ES2305077T3 - Serina-treonina-proteina-cinasa neuronal. - Google Patents
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Abstract
Ácido nucleico, que codifica una serina-treonina-proteína-cinasa neuronal, elegido entre a) el ácido nucleico, con una de las secuencias según SEQ ID Nr. 1 - 4 y el ácido nucleico que codifica una proteína con una secuencia según una de las SEQ ID Nr. 5 - 8; b) el ácido nucleico, que codifica una proteína, que presente al menos una identidad del 70% con respecto a una proteína según una de las SEQ ID Nr. 5 - 8, y cuya expresión pueda ser inducida por medio de isquemia cerebral focal y por reperfusión.
Description
Serina-treonina-proteína-cinasa
neuronal.
La presente invención se refiere a una
serina-treonina-proteína-cinasa,
a ácidos nucleicos, que codifican esta cinasa y a su empleo para el
diagnóstico y la terapia de enfermedades neuronales y
neoplásticas.
La apoplejía, que se denomina también embolia,
derrame cerebral, insulto apoplético, participa aproximadamente en
el 15% de todos los casos de fallecimiento, quedando afectados de
igual modo los hombres y las mujeres. Los síntomas comprenden
trastornos de la conciencia hasta el coma, frecuentemente incluso
hemiplejía espástica, cuadros muy diversos de carencias motoras
centrales, sensibles y sensoriales así como espasmos focales o
generalizados. En cualquier caso, una apoplejía consiste en un
trastorno circulatorio acompañado de carencia de oxígeno en la zona
de una región cerebral circunscrita. Como desencadenantes entran en
consideración dos mecanismos fundamentales. En primer lugar una
hemorragia masiva, encefalorragia, que participa en el 15% de los
casos, presentándose ésta, tras la rotura de los vasos, en la
mayoría de los casos, tras la rotura de las arterias
estrio-lenticulares, con lo cual se destruyen
regiones cerebrales limitadas. Este mecanismo tiene como
consecuencia una elevada letalidad. Como dolencias causales entran
en consideración, de manera especial, la hipertonia, la
arteriosclerosis, el aneurisma intracraneal y, en raros casos, una
coagulopatía por consumo de factores. Como segundo mecanismo
participa un infarto cerebral, encefalomalacia, considerándose ésta
como origen en el 85% de los casos. En este caso se produce, por
regla general, la formación de una necrosis. Los orígenes de la
misma son, entre otras cosas, una trombosis arterial, una
tromboembolia o una isquemia funcional con el lumen vascular
abierto, por ejemplo como consecuencia de una caída de la presión
sanguínea. El infarto cerebral "necrosis isquémica" constituye
entre el 70 y el 80% aproximadamente de las causas de la apoplejía.
Frecuentemente la arteriosclerosis representa la dolencia causante
fundamental. La sintomatología de una encefalomalacia, rara, que se
desarrolla lentamente, se denomina como ictus progresivo
"progressive stroke". Deben ser considerados como síntomas
precoces de un infarto cerebral los síntomas carenciales
neurológicos que se presentan de manera pasajera sin formación de
deterioro tisular ("ataques isquémicos transitorios"). Se
supone que el origen se debe a un trastorno circulatorio limitado
pasajero debido a una estenosis o provocado por microembolias. El
diagnóstico abarca, además de una exploración general y
neurológica, también una tomografía computarizada craneal, una
exploración doble por ultrasonidos cerebrovascular, una punción
lumbar, una escintilografía cerebral dinámica, un EEG así como una
tomografía por resonancia magnética nuclear.
El fundamento molecular de la isquemia y de los
cuadros sucesivos, relacionados con la misma, son casi desconocidos
hasta el momento actual. Sin embargo se supone que es necesaria una
serie compleja de procesos bioquímicos hasta la aparición de la
apoplejía.
La presente invención tenía como fundamento el
problema industrial de identificar los genes que participan en la
génesis de la apoplejía como consecuencia de carencias locales de
oxígeno y, por lo tanto, abrir nuevas posibilidades de profilaxis y
de terapia para la apoplejía. De igual modo, la presente invención
tenía como fundamento el problema industrial de encontrar proteínas
que participen en la génesis de la apoplejía.
Los problemas industriales citados se resuelven
por medio de un ácido nucleico, que codifique una
serina-treonina-proteína-cinasa,
eligiéndose el ácido nucleico entre:
- a)
- el ácido nucleico, con una de las secuencias según SEQ ID Nr. 1 - 4 y el ácido nucleico que codifica una proteína con una secuencia según una de las SEQ ID Nr. 5 - 8;
- b)
- el ácido nucleico, que codifica una proteína, que presente al menos una identidad del 70% con respecto a una proteína según una de las SEQ ID Nr. 5 - 8, y cuya expresión pueda ser inducida por medio de isquemia cerebral focal y por reperfusión.
\vskip1.000000\baselineskip
De igual modo, se describen los ácidos nucleicos
siguientes:
- i)
- el ácido nucleico, que hibridiza con un ácido nucleico según a);
- ii)
- el ácido nucleico, que fue hibridizado con un ácido nucleico según a), teniéndose en consideración la degeneración del código genético;
- iii)
- los derivados de un ácido nucleico según a) - c), obtenidos por substitución, por adición, por inversión y/o por deleción de una o de varias bases; y el ácido nucleico complementario a un ácido nucleico según a) - d).
\vskip1.000000\baselineskip
A título de ejemplo se intercambiarán en los
derivados de las proteínas según la SEQ ID Nr. 5 - 8 los restos de
arginina por restos de lisina, los restos de valina por restos de
isoleucina y los restos del ácido asparagínico por restos del ácido
glutamínico. En este caso son muy similares las propiedades
fisicoquímicas de los aminoácidos intercambiados y de los ácidos
intercambiantes (por ejemplo la ocupación espacial, la basicidad, la
hidrofobicidad). Sin embargo pueden intercambiarse también uno o
varios aminoácidos con respecto a su orden, aportarse o eliminarse,
o pueden combinarse entre sí varias de estas medidas. Las proteínas,
que están modificadas de este modo con respecto a las SEQ ID Nr.
5-8 tienen, de manera preferente, al menos un 70% y,
de manera especialmente preferente, al menos un 90% de identidad
secuencial con respecto a las secuencias SEQ ID Nr.
5-8, calculada según el algoritmo de Altschul et
al., J. Mol. Biol., 215, 403-410, 1990. La
proteína aislada y sus variantes funcionales pueden aislarse
ventajosamente del cerebro de mamíferos tales como el Homo
sapiens, el Rattus norvegicus o el Mus musculus.
De igual modo deben entenderse por variantes funcionales los
homólogos procedentes de otros mamíferos.
Los ácidos nucleicos, de conformidad con la
invención, según las SEQ ID Nr. 1 - 4 representan ácidos nucleicos,
como los que se aíslan a partir del ratón (SEQ ID Nr. 1 y 2) o bien
de los seres humanos (SEQ ID Nr. 3 y 4). En este caso los ácidos
nucleicos según la SEQ ID Nr. 2 y según la SEQ ID Nr. 4 son
variantes de empalme de mayor longitud de la SEQ ID Nr. 1 o bien de
la SEQ ID Nr. 3. Se considerarán de conformidad con la invención
también aquellos ácidos nucleicos, que codifiquen una proteína, que
presente de manera preferente al menos un 70%, de manera muy
especialmente preferente al menos un 90% de identidad con respecto a
una de las proteínas tales como las SEQ ID Nr. 1 - 4.
Los "derivados" de conformidad con la
invención de los ácidos nucleicos precedentemente citados, por
ejemplo las variantes alelofórmicas, se diferencian de los ácidos
nucleicos citados según las SEQ ID Nr. 1 - 4 por la substitución,
por la adición, por la inversión y/o por la deleción de una o de
varias bases, manteniéndose, sin embargo, la actividad cinasa. Los
derivados, tales como los homólogos o las secuencias de ácidos
nucleicos secuencialmente emparentadas pueden aislarse a partir de
todas las especies de mamíferos, con inclusión de los seres
humanos, según los procedimientos usuales mediante hibridación con
una de las secuencias de ácidos nucleicos de conformidad con la
invención o con fragmentos de los mismos.
Se entenderá por "equivalentes funcionales"
también los homólogos del ácido nucleico según la SEQ ID Nr. 1 - 4,
por ejemplos los homólogos procedentes de otros mamíferos, las
secuencias acortadas, el ADN de hebra sencilla o el ARN o el APN de
las secuencias de ácidos nucleicos codificantes y no codificantes.
Tales equivalentes funcionales pueden aislarse a partir de los
ácidos nucleicos de las SEQ ID Nr. 1 - 4, por ejemplo con los
procedimientos usuales de hibridación o con la técnica de la RCP, a
partir de otros vertebrados, tales como mamíferos. Para la
hibridación se utilizan de manera ventajosa oligonucleótidos de
regiones conservadas, que pueden ser determinadas por el técnico en
la materia de manera conocida. Sin embargo pueden utilizarse también
para la hibridación fragmentos de mayor longitud de los ácidos
nucleicos de conformidad con la invención o la secuencia completa.
Según el ácido nucleico - oligonucléotido, fragmento de mayor
longitud o secuencia completa - empleados o según el tipo de ácido
nucleico que sea utilizado para la hibridación - ADN o ARN - se
modifican las condiciones patrón para la hibridación. De este modo,
las temperaturas la fusión de los híbridos de ADN: ADN se
encuentran por ejemplo aproximadamente 10º por debajo de la de los
híbridos de ADN-ARN de igual longitud.
Se entenderá por "condiciones patrón", por
ejemplo, según las temperaturas del ácido nucleico comprendidas
entre 42 y 58ºC en una solución tampón acuosa con una concentración
comprendida entre 0,1 y 5 x SSC (1 X SSC = NaCl 0,15 M, citrato de
sodio 15 mM, pH 7,2) o adicionalmente en presencia de un 50% de
formamida tal como por ejemplo 42ºC en 5 x SSC, 50% de formamida.
De manera ventajosa las condiciones para la hibridación para los
híbridos de ADN:ADN son de 0,1 x SSC y a temperaturas comprendidas
entre aproximadamente 20ºC y 45ºC, de manera preferente
comprendidas entre aproximadamente 30ºC y 45ºC. Para los híbridos de
ADN: ARN las condiciones para la hibridación se encuentran
ventajosamente en 0,1 x SSC y a temperaturas comprendidas entre
aproximadamente 30ºC y 55ºC, de manera preferente comprendidas
entre aproximadamente 45ºC y 55ºC. Estas temperaturas indicadas
para la hibridación son, por ejemplo, los valores calculados de la
temperatura de fusión para un ácido nucleico con una longitud de
aproximadamente 100 nucleótidos y con un contenido G + C del 50% en
ausencia de formamida. Las condiciones experimentales para la
hibridación de ADN han sido descritas en los manuales especializados
de la genética, tal como por ejemplo la publicación Sambrook et
al., "Molecular Cloning", Cold Spring Harbor Laboratory,
1989 y pueden calcularse según las fórmulas conocidas por el técnico
en la materia, por ejemplo en función de la longitud de los ácidos
nucleicos, del tipo de los híbridos o del contenido G + C. El
técnico en la materia puede ver otras informaciones relativas a la
hibridación en los siguientes manuales: Ausubel et al.
(eds), 1985, Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley
& Sons, New York; Hames and Higgins (eds), 1985, Nucleic Acids
Hybridization: A Practical Approach, IRL Press at Oxford University
Press, Oxford; Brown (ed), 1991, Essential Molecular Biology: A
Practical Approach, IRL Press at Oxford University Press,
Oxford.
Se entenderá igualmente por el concepto de
"derivados" las secuencias de conformidad con la invención
según las SEQ ID Nr. 1 - 4 también las variantes del promotor, que
se encuentren conectadas por delante de las regiones codificantes
de las secuencias de conformidad con la invención; éstas pueden
modificarse mediante uno o varios intercambios de nucleótidos,
mediante inserción, mediante adición y/o mediante deleción, sin que
queden afectadas negativamente las propiedades del promotor,
especialmente la potencia del promotor y la aptitud a la inducción.
El concepto de derivado abarca sin embargo, también, aquellas
variantes de promotores, que queden reforzadas en cuanto a su
actividad a partir de las secuencias de conformidad con la invención
por medio de uno o de varios intercambios de nucleótidos.
Las "enfermedades neoplásticas" son
aquellas, que están relacionadas con un comportamiento de
crecimiento anormal de las células, la eliminación de los
mecanismos intercelulares de inhibición, etc. A éstas pertenecen,
por ejemplo, los carcinomas como proliferaciones anormales de
células endodermales, las enfermedades linfoneoplásticas, los
melanomas, etc.
Un ácido nucleico preferente codifica una
proteína con una secuencia según una de las SEQ ID Nr. 5 - 8 o una
proteína que presente al menos un 70% de identidad con respecto a
una de las secuencias citadas.
En otra forma preferente de realización, el
ácido nucleico tiene una identidad al menos del 70% con respecto a
los segmentos codificantes de una de las secuencias según una de las
SEQ ID Nr. 1 - 4.
En otra forma preferente de realización, el
ácido nucleico codifica una secuencia proteínica según una de las
SEQ ID Nr. 5 - 8, siendo especialmente preferente el ácido nucleico,
que codifica la SEQ ID Nr. 7.
De manera preferente, el ácido nucleico de
conformidad con la invención es un ADN, pudiendo entrar en
consideración sin embargo también un ARN o un APN.
Como ácido nucleico, de conformidad con la
invención, son especialmente preferentes aquellos, que sean
adecuados de inhibir la expresión de una
serina-treonina-cinasa en
orientación no codificante o antisentido con respecto a un promotor
tras la introducción en una célula huésped.
Los constructos, de conformidad con la
invención, contienen la secuencia de ácidos nucleicos, de
conformidad con la invención, en combinación con otras secuencias,
con las cuales no están asociados usualmente en el genoma de una
célula huésped. Tales "secuencias foráneas" son, de manera
preferente, elementos genéticos de regulación, las señales de
transcripción y las señales de traducción (denominados también como
"elementos reguladores de la expresión" o secuencias derivadas
de vectores). Las secuencias, de conformidad con la invención,
están enlazadas funcionalmente con estos elementos.
Este enlazamiento puede conducir a un aumento o
a una disminución de la expresión génica, de conformidad con la
aplicación deseada. Con los constructos de ácidos nucleicos
recombinantes, preparados de este modo, pueden transformarse
organismos huésped. Además de estas secuencias reguladoras, puede
estar presente la regulación natural de estas secuencias por
delante de los genes estructurales propiamente dichos y puede ser
modificada genéticamente en caso dado de tal manera, que la
regulación natural sea interrumpida y quede aumentada la expresión
de los genes. Sin embargo, el constructo génico puede estar formado
también de una manera más sencilla, es decir que no se insertan
señales de regulación adicionales por delante de las secuencias y no
se elimina el promotor natural con su regulación. En su lugar puede
mutarse la secuencia reguladora natural de tal manera, que ya no se
verifique ningún tipo de regulación y que se aumente la expresión
génica. Sobre el extremo 3' de las secuencias de ácidos nucleicos,
de conformidad con la invención, puede insertarse otros elementos
reguladores ventajosos. Las secuencias de los ácidos nucleicos
según las SEQ ID Nr. 1 - 4 y/o las secuencias que codifican las
proteínas correspondientes según las SEQ ID Nr. 5 - 8 pueden estar
contenidas en una o en varias copias de un constructo génico, o
pueden estar localizadas en constructos génicos independientes. Las
secuencias reguladoras ventajosas están contenidas, por ejemplo, en
los promotores tales como el promotor cos, el promotor tac, el
promotor trp, el promotor tet, el promotor trp-tet,
el promotor Ipp, el promotor lac, el promotor
Ipp-lac, el promotor laclq, el promotor T7, el
promotor T5, el promotor T3, el promotor gal, el promotor trc, el
promotor ara, el promotor SP6, el promotor I-PR o el
promotor I-PL, que encuentran aplicación, de manera
preferente, en las bacterias gram-negativas. Otras
secuencias reguladoras ventajosas están contenidas, por ejemplo, en
los promotores gram-positivos tales como amy y SPO2,
en los promotores de la levadura tales como ADC1, MFa, AC,
P-60, CYC1, GAPDH o en los promotores de los
mamíferos tales como CaM-cinasa 11, CMV, nestina,
L7, BDNF, NF, MBP, NSE, beta-globina, GFAP, GAP43,
la tirosina hidroxilasa, la subunidad 1 receptora de cainato, la
subunidad B receptora del glutamato. En principio pueden emplearse
todos los promotores naturales con sus secuencias reguladoras como
las que han sido citadas precedentemente. De igual modo, pueden
emplearse, ventajosamente también, los promotores sintéticos. Estas
secuencias reguladoras deben posibilitar la expresión específica de
las secuencias de los ácidos nucleicos y la expresión proteínica.
Esto puede significar, por ejemplo, según el organismo huésped, que
el gen es expresado o que es sobreexpresado solamente tras la
inducción, o que es expresado y/o que es sobreexpresado
inmediatamente. De manera preferente, las secuencias reguladoras o
bien los factores reguladores pueden influenciar en este caso
positivamente la expresión y, de este modo, pueden aumentarla. De
este modo puede llevarse a cabo un reforzamiento de los elementos
reguladores, de manera ventajosa, en el plano de la transcripción,
utilizándose potentes señales de transcripción tales como promotores
y/o "reforzadores". Sin embargo, también es posible un
reforzamiento de la traducción, mejorándose, por ejemplo, la
estabilidad del ARNm. Se entenderá por "reforzadores", por
ejemplo, aquellas secuencias de ADN, que provoquen una expresión
acrecentada mediante un efecto de interacción mejorado entre la
ARN-polimerasa y el ADN. A título de otras
secuencias reguladoras pueden citarse, por ejemplo, las "regiones
de control local" ("locus control regions"), los
"silenciadores" ("silencer") o cualquier secuencia parcial
de los mismos. Estas secuencias pueden emplearse, de manera
ventajosa, para una expresión específica del tejido. Una forma
preferente de realización consiste en el enlazamiento de la
secuencia de ácidos nucleicos, de conformidad con la invención, con
un promotor, colocándose el promotor en el sentido 5' "hacia
arriba". Otras señales reguladoras tales como los terminadores
situados en 3' o las señales de poliadenilación o los reforzadores
pueden encontrar aplicación funcional en el constructo de los
ácidos nucleicos. Se entenderá bajo el concepto también los
constructos vectoriales completos. Estos constructos vectoriales o
vectores se utilizan para la expresión en un organismo huésped
adecuado. De manera ventajosa se insertarán los ácidos nucleicos
y/o los genes, de conformidad con la invención, para las
Ser-Thr-proteínacinasas en un vector
específico para el huésped, que posibilite una expresión óptima de
los genes en el huésped seleccionado. Los vectores son
perfectamente conocidos por el técnico en la materia y pueden
tomarse, por ejemplo, del libro Cloning Vectors (Eds. Pouwels P. H.
et al. Elsevier, Amsterdam-New
York-Oxford, 1985, ISBN 0 444 904018). De igual modo
se entenderá por vectores, además de los plásmidos, también todos
los otros vectores conocidos por el técnico en la materia tales
como, por ejemplo, los fagos, los virus tales como el SV40, el CMV,
el baculovirus, el adenovirus, el virus Sindbis, los transposones,
los elementos IS, los fásmidos, los fagémidos, los cósmidos, los
ADN lineales o circulares. Estos vectores pueden replicarse de
manera autónoma en el organismo huésped o pueden replicarse por vía
cromosómica. Para la integración en los mamíferos se utilizará, de
manera ventajosa, ADN lineal. La expresión de las secuencias de
ácidos nucleicos, de conformidad con la invención, o bien del
constructo de ácidos nucleicos recombinante puede aumentarse de
manera ventajosa mediante el aumento del número de copias génicas
y/o mediante el reforzamiento de los factores reguladores, que
influyen positivamente sobre la expresión génica. De este modo puede
llevarse a cabo un reforzamiento de los elementos reguladores de
manera preferente en el plano de la transcripción, utilizándose
señales de transcripción más potentes tales como promotores y
reforzadores. Sin embargo es posible, de igual modo, un
reforzamiento de la traducción, mejorándose, por ejemplo, la
estabilidad del ARNm o aumentándose la eficiencia de lectura de
este ARNm sobre los ribosomas. Para aumentar el número de copias
génicas pueden incorporarse las secuencias de los ácidos nucleicos
o los genes homólogos, por ejemplo en un fragmento de ácido nucleico
o bien en un vector, que contenga, de manera preferente, las
secuencias génicas reguladoras, asociadas con los genes
correspondientes o que contenga una actividad de promotor que actúe
de manera análoga. De manera especial se utilizarán aquellas
secuencias reguladoras, que refuercen la expresión génica. Las
secuencias de los ácidos nucleicos, de conformidad con la
invención, pueden ser clonadas en un solo vector junto con las
secuencias que codifican proteínas interactuantes y, a continuación,
pueden expresarse en el organismo deseado. De manera alternativa
puede aportarse también cada una de las secuencias de los ácidos
nucleicos potencialmente interactuantes y las secuencias, que
codifican m30, respectivamente en un vector independiente y éstos
pueden aplicarse, por separado, en el organismo correspondiente por
medio de los métodos usuales tales como la transformación, la
transfección, la transducción, la electroporación o el cañón de
partículas. De igual modo puede expresarse el constructo de los
ácidos nucleicos de conformidad con la invención o los ácidos
nucleicos, de conformidad con la invención, también en forma de
fragmentos adecuados desde el punto de vista terapéutico y de
diagnosis. Para la generación de la proteína recombinante pueden
emplearse sistemas vectoriales u oligonucleótidos, que prolonguen a
los ácidos nucleicos o al constructo de los ácidos nucleicos con
determinadas secuencias de nucleótidos y que codifiquen, de este
modo, polipéptidos modificados, que sirvan para una purificación
más sencilla. Se han dado a conocer en la literatura a título de
tales "marcadores" ("Tags"), por ejemplo el marcador de
hexa-histidina o los epitopos, que puedan ser
reconocidos como antígenos de diversos anticuerpos (Studier et
al., Meth. Enzymol., 185, 1990: 60 - 89 y Ausubel et al.
(eds.) 1998, Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley
& Sons, New York).
Como células huésped son adecuadas, en
principio, todas aquellas células que posibiliten una expresión de
los ácidos nucleicos, de conformidad con la invención, sus variantes
alelofórmicas, sus equivalentes o sus derivados funcionales o del
constructo recombinante de los ácidos nucleicos. Por células huésped
se entenderán, por ejemplo, las bacterias, los hongos, las
levaduras, las células vegetales o animales. Las células/ organismos
huésped preferentes son las bacterias tales como Escherichia
coli, Streptomyces, Bacillus o Pseudomonas, microorganismos
eucariotas tales como Saccharomyces cerevisiae, Aspergillus,
células eucariotas superiores procedentes de los seres humanos o de
los animales, por ejemplo las células COS, Heia, HEK293, Sf9 o CHO.
La combinación formada por el organismo huésped y por los vectores
apropiados para los organismos tales como los plásmidos, los virus
o los fagos tales como, por ejemplo, los plásmidos con el sistema de
ARN-polimerasa/promotor, los fagos 1, Mu u otros
fagos o transposones atenuados y/o otras secuencias ventajosamente
reguladoras constituyen un sistema de expresión. Se entenderá por
el concepto de sistema de expresión, de manera preferente, por
ejemplo la combinación constituida por células de mamíferos tales
como células CHO y por vectores tales como el
neo-vector pcDNA3 o las células HEK293 y el vector
CMV, que son adecuados para las células de los mamíferos. Sin
embargo entran también en consideración los sistemas de expresión
in vitro, exentos de células.
También entran en consideración, como huéspedes,
de conformidad con la invención, para la expresión de los ácidos
nucleicos, de conformidad con la invención, tejidos de mamíferos,
órganos de mamíferos o bien mamíferos transgénicos no humanos. Los
huéspedes citados se diferencian del tipo silvestre preferentemente
en que contienen una cantidad modificada de la proteína de
conformidad con la invención en comparación con el tipo silvestre o
bien en una nueva variante proteínica de la
proteína-cinasa, de conformidad con la invención.
Sin embargo quedan abarcados también los organismos huésped, en los
cuales se haya retirado bien por completo o bien en parte el ácido
nucleico, de origen natural, que codifican una proteína de
conformidad con la invención o que hayan sido modificados de tal
manera, que sean inactivos a la transcripción.
De manera preferente, los citados organismos
contienen el ácido nucleico, de conformidad con la invención, o
bien el constructo, de conformidad con la invención, integrado en un
punto del genoma, que no corresponda a su posición natural, como se
presenta en el tipo silvestre.
Como mamíferos transgénicos no humanos entran en
consideración, de manera preferente, los ratones, las ratas, los
corderos, las terneras o los cerdos, entrando en consideración, sin
embargo, como receptores de las secuencias, de conformidad con la
invención, también los organismos no mamíferos, tales como las
plantas. Los organismos transgénicos pueden estar constituidos
también por los denominados animales transgénicos
(Knock-Out). En este caso, los animales
transgénicos pueden contener una secuencia de ácidos nucleicos, de
conformidad con la invención, funcional o no funcional o pueden
contener un constructo de ácidos nucleicos funcional o no funcional.
Otra configuración, de conformidad con la invención, de los
animales transgénicos, precedentemente descritos, está constituida
por animales transgénicos no humanos, en cuyas células germinales o
en la totalidad o en una parte de las células somáticas; o en cuya
célula germinal y en la totalidad o en una parte de las células
somáticas se haya modificado la secuencia de nucleótidos, de
conformidad con la invención, por medio de procedimientos de
ingeniería genética o se haya interrumpido mediante la inserción de
elementos de ADN. Otra posibilidad para el empleo de la secuencia
de nucleótidos o de partes de la misma consiste en la generación de
animales transgénicos o knock-out o de animales
transgénicos knock-out condicionales o
regioespecíficos o de mutaciones específicas en animales
genéticamente modificados (Ausubel et al. (eds.) 1998,
Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, New
York y Torres et al., (eds.) 1997, Laboratory protocols for
conditional gene targeting, Oxford University Press, Oxford).
Pueden generarse modelos animales mediante sobreexpresión
transgénica o mediante mutación genética (mutación nula o
deleciones, inserciones o modificaciones específicas) mediante
recombinación homóloga en células madres embrionales, cuyos modelos
animales puedan proporcionar otras informaciones valiosas sobre la
patogénesis de la apoplejía. Los modelos animales preparados de esta
manera pueden representar sistemas de ensayo esenciales para la
evaluación productos terapéuticos novedosos.
Las proteínas, de conformidad con la invención,
pueden ser obtenidas mediante la expresión de uno de los ácidos
nucleicos, de conformidad con la invención, en un sistema de
expresión adecuado, entrando en consideración, de manera
preferente, células intactas que abarquen sistemas de expresión. De
manera preferente, la proteína de conformidad con la invención, es
una proteína elegida entre una proteína con una de las secuencias
según las SEQ ID Nr. 5 - 8 o una proteína, que sea idéntica con
respecto a las secuencias citadas al menos en un 70%, de manera
especialmente preferente al menos en un 90%. En este caso el "% de
identidad" se calcula con respecto a las secuencias según las
SEQ ID Nr. 5 - 8 según el algoritmo de Altschul et al., J.
Mol. Biol, 250, 403 - 410, 1990. Sin embargo, la proteína, de
conformidad con la invención, y las variantes funcionales de la
misma pueden aislarse también a partir del cerebro de los mamíferos
tales como el Homo sapiens, el Rattus norvegicus o el
Mus musculus. Las proteínas, de conformidad con la invención,
son también aquellas que se deriven de una proteína según una de
las SEQ ID Nr. 5 - 8 mediante intercambio de aminoácidos,
permaneciendo esencialmente sin modificaciones la actividad de la
proteína-cinasa. A título de ejemplo pueden
reemplazarse los aminoácidos en la proteína de partida según las
SEQ ID Nr. 5 - 8 por aquellas con propiedades fisicoquímicas
similares (ocupación especial, basicidad, hidrofobicidad, etc.). A
título de ejemplo pueden intercambiarse restos de arginina por
restos de lisina, restos de valina por restos de isoleucina o restos
de ácido asparagínico por restos de ácido glutamínico. Sin embargo
pueden intercambiarse también uno o varios aminoácidos con respecto
a su orden, pueden ser insertados o eliminados, o pueden combinarse
entre sí varias de las medidas citadas. El técnico en la materia
conoce las medidas para la modificación de una secuencia dada de
aminoácidos para dar una secuencia deseada.
La obtención de los anticuerpos, de conformidad
con la invención, que reaccionan con una proteína, de conformidad
con la invención, es conocida por el técnico en la materia. Con esta
finalidad, el técnico en la materia puede recurrir, por ejemplo, de
la obtención de antisueros policlonales o bien puede recurrir la
tecnología del hibridoma para la obtención de anticuerpos
monoclonales.
Los inhibidores, de conformidad con la
invención, son aquellas substancias de bajo peso molecular o bien
aquellas substancias de tipo proteína, que inhiban de manera
selectiva la actividad de la proteína-cinasa de la
proteína de conformidad con la invención o bien que la puedan
interrumpir por completo. Es posible, sin mayores problemas, que el
técnico en la materia identifique y prepare inhibidores adecuados
mediante el empleo de los ensayos tradicionales de
proteína-cinasa para el cribado de substancias. Los
procedimientos de cribado adecuados y los ensayos de
proteína-cinasa se describen más adelante. De igual
modo pueden identificarse substancias adecuadas con una afinidad de
enlace deseada mediante el empleo del desarrollo de productos
activos con ayuda del ordenador (CAD) (véase por ejemplo la
publicación de Böhm, Klebe, Kubinyi, 1996, Wirkstoffdesign,
Spektrum-Verlag, Heidelberg). Los inhibidores de la
proteína-cinasa, de conformidad con la invención,
identificados de este modo, son adecuados, por ejemplo, para la
profilaxis y/o para la terapia de la apoplejía y de otras
enfermedades neurológicas (en particular neurodegenerativas) o
neoplásticas. Como inhibidores para las substancias de bajo peso
molecular citadas entran en consideración también los péptidos y
las proteínas, que puedan entrar en una interacción específica con
el inhibidor de proteína-cinasa de conformidad con
la invención. Tales inhibidores de péptidos o bien de proteínas
pueden identificarse, por ejemplo, con ayuda del sistema de dos
híbridos o también incluso con otros ensayos. Estos ensayos
permiten la delimitación de los aminoácidos, que son responsables de
una interacción específica con otros participantes en la
interacción. De igual modo puede ensayarse la proteína de
conformidad con la invención y su actividad de
proteína-cinasa sencillamente en un sistema de
ensayo, midiéndose la actividad de la proteína en presencia de la
substancia que debe ser ensayada. En este caso se trata, de manera
preferente, de métodos de medición sencillos (técnicas
calorimétricas, luminométricas, basadas en la fluorescencia o
radioactiva), que permiten la rápida medición de una pluralidad de
substancias de ensayo (véase la publicación de Böhm, Klebe,
Kubinyi, 1996, Wirkstoffdesign, Spektrum-Verlag,
Heidelberg). Los sistemas de ensayo descritos permiten la
exploración de bibliotecas químicas para encontrar substancias, que
tengan efectos inhibidores o bien incluso efectos activadores sobre
las proteínas de conformidad con la invención. La cadena de
transducción de señales puede inhibirse con estos inhibidores, cuya
cadena es inducida en el caso de la isquemia y transcurre a través
de la proteína de conformidad con la invención. Esto posibilita
inhibir o bien impedir las secuelas isquémicas.
De igual modo pueden identificarse por medio del
sistema de selección de dos híbridos, precedentemente citado, los
participantes en la interacción, intracelulares, fisiológicos, de la
proteína-cinasa de conformidad con la invención,
tal como el substrato de fosforilación, así como los participantes
intracelulares en la interacción que regulan la actividad
cinasa.
La cantidad proteínica puede determinarse con
ayuda de anticuerpos y de igual modo puede determinarse la actividad
(por ejemplo la fosforilación específica) de la proteína con las
secuencias de las SEQ ID Nr. 5-8. Por lo tanto,
otro objeto de la invención consiste en un procedimiento para la
cuantificación de la actividad proteínica de una proteína con una
de las secuencias SEQ ID Nr. 5-8. A partir de las
secuencias de los aminoácidos según las SEQ ID Nr.
5-8 pueden generarse péptidos sintéticos, que se
utilizan como antígenos para la producción de anticuerpos. De igual
modo es posible emplear el polipéptido o fragmentos del mismo para
la generación de anticuerpos. Con el concepto de "anticuerpos"
quieren indicarse tanto los anticuerpos policlonales, monoclonales,
humanos o humanizados o recombinantes o fragmentos de los mismos,
anticuerpos de cadena simple (single chain) o incluso anticuerpos
sintéticos. Se entenderá por anticuerpos de conformidad con la
invención o sus fragmentos, en principio, todas las clases de
inmunoglobulina tales como la IgM, la IgG, la IgD, la IgE, la IgA o
sus subclases tales como las subclases del IgG o sus mezclas. Son
preferentes el IgG y sus subclases, tales como por ejemplo el IgG1,
el IgG2, el IgG2a, el IgG2b, el IgG3 o el IgGM. Son especialmente
preferentes los subtipos IgG1/k o IgG2b/k de IgG. Como fragmentos
son citados todos los fragmentos de anticuerpos acortados o
modificados con uno o dos puntos de enlace complementarios del
antígeno, tales como partes de anticuerpos con un punto de enlace
formado por cadenas ligeras y por cadenas pesadas, que corresponden
a los anticuerpos, tales como fragmentos Fv, Fab o F(ab')2 o
fragmentos monocatenarios. Son preferentes los fragmentos
bicatenarios acortados tales como Fv, Fab o F(ab')2. Estos
fragmentos pueden obtenerse, por ejemplo, por vía enzimática
mediante la disociación de la parte Fc del anticuerpo con enzimas
tales como papaína o pepsina, mediante oxidación química o mediante
manipulación por ingeniería genética de los genes de los
anticuerpos. De igual modo pueden emplearse, de manera ventajosa,
los fragmentos no acortados, genéticamente manipulados. Los
anticuerpos o los fragmentos pueden emplearse por sí solos o en
mezclas. Los genes de los anticuerpos para las manipulaciones
realizadas por ingeniería genética pueden aislarse en forma conocida
por el técnico en la materia, por ejemplo a partir de las células
hibridoma (Harlow, E. and Lane, D. 1988, Antibodies: A Laboratory
Manual, Cold Spring Harbor Press, N.Y.; Ausubel et al.,
(eds), 1998, Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley
& Sons, New York). Con esta finalidad se cultivan células
productoras de anticuerpos y se aíslan de manera conocida a partir
de las células los ARNm, cuando la densidad óptica de las células
sea suficiente, mediante lisis celular con tiocianato de
guanidinio, acidificación con acetato de sodio, extracción con
fenol, cloroformo/alcohol isoamílico, precipitación con isopropanol
y lavado con etanol. A continuación se sintetiza con ayuda de la
transcriptasa inversa ADNc a partir del ARNm. El ADNc sintetizado
puede insertarse directamente o tras manipulación genética por
ejemplo mediante la mutagénesis localmente dirigida ("site
directed mutagenesis"), el aporte de inserciones, inversiones,
deleciones o intercambio de bases en vectores animales, fúngicos,
bacterianos o virales adecuados y expresarse en los organismos
huésped correspondientes. Serán preferentes los vectores
bacterianos o los vectores de levaduras tales como pBR322, pUC18/19,
pA-CYC184, los vectores lambda o los vectores mu de
levadura para la clonación de los genes y para la expresión en
bacterias tales como E. coli o bien en las levaduras tales
como Saccharomyces cerevisiae. Los anticuerpos específicos
contra las proteínas, de conformidad con la invención, pueden ser
adecuados tanto como reactivos de diagnóstico así como también como
productos terapéuticos para las enfermedades, en las cuales tenga un
significado patofisiológico la proteína de conformidad con la
invención.
El estuche de diagnóstico, de conformidad con la
invención, contiene uno de los ácidos nucleicos de conformidad con
la invención, o un constructo que lo contenga, una proteína de
conformidad con la invención y/o un anticuerpo, que sea específico
para la proteína de conformidad con la invención, así como los
reactivos adicionales que, de manera usual, constituyen parte
integrante del estuche para el diagnóstico. A éstos pertenecen las
soluciones tampón, adecuadas, y otros reactivos de detección.
La muestra del paciente se pone en contacto, en
el procedimiento de conformidad con la invención, para la diagnosis
de un riesgo de apoplejía o para evaluar el desarrollo de un infarto
cerebral, con un ácido nucleico de conformidad con la invención y
se determina en la muestra del paciente el ácido nucleico
hibridizado de este modo. Un nivel elevado en ácido nucleico, que
hibridice con el ácido nucleico de conformidad con la invención, es
un factor indicador de un riesgo elevado de la aparición de una
apoplejía. De manera alternativa, para la detección del ácido
nucleico en la muestra del paciente podrá determinarse también la
cantidad de proteína, de conformidad con la invención, como factor
indicador de un riesgo de apoplejía. Para la detección de la
proteína pueden emplearse, por ejemplo, los anticuerpos de
conformidad con la invención. Un nivel elevado en proteína en la
muestra del paciente que debe ser ensayada es, igualmente, un factor
indicador de un riesgo mayor de apoplejía. Estas determinaciones
pueden llevarse a cabo también, sin otros problemas, de manera
cuantitativa, siendo el control negativo el material de un paciente
sano.
De igual modo pueden emplearse el ácido
nucleico, de conformidad con la invención, así como la proteína
codificada por el mismo o bien los oligonucleótidos y los péptidos
de los mismos así como los anticuerpos dirigidos contra los
anteriores, para el diagnóstico de otras enfermedades, especialmente
de las enfermedades neurológicas o cardiovasculares o inmunológicas
o tumorales. De igual modo, estos materiales pueden aplicarse para
el diagnóstico de predisposiciones genéticas para determinadas
enfermedades neurológicas, neoplásticas, cardiovasculares e
inmunológicas. De igual modo, puede llevarse a cabo con estos
materiales una monitorización del tratamiento de las enfermedades
citadas.
Un procedimiento para la detección cualitativa y
cuantitativa de un ácido nucleico, de conformidad con la invención,
en una muestra biológica, comprende las etapas siguientes: a) la
incubación de una muestra biológica con una cantidad conocida de
ácido nucleico de conformidad con la invención o con una cantidad
conocida de oligonucleótidos, que sean adecuados como cebadores
para una amplificación del ácido nucleico de conformidad con la
invención, b) la detección del ácido nucleico de conformidad con la
invención por medio de una hibridación específica o por medio de
una amplificación por RCP, c) la comparación de la cantidad de ácido
nucleico hibridizado o de ácido nucleico obtenido mediante la
aplicación por RCP con un patrón cuantitativo. Un procedimiento para
la detección cualitativa y cuantitativa de un heterómero proteínico
de conformidad con la invención o de una proteína, de conformidad
con la invención, en una muestra biológica, comprende las etapas
siguientes: a) la incubación de una muestra biológica con un
anticuerpo, que esté específicamente dirigido contra el heterómero
proteínico o contra la proteína de conformidad con la invención, b)
la detección del anticuerpo/del complejo antígeno, c) la
comparación de la cantidad del anticuerpo/complejo antígeno con un
patrón cuantitativo. Como patrón se tomará, usualmente, una muestra
biológica de un organismo sano. De manera especial, en este caso
puede aprovecharse la propiedad, indicada más adelante, del ácido
nucleico según las SEQ ID Nr. 1 - 4 para elevar la regulación tras
determinados estímulos patofisiológicos, tales como por ejemplo las
isquemias cerebrales I. Esto se refiere, por ejemplo, a la
evaluación del desarrollo de enfermedades (tal como por ejemplo de
la apoplejía), a la evaluación de los éxitos conseguidos con la
terapia, a la graduación de una enfermedad.
La composición farmacéutica, de conformidad con
la invención, contiene un ácido nucleico, de conformidad con la
invención, un constructo que lo contiene, una célula huésped que
contiene los objetos citados, una proteína de conformidad con la
invención, un anticuerpo dirigido contra la anterior y/o un
inhibidor de conformidad con la invención en caso dado junto con
los productos auxiliares y excipientes usuales.
Las aplicaciones terapéuticas de los objetos de
conformidad con la invención se refieren a la modulación de los
procesos, que dependen de la fosforilación de las proteínas
fisiológicas. A éstos pertenecen también los siguientes
acontecimientos fisiológicos o bien patofisiológicos: la
influenciación de los procesos de activación inmunológicos (por
ejemplo la activación de monocitos, de células T); la influenciación
de los procesos de la muerte celular, por ejemplo cascadas, que
conduzcan a la muerte celular, o de procesos que conduzcan a un
crecimiento ilimitado. A los tipos celulares que pueden ser tratados
pertenecen, de manera especial, las células neurales, las células
tumorales y las células del sistema inmunitario. Finalmente pueden
influenciarse con los materiales, de conformidad con la invención,
las interacciones celulares, en las que participan las
proteína-cinasas, por ejemplo la división celular,
la diferenciación celular, la plasticidad y la regeneración.
El ácido nucleico, de conformidad con la
invención, así como el constructo que los contiene, las células
huésped correspondientes así como la proteína, de conformidad con
la invención, el anticuerpo de conformidad con la invención y/o el
inhibidor de conformidad con la invención puede emplearse, de manera
especial, para la profilaxis y/o para la terapia de las
enfermedades neurológicas, especialmente de las enfermedades
neurodegenerativas. A éstas pertenecen, de manera especial, la
apoplejía, la esclerosis múltiple, el Morbus Parkinson, la
esclerosis lateral amiotrófica, las ataxias heterodegenerativas, el
Morbus Huntington, las neuropatías y las epilepsias.
De igual modo pueden diagnosticarse/terapiarse
preferentemente con los mismos las enfermedades tumorales. Ejemplos
de tales enfermedades tumorales son, por ejemplo, el carcinoma de
colon, el rabdomiosarcoma, el carcinoma bronquial.
Los ácidos nucleicos, de conformidad con la
invención, pueden emplearse también en el ámbito de la terapia
génica en los mamíferos y, de manera especial, en los seres humanos.
En la terapia génica pueden emplearse las secuencias, de
conformidad con la invención, bien en el cuerpo o en partes del
mismo o puede regularse la expresión de las secuencias
fisiológicas, tal como, por ejemplo, por medio de la tecnología no
codificante o antisentido. Con esta finalidad pueden utilizarse
oligonucleótidos, por ejemplo con orientación antisentido o pueden
utilizarse oligonucleótidos del híbrido de ARN-ADN,
que contengan secuencias de conformidad con la invención. De igual
modo pueden emplearse constructos virales, que contengan una
secuencia de conformidad con la invención. Finalmente puede
emplearse el ADN desnudo, que contenga un ácido nucleico de
conformidad con la invención.
Los SNP identificados en los ácidos nucleicos,
de conformidad con la invención, son aprovechables de igual modo en
el diagnóstico con investigación de enfermedades hereditarias
humanas. Los ácidos nucleicos, de conformidad con la invención,
pueden utilizarse con objeto de aislar y de caracterizar otros genes
para los ARNm homólogos en el genoma murino y en el genoma humano
con métodos usuales mediante el cribado por homología y
correlacionarse con las características ya conocidas de las
enfermedades hereditarias humanas. Esto posibilita la identificación
de otros genes como origen de determinadas enfermedades
hereditarias.
La figura 1 muestra el principio del
procedimiento de la representación diferencial por medio de la
restricción (RMDD).
La figura 2 muestra la distribución tisular de
la proteína, de conformidad con la invención, en la rata:
La figura superior muestra una transferencia de
Northern que ha sido obtenida con una sonda murina a partir de la
región 3' de la SEQ ID Nr. 1. La figura inferior muestra la
coloración con bromuro de etidio del gel de ARN mostrado en la
parte superior.
Se detecta una sola banda de la muestra. La
expresión de mayor potencia de la proteína, de conformidad con la
invención, se presenta en el cerebro; de igual modo se encuentra
todavía claramente también en los testículos y en el pulmón la
transcriptasa, mientras que los otros tejidos únicamente presentan
una banda débil.
La figura 3 muestra la distribución tisular de
la proteína de conformidad con la invención en los seres
humanos.
Se ha representado una RCP cuantitativa con
ayuda del sistema ciclador de luz (Light-Cycler) y
el aprovechamiento del estuche MTC (ADNc tisular múltiple) de la
firma Clontech. La expresión máxima se encuentra en el cerebro y en
los pulmones y en los órganos intestinales.
La figura 4 muestra la inducción de la
proteína, de conformidad con la invención, por medio de la isquemia
cerebral focal.
Se ha mostrado la cuantificación de la 9B5 ARNm
con ayuda del sistema ciclador de luz tras inducción de una
isquemia cerebral focal en ratones. El ácido nucleico, de
conformidad con la invención, se regula por incremento al cabo de
dos horas desde un episodio isquémico. Al cabo de seis horas desde
la isquemia ya no puede detectarse esta inducción.
La figura 5 muestra la inducción de la
proteína, de conformidad con la invención, por medio de isquemia
cerebral focal (hibridación in situ de cerebro de
ratón).
Se ha mostrado una hibridación in situ de
la 9B5 tras inducción de una isquemia cerebral focal en ratones. El
ácido nucleico, de conformidad con la invención, se regula por
incremento al cabo de dos horas desde un episodio isquémico (lado
izquierdo = isquémico = inducido). De igual modo puede verse que la
9B5 se expresa en neuronas. Se encuentra una inducción especial en
la corteza y en la región del hipocampo.
La figura 6 muestra la región catalítica de la
SEQ ID Nr. 7. En este caso los símbolos tienen el siguiente
significado: I = fijador de fosfato, VIb = región catalítica, VII -
VIII = bucle de activación, V-XI = dominio
catalítico con subdominios (según Hanks und Hunter, 1995, FASEB J.,
9, 576-596); * = puntos de activación, A = puntos
de enlace de ATP; C = centro activo
La figura 7 muestra la construcción fisiológica
de las proteína-cinasas homólogas. La H9B5 es la
proteína filogenética más joven y más emparentada con la
P78/c-TAK 1. También se ha mostrado claramente la
disociación incipiente de la proteína C.elegans
Par-1.
La figura 8 muestra la formación de los
dominios de la 9B5.
La figura 9 es un trazado de la hidrofobicidad
según Kyte-Doolittle.
La figura 10 muestra la estructura genómica de
la 9B5 en los seres humanos.
Se han mostrado los 18 exones del gen de la 9B5.
El exon 16 está sometido a empalmes diferenciales. La variante de
la 9B5 se forma sin exon 16; la variante de la 9B5A contiene el exon
16.
Las secuencias de proteínas murinas (SEQ ID Nr.
5 y 6) son incompletas en el extremo 5'. En el caso de las
secuencias humanas según las SEQ ID Nr. 7 y 8 se trata de clones de
longitud completa. Esto se produce también como consecuencia del
alineamiento con proteína-cinasas homólogas.
Para h9B5 (SEQ ID Nr. 7) se produce una pauta de
lectura abierta, que codifica una proteína con 752 aminoácidos
(peso molecular 82,5 kD; punto isoeléctrico a pH 9,7). El programa
PSORT II no proporciona secuencias de señal significativas, y no
predice ninguna región transmembranal. Un trazado de la
hidrofobicidad de Kyte-Doolittle (figura 9)
presenta, igualmente, una elevada proporción en regiones hidrófilas
y únicamente una gran región hidrófoba (aproximadamente AS
240-255), que, sin embargo, no parece ser
suficientemente hidrófoba para una región transmembranal (índice
> -3). Sin embargo, es interesante en este contexto la
localización protocolizada, asociada con la membrana, de algunas
proteínas emparentadas (p78/c-TAK1, par1).
Para la secuencia h9B5_b (SEQ ID Nr. 8) se
produce una pauta de lectura abierta de 688 aminoácidos con un peso
molecular de 75,3 kD y un punto isoeléctrico a pH 9,8. Mediante la
inserción del exon 16 tiene lugar un desplazamiento de la pauta,
que conduce a un bucle de traducción precoz.
Una comparación con las
proteína-cinasas conocidas permite la asignación de
la proteína, de conformidad con la invención, al subgrupo "CaMK
grupo II" según Hanks mttp://www.sdsc.edu/Kinases/pkr/pk
catalytic/pk hanks seq align long.html), (véase la publicación
de Hanks and Lindberg, Methods Enzymol, 200, 525-32,
(1991); Hanks and Hunter, Faseb J, 9, 576-96,
(1995))). Drewes et al. (Drewes, et al., Cell, 89,
297-308, (1997)) postularon ya para MARK1/MARK2 y
p78 un nuevo subgrupo en el subgrupo SNF1/AMPK, ya definido, del
grupo CaMKII. Tras el alineamiento de la proteína más homóloga
(9B5, Par1, cTAK1/p78, MARK1, EMK) y la construcción filogenética
(figura 7) existe la posibilidad de que la 9B5 defina un nuevo
subgrupo. La 9B5 se diferencia en gran medida en el extremo carboxi
de las otras proteína-cinasas. Las cinasas, que se
encuentran en este grupo, se caracterizan por un dominio
carboxiterminal fuertemente conservado, que termina con la secuencia
"ELKL". Por lo tanto se designó la EMK también como "cinasa
con motivo ELKL". Se supone que existen todavía
proteína-cinasas que son similares en el extremo
carboxi a la 9B5 y que pueden identificarse mediante cribado por
homología. Una busca con el programa "tblastn" frente al banco
de datos de nucleótidos EMBL no ha proporcionado hasta ahora ninguna
indicación sobre homólogos ya conocidos en la región del extremo
carboxi.
De igual modo se conoce por la publicación
WO9801756 la proteína cinasa TcAK1 con una identidad del 67%
aproximadamente en la región codificante con la 9b5 (SEQ ID
NO:1).
El substrato fisiológico de la proteína, de
conformidad con la invención, puede estar constituido por proteínas
con secuencias diana KXGS y/o KVGS. Por lo tanto, la tauproteína o
las proteínas MAP1 y 2 pueden representar un substrato fisiológico
de las proteína-cinasas de conformidad con la
invención.
Los subdominios catalíticos importantes pueden
definirse claramente mediante la comparación con otras
proteína-cinasas (véase la figura 6). Del mismo
modo pueden mostrarse los puntos de activación (una treonina y una
serina que pueden ser fosforiladas; pos. 211 y 215 en h9B5, figura
6). Una mutación de estos aminoácidos por ejemplo para dar alanina
conduce a una inactivación constitutiva. De igual modo la mutación
del resto lisina (enlace ATP) en el subdominio II (véase la figura
6) conduce a una inactivación. Estos conocimientos pueden ser
aprovechados para otros experimentos, por ejemplo con
aprovechamiento de efectos negativos dominantes. Una mutación de
Pos. 211 (Ser) y de 215 (Thr) para dar glutamato o aspartato debería
conducir a la activación constitutiva puesto que el grupo cargado
negativamente puede imitar una fosforilación (Huang and Erikson,
Proc Natl Acad Sci U S A, 91, 8960-3, (1994). Estos
mutantes pueden aprovecharse para la sobreexpresión de la actividad
específica cinasa en células o en animales transgénicos.
Se sabe que el subdominio I actúa a modo de
corchete, que fija los grupos fosfatos que no pueden ser
transferidos del ATP. En este caso la secuencia péptida GKGNFAKV en
la 9B5 se adapta perfectamente al motivo de consenso GXGXXGXV
(Hanks and Hunter, Faseb J, 9, 576-96, (1995)). En
el subdominio II es importante ante todo la lisina (marcada con
"A" en la figura 6); ésta fija y orienta a los
alfa-fosfatos y a los beta-fosfatos
del ATP y es esencial para la función enzimática. El subdominio VIb
está caracterizado porque la secuencia de consenso HRDLKXXN. Ésta
está perfectamente conservada también en la 9B5: HRDLKAEN.
En este caso, probablemente el aspartato (D) es
el aceptor de los protones para el grupo hidroxilo atacante durante
la reacción de transferencia del fósforo (Hanks and Hunter, Faseb J,
9, 576-96, (1995)). El subdominio VII forma con los
iones Mg2+ un complejo quelato, que incluye el
gama-fosfato y, por lo tanto, orienta a este grupo
para la transferencia. La secuencia DFG es prácticamente invariable.
De igual modo se mantiene la secuencia APE conservada en el
subdominio VIII. Este dominio es el encargado del reconocimiento del
péptido. En este caso, pueden enlazarse también péptidos
inhibidores. Muchas proteína-cinasas son activadas
dentro de este subdominio por medio de la fosforilación. Este
dominio está completamente conservado en EMK, p78 y MARK1. En MARK1
se mostró ya, mediante la secuenciación directa, que la treonina (T)
y que la serina (S) pueden ser fosforiladas, y que, de este modo,
se activa la MARK1. Puede partirse con la máxima probabilidad,
debido a esta conservación, de que la 9B5 puede ser fosforilada en
este punto y, de este modo, puede ser regulada. Probablemente tiene
lugar una autofosforilación, pudiendo ser imaginable también una
activación por medio otra cinasa. Probablemente, en este dominio la
tirosina (Y) es un punto de fosforilación (tal como por ejemplo en
el caso de Erk1/2). De igual modo, el subdominio IX participa en el
enlace peptídico (interacción hidrófoba).
Como consecuencia de este desarrollo estructural
puede partirse con seguridad de la base de que la 9B5 es una
proteína-cinasa activa
(serina-treonina-cinasa).
La expresión tisular de la 9B5 se ensayó en el
caso del ratón y en el caso de los seres humanos. En el caso del
ratón se llevó a cabo una "transferencia tisular múltiple"
("multiple tissue northern") con diversos tejidos (figura 2).
Como muestra se utilizó un fragmento procedente de la región 3' del
ADNc del ratón. En este caso se encuentra la expresión en el
cerebro, en los testículos y en los pulmones.
En el caso de los seres humanos se llevó a cabo
inicialmente una "transferencia tisular múltiple" ("multiple
tissue northern") (Clontech) con 2 sondas diferentes (a partir de
la región 3' y a partir de la región 5'). Sin embargo no se obtuvo
ningún tipo de señal clara, lo cual se consideró que se debía a la
pequeña presencia de la 9B5 en los seres humanos. Por lo tanto se
llevó a cabo una RCP cuantitativa con ayuda del ciclador de luz
(Light-Cyclers (Roche Diagnostics, Mannheim)). Se
emplearon muestras de ADNc de 8 tejidos humanos, que están ya
cuantitativamente normalizados con respecto a 4 genes constitutivos
diferentes (firma Clontech). Como control se empleó el plásmido
h9B5-663, que contiene un fragmento amplificado de
9B5-ADNc humano. Como programa para la RCP se
utilizó un protocolo de acceso (touchdown). En todas las muestras de
tejido tuvo lugar una amplificación de un producto con el punto de
fusión de 90ºC, el cual coincide con la RCP de control. Un análisis
de gel subsiguiente de los fragmentos proporcionó un producto de 660
bp aproximadamente, es decir con el tamaño esperado. La 9B5 en el
caso de los seres humanos realmente no está expresada de una manera
muy pronunciada, la amplificación es visible en el ciclador de luz
(LightCycler) solamente hacia el ciclo 32. Se utilizaron los
siguientes cebadores:
\vskip1.000000\baselineskip
seq_h9b5_s1 GTTGCCATCAAGATTATC (en el exon
3)
seq_h9b5_a4 CATGATTTGCTCGAGAGTAC (en el exon
9)
\vskip1.000000\baselineskip
El análisis cuantitativo (figura 3) muestra una
distribución tisular relativamente ubiquitaria con puntos
esenciales en el cerebro y en los pulmones, en el hígado, en los
riñones y en el páncreas.
\vskip1.000000\baselineskip
La
serina-treonina-cinasa 9B5, de
conformidad con la invención, se identificó por medio de un
procedimiento para la clonación de genes diferencialmente regulados
(RMDD) en el hemisferio isquémico del ratón tras isquemia cerebral
focal. El modelo animal de la isquemia cerebral focal representa un
modelo válido para la apoplejía isquémica humana. Para provocar la
isquemia cerebral focal se utilizó el modelo denominado filamentoso,
según el cual se hace avanzar un hilo de nylon recubierto a través
de A. carotis interna hasta la salida de la A. cerebri media y se
induce una apoplejía isquémica (Clark, et al., Neurol. Res.,
19, 641-648, (1997)). La regulación de la
expresión génica juega un papel decisivo en la isquemia cerebral
para el desarrollo y la magnitud de la lesión de las neuronas
(Koistinaho and Hokfelt, Neuroreport, 8, i-viii,
(1997), Schneider, et al., Nat Med, 5,
554-9, (1999)). De manera especial los genes
"inmediatamente primigenios" ("immediate early") juegan
aquí un papel (Atkins, et al., Stroke, 27,
1682-1687, (1996)), tal como por ejemplo
cox-2, (Nogawa, et al., J. Neurosci., 17,
2746-2755, (1997)).
La expresión de la 9B5 se investigó en tres
períodos de tiempo tras una isquemia cerebral focal: por un lado en
una isquemia pasajera al cabo de dos períodos de reperfusión (90
minutos de isquemia, 2 horas y 6 horas de reperfusión), y, por otro
lado, en una isquemia permanente de 24 horas (figura 4). Se obtuvo
ARN a partir de ambas mitades hemisféricas de 3-4
cerebros sin tronco encefálico y sin cerebelo (Fasttrack kit,
Invitrogen). Con ayuda del sistema ciclador de luz
(LightCycler^{TM}) (Roche Diagnostics, Mannheim) se llevó a cabo
una RCP cuantitativa. El contenido en ADNc de las muestras se
normalizó a la expresión de la ciclofilina y de S20 (Schneider,
et al., Proc Natl Acad Sci U S A, 92,
4447-51, (1995)). Los cebadores empleados para la
amplificación de la ciclofilina fueron:
\vskip1.000000\baselineskip
cyc5 ACCCCACCGTGTTCTTCGAC
acyc300 CATTTGCCATGGACAAGATG
\vskip1.000000\baselineskip
y para la amplificación de la 9B5 del ratón:
\vskip1.000000\baselineskip
9_B5_(1)_1s
TATGATCGAACCTCCTTCATGCC
9_B5_(1)_1a ATGTCCAGAACTGGGCCTAGCG
(Estos cebadores amplifican un amplímero de 556 bp, que se encuentra
en el extremo 3' del ADNc del ratón).
\vskip1.000000\baselineskip
En realidad, se muestra una clara regulación por
incremento en un factor de 7-8 del
9B5-ARN sobre el semicerebro (izquierdo) isquémico
al cabo de 2 horas desde el episodio isquémico (middle cerebral
artery occlusion de 90 minutos y 2 horas de reperfusión; (figura
4); las barras de fallos muestran desviaciones normalizadas, que se
producen a partir de las mediciones con diluciones en serie,
realizadas 3 veces, de muestras de ADNc y de este modo representa
la fiabilidad de los resultados de la medición). Sin embargo, al
cabo de 24 horas (en un modelo permanente) no pudo detectarse ya
ninguna diferencia.
De igual modo se llevó a cabo una hibridación
in-situ con una sonda con una longitud de 1,6
kb a partir de la región 3' del 9B5-ADNc de ratón
(respectivamente codificante y no codificante). En este caso se
procedió esencialmente según el protocolo de la firma Roche
Diagnostics (sistema de digoxigenina) según las modificaciones de
Rossner et al. (Mol Cell Neurosci, 9,
460-475, (1997)). Se observó una clara inducción
sobre el lado isquémico (izquierdo), especialmente en neuronas de
la región del hipocampo y de la corteza, en menor proporción en el
tálamo (figura 5).
De igual modo se pone de manifiesto que la 9B5
es expresada preponderantemente en neuronas y que en las mismas
sufre una regulación.
Esto muestra que la 9B5 juega un papel
importante en la patogénesis de la apoplejía. La regulación por
incremento de la 9B5 tiene en este caso un papel similar por
ejemplo al de las
serina-treonina-cinasas conocidas
(por ejemplo JNK, p38).
En los procesos de la muerte celular participa
una pluralidad de
serina-treonina-cinasas (por ejemplo
ASK1 (Tobiume, et al., Biochem Biophys Res Commun, 239,
905-10, (1997), Berestetskaya, et al., J Biol
Chem, 273, 27816-23, (1998), Chen, et
al., Oncogene, 18, 173-80, (1999)), DAP (Inbal,
et al., Nature, 390, 180-4, (1997),
Levy-Strumpf and Kimchi, Oncogene, 17,
3331-40, (1998)), DRAKs (Sanjo, et al., J
Biol Chem, 273, 29066-71, (1998)), ZIP (Kawai, et
al., Mol Cell Biol, 18, 1642-51, (1998),
DRP-1 (Inbal, et al., Mol Cell Biol, 20,
1044-54, (2000))).
Esta regulación por incremento es una prueba de
un nuevo mecanismo transcripcional de regulación en las
proteína-cinasas, y hasta el presente es el único
ejemplo conocido a este respecto en el sistema animal con mamíferos.
De manera interesante se encontró sólo recientemente la regulación
por incremento de varias MAP-cinasas en una
investigación sistemática del transcriptoma de la levadura
(Roberts, et al., Science, 287, 873-80,
(2000)). Esto podría representar un nuevo mecanismo general para
la regulación de las proteína-cinasas.
En los últimos tiempos, han adquirido cada vez
mayor significado, en la investigación farmacológica, los postulados
relativos a la inhibición de/ a la influenciación sobre, las vías
de transducción de señal en el sentido 3' "downstream" de un
receptor situado en la membrana. Estos postulados tendrán en el
futuro, probablemente, una participación importante en la terapia
de las enfermedades humanas, especialmente en el caso de las
enfermedades que, hasta el presente, son difícilmente terapiables o
que no son terapiables (Kletsas and Papavassiliou, Exp. Opin.
Invest. Drugs, 8, 737-746, (1999)). Las ventajas de
estos postulados consisten, en primer lugar, en que pueden
influenciar resultados, que pueden ser provocados por varios
estímulos y en que tienen un recorrido terminal común; en segundo
lugar consisten en que se presentan resultados celulares en el
tiempo tras el estímulo generador y, por lo tanto, son accesibles
durante un mayor tiempo para una intervención.
Ejemplos de ataques con éxito en tales cascadas
de señales son, por ejemplo, los inhibidores para el caspaseno, que
pueden bloquear los procesos de apoptosis incluso mucho tiempo
después desde un estímulo generador. De igual modo ha recibido una
atención especial el factor de transcripción
NF-kappaB y los procesos que lo activan. A título
de ejemplo se siguió la clonación de las
1-kappaB-cinasas con el objeto de
encontrar inhibidores específicos para la transcripción génica
inducida por la NF-kappaB. Los perfiles
diferenciales de transcripción han alcanzado en los últimos tiempos
un gran significado en la investigación farmacológica para la
identificación de posibles nuevos puntos de partida para productos
farmacéuticos. La regulación transcripcional, es decir la
regulación de la cantidad de ARNm de un gen en la célula, es un paso
esencial para la reacción de la célula al estímulo, además de las
fosforilaciones de proteínas, la degradación de proteínas, etc.
Evidentemente la 9B5 está sometida a una regulación muy rápida por
medio de activación transcripcional, como se ha mostrado
precedentemente. De manera frecuente, tales genes, rápidamente
regulados, participan en posiciones clave, críticas, para los
procesos celulares.
Una influenciación farmacológica de la 9B5 es
posible de la manera siguiente: 1º una influenciación de la
cantidad de transcrito en la célula, por ejemplo la supresión de la
rápida regulación por incremento tras procesos patológicos (por
ejemplo mediante la tecnología no codificante o de antisentido); 2º
la inhibición de la actividad enzimática de la 9B5, en particular
la actividad cinasa (por ejemplo por medio de un inhibidor de la
cinasa; 3º la inhibición de una interacción con una o con varias
moléculas diferentes, por ejemplo proteína cinasa que se encuentra
en el sentido 3' (downstream), o adaptadores.
Recientemente se han desarrollado inhibidores
específicos contra algunas MAP-proteína cinasas. Un
ejemplo a este respecto es el PD98059, que es un inhibidor de MEK1.
Éste impide la fosforilación de Tau mediante la estimulación con
beta-amiloide. Esto tiene posiblemente significado
para la terapia de la enfermedad de Alzheimer.
La substancia antitumoral UCN-01
es un inhibidor de la cdc25c-fosforilación (Graves,
et al., J Biol Chem, 275, 5600-5,
(2000)).
Los inhibidores de la
proteína-cinasa de conformidad con la invención
pueden identificarse simplemente con los ensayos tradicionales de
la proteína-cinasa y representan un medio eficaz
para la lucha contra las secuelas de la isquemia cerebral.
Los datos experimentales sobre la 9B5 demuestran
su participación central en los procesos que dependen de la muerte
celular neuronal, de la excitación, de la plasticidad y de la
neurogénesis. La proteína, de conformidad con la invención,
representa una molécula diana importante para la inhibición o bien
para la disminución de las secuelas de una isquemia focal. Además
de este papel central en la génesis de la apoplejía como
consecuencia de la isquemia focal, la proteína, de conformidad con
la invención, podría representar, también, una molécula diana
importante para el tratamiento de las enfermedades neoplásticas,
tales como el cáncer. De igual modo, la proteína, de conformidad
con la invención, o bien su gen, podría representar en este caso la
molécula diana para agentes contra el cáncer. De igual modo, el gen
podría tener un papel importante para el diagnóstico y para la
terapia de las enfermedades cardiovasculares puesto que existen
algunos mecanismos comunes con las enfermedades condicionadas de
manera isquémica.
En una forma de realización especialmente
preferente, de conformidad con la invención, se reduce el nivel o
bien la actividad de la proteína-cinasa, de
conformidad con la invención, para la profilaxis y para la terapia
de la apoplejía. Esto puede verificarse, por ejemplo, en el plano de
la expresión, inhibiéndose o reduciéndose la expresión/ traducción
de los ácidos nucleicos correspondientes, o puede llevarse a cabo en
el plano de la actividad proteínica, reduciéndose o inhibiéndose la
actividad proteína-cinasa por medio de inhibidores
adecuados.
El ácido nucleico, de conformidad con la
invención, y la proteína codificada por el mismo abren nuevos
postulados para la terapia. De este modo puede influenciarse, por
ejemplo, el nivel del ácido nucleico endógeno, ejerciéndose bien un
influjo directo sobre su transcripción o bien ejerciéndose un
influjo sobre su traducción para dar la proteína de conformidad con
la invención. Con esta finalidad entran en consideración, por
ejemplo, postulados de terapéutica génica, en los que se reduce la
traducción de los transcriptos endógenos mediante la
co-supresión o mediante la tecnología no
codificante o de antisentido. De igual modo se ofrecen nuevos
postulados en el plano de la actividad proteica, representando la
proteína, de conformidad con la invención, por ejemplo la molécula
diana de los productos activos farmacéuticos. De este modo puede
modificarse la actividad de la proteína-cinasa, de
conformidad con la invención, por medio de productos activos
farmacéuticos, para actuar de manera reguladora en los mecanismos
de la apoplejía. Los inhibidores de la
proteína-cinasa, que han sido citados
precedentemente, representan una clase de productos activos
farmacéuticos de este tipo. Básicamente, la preparación del ácido
nucleico, de conformidad con la invención, o bien de la proteína, de
conformidad con la invención, posibilita vías completamente nuevas
para la profilaxis o bien para la terapia de la apoplejía.
Los ejemplos siguientes explican la
invención:
Para originar una isquemia cerebral focal en
ratones c57/bl6 se utilizaron ratones con una edad de 3 meses. Una
vez provocada una narcosis por inhalación (70% N_{2}O, 30%
O_{2}, 0,8 - 1% de halotano) se hizo avanzar un hilo de Prolene
5-0 (firma Ethicon), que estaba recubierto con un
0,1% de poli-L-lisina, a través de
la A. carotis externa hasta la A. carotis interna hasta la salida de
la A. cerebri media. La posición correcta del hilo está indicada
por medio de una caída de la señal Doppler de láser (firma Perimed)
en un 10 hasta un 20% de la señal de partida. Tras la realización
de esta operación y, en caso dado, tras la determinación de los
parámetros fisiológicos adicionales (presión sanguínea, pulo, gases
sanguíneos, glucosa en sangre) despertaron los ratones de la
narcosis. Al cabo de determinados tiempos de oclusión se someten los
ratones nuevamente a una narcosis y se retiraron los hilos. De este
modo tiene lugar una reperfusión del tejido. Al cabo de
determinados tiempos de reperfusión se sacrificaron los ratones
mediante fractura de la nuca, y los cerebros se prepararon
inmediatamente y se inactivaron por congelación sobre hielo
seco.
En el caso presente no se llevó a cabo ninguna
reperfusión, sino que únicamente se efectuó una oclusión de 90
minutos o bien de 24 horas.
Con esta finalidad se empleó el estuche de
preparación de ARNm de la firma Invitrogen (Fasttrack).
En este caso se procedió esencialmente según las
patentes Nr. EP 0 743 367 A2; US 5,876,932, con la diferencia de
que se emplearon 2 \mug de poliA-ARN para la
síntesis de la primera cadena. Tras la realización de la síntesis
de la primera cadena, de la segunda cadena, de la restricción Mbol,
se lleva a cabo un ligamiento con adaptadores. A continuación se
llevan a cabo dos reacciones RCP sucesivas con subconjuntos de
combinaciones de cebadores. Las reacciones RCP se cargan a
continuación sobre un gel de poliacrilamida desnaturalizante y
someten a un análisis por transferencia sobre una membrana de nylon
(firma GATC). Las bandas marcadas con biotina se visualizan con
ayuda de una reacción usual de
estreptavidina-peroxidasa. Sobre el gel se aplicaron
conjuntamente, de manera respectiva, las muestras de la RCP de los
hemisferios isquémicos y contralaterales (24 horas MCAO derecho e
izquierdo y 90 minutos MCAO derecho e izquierdo). Se cortan las
bandas de intensidad diferente en el hemisferio derecho o
izquierdo, y se lleva a cabo una reamplificación del producto de la
RCP correspondiente. Los productos amplificados, obtenidos se
clonan en el vector TOPO TA ADNpc 2.1 (firma Invitrogen) y se
secuencian con T7 y con cebadores M13rev (ABI 3700 secuenciador por
electrofóresis capilar).
Cuando se realiza este procedimiento se advierte
una secuencia que aparece regulada por incremento al cabo de 90
minutos sobre el lado isquémico. Ésta se denominó 9B5. Un análisis
con el ciclador de luz (Lightcycler) confirmó una regulación rápida
según MCAO (90 minutos MCAO y 2 horas de reperfusión) (figura
4).
El fragmento RCP aislado, situado en 3', se
utilizó para la hibridación de un banco de cerebros de ratón. En el
mismo se encontraban varios clones, que contenían las partes de
secuencia de la SEQ ID Nr. 1 y de la SEQ ID Nr. 2. Se utilizó una
muestra de ratón procedente de la región 5' para cribar un banco de
cerebros fetales humanos en el lambdaZapll (Stratagene). En este
caso se produjeron a partir de varios clones, de igual modo, 2
secuencias diferentes, que probablemente representan variantes de
empalme del mismo gen (SEQ ID Nr. 3 y 4). A continuación se ha
indicado la obtención detallada de la biblioteca, empleada, de los
ADNc humanos:
Se prepararon con el estuche de síntesis de los
ADNc de la firma Stratagene las bibliotecas de ADNc correspondientes
a partir de 2 \mug de ARNm cerebral de feto humano (firma
Clontech) y de 5 \mug de ARNm procedente de cerebros de ratones
adultos. En este caso se procedió esencialmente de acuerdo con las
indicaciones del fabricante. Para la síntesis de la primera cadena
de ADNc se empleó un cebador oligodT según las indicaciones del
fabricante. Los fragmentos de ADNc de cadena doble compatibles con
la clonación (E-coRI/XhoI) se seleccionaron en
cuanto a su tamaño (según las indicaciones del fabricante/firma
Stratagene) y se enlazaron en el vector plásmido pBluescript SKII
(Stratagene). El ligamiento se transformó mediante electroporación
en E.coli (DH10B, Gibco) y se amplificó sobre placas de agar
LB-ampicilina. El ADN plásmido se aisló mediante
lisis alcalina y mediante cromatografía con intercambio de iones
(estuche QlAfilter, firma Qiagen). La complejidad de los componentes
individuales fue de 4 millones para el banco de ADNc cerebral
humano fetal. Se analizaron de manera estadística 24 clones
individuales de cada banco de ADNc según los tamaños de los
insertos, que mostraban una distribución del tamaño comprendida
entre 800 bp y 4,5 kB inclusive, siendo la longitud media del
inserto de ADNc para el banco humano de 1,2 kB aproximadamente.
\vskip1.000000\baselineskip
La secuencia obtenida de la 9B5 puede utilizarse
para obtener conclusiones sobre la ordenación de la proteína en
cascadas de transdución de señal. Con esta finalidad se clona la
pauta de lectura abierta del gen en un vector de expresión usual
(por ejemplo pCMV-tag, firma Stratagene). Este
constructo puede transfectarse junto con otros constructos en
células eucariotas (por ejemplo con el método del fosfato de calcio,
véase la publicación de Ausubel et al., Current Protocols in
Molecular Biology, New York, 1997). Éstos pueden ser constructos
indicadores, por ejemplo un gen de luciferasa bajo el control de un
promotor mínimo con varios puntos de enlace por ejemplo para el
factor de transcripción NF-kappaB o
AP-1. Entonces pueden someterse los extractos
procedentes de las células a una medición en el luminómetro (por
ejemplo firma Bertold). Un aumento del valor de la luciferasa
indica una influenciación sobre la vía de transducción de señal, que
desemboca en la activación de un determinado factor de
transcripción. Las combinaciones con constructos de expresión para
otros genes (por ejemplo MAP-cinasas) pueden
proporcionar conclusiones sobre la posición exacta de la 9B5 en
cascadas de señal. Estos ensayos indicadores pueden llevarse a cabo
también con otros sistemas, por ejemplo lacZ o
cloroanfenicoltransferasa (ensayo CAT), sin que quede influenciado
el principio del ensayo.
De igual modo, pueden aprovecharse también
estuches prefabricados (por ejemplo estuche de Mercury in
vivo kinase assay, firma Clontech). En este caso se expresa el
represor Tet en fusión con el dominio del transactivador de una
diana de fosforilación (factores de transcripción, por ejemplo Jun).
La activación de un constructo de luciferasa bajo el control de un
elemento represor Tet tiene lugar únicamente cuando se verifique una
fosforilación específica del dominio del transactivador por medio
de una cinasa (por ejemplo la 9B5). De este modo es posible la
ordenación en una vía celular de transducción de señal.
\vskip1.000000\baselineskip
Las proteína-cinasas están
perfectamente caracterizadas desde el punto de vista bioquímico. La
actividad cinasa de la 9B5 puede demostrarse por clonación de la
pauta de lectura abierta de la 9B5 en un vector de expresión con un
epitopo-Tag (por ejemplo
pcDNA-myc-his), y efectuándose la
transfección en células eucariotas (por ejemplo células Cos). Al
cabo de 48 horas pueden obtenerse extractos a partir de estas
células y llevarse a cabo una inmunoprecipitación con un anticuerpo
myc-específico y perlas de proteína A. Se lleva a
cabo una reacción de cinasa en un tampón de cinasa en presencia de
\gamma-^{32}P-ATP. Las proteínas
se desnaturalizan a continuación y se separan sobre un gel
SDS-PAGE. A continuación se lleva a cabo una
autorradiografía. Las bandas marcadas proporcionan una indicación
sobre la actividad cinasa de la 9B5. Frecuentemente se encuentra
también una autofosforilación de la propia cinasa. De igual modo las
cotransfecciones con dianas potenciales proporcionan una indicación
de posibles dianas de fosforilación, por ejemplo diversas
MAP-cinasas, que igualmente pueden ser dotadas con
un marcador y que pueden ser inmunoprecipitadas.
Los ensayos de cinasa pueden llevarse a cabo
también con la 9B5, que haya sido transcrita/traducida in
vitro (por ejemplo el sistema T7-reticulocitos
de la firma Promega). De igual modo puede utilizarse proteína que
haya sido expresada en E. coli, por ejemplo como proteína de
fusión GST o como constructo marcado con HIS. Los marcadores pueden
utilizarse en este caso para la purificación de la proteína. Las
proteínas purificadas pueden incubarse a continuación en el tampón
de cinasa con substratos potenciales. De manera frecuente se
utilizará con esta finalidad MBP (proteína básica de mielina -myelin
basic protein-), que se fosforila frecuentemente de manera
inespecífica por las
Ser-Thr-cinasas.
El dominio de cinasa de las
proteína-cinasas está perfectamente definido.
Frecuentemente es suficiente la mutación de aminoácidos
individuales en el dominio de la transferencia de fosfato para la
pérdida de la función de la proteína (por ejemplo K709M en la ASK1
(Chang, et al., Science, 281, 1860-3,
(1998)); K90A en DRAK 1, K62A en DRAK2 (Sanjo, et al., J
Biol Chem, 273, 29066-71, (1998)) ;
KK429-430AA en NIK (Sanjo, et al., J Biol
Chem, 273, 29066-71, (1998)); K63W en TAK1
(Ninomiya-Tsuji, et al., Nature, 398,
252-6, (1999)) ). Estas cinasas inactivas tienen un
gran significado, frecuentemente para la evaluación de la vía del
metabolismo celular, a título de inhibidores
dominante-negativos, por ejemplo en los experimentos
de cotransfección y en ensayos de cinasa
(Ninomiya-Tsuji, et al., Nature, 398,
252-6, (1999)). Una mutación de este tipo
puede llevarse a cabo también en el caso de la 9B5.
La fosforilación específica de la proteína diana
puede demostrarse también con anticuerpos específicos para la
fosforilación, por ejemplo Phospho-SerThr/Tyr
monoclonal antibody, mouse IgG2b, firma Clontech.
Otros ejemplos de ensayos de cinasa, que se
encuentra a disposición de los especialistas, pueden verse, por
ejemplo, en el libro titulado Protein Phosphorylation, A practical
approach, ed. D.G.Hardie, 2nd ed., Oxford, 1999, especialmente en
los capítulos 9 y 10.
La identificación de la diana de fosforilación
de la 9B5 puede llevarse a cabo por ejemplo mediante cribado por
interacción. En este caso pueden utilizarse, por un lado, los bancos
para la expresión de péptidos en bacteriofagos lambda, que son
bastante clásicos, (el sistema más utilizado es el vector
lambda-gt11, véase la publicación de Ausubel et
al., Current protocols in molecular biology, New York, 1997). Un
postulado es la clonación de la 9B5 en un vector de expresión
bacteriano mediante la intervención de un marcador de purificación
(por ejemplo poli-histidina o GST) y de un punto de
fosforilación de consenso para la proteína-cinasa A
(secuencia RRASV). La 9B5 puede expresarse y purificarse por lo
tanto en bacterias según los procedimientos establecidos. De este
modo la 9B5 puede marcarse como captador con ^{33}P o con ^{32}P
mediante incubación con proteína-cinasaA. El banco
de expresión puede incubarse entonces con la 9B5 marcada. Tras
exposición sobre autorradiogramas pueden identificarse los clones
positivos y pueden aislarse y secuenciarse según procedimientos
establecidos. Este procedimiento puede aplicarse también de la
manera siguiente: puede aprovecharse la propiedad de
autofosforilación de la 9B5 para marcar la 9B5 con
^{33}P-\gammaATP mediante simple incubación. El
procedimiento puede modificarse también de tal manera que el banco
de expresión sea incubado con la 9B5 purificada y con la
^{33}P-\gammaATP bajo condiciones de
fosforilación (tampón de fosforilación, etc.), y los péptidos
expresados son marcados de manera activa por la 9B5. Desde luego
este procedimiento es más inestable que el que ha sido descrito
precedentemente. Los péptidos secuenciados pueden utilizarse para
la obtención de una secuencia de reconocimiento de consenso y de
una secuencia de fosforilación de consenso. Esto posibilita la
localización de substratos potenciales por medio de los métodos
bioinformáticos. Los candidatos pueden verificarse mediante
expresión e incubación con la 9B5. Se encuentran ejemplos para la
realización con éxito de estas formas del cribado de expresión en
las publicaciones de Mochly-Rosen and Gordon, Faseb
J, 12, 35-42, (1998), Blanar and Rutter, Science,
256, 1014-8, (1992), Chapline, et al., J Biol
Chem, 268, 6858-61, (1993), Chapline, et al.,
J Biol Chem, 271, 6417-22, (1996), Kaelin, et
al., Cell, 70, 351-64, (1992), Songyang,
et al., Curr Biol, 4, 973-82, (1994).
La diana de fosforilación de la 9B5 puede
cribarse también en un híbrido de dos levaduras -
yeast-two-hybrid -
(Fields and Song, Nature, 340, 245-6, (1989)). De este modo se descubrió, por ejemplo, la interacción de Ras y de c-Raf (una Ser-Thr-cinasa) en un sistema y2h (Fields and Song, Nature, 340, 245-6, (1989)). De igual modo, precisamente la interacción de la Ser-Thr-cinasa SNF1 con SNF4 es un prototipo para el sistema y2h (Fields and Song, Nature, 340, 245-6, (1989)). De igual modo, pueden emplearse sistemas de animales mamíferos con un principio equivalente al del cribado de las levaduras (Fields and Song, Nature, 340, 245-6, (1989)). Para un cribado y2h se clona la pauta de lectura abierta de la 9B5 en un denominado "vector cebo (vector bait)" con el dominio de enlace GAL4 (por ejemplo pGBT10, firma Clontech). De este modo puede explorarse una biblioteca denominada de presa "librería prey" en una cepa de levadura según varios de los protocolos usuales con respecto a las proteínas interactuantes. En este caso puede ser frecuentemente útil el empleo de mutantes cinasa-negativos, puesto que éstos interaccionan, con frecuencia, de una manera más estable con las dianas de fosforilación. Las serina-treonina-cinasas en una vía de síntesis pueden disponerse en la proximidad espacial por medio de moléculas adaptadoras para poder llevar a cabo mejor las fosforilaciones específicas (Chang, et al., Science, 281, 1860-3, (1998)), (Yasuda, et al., Mol Cell Biol, 19, 7245-54, (1999), Whitmarsh and Davis, Trends Biochem Sci, 23, 481-5, (1998), Whitmarsh, et al., Science, 281, 1671-4, (1998)). Por lo tanto, es posible también encontrar las dianas de fosforilación a través de dos etapas en el sistema híbrido de dos levaduras (yeast-two-hybrid), clonándose en primer lugar una proteína adaptadora y encontrándose con ésta la molécula diana específica a título de "cebo" ("bait"). En conjunto pueden llevarse a cabo también experimentos de mapeado para dominios de interacción con el sistema y2h.
(Fields and Song, Nature, 340, 245-6, (1989)). De este modo se descubrió, por ejemplo, la interacción de Ras y de c-Raf (una Ser-Thr-cinasa) en un sistema y2h (Fields and Song, Nature, 340, 245-6, (1989)). De igual modo, precisamente la interacción de la Ser-Thr-cinasa SNF1 con SNF4 es un prototipo para el sistema y2h (Fields and Song, Nature, 340, 245-6, (1989)). De igual modo, pueden emplearse sistemas de animales mamíferos con un principio equivalente al del cribado de las levaduras (Fields and Song, Nature, 340, 245-6, (1989)). Para un cribado y2h se clona la pauta de lectura abierta de la 9B5 en un denominado "vector cebo (vector bait)" con el dominio de enlace GAL4 (por ejemplo pGBT10, firma Clontech). De este modo puede explorarse una biblioteca denominada de presa "librería prey" en una cepa de levadura según varios de los protocolos usuales con respecto a las proteínas interactuantes. En este caso puede ser frecuentemente útil el empleo de mutantes cinasa-negativos, puesto que éstos interaccionan, con frecuencia, de una manera más estable con las dianas de fosforilación. Las serina-treonina-cinasas en una vía de síntesis pueden disponerse en la proximidad espacial por medio de moléculas adaptadoras para poder llevar a cabo mejor las fosforilaciones específicas (Chang, et al., Science, 281, 1860-3, (1998)), (Yasuda, et al., Mol Cell Biol, 19, 7245-54, (1999), Whitmarsh and Davis, Trends Biochem Sci, 23, 481-5, (1998), Whitmarsh, et al., Science, 281, 1671-4, (1998)). Por lo tanto, es posible también encontrar las dianas de fosforilación a través de dos etapas en el sistema híbrido de dos levaduras (yeast-two-hybrid), clonándose en primer lugar una proteína adaptadora y encontrándose con ésta la molécula diana específica a título de "cebo" ("bait"). En conjunto pueden llevarse a cabo también experimentos de mapeado para dominios de interacción con el sistema y2h.
De igual modo es posible aprovechar
co-inmunoprecipitaciones procedentes de células
transfectadas con vectores de expresión de la 9B5 para purificar
las proteínas enlazadas sobre las mismas y para identificar los
genes por medio de métodos de secuenciación de proteínas (por
ejemplo MALDI).
De igual modo, es posible purificar las bandas
fosforiladas tras una inmunoprecipitación con subsiguiente ensayo
de cinasa a partir de un extracto celular, y llevar a cabo la
secuenciación de las mismas.
Otros ejemplos para la identificación de los
substratos de proteína-cinasa, que son usuales para
los especialistas, pueden verse, por ejemplo, en el libro titulado
Protein Phosphorylation, A practical approach, ed. D.G.Hardie, 2nd
ed., Oxford, 1999.
Un gran número de las
serina-treonina-cinasas,
identificadas hasta el presente, participa en los procesos de
apoptosis, por ejemplo la ASK1 (Zhang, et al., Proc Natl Acad
Sci U S A, 96, 8511-5, (1999)), (Ichijo, et
al., Science, 275, 90-4, (1997)), DRAKs (Zhang,
et al., Proc Natl Acad Sci U S A, 96, 8511-5,
(1999)), (Ichijo, et al., Science, 275,
90-4, (1997)). La participación de la 9B5 en la
cascada de apoptosis puede investigarse además verificando la
transfección de constructos de expresión con la 9B5 en células
eucariotas y ensayándose a continuación la inducción de la
apoptosis. Esto puede llevarse a cabo, por ejemplo, mediante la
coloración con anexina (firma Roche Diagnostics), mediante
anticuerpos que reconocen la forma activa de la
Caspase-3 (firma New England Biolabs), o incluso
mediante los ensayos ELISA, que reconocen los fragmentos de histona
de ADN (cell-death elisa, Roche Diagnostics). Esta
inducción de la apoptosis puede ser específica del tipo celular,
con lo cual tienen que ensayarse varias líneas celulares y varias
células primarias. La inducción de la apoptosis puede ser
igualmente específica del estímulo, con lo cual pueden ser de ayuda
varias situaciones de estrés para la respuesta de esta pregunta,
por ejemplo un choque térmico, condiciones de hipoxia, tratamientos
con citoquinas (por ejemplo II-1,
II-6, TNFalpha), tratamiento con H_{2}O_{2}. Con
relación a los tipos de células entran en consideración varias
líneas aplicables, por ejemplo las células Cos, las células HEK,
las células PC12, las células THP-1 y las células
primarias tales como por ejemplo las neuronas, los astrocitos, así
como otras líneas celulares inmortalizadas y primarias, según las
necesidades.
La 9B5 puede emplearse para encontrar
inhibidores de la interacción con sus socios en la interacción (por
ejemplo moléculas adaptadoras). Esto puede llevarse a cabo, por
ejemplo, con el sistema FRET (transferencia de energía de
frecuencia de resonancia -frequence resonance energy transfer-),
expresándose en fusión la 9B5 con GFP (proteína fluorescente verde
-green fluorescent protein-) y su socio de interacción con BFP
(proteína de fluorescencia azul -blue fluorescent protein-) y
efectuándose su purificación. En un sistema exento de células puede
utilizarse la disminución de la emisión de BFP como indicador de la
presencia de un inhibidor cuando se exploren bancos químicos
complejos.
El objetivo principal, en el aprovechamiento
terapéutico de las proteínacinasas descubiertas consiste sin
embargo, en primer lugar en la desconexión de la función de la
proteínacinasa, puesto que esto puede ser llevado a cabo de la
manera más sencilla. Las proteína-cinasas se
ofrecen, en principio, para la realización de ensayos químicos
ultrarrápidos para la identificación de inhibidores (inhibidores de
molécula pequeña
-small-molecule-inhibitors-) de las
propiedades de cinasa de la proteína, puesto que la propiedad
enzimática propiamente dicha puede emplearse fácilmente como factor
indicador (véase también el ejemplo 3, ensayo de cinasa).
Una implementación sencilla de un sistema HTS
para la 9B5 puede llevarse a cabo según el método de ensayo en
filtro de los autores Reuter et al. (Reuter et al.,
Methods in Enzymology, 255: 245 (1995)). En este caso se aprovecha
el MBP como substrato inespecífico. Éste se aplica sobre placas con
96 pocillos, que son adecuadas para el ensayo ELISA (por ejemplo
FlashPlates, NEN Life Science Products, o NUNC). Se añade tampón de
reacción (3x tampón de reacción cinasa que contiene: 60 mM HEPES
(pH 7,5), 30 mM MgAc, 0,15 mM gammaATP, 3 mM DTT, 0,03 mM
Na-Orthovanadat). 0,25 \muCi
33P-Gamma-ATP y la cinasa descrita
se añaden con una concentración no mayor que 1 \mug/ml (en primer
lugar debería llevarse a cabo una titulación). En presencia del
inhibidor potencial (por ejemplo moléculas pequeñas procedentes de
un banco químico) (por ejemplo 10 \muM) se incuba la reacción
durante 1 hora a 30ºC. Todo el volumen de la reacción es de 100
\mul. La reacción se detiene mediante la adición de EDTA (pH 7)
hasta una concentración final de 80 mM. Las muestras se centrifugan
a continuación y se aplican 50 \mul del sobrenadante sobre un
papel intercambiador de cationes p81 (firma Whatman). Los filtros
se lavan a continuación 3 veces en 200 ml de ácido fosfórico 180 mM
(respectivamente 5 minutos), y una vez en 200 ml de etanol al 96%.
Tras secado al aire se determina la radioactividad de los filtros
mediante recuento de las escintilaciones. Los materiales, que
reducen la actividad cinasa en una proporción >= 50% (con 10
\muM) se destacan por una reducción de la incorporación > 50%.
La especificidad y la sensibilidad de los posibles inhibidores se
determinan mediante titulación para la determinación del IC50, y
mediante la substitución de otras cinasas en el ensayo. La
comparación relativa del efecto inhibidor sobre otras cinasas
permite así una magnitud de la especificidad.
Para la realización del cribado con respecto a
los inhibidores de cinasa se ofrecen también sistemas modernos con
el ensayo de proximidad por escintilación (SPA) (firma Amersham Life
Science, MAP kinase SPA; (Zhang, et al., Proc Natl Acad Sci
U S A, 96, 8511-5, (1999)), (Ichijo, et al.,
Science, 275, 90-4, (1997))). El autor McDonald
describe una montaje para el análisis destinado a la cascada
Raf/MEK/ERK, que pueden identificar los inhibidores de las cascada
completa. Como substrato se utiliza en este caso un péptido
biotinilizado, que puede formarse tras fosforilación con ^{33}P
sobre perlas de SPA recubiertas con avidina. La cascada de MAP se
reconstruye en este caso in vitro, se expresa en E.
coli con los componentes individuales como proteína de
expresión GST o, en el caso de cRAF1 se prepara con el sistema de
baculovirus. El primer elemento de la cascada
(MAP-KKK) tiene que activarse en este caso
permanentemente de manera homogénea, con el fin de poder cribar los
inhibidores de manera fiable. Esto se consiguió, en este caso,
mediante la coexpresión de src en el sistema de baculovirus. De
este modo se consigue una activación rac-análoga del
cRaf. De igual modo puede imaginarse, en principio, otra forma de
activación de una MAP-cinasa mediante fosforilación.
Otra posibilidad de activación constitutiva de una
MAP-cinasa consiste en la mutación de los
aminoácidos que deben ser fosforilados. Esto fue posible, en el
caso de MEK1, por ejemplo, mediante el intercambio de las serinas
Ser218 y Ser222 por glutamato (Zhang, et al., Proc Natl Acad
Sci U S A, 96, 8591-5, (1999)), (Ichijo, et
al., Science, 275, 90-4, (1997)). En el caso de
la 9B5 puede llevarse a cabo, en primer lugar, un cribado por
interacción (por ejemplo sistema y2h), para identificar una diana
de fosforilación, o puede emplearse directamente la MBP (proteína
básica de mielina -myelin basic protein-) como substrato. A
continuación puede sintetizarse un péptido a partir de la secuencia
objetivo con un marcador de biotina. Éste puede enlazarse sobre
perlas de SPA acopladas con avidina de la firma Amersham. En la
reacción se añade, además, 9B5-proteína purificada
(por ejemplo producida por vía bacteriana) y
gamma-32P-ATP. Esto puede llevarse a
cabo a escala de microtitulación. Bajo condiciones normales se
fosforila el péptido diana y se genera una contestación por
escintilación. Ahora se lleva a cabo una incubación previa, a
partir de una biblioteca de substancias químicas, de aquellas con
la reacción, como paso previo a la adición del péptido diana. Tras
la adición del péptido diana puede medirse entonces la respuesta
por escintilación. Una disminución de la respuesta significa la
presencia de un inhibidor potencial. La biblioteca explorada
debería ser tan compleja como fuera posible y debería contener un
gran número de clases diferentes de substancias. Ejemplos de una
clase de substancias de inhibidores específicos para una
proteínacinasa (p38) se encuentra, por ejemplo, en la patente
norteamericana Nr. 5,945,418. Otras clases de substancias que
pueden inhibir las proteínacinasas incluyen, por ejemplo, los
arilcompuestos monocíclicos, bicíclicos o heterocíclicos (WO
92/20642), los derivados de vinilen-azaindol (WO
94/14808), la
1-ciclopropil-4-piridil-quinolona
(patente norteamericana Nr. 5,330,992), los compuestos de estirilo
(patente norteamericana Nr. 5,217,999), los compuestos de piridilo
substituidos por estirilo (patente norteamericana Nr. 5,302,606),
determinados derivados de quinazolina (solicitud EP Nr. 0 566 266
A1), los seleoindoles y los seleniuros (WO 94/03427), los
compuestos polihidroxílicos tricíclicos (WO 92/21660), y los ácidos
bencilfosfónicos (WO 91/15495).
Lo específico del ensayo está determinado
únicamente por la identidad de la
Ser-Thr-cinasa descrita. Pueden
utilizarse diversos substratos. Éstos pueden emplearse en diversas
configuraciones del principio de ensayo anteriormente indicado. En
este caso, el punto esencial consiste, sin embargo, en la
utilización de la actividad cinasa de la 9B5 con finalidades de
cribado. A título de ejemplo el substrato puede presentarse en
solución libre, así como también acoplado sobre una fase, tal como
se ha indicado precedentemente. Sin embargo, el substrato puede
estar soportado también sobre una superficie celular, o incluso
puede ofrecerse de manera intracelular. Esto no tiene ningún efecto
sobre el fundamento del principio del ensayo.
El conocimiento de la secuencia de la 9B5 puede
aprovecharse para la preparación de ratones genéticamente
modificados (u otros animales). Con esta finalidad se expresará, por
ejemplo, un mutante inactivo constitutivo de la 9B5 en ratones
transgénicos, por ejemplo bajo un promotor NSE en neuronas, con un
promotor MBP en oligodendrocitos, etc. Esto debería tener un efecto
dominante negativo, y, de este modo, debería imitarse una inhibición
de la 9B5. Esto puede tener valiosas indicaciones sobre posibles
efectos farmacológicos de los inhibidores in vivo. De igual
modo puede expresarse una cinasa activa constitutiva.
De igual modo, la obtención de animales con
genes inactivos (knock-out) puede tener indicaciones
sobre los efectos de los inhibidores. La obtención de estos ratones
genéticamente modificados o de otros animales se lleva a cabo según
procedimientos usuales, que son conocidos por el técnico en la
materia.
Los animales, genéticamente modificados, pueden
investigarse a continuación en diversos modelos de enfermedades
(por ejemplo en la apoplejía provocada de manera experimental,
MCAO), o en modelos tumorales.
Muchas de las
serina-treonina-cinasas conocidas
hasta ahora participan en procesos neoplásticos. La participación
de la 9B5 en el crecimiento de las células, en el ciclo celular, en
la transformación tumorígena puede ensayarse adicionalmente
efectuando la transfección de constructo de expresión con la 9B5 en
células eucariotas, y ensayándose a continuación la inducción de la
tumorigenicidad, por ejemplo en un ensayo de agar blando
(Soft-Agar-Test (Zhang, et
al., Proc Natl Acad Sci U S A, 96, 8511-5,
(1999)), (Ichijo, et al., Science, 275, 90-4,
(1997))). Como tipos celulares entran en consideración varias
líneas usuales, por ejemplo células Cos, células HEK, células PC12,
células THP-1 y células primarias, por ejemplo
neuronas, astrocitos, así como otras líneas celulares
inmortalizadas y primarias, según las necesidades.
<110> BASF-LYNX
Bioscience
\vskip0.400000\baselineskip
<120> Neuronale
Serin-Threonin-Proteinkinase
\vskip0.400000\baselineskip
<130> p31560
\vskip0.400000\baselineskip
<140>
\vskip0.400000\baselineskip
<141>
\vskip0.400000\baselineskip
<160> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<170> PatentIn Ver. 2.1
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 3170
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Mus musculus
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> polyA_signal
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (3094)..(3099)
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificante:
(1)...(2172)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 3250
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Mus musculus
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> polyA_signal
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (3174)..(3179)
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificante:
(1)...(1980)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 3312
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> polyA_signal
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (3275)..(3280)
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificante:
(64)...(2319)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 3392
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> polyA_signal
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (3355)..(3360)
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificante:
(64)...(2127)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 724
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Mus musculus
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 5
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 660
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Mus musculus
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 6
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 752
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 7
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 688
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 8
\vskip1.000000\baselineskip
Claims (21)
1. Ácido nucleico, que codifica una
serina-treonina-proteína-cinasa
neuronal, elegido entre
- a)
- el ácido nucleico, con una de las secuencias según SEQ ID Nr. 1 - 4 y el ácido nucleico que codifica una proteína con una secuencia según una de las SEQ ID Nr. 5 - 8;
- b)
- el ácido nucleico, que codifica una proteína, que presente al menos una identidad del 70% con respecto a una proteína según una de las SEQ ID Nr. 5 - 8, y cuya expresión pueda ser inducida por medio de isquemia cerebral focal y por reperfusión.
2. Ácido nucleico según la reivindicación 1,
caracterizado porque codifica una secuencia proteínica según
una de las SEQ ID Nr. 5-8.
3. Ácido nucleico según una de las
reivindicaciones 1 a 2, caracterizado porque es un ADN.
4. Constructo, que contiene un ácido nucleico,
según una de las reivindicaciones 1 a 3, preferentemente bajo el
control de la expresión de elementos reguladores.
5. Constructo, que contiene un ácido nucleico,
según la reivindicación 4, caracterizado porque el ácido
nucleico se encuentra en orientación antisentido con respecto al
elemento regulador.
6. Constructo según una de las reivindicaciones
precedentes, caracterizado porque está presente en un
plásmido.
7. Célula huésped, que contiene un constructo
según una de las reivindicaciones 4 a 5.
8. Célula huésped según la reivindicación 7,
caracterizada porque se elige entre bacterias, células de
levadura y células de mamíferos.
9. Tejido, órgano de mamífero y/o de mamífero
transgénico no humano, aislado, que contiene un constructo según
una de las reivindicaciones 4 a 5.
10. Célula huésped y/o tejido de mamífero y/o
órgano de mamífero y/o mamífero transgénico no humano según una de
las reivindicaciones precedentes, caracterizados porque el
ácido nucleico o bien el constructo está integrado en un punto del
genoma, que no corresponde a su posición natural.
11. Proteína, que puede ser obtenida mediante la
expresión de un ácido nucleico según una de las reivindicaciones 1
a 3, en un sistema de expresión, preferentemente en una célula
huésped.
12. Proteína, cuya expresión puede ser inducida
mediante isquemia cerebral focal y reperfusión, que puede ser
obtenida mediante la expresión de un ácido nucleico según una de las
reivindicaciones 1 a 3, en un sistema de expresión, preferentemente
en una célula huésped.
13. Proteína según la reivindicación 11 o 12,
caracterizada porque se elige entre una proteína con una de
las secuencias según las SEQ ID Nr. 5 hasta 8 y entre proteínas que
tengan una identidad del 70% como mínimo con respecto a las
proteínas citadas y cuya expresión pueda ser inducida mediante
isquemia cerebral focal y reperfusión.
14. Anticuerpo, que reacciona de manera
específica con una proteína según una de las reivindicaciones 11 a
13.
15. Estuche para diagnóstico, que contiene un
ácido nucleico según una de las reivindicaciones 1 a 3 y/o un
constructo según una de las reivindicaciones 4 a 5 y/o una proteína
según una de las reivindicaciones 11 a 13 y/o un anticuerpo según
la reivindicación 14.
16. Procedimiento para el diagnóstico de un
riesgo de apoplejía, que comprende las etapas formadas por: la
determinación del nivel de expresión de un ácido nucleico según una
de las reivindicaciones 1 a 3 o de la cantidad de proteína según
una de las reivindicaciones 11 a 13, en una muestra del
paciente.
17. Procedimiento según la reivindicación 16,
caracterizado porque la muestra del paciente se pone en
contacto con un ácido nucleico según una de las reivindicaciones 1
a 3 y/o con un anticuerpo según la reivindicación 14.
18. Procedimiento para la identificación y/o
para el aislamiento de un inhibidor de
proteína-cinasa, caracterizado porque se
determina la actividad de proteína-cinasa de una
proteína según una de las reivindicaciones 11 a 13 en presencia y
en ausencia de la substancia de ensayo y se aísla la substancia
identificada de este modo como adecuada.
19. Ensayo de proteína-cinasa,
caracterizado porque la proteína-cinasa a ser
ensayada comprende una proteína según una de las reivindicaciones
11 a 13.
20. Composición farmacéutica, que contiene un
ácido nucleico, un constructo, una célula huésped, una proteína y/o
un anticuerpo según una de las reivindicaciones 1 a 14.
21. Empleo de un ácido nucleico, de un
constructo, de una célula huésped, de una proteína y/o de un
anticuerpo según una de las reivindicaciones 1 a 14 para la
obtención de un medicamento para la profilaxis y/o para la terapia
de enfermedades neurológicas, con inclusión de la apoplejía, de la
esclerosis múltiple, del Morbus Parkinson, de la esclerosis lateral
amiotrófica; de las ataxias heterodegenerativas, del Morbus
Huntington, de las neuropatías y de las epilepsias y/o de las
enfermedades tumorales, especialmente de los carcinomas.
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