EA040879B1 - Производные бензимидазола и их применение в качестве ингибиторов idh1 - Google Patents

Производные бензимидазола и их применение в качестве ингибиторов idh1 Download PDF

Info

Publication number
EA040879B1
EA040879B1 EA202190009 EA040879B1 EA 040879 B1 EA040879 B1 EA 040879B1 EA 202190009 EA202190009 EA 202190009 EA 040879 B1 EA040879 B1 EA 040879B1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
compound
mmol
pharmaceutically acceptable
stirred
stereoisomer
Prior art date
Application number
EA202190009
Other languages
English (en)
Inventor
Дахай ВАН
Вэньюань Цянь
Шилань ЛЮ
Шухуэй ЧЭНЬ
Original Assignee
Кпс Фармасьютикалз, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Кпс Фармасьютикалз, Инк. filed Critical Кпс Фармасьютикалз, Инк.
Publication of EA040879B1 publication Critical patent/EA040879B1/ru

Links

Description

Перекрестная ссылка на родственные заявки
Эта заявка имеет приоритет заявки CN 201810672394.3, поданной 26 июня 2018 года.
Область изобретения
Настоящее изобретение относится к ряду соединений бензимидазола и их применению в качестве ингибиторов мутантной IDH1 (изоцитратдегидрогеназа 1), в частности к соединению, как оно представлено формулой (I), его таутомеру или его фармацевтически приемлемой соли.
Предшествующий уровень техники
Изоцитратдегидрогеназа является важным ферментом в цикле лимонной кислоты и катализирует окислительное декарбоксилирование изоцитрата до 2-оксоглутарата (т.е. 2-а-кетоглутарата, α-KG). Белок, кодируемый геном IDH1, представляет собой NADP(+)-завасимую изоцитратдегидрогеназу, содержащую перокисомную таргетиноговую сигнальную последовательность PTS-1, присутствующую в цитоплазме и пероксисомах. Присутствие этого фермента в перокисосмах свидетельствует о роли во внутренней регенерации NADPH.
Немутантный фермент, такой как IDH дикого типа, катализирует окислительное декарбоксилирование изоцитрата с одновременным восстановлением NAD+(NADP+) до NADP (NADPH):
Изоцитрат+NAD+(NADP+)^α-KG+СО2+NADP(NADPH)+Н+
Мутантный белок IDH 1/2 (IDH 1/2 m) был обнаружен во многих различных опухолях, включая глиому, острый миелоидный лейкоз (AML), хондросаркому, внутрипочечную холангиому, меланому, рак предстательной железы, ангиоиммунобластную Т-клеточную лимфому. В глиомах более 70% непервичных глиобластом имеют мутации IDH1, и 92,7% опухолей с мутантной IDH1 имеют аргинин, замененный гистидином (т.е. IDH1 R132H) (Hartmann С, Acta Neuropathol. 2009 Oct; 1 18(4):469-74).
Мутантный белок IDH имеет новую функцию, то есть он катализирует восстановление α-KG с продуцированием канцерогенного метаболита 2-гидроксиглутарата (2-HG). Считается, что продуцирование 2-HG вносит вклад в возникновение и развитие рака (Dang L, Nature, 2009 Dec 10;462(7274):739-44). Нормальные клетки продуцируют очень низкие уровни 2-HG, а клетки с мутациями IDH способны продуцировать высокие уровни 2-HG. Высокие уровни 2-HG также могут быть обнаружены в опухолях с мутациями IDH.
Следовательно, ингибирование мутантной IDH и ее новой активности является потенциальным способом лечения рака. Следовательно, существует потребность в получении ингибиторов мутантов IDH для ингибирования продуцирования 2-HG.
В Acta Neuropathol (2017, Vol(133), Issue 4, 629-644) раскрыта конкретная структура соединения BAY1436032.
O-CF,
X™, 0
I || у—NH
Ν
BAY1436032
Краткое изложение сущности изобретения
Согласно настоящему изобретению предложено соединение, как оно представлено в формуле (I),
где
R1 выбран из С1_6алкила, С3_6циклоалкила и фенила, причем С1_6алкил, С3_6циклоалкил и фенил возможно замещены 1, 2 или 3 Ra;
каждый из R2 и R3 независимо выбран из Н, F, Cl, Br, I, ОН, NH2, CN, СООН, С1_6алкила и
- 1 040879
С1-6алкокси, причем С1-6алкил и С1-6алкокси возможно замещены 1, 2 или 3 Rb;
альтернативно R1 и R2 связаны вместе с образованием С4-6циклоалкенила, возможно замещенного 1, или 3 Rc;
L представляет собой -СН2СН2-;
n выбран из 1, 2 и 3; и каждый из Ra, Rb, и Rc независимо выбран из F, Cl, Br, I, ОН, NH2, CN, СООН и Me;
или его стереоизомер, или его фармацевтически приемлемая соль.
В некоторых воплощениях настоящего изобретения вышеупомянутый R1 выбран из C1-3алкила, циклопропанила и фенила, причем C1-3алкил, циклопропанил и фенил возможно замещены 1, 2 или 3 Ra, а остальные переменные такие, как определено в настоящем описании изобретения.
В некоторых воплощениях настоящего изобретения вышеупомянутый R1 выбран из
СНз, CH2F, CHF2, CF3, СН2СНз, CH2CF3, СН2СН2СНз, С(СНз)з, V, СН(СНз)2 и
а остальные переменные такие, как определено в настоящем описании изобретения.
В некоторых воплощениях настоящего изобретения каждый из вышеупомянутых R2 и R3 независимо выбран из Н, F, Cl, Br, I, ОН, NH2, CN, СООН, C1-3алкила и C1-3алкокси, причем C1-3алкил и C13алкокси возможно замещены 1, 2 или 3 Rb, а остальные переменные такие, как определено в настоящем описании изобретения.
В некоторых воплощениях настоящего изобретения каждый из вышеупомянутых R2 и R3 независимо выбран из Н, F, Cl, Br, I, ОН, NH2, CN, СООН, CH3 и CH3O, причем CH3 и CH3O возможно замещены 1, 2 или 3 Rb, а остальные переменные такие, как определено в настоящем описании изобретения.
В некоторых воплощениях настоящего изобретения каждый из вышеупомянутых R2 и R3 независимо выбран из Н, F, Cl, Br, I, ОН, NH2, CN, СООН, CH3, CH2F, CHF2, CF3 и OCH3, а остальные переменные такие, как определено в настоящем описании изобретения.
В некоторых воплощениях настоящего изобретения вышеупомянутый L представляет собой СН2СН2-, а остальные переменные такие, как определено в настоящем описании изобретения.
В некоторых воплощениях настоящего изобретения вышеуказанная структурная
р * R3 Т/Г ^2 выбрана из и z
’ а остальные переменные такие, как определено единица в настояединица щем описании изобретения.
В некоторых воплощениях настоящего изобретения вышеуказанная структурная
выбрана из остальные переменные такие, как определено в настоящем описании изобретения.
а
остальные переменные такие, как определено в настоящем описании изобретения.
В некоторых воплощениях настоящего изобретения вышеуказанная структурная единица
выбрана из
- 2 040879
а остальные переменные такие, как определено в настоящем описании изобретения.
Существуют также некоторые воплощения настоящего изобретения, полученные с любой комбинацией вышеуказанных переменных.
В некоторых воплощениях настоящего изобретения вышеупомянутое соединение или его стереоизомер, или его фармацевтически приемлемая соль, выбрано из
где
Е выбран из -СН2-, -СН2СН2-, -C(CH3)2- и -С(СН3)2СН2-;
L представляет собой -СН2СН2-; и
R1, R2 и R3 такие, как определено в настоящем описании изобретения.
В некоторых воплощениях настоящего изобретения вышеупомянутое соединение, или его стереоизомер, или его фармацевтически приемлемая соль выбрано из
- 3 040879
где
E, L, R1, R2 и R3 такие, как определено в настоящем описании изобретения.
Согласно настоящему изобретению предложено также соединение, как оно представлено в нижеследующей формуле, или его стереоизомер, или его фармацевтически приемлемая соль, которое выбрано из
- 4 040879
В некоторых воплощениях настоящего изобретения вышеупомянутое соединение выбрано из
- 5 040879
- 6 040879
Согласно настоящему изобретению предложено также применение вышеупомянутого соединения, или его стереоизомера, или его фармацевтически приемлемой соли в изготовлении лекарственного средства для лечения заболевания, связанного с IDH1 (изоцитратдегидрогеназа 1).
Определение и описание изобретния
Если не указано иное, нижеследующие термины и фразы, использованные в данном документе, имеют нижеследующие значения. Конкретный термин или конкретная фраза, для которого(ой) не дано конкретного определения, не следует рассматривать как неопределенный (неопределенная) или неясный(неясная), но следует понимать в их обычном значении. Когда в данном описании появляется торго вое наименование, это означает, что оно относится к соответствующему продукту или его активному ингредиенту.
Термин фармацевтически приемлемый в данном документе относится к соединениям, веществам, композициям и/или лекарственным формам, которые в рамках обоснованного медицинского суждения являются подходящими для контактирования с тканями людей и животных без излишней токсичности, раздражения, аллергических реакций или других проблем или осложнений, и которые соизмеримы с разумным соотношением польза/риск.
Термин фармацевтически приемлемая соль относится к соли соединения по настоящему изобретению, которое получено из соединения с конкретными заместителями, раскрытыми в настоящем изобретении, и относительно нетоксичной(ого) кислоты или основания. Когда соединение по настоящему изобретению содержит относительно кислотную функциональную группу, тогда соль присоединения основания может быть получена путем приведения в контакт нейтральной формы соединения с конкрет
- 7 040879 ным количеством основания в чистом растворе или в подходящем инертном растворителе. Фармацевтически приемлемые соли присоединения основания включают натриевую, калиевую, кальциевую, органическую аммониевую или магниевую соль или подобные соли. Когда соединение по настоящему изобретению содержит относительно основную функциональную группу, тогда соль присоединения кислоты может быть получена путем приведения в контакт нейтральной формы соединения с достаточным количеством кислоты в чистом растворе или в подходящем инертном растворителе. Примеры фармацевтически приемлемых солей присоединения кислоты включают соли присоединения неорганической кислоты, включающие, например, гидрохлорид, гидробромид, нитрат, карбонат, бикарбонат, фосфат, моногидрофосфат, дигидрофосфат, сульфат, гидросульфат, гидройодид, фосфит и т.д., а также соли присоединения органической кислоты, где органическая кислота включает, например, уксусную кислоту, пропионовую кислоту, изомасляную кислоту, малеиновую кислоту, малоновую кислоту, бензойную кислоту, янтарную кислоту, октандикислоту, фумаровую кислоту, молочную кислоту, миндальную кислоту, фталевую кислоту, бензолсульфоновую кислоту, пара-толуолсульфоновую кислоту, лимонную кислоту, винную кислоту и метансульфоновую кислоту и т.д.; а также включает соли аминокислот (таких как аргинин и т.д.), и соли органических кислот, таких как глюкуроновая кислота. Некоторые конкретные соединения по настоящему изобретению содержат как основные, так и кислотные функциональные группы и поэтому могут быть превращены либо в соль присоединения основания, либо в соль присоединения кислоты.
Фармацевтически приемлемая соль по настоящему изобретению может быть синтезирована из родительского соединения, содержащего кислотную или основную функциональную группу, общепринятыми химическими способами. Обычно такие соли получают путем проведения реакции этих соединений в форме свободной кислоты или свободного основания со стехиометрическими количествами подходящих оснований или кислот в воде или в органических растворителях или в смеси и того, и другого.
Соединения по настоящему изобретению могут существовать в конкретных геометрических или изомерных формах. Настоящее изобретение предусматривает все такие соединения, включая цис- и транс-изомеры, (-)- и (+)-энантиомеры, (R)- и (S)-энантиомеры, диастереомеры, (D)-изомеры, (L)изомеры и их рацемическую смесь и другие их смеси, такие как смеси, обогащенные энантиомером или диастереомером, которые все входят в объем настоящего изобретения. Дополнительные асимметрические атомы углерода могут присутствовать в заместителе, таком как алкил. Все эти изомеры и их смеси входят в объем настоящего изобретения.
Если не указано иное, термин энантиомер или оптический изомер относится к изомерам, которые являются зеркальными отражениями друг друга.
Если не указано иное, термин цис-транс изомер или геометрический изомер обусловлен неспособностью к свободному вращению из-за двойных связей или одинарных связей атомов углерода, образующих кольцо.
Если не указано иное, термин диастереомер относится к стереоизомерам, которые имеют два или более хиральных центров, и молекулы которых не являются зеркальными отражениями друг друга.
Если не указано иное, (D) или (+) означает правостороннее вращение, (L) или (-) означает левостороннее вращение, и (DL) или (±) означает рацемический.
Если не указано иное, клиновидная сплошная линия ) и клиновидная пунктирная линия прямая пунктирная линия ) используются для указания относительной конфигурации стереоцентра, используются для указания абсолютной конфигурации стереоцентра, прямая сплошная линия ν ) и прямая пунктирная линия (' ) используются для указания относительной конфигурации стереоцентра, волнистая линия ( ) используется для указания клиновидной сплошной линии (*^ ) или клиновидной пунктирной линии (’’ ), волнистая линия ) используется для указания прямой сплошной линии (^ ) и прямой пунктирной линии )’
Если не указано иное, для соединения, в котором имеется двойная связь, такая как углеродуглеродная двойная связь, углерод-азотная двойная связь и азот-азотная двойная связь, и каждый атом на двойной связи связан с двумя разными заместителями (в двойной связи, содержащей атом азота, одиночная пара электронов на атоме азота считается заместителем, связанным с ней); если атом на двойной свя зи в соединении связан с заместителем соединения с волнистой линией Л это означает (Z) изомер, (Е) изомер или смесь двух изомеров соединения. Например, нижеследующая формула (А) означает, что соединение существует в виде единственного изомера формулы (А-1) или формулы (А-2), или в виде смеси двух изомеров формулы (А-1) и формулы (А-2). Нижеследующая формула (В) означает, что соединение существует в виде единственного изомера формулы (В-1) или формулы (В-2), или в виде смеси двух изомеров формулы (В-1) и формулы (В-2). Нижеследующая формула (С) означает, что соединение существует в виде единственного изомера формулы (С-1) или формулы (С-2), или в виде смеси двух изомеров формулы (С-1) и формулы (С-2).
- 8 040879
Соединения по настоящему изобретению могут существовать в конкретных формах. Если не указано иное, термин таутомер или таутомерная форма означает, что при комнатной температуре изомеры с разными функциональными группами находятся в динамическом равновесии и могут быстро превращаться друг в друга. Если возможны таутомеры (такие как в растворе), может достигаться химическое равновесие таутомеров. Например, протонный таутомер, также именуемый прототропным таутомером, включает в себя взаимное превращение посредством миграции протона, такое как кето-енольная изомеризация и имин-енаминная изомеризация. Валентный таутомер включает в себя некоторую перегруппировку электронов связи для взаимного превращения. Конкретным примером кето-енольной таутомерии является таутомерия между двумя таутомерами пентан-2,4-дионом и 4-гидроксипент-3-ен-2-оном.
Если не указано иное, термины обогащенный одним изомером, обогащение изомером, обогащенный одним энантиомером или энантиомерное обогащение означает, что содержание одного изомера или энантиомера составляет менее 100%, и содержание изомера или энантиомера составляет 60% или больше, или 70% или больше, или 80% или больше, или 90% или больше, или 95% или больше, или 96% или больше, или 97% или больше, или 98% или больше, или 99% или больше, или 99,5% или больше, или 99,6% или больше, или 99,7% или больше, или 99,8% или больше, или 99,9% или больше.
Если не указано иное, термин изомерный избыток или энантиомерный избыток относится к разнице между относительными процентами двух изомеров или двух энантиомеров. Например, если содержание одного изомера или энантиомера составляет 90%, а содержание другого изомера или энантиомера составляет 10%, то изомерный или энантиомерный избыток (значение ее) составляет 80%.
Оптически активные (R)- и (S)-изомеры и D и L изомеры могут быть получены в результате хирального синтеза или с использованием хиральных реагентов или другими стандартными методами. Чтобы получить энантиомер соединения по настоящему изобретению, он может быть получен путем асимметрического синтеза или путем дериватизации хиральными вспомогательными агентами, при которой полученную смесь диастереомеров разделяют, и вспомогательную группу отщепляют с получением чистого желаемого энантиомера. Альтернативно, когда молекула содержит основную функциональную группу (такую как аминогруппа) или кислотную функциональную группу (такую как карбоксильная группа), она может образовывать диастереомерные соли с подходящими оптическими активными кислотами или основаниями, и затем диастереомеры могут быть разделены стандартными методами, известными в данной области для выделения чистых энантиомеров. Кроме того, разделение энантиомеров и диастереомеров обычно осуществляют хроматографией, в которой используется хиральная стационарная фаза, и возможно в сочетании с химической дериватизацией (например, карбамат образуется из амина). Соединения по настоящему изобретению могут содержать не встречающиеся в природе соотношения атомных изотопов на одном или более атомах, составляющих соединение. Например, соединения могут быть мечены радиоизотопами, такими как тритий (3Н), йод-125 (125I) или С-14 (14С). В качестве другого примера, дейтерированные лекарственные средства могут быть образованы путем замены водорода дейтерием. Связь между дейтерием и углеродом сильнее, чем связь обычного водорода и углерода. По сравнению с недейтерированными лекарственными средствами дейтерированные лекарственные средства имеют сниженные токсические побочные эффекты и повышенную стабильность лекарственного средства, повышенную эффективность, более длительный биологический период полувыведения и другие преимущества. Все изменения изотопного состава соединений по настоящему изобретению, радиоактивного или нет, входят в объем настоящего изобретения.
Возможный или возможно означает, что событие или условие, описанное далее, необязательно может иметь место, и описание охватывает как ситуацию, где событие или условие имеет место, так и ситуацию, где событие или условие не имеет места.
Термин замещенный означает, что любой один или более атомов водорода на конкретном атоме замещены заместителями, включающими дейтерий и варианты водорода, если только валентность конкретного атома является нормальной и замещенное соединение является стабильным. Когда заместитель представляет собой кислород (т.е. =O), тогда это означает, что замещены два атома водорода. Замещение кислородом не происходит на ароматических группах. Термин возможно замещенный означает, что
- 9 040879 группа может быть замещенной или незамещенной. Если не указано иное, тип и количество заместителей могут быть произвольными, исходя из того, что они могут быть химически реализованы.
Когда любая переменная (такая как R) встречается более одного раза в составе или структуре соединения, тогда ее определение в каждом случае является независимым. Так, например, если группа замещена 0-2 R, то эта группа возможно может быть замещена вплоть до двух R, и в каждом случае R выбран независимо. Кроме того, комбинации заместителей и/или их варианты допустимы, если только такие комбинации приводят к стабильным соединениям.
Когда количество линкерных групп равно 0, например -(CRR)0-, тогда это означает, что линкерная группа представляет собой одинарную связь.
Когда одна из переменных выбрана из одинарной связи, тогда это означает, что две группы связаны напрямую. Например, когда L в A-L-Z представляет собой одинарную связь, тогда это означает, что структура в действительности представляет собой A-Z.
Когда заместитель не используется (является вакантным), тогда это означает, что этот заместитель отсутствует. Например, когда X в A-X не используется, тогда это означает, что структура в действительности представляет собой A. Когда конкретно не указано, через какой атом перечисленный заместитель связан с замещенной группой, тогда такие заместители могут быть связаны по любому атому. Например, пиридильная группа в качестве заместителя может быть связана с замещенной группой через любой атом углерода на пиридиновом кольце. Когда конкретно не указано направление связывания перечисленных линкерных групп, направление связывания является произвольным.
Например, если линкерная группа L в представляет собой -M-W-, то -M-W- может связывать кольцо А и кольцо В направлении в порядке чтения слева направо с образованием
и может также связывать кольцо A и кольцо B в противоположном направлении в
порядке чтения справа налево с образованием
Комбинации линкерных групп, заместителей и/или их вариантов допустимы, если только такие комбинации приводят к стабильным соединениям.
Если не указано иное, термин С1-6алкил применяется для указания линейной или разветвленной насыщенной углеводородной группы, состоящей из 1-6 атомов углерода. С1-6алкильная группа включает C1-5, С1-4, С1-3, С1-2, С2-6, С2-4, С6 и C5 алкильные группы и т.д. и может быть одновалентной (такой как метил), двухвалентной (такой как метилен) или многовалентной (такой как метин). Примеры Ср 6алкильных групп включают, без ограничения, метил (Me), этил (Et), пропил (в том числе н-пропил и изопропил), бутил (в том числе н-бутил, изобутил, втор-бутил и трет-бутил), пентил (в том числе н пентил, изопентил и неопентил), гексил и т.д.
Если не указано иное, термин C1-3алкил применяется к линейной или разветвленной насыщенной углеводородной группе, состоящей из 1-3 атомов углерода. C1-3алкильная группа включает C1-2 и C2-3 алкильные группы и т.д. и может быть одновалентной (такой как метил), двухвалентной (такой как метилен) или многовалентной (такой как метин). Примеры C1-3алкильных групп включают, без ограничения, метил (Me), этил (Et), пропил (в том числе н-пропил и изопропил) и т.п.
Если не указано иное, термин С1-6алкокси относится к алкильной группе, содержащей 1-6 атомов углерода, которая присоединена к остальной части молекулы через атом кислорода. С1-6алкокси группа включает C1-4, С1-3, С1-2, С2-6, С2-4, С6, C4, C4, С3 алкокси и т.д. Примеры С1-6алкокси включают, без ограничения, метокси, этокси, пропокси (в том числе н-пропокси и изопропокси), бутокси (в том числе нбутокси, изобутокси, втор-бутокси и трет-бутокси), пентокси (в том числе н-пентокси, изопентокси и неопентокси), гексокси и т.п.
Если не указано иное, термин C1-3алкокси относится к алкильной группе, содержащей 1-3 атома углерода, которые присоединены к остальной части молекулы через атом кислорода. C1-3алкокси группа включает C1-2, C2-3, С3 и С2 алкоксигруппы и т.д. Примеры C1-3алкоксигрупп включают, без ограничения, метокси, этокси, пропокси (в том числе н-пропокси и изопропокси) и т.п.
Если не указано иное, С3-6циклоалкил означает насыщенную циклическую углеводородную группу, состоящую из 3-6 атомов углерода, которая представляет собой моноциклическую и бициклическую кольцевую систему. С3-6циклоалкил включает С3-5, С4-5 и С5-6циклоалкил и т.д. и может быть одновалентным, двухвалентным или многовалентным. Примеры С3-6циклоалкильных групп включают, без ограничения, циклопропил, циклобутил, циклопентил, циклогексил и т.п.
Если не указано иное, С4-6циклоалкенил означает частично ненасыщенную циклическую углеводородную группу, состоящую из 4-6 атомов углерода, содержащую по меньшей мере одну углеродуглеродную двойную связь, и которая представляет собой моноциклическую и бициклическую систему,
- 10 040879 где бициклическая система включает спирокольцо, конденсированное кольцо и мостиковое кольцо, в которой каждое кольцо является неароматическим. С4-6циклоалкенильная группа включает С4-5 или
С5-6циклоалкенильную группу и т.д. и может быть одновалентной, двухвалентной или многовалентной.
Примеры С4-6циклоалкенила включают, без ограничения, циклобутенил, циклопентенил, циклопентадиенил, циклогексенил, циклогексадиенил, и т.п.
Если не указано иное, термины C6-12 ароматическое кольцо и C6-12арил могут быть использованы в данном документе взаимозаменяемым образом. Термин С6-12ароматическое кольцо или C6-12арил означает циклическую углеводородную группу, состоящую из 6-12 атомов углерода, с сопряженной π-электронной системой, и которая может представлять собой единственное кольцо, конденсированное бициклическое кольцо или конденсированную трициклическую кольцевую систему, где каждое кольцо является ароматическим. Она может быть одновалентной, двухвалентной или многовалентной. C6-12арильные группы включают C6-10, С6-9, С6-8, С12, Сю и С6 арильные группы. Примеры C6.12арильных групп включают, без ограничения, фенил, нафтил (в том числе 1-нафтил, 2-нафтил и т.д.).
Если не указано иное, Cn-n+m или Cn-Cn+m включает в себя любой конкретный случай от n до n+m атомов углерода; например, С1-12 охватывает C1, C2, С3, С4, C5, С6, С7, C8, С9, С10, С11 и C12, в том числе любой диапазон от n до n+m; например, С1-12 охватывает C1-3, С1-6, С1-9, С3-6, С3-9, С3-12, С6-9, C6-12 и С9-12 и т.д. Аналогично, от n-членного до n+m-членного означает, что количество атомов в кольце равно от n до n+m; например, 3-12-членное кольцо включает 3-членное кольцо, 4-членное кольцо, 5-членное кольцо, 6членное кольцо, 7-членное кольцо, 8-членное кольцо, 9-членное кольцо, 10-членное кольцо, 11-членное кольцо и 12-членное кольцо, в том числе любой диапазон от n до n+m; например, 3-12-членное кольцо включает 3-6-членное кольцо, 3-9-членное кольцо, 5-6-членное кольцо, 5-7-членное кольцо, 6-7-членное кольцо, 6-8-членное кольцо и 6-10-членное кольцо и т.п.
Термин уходящая группа относится к функциональной группе или атому, которая(ый) может быть замещен(а) другой функциональной группой или атомом в результате реакции замещения (например, аффинной реакции замещения). Например, репрезентативные уходящие группы включают трифлат; хлор, фтор, бром, йод; сульфонат, такой как мезилат, тозилат, пара-бромбензолсульфонат, паратолуолсульфонат и т.д.; ацилокси, такой как ацетокси, трифторацетокси и т.д.
Термин защитная группа охватывает, без ограничения, защитную группу для амино, защитную группу для гидрокси или защитную группу для тиола. Термин защитная группа для амино относится к защитной группе, подходящей для предотвращения побочных реакций по положению азота аминогруппы. Репрезентативные защитные группы для амино включают, без ограничения: формил; ацил, такой как алканоил (такой как ацетил, трихлорацетил или трифторацетил); алкоксикарбонил, такой как трет-бутоксикарбонил (Boc); арилметилоксикарбонил, такой как бензилоксикарбонил (Cbz) и 9флуоренилметилоксикарбонил (Fmoc); арилметил, такой как бензил (Bn), тритил (Tr), 1,1-ди-(4'метоксифенил)метил; силил, такой как триметилсилил (TMS) и трет-бутилдиметилсилил (TBS) и т.д. Термин защитная группа для гидроксила относится к защитной группе, подходящей для предотвращения побочных реакций гидроксильной группы. Репрезентативные защитные группы для гидроксила включают, без ограничения: алкильные группы, такие как метил, этил и трет-бутил; ацильные группы, такие как алканоил (такой как ацетил); арилметил, такой как бензил (Bn), пара-метилоксибензил (РМВ), 9-флуоренилметил (Fm) и дифенилметил (дифенилметил, DPM); силил, такой как триметилсилил (TMS) и трет-бутилдиметилсилил (TBS) и т.д.
Соединения по настоящему изобретению могут быть получены различными способами синтеза, общеизвестными специалистам в данной области, включая конкретные воплощения, перечисленные ниже, воплощения, образованные их комбинациями с другими способами химического синтеза, и их эквивалентами или альтернативами, известными специалистам в данной области. Предпочтительные воплощения включают, без ограничения, примеры, приведенные в настоящем описании изобретения.
Растворитель, используемый в настоящем изобретении, имеется в продаже. В настоящем описании изобретения использованы следующие сокращения: водн. означает водный; HATU означает О-(7азабензотриазол-1-ил)-N,N,N',N'-тетраметилурония гексафторфосфат; EDC означает N-(3диметиламинопропил)-№-этилкарбодиимида гидрохлорид; m-CPBA означает 3-хлорпероксибензойная кислота; экв. означает эквивалент; CDI означает карбонилдиимидазол; DCM означает дихлорметан; РЕ означает петролейный эфир; DIAD означает диизопропилазодикарбоксилат; DMF означает N,Nдиметилформамид; DMSO означает диметилсульфоксид; EtOAc означает этилацетат; EtOH означает этанол; MeOH означает метанол; CBz означает бензилоксикарбонил, который является защитной группы для аминогруппы; BOC означает трет-бутоксикарбонил, который является защитной группой для аминогруппы; HOAc означает уксусная кислота; NaCNBH3 означает цианоборгидрид натрия; к.т. означает комнатная температура; O/N означает в течение ночи; THF означает тетрагидрофуран; Boc2O означает ди-трет-бутилдикарбонат; TFA означает трифторуксусная кислота; DIPEA означает диизопропилэтиламин; SOC12 означает тионилхлорид; CS2 означает дисульфид углерода; TsOH означает паратолуолсульфоновая кислота; NFSI означает N-фтор-N-(бензолсульфонил)бензолсульфонамид; NCS означает 1-хлорпирролидин-2,5-дион; п-Bu4NF означает фторид тетрабутиламмония; iPrOH означает 2пропанол; Тпл означает точка плавления; EDCl означает 1-(3-диметиламинопропил)-3- 11 040879 этилкарбодиимида гидрохлорид.
Соединения названы вручную или с помощью программного обеспечения ChemDraw®, и коммерчески доступные соединения указаны под каталожными названиями фирмы-поставщика.
Технический результат: на ферментативном уровне соединение по настоящему изобретению оказывает хорошее ингибирующее воздействие на мутантные IDH1R132H и IDH1R132C и в то же время не оказывает ингибирующего воздействия на белок IDH дикого типа; на клеточной уровне соединение по настоящему изобретению оказывает хорошее 2-HG ингибирующее воздействие на клетки глиомы U87MG с мутацией IDH1R132H; соединение по настоящему изобретению имеет значительный ингибирующий эффект и хорошую селективность по отношению к мутантной IDH1 и в то же время имеет лучший коэффициент распределения в опухолях головного мозга и околомозговых тканях, что может снижать потенциальные побочные воздействия на нормальные ткани головного мозга.
Подробное описание изобретения
Нижеследующие примеры предназначены для подробного описания настоящего изобретения, но никоим образом не предназначены для ограничения настоящего изобретения. Настоящее изобретение подробно описано здесь, и его конкретные воплощения также раскрыты. Для специалистом в данной области будет очевидно, что различные изменения и усовершенствования могут быть сделаны в отношении конкретных воплощений настоящего изобретения без отклонения от замысла и объема настоящего изобретения.
Способ А.
где группы такие, как определено в соединение формулы (I) по настоящему изобретению. Пример 1.
Пример 1А.
Карбонат калия (2,46 г, 17,76 ммоль) добавляли в раствор метил-(Е)-3-(4-фтор-3-нитрофенил)акрилата (2 г, 8,88 ммоль) и (R)-1-фенилэтиламина (1,18 г, 9,77 ммоль, 1,26 мл) в тетрагидрофуране (20 мл), и смешанный раствор перемешивали при 50°С в течение 16 ч. Реакционный раствор разбавляли 50 мл воды и затем экстрагировали этилацетатом (30 млх3). Объединенную органическую фазу сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением неочищенного продукта. При 15°С неочищенный продукт перемешивали в смеси петролейный эфир:этилацетат=10:1 (11 мл) в течение 30 мин, фильтровали, и твердое вещество концентрировали при пониженном давлении с получением соединения примера 1А. Ή ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ=8.65 (d, J=5,4 Гц, 1H), 8.35 (d, J=2,1 Гц, 1H), 7.60-7.44 (m, 2H), 7.42-7.29 (m, 5H), 6.70 (d, J=8,9 Гц, 1H), 6.27 (d, J=15,9 Гц, 1H), 4.76 (q, J=6,5 Гц, 1H), 3.80 (s, 3H), 1.70 (d, J=6,7 Гц, 3H).
- 12 040879
Пример 1B.
Под защитой газа азота хлорид никеля (1,99 г, 15,32 ммоль) добавляли в раствор соединения примера 1А (1 г, 3,06 ммоль) в метаноле (20 мл), после охлаждения до 0°С медленно добавляли боргидрид натрия (695,57 мг, 18,39 ммоль) и смешанный раствор перемешивали при 15°С в течение 1 ч. Реакционную смесь гасили добавлением 100 мл насыщенного раствора хлорида аммония и перемешивали в течение 15 мин. Реакционный раствор экстрагировали этилацетатом (80 млх3), и объединенную органическую фазу сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением соединения примера 1В, которое напрямую использовали на следующей стадии без очистки.
Пример 1С.
4-(Трифторметокси)фенил-изотиоцианат (888,84 мг, 4,06 ммоль) добавляли в раствор соединения примера 1В (1,1 г, 3,69 ммоль) в тетрагидрофуране (20 мл), перемешивали при 40°С в течение получаса, затем добавляли EDC-HCl (1,41 г, 7,37 ммоль) и перемешивали при 70°С в течение 16 ч. Реакционный раствор разбавляли 30 мл воды и затем экстрагировали этилацетатом (30 млх3). Объединенную органическую фазу сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением неочищенного продукта, который очищали колоночной хроматографией с получением соединения примера 1С. 1Н ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ=7.43-7.29 (m, 6H), 7.21-7.17 (m, 2H), 7.09-6.98 (m, 3H), 6.91 (br d, J=7,9 Гц, 1H), 5.80 (br s, 1H), 5.67 (q, J=7,1 Гц, 1H), 3.70-3.48 (m, 3H), 2.98 (t, J=7,9 Гц, 2Н), 2.61 (t, J=7,9 Гц, 2Н), 1.82(d, J=7,1 Гц, 3H).
Пример 1.
Гидроксид лития (334,35 мг, 13,96 ммоль) добавляли в раствор соединения примера 1С (1,35 г, 2,79 ммоль) в тетрагидрофуране (10 мл) и воде (10 мл), перемешивали при 15°С в течение 16 ч, реакционный раствор доводили до pH 6 1М соляной кислотой. Реакционный раствор экстрагировали этилацетатом (30 млх3) и объединенную органическую фазу сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением неочищенного продукта. Неочищенный продукт разбавляли 5 мл этилацетата, и затем 20 мл петролейного эфира добавляли для осаждения белого твердого вещества. Твердое вещество отфильтровывали, концентрировали при пониженном давлении и затем разбавляли 10 мл метил-трет-бутилового эфира, перемешивали в течение десяти минут, фильтровали, и твердое вещество концентрировали при пониженном давлении с получением соединения примера 1. 1H ЯМР (400 МГц, метанол^) δ=7.57 (br d, J=8,9 Гц, 2Н), 7.43-7.21 (m, 8H), 6.90-6.63 (m, 2H), 5.97 (br d, J=6,8 Гц, 1H), 3.02-2.83 (m, 2H), 2.59 (br t, J=7,0 Гц, 2Н), 2.03-1.92 (m, 3H)
- 13 040879
Пример 2.
Пример 2А.
Карбонат калия (2,46 г, 17,76 ммоль) добавляли в раствор метил-(Е)-3-(4-фтор-3 нитрофенил)акрилата (2 г, 8,88 ммоль) и (S)-1-фенилэтиламина (1,08 г, 8,88 ммоль) в тетрагидрофуране (20 мл), смешанный раствор перемешивали при 50°С в течение 16 ч. Реакционный раствор разбавляли 50 мл воды и затем экстрагировали этилацетатом (30 млх3). Объединенную органическую фазу сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением неочищенного продукта. При 15°С неочищенный продукт перемешивали в смеси петролейный эфир:этилацетат=10:1 (11 мл) в течение 30 мин, фильтровали, и твердое вещество концентрировали при пониженном давлении с получением соединения примера 2А. 1Н ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ=8.65 (br d, J=5,5 Гц, 1H), 8.35 (d, J=2,1 Гц, 1H), 7.56 (d, J=15,9 Гц, 1H), 7.47 (dd, J=2.0, 8,9 Гц, 1H), 7.41-7.29 (m, 5H), 6.70 (d, J=9,0 Гц, 1H), 6.27 (d, J=15,9 Гц, 1H), 4.76 (q, J=6,5 Гц, 1H), 3.80 (s, 3H), 1.70 (d, J=6,7 Гц, 3H).
Пример 2В.
Под защитой газа азота хлорид никеля (1,99 г, 15,32 ммоль) добавляли в раствор соединения примера 2А (1 г, 3,06 ммоль) в метаноле (20 мл), после охлаждения до 0°С медленно добавляли боргидрид натрия (695,57 мг, 18,39 ммоль), смешанный раствор перемешивали при 15°С в течение 1 ч. Реакционную смесь гасили добавлением 100 мл насыщенного раствора хлорида аммония и перемешивали в течение 15 мин. Реакционный раствор экстрагировали этилацетатом (80 млх3), объединенную органическую фазу сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением соединения примера 2В, которое напрямую использовали на следующей стадии без очистки.
Пример 2С.
4-(Трифторметокси)фенил-изотиоцианат (767,64 мг, 3,50 ммоль) добавляли в раствор соединения примера 2В (950,00 мг, 3,18 ммоль) в тетрагидрофуране (2 мл), перемешивали при 40°С в течение получаса, затем добавляли EDCl (1,22 г, 6,37 ммоль) и перемешивали при 70°С в течение 16 ч. Реакционный раствор разбавляли 30 мл воды и затем экстрагировали этилацетатом (30 млх3). Объединенную органическую фазу сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением неочищенного продукта, который очищали колоночной хроматографией с получением соединения примера 2С. 1Н ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ=7.43-7.27 (m, 6H), 7.23-7.17 (m, 2H), 7.07-6.97 (m, 3H), 6.95-6.86 (m, 1H), 5.82 (br s, 1H), 5.67 (q, J=7,0 Гц, 1H), 3.61 (s, 3H), 2.97 (t, J=7,9 Гц, 2Н), 2.61 (t, J=7,9 Гц, 2Н), 1.82 (d, J=7,1 Гц, 3H).
- 14 040879
Пример 2.
Гидроксид лития (329,42 мг, 13,75 ммоль) добавляли в смешанный раствор соединения примера 2С (1,33 г, 2,75 ммоль) в тетрагидрофуране (10 мл) и воде (10 мл), перемешивали при 15°С в течение 16 ч, реакционный раствор доводили до pH 6 1М соляной кислотой. Реакционный раствор экстрагировали этилацетатом (30 млх3), объединенную органическую фазу сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением неочищенного продукта. Неочищенный продукт разбавляли 5 мл этилацетата и затем 20 мл петролейного эфира добавляли для осаждения белого твердого вещества. Твердое вещество отфильтровывали, концентрировали при пониженном давлении, затем разбавляли 10 мл метил-трет-бутилового эфира, перемешивали в течение десяти минут, фильтровали, и твердое вещество концентрировали при пониженном давлении с получением соединения примера 2. 1H ЯМР (400 МГц, метанол^) δ=7.56 (br d, J=7,2 Гц, 2Н), 7.42-7.22 (m, 8H), 6.866.71 (m, 2H), 6.03-5.88 (m, 1H), 2.98-2.87 (m, 2H), 2.63-2.53 (m, 2H), 2.05-1.92 (m, 3H).
Пример 3.
OCF3
A О
Пример 3А.
4O a
LI
NH
AA
Карбонат калия (982,04 мг, 7,11 ммоль) и (1R)-1-(4-хлорфенил)этиламин (552,91 мг, 3,55 ммоль) добавляли в раствор метилового эфира (Е)-3-(4-фтор-3-нитро-фенил)проп-2-еновой кислоты (800 мг, 3,55 ммоль) в тетрагидрофуране (15 мл), и эту смесь перемешивали при 45°С в течение 20 ч. Реакционную смесь концентрировали при пониженном давлении для удаления растворителя. Остаток разбавляли 100 мл воды и экстрагировали 300 мл (100 млх3) этилацетата. Объединенный органический слой промывали 200 мл (100 млх2) насыщенного водного раствора хлорида натрия и сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением остатка. Остаток очищали колоночной хроматографией с получением соединения примера 3А. 1H ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ=8.58 (br d, J=5,4 Гц, 1H), 8.34 (d, J=2,1 Гц, 1H), 7.55 (d, J=16,0 Гц, 1H), 7.47 (dd, J=2.1, 9,0 Гц, 1H), 7.367.32 (m, 2Н), 7.29-7.27 (m, 2H), 6.62 (d, J=9,0 Гц, 1H), 6.27 (d, J=16,0 Гц, 1H), 4.71 (quin, J=6,4 Гц, 1H), 3.79 (s, 3H), 1.66 (d, J=6,7 Гц, 3H).
- 15 040879
Пример 3В.
В раствор соединения примера ЗА (1,01 г, 2,80 ммоль) в метаноле (10 мл) и тетрагидрофуране (6 мл) добавляли хлорид никеля (3,33 г, 14,00 ммоль) и затем добавляли по каплям раствор боргидрида натрия (1,38 г, 36,39 ммоль) в диметилформамиде (3 мл), контролируя, чтобы внутренняя температура не превышала 10°С, затем реакционную смесь перемешивали при 10°С в течение 1 ч. Воду (80 мл) иэтилацетат (30 мл) добавляли в смесь и фильтровали ее через фильтр из целита. Осадок на фильтре промывали этилацетатом (40 млх3), фильтрат экстрагировали 150 мл этилацетата. Объединенную органическую фазу промывали насыщенным рассолом (100 млх2), сушили над безводным сульфатом натрия и концентрировали в вакууме с получением соединения примера 3В, которое напрямую использовали на следующей стадии без очистки.
Пример 3С.
1-Изотиоцианато-4-(трифторметокси)бензол (515,06 мг, 2,35 ммоль, 381,52 мкл) добавляли в раствор соединения примера 3В (711 мг, 2,14 ммоль) в тетрагидрофуране (8 мл), и эту смесь перемешивали при 45°С в течение 1 ч, затем добавляли EDCl (409,53 мг, 2,14 ммоль), и смесь перемешивали при 70°С в течение 15 ч. Реакционную смесь концентрировали при пониженном давлении для удаления растворителя. Остаток разбавляли 50 мл воды и экстрагировали 100 мл (50 млх2) этилацетата. Объединенный органический слой промывали 100 мл (50 млх2) насыщенного водного раствора хлорида натрия, сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением остатка. Остаток очищали колоночной хроматографией (SiO2, петролейный эфир/этилацетат=от 1/0 до 10:1) с получением соединения примера 3С, которое напрямую использовали на следующей стадии без очистки.
Пример 3.
Гидроксид лития (288,84 мг, 6,88 ммоль) добавляли в раствор соединения примера 3С (713 мг, 1,38 ммоль) в тетрагидрофуране (4 мл) и воде (2 мл), эту смесь перемешивали при 20°С в течение 16 ч. Смесь подкисляли до pH=6 разбавленной соляной кислотой (1 н.) и экстрагировали 200 мл (100 млх2) этилацетата. Объединенный органический слой промывали 200 мл (100 млх2) насыщенного водного солевого раствора, сушили с использованием безводного сульфата натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением остатка. Остаток очищали высокоэффективной жидкостной хроматографией (TFA условия) с получением соединения примера 3D. 1Н ЯМР (400 МГц, DMSO-d6) δ=7.78 (br s, 2H), 7.47 (s, 6H), 7.26 (s, 1H), 6.98-6.76 (m, 2H), 6.14-6.03 (m, 1H), 3.42 (br s, 2H), 2.85 (br t, J=7,3 Гц, 2Н), 1.96 (br d, J=6,7 Гц, 3H).
- 16 040879
Пример 4.
Пример 4А.
Карбонат калия (982,04 мг, 7,11 ммоль) и (1R)-1-(4-фторфенил)этиламин (494,45 мг, 3,55 ммоль) добавляли в раствор метилового эфира (Е)-3-(4-фтор-3-нитро-фенил)проп-2-еновой кислоты (800 мг, 3,55 ммоль) в тетрагидрофуране (15 мл), и эту смесь перемешивали при 45°С в течение 20 ч. Реакционную смесь концентрировали при пониженном давлении для удаления растворителя. Остаток разбавляли 100 мл воды и экстрагировали 300 мл (100 млх3) этилацетата. Объединенный органический слой промывали 200 мл (100 млх2) рассола, сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением остатка. Остаток очищали колоночной хроматографией (SiO2, петролейный эфир/этилацетат=от 1/0 до 5:1) с получением соединения примера 4А. 1H ЯМР (400 МГц, CDCl·,) δ=8.59 (br d, J=5,1 Гц, 1H), 8.34 (d, J=2,2 Гц, 1H), 7.55 (d, J=15,9 Гц, 1H), 7.48 (dd, J=2.1, 8,9 Гц, 1H), 7.34-7.28 (m, 2Н), 7.09-7.01 (m, 2H), 6.65 (d, J=8,9 Гц, 1H), 6.27 (d, J=16,0 Гц, 1H), 4.73 (quin, J=6,5 Гц, 1H), 3.79 (s, 3H), 1.66 (d, J=6,7 Гц, 3H).
Пример 4В.
В раствор соединения примера 4А (1,01 г, 2,93 ммоль) в метаноле (6 мл) и тетрагидрофуране (6 мл) добавляли хлорид никеля (3,49 г, 14,67 ммоль) и затем добавляли по каплям раствор боргидрида натрия (1,4 г, 38,1 ммоль) в диметилформамиде (3 мл), контролируя, чтобы внутренняя температура не превышала 10°С, и затем реакционную смесь перемешивали при 10°С в течение 1 . Смесь вливали в воду (80 мл) и этилацетат (30 мл) и фильтровали через фильтр из целита. Осадок на фильтре промывали этилацетатом (40 млх3), смесь экстрагировали 150 мл этилацетата. Объединенную органическую фазу промывали насыщенным рассолом (100 млх2), сушили над безводным сульфатом натрия и концентрировали в вакууме с получением соединения примера 4В, которое напрямую использовали на следующей стадии без очистки.
Пример 4С.
1-Изотиоцианоил-4-(трифторметокси)бензол (313,22 мг, 1,43 ммоль) добавляли в раствор соедине- 17 040879 ния примера 4В (411 мг, 1,30 ммоль) в тетрагидрофуране (6 мл), и эту смесь перемешивали при 45°С в течение 1 ч, затем добавляли EDCl (249,04 мг, 1,30 ммоль), и смесь перемешивали при 70°С в течение 15 ч . Реакционную смесь концентрировали при пониженном давлении для удаления растворителя. Остаток разбавляли 50 мл воды и экстрагировали 100 мл (50 млх2) этилацетата. Объединенный органический слой промывали 100 мл (50 млх2) водного раствора, сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением остатка. Остаток очищали колоночной хроматографией с получением соединения примера 4С, которое напрямую использовали на следующей стадии без очистки.
Пример 4.
Гидроксид лития (139,33 мг, 3,32 ммоль) добавляли в раствор соединения примера 4С (333 мг, 664,05 мкмоль) в тетрагидрофуране (4 мл) и воде (2 мл), и эту смесь перемешивали при 20°С в течение 16 ч. Смесь подкисляли разбавленной соляной кислотой (1 н., 6 мл) до pH=6 и экстрагировали 200 мл (100 млх2) этилацетата. Объединенный органический слой промывали 200 мл (100 млх2) солевого раствора и сушили с использованием безводного сульфата натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением остатка. Остаток очищали высокоэффективной жидкостной хроматографией (TFA условия) с получением соединения примера 4. 1H ЯМР (400 МГц, DMSO-d6) δ=7.79 (br d, J=8,4 Гц, 2Н), 7.49 (br s, 4H), 7.29-7.21 (m, 3H), 6.95-6.78 (m, 2H), 6.08 (br d, J=7,0 Гц, 1H), 3.44-3.39 (m, 2H), 2.84 (br t, J=7,4 Гц, 2Н), 1.96 (br d, J=6,7 Гц, 3H).
Пример 5.
Пример 5А.
Карбонат калия (920,67 мг, 6,66 ммоль) и (1R)-1-фенилпроп-1-амин (330,25 мг, 2,44 ммоль, 350,58 мкл) добавляли в раствор метил-(Е)-3-(4-фтор-3-нитро-фенил)акрилата (500 мг, 2,22 ммоль) в тетрагидрофуране (10 мл), и эту смесь перемешивали при 50°С в течение 16 ч. Реакционную смесь разбавляли водой (20 мл) и затем экстрагировали этилацетатом (10 млх3). Объединенный органический слой промывали рассолом (30 мл), сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением соединения примера 5А, которое напрямую использовали на следующей стадии без очистки. 1Н ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ=8.67 (br d, J=5,8 Гц, 1H), 8.24 (d, J=2,1 Гц, 1H), 7.46 (d, J=15,9 Гц, 1H), 7.36 (dd, J=2.1, 9,0 Гц, 1H), 7.32-7.19 (m, 6H), 6.60 (d, J=9,0 Гц, 1H), 6.16 (d, J=15,9 Гц, 1H), 4.41 (q, J=6,5 Гц, 1H), 3.70 (s, 3H), 1.95-1.85 (m, 2H), 0.96 (t, J=7,4 Гц, 3H).
- 18 040879
Пример 5В.
В раствор соединения примера 5А (400 мг, 1,18 ммоль) в тетрагидрофуране (5 мл) добавляли гексагидрат дихлорида никеля (1,12 г, 4,70 ммоль) и затем добавляли по каплям раствор боргидрида натрия (88,92 мг, 2,35 ммоль) в диметилформамиде (1 мл), контролируя, чтобы внутренняя температура не превышала 10°С, и затем реакционную смесь перемешивали при 10°С в течение 2 ч, затем порциями добавляли боргидрид натрия (177,84 мг, 4,70 ммоль) при 0°С и перемешивали при 15°С в течение 2 ч. Реакционную смесь разбавляли водой (20 мл) и затем фильтровали. Фильтрат экстрагировали этилацетатом (20 мл х4). Объединенный органический слой промывали рассолом (40 мл х1), сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением соединения примера 5В, которое напрямую использовали на следующей стадии без очистки.
Пример 5С.
4-(Трифторметокси)фенилтиоизоцианат (270,12 мг, 1,23 ммоль) добавляли в раствор соединения примера 5В (350 мг, 1,12 ммоль) в тетрагидрофуране (5 мл), эту смесь перемешивали при 25°С в течение 1 ч. Затем EDCl (429,54 мг, 2,24 ммоль) добавляли в смесь и подвергали взаимодействию при 70°С в течение 2 ч. Реакционную смесь концентрировали при пониженном давлении для удаления тетрагидрофу рана. Остаток разбавляли водой (10 мл) и экстрагировали этилацетатом (10 млх3). Объединенный органический слой промывали HCl (1М, 5 мл) и рассолом (20 мл), сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением соединения примера 5С, которое напрямую использовали на следующей стадии без дополнительной очистки.
Пример 5.
Моногидрат гидроксида лития (126,52 мг, 3,02 ммоль) добавляли в раствор соединения примера 5С (500 мг, 1,01 ммоль) в воде (5 мл), и эту смесь перемешивали при 20°С в течение 16 ч. Смесь доводили до pH 6-7 HCl (1М водный раствор) и экстрагировали этилацетатом (10 мл х4). Объединенный органический слой промывали рассолом (20 мл х1), сушили с использованием безводного сульфата натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением остатка, который отделяли и очищали высокоэффективной жидкостной хроматографией (TFA условия) с получением соединения примера 5. 1H ЯМР (400 МГц, метанолЛ4) δ=67-7.60 (m, 2H), 7.56-7.43 (m, 6H), 7.42-7.36 (m, 1H), 7.32 (s, 1H), 7.08 (d, J=1,0 Гц, 2Н), 5.84 (dd, J=5.5, 10,1 Гц, 1H), 2.98 (t, J=7,5 Гц, 2Н), 2.76-2.65 (m, 1H), 2.65-2.54 (m,
3H), 1.06 (t, J=7,3 Гц, 3H).
Пример 6.
- 19 040879
Пример 6А.
В раствор метил-(Е)-3-(4-фтор-3-нитро-фенил)проп-2-еноата (800 мг, 3,55 ммоль) в тетрагидрофу ране (10 мл) добавляли (1R)-тетрагидронафталин-1-амин (523,04 мг, 3,55 ммоль) и карбонат калия (982,04 мг, 7,11 ммоль), эту смесь перемешивали при 50°С в течение 16 ч. Реакционную смесь концентрировали при пониженном давлении для удаления растворителя. Остаток разбавляли 100 мл воды и экс трагировали 200 мл (100 млх2) этилацетата. Объединенный органический слой промывали 200 мл (100 млх2) солевого раствора, сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением соединения примера 6А, которое напрямую использовали на следующей стадии без очистки.
Пример 6В.
'''О
В раствор соединения примера 6А (1,31 г, 3,72 ммоль) в метаноле (10 мл) добавляли хлорид никеля (4,42 г, 18,59 ммоль) и затем добавляли по каплям раствор боргидрида натрия (1,97 г, 52,05 ммоль), растворенного в диметилформамиде (3 мл), контролируя, чтобы внутренняя температура не превышала 10°С, и затем реакционную смесь перемешивали при 10°С в течение 16 ч. Смесь вливали в воду (100 мл), этилацетат (40 мл) и фильтровали через фильтр из целита. Осадок на фильтре промывали этилацетатом (60 млх3), смесь экстрагировали 150 мл этилацетата. Объединенную органическую фазу промывали насыщенным рассолом (100 млх2), сушили над безводным сульфатом натрия и концентрировали при пониженном давлении с получением соединения примера 6В, которое напрямую использовали на следующей стадии без очистки.
Пример 6С.
В раствор соединения примера 6В (1,09 г, 2,99 ммоль) в тетрагидрофуране (15 мл) добавляли изотиоцианоил-4-(трифторметокси)бензол (720,97 мг, 3,29 ммоль), эту смесь перемешивали при 50°С в течение 1 ч. Затем добавляли EDCl (573,25 мг, 2,99 ммоль), и смесь перемешивали при 70°С в течение 15 ч. Реакционную смесь концентрировали при пониженном давлении для удаления растворителя. Остаток разбавляли 100 мл воды и экстрагировали 200 мл (100 млх2) этилацетата. Объединенный органический слой промывали 200 мл (100 млх2) солевого раствора, сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением остатка. Остаток очищали колоночной хроматографией (SiO2, петролейный эфир/этилацетат=от 1/0 до 12:1) с получением соединения примера 6С.
- 20 040879
Пример 6.
В раствор соединения примера 6С (1,36 г, 2.64 ммоль) в тетрагидрофуране (10 мл) и воде (4 мл) добавляли гидроксид лития (554,44 мг, 13,21 ммоль), и эту смесь перемешивали при 25°С в течение 16 ч. Смесь подкисляли до pH=6 разбавленной соляной кислотой (1 н., 4 мл) и экстрагировали 200 мл (100 млх2) этилацетата. Объединенный органический слой промывали 200 мл (100 млх2) солевого раствора, сушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением остатка. Остаток растворяли в ЕА (10 мл) и перемешивали при 25°С в течение 30 мин, затем смесь фильтровали и промывали этилацетатом (2х10 мл) с получением соединения примера 6. 1H ЯМР (400 МГц, метанол^4) δ=7.60 (br d, J=8,6 Гц, 2Н), 7.33-7.15 (m, 5H), 7.04 (br t, J=7,0 Гц, 1H), 6.83 (br d, J=7,6 Гц, 1H), 6.74 (br d, J=7,9 Гц, 1H), 6.41 (br d, J=8,1 Гц, 1H), 5.88 (brt, J=8,1 Гц, 1H), 3.15-3.01 (m, 1H), 3.00-2.85 (m, 3H), 2.57 (br t, J=7,4 Гц, 2H), 2.30 (br s, 2H), 2.13 (br s, 1H), 2.01 (br d, J=16,1 Гц, 1H).
Пример 7.
Пример 7А.
В раствор метил-(Е)-3-(4-фтор-3-нитрофенил)акрилата (0,5 г, 2,22 ммоль) и (R)-1-(3-хлорфенил)этиламина (380,12 мг, 2,44 ммоль) в тетрагидрофуране (10 мл) добавляли карбонат калия (613,78 мг, 4,44 ммоль), и смешанный раствор перемешивали при 50°С в течение 12 ч. Реакционный раствор разбавляли 30 мл воды и затем экстрагировали этилацетатом (30 млх3). Объединенную органическую фазу сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением неочищенного продукта. Неочищенный продукт очищали колоночной хроматографией с получением соединения примера 7А в виде желтого масла. 1Н ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ=8.49 (br d, J=5,5 Гц, 1H), 8.26 (d, J=2,1 Гц, 1H), 7.47 (d, J=15,9 Гц, 1H), 7.40 (dd, J=2.0, 9,0 Гц, 1H), 7.24 (s, 1H), 7.21-7.16 (m, 2H), 7.16-7.12 (m, 1H), 6.55 (d, J=9,0 Гц, 1H), 6.19 (d, J=15,9 Гц, 1H), 4.62 (quin, J=6,5 Гц, 1H), 3.71 (s, 3H), 1.59 (d, J=6,7 Гц, 3H).
Пример 7В.
Под защитой газа азота хлорид никеля (1,42 г, 10,95 ммоль) добавляли в раствор соединения примера 7А (0,79 г, 2,19 ммоль) в метаноле (10 мл) и после охлаждения до 0°С медленно добавляли боргидрид натрия (828,40 мг, 21,90 ммоль), смешанный раствор перемешивали при 15°С в течение 0,5 ч. Реакционную смесь гасили добавлением 50 мл насыщенного раствора хлорида аммония и перемешивали в течение 15 мин. Реакционный раствор экстрагировали этилацетатом (50 млх3), объединенную органическую фазу сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением соединения примера 7В в виде желтого масла, которое напрямую использовали на следующей стадии без дополнительной очистки.
- 21 040879
Пример 7С.
В раствор соединения примера 7В (0,615 г, 1,85 ммоль) в тетрагидрофуране (10 мл) добавляли 4(трифторметокси)фенил-изотиоцианат (486,02 мг, 2,22 ммоль, 360,01 мкм), и эту смесь перемешивали при 40°С в течение 0,5 часа, затем добавляли EDC-HCl (708,46 мг, 3,70 ммоль) и перемешивали при 70°С в течение 5 ч. Реакционный раствор разбавляли 30 мл воды и затем экстрагировали этилацетатом (30 млх3). Объединенную органическую фазу сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением неочищенного продукта, который очищали колоночной хроматографией с получением соединения примера 7С в виде желтого твердого вещества.
Пример 7.
Гидроксид лития (234,96 мг, 5,60 ммоль) добавляли в смешанный раствор соединения примера 7С (0,58 г, 1,12 ммоль) в тетрагидрофуране (5 мл) и воде (5 мл) и перемешивали при 20°С в течение 16 ч. Реакционный раствор доводили до pH 6 1М соляной кислотой, затем разбавляли 30 мл воды и экстрагировали этилацетатом (30 млх3). Объединенную органическую фазу сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением неочищенного продукта. Неочищенный продукт очищали высокоэффективной жидкостной хроматографией с получением соединения примера 7. 1H ЯМР (400 МГц, DMSO-d6) δ=9.27 (s, 1H), 7.93 (d, J=9,0 Гц, 2Н), 7.44-7.32 (m, 5H), 7.28-7.21 (m, 2H), 6.79-6.68 (m, 2H), 6.07 (q, J=6,9 Гц, 1H), 2.82 (br t, J=7,5 Гц, 2H), 2.53 (br s, 2H), 1.90 (d, J=7,0 Гц, 3H).
Пример 8.
Пример 8А.
В раствор метил-(Е)-3-(4-фтор-3-нитро-фенил)проп-2-еноата (500 мг, 2,22 ммоль) в THF (10 мл) добавляли K2CO3 (920,67 мг, 6,66 ммоль) и (1R)-индан-1-амин (325,33 мг, 2,44 ммоль, 312,81 мкл). Эту смесь перемешивали при 50°С в течение 16 ч. Реакционную смесь разбавляли водой (20 мл) и экстрагировали этилацетатом (20 млх3). Объединенный органический слой промывали рассолом (20 млх2), сушили над сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением
- 22 040879 соединения примера 8А. 1H ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ=8.46 (br d, J=7,0 Гц, 1H), 8.29 (d, J=2,1 Гц, 1H), 7.60 (dd, J=2.1, 9,0 Гц, 1H), 7.54 (d, J=15,9 Гц, 1H), 7.31-7.19 (m, 4H), 7.18-7.11 (m, 1H), 7.05 (d, J=9,0 Гц, 1H),
6.26 (d, J=15,9 Гц, 1H), 5.15 (q, J=7,1 Гц, 1H), 3.73 (s, 3H), 3.08-2.99 (m, 1H), 2.96-2.86 (m, 1H), 2.70-2.60 (m, 1H), 2.02-1.96 (m, 1H).
Пример 8В.
В раствор соединения примера 8А (720 мг, 2,13 ммоль) в MeOH (20 мл) и DMF (5 мл) добавляли NiCl22О (2,02 г, 8,51 ммоль) и NaBH4 (563,54 мг, 14,90 ммоль) порциями. Эту смесь перемешивали при 0°С в течение 1 ч. Реакционную смесь гасили добавлением воды (50 мл) и затем разбавляли этилацетатом (50 мл). Смесь фильтровали и экстрагировали этилацетатом (30 млх3). Объединенный органический слой промывали рассолом (100 мл х1), сушили над сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением соединения примера 8В в виде коричневого масла. Остаток напрямую использовали на следующей стадии без дополнительной очистки.
Пример 8С.
В раствор соединения примера 8В (800 мг, 2,58 ммоль) в THF (10 мл) добавляли 4(трифторметокси)фенил-изотиоцианат (677,91 мг, 3,09 ммоль, 502,16 мкл). Эту смесь перемешивали при 30°С в течение 1 ч. Затем добавляли EDCl (988,19 мг, 5,15 ммоль), и смесь перемешивали при 70°С в течение 2 ч. Реакционную смесь разбавляли водой (30 мл) и экстрагировали этилацетатом (20 млх3). Объединенный органический слой промывали рассолом (30 мл х 1), сушили над сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением остатка. Остаток очищали колоночной хроматографией с получением соединения примера 8С в виде коричневого масла. 1H ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ=7.52-7.42 (m, 3H), 7.37-7.29 (m, 2H), 7.28-7.18 (m, 3H), 7.11 (br d, J=8,7 Гц, 2Н), 7.03-6.93 (m, 1H), 6.06 (t, J=8,3 Гц, 1H), 3.70 (s, 3H), 3.30-3.20 (m, 1H), 3.16-3.09 (m, 1H), 3.06 (t, J=7,8 Гц, 2Н), 2.82-2.73 (m, 1H), 2.70 (t, J=7,9 Гц, 2Н), 2.34 (qd, J=8.8, 13,4 Гц, 1Н).
Пример 8.
В раствор соединения примера 8С (450 мг, 908,19 мкмоль) в THF (2 мл) и H2O (2 мл) добавляли LiOH-H2O (114,33 мг, 2,72 ммоль). Эту смесь перемешивали при 20°С в течение 16 ч. Смесь доводили до pH 7 водным раствором HCl (1М) и затем экстрагировали этилацетатом (10 млх3). Объединенный органический слой промывали рассолом (20 мл), сушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении, и очищали высокоэффективной жидкостной хроматографией с получением соединения примера 8. 1H ЯМР (400 МГц, метанол-d4) δ=7.73-7.59 (m, 2H), 7.56-7.47 (m, 3H), 7.46-7.40 (m, 1H), 7.32-7.20 (m, 3H), 6.96 (d, J=8,3 Гц, 1H), 6.41-6.22 (m, 2H), 3.40-3.34 (m, 1H), 3.20 (td, J=8.5, 16,6 Гц, 1H), 2.99-2.93 (m, 2H), 2.92-2.84 (m, 1H), 2.62-2.55 (m, 2Н), 2.55-2.46 (m, 1H).
- 23 040879
Пример 9.
Пример 9А.
В раствор метил-(Е)-3-(4-фтор-3-нитрофенил)акрилата (0,5 г, 2,22 ммоль) и дифенилметиламина (447,60 мг, 2,44 ммоль, 422,26 мкл) в тетрагидрофуране (10 мл) добавляли карбонат калия (613,78 мг, 4,44 ммоль), и смешанный раствор перемешивали при 50°С в течение 12 ч. Затем добавляли дифенилметиламин (81,38 мг, 444,10 мкмоль, 76,77 мкл), и раствор перемешивали при 55°С в течение 12 ч. Реакционный раствор разбавляли 30 мл воды и затем экстрагировали этилацетатом (30 млх3). Объединенную органическую фазу сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением неочищенного продукта. Неочищенный продукт очищали колоночной хроматографией с получением соединения примера 9А в виде желтого твердого вещества. 1Н ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ=8.74 (br d, J=5,3 Гц, 1H), 8.27 (d, J=1,9 Гц, 1H), 7.48 (d, J=15,9 Гц, 1H), 7.42 (dd, J=1.8, 8,9 Гц, 1H), 7.32-7.20 (m, 10Н), 6.69 (d, J=9,0 Гц, 1H), 6.19 (d, J=15,9 Гц, 1H), 5.70 (d, J=5,5 Гц, 1H), 3.71 (s, 3H).
Пример 9В.
Под защитой газа азота хлорид никеля (1,10 г, 8,50 ммоль) добавляли в раствор соединения примера 9А (0,66 г, 1,70 ммоль) в метаноле (10 мл) и после охлаждения до 0°С добавляли медленно боргидрид натрия (642,86 мг, 16,99 ммоль). Смешанный раствор перемешивали при 20°С в течение 0,5 ч. Реакционную смесь гасили добавлением 50 мл насыщенного раствора хлорида аммония и перемешивали в течение 15 мин. Реакционный раствор экстрагировали этилацетатом (50 млх3), объединенную органическую фазу сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением соединения примера 9В в виде желтого масла, которое напрямую использовали на следующей стадии без очистки.
- 24 040879
Пример 9С.
В раствор соединения примера 9В (0,41 г, 1,14 ммоль) в тетрагидрофуране (10 мл) добавляли 4(трифторметокси)фенил-изотиоцианат (278 мг, 1,27 ммоль, 205,93 мкл) и перемешивали при 40°С в течение 1 ч. Затем добавляли EDC-HCl (436,11 мг, 2,27 ммоль) и перемешивали при 70°С в течение 12 ч. Реакционный раствор разбавляли 30 мл воды и затем экстрагировали этилацетатом (30 млх3). Объединенную органическую фазу сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением неочищенного продукта, который очищали колоночной хроматографией с получением соединения примера 9С в виде желтого твердого вещества.
Пример 9.
В раствор соединения примера 9С (0,46 г, 843,18 мкмоль) в тетрагидрофуране (5 мл) и воде (5 мл) добавляли моногидрат гидроксида лития (176,92 мг, 4,22 ммоль) и перемешивали при 20°С в течение 12 ч.
Реакционный раствор доводили до pH 6 1М соляной кислотой и экстрагировали этилацетатом (20 млх3). Объединенную органическую фазу сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением неочищенного продукта. Неочищенный продукт разбавляли 10 мл смеси петролейный эфир:этилацетат=10:1, перемешивали в течение 30 мин, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением соединения примера 9. 1H ЯМР (400 МГц,
DMSO-d6) δ=12.06 (br s, 1H), 9.33 (br s, 1H), 7.90 (br d, J=8,2 Гц, 2H), 7.46-7.35 (m, 7H), 7.32 (br d, J=8,7 Гц, 2H), 7.26 (br s, 1H), 7.20 (br d, J=7,1 Гц, 4Н), 6.64 (br d, J=7,8 Гц, 1H), 6.28 (br d, J=8,2 Гц, 1H), 2.81 (br t, J=7,5 Гц, 2Н), 2.53 (brs, 2H).
Пример 10.
Пример 10А.
В раствор метил-(Е)-3-(4-фтор-3-нитро-фенил)проп-2-еноата (750 мг, 3,33 ммоль) в тетрагидрофу- 25 040879 ране (10 мл) добавляли карбонат калия (920,67 мг, 6,66 ммоль) и (1R)-1-(2-метоксифенил)этиламин (503,52 мг, 3,33 ммоль), эту смесь перемешивали при 50°С в течение 16 ч. Реакционную смесь концентрировали при пониженном давлении для удаления растворителя. Остаток разбавляли 100 мл воды и экстрагировали 200 мл (100 млх2) этилацетата. Объединенный органический слой промывали 200 мл (100 млх2) солевого раствора, сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением остатка, и этот остаток очищали колоночной хроматографией (SiO2, петролейный эфир/этилацетат=от 1/0 до 15:1) с получением соединения примера 10А.
Пример 10В.
В раствор соединения примера 10А (1,19 г, 3,34 ммоль) в метаноле (10 мл) добавляли хлорид никеля (3,97 г, 16,70 ммоль) и затем добавляли по каплям раствор боргидрида натрия (1,39 г, 36,73 ммоль) в диметилформамиде (5 мл), контролируя, чтобы внутренняя температура не превышала 10°С, и затем реакционную смесь перемешивали при 10°С в течение 16 ч. Смесь вливали в воду (100 мл) и этилацетат (40 мл) и фильтровали через фильтр из целита. Осадок на фильтре промывали этилацетатом (60 млх3), фильтрат экстрагировали 150 мл этилацетата. Объединенные органические фазы промывали насыщенным рассолом (100 млх2), сушили над безводным сульфатом натрия и концентрировали в вакууме с получением соединения примера 10В.
Пример 10С.
В раствор соединения примера 10В (1,11 г, 3,35 ммоль) в тетрагидрофуране (15 мл) добавляли 1изотиоцианоил-4-(трифторметокси)бензол (734,27 мг, 3,35 ммоль, 543,90 мкл), эту смесь перемешивали при 50°С в течение 1 ч, затем добавляли EDCl (642,11 мг, 3,35 ммоль) и смесь перемешивали при 70°С в течение 15 ч . Реакционную смесь концентрировали при пониженном давлении для удаления растворителя. Остаток разбавляли 100 мл воды и экстрагировали 200 мл (100 млх2) этилацетата. Объединенный органический слой промывали 200 мл (100 млх2) насыщенного солевого раствора, сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением остатка. Остаток очищали колоночной хроматографией (SiO2, петролейный эфир/этилацетат=от 1/0 до 6/1) с получением соединения примера 10С.
Пример 10.
В раствор соединения примера 10С (1,32 г, 2,49 ммоль) в тетрагидрофуране (6 мл) и воде (3 мл) добавляли моногидрат гидроксида лития (523,12 мг, 12,47 ммоль), и эту смесь перемешивали при 25°С в течение 16 ч. Смесь подкисляли разбавленной соляной кислотой (1 н., 4 мл) до pH=6 и экстрагировали 200 мл (100 млх2) этилацетата. Объединенный органический слой промывали 200 мл (100 млх2) насыщенного солевого раствора, сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении. Полученный остаток растворяли в смешанном растворе этилацетата (4 мл) и
- 26 040879 петролейного эфира (8 мл) и перемешивали при 25°С в течение 60 мин. Смесь фильтровали, и осадок на фильтре промывали смешанным раствором этилацетата (1 мл) и петролейного эфира (2 мл) с получением соединения примера 10. 1H ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ=7.60-7.55 (m, 2H), 7.37-7.32 (m, 1H), 7.28-7.22 (m,
3H), 7.09-7.03 (m, 3H), 6.98 (dd, J=1.5, 8,3 Гц, 1H), 6.86 (d, J=8,3 Гц, 1H), 5.78 (q, J=7,1 Гц, 1H), 3.70 (s,
3H), 3.13-2.98 (m, 2H), 2.75-2.61 (m, 2H), 1.88 (d, J=7,1 Гц, 3H).
Пример 11.
Пример 11А.
В раствор метил-(Е)-3-(4-фтор-3-нитро-фенил)проп-2-еноата (220 мг, 977,03 мкмоль) в тетрагидрофуране (10 мл) добавляли карбонат калия (675,15 мг, 2,931 ммоль) и (1R)-2,2-диметил-1-фенил-проп-1амина гидрохлорид (195,13 мг, 977,03 мкмоль). Эту смесь перемешивали при 60°С в течение 48 ч. Реакционную смесь концентрировали при пониженном давлении для удаления растворителя. Остаток разбавляли 100 мл воды и экстрагировали 200 мл (100 млх2) этилацетата. Объединенный органический слой промывали 200 мл (100 млх2) насыщенного солевого раствора, сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением остатка. Остаток очищали колоночной хроматографией (SiO2, петролейный эфир/этилацетат=от 1/0 до 12/1) с получением соединения примера 11А.
Пример 11В.
В раствор соединения примера 11А (420 мг, 1,14 ммоль) в метаноле (6 мл) добавляли хлорид никеля (1,35 г, 5,70 ммоль) и затем добавляли по каплям раствор боргидрида натрия (474,42 мг, 12,54 ммоль) в диметилформамиде (3 мл), контролируя, чтобы внутренняя температура не превышала 10°С, и затем реакционную смесь перемешивали при 10°С в течение 2 ч. Смесь вливали в воду (80 мл), этилацетат (20 мл) и фильтровали через фильтр из целита. Осадок на фильтре промывали этилацетатом (50 млх3), и смесь экстрагировали 100 мл этилацетата. Объединенную органическую фазу промывали насыщенным рассолом (80 млх2), сушили над безводным сульфатом натрия и концентрировали в вакууме с получением соединения примера 11В, которое напрямую использовали на следующей стадии без очистки.
- 27 040879
Пример 11С.
В раствор соединения примера 11В (270 мг, 793,05 мкмоль) в тетрагидрофуране (5 мл) добавляли 1изотиоцианато-4-(трифторметокси)бензол (173,82 мг, 793,05 мкмоль, 128,76 мкл), эту смесь перемешивали при 50°С в течение 1 ч, затем добавляли EDCl (167,23 мг, 872,35 мкмоль) и смесь перемешивали при 70°С в течение 15 ч . Реакционную смесь концентрировали при пониженном давлении для удаления растворителя. Остаток разбавляли 100 мл воды и экстрагировали 200 мл этилацетата (100 млх2). Объе диненный органический слой промывали 200 мл насыщенного солевого раствора (100 млх2), сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением остатка, который очищали колоночной хроматографией (SiO2, петролейный эфир/этилацетат=от 1/0 до 10/1) с получением соединения примера 11С.
Пример 11.
В раствор соединения примера 11С (373 мг, 695,52 мкмоль) в тетрагидрофуране (3 мл) и воде (1 мл) добавляли гидроксид лития (145,93 мг, 3,48 ммоль), эту смесь перемешивали при 25°С в течение 6 ч. Смесь подкисляли pH=6 разбавленной соляной кислотой (1 н., 3 мл), фильтровали, осадок на фильтре промывали 20 мл этилацетата с получением остатка. Осадок на фильтре растворяли в метаноле (10 мл) и дихлорметане (10 мл), смесь перемешивали при 80°С в течение 1 ч и затем фильтровали. Осадок на фильтре представлял собой продукт примера 11. 1H ЯМР (400 МГц, DMSO-d6) δ=9.17 (s, 1H), 7.96 (br d, J=9,0 Гц, 2Н), 7.62 (br d, J=7,6 Гц, 2Н), 7.41-7.33 (m, 4H), 7.31-7.25 (m, 1H), 7.18 (s, 1H), 6.76 (d, J=8,3 Гц, 1H), 6.63 (dd, J=1.4, 8,4 Гц, 1H), 5.86 (s, 1H), 2.78 (br t, J=7,6 Гц, 2H), 2.47-2.52(m, 2H), 1.22 (s, 9H).
Пример 12.
Пример 12А.
Метил-(Е)-3-(4-фтор-3-нитро-фенил)проп-2-еноат (0,26 г, 1,15 ммоль) растворяли в ацетонитриле (10 мл), затем добавляли карбонат калия (558,55 мг, 3,45 ммоль) и (R)-циклопропил(фенил)метиламина гидрохлорид (233,30 мг, 1,27 ммоль) и перемешивали при 80°С в течение 2 ч. Реакционную смесь раз бавляли 100 мл воды и экстрагировали 100 мл (50 млх2) этилацетата. Объединенный органический слой промывали 50 мл (50 мл х1) рассолом, сушили над сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении и очищали колоночной хроматографией с получением соединения примера 12 в виде желтого масла. 1H ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ=0.34-0.56 (m, 2Н), 0.60-0.80 (m, 2Н), 1.30-1.43 (m, 1H),
- 28 040879
3.78 (s, 3Н), 4.04 (dd, J=7.95, 5.38 Гц, 1Н), 6.23 (d, J=15.89 Гц, 1Н), 6.56 (d, J=8.93 Гц, 1Н), 6.52-6.62 (m,
1Н), 7.27-7.42 (m, 6Н), 7.53 (d, J=15.89 Гц, 1Н), 8.32 (d, J=2.08 Гц, 1Н), 8.88 (br d, J=5.01 Гц, 1Н).
Пример 12В.
К соединению примера 12А (388 мг, 1,10 ммоль) и гексагидрату хлорида никеля (1,31 г, 5,51 ммоль) добавляли MeOH (6 мл) и THF (6 мл), и добавляли порциями боргидрид натрия (416,54 мг, 11,01 ммоль) при 5°С и перемешивали при 5°С в течение 0,5 ч. Реакционную смесь гасили добавлением 100 мл воды, фильтровали, и фильтрат экстрагировали 100 мл (50 млх2) этилацетата. Объединенный органический слой промывали 50 мл (50 мл х 1) рассолом, сушили над сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением соединения примера 12В.
Пример 12С.
O-CF3
В раствор соединения примера 12В (280 мг, 863,09 мкмоль) в THF (15 мл) добавляли изотиоцианоил-4-(трифторметокси)бензол (227,01 мг, 1,04 ммоль, 168,16 мкл). После добавления смесь перемешивали при 40°С в течение 1 ч и затем добавляли EDCl (330,91 мг, 1,73 ммоль) и перемешивали при 70°С в течение 1 ч. Реакционную смесь концентрировали при пониженном давлении для удаления THF, разбавляли 80 мл воды и экстрагировали 100 мл (50 млх2) этилацетата. Объединенный органический слой промывали 50 мл (50 мл х 1) рассолом, сушили над сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении, и очищали колоночной хроматографией с получением соединения примера 12С в виде бесцветного масла. 1Н ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ=0.47-0.70 (m, 3Н), 0.95-1.07 (m, 1Н), 1.74-1.83 (m, 1Н), 2.70 (t, J=7.89 Гц, 2Н), 3.06 (t, J=7.95 Гц, 2Н), 3.69 (s, 3Н), 4.84 (d, J=9.54 Гц, 1Н), 6.97 (dd, J=8.19, 1.34 Гц, 1Н), 7.05-7.16 (m, 3Н), 7.28-7.33 (m, 2Н), 7.40-7.54 (m, 6Н).
Пример 12.
В раствор соединения примера 12С (0,29 г, 569,16 мкмоль) в THF (3 мл), MeOH (3 мл) и H2O (3 мл) добавляли моногидрат гидроксида лития (119,41 мг, 2,85 ммоль) и перемешивали при 20°С в течение 16 ч. Реакционную смесь медленно доводили до pH=4 1 н. раствором HCl и экстрагировали этилацетатом (40 млх2). Объединенный органический слой промывали 50 мл рассола, сушили над сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении, перемешивали с MeOH (10 мл), фильтровали и сушили под вакуумом с получением соединения примера 12. 1H ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ=4.38 (br s, 1Н), 4.79-4.97 (m, 1Н), 6.51-6.62 (m, 2Н), 7.25-7.27 (m, 1Н), 7.27-7.29 (m, 1Н), 7.38-7.51 (m, 5Н).
- 29 040879
Пример 13.
Пример 13А.
3,3-Диметилинден-1-он (3 г, 18,73 ммоль) растворяли в толуоле (40 мл), туда же добавляли тетраизопропоксид титана (10,64 г, 37,46 ммоль, 11,05 мл) и 2-метилпропан-2-сульфинамид (2,72 г, 22,48 ммоль) и перемешивали при 60°С в течение 24 ч, затем снова добавляли 2-метилпропан-2-сульфинамид (2,72 г, 22,48 ммоль) и тетраизопропоксид титана (5,32 г, 18,73 ммоль, 5,53 мл) и перемешивали при 110°С в течение 16 ч. Реакционную смесь гасили добавлением 200 мл воды и затем фильтровали. Фильтрат экстрагировали 160 мл (80 млх2) этилацетата. Объединенный органический слой промывали 80 мл (80 мл х 1) рассолом, сушили над сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении, и очищали колоночной хроматографией с получением соединения примера 13 А в виде коричневого масла. 1Н ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ=1.29-1.43 (m, 15 Н) 2.98 (d, J=19.07 Гц, 1Н) 3.34 (d, J=19.20 Гц, 1Н) 7.29-7.42 (m, 2Н) 7.48-7.58 (m, 1Н) 7.76 (d, J=7.70 Гц, 1Н).
Пример 13В.
Соединение примера 13А (1,4 г, 5,32 ммоль) растворяли в THF (20 мл) и воде (574,67 мг, 31,89 ммоль, 574,67 мкл), туда же добавляли боргидрид натрия (1,01 г, 26,58 ммоль), и эту смесь перемешивали при 25°С в течение 4 ч. Реакционную смесь гасили добавлением 100 мл воды и затем экстрагировали 100 мл (50 млх2) этилацетата.
Объединенный органический слой промывали 50 мл насыщенного солевого раствора, сушили над сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении, и очищали колоночной хроматографией с получением соединения примера 13В в виде белого твердого вещества. Ή ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ=1.21-1.28 (m, 12Н) 1.38 (s, 3Н) 1.88 (dd, J=12.84, 7.46 Гц, 1Н) 2.37 (dd, J=12.84, 7.21 Гц, 1Н) 3.49 (br d, J=6.60 Гц, 1Н) 4.88-4.99 (m, 1Н) 7.14-7.21 (m, 1Н) 7.23-7.29 (m, 2Н) 7.51-7.60 (m, 1Н).
Пример 13С. (1R)-3,3-Диметилинден-1-амин.
В раствор соединения примера 13В (810 мг, 3,05 ммоль) в MeOH (8 мл) добавляли HCl/диоксан (4М, 3 мл) и перемешивали при 20°С в течение 0,5 ч. Смесь разбавляли метил-трет-бутиловым эфиром (15 мл) и перемешивали при 25°С в течение 30 мин, фильтровали и сушили в вакууме с получением соединения примера 13С в виде белого твердого вещества. 1H ЯМР (400 МГц, метанол-d4) δ=1.15-1.30 (m, 3Н) 1.40-1.50 (m, 3Н) 1.93 (dd, J=13.02, 8.13 Гц, 1Н) 2.53 (dd, J=12.96, 7.70 Гц, 1Н) 3.31 (dt, J=3.30, 1.65 Гц, 1Н) 7.21-7.59 (m, 4Н).
- 30 040879
Пример 13D.
В раствор метил-(Е)-3-(4-фтор-3-нитро-фенил)проп-2-еноата (400 мг, 1,78 ммоль) в THF (12 мл) добавляли карбонат калия (982,04 мг, 7,11 ммоль) и соединение примера 13С (491,69 мг, 2,49 ммоль) и перемешивали при 65°С в течение 16 ч. Смесь разбавляли 100 мл воды и экстрагировали 120 мл (60 млх2) этилацетата. Объединенный органический слой промывали 50 мл (50 мл х 1) рассолом, сушили над сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении, и очищали колоночной хроматографией с получением соединения примера 13D в виде желтого масла. 1Н ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ=1.33 (s, 3Н) 1.43 (s, 3Н) 1.95 (dd, J=12.72, 7.34 Гц, 1Н) 2.60 (dd, J=12.65, 7.15 Гц, 1Н) 3.82 (s, 3Н) 5.25 (q, J=7.21 Гц, 1Н) 6.34 (d, J=15.89 Гц, 1Н) 7.14 (d, J=9.05 Гц, 1Н) 7.25-7.27 (m, 1Н) 7.27-7.29 (m, 1Н) 7.30-7.39 (m, 2Н) 7.57-7.73 (m, 2Н) 8.38 (d, J=2.20 Гц, 1Н) 8.57 (br d, J=7.09 Гц, 1Н).
Пример 13Е.
Соединение примера 13D (300 мг, 818,75 мкмоль) растворяли в THF (5 мл) и MeOH (5 мл), туда же добавляли Pd/C (50 мг, 10%), атмосферу заменяли газом водородом 3 раза, и смесь перемешивали при 25°С в атмосфере H2 (15 фунт/кв.дюйм) в течение 16 ч. После фильтрования фильтрат концентрировали при пониженном давлении с получением соединения примера 13Е в виде коричневого масла.
Пример 13F.
Соединение примера 13Е (255 мг, 753,45 мкмоль) растворяли в THF (8 мл), туда же добавляли 1изотиоцианоил-4-(трифторметокси)бензол (198,17 мг, 904,14 мкмоль, 146,79 мкл) и перемешивали при 40°С в течение 1 ч, затем добавляли EDCl (288,87 мг, 1,51 ммоль) и перемешивали при 70°С в течение 1 ч. Реакционную смесь концентрировали при пониженном давлении для удаления THF, разбавляли 80 мл воды и экстрагировали 100 мл (50 млх2) этилацетата. Объединенный органический слой промывали 50 мл (50 мл х1) рассолом, сушили над сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении, и очищали колоночной хроматографией, и затем подвергали хиральному разделению с получением соединения примера 13F в виде белого твердого вещества. 1H ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ=1.28-1.55 (m, 6Н) 2.14-2.72 (m, 4 Н) 3.06 (br s, 2Н) 3.69 (s, 3Н) 5.50 (br s, 1Н) 6.06 (br s, 1Н) 6.92-7.60 (m, 11H).
Пример 13.
В раствор соединения примера 13F (180 мг, 343,81 мкмоль) в MeOH (2М1) добавляли моногидрат
- 31 040879 гидроксида лития (43,28 мг, 1,03 ммоль), THF (2 мл) и H2O (2 мл) и перемешивали при 25°С в течение
ч. Реакционную смесь медленно доводили до pH=4 1 н. HCl, и затем осадок собирали фильтрованием и сушили под вакуумом с получением соединения примера 13. 1H ЯМР (400 МГц, метанол-d4) δ=1.34 (s,
3Н) 1.54 (s, 3Н) 2.37 (dd, J=12.65, 9.48 Гц, 1Н) 2.48-2.63 (m, 3Н) 2.90 (br t, J=7.58 Гц, 2Н) 6.05-6.37 (m, 2Н) 6.69 (br d, J=8.07 Гц, 1Н) 6.93 (br d, J=7.58 Гц, 1Н) 7.14-7.32 (m, 4 Н) 7.35-7.42 (m, 2Н) 7.59 (br d, J=7.58 Гц, 2H).
Пример 14 и пример 15.
Пример 14А.
В сухой сосуд загружали 1-(трифторметил)-1,2-бензойод-3-он (3,28 г, 10,37 ммоль) и CuBr (123,96 мг, 864,15 мкмоль, 26,32 мкл). Сосуд вакуумировали и заполняли газом азотом три раза. Затем в вышеуказанный сосуд добавляли азидо(триметил)силан (2,49 г, 21,60 ммоль, 2,84 мл) и стирол (900 мг, 8,64 ммоль), растворенный в ACN (40 мл). Реакционную смесь перемешивали при 40°С в течение 1,5 ч. Реакционную смесь разбавляли водой (40 мл) и экстрагировали DCM (20 млх3). Объединенный органический слой промывали рассолом (20 мл х 1), сушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением остатка, который очищали колоночной хроматографией с получением соединения примера 14А в виде бесцветного масла.1H ЯМР (400 МГц, CDCl3) δ=7.50-7.36 (m, 5H), 4.81 (dd, J=5.1, 8,4 Гц, 1H), 2.73-2.45 (m, 2H).
Пример 14В.
В раствор соединения примера 14А (1,1 г, 5,11 ммоль) в MeOH (15 мл) добавляли CuSO4 (81,59 мг, 511,21 мкмоль, 78,46 мкл) и NaBH4 (290,11 мг, 7,67 ммоль). Эту смесь перемешивали при 0°С в течение 1 ч и затем при 20°С в течение 16 ч. Реакционную смесь разбавляли водой (20 мл) и экстрагировали этилацетатом (20 млх3). Объединенный органический слой промывали рассолом (20 млх2), сушили над безводным сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением соединения примера 14В в виде коричневого масла, которое использовали на следующей стадии без дополнительной очистки.
Пример 14С.
В раствор метил-(Е)-3-(4-фтор-3-нитро-фенил)проп-2-еноата (600 мг, 2,66 ммоль) в THF (10 мл) добавляли K2CO3 (1,10 г, 7,99 ммоль) и соединение примера 14В (720 мг, 3,81 ммоль). Эту смесь перемешивали при 50°С в течение 16 ч. Смесь затем перемешивали при 70°С в течение 32 ч. Реакционную смесь концентрировали при пониженном давлении для удаления растворителя. Остаток разбавляли водой (50 мл) и экстрагировали этилацетатом (50 млх3). Объединенный органический слой промывали рассолом (50 мл), сушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением неочищенного продукта примера 14С в виде желтого масла, которое использовали на следующей стадии без дополнительной очистки.
- 32 040879
Пример 14D.
В раствор соединения примера 14С (1 г, 2,54 ммоль) в MeOH (20 мл) добавляли NiCl2-6H2O (2,41 г, 10,14 ммоль), затем добавляли порциями NaBH4 (959,38 мг, 25,36 ммоль) при 0°С, и эту смесь выдерживали при 0°С в течение 1 ч. Реакционную смесь разбавляли водой (50 мл) и экстрагировали этилацетатом (50 млх3). Объединенный органический слой промывали рассолом (50 мл х 1), сушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением соединения примера 14D в виде коричневого масла, которое напрямую использовали на следующей стадии без дополнительной очистки.
Пример 14Е и пример 14F.
Пример 14Е или Пример 14F Пример 14Е или Пример 14F
К соединению примера 14D (770 мг, 2,10 ммоль) в THF (20 мл) добавляли 1-изотиоцианоил-4(трифторметокси)бензол (552,78 мг, 2,52 ммоль, 409,47 мкл). Эту смесь перемешивали при 40°С в течение 1 ч. Затем добавляли EDCl (805,79 мг, 4,20 ммоль), и смесь перемешивали при 70°С в течение 2 ч. Реакционную смесь разбавляли водой (50 мл) и экстрагировали этилацетатом (30 млх3). Объединенный органический слой промывали рассолом (50 мл), сушили над Na2SO4, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением остатка, который очищали колоночной хроматографией с получением остатка. Остаток разделяли методом SFC (сверхкритическая флюидная хроматография) (хиральная колонка: Chiralcel OD-3 50х4,6 мм в.д., 3 мкм; подвижная фаза: А: СО2, В: метанол (содержащий 0,05% DEA); градиент: метанол от 5% до 40%; скорость потока: 3 мл/мин; длина волны: 220 нм) с получением соединения примера 14Е (время удерживания RT=1,546 мин) и соединения примера 14F (время удерживания RT=1,941 мин).
Пример 14 и пример 15.
Пример 14 или Пример 15 Пример 14 или Пример 15
В раствор соединения примера 14Е (220 мг, 39,.93 мкмоль) в MeOH (3 мл) и H2O (3 мл) добавляли LiOH-H2O (50,22 мг, 1,20 ммоль). Эту смесь перемешивали при 30°С в течение 16 ч. Смесь перемешивали при 30°С в течение еще 3 ч. Смесь доводили до pH 5-6 раствором HCl (1М) для осаждения твердого вещества, которое отфильтровывали и сушили с получением соединения примера 14?Н ЯМР (400 МГц, метанол-d4) δ=7.57-7.47 (m, 2Н), 7.43 (d, J=4,4 Гц, 4Н), 7.38-7.33 (m, 1H), 7.30 (s, 1H), 7.25 (d, J=8,3 Гц, 2Н), 6.88 (d, J=0,6 Гц, 2Н), 6.30 (dd, J=3.6, 10,5 Гц, 1H), 3.61-3.37 (m, 2Н), 2.96 (t, J=7,7 Гц, 2Н), 2.61 (t, J=7,7 Гц, 2H).
В раствор соединения примера 14F (300 мг, 543,99 мкмоль) в MeOH (4 мл) и H2O (4 мл) добавляли LiOH-H2O (68,48 мг, 1,63 ммоль). Эту смесь перемешивали при 30°С в течение 16 ч. Смесь доводили до
- 33 040879 pH 5-6 раствором HCl (1М) для осаждения твердого вещества, которое отфильтровывали и сушили с получением соединения примера 15. 1H ЯМР (400 МГц, метанол-d4) δ=7.55-7.49 (m, 2Н), 7.43 (d, J=4,4 Гц,
4Н), 7.38-7.33 (m, 1H), 7.30 (s, 1H), 7.28-7.21 (m, 2H), 6.87 (s, 2H), 6.30 (dd, J=3.5, 10,5 Гц, 1H), 3.56-3.41 (m, 2Н), 2.96 (t, J=7,6 Гц, 2Н), 2.61 (t, J=7,7 Гц, 2Н).
Экспериментальный пример 1. Тестирование активности в отношении IDH1 in vitro.
Мутантная IDH1 катализирует NADPH-зависимое восстановление α-KG (α-кетоглутарат) до 2-HG (2-гидроксиглутарат), и израсходованная NADPH может быть определена считыванием флуоресценции.
Реагенты.
Основной реакционный буфер: 50 мМ KH2PO4, pH 7,5, 10 мМ MgCl2, 10% глицерина, 150 мМ NaCl, 0,05% BSA (бычий сывороточный альбумин), 2 мМ b-МЕ (2-меркаптоэтанол), 0,003% Brij35 (лауриловый эфир полиэтиленгликоля).
Субстраты и кофакторы.
IDHlwt (дикого типа): 65 мкМ изоцитрата + 50 мкМ NADP.
IDH1(R132H): 1500 мкМ α-КГ + 15 мкМ NADPH.
IDH1(R132C): 500 мкМ α-КГ + 15 мкМ NADPH.
Реакционный процесс.
1.33х фермент (нет фермента в контрольной лунке), буфер и NADP или NADPH (контрольная лунка) добавляли в лунки реакционного планшета. Тестируемое соединение растворяли в 100% DMSO и затем добавляли в смесь ферментов (Echo550, нанолитровый уровень) и инкубировали в течение 60 мин после простого центрифугирования. Смесь 4х субстрата и кофактора добавляли для запуска реакции. После простого центрифугирования планшет инкубировали при встряхивании при комнатной температуре в течение 45 мин. Подготовавливали смесь 3х липоамидгидрогеназы и резазурина, добавляли ее в реакционный раствор для тестирования количества NADPH, образовавшегося или оставшегося, и инкубировали при комнатной температуре в течение 10 мин после простого центрифугирования. Многофункциональный микропланшет-ридер Envision использовали для измерения (Ex/Em=535/590 нм).
Результаты экспериментов представлены в табл. 1 и табл. 2.
Таблица 1. Результаты тестирования IC50 в отношении активности фермента IDH1 (IDH1R132H) in vitro
Пример Структура IDH1 R132H (нМ)
Пример 1 OCF3 .А™ 0 HU η \\ / | 1 у-NH 7,9
Пример 2 I о \=о А о о 464,5
- 34 040879
Пример 3 I о \=о О о ω 320
Пример 4 OCF3 I JL %NH 125,5
Пример 5 OCF3 ; 0 I JL %NH 89,53
Пример 6 X О / о 3,94
Пример 7 X О / ΥΥ 121,1
Пример 8 F p-(-F Η0Αγ. » 0 F но Т1Нн 00 2,88
Пример 9 0 о 21,9
- 35 040879
Таблица 2. Результаты тестирования IC50 в отношении активности ферментов IDH1 (IDH1 R132C, WT) in vitro
Пример Структура IDH1 R132C (нМ) IDH1 WT (нМ)
Пример 1 OCF3 ΗΟ^ΏΓΧ 101,8 >10000
Пример 6 OCF3 Λ Ο ηοΛ^Ο:νμ 12,79 >10000
Заключение.
На ферментативном уровне соединения по настоящему изобретению оказывают хорошее ингибирующее воздействие на мутантную IDH1R132H и IDH1R132C и в то же время не оказывают ингибирующего воздействия на белок IDH дикого типа.
Экспериментальный пример 2. Тестирование цитологической активности IDH1.
В этом исследовании соединение инкубировали с клеточной линией с мутантной IDH1, и содержание 2HG в клеточной культуре определяли методом ЖХ-МС (жидкостная хроматография/массспектрометрия) для определения ингибирующей активности соединения в отношении мутантной IDH1. IDH1 катализирует восстановление изоцитрата до α-кетоглутарата (α-KG) в организмах, и мутантная IDH1 дополнительно катализирует восстановление α-KG до 2-гидроксиглутарата (2-HG).
Клеточный штамм U87MG-IDH1-R132H представляет собой стабильный трансфицированный клеточный штамм, который может стабильно экспрессировать мутант IDH1-R132H, полученный через скрининг путем трансфицирования клеток U87MG мутантом IDH1-R132H, и клеточный штамм НТ1080 содержит эндогенный мутант IDH1-R132C.
Экспериментальный процесс следующий.
1) Соединение подвергали 3-кратным разведениям в DMSO и затем добавляли к планшет для клеточных культур в сумме в 10 концентрациях, в двух повторах для каждой концентрации. Лунка отрицательного контроля содержала только DMSO, а лунка положительного контроля содержала BAY1436032 в конечной концентрации 5 мкМ. Конечная концентрация DMSO во всех лунках составляла 0,5%.
2) Клеточную линию с мутантной IDH1 высевали в планшет для клеточных культур, содержащий соединение, при плотности 40000 клеток на лунку. Клетки инкубировали с соединением в инкубаторе при 37°С, 5% CO2, в течение 3 суток.
3) Через 3 суток 10 мкл надосадочной жидкости клеточной культуры отбирали и разводили 21кратно 200 мкл ddH2O воды до 210 мкл и хорошо смешивали, из них отбирали 50 мкл разведенного раствора и добавляли 200 мкл осадителя (ацетонитрил, содержащий 0,4 мкг/мл D-2-гидроксиглутаровой кислоты 13С5). После центрифугирования при 4000 об/мин в течение 10 мин отбирали 100 мкл надоса-
- 36 040879 дочной жидкости для определения содержания 2-HG методом ЖХ-МС.
4) В то же время набор ATPlite 1Step использовали для определения воздействия соединения на жизнеспособность клеток клеточного штамма с мутантной IDH1 согласно инструкциям.
5) Данные по содержанию 2-HG использовали для вычисления процента ингибирования (степень ингибирования, %) для каждой концентрации соединения против мутантной IDH1 по следующей формуле вычисления:
Степень ингибирования, %=(CPD-ZPE)/(HPE-ZPE)x100%
Данные по жизнеспособности клеток использовали для вычисления процента цитотоксичности (цитотоксичность, %) соединения против клеточного штамма с мутантной IDH1 по следующей формуле вычисления:
Цитотоксичность, %=( 1 -CPD/ZPE)x 100%
CPD: сигнал от лунок с соединением.
ZPE: средний сигнал от лунок отрицательного контроля с 0,5% DMSO вместо соединения.
НРЕ: средний сигнал от лунок положительного контроля.
6) Степень ингибирования, %, и цитотоксичность, %, аппроксимировали с использованием программного обеспечения GraphPad Prism к кривой доза-эффект с получением значения IC50 тестируемого соединения.
Результаты эксперимента представлены в табл. 3.
Таблица 3. Результаты тестирования IC50 в отношении
Заключение.
На клеточном уровне соединения по настоящему изобретению оказывают хорошее 2-HG ингибирующее воздействие на клетки глиомы головного мозга U87MG с мутацией IDH1R132H.
Экспериментальный пример 3. Оценка фармакокинетики у мышей.
Цель.
Тестировать фармакокинетические параметры соединения по настоящему изобретению у мышей.
Схема эксперимента:
1) экспериментальное лекарственное средство: соединение примера 6;
2) экспериментальные животные: 8 самцов мышей CD-1 в возрасте 7-10 недель, разделенные на 2 группы, по 4 в каждой группе;
3) подготовка лекарственного средства: для группы инъекции в хвостовую вену отвешивали соответствующее количество лекарственного средства и растворяли в смешанном растворителе DMSO:20% гидроксипропил-бетациклодекстрин (HPbCD)=10:90 для приготовления раствора 0,5 мг/мл; для группы внутрижелудочного введения отвешивали соответствующее количество лекарственного средства и растворяли в смеси DMSO:полиоксиэтиленовое касторовое масло EL (Cremophor EL):5% сульфобутилциклодестрин (Captisol)=5:10:85 для приготовления суспензии.
Проведение эксперимента.
Животным в группе 1 делали однократную инъекцию лекарственного средства в дозе 1 мг/кг и в концентрации 0,5 мг/мл через хвостовую вену, а животным в группе 2 вводили соединение в дозе 20 мг/кг и в концентрации 2 мг/мл через желудочный зонд. Образцы плазмы крови перекрестно собирали из животных при 0,0833 (только группа инъекции в хвостовую вену), 0,25, 0,5, 1, 2, 4, 6, 8 и 24 ч после введения. Метод ЖХ-МС/МС использовали для определения концентрации лекарственного средства в образце плазмы крови, и кинетические параметры тестируемого лекарственного средства представлены в табл. 4.
-

Claims (11)

  1. Таблица 4. Оценочные фармакокинетические параметры у мышей
    Группа инъекции в хвостовую вену Клиренс Начальная концентрация Объем распределения Период полувыведения Площадь под кривой
    С1 (мл/мин/кг) Со (нМ) Vd (л/кг) Т1/2 (Ч) AUCo-last (нМ*ч)
    2,17 3541 0,690 2,90 15463
    Группа внутр ижелудочного введения Наивысшая концентрация Время до наивысшей концентрации Площадь под кривой Биодоступ- ность
    Стах (нМ) Тш(ч) AUCo-last (нМ*ч) F (%)
    33350 1,00 306609 99,1
    Заключение.
    Соединение примера 6 по настоящему изобретению имеет хорошие фармакокинетические свойства у мышей.
    ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ
    1. Соединение, как оно представлено в формуле (I),
    (I) где
    R1 выбран из С1-6алкила, С3-6циклоалкила и фенила, причем С1-6алкил, С3-6циклоалкил и фенил, возможно, замещены 1, 2 или 3 Ra;
    каждый из R2 и R3 независимо выбран из Н, F, Cl, Br, I, ОН, NH2, CN, СООН, С1-6алкила и С1-6алкокси, причем С1-6алкил и С1-6алкокси, возможно, замещены 1, 2 или 3 Rb;
    альтернативно R1 и R2 связаны вместе с образованием С4-6циклоалкенила, возможно, замещенного 1, 2 или 3 Rc;
    L представляет собой -СН2СН2-;
    n выбран из 1, 2 и 3; и каждый из Ra, Rb, и Rc независимо выбран из F, Cl, Br, I, ОН, NH2, CN, СООН и Me; или его стереоизомер, или его фармацевтически приемлемая соль.
  2. 2. Соединение, или его стереоизомер, или его фармацевтически приемлемая соль по п.1, где
    R1 выбран из C1-3алкила, циклопропанила и фенила, причем C1-3алкил, циклопропанил и фенил, возможно, замещены 1, 2 или 3 Ra, или каждый из R2 и R3 независимо выбран из Н, F, Cl, Br, I, ОН, NH2, CN, СООН, C1-3алкила и
    C1-3алкокси, причем C1-3алкил и C1-3алкокси, возможно, замещены 1, 2 или 3 Rb; или
    L представляет собой -CH2CH2-; или р-· 'Я -рг 2 R3 и r2 структурная единица выбрана из ’ или
    - 38 040879
    из
  3. 3. Соединение, или его стереоизомер, или его фармацевтически приемлемая соль по п.2, где R1 вы-
    бран из СНз, CH2F, CHF2, CF3, CHCIК CH2CF3, СН2СН2СНз, С(СНз)з, V, СН(СНз)2 и
  4. 4. Соединение, или его стереоизомер, или его фармацевтически приемлемая соль по п.2, где каждый из R2 и R3 независимо выбран из Н, F, Cl, Br, I, ОН, NH2, CN, СООН, CH3 и CH3O, причем CH3 и CH3O, возможно, замещены 1, 2 или 3 Rb.
  5. 5. Соединение, или его стереоизомер, или его фармацевтически приемлемая соль по п.2, где каждый из R2 и R3 независимо выбран из Н, F, Cl, Br, I, ОН, NH2, CN, СООН, CH3, CH2F, CHF2, CF3 и OCH3.
  6. 6. Соединение, или его стереоизомер, или его фармацевтически приемлемая соль
    по п.2, где струкиз по п.2, где струк
  7. 7. Соединение, или его стереоизомер, или его фармацевтически приемлемая соль выбрана турная единица
    его фармацевтически приемлемая соль по любому из
  8. 8. Соединение, или его стереоизомер, или пп.1, 2, которое выбрано из из
    - 39 040879
    где
    Е выбран из -СН2-, -СН2СН2-, -С(СНз)2- и -С(СНз)2СН2—;
    L представляет собой -СН2СН2-;
    R1 такой, как определено в любом из пп.1, 2; и
    R2 и R3 такие, как определено в любом из пп.1, 2.
  9. 9. Соединение, или его стереоизомер, или его фармацевтически приемлемая соль по п.8, которое выбрано из
  10. 10. Соединение, или его стереоизомер, или его фармацевтически приемлемая соль по п.1, которое выбрано из
    - 40 040879
    или которое выбрано из
    - 41 040879
    - 42 040879
  11. 11. Применение соединения, или его стереоизомера, или его фармацевтически приемлемой соли по любому из пп.1-10 в изготовлении лекарственного средства для лечения заболевания, связанного с IDH1 (изоцитратдегидрогеназа 1).
    Евразийская патентная организация, ЕАПВ
    Россия, 109012, Москва, Малый Черкасский пер., 2
EA202190009 2018-06-26 2019-06-26 Производные бензимидазола и их применение в качестве ингибиторов idh1 EA040879B1 (ru)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201810672394.3 2018-06-26

Publications (1)

Publication Number Publication Date
EA040879B1 true EA040879B1 (ru) 2022-08-10

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP5739446B2 (ja) ピロロ[2,3−d]ピリミジン化合物
CA3149900A1 (en) Rip1 inhibitory compounds and methods for making and using the same
LV11174B (en) (-)-££4- (1,4,5,6- tetrahydro- 4- methyl- 6- oxo- 3- pyridazinyl ) phenyl-|- hydrazono| propanedinitrile
JP7140920B2 (ja) JAK阻害剤としての[1,2,4]トリアゾロ[1,5-a]ピリジン化合物およびその使用
CN114478485B (zh) 作为vanin抑制剂的杂芳族化合物
JP2023528073A (ja) Gpr65モジュレーターとしてのn-フェニルアミノカルボニル、ピリジノ-、ピリミジノ及びベンゾトロパン
CN111517969B (zh) 地佐辛衍生物及其医药用途
EP3816158B1 (en) Benzimidazole derivatives and use thereof as idh1 inhibitors
CA3152836A1 (en) Substituted urea dihydroorotate dehydrogenase inhibitors
KR20210124328A (ko) Pd-l1 면역조절제인 플루오로 비닐 벤즈아미드 화합물
EA040879B1 (ru) Производные бензимидазола и их применение в качестве ингибиторов idh1
JP2021500416A (ja) 疼痛及び疼痛関連状態を治療するための新規アルコキシアミノ誘導体
US11760751B2 (en) Benzo 2-azaspiro[4.4]nonane compound and use thereof
JP2023523830A (ja) ピリミジン系三環式化合物及びその使用
EP2531487B1 (en) Aryl benzylamine compounds
CA3116440A1 (en) Thiadiazole derivative and uses thereof as a gls1 inhibitor
WO2020120606A1 (en) New pyrrolidine-2-carboxylic acid derivatives for treating pain and pain related conditions
WO2014062204A1 (en) Matrix metalloproteinase inhibitors and methods for the treatment of pain and other diseases
WO2016034637A1 (fr) Derives de n-aryl-tricyclopyrimidine-2-amine polyethers macrocycliques comme inhibiteurs de la ftl3 et jak
JP2024515985A (ja) 6員芳香族ヘテロ尿素環の誘導体及びその使用