EA035030B1 - Модифицированные морфолиновые аналоги олигонуклеотидов - Google Patents

Модифицированные морфолиновые аналоги олигонуклеотидов Download PDF

Info

Publication number
EA035030B1
EA035030B1 EA201490994A EA201490994A EA035030B1 EA 035030 B1 EA035030 B1 EA 035030B1 EA 201490994 A EA201490994 A EA 201490994A EA 201490994 A EA201490994 A EA 201490994A EA 035030 B1 EA035030 B1 EA 035030B1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
alkylene
arylene
formula
membered
another embodiment
Prior art date
Application number
EA201490994A
Other languages
English (en)
Other versions
EA201490994A1 (ru
Inventor
Гуннар Дж. Хансон
Дуайт Д. Уэллер
Бао Чжун Цай
Мин Чжоу
Original Assignee
Сарепта Терапьютикс, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Сарепта Терапьютикс, Инк. filed Critical Сарепта Терапьютикс, Инк.
Publication of EA201490994A1 publication Critical patent/EA201490994A1/ru
Publication of EA035030B1 publication Critical patent/EA035030B1/ru

Links

Classifications

    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/04—Antibacterial agents
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12—Antivirals
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12—Antivirals
    • A61P31/14—Antivirals for RNA viruses
    • A61P31/16—Antivirals for RNA viruses for influenza or rhinoviruses
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D413/00—Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, at least one ring having nitrogen and oxygen atoms as the only ring hetero atoms
    • C07D413/02—Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, at least one ring having nitrogen and oxygen atoms as the only ring hetero atoms containing two hetero rings
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07F—ACYCLIC, CARBOCYCLIC OR HETEROCYCLIC COMPOUNDS CONTAINING ELEMENTS OTHER THAN CARBON, HYDROGEN, HALOGEN, OXYGEN, NITROGEN, SULFUR, SELENIUM OR TELLURIUM
    • C07F9/00—Compounds containing elements of Groups 5 or 15 of the Periodic System
    • C07F9/02—Phosphorus compounds
    • C07F9/06—Phosphorus compounds without P—C bonds
    • C07F9/08—Esters of oxyacids of phosphorus
    • C07F9/09—Esters of phosphoric acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07F—ACYCLIC, CARBOCYCLIC OR HETEROCYCLIC COMPOUNDS CONTAINING ELEMENTS OTHER THAN CARBON, HYDROGEN, HALOGEN, OXYGEN, NITROGEN, SULFUR, SELENIUM OR TELLURIUM
    • C07F9/00—Compounds containing elements of Groups 5 or 15 of the Periodic System
    • C07F9/02—Phosphorus compounds
    • C07F9/547—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom
    • C07F9/6558—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom containing at least two different or differently substituted hetero rings neither condensed among themselves nor condensed with a common carbocyclic ring or ring system
    • C07F9/65583—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom containing at least two different or differently substituted hetero rings neither condensed among themselves nor condensed with a common carbocyclic ring or ring system each of the hetero rings containing nitrogen as ring hetero atom
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07F—ACYCLIC, CARBOCYCLIC OR HETEROCYCLIC COMPOUNDS CONTAINING ELEMENTS OTHER THAN CARBON, HYDROGEN, HALOGEN, OXYGEN, NITROGEN, SULFUR, SELENIUM OR TELLURIUM
    • C07F9/00—Compounds containing elements of Groups 5 or 15 of the Periodic System
    • C07F9/02—Phosphorus compounds
    • C07F9/547—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom
    • C07F9/6558—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom containing at least two different or differently substituted hetero rings neither condensed among themselves nor condensed with a common carbocyclic ring or ring system
    • C07F9/65586—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom containing at least two different or differently substituted hetero rings neither condensed among themselves nor condensed with a common carbocyclic ring or ring system at least one of the hetero rings does not contain nitrogen as ring hetero atom
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07F—ACYCLIC, CARBOCYCLIC OR HETEROCYCLIC COMPOUNDS CONTAINING ELEMENTS OTHER THAN CARBON, HYDROGEN, HALOGEN, OXYGEN, NITROGEN, SULFUR, SELENIUM OR TELLURIUM
    • C07F9/00—Compounds containing elements of Groups 5 or 15 of the Periodic System
    • C07F9/02—Phosphorus compounds
    • C07F9/547—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom
    • C07F9/6561—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom containing systems of two or more relevant hetero rings condensed among themselves or condensed with a common carbocyclic ring or ring system, with or without other non-condensed hetero rings
    • C07F9/65616—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom containing systems of two or more relevant hetero rings condensed among themselves or condensed with a common carbocyclic ring or ring system, with or without other non-condensed hetero rings containing the ring system having three or more than three double bonds between ring members or between ring members and non-ring members, e.g. purine or analogs
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07F—ACYCLIC, CARBOCYCLIC OR HETEROCYCLIC COMPOUNDS CONTAINING ELEMENTS OTHER THAN CARBON, HYDROGEN, HALOGEN, OXYGEN, NITROGEN, SULFUR, SELENIUM OR TELLURIUM
    • C07F9/00—Compounds containing elements of Groups 5 or 15 of the Periodic System
    • C07F9/02—Phosphorus compounds
    • C07F9/547—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom
    • C07F9/6564—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom having phosphorus atoms, with or without nitrogen, oxygen, sulfur, selenium or tellurium atoms, as ring hetero atoms
    • C07F9/6581—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom having phosphorus atoms, with or without nitrogen, oxygen, sulfur, selenium or tellurium atoms, as ring hetero atoms having phosphorus and nitrogen atoms with or without oxygen or sulfur atoms, as ring hetero atoms
    • C07F9/6584—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom having phosphorus atoms, with or without nitrogen, oxygen, sulfur, selenium or tellurium atoms, as ring hetero atoms having phosphorus and nitrogen atoms with or without oxygen or sulfur atoms, as ring hetero atoms having one phosphorus atom as ring hetero atom
    • C07F9/65842—Cyclic amide derivatives of acids of phosphorus, in which one nitrogen atom belongs to the ring
    • C07F9/65846—Cyclic amide derivatives of acids of phosphorus, in which one nitrogen atom belongs to the ring the phosphorus atom being part of a six-membered ring which may be condensed with another ring system
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • C12N15/1131—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing against viruses
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10—Type of nucleic acid
    • C12N2310/11—Antisense
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/31—Chemical structure of the backbone
    • C12N2310/314—Phosphoramidates
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/32—Chemical structure of the sugar
    • C12N2310/323—Chemical structure of the sugar modified ring structure
    • C12N2310/3233—Morpholino-type ring
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/34—Spatial arrangement of the modifications
    • C12N2310/346—Spatial arrangement of the modifications having a combination of backbone and sugar modifications
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/35—Nature of the modification
    • C12N2310/351—Conjugate
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/35—Nature of the modification
    • C12N2310/351—Conjugate
    • C12N2310/3513—Protein; Peptide
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/35—Nature of the modification
    • C12N2310/353—Nature of the modification linked to the nucleic acid via an atom other than carbon

Abstract

Представлены функционально-модифицированные аналоги олигонуклеотидов, включающие модифицированные межсубъединичные связи и/или модифицированные 3'- и/или 5'-концевые группы. Раскрытые соединения формулы (I) применимы для лечения заболеваний, где ингибирование экспрессии белков или коррекция продуктов сплайсинга искаженной мРНК создает благоприятные терапевтические эффекты.

Description

Заявление относительно перечня последовательностей
Перечень последовательностей, связанный с настоящей заявкой, представлен в текстовом формате вместо бумажного экземпляра и тем самым включен здесь ссылкой в описание. Имя текстового файла, содержащего перечень последовательностей, является следующим:
120178_498WO_SEQUENCE_LISTING.txt. Текстовый файл имеет объем около 13 KB, был создан 15 ноября 2012 г., и доступен в электронном виде через сервер EFS-web.
Предпосылки изобретения Область техники, к которой относится изобретение
Настоящее изобретение в основном относится к олигонуклеотидным соединениям (олигомерам), применимым в качестве антисмысловых соединений, и более конкретно к олигомерным соединениям, включающим модифицированные межсубъединичные связи и/или концевые группы, и к применению таких олигомерных соединений в антисмысловых методологиях.
Уровень техники
Антисмысловые олигомеры, как правило, рассчитаны на специфичное связывание с последовательностью участков ДНК или РНК и изменяют экспрессию вызывающих болезнь белков. Требования к успешному внедрению антисмысловых терапевтических препаратов включают (а) стабильность in vivo, (b) достаточные способность проникать через мембраны и внутриклеточное поглощение и (с) хороший баланс между связывающей способностью и специфичностью к последовательности. Были разработаны многочисленные аналоги олигонуклеотидов, в которых фосфодиэфирные связи нативной ДНК замещены другими связями, которые устойчивы к разложению нуклеазой (например, см. работы авторов Barawkar, D.A., и др., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, т. 95 (№ 19), стр. 11047-11052 (1998); Linkletter, В. А., и др., Nucleic Acids Res., т. 29 (№ 11), стр. 2370-2376 (2001); Micklefield, J., Curr. Med. Chem., т. 8 (№ 10), стр. 11571179 (2001)). Также были получены антисмысловые олигонуклеотиды, имеющие другие разнообразные модификации скелета (Crooke, S.T., Antisense Drug Technology: Principlesr Strategiesr and Applications (Технология антисмысловых лекарственных средств: принципы, стратегия и варианты применения), Нью-Йорк, издательство Marcel Dekker (2001); Micklefield, J., Curr. Med. Спет., т. 8 (№ 10), стр. 1157-1179 (2001); Crooke, S.T., Antisense Drug Technology (Технология антисмысловых лекарственных средств), Бока-Ратон, издательство CRC Press (2008)). В дополнение олигонуклеотиды были модифицированы конъюгацией пептидов, чтобы повысить внутриклеточное поглощение (Moulton, H.M., и др., Bioconjug. Chem., т. 15 (№ 2), стр. 290-299 (2004); Nelson, M.H., и др., Bioconjug. Chem., т. 16 (№ 4), стр. 959-966 (2005); Moulton, H.M., и др., Biochim. Biophys. Acta (2010)).
Эффективность таких аналогов нуклеиновых кислот в качестве антисмысловых или антигенных лекарственных препаратов была ограничена определенными характеристиками разнообразных аналогов. Например, недостатком аналогов с отрицательно заряженными связями, в том числе аналогов с фосфотиоатными связями, является значительное электростатическое отталкивание между отрицательными зарядами олигомера и целевой ДНК или РНК. Фосфотиоаты также проявляют неспецифическое связывание с другими клеточными компонентами, такими как белки. Эти свойства ограничивают терапевтическую эффективность антисмысловых олигомеров, состоящих из нативной РНК, нативной ДНК и отрицательно заряженных аналогов (Crooke, S.T., Antisense Drug Technology: Principles, Strategies, and Applications (Технология антисмысловых лекарственных средств: принципы, стратегия и варианты применения), Нью-Йорк, издательство Marcel Dekker (2001); Crooke, S.T., Antisense Drug Technology (Технология антисмысловых лекарственных средств), Бока-Ратон, издательство CRC Press (2008)). Неионные олигонуклеотидные аналоги с метилфосфонатными связями могут быть транспортированы в клетки в результате пассивной диффузии и/или пиноцитоза, но их применению препятствует сложность стереоизомерного состава и плохая растворимость (Crooke, S.T., Antisense Drug Technology: Principles, Strategies, and Applications (Технология антисмысловых лекарственных средств: принципы, стратегия и варианты применения), Нью-Йорк, издательство Marcel Dekker (2001); Micklefield, J., Curr. Med. Chem., т. 8 (№ 10), стр. 1157-1179 (2001)).
Несколькими исследовательскими группами был опубликован синтез положительно заряженных олигонуклеотидов (Bailey, C.P., и др., Nucleic Acids Res., т. 26 (№ 21), стр. 4860-4867 (1998); Micklefield, J., Curr. Med. Chem., т. 8 (№ 10), стр. 1157-1179 (2001); Egli, M., и др., Biochemistry, т. 44 (№ 25), стр. 9045-9057 (2005)). Например, был описан класс нуклеозидов с гуанидиниевыми связями (обозначенных DNG), сформированных замещением фосфатных связей в ДНК или РНК ахиральными гуанидиновыми фрагментами (Dempcy, R.O., и др., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, т. 91 (№ 17), стр. 7864-7868 (1994); Dempcy, R.O. и др., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, т. 93 (№ 9), стр. 4326-4330 (1996); Barawkar, D.A., и др., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, т. 95 (№ 19), стр. 11047-11052 (1998); Linkletter, B.A., и др., Nucleic Acids Res., т. 29 (№ 11), стр. 2370-2376 (2001)). Также были описаны олигомеры, связанные положительно заряженными тиомочевинными связями (Arya, D.P., и др., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, т. 96 (№ 8), стр. 4384-4389 (1999)). Замещение некоторых из этих связей нейтральными мочевинными связями было описано для сокращения тенденции таких положительно заряженных олигомеров к неспецифическому к последовательности связыванию (Linkletter, В.А., и др., Bioorg. Med. Chem., т. 8 (№ 8), стр. 1893-1901 (2000)). Ранее были описаны морфолино-олигомеры, содержащие (1-пиперазино) фосфинилиденоксильные и (1-(4- 1 035030 (ш-гуанидиноалканоил))пиперазино)фосфинилиденоксильные связи (например, см. патентный документ
WO 2008036127).
Хотя был достигнут значительный прогресс, в технологии остается потребность в олигонуклеотидных аналогах с улучшенными антисмысловыми характеристиками. Такие улучшенные антисмысловые или антигенные характеристики включают; повышенное сродство к ДНК и РНК без ущерба селективности к последовательности; улучшенные фармакокинетические характеристики и распределение в тканях; улучшенный транспорт в клетку и надежное и контролируемое in vivo распределение.
Краткое описание сущности изобретения
Соединения согласно настоящему изобретению разрешают эти проблемы и обеспечивают усовершенствования сравнительно с существующими в технологии антисмысловыми молекулами. Модификация межсубъединичных связей и/или конъюгация концевых фрагментов по 5'- и/или 3'-концевым группам олигонуклеотидных аналогов, например олигонуклеотида морфолино, приводят к антисмысловому олигомеру, имеющему превосходные свойства. Например, в определенных вариантах осуществления представленные олигомеры имеют улучшенную доставку в клетку, активность и/или распределение в тканях по сравнению с другими олигонуклеотидными аналогами, и/или могут быть эффективно доставлены к целевым органам. Эти превосходные свойства приводят к благоприятным терапевтическим индексам, сокращению клинической дозы и снижению стоимости изделий.
В одном варианте осуществления описываемые здесь соединения представляют собой соединения, включающие скелет, причем скелет включает последовательность морфолиновых циклических структур, соединенных межсубъединичными связями, причем межсубъединичные связи соединяют 3'-конец одной морфолиновой циклической структуры с 5'-концом соседней морфолиновой циклической структуры, причем каждая морфолиновая циклическая структура соединена с фрагментом спаренных оснований таким образом, что соединение может специфично к последовательности связываться с целевой нуклеиновой кислотой.
В одном аспекте представлено соединение, имеющее структуру формулы (I)
W=P—X
(I) или его соль, в которой n представляет собой целое число от 2 до 35;
G5 представляет собой галоген, ОН, О1-О30-алкоксигруппу, OSO2(С1-С12-алкил), OSO2(С6-С30-арил),
или структуру каждый остаток В представляет собой независимо выбранный фрагмент образующего пару основания, каждый фрагмент Y представляет собой независимо O или NR10;
причем, необязательно, R10 и Х8е соединены друг с другом с образованием цикла;
каждый фрагмент W представляет собой независимо S или O;
Z5 представляет собой -(L11)-(R15);
L11 выбирают из
- 2 035030
k) -C(R23)2O-; причем L13 выбирают из
L12 представляет собой линкер, расщепляемый в биологических условиях, выбранный из
a) -(C1-С10-алкилен)-ОС(О)О-СН2О-;
b) -С(О)-(C1-С10-алкилен)-ОС(О)О-СН2О-;
c) -С(О)-(СН=СН)-С(О)О-СН2О-;
d) -(C1-С10-алкилен)-S-S-CH2CH2O- или
e) -С(О)-(C1-С10-алкилен)-S-S-CH2CH2O-;
L15 представляет собой двухвалентный радикал, выбранный из групп С1-С12-алкилен, С3-С8циклоалкилен, С6-С30-арилен, -(С6-С3о-арилен)-(С1-С12-алкилен)-, -(С1-С12-алкилен)-C(=O)-, -(С2-С30алкокси)-C(=O)-, -(3-18-членный гетероалкилен)-C(=O)-, -(С3-С8-циклоалкилен)-C(=O)-, -(С3-С8-циклоалкилен)-(С1-С12-алкилен)-C(=O)-, -(С1-С12-алкилен)(С3-С8-циклоалкилен)-C(=O)-, -(С6-С30-арилен)C(=O)-, -(С6-С30-арилен)-(С1-С12-алкилен)-C(=O)-, -(C1-С12-алкилен)-(С6-С30-арилен)-C(=O)-, -(С1-С12алкилен)-O-C(=O)-, -(С3-С8-циклоалкилен)-O-C(=O)-, -(С7-С30-арилен)-O-C(=O)-, -(С6-С30-арилен)-(С1С12-алкилен)-O-C(=O)-, -(С6-С30-арилен)-(C1-C12-алкилен)-O-C(=O)-, -Q=O)OR21 или -P(=O)(R22)2;
R12 представляет собой электронную пару, при условии, что если R13 представляет собой С1-С12алкил, то R12 представляет собой электронную пару, N-оксид или С1-С6-алкил;
каждый радикал R10 и R13 независимо выбирают из атома водорода, гуанидинильной, амидинильной, гетероциклильной, Q-Сщ-алкильной, С3-С8-циклоалкильной; С6-С30-арильной, С7-С30-арилалкильной, С1-С30-алкилкарбонильной, С3-С8-циклоалкилкарбонильной, С3-С8-циклоалкилалкилкарбонильной, С6-С30-арилкарбонильной, С7-С30-арилалкилкарбонильной, Q-Cn-алкилоксикарбонильной, С3-С8-циклоалкилоксикарбонильной, С7-С30-арилоксикарбонильной, С8-С30-арилалкилоксикарбонильной групп, C(=O)OR21, -C(=O)NHR21 или -P(=O)(R22)2;
R15 независимо выбирают из гуанидинильной, амидинильной, 3-24-членного гетероциклила, С1-С12алкильной, С3-С8-циклоалкильной; С6-С30-арильной, С7-С30-арилалкильной, Q-Cn-алкилкарбонильной, С3-С8-циклоалкилкарбонильной, С3-С8-циклоалкилалкилкарбонильной, С6-С30-арилкарбонильной, С7-С30арилалкилкарбонильной, С2-С30-алкилоксикарбонильной, С3-С8-циклоалкилоксикарбонильной, С7-С30арилоксикарбонильной, С8-C30-арилалкилоксикарбонильной, 3-18-членной алкоксиалкилкарбонильной групп, -SO2R21, -G(=O)OR21, -₽(=O)(OH)2 или -P(=O)(R22)2;
каждый радикал R21 независимо представляет собой Q-Cn-алкильную или 3-18-членную алкокси алкильную группу;
каждый радикал R22 независимо представляет собой C6-C12-арилоксигруппу;
каждый радикал R23 независимо представляет собой Н или ^-С^алкил; или, необязательно, две
- 3 035030
К23-группы, объединенные с образованием 3-8-членного цикла;
R24 представляет собой С1-С6-алкилен;
Q независимо выбирают из X1, Х2, Х3, Х4, Х5, Х6, Х7 или Х8;
каждый X независимо выбирают из X1, Х2, Х3, Х4, Х5, Х6, Х7 или Х8, при условии, что по меньшей мере один X не представляет собой собой X1;
причем X1 представляет собой N(CH3)2;
причем Х2 выбирают из
a) -О-(С1-С12)-алкилен-СО2Н;
b) -О- (С1-С12) -алкилен-тетразолил;
c) -N (R1) - (С1-С12) -алкилен-СО2Н;
d) -N (R1) - (С1-С12) -алкилен-тетразолил;
e) -Ll-CO-(С1-С12)-алкилен-СО2Н;
f) -Ll-CO- (С1-С12) -алкилен-тетразолил;
g) -Ll-CO- (С1-С12) -алкенилен-СО2Н;
h) -Ll-CO- (C1-C12) -алкенилен-тетразолил;
i) -Ll-CO-(C6-C30)-арилен-СО2Н;
j ) -Ll-CO- (C6-C30) -арилен-тетразолил;
k) -Ll-CONH- (C1-C12) -алкилен-СО2Н;
l) -Ll-CONH- (C1-C12) -алкилен-тетразолил;
m) -Ll-CONH- (C6-C30) -арилен-СО2Н;
n) -Ll-CONH- (C6-C30) -арилен-тетразолил;
o) -L1-SO2- (C1-C12) -алкилен-СО2Н;
p) -L1-SO2- (C1-C12) -алкилен-тетразолил;
q) -LI-SO2-(C6-C30)-арилен-СО2Н;
r) -L1-SO2- (С6-Сзо) -арилен-тетразолил;
s) -LI-(C1-C12)-алкилен-СО2Н;
t) -LI- (C1-C12) -алкилен-тетразолил;
u) -LI-(С6-Сзо)-арилен-СО2Н;
v) -LI- (С6-Сзо) -арилен-тетразолил причем Х3 выбирают из
a) -L1-(С1-С3о)-алкил;
b) -L1-(3-24-членный)гетероциклил;
c) -О-(С1-С12)-алкилен-СНН-НН2;
d) -N (R1) - (С1-С12) -алкилен-СЙН-ЙНг;
- 4 035030
e) -li-cnh-nh2;
f) -LI-(C1-C12)-алкилен-СЫН-ЫН2;
g) -LI-(C6-C30)-арилен-СЫН-ЫН2;
h) -Ll-CO- (Ci-Ci2) -алкилен-СЫН-ЫН2;
i) -Ll-CO- (Ci-Ci2) -алкенилен-СЫН-ЫН2;
j ) -Ll-CO- (C6-C30) -арилен-СЫН-ЫН2;
k) -Ll-CONH- (C1-C12) -алкилен-СЫН-ЫН2
l) -Ll-CONH- (С6-Сзо) -арилен-СЫН-ЫН2;
m) -L1-SO2- (Ci-Ci2) -алкилен-СЫН-ЫН2;
n) -L1-SO2- (C6-C30) -арилен-СЫН-ЫН2;
o) -О- (С3-С12) -алкилен-N (R1) 2;
p) -N (R1) - (С2-С12) -алкилен-N (R1) 2;
q) -L1-N(R1)2;
r) -LI-(Ci-Ci2) -алкилен-N (R1) 2;
s) -LI-(C6-C30) -арилен-N (R1) 2;
t) -Ll-CO- (C!-C12) -алкилен-N (R1) 2;
u) -Ll-CO- (Ci-Ci2) -алкенилен-N (R1) 2;
v) -Ll-CO- (C6-C30) -арилен-N (R1) 2;
w) -Ll-CONH- (C1-C12) -алкилен-N (R1) 2;
x) -Ll-CONH- (C6-C30) -арилен-N (R1) 2;
y) -LI-SO2- (С!-С12) -алкилен-N (R1) 2;
z) -О- (C1-C12) -алкилен-N (R2) 3;
aa) -N (R1) - (C1-C12) -алкилен-N (R2) 3;
bb) -L1-N(R2)3;
cc) -LI-(C1-C12)-алкилен-N (R2) 3;
dd) -LI-(C6-C30) -арилен-N (R2) 3;
ее) -Ll-CO- (C1-C12) -алкилен-N (R2) 3;
ff) -Ll-CO- (C1-C12) -алкенилен-N (R2) 3;
gg) -Ll-CO- (C6-C30) -арилен-N (R2) 3;
hh) -Ll-CONH- (Ci-C12) -алкилен-N (R2) 3;
ii) -Ll-CONH- (C6-C30) -арилен-N (R2) 3;
j j ) -LI-SO2- (C1-C12) -алкилен-N (R2) 3;
kk) -О- (C1-C12) -алкилен- (3-24-членный) гетероциклил;
11) -N (R1) - (C1-C12) -алкилен- (3-24-членный) гетероциклил;
mm) -LI-(3-24-членный)алкилен-(3-24-членный)гетероциклил nn) -L1- (С6—С30) -арилен- (3-24-членный) гетероциклил;
- 5 035030 оо) -Ll-CO-(С1-С12)-алкилен-(3-24-членный)гетероциклил;
pp) -Ll-CO-(С1-С12)-алкенилен-(3-24-членный)гетероциклил;
qq) -Ll-CO-(С6-С30)-арилен-(3-24-членный)гетероциклил;
rr) -Ll-CONH-(С1-С12)-алкилен-(3-24-членный)гетероциклил;
ss) -Ll-CONH-(C6-C30)-арилен-(3-24-членный)гетероциклил;
tt) -LI-SO2-(С1-С12)-алкилен-(3-24-членный)гетероциклил;
uu) -О-(Ci-Ci2)-алкилен-N (О) (R2)2;
vv) -N (R1) - (Ci-012)-алкилен-N (О) (R2)2;
ww) -Ll-N(O) (r2)2;
xx) -LI-(C1-C12)-алкилен-N (0) (R2)23;
yy) -Ll-apwien-N (0) (R2) 2;
zz) -Ll-CO-(C1-C12)-алкилен-N (0) (R2)2;
aaa) -Ll-CO- (Ci-C12) -алкенилен-N (0) (R2)23;
bbb) -Ll-CO-(C6-C30)-арилен-N (0) (R2) 2;
ccc) -Ll-CONH-(Ci-C12)-алкилен-N (0) (R2)2;
ddd) -Ll-CONH-(C6-C30)-арилен-N (0) (R2)2;
eee) -L1-SO2-(С2-С12)-алкилен-N (0) (R2)2;
fff) -0-(Ci-C12)-алкилен-НН-СИН-НН2;
ggg) -N (R1) - (С2-С12) -алкилен-НН-СНН-ИН2;
hhh) -L1-NH-CNH-NH2;
iii) -LI-(C!-C12)-ηηκηηθη-ΝΗ-ΟΝΗ-ΝΗ2 ;
j j j ) -LI- (C6-C30) -apwieH-NH-CNH-NH2;
kkk) -Ll-CO-(Ci-Cis)-алкилен-НН-СНН-НН2;
111) -Ll-CO-(C1-C12)-алкенилен-НН-СНН-ИН2;
mmm) -Ll-CO-(C6-C30)-apnHeH-NH-CNH-NH2 ;
nnn) -Ll-CONH-(Ci-Ci2)-алкилен-НН-СНН-ИН2;
ooo) -Ll-CONH-(C6-C30)-apnHeH-NH-CNH-NH2 ;
ppp) -L1-SO2- (Ci-Ci2) -алкилен-НН-СНН-НН2;
qqq) -L1-SO2- (C6-C30) -apHHeH-NH-CNH-NH2;
при условии, что если X1 присутствует как N(CH3)2 и Х7 присутствует как пиперидинил, то X3 не представляет собой
причем Х4 выбирают из
- 6 035030
a) -О- (С1-С12) -алкилен- (Сб-С30) -арил;
b) -N(R2)- (Сб-С30) -арил;
c) -N(R2)- (С1-С12)-алкилен-(C6-C30)-арил;
d) -Ll-СО- (С1-С12) -алкилен- (Сб-С3о) -арил;
e) -Ll-CO- (С1-С12) -алкенилен- (C6-C30) -арил;
f) -Ll-CO- (Сб-С3о) -арилен- (Сб-С3о) -арил;
g) -Ll-CONH- (Ci—С12) -алкилен- (Сб-С30) -арил;
h) -Ll-CONH- (Сб-С30) -арилен- (Сб-С30) -арил;
i) - LI-SO2- (С1-С12) -алкилен- (C6-C30) -арил;
j ) -LI-SO2- (Сб-Сзо) -арилен- (С6-С30) -арил;
k) -LI- (С1-С12) -алкилен- (Сб-С3о) -арил;
l) -L1- (Сб-Сзо) -арилен- (Сб-С3о) -арил;
m) -N (R1) - (С1-С12) -алкилен-N (R1) - (C6-C30) -арил;
n) -N (R1) - (Ci—С12) -алкилен-N (R1) СО- (Сб-С30) -арил;
o) -N (R1) - (С1-С12) -алкилен-N (R1) ЗО2- (Сб-С30) -арил;
p) -N (R1) - (С1-С12) -алкилен-N (R1) СН2- (Сб-С30) -арил;
q) -L1-(Сб-С30) -арил;
г) -Ll-СО-(Сб-С30)-арил;
s) -L1-SO2- (Сб-С30) -арил;
t) -LI- (С1-С12) -алкилен-Р ( (Сб—С30) -арил) 3;
и) -Ll-СО- (С!-С12) -алкилен-Р ( (Сб-С30) -арил) 3;
v) -L1-SO2- (С!-С12) -алкилен-Р ( (С6-С3о) -арил) 3;
причем Х5 выбирают из
a) -О-(Ci-Ci2)-алкилен-(5-14-членный)-гетероарил;
b) - N (R1)-(С!-С12)-алкилен-(5-14-членный)-гетероарил;
c) -Ll-CO-(Сз-С12)-алкилен-(5-14-членный)-гетероарил;
d) -Ll-CO-(С1-С12)-алкенилен-(5-14-членный)-гетероарил;
e) -Ll-СО-(Сб-С30)-арилен-(5-14-членный)-гетероарил;
f) -Ll-CONH-(С1-С12)-алкилен-(5-14-членный)-гетероарил;
д) -Ll-CONH-(Сб-С30)-арилен-(5-14-членный)-гетероарил;
h) -LI-SO2-(С1-С12)-алкилен-(5-14-членный)-гетероарил;
i) -L1-SO2-(Сб-С30)-арилен-(5-14-членный)-гетероарил;
j) -LI- (С1-С12)-алкилен-(5-14-членный)-гетероарил;
к) -L1-(Сб-С3о)-арилен-(5-14-членный)-гетероарил;
1) -N (R1) - (Ci-C12) -алкилен-N (R1) - (5-14-членный) -гетероарил; ш) -N (R1) - (С1-С12) -алкилен-N (R1) СО- (5-14-членный) гетероарил;
n) -N (R1) - (С1-С12) -алкилен-N (R1) SO2- (5-14-членный) гетероарил;
o) -N (R1) - (С1-С12) -алкилен-N (R1) СН2- (5-14-членный) гетероарил;
p) -L1-(5-14-членный)-гетероарил;
причем X6 выбирают из
- 7 035030
a) -О- (С1-С12) -алкилен- (ОСН2СН2) т0Н;
b) -о- (С1-С12) -алкилен- (ОСН2СН2) тОСН3;
c) -N(R4) - (Ci-Ci2) -алкилен- (ОСН2СН2) т0Н;
d) -N(R4) - (Ci-Ci2) -алкилен- (ОСН2СН2) тОСН3;
e) -N(R4) - (С6-С30) -арилен- (ОСН2СН2) тОН;
f) -N (R1) - (С6—С30) -арилен- (ОСН2СН2) тОСН3 ;
g) -LI- (Ci-Ci2) -алкилен- (ОСН2СН2) тОН;
h) -Ll-CO- (Ci-Ci2) -алкилен- (ОСН2СН2) тОН;
i) -Ll-CO- (Ci-Ci2) -алкилен- (ОСН2СН2) тОСН3;
j ) -L1-SO2- (Ci-Ci2) -алкилен- (ОСН2СН2) тОН;
k) -L1-SO2- (Ci-Ci2) -алкилен- (ОСН2СН2) тОСН3;
l) -Ll-СО- (С6-Сзо) -арилен- (ОСН2СН2) тОН;
т) -Ll-СО- (С6-Сзо) -арилен- (ОСН2СН2) тОСН3;
n) -L1-SO2- (Сб-С30) -арилен- (ОСН2СН2) тОН;
o) -L1-SO2- (Сб-С30) -арилен- (ОСН2СН2) тОСН3;
p) -Ll-СО-(ОСН2СН2) тОН;
q) -Ll-CO-(ОСН2СН2) тОСН3;
г) -N (R1)-(дибензо-18-краун-6) ;
s) азакраун-эфир;
причем Х7 выбирают из
a) -гетероциклил;
b) -N (R1) (R3) |с) -Ll-водород;
d) -LI-(С1-С12)-алкил;
е) -Ll-СО- (С1-С30) -алкил;
f) -L1-CONH-(C2-Ci2)-алкил;
g) -Ll-CON ( (С1-С12) -алкил) - (Ci-C12) -алкил;
h) -LI-SO2-(С1-С12)-алкил;
при условии, что если X1 присутствует как N(CH3)2 и Х3 присутствует как
то Х7 не представляет собой пиперидинил;
причем Х8 выбирают из
a) -L1-CA;
b) -Ll-dCA;
c) -li-coch2 (R4) ;
d) -Ll-COCH (R4) NHCO2- (С1-С12) -алкил;
e) -OR5, причем R5 и R10 совместно образуют цикл; каждый R1 независимо представляет собой атом водорода или алкил;
каждый R2 независимо представляет собой С1-С12-алкил, или, необязательно, когда два R2 представляют С1-С12-алкил, то два R2 соединены с образованием 3-24-членного гетероциклического кольца; каждый R3 независимо представляет собой С2-С18-алкил, (С^^-алкенил;
каждый R4 независимо представляет собой атом водорода, (Ц-С^-алкил, гидрокси^-Ц^-алкил, сульфгидрил^-Ц^-алкил или (С6-С30)-арил(С1-С12)-алкил;
каждый R5 независимо представляет собой С1-С12-алкил;
каждый R6 независимо представляет собой атом водорода или С1-С12-алкил;
L1 выбирают из
- 8 035030
причем каждый Q1 и Q2 в каждом случае выбирают из связи, -О- или -N(R6)-;
каждый Е1 независимо выбирают из (С6-С30)-арильной или 5-14-членной гетероарильной группы; каждый Е2 независимо представляет собой азотсодержащую гетероарильную группу;
каждый L4 и L5, в каждом случае независимо, представляет связь, С1-С6-алкильную или (3-24членную) гетероалкильную группу;
m, p, q, s, и t, каждый независимо, составляет 1-4, каждый гетероциклильный фрагмент независимо содержит от 1 до 8 гетероатомов, выбранных из группы, состоящей из N, O, Р и S; и каждый гетероарильный фрагмент независимо содержит от 1 до 6 гетероатомов, выбранных из группы, состоящей из N, O, Р и S, при этом если группа X на фосфористой связи, ближайшей к 3'-концу, представляет собой
где Ahx обозначает 6-аминогексановую кислоту, и R обозначает аргинин, то по меньшей мере три другие группы X не являются X1, и, где X не является
В еще одном варианте по меньшей мере один X выбирают из
- 9 035030
В еще одном варианте по меньшей мере один X представляет собой собой -L1-(3-24членный)гетероциклил, и в котором L1 выбирают из
В еще одном варианте по меньшей мере один X выбирают из
В еще одном варианте по меньшей мере один X выбирают из -N(R1)-(C1-C12)-алкилен-CNH-NH2, -N(R1)-(C1-C12)-алкилен-N(R1)2, -КЩ^ДСрСЩ-алкилен-КЩ2)^ -N(R1)-(C1-C12)-алкилен-(3-24-членный)гетероциклил, -N(R1)-(C1-C12)-алкилен-N(О)(R2)2 и -N(R1)-(С1-С12)-алкилен-NH-CNH-NH2.
В еще одном варианте по меньшей мере один X выбирают из Ж1-(5-14-членный)-гетероарил, -L1(C1-C12)-алкилен-(5-14-членный)-гетероарил, Ж1-(С6-С30)-арилен-(5-14-членный)-гетероарил, -L1-CO(C1-C12)-алкилен-(5-14-членный)-гетероарил, ЖВСОДСгСЩ-алкениленДб-М-членныйугетероарил, -L1СО-(С6-С30)-арилен-(5-14-членный)-гетероарил, -L1-CONH-(C1-C12)-алкилен-(5-14-членный)-гетероарил, -L1-CONH-(С6-С30)-арилен-(5-14-членный)-гетероарил, -L1-SO2-(C1-C12)-алкилен-(5-14-членный)гетероарил, -L1 -SO2-(C6-C30)-арилен-(5-14-членный)-гетероарил.
В еще одном варианте по меньшей мере один X представляет собой -L1-CO-(C1-C12)-алкил.
В еще одном варианте Z5 представляет собой -(L11)-(R15); каждый Y независимо представляет собой O, NH или NR10; каждый W представляет собой O; каждый R1 независимо представляет собой атом водорода или (^-^Д-алкил; каждый R2 независимо представляет собой С1-С12-алкил; и каждый X независимо выбирают из X1, Х2, X3, Х4, Х5, X6, Х7 или Х8.
В еще одном варианте каждый Y представляет собой O, и каждый W представляет собой О.
В еще одном варианте R13 представляет собой трифенилметильную группу.
- 10 035030
В еще одном варианте G5 представляет собой 1 , и Z5 представляет собой -(L11)-(R15), в котором С2-Сзо-алкилоксикарбонил выбирают из -С(=O)ОСН2СН2ОН, -С(=О)ОСН2СН2ОСН2СН2ОН или -С^Ж^С^ОС^С^ОС^С^ОН.
^O-P-N nA; Υ°\/ΟΑ ' О—' ' ' ^ОН
В еще одном варианте Z5 представляет собой НзС СНз ·
Эти и прочие аспекты изобретения будут понятными при обращении к нижеследующему подробному описанию. Для этой цели здесь изложены разнообразные литературные источники, которые более подробно описывают определенную базовую информацию, методики, соединения и/или композиции, и тем самым каждый из них включен здесь ссылкой во всей своей полноте.
Включение ссылкой.
Все публикации, патенты и патентные заявки, упомянутые в этом описании, включены здесь ссылкой в той же мере, как если бы каждые из индивидуальных публикаций, патента или патентной заявки были конкретно и индивидуально указаны как включенные ссылкой.
Краткое описание чертежей
Элементы новизны изобретения в подробностях изложены в пунктах прилагаемой патентной формулы. Лучшее понимание признаков и преимуществ настоящего изобретения будет достигнуто с привлечением нижеследующего подробного описания, которое излагает иллюстративные варианты осуществления, в которых использованы принципы изобретения, и сопроводительных чертежей, в которых фиг. 1 иллюстрирует приготовление линкера для твердофазного синтеза;
фиг. 2 - получение твердого носителя для синтеза олигомера;
фиг. 3 - твердофазный синтез олигомеров и фиг. 4 - отщепление олигомера от твердого носителя.
Подробное описание изобретения
Определения.
В нижеследующем описании определенные специфические детали изложены, чтобы обеспечить доскональное понимание разнообразных вариантов осуществления. Однако квалифицированному специалисту в этой области технологии будет понятно, что изобретение может быть реализовано на практике без этих деталей. В других примерах общеизвестные структуры не были показаны или подробно описаны во избежание ненужных загромождающих описаний вариантов осуществления. Если контекст не оговаривает иного, на всем протяжении описания и пунктов нижеследующей патентной формулы слово включать и его вариации, такие как включает и включающий, следует толковать в открытом, включительном смысле, т.е. как включающий, но не ограничивающийся таковым. Кроме того, приведенные здесь заголовки указаны только для удобства и не для интерпретации области или смысла заявленного изобретения.
Ссылка на протяжении настоящего описания на один вариант осуществления или на вариант осуществления означает, что конкретные признак, структура или характеристика, описываемые в связи с вариантом осуществления, включены по меньшей мере в один вариант осуществления. Так, появление выражений в одном варианте осуществления или в варианте осуществления в различных местах на протяжении этого описания не обязательно предполагает, что все они имеют отношение к одному и тому же варианту осуществления. Кроме того, конкретные признаки, структуры или характеристики могут быть объединены любым подходящим путем в одном или многих вариантах осуществления. Кроме того, как применяемые в этом описании и в пунктах прилагаемой патентной формулы формы единственного числа включают множественные объекты, если содержание определенно не предписывает иного. Также следует отметить, что термин или, как правило, используется в его смысле, включающем и/или, если содержание определенно не оговаривает иного.
Приведенные ниже термины, как применяемые здесь, имеют следующие значения, если не оговорено нечто иное.
Аминогруппа имеет отношение к радикалу -NH2.
Цианогруппа или нитрильная группа имеет отношение к радикалу -CN.
Гидроксигруппа или гидроксил имеет отношение к радикалу -OH.
Иминогруппа имеет отношение к заместителю =NH.
Гуанидинил имеет отношение к заместителю -NHC(=NH)NH2.
Амидинил имеет отношение к заместителю -C(=NH)NH2.
Нитрогруппа имеет отношение к радикалу -NO2.
Оксогруппа имеет отношение к заместителю =O. Тиоксогруппа имеет отношение к заместителю =S.
Холат или CA имеет отношение к следующей структуре:
- 11 035030
Алкил имеет отношение к радикалу с линейной или разветвленной углеводородной цепью, который является насыщенным или ненасыщенным (т.е. содержит одну или более двойных и/или тройных связей), имеет от одного до тридцати атомов углерода, и который присоединен к остальной молекуле ординарной связью. Сюда входят алкилы, включающие любое число атомов углерода от 1 до 30. Алкил, содержащий до 30 атомов углерода, обозначается как Q-C^-алкил, подобным образом, например, алкил, включающий до 12 атомов углерода, представляет собой Q-Сп-алкил. Алкилы (и прочие определяемые здесь фрагменты), включающие другие количества атомов углерода, представлены подобным образом. Алкильные группы включают, но не ограничиваются таковыми, Q-C^-алкил, С1-С20-алкил, С1-С15-алкил, Q-Сщ-алкил, Q-Q-алкил, С1-С6-алкил, С1-С4-алкил, Ci-СУалкил, С1-С2-алкил, С2-С8-алкил, С3-С8-алкил, и С4-С8-алкил.
Показательные алкильные группы включают, но не ограничиваются таковыми, метил, этил, нпропил, 1-метилэтил (изопропил), н-бутил, изобутил, втор-бутил, н-пентил, 1,1-диметилэтил (третбутил), 3-метилгексил, 2-метилгексил, этенил, 1-пропенил, 1-бутенил, 1-пентенил, 1,4-пентадиенил, этинил, пропинил, 2-бутинил, 3-бутинил, пентинил, гексинил и т.п. Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, алкильная группа необязательно может иметь заместители, как описано ниже.
Алкилен, или алкиленовая цепь, имеет отношение к линейной или разветвленной двухвалентной углеводородной цепи, связывающей остальную молекулу с радикальной группой. Алкилены могут быть насыщенными или ненасыщенными (т.е. содержат одну или более двойных и/или тройных связей). Показательные алкилены включают, но не ограничиваются таковыми, Q-Cn-алкилен, Q-Q-алкилен, С1С6-алкилен, С1-С4-алкилен, Q-Q-алкилен, С1-С2-алкилен, Q-алкилен. Показательные алкиленовые группы включают, но не ограничиваются таковыми, метилен, этилен, пропилен, н-бутилен, этенилен, пропенилен, н-бутенилен, пропинилен, н-бутинилен и т.п. Алкиленовая цепь присоединена к остальной молекуле ординарной или двойной связью и к радикальной группе ординарной или двойной связью. Точки присоединения алкиленовой цепи к остальной молекуле и к радикальной группе могут включать один атом углерода или любые два атома углерода внутри цепи. Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, алкиленовая цепь необязательно может иметь заместители, как описано ниже.
Алкоксигруппа имеет отношение к радикалу формулы -ORa, где Ra представляет алкильный радикал, как было определено. Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, алкоксигруппа необязательно может иметь заместители, как описано ниже.
Алкоксиалкил имеет отношение к радикалу формулы -RbORa, где Ra представляет алкильный радикал, как было определено, и где Rb представляет алкиленовый радикал, как было определено. Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, алкоксиалкильная группа необязательно может иметь заместители, как описано ниже.
Алкоксиалкилкарбонил имеет отношение к радикалу с формулой -C(=O)RbORa, где Ra представляет алкильный радикал, как было определено, и где Rb представляет алкиленовый радикал, как было определено. Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, алкоксиалкилкарбонильная группа необязательно может иметь заместители, как описано ниже.
Алкилкарбонил имеет отношение к радикалу с формулой -C(=O)Ra, где Ra представляет алкильный радикал, как было определено выше. Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, алкилкарбонильная группа необязательно может иметь заместители, как описано ниже.
Алкилоксикарбонил имеет отношение к радикалу с формулой -Q=O)ORa, где Ra представляет ал- 12 035030 кильный радикал, как было определено. Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, алкилоксикарбонильная группа необязательно может иметь заместители, как описано ниже. Показательные алкилоксикарбонильные группы включают, но не ограничиваются таковыми, -С(=О)ОСН2СН2ОН,
-С^СЮСЩСЩОСЩСЩОН, -С(=С)ОСН2СН2ОСН2СН2ОСН2СН2ОН, -С(=О)ОСН2СН2ОСНз,
-С(=О)ОСН2СН2ОСН2СН2ОСНз или -С(=С)ОСН2СН2ОСН2СН2ОСН2СН2ОСНз.
Гетероалкилен имеет отношение к алкиленовому радикалу, как описанному выше, где один или более атомов углерода в алкиленовой группе замещены атомом O, N или S. Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, гетероалкиленовая группа необязательно может иметь заместители, как описано ниже. Показательные гетероалкиленовые группы включают, но не ограничиваются таковыми, -ОСН2СН2О-, -ОСН2СН2ОСН2СН2О- или -ОСН2СН2ОСН2СН2ОСН2СН2О-.
Алкиламиногруппа имеет отношение к радикалу формулы -NHRa или -NRaRa, где каждый Ra представляет, независимо, алкильный радикал, как было определено выше. Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, алкиламиногруппа необязательно может иметь заместители, как описано ниже.
Амидил имеет отношение к радикалу формулы -N^C^O)^, где Ra представляет алкильный или арильный радикал, как здесь определено. Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, амидильная группа необязательно может иметь заместители, как описано ниже.
Амидинилалкил имеет отношение к радикалу формулы -Rb-C(=NH)NH2, где Rb представляет алкиленовый радикал, как было определено выше. Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, амидинилалкильная группа необязательно может иметь заместители, как описано ниже.
Амидинилалкилкарбонил имеет отношение к радикалу формулы -G^O^-C^NHN^, где Rb представляет алкиленовый радикал, как было определено выше. Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, амидинилалкилкарбонильная группа необязательно может иметь заместители, как описано ниже.
Аминоалкил имеет отношение к радикалу формулы -Rb-NRaRa, где Rb представляет алкиленовый радикал, как было определено выше, и каждый Ra независимо представляет атом водорода или алкильный радикал.
Тиоалкил имеет отношение к радикалу формулы -SRa, где Ra представляет алкильный радикал, как было определено выше. Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, тиоалкильная группа необязательно может иметь заместители.
Арил имеет отношение к радикалу, производному от углеводородной циклической системы, включающему водород, от 6 до 30 атомов углерода и по меньшей мере одно ароматическое кольцо. Арильный радикал может быть моноциклической, бициклической, трициклической или тетрациклической кольцевой системой, которая может включать конденсированные или мостиковые циклические системы. Арильные радикалы включают, но не ограничиваются таковыми, арильные радикалы, производные от углеводородных циклических систем ацеантрилена, аценафтилена, ацефенантрилена, антрацена, азулена, бензола, хризена, флуорантена, флуорена, асимм-индацена, симм-индацена, индана, индена, нафталина, феналена, фенантрена, плейадиена, пирена и трифенилена. Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, термин арил или префикс ар- (такой как аралкил) предполагается включающим арильные радикалы, которые необязательно имеют заместители.
Аралкил (арилалкил) имеет отношение к радикалу формулы Rb-Rc, где Rb представляет алкиленовую цепь, как было определено выше, и Rc представляет один или более арильных радикалов, как было определено выше. Примеры арилалкила включают, но не ограничиваются таковыми, бензил, дифенилметил, тритил (трифенилметил) и т.п. Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, арилалкильная группа необязательно может иметь заместители.
Арилкарбонил имеет отношение к радикалу формулы C(=O)Rc, где Rc представляет один или более арильных радикалов, как было определено выше, например фенил. Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, арилкарбонильная группа необязательно может иметь заместители.
Арилоксикарбонил имеет отношение к радикалу формулы -C(=O)ORc, где Rc представляет один или более арильных радикалов, как было определено выше, например фенил. Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, арилоксикарбонильная группа необязательно может иметь заместители.
Арилалкилкарбонил имеет отношение к радикалу формулы -C(=O)R-Rc. где Rb представляет алкиленовую цепь, как было определено выше, и Rc представляет один или более арильных радикалов, как было определено выше, например фенил. Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, арилалкилкарбонильная группа необязательно может иметь заместители.
Арилалкилоксикарбонил имеет отношение к радикалу формулы -C(=O)ORb-Rc, где Rb представляет алкиленовую цепь, как было определено выше, и Rc представляет один или более арильных радикалов, как было определено выше, например фенил. Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, арилалкилоксикарбонильная группа необязательно может иметь заместители.
Арилоксигруппа имеет отношение к радикалу формулы -ORc, где Rc представляет один или более арильных радикалов, как было определено выше, например фенил. Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, арилкарбонильная группа необязательно может иметь заместители.
Циклоалкил имеет отношение к стабильному, неароматическому, моноциклическому или поли- 13 035030 циклическому карбоциклическому кольцу, которое может включать конденсированные или мостиковые циклические системы, которое может быть насыщенным или ненасыщенным и присоединено к остальной молекуле ординарной связью. Показательные циклоалкилы включают, но не ограничиваются таковыми, циклоалкильные группы, имеющие от трех до пятнадцати атомов углерода, от трех до десяти атомов углерода, от трех до восьми атомов углерода, от трех до шести атомов углерода, от трех до пяти атомов углерода или от трех до четырех атомов углерода. Моноциклические циклоалкильные радикалы включают, но не ограничиваются таковыми, циклопропил, циклобутил, циклопентил, циклогексил, циклогептил и циклооктил. Полициклические радикалы включают, например, адамантил, норборнил, декалинил и 7,7-диметил-бицикло[2.2.1]гептанил. Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, циклоалкильная группа необязательно может иметь заместители.
Циклоалкилалкил имеет отношение к радикалу формулы -R|,R,|. где Rb представляет алкиленовую цепь, как было определено выше, и Rd представляет циклоалкильный радикал, как было определено выше. Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, циклоалкилалкильная группа необязательно может иметь заместители.
Циклоалкилкарбонил имеет отношение к радикалу формулы -C(=O)Rd, где Rd представляет циклоалкильный радикал, как было определено выше. Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, циклоалкилкарбонильная группа необязательно может иметь заместители.
Циклоалкилоксикарбонил имеет отношение к радикалу формулы -C(=O)ORd, где Rd представляет циклоалкильный радикал, как было определено выше. Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, циклоалкилоксикарбонильная группа необязательно может иметь заместители.
Конденсированный имеет отношение к любой описываемой здесь циклической структуре, которая является конденсированной с существующей циклической структурой. Когда конденсированный цикл представляет собой гетероциклическое ядро или гетероарильный цикл, любой атом углерода в существующей циклической структуре, который становится частью конденсированного гетероциклического ядра или конденсированного гетероароматического цикла, может быть замещен атомом азота.
Гуанидинилалкил имеет отношение к радикалу формулы -Rb-NHC(=NH)NH2, где Rb представляет алкиленовый радикал, как было определено выше. Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, гуанидинилалкильная группа необязательно может иметь заместители, как описывается ниже.
Гуанидинилалкилкарбонил имеет отношение к радикалу формулы -C(=O)Rb-NHC(=NH)NH2, где Rb представляет алкиленовый радикал, как было определено выше. Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, гуанидинилалкилкарбонильная группа необязательно может иметь заместители, как описывается ниже.
Гало или галоген имеет отношение к атомам брома, хлора, фтора и иода.
Галоалкил имеет отношение к алкильному радикалу, как было определено выше, который имеет в качестве заместителей один или более атомов галогенов, как определено выше, например трифторметил, дифторметил, фторметил, трихлорметил, 2,2,2-трифторэтил, 1,2-дифторэтил, 3-бром-2-фторпропил, 1,2дибромэтил и т.п. Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, галоалкильная группа необязательно может иметь заместители.
Пергало или перфтор имеет отношение к фрагменту, в котором каждый атом водорода был замещен атомом галогена или атомом фтора соответственно.
Гетероциклил, или гетероциклическое ядро, имеет отношение к стабильному неароматическому циклическому 3-24-членному радикалу, включающему от 2 до 23 атомов углерода и от 1 до 8 гетероатомов, выбранных из группы, состоящей из азота, кислорода, фосфора и серы. Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, гетероциклильный радикал может представлять собой моноциклическую, бициклическую, трициклическую или тетрациклическую кольцевую систему, которая может включать конденсированные или мостиковые циклические системы; и атомы азота, углерода или серы в гетероциклильном радикале необязательно могут быть окисленными; атом азота необязательно может быть кватернизован; и гетероциклильный радикал может быть частично или полностью насыщенным. Примеры таких гетероциклильных радикалов включают, но не ограничиваются таковыми, диоксоланил, тиенил[1,3]дитианил, декагидроизохинолил, имидазолинил, имидазолидинил, изотиазолидинил, изоксазолидинил, морфолинил, октагидроиндолил, октагидроизоиндолил, 2-оксопиперазинил, 2оксопиперидинил, 2-оксопирролидинил, оксазолидинил, пиперидинил, пиперазинил, 4-пиперидонил, пирролидинил, пиразолидинил, хинуклидинил, тиазолидинил, тетрагидрофурил, тритианил, тетрагидропиранил, тиоморфолинил, тиаморфолинил, 1-оксотиоморфолинил, 1,1-диоксотиоморфолинил, 12-краун-4, 15-краун-5, 18-краун-6, 21-краун-7, аза-18-краун-6, диаза-18-краун-6, аза-21-краун-7 и диаза21-краун-7. Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, гетероциклильная группа необязательно может иметь заместители.
Гетероарил имеет отношение к радикалу с 5-14-членной циклической системой, включающему атомы водорода, от одного до тридцати атомов углерода, от одного до шести гетероатомов, выборанных из группы, состоящей из азота, кислорода, фосфора и серы, и по меньшей мере одно ароматическое ядро. Для целей настоящего изобретения гетероарильный радикал может представлять собой моноциклическую, бициклическую, трициклическую или тетрациклическую кольцевую систему, которая может
- 14 035030 включать конденсированные или мостиковые циклические системы; и атомы азота, углерода или серы в гетероарильном радикале необязательно могут быть окисленными; атом азота необязательно может быть кватернизован. Примеры включают, но не ограничиваются таковыми, азепинил, акридинил, бензимидазолил, бензотиазолил, бензиндолил, бензодиоксолил, бензофуранил, бензоксазолил, бензтиазолил, бензотиадиазолил, бензо[Ъ][1,4]диоксепинил, 1,4-бензодиоксанил, бензонафтофуранил, бензоксазолил, бензодиоксолил, бензодиоксинил, бензопиранил, бензопиранонил, бензофуранил, бензофуранонил, бензотиенил (бензотиофенил), бензотриазолил, бензо[4,6]имидазо[1,2-а]пиридинил, карбазолил, циннолинил, дибензофуранил, дибензотиофенил, фуранил, фуранонил, изотиазолил, имидазолил, индазолил, индолил, индазолил, изоиндолил, индолинил, изоиндолинил, изохинолил, индолизинил, изоксазолил, нафтиридинил, оксадиазолил, 2-оксоазепинил, оксазолил, оксиранил, 1-оксидопиридинил, 1-оксидопиримидинил, 1-оксидопиразинил, 1-оксидопиридазинил, 1-фенил-1Н-пирролил, феназинил, фенотиазинил, феноксазинил, фталазинил, птеридинил, пуринил, пирролил, пиразолил, пиридинил, пиразинил, пиримидинил, пиридазинил, хиназолинил, хиноксалинил, хинолинил, хинуклидинил, изохинолинил, тетрагидрохинолинил, тиазолил, тиадиазолил, триазолил, тетразолил, триазинил и тиофенил (т.е. тиенил). Если в описании конкретно не оговорено нечто иное, гетероарильная группа необязательно может иметь заместители.
Все вышеуказанные группы могут быть либо замещенными, либо незамещенными. Термин замещенный, как используемый здесь, означает, что любая из вышеуказанных групп (т.е. алкильная, алкиленовая, алкоксильная, алкоксиалкильная, алкилкарбонильная, алкилоксикарбонильная группы, алкиламиногруппа, амидильная, амидинилалкильная, амидинилалкилкарбонильная, аминоалкильная, арильная, арилалкильная, арилкарбонильная, арилоксикарбонильная, арилалкилкарбонильная, арилалкилоксикарбонильная, арилоксильная, циклоалкильная, циклоалкилалкильная, циклоалкилкарбонильная, циклоалкилалкилкарбонильная, циклоалкилоксикарбонильная, гуанидинилалкильная, гуанидинилалкилкарбонильная, галоалкильная, гетероциклильная и/или гетероарильная группы) может быть дополнительно функционализирована, причем по меньшей мере один атом водорода замещается связью с неводородным атомом заместителя. Если в описании конкретно не оговорено, замещенная группа может включать один или более заместителей, выбранных из оксогруппы, -CO2H, нитрильной группы, нитрогруппы, гидроксильной группы, тиооксигруппы, алкильной, алкиленовой, алкоксильной, алкоксиалкильной, алкилкарбонильной, алкилоксикарбонильной, арильной, арилалкильной, арилкарбонильной, арилоксикарбонильной, арилалкилкарбонильной, арилалкилоксикарбонильной, арилоксильной, циклоалкильной, циклоалкилалкильной, циклоалкилкарбонильной, циклоалкилалкилкарбонильной, циклоалкилоксикарбонильной, гетероциклильной, гетероарильной групп, диалкиламиногрупп, ариламиногрупп, алкилариламиногрупп, диариламиногрупп, триалкиламмонийной (-N+R3), N-оксидных, имидных и енаминных групп; атом кремния в группах, таких как триалкилсилильные группы, диалкиларилсилильные группы, алкилдиарилсилильные группы, триарилсилильные группы, перфторалкильные или перфторалкоксильные группы, например трифторметильная или трифторметоксильная группы. Замещенный также означает любую из вышеуказанных групп, в которой один или более атомов водорода замещены связью высшего порядка (например, двойной или тройной связью) с гетероатомом, таким как атом кислорода, в оксогруппе, карбонильной, карбоксильной и сложноэфирной группах; и атомом азота в таких группах, как в иминах, оксимах, гидразонах и нитрилах. Например, понятие замещенная включает любую из вышеуказанных групп, в которой один или более атомов водорода замещены фрагментами -NRgC(=O)NRgRh, -NRgC(=O)ORh, -NRgSO2Rh, -OC(=O)NRgRh, -ORg, -SRg, -SORg, -SO2Rg, -OSO2Rg, -SO2ORg, =NSO2Rg и -SO2NRgRh. Замещенная также означает любую из вышеуказанных групп, в которой один или более атомов водорода замещены фрагментами -C(=O)Rg, -C(=O)ORg, -CH2SO2Rg, -CH2SO2NRgRh, -SH, -SRg или -SSRg. В вышеизложенном радикалы Rg и Rh являются одинаковыми или различными и независимо представляют атом водорода, алкильную, алкоксильную группы, алкиламиногруппу, тиоалкильную, арильную, арилалкильную, циклоалкильную, циклоалкилалкильную, галоалкильную, гетероциклильную, N-гетероциклильную, гетероциклилалкильную, гетероарильную, N-гетероарильную и/или гетероарилалкильную группы. В дополнение каждый из вышеупомянутых заместителей также может быть необязательно замещенным одним или более из вышеуказанных заместителей. Кроме того, любая из вышеуказанных групп может быть замещенной для включения одного или более внутренних атомов кислорода или серы. Например, алкильная группа может быть замещена одним или более внутренними атомами кислорода с образованием простого эфира или простой полиэфирной группы. Подобным образом, алкильная группа может быть замещена одним или более внутренними атомами серы с образованием простого тиоэфира, дисульфида и т.д. Амидильные фрагменты могут быть замещенными до 2 атомов галогенов, тогда как другие вышеуказанные группы могут быть замещены одним или более атомами галогенов. За исключением алкильных групп, все прочие группы также могут быть замещены аминогруппой или моноалкиламиногруппой. За исключением алкильных и алкилкарбонильных групп, все прочие группы также могут быть замещены гуанидинильным или амидинильным фрагментом. Необязательные заместители для любой из вышеуказанных групп также включают арилфосфорильную группу, например -RaP(Ar)3, в которой Ra представляет алкилен, и Ar представляет арильный фрагмент, например фенил.
Термины антисмысловой олигомер, или антисмысловое соединение, применяются взаимозаменяемо и имеют отношение к последовательности субъединиц, каждая из которых имеет основание, при
- 15 035030 соединенное к субъединице скелета, составленной из рибозы или другой пентозы в качестве углевода, или морфолиновой группы, и где группы скелета соединены межсубъединичными связями, которые позволяют основаниям в соединении гибридизоваться с целевой последовательностью в нуклеиновой кислоте (обычно РНК) спариванием оснований по Уотсону-Крику, с образованием гетеродуплекса нуклеиновая кислота:олигомер в пределах целевой последовательности. Олигомер может иметь последовательность, в точности комплементарную целевой последовательности или близкую к этому комплементарность. Такие антисмысловые олигомеры предназначены для блокирования или ингибирования трансляции мРНК, содержащей целевую последовательность, и могут быть названы нацеленными на последовательность, с которой они гибридизуются.
Морфолино-олигомер, или РМО, имеет отношение к полимерной молекуле, имеющей скелет, который несет основания, способные образовывать водородные связи с типичными полинуклеотидами, причем полимер не содержит в скелете пентозного углеводного фрагмента и более конкретно рибозного скелета, связанного фосфодиэфирными связями, что является типичным для нуклеотидов и нуклеозидов, но вместо этого содержит циклический азот со связкой по циклическому азоту.
Примерный олигомер морфолино включает морфолиновые субъединичные структуры, связанные между собой (тио)фосфорамидатными или (тио)фосфордиамидатными связями, соединяющими морфолиновый азот одной субъединицы с 5'-экзоциклическим атомом углерода соседней субъединицы, причем каждая субъединица содержит пуриновый или пиримидиновый фрагмент спаренных оснований, эффективных для связывания, с помощью специфического по основаниям водородного связывания, с основанием в полинуклеотиде. Морфолино-олигомеры (в том числе антисмысловые олигомеры) подробно описаны, например, в патентах США №№ 5698685; 5217866; 5142047; 5034506; 5166315; 5185444; 5521063; 5506337 и в находящихся на рассмотрении патентных заявках США 12/271036; 12/271040; и в PCT публикации номер WO 2009064471, все из которых включены здесь ссылкой во всей своей полноте.
РМО+ имеет отношение к фосфордиамидатным морфолиновым олигомерам, включающим любое число (1 -пиперазино)фосфинилиденоксильных, (1 -(4-(ш-гуанидиноалканоил))пиперазино)фосфинилиденоксильных связей, которые были описаны ранее (например, см. PCT публикацию WO 2008036127, которая включена здесь ссылкой во всей своей полноте).
РМО-Х имеет отношение к раскрытым здесь фосфордиамидатным морфолиновым олигомерам.
Фосфорамидатная группа включает фосфор, имеющий три присоединенных атома кислорода и один присоединенный атом азота, тогда как фосфордиамидатная группа включает фосфор, имеющий два присоединенных атома кислорода и два присоединенных атома азота.
Тиофосфорамидатные или тиофосфордиамидатные связи представляют собой фосфорамидатные или фосфордиамидатные связи соответственно, в которых один атом кислорода, типично кислород, связанный со скелетом, замещен серой.
Межсубъединичная связь имеет отношение к связи, соединяющей две морфолиновых субъединицы.
Заряженный, незаряженный, катионный и анионный, как используемые здесь, имеют отношение к преобладающему состоянию химической частицы при близком к нейтральному значении pH, например от около 6 до 8. Например, термин может иметь отношение к преобладающему состоянию химической частицы при физиологическом значении pH, т.е. около 7,4.
Низший алкил имеет отношение к алкильному радикалу из от одного до шести атомов углерода, как, например, к метилу, этилу, н-бутилу, изобутилу, трет-бутилу, изоамилу, н-пентилу и изопентилу. В определенных вариантах осуществления низшая алкильная группа имеет от одного до четырех атомов углерода. В других вариантах осуществления низшая алкильная группа имеет от одного до двух атомов углерода; т.е. метил или этил. Аналогично, низший алкенил имеет отношение к алкенильному радикалу из от двух до шести, предпочтительно от трех до четырех, атомов углерода, например к аллильной и бутенильной группам.
Немешающий (инертный) заместитель представляет собой заместитель, который не оказывает вредного воздействия на способность антисмыслового олигомера, как здесь описываемого, связываться с предназначенной для него мишенью. Такие заместители включают небольшие и/или относительно неполярные группы, такие как метил, этил, метоксильная, этоксильная группы, или атом фтора.
Олигонуклеотид, или антисмысловый олигомер, специфично гибридизуется с целевым полинуклеотидом, если олигомер гибридизуется с мишенью в физиологических условиях, при Tm выше 37°С, свыше 45°С, предпочтительно по меньшей мере 50°С и типично 60-80°С или выше. Tm олигомера представляет температуру, при которой 50% гибридизуются с комплементарным полинуклеотидом. Значение Tm определяют в стандартных условиях в физиологическом растворе, как описано, например, авторами Miyada и др., в Methods Enzymol., т. 154, стр. 94-107 (1987). Такая гибридизация может происходить при близкой или существенной комплементарности антисмыслового олигомера с целевой последовательностью, а также при точной комплементарности.
Полинуклеотиды описываются как комплементарные друг другу, когда гибридизация происходит в антипараллельной конфигурации между двумя одноцепочечными полинуклеотидами. Комплементарность (степень, в которой один полинуклеотид является комплементарным еще одному) может быть оце- 16 035030 йена количественно в терминах доли оснований в противолежащих цепях, которые, как ожидается, сформируют водородные связи друг с другом, согласно общепринятым правилам спаривания оснований.
Первая последовательность представляет собой антисмысловую последовательность в отношении второй последовательности, если полинуклеотид, последовательность которого представляет собой первую последовательность, специфично связывается или специфично гибридизуется со второй полинуклеотидной последовательностью при физиологических условиях.
Термин нацеленная последовательность представляет последовательность в олигонуклеотидном аналоге, которая является комплементарной (что значит в дополнение, по существу. комплементарной) целевой последовательности в РНК-геноме. Вся последовательность в целом или только часть аналогового соединения может быть комплементарной целевой последовательности. Например, в аналоге, имеющем 20 оснований, только 12-14 могут быть нацеленной последовательностью. Как правило, нацеленная последовательность формируется из смежных оснований в аналоге, но может быть альтернативно сформирована несмежными последовательностями, которые будучи размещенными вместе, например, от противоположных концов аналога составляют последовательность, которая охватывает целевую последовательность.
Мишень и нацеленные последовательности описываются как комплементарные друг другу, когда гибридизация происходит в антипараллельной конфигурации. Нацеленная последовательность может иметь близкую или существенную комплементарность целевой последовательности и по-прежнему быть эффективной для целей описываемых в данный момент способов, т.е. все еще быть комплементарной. Олигонуклеотидные аналоговые соединения, используемые в описываемых здесь способах, предпочтительно имеют не более одного ошибочного спаривания с целевой последовательностью из 10 нуклеотидов и предпочтительно не более одного ошибочного спаривания из 20. В альтернативном варианте применяемые антисмысловые олигомеры имеют по меньшей мере 90% гомологии последовательностей и предпочтительно по меньшей мере 95% гомологии последовательностей с примерными нацеленными последовательностями, как здесь обозначенными. Для целей комплементарного связывания с РНК как мишенью, и как обсуждается ниже, гуаниновое основание может быть комплементарным цитозиновому или урациловому основаниям в РНК.
Гетеродуплекс имеет отношение к дуплексу между олигонуклеотидным аналогом и комплементарным участком целевой РНК. Резистетный к нуклеазе гетеродуплекс имеет отношение к гетеродуплексу, образованному связыванием антисмыслового олигомера с его комплементарной мишенью, таким образом, что гетеродуплекс является, по существу, резистентным к in vivo разложению внутриклеточными или внеклеточными нуклеазами, такими как рибонуклеаза RNAse H, которые способны расщеплять двухцепочечные РНК/РНК- или РНК/ДНК-комплексы.
Агент является активно поглощаемым клетками млекопитающих, когда агент может поступать в клетку по иному механизму, нежели пассивная диффузия через клеточную мембрану. Агент может быть транспортирован, например, путем активного транспорта, означающего транспорт агентов через клеточную мембрану млекопитающих, например, по механизму АТФ-зависимого транспорта, или путем облегченного транспорта, т.е. транспорта антисмысловых агентов через клеточную мембрану по механизму транспорта, который требует связывания агента с транспортным белком, который затем облегчает прохождение связанного агента через мембрану.
Термины модулирующая экспрессия и/или антисмысловая активность имеют отношение к способности антисмыслового олигомера либо усиливать, либо, более типично, снижать экспрессию данного белка, путем интерференции с экспрессией или трансляцией РНК. В случае снижения экспрессии белка антисмысловый олигомер может непосредственно блокировать экспрессию данного гена или содействовать ускоренному разрушению РНК, транскрибированной этим геном. Морфолиновые олигомеры, как описываемые здесь, представляются действующими по первому (стерическим блокированием) механизму.
Предпочтительные антисмысловые мишени для стерически блокирующих олигомеров включают участок инициирующего ATG-кодона, сайты сплайсинга, участки, тесно примыкающие к сайтам сплайсинга, и 5'-нетранслируемый участок мРНК, хотя другие участки являлись успешными мишенями с использованием морфолиновых олигомеров.
Аминокислотная субъединица предпочтительно представляет собой α-аминокислотный остаток (-CO-CHR-NH-); она также может представлять собой β- или другой аминокислотный остаток (например, -CO-CH2CHR-NH-), где R представляет аминокислотную боковую цепь.
Термин аминокислота природного происхождения имеет отношение к аминокислоте, присутствующей в природных белках. Термин неприродная аминокислота имеет отношение к тем аминокислотам, которые не находятся в белках природного происхождения; примеры включают бета-аланин (β-Ala) и 6-аминокапроновую кислоту (Ahx).
Эффективное количество или терапевтически эффективное количество имеет отношение к количеству антисмыслового олигомера, вводимого млекопитающему субъекту либо в виде однократной дозы, либо как части последовательных доз, которое является эффективным для достижения желательного терапевтического эффекта, как правило, путем ингибирования трансляции выбранной целевой после
- 17 035030 довательности нуклеиновой кислоты.
Лечение индивида (например, млекопитающего, такого как человек) или клетки представляет собой любой тип вмешательства, применяемого в попытке изменить естественный ход болезни индивида или клетки. Лечение включает, но не ограничивается таковым, введение фармацевтической композиции и может быть проведено либо профилактически, либо как следствие возникновения патологического состояния или контакта с этиологическим агентом.
Таутомер имеет отношение к протонному сдвигу от одного атома в молекуле на еще один атом в той же молекуле. Представленные здесь соединения могут существовать как таутомеры. Таутомеры представляют собой соединения, которые являются взаимопревращающимися в результате миграции атома водорода, которая сопровождается переключением ординарной связи и соседней двойной связи. В структурах связей, где возможна таутомеризация, будет иметь место химическое равновесие. Рассматриваются все таутомерные формы раскрытых здесь соединений. Точное соотношение таутомеров зависит от нескольких факторов, в том числе температуры, растворителя, и значения pH. Некоторые примеры таутомерных взаимопревращений включают
Антисмысловые олигомеры.
А. Олигомеры с модифицированными межсубъединичными связями.
Как было отмечено выше, один вариант осуществления настоящего изобретения направлен на олигомеры, включающие новые межсубъединичные связи. В некоторых вариантах осуществления олигомеры имеют более высокое сродство к ДНК и РНК, чем это типично для соответствующих немодифицированных олигомеров, и демонстрируют улучшенные характеристики доставки в клетку, активности и/или распределения в тканях по сравнению с олигомерами, имеющими другие межсубъединичные связи.
Структурные признаки и свойства связей разнообразных типов и олигомеров более подробно описаны в нижеследующем обсуждении.
Заявители нашли, что повышение антисмысловой активности, биораспределения в поиске тканеймишеней и/или прочие желательные свойства могут быть оптимизированы при получении олигомеров, имеющих разнообразные межсубъединичные связи. В одном аспекте представлено соединение, имеющее структуру согласно формуле (I)
или ее соль или изомер, в которой n представляет целое число от 1 до 50;
G5 представляет галоген, OH, алкоксигруппу, OSO2^kht), СЗСг^рил) или структуру
каждый остаток В представляет независимо выбранный фрагмент спаренных оснований;
каждый фрагмент Y представляет независимо О или NR10; причем, необязательно, R10 и Х8е соединены друг с другом с образованием цикла;
каждый фрагмент W представляет независимо S или О;
Z5 представляет -(L11)-(R15), -(L11)-(L15)-(R16) или -(L11)-(L12)-(R17);
- 18 035030
L11 выбирают из
или
k) -C(R23)2O-;
причем L13 выбирают из
L12 представляет линкер, расщепляемый в биологических условиях, выбранный из
a) -(C1-С10-алкилен)-ОС(О)О-СН2О-;
b) -С(О)-(C1-С10-алкилен)-ОС(О)О-СН2О-;
c) -С(О)-(СН=СН)-С(О)О-СН2О-;
d) -(C1-С10-алкилен)-S-S-CH2CH2O- или
e) -С(О)-(C1-С10-алкилен)-S-S-CH2CH2O-;
L15 представляет двухвалентный радикал, выбранный из групп C1-C3o-алкилен, С3-С8-циклоалкилен, С6-С30-арилен, -(С6-С3o-арилен)-(C1-C3o-алкилен)-, -(С1-С3o-алкилен)-C(=O)-, -(С2-С3o-алкокси)-C(=O)-, -(3-18-членный гетероалкилен)-C(=O)-, -(С3-С8-циклоалкилен)-C(=O)-, -(С3-С8-циклоалкилен)-(С1-С30алкилен)-C(=O)-, -(C1-С30-алкилен)(С3-С8-циклоалкилен)-C(=O)-, -(С6-С30-арилен)-C(=O)-, -(С6-С30арилен)-(С1-С30-алкилен)-C(=O)-, -(C1-С30-алкилен)-(С6-С30-арилен)-C(=O)-, -(С1-С30-алкилен)-O-C(=O)-, -(С3-С8-циклоалкилен)-O-C(=O)-, -(С7-С30-арилен)-O-C(=O)-, -(С6-С30-арилен)-(С1-С30-алкилен)-O-C(=O)-, -(c6-С30-арилен)-(C1-C30-алкилен)-O-C(=O)-, -C(=O)OR21 или -P(=O)(R22)2;
R12 представляет электронную пару при условии, что, если R13 представляет C1-C30-алкил, то R12 представляет электронную пару, N-оксид или С1-С6-алкил;
каждый радикал R10 и R13 независимо выбирают из атома водорода, проникающего в клетку пептида, природной или неприродной аминокислоты, гуанидинильной, амидинильной, гетероциклильной, С1С30-алкильной, С3-С8-циклоалкильной; С6-С30-арильной, С7-С30-арилалкильной, С1-С30-алкилкарбонильной, С3-С8-циклоалкилкарбонильной, С3-С8-циклоалкилалкилкарбонильной, С6-С30-арилкарбонильной, С7-С30-арилалкилкарбонильной, C1-C30-алкилоксикарбонильной, С3-С8-циклоалкилоксикарбонильной, С7-С30-арилоксикарбонильной, С8-С30-арилалкилоксикарбонильной групп, -C(=O)OR21, -C(=O)NHR21 или -P(=O)(R22)2;
R15 независимо выбирают из проникающего в клетку пептида, природной или неприродной аминокислоты, гуанидинильной, амидинильной, гетероциклильной, С1-С30-алкильной, С3-С8-циклоалкильной; С6-С30-арильной, С7-С30-арилалкильной, C1-C30-алкилкарбонильной, С3-С8-циклоалкилкарбонильной, С3С8-циклоалкилалкилкарбонильной, С6-С30-арилкарбонильной, С7-С30-арилалкилкарбонильной, С2-С30алкилоксикарбонильной, С3-С8-циклоалкилоксикарбонильной, С7-С30-арилоксикарбонильной, С8-С30арилалкилоксикарбонильной, 3-18-членной алкоксиалкилкарбонильной групп, -SO2R21, -C(=O)OR21, -P(=O)(OH)2 или -P(=O)(R22)2;
R16 представляет твердую несущую матрицу, пригодную для твердофазного синтеза олигонуклео тидов;
R17 представляет лекарственное средство, белок или токсин;
каждый радикал R21 независимо представляет С1-С30-алкильную или 3-18-членную алкоксиалкиль ную группу;
каждый радикал R22 независимо представляет C6-C12-арилоксигруппу;
каждый радикал R23 независимо представляет H или ^-^-алкил; или, необязательно, две R23- 19 035030 группы, объединенные с образованием 3-8-членного цикла;
R24 представляет СгС6-алкилен;
Q независимо выбирают из X1, Х2, X3, Х4, Х5, X6, Х7 или Х8;
каждый X независимо выбирают из X1, Х2, X3, Х4, Х5, X6, Х7 или Х8 при условии, что по меньшей мере один X не представляет собой X1;
причем X1 представляет N(CH3)2;
причем Х2 выбирают из
a) -0-алкилен-С02Н;
b) -О-алкилен-СНЫ4;
c) -N (R1) -алкилен-СО2Н;
d) -N (R1)-алкилен-СНЫ4;
e) -Ъ1-СО-алкилен-СО2Н;
f) -Ъ1-СО-алкилен-СНЫ4;
д) -Ъ1-СО-алкенилен-СО2Н;
h) -Ъ1-СО-алкенилен-СНЫ4;
i) -Ъ1-СО-арилен-СО2Н;
j) -Ъ1-СО-арилен-СНЫ4 ;
k) -Ъ1-ССЖН-алкилен-СО2Н;
l) -Ъ1-ССЖН-алкилен-СНЫ4;
ш) -Ъ1-ССЖН-арилен-СО2Н;
п) -Ъ1-ССЖН-арилен-СНЫ4;
о) -Ъ1-ЭО2-алкилен-СО2Н;
р) -Ъ1-ЭО2-алкилен-СНЫ4 ;
д) -Ъ1-ЭО2-арилен-СО2Н;
г) -Ъ1-ЭО2-арилен-СНЫ4;
s) -Ъ1-алкилен-СО2Н;
t) -Ъ1-алкилен-СНЫ4;
и) -Ъ1-арилен-СО2Н;
ν) -Ъ1-арилен-СНЫ4; и
w) защищенная форма любой из вышеуказанных Х2-групп;
причем X3 выбирают из
a) -Ll-алкил;
b) -L1-гетероциклил;
- 20 035030
c) -О-алкилен-СЫН-ЫН2;
d) -N (R1)-алкилен-СЫН-ЫН2;
e) -L1-CNH-NH2;
f) -Ъ1-алкилен-СЫН-ЫН2 ;
g) -Ъ1-арилен-СЫН-ЫН2 ;
h) -Ъ1-СО-алкилен-СЫН-ЫН2 ;
i) -Ъ1-СО-алкенилен-СЫН-ЫН2 ;
j) -Ъ1-СО-арилен-СЫН-ЫН2 ;
k) -Ъ1-СОЫН-алкилен-СЫН-ЫН2
l) -Ll-CONH-apnneH-CNH-NH2 ;
m) -Ъ1-ЗО2-алкилен-СЫН-ЫН2 ;
n) -Ll-SO2-apnneH-CNH-NH2 ;
o) -О-алкилен-N (R1) 2;
p) -N (R1) -алкилен-N (R1) 2;
q) -L1-N(R1)2;
г) -Ь1-алкилен-Ы(R1) 2;
s) -Ъ1-арилен-Ы (R1) 2;
t) -Ъ1-С0-алкилен-Ы (R1) 2;
u) -Ъ1-С0-алкенилен-Ы(R1) 2;
v) -Ш-СО-арилен-Ы (R1) 2;
w) -Ш-СОЫН-алкилен-Ы (R1) 2;
x) -Ll-CONH-apnneH-N(R1) 2;
y) -Ъ1-ЗО2-алкилен-Ы (R1) 2;
z) -О-алкилен-N (R2) 3;
aa) -N (R1)-алкилен-N (R2) 3;
bb) -L1-N(R2)3;
cc) -LI-алкилен-N(R2) 3;
dd) -Ll-apnneH-N(R2) 3;
ее) -Ll-CO-anKnneH-N (R2) 3;
ff) -Ll-CO-anKeHnneH-N (R2) 3;
gg) -Ll-CO-apnneH-N (R2) 3;
hh) -Ll-CONH-anKnneH-N (R2) 3;
ii) -Ll-CONH-apnneH-N (R2) 3;
jj) -Ll-SO2-anKnneH-N (R2) 3;
kk) -О-алкилен-гетероциклил;
11) -N (R1)-алкилен-гетероциклил
- 21 035030 mm) -Ll-алкилен-гетероциклил;
nn) -L1-арилен-гетероциклил;
oo) -Ll-CO-алкилен-гетероциклил;
pp) -LI-CO-алкенилен-гетероциклил;
qq) -Ll-CO-арилен-гетероциклил;
rr) -L1-CONH-алкилен-гетероциклил;
ss) -Ll-CONH-арилен-гетероциклил;
tt) -й1-302-алкилен-гетероциклил;
uu) -О-алкилен-N(0) (R2)2;
vv) -N (R1)-алкилен-N (0) (R2)2;
ww) -Ll-N (0) (R2) 2;
xx) -Ь1-алкилен-Ы(0)(R2)23;
yy) -Ь1-арилен-Ы(0) (R2)2;
zz) -Ll-CO-алкилен-Ы(0) (R2)2;
aaa) -Ь1-С0-алкенилен-Ы(0)(R2)23;
bbb) -Ы-СО-арилен-N (0) (R2)2;
ccc) -Ь1-С0ЫН-алкилен-Ы(0) (R2)2;
ddd) -Ll-CONH-apwien-N (0) (R2)2;
eee) -й1-ЗО2-алкилен-Ы(0) (R2)2;
fff) -О-алкилен-ЫН-СЫН-ЫН2;
ggg) -N (R1)-алкилен-ЫН-СЫН-ЫН2;
hhh) -L1-NH-CNH-NH2;
iii) -Ь1-алкилен-ЫН-СЫН-ЫН2;
jjj) -Ы-арилен-ЫН-СЫН-ЫН2;
kkk) -Ь1-С0-алкилен-ЫН-СЫН-ЫН2;
ill) -Ь1-С0-алкенилен-ЫН-СЫН-ЫН2;
mmm) -Ь1-С0-арилен-ЫН-СЫН-ЫН2 ;
nnn) -LI-CONH-алкилeH-NH-CNH-NH2 ;
ooo) -Ll-CONH-apwieH-NH-CNH-NH2;
ppp) -Ь1-ЗО2-алкилен-ЫН-СЫН-ЫН2;
qqq) -Ll-SO2-apKneH-NH-CNH-NH2; и rrr) защищенная форма любой из вышеуказанных ХЗ-групп;
при условии, что если X1 присутствует как N(CH3)2 и Х7 присутствует как пиперидинил, то X3 не представляет
причем Х4 выбирают из
- 22 035030
a) -О-алкилен-арил;
b) -N (R1) -арил;
c) -N (R1)-алкилен-арил;
d) -Ll-CO-алкилен-арил;
e) -Ll-CO-алкенилен-арил;
f) -Ll-CO-арилен-арил;
g) -Ll-CONH-алкилен-арил;
h) -Ll-CONH-арилен-арил;
i) -Ь1-ЗО2-алкилен-арил;
j) -Ь1-ЗО2-арилен-арил;
k) -Ll-алкилен-арил;
l) -Ll-арилен-арил;
m) -N (R1) -алкилен-N (R1) -арил;
η) -N (R1)-алкилен-N (R1) СО-арил;
ο) -N (R1)-алкилен-N (R1) ЗО2-арил;
p) -N (R1)-алкилен-N (R1) СН2-арил;
q) -Ll-арил;
r) -Ll-CO-арил;
s) -Ь1-ЗО2-арил;
t) -Ll-алкилен-Р(арил)3;
u) -Ll-CO-алкилен-Р(арил)3;
v) -Ы-ЗО2-алкилен-Р (арил) 3; и
w) защищенная форма любой из вышеуказанных Х4-групп причем Х5 выбирают из
a) -О-алкилен-гетероарил;
b) - N (R1)-алкилен-гетероарил;
c) -Ll-CO-алкилен-гетероарил;
d) -Ll-CO-алкенилен-гетероарил;
e) -Ll-CO-арилен-гетероарил;
f) -Ll-CONH-алкилен-гетероарил;
g) -Ll-CONH-арилен-гетероарил;
h) -Ъ1-302-алкилен-гетероарил;
i) -Ъ1-302-арилен-гетероарил;
j) -Ll-алкилен-гетероарил;
k) -Ll-арилен-гетероарил;
l) -N (R1) -алкилен-N (R1) -гетероарил;
m) -N (R1) -алкилен-N (R1) СО-гетероарил;
η) -N (R1) -алкилен-N (R1) 302-гетероарил;
ο) -N (R1) -алкилен-N (R1) СН2-гетероарил;
p) -LI-гетероарил; и
q) защищенная форма любой из вышеуказанных Х5-групп причем X6 выбирают из
- 23 035030
a) -О-алкилен-(ОСН2СН2) mOH;
b) -О-алкилен-(ОСН2СН2)тОСН3;
c) -N (R1)-алкилен-(ОСН2СН2) тОН;
d) -NfR1) -алкилен- (ОСН2СН2) тОСН3;
e) -N (R1)-арилен-(ОСН2СН2) тОН;
f) -N (R1)-арилен-(ОСН2СН2) тОСН3;
д) -Ll-алкилен-(ОСН2СН2) тОН;
h) -Ll-CO-алкилен-(ОСН2СН2)тОН;
1) -Ll-CO-алкилен- (ОСН2СН2) тОСН3;
j) -Ъ1-ЗО2-алкилен-(ОСН2СН2)тОН;
k) -Ъ1-ЗО2-алкилен- (ОСН2СН2) тОСН3;
l) -Ll-CO-арилен-(ОСН2СН2)тОН;
т) -Ll-CO-арилен-(ОСН2СН2)тОСН3;
п) -Ъ1-ЗО2-арилен-(ОСН2СН2)тОН;
о) -Ъ1-ЗО2-арилен- (ОСН2СН2) тОСН3;
р) -Ll-СО-(ОСН2СН2)тОН;
q) -Ll-CO- (ОСН2СН2) тОСН3;
г) -N (R1)-(дибензо-18-краун-6) ;
s) азакраун-эфир; и
t) защищенная форма любой из вышеуказанных Хб-групп;
причем Х7 выбирают из
a) -гетероциклил;
b) -NiR1) (R3)
с) -Ll-водород;
d) -Ll-алкил;
е) -Ll-CO-алкил;
f) -Ll-CONH-алкил;
g) -Ll-CON(алкил)-алкил;
h) -Ъ1-ЗО2-алкил; и
1) защищенная форма любой из вышеуказанных Х7-групп;
при условии, что если X1 присутствует как N(CH3)2 и X3 присутствует как
то Х7 не представляет пиперидинил;
причем Х8 выбирают из
a) -L1-CA;
b) -L1-dCA;
c) -L1-COCH2(R4);
d) ^-СОСН^т^-алкил;
e) -OR5, причем R5 и R10 совместно образуют цикл;
f) защищенная форма любой из вышеуказанных Х8-групп;
каждый R1 независимо представляет атом водорода, алкил или проникающий в клетку пептид;
каждый R2 независимо представляет С1-С12-алкил, или, необязательно, когда два R2 представляют С1-С12-алкил, то два R2 соединены с образованием гетероциклического кольца;
каждый R3 независимо представляет С2-С18-алкил, алкенил или алкинил;
каждый R4 независимо представляет атом водорода, алкил, гидроксиалкил, сульфгидрилалкил или арилалкил;
каждый R5 независимо представляет С1-С12-алкил;
каждый R6 независимо представляет атом водорода или CrCn-алкил;
- 24 035030
L1 выбирают из
причем каждый Q1 и Q2 в каждом случае выбирают из связи, -О- или -N(R6)-;
каждый Е1 независимо выбирают из необязательно замещенной арильной или необязательно замещенной гетероарильной группы;
каждый Е2 независимо представляет необязательно замещенную азотсодержащую гетероарильную группу;
каждый L4 и L5, в каждом случае независимо, представляет связь, необязательно замещенную С1С6-алкильную или необязательно замещенную гетероалкильную группу; и m, р, q, s и t, каждый независимо, составляют 1-4.
В некоторых вариантах осуществления формулы (I) Z5 представляет -(L11)-(R15). В других вариантах осуществления Z5 представляет -(L11)-(L15)-(R16). В еще других вариантах осуществления Z5 представляет -(L12)-(R17). В одном дополнительном варианте осуществления формулы (I) каждый Y независимо представляет O, NH или NR10. В одном дополнительном варианте осуществления вышеуказанных вариантов осуществления каждый W представляет О. В еще одном дополнительном варианте осуществления каждый R1 независимо представляет атом водорода или алкил. В одном дополнительном варианте осуществления каждый R2 независимо представляет С1-С12-алкил. В еще одном дополнительном варианте осуществления каждый X независимо выбирают из X1, Х2, X3, Х4, Х5, X6, Х7 или Х8.
В одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Z5 представляет -(L11)-(R15), каждый Y независимо представляет O, NH или NR10, каждый W представляет O, каждый R1 независимо представляет атом водорода или алкил, каждый R2 независимо представляет С1-С12-алкил, каждый X независимо выбирают из X1, Х2, X3, Х4, Х5, X6, Х7 или Х8, и n представляет целое число от 1 до 35.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n составляет 1, Z5 представляет -(L11)-(R15), каждый Y независимо представляет O, NH или NR10, каждый W представляет O, каждый R1 независимо представляет атом водорода или алкил, каждый R2 независимо представляет С1-С12-алкил, и X выбирают из Х2, X3, Х4, Х5, X6, Х7 или Х8. В некоторых вариантах осуществления формулы (I), в которой n составляет 1, G5 представляет галоген. В еще одном варианте осуществления W представляет О. В еще одном варианте осуществления Y представляет О. В еще одном варианте осуществления R13 представляет арилалкил. В еще одном варианте осуществления R13 представляет необязательно замещенную трифенилметильную группу.
В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n составляет 1, G5 представляет галоген, W представляет O, Y представляет O, R13 представляет необязательно замещенную трифенилметильную группу, и X представляет Х2. В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n составляет 1, G5 представляет галоген, W представляет O, Y представляет O, R13 представляет необязательно замещенную трифенилметильную группу, и X представляет Х3. В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n составляет 1, G5 представляет галоген, W представляет O, Y представляет O, R13 представляет необязательно замещенную трифенилметильную группу, и X представляет Х4. В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n составляет 1, G5 представляет галоген, W представляет O, Y представляет O, R13 представляет необязательно замещенную трифенилметильную группу, и X представляет Х5. В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n составляет 1, G5 представляет галоген, W представляет O, Y представляет O, R13 представляет необязательно замещенную трифенилметильную группу, и X представляет Х6. В некоторых
- 25 035030 вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n составляет 1, G5 представляет галоген, W представляет О, Y представляет О, R13 представляет необязательно замещенную трифенилметильную группу, и X представляет Х7. В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n составляет 1, G5 представляет галоген, W представляет О, Y представляет О, R13 представляет необязательно замещенную трифенилметильную группу, и X представляет Х8.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой G5 представляет -(L13)-(L15)-(R16). В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой G5 представляет -(L13)-(R15). В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой G5 представляет -(L13)-(L12)-(R17).
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n составля5 Г ет целое число от 1 до 35 и G представляет — . В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n составляет целое число от 1 до 35 и W представляет О. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n составляет целое число от 1 до 35, и Y представляет О. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I),
V в которой n составляет целое число от 1 до 35, G представляет , каждый W представляет О, каждый Y представляет О и каждый X независимо выбирают из X1, Х2, X3, Х4, Х5, X6, Х7 или Х8.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n составля5 ет целое число от 1 до 35, G представляет -4- , каждый W представляет О, каждый Y представляет О и по меньшей мере один X представляет Х2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 выбирают из -О-алкилен-СО2Н, -О-алкилен-СНХ4, -Ы(К1)-алкилен-СО2Н, и -Х(К1)-алкилен-СНЫ4. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет -О-алкилен-СО2Н. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет -О-алкилен-СНХ4. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет -Ы(К1)-алкилен-СО2Н. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет -Х(К1)-алкилен-СНЫ4. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 выбирают из -О-алкилен-СО2Н, -О-алкилен-СНЩ -Ы(К1)-алкилен-СО2Н и -Х(К1)-алкилен-СНХ4, причем -алкилен- представляет -СН2-, -СН2СН2- или -СН2СН2СН2-. В дополнительных вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 выбирают из -Ы(Н)СН2СО2Н, -Ы(СН3)СН2СО2Н, -Ы(СН2СН3)СН2СО2Н, -Ы(Н)СН2СН2СО2Н и -Ы(СН3)СН2СН2СО2Н. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет -Ы(Н)СН2СО2Н. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет -Ы(СН3)СН2СО2Н. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет -Ы(СН2СН3)СН2СО2Н. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет -Ы(Н)СН2СН2СО2Н. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет -Ы(СН3)СН2СН2СО2Н. В дополнительных вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 выбирают из -В1-СО-алкилен-СО2Н, алкилен-СНХ4, -Ь1-СО-алкенилен-СО2Н, -В1-СО-алкенилен-СНЫ4, -Ь1-СО-арилен-СО2Н и арилен-СНЫ4. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет алкилен-СО2Н. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет алкилен-СНЩ. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет алкенилен-СО2Н. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет -L1СО-алкенилен-СНЫ4. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет -Ь1-СО-арилен-СО2Н. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет L1-CO-арилен-CHN4. В дополнительных вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 выбирают из -Ь1-СО-алкилен-СО2Н, -В1-СО-алкилен-СНХ4, -Ь1-СО-алкенилен-СОН, -В1-СО-алкенилен-СНЫ4,
L1-COLl-СОLl-COLl-СОLl-СО-
-Ь1-СО-арилен-СО2Н, и -В1-СО-арилен-СНХ4, причем L1 представляет
В еще других дополнительных вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 выбирают из -Ь1-СО-алкилен-СО2Н. -В1-СО-алкилен-СНХ4, -Ь1-СО-алкенилен-СО2Н, -Ы-СО-алкенилен-СНЫ4, -L1СО-арилен-СО2Н и -Ш-СО-арилен-СЫЩ причем L1 представляет 5 ? и -алкилен- представляет
-СН2-, -СН2СН2- или -СН2СН2СН2-. В еще одном варианте осуществления по меньшей мере один Х2 выбирают из -L1-CO-алкилен-СО2Н, -L1-СО-алкилен-CHN4, Ъ1-СО-алкенилен-СО2Н, -Ы-СО-алкенилен-
СО-СНЫ4, -Ь1-СО-арилен-СО2Н и -В1-СО-арилен-СНЫ4, причем L1 представляет
В еще одном варианте осуществления по меньшей мере один Х2 выбирают из -L-1-СО-алкиленСО2Н, -В1-СО-алкилен-СНЫ4, -Ь1-СО-алкенилен-СО2Н, -В1-СО-алкенилен-СНЫ4, -Ь1-СО-арилен-СО2Н
- 26 035030
и -алкилен- представляет -СН2-, -СН2СН2и -L1-СО-арилен-CHN4, причем L1 представляет или -СН2СН2СН2-.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ/В ?
ляет целое число от 1 до 35, G представляет , каждый W представляет O, каждый Y представляет O, по меньшей мере один X представляет Х2, и Х2 выбирают из
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ
ляет целое число от 1 до 35, G5 представляет , каждый W представляет O, каждый Y представляет O, по меньшей мере один X представляет Х2, и Х2 выбирают из
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ- 27 035030
ляет целое число от 1 до 35, G5 представляет , каждый W представляет O, каждый Y представляет O, по меньшей мере один X представляет Х2, и Х2 выбирают из -L1-CONH-алкилен-СО2Н, -L1-CONHалкилен-ОИХд, -L1-CONH-арилен-СО2Н и -L1-CONH-арилен-CHN4. В некоторых вариантах осуществления Х2 представляет -L1-CONH-алкилен-СО2Н. В некоторых вариантах осуществления Х2 представляет -L1-CONH-алкилен-CHN4. В некоторых вариантах осуществления Х2 представляет -L1-CONHарилен-CO2H. В некоторых вариантах осуществления Х2 представляет -L1-CONH-арилен-CHN4. В еще одном варианте осуществления Х2 выбирают из -L1-CONH-алкилен-CO2H, L1-CONH-алкилен-CHN4,
-L1-CONH-арилен-СО2Н и -L1-CONH-арилен-CHN4, причем L1 представляет * . В еще одном варианте осуществления Х2 выбирают из -L1-CONH-алкилен-СО2Н, -L1-CONH-алкилен-CHN4, -L1CONH-арилен-СО2Н и -L1-CONH-арилен-CHN4, причем L1 представляет < < и -алкилен- представляет -СН2-, -СН2СН2- или -СН2СН2СН2-. В еще одном варианте осуществления Х2 выбирают из -L1CONH-алкилен-СО2Н, -L1-CONH-алкилен-CHN4, -L1-CONH-арилен-СО2Н и -L1-CONH-арилен-CHN4,
причем L1 представляет
В еще одном варианте осуществления Х2 выбирают из -L1-CONH-алкилен-СО2Н, -L1-CONHалкилен-CHN4, -L1-CONH-арилен-СО2Н и -L1-CONH-арилен-CHN4, причем L1 представляет
и -алкилен- представляет -СН2-, -СН2СН2- или -СН2СН2СН2-.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представляет целое число от 1 до 35, G5 представляет
O, по меньшей мере один X представляет Х2, и Х2 выбирают из , каждый W представляет O, каждый Y представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ-
ляет целое число от 1 до 35, G5 представляет , каждый W представляет O, каждый Y представляет O, по меньшей мере один X представляет Х2, и Х2 выбирают из -L1-SO2-алкилен-СО2Н, -L1-SO2алкилен-CHN4, -L1-SO2-арилен-СО2Н и -L1-SO2-арилен-CHN4. В некоторых вариантах осуществления Х2 представляет -L1-SO2-алкилен-СО2Н. В некоторых вариантах осуществления Х2 представляет -L1SO2-алкилен-CHN4. В некоторых вариантах осуществления Х2 представляет -L1-SO2-арилен-СО2Н. В некоторых вариантах осуществления Х2 представляет -L1-SO2-арилен-CHN4. В еще одном варианте осуществления Х2 выбирают из -L1-SO2-алкилен-СО2Н, -L1-SO2-алкилен-CHN4, -L1-SO2-арилен-СО2Н и
-L1-SO2-арилен-CHN4, причем L1 представляет
- 28 035030
В еще одном варианте осуществления Х2 выбирают из -Ы-8О2-алкилен-СО2Н, -Ы-8О2-алкилен-
CHN4, -L1-SO2-арилен-СО2Н и -L1-SO2-арилен-CHN4, причем L1 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ-
ляет целое число от 1 до 35, G5 представляет , каждый W представляет O, каждый Y представляет
O, по меньшей мере один X представляет Х2, и Х2 выбирают из
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет
вариантах осуществления по меньшей мере один
Х2 представляет
В некоторых
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один
Х2 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ- 29 035030
ляет целое число от 1 до 35, G5 представляет , каждый W представляет O, каждый Y представляет
O, по меньшей мере один X представляет Х2, и Х2 выбирают из -L1-алкилен-CO2H, -L1-алкилен-CHN4, -L1-арилен-CO2H и -L1-арилен-CHN4. В некоторых вариантах осуществления Х2 представляет -L1алкилен-CO2H. В некоторых вариантах осуществления Х2 представляет -L1-алкилен-CHN4. В некоторых вариантах осуществления Х2 представляет -L1-арилен-CO2H. В некоторых вариантах осуществления Х2 представляет -Ы-арилен-СНИд. В некоторых вариантах осуществления Х2 выбирают из -L .ГалкиленСО2Н, -11-алкилен-СНХ4, -11-арилен-СО2Н и -11-арилен-СНХ4. В еще одном варианте осуществления Х2 выбирают из -11-алкилен-СО2Н, -11-алкилен-СНХ4, -11-арилен-СО2Н и -11-арилен-СНХ4, причем L1 представляет
. В еще одном варианте осуществления Х2 выбирают из -Е1-алкилен-СО2Н, -L1-
алкилен-СНХ4, -11-арилен-СО2Н и -11-арилен-СНХ4, причем L1 представляет и -алкиленпредставляет -СН2-, -СН2СН2- или -СН2СН2СН2-. В еще одном варианте осуществления Х2 выбирают из -L1-алкилен-СО2Н, -L1-алкилен-CHN4, -L1-арилен-СО2Н и -L1-арилен-CHN4, причем L1 представляет
. В еще одном варианте осуществления Х2 выбирают из ^1-алкилен-СО2Н, ^1-алкилен-
и -алкилен- представляет
СНХ4, -L1-арилен-СО2Н и -L1-арилен-CHN4, причем L1 представляет -СН2-, -СН2СН2- или -СН2СН2СН2-.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ5 т ляет целое число от 1 до 35, G представляет ~ , каждый W представляет O, каждый Y представляет O, по меньшей мере один X представляет Х2, и Х2 выбирают из
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ- 30 035030 ляет целое число от 1 до 35, G5 представляет ляет O, по меньшей мере один X представляет Х2, и Х2 выбирают из
, каждый W представляет O, каждый Y представ-
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х2 представляет
В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х2, представлен еще один вариант осуществления, в котором n представляет целое число от 30 до 35. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х2, n представляет целое число от 25 до 29. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х2, n представляет целое число от 20 до 24. В дополнительных вариантах осуществления любого из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х2, n представляет целое число от 15 до 19. В дополнительных вариантах осуществления любого из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х2, n представляет целое число от 10 до 14. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х2, n представляет целое число от 5 до 9. В еще других дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х2, n представляет целое число от 1 до 4.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представI ,ох т
ляет целое число от 1 до 35, G представляет -г- , каждый W представляет O, каждый Y представляет O, по меньшей мере один X представляет X3. В дополнительных вариантах осуществления по меньшей мере один X3 выбирают из -11-алкил и -11-гетероциклил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 выбирают из -11-алкил. В еще одном варианте осуществления по меньшей мере один X3 представляет -Ы-алкил, и L1 представляет . В еще одном варианте осуществления по меньшей мере один X3 представляет -11-алкил, и L1 представляет
. В еще одном варианте осуществления по меньшей мере один X3 представляет -11-алкил, и L1 представляет
. В одном дополнительном варианте осуществления вышеупомянутных вариантов осуществления, в котором по меньшей мере один X представляет X3, алкил представляет метил, этил, пропил и изопропил. В еще одном варианте осуществления алкил представляет CF3. В еще одном варианте осуществления алкил представляет CN.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ- 31 035030
I ляет целое число от 1 до 35, G представляет ~ , каждый W представляет О, каждый Y представляет
O, по меньшей мере один X представляет X3, и X3 выбирают из
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X представляет X3, и X3 представляет \—И . В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X представляет X3, и X3 представляет
. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X представляет
X3, и X3 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X представляет X3, и X3 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один
X представляет X3, и X3 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X представляет X3, и X3 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представляет целое число от 1 до 35, G5 представляет
, каждый W представляет O, каждый Y представляет O, по меньшей мере один X представляет X3, и X3 представляет -IJ-гетероциклил. В еще одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один X3 представляет -Ы-гетероциклил, и L1 представляет \. В еще одном варианте осуществления по меньшей мере один X3 представляет ^1-гетероциклил, и L1 представляет * VY~N < В еще одном варианте осуществления по меньшей мере один X3 представляет L1-гетероциклил, и L1 представляет еще одном варианте осуществления вышеупомянутных вариантов осуществления, в котором по меньшей мере один X представляет X3, гетероциклил представляет фрагмент пирролидина, тетрагидрофурана, пиперидина, морфолина, пиперазина, пиррола, фурана, тиофена, пиразола, имидазола, оксазола, изоксазола, пиридина и пиримидина. В одном дополнительном варианте осуществления гетероциклил представляет фрагмент пирролидина. В одном дополнительном варианте осуществления гетероциклил представляет фрагмент пиперидина. В одном дополнительном варианте осуществления гетероциклил представляет фрагмент морфолина. В одном дополнительном варианте осуществления гетероциклил представляет фрагмент пиперазина. В одном дополнительном варианте осуществления гетероциклил представляет фрагмент пиридина. В одном дополнительном варианте осуществления гетероциклил представляет фрагмент пиримидина.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ-
ляет целое число от 1 до 35, G5 представляет , каждый W представляет O, каждый Y представляет
O, по меньшей мере один X представляет X3, и X3 выбирают из
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X представляет X3, и X3 представляет
. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X представляет X3, и X3 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X представляет
X3, и X3 представляет
. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X представляет X3, и X3 представляет
. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X представляет X3, и X3 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ- 32 035030
ляет целое число от 1 до 35, G5 представляет , каждый W представляет O, каждый Y представляет O, по меньшей мере один X представляет X3, и X3 выбирают из -О-алкилен-CNH-NH2, -N(R1)алкилен-CNH-NH2, -O-алкилен-N(R1)2, -ЭДД^-алкилен-ЭДД1^, -О-алкилен-^Д2)3, -ЭДД^-алкилен-ЭДД2)^ -О-алкилен-гетероциклил, ^(Д^-алкилен-гетероциклил, -О-алкилен-^О)(Д2)2, -^Д^-алкиленN(O)(R2)2, -O-алкилен-NH-CNH-NH2 и -N(R1)-алкилен-NH-CNH-NH2. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один X3 выбирают из -О-алкилен-CNH-NH2, -N(R1)-алкилен-CNH-NH2, -О-алкилен-^Д1)^ -ЭДД^-алкилен-ЭДД1^, -О-алкилен-Х(И2)3. -^Д^-алкилен-ЭДД2)^ -О-алкиленгетероциклил, -^Д^-алкилен-гетероциклил, -О-алкилен-^О)(Д2)2, -^Д^-алкилен-^ОХД2)^ -Оалкилен-NH-CNH-NH2, и -N(R1)-алкилен-NH-CNH-NH2, причем -алкилен- представляет -СН2СН2- или -СН2СН2СН2-. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один X3 выбирают из -O-алкилен-CNH-NH2, -О-алкилен-^Д1)^ -О-алкилен^(Д2)3, -О-алкилен-гетероциклил, -О-алкилен^О)(Д2)2 и -O-алкилен-NH-CNH-NH2. В еще одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один X3 выбирают из -N(R1)-алкилен-CNH-NH2, -^Д^-алкилен-^Д1)^ -ЭДД^-алкилен-ЭДД2)^ ^Д^-алкилен-гетероциклил, -^Д^-алкилен-^ОХД2^ и -N(R1)-алкилен-NH-CNH-NH2, причем -алкилен- представляет -СН2СН2- или -СН2СН2СН2-. В некоторых из вышеуказанных вариантов осуществления по меньшей мере один X3 представляет -O-алкилен-CNH-NH2. В некоторых из вышеуказанных вариантов осуществления по меньшей мере один X3 представляет -N(R1)-алкилен-CNH-NH2. В некоторых из вышеуказанных вариантов осуществления по меньшей мере один X3 представляет -О-алкиленΝ^)2. В некоторых из вышеуказанных вариантов осуществления по меньшей мере один X3 представляет -^Д^-алкилен-^Д1^. В некоторых из вышеуказанных вариантов осуществления по меньшей мере один X3 представляет -О-алкилен-^Д2)3. В некоторых из вышеуказанных вариантов осуществления по меньшей мере один X3 представляет -^Д^-алкилен-^Д2)^ В некоторых из вышеуказанных вариантов осуществления по меньшей мере один X3 представляет -О-алкилен-гетероциклил. В некоторых из вышеуказанных вариантов осуществления по меньшей мере один X3 представляет -^Д^-алкиленгетероциклил. В некоторых из вышеуказанных вариантов осуществления по меньшей мере один X3 представляет -О-алкилен^(О)(Д2)2. В некоторых из вышеуказанных вариантов осуществления по меньшей мере один X3 представляет -^Д^-алкилен-^ОХД2^. В некоторых из вышеуказанных вариантов осуществления по меньшей мере один X3 представляет -О-алкилен-NH-CNH-NH2. В некоторых из вышеуказанных вариантов осуществления по меньшей мере один X3 представляет -^Д^-алкилен^НCNH-NH2.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ5 ν ляет целое число от 1 до 35, G представляет 4- , каждый W представляет О, каждый Y представляет
ет
О, по меньшей мере один X представляет X3, и X3 выбирают из
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X представляет X3, и X3 представля. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X представляет X3, и X3 представляет ' .
В дополнительных вариантах осуществления по меньшей мере один X представляет X3, и X3 выбирают из
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X представляет X3, и X3 представляет . В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X представляет X3, и X3 . В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X представляет X3, представляет и X3 представляет ? н . В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X представляет X3, и X3 представляет ? ι . В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X
-h представляет X3, и X3 представляет ? . В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере
- 33 035030 один X представляет X3, и X3 представляет один X представляет X3, и X3 представляет * 1 . В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X представляет X3, и X3 представляет. В некоторых вариантах осуществле. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X представляет X3, и X3 представляет ' ·
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представляет целое число от 1 до 35, G5 представляет 4- , каждый W представляет O, каждый Y представляет O, по меньшей мере один X представляет X3, и X3 выбирают из -L1-CNH-NH2, -L1-алкилен-CNH-NH2, -L1арилен-CNH-NH2, -L 4-адкиден-\(Ц')2, -Ы-арилен-^К1)^ -Ь1-алкилен-\(К2)3, -Ь1-арилен-\(К2)3, -L1алкилен-гетероциклил, -Ь1-арилен-гетероциклил, -Ь1-алкилен-\(О)(К2)2, -Ь1-арилен-\(О)(К2)2, -L1алкилен-\Н-С\Н-\Н2 и -Ы-арилен-\Н-С\Н-\Н2. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один X3 выбирают из -Ь1-арилен-С\Н-\Н2, -Ы-арилен-^К1)^ -Ь1-арилен-\(К2)3, -L1арилен-гетероциклил, -Ь1-арилен-\(О)(К2)2 и -Ь1-арилен-\Н-С\Н-\Н2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -Ь1-арилен-С\Н-\Н2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -Ы-арилен-\(К')2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -Ы-арилен-\(И2)3. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -Ы-арилен-гетероциклил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -Ь1-арилен-\(О)(К2)2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -Ь1-арилен-\Н-С\Н-\Н2. В одном дополнительном варианI 1 Ν_|— τ'» те осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления L1 представляет 5 ν . В еще одном дополнительном варианте осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления L1 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ5 V ляет целое число от 1 до 35, G представляет , каждый W представляет О, каждый Y представляет О, по меньшей мере один X представляет X3, и X3 выбирают из -Ы-С\Н-\Н2, -Ы-алкилен-С\Н-\Н2, -Ы-алкилен-^И/Д, -Ь1-алкилен-\(К2)3, -Ь1-алкилен-гетероциклил, -Ь1-алкилен-\(О)(К2)2 и -L1алкилен-\Н-С\Н-\Н2. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один X3 выбирают из -Р1-С\Н-\Н2, -IД-алкилен-С\Н-\Н2 и -Ь1-алкилен-\Н-С\Н-\Н2. В еще одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один X3 выбирают из -Ы-алкилен-^И/Д, -L1алкилен-\(К2)3, -Ь1-алкилен-гетероциклил и -L 4-алкиден-\(О)(К2)2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -L1-CNH-NH2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -L1-алкилен-CNH-NH2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -L1-алкилен-NH-CNH-NH2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -И-алкилен-^К1^. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -L Д-адкиден-\(Ц2)2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -Ы-алкилен-гетероциклил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -Ь1-алкилен-\(О)(К2)2. В одном дополнительном варианте осу-1-0^0ществления вышеупомянутых вариантов осуществления L1 представляет < xy < . В еще одном дополнительном варианте осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления L1 представляет
В еще одном дополнительном варианте осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- представляет -СН2СН2- или -СН2СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- представляет -СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- представляет -СН2СН2СН2-.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ5 I ляет целое число от 1 до 35, G представляет , каждый W представляет О, каждый Y представляет
О, по меньшей мере один X представляет X3, и X3 выбирают из
HN
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет NH?
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ- 34 -
N ляет целое число от 1 до 35, G5 представляет 4- , каждый W представляет O, каждый Y представляет
O, по меньшей мере один X представляет X3, и X3 выбирают из
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ5 I ляет целое число от 1 до 35, G5 представляет 4- , каждый W представляет O, каждый Y представляет O, по меньшей мере один X представляет X3, и X3 выбирают из -L1-СО-алкилен-CNH-NH2, -Ll-СОалкенилен-СЖ^И2, L1-СО-арилен-CNH-NH2, -L1-CONH-алкилен-CNH-NH2, -L1-CONH-арилен-CNHNH2, ^^-алкилен-С^^г, -L1-SO2-арилен-CNИ-NИ2, -L1-CO-алкилен-N(R1)2, -Ll-СО-алкениленN(R1)2, ФЬСО-арилен^Щ1)^ ^1-^^^^^^(^)2, -L1-CONH-арилен-N(R1)2, ^^-алкиленN(R1)2, -L1-CO-алкилен-N(R2)3, Ф1-СО-алкенилен^Щ2)3, -1.1-СО-арилен-\(К');. ШЬТО^-алкиленN(R2)3, -L1-CONH-арилен-N(R2)3, -L1-SO2-алкилен-N(R2)3, Ф1-СО-алкилен-гетероциклил, -L1-COалкенилен-гетероциклил, -L 1-СО-арилен-гетероциклил, -L1 -CONH-алкилен-гетероциклил, -L1-CONHарилен-гетероциклил, -L1-SO2-алкилен-гетероциклил, -Ы-СХЭ-алкилен-Х (ОХК2)^ Ф1-СО-алкениленN(Q)(R2)2, Т1-СО-арилен-Ы(О)(К2)2, -L1-CONH-алкилен-N(O)(R2)2, -L1-CONИ-арилен-N(O)(R2)2, -L1- 35 035030
-L1 -СО-алкенилен-NH-CNH-NH2,
-L1 -CONH-apHReH-NH-CNH-NH2,
SO2-алкилeн-N(О)(R2)2, -L1 -CO-алкилeн-NH-CNH-NH2, аpилeн-NH-CNH-NH2, -L1 -CONH-алкилeн-NH-CNH-NH2, алкилeн-NH-CNH-NH2 и -L1-SO2-аpилeн-NH-CNH-NH2. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один X3 выбирают из -L1-CO-аpилeн-CNH-NH2, -L1-CONH-аpилeн-CNH-NH2, -L1SO2-аpилeн-CNH-NH2, -Ы-СО-арилен-ПЩ1^, -L1-CONH-аpилeн-N(R1)2, Ж1-СО-арилен-ИЩ2)3, -L1CONH-аpилeн-N(R2)3, -ШСО-арилен-гетероциклил, -L1-CONH-аpилeн-гeтepоциклил, -Ь1-СО-арилен^О)Щ2)2, -L1-CONH-аpилeн-N(O)(R2)2, -L1-CO-аpилeн-NH-CNH-NH2, и -L1-SO2-аpилeн-NH-CNH-NH2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -L1-CO-аpилeн-CNH-NH2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -L1-CONH-аpилeн-CNH-NH2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -L1-SO2-аpилeн-CNH-NH2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет ^1-СО-арилен^(И?)2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -L1-CONH-аpилeн-N(R1)2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -Ь1-СО-арилен^^2)3. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -L1-CONH-аpилeн-N(R2)3. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -L1-CO-аpилeн-гeтepоциклил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -L1-CONH-аpилeн-гeтepоциклил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -Ы-СХ)-а|эилен-^О)(Е2)2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -L1-CONH-аpилeн-N(О)(R2)2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -L1-СО-аpилeн-NH-CNH-NH2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -L1-CONH-аpилeн-NH-CNHNH2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет ^1^О2-ариленNH-CNH-NH2. В одном дополнительном варианте осуществления вышеупомянутых вариантов осущест-L1-CO-L1-SO2вления L1 представляет * < .
В еще одном варианте осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления L1 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ-
т ляет целое число от 1 до 35, G представляет , каждый W представляет О, каждый Y представляет О, по меньшей мере один X представляет X3, и X3 выбирают из
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет м х
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет о
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ ляет целое число от 1 до 35, G5 представляет 4- , каждый W представляет О, каждый Y представляет О, по меньшей мере один X представляет X3, и X3 выбирают из -L1-СО-алкилeн-CNH-NH2, -L1-Oалкенилен^^^^ -L1-CONH-алкилeн-CNH-NH2, -L1-SO2-алкилeн-CNH-NH2, -L1-CO-алкилeн-N(R1)2, -Ь1-СО-алкенилен^^)2, -L1-CONH-алкилeн-N(R1)2, -Ы^О^алкилен^^1)^ -Ы-СО-алкилен^^2)3, -Ь1-СО-алкенилен^^2)3, -L1-CONH-алкилeн-N(R2)3, -Ь1^О2-алкилен^^2)3, -Ы^О-алкилен-гетероциклил, -L1-CO-алкeнилeн-гeтepоциклил, -L1-CONH-алкилeн-гeтepоциклил, -Ь1^О2-алкилен-гетероциклил, -Ь1-СО-алкилен^(О)^2)2, -Ь1-СО-алкенилен^(О)^2)2, -L1-CONH-алкилeн-N(O)(R2)2, -Ь1^О2алкилен-И(О)Щ2)2, -L1-CO-алкилeн-NH-CNH-NH2, -L1-CO-алкeнилeн-NH-CNH-NH2, -ШТОКИалкилeн-NH-CNH-NH2 и -L1-SO2-алкилeн-NH-CNH-NH2. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один X3 выбирают из -L1-SO2-алкилeн-CNH-NH2, ^1^О2-алкилен^^)2, -L1SO2-алкилeн-N(R2)3, ^1^О2-алкилен-гетероциклил, ^1^О2-алкилен^(О)^2)2 и ^^О-алкениленNH-CNH-NH2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет ^1^О2алкилeн-CNH-NH2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -L1SO2-алкилeн-N(R1)2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -L1SO2-алкилeн-N(R2)3. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -L1SO2-алкилeн-гeтepоциклил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представ- 36 035030 ляет -Ы-8О2-алкилен-Ы(О)(К2)2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -Ы-8О2-алкенилен-ХН-СХН-ХН2. В одном дополнительном варианте осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления L1 представляет λ /“ ? .
В еще одном варианте осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления L1 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ ляет целое число от 1 до 35, G5 представляет ' , каждый W представляет O, каждый Y представляет O, по меньшей мере один X представляет X3, и X3 выбирают из -L1-СО-алкилен-CNH-NH2, -L1-G.Oалкенилен-CNH-NH2, Ш1-СОХН-алкилен-СХН-ХН2, -ШСО-алкилен-ХЩД -Ш-СО-алкенилен-МВУ, П-СОХН-алкилен-ХЩУ, -Ы-СО-алкилен-МВ2),, Ш1-СО-алкенилен-Х(В2)3, -ШСОХН-алкиленN(R2)3, -Ш-СО-алкилен-гетероциклил, -Ш-СО-алкенилен-гетероциклил, -Ы-СОХН-алкилен-гетероциклил, Ш1-СО-алкилен-Х(О)(В2)2, Ш1-СО-алкенилен-Х(О)(В2)2, Ш1-СОХН-алкилен-Х(О)(В2)2, -L1-GOалкилен-ХН-СХН-ХН2, Ш1-СО-алкенилен-ХН-СХН-ХН2 и Ш1-СОХН-алкилен-ХН-СХН-ХН2. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один X3 выбирают из -Ы-СО-алкениленСХН-ХН2, -Ы-СО-алкенилен-МВУ, Ш1-СО-алкенилен-Х(В2)3, -Ш-СО-алкенилен-гетероциклил, -L1СО-алкенилен-Х(О)(В2)2, и Ш1-СО-алкенилен-ХН-СХН-ХН2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -Ы-СО-алкенилен-СХН-ХН2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -Ы-СО-алкенилен-МВ'р. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -Ы-СО-алкенилен-Х(В:)3. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -Ы-СО-алкенилен-гетероциклил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -В-1-СО-алкенилен-Х(О)(В:)2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -Ы-СО-алкенилен-ХН-СХН-ХН2. В одном дополнительном варианте осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления L1 представляет
В еще одном варианте осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления L1 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представляет целое число от 1 до 35, G5 представляет 4- , каждый W представляет О, каждый Y представляет О, по меньшей мере один X представляет X3, и X3 выбирают из Ш1-СО-алкилен-СХН-ХН2, -Ы-СОХНалкилен-СХН-ХН2, П-СО-алкилен-ХЩУ, П-СОХН-алкилен-ХЩУ, Ш1-СО-алкилен-Х(В2)3, -L1СОХН-алкилен-Х(В2)3, -Ш-СО-алкилен-гетероциклил, L1-COХH-алкилен-гетероциклил, -L-1-СОалкилен-Х(О)(В2)2, Ш1-СОХН-алкилен-Х(О)(В2)2, Ш1-СО-алкилен-ХН-СХН-ХН2 и П-СОХН-алкиленХН-СХН-ХН2. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один X3 выбирают из Ш1-СО-алкилен-СХН-ХН2, П-СО-алкилен-ХЩД Ш1-СО-алкилен-Х(В2)3, -Ы-СО-алкиленгетероциклил, Ш1-СО-алкилен-Х(О)(В2)2 и Ш1-СО-алкилен-ХН-СХН-ХН2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет Ш1-СО-алкилен-СХН-ХН2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет П-СО-алкилен-ХЩ1)^ В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет Ш1-СО-алкилен-Х(В2)3. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет -Ы-СО-алкилен-гетероциклил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет Ш1-СО-алкилен-Х(О)(В2)2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет Ш1-СО-алкилен-ХН-СХН-ХН2. В одном дополнительном варианте осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления L1 представВ еще одном варианте осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления L1 представляет ляет
В еще одном дополнительном варианте осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- представляет -СН2-, -СН2СН2-, -СН2СН2СН2-, -СН2СН2СН2СН2- и -СН2СН2СН2СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- представляет -СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкиленпредставляет -СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- представляет -СН2СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- представляет -СН2СН2СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- представляет -СН2СН2СН2СН2СН2-.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ- 37 035030 ляет целое число от 1 до 35, G5 представляет 4- , каждый W представляет О, каждый Y представляет О, по меньшей мере один X представляет ХЗ, и ХЗ выбирают из
0
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один ХЗ представляет н Nb
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой п представ5 ?
ляет целое число от 1 до 35, G представляет , каждый W представляет О, каждый Y представляет О, по меньшей мере один X представляет ХЗ, и ХЗ выбирают из -Ы-СО-алкилен-СМН-МН2, -L1-CONHалкилен-СМН-МН2, -L1 -СО-алкилен-Ъ^К1)^ -L1 -СОМН-алкилен-Ъ^К1)^ -L1 -СО-алкилен-М(К2)3, -L1СОМН-алкилен-М(К2)з, -Ll-CO-алкилен-гетероциклил, Ll-CONH-алкилен-гетероциклил, -L1-COалкилен-М(О)(К2)2, -Ы-СОМН-алкилен-М(О)(К2)2, -Ы-СО-алкилен-МН-СМН-МН2 и -LI-CONН-алкиленNH-CNH-NH2. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один ХЗ выбирают из -Ы-СО-алкилен-СМН-МН2, -Ы-СО-алкилен-^Я1^, -Ы-СО-алкилен-М(К2)з, -Ll-CO-алкилен-гетероциклил, -Ы-СО-алкилен-М(О)(Я2)2 и -Ы-СО-алкилен-МН-СМН-МН2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один ХЗ представляет -Ы-СО-алкилен-СМН-МН2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один ХЗ представляет -Ы-СО-алкилен-М(Я1)2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один ХЗ представляет -Ы-СО-алкилен-М(К2)3. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один ХЗ представляет -Ll-CO-алкилен-гетероциклил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один ХЗ представляет -Ы-СО-алкилен-М(О)(Я2)2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один ХЗ представляет -Ы-СО-алкилен-МН-СМН-МН2. В одном дополнительном варианте осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления L1 представВ еще одном варианте осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления L1 представляет ляет
В еще одном дополнительном варианте осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- представляет -СН2СН2-, -СН2СН2СН2-, -СН2СН2СН2СН2- и -СН2СН2СН2СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- представляет -СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- представляет -СН2СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления алкилен- представляет -СН2СН2СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- представляет -СН2СН2СН2СН2СН2-.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой п представ-
?
ляет целое число от 1 до 35, G представляет 4- , каждый W представляет О, каждый Y представляет О, по меньшей мере один X представляет ХЗ, и ХЗ выбирают из -ΕΙ-ΝζΚ1)^ -L1-N(R2)3, -L1-N(O)(R2) 2, -L1-NH-CNH-NH2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один ХЗ представляет -L1N(Rx)2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один ХЗ представляет -L1-N(R2)3. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один ХЗ представляет -L1-N(O)(R2)2. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один ХЗ представляет -L1-NH-CNH-NH2. В дополнительных вариантах осуществления по меньшей мере один ХЗ выбирают из
-38035030
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет
-nh2
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет ’
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет * ту .
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет
В еще дополнительных вариантах осуществления по меньшей мере один X3 выбирают из
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X3 представляет
В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет X3, представлен еще один вариант осуществления, в котором n представляет целое число от 30 до 35. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет X3, n представляет целое число от 25 до 29. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет X3, n представляет целое число от 20 до 24. В дополнительных вариантах осуществления любого из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет X3, n представляет целое число от 15 до 19. В дополнительных вариантах осуществления любого из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет X3, n представляет целое число от 10 до 14. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет X3, n представляет целое число от 5 до 9. В еще других дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет X3, n представляет целое число от 1 до 4.
В еще одном варианте осуществления группа X3 представлена в защищенной форме. В еще одном варианте осуществления защищенная форма включает защищенный атом азота. В еще одном варианте осуществления защищенный атом азота защищен трифторацетильной группой.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ ляет целое число от 1 до 35, G5 представляет , каждый W представляет O, каждый Y представляет O, по меньшей мере один X представляет Х4. В дополнительных вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 выбирают из -O-алкилен-арил, -Ы(К1)-арил, -К(К1)-алкилен-арил, -К(К1)-алкилен-К(К1)-арил, -К(К1)-алкилен-К(К1)СО-арил, -N(R1)-алкилен-N(R1)SO2-арил и -К^)-алкилен-К^)СН2-арил. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х4 представляет -O-алкилен-арил.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ5 ΐ ляет целое число от 1 до 35, G представляет -г- , каждый W представляет O, каждый Y представляет O, по меньшей мере один X представляет Х4, и по меньшей мере один Х4 выбирают из -К^)-арил, -К^)-алкилен-арил, -К^^-алкилен-К^^-арил, -К^^-алкилен-К^^СО-арил, -К^)-алкиленN(R1)SO2-арил и -К^^-алкилен-К^^СН^арил. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х4 представляет -К^)-арил. В еще дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ ляет целое число от 1 до 35, G5 представляет 4- , каждый W представляет O, каждый Y представляет O, по меньшей мере один X представляет Х4, и по меньшей мере один Х4 представляет -К^)-алкиленарил. В дополнительных вариантах осуществления -алкилен- представляет -СН2-, -СН(СН3)-, -СН2СН2- и -СН2СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления -алкилен- представляет -СН2-. В некоторых вари- 39 035030 антах осуществления -алкилен- представляет -СН(СН3)-. В некоторых вариантах осуществления
-алкилен- представляет -СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления -алкилен- представляет
-СН2СН2СН2-. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х4 выбирают из
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет !
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представляет целое число от 1 до 35, G5 представляет Ά , каждый W представляет O, каждый Y представляет O, по меньшей мере один X представляет Х4, и по меньшей мере один Х4 выбирают из -К(К1)-алкиленК(К1)-арил и -К(К1)-алкилен-К(К1)СН2-арил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет -К(К1)-алкилен-К(К1)-арил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет -К(К1)-алкилен-К(К1)СН2-арил. В дополнительных вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 выбирают из
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В еще дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х4 выбирают из -N(R1)алкилен-М^)СО-арил и -М^Й-алкилен-М^ЙБО^арил. В дополнительных вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 выбирают из
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В одном дополнительном варианте осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- выбирают из -СН2СН2-, -СН2СН2СН2-, -СН2СН2СН2СН2- и -СН2СН2СН2СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- представляет -СН2СН2-.
В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- представляет -СН2СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления алкилен- представляет -СН2СН2СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вари- 40 035030 антов осуществления -алкилен- представляет -СН2СН2СН2СН2СН2-.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ5 ?
ляет целое число от 1 до 35, G представляет , каждый W представляет O, каждый Y представляет O, по меньшей мере один X представляет Х4, и по меньшей мере один Х4 выбирают из -L1-CO-алкиленарил, -L1-CO-алкенилен-арил, -1 Л-СО-арилеи-арил, -L1-CONH-алкилен-арил, -L1-CONH-арилен-арил, -L1-SO2-алкилен-арил, -L1-SO2-арилен-арил, L1-CO-арил, -L1-SO2-арил, -L1-CO-алкилен-Р(арил)3 и -L1SO2-алкилен-P(арил)3. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х4 представляет -L1-SO2-алкилен-Р(арил)3. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х4 представляет -L1-CO-алкилен-P(арил)3. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х4 выбирают из -L1-CO-алкилен-арил, -L1-CO-алкенилен-арил, -11-СО-ариленарил, -L1-CONH-алкилен-арил, -L1-CONH-арилен-арил, -L1-SO2-алкилен-арил, -L1-SO2-арилен-арил, -L1-CO-арил и -L1-SO2-арил. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х4 выбирают из -L1-SO2-алкилен-арил, -L1-SO2-арилен-арил и -L1-SO2-арил. В некоторых вариантах осуществления осуществления осуществления осуществления
-11-СО-арилен-арил, -L1-CONH-алкилен-арил, -L1-CONH-арилен-арил и -L1-CO-арил. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х4 выбирают из -L1-CONH-алкилен-арил и -L1-CONH-арилен-арил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет -L1-CONH-алкилен-арил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет -L1-CONH-арилен-арил. В еще дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х4 выбирают из -L1-CO-алкилен-арил, -L1-CO-алкенилен-арил, -11-СО-арилен-арил и -L1-CO-арил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет -L1-CO-алкилен-арил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет -L1-CO-алкенилен-арил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет -11-СО-арилен-арил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет -L1-CO-арил. В одном дополнименьшей мере один Х4 представляет -Е1-8О2-алкилен-арил. В некоторых вариантах меньшей мере один Х4 представляет -L1-SO2-арилен-арил. В некоторых вариантах меньшей мере один Х4 представляет -L1-SO2-арил. В еще дополнительном варианте меньшей мере один Х4 выбирают из -L1-CO-алкилен-арил, -Ы-СО-алкенилен-арил, по по по по тельном варианте осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления L1 представляет * ξ . В еще одном дополнительном варианте осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления
L1 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ ляет целое число от 1 до 35, G5 представляет , каждый W представляет O, каждый Y представляет O, по меньшей мере один X представляет Х4, и Х4 выбирают из
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х4 выбирают из
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представляет целое число от 1 до 35, G5 представляет 4- , каждый W представляет O, каждый Y представляет O,
- 41 035030 по меньшей мере один X представляет Х4, и Х4 выбирают из
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
- 42 035030
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
CI .
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
- 43 035030
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х4 выбирают из
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ ляет целое число от 1 до 35, G5 представляет 4- , каждый W представляет O, каждый Y представляет O, по меньшей мере один X представляет Х4, и по меньшей мере один Х4 выбирают из -Ll-алкиленарил, -Ll-арилен-арил, -Ll-арил и ^1-алкилен-Р(арил)3. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет -Ll-алкилен-арил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет -Ll-арилен-арил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет -Ll-арил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет -L 4-алкилен-Р(арил)3. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере
- 44 035030
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет
NH
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х4 представляет .
В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х4, представлен еще один вариант осуществления, в котором n представляет целое число от 30 до 35. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х4, n представляет целое число от 25 до 29. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х4, n представляет целое число от 20 до 24. В дополнительных вариантах осуществления любого из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х4, n представляет целое число от 15 до 19. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х4, n представляет целое число от 10 до 14. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х4, n представляет целое число от 5 до 9. В еще других дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х4, n представляет целое число от 1 до 4.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ ляет целое число от 1 до 35, G5 представляет А , каждый W представляет O, каждый Y представляет O, и по меньшей мере один X представляет Х5. В дополнительных вариантах осуществления по меньшей мере один Х5 выбирают из -O-алкилен-гетероарил, ^(К^-алкилен-гетероарил, ^(К^-алкилен-^К1)гетероарил, ^(К^-алкилен-^К^СО-гетероарил, ^(К^-алкилен-^К^ЗО^гетероарил и -Х(К.')-алкиле11^К?)СН2-гетероарил.
В еще дополнительных вариантах осуществления по меньшей мере один Х5 выбирают из -Ν(β?)алкилен-гетероарил, ^(К^-алкилен-^К^-гетероарил, ^(К^-алкилен-^К^СО-гетероарил, -Ν(β?)алкилен-^К^ЗО^гетероарил и ^(К^-алкилен-^К^СН^гетероарил.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ5 I ляет целое число от 1 до 35, G представляет , каждый W представляет О, каждый Y представляет О, по меньшей мере один X представляет Х5, и по меньшей мере один Х5 представляет ^(К^-алкиленгетероарил. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х5 представляет -О-алкилен-гетероарил. В еще дополнительных вариантах осуществления -алкилен- представляет -СН2-, -СН(СН3)-, -СН2СН2- и -СН2СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления -алкилен- представляет -СН2-. В некоторых вариантах осуществления -алкилен- представляет -СН(СН3)-. В некоторых вариантах осуществления -алкилен- представляет -СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления -алкиленпредставляет -СН2СН2СН2-.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ ляет целое число от 1 до 35, G5 представляет - , каждый W представляет О, каждый Y представляет О, по меньшей мере один X представляет Х5, и по меньшей мере один Х5 выбирают из ^(К^-алкиленгетероарил, ^(К^-алкилен-^К^-гетероарил, ^(К^-алкилен-^К^СО-гетероарил, ^(К^-алкилен^К')ЗО2-гетероарил и ^(К^-алкилен-^К^СН^гетероарил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х5 представляет ^(К^-алкилен-гетероарил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х5 представляет ^(К^-алкилен-^К^-гетероарил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х5 представляет ^(К^-алкилен-^К^СО-гетероарил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х5 представляет ^(К^-алкилен-^К^ЗО^гетероарил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х5 представляет ^(К^-алкиленΝ^ΚΊ 12-гетероарил. В одном дополнительном варианте осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- выбирают из -СН2СН2-, -СН2СН2СН2-, -СН2СН2СН2СН2- и -СН2СН2СН2СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- представляет -СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- представляет -СН2СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- представляет -СН2СН2СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- представляет -СН2СН2СН2СН2СН2-.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ
- 45 035030 ляет целое число от 1 до 35, G5 представляет А , каждый W представляет O, каждый Y представляет O, по меньшей мере один X представляет Х5, и по меньшей мере один Х5 выбирают из -Ы-гетероарил, -Ы-алкилен-гетероарил, -Ы-арилен-гетероарил, -L1-CO-алкилен-гетероарил, -Ы-СО-алкениленгетероарил, -L1-CO-арилен-гетероарил, -L1-CONH-алкилен-гетероарил, -L1-CONH-арилен-гетероарил, -Ы-SO2-алкилен-гетероарил, -Ы-SO2-арилен-гетероарил. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х5 выбирают из -Ы-SO2-алкилен-гетероарил и -Ы-SO2-арилен-гетероарил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х5 представляет -Ы-SO2-алкиленгетероарил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х5 представляет -L1-SO2арилен-гетероарил. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х5 выбирают из -L1-CONH-алкилен-гетероарил и -L1-CONH-арилен-гетероарил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х5 представляет -L1-CONH-алкилен-гетероарил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х5 представляет -L1-CONH-арилен-гетероарил. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х5 выбирают из -L1-CO-алкиленгетероарил, L1 -CO-алкенилен-гетероарил и -L1 -CO-арилен-гетероарил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х5 представляет -L1-CO-алкилен-гетероарил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х5 представляет -L1-CO-алкенилен-гетероарил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х5 представляет -L1 -CO-алкенилен-гетероарил. В одном дополнительном варианте осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления L1 представляет
В еще одном варианте осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления L1 представляет
В еще дополнительном варианте осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- выбирают из -СН2-, -СН(СН3)-, -СН2СН2- и -СН2СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- представляет -СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- представляет -СН(СН3)-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- представляет -СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкиленпредставляет -СН2СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х5 представляет -Ы-гетероарил. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х5 выбирают из
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X представляет Х5, и Х5 представляет ? '— n=/ .
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х5 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х5 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х5 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ-
f ляет целое число от 1 до 35, G представляет , каждый W представляет O, каждый Y представляет O, по меньшей мере один X представляет Х5, и по меньшей мере один Х5 выбирают из -Ы-алкиленгетероарил и -Ы-арилен-гетероарил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х5 представляет -Ы-арилен-гетероарил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х5 представляет -Ы-алкилен-гетероарил. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х5 выбирают из
- 46 035030
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х5 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х5 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х5 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х5 представляет
В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х5, представлен еще один вариант осуществления, в котором n представляет целое число от 30 до 35. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х5, n представляет целое число от 25 до 29. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х5, n представляет целое число от 20 до 24. В дополнительных вариантах осуществления любого из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х5, n представляет целое число от 15 до 19. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х5, n представляет целое число от 10 до 14. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х5, n представляет целое число от 5 до 9. В еще других дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х5, n представляет целое число от 1 до 4.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ- 5
V ляет целое число от 1 до 35, G представляет 4- , каждый W представляет O, каждый Y представляет O, и по меньшей мере один X представляет X6. В дополнительных вариантах осуществления по меньшей мере один X6 выбирают из -O-алкилен-O(СН2СН2)mOH, -O-алкилен-O(СН2СН2)mOCH3, -К(Я1)-алкиленО(СН2СН2)mOH, -N(R1)-алкилен-O(CH2CH2)mOCH3, -N(R1)-арилен-О(СН2СН2)mOH и -К(Я1)-ариленO(СН2СН2)mOCH3. В дополнительных вариантах осуществления по меньшей мере один X6 выбирают из -O-алкилен-O(СН2СН2)mOH и -O-алкилен-O(СН2СН2)mOCH3. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X6 представляет -O-алкилен-O(СН2СН2)mOH. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X6 представляет -O-алкилен-O(СН2СН2)mOCH3. В дополнительных вариантах осуществления по меньшей мере один X6 выбирают из -N(R1)-алкилен-O(СН2СН2)mOH, К(Я1)-алкиленO(CH2CH2)mOCH3, -N(R1)-арилен-O(СН2СН2)mOH и -N(R1)-арилен-O(СН2СН2)mOCH3. В еще дополнительных вариантах осуществления по меньшей мере один X6 выбирают из -К(Я1)-алкиленO(CH2CH2)mOH и -N(R1)-алкилен-O(CH2CH2)mOCH3. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X6 представляет -N(R1)-алкилен-O(CH2CH2)mOH. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X6 представляет -N(R1)-алкилен-O(СН2СН2)mOCH3. В дополнительных вариантах осуществления по меньшей мере один X6 выбирают из -N(R1)-арилен-O(CH2CH2)mOH и -К(Я1)-ариленO^R^n^OC^. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X6 представляет -N(R1)-арилен-O(CH2CH2)mOH. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X6 представляет -N(R1)-арилен-O(CH2CH2)mOCH3. В еще одном дополнительном варианте осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- выбирают из -СН2СН2-, -СН2СН2СН2-, -СН2СН2СН2СН2- и -СН2СН2СН2СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- представляет -СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- представляет -СН2СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- представляет -СН2СН2СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- представляет -СН2СН2СН2СН2-.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ- 47 035030 ляет целое число от 1 до 35, G5 представляет 4- , каждый W представляет O, каждый Y представляет O, по меньшей мере один X представляет X6, и X6 выбирают из -L1-алкилен-О(СН2СН2)mOH, -L1-GQалкилен-ОСН2СН2)тОН, Х1-СО-алкилен-О(СН2СН2)тОСН3, Х1^О2-алкилен-О(СН2СН2)тОН, -L1-SO2алкилен-О(СН2СН2)тОСН3, Х1-СО-арилен-О(СН2СН2)тОН, Х1-СО-арилен-О(СН2СН2)тОСН3, -L1-SO2арилен-О(СН2СН2)тОН и Х1^О2-арилен-О(СН2СН2)тОСН3. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один X6 выбирают из Х1^О2-алкилен-О(СН2СН2)тОН, Х1^О2-алкиленО(СН2СН2)тОСН3, ^1^О2-арилен-О(СН2СН2)тОН и -И^О2-арилен-О(СН2СН2)тОСН3. В еще одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один X6 выбирают из Х1^О2-алкиленО(СН2СН2)тОН и Х1^О2-алкилен-О(СН2СН2)тОСН3. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X6 представляет -Ы^О2-алкилен-О(СН2СН2)тОН. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X6 представляет -Ы^О2-арилен-О(СН2СН2)тОСН3. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один X6 выбирают из Х1^О2-арилен-О(СН2СН2)тОН и -NSO2-арилен-Q(СН2СН2)mOCH3. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X6 представляет Х1^О2-арилен-О(СН2СН2)тОН. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X6 представляет Х1^О2-арилен-О(СН2СН2)тОСН3. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один X6 выбирают из Х1-алкилен-(ОСН2СН2)тОН, Х1-СО-алкилен-О(СН2СН2)тОН, Х1-СО-алкилен-О(СН2СН2)тОСН3, Х1-СО-арилен-О(СН2СН2)тОН и Х1-СО-арилен-О(СН2СН2)тОСН3. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X6 представляет -L J-алкилен(ОСН2СН2)тОН. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один X6 выбирают из -LЛ-СХЭ-алкилен-О(СЛ 12СН2)тО11. Х1-СО-алкилен-О(СН2СН2)тОСН3. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X6 представляет -Ы-СО-алкилен-О(СН2СН2)тО11. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X6 представляет -И-СО-алкилен-О(СН2СН2)тОСН3. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один X6 выбирают из -Г1-СО-ариленО(СН2СН2)тОН и -Ы-СО-арилен-О(СН2СН2)т(ХХ 13. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X6 представляет -Ы-СО-арилен-О(СН2СН2)тО11. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X6 представляет Х1-СО-арилен-О(СН2СН2)тОСН3. В одном дополнительном варианте осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления L1 представляет 5 .
В еще одном варианте осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления L1 представляет . .______ R6 с
В еще одном дополнительном варианте осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- выбирают из -СН2СН2-, -СН2СН2СН2-, -СН2СН2СН2СН2- и -СН2СН2СН2СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- представляет -СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- представляет -СН2СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления алкилен- представляет -СН2СН2СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления -алкилен- представляет -СН2СН2СН2СН2СН2-. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления т составляет 1. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления т составляет 2. В некоторых вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления т составляет 3.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представZ5 | /В ляет целое число от 1 до 35, G5 представляет , каждый W представляет О, каждый Y представляет О, по меньшей мере один X представляет X6, и X6 выбирают из -Ы-алкилен-((ХХ 12СН2)тО11. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X6 представляет * .
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X6 представляет \___/ Н
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представТ.О. /В ляет целое число от 1 до 35, G5 представляет - , каждый W представляет О, каждый Y представляет О, по меньшей мере один X представляет X6, и X6 выбирают из Х1-СО-О(СН2СН2)тОН и -Г1-СОО(СН2СН2)тОСН3. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один X6 представляет Х1-СО-О(СН2СН2)тОН. В еще одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один X6 представляет Х1-СО-О(СН2СН2)тОСН3.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представляет целое число от 1 до 35, G5 представляет , каждый W представляет О, каждый Y представляет О,
- 48 035030 по меньшей мере один X представляет X6, и X6 выбирают из -Ы(К1)-(дибензо-18-краун-6) и азакраунэфира. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X6 представляет -Ы(К1)-(дибензо18-краун-6). В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X6 представляет азакраунэфир. В дополнительных вариантах осуществления по меньшей мере один X представляет X6, и X6 выбирают из
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X6 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X6 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один X6 представляет
В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет X6, представлен еще один вариант осуществления, в котором n представляет целое число от 30 до 35. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет X6, n представляет целое число от 25 до 29. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет X6, n представляет целое число от 20 до 24. В дополнительных вариантах осуществления любого из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет X6, n представляет целое число от 15 до 19. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет X6, n представляет целое число от 10 до 14. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет X6, n представляет целое число от 5 до 9. В еще других дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет X6, n представляет целое число от 1 до 4. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представляет целое число от 1 до 35,
G5 представляет , каждый W представляет O, каждый Y представляет O, и по меньшей мере один
X представляет Х7. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х7 представляет гетероцикл. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один X представляет Х7, и Х7 выбирают из
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х7 представляет
- 49 035030
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х7 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х7 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х7 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х7 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х7 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х7 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ-
V ляет целое число от 1 до 35, G представляет ~ , каждый W представляет O, каждый Y представляет O, по меньшей мере один X представляет X7, и по меньшей мере один Х7 представляет N(R1)(R3). В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х7 выбирают из
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х7 представляет
-S-Ν’
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х7 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х7 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х7 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х7 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х7 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х7 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ-
ляет целое число от 1 до 35, G5 представляет , каждый W представляет O, каждый Y представляет
O, по меньшей мере один X представляет X7, и по меньшей мере один Х7 представляет N(R1)(R3). В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х7 выбирают из -Ы-СО-алкил, -L1-CONH-алкил, -L1-CON(алкил)алкил и -L1-SO2-алкил. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х7 представляет -L1-CO-алкил. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х7 представляет -L1-CONH-алкил. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х7 представляет -L1-CON(алкил)алкил. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х7 представляет -L1-SO2-алкил.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ-
ляет целое число от 1 до 35, G5 представляет , каждый W представляет O, каждый Y представляет
O, по меньшей мере один X представляет Х7, и по меньшей мере один Х7 выбирают из
- 50 035030
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х7 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х7 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х7 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х7 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х7 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х7 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х7 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х7 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х7 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х7 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х7 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представ-
ляет целое число от 1 до 35, G5 представляет , каждый W представляет O, каждый Y представляет O, по меньшей мере один X представляет X7, и по меньшей мере один Х7 представляет N(R1)(R3). В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х7 выбирают из
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х7 представляет
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х7 представляет
- 51 035030
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х7 представляет
В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет X7, представлен еще один вариант осуществления, в котором n представляет целое число от 30 до 35. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет X7, n представляет целое число от 25 до 29. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х7, n представляет целое число от 20 до 24. В дополнительных вариантах осуществления любого из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х7, n представляет целое число от 15 до 19. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет X7, n представляет целое число от 10 до 14. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х7, n представляет целое число от 5 до 9. В еще других дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет X7, n представляет целое число от 1 до 4. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представляет целое число от 1 до 35,
Т /В
G5 представляет , каждый W представляет O, каждый Y представляет O, по меньшей мере один X представляет Х8. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х8 представляет -L1-CA. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х8 представляет -L1-dCA. В одном дополнительном варианте осуществления по меньшей мере один Х8 выбирают из -L1COCH2(R4) и -L1-COCH(R4)NHCO2-алкил. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х8 представляет -L1-COCH2(R4). В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один Х8 представляет -L1-COCH(R4)NHCO2^kh4.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой n представляет целое число от 1 до 35, G5 представляет 4- , каждый W представляет O, по меньшей мере один Y представляет NR10, по меньшей мере один X представляет Х8, по меньшей мере один Х8 представляет -OR5, и R5 и R10 совместно образуют цикл. В одном дополнительном варианте осуществления сформированный цикл выбирают из
В некоторых вариантах осуществления сформированный цикл представляет собой
В некоторых вариантах осуществления сформированный цикл представляет собой
В некоторых вариантах осуществления сформированный цикл представляет собой
В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х8, представлен еще один вариант осуществления, в котором n представляет целое число от 30 до 35. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х8, n представляет целое число от 25 до 29. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х8, n представляет целое число от 20 до 24. В дополнительных вариантах осуществления любого из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х8, n представляет целое число от 15 до 19. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х8, n представляет целое число от 10 до 14. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х8, n представляет целое число от 5 до 9. В еще других дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X представляет Х8, n представляет целое число от 1 до 4. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L1 представляет
- 52 035030
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L1 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L1 пред ставляет
в которой p составляет 2 и q составляет 2. В еще одном ставляет 2.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение, в котором p составляет 2 и q соварианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L1 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L1 представляет
в которой p составляет 1, и q составляет 2. В еще одном варианте осуществления представлено соединение, в котором p составляет 2 и q составляет 2. В еще одном варианте осуществления представлено соединение, в котором p составляет 3 и q составляет 2.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L1 ставляет пред-
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L1 ставляет пред-
и в которой Q1 представляет -N(R6)-.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L1 ставляет пред-
И в которой Q2 представляет -N(R6)-.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L1 ставляет пред-
и в которой Е1 представляет фенил.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L1 представляет
- 53 035030 и в которой Е1 представляет гетероарил.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L1 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L1 представляет
в которой Q1 представляет -N(R6)-.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L1 представляет
в которой Е2 представляет пирролил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Е2 представляет имидазолил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Е2 представляет триазинил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Е2 представляет имидазолил.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой W представляет O и Y представляет NH.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой W представляет O и Y представляет NR10. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой W представляет O и Y представляет NR10, причем R10 и Х8е совместно образуют цикл. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R10 и Х8е совместно составляют структуру, выбранную из
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L11 представляет
IR23 r23 о
У к \ ”»'ϊι”
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L11 пред ставляет
IR23R 23O R1 R1 .r-n-r24-n-14 ° Q
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L11 пред ставляет R23R23O R1 R1 ,R-N-R24-N-i4 0 о 5 и R24 представляет С2-С4-алкилен. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L11 представляет
IWi? R1 R1 ,r-n-r24-n-|0 ° , и в которой R24 представляет этиленовый или пропиленовый фрагмент, и R1 представляет атом водорода или метил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L11 представляет
- 54 035030
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L11 представляет
и R4 представляет атом водорода или метил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L11 представляет
R23R23O СН3 о
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L13 пред-
ставляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L13 представляет
и в которой p составляет 2 и q составляет 2. В еще одном варианте осуществления cvj ч представлено соединение формулы (I), в которой L представляет и в которой p составляет 2 и q составляет 3. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой
L13 представляет И .
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L13 представляет
, p и q независимо выбирают из 1 или 2 и R6 представляет СН3. В еще одном варианте
осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L13 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L13 пред-
ставляет и p, q, s и t независимо выбирают из 1 или 2. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Q представляет X1. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R23 представляет атом водорода, метил, или обе группы R23 совместно образуют циклопропильное, циклобутильное, циклопентильное или циклогексильное кольцо. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R23 представляет атом водорода или метил.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Q представляет Х2. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Q представляет X3. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Q представляет Х4. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Q представляет Х5. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Q представляет X6. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Q представляет Х7. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Q представляет Х8.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Z5 представляет С^23)2ОР(=О)(ОН)2. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R23 представляет атом водорода.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Z5 представляет (L11)-(R15), и R15 представляет Q-C^-алкил, C1-C3o-алкилкарбонил, C2-C3o-алкилоксикарбонил, или 3-18-членный алкоксиалкилкарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Z5 представляет (L11)-(R15) и R15 представляет С2-С30-алкилоксикарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Z5 представляет (L11)-(R15), и R15 выбирают из -С(=О)ОСН2СН2ОН, -С(=О)ОСН2СН2ОСН2СН2ОН или -С(=О)ОСН2СН2ОСН2СН2ОСН2СН2ОН. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Z5
-С(=О)ОСН2СН2ОСН2СН2ОСН2СН2ОН.
представляет (L11)-(R15) и R15 представляет
- 55 035030
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Z5 представляет (L11)-(R15) и R15 представляет проникающий в клетку пептид. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R15 представляет проникающий в клетку пептид, и проникающий в клетку пептид связан через линкер, производный от аминокапроновой кислоты. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R15 представляет проникающий в клетку пептид, и проникающий в клетку пептид связан через линкер, производный от аминокапроновой кислоты, включающий структуру
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Z5 выбирают из
В еще одном варианте осуществления представлено соединение ставляет формулы (I), в которой Z5 пред-
В еще одном варианте осуществления представлено соединение ставляет -(L11)-(L15)-(R16).
В еще одном ставляет варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Z5 формулы (I), которой L11 предпредr23r23o
В еще одном ставляет
Q .
варианте осуществления представлено соединение формулы (I), которой L11 предВ еще одном ставляет
варианте осуществления представлено соединение формулы (I), которой L11 пред1
-R24-n4‘
Q и R24 представляет С2-С4-алкилен. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L11 представляет
и в которой R24 представляет этиленовый или пропиленовый фрагмент, R1 представляет атом водорода или метил.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L11 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L11 представляет
и R4 представляет атом водорода или метил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L11 представляет
- 56 035030
R23R23O сн3 о Q н
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в
которой L13 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L представляет Н и в которой p составляет 2 и q составляет 2.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в
ставляет
В еще одном которой L13 пред-
и в которой p составляет 2 и q составляет 3.
ί варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L13 представляет
В еще одном
варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L13 представляет
В еще одном
p и q независимо выбирают из 1 или 2 и R6 представляет СН3. варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L13 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в
которой L13 представляет и p, q, s и t независимо выбирают из 1 или 2. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Q представляет X1. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R23 представляет атом водорода, метил, или обе группы R23 совместно образуют циклопропильное, циклобутильное, циклопентильное или циклогексильное кольцо. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R23 представляет атом водорода или метил.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Q представляет Х2. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Q представляет X3. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Q представляет Х4. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Q представляет Х5. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Q представляет X6. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Q представляет Х7. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Q представляет Х8.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Z5 представляет -(L11)-(L15)-(R16), и L15 выбирают из -(C1-C3o-алкилен)-С(=O)- или -(C2-C3o-алкокси)-С(=O)-. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Z5 представляет -(L11)-(L15)-(R16), и L15 выбирают из -(C2-C3o-алкокси)-C(=O)-.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Z5 представляет -(L11)-(L15)-(R16), и представлено структурой
в которой группа А представляет аминометилированную полистирольную смолу.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Z5 представляет -(L11)-(L15)-(R16), и R16 представлен структурой
- 57 035030
в которой группа А представляет аминометилированную полистирольную смолу.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Z5 ставляет -(L11)-(L15)-(R16), и L15 представлен структурой ·
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R12 предпредставляет электронную пару.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет Ц-Озо-алкил, и R12 представляет С1-С6-алкил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет метильную группу, и R12 представляет метильную группу.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 пред ставляет атом водорода.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет С1-С30-алкил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет С1-С10-алкил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет С1-С6-алкил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 выбирают из пренильного, геранильного, фарнезильного или геранилгеранильного остатка.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет проникающий в клетку пептид.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет гуанидинильную или амидинильную группу.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет С3-С8-циклоалкил.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет С1-С30-алкилкарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет С1-С15-алкилкарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет С1-С10-алкилкарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет С1-С8алкилкарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет С1-С5-алкилкарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет С1-С4-алкилкарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет С1-С2-алкилкарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет С1алкилкарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет СН3СО-.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет С1-С15-алкилкарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет С1-С30-алкилоксикарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет С1-С10-алкилоксикарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет С1-С10алкилоксикарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет С1-С5-алкилоксикарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет С1-С3-алкилоксикарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет С1-алкилоксикарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет СН3ОСО-. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет -С(=О)ОСН2СН2ОН, -С(=О)ОСН2СН2ОСН2СН2ОН или -С(=О)ОСН2СН2ОСН2СН2ОСН2СН2ОН.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет -C(=O)NHR21. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет -C(=O)NHR21, и R21 представляет метил.
Табл. 1 представляет только в качестве примера показательные связи для соединений формулы (I).
- 58 035030
Таблица 1
Показательные межсубъединичные связи (Х-группы)
- 59 035030
- 60 035030
38 0
39 ° '0..
40 OZ |у°ЧСРз
41 ΓχΧγΟ. / ^WCF5 0 UC Cl
/СНП
42 4^40.CF3
43 ΓνΥγΟ. 0 CJ
44 45 Cl f vYy/ji o 0 ^XY°x °\
46
47 A o-^Y=^ n a> <> ДАо <?
48 fvXyO oz
49 i'C^)
50 -^-1/ \l--^>--NO 2
51 tNC^°
52 fX о—'
53 /°—\ \ '—0 0--/
54 tNCYcF!
55
- 61 035030
- 62 035030
- 63 035030
95 < * '---' E—0H С)
96 —|/ \l у ^0 ОН
97 \ #—0Н 0
98 —NH 0
99 0 XОН —г/ —NH
100 ОН 0
101 < \---/ --и он
102 ЕОХнДн
103 О X
104 .N Z y NH An 0 -j—NH
105 l/ \ —\—
106
107 у
108 109 ! / IZ ? ? 2=E 2—
110 . 1 ? H
111 ς 1
112
113
114
115
- 65 035030
135
136 hAq
137 Αό
138
139 > υΟ Ή
140 1
141 γ
142 ? 1 0
143 Γι ΟΑΟ
144 S ΛΑ АП b
145 -Ю-уЭ 0 О
146 ь
147 -S-N )—NH О
148 -S-N )—NH о
149 ->-N )--NH о ^=N
150 г/ --NH О-^
151 -J>-m у—\ О \=N
152 -^- N \l—\ О \=N
153 -^-N \|—у nA W
154 -^-h/ \—\ (у) \=N
- 66 035030
В. Олигомеры с модифицированными концевыми группами.
Как было отмечено выше, настоящее изобретение также представляет олигомер, включающий модифицированные концевые группы. Заявители обнаружили, что модификация 3'- и/или 5'-конца олигомера разнообразными химическими фрагментами создает более благоприятные терапевтические свойства (например, усиленную доставку в клетку, активность и/или распределение в тканях и т.д.) олигомеров. В разнообразных вариантах осуществления модифицированные концевые группы включают гидрофобный фрагмент, тогда как в других вариантах осуществления модифицированные концевые группы включают гидрофильный фрагмент. Модифицированные концевые группы могут присутствовать с описанными выше связями или без них. Например, в некоторых вариантах осуществления олигомеры включают одну или более модифицированных концевых групп и модифицированные межсубъединичные связи. Комбинации модифицированных концевых групп и модифицированных межсубъединичных связей также придают олигомерам более благоприятные терапевтические свойства. В некоторых вариантах осуществления модифицированная концевая группа представляет собой переносчик пептидов, как здесь описываемый.
- 67 035030
В еще ставляет одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L11 предr2?r230
В еще ставляет одном
Q варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L11 предR1
В еще ставляет одном
R23R23O R1 XX xR-N-R24
А- О '
Q варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L11 предR23R 23Q r1 ΐί Ί' ί
Ρ-Ν-R24-N-jQ и R24 представляет С2-С4-алкилен.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L11 представляет
IR23 r23 О R1 R1
XX ^r-n-r24-n-|Y о \ г
Q и в которой R24 представляет этиленовый или пропиленовый фрагмент и R1 представляет атом водорода или метил.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение ставляет формулы (I), в которой L11 пред-
В еще одном варианте осуществления представлено соединение ставляет формулы (I), в которой L11 преди R4 представляет атом водорода или метил. В еще одном ставляет
варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L11 предВ еще одном
варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L13 представляет
В еще одном
ставляет
В еще одном
ставляет
В еще одном
ставляет
В еще одном
варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L13 преди в которой p составляет 2 и q составляет 2.
варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в и в которой p составляет 2 и q составляет 3. варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в ставляет , p и q независимо выбирают из 1 или 2 и R6 представляет СН3.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L13 которой L13 которой L13 которой L13 предпредпредпред- 68 035030 ставляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L13 представляет
и p, q, s и t независимо выбирают из 1 или 2. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R1 представляет метил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R23 представляет атом водорода, метил, или обе группы R23 совместно образуют циклопропильное, циклобутильное, циклопентильное или циклогексильное кольцо. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R23 представляет атом водорода или метил.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Z5 представляет QR^OP^OXOH)^ В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R23 представляет атом водорода.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Z5 представляет (L11)-(R15), и R15 представляет Q-C^-алкил, C1-C3o-алкилкарбонил, C2-C3o-алкилоксикарбонил, или 3-18-членный алкоксиалкилкарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Z5 представляет (L11)-(R15), и R15 представляет С2-С30-алкилоксикарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Z5 представляет (L11)-(R15), и R15 выбирают из -C(=O)OCH2CH2OH, -С(=О)ОСН2СН2ОСН2СН2ОН или
-C(=O)OCH2CH2OCH2CH2OCH2CH2OH. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Z5 представляет (L11)-(R15) и R15 представляет -С^ОС^С^ОС^С^ОС^С^ОН.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Z5 выбирают из
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Z5 представляет
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R12 пред ставляет электронную пару.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет CrC^-алкил и R12 представляет C1-C6-алкил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет метильную группу и R12 представляет метильную группу.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 пред ставляет атом водорода.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет Q-C^-алкил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет Q-Cw-алкил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет С1-С6-алкил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 выбирают из пренильного, геранильного, фарнезильного или геранилгеранильного остатка.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет проникающий в клетку пептид.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет гуанидинильную или амидинильную группу.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет С3-С8-циклоалкил.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет Q-C^-алкилкарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение форму
- 69 035030 лы (I), в которой R13 представляет С1-С15-алкилкарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет CrQo-алкилкарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет C1-C8алкилкарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет С1-С5-алкилкарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет С1-С4-алкилкарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет С1-С2-алкилкарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет C1алкилкарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет СН3СО-.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет С1-С15-алкилкарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет C1-C30-алкилоксикарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет C1-C10-алкилоксикарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет C1-C10алкилоксикарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет С1-С5-алкилоксикарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет C1-С3-алкилоксикарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет Q-алкилоксикарбонил. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет СН3ОСО-. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет -C(=O)OCH2CH2OH, -C(=O)OCH2CH2OCH2CH2OH или -C(=O)OCH2CH2OCH2CH2OCH2CH2OH.
В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет -C(=O)NHR21. В еще одном варианте осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет -C(=O)NHR21 и R21 представляет метил.
В некоторых других вариантах осуществления только 3'-конец олигомера сопряжен с одной из указанных выше групп. В некоторых других вариантах осуществления только 5'-конец олигомера сопряжен с одной из указанных выше групп. В других вариантах осуществления оба из 3'- и 5'-концов включают одну из указанных выше групп. Концевая группа для одного 5'-конца, 3'-конца или для обоих из них может быть выбрана из любой одной из групп, указанных выше, или любой из конкретных групп, иллюстрированных в табл. 2.
Таблица 2
Показательные концевые группы
Наименование
Структура
Триметоксибензоил
9-Флуоренкарбонил
4-Карбазолилбензоил
- 70 035030
4 4-Индазолилбензоил О .......σ1· оО^/^сн3 СН3
5 Фарнезил сн3 сн3 сн3 1
6 Геранил Н3С.\^Р^^ сн3 сн3 1
Ί Пренил Η3Οχ^ρ\ сн3 1
8 Дифенилацетил Ох 0
9 Хлордифенилацетил у+ 0
10 Гидроксидифенилацетил ό
11 Трифенилпропионил су......V 0
12 Трифенилпропил С Ι// Н ууЛ<
13 Трифенилацетил 9 Огл
14 Тритил (Тг) О оо и 0
15 Метокситритил (МеОТг) уО -ЮН о \ /
16 Метилсукцинимидилциклогексоил о
- 71 035030
- 72 035030
1. Переносчики пептидов.
В некоторых вариантах осуществления обсуждаемый олигомер конъюгирован со структурой переносчика пептидов, например структурой переносчика проникающего в клетку пептида, который действует для улучшения транспорта олигомера в клетки. Например, в некоторых вариантах осуществления структура переносчика пептидов представляет собой обогащенный аргинином пептид. В дополнительных вариантах осуществления структура переносчика присоединена либо к 5'-, либо к 3'-концу олигомера. Когда такой пептид конъюгирован с одним из концов, тогда противоположный конец доступен для дополнительной конъюгации с модифицированной концевой группой, как здесь описываемой.
В некоторых вариантах осуществления вышеизложенного структура переносчика пептидов включает от 6 до 16 субъединиц, выбранных из X'-субъединиц, Y'-субъединиц и Z'-субъединиц, где (a) каждая X'-субъединица независимо представляет лизин, аргинин или аналог аргинина, причем указанный аналог представляет собой катионную α-аминокислоту, включающую боковую цепь со структурой R33N=C(NH2)R34, где R33 представляет H или R; R34 представляет R35, NH2, NHR или NR34, где R35 представляет низший алкил или низший алкенил, и может дополнительно включать кислород или азот; R33 и R34 могут совместно образовывать цикл; и боковая цепь связана с указанной аминокислотой через R33 или R34;
(b) каждая Y'-субъединица независимо представляет нейтральную аминокислоту -C(G)-(CHR)n-NH-, где n составляет от 2 до 7 и каждый R независимо представляет H или метил; и (c) каждая Z'-субъединица независимо представляет α-аминокислоту, имеющую нейтральную арилалкильную боковую цепь;
причем пептид включает последовательность, представленную одним из (X'Y'X')p, (X'Y')m и (X'Z'Z')p, где p составляет от 2 до 5 и m составляет от 2 до 8.
В избранных вариантах осуществления для каждой X' структура боковой цепи представляет собой гуанидил, как в аминокислотной субъединице аргинине (Arg). В дополнительных вариантах осуществления каждая Y' представляет -CG-(CH2)n-CHR-NH-, где n составляет от 2 до 7 и R представляет Н. Например, когда n составляет 5, и R представляет H, Y' представляет субъединицу 6-аминокапроновой кислоты, сокращенно называемой здесь Ahx; когда n составляет 2 и R представляет H, Y' представляет βаланиновую субъединицу.
В определенных вариантах осуществления пептиды этого типа включают такие, которые содержат аргининовые димеры, чередующиеся с одиночными Y'-субъединицами, где Y' представляет Ahx. Примеры включают пептиды, имеющие формулу (RY'R)p или формулу (RRY')p, где Y' представляет Ahx. В одном варианте осуществления Y' представляет субъединицу 6-аминокапроновой кислоты, R представляет аргинин, и p равен 4.
В одном дополнительном варианте осуществления каждая Z' представляет фенилаланин, и составляет 3 или 4.
В некоторых вариантах осуществления конъюгированный пептид связан с концом олигомера через линкер Ahx-B, где Ahx представляет субъединицу 6-аминокапроновой кислоты и В представляет βаланиновую субъединицу.
В избранных вариантах осуществления для каждой X' структуру боковой цепи независимо выбирают из группы, состоящей из гуанидила (NH=C(NH2)NH-), амидинила (NH=C(NH2)C-), 2аминодигидропиримидила, 2-аминотетрагидропиримидила, 2-аминопиридинила и 2-аминопиримидонила, и предпочтительно выбирают из гуанидила и амидинила. В одном варианте осуществления структура боковой цепи представляет собой гуанидил, как в аминокислотной субъединице аргинина (Arg).
В некоторых вариантах осуществления Y'-субъединицы либо являются смежными, таким образом, что никакие X'-субъединицы не введены между Y'-субъединицами, либо вкраплены поодиночке между X'-субъединицами. Однако в некоторых вариантах осуществления между Y'-субъединицами может быть связывающая субъединица. В одном варианте осуществления Y'-субъединицы находятся на конце переносчика пептидов; в других вариантах осуществления они фланкированы X'-субъединицами. В дополнительных вариантах осуществления каждая Y' представляет -CG-(CH2)n-CHR-NH-, где n составляет от 2 до 7, и каждый R представляет H. Например, когда n составляет 5, и R представляет Н, Y' представляет субъединицу 6-аминокапроновой кислоты, сокращенно называемой здесь Ahx. В избранных вариантах осуществления этой группы каждая X' включает структуру гуанидильной боковой цепи, как в аргининовой субъединице. Примерные пептиды этого типа включают такие, которые содержат аргининовые димеры, чередующиеся с одиночными Y'-субъединицами, где Y' предпочтительно представляет Ahx. Примеры включают пептиды, имеющие формулу (RY'R)4 или формулу (RRY')4, где Y' предпочтительно представляет Ahx. В одном варианте осуществления Y' представляет субъединицу 6-аминокапроновой кислоты, R представляет аргинин, и p равен 4. В некоторых вариантах осуществления аналог нуклеиновой кислоты связан с концевой Y'-субъединицей предпочтительно на С-конце. В других вариантах осуществления линкер имеет структуру AhxB, где Ahx представляет субъединицу 6-аминокапроновой кислоты, и В представляет β-аланиновую субъединицу.
- 73 035030
Было показано, что структуры переносчиков пептидов, как описываемых здесь, резко облегчают поступление в клетку присоединенных олигомеров, сравнительно с поглощением олигомера в отсутствие присоединенной транспортной структуры и сравнительно с поглощением присоединенной транспортной структуры, не имеющей гидрофобных Y'-субъединиц. Такое усиленное поглощение может быть подтверждено по меньшей мере двукратным повышением или в других вариантах осуществления четырехкратным повышением поглощения соединения клетками млекопитающих сравнительно с поглощением агента с присоединенной транспортной структурой, не имеющей гидрофобных Y'-субъединиц. В некоторых вариантах осуществления поглощение усиливается по меньшей мере в двадцать раз или по меньшей мере в сорок раз сравнительно с неконъюгированным соединением.
Дополнительным благоприятным эффектом структуры переносчика пептидов является ее ожидаемая способность стабилизировать дуплекс между антисмысловым олигомером и его целевой последовательностью нуклеиновой кислоты. Без намерения вдаваться в теорию, представляется, что эта способность стабилизировать дуплекс может обусловливаться электростатическим взаимодействием между положительно заряженной структурой переносчика и отрицательно заряженной нуклеиновой кислотой. В некоторых вариантах осуществления число заряженных субъединиц в переносчике составляет менее 14, как было отмечено выше, или в других вариантах осуществления между 8 и 11, поскольку слишком большое число заряженных субъединиц может вести к снижению специфичности к последовательности.
Примерные обогащенные аргинином переносчики проникающих в клетку пептидов приведены ниже в табл. 3.
Таблица 3
Обогащенные аргинином переносчики проникающих в клетку пептидов
Наименование Последовательность (от аминного до карбоксильного конца, от 5' до 3') SEQ ID NO
(RFF)3; СР0407 N-RFFRFFRFF6-aMHHOKanpoHOBaM кислотабета-аланин-СООН 1
RTR N-RTRTRFLRRT6-aMHHOKanpoHOBaM кислотабета-аланин-СООН 2
RFFR N-RFFRFFRFFR6-aMHHOKanpoHOBaM кислотабета-аланин-СООН 3
KTR Н-КТИТКЕПККТб-аминокапроновая кислотабета-аланин-СООН 4
KFF И-КЕЕКЕЕКЕЕб-аминокапроновая кислотабета-аланин-СООН 5
KFFK И-КЕЕКЕЕКЕЕКб-аминокапроновая кислотабета-аланин-СООН 6
(RFF) 2 Н-НЕЕИЕЕб-аминокапроновая кислотабета-аланин-СООН 7
- 74 035030
(RFF) 2R Ы-РГГРГГР6-аминокапроновая кислотабета-аланин-СООН 8
R6- аминокапроновая кислота N-Рб-аминокапроновая кислотабаминокапроновая кислотаРбаминокапроновая кислотабаминокапроновая кислотаРбаминокапроновая кислотабаминокапроновая кислотабета-аланинСООН 9
(R6- аминокапроновая кислотаН)4; Р007 N-Рб-аминокапроновая кислотаРРбаминокапроновая кислотаРРбаминокапроновая кислотаРРбаминокапроновая кислотаРбаминокапроновая кислотабета-аланинСООН 10
rTat RRRQRRKKRC 11
R9F2 RRRRRRRRRFFC 12
(RR6- аминокапроновая кислота) 4В РРб-аминокапроновая кислотаРРбаминокапроновая кислотаРРбаминокапроновая кислотаРРбаминокапроновая кислотабета-аланин 13
(R6- аминокапроновая кислотаИ)46- аминокапроновая кислотаВ; (Р007) Рб-аминокапроновая кислотаРРбаминокапроновая кислотаРРбаминокапроновая кислотаРРбаминокапроновая кислотаРбаминокапроновая кислотабета-аланин 14
(6- аминокапроновая кислотаРР)46- аминокапроновая кислотаВ б-аминокапроновая кислотаРРбаминокапроновая кислотаРРбаминокапроновая кислотаРРбаминокапроновая кислотаРРбаминокапроновая кислотабета-аланин 15
(R6- аминокапроновая кислота) 6В Рб-аминокапроновая кислотаРб- аминокапроновая кислотаРб- аминокапроновая кислотаРб- аминокапроновая кислотаРб- аминокапроновая кислотаРбаминокапроновая кислотабета-аланин 16
(R6- аминокапроновая кислота) 8В Рб-аминокапроновая кислотаРб- аминокапроновая кислотаРб- аминокапроновая кислотаРб- аминокапроновая кислотаРб- аминокапроновая кислотаРб- аминокапроновая кислотаРбаминокапроновая кислотабета-аланин 17
(R6- аминокапроновая кислотаР)56- аминокапроновая кислотаВ (СР04057) Рб-аминокапроновая кислотаРРбаминокапроновая кислотаРРбаминокапроновая кислотаРРбаминокапроновая кислотаРРбаминокапроновая кислотаРбаминокапроновая кислотабета-аланин 18
(R6аминокапроновая кислотаРРВР)26аминокапроновая кислотаВ; (СР06062) Рб-аминокапроновая кислотаРРбетааланин РРб-аминокапроновая кислотаРРбета-аланинРбаминокапроновая кислотабета-аланин 19
R4G RRRRG 20
r5g RRRRRG 21
R6G RRRRRRG 22
R7G RRRRRRRG 23
r8g RRRRRRRRG 24
r5gr4g RRRRRGRRRRG 25
r5f2r4g RRRRRFFRRRRG 26
Tat-G RKKRRQRRRG 27
rTat-G RRRQRRKKRG 28
- 75 035030
(R6- аминокапроновая кислотаИ262) 2 Иб-аминокапроновая KHCHOTaRRGGR6- аминокапроновая кислотаИОО 29
(R6- аминокапроновая кислотаИ3б- аминокапроновая кислота) 2G Иб-аминокапроновая кислотаНННбаминокапроновая кислотаИбаминокапроновая кислотаННИб 30
r4p RRRRP 31
R5P RRRRRP 32
R6P RRRRRRP 33
R7P RRRRRRRP 34
R8P RRRRRRRRP 35
В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой Z5 пред11 12 17 17 ставляет -(L )-(L )-(R ) и R представляет лекарственное средство, белок или токсин. В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L12 представляет линкер, расщепляемый в биологических условиях. В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой L12 выбирают из
a) -(C1-C1o-алкилен)-ОС(О)О-СН2О-;
b) -С(О)-(C1-C1o-алкилен)-ОС(О)О-СН2О-;
c) -С(О)-(СН=СН)-С(О)О-СН2О-;
d) -(C1-C1o-алкилен)-S-S-CH2CH2O- или
e) -С(О)-(c1-C1o-алкилен)-S-S-CH2CH2O-.
В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R17 представляет ДНК-связывающий белок. В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R17 представляет фактор транскрипции. В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R17 представляет белок цинковый палец. В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R17 представляет лекарственное средство, белок или токсин, выбранные из списка, приведенного в табл. 4.
Таблица 4 Антиандрогены.
Бикалутамид, бифлуранол, циотеронел, ципротерон, делмадинона ацетат, флутамид, нилутамид, озатерон, оксендолон.
Антибактериальные препараты (антибиотики).
Аминогликозиды:
амикацин, арбекацин, бамбермицины, бутирозин, дибекацин, дигидрострептомицин, фортимицины, гентарницин, изепамицин, канамицин, микрономицин, неомицин, нетилмицин, паромомицин, рибостамицин, сизомицин, спектиномицин, стрептомицин, тобрамицин, троспектомицин.
Амфениколы:
азидамфеникол, хлорамфеникол, тиамфеникол.
Ансамицины:
рифамид, рифампин, рифамицин SV, рифапентин, рифаксимин.
β-Лактамы.
Карбацефемы:
лоракарбеф.
Карбапенемы:
биапенем, эртапенем, фропенем, имипенем, меропенем, панипенем.
Цефалоспорины:
цефаклор, цефадроксил, цефамандол, цефатризин, цефазедон, цефазолин, цефкапен-пивоксил, цефклидин, цефдинир, цефдиторен, цефепим, цефетамет, цефиксим, цефменоксим, цефодизим, цефоницид, цефоперазон, цефоранид, цефозелис, цефотаксим, цефотиам, цефозопран, цефпимизол, цефпирамид, цефпиром, цефподоксима проксетил, цефпрозил, цефроксадин, цефсулодин, цефтазидим, цефтерам, цефтезол, цефтибутен, цефтизоксим, цефтриаксон, цефуроксим, цефузонам, цефацетрила натриевая соль, цефалексин, цефалоглицин, цефалоридин, цефалоспорин С, цефалотин, цефазолина натриевая соль, цефрадин, пивцефалексин.
Цефамицины:
цефбуперазон, цефметазол, цефминокс, цефотетан, цефокситин.
Монобактамы:
азтреонам, карумонам, тигемонам.
Оксацефемы:
фломоксеф, моксалактам.
Пенициллины:
- 76 035030 амдиноциллин, амдиноциллин-пивоксил, амоксициллин, ампициллин, апалциллин, аспоксициллин, азидоциллин, азлоциллин, бакампициллин, карбенициллин, кариндациллин, клометоциллин, клоксациллин, циклациллин, диклоксациллин, эпициллин, фенбенициллин, флоксациллин, гетациллин, ленампициллин, метампициллин, метициллина натриевая соль, мезлоциллин, нафциллин, оксациллин, пенамициллин, пенетамата гидроиодид, пенициллин G, пенициллин G бензатин, пенициллин G прокаин, пенициллин N, пенициллин O, пенициллин V, пенимепициклин, фенетициллина калиевая соль, пиперациллин, пивампициллин, пропициллин, хинациллин, сульбенициллин, сультамициллин, талампициллин, темоциллин, тикарциллин.
Прочие:
ритипенем.
Линкозамиды:
клиндамицин, линкомицин.
Макролиды:
азитромицин, карбомицин, клэритромицин, диритромицин, эритромицин, эритромицина ацистрат, эритромицина эстолат, эритромицина глюкогептонат, эритромицина лактобионат, эритромицина пропионат, эритромицина стеарат, джозамицин, лейкомицины, мидекамицины, миокамицин, олеандомицин, примицин, рокитамицин, розарамицин, рокситромицин, спирамицин, телитромицин, тролеандомицин.
Полипептиды:
амфомицин, бацитрацин, бацитрацин-цинк, капреомицин, колистин, эндурацидин, энвиомицин, фузафунгин, грамицидин(ны), грамицидин S, полимиксин, хинупристин, ристоцетин, тейкопланин, тиострептон, туберактиномицин, тироцидин, тиротрицин, ванкомицин, биомицин.
Тетрациклины:
хлортетрациклин, кломоциклин, демеклоциклин, доксициклин, гуамециклин, лимециклин, меклоциклин, метациклин, миноциклин, окситетрациклин, пенимепициклин, пипациклин, ролитетрациклин, санциклин, тетрациклин.
Прочие:
циклосерин, дальфопристин, мупироцин, пристинамицин, виргиниамицин.
Антибактериальные препараты (синтетические).
2,4-Диаминопиримидины:
бродимоприм, тетроксоприм, триметоприм, нитрофураны, фуральтадон, фуразолия хлорид, нифурател, нифурфолин, нифурпиринол, нифурпразин, нифуртоинол, нитрофурантоин, оксазолидиноны.
Линезолид.
Хинолоны и аналоги:
балофлоксацин, циноксацин, ципрофлоксацин, клинафлоксацин, эноксацин, флероксацин, флумеквин, гатифлоксацин, гемифлоксацин, грепафлоксацин, ломефлоксацин, милоксацин, моксифлоксацин, надифлоксацин, налидиксовая кислота, норфлоксацин, офлоксацин, оксолиновая кислота, пазуфлоксацин, пефлоксацин, пипемидовая кислота, пиромидовая кислота, розоксацин, руфлоксацин, ситафлоксацин, спарфлоксацин, тозуфлоксацин, тровафлоксацин.
Сульфонамиды:
ацетилсульфаметоксипиразин, хлорамин-Б, хлорамин-Т, дихлорамин-Т, ^-формилсульфизомидин, ^-З-Э-глюкозилсульфаниламид, мафенид, ноприлсульфамид, фталилсульфацетамид, фталилсульфатиазол, салазосульфадимидин, сукцинилсульфатиазол, сукцинилсульфатиазол, сульфацетамид, сульфахлорпиридазин, сульфахризоидин, сульфацитин, сульфадиазин, сульфадикрамид, сульфадиметоксин, сульфадоксин, сульфаэтидол, сульфагуанидин, сульфагуанол, сульфален, сульфалоксоновая кислота, сульфамеразин, сульфаметер, сульфаметазин, сульфаметизол, сульфаметомидин, сульфаметоксазол, сульфаметоксипиридазин, сульфаметрол, сульфамидохризоидин, сульфамоксол, сульфаниламид, 4сульфаниламидосалициловая кислота, ^-сульфанилилсульфаниламид, сульфанилилмочевина, Nсульфанилил-3,4-ксиламид, сульфаперин, сульфафеназол, сульфапроксилин, сульфапиразин, сульфапиридин, сульфазомизол, сульфазимазин, сульфатиазол, сульфатиомочевина, сульфизомидин, сульфизоксазол.
Сульфоны:
ацедапсон, ацедиасульфон, ацетосульфон натрия, дапсон, диатимосульфон, глюкосульфон натрия, соласульфон, сукцисульфон, сульфаниловая кислота, парасульфанилилбензиламин, сульфоксон натрия, тиазолсульфон.
Прочие:
клофоктол, гекседин, метенамин, метронидазол, нитроксолин, пексиганан, тауролидин, ксиборнол. Антибактериальные препараты (лепростатики).
Ацедапсон, ацетосульфон натрия, клофазимин, дапсон, диатимосульфон, глюкосульфон натрия, гиднокарповая кислота, соласульфон, сукцисульфон, сульфоксон натрия.
Антибактериальные препараты (туберкулостатики):
- 77 035030 парааминосалициловая кислота, парааминосалициловой кислоты гидразид, бензоилпас, 5бромсалицилгидроксамовая кислота, капреомицин, клофазимин, циацетацид, циклосерин, дигидрострептомицин, энвиомицин, этамбутол, этионамид, фуроназид, гликониазид, изониазид, морфазинамид, опиниазид, фениламиносалицилат, протионамид, пиразинамид, рифабутин, рифалазил, рифампин, рифапентин, салиназид, стрептомицин, стрептоникозид, сульфониазид, тиоацетазон, тиокарлид, туберактиномицин, туберцидин, биомицин, диметазан, фенкамин, индалпин, инделоксазина гидрохлорид, нефопам, номифензин, окситриптан, см. 4873 оксипертин, пароксетин, сертралин, тиазезим, тразодон.
Г идразиды/гидразины:
ипроклозид, ипрониазид, изокарбоксазид, ниаламид, октамоксин, фенелзин.
Фенилоксазолидиноны:
бефлоксатон, толоксатон.
Пирролидоны:
котинин.
Тетрацидики:
мапротилин, метралиндол, миансерин, миртазапин.
Трициклики:
адиназолам, аминептин, амитриптилин, амитриптилиноксид, амоксапин, бутриптилин, кломипрамин, демексиптилин, дезипрамин, дибензепин, диметацин, дотиепин, доксепин, флуацизин, имипрамин, имипрамина N-оксид, иприндол, лофепрамин, мелитрацен, метапрамин, нортриптилин, ноксиптилин, опипрамол, пизотилин, пропизепин, протриптилин, хинупрамин, тианептин, тримипрамин.
Прочие:
адрафинил, бупропион, бутацетин, диоксадрол, дулоксетин, этоперидон, фемоксетин, фенпентадиол, флуоксетин, флувоксамин, гематопорфирин, гиперицин, левофацетопиран, медифоксамин, милнаципран, минаприн, моклобемид, нефазодон, оксафлозан, пибералин, пролинтан, пиросукцидеанол, ребоксетин, ритансерин, роксиндол, хлорид рубидия, сульфид, тандоспирон, тозалинон, тофенацин, транилципромин, триптофан, венлафаксин, вилоксазин, зимелдин.
Антидиабетические препараты.
Бигуаниды:
буформин, метформин, фенформин.
Гормоны/аналоги:
амилин, инсулин, инсулин аспарт, инсулин гларгин, инсулин лизпро, прамлинтид.
Производные сульфонилмочевины:
Ацетогексамид, карбутамид, хлорпропамид, глибомурид, гликлазид, глимепирид, глипизид, глихидон, глизоксепид, глибурид, глибутиазол, глибузол, глигексамид, глимидин, глипинамид, фенбутамид, толазамид, толбутамид, толцикламид.
Тиазолидиндионы:
пиоглитазон, розиглитазон, троглитазон.
Прочие:
акарбоза, мезоксалат кальция, миглитол, натеглинид, репаглинид, воглибоз.
Антиэстрогены:
центхроман, делмадинона ацетат, тамоксифен, торемифен.
Противогрибковые препараты (антибиотики).
Полиены:
амфотерицин В, кандицидин, дермостатин, филипин, фунгихрорнин, хачимицин, хамицин, луцензомицин, клепатрицин, натамицин, нистатин, пецилоцин, перимицин.
Прочие:
азасерин, каспофунгин, гризеофульвин, охгомицины, пирролнитрин, сикканин, туберцидин, виридин.
Противогрибковые препараты (синтетические).
Аллиламины:
бутенафин, нафтифин, тербинафин.
Имидазолы:
бифоназол, бутоконазол, хлордантоин, хлормидазол, клоконазол, клотримазол, эконазол, энилконазол, фентиконазол, флутримазол, изоконазол, кетоконазол, ланоконазол, миконазол, нетиконазол, омоконазол, оксиконазола нитрат, сертаконазол, сулконазол, тиоконазол.
Тиокарбаматы:
лиранафтат, толциклат, толиндат, толнафтат, триазолы флуконазол, итраконазол, позаконазол, саперконазол, терконазол, вориконазол.
Прочие:
Акризорцин, аморолфин, бифенамин, бромосалицилхлоранилид, буклозамид, пропионат кальция, хлорфенезин, циклопирокс, клоксиквин, копараффинат, диамтазола дигидрохлорид, экзаламид, флуцитозин, гексетидин, лофлукарбан, нифурател, иодид калия, пропионовая кислота, пиритион, салициланилид,
- 78 035030 пропионат натрия, сулбентин, тенонитрозол, триацетин, ундециленовая кислота, пропионат цинка.
Антигонадотропины.
Даназол, гестринон, пароксипропион.
Антинеопластики.
Алкалоиды:
9-аминокамптотецин, доцетаксел, эктеинасцидины, этопозид, иринотекан, паклитаксел, рубитекан, тенипозид, топотекан, винбластин, винкристин, виндезин.
Алкилирующие агенты.
Алкилсульфонаты:
бусульфан, импросульфан, пипосульфан.
Азиридины:
карбоквон, уредепа.
Этиленимины и метилмеламины:
алтретамин, триэтиленмеламин, триэтиленфосфорамид, триэтилентиофосфорамид.
Азотистые иприты:
хлорамбуцил, хлорнафазин, циклофосфамид, эстрамустин, ифосфамид, мехлорэтамин, мехлорэтаминоксида гидрохлорид, мелфалан, новэмбихин, перфосфамид, фенэстерин, преднимустин, трихлортриэтиламина гидрохлорид, трофосфамид, урамустин.
Нитрозомочевины:
кармустин, хлорозотоцин, фотемустин, ломустин, нимустин, ранимустин.
Прочие:
дакарбазин, манномустин, митобронитол, митолактол, пипоброман, темозоломид.
Антибиотики и аналоги:
аклациномицины, антрамицин, азасерин, блеомицины, кактиномицин, карубицин, хромомицины, дактиномицин, даунорубицин, 6-диазо-5-оксо-Ь-норлейцин, доксорубицин, эпирубицин, идарубицин, меногарил, митомицины, микофеноловая кислота, ногаламицин, оловомицины, пепломицин, пирарубицин, пликамицин, порфиромицин, пуромицин, стрептонигрин, стрептозоцин, TNP-470, туберцидин, валрубицин, зиностатин, зоробицин.
Антиметаболиты.
Аналоги/антагонисты фолковой кислоты:
деноптерин, эдатрексат, метотрексат, нолатрексед, пеметрексед, пиритрексим, птероптерин, ралтитрексед, триметрексат.
Пуриновые аналоги:
кладрибин, флударабин, 6-меркаптопурин, тиамиприн, тиогуанин, тиазофурин.
Пиримидиновые аналоги:
анцитабин, азацитидин, 6-азауридин, капецитабин, кармофур, цитарабин, децитабин, доксифлуридин, эмитефур, эноцитабин, флоксуридин, фторурацил, гемцитабин, тегафур.
Ферменты:
L-аспарагиназа, ранпирназа.
Иммуномодуляторы:
бропиримин, интерферон-α, интерферон-γ, интерлейкин-2, лентинан, пропагерманиум, PSK®, рохинимекс, сизофиран, убенимекс.
Иммунотоксины:
денилейкин дифтитокс.
Моноклональные антитела:
алемтузумаб, эдреколомаб, гемтузумаб озогамицин, ибритумомаб тиуксетан, ритуксимаб, тозитумомаб 131I трастузумаб.
Комплексы платины:
карбопиатин, цисплатин, лобаплатин, мибоплатин, оксалиплатин.
Прочие:
амсакрин, триоксид мышьяка, бизантрен, дефосфамид, демеколин, диазиквон, эфлорнитин, эллиптиния ацетат, этоглуцид, фенретинид, флавопридол, нитрат галлия, гидроксимочевина, иматиниб, лиарозол, лонидамин, милтефозин, митогуазон, митоксантрон, мопидамол, нитракрин, пентостатин, фенамет, 2-этилгидразид подофиллиновой кислоты, прокарбазин, разоксан, собузоксан, спирогерманий, тенуазоновая кислота, тирапазамин, триазиквон, уретан.
Антинеопластики (гормональные).
Андрогены:
калустерон, дромостанолон, эпитиостанол, мепитиостан, тестолактон.
Антиадреналиновые препараты:
аминоглютетимид, митотан, трилостан.
Антиандрогены:
бикалутамид, флутамид, нилутамид.
- 79 035030
Антиэстрогены:
дролоксифенк, идоксифен, тамоксифен, торкмифен.
Антипрогестины:
онапристон.
Ингибиторы ароматазы:
аминоглютетимид, анастрозол, экземестан, фадрозол, форместан, летрозол, ворозол.
Эстрогены: диэтилстильбэстрол, фосфэстрол, гексэстрол, полиэстрадиола фосфат.
Аналоги лютеинизирующего рилизинг-гормона (LH-RH):
бусерелин, цетрореликс, гозерелин, лейпролид, трипторелин.
Прогестогены:
хлормадинона ацетат, медроксипрогестерон, мегестрола ацетат, меленгестрол.
Ретиноиды и аналоги:
алитретиноин, бексаротен, мофаротен.
Аналоги соматостатина:
ланреотид.
Антинеопластики (фотосенсибилизаторы).
Порфимер натрия, темопорфин, этиопурпурин этилолова.
Антинеопластики (источник радиации).
Америций, фосфат хрома(Ш), радиоактивные, кобальт, золото, радиоактивные, коллоидальные, ибритумомаб тиуксетан, '^'[-этиолированное масло иобенгуан, радий, радон, самария 153Sm лексидронам, иодид натрия, радиоактивный, фосфат натрия, радиоактивный, хлорид стронция, радиоактивные, тозитумомаб 131[.
Дополнения антинеопластиков.
Антиметастатические агенты:
батимастат, приномастат.
Хемомодуляторы:
энилюрацил.
Хемосенсибилизаторы:
бирикодар, вальсподар.
Радиопротекторы:
амифостин.
Радиосенсибилизаторы:
броксуридин, этанидазол, RSR-13.
Уропротекторы:
месна.
Средства против нейтропении.
Гранулоцитарный колониестимулирующий фактор, гранулоцитарно макрофагальный колониестимулирующий фактор, интерлейкин-3.
Средства против феохромоцитомы.
Метирозин, феноксибензамин, фентоламин.
Средства против пневмоцистоза.
Атоваквон, эфлорнитин, пентамидин, сульфаметоксазол.
Антипрогестин.
Онапристон.
Средства против гипертрофии простаты.
Доксазозин, дутастерид, эпристерид, финастерид, гестонорона капроат, мепартрицин, озатерон, оксендолон, тамсулозин, теразозин.
Антипротозойные средства (криптоспоридии).
Нитазоксанид.
Антипротозойные средства (лейшмании).
Этилстибамин, гидроксистильбамидин, N-метилглюкамин, пентамидин, стибоглюконат натрия см. 707 стильбамидин, стибамин мочевины.
Антипротозойные средства (токсоплазма).
Пириметамин.
Антипротозойные средства (трихомонады).
Ацетарсон, аминитрозол, анизомицин, азанидазол, фуразолидон, хачимицин, лаурогуадин, мепартрицин, метронизадол, нифурател, нифуроксим, ниморазол, секнидазол, пикрат серебра, тенонитрозол, тинидазол.
Антипротозойные средства (трипаносомы).
Бензнидазол, эфломитин, меларсопрол, нифуртимокс, оксофенарсина гидрохлорид, пентамидин, пропамидин, пуромицин, хинапирамин, стильбамидин, сурамина натрий, трипан красный, трипарсамид.
- 80 035030
Противовирусные препараты.
Моноклональные антитела:
паливизумаб.
Пептидомиметики:
ампренавир, индинавир, лопинавир, нелфинавир, ритонавир, саквинавир.
Полинуклеотиды:
амплиген, фомивирсен.
Пурины/пиримидино ны:
абакавир, ацикловир, адефовир, цидофовир, цитарабин, диданозин, дидезоксиаденозин, эдоксудин, эмтрицитабин, фамцикловир, флоксуридин, ганцикловир, идоксуридин, инозин пранобекс, ламивудин, MADU, пенцикловир, соривудин, ставудин, тенофовир, трифлуридин, валацикловир, вальганцикловир, видарабин, зальцитабин, зидовудин.
Аналоги сиаловой кислоты:
озельтамивир, занамивир.
Прочие:
ацеманнан, ацетиллейцин моноэтаноламин, амантадин, амидиномицин, атевирдин, каправирин, делавирдин, н-докозанол, эфавиренз, фоскамет натрий, интерферон-V, интерферон-3, интерферон-γ, кетоксал, лизоцим, метисазон, мороксидин, невирапин, Pentafiiside, плеконарил, подофиллотоксин, рибавирин, римантадин, сталлимицин, статолон, тремакамра, тромантадин.
Ингибиторы ароматазы:
аминоглютетимид, анастрозол, экземестан, фадрозол, форместан, летрозол, ворозол.
Диагностический критерий (контрастное вещество для получения изображения в методе ядерномагнитной резонансной томографии (MRI)).
Оксиды железа, Ferumoxsil, гадобенат димеглюмин, гадобутрол, гадодиамид, гадопентетовая кислота, гадотеридол, гадоверсетамид, гадоксетовая кислота, мангафодипир, MS-325, перфлуброн.
Диагностический критерий (радиоактивное визуализирующее средство).
Арцитумомаба комплекс с технецием (Tc), бутедроновой кислоты комплекс, капромаб пендетид, депреотида комплекс с Tc, дисофенина комплекс с Tc, экзаметазима комплекс с Tc, флудезоксиглюкоза F18, натрия о-йодгиппурат 131I, иофетамин 123I.
Г люкокортикоиды.
21-Ацетоксипрегненолон, алклометазон, алгестон, амцинонид, беклометазон, бетаметазон, будесонид, хлоропреднизон, циклесонид, клобетазол, клобетазон, клокортолон, клопреднол, кортикостерон, кортизон, кортивазол, дефлазакорт, преднизолона натрия фосфат, преднизон, преднивал, преднилиден, римексолон, тиксокортол, триамцинолон, триамцинолона ацетонид, триамцинолона бенетонид, триамцинолона гексацетонид.
Антагонисты/ингибиторы гормона роста.
Октреотид, пегвисомант, соматостатин.
Рилизинг-фактор гормона роста.
Серморелин.
Стимулятор роста.
Соматотропин.
Ингибиторы обратной транскриптазы.
Абакавир, атевирдин, каправирин, делавирдин, диданозин, дидезоксиаденозин, эфавиренз, эмтрицитабин, фоскарнет натрия, ламивудин, невирапин, ставудин, сурамин натрий, тенофовир, зальцитабин, зидовудин.
Ингибиторы топоизомеразы.
9-Аминокамптотецин, иринотекан, топотекан.
Ингибиторы топоизомеразы-2.
Даунорубицин, доксорубицин, этопозид, собузоксан, тенипозид.
С. Свойства олигомеров.
Как было отмечено выше, настоящее изобретение направлено на олигомер, включающий разнообразные модификации, которые придают олигомерам желательные свойства (например, повышенную антисмысловую активность). В определенных вариантах осуществления олигомер включает скелет, содержащий последовательность морфолиновых циклических структур, соединенных межсубъединичными связями, причем межсубъединичные связи соединяют 3'-конец одной морфолиновой циклической структуры с 5'-концом соседней морфолиновой циклической структуры, причем каждая морфолиновая циклическая структура связана с фрагментом спаренного основания таким образом, что олигомер может связываться специфичным к последовательности образом с целевой нуклеиновой кислотой. Морфолиновые циклические структуры могут иметь следующее строение (i):
- 81 035030
в которой В, в каждом случае независимо, представляет фрагмент спаренного основания.
Каждая морфолиновая циклическая структура несет фрагмент (Pi) спаренного основания для формирования последовательности фрагментов спаренных оснований, которая типично предназначена для гибридизации с выбранной антисмысловой мишенью в клетке или в подвергаемом лечению субъекте. Фрагмент спаренного основания может быть пурином или пиримидином, присутствующими в нативной ДНК или РНК (A, G, C, T или U), или аналогом, таким как гипоксантин (основание, входящее компонентом в нуклеозид инозин) или 5-метилцитозин. Обсуждаемый аналог основания повышает аффинность связывания с олигомером, который также может быть использован. Примерные аналоги в этом отношении включают С5-пропинилмодифицированные пиримидины, 9-(аминоэтокси)феноксазин (фиксатор) и т.п.
Дополнительные примеры фрагментов спаренных оснований включают, но не ограничиваются таковыми, урацил, тимин, аденин, цитозин и гуанин, имеющие свои соответствующие аминогруппы, защищенные ацильными защитными группами, 2-фторурацил, 2-фторцитозин, 5-бромурацил, 5-иодурацил, 2,6-диаминопурин, азацитозин, пиримидиновые аналоги, такие как псевдоизоцитозин и псевдоурацил, и прочие модифицированные азотистые основания нуклеиновых кислот, такие как 8-замещенные пурины, ксантин или гипоксантин (последние два представляют собой продукты естественной деградации). Также рассматриваются модифицированные нуклеооснования, описанные в работах авторов Chiu и Rana, RNA, 2003, т. 9, стр. 1034-1048, Limbach и др., Nucleic Acids Research, 1994, т. 22, стр. 2183-2196, и Revankar и Rao, Comprehensive Natural Products Chemistry, т. 7, стр. 313.
Дополнительные примеры фрагментов спаренных оснований включают, но не ограничиваются таковыми, нуклеооснования увеличенного размера, в которые введены один или более бензольных циклов. Замещения гетероциклических оснований нуклеиновых кислот, описанные в каталоге Glen Research (www.glenresearch.com); в работах авторов Krueger A.T, и др., Acc. Chem. Res., 2007, т. 40, стр. 141-150; Kool, E.T., Acc. Chem. Res., 2002, т. 35, стр. 936-943; Benner S.A., и др., Nat. Rev. Genet., 2005, т. 6, стр. 553-543; Romesberg, F.E., и др., Curr. Opin. Chem. Biol., 2003, т. 7, стр. 723-733; Hirao, I., Curr. Opin. Chem. Biol., 2006, т. 10, стр. 622-627, рассматриваются как применимые для синтеза описываемых здесь олигомеров. Некоторые примеры этих нуклеооснований увеличенного размера показаны ниже
может быть модифицирован
Как было отмечено выше, олигомер в
соответствии с одним аспектом изобретения введением одной или более групп Х2-Х8. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I) содержит по меньшей мере одну X3-Х8-группу и не содержит Х2-группу. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I) содержит по меньшей мере одну Х2-, Х4-, Х5-, Х6-, Х7- или Х8-группу, и не содержит X3-группу. В некоторых вариантах осуществления соединение фор- 82 035030 мулы (I) содержит по меньшей мере одну Х2-, X3-, Х5-, Х6-, Х7- или Х8-группу и не содержит Х4группу. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I) содержит по меньшей мере одну Х2-, X3-, Х4-, Х6-, Х7- или Х8-группу и не содержит Х5-группу. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I) содержит по меньшей мере одну Х2-, X3-, Х4-, Х5-, Х7- или Х8-группу и не содержит X6-группу. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I) содержит по меньшей мере одну Х2-, X3-, Х4-, Х5-, X6- или Х8-группу и не содержит Х7-группу. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I) содержит по меньшей мере одну Х2-Х7-группу и не содержит Х8-группу. В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой X не является
В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет ацетил и X не является
В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой X не является
В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет ацетил и X не является
В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой X не является
В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет ацетил и X не является
В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой X не является
о
В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет ацетил и X не является
- 83 035030
В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой X не является
В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет ацетил и X не является
В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой X не является
В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет ацетил и X не является
В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой X не является
. В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет ацетил и X не является
В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой X не является
'3
В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет ацетил и X не является
В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой X не является
CF3
В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 представляет ацетил и X не является
В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой X не является
NHhxARhxARNHAc
В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой R13 пред- 84 035030 ставляет ацетил и X не является
NHhxARhxARNHAc
В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы I, в которой каждую группу X независимо выбирают, как было описано выше, при условии, что если группа X на фосфористой связи, ближайшей к 3'-концу, представляет собой
то по меньшей мере одна другая группа X не является X1.
В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой каждую группу X независимо выбирают, как было описано выше, при условии, что если группа X на фосфористой связи, ближайшей к 3'-концу, представляет собой
то по меньшей мере две других группы X не являются X1.
В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы I, в которой каждую группу X независимо выбирают, как было описано выше, при условии, что если группа X на фосфористой связи, ближайшей к 3'-концу, представляет собой
- 85 035030
то по меньшей мере три других группы X не являются X1.
В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой каждую группу X независимо выбирают, как было описано выше, при условии, что если группа X на фосфористой связи, ближайшей к 3'-концу, представляет собой
то все другие группы X не являются X1.
В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой каждую группу X независимо выбирают, как было описано выше, при условии, что если группа X1 присутствует как N(CH3)2 и X3 присутствует как
то Х7 не представляет пиперидинил.
В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой каждую группу X независимо выбирают, как было описано выше, при условии, что если группа X1 присутствует как N(CH3)2 и Х7 присутствует как пиперидинил, то X3 не является
В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I) содержит одну Х2-Х8-группу на каждые 2-5 Х1-групп. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I) содержит 3-5 Х2Х8-групп на каждые 10 Х1-групп. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I) содержит 3-5 Х2-Х8-групп на каждые 10 Х1-групп. В некоторых вариантах осуществления соединение
- 86 035030 формулы (I) содержит 100% Х2-Х8-групп. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I) содержит 95-100% Х2-Х8-групп. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I) содержит 90-95% Х2-Х8-групп. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I) содержит 85-90% Х2-Х8-групп. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I) содержит 80-85% Х2-Х8-групп. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I) содержит 75-80% Х2-Х8групп. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I) содержит 70-75% Х2-Х8-групп. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I) содержит 65-70% Х2-Х8-групп. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I) содержит 60-65% Х2-Х8-групп. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I) содержит 55-60% Х2-Х8-групп. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I) содержит 50-55% Х2-Х8-групп. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I) содержит 45-50% Х2-Х8-групп. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I) содержит 40-45% Х2-Х8-групп. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I) содержит 35-40% Х2-Х8-групп. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I) содержит 30-35% Х2-Х8-групп. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I) содержит 25-30% Х2-Х8-групп. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I) содержит 20-25% Х2-Х8-групп. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I) содержит 15-20% Х2-Х8-групп.
В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I) содержит 10-15% Х2-Х8-групп. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I) содержит 5-10% Х2-Х8-групп. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I) содержит менее 5% Х2-Х8-групп.
В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой группы X1 и группы Х2-Х8 рассеяны вдоль скелета. В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой группы X1 и группы Х2-Х8 образуют картину строгого чередования вдоль скелета. В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), в которой группы X1 и группы Х2-Х8 не образуют картину строгого чередования вдоль скелета. В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), имеющей блоки Х1-групп и блоки Х2-Х8-групп. В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), имеющей центральный блок из Х1-групп, фланкированный блоками из Х2-Х8-групп. В некоторых вариантах осуществления представлено соединение формулы (I), имеющей центральный блок из Х2-Х8-групп, фланкированный блоками из Х1-групп.
В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X выбирают из Х2-Х8, представлен еще один вариант осуществления, в котором n представляет целое число от 30 до 35. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X выбирают из Х2-Х8, n представляет целое число от 25 до 29. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X выбирают из Х2-Х8, n представляет целое число от 20 до 24. В дополнительных вариантах осуществления любого из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X выбирают из Х2-Х8, n представляет целое число от 15 до 19. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X выбирают из Х2-Х8, n представляет целое число от 10 до 14. В дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X выбирают из Х2-Х8, n представляет целое число от 5 до 9. В еще дополнительных вариантах осуществления вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой по меньшей мере один X выбирают из Х2-Х8, n представляет целое число от 1 до 4.
В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 30 до 35, представлен еще один вариант осуществления, в котором один X представляет Х2Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 30 до 35, представлен еще один вариант осуществления, в котором два X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 30 до 35, представлен еще один вариант осуществления, в котором три X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 30 до 35, представлен еще один вариант осуществления, в котором четыре X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 30 до 35, представлен еще один вариант осуществления, в котором пять X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 30 до 35, представлен еще один вариант осуществления, в котором шесть X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 30 до 35, представлен еще один вариант осуществления, в котором семь X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 30 до 35, представлен еще один вариант осуществления, в котором восемь X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 30 до
- 87 035030
35, представлен еще один вариант осуществления, в котором девять X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 30 до 35, представлен еще один вариант осуществления, в котором десять X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 30 до 35, представлен еще один вариант осуществления, в котором одиннадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 30 до 35, представлен еще один вариант осуществления, в котором двенадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 30 до 35, представлен еще один вариант осуществления, в котором тринадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 30 до 35, представлен еще один вариант осуществления, в котором четырнадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 30 до 35, представлен еще один вариант осуществления, в котором пятнадцать X независимо выбирают из Х2Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 30 до 35, представлен еще один вариант осуществления, в котором шестнадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 30 до 35, представлен еще один вариант осуществления, в котором семнадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 30 до 35, представлен еще один вариант осуществления, в котором восемнадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 30 до 35, представлен еще один вариант осуществления, в котором девятнадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 30 до 35, представлен еще один вариант осуществления, в котором двадцать X независимо выбирают из Х2-Х8.
В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 25 до 30, представлен еще один вариант осуществления, в котором один X представляет Х2Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 25 до 30, представлен еще один вариант осуществления, в котором два X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 25 до 30, представлен еще один вариант осуществления, в котором три X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 25 до 30, представлен еще один вариант осуществления, в котором четыре X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 25 до 30, представлен еще один вариант осуществления, в котором пять X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 25 до 30, представлен еще один вариант осуществления, в котором шесть X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 25 до 30, представлен еще один вариант осуществления, в котором семь X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 25 до 30, представлен еще один вариант осуществления, в котором восемь X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 25 до 30, представлен еще один вариант осуществления, в котором девять X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 25 до 30, представлен еще один вариант осуществления, в котором десять X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 25 до 30, представлен еще один вариант осуществления, в котором одиннадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 25 до 30, представлен еще один вариант осуществления, в котором двенадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 25 до 30, представлен еще один вариант осуществления, в котором тринадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 25 до 30, представлен еще один вариант осуществления, в котором четырнадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 25 до 30, представлен еще один вариант осуществления, в котором пятнадцать X независимо выбирают из Х2Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 25 до 30, представлен еще один вариант осуществления, в котором шестнадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 25 до 30, представлен еще один вариант осуществления, в котором семнадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления фор
- 88 035030 мулы (I), в которой n представляет целое число от 25 до 30, представлен еще один вариант осуществления, в котором восемнадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 25 до 30, представлен еще один вариант осуществления, в котором девятнадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 25 до 30, представлен еще один вариант осуществления, в котором двадцать X независимо выбирают из Х2-Х8.
В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 20 до 25, представлен еще один вариант осуществления, в котором один X представляет Х2Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 20 до 25, представлен еще один вариант осуществления, в котором два X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 20 до 25, представлен еще один вариант осуществления, в котором три X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 20 до 25, представлен еще один вариант осуществления, в котором четыре X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 20 до 25, представлен еще один вариант осуществления, в котором пять X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 20 до 25, представлен еще один вариант осуществления, в котором шесть X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 20 до 25, представлен еще один вариант осуществления, в котором семь X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 20 до 25, представлен еще один вариант осуществления, в котором восемь X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 20 до 25, представлен еще один вариант осуществления, в котором девять X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 20 до 25, представлен еще один вариант осуществления, в котором десять X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 20 до 25, представлен еще один вариант осуществления, в котором одиннадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 20 до 25, представлен еще один вариант осуществления, в котором двенадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 20 до 25, представлен еще один вариант осуществления, в котором тринадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 20 до 25, представлен еще один вариант осуществления, в котором четырнадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 20 до 25, представлен еще один вариант осуществления, в котором пятнадцать X независимо выбирают из Х2Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 20 до 25, представлен еще один вариант осуществления, в котором шестнадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 20 до 25, представлен еще один вариант осуществления, в котором семнадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 20 до 25, представлен еще один вариант осуществления, в котором восемнадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 20 до 25, представлен еще один вариант осуществления, в котором девятнадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 20 до 25, представлен еще один вариант осуществления, в котором двадцать X независимо выбирают из Х2-Х8.
В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 15 до 20, представлен еще один вариант осуществления, в котором один X представляет Х2Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 15 до 20, представлен еще один вариант осуществления, в котором два X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 15 до 20, представлен еще один вариант осуществления, в котором три X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 15 до 20, представлен еще один вариант осуществления, в котором четыре X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 15 до 20, представлен еще один вариант осуществления, в котором пять X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 15 до 20, представлен еще один вариант осуществления, в котором шесть X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов
- 89 035030 осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 15 до 20, представлен еще один вариант осуществления, в котором семь X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 15 до 20, представлен еще один вариант осуществления, в котором восемь X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 15 до 20, представлен еще один вариант осуществления, в котором девять X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 15 до 20, представлен еще один вариант осуществления, в котором десять X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 15 до 20, представлен еще один вариант осуществления, в котором одиннадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 15 до 20, представлен еще один вариант осуществления, в котором двенадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 15 до 20, представлен еще один вариант осуществления, в котором тринадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 15 до 20, представлен еще один вариант осуществления, в котором четырнадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 15 до 20, представлен еще один вариант осуществления, в котором пятнадцать X независимо выбирают из Х2Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 16 до 20, представлен еще один вариант осуществления, в котором шестнадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 17 до 20, представлен еще один вариант осуществления, в котором семнадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 18 до 20, представлен еще один вариант осуществления, в котором восемнадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 19 до 20, представлен еще один вариант осуществления, в котором девятнадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n составляет 20, представлен еще один вариант осуществления, в котором двадцать X независимо выбирают из Х2-Х8.
В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 10 до 15, представлен еще один вариант осуществления, в котором один X представляет Х2Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 10 до 15, представлен еще один вариант осуществления, в котором два X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 10 до 15, представлен еще один вариант осуществления, в котором три X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 10 до 15, представлен еще один вариант осуществления, в котором четыре X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 10 до 15, представлен еще один вариант осуществления, в котором пять X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 10 до 15, представлен еще один вариант осуществления, в котором шесть X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 10 до 15, представлен еще один вариант осуществления, в котором семь X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 10 до 15, представлен еще один вариант осуществления, в котором восемь X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 10 до 15, представлен еще один вариант осуществления, в котором девять X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 10 до 15, представлен еще один вариант осуществления, в котором десять X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 11 до 15, представлен еще один вариант осуществления, в котором одиннадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 12 до 15, представлен еще один вариант осуществления, в котором двенадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 13 до 15, представлен еще один вариант осуществления, в котором тринадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 14 до 15, представлен еще один вариант осуществления, в котором четырнадцать X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n составляет 15, представлен еще один вариант осуществления, в котором пятнадцать X независимо выбирают из Х2-Х8.
- 90 035030
В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 5 до 10, представлен еще один вариант осуществления, в котором один X представляет Х2Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 5 до 10, представлен еще один вариант осуществления, в котором два X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 5 до 10, представлен еще один вариант осуществления, в котором три X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 5 до 10, представлен еще один вариант осуществления, в котором четыре X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 5 до 10, представлен еще один вариант осуществления, в котором пять X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 6 до 10, представлен еще один вариант осуществления, в котором шесть X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 7 до 10, представлен еще один вариант осуществления, в котором семь X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 8 до 10, представлен еще один вариант осуществления, в котором восемь X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 9 до 10, представлен еще один вариант осуществления, в котором девять X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n составляет 10, представлен еще один вариант осуществления, в котором десять X независимо выбирают из Х2-Х8.
В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 1 до 5, представлен еще один вариант осуществления, в котором один X представляет Х2Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 2 до 5, представлен еще один вариант осуществления, в котором два X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 3 до 5, представлен еще один вариант осуществления, в котором три X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n представляет целое число от 4 до 5, представлен еще один вариант осуществления, в котором четыре X независимо выбирают из Х2-Х8. В любом из вышеупомянутых вариантов осуществления формулы (I), в которой n составляет 5, представлен еще один вариант осуществления, в котором пять X независимо выбирают из Х2-Х8.
В некоторых вариантах осуществления антисмысловых подходов олигомер может быть на 100% комплементарным целевой последовательности нуклеиновой кислоты или он может включать ошибочные спаривания оснований, например содержать варианты в той мере, насколько гетеродуплекс, сформированный между олигомером и целевой последовательностью нуклеиновой кислоты, является достаточно стабильным, чтобы противостоять воздействию клеточных нуклеаз и прочих путей деградации, которые могут иметь место in vivo. Ошибочные спаривания оснований, если присутствуют, меньше дестабилизируют в сторону концевых участков, чем в середине. Число ошибочных спариваний оснований будет допустимым в зависимости от длины олигомера, процентной доли С:О-пар оснований в дуплексе и от положения ошибочного(ных) спаривания(ний) оснований в дуплексе согласно хорошо понятным принципам стабильности дуплекса. Хотя такой антисмысловый олигомер не обязательно является на 100% комплементарным целевой последовательности нуклеиновой кислоты, он в состоянии стабильно и специфично связываться с целевой последовательностью так, что модулируется биологическая активность нуклеиновой кислоты как мишени, например, экспрессия кодированного(ных) белка(ков).
Стабильность дуплекса, сформированного между олигомером и целевой последовательностью, представляет собой функцию показателя связывания Tm и чувствительности дуплекса к ферментативному расщеплению в клетке. Значение Tm антисмыслового соединения в отношении комплементарной последовательности РНК может быть измерено общеупотребительными методами, такими как описанные авторами Hames и др., Nucleic Acid Hybridization (Гибридизация нуклеиновых кислот), издательство IRL Press, 1985, стр. 107-108, или как описано в работе Miyada C.G. и Wallace R.B., 1987, Oligonucleotide hybridization techniques (Методы гибридизации олигонуклеотидов), Methods Enzymol., т. 154, стр. 94107.
В некоторых вариантах осуществления каждый антисмысловый олигомер имеет показатель связывания Tm в отношении комплементарной последовательности РНК выше, чем температура тела, или в других вариантах осуществления свыше 50°С. В других вариантах осуществления значения Tm варьируют в диапазоне 60-80°С или больше. Согласно общеизвестным принципам Tm олигомерного соединения в отношении гибрида с комплементарно-связанной РНК может быть повышено путем увеличения отношения CO-пар оснований в дуплексе и/или увеличением длины (по парам оснований) гетеро дуплекса. В то же время для целей оптимизации поглощения клеткой может быть благоприятным ограничение размера олигомера. По этим соображениям соединения, которые проявляют высокое значение Tm (50°С или выше) при длине в 20 оснований или менее, как правило, являются предпочтительными перед такими,
- 91 035030 которые требуют свыше 20 оснований для высоких значений Tm. Для некоторых вариантов применения могут иметь определенные преимущества более длинные олигомеры, например длиннее 20 оснований.
Например, в определенных вариантах осуществления более длинные олигомеры могут найти практическое применение для использования в пропуске экзона или модуляции сплайсов.
Основания нацеленной последовательности могут представлять собой основания обычной ДНК, или их аналоги, например урацил и инозит, которые способны к спариванию оснований по УотсонуКрику с основаниями целевой последовательности РНК.
Олигомеры также могут включать гуаниновые основания вместо аденина, когда целевой нуклеотид представляет собой урацильный остаток. Это полезно, когда целевая последовательность варьирует среди различных видов вирусов, и вариация на любом данном нуклеотидном остатке представляет собой либо цитозин, либо урацил. При использовании гуанина в нацеленном олигомере в положении вариабельности можно воспользоваться общеизвестной способностью гуанина образовывать пару оснований с урацилом (обозначаемой С/Ц:О-спаривание оснований). Введением гуанина в эти положения единственный олигомер может быть эффективно нацелен на широкий диапазон вариабельности целевой РНК.
Соединения (например, олигомеры, межсубъединичные связи, концевые группы) могут существовать в различных изомерных формах, например в виде структурных изомеров (например, таутомеров). В отношении стереоизомеров соединения могут иметь хиральные центры и могут существовать как рацематы, энантиомерно обогащенные смеси, индивидуальные энантиомеры, смеси диастереомеров или индивидуальные диастереомеры. Все такие изомерные формы включены в область настоящего изобретения, в том числе их смеси. Соединения также могут обладать аксиальной хиральностью, которая может проявляться в атропоизомерах. Кроме того, некоторые из кристаллических форм соединений могут существовать как полиморфы, которые включены в настоящее изобретение. В дополнение, некоторые из соединений также могут образовывать сольваты с водой или другими органическими растворителями. Такие сольваты точно так же включены в область настоящего изобретения.
Описываемые здесь олигомеры могут быть использованы в методах ингибирования продуцирования белка или репликации вируса. Соответственно этому в одном варианте осуществления нуклеиновую кислоту, кодирующую такой белок, подвергают воздействию олигомера, как здесь раскрытого. В дополнительных вариантах осуществления вышеизложенного антисмысловый олигомер включает модифицированную либо 5'-, либо З'-концевую группу или их комбинацию, как раскрыто здесь, и фрагменты В спаренных оснований образуют последовательность, эффективную в гибридизации с участком нуклеиновой кислоты в местоположении, эффективном для ингибирования продуцирования белка. В одном варианте осуществления местоположение представляет собой участок ATG-стартового кодона, сайты сплайсинга пре-мРНК или вирусную целевую последовательность, как описывается ниже.
В одном варианте осуществления олигомер имеет значение Tm в отношении связывания с целевой последовательностью свыше чем около 50°С и поглощается клетками млекопитающих или бактериальными клетками. В еще одном варианте осуществления олигомер может быть конъюгирован с частицей переносчика, например, обогащенным аргинином пептидом, как описано здесь, для облегчения такого поглощения. В еще одном варианте осуществления описываемые здесь модификации концевых участков могут действовать как транспортная частица для облегчения поглощения клеткой млекопитающего и/или бактериальной клеткой.
Получение и свойства морфолиновых олигомеров более подробно описаны ниже, и в патенте США № 5185444, и в патентном документе WO 2009/064471, каждый из которых включен здесь ссылкой во всей своей полноте.
D. Составление и введение олигомеров.
Настоящее изобретение также представляет составление и доставку раскрытых олигомеров. Соответственно этому в одном варианте осуществления настоящее изобретение направлено на композицию, включающую олигомер, как раскрытый здесь, и фармацевтически приемлемый носитель.
Важным аспектом лечения является эффективная доставка антисмыслового олигомера к целевой нуклеиновой кислоте. Пути доставки антисмыслового олигомера включают, но не ограничиваются таковыми, разнообразные системные пути, включающие оральные и парентеральные пути, например внутривенное, подкожное, внутрибрюшинное и внутримышечное введение, а также доставку ингаляцией, чрезкожную и местную доставку. Надлежащие пути могут быть определены квалифицированным специалистом в этой области технологии, как это согласуется с состоянием субъекта при лечении. Например, подходящим путем доставки антисмыслового олигомера при лечении вирусной инфекции кожи является местное введение, тогда как доставка антисмыслового олигомера для лечения вирусной респираторной инфекции выполняется ингаляцией. Олигомер также может быть введен непосредственно в место вирусной инфекции, или же в кровоток.
Антисмысловый олигомер может быть введен с любым удобным наполнителем, который является физиологически и/или фармацевтически приемлемым. Такая композиция может включать любой из многообразных стандартных фармацевтически приемлемых носителей, используемых квалифицированнными специалистами в этой области технологии. Примеры включают, но не ограничиваются таковыми, физиологический раствор, физиологический раствор с фосфатным буфером (PBS), воду, водный этанол,
- 92 035030 эмульсии, такие как масляно-водные эмульсии или триглицеридные эмульсии, таблетки и капсулы. Выбор подходящего физиологически приемлемого носителя будет варьировать в зависимости от выбранного режима введения.
Соединения (например, олигомеры) согласно настоящему изобретению, как правило, могут быть использованы в виде свободной кислоты или свободного основания. В альтернативном варианте соединения согласно настоящему изобретению могут быть применены в форме солей присоединения кислоты или основания. Соли кислот с присоединением к свободным аминосоединениям согласно настоящему изобретению могут быть получены способами, хорошо известными в технологии, и могут быть сформированы из органических и неорганических кислот. Подходящие органические кислоты включают малеиновую, фумаровую, бензойную, аскорбиновую, янтарную, метансульфоновую, уксусную, трифторуксусную, щавелевую, пропионовую, виннокаменную, салициловую, лимонную, глюконовую, молочную, миндальную, коричную, аспарагиновую, стеариновую, пальмитиновую, гликолевую, глутаминовую и бензолсульфоновую кислоты. Пригодные неорганические кислоты включают хлористоводородную, бромистоводородную, серную, фосфорную и азотную кислоты. Соли присоединения оснований включают такие соли, которые образуются с карбоксилатным анионом, и включают соли, образованные с органическими и неорганическими катионами, такими как выбранные из щелочных и щелочно-земельных металлов (например, лития, натрия, калия, магния, бария и кальция), а также иона аммония и его замещенных производных (например, дибензиламмония, бензиламмония, 2-гидроксиэтиламмония и т.п.). Таким образом, термин фармацевтически приемлемая соль структуры (I) предполагается охватывающим любую или все приемлемые солевые формы.
В дополнение в пределы контекста настоящего изобретения также включены пролекарства. Пролекарства представляют собой любые ковалентно связанные носители, которые высвобождают соединение структуры (I) in vivo, когда такое пролекарство вводят пациенту. Пролекарства, как правило, получают модифицированием функциональных групп таким путем, что модификация расщепляется, либо при обычной обработке, или in vivo, приводя к родоначальному соединению. Пролекарства включают, например, соединения согласно настоящему изобретению, в которых гидроксильные, аминные или сульфгидрильные группы связаны с любой группой так, что при введении пациенту связи расщепляются с образованием гидроксильных, аминных или сульфгидрильных групп. Так, показательные примеры пролекарств включают (но не ограничиваются таковыми), ацетатные, формиатные и бензоатные производные спиртовых и аминных функциональных групп соединений структуры (I). Кроме того, в случае карбоновой кислоты (-COOH) могут быть использованы сложные эфиры, такие как метиловые сложные эфиры, этиловые сложные эфиры и т.п.
В некоторых примерах для облегчения поглощения антисмыслового олигонуклеотида клетками могут быть использованы липосомы. (Например, см. работы авторов Williams, S.A., Leukemia, т. 10 (№ 12), стр. 1980-1989, 1996; Lappalainen и др., Antiviral Res., т. 23, стр. 119, 1994; Uhlmann и др., Antisense oligonucleotides: a new therapeutic principle (Антисмысловые олигонуклеотиды: новые терапевтические принципы), Chemical Reviews, т. 90, № 4, стр. 544-584, 1990; Gregoriadis, G., гл. 14, Liposomes, Drug Carriers in Biology and Medicine (Липосомы, носители лекарственных препаратов в биологии и медицине), стр. 287-341, изд-во Academic Press, 1979). Для введения антисмыслового олигомера в качестве носителей также могут быть применены гидрогели, например, как описано в патентном документе WO 93/01286. В альтернативном варианте олигонуклеотиды могут быть введены в микросферах или микрочастицах (например, см. работу авторов Wu, G.Y. и Wu, C.H., J. Biol. Chem., т. 262, стр.4429-4432, 1987). В альтернативном варианте интенсифицировать доставку к целевой ткани может применение газонаполненных микропузырьков в сочетании с антисмысловыми олигомерами, как описано в патенте США № 6245747. Также могут быть применены композиции с пролонгированным высвобождением. Они могут включать полупроницаемые полимерные матрицы в форме формованных изделий, таких как пленки или микрокапсулы.
В одном варианте осуществления антисмысловое ингибирование является эффективным в лечении вирусной инфекции животного-хозяина путем контактирования инфицированной вирусом клетки с антисмысловым агентом, эффективным в подавлении репликации конкретного вируса. Антисмысловый агент вводят млекопитающему субъекту, например человеку или домашнему животному, инфицированному данным вирусом, в подходящем фармацевтическом носителе. Как ожидается, антисмысловый олигонуклеотид подавляет рост РНК-вируса в хозяине. Может быть сокращена численность РНК-вируса, или он может быть устранен с малым влиянием или без вредного воздействия на нормальный рост и развитие хозяина.
В одном аспекте способа субъект представляет собой человеческий субъект, например, пациент, диагностированный как имеющий локализованную или системную вирусную инфекцию. Состояние пациента также может потребовать профилактического введения антисмыслового олигомера согласно изобретению, например, в случае пациента, который (1) имеет ослабленный иммунитет; (2) является жертвой пожара; (3) имеет постоянный катетер или (4) подлежит хирургическому вмешательству или недавно был прооперирован. В одном предпочтительном варианте осуществления олигомер представляет собой фосфордиамидатный морфолиновый олигомер, содержащийся в фармацевтически приемлемом носителе,
- 93 035030 и его вводят орально. В еще одном предпочтительном варианте осуществления олигомер представляет собой фосфордиамидатный морфолиновый олигомер, содержащийся в фармацевтически приемлемом носителе, и его вводят внутривенно (i.v.).
В еще одном варианте применения способа субъект представляет собой домашний скот, например курицу, индейку, свинью, корову или козу и т.д., и лечение является либо профилактическим, либо терапевтическим. Изобретение также включает пищевую композицию для домашнего скота и птицы, содержащую продовольственное зерно, дополненное субтерапевтическим количеством противовирусного антисмыслового соединения описанного выше типа. В способе кормления домашнего скота и птицы продовольственным зерном, дополненным субтерапевтическими уровнями противовирусного препарата, также предполагается усовершенствование, в котором продовольственное зерно дополняют субтерапевтическим количеством противовирусной олигонуклеотидной композиции, как описанной выше.
В одном варианте осуществления антисмысловое соединение вводят в количестве и путем, эффективными для достижения максимальной концентрации в крови по меньшей мере 200-400 нМ антисмыслового олигомера. Как правило, вводят одну или более доз антисмыслового олигомера, обычно с регулярными интервалами, в течение периода времени от около одной до двух недель. Предпочтительные дозы для орального введения составляют от около 1-1000 мг олигомера на 70 кг. В некоторых случаях могут быть необходимыми дозы свыше 1000 мг олигомера на пациента. Для внутривенного (i.v.) введения предпочтительные дозы составляют от около 0,5 до 1000 мг олигомера на 70 кг. Антисмысловый олигомер может быть введен с регулярными интервалами в течение короткого периода времени, например ежедневно до двух недель или менее. Однако в некоторых случаях олигомер вводят с перерывами на протяжении более длительного периода времени. После введения может следовать или быть одновременным введение антибиотика или другое терапевтическое лечение. Режимы лечения могут быть скорректированы (по дозе, частоте, пути и т.д.) по показаниям на основе результатов иммунологического анализа, других биохимических тестов и физиологического обследования субъекта в ходе лечения.
Эффективные in vivo режимы лечения с использованием антисмысловых олигонуклеотидов согласно изобретению могут варьировать сообразно длительности, дозе, частоте и пути введения, а также состоянию субъекта при лечении (т.е. профилактическое лечение против введения в ответ на локализованную или системную инфекцию). Соответственно этому такая in vivo терапия часто будет требовать мониторинга с помощью тестов, подходящих для конкретного типа вирусной инфекции при лечении, и соответственных корректировок дозы или режима лечения для достижения оптимального терапевтического результата. Лечение может отслеживаться, например, по общим показателям болезни и/или инфекции, таким как клинический анализ крови (СВС), методы детектирования нуклеиновых кислот, иммунодиагностические тесты, культивирование вируса или детектирование гетеродуплекса.
Эффективность вводимого in vivo противовирусного антисмыслового олигомера согласно изобретению в подавлении или устранении роста одного или более типов РНК-вируса может быть определена по биологическим образцам (тканей, крови, мочи и т.д.), отобранным у субъекта до, во время и после введения антисмыслового олигомера. Анализы таких образцов включают: (1) мониторинг наличия или отсутствия формирования гетеродуплекса с мишенью и нецелевыми последовательностями, с использованием методик, известных квалифицированным специалистами в этой области технологии, например анализом электрофоретической подвижности в геле; (2) мониторинг количества продуцирования вирусного белка, как определяется стандартными способами, такими как ELISA (иммуноферментный анализ) или вестерн-блоттинг, или (3) измерение действия на титр вируса, например, методом Спирмана-Карбера (например, см. работы авторов Pari, G.S., и др., Antimicrob. Agents and Chemotherapy, т. 39 (№ 5), стр. 1157-1161, 1995; Anderson, Н.Р., и др., Antimicrob. Agents and Chemotherapy, т. 40 (№ 9), стр. 2004-2011, 1996, Cottral, G.E. (редактор), в Manual of Standard Methods for Veterinary Microbiology (Руководство по стандартным методам ветеринарной микробиологии), стр. 60-93, 1978).
В некоторых вариантах осуществления олигомер активно поглощается клетками млекопитащих. В дополнительных вариантах осуществления олигомер может быть конъюгирован с частицей переносчика (например, переносчика пептидов), как здесь описано, для облегчения такого поглощения.
Е. Получение олигомеров.
Морфолиновые субъединицы, модифицированные межсубъединичные связи и олигомеры, включающие их, могут быть получены, как описано в примерах и в патентах США №№ 5185444 и 7943762, которые включены здесь ссылкой во всей своей полноте. Морфолиновые субъединицы могут быть получены согласно следующей общей реакционной схеме I.
- 94 035030
Реакционная схема I
Получение морфолиновых субъединиц в В о I 1. NalO4, МеоН (водный) но
N 2. (ΝΗ4)2Β4Ο7I \____/ 3. Боран-триэтиламин / \ 4. Раствор кислоты/ у
1_Ю q|_] (napa-TsOH или HCI) в метаноле |_||_|
2
С привлечением реакционной схемы I, в которой В представляет фрагмент спаренного основания и PG представляет защитную группу, морфолиновые субъединицы могут быть получены из соответствующего рибонуклеозида (1), как показано. Морфолиновая субъединица (2) необязательно может быть защищена реакцией с подходящим прекурсором защитной группы, например тритилхлоридом. 3'Защитная группа обычно удаляется во время твердотельного синтеза олигомера, как более подробно описано ниже. Фрагмент спаренного основания может быть надлежащим образом защищен для твердофазного синтеза олигомера. Подходящие защитные группы включают бензоил для аденина и цитозина, фенилацетил для гуанина и пивалоилоксиметил для гипоксантина (1). Пивалоилоксиметильная группа может быть введена в Ы1-положение гипоксантинового гетероциклического основания. Хотя может быть использована незащищенная гипоксантиновая субъединица, выходы в реакциях активации являются гораздо более высокими, когда основание защищено. Другие пригодные защитные группы включают такие, которые описаны в одновременно находящейся на рассмотрении патентной заявке США № 12/271040, которая включена здесь ссылкой во всей своей полноте.
Реакция продукта (3) с активированным фосфористым соединением (4) приводит к морфолиновым субъединицам, имеющим желательный фрагмент (5) связи. Соединения структуры (4) могут быть получены с использованием любого числа способов, известных квалифицированным специалистам в этой области технологии. Например, такие соединения могут быть получены реакцией соответствующего амина и хлорокиси фосфора. В этом отношении амин в качестве исходного материала может быть получен с использованием любого способа, известного в технологии, например способов, описанных в примерах и в патенте США № 7943762.
Соединения структуры (5) могут быть использованы в твердофазном автоматизированном синтезе олигомеров для получения олигомеров, включающих межсубъединичные связи. Такие способы хорошо известны в технологии. Вкратце, соединение структуры (5) может быть модифицировано по 5'-концу формированием линкера с твердым носителем. Например, соединение (5) может быть связано с твердым носителем линкером, включающим L11 и L15. Примерный способ продемонстрирован на фиг. 1 и 2. После иммобилизации на носителе удаляют защитные группы (например, тритил) и свободный амин вводят в реакцию с активированным фосфористым производным второго соединения структуры (5). Эту последовательность продолжают до достижения желательной длины полученного олигомера. Защитные группы на 5'-конце могут быть либо удалены, либо оставлены, если желательно 5'-модифицирование. Олигомер может быть удален с твердого носителя с использованием любого числа способов, например обработкой DTT (дитиотретол) с последующим действием гидроксида аммония, как изображено на фиг. 3.
Получение модифицированных морфолиновых субъединиц и морфолиновых олигомеров более подробно описано в примерах. Морфолиновые олигомеры, содержащие любое число модифицированных связей, могут быть получены с использованием описываемых здесь способов, известных в технологии способов и/или описанных в приведенных здесь литературных ссылках. В примерах также описаны глобальные модификации морфолиновых олигомеров, полученных, как было описано ранее (например, см. PCT публикацию WO 2008036127).
Термин защитная группа имеет отношение к химическим фрагментам, которые блокируют некоторые или все реакционноспособные группы соединения и предохраняют такие группы от участия в химических реакциях до тех пор, пока не будет удалена защитная группа, например, эти группы перечислены и описаны в книге авторов T.W. Greene, P.G.M. Wuts, Protective Groups in Organic Synthesis (Защитные группы в органическом синтезе), 3-е изд., редактированное, издательство John Wiley & Sons (1999). Это может быть полезным, где применяются различные защитные группы, причем каждая (иная) защитная группа может быть удалена особым способом. Защитные группы, которые отщепляются в ус
- 95 035030 ловиях совершенно различных реакций, позволяют дифференцированно удалять такие защитные группы. Например, защитные группы могут быть удалены кислотой, основанием и гидрогенолизом. Такие группы, как тритильная, диметокситритильная, ацетальная и трет-бутилдиметилсилильная, нестабильны в кислотных условиях и могут быть применены для защиты карбоксильных и гидроксильных реакционноспособных фрагментов в присутствии аминогрупп, защищенных Cbz-группами (бензилоксикарбонильными), которые могут быть удалены гидрогенолизом, и Fmoc-группами (флуоренилметоксикарбонильными), которые неустойчивы при действии оснований. Фрагменты карбоновых кислот могут быть защищены основнолабильными группами, такими, без ограничений, как метильная, или этильная, и гидроксильные реакционноспособные группы могут быть блокированы такими основнолабильными группами, как ацетил, в присутствии аминов, блокированных кислотнолабильными группами, такими как третбутилкарбаматная, или карбаматами, которые устойчивы к действию как кислоты, так и основания, но удаляются гидролитически.
Реакционноспособные остатки карбоновых кислот и гидроксильные группы также могут быть блокированы гидролитически удаляемыми защитными группами, такими как бензильная группа, тогда как аминогруппы могут быть защищены основнолабильными группами, такими как Fmoc. В особенности полезной группой для защиты аминов в синтезе соединений формулы (I) является трифторацетамидная. Реакционноспособные остатки карбоновых кислот могут быть блокированы удаляемыми в условиях окисления защитными группами, такими как 2,4-диметоксибензильная, тогда как одновременно присутствующие аминогруппы может быть защищены силилкарбаматами, неустойчивыми к действию фторидов.
Аллильные блокирующие группы полезны в присутствии защитных от кислот и оснований групп, поскольку первые устойчивы и могут быть впоследствии удалены металлическим или pi-кислотным катализаторами. Например, аллильная защита может быть удалена с карбоновой кислоты реакцией с палладиевым(0) катализатором в присутствии кислотнолабильных трет-бутилкарбаматных или основнолабильных ацетатных групп на аминах. Еще одной формой защитной группы является смола, к которой могут быть присоединены соединение или интермедиат. Как только остаток присоединяют к смоле, эта функциональная группа блокируется и не может реагировать. Будучи отделенной от смолы, функцио нальная группа становится доступной для взаимодействия.
Типичные блокирующие/защитные группы известны в технологии и включают, но без ограничения, нижеследующие фрагменты:
F. Антисмысловая активность олигомеров РНКи.
РНК-интерференция (РНКи, RNAi) представляет собой метод модуляции экспрессии генов. РНКи представляет собой протекающий в природе процесс. РНКи также может быть индуцирована подведением экзогенных РНК-последовательностей.
Естественным образом происходящая РНКи инициируется распознаванием двухцепочных РНКпоследовательностей (dsRNA) ферментом RNase III (например, рибонуклеазой Dicer), с последующим расщеплением dsRNA на короткие фрагменты по ~20 нуклеотидов, называемые малыми интерферирующими РНК (siRNA). Dicer представляет собой фермент RNase III с АТРазой/РНК-геликазой, доменом DUF283 (домен с неизвестной функцией), доменом PAZ (Piwi, Argonaut и Zwille), который может связывать характеристические двухосновные выступающие 3'-концы микроРНК (miRNA) и siRNA, два каталитических домена RNase III (RHIa и RHIb) и С-концевой домен связывания двухцепочечной РНК (dsRBD). После расщепления каждая молекула siRNA разматывается на две одноцепочечных РНКпоследовательности (ssRNA). Одна цепь, пассажир, подвергается деградации. Другая цепь, ведущая, внедряется в РНК-индуцированный комплекс сайленсинга (RISC). RISC представляет собой рибонуклеопротеиновый комплекс, содержащий члены семейства белков Argonaute (Ago). Белки Argonaute имеют эндонуклеазную активность. РНКи происходит, когда основание ведущей цепи связывается с комплементарной РНК-последовательностью (например, мРНК или пре-мРНК). Связывание ведущей последо- 96 035030 вательности вызывает расщепление ведущей последовательности и комплементарной последовательности действием Argonaute.
РНКи может быть также инициирована введением экзогенных РНК-последовательностей, например последовательностей siRNA, последовательностей miRNA и антисмысловых олигонуклеотидов. Антисмысловые олигонуклеотиды (AON, AOH) представляют собой одноцепочечные олигонуклеотиды, которые комплементарны целевой последовательности пре-мРНК или мРНК. При контакте с комплементарной последовательностью АОН будут связываться с комплементарной последовательностью путем спаривания оснований по Уотсону-Крику. В определенных ситуациях экзогенные АОН поступают в клетку. АОН связываются с комплементарной РНК-последовательностью (например, пре-мРНК или мРНК), и связывание молекулы антисмысловой последовательности индуцирует расщепление комплементарной РНК-последовательности (например, с помощью RNase-H).
В альтернативном варианте АОН могут быть спроектированы так, чтобы их связывание не индуцировало расщепления комплементарной цепи РНК, но вместо этого прерывало бы процессинг пре-мРНК (например, сплайсинг, кэпирование, полиаденилирование) или изменяло или предотвращало трансляцию последовательностей пре-мРНК (например, стерическим препятствованием связыванию одного или более ферментов). Например, генерирование АОН в виде морфолино приводит к AOH, который не поддерживает обусловленное RNase-H как посредника расщепления комплементарной цепи. Вместо этого связывание морфолино-АОН с целевой пре-мРНК-последовательностью приводит к стабильному комплексу, который может (a) нарушать способность сплайсосомы сплайсировать пре-мРНК (например, блокированием акцепторного сайта сплайсинга или донорного сайта сплайсинга), (b) нарушать кэпирование пре-мРНК или (c) нарушать полиаденилирование пре-мРНК (например, блокированием сайта связывания для факторов CPSF, CstF или CFI).
Настоящее изобретение представляет способ ингибирования или изменения экспрессии целевой последовательности нуклеиновой кислоты, причем способ включает стадию, в которой подвергают нуклеиновую кислоту, кодирующую белок, воздействию олигомера, как здесь описываемого. Соответственно этому в одном варианте осуществления целевую последовательность нуклеиновой кислоты подвергают воздействию антисмыслового олигомера, как здесь описываемого, или в других вариантах осуществления от 10 до 50% таких модифицированных связей, как здесь раскрытых, где фрагменты Pi спаренных оснований формируют последовательность, эффективную для гибридизации с участком целевой последовательности нуклеиновой кислоты в местоположении, эффективном для ингибирования или изменения экспрессии целевой последовательности нуклеиновой кислоты. Олигомер может быть нацелен, например, на участок ATG-стартового кодона мРНК, сайт сплайсинга пре-мРНК или целевую последовательность вируса, как описано ниже. В еще одном варианте осуществления способ включает стадию, в которой целевую последовательность нуклеиновой кислоты подвергают воздействию антисмыслового олигомера, включающего по меньшей мере одну концевую модификацию. В еще одном варианте осуществления способ включает стадию, в которой целевую последовательность нуклеиновой кислоты подвергают воздействию антисмыслового олигомера, включающего частицу переносчика пептидов.
В еще одном варианте осуществления изобретение представляет способ усиления антисмысловой активности олигомера, имеющего последовательность морфолиновых субъединиц, соединенных межсубъединичными связями, несущего фрагменты спаренных оснований, причем способ включает стадию, в которой олигомер, как здесь описываемый, модифицируют так, чтобы он содержал по меньшей мере одну из модифицированных концевых групп, по меньшей мере одну межсубъединичную связь, в которой X не равно X1, или их комбинации.
В некоторых вариантах осуществления усиление антисмысловой активности может быть подтверждено (i) снижением экспрессии целевой последовательности нуклеиновой кислоты сравнительно с тем, что обеспечивает соответствующий немодифицированный олигомер, или (ii) повышением экспрессии целевой последовательности нуклеиновой кислоты сравнительно с тем, что обеспечивает соответствующий немодифицированный олигомер. Аналитические методы, пригодные для измерения этих эффектов, дополнительно описаны ниже. В одном варианте осуществления модификация обеспечивает такую активность в анализе бесклеточной трансляции, анализе трансляции коррекции сплайсинга в клеточной культуре или коррекцию доминантно-негативных мутаций сплайсинга в животной модельной системе, как здесь описано. В одном варианте осуществления активность усиливается по меньшей мере вдвое, по меньшей мере в пять раз или по меньшей мере в десять раз.
Нижеописанное представляет разнообразные примерные варианты применения олигомеров согласно изобретению, включающие противомикробные (например, противовирусные и антибактериальные) варианты применения, лечение путем изменения экспрессии генов, лечение рака и лечение воспалительных процессов, заболеваний сердечно-сосудистой системы и метаболических заболеваний. Настоящее описание никоим образом не означает ограничения изобретения, но служит для иллюстрирования диапазона заболеваний и расстройств, которые могут быть устранены с использованием олигомеров, включающих описываемые здесь модифицированные межсубъединичные связи.
Антисмысловые олигонуклеотиды были применены в качестве противомикробных лекарственных
- 97 035030 препаратов (например, противовирусных и антибактериальных). В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I), как раскрытое здесь, используют в качестве противовирусного средства. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I), как раскрытое здесь, применяют для ингибирования экспрессии кодируемых вирусом белков. В некоторых вариантах осуществления ингибирование экспрессии кодируемых вирусом белков излечивает вирусную инфекцию. В некоторых вариантах осуществления олигомеры могут быть использованы в методах ингибирования в клетках млекопитающего-хозяина репликации РНК заражающего вируса, имеющего одноцепочечный положительносмысловый геном. Способ включает стадию, в которой в зараженные клетки хозяина вводят подавляющее вирус количество олигомера, как здесь описываемого, имеющего нацеленную последовательность по меньшей мере из 12 субъединиц, которая комплементарна целевой последовательности нуклеиновой кислоты вируса. Соединение может быть введено млекопитающему субъекту, зараженному вирусом, или при риске заражения вирусом. В некоторых вариантах осуществления целевая последовательность кодирует полипротеин, содержащий неструктурные белки, такие как полимеразы, геликазы и протеазы. В некоторых вариантах осуществления целевые сайты включают мишени, которые сохраняются среди разнообразных изолятов вирусов. Другие предпочтительные сайты включают IRES (внутренний сайт связывания рибосомы), сайты связывания белка трансактивации и сайты инициации репликации.
В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I), как раскрытое здесь, используют в качестве антибактериального средства. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I), как раскрытое здесь, ингибирует экспрессию бактериального фактора вирулентности (например, токсина или белка, который ингибирует иммунный отклик хозяина). В некоторых вариантах осуществления ингибирование экспрессии бактериального фактора вирулентности излечивает бактериальную инфекцию.
В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I), как раскрытое здесь, применяют для лечения заболевания или расстройства (например, рака, воспаления, метаболического, неврологического, сердечно-сосудистого заболевания) путем изменения экспрессии гена. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I), как раскрытое здесь, применяют для лечения заболевания или расстройства, характеризуемого нежелательной или чрезмерной экспрессией гена. Например, заболевания, характеризуемые нежелательной или чрезмерной экспрессией гена, могут быть излечены с использованием соединения формулы (I), как раскрытого здесь, для ингибирования экспрессии VEGF (эндотелиальный фактор роста сосудов) или любого другого гена, вовлеченного в ангиогенез. В некоторых вариантах осуществления расстройства, характеризуемые продуктами мутантного (например, нефункционального) гена, устраняются соединением формулы (I), как раскрытым здесь. Например, мышечная дистрофия Дюшенна (DMD) характеризуется соматическими мутациями, которые ведут к усеченному или нефункциональному дистрофину. Антисмысловые олигонуклеотиды были использованы для изменения сплайсинга пре-мРНК мутантного дистрофина таким образом, чтобы продуцировался усеченный, но функциональный белок дистрофии.
В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I), как раскрытое здесь, применяют для лечения рака. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I), как раскрытое здесь, используют для снижения экспрессии гена, который ингибирует апоптоз, ингибирует неспецифическую адгезию клеток, промотирует ангиогенез, промотирует пролиферацию клеток, промотирует рост клеток или участвует в восстановлении ДНК. Например, некоторые виды рака связаны со сверхэкспрессией антиапоптозных генов. Ингибирование экспрессии этих генов применением соединения формулы (I), как раскрытым здесь, может иметь результатом усиление апоптоза раковых клеток или повышение чувствительности к химиотерапевтическим препаратам.
В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I), как раскрытое здесь, используют для лечения воспалительного расстройства. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I), как раскрытое здесь, применяют для снижения экспрессии цитокинов или клеточных поверхностных молекул, вовлеченных в хемотаксис. Например, аутоиммунные расстройства связаны с нежелательной или чрезмерной миграцией иммунных клеток. Ингибирование экспрессии цитокинов или клеточных поверхностных молекул, связанных с хемотаксисом, может приводить к сокращению миграции иммунных клеток и воспаления.
В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I), как раскрытое здесь, применяют для лечения сердечно-сосудистого расстройства. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I), как раскрытое здесь, используют для ингибирования экспрессии липопротеинов, или ингибирования экспрессии белков или ферментов, которые снижают уровень кардиопротективных молекул (например, HDL (липопротеинов высокой плотности)).
В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I), как раскрытое здесь, применяют для лечения метаболического нарушения. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I), как раскрытое здесь, используют для ингибирования экспрессии генных продуктов, которые ведут к пониженной чувствительности к инсулину или к сниженной интенсивности обмена веществ.
В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I), как раскрытое здесь, применяют для лечения неврологического расстройства. В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I), как раскрытое здесь, используют для ингибирования экспрессии генных продуктов, которые ведут
- 98 035030 к пониженной скорости передачи нервного импульса (например, генные продукты, которые снижают миелин).
В некоторых вариантах осуществления соединение формулы (I), как раскрытое здесь, применяют для модуляции экспрессии ядерных гормональных рецепторов (NHR) из суперсемейства ядерных гормональных рецепторов (NHRSF). Примеры конкретных NHR включают глюкокортикоидный рецептор (GR), рецептор прогестерона (PR) и андрогеновый рецептор (AR). В определенных вариантах осуществления антисмысловые олигонуклеотиды и описываемые здесь агенты ведут к повышенной экспрессии лиганд-независимых или прочих выбранных форм рецепторов, и сниженной экспрессии их инактивных форм.
NHR-модуляторы могут быть полезными при лечении связанных с ядерными гормональными рецепторами (NHR) заболеваний, включающих заболевания, обусловленные экспрессией генных продуктов, транскрипция которых стимулируется или подавляется NHR. Соединения, которые противодействуют трансактивации, могут быть полезными в лечении метаболических заболеваний, связанных с повышенными уровнями глюкокортикоида, таких как диабет, остеопороз и глаукома, помимо прочих. Кроме того, соединения, которые затрудняют трансактивацию, могут быть полезными в лечении метаболических заболеваний, связанных с недостатком ядерных гормональных рецепторов.
Модификации.
Функционирование антисмысловых олигонуклеотидов зависит как от последовательности AOH, так и от химической структуры AOH. Разнообразные модификации могут быть выполнены введением фрагментов в нуклеотиды или замещением их участков, не вовлеченных в связывание спариванием оснований по Уотсону-Крику. Модификации химической структуры могут влиять на аффинность, стабильность, растворимость, токсичность и устойчивость AOH.
Различные модификации могут повышать аффинность AOH к комплементарной последовательности. Они также могут снижать аффинность к некомплементарным последовательностям. Изменения заряда или хиральности скелета также могут влиять на аффинность.
Модификации могут повышать резистентность к нежелательной деградации нуклеазами. Модификации также могут повышать или снижать аффинность AOH к RNase H. Например, морфолиновые олигонуклеотиды и пептидо-нуклеиновые кислоты (PNA) не активируют RNase H.
Модификации могут быть рассчитаны так, что они увеличивают размер AOH до такой степени, что с трудом фильтруется клубочками. Например, соединение AOH с полиэтиленгликолем (PEGилирование) увеличивает размер AOH так, что сокращается ренальная фильтрация. Модификации могут повышать способность AOH к связыванию с белками плазмы in vivo так, что они не быстро фильтруются из крови.
Токсичность AOH также может обусловливаться модификациями химической структуры AOH. Когда это желательно, токсичность может быть повышена определенными модификациями (например, с использованием AOH в качестве противомикробного средства). В альтернативном варианте токсичность может быть снижена путем определенных модификаций. Фосфордитиоатные аналоги имеют повышенную токсичность по сравнению с другими аналогами.
Кроме того, модификации химической структуры AOH могут иметь результатом AOH, направленные на конкретные ткани, органы или клетки. AOH может быть направлен на конкретную ткань модификацией AOH таким образом, что он распознает тканеспецифические белки, экспрессированные клетками целевой ткани. Конъюгация лиганда может направлять AOH на конкретную клетку. Например, AOH может быть конъюгирован с лигандом, который распознает специфический рецептор и связывается с ним, находящийся только в определенных клетках (например, гепатоцитах). Конъюгат АОН/лиганд связывается и рецептором и проникает в клетку путем рецептор-опосредованного эндоцитоза. Конъюгированный с AOH холестерин может нацеливать AOH на печень. Кроме того, модификации, которые промотируют клеточно/тканеспецифическое поглощение, включают конъюгацию полимеров, меченых углеводами или пептидами наночастиц, или липосом, способных распознавать клеточноспецифические белки.
Модификации химической структуры также могут повышать способность AOH проникать в клетку. В определенных ситуациях конъюгированные с AOH липиды могут увеличивать внутриклеточное поглощение. Дополнительные конъюгаты могут включать белки-переносчики сигнала и сигналы ядерной локализации.
Дополнительно AOH могут быть модифицированы для нагружения. С AOH могут быть конъюгированы терапевтические или профилактические средства. Например, AOH, нацеленный на раковую клетку, может дополнительно включать известный терапевтический препарат, или AOH, нацеленный на бактериальную клетку, может быть конъюгирован с антибактериальным средством. Также с AOH могут быть конъюгированы метки, например, так, что может отслеживаться правильное таргетирование, или же может проводиться мониторинг лечения. AOH могут быть конъюгированы с радиоактивными метками, контрастными агентами (например, гадолинием), или флюорофорами.
Модификации химической структуры AOH также могут влиять на способ введения AOH. Модификации могут промотировать чрескожное или трансмукозальное проникновение таким образом, что AOH может быть введен локально (например, в виде назального аэрозоля, ушных капель, глазных капель,
- 99 035030 орального спрея). Как обсуждалось выше, модификации могут повышать устойчивость к ренальной фильтрации так, что AOH может быть введен парентерально. Модификации могут приводить к AOH, которые могут быть введены орально, при повышении устойчивости AOH к разложению в кислотной среде желудка или основной среде кишечника.
В определенных примерах варьирование модификаций индивидуальных нуклеотидов может приводить к усилению желательных свойств или к сокращению нежелательных свойств.
Примеры
I. Химический синтез.
Если не оговорено нечто иное, все химические реагенты были приобретены в фирмах SigmaAldrich-Fluka. Бензоиладенозин, бензоилцитидин и фенилацетилгуанозин были получены от фирмы Carbosynth Limited, Великобритания.
Синтезы дополнительных модификаций связей, содержащих РМО, РМО+, РРМО и РМО, как здесь описаны, были выполнены с использованием известных в технологии способов, и описаны в находящихся на рассмотрении патентных заявках США №№ 12/271036 и 12/271040, и в PCT публикации номер WO 2009/064471, которые включены здесь ссылкой во всей своей полноте.
РМО с 3'-тритильной модификацией синтезированы по существу так, как описано в PCT публикации номер WO 2009/064471, с тем исключением, что стадия детритилирования опущена.
Методика А получения активированных субъединиц.
К перемешиваемому раствору соединения (6) (1 экв.) в дихлорметане добавили POCl3 (1,1 экв.), затем добавили диизопропилэтиламин (3 экв.) при температуре 0°С, при охлаждении в ледяной бане. Через 15 мин ледяную баню убрали и раствор оставили нагреваться до комнатной температуры в течение 1 ч. По завершении взаимодействия реакционный раствор разбавили дихлорметаном, трижды промыли 10%ным водным раствором лимонной кислоты. После высушивания над MgSO4 органический слой пропустили через слой силикагеля и сконцентрировали в вакууме. Полученный фосфорамиддихлорид (4) использовали непосредственно для следующей стадии без дополнительной очистки.
К раствору фосфорамиддихлорида (4) (1 экв.), 2,6-лутидина (1 экв.) в дихлорметане добавили раствор Mo(Tr)T (7) (0,5 экв.) в дихлорметане с последующим добавлением N-метилимидазола (0,2 экв.). Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение ночи. По завершении взаимодействия реакционный раствор разбавили дихлорметаном и трижды промыли 10%-ным водным раствором лимонной кислоты. После высушивания над MgSO4 органический слой отфильтровали, затем упарили. Продукт (8) очистили хроматографией на силикагеле (вымывание с градиентом этилацетат/гексаны) и затем хранили при температуре -20°С. Структура была подтверждена LCMS-анализом (жидкостная хроматография - масс-спектрометрия).
Методика В получения активированных субъединиц.
9 8
К раствору POCl3 (1,1 экв.) в дихлорметане добавили 2,6-лутидин (2 экв.), затем по каплям добавили раствор Mo(Tr)T (7) (1 экв.) в дихлорметане при температуре 0°С. Спустя 1 ч реакционный раствор разбавили дихлорметаном и быстро трижды промыли 10%-ным водным раствором лимонной кислоты. Целевой фосфодихлоридат (9) получили после высушивания над MgSO4 и испарения растворителя.
К раствору фосфодихлоридата (9) в дихлорметане по каплям добавили раствор соединения (6) (1 экв.) в дихлорметане при температуре раствора 0°С. Через 15 мин реакционную смесь оставили нагреваться до комнатной температуры в течение около 1 ч. По завершении реакции продукт (8) в виде белого твердого вещества собрали осаждением с добавлением гексанов с последующим фильтрованием. После высушивания в вакууме продукт хранили при температуре -20°С. Структура была подтверждена LCMSанализом.
- 100 035030
Пример 1. ((2Б,6К)-6-(5-метил-2,4-диоксо-3,4-дигидр0пиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метилфосфородихлоридат
CI
К охлаждаемому (в водяной бане со льдом) дихлорметановому (DCM, ДХМ) раствору (20 мл) оксихлорида фосфора (2,12 мл, 22,7 ммоль) добавили по каплям 2,6-лутидин (4,82 мл, 41,4 ммоль), затем ДХМ-раствор (20 мл) Mo(Tr)T (2) (10,0 г, 20,7 ммоль) добавляли по каплям в течение 15 мин (внутренняя температура 0-10°С), затем баню убрали и перемешивание продолжали при температуре окружающей среды в течение 20 мин. Реакционную смесь промыли раствором лимонной кислоты (трижды по 40 мл, 10%-ный (вес./об.) водный раствор), профильтровали и упарили с образованием белой пены (9,79 г), затем использовали непосредственно для следующей процедуры.
Пример 2. (6-(5-Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2-ил)метил (4-диметиламино)пиперидин-1 -ил)фосфонохлоридат
К охлаждаемому (в водяной бане со льдом) ДХМ-раствору (5 мл) дихлорфосфата из примера 1 (5,00 г, 5,00 ммоль) добавили по каплям DCM-раствор (5 мл) пиперидина (0,61 г, 4,76 ммоль), затем баню убрали и перемешивание продолжали при температуре окружающей среды в течение 30 мин. Реакционную смесь непосредственно перенесли в колонку. Хроматографическая очистка [колонка с SiO2 (40 г), элюент ДХМ/EtOH (градиент от 1:0 до 1:1)] привела к указанному в заголовке соединению (2,5 г) в виде белой пены. ESI/MS (масс-спектрометрия с электроспрей-ионизацией): рассчитано для 1-(4-нитрофенил)пиперазинового производного C46H55N8O7P 862,4, найдено m/z=863,6 (M+1).
Пример 3. Хлорид 1-(1-(хлор-((6-(5-метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4тритилморфолин-2-ил)метокси)фосфорил)пиперидин-4-ил)-1 -метилпирролидиния-1
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в примере 2, для получения указанного в заголовке соединения (0,6 г) в виде белого твердого продукта. ESI/MS: рассчитано для 1-(4-нитрофенил)пиперазинового производного C49H60N8O7P 903,4, найдено m/z=903,7 (M+).
Пример 4. ((2S,6R)-6-(5-метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-(4-метилпиперазин4-ил)фосфонохлоридат
Trt
К охлаждаемому (в водяной бане со льдом) ДХМ-раствору (10 мл) оксихлорида фосфора (1,02 мл, 11,0 ммоль) добавили по каплям 2,6-лутидин (3,49 мл, 29,9 ммоль), затем добавили по каплям ДХМраствор (10 мл) метилпиперазина (1,00 г, 10,0 ммоль) и перемешивание продолжали в течение 1 ч. Добавили ДХМ-раствор (10 мл) Mo(Tr)T (2) (4,82, 10,0 ммоль) и NMI (N-метилимидазол) (79 мкл, 1,0 ммоль) и перемешивали в течение 4 ч, затем непосредственно перенесли в колонку. Хроматографическая очистка [колонка с SiO2 (80 г), элюент ДХМ/ацетон с 2% TEA (триэтаноламин) (градиент от 1:0 до 0:1)] привела к указанному в заголовке соединению (0,8 г) в виде белой пены. ESI/MS: рассчитано для 1-(4- 101 035030 нитрофенил)пиперазинового производного C.|3I I.|8N7O8P 834,4, найдено m/z=835,5 (M+1).
Пример 5. ((28,6К)-6-(5-метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метилморфолинофосфонохлоридат
К охлаждаемому (в водяной бане со льдом) раствору (10 мл) оксихлорида фосфора (19,1 мл, 205 ммоль) в ДХМ (410 мл) добавили по каплям 2,6-лутидин (54,2 мл, 465 ммоль), затем порциями Mo(Tr)T (2) (90,0 г, 186 ммоль) в течение 15 мин (внутренняя температура 0-10°С) и перемешивали. Через 5 мин добавили по каплям ДХМ-раствор (205 мл) морфолина (17,9 мл, 205 ммоль) в течение 15 мин (внутренняя температура 0-8°С) и перемешивали. Спустя 15 мин добавили дополнительный ДХМ-раствор (10 мл) морфолина (0,500 мл), перемешивали в течение 5 мин, затем промыли раствором лимонной кислоты (трижды по 3000 мл, 10%-ный (вес./об.) водный раствор), высушили (MgSO4), профильтровали и упарили с образованием вязкого масла, которые непосредственно перенесли в колонку. Хроматографическая очистка [колонка с SiO2 (330 г), элюент гексаны/EtOAc (градиент от 1:0 до 0:1)] привела к указанному в заголовке соединению (78,5 г, выход 65%) в виде белой пены. ESI/MS: рассчитано для 1-(4-нитрофенил) пиперазинового производного C43H48N7O8P 821,3, найдено m/z=844,4 (M+Na).
Пример 6. (9-((2К^)-6-(((хлор(морфолино)фосфорил)окси)метил)-4-тритилморфолин-2-ил)-6оксо-6,9-дигидро-1Н-пурин-1-ил)метилпивалат
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в примере 5, для получения указанного в заголовке соединения (6,35 г, выход 79%) в виде белой пены. ESI/MS: рассчитано для 1-(4-нитрофенил)пиперазинового производного C49H56N9O9P 945,4, найдено m/z=1891,9 (2M+1).
Пример 7. (^,6Я)-6-(5-метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-(4-этилпиперазин-1 -ил)фосфонохлоридат
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в примере 5, для получения указанного в заголовке соединения (11,5 г) в виде белой пены. ESI/MS: рассчитано для 1(4-нитрофенил)пиперазинового производного C45H53N8O7P 848,4, найдено m/z=849,7 (М+1).
Пример 8. ((2S,6R)-6-(6-бензамидо-9Н-пурин-9-ил)-4-тритилморфолин-2-ил)метил-(4-этилпиперазин-1-ил)фосфонохлоридат
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в примере 5, для получения указанного в заголовке соединения (4,5 г) в виде белой пены. ESI/MS: рассчитано для 1(4-нитрофенил)пиперазинового производного C52H56N11O6P 961,4, найдено m/z=962,8 (M+1).
Пример 9. ((2S,6R)-6-(5-метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-(4-изопропилпиперазин-1-ил)фосфонохлоридат
- 102 035030
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в примере 5, для получения указанного в заголовке соединения (3,5 г) в виде белой пены. ESI/MS: рассчитано для 1(4-нитрофенил)пиперазинового производного C46H55N8O7P 862,4, найдено m/z=863,7 (M+1).
Пример 10. ((2S,6R)-6-(5-метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-метил-(2-(2,2,2-трифторацетамидо)этил)фосфорамидохлоридат
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в примере 5, для получения указанного в заголовке соединения (1,0 г) в виде белой пены. ESI/MS: рассчитано для 1(4-нитрофенил)пиперазинового производного C44H48F3N8O8P 904,3, найдено m/z=903,7 (M-1).
Пример 11. ((2S,6R)-6-(5-метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-метил-(2-(2,2,2-трифтор-Л-метилацетамидо)этил)фосфорамидохлоридат
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в примере 5, для получения указанного в заголовке соединения (1,8 г) в виде белой пены. ESI/MS: рассчитано для 1(4-нитрофенил)пиперазинового производного C45H50F3N8O8P 918,3, найдено m/z=1836,6 (2М+).
Пример 12. ((2S,6R)-6-(5-метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-(4-(2,2,2-трифторацетамидо)пиперидин-1-ил)фосфонохлоридат
К охлаждаемому (в водяной бане со льдом) раствору оксихлорида фосфора (17,7 мл, 190 ммоль) в ДХМ (190 мл) добавили по каплям 2,6-лутидин (101 мл, 864 ммоль), затем порциями Mo(Tr)T (2) (83,5 г, 173 ммоль) в течение 15 мин (внутренняя температура 0-10°С) и перемешивали. Через 30 мин добавили по каплям пиперидин (48,9 г, ~190 ммоль) в течение 15 мин (внутренняя температура 0-8°С) и перемешивали. Спустя 1 ч добавили по каплям DIPEA (диизопропилэтиламин) (50 мл) (внутренняя температура 0-10°С) и перемешивали в течение 1 ч. Реакционную смесь промыли раствором лимонной кислоты (трижды по 500 мл, 10%-ный (вес./об.) водный раствор), высушили (MgSO4), профильтровали и упарили до вязкого масла, которые непосредственно перенесли в колонку. Хроматографическая очистка [колонка с SiO2 (330 г), элюаент гексаны/EtOAc (градиент от 1:0 до 0:1)] привела к указанному в заголовке соединению (91,3 г, выход 70%) в виде белой пены. ESI/MS: рассчитано для 1-(4-нитрофенил)пиперазинового производного C43H48N7O8P 930,9, найдено m/z=954,4 (M+Na).
Примеры 13-37 были получены соответственно описанной выше методике А.
Пример 13. (6-(5-Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-(4-( 1 -(2,2,2-трифторацетил)пиперидин-1 -ил)пиперазин-1 -ил)фосфонохлоридат
- 103 035030
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике
А, с получением указанного в заголовке соединения (1,09 г, выход 23%). ESI/MS: рассчитано для 1-(4нитрофенил) пиперазинового производного C51H58F3N8O8P 998,41, найдено m/z=997,5 (M-1).
Пример 14. (6-(5-Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-(4-морфолинопиперидин-1 -ил)фосфонохлоридат
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике А, с получением указанного в заголовке соединения (0,98 г, выход 84%). ESI/MS: рассчитано для 1-(4нитрофенил)пиперазинового производного C48H57N8O8P 904,40, найдено m/z=903,5 (M-1).
Пример 15. (6-(5-Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1 (2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-бис-(3-(2,2,2-трифторацетамидо)пропил)фосфорамидохлоридат
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике А, с получением указанного в заголовке соединения (7,52 г). ESI/MS: рассчитано для 1-(4-нитрофенил) пиперазинового производного C49H54F6N9O9P 1057,37, найдено m/z=1056,4 (M-1).
Пример 16. (6-(5-Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-метил-(6,7,9,10,17,18,20,21 -октагидродибензо[В,К] [1,4,7,10,13,16]гексаоксациклооктадецин-2ил)фосфорамидохлоридат
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике А, с получением указанного в заголовке соединения (0,30 г). ESI/MS: рассчитано для C50H56ClN4O11P 952,32, найдено m/z=951 (M-1).
Пример 17. (6-(5-Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-1,4,7,10-тетраокса- 13-азациклопентадекан- 13-илфосфонохлоридат
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике А, с получением указанного в заголовке соединения (4,26 г, выход 25%). ESI/MS: рассчитано для 1-(4нитрофенил)пиперазинового производного C49H60N7O11P 953,41, найдено m/z=952,7 (M-1).
Пример 18. (6-(5-Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2-ил)метил-1,4,7,10,13-пентаокса-16-азациклооктадекан-16-илфосфонохлоридат
- 104 035030
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике
А, с получением указанного в заголовке соединения (1,11 г, выход 18%). ESI/MS: рассчитано для 1-(4нитрофенил)пиперазинового производного C51H64N7O12P 997,44, найдено m/z=996,5 (М-1).
Пример 19. (6-(5-Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-(4-оксопиперидин-1 -ил)фосфонохлоридат
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике А, с получением указанного в заголовке соединения (1,03 г, выход 14%). ESI/MS: рассчитано для 1-(4нитрофенил)пиперазинового производного C44H48N7O8P 833,33, найдено m/z=832,4 (M-1).
Пример 20. (6-(5-Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-(октагидроизохинолин-2(1Н)-ил)фосфонохлоридат
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике А, с получением указанного в заголовке соединения (4,87 г, выход 32%). ESI/MS: рассчитано для 1-(4нитрофенил)пиперазинового производного C48H56N7O7P 873,40, найдено m/z=872,7 (M-1).
Пример 21. (6-(5-Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-(4-(трифторметил)пиперидин-1 -ил)фосфонохлоридат
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике А, с получением указанного в заголовке соединения (1,59 г, выход 42%). ESI/MS: рассчитано для 1-(4нитрофенил)пиперазинового производного C45H49F3N7O7P 887,34, найдено m/z=886,6 (M-1).
Пример 22. (6-(5-Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-(4-(4-нитрофенил)пиперазин-1-ил)фосфонохлоридат
- 105 035030
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике
А, с получением указанного в заголовке соединения (2,27 г, выход 24%). ESI/MS: рассчитано для 1-(4нитрофенил)пиперазинового производного C49H52N9O9P 941,36, найдено m/z=940,7 (M-1).
Пример 23. (6-(5-Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-(4-ацетил-1,4-диазепан-1 -ил)фосфонохлоридат
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике А, с получением указанного в заголовке соединения (6,08 г, выход 20%). ESI/MS: рассчитано для 1-(4нитрофенил) пиперазинового производного C46H53N8O8P 876,37, найдено m/z=875,9 (М-1).
Пример 24. (6-(5-Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-(4-ацетилпиперазин-1 -ил)фосфонохлоридат
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике А, с получением указанного в заголовке соединения (3,30 г, выход 20%). ESI/MS: рассчитано для 1-(4нитрофенил) пиперазинового производного C45H51N8O8P 862,36, найдено m/z=861,7 (M-1).
Пример 25. (6-(5-метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-(4-цианопиперидин-1 -ил)фосфонохлоридат
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике А, с получением указанного в заголовке соединения (0,84 г, выход 25%). ESI/MS: рассчитано для 1-(4нитрофенил)пиперазинового производного C45H49N8O7P 844,35, найдено m/z=843,6 (М-1).
Пример 26. (6-(5-Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-гекс-5-ин-1-ил-(метил)фосфорамидохлоридат
- 106 035030
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике
А, с получением указанного в заголовке соединения (0,53 г). ESI/MS: рассчитано для C36H4oClN4O5P
674,24, найдено m/z=673 (M-1).
Пример 27. (6-(5-Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-гекс-5 -ен-1 -ил-(метил)фосфорамидохлоридат
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике А, с получением указанного в заголовке соединения (1,58 г). ESI/MS: рассчитано для C36H42ClN4O5P 676,26, найдено m/z=675 (M-1).
Пример 28. (6-(5-Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-(4-( [1,1 '-бифенил]-3-илкарбоксамидо)пиперидин- 1-ил)фосфонохлоридат
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике А, с получением указанного в заголовке соединения (2,78 г). ESI/MS: рассчитано для C47H47ClN5O6P 843,30, найдено m/z=842 (M-1).
Пример 29. (6-(5-Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-(4-(3-цианобензамидо)пиперидин-1-ил)фосфонохлоридат
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике А, с получением указанного в заголовке соединения (4,89 г). ESI/MS: рассчитано для C42H42ClN6O6P 792,26, найдено m/z=193 (M-1).
Пример 3 0. (6-(5-Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1 (2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2-ил)метил-[1,4'-бипиперидин]-1 '-илфосфонохлоридат
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике А, с получением указанного в заголовке соединения (0,83 г). ESI/MS: рассчитано для C39H47ClN5O5P 731,30, найдено m/z=730 (M-1).
Пример 31. (6-(5-Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-(4-(2',4'-диметокси-[1,1'-бифенил]-3-илкарбоксамидо)пиперидин-1-ил)фосфонохлоридат
- 107 035030
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике
А, с получением указанного в заголовке соединения (0,34 г). ESI/MS: рассчитано для C49H51ClN5O8P
903,32, найдено m/z=902(M-1).
Пример 32. (6-(5-Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-бут-3 -ен-1 -ил-(метил)фосфорамидохлоридат
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике А, с получением указанного в заголовке соединения (0,66 г). ESI/MS: рассчитано для C34H38ClN4O5P 648,23, найдено m/z=671 (M+Na).
Пример 3 3. (6-(5 -Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1 (2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-(4-(2',3'-диметокси-[1,1'-бифенил]-3-илкарбоксамидо)пиперидин-1-ил)фосфонохлоридат
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике А, с получением указанного в заголовке соединения (0,62 г). ESI/MS: рассчитано для C49H51ClN5O8P 903,32, найдено m/z=902 (M-1).
Пример 34. (6-(5-Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-(4-(3'-(трифторметокси)-[1,1'-бифенил]-3-илкарбоксамидо)пиперидин-1-ил)фосфонохлоридат
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике А, с получением указанного в заголовке соединения (0,44 г). ESI/MS: рассчитано для C48H46ClF3N5O7P 927,28, найдено m/z=926 (M-1).
Пример 3 5. (6-(5 -Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1 (2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-(4-(4'-(трифторметокси)-[1,1 '-бифенил]-3 -илкарбоксамидо)пиперидин-1 -ил)фосфонохлоридат
- 108 035030
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике
А, с получением указанного в заголовке соединения (0,51 г). ESI/MS: рассчитано для C48I I46ClF3N5O7P
927,28, найдено m/z=926 (M-1).
Пример 36. (6-(5-Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-(4-(4'-хлор-3'-(трифторметокси)-[1,1'-бифенил]-3-илкарбоксамидо)пиперидин-1-ил)фосфонохлоридат
CI
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике А, с получением указанного в заголовке соединения (0,56 г). ESI/MS: рассчитано для C48H45Cl2F3N5O6P 945,24, найдено m/z=944 (M-1).
Пример 37. (6-(5-Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-(4-(3',5'-дихлор-[1,1'-бифенил]-3-илкарбоксамидо)пиперидин-1-ил)фосфонохлоридат
CI
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике А, с получением указанного в заголовке соединения (0,42 г). ESI/MS: рассчитано для C47H45Cl3N5O6P 911,22, найдено m/z=910 (M-1).
Примеры 38-40 были получены с использованием описанной выше методики В.
Пример 3 8. (6-(5-Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1 (2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-(4-(пиримидин-2-ил)пиперазин-1 -ил)фосфонохлоридат
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике В, с получением указанного в заголовке соединения (3,13 г, выход 24%). ESI/MS: рассчитано для 1-(4нитрофенил)пиперазинового производного C47H51N10O7P 898,37, найдено m/z=897,7 (M-1).
Пример 39. (6-(5-Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-(4-(2-диметиламино)этил)пиперазин-1 -ил)фосфонохлоридат
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике В, с получением указанного в заголовке соединения (1,0 г, выход 79%). ESI/MS: рассчитано для 1-(4нитрофенил) пиперазинового производного C47H58N9O7P 891,42, найдено m/z=890,8 (M-1).
Пример 40. (6-(5-Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2- 109 035030 ил)метил-(4-фенилпиперазин-1 -ил)фосфонохлоридат
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике В, с получением указанного в заголовке соединения (0,72 г, выход 67%). ESI/MS: рассчитано для 1-(4нитрофенил)пиперазинового производного C49H53N8O7P 896,38, найдено m/z=895,6 (М-1).
Активированные субъединицы вышеописанных примеров могут быть модифицированы введением нуклеооснований A, G и С, с использованием методики А и замещением надлежащих морфолиновых производных A, G и С на Mo(Tr)N. Структуры подходящих морфолино с защищенными A, G и С показаны в примерах 41-51.
Пример 41. №(9-(6-гидроксиметил)-4-тритилморфолин-2-ил)-9Н-пурин-6-ил)бензамид (защищенный А)
Пример 42. (9-(6-Гидроксиметил)-4-тритилморфолин-2-ил)-2-(2-фенилацетамидо)-9Н-пурин-6ил)пивалат (защищенный G)
Пример 43. №(1-(6-гидроксиметил)-4-тритилморфолин-2-ил)-2-оксо-1,2-дигидропиримидин-4ил)бензамид (защищенный С)
Пример 44. (6-(5-Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-(4-(2,2,2-трифтор-№метилацетамидо)пиперидин-1-ил)фосфонохлоридат
Пример 45. (6-(5-Метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2- 110 035030
ил)метил-метил-(3-(2,2,2-трифтор-К-метилацетамидо)пропил)фосфорамидохлоридат
и
Пример 46. (6-(6-Бензамидо-9Н-пурин-9-ил)-4-тритилморфолин-2-ил)метилморфолинофосфонохлоридат
Указанное в заголовке соединение синтезировали с получением указанного в заголовке соединения (10,81 г). ESI/MS: рассчитано для C40H39ClN7O5P 763,24, найдено m/z=762 (М-1).
Пример 47. (6-(6-Бензамидо-9Н-пурин-9-ил)-4-тритилморфолин-2-ил)метил-(4-ацетилпиперазин-1 ил)фосфонохлоридат
Указанное в заголовке соединение синтезировали с получением указанного в заголовке соединения (8,67 г). ESI/MS: рассчитано для C42H42ClN8O5P 804,27, найдено m/z=803 (M-1).
Пример 48. 9-(6-(((Хлор-(морфолино)фосфорил)окси)метил)-4-тритилморфолин-2-ил)-2-(2фенилацетамидо)-9Н-пурин-6-илпивалат
Указанное в заголовке соединение синтезировали с получением указанного в заголовке соединения (9,88 г). ESI/MS: рассчитано для C53H55ClN7O8P 983,35, найдено m/z=985 (M-1).
Пример 49. 9-(6-(((4-Ацетилпиперазин-1-ил)хлорфосфорил)окси)метил)-4-тритилморфолин-2-ил)-2(2-фенилацетамидо)-9Н-пурин-6-илпивалат
Указанное в заголовке соединение синтезировали с получением указанного в заголовке соединения (8,40 г). ESI/MS: рассчитано для C55H58ClN8O8P 1024,38, найдено m/z=1023 (M-1).
Пример 50. (6-(4-Бензамидо-2-оксопиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2-ил)метил-(4ацетилпиперазин-1-ил)фосфонохлоридат
- 111 035030
Указанное в заголовке соединение синтезировали с получением указанного в заголовке соединения (6,36 г). ESI/MS: рассчитано для C41H42ClN6O6P 780,26, найдено m/z=779 (M-1).
Пример 51. (6-(4-Бензамидо-2-оксопиримидин-1 (2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2-ил)метилморфолинофосфонохлоридат
Указанное в заголовке соединение синтезировали с получением указанного в заголовке соединения (10,29 г). ESI/MS: рассчитано для C39H39ClN5O6P 739,23, найдено m/z=738 (M-1).
Пример 52. (^,6Я)-6-(6-бензамидо-9Н-пурин-9-ил)-4-тритилморфолин-2-ил)метил-(4-(2,2,2трифторацетамидо)пиперидин-1 -ил)фосфонохлоридат
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике А, с получением указанного в заголовке соединения (15,4 г, выход 66%) в виде белого твердого продукта. ESI/MS: рассчитано для 1-(4-нитрофенил)пиперазинового производного C53H53F3N11O7P 1043,4, найдено m/z=1042,5 (M-1).
Пример 53. (Я)-метил-(1-фенилэтил)фосфорамиддихлорид
К охлаждаемому (в водяной бане со льдом) раствору оксихлорида фосфора (2,83 г, 30,3 ммоль) в ДХМ (30 мл) добавили последовательно по каплям и при перемешивании 2,6-лутидин (7,06 мл, 60,6 ммоль) и ДХМ-раствор (Я)-(+)-Л,а-диметилбензиламина (3,73 г, 27,6 ммоль). Через 5 мин баню убрали и реакционную смесь оставили нагреваться до температуры окружающей среды. Спустя 1 ч реакционный раствор промыли раствором лимонной кислоты (трижды по 50 мл, 10%-ный (вес./об.) водный раствор), высушили (MgSO4), профильтровали через SiO2 и упарили с получением указанного в заголовке соединения (3,80 г) в виде белой пены. ESI/MS: рассчитано для 1-(4-нитрофенил)пиперазинового производного C19H25N4O4P 404,2, найдено m/z=403,1 (M-1).
Пример 54. ^)-Метил-(1-фенилэтил)фосфорамиддихлорид
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в примере 53, с получением указанного в заголовке соединения (3,95 г) в виде белой пены. ESI/MS: рассчитано для 1-(4-нитрофенил)пиперазинового производного C19H25N4O4P 402,4, найдено m/z=403,1 (M-1).
Пример 55. (^,6Я)-6-(5-метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-метил-((Я)-1 -фенилэтил)фосфорамидохлоридат
- 112 035030
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике
А, с получением указанного в заголовке хлорфосфорамидата (4,46 г, выход 28%) в виде белого твердого продукта. ESI/MS: рассчитано для C38H40ClN4O5P 698,2, найдено m/z=697,3 (M-1).
Пример 56. ((2S,6R)-6-(5-метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-метил-(^)-1 -фенилэтил)фосфорамидохлоридат
Указанное в заголовке соединение синтезировали способом, аналогичным описанному в методике А, с получением указанного в заголовке хлорфосфорамидата (4,65 г, выход 23%) в виде белого твердого продукта. ESI/MS: рассчитано для C38H40ClN4O5P 698,2, найдено m/z=697,3 (M-1).
Пример 57. Гидрохлорид дихлорида (4-(пирролидин-1-ил)пиперидин-1-ил)фосфоновой кислоты
К охлаждаемому (в водяной бане со льдом) раствору оксихлорида фосфора (5,70 г, 55,6 ммоль) в ДХМ (30 мл) добавили 2,6-лутидин (19,4 мл, 167 ммоль) и ДХМ-раствор (30 мл) 4-(1-пирролидинил)пиперидина (8,58 г, 55,6 ммоль), и перемешивали в течение 1 ч. Суспензию профильтровали и твердый продукт промыли избытком диэтилового эфира для получения указанного в заголовке пирролидина (17,7 г, выход 91%) в виде белого твердого вещества. ESI/MS: рассчитано для 1-(4-нитрофенил) пиперазинового производного C19H30N5O4P 423,2, найдено m/z=422,2 (M-1).
Пример 58. Гидрохлорид ((2S,6R)-6-(5-метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4тритилморфолин-2-ил)метил-(4-пирролидин-1-ил)пиперидин-1-ил)фосфонохлоридата
К перемешиваемому, охлаждаемому (в водяной бане со льдом) раствору дихлорфосфорамидата из примера 57 (17,7 г, 50,6 ммоль) в ДХМ (100 мл) добавили ДХМ-раствор (100 мл) Mo(Tr)T (2) (24,5 г, 50,6 ммоль), 2,6-лутидин (17,7 мл, 152 ммоль), и 1-метилимидазол (0,401 мл, 5,06 ммоль) по каплям в течение 10 мин. Баню оставили нагреваться до температуры окружающей среды, в то же время с перемешиванием суспензии. Через 6 ч суспензию вылили в диэтиловый эфир (1 л), перемешивали в течение 15 мин, профильтровали и твердый продукт промыли дополнительным эфиром для получения белого твердого вещества (45,4 г). Сырой продукт очистили хроматографией [колонка с SiO2 (120 г), элюент ДХМ/МеОН (градиент от 1:0 до 6:4)] и объединенные фракции вылили в диэтиловый эфир (2,5 л), перемешивали в течение 15 мин, профильтровали и полученный твердый продукт промыли дополнительным эфиром с получением указанного в заголовке соединения (23,1 г, выход 60%) в виде белого твердого вещества. ESI/MS: рассчитано для 1-(4-нитрофенил)пиперазинового производного C48H57N8O7P 888,4, найдено m/z=887,6 (М-1).
Пример 59. 3-(трет-Бутилдисульфанил)-2-(изобутоксикарбониламино)пропионовая кислота
К S-трет-бутилмеркапто-Е-цистеину (10 г, 47,8 ммоль) в CH3CN (40 мл) добавили K2CO3 (16,5 г, 119,5 ммоль) в Н2О (20 мл). После перемешивания в течение 15 мин медленно ввели изо- 113 035030 бутилхлорформиат (9,4 мл, 72 ммоль). Реакционную смесь оставили для взаимодействия в течения 3 ч.
Белое твердое вещество отфильтровали через целит; фильтрат упарили для удаления CH3CN. Остаток растворили в этилацетате (200 мл), промыли 1н. HCl (трижды по 40 мл), рассолом (однократно 40), высушили над Na2SO4. Указанное в заголовке соединение получили после хроматографической очистки (5% МеОН/ДХМ).
Пример 60. трет-Бутил-4-(3-трет-бутилдисульфанил)-2-(изобутоксикарбониламино)пропанамидо) пиперидин-1 -карбоксилат
К кислоте из примера 59 (6,98 г, 22,6 ммоль) в диметилформамиде (DMF, ДМФА) (50 мл) добавили HATU [О-(7-азабензотриазол-1-ил)-НН№,№-тетраметилурония гексафторфосфат] (8,58 г, 22,6 ммоль). Спустя 30 мин к смеси добавили основание Хюнига (4,71 мл, 27,1 ммоль) и 1-Вос-4-аминопиперидин (5,43 г, 27,1 ммоль). Перемешивание реакционной смеси продолжали при комнатной температуре (RT) в течение дополнительных 3 ч. ДМФА удалили в глубоком вакууме, сырой остаток растворили в этилацетате (EtAc) (300 мл), промыли водой (Н2О) (трижды по 50 мл). Указанное в заголовке соединение получили после очистки в системе флеш-хроматографии (ISCO) (5% МеОН/ДХМ).
Пример 61. Изобутил-3 -(изопропилдисульфанил)-1 -оксо-1 -(пиперидин-4-иламино)пропан-2илкарбамат
К соединению из примера 60 (7,085 г, 18,12 ммоль) добавили 30 мл 4М HCl/диоксана. Реакция завершилась после 2 ч при комнатной температуре. Указанное в заголовке соединение использовали для следующей стадии без дополнительной очистки.
Пример 62. Изобутил-3-(трет-бутилдисульфанил)-1-(1 -дихлорфосфорил)пиперидин-4-иламино)-1 оксопропан-2-илкарбамат
К соединению из примера 61 (7,746 г, 18,12 ммоль) в ДХМ (200 мл) при температуре -78°С медленно добавили POCl3 (1,69 мл, 18,12 ммоль) в атмосфере аргона (Ar), с последующим добавлением Et3N (7,58 мл, 54,36 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре (RT) в течение 5 ч, упарили для удаления избыточного основания и растворителя. Указанное в заголовке соединение получили в виде белого твердого вещества после ISCO-очистки (50% этилацетат/гексан).
Пример 63. Изобутил-3-(трет-бутилдисульфанил)-1-(1-хлор(((2S,6R)-6-(5-метил-2,4-диоксо-3,4дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2-ил)метокси)фосфорил)пиперидин-4-иламино)-1оксопропан-2-илкарбамат
К 1-((2S,6R)-6-(гидроксиметил)-4-тритилморфолин-2-ил)-5-метилпиримидин-2,4(1Н,3Н))-диону (moT(Tr)) (5,576 г, 10,98 ммоль) в ДХМ (100 мл) при температуре 0°С добавили лутидин (1,92 мл, 16,47 ммоль) и DMAP (диметиламинопиридин) (669,мг, 5,5 ммоль), с последующим добавлением соединения из примера 62 (6,13 г, 12,08 ммоль). Реакционную смесь оставили с перемешиванием при комнатной температуре (RT) в течение 18 ч. Указанное в заголовке соединение получили после ISCO-очистки (50% этилацетат/гексан).
Пример 64. ((2S,6R)-6-(5-метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-гексил-(метил)фосфорамидохлоридат
- 114 035030
Раствор N-гидроксиметиламина (4,85 мл, 32 ммоль) в ДХМ (80 мл) охладили до температуры -78°С под азотом (N2). Медленно добавили раствор фосфорилхлорида (2,98 мл, 32 ммоль) в ДХМ (10 мл), затем раствор Et3N (4,46 мл, 32 ммоль) в ДХМ (10 мл). Перемешивание продолжали, в то же время обеспечивая нагревание реакционной смеси до комнатной температуры, в течение ночи. Целевой фосфорамидодихлорид получили в виде прозрачного масла после ISCO-очистки (20% этилацетат/гексан).
К moT(Tr) (2) (5,10 г, 10,54 ммоль) в ДХМ (100 мл) при температуре 0°С добавили лутидин (3,68 мл, 31,6 ммоль) и DMAP (642 мг, 5,27 ммоль), с последующим добавлением фосфорамидодихлорида (4,89 г, 21,08 ммоль). Реакционную смесь оставили с перемешиванием при комнатной температуре (RT) в течение 18 ч. Указанное в заголовке соединение получили после ISCO-очистки (50% этилацетат/гексан).
Пример 65. (^,6Я)-6-(5-метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-додецил-(метил)фосфорамидохлоридат
Указанное в заголовке соединение получили соответственно общим методикам, описанным в примерах 53 и 55.
Пример 66. (^,6Я)-6-(5-метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метилморфолинофосфонохлоридат
Указанное в заголовке соединение получили соответственно общим методикам, описанным в примерах 53 и 55.
Пример 67. (^,6Я)-6-(5-метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-^)-2-(метоксиметил)пирролидин-1 -илфосфонохлоридат
Указанное в заголовке соединение получили соответственно общим методикам, описанным в примерах 53 и 55.
Пример 68. (^,6Я)-6-(5-метил-2,4-диоксо-3,4-дигидропиримидин-1(2Н)-ил)-4-тритилморфолин-2ил)метил-4-(3,4,5-триметоксибензамидо)пиперидин-1-илфосфонохлоридат
- 115 035030
К l-Boc-4-пиперидину (1 г, 5 ммоль) в ДХМ (20 мл) добавили основание Хюнига (1,74 мл, 10 ммоль), с последующим добавлением 3,4,5-триметоксибензоилхлорида (1,38 г, 6 ммоль). Реакцию проводили при комнатной температуре (RT) в течение 3 ч, упарили для удаления растворителя и избыточного основания. Остаток растворили в этилацетате (EtAc) (100 мл), промыли 0,05н. HCl (трижды по 15 мл), насыщенным раствором NaHCO3 (дважды по 15 мл), высушили над Na2SO4. Продукт (10) получили после ISCO-очистки (5% МеОН/ДХМ).
К продукту 10 добавили 15 мл 4н. HCl/диоксана, реакцию прекратили после 4 ч. Продукт (11) получили в виде белого твердого вещества.
Раствор продукта (11) (1,23 г, 4,18 ммоль) в ДХМ (20 мл) охладили до температуры -78°С под азотом (N2). Медленно добавили раствор фосфорилхлорида (0,39 мл, 4,18 ммоль) в ДХМ (2 мл), затем раствор Et3N (0,583 мл, 4,18 ммоль) в ДХМ (2 мл). Перемешивание продолжали, в то же время обеспечивая нагревание реакционной смеси до комнатной температуры, в течение ночи. Целевой продукт (12) получили после ISCO-очистки (50% этилацетат/гексан).
К moT(Tr) (1,933 г, 4,0 ммоль) в ДХМ (20 мл) при температуре 0°С добавили лутидин (0,93 мл, 8 ммоль) и DMAP (49 мг, 0,4 ммоль), с последующим добавлением продукта (12) (1,647 г, 4 ммоль). Реакционную смесь оставили с перемешиванием при комнатной температуре (RT) в течение 18 ч. Целевой продукт (13) получили после ISCO-очистки (50% этилацетат/гексан).
Пример 69. Синтез циклофосфорамида, содержащего субъединицу
moT-Субъединицу (7) (25 г) суспендировали в ДХМ (175 мл) и добавили NMI (N-метилимидазол, 5,94 г, 1,4 экв.) до получения прозрачного раствора. К реакционной смеси добавили тозилхлорид и протекание реакции отслеживали с помощью тонкослойной хроматографии (TLC, ТСХ) до ее завершения (около 2 ч). Водную обработку выполняли промыванием 0,5М лимоннокислым буфером (pH 5), затем рассолом. Органический слой отделили и высушили над Na2SO4. Растворитель удалили с помощью роторного испарителя для получения сырого продукта (14), который использовали в следующей стадии без дополнительной очистки.
moT-Тозилат (14) смешали с пропаноламином (1 г/10 мл). Затем реакционную смесь поместили в термостат с температурой 45°С на ночь, затем разбавили дихлорметаном (ДХМ) (10 мл). Водную обработку проводили промыванием 0,5М лимонно-кислым буфером (pH 5), затем рассолом. Органический слой отделили и высушили над Na2SO4. Растворитель удалили с помощью роторного испарителя для получения сырого продукта (15). Сырой продукт был проанализирован с использованием NMR (ядерного магнитого резонанса, ЯМР) и HPLC (высокоэффективной жидкостной хроматографии, ВЭЖХ) и был определен как готовый для следующей стадии без дополнительной очистки.
Сырой продукт (15) растворили в ДХМ (2,5 мл ДХМ/г, 1 экв.) и смешали с DIEA (N,Nдиизопропилэтиламин) (3 экв.). Этот раствор охладили смесью сухой лед-ацетон и по каплям добавили POCl3 (1,5 экв.). Полученную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение ночи. Водную обработку проводили промыванием 0,5М лимоннокислым буфером (pH 5), затем рассолом. Органический слой отделили и высушили над Na2SO4. Растворитель удалили с помощью роторного испарителя для получения сырого продукта в виде желтоватого твердого вещества. Сырой продукт очищали хроматографией на силикагеле (отношение сырой продукт/кремнезем = от 1 до 5, градиент от ДХМ до 50% этилацетат/ДХМ), фракции объединили согласно ТСХ-анализу. Растворитель удалили для получения желательного продукта (16) в виде смеси диастереомеров. Очищенный продукт анализировали с использованием HPLC (проявление NPP (паранитрофенилфосфат)) и ЯМР (1Н и 31Р).
Смесь диастереомеров разделили согласно следующей методике. Смесь (2,6 г) растворили в ДХМ. Этот образец поместили в колонку RediSepRf (80 г нормальной фазы, производства фирмы Teledyne Isco) и элюировали смесью от 10% этилацетат/ДХМ до 50% этилацетат/ДХМ в течение 20 мин. Фракции собрали и проанализировали с использованием ТСХ. Фракции объединили согласно результатам ТСХанализа и растворитель удалили с помощью роторного испарителя при комнатной температуре. Соотно- 116 035030 шение диастереомеров в этих объединенных фракциях определяли с использованием 31Р-ЯМР и анализа с NPP-TFA (паранитрофенилфосфат-трифторуксусная кислота). При необходимости вышеуказанную процедуру повторяли, пока диастереомерное соотношение не достигало 97%.
Пример 70. Глобальная модификация холевой кислоты
ОН
В круглодонную колбу поместили холевую кислоту (17) (12 г, 29,4 ммоль), N-гидроксисукцинимид (4,0 г, 34,8 ммоль), EDCI (1-этил-3-(3-диметиламинопропил)карбодиимид) (5,6 г, 29,3 ммоль) и DMAP (1 г, 8,2 ммоль). Для растворения добавили ДХМ (400 мл) и THF (тетрагидрофуран, ТГФ) (40 мл). Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение ночи. Затем к реакционной смеси добавили воду (400 мл), органический слой отделили и промыли водой (дважды по 400 мл), затем насыщенным раствором NaHCO3 (300 мл) и рассолом (300 мл). Затем органический слой высушили над Na2SO4. Растворитель удалили в роторном испарителе для получения белого твердого вещества. Сырой продукт (18) растворили в хлороформе (100 мл) и осадили выливанием в гептан (1000 мл). Твердый продукт отделили фильтрованием, проанализировали с использованием HPLC и ЯМР и использовали без дополнительной очистки.
Соединение 19 (20 мг, 2,8 мкмоль) отвесили в пробирку (4 мл) и растворили в диметилсульфоксиде (ДМСО) (500 мкл). К реакционной смеси добавили активированный сложный эфир (18) холевой кислоты (13 мг, 25 мкмоль) согласно соотношению двух эквивалентов активного сложного эфира на сайт модификации, с последующим перемешиванием при комнатной температуре в течение ночи. Протекание реакции определяли с помощью MALDI (матрично-активированная лазерная десорбция/ионизация) и HPLC (колонки С-18 или SAX).
После завершения реакции (что определялось по исчезновению соединения 19) к реакционной смеси добавили 1 мл концентрированного раствора аммиака, как только реакция закончилась. Затем реакционную пробирку поместили в термостат (температура 45°С) в течение ночи (18 ч), затем охладили до комнатной температуры и разбавили 1%-ным раствором аммиака в воде (10 мл). Этот образец поместили в колонку SPE (2 см) и пробирку прополоскали 1%-ным раствором аммиака (дважды по 2 мл). Колонку SPE промыли 1%-ным раствором аммиака в воде (трижды по 6 мл) и продукт элюировали 45%-ным раствором ацетонитрила в 1%-ном растворе аммиака в воде (6 мл). Фракции, содержащие олигомер, идентифицировали измерением УФ-оптической плотности. Продукт (20) выделили лиофилизацией. Чистоту и идентичность определяли с помощью MALDI и HPLC (колонки С-18 или SAX).
Эта же методика применима для активации дезоксихолевой кислоты и конъюгации с (19).
Пример 71. Глобальное гуанидилирование.
Соединение (19) (25 мг, 2,8 мкмоль) отвесили в пробирку (6 мл). В пробирку добавили хлорид 1Нпирозол-1-карбоксамида (15 мг, 102 мкмоль) и карбонат калия (20 мг, 0,15 ммоль). Добавили воду (500 мкл) и реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение ночи (около 18 ч). Завершение реакции определяли с помощью MALDI.
По завершении взаимодействия реакционную смесь разбавили 1%-ным раствором аммиака в воде (10 мл) и поместили в колонку SPE (2 см). Пробирку прополоскали 1%-ным раствором аммиака (дважды по 2 мл) и колонку SPE промыли 1%-ным раствором аммиака в воде (трижды по 6 мл). Продукт элюировали 45%-ным раствором ацетонитрила в 1%-ном растворе аммиака в воде (6 мл). Фракции, содержащие олигомер, идентифицировали измерением УФ-оптической плотности. Продукт (20) выделили лиофилизацией. Чистоту и идентичность определяли с помощью MALDI и HPLC (колонки С-18 или SAX).
- 117 035030
Пример 72. Глобальная тиоацетильная модификация.
Соединение (19) (20 мг, 2,3 мкмоль) отвесили в пробирку (4 мл) и растворили в ДМСО (500 мкл). К реакционной смеси добавили К-сукцинимидил-3-ацетилтиоацетат (SATA) (21) (7 мг, 28 мкмоль) и оставили с перемешиванием при комнатной температуре в течение ночи. Протекание реакции отслеживали с использованием MALDI и HPLC.
По завершении взаимодействия к реакционной смеси добавили 1%-ный раствор аммиака в воде и смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 2 ч. Этот раствор поместили в колонку SPE (2 см). Пробирку прополоскали 1%-ным раствором аммиака (дважды по 2 мл) и колонку SPE промыли 1%-ным раствором аммиака в воде (трижды по 6 мл). Продукт (23) элюировали 45%-ным раствором ацетонитрила в 1%-ном растворе аммиака в воде (6 мл). Фракции, содержащие олигомер, идентифицировали измерением УФ-оптической плотности. Продукт (20) выделили лиофилизацией. Чистоту и идентичность определяли с помощью MALDI и HPLC (колонки С-18 или SAX).
Пример 73. Глобальная модификация янтарной кислотой
Соединение (19) (32 мг, 3,7 мкмоль) отвесили в пробирку (4 мл) и растворили в ДМСО (500 мкл). К реакционной смеси добавили N-этилморфолин (12 мг, 100 мкмоль) и янтарный ангидрид (10 мг, 100 мкмоль) и оставили с перемешиванием при комнатной температуре в течение ночи. Протекание реакции отслеживали с использованием MALDI и HPLC.
По завершении взаимодействия к реакционной смеси добавили 1%-ный раствор аммиака в воде и смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 2 ч. Этот раствор поместили в колонку SPE (2 см). Пробирку прополоскали 1%-ным раствором аммиака (дважды по 2 мл) и колонку SPE промыли 1%-ным раствором аммиака в воде (трижды по 6 мл). Продукт (24) элюировали 45%-ным раствором ацетонитрила в 1%-ном растворе аммиака в воде (6 мл). Фракции, содержащие олигомер, идентифицировали измерением УФ-оптической плотности. Продукт (20) выделили лиофилизацией. Чистоту и идентичность определяли с помощью MALDI и HPLC (колонки С-18 или SAX).
Вышеуказанная методика применима также для модификации соединения (19) глутаровой кислотой (глутаровым ангидридом) и тетраметиленглутаровой кислотой (тетраметиленглутаровым ангидридом).
Тетраметиленглутаровый ангидрид Глутаровый ангидрид
Пример 74. Получение аналога олигонуклеотида, включающего модифицированную концевую группу.
К раствору 25-мерного фосфордиамидатного морфолинового олигомера (РМО), содержащего свободный 3'-конец (27,7 мг, 3,226 мкмоль) в ДМСО (300 мкл), добавили фарнезилбромид (1,75 мкл, 6,452 мкмоль) и диизопропилэтиламин (2,24 мкл, 12,9 мкмоль). Реакционную смесь перемешивали при ком- 118 035030 натной температуре в течение 5 ч. Необработанную реакционную смесь разбавили 10 мл 1%-ного водного NH4OH и затем поместили в колонку Amberchrome CG300M на 2 мл. Затем колонку промыли водой в количестве 3 объемов колонки и продукт элюировали 6 мл смеси 1:1 ацетонитрила и воды (об./об.). Затем раствор лиофилизировали для получения указанного в заголовке соединения в виде белого твердого вещества.
Пример 75. Получение морфолиновых олигомеров.
Получение тритилированного пиперазинофенилкарбамата 1b (см. фиг. 1): к охлажденной суспензии соединения 1a в дихлорметане (6 мл/г (11)) добавили раствор карбоната калия (3,2 экв.) в воде (4 мл/г карбоната калия). К этой двухфазной смеси медленно добавили раствор фенилхлорформиата (1,03 экв.) в дихлорметане (2 г/г фенилхлорформиата). Реакционную смесь нагрели до температуры 20°С. По завершении реакции (1-2 ч) разделили слои. Органический слой промыли водой и высушили над безводным карбонатом калия. Продукт 1b выделили кристаллизацией из ацетонитрила. Выход = 80%.
Получение спиртового производного карбамата 1с: гидрид натрия (1,2 экв.) суспендировали в 1метил-2-пирролидиноне (32 мл/г гидрида натрия). К этой суспензии добавили триэтиленгликоль (10,0 экв.) и соединение 1b (1,0 экв.). Полученную суспензию нагрели до температуры 95°С. По завершении реакции (1-2 ч) смесь охладили до температуры 20°С. К этой смеси добавили смесь 30% дихлорметана/метил-трет-бутилового простого эфира (об./об.) и воды. Содержащий продукт органический слой промыли последовательно водным раствором NaOH, водным раствором янтарной кислоты и насыщенным водным раствором хлорида натрия. Продукт 1с выделили кристаллизацией из смеси дихлорметан/метил-трет-бутиловый простой эфир/гептан. Выход = 90%.
Получение хвост-кислоты 1d: к раствору соединения 1с в тетрагидрофуране (7 мл/г (36)) добавили янтарный ангидрид (2,0 экв.) и DMAP (0,5 экв.). Смесь нагрели до температуры 50°С. По завершении реакции (5 ч) смесь охладили до температуры 20°С и скорректировали значение pH до 8,5 добавлением водного раствора NaHCO3,. Добавили метил-трет-бутиловый простой эфир и продукт экстрагировали в водный слой. Добавили дихлорметан и величину pH смеси довели до pH 3 добавлением водного раствора лимонной кислоты. Содержащий продукт органический слой промыли смесью цитратного буфера с pH 3 и насыщенного водного раствора хлорида натрия. Этот раствор соединения 1d в дихлорметане использовали без выделения в получении соединения 1е.
Получение соединения 1е: к раствору соединения 1d добавили имид Ы-гидрокси-5-норборнен-2,3дикарбоновой кислоты (HONB) (1,02 экв.), 4-диметиламинопиридин (DMAP) (0,34 экв.) и затем гидрохлорид 1-(3-диметиламинопропил)-Л'-этилкарбодиимида (EDC) (1,1 экв.). Смесь нагрели до температуры 55°С. По завершении реакции (4-5 ч) смесь охладили до температуры 20°С и промыли последовательно 1:1-смесью 0,2М лимонной кислоты/рассола и рассолом. Раствор в дихлорметане подвергли обмену растворителя на ацетон и затем на N.N-диметилформамид. продукт выделили осаждением из смеси ацетон/Х,Х-диметилформамид в насыщенном водном растворе хлорида натрия. Сырой продукт повторно суспендировали несколько раз в воде для удаления остаточного Ν,Ν-диметилформамида и солей. Выход = 70% продукта 1е из соединения 1с. Иммобилизацию активированного хвоста (Tail) на смоле с дисульфидной фиксирующей связкой выполняли в N-метилпирролидоне (NMP) по методике, применяемой для введения субъединиц во время твердофазного синтеза.
Получение твердого носителя для синтеза морфолиновых олигомеров (см. фиг. 2): эту процедуру выполняли в силанизированном пептидном реакторе с рубашкой (сделанном по заказу фирмой ChemGlass, Нью-Джерси, США) с крупнопористой (40-60 мкм) стеклянной фриттой, верхней мешалкой и трехходовым тефлоновым краном, чтобы обеспечить пробулькивание азота (N2) через фритту или вакуумное отсасывание. Регулирование температуры в реакционном резервуаре проводили с помощью циркуляционной водяной бани.
Стадии обработки смолой/промывания в нижеследующей методике состоят из двух базовых операций: флюидизации смолы и выведения растворителя/раствора. Для флюидизации смолы кран позиционировали для возможности протекания потока N2 через фритту, и в реактор добавляли заданный для обработки смолы промывной состав и обеспечивали возможность пропитывания и полного смачивания смолы. Затем начинали перемешивание и суспензию смолы перемешивали в течение заданного периода времени. Для выведения растворителя/раствора перемешивание и барботирование N2 прекращали и включали вакуумный насос, затем кран поворачивали в положение для выведения промывного состава для обработки смолы в отходы. Все объемы промывного состава для обработки смолы составляли 15 мл/г смолы, если не оговорено иное.
К аминометилированной полистирольной смоле (100-200 меш; ~1,0 ммоль/г замещения N2; 75 г, 1 экв., фирма Polymer Labs, Великобритания, партия № 1464-Х799) в силанизированном пептидном реакторе с рубашкой добавили 1-метил-2-пирролидинон (NMP; 20 мл/г смолы), и смолу оставили для набухания при перемешивании в течение 1-2 ч. После удаления растворителя для набухания смолу промыли дихлорметаном (дважды по 1-2 мин), 5%-ным диизопропилэтиламином в смеси 25% изопропанол/ дихлорметан (дважды по 3-4 мин) и дихлорметаном (дважды по 1-2 мин). После удаления конечной промывной смеси смолу флюидизировали с раствором дисульфидного анкерного реагента 2а в 1-метил-2пирролидиноне (0,17М; 15 мл/г смолы, ~2,5 экв.), смесь смолы и реагента нагревали при температуре
- 119 035030
45°С в течение 60 ч. По завершении реакции нагревание прекращали, анкерный раствор удаляли и смолу промывали 1-метил-2-пирролидиноном (четырежды по 3-4 мин) и дихлорметаном (шесть раз по 1-2 мин). Смолу обрабатывали раствором 10% (об./об.) диэтилкарбоната в дихлорметане (16 мл/г; дважды по 5-6 мин), затем промывали дихлорметаном (шесть раз по 1-2 мин). Смолу 2b высушивали в токе азота (N2) в течение 1-3 ч и затем в вакуумме до постоянного веса (±2%). Выход: 110-150% от исходного веса смолы.
Определение нагрузки аминометилполистирол-дисульфидной смолы: нагрузку смолы (число потенциально доступных реакционных центров) определяют спектрометрическим анализом по числу трифенилметильных (тритильных) групп на 1 г смолы.
Высушенную смолу известного веса (25±3 мг) переносят в силанизированную мерную колбу емкостью 25 мл и добавляют ~5 мл 2%-ного (об./об.) раствора трифторуксусной кислоты в дихлорметане. Содержимое перемешивают осторожным взбалтыванием вращательными движениями и затем оставляют стоять в течение 30 мин. Объем доводят до 25 мл добавлением дополнительного 2%-ного (об./об.) раствора трифторуксусной кислоты в дихлорметане и содержимое тщательно перемешивают. С использованием пипетки прямого вытеснения аликвоту тритилсодержащего раствора (500 мкл) переносят в мерную колбу емкостью 10 мл и объем доводят до 10 мл добавлением метансульфоновой кислоты.
Содержание тритил-катионов в конечном растворе измеряют по УФ-поглощению на длине волны 431,7 нм, нагрузку смолы рассчитывают по содержанию тритильных групп на 1 г смолы (мкмоль/г) с использованием подходящих объемов, разбавлений, коэффициента экстинкции (s: 41 мкмоль-1 см-1) и веса смолы. Анализ выполняют в трипликатах и рассчитывают среднее значение нагрузки.
Процедура нагрузки смолы в этом примере будет давать смолу с нагрузкой приблизительно 500 мкмоль/г. Нагрузка на уровне 300-400 мкмоль/г была получена, если стадию введения дисульфидного анкера выполняли в течение 24 ч при комнатной температуре.
Хвост-нагрузка: с использованием таких же конфигураций и объемов, как для получения аминометилполистирол-дисульфидной смолы, в молекулу может быть введен хвост (Tail). Для стадии связывания вместо дисульфидного анкерного раствора использовали раствор соединения 1е (0,2М) в NMP, содержащем 4-этилморфолин (NEM, 0,4М). Через 2 ч при температуре 45°С смолу 2b дважды промыли 5%ным раствором диизопропилэтиламина в смеси 25% изопропанол/дихлорметан и однократно дихлорметаном (ДХМ). К смоле добавили раствор бензойного ангидрида (0,4М) и NEM (0,4М). Через 25 мин рубашку реактора охладили до комнатной температуры и смолу промыли дважды 5%-ным раствором диизопропилэтиламина в смеси 25% изопропанол/дихлорметан и восемь раз дихлорметаном. Смолу 2с отфильтровали и высушили в глубоком вакууме. Нагрузку смолы 2с определяют как составляющую нагрузку исходной аминометилполистирол-дисульфидной смолы 2b, использованной в нагрузке хвоста.
Твердофазный синтез: морфолиновые олигомеры были получены на автоматическом пептидном синтезаторе Gilson AMS-422 в полипропиленовых реакционных колонках Gilson емкостью 2 мл (партия № 3980270). Алюминиевый блок с каналами для проточной воды разместили вокруг колонок, когда они установлены в синтезаторе. В прибор AMS-422 можно попеременно добавлять реагенты/промывные растворы, выдерживать в течение заданного времении и эвакуировать колонки с использованием вакуума.
Для олигомеров в диапазоне до около 25 субъединиц в длину предпочтительна аминометилполистирол-дисульфидная смола с нагрузкой около 500 мкмоль/г смолы. Для более крупных олигомеров предпочтительной является аминометилполистирол-дисульфидная смола с нагрузкой около 300-400 мкмоль/г смолы. Если желательна молекула с 5'-хвостом, смолу, которая нагружена хвостом, выбирают с теми же характеристиками нагрузки.
Были приготовлены следующие растворы реагентов. Раствор для детритилирования: 10%-ная (вес./об.) циануксусная кислота в 4:1 смеси дихлорметан/ацетонитрил; нейтрализационный раствор: 5% диизопропилэтиламин в 3:1 смеси дихлорметан/изопропанол; раствор для сочетания: 0,18М (или 0,24М для олигомеров, вырастающих длиннее 20 субъединиц) активированная морфолиновая субъединица с желательными основанием и типом связи и 0,4М N-этилморфолин в 1,3-диметилимидазолидиноне. Дихлорметан (DCM, ДХМ) использовали в качестве переходного промывного средства, разделяющего промывания иными растворами реагентов.
На синтезаторе с блоком, настроенным на температуру 42°С, в каждую колонку, содержащую 30 мг аминометилполистирол-дисульфидной смолы (или Tail-смолы), добавляли 2 мл 1-метил-2пирролидинона и оставляли для выдерживания при комнатной температуре в течение 30 мин. После промывания дважды по 2 мл дихлорметаном, использовали следующие синтетические циклы:
- 120 035030
Стадия Объем Доставка Продолжительность выдерживания
Детритилирование 1,5 мл Сочетание 15 секунд
Детритилирование 1,5 мл Сочетание 15 секунд
Детритилирование 1,5 мл Сочетание 15 секунд
Детритилирование 1,5 мл Сочетание 15 секунд
Детритилирование 1,5 мл Сочетание 15 секунд
Детритилирование 1,5 мл Сочетание 15 секунд
Детритилирование 1,5 мл Сочетание 15 секунд
Дихлорметан 1,5 мл Сочетание 30 секунд
Нейтрализация 1,5 мл Сочетание 30 секунд
Нейтрализация 1,5 мл Сочетание 30 секунд
Нейтрализация 1,5 мл Сочетание 30 секунд
Нейтрализация 1,5 мл Сочетание 30 секунд
Нейтрализация 1,5 мл Сочетание 30 секунд
Нейтрализация 1,5 мл Сочетание 30 секунд
Дихлорметан 1,5 мл Сочетание 30 секунд
Коллектор 350 мкл - 500 мкл Шприц 40 минут
Дихлорметан 1,5 мл Сочетание 30 секунд
Нейтрализация 1,5 мл Сочетание 30 секунд
Нейтрализация 1,5 мл Сочетание 30 секунд
Дихлорметан 1,5 мл Сочетание 30 секунд
Дихлорметан 1,5 мл Сочетание 30 секунд
Дихлорметан 1,5 мл Сочетание 30 секунд
Последовательности индивидуальных олигомеров были запрограммированы в синтезаторе так, что каждая колонка получает надлежащий раствор для сочетания (A, C, G, T, I) в правильной последовательности. Когда олигомер в колонке имел завершенное введение его конечной субъединицы, колонку извлекали из блока и конечный цикл выполняли вручную с использованием раствора для сочетания, включающего 4-метокситрифенилметилхлорид (0,32М в DMI (1,3-диметил-2-имидазолидинон)), содержащего 0,89М 4-этилморфолин.
Отщепление от смолы и удаление оснований и скелетных защитных групп: после метокситритилирования смолу промывали 8 раз по 2 мл 1-метил-2-пирролидиноном. Добавляли 1 мл расщепляющего раствора, состоящего из 0,1М 1,4-дитиотреитола (DTT) и 0,73М триэтиламина в 1-метил-2пирролидиноне, колонку закупоривали и оставляли для выдерживания при комнатной температуре в течение 30 мин. После этого времени раствор сливали в пробирку Wheaton емкостью 12 мл. Смолу с сильной усадкой дважды промывали по 300 мкл расщепляющим раствором. К раствору добавляли 4,0 мл концентрированного водного раствора аммиака (сохраняемого при температуре -20°С), пробирку плотно закрывали крышкой (закручивающейся крышкой с тефлоновой прокладкой) и смесь взбалтывали вращательными движениями для перемешивания раствора. Пробирку помещали в термостат при температуре 45°С на время 16-24 ч для обеспечения расщепления основания и скелетных защитных групп.
Начальное выделение олигомеров: раствор для аммонолиза в пробирке извлекали из термостата и оставляли охлаждаться до комнатной температуры. Раствор разбавляли 20 мл 0,28%-го водного аммиака и пропускали через колонку 2,5x10 см, содержащую смолу Macroprep HQ (фирмы BioRad). Солевой градиент (А: 0,28% аммиак с В: 1М раствор хлорида натрия в 0,28%-ном растворе аммиака; 0-100% В за 60 мин) использовали для вымывания пика, содержащего метокситритил. Объединенные фракции объединили и подвергли дополнительной обработке в зависимости от желательного продукта.
Деметокситритилирование морфолиновых олигомеров: объединенные фракции из очистки на Macroprep обработали 1М раствором Н3РО4 для снижения величины pH до 2,5. После первоначального перемешивания образцы оставляли при комнатной температуре на 4 мин, в это время нейтрализовали их до величины pH 10-11 добавлением 2,8%-ного водного раствора аммиака. Продукты очищали твердофазной экстракцией (SPE).
В фриттовые колонки (хроматографические колонки BioRad Econo-Pac (732-1011)) емкостью 20 мл помещают Amberchrome CG-300М (фирмы Rohm and Haas; Филадельфия, Пенсильвания) (3 мл) и смолу промывают 3 мл в следующем порядке: 0,28% NH4OH/80% ацетонитрила; 0,5М NaOH/20% этанола; во
- 121 035030 да; 50 мМ Н3РО4/80% ацетонитрила; вода; 0,5 NaOH/20% этанола; вода; 0,28% NH4OH.
Раствор из стадии деметокситритилирования помещали в колонку и смолу промывали трижды 3-6 мл 0,28%-ного водного раствора аммиака. Пробирку Wheaton (12 мл) поместили в колонку и продукт элюировали двумя промываниями по 2 мл 45%-ного раствора ацетонитрила в 0,28%-ном водном растворе аммиака. Растворы заморозили в сухом льду и пробирки поместили в сублимационную камеру для получения пушистого белого порошка. Образцы растворили в воде, профильтровали через фильтр с порами 0,22 мкм (фирмы Pall Life Sciences, шприцевый фильтр Acrodisc диаметром 25 мм, с 0,2-микронной мембраной НТ Tuffryn), с использованием шприца, и оптическую плотность (OD) измерили на УФспектрофотометре для определения OD единиц присутствующего олигомера, а также для подготовки образца для анализа. Затем поместили растворы обратно в пробирки Wheaton для лиофилизации.
Анализ морфолиновых олигомеров: для определения состава фракций при очистке, а также для подтверждения идентичности (молекулярной массы) олигомеров использовали масс-спектрометрию MALDI-TOF (матрично-активированная лазерная десорбция/ионизация времяпролетная массспектрометрия). Образцы проводили сообразно разбавлению раствором 3,5-диметокси-4гидроксикоричной кислоты (синапиновой кислоты), 3,4,5-тригидроксиацетофенона (ТНАР) или α-циано4-гидроксикоричной кислоты (НССА) в качестве матриц.
Катионообменную (SCX) HPLC выполняли с использованием колонки Dionex ProPac SCX-10, 4x250 мм (фирмы Dionex Corporation; Саннивейл, Калифорния) с использованием 25 мМ раствора ацетата натрия с pH 5-25% ацетонитрила (буфер А) и 25 мМ раствора ацетата натрия с pH 5-25% ацетонитрила-1,5М хлорида калия (буфер В) (градиент 10-100% В в 15 мин) или 25 мМ KH2PO4-25% ацетонитрила при pH 3,5 (буфер А) и 25 мМ KH2PO4-25% ацетонитрила при pH= ,5 с 1,5М хлорида калия (буфер В) (градиент 0-35% В в 15 мин). Первую из названных систем применяли для положительно заряженных олигомеров, которые не имеют присоединенного пептида, тогда как последнюю использовали для пептидных конъюгатов.
Очистка морфолиновых олигомеров с помощью катионообменной хроматографии: образец растворяют в 20 мМ растворе ацетата натрия, pH 4,5 (буфер А) и вносят в колонку Source 30 с катионообменной смолой (фирмы GE Healthcare), элюируют в градиенте 0,5М хлорида натрия в 20 мМ ацетата натрия и 40% ацетонитрила, pH 4,5 (буфер В). Объединенные фракции, содержащие продукт, нейтрализуют концентрированным водным раствором аммиака и вносят в колонку Amberchrome SPE. Продукт элюируют, замораживают и лиофилизируют, как указано выше.
I. Биологическая оценка.
Пример 1. Лечение клеток, зараженных вирусом гриппа А.
Приготовили серию РМО-содержащих разнообразных модифицированных межсубъединичных связей и использовали для лечения зараженных вирусом гриппа А клеток в культуре. Все PMO и PMOсодержащие модифицированные межсубъединичные связи согласно настоящим изобретениям были рассчитаны нацеленными на сегмент М1/М2 вируса при AUG-стартовом кодоне, и имеют одну из двух последовательностей оснований. Ингибирование репликации вируса гриппа А антисмысловым нацеливанием на многочисленные сайты внутри М1/М2-сегмента описано в патентной заявке США № 12945081, которая включена здесь ссылкой во всей своей полноте. В дополнение к ингибированию трансляции нацеливанием на общий М1/М2-AUG-стартовый сайт мишенями с использованием соединений согласно изобретению также могут быть донорные сайты сплайсинга и акцепторные сайты сплайсинга.
Клеточная линия мышиного альвеолярного макрофага (АТСС; AMJ2-C11) была заражена при 0,1 MOI вирусом H1N1 (штамм PR8), через 1 ч после инфицирования было добавлено испытуемое соединение. Клетки инкубировали при 35°С в течение ночи. Затем отобрали супернатант с вирусными частицами и инкубировали с VNAR-протеазой для высвобождения вирусной РНК. Гемагглютинин (НА) РНК количественно оценивали с использованием количественной полимеразной цепной реакции (PCR, ПЦР) в режиме реального времени (qRT-PCR). Клетки промывали, фиксировали и пермеабилизировали. Затем белки M1 и М2 были зондированы моноклональными антителами в течение 30 мин при температуре 37°С. Клетки промывали и антимышиный IgG, конъюгированный с Alexa 646, добавляли в течение 15 мин при комнатной температуре. Затем M1 и М2 исследовали проточным цитометрическим анализом. Для определения уровней белков M1 и М2 процентную долю M1- или М2-положительнвх клеток умножали на среднюю интенсивность флуоресценции M1 или М2. Каждый образец затем был разделен для необработанного контроля, чтобы генерировать процентную долю M1 или М2 сравнительно с необработанными шифрованными контрольными образцами.
Наблюдалось снижение уровней вирусного белка М2 из клеток, обработанных разнообразными соединениями согласно изобретению. Вышеописанный метод проточного цитометрического анализа использовали для определения относительной экспрессии белка М2 после обработки при 60 микромолярном уровне. Соединения согласно изобретению ингибировали продуцирование белка М2 с переменной степенью.
Пример 2. Лечение in vivo зараженных вирусом гриппа А мышей.
Дополнительные эксперименты в поддержку изобретения были выполнены с использованием мы
- 122 035030 шей Balb/c, инфицированных штаммом PR8 гриппа А. Мыши были инфицированы при титре 3,5 TCID50 интраназальной инокуляцией после того, как были обработаны за 4 ч до этого разнообразными раскрытыми здесь соединениями согласно изобретению. В некоторых экспериментах дополнительную дозу испытуемого соединения вводили через 96 ч после инфицирования. Все дозы состояли из 100 мкг испытуемого соединения в 50 мкл натрий-фосфатного буфера (PBS) и были введены интраназальным вдуванием. Ежедневно отслеживали вес животных и использовали как клиническую конечную точку для противовирусной активности лекарственного средства. На 7-й день после инфицирования животные были забиты и легкие были изъяты для определений вирусной нагрузки с использованием метода qRT-PCR, описанного в примере 1.
Определения TCID50 были выполнены с использованием полулогарифмических серийных разведений легочных гомогенатов и размещением на клетках макрофагов AMJ-C12. Через 24 ч при температуре 35°С среду заменили и инкубировали в течение дополнительных 72 ч при температуре 35°С. Добавили 50 мл 0,5%-ного раствора куриных эритроцитов (RBC) в PBS и инкубировали в течение 1 ч при 4°С. Считывали картину гемагглютинации и рассчитывали TCID50 с использованием метода Рида-Мюнха. Значения TCID50 затем нормализовали по весу исходной ткани.
Соединения согласно изобретению, как здесь раскрытые, проявляют повышенную противовирусную активность и уменьшают потерю веса по сравнению с PMO-плюс-соединением после инфицирования H1N1. Мыши Balb/c (n=4) были инфицированы H1N1 и получали однократную дозу в 100 мкг испытуемого соединения за 4 ч до инфицирования. Мышей ежедневно взвешивали и определяли потерю веса в процентах от веса до инфицирования. Легкие были отобраны на 7 день после инфицирования и проанализированы на вирусную нагрузку по TCID50. Результаты представлены как кратное повышение противовирусной активности сравнительно с голым PMO. Этот эксперимент показывает приблизительно 50кратное повышение противовирусной активности двух РМО-Х соединений сравнительно с немодифицированным РМО и приблизительно 10-кратно более высокую активность по сравнению с PMO-плюссоединением.
Описанные выше разнообразные варианты осуществления могут быть скомбинированы для создания дополнительных вариантов осуществления. Все патенты США, публикации патентных заявок США, патентные заявки США, иностранные патенты, иностранные патентные заявки и непатентные публикации, цитированные в этом описании, и/или перечисленные в инструкции по применению изделия, включены здесь ссылкой во всей своей полноте. Аспекты вариантов осуществления могут быть модифицированы, если необходимо, для реализации принципов разнообразных патентов, заявок и публикаций, для создания еще дополнительных вариантов осуществления. Эти и прочие изменения могут быть сделаны в отношении вариантов осуществления с учетом подробного вышеприведенного описания. В общем, в пунктах нижеследующей патентной формулы, использованные термины не должны толковаться как ограничивающие пункты патентной формулы конкретными вариантами осуществления, раскрытыми в описании и в пунктах патентной формулы, но должны рассматриваться как включающие все возможные варианты осуществления вместе со всем диапазоном эквивалентов, к которым такие пункты патентной формулы относятся. Соответственно этому пункты патентной формулы не ограничиваются описанием.
В то время как здесь были показаны и описаны предпочтительные варианты осуществления настоящего изобретения, квалифицированным специалистам в этой области технологии будет очевидно, что такие варианты осуществления приведены только в качестве примера. Многообразные вариации, изменения и замены теперь будут сделаны квалифицированными специалистами в этой области технологии без выхода за пределы изобретения. Должно быть понятно, что при практической реализации изобретения могут быть использованы разнообразные альтернативы вариантов осуществления описанного здесь изобретения. Предполагается, что пункты нижеследующей патентной формулы определяют область изобретения, и что тем самым охватываются методы и структуры в пределах области этих пунктов патентной формулы и их эквиваленты.
Настоящая заявка согласно Разделу 35 Кодекса законов США, §119(е), утверждает преимущество предварительной патентной заявки США № 61/561806, поданной 18 ноября 2011 г.; данная заявка включена здесь ссылкой во всей своей полноте.

Claims (12)

  1. ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ
    1. Соединение, имеющее структуру формулы (I)
    - 123 035030
    W=P—X
    I
    R13 (I) или его соль, в которой n представляет собой целое число от 2 до 35;
    G5 представляет собой галоген, OH, Q-C^-алкоксигруппу, OSO2(Cl-Cl2-алкил), OSO2(С6-С3o-арил), или структуру
    каждый остаток В представляет собой независимо выбранный фрагмент образующего пару основания, каждый фрагмент Y представляет собой независимо O или NR10; причем, необязательно, R10 и Х8е соединены друг с другом с образованием цикла;
    каждый фрагмент W представляет собой независимо S или О;
    Z5 представляет собой -(L11)-(R15);
    L11 выбирают из
    k) -C(R23)2O-; причем L13 выбирают из
    - 124 035030
    L12 представляет собой линкер, расщепляемый в биологических условиях, выбранный из
    a) -(С1-Сю-алкилен)-ОС(О)О-СН2О-;
    b) -C(O)-(C1-C1o-алкилен)-ОС(О)О-СН2О-;
    c) -С(О)-(СН=СН)-С(О)О-СН2О-;
    d) -(C1-C10-алкилен)-S-S-CH2CH2O- или
    e) -C(O)-(C1-C1o-алкилен)-S-S-CH2CH2O-;
    L15 представляет собой двухвалентный радикал, выбранный из групп С1-С12-алкилен, С3-С8циклоалкилен, С6-С30-арилен, -(С6-С30-арилен)-(С1-С12-алкилен)-, -(С1-С12-алкилен)-С(=С)-, -(С2-С30алкокси)-С(=С)-, -(3-18-членный гетероалкилен)-С(=С)-, -(С3-С8-циклоалкилен)-C(=O)-, -(С3-С8-циклоалкилен)-(С1-С12-алкилен)-О(=С)-, -(С1-С12-алкилен)(С3-С8-циклоалкилен)-C(=O)-, -(С6-С30-арилен)C(=O)-, -(С6-С30-арилен)-(С1-С12-алкилен)-C(=O)-, -(c1-С12-алкилен)-(С6-С30-арилен)-C(=O)-, -(С1-С12алкиленЬС-О^С)-, -(С3-С8-циклоалкилен)-O-C(=O)-, -(С7-С30-арилен)-O-C(=O)-, -(С6-С30-арилен)-(С1С12-алкилен)-O-C(=O)-, -(С6-С30-арилен)-(С1-С12-алкилен)-О-С(=О)-, -С(=О)ОК21 или -P(=O)(R22)2;
    R12 представляет собой электронную пару, при условии, что если R13 представляет собой С1-С12алкил, то R12 представляет собой электронную пару, N-оксид или С1-С6-алкил;
    каждый радикал R10 и R13 независимо выбирают из атома водорода, гуанидинильной, амидинильной, гетероциклильной, С1-С12-алкильной, С3-С8-циклоалкильной; С6-С30-арильной, С7-С30-арилалкильной, С1-С30-алкилкарбонильной, С3-С8-циклоалкилкарбонильной, С3-С8-циклоалкилалкилкарбонильной, С6-С30-арилкарбонильной, С7-С30-арилалкилкарбонильной, С1-С12-алкилоксикарбонильной, С3-С8-циклоалкилоксикарбонильной, С7-С30-арилоксикарбонильной, С8-С30-арилалкилоксикарбонильной групп, -C(=O)OR21, -C(=O)NHR21 или -P(=o)(R22)2;
    R15 независимо выбирают из гуанидинильной, амидинильной, 3-24-членного гетероциклила, С1-С12алкильной, С3-С8-циклоалкильной; С6-С30-арильной, С7-С30-арилалкильной, С1-С12-алкилкарбонильной, С3-С8-циклоалкилкарбонильной, С3-С8-циклоалкилалкилкарбонильной, С6-С30-арилкарбонильной, С7-С30арилалкилкарбонильной, С2-С30-алкилоксикарбонильной, С3-С8-циклоалкилоксикарбонильной, С7-С30арилоксикарбонильной, С8-С30-арилалкилоксикарбонильной, 3-18-членной алкоксиалкилкарбонильной групп, -SO2R21, -Q^^R21, -P(=O)(OH)2 или -P(=O)(R22)2;
    каждый радикал R21 независимо представляет собой С1-С12-алкильную или 3-18-членную алкокси алкильную группу;
    каждый радикал R22 независимо представляет собой С6-С12-арилоксигруппу;
    каждый радикал R23 независимо представляет собой H или С1-С6-алкил; или, необязательно, две R23-группы, объединенные с образованием 3-8-членного цикла;
    R24 представляет собой С1-С6-алкилен;
    Q независимо выбирают из X1, Х2, Х3, Х4, Х5, Х6, Х7 или Х8;
    каждый X независимо выбирают из X1, Х2, Х3, Х4, Х5, Х6, Х7 или Х8, при условии, что по меньшей мере один X не представляет собой X1;
    причем X1 представляет собой N(d 13)2;
    причем Х2 выбирают из
    a) -O-(C1-C12)-алкилен-СО2Н;
    b) -O-(С1-С12)-алкилен-тетразолил;
    c) -^К^ДСгС^-алкилен-СОгН;
    d) -^Е^ХС^СпДалкилен-тетразолил;
    e) -L1-CO-(C1-C12)-алкилен-СО2Н;
    f) -L1-CO-(C1-C12)-алкилен-тетразолил;
    g) -L1-CO-(C1-C12)-алкенилен-СО2Н;
    h) -L1 -CO-(C1-C12)-алкенилен-тетразолил;
    i) -L1-CO-(С6-Сзo)-арилен-СО2Н;
    j) -L1 -CO-(С6-С30)-арилен-тетразолил;
    k) -L1-CONH-(C1-C12)-алкилен-СО2Н;
    - 125 035030
    l) -L1 -CONH-(Ci -Ci 2)-алкилен-тетразолил;
    m) -L1-CONH-(С6-Сзo)-арилен-СО2Н;
    n) -L1 -CONH-(С6-Сзo)-арилен-тетразолил;
    o) -L1-SO2-(C1-C12)-алкилен-СО2Н;
    p) -L 1-SO2-(C1 -C12)-алкилен-тетразолил;
    q) -L1-SO2-(С6-Сзo)-арилен-СО2Н;
    r) -L 1-SO2-(С6-Сзo)-арилен-тетразолил;
    s) -L1-(C1-C12)-алкилен-СО2Н;
    t) -Ы-^-СД-алкилен-тетразолил;
    u) -С1-(С6-Сзо)-арилен-СО2Н;
    v) -Ь1-(С6-С30)-арилен-тетразолил;
    причем X3 выбирают из
    a) -СЬ^-СД-алкил;
    b) -L1 -(3 -24-членный)гетероциклил;
    c) -O-(C1-C12)-алкилен-CNH-NH2;
    d) -N(R1)-(С1-С12)-алкилен-CNH-NH2;
    e) -L1-CNH-NH2;
    f) ^1-(^-^2)^^^-0^4-14¾
    g) -L1-(C6-C30)-арилен-CNH-NH2;
    h) -L1-CO-(C1-C12)-алкилен-CNH-NH2;
    i) -L1-CO-(C1-C12)-алкенилен-CNH-NH2;
    j) -L1-CO-(C6-Cзо)-арилен-CNH-NH2;
    k) -L1 -CONH-(C1 -C12)-алкилен-CNH-NH2;
    l) -L1-CONH-(C6-Cзо)-арилен-CNH-NH2;
    m) -L1-SO2-(C1-C12)-алкилен-CNH-NH2;
    n) -L1-SO2-(C6-C30)-арилен-CNH-NH2;
    o) -ОДС-СД-алкилен-^К1)^
    p) -N(R1)-(C1 -C12) -алкилен-N (R1)2;
    q) -L1-N(R1)2;
    r) -L1-(C1-C12)-алкилен-N(R1)2;
    s) -L1-(c6-Cзо)-арилен-N(R1)2;
    t) -L1-CO-(C1-C12)-алкилен-N(R1)2;
    u) -L1 -CO-(C1 -C1 гУалкенилен-КЩ^г;
    v) -L1 -CO-(C6-C30)-арилен-N(R1 )2;
    w) -L1-CONH-(C1-C12)-алкилен-N(R1)2;
    x) -L1 -CONH-(C6-Cзо)-арилен-N(R1 )2;
    y) -L 1-SO2-(C1 -C12)-алкилен-N(R1 )2;
    z) -O-(С1-С12)-алкилен-N(R2)3;
    aa) -N(R1)-(C1 -C12)-алкилен-N(R2)3;
    bb) -L1-N(R2)3;
    cc) -L1-(C1-C12)-алкилен-N(R2)3;
    dd) -L1-(C6-C30)-арилен-N(R2)3;
    ее) -L1 -CO-(C1 -C12) -алкилен-МАу,;
    ff) -L1 -CO-(C1 -C12)-алкенилен-N(R2)3;
    gg) -L1 -CO-(C6-Cзо)-арилен-N(R2)з;
    hh) -L1 -CONH-(C1 -C12)-алкилен-N(R2)з;
    ii) -L1 -CONH-(C6-Cзо)-арилен-N(R2)з;
    j j) -L1-SO2-(C1-C12)-алкилен-N(R2)3;
    kk) -O-(O -С12)-алкилен-(3 -24-членный)гетероциклил;
    ll) -N(R1)-(C1-C12)-алкилен-(3-24-членный)гетероциклил;
    mm) -L1-(3-24 -членный)алкилен-(3 -24-членный)гетероциклил;
    nn) -L1 -(С6-С30)-арилен-(3 -24-членный)гетероциклил;
    оо) -L1 -CO-(C1 -О2)-алкилен-(3 -24-членный)гетероциклил;
    pp) -L1 -CO-(C1 -О2)-алкенилен-(3 -24-членный)гетероциклил;
    qq) -L1 -CO-(C6-C30)-арилен-(3 -24-членный)гетероциклил;
    rr) -L1 -CONH-(C1 -C12)-алкилен-(3 -24-членный)гетероциклил;
    ss) -L1 -CONH-(C6-C30)-арилен-(3 -24-членный)гетероциклил;
    tt) -L1 -SO2-(Q -С12)-алкилен-(3 -24-членный)гетероциклил;
    uu) -O-(C1-C12)-алкилен-N(О)(R2)2;
    vv) -N(R1)-(С1-С12)-алкилен-N(О)(R2)2;
    ww) -L1-N(O)(R2)2;
    xx) -L1 -(C1 -C12)-алкилен-Н(О)Щ2)23;
    - 126 035030 yy) -L1-apHneH-N(O)(R2)2;
    zz) -L1-CO-(Ci-Ci2)-anKuneH-N(O)(R2)2; aaa) -L1-CO-(C1-C12)-anKeHHneH-N(o)(R2)23;
    bbb) -L1 -CO-(C6-Cзo)-apилeн-N(O)(R2)2; ccc) -L1 -CONH-(C 1 -C п)-алкилен^(О)Щ2)2;
    ddd) -L1 -CONH-(C6-C30)-apилeн-N(O)(R2)2;
    eee) -L1-SO2-(C1-C12)-aлкилeн-N(O)(R2)2;
    fff) -O-(С1-С12)-aлкилeн-NH-CNH-NH2;
    ggg) -N(R1)-(C1-C12)-aлкилeн-NH-CNH-NH2;
    hhh) -L1-NH-CNH-NH2;
    iii) -L1-(C1-C12)-aлкилeн-NH-CNH-NH2; jjj) -L1-(c6-C30)-apилeн-NH-CNH-NH2;
    kkk) -L1-CO-(C1-C12)-aлкилeн-NH-CNH-NH2;
    lll) -L1-CO-(C1-C12)-aлкeнилeн-NH-CNH-NH2;
    mmm) -L1-CO-(C6-Cзo)-apилeн-NH-CNH-NH2;
    nnn) -L1-CONH-(C1-C12)-aлкилeн-NH-CNH-NH2;
    ooo) -L1 -CONH-(c6-C30)-apилeн-NH-CNH-NH2;
    ppp) -LI-SO2-(C1-C12)-aлкилeн-NH-CNH-NH2;
    qqq) -L1-SO2-(C6-Cзo)-apилeн-NH-CNH-NH2;
    при условии, что если X1 присутствует как N(CH3)2 и Х7 присутствует как пиперидинил, то X3 не представляет собой
    причем Х4 выбирают из
    a) -O-(С1-С12)-aлкилeн-(С6-С3o)-apил;
    b) -N(R1)-(C6-Cзo)-apил;
    c) -N(R1)-(C1-C12)-aлкилeн-(С6-С3o)-apил;
    d) -L1-CO-(C1-C12)-aлкилeн-(С6-С30)-apил;
    e) -L1-CO-(C1-C12)-aлкeнилeн-(С6-С30)-apил;
    f) -L1 -CO-(С6-С30)-apилeн-(С6-С30)-apил;
    g) -L1-CONH-(C1-C12)-aлкилeн-(С6-С30)-apил;
    h) -L1-CONH- (С6-С3о)-арилен-(С6-С3о)-арил
    i) -L1-SO2-(С1-С12)-aлкилeн-(С6-С30)-apил;
    j) -L1-SO2-(С6-С30)-apилeн-(С6-С30)-apил;
    k) -L1-(C1-C12)-aлкилeн-(С6-С30)-apил;
    l) -L1 -(С6-С30)-арилен-(С6-С30)-арил;
    m) -N(R1)-(C1-C12)-aлкилeн-N(R1)-(С6-С30)-apил;
    n) -N(R1)-(C1-C12)-aлкилeн-N(R1)СO-(С6-Сзо)-apил;
    o) -N(R1)-(C1-C12)-aлкилeн-N(R1)SO2-(C6-Cзо)-apил;
    p) -N(R1)-(C1-C12)-aлкилeн-N(R1)СН2-(С6-Сзо)-apил;
    q) -LP^^^^;
    r) -Б1-СО-(С6-С30)-арил;
    s) -L1-SO2-(С6-С30)-apил;
    t) -L1 -(C1 -C 12)-алкилен-Р((С6-С30)-арил)3;
    u) -L1-CO-(C1-C12)-aлкилeн-Р((С6-С30)-apил)3;
    v) -L1-SO2-(C1-C12)-aлкилeн-Р((С6-С30)-apил)3; причем Х5 выбирают из
    a) -O-(C1-C12)-aлкилeн-(5-14-члeнный)гeтepоapил;
    b) -N(R1)-(C1-C12)-aлкилeн-(5-14-члeнный)гeтepоapил;
    c) -L1-CO-(C1-C12)-aлкилeн-(5-14-члeнный)гeтepоapил;
    d) -L1-CO-(C1-C12)-aлкeнилeн-(5-14-члeнный)гeтepоapил;
    e) -L1 -СО-(С6-С30)-арилен-(5-14-членный)гетероарил;
    f) -L1-CONH-(C1-C12)-aлкилeн-(5-14-члeнный)гeтepоapил;
    g) -L1 -CONH-(C6-C30)-apилeн-(5 -14-членный)гетероарил;
    h) -L1-SO2-(С1-С12)-aлкилeн-(5-14-члeнный)гeтepоapил;
    i) -L1 -SO2-(С6-С30)-apилeн-(5-14-члeнный)гeтepоapил;
    j) -L1 -(C1 -C 12)-алкилен-(5-14-членный)гетероарил;
    k) -L1 -(С6-С30)-арилен-(5-14-членный)гетероарил;
    l) -NfR/HQ -С12)-алкилен^ (R1)-(5-14 -членный)гетероарил;
    - 127 035030
    m) -Х(К1)-(С1-С12)-алкилен-Х(К1)СО-(5-14-членный)гетероарил;
    n) -N(R1)-(C1-C12)-алкилен-N(R1)SO2-(5-14-членный)гетероарил;
    o) -N(R1)-(C1-C12)-алкилен-N(R1)СН2-(5-14-членный)гетероарил;
    p) -L 1-(5-14-членный)гетероарил; причем X6 выбирают из
    a) -O-(C1-C12)-алкилен-(ОСН2СН2)mOH;
    b) -O-(C1-C12)-алкилен-(ОСН2СН2)mOCH3;
    c) -N(R1)-(С1-С12)-алкилен-(ОСН2СН2)mOH;
    d) -N(R1)-(С1-С12)-алкилен-(0СН2СН2)m0CHз;
    e) -N(R1)-(С6-Сзo)-арилен-(ОСН2СН2)mOH;
    f) -N(R1)-(С6-Сзo)-арилен-(ОСН2СН2)mOCHз;
    g) -L1-(C1-C12)-алкилен-(ОСН2СН2)mOH;
    h) -L1-CO-(C1-C12)-алкилен-(ОСН2СН2)mOH;
    i) -L1-CO-(C1-C12)-алкилен-(ОСН2СН2)mOCHз;
    j) -L1-SO2-(С1-С12)-алкилен-(ОСН2СН2)mOH;
    k) -L1-SO2- (C1-C12)-алкилен-(ОСН2СН2)mOCHз;
    l) -L1-СО-(С6-Сзo)-арилен-(ОСН2СН2)mOH;
    m) -L1-СО-(С6-Сзo)-арилен-(ОСН2СН2)mOCHз;
    n) -L1-SO2-(С6-Сзo)-арилен-(ОСН2СН2)mOH;
    o) -L1-SO2-(c6-Сзo)-арилен-(oСН2СН2)mOCHз;
    p) -L1-СО-(ОСН2СН2)mOH;
    q) -L1-CO-(OCH2CH2)mOCH3;
    r) -Ы/Д?)-(дибензо-18-краун-6);
    s) азакраун-эфир; причем Х7 выбирают из
    a) -гетероциклил;
    b) -N(R1)(R3);
    c) -Шводород;
    d) -L1-(C1-C12)-алкил;
    e) -L1-CO-(C1-C3o)-алкил;
    f) -L1-CONH-(С1-С12)-алкил;
    g) -L1-CON((C1-C12)-алкил)-(C1-C12)-алкил;
    h) -L1-SO2-(С1-С12)-алкил;
    при условии, что если X1 присутствует как N(CH3)2 и X3 присутствует как
    то Х7 не представляет собой пиперидинил;
    причем Х8 выбирают из
    a) -L1-CA;
    b) -L1-dCA;
    c) -L1-COCH2(R4);
    d) -L1-COCH(R4)NHCO2-(C1-Cn)^^;
    e) -OR5, причем R5 и R10 совместно образуют цикл;
    каждый R1 независимо представляет собой атом водорода или алкил;
    каждый R2 независимо представляет собой С1-С12-алкил, или, необязательно, когда два R2 представляют С1-С12-алкил, то два R2 соединены с образованием 3-24-членного гетероциклического кольца;
    каждый R3 независимо представляет собой С2-С18-алкил, (С2-C6)-алкенил;
    каждый R4 независимо представляет собой атом водорода, (Л-С^-алкил, гидрокси^-Л^-алкил, сульфгидрил(C1-C12)-алкил или (С6-С30)-арил(С1-С12)-алкил;
    каждый R5 независимо представляет собой С1-С12-алкил;
    каждый R6 независимо представляет собой атом водорода или С1-С12-алкил;
    L1 выбирают из
    - 128 035030
    причем каждый Q1 и Q2 в каждом случае выбирают из связи, -О- или -N(R6)-;
    каждый Е1 независимо выбирают из (С6-С30)-арильной или 5-14-членной гетероарильной группы;
    каждый Е2 независимо представляет собой азотсодержащую гетероарильную группу;
    каждый L4 и L5, в каждом случае независимо, представляет связь, С1-С6-алкильную или (3-24членную)гетероалкильную группу;
    m, р, q, s, и t, каждый независимо, составляет 1-4, каждый гетероциклильный фрагмент независимо содержит от 1 до 8 гетероатомов, выбранных из группы, состоящей из N, О, Р и S; и каждый гетероарильный фрагмент независимо содержит от 1 до 6 гетероатомов, выбранных из группы, состоящей из N, О, Р и S, при этом, если группа X на фосфористой связи, ближайшей к 3'-концу, представляет собой
    где Ahx обозначает 6-аминогексановую кислоту и R обозначает аргинин, то по меньшей мере три другие группы X не являются X1, и где X не является
  2. 2. Соединение по п.1, в котором по меньшей мере один X выбирают из
    - 129 035030
    по меньшей мере один X представляет собой -L1-(
  3. 3-243. Соединение по п.1, в котором членный)гетероциклил и в котором L1 выбирают из
  4. 4. Соединение по п.1, в котором по меньшей мере один X выбирают из
  5. 5. Соединение по п.1, в котором по меньшей мере один X выбирают из -N(R1)-(C1-C12)-алкиленCNH-NH2, -Х(К1)-(С1-С12)-алкилен-Х(Я1)2, -N(R1)-(C1-C12)-алкилен-N(R2)3, -N(R1)-(C1-C12)-алкилен-(3-24членный)гетероциклил, -N(R1)-(C1-C12)-алкилен-N(O)(R2)2 и -N(R1)-(C1-C12)-алкилен-NH-CNH-NH2.
  6. 6. Соединение по п.1, в котором по меньшей мере один X выбирают из Щ1-(5-14-членный)гетероарил, -L1-(C1-C12)-алкилен-(5-14-членный)гетероарил, -L1-(C6-C3o)-арилен-(5-14-членный)гетероарил, -L1-CO-(C1-C12)-алкилен-(5-14-членный)гетероарил, Ш1-С’О-(С’|-С’|2)-алкенилен-(5-14-членный)гетероарил, -L1 -СО-(С6-С30)-арилен-(5- 14-членный)гетероарил, -L1 -CONH-(C1-C12) -алкилен-(5 - 14-членный) гетероарил, -L1 -CONH-(С6-С30)-арилен-(5-14-членный)гетероарил, -L 1-SO2-(C1-C12)-алкилен-(5-14членный)гетероарил, -L1 -SO2-(C6-C30)-арилен-(5 - 14-членный)гетероарил.
  7. 7. Соединение по п.1, в котором по меньшей мере один X представляет собой -L1-CO-(C1-C12)алкил.
  8. 8. Соединение по любому из пп.1-7, в котором Z5 представляет собой -(L11)-(R15); каждый Y независимо представляет собой О, NH или NR10; каждый W представляет собой О; каждый R1 независимо представляет собой атом водорода или (C1-C12)-алкил; каждый R2 независимо представляет собой С1-С12алкил; и каждый X независимо выбирают из X1, Х2, Х3, Х4, Х5, Х6, Х7 или Х8.
  9. 9. Соединение по любому из пп.1-7, в котором каждый Y представляет собой О, и каждый W представляет собой О.
  10. 10. Соединение по любому из пп. 1-9, в котором R13 представляет собой трифенилметильную группу.
  11. 11. Соединение по любому из пп.1-10, в котором G5 представляет собой
    - 130 035030 в
    и Z5 представляет собой -(L11)-(R15), в котором С2-С30-алкилоксикарбонил выбирают из
    -С(=О)ОСН2СН2ОН, -С(=О)ОСН2СН2ОСН2СН2ОН или -С^ЖН^Н^СН^Н^СН^Н^Н.
  12. 12. Соединение по п.11, в котором Z5 представляет собой
    N • Ν
EA201490994A 2011-11-18 2012-11-15 Модифицированные морфолиновые аналоги олигонуклеотидов EA035030B1 (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201161561806P 2011-11-18 2011-11-18
PCT/US2012/065350 WO2013074834A1 (en) 2011-11-18 2012-11-15 Functionally-modified oligonucleotides and subunits thereof

Publications (2)

Publication Number Publication Date
EA201490994A1 EA201490994A1 (ru) 2014-11-28
EA035030B1 true EA035030B1 (ru) 2020-04-20

Family

ID=48430160

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
EA201490994A EA035030B1 (ru) 2011-11-18 2012-11-15 Модифицированные морфолиновые аналоги олигонуклеотидов
EA202090338A EA202090338A1 (ru) 2011-11-18 2012-11-15 Функционально-модифицированные олигонуклеотиды и их субъединицы

Family Applications After (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
EA202090338A EA202090338A1 (ru) 2011-11-18 2012-11-15 Функционально-модифицированные олигонуклеотиды и их субъединицы

Country Status (13)

Country Link
US (5) US9278987B2 (ru)
EP (1) EP2780299A4 (ru)
JP (4) JP2015500204A (ru)
KR (4) KR102271212B1 (ru)
CN (3) CN104039739A (ru)
AU (4) AU2012340390B2 (ru)
BR (1) BR112014011875B1 (ru)
CA (1) CA2854907C (ru)
EA (2) EA035030B1 (ru)
HK (2) HK1201514A1 (ru)
IL (3) IL232651B (ru)
MX (1) MX354940B (ru)
WO (1) WO2013074834A1 (ru)

Families Citing this family (33)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CA2596506C (en) 2005-02-09 2021-04-06 Avi Biopharma, Inc. Antisense composition and method for treating muscle atrophy
US8067571B2 (en) 2005-07-13 2011-11-29 Avi Biopharma, Inc. Antibacterial antisense oligonucleotide and method
JP2013530154A (ja) 2010-05-28 2013-07-25 サレプタ セラピューティクス， インコーポレイテッド 修飾されたサブユニット間結合および／または末端基を有するオリゴヌクレオチドアナログ
US10017763B2 (en) 2010-09-03 2018-07-10 Sarepta Therapeutics, Inc. dsRNA molecules comprising oligonucleotide analogs having modified intersubunit linkages and/or terminal groups
US20130085139A1 (en) 2011-10-04 2013-04-04 Royal Holloway And Bedford New College Oligomers
EA035030B1 (ru) * 2011-11-18 2020-04-20 Сарепта Терапьютикс, Инк. Модифицированные морфолиновые аналоги олигонуклеотидов
DK2788487T3 (en) 2011-12-08 2018-07-23 Sarepta Therapeutics Inc Oligonucleotide Analogs Targeted against HUMAN LMNA
CN105228999B (zh) * 2013-05-24 2021-03-02 味之素株式会社 吗啉代寡核苷酸的制备方法
KR20210088009A (ko) 2013-09-05 2021-07-13 사렙타 쎄러퓨틱스, 인코퍼레이티드 산성 알파-글루코시다제 내 안티센스-유도된 엑손2 포함
JP6673211B2 (ja) * 2014-10-14 2020-03-25 味の素株式会社 モルフォリノオリゴヌクレオチドの製造方法
CA2972653A1 (en) 2014-12-31 2016-07-07 Board Of Regents, The University Of Texas System Antisense antibacterial compounds and methods
BR112017015019A2 (pt) 2015-01-16 2018-01-30 The General Hospital Corporation compostos para melhorar a splicing de mrna
US20180216111A1 (en) * 2015-02-27 2018-08-02 Sarepta Therapeutics, Inc. Antisense-induced exon2 inclusion in acid alpha-glucosidase
MA41795A (fr) 2015-03-18 2018-01-23 Sarepta Therapeutics Inc Exclusion d'un exon induite par des composés antisens dans la myostatine
MA50829A (fr) 2015-06-01 2018-04-11 Sarepta Therapeutics Inc Exclusion d'exon induite pat technologie antisens dans le collagène de type vii
EP3302489A4 (en) 2015-06-04 2019-02-06 Sarepta Therapeutics, Inc. METHOD AND COMPOUNDS FOR THE TREATMENT OF DISEASES AND SUFFERING IN CONNECTION WITH LYMPHOCYTES
SI3331891T1 (sl) 2015-08-05 2022-04-29 Eisai R&D Management Co., Ltd. Postopek priprave v bistvu diastereomerno čistega fosforodiamidatnega oligomera, fosforodiamidatni oligomer izdelan po takem postopku in farmacevtski sestavek, ki vsebuje tak fosforodiamidatni oligomer
MA45819A (fr) 2015-10-09 2018-08-15 Sarepta Therapeutics Inc Compositions et méthodes pour traiter la dystrophie musculaire de duchenne et troubles associés
MX2018007307A (es) * 2015-12-15 2019-03-14 Sarepta Therapeutics Inc Conjugados de peptidos y oligonucleotidos.
KR102522059B1 (ko) 2016-04-18 2023-04-14 사렙타 쎄러퓨틱스 인코퍼레이티드 안티센스 올리고머, 및 산성 알파-글루코시다제 유전자와 연관된 질환을 치료하기 위한 이의 사용 방법
EA201892467A1 (ru) 2016-04-29 2019-05-31 Сарепта Терапьютикс, Инк. Олигонуклеотидные аналоги, нацеленные на lmna человека
US11472824B2 (en) 2016-05-24 2022-10-18 Sarepta Therapeutics, Inc. Processes for preparing phosphorodiamidate morpholino oligomers
MA45362A (fr) 2016-05-24 2019-04-10 Sarepta Therapeutics Inc Procédés de préparation d'oligomères morpholino de phosphorodiamidate
EP3564248A1 (en) 2016-05-24 2019-11-06 Sarepta Therapeutics, Inc. Processes for preparing phosphorodiamidate morpholino oligomers
MA45183A (fr) * 2016-05-24 2019-04-10 Sarepta Therapeutics Inc Procédés de préparation d'oligomères morpholino de phosphorodiamidate
JP6987081B2 (ja) 2016-05-24 2021-12-22 サレプタ セラピューティクス， インコーポレイテッド ホスホロジアミダートモルホリノオリゴマーを調製するためのプロセス
CN110536694A (zh) 2017-04-20 2019-12-03 Atyr 医药公司 用于治疗肺部炎症的组合物和方法
CN107589189B (zh) * 2017-09-06 2018-07-10 中国农业科学院饲料研究所 一种氟甲喹的手性对映体的检测方法
US11555189B2 (en) 2017-10-18 2023-01-17 Sarepta Therapeutics, Inc. Antisense oligomer compounds
SG11202011094PA (en) 2018-05-10 2020-12-30 Nippon Shinyaku Co Ltd Method for preparing oligonucleic acid compound
US10758629B2 (en) * 2018-05-29 2020-09-01 Sarepta Therapeutics, Inc. Exon skipping oligomer conjugates for muscular dystrophy
WO2021095875A1 (ja) * 2019-11-13 2021-05-20 日本新薬株式会社 オリゴ核酸化合物の製造方法
KR20220098217A (ko) 2019-11-13 2022-07-11 니뽄 신야쿠 가부시키가이샤 올리고 핵산 화합물의 제조 방법

Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5506337A (en) * 1985-03-15 1996-04-09 Antivirals Inc. Morpholino-subunit combinatorial library and method
US20050107312A1 (en) * 2003-10-27 2005-05-19 Genelabs Technologies, Inc. Nucleoside compounds for treating viral infections
WO2009064471A1 (en) * 2007-11-15 2009-05-22 Avi Biopharma, Inc. Method of synthesis of morpholino oligomers
US20100130591A1 (en) * 2008-10-24 2010-05-27 Peter Sazani Multiple exon skipping compositions for dmd
US20100234281A1 (en) * 2005-07-13 2010-09-16 Weller Dwight D Antibacterial antisense oligonucleotide and method
US20110118334A1 (en) * 2009-11-13 2011-05-19 Avi Biopharma, Inc. Antisense antiviral compound and method for treating influenza viral infection

Family Cites Families (116)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5521063A (en) 1985-03-15 1996-05-28 Antivirals Inc. Polynucleotide reagent containing chiral subunits and methods of use
ATE81872T1 (de) 1985-03-15 1992-11-15 James Summerton Stereoregulare polynukleotiden bindende polymere.
US5034506A (en) 1985-03-15 1991-07-23 Anti-Gene Development Group Uncharged morpholino-based polymers having achiral intersubunit linkages
US5166315A (en) 1989-12-20 1992-11-24 Anti-Gene Development Group Sequence-specific binding polymers for duplex nucleic acids
US5217866A (en) 1985-03-15 1993-06-08 Anti-Gene Development Group Polynucleotide assay reagent and method
US5185444A (en) 1985-03-15 1993-02-09 Anti-Gene Deveopment Group Uncharged morpolino-based polymers having phosphorous containing chiral intersubunit linkages
US5749847A (en) 1988-01-21 1998-05-12 Massachusetts Institute Of Technology Delivery of nucleotides into organisms by electroporation
US5223168A (en) 1989-12-12 1993-06-29 Gary Holt Surface cleaner and treatment
AU655164B2 (en) 1989-12-20 1994-12-08 Antivirals Inc. Uncharged morpholino-based polymers having phosphorous-containing chiral intersubunit linkages
US5506351A (en) 1992-07-23 1996-04-09 Isis Pharmaceuticals Process for the preparation of 2'-O-alkyl guanosine and related compounds
US5212295A (en) 1990-01-11 1993-05-18 Isis Pharmaceuticals Monomers for preparation of oligonucleotides having chiral phosphorus linkages
US5587470A (en) 1990-01-11 1996-12-24 Isis Pharmaceuticals, Inc. 3-deazapurines
US5459255A (en) 1990-01-11 1995-10-17 Isis Pharmaceuticals, Inc. N-2 substituted purines
US5852188A (en) 1990-01-11 1998-12-22 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotides having chiral phosphorus linkages
US5457191A (en) 1990-01-11 1995-10-10 Isis Pharmaceuticals, Inc. 3-deazapurines
US5578718A (en) 1990-01-11 1996-11-26 Isis Pharmaceuticals, Inc. Thiol-derivatized nucleosides
US5587361A (en) 1991-10-15 1996-12-24 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotides having phosphorothioate linkages of high chiral purity
US5378825A (en) 1990-07-27 1995-01-03 Isis Pharmaceuticals, Inc. Backbone modified oligonucleotide analogs
US5610289A (en) 1990-07-27 1997-03-11 Isis Pharmaceuticals, Inc. Backbone modified oligonucleotide analogues
US5541307A (en) 1990-07-27 1996-07-30 Isis Pharmaceuticals, Inc. Backbone modified oligonucleotide analogs and solid phase synthesis thereof
US5386023A (en) 1990-07-27 1995-01-31 Isis Pharmaceuticals Backbone modified oligonucleotide analogs and preparation thereof through reductive coupling
US5608046A (en) 1990-07-27 1997-03-04 Isis Pharmaceuticals, Inc. Conjugated 4'-desmethyl nucleoside analog compounds
US5218105A (en) 1990-07-27 1993-06-08 Isis Pharmaceuticals Polyamine conjugated oligonucleotides
US5138045A (en) 1990-07-27 1992-08-11 Isis Pharmaceuticals Polyamine conjugated oligonucleotides
US5602240A (en) 1990-07-27 1997-02-11 Ciba Geigy Ag. Backbone modified oligonucleotide analogs
US6262241B1 (en) 1990-08-13 2001-07-17 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compound for detecting and modulating RNA activity and gene expression
CA2089562A1 (en) 1990-08-14 1992-02-15 Lex M. Cowsert Inhibition of influenza virus type a, ann arbor strain h2n2 by antisense oligonucleotides
US5539082A (en) 1993-04-26 1996-07-23 Nielsen; Peter E. Peptide nucleic acids
JPH07501204A (ja) 1991-06-28 1995-02-09 マサチューセッツ インスティテュート オブ テクノロジー 局所的オリゴヌクレオチド療法
US6030954A (en) 1991-09-05 2000-02-29 University Of Connecticut Targeted delivery of poly- or oligonucleotides to cells
US5576302A (en) 1991-10-15 1996-11-19 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotides for modulating hepatitis C virus having phosphorothioate linkages of high chiral purity
US5599797A (en) 1991-10-15 1997-02-04 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotides having phosphorothioate linkages of high chiral purity
EP0672175A4 (en) 1991-12-23 1997-08-06 Chiron Corp HAV PROBES USED IN SOLUTION PHASE SANDWICH HYBRIDIZATION METHODS.
US6174868B1 (en) 1992-09-10 2001-01-16 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for treatment of hepatitis C virus-associated diseases
US6391542B1 (en) 1992-09-10 2002-05-21 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for treatment of Hepatitis C virus-associated diseases
US5571902A (en) 1993-07-29 1996-11-05 Isis Pharmaceuticals, Inc. Synthesis of oligonucleotides
US5801154A (en) 1993-10-18 1998-09-01 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense oligonucleotide modulation of multidrug resistance-associated protein
US6060456A (en) 1993-11-16 2000-05-09 Genta Incorporated Chimeric oligonucleoside compounds
US5554746A (en) 1994-05-16 1996-09-10 Isis Pharmaceuticals, Inc. Lactam nucleic acids
US5734039A (en) 1994-09-15 1998-03-31 Thomas Jefferson University Antisense oligonucleotides targeting cooperating oncogenes
GB9510718D0 (en) 1995-05-26 1995-07-19 Sod Conseils Rech Applic Antisense oligonucleotides
US5955318A (en) 1995-08-14 1999-09-21 Abbott Laboratories Reagents and methods useful for controlling the translation of hepatitis GBV proteins
US6245747B1 (en) 1996-03-12 2001-06-12 The Board Of Regents Of The University Of Nebraska Targeted site specific antisense oligodeoxynucleotide delivery method
CA2252706A1 (en) 1996-05-01 1997-11-06 Antivirals Inc. Polypeptide conjugates for transporting substances across cell membranes
US20040161844A1 (en) 1996-06-06 2004-08-19 Baker Brenda F. Sugar and backbone-surrogate-containing oligomeric compounds and compositions for use in gene modulation
PL337033A1 (en) 1997-05-21 2000-07-31 Univ Leland Stanford Junior Composition for and methods of enhancing transport through permeable biological membranes
US6133246A (en) 1997-08-13 2000-10-17 Isis Pharmaceuticals Inc. Antisense oligonucleotide compositions and methods for the modulation of JNK proteins
US6228579B1 (en) 1997-11-14 2001-05-08 San Diego State University Foundation Method for identifying microbial proliferation genes
US6548651B1 (en) 1998-11-11 2003-04-15 Pantheco A/S Modified peptide nucleic acid (PNA) molecules
EP1173561A2 (en) 1999-01-29 2002-01-23 Avi Biopharma, Inc. Non-invasive method for detecting target rna
US7094765B1 (en) 1999-01-29 2006-08-22 Avi Biopharma, Inc. Antisense restenosis composition and method
JP3917372B2 (ja) 1999-03-19 2007-05-23 プロリンクス・インコーポレイテッド ボロン酸含有試薬およびオリゴヌクレオチド
US6521438B1 (en) 1999-11-05 2003-02-18 North Carolina State University Chemoreceptors in plant parasitic nematodes
US20030095953A1 (en) 1999-11-12 2003-05-22 Myles C. Cabot Methods of reversing drug resistance in cancer cells
EP1238071B1 (en) 1999-11-29 2008-04-23 Avi Biopharma, Inc. Uncharged antisense oligonucleotides targeted to bacterial 16s and 23s rrnas and their uses
EP1248813A2 (en) 2000-01-04 2002-10-16 Avi Biopharma, Inc. Antisense antibacterial cell division composition and method
US7833992B2 (en) 2001-05-18 2010-11-16 Merck Sharpe & Dohme Conjugates and compositions for cellular delivery
US20040072743A1 (en) 2000-04-06 2004-04-15 Christensen Jeppe Viggo Pharmaceutical composition of modified pna molecules
WO2001083740A2 (en) 2000-05-04 2001-11-08 Avi Biopharma, Inc. Splice-region antisense composition and method
EP1301525B1 (en) 2000-07-06 2015-09-02 Sarepta Therapeutics, Inc. Transforming growth factor beta (tgf-beta) blocking agent-treated stem cell composition and method
IL154853A0 (en) 2000-10-27 2003-10-31 Chiron Spa Nucleic acids and proteins from streptococcus groups a & b
WO2002079467A2 (en) 2001-03-29 2002-10-10 Københavns Universitet Antibiotic-free bacterial strain selection with antisense molecules
CA2447444A1 (en) 2001-05-11 2002-11-21 Orasense, Ltd. Antisense permeation enhancers
KR20040004629A (ko) 2001-05-17 2004-01-13 에이브이아이 바이오파마 인코포레이티드 ｃ-ｍｙｃ 안티센스 올리고머를 사용한 암치료를 위한조합 접근법
WO2002094250A2 (en) 2001-05-18 2002-11-28 Cureon A/S Therapeutic uses of lna-modified oligonucleotides in infectious diseases
US20030224353A1 (en) 2001-10-16 2003-12-04 Stein David A. Antisense antiviral agent and method for treating ssRNA viral infection
CN100547071C (zh) 2001-10-16 2009-10-07 Avi生物制药公司 用于治疗单链rna病毒感染的抗病毒反义核酸的试剂和方法
BR0314236A (pt) 2002-09-13 2005-08-09 Replicor Inc Formulação de oligonucleotìdeo, composição farmacêutica, kit, composto antiviral, preparação de oligonucleotìdeo e métodos para seleção de um oligonucleotìdeo antiviral para uso como um agente antiviral, para profilaxia ou tratamento de uma infecção viral em um paciente, para tratamento profilático de câncer causado por oncovìrus, para identificação de um composto que altera a ligação de um oligonucleotìdeo a pelo menos um componente viral, para purificação da ligação de oligonucleotìdeos a pelo menos um componente viral e para enriquecimento de oligonucleotìdeos a partir de um agrupamento de oligonucleotìdeos
EP2977470B1 (en) 2002-10-16 2018-01-03 Gen-Probe Incorporated Compositions and methods for detecting west nile virus
AU2003280247A1 (en) 2002-11-05 2004-06-07 Affinium Pharmaceuticals, Inc. Essential novel bacterial polypeptides
EP1585755B1 (en) 2002-12-31 2015-08-05 Sigma-Aldrich Co. LLC Methods and compositions for the tandem synthesis of two or more oligonuleotides on the same solid support
EP1629105B1 (en) 2003-04-29 2010-09-01 AVI BioPharma, Inc. Compositions for enhancing transport and antisense efficacy of nucleic acid analog into cells
JP2007509608A (ja) 2003-05-23 2007-04-19 ウペエフエル・エコル・ポリテクニック・フェデラル・ドゥ・ローザンヌ アシル担体タンパク質に基づくタンパク質をラベルするための方法
CA2533218C (en) 2003-08-05 2014-11-18 Avi Biopharma, Inc. Oligonucleotide analog and method for treating flavivirus infections
US20050171044A1 (en) 2003-12-24 2005-08-04 Stein David A. Oligonucleotide compound and method for treating nidovirus infections
EP1713332A4 (en) 2004-01-23 2010-08-18 Avi Biopharma Inc ANTISENSE OLIGOMERS AND METHOD FOR INDUCTION OF IMMUNOTHERAPY AND IMMUNOSUPPRESSION
US7402574B2 (en) 2004-03-12 2008-07-22 Avi Biopharma, Inc. Antisense composition and method for treating cancer
US20050288246A1 (en) 2004-05-24 2005-12-29 Iversen Patrick L Peptide conjugated, inosine-substituted antisense oligomer compound and method
HUE028632T2 (en) 2004-06-28 2016-12-28 Univ Western Australia To skip an antisense oligonucleotide exon and use it for procedures
SI1766012T1 (sl) 2004-07-02 2011-10-28 Avi Biopharma Inc Protismiselni antibakterijski postopek in spojina
US8129352B2 (en) 2004-09-16 2012-03-06 Avi Biopharma, Inc. Antisense antiviral compound and method for treating ssRNA viral infection
US8357664B2 (en) 2004-10-26 2013-01-22 Avi Biopharma, Inc. Antisense antiviral compound and method for treating influenza viral infection
US7524829B2 (en) 2004-11-01 2009-04-28 Avi Biopharma, Inc. Antisense antiviral compounds and methods for treating a filovirus infection
US7838657B2 (en) 2004-12-03 2010-11-23 University Of Massachusetts Spinal muscular atrophy (SMA) treatment via targeting of SMN2 splice site inhibitory sequences
GB0501944D0 (en) 2005-01-31 2005-03-09 Univ Cambridge Tech Compounds for use in chemical detection and/or quantitation
CA2596506C (en) 2005-02-09 2021-04-06 Avi Biopharma, Inc. Antisense composition and method for treating muscle atrophy
US20060293268A1 (en) * 2005-05-05 2006-12-28 Rieder Aida E Antisense antiviral compounds and methods for treating foot and mouth disease
DK3308788T3 (da) 2005-06-23 2019-01-02 Biogen Ma Inc Sammensætninger og fremgangsmåder til modulering af smn2-splejsning
AU2006267051B2 (en) 2005-07-13 2013-03-07 Sarepta Therapeutics, Inc. Antisense antibacterial method and compound
US7790694B2 (en) 2005-07-13 2010-09-07 Avi Biopharma Inc. Antisense antibacterial method and compound
WO2007030691A2 (en) 2005-09-08 2007-03-15 Avi Biopharma, Inc. Antisense antiviral compound and method for treating picornavirus infection
WO2007030576A2 (en) 2005-09-08 2007-03-15 Avi Biopharma, Inc. Antisense antiviral compound and method for treating picornavirus infection
EP2002018B1 (en) 2006-03-07 2010-05-12 AVI BioPharm, Inc. Antisense antiviral compound and method for treating arenavirus infection
CA2651881A1 (en) 2006-05-10 2008-03-27 Avi Biopharma, Inc. Oligonucleotide analogs having cationic intersubunit linkages
US8785407B2 (en) 2006-05-10 2014-07-22 Sarepta Therapeutics, Inc. Antisense antiviral agent and method for treating ssRNA viral infection
CN101517091B (zh) * 2006-06-01 2013-02-13 垂林克生物技术公司 用于核酸扩增的化学修饰的寡核苷酸引物
PL2049664T3 (pl) 2006-08-11 2012-02-29 Biomarin Tech Bv Jednoniciowe oligonukleotydy komplementarne do powtarzalnych elementów do leczenia chorób genetycznych związanych z niestabilnością powtórzeń DNA
AU2007297535C1 (en) 2006-09-21 2017-11-23 University Of Florida Research Foundation, Inc. Compositions and methods related to protein displacement therapy for myotonic distrophy
US20100016215A1 (en) 2007-06-29 2010-01-21 Avi Biopharma, Inc. Compound and method for treating myotonic dystrophy
US8299206B2 (en) 2007-11-15 2012-10-30 Avi Biopharma, Inc. Method of synthesis of morpholino oligomers
US8076476B2 (en) 2007-11-15 2011-12-13 Avi Biopharma, Inc. Synthesis of morpholino oligomers using doubly protected guanine morpholino subunits
ES2625938T3 (es) * 2008-05-27 2017-07-21 Trilink Biotechnologies Nucleósidos 5¿-trifosfatos modificados químicamente para replicación de ácido nucleico iniciada térmicamente
US9000142B2 (en) 2008-07-07 2015-04-07 Syntrix Biosystems, Inc. Photocleavable sense-antisense complex
US20120149757A1 (en) 2009-04-13 2012-06-14 Krainer Adrian R Compositions and methods for modulation of smn2 splicing
EP3643783A1 (en) 2009-06-17 2020-04-29 Biogen MA Inc. Compositions and methods for modulation of smn2 splicing in a subject
WO2011113015A2 (en) 2010-03-12 2011-09-15 Avi Biopharma, Inc. Antisense modulation of nuclear hormone receptors
JP2013530154A (ja) 2010-05-28 2013-07-25 サレプタ セラピューティクス， インコーポレイテッド 修飾されたサブユニット間結合および／または末端基を有するオリゴヌクレオチドアナログ
US8198429B2 (en) 2010-08-09 2012-06-12 Avi Biopharma, Inc. Antisense antiviral compounds and methods for treating a filovirus infection
US10017763B2 (en) 2010-09-03 2018-07-10 Sarepta Therapeutics, Inc. dsRNA molecules comprising oligonucleotide analogs having modified intersubunit linkages and/or terminal groups
PT2623507T (pt) 2010-09-30 2016-12-23 Nippon Shinyaku Co Ltd Derivado de ácido morfolino-nucleico
US20120122769A1 (en) 2010-11-12 2012-05-17 Avi Biopharma, Inc. Antisense antibacterial compounds and methods
US9161948B2 (en) 2011-05-05 2015-10-20 Sarepta Therapeutics, Inc. Peptide oligonucleotide conjugates
AU2011367230B2 (en) * 2011-05-05 2017-08-10 Sarepta Therapeutics, Inc. Peptide oligonucleotide conjugates
EA035030B1 (ru) * 2011-11-18 2020-04-20 Сарепта Терапьютикс, Инк. Модифицированные морфолиновые аналоги олигонуклеотидов
DK2788487T3 (en) 2011-12-08 2018-07-23 Sarepta Therapeutics Inc Oligonucleotide Analogs Targeted against HUMAN LMNA
EA031110B1 (ru) 2012-03-20 2018-11-30 Сарепта Терапьютикс, Инк. Конъюгаты бороновых кислот олигонуклеотидных аналогов

Patent Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5506337A (en) * 1985-03-15 1996-04-09 Antivirals Inc. Morpholino-subunit combinatorial library and method
US20050107312A1 (en) * 2003-10-27 2005-05-19 Genelabs Technologies, Inc. Nucleoside compounds for treating viral infections
US20100234281A1 (en) * 2005-07-13 2010-09-16 Weller Dwight D Antibacterial antisense oligonucleotide and method
WO2009064471A1 (en) * 2007-11-15 2009-05-22 Avi Biopharma, Inc. Method of synthesis of morpholino oligomers
US20100130591A1 (en) * 2008-10-24 2010-05-27 Peter Sazani Multiple exon skipping compositions for dmd
US20110118334A1 (en) * 2009-11-13 2011-05-19 Avi Biopharma, Inc. Antisense antiviral compound and method for treating influenza viral infection

Also Published As

Publication number Publication date
AU2020202289A1 (en) 2020-04-23
IL267905B (en) 2021-09-30
BR112014011875A2 (pt) 2017-05-16
KR20200023488A (ko) 2020-03-04
KR102271212B1 (ko) 2021-07-01
JP2018048208A (ja) 2018-03-29
MX354940B (es) 2018-03-27
KR20210081448A (ko) 2021-07-01
WO2013074834A1 (en) 2013-05-23
AU2012340390B2 (en) 2016-11-24
US20180223278A1 (en) 2018-08-09
JP2020176141A (ja) 2020-10-29
US20160376587A1 (en) 2016-12-29
HK1201514A1 (en) 2015-09-04
IL285797A (en) 2021-09-30
CA2854907C (en) 2020-03-10
US10344281B2 (en) 2019-07-09
AU2018232949A1 (en) 2018-10-11
EA201490994A1 (ru) 2014-11-28
KR20140097398A (ko) 2014-08-06
US20140330006A1 (en) 2014-11-06
AU2012340390A1 (en) 2014-06-26
US20200115709A1 (en) 2020-04-16
CA2854907A1 (en) 2013-05-23
NZ724064A (en) 2018-04-27
JP2015500204A (ja) 2015-01-05
CN111808135A (zh) 2020-10-23
AU2016250482A1 (en) 2016-11-17
KR102142689B1 (ko) 2020-08-10
EP2780299A4 (en) 2015-04-22
NZ740716A (en) 2019-10-25
IL232651B (en) 2019-07-31
KR20200097810A (ko) 2020-08-19
JP2019059789A (ja) 2019-04-18
EP2780299A1 (en) 2014-09-24
HK1202111A1 (en) 2015-09-18
MX2014005840A (es) 2014-10-17
NZ757502A (en) 2021-04-30
US20220127613A1 (en) 2022-04-28
US11208655B2 (en) 2021-12-28
IL267905A (en) 2019-09-26
BR112014011875B1 (pt) 2022-01-04
NZ624961A (en) 2016-09-30
CN104039739A (zh) 2014-09-10
AU2016250482B2 (en) 2018-11-01
AU2018232949B2 (en) 2020-04-30
JP6814127B2 (ja) 2021-01-13
EA202090338A1 (ru) 2021-04-30
US9790499B2 (en) 2017-10-17
IL232651A0 (en) 2014-06-30
US9278987B2 (en) 2016-03-08
CN108864192A (zh) 2018-11-23

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US11208655B2 (en) Functionally-modified oligonucleotides and subunits thereof
CN109890207B (zh) 包含可逆修饰的寡核苷酸的组合物及其用途
JP2020111607A (ja) ペプチドオリゴヌクレオチドコンジュゲート
NZ724064B2 (en) Functionally-modified oligonucleotides and subunits thereof
NZ740716B2 (en) Functionally-modified oligonucleotides and subunits thereof
NZ757502B2 (en) Functionally-modified oligonucleotides and subunits thereof
NZ624961B2 (en) Functionally-modified oligonucleotides and subunits thereof