EP1611537A2 - Krankheitsverlaufkontrolle - Google Patents

Krankheitsverlaufkontrolle

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Publication number
EP1611537A2
EP1611537A2 EP04725920A EP04725920A EP1611537A2 EP 1611537 A2 EP1611537 A2 EP 1611537A2 EP 04725920 A EP04725920 A EP 04725920A EP 04725920 A EP04725920 A EP 04725920A EP 1611537 A2 EP1611537 A2 EP 1611537A2
Authority
EP
European Patent Office
Prior art keywords
class
sample
data
parameter
samples
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Withdrawn
Application number
EP04725920A
Other languages
English (en)
French (fr)
Inventor
Wolfang Petrich
Gerhard Werner
Heinz-Michael Hein
Hans-Juergen Kuhr
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
F Hoffmann La Roche AG
Roche Diagnostics GmbH
Original Assignee
F Hoffmann La Roche AG
Roche Diagnostics GmbH
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by F Hoffmann La Roche AG, Roche Diagnostics GmbH filed Critical F Hoffmann La Roche AG
Publication of EP1611537A2 publication Critical patent/EP1611537A2/de
Withdrawn legal-status Critical Current

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Classifications

    • GPHYSICS
    • G16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16HHEALTHCARE INFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR THE HANDLING OR PROCESSING OF MEDICAL OR HEALTHCARE DATA
    • G16H10/00ICT specially adapted for the handling or processing of patient-related medical or healthcare data
    • G16H10/40ICT specially adapted for the handling or processing of patient-related medical or healthcare data for data related to laboratory analysis, e.g. patient specimen analysis
    • GPHYSICS
    • G16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16HHEALTHCARE INFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR THE HANDLING OR PROCESSING OF MEDICAL OR HEALTHCARE DATA
    • G16H50/00ICT specially adapted for medical diagnosis, medical simulation or medical data mining; ICT specially adapted for detecting, monitoring or modelling epidemics or pandemics
    • G16H50/50ICT specially adapted for medical diagnosis, medical simulation or medical data mining; ICT specially adapted for detecting, monitoring or modelling epidemics or pandemics for simulation or modelling of medical disorders

Definitions

  • the invention relates to the field of analysis methods which are suitable for the diagnosis of diseases in human or animal samples.
  • electromagnetic spectra are recorded and stored and analyzed using multivariate evaluation methods.
  • the diagnosis of diseases by means of multivariate evaluation methods is already known in the prior art and is explained in more detail below.
  • the method according to the invention it is possible for the first time to reliably recognize individual forms of a clinical picture in addition to the detection of a specific disease.
  • the method according to the invention thus makes it possible for the first time to diagnose individual course stages, which can, for example, indicate the development of a disease or reflect the effect of therapeutic methods on the health status of a patient.
  • a diagnosis of individual diseases is particularly difficult, since the substances to be analyzed for crane failure cannot be clearly determined or are even unknown. A diagnosis of such diseases can often only be guaranteed by extensive analyzes of various parameters, which give an indication of the crane number.
  • An example of a disease that is difficult to diagnose is z. B.
  • the metabolic syndrome which is believed to affect at least one in ten adults in the United States. This disease is one of the most common health anomalies in a western civilization. Metabolic syndrome is a collection of five different risk factors that result in high cardiovascular mortality. A metabolic syndrome is diagnosed if at least three out of five risk factors are present. The risk factors or parameters that count to determine this disease include obesity, high blood pressure, cholesterol levels and increased blood sugar and fat levels. The example given shows that five different examinations are necessary to diagnose this disease, which can then be concluded from the clinical picture.
  • Multivariate evaluation methods allow an unknown sample to be analyzed with a high degree of reliability and to be assigned to various diseases depending on a previously trained database. To create the database, samples are first taken from patients who have a specific clinical picture. The measured spectra are then assigned to a class that characterizes the respective disease family.
  • the database can be trained. According to their classification, these spectra are fed to the multivariate evaluation method, so that the database contains characteristic spectra patterns, each of which belongs to a class and is therefore assigned to a disease family.
  • the system is trained until it is possible to differentiate between different classes. For example, this is a categorization of samples taken from healthy people or people suffering from an anomaly to be examined. If an unknown sample is now used measure, the system can assign the unknown sample to a class with sufficient reliability, so that a diagnostic note is given.
  • a pattern recognition of the measured spectrum preferably takes place in a previously defined, measured wavelength range, on the basis of which an unknown sample is classified into a previously classified group of diseases (sick / healthy).
  • Basic principles of such a method which enables the classification of samples by means of IR spectroscopy and multivariate evaluation methods, are, for. B. described in document EP 0 644 412.
  • spectra of healthy patients as well as spectra of patients suffering from the metabolic syndrome are stored and classified in a database in a predetermined wavelength range.
  • a wavelength range is selected in which characteristic spectra patterns allow an assignment to a class.
  • a determination of the respective wavelength range can, for. B. using multivariate methods or algorithms such as z. B. in "NMA Biomedicine ⁇ , Vol. 11, Issue 4-5 (1998), pp. 209-216.
  • a correlation matrix is therefore first set up. On the basis of the correlation matrix, the evaluation method determines which wavelengths with which influence should be used for the classification.
  • the wavelengths used for the evaluation span a space whose dimensions correspond to the number of wavelengths.
  • a subspace is selected from the evaluation method in which the assignment of samples to the classes is as clear as possible.
  • the assignment of samples to a class results from their spatial proximity in the subspace mentioned.
  • the data can be stored in the system so that an analysis system can provide diagnostic information for a large number of diseases.
  • Multivariate evaluation methods are explained in more detail below using the example of discriminant analysis.
  • the linear discriminant analysis enables a separation between two data sets.
  • B. reflect patient data of a healthy and a sick patient, with the aim of enabling a reliable differentiation between the data sets.
  • Practice shows that the data sets often overlap, and a number of data can be assigned to both the "healthy" data set and the "sick" data set. There is therefore no clear classification of this data, which in the example given can be referred to as the intersection of the data records "healthy" and "sick". It is therefore not possible to assign unknown samples whose measured parameters lie in this intersection of the two data sets.
  • linear discriminant analysis draws a boundary between two data sets to which an assignment is to be made. All data that are within this limit / limit values include e.g. The larger the data set of a class is selected, the more sensitive it is to assign an unknown sample to this class, so that almost all samples belonging to this class are also assigned to this class. Such a large one
  • the data record then also includes the assignment of the samples that were wrongly assigned to the class, so that a sensitive assignment has a correspondingly low specificity. It is therefore the task of such evaluation methods to achieve an optimum of the assignment that weighs between sensitivity and specificity.
  • the program can be trained to increase the sensitivity and specificity of the assignment by means of the measurement and assignment of known samples.
  • the process parameters that indicate the sensitivity and specificity of the method are specified during the evaluation in accordance with the respective assignment the values of unknown Pr above, which are located directly in an intersection of data records, are evaluated as non-evaluable in order to avoid an excessive error in the assignment.
  • a diagnostic note for a sample whose parameters are within the intersection is not possible.
  • a disadvantage of the prior art is therefore that the diagnosis of a disease can only be made with respect to different classes (eg "healthy” or "sick") without, for example, B. Data within the intersection can be taken into account.
  • a patient's continuous course of illness is thus divided into two discrete steps which, as diagnostic information, exclusively state “healthy” or “sick” allow.
  • a real course of a disease with different disease stages cannot be considered.
  • the object of the method according to the invention is to avoid the disadvantage of the prior art described.
  • the method according to the invention takes into account the continuous course of a disease and thus in particular also enables evaluation of spectra within an intersection of data records.
  • the method according to the invention consequently makes use of precisely these data, which according to the prior art are not considered to be evaluable.
  • the inventive method is such. B. early detection of diseases and diagnosis of disease courses, etc.
  • the invention includes a method for evaluating an electromagnetic spectrum, a membership of the electromagnetic spectrum being determined proportionally to a class. In this way it is ensured that a real health or. The course of the disease can be mapped so that significant conclusions can be drawn e.g. B. therapy can be taken or preventive measures are possible.
  • the method according to the invention analyzes an electromagnetic spectrum that was generated by measuring an unknown sample.
  • a sample parameter is determined that can be assigned to a data set.
  • the data record is calculated by the interpolation between at least a part of first data and at least a part of second data, the first and second data each being assigned to a first and second class.
  • the first data include a first parameter that was generated on the basis of electromagnetic spectra of known samples belonging to the first class by means of the multivariate evaluation method, so that a reliable assignment of samples to the first class is possible on the basis of the first parameter.
  • the second data contain a second parameter, which was also generated on the basis of electromagnetic spectra of known samples belonging to the second class by means of the multivariate evaluation method, so that a reliable assignment of samples to the second class is possible on the basis of the second parameter.
  • a proportion of the sample parameter in at least a part of the data record is determined.
  • a share of the sample parameter in a class is reproduced, so that the share of the unknown sample with which the unknown sample belongs to a class is determined.
  • the method according to the invention enables a sample to be classified continuously between different disease families. Due to the interpolation between data e.g. B. in the late stage of a disease family and data that can be determined by a healthy patient, the course of a disease can be mapped by a curve of the interpolated data.
  • the interpolated data set is defined by a data area which is spanned by the interpolation between at least two values, so that the data set contains at least one intermediate value which defines the spanned data area between the known values.
  • the known data between which an interpolation takes place belong to the first and second class according to the invention.
  • An assignment of measured data to a curve of the interpolated data set enables the disease stage of a sample to be depicted precisely and, for example, B. to make a prognosis of the course of the disease or, if necessary, to calculate a probability of a possible disease.
  • Such a classification of the sample thus offers u. a. the possibility to ensure early diagnosis, which are essential for curing many diseases.
  • the continuous differentiation of the clinical picture allows a prognosis for diseases and a monitoring of the respective acute form to be depicted without the method being restricted to the exclusive assignment between two classes. An evaluation of data that lie within an intersection according to the prior art is possible.
  • the method according to the invention is concerned with the analysis of body fluids, cell suspensions and bacterial suspensions.
  • Clinically relevant body fluids that can be evaluated using this procedure include: B. blood, plasma, serum, hemolysate, urine, cerebrospinal fluid, saliva, perspiration fluid, eye fluid, cyst fluid, amniotic fluid, sputum, ascitis, sperm. These are among cell and bacterial suspensions To understand samples that are obtained either directly (e.g. by puncture, smear etc.) or by culturing in a nutrient medium.
  • a method according to the invention is suitable for analyzing liquids with a large number of different ingredients. This is especially true for blood, plasma, serum and hemolysate.
  • the implementation of the method according to the invention begins with the provision of the sample liquid or suspension to be classified. This can be done in a well known manner e.g. B. by taking a blood or urine sample. For some types of samples, it is advantageous if processing is carried out before the method is carried out. Whole blood can be centrifuged, for example, to separate serum and blood cake.
  • the sample obtained can advantageously be placed on a support which makes it possible to record an infrared spectrum.
  • a support can be, for example, a metallized slide.
  • Preferred carriers are those which are reflective on their surface and have a roughness which causes diffuse scattering of infrared radiation.
  • supports which are mirrored on the surface to which the sample is applied.
  • a coating of the carrier can with metals, preferably noble metals such as gold, platinum, palladium but also z. B. with base metals, preferably aluminum and chrome. These coatings have the advantage that they are largely inert to the sample and also to the ambient air.
  • the supports can have a flat surface on which the sample is applied.
  • preferred carriers according to the invention are those which have a recess for holding the sample liquid.
  • Suitable sample carriers are e.g. B. described in the patent US 5,734,587 for
  • sample carriers are e.g. B. described in the document EP 0 644412 and DE 4331596.
  • supports for transmission measurement can also advantageously be used, which transmit the irradiated radiation.
  • the supports mentioned can be made, for example, of plastics, such as poly carbonate, polyethylene or polymethyl methacrylate, which are permeable to infrared radiation in a wide range of wavenumbers.
  • These carriers for the transmission measurement can have depressions for the sample liquid analogously to those for the reflection measurement.
  • measurements in diffuse reflection have the advantage that inhomogeneities of the sample material, e.g. B. opacities that do not interfere with the evaluation, but even support diffuse reflection.
  • ATR measurements measurements under attenuated total reflection
  • Infrared spectroscopy often uses measurements in the medium infrared range (2.5 - 25 ⁇ m). To record an infrared spectrum, the sample on the sample carrier is illuminated with infrared radiation. Infrared radiation in the wave number ranges already described can be generated with IR spectrometers from the market, for example Nicolet, Bruker and Perkin Elmer.
  • Raman spectroscopy is also frequently used, although it has a significantly lower sensitivity for detecting an analyte compared to infrared spectroscopy.
  • infrared spectroscopy only slightly disturbing water bands affect the analyte signal overlap.
  • infrared measurements often lead to falsified analysis results, since there is a strong absorption band of water in the middle infrared range.
  • Raman spectroscopy may prove to be a suitable spectroscopy method. More detailed information on the spectroscopy methods mentioned and possible applications are, for. B. in the document "Mid-IR and Raman spectroscopy for medical diagnostics", Appl. Spectros. Rev. 36, pp. 181-237 (2001), by W. Petrich.
  • the sample can be dried by simply evaporating the liquid at room temperature or else under special conditions, for example by applying a vacuum, heating the sample or storing it in the presence of a drying agent.
  • drying-up essentially does not mean that the sample is dried completely, so that a dried sample contains a few percent residual moisture.
  • the drying steps - as described - have the advantage that the sample forms a coherent film without cracks, which could impair an evaluation.
  • a drying residue of varying shape arises when the sample dries.
  • a circular bead When serum samples of exposed surfaces dry up, a circular bead generally forms, the thickness of which decreases in the direction of the center of the circle.
  • a bulge In the case of cantilevered films, a bulge also forms in the edge zones to the carrier material, which merges into a relatively uniformly thick film in the middle of the opening.
  • the sample is preferably irradiated in reflection and transmission in such a way that the entire sample is captured by the IR beam. Due to this integral irradiation of the sample, the measurement is largely independent of the drying profile of the sample. This is another essential factor that increases the reproducibility of the spectrum evaluation.
  • Raman spectroscopy is used as the analysis method, a drying step during the sample preparation is not necessary.
  • the sample is illuminated with infrared radiation.
  • the infrared radiation can be within the entire infrared range, ie about 400 to 15,000 cm "1.
  • IR spectroscopy in the range from 400 to 4,000 cm " is particularly advantageous in connection with the aforementioned drying method, since it has a high specificity in this range.
  • the radiation that has passed through or is reflected by the sample is collected by a detector, which should detect as much of the radiation as possible.
  • a detector which should detect as much of the radiation as possible.
  • infrared sensitive detectors such as. B. bolometers, thermocouples, photovoltaic elements and semiconductor detectors are known. Before the radiation reaches the detector, it can be passed through a system of lenses, diaphragms and mirrors.
  • the transmitted or reflected radiation is recorded as a function of the incident wavelength.
  • such a spectrum is evaluated by a multivariate evaluation method for generating a sample parameter.
  • the term spectrum encompasses any form of data structure that is generated by measuring a sample as described. It is irrelevant for the evaluation method according to the invention whether the method z.
  • the data of an interfering program or the resulting Fourier-transformed data can be used as a basis.
  • the spectrum must first be digitized, unless it has already been recorded digitally. This means that the spectrum is converted into a table of values that contains the absorption or transmission for discrete wavenumbers. The number of value pairs depends essentially on the capacity of the existing software or hardware.
  • the table of values that is used for evaluation is limited to certain areas of the wave numbers.
  • a variety of methods can be used to select wavelength ranges. Such methods are well known in the art and z. B. in EP 0644412 and WO 02/66963. In this way, a selection of relevant areas of the spectra can be made and parts of the spectrum which are of low information content can be eliminated.
  • the digitized spectrum is transferred to a multivariate evaluation process, which is available as a computer program.
  • multivariate evaluation methods are discriminant analyzes, regularized discriminant analyzes, neural networks, cluster analyzes, etc.
  • any conceivable multivariate evaluation methods as are sufficiently known in the prior art, are possible when carrying out the method according to the invention.
  • the software packages mentioned can be obtained, for example, from the companies STSC, STAT SOFT, SAS and Galactic Industries.
  • the multivariate evaluation methods must be trained in the application area before they can be used according to the invention. This is usually done by a number of training runs in which infrared spectra of a plurality of samples of known classifications are entered into the evaluation method. The type of classification of the individual samples is also communicated to the evaluation method. In the aforementioned training run, the evaluation algorithm automatically selects parameters that ensure that the samples are reliably assigned to the specified classes. The parameters obtained in this way can later be used to calculate the interpolated data set. According to the invention, it is irrelevant here whether an interpolation between the parameters takes place directly or an interpolation is first carried out between the spectra data before the parameters are generated. It turns out, however, that first the determination of the parameters and then an interpolation between the parameters considerably simplifies generation of the interpolated data set.
  • the analysis system can contain a large number of different classes, between which it is possible to interpolate according to the invention.
  • the invention enables the interpolation between data to be able to reflect the course of a disease and thus also to precisely depict and track intermediate stages of a clinical picture.
  • the sample is classified into different course curves for different disease courses which, with previous methods, required a large number of separate analysis processes. Classes that fall within the field of internal diseases are particularly important for clinical analysis.
  • the method according to the invention makes it possible to generate progress curves which make it possible to predict whether there is a liver or kidney disease.
  • the described classification of an unknown sample is not to be equated with an unambiguous diagnosis, since the same spectral changes in the sample can be caused by various diseases or disorders. Rather, the classification of the sample mentioned represents a screening process with which it can be decided on which diseases the sample is to be tested using conventional methods. This results in the saving of a large number of analytical tests which normally, for example B. at an incoming inspection in clinical laboratories, would be necessary.
  • the method according to the invention enables the early detection of diseases which, under certain circumstances, cannot be achieved by means of traditional methods.
  • the interpolation between two classes can be carried out using the example of linear discriminant analysis, in that the distance between the discriminant function and the sample parameter of the sample to be examined is advantageously calculated in multidimensional space.
  • This room could e.g. B. the space of the main components, the distance could be defined by the Euclidean distance, or the Mahalalobis distance.
  • This distance measure can then be standardized over the entire data set of the training and understood as a special form of an interpolation.
  • you could the distance can be converted using a probability function. It is also conceivable to use the value of the discriminant function, or a value of the discriminant function modified with the aid of a probability function.
  • reshaping with any function is conceivable, for example a probability function.
  • a monitored classification as is the case with a neural • network, it is also possible to implement a (or more) new class - represented by one or more new output neurons - when training the network and to use such spectra here, which cannot be adequately assigned to group A or B (e.g. healthy or sick).
  • Diabetes exemplified.
  • An interpolation takes place between the first data belonging to a class which is referred to as "healthy", ie these data were generated on the basis of known samples which were taken from healthy patients or patients who did not have diabetes, and the second Data that was generated on the basis of samples taken from patients suffering from diabetes
  • parameters are first generated using a selected multivariate evaluation method, so that the parameters can be assigned to the first and the second class, followed by an interpolation between
  • the parameters advantageously show that a curve of a crane correlates with the curve curve of the interpolated data calculated in this way, so that samples from patients in different disease stages can be assigned to the interpolated data set
  • a sample parameter is first determined using the same multivariate evaluation method, so that the sample parameter can be assigned to the data record that results from the interpolation between the first and second parameters.
  • the share value of the sample parameter in a class can be calculated as a percentage.
  • This share value reflects the assignment of the sample parameter to a point in the curve of the interpolated data set. It is also conceivable that the share value instead of a numerical value z. B. is depicted.
  • An assignment of the sample parameter to the calculated course curve corresponding to a course of the disease thus illustrates the patient's disease state. This gives the doctor an indication of the stage of the disease at which the patient whose sample was taken is located.
  • the invention further includes a system with which a sample's membership of a class can be determined proportionately, so that a state of health is characterized.
  • the system includes a storage unit for storing the signals of an electromagnetic spectrum obtained from a detector, which was generated by measuring an unknown sample.
  • the system also includes an evaluation unit for generating a sample parameter using a multivariate evaluation method based on the signals of the electromagnetic spectrum.
  • the sample parameter is assigned to a data record by means of an evaluation unit. This data record results from the interpolation between at least some of the first data and at least some of the second data, each of which is assigned to a first and second class.
  • the first and second data each contain a first and a second parameter, respectively, which belong to the first and the second class, respectively.
  • This data record is advantageously stored in a permanent memory of the storage unit.
  • the storage unit contains a permanent memory in which only a first and a second parameter, each belonging to a first and second class, are stored.
  • the interpolated data set is then calculated as required.
  • the evaluation unit also determines a proportion of the sample parameter in at least part of the data set.
  • This share value reflects a share of the sample parameter in a class, so that the share of the unknown sample is determined with which the unknown sample belongs to a class.
  • An output unit shows the affiliation of a sample to a class. Data on more than two classes are advantageously stored in the system, so that a system can provide diagnostic information for a large number of different diseases and disease courses. In a preferred one
  • the system further includes a radiation source for irradiating a sample with electromagnetic radiation and a detector that detects the radiation interacting with the sample.
  • a radiation source for irradiating a sample with electromagnetic radiation
  • a detector that detects the radiation interacting with the sample. Emits the radiation source e.g. B. electromagnetic radiation in the infrared range, the detector advantageously detects signals in the range from 1 ⁇ m to 25 ⁇ m. Further advantageous embodiments of the system result as already described.
  • Figure 1 Spectral data of a sample from a healthy person compared to samples from a person suffering from diabetes and from a metabolic syndrome.
  • Figure 2 Comparison of the DPR score, which was obtained on the basis of samples from a healthy person, a person suffering from metabolic syndrome and a person suffering from diabetes.
  • Figure 4 Bar chart showing the interpolation between the DPR score.
  • Figure 5 Braunwald cycle
  • FIG. 1 shows various evaluations of spectral data that were generated when measuring samples from a healthy patient, a patient suffering from the metabolic syndrome and a diabetic.
  • the corresponding samples and the relevant classes are referred to as healthy, metabolic syndrome and diabetes for the sake of simplicity.
  • Characteristic wavenumber ranges between 900 and 1,200 cm '1 , 1,700 to 1,800 cm “1 and 2,800 to 3,000 cm “ 1 are shown in FIGS.
  • the course of the curve marked with 1 in FIG. 1 represents the difference between the data healthy and diabetes and the curve marked with 2 between healthy and metabolic syndrome.
  • Curve 3 illustrates the resulting differences in the spectra between the data healthy and healthy as a result of random differences are generated.
  • FIG. 1 a shows the respective curve shape in the wave number ranges mentioned, which result from the difference between the mean values of the data points.
  • statistical evaluation methods known in the prior art are used.
  • u. a. assessed the significance of differentiation criteria in the spectra.
  • a common method is, for example, to compare the (squared) mean values with (the squared sum) the standard deviations of the respective wavelength.
  • FIG. 1b shows the application of the so-called Fischer criterion to the correspondingly selected wave number ranges.
  • the Fischer criterion allows weighting of the resulting differences in the spectra. For this purpose, the deviation of two curves, each belonging to a different class, is shown in relation to the respective standard deviation within the class. However, no statistical significance of the resulting differences is taken into account.
  • FIG. 1c shows a corresponding graphic in which the T value is plotted against the wave number ranges mentioned.
  • FIG. 2 shows the data of the different classes corresponding to FIG. 1.
  • the data was evaluated using a multivariate evaluation method, so that a parameter was generated in each case that can be assigned to the respective class.
  • the parameters calculated in this way are referred to as the DPR score, after which the parameters have been normalized.
  • the standardization of the DPR score is chosen so that a DPR score of 0 provides diagnostic information about diabetes and a DPR score of 1 was generated by the sample from a healthy patient.
  • the bottom edge of the box shows the DPR score below which 25% of the parameters lie.
  • the middle line in the box is referred to as the median, with 50% of the parameters being smaller than this value, 75% of the parameters can be assigned below the DPR score of the top edge of the box.
  • the respective error bars in the display show the area in which 90% of the parameters are arranged, as can be seen from the data presented in this way, about 75% of the parameters in the diabetes class are less than 0.25, so that these samples can be clearly assigned to the class Accordingly, 50% of the data in the class metabolic syndrome are below the DPR score 0.87. 75% of the data belonging to the healthy class are above the DPR score of 0.87. As can be seen from the illustration, 50% of the data in the class metabolic syndrome are in the range DPR> 0.87, which also allows an assignment to the class healthy. The classes consequently have an intersection of data, and it is not possible to assign a sample parameter to this intersection in the prior art.
  • an unknown sample is assigned to a data record which is determined by the interpolation between e.g. B. the data of the class "healthy” and the data of the class "diabetes" are calculated.
  • the data is interpolated by an interpolation between the DPR scores of the respective classes. If there is an interpolation between the DPR scores of the healthy and diabetes class, a curve results which advantageously reflects the course of the disease of the disease diabetes. This shows that the DPR score of the class of the metabolic syndrome can be assigned to the interpolated data set between the classes healthy and diabetes. In this way, a connection between the three different classes becomes clear, which allows conclusions to be drawn about a medical connection between the diseases. According to the evaluation, the diagnosis of the metabolic syndrome is therefore to be classified in the course of the disease of the disease diabetes and is therefore to be regarded as a preliminary stage of the disease diabetes.
  • FIG. 3 shows the application of two main components of a multivariate evaluation method that were generated during the analysis of a sample. Plotting the main components of a multivariate evaluation procedure against each other allows areas to be identified, which can each be assigned to a class A or B.
  • the data points shown in a square are in the area of class B and the data points in a circle represent the area of class A.
  • the discriminant function (20) delimits the areas of the respective classes. In an area in the immediate vicinity of the discriminant function, an assignment to class A or B can no longer be made clearly. In this area, the data points are each marked with a cross. These data points form an intersection between classes A and B, the assignment of which to a class was not possible in the prior art using known methods.
  • FIG. 4 shows a quantification of the disease state derived from this, which results from an interpolation between the DPR scores of classes A and B.
  • the number of samples that were measured is plotted against the calculated DPR score. This shows that a significant proportion of samples lies in the area of the intersection, so that no assignment to a class is possible in the prior art.
  • a sample with a DPR score of 0.6 can thus be given the diagnostic indication that there is a certain proportion of the risk of developing class A disease. This risk can be expressed as a percentage, for example, so that a DPR score of 0.6 reflects a 60% probability of developing class A.
  • a DPR score of 0 is assigned to class B and 1 to class A.
  • the distance of a data point to the Discriminant function can be used to determine the share value.
  • the distance (21) is calculated as a plumb line to the discriminant function in accordance with the range of 0-1 between class A and B spanned by the DPR score. Such relationships can also be illustrated in a graphic.
  • FIG. 5 shows the course of a disease which is described in the prior art (Circulation 80, 410-414 (1989)) as the Braunwald cycle.
  • the Braunwald cycle depicts the course of a coronary heart disease and thus reflects relationships between different disease states. Based on specific risk factors or other early stages of a disease, the course of the disease first manifests itself in the symptoms of arteriosclerosis. If arterioslderosis is diagnosed, this condition can initially be undetermined. At this point in time there is no clear connection to a serious heart disease. However, if arteriosclerosis changes into coronary heart disease, angina pectoris can be induced. According to the Braunwald cycle, this condition can result in a heart attack.

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  • Investigating Or Analysing Materials By Optical Means (AREA)

Abstract

Die Erfindung bezieht sich auf das Gebiet von Analysemethoden, die zur Diagnose von Krankheiten an menschlichen und tierischen Proben geeignet sind. Die Erfindung offenbart ein Auswerteverfahren, durch das es möglicht wird, einzelne Krankheitsstadien zu diagnostizieren, so dass der Verlauf einer Krankheit abgebildet werden kann. Hierdurch können eine Früherkennung von Krankheiten sowie Therapiekontrollen etc. geleistet werden. Das erfindungsgemässe Verfahren macht sich multivariable Auswerteverfahren zunutzen, die im Stand der Technik zur Klassifizierung von Proben bekannt sind. Anders als im Stand der Technik erfolgt jedoch erfindungsgemäss keine Zuordnung einer Probe zu einer Klasse, sondern eine Einordnung in einen Datensatz, der sich aus der Interpolation zwischen verschiedenen Klassen ergibt.

Description

KRANKHEITSVERLAUFKONTROLLE
Die Erfindung bezieht sich auf das Gebiet von Analysemethoden, die zur Diagnose von Krankheiten an menschlichen oder tierischen Proben geeignet sind. Zur Analyse der Proben werden elektromagnetische Spektren aufgenommen und gespeichert und mittels multivariater Auswerteverfahren analysiert. Die Diagnose von Krankheiten mittels mul- tivariater Auswerteverfahren ist im Stand der Technik bereits bekannt und wird im Nachfolgenden noch näher erläutert. Mit Hilfe des erfindungsgemäßen Verfahren ist es jedoch erstmals möglich, neben der Erkennung einer spezifischen Krankheit auch einzelne Verlaufsformen eines Krankheitsbildes sicher zu erkennen. Das erfindungsgemäße Verfahren ermöglicht somit erstmals einzelne Verlaufsstadien, eine Kranldieit zu diagnostizieren, die zum Beispiel Hinweis auf die Entstehung einer Krankheit geben können, oder Auswirkung von Therapiemethoden auf den Gesundheitszustand eines Patienten widerspiegeln.
Im Stand der Technik beruhen die meisten diagnostischen λ^erfahren derzeitig auf der Erkennung einzelner charakteristischer Stoffe in einer zu untersuchenden Probe, die Hinweis auf eine Kranldieit geben. Diese Stoffe werden zum Beispiel im Blut, Urin oder andere Körperflüssigkeiten nachgewiesen. Für eine Kranldieit charakteristische Stoffe sind z. B. krankheitsbedingte Stoffwechselprodukte, die sich im Körper akkumulieren und im Blut nachgewiesen werden können. Die von den Patienten entnommenen Proben werden mittels klinischer Analyseverfahren oder spektroskopischer Verfahren untersucht und in einem Zusammenhang mit den Krankheitssymptomen des Patienten gestellt. Aufgrund dieser Befunde erfolgt eine ärztliche Diagnose, die sowohl die Analyseergebnisse der Probe als auch die Krankheitssymptome des Patienten berücksichtigt.
Oftmals zeigt es sich jedoch, dass die Diagnose einzelner Krankheiten besonders schwierig ist, da hier die für die Kranldieit zu analysierenden Stoffe nicht eindeutig bestimmbar oder sogar unbekannt sind. Eine Diagnose derartiger Krankheiten kann häufig nur durch aufwendige Analysen vielfältiger Parameter gewährleistet werden, die einen Hinweis auf die Kranldieit geben. Ein Beispiel für eine schwer diagnostizierbare Krankheit ist z. B. das metabolische Syndrom, unter dem - wie vermutet wird - in den Vereinigten Staaten mindestens jeder 10. Erwachsene leidet. Damit ist diese Erkrankung eine der häufigsten Gesundheitsanomalien in einer westlichen Zivilisation. Beim metabolischen Syndrom handelt es sich um eine Ansammlung von fünf verschiedenen Risikofaktoren, die eine hohe kardiovaskuläre Sterblichkeit nach sich ziehen. Ein metabolisches Syndrom gilt dann als diagnostiziert, wenn mindestens drei von fünf Risiko faktoren vorhanden sind. Zu den Risikofaktoren bzw. Parametern, die zur Bestimmung dieser Krankheit zählen, gehören Fettsucht, Bluthochdruck, Cholesterinwerte sowie erhöhter Blutzucker- und Blutfettwert. Das angeführte Beispiel zeigt, dass zur Diagnose diese Krankheit fünf unterschiedliche Untersuchungen notwendig sind, die dann auf das Krankheitsbild schließen lassen.
Um derartige Aufwendige Untersuchungsverfahren zu vereinfachen und eine größere Diagnosesicherheit zu gewinnen, wurden Verfahren zur Krankheitsanalyse entwickelt, die auch ohne die Kenntnis von einem eindeutigen für eine Krankheit charakteristischen Stoff eine sichere Diagnose mit nur einem Messverfahren zulassen. Diese Verfahren werden z. B. mittels der IR-Spektroskopie durchgeführt und machen sich u. a. multi- variate Auswerteverfahren zunutzen. Mit Hilfe multivariater Auswertealgorithmen ist es dabei möglich, eine Mustererkennung von Spektren vorzunehmen, ohne dass die Charakterisierung einzelner Stoffe vorgenommen werden muss. Multivariate Auswer- teverfahren erlauben dabei, mit einer hohen Zuverlässigkeit eine unbekannte Probe zu analysieren und sie in Abhängigkeit von einer zuvor trainierten Datenbank verschiedenen Krankheiten zuzuordnen. Zur Erstellung der Datenbank werden zunächst Proben von Patienten entnommen, die ein spezifisches Krankheitsbild aufweisen. Die vermessenen Spektren werden anschließend einer Klasse zugeordnet, die die jeweilige Krank- heitsfamilie charakterisiert. Wird für eine Vielzahl von Proben Infrarotspektren nach identischen oder zumindest vergleichbaren Messverfahren aufgenommen, die einer bekannten Klasse angehören, kann ein Training der Datenbank erfolgen. Diese Spektren werden entsprechend ihrer Klassifikation dem multivariaten Auswerteverfahren zugeführt, sodass die Datenbank charakteristische Spektrenmuster, die jeweils einer Klasse angehören und somit einer Krankheitsfamilie zugeordnet sind, beinhaltet. Mit Hilfe von multivariaten Auswertealgorithmen wird das System solange trainiert, bis zwischen verschiedenen Klassen unterschieden werden kann. Beispielsweise erfolgt so eine Kate- gorisierung von Proben, die von gesunden bzw. an einer zu untersuchenden Anomalie erkrankten Menschen entnommen wurden. Wird nun eine unbekannte Probe ver- messen, kann das System mit hinreichender Zuverlässigkeit die unbekannte Probe einer Klasse zuordnen, sodass eine Diagnosehinweis gegeben wird. Hierbei findet vorzugsweise eine Mustererkennung des vermessenen Spektrums in einem zuvor definierten, vermessenen Wellenlängenbereich statt, auf dessen Basis eine Einordnung einer unbe- kannten Probe in eine zuvor klassifizierte Krankheitsgruppe (krank/gesund) erfolgt. Grundprinzipien eines derartigen Verfahrens, das eine Klassifizierung von Proben mittels IR-Spektroskopie und multivariaten Auswerteverfahren ermöglicht, sind z. B. in dem Dokument EP 0 644 412 beschrieben.
Des weiteren wird in dem Dokument EP 02 000 952.8 die Anwendung eines derartigen Verfahrens zur Analyse des metabolischen Syndroms offenbart. Hierfür werden in einer Datenbank, die in einem vorbestimmten Wellenlängenbereich Spektren von gesunden Patienten sowie Spektren von Patienten, die unter dem metabolischen Syndrom leiden, gespeichert und klassifiziert.
In Abhängigkeit der zu erstellenden Analyse wird ein Wellenlängenbereich ausgewählt, in dem charakteristische Spektrenmuster eine Zuordnung zu einer Klasse sicher erlauben. Eine Bestimmung des jeweiligen Wellenlängenbereiches, der sich zur Analyse eines bestimmten Krankheitsbildes als geeignet erweist, kann z. B. mittels multivariater Verfahren erfolgen oder Algorithmen, wie sie z. B. in „NMA Biomedicineκ, Vol. 11, Issue 4 - 5 (1998), pp. 209-216, beschrieben sind. Bei einer Vielzahl von Auswerteverfahren, wie der Diskriminanz- und Clusteranalyse, wird folglich zunächst eine Korrelationsmatrix aufgestellt. Aufgrund der Korrelationsmatrix ermittelt das Auswerteverfahren welche Wellenlängen mit welchem Einfluss zur Klassifizierung verwendet werden sollen. Die zur Auswertung herangezogenen Wellenlängen spannen einen Raum auf, der in seiner Dimension mit der Zahl der Wellenlängen übereinstimmt. Von dem Auswerteverfahren wird ein Unterraum gewählt, in dem die Zuordnung von Proben zu den Klassen möglichst eindeutig erfolgt. Hierbei ergibt sich die Zuordnung von Proben zu einer Klasse aus ihrer räumlichen Nähe in dem genannten Unterraum. Sobald ein Schema zur Klassifikation entsprechend einer Krankheitsfamilie entwickelt wurde, können die Daten im System gespeichert werden, sodass ein Analysesystem Diagnosehinweise für eine Vielzahl von Krankheiten leisten kann.
Im Folgenden werden anhand des Beispiels der Diskriminanzanalyse multivariate Auswerteverfahren, wie sie im Stand der Technik bekannt sind, näher erläutert. Die lineare Diskriminanzanalyse ermöglicht eine Trennung zwischen zwei Datensätzen, die im aufgeführten Beispiel, z. B. Patientendaten eines gesunden und eines erkrankten Patienten, wiederspiegeln, mit dem Ziel eine sichere Unterscheidung zwischen den Datensätzen zu ermöglichen. Hierbei zeigt die Praxis, dass es häufig zu Überlappungen der Datensätze kommt, wobei eine Anzahl von Daten sowohl den Datensatz „gesund" als auch den Datensatz „krank" zugeordnet werden kann. Eine eindeutige Klassifizierung dieser Daten, die im angeführten Beispiel als Schnittmenge der Datensätze „gesund" und „krank" bezeichnet werden kann, ist somit nicht gegeben. Eine Zuordnung von unbekannten Probe, deren vermessene Parameter in diesen Schnittbereich der beiden Datensätze liegen, ist deshalb nicht möglich. Die lineare Diskriminanzanalyse zieht analog zu anderen multivariaten Auswerteverfahren eine Grenze zwischen zwei Datensätzen, zu denen eine Zuordnung jeweils erfolgen soll. Alle Daten, die innerhalb dieser Grenze/Grenzwerte liegen, gehören z. B. der Klasse „gesund" an. Je größer der Datensatz einer Klasse gewählt wird, desto sensitiver ist eine Zuordnung einer unbe- kannten Probe in diese Klasse, sodass nahezu alle Proben, die dieser Klasse angehören, auch dieser zugeordnet werden. Ein derartig großer Datensatz umfasst dann jedoch auch die Zuordnung der Proben, die der Klasse fälschlicher Weise zugeordnet wurden, sodass eine sensitive Zuordnung eine entsprechend geringe Spezifität aufweist. Aufgabe von derartigen Auswerteverfahren ist es deshalb, ein Optimum der Zuordnung zu erreichen, das zwischen Sensitivität und Spezifität abwägt. Dabei ist ein Training des Programms, das Sensitivität und Spezifität der Zuordnung erhöht mittels der Vermessung und Zuordnung von bekannten Proben möglich. In der Praxis werden bei der Auswertung die Verfahrensparameter entsprechend der jeweiligen Zuordnung angegeben, die die Sensitivität und Spezifität des Verfahrens kennzeichnen. Hierbei werden die Werte von unbekannten Proben, die sich unmittelbar in einer Schnittmenge von Datensätze befinden, als nicht auswertbar gewertet, um einen zu großen Fehler bei der Zuordnung zu vermeiden. Ein Diagnosehinweis zu einer Probe, deren Parameter innerhalb der Schnittmenge liegen, ist nicht möglich.
Nachteil des Standes der Technik ist folglich, dass die Diagnose einer Krankheit nur bezüglich verschiedener Klassen (z. B. „gesund" oder „krank") erfolgen kann, ohne dass z. B. Daten innerhalb der Schnittmenge berücksichtigt werden können. Ein an sich kontinuierlicher Krankheitsverlauf eines Patienten wird somit in zwei diskrete Schritte eingeteilt, die als Diagnosehinweis ausschließlich den Zustand „gesund" oder „krank" zulassen. Ein realer Verlauf einer Krankheit mit verschiedener Krankheitsstadien kann somit nicht berücksichtigt werden.
Das erfindungsgemäße Verfahren hat die Aufgabe, die beschriebenen Nachteiles des Standes der Technik zu vermeiden. Insbesondere berücksichtigt dabei das erfindungs- gemäße Verfahren den kontinuierlichen Verlauf einer Krankheit und ermöglicht somit insbesondere auch eine Auswertung von Spektren innerhalb einer Schnittmenge von Datensätzen. Das erfindungsgemäße Verfahren macht sich folglich gerade diese Daten zunutze, die nach dem Stand der Technik als nicht auswertbar gelten. Durch das erfindungsgemäße Verfahren wird z. B. eine Früherkennung von Krankheiten sowie eine Diagnostizierung von Krankheitsverläufen etc. ermöglicht.
Die Erfindung beinhaltet ein Verfahren zur Auswertung eines elektromagnetischen Spektrums, wobei eine Zugehörigkeit des elektromagnetischen Spektrums zu einer Klasse anteilmäßig bestimmt wird. Auf diese Weise wird gewährleistet, dass ein realer Gesundheits-/bzw. Krankheitsverlauf abgebildet werden kann, sodass wesentliche Rückschlüsse z. B. auf eine Therapie getroffen werden können oder krankheitsvorbeugende Maßnahmen möglich werden.
Das erfindungsgemäße Verfahren analysiert ein elektromagnetisches Spektrums, das durch eine Vermessung einer unbekannten Probe generiert wurde. Mittels eines multivariaten Auswerteverfahren wird hierbei ein Probenparameter ermittelt, der zu einem Datensatz zugeordnet werden kann. Der Datensatz wird durch die Interpolation zwischen mindestens einem Teil von ersten Daten und mindestens einem Teil von zweiten Daten berechnet, wobei die ersten und zweiten Daten jeweils einer ersten und zweiten Klasse zugeordnet sind. Hierbei beinhalten die ersten Daten einen ersten Parameter, der anhand von elektromagnetischen Spektren von bekannten Proben, die der ersten Klasse angehören, mittels des multivariaten Auswerteverfahrens generiert wurde, sodass eine zuverlässige Zuordnung von Proben zu der ersten Klasse aufgrund des ersten Parameters möglich ist.
Die zweiten Daten beinhalten analog einen zweiten Parameter, der ebenfalls anhand von elektromagnetischen Spektren von bekannten Proben, die der zweiten Klasse angehören, mittels des multivariaten Auswerteverfahrens generiert wurde, sodass eine zuverlässige Zuordnung von Proben zu der zweiten Klasse aufgrund des zweiten Parameters möglich ist. Nach der Zuordnung des Probenparameters zum Datensatz, wird ein Anteilswert des Probenparameters an zumindest einem Teil des Datensatzes bestimmt. Aufgrund der Basis dieses Anteilswertes wird ein Anteil des Probenparameters an einer Klasse wiedergegeben, sodass der Anteil der unbekannten Probe bestimmt wird, mit dem die unbekannte Probe einer Klasse angehört.
Das erfindungsgemäße Verfahren ermöglicht eine kontinuierliche Klassifizierung einer Probe zwischen verschiedenen Krankheitsfamilie. Aufgrund der Interpolation zwischen Daten, die z. B. im Spätstadium einer Krankheitsfamilie gefunden werden und Daten, die von einem gesunden Patienten ermittelt werden können, kann der Verlauf einer Krankheit durch eine Verlaufskurve der interpolierten Daten abgebildet werden. Im Rahmen der Erfindung wird der interpolierte Datensatz durch einen Datenbereich definiert, der durch die Interpolation zwischen mindestens zwei Werten aufgespannt wird, so dass der Datensatz mindestens einen Zwischenwert beinhaltet, der den aufgespannten Datenbereich zwischen den bekannten Werten definiert. Hierbei gehören die bekannten Daten, zwischen denen eine Interpolation erfolgt, erfindungsgemäß jeweils der ersten und zweiten Klasse an.
Eine Zuordnung von vermessenen Daten zu einer Verlaufskurve des interpolierten Datensatzes ermöglicht, das Krankheitsstadium einer Probe genau abzubilden und so z. B. eine Prognose über den Verlauf der Krankheit zu erstellen oder ggf. eine Wahrscheinlichkeit einer möglichen Erkrankung zu berechnen. Eine derartige Einordnung der Probe bietet somit u. a. die Möglichkeit, Frühdiagnose sicher zu gewährleisten, die sich zur Heilung vieler Krankheiten als wesentlich erweisen. Die kontinuierliche Differenzierung des Krankheitsbildes erlaubt hierbei eine Verlaufsprognose für Krankheiten und ein Monitoring der jeweiligen akuten Verlaufsform abzubilden, ohne dass das Verfahren auf die ausschließliche Zuordnung zwischen zwei Klassen beschränkt ist. Eine Auswertung von Daten, die nach dem Stand der Technik innerhalb einer Schnittmenge liegen, wird möglich.
Das erfindungsgemäße Verfahren befasst sich mit der Analyse von Körperflüssigkeiten, Zeil- und Bakteriensuspensionen. Klinisch relevante Körperflüssigkeiten, die mit diesem Verfahren ausgewertet werden können, sind z. B. Blut, Plasma, Serum, Hämolysat, Urin, Liquor, Speichel, Transpirationsflüssigkeit, Augenflüssigkeit, Zystenflüssigkeit, Fruchtwasser, Sputum, Ascitis, Sperma. Unter Zeil- und Bakteriensuspensionen sind solche Proben zu verstehen, die entweder direkt (z. B. durch Punktion, Abstrich etc.) oder durch Anzucht in einem Nährmedium gewonnen werden.
Insbesondere ist ein erfindungsgemäßes Verfahren geeignet, Flüssigkeiten mit einer Vielzahl verschiedener Inhaltsstoffe zu analysieren. Dies gilt besonders für Blut, Plasma, Serum und Hämolysat.
Die Durchführung des erfindungsgemäßen Verfahrens beginnt mit einem Zurverfü- gungstellen der zu klassifizierenden Probeflüssigkeit bzw. -Suspension. Dies kann in ausreichend bekannter Weise z. B. durch die Entnahme einer Blut- oder Urinprobe erfolgen. Für einige Arten von Proben ist es vorteilhaft, wenn vor der Durchführung des Verfahrens eine Aufarbeitung erfolgt. Vollblut kann beispielsweise zentrifugiert werden, um Serum und Blutkuchen voneinander zu trennen.
Die gewonnene Probe kann vorteilhafterweise auf einen Träger aufgegeben werden, der es ermöglicht, ein Infrarotspektrum aufzunehmen. Ein solcher Träger kann beispielsweise ein metallisierter Objektträger sein. Bevorzugt sind solche Träger, die auf ihrer Oberfläche reflektierend sind und eine Rauhigkeit besitzen, die eine diffuse Streuung von Infrarotstrahlung bewirkt. Ebenfalls können solche Träger verwendet werden, die auf ihrer Oberfläche, auf die die Probe aufgebracht wird, verspiegelt sind. Eine Beschichtung der Träger kann mit Metallen, vorzugsweise Edelmetallen wie Gold, Platin, Palladium aber auch z. B. mit unedlen Metallen, vorzugsweise Aluminium und Chrom erfolgen. Diese Beschichtungen besitzen den Vorteil, dass sie weitgehend inert gegenüber der Probe und auch gegenüber der Umgebungsluft sind. Die Träger können eine ebene Oberfläche besitzen, aufweiche die Probe aufgegeben wird. Erfindungsgemäß bevorzugt sind jedoch solche Träger, die eine Vertiefung zur Aufnahme der Probenflüssigkeit besitzen.
Geeignete Probenträger werden z. B. in dem Patent US 5,734,587 beschrieben, für
Transmissionsmessungen sowie für Reflektionsmessungen in dem Patent US 5,869,001.
Weitere bevorzugte Ausführungsformen von Probenträgern werden z. B. in dem Dokument EP 0 644412 und DE 4331596 beschrieben.
Neben zur Reflektionsmessung geeigneten Trägern können auch Träger zur Transmis- sionsmessung vorteilhaft verwendet werden, welche die eingestrahlte Strahlung hindurchlassen. Die genannten Träger können zum Beispiel aus Kunststoffen, wie Poly- carbonat, Polyethylen oder Polymethylmefhacrylat, bestehen, die für Infrarotstrahlung in weiten Wellenzahlbereichen durchlässig sind. Diese Träger für die Transmissionsmessung können analog denen für die Reflektionsmessung Vertiefungen für die Pro- benflüssigkeit besitzen. Hierbei besitzen Messungen in diffuser Reflektion den Vorteil, dass Inhomogenitäten des Probenmaterials, z. B. Trübungen, die Auswertung nicht stören, sondern sogar die diffuse Reflektion unterstützen. Zur Verwendung der oben genannten Träger hat es sich als vorteilhaft erwiesen, die aufgetragene Probe vor dem Vermessen zunächst eintrocknen zu lassen. Beispiele zum Trocknen der Probe werden z. B. in dem US-Patent 5,869,001 offenbart. Es besteht jedoch auch die Möglichkeit, auf den Trockenschritt zu verzichten und die flüssige Probe direkt zu vermessen. Messungen an flüssigen Proben werden beispielsweise im Dokument WO 02/057753 beschrieben. Hierbei erfolgt die Messung in Transmission durch eine Messzelle mit einer Dicke von wenigen μm.
Des weiteren erweisen sich auch Messungen unter abgeschwächter Totalreflektion (ATR-Messungen) für das erfindungsgemäße Verfahren als geeignet.
Anordnungen zur Auswertung diffuser oder direkter Reflektion sowie zur Transmissionsmessung sind im Stand der Technik prinzipiell bekannt und werden deshalb an dieser Stelle nicht näher erläutert. Eine Anordnung, die zur Auswertung diffus reflektierter Strahlung dient, ist z. B. in der Patentanmeldung DE 43 31596 detaillierter dar- gestellt.
Prinzipiell gibt es zwei verschiedene Messtechniken, die häufig in der Spektroskopie zur Untersuchung von Proben im diagnostischen Bereich verwendet wird. Hierbei wird bei der Infrarotspektroskopie häufig im mittleren Infrarotbereich (2,5 - 25 μm) gemessen. Zur Aufnahme eines Infrarotspektrums wird die Probe auf dem Probenträger mit Infra- rotstrahlung beleuchtet. Infrarotstrahlung in den bereits beschriebenen Wellenzahlbereichen kann mit im Markt befindlichen IR-Spektrometern von beispielsweise Nicolet, Bruker und Perkin Eimer erzeugt werden.
In Abhängigkeit von der zu untersuchenden Probe verwendet man ebenfalls häufig die Raman-Spektroskopie, die jedoch im Vergleich zur Infrarotspektroskopie eine wesent- lieh geringere Sensitivität zum Nachweis eines Analyten aufweist. Hierfür macht man sich jedoch gerade bei biologischen Proben häufig den Vorteil zunutze, dass, anders als in der Infrarotspektroskopie, nur geringfügig störende Wasserbanden das Analytsignal überlagern. Gerade bei biologischen Proben, bei denen der Wassergehalt häufig sehr hoch ist, führen Infrarotmessungen häufig zu verfälschten Analyseergebnissen, da eine starke Absorptionsbande von Wasser im mittleren Infrarotbereich liegt. Trotz der schlechteren Sensitivität erweist sich somit die Raman-Spektroskopie unter Umständen als eine geeignete Spektroskopiemethode. Nähere Informationen zu den genannten Spektroskopiemethoden sowie möglichen Anwendungen werden z. B. in dem Dokument „Mid-IR and Raman spectroscopy for medical diagnostics", Appl. Spectros. Rev. 36, pp. 181 - 237 (2001), bei W. Petrich, vorgestellt.
Um die Absorption von Wasser bei der Infrarotspektroskopie weitestgehend zu mini- mieren, kann es sich als vorteilhaft erweisen, die Probe vor dem Vermessen, wie bereits beschrieben, zunächst auf dem Probenträger eintrocknen zu lassen. Dabei hat sich herausgestellt, dass das Eintrocknung in der Regel zu keiner Beeinträchtigung der Probe führt, die eine Analyse und Klassifikation unmöglich macht. Die Eintrocknung ist hingegen ein wichtiger Schritt, um die benötigte hohe Reproduzierbarkeit bei der Spektren- aufzeichnung zu erhalten.
Das Eintrocknen der Probe kann durch einfaches Verdampfen der Flüssigkeit bei Raumtemperatur oder aber auch unter besonderen Bedingungen, beispielsweise durch Anlegen eines Vakuums, Erwärmung der Probe oder Aufbewahrung in Gegenwart eines Trockenmittels, erfolgen. Hierbei wird unter dem Begriff Eintrocknen im Wesentlichen keine hundertprozentige Trocknung der Probe gemeint, sodass eine getrocknete Probe wenige Prozent Restfeuchte enthält. Die Trockenschritte - wie beschrieben - besitzen dabei den Vorteil, dass die Probe einen zusammenhängenden Film ohne Risse ausbildet, die eine Auswertung beeinträchtigen könnten.
Beim Eintrocknen der Probe entsteht abhängig von den Trockenbedingungen, Träger und der Art der Probe ein Trocknungsrest von variierender Gestalt. Beim Eintrocknen von Serumproben aufgeschlossenen Oberflächen bildet sich in der Regel ein kreisförmiger Wulst, dessen Dicke in Richtung auf das Kreiszentrum hin abnimmt. Bei freitragenden Filmen bildet sich in den Randzonen zum Trägermaterial ebenfalls ein Wulst, der zur Mitte der Öffnung in einen relativ gleichmäßig dicken Film übergeht.
Die Bestrahlung der Probe in Reflexion und Transmission erfolgt bevorzugt so, dass die gesamte Probe von dem IR-Strahlenbündel erfasst wird. Aufgrund dieser integralen Bestrahlung der Probe ist die Messung weitestgehend unabhängig von dem Trock- nungsprofil der Probe. Dies ist ein weiterer, wesentlicher Faktor, der die Reproduzierbarkeit der Spektrenauswertung erhöht.
Wird Raman-Spektroskopie als Analysemethode verwendet, ist ein Trockenschritt während der Probenpräparation nicht notwendig.
Zur Aufnahme eines Infrarotspektrums wird die Probe mit Infrarotstrahlung beleuchtet. Die Infrarotstrahlung kann innerhalb des gesamten Infrarotbereichs, d. h. etwa 400 bis 15.000 cm"1 liegen. Besonders vorteilhaft in Zusammenhang mit der vorgenannten Trocknungsmethode ist die IR-Spektroskopie im Bereich von 400 bis 4.000 cm" , da sie in diesem Bereich eine hohe Spezifität besitzt.
Die durch die Probe hindurchgetretene oder von der Probe reflektierte Strahlung wird durch einen Detektor aufgefangen, der einen möglichst großen Teil der Strahlung erfassen sollte. Im Stand der Technik sind infrarotsensitive Detektoren, wie z. B. Bolometer, Thermoelemente, photovoltaische Elemente und Halbleiterdetektoren bekannt. Bevor die Strahlung in den Detektor gelangt, kann sie durch ein System aus Linsen, Blenden und Spiegeln geleitet werden.
Die Aufnahme von Infrarotspektren ist aus dem Stand der Technik hinlänglich bekannt. Bezüglich der Aufnahme von IR-Spektren eingetrockneter Proben sei hier auf die Patentanmeldung DE 4331596 verwiesen.
Bei den üblichen Verfahren der Spektrenauswertung wird in Abhängigkeit von der ein- gestrahlten Wellenlänge die transmittierte oder reflektierte Strahlung aufgezeichnet.
Erfindungsgemäß wird ein solches Spektrum durch ein multivariates Auswerteverfahren zur Genierung eines Probenparameters ausgewertet. Im Rahmen der Erfindung umfasst dabei der Begriff Spektrum jegliche Form der Datenstruktur, die durch die Vermessung einer Probe, wie beschrieben, generiert wird. Dabei ist es für das erfindungsgemäßen Auswerteverfahren ohne Bedeutung, ob dem Verfahren z. B. die Daten eines Inter- ferrogramms oder die hieraus resultierenden fouriertransformierten Daten zugrunde gelegt werden. Für diesen Auswerteprozess muss das Spektrum zunächst digitalisiert werden, sofern es nicht bereits digital aufgezeichnet wurde. Dies bedeutet, dass das Spektrum in eine Wertetabelle umgesetzt wird, die für diskrete Wellenzahlen die Absorption oder Transmission enthält. Die Zahl der Wertepaare richtet sich im wesentlichen nach der Kapazität der vorhandenen Soft- bzw. Hardware. Erfindungsgemäß ist es nicht notwendig, aus dem Spektrum einzelne Banden zu analysieren und getrennt auszuwerten. Es hat sich für einige Analysen jedoch als vorteilhaft erwiesen, wenn die Wertetabelle, die zur Auswertung kommt, auf bestimmte Bereiche der Wellenzahlen beschränkt wird. Prinzipiell können vielfältige Verfahren zur Selektion von Wellenlängenbereichen verwendet werden. Derartige Verfahren sind im Stand der Technik hinlänglich bekannt und z. B. in EP 0644412 und WO 02/66963 dargelegt. Auf diese Weise kann eine Auswahl relevanter Bereiche der Spektren erfolgen und Spektrenteile, die von geringem Informationsgehalt sind, können eliminiert werden.
Das digitalisierte Spektrum wird einem multivariaten Auswerteverfahren, das als Computerprogramm zur Verfügung steht, übergeben.
Multivariate Auswerteverfahren sind im Sinne der Erfindung Diskriminanzanalysen, regularisierte Diskriminanzanalysen, neuronale Netze, Clusteranalysen usw. Prinzipiell sind jegliche denkbaren multivariaten Auswerteverfahren, wie sie im Stand der Technik hinreichend bekannt sind, bei der Durchführung des erfindungsgemäßen Verfahrens möglich.
Genannte Softwarepakete können beispielsweise von den Firmen STSC, STAT SOFT, SAS und Galactic Industries bezogen werden.
Die multivariaten Auswerteverfahren müssen vor ihrer erfindungsgemäßen Anwendung auf das Anwendungsgebiet trainiert werden. Dies erfolgt in der Regel durch eine Zahl von Trainingsläufen, bei denen Infrarotspektren einer Mehrzahl von Proben bekannter Klassifikationen in das Auswerteverfahren eingegeben werden. Ebenfalls wird die Art der Klassifikation der einzelnen Proben dem Auswerteverfahren mitgeteilt. Bei dem genannten Trainingslauf wählt der Auswertealgorithmus selbsttätig Parameter, die eine sichere Zuordnung der Proben zu den vorgegebenen Klassen sicherstellen. Die auf diese Weise gewonnenen Parameter können im späteren Verlauf zur Berechnung des inter- polierten Datensatzes dienen. Hierbei ist es erfindungsgemäß ohne Bedeutung, ob eine Interpolation zwischen den Parametern direkt erfolgt oder eine Interpolation zunächst zwischen den Spektrendaten durchgeführt wird, bevor eine Generierung der Parameter erfolgt. Es zeigt sich jedoch, dass zunächst die Bestimmung der Parameter und anschließend eine Interpolation zwischen den Parametern eine Generierung des interpolierten Datensatzes erheblich vereinfacht.
Das Analysesystem kann in der Regel eine Vielzahl von verschiedenen Klassen beinhalten, zwischen denen erfindungsgemäß interpoliert werden kann. Das erfindungsgemäße Verfahren ermöglicht durch die Interpolation zwischen Daten einen Krankheitsverlauf widerspiegeln zu können und somit auch Zwischenstufen eines Krankheitsbildes genau abzubilden und zu verfolgen. Mit Hilfe des erfindungsgemäßen Verfahrens erfolgt eine Einordnung der Probe in verschiedene Verlaufskurven unterschiedliche Krankheits- Verläufe, die mit bisherigen Methoden eine Vielzahl separater Analyseprozesse benötigte. Hierbei sind Klassen, die in den Bereich der inneren Krankheiten fallen, für die klinische Analyse besonders wichtig. Beispielsweise ist mit erfindungsgemäßen Verfahren die Generierung von Verlaufskurven möglich, die es erlaubt, vorauszusagen, ob eine Leberoder Nierenkrankheit vorliegt. Die beschriebene Einordnung einer unbekannten Probe ist jedoch nicht mit einer eindeutigen Diagnose gleichzusetzen, da gleiche spektrale Veränderungen der Probe unter Umständen durch verschiedene Krankheiten oder Störungen hervorgerufen werden können. Die genannte Einordnung der Probe stellt vielmehr ein Screeningverfahren dar, mit dem entschieden werden kann, aufweiche Krankheiten die Probe mit klassischen Verfahren geprüft werden soll. Hieraus resultiert eine Ein- sparung einer Vielzahl von analytischen Tests, die normalerweise, z. B. bei einer Eingangskontrolle in Klinildabors, notwendig wären.
Darüber hinaus ermöglicht das erfindungsgemäße Verfahren die Früherkennung von Krankheiten, die unter Umständen mittels ldassischer Verfahren nicht geleistet werden können.
Wie im weiteren Verlauf noch dargestellt wird, ist es mittels des erfindungsgemäßen Verfahrens gelungen, erstmals Zusammenhänge zwischen verschiedenen Krankheiten abzubilden, die bislang unabhängig voneinander betrachtet und behandelt wurden. Es wird schnell ersichtlich, dass derartige neu gewonnene Erkenntnisse über Zusammenhänge von bislang als unabhängig betrachteten Krankheiten, vielfältige neue Möglich- keiten der Therapie und Vorsorge bieten.
Erfindungsgemäß kann die Interpolation zwischen zwei Klassen (z. B. gesund und krank) am Beispiel der linearen Diskriminanzanalyse erfolgen, indem vorteilhafterweise der Abstand zwischen der Diskriminanzfunktion und des Probenparameters der zu untersuchenden Probe im multidimensionalen Raum berechnet wird. Dieser Raum könnte z. B. der Raum der Hauptkomponenten sein, der Abstand könnte definiert werden durch den euklidischen Abstand, oder dem Mahalalobis-Abstand. Dieses Abstandmaß kann dann über den gesamten Datensatz des Trainings normiert werden und als besondere Ausformung einer Interpolation verstanden werden. Alternativ hierzu könnte der Abstand mit Hilfe einer Wahrscheinlichkeitsfunktion umgerechnet werden. Ebenso ist es denkbar, den Wert der Diskriminanzfunktion zu benutzen, oder einen mit Hilfe einer Wahrscheinlichkeitsfunktion modifizierten Wert der Diskriminanzfunktion.
Im Fall einer Auswertung durch neuronale Netze ist es denkbar, die Gewichtung der jeweiligen Vernetzung bzw. Neuronen zu den beiden Ausgangsneuronen, z. B. den Klassen krank und gesund, miteinander zu kombinieren, zu normieren und eine Skalierung dieser normierten Gewichtung zwischen den beiden Klassen/ Ausgangsneuronen als Interpolation zu benutzen.
Auch hier ist die Umformung mit einer beliebigen Funktion denkbar, z.B. einer Wahr- scheinlichkeitsfunktion. Bei einer überwachten Klassifikation wie sie bei einem neuro- nalen Netz der Fall ist, ist es ferner möglich beim Trainieren des Netzes eine (oder mehrere) neue Klasse - vertreten durch ein oder mehrere neues Ausgangsneuron - zu implementieren und hier solche Spektren zu verwenden, die nicht hinreichend der Gruppe A oder B (z.B. gesund oder krank) zugeordnet werden können.
Im Folgenden wird eine Interpolation zwischen Daten anhand des Krankheitsbildes,
Diabetes, beispielhaft veranschaulicht. Eine Interpolation erfolgt zwischen ersten Daten, die einer Klasse angehören, die als „gesund" bezeichnet wird, d. h. diese Daten wurden anhand von bekannten Proben, die von gesunden Patienten oder Patienten, die nicht an Diabetes erkrankt sind, entnommen wurden, generiert- und zweiten Daten, die anhand von an Diabetes erkrankten Patienten entnommenen Proben generiert wurden. Basierend auf den jeweiligen Daten der Klasse werden zunächst mittels eines ausgewählten multivariaten Auswerteverfahrens Parameter generiert, sodass die Parameter jeweils der ersten und der zweiten Klasse zugeordnet werden können. Anschließend erfolgt eine Interpolation zwischen den Parametern. Hierbei zeigt sich vorteilhafterweise, dass ein Verlauf einer Kranldieit mit dem auf diese Weise berechneten Kurvenverlauf der interpolierten Daten korreliert, sodass Proben von Patienten in unterschiedlichen Krankheitsstadien dem interpoliertem Datensatz zugeordnet werden können. Wird ein Auswerteverfahren wie beschrieben durchgeführt, wird bei der Analyse einer unbekannten Probe zunächst mittels des selben multivariaten Auswerteverfahrens ein Probenpara- meter ermittelt, sodass eine Zuordnung des Probenparameters zu dem Datensatz, der sich aus der Interpolation zwischen dem ersten und zweiten Parameter ergibt, erfolgen kann. Anhand dieser Zuordnung lässt sich nun ein Anteilswert des Probenparameters bestimmen, mit dem die Probe einer Klasse angehört. Beispielsweise kann der Anteils- wert des Probenparameters an einer Klasse prozentual berechnet werden. Dieser Anteilswert spiegelt die Zuordnung des Probenparameters zu einem Punkt in der Verlaufskurve des interpolierten Datensatzes wider. Es ist weiterhin auch denkbar, dass der Anteilswert anstelle eines numerischen Wertes z. B. bildlich dargestellt wird. Eine Zuordnung des Probenparameters zu der berechneten Verlaufskurve entsprechend einem Krankheitsverlauf veranschaulicht somit bildlich den Krankheitszustand des Patienten. Der Arzt erhält hierdurch einen Hinweis, in welchem Stadium der Krankheit sich der Patient, dessen Probe entnommen wurde, befindet.
Hierbei haben Untersuchungen ergeben, dass bei der Vermessung einer Probe eines Patienten, der unter dem metabolischen Syndrom leidet, die hieraus generierten Parameter der Verlaufskurve der Krankheit Diabetes zugeordnet werden können. Eine Zuordnung des Probenparameters eines Patienten mit einem metabolischen Syndrom in die Verlaufskurve eines gesunden und an Diabetes erkrankten Patienten lässt somit daraufschließen, dass es sich bei dem metabolischen Syndrom um eine Vorstufe von Dia- betes handelt. Es ergibt sich somit ein direkter Zusammenhang zwischen der Krankheit „metabolisches Syndrom" und der Krankheit „Diabetes". Das Beispiel verdeutlicht anschaulich, welche neuen Möglichkeiten durch das erfindungsgemäße Verfahren gegeben sind. Eine Vorbeugung der Krankheit Diabetes könnte somit bereits in einem frühen Stadium z. B. durch eine Medikamentenvergabe gegen Bluthochdruck, Fettsucht oder erhöhten Cholesterinwerten etc. gewährleistet sein, sodass der Ausbruch der Krankheit Diabetes unter Umständen verhindert werden kann.
Die Erfindung beinhaltet weiterhin ein System, mit dem eine Zugehörigkeit einer Probe zu einer Klasse anteilsmäßig bestimmt werden kann, sodass ein Gesundheitszustand charakterisiert wird. Das System beinhaltet eine Speichereinheit zur Speicherung der von einem Detektor erhaltenen Signale eines elektromagnetischen Spektrums, das durch Vermessen einer unbekannten Probe generiert wurde. Das System beinhaltet weiterhin eine Auswerteeinheit zur Generierung eines Probenparameters mittels eines multivariaten Auswerteverfahrens auf der Basis der Signale des elektromagnetischen Spektrums. Mittels einer Auswerteinheit wird der Probenparameter zu einem Datensatz zugeordnet. Dieser Datensatz ergibt sich aus der Interpolation zwischen mindestens einem Teil von ersten Daten und mindestens einem Teil von zweiten Daten, die jeweils einer ersten und zweiten Klasse zugeordnet sind. Hierbei beinhalten die ersten bzw. zweiten Daten jeweils einen ersten bzw. zweiten Parameter, der jeweils der ersten bzw. der zweiten Klasse angehört. Diese Parameter wurden anhand von elektromagnetischen Spektren von bekannten Proben, die der jeweiligen Klasse angehören, mittels des multivariaten Auswerteverfahrens generiert, sodass eine zuverlässige Zuordnung von Proben zu der jeweiligen Klasse aufgrund des jeweiligen Parameters möglich ist. Vorteilhafterweise ist dieser Datensatz in einem permanenten Speicher der Speichereinheit gespeichert. Es ist jedoch auch denkbar, dass die Speichereinheit einen Permanentspeicher enthält, in dem nur ein erster und ein zweiter Parameter, die jeweils einer ersten und zweiten Klasse angehören, gespeichert sind. Eine Berechnung des interpolierten Datensatzes erfolgt dann bei Bedarf. Die Auswerteinheit bestimmt weiterhin einen Anteilswert des Probenparameters an zumindest einem Teil des Datensatzes. Dieser Anteilswert gibt einen Anteil des Probenparameters an einer Klasse wieder, sodass der Anteil der unbekannten Probe bestimmt wird, mit dem die unbekannte Probe einer Klasse angehört. Eine Ausgabeeinheit zeigt die Zugehörigkeit einer Probe zu einer Klasse an. Vorteilhafterweise sind in dem System Daten zu mehr als zwei Klassen gespeichert, sodass ein System Diagnosehinweise für eine Vielzahl von unterschiedlichen Krankheiten und Krankheitsverläufen leisten kann. In einer bevorzugten
Ausführungsformen beinhaltet das System weiterhin eine Strahlenquelle zum Bestrahlen einer Probe mit elektromagnetischer Strahlung sowie einen Detektor, der die mit der Probe wechselwirkende Strahlung detektiert. Emittiert die Strahlenquelle z. B. elektromagnetische Strahlung im Infrarotbereich, wird vorteilhafterweise vom Detektor Signale im Bereich von 1 μm bis 25 μm detektiert. Weiter vorteilhafte Ausführungsformen des Systems ergeben sich wie bereits beschrieben.
Im nachfolgenden werden anhand von Figuren Ausführungen der Erfindung näher erläutert, ohne dass hierdurch eine einschränkende Wirkung gegeben ist.
Figur 1: Spektrendaten einer Probe eines gesunden Menschen im Vergleich zu Proben eines an Diabetes ericrankten sowie an einem metabolischen Syndrom erkrankten Menschen.
Figur 2: Gegenüberstellung des DPR-Scores, der anhand von Proben eines gesunden, eines an metabolischem Syndrom erkrankten und eines an Diabetes erkrankten Menschen gewonnen wurde.
Figur 3: Parameterverteilung zweier Klassen
Figur 4: Balkendiagramm, das die Interpolation zwischen dem DPR-Score darstellt. Figur 5: Braunwaldzyklus
Figur 1 zeigt verschiedene Auswertungen von Spektrendaten, die bei der Vermessung von Proben eines gesunden, eines am metabolischen Syndrom erkrankten Patienten und eines Diabetikers generiert wurden. Im Nachfolgenden werden die entsprechenden Proben und die diesbezüglichen Klassen der Einfachheit halber als gesund, metabo- lisches Syndrom und Diabetes bezeichnet.
In Figur la bis c werden jeweils charakteristische Wellenzahlenb er eiche zwischen 900 und 1.200 cm'1, 1.700 bis 1.800 cm"1 und 2.800 bis 3.000 cm"1 dargestellt. Hierbei stellt der mit 1 gekennzeichnete Kurvenverlauf in Figur 1 die Differenz zwischen den Daten gesund und Diabetes und die mit 2 gekennzeichnete Kurve zwischen gesund und meta- bolisches Syndrom dar. Kurve 3 veranschaulicht sich ergebene Differenzen der Spektren zwischen den Daten gesund und gesund, die durch zufälliger Unterschiede generiert werden.
Figur la zeigt den jeweiligen Kurvenverlauf in den genannten Wellenzahlenbereichen, die sich aus der Differenz der Mittelwerte der Datenpunkte jeweils ergeben. Um eine bessere Differenzierung zwischen den verschiedenen Zuständen erzielen zu können, werden im Stand der Technik bekannte statistische Auswertemethoden angewendet. Hierbei wird u. a. die Signifikanz von Unterscheidungskriterien in den Spektren beurteilt. Ein geläufiges Verfahren ist beispielsweise, die (quadrierten) Mittelwerte mit (der quadrierten Summe) den Standardabweichungen der jeweiligen Wellenlänge zu vergleichen.
Figur lb zeigt die Anwendung des sogenannten Fischer-Kriteriums auf die entsprechend ausgewählten Wellenzahlenbereiche. Das Fischer-Kriterium erlaubt eine Gewichtung der sich ergebenen Differenzen in den Spektren. Hierzu werden die Abweichung zweier Kurven, die jeweils einer unterschiedlichen Klasse angehören, im Verhältnis zu der jeweiligen Standardabweichung innerhalb der Klasse darstellt. Es wird jedoch keine statistische Signifikanz der sich ergebenen Differenzen berücksichtigt.
Zur Berechnung der Signifikanz spektraler Unterschiede wird das im Stand der Technik als T-Test geläufige Auswerteverfahren angewendet, das die Anzahl der vermessenen Proben bei der Berechnung mit einbezieht. Figur lc zeigt eine entsprechende Grafik, bei der der T-Wert gegen die genannten Wellenzahlenbereiche aufgetragen wird. Wie dem Kurvenverlauf in den gezeigten Wellenzahlenbereichen zu entnehmen ist, ist mit Hilfe statistischer Auswerteverfahren eine Unterscheidung und somit eine eindeutige Klassifizierung von Proben in die Klassen gesund, metabolisches Syndrom und Diabetes möglich.
Figur 2 zeigt zu den in Figur 1 entsprechenden Daten der verschiedenen Klassen. Zur Klassifikation wurden die Daten mittels eines multivariaten Auswerteverfahrens ausgewertet, sodass jeweils ein Parameter generiert wurde, der der jeweiligen Klasse zugeordnet werden kann. Im Rahmen der Erfindung werden die so berechneten Parameter als DPR-Score bezeichnet, nach dem eine Normierung der Parameter erfolgt ist. Die Normierung des DPR-Scores ist dabei so gewählt, dass ein DPR-Score von 0 einen an Diabetes erkrankten Diagnosehinweis liefert und ein DPR-Score von 1 durch die Probe eines gesunden Patienten generiert wurde. Findet eine Unterteilung der Zustände Diabetes, metabolisches Syndrom und Gesund in jeweils drei voneinander unabhängige Klassen statt, ergibt sich für die Klasse Diabetes ein DPR-Score im Mittelwert (10) von 0,25, für das metabolische Syndrom ein Mittelwert (10) von 0,65 und für die Klasse „gesund" einen Mittelwert (10) von 0,87. In der dargestellten Box and Whiskers Plot zeigt dabei die Unterkante der Box jeweils den DPR-Score an unterhalb dieses Wertes 25 % der Parameter liegen. Der Mittelstrich in der Box wird als Mediän bezeichnet, wobei 50 % der Parameter kleiner als dieser Wert sind. Unterhalb des DPR-Scores der Ober- kante der Box sind 75 % der Parameter zuweisbar. Des weiteren zeigen die jeweiligen Fehlerbalken in der Darstellung den Bereich, in dem 90 % der Parameter angeordnet sind. Wie den so dargestellten Daten zu entnehmen ist, sind in der Klasse Diabetes ca. 75 % der Parameter kleiner 0,25, sodass eine eindeutige Zuordnung dieser Proben in die Klasse möglich ist. Entsprechend liegen 50 % der Daten der Klasse metabolisches Syn- drom unterhalb des DPR-Scores 0,87. 75 % der Daten, die der Klasse gesund angehören, liegen oberhalb des DPR-Scores 0,87. Wie der Darstellung beispielhaft zu entnehmen ist, liegen 50 % der Daten der Klasse metabolisches Syndrom in den Bereich DPR > 0,87, der ebenfalls einer Zuordnung zu der Klasse gesund zulässt. Die Klassen weisen folglich eine Schnittmenge an Daten auf, wobei eine Zuordnung eines Probenparameters zu dieser Schnittmenge im Stand der Technik nicht möglich ist.
Erfindungsgemäß erfolgt eine Zuordnung einer unbekannten Probe jedoch zu einem Datensatz, der sich durch die Interpolation zwischen z. B. den Daten der Klasse „gesund" und den Daten der Klasse „Diabetes" berechnet. Im gezeigten Beispiel erfolgt die Interpolation der Daten durch eine Interpolation zwischen den DPR-Scores der jeweiligen Klassen. Erfolgt eine Interpolation zwischen den DPR-Scores der Klasse gesund und Diabetes, ergibt sich ein Kurvenverlauf, der vorteilhafterweise den Krankheitsverlauf der Krankheit Diabetes widerspiegelt. Hierbei zeigt sich, dass der DPR-Score der Klasse des metabolischen Syndroms zu dem interpolierten Datensatz zwischen den Klassen gesund und Diabetes zuordnen lasst. Auf diese Weise wird ein Zusammenhang der drei verschiedenen Klassen deutlich, der auf einen medizinischen Zusammenhang der Krankheiten Rückschlüsse zulasst. Entsprechend der Auswertung ist folglich die Diagnose des metabolischen Syndroms in den Krankheitsverlauf der Krankheit Diabetes einzuordnen und ist somit als eine Vorstufe der Krankheit Diabetes anzusehen.
Figur 3 zeigt die Auftragung zweier Hauptkomponente eines multivariaten Auswerteverfahrens, die bei der Analyse einer Probe generiert wurden. Eine Auftragung von Hauptkomponenten eines multivariaten Auswerteverfahrens gegeneinander lasst die Kennzeichnung von Bereichen zu, die jeweils einer Klasse A oder B zugeordnet werden können. Hierbei liegen die viereckig dargestellten Datenpunkte im Bereich der Klasse B sowie die kreisförmig dargestellten Datenpunkte den Bereich der Klasse A wiedergeben. Die Diskriminanzfunktion (20) grenzt die Bereiche der jeweiligen Klassen ab. In einem Bereich in unmittelbarer Nahe der Diskriminanzfunktion, kann eine Zuordnung zur Klasse A oder B nicht mehr eindeutig erfolgen. In diesem Bereich werden die Datenpunkte jeweils mit einem Kreuz gekennzeichnet. Diese Datenpunkte bilden eine Schnittmenge zwischen den Klassen A und B, deren Zuordnung zu einer Klasse im Stand der Technik mittels bekannter Verfahren nicht möglich war.
Figur 4 stellt eine hieraus abgeleitete Quantifizierung des Krankheitszustandes dar, der sich aus einer Interpolation zwischen den DPR-Scores von Klasse A und B ergibt. Es erfolgt eine Auftragung der Anzahl der Proben, die vermessen wurde, gegen den berech- neten DPR-Score. Hierbei zeigt sich, dass ein erheblicher Anteil Proben in dem Bereich der Schnittmenge liegt, sodass im Stand der Technik keine Zuordnung zu einer Klasse möglich ist. Mit Hilfe des erfindungsgemaßen Verfahrens ist eine Zuordnung dieser Proben in den abgebildeten Krankheitsverlauf problemlos möglich. Eine Probe mit einem DPR-Score von 0,6 kann somit der Diagnosehinweis gegeben werden, dass ein Risiko, an der Krankheit der Klasse A zu erkranken, zu einem bestimmten Anteil gegeben ist. Dieses Risiko kann beispielsweise prozentual ausgedruckt, sodass ein DPR-Score von 0,6 eine 60%ige Wahrscheinlichkeit an der Klasse A zu erkranken wiedergibt. In dem aufgeführten Beispiel wird jeweils ein DPR-Score von 0 der Klasse B und von 1 der Klasse A zugeordnet. Alternativ kann auch der Abstand eines Datenpunktes zu der Diskriminanzfunktion, wie in Figur 3 veranschaulicht, zur Bestimmung des Anteilswertes herangezogen werden. Hierbei wird der Abstand (21) als Lot zur Diskriminanzfunktion entsprechend dem vom DPR-Score aufgespannten Bereich von 0-1 zwischen Klasse A und B berechnet. Ebenso können in einer Graphik derartige Zusammenhänge veranschaulicht werden.
Figur 5 zeigt die Darstellung eines Krankheitsverlaufes, der im Stand der Technik (Circulation 80, 410 - 414 (1989)) als Braunwaldzyklus beschrieben wird. Der Braunwaldzyklus bildet die Verlaufsform einer koronaren Herzerkrankung ab und spiegelt somit Zusammenhänge zwischen verschiedenen Krankheitszuständen wider. Ausgehend von spezifischen Risikofaktoren oder anderen Frühstadien einer Krankheit äußert sich der Krankheitsverlauf zunächst an den Symptomen einer Arteriosklerose. Wird eine Arterioslderose diagnostiziert kann dieser Krankheitszustand anfangs noch unbestimmt verlaufen. Zu diesem Zeitpunkt ist noch kein eindeutiger Zusammenhang zu einer schweren Herzerkrankung gegeben. Geht jedoch eine Arteriosklerose in eine koronare Herzerkrankung über, kann hierdurch bedingt eine Angina pectoris induziert werden. Gemäß dem Braunwaldzyklus kann dieser Krankheitszustand ein Herzinfarkt zur Folge haben.
Mit Hilfe des erfindungsgemäßen Verfahrens ist es möglich, Zusammenhänge zwischen Krankheiten, wie sie sich bereits im Braunwaldzyklus anhand von klinischen Unter- suchungen darstellen lassen, direkt durch die Interpolation zwischen einem gesunden und einem kranken Zustand zu erfassen. Auf diese Weise können Diagnosehinweise einfach erstellt werden. Darüber hinaus können Zusammenhänge zwischen verschiedenen Krankheiten entsprechend einem Braunwaldzyklus erkannt werden. Beispielsweise werden somit Diagnosen von Krankheiten bereits in einem frühen Krankheits- Stadium möglich. Die Früherkennung von Krebs oder TSE induzierten krankhaften Veränderungen wie BSE sind nur einige Beispiele, die die Anwendung des erfindungsgemäßen Verfahrens besonders vorteilhaft erscheinen lassen.

Claims

PATENTANSPRÜCHE
1. System, mit dem eine Zugehörigkeit einer Probe zu einer Klasse anteilmäßig bestimmt wird, sodass ein Diagnosehinweis zu einem Gesundheitszustand erstellt werden kann, beinhaltend
- eine Speichereinheit zur Speicherung der von einem Detektor erhaltenen Signale eines elektromagnetischen Spektrums, das durch Vermessen einer unbekannten Probe generiert wurde, und
- eine Auswerteinheit zur Generierung eines Probenparameters mittels eines mul- tivariaten Auswerteverfahrens auf der Basis der Signale des elektromagnetischen
Spektrums, und
- zum Zuordnen des Probenparameter zu einem Datensatz, der sich aus der Interpolation zwischen mindestens einem Teil von ersten Daten und mindestens einem Teil von zweiten Daten berechnet, wobei
- die ersten und zweiten Daten jeweils einer ersten und zweiten Klasse zugeordnet sind, und die ersten Daten einen ersten Parameter beinhalten, der anhand von elektromagnetischen Spektren von bekannten Proben, die der ersten Klasse angehören, mittels des multivariaten Auswerteverfahrens generiert wurde, sodass eine zuverlässige Zuordnung von Proben zu der ersten Klasse aufgrund des ersten Parameters möglich ist, und
- die zweiten Daten einen zweiten Parameter beinhalten, der anhand von elektromagnetischen Spektren von bekannten Proben, die der zweiten Klasse angehören, mittels des multivariaten Auswerteverfahrens generiert wurde, sodass eine zuverlässige Zuordnung von Proben zu der zweiten Klasse aufgrund des zweiten Parameters möglich ist,
- und die Auswerteinheit weiterhin zur Bestimmung eines Anteilswertes des Probenparameters an zumindest einem Teil des Datensatzes geeignet ist, wobei der Anteilswert eine Zugehörigkeit des Probenparameters zu einer Klasse wiedergibt, sodass ein Anteil der unbekannten Probe bestimmt wird, mit dem die unbekannte Probe einer Klasse angehört - eine Ausgabeeinheit zur Anzeige der Zugehörigkeit einer Probe zu einer Klasse.
2. System gemäß Anspruch 1, bei dem der erste und der zweite Parameter in einem Permanentspeicher der Speichereinheit gespeichert sind.
3. System gemäß Anspruch 1, bei dem der Datensatz in einem Permanentspeicher der Speichereinheit gespeichert ist.
4. System nach einer der vorherigen Ansprüche, bei dem Daten zu mehr als zwei Klassen gespeichert sind.
5. Analysesystem mit einem System nach einer der vorhergehenden Ansprüche, das eine Strahlenquelle zum Bestrahlen einer Probe mit elektromagnetischer Strahlung beinhaltet.
6. Analysesystem nach Anspruch 5, bei dem die Strahlenquelle elektromagnetische Strahlung im IR-Bereich emittiert.
7. Analysesystem mit einem System nach einer der vorhergehenden Ansprüche, das einen Detektor zur Detektion der mit der Probe wechselwirkenden Strahlung beinhaltet.
8. Analysesystem nach Anspruch 7, bei dem der Detektor Signale im Bereich von 1 μm - 25 μm detektiert.
. Verfahren zur Auswertung eines elektromagnetischen Spektrums, wobei eine Zugehörigkeit des elektromagnetischen Spektrums zu einer Klasse anteilmäßig bestimmt wird, sodass ein Diagnosehinweis zu einem Gesundheitszustand erstellt werden kann, beinhaltend
- Ermittlung eines Probenparameters mittels eines multivariaten
Auswerteverfahren auf der Basis eines elektromagnetischen Spektrums, das durch eine Vermessung einer unbekannten Probe generiert wurde,
- Zuordnen des Probenparameters zu einem Datensatz, der sich aus der Interpolation zwischen mindestens einem Teil von ersten Daten und mindestens einem Teil von zweiten Daten berechnet, wobei die ersten und zweiten Daten jeweils einer ersten und zweiten Klasse zugeordnet sind,
- und die ersten Daten einen ersten Parameter beinhalten, der anhand von elektromagnetischen Spektren von bekannten Proben, die der ersten Klasse angehören, mittels des multivariaten Auswerteverfahrens generiert wurde, sodass eine zuverlässige Zuordnung von Proben zu der ersten Klasse aufgrund des ersten
Parameters möglich ist,
- und die zweiten Daten einen zweiten Parameter beinhalten, der anhand von elektromagnetischen Spektren von bekannten Proben, die der zweiten Klasse angehören, mittels des multivariaten Auswerteverfahrens generiert wurde, sodass eine zuverlässige Zuordnung von Proben zu der zweiten Klasse aufgrund des zweiten Parameters möglich ist,
- Bestimmen eines Anteilswertes des Probenparameters an zumindest einem Teil des Datensatzes, wobei der Anteilswert eine Zugehörigkeit des Probenparameters zu einer Klasse wiedergibt, sodass ein Anteil der unbekannten Probe bestimmt wird, mit dem die unbekannte Probe einer Klasse angehört.
10. Verfahren gemäß Anspruch 9, bei dem die erste Klasse den Gesundheitszustand eines Patienten mit Diabetes und die zweite Klasse den Gesundheitszustand eines Patienten ohne Diabetes charakterisiert und der Datensatz einen Probenparameter mit einschließt, der durch eine Probe eines Patienten mit metabolischem Syndrom generiert wird.
11. Verfahren gemäß Anspruch 9, bei dem die Interpolation zwischen dem ersten und dem zweiten Parameter erfolgt.
12. Verfahren gemäß Anspruch 9, bei dem der Anteil eines Probenparameters an einer Klasse prozentual berechnet wird.
13. Verfahren gemäß Anspruch 9, bei dem zwischen dem Datensatz und einem Krankheitsverlauf ein Zusammenhang erstellt wird.
14. Verfahren gemäß Anspruch 9, bei dem im Rahmen des multivariaten Auswerteverfahrens eine lineare Diskriminanzanalyse durchgeführt wird.
15. Verfahren gemäß Anspruch 9, bei dem im Rahmen des multivariaten Auswerteverfahrens neuronale Netze verwendet werden.
16. Verfahren gemäß Anspruch 9, das Diagnosehinweise zur Früherkennung von Krebs- und TSE-induzierten krankhaften Anomalien leistet.
17. System nach Anspruch 1, das für ein Verfahren nach einem der Ansprüche 9- 16 geeignet ist.
18. Verfahren nach Anspruch 9, bei dem ein System nach einem der Ansprüche 1-4 verwendet wird.
9. Datenträger mit einem Datensatz zur Analyse einer Probe beinhaltend
- einen Datensatz, der sich aus der Interpolation zwischen mindestens einem Teil von ersten Daten und mindestens einem Teil von zweiten Daten berechnet, wobei
- die ersten und zweiten Daten jeweils einer ersten und zweiten Klasse zugeordnet sind, und die ersten Daten einen ersten Parameter beinhalten, der anhand von elektromagnetischen Spektren von bekannten Proben, die der ersten Klasse angehören, mittels eines multivariaten Auswerteverfahrens generiert wurde, sodass eine zuverlässige Zuordnung von Proben zu der ersten Klasse aufgrund des ersten Parameters möglich ist, und
die zweiten Daten einen zweiten Parameter beinhalten, der anhand von elektromagnetischen Spektren von bekannten Proben, die der zweiten Klasse angehören, mittels des multivariaten Auswerteverfahrens generiert wurde, sodass eine zuverlässige Zuordnung von Proben zu der zweiten Klasse aufgrund des zweiten Parameters möglich ist, wobei
- eine Zuordnung eines Probenparameters, der mittels des multivariaten Auswerteverfahrens auf der Basis eines elektromagnetischen Spektrums einer unbekannten Probe generiert wurde, zu dem Datensatz möglich ist.
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