ES2257125B1 - Metodo para mejorar la viabilidad y la capacidad fermentativa de levaduras de panaderia en condiciones de estres hiperosmotico y estres por congelacion. - Google Patents

Metodo para mejorar la viabilidad y la capacidad fermentativa de levaduras de panaderia en condiciones de estres hiperosmotico y estres por congelacion. Download PDF

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Abstract

Método para mejorar la viabilidad y la capacidad fermentativa de levaduras de panadería en condiciones de estrés hiperosmótico y estrés por congelación. La presente invención se refiere a un método para mejorar la viabilidad y la capacidad fermentativa de levaduras de panadería en condiciones de estrés hiperosmótico y estrés por congelación, mediante la transformación genética de las levaduras con una secuencia de nucleótidos que permite la expresión de una proteína con actividad Crz1.

Description

Método para mejorar la viabilidad y la capacidad fermentativa de levaduras de panadería en condiciones de estrés hiperosmótico y estrés por congelación.
Sector de la técnica
La invención se centra en el campo de la biotecnología y en particular en el de levaduras de panadería utilizadas en procesos de fermentación en los que se requiere que las células de este organismo exhiban una alta tolerancia a estrés hiperosmótico (alta concentración de azúcares) y estrés por congelación, condiciones que habitualmente dan lugar a una pérdida de viabilidad y capacidad fermentativa. En concreto, la invención hace referencia a un proceso para alterar la respuesta a estrés en células de levadura, mediante la sobreexpresión del gen CRZ1 de S. cerevisiae o de genes funcionalmente homólogos a éste, y a un fragmento de nucleótidos que codifica una proteína con dedos de zinc del tipo Cys2His2, requerida para la activación "vía calcineurina" de genes de respuesta a estrés hiperosmótico.
Estado de la técnica
La habilidad de las levaduras industriales de panadería para hacer frente a condiciones ambientales adversas es clave en el proceso de panificación. En consecuencia, la mejora de la tolerancia a estrés de estas levaduras ha centrado la atención de investigadores e industriales durante los últimos años. Este interés se ha acrecentado por la enorme expansión del mercado de productos de bollería, en particular, congelada, que ha pasado a representar más del 10% de las ventas de productos de panadería en Europa y un 25-30% en todo el mundo, previéndose un fuerte crecimiento en los próximos años.
Las levaduras comerciales de panadería, son cepas de Saccharomyces cerevisiae que han sido seleccionadas durante años por su habilidad para producir, de forma rápida y constante, el CO_{2} requerido en la fermentación de masas de pan común. En masas de productos de bollería, su capacidad fermentativa se ve, sin embargo, muy disminuida. Estos productos contienen hasta un 30% de azúcar (sacarosa) o jarabe invertido (mezcla de glucosa y fructosa), como agente edulcorante, además de leche en polvo, grasa y sal, que reducen la actividad de agua y aumentan, por tanto, la presión osmótica. En estas condiciones, las células de levadura se deshidratan rápidamente, y reducen su capacidad de crecimiento y de producción de gas [Attfield PV (1997) Stress tolerance: the key to effective strains of industrial baker's yeast. Nature Biotechnol 15:1351-1357; Randez-Gil F, Sanz P, Prieto JA (1999) Engineering baker's yeast: room for improvement. Trends Biotechnol 17:237-244]. Como consecuencia, el tiempo de fermentación se incrementa y el volumen de estos productos se reduce.
Esta situación empeora en masas congeladas, ya que la congelación de la masa es también una fuente de estrés iónico y osmótico para la levadura. A temperaturas por debajo de 0ºC, el efecto deletéreo sobre las células depende de la velocidad de congelación. A velocidades lentas, como las que se dan habitualmente en la congelación de una masa panaria, se observa una contracción celular y la formación de hielo extracelular [Kaul SC, Obuchi K, Iwahashi H, Komatsu Y (1992) Cryoprotection provided by heat shock treatment in Saccharomyces cerevisiae. Cell Mol Biol 38:135-143], con el consiguiente estrés osmótico [Wolfe J, Bryant G (1999) Freezing, crying, and/orvitrification of membrane-solute-water systems. Criobiology 39:103-129]. A mayor velocidad de congelación, ésta produce además, daños a nivel estructural y desnaturalización de proteínas y macromoleculas [Myers DK, Attfield PV (1999) Intracellular concentration of exogenous glycerol in Saccharomyces cerevisiae provides for improved leavening of frozen sweet doughs. Food Microbiol 16:45-51]. No es de extrañar por tanto, que la tolerancia a la congelación en S. cerevisiae dependa de diferentes factores, y entre ellos, de su respuesta a estrés osmótico.
Por otra parte, la adición de sal (NaCl, alrededor del 2%, base harina) en masas dulces puede generar efectos adicionales, a los puramente osmóticos. En efecto, la acumulación de Na^{+} y Cl^{-} en el citosol puede tener efectos tóxicos para la mayoría de sistemas enzimáticos [Serrano R (1996) Salt tolerance in plants and microorganisms: toxicity targets and defense responses. Int Rev Cytol 165:1-52]. Estos efectos son observados a concentraciones de Na^{+} y Cl^{-} en el intervalo de 50-100 mM, lo cual es mucho más bajo que los niveles requeridos para un efecto osmótico [Serrano R, Márquez JA, Ríos G (1997) Crucial factors in salt stress tolerance. In: Hohmann S, Mager WH (eds) Yeast Stress Responses. Springer-Verlag, Heidelberg, pp 147-169]. La toxicidad de estos iones, y en particular la del Na^{+}, se ha asociado a su capacidad para inhibir rutas metabólicas específicas, entre ellas la asimilación de sulfato [Murguia JR, Belles JM, Serrano R (1995) A salt-sensitive 3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase involved in sulfate activation. Science 267:232-234; Murguia JR, Belles JM, Serrano R (1996) The yeast HAL2 nucleotidase is an in vivo target of salt toxicity. J Biol Chem 271:29029-29033]. Se ha visto, que la inhibición por Na^{+} de ciertas enzimas de esta ruta puede revertirse por adición de potasio (K^{+}), sugiriendo que la relación Na^{+}/K^{+} es crucial para la actividad enzimática, y no la concentración absoluta de Na^{+}. Esto explicaria porque la levadura en condiciones de estrés por Na^{+}, aumenta la expresión de genes que codifican proteínas responsables del eflujo de Na^{+} y Li^{+}, simultáneamente a aquellas que permiten la retención intracelular de K^{+} [Posas F, Chambers JR, Heyman JA, Hoeffler JP, de Nadal E, Ariño J (2000) The transcriptional response of yeast to saline stress. J Biol Chem 275:17249-17255; Rep M, Krantz M, Thevelein JM, Hohmann S (2000) The transcriptional response of Saccharomyces cerevisiae to osmotic shock. Hotlp and Msn2p/Msn4p are required for the induction of subsets of high osmolarity glycerol pathway-dependent genes. J Biol Chem 275:8290-8300; Yale J, Bohnert HJ (2001) Transcript expression in Saccharomyces cerevisiae at high salinity. J Biol Chem 276:15996-16007].
Así pues, aquellas levaduras destinadas a la producción de masas dulces y masas dulces congeladas deberían exhibir una elevada tolerancia a estrés osmótico y a la toxicidad del Na^{+}. Sin embargo, ninguna cepa comercial reúne estas propiedades tecnológicas, por lo que es común en la elaboración de estos productos, adicionar un exceso de levadura (2-8%, base harina) para compensar la perdida de capacidad fermentativa. No obstante, esta practica afecta negativamente a la calidad organoléptica de los productos y encarece su precio. Alternativamente, es también posible utilizar agentes leudantes, como p.e. bicarbonato sódico, pero estos productos modifican el sabor del producto. Además, existe un rechazo generalizado por parte del consumidor al uso de aditivos químicos. En consonancia, seria necesario un esfuerzo para dotar a la levadura de la capacidad para responder y adaptarse a las condiciones restrictivas encontradas en masas dulces y masas dulces congeladas. En este sentido, existen datos suficientes como para afirmar que las células de levadura ponen en marcha mecanismos de respuesta y rediseñan su maquinaria metabólica para hacer frente y superar condiciones medioambientales adversas [Gasch AP, Spellman PT, Kao CM, Carmel-Harel O, Eisen MB, Storz G, Botstein D, Brown PO (2000) Genomic expression programs in the response of yeast cells to environmental changes. Mol Biol Cell 11:4241-4257; Causton HC, Ren B, Koh SS, Harbison CT, Kanin E, Jennings EG, Lee TI, True HL, Lander ES, Young RA (2001) Remodeling of yeast genome expression in response to environmental changes. Mol Biol Cell 12:323-337; Rodríguez-Vargas S, Estruch F, Randez-Gil F (2002) Gene expression analysis of cold and freeze stress in baker's yeast. Appl Environ Microbiol 68:3024-3030].
Estudios básicos en levadura han permitido determinar los mecanismos de eflujo iónico y han identificado genes clave en el mantenimiento de una alta relación K^{+}/Na^{+} [Serrano R, Mulet JM, Rios G, Marquez JA, de LIF, Leube MP, Mendizabal I, Pascual AA, Proft M, Ros R, Montesinos C (1999) A glimpse of the mechanisms of ion homeostasis during salt stress. J Exp Bot 50:1023-1036; Rodriguez-Navarro A (2000) Potasium transport in fungi and plants. Biochim Biophys Acta 1469:1-30].
Entre ellos, genes envueltos en la extrusión y compartimentación vacuolar de iones Na^{+} son fundamentales. Recientemente, se han identificado y caracterizado diversas proteína kinasas y rutas de señalización implicadas en la respuesta a estrés osmótico y iónico [Serrano R, Rodriguez-Navarro A (2001) Ion homeostasis during salt stress in plants. Curr Opin Cell Biol 13:399-404]. Entre ellas, la proteína-fosfatasa calcineurina esta implicada en diferentes procesos de señalización celular [Rusnak F, Mertz P (2000) Calcineurin: form and function. Physiol Rev 80:1483-1521; Sherman F, Fink GR, Hicks JB (1986) Methods in yeast genetics. Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, N.Y.; Sugiura R, Sio SO, Shuntoh H, Kuno T (2001) Molecular genetic analysis of the calcineurin signalling pathways. Cell Mol Life Sci 58:278-288]. En S. cerevisiae, calcineurina es esencial en su tolerancia a sal, ya que mutantes que carecen de la subunidad reguladora, codificada por CNB1, son sensibles a Na^{+} y Li^{+} [Nakamura T, Liu Y, Hirata D, Namba H, Harada S, Hirokawa T, Miyakawa T (1993) Protein phosphatase type 2B (calcineurin)-mediated, FK506-sensitive regulation of intracellular ions in yeast is an important determinant for adaptation to high salt stress conditions. EMBO J 12:4063-4071; Mendoza I, Rubio F, Rodriguez-Navarro A, Pardo JM (1994) The protein phosphatase calcineurin is essential for NaCl tolerance of Saccharomyces cerevisiae. J Biol Chem 269:8792-8796]. Calcineurina activa la respuesta transcripcional a estrés salino vía el factor transcripcional Crz1p el cual es traslocado al núcleo después de su defosforilación por calcineurina [Matheos DP, Kingsbury TJ, Ahsan US, Cunningham KW (1997) Tcn1p/Crz1p, a calcineurin-dependent transcription factor that differentially regulates gene expression in Saccharomyces cerevisiae. Genes Dev 11:3445-3458; Stathopoulos AM, Cyert MS (1997) Calcineurin acts through the CRZ1/TCN1-encoded transcription factor to regulate gene expression in yeast. Genes Dev 11:3432-3444; Stathopoulos-Gerontides A, Guo JJ, Cyert MS (1999) Yeast calcineurin regulates nuclear localization of Crz1p transcription factor through dephosphorylation. Genes Dev 13:798-803]. Crz1p se une especificamente a la secuencia consenso CDRE (del Inglés "Calcineurin-Dependent Response Element"), localizada en una región de 24 pares de bases, CAC
CAGTCGGTGGCTGTGCGCTTG, del promotor del gen FKS2 de S. cerevisiae [Stathopoulos AM, Cyert MS (1997) Calcineurin acts through the CRZ1/TCN1-encoded transcription factor to regulate gene expression in yeast. Genes Dev 11:3432-3444]. Recientemente, Mendizabal y col. [Mendizabal I, Pascual-Ahuir A, Serrano R, de Larrinoa IF (2001) promoter sequences regulated by the calcineurin-activated transcription factor Crz1 in the yeast ENA1 gene. Mol Genet Genomics 265:801-811] han propuesto que un fragmento de 9 pares de bases de la secuencia anterior, CGGTGGCTG, actúa como elemento central de unión de Crz1p, y han localizado variantes de esta secuencia en la región del promotor de varios genes regulados por calcineurina/Crz1p.
El elemento de respuesta dependiente de calcineurina (CDRE), la secuencia central de unión a Crz1p de S. cerevisiae y variantes de dicha secuencia encontradas en genes diana de la ruta calcineurina/Crz1p se describen con profusión en la literatura [Stathopoulos AM, Cyert MS (1997) Calcineurin acts through the CRZ1/TCN1-encoded transcription factor to regulate gene expression in yeast. Genes Dev 11:3432-3444; Mendizabal I, Pascual-Ahuir A, Serrano R, de Larrinoa IF (2001) promoter sequences regulated by the calcineurin-activated transcription factor Crz1 in the yeast ENA1 gene. Mol Genet Genomics 265:801-811].
La activación de la ruta calcineurina/Crz1p induce la expression de ENA1 [Marquez JA, Serrano R (1996) Multiple transduction pathways regulate the sodium-extrusion gene PMR2/ENA1 during salt stress in yeast. FEBS Lett 382:89-92], PMC1 y PMR1, cuyos productos génicos confieren tolerancia a Ca^{2+}, Mn^{2+} y Na^{+}, respectivamente [Matheos DP, Kingsbury TJ, Ahsan US, Cunningham KW (1997) Tcn1p/Crz1p, a calcineurin-dependent transcription factor that differentially regulates gene expression in Saccharomyces cerevisiae. Genes Dev 11:3445-3458; Stathopoulos AM, Cyert MS (1997) Calcineurin acts through the CRZ1/TCN1-encoded transcription factor to regulate gene expression in yeast. Genes Dev 11:3432-3444]. Calcineurin acts through the CRZ1/TCN1-encoded transcription factor to regulate gene expression in yeast. Genes Dev 11:3432-3444; Mendizabal I, Rios G, Mulet JM, Serrano R, de Larrinoa IF (1998) Yeast putative transcription factors involved in salt tolerance. FEBS Lett 425:323-328].
Además, el análisis global de la expresión génica en S. cerevisiae, indica que la expresión de un gran número de genes inducidos por estrés salino depende de la ruta calcineurina/Crz1p [Yoshimoto H, Saltsman K, Gasch AP, Li HX, Ogawa N, Botstein D, Brown PO, Cyert MS (2002) Genome-wide analysis of gene expression regulated by the calcineurin/Crzlp signaling pathway in Saccharomyces cerevisiae. J Biol Chem 277:31079-31088]. No se conoce, sin embargo, el efecto de la sobreexpresión de CRZ1 en la tolerancia a la congelación de S. cerevisiae, ni si la presencia en células de este organismo de una cantidad por encima de la habitual de Crz1p, puede alterar la capacidad fermentativa de cepas de levadura de laboratorio o de levaduras industriales de panadería en medios hiperosmóticos con un alto contenido en azúcar.
La habilidad para transformar S. cerevisiae mediante la utilización de la tecnología del ADN recombinante, ha abierto la posibilidad para manipular un simple gen o una ruta metabólica sin alterar otros genes de importancia para un fin tecnológico en particular [Randez-Gil F, Sanz P, Prieto JA (1999) Engineering baker's yeast: room for improvement. Trends Biotechnol 17:237-244; Dequin S (2001) The potential of genetic engineering for improving brewing, wine-making and baking yeasts. Appl Microbiol Biotechnol 56:577-588]. Es también posible, activar o inactivar la expresión de un grupo de genes en una etapa tecnológica, sin modificar su comportamiento durante su producción a nivel industrial. Esta tecnología puede tener especialmente éxito cuando se altera el nivel de expresión de un factor transcripcional, pues estos elementos reguladores desencadenan una cascada de alteraciones que pueden afectar dramáticamente la respuesta a diferentes condiciones ambientales. Así, células sobreexpresando factores transcripcionales de respuesta estrés deben producir en mayor cantidad, proteínas implicadas en tolerancia y/o adaptación a estas condiciones restrictivas. Esta alteración debería aumentar la resistencia de estas células, permitiendo mejorar su viabilidad y capacidad de crecimiento y desarrollo. De acuerdo a esto, la identificación de proteínas, y en particular de factores de transcripción, cuya expresión en bajo o alto número de copias, sea capaz de aumentar la viabilidad y capacidad fermentativa de levaduras de panadería tiene una gran importancia científica y tecnológica.
Por otra parte, una estrategia valida para alterar la capacidad de respuesta de un organismo, es la de utilizar genes heterólogos procedentes de otra especie que muestre una especial resistencia a las condiciones en las que se desea cultivar o utilizar el organismo hospedador. La levadura Torulaspora delbrueckii es aislada con frecuencia de bebidas alcoholicas, jugos de frutas y alimentos conteniendo un alto contenido en azúcar [Esteve-Zarzoso B, Gostincar A, Bobet R, Uruburu F, Querol A (2001) Selection and molecular characterization of wine yeasts isolated from the "El Pendes" area. Food Microbiol 17:553-562]. T. delbrueckii es también una de las especies de levadura más abundantes en masas espontáneas de maíz y centeno [Hahn Y-S, Kawai H (1990) Isolation and characterization of freeze-tolerant yeasts from nature available for the frozen-dough method. Agric Biol Chem 54:829-831; Almeida MJ, Pais CS (1996a) Characterization of the yeast population from traditional corn and rye bread doughs. Lett Appl Microbiol 23:154-158] y ha sido caracterizada como tolerante a la congelación [Almeida MJ, Pais CS (1996b) Leavening ability and freeze tolerance of yeasts isolated from traditional corn and rye bread doughs. Appl Environ Microbiol 62:4401-4404]. Este organismo, muestra también una especial tolerancia a condiciones de estrés de interés tecnológico. Así, células de T. delbrueckii exhiben una especial resistencia a la toxicidad del Na^{+} y una elevada capacidad fermentativa en masas dulces de elevado contenido en azúcar [Hernandez-Lopez MJ, Prieto JA, Randez-Gil F (2003) Osmotolerance and leavening ability in sweet and frozen sweet dough. Comparative analysis between Torulaspora delbrueckii and Saccharomyces cerevisiae baker's yeast strains. Antonie van Leeuwenhoek 84:125-134). Estas características, hacen de esta levadura un sistema modelo para conocer y explorar los mecanismos que determinan la resistencia a estrés en levadura y una potencial fuente para el aislamiento de genes que confieran resistencia a diferentes condiciones de estrés.
Descripción detallada de la invención
Torulaspora delbrueckii IGC5321, muestra un claro fenotipo de osmotolerancia, así como de tolerancia a la toxicidad del Na^{+}. [Hernández-López MJ, Prieto JA, Randez-Gil F (2003) Osmotolerance and leavening ability in sweet and frozen sweet dough. Comparative analysis between Torulaspora delbrueckii and Saccharomyces cerevisiae baker's yeast strains. Antonie van Leeuwenhoek 84:125-134]. Utilizando una librería genómica de este microorganismo, se ha aislado un clon capaz de mejorar el crecimiento de cepas de laboratorio y cepas comerciales de panadería de S. cerevisiae, en condiciones de estrés salino. El gen heterólogo contenido en dicho clon, codifica una proteína con cierta homología (37%) con Crz1p de S. cerevisiae (ScCRZ1). La presente invención revela la funcionalidad de esta secuencia y de la proteína que codifica, la cual complementa el fenotipo de sensibilidad a Na^{+}, Li^{+} y Mn^{2+} de mutantes crz1 y cnb1 de S. cerevisiae. Además, esta proteína recombinante es capaz de activar la transcripción de una fusión génica 4x-CDRE::lacZ. Todo esto indica, que la proteína funciona como un activador transcripcional de respuesta a calcineurina, y que el gen aislado de T. delbrueckii es el homologo en esta levadura del gen CRZ1 de S. cerevisiae (ScCRZ1), por lo que se le ha denominado TdCRZ1.
La expresión del gen TdCRZ1 no sólo mejora la resistencia a la presencia de NaCl en el medio, sino también su tolerancia a la congelación. Además, transformantes de cepas de panadería conteniendo el gen TdCRZ1 en alto número de copias, muestran una mayor capacidad fermentativa en masas dulces (>20% de sacarosa) y en masas dulces congeladas.
Como muestra la presente invención, cepas de levadura de panadería con mayor viabilidad y capacidad fermentativa en condiciones de estrés hiperosmótico (alta concentración de azúcares) y estrés por congelación, pueden ser también logradas por incremento del número de copias del gen CRZ1/TCN1 (YNL027w) de S. cerevisiae (ScCRZ1).
En resumen, la presente invención se basa en que los inventores han observado que la transformación genética de levaduras de panadería mediante la introducción en las mismas de una secuencia de nucleótidos que permite la expresión de una proteína con actividad Crz1 les confiere una mayor viabilidad y capacidad fermentativa. Estas últimas capacidades que adquieren dichas levaduras de panadería se basan en que dicha proteína con actividad Crz1 incrementa la resistencia de las levaduras a la congelación, al estrés hiperosmótico y al estrés iónico.
Tal como se utiliza en la presente invención el término "levaduras de panadería" se refiere a levaduras de Saccharomyces cerevisiae y Torulaspora delbrueckii.
El término "proteína con actividad Crz1" tal como se utiliza en la presente invención se refiere a una proteína o fragmento de proteína de levaduras con una homología en la secuencia de aminoácidos de al menos el 30% con respecto a la proteína o fragmento equivalente de Crz1 de S. cerevisiae (ScCrz1p), con dedos de zinc del tipo Cys2His2 y capaz de activar "in vivo" la transcripción de una fusión génica 4x-CDRE::lacZ.
Así, un objeto de la presente invención lo constituye un método de obtención de levaduras de panadería con alta capacidad de resistencia a la congelación, al estrés hiperosmótico (alto contenido en azúcar) y al estrés iónico, en adelante método obtención de levaduras de panadería de la presente invención, basado en la transformación genética de dichas levaduras mediante una secuencia de nucleótidos que permita la expresión de una proteína con actividad Crz1.
Un objeto particular de la invención lo constituye el método de obtención de levaduras de panadería de la presente invención en el que la secuencia de nucleótidos que permite la expresión de una proteína con actividad Crz1 es una secuencia que comprende la secuencia de nucleótidos codificante de la proteína Crz1p de S.cerevisiae (ScCrz1p) conjuntamente con otras secuencias de nucleótidos que permiten la regulación de dicha expresión. Una realización concreta del método de obtención de levaduras de la presente invención es aquel método en el que de dicha secuencia de nucleótidos codificante de la proteína ScCrz1p es el plásmido YEpScCRZ1 que permite la expresión de un alto número de copias del gen ScCRZ1.
Un objeto particular de la invención lo constituye el método de obtención de levaduras de panadería de la presente invención en el que la secuencia de nucleótidos que permite la expresión de una proteína con actividad Crz1 es una secuencia que comprende la secuencia de nucleótidos codificante de la proteína Crz1p de Torulaspora delbrueckii (TdCrz1p) conjuntamente con otras secuencias de nucleótidos que permiten la regulación de dicha expresión. Una realización concreta del método de obtención de levaduras de la presente invención es aquel en el que de dicha secuencia de nucleótidos codificante de la proteína TdCrz1p consiste o comprende alguna de las secuencias pertenecientes al siguiente grupo:
i)
secuencia de nucleótidos codificante de la proteína TdCrz1p (SEQ ID NO 2),
ii)
construcción genética identificada en la SEQ ID NO 1, y
iii)
un vector de expresión que comprende la secuencia i) ó ii), y en concreto el plásmido YEpTdCRZ1, sin que este ejemplo de realización límite el alcance de la presente invención.
Otro objeto de la presente invención lo constituye una secuencia de nucleótidos codificante de la proteína TdCrz1p que consiste o comprende alguna de las secuencias pertenecientes al siguiente grupo:
i)
secuencia de nucleótidos codificante de la proteína TdCrz1p (SEQ ID NO 2),
ii)
construcción genética descrita en la SEQ ID NO 1, y
iii)
un vector de expresión que comprende la secuencia i) ó ii), y en concreto el plásmido YEpTdCRZ1, sin que este ejemplo de realización limite el alcance de la presente invención;
y, que permiten la realización del método de obtención de levaduras de panadería de la presente invención.
Una secuencia de nucleótidos codificante de una proteína con actividad Crz1 puede encontrarse en forma parecida en otras especies de levaduras distintas que las aquí descritas o que formen parte del estado de la técnica actual, donde puede estar de forma natural. Estas secuencia de nucleótidos codificante de una proteína con actividad Crz1 pueden ser aisladas, mediante técnicas convencionales, a partir del ADN de cualquier levadura, mediante el empleo de sondas o de oligonucleótidos, preparados gracias a la información y a la secuencia de nucleótidos proporcionada en la presente invención. Además, forma parte de la presente invención una secuencia de nucleótidos análoga a la secuencia de nucleótidos codificante de la proteína TdCrz1p (SEQ ID NO 2). En el sentido utilizado en esta descripción, el término "análoga" pretende incluir a cualquier secuencia de nucleótidos que pueda ser aislada o construida en base a la secuencia de nucleótidos codificante de la proteína TdCrz1p, descrita en la presente invención (ver SEQ ID NO 1), por ejemplo, mediante la introducción de sustituciones de nucleótidos conservativas o no conservativas, incluyendo la inserción de uno o más nucleótidos, la adición de uno o más nucleótidos en cualquiera de los extremos de la molécula o la deleción de uno o más nucleótidos en cualquier extremo o en el interior de la secuencia. En general, una secuencia de nucleótidos análoga es sustancialmente homóloga a la secuencia de nucleótidos identificada como la codificante de la proteína TdCrz1p (ver SEQ ID NO 1). En el sentido utilizado en esta descripción, la expresión "sustancialmente homóloga" significa que las secuencias de nucleótidos en cuestión tienen un grado de identidad, a nivel de nucleótidos, de, al menos, un 30%, preferentemente de, al menos un 60%, o más preferentemente de, al menos, un 95%.
La secuencia de nucleótidos codificante de la proteína Crz1p, ya sea ScCrz1p ó TdCrz1p, indicadas anteriormente en i) y ii) puede ser utilizada, en general, en la generación de un vector de expresión iii), que permite la expresión de estas proteínas en una amplia gama de células huésped. En general, el vector de expresión de la presente invención comprende, al menos, la secuencia de nucleótidos codificante de la proteína Crz1p (por ejemplo TdCrz1p, SEQ ID NO 2) y, al menos, un promotor que dirige la transcripción del gen de interés, al que está operativamente enlazado, y otras secuencias necesarias o apropiadas para la transcripción del gen de interés y su regulación adecuada en tiempo y lugar, por ejemplo, señales de inicio y terminación, sitios de corte, señal de poliadenilación, origen de replicación, activadores transcripcionales (enhancers), silenciadores transcripcionales (silencers), etc. Ejemplos de vectores de expresión apropiados pueden seleccionarse de acuerdo con las condiciones y necesidades de cada caso concreto entre plásmidos, o fragmentos de integración, que pueden contener, además, un origen bacteriano o de levadura de replicación para que pueda ser amplificado en bacterias o levaduras, así como un marcador utilizable para seleccionar las células transformadas diferente al gen o genes de interés. Por tanto, la invención también se refiere a un vector que comprende una secuencia de nucleótidos codificante de la proteína Crz1p. La elección del vector dependerá de la célula hospedadora en la que se va a introducir posteriormente. A modo de ejemplo, el vector donde se introduce dicha secuencia de nucleótidos puede ser un plásmido que, cuando se introduce en una célula hospedadora, se integra en el genoma de dicha célula y se replica junto con el cromosoma de la célula huésped. El vector de la invención puede ser obtenido por métodos convencionales conocidos por los técnicos en la materia [Kovesdi et al. 1997. Curr Opin Biotech 8:583-589 Transgenic Res. 10:83-103; Coffin et al. 1998. Retroviruses, CSHLP; Robbins et al. 1998. Trends Biotech. 16:35-40; Anderson. 1998. Nature 392:25-30; Schindelhauer. 1999. BioEssays 21:76-83].
Así, el uso de las distintas secuencias de nucleótidos de los puntos i) y ii) mencionados anteriormente en la elaboración de un vector de expresión génica forma parte de la presente invención. De igual forma, forma parte de la presente invención el uso del vector de expresión mencionado anteriormente en la transformación de levaduras de panadería para incrementar su resistencia a la congelación, estrés hiperosmótico y estrés iónico.
Otro objeto de la presente invención lo constituye la proteína TdCRZ1 descrita en la presente invención (SEQ ID NO 2).
Otro objeto de la presente invención lo constituye una levadura de panadería transformada genéticamente mediante el método de la presente invención y en la que se expresa de forma recombinante una proteína con actividad Crz1 y que presentan un alta capacidad fermentativa con incremento de su resistencia a la congelación, al estrés hiperosmótico y al estrés iónico, en adelante levadura de panadería de la presente invención. Un objeto particular de la presente invención lo constituye una levadura de panadería, entre otras, S. cerevisiae, que comprende
i)
una secuencia de nucleótidos capaz de expresar la proteína ScCrz1, y en concreto la levadura de panadería HS13(YEpScCRZ1) (Ejemplo 8), sin que este ejemplo de realización limite el alcance de la presente invención,
ó
ii)
una secuencia de nucleótidos capaz de expresar la proteína TdCrz1, y en concreto la levadura de panadería HS13(YEpTdCRZ1) (Ejemplo 6 y 7), sin que este ejemplo de realización limite el alcance de la presente invención.
Otro objeto de la presente invención lo constituye el uso de la levadura de la presente invención en la elaboración de masa de panadería, dulce o de pan común, ya sea para congelación o no.
Un cultivo de Escherichia coli DH10B, portadora de un vector de expresión, identificado como YEpTdCRZ1, ha sido depositado en la Colección Española de Cultivos Tipo (CECT), Universidad de Valencia, Edificio de Investigación, Campus de Burjassot, 46100 Burjassot, Valencia, España, el 31 de Julio de 2003, correspondiéndole el número de depósito CECT 5837. Otro cultivo de la bacteria Escherichia coli DH10B, portadora de un vector de expresión identificado como YEpScCRZ1, ha sido depositado en la Colección Española de Cultivos Tipo (CECT), Universidad de Valencia, Edificio de Investigación, Campus de Burjassot, 46100 Burjassot, Valencia, España, el 31 de Julio de 2003, correspondiéndole el número de depósito CECT 5838.
Descripción del contenido de los dibujos
A lo largo de la descripción detallada de la presente invención, se hace referencia a las siguientes Figuras, en las que,
La Figura 1 muestra la secuencia de nucleótidos del gen TdCRZ1 y su correspondiente secuencia de aminoácidos, incluyendo parte de la secuencia del promotor y terminador de dicho gen. Los codones de inicio y terminación, ATG y TAG, respectivamente, se muestran en negrita. Los dos dominios consensos caracteristicos de factores transcripcionales con dedos de zinc del tipo Cys2His2 se muestran subrayados.
La Figura 2 muestra el mapa de restricción del plásmido 14.A y esquematiza el proceso seguido para la construcción a partir de éste, del plásmido YEpTdCRZ1.
La Figura 3 muestra el crecimiento de alícuotas (3 \mul) de diluciones seriadas (10^{-1} a 10^{-5}) de una suspensión de células de los transformantes YEplac 195 y YEpTdCRZ1 de las cepas de S. cerevisiae YPH499 (salvaje), DD12 (cnb1), ASY472 (crz1) y ASY475 (cnb1 crz1) en placas de medio de cultivo conteniendo Mn_{2}Cl, LiCl o NaCl.
La Figura 4 muestra el crecimiento de alícuotas (3 \mul) de diluciones seriadas (10^{-1} a 10^{-5}) de una suspensión de células de los transformantes YEplac195 y YEpTdCRZ1 de la cepa de levadura de panadería HS13 en placas de medio de cultivo con o sin la adición de 1M de NaCl.
La Figura 5 es una gráfica en la que se muestra las curvas de producción de CO_{2} de transformantes YEplac195 (símbolos llenos) y YEpTdCRZ1 (símbolos vacíos) de la cepa de levadura de panadería HS13, durante la fermentación a 30ºC de masas dulces conteniendo un 20 (circulo), 25 (triángulo) o 30% (cuadrado) de sacarosa.
La Figura 6A muestra el crecimiento en placa de alícuotas (3 \mul) de diluciones seriadas (10^{-1} a 10^{-5}) de una suspensión de células de los transformantes YEplac195 y YEpTdCRZ1 de la cepa HS13 después de 12 días de almacenamiento a -20ºC.
La Figura 6B es una gráfica en la que se representa el logaritmo del número de viables frente al tiempo de almacenamiento a -20ºC de suspensiones de células de los transformantes YEplac195 (símbolos llenos) y YEpTdCRZ1 (símbolos vacíos) de la cepa HS13.
La Figura 7 es una gráfica en la que se muestra la perdida de capacidad fermentativa de masas elaboradas con los transformantes YEplac195 (barras en negro) y YEpTdCRZ1 (barras en gris) de la cepa HS13, antes (0), inmediatamente después de su congelación (0') y durante su almacenamiento a -20ºC.
La Figura 8 es una gráfica en la que se muestra las curvas de producción de CO_{2} de transformantes YEplac195 (símbolos llenos) y YEpTdCRZ1 (símbolos vacíos) de la cepa HS13, durante la fermentación a 30ºC de masas dulces (30% de sacarosa) después de su almacenamiento a -20ºC durante 12 días.
La Figura 9 es una gráfica en la que se representa el logaritmo del número de viables frente al tiempo de almacenamiento a -20ºC de suspensiones de células de los transformantes YEplac195 (símbolos llenos) y YEpScCRZ1 (símbolos vacíos) de la cepa HS13.
Ejemplos de la realización de la invención Ejemplo 1 Extracción de DNA genómico y construcción de una librería genómica de T. delbrueckii IGC5321
200 ml de un cultivo (DO_{600} = 2,5) de la cepa de T. delbrueckii IGC5321 [Almeida MJ, Pais CS (1996b) Leavening ability and freeze tolerance of yeasts isolated from traditional corn and rye bread doughs. Appl Environ Microbiol 62:4401-4404] se centrifugan a 3.500 r.p.m. durante 5 min, recogiéndose el sedimento de células. Para la obtención de protoplastos, el sedimento se resuspende en 20 ml de una solución de pretratamiento (50 mM de Tris-HCl, 10 mM de DTT, a pH = 8.0). La suspensión es incubada a 30ºC durante 30 min, tras lo cual, se centrifuga a 3.000 rpm y 4ºC de temperatura, durante 5 min. El "pellet" o sedimento resultante se resuspende en 20 ml de una solución en agua conteniendo sorbitol (1 M), tampón Tris-HCl (50 mM, pH= 8.0) y Zymoliasa 20T (0,25 mg/ml) y se incuba a 30ºC durante 1 h. Se comprueba la presencia de esferoplastos mediante observación al microscopio. Éstos, se recogen por centrifugación a 3.000 r.p.m. (5 min) y se resuspenden, con la pipeta, en 4 ml de solución de lisis (50 mM de tampón Tris-HCl a pH = 8.0, 10 mM de EDTA, 0.15 M de NaCl). A esta suspensión de células rotas se le añade SDS a una concentración final del 1%, y se incuba a 65ºC durante 20 min. Se añaden 1,5 ml de 5 M de acetato potásico, y los residuos celulares se eliminan por centrifugación a 13.000 r.p.m. (10 min) a temperatura ambiente. El sobrenadante se aspira con la ayuda de una pipeta y los ácidos nucleicos se precipitan con etanol absoluto, en una proporción de 1:2 (v:v). Tras centrifugar a 13.000 r.p.m. (15 min), el precipitado resultante se limpia de sales con etanol al 70% en agua (v:v), y se resuspende en tampón TE (10 mM de Tris-HC1 a pH 8.0, 1 mM de EDTA) y se incuba 1 h a 37ºC con una solución acuosa de la enzima RNAsa (10 mg/ml) para eliminar el RNA. El DNA resultante es extraído sucesivamente con un volumen igual de fenol, fenol-cloroformo (1:19, v:v) y cloroformo. Finalmente, el DNA es precipitado con etanol, recogido por centrifugación y resuspendido en 0,5 ml de tampón TE.
El DNA genómico de T. delbrueckii IGC5321 se digiere parcialmente con la enzima de restricción Sau3A. A continuación, se separan los fragmentos resultantes en un gradiente de sacarosa (10-30%, p:v) a 30.000 x g durante 15 h,
seleccionándose las fracciones que contienen fragmentos de DNA entre 5 y 15 kilobases (kb) y se ligan en el vector lanzadera YEplac181 [Gietz RD, Sugino A (1988) New yeast-Escherichia coli shuttle vectors constructed with in vitro mutagenized yeast genes lacking six-base pair restriction sites. Gene 74:527-534] digerido previamente con BamHI y defosforilado. La mezcla de plasmidos (genoteca) se utiliza para transformar mediante electroporación, células de la cepa de Escherichia coli DH10B. Los transformantes se seleccionan en placas de medio Luria Bertani, LB (1% de peptona, 0,5% de extracto de levadura, 0,5% de NaCl) suplementado con ampicilina (50 mg/l). Finalmente el DNA amplificado se recupera mediante extracción.
Ejemplo 2 Aislamiento del gen TdCRZ1
Con el objeto de identificar genes de T. delbrueckii que mejoren la osmotolerancia de Saccharomyces cerevisiae, se transforma la cepa de laboratorio CEN.PK2-1A (MAT a ura3-52 his3-\Delta1 leu2-3,112 trp1-289 SUC2) con la genoteca descrita en el Ejemplo 1 y los transformantes se seleccionan en placas de medio sintético SD [0,17% de medio base para levaduras (YNB), 0,5% de sulfato amónico] conteniendo glucosa (2%), 0.5 M de NaCl, y una mezcla de aminoácidos, excepto leucina, a las concentraciones descritas por Sherman y col. [Sherman F, Fink GR, Hicks JB (1986) Methods in yeast genetics. Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, N.Y.]. Después de 5 días de incubación a 30ºC, se recogieron 18 colonias. Se extraen los plásmidos de las levaduras [Robzyk K, Kassir Y (1992) A simple and highly efficient procedure for rescuing autonomous plasmids from yeast. Nucleic Acids Res 20:3790] y se obtiene su mapa fisico tras digerirlos con endonucleasas de restricción, EcoRI, PstI, BamHI y HindIII. Así agrupamos los 18 plásmidos según 5 patrones de restricción. Un plásmido representante de cada grupo se reintrodujo en la cepa CEN.PK2-1A, confirmándose que su presencia aumenta la resistencia a estrés salino de esta levadura. Uno de estos plásmidos, denominado 14.A y cuyo mapa de restricción se describe en la Figura 2, reveló la existencia de una pauta de lectura abierta (Figura 1) con un 37% de homología con el gen CRZ1/TCN1 (YNL027w) de S. cerevisiae [Matheos DP, Kingsbury TJ, Ahsan US, Cunningham KW (1997) Tcn1p/Crz1p, a calcineurin-dependent transcription factor that differentially regulates gene expression in Saccharomyces cerevisiae. Genes Dev 11:3445-3458; Stathopoulos AM, Cyert MS (1997) Calcineurin acts through the CRZ1/TCN1-encoded transcription factor to regulate gene expression in yeast. Genes Dev 11:3432-3444], al que denominamos en la presente invención ScCRZ1.
Ejemplo 3 Análisis de la secuencia de TdCRZ1
TdCrz1p es una proteína de 506 aminoácidos (Figura 1), con un tamaño molecular calculado a partir de su secuencia de 56 KDa, que contiene en su extremo carboxi-terminal 2 dedos de zinc (posiciones 395-414 y 422-444) del tipo Cys2His2, característicos de proteínas de unión a DNA [Evans RM, Hollenberg SM (1988) Zinc fingers: Gilt by association. Cell 52:1-3; Desjarlais JR, Berg JM (1992) Toward rules relating zinc forger protein sequences and DNA binding site preferences. Proc Natl Acad Sci 89:7345-7349]. Además, TdCrzlp contiene un posible tercer dedo de zinc menos conservado, conteniendo tan solo 1 residuo de cisteína, Cys (posición 462, Figura 1) y 1 residuo de histidina, His (posición 475, Figura 1). Estas estructuras también se encuentran en ScCrz1p, la proteína de Saccharomyces, que cuenta además, con tres regiones de aminoácidos ácidos, separadas por una región rica en glutamina (caracteristica de los dominios de activación transcripcional) y otra rica en serina y threonina [Stathopoulos AM, Cyert MS (1997) Calcineurin acts through the CRZ1/TCN1-encoded transcription factor to regulate gene expression in yeast. Genes Dev 11:3432-3444; Matheos DP, Kingsbury TJ, Ahsan US, Cunningham KW (1997) Tcn1p/Crz1p, a calcineurin-dependent transcription factor that differentially regulates gene expression in Saccharomyces cerevisiae. Genes Dev 11:3445-3458]. La proteína de Torulaspora, TdCrz1p carece, sin embargo, de estos motivos.
Ejemplo 4 Construcción de un plásmido para la sobreexpresión de TdCRZ1 y efecto de ésta en la osmotolerancia de S. cerevisiae
Para confirmar que el efecto observado en transformantes de S. cerevisiae conteniendo el plásmido 14.A de la librería genómica era debido a la presencia del gen heterólogo TdCRZ1, el inserto contenido en dicho plásmido, se digirió con los enzimas de restricción ScaI y EcoRI, liberándose un fragmento de 1.980 pb correspondiente a 350 pb del promotor, 1.518 pb de la pauta de lectura abierta y 122 pb del terminados. Este fragmento se subclonó en el vector de expresión YEplac 195 digerido con las enzimas de restricción SmaI y EcoRI, obteniendose el plásmido YEpTdCRZ1. La Figura 2 muestra una representación esquemática de las etapas de subclonación.
El plásmido YEpTdCRZ1 se utilizó para transformar células de las cepas de laboratorio CEN.PK2-1A e YPH499 (MATa ura3-52 lys2-801 ade2-101 trp-\boxempty63 his3-\boxempty200 leu2-\boxempty1), [Sikorski RS, Hieter P (1989) A system of shuttle vectors and yeast host strains designed for efficient manipulation of DNA in Saccharomyces cerevisiae. Genetics 122:19-27], seleccionándose los transformantes en medio SD sin uracilo. Como control se obtuvieron transformantes de ambas cepas conteniendo el plásmido vacío YEplac 195 [URA3 (Gietz RD, Sugino A (1988) New yeast-Escherichia coli shuttle vectors constructed with in vitro mutagenized yeast genes lacking six-base pair restriction sites. Gene 74:527-534)]. Como se observa en la Figura 3, la sobreexpresión del gen TdCRZ1 en células de la cepa YPH499 aumentó su resistencia a NaCl (1,0 M), LiCl (0,4 M) y MnCl_{2} (2,5 mM). Resultados similares se observan para transformantes de la cepa de S. cerevisiae CEN.PK2-1A (datos no mostrados). Por consiguiente, el efecto encontrado para el plásmido 14.A se puede atribuir a la presencia del gen TdCRZ1.
Ejemplo 5 TdCRZ1 codifica para el homologo de ScCRZ1 en T. delbrueckii
Se ha descrito que la sobreexpresión de ScCRZ1 suprime, parcialmente, el fenotipo de sensibilidad a Mn^{2+} y Li^{+} de una cepa mutante en la subunidad reguladora, CNB1, de calcineurina [Matheos DP, Kingsbury TJ, Ahsan US, Cunningham KW (1997) Tcn1p/Crz1p, a calcineurin-dependent transcription factor that differentially regulates gene expression in Saccharomyces cerevisiae. Genes Dev 11:3445-3458; Stathopoulos AM, Cyert MS (1997) Calcineurin acts through the CRZ1/TCN1-encoded transcription factor to regulate gene expression in yeast. Genes Dev 11:3432-3444]. Así pues, analizamos si el gen de T. delbrueckii era capaz de complementar el defecto de crecimiento de un mutante cnb1 (cepa DD12), en medios con un elevado contenido en Na^{+}, Mn^{2+} o Li^{+}. La obtención de la cepa DD12 (cnb1::hisG), un derivado de la cepa salvaje YPH499 ha sido descrita previamente [Cyert MS, Thomer J (1992) Regulatory subunit (CNB1 gene product) of yeast Ca^{2+}/calmodulin-dependent phosphoprotein phosphatases is required for adaptation to pheromone. Mol Cell Biol 12:3460-3469]. Como vemos en la Figura 3, transformantes YEpTdCRZ1 de la cepa DD12 muestran una mejora importante en su capacidad de crecimiento en comparación con los transformantes control (YEplac195), en todos los medios ensayados, confirmando que la sobreexpresión de TdCRZ1 complementa la mutación de CNB1. Además, la expresión en un alto número de copias de TdCRZ1 en un mutante crzl de S. cerevisiae (cepa ASY472), un derivado (crz1::loxP-kanMX-loxP) de YPH499 descrito anteriormente [Stathopoulos AM, Cyert MS (1997) Calcineurin acts through the CRZ1/TCN1-encoded transcription factor to regulate gene expression in yeast. Genes Dev 11:3432-3444] complementó el fenotipo de sensibilidad a NaCl y LiCl de éste. Similares resultados se observan para transformantes YEpTdCRZ1 de un doble mutante cnb1 crz1 de la cepa salvaje YPH499 [cepa ASY475, crz1::loxP-kanMX-loxP (Stathopoulos y Cyert 1997)]. Por consiguiente la pauta de lectura abierta encontrada en el plásmido 14.A es capaz de complementar en alto número de copias la ausencia de la función de los genes CRZ1 y/o CNB1 de S. cerevisiae.
Por otra parte, se analizó si la sobreexpresión de TdCRZ1 era capaz de activar la expresión "in vivo" del gen lacZ de E. coli bajo el control de un promotor heterólogo constituido por 4 copias seguidas de la secuencia CDRE (4x-CDRE::lacZ). Para ello, se utilizó la cepa ASY834 (cedida por MS Cyert), un derivado de la cepa mutante DD12 (crz1) que contiene integrado en el locus URA3 el plásmido pBJ304 (TRP1-4x-CDRE-lacZ::ura3). Detalles de la construcción de este plásmido pueden encontrarse en [Jiang B, Cyert M (1999) Identification of a novel region critical for calcineurin function in vivo and in vitro J. Biol.Chem. 274:18543-18551]. El plásmido YEpTdCRZ1 descrito en el Ejemplo 4, se utilizó para transformar la cepa ASY834, seleccionando aquellas células capaces de crecer en ausencia de uracilo. Como control se prepararon transformantes de dicha cepa con el plásmido vacío YEplac195 (URA3). Células de ambos tipos de transformante se crecieron en medio SD, sin uracilo, hasta fase exponencial (DO_{600} = 0,5-0,7), se colectaron por centrifugación y se resuspendieron en medio rico YPD (2% de extracto de levadura, 2% de peptona y 2% de glucosa) o en medio YPD conteniendo CaCl_{2} (200 mM, concentración final). Las células se incuban a 30ºC durante 4 h en un agitador orbital (200 r.p.m.), se centrifugan (15 unidades de DO_{600}), se lavan con tampón Z (60 mM de Na_{2}HPO_{4}, 40 mM NaH_{2}PO_{4}, 10 mM KCl, 1 mM MgSO_{4}, pH 7.0) y el deposito de células se congela a -20ºC hasta su análisis. Para preparar los extractos celulares, las células se resuspenden en 0,5 ml de tampón Z conteniendo \beta-mercaptoetanol (38 mM, concentración final) y la suspensión se transfiere a un tubo Eppendorf conteniendo 0,5 g de perlas de vidrio (0,4-mm de diámetro), se agita vigorosamente en el Vortex durante 3 periodos de 1 min y se centrifuga a 12.000 x g (4ºC) durante 10 min. Finalmente, se determina en el sobrenadante el contenido en proteína y el nivel de actividad \beta-galactosidasa. El análisis de proteína se llevó a cabo utilizando un "kit" comercial de BioRad. La actividad \beta-galactosidasa se ensayó a temperatura ambiente usando el substrato ONPG (O-nitrofenil-\beta-D-galactopiranosido, Sigma), de acuerdo al protocolo descrito por Miller (1972). Ésta se expresa como nanomoles de ONPG transformadas por min y mg de proteína. En células de los transformantes YEpTdCRZ1 transferidas durante 4 h a medio YPD, el nivel de actividad \beta-galactosidasa intracelular fue de 118,1 \pm 36 unidades, mientras que en las mismas células transferidas a medio YPD + 200 mM de CaCl_{2} la actividad alcanzó las 722,1 \pm 295 unidades. En las mismas condiciones, YPD o YPD + 200 mM de CaCl_{2}, ninguna actividad \beta-galactosidasa, pudo ser detectada en células de los transformantes control YEplac195. Por consiguiente, el producto del gen TdCRZ1 es capaz de activar, en una forma dependiente de calcineurina, la transcripción de un gen chivato (lacZ) situado bajo el control de un promotor sintético conteniendo una secuencia consenso (CDRE) de unión a la proteína Crz1p de S. cerevisiae. Estos resultados confirman que, en efecto, el gen TdCRZ1 codifica para el homologo del gen ScCRZ1.
Ejemplo 6 Efecto de la sobreexpresión de TdCRZ1 en la osmotolerancia de levaduras de panadería
A la vista de los resultados descritos arriba, decidimos probar el efecto de la sobreexpresión del gen TdCRZ1 en el crecimiento y capacidad fermentativa de células de una cepa de levadura de panadería. Para ello utilizamos como cepa hospedadora HS13, un derivado de esporulación de la cepa comercial S47 [Ura^{-} (Lesaffre International)] y como control, el plásmido vacío YEplac195. Como se observa en la Figura 4, la sobreexpresión de este gen heterólogo en células de la cepa HS13 no alteró su capacidad de crecimiento en placas de medio SD isotónico (-NaCl), con respecto a la observada en células control (YEplac195). Por el contrario, en medio SD conteniendo NaCl (1 M) la expresión de la proteína recombinante aumentó claramente la tolerancia a estrés salino de la cepa hospedadora.
También analizamos el efecto de la sobreexpresión del gen TdCRZ1, en la capacidad fermentativa en masas dulces, de células de la levadura de panadería HS13. Para ello, 300 \mul de una suspensión de células (20 unidades de DO_{600} por ml, conteniendo 0,24 \mug/ml de biotina) de cada uno de los transformantes analizados se siembra en placas de medio melaza (0,5% de melaza, 0,05% de (NH4)_{2}HPO_{4}, 2,6% de agar bacteriológico, pH 5,5) a 30ºC durante 20 h. A continuación, se recogen las células con un volumen de 5 ml de agua estéril por placa y se determina la DO_{600} de la suspensión final. Esta suspensión se utiliza para preparar la masa panaria según la siguiente formula, 50 g de harina de trigo (humedad 16%; W, 113,5 x 10^{-4} J [Alveografo]; P/L, 0,26 [Alveografo]); 25 ml de agua, 2572 unidades de DO_{600} de células de levadura [equivalente a un 0,9% (base harina) de levadura (peso seco)], 1,0 g de sal común y 10, 12,5 o 15 g de azúcar para masas con un 20, 25 o 30% de azúcar (base harina), respectivamente. Los ingredientes se amasan en la amasadora del Farinografo (Brabender, Alemania) durante 8 min y la masa resultante se divide en piezas de 35 g para analizar su capacidad fermentativa. Para determinar la producción de CO_{2} se siguió el principio de Burrows y Harrison, según el que el volumen de gas desprendido corresponde al volumen de desplazamiento de una solución alcalina, utilizando un Fermentómetro (aparato Chittick, AACC, 12-10). La temperatura de fermentación se mantuvo a 30ºC con la ayuda de un baño de agua termostatado. La capacidad fermentativa se expresa como ml de CO_{2} desprendido por mg de levadura (peso seco) frente al tiempo de fermentación.
Como se observa en la Figura 5, la sobreexpresión de TdCRZ1 en células de la cepa HS13 incrementó su capacidad de producción de CO_{2} con respecto al observado para células control (YEplac195). Este efecto es más acusado a medida que se incrementa el contenido de azúcar en la formulación de la masa y por tanto la presión osmótica. Así, el incremento a los 180 min de fermentación, fue de un 7% para masas conteniendo un 20% de azúcar, mientras que este valor ascendió hasta un 16 y un 25%, para masas conteniendo un 25 o un 30% de azúcar, respectivamente (Figura 5).
Ejemplo 7 La sobreexpresión de TdCRZ1 en levadura de panadería aumenta su tolerancia a la congelación
El aumento de la presencia de sales en el medio, no es la única condición ambiental que implica una reducción de la actividad de agua celular. En efecto, la desecación y en particular la congelación, también tienen en común la exposición de las células a estrés hiperosmótico, lo que resulta en un movimiento de agua a través de la membrana [Wolfe J, Bryant G (1999) Freezing, crying, and/orvitrification of membrane-solute-water systems. Criobiology 39:103-129]. En consecuencia, decidimos analizar el efecto de la sobreexpresión de TdCRZ1 en la viabilidad y capacidad fermentativa de células de levadura de panadería sometidas a condiciones de estrés por congelación. Con este fin, preparamos biomasa de los transformantes YEpTdCRZ1 y YEplac195 mediante su cultivo en placas de medio melaza, tal y como se describió en el Ejemplo 6, excepto que la suspensión de células se diluyo en una solución sálina (135 g de NaCl y 20 g de (NH_{4})_{2}SO_{4} en 5 l de agua desionizada) hasta una densidad final de 15 mg de células (peso seco) por ml (1 unidad de DO_{600} equivale a 0,35 mg de células, peso seco). 15 ml de tal suspensión se mezclan con 15 ml de una solución de nutrientes [(SN) 0,5% de extracto de levadura, 3,0% de glucosa, 9,0% de maltosa, 0,4% de MgSO_{4}, 0,16% de KC1, 0,94% de (NH_{4})_{2}HPO_{4}, 8 ppm de vitamina B1, 8 ppm de vitamina B6, 80 ppm de ácido nicotínico y 0,3 M de tampón citrato, pH 5.5). Alícuotas de 1 ml de la mezcla final, se transfieren a tubos Eppendorf y se congelan a -20ºC. En diferentes momentos durante su almacenamiento en congelación, la suspensión de células se descongela a 30ºC durante 30 min y se determina el número de viables y su crecimiento en placa. El número de viables se determina mediante recuento del nº de colonias en placas de YPD tras 48 h de incubación a 30ºC. Para visualizar el crecimiento, alícuotas (3 ml) de diluciones seriadas (10^{-1} a 10^{-5}) de la suspensión inicial se depositan sobre placas de YPD. Como muestra la Figura 6A, la sobreexpresión de TdCRZ1 en células de la cepa HS13 aumenta de forma notable su resistencia a la congelación y almacenamiento a -20ºC. Así, después de 12 días de almacenamiento en estas condiciones, la suspensión de células transformantes YEpTdCRZ1 mantuvo un nivel de viables alrededor de un orden de magnitud más alto que la suspensión de células control YEplac195 (Figura 6B).
Este efecto se observa también en la capacidad fermentativa de masas de pan común congeladas. Para analizar este parámetro, piezas de 35 g de masas preparadas como se describió en el Ejemplo 6, excepto que no contenían azúcar, se moldean a mano hasta conseguir una lamina de un espesor de unos 0,5-cm, se envuelven en plástico y se congelan a -80ºC. Después de 1 h a esta temperatura, las piezas se trasladan a un congelador a -20ºC para su almacenamiento. A diferentes tiempos, las piezas de masa congelada se descongelan a 30ºC durante 30 min y se determina inmediatamente su capacidad fermentativa. Una masa sin congelar (tiempo 0) y una masa congelada durante 3 h (tiempo 0') se utilizaron como control. La Figura 7 muestra la variación de la producción de CO_{2} a lo largo del almacenamiento durante un máximo de 20 días (-20ºC) de masas elaboradas con los transformantes YEpTdCRZ1 y YEplac195. Los resultados se expresan como ml de CO_{2}/mg de levadura (base seca), a los 120 min de fermentación a 30ºC. Como puede observarse, la capacidad fermentativa de ambos transformantes se redujo con el tiempo de almacenamiento en congelación. Sin embargo, este efecto fue menos acusado para los transformantes YEpTdCRZ1, los cuales producen en todos los tiempos ensayados más gas que los transformantes control (Figura 7). Como ejemplo, a los 20 días de almacenamiento las masas elaboradas con éstos transformantes muestran una producción de CO_{2} un 38% superior a la registrada para las masas control (YEplac195).
Una situación similar se observa para masas dulces congeladas, elaboradas con cada uno de los transformantes analizados, YEpTdCRZ1 y YEplac195. La Figura 8 muestra como ejemplo la cinética de producción de CO_{2} en masas dulces (30% de azúcar) almacenadas durante 20 días a -20ºC. En todos los tiempos analizados, la producción de CO_{2} en masas elaboradas con los transformantes YEpTdCRZ1 fue superior respecto a la observada en masas control; por ejemplo a los 360 min de fermentación esta diferencia alcanzó un valor del 53%.
Ejemplo 8 La sobreexpresión de ScCRZ1 en levadura de panadería tiene efectos osmóticos y de resistencia a la congelación
Se analizó también si los efectos en levadura de panadería de la sobreexpresión del gen TdCRZ1 podían también obtenerse mediante expresión en un alto número de copias del gen homologo de S. cerevisiae (ScCRZ1). Como se observa en la Figura 9, transformantes YEpScCRZ1 de la cepa de panadería HS13 muestran una mayor resistencia a la congelación y mantenimiento en esta situación (-20ºC), que transformantes conteniendo el plásmido vacío YEplac195. El número de viables se determinó tal y como se describió en el Ejemplo 7. La capacidad fermentativa de la cepa hospedadora HS13 en masas dulces también se ve sensiblemente mejorada por la sobreexpresión de ScCRZ1. Así, en masas conteniendo un 30% de sacarosa, los transformantes YEpScCRZ1 producen a los 180 min de fermentación, un 40% más de CO_{2} que los transformantes YEplac195. También el poder fermentativo de la levadura HS13 en masas dulces congeladas mejora notablemente por la sobreexpresión de ScCRZ1. En efecto, a los 360 min de fermentación, las masas elaboradas con los transformantes YEpScCRZ1 producen un 125% más de CO_{2} que aquellas preparadas con los transformantes control YEplac195.
<110> CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTÍFICAS
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<120> Método para mejorar la viabilidad y la capacidad fermentativa de levaduras de panadería en condiciones de estrés hiperosmótico y estrés por congelación
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<130> Mejora de levaduras de panadería
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<160> 4
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<170> PatentIn versión 3.1
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<210> 1
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Claims (16)

1. Método de obtención de levaduras de panadería con alta capacidad de resistencia a la congelación, al estrés hiperosmótico (alto contenido en azúcar) y al estrés iónico caracterizado porque se basa en la transformación genética de dichas levaduras mediante una secuencia de nucleótidos que permite la expresión de una proteína con actividad Crz1.
2. Método de obtención de levaduras de panadería según la reivindicación 1 caracterizado porque la secuencia de nucleótidos que permite la expresión de una proteína con actividad Crz1 es una secuencia que comprende la secuencia de nucleótidos codificante de la proteína Crz1p de Saccharomyces cerevisiae (ScCrz1p).
3. Método de obtención de levaduras de panadería según la reivindicación 2 caracterizado porque la secuencia de nucleótidos codificante de la proteína ScCrz1p es el plámido YEpScCRZ1.
4. Método de obtención de levaduras de panadería según la reivindicación 1 caracterizado porque la secuencia de nucleótidos que permite la expresión de una proteína con actividad Crz1 es una secuencia que comprende la secuencia de nucleótidos codificante de la proteína Crz1p de Torulaspora delbrueckii (TdCrz1p).
5. Método de obtención de levaduras de panadería según la reivindicación 4 caracterizado porque la secuencia de nucleótidos que codifica la proteína TdCrz1p consiste en la secuencia codificante identificada como SEQ ID NO 3.
6. Método de obtención de levaduras de panadería según la reivindicación 4 caracterizado porque la secuencia de nucleótidos que codifica la proteína TdCrz1p está constituida por la construcción genética identificada como SEQ ID NO 1.
7. Método de obtención de levaduras de panadería según la reivindicación 4 caracterizado porque la secuencia de nucleótidos que codifica de la proteína TdCrz1p consiste en un vector de expresión, entre otros el vector YEpTdCRZ1, que comprende la secuencia SEQ ID NO 3 o SEQ ID NO 1.
8. Secuencia de nucleótidos que codifica la proteína TdCrz1p caracterizada porque consiste en la secuencia codificante identificada como SEQ ID NO 3.
9. Secuencia de nucleótidos que codifica la proteína TdCrz1p caracterizada porque consiste en la construcción genética identificada como SEQ ID NO 1.
10. Secuencia de nucleótidos que codifica la proteína TdCrz1p caracterizada porque consiste en un vector de expresión, entre otros el vector YEpTdCRZ1, que comprende la secuencia SEQ ID NO 3 o SEQ ID NO 1.
11. Uso de cualquiera de las secuencias según las reivindicaciones de la 8 a la 10 en la elaboración de un vector de expresión génica.
12. Uso de un vector según la reivindicación 11 en la transformación de levaduras de panadería para incrementar su resistencia a la congelación, estrés hiperosmótico y estrés iónico.
13. Una levadura de panadería caracterizada porque ha sido transformada genéticamente mediante el método según las reivindicaciones de la 1 a la 7 para la expresión recombinante de una proteína con actividad Crz1 y porque presenta una alta capacidad fermentativa con incremento de su resistencia a la congelación, estrés hiperosmótico y estrés iónico.
14. Una levadura de panadería según la reivindicación 13 caracterizada porque comprende una secuencia de nucleótidos capaz de expresar la proteína ScCrz1, entre otras la levadura de panadería HS13 (YEpScCRZ1).
15. Una levadura de panadería según la reivindicación 13 caracterizada porque comprende una secuencia de nucleótidos capaz de expresar la proteína TdCrzl, entre otras la levadura de panadería HS13 (YEpTdCRZ1).
16. Uso de cualquiera de las levaduras según una cualquiera de las reivindicaciones de la 13 a la 15 en la elaboración de masa de panadería, dulce o de pan común, ya sea congelada o no congelada.
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