ES2332258B2 - Peptidos lineales antimicrobianos con aminoacidos de la serie d. - Google Patents

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Abstract

Péptidos lineales antimicrobianos con aminoácidos de la serie D.
La presente invención se refiere a nuevos péptidos lineales que presentan actividad antimicrobiana. Dichos péptidos están formados por 11 residuos de aminoácidos, y contienen al menos un aminoácido de la serie D. La invención describe la síntesis y la utilización de los mencionados péptidos como agentes antimicrobianos frente a bacterias patógenas de vegetales y/o humanos y/o animales. También se refiere a composiciones que comprenden una cantidad efectiva de dichos péptidos y al menos un agente auxiliar, y al uso de dichas composiciones para tratar enfermedades infecciosas en plantas, humanos y animales causadas por bacterias patógenas.

Description

Péptidos lineales antimicrobianos con aminoácidos de la serie D.
Campo de la técnica
La presente invención se refiere a péptidos lineales que incluyen al menos un aminoácido de la serie D, que presentan propiedades antimicrobianas, y que son particularmente eficaces frente a microorganismos patógenos de plantas y/o humanos y/o animales.
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Estado de la técnica anterior
Las enfermedades de origen microbiano continúan siendo responsables de pérdidas de gran importancia económica en los procesos productivos y en la salud humana y/o animal. Las bacterias fitopatógenas son responsables de pérdidas de gran importancia económica en agricultura. Entre ellas se destacan, por ejemplo, las bacteriosis causadas por las bacterias Erwinia amylovora, Pseudomonas syringae, y Xanthomonas vesicatoria.
Por otra parte, un gran número de bacterias son responsables de enfermedades infecciosas en humanos y animales. Entre ellas se destacan, por ejemplo, las causadas por las bacterias Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Salmonella typhimurium, y Listeria monocytogenes.
El uso de antibióticos, tanto en protección vegetal, como en clínica o veterinaria, está limitado por la aparición de cepas resistentes de los patógenos causantes de enfermedades. Por ello, es necesario el desarrollo de nuevos antimicrobianos que puedan evitar la resistencia en las bacterias. Además, para su uso en agricultura deben ser poco persistentes en el medio ambiente.
En los ultimas años se ha intensificado la investigación sobre la aplicación de péptidos antimicrobianos naturales, presentes en plantas y animales, como alternativa a los antibióticos convencionales.
Por ejemplo, la cecropina A es un péptido lineal formado por 37 aminoácidos que se encuentra en la hemolinfa de la mariposa Hyalophora cecropia. Dicho péptido presenta una potente actividad lítica contra bacterias Gram-positivas y Gram-negativas.
Se ha observado que los péptidos de origen natural habitualmente tienen secuencias largas de aminoácidos, presentan una baja biodisponibilidad, y son susceptibles a la degradación por proteasas o son tóxicos. Por lodo ello, juntamente con el elevado coste de producción debido a su longitud considerable, existen dificultades para su empleo en protección vegetal, clínica, o veterinaria.
Se ha descrito la preparación de péptidos con secuencias más cortas, que contienen la combinación de fragmentos de péptidos de origen natural. También se han desarrollado nuevos agentes antimicrobianos por introducción de modificaciones en péptidos de origen natural o derivados de ellos.
Por ejemplo, en Ali et al., Mol. Plant-Microbe Interact., 2000, 13, 847-859 se describe un undecapéptido formado por fragmentos de los péptidos de origen natural cecropina A y melitina, que es activo frente a algunas bacterias patógenas de las plantas como son Erwinia carotovora subsp. carotovora, y Erwinia carotovora subsp. atroseptica.
Por ejemplo en el articulo de Badosa et al., A library of linear undeca-peptides with antibacterial activity against phytopathogenic bacteria, Peptides, 2007, 28, 2276-2285, se describen undecapéptidos con propiedades antimicrobianas frente a las bacterias fitopatógenas E. amylovora, X. vesicatoria, y P. syringae.
Por ejemplo en el articulo de Friedrich et al, Antibacterial Action of Structurally Diverse Cationic Peptides on Gram-Positive Bacteria. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 2000, 44: 2086-2092, se describen péptidos de 12 a 26 aminoácidos con propiedades antimicrobianas frente a bacterias patógenas de humanos y animales como Staphylococcus aureus, Listeria monocytogenes o Streptococcus pyogenes.
A pesar de dichos desarrollos, subsiste la necesidad de disponer de nuevos compuestos antimicrobianos que sean activos frente a bacterias patógenas, y que además posean características adicionales apropiadas, como por ejemplo espectro de acción amplio, toxicidad baja y estabilidad frente a proteasas.
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Objeto de la invención
El objeto de la presente invención es proporcionar péptidos lineales que presentan propiedades antimicrobianas.
También forma parte del objeto de la invención dichos péptidos para uso como medicamento.
Forma también parte del objeto de la invención la utilización de dichos péptidos como agentes antimicrobianos.
También forma parte del objeto de la invención la utilización de dichos péptidos para la preparación de una composición antimicrobiana.
También es objeto de la invención una composición antimicrobiana que comprende los péptidos de la invención y un agente auxiliar.
Forma parte también del objeto de la invención un método para prevenir yin tratar enfermedades infecciosas en plantas causadas por bacterias.
También forma parte del objeta de la invención la utilización de dichos péptidos para preparar un medicamento para tratar enfermedades infecciosas en humanos y animales causadas por bacterias.
Descripción de la invención
Los autores de la presente invención han desarrollado nuevos péptidos que resultan de fácil preparación y que presentan una elevada eficacia para inhibir el crecimiento de bacterias patógenas tanto para plantas como para humanos o animales. Además dichos péptidos presentan grados variables de estabilidad frente a proteasas y de toxicidad.
Péptidos
El objeto de la presente invención es proporcionar péptidos lineales que responden a la fórmula (I):
(I)KKLFKKILKYL
en donde al menos uno de los aminoácidos es de la serie D, y en donde el aminoácido leucina del extremo C-terminal está en forma de grupo carboxilo o carboxamida.
En una realización preferida, los péptidos de la invención tienen el aminoácido leucina del extremo C-terminal en forma de carboxamida, y se pueden representar mediante la fórmula:
(I)KKLFKKILKYL-NH_{2}
en donde al menos uno de los restos de aminoácidos es de la serie D.
En la fórmula (I) los aminoácidos se representan mediante una única letra de acuerdo con la Comisión para la Nomenclatura Bioquímica de la IUPAC-IUB, según se describe en el libro Biochemical Nomenclature and Related Documents, 2nd edition, Portland Press, 1992, Londres [ISBN 1-85578-005-4] y que es bien conocida por el experto en la materia.
Según dicha nomenclatura, la letra K representa el aminoácido L-lisina, la letra L el aminoácido L-leucina, la letra I el aminoácido L-isoleucina, la letra Y el aminoácido L-tirosina y la letra F el aminoácido L-fenilalanina.
En esta descripción, los aminoácidos de la serie D se representan en letra minúscula, negrita y subrayada: la letra k representa el aminoácido D-lisina, la letra I el aminoácido D-leucina, la letra i el aminoácido D-isoleucina, la letra y el aminoácido D-tirosina y la letra f el aminoácido D-fenilalanina.
Siguiendo la nomenclatura de la IUPAC, los péptidos de esta descripción se representan con el extremo N-terminal en la parte izquierda de la fórmula y con el extremo C-terminal en la parte derecha de la misma.
Entre los péptidos de la invención resultan preferidos aquéllos definidos por la fórmula (I) que incluyen un residuo de aminoácido de la serie D en cualquiera de las posiciones 1 a 8.
De acuerdo con la nomenclatura de la IUPAC, la numeración de las posiciones de los aminoácidos se inicia en el extremo N-terminal, tal como se puede ver a continuación:
K^{1}K^{2}L^{3}F^{4}K^{5}K^{6}I^{7}L^{8}K^{9}Y^{10}L^{11}
\newpage
Resultan especialmente preferidos los péptidos seleccionados entre el grupo formado por los péptidos que Figuran en la Tabla 1;
TABLA 1
1
Más especialmente preferido es el péptido definido por la fórmula KKL f KKILKYL (SEQ_ID_NO: 6, BP143).
También resultan preferidos aquéllos definidos por la fórmula (I) que incluyen entre cinco y once aminoácidos de la serie D consecutivos.
Dichos aminoácidos de la serie D pueden estar colocados en cualquier posición en la secuencia de aminoácidos. Por ejemplo pueden estar colocados consecutivos, o alternados, o siguiendo ningún orden particular.
Resultan especialmente preferidos los péptidos seleccionados entre el grupo formado por los péptidos que figuran en la Tabla II:
TABLA II
2
Aún más especialmente preferidos resultan los péptidos seleccionados entre el grupo formado por los péptidos definidos por las fórmulas kklfkkilkyl (SEQ_ID_NO: 16, BP153) y KKLF kkilkyl (SEQ_ID_NO: 21, BP158).
También resultan preferidos aquellos péptidos definidos por la fórmula (I) que incluyen dos o tres aminoácidos de la serie D.
Resultan especialmente preferidos los péptidos seleccionados entre el grupo formado por los péptidos que figuran en la Tabla III:
TABLA III
3
Aún más especialmente preferidos resultan los péptidos seleccionados entre el grupo formado por los péptidos definidos por las fórmulas KKLFKKI Ik YL (SEQ_ID_NO: 13, BP150) y KK I FK k IL k YL (SEQ_ID NO: 14, BP151).
Como ya se ha indicado anteriormente resultan preferidos aquellos péptidos que tienen un grupo carboxamido en el grupo C-terminal.
Los péptidos descritos en la invención están formados por 11 aminoácidos que los hace apropiados para ser preparados empleando los procedimientos habituales de síntesis de péptidos en fase sólida, como por ejemplo los descritos por R.B. Merrifield, J. Am. Chem. Soc., 1963, 85: 2149-2154.
Entre ellos se puede mencionar el que emplea como soporte sólido la resina 4-metilbencidrilamina (MBHA) funcionalizada con grupos amino. Sobre dicho soporte sólido se llevan a cabo las reacciones sucesivas de acoplamiento entre los diferentes aminoácidos que integran el péptido.
Dicho procedimiento es bien conocido por el experto en la materia y se encuentra descrito, por ejemplo, en S.A. Kates, F. Albericio Eds., Solid-Phase Synthesis. A practical guide, Marcel Dekker, New York, 2000 [ISBN: 0-8247-0359-6], o en K. Burguess Eds., Solid-Phase Organic Synthesis, Wiley. John & Sons. New York, 1999 [ISBN: 0471318256].
Cuando se emplea la resina MBHA como soporte sólido, habitualmente se incorpora a dicha resina un espaciador bifuncional sensible al medio ácido, que permite el desanclaje en condiciones suaves del péptido una vez sintetizada.
Por ejemplo un espaciador bifuncional apropiado es el Fmoc-Rink-Linker (número CAS: 145469-56-3) comercializado por la empresa Iris Biotech (Alemania).
Dicho espaciador, una vez se ha unido a través de su grupo carboxílico al grupo amino de la resina MBHA, y se ha eliminado el grupo protector Fmoc, presenta un grupo amino libre que permite el anclaje de un aminoácido que tenga un grupo carboxílico libre.
En el mercado se puede adquirir la resina Fmoc-Rink-MBHA en la empresa Iris Biotech, que ya tiene incorporado el espaciador mencionado.
También se puede emplear el ácido 4-hidroximetilfenoxiacético (HMPA) como espaciador unido a una resina, comercializado por ejemplo por la compañía Novabiochern.
Un procedimiento para la preparación de los péptidos de la invención puede ser por ejemplo el que se describe a continuación.
En dicho procedimiento se utiliza la química del grupo Fmoc (9-fluorenilmetoxicarbonilo) como protector del grupo \alpha-amino de los aminoácidos que se emplean para preparar los péptidos de la invención.
Para la protección de la cadena lateral de la lisina (Lys) se ha empleado el grupo terc-butiloxicarbonilo (Boc). Para la protección de la cadena lateral de la tirosina (Tyr) se ha empleado el grupo terc-butilo (t-Bu).
En la primera etapa se procede a la eliminación del grupo protector Fmoc, presente en el grupo amino del espaciador bifuncional. A continuación se procede al anclaje del aminoácido leucina, que también tiene el grupo \alpha-amino protegido por el grupo Fmoc.
Antes de proceder al nuevo acoplamiento se elimina el grupo protector Fmoc de la leucina anclada en la resina.
El ciclo de acoplamiento-desprotección se repite hasta completar la estructura del péptido.
La incorporación de los dos últimos aminoácidos del péptido se realiza habitualmente mediante 2 o 3 acoplamientos sucesivos con el fin de completar la reacción de acoplamiento del aminoácido con el péptido anclado en la resina.
La escisión del péptido del soporte sólido se realiza en condiciones ácidas, al mismo tiempo que se eliminan los grupos protectores de las cadenas laterales de los aminoácidos que forman el péptido.
El empleo del Fmoc-Rink-Linker (número CAS: 145469-56-3) comercializado por la empresa Iris Biotech (Alemania) en la síntesis de las péptidos conduce a la formación de un grupo carboxamido en el extremo C-terminal de los péptidos.
Al emplear como espaciador el HMPA, la escisión del péptido de la resina conduce a obtener el extremo C-terminal en forma de grupo carboxílico. Se ha observado que los péptidos que tienen un grupo carboxílico en el extremo C-terminal en lugar de un grupo carboxamido también presentan actividad antimicrobiana.
Tras un proceso convencional de aislamiento, los péptidos de la invención se obtienen con una buena pureza, habitualmente superior al 80%, determinada por HPLC, en forma de sólidos pulverulentos, y se pueden caracterizar por espectrometría de masas (ESI-MS).
Sorprendentemente se ha comprobado que los péptidos de la invención presentan una actividad antimicrobiana frente a bacterias patógenas de plantas y/o humanos y/o animales, que es particularmente efectiva frente a bacterias patógenas de las plantas como son las bacterias Erwinia amylovora, Xanthomonas vesicatoria, y Pseudomonas syringae, y que además es posible modular la citotoxicidad frente a células eucariotas y la estabilidad frente a proteasas.
Forma parte del objeto de la invención los péptidos de la invención para uso como medicamento.
Forma parte del objeto de la invención la utilización de los péptidos de la invención coma agentes antimicrobianos.
También forma parte del objeto de la invención la utilización de los péptidos de la invención para la preparación de una composición antimicrobiana.
Forma parte también del objeto de la invención la utilización de los péptidos de la invención para preparar un medicamento para tratar enfermedades infecciosas en animales y humanos.
Los péptidos de la invención presentan diferentes grados de citotoxicidad y diferentes grados de estabilidad a la degradación enzimálica, de modo que se pueden combinar varios de los péptidos de la invención en una composición antimicrobiana para modular la citotoxicidad y la degradación frente a proteasas.
Preferiblemente los péptidos de la invención se utilizan como agentes antimicrobianos frente a bacterias patógenas de las plantas.
Preferiblemente las bacterias fitopatógenas se seleccionan entre el grupo formado por Erwinia amylovora, Xanthomonas vesicatoria, y Pseudomonas syringae.
Entre los péptidos de la invención que resultan ser preferidos para ser utilizados como agentes antimicrobianos frente a bacterias patógenas de las plantas, se encuentran los péptidos preferidos indicados anteriormente en este mismo apartado.
Las bacterias mencionadas resultan ser indicadores apropiados para determinar la actividad antimicrobiana de compuestos que son susceptibles de ser empleados para combatir infecciones y enfermedades causadas por bacterias en plantas.
Erwinia amylovora es una bacteria Gram-negativa que causa la enfermedad conocida como fuego bacteriano que afecta a las plantas de la familia de las rosáceas, entre las que se encuentran árboles frutales de gran importancia económica como son el manzano y el peral, y plantas ornamentales como el serbal, el espino de fuego, y el mostajo. En Europa está catalogada como una bacteria de cuarentena en agricultura. El fuego bacteriano puede afectar a prácticamente todos los órganos de la planta y con frecuencia implica la muerte de los árboles o arbustos enfermos. Actualmente no hay métodos efectivos para el control del fuego bacteriano y es necesario combinar distintas medidas encaminadas a eliminar o reducir el inóculo.
Xanthomonas vesicatoria es una bacteria Gram-negativa que provoca la enfermedad denominada mancha bacteriana en plantas de la familia de las solanáceas que tienen una gran importancia económica como son el tomate y el pimiento. Esta enfermedad afecta a hojas, tallos y frutos provocando su marchitez o muerte.
Pseudomonas syringae es una bacteria Gram-negativa que causa un gran numero de enfermedades denominadas necrosis bacterianas en plantas de cultivos hortícolas y leñosos como frutales. La patogenicidad de P. syringae reside en muchos casas en su actividad nucleadora del hielo (INA+) que potencia los daños por helada. y la producción de diversas fitotoxinas como las siringomicinas.
Preferiblemente las plantas que se pueden tratar con los péptidos de la invención se seleccionan entre el grupo formado por árboles frutales, plantas hortícolas, y plantas ornamentales.
Entre los árboles frutales se pueden mencionar los de pepita (manzano, peral), y hueso (melocotonero, albaricoquero, ciruelo, cerezo) y el platanero.
Entre las plantas hortícolas se encuentran las solanáceas (tomate, pimiento, patata) y cucurbitáceas (melón, sandía).
Ejemplos de plantas ornamentales son serbal, clavel, espino albar y mostajo.
Los péptidos de la invención también se pueden emplear coma agentes antimierobianos frente a bacterias patógenas de humanos y animales.
Escherichia coli y Salmonella sp. son enterobacterias Gram-negativas, que ocasionan típicamente toxiinfeciones alimentarias y causan gastroenteritis, que se combaten con diversos antibióticos y tienen una gran incidencia en la alimentación humana y animal.
Listeria monocytogenes es una bacteria Gram-positiva que produce infecciones en diversos órganos en peces, aves y mamíferos. En humanos afecta a profesionales que trabajan con animales y también se transmite por alimentos, sobre todo leche, derivados lácteos, productos cárnicos crudos o fermentados, y productos vegetales frescos. Se combate con diversos antibióticos.
Starphylococcus aureus es una bacteria Gram-positiva que vive en la superficie de la piel de animales, en especial mamíferos, y causa infecciones tanto en la piel como en mucosas y otros órganos, que se tratan con diversos antibióticos, aunque es frecuentemente resistente a antibióticos convencionales, siendo diversas cepas multiresistentes responsables de infecciones nosocomiales. Producen diversas toxinas muy activas en mamíferos.
Con los péptidos de la invención se pueden tratar tanto los animales o humanos, como los alimentos o materiales destinados a estar en contacto con éstos.
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Composiciones antimicrobianas
También forma parte del objeto de la invención una composición antimicrobiana que comprende
a)
una cantidad efectiva de al menos un péptido lineal de la invención, y
b)
un agente auxiliar.
El péptido lineal de la invención responde a la fórmula (I):
(I)KKLFKKILKYL
en donde al menos uno de los aminoácidos es de la serie D.
Entre los péptidos de la invención que resultan ser preferidos para formar parte de dichas composiciones antimicrobianas, se encuentran los péptidos mencionados coma preferidas en el apartado anterior denominado Péptidos.
Las composiciones antimicrobianas de la invención presentan buenas propiedades antimicrobianas frente a bacterias patógenas de las plantas y/o de los humanos y/o de los animales. Preferiblemente las composiciones antimicrobianas de la invención son composiciones fitosanitarias que se emplean frente a bacterias patógenas de plantas.
Habitualmente, en las composiciones antimicrobianas se combinan varios principios activos para obtener una mayor eficacia o un espectro más amplio de actuación. En este caso, las composiciones antimicrobianas de la invención también pueden comprender la combinación de varios péptidos de la invención o bien la combinación de éstos con otros agentes antibacterianos para conseguir una mayor eficacia antimicrobiana.
En el caso de composiciones fitosanitarias los péptidos de la invención también se pueden combinar con agentes antifúngicos, y así desplegar una acción antimicrobiana más amplia.
La cantidad de péptido que forma parte de la composición fitosanitaria puede ser variable en función de factores tales como el tipo de planta, la concentración de las bacterias patógenas en la planta, la extensión de la enfermedad, etc. La concentración efectiva del péptido se puede determinar y ajustar fácilmente mediante métodos de rutina bien conocidos por el experto en la materia. Habitualmente la concentración efectiva del péptido se encuentra comprendida entre 0.01 y 0,5 g/l, preferiblemente entre 0,02 y 0,3 g/l, y aún más preferiblemente entre 0.05 y
0,2 g/l.
El agente auxiliar que acompaña los péptidos de la invención en dichas composiciones antimicrobianas puede tener varias funciones, como por ejemplo, facilitar la dosificación del péptido, proporcionar un producto fácilmente manipulable, mejorar el mojado de las plantas con la composición antimicrobiana.
Dicho agente auxiliar puede ser seleccionado entre el grupo formado por disolventes, diluyentes, cargas inertes, agentes tensioactivos humectantes, agentes tamponantes, agentes dispersantes, agentes antiapelmazantes, lubricantes, filtros de la radiación ultravioleta, y/o mezclas de los mismos.
Preferiblemente el agente auxiliar se selecciona entre el grupo formado por disolventes, tensioactivos, agentes tamponantes, filtros de la radiación ultravioleta y/o sus mezclas.
Más preferiblemente el disolvente es agua.
Las composiciones fitosanitarias pueden presentarse en forma líquida o en forma sólida. Por ejemplo, en el caso de formulaciones líquidas, la composición de la invención puede presentarse en forma de una composición diluida lista para ser empleada, o bien en forma de una composición concentrada, que requiere su dilución antes de ser usada, habitualmente con agua.
En el caso de composiciones fitosanitarias líquidas acuosas, la presencia de agentes tensioactivos humectantes facilita el mojado de las plantas cuando se pulverizan con dicha composición.
Una ventaja de los péptidos de la invención es que se pueden disolver en agua con facilidad, y se pueden formular generalmente como disoluciones acuosas sin necesidad de emplear disolventes orgánicos adicionales.
Las composiciones fitosanitarias en forma sólida pueden ser en forma de gránulos, o polvos, en las que los péptidos de la invención se mezclan con cargas inertes finamente divididas como, por ejemplo, caolín, tierra de diatomeas, dolomita, carbonato cálcico, o talco. También pueden presentarse en forma de polvos o gránulos dispersables, que comprenden un agente humectante para facilitar la dispersión de los mismos en el líquido.
Las composiciones antimicrobianas de la invención también se pueden emplear como composiciones farmacéuticas para hacer frente a bacterias patógenas en humanos y en animales.
Dichas composiciones farmacéuticas se pueden formular en formas sólidas tales como granulados, tabletas, cápsulas, grageas y supositorios, en formas semisólidas tales como pomadas, o geles, o en formas líquidas tales como disoluciones inyectables, emulsiones o suspensiones.
Dependiendo de la formulación se pueden utilizar excipientes apropiados bien conocidos por el experto en la materia, como los que se describen en el libro de R.C. Rowe y col. "Handbook of Pharmaceutical Excipients", 4ª edición. Pharmaceutical Press, Londres, 2003 [ISBN: 0-85359-472-9].
Las composiciones farmacéuticas de acuerdo con la invención se pueden administrar por las vías oral, parenteral o rectal, o se pueden utilizar por vía tópica.
Las composiciones útiles por vía oral son, por ejemplo, los granulados, los comprimidos, las cápsulas o las grageas. Son composiciones útiles por vía parenteral, por ejemplo, las emulsiones acuosas, las suspensiones o las disoluciones. Se pueden aplicar por vía tópica las pomadas, las emulsiones y suspensiones acuosas u oleosas así como los pulverizadores.
También forma parte del objeto de la invención un método para prevenir y/o tratar infecciones y enfermedades en plantas causadas por bacterias que comprende poner en contacto la planta con una composición antimicrobiana que incluye los péptidos de la invención.
\newpage
En el método de la invención la composición antimicrobiana se puede aplicar de forma preventiva a las plantas para evitar la aparición de enfermedades infecciosas causadas por bacterias. El tratamiento preventivo tiene su base en que los péptidos de la invención inhiben el crecimiento de bacterias patógenas de las plantas.
Entre los péptidos de la invención que resultan ser preferidos para formar parte de dichas composiciones antimicrobianas, se encuentran los péptidos mencionados como preferidos en el apartado anterior denominado Péptidos.
En el método de la invención, la composición antimicrobiana también se puede emplear para tratar enfermedades infecciosas una vez se ha detectado su presencia en las plantas, ya que los péptidos de la invención inhiben el crecimiento de las bacterias causantes de dichas enfermedades infecciosas.
En esta descripción la expresión "enfermedad infecciosa" se refiere a la invasión y destrucción de un órgano, por ejemplo, hojas, flores, o frutos, por parte de los microorganismos patógenos. Por tanto, se trata de un proceso localizado. En cambio, el término enfermedad se refiere a un proceso que afecta a la planta, dando lugar a linos determinados síntomas.
Preferiblemente el método de la invención se emplea para tratar enfermedades infecciosas provocadas por bacterias patógenas de las plantas seleccionadas entre el grupo formado por Erwinia amylovora, Xanthomonas vesicatoria, y Pseudomonas syringae.
Preferiblemente las plantas que se pueden tratar con los péptidos de la invención se seleccionan entre el grupo formado por árboles frutales, plantas hortícolas, y plantas ornamentales.
En el método de la invención, la composición se puede poner en contacto con las partes de las plantas seleccionadas entre el grupo formado por semillas, raíces, tallos, hojas, o frutos, o con el suelo o cualquier medio de crecimiento que rodee las raíces de las plantas.
En el método de la invención, la composición antimicrobiana se puede poner en contacto con la planta por cualquier técnica convencional, entre las que destacan, la pulverización, la inmersión o el riego.
Por ejemplo se puede preparar una disolución acuosa de los péptidos de la invención y proceder a la pulverización de las partes de las plantas afectadas o susceptibles de ser afectadas. Si se trata de los Frutos de un árbol frutal, por ejemplo, también se puede realizar el tratamiento de los mismos por pulverización o por inmersión antes de su cosecha o en post-cosecha.
El tratamiento de las raíces puede llevarse a cabo por ejemplo empleando una composición sólida en la que los péptidos se encuentran dispersos en tina carga inerte, o por pulverización con la mencionada disolución acuosa, o mediante su aplicación por riego.
También forma parte del objeto de la invención un método para tratar enfermedades infecciosas en animales y humanos causadas por bacterias que comprende la administración de una cantidad terapéuticamente efectiva de una composición de la invención.
Preferiblemente el método de la invención se emplea para tratar enfermedades infecciosas provocadas por bacterias patógenas de las animales y humanos seleccionadas entre el grupo formado par Escherichia coli, Slaphylococcus aureus, Salmonella typhimurin, y Listeria monocytogenes.
La composición antimicrobiana se puede aplicar para tratar infecciones y enfermedades causadas por bacterias, ya que dichos péptidos inhiben el crecimiento de bacterias patógenas de animales y humanos.
En el método de la invención, la composición antimicrobiana también se puede emplear para tratar dichas enfermedades una vez se ha detectado su presencia, ya que los péptidos de la invención inhiben el crecimiento de las bacterias causantes de dichas infecciones y enfermedades.
En esta descripción la expresión "enfermedad infecciosa" se refiere a la invasión y destrucción de un órgano, por ejemplo, piel, pulmones, sistema gastrointestinal, genitourinario, etc., por parte de los microorganismos patógenos.
En el método de la invención, la composición conteniendo una disolución acuosa de los péptidos de la invención se puede administrar por vía oral o por vía parenteral.
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Ensayos biológicos
La actividad antimicrobiana de los péptidos de la invención frente a bacterias patógenas para plantas se ha evaluado mediante la determinación de la concentración mínima de péptido necesaria para inhibir el crecimiento de los microorganismos. Habitualmente dicha concentración se denomina concentración mínima inhibitoria (CMI).
\newpage
Este tipo de ensayos es habitual en microbiología y es bien conocido por el experto en la materia. Una descripción de la metodología empleada se encuentra por ejemplo en VI.J. Pelezar Jr, E.C.S. Chan. N.R. Krieg. Microbiology: Concepts and Applications. New York: McGraw-Hill, 1997.
Para evaluar dicho efecto antimicrobiano de los péptidos de la invención se emplearon las siguientes cepas de bacterias patógenas: Erwinia amylovora PMV6076 (INRA, Angers, Francia), Xanthomonas vesicatoria 2133-2 (IVIA, Valencia, España), Pseudomonas syringae pv. syringae EPS94 (INTEA, Universitat de Girona, España), Escherichia coli ATCC11775 (American Type Culture Colection), Listeria monocytogenes ATCC 15313, Sthaphylococcus aureus ATCC 9144, y Salmonella typhimurium LT2 ATCC 15277.
Se ha comprobado que las composiciones que comprenden los péptidos de la invención disueltos en agua a concentraciones comprendidas entre 0,8 y 7,5 \muM son efectivas para inhibir el crecimiento de bacterias como Erwinia amylovora, Xanthomonas vesicatoria, y/o Pseudomonas syringae.
Estos resultados demuestran la eficacia de la actividad antimicrobiana de los péptidos de la invención, ya que en Avrahami et al. Biochemistry, 2001, 40, 12591-12603, se describe que una concentración inhibitoria mínima inferior a 50 \muM es considerada coma significativa.
Los péptidos de la invención presentan una actividad antimicrobiana igual o superior a la del péptido descrito en el articulo de Badosa et al., y además se puede modular su citotoxicidad frente a células eucariotas y su estabilidad frente a proteasas.
Entre los péptidos de la invención se encuentran péptidos activos preferentemente frente a patógenos de plantas como por ejemplo: BP141, BP142, BP144: y también de amplio espectro como por ejemplo: BP147, BP153, BP154, BP160, BP161.
La actividad hemolítica de los péptidos es un indicador de la toxicidad en células eucariotas, y una característica que generalmente se determina para aquellos compuestos que pueden llegar a entrar en contacto con el cuerpo humano. Este seria el caso si frutas u hortalizas tratadas con los péptidos de la invención contuvieran restos de los mismos y fuesen consumidos por las personas, o al ser manipulados por operarios durante su aplicación o preparación.
La mencionada actividad hemolítica se ha evaluado mediante la determinación de la liberación de hemoglobina que se produce al poner en contacto una solución de dichos péptidos en tampón de TRIS con suspensiones de eritrocitos al 5% en volumen/volumen procedentes de sangre humana fresca. El resultado de dicha determinación se expresa como el porcentaje de hemólisis que se produce para una concentración conocida de péptido. Una descripción de la metodología empleada para la determinación de la actividad hemolítica se encuentra en Oren et al. Biochemistry. 2000, 39, 6103-6114, yen Raguse et al, J. Am. Chem. Soc., 2002, 124, 12774-12785.
Se ha comprobado que la gran mayoría de los péptidos de la invención presentan una actividad hemolítica significativa a una concentración que puede llegar a ser varios órdenes de magnitud superior a la concentración a la que son activos para inhibir el crecimiento de bacterias patógenas.
La estabilidad de los péptidos a la degradación por proteasas es una característica que permite evaluar que los péptidos se encuentren inalterados en la planta o en el cuerpo humano o en el cuerpo de los animales durante un tiempo de vida medio razonable. Los péptidos pueden ser degradados tanto por proteasas como por microorganismos.
La estabilidad de los péptidos a la degradación por proteasas se ha evaluado mediante el tratamiento de soluciones de los péptidos en tampón TRIS con Proteinasa K (Sigma-Aldrich), y la monitorización de su degradación por HPLC a diferentes intervalos de tiempo. La degradación se expresa como el porcentaje de péptido degradado después de 45 minutos calculados a partir de la disminución del área del pico del péptido nativo por HPLC. Una descripción de la metodología empleada para la determinación de la estabilidad a proteasas se encuentra en Rozek et al, Biochemistry, 2003, 42, 14130-14138.
Se ha comprobado que algunos péptidos de la invención son mucho más estables a la degradación por proteasas que el péptido descrito por Badosa et al.
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En la Tabla IV se presentan la citotoxicidad (H_{250}, hemólisis a 250 \muM) y la degradación frente a proteasas a los 45 minutos de algunos de los péptidos de la invención para poner de manifiesto que es posible modular dichas propiedades con dichos péptidos solos o en combinación:
TABLA IV
5
Se puede observar que la actividad hemolítica no está directamente relacionada con el número de aminoácidos de la serie D que figuran en un determinado péptido.
Así, se pueden encontrar péptidos con una baja actividad hemolítica que tienen o bien un único aminoácido de la serie D (BP142) o bien varios (BP151). Análogamente, se pueden encontrar péptidos con una actividad hemolítica considerable que tienen e bien un único aminoácido de la serie D (BP147) o bien varios (BP161).
También se puede observar que la degradación frente a proteasas tampoco está relacionada con el número de aminoácidos de la serie D que figuran en un determinado péptido.
De esta forma se pueden encontrar péptidos con una baja degradación que tienen o bien un único aminoácido de la serie D (BP141) o bien varios (BP161). Análogamente, se pueden encontrar péptidos que sufren una degradación considerable que tienen o bien un único aminoácido de la serie D (BP145) o bien varios (BP154).
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Así pues, con los péptidos antimicrobianos de la invención se dispone de compuestos antimicrobianos frente a bacterias patógenas de plantas y/o humanos y/o animales, cuya citotoxicidad frente a células eucariotas y degradación frente a las proteasas se puede modular tal como se muestra en la Tabla V:
TABLA V
7
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A continuación, a los efectos de completar de forma suficiente la anterior descripción, se exponen los siguientes ejemplos.
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Ejemplos
En los ejemplos que siguen se emplean las siguientes abreviaciones: BHI, Brain Heart infusion; Boc: terc-butiloxi-
carbonilo; t-Bu: terc-butilo; CMI: concentración mínima inhibitoria; DIEA: N,N-diisopropiletilamina; DMF: N,N-dimetilformamida; EDTA, ácido etilendiaminotetracético; ESI-MS: espectrometría de masas con ionización por electropulverización: Fmoc: 9-fluorenilmetoxicarbonilo; HBTU: hexafluorofosfato de N-óxido de N-[(1H-benzotriazol-1-il)(dimetilamino)metilen]-N-metilmetanaminio; HOBt: 1-hidroxibenzotriazol; HPLC: cromatografía líquida de alta resolución: LB: Luria Bertani: MBHA: 4-metilbencidrilamina; NMP: N-metilpirrolidona: TFA: ácido trifluoroacético; TIS: triisopropilsilano; TRIS: tris(hidroximetil)aminometano; TSB: Trypticase Soy Broth: VV: ultravioleta.
Los productos Fmoc-Lys(Boc)-OH, Fmoc-Phe-OH, Fmoc-Leu-OH, Fmoc-Ile-OH, Fmoc-Tyr(tBu)-OH, Fmoc-D-Lys(Boe)-OH, Fmoc-D-Phe-OH, Fmoc-D-Leu-OH, Fmoc-D-Ile-OH, Fmoc-D-Tyr(tBu)-OH, la resina Fmoc-Rink-MBHA funcionalizada con grupos amino, HOBt y HBTU, se obtuvieron de Iris Biotech. Los productos ácido trifluoroacético, N-metilpirrolidona, y TIS se obtuvieron de Aldrich. Los productos piperidina y DIEA se obtuvieron de Fluka.
Las siguientes indicaciones sabre el procedimiento para la preparación de los péptidos son de carácter general:
-
Se emplearon aminoácidos que tienen el grupo \alpha-amino protegido con el grupo Fmoc.
-
Para la protección de la cadena lateral de la lisina se empleó el grupo terc-butiloxicarbonilo (Boc). Para la protección de la cadena lateral de la tirosina se empleó el grupo terc-butilo (t-Bu).
-
Las reacciones se llevaron a cabo en jeringas de 2 ml que tenían incorporado un Filtro microporoso de polipropileno.
-
Todas las transformaciones y lavados se llevaron a cabo a 25ºC, a no ser que se indique lo contrario.
-
El análisis por HPLC se llevó a cabo con un flujo de 1.0 ml/min empleando una columna de fase reversa Kromasil (4.6 \times 40 mm: tamaño de partículas de 3,5 \mum). Se emplearon gradientes lineales con TFA acuoso al 0.1% y TFA en acetonitrilo al 0,1%, con una relación comprendida entre 0.98:0,02 y 0.98:0.1 durante un periodo de tiempo de 7 minutos con detección UV a una longitud de onda de 220 nm.
-
Los espectros ESI-MS fueron adquiridos empleando un instrumento Esquire 6000 ESI ion Trap LC/MS (Bruker Daltonics), operando en el modo positivo de iones (ES+).
-
Todas las relaciones entre los disolventes son volumen/volumen, a no ser que se especifique otro tipo de proporción.
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Ejemplo I
Preparación de Lys-Lys-Leu-D-Phe-Lys-Lys-Ile-Leu-Lys-Tyr-Leu-NH_{2} (KKLfKKILKYL-NH_{2} SEQ ID NO: 6, BP143)
En una jeringa de 2 ml de capacidad, equipada con un filtro microporoso en la parte inferior, se colocaron 30 mg de resina Fmoc-Rink-MBHA con una funcionalización de 0.66 mmol/g, equivalentes a 19,8 \mumoles de grupos amino, y se llenó la jeringa con disolvente para hinchar-lavar la resina de acuerdo con la siguiente secuencia: CH_{2}Cl_{2} (1 \times 20 min) y DMF (1 \times 20 min). La expresión CH_{2}Cl_{2} (1 \times 20 min) se refiere a que se realizó 1 lavado de 20 minutos con cloruro de metileno. Después de cada etapa de lavado se eliminó el disolvente mediante un filtrador de vacío múltiple (Vac Man Laboratory Vacuum Manifold de Promega Distribuidora).
Después de hinchar-lavar la resina, ésta se trató con una mezcla de piperidina y DMF (3:7, 1 \times 2 min y 1 \times 10 min) para eliminar el grupo Fmoc presente en el grupo amino del espaciador bifuncional, y, a continuación, se lavó con DMF (6 \times 1 min).
Seguidamente la resina se trató con 28 mg de Fmoc-Leu-OH (79 \mumoles), 28 mg de HBTU (75 \mumoles), 11 mg de HOBt (79 \mumoles) y 27 \mul de DIEA (154 \mumoles) en 0,1 ml de DMF. Después de 1 h se lavó la resina con DMF (6 \times 1 min) y se comprobó que el test de ninhidrina era negativo (Kaiser et al, Anal. Biochem., 1970, 34, 595-598).
La eliminación del grupo Fmoc y los lavados subsiguientes se realiza- ron como ya se ha descrito anteriormente.
El ciclo de acoplamiento-desprotección se repitió para los siguientes cuatro aminoácidos protegidos con el grupo N^{\alpha}-Fmoc: Fmoc-Tyr(tBu)-OH, Fmoc-Lys(Boc)-OH, Fmoc-Leu-OH y Fmoc-Ile-OH. En cada etapa se procedió al lavado con DMF (6 \times 1 min).
A partir del quinto aminoácido incorporado, tanta la eliminación del grupo Fmoc, los ciclos acoplamiento-desprotección como los correspondientes lavados se realizaron de la misma manera substituyendo en estos casos la DMF por NMP. Los seis últimos aminoácidos se incorporaron protegidos con el grupo N^{\alpha}-Fmoc: Fmoc-Lys(Boc)-OH, Fmoc-D-Phe-OH y Fmoc-Leu-OH. Para la incorporación de los dos últimos aminoácidos se realizaron 2-3 acoplamientos sucesivos para obtener un test de ninhidrina negativo.
Después de eliminar el grupo Fmoc del último aminoácido acoplado, como ya se ha descrito anteriormente, se lavó la resina con NMP (6 \times 1 min) y CH_{2}Cl_{2} (6 \times 1 min), y se obtuvo el péptido lineal unido a la resina, Lys(Boc)-Lys(Boc)-Leu-D-Phe-Lys(Boc)-Lys(Boc)-Ile-Leu-Lys(Boc)-Tyr(tBu)-Leu-Rink-MBHA. A continuación se escindió el péptido de la resina mediante un tratamiento con 1 ml de una mezcla de TFA, agua y T1S (95:2,5:2,5) durante 2 horas. Se recogieron los filtrados en un vial mediante una presión positiva de nitrógeno. La resina se lavó con una mezcla de TFA, agua y TIS (95:2,5:2,5, 2 \times 0,5 ml). Los filtrados se combinaron y se evaporaron casi a sequedad bajo una corriente de nitrógeno hasta obtener un aceite. Dicho aceite se precipitó con éter dietílico, se centrifugó, y el éter se decantó. Este proceso se repitió 3 o 4 veces. Finalmente, el producto sólido obtenido se disolvió en agua, y se liofilizó.
Se obtuvo un sólido pulverulento que tenia una pureza superior al 80% analizada por HPLC (tiempo de retención 6,28 minutos), y su estructura se confirmó por FSI-MS.
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Ejemplos 2 a 24
Preparación de péptidos de la invención
Siguiendo un procedimiento análogo al descrito en el Ejemplo 1 se prepararon los péptidos de la invención que se muestran en la Tabla VI:
TABLA VI
8
9
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Todos los péptidos de la Tabla VI tienen un grupo carboxamida en el grupo C-terminal.
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Ejemplo 25
Ensayos de actividad antimicrobiana
El efecto antimicrobiano de los péptidos de la invención se determinó frente a cepas de bacterias fitopatógenas y cepas patógenas de importancia en clínica humana. Las cepas fitopatógenas corresponden a: Erwinia amylovora PMV6076 (IN-RA, Angers, Francia), Xanthomonas vesicatoria 2133-2 (IVIA, Valencia, España), y Pseudomonas syringae pv. syringae EPS94 (INTEA, Universitat de Girona, España). Las cepas patógenas de clínica humana corresponden a: Escherichia coli ATCC11775 (American Type Culture Collection), Listeria monocytogenes ATCC15313, Staphylococcus aureus ATCC 9144 y Salmonella typhimurium LT2 ATCC 15277.
Todas las bacterias se conservaron a una temperatura de -80ºC en medio Luria-Bertani (LB) complementado con glicerina al 20% en volumen/volumen.
Las suspensiones de las bacterias E. amylovora PMV6076 y P. syringae pv. syringae EPS94 se obtuvieron después de un crecimiento de 24 horas a 25ºC en agar LB. X. vesicatoria 2133-2 se obtuvo después de la incubación durante 48 horas a 25ºC en agar LB. En cuanto a las cepas de E. coli ATCC 1 1775, S. aureus ATCC 9144 y S. typhimurium LT2 ATCC 15277 se obtuvieron después de un crecimiento de 24 horas a 37ºC en agar LB y L. monocytogenes ATCC 15313 se obtuvo después de la incubación durante 24 horas a 37ºC en medio Brain Heart Infusion (BHI). En todos los casos se resuspendieron en agua estéril para obtener una suspensión ajustada a una absorbancia de 0.2 a 600 nm, que correspondía aproximadamente a 10^{8} unidades formadoras de colonias/ml.
Para determinar la concentración inhibitoria mínima (CIM), los péptidos se solubilizaron en agua estéril milli-Q hasta una concentración final de 1000 \mum y se esterilizaron a través de un filtro de 0,22 \mum de poro.
Se realizaron diluciones de los péptidos de la invención para obtener soluciones a las concentraciones 500: 250: 125: 100: 75: 62.5: 50: 31,2: 25: 16.5; 12,5 y 8 \muM.
Se mezclaron 20 \mul de cada dilución con 20 \mul de la suspensión del indicador bacteriano correspondiente, y 160 \mul de medio líquido correspondiente (Trypticase Soy Broth (TSB), para las bacterias fitopatógenas X. vesicatoria. E. amylovora y P. syringae: LB para E. coli, S. aureus y S. thyphimurium y BHI para L. monocytogenes), hasta un volumen total de 200 \mul en cada pocillo de una microplaca. Así las concentraciones efectivas a las que se sometían las suspensiones de bacterias fueron 50: 25: 12.5: 10: 7,5: 6.25; 5: 3.12: 2,5: 1,65: 1.25 y 0,8 \muM.
Se llevaron a cabo tres réplicas para cada cepa, concentración y péptido en ensayo.
Los controles positivos contenían agua en lugar de péptido, y los controles negativos contenían los péptidos sin la suspensión bacteriana.
El crecimiento microbiano se determinó automáticamente mediante la medida de la densidad óptica a 600 nm empleando el Microbiology Analyser Bioscreen C (Labsystems).
Las microplacas se incubaron a 25ºC para E. amylovora, P. syringae y X. vesicatoria y a 37ºC para L. monocytogenes, S. thyphimurium, S. aureus y E. coli durante 48 horas con una agitación de 10 segundos antes de la medida de la absorbancia cada hora. Cada experimento se realizó dos veces.
Como CMI se tomó la concentración de péptido más baja a la que no se producía crecimiento bacteriano al final del experimento.
En la Tabla VII se presenta el rango de concentraciones entre las que se encuentra la CMI, expresada en \muM, después de 48 h de incubación a 25ºC, para diferentes péptidos de la invención frente a las bacterias Xanthomonas vesicatoria (X v.), Pseaudomonas syringae (P.,s.) y Erwinia amylovora (E.a.).
TABLA VII
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10
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Se puede comprobar que los péptidos de la invención presentan una buena eficacia para inhibir el crecimiento de las bacterias Xanthomonas vesicatoria, Pseudomonas syringae, y/o Erwinia amylovora, siendo muchos de ellos más activos que el péptido ya conocido, cuyos resultados se presentan en la primera fila de la tabla anterior bajo la denominación de Ejemplo comparativo y referencia BP100.
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En la Tabla VIII se presenta el rango de concentraciones entre las que se encuentra la CMI, expresada en \muM, después de 48 h de incubación a 25ºC, para diferentes péptidos de la invención frente a las bacterias patógenas para humanos y/o animales Escherichia coli (E.c.), Staphylococcus aureus (S.a.), Salmonella typhimurium (.S.t.), y Lysteria monocytogenes (L.m):
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TABLA VIII
12
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Se puede comprobar que los péptidos de la invención presentan una buena eficacia para inhibir el crecimiento de las bacterias Escherichia coli, Staphylocpccus aureus, Salmonella typhimurim, y Lysteria monocytogenes, siendo muchos de ellos más activos que el péptido ya conocido, cuyos resultados se presentan en la primera fila de la tabla anterior bajo la denominación de Ejemplo comparativo y referencia BP100.
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Ejemplo 26
Ensayos de actividad hemolítica
La actividad hemolítica de los péptidos de la invención se evaluó mediante la determinación de la liberación de hemoglobina que se produce al poner en contacto una solución de los péptidos con una suspensión de eritrocitos al 5% en volumen procedentes de sangre humana fresca.
La sangre se recogió asépticamente empleando un sistema Vacutainer K2E (Belliver, Gran Bretaña) con EDTA, y se almacenó a 4ºC durante un período inferior a 2 horas.
La sangre se centrifugó a 6.000 g durante 5 minutos para separar los eritrocitos. Éstos se lavaron tres veces con tampón TRIS (10 mM TRIS, 150 mM NaCl, pH 7,2), y se suspendieron en tampón TRIS hasta obtener una suspensión que contenía un 10% en volumen de eritrocitos.
Los péptidos se solubilizaron en tampón TRIS hasta una concentración final de 500 \muM.
Se emplearon tres réplicas para cada péptido y concentración.
Se mezclaron 65 \mul de la suspensión de eritrocitos al 10% en volumen con 65 \mul de la solución de péptido en cada pocillo de una placa de 96 pocillos Micro-Amp (Applied Biosystems. EE.UU.) (5% en volumen de eritrocitos), y se incubó la mezcla durante 1 h a 37ºC bajo agitación. De este modo las suspensiones de eritrocitos se sometieron a una concentración de péptido de 250 \muM.
A continuación se centrifugaron las placas a 3.500 g durante 10 minutos, y se transfirieron alicuotas de 80 \mul del sobrenadante a microplacas de 100 pocillos (Bioscreen), que se diluyeron con 80 \mul de agua milli-Q.
El grado de hemólisis se determinó a partir de la absorbancia a 540 nm con un lector de placas Bioscreen.
El control positivo de hemólisis completa se determinó en una solución de tampón TRIS que contenía melitina 200 \muM (Sigma-Aldrich, España).
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El porcentaje de hemólisis (H) se determinó empleando la ecuación:
H = 100x[(Op-Ob)/(Om-Ob)]
donde Op es la densidad óptica medida para una concentración de péptido determinada, Ob es la densidad óptica de la solución tampón, y Om es la densidad óptica para el control positivo con melitina.
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En la Tabla IX se presentan los resultados de actividad hemolítica, expresada como el porcentaje de hemólisis calculado según la ecuación anterior, para una concentración de péptidos de la invención correspondiente a 250 \muM. En dicha Tabla se incluye el resultado obtenido con el péptido descrito por Badosa et al, como Ejemplo comparativo y referencia BP100.
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TABLA IX
14
15
En todos los casos se observa que la concentración en la que se llegaría a producir una hemólisis significativa puede llegar a ser varios órdenes de magnitud superior a la concentración en la que los péptidos de la invención presentan actividad antimicrobiana.
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Ejemplo 27
Ensayos de estabilidad a la degradación por proteasas
La estabilidad de los péptidos de la invención a la degradación por proteasas se determinó mediante un ensayo de digestión del péptido por Proteinasa K (Sigma-Aldrich Corporation, Madrid, España).
Se empleó una disolución de 50 \mug/ml de péptido y de 1 \mug/ml de Proteinasa K en tampón TRIS 100 mM a pH 7,6, a temperatura ambiente.
El progreso de la hidrólisis del péptido se determinó cromatográficamente a tiempos comprendidos entre 5 minutos y 1 hora. Para ello se empleó una columna C_{18} de fase reversa (Kromasil, 4.6 \times 40 mm: 3.5 \mum de tamaño de partícula), y gradientes lineales de TFA acuoso al 0,1% y TFA en acetonitrilo al 0,1% desde 0,98:0.02 a 0:1 durante 7 min realizando la detección mediante absorbancia en el ultravioleta a 220 nm.
En la Tabla X se presentan los resultados de estabilidad a la degradación por proteasas de algunos de los péptidos de la invención.
La estabilidad se expresa como el porcentaje de degradación de cada péptido a los 45 minutos. En dicha Tabla se incluye coma Ejemplo comparativo y referencia BP 100 el resultado correspondiente al péptido descrito en Badosa et al.
TABLA X
16
Se puede observar que es posible modular la degradación por proteasas de los péptidos antimicrobianos de la invención, de modo que se puede ajustar dicha degradación en función de las necesidades de la aplicación.
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Texto libre de la lista de secuencias Traducción por orden alfabético
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Artificial sequence: Secuencia artificial
\bullet
Linear peptides containing D-amino acids: Péptidos lineales conteniendo aminoácidos de la serie D
\bullet
PatentIn version 3.3: PatentIn versión 3.3
\bullet
PEPTIDE: Péptido
\bullet
Residue: Residuo
\bullet
Residues 2 to 11 are D-amino acids: los residuos 2 a 11 son aminoácidos de la serie D
\bullet
Residues 3 to 11 are D-amino acids: los residuos 3 a 11 son aminoácidos de la serie D
\bullet
Residues 4 to 11 are D-amino acids: los residuos 4 a 11 son aminoácidos de la serie D
\bullet
Residues 5 to 11 are D-amino acids: los residuos 5 a 11 son aminoácidos de la serie D
\bullet
Residues 6 to 11 are D-amino acids: los residuos 6 a 11 son aminoácidos de la serie D
\bullet
Residues 7 to 11 are D-amino acids: los residuos 7 a 11 son aminoácidos de la serie D
\bullet
Residues 8 to 11 are D-amino acids: los residuos 8 a 11 son aminoácidos de la serie D
\bullet
SEQUENCE LISTING: Listado de secuencias
\bullet
University of Girona: Universidad de Girona
<110> University of Girona
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\vskip0.400000\baselineskip
<120> Linear peptides containing D-amino acids
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\vskip0.400000\baselineskip
<130> P09032310
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\vskip0.400000\baselineskip
<160> 24
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\vskip0.400000\baselineskip
<170> PatentIn version 3.3
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
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<211> 11
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<212> PRT
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<213> Artificial sequence
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Linear peptide containing D-amino acids
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<220>
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<221> PEPTIDE
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<222> (1)..(11)
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<223> Residue 10 = D-Tyr
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\hskip1cm
18
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<210> 2
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<211> 11
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<212> PRT
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<213> Artificial sequence
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<220>
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<223> Linear peptide containing D-amino acids
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<220>
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<221> PEPTIDE
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<222> (1)..(11)
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<223> Residue 11 = D-Leu
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
\hskip1cm
19
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial sequence
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Linear peptide containing D-amino acids
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<221> PEPTIDE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Residue 9 = D-Lys
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 3
\hskip1cm
20
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
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<213> Artificial sequence
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Linear peptide containing D-amino acids
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<221> PEPTIDE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Residue 8 = D-Leu
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 4
\hskip1cm
21
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
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<213> Artificial sequence
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Linear peptide containing D-amino acids
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> PEPTIDE
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<222> (1)..(11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Residue 5 = D-Lys
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 5
\hskip1cm
22
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial sequence
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Linear peptide containing D-amino acids
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> PEPTIDE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Residue 4 = D-Phe
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 6
\hskip1cm
23
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial sequence
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Linear peptide containing D-amino acids
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> PEPTIDE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Residue 3 = D-Leu
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 7
\hskip1cm
24
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial sequence
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Linear peptide containing D-amino acids
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> PEPTIDE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Residue 2 = D-Lys
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 8
\hskip1cm
25
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial sequence
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Linear peptide containing D-amino acids
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> PEPTIDE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Residue 6 = D-Lys
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 9
\hskip1cm
26
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial sequence
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Linear peptide containing D-amino acids
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> PEPTIDE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Residue 1 = D-Lys
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 10
\hskip1cm
27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial sequence
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Linear peptide containing D-amino acids
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> PEPTIDE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Residue 7 = D-Ile
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 11
\hskip1cm
28
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial sequence
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Linear peptide containing D-amino acids
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> PEPTIDE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Residue 3 = D-Leu; Residue 9 = D-Lys
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 12
\hskip1cm
29
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 13
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial sequence
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Linear peptide containing D-amino acids
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> PEPTIDE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Residue 8 = D-Leu; Residue 9 = D-Lys
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 13
\hskip1cm
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial sequence
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Linear peptide containing D-amino acids
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> PEPTIDE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Residue 3 = D-Leu; Residue 6 = D-Lys; Residue 9 = D-Lys
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 14
\hskip1cm
31
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial sequence
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Linear peptide containing D-amino acids
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> PEPTIDE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Residue 7 = D-Ile; Residue 8 = D-Leu; Residue 9 = D-Lys
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 15
\hskip1cm
32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 16
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial sequence
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Linear peptide containing D-amino acids
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> PEPTIDE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> All residues in the sequence are D-amino acids
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 16
\hskip1cm
33
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial sequence
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Linear peptide containing D-amino acids
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> PEPTIDE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Residue 1 = D-Lys; Residue 2 = D-Lys; Residue 4 = D-Phe
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 17
\hskip1cm
34
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial sequence
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Linear peptide containing D-amino acids
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> PEPTIDE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Residues 8 to 11 are D-amino acids
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 18
\hskip1cm
35
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial sequence
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Linear peptide containing D-amino acids
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> PEPTIDE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Residues 7 to 11 are D-amino acids
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 19
\hskip1cm
36
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial sequence
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Linear peptide containing D-amino acids
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> PEPTIDE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Residues 6 to 11 are D-amino acids
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 20
\hskip1cm
37
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial sequence
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Linear peptide containing D-amino acids
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> PEPTIDE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Residues 5 to 11 are D-amino acids
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 21
\hskip1cm
38
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial sequence
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Linear peptide containing D-amino acids
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> PEPTIDE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Residues 4 to 11 are D-amino acids
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 22
\hskip1cm
39
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial sequence
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Linear peptide containing D-amino acids
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> PEPTIDE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Residues 3 to 11 are D-amino acids
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 23
\hskip1cm
40
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial sequence
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Linear peptide containing D-amino acids
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> PEPTIDE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Residues 2 to 11 are D-amino acids
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 24
\hskip1cm
41

Claims (9)

1. Péptidos lineales antimicrobianos, que comprenden al menos uno de los aminoácidos de la serie D, que responden a la fórmula (I):
(I)KKLFKKILKYL
seleccionados entre el grupo formado por los péptidos definidos por las secuencias SEQ_ID_NO: 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 19, 20, 21, 22, 23 y 24 y en donde el aminoácido leucina del extremo C-terminal está en forma de grupo carboxamida.
2. Utilización de los péptidos de la reivindicación 1 como agentes antimicrobianos.
3. Utilización de los péptidos de la reivindicación 1 para la preparación de un medicamento para tratar enfermedades infecciosas en animales y humanos.
4. Utilización según la reivindicación 2 como agentes antimicrobianos frente a bacterias patógenas de las plantas.
5. Utilización según la reivindicación 2 como agentes antimicrobianos frente a bacterias patógenas de animales y humanos.
6. Utilización de los péptidos de la reivindicación 1 para preparar un medicamento para tratar enfermedades infecciosas en humanos y animales causadas por bacterias.
7. Utilización de los péptidos de la reivindicación 1 para la preparación de una composición antimicrobiana.
8. Composición antimicrobiana caracterizada porque comprende
a)
una cantidad efectiva de al menos un péptido lineal de la reivindicación 1, y
b)
un agente auxiliar.
9. Método para tratar enfermedades infecciosas en plantas causadas por bacterias caracterizado porque comprende poner en contacto la planta con una composición antimicrobiana según la reivindicación 8.
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