ES2206569T3 - Nuevas secuencias de adn del citomegalovirus humanos. - Google Patents
Nuevas secuencias de adn del citomegalovirus humanos.Info
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Abstract
SE DESCRIBEN NUEVAS SECUENCIAS DE ADN DEL CITOMEGALOVIRUS HUMANO TOLEDO Y TOWNE (HCMV) Y PROTEINAS CODIFICADAS POR EL. LAS SECUENCIAS RESULTAN UTILES EN PROCEDIMIENTOS Y COMPOSICIONES PARA DETECTAR INFECCIONES POR HCMV Y EN COMPOSICIONES INMUNOGENICAS PARA EVITAR INFECCIONES POR HCMV.
Description
Nuevas secuencias de ADN del citomegalovirus
humano.
El citomegalovirus humano (HCMV) es un agente
ubicuo en las poblaciones humanas. Las infecciones son generalmente
asintomáticas, pero pueden tener secuelas médicas serias en
individuos inmunocomprometidos y en recién nacidos infectados
congénitamente. La infección por HCMV puede resultar en neumonía
intersticial, retinitis que progresa hacia ceguera, e infección
diseminada. Las infecciones en recién nacidos pueden ser gravemente
destructivas, implicando múltiples órganos, incluyendo el sistema
nervioso central, y también podrían resultar en lesiones auditivas.
Los mecanismos de patogénesis no se conocen, aunque se cree que
podrían estar implicados factores huéspedes, tales como respuestas
celulares y/o humorales inmunes. Consultar, Alford y Britt, "The
Human Herpesvirus", Eds. B. Roizman, R. J. Whitley y C. López,
Raven Press, Nueva York, 1993, pp. 227-255. Se ha
especulado también que la variabilidad genética (bien estructural, o
antigénica, o ambas) entre diferentes cepas de HCMV podría ser
responsable de las variaciones observadas en las manifestaciones
clínicas. Pritchett, J. Virol. 36:152-161
(1980); Lehner, J. Clin. Microbiol.
29:2494-2502 (1991); Fries, J. Infect. Dis.
169:769-774 (1994).
Recientemente se ha prestado una atención
considerable al análisis de la variación de cepas entre aislados de
HCMV. Se han aislado unas veinte cepas diferentes de HCMV, y se han
diferenciado mediante el análisis de restricción de fragmentos de
ADN amplificados mediante PCR. Chou, J. Infect. Dis.
162:738-742 (1990).
Una cepa, la cepa Towne, se ha desarrollado como
una vacuna atenuada, viva, y se ha administrado con cierto éxito a
pacientes de transplantes renales. Ver Quinnan, Annals of Int.
Med. 101:478-483 (1984); Plotkin, Lancet
1:528-530 (1984). Sin embargo, las vacunas de la
cepa Towne que fueron directamente desafiadas en un estudio por
virus del tipo salvaje de la cepa Toledo con pocos pasajes, se halló
que resistían dosis de desafío de sólo 10 unidades formadoras de
calvas (pfu) o menos. Plotkin, J. Infect. Dis.
159:860-865 (1989). Por tanto, parece ser que la
cepa Towne podría estar excesivamente atenuada, es decir, estar tan
extensamente modificada genéticamente, a resultas de su paso en
serie en cultivos de células, que ha perdido una inmunogenicidad
significativa, presumiblemente debido a la pérdida de información
genética durante su paso por células. Sin embargo, de forma
ventajosa, la cepa Towne no se ha observado nunca que se
reactivara.
Se ha hallado heterogeneidad en la secuencia de
ADN entre la cepa Towne y otra cepa de HCMV, AD169. Pritchett, J.
Virol. 36:152-161 (1980). (En la patente
estadounidense nº 4.762.780 se descubre un mapa de restricción del
genoma del HCMV AD169). También se ha detectado la variación en el
contenido de ADN entre otras cepas aisladas del HCMV. Huang, Yale
J. Biol. and Med. 49:29-43 (1976). Los patrones
de corte de las digestiones con enzimas de restricción del ADN de
HCMV de varias cepas han sido analizados. Kilpatrick, J.
Virol. 18:1095-1105 (1976); LaFemina,
"Structural Organization of the DNA Molecules from Human
Cytomegalovirus", en Animal Virus Genetics, Eds. B. N.
Field y R. Jaenish, Academic Press, N.Y. (1980); Chandler, J.
Gen. Virol. 67:2179-2192 (1986); Zaia, J.
Clin. Microbiol. 28:2602-2607 (1990). No
obstante, aunque se ha determinado la estructural general del genoma
del HCMV, y se ha mapado el polimorfismo de sitios de restricción
entre cepas para muchas de las cepas, no se han determinado las
diferencias entre cepas en las secuencias de ADN del genoma del
HCMV. Solo se han deducido y comparado secuencias parciales. Por
ejemplo, se han deducido las secuencias de ADN y aminoácidos de las
glicoproteína B de la cubierta (gpUL55(gB)] de ambas, las
cepas Towne y AD169, ver Spaete, Virology
167:207-225 (1988), y se han comparado con varios
aislados clínicos, ver Chou, J. Infect. Dis.
163:1229-1234 (1991), para identificar regiones
conservadas y regiones de variabilidad. Además, se ha completado el
análisis de la secuencia de ADN de ciertas regiones del gen gp58/116
[gpUL55(gB)], del gen IMP, y del potenciador/promotor
IE-1/2. Lehner, J. Clin. Microbiol.
29:2494-2502 (1991).
Mientras que se ha deducido la secuencia de ADN
completa de la cepa AD169 del HCMV, (Nº de acceso al EMBL: X17403),
la secuencia de ADN completa de la cepa Towne no ha sido deducida,
que nosotros sepamos. Sin embargo, se ha especulado que la AD169 y
otra cepa de laboratorio, Davis, carecen de dos a cuatro pares de
kilobases (k.b.) de la secuencia de ADN, en comparación con la cepa
Towne, en la porciones internas extremas de ambas repeticiones
L. LeFemina, ver más arriba, en pp.
52-53.
El impacto en la salud pública de las infecciones
del HCMV no ha sido bien controlado mediante las estrategias de
tratamiento actuales, o mediante las quimioterapias antivirales
disponibles. Es probable que las estrategias de vacunas preventivas
se muestren eficaces a causa de las observaciones de que los
receptores de transplantes renales seropositivos están protegidos de
enfermedades del HCMV graves, y de la que inmunidad maternal protege
el feto de la enfermedad después de una infección intrauterina.
Marshall y Plotkin, "Cytomegalovirus Vaccines", en The Human
Herpesviruses, Eds. B. Roizman, R. J. Whitley, y C. Lopez, Raven
Press, Nueva York, 1993, pp 381-395. Sin embargo, un
obstáculo adicional para el desarrollo de un vacuna contra el HCMV
es la ausencia de un sistema modelo animal que pueda usarse para
ensayar la seguridad y eficacia de las candidatos a vacuna. En
consecuencia, persiste en la técnica una necesidad de vacunas
eficaces para el tratamiento profiláctico del HCMV en humanos.
En un aspecto, la invención proporciona
secuencias de ADN de HCMV nuevas, no reconocidas o conocidas hasta
el momento en la técnica. Estas secuencias de HCMV nuevas se
aislaron a partir de las cepas Toledo y Towne del HCMV, y comprenden
ADN que no compartido por la cepa de referencia AD169 del HCMV. En
consecuencia, en este aspecto la invención proporciona secuencias de
ADN nuevas, aisladas, de la cepa Toledo del HCMV, tal como se
detalla en una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3. Tal como se
usa en ésta, el término "aislado" significa sustancialmente
libre de otras secuencias de ADN viral con la que el ADN sujeto se
halla típicamente en su estado nativo, es decir, endógeno. Estas
secuencias de ADN nuevas del HCMV Toledo se caracterizan por
comprender la misma, o sustancialmente la misma secuencia que la de
la Figura 1 (SEC. Nº ID.: 6), o fragmentos activos de la misma. Las
secuencias de ADN podrían incluir secuencias 5' y 3' no codificantes
flanqueando la secuencia codificante. Las secuencias de ADN podrían
estar en una orientación invertida con respecto a la orientación
mostrada en la Figura 1. Los segmentos o fragmentos de la secuencia
de ADN mostrada en la Figura 1 (SEC. Nº ID.: 6) podrían reordenarse
o invertirse internamente. Las secuencias de ADN de la invención
también comprenden secuencias de nucleótidos capaces de hibridarse
en condiciones rigurosas, o la cuales serían capaces de hibridarse
bajo dichas condiciones, excepto por la degeneración del código
genético, a una secuencia correspondiente a la secuencia de la
Figura 1. La Figura 1 (SEC. Nº ID.: 6) ilustra la secuencia de ADN
de la nueva cepa Toledo del HCMV. En esta secuencia se identificaron
veintiuna pautas de lectura abiertas (ORF). Las secuencias putativas
de estas ORF de la nueva cepa Toledo del HCMV se enumeran en la
secuencia con los números de identificación 7 a 27, páginas 58 a 78
[en el original], ver más abajo. En la Figura 1, el inicio y final
de las 21 ORF se identifica mediante las flechas y las
denominaciones "UL133", "UL134", etc. (ver más abajo). En
las secuencias reordenadas de la invención, podrían crearse o
destruirse nuevas pautas de lectura abiertas.
En otro aspecto, la invención proporciona nuevas
secuencias de ADN del HCMV, no reconocidas o conocidas hasta la
fecha en la técnica. Estas secuencias adicionales se aislaron a
partir de la cepa Towne del HCMV, y comprenden ADN que no es
compartido por la cepa AD169 o por la cepa Toledo del HCMV. Estas
nuevas secuencias de ADN del HCMV Towne se caracterizan por
comprender la misma, o sustancialmente la misma secuencia de
nucleótidos que la de la Figura 2 (SEC. Nº ID.: 1), o fragmentos
activos de la misma. La secuencia de ADN podría incluir secuencias
5' y 3' no codificantes flanqueando la secuencia codificante. Las
secuencias de ADN de la invención también comprenden secuencias de
nucleótidos capaces de hibridarse en condiciones rigurosas, o la
cuales serían capaces de hibridarse bajo dichas condiciones, excepto
por la degeneración del código genético, a una secuencia
correspondiente a la secuencia de la Figura 2 (SEC. Nº ID.: 1). La
Figura 1 (SEC. Nº ID.: 1) ilustra la secuencia de ADN de la nueva
cepa Towne del HCMV. En esta secuencia se identificaron cuatro ORF.
Las secuencias putativas de estas nuevas ORF se enumeran en la
secuencia con los números de identificación 2 a 5, páginas 42 a 45
[en el original], ver más abajo. En la Figura 2, el inicio y final
de las 4 ORF se identifica mediante las flechas y las denominaciones
"UL147", "UL152", "UL153", y "UL154".
Se entiende que las secuencias de ADN de esta
invención podrían excluir algunas o todas las secuencias señales y/o
flanqueantes. Además, las secuencias de ADN de la presente invención
también comprenden ADN capaz de hibridarse en condiciones rigurosas,
o que sería capaz de hibridarse bajo tales condiciones, excepto por
la degeneración del código genético, con una secuencia de ADN
aislada de la Figura 1 o Figura 2 (SEC. Nº ID.: 6 y 1). Tal como se
usa en ésta, el término "condiciones rigurosas" indica
condiciones de elevada rigurosidad, por ejemplo 6x SSC, 0,2%
polivinilpirrolidona, 0,2% Ficoll, 0,2% de albúmina de suero bovino,
0,1% de sulfato de sodiododecil, 100 \mug/ml de ADN de esperma de
salmón, y 15% de formamida a 68ºC. (Ver Materiales y
Procedimientos, Parte C, más abajo). Las moléculas de ARN,
transcritas a partir de un ADN de la invención tal como se ha
descrito más arriba, son un aspecto adicional de la invención.
En otro aspecto, la invención proporciona nuevas
proteínas del HCMV, tal como se detalla en la reivindicación 4 ó
reivindicación 10, las cuales están sustancialmente libres de otras
proteínas del HCMV, con las cuales se hallan típicamente en su
estado nativo. Estas nuevas proteínas del HCMV comprenden las pautas
de lectura abiertas (ORF): UL133 (SEC. Nº ID.: 7), UL134 (SEC. Nº
ID.: 8), UL135 (SEC. Nº ID.: 9), UL136 (SEC. Nº ID.: 10), UL137
(SEC. Nº ID.: 11), UL138 (SEC. Nº ID.: 12), UL139 (SEC. Nº ID.: 13),
UL140 (SEC. Nº ID.: 14), UL141 (SEC. Nº ID.: 15), UL142 (SEC. Nº
ID.: 16), UL143 (SEC. Nº ID.: 17), UL144 (SEC. Nº ID.: 18), UL145
(SEC. Nº ID.: 19), UL146 (SEC. Nº ID.: 20), UL147 (SEC. Nº ID.: 21),
UL148 (SEC. Nº ID.: 22), UL149 (SEC. Nº ID.: 24), UL150 (SEC. Nº
ID.: 25), y/o UL151 (SEC. Nº ID.: 26), identificadas en la secuencia
de ADN de la cepa Toledo, y UL147 (SEC. Nº ID.: 2), UL152 (SEC. Nº
ID.: 3), UL153 (SEC. Nº ID.: 4), y/o UL154 (SEC. Nº ID.: 5),
identificadas en la secuencia de ADN de la cepa Towne. Se
identificaron dos ORF adicionales en la secuencia de ADN de la nueva
cepa Toledo, UL130 y UL131 (SEC. Nº ID.: 23 y 27). Estas dos
secuencias están presentes también en la AD169 (ver Figura 5). Las
proteínas podrían producirse mediante técnicas de ingeniería
genética recombinante. Adicionalmente, podrían purificarse a partir
de fuentes celulares infectadas con el HCMV. También podrían
sintetizarse mediante técnicas químicas. Un especialista en la
técnica podría aplicar una combinación de las metodologías
identificadas más arriba para sintetizar la proteína.
Adicionalmente, se proporcionan análogos de las proteínas del HCMV
de la invención, e incluyen polipéptidos truncados, por ejemplo,
mutantes en los que hay variaciones en la secuencia de aminoácidos,
la cual retiene la actividad biológica, tal como se define más
abajo, y tienen una homología de al menos el 90%, y más
preferiblemente del 95%, con las regiones correspondientes de las
secuencias de aminoácidos de las cepas Toledo o Towne del HCMV (SEC.
Nº ID.: 2, 3, 4, 5, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19,
20, 21, 22, 24, 25 y 26). Los ejemplos incluyen polipéptidos con
variaciones menores añadidas de aminoácidos a partir de las
secuencias de aminoácidos nativas de las secuencias de aminoácidos
de las cepas Toledo o Towne del HCMV (SEC. Nº ID.: 2, 3, 4, 5, 7, 8,
9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 24, 25 y 26);
en particular, sustitución conservadora de aminoácidos. Las
sustituciones conservadoras son aquéllas que tienen lugar dentro de
una familia de aminoácidos que están relacionados por sus cadenas
laterales. Los aminoácidos codificados genéticamente se dividen
generalmente en cuatro familias: (1) ácidos = aspartato, glutamato;
(2) básicos = lisina, arginina, histidina; (3) apolares = alanina,
valina, leucina, isoleucina, prolina, fenilalanina, metionina,
triptófano; y (4) polares no cargados = glicina, asparagina,
glutamina, cistina, serina, treonina, tirosina. La fenilalanina, el
triptófano y la tirosina se clasifican a veces conjuntamente como
aminoácidos aromáticos. Por ejemplo, es razonable esperar que una
sustitución aislada de una leucina con una isoleucina o valina, un
aspartato con un glutamato, una treonina con un serina, o una
sustitución conservadora similar de un aminoácido con un aminoácido
estructuralmente relacionado no tendrá un efecto importante sobre la
actividad o funcionalidad.
Usando las secuencias de aminoácidos de Toledo o
Towne (SEC. Nº ID.: 2, 3, 4, 5, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16,
17, 18, 19, 20, 21, 22, 24, 25 y 26). La obtención de otros
polipéptidos, u otras secuencias de ADN codificando la proteína de
HCMV Towne o Toledo, a partir de aislados clínicos se halla entre
los conocimientos de la técnica. Por ejemplo, el gen estructural
puede manipularse variando nucleótidos individuales mientras que se
retienen los aminoácidos correctos, o variando los nucleótidos, con
objeto de modificar los aminoácidos, sin pérdida de actividad. Los
nucleótidos pueden sustituirse, insertarse, o suprimirse mediante
técnicas conocidas, incluyendo, por ejemplo, la mutagénesis in
vitro y la reparación de cebadores. El gen estructural puede
truncarse en su extremos 3' y/o extremo 5' mientras retenga su
actividad. También podría ser deseable suprimir la región
codificando la secuencia señal, y/o remplazarla con una secuencia
heteróloga. También podría ser deseable ligar un porción de las
secuencias de aminoácidos de Toledo o Towne (SEC. Nº ID.: 2, 3, 4,
5, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 24,
25 y 26), particularmente aquélla que incluye el dominio
amino-terminal, a una secuencia codificante
heteróloga, y de ese modo crear un péptido de fusión del HCMV Toledo
o Towne.
Al diseñar tales modificaciones, se espera que
los cambios en regiones no conservadas de las secuencias de
aminoácidos de Toledo o Towne (SEC. Nº ID.: 2, 3, 4, 5, 7, 8, 9, 10,
11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 24, 25 y 26) tendrán
efectos relativamente menores sobre la actividad, mientras que los
cambios en las regiones conservadas, y particularmente en, o cerca
del dominio amino-terminal, se espera que produzcan
efectos mayores. Los residuos aminoácidos que están conservados
entre las secuencias de aminoácidos de Toledo o Towne (SEC. Nº ID.:
2, 3, 4, 5, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21,
22, 24, 25 y 26), y al menos otras dos secuencias, por ejemplo,
procedentes de aislados clínicos de HCMV, no se espera que sean
candidatos para la sustitución. Un residuo que muestra variaciones
conservadoras entre las secuencias del HCMV y al menos dos de las
otras secuencias, se espera que sea susceptible de una sustitución
conservadora similar de las secuencias del HCMV. De forma similar,
un residuo que varía de forma no conservadora entre las secuencias
del HCMV y al menos tres de las otras secuencias, se espera que sea
susceptible de una sustitución conservadora o no conservadora.
Cuando se diseñan sustituciones de las secuencias del HCMV, es
especialmente preferido el remplazo con un aminoácido que no se
halla en la posición alineada comparable de una de las otras
secuencias.
Esta invención proporciona adicionalmente un
vector de ADN recombinante que comprende un vector de ADN y una
secuencia de ADN que codifica un polipéptido del HCMV Toledo o un
polipéptido del HCMV Towne. El vector proporciona el ADN del HCMV
Toledo o Towne en un asociación operativa con una secuencia
reguladora capaz de dirigir la replicación y expresión de una
proteína del HCMV Toledo o Towne en una célula huésped seleccionada.
También se proporcionan en esta invención las células huésped
transformadas con tales vectores, para su uso en la expresión de
proteínas recombinantes de HCMV Toledo o Towne. También se
proporciona un proceso novedoso para producir proteínas
recombinantes de HCMV Toledo o Towne, o fragmentos activos de las
mismas. En este proceso, una línea celular huésped, transformada con
un vector tal como se ha descrito más arriba, conteniendo una
secuencia de ADN (SEC. Nº ID.: 1 y 6) que codifica la expresión de
una proteína de HCMV Toledo o Towne, en asociación operativa con una
secuencia regulador apropiada y capaz de dirigir la replicación y
controlar la expresión de una proteína de HCMV Toledo o Towne, se
cultiva en condiciones apropiadas, permitiendo la expresión del ADN
recombinante. La proteína expresada se recolecta a continuación de
la célula huésped o del medio de cultivo, usando medios
convencionales apropiados. Este proceso novedoso podría emplear
varias células conocidas como líneas celulares huéspedes para la
expresión de la proteína. Las células actualmente preferidas son
líneas celulares de células de mamíferos, levadura, insecto, y
bacterias. Las líneas celulares de mamífero son especialmente
preferidas.
La práctica de esta invención empleará, a menos
que se indique lo contrario, técnicas convencionales de biología
molecular, microbiología, manipulación y producción de ADN
recombinante, e inmunología, las cuales forman parte de los
conocimientos de la técnica. Tales técnicas se explican
detalladamente en la literatura. Ver, por ejemplo, Sambrook,
Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2ª edición (1989);
DNA Cloning, Volúmenes I y II, (Ed. D. N. Glover, 1985);
Oligonucleotide Synthesis, (Ed. M. J. Gait, 1984); Nucleic
Acid Hybridization, (Eds. B. D. Hames y S. J. Higgins, 1984);
Transcription and Translation, (EDs. B. D. Hames y S. J.
Higgins, 1984); Animal Cell Culture, (Ed. R. I. Freshney,
1986); Immobilized Cells and Enzymes, (IRL PRess, 1986); B.
Perbal, A Practical Guide to Molecular Cloning, (1984); la
serie Methods in Enzymology, (Academic Press, Inc.); Gene
Transfer Vectors for Mammalian Cells, (Eds. J. H. Miller y M. P.
Calos, 1987, Cold Spring Harbor Laboratory), Methods in
Enzymology, Volúmenes 154 y 155 (respectivamente, Eds. Wu y
Grossman, y Wu), (Eds. Mayer y Walker, 1987), Immunochemical
Methods in Cell and Molecular Biology, (Academic Press, London),
Scopes (1987); Protein Purification: Principles and Practice,
2ª edición, Springer Verlag, N.Y.; y Handbook of Experimental
Immunology, Volúmenes I-IV (Eds. D. M. Weir y C.
C. Blackwell, 1986).
Esta invención proporciona adicionalmente
composiciones para detectar infecciones de HCMV en humanos. Estas
composiciones comprenden sondas que tienen al menos un fragmento de
hebra única de al menos 10 bases de longitud, más preferiblemente 15
bases de longitud, de la nueva secuencia de Toledo, y fragmentos que
se hibridan a estos fragmentos de hebra única en condiciones de
hibridación rigurosas, y que no se hibridan de forma cruzada con el
ADN humano. Adicionalmente, esta composiciones comprenden al menos
un fragmento de hebra única de al menos 10 bases de longitud, más
preferiblemente 15 bases de longitud, o la nueva secuencia Towne, y
fragmentos que se hibridan a estos fragmentos de hebra única en
condiciones de hibridación rigurosas, y que no se hibridan de forma
cruzada con el ADN humano. Algunas composiciones de sondas podrían
comprender adicionalmente una marca, unida al fragmento, para
proporcionar una señal detectable, como se enseña en la patente
estadounidense nº 4.762.780.
Esta invención proporciona además procedimientos
para detectar una infección de HCMV en un huésped humano. Tales
procedimientos comprenden combinar, en condiciones de rigurosidad
predeterminadas, una muestra clínica sospechosa de contener ADN de
HCMV con al menos un fragmento de ADN de hebra única, de la nueva
cepa Toledo o Towne de HCMV, que tiene al menos 10 bases, más
preferiblemente 15 bases, y que no se hibrida de forma cruzada con
el ADN humano, y detectar la formación de dúplexes entre los
fragmentos de hebra única de la cepa Toledo o Towne del HCMV y el
ADN de la muestra. Alternativamente, la PCR podría usarse para
incrementar el número de copias de ácido nucleico viral mediante
amplificación para facilitar la identificación de HCMV en individuos
infectados. En tal caso, los fragmentos de secuencia de ADN de la
cepa Toledo o Towne de la presente invención pueden usarse para
construir cebadores de PCR para sistemas de amplificación basados en
PCR para el diagnóstico de HCMV. Tales sistemas son bien conocidos
en la técnica. Ver, por ejemplo, la patente estadounidense nº
5.008.182 (detección mediante PCR de virus asociados con el SIDA), y
Hedrum, PCR Methods and Applications
2:167-171 (1992) (detección de Chlamydia
trachomatic mediante PCR y recuperación inmunomagnética).
Las secuencias de ADN de esta invención podrían
usarse también para preparar composiciones inmunizantes. Las
secuencias de ADN de la nueva Toledo se recombinan en la cepa Towne
o la cepa AD169 del HCMV, y se ensayan las propiedades de
crecimiento de estos virus recombinantes en células endoteliales, o
en tejidos humanos transplantados en ratones SCID, o se ensayan en
el modelo del ojo de la rata. Mocarski, Proc. Natl. Acad.
Sci. 90:104-108 (1993). Tales recombinantes
mostrarán una inmunogenicidad incrementada frente a la mostrada por
la cepa Towne-125, en uso actualmente en humanos,
sin exhibir la virulencia total mostrada por la cepa
Toledo-1. Por tanto, un aspecto adicional de la
invención son las composiciones inmunizantes que comprenden, bien la
cepa Towne o la cepa de referencia AD169 del HCMV, a la cual se le
ha añadido la nueva secuencia de ADN de la Toledo, o fragmentos
análogos de la misma, resultando en una inmunogenicidad incrementada
del virus recombinante. La invención también incluye el uso de una
composición inmunogénica, tal como la definida más arriba, para la
preparación de un medicamento para el tratamiento profiláctico de un
enfermedad o condición relacionada con el HCMV, y el uso de un
proteína del HCMV, tal como se ha definido más arriba, para la
preparación de un medicamento para el tratamiento profiláctico de
una enfermedad o condición relacionada con el HCMV.
Otros aspectos y ventajas de esta invención se
describen en la siguiente DESCRIPCIÓN DETALLADA, en la cual:
La Figura 1 ilustra la nueva secuencia de ADN de
Toledo de la invención, aislada a partir de la cepa Toledo del HCMV.
Las flechas indican los inicios y los finales de las secuencias de
nucleótidos que codifican las 21 secuencias de aminoácidos putativas
identificadas.
La Figura 2 ilustra la nueva secuencia de ADN de
Towne de la invención, aislada a partir de la cepa Towne del HCMV.
Las flechas indican los inicios y los finales de las secuencias de
nucleótidos que codifican las 21 secuencias de aminoácidos putativas
identificadas.
La Figura 3 es la representación esquemática de
una transferencia Southern de un ADN de la cepa Towne o Toledo de
HCMV, digerido con enzimas de restricción tal como se detalla en el
EJEMPLO 1. La flecha indica una banda de 5 p.k.b. (pares de
kilobases) del ADN de Toledo en la digestión con BamHI que
está ausente en el ADN de Towne, significando la presencia adicional
de secuencia de ADN de Toledo.
La Figura 4 ilustra una autoradiografía compuesta
del ADN, digerido con enzimas de restricción, procedente de AD169,
Towne, Toledo y cinco aislados clínicos del HCMV, tal como se
describe en el Ejemplo 3.
La Figura 5 es una representación esquemática de
las nuevas pautas de lectura identificadas en las secuencias de ADN
de las nuevas Toledo o Towne.
La Figura 6 es una representación esquemática de
las posiciones relativas de las nuevas secuencias identificadas en
el ADN genómico de Toledo, el ADN genómico de Towne, en una
comparación con el ADN genómico de la cepa AD169.
La invención proporciona dos secuencia de ADN de
HCMV nuevas, denominadas secuencia Toledo y secuencia Towne, no
reconocidas o conocidas hasta el momento en la técnica. Esta
invención también proporciona composiciones inmunizantes y
procedimientos que usan las nuevas secuencias de ADN de HCMV de la
invención, y también proporciona otros usos diagnósticos y
terapéuticos para las secuencias y sus productos proteicos. Las
nuevas secuencias de ADN se hallaron originalmente en las cepas
Toledo y Towne del HCMV. Los detalles de las secuencias y de las
características estructurales se proporcionan en los Ejemplos más
adelante.
Más deseablemente, se proporcionan composiciones
inmunogénicas del HCMV que comprenden la cepa de referencia AD169 o
la Towne, a las que se les han añadido secuencias de ADN de la nueva
Toledo, o análogos o fragmentos de las mismas, con objeto de
incrementar la inmunogenicidad de las cepas excesivamente atenuadas.
Por tanto, un aspecto de esta invención incluye aislar ADN, y las
correspondientes secuencias de ARN, tal como se descubre en las
Figuras 1 y 2 (SEC. Nº ID.: 6 y 1). Tal como se usa en ésta, el
término "aislado" indica sustancialmente libre de otras
secuencias de nucleótidos o polipéptidos con las cuales la secuencia
de nucleótidos o polipéptidos sujeto se halla típicamente en su
estado nativo, es decir, endógeno. En otro aspecto, la invención
comprende proteína de Toledo o Towne del HCMV aislada codificada por
las respectivas secuencias de ADN de Toledo o Towne del HCMV (SEC.
Nº ID.: 2, 3, 4, 5, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19,
20, 21, 22, 24, 25 y 26).
Otro aspecto de esta invención incluye ensayos de
diagnóstico para la detección de variantes de cepas del HCMV. En
resumen, tales ensayos de diagnóstico incluyen el uso de fragmentos
de secuencia de ADN de la invención como cebadores para amplificar
ácidos nucleicos relacionados con el HCMV en una reacción en cadena
de la polimerasa (PCR), o por detección directa mediante
hibridación. Los ensayos de diagnóstico de la invención también
podrían incluir el uso de anticuerpos específicos contra los nuevos
ORF codificados por las secuencias de ADN de Toledo o Towne
descubiertas en ésta. Todavía otro aspecto de la invención es el uso
de las nuevas secuencias de ADN, modificadas con un único sitio de
restricción, para actuar como marcadores de vacunas.
Se anticipa que la invención permitirá la
producción de vacunas que ofrecerán ventajas respecto a la actual
vacuna del HCMV, la cual está demasiado atenuada, y, por tanto, no
es consistentemente efectiva a la hora de elicitar una respuesta
inmune. Más específicamente, la introducción o inserción de las
nuevas secuencias de la cepa Toledo de la presente invención en la
cepa Towne o en la cepa AD169 resultarán en la introducción de
secuencias de ADN específicas en el genoma del HCMV Towne, lo que no
es posible usando vacunas de pasajes en células. De forma importante
para la producción de vacunas, esto permite la medición precisa del
grado de atenuación introducido por diferentes fragmentos de las
secuencias de ADN de la invención, permitiendo por tanto la
modificación controlada de la atenuación de la cepa Towne que se
precisa en la técnica para corregir la característica de la cepa
Towne de estar demasiado atenuada, y mejorar su función en una
composición inmunogénica.
El ADN de Towne o AD169 recombinante se deriva
co-transfectando de un plásmido que contiene las
nuevas secuencias de Toledo, o análogos o fragmentos de las mismas,
y un marcador seleccionable, tal como el gpt o la
\beta-galactosidasa, en células de fibroblastos
primarios, u otras líneas celulares conocidas por permitir el
crecimiento de CMV. Los virus recombinantes se seleccionan mediante
cultivo en medios que contienen ácido micofenólico, o se identifican
mediante fenotipos de calvas azules después de aplicar un sustrato
cromogénico como la X-gal. Los virus recombinantes
se purifican a partir de la calva y se caracterizan mediante
análisis con enzimas de restricción y procedimientos de
transferencia Southern. La nueva secuencia del HCMV Toledo, o
análogos o fragmentos de la misma, podrían usarse sin modificar con
respecto a las señales endógenas promotoras y terminadoras de la
transcripción. Alternativamente, la región codificante del ADN de la
cepa Toledo puede colocarse bajo control transcripcional de un
promotor, tal como el promotor temprano inmediato principal del CMV
(citomegalovirus), el promotor temprano del SV40, u otro promotor
viral o celular que genere niveles de expresión adecuados, tal como
se discute en ésta. El HCMV de las cepas Towne o AD169 modificadas
se hace crecer en células de cultivo de tejidos. Para experimentos
con mamíferos, que no incluyan humanos, se usan células tales los
fibroblastos de prepucio humano (HF) o células
MRC-5, para propagar el virus. El virus se recolecta
a partir de cultivos de estas células y, a continuación se estudia
con más detalle el virus recombinante aislado por su capacidad para
elicitar una respuesta inmune y proporcionar protección frente a la
infección por HCMV.
Para su uso en humanos, el virus recombinante se
produce en grandes cantidades a partir de una línea celular aprobada
por la FDA. Tales células incluyen las células MRC-5
y WI-38 (ambas son fibroblastos diploides humanos
primarios). El virus recombinante se genera en la línea celular de
producción mediante transfección de ADN viral, o de cápsides
preparadas a partir de virus recombinante aislado a partir de otra
línea celular. El procedimiento de transfección debería prevenir la
contaminación de las células aprobadas por la FDA con agentes
adventicios o contaminantes procedentes de un línea celular no
cualificada. Un virus HCMV producido a partir de las anteriores
líneas celulares se usará para infectar progresivamente frascos de
cultivos mayores de células de cultivos de tejidos. Las células
infectadas se usarán en inoculaciones subsiguientes. Las células del
cultivo celular infectadas y viables se extraen de los frascos de
cultivos celulares usando tripsina, y se añaden hasta un exceso de 1
a 100 veces (o más) de células sin infectar para conseguir
progresivamente inoculaciones mayores. Una vez se haya obtenido un
rendimiento óptimo, el virus se recolectará a partir de células de
cultivos celulares. Este proceso puede repetirse hasta que se
alcanza una producción a gran escala. Las células infectadas se
recuperarán de los frascos de cultivos celulares y se romperán
usando, por ejemplo, sonicación, homogeneización con homogenizador
dounce, o alguna combinación de los mismos. Los virus se
aíslan a continuación a partir del material celular usando técnicas
de centrifugación conocidas en la técnica. Una vez se ha aislado el
virus, se añade un agente estabilizador, tal como un carbohidrato o
un derivado de carbohidrato, y entonces se alícuota el virus y se
liofiliza.
Las composiciones inmunogénicas pueden
administrarse a sujetos para prevenir infecciones por HCMV. Las
composiciones inmunogénicas previenen las infecciones por HCMV
estimulando el sistema inmune con un virus atenuado incapaz de
manifestar totalmente la enfermedad. Una ventaja principal de las
composiciones inmunogénicas de HCMV proporcionada en ésta es que su
grado de inmunogenicidad incrementado resultará en una prevención
más efectiva de una infección por HCMV en la población.
La cepa Towne del HCMV servirá preferiblemente
como cepa progenitora debido a su incapacidad probada para
reactivarse. Para preparar composiciones inmunogénicas de HCMV, se
introducen secuencias de ADN de Toledo completas, truncadas y/o
modificadas, en un virus de la cepa Towne o AD169 del HCMV, tal como
se discute en ésta. La efectividad de la composición inmunogénica
para impedir las infecciones por HCMV se medirá en humanos. Los
humanos se inocularán primero con PFU que oscilarán desde
100-20.000 PFU de virus mutantes por inoculación, la
PFU se miden tal como se discute en ésta. Después de la primera
inoculación, usualmente se administrará una segunda inyección de
impulso de igual dosis o incrementada. Los sujetos se expondrán
entonces a HCMV del tipo salvaje, después de la primera o segunda
inoculación, y se observará la presencia de infecciones por CMV. Los
posibles efectos secundarios de la vacuna se monitorizarán en
voluntarios adultos previamente expuestos al CMV, antes de inocular
sujetos que nunca han desarrollado infecciones por CMV. El virus
atenuado se usa sin un adyuvante y con un portador fisiológicamente
apropiado.
Tal como se conoce en la técnica y se discute en
ésta, el nuevo ADN se inserta en el genoma viral de Towne o AD169
usando, por ejemplo, técnicas de recombinación homólogas. La
inserción se hace generalmente en un gen que no es esencial en la
naturaleza. Han sido descritos vectores lanzadera de plásmidos que
facilitan enormemente la construcción de virus recombinantes. Ver,
por ejemplo, Spaete y Mocarski, Proc. Natl. Acad. Sci.
84:7213-7217 (1987). La expresión del polipéptido
codificado por el ADN de la nueva Toledo ocurre entonces en células
o individuos que están inmunizados con el virus recombinantes
vivo.
Alternativamente, las nuevas proteínas
purificadas del HCMV podrían emplearse en composiciones terapéuticas
y/o inmunogénicas para una subunidad, para impedir o tratar
condiciones relacionadas con el HCMV. Tales composiciones
farmacéuticas comprenden una cantidad efectiva inmunogénicamente
inductora de una o más de las proteínas de la presente invención, en
mezcla con un portador farmacéuticamente aceptable, por ejemplo, una
sistema de presentación adyuvante/antígeno tal como el alum. También
podrían usarse otros sistemas de presentación adyuvante/antígeno,
por ejemplo, el MF59 (Chiron Corp.), QS-21
(Cambridge Biotech Corp.), 3-DMPL
(3-deacil-monofosforil Lípido A)
(RibiImmunoChem Research Inc.), adyuvante de Freund incompleto de
grado clínico (IFA), liposomas fusogénicos, polímeros solubles en
agua, o Iscoms (Complejos estimulantes Inmunes). Otros ejemplos de
portadores o soluciones farmacéuticamente aceptables son el
hidróxido de aluminio, la solución salina, y la solución salina
tamponada con fosfato. La composición puede administrarse
sistémicamente, preferiblemente subcutáneamente o
intramuscularmente, en formar de una solución subcutánea o
intramuscular aceptable. También puede efectuarse la inoculación
mediante escarificación de la superficie o mediante la inoculación
de una cavidad corporal. La preparación de tales soluciones, con la
debida consideración del pH, isotonicidad, estabilidad y
similares, se halla dentro de los conocimientos de la técnica. El
régimen de dosificación será determinado por el médico encargado,
teniendo en consideración varios factores que se sabe modifican la
acción de las drogas, tales como, por ejemplo, la condición física,
el peso corporal, el sexo, la dieta, la gravedad de la condición, el
tiempo de administración, y otros factores clínicos. Los rangos de
dosis de ejemplo comprenden entre aproximadamente 1 \mug hasta
1000 \mug de proteína.
Al practicar el procedimiento de tratamiento de
esta invención, se administra una cantidad efectiva
inmunológicamente inductora de proteína a un paciente humano que
precisa de un tratamiento profiláctico o terapéutico. Un cantidad
efectiva inmunológicamente inductora de una composición de esta
invención se contempla que esté en el rango de aproximadamente 1
microgramo a aproximadamente 1 miligramo por dosis administrada. El
número de dosis administradas podría variar, dependiendo de los
factores antes mencionados.
Las nuevas secuencias de ADN de Toledo y Towne de
la presente invención pueden usarse en ensayos de diagnóstico para
detectar HCMV en una muestra, para detectar secuencias similares a
la de Toledo y Towne, y para detectar diferencias entre cepas en
aislados clínicos de HCMV, usando fragmentos de ADN de Toledo o
Towne sintetizados químicamente o recombinantes. Adicionalmente, las
nuevas secuencias pueden usarse como un marcador de vacuna para
diferenciar entre un individuo o muestra infectado con, o
conteniendo HCMV del tipo salvaje, y un individuo o muestra
infectada con, o que contiene una vacuna de HCMV, es decir, una
vacuna de HCMV viva atenuada actualmente en uso, tal como la vacuna
de Towne. En todavía otra realización, los fragmentos de la
secuencia de ADN pueden unirse también a ácidos nucleicos
secundarios que, o se unen a un soporte sólido o a otras sondas de
detección para su uso en ensayos de diagnóstico.
En un aspecto de la invención, pueden usarse
fragmentos de las nuevas secuencias de ADN de Toledo o Towne (SEC.
Nº ID.: 1 y 3), que comprenden al menos entre 10 y 20 nucleótidos,
como cebadores para amplificar ácidos nucleicos usando
procedimientos de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), bien
conocidos en la técnica, y como sondas en ensayos de hibridación de
ácido nucleico para detectar material genético diana, tal como el
ADN de HCMV en especímenes clínicos (con o sin PCR). Ver, por
ejemplo, las patentes estadounidenses nº 4.683.202; 4.683.195;
5.091.310; 5.008.182 y 5.168.039. En un ensayo de ejemplo, se
selecciona una región de la nueva secuencia de ADN conservada entre
variantes del virus como la secuencia a amplificar y detectar en el
ensayo de diagnóstico. Se construyen cebadores oligonucleotídicos,
al menos sustancialmente complementarios a (pero preferiblemente
idénticos a) la secuencia a amplificar, y se trata una muestra
sospechosa de contener una secuencia de ácido nucleico de HCMV a
detectar con cebadores para cada hebra de la secuencia de ácido
nucleico del HCMV, cuatro trifosfatos de deoxinucleótidos, y un
agente de polimerización, en condiciones apropiadas, de tal forma
que se sintetiza un producto de extensión de cada cebador que es
complementario con las secuencias de ácido nucleico del HCMV que se
sospecha hay en la muestra, los cuales productos de extensión
sintetizados a partir de un cebador, cuando se separan de su
complemento, pueden servir como plantilla para la síntesis del
producto de extensión del otro cebador en una reacción en cadena de
la polimerasa. Después de la amplificación, el producto de la PCR
puede detectarse mediante la adición de una sonda marcada,
construida del mismo modo a partir de la nueva secuencia de ADN,
capaz de hibridarse con la secuencia amplificada, como es bien
conocido en la técnica. Ver, por ejemplo, la patente estadounidense
nº 5.008.182.
En otra realización, las sondas o cebadores
pueden usarse en un ensayo de marcador de vacuna para detectar una
vacuna o infección con el tipo salvaje. Alternativamente, la
introducción de un sitio de restricción en la nueva secuencia de ADN
proporcionará un marcador de vacuna que puede usarse con fragmentos
de PCR para detectar tales diferencias en un digerido de
restricción. Tales procedimientos y técnicas para detectar variantes
de la secuencia, tales como mutaciones localizadas, con la esperada
ubicación o configuración de la mutación, son conocidas en las
técnicas y se han aplicado en la detección de la anemia de células
falciformes, de la enfermedad de la hemoglobina C, de la diabetes, y
otras enfermedades y condiciones, tal como se descubre en la patente
estadounidense nº 5.137.806. Estos procedimientos son fácilmente
aplicados por un especialista en la técnica para detectar y
diferenciar entre infecciones por el tipo salvaje y la vacuna del
HCMV.
En otra realización, las nuevas secuencias de ADN
de Toledo o Towne pueden usarse, en su totalidad o como fragmentos,
para detectar la presencia de secuencias de ADN, secuencias
relacionadas, o productos de transcripción en células, tejidos,
muestras, y similares, usando técnicas de hibridación de sondas
conocidas en la técnica, o conjuntamente con uno de los
procedimientos discutidos en ésta. Cuando se usan como sonda de
hibridación, los fragmentos de las nuevas secuencias de ADN de la
invención tienen preferiblemente de 50-200
nucleótidos de longitud, más preferiblemente 100-300
nucleótidos de longitud, y más preferiblemente más de 300
nucleótidos de longitud.
Las nuevas secuencias de ADN de la invención
pueden expresarse en diferentes vectores usando diferentes técnicas
conocidas en la técnica, lo que resulta en la generación de virus
quiméricos. Las técnicas útiles y conocidas incluyen la
transferencia de marcador o la recombinación homóloga, la ligación
in vitro directa, la tecnología del vector defectuoso y la
generación de amplicón (ver, por ejemplo, Frenkel, N. et al.,
Gene Transfer and Cancer, editado por M. L. Pearson y N. L.
Sternberg (1984), Kwong A. D. y Frenkel, Virology
142:421-425 (1985), la patente estadounidense (nº de
serie 07/923.015, por Roizman). Los vectores usados en tales
técnicas incluyen los cósmidos, plásmidos, y los virus infecciosos o
defectuosos. Tales vectores son conocidos en la técnica. Un cósmido,
tal como se usa en ésta, es un plásmido que contiene un sitio
cos del bacteriófago lambda. El sitio cos es la señal
cis para el empaquetado del ADN de lambda. Por tanto, un
cósmido, a diferencia de un plásmido, puede ser empaquetado in
vitro con elevada eficiencia en una cabeza de lambda. Esta
técnica permite la clonación de fragmentos muy grandes
(30-45 p.k.b.) de ADN. La cotransfección de cósmidos
que se solapan puede usarse para construir mutantes de
citomegalovirus humanos siguiendo los procedimientos de Kemble,
J. Virology 70:2044-2048 (1996). Los vectores
pueden ser de hebra única o de doble hebra, y prepararse tanto con
ADN como con ARN.
Generalmente, la secuencia de ADN se inserta en
le vector sola o unida a otro ADN genómico de HCMV. En usos de la
ligación in vitro directa, se usa la secuencia aislada sola.
En la recombinación homóloga y transferencia de marcador se
requieren secuencias de ácido nucleico flanqueantes para efectuar la
transferencia de la secuencia a un genoma viral de HCMV. Para su uso
en complementación viral usando cósmidos, y otros vectores
discutidos en ésta, la secuencia (o un fragmento de la misma) en un
vector está preferiblemente unida operativamente a al menos 1 k.b.
del ácido nucleico genómico del HCMV, y más preferiblemente a al
menos 5 k.b. de ácido nucleico del HCMV. El ácido nucleico genómico
del HCMV puede usarse en un lado o en ambos lados de la pauta de
lectura abierta. Si sólo va a usarse una región específica de la
pauta de lectura abierta para generar un virus mutante, se inserta
en un vector una pauta de lectura abierta o un fragmento de la
misma.
Otro aspecto de la invención incluye el
aislamiento de proteínas codificadas por la secuencia de ADN de
Toledo o Towne tal como se enseña en ésta. Las proteínas pueden
usarse para estudiar o modificar el ciclo vital del HCMV, porque
codifican glicoproteínas de superficie que podrían ser
inmunogénicas, y responder a tropismos de tejidos, o influenciar la
respuesta inmune en un individuo infectado. Tales proteínas podrían,
por tanto, usarse en la producción de una vacuna de subunidad contra
el CMV. La construcción de tales candidatos de vacunas de
subunidades contra el CMV es conocida en la técnica. Ver, por
ejemplo, Spaete, Virology 167:207-225
(1988).
Mediante análisis de ORF se han identificado
veintiuna proteínas nuevas de Toledo y cuatro de Towne. Las nuevas
proteínas de Toledo incluyen la UL130 (SEC. Nº ID.: 23), UL132 (SEC.
Nº ID.: 27), UL133 (SEC. Nº ID.: 7), UL134 (SEC. Nº ID.: 8), UL135
(SEC. Nº ID.: 9), UL136 (SEC. Nº ID.: 10), UL137 (SEC. Nº ID.: 11),
UL138 (SEC. Nº ID.: 12), UL139 (SEC. Nº ID.: 13), UL140 (SEC. Nº
ID.: 14), UL141 (SEC. Nº ID.: 15), UL142 (SEC. Nº ID.: 16), UL143
(SEC. Nº ID.: 17), UL144 (SEC. Nº ID.: 18), UL145 (SEC. Nº ID.: 19),
UL146 (SEC. Nº ID.: 20), UL147 (SEC. Nº ID.: 21), UL148 (SEC. Nº
ID.: 22), 7 (SEC. Nº ID.: 24), UL150 (SEC. Nº ID.: 25), y/o UL151
(SEC. Nº ID.: 26). La UL130 está codificada por los nucleótidos
13.109 a 13.753, tal como muestra la Figura 1. La UL132 está
codificada por los nucleótidos 11.673 a 12.485, tal como muestra la
Figura 1. La UL133 está codificada por los nucleótidos 51 a 824, tal
como muestra la Figura 1. La UL134 está codificada por los
nucleótidos 541 a 1068, tal como muestra la Figura 1. La UL135 está
codificada por los nucleótidos 941 a 1927, tal como muestra la
Figura 1. La UL136 está codificada por los nucleótidos 2018 a 2740,
tal como muestra la Figura 1. La UL137 está codificada por los
nucleótidos 2599 a 2890, tal como muestra la Figura 1. La UL138 está
codificada por los nucleótidos 2823 a 3332, tal como muestra la
Figura 1. La UL139 está codificada por los nucleótidos 3895 a 4302,
tal como muestra la Figura 1. La UL140 está codificada por los
nucleótidos 4484 a 4828, tal como muestra la Figura 1. La UL141 está
codificada por los nucleótidos 5098 a 6375, tal como muestra la
Figura 1. La UL142 está codificada por los nucleótidos 6448 a 7368,
tal como muestra la Figura 1. La UL143 está codificada por los
nucleótidos 7353 a 7631, tal como muestra la Figura 1. La UL144 está
codificada por los nucleótidos 8008 a 8538, tal como muestra la
Figura 1. La UL145 está codificada por los nucleótidos 8867 a 9169,
tal como muestra la Figura 1. La UL146 está codificada por los
nucleótidos 9450 a 9803, tal como muestra la Figura 1. La UL147 está
codificada por los nucleótidos 9868 a 10.347, tal como muestra la
Figura 1. La UL148 está codificada por los nucleótidos 10.646 a
11.596, tal como muestra la Figura 1. La UL149 está codificada por
los nucleótidos 15.756 a 16.124, tal como muestra la Figura 1. La
UL150 está codificada por los nucleótidos 15.874 a 17.802, tal como
muestra la Figura 1. La UL151 está codificada por los nucleótidos
17.289 a 18.299, tal como muestra la Figura 1.
Las nuevas proteínas de Towne incluyen la UL147,
UL152, UL153 y UL154 (SEC. Nº ID.: 2, 3, 4 y 5, respectivamente). La
UL147 está codificada por los nucleótidos 841 a 1321, tal como
muestra la Figura 2. La UL152 está codificada por los nucleótidos
1365 a 1721, tal como muestra la Figura 2. La UL153 está codificada
por los nucleótidos 2501 a 3337, tal como muestra la Figura 2. La
UL154 está codificada por los nucleótidos 3512 a 4711, tal como
muestra la Figura 2.
"Proteína o proteínas de Toledo y/o Towne",
tal como se usa en ésta, se refiere a las anteriores secuencias,
enumeradas también en el listado de secuencias. "Proteína o
proteínas de Toledo y/o Towne" se refiere también a una proteína
homóloga procedente de cualquier cepa o aislado clínico de HCMV,
incluyendo proteínas del HCMV que son al menos un 90% homólogas con
las secuencias de aminoácidos de Toledo o Towne (SEC. Nº ID.: 2, 3,
4, 5, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22,
24, 25, 26 y 27). La proteína de Toledo o Towne puede modificarse
para afectar el ciclo vital del HCMV mediante supresión, inserción y
sustitución en la secuencia de ADN, tal como se discute en esta, o
mediante síntesis química de una secuencia de aminoácidos diferente,
o mediante modificación química. Las proteínas truncadas pueden
formarse mediante supresión de una porción de la secuencia de ADN, o
mediante la introducción de señal(es) de terminación en la
secuencia de ADN. Las supresiones preferidas a la proteína
corresponden a una secuencia o secuencias de aminoácidos suprimidas
que contienen al menos un aminoácido seleccionado de entre el grupo
consistente en Glu, Asp, Arg, Lys, Cys y Pro. Más preferiblemente,
la secuencia o secuencias de aminoácidos suprimidas contienen al
menos dos aminoácidos seleccionados de entre el grupo consistente en
Glu, Asp, Arg, Lys, Cys y Pro. Más preferiblemente, la secuencia o
secuencias de aminoácidos suprimidas contienen al menos dos
prolinas.
Otras mutaciones de la proteína útiles para
modificar el ciclo vital del HCMV incluyen, pero no se limitan a, la
modificación de los sitios de fosforilación por cAMP
(Arg/Lys-Arg/Lys-X-X-Asp/Glu)
y/o de miristilización
(Glicina-X1-X2-X3-Ser/Thr-X-X-Asp/Glu;
en donde X1 no es Glu, Asp, Arg, Lys, His, Pro, Phe, Tyr, Trp, en
donde X2 es cualquier aminoácido, y en donde X2 no es Pro), o
modificaciones de sitios de fosforilación de la PKC
(Ser/Thr-X-Arg/Lys), y/o sitios de
glicosilación unida a N
(Asn-X-Ser/Thr, en donde X no es
Pro).
Las secuencias de ADN de Toledo o Towne, los
análogos o fragmentos de la misma pueden expresarse en un mamífero,
insecto, o microorganismo huésped. El polinucleótido se inserta en
un vector de expresión apropiado, compatible con el tipo de célula
huésped empleado, y está operativamente unido a los elementos de
control dentro del vector. La construcción del vector emplea
técnicas que son conocidas en la técnica. El corte del ADN
específico en un sitio implicado en tal construcción se realiza
mediante tratamiento con enzimas de restricción apropiados, bajo
condiciones que generalmente están especificadas por el fabricante
de estos enzimas disponibles comercialmente. Un vector de expresión
apropiado es uno que es compatible con la función deseada (por
ejemplo, expresión transitoria, expresión a largo plazo,
integración, replicación, amplificación), y en el cual los elementos
de control son compatibles con la célula huésped.
Los vectores apropiados para la replicación en
células de mamífero son conocidos en la técnica, y pueden incluir
replicones virales, o secuencias que aseguran la integración de la
secuencia que codifica el ADN de Toledo o Towne en el genoma del
huésped. Los ejemplos de vectores incluyen aquéllos derivados del
SV40, retrovirus, virus del papiloma bovino, virus de la viruela
vacuna, otros herpesvirus y adenovirus.
Tales vectores de expresión en mamíferos
apropiados contienen un promotor para mediar la transcripción de
secuencias de ADN ajenas y, opcionalmente, un potenciador. Los
promotores apropiados son conocidos en la técnicas e incluyen
promotores virales tales como los procedentes del SV40, del
citomegalovirus (CMV), del virus del sarcoma de Rous (RSV), de
adenovirus (ADV), y del virus del papiloma bovino (BPV).
La presencia opcional de un potenciador,
combinado con el promotor descrito más arriba, típicamente
incrementará los niveles de expresión. Un potenciador es cualquier
secuencia de ADN reguladora que puede estimular la transcripción
hasta 1000 veces cuando se une a promotores endógenos o heterólogos,
iniciándose la síntesis en el sitio de inicio normal del mARN. Los
potenciadores son también activos cuando se colocan cadena arriba o
cadena abajo respecto del sitio de inicio de la transcripción, tanto
en orientación normal como invertida, o a una distancia de más de
1000 nucleótidos del promotor. Ver Maniatis, Science 236:1237
(1987), Alberts, Molecular Biology of the Cell, 2ª edición
(1989). Los potenciadores derivados de virus podrían ser
particularmente útiles, puesto que típicamente tienen un rango de
huéspedes más amplio. Los ejemplos incluyen el potenciador del gen
temprano del SV40 (ver Dijkema, EMBO J. 4:761 (1985), y los
potenciadores/promotores derivados de la repetición terminal larga
(LTR) del RSV (ver Gorman, Proc. Natl. Acad. Sci. 79:6777
(1982b)), y del citomegalovirus humano (ver Boshart, Cell
41:521 (1985)). Adicionalmente, algunos potenciadores son regulables
y devienen activos sólo en la presencia de un inductor, tal como una
hormona o ion metálico (ver Sassone-Corsi y Borelli,
Trends Genet. 2:215 (1986)); Maniatis, Science
236:1237 (1987). Además, el vector de expresión puede incluir, y
típicamente incluirá una secuencia de terminación y secuencias de
adición poli(A), las cuales están operativamente unidas a la
secuencia codificante de Toledo o Towne.
Las secuencias que causan la amplificación del
gen también podrían incluirse de forma deseable en el vector de
expresión, o en otro vector que es co-traducido con
el vector de expresión que contiene una secuencia de ADN de Toledo o
Towne, como lo son las secuencias que codifican marcadores
seleccionables. Los marcadores seleccionables para células de
mamíferos son conocidos en la técnica, e incluyen, por ejemplo, la
quinasa de timidina, la reductasa del dihidrofolato (junto con el
metotrexato como un amplificador de la DHFR), la fosfotransferasa de
aminoglicósido, la fosfotransferasa de la higromicina B, la
sintetasa de asparagina, la deaminasa de adenosina, la
metalotioneína, y genes de resistencia a antibióticos como la
neomicina.
El vector que codifica una proteína o polipéptido
nuevo de Toledo o Towne de esta invención puede usarse para la
transformación de una célula huésped de mamífero apropiada. La
transformación puede ser mediante cualquier procedimiento conocido
para introducir polinucleótidos en una célula huésped, incluyendo,
por ejemplo, el empaquetado del polinucleótido en un virus y la
transducción de un célula huésped con el virus. El procedimiento de
transformación usado depende del huésped a transformar. Los
procedimientos para la introducción de un polinucleótido heterólogo
en células de mamífero son conocidos en la técnica, e incluyen la
transfección mediada por dextrano, la precipitación con fosfato
cálcico. la transfección mediada con polibreno, la fusión de
protoplastos, la electroporación, la encapsulación de
polinucleótido(s) en liposomas, y la microinyección directa
del ADN en el núcleo.
Las líneas celulares disponibles como huéspedes
para la expresión son conocidas en la técnica e incluyen muchas
líneas celulares inmortalizadas disponibles de la American Type
Culture Collection (ATCC), incluyendo, pero no limitada a las
células ováricas de hámster chino (CHO), las células HeLa, las
células renales de cría de hámster (BHK), las células renales de
mono (COS), las células de carcinoma hepatocelular humano (por
ejemplo, las Hep G2), y un cierto número de otras líneas
celulares.
Los componentes de un sistema de expresión en
células de insecto incluyen un vector de transferencia, usualmente
un plásmido bacteriano, el cual contiene ambos, un fragmento del
genoma del baculovirus y un sitio de restricción apropiado para la
inserción del gen o genes heterólogos a expresar; un baculovirus del
tipo salvaje con una secuencia homóloga al fragmento específico de
baculovirus en el vector de transferencia (esto permite la
recombinación homóloga del gen heterólogo en el genoma del
baculovirus); y células huésped de insecto apropiadas y medio de
cultivo. Los ejemplos de vectores de transferencia para introducir
genes ajenos en células de insecto incluyen el pAc373 y el pVL985.
Ver Luckow y Summers, Virology 17:31 (1989).
El plásmido puede contener también la señal de
poliadenilación polihedrón, y un gen procariota de resistencia a la
ampicilina (amp) y un origen de replicación para la selección
y propagación en E. coli. Ver Miller, Ann. Rev.
Microbiol. 42:177 (1988).
Los vectores de transferencia para baculovirus
usualmente contienen un promotor de baculovirus, esto es, una
secuencia de ADN capaz de unir una polimerasa de ARN de baculovirus
e iniciar la transcripción cadena abajo (5' a 3') de una secuencia
codificante (por ejemplo, un gen estructural) en mARN. El promotor
tendrá una región de inicio de la transcripción, la cual está
usualmente ubicada en situación proximal al extremo 5' de la
secuencia codificante, y típicamente incluye un sitio de unión para
polimerasa de ARN y un sitio de inicio de la transcripción. Un
vector de transferencia para baculovirus también puede tener un
potenciador, el cual, si está presente, está habitualmente en
posición distal respecto el gene estructural. La expresión puede ser
regulada o constitutiva.
Un sistema de expresión en levadura puede incluir
típicamente uno o más de los siguientes: una secuencia promotora,
una secuencia acompañante de la fusión, una secuencia líder, una
secuencia de terminación de la transcripción. Un promotor de
levadura, capaz de unir la polimerasa de ARN de levadura e iniciar
la transcripción cadena abajo (3') de una secuencia codificante (por
ejemplo, un gen estructural) en mARN, tendrá una región de inicio de
la transcripción usualmente ubicada en posición proximal al extremo
5' de la secuencia codificante. Esta región de inicio de la
transcripción típicamente incluye un sitio de unión a la polimerasa
de ARN (una caja "TATA") y un sitio de inicio de la
transcripción. El promotor de levadura puede tener también una
secuencia activadora cadena arriba, usualmente en posición distal
respecto el gen estructural. La secuencia activadora permite la
expresión inducible de la secuencia de ADN heteróloga deseada. La
expresión constitutiva ocurren en ausencia de una secuencia
activadora. La expresión regulada puede ser tanto positiva como
negativa, potenciando o reduciendo de ese modo la transcripción.
Los promotores de levadura particularmente útiles
incluyen los de la deshidrogenasa de alcohol (ADH) (patente EP
publicada con el número 284.044), de la enolasa, de la glucoquinasa,
de la isomerasa de
glucosa-6-fosfato, de la
deshidrogenasa del
gliceraldehído-3-fosfato (GAP o
GAP-DH), de la hexoquinasa, de la
fosfofructoquinasa, de la mutasa de
3-fosfoglicerato, y de la quinasa de piruvato (PyK)
(patente EP publicada con el número 329.203). El gen PHO5 de
levadura, que codifica la fosfatasa ácida, proporciona también
secuencias promotoras útiles. Ver Myanohara, Proc. Natl. Acad.
Sci. 80:1 (1983).
Una secuencia de Toledo o Towne, un análogo o
fragmento activo de la misma, puede expresarse intracelularmente en
levadura. Una secuencia promotora puede unirse directamente con la
secuencia o fragmento, en cuyo caso el primer aminoácido en el
extremo N-terminal de la proteína recombinante será
siempre una metionina, la cual está codificada por el codón de
inicio ATG. Si se desea, la metionina en el extremo
N-terminal puede cortarse de la proteína mediante
incubación in vitro con bromuro de cianógeno.
Las proteínas de fusión expresadas
intracelularmente proporcionan una alternativa a la expresión
directa de una secuencia. Típicamente, una secuencia de ADN que
codifica la porción N-terminal de una proteína
estable, un acompañante de fusión, se fusiona al extremo 5' del ADN
heterólogo que codifica el polipéptido deseado. A partir de su
expresión, esta construcción proporciona una fusión de las dos
secuencias de aminoácidos. Por ejemplo, el gen de la superóxido
dismutasa (SOD) humana o de levadura puede unirse al extremo 5' de
una secuencia y expresarse en levadura. La secuencia de ADN en la
unión de las dos secuencias de aminoácidos podría codificar o no un
sitio suprimible. Ver, por ejemplo, la patente EP con nº de
publicación 196.056. Alternativamente, los polipéptidos pueden
secretarse también, a partir de la célula hacia el medio de cultivo,
mediante la creación de una proteína de fusión que formada por un
fragmento de secuencia líder que proporciona la secreción del
polipéptido en levaduras o bacterias. Preferiblemente, hay sitios de
procesado codificados entre el fragmento líder y la secuencia que
pueden cortarse in vivo o in vitro. El fragmento de
secuencia líder típicamente codifica un péptido señal formado por
aminoácidos hidrofóbicos, el cual dirige la secreción de la proteína
a partir de la célula. El ADN codificando secuencias señalizadoras
apropiadas puede derivarse a partir de genes de proteínas de
levadura secretadas, tales como el gen de la invertasa de levadura
(patente EP con nº de publicación 12.873) y el gen del
factor-A (patente estadounidense nº 4.588.684).
Alternativamente, pueden usarse líderes no originarios de levaduras,
tales como el líder del interferón, para proporcionan la secreción
en levadura (patente EP con nº de publicación 60.057). Las
secuencias de terminación de la transcripción reconocidas por la
levadura son regiones reguladoras ubicadas 3' respecto el codón de
detención de la traducción. Éstas, junto con el promotor, flanquean
la secuencia codificante heteróloga deseadas. Estas secuencias
flanqueantes dirigen la transcripción de un mARN, el cual puede
traducirse en el polipéptido codificado por el ADN.
Típicamente, los componentes descritos más
arriba, que comprenden una secuencia promotora, líder (si se desea)
y codificante de interés, y una secuencia de terminación de las
transcripción, se colocan juntos en plásmidos capaces de mantenerse
estables en un huésped tal como levadura o bacteria. El plásmido
puede tener dos sistemas de replicación, de forma que puede
mantenerse como un vector lanzadera, por ejemplo, en levadura para
la expresión y en un huésped procariota para su clonación y
amplificación. Los ejemplos de tales vectores lanzadera
levadura-bacteria incluyen el YEp24 (ver Botstein,
Gene 8:17-24 (1979)), pCI/I (ver Brake,
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:4642-4646
(1984)), y YRp17 (ver Stinchcomb, J. Mol. Biol. 158:157
(1982)). Además, el plásmido puede ser tanto un plásmido con un
número elevado o bajo de copias. Un plásmido con un número elevado
de copias generalmente tendrá un número de copias que oscilará desde
aproximadamente 5 hasta aproximadamente 200, y típicamente desde
aproximadamente 10 hasta aproximadamente 150. Un huésped que
contenga un plásmido con un número elevado de copias tendrá
preferiblemente al menos aproximadamente 10, y más preferiblemente
al menos aproximadamente 20. Podría seleccionarse tanto un vector
con un número elevado o bajo de copias, dependiendo del efecto del
vector sobre el huésped y de los polipéptidos. Ver, por ejemplo,
Brake et al., ver más arriba.
Alternativamente, las construcciones de expresión
pueden integrarse en el genoma de levadura con un vector de
integración. Los vectores de integración típicamente contienen al
menos una secuencia homóloga a un cromosoma de levadura, la cual
permite la integración del vector, y preferiblemente contiene dos
secuencias homólogas flanqueando la construcción de expresión. Ver
Orr-Weaver, Methods in Enzymology
101:228-245 (1983) y Rine, Proc. Natl. Acad. Sci.
USA 80:6750 (1983).
Típicamente, los vectores extracromosómicos y de
integración pueden contener marcadores seleccionables parar permitir
la selección de cepas de levadura que hayan sido transformadas. Los
marcadores seleccionable pueden incluir genes biosintéticos que
pueden expresarse en la levadura huésped, tales como ADE2, HIS4,
LEU2, TRP1, y ALG7, y el gen de la resistencia G418, los cuales
confieren a las células de levadura resistencia respectivamente
contra la tunicamicina y el G418. Además, un marcador seleccionable
apropiado puede proporcionar también levaduras con la capacidad de
crecer en presencia de compuestos tóxicos, tales como metales. Por
ejemplo, la presencia de CUP1 permite a las levaduras crecer
en presencia de iones de cobre. Ver Butt, Microbiol. Rev.
51:351 (1987).
Alternativamente, algunos de los componentes
descritos más arriba pueden disponerse juntos en vectores de
transformación. Los vectores de transformación están formados
típicamente por un marcador seleccionable, que o se mantiene en un
replicón o se desarrolla en un vector de integración, tal como se ha
descrito más arriba. Se han desarrollado muchos vectores de
expresión y transformación, o extracromosómicos o integrantes, para
la transformación en muchas levaduras. Los ejemplos de líneas de
levaduras son Candida albicans (Kurtz, Mol. Cell.
Biol. 6:142 (1986)), Candida maltosa (Kunze, J. Basic
Microbiol. 25:141 (1985)), Hansenula polymorpha (Gleeson,
J. Gen. Microbiol. 132:3459 (1986) y Roggenkamp, Mol. Gen.
Genet. 202:302 (1986)), Kluyveromyces fragilis (Das,
J. Bacteriol. 158:1165 (1984)), Kluyveromyces lactis
(De Louvencourt, J. Bacteriol. 154:737 (1983) y Van den Berg,
Bio/Technology 8:135 (1990), Saccharomyces cerevisiae
(Hinnen, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 75:1929 (1978) e Ito,
J. Bacteriol. 153:163 (1983)), Schizosaccharomyces
pombe (Beach and Nurse, Nature 300:706 (1981)), y
Yarrowia lipolytica (Davidow, Curr. Genet.
10:380-471 (1985) y Gaillardin, Curr. Genet.
10:49 (1985)).
Los procedimientos para introducir ADN exógeno en
huéspedes de levadura son bien conocidos en la técnica, e incluyen
típicamente, o la transformación de esferoplastos o de células de
levadura intactas tratadas con cationes alcalinos. Los
procedimientos de transformación usualmente varían con las especies
de levaduras a transformar. Consultar las publicaciones listadas en
el parágrafo anterior para técnicas de transformación
apropiadas.
Adicionalmente, el gen o fragmento del mismo
puede expresarse en un sistema bacteriano. En tal sistema, un
promotor bacteriano es cualquier secuencia de ADN capaz de unir la
polimerasa de ARN bacteriana e iniciar la transcripción cadena abajo
(3') de una secuencia codificante (por ejemplo, un gen heterólogo
deseado) en mARN. Un promotor tendrá una región de inicio de la
transcripción que está usualmente ubicada de forma proximal respecto
el extremo 5' de la secuencia codificante. Esta región de inicio de
la transcripción típicamente incluye un sitio de unión a la
polimerasa de mARN y un sitio de inicio de la transcripción. Un
promotor bacteriano puede tener también un segundo dominio
denominado un operador, el cual puede solapar un sitio de unión de
polimerasa de mARN adyacente en el cual se inicia la síntesis del
ARN. El operador permite una transcripción regulada negativamente
(inducible), ya que una proteína represora del gen puede unirse al
operador e inhibir de ese modo la transcripción de un gen
específico. La expresión constitutiva puede ocurrir en ausencia de
elementos reguladores negativos, tales como el operador. Además, la
regulación positiva puede conseguirse mediante una secuencia unidora
de proteína activadora de genes, las cual, si está presente, está
habitualmente en situación proximal (5') respecto la secuencia de
unión de la polimerasa de ARN. Un ejemplo de proteína activadora de
genes es la proteína activadora catabólica (CAP), la cual ayuda a
que se inicie la transcripción del operón lac en Escherichia
coli (E. coli). Ver Raibaud, Ann. Rev. Genet.
18:173 (1984). Por tanto, la expresión regulada puede ser positiva o
negativa, potenciando o reduciendo de ese modo la transcripción.
Las secuencias que codifican enzimas de vías
metabólicas proporcionan secuencias promotoras particularmente
útiles. Los ejemplos incluyen las secuencias promotoras derivadas de
enzimas que metabolizan azúcares, tales como la galactosa, lactosa
(lac) (ver Chang, Nature 198:1056 (1977)), y maltosa.
Los ejemplos adicionales incluyen secuencias promotoras derivadas de
enzimas biosintéticos tales como el triptófano (trp) (ver
Goeddel, Nuc. Acids Res. 8:4057 (1981), Yelverton, Nuc.
Acids Res. 9:731 (1981), patente estadounidense nº 4.738.921 y
patente EP con nº de publicación 36.776 y 121.775). El sistema
promotor de la lactomasa (bla) (ver Weissmann, Interferon
3 (ed. I. Gresser), el sistema del promotor PL del bacteriófago
lambda (ver Shimatake, Nature 292:128 (1981), y el sistema
promotor del T5 (patente estadounidense nº 4.689.406) también
proporcionan secuencias promotoras útiles.
Además, los promotores sintéticos que no ocurren
en la naturaleza también funcionan como promotores bacterianos. Por
ejemplo, las secuencias de activación de la transcripción de un
promotor bacteriano o de bacteriófago pueden unirse con las
secuencias operón de otro promotor bacteriano o de bacteriófago,
creando un promotor híbrido sintético tal como el promotor
tac (ver patente estadounidense nº 4.551.433, Amann,
Gene 25:167 (1983) y de Boer, Proc. Natl. Acad. Sci.
80:21 (1983)). Un promotor bacteriano puede incluir promotores que
ocurren de forma natural de origen no bacteriano que tienen la
capacidad de unir la polimerasa de ARN bacteriana e iniciar la
transcripción. Un promotor que ocurre de forma natural y que no es
de origen bacteriano puede unirse con una polimerasa de ARN
compatible para producir niveles elevados de expresión de algunos
genes en procariotas. El sistema promotor/polimerasa de ARN del
bacteriófago T7 es un ejemplo (ver Studier, J. Mol. Biol.
189:113 (1986) y Tabor, Proc. Natl. Acad. Sci. 82:1074
(1985)).
Además de una secuencia promotora funcional, un
sitio de unión a ribosomas eficiente también es útil para la
expresión de la secuencia de ADN, o de un fragmento de la misma, en
procariotas. En E. coli, el sitio de unión de ribosomas se
denomina secuencia Shine-Dalgarno (SD) e incluye un
codón de inicio (ATG) y una secuencia de 3-9
nucleótidos de longitud ubicada 3-11 nucleótidos
cadena arriba respecto el codón de inicio (ver Shine, Nature
254:34 (1975)). Se cree que la secuencia SD promueve la unión del
mARN al ribosoma emparejando las bases entre la secuencia SD y el
extremo 3' del rRNA de 16S de E coli (ver Steitz,
Biological Regulation and Development: Gene Expression, ed.
R. F. Goldberger, 1979).
Las nuevas proteínas de Toledo o Towne de la
expresión pueden expresarse intracelularmente. Una secuencia
promotora puede unirse directamente a una secuencia nueva de Toledo
o Towne, a un análogo o fragmento de la misma, en cuyo caso el
primer aminoácido en el extremo N-terminal será una
metionina, la cual está codificada por el codón de inicio ATG. Si se
desea, la metionina en el extremo N-terminal puede
separarse de la proteína mediante incubación in vitro con
bromuro de cianógeno, o mediante incubación in vivo o in
vitro con una peptidasa bacteriana de metionina
N-terminal. Ver la patente EP con nº de publicación
219.237.
Las proteínas de fusión proporcionan una
alternativa a la expresión directa. Típicamente, una secuencia de
ADN que codifica la porción N-terminal de una
proteína bacteriana endógena, u otra proteína estable, se fusiona al
extremo 5' de secuencias codificantes heterólogas. Esta
construcción, a partir de su expresión, proporcionará una fusión de
las dos secuencias de aminoácidos. Por ejemplo, el gen de la célula
del bacteriófago lambda puede unirse al extremo 5' de un fragmento
de secuencia de la misma, y expresarse en bacteria. La proteína de
fusión resultante preferiblemente retiene un sitio para que un
enzima procesador (factor Xa) separe la proteína del bacteriófago de
la secuencia o fragmento de la misma (ver Nagai, Nature
309:810 (1984)). Una proteína de fusión también puede prepararse con
secuencias procedentes del gen lacZ (Jia, Gene 60:197
(1987)), del gen trpE (Allen, J. Biotechnol. 5:93
(1987)) y Makoff, J. Gen. Microbiol. 135:11 (1989), y del gen
Chey (patente EP con nº de publicación 324.647). La secuencia
de ADN en la unión de las dos secuencias de aminoácidos podría
codificar o no un sitio suprimible. Otro ejemplo es una proteína de
fusión de ubiquitina (por ejemplo, una proteasa de procesamiento
específica para ubiquitina) para separar la ubiquitina del
polipéptido. A través de este procedimiento, pueden aislarse
polipéptidos maduros de Toledo o Towne. Ver Miller,
Bio/Technology 7:698 (1989).
Alternativamente, las proteínas o polipéptidos
pueden secretarse también a partir de la células mediante la
creación de moléculas de ADN quiméricas que codifican una proteína
de fusión que comprende un fragmento de una secuencia de un péptido
señal para la secreción de las proteínas o polipéptidos en
bacterias. (Ver, por ejemplo, la patente estadounidense nº
4.336.336). El fragmento de la secuencia señal típicamente codifica
un péptido señal formado por aminoácidos hidrofóbicos que dirigen la
secreción de la proteína a partir de la célula. La proteína o se
secreta hacia el medio de cultivo (bacterias
gram-positivas) o hacia el espacio periplasmático,
ubicado entre las membranas interna y externa de la célula
(bacterias gram-negativas). Preferiblemente hay
sitios de procesamiento, los cuales pueden cortarse bien in
vivo o in vitro, codificados entre el fragmento del
péptido señal y la proteína o polipéptido.
El ADN que codifica secuencias señal apropiadas
puede derivarse a partir de genes de proteínas bacterianas
secretadas, tales como el gen de la proteína de membrana externa de
E. coli (ompA) (Masui, Experimental Manipulation of
Gene Expression (1983) y Ghrayeb, EMBO J. 3:2437 (1984)),
y la secuencia señal de la fosfatasa alcalina de E. coli
(phoA) (ver Oka, Proc. Natl. Acad. Sci. 82:7212
(1985)). La secuencia señal del gen de la
alfa-amilasa procedente de varias cepas de
Bacilus puede usarse para secretar proteínas heterólogas a
partir de B. subtilis (ver Palva, Proc. Natl. Acad.
Sci. 79:5582 (1982) y la patente EP con nº de publicación
244.042).
Las secuencias de terminación de la transcripción
reconocidas por bacterias son regiones reguladoras ubicadas 3'
respecto el codón de paro de la traducción. Flanquean, junto con el
promotor, la secuencia codificante. Estas secuencias dirigen la
transcripción de un mARN, el cual puede traducirse en la proteína o
polipéptido de Toledo o Towne codificado por la secuencia de ADN.
Las secuencias de terminación de la transcripción frecuentemente
incluyen secuencias de ADN de aproximadamente 50 nucleótidos,
capaces de formar estructuras con forma de bucle de tronco que
ayudan a finalizar la transcripción. Los ejemplos incluyen las
secuencias de terminación de la transcripción derivadas de genes con
promotores fuertes, tales como el gen trp en E. coli,
así como otros genes biosintéticos.
Típicamente, el promotor, la secuencia
señalizadora (si se desea), la secuencia codificante de interés, y
la secuencia de terminación de la transcripción se mantienen en un
elemento extracromosómico (por ejemplo, un plásmido) capaz de
mantenerse estable en el huésped bacteriano. El plásmido tendrá un
sistema de replicación, permitiendo por tanto que se mantenga en el
huésped bacteriano tanto para su expresión o para su clonación y
amplificación. Además, el plásmido puede ser un plásmido con un
número elevado o bajo de copias. Un plásmido con un número elevado
de copias tendrá generalmente un número de copias que oscilará desde
aproximadamente 5 hasta aproximadamente 200, y típicamente desde
aproximadamente 10 hasta aproximadamente 150. Un huésped que
contenga un plásmido con un número elevado de copias contendrá
preferiblemente al menos aproximadamente 10, y más preferiblemente
al menos aproximadamente 20 plásmidos.
Alternativamente, las construcciones de expresión
pueden integrarse en el genoma bacteriano con un vector de
integración. Los vectores de integración contienen típicamente al
menos una secuencia homóloga con el cromosoma bacteriano, la cual
permite que se integre el vector. La integración parece resultar de
recombinaciones entre ADN homólogos en el vector y el cromosoma
bacteriano. Ver, por ejemplo, la patente EP con nº de publicación
127.328.
Típicamente, las construcciones de expresión
extracromosómicas e integradoras pueden contener marcadores
seleccionables para permitir la selección de cepas bacterianas que
hayan sido transformadas. Los marcadores seleccionables pueden
expresarse en el huésped bacteriano y pueden incluir genes que hacen
a la bacteria resistente a drogas tales como la ampicilina, el
cloramfenicol, al eritromicina, la kanamicina (neomicina) y la
tetraciclina (ver Davies, Ann. Rev. Microbiol. 32:469
(1978)). Los marcadores seleccionables pueden incluir también genes
biosintéticos, tales como los de las vías biosintéticas de la
histidina, triptófano y leucina.
Alternativamente, algunos de los componentes
descritos más arriba pueden disponerse juntos en vectores de
transformación. Los vectores de transformación están típicamente
formados por un marcador seleccionable, el cual se mantiene bien en
un vector extracromosómico, bien en un vector que se integra, tal
como se ha descrito más arriba.
Se han desarrollado vectores de expresión y
transformación, bien extracromosómicos o integradores, para la
transformación en muchas bacterias. Son ejemplos los vectores de
expresión descubiertos en Palva, Proc. Natl. Acad. Sci.
79:5582 (1982), las patentes EP con nº de publicación 036.259 y
063.953, y la publicación de patente PCT WO84/04.541 (para B
subtilis); en Shimatake, Nature 292:128 (1981), Amann,
Gene 40:183 (1985), Studier, J. Mol. Biol. 189:113
(1986), y las patentes EP con nº de publicación 036.776, 136.829 y
136.907 (para E. coli); en Powell, Appl. Environ.
Microbiol. 54:655 (1988) y en la patente estadounidense nº
4.745.056 (para Streptococcus).
Los procedimientos para introducir ADN exógeno en
huéspedes bacterianos son bien conocidos en la técnica, y
típicamente incluyen la transformación de bacterias tratadas con
CaCl_{2} u otros agentes, tales como cationes divalentes y DMSO.
En ADN puede introducirse también en células bacterianas mediante
electroporación. Las metodologías de ejemplo pueden hallarse en
Masson, FEMS Microbiol. Let. 60:273 (1989), Palva, Proc.
Natl. Acad. Sci. 79:5582 (1982), las patentes EP con nº de
publicación 036.259 y 063.953, y la patente PCT publicada como
WO-84/05.541 para la transformación de
Bacillis. Para la transformación de campylobacter
consultar, por ejemplo, Miller, Proc. Natl. Acad. Sci. 85:856
(1988) y Wang, J. Bacteriol. 172:949 (1990). Para E.
coli consultar, por ejemplo, Cohen, Proc. Natl. Acad.
Sci. 69:2110 (1973), Dower, Nuc. Acids. Res. 16:6127
(1988); Kushner, Genetic Engineering: Proceedings of the
International Symposium on Genetic Engineering (Eds. H. W. Boyer
y S. Nicosia); Mandel, J. Mol. Biol. 53:159 (1970) y Taketo,
Biochem. Biophys. Acta 949:318 (1988). Para
Lactobacillus y Pseudomonas consultar, por ejemplo,
Chassy, FEMS Microbiol. Let. 44:173 (1987) y Fiedler,
Anal. Biochem. 170:38 (1988), respectivamente. Para
Streptococcus consultar, por ejemplo, Augustin, FEMS
Microbiol. Let. 66:203 (1990); Barany, J. Bacteriol.
144:698 (1980); Harlander, Streptococcal Genetics (Eds. J.
Ferretti y R. Curtiss III) (1987); Perry, Infec. Immun.
32:1295 (1981); Powell, Appl. Environ. Microbiol. 54:655
(1988) y Somkuti, Proc. 4th Evr. Cong. Biotechology 1:412
(1987).
La presente invención se ilustra mediante los
ejemplos siguientes.
Las cepas AD169, Towne y Toledo del CMV humano se
obtuvieron de E. S. Mocarski (Stanford University) y se usaron en
todos los experimentos. Dos de estas cepas estaban también
disponibles a través de la ATCC, nº de acceso VR-538
(AD169) y VR-977 (Towne). Los virus se cultivaron
en células de fibroblastos de prepucio humano (HF) con medio de
Dulbecco modificado por Eagle (DME) (JRH Biosciences, Lenexa, KS)
tal como se ha descrito previamente en Spaete y Mocarski, J.
Virol. 56:135-143 (1985), pero suplementado con
un 10% de suero fetal bovino (FCS) (JRH Biosciences, Lenexa, KS),
L-glutamina (2 mM), penicilina (100 unidades/ml),
estreptomicina (0,1 mg/ml), y piruvato (1 mM). Para preparar los ADN
de las cepas AD169, Towne y Toledo de CMV mediante centrifugación
hasta el equilibrio en gradiente de NaI, tal como se habían descrito
previamente Spaete y Mocarski, J. Virol.
54:817-824 (1985), se infectaron botellas rotatorias
con las cepas de CMV a una multiplicidad de infección (MOI) de 0,001
unidades formadoras de calvas (pfu)/célula para minimizar la
producción de partículas de virus defectuosas. Las células
infectadas se alimentaron de nuevo con medio a los cuatro días
después de la infección. A los ocho días después de la infección,
cuando la monocapa estaba bien infectada, se rasparon las células en
tubos cónicos de 50 ml, en 10 ml de medio por botella rotatoria, y
se apelotonaron a 1000 revoluciones por minuto (r.p.m.) durante 10
minutos. Los precipitados se resuspendieron en 2,0 ml de Tris 0,01 M
y EDTA 0,01 (TE) (pH 7,4) con un 1% de NP40, un 1% de
deoxicolato, y se incubaron sobre hielo hasta que todos los núcleos
celulares estaban lisados cuando se observaban al microscopio. Los
lisados se transfirieron a tubos 2059 (Falcon) y se centrifugaron a
2600 r.p.m. durante 5 minutos a 4ºC. Los sobrenadantes se
transfirieron a otros tubos 2059, y se añadió RNAsa
(Worthington-libre de ADNasa) a 50 \mug/ml,
seguida inmediatamente por Proteinasa K (200 \mug/ml) y
sodiododecilsulfato (SDS). Los sobrenadantes se incubaron en un baño
de agua a 65ºC durante 60 minutos, se llevaron hasta 16 ml con TE,
pH 7,4, se añadieron a 24 ml de NaI saturado y 0,15 ml de
bromuro de etidio (5 mg/ml). Se centrifugaron las muestras hasta su
equilibrio a 55.000 r.p.m., a 20ºC, durante 24 horas, en un rotor
Beckman Ti70. Las fracciones que contenían el ADN viral se
extrajeron con butanol equilibrado con TE con agitación suave,
seguida por centrifugación a 3000 r.p.m. durante 10 minutos a 20ºC,
y se extrajeron aún más de 2 a 3 veces con butanol para reducir el
volumen. Las muestras se extrajeron con un volumen igual de alcohol
isoamílico equilibrado con TE, se agitaron, y se extrajeron de
nuevo. El ADN se dializó respecto tres cambios de TE con 1% de fenol
y NaCl 1 M. Se leyeron la OD_{260} y la OD_{280} para determinar
la pureza del ADN de AD160, Toledo y Towne.
Los aislados clínicos se obtuvieron de M. Fiala
(Rancho Mirage, CA) y S. Choyu (Oregon Health Sciences University).
El aislamiento rápido del ADN viral de células infectadas por el
HCMV se realizó tal como ha sido previamente descrito en Spaete y
Frenkel, Cell 30:295-304 (1982), excepto que
el ADN no se marcó radiactivamente antes de su purificación. En
resumen, las monocapas de células infectadas (frascos de 25
cm^{2}) se lavaron dos veces con solución salina tamponada con
fosfato (PBS), y se lisaron en 1,0 ml de una solución 0,1 M de NaCl,
TE, pH 8,0, SDS al 0,05%, y 0,1 mg/ml de Proteinasa K. Los
lisados de incubaron 2-24 horas a 37ºC, se
extrajeron dos veces con 1 volumen de fenol, 1 volumen de
cloroformo, seguidos por centrifugación a 2500 r.p.m. durante 5
minutos para separar las fases. La fase acuosa se extrajo dos veces
con 1 volumen de éter y el ADN se precipitó con 0,1 volúmenes de
NaAC 4 M y dos volúmenes de etanol o isopropanol. Se congeló el ADN,
se recolectó mediante centrifugación o enrollado sobre una vara de
vidrio, se secó y se resuspendió en TE.
Los plásmidos pXbal E, pXbal T y pXbal Q (Thomsen
y Stinski, 1981), representando las unidades 0,69 a 0,8 del mapa de
la cepa Towne, se obtuvieron de M. Stinski (University of Iowa).
El clon 65 se derivó mediante clonación de un
fragmento de ADN de Toledo, digerido con BamHI y extraído en
gel, en el sitio BamHI del plásmido pGEM®-3Zf+ (Promega,
Madison, WI). En resumen, cinco \mug de ADN de Toledo se
digirieron con 40 unidades de BamHI y se electroforesaron en
un gel preparativo de agarosa de bajo punto de fusión, al 1%, a 490
voltios hora, en tampón TAE 1x. El ADN de Toledo que migraba a cerca
de 5 pares de kilobases (kpb) se cortó, y se digirió la agarosa con
2 unidades de \beta-agarasa I (New England
BioLabs, Beverly, MA). Este fragmento de ADN se precipitó con 2
volúmenes de isopropanol, se congeló a -20ºC, se centrifugó en una
centrífuga Eppendorf durante 15 minutos, se secó y resuspendió en 50
\mul de TE. El fragmento extraído del gel se ligó a pGEM®-3Zf+
digerido con BamHI usando la ligasa de ADN de T4 (New England
BioLabs, Berverly, MA), y una alícuota de la mezcla de ligación se
usó para transformar Escherichia coli XL-1
Blues competente (Stratagene, La Jolla, CA) mediante el
procedimiento de choque con calcio (Mandel y Riga, 1970), o mediante
electroporación usando procedimientos como el escrito en la Pulse
Controller Guide publicada por BioRad (Richmond, CA).
El Cósmido 1 es fragmento de ADN de Toledo de
aproximadamente 53 kbp, digerido parcialmente con HindIII,
que abarca 0,69 a 0,87 unidades de mapa clonadas en el cósmido pHC79
(Hohn y Collins, 1980) obtenido de E. S. Mocarski (Stanford
University). Los siguientes se subclonaron a partir del Cósmido
1:
- Los clones 4 y C1300 se derivaron mediante clonación de fragmentos digeridos con BamHI procedentes del Cósmido 1 en un vector plasmídico Bluescript M13+. Como tales, estos clones representan secuencia de ADN de Toledo que abarca porciones del Cósmido 1.
- El clon C23K se derivó como un fragmento completo del ADN del Cósmido 1, digerido con BamHI y circularizado mediante ligación.
El ADN plasmídico o viral se marcó
radiactivamente in vitro mediante traducción con muescas
(Rigby et al., 1977) con un equipo (Boehringer Mannheim), y
usando [\alpha^{32}P]dCTP (Amersham Corp.). Las
hibridaciones a ADN de CMV inmovilizado se realizaron esencialmente
como describieron Spaete y Mocarski, J. Virol.
54:817-824 (1985), pero a 68ºC en una solución de 6x
SSC (1x SSC es NaCl 0,15, más citrato sódico 0,015 M), 0,2% de
polivinilpirrolidona, 0,2% de Ficoll, 0,2% de albúmina de suero
bovino, y 0,1% de sodiododecilsulfato, con la cantidad de ADN de
esperma de salmón cambiada de 25 \mug/ml a 100 \mug/ml, y
reduciéndose el 30% de formamida al 15%.
El ADN se transfirió a membranas de transferencia
de nilón Hybond-N+ (Amersham Corp.), después de su
digestión con enzima de restricción y electroforesis en geles de
agarosa al 1%, mediante técnicas estándares (Maniatis et al.,
1982). El ADN se entrecruzó con la membrana con 120.000
microjoules/cm^{2} de irradiación UV, usando un UV Crosslinker
1000 (Hoefer Scientific Instruments, San Francisco, CA). Las
membranas de pre-hibridaron durante 1 hora a 68ºC en
una solución A (6x SSC, 0,2% de polivinilpirrolidona, 0,2% de
Ficoll, 0,2% de albúmina de suero bovino, 0,1% de
sodiododecilsulfato, 100 \mug/ml de ADN de esperma de salmón, y
15% de formamida); a continuación, la sonda marcada con
[\alpha^{32}P] y traducida con muescas, en una solución que
contenía 100 \mug/ml de ADN de esperma de salmón, se desnaturalizó
hirviéndola durante cinco minutos, se enfrió rápidamente sobre
hielo, se añadió a la membrana y se dejó hibridar durante la noche a
68ºC. Después de la hibridación, la sonda sin templar se retiró
lavando la membrana con 3x de 2x SSC, seguida por reincubación en
solución A que carecía de ADN de esperma de salmón, a 68ºC, durante
15 minutos. El procedimiento de lavado se repitió, se lavó la
transferencia en un gran volumen de 2xSSC a temperatura ambiente, se
secó la membrana con aire y se autoradiografió usando película Kodak
X-AR.
Todas las secuencias de ácido nucleico se
determinaron mediante el procedimiento de terminación de la cadena
con dideoxinucleótido (Sanger et al., 1977). Se prepararon
una variedad de plantillas para secuenciar; éstas incluían ADN de
fago de hebra única, ADN de cósmido y plásmido de doble hebra, ADN
genómico viral, y productos de la PCR. Se emplearon la secuenciación
manual y automática (con un instrumento ABI 373A). Se usaron ambos,
protocolos de un ciclo y de múltiples ciclos. La secuencia se
determinó para ambas hebras. Las regiones ambiguas se corrigieron
mediante secuenciación adicional después de corregir las pruebas.
Los cebadores usados para la secuenciación se sintetizaron en un
instrumento ABI 392 (Applied Biosystems). Los análisis de
contig y de la secuencia se realizaron usando MacDANSIS
(Hitachi). Las búsquedas de homología se realizaron usando el
programa BLAST a través de los servicios NCBI.
Para determinar la representación cruzada de las
secuencias de ADN en las cepas Towne y Toledo de CMV, el ADN viral
procedente de cada cepa se digirió hasta su conclusión con
XbaI, ClaI, BamHI, BgIHI, EcoRI,
y HindIII. Después de su electroforesis a través de un gel
de agarosa al 1%, los ADN de CMV se desnaturalizaron en NaCl 0,2
M/NaOH 0,6 M, se neutralizaron en NaCl 0,6 M/Tris 1 M, pH
7,5, in situ, y el gel se sumergió en 20x SSC durante 30
minutos. Se prepararon transferencias en estéreo colocando membranas
de nilón Hybond-N+ de igual tamaño (Amerham Corp.)
sobre cada cara del gel, y transfiriendo los ADN a las membranas en
ambas direcciones usando la acción capilar de toallitas de papel.
Después de transferir durante la noche en 20x SSC, se lavaron las
membranas en 2x SSC, y los ADN se inmovilizaron sobre las membranas
mediante irradiación con UV tal como se ha descrito más arriba.
Se prepararon sondas de ADN con ADN de Toledo y
Towne con un promedio de 500 p.b. sonicando 10 \mug de cada ADN en
un tubo 2063 (Falcon Plastics), usando 4 pulsos de 10 segundos cada
uno, a un ajuste de 3 en un sonicador de Heat Systems Inc.
(Farmingdale, NY). A continuación de la sonicación, los ADN virales
se digirieron con los enzimas de restricción AvaI,
BanI y BfaI, para reducir aún más la complejidad de
tamaño de la sonda de ADN. Se escogieron estos enzimas porque una
búsqueda de las secuencias de ADN de AD169 en las bases de datos
(EMBL, número de acceso X17403), reveló abundante sitios de corte
(326, 386 y 341, respectivamente); sus tampones de digestión con
enzimas de restricción son compatibles; y sus sitios no se solapan.
Los geles teñidos con bromuro de etidio de los ADN virales
trasquilados preparados de este modo, revelaron un rango de tamaños
de ADN desde 1300 p.b. hasta menos de 100 p.b., con la mayoría de
ADN migrando a aproximadamente 300 p.b., tal como se juzgó mediante
migración simultánea con un marcador estándar de ADN de
\varnothingX174 digerido con HaeIII (New England BioLabs,
Beverly, MA). El ADN de la sonda trasquilada de Towne y Toledo se
tradujo a continuación con muescas usando
[\alpha^{32}P]dCTP (Amersham Corp.), tal como se ha
descrito más arriba, y cada sonda se aplicó a transferencias estéreo
de ADN de Towne y Toledo inmovilizado, y digerido con enzimas de
restricción. Después de su hibridación y autoradiografía, se
analizaron los patrones de hibridación para determinar los
fragmentos en cada perfil de ADN que no se habían hibridado con la
sonda de la cepa heteróloga, pero que sí se hibridaban con la sonda
de la cepa homóloga. Por ejemplo, la pérdida de una señal para un
banda prominente de 5 p.k.b. en el digerido con BamHI del ADN
de Toledo, cuando se usaba la sonda de Towne, la cual estaba
presente cuando se usaba el ADN de Toledo para verificarse a sí
mismo, revelaron una región de divergencia de secuencia entre los
dos aislados (ver la Figura 3).
Este fragmento de 5 p.k.b. se clonó mediante
extracción del gel, tal como se ha descrito más arriba, y se
denominó clon 65. El ADN de Toledo del clon 65 se secuenció en su
totalidad y se comparó con la secuencia de ADN de Towne generada a
partir del clon pXbal T, el cual mostraba que era divergente de las
secuencias de ADN de AD169 (ver Ejemplo 2, más adelante). La
secuencia completa del clon 65 se muestra en la Figura 1. En la
Figura 1, el clon 65 empieza con el nucleótido 4664 y termina con el
nucleótido 9327. Sorprendentemente, el ADN procedente del clon pXbal
T del ADN de Towne (1856 p.b.) y el clon 65 del ADN de Toledo (4668
p.b.) compartían 104 p.b. de identidad de secuencia. Este pequeño
trozo de homología de secuencia permitió el mapado de la región de
divergencia del ADN de Toledo hasta la frontera del componente Único
Largo (U_{L}), y las repeticiones invertidas (denominadas
alternativamente IRL o secuencias b') en los mapas de ADN de
AD169 y Towne. Estas secuencias recién aisladas de nucleótidos de la
cepa Toledo procedentes del clon 65 no estaban representadas en la
cepa de laboratorio de referencia, AD169, la cual había sido
secuenciada en su totalidad por Chee y colegas (EMBL, nº de acceso
X17403).
Se ha hallado heterogeneidad de secuencia de ADN
entre la cepa Towne y la cepa AD169. Ver, Pritchett, J.
Virology 36:152-161 (1980). No obstante, aunque
la organización estructural general del genoma del CMV ha sido
determinada, y los polimorfismos de sitios de restricción entre
cepas han sido mapados para muchas cepas, las diferencias entre
cepas a nivel de nucleótido no han sido determinadas. La cepa de
laboratorio AD169 fue el primer aislado de CMV que se secuenció y ha
servido como cepa de referencia para definir la complejidad genética
del genoma del CMV.
Con objeto de examinar las diferencias de
secuencia de nucleótidos entre la Towne y la AD169, nos concentramos
en la región que se había mostrado era divergente en la cepa Toledo,
es decir, la frontera entre el componente U_{L} y las secuencias
b', tal como se ha explicado con detalle en el EJEMPLO 1. El
plásmido pXbal T se marcó usando el equipo de detección NEBlot™
Phototope™ (New England BioLabs, Beverly, MA), y se usó como una
sonda en transferencias de ADN de AD169, Toledo y Towne digerido con
enzimas de restricción e inmovilizado. En resume, el pXbal T se
linealizó con PvuII, se precipitó con etanol y se resuspendió
en 34 \mul de agua libre de nucleasas. El plásmido se
desnaturalizó en agua hirviendo durante cinco minutos, se enfrió
rápidamente sobre hielo durante cinco minutos, y se centrifugó
brevemente a 4ºC. Los siguientes reactivos se añadieron a un tubo en
el orden indicado: 10 \mul de 5x mezcla de marcaje, 5 \mul de
mezcla de dNTP, 1 \mul de polimerasa I de ADN (fragmento Klenow).
Se incubó la mezcla a 37ºC durante 6 horas, y se terminó la reacción
añadiendo 5 \mul de EDTA 0,2 M, pH 8,0. La sonda se
precipitó añadiendo 5 \mul de LiCl 4 M y 150 \mul de etanol,
congelando a -80ºC durante 30 minutos, se precipitó en una
centrífuga Eppendorf, se lavó con etanol al 70% y se resuspendió en
20 \mul de Tampón de Resuspensión tal como lo suministraba el
equipo. La reacción de hibridación fue esencialmente como se ha
descrito más arriba, excepto que después de la hibridación la
membrana se lavó dos veces en 2x SSC, 0,1% de SDS, a temperatura
ambiente durante 5 minutos cada una, seguidas por dos lavados en
0,1x SSC, 0,1% de SDS, a 68ºC durante 15 minutos. Las reacciones de
detección unen las sondas biotiniladas a la fosfatasa alcalina a
través de un puente de estreptoavidina, y la sonda fue visualizada
mediante corte del sustrato Lumigen-PPD. Los pasos
de bloqueo, incubación con estreptoavidina, incubación con fosfatasa
alcalina, y la reacción con Lumigen-PPD se
realizaron tal como se describe en el manual del equipo. La
exposición de las transferencias a película Kodak XAR reveló que,
tal como se esperaba, (i) un fragmento digerido con XbaI de
1,85 p.k.b. de tamaño (XbaI T) se hibridaba con ADN de Towne
sondeado con pXbal T, y (ii) en el ADN de Toledo había un fragmento
digerido con XbaI que migraba conjuntamente. El ADN de AD169
no consiguió mostrar ninguna señal de hibridación en ninguno de los
patrones de digestión con enzimas de restricción. La secuencia de
nucleótidos del pXbal T confirmó la total ausencia de identidad del
ADN de Towne y del ADN de AD169. La secuenciación de nucleótidos del
ADN del Cósmido 1 (ver B. ADN plasmídico en Materiales y
Procedimientos, más arriba) procedente de Toledo reveló una
extensa identidad de secuencia entre el ADN recién identificado de
Towne y el ADN de Toledo del cósmido 1 en esta región.
Sorprendentemente, la orientación de la secuencia estaba invertida
en Toledo en relación a Towne.
Para determinar la penetración de las secuencias
representadas por el clon 65 en aislados clínicos recientes, se
digirieron cinco aislados clínicos representativos (HCMVF, C128,
C354, C793 y C980) con los enzimas de restricción BamHI y
XbaI, junto con los ADN de Toledo, Towne y AD169 preparados
tal como se describe más arriba en la sección MATERIALES Y
PROCEDIMIENTOS, se electroforesaron a través de agarosa, se
transfirieron a membrana de transferencia de nilón
Hybond-N+, y se sondearon con el clon 65 marcado con
[\alpha^{32}P], traducido con muescas, de acuerdo con los
procedimientos detallados en la sección de MATERIALES y
PROCEDIMIENTOS. Como puede observarse en la Figura 4, las
autoradiografías revelaron que se detectaba homología en la
totalidad de los aislados clínicos. En la Figura 4, una banda de
aproximadamente 5 p.k.b está visible en el carril 1 (el ADN de
Toledo), aparece en el ADN de Towne (carril 2), está ausente en el
carril 3 (el ADN de AD169), y visible en los carriles 4 a 8 (los
aislados clínicos HCMVF, C128, C354, C793 y C980). Estos resultados
demuestran que la secuencia recién aislada, que se halla en la cepa
Toledo del HCMV, también está presente en los aislados clínicos
recientes, pero no está presente en la cepa de referencia AD169. El
análisis de la secuencia de nucleótidos revela que la razón de la
débil señal de hibridación al fragmento de ADN de Towne se debe a la
existencia de tan sólo 151 nucleótidos de identidad de secuencia con
el ADN de Towne. La identidad de 104 p.b. compartidas del Ejemplo 1
es responsable de la débil señal de hibridación con los fragmentos
de tamaño "T" de XbaI procedentes de ambos, los ADN de
Towne y Toledo, observada en las digestiones con XbaI
(carriles 9 y 10). La digestión con XbaI de los aislados
clínicos (carriles 12 a 16) revela también la hibridación a
múltiples bandas de peso molecular elevado. El análisis de estos y
otros genomas de aislados clínicos con otras sondas en la región ha
relevado que las secuencias compartidas podrían estar en orientación
invertida en algunos aislados en relación a la orientación en la
cepa Toledo.
La Figura 6 es una ilustración esquemática de las
posiciones relativas de las nuevas secuencias identificadas en el
ADN genómico de Toledo, el ADN genómico de Towne, en una comparación
con el ADN genómico de la cepa AD169. Las líneas de guiones
delimitan la región del genoma en donde se hallan las secuencias
homólogas y divergentes. La línea superior ilustra un mapa de
restricción de ADN de Toledo mostrando sitios de restricción
BamHI (indicados por "B") y XbaI (indicados por
"X") que se extienden entre los puntos de rotura de la
homología, identificados por triángulos invertidos en los
nucleótidos 175.068 y 188.843 (numerados con referencia a la
secuencia de ADN de AD169, número de acceso X17403 en EMBL). Los
subclones 4, 1300, C23K y 65 de la secuencia de ADN de Toledo se
muestran en recuadros por encima del mapa. Se muestra una región
invertida de homología con respecto a Towne mediante los triángulos
invertidos entre los nucleótidos 178.221 y 175.082. Las secuencias
únicas se muestran mediante una línea fina, unas secuencias de
repeticiones invertidas mediante líneas gruesas, b'a'c'. El
final de las repeticiones c' se muestra con una flecha en el
nucleótido 191.412. La línea del medio ilustra un mapa de
restricción del ADN de Towne mostrando sitios de enzimas de
restricción BamHI (B) y XbaI (X) tal como se ha
descrito más arriba para Toledo, y mostrando los clone E, T y Q de
XbaI en recuadros más abajo. Las áreas sombreadas se refieren
a regiones homólogas compartidas con el ADN de Toledo pero
invertidas en su orientación. Los números de nucleótidos mostrados
lo son por referencia a la secuencia de ADN de AD169. La extensión
indeterminada de las secuencias de repetición b' en la cepa
Towne se muestran mediante líneas delgadas en el nucleótido de
referencia 180.034 de la cepa AD169. La línea inferior ilustra el
genoma de AD169 mostrado en la orientación del prototipo. Las
secuencias únicas se muestran mediante una línea delgada, y la
repeticiones invertidas de los componentes largo (U_{L}) y corto
(U_{S}) se denotan mediante recuadros,
ab-b'a' y a'c'-ca. La
secuencia a es una repetición directa terminal con una copia
invertida (a') en la unión de los componentes largo y corto.
La longitud de la secuencia de ADN de AD169 se indica como 229.354
nucleótidos y la posición del mapa de la repeticiones internas se
muestra con los números de referencia de los nucleótidos y con
flechas.
La secuencias nuevas de Toledo y Towne codifican
pautas de lectura abiertas (ORF) potenciales. Usando un parámetro
arbitrario de 10 kilodaltones como el mínimo peso molecular de
proteína calculado, se identificaron un total de 36 ORF en la nueva
secuencia de Toledo, y se identificaron un total de 4 ORF en la
nueva secuencia de Towne. Las secuencias de aminoácidos putativas de
estas ORF se detallan en el listado de secuencias (SEC. Nº ID.: 2,
3, 4, 5, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21,
22, 23, 24, 25, 26 y 27). La Figura 5 muestra la presentación
esquemática de estas ORF en las nuevas secuencias de ADN de Toledo y
Towne, junto con las ORF de AD169 de la región correspondiente
previamente descritas. Se asignaron nombres a estas ORF empezando
desde UL133 como la primera ORF en el extremo izquierdo de la UL en
la secuencia de Toledo. La primera ORF en la nueva secuencia de
Towne se asignó a UL147, la cual se determinó que estaba presente en
la nueva secuencia de Toledo descrita en ésta. Se determinó que
UL130 y UL132 de AD169 estaban presentes en la nueva secuencia de
Toledo. Adicionalmente, UL153 y UL154 presentaban regiones de
homología con IRL14 e IRL12 respectivamente. Todas las ORF se
examinaron en busca de secuencias homólogas en las bases de datos no
redundantes del NCBI usando el programa BLASTP. Entre las ORF
buscadas, sólo la UL132 identificó un homólogo en la base de datos,
la cual fue la mtrIII del HCMV (Nº de acceso a GenBank X75606),
presentando un 76% de identidad a nivel de aminoácidos. El círculo
sólido identifica las ORF que contenían el potencial de secuencias
de sitios de glicosilación unidos a N,
N-X(-P)-S/T. Estas glicoproteína
potenciales podrían ser biológicamente significativas como moléculas
antigénicas o inmunogénicas.
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE: Spaete, Richard
\hskip 3,3cmCha, Tai-An
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: NUEVAS SECUENCIAS DE CITOMEGALOVIRUS HUMANO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SEQUENCIAS: 27
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- DIRECCIÓN DE CORRESPONDENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- DESTINATARIO: Luann, Cserr, Attorney at Law
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 750 Arimo Avenue
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: Oakland
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: CA
\vskip0.333000\baselineskip
- (E)
- PAIS: EE.UU.
\vskip0.333000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL (ZIP): 94610
\vskip0.666000\baselineskip
- (v)
- FORMATO LEGIBLE POR ORDENADOR:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- TIPO DE MEDIO: Disquete
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR: Compatible con PC de IBM
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- PROGRAMA: PatentIn Release #1.0, Version #1.25
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- DATOS DE LA PRESENTE SOLICITUD:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD: 08/414.926
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE REGISTRO: 31 de marzo de 1995
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- CLASIFICACIÓN:
\vskip0.666000\baselineskip
- (viii)
- INFORMACIÓN DEL REPRESENTANTE LEGAL/AGENTE:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: Cserr, Luann
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- NÚMERO DE REGISTRO: 31.822
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REFERENCIA/CERTIFICADO: AVIR 11 WO
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 1:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 4711 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: CMV humano
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CEPA: Towne
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: complemento (845...1321)
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /producto="UL147"
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: complemento (1368...1721)
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /producto="UL152"
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: complemento (2504...3337)
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /producto="UL153"
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: complemento (3515...4711)
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /producto="UL154"
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 1:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 2:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 159 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGIA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCION DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SECUENCIA ID. Nº 3:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 118 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TIPOLÓGIA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 4:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 278 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 4:
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 5:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 399 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGIA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 6:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18318 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADL (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: CMV humano
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CEPA: Toledo
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 511...1281
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /producto=" UL133"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1401...2384
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /producto=" UL135"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 2478...3197
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /producto=" UL136"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 3283...3789
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /producto=" UL138"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 4355...4759
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /producto=" UL139"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 4944...5285
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /producto=" UL140"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 5558...6832
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /producto=" UL141"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 6908...7825
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /producto=" UL142"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 7813...8088
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /producto=" UL143"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 8468...8995
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /producto=" UL144"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 9327...9626
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /producto=" UL145"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 9910...10260
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /producto=" UL146"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 10328...10804
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /producto=" UL147"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 11106...12053
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /producto=" UL148"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 12133...12942
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /producto=" UL132"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 13569...14210
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /producto=" UL130"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 16216...16581
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /producto=" UL149"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1004...1528
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /producto=" UL134"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 3063...3350
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /producto=" UL137"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 16337...18262
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /producto=" UL150"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 17752...18759
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /producto=" UL151"
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. N°: 6:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 7:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 257 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: tol.01
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Proteína
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1...257
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- OTRA INFORMACIÓN: /label=UL133
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 7:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 8:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 175 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: tol.02
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Proteína
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1...175
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- OTRA INFORMACIÓN: /label=UL134
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 8:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 9:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 328 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: tol.03
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Proteína
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1...328
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- OTRA INFORMACIÓN: /label=UL135
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 9:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 10:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 240 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: tol.04
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Proteína
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1...240
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- OTRA INFORMACIÓN: /label=UL136
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 10:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 11:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 96 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: tol.05
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Proteína
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1...96
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- OTRA INFORMACIÓN: /label=UL137
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 11:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 12:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 169 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: tol.06
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Proteína
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1...169
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- OTRA INFORMACIÓN: /label=UL138
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 12:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 13:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 135 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: tol.07
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Proteína
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1...135
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- OTRA INFORMACIÓN: /label=UL139
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 13:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 14:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 114 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: tol.08
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Proteína
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1...114
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- OTRA INFORMACIÓN: /label=UL140
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 14:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 15:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 425 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: tol.09
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Proteína
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1...425
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- OTRA INFORMACIÓN: /label=UL141
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 15:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 16:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 306 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: tol.10
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Proteína
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1...306
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- OTRA INFORMACIÓN: /label=UL133
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 16:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 17:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 92 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: tol.11
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Proteína
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1...92
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- OTRA INFORMACIÓN: /label=UL143
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 17:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 18:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 176 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: tol.12
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Proteína
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1...176
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- OTRA INFORMACIÓN: /label=UL144
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 18:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 19:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 100 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: tol.13
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Proteína
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1...100
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- OTRA INFORMACIÓN: /label=UL145
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 19:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 20:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 117 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: tol.14
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Proteína
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1...117
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- OTRA INFORMACIÓN: /label=UL146
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 20:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 21:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 159 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: tol.15
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Proteína
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1...159
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- OTRA INFORMACIÓN: /label=UL147
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 21:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 22:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 316 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: tol.16
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Proteína
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1...316
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- OTRA INFORMACIÓN: /label=UL148
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 22:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 23:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 214 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: tol.19
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Proteína
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1...214
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- OTRA INFORMACIÓN: /label=UL130
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 23:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 24:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 122 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: tol.20
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Proteína
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1...122
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- OTRA INFORMACIÓN: /label=UL149
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 24:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 25:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 642 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: tol.21
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Proteína
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1...642
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- OTRA INFORMACIÓN: /label=UL150
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 25:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 26:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 336 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: tol.22
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Proteína
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1...336
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- OTRA INFORMACIÓN: /label=UL151
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 26:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 27:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 270 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: tol.23
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Proteína
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1...270
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- OTRA INFORMACIÓN: /label=UL132
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 27:
Claims (18)
1. Secuencia de ADN aislada que comprende:
- (a)
- una secuencia de ADN correspondiente a la secuencia de nucleótidos de SEC. Nº ID.: 6;
- (b)
- una secuencia de ADN correspondiente a la secuencia de nucleótidos de SEC. Nº ID.: 1; o
- (c)
- una secuencia de ADN correspondiente a la secuencia de nucleótidos de SEC. Nº ID.: 6 en una orientación invertida.
2. Secuencia de ADN aislada que comprende un
marco de lectura abierto completo del citomegalovirus humano, en
donde el marco de lectura abierto codifica una proteína que tiene
una secuencia de aminoácidos tal como se detalla en la SEC. Nº ID.:
2, SEC. Nº ID.: 3, SEC. Nº ID.: 4, SEC. Nº ID.: 7, SEC. Nº ID.: 8,
SEC. Nº ID.: 9, SEC. Nº ID.: 10, SEC. Nº ID.: 11, SEC. Nº ID.: 12,
SEC. Nº ID.: 13, SEC. Nº ID.: 14, SEC. Nº ID.: 15, SEC. Nº ID.: 16,
SEC. Nº ID.: 17, SEC. Nº ID.: 18, SEC. Nº ID.: 19, SEC. Nº ID.: 20,
SEC. Nº ID.: 21, SEC. Nº ID.: 22, SEC. Nº ID.: 24, SEC. Nº ID.: 25 o
SEC. Nº ID.: 26.
3. Secuencia de ADN aislada que es capaz de
hibridarse bajo condiciones rigurosas con una secuencia de ADN que
codifica una proteína que tiene una secuencia de aminoácidos tal
como se detalla en la SEC. Nº ID.: 2, SEC. Nº ID.: 3, SEC. Nº ID.:
7, SEC. Nº ID.: 8, SEC. Nº ID.: 9, SEC. Nº ID.: 10, SEC. Nº ID.: 11,
SEC. Nº ID.: 12, SEC. Nº ID.: 13, SEC. Nº ID.: 14, SEC. Nº ID.: 15,
SEC. Nº ID.: 16, SEC. Nº ID.: 17, SEC. Nº ID.: 18, SEC. Nº ID.: 19,
SEC. Nº ID.: 20, SEC. Nº ID.: 21, SEC. Nº ID.: 24, SEC. Nº ID.: 25 o
SEC. Nº ID.: 26, y en donde las condiciones de hibridación rigurosas
emplean 6x SSC, 0,2% de polivinilpirrolidona, 0,2% de Ficoll, 0,2%
de albúmina de suero bovino, 0,1% de dodecilsulfato de sodio, 100
\mug de ADN de esperma de salmón, y 15% de formamida a 68ºC.
4. Secuencia de ADN aislada de la reivindicación
2 o reivindicación 3, en donde dicha secuencia de ADN aislada
comprende un genoma replicable de citomegalovirus que codifica un
citomegalovirus humano infeccioso.
5. Secuencia de ADN aislada de la reivindicación
1, en donde dicha secuencia de ADN aislada comprende un genoma
replicable de citomegalovirus que codifica un citomegalovirus humano
infeccioso.
6. Molécula de ARN transcrita a partir de una
secuencia de ADN de cualquiera de las reivindicaciones 2 a 4.
7. Vector que comprende una secuencia de ADN de
una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4.
8. Célula hospedadora transformada con una
secuencia de ADN de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, en
una asociación operativa con una secuencia de control de la
expresión capaz de dirigir la replicación y expresión de dicha
secuencia de ADN.
9. Proteína del HCMV codificada por una secuencia
de ADN de una cualquiera de las reivindicaciones 2 a 4.
10. Proteína que comprende:
- (a)
- una proteína de HCMV que tiene una secuencia de aminoácidos tal como se detalla en la SEC. Nº ID.: 2, SEC. Nº ID.: 3, SEC. Nº ID.: 4, SEC. Nº ID.: 5, SEC. Nº ID.: 7, SEC. Nº ID.: 8, SEC. Nº ID.: 9, SEC. Nº ID.: 10, SEC. Nº ID.: 11, SEC. Nº ID.: 12, SEC. Nº ID.: 13, SEC. Nº ID.: 14, SEC. Nº ID.: 15, SEC. Nº ID.: 16, SEC. Nº ID.: 17, SEC. Nº ID.: 18, SEC. Nº ID.: 19, SEC. Nº ID.: 20, SEC. Nº ID.: 21, SEC. Nº ID.: 22, SEC. Nº ID.: 24, SEC. Nº ID.: 25 o SEC. Nº ID.: 26;
- (b)
- una proteína que tiene al menos una homología de secuencia de aminoácidos del 90% con una proteína del HCMV tal como se define en (a).
11. Procedimiento para producir una proteína de
HCMV que comprende cultivar una célula hospedadora de la
reivindicación 8 en un medio de cultivo apropiado, y aislar dicha
proteína de dicho medio.
12. Procedimiento para producir un HCMV
recombinante que comprende:
- (a)
- transfectar un plásmido que contiene una secuencia de ADN de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, y (i) transfectar ADN viral que comprende HCMV de la cepa AD169 o Towne, o (ii) superinfectar HCMV de la cepa AD169 o Towne en una línea celular permisiva para el crecimiento de CMV; y
- (b)
- aislar dicho HCMV recombinante a partir de dicha línea celular.
13. Composición inmunogénica que comprende un
HCMV recombinante construido mediante el procedimiento de la
reivindicación 12.
14. Utilización de una composición inmunogénica
de la reivindicación 13 para la preparación de un medicamento para
el tratamiento profiláctico de una enfermedad o condición
relacionada con el HCMV.
15. Procedimiento para detectar una infección por
HCMV en un humano, que comprende:
- (i)
- combinar bajo condiciones de rigurosidad predeterminadas una muestra clínica sospechosa de contener ADN de HCMV, con al menos un fragmento de ADN de hebra única de una secuencia de ADN de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5, que tiene al menos 10 bases y que no se hibrida de forma cruzada con ADN humano; y,
- (ii)
- detectar la formación de dúplex entre dicho fragmento de ADN de hebra única y la muestra de ADN.
16. Composición farmacéutica que comprende una
proteína codificada por una secuencia de ADN de una cualquiera de
las reivindicaciones 1 a 5 en mezcla con un portador
farmacéuticamente aceptable.
17. Proteína de HCMV de la reivindicación 9 o
reivindicación 10 para su utilización en un procedimiento de
tratamiento médico.
18. Utilización de una proteína de HCMV de la
reivindicación 9 o reivindicación 10 para la preparación de un
medicamento para el tratamiento profiláctico de una enfermedad o
condición relacionada con el HCMV.
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