10.

Description

Diagnóstico de la enfermedad de Alzheimer por análilsis de polimorfismos del gen IL-10.
Esta invención se refiere al uso de IL-10 en el diagnóstico de la enfermedad de Alzheimer.
La causa principal del deterioro cognitivo en los ancianos es la enfermedad de Alzheimer (AD). Debido al aumento de la duración de la vida en todo el mundo, se espera que se triplique el número de personas afectadas por AD durante los próximos 50 años (1). La AD es un síndrome clínico caracterizado por mecanismos patógenos complejos y heterogéneos. Los factores genéticos reconocidos incluyen mutaciones del gen que codifica la proteína precursora de amiloide (2), y la presenilina 1 y 2 (3, 4), que son las responsables de una pequeña parte de los casos de AD familiares y normalmente de inicio prematuro. También se han asociado factores genéticos con la forma esporádica o no familiar de la enfermedad y el alelo e4 de la apolipoproteína E (Apo E) aumenta significativamente el riesgo de AD, pero no es necesario ni suficiente para el desarrollo de la enfermedad (5-7). Por lo tanto, es probable que estén implicados otros factores genéticos y ambientales y se investigarán activamente.
Las moléculas que intervienen en la cascada inflamatoria tienen un gran interés debido a que se ha sugerido repetidamente que la inflamación está asociada con el proceso neurodegenerativo característico del cerebro con AD (8). De esta manera, se observa astrocitosis reactiva tanto en la corteza como en el hipocampo de estos pacientes y las células gliales también están activadas dentro o cerca de las placas neuríticas. Un exceso de expresión de citocinas y otras moléculas inflamatorias son características comunes de la patología del cerebro con AD (9). Además, los estudios epidemiológicos demostraron que el uso a largo plazo de antiinflamatorios no esteroideos está asociado con una reducción de la incidencia de AD en un estudio de control en gemelos siameses (10) y otros diversos estudios clínicos confirmaron una menor asociación de AD en individuos tratados con antiinflamatorios (11), incluyendo inhibidores específicos de COX2 (12). Estos descubrimientos confirman la hipótesis de que la inflamación podría contribuir a la neurodegeneración asociada con la AD (13).
Con la intención de entender mejor la biología de la AD, recientemente se ha investigado el posible papel de varias citocinas y quimioquinas. Se ha sugerido que prácticamente todos los mediadores analizados en estos estudios, incluyendo IL-1b, IL-6, TNF-\alpha, IL-8, TGF-\beta y la proteína-1a inflamatoria de macrófagos (MIP-1a), están regulados positivamente en la AD en comparación con controles sin demencia (14-18). Por el contrario, se obtienen resultados conflictivos en relación con la citocina inmunomoduladora IL-10, una citocina de tipo 2 que reprime a los linfocitos T y la inmunidad mediada por células en seres humanos y ratones y tiene potentes propiedades antiinflamatorias (19-21).
Estos estudios consideraron cada citocina independientemente como polimorfismos génicos y/o producción, pero nunca investigaron la relación entre factores que actúan a favor y en contra de la inflamación, tales como la IL-10 y la IL-6 en la misma muestra de población.
Merece la pena recordar que se conocen polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) en la región promotora de estos dos genes. El gen que codifica IL-10, localizado en el cromosoma 1 entre 1q31 y 1q32, es muy polimórfico. La producción de IL-10 está correlacionada con polimorfismos bialélicos en las posiciones: -1082 (sustitución de guanina por adenina), -819 (sustitución de timina por citosina) y -592 (sustitución de adenina por citosina). El polimorfismo en la posición -1082 está dentro de un sitio de reconocimiento de tipo Ets (específico de E-26) y puede afectar a la unión de este factor de transcripción y por lo tanto alterar la activación de la transcripción; el alelo -1082A se correlaciona con la generación de IL-10 después de la estimulación de células T in vitro (57), mientras que no parecen estar implicados polimorfismos en las posiciones -819 y -592. El gen de la IL-6 en seres humanos está organizado en cinco exones y cuatro intrones y se localiza en el brazo corto del cromosoma 7 (7p21) (50, 73). La implicación de la IL-6 en muchas funciones biológicas tiene su paralelo en asociaciones genéticas de sus variantes alélicas con varias afecciones fisiológicas y patofisiológicas. Frecuentemente se han usado dos de sus sitios polimórficos para estudios de asociación genética: un número variable multialélico de polimorfismos de repeticiones en tándem (VNTR) en la región flanqueante 3' (repeticiones AT) y un polimorfismo bialélico de G a C del promotor en la posición -174. El polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) G/C parece estar asociado con niveles sanguíneos y velocidades de transcripción variables de IL-6 (54, 56, 68).
A la luz de estas consideraciones y basándose en un estudio de asociación caso-control en pacientes italianos con AD esporádica de inicio tardío y en controles sanos (HC) equiparables, los presentes inventores evaluaron si los SNP de IL-10 e IL-6 estaban relacionados con el desarrollo de la AD. Los resultados arrojan más luz sobre la hipótesis patogénica inflamatoria de la AD y sugieren una predisposición genética independiente de la metabólica.
Estas variaciones alélicas están asociadas con diferencias medibles en la producción de IL-10 e IL-6 por linfocitos de sangre periférica estimulados por antígeno y por mitógeno. De hecho, estos polimorfismos se producen en la región reguladora del gen y están asociados con una producción elevada, intermedia o baja de IL-10 (22).
Los presentes inventores investigaron la producción de IL-10 e IL-6 estimulada por beta amiloide por linfocitos de sangre periférica (PBMC) de pacientes con AD y de controles sanos de edades equiparables. Como la generación de esta citocina estaba significativamente reducida en los pacientes con AD, se analizaron los polimorfismos de IL-10 en estos mismos individuos. Los resultados demostraron que el alelo de alta producción de IL-10 es extremadamente raro en los pacientes con AD.
Específicamente, los genotipos de IL-10 están distribuidos de diferente forma cuando la AD se compara con HC (\chi^{2} = 16,007; p = 0,007). Por lo tanto, los genotipos correspondientes a una producción reducida de IL-10 tienen una distribución significativamente mayor entre los sujetos con AD (tabla I). La presencia de genotipos con baja producción de IL-10 está asociada con un peor resultado clínico de AD entendido como se indica a continuación: 1) menor edad de inicio de la enfermedad (tabla II); y 2) progresión más rápida de la enfermedad (puntuación del MMSE) (tabla III).
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TABLA I Distribución de genotipos de IL-10
1
Las frecuencias de los diferentes genotipos entre los pacientes con enfermedad de Alzheimer (AD) son estadísticamente diferentes de las de los controles sanos (HC). \chi^{2} = 16,700, df = 5, p = 0,007. Entre paréntesis, (c), se proporcionan los correspondientes fenotipos de producción alta (H), intermedia (M) y baja (L).
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TABLA II Distribución de genotipos de IL-10 y edad de inicio
2
Correlación entre los diferentes genotipos en pacientes con enfermedad de Alzheimer y la edad de inicio. ANOVA: p = 0,042.
TABLA III Distribución de genotipos de IL-10 y MMSE
3
Correlación entre los diferentes genotipos en pacientes con enfermedad de Alzheimer y ANOVA de MMSE: p = 0,010.
Se sugiere que la inflamación crónica está implicada en el proceso neurodegenerativo característico de la AD (24, 25); esta sugerencia procede de los criterios tanto in vivo como ex adjuvantibus. De esta manera, se observa que los mediadores inflamatorios y las células gliales activadas están muy asociados con las placas neuríticas in vivo. Además, ciertos datos recientes indican que la terapia antiinflamatoria podría ser útil en la modulación de la progresión de la enfermedad (10-12). A pesar de esta gran cantidad de evidencias, las correlaciones biológicas de la AD aún no están claras. Para arrojar luz sobre este problema, se centró la atención en la IL-10. Esta citocina es una citocina reguladora fundamental implicada en muchas facetas de la respuesta inmune y está desregulada en enfermedades autoinmunes (26), malignas (27-31) e infecciosas (32-35) humanas. Más recientemente se ha demostrado que la presencia de mayores niveles determinados genéticamente de la secreción de IL-10 es un componente importante de la base genética para el lupus eritematoso sistémico (36) y para el resultado de enfermedades infecciosas (37). También se ha demostrado que la secreción de IL-10, resultante de la estimulación in vitro de leucocitos de sangre periférica humana con LPS, varía notablemente entre individuos y que los haplotipos de citocinas están asociados con diferentes niveles de secreción (38). Además, las diferencias en la producción en suero de IL-10 por células de pacientes y de sus familiares de primer grado (37, 39), así como las diferencias en la distribución de los alelos de IL-10, sugirió la implicación de las diferentes isoformas del gen de IL-10 como un locus de rasgos cuantitativos importantes para la enfermedad humana en infecciones (37, 40), enfermedades autoinmunes (26, 36, 41, 42) y enfermedades
malignas (43).
Los presentes inventores analizaron inicialmente la producción de IL-2 e IL-10 específica de LPS, Flu y péptido amiloide por células mononucleares de sangre periférica (PBMC) de pacientes con AD y HC de edades equiparables. Los resultados demostraron que: 1) la producción de IL-2 por PBMC de pacientes con AD y controles fue similar en todas las condiciones medidas; y 2) la generación de IL-10 por PBMC estimuladas por LPS y Flu era comparablemente similar entre los dos grupos de individuos. Por el contrario, en los pacientes con AD estaba presente un deterioro inmune específico de amiloide caracterizado por una reducción de la generación de IL-10. La observación de que este desequilibrio de citocinas no se veía en PBMC estimuladas por mitógeno indica que las respuestas inmunes específicas de amiloide están alteradas selectivamente en los pacientes con AD. Además, los resultados que demostraban que la proliferación estimulada por Flu era similar en los pacientes y controles indica que en estos pacientes no son defectuosos el procesamiento y la presentación antigénica en asociación con moléculas de HLA de clase II, y la ruta de activación del sistema inmune autorrestringida por CD4-HLA de clase II (44).
A continuación se analizaron polimorfismos en el gen de IL-10 en el mismo grupo de sujetos. Los resultados procedentes del análisis de la distribución de los alelos de IL-10 en esta muestra italiana de individuos sanos demostró una gran similitud con los presentados para otras poblaciones caucásicas (45). Por el contrario, se observó una frecuencia significativamente mayor de los genotipos correspondientes a una producción reducida de IL-10 (ACC/ACC, ACC/ATA y ATA/ATA) en pacientes con AD. De esta manera, se determinó una prevalencia aumentada de forma anómala de isoformas de baja producción de IL-10 en la población con AD; la correlación fenotípica de estas isoformas se volvió evidente cuando se midieron respuestas inmunes específicas de amiloide.
Los análisis posteriores se centraron en posibles correlaciones entre una producción alterada de IL-10 y las manifestaciones clínicas de la AD verificando si la presencia de genotipos de producción baja/intermedia de IL-10 estaría asociada con diferentes resultados de la enfermedad. Los resultados confirmaron que éste era el caso. De esta manera, la presencia de los genotipos ATA/ATA y de los genotipos GCC/ATA se correlacionaba con una menor edad en el inicio de la enfermedad. Además, los alelos ACC/ATA y ACC/ACC (todos éstos son genotipos de producción de IL-10 baja/intermedia) estaban asociados con un deterioro cognitivo más severo como se indica por una menor puntuación en el MMSE.
Es interesante observar que un informe reciente sobre centenarios italianos, individuos que, por definición, son menor propensos a desarrollar enfermedades relacionadas con la edad, ha demostrado que la extrema longevidad está asociada con una frecuencia significativamente mayor de los genotipos de alta producción de IL-10 (46).
Se sabe que la IL-10 tiene potentes propiedades antiinflamatorias (47); por lo tanto, se podría hipotetizar un escenario biológico en el que la reducción de la producción de IL-10 específica de amiloide favorecería el desencadenamiento del proceso inflamatorio crónico observado en la progresión de la AD. Estos resultados sugieren que en individuos sin AD puede estar activo un circuito de retroalimentación inhibidor mediado por IL-10 y específico de amiloide; la ruptura de este circuito podría estar asociada o ser predictiva del desarrollo de AD. Recientemente, un estudio convincente demostró que un circuito de IL-10/proinflamatorio que gira alrededor de células del sistema inmune innato regula la susceptibilidad a enfermedades autoinmunes (48). Estos resultados se expanden demostrando que en pacientes con AD está presente una alteración de este circuito.
Los presentes inventores han identificado regiones polimórficas, siendo los polimorfos indicativos de una disfunción de la producción de citocinas y por lo tanto estando asociados con una predisposición a una enfermedad inflamatoria autoinmune, neurodegenerativa o crónica.
En el momento actual, la enfermedad de Alzheimer se diagnostica por criterios reconocidos tales como DMS IV o NINCDS-ADRDA (23), a menudo junto con un examen por imágenes de resonancia magnética (MRI) o por tomografía asistida por ordenador (CT) del cerebro para identificar las placas amiloides y los ovillos neurofibrilares característicos junto con la atrofia del área del hipocampo del cerebro.
Sólo es posible un diagnóstico confirmatorio definitivo de la enfermedad de Alzheimer por inspección visual de las áreas afectadas del cerebro durante un examen post mortem o por medio de una biopsia cerebral (no recomendada debido a la falta de terapias eficaces).
Actualmente se están buscando urgentemente terapias y métodos para la monitorización de la enfermedad de Alzheimer. Según se progrese en los esfuerzos para prevenir o retrasar la neurodegeneración y la progresión de la enfermedad, ganarán importancia la detección precoz de la enfermedad de Alzheimer y la identificación de pacientes susceptibles, ya que esto permitirá emplear medidas preventivas tan pronto como sea posible. Por lo tanto, existe la necesidad de proporcionar ensayos predictivos y fiables para la susceptibilidad a la enfermedad de Alzheimer sin necesidad de evaluaciones prolongadas y subjetivas del comportamiento cognitivo.
Por consiguiente, la presente invención proporciona un método para determinar la existencia o una predisposición a la enfermedad de Alzheimer, enfermedades autoinmunes u otras enfermedades neurodegenerativas, comprendiendo el método las etapas de tomar una muestra que lleva ADN de un sujeto animal y analizar la muestra para determinar las variantes alélicas presentes en uno o más de los loci de SNP en las posiciones -1082, -819 y -592 del gen que codifica IL-10, o dicho de otra forma, analizar la muestra con respecto a la presencia o ausencia de los alelos de la Figura 2.
Preferiblemente se determina el genotipo en las tres posiciones -1082, -819 y -592.
Aunque se ha descubierto que la identificación de los alelos de la Figura 2 es útil o predictiva en la identificación de la enfermedad de Alzheimer, se ha descubierto que una combinación de los alelos de IL-10 e IL-6 es más predictiva de una predisposición a la enfermedad de Alzheimer o un diagnóstico de la presencia de la enfermedad de Alzheimer.
La apolipoproteína E (Apo-E) se ha asociado con una AD esporádica o no familiar. Por lo tanto, en un aspecto adicional de la invención, un método para diagnosticar la enfermedad de Alzheimer comprende las etapas de obtener una muestra que lleva ADN de un animal e identificar la presencia de un alelo polimórfico de IL-10, de IL-6 y de Apo-E.
Preferiblemente, el alelo polimórfico es uno de los alelos de la Figura 2.
Además, la muestra puede analizarse con respecto a la presencia/ausencia de polimorfismos u otras variaciones alélicas de otras citocinas además de IL-10 e IL-6, por ejemplo IL-10 e IL-6 más IL-4 y/o IL-1.
Como alternativa, la muestra puede ensayarse con respecto a la presencia o ausencia de polimorfismos u otras variaciones alélicas de IL-10 más Apo-E, o IL-6 más Apo-E.
Se ha asociado un polimorfismo de la interleucina 1 alfa (IL-1 alfa) con la enfermedad de Alzheimer (77). Por lo tanto, en otro aspecto de la invención, un método de diagnóstico de la enfermedad de Alzheimer comprende las etapas de obtener una muestra que lleva ADN de un animal e identificar la presencia de un alelo polimórfico de IL-10, IL-6, Apo-E e IL-1.
\newpage
Generalmente, se obtendrá un valor predictivo óptimo combinando tantos factores predictivos como sea posible en el ensayo. Los métodos descritos en la presente memoria junto con marcadores tales como Apo-E e IL-1 permiten el desarrollo de un método de diagnóstico poderoso que incluya todos los marcadores biológicos que han demostrado tener un valor predictivo del desarrollo de AD.
Por consiguiente, la presente invención también proporciona un método para explorar compuestos que modulan la IL-10 implicada en la enfermedad de Alzheimer, comprendiendo el método introducir el compuesto a explorar en fragmentos de ADN o ADNc que codifican los polimorfismos alélicos de la tabla I, o dicho de otra manera los polimorfismos alélicos de la Figura 2, y evaluar la hibridación entre el compuesto y el fragmento.
Por lo tanto, la presente invención también proporciona compuestos que modulan la enfermedad de Alzheimer, identificados por el método anterior.
Preferiblemente, el animal es un mamífero y más preferiblemente un ser humano.
Los datos presentados en la presente memoria confirman el papel de procesos inflamatorios en la patogénesis de la AD; refuerzan la hipótesis de que en pacientes con AD la neurodegeneración está muy asociada con una respuesta inmune específica de antígeno aberrante; y apoyan adicionalmente el uso de compuestos antiinflamatorios en la terapia de esta enfermedad.
A continuación se describirán realizaciones de la invención a modo de ejemplo únicamente, haciendo referencia a los dibujos adjuntos de los que las Figuras 1A-1D son diagramas de barras en los que se muestran las producciones estimuladas por LPS y \beta-amiloide (un grupo de 3 péptidos de \beta-amiloide: \betaA: fragmento 25-35; \betaB: fragmento 1-40; y \betaC: fragmento 1-16) de IL-2 (paneles A y C) y de IL-10 (paneles B y D) por PBMC de 47 pacientes con AD (O) y 25 controles sanos de edades y sexos equiparables (O). Se muestran los valores medios \pm errores típicos. p \leq 0,023;
la Figura 2 muestra un ejemplo paradigmático de la genotipificación de IL-10 para seis muestras diferentes. En cada gel, las bandas mas pesadas corresponden a los amplicones del gen de la \beta-globina humana que se usa como control interno. Los otros fragmentos de ADN amplificados específicos corresponden a los polimorfismos del gen de IL-10: GCG/GCC (A), GCC/ACC (B), GCC/ATA (C), ACC/ACC (D), ACC/ATA (E), ATA/ATA (F), y
las Figuras 3A-3D son los gráficos de barras que muestran la producción estimulada por LPS y \beta-amiloide (un grupo de tres péptidos de \beta-amiloide; \betaA, fragmento 25-35; \betaB, fragmento 1-40; y \betaC, fragmento 1-16) de IL-6 (paneles A y C) e IL-10 (paneles B y D) por PBMC de 47 pacientes con AD (O) y 25 controles sanos de edades y sexos equiparables (O). Medias \pm errores típicos; p \leq 0,023.
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Ejemplo 1 Pacientes y controles
En un estudio de la enfermedad de Alzheimer se incluyeron cuarenta y siete pacientes con AD y 25 sujetos sin demencia (HC). Estos pacientes se seleccionaron entre una muestra de población de mayor tamaño seguida en el Departamento Geriátrico del Hospital Maggiore IRCCS, Universidad de Milán, Italia (Geriatric Department of the Ospedale Maggiore IRCCS, University of Milan, Italy). Se adoptaron los criterios del DMS IV y del NINCDS-ADRDA (23) para obtener el diagnóstico clínico de la AD. Los comportamientos cognitivos y las alteraciones cognitivas se evaluaron de acuerdo con el Mini-Examen del Estado Mental (MMSE). Los pacientes con AD y HC estaban viviendo en su casa, se sometieron a un examen físico cuidadoso el día de la extracción de sangre y se evaluaron sus registros clínicos. Para minimizar el riesgo de procesos inflamatorios clínicos o subclínicos, todos los pacientes se seleccionaron como se indica a continuación: sólo se incluyeron en el estudio los pacientes con AD y HC sin signos clínicos de inflamación (por ejemplo, temperatura corporal normal o ausencia de enfermedad inflamatoria concomitante). También se evaluaron los parámetros de química sanguínea y se excluyeron los sujetos con una velocidad de sedimentación de glóbulos rojos anómala o un perfil sanguíneo alterado de niveles plasmáticos de albúmina y transferrina. Se realizó una selección adicional de pacientes con AD de acuerdo con los niveles plasmáticos de proteína reactiva C (CRP) y los pacientes con niveles de CRP por encima de 5 mg/l (valor medio \pm 2 desviaciones típicas de los valores de control) no se incluyeron en el estudio.
Se obtuvo un consentimiento informado para realizar el estudio de los controles y de un familiar de cada paciente con AD.
Recogida de muestras de sangre
Se recogió sangre entera por punción venosa en tubos Vacutainer que contenían EDTA (Becton Dickinson Co, Rutherford, NJ). Se separaron células mononucleares de sangre periférica (PBMC) por centrifugación en medio de separación de linfocitos (Organon Teknika Corp., Durham; NC) y se lavaron dos veces en PBS. El número de linfocitos viables se determinó por exclusión de azul tripán y un hemocitómetro.
Producción de citocinas in vitro
Las PBMC se resuspendieron a 3x10^{6}/ml en RPMI 1640 y se dejaron sin estimular o se estimularon con LPS (Sigma, St. Louis, Ml) (10 g/ml), con un grupo de 3 péptidos diferentes de la proteína \beta-amiloide que se indican a continuación: \beta-A; fragmento 25-35 (25 mg/ml); \beta-B: fragmento 1-40 (150 ng/ml); \beta-C: fragmento 1-18 (150 ng/ml) (Sigma, St. Louis, MI); o con vacuna del virus de la gripe (A/Taiwan+A/Shanghai+B/Victoria) (24 g/l; dilución final 1:1000) (Flu) (antígeno de control) a 37ºC en una atmósfera húmeda con 7% de CO_{2}. Los sobrenadantes se recogieron después de 48 horas en el caso de la estimulación con LPS y después de 5 días de cultivo en el caso de los péptidos de proteína \beta-amiloide y Flu. La producción de IL-2 e IL-10 por PBMC se evaluó con kits ELISA disponibles en el mercado (ACCUCYTE, Cytimmune Sciences, Inc, College Park, MD). Todos los kits de ensayo se usaron siguiendo los procedimientos sugeridos por el fabricante.
Genotipificación de IL-10
Se extrajo ADN genómico de sangre periférica tratada con EDTA (10 ml) usando un método convencional de proteinasa K y fenol/cloroformo. La concentración y pureza del ADN se determinaron por un análisis espectrofotométrico. Se utilizó la metodología de cebadores con especificidad de secuencia para reacción en cadena de la polimerasa (PCR-SSP) para evaluar los genotipos de IL-10. La amplificación de la secuencia en la región promotora del gen de la IL-10 (posiciones polimórficas -1082, -819, -592) se realizó usando el método de bandeja de genotipificación de citocinas (One Lambda, Canoga Park, CA, USA); el gen de la \beta-globina humana se amplificó como un control interno de la preparación de ADN genómico. Las condiciones de PCR se indicaron por el programa One Lambda PCR (OLI-1); los productos de PCR después se visualizaron por electroforesis en un gel de agarosa al 2,5%.
Análisis estadístico
El análisis estadístico se realizó usando el paquete estadístico SPSS (SPSS, Chicago, IL). Las diferencias en la producción de IL-10 se debían a procedimientos analíticos basados en análisis no paramétricos (Mann-Whitney); las comparaciones entre diferentes grupos de pacientes se realizaron usando el ensayo bilateral exacto de Fisher. Se compararon las frecuencias genotípicas entre los grupos de estudio por un ensayo c^{2} con un nivel de significado observado del ensayo por debajo de 0,05. Las comparaciones entre los valores medios de la edad al principio y el MMSE en los seis grupos diferentes de AD se realizaron por un análisis ANOVA de una vía.
Edad, sexo y puntuaciones del MMSE en pacientes con AD y en HC
En el estudio se incluyeron cuarenta y siete pacientes con AD y 25 controles sanos de edades equiparables. El mini-examen del estado mental (MMSE) demostró la presencia de un deterioro cognitivo de leve a severo en los pacientes con AD. Estos datos se muestran en la Tabla I.
La producción de IL-10 estimulada por MBP está reducida en pacientes con AD
Se estimularon PBMC de cuarenta y siete pacientes con AD y de 25 HC de edades y sexos equiparables con un mitógeno (LPS); un grupo de 3 péptidos \beta-amiloides (\betaA: fragmento 25-35, \betaB: fragmento 1-40 y \betaC: fragmento 1-16) (\beta-amiloide) o Flu (usado como antígeno de control) y se midió la producción de IL-2 e IL-10 por métodos ELISA. No se observaron diferencias cuando se comparó la producción de IL-2 e IL-10 estimulada por LPS o Flu en pacientes AD y HC. La producción de IL-2 estimulada por amiloide también fue similar en los dos grupos de individuos estudiados. En contraste con estos resultados, la producción de IL-10 estimulada por amiloide estaba significativamente reducida (p = 0,023) en pacientes con AD en comparación con los controles. Estos datos se muestran en la Figura 1.
La distribución de genotipos de producción alta, intermedia y baja de IL-10 está sesgada en pacientes con AD
En la Fig. 2 se muestra un ejemplo paradigmático de los seis genotipos diferentes de IL-10, evaluados por PCR-SSP, y en la tabla II se muestra su distribución relativa entre una muestra de población caucásica típica. A diferencia de la distribución observada en HC, la frecuencia de los diferentes genotipos de IL-10 entre los pacientes con AD estaba significativamente sesgada (c^{2} = 16,007 con p = 0,007) (tabla II). Por lo tanto, los genotipos correspondientes a una producción de IL-10 reducida (genotipos ACC/ACC, ACC/ATA y ATA/ATA) tuvieron una distribución significativamente mayor entre los sujetos con AD (17%, 26% y 11% respectivamente frente a 4%, 16% y 4% en HC). Además, la relación entre GCC/ACC y GCC/ATA (fenotipo intermedio) fue de 1:1 en AD mientras que fue de 3:1 en HC.
Una baja producción de IL-10 está correlacionada con un peor resultado clínico de AD
Para analizar las posibles correlaciones clínicas de la presencia de un genotipo de baja producción de IL-10, posteriormente se examinaron los seis genotipos en relación con la edad de inicio de AD (tabla III) y la progresión del deterioro cognitivo (tabla IV). Los resultados confirmaron que la presencia de genotipos de baja producción de IL-10 efectivamente está asociada con un peor resultado clínico de la AD. De esta manera, la presencia de los genotipos de ATA/ATA y GCC/ATA estaba asociada con una menor edad de inicio de la enfermedad (ANOVA: p = 0,042) (tabla III); además, se detectó una correlación inversa entre ACC/ATA y ACC/ACC, genotipos de baja producción de IL-10 y la puntuación del MMSE (ANOVA: p = 0,010) (tabla IV).
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Ejemplo 2 Pacientes y controles
Se incluyeron sesenta y cinco pacientes con AD (44 mujeres/21 hombres, edad media 80 \pm 2) y 65 controles sanos de edades y sexos equiparables sin demencia (HC). Los pacientes se seleccionaron de una muestra de población de mayor tamaño seguida en el Departamento Geriátrico del Hospital Maggiore, IRCCS, Universidad de Milán, Italia. Se aplicaron los criterios del DMS IV y NINCDS-ADRDA (23) para obtener el diagnóstico clínico de la AD; se obtuvo un examen reciente de imágenes de resonancia magnética (MRI) cerebral/tomografía computarizada (CT) de todos los sujetos. Los comportamientos y las alteraciones cognitivas se evaluaron de acuerdo con el mini-examen del estado mental (MMSE). Los pacientes con AD y HC estaban viviendo en su casa, se realizó un examen físico cuidadoso el día de la extracción de la sangre y se consultaron sus registros clínicos.
Para minimizar el riesgo de procesos inflamatorios clínicos o subclínicos, se seleccionaron los siguientes sujetos: sólo se podían elegir AD y HC sin signos clínicos de inflamación (por ejemplo, temperatura corporal normal, sin inflamación concomitante). Se realizaron ensayos de química sanguínea y se excluyeron los sujetos con una velocidad de sedimentación anómala de glóbulos rojos o con niveles plasmáticos alterados de albúmina y transferrina. Los pacientes con AD se seleccionaron adicionalmente con sus niveles plasmáticos de proteína C reactiva (CRP) y no se eligió ningún paciente con CRP por encima de 5 mg/l (media + 2 desviaciones típicas de los valores de control).
Se obtuvo un consentimiento informado de todos los sujetos o sus familiares. El protocolo de estudio se aprobó por el Comité de Ética del Hospital Universitario.
Extracción de muestras de sangre
Se recogió sangre entera por punción venosa en tubos Vacutainer que contenían EDTA (Becton Dickinson Co., Rutherford, NJ). Se separaron las células mononucleares de sangre periférica (PBMC) por centrifugación en medio de separación de linfocitos (Organon Teknika Corp., Durham, NC) y se lavaron dos veces en PBS. Los linfocitos viables se contaron por exclusión de azul tripán y un hemocitómetro.
Genotipificación
Se extrajo ADN genómico usando el método convencional de proteinasa K y fenol/cloroformo. La concentración y la pureza del ADN se determinaron por un análisis espectrofotométrico. Se utilizó el método de cebadores específicos de secuencia para reacción en cadena de la polimerasa (PCR-SSP) para evaluar los genotipos de IL-10 e IL-6. La secuencia en la región promotora de los genes de IL-10 (posiciones polimórficas -1082, -819, -592) e IL-6 (posición polimórfica -174) se amplificó usando el método de bandeja de genotipificación de citocinas (One Lambda, Canoga Park, CA, USA); el gen de la \beta-globina humana se amplificó como un control interno para la preparación de ADN genómico. Las condiciones de PCR se indicaron por el programa One Lambda PCR (OLI-1) y los productos de PCR se visualizaron por electroforesis en gel de agarosa al 2,5%.
Los genotipos de ApoE se determinaron por amplificación por PCR de un fragmento de 234 pares de bases del exón 4 del gen de ApoE, seguido de digestión con Cfo1. Los patrones de restricción se obtuvieron por electroforesis en gel.
Producción de citocinas in vitro
Se resuspendieron PBMC a 3x10^{6}/ml en RPMI 1640 y se dejaron sin estimular o se estimularon con LPS (Sigma, St. Louis, Ml) (10 \mug/ml), con un grupo de los 3 péptidos procedentes de la proteína \beta-amiloide indicados a continuación: \beta-A, fragmento 25-35 (25 g/ml); \beta-B: fragmento 1-40 (150 ng/ml); \beta-C: fragmento 1-16 (150 ng/ml) (Sigma) o con vacuna del virus de la influenza (A/Taiwan+A/Shanghai+B/Victoria) (24 \mug/l; dilución final 1:1000) (Flu) (antígeno de control) a 37ºC en una atmósfera húmeda con 7% de CO_{2}. Los sobrenadantes se recogieron después de 48 horas para la estimulación con LPS y después de 5 días de cultivo para los péptidos de proteína \beta-amiloide. La producción de IL-10 e IL-6 por PBMC se evaluó con kits ELISA comerciales (ACCUCYTE, Cytimmune Sciences, Inc, College Park, MD). Todos los kits de ensayo se usaron siguiendo las instrucciones del fabricante.
Análisis estadístico
El análisis estadístico se realizó usando el paquete estadístico SPSS (SPSS, Chicago, IL). Las frecuencias de los genotipos en los grupos de estudio se compararon por el ensayo \chi^{2} con un nivel de significado por debajo de 0,05. También se calcularon la razón de probabilidades (OR) y los intervalos de confianza de 95% (CI). Las OR ajustadas se estimaron por regresión logística, controlando el estado portador de ApoE 4. La homogeneidad de las OR entre los estratos se evaluó incluyendo los términos de interacción apropiados en el modelo. Las diferencias en la producción de IL-10 e IL-6 se establecieron por procedimientos basados en un análisis no paramétrico (Mann-Whitney); se compararon diferentes grupos de pacientes usando el ensayo bilateral exacto de Fisher.
La distribución de los genotipos de producción alta, intermedia y baja de IL-10 está sesgada en los pacientes con AD
En la tabla V se presentan las frecuencias de genotipos y alelos del polimorfismo bialélico en la posición -1082. Este SNP altera la activación de la transcripción con un efecto relacionado con la dosificación del gen, de forma que el genotipo GG se correlaciona con una alta producción de IL-10, GA con una producción intermedia de IL-10 y AA con una baja producción de IL-10 después de la estimulación de células T in vitro (57). Los pacientes con AD muestran una frecuencia significativamente mayor del alelo de baja producción -1082 A, lo cual sesga la distribución genotípica en AD en comparación con HC con una reducción significativa del genotipo de alta producción -1082GG (tabla V).
TABLA V Frecuencia de los diferentes alelos y genotipos de IL-10 observados en pacientes con enfermedad de Alzheimer (AD) y en controles sanos de edades equiparables
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Algunos SNP están ligados a otros dos SNP en las posiciones -819 y -592. Se combinan con alelos microsatélite para formar haplotipos donde la diferencia en la producción de IL-10 se justifica principalmente por el SNP -1082 (3\beta, 42). Las frecuencias genotípicas y de alelos de los SNP -819 C\rightarrowT y -592 C\rightarrowA se distribuyeron de manera similar en las muestras de AD y HC de los presentes solicitantes (datos no mostrados).
El alelo -174C en el gen de IL-6 está representado en exceso en pacientes con AD
En la tabla 6 se muestra la distribución de alelos y genotipos de IL-6 HC y AD. Este polimorfismo funcional también parece relacionado con la concentración plasmática de IL-6; sin embargo, no está claro cómo influye este SNP en los niveles plasmáticos de IL-6 (54). Los resultados de la distribución genotípica en las muestras de AD y HC de los presentes solicitantes indican una menor frecuencia de genotipo GG en pacientes con AD. De forma similar, la distribución de alelos fue significativamente diferente en los dos grupos, siendo el alelo C significativamente mayor en AD (tabla VI).
TABLA VI Frecuencia de los diferentes alelos y genotipos de IL-6 observados en pacientes con la enfermedad de Alzheimer (AD) y en controles sanos de edades equiparables
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Combinación de alelos de IL-10 e IL-6 y riesgo relativo de desarrollar AD
Se investigó si cualquier combinación de los alelos GA de IL-10 y GC de IL-6 afectaba al riesgo de padecer AD. La presencia concomitante de alelos IL-10 A e IL-6 C elevó significativamente este riesgo, independientemente del estado de ApoE 4 (tabla VII). Tanto el genotipo de IL-10 A/A solo como el genotipo de IL-6 C/C solo conferían un menor aumento en el riesgo de padecer la enfermedad (OR 5,8, CI 1,7-20, p = 0,005; OR 3,0, CI 0,9-10,6, p = 0,087).
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TABLA VII Alelos de IL-10 e IL-6 y riesgo de padecer enfermedad de Alzheimer
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La producción de IL-10 e IL-6 estimulada por péptido amiloide, Flu y LPS está reducida en pacientes con AD
Se estimularon PBMC de 47 pacientes con AD y 25 pacientes HC de edades y sexos equiparables con un mitógeno (LPS), con un grupo de tres péptidos \beta amiloides (\betaA, fragmento 25-35; \betaB, fragmento 1-40; \betaC, fragmento 1-16) o con Flu y se midió la producción de IL-10 e IL-6 con métodos ELISA. No hubo diferencias en la producción de IL-6 e IL-10 estimulada con LPS o Flu en AD y HC. Por el contrario, cuando se analizó la producción de IL-6 e IL-10 estimulada por \beta-amiloide, se observó un aumento marginal en la producción de IL-6 y una reducción significativa de la generación de IL-10 (p = 0,023) en los pacientes con AD en comparación con HC, lo que sugiere una alteración específica de antígeno en la producción de estas citocinas. Estos datos se muestran en la Figura 3.
El papel causante de la inflamación crónica en la patogénesis de la AD es principalmente especulativo (24, 25). Sin embargo, se ha propuesto un "ciclo de citocinas" donde (19) las citocinas antiinflamatorias (IL-4, IL-10 e IL-13) regulan las respuestas inflamatorias de microglía/macrófagos inducidas por \beta-amiloide y modifican la actividad microglial que rodea a las placas neuríticas amiloides (52). Estas citocinas pueden inhibir la inducción de IL-1, TNF-\alpha y MCP-1 en monocitos humanos diferenciados y, sobre todo, la IL-10 produce una inhibición dependiente de la dosis de la secreción de IL-6 inducida por \beta-amiloide en estas células y en la microglía murina (19).
Desde un punto de vista clínico, la IL-10 está implicada en enfermedades autoinmunes (41, 42, 26) y en malignidades (31, 27, 43) donde los mayores niveles de la citocina dependen de la base genética (59) pero también influyen en el resultado de las infecciones (34, 40, 37).
Es más consistente la evidencia de un papel de la IL-6 en la patogénesis de la AD. Se observó una inmunorreactividad elevada de IL-6 cerca de las placas amiloides en el cerebro de estos pacientes (67); la IL-6 induce la síntesis de la proteína precursora \beta-amiloide (69), y en modelos de ratones transgénicos, los niveles elevados en el SNC de IL-6 producen efectos neuropatogénicos y déficits cognitivos (51).
Se notificó que el alelo C de un VNTR en el gen de IL-6 reducía la actividad de la citocina (61), el alelo C del VNTR de la IL-6 se ha correlacionado con un retraso del inicio y una reducción del riesgo de AD en una población alemana (63). El polimorfismo funcional -178 de la región promotora también podría estar implicado en el desarrollo del fenotipo de AD debido a su asociación con las concentraciones plasmáticas de la citocina (54). Sin embargo, en dos series clínicas de diferente origen étnico los resultados fueron discutibles (49).
En la muestra de los presentes solicitantes, los datos del análisis de SNP demostraron que HC tenía una distribución de alelos de IL-10 e IL-6 similar a la de una población italiana (65). Es más importante el hecho de que los presentes resultados se dirijan a un porcentaje significativamente mayor de portadores de -1082A de IL-10 entre los casos de AD. Un informe reciente sobre italianos centenarios, que claramente son menos propensos que las personas más jóvenes a padecer enfermedades relacionadas con la edad, demostró que la extrema longevidad está asociada significativamente con los genotipos de alta producción de IL-10 (58).
Como se ha notificado previamente, los resultados sobre los SNP de IL-6 son más contradictorios. El alelo G de IL-6 parece significativo en la AD de los japoneses (66) y también de poblaciones del sur de Italia (64), mientras que en la muestra de los presentes solicitantes es el alelo C el que parece estar representado en exceso.
Para asociar estos descubrimientos diferentes tienen que considerarse varios puntos. La etnicidad puede influir fuertemente en el papel de factores de riesgo genético, y por lo tanto también lo puede hacer la distribución de variantes de genes en las poblaciones de diferentes países europeos, o incluso entre diferentes áreas del mismo país (53, 55, 60, 62, 70). Además, la asociación entre AD y SNP de IL-6 puede limitarse a edades particulares, y en las muestras de los presentes solicitantes todos los sujetos AD y HC eran de edad avanzada.
Finalmente, se debe considerar el papel desempeñado por un gen o por varios genes en el desequilibrio de ligamiento con esta mutación: en alemanes se ha descrito un fuerte desequilibrio entre SNP -174 y el polimorfismo VNTR de la región flanqueante 3' del gen de IL-6 (49).
El descubrimiento principal de este estudio fue la identificación de un grupo de sujetos con un alto riesgo de AD de inicio tardío debido a la presencia concomitante de los alelos -1082A de IL-10 y -174 C de e IL-6. También se exploraron las interacciones entre los genes de IL-10 o IL-6 y ApoE, pero no se encontró ninguna prueba de efectos sinérgicos, lo que sugiere que estos alelos relacionados con la inflamación son un factor de riesgo adicional e independiente para la AD.
Para arrojar más luz sobre los resultados genéticos, los inventores también analizaron la producción de IL-10 e IL-6 específica de péptido \beta-amiloide, LPS y Flu por células mononucleares de sangre periférica (PBMC) en una subserie de pacientes con AD y HC de edades equiparables. Los resultados demostraron que: 1) la producción de IL-6 por PBMC de los pacientes con AD y los controles no difería significativamente en ninguna condición; y 2) la generación de IL-10 por PBMC estimuladas por LPS y Flu era comparable en los dos grupos, mientras que en AD se detectó un deterioro inmune específico de \beta-amiloide caracterizado por una generación reducida de IL-10. El hecho de que este desequilibrio de citocinas no se observara en las PBMC estimuladas por mitógeno indica que las respuestas inmunes específicas de \beta-amiloide están alteradas selectivamente en AD. Además, el descubrimiento de que la proliferación estimulada por Flu era similar en pacientes y controles indica que el procesamiento y la presentación antigénica en asociación con las moléculas de HLA de clase II, y la ruta autorrestringida por CD4-HLA de clase II de activación del sistema inmune (44), no son defectuosos en los pacientes con AD. De esta manera, es concebible un escenario biológico en el que la reducción de la producción de IL-10 específica de amiloide favorece el desencadenamiento del proceso inflamatorio crónico observado en el cerebro con AD. En los individuos sin AD podría estar activo un circuito de retroalimentación inhibidora mediado por IL-10 y específico de amiloide, y una ruptura de este circuito podría estar asociada o ser predictiva del desarrollo de AD. Un estudio reciente demostró convincentemente que un circuito proinflamatorio/IL-10 que gira alrededor de las células del sistema inmune innato regula la susceptibilidad a enfermedades autoinmunes (48). Los resultados de los presentes solicitantes amplían este concepto demostrando que en pacientes con AD este circuito está alterado. Los datos en conjunto confirman la teoría de que el riesgo total de desarrollar AD puede estar gobernado por un "perfil de susceptibilidad" que refleja la influencia combinada de heredar múltiples alelos de alto riesgo, y arroja luz sobre el papel central de los SNP de la IL-10 y la IL-6 en
este perfil.
La inflamación está implicada en la patogénesis de la enfermedad de Alzheimer (AD), la citocina antiinflamatoria interleucina-10 (IL-10) podría contrarrestar la actividad de la IL-6 en el cerebro. Como el promotor de estos genes es polimórfico, los presentes solicitantes investigaron en los 65 pacientes con AD y los 65 controles sanos (HC) los alelos -1082 GA de IL-10 y -174 GC de IL-6. En varios casos, también evaluaron la producción de IL-10 e IL-6 por PBMC. En el caso de la IL-10 hubo un nivel significativamente mayor del genotipo -1082GG (p = 0,019) en HD en comparación con HC, mientras que en el caso de la IL-6 el genotipo G/G era menor y el alelo C mayor (p<0,005). La concomitancia de los alelos A de IL-10 y C de IL-6 elevó significativamente el riesgo de AD (razón de probabilidades: OR 11,2, intervalo de confianza: CI 1,3-97,3; p<0,05) independientemente de la ApoE 4 (OR ajustada 10,3, CI 1-108; p<0,05). Sólo la producción de IL-10 estimulada por amiloide difería en AD y HC (p = 0,023). Estos resultados son conflictivos con la teoría inflamatoria en AD, indicando un papel central de polimorfismos de IL-10 e IL-6 y una alternancia selectiva en esta red.
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Ejemplo 3 Análisis de genotipos sobre el interferón-\gamma y el TNF-\alpha
Los métodos descritos en los ejemplos anteriores se usaron para realizar análisis de genotipos sobre el interferón-\gamma y el TNF-\alpha en pacientes con Alzheimer y controles sanos. En las tablas VIII y IX se muestra un resumen de los resultados.
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TABLA VIII Distribución de genotipos de IFN-\gamma
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Las frecuencias de los diferentes genotipos entre pacientes con enfermedad de Alzheimer (AD) no fueron estadísticamente diferentes de las observadas en los controles sanos (HC).
\chi^{2} = 0,305, df = 2, p = 0,859.
Entre paréntesis, (c), se muestran los correspondientes fenotipos de producción elevada (H), intermedia (M) y baja (L).
Alelo:
\chi^{2} = 0,174, df = 1, p = 0,676.
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TABLA IX Distribución de genotipos de TNF-\alpha
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No hay diferencias estadísticamente significativas cuando se comparan los pacientes con Alzheimer y los controles, lo que indica que ni el interferón-\gamma ni el TNF-\alpha están asociados con la probabilidad de desarrollar la enfermedad de Alzheimer.
Por el contrario, la presente invención demuestra que la IL-10 y la IL-6 son altamente predictivas del desarrollo de Alzheimer y posiblemente también predicen la progresión de la enfermedad. El mejor valor predictivo se conseguirá combinando ensayos de genotipos para múltiples polimorfismos génicos, por ejemplo, IL-10, IL-6, ApoE y otros que según se ha demostrado están asociados con la enfermedad de Alzheimer.
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Claims (5)

1. Un método para determinar la existencia de una predisposición a la enfermedad de Alzheimer, comprendiendo el método analizar in vitro una muestra que lleva ADN tomada a partir de un sujeto animal para determinar las variantes alélicas presentes en uno o más de los loci de SNP en las posiciones -1082, -819 y -592 del gen que codifica IL-10.
2. Un método de acuerdo con la reivindicación 1, en el que se determina el genotipo en las tres posiciones -1082, -819 y -592.
3. Un método de acuerdo con la reivindicación 1 o la reivindicación 2, que comprende además analizar la muestra para determinar los alelos presentes para los genes que codifican IL-6 y ApoE.
4. Un método de acuerdo con la reivindicación 3, que comprende además analizar la muestra para determinar los alelos presentes para el gen que codifica IL-1.
5. Uso de los fragmentos de ADN o ADNc que codifican el gen de IL-10 y que comprenden los polimorfismos alélicos GCC/GCC, GCC/ACC, GCC/ATA, ACC/ACC, ACC/ATA y ATA/ATA en un método de exploración de compuestos con respecto a su capacidad de modular o prevenir la enfermedad de Alzheimer.
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