ES2318847T3 - Metodos y reactivos mejorados para el diagnostico y el tratamiento de diabetes y del sindrome de stiff man. - Google Patents

Metodos y reactivos mejorados para el diagnostico y el tratamiento de diabetes y del sindrome de stiff man. Download PDF

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Abstract

LA INVENCION PROPORCIONA FRAGMENTOS DE GAD 65 QUE SON ESPECIFICAMENTE REACTIVAS CON AL MENOS UNA CLASE DE AUTOANTICUERPOS GAD{SUB,65}. LA MAYORIA DE LOS FRAGMENTOS ESTAN SUSTANCIALMENTE LIBRES DE AMINOACIDOS N-TERMINALES QUE DE OTRA MANERA LIMITARIAN LA SOLUBILIDAD. LOS DIFERENTES FRAGMENTOS CONTIENEN EPITOPOS PARA LAS DISTINTAS CLASES DE ANTICUERPOS GAD{SUB,65}. LOS ANTICUERPOS SON UTILIZADOS EN METODOS DE DIAGNOSTICO Y TRATAMIENTO DEL MELLITUS DIABETICO DEPENDIENTE DE LA INSULINA Y EL SINDROME DE STIFF MAN.

Description

Métodos y reactivos mejorados para el diagnóstico y el tratamiento de diabetes y del síndrome de Stiff Man.
Esta solicitud se relaciona en contenido con la solicitud estadounidense con serial número 07/984.935, presentada en 3 de diciembre de 1992. El contenido de la presente invención se relaciona con aquel de USSN 07/756.207, presentada el 6 de septiembre de 1991.
La presente invención se relaciona generalmente con métodos y reactivos mejorados para identificar y tratar individuos que sufren de, o son susceptibles a la diabetes mellitus dependiente de insulina o al síndrome de Stiff Man.
La diabetes mellitus dependiente de insulina (IDDM) (también conocida como diabetes tipo 1) aflige principalmente a gente joven. Aunque se encuentra disponible insulina para el tratamiento, la morbilidad y la mortalidad varias veces mayores asociadas con esta enfermedad requieren del desarrollo de métodos preventivos y de diagnóstico temprano. La destrucción de las células \beta pancreáticas (que son las células que segregan insulina de los islotes de Langerhans) que precede al nacimiento clínico de la IDDM, es mediada por mecanismos autoinmunes. Entre las anormalidades autoinmunes estudiadas más completamente asociadas con la enfermedad está la alta incidencia de anticuerpos circulantes específicos para las células \beta al momento del diagnóstico. Los estudios familiares han mostrado que los anticuerpos aparecen antes de una IDDM palpable con varios años de anticipación, lo cual sugiere un largo período que anuncia la presencia de la enfermedad de autoinmunidad humoral antes de la aparición de los síntomas clínicos. Los estudios familiares han documentado también una pérdida lenta pero progresiva de la respuesta de la insulina a la glucosa intravenosa en los años previos al diagnóstico. La presencia de anticuerpos específicos para las células \beta en el período prediabético probablemente refleja el progreso del proceso autoinmune, en que eventualmente conduce a un agotamiento crítico de células \beta y a dependencia de la insulina. Se ha estimado que únicamente el 10% de la masa total de células \beta permanece al momento del nacimiento clínico.
El objetivo de los anticuerpos en células \beta pancreáticas en la IDDM fue identificado originalmente como un antígeno de 64 kDa por medio de experimentos de inmunoprecipitación utilizando lisados de detergente de islotes humanos (Baekkeskov y colaboradores, (1982), Nature 298: 167 - 169). Anticuerpos para el antígeno de 64 kDa preceden al inicio clínico de la IDDM y se ha mostrado que tienen una incidencia de aproximadamente del 80% en el inicio clínico y durante el período prediabético (Baekkeskov y colaboradores, (1987), J. Clin. Invest. 79: 926 - 934; Atkinson y colaboradores, (1990), Lancet 335: 1357 - 1360; y Christie y colaboradores, (1988), Diabetología 31: 597 - 602). La proteína de 64 kDa humana y de rata son altamente homólogas con relación a los epítopos autoantigénicos (Christie y colaboradores, (1990), J. Biol. Chem. 265: 376 - 381). El autoantígeno de 64 kDa en islotes de Langerhans se detecta en tres formas diferentes con relación a la hidrofobicidad y la compartamentalización: una forma hidrofílica soluble de 65 kDa y Pi de aproximadamente 7,1; una forma hidrófoba de 64 kDa, que es soluble o de una baja avidez de membrana y tiene un Pi de aproximadamente 6,7; y una forma hidrófoba firmemente anclada a la membrana de la misma movilidad electroforética y Pi. Tanto la forma enlazada a la membrana como la hidrófoba soluble de 64 kDa existen como dos isoformas, a y b, que tienen idéntico Pi y propiedades hidrófobas pero difieren aproximadamente en 1 kDa (Baekkeskov y colaboradores, (1989), Diabetes 38: 1133 - 1141). Se encontró que el autoantígeno de 64 kDa era específico para la célula \beta en un análisis de una cantidad de tejidos, que no incluyeron al cerebro (Christie y colaboradores, ver más arriba).
Se ha demostrado recientemente que el autoantígeno de 64 kDa de células \beta pancreáticas es ácido glutámico descarboxilasa (GAD, L-glutamato 1-carboxi-liase, EC 4.1.1.15). La enzima GAD sintetiza GABA a partir de ácido glutámico y es una proteína abundante de las neuronas que secretan GABA en el sistema nervioso central (CNS). Ver la solicitud de patente en trámite junto con la presente, con Serial Número 07/756,207; Baekkeskov y colaboradores, (1990), Nature 347: 151 - 157.
GAD es una proteína abundante y parcialmente caracterizada de neuronas que segregan GABA en el sistema nervioso central. La enzima GAD tiene dos formas codificadas por dos genes no alélicos distintos, GAD_{67} y GAD_{65} (conocidas también como GAD-1 y GAD-2), que pueden haberse desarrollado de un gen ancestral común durante filogenia de vertebrados. GAD_{67} y GAD_{65} son muy diferentes en los primeros 95 aminoácidos pero comparten una homología significativa (aproximadamente del 75%) en el resto de la molécula. Ambas tienen una zona activa proteolítica de 80 - 90 aminoácidos a partir del N-terminal (Christgau y colaboradores, (1991), J. Biol. Chem. 266: 21257 - 21264; Christgau y colaboradores, (1992), J. Cell Biol. 118: 309 - 320), que puede representar un límite de un dominio. El dominio N-terminal alberga las modificaciones posteriores a la traducción que resultan en el anclaje de GAD_{65} a la membrana de vesículas sinápticas y controla la ubicación subcelular precisa de esta proteína.
En tejido cerebral, se producen tanto GAD_{65} como GAD_{67} (Bu y colaboradores, (1992), Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89: 2115 - 2119; Kaufman y colaboradores, (1986), Science 232: 1138 - 1140; Chang & Gottlieb (1988), J. Neurosci. 8: 2123 - 2130). Algunas especies expresan ambas proteínas GAD en sus islotes pancreáticos. Sin embargo, en islotes humanos únicamente se expresa GAD_{65} (Karlsen y colaboradores, (1991), Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 88: 8337 - 8341; Karlsen y colaboradores, (1992), Diabetes 41: 1355 - 1359). La reactividad inmunogénica cruzada entre islotes de GAD_{65} y GAD_{67} de diferentes especies de vertebrados indica un alto grado de conservación de determinantes antigénicos desde roedores hasta humanos (Legay y colaboradores, (1986), J. Neurochem. 46: 1478 - 1486). Consistente con esta observación, los polipéptidos de las GAD_{65} y GAD_{67} humanas comparten una identidad de secuencia de aminoácidos mayor al 90% con polipéptidos análogos en otros mamíferos. Bu y colaboradores, ver más arriba.
Los ADNc de GAD_{67} y GAD_{65} del CNS humano han sido clonados y secuenciados (Bu y colaboradores, ver más arriba). Karlsen y colaboradores, (1991), ver más arriba, han reportado datos de secuencia para GAD_{65} de la célula pancreática beta humana. La información de la secuencia de ADN está disponible también para las GAD_{65} y GAD_{67} del CNS de rata (Erlander y colaboradores, (1991), Neuron 7: 91 - 100; Julien y colaboradores, (1990), J. Neurochem. 54: 703 - 705) y GAD_{65} de células beta de rata (Michelson y colaboradores, (1991), Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 88: 8754 - 8758).
La equivalencia demostrada del antígeno de 64 kDa de IDDM y GAD explica las primeras observaciones que relacionan a la IDDM con una rara, pero severa, enfermedad neurológica llamada síndrome de Stiff Man, en la cual se ha reconocido a la GAD como el antígeno predominante (Solimena y colaboradores, (1988), N. Engl. J. Med. 318: 1012 - 1020; Solimena y colaboradores, (1990), N. Engl. J. Med. 322: 1555 - 1560). Casi todos los pacientes positivos para autoanticuerpo neuronal GABA-érgico fueron también positivos para anticuerpos citoplasmáticos de células de islote, y un tercio tenía IDDM. Además, se detectaron anticuerpos para neuronas GABA-érgicas en 3 de 74 pacientes con IDDM sin SMS (Solimena y colaboradores, (1988), ver más arriba, y Solimena y colaboradores, (1990), ver más arriba). Otros estudios también han reportado una alta incidencia de IDDM en pacientes con SMS (Lorish y colaboradores, (1989), Mayo Clin. Proc. 64: 629 - 636).
La equivalencia demostrada del antígeno de 64 kDa y GAD ha conducido también a alguna mejora en los métodos para diagnosticar IDDM. Previamente, el antígeno de 64 kDa había sido identificado únicamente en la célula pancreática \beta, y no podía ser purificado en cantidades suficientes para permitir la clonación, secuenciación u otra caracterización que hubiera permitido la preparación ha gran escala de los reactivos necesarios para una detección o terapia eficientes. En contraste, la abundancia de GAD en el cerebro permite la producción fácil por clonación, o bien, de grandes cantidades de proteína GAD (ya sea GAD_{65} o GAD_{67}) como un reactivo para diagnóstico. Ver la solicitud de patente en trámite junto con la presente, 07/756.207.
Aunque es una mejora sobre los métodos anteriores, el diagnóstico utilizando formas de longitud completa de proteína GAD purificada no es aún completamente satisfactorio. Las moléculas de GAD tienen una modificación de lípidos en la región N-terminal y son por lo tanto insolubles, excepto en presencia de detergente. La insolubilidad de las moléculas de GAD de longitud completa entorpece la purificación, y el uso de GAD, en ensayos simples como la inmunoprecipitación, ELISA o radioinmunoensayos. Además, el uso de GAD de longitud completa como reactivo de diagnóstico no distingue entre diferentes clases de anticuerpos de GAD, el cual puede ser diagnóstico de diferentes fases temporales de una enfermedad autoinmune y/o de diferentes enfermedades. Además, las proteínas GAD insolubles son inadecuadas para administración in vivo como reactivos terapéuticos.
WO 92/0546 discute el uso GAD_{65} recombinante o de fragmentos de la misma para diagnóstico de tratamiento de la diabetes mellitus dependiente de insulina.
Con base en lo anterior, es claro que existe la necesidad por métodos y reactivos mejorados para diagnosticar y tratar a pacientes que tienen, o están en riesgo de, IDDM y del síndrome de Stiff Man. La presente invención satisface esta y otras necesidades.
De acuerdo a una modalidad de la invención, la invención provee un método para elaborar un fragmento soluble de una proteína GAD_{65} que es específicamente reactiva con un anticuerpo de GAD_{65}, lo cual incluye la expresión de un vector que codifica al fragmento soluble para producir el fragmento soluble, en donde el fragmento está libre de aminoácidos N-terminales que limitan la solubilidad. En algunos fragmentos, los aminoácidos N-terminales 24 - 31 y preferiblemente 45 de una proteína GAD_{65} son suprimidos o mutados. Adecuadamente, existe un residuo de alanina en una posición del fragmento en lugar de un residuo de cisteína de ocurrencia natural. Otros fragmentos contienen una supresión mayor de secuencias N-terminales, que pueden cubrir a los aminoácidos 1 - 244. Algunos fragmentos también están libres de un segmento que tiene un epítopo específicamente reactivo con un segundo anticuerpo de GAD_{65}. Estos fragmentos son útiles para métodos de diagnóstico diferencial (por ejemplo, que distinguen la IDDM del síndrome de Stiff Man o que distinguen las diferentes fases temporales de la IDDM). Por ejemplo, en algunos fragmentos, se remueve el segmento que cubre a los aminoácidos 545 - 585, en otros fragmentos, el segmento de aminoácidos 245 - 295.
Convenientemente, el fragmento consiste de al menos ocho aminoácidos contiguos desde el aminoácido 545 al 585.
Algunos fragmentos solubles incluyen una secuencia contigua de aminoácidos 245 - 585 de una proteína GAD_{65}. Estos fragmentos incluyen tres epítopos diferentes específicamente reactivos con tres diferentes anticuerpos de GAD_{65}.
Otros fragmentos adecuados incluyen una secuencia contigua de al menos ocho aminoácidos de los aminoácidos 1 - 20 ó 70 - 101 por ejemplo un fragmento que consiste de los aminoácidos 1 - 20 ó 70 - 101. Estos fragmentos son específicamente reactivos con dos clases de anticuerpos contra la proteína GAD_{65} que son diagnóstico del síndrome de Stiff Man. Algunos de estos fragmentos están sustancialmente libres de los aminoácidos 245 - 585 y se vuelven por lo tanto incapaces de enlazarse específicamente con tres clases de anticuerpos para diagnóstico de IDDM.
En otro aspecto, la invención provee un polipéptido de fusión GAD_{65} inmovilizado a un soporte sólido, incluyendo el polipéptido de fusión un polipéptido GAD_{65} específicamente reactivo con un anticuerpo de GAD_{65} y un polipéptido de extensión fusionado al N-terminal del polipéptido GAD_{65}, en donde el polipéptido de fusión está inmovilizado en el soporte a través del péptido de extensión. La unión a través del péptido de extensión asegura que los epítopos enlazados al anticuerpo de GAD_{65} en la proteína GAD_{65} o fragmento de la misma sean accesibles a los anticuerpos de enlazamiento. Se puede detectar la interacción específica entre la proteína GAD_{65} o un fragmento y los anticuerpos de GAD_{65} en el suero.
En otro aspecto, la invención provee un polipéptido GAD_{65} inmovilizado a un soporte sólido, en donde el polipéptido es específicamente reactivo con un autoanticuerpo de GAD_{65}, y el polipéptido está inmovilizado al soporte a través de un anticuerpo anti-GAD_{65} específicamente reactivo dentro de los aminoácidos 1 - 244 del polipéptido GAD_{65}. La inmovilización a través del anticuerpo deja al resto de la proteína GAD_{65} o un fragmento de la misma, que contiene un segundo epítopo específicamente reactivo con un anticuerpo de GAD_{65}, accesible para enlazamiento con los anticuerpos. Se puede detectar la interacción específica entre la proteína GAD_{65} o un fragmento de la misma y los anticuerpos de GAD_{65} en el suero.
En otro aspecto, la invención provee un método para detectar anticuerpos de GAD_{65} en sueros, comprendiendo el método:
exponer una muestra de suero a un fragmento soluble de GAD_{65} producido como se describió anteriormente que es específicamente reactivo con un autoanticuerpo de GAD_{65}; y
detectar una interacción específica entre el fragmento de GAD_{65} y el autoanticuerpo.
Preferiblemente, el fragmento de la misma secuencia de aminoácidos es de ocurrencia natural.
Preferiblemente, el autoanticuerpo de GAD_{65} es un autoanticuerpo de célula humana pancreática \beta de 64 kDa.
Preferiblemente, el fragmento soluble de GAD_{65} está marcado.
Preferiblemente, el método comprende además la etapa de precipitar un complejo formado entre el fragmento soluble de GAD_{65} y el autoanticuerpo de GAD_{65} antes de la etapa de detección.
Preferiblemente, el método comprende además la etapa de añadir un polipéptido GAD_{65} no marcado que compite con el fragmento marcado de GAD_{65} por el enlazamiento específico con el autoanticuerpo de GAD_{65}.
Preferiblemente, el método comprende además la etapa de combinar la muestra de suero con un anticuerpo marcado que compite con el auto anticuerpo para formar complejos con el fragmento de GAD_{65}.
Preferiblemente, el fragmento de GAD_{65} está enlazado a una fase sólida y el método comprende además la etapa de remover la fase sólida de la muestra de suero para separar los complejos del anticuerpo marcado no enlazado.
En otro aspecto, la invención provee un método para detectar autoanticuerpos de GAD_{65} en sueros, comprendiendo el método:
proveer un polipéptido de fusión que incluye una proteína GAD_{65} o fragmento de la misma, específicamente reactivo con un autoanticuerpo de GAD_{65}, y un polipéptido de extensión fusionado al N-terminal de la proteína o el fragmento de la misma;
inmovilizar el polipéptido de fusión a un soporte sólido a través del polipéptido de extensión;
exponer una muestra de suero al polipéptido de fusión; y
detectar una interacción específica entre el fragmento y el autoanticuerpo.
En otro aspecto, la invención provee un método para detectar anticuerpos de GAD_{65} en sueros, comprendiendo el método:
proveer un primer anticuerpo específicamente reactivo con un primer epítopo que se presenta dentro de los aminoácidos 1 a 244 o un polipéptido GAD_{65};
inmovilizar el primer anticuerpo a un soporte sólido;
exponer el polipéptido GAD_{65} al primer anticuerpo para inmovilizar la proteína a dicho soporte a través del primer anticuerpo, en donde el polipéptido GAD_{65} incluye a un primer epítopo reactivo con un autoanticuerpo de GAD_{65};
exponer una muestra de suero al fragmento de GAD_{65}; y
detectar una interacción específica entre el fragmento de GAD_{65} y el autoanticuerpo.
Preferiblemente, el polipéptido GAD_{65} se presenta naturalmente y el primer anticuerpo es específicamente reactivo con un primer epítopo entre los aminoácidos 60 y 120 del polipéptido GAD_{65}.
En otro aspecto, la invención provee un método para diagnosticar o monitorear diabetes mellitus dependiente de insulina en un paciente, comprendiendo el método:
exponer una muestra de suero del paciente a un fragmento soluble de GAD_{65} que tiene un epítopo específicamente reactivo con un autoanticuerpo de GAD_{65} para diagnóstico de diabetes mellitus dependiente de insulina producido como se describió anteriormente; y
detectar la interacción entre el fragmento y el autoanticuerpo para diagnóstico de la diabetes mellitus dependiente de insulina.
En otro aspecto, la invención provee un método de monitorear la progresión de la diabetes mellitus dependiente de insulina en un paciente, comprendiendo el método las etapas de:
exponer una muestra de suero del paciente a un primer fragmento de GAD_{65} que incluye un primer epítopo específicamente reactivo con un primer autoanticuerpo de GAD_{65}, en donde el fragmento de GAD es producido como se describió anteriormente;
detectar la interacción específica entre el primer fragmento y el primer autoanticuerpo;
exponer la muestra de suero a un segundo fragmento de GAD_{65} que incluye un segundo epítopo específicamente reactivo con un segundo autoanticuerpo de GAD_{65}; y
detectar una interacción específica entre el segundo fragmento y el segundo autoanticuerpo.
Preferiblemente, el primer autoanticuerpo es diagnóstico de una primera fase temporal de la diabetes mellitus dependiente de insulina y el segundo autoanticuerpo es diagnóstico de una segunda fase temporal de la diabetes mellitus dependiente de insulina.
Preferiblemente, los fragmentos son solubles.
En otro aspecto, la invención provee una composición farmacéutica que incluye un fragmento soluble de GAD_{65} específicamente reactivo con un autoanticuerpo de GAD_{65}, en donde el fragmento está libre de aminoácidos N-terminales que limitan la solubilidad, en un portador farmacéuticamente aceptable.
En otro aspecto, la invención provee el uso de un fragmento soluble de GAD_{65} en la fabricación de una composición para uso en terapia en un método para tratar a un paciente que sufre de, o con riesgo de, diabetes mellitus dependiente de insulina o de síndrome de Stiff Man.
En algunos métodos, se administra una dosis terapéuticamente efectiva de un fragmento soluble de GAD_{65} que es específicamente reactivo con un anticuerpo de GAD_{65} o con una célula T a un paciente para inducir inmunotolerancia a un auto-antígeno de GAD_{65}. En otro método, se utiliza un fragmento soluble GAD_{65} para generar células auxiliares T específicas para el fragmento de GAD_{65} de las células de sangre periférica obtenidas de un paciente. Las células auxiliares T así generadas, o una porción de las mismas, que se capaz de incluir una respuesta inmune in vivo contra las células auxiliares T, es administrada al paciente.
En otro aspecto, la invención provee un fragmento soluble de GAD_{65}, en donde el fragmento está libre de aminoácidos N-terminales que limitan la solubilidad, y contiene un epítopo específicamente reactivo con un autoanticuerpo de GAD_{65} y acoplado a una inmunoglobulina o célula linfoide de un paciente que va a ser tratado con eso.
En otro aspecto, la invención provee un fragmento soluble de una proteína GAD_{65}, en donde el fragmento está libre de aminoácidos N-terminales que limitan la solubilidad, y es específicamente reactivo con autoanticuerpo de GAD_{65} para uso en un método de tratamiento o profilaxis de la IDDM.
En los dibujos acompañantes:
La Fig. 1 muestra las secuencias de aminoácidos de las proteínas GAD_{65} humanas (parte de arriba) (SEQ ID NO: 1) y de rata (parte inferior) (SEQ ID NO: 2). Para la secuencia de rata, únicamente se muestran los aminoácidos que difieren de la secuencia humana.
La Fig. 2 muestra los resultados de inmunoprecipitación de las GAD_{65} y GAD_{67} humanas marcadas con metionina con ^{35}S expresadas a partir de un vector baculovirus en células Sf9 con las MICA, IgG humana (control), la GAD6 monoclonal de ratón específica de GAD_{65} y el antisuero K2 de conejo específico de GAD_{67}. La inmunoprecipitación de células Sf9 infectadas con baculovirus de tipo silvestre se muestra en paralelo (sendas 15 - 21).
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La Fig. 3 muestra una transferencia Western de GAD_{65} y GAD_{67} humanas expresadas a partir de un vector baculovirus en células Sf9 junto con células Sf9 infectadas con baculovirus de tipo silvestre (control) utilizando: antisuero 1266 que reconoce tanto GAD_{65} como GAD_{67} (sendas 1 - 3); antisuero GAD6, que específicamente reconoce GAD_{65}, (sendas 4 - 6), MICA 1 (sendas 7 - 9), y MICA 2 (sendas 10 - 12).
La Fig. 4 muestra los resultados de inmunoprecipitación de GAD_{65} de rata de tipo silvestre marcada con metionina con ^{35}S y una proteína truncada expresada a partir de un constructo de baculovirus en células Sf9 con las MICA, GAD6 (un anticuerpo monoclonal anti-GAD_{65} de ratón), o IgG humana (control). La inmunoprecipitación de células Sf9 infectadas con baculovirus de tipo silvestre se muestra en paralelo.
La Fig. 5 muestra la huella de la proteína de inmunocomplejos entre las MICA o la IgG humana (control) y GAD_{65} humana marcada con metionina con ^{35}S de células Sf9.
La Fig. 6 muestra la reactividad de las MICA con mutantes de supresión de GAD_{65}.
A.
Resumen del enlazamiento de anticuerpo a mutantes de GAD_{65} de rata expresados en células COS-7. GAD1 y GAD6 son anticuerpos monoclonales anti-GAD de ratón (Gottlieb y colaboradores, 1986, Chang y Gottlieb 1988). GAD1 es distinta de otras monoclonales en que únicamente reconoce GAD_{65} intacta. GAD6 tiene un patrón de reconocimiento similar a MICA2, excepto porque GAD6 reacciona igualmente bien en condiciones nativa y desnaturalizada.
B.
La inmunoprecipitación de mutantes de supresión N-terminales de GAD_{65} de rata, expresados en células COS-7 con las MICA, GAD6 e IgG humana (control).
C.
La inmunoprecipitación de mutantes de supresión C-terminales de GAD_{65} de rata, expresados en células COS-7 con las MICA, GAD6 e IgG humana (control).
La Fig. 7 muestra inmunoprecipitación de mutantes de supresión N-terminales y C-terminales de GAD_{65} de rata expresados en células COS-7 con sueros de nueve pacientes diabéticos recientemente diagnosticados en forma independiente (D1-9). Se analizaron también los sueros de un individuo prediabético (PI), un positivo individual para anticuerpos citoplasmáticos de células de islote (P2), y de dos individuos sanos de control (C1 y C2). El suero D10 es del paciente del cual se derivaron las MICA 1 - 6.
La Fig. 8 muestra transferencias Western de GAD_{67}, GAD_{65}, GAD_{65} \Delta 1-69/70, y GAD_{65} \Delta 1-101, coloreadas con un suero SMS típico, y un suero de control positivo.
La Fig. 9 muestra análisis en gel SDS de GAD_{65} y proteínas mutantes marcadas por ácido palmítico con [^{3}H] y metionina con ^{35}S.
La Fig. 10 muestra transferencias Western de fracciones acuosas (A) y en detergente (D) de proteína celular total de células COS que expresan GAD_{65} y mutantes de supresión N-terminales, coloreadas con sueros reactivos con un péptido C-terminal de GAD_{65}.
Definiciones
Cuando se describe un fragmente de GAD_{65} como "sustancialmente libre" de un segmento de aminoácidos, aproximadamente al menos 50%, más usualmente aproximadamente al menos 75%, y lo más comúnmente aproximadamente al menos 90% de los aminoácidos dentro del segmento especificado están ausentes o sustituidos. La remoción de estos aminoácidos confiere un cambio en una propiedad biológica o química del fragmento residual, tal como la pérdida de capacidad para reaccionar con una clase de anticuerpo, o la adquisición de solubilidad en solventes acuosos.
Los términos "interacción específica" y "específicamente reactivo" significa que la constante de disociación para el enlazamiento de un ligando y un anticuerpo es aproximadamente menor de 1 iM, más usualmente aproximadamente menor de 1 nM.
El término "análogo" se refiere a una secuencia génica que está evolutiva y funcionalmente relacionada entre especies. Por ejemplo, en el genoma humano, el gen CD4 humano es el gen análogo al gen CD4 de ratón, ya que las secuencias y estructuras de estos dos genes indican que son altamente homólogos y ambos genes codifican una proteína que funciona en el señalamiento de la activación de la célula T a través del reconocimiento del antígeno restringido de MCH clase II. Los genes análogos preferidos son: el humano, de rata, de conejo, de canino, de primate no humano, de porcino, de múrido y de hámster.
El término análogo de GAD_{65} incluye cualquier proteína que compita con la proteína GAD_{65} de rata de Bu y colaboradores, (1992), Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 89:2115-2119, para el enlazamiento con anticuerpos GAD_{65}. Los análogos incluyen polipéptidos mutantes naturales e inducidos. Las proteína análogas pueden incluir estereoisómeros (esto es, D-aminoácidos) de los veinte aminoácidos convencionales, aminoácidos no naturales tales como \alpha,\alpha-disustituidos, N-alquil aminoácidos, ácido láctico, 4-hidroxiprolina, \gamma-carboxiglutamato, \varepsilon-N,N,N-trimetillisina, \varepsilon-N-acetillisina, O-fosfoserina, N-acetilserina, N-formilmetionina, 3-metilhistidina, 5-hidroxilisina, \omega-N-metilarginina, y otros aminoácidos similares e imino ácidos (por ejemplo, 4-hidroxiprolina). Las proteínas análogas también incluyen proteínas que tienen columnas vertebrales modificadas por fosforilación, glicosilación, palmitoilación y
similares.
Las condiciones rigurosas dependen de la secuencia y serán diferentes en diferentes circunstancias. Generalmente, las condiciones rigurosas se seleccionan para ser aproximadamente 5ºC menores que el punto térmico de fusión (Tm) para la secuencia específica con una fuerza iónica y un pH definidos. El Tm es la temperatura (bajo una fuerza iónica y un pH definidos) a la cual 50% de la secuencia objetivo hibrida con una sonda perfectamente correspondiente. Típicamente, las condiciones rigurosas serán aquellas en las cuales la concentración de sal sea aproximadamente al menos de 0,02 molar a pH 7 y la temperatura es aproximadamente al menos de 60ºC. Ya que otros factores pueden afectar significativamente la rigurosidad de la hibridación, incluyendo, entre otros, la composición de la base y el tamaño de las cadenas complementarias, la presencia de solventes orgánicos y el grado de incompatibilidad de las bases, la combinación de parámetros es más importante que la medida absoluta de cualquiera de éstas.
El término "sustancialmente soluble" significa que un fragmento exhibe típicamente una solubilidad de al menos 50 \mug/ml en un solvente acuoso.
El término "polipéptido" se refiere a un polímero de aminoácidos e incluye proteínas de longitud completa y fragmentos de la misma.
Se describirán ahora modalidades preferidas de la invención.
I. Reactivos para Diagnóstico de la IDDM y del Síndrome de Stiff Man
De acuerdo a una modalidad de la invención, se proveen los reactivos para diagnóstico de pacientes que sufren de, o que están en riesgo de padecer IDDM y/o el síndrome de Stiff Man. Los polipéptidos son usualmente fragmentos solubles de GAD_{65} que enlazan uno o más anticuerpos de GAD_{65}, diagnóstico para una de estas enfermedades.
A. Anticuerpos para GAD_{65}
Como se discutió anteriormente, GAD_{65} es uno de dos genes (siendo el otro GAD_{67}) que codifican a dos subtipos de enzima GAD. Dentro de cada subtipo no alélico existen también diferentes variantes alélicas (ver la Sección de Antecedentes). Por lo tanto, el término anticuerpo de GAD_{65} incluye anticuerpos reactivos con cualquier variante alélica de la enzima GAD_{65} o un epítopo de la misma. Por ejemplo, el término anticuerpo de GAD_{65} abarca anticuerpos para el autoantígeno de células \beta pancreáticas de 64 kDa. La detección de anticuerpos para GAD_{65} en suero humano es diagnóstica de IDDM y/o del síndrome de Stiff Man. La detección de anticuerpos para GAD_{67} puede ser un método factible de diagnóstico. Sin embargo, los resultados del Ejemplo 3 sugieren que los anticuerpos para la enzima GAD_{65} son mucho más predominantes que aquellos para GAD_{67}. Por lo tanto, se prefiere la detección de los anticuerpos para GAD_{65}.
B. Producción d Polipéptidos GAD_{65}
Frecuentemente, se detectan los anticuerpos para la enzima GAD_{65} utilizando fragmentos de polipéptidos de GAD_{65}. Estos fragmentos son producidos por medio de una variedad de métodos. Los fragmentos de la presente invención pueden ser naturales, esto es, fragmentos de CNS o de GAD_{65} pancreático, aislados de fuentes adecuadas, tales como el CNS humano o no humano y de células pancreáticas. Los métodos para tal aislamiento están descritos en Oertel y colaboradores (1980), Brain Res. Bull. Vol. 5, Suplemento 2, páginas 713 - 719; Oertel y colaboradores, (1981), J. Neurosci. 6: 2689 - 2700; y Chang & Gottlieb (1988), J. Neurosci. 8: 2123 - 2130. Usualmente, los polipéptidos naturales se aislaran de células del CNS donde GAD_{65} es más abundante que en células pancreáticas. Las composiciones purificadas de la forma pancreática de GAD_{65} se pueden aislar y caracterizar completamente utilizando GAD_{65} del CNS como referencia. Debido a que los genes para GAD_{65} y las proteínas están altamente conservados entre especies, la proteína GAD_{65} y los fragmentos de la misma utilizados en la presente invención pueden ser humanos o no humanos.
Los polipéptidos naturales se aíslan por medio de técnicas convencionales tales como cromatografía de afinidad. Por ejemplo, se incrementan los anticuerpos policlonales o monoclonales contra las GAD_{65} previamente purificadas y se unen a una columna adecuada de afinidad por medio de técnicas conocidas. Ver, por ejemplo, Hudson & Hay, Practical Immunology (Blackwell Scientific Publications, Oxford, Reino Unido, 1980), Capítulo 8. Usualmente, se obtiene una forma intacta de GAD_{65} por medio de tales técnicas de aislamiento. Se generan fragmentos de péptido a partir de GAD_{65} por medio de escisión química o enzimática de la molécula intacta.
Como una alternativa para el aislamiento de proteína GAD_{65} intacta y de fragmentos de la misma a partir de fuentes naturales, estos polipéptidos se preparan con base en la secuencia de nucleótidos de un gen para GAD_{65} o de una secuencia de aminoácidos de una proteína GAD. La gran extensión de datos de la secuencia de aminoácidos y de ácido nucleico de GAD_{65} de diferentes especies ya se encuentra disponible (ver, la Sección de Antecedentes). Los datos adicionales, si procede, se generan fácilmente por medio de métodos convencionales. Por ejemplo, una secuencia conocida de nucleótidos de una especie se puede utilizar como sonda para clonar genes para GAD_{65} de otra especie. Alternativamente, se pueden utilizar anticuerpos para una proteína GAD_{65} conocida como sondas para detectar los productos de expresión de GAD_{65}. Una vez clonados, se secuencian fácilmente los genes para GAD_{65} por medio de métodos convencionales.
Se pueden producir proteína y polipéptidos sintéticos por medio de al menos 3 aproximaciones generales. Primero, se pueden sintetizar polipéptidos que tienen aproximadamente hasta 150 aminoácidos, usualmente que tienen aproximadamente menos de 100 aminoácidos, y mas usualmente que tienen aproximadamente menos de 75 aminoácidos, por medio del método de síntesis conocido en fase sólida de Merrifield en el cual se añaden secuencialmente aminoácidos a una cadena en crecimiento. Ver, Merrifield (1963), J. Am. Chem. Soc. 85: 2149 - 2156. Los sintetizadores automatizados de péptidos se encuentran comercialmente disponibles con numerosos proveedores, tales como Applied Biosystems, Foster City, California.
Un segundo método para síntesis de las proteínas y de los péptidos de la presente invención involucra la expresión en células de cultivo de mamífero de moléculas de ADN recombinante que codifican al gen deseado para GAD_{65} o una porción del mismo. Los sistemas de expresión de mamíferos, tales como las células de ovario de hámster chino (CHO), efectúan la modificación post-traduccional de las proteínas y polipéptidos mejorando así la similitud inmunológica de los productos sintéticos con las formas nativas de GAD_{65}. Además, los sistemas de expresión de baculovirus y levadura a menudo efectúan las necesarias modificaciones post-traduccionales. El gen para GAD_{65} puede ser natural o sintético, pudiendo se obtener el gen natural a partir de ADNc o de bibliotecas genómicas utilizando sondas degeneradas con base en la secuencia conocida de aminoácidos expuesta en Julien y colaboradores, ver más arriba. Alternativamente, se pueden sintetizar nucleótidos con base en la secuencia reportada de ADN por medio de técnicas conocidas. Por ejemplo, se pueden preparar fragmentos de ADN monocatenario por medio del método de fosforamidita descrito por Beaucage y Carruthers (1981), Tett. Letters 22: 1859 - 1862. Se puede obtener entonces un fragmento bicatenario sintetizando la cadena complementaria y apareando las cadenas juntas bajo condiciones apropiadas o por medio de la adición de la cadena complementaria utilizando ADN polimerasa con una secuencia apropiada de iniciador.
Los fragmentos naturales o sintéticos de ADN que codifican para la proteína GAD_{65} deseada o fragmento de la misma se incorporan luego en constructos de ADN. Usualmente, los constructos de ADN son capaces de replicar en huéspedes procariotas con el propósito de facilitar la manipulación inicial y la multiplicación del constructo. Después de que se ha obtenido una cantidad suficiente del constructo, se introduce dentro del genoma del mamífero cultivado, insecto (por ejemplo, SF9), levadura u otras líneas celulares eucariotas.
Los constructos adecuados de ADN para introducción en bacterias o levadura usualmente incluyen un sistema de replicación reconocido por el huésped, el fragmento de ADN para GAD_{65} que codifica a la proteína deseada o al producto polipeptídico, iniciación transcripcional y de traducción y secuencias reguladoras unidas al extremo 5' de la secuencia estructural de ADN y las secuencias iniciadoras de transcripción y de traducción y las reguladoras unidas al extremo 5' de la secuencia estructural de ADN, y las secuencias reguladoras de terminación de transcripción y de traducción unidas al extremo 3' de la secuencia estructural. Las secuencias reguladoras de transcripción incluyen un promotor heterólogo que es reconocido por el huésped.
Convenientemente, se pueden emplear los vectores de clonación disponibles que incluyen al sistema de replicación y las secuencias reguladoras de transcripción y de traducción junto con un sitio de inserción para la secuencia de ADN del GAD_{65}. Para la transformación de líneas celulares de mamífero y de otras eucariotas, se puede emplear la cotransfección de las líneas celulares en presencia de un marcador adecuado, tal como el gen DHFR. La transfección se puede lograr utilizando también técnicas químicas o de electroporación.
Se purifican los polipéptidos GAD_{65}, si se desea, a partir de cultivos celulares que expresan genes recombinantes por medio de una variedad de métodos. Por ejemplo, se puede purificar el polipéptido por medio de una combinación de métodos convencionales con base en las diferencias en tamaño (filtración por gel), carga (cromatografía de intercambio iónico), hidrofobicidad (cromatografía de fenil- sefarosa) u otros parámetros físicos. Se puede utilizar también cromatografía de afinidad inmunoabsorbente que soporta anticuerpos específicos para GAD_{65}. La cromatografía de afinidad se lleva a cabo enlazando primero los anticuerpos a un soporte en fase sólida y luego poniendo en contacto a los anticuerpos enlazados con una fuente de los polipéptidos que van a ser purificados, por ejemplo, lisados del CNS o de células pancreáticas o de células que han sido modificadas en forma recombinante para producir GAD_{65}, o de súper mutantes de células que han sido modificadas en forma recombinante para secretar GAD_{65} cuando se las cultiva.
Un tercer método para sintetizar polipéptidos GAD_{65} es emplear un sistema de transcripción/traducción in vitro. Se clona un ADN que codifica a un polipéptido GAD_{65} sobre un vector de expresión como se describe más arriba. Se transcribe y traduce luego el vector de expresión in vitro, por ejemplo, en un sistema lisado de reticulocitos de conejo. Se puede utilizar el producto de la traducción directamente o purificado primero. Los péptidos resultantes de la traducción in vitro típicamente no contienen las modificaciones post-traducción presentes sobre polipéptidos sintetizados in vivo. Por ejemplo, los polipéptidos GAD_{65} traducidos in vitro son típicamente no palmitoilados en los aminoácidos 31 y 45, y estos aminoácidos no tendrían necesariamente que ser mutados o suprimidos para conferir solubilidad en solventes acuosos.
Para uso en purificación, se pueden obtener anticuerpos para GAD_{65} inyectando fragmentos de los mismos GAD_{65} en una amplia variedad de vertebrados de acuerdo con técnicas convencionales. Los vertebrados adecuados incluyen ratones, ratas, ovejas, y cabras. Usualmente, se sangran periódicamente los animales con sangrados sucesivos que tienen un título y especificidad mejorados. Los antígenos pueden ser inyectados en forma intramuscular, interperitoneal, subcutánea, o similares, usualmente, en un adyuvante completo o incompleto de Freund. Se pueden preparar anticuerpos monoclonales por medio de técnicas conocidas. Se pueden producir también fragmentos monoclonales Fab. Ver, por ejemplo, Huse y colaboradores (1989), Science 246: 1275 - 1281.
Los fragmentos de GAD_{65} de la presente invención pueden ser utilizados ya sea como un componente de un lisado crudo o en forma sustancialmente pura. "Sustancialmente pura" significa que un polipéptido es típicamente aproximadamente al menos 50% p/p (peso/peso) puro, así como también que está sustancialmente libre de proteínas y de contaminantes que interfieren. Algunas veces los fragmentos se aíslan o se sintetizan con una pureza de aproximadamente al menos el 80% p/p y, más preferiblemente aproximadamente de al menos el 95% p/p de pureza. Sin embargo, utilizando técnicas convencionales de purificación de proteínas, se pueden obtener péptidos homogéneos al menos en un 99% p/p.
C. Mapeo de Epítopo
Los fragmentos de polipéptido de la presente invención contienen al menos un epítopo reactivo al menos con una clase de anticuerpo contra la proteína GAD_{65}. La localización de epítopos dentro de la proteína GAD_{65} es facilitada por la disponibilidad de anticuerpos monoclonales reactivos con GAD_{65} que se han obtenido de un paciente que sufre de, o que tiene riesgo de padecer de IDDM o síndrome de Stiff Man. Los procedimientos para aislar y seleccionar anticuerpos monoclonales humanos son descritos por Richter y colaboradores (1992), Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 89: 8467 - 71. En resumen, se derivaron una cantidad de líneas celulares ä inmortalizadas con EBV a partir de la sangre periférica de pacientes recientemente diagnosticados con IDDM. Las líneas celulares monoclonales B que producen IgG fueron seleccionadas para enlazarse al antígeno de células ä pancreáticas de 64 kDa por medio de coloración indirecta de inmunofluorescencia de secciones congeladas de páncreas humano. Se estabilizaron las líneas celulares por medio de clonación repetida de células individuales. Seis líneas celulares estables aisladas por medio de este método produjeron anticuerpos monoclonales denominados MIICA 1 - 6.
Se utilizan anticuerpos monoclonales humanos contra GAD_{65}, o suero policlonal de pacientes que tienen, o con riego de padecer, de IDDM o del síndrome de Stiff Man, para mapear epítopos de GAD_{65} útiles para detectar la presencia de autoanticuerpos de GAD_{65}. Los epítopos de GAD_{65} se mapean analizando una colección de péptidos GAD_{65} (preparados como en la Sección I.B) para enlazarse a anticuerpos monoclonales o a sueros policlonales. El enlazamiento usualmente se detecta por medio de un ensayo convencional de inmunoprecipitación. El enlazamiento se puede detectar también por medio de transferencias Western. Sin embargo, ya que las transferencias Western se realizan bajo condiciones de desnaturalización, se detecta el enlazamiento únicamente con epítopos lineales. La comparación de resultados de inmunoprecipitación y de transferencias Western indica que epítopos son lineales y cuales son conformacionales.
En otra aproximación, se pueden mapear los epítopos por medio de huellas digitales de proteínas. En esta técnica, se le permite a una proteína o péptido GAD_{65} enlazarse a un anticuerpo y luego se exponen a una proteasa. Los residuos de enlazamiento de GAD_{65} con el anticuerpo monoclonal se protegen de degradación proteolítica, y se identifican por medio de secuenciación de aminoácidos.
D. Fragmentos de GAD_{65} como Reactivos de Diagnóstico
La identificación de las coordenadas de secuencia de los epítopos de GAD_{65} reactivos con anticuerpos permite la producción de fragmentos de GAD_{65} que contienen uno o más de tales epítopos como reactivos de diagnóstico. Las coordenadas de secuencia utilizadas para definir los fragmentos de GAD_{65} se refieren a aminoácidos de la secuencia de 585 aminoácidos de GAD_{65} de rata divulgada por Bu y colaboradores (1992), Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 89: 2115 - 2119 y mostrada en la Fig. 1, correspondiente a los aminoácidos de la secuencia de 585 aminoácidos de GAD_{65} humana divulgada por Bu y colaboradores (también mostrada en la Fig. 1), o los aminoácidos correspondientes de cualquier otro de los polipéptidos afines o análogos de GAD_{65}, cuando tales polipéptidos están alineados en forma máxima con la secuencia de GAD_{65} de rata de Bu y colaboradores. Una proteína se considera "alineada en forma máxima" con las secuencias de GAD_{65} de rata de acuerdo con el criterio de cualquiera de las siguientes referencias: Smith & Waterman (1981), Adv. Appl. Math. 2: 482; Needleman & Wunsch (1970), J. Mol. Biol. 48: 443; Pearson & Lipman (1988), Proc. Natl. Acad. Sci. (U.S.A.) 85: GAP, BESTFIT, FASTA, y TFASTA en el Wisconsin Genetics Software Package, Genetics Computer Group, 575 Science Dr., Madison, WI. Usualmente, proteínas análogas son codificadas por ácidos nucleicos que tienen la capacidad de hibridar al ADN que codifica a la proteína GAD_{65} de rata bajo condiciones restrictivas.
Usualmente, los fragmentos de GAD_{65} están libres de aminoácidos N-terminales que limitan la solubilidad en solventes acuosos. Tales aminoácidos se pueden remover por medio de supresión y/o de sustitución. Los aminoácidos N-terminales que son removidos y/o mutados pueden incluir más de doscientos aminoácidos del N-terminal de la proteína GAD_{65}. Sin embargo, algunos fragmentos de GAD_{65} de la invención están libres de segmentos N-terminales más cortos, que incluyen por ejemplo, aproximadamente 8, 25, 50, 75, 100 y 150 aminoácidos de la región N-terminal. Como mínimo, se deben remover o sustituir los aminoácidos aproximadamente de las posiciones 24 - 31. Preferiblemente, el aminoácido 45 debe ser removido o sustituido también. De este modo, por ejemplo, un fragmento que tiene una supresión de los aminoácidos 1 - 31, y, preferiblemente, una sustitución de un residuo de alanina por un residuo de cisteína en el aminoácido 45 es soluble. Un fragmento que tiene una supresión de los aminoácidos 1 - 45 es también soluble.
Alternativamente, los polipéptidos GAD_{65} solubles se pueden producir sintetizando los polipéptidos bajo condiciones tales que no ocurran modificaciones post-traduccionales. Por ejemplo, se pueden sintetizar polipéptidos en un sistema de traducción in vitro o en un sintetizador de péptidos. Ver la Sección I.B más arriba. Se pueden sintetizar también polipéptidos in vivo en presencia de un inhibidor de unión de lípidos tal como la cerulenina.
A menudo, los aminoácidos que son removidos para conferir solubilidad a un péptido GAD_{65}, son contiguos, pero esto no es esencial. Todo lo que se necesita es que se suprima suficiente secuencia de aminoácidos N-terminales para que el resto del fragmento de la proteína sea soluble o sustancialmente soluble en un medio acuoso, tal como el medio típicamente empleado en la purificación de proteínas o para inmunoensayo.
Sorprendentemente, los resultados presentados en el Ejemplo 5 indican que la supresión de al menos los primeros 244 aminoácidos del N-terminal de GAD_{65} no desmejora la reactividad de los epítopos principales de GAD_{65} contra los anticuerpos de IDDM. De este modo, un fragmento soluble que carezca de los 244 aminoácidos N-terminales, pero que contenga los restantes aminoácidos de GAD_{65} (esto es, una secuencia contigua de los aminoácidos 245 a 585 (el aminoácido C-terminal)) es reactivo con todas las tres clases de anticuerpos de IDDM definidas por MICA1/MICA3, MICA4/MICA6 y MICA2. Ver el Ejemplo 5. También son adecuados los fragmentos solubles de ocurrencia natural de GAD_{65} o de GAD_{67} que resultan de degradación proteolítica o de patrones alternativos de empalme. Estos fragmentos han sido detectados en extractos de cerebro, en células \beta y en sistemas de expresión recombinante. Los fragmentos usualmente tienen un peso molecular de aproximadamente 55 - 57 kDa y carecen aproximadamente de 65 - 80 aminoácidos del N-terminal. Ver, por ejemplo, Christgau y colaboradores (1992), J. Cell Biol. 118: 309 - 320. La ausencia de estos aminoácidos N-terminales produce los fragmentos sustancialmente solubles en solventes acuosos. Los fragmentos de ocurrencia natural son purificados convenientemente por medio de cromatografía de inmunoafinidad utilizando un anticuerpo específico para los epítopos contenidos aproximadamente dentro de los aminoácidos 60 - 120. Se puede utilizar el mismo anticuerpo para inmovilizar los fragmentos para inmunoensayo.
La invención también provee fragmentos solubles que tienen modificaciones tanto en el N-terminal (para producir el fragmento soluble) como en otro sitio. Uno de tales fragmentos está sustancialmente libre al menos aproximadamente de 41 aminoácidos del C-terminal (esto es, los aminoácidos 545 - 585). Un fragmento sustancialmente libre de los 41 aminoácidos C-terminales es capaz de reconocer a los anticuerpos de la IDDM que tienen la especificidad de MICA4/MICA6, pero no con la especificidad de MICA1/MICA3 o MICA2.
Otro fragmento suministrado por la invención se convierte en soluble por medio de la supresión o sustitución de los aminoácidos N-terminales y está también sustancialmente libre de un segmento de aproximadamente 245 a 295 aminoácidos. Este fragmento es capaz de reconocer autoanticuerpos de IDDM con la especificidad de MICA2, pero no anticuerpos que tengan la especificidad de MICA1/MICA3 o MICA2/MICA4.
Algunos fragmentos están sustancialmente libres de los aminoácidos 70 - 101 y/o 1 - 20, y se los considera por lo tanto libres de epítopos no conformacionales reactivos con anticuerpos para diagnostico del síndrome de Stiff Man. Sin embargo, tales fragmentos son reactivos con los anticuerpos del síndrome de Stiff Man que reconocen epítopos conformacionales. Los fragmentos que reaccionan con uno o más anticuerpos para el diagnóstico de IDDM pero no reaccionan con ninguna clase de anticuerpos para el diagnóstico de SMS pueden ser producidos por medio de epítopos adicionales de localización de IDDM con fragmentos de péptido de longitud mínima o casi mínima. Estos fragmentos pueden constituir secuencias de aminoácidos de GAD_{65}, o miniproteínas análogas, como las descritas por Ladner y colaboradores, patente estadounidense No. 5.223.409 (1993). Los fragmentos o miniproteínas podrían ser seleccionadas luego por ausencia de reactividad con sueros de pacientes con SMS.
La invención también provee fragmentos que contienen al menos un epítopo lineal (o no conformacional) reactivo con anticuerpos del SMS. Como se observó anteriormente, estos epítopos están contenidos dentro de los aminoácidos 1 - 20 (los aminoácidos 1 - 10 son particularmente importantes para el enlazamiento) y 70 - 101. Para un epítopo funcional, usualmente al menos aproximadamente 6, 8 ó 10 aminoácidos contiguos y más usualmente, todos, o sustancialmente todos (esto es, 70, 80, 90 ó 95%) de los segmentos especificados están presentes. Los epítopos del SMS son ambos lineales y por lo tanto reactivos con anticuerpos de SMS independientemente de la conformación del resto de la molécula. De este modo, incluso un fragmento que consiste esencialmente de los aminoácidos aproximadamente de 70 - 101 o de los aminoácidos aproximadamente de 1 - 20 y que carece de aminoácidos de flanqueo es reactivo con los anticuerpos del SMS. Desde luego, tal fragmento carece de los epítopos requeridos para enlazamiento con las clases principales de anticuerpos de la IDDM. Sin embargo, se proveen fragmentos mayores en los cuales uno o más de otros epítopos para diagnóstico de IDDM están presentes. De este modo, por ejemplo, un fragmento que contiene a los aminoácidos 1 - 20, 70 - 101 y 245 - 585 contendrían epítopos para las tres clases principales de anticuerpos de IDDM, así como para clases conformacionales y no conformacionales de anticuerpos de
SMS.
La provisión de fragmentos de GAD_{65} que tienen epítopos de enlazamiento de anticuerpo ofrece numerosas ventajas comparada con la GAD_{65} intacta. Los fragmentos de la invención usualmente tienen una alta solubilidad en solventes acuosos en contraste con la GAD_{65} intacta, que requiere de detergente para solubilización y tiene una tendencia a formar agregados y precipitan incluso en presencia de detergente. La formación de agregados puede enmascarar epítopos y por lo tanto reducir la sensibilidad y la precisión de la detección de autoanticuerpos. Además, la presencia de detergente es a menudo perjudicial para el enlazamiento con placas de ELISA. Aunque se puede solubilizar GAD_{65} utilizando detergentes iónicos y solventes de desnaturalización, tales condiciones son incompatibles con el mantenimiento de epítopos conformacionales. La conformación auténtica es particularmente importante para detectar anticuerpos para IDDM de la especificidad de MICA1/MICA3 o MICA4/MICA6. Ver el Ejemplo 4.
Una ventaja adicional de los presentes fragmentos es que ellos permiten la distinción entre IDDM y el síndrome de Stiff Man. Por ejemplo, un fragmento que consiste esencialmente de los aminoácidos 1 - 20 y/o 70 - 101 es reactivo únicamente con anticuerpos de SMS, un fragmento de los aminoácidos 245 - 585 es reactivo con anticuerpos de IDDM y con anticuerpos conformacionales de SMS, y un fragmento que contiene a los aminoácidos 1- 20 y/o 70 - 101 y 245 - 585 es reactivo con todas estas clases de autoanticuerpos.
Una ventaja adicional más de los presentes fragmentos es su capacidad para distinguir diferentes fases temporales en el progreso de la IDDM. Como se discute en el Ejemplo 7, es probable que los autoanticuerpos que tengan la especificidad de enlazamiento de MICA1/MICA3 aparezcan primero, seguidos por los autoanticuerpos que tienen la especificidad de MICA4/MICA6, seguidos por autoanticuerpos que tiene la especificidad de MICA2. De este modo, las proporciones relativas de estos anticuerpos diferentes en un suero de paciente permite monitorear la enfermedad a través de sus fases primarias hasta el inicio clínico y más allá. Los diferentes anticuerpos se distinguen fácilmente utilizando diferentes fragmentos como reactivos de diagnóstico. Un fragmento que contiene un segmento de GAD aproximadamente de los aminoácidos 245 - 585 enlaza a las tres clases de anticuerpos, un fragmento aproximadamente de los aminoácidos 245 - 545 enlaza únicamente a la clase MICA4/6 y un fragmento aproximadamente de los aminoácidos 445 - 585 enlaza únicamente a la clase MICA2.
E. Otros Reactivos de Diagnóstico
Se pueden utilizar los fragmentos de GAD_{65} de la invención para inmunizar animales de laboratorio y por lo tanto derivar anticuerpos monoclonales contra los fragmentos. Se utilizan luego a su vez los anticuerpos monoclonales para inmunizar otros animales y generar anticuerpos anti-idiotípicos. Se selecciona un anti-idiotipo cuyo enlazamiento con el anticuerpo primario es inhibido por un fragmento de GAD_{65}. Debido a que tanto el anticuerpo anti-idiotípico como el fragmento de GAD_{65} enlazan a la inmunoglobulina primaria, la inmunoglobulina anti-idiotípica puede representar la "imagen interna" de un epítopo y por lo tanto se puede sustituir por el fragmento de GAD_{65}. Los anticuerpos anti-idiotípicos se utilizan en métodos de diagnóstico esencialmente de la misma forma que los fragmentos de
GAD_{65}.
II. Métodos de Uso A. Ensayos de Diagnóstico y de Predicción
Los métodos de diagnóstico de la presente invención requieren de técnicas para detectar la interacción específica entre ligandos (por ejemplo, un fragmento de GAD_{65}) y autoanticuerpos. El protocolo particular del ensayo escogido no es crítico, y únicamente es necesario que el ensayo sea lo suficientemente sensible para detectar un nivel de umbral del autoantígeno que se considere que sea positivo. Los ensayos adecuados incluyen protocolos tanto fase sólida (heterogénea) como fase no sólida (homogénea). Se pueden llevar a cabo los ensayos utilizando formatos tanto competitivos como no competitivos, y utilizando una amplia variedad de marcadores, tales como radioisótopos, enzimas, fluorescentes, quimioluminiscentes, marcadores de giro, y similares.
Los anticuerpos de GAD_{65} se detectan a menudo por medio de una técnica de inmunoprecipitación, en la cual los polipéptidos GAD_{65} son marcados con un isótopo o ligando. Los polipéptidos se pueden marcar durante la síntesis (por ejemplo, por medio de la adición de metionina con ^{35}S a un sistema de traducción in vitro o sistema de expresión celular), o después de la síntesis. Se incuba el polipéptido marcado con una muestra de suero para formar inmunocomplejos. Los inmunocomplejos se precipitan con polietilén glicol, con estafilococos aureus o con proteína A inmovilizada sobre cuentas. Después de varios lavados, se cuentan los inmunoprecipitados para evaluar cuanto antígeno radiactivo ha sido precipitado. Opcionalmente, se puede añadir también un polipéptido GAD_{65} no marcado para competir con el polipéptido marcado para enlazamiento con autoanticuerpos.
Algunos ensayos se basan en protocolos heterogéneos donde el ligando es enlazado a una fase sólida que es utilizada para separar el complejo ligando - autoanticuerpo que se forma cuando el autoanticuerpos está presente en una muestra de suero. El ligando puede ser convenientemente inmovilizado sobre una variedad de fases sólidas, tales como varillas indicadoras, partículas, microesferas, partículas magnéticas, tubos de ensayo, pozos de microtitulación, y membranas de nitrocelulosa o de nylon, y similares.
Se expone la fase sólida a una muestra de suero de tal manera que el autoanticuerpo, si lo hay, es capturado por el ligando. Removiendo luego la fase sólida de la muestra de suero, el autoanticuerpo capturado es removido de los autoanticuerpos no enlazados y de otros contaminantes en la muestra de suero. Se puede detectar luego el autoanticuerpo capturado utilizando la técnica "sándwich" no competitiva donde se expone el ligando marcado por el autoanticuerpo a la fase sólida lavada. Alternativamente, los formatos competitivos cuentan con la introducción previa de un anticuerpo marcado de GAD_{65} a la muestra de suero de tal manera que las formas marcada y no marcada compitan por el enlazamiento con la fase sólida. Tales técnicas de ensayo son bien conocidas y están bien descritas tanto en patentes como en literatura científica. Ver, por ejemplo, las patentes estadounidenses Nos. 3.791.932; 3.817.837; 3.839.153; 3.850.752; 3.850.578; 3.853.987; 3.867.517; 3.879.262; 3.901.654; 3.935.074; 3.984.533; 3.996.345; 4.034.074; y 4.098.876. Los métodos de ensayo de inmunoabsorbente ligado a enzimas (ELISA) son descritos en detalle en las patentes estadounidenses Nos. 3.791.932; 3.839.153; 3.850.752; 3.879.262; y 4.034.074. Los ensayos de ELISA detectan títulos muy bajos de autoanticuerpos.
Se pueden detectar también autoanticuerpos por medio de radioinmunoensayos en fase sólida (RIA). Se expone la fase sólida a la muestra de suero en presencia de anticuerpos radiomarcados que compiten por el enlazamiento con el ligando inmovilizado. En este ensayo, la cantidad de radiomarcador enlazado con la fase sólida está inversamente relacionada con la cantidad de autoanticuerpos inicialmente presentes en la muestra de suero. Después de la separación de la fase sólida, se remueve por medio de lavado el radiomarcador no específicamente enlazado, y se determina la cantidad de radiomarcador enlazado a la fase sólida. La cantidad de radiomarcador enlazado, a su vez, está relacionada con la cantidad de autoanticuerpos inicialmente presente en la muestra. En una variación adicional, cuando el ligando es un fragmento de GAD_{65} que contiene suficiente secuencia de aminoácidos para retener la actividad de la L-glutamato 1-carboxilasa, se detecta autoanticuerpo por medio de la extinción de la actividad enzimática en el enlazamiento de autoanticuerpo.
Al menos tres métodos mejorados para detectar autoanticuerpos de GAD_{65} se derivan en parte del descubrimiento de que no se requieren cantidades sustanciales de secuencia N-terminal de GAD_{65} para enlazarse a autoanticuerpos de GAD_{65}. En algunos métodos, se detectan autoanticuerpos de GAD_{65} utilizando fragmentos solubles de GAD_{65}. Los fragmentos se vuelven solubles por medio de la supresión o sustitución de aminoácidos N-terminales. Como se discutió más arriba, al menos aproximadamente los aminoácidos 24 - 31 y, preferiblemente el aminoácido 45 deben ser removidos y/o sustituidos. Se pueden utilizar todos los fragmentos solubles discutidos anteriormente. Las ventajas de los métodos de diagnóstico utilizando fragmentos solubles, particularmente, la facilidad de purificación del fragmento, y la capacidad para realizar el ensayo bajo condiciones no desnaturalizantes, han sido discutidas más arriba (ver la Sección I.D.).
El descubrimiento de los epítopos autorreactivos en la mitad y en la parte C-terminal de la molécula de GAD_{65} no solamente permite la supresión de algunos o de todos los aminoácidos 1 - 244 para crear fragmentos solubles, sino que libera mucha de la región N-terminal para otras modificaciones útiles. Por ejemplo, las fracciones inmovilizadas y/o radioactivas se pueden unir a la parte N-terminal de la enzima sin afectar a los epítopos principales de enlazamiento del anticuerpo, De este modo, algunos métodos de la invención utilizan una proteína de fusión como el reactivo de diagnóstico, y la proteína de fusión puede o no ser soluble. La proteína de fusión tiene dos componentes peptídicos. Un componente es una proteína GAD_{65}, o un péptido del mismo, que tiene al menos un epítopo reactivo con un autoanticuerpo de GAD_{65}. El segundo péptido no está usualmente relacionado con GAD_{65} y es modificado por ingeniería genética para tener una o más propiedades adecuadas para la purificación de la proteína de fusión y/o el uso de la proteína de fusión como un reactivo de diagnóstico. Por ejemplo, en Blanar & Rutter (1992), Science 256: 1014 - 1018 se describe una extensión amino terminal con sitios de reconocimiento para un anticuerpo monoclonal y para una proteína quinasa específica para el sitio. La fusión de tal producto de extensión N-terminal a una proteína o fragmento de GAD_{65} permite que la proteína de fusión sea purificada en una única etapa por medio de cromatografía de inmunoafinidad utilizando el anticuerpo monoclonal para la extensión N-terminal. El fragmento se eluye por medio de cantidades competitivas del péptido correspondiente, en vez de extremos en el pH que dañan a los epítopos diabéticos conformacionales. Se puede inmovilizar luego la molécula a placas de ELISA a través del anticuerpo monoclonal que reconoce al péptido de extensión N-terminal. Cuando se los inmoviliza en esta orientación, los epítopos que enlazan a los anticuerpos principales para diagnóstico de IDDM están alejados de la placa y por lo tanto disponibles para enlazamiento. Esto elimina el problema de impedimento estérico que puede resultar del recubrimiento de las placas directamente con el antígeno. Además, el sitio de la quinasa permite la marcación de la molécula con ^{32}P para radioinmunoensayos muy sensibles y rápidos después de su purificación por medio de cromatografía de inmunoafinidad utilizando el anticuerpo monoclonal. Por ejemplo, se puede marcar un sitio de una quinasa de músculo cardíaco con ATP con ^{32}P y quinasa de músculo cardíaco.
En otros métodos de la invención, se inmoviliza un fragmento de péptido o proteína GAD_{65} en un soporte sólido utilizando un anticuerpo monoclonal específicamente reactivo con un epítopo que se presenta dentro de los aminoácidos 1 - 244 del N-terminal. Estos aminoácidos no se requieren para el enlazamiento de los anticuerpos principales de IDDM con GAD_{65}, y por lo tanto la unión a través de la secuencia N-terminal no daña el enlazamiento con estos autoanticuerpos. Un anticuerpo adecuado para anclar la secuencia N-terminal surge inyectando un péptido formado por los aminoácidos 1 - 244 (o un subfragmento del mismo) en un animal de laboratorio, tal como conejos o ratones, y el aislamiento de un anticuerpo monoclonal por medio de métodos convencionales. Esta aproximación no necesita de la adición de la extensión amino terminal a la molécula de GAD_{65} descrita anteriormente.
La inmovilización del fragmento de GAD_{65} a través del anticuerpo tiene al menos dos ventajas. La primera, que los fragmentos de GAD_{65} pueden ser purificados por medio de cromatografía de inmunoafinidad (un procedimiento suave que preserva la conformación de epítopos autoinmunes). Los fragmentos purificados de GAD_{65} están entonces disponibles para uso, por ejemplo, en ensayos de inmunoprecipitación. Alternativamente, se inmoviliza una preparación cruda de GAD_{65} a través del anticuerpo con las placas para ELISA. GAD_{65} se enlaza a las placas en una orientación que permite que los epítopos sean accesibles a los autoanticuerpos de IDDM. Se retiran las impurezas lavándolas, mientras que la GAD_{65} permanece enlazada. Se detectan luego los autoanticuerpos por medio de
ELISA.
Todos los tres tipos de métodos mejorados de diagnóstico descritos pueden ser utilizados para detectar una o más de las tres clases principales de autoanticuerpos para diagnóstico o IDDM como se describe en los Ejemplos 5 y 7. La detección de estos autoanticuerpos indican que un paciente tiene, o esta en riesgo de padecer IDDM (esto es, que el paciente es prediabético). Los pacientes prediabéticos tienen autoanticuerpos circulando para GAD_{65} pero no han sufrido aún suficiente daño con las células \beta productoras de insulina para ser clínicamente identificados como pacientes con IDDM. Los ensayos son útiles también para monitorear el efecto de la inmunoterapia para bloquear o prevenir las reacciones autoinmunes con las células \beta y para monitorear el progreso de la enfermedad desde la etapa prediabética hasta la diabetes clínica. Los ensayos son útiles también para monitorear el estado de las células \beta pancreáticas trasplantadas en pacientes diabéticos, que han sufrido un injerto de células de islote, donde la presencia de autoanticuerpos de GAD_{65} indica una respuesta inmune adversa a las células trasplantadas.
Los métodos de diagnóstico que utilizan proteínas de fusión N-terminales son igualmente aplicables para detectar autoanticuerpos para diagnóstico del síndrome de Stiff Man que se enlazan a un epítopo lineal formado entre los aminoácidos 1 - 20 ó 70 - 101. Debido a que estos epítopos son no conformacionales, no es probable que la adición de un péptido N-terminal afecte su capacidad de enlazamiento con autoanticuerpos de SMS. Sin embargo, los otros métodos mejorados que involucran la supresión de cantidades sustanciales de secuencia N-terminal o el anclaje de una proteína GAD_{65} o fragmento de la misma a través de su secuencia N-terminal deben ser modificados para la detección del síndrome de Stiff Man. Por ejemplo, mientras se pueden suprimir longitudes sustanciales de la secuencia N-terminal para producir un péptido soluble, la secuencia suprimida usualmente no abarca a los aminoácidos 1 - 20 ó 70 - 101. En forma similar, en los métodos en los cuales el péptido GAD_{65} se ancla a un soporte a través de un anticuerpo monoclonal, el anticuerpo monoclonal se debe enlazar a un epítopo que no se sobreponga a los epítopos de 1 - 120 y 70 - 101 y está usualmente al menos a 10, más usualmente al menos a 50 aminoácidos de distancia de estos
epítopos.
La invención también provee métodos para la detección de ciertos autoanticuerpos de GAD_{65} utilizando fragmentos insolubles de GAD_{65}. Los Ejemplos describen que una clase de autoanticuerpos de IDDM (ejemplificados por MICA2) y dos clases de autoanticuerpos de SMS reconocen epítopos no conformacionales. Por lo tanto, los fragmentos que contienen estos epítopos se pueden purificar por medio de solubilización en detergentes iónicos sin preocuparse de que la perdida de conformación alterará la capacidad de enlazamiento con autoanticuerpos que se enlazan a los epítopos no conformacionales. De este modo, en estos métodos, los fragmentos intactos o insolubles de GAD_{65}, que incluyen un epítopo no conformacional (esto es que incluyen al menos un segmento de los aminoácidos 1 - 20, 70 - 101 ó 545 - 585), se purifican en condiciones desnaturalizantes, y se utilizan luego para detectar autoanticuerpos de GAD_{65}, sin renaturalización.
3. Métodos de Diagnóstico Diferencial
En otro aspecto de la invención, se proveen métodos de diagnóstico que distinguen entre IDDM y el síndrome de Stiff Man, y/o entre diferentes fases temporales en la progresión de la IDDM. Algunos métodos detectan autoanticuerpos para diagnóstico del síndrome de Stiff Man sin detectar autoanticuerpos para diagnóstico de IDDM. En estos métodos, el reactivo de diagnóstico es un fragmento de GAD_{65} que tiene un epítopo reactivo con un autoanticuerpo del síndrome de Stiff Man y está libre de un epítopo reactivo con un autoanticuerpo de IDDM. Por ejemplo, es adecuado un fragmento que contiene los aminoácidos 1 - 20 y/o los aminoácidos 70 - 101 y que está sustancialmente libre de los aminoácidos 245 - 585, de manera que carezca de los tres epítopos de enlazamiento del autoanticuerpo principal de IDDM. Un fragmento que consiste esencialmente de los aminoácidos 1 - 101, también es
adecuado.
Se proveen otros métodos para monitorear el progreso temporal de la IDDM. Estos métodos distinguen entre el reconocimiento temprano y tardío del epítopo y por lo tanto estiman la duración de la respuesta inmune. Los métodos se derivan, en parte, de la identificación de tres epítopos que enlazan diferentes clases de autoanticuerpos para diagnostico de diferentes fases temporales del progreso de la enfermedad. En estos métodos, se expone una muestra de suero de un paciente a un primer fragmento de GAD_{65} que tiene un epítopo reactivo con un primer autoanticuerpo de GAD_{65}. Se detecta la presencia o la ausencia de una interacción específica con un autoanticuerpo de GAD_{65}, que puede o no estar presente en el suero. Estas etapas se repiten luego, utilizando un segundo fragmento de GAD_{65} que tiene un epítopo reactivo con un segundo autoanticuerpo de GAD_{65}.
Los fragmentos adecuados de GAD_{65} para diagnóstico temporal deferencial de la IDDM han sido discutidos en la sección I.D., ver más arriba. En resumen, un fragmento que incluye una secuencia contigua de los aminoácidos 245 - 585 contiene epítopos reactivos con todas las tres clases principales de autoanticuerpos de IDDM. Estas clases son autoanticuerpos que tienen la especificidad de enlazamiento de MICA1/MICA3 (producidos primero), autoanticuerpos que tienen la misma especificidad de enlazamiento que MICA4/6 (producidos en segundo lugar) y autoanticuerpos que tienen la misma especificidad de enlazamiento que MICA2 (producidos en tercer lugar). Un fragmento que carece aproximadamente de los 41 aminoácidos C-terminales (esto es, 545 - 585) es reactivo únicamente con autoanticuerpos de la clase MICA4/MICA6. Un fragmento que incluye a los aminoácidos 545 - 585 y que está sustancialmente libre de los aminoácidos 245 - 295 es reactivo únicamente con autoanticuerpos de la clase MICA2. De este modo, por ejemplo, una interacción específica con un fragmento de los aminoácidos 245 - 585, pero no las otras dos clases de fragmentos indica a un paciente en las fases tempranas de la respuesta autoinmune al epítopo de células \beta. La interacción específica tanto con un fragmento de 245 - 585 como con un fragmento que carece de los 41 aminoácidos terminales indica a un paciente en una fase intermedia de respuesta autoinmune. La reactividad con los tres fragmentos indica una fase tardía de respuesta autoinmune.
4. Valor Predictivo de los Autoanticuerpos de GAD_{65} para Diagnóstico de IDDM
Después del inicio de los síntomas clínicos de la IDDM, aproximadamente setenta por ciento de los pacientes producen al menos una clase de autoanticuerpo de GAD_{65}. En contraste, aproximadamente únicamente 1 - 2% de los pacientes normales produce estos autoanticuerpos. Ver, por ejemplo Karlsen y colaboradores, Diabetes 41, 1355 - 1359 (1992); Hagopian y colaboradores, Diabetes 42, 631 - 636 (1993). Por lo tanto, la detección de autoanticuerpos de GAD_{65} es fuertemente diagnóstica de una IDDM establecida.
La detección de autoanticuerpos de GAD_{65} en individuos normales es también altamente predictiva en la identificación de individuos con riesgo de desarrollar IDDM. En un estudio, se analizaron muestras de suero de niños inicialmente sanos durante un período de tiempo de once años. Siete de las muestras tomadas al comienzo del estudio se encontró que contenían al menos una clase de autoanticuerpos de GAD_{65}. Cinco de los siete niños de los cuales se derivaban estas muestras procedieron a desarrollar IDDM durante el transcurso del estudio. En contraste, entre cien niños cuyas muestras iniciales estaban libres de autoanticuerpos de GAD_{65}, únicamente uno desarrolló IDDM.
B. Método de Tratamiento 1. Inmunotolerancia
Se administran los fragmentos solubles de GAD_{65} descritos anteriormente a un paciente in vivo para inducir tolerancia inmunogénica a los determinantes antigénicos sobre el fragmento soluble. Desde luego, se debe tener cuidado de que la administración de los fragmentos de GAD_{65} no perpetúe la respuesta inmune. La naturaleza de la respuesta (esto es, inmunogénica o tolerogénica) depende de la dosis, de la forma física y de la ruta de administración del antígeno. Dosis altas o bajas de un antígeno conducen a menudo a inmunotolerancia, mientras que dosis intermedias pueden ser inmunogénicas. Las formas monoméricas de antígeno son usualmente tolerogénicas, mientras que agregados de alto peso molecular probablemente son inmunogénicas. Una administración oral, nasal, gástrica o una inyección intravenosa de antígeno frecuentemente conducen a tolerancia, mientras que un reto intradérmico o intramuscular especialmente en presencia de adyuvantes favorece una respuesta inmunogénica. Se ha mostrado que la administración oral de una antígeno autoinmune protege contra el desarrollo de encefalomielitis alérgica experimental en modelos animales, y suprime la artritis reumatoide en modelos animales y en ensayos clínicos. Ver, Marx, Science 252, 27 - 28 (1991); Trentham y colaboradores, Science 261, 1727 - 1730 (1993). También se ha reportado que la administración nasal de un autoantígeno confiere protección contra encefalomielitis alérgica experimental, y es una ruta preferida para administración de fragmentos pequeños. Ver Metzler & Wraith, International Immunology 5, 1159 - 1165 (1993). En algunos métodos, la inmunotolerancia es inducida bajo la cobertura del tratamiento inmunosupresor. Ver, Cobbold y colaboradores, WO90/15152 (1990).
La tolerancia se imparte por medio de la eliminación o de la inducción de no sensibilidad en células T o B autoinmunes. Se puede inducir en parte por medio de la activación de mecanismos supresores por parte del fragmento soluble, que suprime las respuestas celulares y humorales dirigidas al fragmento. La supresión de respuestas celulares es de importancia particular en la prevención de la destrucción de las células \beta pancreáticas en la IDDM. Por lo tanto, los fragmentos de GAD_{65} que específicamente se enlazan a una célula T autoreactiva de GAD_{65} (célula T de GAD_{65}) son particularmente adecuados para la inducción de inmunotolerancia. Ver, por ejemplo, Kaufman y colaboradores, (1993), Nature 366: 69 - 71; Tisch y colaboradores (1993), Nature 366, 71 - 75. La supresión de respuestas humorales se cree que es de importancia particular en la prevención del daño de las neuronas en el síndrome de Stiff Man.
En algunas modalidades, la generación de la falta de respuesta y el consecuente daño de la respuesta autoinmune se facilita por medio del acoplamiento de los fragmentos solubles de GAD_{65} de la presente invención con inmunoglobulinas, por ejemplo, IgG, o con células linfoides del paciente que está siendo tratado. Ver, Bradley-Mullen (1982), Annals N.Y. Acad. Sci. 392: 156 - 166.
2. Inhibición de la Activación de las Células por medio de Péptidos de Bloqueo de GAD_{65}
Los fragmentos solubles de GAD_{65} también son utilizados para inhibir la activación de las células T por medio del bloqueo del enlazamiento de autoantígenos con un receptor de MHC utilizando, por ejemplo, el método descrito por Wraith y colaboradores (1989), Cell 59: 247 - 255. Los fragmentos de GAD_{65} para uso en estos métodos son sometidos primero a una modificación de su secuencia de ocurrencia natural. La modificación se puede efectuar, por ejemplo, por medio de mutagénesis in vitro de fragmentos de ADN que codifican para GAD_{65}, o por medio de una nueva síntesis de péptidos análogos sobre un sintetizador de péptidos. Las modificaciones introducidas dentro de los fragmentos solubles de GAD_{65} sirven para reducir o eliminar la afinidad de enlazamiento de los fragmentos solubles de GAD_{65} por un receptor de células T, mientras que el mantenimiento, o preferiblemente el reforzamiento de la capacidad de los fragmentos para enlazarse a moléculas de MHS. Las moléculas con la especificidad de enlazamiento deseada se pueden seleccionar por medio, por ejemplo, de una tecnología con despliegue de fagos. Ver, por ejemplo, Devlin, WO91/18980. Los fragmentos solubles de GAD_{65} modificados de esta forma compiten con los autoantígenos de GAD_{65} por el enlazamiento con moléculas de MHC, pero son incapaces de activar a las células T cuando están enlazados. Por lo tanto, se reducen la cantidad de autoantígeno auténtico de GAD_{65} enlazada a receptores de MHC, y el grado de respuesta inmune mediada por células T logrado por tal enlazamiento.
3. Eliminación de Células T Específicas para Autoantígenos de GAD_{65}
Otra aproximación para el tratamiento de enfermedades autoinmunes se basa en la inducción de una respuesta inmune de células B dirigida contra las células T responsables por mediar una enfermedad autoinmune. Ver, generalmente, Sinha y colaboradores (1990), Science 248: 1380-1388. En estos métodos, se utilizan fragmentos solubles de GAD_{65} para la propagación y el aislamiento de aislados clonales de células T auxiliares o citotóxicas específicas para el autoantígeno de GAD_{65}. Estas células T o componentes de las mismas son utilizadas luego como una vacuna para inducir una respuesta inmune de las células B.
Se recolectan los linfocitos de sangre periférica de un individuo que sufre, o está en riesgo de sufrir de IDDM o del síndrome de Stiff Man. Se estimulan las células T auxiliares o citotóxicas dentro de los linfocitos de sangre periférica por medio de la exposición a un péptido soluble de GAD_{65}, utilizando métodos conocidos en el arte (ver, por ejemplo, Leukocyte Typing II, Vol. 1 (Reinherz y colaboradores eds., Springer Verlag, NY, 1986). Usualmente, están presentes otros mitógenos y reforzadores de crecimiento, por ejemplo, fitohemaglutinina, interleuquina 2, y similares. Se aíslan los clones de células auxiliares T o de células T citotóxicas de estos cultivos. Se pueden atenuar luego los clones de las células T (por ejemplo, por medio de exposición a la radiación) antes de la incorporación en una composición farmacéutica para administración in vivo. Como una alternativa a la atenuación, porciones de las células T, que son capaces de actuar como inmunógenos, pero que por si mismas carecen de la actividad auxiliar de T o citotóxica de T de una célula intacta, por ejemplo, por fraccionamiento bioquímico. El receptor de las células T o de los fragmentos inmunogénicos de las mismas, que son capaces de una respuesta inmune específica para un aislado clonal de células T, son particularmente adecuados. Se preparan fragmentos de receptores de células T por medio de técnicas convencionales de ADN recombinante.
C. Composiciones Farmacéuticas
Se pueden incorporar fragmentos solubles de GAD_{65} o componentes de células T en composiciones farmacéuticas útiles para atenuar, inhibir, o prevenir la destrucción de células \beta pancreáticas asociadas con el inicio de la diabetes mellitus dependiente de insulina, o el daño de las neuronas asociado con el síndrome de Stiff Man. Las composiciones deben contener una cantidad terapéutica o profiláctica de al menos un fragmento soluble de GAD_{65} y/o un componente de células T (por ejemplo, un fragmento receptor de células T) en un portador farmacéuticamente aceptable. El portador farmacéutico puede ser cualquier sustancia no tóxica compatible adecuada para suministrar los polipéptidos al paciente. Se pueden utilizar como portadores, agua estéril, alcoholes, grasas, ceras, y sólidos inertes. Los adyuvantes farmacéuticamente aceptables, agentes amortiguadores, agentes dispersantes, y similares, pueden ser incorporados también en las composiciones farmacéuticas. La concentración del péptido GAD_{65} o de otro agente activo en la composición farmacéutica puede variar ampliamente, esto es, aproximadamente de menos de 0,1% en peso, usualmente siendo al menos aproximadamente de 1% en peso hasta un 20% en peso o más.
Para administración oral, se puede administrar el ingrediente activo en formas de dosificación sólidas, tales como cápsulas, y polvos, o en formas de dosificación líquida, tales como elíxires, jarabes, y suspensiones. El(los) componente(s) activo(s) se puede(n) encapsular en cápsulas de gelatina junto con ingredientes activos y portadores en polvo, tales como glucosa, lactosa, sacarosa, manitol, almidón, celulosa o derivados de celulosa, estearato de magnesio, ácido esteárico, sacarina sódica, talco, carbonato de magnesio y similares. Los ejemplos de ingredientes inactivos adicionales que pueden ser añadidos para suministrar características deseables de color, sabor, estabilidad, capacidad amortiguadora, dispersión u otras características conocidas deseables son el óxido de hierro rojo, gel de sílice, lauril sulfato de sodio, dióxido de titanio, tinta blanca comestible y similares. Se pueden utilizar diluyentes similares para elaborar tabletas comprimidas. Tanto las tabletas como las cápsulas se pueden elaborar como productos de liberación sostenida para proveer una liberación continuada del medicamento durante un período de horas. Las tabletas comprimidas pueden estar recubiertas de azúcar o recubiertas con una película para enmascarar cualquier sabor desagradable y proteger la tableta de la atmósfera, o con un recubrimiento entérico para desintegración selectiva en el tracto gastrointestinal. Las formas líquidas de dosificación para administración oral pueden contener colorante y saborizante para incrementar la aceptación por parte del paciente.
Una composición típica para infusión intravenosa podría ser elaborada para contener de 100 a 500 ml de solución estéril de Ringer y de 100 a 500 mg de un péptido GAD_{65} o de un péptido receptor de células T. Se elaboraría una composición farmacéutica típica para inyección intramuscular para contener, por ejemplo, 1 ml de agua amortiguada estéril y de 1 a 100 \mug del ligando purificado de la presente invención. Los métodos para preparar composiciones que pueden administrarse en forma parenteral son bien conocidos en el arte y están descritos con más detalle en diferentes fuentes, incluyendo, por ejemplo, Remington's Pharmaceutical Science (15th ed., Mack Publishing, Easton, PA,
1980).
D. Métodos de Administración
Las composiciones farmacéuticas de la presente invención se las administra usualmente en forma intravenosa u oral. La administración intradérmica o intramuscular es posible también en algunas circunstancias. Las composiciones se pueden administrar para tratamiento profiláctico de individuos que sufren de, o que están riesgo de sufrir, de IDDM o de síndrome de Stiff Man, como los identificados por medio de los métodos de diagnóstico de la presente invención. Para aplicaciones terapéuticas, se administran las composiciones farmacéuticas a un paciente que sufre de diabetes establecida en una cantidad suficiente para inhibir o para evitar una destrucción adicional de células \beta. Para individuos con riego de padecer de IDDM o de síndrome de Stiff Man, se administran las composiciones farmacéuticas profilácticamente en una cantidad suficiente ya sea para prevenir o para inhibir la destrucción inmunológica de las células \beta. Una cantidad adecuada para lograr esto está definida como una "dosis terapéuticamente efectiva". Tal dosis efectiva dependerá de la severidad de la respuesta autoinmune y del estado general de salud del paciente, pero estará generalmente en un rango aproximadamente entre 1 y 500 mg de ligando purificado por kilogramo de peso corporal, siendo utilizada más comúnmente una dosis aproximadamente entre 5 y 25 mg por kilogramo.
III. Células T Específicas para Fragmentos de GAD_{65}
También se proveen células T que han sido estimuladas por exposición a un fragmento soluble de GAD_{65}. Las células T son usualmente células T auxiliares o citotóxicas. Las células T son específicas para fragmentos de GAD_{65} ya que ellas exhiben enlazamiento específico con células que soportan tales fragmentos formando complejos con moléculas de MHC. También se proveen componentes de las células T que son capaces de inducir una respuesta inmune contra células T específicas para GAD_{65}. Los componentes son usualmente receptores de células T o fragmentos de los mismos. Los fragmentos del receptor deben ser capaces de inducir una respuesta inmune contra los aislados clonales de células T a partir de los cuales se deriva el fragmento.
Los siguientes ejemplos se ofrecen a manera de ilustración y no como una limitante.
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Ejemplos
Ejemplo 1
Expresión de Proteínas GAD_{65} y GAD_{67}
Se construyeron vectores baculovirus recombinantes que expresan GAD_{67} humana y GAD_{65} de rata ligando un fragmento de BamHI de 1,8 kb de un clon de ADNc que codifica para GAD_{65} humana dentro del sitio BamHI del vector baculovirus pVL 941 (del Dr. D. Morgan, UCSF) y un fragmento de EcoRI de 2,7 kb de GAD_{67} humana o un fragmento EcoRI de 2,4 kb de un clon de ADNc que codifica para GAD_{65} de rata dentro del sitio EcoRI del vector baculovirus pVL1392 (Invitrogen, San Diego, CA). Los ADNc que codifican para GAD_{65} y GAD_{67} eran del Dr. A. Tobin, UCLA. Se derivaron y aislaron los virus recombinantes como se describió (ver, Christgau y colaboradores (1992), J. Cell Biol. 118: 309 - 320) utilizando métodos establecidos (Summers y Smith (1987), Tex. Agric. Exp. Stn. Bull. 1555: 1 - 56). Se describió antes el baculovirus recombinante que hospeda a la GAD_{65} (ver, Christgau y colaboradores (1992), más arriba).
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Ejemplo 2
Expresión de Mutantes de Supresión de GAD_{65}
Se generó un mutante de supresión N-terminal, que carecía de los primeros 101 aminoácidos, por medio de mutagénesis dirigida de oligonucleótidos (ver, Kunkel (1985), Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 82: 488 - 492) del constructo de GAD_{65} de longitud completa insertado dentro del vector pVL1392, y expresado en células de insecto.
Se prepararon otros mutantes de supresión para expresión en células COS-7 (American Type Culture Collection, Bethesda, MD) de la siguiente forma. Se subclonó GAD_{65} dentro de los sitios KpnI y NotI del vector pSV-SPORT (BRL, Gaithersburg, MD). Se generó una colección de mutantes de supresión N-terminales y C-terminales de GAD_{65} por medio de reacción en cadena de la polimerasa (ver, Saiki y colaboradores (1988), Science 239: 487 - 494) en sitios predeterminados utilizando iniciadores anclados. Se generó un mutante interno de supresión que carecía de los aminoácidos 363 - 422 utilizando los sitios de restricción NsiI en GAD_{65}. En forma similar, se utilizaron sitios de restricción BglII para generar una molécula híbrida que contenía los aminoácidos 1 - 95 de GAD_{67} de rata y los aminoácidos 353 - 585 de GAD_{65} de rata. Se analizó la expresión de los fragmentos de proteína por medio transferencias Western utilizando anticuerpos específicos de GAD_{65} o específicos de GAD_{67} como sondas. Estos anticuerpos fueron obtenidos de las siguientes fuentes: GAD1monoclonal de ratón (ver, Gottlieb y colaboradores (1986), Neurobiol. 83: 8808 - 8812), que reconoce las formas nativas de GAD_{65} y de GAD_{67}, a partir de la American Type Tissue Collection. GAD6 monoclonal de ratón (ver, Chang y Gottlieb (1988), J. Neurosci. 7: 2123 - 2130), que es específico para GAD_{65}, fue donado por el Dr. D. Gottlieb (Washington University, St. Louis). Un anticuerpo policlonal de conejo, 1266, surgido contra un péptido C-terminal de GAD_{67} de rata, que reconoce tanto a GAD_{65} como a GAD_{67}, fue un obsequio del Dr. J. S. Petersen, Hagedorn Research Laboratory, Copenhague. El antisuero K2, que reconoce predominante a GAD_{67}, fue un obsequio del Dr. A. Tobin, UCLA. El suero de un paciente con SMS fue obtenido con el Dr. Vanda Lennon (Mayo Clinic, Rochester, NY).
Se purificaron los fragmentos de proteína de células para ensayo como lo describen Christgau y colaboradores (1991), J. Biol. Chem. 266: 21257 - 21264; Christgau y colaboradores (1992), J. Cell Biol. 118: 309 - 320).
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Ejemplo 3
Anticuerpos Monoclonales Contra GAD_{65} Derivados de un Paciente con IDDM
Se examinó la habilidad de un conjunto de anticuerpos monoclonales derivados de un paciente diabético tipo 1 (las MICA 1-6, ver, Richter y colaboradores, más arriba) para reconocer proteínas GAD_{65} y/o GAD_{67} humanas nativas expresadas en células Sf9 de insecto o en células COS-7. Se evaluó el enlazamiento de anticuerpos con GAD_{65} por medio de inmunoprecipitación como lo describen Christgau y colaboradores (1992), ver más arriba; Baekkeskov y colaboradores (1990), Nature 347: 151 - 157).
Las MICA 1, 2, 3, 4, y 6 todas reconocidas por GAD_{65}, pero no por GAD_{67}, bajo condiciones nativas. (Ver, Fig. 2).
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Ejemplo 4
Determinación de la Dependencia de la Conformación de Epítopos Reconocida por Autoanticuerpos de Diabetes Mellitus Dependiente de Insulina
Se determine la dependencia de la conformación analizando la habilidad de las MICA 1 - 4 y 6 para enlazarse con proteína GAD_{65} bajo condiciones desnaturalizantes, como se determinó por medio de transferencias Western (ver, Christgau y colaboradores (1992), más arriba, Baekkeskov y colaboradores (1990), más arriba. Únicamente MICA2 reconoció GAD_{65} desnaturalizada sobre transferencias Western (Fig. 3). Además, el suero del paciente diabético tipo 1 del cual se derivaron las MICA 1 - 6, coloreó débilmente la GAD_{65} desnaturalizada, pero no la GAD_{67}, sobre transferencias Western. Los resultados muestran que las MICA 1, 3, 4 y 6 únicamente reconocen los epítopos no lineales o conformacionales, mientras que MICA2 reconoce a un epítopo lineal específico para la molécula de GAD_{65}. Por lo tanto, la proteína GAD_{65} hospeda epítopos autoinmunes lineales, así como no lineales o conformacionales, ausentes en la molécula de GAD_{67}.
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Ejemplo 5
Mapeo del Epítopo de los Anticuerpos de Diabetes Mellitus Dependiente de Insulina por Medio del Análisis de Mutantes de Supresión
En experimentos de inmunoprecipitación, todas las MICA reconocieron a un mutante de supresión que carecía de los primeros 101 aminoácidos (Fig. 4). Para localizar además los dominios reconocidos por las MICA, se analizaron una cantidad de mutantes de supresión N-terminales así como C-terminales de GAD_{65} de rata expresados en células COS-7 por enlazamiento con las MICA. El tamaño de los fragmentos expresados de GAD_{65}, su ubicación en la secuencia de aminoácidos, y su reactividad con diferentes MICA se resumen en la Fig. 6A. El mutante de supresión N-terminal GAD_{65}N44, que carece de los primeros 194 aminoácidos, así como el mutante de supresión N-terminal GAD_{65}N39, que pierde 50 aminoácidos adicionales (\Delta1 - 244), fueron reconocidos por todos los monoclonales en experimentos de inmunoprecipitación (Figs. 6A y 6B). El mutante de supresión N-terminal GAD_{65}N33, en el cual se han suprimido 51 aminoácidos adicionales del N-terminal (\Delta1 - 295) no fue sin embargo reconocido por las MICA 1, 4, y 6, y fue o bien muy débilmente positivo o negativo con MICA3 y débilmente positivo con MICA2 en experimentos de inmunoprecipitación (Figs. 6A y 6B). MICA2 reaccionó igualmente bien con esta forma sobre transferencias Western que con la molécula de longitud completa. Sin embargo, MICA2, fue únicamente débilmente positiva en experimentos de inmunoprecipitación (Figs. 6A y 6B), sugiriendo que el epítopo lineal reconocido por este anticuerpo monoclonal es secuestrado en la proteína truncada plegada.
El análisis de los mutantes de supresión C-terminales mostro que la remoción de 41 aminoácidos en el C-terminal eliminó el enlazamiento de MICA1, MICA2 y MICA3 (Fig. 6A y 6C). Sin embargo, MICA4 y MICA6 reconocieron tanto a este mutante (GAD_{65}C61, \Delta545 - 585) como al mutante de supresión C-terminal GAD_{65}C53 (\Delta476 - 585) que carecía de 69 aminoácidos adicionales en el C-terminal (Figs. 6A y 6C). MICA4 mostró un enlazamiento más fuerte con ambos mutantes que MICA6. Ninguno de los monoclonales mostró reactividad con el mutante de supresión C-terminal GAD_{65}C41 (\Delta376 - 585), que está perdiendo 100 aminoácidos adicionales en el C-terminal (Fig. 6A).
Para analizar el efecto de las supresiones en la parte interna de la molécula, se analizó el enlazamiento de las MICA con un mutante de supresión, GAD_{65}I59, que carecía de los aminoácidos 363 - 422 que hospedaban al sitio de enlazamiento de piridoxalfosfato de la enzima. Ninguna de las MICA excepto MICA2 reconoció a este mutante en experimentos de inmunoprecipitación. Sin embargo, aunque MICA2 reaccionó igualmente bien con este mutante y con la molécula de longitud completa sobre transferencias Western, se enlazó únicamente débilmente en experimentos de inmunoprecipitación (Fig. 6A) sugiriendo que el epítopo lineal de MICA2 está únicamente parcialmente expuesto bajo las condiciones nativas inmunoprecipitación. Se observó el mismo patrón de reacción con una molécula híbrida que contenía los aminoácidos 1 - 95 de GAD_{67} enlazada a los últimos 233 aminoácidos de GAD_{65} (Fig. 6A). Se puede concluir que los aminoácidos dentro de los últimos 41 aminoácidos de la molécula de GAD_{65} son parte del epítopo lineal MICA2. Entre aquellos 41 aminoácidos los últimos 16 probablemente no juegan un papel debido a que son idénticos a GAD_{67} (ver, Erlander y colaboradores (1991), Neuron. 7: 91 - 100) y debido a las cantidades excesivas de un péptido que contiene esta secuencia no afectó el enlazamiento de ninguna MICA con GAD_{65}. Entre los 5 aminoácidos que difieren entre GAD_{65} y GAD_{67} en los 25 aminoácidos restantes, uno es un cambio conservado. Uno o más de los 4 aminoácidos restantes probablemente juegan un papel principal en el epítopo de MICA2.
El análisis de los mutantes de supresión indica tres patrones principales de reconocimiento de las MICA. Uno, definido por las MICA 1 y 3, depende de los últimos 41 aminoácidos en la molécula. El segundo, definido por las MICA4 y 6, depende de estos residuos y está confinado a los aminoácidos hacia el centro de la molécula. El tercero, definido por MICA2, depende de los últimos 41 aminoácidos en la molécula, pero es independiente de los otros aminoácidos.
GAD_{67} y GAD_{65} son muy diversas en los primeros 95 aminoácidos pero comparten una homología significativa (aproximadamente del 75%) en el resto de la molécula. Ver, Erlander y colaboradores (1991), más arriba. Sin embargo, sorprendentemente, ninguno de los epítopos específicos de GAD_{65} reconocidos por las MICA fue localizados en los primeros 244 aminoácidos en el N-terminal. Por lo tanto, los epítopos de las MICA se concentran en áreas de la molécula que están significativamente apartadas del dominio de anclaje N-terminal en la membrana. Los últimos 110 aminoácidos en el C-terminal no contribuyen con el (los) epítopo(s) de MICA 4 y 6, que abarca(n) a los residuos en la mitad de la molécula. En contraste, la supresión de 41 aminoácidos en el C-terminal elimina los epítopos de las MICA 1 y 3. Además, la supresión de los aminoácidos 245 - 295 elimina todos los cambios conformacionales en la región C-terminal, como lo sugiere el enlazamiento débil de MICA2 con este mutante, mientras que la supresión de los aminoácidos 1 - 41 y 42 - 110 en el C-terminal no parece afectar a la región media de la molécula de GAD_{65} donde los epítopos de las MICA 4 y 6 permanecen intactos. Finalmente, MICA3 se enlazó débilmente con el mutante GAD_{65}N33, mientras que no se detectó enlazamiento con los mutantes de supresión C-terminales. Por lo tanto, la supresión de los aminoácidos 244 - 295 probablemente afecta la conformación de la región C-terminal, mientras que la supresión de los aminoácidos C-terminales parece afectar directamente a los epítopos de las MICA 1 y 3. Una parte significativa del epítopo lineal de MICA2 está localizada entre los aminoácidos 545 y 569, esto es, cerca al
C-terminal.
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Ejemplo 6
Mapeo de Epítopo de los Anticuerpos de GAD_{65} por medio de la Huella Digital de la Proteína
Las similitudes y diferencias en el reconocimiento del epítopo por medio de las MICA fueron analizadas por medio de la huella digital de la proteína (ver, Sheshberadaran & Payne (1988), Proc. Natl. Acad. Sci. 85: 1 - 5), utilizando 500 \mul de sobrenadante de MICA o 10 \mul de GAD6 o GAD1 de ascitis respectivamente. Se aislaron los inmunocomplejos por medio del enlazamiento con proteína-A- sefarosa y se lavó. Para estabilizar los inmunocomplejos, se incubó anticuerpo IgG anti-humano (específico de H+L, fragmentos F(ab)2, Jackson) con el complejo PAS antígeno-anticuerpo durante 45 minutos a 4ºC antes de incubar con proteasas. Las incubaciones con proteasas fueron de 30 minutos sobre hielo (quimotripsina y tripsina) o de 1 hora a 37ºC (quimotripsina). Se detuvo el tratamiento con proteasa lavando los complejos enlazados con PAS en amortiguador de IMP, seguido por análisis SDS-PAGE y fluorografía. Se digirieron los inmunocomplejos de GAD_{65}, enlazadas a las MICA individuales y se estabilizó por medio del enlazamiento con un anticuerpo secundario, con tripsina y quimotripsina. Se analizaron entonces los fragmentos protegidos de la degradación por las MICA, por medio de SDS-PAGE.
La Fig. 5 muestra dos patrones principales distintos de huellas digitales que distinguen a las MICA 1, 2 y 3 de las MICA 4 y 6. Dentro del primer grupo, MICA 1 y 3 mostraron patrones idénticos que fueron similares aunque distintos de aquellos de MICA2. Además, en el Segundo grupo, MICA4 y MICA6 mostraron únicamente diferencias menores (Fig. 5).
Tanto MICA4 como MICA6 protegieron a la molécula de longitud completa de GAD_{65} y a un fragmento de 55 kDa que carecía del N-terminal (ver, Christgau y colaboradores (1992), más arriba), más eficientemente de lo que lo hicieron las MICA 1, 2 y 3. Por lo tanto, en contraste con las MICA 4 y 6, no se detectó GAD_{65} de longitud completa o un fragmento de 55 kDa en inmunocomplejos con las MICA 1, 2 y 3 después de una incubación prolongada con quimotripsina. (Fig. 5, comparación de las líneas 10 y 11 con las líneas 7 y 9). Estos resultados sugieren que la MICA4 y la MICA6 enlazan áreas de la molécula cercanas al N-terminal y por lo tanto protegen esta parte de la molécula mejor que las MICA 1, 2, y 3.
Mientras que las MICA 1, 3, 4 y 6 mostraban aún un patrón de huella digital complejo después de incubaciones prolongadas con quimotripsina (Fig. 5, líneas 7 - 12), únicamente 1 banda de aproximadamente 14 kDa fue protegida por medio de MICA2 bajo esas condiciones (Fig. 5, línea 8).
En resumen, los patrones de huellas digitales complejas de las MICA 1, 3, 4 y 6 son consistentes con un reconocimiento no lineal del epítopo, mientras que el fragmento individual de 14 kDa protegido por MICA2 es consistente con un reconocimiento lineal del epítopo por medio de este anticuerpo monoclonal. Además, los resultados de la huella digital sugieren que las MICA 4 y 6 reconocen áreas más hacia el N-terminal que las MICA 1, 2, y 3.
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Ejemplo 7
Uso de Fragmentos de GAD_{65} para Diagnóstico de Sueros de Pacientes Diabéticos Tipo 1
Se analizaron los sueros de nueve pacientes diabéticos jóvenes tipo 1 recientemente diagnosticados (\Delta1 - 9, Fig. 7) con edades entre 4-1/2 hasta 26 años (6H, 3M), y 1 individuo prediabético (PI, hembra, 11 años de edad) muestreados 32 meses antes del inicio clínico de la enfermedad, por su enlazamiento con los mutantes de supresión N-terminal y C-terminal. Los sueros de pacientes diabéticos tipo 1 fueron obtenidos con el Dr. H. J. Aanstoot (Universidad de Rotterdam, Países Bajos) o descritos previamente (ver, Baekkeskov y colaboradores (1987), J. Clin. Invest. 79: 926 - 934).
Además, se analizaron paralelamente sueros del paciente de quién se derivaron las MICA (D10) y de otro individuo (macho de 24 años), positivos para autoanticuerpos citoplasmáticos de células de islote, pero que no tenían síntomas clínicos de diabetes tipo 1 (P2), (Fig. 7). Todos los once sueros nuevos reconocieron al mutante de supresión N-terminal GAD_{65}N44 (Ä1 - 194) (Fig. 7) al igual que la molécula de longitud completa. La supresión de 244 aminoácidos N-terminales (GAD_{65}N39) resultó en una reactividad ligeramente menor con algo de los sueros (Fig. 7), mientras que la supresión adicional de 51 aminoácidos (GAD_{65}N33) eliminó el reconocimiento por parte de todos los sueros. Los sueros probaron ser distinguibles en el análisis del mutante que carecía de 41 aminoácidos en el C-terminal (GAD_{65}C61). Cuatro sueros incluido el suero del individuo prediabético (PI), muestreados 32 meses antes del inicio clínico de la enfermedad, así como los sueros de tres pacientes recientemente diagnosticados (D3, hembra de 11 años, D4, macho de 4,5 años, y D5, macho de 26 años), todos los cuales fueron fuertemente positivos para los anticuerpos de GAD_{65}, mostraron ser o bien muy débiles o no reactivos con el mutante GAD_{65}C61 (Fig. 7). El resto de los sueros eran aún fuertemente positives para esta proteína truncada (Fig. 7). En resumen, la supresión de 1/3 de la molécula de GAD_{65} del N-terminal no resultó en una disminución detectable en inmunoreactividad con los sueros diabéticos, mientras que la supresión de 41 aminoácidos del C-terminal efectivamente eliminó los epítopos reconocidos por algunos de los sueros de los pacientes. Ninguno de los 11 sueros de los pacientes reconoció GAD_{65} sobre transferencias Western y por lo tanto no contenían autoanticuerpos con un reconocimiento lineal de epítopo, tal como MICA2.
Las frecuencias relativas con las cuales las tres diferentes clases de anticuerpos de diabetes mellitus se presentan en diferentes muestras de suero se pueden relacionar con el tiempo en el cual se producen. En enfermedades autoinmunes, tanto la autoinmunidad humoral como la celular están a menudo dirigidas a un epítopo dominante único en las fases tempranas pero pueden propagarse a otras regiones en el autoantígeno con mayor duración de respuestas autoinmunes (ver, McNeilage y colaboradores, (1990), J. Immunol. 145: 3829 - 3835; St. Clar y colaboradores, (1990), J. Clin. Invest. 85: 515; Lehmann y colaboradores, (1992), Nature 358: 155 - 157). Los autoanticuerpos de GAD_{65} han sido detectados durante fases tempranas de destrucción de células \beta pancreáticas, que es a menudo varios años antes de que la mayoría de las células \beta hayan desaparecido y se hayan desarrollado los síntomas clínicos (ver, Baekkeskov y colaboradores, (1987), más arriba, Atkinson y colaboradores, (1990), Lancet 335: 1357 - 1360). Estas observaciones sugieren que la respuesta autoinmune primaria puede estar limitada a autoanticuerpos contra un epítopo único, con autoanticuerpos más diversos desarrollándose posteriormente durante la respuesta autoinmune primaria. Por lo tanto, es probable que los epítopos de GAD_{65} definidos por las MICA representen tanto respuestas humorales tempranas como tardías. El epítopo definido por las MICA 1 y 3, que fue reconocido por todos los sueros analizados, es probablemente indicativo de una respuesta humoral temprana. El epítopo definido por las MICA 4 y 6, que fue reconocido por algunos, pero no por todos los sueros analizados, probablemente representa una respuesta humoral intermedia. El epítopo definido por MICA2, que fue reconocido únicamente por sueros del paciente de quien se derivaron las MICA, probablemente representa una respuesta humoral tardía. Las respuestas tumorales progresivas propuestas par alas diferentes clases de epítopos se pueden confirmar monitoreando las muestras de suero de individuos prediabéticos durante un período de tiempo.
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Ejemplo 8
Mapeo del Epítopo de Autoanticuerpos del Síndrome de Stiff Man
Se han llevado a cabo experimentos para localizar epítopos reconocidos por sueros de pacientes con SMS sobre la molécula de GAD_{65}. Se construyeron mutantes de supresión N-terminales de GAD_{65} en los cuales se suprimieron los primeros 69 - 70 o los primeros 101 aminoácidos. Se analizaron estos fragmentos para el enlazamiento con autoanticuerpos en sueros de pacientes con SMS bajo condiciones desnaturalizantes. La Fig. 8 muestra la coloración de transferencias Western de GAD_{67} intacta, GAD_{65} intacta, de un fragmento tríptico de 57 kDa de GAD_{65}, que carecen de los primeros 69 - 70 aminoácidos, y un mutante de supresión de 55 kDa de GAD_{65} que carece de los primeros 101 aminoácidos con i) un suero típico del SMS, que reconoce GAD_{65} pero no GAD_{67}, que muestra una coloración más débil con el fragmento de 57 kDa que la proteína de longitud completa, y que no muestra reactividad con el mutante de supresión de 55 kDa, ii) sueros de conejo policlonales de conejo de control, los cuales colorean todos los fragmentos.
La Fig. 8 muestra que la reactividad de los sueros del SMS con la proteína GAD_{65} cae significativamente en el fragmento de GAD_{65} que carece de los primeros 69 - 70 aminoácidos, indicando que un epítopo lineal está localizado dentro de estos residuos. La pérdida completa de reactividad en el fragmento \Delta 101 de GAD_{65} indica que un segundo epítopo está localizado entre los aminoácidos 69 ó 70 y el aminoácido 101. De 26 muestras analizadas de sueros del SMS, 22 mostraron los resultados anteriores.
Los dos epítopos lineales identificados por medio de transferencias Western han sido localizados adicionalmente por medio de experimentos de enlazamiento competitivo utilizando péptidos GAD_{65} artificiales. Se ha encontrado que los péptidos que contienen los aminoácidos 1 - 20 ó 70 - 101 de GAD_{65} efectivamente compiten con los sueros del SMS por el enlazamiento con GAD_{65}. Los resultados localizan un epítopo en los aminoácidos 1 - 20, y otro epítopo en los aminoácidos 70 - 101.
La diferencia clara en el reconocimiento del epítopo entre autoanticuerpos de pacientes que sufren de IDDM y del síndrome de Stiff Man sugiere que la autoinmunidad humoral con GAD_{65} está probablemente relacionada con los diferentes mecanismos patogénicos a través de los cuales surge el síndrome de Stiff Man o la IDDM.
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Ejemplo 9
Localización del Dominio N-Terminal de GAD_{65} que Confiere Insolubilidad sobre la Proteína Intacta
Como se discutió anteriormente, el dominio N-terminal de GAD_{65} contiene modificaciones lipídicas que hacen insoluble a la proteína intacta en solventes acuosos. Este Ejemplo localiza los sitios de los aminoácidos en los cuales se presentan las modificaciones, y que deben ser removidos para generar un fragmento soluble de GAD_{65}.
Para analizar si los residuos de cisteína en las posiciones 30 y 45 son sitios de palmitoilación, se construyeron polipéptidos mutantes GAD_{65} por medio de mutagénesis dirigida al sitio en la cual uno o ambos de estos residuos fueron reemplazados con residuos de alanina. Los mutantes individuales fueron llamados 30A y 45A, y el mutante doble fue llamado 30/45A. Los vectores que contenían estos tres mutantes de GAD, GAD_{65} de tipo silvestre o un mutante \Delta101 de GAD_{65} se expresaron en forma transitoria en células COS en el medio que contenía ácido palmítico con [^{3}H] o metionina con [^{35}S]. Se inmunoprecipitaron los polipéptidos GAD_{65} y se los analizó por medio de SDS PAGE. La Fig. 9 compara la incorporación de una marcación en la variedad de tipo silvestre; en el mutante 30A, en el mutante 45A, en el mutante \Delta1-101, y en el mutante 30/45A. La figura muestra que el mutante doble 30/45A, pero no los mutantes individuales 30A o 45A, han perdido la habilidad para convertirse en palmitoilados. El mutante \Delta 101 ha perdido también la habilidad para convertirse en palmitoilado.
Aunque los análisis anteriores identifican a los aminoácidos 30 y 45 como los sitios de palmitoilación, otros aminoácidos N-terminales pueden ser objeto de otras modificaciones lipídicas. Esta posibilidad fue analizada por medio de la construcción de una serie de mutantes de supresión del fragmento 30/45A de GAD_{65}, en los cuales se suprimieron cantidades crecientes de la secuencia N-terminal. Se insertaron los fragmentos en los vectores de expresión y se los transformó dentro de células COS. Se extrajo la proteína celular total de las células COS que expresan GAD65 o a un mutante de supresión N-terminal con amortiguador Hepes más TX-114 al 1%, y se dividió entre una fase acuosa (A) y una fase detergente (D) en un ensayo de partición en TX-114. Se analizaron las fracciones por medio de SDS PAGE, y se detectaron los polipéptidos GAD_{65} por medio de transferencias Western utilizando sueros contra un péptido GAD_{65} C-terminal como la sonda. La Fig. 10 muestra que para GAD_{65} de tipo silvestre y los mutantes de supresión 30/45A \Delta 1 - 8, 30/45A A 1 - 15 y 30/45A \Delta 1 - 23, el fragmento de GAD_{65} aparece en ambas fases, la acuosa y la detergente. Sin embargo, para los mutantes 30/45A \Delta 1 - 31 y 30/45A \Delta 1 - 38, el fragmento de GAD_{65} aparece exclusivamente en la fase acuosa. La comparación de los aminoácidos presentes en los polipéptidos hidrófobos e hidrofílicos indica que los aminoácidos 24 - 31 confieren la hidrofobicidad de los polipéptidos
GAD_{65}.
Estos resultados han sido confirmados por medio de análisis de inmunofluorescencia de células intactas que expresan GAD_{65} de tipo silvestre o un mutante de supresión 30/45A \Delta 1 - 38 de la misma. Mientras que la proteína GAD_{65} de tipo silvestre se encuentra concentrada en estructuras membranosas perinucleares consistentes con el anclaje en la proteína, la ubicación del mutante de supresión N-terminal es citosólica.
Se concluye que se puede producir un fragmento soluble de GAD_{65} por medio de la supresión de los aminoácidos 24 - 31 y, preferiblemente, la mutación del aminoácido 45. Desde luego, supresiones N-terminales más sustanciales que abarcan estos cambios son también efectivas, por ejemplo, la supresión de los aminoácidos 1 - 45. Se produciría también un fragmento soluble de GAD_{65} por medio de la síntesis del fragmento bajo condiciones, por ejemplo, de traducción in vitro, bajo las cuales no ocurren las modificaciones posteriores a la traducción.
Aunque la anterior invención ha sido descrita en detalle para propósitos de claridad en su comprensión, será obvio que se pueden practicar ciertas modificaciones dentro del alcance de las reivindicaciones adjuntas.
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Referencias citadas en la descripción
Este listado de referencias citado por el solicitante es únicamente para conveniencia del lector. No forma parte del documento europeo de la patente. Aunque se ha tenido gran cuidado en la recopilación, no se pueden excluir los errores o las omisiones y la OEP rechaza toda responsabilidad en este sentido.
Documentos de patente citados en la descripción
\bullet US 98493592 A [0001]
\bullet US 3879262 A [0082] [0082]
\bullet US SN07756207 A [0001]
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\bullet US 3935074 A [0082]
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Richter, Wiltrud
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Namchuk, Mark
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Kim, John
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<120> Métodos y Reactivos Mejorados para el Diagnóstico y el Tratamiento de Diabetes y del Síndrome de Stiff Man
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<160> 2
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<170> PatentIn versión 3.3
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<210> 1
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<211> 585
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 1
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1
2
3
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<211> 585
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<212> PRT
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<213> Rattus sp.
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<400> 2
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Claims (36)

1. Un método para elaborar un fragmento soluble de una proteína GAD_{65} que es especialmente reactiva con un autoanticuerpo de GAD_{65}, que comprende la expresión de un vector que codifica al fragmento soluble para producir el fragmento soluble, en donde el fragmento está libre de aminoácidos N-terminales que limitan la solubili-
dad.
2. El método de la Reivindicación 1, en donde los aminoácidos N-terminales son los aminoácidos 24 a 31, y 45, que tienen un residuo de alanina en la posición 45 del fragmento en lugar de un residuo de cisteína de ocurrencia natural.
3. El método de la Reivindicación 2, en donde los aminoácidos N-terminales son los aminoácidos 1 a 244.
4. El método de la Reivindicación 1, en donde el fragmento está libre de un segmento que tiene un epítopo específicamente reactivo con un segundo autoanticuerpo de GAD_{65}.
5. El método de la Reivindicación 4, en donde el segmento es de los aminoácidos 545 a 585.
6. El método de la Reivindicación 4, en donde el segmento es de los aminoácidos 245 a 295.
7. El método de la Reivindicación 6, en donde el fragmento consiste de al menos ocho aminoácidos contiguos de los aminoácidos 545 a 585.
8. El método de la Reivindicación 1, en donde el fragmento comprende una secuencia contigua de los aminoácidos 245 a 585, y el fragmento comprende tres epítopos diferentes específicamente reactivos con tres diferentes autoanticuerpos de GAD_{65}.
9. El método de la Reivindicación 8, en donde dicho fragmento está libre de los aminoácidos 1 a 101.
10. El método de la Reivindicación 1, en donde el fragmento comprende una secuencia contigua de al menos ocho aminoácidos de la secuencia de aminoácidos 70 a 101.
11. El método de la Reivindicación 10, en donde el fragmento comprende una secuencia contigua de los aminoácidos 70 - 101.
12. El método de la Reivindicación 1, en donde el fragmento comprende una secuencia contigua de al menos ocho aminoácidos de los aminoácidos 1 a 20.
13. El método de la Reivindicación 12, en donde el fragmento comprende una secuencia contigua de los aminoácidos 1 a 20.
14. El método de la Reivindicación 11, en donde el fragmento consiste de los aminoácidos 70 a 101.
15. El método de la Reivindicación 12, en donde el fragmento consiste de los aminoácidos 1 a 20.
16. Un polipéptido de fusión GAD_{65} inmovilizado a un soporte sólido, el polipéptido de fusión incluyendo un polipéptido GAD_{65} específicamente reactivo con un autoanticuerpo de GAD_{65}, y un polipéptido de extensión fusionado al N-terminal del polipéptido GAD_{65}, en donde el polipéptido de fusión está inmovilizado al soporte a través del péptido de extensión.
17. Un polipéptido GAD_{65} inmovilizado a un soporte sólido, en donde el polipéptido es específicamente reactivo con un autoanticuerpo de GAD_{65}, y el polipéptido está inmovilizado al soporte a través de un anticuerpo anti-GAD_{65} específicamente reactivo con un epítopo dentro de los aminoácidos 1 - 244 del polipéptido GAD_{65}.
18. Un método para detectar autoanticuerpos de GAD_{65} en sueros, el método comprendiendo:
exponer una muestra de suero a un fragmento soluble de GAD_{65} producido como se reivindica en cualquiera de las Reivindicaciones 1 a 15 que es específicamente reactivo con un autoanticuerpo de GAD_{65}; y
detectar una interacción específica entre el fragmento de GAD_{65} y el autoanticuerpo.
19. El método de la Reivindicación 18, en donde el fragmento de la misma secuencia de aminoácidos es de ocurrencia natural.
20. El método de la Reivindicación 18 o la Reivindicación 19, en donde el autoanticuerpo de GAD_{65} es un autoanticuerpo de célula pancreática \beta de 64 kDa.
21. El método de cualquiera de las Reivindicaciones 18 a 20, en donde el fragmento soluble de GAD_{65} está marcado.
22. El método de la Reivindicación 21 que comprende además la etapa de precipitar un complejo formado entre el fragmento soluble de GAD_{65} y el autoanticuerpo de GAD_{65} antes de la etapa de detección.
23. El método de la Reivindicación 21 que comprende además la etapa de añadir un polipéptido GAD_{65} no marcado que compite con el fragmento marcado de GAD_{65} por el enlazamiento específico con el autoanticuerpo de GAD_{65}.
24. El método de la Reivindicación 20, que comprende además la etapa de combinar la muestra de suero con un anticuerpo marcado que compite con el autoanticuerpo para formar complejos con el fragmento de GAD_{65}.
25. El método de la Reivindicación 24, en donde el fragmento de GAD_{65} se enlaza a una fase sólida y el método comprende además la etapa de remover la fase sólida de la muestra de suero para separar los complejos de anticuerpo marcado no enlazado.
26. Un método para detectar autoanticuerpos de GAD_{65} en sueros, el método comprendiendo:
proveer un polipéptido de fusión que incluye una proteína GAD_{65} o fragmento de la misma, específicamente reactivo con un autoanticuerpo de GAD_{65}, y un polipéptido de extensión fusionado al N-terminal de la proteína o del fragmento;
inmovilizar el polipéptido de fusión a un soporte sólido a través del polipéptido de extensión;
exponer una muestra de suero al polipéptido de fusión; y detectar una interacción específica entre el fragmento y el autoanticuerpo.
27. Un método para detectar autoanticuerpos de GAD_{65} en sueros, el método comprendiendo:
proveer un primer anticuerpo específicamente reactivo con un primer epítopo que se presenta dentro de los aminoácidos 1 a 244 o un polipéptido GAD_{65};
inmovilizar el primer anticuerpo a un soporte sólido; exponer el polipéptido GAD_{65} al primer anticuerpo para inmovilizar la proteína a dicho soporte a través del primer anticuerpo, en donde el polipéptido GAD_{65} incluye a un primer epítopo reactivo con un autoanticuerpo de GAD_{65}; exponer una muestra de suero al fragmento de GAD_{65}; y
detectar una interacción específica entre el fragmento de GAD_{65} y el autoanticuerpo.
28. El método de la Reivindicación 27, en donde el polipéptido GAD_{65} es de ocurrencia natural y el primer anticuerpo es específicamente reactivo con un primer epítopo entre los aminoácidos 60 y 120 del péptido GAD_{65}.
29. Un método para diagnosticar o monitorear diabetes mellitus dependiente de insulina en un paciente, comprendiendo el método:
exponer una muestra de suero del paciente a un fragmento soluble de GAD_{65} que tiene un epítopo específicamente reactivo con un autoanticuerpo de GAD_{65} para diagnóstico de diabetes mellitus dependiente de insulina producido como en cualquiera de las Reivindicaciones 1 - 15; y
detectar la interacción entre el fragmento y el autoanticuerpo diagnóstico para la diabetes mellitus dependiente de insulina.
30. Un método para monitorear el progreso de la diabetes mellitus dependiente de insulina en un paciente, el método comprendiendo las etapas de:
exponer una muestra de suero del paciente a un primer fragmento de GAD_{65} que incluye un primer epítopo específicamente reactivo con un primer autoanticuerpo de GAD_{65}, en donde el fragmento de GAD es producido de acuerdo con cualquiera de las Reivindicaciones 1 - 15;
detectar una interacción específica entre el primer fragmento y el primer autoanticuerpo;
exponer la muestra de suero a un segundo fragmento de GAD_{65} que incluye un segundo epítopo específicamente reactivo con un segundo autoanticuerpo de GAD_{65}; y
detectar una interacción específica entre el segundo fragmento y el segundo autoanticuerpo.
\newpage
31. El método de la Reivindicación 30, en donde el primer autoanticuerpo es diagnóstico de una primera fase temporal de la diabetes mellitus dependiente de insulina y el segundo autoanticuerpo es diagnóstico de una segunda fase temporal de diabetes mellitus dependiente de insulina.
32. El método de la Reivindicación 31, en donde los fragmentos son solubles.
33. Una composición farmacéutica que incluye un fragmento soluble de GAD_{65} específicamente reactivo con un autoanticuerpo de GAD_{65}, en donde el fragmento está libre de aminoácidos N-terminales que limitan la solubilidad, en un portador farmacéuticamente aceptable.
34. El uso de un fragmento soluble de GAD_{65} en la fabricación de una composición para uso en terapia en un método para tratar a un paciente que sufre de, o que está en riesgo de padecer de diabetes mellitus dependiente de insulina o de síndrome de Stiff Man.
35. Un fragmento soluble de GAD_{65}, en donde el fragmento está libre de aminoácidos N-terminales que limitan la solubilidad, y que contiene un epítopo específicamente reactivo con un autoanticuerpo de GAD_{65} y acoplado con una inmunoglobulina o célula linfoide de un paciente que va a ser tratado con eso.
36. Un fragmento soluble de una proteína GAD_{65}, en donde el fragmento está libre de aminoácidos N-terminales que limitan la solubilidad, y es específicamente reactivo con un autoanticuerpo de GAD_{65} para uso en un método de tratamiento o profilaxis de IDDM.
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