ES2257388T3 - Procedimientos y composiciones para la seleccion de integrinas. - Google Patents

Procedimientos y composiciones para la seleccion de integrinas.

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ES2257388T3 ES01402843T ES01402843T ES2257388T3 ES 2257388 T3 ES2257388 T3 ES 2257388T3 ES 01402843 T ES01402843 T ES 01402843T ES 01402843 T ES01402843 T ES 01402843T ES 2257388 T3 ES2257388 T3 ES 2257388T3
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Abstract

Un procedimiento para seleccionar o identificar un compuesto que modula, inhibe o activa la actividad de una integrina alfa4beta7 o alfaEbeta7, que comprende: - poner en contacto (i) una preparación de membrana marcada que comprende integrina alfa4beta7 o alfaEbeta7 y un compuesto candidato con (ii) un material soporte que une integrina alfa4beta7 o alfaEbeta7, respectivamente, por medio de un ligando de las mismas y contiene un centelleador, - evaluar la cantidad de integrina alfa4beta7 o alfaEbeta7 unida al soporte, y - comparar la cantidad de integrina unida al soporte en presencia y en ausencia del compuesto candidato, y/o en presencia de un anticuerpo bloqueante, y seleccionar o identificar el compuesto que modula dicha cantidad.

Description

Procedimientos y composiciones para la selección de integrinas.
Campo de la invención
La presente invención se refiere a procedimientos de selección de compuestos que modulan la actividad de integrinas, más particularmente las integrinas de la subfamilia \alpha\beta7. La invención está de más preferencia basada en la tecnología SPA que selecciona compuestos que modulan integrinas de la subfamilia \alpha\beta7, más específicamente la actividad de las integrinas \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7. La invención también incluye las composiciones, productos, equipos para uso para llevar a cabo los procedimientos anteriores, así como los compuestos identificados por dichos procedimientos y sus usos.
Antecedentes de la invención
Las integrinas son una familia de moléculas de adhesión de transmembrana involucradas en las comunicaciones célula-célula y célula-matriz extracelular. Las integrinas comprenden diversas familias de moléculas heterodiméricas, comprendiendo una subunidad \alpha y una \beta, expresadas de manera no covalente en la superficie de la célula (Wardlaw, Drugs of the Future, 1999, 24(3), 279). La subunidad de integrina \beta7 puede constar de dos cadenas \alpha, \alpha4 y \alphaE y se expresa principalmente en linfocitos. Como un heterodímero \alpha4, se une a la molécula de adhesión celular de adresina de la mucosa MADCAM-1 y media en el reclutamiento selectivo de células de memoria T y B a la mucosa gastrointestinal y al tejido linfoide asociado al intestino. Como un heterodímero \alphaE, se une a la E-cadherina y media en la adhesión de linfocitos T intraepiteliales a las células epiteliales.
La expresión de MADCAM-1 parece estar regulada en sitios asociados con enfermedad intestinal inflamatoria (Briskin y col., 1997, AJP 151(1), 97). La administración del anticuerpo monoclonal anti-\alpha4\beta7 ACT-1 a monos tamarines cabeza de algodón con colitis crónica inhibe el reclutamiento de diversas subclases de leucocitos hacia la mucosa del colon inflamada (Hesterberg y col., 1996, Gastroenterology 111, 1373). Se observó reducción de la actividad inflamatoria del colon en ratones SCID reconstituidos con células T CD45Rbhi CD4+ tras la administración de anticuerpos contra \beta7 y/o contra MADCAM-1 (Picarella y col., 1997, J. Immunol. 158, 2099, Walsh y col., 1996, Immunology 89, 112-119, sugieren la unión dependiente de \alpha4\beta7 de eosinófilos a transfectantes VCAM-1 y MadCAM-1).
Con respecto a \alphaE\beta7, esta integrina, de acuerdo con nuestros conocimientos, nunca se ha usado como un blanco para la selección de medicamentos. Sin embargo, los inventores de la presente solicitud ahora han obtenido resultados experimentales que muestran que esta molécula puede jugar un rol crítico en el reclutamiento de células T y también representa un blanco interesante para diversas enfermedades tales como, más específicamente, asma. Al respecto, la deficiencia de \alphaE reduce la hiperrespuesta de las vías aéreas en ratones con desafío antigénico y un anticuerpo anti-\alphaE (M290) demostró buena actividad en un modelo de ratón de eosinofilia inducida por ovoalbúmina (resultados sin publicar por parte de los inventores). Además, \alphaE\beta7 también puede estar involucrada en las enfermedades inflamatorias del intestino.
Consecuentemente, las integrinas \alpha4\beta7 y \alphaE\beta7 representan un blanco interesante para el desarrollo de fármacos o compuestos farmacológicamente activos. En particular, compuestos que tienen la capacidad de modular la actividad de esas integrinas podrían representar compuestos altamente potenciales para el tratamiento de todas las enfermedades donde estén involucradas tales como enfermedades inflamatorias (por ejemplo, enfermedad intestinal inflamatoria, esclerosis múltiple, psoriasis, epidermodisplasia verruciforme, artritis inflamatoria), enfermedades alérgicas (por ejemplo, dermatitis, enfermedades relacionadas con T ayudante-1, enfermedad pulmonar obstructiva crónica, asma, etc.) y enfermedades inmunes.
La disponibilidad de ensayos adecuados para seleccionar compuestos que tienen tal propiedad podría entonces resultar de mayor interés. Al respecto, los ensayos de integrina actuales son ensayos de adhesión que usan placas recubiertas con ligandos en contacto con células que expresan integrinas y un compuesto de prueba. Sin embargo, esta prueba no es adecuada para formato de alto rendimiento y carece de sensibilidad y/o reproducibilidad. Se usó un ensayo de centelleo por proximidad (SPA) para el estudio de inhibidores de interacciones de VCAM-1 y \alpha4\beta1 (Doyle y col., 1996, Int. J. Peptide Protein Res. 47, 427-436). De acuerdo con nuestros conocimientos no se informaron ensayos eficaces en la técnica que permitan una selección eficaz, fiable, sensible y reproducible de compuestos que modulan la actividad de las integrinas que tienen una subunidad \beta7.
Resumen de la invención
La presente invención describe composiciones y procedimientos para la selección de compuestos que modulan, inhiben o activan la actividad de integrinas \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7 con fiabilidad y eficacia. Los procedimientos de acuerdo con esta invención son simples, fiables, sensibles, cómodos y económicos y permiten la selección de compuestos en base a alto rendimiento. En particular, la invención puede usarse para seleccionar en paralelo, gran cantidad de compuestos, incluyendo bibliotecas combinatorias de compuestos para identificar fármacos candidatos o blanco. Este tipo de invención permite entonces, por primera vez, seleccionar compuestos activos usando integrinas \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7 como blancos, para la selección, mejora y/o desarrollo de productos terapéuticamente activos.
Un objetivo de esta invención reside más específicamente en un procedimiento para seleccionar o identificar un compuesto que modula la actividad de integrinas \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7. El procedimiento de más preferencia comprende la identificación, selección, caracterización o selección de compuestos que inhiben la actividad de la integrina \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7.
Un objetivo particular de la presente invención reside en un procedimiento que selecciona o identifica un compuesto que modula, inhibe o activa la actividad de una integrina \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7, el procedimiento comprende:
-
poner en contacto (i) una preparación de membrana marcada que comprende integrina \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7 con un compuesto candidato con (ii) un material soporte que une integrina \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7, respectivamente, mediante un lingando de la misma y contiene un centelleador, y
-
evaluar la cantidad de integrina \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7 unida al soporte.
El material soporte puede estar compuesto de o comprender diversos elementos, tales como: polímeros, geles, vidrios, elementos artificiales u orgánicos, etc. El soporte puede estar funcionalizado adicionalmente y se le puede dar diversas formas, incluyendo la forma de perlas. Ya que el procedimiento de preferencia usa la tecnología de centelleo por proximidad (SPA), el material soporte además comprende un material centelleador, el que puede ser excitado tras la unión de la integrina marcada con el mismo o cuando el material de integrina marcada se lleva próximo al mismo. En una forma de realización de preferencia, el material soporte comprende un centelleador y está recubierto con un ligando de la integrina, es decir con un compuesto que es capaz de (específicamente) interactuar con integrina o una parte funcional de la misma.
En el procedimiento de la presente invención, determinar la cantidad de integrina unida al material soporte comprende de preferencia la determinación de la señal de centelleo del soporte. De más preferencia, el procedimiento comprende comparar la cantidad de integrina unida al soporte en presencia y en ausencia de un compuesto candidato y/o en presencia de un anticuerpo bloqueante e identificar el compuesto que modula dicha cantidad. Además, la invención puede usarse para seleccionar grandes cantidades de compuestos candidatos en paralelo, tales como parte o la totalidad de las bibliotecas combinatorias de compuestos.
La invención puede usarse para seleccionar, identificar, caracterizar, mejorar, comparar, etc. compuestos que modulan, inhiben o activan la actividad de la integrina \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7. La invención es particularmente más adecuada para seleccionar inhibidores de integrina \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7.
Otro objetivo de esta invención reside en un equipo para usar en la selección de moduladores de integrina \alphaE\beta7 o \alpha4\beta7, el equipo comprende una preparación de la membrana marcada que comprende integrina \alphaE\beta7 o \alpha4\beta7 o una parte funcional de la misma y/o material soporte en el que el material soporte comprende un ligando que une integrina \alphaE\beta7 o \alpha4\beta7 o una parte funcional de las mismas y contiene un centelleador.
Leyenda de los dibujos
Figura 1: Representación esquemática del ensayo basado en SPA.
Descripción detallada de la invención
Como se indicó, esta invención reside, generalmente, en procedimientos mejorados de selección para moduladores de integrinas. Estos procedimientos, generalmente, usan formatos SPA y preparaciones de membrana que comprenden la integrina seleccionada o partes funcionales de la misma (ver figura 1). Los procedimientos pueden usarse para seleccionar activadores así como inhibidores de integrina, por ejemplo compuestos que incrementan o disminuyen la unión de integrinas a los ligandos de las mismas. De preferencia, se seleccionan inhibidores, es decir, compuestos que disminuyen los niveles de dicha interacción, típicamente al menos un 20%, de preferencia al menos un 50%.
Típicamente, la presente invención reside en un procedimiento de selección o identificación de un compuesto que modula, inhibe o activa la actividad de una integrina \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7, el procedimiento comprende:
-
poner en contacto (i) una preparación de membrana marcada que comprende integrina \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7 con un compuesto candidato con (ii) un material soporte que une integrina \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7, respectivamente, y contiene un centelleador, y
-
evaluar la cantidad de integrina \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7 unida al soporte.
En una forma de realización de preferencia, la cantidad de integrina unida al soporte en presencia de un compuesto candidato se compara con la cantidad de integrina unida al soporte en ausencia de un compuesto candidato y/o en presencia de un anticuerpo bloqueante, compuestos que modulan dicha cantidad representan compuestos que modulan la actividad de la integrina.
Como se indicó, la presente invención de preferencia incluye un ensayo de centelleo tal como el ensayo de centelleo por proximidad (SPA). La tecnología del ensayo de centelleo próximo (SPA) incluye el uso de material de soporte de centelleo (por ejemplo perlas) que contienen un centelleador orgánico tal como difeniloxazol (PPO). Los ensayos usualmente se llevan a cabo en tampones acuosos usando isótopos radiactivos tales como ^{3}H, ^{125}I, ^{14}C, ^{35}S o ^{33}P que emiten radiación de baja energía, la energía de estos es fácilmente disipada en un ambiente acuoso. Por ejemplo, los electrones emitidos por ^{3}H tienen una energía promedio de sólo 6 keV y tienen paso del haz muy corto (-1 \simtm) en agua. Si una molécula marcada con uno de estos isótopos está unida a la superficie del material de soporte, ya sea directamente o mediante interacción con otra molécula previamente acoplada al material de soporte, la radiación emitida activará el centelleador y producirá luz. La cantidad de luz producida, que es proporcional a la cantidad de moléculas marcadas unidas al material soporte, puede medirse convenientemente con un contador de centelleo líquido (LS). Si la molécula marcada no está unida al material de soporte, su energía radiante es absorbida por el solvente acuoso que la rodea antes de llegar al material de soporte y no se produce ninguna luz. Así, los ligandos unidos dan una señal de centelleo, pero los ligandos libres dan un valor basal muy bajo, y se elimina la necesidad de una etapa de separación que agrega tiempo al procedimiento, característica de los ensayos de unión de ligandos radiactivos convencionales. Disminuyen las manipulaciones necesarias en los ensayos a unas simples etapas de pipeteo lo que lleva a una precisión y reproducibilidad mayor y a un rendimiento superior.
En una forma de realización de más preferencia, el procedimiento comprende el uso de perlas de SPA recubiertas con un ligando de integrina, típicamente un ligando endógeno de integrina. El recubrimiento se lleva a cabo, de preferencia por medio de interacción química o física con las perlas, aunque pueden contemplarse otros medios de unión. En particular, el recubrimiento puede llevarse a cabo usando perlas con estreptavidina y moléculas de ligando biotiniladas.
Esta invención es el resultado de la selección y validación de integrinas como blancos para el desarrollo de fármacos en enfermedades inflamatorias, alérgicas e inmunes, así como de la selección de condiciones eficaces de ensayos de selección de tales fármacos. Al respecto, la invención muestra inesperadamente que formatos de ensayo SPA particulares que usan preparaciones de membrana pueden usarse para identificar compuestos que interfieren con interacciones de proteína-proteína complejas entre moléculas complejas tales como receptores heterodiméricos, en particular receptores heterodiméricos recombinantes. La invención además muestra que es factible el alto rendimiento, ya que pueden usarse formatos con placas con 384 pocillos, con volúmenes bajos.
El Material de Soporte
La presente invención describe ahora un procedimiento nuevo para seleccionar compuestos activos usando un formato de ensayo SPA y material de soporte. El material de soporte tiene la capacidad de unir el complejo de integrinas seleccionado en conformación esencialmente nativa o partes funcionales de la misma.
Al respecto, el soporte puede estar compuesto, al menos en parte, de silicato, poliviniltolueno (PVT), (poli)acrilamida, agarosa, sefarosa, poliestireno, etc. Los ejemplos específicos de materiales de soporte incluyen PVT o material de silicato, opcionalmente recubiertos con ligandos tales como WGA, estreptavidina, polilisina, etc. El material de mayor preferencia comprende silicato de itrio (YtSi) o PVT recubierto o funcionalizado, en particular recubierto con un ligando de la integrina.
En una forma de realización de más preferencia, el soporte contiene un centelleador (o un centelleador orgánico). El centelleador es de preferencia insoluble en agua y excitable a un estado de energía superior tras la unión de la integrina marcada al soporte. El centelleador debería producir suficiente energía lumínica para ser detectada usando un dispositivo adecuado (contador de centelleo, por ejemplo). Un ejemplo típico de centelleador es difeniloxazol (PPO). Este centelleador se excita eficazmente por isótopos radiactivos que emiten rayos beta.
El material de soporte adecuado para uso en la presente invención puede encontrarse en el comercio, tal como por ejemplo en productos Amersham perlas de PVT recubiertas con WGA (RPNQ0001), perlas de PVT con WGA tratadas con PEI (RPNQ0003), perlas de PVT recubiertas con estreptavidina (RPNQ0007; RPNQ0007), perlas de silicato de itrio recubiertas con polilisina (RPNQ0010), perlas de silicato de itrio recubiertas con WGA (RPNQ0011), perlas de silicato de itrio recubiertas con estreptavidina (RPNQ0012) y perlas de SPA de silicato de itrio de unión a ARN (RPNQ0013).
Aunque el material de soporte puede ser de formas variadas, típicamente está en la forma de perlas (al respecto, ver "Proximity News", 39 (Dic. 1998), 1). Debería entenderse que una persona experta en la técnica puede ajustar la forma y composición precisa del material del soporte usando los conocimientos generales.
En una forma de realización de preferencia, el material de soporte, (por ejemplo, las perlas) está unido a (o recubierto con) un ligando (endógeno) de integrina \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7. El término ligando designa a cualquier molécula que tiene la capacidad de interactuar con la integrina seleccionada. En una forma de realización de más preferencia, el ligando es un ligando endógeno de la integrina, es decir, un compuesto que se sabe que interacciona fisiológicamente con la integrina seleccionada. Por cierto, resulta de más preferencia usar moléculas selectivas del ligando, es decir, moléculas que interactúan de preferencia con la integrina deseada y usar moléculas de ligando fisiológicas para producir los resultados más fiables.
Al respecto, en una primera variante de preferencia, el procedimiento usa material de soporte recubierto con (o unido a) MADCAM-1 o una parte funcional del mismo. MADCAM-1 es un ligando endógeno de la integrina \alpha4\beta7. Las secuencias de ácido nucleico y aminoácidos de MADCAM-1 están disponibles en Genbank, número de acceso MN_007164.
En una segunda variante de preferencia, el procedimiento usa material de soporte recubierto con E-cadherina o una parte funcional de la misma. La E-cadherina es un ligando endógeno de la integrina \alphaE\beta7. Las secuencias de ácido nucleico y aminoácidos de E-cadherina están disponibles en Genbank, número de acceso XM_007840.
El término parte funcional designa a cualquier variante o fragmento del ligando que retiene la capacidad de interactuar con la integrina seleccionada. En particular, la parte funcional puede estar constituida por un fragmento del ligando conteniendo el sitio de unión y desprovisto del domino citoplasmático. La parte funcional puede también comprender una variante del ligando, teniendo una o diversas modificaciones de aminoácidos (por ejemplo deleción, sustitución, mutación y/o adición), que aún exhibe la capacidad de unirse a la integrina. Tales variantes también incluyen variantes que se producen naturalmente tales como polimorfismos, formas de corte y empalme, homólogos de especies diferentes, etc.
El ligando puede recubrir el material de soporte de diferentes maneras, tales como mediante interacciones covalentes o no covalentes. De preferencia, el ligando recubre de manera covalente, a través de una unión química o espaciador, tal como por ejemplo estreptavidina/biotina.
Generalmente, se usan desde 0,05 hasta 5 mg de material de soporte (por ejemplo, perlas recubiertas) para cada ensayo. Debería entenderse que un experto en la técnica podría ajustar la cantidad precisa de material de soporte, dependiendo del material de soporte, cantidades de reactivos, etc.
Preparación de la Membrana Marcada
Como se indicó anteriormente, esta invención usa una preparación de membrana marcada comprendiendo la integrina seleccionada, cuya actividad debe detectarse bajo las condiciones descritas anteriormente. Los inventores demostraron, por cierto que la selección es mucho más eficaz y fiable cuando se usan preparaciones de membrana, en vez de polipéptidos de integrina aislados o purificados. Además, los inventores han demostrado que las preparaciones de membrana pueden usarse en la selección para evaluar la interacción entre moléculas receptoras complejas y el ligando en un formato de alto rendimiento.
La preparación de la membrana puede ser una célula entera o una preparación derivada de una célula entera comprendiendo una fracción de la membrana de la misma, en la que dicha célula o fracción de membrana comprende la integrina \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7 o una parte funcional de las mismas. La preparación de membrana puede también ser una preparación de membrana artificial comprendiendo la integrina seleccionada, por ejemplo una micela o un liposoma producido mezclando lípidos y los polipéptidos de integrina juntos bajo condiciones adecuadas. En una forma de realización de preferencia, la preparación de membrana es un lisado celular producido a partir de una célula que expresa el polipéptido de integrina seleccionada o una parte funcional de la misma.
En una forma de realización particular, el procedimiento usa una preparación de membrana, tal como un lisado celular o una fracción celular, comprendiendo la integrina, derivada (u obtenida) de células de mamífero o bacterianas (recombinantes).
La integrina puede ser de diversos orígenes, tal como humano o animal, de preferencia humano. La integrina puede ser una integrina que se produce naturalmente, por ejemplo, preparada en un cultivo de células que producen naturalmente dicha molécula (cultivo tisular, cultivo celular, etc.), o una molécula recombinante preparada a partir de células conteniendo el ácido nucleico recombinante que la codifica. Al respecto, la integrina puede obtenerse a partir de células transfectadas conteniendo un ácido nucleico que codifica dicha molécula. Las secuencias de ácido nucleico que codifican una integrina humana \alphaE\beta7 o \alpha4\beta7 fueron clonadas y se describen en la técnica, por ejemplo estas secuencias están disponibles en Genbank bajo los números de acceso XM_029724; XP_039011; XP_008508; XM_039011.1; XM_008508.5. La secuencia puede transfectarse en células usando plásmidos y/o vectores diversos, conteniendo promotores diversos, para producir la molécula recombinante. El lisado de tales células (u otras preparaciones derivadas del mismo) puede usarse en los ensayos de selección de esta invención. Las células pueden ser de diversos orígenes tales como mamíferos, eucarióticas (por ejemplo levaduras), procarióticas (por ejemplo bacterias), vegetal, etc. Usualmente, las células de preferencia son de mamífero, de manera que la integrina recombinante es funcional y se procesa de acuerdo a los mecanismos naturales. Sin embargo, pueden usarse células no humanas para incrementar además la selectividad del procedimiento, es decir, para producir membranas celulares que expresan la integrina humana seleccionada y ningún otro polipéptido de integrina humana. Al respecto, las células de mamífero o humanas de preferencia son células que esencialmente no expresan naturalmente moléculas de integrina.
Las células pueden ser células primarias o cultivos celulares establecidos. Pueden cultivarse en cualquier medio adecuado, posteriormente tratarse para preparar la preparación de membrana que contiene integrinas (extractos celulares, fracciones celulares y similares). Típicamente, se somete a las células a tratamiento físico y/o químico para producir el material que contiene integrinas. En un experimento típico, las células se someten a lisis enzimática y/o química y/o física, usando de preferencia tripsina, ciclos de congelación/descongelación, ultrasonido, etc., solos o en combinaciones diversas. Los extractos (o fracciones) celulares se recogen y pueden además concentrarse, suspenderse en tampones adecuados, purificarse, acondicionarse, etc.
Típicamente la preparación de membrana con integrinas usada es un lisado o fracciones celulares (u otro material derivado de células). La preparación de membrana con integrinas puede comprender también extractos celulares (transfectados) totales.
En una forma de realización de preferencia la preparación de membrana se obtiene a partir de una célula (de mamífero) recombinante que expresa una molécula de polipéptido de integrina \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7, aún de más preferencia a partir de una célula recombinante que expresa integrina humana \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7, o una parte funcional de las mismas. Para producir tal preparación de membrana, pueden usarse diversas células, tales como células que expresan naturalmente la integrina seleccionada, o células transducidas con un ácido nucleico que codifica la misma o una parte funcional de la misma. El término parte funcional es como se definió anteriormente para el ligando. Por cierto, no es necesario que la integrina expresada sea idéntica a la integrina que se produce naturalmente, siempre que (i) retenga un sitio de unión funcional y (ii) sea capaz de interactuar con el ligando que recubre el material de soporte. De acuerdo a esto, la integrina puede carecer de dominios citoplasmáticos o aminoácidos y/o contener variaciones de aminoácidos comparadas con las moléculas de tipo salvaje.
Como se indicó, la preparación de membrana está marcada para permitir la detección de una interacción con el material de soporte recubierto. La preparación de membrana marcada está marcada de preferencia radiactivamente. La marcación radiactiva puede llevarse a cabo usando isótopos radiactivos diversos, incluyendo ^{3}H, ^{125}I, ^{14}C, ^{35}S, ^{33}P o ^{32}P. De preferencia, el isótopo radiactivo debería emitir radiación de baja energía, cuya energía se disipa fácilmente en un ambiente acuoso. Por cierto, se necesita que las membranas marcadas no unidas no activen esencialmente el centelleador contenido en el material de soporte. La naturaleza del isótopo puede seleccionarse también dependiendo del tipo del centelleador. Por ejemplo, en caso de usar PPO como centelleador, el isótopo debería emitir de preferencia rayos beta, tal como por ejemplo ^{3}H. En una forma de realización de preferencia, las preparaciones de membrana están tritiadas.
El marcado puede llevarse a cabo de acuerdo con diversas técnicas conocidas, tal como la incorporación de elementos marcados en las membranas celulares (por ejemplo aminoácidos, lípidos, etc. marcados), o poniendo las preparaciones de membrana en contacto con un marcador (ligando marcado, etc.). De preferencia, las membranas se marcan incorporando elementos marcados durante el cultivo celular. Aún de más preferencia, se marcan incorporando aminoácidos marcados. De acuerdo con esto, en una forma de realización de preferencia, la preparación de membrana se marca radiactivamente cultivando una célula en presencia de un aminoácido marcado radiactivamente previo a la preparación de la preparación de membrana. El aminoácido marcado puede ser por ejemplo metionina, que se incorpora en muchos polipéptidos, ya que está codificado por el codón ATG de inicio. Debería entenderse que pueden usarse otros aminoácidos marcados.
La cantidad de preparación de membrana marcada para el ensayo puede ser ajustada por un experto en la técnica. En un experimento típico, se usa entre 1 x 10^{4} hasta 5 x 10^{8} cpm/ml de preparación de membrana marcada para cada reacción de ensayo, de más preferencia aún entre 1 x 10^{5} hasta 5 x 10^{7} cpm/ml. En un experimento típico, se usan entre 1 x 10^{6} y 5 x 10^{6} cpm/ml.
Condiciones del Ensayo
El ensayo puede llevarse a cabo en cualquier soporte o dispositivo adecuado, incluyendo placa, tubo, matraz y similar. Generalmente, el contacto se lleva a cabo en placas de pocillos múltiples, permitiendo realizar múltiples ensayos en paralelo. Los soportes típicos incluyen placas de microtitulación, especialmente de 96 o 384 pocillos y formatos de placas de microtitulación de alto rendimiento, que son fáciles de manejar y de iluminar por medio de excitación convencional. Pueden usarse también otros formatos, incluyendo placas de microtitulación mayores o nanotecnologías.
Dependiendo del soporte y del compuesto de prueba, pueden usarse en el ensayo cantidades variables de reactivos. Típicamente, pueden distribuirse las siguientes cantidades en un volumen final máximo de 250 \mul por pocillo:
0,05-5 mg/ml de perlas recubiertas con ligando, y
1 x 10^{4} a 5 x 10^{8} cpm/ml de preparación de membrana marcada radiactivamente.
La reacción puede llevarse a cabo en cualquier tampón de ensayo adecuado, comprendiendo por ejemplo cualquier tampón, solución salina, solución acuosa, etc., que permita poner en contacto los reactivos y que no altere su actividad biológica.
Debería entenderse que las cantidades (o concentraciones) respectivas precisas de reactivos y compuestos de prueba pueden ser ajustadas por el usuario, dependiendo del tipo de compuesto, el tipo de integrina, la longitud del período de incubación, etc. Además, si es necesario, los reactivos pueden mezclarse en presencia de agentes adicionales para mejorar el rendimiento del ensayo.
La etapa de contacto i) puede durar hasta 6 horas, típicamente menos de 4 horas. Por cierto, los reactivos diversos son incubados de preferencia durante un período de tiempo suficiente para permitir que se produzca la interacción. Dependiendo de los ensayos, este período usualmente dura menos de aproximadamente 3 horas. En un experimento típico, la mezcla se lleva a cabo durante aproximadamente 1 hora o menos. El soporte puede agregarse durante aproximadamente 10 minutos o varias horas. Típicamente, la mezcla de reacción se agita durante los primeros 5-30 minutos y la mezcla se deja durante otros 15-100 minutos o más.
La cantidad de integrina unida al soporte puede evaluarse de diversas maneras, como una indicación de la actividad del compuesto candidato. Generalmente, se evalúa por conteo de centelleo usando dispositivos convencionales. En particular, los conteos pueden medirse directamente en la mezcla de reacción, sin necesidad de etapas de separación. Alternativamente, el lípido de unión al soporte puede detectarse o cuantificarse usando otras técnicas convencionales, tales como cromatografía, inmunoensayo, etc.
Una forma de realización de preferencia de esta invención incluye un procedimiento de selección o identificación de un compuesto que modula la actividad de integrina \alpha4\beta7, comprendiendo:
poner en contacto, en presencia o en ausencia del compuesto candidato, (i) una preparación de membrana marcada que comprende integrina \alpha4\beta7 o una parte funcional de la misma con (ii) un material de soporte recubierto con MADCAM-1 o una parte funcional del mismo que se une selectivamente a \alpha4\beta7 contenida en dicha preparación de membrana, comprendiendo dicho material de soporte un centelleador, y
evaluar el efecto del compuesto candidato en la actividad de integrina \alpha4\beta7 comparando la señal de centelleo en presencia y en ausencia del compuesto candidato y/o en presencia de un anticuerpo bloqueante, los compuestos que modulan dicha señal de centelleo representan compuestos que modulan dicha actividad.
Otra forma de realización de preferencia de esta invención reside en un procedimiento de selección o identificación de un compuesto que modula la actividad de integrina \alphaE\beta7, comprendiendo:
poner en contacto, en presencia o en ausencia del compuesto candidato, (i) una preparación de membrana marcada que comprende integrina \alphaE\beta7 o una parte funcional de la misma con (ii) un material de soporte recubierto con E-Cadherina o una parte funcional de la misma que se une selectivamente a \alphaE\beta7 contenida en dicha preparación de membrana, comprendiendo dicho material de soporte un centelleador, y
evaluar el efecto del compuesto candidato en la actividad de integrina \alphaE\beta7 comparando la señal de centelleo en presencia y en ausencia del compuesto candidato y/o en presencia de un anticuerpo bloqueante, los compuestos que modulan dicha señal de centelleo representan compuestos que modulan dicha actividad.
Los procedimientos anteriores están dirigidos de preferencia a la identificación o selección de inhibidores de integrinas.
El (los) Compuesto(s) de Prueba (o Candidato)
El compuesto de prueba puede ser cualquier producto en forma aislada o mezclado con cualquier otro material (por ejemplo cualquier otro producto(s)). El compuesto puede estar definido en términos de estructura y/o composición, o puede estar indefinido. Por ejemplo, el compuesto puede ser un producto aislado y estructuralmente definido, un producto aislado de estructura desconocida, una mezcla de diversos productos conocidos y caracterizados o una composición indefinida comprendiendo uno o varios productos. Los ejemplos de tales composiciones indefinidas incluyen por ejemplo muestras de tejido, fluidos biológicos, extractos celulares, preparaciones vegetales, etc. El compuesto de prueba puede ser cualquier producto orgánico o inorgánico, incluyendo un polipéptido (o una proteína o péptido), un ácido nucleico, un lípido, un polisacárido, un producto químico o cualquier mezcla o derivados de los mismos. Los compuestos pueden ser de origen natural, de origen sintético, incluyendo bibliotecas de compuestos.
Como se discutirá más adelante, la presente invención está particularmente adaptada para la selección de gran cantidad de compuestos, tales como bibliotecas combinatorias de compuestos. Por cierto, la presente invención provee composiciones y procedimientos que permiten la selección eficaz y simple de varios compuestos en períodos de tiempo cortos. En particular, los presentes procedimientos pueden automatizarse parcialmente, y por lo tanto permiten la selección eficaz y simultánea de grandes series de compuestos.
Generalmente, la actividad del compuesto(s) de prueba es desconocida, y el procedimiento de esta invención se usa para identificar compuestos que exhiben la propiedad seleccionada (por ejemplo moduladores de integrinas). Sin embargo, en situaciones particulares cuando la actividad (o tipo de actividad) del compuesto(s) de prueba se conoce o espera, el procedimiento puede usarse para caracterizar adicionalmente dicha actividad (en términos de especificidad, eficacia, etc.) y/o para optimizar dicha actividad evaluando derivados de dichos compuestos de prueba.
La invención también incluye equipos para uso en la selección de moduladores de integrinas \alphaE\beta7 o \alpha4\beta7, que comprenden una preparación de membrana marcada comprendiendo integrinas \alphaE\beta7 o \alpha4\beta7 o una parte funcional de las mismas y/o un material de soporte en el que el material de soporte se une a la integrina \alphaE\beta7 o \alpha4\beta7 o a una parte funcional de la misma y contiene un centelleador. El equipo también puede incluir los reactivos y/o protocolos para tecnología SPA, tales como tampones, etc.
Ejemplos 1. Ensayo SPA de \alphaE\beta7 1.1. Materiales
Los transfectantes de la línea celular K562 de leucemia mielógena crónica humana que expresan \alphaE\beta7 y las proteínas tales como proteína de fusión de E-Cadherina-Fc, fueron como los descritos en Brenner y col. (Molecular basis for Leukocyte Integrin \alphaE\beta7 Adhesion to Epithelial (E)-Cadherin, Structure-Function analysis of integrin \beta7 subunit). Estos pueden prepararse de acuerdo con técnicas conocidas. La biotinilación de (E)-Cadherina se llevó a cabo de acuerdo con el protocolo clásico (Cf: Amersham proximity news: Biotinylation techniques...). El medio de cultivo incluyendo todos los suplementos se adquirió en LifeTech (Paris, Francia), [^{3}H] metionina (TRK583, 85 Ci/mmol) y las perlas de SPA con estreptavidina (RPNQ0007) se adquirieron en Amersham (Paris, Francia).
1.2. Cultivo
Se cultivaron las células K562 en RPMI 1640 con medio L-glutamina (Life Tech Nº21875-0.34), Clon Fetal I 10%, L-Glu 2 mM adicional, Pen/Strep 100 X, Geneticina 550 mg/l, Higromicina B 550 mg/l. Las células se dividen cada 2-3 días. Usualmente resuspendemos a una concentración de 0,4 millones/ml en matraces COSTAR de 150 cm^{2} (retirándolos).
1.3. Tritiado de Membrana
Se cultiva la línea celular humana K562 (50 x 10^{6} células/100 ml) durante 18 horas en RPMI1640 libre de metionina (LifeTech Nº11876-026) con 10% FBS en presencia de 80 \muCi de [^{3}H] metionina (Amersham NºTRK583, 85 Ci/mmol). Se lavan las células dos veces con 25 ml de PBS, se centrifugan a 1500 rpm durante 10 min. y se resuspenden en 10 ml de tampón de lisis hipotónico (20 mM Hepes, 2 mM CaCl_{2}, 20 mM NaCl y 25 \mug/ml de aprotinina) para 50 x 10^{6} células y se mantienen a -80ºC.
1.4. Ensayo de Centelleo por Proximidad
Se mezclan las perlas de SPA con estreptavidina con biot-E-Cadherina (5 \mug/mg perlas) durante 30 minutos a temperatura ambiente en tampón de ensayo (HBSS (Gibco, 14025-076), 0,5 mM Mn^{2+} (MnCl_{2}), 25 mM HEPES, pen/strep [1X], Complete^{TM} libre de EDTA (inhibidor de Proteasas): un comprimido/50 ml de tampón de ensayo (Boehringer Mannheim Nº1873580), 15% glicerol), se centrifugan a 3000 rpm durante 5 minutos y se resuspenden en el tampón de ensayo a 70 \mug/100 \mul/pocillo.
El ensayo de centelleo por proximidad se lleva a cabo a temperatura ambiente en tampón de ensayo. Cada ensayo se lleva a cabo en un volumen de reacción de 200 \mul conteniendo 0,7 mg/ml de perlas SPA recubiertas y 2,3 x 10^{6} cpm/ml de membranas tritiadas. La señal no específica se determina en presencia de concentraciones altas de anticuerpo bloqueante. Se incuban las placas de microtitulación a temperatura ambiente durante 45 minutos en un agitador orbital y se realiza el conteo en un contador de centelleo Wallac Microbeta^{TM}.
1.5. Resultados
Se completó la selección de varias bibliotecas. Se seleccionaron diversas entidades químicas y se confirmó su capacidad para inhibir la actividad de integrinas.
2. Ensayo SPA de \alpha4\beta7 2.1 Materiales
Células que expresan \alpha4\beta7: RPMI8866.
Ligando: Proteína de Fusión MADCAM-Fc.
El biotinilado de la Proteína de Fusión MADCAM-Fc se llevó a cabo de acuerdo con el protocolo clásico (Cf: Amersham proximity news: Biotinylation techniques...).
El medio de cultivo incluyendo todos los suplementos se adquirió en LifeTech (Paris, Francia), [^{3}H] metionina (TRK583, 85 Ci/mmol) y las perlas de SPA con estreptavidina (RPNQ0007) se adquirieron en Amersham (Paris, Francia).
2.2 Cultivo
Se cultivaron las células RPMI 8866 en RPMI 1640 con medio L-glutamina (Life Tech Nº21875-0.34), Gentamicina 0,1 mg/ml, FBS 10%. Las células se dividen cada 2-3 días. Usualmente resuspendemos a una concentración de 0,4 millones/ml.
2.3. Tritiado de Membrana
Se cultiva la línea celular humana RPMI 8866 (25 x 10^{6} células/50 ml) durante 18 horas en RPMI1640 libre de metionina (LifeTech Nº11876-026) con 10% FBS y gentamicina en presencia de 80 \muCi de [^{3}H] metionina. Se lavan las células dos veces con 25 ml de PBS, se centrifugan a 1500 rpm durante 10 min. y se resuspenden en 10 ml de tampón de lisis hipotónico (20 mM Hepes, 2 mM CaCl_{2}, 20 mM NaCl y 25 \mug/ml de aprotinina) para 50 x 10^{6} células y se mantienen a -80ºC.
2.4. Ensayo de Centelleo por Proximidad
Se mezclan las perlas de SPA con estreptavidina con biot-MADCAM (12 \mug/mg perlas) durante 30 minutos a temperatura ambiente en tampón de ensayo (HBSS, 0,5 mM Mn^{2+} (MnCl_{2}), 25 mM HEPES, pen/strep [1X], Complete^{TM} libre de EDTA (inhibidor de Proteasas): un comprimido/50 ml de tampón de ensayo (Boehringer Mannheim Nº1873580), 15% glicerol), se centrifugan a 3000 rpm durante 5 minutos y se resuspenden en el tampón de ensayo a 70 \mug/100 \mul/pocillo.
El ensayo de centelleo por proximidad se lleva a cabo a temperatura ambiente en tampón de ensayo. Cada ensayo se lleva a cabo en un volumen de reacción de 200 \mul conteniendo 0,7 mg/ml de perlas SPA recubiertas y 1,25 x 10^{6} cpm/ml de membranas tritiadas. La señal no específica se determina en presencia de concentraciones altas de anticuerpo bloqueante. Se incuban las placas de microtitulación a temperatura ambiente durante 45 minutos en un agitador orbital y se realiza el conteo en un contador de centelleo Wallac Microbeta^{TM}.
En conclusión, de acuerdo con los ejemplos anteriores se creó una prueba SPA para \alpha4\beta7, usando perlas con \alpha4\beta7 tritiado y MADCAM-1. Esta prueba es muy robusta, tanto en el formato de 96 como de 384 pocillos y nos permite seleccionar rápidamente bibliotecas de compuestos para ordenar inhibidores de la cavidad de unión de MADCAM-1 con sensibilidad exquisita. Esta prueba no necesita integrinas purificadas, se lleva a cabo usando extractos crudos de células (transitoriamente transfectadas). Según nuestro conocimiento, este es el primer ensayo eficaz descrito hasta el momento para integrinas con la subunidad \beta7, el que abre nuevas posibilidades para el desarrollo de moléculas activas. Las moléculas activas aisladas u obtenidas así pueden usarse como candidatos de fármacos, o implicarse en otros programas de optimización, para diseñar bibliotecas de compuestos orientadas o introducir otras modificaciones químicas.

Claims (22)

1. Un procedimiento para seleccionar o identificar un compuesto que modula, inhibe o activa la actividad de una integrina \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7, que comprende:
-
poner en contacto (i) una preparación de membrana marcada que comprende integrina \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7 y un compuesto candidato con (ii) un material soporte que une integrina \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7, respectivamente, por medio de un ligando de las mismas y contiene un centelleador,
-
evaluar la cantidad de integrina \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7 unida al soporte, y
-
comparar la cantidad de integrina unida al soporte en presencia y en ausencia del compuesto candidato, y/o en presencia de un anticuerpo bloqueante, y seleccionar o identificar el compuesto que modula dicha cantidad.
2. El procedimiento de la reivindicación 1 para seleccionar o identificar un inhibidor de integrina \alpha4\beta7.
3. El procedimiento de la reivindicación 1 para seleccionar o identificar un inhibidor de integrina \alphaE\beta7.
4. El procedimiento de una cualquiera de las reivindicaciones precedentes, en el que la preparación de membrana es una célula entera o una preparación derivada de una célula entera comprendiendo una fracción de membrana de la misma, en el que dicha célula o fracción de membrana comprende integrina \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7 o una parte funcional de las mismas.
5. El procedimiento de la reivindicación 4, en el que la preparación de membrana es un lisado celular.
6. El procedimiento de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5, en el que la preparación de membrana se obtiene a partir de una célula recombinante que expresa integrina \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7 o una parte funcional de las mismas.
7. El procedimiento de la reivindicación 6, en el que la célula recombinante expresa integrinas \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7 humanas, o una parte funcional de las mismas.
8. El procedimiento de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones precedentes, en el que la preparación de membrana está marcada radiactivamente, de más preferencia tritiada.
9. El procedimiento de la reivindicación 8, en el que la preparación de membrana se marca radiactivamente cultivando una célula en presencia de un aminoácido marcado radiactivamente previamente a la preparación de la preparación de membrana.
10. El procedimiento de una cualquiera de las reivindicaciones precedentes, en el que el material de soporte comprende silicato de itrio, poliviniltolueno (PVT), (poli)acrilamida, agarosa, sefarosa o poliestireno.
11. El procedimiento de la reivindicación 1 ó 10, en el que el soporte es una perla.
12. El procedimiento de una cualquiera de las reivindicaciones precedentes, en el que el material de soporte está recubierto con un ligando de integrina \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7.
13. El procedimiento de la reivindicación 12, en el que el soporte está recubierto con MADCAM-1 o una parte funcional de la misma.
14. El procedimiento de la reivindicación 12, en el que el soporte está recubierto con E-cadherina o una parte funcional de la misma.
15. El procedimiento de una cualquiera de las reivindicaciones precedentes, en el que el centelleador es difeniloxazol.
16. El procedimiento de la reivindicación 1, que comprende poner en contacto el compuesto candidato en un tampón de ensayo con:
- 0,05-5 mg/ml de perlas recubiertas con ligando, y
- 1 x 10^{4} a 5 x 10^{8} cpm/ml de preparación de membrana marcada radiactivamente.
17. El procedimiento de una cualquiera de las reivindicaciones precedentes, en el que la determinación de la cantidad de integrina unida al material de soporte comprende la determinación de la señal de centelleo del soporte.
18. El procedimiento de la reivindicación 1, en el que se prueban varios compuestos candidato en paralelo.
19. El procedimiento de la reivindicación 1, en el que la etapa de poner en contacto los componentes se lleva a cabo en una placa de microtitulación.
20. Un procedimiento de la reivindicación 1, para seleccionar o identificar un compuesto que modula la actividad de integrina \alpha4\beta7, que comprende:
- poner en contacto, en presencia o ausencia de un compuesto candidato, (i) una preparación de membrana marcada que comprende integrina \alpha4\beta7 o una parte funcional de la misma con (ii) un material de soporte recubierto con MADCAM-1 o una parte funcional de la misma que se une selectivamente a \alpha4\beta7 contenida en dicha preparación de membrana, comprendiendo dicho material de soporte un centelleador, y
- evaluar el efecto del compuesto candidato en la actividad de integrina \alpha4\beta7 comparando la señal de centelleo en presencia y en ausencia del compuesto candidato y/o en presencia de un anticuerpo bloqueante, los compuestos que modulan dicha señal de centelleo representan compuestos que modulan dicha actividad.
21. Un procedimiento de la reivindicación 1, para seleccionar o identificar un compuesto que modula la actividad de integrina \alphaE\beta7, que comprende:
- poner en contacto, en presencia o ausencia de un compuesto candidato, (i) una preparación de membrana marcada que comprende integrina \alphaE\beta7 o una parte funcional de la misma con (ii) un material de soporte recubierto con E-cadherina o una parte funcional de la misma que se une selectivamente a \alphaE\beta7 contenida en dicha preparación de membrana, comprendiendo dicho material de soporte un centelleador, y
- evaluar el efecto del compuesto candidato en la actividad de integrina \alphaE\beta7 comparando la señal de centelleo en presencia y en ausencia del compuesto candidato y/o en presencia de un anticuerpo bloqueante, los compuestos que modulan dicha señal de centelleo representan compuestos que modulan dicha actividad.
22. Un equipo para usar en la selección de moduladores de integrina \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7, que comprende una preparación de membrana marcada comprendiendo integrina \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7 o una parte funcional de las mismas y un material de soporte en el que el material de soporte comprende un ligando que se une a integrinas \alpha4\beta7 o \alphaE\beta7 o a una parte funcional de las mismas y contiene un centelleador.
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Families Citing this family (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP1687637A4 (en) * 2003-11-29 2007-09-05 Proteogen Inc HIGH-PERFORMANCE SCREENING PROCESS FOR AN INTEGRIN ANTAGONIST AND SCREENING THEREOF TO RECEIVE NEW PEPTIDE
WO2007007151A2 (en) * 2005-07-11 2007-01-18 Pfizer Limited Use of anti-mad-cam antibody for the treatment of emphysema
WO2011103049A2 (en) * 2010-02-16 2011-08-25 Immune Disease Institute, Inc. Method for screening receptors/ligands interactions
DE102017114537A1 (de) * 2017-06-29 2019-01-03 Endress+Hauser Conducta Gmbh+Co. Kg Sensormembran, Sensorkappe und optischer Sensor

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5837478A (en) * 1993-12-23 1998-11-17 Icos Corporation Method of identifying modulators of binding between and VCAM-1
CA2224571A1 (en) * 1996-04-15 1997-10-23 Icos Corporation Cytoplasmic modulators of integrin regulation/signaling
EP1078006B1 (en) * 1998-05-13 2009-03-04 Genentech, Inc. Diagnosis and treatment of hepatic disorders

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