EA040507B1 - Анти-cd3-антитело и фармацевтическая композиция для лечения онкологических заболеваний, содержащая его - Google Patents

Анти-cd3-антитело и фармацевтическая композиция для лечения онкологических заболеваний, содержащая его Download PDF

Info

Publication number
EA040507B1
EA040507B1 EA202090944 EA040507B1 EA 040507 B1 EA040507 B1 EA 040507B1 EA 202090944 EA202090944 EA 202090944 EA 040507 B1 EA040507 B1 EA 040507B1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
antibody
cancer
cells
variable region
treatment
Prior art date
Application number
EA202090944
Other languages
English (en)
Inventor
Ки Су КИМ
Дзун Хонг Дзеонг
Ае Рин Йоон
Еун Дзунг Сонг
Хие Дзи Чои
Ок Дзае Лим
Юн Дзунг Ли
Хиунг Квон Лим
Дзонг Вха Вон
Original Assignee
Грин Кросс Корпорейшн
Могам Инститьют Фор Байомедикал Рисерч
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Грин Кросс Корпорейшн, Могам Инститьют Фор Байомедикал Рисерч filed Critical Грин Кросс Корпорейшн
Publication of EA040507B1 publication Critical patent/EA040507B1/ru

Links

Description

Область техники, к которой относится изобретение
Настоящее изобретение относится к анти-CD3-антителу и фармацевтической композиции для лечения онкологических заболеваний, содержащей его.
Уровень техники
Среди различных причин смертности часто имеет место смерть в результате онкологических заболеваний, которые составляют вторую по величине долю летальных исходов. В прошлом предпринимались различные попытки лечения онкологических заболеваний. В настоящее время в отношении способов лечения онкологических заболеваний они сводятся к введению противоопухолевого средства, лучевой терапии или хирургической операции. Однако такие способы лечения могут быть эффективными на ранних стадиях злокачественного заболевания и имеют низкий терапевтический эффект на терминальных стадиях онкологических заболеваний, когда заболевание распространилось на другие ткани или когда имеет место его рецидив.
В последние годы внимание было обращено на исследование адоптивной клеточной иммунотерапии, где рак лечат, подвергая лимфоциты, выделенные из периферической крови пациента, массовому культивированию in vitro, и затем повторной трансплантации культивированных лимфоцитов пациенту. Кроме того, также в процессе разработки находится способ, в котором токсичным T-клеткам, специфичным для опухолевых клеток, обеспечивается возможность элиминировать опухолевые клетки, подвергая иммунные клетки, выделенные из периферической крови пациента, массовой пролиферации in vitro, подвергая пролиферированные иммунные клетки обработке антигенами, такими как лизаты опухолевых клеток, так что в результате иммунные клетки активируются, и затем полученные иммунные клетки вводят пациенту повторно.
Техническая проблема
Настоящее изобретение выполнено для решения вышеуказанных проблем предшествующего уровня техники. Целью настоящего изобретения является обеспечение антитела, обладающего высокой аффинностью связывания с CD3, и фармацевтической композиции, обладающей высокой эффективностью лечения онкологических заболеваний, с использованием его.
Однако проблема, решаемая настоящим изобретением, не ограничивается вышеуказанными проблемами, и другие проблемы, которые не были упомянуты, будут понятны специалистам в данной области техники из следующего описания изобретения.
Решение проблемы
В аспекте настоящего изобретения обеспечивается антитело, содержащее вариабельную область легкой цепи (VL-область), состоящую из последовательности, обладающей по меньшей мере 80% идентичностью с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 7, 8, 15 или 16, и вариабельную область тяжелой цепи (VH-область), состоящую из последовательности, обладающей по меньшей мере 80% идентичностью с аминокислотной последовательностью любой из SEQ ID NO: 18-25.
В еще одном аспекте настоящего изобретения обеспечивается полинуклеотид, который кодирует вариабельную область легкой цепи (VL-область) и вариабельную область тяжелой цепи (VH-область) антитела.
В еще одном аспекте настоящего изобретения обеспечивается вектор экспрессии, содержащий полинуклеотид.
В еще одном аспекте настоящего изобретения обеспечивается клетка-хозяин, трансформированная вектором экспрессии.
В еще одном аспекте настоящего изобретения обеспечивается способ получения антитела, которое специфически связывается с CD3, включающий стадию культивирования клетки-хозяина.
В еще одном аспекте настоящего изобретения обеспечивается фармацевтическая композиция для профилактики или лечения онкологических заболеваний, содержащая антитело или его фрагмент.
Преимущественные эффекты изобретения
За счет высокой аффинности и специфичности к CD3 антитело против CD3 по настоящему изобретению можно эффективно применять для профилактики или лечения рака.
Следует понимать, что эффект настоящего изобретения не ограничивается вышеописанными эффектами, и оно включает все эффекты, которые вытекают из конфигурации изобретения, описанного в разделе Подробное описание или формуле настоящего изобретения.
Краткое описание фигур
На фиг. 1 показаны результаты, полученные в анализе аффинности связывания с человеческими T-клетками, антител в соответствии с вариантом осуществления настоящего изобретения.
На фиг. 2 показаны результаты, полученные в анализе аффинности связывания с T-клетками обезьяны, антител в соответствии с вариантом осуществления настоящего изобретения.
Подробное описание изобретения
Далее настоящее изобретение будет описано подробно.
В аспекте настоящего изобретения обеспечивается антитело, содержащее вариабельную область легкой цепи (VL-область), состоящую из последовательности, обладающей по меньшей мере 80% идентичностью с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 7, 8, 15 или 16, и вариабельную область
- 1 040507 тяжелой цепи (VH-область), состоящую из последовательности, обладающей по меньшей мере 80% идентичностью с аминокислотной последовательностью любой из SEQ ID NO: 18-25.
Вариабельная область легкой цепи может состоять из аминокислотной последовательности, обладающей по меньшей мере 80%, предпочтительно по меньшей мере 90%, более предпочтительно по меньшей мере 95% и наиболее предпочтительно по меньшей мере 99% идентичностью с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 7, 8, 15 или 16.
Вариабельная область тяжелой цепи может состоять из аминокислотной последовательности, обладающей по меньшей мере 80%, предпочтительно по меньшей мере 90%, более предпочтительно по меньшей мере 95% и наиболее предпочтительно по меньшей мере 99% идентичностью с аминокислотной последовательностью любой из SEQ ID NO: 18-25.
Антитело, содержащее вариабельную область легкой цепи и вариабельную область тяжелой цепи, может специфически связываться с кластером дифференцировки (CD3). Здесь антитело может обладать перекрестной реактивностью с CD3 человека или обезьяны. То есть, CD3 может включать, не ограничиваясь этим, CD3, происходящий от человека, и CD3, происходящий от обезьяны.
Как здесь используется, термин CD3 может относиться к понятию, которое в совокупности относится к самому CD3 и любому его варианту, изотипу и паралогу, которые присутствуют у животного и предпочтительно у человека и обезьяны. Кроме того, как здесь используется, термин человеческий CD3 относится к CD3, происходящему от человека. Как здесь используется, термин CD3 обезьяны относится к CD3, происходящему от обезьяны.
Как здесь используется, термин антитело относится к молекуле иммуноглобулина (Ig), которая иммунологически реагирует с определенным антигеном, т.е. белковой молекуле, которая функционирует в качестве рецептора, который специфически распознает антиген. Кроме того, антитело может представлять собой полное антитело или фрагмент антитела.
В вариабельных областях легкой и тяжелой цепей некоторые аминокислоты могут быть замещены, вставлены и/или делецированы при условии, пока сохраняются свойства, соответствующие объекту настоящего изобретения, такие как аффинность и специфичность к CD3. Например, консервативные аминокислотные замены могут иметь место в вариабельных областях легкой и/или тяжелой цепи. Консервативная замена означает замену исходной аминокислотной последовательности другим аминокислотным остатком, имеющим сходные с ним свойства.
Например, лизин, аргинин и гистидин имеют сходные свойства в том, что они имеют основную боковую цепь, и аспарагиновая кислота и глутаминовая кислота имеют сходные свойства в том, что они содержат кислую боковую цепь. Кроме того, глицин, аспарагин, глутамин, серин, треонин, тирозин, цистеин и триптофан имеют сходные свойства в том, что они содержат незаряженную полярную боковую цепь; аланин, валин, лейцин, треонин, изолейцин, пролин, фенилаланин и метионин имеют сходные свойства в том, что они содержат неполярную боковую цепь; и тирозин, фенилаланин, триптофан и гистидин имеют сходные свойства в том, что они содержат ароматическую боковую цепь.
Следовательно, специалистам в данной области техники очевидно, что аминокислотные замены в группе аминокислот, имеющих сходные свойства, как описано выше, не будут вызывать какого-либо существенного изменения свойств. По этой причине антитела, которые претерпели изменения, вызванные консервативной заменой в вариабельной области, также включаются в объем настоящего изобретения, если такие антитела сохраняют свойства антитела по настоящему изобретению.
С другой стороны, антитело может специфически связываться с T-клетками, конкретно с поверхностью T-клеток, посредством специфического связывания с CD3. Здесь T-клетки могут включать, не ограничиваясь этим, человеческие T-клетки и T-клетки обезьяны.
То есть, когда антитело находится в организме, то такое антитело может привлекать T-клетки посредством специфического связывания с CD3. Соответственно, привлеченные T-клетки могут индуцировать иммунные ответы в непосредственной близости от них и могут дополнительно атаковать опухоли, такие как опухолевые клетки и т.п.
Вариабельные области легкой и тяжелой цепей антитела могут состоять из определяющих комплементарность участков (CDR) и каркасных областей (FR). Как правило, CDR обеспечивают специфичность связывания со специфическими антигенами, и FR функционируют для формирования свернутой структуры антитела для поддержания связывания CDR или т.п.
Антитело может представлять собой антитело, которое сохраняет CDR существующего мышиного анти-CD3-антитела SP34, в котором аминокислоты константной области (Fc) и FR вариабельной области SP34 частично или полностью замещены их человеческими аналогами.
Антитело может содержать CDR1 легкой цепи, включающий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 29; CDR2 легкой цепи, включающий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 30; CDR3 легкой цепи, включающий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 31; CDR1 тяжелой цепи, включающий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 32; CDR2 тяжелой цепи, включающий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 33; и CDR3 тяжелой цепи, включающий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 34.
Следовательно, антитело может представлять гуманизированное антитело, которое специфически
- 2 040507 связывается с CD3 человека. Как здесь используется, термин гуманизированное антитело относится к химерному антителу, которое содержит минимальную последовательность, полученную из иммуноглобулина антитела, отличного от человеческого, такого как мышиное антитело, и может означать такое антитело, в котором все части, за исключением последовательности, соответствующей гипервариабельной области, замещены их человеческими аналогами.
Кроме того, термин гипервариабельная область (HVR) относится к области вариабельного домена, которая проявляет гипервариабельность или образует структурно определенную петлю в последовательности антитела. Среди определений, идентифицирующих ее, определение определяющего комплементарность участка (CDR) согласно системе Kabat чаще всего используется для классификации областей на основе вариабельности последовательности.
Также можно использовать фрагмент антитела при условии, что фрагмент антитела сохраняет функцию антитела. Антитело или фрагмент антитела могут включать, не ограничиваясь этим, одноцепочечные антитела, диатела, триатела, тетратела, Fab-фрагменты, F(ab')2-фрагменты, Fd, scFv, доменные антитела, мини-тела, scAb, IgD антитела, IgE антитела, IgM антитела, IgG1 антитела, IgG2 антитела, IgG3 антитела, IgG4 антитела, производные константных областей антител, искусственные антитела на основе белковых каркасов и т.п., которые сохраняют функцию связывания с CD3.
Между тем, антитело также можно использовать в форме конъюгата антитело-лекарственное средство (ADC), полученного посредством связывания антитела с противоопухолевым лекарственным средством, обладающим эффективностью ингибирования пролиферации опухолевых клеток. Как здесь используется, термин противоопухолевое включает профилактическое и лечебное воздействие на злокачественную опухоль, и профилактика означает любое действие, направленное на ингибирование или задержку развития онкологического заболевания. Кроме того, лечение означает любое действие, направленное на ослабление или целебное изменение симптомов онкологического заболевания.
Лекарственное средство, которое можно использовать в конъюгате антитело-лекарственное средство, включает любое соединение, обладающее цитотоксическим или цитостатическим действием, и часть или функциональную группу соединения. Примеры лекарственного средства включают ингибиторы полимеризации микротубулина, ингибиторы мейоза, ингибиторы РНК-полимеразы, ингибиторы топоизомеразы, интеркаляторы ДНК, алкилаторы ДНК, ингибиторы рибосомы, миРНК, sh-РНК, si-РНК, радиоизотопы и токсины, среди которых можно использовать по меньшей мере одно соединение.
Лекарственное средство может включать, не ограничиваясь этим, майтанзиноид, ауристатин, доластатин, трихотецен, CC1065 (NSC 298223), калихеамицин, таксан, антрациклин, метотрексат, адриамицин, виндезин, алкалоиды барвинка (винкристин, винбластин, этопозид), доксорубицин, мелфалан, митомицин C, хлорамбуцил, даунорубицин, дауномицин, этопозид, тенипозид, карминомицин, аминоптерин, дактиномицин, митомицины, блеомицины, эсперамицины, другие энедииновые антибиотики, 5-фторурацил, другие азотистые иприты и их стереоизомеры, изостеры, гомологи или производные, цисплатин и гомологи цисплатина, другие интеркаляторные ферменты и их фрагменты, например нуклеазы, антибиотики, токсины (ферментативно активные токсины или низкомолекулярные токсины бактериального, грибкового, растительного или животного происхождения) и различные противоопухолевые или противораковые агенты, такие как цисплатин, CPT-11, паклитаксел и доцетаксел.
Кроме того, радиоизотоп (радионуклид) включает 3H, 14C, 32P, 35S, 36Cl, 51Cr, 57Co, 58Co, 59Fe, 90Y, 125I, 131I, 186Re и т.п. Также можно использовать микроРНК (миРНК), si-РНК, sh-РНК и т.п., которые могут ингибировать экспрессию некоторых онкогенов.
Связывание анти-CD3-антитела с лекарственным средством предпочтительно достигается конъюгацией с использованием функциональной группы, такой как тиоловая группа аминокислотного остатка, такого как лизин или цистеин, в антителе. При необходимости также можно провести конъюгацию в линкер-опосредованной форме, которая обычно используется. Также можно использовать линкер на основе малеимида или йодацетамида.
Когда лекарственное средство конъюгировано с антителом или его фрагментом, то лекарственное средство может быть конъюгировано с C-концевым сайтом, противоположным антигенсвязывающему сайту, для снижения влияния на способность или специфичность связывания антитела или фрагмента с CD3 и т.п. Когда используется полное антитело, а не его фрагмент, то лекарственное средство может быть конъюгировано с Fc-областью.
Кроме того, антитело также можно использовать в качестве терапевтического агента на основе химерного антигенного рецептора (CAR), содержащего его. Примеры такого терапевтического средства предпочтительно включают, не ограничиваясь этим, терапевтические средства на основе T-клетки с химерным антигенным рецептором (CAR-T-клетка) или природной клетки-киллера с химерным антигенным рецептором (CAR-NK-клетка).
Антитело также можно использовать в форме биспецифического антитела, включающего антитело против CD3. Биспецифическое антитело представляет антитело, которое обладает способностью связываться с двумя антигенами одновременно и, как правило, может находиться в форме, в которой пары тяжелых и легких цепей, которые связываются с различными антигенами, соединены друг с другом.
Кроме того, биспецифическое антитело доступно в форме, такой как биспецифическое одноцепо- 3 040507 чечное антитело, где фрагменты одноцепочечного антитела (scFv), в которых VL и VH связаны друг с другом посредством короткого линкерного пептида, связаны в форме scFv1-scFv2(-Fc), двойного антитела на основе однодоменного антитела (sdAb), с использованием VH и биспецифического антитела, полученного с использованием технологии BiTE (см. http://www.micromet.de) от Micromet, Германия.
Биспецифическое антитело может находиться в форме, в которой анти-CD3-антитело связано с антителом или его фрагментом, обладающим способностью связываться с молекулой-мишенью, специфичной для иммуноэффективной клетки. Молекула-мишень, специфичная для иммуноэффективной клетки, предпочтительно может быть выбрана, не ограничиваясь этим, из TCR/CD3, CD16 (FcyRIIIa), CD44, CD56, CD69, CD64 (FcyRI), CD89 и CD11b/CD18 (CR3).
В еще одном аспекте настоящего изобретения обеспечивается полинуклеотид, кодирующий вариабельную область легкой цепи (VL-область) и вариабельную область тяжелой цепи (VH-область) антитела в соответствии с настоящим изобретением, и вектор экспрессии, содержащий его.
Полинуклеотид, который кодирует вариабельную область тяжелой цепи антитела или фрагмента антитела, т.е. ген, может быть легко получен специалистами в данной области из аминокислотной последовательности анти-CD3-антитела.
Как здесь используется, термин вектор экспрессии относится к рекомбинантному вектору, способному экспрессировать целевой белок в клетке-хозяине, и означает генную конструкцию, которая содержит важные регуляторные элементы, операбельно связанные с ней, для экспрессии вставленного гена. Ген, кодирующий анти-CD3-антитело, может быть вставлен в отдельный вектор или может быть использован в форме вставки в один и тот же вектор.
В частности, полинуклеотид, который кодирует аминокислотную последовательность анти-CD3антитела, можно использовать в форме вставки в отдельный или один и тот же вектор, и полинуклеотид, который кодирует тяжелую цепь или ее вариабельную область, можно использовать в форме вставки в отдельный или один и тот же вектор.
Как здесь используется, термин операбельно связанный означает, что регуляторная последовательность экспрессии нуклеиновой кислоты и последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая желаемый белок, операбельно связаны для выполнения желаемой функции. Операбельная связь с рекомбинантным вектором может быть достигнута с использованием методов генетической рекомбинации, хорошо известных в данной области, и сайт-специфическое расщепление и лигирование ДНК может быть легко достигнуто с использованием ферментов и т.п., хорошо известных в данной области.
Векторы экспрессии, подходящие для продуцирования анти-CD3-антитела, могут содержать сигнальные последовательности для нацеливания на мембраны или секреции в дополнение к регуляторным элементам экспрессии, таким как промоторы, кодоны инициации, кодоны терминации, сигналы полиаденилирования и энхансеры. Кодоны инициации и кодоны терминации обычно считаются частью нуклеотидной последовательности, кодирующей иммуногенный целевой белок. Такие кодоны должны быть функциональными у индивидуума при введении генной конструкции и должны находиться в рамке считывания с кодирующей последовательностью. В общем, промоторы могут быть конститутивными или индуцибельными. Промотор может включать, не ограничиваясь этим, прокариотические промоторы, такие как lac, tac, T3 и T7, промоторы обезьяньего вируса 40 (SV40), промоторы вируса опухоли молочной железы мыши (MMTV), промоторы вируса иммунодефицита человека (ВИЧ), например, промотор длинного концевого повтора (LTR) ВИЧ, промоторы вируса лейкоза мышей Молони, промоторы цитомегаловируса (CMV), промоторы вируса Эпштейна-Бара (EBV), промоторы вируса саркомы Рауса (RSV), а также промоторы β-актина, эукариотические промоторы человеческого гемоглобина, человеческого креатина мышечной ткани, человеческого металлотионеина и т.п.
Вектор экспрессии может дополнительно содержать селектируемый маркер, который позволяет отбирать клетки-хозяева, содержащие его. Селектируемый маркер используется для отбора клеток, трансформированных вектором. В качестве селектируемого маркера можно использовать маркеры, которые придают селектируемый фенотип, такой как лекарственная устойчивость, ауксотрофия, устойчивость к цитотоксическим агентам или экспрессия поверхностных белков. В среде, обработанной селективным агентом, выживают только клетки, экспрессирующие селектируемый маркер, что позволяет отобрать трансформированные клетки. Кроме того, когда вектор является реплицируемым вектором экспрессии, такой вектор может содержать ориджин репликации, представляющий собой специфическую нуклеиновокислотную последовательность, из которой инициируется репликация.
В качестве рекомбинантного вектора экспрессии для вставки чужеродного гена можно использовать различные формы векторов, такие как плазмиды, вирусы и космиды. Тип рекомбинантного вектора конкретным образом не ограничивается при условии, что вектор функционирует для экспрессии желаемого гена и продуцирования желаемого белка в различных клетках-хозяевах, включая прокариотические и/или эукариотические клетки. Вектор может предпочтительно представлять вектор, способный продуцировать большое количество чужеродного белка, который находится в форме, сходной с его природным состоянием, при этом имея промотор с высокой активностью и высокой способностью экспрессии.
Для экспрессии анти-CD3-антитела можно использовать различные комбинации хозяин/вектор экс- 4 040507 прессии. Вектор экспрессии, подходящий для эукариотических хозяев, включает, не ограничиваясь этим, регуляторные последовательности экспрессии, полученные из SV40, вируса папилломы крупного рогатого скота, аденовируса, аденоассоциированного вируса, цитомегаловируса и ретровируса. Вектор экспрессии, который можно использовать в бактериальных хозяевах, включает бактериальные плазмиды, полученные из Escherichia coli, такие как pET, pRSET, pBluescript, pGEX2T, вектор pUC, colE1, pCR1, pBR322, pMB9 и их производные; плазмиды, имеющие широкий ряд хозяев, такие как RP4; ДНК-фаги, примером которых может служить широкий ряд производных лямбда фагов, таких как λgt10, λgt11 и NM989; и другие ДНК-фаги, такие как M13 и нитчатые одноцепочечные ДНК-фаги. Вектор экспрессии, пригодный для дрожжевых клеток, может включать 2-микронные плазмиды и их производные. Вектор, пригодный для клеток насекомых, может представлять собой pVL941.
В еще одном аспекте настоящего изобретения обеспечивается клетка-хозяин, трансформированная вектором экспрессии в соответствии с настоящим изобретением. Вектор экспрессии может быть вставлен в клетку-хозяин с образованием трансформанта. Подходящая клетка-хозяин для вектора может включать прокариотические клетки, такие как Escherichia coli, Bacillus subtilis, Streptomyces sp., Pseudomonas sp., Proteus mirabilis или Staphylococcus sp. Кроме того, клетка-хозяин может включать эукариотические клетки, включая клетки низших эукариот из грибов, таких как Aspergillus sp., дрожжи, такие как Pichia pastoris, Saccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomyces sp. и Neurospora crassa, и другие низшие эукариоты, а также высшие эукариотические клетки, такие как клетки насекомых. Кроме того, клетка-хозяин также может быть получена из растений или млекопитающих. Предпочтительно клеткахозяин, которую можно использовать, включает, не ограничиваясь этим, клетки почки зеленой мартышки (клетки COS7), клетки NS0 (клетки мышиной миеломы), клетки SP2/0 (клетки мышиной миеломы), другие клетки миеломной линии, клетки яичника китайского хомячка (CHO), клетки W138 (культура диплоидных клеток человека), клетки почки детеныша хомячка (BHK), клетки MDCK, HuT 78, клетки HEK293 и т.п., где предпочтительными являются клетки CHO.
Как здесь используется, термин трансформация в клетки-хозяева предназначен для включения любого метода введения нуклеиновой кислоты в организм, клетку, ткань или орган, и такую трансформацию можно выполнить с использованием стандартной методики, известной в данной области техники, выбранной в зависимости от типа клетки-хозяина. В частности, можно использовать электропорацию, слияние протопластов, осаждение фосфатом кальция (CaPO4), осаждение хлоридом кальция (CaCl2), перемешивание с использованием волокна карбида кремния, трансформацию, опосредованную Agrobacterium, трансформацию, опосредованную пэгом, декстраном сульфатом, липофектамином или высыханием/ингибированием или т.п. Однако настоящее изобретение не ограничивается этими методами.
В еще одном аспекте настоящего изобретения обеспечивается способ получения антитела, которое специфически связывается с CD3, включающий культивирование клетки-хозяина. В частности, способ получения антитела может включать стадии: вставку в вектор нуклеотидной последовательности, кодирующей анти-CD3-антитело, для конструирования рекомбинантного вектора; трансформацию клеткихозяина рекомбинантным вектором и проведение культивирования; и отделение и очистку гуманизированного антитела от культивированного трансформанта.
Гуманизированные антитела можно получить в большом количестве культивированием трансформанта, в котором экспрессируется рекомбинантный вектор, в питательной среде, и среду и условия культивирования можно соответствующим образом выбрать из тех, которые известны в данной области, в зависимости от типа клетки-хозяина. Во время культивирования такие условия, как температура, pH среды и время культивирования, могут быть соответствующим образом скорректированы, чтобы они подходили для роста клеток и массовой продукции белка.
Полученные рекомбинантным способом анти-CD3-антитела, как описано выше, можно выделить из среды или клеточного лизата. Когда антитело находится в мембраносвязанной форме, то такое антитело можно выделить из мембраны с использованием подходящего раствора поверхностно-активного вещества (например, Triton-X 100) или ферментативным расщеплением. Клетки, используемые для экспрессии гуманизированных антител, можно подвергнуть разрушению с использованием различных физических и химических способов, таких как циклы замораживания-оттаивания, обработка ультразвуком, механическое разрушение или применение агентов, лизирующих клетки, и разделение и очистку можно выполнить с использованием обычных методов биохимического разделения. Метод биохимического разделения, который можно использовать, включает, не ограничиваясь этим, электрофорез, центрифугирование, гель-фильтрацию, осаждение, диализ, хроматографию (ионообменную хроматографию, аффинную хроматографию, иммуноабсорбционную хроматографию, эксклюзионную хроматографию или т.п.), изоэлектрическое фокусирование и т.п.
В еще одном аспекте настоящего изобретения обеспечивается фармацевтическая композиция для профилактики или лечения онкологического заболевания, содержащая антитело по настоящему изобретению или его фрагмент.
Тип онкологического заболевания, который можно лечить фармацевтической композицией, может включать как солидный рак, так и рак крови и предпочтительно может включать любые злокачественные опухоли, которые экспрессируют CD3. Здесь антитело может привлекать T-клетки посредством специ
- 5 040507 фического связывания с CD3 и, таким образом, вызывать гибель опухолевых клеток.
В частности, рак может представлять, не ограничиваясь этим, рак поджелудочной железы, рак печени, рак желудка, рак легкого, колоректальный рак, рак прямой кишки, рак щитовидной железы, рак пищевода, рак почки, рак мочевого пузыря, рак предстательной железы, рак шейки матки, рак молочной железы, рак крови, рак кожи, эпителиальный рак, рак головного мозга, рак центральной нервной системы или рак яичника.
Фармацевтическая композиция может дополнительно содержать фармацевтически приемлемый носитель. В качестве фармацевтически приемлемого носителя для перорального введения можно использовать связующее вещество, скользящее вещество, разрыхлитель, эксципиент, солюбилизатор, диспергатор, стабилизатор, суспендирующий агент, пигмент, ароматизатор и т.п.; буфер, консервант, обезболивающее средство, солюбилизатор, изотонический агент, стабилизатор и т.п. можно использовать в смеси для инъекций; и основу, эксципиент, скользящее вещество, консервант и т.п. можно использовать для местного применения.
Состав фармацевтической композиции по настоящему изобретению может быть приготовлен различными способами посредством смешивания с фармацевтически приемлемым носителем, как описано выше. Например, для перорального введения фармацевтическая композиция может быть составлена в форме таблеток, пастилок, капсул, эликсиров, суспензий, сиропов, облаток или т.п. Для инъекций фармацевтическая композиция может быть формулирована в виде ампул с разовыми дозами или форм с множеством доз.
Кроме того, фармацевтическая композиция может содержать поверхностно-активное вещество, которое может повышать проницаемость мембраны. Такие поверхностно-активные вещества могут быть получены из стероидов или могут включать катионные липиды, такие как хлорид К-[1-(2,3-диолеоил)пропил-К,К,К-триметиламмония (DOTMA), или различные соединения, такие как холестерина гемисукцинат и фосфатидилглицерин. Однако поверхностно-активное вещество этим не ограничивается.
В еще одном аспекте настоящего изобретения обеспечивается способ лечения онкологического заболевания или ингибирования роста злокачественной опухоли, включающий введение фармацевтической композиции индивидууму. Фармацевтическую композицию, содержащую анти-CD3-антитело, можно вводить в фармацевтически эффективном количестве для воздействия на опухолевые клетки или их метастазы или для ингибирования роста злокачественной опухоли. Эффективное количество может варьироваться в зависимости от различных факторов, таких как тип онкологического заболевания, возраст пациента, масса тела, характер и тяжесть симптомов, тип текущей терапии, количество видов лечения, лекарственная форма и способ введения, и может быть легко определено специалистами в соответствующей области.
Фармацевтическую композицию можно вводить вместе или последовательно с вышеуказанными фармакологическими или физиологическими компонентами и также можно вводить в комбинации с дополнительными обычными терапевтическими агентами, в этом случае фармацевтическую композицию можно вводить последовательно или одновременно с обычными терапевтическими агентами. Такое введение может быть однократным или многократным. Принимая во внимание все вышеуказанные факторы, важно вводить количество, которое является минимальным количеством и позволяет обеспечить максимальный эффект без проявления побочных эффектов, и такое количество может легко определить специалист в данной области техники.
Как здесь используется, термин индивидуум относится к млекопитающему, предпочтительно человеку, страдающему или имеющему риск развития патологического состояния или заболевания, которое можно облегчить, подавить или лечить введением фармацевтической композиции.
Как здесь используется, термин введение означает введение заранее определенного вещества индивидууму любым подходящим способом, и фармацевтическую композицию можно вводить любым путем при условии, что путь позволяет фармацевтической композиции достичь ткани-мишени. Такой способ введения может включать, без ограничения, внутрибрюшинное введение, внутривенное введение, внутримышечное введение, подкожное введение, внутрикожное введение, пероральное введение, местное введение, интраназальное введение, пульмонарное введение или ректальное введение. Здесь, в случае перорального введения, с точки зрения того, что белки подвергаются перевариванию, может быть желательным формулировать композицию для перорального применения таким образом, чтобы активный агент был покрыт оболочкой или композиция была защищена от переваривания в желудке. Кроме того, фармацевтическую композицию можно вводить с использованием любого устройства, так чтобы активный ингредиент мог мигрировать в его клетку-мишень.
В еще одном аспекте настоящего изобретения обеспечивается применение антитела по настоящему изобретению для профилактики или лечения онкологического заболевания.
В еще одном аспекте настоящего изобретения обеспечивается применение антитела по настоящему изобретению для производства лекарственного средства для профилактики или лечения онкологического заболевания.
В еще одном аспекте настоящего изобретения обеспечивается способ профилактики или лечения
- 6 040507 онкологического заболевания, включающий введение антитела по настоящему изобретению индивидууму.
Наилучший способ осуществления изобретения
Далее настоящее изобретение будет описано более подробно с помощью примеров. Следующие примеры описаны с целью иллюстрации настоящего изобретения, и объем настоящего изобретения этим не ограничивается.
Пример 1. Получение гуманизированных анти-CD3-антител.
Пример 1.1. Селекция антител-кандидатов для гуманизации.
Аминокислотные последовательности вариабельной области легкой цепи (VL-область) и вариабельной области тяжелой цепи (VH-область) мышиного антитела SP34, известного как анти-CD3антитело, вводили в базу данных web (IgBLAST) и затем проводили поиск наиболее сходных последовательностей эмбриональных антител человека. В результате наибольшее сходство аминокислотной последовательности было показано между вариабельной областью легкой цепи мышиного антитела SP34 и Homo sapiens IGKV7-46*01 (название гена в базе данных IMGT) и между вариабельной областью тяжелой цепи мышиного антитела SP34 и Homo sapiens IGHV1-73*02 (название гена в базе данных IMGT).
Пример 1.2. Гуманизация вариабельной области легкой цепи.
Аминокислотную последовательность CDR Homo sapiens IGKV7-46*01 (название гена в базе данных IMGT), человеческого эмбрионального антитела, имеющего последовательность, наиболее сходную с вариабельной областью легкой цепи антитела SP34, заменяли последовательностью CDR мышиного антитела SP34 с получением частично гуманизированной вариабельной области легкой цепи SP34.
Для усиления антигенсвязывающих свойств частично гуманизированной вариабельной области легкой цепи SP34 аминокислотные остатки в последовательностях каркасной области (FR), которые, как полагают, играют важную функцию в обеспечении антигенсвязывающих свойств, заменяли такими же аминокислотными остатками, что и в мышином антителе SP34. Полученная таким образом аминокислотная последовательность гуманизированной вариабельной области легкой цепи SP34 показана в табл. 1.
Как показано в табл. 1, были сделаны случайные модификации аминокислотных остатков 38, 48, 51 и 71 вариабельной области легкой цепи мышиного антитела SP34 с получением в общей сложности 16 гуманизированных вариабельных областей легкой цепи SP34. Здесь вариабельную область легкой цепи мышиного антитела SP34 использовали в качестве контроля для сравнения аффинности к антигену CD3.
- 7 040507
Таблица 1
Клон Вариабельная область Аминокислотная последовательность (участки, выделенные жирным шрифтом, указывают CDR1, CDR2, CDR3 легкой цепи по порядку) SEQ ID NO
01 Легкая цепь QAVVTQEPSLTVSPGGTVTLTCRSSTGAVTTSNYA NWFQQKPGQAPRTLIYGTNKRAPWTPARFSGSLL GGKAALTLSGAQPEDEAEYYCALWYSNLWVFGG GTKLTVLG 1
02 Легкая цепь QAVVTQEPSLTVSPGGTVTLTCRSSTGAVTTSNYA NWFQQKPGQAPRTLIYGTNKRAPWTPARFSGSLL GDKAALTLSGAQPEDEAEYYCALWYSNLWVFGG GTKLTVLG 2
03 Легкая цепь QAVVTQEPSLTVSPGGTVTLTCRSSTGAVTTSNYA NWFQQKPGQAPRTLIGGTNKRAPWTPARFSGSLL GGKAALTLSGAQPEDEAEYYCALWYSNLWVFGG GTKLTVLG 3
04 Легкая цепь QAVVTQEPSLTVSPGGTVTLTCRSSTGAVTTSNYA NWFQQKPGQAPRTLIGGTNKRAPWTPARFSGSLL GDKAALTLSGAQPEDEAEYYCALWYSNLWVFGG GTKLTVLG 4
05 Легкая цепь QAVVTQEPSLTVSPGGTVTLTCRSSTGAVTTSNYA NWFQQKPGQAPRGLIYGTNKRAPWTPARFSGSLL GGKAALTLSGAQPEDEAEYYCALWYSNLWVFGG GTKLTVLG 5
06 Легкая цепь η QAVVTQEPSLTVSPGGTVTLTCRSSTGAVTTSNYA NWFQQKPGQAPRGLIYGTNKRAPWTPARFSGSLL GDKAALTLSGAQPEDEAEYYCALWYSNLWVFGG GTKLTVLG 6
07 Легкая цепь QAVVTQEPSLTVSPGGTVTLTCRSSTGAVTTSNYA NWFQQKPGQAPRGLIGGTNKRAPWTPARFSGSLL GGKAALTLSGAQPEDEAEYYCALWYSNLWVFGG GTKLTVLG 7
- 8 040507
08 Легкая цепь QAVVTQEPSLTVSPGGTVTLTCRSSTGAVTTSNYA NWFQQKPGQAPRGLIGGTNKRAPWTPARFSGSLL GDKAALTLSGAQPEDEAEYYCALWYSNLWVFGG GTKLTVLG 8
09 Легкая цепь QAVVTQEPSLTVSPGGTVTLTCRSSTGAVTTSNYA NWVQQKPGQAPRTLIYGTNKRAPWTPARFSGSLL GGKAALTLSGAQPEDEAEYYCALWYSNLWVFGG GTKLTVLG 9
10 Легкая цепь η QAVVTQEPSLTVSPGGTVTLTCRSSTGAVTTSNYA NWVQQKPGQAPRTLIYGTNKRAPWTPARFSGSLL GDKAALTLSGAQPEDEAEYYCALWYSNLWVFGG GTKLTVLG 10
11 Легкая цепь η QAVVTQEPSLTVSPGGTVTLTCRSSTGAVTTSNYA NWVQQKPGQAPRTLIGGTNKRAPWTPARFSGSLL GGKAALTLSGAQPEDEAEYYCALWYSNLWVFGG GTKLTVLG 11
12 Легкая цепь QAVVTQEPSLTVSPGGTVTLTCRSSTGAVTTSNYA NWVQQKPGQAPRTLIGGTNKRAPWTPARFSGSLL GDKAALTLSGAQPEDEAEYYCALWYSNLWVFGG GTKLTVLG 12
13 Легкая цепь QAVVTQEPSLTVSPGGTVTLTCRSSTGAVTTSNYA NWVQQKPGQAPRGLIYGTNKRAPWTPARFSGSLL GGKAALTLSGAQPEDEAEYYCALWYSNLWVFGG GTKLTVLG 13
14 Легкая цепь QAVVTQEPSLTVSPGGTVTLTCRSSTGAVTTSNYA NWVQQKPGQAPRGLIYGTNKRAPWTPARFSGSLL GDKAALTLSGAQPEDEAEYYCALWYSNLWVFGG GTKLTVLG 14
15 Легкая цепь QAVVTQEPSLTVSPGGTVTLTCRSSTGAVTTSNYA NWVQQKPGQAPRGLIGGTNKRAPWTPARFSGSLL GGKAALTLSGAQPEDEAEYYCALWYSNLWVFGG GTKLTVLG 15
16 SP34 Легкая цепь Легкая цепь QAVVTQEPSLTVSPGGTVTLTCRSSTGAVTTSNYA NWVQQKPGQAPRGLIGGTNKRAPWTPARFSGSLL GDKAALTLSGAQPEDEAEYYCALWYSNLWVFGG GTKLTVLG QAVVTQESALTTSPGETVTLTCRSSTGAVTTSNYA NWVQEKPDHLFTGLIGGTNKRAPGVPARFSGSLIG DKAALTITGAQTEDEAIYFCALWYSNLWVFGGGT KLTVLG 16 17
Пример 1.3. Гуманизация вариабельной области тяжелой цепи.
Аминокислотную последовательность CDR Homo sapiens IGHV3-73*03 (название гена в базе данных IMGT), человеческого эмбрионального антитела, имеющего последовательность, наиболее сходную с вариабельной областью тяжелой цепи SP34, заменяли последовательностью CDR мышиного антитела SP34 с получением частично гуманизированной вариабельной области тяжелой цепи SP34.
Для усиления антигенсвязывающих свойств частично гуманизированной вариабельной области тяжелой цепи SP34 аминокислотные остатки в последовательностях каркасной области (FR), которые, как полагают, играют важную функцию в обеспечении антигенсвязывающих свойств, заменяли такими же аминокислотными остатками, что и в мышином антителе SP34. Полученная таким образом аминокислотная последовательность гуманизированной вариабельной области тяжелой цепи SP34 показана в табл. 2.
Как показано в табл. 2, были сделаны случайные модификации аминокислотных остатков 49, 78, 79 и 81 в вариабельной области тяжелой цепи мышиного антитела SP34 с получением в общей сложности
- 9 040507 восемь гуманизированных вариабельных областей тяжелой цепи SP34. Здесь вариабельную область тяжелой цепи мышиного антитела SP34 использовали в качестве контроля для сравнения аффинности к антигену CD3.
Таблица 2
Клон Вариабельная область Аминокислотная последовательность (участки, выделенные жирным шрифтом, указывают CDR1, CDR2, CDR3 легкой цепи по порядку) EVQLVESGGGLVQPGGSLKLSCAASGFTFNTYA SEQ ID NO
А Тяжелая цепь MNWVRQASGKGLEWVGRIRSKYNNYATYYADS VKDRFTISRDDSKNTAYLQMNSLKTEDTAVYYC VRHGNFGNSYVSWFAYWGQGTLVTVSS EVQLVESGGGLVQPGGSLKLSCAASGFTFNTYA 18
В Тяжелая цепь MNWVRQASGKGLEWVGRIRSKYNNYATYYADS VKDRFTISRDDSKNTLYLQMNSLKTEDTAVYYCV RHGNFGNSYVSWFAYWGQGTLVTVSS EVQLVESGGGLVQPGGSLKLSCAASGFTFNTYA 19
С Тяжелая цепь MNWVRQASGKGLEWVGRIRSKYNNYATYYADS VKDRFTISRDDSQSTAYLQMNSLKTEDTAVYYCV RHGNFGNSYVSWFAYWGQGTLVTVSS 20
EVQLVESGGGLVQPGGSLKLSCAASGFTFNTYA
D Тяжелая цепь MNWVRQASGKGLEWVGRIRSKYNNYATYYADS VKDRFTISRDDSQSTLYLQMNSLKTEDTAVYYCV RHGNFGNSYVSWFAYWGQGTLVTVSS 21
EVQLVESGGGLVQPGGSLKLSCAASGFTFNTYA
Е Тяжелая цепь MNWVRQASGKGLEWVARIRSKYNNYATYYADS VKDRFTISRDDSKNTAYLQMNSLKTEDTAVYYC VRHGNFGNSYVSWFAYWGQGTLVTVSS 22
EVQLVESGGGLVQPGGSLKLSCAASGFTFNTYA
F Тяжелая цепь MNWVRQASGKGLEWVARIRSKYNNYATYYADS VKDRFTISRDDSKNTLYLQMNSLKTEDTAVYYCV RHGNFGNSYVSWFAYWGQGTLVTVSS 23
EVQLVESGGGLVQPGGSLKLSCAASGFTFNTYA
G Тяжелая цепь MNWVRQASGKGLEWVARIRSKYNNYATYYADS VKDRFTISRDDSQSTAYLQMNSLKTEDTAVYYCV RHGNFGNSYVSWFAYWGQGTLVTVSS 24
EVQLVESGGGLVQPGGSLKLSCAASGFTFNTYA
Н Тяжелая цепь MNWVRQASGKGLEWVARIRSKYNNYATYYADS VKDRFTISRDDSQSTLYLQMNSLKTEDTAVYYCV RHGNFGNSYVSWFAYWGQGTLVTVSS 25
EVQLVESGGGLVQPKGSLKLSCAASGFTFNTYA
SP34 Тяжелая цепь MNWVRQAPGKGLEWVARIRSKYNNYATYYADS VKDRFTISRDDSQSILYLQMNNLKTEDTAMYYCV RHGNFGNSYVSWFAYWGQGTLVTVSS 26
Пример 1.4. Клонирование гуманизированных анти-CD3-антител-кандидатов.
Каждый из генов 16 вариабельных областей легкой цепи, как описано выше, вставляли в вектор экспрессии pcDNA3.4 для клеток животных, содержащий константную область легкой цепи лямбда (λ-CL), и каждый из генов восьми вариабельных областей тяжелой цепи встраивали в вектор экспрессии pcDNA3.4 для клеток животных, содержащий константные области IgG1 (CH1, шарнирная область, CH2, CH3).
Соответствующие специфические аминокислотные последовательности для константной области легкой цепи лямбда и константной области тяжелой цепи IgG1 показаны в табл. 3.
- 10 040507
Таблица 3
Клон Вариабельная область Аминокислотная последовательность SEQ ID NO
λ Легкая цепь QPKANPTVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAV TVAWKADGSPVKAGVETTKPSKQSNNKYAASSYLS 27
IgGl Тяжелая цепь LTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTEC ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPV TVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPS SSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTC PPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVV VDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYN STYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPI EKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLV KGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFF LYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQK SLSLSPGK 28
Пример 1.5. Трансфекция гуманизированных анти-CD3-антител-кандидатов.
За 24 ч до трансфекции клетки Expi293F с плотностью 2,0х106 клеток/мл пассировали в среде Expi293 в термостате со встряхиванием со скоростью 125±10 об/мин в условиях 37°C и 8% CO2. Когда выполняли трансфекцию, то измеряли количество клеток и оценивали жизнеспособность клеток для определения наличия жизнеспособности клеток на уровне 95% или выше.
Клетки помещали с титром 7,5x107 клеток в культуральную колбу емкостью 125 мл и затем добавляли среду Expi293 для доведения конечного объема до 25 мл (из расчета на 30 мл). Используя среду Opti-MEM I, 30 мкг вектора, экспрессирующего антитело, смешивали с общим объемом 1,5 мл и проводили инкубацию в течение 5 мин при комнатной температуре. Для векторов антител использовали в целом 128 гуманизированных IgG1 антител SP34, полученных комбинированием вектора экспрессии для 8 вариабельных областей тяжелой цепи и векторов экспрессии для 16 вариабельных областей легкой цепи. В качестве вектора контрольного антитела использовали химерное мышиное/человеческое IgG1 антитело SP34. Конкретные комбинации антител показаны в табл. 4.
Используя среду Opti-MEM I, 80 мкл реагента для трансфекции смешивали с общим объемом 1,5 мл и проводили инкубацию в течение 5 мин при комнатной температуре. Среду Opti-MEM I, соответственно содержащую вектор и реагент для трансфекции, осторожно перемешивали и оставляли взаимодействовать при комнатной температуре на 20 мин. Затем полученную смесь помещали в колбу, содержащую
- 11 040507 клетки Expi293F. Инкубацию проводили в термостате со встряхиванием со скоростью 125±10 об/мин в течение 16-20 ч при 37°C и 8% CO2. Затем добавляли 1,5 мл усилителя трансфекции I и 150 мкл усилителя трансфекции II и проводили инкубацию в течение 6 суток для получения антител-кандидатов.
Пример 1.6. Очистка антител.
Инкубационную смесь центрифугировали при 4000 об/мин в течение 30 мин, фильтровали через фильтр 0,22 мкм и затем удаляли клеточный дебрис с получением супернатанта. 0,2 мл смолы Mabselect Xtra добавляли на колонку и уравновешивание проводили с использованием буфера, связывающегося с белком A, в объеме, соответствующем 10-кратному объему смолы.
Затем супернатант загружали на колонку под действием силы тяжести. После завершения загрузки колонку промывали буфером, связывающимся с белком A, в объеме, соответствующем 10-кратному объему смолы.
Затем на колонку добавляли элюирующий IgG буфер и проводили элюирование. Элюат нейтрализовали добавлением 25 мкл 1,5 М Трис-Cl на 1 мл элюата. Затем концентрацию элюата измеряли при OD 280 нм. Элюент, для которого была измерена концентрация, подвергали диализу с буферным обменом с PBS.
Пример 2. Селекция гуманизированных анти-CD3-антител.
Твердофазный иммуноферментный анализ (ELISA) использовали для селекции антител, проявляющих аффинность к CD3 человека и CD3 обезьяны, из общего числа 128 комбинаций анти-CD3-антител (SP34).
В частности, рекомбинантный гетеродимер CD3c/e человека или обезьяны Cynomolgus разводили буфером для покрытия и использовали для обработки 96-луночного планшета. Планшет выдерживали при 4°C в течение 12 ч или более. Затем буфер удаляли и обрабатывали 1% раствором бычьего сывороточного альбумина (BSA)/PBS при комнатной температуре в течение 1 ч. Затем раствор удаляли. Затем лунки, покрытые рекомбинантным CD3, обрабатывали растворами клеточных культур, экспрессирующих антитела, в течение примерно 1 ч.
Лунки промывали раствором 0,05% Твин-20/PBS и затем проводили обработку человеческим IgG антителом, конъюгированным с пероксидазой хрена, которое было разведено в 1% растворе BSA/PBS, при комнатной температуре в течение 1 ч. Затем раствор удаляли и лунки промывали раствором 0,05% Твин-20/PBS.
Раствор TMB (3,3',5,5'-тетраметилбензидина) использовали для обработки 96-луночного планшета и 96-луночный планшет выдерживали при комнатной температуре в течение 30 мин. Затем проводили обработку стоп-раствором и сразу определяли интенсивность развития окрашивания при длине волны поглощения 450 нм. Среди кандидатов гуманизированных антител SP34 только те образцы, у которых появилась окрашивание, представляли клоны, которые сохраняли аффинность к CD3 мышиного антитела SP34. Конкретные результаты, полученные в анализе измерения аффинности, приведены в табл. 5.
Таблица 5
Клон Поглощение (450 нм) Клон Поглощение (450 нм)
BSA CD3 человека CD3 обезьяны Cynomolgus BSA CD3 человека CD3 обезьяны Cynomolgus
А01 0,107 0,152 0,098 Е01 0,078 0,100 0,078
А02 0,071 0,098 0,068 Е02 0,077 0,095 0,070
АОЗ 0,092 0,132 0,094 ЕОЗ 0,098 0,134 0,076
А04 0,063 0,098 0,065 Е04 0,080 0,087 0,067
А05 0,152 0,167 0,141 Е05 0,083 0,085 0,068
А06 0,084 0,140 0,108 Е06 0,206 0,112 0,086
- 12 040507
A07 0,089 1,315 2,546 E07 0,097 0,109 0,115
A08 0,094 0,875 2,339 E08 0,106 0,074 0,099
A09 0,061 0,092 0,050 E09 0,072 0,096 0,084
АЮ 0,077 0,097 0,066 ЕЮ 0,064 0,083 0,065
All 0,072 0,122 0,105 Ell 0,065 0,098 0,075
А12 0,060 0,097 0,068 E12 0,059 0,088 0,064
А13 0,098 0,172 0,154 E13 0,085 0,139 0,114
А14 0,082 0,125 0,113 E14 0,068 0,105 0,078
А15 0,099 2,785 2,864 E15 0,130 2,411 2,702
А16 0,068 2,538 2,799 E16 0,089 2,399 2,736
BOI 0,055 0,097 0,071 F01 0,084 0,118 0,086
B02 0,059 0,086 0,072 F02 0,062 0,093 0,076
ВОЗ 0,071 0,126 0,091 F03 0,078 0,128 0,101
B04 0,053 0,087 0,059 F04 0,057 0,084 0,069
B05 0,069 0,102 0,100 F05 0,066 0,105 0,075
B06 0,077 0,138 0,143 F06 0,079 0,115 0,096
B07 0,061 0,718 2,449 F07 0,142 0,133 0,163
B08 0,060 0,424 2,193 F08 0,076 0,134 0,180
B09 0,063 0,096 0,099 F09 0,071 0,099 0,084
BIO 0,078 0,098 0,076 F10 0,068 0,118 0,091
Bll 0,074 0,132 0,107 Fil 0,071 0,138 0,104
B12 0,059 0,098 0,072 F12 0,090 0,090 0,077
B13 0,130 0,169 0,156 F13 0,076 0,192 0,151
B14 0,078 0,127 0,102 F14 0,071 0,114 0,100
B15 0,204 2,709 3,161 F15 0,081 2,489 2,755
B16 0,064 2,370 2,926 F16 0,066 2,455 2,855
C01 0,128 0,131 0,075 G01 0,080 0,113 0,096
C02 0,108 0,099 0,071 G02 0,075 0,146 0,069
C03 0,126 0,140 0,089 G03 0,078 0,098 0,088
C04 0,073 0,093 0,067 G04 0,067 0,129 0,063
C05 0,099 0,107 0,128 G05 0,079 0,109 0,072
C06 0,080 0,108 0,083 G06 0,095 0,118 0,078
C07 0,113 0,960 2,604 G07 0,077 0,118 0,316
- 13 040507
С08 0,111 0,446 2,178 G08 0,148 0,137 0,119
С09 0,083 0,109 0,075 G09 0,083 0,106 0,079
СЮ 0,066 0,096 0,074 G10 0,072 0,099 0,079
СП 0,168 0,288 0,261 G11 0,086 0,104 0,080
С12 0,065 0,087 0,065 G12 0,057 0,085 0,065
С13 0,128 0,179 0,179 G13 0,132 0,265 0,242
С14 0,075 0,107 0,095 G14 0,075 0,105 0,099
С15 0,098 2,454 2,813 G15 0,091 2,415 2,694
С16 0,092 2,369 2,802 G16 0,108 2,482 2,773
D01 0,124 0,136 0,099 Н01 0,087 0,121 0,154
D02 0,056 0,150 0,073 Н02 0,125 0,111 0,080
D03 0,073 0,159 0,130 НОЗ 0,068 0,113 0,085
D04 0,083 0,091 0,072 Н04 0,055 0,077 0,068
D05 0,061 0,121 0,101 Н05 0,059 0,078 0,061
D06 0,092 0,136 0,110 Н06 0,086 0,134 0,101
D07 0,074 1,168 2,393 Н07 0,060 0,110 0,090
D08 0,083 0,897 2,532 Н08 0,091 0,118 0,136
D09 0,083 0,122 0,098 Н09 0,085 0,141 0,113
D10 0,076 0,117 0,113 НЮ 0,055 0,088 0,077
D11 0,105 0,138 0,134 НИ 0,083 0,122 0,142
D12 0,081 0,095 0,114 Н12 0,060 0,099 0,083
D13 0,314 0,569 0,532 Н13 0,083 0,175 0,196
D14 0,121 0,149 0,113 Н14 0,064 0,096 0,094
D15 0,108 2,529 3,006 Н15 0,067 2,436 2,836
D16 0,080 2,655 2,872 Н16 0,080 2,461 2,873
Как видно из результатов в табл. 5, было показано, что 24 клона, A7, A8, A15, A16, B7, B8, B15, B16, C7, C8, C15, C16, D7, D8, D15, D16 E15, E16, F15, F16, G15, G16, H15 и H16 сохраняли аффинность к CD3 человека и CD3 обезьяны. Таким образом, эти 24 клона были отобраны в качестве гуманизированных анти-CD3-антител (SP34).
Пример 3. Измерение аффинности гуманизированных анти-CD3-антител к рекомбинантному CD3.
Систему Octet использовали для измерения аффинности к рекомбинантному CD3 гуманизированных анти-CD3-антител (SP34), полученных, как описано в примере 2.
В частности, раствор рекомбинантного CD3ε/δ человека или обезьяны готовили в концентрации 5 мкг/мл в 1х кинетическом буфере и использовали для обработки 96-луночного планшета из расчета 200 мкл/лунку. CD3 после обработки фиксировали на биосенсоре анти-Penta His (HIS1K, Cat # 18-5121, Fortebio).
Клоны, проявившие аффинность связывания с рекомбинантным CD3ε/δ человека или обезьяны по результатам ELISA, готовили в концентрации 50 нМ в 1х кинетическом буфере и обработку этим раствором проводили из расчета 200 мкл/лунку. 1х кинетический буфер получали разведением 10х кинетического буфера (ForteBio, Cat # 18-1092) в 10 раз PBS и использовали.
Взаимодействие между CD3ε/δ, фиксированным на биосенсоре, и антителом в концентрации 50 нМ анализировали для расчета аффинности антиген-антитело, и результаты приведены в табл. 6.
- 14 040507
Таблица 6
Ag Человеческий CD3E/D CD3E/D обезьяны Cynomolgus
Клон KD(M) kon(l/Mc) kdis(l/c) KD (Μ) kon(l/Mc) kdis(l/c)
cSP34 2.29Е-10 2.62Е+05 6.01Е-05 1.40E-10 3.78E+05 5.30E-05
А7 1.95Е-08 1.19Е+05 2.32Е-03 2.05E-08 1.53E+05 3.15E-03
В7 2.14Е-08 1.98Е+05 4.23Е-03 3.09E-08 2.08E+05 6.42E-03
С7 2.30Е-08 1.52Е+05 3.49Е-03 2.75E-08 1.94E+05 5.35E-03
D7 1.90Е-08 1.13Е+05 2.14Е-03 2.00E-08 1.43E+05 2.84E-03
А8 2.22Е-08 1.02Е+05 2.26Е-03 2.19E-08 1.47E+05 3.21E-03
В8 2.76Е-08 1.48Е+05 4.07Е-03 2.63E-08 1.99E+05 5.25E-03
С8 2.94Е-08 1.08Е+05 3.17Е-03 3.56E-08 1.66E+05 5.89E-03
D8 3.50Е-08 8.20Е+04 2.87Е-03 2.16E-08 1.23E+05 2.66E-03
А15 2.96Е-10 3.23Е+05 9.58Е-05 3.64E-10 4.53E+05 1.65E-04
В15 5.21Е-10 3.71Е+05 1.93Е-04 6.27E-10 5.23E+05 3.28E-04
С15 4.30Е-10 3.76Е+05 1.62Е-04 6.53E-10 5.25E+05 3.43E-04
D15 2.94Е-10 3.27Е+05 9.60Е-05 5.33E-10 4.37E+05 2.33E-04
Е15 1.74Е-09 2.25Е+05 3.92Е-04 1.86E-09 2.90E+05 5.40E-04
F15 1.04Е-09 1.97Е+05 2.06Е-04 1.33E-09 2.24E+05 2.97E-04
G15 1.59Е-09 2.09Е+05 3.32Е-04 1.72E-09 2.69E+05 4.61E-04
Н15 9.53Е-10 1.99Е+05 1.89Е-04 1.17E-09 2.30E+05 2.69E-04
А16 2.93Е-10 2.75Е+05 8.07Е-05 6.57E-10 3.70E+05 2.43E-04
В16 4.45Е-10 3.22Е+05 1.44Е-04 6.60E-10 4.66E+05 3.08E-04
С16 4.19Е-10 2.68Е+05 1.12Е-04 8.88E-1O 3.84E+05 3.41E-04
D16 4.46Е-10 2.40Е+05 1.07Е-04 6.11E-10 3.56E+05 2.17E-04
Е16 1.76Е-09 1.62Е+05 2.84Е-04 2.19E-09 2.20E+05 4.82E-04
F16 8.52Е-10 1.41Е+05 1.20Е-04 1.37E-09 1.85E+05 2.53E-04
G16 1.32Е-09 1.53Е+05 2.01Е-04 1.75E-09 1.95E+05 3.40E-04
Н16 8.81Е-1О 1.36Е+05 1.20Е-04 1.13E-09 1.82E+05 2.06E-04
Как видно из результатов в табл. 6, было установлено, что все клоны демонстрируют высокую аффинность к CD3ε/δ как человека, так и обезьяны; и среди них клоны A15, B15, C15, D15, A16, B16, C16 и D16 показывают наиболее высокую аффинность.
Пример 4. Измерение аффинности гуманизированных анти-CD3-антител к T-клеткам человека.
Проточную цитометрию использовали для измерения аффинности к T-клеткам человека гуманизированных анти-CD3-антител (SP34), селектированных, как описано в примере 2.
В частности, клетки H9 (ATCC® HTB-176TM) готовили с титром 2x105 клеток в 100 мкл буфера FACS (1% FBS/FACS для покрытия) на образец антитела и затем для обработки клеток использовали 1 мкг антитела. Полученную смесь выдерживали в течение 25 мин в темноте при 4°C. Затем проводили обработку 3 мл буфера FACS и центрифугирование проводили при 2000 об/мин в течение 3 мин. Затем супернатант отбрасывали.
Затем для обработки клеток использовали 100 мкл буфера FACS, содержащего 1 мкг человеческого IgG-антитела, конъюгированного с фикоэритрином (PE), и полученную смесь выдерживали в течение 25 мин в темноте при 4°C. Затем проводили обработку 3 мл буфера FACS и центрифугирование проводили при 2000 об/мин в течение 3 мин. Затем супернатант отбрасывали.
Клетки обрабатывали 4% раствором формальдегида, выдерживали в темноте при 4°C в течение 30 мин и затем обрабатывали 3 мл буфера FACS. Центрифугирование проводили при 2000 об/мин в течение 3 мин и затем супернатант отбрасывали. Проводили обработку 350 мкл буфера FACS и использовали проточный цитометр для анализа аффинности антител к T-клеткам человека. Результаты анализа приведены на фиг. 1.
Как показано на фиг. 1, было установлено, что все антитела, которые связывались с рекомбинантным CD3ε/δ человека, также специфически связывались с T-клетками человека.
Пример 5. Измерение аффинности гуманизированных анти-CD3-антител к T-клеткам обезьяны.
Проточную цитометрию использовали для измерения аффинности к T-клеткам обезьяны гуманизированных анти-CD3-антител (SP34), селектированных, как описано в примере 2.
В частности, спленоциты обезьяны готовили из расчета 10 клеток в 100 мкл раствора FACS на образец антитела и затем для обработки клеток использовали 1 мкг антитела. Полученную смесь выдержи-

Claims (14)

  1. вали в течение 25 мин в темноте при 4°C. Затем проводили обработку 3 мл буфера FACS и центрифугирование проводили при 2000 об/мин в течение 3 мин. Затем супернатант отбрасывали.
    Затем для обработки клеток использовали 100 мкл буфера FACS, содержащего 1 мкг РЕ-конъюгированного человеческого IgG-антитела и полученную смесь выдерживали в течение 25 мин в темноте при 4°C. Затем проводили обработку 3 мл буфера FACS и центрифугирование проводили при 2000 об/мин в течение 3 мин. Затем супернатант отбрасывали.
    Клетки обрабатывали FITC-конъюгированным анти-CD20-антителом, PE-Cy5-конъюгированным анти-CD14, антителом 7-AAD, APC-Cy7-конъюгированным анти-CD16-антителом или V450конъюгированным анти-CD45-антителом, и полученные смеси выдерживали в течение 25 мин в темноте при 4°C. Затем проводили обработку 3 мл буфера FACS и центрифугирование проводили при 2000 об/мин в течение 3 мин. Затем супернатант отбрасывали.
    Клетки обрабатывали 4% раствором формальдегида, выдерживали в темноте при 4°C в течение 30 мин и затем обрабатывали 3 мл буфера FACS. Центрифугирование проводили при 2000 об/мин в течение 3 мин и затем супернатант отбрасывали. Проводили обработку 350 мкл буфера FACS и использовали проточный цитометр для анализа аффинности антител к T-клеткам обезьяны. Результаты анализа приведены на фиг. 2.
    Как показано на фиг. 2, было установлено, что все антитела, которые связывались с рекомбинантным CD3ε/δ обезьяны, также специфически связывались с T-клетками обезьяны.
    Несмотря на то, что варианты осуществления были описаны с помощью ограниченного числа примеров и фигур, приведенных выше, специалистам в данной области техники будет очевидно, что можно сделать различные изменения и модификации без отклонения от сущности и объема изобретения. Например, желаемых результатов можно достичь даже в случае, когда описанные методики выполняются в другом порядке, чем описанный способ, и/или описанные компоненты составлены или объединены в форме, отличной от описанного способа, или заменены или замещены другими компонентами или эквивалентами.
    Следовательно, другие выполнения, другие варианты осуществления и эквиваленты прилагаемой формулы изобретения попадают в объем прилагаемой формулы изобретения.
    ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ
    1. Антитело, специфически связывающееся с кластером дифференциации 3 (CD3), где антитело содержит вариабельную область легкой цепи (VL-область), состоящую из последовательности, обладающей по меньшей мере 80% идентичностью с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 7, 8, 15 или 16; и вариабельную область тяжелой цепи (VH-область), состоящую из последовательности, обладающей по меньшей мере 80% идентичностью с аминокислотной последовательностью любой из SEQ ID NO: 18-25.
  2. 2. Антитело по п.1, где CD3 включает CD3, происходящий от человека, и CD3, происходящий от обезьяны.
  3. 3. Антитело по п.1, в котором антитело специфически связывается с T-клетками.
  4. 4. Антитело по п.3, где T-клетки включают T-клетки человека и T-клетки обезьяны.
  5. 5. Антитело по п.1, где антитело представляет гуманизированное антитело.
  6. 6. Полинуклеотид, который кодирует вариабельную область легкой цепи (VL-область) и вариабельную область тяжелой цепи (VH-область) антитела по п.1.
  7. 7. Вектор экспрессии, содержащий полинуклеотид по п.6.
  8. 8. Клетка-хозяин, трансформированная вектором экспрессии по п.7.
  9. 9. Способ получения антитела, которое специфически связывается с CD3, включающий культивирование клетки-хозяина по п.8.
  10. 10. Фармацевтическая композиция для профилактики или лечения онкологического заболевания, отличающаяся тем, что содержит антитело по п. 1 или его антигенсвязывающий фрагмент.
  11. 11. Фармацевтическая композиция по п.10, где рак представляет рак поджелудочной железы, рак печени, рак желудка, рак легкого, колоректальный рак, рак прямой кишки, рак щитовидной железы, рак пищевода, рак почки, рак мочевого пузыря, рак предстательной железы, рак шейки матки, рак молочной железы, рак крови, рак кожи, эпителиальный рак, рак головного мозга, рак центральной нервной системы или рак яичника.
  12. 12. Применение антитела по п.1 для профилактики или лечения онкологического заболевания.
  13. 13. Применение антитела по п.1 для производства лекарственного средства для профилактики или лечения онкологического заболевания.
  14. 14. Способ профилактики или лечения онкологического заболевания, включающий введение антитела по п.1 индивидууму.
    -
EA202090944 2017-10-20 2018-10-22 Анти-cd3-антитело и фармацевтическая композиция для лечения онкологических заболеваний, содержащая его EA040507B1 (ru)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
KR10-2017-0136564 2017-10-20

Publications (1)

Publication Number Publication Date
EA040507B1 true EA040507B1 (ru) 2022-06-14

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP6010241B2 (ja) Dll3モジュレーター及び使用方法
JP6401060B2 (ja) 抗sez6抗体及び使用方法
US20230192851A1 (en) Anti-cd3 antibody and pharmaceutical composition for cancer treatment comprising same
KR20140018837A (ko) 노텀 단백질 조절 인자 및 사용 방법
JP2016538318A (ja) 新規sez6モジュレーターおよび使用方法
US11401343B2 (en) Anti-MSLN antibody and pharmaceutical composition for cancer treatment comprising same
EA040507B1 (ru) Анти-cd3-антитело и фармацевтическая композиция для лечения онкологических заболеваний, содержащая его
CN113166264B (zh) 一种分离的抗原结合蛋白及其用途
CN113164601B (zh) 一种分离的抗原结合蛋白及其用途
EA043079B1 (ru) Анти-msln-антитело и фармацевтическая композиция для лечения онкологических заболеваний, содержащая его
JP2024508304A (ja) Claudin-6に対する抗体およびそれの使用
CN117597362A (zh) 抗紧密连接蛋白-6的抗体及其用途