EA039776B1 - Новые белки, полученные из альфа-1-микроглобулина, и их применение - Google Patents

Новые белки, полученные из альфа-1-микроглобулина, и их применение Download PDF

Info

Publication number
EA039776B1
EA039776B1 EA201892085A EA201892085A EA039776B1 EA 039776 B1 EA039776 B1 EA 039776B1 EA 201892085 A EA201892085 A EA 201892085A EA 201892085 A EA201892085 A EA 201892085A EA 039776 B1 EA039776 B1 EA 039776B1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
absent
asp
seq
met
lys
Prior art date
Application number
EA201892085A
Other languages
English (en)
Other versions
EA201892085A1 (ru
Inventor
Лена Вестер Розенлёф
Аннели Эдстрем Хегервалль
Бо Окерстрем
Original Assignee
Гард Терапьютикс Интернэшнл Айби
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Гард Терапьютикс Интернэшнл Айби filed Critical Гард Терапьютикс Интернэшнл Айби
Publication of EA201892085A1 publication Critical patent/EA201892085A1/ru
Publication of EA039776B1 publication Critical patent/EA039776B1/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/46Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
    • C07K14/47Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
    • C07K14/4701Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
    • C07K14/4717Plasma globulins, lactoglobulin
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P13/00Drugs for disorders of the urinary system
    • A61P13/12Drugs for disorders of the urinary system of the kidneys
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02ATECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A50/00TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
    • Y02A50/30Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)

Abstract

Данное изобретение относится к белку, полученному из альфа-1-микроглобулина, для применения в медицине.

Description

Настоящее изобретение относится к модифицированным вариантам белка α-1-микроглобулина человека с улучшенными свойствами и применению таких вариантов в лечении и диагностике в медицине. Заявители изобретения неожиданно обнаружили, что интродукция определенных аминокислотных замен и/или добавление определенных N-концевых удлинений обеспечивают улучшенные свойства альфа-1микроглобулина в отношении стабильности, растворимости и связывания тема.
Уровень техники
A1M (α-1-микроглобулин) представляет собой низкомолекулярный белок с фильтрующей функцией для внеклеточной ткани (Ekstrom et al., 1977; Akerstrom and Gram, 2014). Он присутствует во всех тканях и органах у рыб, птиц, грызунов, млекопитающих и других позвоночных. A1M в основном синтезируется в печени, но также на более низком уровне в большинстве других клеток в организме. Он кодируется геном предшественника а1-микроглобулин-бикунина (АМВР) и транслируется во всех клетках и у всех видов как постоянный пептидный предшественник вместе с другим белком, бикунином (Kaumeyer et al., 1986). Однако два белка разделяются расщеплением протеазой, процессируются и секретируются в кровь в виде двух разных белков с различными функциями (Lindqvist et al., 1992; Bratt et al., 1993). Причина повсеместного совместного синтеза A1M и бикунина пока неизвестна. В крови примерно 50% A1M находится в свободной мономерной форме, а остальные 50% в виде высокомолекулярных комплексов, ковалентно связанных с иммуноглобулином А, альбумином и протромбином (Berggard et al., 1997).
A1M является однодоменным, гликозилированным белком из 183 аминокислот. Недавно была опубликована кристаллическая структура большого фрагмента A1M, экспрессированного в E.coli (Meining and Skerra, 2012). На основании его структуры A1M относится к белкам семейства липокалинов, которое включает 50 и более членов животного, растительного и бактериального происхождения (Flower, 1996; Akerstrom et al., 2006). Липокалины имеют общую трехмерную структуру, состоящую из восьми антипараллельных β-тяжей, образующих бочонок с одним закрытым концом (внизу) и открытым концом (вверху). Бочонок функционирует в качестве кармана для гидрофобных лигандов у большинства липокалинов. Четыре петли (петля 1-4), которые составляют внешнюю оболочку открытого конца бочонка, очень резко различаются по длине и составу между различными липокалинами. Было показано, что в A1M небольшое количество боковых групп аминокислот, расположенных в этих петлях или на внутренней стороне кармана, имеет важное значение для проявления установленных функций белка. Таким образом, свободный цистеин С34, расположенный в короткой спирали в петле 1, обладает отрицательным редокс-потенциалом и обеспечивает редуктазные свойства A1M (Allhorn et al., 2005). Было показано, что два остатка тирозина, Y22 и 132, ковалентно модифицируются продуктами свободнорадикального окисления in vitro (Akerstrom et al., 2007). Четыре лизиновых остатка, K69, 92, 118 и 130, регулируют редуктазную активность (Allhorn et al., 2005), оказывают влияние на связывание свободных групп гема (Rutardottir et al., 2015) и ковалентно модифицируются в A1M, выделенном из мочи и амниотической жидкости человека низкомолекулярными желто-коричневыми гетерогенными веществами (Berggard et al., 1999; Sala et al., 2004).
За счет редуктазной активности, способности гасить радикалы и связывания гема, A1M функционирует в качестве антиоксиданта, который защищает клетки и ткани от окислительного повреждения. Показано, что A1M защищает in vitro культуры клеток крови, ткань плаценты и кожи от окислительного повреждения, вызванного гемоглобином, гемом и активными формами кислорода (ROS) (Olsson et al., 2008; May et al., 2011; Olsson et al., PloS One, 2011, Olsson et al., ARS 2012). A1M также показал протективные эффекты in vivo у крыс и кроликов от повреждения плаценты и почек после инфузии гемоглобина (Sverrison et al., 2014; Naav et al., 2015). В серии сообщений было показано, что гемоглобин и окислительный стресс вовлечены в патогенез преэклампсии, серьезного осложнения при беременности (Centlow et al., 2008; Hansson et al., 2013), и уровни мРНК и белка A1M в печени, плаценте и плазме повышены у беременных женщин с преэклампсией (Olsson et al., 2010; Anderson et al., 2011). Следовательно, было высказано предположение, что A1M можно использовать в качестве терапевтического агента для лечения беременных женщин с преэклампсией в целях ослабления окислительного повреждения и, следовательно, клинических симптомов заболевания (Olsson et al., 2010).
Разработан способ получения рекомбинантного человеческого A1M в E.coli, и было показано, что он обладает редуктазными, связывающими радикалы и связывающими гем свойствами (Kwasek et al., Allhorn et al., 2002, 2005; Akerstrom et al., 2007). Действительно, данный рекомбинантный вариант A1M показал терапевтические эффекты in vivo на модели преэклампсии на овцах (Wester-Rosenlof et al., 2014). Однако, несмотря на то, что он является функциональным, в экспрессированном в E.coli рекомбинантном A1M отсутствует гликозилирование, и он обладает низкой растворимостью и стабильностью по сравнению с человеческим A1M, выделенным из мочи или плазмы. Отсутствие стабильности и растворимости белка ограничивает его применение в качестве лекарственного средства для использования человеку, главным образом, за счет трудностей с получением высококонцентрированных растворов и обеспечением длительного хранения в буферах в условиях физиологических значений рН и концентрации солей.
- 1 039776
Следовательно, существует потребность в разработке белка со структурным сходством с человеческим A1M, но с улучшенными свойствами в отношение стабильности и растворимости. Более того, необходимо, чтобы белок было относительно легко получать в количествах, подходящих для терапевтического применения.
Подробное описание изобретения
Настоящее изобретение относится к новым белкам альфа-1-микроглобулина с улучшенными профилями стабильности и растворимости.
Сайт-направленный и аддитивный мутагенез использовали для получения генно-инженерных видов A1M с сохраненными или, возможно, более высокими функциональными свойствами, но с улучшенной стабильностью и растворимостью белка, которые обеспечивают длительное хранение при высоких концентрациях в физиологических буферах.
Как следует из приведенных здесь примеров, следовали четырем направлениям обоснования при выборе положений и идентичностей мутантных аминокислотных боковых групп.
1) Экспрессировали гомологи животных разных видов с различной предполагаемой экологической нагрузкой с точки зрения окислительного стресса, температуры, давления кислорода (N=12).
2) Вводили единичные аминокислотные замены, которые часто встречаются среди 56 секвенированных гомологов A1M в положениях, расположенных в петлях 1-4 или внутренней поверхности гидрофобного кармана, в конструкцию человеческого гена и экспрессировали варианты (N=3).
3) Добавляли или удаляли благоприятно расположенные остатки лизина или тирозина на основе гипотезы о том, что они могут оказывать влияние на pKa тиолила С35 (Allhorn et al., 2005) или служить в качестве сайтов захвата свободных радикалов (Berggard et al., 1999; Sala et al., 2004; Akerstrom et al., 2007) (N=5).
4) Кроме того, исследовали влияние N-концевых, заряженных и гидрофильных удлинений в некоторых вариантах A1M. Обоснованием для конструирования тестируемых N-концевых удлинений было добавление 1) метки для очистки (например, His-метки), 2) линкера для отделения метки от белкового кора A1M, 3) нескольких (1-5) заряженных аминокислотных боковых групп, обеспечивающих гидрофильные свойства белка, для достижения максимальной стабильности и растворения в водных растворах, 4) без нарушения физиологических функций A1M.
Проект разделяли на три основных фазы.
Фаза I) экспрессия 27 вариантов A1M, описанных выше, с последующим анализом растворимости, стабильности и функции.
Фаза II) конструирование, экспрессия и анализ нескольких вариантов A1M с предполагаемыми оптимальными свойствами на основе результата фазы 1.
Фаза III) конструирование, экспрессия и анализ немутантного A1M дикого типа (wt) и наиболее успешного мутантного варианта A1M, имеющего N-концевые, заряженные и гидрофильные удлинения или без них.
Как здесь будет пояснено более подробно, настоящее изобретение относится к белку, полученному из A1M, имеющему аминокислотную последовательность формулы I:
X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9-X10-X11-X12-X13-X14-GPVPTPPDN IQVQENFX15-IS
RIYGKWYNLA IGSTCPWLKK I-X16-DRMTVSTL VLGEGATEAE ISMTST-X17WRK GVCEETSGAY EKTDTDGKFL YHKSKW-X18-ITM ESYWHTNYD EYAIFLTKKF SRHHGPTITA KLYGRAPQLR ETLLQDFRW AQGVGIPEDS IFTMADRGEC VPGEQEPEPI LIPR (формула I) где присутствует по меньшей мере один X и (в пояснении приведены предложения для дополнительных замен) и
X1 отсутствует или представляет Met или N-формил-Met;
X2 отсутствует или представляет His;
X3 отсутствует или представляет His;
X4 отсутствует или представляет His;
X5 отсутствует или представляет His;
X6 отсутствует или представляет His;
X7 отсутствует или представляет His;
X8 отсутствует или представляет His;
X9 отсутствует или представляет His;
X10 отсутствует или выбран из Asp и Glu, Lys и Arg;
X11 отсутствует или выбран из Asp и Glu, Lys и Arg;
X12 отсутствует или выбран из Asp и Glu, Lys и Arg;
X13 отсутствует или выбран из Asp и Glu, Lys и Arg;
X14 отсутствует или представляет Lys или Glu, Asp или Arg или Met или N-формил-Met ;
- 2 039776
X15 представляет Asp или Asn или Glu;
X16 представляет Met или Lys или Arg;
X17 представляет Arg или His или Lys;
X18 представляет Asp или Asn или Glu;
или его фармацевтически приемлемой соли, при условии, что, когда все Х1-Х14 отсутствуют, то X15 представляет Asn, X16 представляет Met и X17 представляет Arg, то тогда X18 не может быть Asn.
Изобретение также обеспечивает производное A1M, т.е. Х114-А1М, где A1M может быть любым A1M, полученным из видов, указанных в табл. 2 (т.е. человека, мыши, голого землекопа, лягушки, цыпленка, кролика, беличьей обезьяны, моржа, ламантина, камбалы и орангутанга). Заявители настоящего изобретения обнаружили, что включение Х1-Х14 придает улучшенные свойства, по меньшей мере, человеческому A1M, и соответственно предполагается, что эта исходная последовательность также может придавать важные улучшенные свойства для A1M из других видов или рекомбинантному с видовой специфичностью A1M.
Настоящее изобретение также обеспечивает белок, полученный из A1M, имеющий аминокислотную последовательность формулы II:
Х^Х^ХЗ-Х^Х^Хб-Х^Х^Х^Х^-Х^-Х^-Х^-Х^-СРУРТРРОЫ IQVQENFX15-IS RIYGKWYNLA IGSTCPWLKK I-X16-DRMTVSTL VLGEGATEAE ISMTST-X17WRK GVCEETSGAY EKTDTDGKFL YHKSKW-X18-ITM ESYWHTNYD EYAIFLTKKF
SRHHGPTITA KLYGRAPQLR ETLLQDFRW AQGVGIPEDS IFTMADRGEC
VPGEQEPEPI (формула II) где присутствует по меньшей мере один X и (в пояснении приведены предложения для дополнительных замен) и
X1 отсутствует или представляет Met или N-формил-Met ;
X2 отсутствует или представляет His;
X3 отсутствует или представляет His;
X4 отсутствует или представляет His;
X5 отсутствует или представляет His;
X6 отсутствует или представляет His;
X7 отсутствует или представляет His;
X8 отсутствует или представляет His;
X9 отсутствует или представляет His;
X10 отсутствует или выбран из Asp и Glu, Lys и Arg;
X11 отсутствует или выбран из Asp и Glu, Lys и Arg;
X12 отсутствует или выбран из Asp и Glu, Lys и Arg;
X13 отсутствует или выбран из Asp и Glu, Lys и Arg;
X14 отсутствует или представляет Lys или Glu, Asp или Arg или Met или N-формил-Met;
X15 представляет Asp или Asn или Glu;
X16 представляет Met или Lys или Arg;
X17 представляет Arg или His или Lys;
X18 представляет Asp или Asn или Glu;
или его фармацевтически приемлемую соль, при условии, что, когда все Х1-Х14 отсутствуют, X15 представляет Asn, X16 представляет Met и X17 представляет Arg, то тогда X18 не может быть Asn.
Изобретение также обеспечивает производное A1M, т.е. Х114-А1М, где A1M может быть любым A1M, полученным из видов, указанных в табл. 2 (т.е. человека, мыши, голого землекопа, лягушки, курицы, кролика, беличьей обезьяны, моржа, ламантина, камбалы и орангутанга), где A1M усечен на С-конце таким образом, что последовательность С-концевого тетрапептида LIPR не является частью белка.
Как следует из приведенных здесь примеров, заявители настоящего изобретения обнаружили, что
i) исходная последовательность Х1-Х14, по-видимому, придает улучшенные свойства AIM;
ii) точечная мутация M41K, R66H или N17,96D молекулы A1M придает повышенную стабильность с сохраненной функцией A1M;
iii) мутации (M41K+R66H), (M41K+N17,96D), (R66H+N17,96D) и/или (M41K+R66H+N17,96D) придают повышенную растворимость и/или стабильность с сохраненной функцией;
iv) мутация (R66H+N17,96D) обеспечивала наилучшую общую фунциональную активность в проведенных экспериментах;
v) тестировали A1M с мутациями (R66H+N17,96D) и исходные последовательности
MHHHHHHHHGGGGGGEGEG (M8H5GIEGR),
MHHHHHHHDDDDK (M8H4DK),
- 3 039776
MHHHHHDDDDK (M6H4DK) или
МНННННННН (М8Н) в виде N-концевых последовательностей, и варианты белка с мутацией M8H4DK в виде N-концевой последовательности показали более высокую растворимость и/или стабильность по сравнению с другими
N-концевыми удлинениями;
vi) усечение С-конца A1M, по-видимому, способствует улучшению связывания и деградации гема.
Интересно отметить, что последовательность данного N-концевого удлинения напоминает Hisметку с сайтом расщепления энтерокиназой, но она не обладает способностью отщеплять His-метку из A1M, поскольку не включена аминокислота Ala. Наличие Ala в DDDKA указывает на сайт расщепления энтерокиназой. Таким образом, предполагается, что сама N-концевая последовательность придает A1M улучшенные свойства в отношение стабильности и растворимости белка, когда за повторами Hisостатков следуют пять заряженных аминокислот.
Исходя из этих наблюдений, предполагается, что изменение белка A1M согласно указанным выше направлениям обеспечивает белки с функциональными свойствами A1M, но с улучшенными характеристиками относительно стабильности и/или растворимости.
Таким образом, настоящее изобретение относится ко всем возможным комбинациям A1M, содержащим Х1-Х18, как описано выше.
Более конкретно, следующие белки, полученные из A1M, входят в объем настоящего изобретения, при этом все белки могут быть полноразмерными, соответствующими человеческому A1M дикого типа; или могут быть усечены на С-конце, т.е. без LIPR.
Метка Положение в hAlM Мутации Соединен ие XI X2 ХЗ X4
1 Met/Отсутств His/Отсутствуе His/Отсутстве His/Отсутстве
Максимально широкое требование ует T т T
6-His 'в последовательности' могут быть любыми мутации 2 (f) Met His His His
8-His 'в последовательности' могут быть любыми мутации 3 (f) Met His His His
Без метки; 'в последовательности' могут быть любыми мутации 4 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Любая метка М41К 5 Met/отсутств ет His/отсутствет His/отсутстве т His/отсутстве T
Любая метка N17,96D 6 Met/отсутств ет His/отсутствет His/отсутстве т His/отсутстве T
Без метки N17D 7 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки N17,96D 8 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки N96D 9 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки N17,96D, R66H 10 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки М41К 11 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки R66H 12 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки N17,96D, M41K, R66H 13 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки N17D, R66H 14 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки R66H, N96D 15 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки M41K, R66H 16 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки N17,96D, M41K 17 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки N17D, M41K 18 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки M41K, N96D 19 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Любая 20 Met/Отсутств His/Отсутствуе His/Отсутству His/Отсутству
метка N17,96D, R66H ует т ет ет
Без метки N17D, M41K, R66H 21 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки M41K, R66H, N96D 22 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
6His N17D 23 (f) Met His His His
6His N17,96D 24 (f)Met His His His
6His N96D 25 (f)Met His His His
6His N17,96D, R66H 26 (f) Met His His His
- 4 039776
Метка Положение в hAlM Мутации Соединен ие XI X2 X3 X4
6His M41K 27 (f) Met His His His
6His R66H 28 (f) Met His His His
6His N17,96D, M41K, R66H 29 (f) Met His His His
6His N17D, R66H 30 (f) Met His His His
6His R66H, N96D 31 (f) Met His His His
6His M41K, R66H 32 (f) Met His His His
6His N17,96D, M41K 33 (f) Met His His His
6His N17D, M41K 34 (f) Met His His His
6His M41K, N96D 35 (f) Met His His His
6His N17D, M41K, R66H 36 (f) Met His His His
6His M41K, R66H, N96D 37 (f) Met His His His
8His N17D 38 (f) Met His His His
8His N17,96D 39 (f) Met His His His
8His N96D 40 (f) Met His His His
8His N17,96D, R66H 41 (f) Met His His His
8His M41K 42 (f) Met His His His
8His R66H 43 (f) Met His His His
8His N17,96D, M41K, R66H 44 (f) Met His His His
8His N17D, R66H 45 (f) Met His His His
8His R66H, N96D 46 (f) Met His His His
8His M41K, R66H 47 (f) Met His His His
8His N17,96D, M41K 48 (f) Met His His His
8His N17D, M41K 49 (f) Met His His His
8His M41K, N96D 50 (f) Met His His His
8His N17D, M41K, R66H 51 (f) Met His His His
8His M41K, R66H, N96D Соедин Положение в HAIM ение (предо 52 (f)Met N-концевая 'метка' His His His
Метка лжение Х5 Мутации ) Х6 X7 X8 X9 X10
Максимально широкое g His/Отсутств His/Отсутств His/Отсутст His/Отсутст His/Отсутст Азр/Отсутствуе
требование ует ует вует вует вует τ/Glu/Lys/Arg
' в последовательности 2 His His His Отсутствует Отсутствует Asp
мутации могут быть б-His любыми в последовательности мутации могут быть 8-His любыми в последовательности 3 4 His Отсутствует His Отсутствует His Отсутствует His Отсутствует His Отсутствует Asp Отсутствует
Без мутации могут быть метки; любыми Любая метка М41К 5 His/Отсутств ует His/Отсутств ует His /Отсутст вует His/Отсутст вует His/Отсутст вует Asp/Отсутствуе τ/Glu/Lys/Arg
Любая метка N17,96D 6 His/Отсутств ует His/Отсутств ует His/Отсутст вует His/Отсутст вует His/Отсутст вует Asp/Отсутствуе τ/Glu/Lys/Arg
Без метки N17D 7 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки N17,96D 8 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки N96D 9 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки N17,96D, R66H 10 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки М41К 11 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки R66H 12 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки N17,96D, М41К, R66H 13 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки N17D, R66H 14 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без R66H, N96D 15 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
метки
Без метки М41К, R66H 16 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки N17,96D, М41К 17 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки N17D, М41К 18 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки М41К, N96D 19 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Любая метка N17,96D, R66H 20 His/Отсутств ует His/Отсутств ует His/Отсутст вует His/Отсутст вует His/Отсутст вует Asp/Отсутствуе τ/Glu/Lys/Arg
Без метки N17D, М41К, R66H 21 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки М41К, R66H, N96D 22 Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует Отсутствует
6His N17D 23 His His His Отсутствует Отсутствует Asp
6His N17,96D 24 His His His Отсутствует Отсутствует Asp
6His N96D 25 His His His Отсутствует Отсутствует Asp
6His N17,96D, R66H 26 His His His Отсутствует Отсутствует Asp
- 5 039776
Соединены
Положение в hAlM e N-концевая 'метка'
(продолже X5 X6 X7 X8 X9 X10
Метка Мутации ние)
6His M41K 27 His His His Отсутству ет Отсутствуе T Asp
6His R66H 28 His His His Отсутству ет Отсутствуе T Asp
6His N17,96D, M41K, R66H 29 His His His Отсутству ет Отсутствуе T Asp
30 His His His Отсутству Отсутствуе Asp
6His N17D, R66H ет T
6His R66H, N96D 31 His His His Отсутству ет Отсутствуе T Asp
6His M41K, R66H 32 His His His Отсутству ет Отсутствуе T Asp
6His N17,96D, M41K 33 His His His Отсутству ет Отсутствуе T Asp
6His N17D, M41K 34 His His His Отсутству ет Отсутствуе T Asp
35 Hi s Отсутству Отсутствуе Asp
6His M41K, N96D ет T
6His N17D, M41K, R66H 36 His His His Отсутству ет Отсутствуе T Asp
37 His His His Отсутству Отсутствуе Asp
6His M41K, R66H, N96D ет T
8His N17D 38 His His His His His Asp
8His N17,96D 39 His His His His His Asp
8His N96D 40 His His His His His Asp
8His N17,96D, R66H 41 His His His His His Asp
8His M41K 42 His His His His His Asp
8His R66H 43 His His His His His Asp
8His N17,96D, M41K, R66H 44 His His His His His Asp
8His N17D, R66H 45 His His His His His Asp
8His R66H, N96D 46 His His His His His Asp
8His M41K, R66H 47 His His His His His Asp
8His N17,96D, M41K 48 His His His His His Asp
8His N17D, M41K 49 His His His His His Asp
8His M41K, N96D 50 His His His His His Asp
8His N17D, M41K, R66H 51 His His His His His Asp
8His M41K, R66H, N96D 52 His His His His His Asp
Соединены
Положение в НА1М е (продолже
Метка Мутации ние)
Максимально широкое требование 1 Asp/Отсутствует/GI u/Lys/Arg Asp/Отсутствует/Glu /Lys/Arg Asp/Отсутствует/Glu/Lys/ Arg
'в последовательности мутации б-His могут быть любыми 2 Asp Asp Asp
в последовательности мутации
8-His могут быть любыми Asp Asp Asp
Без в последовательности мутации 4 Отсутствует Отсутствует Отсутствует
метки; могут быть любыми
Любая Asp/Отсутствует/GI Asp/Отсутствует/Glu Asp/Отсутствует/Glu/Lys/
метка М41К u/Lys/Arg /Lys/Arg Arg
Любая Азр/Отсутствует/Gl Asp/Отсутствует/Glu Asp/Отсутствует/Glu/Lys/
метка N17,96D u/Lys/Arg /Lys/Arg Arg
Без метки N17D 7 Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки N17,96D 8 Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без g Отсутствует Отсутствует Отсутствует
метки N96D
Без метки N17,96D, R66H 10 Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки М41К 11 Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки R66H 12 Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки N17,96D, М41К, R66H 13 Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки N17D, R66H 14 Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки R66H, N96D 15 Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки М41К, R66H 16 Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки N17,96D, М41К 17 Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки N17D, М41К 18 Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки М41К, N96D 19 Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Любая 20 Asp/Отсутствует/G1 Asp/Отсутствует/Glu Asp/Отсутствует/Glu/Lys/
метка N17,96D, R66H u/Lys/Arg /Lys/Arg Arg
Без метки N17D, М41К, R66H 21 Отсутствует Отсутствует Отсутствует
Без метки М41К, R66H, N96D 22 Отсутствует Отсутствует Отсутствует
6His N17D 23 Asp Asp Asp
6His N17,96D 24 Asp Asp Asp
6His N96D 25 Asp Asp Asp
6His N17,96D, R66H 26 Asp Asp Asp
- 6 —
Метка Положение в hAlM Мутации Соединение (продолжение) XII X12 X13
6His M41K 27 Asp Asp Asp
6His R66H 28 Asp Asp Asp
6His N17,96D, M41K, R66H 29 Asp Asp Asp
6His N17D, R66H 30 Asp Asp Asp
6His R66H, N96D 31 Asp Asp Asp
6His M41K, R66H 32 Asp Asp Asp
6His N17,96D, M41K 33 Asp Asp Asp
6His N17D, M41K 34 Asp Asp Asp
6His M41K, N96D 35 Asp Asp Asp
6His N17D, M41K, R66H 36 Asp Asp Asp
6His M41K, R66H, N96D 37 Asp Asp Asp
8His N17D 38 Asp Asp Asp
8His N17,96D 39 Asp Asp Asp
8His N96D 40 Asp Asp Asp
8His N17,96D, R66H 41 Asp Asp Asp
8His M41K 42 Asp Asp Asp
8His R66H 43 Asp Asp Asp
8His N17,96D, M41K, R66H 44 Asp Asp Asp
8His N17D, R66H 45 Asp Asp Asp
8His R66H, N96D 46 Asp Asp Asp
8His M41K, R66H 47 Asp Asp Asp
8His N17,96D, M41K 48 Asp Asp Asp
8His N17D, M41K 49 Asp Asp Asp
8His M41K, N96D 50 Asp Asp Asp
8His N17D, M41K, R66H 51 Asp Asp Asp
M41K, R66H, N96D
8His 52 Asp Asp Asp
Положение в ПА1М Соединение Метка'/первая AA 17 41 66 96
(продолжени X14 X15 X16 X17 X18
Метка Мутации е)
Максимально 6-His 8-His Без метки; Любая метка Любая метка широкое требование 'в последовательности мутации могут быть любыми в последовательности мутации могут быть любыми в последовательности мутации могут быть любыми М41К N17,96D 1 2 3 4 5 6 Lys/(f)Met/Отсутствует/С lu/Asp/Arg Lys Lys Отсутствует Lys/(f)Met/Отсутствует/С lu/Asp/Arg Lys/(f)Met/Отсутствует Glu/Asp/Arg Asp/Asn Asp/Asn Asp/Asn Asp/Asn Asn Asp Met/Lys/ Arg Met/Lys/ Arg Met/Lys/ Arg Met/Lys/ Arg Lys Met Arg/His/ Lys Arg/His/ Lys Arg/His/ Lys Arg/His/ Lys Arg Arg Asp/A sn Asp/A sn Asp/A sn Asp/A sn Asn Asp
Без метки N17D 7 (f) Met Asp Met Arg Asn
Без метки N17,96D 8 (f) Met Asp Met Arg Asp
Без метки N96D 9 (f)Met Asn Met Arg Asp
Без метки N17,96D, R66H 10 (f)Met Asp Met His Asp
Без метки М41К 11 (f) Met Asn Lys Arg Asn
Без метки R66H 12 (f)Met Asp Met His Asn
Без метки N17,96D, M41K, R66H 13 (f) Met Asp Lys His Asp
Без метки N17D, R66H 14 (f) Met Asp Met His Asn
Без метки R66H, N96D 15 (f) Met Asn Met His Asp
Без метки M41K, R66H 16 (f) Met Asn Lys His Asn
Без метки N17,96D, M41K 17 (f) Met Asp Lys Arg Asp
Без метки N17D, M41K 18 (f) Met Asp Lys Arg Asn
Без метки Любая метка M41K, N96D N17,96D, R66H 19 20 (f)Met Lys/(f)Met/Отсутствует Glu/Asp/Arg Asn Asp Lys Met Arg His Asp Asp
Без метки N17D, M41K, R66H 21 (f)Met Asp Lys His Asn
Без метки M41K, R66H, N96D 22 (f)Met Asn Lys His Asp
6His N17D 23 Lys Asp Met Arg Asn
6His N17,96D 24 Lys Asp Met Arg Asp
6His N96D 25 Lys Asn Met Arg Asp
6His N17,96D, R66H 26 Lys Asp Met His Asp
- 7 039776
Метка Положение в hAlM Мутации Соединение (продолжени e) Метка'/первая AA Χ14 17 X15 41 X16 66 X17 96 X18
6His M41K 27 Lys Asn Lys Arg Asn
6His R66H 28 Lys Asn Met His Asn
6His N17,96D, M41K, R66H 29 Lys Asp Lys His Asp
6His N17D, R66H 30 Lys Asp Met His Asn
6His R66H, N96D 31 Lys Asn Met His Asp
6His M41K, R66H 32 Lys Asn Lys His Asn
6His N17,96D, M41K 33 Lys Asp Lys Arg Asp
6His N17D, M41K 34 Lys Asp Lys Arg Asn
6His M41K, N96D 35 Lys Asn Lys Arg Asp
6His N17D, M41K, R66H 36 Lys Asp Lys His Asn
6His M41K, R66H, N96D 37 Lys Asn Lys His Asp
8His N17D 38 Lys Asp Met Arg Asn
8His N17,96D 39 Lys Asp Met Arg Asp
8His N96D 40 Lys Asn Met Arg Asp
8His N17,96D, R66H 41 Lys Asp Met His Asp
8His M41K 42 Lys Asn Lys Arg Asn
8His R66H 43 Lys Asn Met His Asn
8His N17,96D, M41K, R66H 44 Lys Asp Lys His Asp
8His N17D, R66H 45 Lys Asp Met His Asn
8His R66H, N96D 46 Lys Asn Met His Asp
8His M41K, R66H 47 Lys Asn Lys His Asn
8His N17,96D, M41K 48 Lys Asp Lys Arg Asp
8His N17D, M41K 49 Lys Asp Lys Arg Asn
8His M41K, N96D 50 Lys Asn Lys Arg Asp
8His N17D, M41K, R66H 51 Lys Asp Lys His Asn
8His M41K, R66H, N96D 52 Lys Asn Lys His Asp
сиедипепи .. w π Комментарии
Положение в hAlM е (продолже
Метка Mutations ние)
Максимально широкое требование 1 П₽И когда все X1-X14 отсутствуют, Х15 представляет Asn, Х16 и условии. представляют Arg, то тогда Х18 не может быть Asn
'в последовательности
мутации могут быть 2
6-His любыми в последовательности мутации могут быть 3
8-His любыми
в последовательности При условии· КОГДа представляет Asn, Х16 представляет Met,
Без метки; мутации могут быть любыми 4
Любая метка М41К 5 и XI7 представляет Arg, то тогда XI8 не может быть Asn
Любая
метка N17,96D
Без метки N17D 7
Без метки N17,96D 8
Без метки N96D 9
Без метки N17,96D, R66H 10 Предпочтительная мутация без метки
Без метки М41К 11
Без метки R66H 12
Без метки N17,96D, M41K, R66H 13 Все мутации
Без метки N17D, R66H 14
Без метки R66H, N96D 15
Без метки M41K, R66H 16
Бев метки N17,96D, M41K 17
Без метки N17D, M41K 18
Без метки M41K, N96D 19
Любая
метка N17,96D, R66H
Без метки N17D, M41K, R66H 21
Без метки M41K, R66H, N96D 22
6His N17D 23
6His N17,96D 24
6His N96D 25
6His N17,96D, R66H 26 Предпочтительная мутация с 6His
- 8 039776
Положение в hAlM Соединение Комментарий
(продолжени
Метка Мутации e)
6His M41K 27
6His R66H N17,96D, 28 29
6His M41K, R66H
6His N17D, R66H 30
6His R66H, N96D 31
6His M41K, R66H N17,96D, 32 33
6His M41K
6His N17D, M41K 34
6His M41K, N96D N17D, M41K, 35 36
6His R66H
M41K, R66H, о 7
6His N96D
8His N17D 38
8His N17,96D 39
8His N96D 40
8His N17,96D, R66H 41 Предпочтительная мутация c 8His
8His M41K 42
8His R66H N17,96D, 43 44
8His M41K, R66H
8His N17D, R66H 45
8His R66H, N96D 46
8His M41K, R66H N17,96D, 47 48
8His M41K
8His N17D, M41K 49
8His M41K, N96D 50
N17D, M41K, 1
8His R66H о ±
M41K, R66H, с, о
8His N96D
Альфа-1-микроглобулин - общая исходная информация
A1M синтезируется в печени на высоком уровне, секретируется в кровоток и переносится через стенки сосудов во внесосудистый компартмент всех органов. Белок также синтезируется в других тканях (клетках крови, головном мозге, почках, коже), но на более низком уровне. За счет небольшого размера свободный A1M быстро фильтруется из крови в почках.
A1M является членом суперсемейства липокалинов, группы белков животных, растений и бактерий с консервативной трехмерной структурой, но очень разнообразными функциями. Каждый липокалин состоит из цепи 160-190 аминокислотных остатков, которая складывается в карман структуры β-бочонка с гидрофобной внутренней частью. Известно по меньшей мере двенадцать генов человеческих липокалинов. A1M представляет собой плазматический и тканевой белок с молекулярной массой 26 кДа, который к настоящему времени был обнаружен у млекопитающих, птиц, рыб и лягушек. Трехмерная структура A1M, определенная рентгеновской кристаллографией, показана на фиг. 10. A1M синтезируется в печени на высоком уровне, секретируется в кровоток и быстро (Т1/2=2-3 мин) переносится через стенки сосуда во внесосудистый компартмент всех органов. A1M обнаружен как в виде свободной мономерной формы, так и в виде ковалентных комплексов с более крупными молекулами (IgA, альбумином, протромбином) в крови и интерстициальных тканях. За счет небольшого размера, свободный A1M быстро фильтруется из крови в почках. Большая часть затем реадсорбируется, но значительные количества выделяются с мочой.
Антиоксиданты являются защитными факторами, которые удаляют окислители или предупреждают вредные последствия окислительных реакций. Организм человека может продуцировать антиоксиданты в ответ на окислительный стресс. Такие эндогенные антиоксиданты включают супероксиддисмутазу, фермент, разрушающий супероксиды (SOD), каталазу и глутатионпероксидазу, ферменты, разрушающие пероксиды водорода, и гемоксигеназу-1, фермент, разрушающий гем (НО-1). Недавно было показано, что A1M участвует в защите тканей от окислительного повреждения, функционируя в качестве акцептора свободных радикалов и гема, а также редуктазы и ингибитора окисления. В нескольких недавно опубликованных статьях было показано, что A1M защищает клеточные культуры и эксплантаты органов от окислительного повреждения, частично посредством накопления в митохондриях и защиты митохондриальной функции. Действительно, инфузия человеческого рекомбинантного A1M была успешно использована для лечения in vivo преэклампсии, связанной с окислительным стрессом, и индуцированных гемо- 9 039776 глобином повреждений клубочкового аппарата на животных моделях. Последовательность и структурные свойства A1M.
Известна полная последовательность человеческого A1M. Белок состоит из полипептида с 183 аминокислотными остатками. Было обнаружено, выделено и/или секвенирвоано много дополнительных кДНК и/или белков A1M из других млекопитающих, птиц, амфибий и рыб. Длина пептидной цепи A1M незначительно различается среди видов, в основном за счет изменений на С-конце. Сравнение выравниванием различных выведенных аминокислотных последовательностей показывает, что процент идентичности варьируется в пределах примерно 75-80% между грызунами или представителями когорты Ferungulata и человеком, примерно на урове 45% между рыбами и млекопитающими. Свободная боковая цепь цистеина в положении 34 сохраняется. Показано, что эта группа участвует в редокс-реакциях (см. ниже), в сложном образовании с другими белками плазмы и в связывании с желто-коричневым хромофором. Трехмерная структура A1M показывает, что С34 является гидрофильным и расположенным около отверстия липокалинового кармана (см. фиг. 10).
В контексте настоящего изобретения термин а1-микроглобулин предназначен для охвата α1микроглобулина, последовательность которого показана в SEQ ID NO: 1 (человеческий A1M), SEQ ID NO: 2 (человеческий рекомбинантный A1M) и A1M от других видов, включая их гомологи, фрагменты или варианты, обладающие сходной терапевтической активностью. Таким образом, как здесь используется, термин A1M предназначен для обозначения белка, обладающего по меньшей мере 80% идентичностью последовательности с SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 2. Как здесь используется, предпочтительно, чтобы A1M обладал по меньшей мере 90% идентичностью последовательности с SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 2. Как здесь используется, еще более предпочтительно, чтобы A1M обладал по меньшей мере 95%, например 99% или 100% идентичностью последовательности с SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 2. В предпочтительном аспекте а1-микроглобулин соответствует SEQ ID NO: 1 или 2, как здесь определено. В списке последовательностей приведены аминокислотные последовательности человеческого A1M и человеческого рекомбинантного A1M (SEQ ID NO: 1 и 2 соответственно). Однако гомологи, варианты и фрагменты A1M, имеющие важные участки белков, определенные ниже, также входят в понятие термина A1M, как здесь используется. В отношение выравнивания/идентичности см. следующий абзац.
Подробная информация о выравнивании/идентификации
Положения аминокислотных остатков здесь относятся к положениям в человеческом wt-A1M, который обнаружен в плазме крови человека (SEQ ID NO: 1). В отношение аминокислотных остатков в рекомбинантном A1M, который содержит остаток метионина или N-формилметионина, связанный на Nконце с остатком глицина, который является исходным остатком в wt-A1M (SEQ ID NO: 2), или в мутантном человеческом A1M или A1M из других видов, то специалист в данной области поймет, как идентифицировать остатки, соответствующие остаткам в человеческом wt-A1M (SEQ ID NO: 1), даже, когда положения смещены за счет, например, делеций или инсерций.
Когда продуцируются рекомбинантные белки, то чаще всего они начинаются с исходного остатка Met, который может быть удален, например, при участии метионинаминопептидазы или другого фермента с аналогичной активностью. Представленные здесь варианты A1M могут быть с исходным остатком Met или без него.
Гомологи A1M
Как указывалось выше, гомологи A1M также можно использовать в соответствии с описанием, представленным в настоящем документе. Теоретически A1M из всех видов может использоваться для описанных здесь целей, включая наиболее примитивные, найденные к настоящему времени, которые происходят из рыб (камбалы). A1M также доступен в выделенной форме от человека, орангутанга, белковой обезьяны, крысы, голого землекопа, мыши, кролика, морской свинки, коровы, лягушки, цыпленка, моржа, ламантина и камбалы.
В отношение гомологов, вариантов и фрагментов A1M, в качестве фрагментов белка, важных для антиокислительного эффекта, были идентифицированы следующие:
Y22 (тирозин, положение 22, п.о. 64-66);
С34 (цистеин, положение 34, п.о. 100-102);
K69 (лизин, положение 69, п.о. 205-207);
K92 (лизин, положение 92, п.о. 274-276);
K118 (лизин, положение 118, п.о. 352-354);
K130 (лизин, положение 130, п.о. 388-390);
Y132 (тирозин, положение 132, п.о. 394-396);
L180 (лейцин, положение 180, п.о. 538-540);
1181 (изолейцин, положение 181, п.о. 541-543);
Р182 (пролин, положение 182, п.о. 544-546);
R183 (аргинин, положение 183, п.о. 547-549).
Нумерация аминокислот и нуклеотидов по всему тексту настоящего документа относится к SEQ ID 1; если используются другие A1M из других видов, аналоги A1M или их рекомбинантные последова- 10 039776 тельности, то специалист в данной области будет знать, как идентифицировать аминокислоты, соответствующие аминокислотам в SEQ ID NO: 1.
Таким образом, в тех случаях, когда A1M, например, обладает 80% (или 90%, или 95%) идентичностью последовательности с одной из последовательностей SEQ ID NO: 1 или 2, то предпочтительно, чтобы вышеуказанные аминокислоты присутствовали в соответствующих участках в молекуле.
Человеческий A1M замещен олигосахаридами в трех положениях, двумя сиалилированными сложного типа, вероятно, диантенными углеводами, связанными с N17 и N96, и еще одним простым олигосахаридом, связанным с Т5. Содержание углеводов в белках A1M из разных видов сильно варьирует, начиная от отсутствия гликозилирования вообще в Xenopus leavis до спектра различных паттернов гликозилирования. Однако один сайт гликозилирования, соответствующий N96 у человека, сохраняется у млекопитающих, что указывает на то, что данный специфический углевод может быть более важной составляющей белка, чем два других олигосахарида.
A1M имеет желто-коричневый цвет при выделении из плазмы или мочи. Цвет обусловлен наличием гетерогенных соединений, ковалентно связанных с различными аминокислотными боковыми группами, преимущественно расположенными у входа в карман. Эти модификации представляют собой окисленные продукты деградации органических окислителей, ковалентно захваченных A1M in vivo, например гема, кинуренина и тирозильных радикалов.
A1M также является неоднородным по заряду и размеру, и более сильно окрашенные в коричневый цвет молекулы A1M являются более отрицательно заряженными. Вероятное объяснение такой неоднородности заключается в том, что различные боковые группы модифицируются в различной степени разными радикалами и что модификации изменяют суммарный заряд белка. Ковалентно связанные окрашенные соединения локализованы в С34 и K92, K118 и K130, последние с молекулярными массами от 100 до 300 Да. Метаболит кинуренинового пути обмена триптофана был обнаружен ковалентно присоединенным к остаткам лизина в A1M из мочи пациентов, находящихся на гемодиализе и, по-видимому, в этом случае является причиной коричневого цвета белка [6]. Окисленные фрагменты синтетического радикала ABTS (2,2'-азино-ди-(3-этилбензотиазолин)-6-сульфоновой кислоты) были связаны с боковыми цепями Y22 и Y132.
С34 представляет реактивный центр A1M. Он становится высокоэлектроотрицательным, означая, что он имеет высокий потенциал для отвода электронов посредством близости положительно заряженных боковых цепей K69, K92, K118 и K130, которые индуцируют депротонирование С34 тиоловой группы, что является необходимым условием окисления атома серы. Предварительные данные показывают, что С34 является одной из наиболее известных электроотрицательных групп.
Теоретически аминокислоты, которые определяют свойства A1M (С34, Y22, K92, K118, K130, Y132, L180, 1181, Р182, R183), которые будут описаны более подробно ниже, могут располагаться в аналогичной трехмерной конфигурации в другой рамке считывания, например, белка с таким же общим фолдингом (другой липокалин) или полностью искусственной органической или неорганической молекулы, такой как синтетический полимер, наночастица или металл-полимер.
Трехмерное расположение некоторых этих аминокислот (синие эллипсы, лизины изображены +), А1М-рамка считывания (бочонок), электронный поток и захват радикалов на фиг. 10.
Следовательно, предпочтительными являются гомологи, фрагменты или варианты, содержащие структуру, включающую реактивный центр и его окружение, как показано выше.
Модификации и изменения были внесены в структуру полипептидов по настоящему изобретению, которые обеспечивали молекулу, имеющую аналогичные функциональные характеристики, как и исходный полипептид (например, консервативная аминокислотная замена). Например, некоторые аминокислоты могут быть заменены на другие аминокислоты в последовательности без существенной потери активности. Поскольку интерактивная способность и природа полипептида определяет биологическую функциональную активность полипептида, то можно ввести некоторые аминокислотные замены в полипептидную последовательность и тем не менее получить полипептид с аналогичными функциональными свойствами.
При осуществлении таких изменений может быть учтен гидропатический индекс аминокислот. Важность гидропатического индекса аминокислот в придании интерактивной биологической функции полипептиду хорошо известна в данной области. Известно, что некоторые аминокислоты могут быть замещены на другие аминокислоты, имеющие аналогичный гидропатический индекс или показатель, и по-прежнему приводя к получению полипептида с аналогичной биологической активностью. Каждой аминокислоте был присвоен гидропатический индекс на основании ее гидрофобности и характеристик заряда. Такими показателями являются: изолейцин (+4,5); валин (+4,2); лейцин (+3,8); фенилалаланин (+2,8); цистеин/цистеин (+2,5); метионин (+1,9); аланин (+1,8); глицин (-0,4); треонин (-0,7); серин (-0,8); триптофан (-0,9); тирозин (-1,3); пролин (-1,6); гистидин (-3,2); глутамат (-3,5); глутамин (-3,5); аспартат (-3,5); аспарагин (-3,5); лизин (-3,9); и аргинина (-4,5).
Полагается, что относительный гидропатический характер аминокислоты определяет вторичную структуру полученного полипептида, которая, в свою очередь, определяет взаимодействие полипептида с другими молекулами, такими как ферменты, субстраты, рецепторы, антитела, антигены и тому подоб- 11 039776 ное. В данной области известно, что аминокислота может быть заменена другой аминокислотой, имеющей аналогичный гидропатический индекс, и все же можно получить функционально эквивалентный полипептид. При таких изменениях замена аминокислот, у которых гидропатические индексы находятся в пределах ±2, являются предпочтительными, особенно предпочтительными являются те, которые имеют данный показатель в пределах ±1, и наиболее предпочтительными в пределах ±0,5.
Замена подобных аминокислот также может быть сделана на основе гидрофильности, особенно где биологически функциональный эквивалентный полипептид или пептид, созданный таким образом, предназначен для применения в иммунологических вариантах осуществления. Аминокислотным остаткам были даны следующие значения гидрофильности: аргинин (+3,0); лизин (+3,0); аспартат (+3,0±1); глутамат (+3,0±1); серин (+0,3); аспарагин (+0,2); глутамин (+0,2); глицин (0); пролин (-0,5±1); треонин (-0,4); аланин (-0,5); гистидин (-0,5); цистеин (-1,0); метионин (-1,3); валин (-1,5); лейцин (-1,8); изолейцин (-1,8); тирозин (-2,3); фенилаланин (-2,5); триптофан (-3,4). Следует понимать, что аминокислота может быть заменена другой аминокислотой, имеющей сходное значение гидрофильности и все еще давая биологически эквивалентный, и в частности иммунологически эквивалентный полипептид. При таких изменениях замена аминокислот, у которых значения гидрофильности находятся в пределах ±2, являются предпочтительными, особенно предпочтительными являются те, которые имеют данный показатель в пределах ±1, и наиболее предпочтительными в пределах ±0,5.
Как указано выше, аминокислотные замены в основном основаны на относительном сходстве заместителей в боковой цепи аминокислоты, например их гидрофобности, гидрофильности, заряда, размера и тому подобное. Примеры замен, которые учитывают различные указанные выше характеристики, хорошо известны специалистам в данной области техники и включают, не ограничиваясь этим (исходный остаток:примерная замена) (Ala:
Gly, Ser), (Arg: Lys), (Asn: Gin, His), (Asp: Glu, Cys, Ser), (Gin: Asn), (Glu: Asp), (Gly: Ala), (His: Asn, Gin), (lie: Leu,
Val), (Leu: lie, Val), (Lys: Arg), (Met: Leu, Tyr), (Ser: Thr), (Thr: Ser), (Trp: Tyr), (Tyr: Trp, Phe) и (Val: Tie, Leu).
Таким образом, варианты осуществления настоящего раскрытия включают функциональные или биологические эквиваленты полипептида, как указано выше. В частности, варианты осуществления полипептидов могут включать варианты, имеющие примерно 50, 60, 70, 80, 90 и 95% идентичности последовательности с представляющим интерес полипептидом.
В контексте настоящего изобретения гомология между двумя аминокислотными последовательностями или между двумя последовательностями нуклеиновых кислот описывается параметром идентичность (см. также выше). Выравнивание последовательностей и вычисление баллов гомологии может быть выполнено с использованием полного выравнивания Смита-Ватермана, пригодного как для выравнивания белков, так и для ДНК. Матрицы оценки по умолчанию BLOSUM50 и матрица идентичности используются для выравнивания белков и ДНК соответственно. Штраф за первый остаток в гэпе составляет -12 для белков и -16 для ДНК, тогда как штраф за дополнительные остатки в гэпе составляет -2 для белков и -4 для ДНК. Выравнивание можно проводить с версией пакета FASTA v20u6.
Множественные выравнивания белковых последовательностей могут быть сделаны с использованием алгоритма ClustalW. Множественные выравнивания последовательностей ДНК могут быть выполнены с использованием выравнивания белка в качестве матрицы, заменяя аминокислоты соответствующим кодоном из последовательности ДНК.
Альтернативно для выравнивания аминокислотных последовательностей и последовательностей ДНК можно использовать другое программное обеспечение. Выравнивание двух аминокислотных последовательностей представляет собой, например, определение с помощью программы Needle из пакета EMBOSS (http://emboss.org) версии 2.8.0. Программа Needle реализует алгоритм глобального выравнивания. Используемая матрица замещения представляет BLOSUM62, штраф за открытие гэпа равен 10, и штраф за удлинение гэпа равен 0,5.
Степень идентичности между аминокислотной последовательностью, например SEQ ID NO: 1, и другой аминокислотной последовательностью (например, SEQ ID NO: 2) вычисляют в виде числа точных совпадений при выравнивании двух последовательностей, деленное на длину SEQ ID NO: 1 или длину SEQ ID NO: 2, в зависимости от того, какая последовательность является самой короткой. Результат выражается в процентах идентичности. См. выше информацию относительно выравнивания и идентичности.
Точное совпадение имеет место, когда две последовательности имеют одинаковые аминокислотные остатки в одинаковых положениях при наложении.
При необходимости степень идентичности между двумя нуклеотидными последовательностями может быть определена методом Уилбера-Липмана с использованием программного обеспечения LASER-GENE™ MEGALIGN™ (DNASTAR, Inc., Madison, Wl) с таблицей идентификации и следующими
- 12 039776 многочисленными параметрами выравнивания: штраф за гэп 10 и штраф за длину гэпа 10 баллов. Парные параметры выравнивания представляют Ktuple=3, штраф за гэп=3 и окна=20.
Процент идентичности аминокислотной последовательности полипептида, с или к, аминокислотам SEQ ID NO: 1 может быть определен: i) выравниванием двух аминокислотных последовательностей с использованием программы Needle с матрицей замены BLOSUM62, штрафом за открытие гэпа 10 и штрафом за удлинение гэпа 0,5; ii) подсчетом числа точных совпадений при выравнивании; iii) делением числа точных совпадений на длину самой короткой из двух аминокислотных последовательностей и iv) преобразованием результата деления iii) в проценты. Процент идентичности, к или с, другим последовательностям по изобретению рассчитывается аналогичным образом.
В качестве примера полипептидная последовательность может быть идентична референсной последовательности, которая должна быть на 100% идентичной или может включать определенное целое число аминокислотных изменений по сравнению с референсной последовательностью, так что идентичность в % будет ниже 100%. Такие изменения выбраны из по меньшей мере, делеции одной аминокислоты, замены (включая консервативную и неконсервативную замену) или инсерции, и где указанные изменения могут иметь место в положениях на аминоконце или карбоксиконце референсной полипептидной последовательности или где-либо между этими концевыми положениями, располагаются либо индивидуально среди аминокислот в референсной последовательности, либо в одной или нескольких смежных группах в референсной последовательности.
Консервативные варианты аминокислот могут также включать неприродные аминокислотные остатки. Не встречающиеся в природе аминокислоты включают, без ограничения, транс-3-метилпролин, 2,4-метанопролин, цис-4-гидроксипролин, транс-4-гидроксипролин, N-метилглицин, аллотреонин, метилтреонин, гидроксиэтилцистеин, гидроксиэтилгомоцистеин, нитроглутамин, гомоглутамин, пипеколиновую кислоту, тиазолидинкарбоновую кислоту, дегидропролин, 3- и 4-метилпролин, 3,3диметилпролин, трет-лейцин, норвалин, 2-азафенилаланин, 3-азафенилаланин, 4-азафенилаланин и 4фторфенилаланин. В данной области известно несколько способов включения в белки не встречающихся в природе аминокислотных остатков. Например, можно использовать систему in vitro, в которой нонсенс-мутации подавляются с использованием химически аминоацилированных супрессорных тРНК. Способы синтеза аминокислот и аминоацилирующей тРНК известны в данной области. Транскрипцию и трансляцию плазмид, содержащих нонсенс-мутации, проводят в бесклеточной системе, содержащей экстракт ЕЗО Е. coli и коммерчески доступные ферменты и другие реагенты. Белки очищают хроматографией. Во втором способе трансляцию проводят в ооцитах Xenopus микроинъекцией мутированной мРНК и химически аминоацилированных супрессорных тРНК. В третьем способе клетки Е. coli культивируют в отсутствие природной аминокислоты, которая должна быть заменена (например, фенилаланин), и в присутствии желаемой неприродной аминокислоты (аминокислот) (например, 2-азафенилаланина, 3азафенилаланина, 4-азафенилаланина или 4-фторфенилаланина). Не встречающаяся в природе аминокислота вводится в белок вместо ее природного аналога. Встречающиеся в природе аминокислотные остатки могут быть превращены в не встречающиеся в природе виды химической модификацией in vitro. Химическую модификацию можно объединить с сайт-направленным мутагенезом для дальнейшего расширения ряда замен.
Альтернативные химические структуры, обеспечивающие трехмерную структуру, достаточную для поддержания антиокислительных свойств A1M, могут быть обеспечены другими технологиями, например, искусственными скаффолдами, аминокислотными заменами и тому подобное. Кроме того, структуры, имитирующие активные сайты A1M, как указано выше, рассматриваются как имеющие аналогичную терапевтическую или физиологическую функцию, что и A1M.
Фармацевтические композиции и дозировка
Настоящее изобретение также обеспечивает набор, включающий
i) фармацевтическую композицию, содержащую контрастное вещество, и ii) фармацевтическую композицию, содержащую A1M с любой из последовательностей SEQ ID NO: 1-10 и 17, или любой из белков, полученных из A1M, указанных здесь (или мутант, аналог, фрагмент или вариант, как здесь определено).
Ниже приводится список последовательностей. Изобретение охватывает все возможные варианты, например такие, как приведенные здесь.
SEQ ID NO: 1: wt hAlM
SEQ ID NO: 2: rhAlM (т.е. Met-AIM)
SEQ ID NO: 3: предпочтительная мутация без «удлинения» - 13 039776
N17,96D, R66H
SEQ ID NO: 4: без удлинения, M41K
SEQ ID NO: 5: предпочтительная мутация c 6His, N17,96D,
R66H
SEQ ID NO: 6: 6His, M41K
SEQ ID NO: 7 : предпочтительная мутация с удлинением 8His, N17,96D, R66H
SEQ ID NO: 8: 8His, M41K
SEQ ID NO: 9: удлинение+wt hAlM
SEQ ID NO: 10: идентичный AIM с возможными удлинениями
SEQ ID NO: 11-16: сегменты wt hAlM
SEQ ID NO: 17: идентичный AIM, усеченный на С-конце, с возможными удлинениями
SEQ ID NO: 18: предпочтительная мутация без «удлинения» N17,96D, R66; усеченный на С-конце
SEQ ID NO: 19: без удлинения, М41К; усеченный на С-конце
SEQ ID NO: 20: предпочтительная мутация с 6His, N17,96D,
R66H; усеченный на С-конце
SEQ ID NO: 21: 6His, М41К; усеченный на С-конце
SEQ ID NO: 22: предпочтительная мутация с удлинением 8His, N17,96D, R66H; усеченный на С-конце
SEQ ID NO: 23: 8His, М41К; усеченный на С-конце.
Набор находится в форме одной упаковки, содержащей две вышеуказанные композиции.
Фармацевтическая композиция, содержащая контрастное вещество, обычно представляет собой композицию, уже представленную на рынке.
Фармацевтическая композиция, содержащая A1M (или его аналог, фрагмент или вариант, как здесь определено), предназначена для в/в введения. Следовательно, A1M может быть формулирован в жидкости, например в растворе, дисперсии, эмульсии, суспензии и т.д.
Для парентерального применения подходящими растворителями являются вода, растительные масла, пропиленгликоль и органические растворители, обычно разрешенные для таких целей. В общем, специалист в данной области может найти указания в Remington's Pharmaceutical Science под редакцией Gennaro et al. (Mack Publishing Company), в Handbook of Pharmaceutical Excipients под редакцией Rowe et al. (PhP Press) и в официальных монографиях (например, Ph.Eur. или USP), в разделах, касающихся соответствующих эксципиентов для конкретных типов составов, и к способам получения конкретного состава.
A1M будет вводиться в виде одной или более доз в сочетании с введением контрастного вещества. Предпочтительно каждая доза будет вводиться в/в либо в виде разовой дозы, в виде разовой дозы с последующей медленной инфузией в течение короткого периода времени до 60 мин или только в виде медленной инфузии в течение короткого периода времени до 60 мин. Первая доза может вводиться одновременно с контрастным веществом или в течение периода продолжительностью от 0-60 мин до 0-30 мин после инъекции контрастного вещества. Могут вводиться дополнительные дозы A1M, но они могут быть необязательными, после инъекции контрастного вещества. Каждая доза содержит количество A1M, которое зависит от массы тела пациента: 1-15 мг А1М/кг пациента.
Свободный текст перечня последовательностей:
SEQ ID NO: 1 < 223> человеческий AIM дикого типа, без мутаций
SEQ ID NO: 2 < 223> rhAlM, т.е. N-концевой Met
SEQ ID NO: 3 < 223> hAlM, без метки, N-концевой Met, N17,96D; R66H
SEQ ID NO: 4 < 223> hAlM, без метки, N-концевой Met, M41K
SEQ ID NO: 5 < 223> 6His, N17,96D; R66H
SEQ ID NO: 6 < 223> hAlM, 6His, M41K
SEQ ID NO: 7 < 223> 8His, N17,96D; R66H
SEQ ID NO: 8 < 223> hAlM, 8His, M41K
SEQ ID NO: 9
- 15 039776 < 223> hAlM, 8His, без мутации
SEQ ID NO: 10 < 211> 193 < 212> БЕЛОК < 213> Homo sapiens <220>
< 221> ВАРИАНТ < 222> 1 < 223> Xaa=Met или отсутствует <220>
< 221> ВАРИАНТ < 222> 1 < 223> Xaa=Met или отсутствует <220>
< 221> ВАРИАНТ < 222> 2 < 223> Xaa=His или отсутствует <220>
< 221> ВАРИАНТ < 222> 2 < 223> Xaa=His или отсутствует <220>
< 221> ВАРИАНТ < 222> 3 < 223> Xaa=His или отсутствует <220>
< 221> ВАРИАНТ < 222> 3 < 223> Xaa=His или отсутствует <220>
< 221> ВАРИАНТ < 222> 4 < 223> Xaa=His или отсутствует <220>
< 221> ВАРИАНТ < 222> 4
- 16 039776
<223> Xaa=His или отсутствует
<220>
<221> ВАРИАНТ
<222> 5
<223> Xaa=His или отсутствует
<220>
<221> ВАРИАНТ
<222> 5
<223> Xaa=His или отсутствует
<220>
<221> ВАРИАНТ
<222> 6
<223> Xaa=His или отсутствует
<220>
<221> ВАРИАНТ
<222> 6
<223> Xaa=His или отсутствует
<220>
<221> ВАРИАНТ
<222> 7
<223> Xaa=His или отсутствует
<220>
<221> ВАРИАНТ
<222> 7
<223> Xaa=His или отсутствует
<220>
<221> ВАРИАНТ
<222> 8
<223> Xaa=His или отсутствует
<220>
<221> ВАРИАНТ
<222> 8
<223> Xaa=His или отсутствует
<220>
<221> ВАРИАНТ
<222> 9
- 17 039776
<223> Xaa=His или отсутствует
<220>
<221> ВАРИАНТ
<222> 9
<223> Xaa=His или отсутствует
<220>
<221> ВАРИАНТ
<222> 10
<223> Xaa=Asp, Glu, Lys, Arg или отсутствует
<220>
<221> ВАРИАНТ
<222> 10
<223> Xaa=Asp, Glu, Lys, Arg или отсутствует
<220>
<221> ВАРИАНТ
<222> 11
<223> Xaa=Asp, Glu, Lys, Arg или отсутствует
<220>
<221> ВАРИАНТ
<222> 11
<223> Xaa=Asp, Glu, Lys, Arg или отсутствует
<220>
<221> ВАРИАНТ
<222> 12
<223> Xaa=Asp, Glu, Lys, Arg или отсутствует
<220>
<221> ВАРИАНТ
<222> 12
<223> Xaa=Asp, Glu, Lys, Arg или отсутствует
<220>
<221> ВАРИАНТ
<222> 13
<223> Xaa=Asp, Glu, Lys, Arg или отсутствует
<220>
<221> ВАРИАНТ
<222> 13
- 18 039776
<223> Xaa=Asp, Glu, Lys, Arg или отсутствует
<220>
<221> ВАРИАНТ
<222> 14
<223> Xaa=Asp, Glu, Lys, Arg или отсутствует
<220>
<221> ВАРИАНТ
<222> 14
<223> Xaa=Asp, Glu, Lys, Arg или отсутствует
<220>
< 221> ВАРИАНТ < 222> 31 < 223> Xaa=Asn или Asp <220>
< 221> ВАРИАНТ <222> 55
223> Xaa=Met или Lys <220>
< 221> ВАРИАНТ < 222> 80 < 223> Xaa=Arg или His <220>
< 221> ВАРИАНТ < 222> 110 <223> Xaa=Asn или Asp
SEQ ID NO: 11 <223> Y1
SEQ ID NO: 12 <223> Y2
SEQ ID NO: 13 <223> Y3
SEQ ID NO: 14 <223> Y4
SEQ ID NO: 15 <223> Y5
SEQ ID NO: 16
- 19 039776 <223> Y5
SEQ ID NO: 17 <211> 197 < 212> БЕЛОК < 213> Homo sapiens <220>
< 221> ВАРИАНТ < 222> 1 < 223> Xaa=Met или отсутствует <220>
< 221> ВАРИАНТ < 222> 1 < 223> Xaa=Met или отсутствует <220>
< 221> ВАРИАНТ < 222> 2 < 223> Xaa=His или отсутствует <220>
< 221> ВАРИАНТ < 222> 2 < 223> Xaa=His или отсутствует <220>
< 221> ВАРИАНТ < 222> 3 < 223> Xaa=His или отсутствует <220>
< 221> ВАРИАНТ < 222> 3 < 223> Xaa=His или отсутствует <220>
< 221> ВАРИАНТ < 222> 4 < 223> Xaa=His или отсутствует <220>
< 221> ВАРИАНТ < 222> 4
- 20 039776 < 223> Xaa=His или отсутствует <220>
< 221> ВАРИАНТ < 222> 5 < 223> Xaa=His или отсутствует <220>
< 221> ВАРИАНТ < 222> 5 < 223> Xaa=His или отсутствует <220>
< 221> ВАРИАНТ < 222> 6 < 223> Xaa=His или отсутствует <220>
< 221> ВАРИАНТ < 222> 6 < 223> Xaa=His или отсутствует <220>
< 221> ВАРИАНТ < 222> 7 < 223> Xaa=His или отсутствует <220>
< 221> ВАРИАНТ < 222> 7 < 223> Xaa=His или отсутствует <220>
< 221> ВАРИАНТ < 222> 8 < 223> Xaa=His или отсутствует <220>
< 221> ВАРИАНТ < 222> 8 < 223> Xaa=His или отсутствует <220>
< 221> ВАРИАНТ < 222> 9
- 21 039776 <223> Xaa=His или отсутствует <220 <221> ВАРИАНТ <222> 9 <223> Xaa=His или отсутствует <220 <221> ВАРИАНТ <222> 10 <223> Xaa=Asp
Glu
Lys ,
Arg или отсутствует <220 <221> ВАРИАНТ <222> 10 <223> Xaa=Asp
Glu
Lys ,
Arg или отсутствует <220 <221> ВАРИАНТ <222> 11 <223> Xaa=Asp
Glu
Lys ,
Arg или отсутствует <220 <221> ВАРИАНТ <222> 11 <223> Xaa=Asp
Glu
Lys ,
Arg или отсутствует <220 <221> ВАРИАНТ <222> 12 <223> Xaa=Asp
Glu
Lys ,
Arg или отсутствует <220 <221> ВАРИАНТ <222> 12 <223> Xaa=Asp
Glu
Lys ,
Arg или отсутствует <220 <221> ВАРИАНТ <222> 13 <223> Xaa=Asp
Glu
Lys ,
Arg или отсутствует <220 <221> ВАРИАНТ <222> 13
- 22 039776
<223> Xaa=Asp, Glu, Lys, Arg или отсутствует
<220>
<221> ВАРИАНТ
<222> 14
<223> Xaa=Asp, Glu, Lys, Arg или отсутствует
<220>
<221> ВАРИАНТ
<222> 14
<223> Xaa=Asp, Glu, Lys, Arg или отсутствует
<220>
< 221> ВАРИАНТ <222> 31 < 223> Xaa=Asn или Asp <220>
< 221> ВАРИАНТ <222> 55 < 223> Xaa=Met или Lys <220>
< 221> ВАРИАНТ <222> 80 < 223> Xaa=Arg или His <220>
< 221> ВАРИАНТ <222> 110 < 223> Xaa=Asn или Asp
SEQ ID NO: 18 < 223> hAlM, без метки, N-концевой Met, N17,96D; R66H усеченный
SEQ ID NO: 19 < 223> hAlM, без метки, N-концевой Met, M41K; усеченный
SEQ ID NO: 20 < 223> 6His, N17,96D; R66H; усеченный
SEQ ID NO: 21 < 223> hAlM, 6His, M41K; усеченный
SEQ ID NO: 22 < 223> 8His, N17,96D; R66H; усеченный
- 23 039776
SEQ ID NO: 23 < 223> hAlM, 8His, M41K; усеченный
SEQ ID NO: 24 < 223> 1 .M8H5GIEGR-Mbmib
SEQ ID NO: 25 < 223> 2. М8Н5С1ЕСЙ-голый землекоп
SEQ ID NO: 26 < 223> 3. М8Н5С1ЕСЙ-лягушка
SEQ ID NO: 27 < 223> 4. М8Н5С1ЕСЙ-цыпленок
SEQ ID NO: 28 < 223> 5. M8H5GIEGR-KponnK
SEQ ID NO: 29 < 223> 6. М8Н5С1ЕСЙ-беличья обезьяна
SEQ ID NO: 30 < 223> 7. М8Н5С1ЕСЙ-морж
SEQ ID NO: 31 < 223> 8. М8Н5С1ЕСЙ-ламантин
SEQ ID NO: 32 < 223> 9. M8H5GIEGR-KaM6ana
SEQ ID NO: 33 < 223> 10. М8Н5С1ЕСЙ-орангутанг
SEQ ID NO: 34 < 223> 11. M8H5GIEGR-nenoBeK P35K
SEQ ID NO: 35 < 223> 12. M8H5GIEGR-nenoBeK M41K
SEQ ID NO: 36
M8H5GIEGR-nenoBeK R66H
SEQ ID NO: 37 < 223> 14. M8H5GIEGR-nenoBeK T75K
SEQ ID NO: 38 < 223> 15. M8H5GIEGR-nenoBeK T75Y
SEQ ID NO: 39 < 223> 16. M8H5GIEGR-nenoBeK M99K
SEQ ID NO: 40 < 223> 17. M8H5GIEGR-nenoBeK S101Y
- 24 039776
SEQ ID NO: 41 < 223> 18. М8Н5С1ЕСЙ-человек K69.92.118.130R
SEQ ID NO: 42 < 223> 19. М8Н5С1ЕСЙ-латимерия
SEQ ID NO: 43 < 223> 21. М8Н5С1ЕСЙ-человек L89T
SEQ ID NO: 44 < 223> 22. М8Н5С1ЕСЙ-человек N1796D
SEQ ID NO: 45 < 223> 23. М8Н5С1ЕСЙ-человек T45K
SEQ ID NO: 46 < 223> 24. М8Н5С1ЕСЙ-человек A135E
SEQ ID NO: 47 < 223> 25. М8Н5С1ЕСЙ-человек V170S
SEQ ID NO: 48 < 223> 26. М8Н5С1ЕСЙ-человек
SEQ ID NO: 49 < 223> 27. М8Н5С1ЕСЙ-человек G172Q
SEQ ID NO: 50 < 223> 33. М8Н4ОК-человек M41K+
SEQ ID NO: 51 < 223> 34. М8Н4ОК-человек M41K+N1796D 34
SEQ ID NO: 52 < 223> 35. М8Н4ОК-человек R66H+N1796D
SEQ ID NO: 53 < 223> 36. М8Н4ОК-человек M41K+R66H+N1796D
SEQ ID NO: 54 < 223> 38. М8Н4ОК-человек R66H
SEQ ID NO: 55 < 223> 39.М8Н4ОК-человек
SEQ ID NO: 56 < 223> 40. М8Н-человеческий wt
SEQ ID NO: 57 < 223> 41. М8Н-человек R66H+N1796D
SEQ ID NO: 58 < 223> 60. М8Н4ОК-человеческий wt
- 25 039776
SEQ ID NO: 59 < 223> 1 .M8H5GIEGR-Mbmib
SEQ ID NO: 60 < 223> 2. М8Н5С1ЕСЕ-голый землекоп
SEQ ID NO: 61 < 223> 3. М8Н5С1ЕСЕ-лягушка
SEQ ID NO: 62 < 223> 4. M8H5GIEGR-UbinneHOK
SEQ ID NO: 63 < 223> 5. M8H5GIEGR-KponnK
SEQ ID NO: 64 < 223> 6. М8Н5С1ЕСЕ-беличья обезьяна
SEQ ID NO: 65 < 223> 7. M8H5GIEGR-Mop;K
SEQ ID NO: 66 < 223> 8. М8Н5С1ЕСЕ-ламантин
SEQ ID NO: 67 < 223> 9. M8H5GIEGR-KaM6ana
SEQ ID NO: 68 < 223> 10. М8Н5С1ЕСЕ-орангутанг
SEQ ID NO: 69 < 223> 11. M8H5GIEGR-4enoBeK P35K
SEQ ID NO: 70 < 223> 12. М8Н5С1ЕСЕ-человек M41K
SEQ ID NO: 71 < 223> 13. M8H5GIEGR- человек R66H
SEQ ID NO: 72 < 223> 14. M8H5GIEGR-4enoBeK T75K
SEQ ID NO: 73 < 223> 15. M8H5GIEGR-4enoBeK T75Y
SEQ ID NO: 74 < 223> 16. M8H5GIEGR-4enoBeK M99K
SEQ ID NO: 75 < 223> 17. M8H5GIEGR-4enoBeK S101Y
SEQ ID NO: 76 < 223> 18. M8H5GIEGR-4enoB6K K69.92.118
- 26 039776
SEQ ID NO: 77 < 223> 19. М8Н5С1ЕСИ-латимерия
SEQ ID NO: 78 < 223> 21. M8H5GIEGR- человек L89T
SEQ ID NO: 79 < 223> 22. M8H5GIEGR-4enoBeK N1796D
SEQ ID NO: 80 < 223> 23. М8Н5С1ЕСН-человек T45K
SEQ ID NO: 81 < 223> 24. М8Н5С1ЕСК-человек A135E
SEQ ID NO: 82 < 223> 25. М8Н5С1ЕСК-человек V170S
SEQ ID NO: 83 < 223> 26. М8Н5С1ЕСЕ-человек V148D
SEQ ID NO: 84 < 223> 27. M8H5GIEGR-4enoBeK G172Q
SEQ ID NO: 85 < 223> 33. М8Н4ОК-человек M41K+R66H
SEQ ID NO: 86 < 223> 34. M8H4DK-4enoBeK M41K+N1796D
SEQ ID NO: 87 < 223> 35. М8Н4ОК-человек R66H+N1796D
SEQ ID NO: 88 < 223> 36. М8Н4ОК-человек M41K+R66H+N1796D
SEQ ID NO: 89 < 223> 37. М8Н4ОК-человек M41K
SEQ ID NO: 90 < 223> 38. М8Н4ОК-человек R66H
SEQ ID NO: 91 < 223> 39. М8Н4ОК-человек N1796D
SEQ ID NO: 92 < 223> 40. М8Н-человеческий wt
SEQ ID NO: 93 < 223> 41. М8Н-человек R66H+N1796D
SEQ ID NO: 94 < 223> 42. без метки, человек R66H+N1796D
SEQ ID NO: 95 < 223> 61. без метки, человеческий wt
Сокращенные обозначения:
AIM: альфа-1-микроглобулин;
IB: тельца включения;
wt: дикий тип;
R66H: точечная мутация в гене A1M, приводящая к экспрессии His вместо Arg в положении 66;
- 27 039776
N17,96D: точечные мутации в гене A1M, приводящие к экспрессии Asp вместо Asn в положениях и 96;
M8H4DK: пептид с аминокислотной последовательностью MHHHHHHHHDDDK;
M6H4DK: пептид с аминокислотной последовательностью MHHHHHHDDDDK;
M8H: пептид с аминокислотной последовательностью МННННННН; M8H5GIEGR:
пептид с аминокислотной последовательностью MHHHHHHHHGGGGGGIEGR;
CV: объем колонки;
SEC: эксклюзионная хроматография;
DLS: динамическое рассеяние света;
DSF: дифференциальная сканирующая флуориметрия;
Gu-HCl: гуанинидин гидрохлорид;
ORAC: объем поглощения кислородных радикалов;
SD: стандартное отклонение;
PAGE: электрофорез в полиакриламидном геле.
Определения
В описании и формуле раскрытого предмета изобретения будет использоваться следующая терминология в соответствии с определениями, изложенными ниже. Если не указано иное, то все технические и научные термины, используемые здесь, имеют то же значение, которое обычно понимается специалистом обычной квалификации в области, к которой относится настоящее раскрытие. В некоторых случаях обычно понимаемые значения определены в данной заявке для пояснения и/или для готовой справки, и включение таких определений не требует интерпретации того, что представляют существенные отличия от того, что обычно понимается в этой сфере знаний. Методики и процедуры, описанные или упомянутые здесь, хорошо понятны и обычно используются с применением общепринятой методологии специалистами в данной области. При необходимости процедуры, связанные с использованием коммерчески доступных наборов и реагентов, обычно выполняются в соответствии с описанными изготовителем протоколами и/или параметрами, если не указано иное. Несмотря на то, что на практике или при испытании настоящего изобретения могут использоваться любые способы и материалы, подобные или эквивалентные описанным здесь способам и материалам, здесь приводится описание предпочтительных способов и материалов.
В настоящем описании, если не указано иное, то а или an означает один или более.
Термины лечение или профилактика в их различных грамматических формах в контексте настоящего изобретения относятся к предупреждению, излечению, реверсии, ослаблению, облегчению, улучшению состояния, ингибированию, минимизации, подавлению или остановке (1) патологических эффектов расстройства, (2) прогрессирования расстройства или (3) развития возбудителя расстройства.
Термин эффективное количество в контексте настоящего изобретения относится к такому количеству, которое обеспечивает терапевтический эффект для данного патологического состояния и режима введения. Это заранее определенное количество активного вещества, рассчитанное для получения желаемого терапевтического эффекта в сочетании с необходимыми добавками и разбавителями; т.е. носителем или растворителем для введения. Кроме того, данный термин предназначен для обозначения количества, достаточного для снижения и наиболее предпочтительно предупреждения клинически значимого дефицита активности, функции и ответа хозяина. Альтернативно терапевтически эффективное количество является достаточным, чтобы вызвать улучшение клинически значимого состояния у хозяина. Как понятно специалистам в данной области, количество соединения может варьироваться в зависимости от его специфической активности. Подходящие дозировки могут содержать заранее определенное количество активной композиции, рассчитанное так, чтобы обеспечивать желаемый терапевтический эффект в сочетании с необходимым разбавителем, т.е. носителем или добавкой. Кроме того, вводимая дозировка будет варьироваться в зависимости от активного вещества или активных веществ, которые должны использоваться, возраста, массы тела и т.д. пациента, подвергающегося лечению, но обычно будет находиться в пределах от 0,001 до 1000 мг/кг массы тела/сутки. Кроме того, доза зависит от пути введения.
Термин полипептиды включает белки и их фрагменты. Полипептиды раскрыты здесь в виде последовательностей аминокислотных остатков. Данные последовательности представлены слева направо в направлении от аминогруппы к карбоксиконцу. В соответствии со стандартной номенклатурой последовательности аминокислотных остатков обозначены трехбуквенным или однобуквенным кодом, как указано ниже: аланин (Ala, А), аргинин (Arg, R), аспарагин (Asn, N), аспарагиновая кислота (Asp, D), цистеин (Cys, С), глутамин (Gln, Q), глутаминовая кислота (Glu, Е), глицин (Gly1 G), гистидин (His, H), изолейцин (Ile, I), лейцин (Leu, L), лизин (Lys, K), метионин (Met, М), фенилаланин (Phe, F), пролин (Pro, P), серин (Ser, S), треонин (Thr, T), триптофан (Trp, W), тирозин (Tyr, Y) и валин (Val, V).
Вариант относится к полипептиду или полинуклеотиду, который отличается от референсного полипептида или полинуклеотида, но сохраняет основные свойства. Типичный вариант полипептида отличается по аминокислотной последовательности от другого референсного полипептида. Как правило, различия ограничиваются таким образом, что последовательности референсного полипептида и варианта в целом очень сходны (гомологичны) и во многих областях идентичны. Вариант и референсный полипеп- 28 039776 тид могут отличаться по аминокислотной последовательности одной или более модификациями (например, заменами, добавлениями и/или делециями). Замененный или вставленный аминокислотный остаток может кодироваться или может не кодироваться генетическим кодом. Вариант полипептида может встречаться в природе, такой как аллельный вариант, или он может быть вариантом, который, как известно, не встречается в природе.
Изобретение далее иллюстрировано (но не ограничивается) фигурами.
Пояснения к фигурам
Фиг. 1. Выравнивание аминокислотной последовательности A1M из 12 различных видов.
Аминокислотную последовательность человеческого wt A1M и 11 дополнительных видов, исследованных в фазе I проекта, выравнивали с использованием программного обеспечения http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/. Идентичность различных последовательностей с человеческой последовательностью представлена в виде процентов. Аминокислоты, идентичные между всеми видами, выделены желтым цветом. Кроме того, выделены аминокислоты, которые считаются важными в человеческом A1M: неспаренный остаток цистеина (С34), важный для проявления восстановительных и антиоксидантных свойств (Allhorn et al., 2005), а также связывания гема, выделены розовым цветом (Mening and Skerra, 2012). Аспарагины, которые, как известно, являются гликозилированными (N17 и 96), отмечены зеленым цветом (Escribano et al., 1990). Четыре лизина (K69, 92, 118 и 130), которые были обнаружены модифицированными в A1M из мочи (Akerstrom et al., 1995; Berggard et al., 1999) и считаются важными для проявления редуктазной активности (Allhorn et al., 2005), отмечены голубым цветом. Н123, который предположительно участвует в связывании гема (Meining and Skerra, 2012), выделен серым цветом, и, наконец, тирозины (Y22 и 132), которые, как показано, участвуют в гашении свободных радикалов (Akerstrom et al., 2007), выделены в темно-синим цветом.
Фиг 2. SDS-PAGE экспрессированных белков в фазе III. Равное количество бактериального лизата из неиндуцированных образцов (обозначено 0) и образцов, отобранных через 1-4 ч после индукции (обозначены 1, 2, 3, 4), разделяли электрофорезом SDS-PAGE. В этих образцах полоса чуть ниже 25 кДа экспрессируется в возрастающих количествах во времени. Интенсивность полос достигает максимума через 3 ч после индукции. М8Н-меченные wt-A1M и R66K+N17,96D-A1M экспрессируются с молекулярными массами несколько ниже, чем соответствующие полосам M8H4DK, но и в данном случае уровень экспрессии достигает максимума примерно через 3 ч. Немеченные wt-A1M и R66H+N17,96D-A1M присутствуют в виде еще более мелких полос, но в данном случае интенсивность полос выше на 4 ч, чем на 3 ч, что указывает на несколько замедленную экспрессию, в частности для wt A1M.
Фиг. 3. Выход, чистота и агрегация вариантов фазы III.
А. Сравнивали выходы выделенных A1M всех вариантов фазы III. Все варианты были получены с высокими выходами, с несколько более низким выходом немеченного wt-A1M.
В. Чистоту определяли разделением 10 мкг всех вариантов электрофорезом SDS-PAGE. Чистоту определяли с помощью денсиометрического анализа основной полосы мономера по сравнению со всеми полосами с использованием программного обеспечения Image от Bio-Rad. Все варианты с гистидиновыми метками показали очень высокую чистоту, в то время как чистота немеченных вариантов была несколько ниже (примерно 90%).
С. Присутствие крупных агрегатов анализировали разделением 20 мкг каждого варианта нативным PAGE. Интенсивность основной полосы мономера и вещества, оставшегося в щели для нанесения (очень крупный агрегированный), определяли денситометрией. Большинство вариантов демонстрировали низкие количества крупных агрегатов, за исключением M8H-wt-A1M и немеченных вариантов, которые имеют несколько более высокий процент. Все варианты кодированы номером, указанным на панели А.
Фиг. 4. Анализ агрегации 100 мкМ и 1 мМ растворов вариантов фазы III в различных буферах.
Тенденцию к агрегации после концентрирования из 100 мкМ до 1 мМ в разных буферах исследовали анализом нативным PAGE. 20 мкг белка разделяли в каждой полосе. Процент крупных агрегатов рассчитывали с использованием денситометрического анализа по интенсивности отдельных полос.
А. Все варианты концентрировали из 100 мкМ до 1 мМ в Трис-буфере с рН 8,0 или 7,4 и разделяли PAGE. M8H4DK-wt, R66H+N1796D, М41К, R66H, N1796D обозначены как 60, 35, 37, 38 и 39 соответственно, M8H-wt и M8H-R66H+N1796D обозначены как 40 и 41 и немеченные wt и R66H+N1796D обозначены как 61 и 42.
В. Варианты концентрировали до 1 мМ в Трис-буфере с рН 8,0 и 7,4 и в PBS с рН 7,4, подвергали одному циклу замораживания-оттаивания и затем разделяли PAGE и анализировали, как описано выше.
Фиг. 5. Анализ редуктазной и антиоксидантной активности вариантов фазы III.
А. Редуктазную активность анализировали по восстановлению ABTS-радикала. 0-2 мкМ A1M добавляли в двух повторностях к 56 мкМ ABTS-радикала. Восстановление оценивали по уменьшению поглощения при 405 нм в течение 95 с. Рассчитывали площадь под кривой (AUC) для каждой концентрации, и общую AUC рассчитывали вычитанием AUC только буфера. Строили график зависимости среднего значения общей AUC+SEM по двум повторностям против концентрации. Все варианты M8H4DK имеют примерно такую же активность, как wt A1M, с тенденцией к снижению активности для М41К и R66H. М8Н и немеченные варианты также демонстрируют полную активность с наличием небольшой
- 29 039776 тенденции к повышению активности для вариантов R66H+N1796D по сравнению с wt A1M.
В. Антиоксидантную активность исследовали в анализе ORAC. Активность вариантов A1M сравнивали со стандартом Тролокс и выражали в виде количества эквивалентов Тролокс. Каждый анализ проводили в трех повторностях и результат для M84DK-wt устанавливали на 100%. Антиоксидантную активность всех других вариантов выражали по отношению к нему. Вариант M8H4DK-R66H+N17,96D показал достоверно более высокую активность, чем M8H4DK-wt A1M. Когда метки были укорочены или удалены, то разница была меньше. Приведенные данные представляют объединенные результаты двух независимых экспериментов.
Фиг. 6. Анализ редуктазной активности и связывания гема вариантов фазы III.
А. Способность вариантов A1M восстанавливать цитохром С исследовали смешиванием серийных разведений (0-10 мкМ) A1M с 100 мкМ цитохрома С+100 мкМ NADH и оценкой увеличения оптической плотности при 550 нм в течение 20 мин. Анализ проводили в двух повторностях. AUC рассчитывали для каждой концентрации и общую AUC рассчитывали вычитанием AUC только буфера. Данные представлены в виде общая AUC+SEM по двум независимым экспериментам. В качестве отрицательного контроля использовали овальбумин. Большинство вариантов A1M показали несколько более низкую способность к восстановлению по сравнению с A1M дикого типа в более низких концентрациях. Для N17,96DA1M и R66H+N17,96D-A1M эта тенденция была достоверной (при 0,3-0,6 мкМ). Укорочение и удаление метки не повлияло на эту активность.
B. Включение гема в варианты A1M анализировали по появлению пика поглощения между 410420 нм и величиной красного смещения пика (Karnaukhova et al., 2014; Rutardottir et al., 2016); 44 мкМ белковых растворов смешивали с 40 мкМ гема в двух повторностях и инкубировали в течение 2 ч при комнатной температуре. Смеси анализировали сканированием при длинах волн в интервале 270-450 нм. Вычисляли положение максимального пика и отношение 413:386. Все варианты M8H4DK имеют примерно одинаковое красное смещение и отношение, что и wt-A1M, в то время как М8Н-меченные варианты имеют достоверно более высокое отношение. Немеченные варианты не имеют активности красного смещения, что подтверждает ранее полученные результаты (Karnaukhova et al., 2014).
C. Связывание A1M с гем-гарозой. Специфическое связывание A1M анализировали смешиванием серийных разведений A1M или контрольного овальбумина с гем-гарозой или контрольной агарозой. Анализ проводили в двух повторностях. Количественное определение белка исходного материала и проточных фракций с инкубации с гем-агарозой и контрольной агарозой определяли с использованием ВСА. По этим данным можно определить количество белка, специфически связанного с гем-агарозой, для каждого образца. Строили график зависимости связанного белка против добавленного белка, и была показана линейная корреляция для всех вариантов. Наклон линии рассчитывали линейной регрессией, и показано среднее значение для двух повторностей. Все варианты связывают гем в этом методе примерно в одинаковой степени.
Фиг. 7. Спасение клеток K562 от гибели, индуцированной гемом.
Клетки K562 подвергали воздействию 100 мкМ гема в присутствии серийных разведений A1M (010 мкМ) в течение 1 ч. Затем определяли гибель клеток по высвобождению ЛДГ в среду. Значение поглощения от живых клеток вычитали и сигнал клеток, инкубированных с гемом без A1M, устанавливали на 100%. Рассчитывали значения инкубации с A1M относительно этого значения. Анализ проводили в двух повторностях. Средний результат трех независимых экспериментов (среднее значение+SEM) показан на фигуре. Отсутствовала достоверная разница между вариантами, за исключением немеченного R66H+N17,96D-A1M, который имел более низкую активность, чем немеченный wt-A1M.
Фиг. 8. Разделение по размеру и редуктазная активность M8H4DK-R66H+N17,96D-A1M и M8H4DK-wt-AlM после хранения при +4°С и комнатной температуре.
M8H4DK-Wt-A1M и M8H4DK-R66H+N17,96D-A1M представлены в виде wt и варианта 35 и показаны соответственно на верхней и нижней панелях. Агрегацию анализировали SEC-FPLC. Мономерный A1M и крупные агрегаты элюировались примерно при 15 мл и 8 мл соответственно. Небольшое плечо, видимое примерно при 13-14 мл, вероятно, представляет димерный A1M. Процент крупных агрегатов рассчитывали по площади под пиком, соответствующим 8 мл, в сравнении с общей площадью пика. Выделение белка (%, показанное курсивом) после воздействия напряжения рассчитывали по общим площадям пиков по сравнению с общей площадью пика исходного материала. Восстановительную активность ABTS анализировали в 2 мкМ растворах A1M. Данные представлены в виде среднего значения для двух повторностей. Только размороженные 100 мМ растворы A1M показаны в (А), 100 мкМ раствор A1M, подвергнутый пяти циклам замораживания-оттаивания (В), 1 мМ раствор A1M, хранящийся при +4°С в течение ночи (С), 1 мМ раствор A1M, хранящийся при +4°С в течение недели (D), 100 мкМ раствор A1M, хранящийся при комнатной температуре в течение недели (Е), и 1 мМ раствор A1M, хранящийся при комнатной температуре в течение недели (F). Данные показывают, что M8H4DKR66H+N1796D лучше выдерживают концентрирование до 1 мМ (С & D) и хранение при комнатной температуре (Е и F).
Фиг. 9. Разделение по размеру и редуктазная активность 1 мМ M8H4DK-wt-A1M и M8H4DK
- 30 039776
R66H+N17,96D-A1M после хранения при +37°С.
Wt-A1M и R66H+N17,96D-A1M обозначены в виде ht2014 и 35 и показаны соответственно на верхней и нижней панелях. Агрегацию анализировали SEC-FPLC. Мономерный A1M и крупные агрегаты элюируются примерно на 20 мин и 12 мин соответственно. Небольшое плечо, наблюдаемое примерно на 18-19 мин, вероятно, является димерным A1M. Процент крупных агрегатов рассчитывали по площади под пиком на 12 мин по сравнению с общей площадью пика. Выделение белка (%, показанное курсивом) после приложения напряжения рассчитывали по общим площадям пиков по сравнению с общей площадью пика исходного материала. Редуктазную активность для ABTS анализировали в 2 мкМ растворах A1M. Данные представлены в виде среднего значения для двух повторностей. 1 мМ растворы A1M, хранящиеся в течение 1,5 ч (В), 2,5 ч (С) и 4,5 ч (D), сравнивали с 1 мМ исходным материалом A1M (A) . M8H4DK-wt на 4,5 ч полностью выпадал в осадок, и его анализ не проводили. Данные свидетельствуют о том, что M8H4DH-R66H+N1796D лучше выдерживает хранение при +37°С, чем M8H4DK-wt.
Фиг. 10. Модель структуры A1M. Модель была подготовлена, как описано ранее (ссылка 29). Восемь β-тяжей, показанных в виде лент, образуют слегка конусообразный цилиндр с гидрофобной внутренней частью: липокалиновый карман. Одна сторона липокалинового кармана открыта (показана стрелкой), т.е. обеспечивает вхождение небольших молекул. Обратная сторона закрыта. Две α-спирали показаны в виде цилиндров. Показаны положения трех углеводных фрагментов (Т5; N17; N96) и четырех боковых цепей, участвующих в проявлении редуктазной активности (С34; K92, K118, K130).
Фиг. 11. Связывание гема анализировали по изменению миграции/гашению флуоресценции нативным PAGE (А и В) и спектрофотометрией по поглощению в УФ-свете (С).
А. Пятнадцать мкг M8H4DK-wt A1M (wt-А1М) или M8H4DK-35-A1M (35-A1M) инкубировали с различными количествами тема в течение 30 мин при 20°С, разделяли нативным PAGE и гель анализировали флуоресценцией триптофана (Flourescence) и сканированием денситометрией после окрашивания кумасси (краситель).
В. Изображения преобразовывали в цифровую форму с помощью программного обеспечения Image Lab™ (Bio-Rad). Строили график зависимости связывания тема, измеренного в виде гашения флуоресценции (черный) и расстояния миграции (синий), против молярного отношения А1М:гем. Представлены средние значения для двух экспериментов, wt-A1M (закрашенные символы), 35-А1М (незакрашенные символы).
С. A1M и гем смешивали (32 и 19 мкМ соответственно), инкубировали в течение 2 ч при 20°С и сканировали. Для сравнения показано поглощение только белков в концентрации 32 мкМ. Поглощение буфера (20 мМ Трис-HCl, рН 8,0+0,15 М NaCl) вычитали из всех сканов в качестве контроля.
Фиг. 12. Сравнение ферментативных свойств M8H4DK-wt A1M (wt-A1M) и M8H4DK-35-A1M (35-А1М).
А. Свежевыделенные wt-A1M () или 35-А1М (о) в различных концентрациях смешивали с ABTSрадикалом в 56 мкМ в 25 мМ натрий-фосфатном буфере с рН 8,0 в лунках микротитрационного планшета, после чего определяли скорость восстановления на ридере по поглощению при 405 нм в течение 95 с. Строили график зависимости поглощения для каждой концентрации против времени и рассчитывали площадь под кривой (AUC) между 0 и 95 с для каждой концентрации. Общую AUC рассчитывали вычитанием AUC только буфера. Показаны значения для трех повторностей ± SEM.
В. Скорость восстановления ABTS определяли, как описано в А, но с использованием wt-A1M () или 35-А1М (о) после хранения в течение 7 суток при 4°С или комнатной температуре и концентрации 0,1 или 1 мМ. Показаны отдельные эксперименты.
С. Восстановление цитохрома С исследовали смешиванием серийных разведений (0-10 мкМ) wtA1M () или 35-А1М (о) с 100 мкМ цитохрома С+100 мкМ NADH и последующим мониторингом повышения оптической плотности при 550 нм в течение 20 мин. Анализ проводили в двух повторностях. AUC рассчитывали для каждой концентрации и общую AUC рассчитывали вычитанием AUC только буфера. Данные представлены в виде общая AUC±SEM для двух независимых экспериментов. В качестве отрицательного контроля использовали овальбумин.
D. Антиоксидантную активность определяли в анализе ORAC. Активность вариантов A1M в концентрации 5 мкМ сравнивали со стандартом Тролокс и выражали в виде количества эквивалентов Тролокс. Каждый анализ проводили в трех повторностях, и результат wt-A1M устанавливали на 100%.
Представленные данные представляют собой среднее значение для двух независимых экспериментов ± SEM.
Фиг. 13. Клетки K562, культивированные из расчета 105 клеток на лунку в 96-луночном микротитрационном планшете, подвергали воздействию 100 мкМ гема в присутствии серийных разведений M8H4DK-wt A1M (wt-A1M) или M8H4DK-35-A1M (35-А1М) (0-10 мкМ) в течение 1 ч. Гибель клеток определяли по высвобождению ЛДГ в среду. Значение ЛДГ для живых клеток вычитали и сигнал клеток, инкубированных с гемом без A1M, устанавливали на 100%, и значения для инкубации с A1M рассчитывали по отношению к этому значению. Анализ проводили в двух повторностях. Показано среднее значение для трех независимых экспериментов (среднее значение±SEM). Wt-A1M () или 35-А1М (о).
- 31 039776
Фиг. 14. Клетки HK-2 подвергали воздействию смеси 200 мкМ (NH4) Fe(SO4)2, 400 мкМ перекиси водорода и 2 мМ аскорбата (реакция Фентона, показано на А и В) или 0-30 мкМ гема (показано на С и
D), с одновременным добавлением 0-20 мкМ M8H4DK-wt A1M (wt-A1M) (показано в виде и черных столбцов) или M8H4DK-35-A1M (35-А1М) (показано в виде о и белых столбцов) в течение 6 ч.
После инкубации клетки анализировали на жизнеспособность с использованием WST-1 (показано на А и С) или экспрессии мРНК НО-1 и Hsp70 (показано на В и D), как описано в разделе Материалы и методы. Жизнеспособность клеток (А и С) нормализовали к контрольным образцам, представляющим необработанные клетки.
Результаты представляют данные трех параллельных экспериментов и представлены в виде среднего значения ± SEM. Экспрессию мРНК НО-1 и Hsp70 (В и D) нормализовали к GAPDH и представляли в виде кратного изменения. Значения кратного изменения рассчитывали нормализацией к контрольным образцам, представляющим необработанные клетки. Результаты представляют данные трех параллельных экспериментов и представлены в виде среднего значения ± SEM. Различия между соответствующими экспозициями и контрольными условиями анализировали с использованием одностороннего ANOVA с апостериорной поправкой Бонферрони.
*указывает статистическое сравнение по сравнению с реакцией Фкнтона (показано на В) или гемом (показано на D). * Р <0,05, ** Р <0,01, *** Р <0,001. При сравнении wt-A1M и 35-А1М достоверной разницы не наблюдали.
Фиг. 15. Клиренс из плазмы крови (фармакокинетика, показано на А) и биораспределение (показано на В) M8H4DK-wt A1M (wt-A1M) и M8H4DK-35-A1M (35-А1М) определяли после внутривенного введения животным.
A. Wt-A1M () или 35-А1М (о) вводили (в дозе 5 мг/кг) крысам Вистар и отбирали образцы крови через регулярные промежутки времени. Концентрацию A1M определяли анализом RIA с использованием определенного варианта A1M в качестве стандарта. Каждая точка происходит от трех животных и представлена в виде среднего значения ±SEM. В. Wt-A1M или 35- вводили внутривенно в дозе 5 мг/кг мышам C57BL/6NRj, которых подвергали эвтаназии через 10 и 30 мин после инъекции. Органы отбирали, взвешивали и гомогенизировали. Концентрацию введенного (человеческого) A1M определяли с помощью сэндвич ELISA. Каждый столбец соответствует трем животным и представлен в виде среднего значения ±SD. Wt-А1М, 10 мин (черный) и 30 мин (темно-серый); 35-А1М, 10 мин (белый) и 30 мин (светло-серый).
Фиг. 16. Мышам самкам C57BL/6 вводили глицерин (в дозе 2,0 мл/кг, в/м) и затем в/в M8H4DK-35A1M (wt-A1M) (темно-серые столбцы, n=10), M8H4DK-35-A1M (35-А1М) (белые столбцы, n=10) или буфер, который использовали в качестве растворителя (контроль плацебо, серые столбцы, n=6) через 30 мин после инъекции глицерина. Через 4 ч (после введения глицерина) животных подвергали эвтаназии и извлекали почки, замораживали и затем анализировали на экспрессию мРНК НО-1 (А) и Hsp70 (В) с использованием ПЦР в режиме реального времени, как описано в разделе Материалы и методы. Экспрессию мРНК нормализовали к показателям экспрессии GAPDH, и значения кратных изменений рассчитывали нормализацией к контрольным образцам от необработанных животных (контролей).
Результаты представлены в виде коробчатых графиков, отображающих медианы и 25-й и 75-й процентили. Статистическое сравнение между группами проводили с помощью ANOVA с апостериорной поправкой Бонферрони. *указывает статистическое сравнение против глицерина. * Р <0,05, ** Р <0,01. При сравнении wt-A1M и 35-А1М достоверной разницы не наблюдали.
Далее изобретение будет иллюстрировано следующими примерами. Примеры являются иллюстративными, и никоим образом не ограничивают объем изобретения.
Экспериментальный раздел
Экспериментальная работа была разделена на три основные фазы.
Фаза I): экспрессия 27 вариантов A1M, описанных выше, с последующим анализом растворимости, стабильности и функциональных свойств.
Фаза II): конструирование, экспрессия и анализ нескольких вариантов A1M с предполагаемыми оптимальными свойствами на основе результата фазы 1.
Фаза III): конструирование, экспрессия и анализ wt-A1M и наиболее эффективного мутированного варианта A1M, имеющего N-концевые метки или без них.
В фазе I использовали четыре направления обоснования при выборе положений и идентичности мутированных аминокислотных боковых групп: 1) экспрессировали гомологи животных разных видов с различной предполагаемой экологической нагрузкой с точки зрения окислительного стресса, температуры, давления кислорода (N=12); 2) вводили единичные аминокислотные замены, которые часто встречаются среди 56 секвенированных гомологов A1M в положениях, расположенных в петлях 1-4 или внутренней поверхности гидрофобного кармана, в конструкцию человеческого гена и экспрессировали варианты (N=3); 3) добавляли или удаляли благоприятно расположенные остатки лизина или тирозина на основе гипотезы о том, что они могут оказывать влияние на рКа тиолила С35 (Allhorn et al., 2005) или служить в качестве сайтов захвата свободных радикалов (Berggard et al., 1999; Sala et al., 2004; Akerstrom
- 32 039776 et al. , 2007) (N=5); 4) гидрофобные^гидрофильные замены на поверхности белка, без прогнозируемого влияния на функцию или фолдинг (N=7).
Материалы и методы
Экспрессия
Последовательности вариантов A1M были предоставлены компании DNA2.0, Inc. (США), которая провела синтез и клонирование генов в экспрессионный вектор PJ401Express (промотор Т5, резистентность к канамицину). Последовательность ДНК подтверждали секвенированием. Векторы трансформировали в компетентные Е. coli (BL21 Star (DE3) (Invitrogen, Life technologies corp, USA)) в соответствии с инструкциями изготовителя и четыре отдельных клона каждого варианта тестировали на микроэкспрессию. Получали клон с самой высокой экспрессией каждого варианта в виде стокового материала в глицерине, который использовали для продукционной экспрессии.
Экспрессионные клоны варианта A1M культивировали в полной среде NYAT (15 мМ (NH4)2SO4, 84 мМ K2HPO4, 23 мМ NaH2PO4xH2O, 2,2 мМ (NH4)2Н-цитрат, 1% (мас./об.), 2 мМ MgSO4, 9 мкМ CaCl2χ2Н2О, 85 мкМ FeCl3x6 Н2О, 1,3 мкМ ZnSO4x7 Н2О, 1,3 мкМ CuSO4x5 H2O, 1,8 мкМ MnSO4xH2O, 1,5 мкМ CoCl2x6 Н2О, 108 мкМ ЭДТА, 50 мкг/мл канамицина) до оптической плотности OD600 1,5. Затем экспрессию белка индуцировали добавлением 1 мМ IPTG. Продукция продолжалась 4 ч. Образцы для анализа SDS-PAGE отбирали перед индукцией и через 1, 2, 3 и 4 ч после индукции.
Очистка
Бактерии из культур собирали центрифугированием при 5000 об/мин, в течение 15 мин. Бактериальные осадки лизировали в пяти циклах замораживания-оттаивания, разводили в 3 раза 20 мМ Трис-HCl буфером, рН 8,0, и обрабатывали ультразвуком. Тельца включения (IB) собирали центрифугированием при 6000 об/мин, в течение 30 мин и отмывали тремя циклами ресуспендирования и центрифугирования. Для экстракции тельца включения ресуспендировали в 6 М растворе гуанидина гидрохлорида, 20 мМ Трис-HCl, рН 8,0 (6 М Gu-HCl) и инкубировали при перемешивании в течение ночи при +4°С. Экстракт осветляли высокоскоростным центрифугированием при 26000 g в течение 60 мин. Супернатант сохраняли для дальнейшего осветления, в то время как осадок подвергали еще одному циклу экстракции. Супернатанты экстрактов объединяли и дополнительно осветляли фильтрацией на глубинном фильтре (фильтр К7ООР, помещенный поверх фильтра KS50P, Pall Corp., США). A1M в осветленном экстракте очищали с использованием Ni-агарозной смолы (Sigma-Aldrich, США). Вкратце, смолу упаковывали в одноразовую хроматографическую колонку объемом 10 мл (Bio-Rad, США) и уравновешивали 6М Gu-HCl. Экстракт A1M наносили на колонку с использованием свободного потока и протока. Колонку промывали пятью объемами колонки 6М Gu-HCl и затем элюировали четырьмя объемами 6М Gu-HCl+0,5 M имидазола. Исходный материал, проточные фракции и элюированные фракции осаждали этанолом, растворяли в загрузочном буфере 1x SDS-PAGE и разделяли SDS-PAGE. Процедуру очистки повторяли, если проточная фракция содержала значительные количества A1M. Содержание белка в экстракте определяли поглощением при 280 нм.
Элюаты с Ni-агарозы разбавляли до оптической плотности А280 примерно 5,0 и охлаждали до +4°С перед рефолдингом. Затем элюат смешивали с 2/3 объемами 0,275 М L-цистеина в 20 мМ Трис-HCl, рН 9,5+0,1 М NaCl. Затем быстро добавляли 16,7 объемов буфера для рефолдинга. Конечная концентрация компонентов буфера составляла: (0,2 мг/мл A1M, 0,1 М Трис, 0,6 М NaCl, 0,45 М L-аргинина, 2 мМ ЭДТА, 10 мМ L-цистеина и 1 мМ L-цистеина, рН 9,5). Затем смесь перемешивали в течение 1 ч при +4°С и раствор концентрировали до исходного объема раствора A1M с использованием устройства для ультрафильтрации Centricon plus 70, 10K (Merck Millipore, США). После концентрирования раствор A1M подвергали диафильтрации с 20 мМ Трис-HCl, рН 8,0, используя те же устройства, в 10 последовательных циклах 2,5x разбавления/концентрирования. После диафильтрации раствор осветляли центрифугированием при 15000 g в течение 15 мин и затем пропускали через фильтр 0,2 мкм.
Подвергшийся рефолдингу A1M сразу наносили на 5-мл картридж Bio-Scale Mini UNOspere Q (BioRad), уравновешенный 20 мМ Трис-HCl, pH 8,0. Колонку анализировали на системе для очистки AKTA 10 (GE Healthcare, США) в соответствии с инструкцией Bio-Rad для картриджей. После нанесения образца колонку промывали пятью объемами колонки (CV) 20 мМ Трис-HCl, рН 8,0, перед элюированием линейным градиентом 20 CV от 0 до 0,35 М NaCl. Наконец, колонку промывали тремя CV 1 M NaCl. Проточные фракции и выбранные фракции, собранные во время линейного градиента, анализировали с помощью SDS-PAGE. Проточную фракцию с оставшимся A1M немедленно анализировали повторно на новой колонке и фракции, содержащие A1M, объединяли, концентрировали до 100 мкМ, стерилизовали фильтрованием и замораживали в аликвотных порциях при -20°С.
Гель-электрофорез SDS-PAGE проводили, как описано Laemmli (Laemmli, 1970) с использованием стандартных протоколов. Белки разделяли на бесцветных 4-20% TGX-гелях (Bio-Rad) при 300 В в течение 17 мин. Нативный PAGE проводили без SDS и без восстанавливающих агентов на бесцветных 4-20% TGX гелях при 200 В в течение 40 мин. Гели анализировали на приборе Chemidoc MP (Bio-Rad).
Круговой дихроизм
Спектры кругового дихроизма 10 мкМ растворов в 20 мМ Трис-HCl, рН 8,0+0,15 М NaCl снимали
- 33 039776 на спектрофлуориметре Jasco-J180 (JASCO Inc., Япония) в 2 мм кювете. Растворы сканировали при +22°С при 190-260 нм. Три анализа проводили для каждого образца. Процент структуры α-спирали и βлиста рассчитывали с использованием программного обеспечения http://k2d3.ogic.ca.
SEC-FPLC
Белки анализировали эксклюзионной хроматографией в системе для очистки АКТА 10 с использованием колонки Superose 12 10/30 GL объемом 24 мл (GE Healthcare). Колонку уравновешивали 20 мМ Трис-HCl, рН 8,0+0,15 М NaCl, используя скорость потока 1 мл/мин; 100-200 мкг белка наносили на колонку в объеме 100 мкл и элюировали 20 мМ Трис-HCl, рН 8,0+0,15 М NaCl, используя скорость потока 0,75 мл/мин. Как правило, мономерный A1M элюировался после 15 мл/20 мин, димерный после 1314 мл/18-19 мин и крупные агрегаты элюировались после 8 мл/12 мин. Процент крупных агрегатов рассчитывали по площади под пиком 8 мл по сравнению с общей площадью пика. Процент общего белка, полученного на колонке после приложения напряжения (см. ниже), рассчитывали сравнением общих площадей пиков обработанных или необработанных образцов.
ОФ-ВЭЖХ
Обращеннофазовую ВЭЖХ проводили на системе Agilent 1260 Infinity Binary LC с использованием колонки Aeris Wildpore 3,6 мкМ ХР-С8 (Phenomenex Inc., США). Анализ на колонке проводили при +25°С с использованием скорости потока 1 мл/мин и уравновешивания смесью 70% Н2О+0,1% ТФУ и 30% ацетонитрила+0,1% ТФУ. Наносили 10 мкл (=10 мкг белка) и элюировали в линейном градиенте 3050% ацетонитрила в течение 20 мин. Колонку регенерировали промыванием 95% ацетонитрилом в течение 10 мин.
Динамическое рассеяние света
Анализ динамического рассеяния света (DLS) образцов без приложения напряжения и с приложением напряжения сдвига проводили с использованием устройства SARomics Biostructure AB, Lund. Образцы A1M, разведенные до 10 мкМ в 10 мМ Трис-HCl, рН 8,0+0,125 М NaCl, анализировали на приборе Malvern APS при +20°С. Образцы готовили в двух повторностях, и каждый образец анализировали три раза.
Дифференциальная сканирующая флуориметрия
Термостабильность вариантов A1M анализировали с помощью дифференциальной сканирующей флуориметрии (DSF), используя устройство SARomics Biostructure AB, Lund. A1M, разведенный до 4,4 мкМ в 10 мМ HEPES рН 8,0+0,125 М NaCl, смешивали с SYPRO оранжевым (разведение SYPRO 1000х в целом). Анализ проводили в двух повторностях и рассчитывали среднюю температуру плавления.
Введение напряжения сдвигающей силой мкл 100 мкМ растворов A1M подвергали напряжению сдвигающей силой 80-кратным пипетированием с помощью многоканальных пипеток с использованием 0-10 мкл наконечников пипеток. Приложение напряжения проводили в двух повторностях.
После пипетирования повторности объединяли и разводили в 10 раз перед анализом с помощью DLS, как описано выше.
Напряжение, индуцированное высокой концентрацией
Растворимость и стабильность A1M анализировали при высокой концентрации. 500 мкл 100 мкМ растворов A1M концентрировали в десять раз до 50 мкл с использованием устройства Amicon Ultra-0.5, 10K (Merck Millipore) центрифугированием при 14000 g в течение 10 мин. После концентрирования объемы доводили точно до 50 мкл с использованием соответствующих проточных фракций. Концентрированные и неконцентрированные образцы (10 мкг) последовательно сравнивали анализом нативным PAGE. Влияние различных буферов исследовали диафильтрацией образцов до концентрирования. Данный анализ проводили с пятью циклами 10-кратного разведения/концентрирования на устройстве Amicon Ultra-15, 10K.
Количественное определение свободных тиоловых групп
Свободные тиоловые группы вариантов A1M определяли с помощью набора для количественного определения тиолов и сульфидов производства Molecular probes. Анализ проводили в 96-луночных планшетах в соответствии с инструкцией к набору. Стандарт или A1M (100 мкМ) в объеме 3 мкл смешивали с 3 мкл рабочего раствора цистамина, 100 мкл папаина-SSCH, 100 мкл L-BAPNA. Результаты анализа определяли на ридере по поглощению при 405 нм.
Анализ восстановления ABTS
Анализ является модификацией ранее опубликованного протокола (Akerstrom et al., 2007). 7 мМ раствор диаммониевой соли 2,2'-азино-бис(3-этилбензтиазолин-6-сульфоновой кислоты) (Sigma-Aldrich) в течение ночи окисляли 2,45 мМ раствором K2S2O8 и затем разбавляли до 56 мкМ 25 мМ натрийфосфатным буфером с рН 8,0. Рабочий раствор ABTS добавляли из расчета 100 мкл на лунку в 96луночном планшете. Измерение на нулевой точке проводили при А405 с использованием ридера для планшетов Perkin Elmer Plate. 2 мкл раствора A1M (0-100 мкМ) быстро добавляли многоканальной пипеткой. Кинетику снижения поглощения при 405 нм быстро анализировали в течение 95 с. По практическим соображениям на это время анализировали только 8 лунок. Серийные разведения A1M анализировали в двух или в трех повторностях. Если для количества образцов, подлежащих анализу, требовалось
- 34 039776 несколько планшетов, то новый стоковый материал ABTS разводили для приготовления рабочего раствора для каждого планшета и контрольный образец wt-A1M включали во все планшеты. Строили график зависимости поглощения для каждой концентрации против времени и площадь под кривой (AUC) рассчитывали для каждой концентрации. Общую AUC рассчитывали вычитанием AUC только буфера.
Анализ объема поглощения кислородных радикалов (ORAC)
Коммерческий набор OxySelect™ для анализа объема поглощения кислородных радикалов (ORAC) (Cell Biolabs, Inc., США) основан на окислении и разрушении флуоресцентного зонда пероксильными радикалами. Когда присутствует антиоксидант, то разрушение ингибируется. В качестве стандарта использовали водорастворимый витамин Е Тролокс. Постановку, анализ и расчеты проводили согласно инструкции к набору, и концентрации A1M 2,5-5 мкМ четко соответствовали стандартной кривой. Овальбумин (Sigma-Aldrich) использовали в качестве отрицательного белкового контроля.
Анализ восстановления цитохрома С
Анализ является модификацией ранее опубликованного протокола (Allhorn el al., 2005). Рабочий раствор готовили смешиванием 100 мкМ цитохрома С (Sigma-Aldrich) и 100 мкМ NADH в 10 мМ ТрисHCl, рН 8,0+0,125 М NaCl. 11 мкл раствора A1M (0-100 мкМ) добавляли в 96-луночный планшет в двух параллелях. Рабочий раствор цитохрома С быстро добавляли в лунки с использованием многоканальной пипетки. Кинетику повышения поглощения при 550 нм анализировали в течение 20 мин. На каждое время анализировали один планшет. Никакие отклонения со временем не могли наблюдать. Если требовалось анализировать несколько планшетов, то для всех использовали один и тот же рабочий раствор без каких-либо наблюдаемых артефактов, вызванных данной процедурой. После измерений результаты анализировали, как описано для анализа ABTS.
Анализ красного смещения
Включение свободного гема в A1M приводит к красному смещению пика поглощения полосы Сорета (Karnaukhova et al., 2014; Rutardottir et al., 2016) и оценивали для мутантов A1M в виде отношения А413386. 44 мкМ A1M в 20 мМ Трис-HCl, рН 8,0+0,25 М NaCl, смешивали с 40 мкМ свободного гема (Applichem). Инкубации проводили в двух повторностях и инкубировали в течение 2 ч при комнатной температуре. Красное смещение анализировали в четырехкратно разведенных образцах сканированием при длинах волны на спектрофотометре Бекмана. Рассчитывали средний максимальный пик для двух повторностей, а также среднее соотношение между поглощением при 413 и 386 нм. Только овальбумин и буфер использовали в качестве отрицательных контролей.
Специфическое связывание A1M с гем-агарозой
Связывание A1M с гем-агарозой анализировали методом (Larsson et al., 2004), модифицированным, как описано ранее (Rutardottir et al., 2016). Гем-агарозу (Sigma-Aldrich) и контрольную сефарозу 4В (SigmaAldrich) уравновешивали 20 мМ Трис-HCl, рН 8,0+0,25 М NaCl, и готовили в виде 50% суспензий. 75 мкл серийных разведений A1M (0-13,3 мкМ) вносили в два параллельных 96-луночных планшета (один планшет для гем-агарозы и один для контрольной сефарозы). 20 мкл суспензий гем-агарозы или контрольной сефарозы добавляли в лунки осторожным пипетированием для обеспечения переноса одинаковых количеств и инкубировали в течение 30 мин при комнатной температуре при вращательном перемешивании. Смеси переносили переносили в 96-луночный фильтрующий планшет AcroPrep Advance, мембрана Supor 1,2 мкм (Pall Corp). Планшеты центрифугировали в течение 2 мин при 1000g, собирая проточную фракцию в микропланшет с низким связыванием. 25 мкл каждой проточной фракции, а также исходного материала без инкубации анализировали на содержание белка с использованием набора для анализа белка Pierce BCA (Thermo Scientific Inc., США). Количество белка пересчитывали в виде связанного количества (добавленного минус количество в проточной фракции) для образцов, инкубированных с гемом и контрольной сефарозой. После вычитания количества, связанного с контрольной сефарозой, строили график зависимости количества, специфически связанного с гем-агарозой, против добавленного количества. Наклон кривой рассчитывали линейной регрессией. SD двух повторностей использовали для оценки статистической значимости различий между вариантами A1M.
Связывание гема M8H4DK-wt A1M (Wt-A1M) и M8H4DK-35-A1M (35-А1М)
Связывание гема анализировали, как описано ранее, нативным PAGE (Karnaukhova et al., 2014) и УФ-спектрофотометрией (Ruttarsdottir et al., 2016). Вкратце, для нативного PAGE A1M и гем в различных концентрациях инкубировали в Трис-буфере, рН 8,0 в течение 30 мин при комнатной температуре, разделяли нативным PAGE на 12% бесцветных гелях TGX Criterion при 200 В в течение 40 мин. Полосы геля анализировали на приборе Chemidoc MP (Bio-Rad) на флуоресценцию триптофана, используя режим без окрашивания, с окрашиванием кумасси бриллиантовым синим, который снова обесцвечивали и визуализировали на Chemidoc, используя режим с окрашиванием кумасси. Затем оба набора полос анализировали количественно с использованием программного обеспечения Image Lab™ Software (Bio-Rad). Затем связывание гема оценивали по уровню гашения флуоресценции триптофана относительно суммарного количества белка после окрашивания кумасси. Спектры поглощения снимали на спектрофотометре Beckman (Beckman Instruments, Fullerton, CA) DU 800 с использованием скорости сканирования 600 нм/мин в области UV-VIS между 250 и 700 нм при 22°С. Концентрации A1M и гема составляли соответственно
- 35 039776 и 19 мкМ в 20 мМ Трис-HCl, рН 8,0, 0,15 М NaCl. Гем добавляли из 10 мМ стокового раствора в
ДМСО. Растворы белков сканировали через 2 ч после смешивания.
Клиренс из плазмы крови и биораспределение
Для исследования клиренса из плазмы крови каждый вариант A1M вводили внутривенно (в/в) шести крысам самцам Вистар (в дозе 5,0 мг/кг, стоковые растворы в 20 мМ Трис-HCl, рН 8,0) и образцы крови отбирали в пробирки с ЭДТА на 1; 5; 15; 30 мин и 1, 3, 6, 16 и 24 ч после инъекции с использованием групп из трех крыс на разные интервалы отбора, чтобы избежать отрицательных последствий слишком частого отбора образцов. Плазму аспирировали после центрифугирования 140х g в течение 10 мин, и концентрацию A1M определяли с помощью радиоиммуноанализа (RIA), как описано (Gram et al., 2015) с использованием специфического варианта A1M в качестве стандарта. Для исследования биораспределения варианты A1M вводили в/в мышам C57BL/6NRJ (в дозе 5,0 мг/кг, стоковые растворы в 20 мМ ТрисHCl, рН 8,0). Мышей подвергали эвтаназии через 10 мин после инъекции (n=3) и через 30 мин (n=3). Отбирали образцы органов, взвешивали и гомогенизировали в буфере для экстракции клеток 5:1 (объем:масса), содержащей 50 мкл/мл complete Mini, таблетки смесей ингибиторов протеиназ без ЭДТА (Roche, номер по каталогу 11836170001). Концентрацию A1M определяли с помощью варианта сэндвич ELISA заявителей. Вкратце, 96-луночные микротитрационные планшеты покрывали в течение ночи при 4°С мышиным моноклональным анти-А1М-антителом (клон 35,14, 5 мкг/мл в PBS), отмывали и затем инкубировали со стандартами A1M (A1M из мочи человека, выделенный как описано в лаборатории заявителей (Akerstrom et al., 1995) или гомогенизированными образцами тканей, разбавленными буфером для инкубации (PBS+0,05% твин 20+0,5% бычьего сывороточного альбумина) в течение 60 мин при комнатной температуре. После отмывки лунки инкубировали с мышиным моноклональным антителом против A1M, конъюгированным с пероксидазой хрена (клон 57,10, 5 нг/мл в буфере для инкубации) в течение 60 мин при комнатной температуре. Планшеты отмывали и развивали инкубацией с субстратом пероксидазы SureBlue TMB (KPL) в темноте в течение 20 мин и, наконец, реакцию останавливали добавлением 1 М серной кислотой. Поглощение определяли на ридере при 450 нм на счетчике Wallac 1420 Multilabel Counter. Два мышиных моноклональных антитела получали от AgriSera AB (Vannas, Швеция) против A1M из мочи человека. ELISA был специфичен для человеческого A1M, не реагировал перекрестно с эндогенным плазматическим A1M мыши, и в одинаковой степени реагировал с A1M из мочи человека, M8H4DK-wt A1M (wt-A1M) и M8H4DK-35-A1M (35-А1М).
Повреждение почек,, индуцированное рабдомиолизом
Данное исследование было одобрено этическим комитетом по проведению исследований на животных в Malmo-Lund, no. M21-15. Мышей самок C57BL/6 с массой тела 20,5±0,7 г получали из питомника Taconic (Дания), помещали в клетки с проволочными крышками для грызунов типа III при постоянной комнатной температуре с 12 ч циклом свет-темнота. В ходе исследований поддерживалась постоянная температура (20±0,5°С) и относительная влажность (50±5%). Все животные имели свободный доступ к корму (RM1 (Е) SQC, SDS, Англия), водопроводной воде и обогащению клеток. После лишения воды в течение ночи (15 ч) животных взвешивали и проводили анестезию с использованием изофлурана, и затем распределяли на следующие четыре группы: 1) контрольная группа (n=6), без внутримышечного (в/м) или внутривенного (в/в) введения; 2) группа с глицерином (n=10), животные получали 50% стерильный глицерин (Teknova, Hollister, CA, USA), в/м (2,0 мл/кг массы тела, однократная доза, разделенная на введение в обе задние конечности); 3) группа с глицерином+M8H4DK-wt A1M (wt-A1M) (n=10), животные получали wt-A1M, в/в (7 мг/кг массы тела, однократная доза) через 30 мин после введения глицерина в/м (2,0 мл/кг массы тела); и 4) группа с глицерином+М8Н4DK-35-А1М (35-А1М) (n=10), животные получали 35-А1М, в/м (7 мг/кг массы тела, однократная доза) через 30 мин после введения глицерина, в/м (2,0 мл/кг массы тела). После в/м введения животных помещали на подушку с подогревом на время пробуждения и затем возвращали в их клетки и обеспечивали свободный доступ к корму и воде. Через 4 ч (после введения глицерина) животных подвергали анестезии с использованием изофлурана и отбирали почки, для экстракции РНК с последующим определением фракции мРНК, как описано ниже.
Выделение РНК и ПЦР в режиме реального времени
Общую фракцию РНК выделяли из клеток HK-2, используя набор Direct-zol™ РНК MiniPrep, производства Zymo Research (Irvine, СА, США), или почек мышей с использованием набора NucleoSpin RNA/protein (Machery-Nagel, Duren, Германия), с последующим использованием набора RNeasy® Mini (QIAGEN, German-town, MD, США). Соотношение OD (оптическая плотность при 260 нм/280 нм) РНК во всех случаях было выше 1,9. Обратную транскрипцию проводили согласно инструкциям изготовителя на 1,0 мкг общей фракции РНК с использованием набора для синтеза кДНК iScriptTM (Bio-Rad, СА, США). Набор праймеров RT2 qPCR Primer Assay (человеческие (HK-2 клетки) и мышиные (почки) от QIAGEN) использовали для количественной оценки экспрессии мРНК гемоксигеназы-1 (НО-1) и белка теплового шока 70 (Hsp70). Данные нормализовали к глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназе (человеческие клетки (HK-2) и мышиные (почки) GAPDH, RT2 qPCR Primer Assay от QIAGEN). Данные представлены в виде столбцов, представляющих среднее значение±SEM для данных in vitro, и коробчатых графиков, отображающих медианы и 25-й и 75-й процентили для данных in vivo. Значения кратных изменений
- 36 039776 рассчитывали нормализацией к контрольным образцам из необработанных клеток или животных (контроли). Экспрессию анализировали с использованием реакционных смесей iTaq™ Universal с красителем
SYBR® Green (Bio-Rad). Амплификацию проводили, как описано изготовителем (Bio-Rad) в 40 циклах в термоциклере iCycler (Bio-Rad), и данные анализировали с использованием программного обеспечения iCycler iQ Optical System (Bio-Rad).
Спасение клеток K562 от гибели, индуцированной гемом
Ранее было показано, что A1M ингибирует индуцированную гемом гибель человеческих эритроидных клеток K562 (Olsson et al., 2008). Клетки культивировали в DMEM с глутамаксом+10% FCS и антибиотиками (Gibco, Life Technologies Corp., США) в соответствии с инструкциями АТСС. Клетки отмывали и ресуспендировали в DMEM без фенолового красного и FCS, но добавляли глутамакс I и антибиотики (Gibco). Клетки высевали в 96-луночные планшеты из расчета 105 клеток на лунку и подвергали воздействию 100 мкМ тема в присутствии серийных разведений 0-10 мкМ A1M. В качестве положительного контроля на гибель клеток добавляли 10 мкл раствора для лизиса из набора для определения ЛДГ (см. ниже). Клетки инкубировали при 37°С в СО2-инкубаторе в течение 1 ч. Планшеты быстро центрифугировали при 350g в течение 4 мин, после чего 50 мкл среды переносили в 96-луночный микропланшет для анализа высвобождения ЛДГ с использованием набора cytoTox 96® Non-Radio. Анализ цитотоксичности (Promega Biotech AB, Швеция) проводили в соответствии с инструкциями изготовителя. Индуцированные гемом клетки обычно давали сигнал в 7 раз выше по сравнению с живыми клетками и 70% сигнала полностью лизированных клеток. Среднее значение сигнала клеток, инкубированных без добавления тема или A1M, вычитали из всех показаний, и сигнал клеток, инкубированных только с гемом, устанавливали на 100%. Все другие сигналы сравнивали с этим значением. Данная процедура позволила сравнить результаты нескольких независимых экспериментов.
Защита клеток HK-2
Эпителиальные клетки проксимальных канальцев коры почек человека (HK-2, АТСС® CRL-2190, ATCC, Teddington, UK) культивировали в бессывороточной среде для кератиноцитов (K-SFM), с добавлением экстракта гипофиза крупного рогатого скота (ВРЕ, 0,05 мг/мл) и эпидермального фактора роста (5 нг/мл) (все производства Invitrogen, Paisley, UK). Когда клетки достигали примерно 80-90% конфлюентности, добавляли гем (0-30 мкМ, из свежеприготовленного 10 мМ стокового раствора) или смесь (NH4)Fe(SO4)2, перекись водорода и аскорбат (0-200 мкМ, реакция Фентона) с одновременным добавлением A1M (0-20 мкМ, M8H4DK-wt A1M (wt-A1M) и M8H4DK-35-A1M (35-А1М)), и клетки инкубировали в течение 6 ч. После инкубации клетки анализировали на жизнеспособность с использованием WST-1 (показатель метаболической активности клеток, например, показатель клеточного расщепления стабильной тетразолиевой соли WST-1 до растворимого формазанового красителя, который прямо коррелирует с числом жизнеспособных клеток) (Roche Diagnostics GmbH, Mannheim, Германия) в соответствии с инструкциями изготовителя. Жизнеспособность клеток нормализовали к контрольным образцам из необработанных клеток. Параллельные культуры собирали с использованием реагента Qiazol™ Lysis (для экстракции РНК, QIAGEN, Germantown, MD, США). Общую фракцию РНК экстрагировали из клеток для оценки экспрессии мРНК, как описано ниже.
Статистика
Сравнение между отдельными группами проводили с помощью ANOVA с апостериорной поправкой Бонферрони. Значения Р <0,05 считались значимыми.
Результаты и обсуждение
Обзор проекта
Целью настоящего исследования является идентификация более стабильных и растворимых вариантов A1M с сохраненными функциональными свойствами. Проект выполняли в три фазы. В фазе I A1M из различных видов и с точечными мутациями человеческого A1M подвергали скринингу для идентификации отдельных аминокислот, которые оказывали положительное влияние на стабильность без нарушения функции. В фазе II аминокислоты, показавшие положительный эффект в фазе I, объединяли для поиска еще лучших комбинаций. Наконец, в фазе III подтверждали данные, полученные в фазах I и II, и исследовали влияние различных N-концевых меток. Во всех трех фазах белки экспрессировали в одной и той же системе E-coli, используя тот же вектор и протокол очистки. Все варианты экспрессировали, выделяли и анализировали параллельно, используя аналогичные протоколы и процедуры в каждой фазе. Панель анализа в каждой фазе обобщена в табл. 1. Аминокислотную последовательность и последовательность ДНК всех конструкций можно найти ниже.
- 37 039776
Таблица 1. Анализы, проведенные в различных фазах проекта по исследованию вариантов A1M
Анализ фаза I фаза II фаза III
1 SDS-PAGE (идентичность, чистота) X X X
2 Поглощение при 280 нм (количество) X X X
3 Круговой дихроизм (идентичность) X
4 PAGE (анализ агрегации) X X X
5 SEC-FPLC (анализ агрегации) X
6 DLS (анализ агрегации) X X
7 ОФ-ВЭЖХ (чистота, анализ агрегации) X
8 DSF (термостабильность) X X
9 Стабильность к сдвигу (анализ DLS) X X
10 Стабильность при концентрировании (анализ PAGE) X X X
11 Стабильность при концентрировании в различных буферах (анализ PAGE) X
12 Стабильность при замораживании-оттаивании, длительном хранении в холодильнике, комнатной температуре, +37°С (SEC-FPLC, восстановление ABTS)*
13 Количественное определение свободных тиоловых групп X
14 Восстановительная активность для ABTSрадикала X X X
15 Объем поглощения кислородных радикалов (ORAC) X
16 Восстановительная активность для цитохрома С X
17 Восстановительная/связывающая активность для свободного гема X X X
18 Связывающая активность для гем-агарозы X X X
19 Спасение клеток К562 от гибели, индуцированной гемом X X
* Проводили только на человеческом AIM дикого типа и варианте M8H4DKR66H+N1796D
- 38 039776
Аминокислотная последовательность всех конструкций.
60. М8Н40К-человеческий wt (rhAlM) (SEQ ID NO: 9)
MHHHHHHHHDDDDKGPVPTPPDNIQVQENFNISRIYGKWYNLAIGSTCPWLKKIMDRMT VSTLVLGEGATEAEISMTSTRWRKGVCEETSGAYEKTDTDGKFLYHKSKWNITMESYWHTNYD EYAIFLTKKFSRHHGPTITAKLYGRAPQLRETLLQDFRWAQGVGIPEDSIFTMADRGECVPGE QEPEPILIPR .M8H5GIEGR-Mbmib (SEQ ID NO: 24)
MHHHHHHHHGGGGGIEGRDPASTLPDIQVQENFSESRI
YGKWYNLAVGS TCPWLSRIKDKMSVQTLVLQEGATETEISMTS TRWRRGVCEEIT
GAYQKTDIDGKFLYHKSKWNITLESYWHTNYDEYAIFLTKKSSHHHGLTI
TAKLYGREPQLRDSLLQEFKDVALNVGISENSIIFMPDRGECVPGDREVEPTSIAR
2. М8Н5С1ЕСР-голый землекоп (SEQ ID NO: 25)
MHHHHHHHHGGGGGIEGRNPVPMPPDNIQVQENFDESRIYGKWFNLATGSTCPWLKRIK DRLSVSTMVLGKGTTETQISTTHTHWRQGVCQETSGVYKKTDTAGKFLYHKSKWNVTMESYVVH TNYDEYAIILTKKFSHHHGPTITAKLYGREPRLRDSLLQEFREMALGVGIPEDSIFTMANRGEC VPGDQAPESTPAPR
3. M8H5GIEGR-nnrymKa (SEQ ID NO: 26)
MHHHHHHHHGGGGGIEGRCSPIQPEDNIQIQENFDLQRIYGKWYDIAIGSTCKWLKHHK EKFNMGTLELSDGETDGEVRIVNTRMRHGTCSQIVGSYQKTETPGKFDYFNARWGTTIQNYIVF TNYNEYVIMQMRKKKGSETTTTVKLYGRSPDLRPTLVDEFRQFALAQGIPEDSIVMLPNNGECS PGEIEVRPRR
- 39 039776
4. М8Н5С1ЕСИ-цыпленок (SEQ ID NO: 27)
MHHHHHHHHGGGGGIEGRTPVGDQDEDIQVQENFEPERMYGKWYDVAVGTTCKWMKNYK EKFSMGTLVLGPGPSADQISTISTRLRQGDCKRVSGEYQKTDTPGKYTYYNPKWDVSIKSYVLR TNYEEYAVILMKKTSNFGPTTTLKLYGRSPELREELTEAFQQLALEMGIPADSVFILANKGECV PQETATAPER
5. M8H5GIEGR-KponnK (SEQ ID NO: 28)
MHHHHHHHHGGGGGIEGRDPVPTLPDDIQVQENFELSRIYGKWYNLAVGSTCPWLKRIK DRMAVSTLVLGEGTSETEISMTSTHWRRGVCEEISGAYEKTDTDGKFLYHKAKWNLTMESYVVH TNYDEYAIFLTKKFSRRHGPTITAKLYGREPQLRESLLQEFREVALGVGIPENSIFTMIDRGEC VPGQQEPKPAPVLR
6. M8H5GIEGR-SQ обезьяна (SEQ ID NO: 29)
MHHHHHHHHGGGGGIEGRSPVPTPPEGIQVQENFNLSRIYGKWYNLAIGSTCPWLKKIM DRLKVSTLVLEEGATEAEISMTSTRWRKGFCEQTSWAYEKTDTDGKFLYHEPKWNVTMESYVAH TNYEEYAIFLTKKFSRHHGPTITAKLYGREPQLRESLLQDFRWAQGVGIPEDSIFTMANRGEC VPGEQEPQPILHRR
7. М8Н5С1ЕСЕ-морж (SEQ ID NO: 30)
MHHHHHHHHGGGGGIEGRSPVLTPPDAIQVQENFDISRIYGKWFHVAMGSTCPWLKKFM DRMSMSTLVLGEGATDGEISMTSTRWRRGTCEEISGAYEKTSTNGKFLYHNPKWNITMESYVVH TDYDEYAIFLTKKFSRHHGPTITAKLYGRQPQLRESLLEEFRELALGVGIPEDSIFTMANKGEC VPGEQEPEPSPHMR
8. М8Н5б1ЕСК-ламантин (SEQ ID NO: 31)
MHHHHHHHHGGGGGIEGRSPVKTPLNDIQVQENFDLPRIYGKWFNIAIGSTCQWLKRLK AGPTMSTLVLGEGATDTEISTTSTRWRKGFCEEISGAYEKTDTAGKFLYHGSKWNVTLESYVVH TNYDEYAIFLTKKFSRYGLTITAKLYGRQPQVRESLLEEFREFALGVGIPEDSIFTTADKGECV PGEQEPEPTAALR
9. M8H5GIEGR-KaM6ana (SEQ ID NO: 32)
MHHHHHHHHGGGGGIEGRLPVLPEPLYPTQENFDLTRFVGTWHDVALTSSCPHMQRNRA DAAIGKLVLEKDTGNKLKVTRTRLRHGTCVEMSGEYELTSTPGRIFYHIDRWDADVDAYWHTN YDEYAIIIMSKQKTSGENSTSLKLYSRTMSVRDTVLDDFKTLVRHQGMSDDTIIIKQNKGDCIP GEQVEEAPSQPEPKR
10. М8Н5С1ЕСР-орангутанг (SEQ ID NO: 33)
MHHHHHHHHGGGGGIEGRGPVPTPPDNIQVQENFNISRIYGKWYNLAIGSTCPWLKKIM DRMTVSTLVLGEGATEAEISMTSTRWRKGVCEETSGAYEKTDTDGKFLYHKSKWNITMESYWH TNYDEYAIFLTKKFSRRHGPTITAKLYGRAPQLRETLLQDFRWAQGVGIPEDSIFTMADRGEC VPGEQEPEPILIPR
11. М8Н5С1ЕСК-человек P35K (SEQ ID NO: 34)
- 40 039776
MHHHHHHHHGGGGGIEGRGPVPTPPDNIQVQENFNISRIYGKWYNLAIGSTCKWLKKIM DRMTVSTLVLGEGATEAEISMTSTRWRKGVCEETSGAYEKTDTDGKFLYHKSKWNITMESYVVH TNYDEYAIFLTKKFSRHHGPTITAKLYGRAPQLRETLLQDFRWAQGVGIPEDSIFTMADRGEC VPGEQEPEPILIPR
12. M8H5GIEGR-4eJiOBeK M41K (SEQ ID NO: 35)
MHHHHHHHHGGGGGIEGRGPVPTPPDNIQVQENFNISRIYGKWYNLAIGSTCPWLKKIK DRMTVSTLVLGEGATEAEISMTSTRWRKGVCEETSGAYEKTDTDGKFLYHKSKWNITMESYWH TNYDEYAIFLTKKFSRHHGPTITAKLYGRAPQLRETLLQDFRWAQGVGIPEDSIFTMADRGEC VPGEQEPEPILIPR
13. M8H5GIEGR-4eJiOBeK R66H (SEQ ID NO: 36)
MHHHHHHHHGGGGGIEGRGPVPTPPDNIQVQENFNISRIYGKWYNLAIGSTCPWLKKIM DRMTVSTLVLGEGATEAEISMTSTHWRKGVCEETSGAYEKTDTDGKFLYHKSKWNITMESYWH TNYDEYAIFLTKKFSRHHGPTITAKLYGRAPQLRETLLQDFRWAQGVGIPEDSIFTMADRGEC VPGEQEPEPILIPR
14. M8H5GIEGR-4eJiOBeK T75K (SEQ ID NO: 37)
MHHHHHHHHGGGGGIEGRGPVPTPPDNIQVQENFNISRIYGKWYNLAIGSTCPWLKKIM DRMTVSTLVLGEGATEAEISMTSTRWRKGVCEEKSGAYEKTDTDGKFLYHKSKWNITMESYWH TNYDEYAIFLTKKFSRHHGPTITAKLYGRAPQLRETLLQDFRWAQGVGIPEDSIFTMADRGEC VPGEQEPEPILIPR
15. M8H5GIEGR-4eJiOBeK T75Y (SEQ ID NO: 38)
MHHHHHHHHGGGGGIEGRGPVPTPPDNIQVQENFNISRIYGKWYNLAIGSTCPWLKKIM DRMTVSTLVLGEGATEAEISMTSTRWRKGVCEEYSGAYEKTDTDGKFLYHKSKWNITMESYWH TNYDEYAIFLTKKFSRHHGPTITAKLYGRAPQLRETLLQDFRWAQGVGIPEDSIFTMADRGEC VPGEQEPEPILIPR
16. M8H5GIEGR-4eJiOBeK M99K (SEQ ID NO: 39)
MHHHHHHHHGGGGGIEGRGPVPTPPDNIQVQENFNISRIYGKWYNLAIGSTCPWLKKIM DRMTVSTLVLGEGATEAEISMTSTRWRKGVCEETSGAYEKTDTDGKFLYHKSKWNITKESYWH TNYDEYAIFLTKKFSRHHGPTITAKLYGRAPQLRETLLQDFRWAQGVGIPEDSIFTMADRGEC VPGEQEPEPILIPR
17. M8H5GIEGR-4eJiOBeK S101Y (SEQ ID NO: 40)
MHHHHHHHHGGGGGIEGRGPVPTPPDNIQVQENFNISRIYGKWYNLAIGSTCPWLKKIM DRMTVSTLVLGEGATEAEISMTSTRWRKGVCEETSGAYEKTDTDGKFLYHKSKWNITMEYYWH TNYDEYAIFLTKKFSRHHGPTITAKLYGRAPQLRETLLQDFRWAQGVGIPEDSIFTMADRGEC VPGEQEPEPILIPR
18. M8H5GIEGR-4eJiOBeK K69.92.118.130R (SEQ ID NO: 41)
MHHHHHHHHGGGGGIEGRGPVPTPPDNIQVQENFNISRIYGKWYNLAIGSTCPWLKKIM
- 41 039776
DRMTVSTLVLGEGATEAEISMTSTRWRRGVCEETSGAYEKTDTDGKFLYHRSKWNITMESYWH TNYDEYAIFLTKRFSRHHGPTITARLYGRAPQLRETLLQDFRWAQGVGIPEDSIFTMADRGEC VPGEQEPEPILIPR
19. М8Н5С1ЕСР-латимерия (SEQ ID NO: 42)
MHHHHHHHHGGGGGIEGRGSPLRDEDIQVQENFDLPRIYGKWYEIAIASTCPWVKNHKD KMFMGTMVLQEGEQSDRISTTSTRIRDGTCSQITGYYTLTTTPGKFAYHNSKWNLDVNSYWHT NYDEYSIVMMQKYKSSNSTTTVRLYGRTQELRDSLHAEFKKFALDQGIDEDSIYILPKRDECVP GEPKAESLMAR
21. М8Н5С1ЕСР-человек L89T (SEQ ID NO: 43)
MHHHHHHHHGGGGGIEGRGPVPTPPDNIQVQENFNISRIYGKWYNLAIGSTCPWLKKIM DRMTVSTLVLGEGATEAEISMTSTRWRKGVCEETSGAYEKTDTDGKFTYHKSKWNITMESYWH TNYDEYAIFLTKKFSRHHGPTITAKLYGRAPQLRETLLQDFRWAQGVGIPEDSIFTMADRGEC VPGEQEPEPILIPR
22. M8H5GIEGR-4enoBeK N1796D (SEQ ID NO: 44)
MHHHHHHHHGGGGGIEGRGPVPTPPDNIQVQENFDISRIYGKWYNLAIGSTCPWLKKIM DRMTVSTLVLGEGATEAEISMTSTRWRKGVCEETSGAYEKTDTDGKFLYHKSKWDITMESYWH TNYDEYAIFLTKKFSRHHGPTITAKLYGRAPQLRETLLQDFRWAQGVGIPEDSIFTMADRGEC VPGEQEPEPILIPR
23. M8H5GIEGR-4enoBeK T45K (SEQ ID NO: 45)
MHHHHHHHHGGGGGIEGRGPVPTPPDNIQVQENFNISRIYGKWYNLAIGSTCPWLKKIM DRMKVSTLVLGEGATEAEISMTSTRWRKGVCEETSGAYEKTDTDGKFLYHKSKWNITMESYWH TNYDEYAIFLTKKFSRHHGPTITAKLYGRAPQLRETLLQDFRWAQGVGIPEDSIFTMADRGEC VPGEQEPEPILIPR
24. M8H5GIEGR-4enoBeK A135E (SEQ ID NO: 46)
MHHHHHHHHGGGGGIEGRGPVPTPPDNIQVQENFNISRIYGKWYNLAIGSTCPWLKKIM DRMTVSTLVLGEGATEAEISMTSTRWRKGVCEETSGAYEKTDTDGKFLYHKSKWNITMESYWH TNYDEYAIFLTKKFSRHHGPTITAKLYGREPQLRETLLQDFRWAQGVGIPEDSIFTMADRGEC VPGEQEPEPILIPR
25. M8H5GIEGR-4enoBeK V170S (SEQ ID NO: 47)
MHHHHHHHHGGGGGIEGRGPVPTPPDNIQVQENFNISRIYGKWYNLAIGSTCPWLKKIM DRMTVSTLVLGEGATEAEISMTSTRWRKGVCEETSGAYEKTDTDGKFLYHKSKWNITMESYWH TNYDEYAIFLTKKFSRHHGPTITAKLYGRAPQLRETLLQDFRWAQGVGIPEDSIFTMADRGEC SPGEQEPEPILIPR
26. M8H5GIEGR-4enoBeK V148D (SEQ ID NO: 48)
MHHHHHHHHGGGGGIEGRGPVPTPPDNIQVQENFNISRIYGKWYNLAIGSTCPWLKKIM DRMTVSTLVLGEGATEAEISMTSTRWRKGVCEETSGAYEKTDTDGKFLYHKSKWNITMESYWH
- 42 039776
TNYDEYAIFLTKKFSRHHGPTITAKLYGRAPQLRETLLQDFRDVAQGVGIPEDSIFTMADRGEC VPGEQEPEPILIPR
27. М8Н5С1ЕСР-человек G172Q (SEQ ID NO: 49)
MHHHHHHHHGGGGGIEGRGPVPTPPDNIQVQENFNISRIYGKWYNLAIGSTCPWLKKIM DRMTVSTLVLGEGATEAEISMTSTRWRKGVCEETSGAYEKTDTDGKFLYHKSKWNITMESYWH TNYDEYAIFLTKKFSRHHGPTITAKLYGRAPQLRETLLQDFRWAQGVGIPEDSIFTMADRGEC VPQEQEPEPILIPR
33. М8Н4ОК-человек M41K+R66H (SEQ ID NO: 50)
MHHHHHHHHDDDDKGPVPTPPDNIQVQENFNISRIYGKWYNLAIGSTCPWLKKIKDRMT VSTLVLGEGATEAEISMTSTHWRKGVCEETSGAYEKTDTDGKFLYHKSKWNITMESYWHTNYD EYAIFLTKKFSRHHGPTITAKLYGRAPQLRETLLQDFRWAQGVGIPEDSIFTMADRGECVPGE QEPEPILIPR
34. М8Н4ОК-человек M41K+N1796D (SEQ ID NO: 51)
MHHHHHHHHDDDDKGPVPTPPDNIQVQENFDISRIYGKWYNLAIGSTCPWLKKIKDRMT VSTLVLGEGATEAEISMTSTRWRKGVCEETSGAYEKTDTDGKFLYHKSKWDITMESYWHTNYD EYAIFLTKKFSRHHGPTITAKLYGRAPQLRETLLQDFRWAQGVGIPEDSIFTMADRGECVPGE QEPEPILIPR
35. М8Н4ОК-человек R66H+N1796D (SEQ ID NO: 52)
MHHHHHHHHDDDDKGPVPTPPDNIQVQENFDISRIYGKWYNLAIGSTCPWLKKIMDRMT VSTLVLGEGATEAEISMTSTHWRKGVCEETSGAYEKTDTDGKFLYHKSKWDITMESYWHTNYD EYAIFLTKKFSRHHGPTITAKLYGRAPQLRETLLQDFRWAQGVGIPEDSIFTMADRGECVPGE QEPEPILIPR
36. М8Н4ОК-человек M41K+R66H+N1796D (SEQ ID NO: 53)
MHHHHHHHHDDDDKGPVPTPPDNIQVQENFDISRIYGKWYNLAIGSTCPWLKKIKDRMT VSTLVLGEGATEAEISMTSTHWRKGVCEETSGAYEKTDTDGKFLYHKSKWDITMESYWHTNYD EYAIFLTKKFSRHHGPTITAKLYGRAPQLRETLLQDFRWAQGVGIPEDSIFTMADRGECVPGE QEPEPILIPR
37. М8Н4ОК-человек M41K (SEQ ID NO: 8)
MHHHHHHHHDDDDKGPVPTPPDNIQVQENFNISRIYGKWYNLAIGSTCPWLKKIKDRMT VSTLVLGEGATEAEISMTSTRWRKGVCEETSGAYEKTDTDGKFLYHKSKWNITMESYWHTNYD EYAIFLTKKFSRHHGPTITAKLYGRAPQLRETLLQDFRWAQGVGIPEDSIFTMADRGECVPGE QEPEPILIPR
38. М8Н4ОК-человек R66H (SEQ ID NO: 54)
MHHHHHHHHDDDDKGPVPTPPDNIQVQENFNISRIYGKWYNLAIGSTCPWLKKIMDRMT VSTLVLGEGATEAEISMTSTHWRKGVCEETSGAYEKTDTDGKFLYHKSKWNITMESYWHTNYD EYAIFLTKKFSRHHGPTITAKLYGRAPQLRETLLQDFRWAQGVGIPEDSIFTMADRGECVPGE
- 43 039776
QEPEPILIPR
39. М8Н4ОК-человек N1796D (SEQ ID NO: 55)
MHHHHHHHHDDDDKGPVPTPPDNIQVQENFDISRIYGKWYNLAIGSTCPWLKKIMDRMT VSTLVLGEGATEAEISMTSTRWRKGVCEETSGAYEKTDTDGKFLYHKSKWDITMESYWHTNYD EYAIFLTKKFSRHHGPTITAKLYGRAPQLRETLLQDFRWAQGVGI PEDSIFTMADRGECVPGE QEPEPILIPR
40. М8Н-человеческий wt (SEQ ID NO: 56)
MHHHHHHHHGPVPTPPDNIQVQENFNISRIYGKWYNLAIGSTCPWLKKIMDRMTVSTLV LGEGATEAEISMTSTRWRKGVCEETSGAYEKTDTDGKFLYHKSKWNITMESYWHTNYDEYAIF LTKKFSRHHGPTITAKLYGRAPQLRETLLQDFRWAQGVGIPEDSIFTMADRGECVPGEQEPEP ILIPR
41. М8Н-человек R66H+N1796D (SEQ ID NO: 57)
MHHHHHHHHGPVPTPPDNIQVQENFDISRIYGKWYNLAIGSTCPWLKKIMDRMTVSTLV LGEGATEAEISMTSTHWRKGVCEETSGAYEKTDTDGKFLYHKSKWDITMESYWHTNYDEYAIF LTKKFSRHHGPTITAKLYGRAPQLRETLLQDFRWAQGVGIPEDSIFTMADRGECVPGEQEPEP ILIPR
42. R66H+N1796D (SEQ ID NO: 3)
MGPVPTPPDNIQVQENFDISRIYGKWYNLAIGSTCPWLKKIMDRMTVSTLVLGEGATEA EISMTSTHWRKGVCEETSGAYEKTDTDGKFLYHKSKWDITMESYWHTNYDEYAIFLTKKFSRH HGPTITAKLYGRAPQLRETLLQDFRWAQGVGIPEDSIFTMADRGECVPGEQEPEPILIPR
61. без метки, человеческий wt (SEQ ID NO: 2)
MGPVPTPPDNIQVQENFNISRIYGKWYNLAIGSTCPWLKKIMDRMTVSTLVLGEGATEA ΕISMTSTRWRKGVCEETSGAYEKTDTDGKFLYHKSKWNITMESYWHTNYDEYAIFLTKKFSRH HGPTITAKLYGRAPQLRETLLQDFRWAQGVGIPEDSIFTMADRGECVPGEQEPEPILIPR
Последовательность ДНК всех конструкций.
60. М8Н4ОК-человеческий wt (SEQ ID NO: 58)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGATGACGATGACAAGGGCCCTGTGCCAACGCC GCCCGACAACATCCAAGTGCAGGAAAACTTCAATATCTCTCGGATCTATGGGAAGTGGTACAAC CTGGCCATCGGTTCCACCTGCCCCTGGCTGAAGAAGATCATGGACAGGATGACAGTGAGCACGC TGGTGCTGGGAGAGGGCGCTACAGAGGCGGAGATCAGCATGACCAGCACTCGTTGGCGGAAAGG TGTCTGTGAGGAGACGTCTGGAGCTTATGAGAAAACAGATACTGATGGGAAGTTTCTCTATCAC AAAT С С AAAT G GAAC AT AAC C AT G GAG TCCTATGTGGTC С AC AC С AAC TAT GAT GAG T AT G С C A TTTTCCTGACCAAGAAATTCAGCCGCCATCATGGACCCACCATTACTGCCAAGCTCTACGGGCG GGCGCCGCAGCTGAGGGAAACTCTCCTGCAGGACTTCAGAGTGGTTGCCCAGGGTGTGGGCATC CCTGAGGACTCCATCTTCACCATGGCTGACCGAGGTGAATGTGTCCCTGGGGAGCAGGAACCAG AGCCCATCTTAATCCC GAGAT GA
- 44 039776
1. M8H5GIEGR-Mbmib (SEQ ID NO: 59)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGGTGGAGGAGGGGGTATCGAGGGCCGCGACCC TGCGTCAACACTGCCAGATATCCAGGTTCAGGAGAACTTCAGTGAGTCCCGGATCTATGGAAAA TGGTACAACCTGGCGGTGGGATCCACCTGCCCGTGGCTGAGCCGCATTAAGGACAAGATGAGCG TGAGCACGCTGGTGCTGCAGGAGGGGGCGACAGAAACAGAGATCAGCATGACCAGTACTCGATG GCGGAGAGGTGTCTGTGAGGAGATCACTGGGGCGTACCAGAAGACGGACATCGATGGAAAGTTC С T С TAC СACAAAT С СAAAT G GAACATAAC С T T G GAAT CCTATGTGGTC СACAC СAAC TAT GAC G AATATGCCATTTTCCTTACCAAGAAGTCCAGCCACCACCACGGGCTCACCATCACTGCCAAGCT CTATGGTCGGGAGCCACAGCTGAGGGACAGCCTTCTGCAGGAGTTCAAGGATGTGGCCCTGAAT GTGGGCATCTCTGAGAACTCCATCATTTTTATGCCTGACAGAGGGGAATGTGTCCCTGGGGATC GGGAGGTGGAGCCCACATCAATTGCCAGATGA
2. M8H5GIEGR-ronbiii землекоп (SEQ ID NO: 60)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGGTGGAGGAGGGGGTATCGAGGGCCGCAATCC TGTGCCGATGCCGCCAGACAACATCCAAGTGCAGGAGAACTTTGATGAATCCCGGATCTATGGG AAATGGTTCAACCTGGCTACGGGCTCCACGTGCCCGTGGCTGAAGAGGATCAAAGACAGGCTGA GTGTGAGCACAATGGTGCTGGGCAAGGGGACCACGGAGACACAGATCAGCACAACCCACACCCA CTGGCGGCAAGGGGTGTGCCAGGAGACCTCAGGGGTTTACAAGAAAACAGACACGGCTGGGAAG TTССTСTACCACAAGTСCAAATGGAATGTAACCATGGAGTССTATGTGGTССACACCAACTATG AT GAG TATGCCATCATTC TAAC TAAGAAG T T CAG С СAC СAC CAT G GAC C GAC CAT TAC T G С СAA GCTCTATGGGAGAGAGCCGCGGCTGAGAGACAGCCTCCTGCAGGAATTCAGGGAGATGGCCCTG GGCGTAGGCATCCCCGAGGATTCCATCTTCACAATGGCCAACAGAGGGGAATGTGTCCCTGGTG AC CAG G СAC CAGAG T С СAC С C CAG С С С C GAG G T GA
3. M8H5GIEGR-nnrymKa (SEQ ID NO: 61)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGGTGGAGGAGGGGGTATCGAGGGCCGCTGCAG CCCAATCCAGCCAGAGGACAATATCCAGATCCAGGAGAACTTTGATCTCCAGAGGATTTATGGC AAATGGTACGACATTGCCATCGGCTCCACCTGCAAATGGCTGAAGCACCACAAGGAAAAGTTCA ACATGGGGACACTGGAGCTTAGCGATGGGGAGACCGACGGGGAGGTGCGGATTGTGAACACAAG GATGAGGCACGGAACCTGCTCTCAGATTGTTGGGTCCTATCAGAAGACAGAGACCCCAGGGAAG TTCGACTATTTCAACGCACGGTGGGGAACCACGATCCAAAACTACATTGTCTTCACTAACTACA ATGAGTATGTCATCATGCAGATGAGGAAGAAGAAGGGATCGGAGACCACCACGACCGTCAAGCT GTATGGGCGGAGCCCAGACTTGCGTCCGACCCTCGTTGATGAATTCAGGCAGTTTGCCTTGGCT CAGGGCATTCCTGAAGACTCCATCGTGATGCTACCTAACAATGGTGAGTGCTCTCCAGGGGAAA TAGAAG T GAGAC CAC G GAGAT GA
4. M8H5GIEGR-UbinnenoK (SEQ ID NO: 62)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGGTGGAGGAGGGGGTATCGAGGGCCGCACGCC TGTTGGGGACCAGGATGAGGACATTCAAGTGCAAGAGAATTTTGAGCCTGAGCGGATGTATGGG
- 45 039776
AAATGGTATGACGTAGCTGTTGGCACCACCTGCAAGTGGATGAAGAACTACAAGGAGAAGTTCA GCATGGGCACACTGGTGCTGGGCCCCGGCCCCAGCGCTGACCAGATCAGTACCATCAGCACCAG GCTGCGGCAAGGTGACTGCAAACGTGTCTCAGGAGAGTACCAGAAAACTGACACCCCTGGCAAA TACACCTACTATAACCCCAAGTGGGATGTGTCTATCAAGTCCTACGTGCTTCGCACCAACTATG AAGAATAC G GAG T CAT T С T GAT GAAGAAGACAAG TAATTTTGGCC СAAC САС САСAC T GAAG С T GTATGGGAGAAGCCCAGAGCTGCGGGAAGAGCTCACCGAGGCTTTCCAGCAGCTGGCTCTGGAG ATGGGCATCCCTGCAGATTCCGTCTTCATCCTGGCCAACAAAGGTGAATGTGTCCCACAGGAGA CTGCCACTGCCCCTGAGAGGTGA
5. М8Н5С1ЕСИ-кролик (SEQ ID NO: 63)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGGTGGAGGAGGGGGTATCGAGGGCCGCGACCC CGTGCCCACCCTGCCGGACGACATCCAAGTGCAGGAGAACTTCGAGCTCTCTCGGATCTACGGG AAATGGTACAACCTGGCTGTGGGGTCCACCTGCCCGTGGCTGAAGAGGATCAAGGACAGGATGG CCGTGAGCACGCTGGTGCTGGGAGAGGGGACGAGCGAGACGGAGATCAGCATGACCAGCACGCA CTGGCGGAGGGGCGTCTGTGAGGAGATCTCCGGGGCCTATGAGAAAACGGACACTGACGGGAAG TTCCTGTACCACAAAGCCAAATGGAACTTAACCATGGAGTCCTACGTGGTGCACACCAACTACG ATGAGTATGCCATTTTTCTCACCAAGAAATTCAGCCGCCGCCACGGCCCCACCATCACCGCCAA GCTCTATGGGCGGGAGCCGCAGCTGAGGGAGAGCCTCCTGCAGGAGTTCAGGGAGGTGGCTCTC GGGGTGGGGATCCCCGAGAACTCCATCTTCACCATGATCGACAGAGGGGAATGTGTGCCCGGGC AGCAGGAACCAAAGCCTGCCCCCGTGTTGAGATGA
6. М8Н5С1ЕСИ-беличья обезьяна (SEQ ID NO: 64)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGGTGGAGGAGGGGGTATCGAGGGCCGCAGCCC AGTGCCGACGCCGCCCGAAGGCATTCAAGTGCAGGAAAACTTCAATCTCTCTCGGATCTACGGC AAGTGGTACAACCTGGCCATCGGTTCCACCTGCCCCTGGCTAAAGAAGATCATGGACAGGTTGA AAGTGAGCACGCTGGTGCTGGAAGAGGGCGCCACGGAGGCGGAGATCAGCATGACCAGCACTCG CTGGCGGAAAGGTTTCTGTGAGCAGACCTCTTGGGCTTATGAGAAAACAGATACTGATGGGAAG TTTСTСTATCACGAACССAAATGGAACGTAACCATGGAGTССTATGTGGСССACACCAACTATG AGGAGTATGCCATTTTCCTGACCAAGAAATTCAGCCGCCATCATGGACCCACCATTACTGCCAA GCTCTATGGGCGGGAGCCACAGCTGAGGGAAAGCCTCCTGCAGGACTTCAGAGTGGTTGCCCAG GGTGTGGGCATCCCTGAGGATTCCATCTTCACCATGGCTAACCGAGGTGAATGCGTCCCTGGGG AG CAG GAAC CACAG С С CAT С С ТАСAC C G GAGAT GA
7. М8Н5С1ЕСИ-морж (SEQ ID NO: 65)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGGTGGAGGAGGGGGTATCGAGGGCCGCAGTCC CGTGCTGACGCCGCCTGACGCCATCCAAGTGCAAGAGAACTTCGACATCTCTCGGATCTACGGG AAGTGGTTTCATGTGGCCATGGGCTCCACCTGCCCGTGGCTGAAGAAGTTCATGGACAGGATGT CCATGAGCACGCTGGTGCTGGGCGAGGGGGCGACGGATGGGGAGATCAGCATGACCAGCACACG TTGGCGGAGAGGCACCTGTGAGGAGATCTCTGGGGCTTATGAGAAAACCAGCACTAACGGAAAG
- 46 039776
Т Т С С Т С ТАТ САТААТ С ССАААТ GGAACАТ САССAT GGAGTCCTATGTGGTCСАСАССGAC ТAT G ATGAGTACGCCATCTTTCTGACCAAGAAATTCAGCCGCCACCATGGGCCCACCATTACTGCCAA GCTCTATGGGCGACAGCCGCAGCTTCGAGAAAGCCTGCTGGAGGAGTTCAGGGAGCTTGCCTTG GGTGTGGGCATCCCCGAGGACTCCATCTTCACCATGGCCAACAAAGGTGAGTGTGTCCCTGGGG AG СAG GAAC СAGAG С С С Т С Т С СACACAT GAG G Т GA
8. М8Н561ЕСИ-ламантин (SEQ ID NO: 66)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGGTGGAGGAGGGGGTATCGAGGGCCGCAGCCC AGTGAAAACACCACTCAACGACATCCAAGTGCAGGAGAACTTTGACCTCCCTCGGATCTACGGG AAATGGTTCAACATAGCCATTGGCTCCACCTGCCAATGGCTGAAGAGGTTGAAGGCCGGGCCGA CCATGAGCACCCTGGTCCTGGGAGAGGGAGCTACAGACACAGAGATCAGCACAACCAGCACTCG TTGGCGGAAAGGCTTCTGTGAGGAGATCTCTGGGGCATATGAGAAAACAGACACAGCTGGGAAG TTCCTTTATCACGGATCCAAATGGAATGTAACCTTGGAGTCCTATGTGGTCCACACCAACTATG ATGAGTACGCCATTTTTCTGACCAAGAAATTCAGCCGCTATGGACTCACCATTACTGCTAAGCT CTATGGGCGGCAGCCTCAGGTGAGGGAGAGCCTCCTGGAGGAGTTCAGGGAATTTGCCCTGGGT GTGGGCATCCCTGAGGATTCCATCTTCACCACGGCCGACAAAGGTGAGTGTGTCCCTGGAGAGC AGGAGCCAGAACCCACCGCAGCCCTGAGATGA
9. М8Н561ЕСИ-камбала (SEQ ID NO: 67)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGGTGGAGGAGGGGGTATCGAGGGCCGCCTCCC TGTGCTCCCTGAACCTCTTTACCCGACACAGGAGAACTTTGATCTGACCCGGTTTGTGGGGACA TGGCACGATGTTGCCTTGACGAGCAGCTGCCCCCATATGCAGCGTAACAGGGCGGATGCAGCCA T T GGTAAAC T GGT T С T GGAGAAAGACAC T GGAAACAAAC T CAAGGT GACACGAAC TAGAC T CAG ACATGGAACATGTGTGGAGATGTCTGGAGAATATGAGTTAACCAGCACACCAGGACGAATCTTC TACCATATTGACAGGTGGGATGCAGACGTGGACGCCTACGTGGTTCACACCAACTACGACGAGT ACGCAATTATAATAATGAGCAAACAGAAAACATCGGGGGAGAACAGCACСTСАСTCAAGCTGTA CAGTCGGACGATGTCTGTGAGAGACACTGTGCTGGATGACTTCAAAACTCTGGTCAGACATCAG GGAATGAGTGACGACACCATTATCATCAAGCAGAACAAAGGTGACTGTATTCCTGGAGAGCAGG TGGAAGAAGCACCATCTCAGCCAGAGCCCAAGCGGTGA
10. M8H5GIEGR-opaHryTaHr (SEQ ID NO: 68)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGGTGGAGGAGGGGGTATCGAGGGCCGCGGCCC TGTGCCGACGCCGCCCGACAACATCCAAGTGCAGGAAAACTTCAATATCTCTCGGATCTATGGG AAGTGGTACAACCTGGCCATCGGTTCCACCTGCCCCTGGCTGAAGAAGATCATGGACAGGATGA CAGTGAGCACCCTGGTGCTGGGAGAGGGCGCTACAGAGGCGGAGATCAGCATGACCAGCACTCG TTGGCGGAAAGGTGTСTGTGAGGAGACATСTGGAGCTTATGAGAAAACAGATACTGATGGGAAG ТТТСТСТАТ СACАААТ С СAAAT G GAACATAAC CAT G GAG TCCTATGTGGTC СACAC СAAC TAT G ATGAGTATGCCATTTTCCTGACCAAGAAATTCAGCCGCCGTCATGGACCCACCATTACTGCCAA GCTCTACGGGCGGGCGCCGCAGCTGAGGGAAACCCTCCTGCAGGACTTCAGAGTGGTTGCCCAG
- 47 039776
GGTGTGGGCATCCCTGAGGACTCCATCTTCACCATGGCTGACCGAGGTGAATGTGTCCCTGGGG AACAG GAAC CAGAG CCCATCTTAATCCC GAGAT GA
11. М8Н561Е6Н-человек P35K (SEQ ID NO:69)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGGTGGAGGAGGGGGTATCGAGGGCCGCGGCCC TGTGCCAACGCCGCCCGACAACATCCAAGTGCAGGAAAACTTCAATATCTCTCGGATCTATGGG AAGTGGTACAACCTGGCCATCGGTTCCACCTGCAAATGGCTGAAGAAGATCATGGACAGGATGA CAGTGAGCACGCTGGTGCTGGGAGAGGGCGCTACAGAGGCGGAGATCAGCATGACCAGCACTCG TTGGCGGAAAGGTGTCTGTGAGGAGACGTCTGGAGCTTATGAGAAAACAGATACTGATGGGAAG TTTCTCTAT СACAAAT С СAAAT G GAACATAAC CAT G GAG TCCTATGTGGTC СACAC CAAC TAT G ATGAGTATGCCATTTTCCTGACCAAGAAATTCAGCCGCCATCATGGACCCACCATTACTGCCAA GCTCTACGGGCGGGCGCCGCAGCTGAGGGAAACTCTCCTGCAGGACTTCAGAGTGGTTGCCCAG GGTGTGGGCATCCCTGAGGACTCCATCTTCACCATGGCTGACCGAGGTGAATGTGTCCCTGGGG AG CAG GAAC CAGAG CCCATCTTAATCCC GAGAT GA
12. М8Н561Е6Н-человек M41K (SEQ ID NO: 70
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGGTGGAGGAGGGGGTATCGAGGGCCGCGGCCC TGTGCCAACGCCGCCCGACAACATCCAAGTGCAGGAAAACTTCAATATCTCTCGGATCTATGGG AAGTGGTACAACCTGGCCATCGGTTCCACCTGCCCCTGGCTGAAGAAGATCAAAGACAGGATGA CAGTGAGCACGCTGGTGCTGGGAGAGGGCGCTACAGAGGCGGAGATCAGCATGACCAGCACTCG TTGGCGGAAAGGTGTCTGTGAGGAGACGTCTGGAGCTTATGAGAAAACAGATACTGATGGGAAG TTTCTCTAT C AC AAAT С C AAAT G GAAC AT AAC C AT G GAG TCCTATGTGGTC С AC AC C AAC T AT G ATGAGTATGCCATTTTCCTGACCAAGAAATTCAGCCGCCATCATGGACCCACCATTACTGCCAA GCTCTACGGGCGGGCGCCGCAGCTGAGGGAAACTCTCCTGCAGGACTTCAGAGTGGTTGCCCAG GGTGTGGGCATCCCTGAGGACTCCATCTTCACCATGGCTGACCGAGGTGAATGTGTCCCTGGGG AG CAG GAAC CAGAG CCCATCTTAATCCC GAGAT GA
13. M8H5GIEGR-4enoBeK R66H (SEQ ID NO: 71)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGGTGGAGGAGGGGGTATCGAGGGCCGCGGCCC TGTGCCAACGCCGCCCGACAACATCCAAGTGCAGGAAAACTTCAATATCTCTCGGATCTATGGG AAGTGGTACAACCTGGCCATCGGTTCCACCTGCCCCTGGCTGAAGAAGATCATGGACAGGATGA CAGTGAGCACGCTGGTGCTGGGAGAGGGCGCTACAGAGGCGGAGATCAGCATGACCAGCACTCA TTGGCGGAAAGGTGTCTGTGAGGAGACGTCTGGAGCTTATGAGAAAACAGATACTGATGGGAAG TTTCTCTAT CACAAATСCAAAT GGAACATAACCAT GGAGTCCTATGTGGTCСACACC AAC TAT G ATGAGTATGCCATTTTCCTGACCAAGAAATTCAGCCGCCATCATGGACCCACCATTACTGCCAA GCTCTACGGGCGGGCGCCGCAGCTGAGGGAAACTCTCCTGCAGGACTTCAGAGTGGTTGCCCAG GGTGTGGGCATCCCTGAGGACTCCATCTTCACCATGGCTGACCGAGGTGAATGTGTCCCTGGGG AG CAG GAAC CAGAG CCCATCTTAATCCC GAGAT GA
14. M8H5GIEGR-4enoBeK T75K (SEQ ID NO: 72)
- 48 039776
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGGTGGAGGAGGGGGTATCGAGGGCCGCGGCCC TGTGCCAACGCCGCCCGACAACATCCAAGTGCAGGAAAACTTCAATATCTCTCGGATCTATGGG AAGTGGTACAACCTGGCCATCGGTTCCACCTGCCCCTGGCTGAAGAAGATCATGGACAGGATGA CAGTGAGCACGCTGGTGCTGGGAGAGGGCGCTACAGAGGCGGAGATCAGCATGACCAGCACTCG TTGGCGGAAAGGTGTCTGTGAGGAGAAATCTGGAGCTTATGAGAAAACAGATACTGATGGGAAG TTTCTCTAT СACAAAT С СAAAT G GAACATAAC CAT G GAG TCCTATGTGGTC СACAC СAAC TAT G ATGAGTATGCCATTTTCCTGACCAAGAAATTCAGCCGCCATCATGGACCCACCATTACTGCCAA GCTCTACGGGCGGGCGCCGCAGCTGAGGGAAACTCTCCTGCAGGACTTCAGAGTGGTTGCCCAG GGTGTGGGCATCCCTGAGGACTCCATCTTCACCATGGCTGACCGAGGTGAATGTGTCCCTGGGG AG CAG GAAC CAGAG CCCATCTTAATCCC GAGAT GA
15. M8H5GIEGR-4eJiOBeK T75Y (SEQ ID NO: 73)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGGTGGAGGAGGGGGTATCGAGGGCCGCGGCCC TGTGCCAACGCCGCCCGACAACATCCAAGTGCAGGAAAACTTCAATATCTCTCGGATCTATGGG AAGTGGTACAACCTGGCCATCGGTTCCACCTGCCCCTGGCTGAAGAAGATCATGGACAGGATGA CAGTGAGCACGCTGGTGCTGGGAGAGGGCGCTACAGAGGCGGAGATCAGCATGACCAGCACTCG TTGGCGGAAAGGTGTCTGTGAGGAGTATTCTGGAGCTTATGAGAAAACAGATACTGATGGGAAG TTTCTCTAT CACAAAT С CAAAT G GAACATAAC CAT G GAG TCCTATGTGGTC СACAC CAAC TAT G ATGAGTATGCCATTTTCCTGACCAAGAAATTCAGCCGCCATCATGGACCCACCATTACTGCCAA GCTCTACGGGCGGGCGCCGCAGCTGAGGGAAACTCTCCTGCAGGACTTCAGAGTGGTTGCCCAG GGTGTGGGCATCCCTGAGGACTCCATCTTCACCATGGCTGACCGAGGTGAATGTGTCCCTGGGG AG CAG GAAC CAGAG CCCATCTTAATCCC GAGAT GA
16. M8H5GIEGR-4eJiOBeK M99K (SEQ ID NO: 74)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGGTGGAGGAGGGGGTATCGAGGGCCGCGGCCC TGTGCCAACGCCGCCCGACAACATCCAAGTGCAGGAAAACTTCAATATCTCTCGGATCTATGGG AAGTGGTACAACCTGGCCATCGGTTCCACCTGCCCCTGGCTGAAGAAGATCATGGACAGGATGA CAGTGAGCACGCTGGTGCTGGGAGAGGGCGCTACAGAGGCGGAGATCAGCATGACCAGCACTCG TTGGCGGAAAGGTGTCTGTGAGGAGACGTCTGGAGCTTATGAGAAAACAGATACTGATGGGAAG TTTCTCTAT CACAAAT С CAAAT G GAACATAAC CAAAGAG TCCTATGTGGTC СACAC CAAC TAT G ATGAGTATGCCATTTTCCTGACCAAGAAATTCAGCCGCCATCATGGACCCACCATTACTGCCAA GCTCTACGGGCGGGCGCCGCAGCTGAGGGAAACTCTCCTGCAGGACTTCAGAGTGGTTGCCCAG GGTGTGGGCATCCCTGAGGACTCCATCTTCACCATGGCTGACCGAGGTGAATGTGTCCCTGGGG AG CAG GAAC CAGAG CCCATCTTAATCCC GAGAT GA
17. M8H5GIEGR-4eJiOBeK S101Y (SEQ ID NO: 75)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGGTGGAGGAGGGGGTATCGAGGGCCGCGGCCC TGTGCCAACGCCGCCCGACAACATCCAAGTGCAGGAAAACTTCAATATCTCTCGGATCTATGGG AAGTGGTACAACCTGGCCATCGGTTCCACCTGCCCCTGGCTGAAGAAGATCATGGACAGGATGA
- 49 039776
CAGTGAGCACGCTGGTGCTGGGAGAGGGCGCTACAGAGGCGGAGATCAGCATGACCAGCACTCG TTGGCGGAAAGGTGTCTGTGAGGAGACGTCTGGAGCTTATGAGAAAACAGATACTGATGGGAAG TTTCTCTAT GAGAAAT С CAAAT G GAACATAAC CAT G GAG TATTATGTGGTC СACAC CAAC TAT G ATGAGTATGCCATTTTCCTGACCAAGAAATTCAGCCGCCATCATGGACCCACCATTACTGCCAA GCTCTACGGGCGGGCGCCGCAGCTGAGGGAAACTCTCCTGCAGGACTTCAGAGTGGTTGCCCAG GGTGTGGGCATCCCTGAGGACTCCATCTTCACCATGGCTGACCGAGGTGAATGTGTCCCTGGGG AG CAG GAAC CAGAG CCCATCTTAATCCC GAGAT GA
18. M8H5GIEGR-4enoBeK K69.92.118.130R (SEQ ID NO: 76)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGGTGGAGGAGGGGGTATCGAGGGCCGCGGCCC TGTGCCAACGCCGCCCGACAACATCCAAGTGCAGGAAAACTTCAATATCTCTCGGATCTATGGG AAGTGGTACAACCTGGCCATCGGTTCCACCTGCCCCTGGCTGAAGAAGATCATGGACAGGATGA CAGTGAGCACGCTGGTGCTGGGAGAGGGCGCTACAGAGGCGGAGATCAGCATGACCAGCACTCG TTGGCGGCGTGGTGTCTGTGAGGAGACGTCTGGAGCTTATGAGAAAACAGATACTGATGGGAAG TTTСTСTATСACCGTTСCAAATGGAACATAACCATGGAGTССTATGTGGTССACACCAACTATG ATGAGTATGCCATTTTCCTGACCAAGCGTTTCAGCCGCCATCATGGACCCACCATTACTGCCCG TCTCTACGGGCGGGCGCCGCAGCTGAGGGAAACTCTCCTGCAGGACTTCAGAGTGGTTGCCCAG GGTGTGGGCATCCCTGAGGACTCCATCTTCACCATGGCTGACCGAGGTGAATGTGTCCCTGGGG AG CAG GAAC CAGAG CCCATCTTAATCCC GAGAT GA
19. M8H5GIEGR-naTHMepnM (SEQ ID NO: 77)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGGTGGAGGAGGGGGTATCGAGGGCCGCGGAAG TCCCCTTC GAGAT GAAGACAT С CAAG T G CAG GAGAAC T T T GAC С T T С C CAG GAT T TAT G GAAAA TGGTACGAAATTGCAATCGCTTCGACCTGTCCCTGGGTGAAGAATCACAAGGATAAGATGTTCA TGGGAACTATGGTGCTACAAGAGGGAGAGCAGAGTGACCGGATCAGTACCACCTCCACCCGAAT CAGGGATGGAACCTGCTCACAGATCACTGGATATTACACGTTAACCACAACACCTGGGAAGTTC G С T TAT СACAAT T С TAAAT G GAAC T T G GAT G T CAACAG TTATGTTGTT СACAC TAAC TAT GAC G AATACTCGATTGTGATGATG CAGAAATACAAAAG С T С TAAC T С TAC CAC TAGAG T С C GAC T С TA TGGAAGAACTCAAGAGCTACGAGACAGCTTGCATGCCGAGTTCAAAAAGTTTGCTCTGGATCAG G GAATAGAT GAG GAC T С CAT T TAGAT T С T G С CAAAAAGAGAT GAAT GTGTACCTGGT GAAC СТА AAGCAGAATCTCTCATGGCACGTTGA
21. M8H5GIEGR-4enoBeK L89T (SEQ ID NO: 78)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGGTGGAGGAGGGGGTATCGAGGGCCGCGGCCC TGTGCCAACGCCGCCCGACAACATCCAAGTGCAGGAAAACTTCAATATCTCTCGGATCTATGGG AAGTGGTACAACCTGGCCATCGGTTCCACCTGCCCCTGGCTGAAGAAGATCATGGACAGGATGA CAGTGAGCACGCTGGTGCTGGGAGAGGGCGCTACAGAGGCGGAGATCAGCATGACCAGCACTCG TTGGCGGAAAGGTGTCTGTGAGGAGACGTCTGGAGCTTATGAGAAAACAGATACTGATGGGAAG TTTACCTAT CACAAAT С CAAAT G GAACATAAC CAT G GAG TCCTATGTGGTC СACAC CAAC TAT G
- 50 039776
ATGAGTATGCCATTTTCCTGACCAAGAAATTCAGCCGCCATCATGGACCCACCATTACTGCCAA GCTCTACGGGCGGGCGCCGCAGCTGAGGGAAACTCTCCTGCAGGACTTCAGAGTGGTTGCCCAG GGTGTGGGCATCCCTGAGGACTCCATCTTCACCATGGCTGACCGAGGTGAATGTGTCCCTGGGG AG GAG GAAC CAGAG CCCATCTTAATCCC GAGAT GA
22. M8H5GIEGR-4eiiOBeK N1796D (SEQ ID NO: 79)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGGTGGAGGAGGGGGTATCGAGGGCCGCGGCCC TGTGCCAACGCCGCCCGACAACATCCAAGTGCAGGAAAACTTCGATATCTCTCGGATCTATGGG AAGTGGTACAACCTGGCCATCGGTTCCACCTGCCCCTGGCTGAAGAAGATCATGGACAGGATGA CAGTGAGCACGCTGGTGCTGGGAGAGGGCGCTACAGAGGCGGAGATCAGCATGACCAGCACTCG TTGGCGGAAAGGTGTCTGTGAGGAGACGTCTGGAGCTTATGAGAAAACAGATACTGATGGGAAG ТТТСТСТАТ СACAAAT С СAAAT G G GATATAAC CAT G GAG TCCTATGTGGTC СACAC CAAC TAT G ATGAGTATGCCATTTTCCTGACCAAGAAATTCAGCCGCCATCATGGACCCACCATTACTGCCAA GCTCTACGGGCGGGCGCCGCAGCTGAGGGAAACTCTCCTGCAGGACTTCAGAGTGGTTGCCCAG GGTGTGGGCATCCCTGAGGACTCCATCTTCACCATGGCTGACCGAGGTGAATGTGTCCCTGGGG AG CAG GAAC CAGAG CCCATCTTAATCCC GAGAT GA
23. М8Н561Е6Е-человек T45K (SEQ ID NO: 80)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGGTGGAGGAGGGGGTATCGAGGGCCGCGGCCC TGTGCCAACGCCGCCCGACAACATCCAAGTGCAGGAAAACTTCAATATCTCTCGGATCTATGGG AAGTGGTACAACCTGGCCATCGGTTCCACCTGCCCCTGGCTGAAGAAGATCATGGACAGGATGA AAGTGAGCACGCTGGTGCTGGGAGAGGGCGCTACAGAGGCGGAGATCAGCATGACCAGCACTCG TTGGCGGAAAGGTGTCTGTGAGGAGACGTCTGGAGCTTATGAGAAAACAGATACTGATGGGAAG ТТТСТСТАТ САСAAAT С CAAAT G GAACATAAC CAT G GAG TCCTATGTGGTC СACAC CAAC TAT G ATGAGTATGCCATTTTCCTGACCAAGAAATTCAGCCGCCATCATGGACCCACCATTACTGCCAA GCTCTACGGGCGGGCGCCGCAGCTGAGGGAAACTCTCCTGCAGGACTTCAGAGTGGTTGCCCAG GGTGTGGGCATCCCTGAGGACTCCATCTTCACCATGGCTGACCGAGGTGAATGTGTCCCTGGGG AG CAG GAAC CAGAG С С CAT С T TAAT С С CGAGAT GA
24. М8Н561Е6Е-человек A135E (SEQ ID NO: 81)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGGTGGAGGAGGGGGTATCGAGGGCCGCGGCCC TGTGCCAACGCCGCCCGACAACATCCAAGTGCAGGAAAACTTCAATATCTCTCGGATCTATGGG AAGTGGTACAACCTGGCCATCGGTTCCACCTGCCCCTGGCTGAAGAAGATCATGGACAGGATGA CAGTGAGCACGCTGGTGCTGGGAGAGGGCGCTACAGAGGCGGAGATCAGCATGACCAGCACTCG TTGGCGGAAAGGTGTCTGTGAGGAGACGTCTGGAGCTTATGAGAAAACAGATACTGATGGGAAG ТТТСТСТАТ САСAAAT С CAAAT G GAACATAAC CAT G GAG TCCTATGTGGTC СACAC CAAC TAT G ATGAGTATGCCATTTTCCTGACCAAGAAATTCAGCCGCCATCATGGACCCACCATTACTGCCAA GCTCTACGGGCGGGAACCGCAGCTGAGGGAAACTCTCCTGCAGGACTTCAGAGTGGTTGCCCAG GGTGTGGGCATCCCTGAGGACTCCATCTTCACCATGGCTGACCGAGGTGAATGTGTCCCTGGGG
- 51 039776
AG GAG GAAC CAGAG CCCATCTTAATCCC GAGAT GA
25. М8Н5С1ЕСЕ-человек V170S (SEQ ID NO: 82)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGGTGGAGGAGGGGGTATCGAGGGCCGCGGCCC TGTGCCAACGCCGCCCGACAACATCCAAGTGCAGGAAAACTTCAATATCTCTCGGATCTATGGG AAGTGGTACAACCTGGCCATCGGTTCCACCTGCCCCTGGCTGAAGAAGATCATGGACAGGATGA CAGTGAGCACGCTGGTGCTGGGAGAGGGCGCTACAGAGGCGGAGATCAGCATGACCAGCACTCG TTGGCGGAAAGGTGTCTGTGAGGAGACGTCTGGAGCTTATGAGAAAACAGATACTGATGGGAAG ТТТСТСТАТ СACАААТ С СAAAT G GAACATAAC CAT G GAG TCCTATGTGGTC СACAC CAAC TAT G AT GAG TATGCCATTTTCCT GAC CAAGAAAT T CAG CCGCCATCATG GAC С СAC CAT TAC T G С СAA GCTCTACGGGCGGGCGCCGCAGCTGAGGGAAACTCTCCTGCAGGACTTCAGAGTGGTTGCCCAG GGTGTGGGCATCCCTGAGGACTCCATCTTCACCATGGCTGACCGAGGTGAATGTTCTCCTGGGG AG CAG GAAC CAGAG CCCATCTTAATCCC GAGAT GA
26. М8Н5С1ЕСЕ-человек V148D (SEQ ID NO: 83)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGGTGGAGGAGGGGGTATCGAGGGCCGCGGCCC TGTGCCAACGCCGCCCGACAACATCCAAGTGCAGGAAAACTTCAATATCTCTCGGATCTATGGG AAGTGGTACAACCTGGCCATCGGTTCCACCTGCCCCTGGCTGAAGAAGATCATGGACAGGATGA CAGTGAGCACGCTGGTGCTGGGAGAGGGCGCTACAGAGGCGGAGATCAGCATGACCAGCACTCG TTGGCGGAAAGGTGTCTGTGAGGAGACGTCTGGAGCTTATGAGAAAACAGATACTGATGGGAAG ТТТСТСТАТ САСАААТ С САААТ G GAACATAAC СAT G GAG TCCTATGTGGTC САСАС СAAC ТAT G AT GAG TATGCCATTTTCCT GAC CAAGAAAT T CAG CCGCCATCATG GAC С СAC CAT TAC T G С СAA GCTCTACGGGCGGGCGCCGCAGCTGAGGGAAACTCTCCTGCAGGACTTCAGAGATGTTGCCCAG GGTGTGGGCATCCCTGAGGACTCCATCTTCACCATGGCTGACCGAGGTGAATGTGTCCCTGGGG AG CAG GAAC CAGAG CCCATCTTAATCCC GAGAT GA
27. М8Н5С1ЕСЕ-человек G172Q (SEQ ID NO: 84)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGGTGGAGGAGGGGGTATCGAGGGCCGCGGCCC TGTGCCAACGCCGCCCGACAACATCCAAGTGCAGGAAAACTTCAATATCTCTCGGATCTATGGG AAGTGGTACAACCTGGCCATCGGTTCCACCTGCCCCTGGCTGAAGAAGATCATGGACAGGATGA CAGTGAGCACGCTGGTGCTGGGAGAGGGCGCTACAGAGGCGGAGATCAGCATGACCAGCACTCG TTGGCGGAAAGGTGTCTGTGAGGAGACGTCTGGAGCTTATGAGAAAACAGATACTGATGGGAAG ТТТСТСТАТ САСАААТ С САААТ G GAACATAAC СAT G GAG TCCTATGTGGTC САСАС СAAC ТAT G AT GAG TATGCCATTTTCCT GAC CAAGAAAT T CAG CCGCCATCATG GAC С СAC CAT TAC T G С CAA GCTCTACGGGCGGGCGCCGCAGCTGAGGGAAACTCTCCTGCAGGACTTCAGAGTGGTTGCCCAG GGTGTGGGCATCCCTGAGGACTCCATCTTCACCATGGCTGACCGAGGTGAATGTGTCCCTCAGG AG CAG GAAC CAGAG CCCATCTTAATCCC GAGAT GA
33. М8Н4ОК-человек M41K+R66H (SEQ ID NO: 85)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGATGACGATGACAAGGGCCCTGTGCCAACGCC
- 52 039776
GCCCGACAACATCCAAGTGCAGGAAAACTTCAATATCTCTCGGATCTATGGGAAGTGGTACAAC CTGGCCATCGGTTCCACCTGCCCCTGGCTGAAGAAGATCAAAGACAGGATGACAGTGAGCACGC TGGTGCTGGGAGAGGGCGCTACAGAGGCGGAGATCAGCATGACCAGCACTCATTGGCGGAAAGG TGTCTGTGAGGAGACGTCTGGAGCTTATGAGAAAACAGATACTGATGGGAAGTTTCTCTATCAC AAAT С CAAAT G GAACATAAC CAT G GAG TCCTATGTGGTC СACAC CAAC TAT GAT GAG TAT G С CA TTTTCCTGACCAAGAAATTCAGCCGCCATCATGGACCCACCATTACTGCCAAGCTCTACGGGCG GGCGCCGCAGCTGAGGGAAACTCTCCTGCAGGACTTCAGAGTGGTTGCCCAGGGTGTGGGCATC CCTGAGGACTCCATCTTCACCATGGCTGACCGAGGTGAATGTGTCCCTGGGGAGCAGGAACCAG AGCCCATCTTAATCCC GAGAT GA
34. М8Н4ОК-человек M41K+N1796D (SEQ ID NO: 86)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGATGACGATGACAAGGGCCCTGTGCCAACGCC GCCCGACAACATCCAAGTGCAGGAAAACTTCGATATCTCTCGGATCTATGGGAAGTGGTACAAC CTGGCCATCGGTTCCACCTGCCCCTGGCTGAAGAAGATCAAAGACAGGATGACAGTGAGCACGC TGGTGCTGGGAGAGGGCGCTACAGAGGCGGAGATCAGCATGACCAGCACTCGTTGGCGGAAAGG TGTCTGTGAGGAGACGTCTGGAGCTTATGAGAAAACAGATACTGATGGGAAGTTTCTCTATCAC AAATCCAAATGGGATATAACCATGGAGTCCTATGTGGTCCACACCAACTATGATGAGTATGCCA TTTTCCTGACCAAGAAATTCAGCCGCCATCATGGACCCACCATTACTGCCAAGCTCTACGGGCG GGCGCCGCAGCTGAGGGAAACTCTCCTGCAGGACTTCAGAGTGGTTGCCCAGGGTGTGGGCATC CCTGAGGACTCCATCTTCACCATGGCTGACCGAGGTGAATGTGTCCCTGGGGAGCAGGAACCAG AGCCCATCTTAATCCC GAGAT GA
35. М8Н4ОК-человек R66H+N1796D (SEQ ID NO: 87)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGATGACGATGACAAGGGCCCTGTGCCAACGCC GCCCGACAACATCCAAGTGCAGGAAAACTTCGATATCTCTCGGATCTATGGGAAGTGGTACAAC CTGGCCATCGGTTCCACCTGCCCCTGGCTGAAGAAGATCATGGACAGGATGACAGTGAGCACGC TGGTGCTGGGAGAGGGCGCTACAGAGGCGGAGATCAGCATGACCAGCACTCATTGGCGGAAAGG TGTCTGTGAGGAGACGTCTGGAGCTTATGAGAAAACAGATACTGATGGGAAGTTTCTCTATCAC AAATCCAAATGGGATATAACCATGGAGTCCTATGTGGTCCACACCAACTATGATGAGTATGCCA TTTTCCTGACCAAGAAATTCAGCCGCCATCATGGACCCACCATTACTGCCAAGCTCTACGGGCG GGCGCCGCAGCTGAGGGAAACTCTCCTGCAGGACTTCAGAGTGGTTGCCCAGGGTGTGGGCATC CCTGAGGACTCCATCTTCACCATGGCTGACCGAGGTGAATGTGTCCCTGGGGAGCAGGAACCAG AGCCCATCTTAATCCC GAGAT GA
36. М8Н4ОК-человек M41K+R66H+N1796D (SEQ ID NO: 88)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGATGACGATGACAAGGGCCCTGTGCCAACGCC GCCCGACAACATCCAAGTGCAGGAAAACTTCGATATCTCTCGGATCTATGGGAAGTGGTACAAC CTGGCCATCGGTTCCACCTGCCCCTGGCTGAAGAAGATCAAAGACAGGATGACAGTGAGCACGC TGGTGCTGGGAGAGGGCGCTACAGAGGCGGAGATCAGCATGACCAGCACTCATTGGCGGAAAGG
- 53 039776
TGTCTGTGAGGAGACGTCTGGAGCTTATGAGAAAACAGATACTGATGGGAAGTTTCTCTATCAC AAATCCAAATGGGATATAACCATGGAGTCCTATGTGGTCCACACCAACTATGATGAGTATGCCA TTTTCCTGACCAAGAAATTCAGCCGCCATCATGGACCCACCATTACTGCCAAGCTCTACGGGCG GGCGCCGCAGCTGAGGGAAACTCTCCTGCAGGACTTCAGAGTGGTTGCCCAGGGTGTGGGCATC CCTGAGGACTCCATCTTCACCATGGCTGACCGAGGTGAATGTGTCCCTGGGGAGCAGGAACCAG AGCCCATCTTAATCCC GAGAT GA
37. М8Н4ОК-человек M41K (SEQ ID NO: 89)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGATGACGATGACAAGGGCCCTGTGCCAACGCC GCCCGACAACATCCAAGTGCAGGAAAACTTCAATATCTCTCGGATCTATGGGAAGTGGTACAAC CTGGCCATCGGTTCCACCTGCCCCTGGCTGAAGAAGATCAAAGACAGGATGACAGTGAGCACGC TGGTGCTGGGAGAGGGCGCTACAGAGGCGGAGATCAGCATGACCAGCACTCGTTGGCGGAAAGG TGTCTGTGAGGAGACGTCTGGAGCTTATGAGAAAACAGATACTGATGGGAAGTTTCTCTATCAC AAAT С CAAAT G GAACATAACCAT GGAGTCCTATGTGGTCСACACCAAC TAT GAT GAGTAT GСCA TTTTCCTGACCAAGAAATTCAGCCGCCATCATGGACCCACCATTACTGCCAAGCTCTACGGGCG GGCGCCGCAGCTGAGGGAAACTCTCCTGCAGGACTTCAGAGTGGTTGCCCAGGGTGTGGGCATC CCTGAGGACTCCATCTTCACCATGGCTGACCGAGGTGAATGTGTCCCTGGGGAGCAGGAACCAG AGCCCATCTTAATCCC GAGAT GA
38. М8Н4ОК-человек R66H (SEQ ID NO: 90)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGATGACGATGACAAGGGCCCTGTGCCAACGCC GCCCGACAACATCCAAGTGCAGGAAAACTTCAATATCTCTCGGATCTATGGGAAGTGGTACAAC CTGGCCATCGGTTCCACCTGCCCCTGGCTGAAGAAGATCATGGACAGGATGACAGTGAGCACGC TGGTGCTGGGAGAGGGCGCTACAGAGGCGGAGATCAGCATGACCAGCACTCATTGGCGGAAAGG TGTCTGTGAGGAGACGTCTGGAGCTTATGAGAAAACAGATACTGATGGGAAGTTTCTCTATCAC AAAT С CAAAT G GAACATAACCAT GGAGTCCTATGTGGTCСACACCAAC TAT GAT GAGTAT GСCA TTTTCCTGACCAAGAAATTCAGCCGCCATCATGGACCCACCATTACTGCCAAGCTCTACGGGCG GGCGCCGCAGCTGAGGGAAACTCTCCTGCAGGACTTCAGAGTGGTTGCCCAGGGTGTGGGCATC CCTGAGGACTCCATCTTCACCATGGCTGACCGAGGTGAATGTGTCCCTGGGGAGCAGGAACCAG AGCCCATCTTAATCCC GAGAT GA
39. М8Н4ОК-человек N1796D (SEQ ID NO: 91)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGATGACGATGACAAGGGCCCTGTGCCAACGCC GCCCGACAACATCCAAGTGCAGGAAAACTTCGATATCTCTCGGATCTATGGGAAGTGGTACAAC CTGGCCATCGGTTCCACCTGCCCCTGGCTGAAGAAGATCATGGACAGGATGACAGTGAGCACGC TGGTGCTGGGAGAGGGCGCTACAGAGGCGGAGATCAGCATGACCAGCACTCGTTGGCGGAAAGG TGTCTGTGAGGAGACGTCTGGAGCTTATGAGAAAACAGATACTGATGGGAAGTTTCTCTATCAC AAATCCAAATGGGATATAACCATGGAGTCCTATGTGGTCCACACCAACTATGATGAGTATGCCA TTTTCCTGACCAAGAAATTCAGCCGCCATCATGGACCCACCATTACTGCCAAGCTCTACGGGCG
- 54 039776
GGCGCCGCAGCTGAGGGAAACTCTCCTGCAGGACTTCAGAGTGGTTGCCCAGGGTGTGGGCATC CCTGAGGACTCCATCTTCACCATGGCTGACCGAGGTGAATGTGTCCCTGGGGAGCAGGAACCAG AGCCCATCTTAATCCC GAGAT GA
40. М8Н-человеческий wt (SEQ ID NO: 92)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGGCCCTGTGCCAACGCCGCCCGACAACATCCA AGTGCAGGAAAACTTCAATATCTCTCGGATCTATGGGAAGTGGTACAACCTGGCCATCGGTTCC ACCTGCCCCTGGCTGAAGAAGATCATGGACAGGATGACAGTGAGCACGCTGGTGCTGGGAGAGG GCGCTACAGAGGCGGAGATCAGCATGACCAGCACTCGTTGGCGGAAAGGTGTCTGTGAGGAGAC GT С T GGAGC T TAT GAGAAAACAGATAC T GAT GGGAAGT T T С T C TAT CACAAAT CCAAAT GGAAC ATAAC CAT G GAG TCCTATGTGGTC СACAC CAAC TAT GAT GAG TATGCCATTTTCCT GAC CAAGA AATTCAGCCGCCATCATGGACCCACCATTACTGCCAAGCTCTACGGGCGGGCGCCGCAGCTGAG GGAAACTCTCCTGCAGGACTTCAGAGTGGTTGCCCAGGGTGTGGGCATCCCTGAGGACTCCATC TTCACCATGGCTGACCGAGGTGAATGTGTCCCTGGGGAGCAGGAACCAGAGCCCATCTTAATCC CGAGATGA
41. М8Н-человек R66H+N1796D (SEQ ID NO: 93)
ATGCATCACCATCACCATCACCATCACGGCCCTGTGCCAACGCCGCCCGACAACATCCA AGTGCAGGAAAACTTCGATATCTCTCGGATCTATGGGAAGTGGTACAACCTGGCCATCGGTTCC ACCTGCCCCTGGCTGAAGAAGATCATGGACAGGATGACAGTGAGCACGCTGGTGCTGGGAGAGG GCGCTACAGAGGCGGAGATCAGCATGACCAGCACTCATTGGCGGAAAGGTGTCTGTGAGGAGAC GTСTGGAGCTTATGAGAAAACAGATACTGATGGGAAGTTTСTCTATCACAAATCCAAATGGGAT ATAAC CAT G GAG TCCTATGTGGTC СACAC CAAC TAT GAT GAG TATGCCATTTTCCT GAC CAAGA AATTCAGCCGCCATCATGGACCCACCATTACTGCCAAGCTCTACGGGCGGGCGCCGCAGCTGAG GGAAACTCTCCTGCAGGACTTCAGAGTGGTTGCCCAGGGTGTGGGCATCCCTGAGGACTCCATC TTCACCATGGCTGACCGAGGTGAATGTGTCCCTGGGGAGCAGGAACCAGAGCCCATCTTAATCC CGAGATGA
42. без метки, человек R66H+N1796D (SEQ ID NO: 94)
ATGGGCCCTGTGCCAACGCCGCCCGACAACATCCAAGTGCAGGAAAACTTCGATATCTC TCGGATCTATGGGAAGTGGTACAACCTGGCCATCGGTTCCACCTGCCCCTGGCTGAAGAAGATC ATGGACAGGATGACAGTGAGCACGCTGGTGCTGGGAGAGGGCGCTACAGAGGCGGAGATCAGCA TGACCAGCACTCATTGGCGGAAAGGTGTCTGTGAGGAGACGTCTGGAGCTTATGAGAAAACAGA TACTGATGGGAAGTTTCTCTATCACAAATCCAAATGGGATATAACCATGGAGTCCTATGTGGTC СACAC CAAC TAT GAT GAG TAT GCCATTTTCCT GAC CAAGAAAT T CAG CCGCCATCATG GAC С CA CCATTACTGCCAAGCTCTACGGGCGGGCGCCGCAGCTGAGGGAAACTCTCCTGCAGGACTTCAG AGTGGTTGCCCAGGGTGTGGGCATCCCTGAGGACTCCATCTTCACCATGGCTGACCGAGGTGAA TGTGTCCCTGGGGAGCAGGAACCAGAGCCCATCTTAATCCCGAGATGA
61. без метки, человеческий wt (SEQ ID NO: 95)
- 55 039776
ATGGGCCCTGTGCCAACGCCGCCCGACAACATCCAAGTGCAGGAAAACTTCAATATCTC TCGGATCTATGGGAAGTGGTACAACCTGGCCATCGGTTCCACCTGCCCCTGGCTGAAGAAGATC ATGGACAGGATGACAGTGAGCACGCTGGTGCTGGGAGAGGGCGCTACAGAGGCGGAGATCAGCA TGACCAGCACTCGTTGGCGGAAAGGTGTCTGTGAGGAGACGTCTGGAGCTTATGAGAAAACAGA TACTGATGGGAAGTTTCTCTATCACAAATCCAAATGGAACATAACCATGGAGTCCTATGTGGTC САСAC CAAC TAT GAT GAG TATGCCATTTTCCT GAC CAAGAAAT T CAG CCGCCATCATG GAC С CA CCATTACTGCCAAGCTCTACGGGCGGGCGCCGCAGCTGAGGGAAACTCTCCTGCAGGACTTCAG AGTGGTTGCCCAGGGTGTGGGCATCCCTGAGGACTCCATCTTCACCATGGCTGACCGAGGTGAA TGTGTCCCTGGGGAGCAGGAACCAGAGCCCATCTTAATCCCGAGATGA
Обоснование конструкций вариантов AIM
Были сконструированы, экспрессированы, выделены и анализированы человеческий wt-A1M, 11 гомологов A1M из разных видов и 15 вариантов A1M с точечными мутациями, в общей сложности 27 вариантов A1M (табл. 2). 11 гомологов A1M были выбраны по следующим соображениям. A1M является высококонсервативным между видами. Проводили поиск последовательностей A1M из разных видов в базах данных (www.ncbi.nlm.nih.gov и www.uniprot.org). Были найдены последовательности АМВР из 67 разных видов. Последовательности исследовали на присутствие А1М-специфических функциональных групп (K69, K92, K118, K130, Y22, Y132, Н122 и Н123), липокалиновых мотивов (SCR1, 2, 3) (см. ссылки в разделе Введение) и прогнозируемых сайтов связывания углеводов (Escribano et al., 1990). Пять были классифицированы в качестве не отосящихся к A1M и отброшены, поскольку в них отсутствовал цистеин 34, три были отброшены, потому что в них отсутствовал цистеин 169, четыре, потому что они были неполными, и два, потому что у них были длинные, сомнительные вставки. Аминокислотные последовательности оставшихся 53 гомологов выравнивали, и была моделирована их гипотетическая трехмерная 3D-структура проекцией их аминокислотных последовательностей на кристаллическую структуру человеческого A1M (Meining and Skerra, 2012), для идентификации расположения отдельных аминокислотных боковых цепей в петлях липокалина или внутри или снаружи кармана. Результат этого моделирования использовали для конструирования точечных мутаций, оказывающих влияние на функцию A1M, как описано ниже. Обоснование для выбора конечных 11 гомологов (см. табл. 2) базировалось на комбинации широко распространенного эволюционного представления, методологической осуществимости, потенциально повышенной экологической нагрузки с точки зрения окислительного стресса в среде обитания видов, наличия или отсутствия функциональных A1M-сnецифичных групп и отсутствия гликозилирования. 15 вариантов A1M с точечными мутациями были выбраны по следующим соображениям. Восемь вариантов были мутированы в стратегических аминокислотах, связанных с проявлением функциональных свойств, и семь вариантов в гидрофильных положениях для повышения стабильности/растворимости (табл. 2). Восемь функциональных мутаций были выбраны, поскольку они 1) имели место у других видов в положениях в 3D-структурной модели (см. выше), которые потенциально могли влиять на функцию A1M и/или 2) теоретически должны уменьшать pKa цистеина 34 и/или 3) теоретически будут обеспечивать дополнительный сайт захвата радикалов.
Прогнозированные данные для всех вариантов рассчитывали с использованием инструмента http://www.alphalyse.com/gpmaw lite.html (табл. 3).
- 56 039776
Таблица 2. Варианты, экспрессированные и анализированные в фазе I проекта по исследованию вариантов A1M
Номер * Название Системное название Последователь ность белка Идентифика тор гена Info Цель мутации Обоснование Nконцевая метка
60 человек wt Ното sapiens NP_001624 gi:4502067 M8H4DK
1 МЫШЬ Mus musculus NP_031469 gi:311703 Вид только грызуны, лабораторные животные, были антитела M8H5GIEGR
2 голый Землекоп Heterocep halus glaber XP_004885260 gi:5128435 27 Вид долгожители, низкая частота опухолей предполагает наличие хороших эндогенных антиоксидантов M8H5GIEGR
3 лягушка Xenopus laevis NP_001080820 gi:1479057 74 Вид отсутствие прогнозированного углевода предполагает высокую растворимость полипептида, 1 дополнительный Cys, высокое значение pl M8H5GIEGR
4 цыпленок Gallus gallus NP_001264627 gi:4787329 96 Вид только у птиц M8H5GIEGR
5 кролик Oryctolag us cuniculus XP_008271622 gi:6558786 96 Вид лабораторные животные, были антитела M8H5GIEGR
6 беличья обезьяна Saimiri boliviens XP_0039252551 gi:4032661 41 Вид два примата, меньше замен по сравнению с человеком, более легкое считывание M8H5GIEGR
7 морж Odobenus rosmarus XP_004397010 gi:4723547 01 Вид неравномерное окисление за счет деления M8H5GIEGR
8 ламантин Trichechu s manatus XP_004372191 gi:0471363 267 Вид неравномерное окисление за счет деления M8H5GIEGR
9 камбала Pleuronec tes platessa 2021284A gi:1091607 Вид неравномерное окисление за счет деления M8H5GIEGR
10 орангутанг Pongo abelii NP_001127069 gi: 1971027 75 Вид одна замена - H122R - в представляющем интерес положении: редуктаза и связывание гема M8H5GIEGR
11 человек Р35К Функция а) встречается у птиц и лягушек, Ь) может снижать рКа С34, с) может быть местом захвата радикалов M8H5GIEGR
12 человек М41К Функция а) встречается у многих видов, Ь) может снижать рКа С34, с) может быть местом захвата радикалов M8H5GIEGR
13 человек R66H Функция встречается у многих видов, см. грызуны и кролики M8H5GIEGR
14 человек Т75К Функция а) может снижать рКа С34, Ь) может быть местом захвата радикалов M8H5GIEGR
15 человек T75Y Функция может быть местом захвата радикалов M8H5GIEGR
16 человек М99К Функция а) может снижать рКа С34, Ь) может быть местом захвата радикалов M8H5GIEGR
17 человек S101Y Функция может быть местом захвата радикалов M8H5GIEGR
18 человек К69,92,118, 130R Функция может быть местом захвата радикалов M8H5GIEGR
19 латимерия Latimeria chalumnae XP_005994505. 1 gi:5569726 95 Вид идентифицированная самая примитивная последовательность AIM M8H5GIEGR
21 человек L89T Растворимость гидрофильное положение, повышенная гидрофильность, имеет место у многих видов M8H5GIEGR
22 человек N17,96D Растворимость углеводные фрагменты, повышенная гидрофильность M8H5GIEGR
23 человек Т45К Растворимость гидрофильное положение, повышенный заряд, имеет место у многих видов M8H5GIEGR
24 человек А135Е Растворимость гидрофильное положение, повышенный заряд, имеет место у многих видов M8H5GIEGR
25 человек V170S Растворимость гидрофильное положение, гидрофильность, имеет место у многих видов M8H5GIEGR
26 человек V148D Растворимость гидрофильное положение, гидрофильность, имеет место у многих видов M8H5GIEGR
27 человек G172Q Растворимость гидрофильное положение, гидрофильность, имеет место у птиц M8H5GIEGR
• Нумерация соответствует последовательностям, указанным выше
- 57 039776
Таблица 3. Прогнозируемые данные для вариантов в фазе I
# Вариант # аминокисл от Молекулярн ая масса (Да) pi Суммарны й Заряд (D+E)(R+K) Коэффиц иент экстинк ции 2 8 Опт (ст-1) Индекс гидрофобно СТИ
60 человечески й wt 197 22561 6, 4 -5 1,47 -0,64
1 мышь 200 22732 6, 6 -4 1,46 -0,60
2 голый Землекоп 201 22741 9,2 2 1,40 -0,73
3 лягушка 197 22660 8,0 0 1,22 -0,79
4 цыпленок 197 22302 6,5 -3 1,40 -0,76
5 кролик 201 22911 6, 9 -2 1,45 -0,61
6 беличья обезьяна 201 23066 7,3 -1 1,68 -0,69
7 морж 201 22837 6, 6 -4 1,39 -0,63
8 ламантин 200 22469 6, 6 -3 1,47 -0,54
9 камбала 202 22896 6, 6 -4 0,89 -0,71
10 орангутанг 201 22733 7,2 -1 1,46 -0,58
11 человек Р35К 201 22745 7,2 -1 1,46 -0,58
12 человек М41К 201 22711 7,2 -1 1,46 -0,60
13 человек R66H 201 22695 6, 7 -3 1,46 -0,57
14 человек Т75К 201 22741 7,2 -1 1,46 -0,59
15 человек T75Y 201 22776 6, 9 -2 1,51 -0,58
16 человек М99К 201 22711 7,2 -1 1,46 -0,60
17 человек S101Y 201 22790 6, 9 -2 1,51 -0,57
18 человек К69,92,118, 130R 201 22826 6, 9 -2 1,45 -0,58
19 латимерия 198 22741 6, 7 -3 1,38 -0,78
21 человек L89T 201 22702 6, 9 -2 1,46 -0,59
22 человек N17/96D 201 22716 6, 5 -4 1,46 -0,57
23 человек Т45К 201 22741 7,2 -1 1,46 -0,59
24 человек А135Е 201 22772 6, 7 -3 1,45 -0,60
25 человек V170S 201 22702 6, 9 -2 1,46 -0,60
26 человек V148D 201 22730 6, 7 -3 1,46 -0,61
27 человек G172Q 201 22785 6, 9 -2 1,45 -0,59
Фаза I.
Варианты экспрессировали в параллельных встряхиваемых колбах. Имела место вариация уровней экспрессии, и для нескольких вариантов A1M экспрессию повторяли несколько раз, чтобы получить приемлемые количества белка. Хорошая экспрессия и относительно большие количества после очистки (>10 мг/л культуры) были получены для белков мыши, беличьей обезьяны, моржа, орангутанга, М41К, R66H, T75Y, М99К, N17,96D, T45K и V148D. Экспрессия и количество очищенного белка были сходны с ранее полученными выходами для человеческого wt A1M (12 мг/л), экспрессированного и выделенного в аналогичных условиях. Варианты с более низкими уровнями экспрессии, что приводило к более низким выходам (1-10 мг/л), представляли белки от голого землекопа, лягушки, кролика, ламантина, Р35К, Т75К, S101Y, L89T, V170S и G172Q. A1M от цыпленка, камбалы и латимерии имели субоптимальные уровни экспрессии, в результате чего достигался выход выделения <1 мг/л культуры. Человеческий му- 58 039776 тант с четырьмя мутациями K69,92,118,130R хорошо экспрессировался, но невозможно было успешно провести рефолдинг. Также Т75К-А1М показывал повышенную тенденцию к преципитации при очистке.
Все варианты очищали до чистоты >99% согласно данным SDS-PAGE, за исключением A1M цыпленка и камбалы, очистка которых обеспечивала чистоту на уровне 95%. По результатам SDS-PAGE все варианты содержали максимум 0,5% ковалентных димеров без существенных различий между вариантами. Результаты кругового дихроизма показали примерно структуры 2% альфа-спирали и 40% структуры β-листа для всех вариантов без существенных различий между ними, ожидаемые значения для A1M (Kwasek et al., 2007). После очистки все варианты анализировали, как обобщенно в табл. 4. Сначала анализировали стабильность и растворимость. Тенденцию к агрегации и термостабильность сразу же после оттаивания, без приложения напряжения 0,1 мМ растворов белка анализировали с использованием динамического рассеяния света (DLS), PAGE (агрегация) и дифференциальной сканирующей флуориметрии (DSF) (термостабильность). Кроме того, была исследована тенденция к агрегации в ответ на сдвигающие силы или концентрирование до 1 мМ. Человеческий wt A1M относительно хорошо проявлял себя в этих анализах (табл. 4), но некоторые варианты были даже еще лучше в отношение свойств стабильности/растворимости: A1M цыпленка, A1M ламантина и N17,96D-A1M. A1M цыпленка и ламантина отличались от человеческого wt A1M по многим положениям, чтобы допустить предположение об отдельных аминокислотах, пригодных для человеческого A1M, и не использовались в дальнейших исследованиях. Когда исследовали функциональные свойства, то было обнаружено, что М41К и R66H имеют одинаковые (R66H) или улучшенные (М41К) функции. Поскольку данные варианты также имели более высокую термостабильность и лишь незначительно более высокую тенденцию к агрегации, чем большинство других вариантов, то они были отобраны для дальнейшего исследования. Следовательно, исследование N17,96D-A1M, M41K-A1M и R66H-A1M было продолжено в фазе II настоящего проекта.
Таблица 4. Растворимость, стабильность и функциональные свойства вариантов в фазе I
Стабильность и растворимость Функциональные свойства
Агрегация при 0,1 мМ Термостаби льность Стабильность к сдвигу при 0,1 мМ Агрегация при 1 мМ Свободные тиолы Связывание гема Восстановление гема Восстановление ABTS
PAG Е DLS DSF DLS PAGE
Агр era ты (%) Сред НИЙ ради ус (нм) Испол ьзова иные измер ения (# ИЗ 6) тт Средний радиус (нм) Испол ьзова иные измер ения (# из 6) Агрегаты (%) нмоль Lцистеин/ нмоль AIM мкМ связанного /мкМ добавленно го Пик λ (380-420 нм) Средняя максимальная общая AUC
No Название
60 человечес кий wt 4,8 3,2 6 46, 6 3,8 4 22,3 0,6 0,81 405 -1,84 to -2,04
1 мышь 45, 8 20 6 43 32,8 6 93,7 0,3 0,71 393 -1,43
2 голый Землекоп 54, 8 2,7 6 51,6 3 6 80,1 0,1 0,69 397 -1,42
3 лягушка 9,9 2,8 5 NM 3 1 24,1 0,1 0,81 410 -1,33
4 цыпленок 22, 42. 4 3,3 5 67,6767775 67. 67,5 5 3,4 6 3,5 0,1 0,66 391 -1,98
5 кролик 50, 2 33 6 4848,7 48.77 43,4 6 28,2 0,1 0,65 395 -1,50
6 беличья обезьяна 20, 2 3,2 6 4949,99 3 6 38,3 0,3 0,72 407 -1,98
7 морж 4,0 3,8 3 NM 3,9 1 52,3 0,3 0,81 398 -1,33
8 ламантин 1,7 3,5 6 535453,23. 2 3,6 5 2,0 0,1 0,80 391 -1,81
9 камбала 6, 6 3,1 6 NM 3,1 6 30,0 0,0 0,73 388 -1,25
10 орангутан г 18, 3 3,1 6 45,9 3 4 29,7 0,6 0,77 401 -2,06
11 человек Р35К 94, 5 29,2 6 44,6 40,9 6 86,7 0,1 0,81 396 -1,29
- 59 039776
12 человек М41К 20, 5 3,2 3 44947,87.9 3,2 5 27,5 0,4 0,92 414 -1,87
13 человек R66H 13, 6 3,1 4 44949,97.8 19 6 37,0 0,7 0,79 405 -2,19
14 человек Т75К 60, 0 42,3 6 43,3 82 6 96, 3 0,3 0,76 393 -1,28
15 человек T75Y 36, 1 35,7 6 49,8 32,4 6 45,7 0,4 0,87 392 -2,08
16 человек М99К 37, 7 65,8 6 45,9 56,4 6 44,8 0,4 0,69 397 -1,71
17 человек S101Y 36, 8 2,7 6 46, 1 3 3 70,7 0,4 0,79 403 -1,63
Стабильность и растворимость Функциональные свойства
Агрегация при 0,1 мМ Термостабил ьность Стабильность к сдвигу при 0,1 мМ Агрегация при 1 мМ ь Свободные тиолы Связывание гема Восстановление гема Восстановление ABTS
PAG Е DLS DSF DLS PAGE
Агр era ты (%) Сред НИЙ ради ус (нм) Испол ьзова иные измер ения (# ИЗ 6) тт Средний радиус (нм) Испол ьзова иные измер ения (# из 6) Агрегаты (%) нмоль L- цистеин/ нмоль AIM мкМ связанного /мкМ добавленно го Пик λ (380-420 нм) Средняя максимальная общая AUC
No Название
60 человечес кий, wt 4,8 3,2 6 46, 6 3,8 4 22,3 0,6 0,81 405 от -1,84 до 2,04
19 латимерия 4,1 3,7 6 NM 3,8 6 38,2 0,2 0,68 396 -2,00
21 человек L89T 42, 1 2,9 1 46, 1 25,7 6 51,6 0,5 0,96 403 -1,69
22 человек N17,96D 2,9 3,1 6 49,6 3,7 4 9,9 0,6 0,80 409 -2,48
23 человек Т45К 91, 2 48,5 6 42,8 86, 9 6 89,9 0,3 0,94 394 -1,29
24 человек А135Е 54, 6 23,9 6 46, 1 17,5 6 90,7 0,3 0,70 400 -1,47
25 человек V170S 40, 1 3 6 46 23,7 6 58,8 0,4 0 0,90,90 399 -2,04
26 человек V148D 35, 8 3 6 46 3 2 44,9 0,6 0 0,86,86 402 -2,16
27 человек G172Q 93, 4 36,1 6 44,1 34,2 6 89,5 0,2 0,81 396 -1,95
Свойства варианта, которые оцениваются как превосходящие человеческий wt A1M, отмечены синим цветом с белым жирным шрифтом. Свойства, которые рассматриваются как уступающие человеческому wt A1M, отмечены красным цветом. Все остальные свойства рассматриваются как аналогичные с человеческим wt A1M.
В PAGE варианты с достоверно более высоким процентом крупных агрегатов оцениваются как уступающие человеческому wt A1M.
В DLS средний радиус >>3 нм рассматривается как указывающий на наличие агрегатов, а также трудности с регистрацией измерений (это видно по меньшему количеству измерений, используемых для расчетов).
В DSF Tm >3 S.D человеческого wt A1M рассматривается как более высокая или более низкая.
Свободные тиолы человеческого wt A1M обычно находятся в диапазоне 0,6-0,8, все, что достоверно ниже этого показателя, рассматривается как уступающие.
В анализе связывания тема человеческий wt A1M связывается на «80% в данном анализе. Связывание других вариантов ниже 75% и выше 85% рассматривается как отличающееся.
В анализе восстановления тема максимум пика полосы Сорета <400 нм считается более низким по сравнению с человеческим wt A1M, и сдвиг >409 нм считается лучше, чем у человеческого wt A1M.
В анализе ABTS считается, что Р-значение в t-тесте <0,2 является показателем уступающей активности восстановления ABTS.
Фаза II.
Цель фазы II проекта заключалась в том, чтобы объединить полезные мутации ^41^ R66H и N17,96D), для исследования того, можно ли сконструировать еще более стабильные варианты с аналогичной или улучшенной функцией. Кроме того, вводили аналогичную N-концевую метку (M8H4DK), которую использовали для человеческого wt A1M (табл. 5). Таким образом, новые комбинированные варианты M8H4DK сравнивали с М8Н4DK-человеческим wt.
- 60 039776
Таблица 5. Варианты, экспрессированные в фазе II, с прогнозируемыми данными
# Вариант # амино кисло т Молек улярн ая масса (Да) pi Суммарны й Заряд (D+E)(R+K) Коэффиц иент экстинк ции 280 нм (см1) Индекс гидрофо бности
12 M8H5GIEGR- М41К 201 22711 7,2 -1 1,46 -0,60
13 M8H5GIEGR- R66H 201 22695 6,7 -3 1,46 -0,57
22 M8H5GIEGR- N17,96D 201 22716 6,5 -4 1,46 -0,57
60 M8H4DK-wt 197 22561 6,4 -5 1,47 -0,64
33 M8H4DK-M41K+R6 6Н 197 22539 6,4 -5 1,47 -0,67
34 M8H4DK-M41K+N17,96D 197 22560 6,2 -6 1,47 -0,67
35 M8H4DK-R66H+N17,96D 197 22544 6, 1 -8 1,47 -0,64
36 M8H4DK-M41KR66H+N1796D 197 22541 6,2 -7 1,47 -0,67
Все четыре новых варианта (M8H4DK-M41K+R66H, M8H4DK-M41K+N17,96D, M8H4DKR66H+N17,96D и M8H4DK-M41K+R66H+N17,96D) очень хорошо экспрессировались и давали 29, 13, 37 и 15 мг чистого белка/л. Четыре новых варианта очищали до чистоты >99% согласно данным SDS-PAGE, и показали такой же или более низкий процент ковалентных димеров, за исключением M8H4DKM41K+R66H, который показал наличие примерно 2% ковалентных димеров.
Анализировали показатели солюбилизации/стабильности (табл. 6а). Полученные данные показали, что комбинация М41К и R66H была субоптимальной в отношение термостабильности. С другой стороны, мутация N17,96D была в целом полезной для обеспечения солюбилизации и стабильности, и комбинация с R66H (т.е. M8H4DK-R66H+N17,96D-A1M) обеспечивала еще более высокую солюбилизацию и стабильность.
Анализировали функциональные свойства (табл. 6b). Данные показали, что мутация М41К повышала способность к восстановлению гема, но снижала связывание гема. Однако когда мутацию М41К объединяли с N17,96D, то она показывала более низкий потенциал для спасения клеток от гибели, индуцированной гемом. Комбинация R66H+N17,96D давала аналогичные результаты по сравнению с wt-A1M во всех исследованных функциональных аспектах. Таким образом, М6Н4DK-меченный R66H+N17,96D AIM является перспективным кандидатом после проведения фазы II, тогда как мутация М41К в данном случае менее пригодна.
Таблица 6а. Растворимость, стабильность и функциональные свойства вариантов в фазе II
Стабильность и растворимость
Агрегация при 0,1 мМ Термостабиль ность Стабильность к сдвигу при 0,1 мМ Агрегация при 1 мМ
PAGE DLS SEC-FPLC DSF DLS PAGE SEC-FPLC
Агрегаты (%) Средний радиус (нм) Использова иные измерения (# из 6) Мономер (%) тт Средний радиус (нм) Использова иные измерения (# из 6) Агрегат ы (%) Мономер (%)
No Название
60 M8H4DK-wt 1-2 3,0 6 87-94 46, 6 3,0 2 8 80-87
12 M8H5GIEGR-M41K 34 6, 0 3 ND 51,8 4,1 2 33 ND
13 M8H5GIEGR-R66H 25 3,2 6 ND 47,3 10,3 1 51 ND
22 M8H5GIEGR-N1796D 1 3,0 4 94 49,9 6,5 2 4,2 82
33 M8H4DK-M41K+R66H 19 3,4 1 ND 34,3 13,7 5 42,9 ND
34 M8H4DK-M41K+N1796D 1 3,4 6 96 52,7 3,2 5 1,0 77
35 M8H4DK-R6 6H+N17 9 6D 0,4 3,3 6 93 51,6 3,1 66 0,4 89
36 M8H4DK- М41K+R6 6H+N17 9 6D 0,8 3,3 5 82 37,4 3,6 66 1,1 63
Свойства варианта, которые оцениваются как превосходящие человеческий wt AIM, отмечены синим цветом с белым жирным шрифтом. Свойства, которые рассматриваются как уступающие человеческому wt AIM, отмечены красным цветом. Все остальные свойства рассматриваются как аналогичные с человеческим wt AIM.
В PAGE варианты с достоверно более высоким процентом крупных агрегатов оцениваются как уступающие человеческому wt AIM.
В DLS средний радиус >> 3 нм рассматривается как указывающий на наличие агрегатов, а также трудности с регистрацией измерений (это видно по меньшему количеству измерений, используемых для расчетов).
В DSF Tm >3 S.D человеческого wt A1M рассматривается как более высокая или более низкая.
- 61 039776
Таблица 6b. Функциональные свойства вариантов в фазе II
Функциональные свойства
Связывание с гем-агарозой Красное смещение пика связывания гема Восстановление ABTS Спасение от гибели клеток, индуцирова иной гемом
мкМ связанного / мкМ добавленного Пик λ (нм) Средняя максимальная общая AUC Визуальное наблюдение в двух отдельных эксперимен тах
No Название
60 M8H4DK-wt 0,85 415 -2,1
12 M8H5GIEGR-M41K 0,81 408 -1,2 Аналогично дикому типу
13 M8H5GIEGR-R66H 0,84 ND -1,5 Аналогично дикому типу
22 M8H5GIEGR-N1796D 0,82 415 -2,2 Аналогично дикому типу
33 M8H4DK-M41K+R66H 0,68 417 -1,8 Аналогично дикому типу
34 M8H4DKM41K+N1796D 0,74 419 -2,2 Слабее чем дикого типа
35 M8H4DKR66H+N1796D 1,07 413 -2,1 Аналогично дикому типу
36 M8H4DKМ41K+R6 6H+N17 9 6D 1,13 412 -2,0 Аналогично дикому типу
В анализе связывания с гем-агарозой человеческий wt A1M связывается на 80%. Связывание других вариантов ниже 75% и выше 85% рассматривается как отличающееся.
В анализе связывания гема красное смещение к <400 нм считается более низким по сравнению с человеческим wt A1M, и смещение >409 нм считается лучше, чем у человеческого wt A1M.
В анализе ABTS считается, что Р-значение в t-тесте <0,2 является показателем уступающей активности восстановления ABTS.
Фаза III.
Первой целью фазы III было сравнение М8Н4DK-меченых R66H+N17,96D-A1M с wt-A1M и перспективных одиночных мутаций с М8Н4DK-меткой в фазе I и II при параллельной экспрессии в идентичных условиях. Вторая цель заключалась в исследовании влияния метки на стабильность, растворимость и функциональные свойства. N-концевая метка человеческого wt-A1M (M8H4DK) состоит из 8 гистидиновых меток, за которыми следует сайт расщепления энтерокиназой. Сайт расщепления позволяет отщеплять гистидиновую метку после экспрессии и очистки. Следовательно, wt-A1M и R66H+N17,96D-A1M были экспрессированы с N-концевыми метками M8H4DK- и М8Н и без метки. Третья цель состояла в том, чтобы более детально сравнить свойства M8H4DK-wt A1M (Wt-A1M) и M8H4DK-R66H+N17,96D-A1M (35-А1М). Все экспрессированные варианты фазы III с прогнозируемыми данными приведены в табл. 7.
- 62 039776
Таблица 7. Варианты, экспрессированные в фазе III с прогнозируемыми данными
# Вариант # аминок ислот Молек улярн ая масса (Да) pi Суммарны й Заряд (D+E)(R+K) Коэффиц иент экстинк ции 280 нм (см-1) Индекс гидрофо бности
60 M8H4DK-wt 197 22561 6, 4 -5 1,47 -0,64
35 M8H4DK-R6 6H+N17 9 6D 197 22544 6, 1 -8 1,47 -0,64
37 M8H4DK-M41K 197 22558 6, 5 -4 1,47 -0,67
38 M8H4DK-R66H 197 22542 6, 3 -8 1,47 -0,64
39 M8H4DK-N17.96D 197 22563 6, 1 -7 1,47 -0,64
40 M8H-wt 192 21973 6, 9 -2 1,51 -0,57
41 M8H-R66H+N1796D 192 21956 6, 4 -5 1,51 -0,56
42 M-R66H+N1796D 184 20859 5,6 -5 1,59 -0,45
61 M-wt 184 20876 6, 3 -2 1,59 -0.45
Параллельные экспрессия и очистка позволили более точно сравнить уровни экспрессии и выходы при выделении. Было обнаружено, что бактерии, экспрессирующие все варианты A1M, растут с одинаковой скоростью (не показано) и с одинаковым относительно хорошим выходом (фиг. 2). Единственное отличие заключалось в более медленной экспрессии немеченных вариантов (# 60 и # 42) по сравнению с остальными. Из экспрессии 2x750 мл можно было выделить 20-60 мг каждого варианта (фиг. 3а). Все варианты с гистидиновой меткой очищали до чистоты >99%, в то время как немеченные варианты (# 61 и # 42) демонстрировали несколько более низкую чистоту (примерно 90%) (фиг. 3b). Все имели небольшое количество ковалентных димеров. Анализ PAGE показал наличие менее 1-2% крупных агрегатов во всех вариантах, за исключением M8H-wt (40) и немеченного wt-A1M (# 61) (фиг. 3с). Таким образом, можно получить все варианты A1M с одиночными и многочисленными М8Н4DK-метками, М8Нметками и без метки.
Агрегацию и термостабильность 100 мкМ растворов анализировали обращеннофазовой ВЭЖХ, динамическим рассеянием света и дифференциальной сканирующей флуориметрией (табл. 8). M8H4DKмеченные варианты элюировались в ОФ-ВЭЖХ примерно через 12 мин с 87-90% белка в основном пике. Единственным исключением был M8H4DK-M41K, который появлялся со временем удерживания 9,8 мин и только 80% белка было в основном пике. Данные еще раз указывают на то, что мутация М41К придает белку A1M неожиданные свойства и является субоптимальной. Изменение метки на М8Н или полное удаление метки приводило к увеличению времени удерживания до 12,2 и 12,9 мин соответственно, указывая на большее количество гидрофобных молекул, как и ожидалось. Меньше белка проявлялось в основном пике M8H-wt и обоих немеченных вариантах, что, возможно, отражает несколько более низкую чистоту, наблюдаемую в SDS-PAGE для этих вариантов. Данные DLS указывают средний радиус, равный примерно 3 у всех вариантов, и возможность собрать данные из всех 6 измерений. Все варианты имели одинаковую или более высокую термостабильность по сравнению с M8H4DK-wt A1M. Более высокая стабильность наблюдалась для всех вариантов, несущих мутацию N17,96D.
Таблица 8. Агрегация и термостабильность не подвергшихся напряжению вариантов в фазе III
ОФ-ВЭЖХ DLS DSF
# Вариант RT [мин] Основной пик ( % общего) Средний радиус (нм) Использовании е измерения (# из 6) Tm
60 M8H4DK-wt 12,1 87 2,9 6 46,6
35 M8H4DKR66H+N1796D 12,1 89 3,2 6 49,8
37 M8H4DK-M41K 9, 8 80 3,3 6 46,8
38 M8H4DK-R66H 12,1 89 2,9 6 46,4
39 M8H4DK- N1796D 12,1 90 3, 0 6 49,7
40 M8H-wt 12,2 78 3,2 6 47,1
41 M8H-R66H+N1796D 12,2 88 3,2 6 50,2
61 M-wt 12,9 81 3, 8 6 46,3
42 M-R66H+N1796D 12,9 82 3,4 6 50,2
Варианты фазы III были подвергнуты воздействию сдвигающих сил пипетированием 80 раз в узком наконечнике пипетки. Агрегацию, вызванную напряжением сдвига, анализировали с помощью DLS. В общем, все варианты с мутацией N17,96D показали высокую устойчивость к напряжению сдвига (табл. 9), за исключением М8Н-меченного варианта R66H+N1796D (# 41). Кроме того, исследовали устойчивость к напряжению, вызванному концентрированием до 1 мМ в различных буферах. Все варианты концентри- 63 039776 ровали до 1 мМ в 20 мМ Трис-НС1+0,125 М NaCl, pH 8,0 или 7,4, и сразу же анализировали с помощью PAGE (фиг. 4а, табл. 10). 0,1 мМ и 1 мМ образцы также анализировали с помощью PAGE после одного цикла замораживания-оттаивания в Трис-буферах или PBS (фиг. 4b, табл. 10). Среди М8Н4DK-меченых вариантов все несущие N17,96D-мутации, демонстрировали повышенную устойчивость к концентрированию, замораживанию-оттаиванию, снижению рН и изменению буфера (на PBS) по сравнению с wt A1M. Добавление мутации R66H еще больше повышало стабильность и растворимость. Только одна мутация R66H обеспечивала примерно такую же устойчивость, как и у w1 A1M, тогда как мутация М41К давала достоверно более низкую устойчивость. Укорочение или удаление N-концевой метки оказывало отрицательное влияние на устойчивость, что было более выражено для wt A1M по сравнению с соответствующими вариантами R66H+N17,96D.
Таблица 9. Устойчивость к сдвигу вариантов в фазе III
# Вариант Средний радиус (нм) Использованные измерения (#из 6)
60 M8H4DK-wt 2,9 3
35 M8H4DK-R66H+N179 6D 3, 0 6
37 M8H4DK-M41K 0
38 M8H4DK-R66H 0
39 M8H4DK-N1796D 3, 1 6
40 M8H-wt 3, 1 1
41 M8H-R66H+N1796D 0
61 M-wt 3, 9 5
42 M-R66H+N1796D 3,4 6
Таблица 10. Стабильность при концентрировании и замораживании-оттаивании вариантов в фазе III в различных буферах
Large aggregates (%)
# Вариант 0,1 мМ pH 8,0 1 мМ pH 8,0 1 мМ pH 8,0, lx замораживай иеоттаивание 0,1 мМ pH 7,4 1 мМ pH 7,4 1 мМ pH 7,4, 1х замораживай иеоттаивание 1 мМ PBS pH 7,4, 1х замораживай иеоттаивание
60 M8H4DK-wt 0,3 1,1 2,0 0,4 1,2 3,1 13,2
35 M8H4DK-R66H+N1796D 0,2 0,3 ο,ι 0,4 0,2 0,3 1,3
37 M8H4DK-M41K 1,3 4,1 4,8 0,8 7,9 11,9 15,6
38 M8H4DK-R66H 0,6 0,5 1,0 0,2 0,7 2,4 16, 0
39 M8H4DK-N1796D 0,7 1,1 ο,ι 0,2 0,1 0,7 2,5
40 M8H-wt 0,8 7,2 3,6 8,4 10,2 11,4 14,0
41 M8H-R66H+N1796D 0,3 0,4 0,4 0,3 0,4 1,2 7,6
61 M-wt 0,4 2,0 2,3 9,1 1,6 3,9 17,9
42 M-R66H+N1796D 0,4 0,3 0,5 0,4 0,5 0,5 1,6
Функциональную активность всех вариантов в фазе III исследовали по расширенной программе для охвата всех возможных аспектов известных функций A1M. Восстановительную способность, не связанную с гемом, исследовали на синтетическом радикале ABTS и в коммерчески доступном анализе объема поглощения кислородных радикалов (ORAC) (фиг. 5). М8Н4DK-меченный N17,96D-A1M и R66H+N17,96D-A1M показали одинаковую восстановительную способность с wt A1M, в то время как М8Н4DK-меченный М41К-А1М и R6 6H-A1M демонстрировали несколько более низкую восстановительную способность для ABTS (фиг. 5А). Укорочение или удаление метки оказывало незначительное влияние, но варианты R66H-N17,96D демонстрировали тенденцию к более высокой способности к восстановлению, чем wt A1M с М8Н-меткой и в отсутствии метки. Функциональную активность M8H4DKмеченного wt A1M в анализе ORAC устанавливали на 100%, и другие варианты сравнивали по отношению к нему. Все варианты M8H4DK показали аналогичные результаты в ORAC, что и M8H4DK-wt, за исключением M8H4DK-R66H+N17,96D, который имел достоверно более высокую активность (фиг. 5b). Также М8Н-меченный и немеченный R66H+N17,96D-A1M показали несколько более высокую восстановительную активность в ORAC, чем wt-A1M. Также исследовали восстановительную активность в анализе восстановления цитохрома С (фиг. 6). Большинство вариантов показало несколько более низкую восстановительную активность в более низких концентрациях по сравнению с wt-A1M, и для N17,96D и R66H+N17,96D эта тенденция была достоверной (при 0,3-0,6 мкМ) (фиг. 6А). Значение этого не понятно. Укорочение и удаление метки не повлияло на данное свойство.
Связывание гема исследовали в анализе включения свободного гема и в анализе связывания с гемагарозой (фиг. 6). Включение и координация свободного гема проявляется в виде появления пика поглощения примерно при 410-415 нм, так называемой полосы Сорета (Karnaukhova et al., 2014; Rutardottir et al., 2016). Гем обычно имеет пик поглощения при 380-390 нм, и это можно увидеть, когда его растворяют один или смешивают и инкубируют с несвязывающим контрольным белком, таким как овальбумин. Однако когда гем смешивают с wt A1M, то пик поглощения появляется между 410-415 нм, давая так называемое красное смещение (т.е. смещение пика в сторону более высоких длин волн) и повышенное соотношение поглощения (413/386). Было показано, что степень красного смещения и отношение поглощений (413/386) связаны с функцией связывания тема A1M (Rutardottir et al., 2016). Следовательно, эти
- 64 039776 свойства сравнивали для всех вариантов в фазе III (фиг. 6b). Среди М8Н4DK-меченных вариантов все показали примерно одинаковое красное смещение, что и wt A1M, за исключением вариантов М41К, которые имели более сильное смещение. Интересно, что укорочение метки до М8Н увеличило красное смещение, в то время как удаление метки уменьшало красное смещение. Очевидно, что метка оказывала сильное влияние на это свойство. Связывание гема с AIM исследовали как связывание серийных разведений AIM с гем-агарозой по сравнению со связыванием с контрольной агарозой. Как правило, контрольный белок, такой как овальбумин, не демонстрирует связывания с гем-агарозой выше фонового связывания с контрольной агарозой (фиг. 6С). Как правило, 70-80% добавленного M8H4DK-wt AIM (35A1M) связывалось с гем-агарозой, тогда как отсутствие связывания наблюдали для контрольной агарозы. Связывание сравнивали для всех вариантов в фазе III. Все показали сходную степень связывания с гемагарозой (66-72%), тогда как овальбумин не проявлял связывания.
Затем анализировали связывание гема M8H4DK-wt AIM (wt-A1M) и M8H4DK-35-A1M (35-А1М) (фиг. 11) с использованием комбинации изменения миграции и анализа флуоресценции (Karnaukhova et al., 2014). В результате включения гема миграция wt-A1M и 35-А1М в анализе нативным PAGE замедлялась при соотношении гем:белок <1 и ускорялась при соотношении гем:белок >1, проявляя аналогичную зависимость от концентрации гема (фиг. 11А и В). В высоких концентрациях гема оба варианта проявляли тенденцию к олигомеризации, что подтверждает предыдущие результаты для wt-А1М (Karanaukhova et al., 2014). Аналогично включение гема индуцировало гашение флуоресценции триптофана как в wtA1M, так и в 35-А1М с аналогичной кинетикой (фиг. 11В). Ранее было показано, что координация гема в AIM индуцировала формирование пика поглощения в УФ-свете при 415 нм (Ruttarsdottir et al., 2016; Karnaukhova et al., 2014). Наблюдали аналогичные УФ-спектры поглощения комплексов wt-A1M/- и 35А1М/гем (фиг. 11С) с небольшим красным смещением пика 35-А1М (415^417 нм).
Исследовали скорость восстановления радикалов ABTS под действием wt-A1M и 35-А1М [10], и она была аналогичной для wt-А1М и 35-А1М с использованием свежеприготовленных белков без приложения напряжения (фиг. 12А). После хранения в течение 7 суток wt-A1M проявлял более медленную скорость восстановления после концентрирования до 1 мМ и при 22°С (фиг. 12В), что указывало на потерю активности белка в дополнение к агрегации, отмеченной в этих условиях (табл. 11). Восстановление цитохрома С 35-А1М (фиг. 12С) (Allhorn et al., 2005) проходило несколько медленнее, в то время как антиоксидантная способность, измеренная анализом ORAC, была несколько выше для 35-А1М (фиг. 12D).
Таблица 11. Физико-химические свойства M8H4DK-wt AIM (wt-A1M) и
M8H4DK-35-A1M (35-А1М)
Условия1 Концентра ЦИН Мето Д Параметр wt- А1М 35- А1М
Время
Без напряжения2 0,1 мМ ВЭЖХ элюирования 12,1 12,1
(мин)
Мономер (%) 87 89
DLS Радиус (нМ) 2,9 3,2
PAGE Агрегаты (%) 1,5 0,4
SEC Мономер (%) 87 93
С напряжением
Нагревание 0,1 мМ DSF Тт (°C) 46,6 51,6
Высокая концентрация 1 мМ PAGE Агрегаты (%) 1,1 0,4
pH 7,43 1 мМ PAGE Агрегаты (%) 1,2 0,4
Замораживаниеоттаивание3 1 мМ PAGE Агрегаты (%) 2,0 0,4
Замораживаниеоттаивание/ PBS 1 мМ PAGE Агрегаты (%) 13,2 7,6
Длительное хранение4
4°С - 1 сутки 1 мМ SEC Извлечение5 (%) 100 100
Агрегаты (%) 17,9 3,9
4°С - 7 суток 1 мМ SEC Извлечение (%) 100 100
Агрегаты (%) 12,1 3,7
RT - 7 суток 1 мМ SEC Извлечение (%) 44 100
Агрегаты (%) 0,2 ο,ι
37°С - 1,5 ч 1 мМ SEC Извлечение (%) 67 100
Агрегаты (%) 53 28
37°С - 4,5 ч 1 мМ SEC Извлечение (%) 0 44
Агрегаты (%) ND6 15
Примечания:
1) комнатная температура, если не указано иное;
2) 20 мМ Трис-HCl, 0,125 М NaCl, pH 8,0;
3) 20 мМ Трис-HCl, 0,125 М NaCl, pH 7,4;
4) PBS;
5) рассчитано после центрифугирования при 10000xg от общей площади пиков по сравнению с исходным материалом;
6) не определяли
- 65 039776
Проводили биологический анализ, в котором была исследована способность вариантов A1M в отношение спасения клеток K562 от гибели, индуцированной гемом (фиг. 7). Степень гибели клеток, которую определяли по высвобождению лактатдегидрогеназы, устанавливали на 100% для клеток, инкубированных с гемом без A1M. Все М8Н4DK-меченные варианты, включая wt-A1M, показали почти 100% спасение при 10 мкМ (фиг. 7), без достоверных различий между вариантами. М8Х-меченные варианты демонстрировали почти одинаковую способность к спасению клеток, в то время как для немеченных вариантов наблюдали несколько более низкий потенциал.
Способность M8H4DK-wt A1M (35-A1M) и M8H4DK-35-A1M (wt-A1M) защищать клетки
Способность двух вариантов A1M защищать клетки тестировали на клетках K562 и линии эпителиальных клеток проксимальных канальцев почки человека (HK-2), подвергнутых воздействию свободного тема и свободного железа. На фиг. 12 показано, что оба варианта A1M полностью ингибировали гибель клеток, измеренную по внеклеточному высвобождению цитозольного маркера ЛДГ, на клетках K562, подвергнутых воздействию 0,1 мМ гема. Кривые доза-реакция wt-A1M и 35-А1М перекрываются почти полностью, что указывает на аналогичную способность защищать клетки.
Данные по защите клеток HK-2 приведены на фиг. 14. Сначала повреждение клеток индуцировали реакцией Фентона, смесью свободного железа, аскорбата и перекиси водорода, которая генерирует гидроксильные радикалы. Жизнеспособность клеток, измеренная с помощью анализа WST-1, восстановливалась под действием обоих вариантов A1M, о чем свидетельствует наложение кривых зависимости доза-ответ (фиг. 14А). Повышающая регуляция гемоксигеназы-1 (НО-1), хорошо известного биомаркера ответа на окислительный стресс (Alam et al., 1999), достоверно подавлялась под действием wt-A1M и 35А1М в одинаковой степени (фиг. 14В). Повреждение клеток HK-2 также индуцировали инкубацией с гемом, и оно подавлялось вариантами A1M (фиг. 14С и 14D). Вновь, жизнеспособность клеток, измеренная методом WST-1, восстанавливалась под действием обоих белков с аналогичной степенью, при использовании двух концентраций гема, 10 и 30 мкМ (фиг. 14С). Повышающая регуляция гена НО-1 и другого гена ответа на клеточный стресс, Hsp70, ингибировалась в одинаковой степени обоими вариантами A1M (фиг. 14D).
Распределение in vivo M8H4DK-wt A1M (wt-A1M) и M8H4DK-35-1M (35-A1M) у мышей
Ранее было показано, что после внутривенного введения A1M быстро подвергался клиренсу из крови и преимущественно локализовался в почках и печени у крыс и мышей (Larsson et al., 2001; Ahlstedt et al., 2015). Сравнивали скорости клиренса в крови и распределение в органах wt-AlM и 35-А1М (фиг. 15). Аналогичные скорости обмена наблюдали в течение первых 60 мин, тогда как 35-А1М выделялся быстрее через 1 ч. Распределение A1M в анализированных органах через 10 и 30 мин не выявило достоверных различий между двумя белками. Оба wt-A1M и 35-А1М были обнаружены преимущественно в почках, и меньшие количества отмечали в сердце, печени, легких, коже и селезенке, в то время как в головном мозгу были обнаружены незначительные количества.
Защита in vivo почек M8H4DK-wt A1M (wt-A1M) и M8H4DK-35-A1M (35-A1M)
Ранее было показано, что A1M проявляет терапевтические эффекты in vivo на животных моделях, на которых индуцировали связанные с гемом и окислительным стрессом повреждения почек (WesterRosenlof et al., 2014; Naav et al., 2015; Sverrison et al., 2014). Исследовали защитные эффекты in vivo двух вариантов A1M на мышиной модели рабдомиолиза, индуцированного инъекцией глицерина, где острые повреждения почек (AKI) развиваются в результате повреждения мышечной ткани с высвобождением миоглобина, свободного тема, радикалов и других компонентов ткани. Инъекция глицерина приводила к массивной повышающей регуляции генов НО-1 и Hsp70, двух биомаркеров клеточного стресса (фиг. 16А и В), и большая часть повышающей регуляции ингибировалась одновременной инъекцией wt-A1M или 35-А1М. Достоверного различия между двумя вариантами A1M не наблюдали в использованных дозах (7 мг/кг массы тела животных).
Таким образом, исследования в фазе III показали, что мутации A1M, включающие N17,96D, достоверно повышали стабильность молекулы A1M, которая дополнительно увеличивалась при добавлении мутации R66H. Кроме того, М8Н4DK-меченные варианты A1M были более стабильными, чем варианты с более короткой меткой или без метки. Следовательно, метка служит не только средством очистки, но также обеспечивает A1M повышенной стабильностью, и стабильность не мешает проявлению функций. Молекула M8H4DK-R66H+N1796D (35-А1М) обладает аналогичными или лучшими функциональными свойствами, возможно, за исключением восстановления цитохрома С. В заключение следует отметить, что исследования стабильности/растворимости и функциональных свойств показывают, что M8H4DKR66H+N17,96D (35-А1М) обладает улучшенными молекулярными свойствами по сравнению с M8H4DKwt A1M (wt-A1M) , и оба wt-A1M, так и 35-А1М показывают в vivo защитные эффекты для почек с использованием модели рабдомиолиза, индуцированного инъекцией глицерина, острой почечной недостаточности.
Дополнительные исследования стабильности на M8H4DK-R66H+N1796D по сравнению с M8H4DK-wt
Для дополнительного сравнения M8H4DK-R66H+N17,96D-A1M и wt-А1М агрегацию и функциональные свойства тестировали с использованием SEC-FPLC и анализа восстановления ABTS после циклов
- 66 039776 замораживания-оттаивания и хранения при +4°С и комнатной температуре (фиг. 8). Образцы (100 мкМ) wtAlM и R66H+N17,96D-A1M очень хорошо выдерживали 5 циклов замораживания-оттаивания. Как было показано выше, wt-A1M демонстрировал более высокий уровень агрегации после концентрирования до 1 мМ, чем R66H+N17,96D-A1M, и аналогичные результаты наблюдали после хранения в течение 1 недели по сравнению с хранением в течение ночи. Повышенная агрегация wt-A1M не влияла на восстановительную активность для ABTS 2 мкМ образцов. Визуальные исследования показывают полностью прозрачные растворы обоих вариантов после замораживания-оттаивания, концентрирования и хранения в течение 1 недели при +4°С. Для того, чтобы подвергнуть растворы AIM дополнительному напряжению, 100 мМ и 1 мМ растворы хранили при комнатной температуре в течение 1 недели. Визуальное исследование 100 мкМ растворов свидетельстовало о наличии небольшого помутнения wt-A1M, но раствор R66H+N17,96D-A1M оставался прозрачным. Результаты SEC-FPLC показали уменьшенную площадь под кривой wt-A1M до 80% исходного вещества, что указывает на потерю wt-A1M, несмотря на то, что не наблюдали повышения образования крупных агрегатов. Потери, скорее всего, были вызваны выпадением в осадок белка и удалением фильтрацией перед анализом FPLC. Для R66H+N17,96D-A1M можно было наблюдать некоторую повышенную агрегацию, но без потери белка после хранения при комнатной температуре в течение одной недели при концентрации 100 мкМ. В анализе восстановления ABTS R66H+N17,96D-A1M все еще проявлял полную активность, в то время как небольшое снижение наблюдали для wt-AlM. Визуальное исследование 1 мМ растворов, хранящихся в течение 1 недели, выявило наличие помутнения обоих вариантов, но раствор wt-A1M оказался более мутным. Когда растворы разбавляли в 10 раз для загрузки на SEC, то осадок R66H+N17,96D-A1M, но не wt-A1M, растворялся. В SEC наблюдали очень небольшое количество аггрегатов, но оставалось только 44% исходного вещества wt-A1M. Напротив, оставалось 100% R66H+N17,96D-A1M. В анализе восстановления ABTS активность wt-A1M существенно снижалась, тогда как активность R66H+N17,96D-A1M оставалась без изменений. Результаты этого исследования показывают, что M8H4DK-R66H+N17,96D-A1M может выдерживать хранение при высоких концентрациях при комнатной температуре, тогда как wt-A1M не может.
Исследована стабильность 1 мМ растворов при 37°С. Образцы инкубировали в течение 1,5; 2,5 и 4,5 ч и затем осматривали визуально, анализировали SEC-FPLC и анализом восстановительной активности для ABTS (фиг. 9). После инкубации в течение 1,5 ч оба раствора все еще были прозрачными при осмотре, но анализ SEC-FPLC выявил большее количество агрегатов в растворе wt-A1M (53%) по сравнению с раствором R66H+N17,96D-A1M (28%). Только 67% исходного вещества элюировалось в SEC wt-A1M, и 100% элюировалось R66H+N17,96D-A1M, что определяли по площади под кривой. Оба варианта показали полную активность в анализе восстановления ABTS. Через 2,5 ч инкубации раствор wt-A1M становился мутным, в котором частички было невозможным растворить. 40% исходного вещества было обнаружено в SEC, и активность в восстановлении ABTS достоверно снижалась. Раствор R66H+N17,96DA1M все еще был прозрачным и показал полную активность в анализе восстановления ABTS, но образование крупных агрегатов повышалось с 28 до 38% по данным SEC-FPLC. Через 4,5 ч wt-A1M превратился в мутное вещество, которое невозможно было пипетировать. Следовательно, далее его не анализировали. R66H+N17, 96D-A1M стал мутным, но все еще его можно было набирать пипеткой. Некоторое количество осадка оставалось после разбавления. Количество белка, элюированного в SEC, составляло 44% от исходного вещества, и наблюдали пониженную активность в анализе восстановления ABTS. На основании результатов исследования можно предположить, что после инкубации при +37°С AIM сначала образует растворяющиеся агрегаты, затем он образует необратимые агрегаты, и имеет место потеря активности в анализе восстановления ABTS. Через 2,5 ч инкубации наблюдали полное необратимое осаждение wt-A1M, частичное необратимое осаждение наблюдали только через 4,5 ч для M8H4DKR66H+N17,96D-A1M. Следовательно, M8H4DK-R66H+N17,96D-A1M более устойчивы к хранению при +37°С, чем M8H4DK-wt-A1M.
Ссылки.
Ahlstedt J., Tran Т.А., Strand F., Holmqvist В., Strand S.E., Gram M. and Akerstrom B. Biodistribution and
- 67 039776 pharmacokinetics of recombinant αι-microglobulin and its potential use in radioprotection of kidneys. Am. J. Nucl. Med. Mol. Imaging., 5(4): 333-347, 2015.
Alam J., Stewart D., Touchard C., Boinapally S., Choi A.M., and Cook J.L. Nrf2, a Cap'n'Collar transcription factor, regulates induction of the heme-oxygenase gene. J. Biol. Chern., 274: 26071-26078, 1999.
Allhorn M., Berggard T., Nordberg J., Olsson M.L., Akerstrom B. Processing of the lipocalin OQ-microglobulin by hemoglobin induces heme-binding and heme-degradation properties. Blood, 99; 2002: 1894-1901.
Allhorn M., Klapyta A., Akerstrom B. Redox properties of the lipocalin αι-microglobulin: reduction of cytochrome c, hemoglobin, and free iron. Free Radic. Biol. Med., 38; 2005: 557-567.
Anderson U.D., Rutardottir S., Centlow M., Olsson M.G., Kristensen K., Isberg P.E., Thilaganatan B., Akerstrom B., Hansson S.R. Fetal hemoglobin and αι-microglobulin as first and early second trimester predictive biomarkers of preeclampsia. Am. J. Obst. Gynecol., 204; 2011: 520. el-52 0.e5
Berggard T., Cohen A., Persson P., Lindqvist A., Cedervall T., Silow M., Thogersen I.B., Jonsson J.-A., Enghild J.J., Akerstrom B. αι-Microglobulin chromophores are located to three lysine residues semiburied in the lipocalin pocket and associated with a novel lipophilic compound. Protein Sci., 8; 1999: 2611-2620.
Berggard T., Thelin N., Falkenberg C., Enghild J. J., Akerstrom B. Prothrombin, albumin and immunoglobulin A form covalent complexes with op-microglobulin in human plasma. Eur. J. Biochem., 245; 1997: 676-683.
Bratt T., Olsson H., Sjoberg E.M., Jergil B., Akerstrom B. Cleavage of the ag-microglobulin -bikunin precursor is localized to the Golgi apparatus of rat liver cells. Biochim. Biophys. Acta, 1157; 1993: 147-154.
Centlow M., Carninci P., Nemeth K., Mezey E., Brownstein
- 68 039776
M., Hansson S.R. Placental expression profiling in preeclampsia: local overproduction of hemoglobin may drive pathological changes. Fertility and sterility, 90; 2008: 1834-1843.
Ekstrom B., Berggard I. Human a1-microglobulin: Purification procedure, chemical and physicochemical properties. J. Biol. Chem., 252(22); 1977: 8048-8057.
Escribano J., Lopez-Otin C., Hjerpe A., Grubb A., Mendez E. Location and characterization of the three carbohydrate prosthetic groups of human protein HC. FEBS Lett., 2 66(1 —2) ; 1990: 167-170.
Flower D.R. The lipocalin family. Biochem. J., 318; 1996: 1-14 .
Gram M., Anderson U.D., Johansson M.E., Edstrom-Hagerwall A., Larsson I., Jalmby M., Hansson S.R., and Akerstrdm B. The human endogenous protection system against cell-free hemoglobin and heme is overwhelmed in preeclampsia and provides potential biomarkers and clinical indicators. PloS. One., 10(9): e0138111, 2015.
Hansson S.R., Gram M. and Akerstrdm B. Fetal hemoglobin in preeclampsia: a new etiological tool for prediction/diagnosis and a potential target for therapy. Gurr. Opin. Obstet. Gynecol., 25(6); 2013: 448-455.
Karnaukhova E., Rutardottir S., Majabi M., Wester Rosenlof L., Alayash A.I., Akerstrdm B. Characterization of heme binding to recombinant αι-microglobulin. Front. Physiol., 5; 2014: 465. doi: 10.3389/fphys.2014.00465.
Kaumeyer J.F., Polazzi J.0., Kotick M.P. The mRNA for a proteinase inhibitor related to the HI-30 domain of inter-alphatrypsin inhibitor also encodes OQ-microglobulin (protein HC) . Nucleic Acids Res., 14(20); 1986: 7839-7850.
Kwasek A., Osmark P., Allhorn M., Lindqvist A., Akerstrdm B., Wasylewski Z. Production of recombinant human «imicroglobulin and mutated forms involved in chromophore formation. Prot. Expr. Purif., 53; 2007: 145-152.
Laemmli U.K. Cleavage of structural proteins during the
- 69 039776 assembly of the head of bacteriophage T4. Nature, 227; 1970: 680-685.
Larsson J., Wingardh K., Berggard T., Davies J.R., Logdberg L., Strand S.-E. , Akerstrom B. Distribution of 125I-labelled ai~ microglobulin in rats after intravenous injection. J. Lab. Clin. Med., 137: 165-175, 2001
Lindqvist A., Bratt T., Altieri M., Kastern W., Akerstrom B. Rat αι-microglobulin: co-expression in liver with the light chain of inter-alpha-trypsin inhibitor. Biochim. Biophys. Acta, ИЗО; 1992: 63-67.
May K. , Rosenlof L., Olsson M.G., Centlow M., Morgelin M., Larsson I., Cederlund M., Rutardottir S., Schneider H., Siegmund W., Akerstrom B., Hansson S.R. Perfusion of human placenta with haemoglobin introduces preeclampsia-like injuries that are prevented by αι-microglobulin. Placenta, 32(4); 2011: 323-332.
Meining W., Skerra A. The crystal structure of human aimicroglobulin reveals a potential haem-binding site. Biochem. J. , 445 (2) ; 2012: 175-82.
Naav A., Erlandsson L., Axelsson J., Larsson I., Johansson M., Wester Rosenlof L., Morgelin M., Casslen V., Gram M., Akerstrom B., Hansson S.R. AIM ameliorates preeclampsia-like symptoms in placenta and kidney induced by cell-free fetal hemoglobin in rabbit. PloS One, 10(5); 2015: e0125499.
Olsson M.G., Allhorn M., Larsson J., Cederlund M., Lundqvist K., Schmidtchen A., Sorensen O.E., Morgelin M., Akerstrom B. Up-regulation of ΑΙΜ/αι-microglobulin in skin by heme and reactive oxygen species gives protection from oxidative damage. PLoS One, 6(11); 2011: e27505.
Olsson M.G., Centlow M., Rutardottir S., Stenfors I., Larsson J., Hosseini-Maaf B., Olsson M.L., Hansson S.R., Akerstrom B. Increased levels of free hemoglobin, oxidation markers, and the antioxidative heme scavenger ai-microglobulin in preeclampsia. Free Rad. Biol. Med., 48; 2010: 284-291.
Olsson M.G., Olofsson T., Tapper H., Akerstrom B. The lipocalin ai-microglobulin protects erythroid K562 cells against
- 70 039776 oxidative damage induced by heme and reactive oxygen species.
Free Rad. Res., 42; 2008: 725-736.
Olsson M.G., Rosenlof L.W., Kotarsky H., Olofsson T., Leanderson T., Morgelin M., Fellman V., Akerstrom B. The radical-binding lipocalin AIM binds to a Complex I subunit and protects mitochondrial structure and function. Antiox. Redox. Signal., 18(16); 2013: 2017-2028.
Rutardottir S., Karnaukhova E., Nantasenamat C., Songtawee N., Prachayasittikul V., Rajabi M., Wester Rosenlof L., Alayash A. I., Akerstrom B. Studies of two heme binding sites in AIM/oqmicroglobulin using site-directed mutagenesis and molecular simulation. Biochim. Biophys. Acta, 1864(1); 2016: 29-41.
Sala A., Campagnoli M., Perani E., Romano A., Labd S., Monzani E., Minchiotti L., Galliano M. Human OQ-microglobulin is covalently bound to kynurenine-derived chromophores. J. Biol. Chem., 279(49); 2004: 51033-51044.
Sverrisson K. , Axelsson J., Rippe A., Gram M., Akerstrom B., Hansson S.R., Rippe B. Extracellular fetal hemoglobin (HbF) induces increases in glomerular permeability. Inhibition with aimicroglobulin (AIM) and Tempol. Am. J. Physiol. Renal. Physiol., 306(4); 2014: F442-448.
Wester-Rosenlof L., Casslen V., Axelsson J., EdstromHagerwall A., Gram M., Holmquist M., Johansson M.E., Larsson I., Ley D., Marsal K. , Morgelin M., Rippe B., Rutardottir S., Shohani B., Akerstrom B., Hansson S.R. AlM/ai-microglobulin protects from heme-induced placental and renal damage in a pregnant sheep model of preeclampsia. PLoS One, 9(1); 2014:
e86353.
Akerstrom B., Borregaard N., Flower D., Salier J.P. Lipocalins, an introduction. In Lipocalins. Eds. Akerstrom B., Borregaard N., Flower D., Salier J.P., Landes Bioscience, Georgetown TX.
Akerstrom B., Gram M. AIM, an extravascular tissue cleaning and house-keeping protein. Free Rad. Biol. Med., 74; 2014: 274282 .
Akerstrom B., Maghzal G.J., Winterbourn C.C., Kettle A. J. The lipocalin oci-microglobulin has radical scavenging activity. J. Biol. Chem., 282; 2007: 31493-31503.
Akerstrom B., Bratt T., Enghild J. J. Formation of the microglobulin chromophore in mammalian and insect cells: a novel post-translational mechanism? FEBS Lett., 362, 50-54, 1995.
ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ

Claims (19)

  1. ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ
    1. Белок, полученный из альфа-1-микроглобулина, выбранный из аминокислотной последовательности, состоящей из формулы I:
    x1-x2-x3-x4-x5-x6-x7-x8-x9-x10-x11-x12-x13-x14-gpvptppdn IQVQENF-X15-IS RIYGKWYNLA igstcpwlkk i-x16-drmtvstl vlgegateae ismtst-x17-wrk gvceetsgay ektdtdgkfl
    - 71 039776
    YHKSKW-X18-ITM ESYVVHTNYD EYAIFLTKKF SRHHGPTITA KLYGRAPQLR ETLLQDFRVV
    AQGVGIPEDS IFTMADRGEC VPGEQEPEPI LIPR (SEQ ID NO: 10), и аминокислотной последовательности, состоящей из формулы II:
    X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9-X10-X11-X12-X13-X14-GPVPTPPDN IQVQENF-X15-IS RIYGKWYNLA IGSTCPWLKK I-X16-DRMTVSTL VLGEGATEAE ISMTST-X17-WRK GVCEETSGAY EKTDTDGKFL YHKSKW-X18-ITM ESYVVHTNYD EYAIFLTKKF SRHHGPTITA KLYGRAPQLR ETLLQDFRVV AQGVGIPEDS IFTMADRGEC VPGEQEPEPI (SEQ ID NO: 17), где присутствует по меньшей мере один из Х1-Х14, и
    X1 отсутствует или представляет Met или N-формил-Met ;
    X2 отсутствует или представляет His;
    X3 отсутствует или представляет His;
    X4 отсутствует или представляет His;
    X5 отсутствует или представляет His;
    X6 отсутствует или представляет His;
    X7 отсутствует или представляет His;
    X8 отсутствует или представляет His;
    X9 отсутствует или представляет His;
    X10 отсутствует или выбран из Asp, Glu, Lys и Arg;
    X11 отсутствует или выбран из Asp, Glu, Lys и Arg;
    X12 отсутствует или выбран из Asp, Glu, Lys и Arg;
    X13 отсутствует или выбран из Asp, Glu, Lys и Arg;
    X14 отсутствует или выбран из Asp, Glu, Lys и Arg;
    X15 представляет Asp или Asn;
    X16 представляет Met, или Lys, или Arg;
    X17 представляет Arg, или His, или Lys;
    X18 представляет Asp или Asn;
    или его фармацевтически приемлемая соль, при условии, что последовательность не представляет SEQ ID NO:1 или SEQ ID NO:2, где указанный белок обладает улучшенными стабильностью и/или растворимостью при сохраненной или улучшенной функции по сравнению с альфа-1-микроглобулином человека дикого типа (SEQ ID NO:1).
  2. 2. Белок по п.1, где
    X1 представляет Met или N-формил-Met;
    X2, X3, X4, X5, X6, X7 представляют His;
    X8 и X9 отсутствуют;
    X10, X11, X12 и X13 представляют Asp;
    X14 представляет Lys;
    и Х1518 имеют значения, определенные выше.
  3. 3. Белок по п.1, где
    X1 представляет Met или N-формил-Met;
    X2, X3, X4, X5, X6, X7, X8 и X9 представляют His;
    X10, X11, X12 и X13 представляют Asp;
    X14 представляет Lys;
    и Х1518 имеют значения, определенные выше.
  4. 4. Белок по п.1, где
    X1 представляет Met;
    X2, X3, X4, X5, X6, X7, X8, X10, X11, X12, X13 и X14 отсутствуют;
    X15 представляет Asp;
    X16 представляет Met;
    X17 представляет His;
    X18 представляет Asp.
  5. 5. Белок по п.4, имеющий аминокислотную последовательность, соответствующую SEQ ID NO: 3 или SEQ ID NO: 18.
  6. 6. Белок по п.1, где
    X1 представляет Met;
    X2, X3, X4, X5, X6, X7, X8, X10, X11, X12, X13 и X14 отсутствуют;
    X15 представляет Asn;
    X16 представляет Lys;
    X17 представляет Arg;
    X18 представляет Asp.
  7. 7. Белок по п.6, имеющий аминокислотную последовательность, соответствующую SEQ ID NO: 4 или SEQ ID NO: 19.
  8. 8. Белок по п.1, где
    - 72 039776
    X1 представляет Met или N-формил-Met;,
    X2, X3, X4, X5, X6, X7 представляют His;
    X8 и X9 отсутствуют;
    X10, X11, X12 и X13 представляют Asp;
    X14 представляет Lys;
    X15 представляет Asp;
    X16 представляет Met;
    X17 представляет His;
    X18 представляет Asp.
  9. 9. Белок по п.8, имеющий аминокислотную последовательность, соответствующую SEQ ID NO: 5 или SEQ ID NO: 20.
  10. 10. Белок по п.1, где
    X1 представляет Met или N-формил-Met;
    X2, X3, X4, X5, X6, X7 представляют His;
    X8 и X9 отсутствуют;
    X10, X11, X12 и X13 представляют Asp;
    X14 представляет Lys;
    X15 представляет Asn;
    X16 представляет Lys;
    X17 представляет Arg;
    X18 представляет Asn.
  11. 11. Белок по п.10, имеющий аминокислотную последовательность, соответствующую SEQ ID NO: 6 или SEQ ID NO: 21.
  12. 12. Белок по п.1, где
    X1 представляет Met или N-формил-Met;
    X2, X3, X4, X5, X6, X7, X8 и X9 представляют His;
    X10, X11, X12 и X13 представляют Asp;
    X14 представляет Lys;
    X15 представляет Asp;
    X16 представляет Met;
    X17 представляет His;
    X18 представляет Asp.
  13. 13. Белок по п.12, имеющий аминокислотную последовательность, соответствующую SEQ ID NO: 7 или SEQ ID NO: 22.
  14. 14. Белок по п.1, где
    X1 представляет Met или N-формил-Met;
    X2, X3, X4, X5, X6, X7, X8 и X9 представляют His;
    X10, X11, X12 и X13 представляют Asp;
    X14 представляет Lys;
    X15 представляет Asn;
    X16 представляет Lys;
    X17 представляет Arg;
    X18 представляет Asn.
  15. 15. Белок по п.14, имеющий аминокислотную последовательность, соответствующую SEQ ID NO: 8 или SEQ ID NO: 23.
  16. 16. Белок по любому из предшествующих пунктов, где указанный белок является антиоксидантом.
  17. 17. Белок по любому из предшествующих пунктов, где указанный белок связывает гем.
  18. 18. Фармацевтическая композиция, содержащая белок по любому из пп.1-17, и один или более фармацевтически приемлемых эксципиентов.
  19. 19. Применение белка по любому из пп.1-17 в качестве антиоксиданта в медицине.
EA201892085A 2016-03-18 2017-03-17 Новые белки, полученные из альфа-1-микроглобулина, и их применение EA039776B1 (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
DKPA201670158 2016-03-18
PCT/EP2017/056436 WO2017158181A1 (en) 2016-03-18 2017-03-17 Novel alpha-1-microglobulin derived proteins and their use

Publications (2)

Publication Number Publication Date
EA201892085A1 EA201892085A1 (ru) 2019-02-28
EA039776B1 true EA039776B1 (ru) 2022-03-11

Family

ID=56080208

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
EA201892085A EA039776B1 (ru) 2016-03-18 2017-03-17 Новые белки, полученные из альфа-1-микроглобулина, и их применение

Country Status (15)

Country Link
US (1) US10981963B2 (ru)
EP (1) EP3430032B1 (ru)
JP (1) JP6976579B2 (ru)
KR (1) KR102437662B1 (ru)
CN (1) CN108779157B (ru)
AU (1) AU2017235608B2 (ru)
BR (1) BR112018068522A2 (ru)
CA (1) CA3017836A1 (ru)
EA (1) EA039776B1 (ru)
ES (1) ES2896734T3 (ru)
MX (1) MX2018011193A (ru)
NZ (1) NZ746677A (ru)
SG (1) SG11201807352XA (ru)
WO (1) WO2017158181A1 (ru)
ZA (1) ZA201805797B (ru)

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CA3081416A1 (en) * 2017-11-03 2019-05-09 Guard Therapeutics International AB Use of alpha-1-microglobulin for protection of bone marrow cells

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2010006809A2 (en) * 2008-07-18 2010-01-21 Akerstroem Bo Medical use of the radical scavenger and antioxidant alpha-1-microglobulin
WO2014037390A1 (en) * 2012-09-05 2014-03-13 A1M Pharma Ab Alpha-1-microglobulin for use in the treatment of mitochondria-related diseases

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US9758554B2 (en) * 2012-01-31 2017-09-12 Technische Universitaet Muenchen Muteins of α1m lipocalin and method of production therefor
WO2014047490A1 (en) * 2012-09-21 2014-03-27 Beintoo, S.P.A. Interactive experience fully contained within an expandalble embedded unit
US10226570B2 (en) * 2017-03-10 2019-03-12 Seton Healthcare Family Apparatus and method for temporarily securing a movable accessory device relative to a movable patient

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2010006809A2 (en) * 2008-07-18 2010-01-21 Akerstroem Bo Medical use of the radical scavenger and antioxidant alpha-1-microglobulin
WO2014037390A1 (en) * 2012-09-05 2014-03-13 A1M Pharma Ab Alpha-1-microglobulin for use in the treatment of mitochondria-related diseases

Also Published As

Publication number Publication date
JP6976579B2 (ja) 2021-12-08
EP3430032A1 (en) 2019-01-23
BR112018068522A2 (pt) 2019-01-22
KR20180127411A (ko) 2018-11-28
NZ746677A (en) 2023-02-24
ZA201805797B (en) 2022-03-30
AU2017235608B2 (en) 2020-10-22
AU2017235608A1 (en) 2018-10-18
WO2017158181A1 (en) 2017-09-21
SG11201807352XA (en) 2018-09-27
ES2896734T3 (es) 2022-02-25
US10981963B2 (en) 2021-04-20
JP2019519466A (ja) 2019-07-11
MX2018011193A (es) 2019-03-28
EA201892085A1 (ru) 2019-02-28
KR102437662B1 (ko) 2022-08-29
CA3017836A1 (en) 2017-09-21
CN108779157A (zh) 2018-11-09
EP3430032B1 (en) 2021-09-01
CN108779157B (zh) 2022-12-30
US20190161524A1 (en) 2019-05-30

Similar Documents

Publication Publication Date Title
DK2900254T3 (en) ALFA-1 MICROGLOBULIN TO USE IN THE TREATMENT OF MITOCONDRY-RELATED DISEASES
US20170000851A1 (en) Ptd-smad7 therapeutics
US11866468B2 (en) Methods for treatment of nephrotic syndrome and related conditions
KR102221041B1 (ko) 신증후군 및 관련 병태의 치료 방법
EA039776B1 (ru) Новые белки, полученные из альфа-1-микроглобулина, и их применение
CA2801579C (en) Methods for treatment of nephrotic syndrome and related conditions
TW201643199A (zh) 用於放射性核種治療中保護腎臟之α-1-微球蛋白
IL272167B2 (en) Mofexin formulations
JP2017149685A (ja) 造影剤の使用に関連して腎臓の保護に使用するためのα−1−ミクログロブリン