EA025042B1 - Method for differential diagnostics of vaginal microflora balance disorders - Google Patents
Method for differential diagnostics of vaginal microflora balance disorders Download PDFInfo
- Publication number
- EA025042B1 EA025042B1 EA201400641A EA201400641A EA025042B1 EA 025042 B1 EA025042 B1 EA 025042B1 EA 201400641 A EA201400641 A EA 201400641A EA 201400641 A EA201400641 A EA 201400641A EA 025042 B1 EA025042 B1 EA 025042B1
- Authority
- EA
- Eurasian Patent Office
- Prior art keywords
- dna
- obv
- concentration
- microflora
- bacterial
- Prior art date
Links
Abstract
Description
Изобретение относится к медицине, более конкретно - к лабораторной диагностике, и может быть использовано для дифференциальной диагностики нарушений баланса вагинальной микрофлоры.The invention relates to medicine, more specifically to laboratory diagnostics, and can be used for differential diagnosis of imbalances in the vaginal microflora.
Уровень техникиState of the art
Инфекционные заболевания урогенитального тракта у женщин занимают первое место в структуре гинекологической патологии [Оопбегк О.О.О. ИейиШои апб с1акк1йсайоп о£ аЬиогта1 уадта1 Лога. Век! Ргас!. Кек. СЬп. ОЬк!е!. Оупаесо1. 2007 1ип; 21(3): 355-373. ЕриЬ 2007 Арг 16].Infectious diseases of the urogenital tract in women occupy the first place in the structure of gynecological pathology [Oopbegk O.O.O. Ieyi Shoi apb s1akk1ysayop o £ aiogta1 wadta1 Log. Century! Rgas !. Kek. Bn. Ok! E !. Oupaeso 1. 2007 1ip; 21 (3): 355-373. Yer 2007 Arg 16].
Возбудителями инфекционных заболеваний урогенитального тракта могут являться не только облигатно патогенные микроорганизмы (№1ккейа допоггЬоеае, СЫатуФа йасЬотайк, Мусор1акта депПаЮт, ТпсНотопак уадшаЬк и др.), но при определённых условиях и условно-патогенные микроорганизмы, в норме обитающие во влагалище.The causative agents of infectious diseases of the urogenital tract can be not only obligate pathogenic microorganisms (No. 1kkeya dopoggoeae, Syatufa sapiotaik, Musoracta deptum, TpsNotopacum uadshaq, etc.), but under certain conditions they are also normally pathogenic organisms.
В составе вагинальной микрофлоры здоровой женщины репродуктивного возраста доминируют лактобактерии (лактобациллы, Ьас!оЬасШик крр., от лат. креыа1ек - виды), такие как ЬаЛоЬасШик спкраШк, ЬаЛоЬасШик шегк, ЬаЛоЬасШик даШпагит, Ьас!оЬасШик даккегк Ьас!оЬасШик уадшаЬк, Ьас!оЬасШик ]епкеш1, ЛасЮЬасШик ашбой1ик, Ьас!оЬасШик р1аи1агит [Под ред. Чайки В.К. Инфекции в акушерстве и гинекологии: Практическое руководство. Донецк, ООО Альматео, 2006; Бйшуакап 8. апб N. Ргебйскк Ό.Ν. ТЬе Нитап Уадша1 Вас1епа1 Вю1а апб Вас1епа1 Уадшоык. 1п1егб1кс1р1шагу Регкресйуек оп Шесйоик ЭРеакек, Уо1ите 2008, Агйс1е ГО 750479].As part of the vaginal microflora of healthy women of reproductive age is dominated by lactobacilli (Lactobacillus, Lac oasShik CRE, from the Latin kreya1ek -!.. Types), such as aLoasShik spkraShk, aLoasShik shegk, aLoasShik daShpagit, Lac oasShik dakkegk Lac oasShik uadshak, Lac oasShik!!! ] epkesh1, Laskyas Shik ashboy1ik, bas! obasShik p1ai1agit [Ed. Seagulls V.K. Infections in Obstetrics and Gynecology: A Practical Guide. Donetsk, LLC Almateo, 2006; Byshuacap 8. apb N. Rgebysk Ό.Ν. Thi Nitap Wadsha1 Vas1epa1 Vu1a apb Vas1epa1 Wadshoyk. 1p1egb1ks1r1shagu Regkresyuek op Shesyoyik EReakek, Uoite 2008, Agys1e GO 750479].
Лактобактерии, составляющие нормофлору влагалища, защищают его от размножения патогенных и условно-патогенных бактерий. К защитным факторам лактобактерии относят образование молочной кислоты, ведущее к поддержанию кислой среды здорового влагалища, образование перекиси водорода и бактериоцинов, высокую адгезионную способность и иммуностимулирующие свойства, в совокупности обеспечивающие колонизационную резистентность влагалищного микробиоценоза [Под ред. Чайки В.К. Инфекции в акушерстве и гинекологии: Практическое руководство. Донецк, ООО Альматео, 2006].Lactobacilli, which make up the normoflora of the vagina, protect it from the multiplication of pathogenic and conditionally pathogenic bacteria. The protective factors of lactobacilli include the formation of lactic acid, which leads to the maintenance of an acidic environment of a healthy vagina, the formation of hydrogen peroxide and bacteriocins, high adhesive ability and immunostimulating properties, which together provide the colonization resistance of vaginal microbiocenosis [Ed. Seagulls V.K. Infections in Obstetrics and Gynecology: A Practical Guide. Donetsk, LLC Almateo, 2006].
Кроме лактобактерий, в составе микрофлоры влагалища могут присутствовать в вариабельных, но в норме незначительных количествах следующие бактерии: ВбгбоЬаЛейит крр., ЕиЬас!ейит крр., С1окйгбшт крр., РгорюшЬас1епит крр., СогупеЬаЛейит крр., ВаЛегсибек крр., Ргеуо!е11а крр., РикоЬаЛейит крр., ЬерЮПгх крр., Сатру1оЬаЛег крр., ЕйегоЬаЛейасеае крр. (ЕксЬейсЫа крр., К1еЬк1е11а крр., Еп1егоЬас!ег крр., Рго!еик крр.), Асше!оЬаЛег крр., МоЬбипсик крр., Ркеиботопак крр., Оагбпеге11а уадшайк, А1ороЬшт уад1пае, 8!арЬу1ососсик крр., Мюгососсик крр., Ейегососсик крр., 81гер!ососсик крр., РерЮсоссик крр., РерЮкЛерЮсоссик крр., Уеб1опе11а крр., Мусор1акта Ьотшщ, Игеар1акта крр. (Игеар1акта рагуит, Игеар1акта игеа1уйсит), а также грибы Сапб1ба крр. (Сапб1ба а1Ысапк, Сапб1ба д1аЬга!а, Сапб|ба калек Сапб|ба рагаркбоык, Сапб1ба ЛорюаЬк), Асйпотусек крр. и др. [Под ред. Чайки В.К. Инфекции в акушерстве и гинекологии: Практическое руководство. Донецк, ООО Альматео, 2006].In addition to lactobacilli, the following bacteria can be present in variable but insignificant amounts in the composition of the vaginal microflora: ., RikoLaileit krr., Lepyuhr krr., Satru1oLaeg krr., EeyeLaLeasee krr. (ExeCeCr., KlEbk1e11a krr., Ep1egoac! Ekr., Rgo! Eik krr.), Ashe! OeLeg kr. ., Ejegosossik krr., 81ger! Ossossik krr., RerYusossik krr., RerYukLerYusossik krr., Ueb1ope11a krr., Musor1acta botsch, Igearakta krr. (Igear1akta raguit, Igear1akta igee1uysit), as well as mushrooms Sapb1ba krr. (Sapb1ba a1Ysapk, Sapb1ba d1abga! A, Sapb | ba kalek Sapb | ba ragarkboyk, Sapb1ba loruybk), Asypotusek krr. et al. [Ed. Seagulls V.K. Infections in Obstetrics and Gynecology: A Practical Guide. Donetsk, LLC Almateo, 2006].
Неблагоприятные эндогенные и экзогенные факторы (гормональные нарушения, использование антибиотиков, оральных и внутриматочных контрацептивов, снижение иммунитета, перенесённые воспалительные заболевания и др.) могут приводить к нарушениям баланса вагинальной микрофлоры, т.е. снижению содержания лактобактерий и замещению их условно-патогенными микроорганизмами. Известно два основных вида таких нарушений: бактериальный вагиноз и аэробный вагинит.Adverse endogenous and exogenous factors (hormonal disorders, the use of antibiotics, oral and intrauterine contraceptives, decreased immunity, past inflammatory diseases, etc.) can lead to imbalances in the vaginal microflora, i.e. reducing the content of lactobacilli and replacing them with opportunistic microorganisms. Two main types of such disorders are known: bacterial vaginosis and aerobic vaginitis.
Бактериальный вагиноз - это клинический синдром, вызванный замещением лактобактерий вагинальной микрофлоры условно-патогенными анаэробными и факультативно-анаэробными бактериями. [Под ред. Савельевой Г.М., Бреусенко В.Г. Гинекология: Учебник. Москва, ГЭОТАРМЕД, 2004]. Бактериальный вагиноз является полимикробным синдромом с чрезвычайно широким спектром обнаруживаемых условно-патогенных микроорганизмов, насчитывающим сотни видов. Достоверная связь с бактериальным вагинозом была продемонстрирована для представителей восьми родов бактерий ОагбпегеПа, А1ороЬшт, МедакрЬаега, ЕддейЬе11а, Аегососсик, Ьер!о!г1сЬ1а/8пеа!Ь1а, Ргеуо!е11а, РарбЬЬаЛег [Ьшд Ζ. е! а1. Мо1еси1аг апа1ук1к о£ !Ье б1уегкЬу о£ уад1па1 тюгоЬю!а аккола1еб \\ЬЬ ЬаЛепа1 уадшоык. ВМС Оепотюк. 2010 8ер 7; 11:488].Bacterial vaginosis is a clinical syndrome caused by the replacement of lactobacilli by the vaginal microflora with conditionally pathogenic anaerobic and facultative anaerobic bacteria. [Ed. Savelyeva G.M., Breusenko V.G. Gynecology: Textbook. Moscow, GEOTARMED, 2004]. Bacterial vaginosis is a polymicrobial syndrome with an extremely wide range of detectable opportunistic microorganisms, numbering hundreds of species. A reliable connection with bacterial vaginosis has been demonstrated for representatives of the eight bacterial genes Ogbpepea, Aloporhon, Medacrea, Eddebie11a, Aegosossik, Ep! O! R1c1a / 8pea! B1a, Prheuo! E11a, Parbie. e! a1. Mo1e1aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa! Navy Oepotyuk. 2010 8er 7; 11: 488].
Также специалисты выделяют промежуточный тип микрофлоры, при котором не происходит полного (или почти полного) замещения лактобактерий условно-патогенными анаэробными и факультативно-анаэробными бактериями, однако количество последних существенно повышено по сравнению с нормой. Промежуточный тип микрофлоры можно рассматривать как переход от нормы к бактериальному вагинозу (только-только заболевает) или обратно (восстановление микрофлоры) [№деп! К.Р. е! а1. КеЬаЬбЬу о£ б1адпокшд ЬаЛепа1 уадшоык 1к ипргоуеб Ьу а к1апбагб|/еб тебюб о£ дгат к!а1п иНегргеЫбоп. 1. СЬп. МюгоЬю1. 1991 РеЬ; 29(2): 297-301].Experts also identify an intermediate type of microflora, in which there is no complete (or almost complete) replacement of lactobacilli by conditionally pathogenic anaerobic and facultative anaerobic bacteria, however, the number of the latter is significantly increased compared to the norm. An intermediate type of microflora can be considered as a transition from normal to bacterial vaginosis (just getting sick) or vice versa (restoring microflora) [No Dep! K.R. e! a1. Ь а Ь о о п п п п Л Л Л Л еп еп Л Л а а а б б б б б б!!!! А а а а а а 1 1 1 1 1 оп. 1. Cn. Hugo 1. 1991 Peb; 29 (2): 297-301].
Аэробный вагинит - это нарушение баланса вагинальной микрофлоры, отличное от бактериального вагиноза. При аэробном вагините происходит замещение лактобактерий вагинальной микрофлоры условно-патогенными аэробными микроорганизмами (Еп1егоЬаЛейасеае крр., в том числе ЕксЬейсЫа соЬ, К1еЬк1е11а крр., Рго1еик крр., 8!арЬу1ососсик крр., в том числе 8!арЬу1ососсик аигеик, 8!гер!ососсик крр., в том числе Огоир В 8!гер!ососсик, он же 8Лер!ососсик ада1асйае, Огоир А 81гер!ососсик, Ейегососсик крр.). В отличие от бактериального вагиноза, имеющего не воспалительный характер, аэробный вагинит харак- 1 025042 теризуется развитием местной воспалительной реакции и иммунного ответа [ΌοηάβΓδ О.О.О. е( а1. Όβίΐηί!ίοη οί а 1урс οί аЬпогта1 уадта1 йога Ша! ίδ ΟίδΙίηοί Ггот Ьас1сг1а1 ναβίηοδίδ: аегоЫс уадтШз. ВЮС. 2002 ,1ап; 109(1): 34-43].Aerobic vaginitis is an imbalance in the vaginal microflora that is different from bacterial vaginosis. In aerobic vaginitis, lactobacilli of the vaginal microflora are replaced by conditionally pathogenic aerobic microorganisms (Epilogue Leucase crp. Ossossian krr., including Ogoyr B 8! ger! ossossik, he is 8Ler! ossossik ada1asyaye, Ogoyr A 81ger! ossossik, Eyegosossik krr.). In contrast to bacterial vaginosis, which is not inflammatory in nature, aerobic vaginitis is characterized by the development of a local inflammatory response and immune response [ΌοηάβΓδ O.O.O. e (a1. Όβίΐηί! ίοη οί а 1urs οί аЬпогта1 уадта1 yoga Ша! ίδ ΟίδΙίηοί Goth bac1sg1a1 ναβίηοδίδ: aegus wadt. VUS. 2002, 1ap; 109 (1): 34 (34).
Нарушения баланса вагинальной микрофлоры могут сопровождаться клиническими проявлениями (патологические выделения с неприятным запахом, зуд, жжение, диспареуния), однако могут протекать и бессимптомно. Бессимптомное течение особенно опасно, так как в отсутствие адекватной терапии возможно развитие таких грозных последствий для здоровья женщины и её потомства, как воспалительные заболевания органов малого таза, преждевременные роды, рождение детей с низкой массой тела, воспалительные осложнения беременности и родов, повышенная восприимчивость к инфекциям, передающимся половым путём [Под ред. Савельевой Г.М., Бреусенко В.Г. Гинекология: Учебник. Москва, ГЭОТАРМЕД, 2004].Imbalances in the vaginal microflora can be accompanied by clinical manifestations (pathological discharge with an unpleasant odor, itching, burning, dyspareunia), but they can also be asymptomatic. An asymptomatic course is especially dangerous, since in the absence of adequate therapy, it is possible to develop such formidable consequences for the health of a woman and her offspring as inflammatory diseases of the pelvic organs, premature birth, the birth of children with low body weight, inflammatory complications of pregnancy and childbirth, and increased susceptibility to infections sexually transmitted [Ed. Savelyeva G.M., Breusenko V.G. Gynecology: Textbook. Moscow, GEOTARMED, 2004].
В связи с этим трудно переоценить важность надёжной и эффективной диагностики (в том числе дифференциальной) нарушений баланса вагинальной микрофлоры, позволяющей своевременно определиться с выбором подходящей терапии. Сложности такой диагностики обусловлены, во-первых, неспецифичностью соответствующих симптомов, а в ряде случаев и их отсутствием, во-вторых, огромным разнообразием видов условно-патогенной микрофлоры, имеющих разные свойства, в том числе различную чувствительность к антибиотикам, в-третьих, условно-патогенным характером возбудителей, который обуславливает ограниченную диагностическую ценность их качественного определения и требует только количественного подхода.In this regard, it is difficult to overestimate the importance of reliable and effective diagnosis (including differential) of imbalance in the vaginal microflora, which allows you to timely determine the choice of suitable therapy. The difficulties of this diagnosis are caused, firstly, by the non-specificity of the corresponding symptoms, and in some cases by their absence, secondly, by the huge variety of opportunistic microflora species that have different properties, including different sensitivity to antibiotics, and thirdly, conditionally the pathogenic nature of pathogens, which determines the limited diagnostic value of their qualitative determination and requires only a quantitative approach.
Существующие на настоящий момент методы диагностики не в полной мере справляются с указанными затруднениями.Existing diagnostic methods do not fully cope with these difficulties.
Классические методы лабораторной диагностики, основанные на культивировании микроорганизмов на питательных средах, не подходят для выявления некультивируемых и трудно культивируемых условно-патогенных микроорганизмов, среди которых микроорганизмы, ассоциированные с бактериальным вагинозом. Для культивируемых микроорганизмов этот метод также не лишён существенных недостатков, среди которых сложности стандартизации и количественного определения, длительные сроки культивирования.Classical laboratory diagnostic methods based on the cultivation of microorganisms on nutrient media are not suitable for identifying uncultivated and difficult to cultivate conditionally pathogenic microorganisms, among which are microorganisms associated with bacterial vaginosis. For cultivated microorganisms, this method is also not without significant drawbacks, including the difficulties of standardization and quantification, long cultivation periods.
Традиционно используемые для диагностики бактериального вагиноза критерии Амселя обладают невысокой диагностической чувствительностью [§На В.Е. е! а1. ИШНу οί Лтхе1 сгИейа, Ыидей δ^ΐΐ, амЬ диайНаБуе РСК Юг СагЬиегеПа νη^ίηπίΐδ. Мутор^та Ιιοιηίηίδ. аЫ касГОЬасПН.^ δρρ. Γογ άίη§ηοδίδ οΓ Ьас1ейа1 νηφηοδίδ ίη Питан ^ттиηοάейс^еηсу νίιπδ-ίηί€^ά \νοηκη. 1. С1ш. МюгоЬю1. 2005 §ер; 43(9): 4607-4612] и не дают информации о качественном и количественном составе микрофлоры, что может привести к ошибкам в выборе терапии.Amsel’s criteria traditionally used for the diagnosis of bacterial vaginosis have a low diagnostic sensitivity [§N.A. e! a1. ISHNU ίί х х 1 сг 1 сг а а а,, ид ид δ δ δ ΐΐ ΐΐ ΐΐ Юг Юг Юг Юг Юг Юг Юг Юг ίΐ ίΐ ίΐ ίΐ. Ν. Mutor ^ that Ιιοιηίηίδ. AY KASGOBASPN. ^ δρρ. Γογ άίη§ηοδίδ οΓ bac1eya1 νηφηοδίδ ίη Pitan ^ ttiηοάais ^ eηсу νίιπδ-ίηί € ^ ά \ νοηκη. 1. C1. Hugo 1. 2005 §per; 43 (9): 4607-4612] and do not provide information on the qualitative and quantitative composition of microflora, which can lead to errors in the choice of therapy.
Метод диагностики бактериального вагиноза, основанный на микроскопии окрашенных по Граму препаратов с подсчётом морфотипов бактерий и применением критериев Ньюджента, достаточно точен, но не лишён некоторой доли субъективизма и очень трудоёмок, что значительно снижает пропускные возможности лаборатории. Кроме того, некоторые значимые для диагностики бактериального вагиноза виды условно-патогенной микрофлоры, в частности ΑίοροΝιιιπ νад^ηае, не имеют специфических микроскопических признаков и ошибочно принимаются за другие виды [БсПМегй Α. е! а1. Τ1ιΐΌ\νίη§ (Не Ысе Гэг (Пе άίηβηοδίδ οί \'адта1 ^трИтй? Αηη С1т МюгоЬю1 АйтисгоЬ. 2006 РеЬ 17; 5:4].A method for diagnosing bacterial vaginosis, based on microscopy of Gram-stained preparations with the calculation of bacterial morphotypes and the use of Nugent's criteria, is quite accurate, but it does not lack some share of subjectivity and is very laborious, which significantly reduces the laboratory capacity. In addition, some species of conditionally pathogenic microflora that are significant for the diagnosis of bacterial vaginosis, in particular ΑίοροΝιιιπ νад ^ ηае, do not have specific microscopic features and are mistaken for other species [БсПМегй Α. e! a1. Ϊ́Ό1ιΐΌ \ νίη§ (Not Is Gegh (Пе άίηβηοδίδ οί \ 'adta1 ^ 3)? Ηηη С1т МюгоЬю1 АайтисгоЬ. 2006 Re 17; 5: 4].
Метод диагностики аэробного вагинита, основанный на микроскопии нативных препаратов с оценкой лактобациллярной степени, морфотипов сопутствующей микрофлоры и подсчётом лейкоцитов и парабазальных эпителиоцитов, также трудоёмок и не лишён некоторой доли субъективизма |Οοηώ;Γδ С.С.С. е! а1. □еПтНю!'! οί а !уре οί аЬгюгта1 \'адта1 Ποπι !На! ίδ άίδίίηΟ Ггот Ьас1ейа1 νηβίηοδίδ: аегоЫс νΗβίηίΙίδ. ВГОС. 2002 1ащ 109(1): 34-43].A method for diagnosing aerobic vaginitis based on microscopy of native drugs with an assessment of the lactobacillary degree, morphotypes of concomitant microflora and counting leukocytes and parabasal epithelial cells, is also laborious and not without some share of subjectivity | Οοηώ; Γδ С. С. С. e! a1. □ ePtNu! '! οί а! ure οί аЬгугта1 \ 'ads1 Ποπι! On! ίδ άίδίίηΟ Ggot асac1eya1 νηβίηοδίδ: aegis νΗβίηίΙίδ. VGOS. 2002 1ash 109 (1): 34-43].
Современные молекулярно-биологические методы, основанные на амплификации нуклеиновых кислот, имеют множество преимуществ перед традиционными методами диагностики. Наибольшее распространение получил метод, основанный на полимеразной цепной реакции (ПЦР). Анализ методом ПЦР возможно проводить как в качественном, так и в количественном формате.Modern molecular biological methods based on the amplification of nucleic acids have many advantages over traditional diagnostic methods. The most widely used method based on the polymerase chain reaction (PCR). PCR analysis can be performed in both qualitative and quantitative formats.
ПЦР позволяет в короткие сроки, с высокой чувствительностью и специфичностью выявлять как культивируемые, так и некультивируемые микроорганизмы в любом биологическом образце. Количественная ПЦР позволяет объективно и достоверно определять количества микроорганизмов. Возможность стандартизации и автоматизации анализа являются его дополнительными преимуществами.PCR allows you to quickly identify, with high sensitivity and specificity, both cultivated and uncultured microorganisms in any biological sample. Quantitative PCR allows you to objectively and reliably determine the number of microorganisms. The ability to standardize and automate analysis is an additional benefit.
Известен способ исследования биоценоза урогенитального тракта у женщин методом ПЦР в режиме реального времени и набор реагентов для его осуществления ФЕМОФЛОР 16. В 16 пробирках определяется общее количество бактерий (общая бактериальная масса, ОБМ) в образце, количество лактобактерий и количества 22 условно-патогенных микроорганизмов/групп микроорганизмов: 16 видов/родов анаэробных бактерий (СагЬиегеПа νад^ηа1^δ/Р^еνο!е11а Ь^ν^а/Рο^ρПу^οтοηаδ δρρ., ЕиЬас!егшт δρρ., Бте-Ийа δρρ./^еρ!ο!^^Н^а δρρ./ΡиδοЬас!е^^ит δρρ., Ме^рПега δρρ./Vе^1οηе11а δρρ./^^а1^δ!е^ δρρ., ^асНηοЬас!е^^ит δρρ./С1οδί^^ά^ит δρρ., ΜοΝΗιικιΐδ δρρ./Сο^уηеЬас!е^^ит δρρ., Рер^й^Ш^сс^ δρρ., Α!οροЬ^ит νηφηκΕ одно семейство и два рода аэробных бактерий (ЕйегоЬайейасеае, БЕерЮ^сс^ δρρ., БОрНу^^сс^ δρρ.), Мутор^та Нοт^η^δ. Игеар^та δρρ., С-пЫй- δρρ. Способ включает в себя алгоритмA known method of studying the biocenosis of the urogenital tract in women by real-time PCR and a set of reagents for its implementation FEMOFLOR 16. The total number of bacteria (total bacterial mass, MBP) in the sample, the number of lactobacilli and the number of 22 conditionally pathogenic microorganisms are determined in 16 tubes / groups of microorganisms: 16 species / genera of anaerobic bacteria (Cacterium bacillus ηa1 ^ δ / P ^ eνο! e11a L ^ ν ^ a / Pο ^ ρпу ^ οтοηаδ δρρ., Ейбас! ешп δρρ., Бте-Ийа δρρ. ! ο! ^^ Н ^ а δρρ. / ΡиδοЬас! е ^^ и δρρ., Ме ^ рПега δρρ. / Vе ^ 1οηе11а δρρ ./^^ а1 ^ δ! е ^ δρρ ., ^ acNηοbas! е ^^ um δρρ. / С1οδί ^^ ά ^ it δρρ., ΜοΝΗιικιΐδ δρρ. / Сο ^ унееас! е ^^ um δρρ., Рер ^ й ^ Ш ^ сс ^ δρρ., Α! οροЬ ^ um νηφηκΕ is one family and two genera of aerobic bacteria (Eeye, ейейейасасасаее,,, ЕерЮЮЮ ^ сс ^ ^ δ δ δρρ., BorNu ^^ ss ^ δρρ.), Mutor та No ^ η ^ δ. Igearарa δρρ., С-пЫй-δρρ. The method includes an algorithm
- 2 025042 формирования лабораторного заключения на основании анализа относительных (в % от ОБМ) количеств выявленных бактерий [ФЕМОФЛОР. Исследование биоценоза урогенитального тракта у женщин методом ПЦР с детекцией результатов в режиме реального времени. Методическое пособие для лаборантов. ФГБУ ГНЦ Институт иммунологии ФМБА России. ЗАО НПФ ДНК-Технология].- 2 025042 the formation of a laboratory report on the basis of an analysis of the relative (in% of MBP) quantities of detected bacteria [FEMOFLOR. The study of the biocenosis of the urogenital tract in women by PCR with the detection of results in real time. Toolkit for laboratory assistants. FSBI SSC Institute of Immunology FMBA of Russia. ZAO NPF DNA-Technology].
Однако данный подход имеет ряд недостатков. В диагностикум включен ряд представителей условно-патогенной микрофлоры, диагностическая ценность которых не подтверждена опубликованными результатами исследований. Во влагалище женщин с бактериальным вагинозом различными исследователями было обнаружено большое количество разнообразных условно-патогенных микроорганизмов, однако одного факта такого обнаружения недостаточно для эффективного использования микроорганизмов в качестве количественных диагностических маркеров заболевания [Мепагб ТР. е1 а1. Мо1еси1аг сщапбПсабоп оГ Оагбпеге11а уадиыПя апб АЮроЬшт уадтае 1оабя 1о ргеб1с1 Ьас1ег1а1 уадшоя1я. С1т 1пГес1 Όίδ. 2008 1и1. 1; 47(1): 33-43]. Включение невалидированных маркеров в исследование неоправданно повышает трудоёмкость проведения анализа и сложность его интерпретации.However, this approach has several disadvantages. The diagnosticum includes a number of representatives of opportunistic microflora, the diagnostic value of which is not confirmed by published research results. Various researchers found a large number of various opportunistic microorganisms in the vagina of women with bacterial vaginosis, but the mere fact of such detection is not enough for the effective use of microorganisms as quantitative diagnostic markers of the disease [Mepagb TR. e1 a1. Mauciociag sschapbPsabop oG Oagbpege11a wadia Pyat apb Ayurobt wadtae 1oobya 1o rgeb1s1 bac1eg1a1 wadshoya. С1т 1пГес1 Όίδ. 2008 1 and 1. one; 47 (1): 33-43]. The inclusion of invalid markers in the study unnecessarily increases the complexity of the analysis and the complexity of its interpretation.
Выдаваемые лабораторные заключения (абсолютный/относительный нормоценоз, выраженный/умеренный аэробный/анаэробный/смешанный дисбиоз) не содержат указаний на известные нозологии. Кроме того, авторам настоящего изобретения не известно опубликованных данных о валидации данного способа, включающего количественный алгоритм формирования заключения, относительно стандартных методов диагностики соответствующих нозологии (бактериальный вагиноз, аэробный вагинит).The issued laboratory findings (absolute / relative normocenosis, severe / moderate aerobic / anaerobic / mixed dysbiosis) do not indicate known nosologies. In addition, the authors of the present invention do not know the published data on the validation of this method, including a quantitative algorithm for generating a conclusion, regarding standard diagnostic methods for the corresponding nosology (bacterial vaginosis, aerobic vaginitis).
Наиболее близким по технической сущности к настоящему изобретению является способ диагностики бактериального вагиноза, описанный в международной заявке на изобретение νθ 2011/068679 [ЦИЕЗТ Ι)ΙΑ(.,ΝΟδΤΙ('δ ΙΝνΕδΤΜΕΝΤδ ШСОРРОКАТЕИ, Мебюбя Гог 1Не б1адиоя1я оГ Ьас1епа1 уадшоя1я, 09.06.2011].The closest in technical essence to the present invention is a method for the diagnosis of bacterial vaginosis, described in the international application for the invention νθ 2011/068679 ].
Способ включает количественное определение одного или более вида лактобактерий и двух или более видов условно-патогенных микроорганизмов в биологическом образце и расчёт на их основании диагностического показателя. При его значении меньше 0,2 диагностируют бактериальный вагиноз, при значении от 0,2 до 4,99 диагностируют промежуточный тип вагинальной микрофлоры, и при значении 5 и более диагностируют нормальное состояние вагинальной микрофлоры. Диагностический показатель представляет собой отношение суммы логарифмов концентраций лактобактерий к сумме логарифмов концентраций условно-патогенных бактерий или отношение логарифма суммы концентраций лактобактерий к логарифму суммы концентраций условно-патогенных бактерий. Условно-патогенные бактерии выбраны из группы АЮроЬшт уащпае. МедаярЬега ярр., Оагбпеге11а уадшаПя.The method includes the quantitative determination of one or more types of lactobacilli and two or more types of opportunistic microorganisms in a biological sample and calculation based on them of a diagnostic indicator. With its value less than 0.2, bacterial vaginosis is diagnosed, with a value of 0.2 to 4.99, an intermediate type of vaginal microflora is diagnosed, and with a value of 5 or more, the normal state of vaginal microflora is diagnosed. The diagnostic indicator is the ratio of the sum of the logarithms of the concentrations of lactobacilli to the sum of the logarithms of the concentrations of opportunistic bacteria or the ratio of the logarithm of the sum of concentrations of lactobacilli to the logarithm of the sum of the concentrations of opportunistic bacteria. Conditionally pathogenic bacteria are selected from the group Auroptum uaschpae. Medayar Yarr., Oagbpege 11a Wadsha Pya.
Данный способ диагностики валидирован относительно критериев Ньюджента, однако его чувствительность и специфичность невысока: 57 и 60% соответственно (для различных вариантов расчёта диагностического показателя значения чувствительности и специфичности различаются, здесь приведены наилучшие характеристики).This diagnostic method is validated against Nugent’s criteria, however, its sensitivity and specificity are low: 57 and 60%, respectively (for different options for calculating a diagnostic indicator, the values of sensitivity and specificity differ, the best characteristics are given here).
Кроме того, способ обладает ещё одним существенным недостатком: он разграничивает только три состояния вагинальной микрофлоры: бактериальный вагиноз, промежуточный тип вагинальной микрофлоры и нормальное состояние вагинальной микрофлоры. Нарушения баланса вагинальной микрофлоры, отличные от бактериального вагиноза и промежуточного типа вагинальной микрофлоры (например, преобладание аэробной микрофлоры, аэробный вагинит), способ ошибочно относит к промежуточному типу вагинальной микрофлоры.In addition, the method has another significant drawback: it distinguishes only three states of vaginal microflora: bacterial vaginosis, an intermediate type of vaginal microflora and the normal state of vaginal microflora. Violations of the balance of vaginal microflora other than bacterial vaginosis and an intermediate type of vaginal microflora (for example, the predominance of aerobic microflora, aerobic vaginitis), the method mistakenly refers to the intermediate type of vaginal microflora.
Отсутствие определения общего количества бактерий в образце не позволяет оценить адекватность взятия биологического образца, что может приводить к погрешностям в определении диагностического показателя; не позволяет отличить нарушения баланса вагинальной микрофлоры иного (не анаэробного) генеза, а также состояние снижения бактериальной обсеменённости влагалища.The lack of determination of the total number of bacteria in the sample does not allow us to assess the adequacy of taking a biological sample, which may lead to errors in the determination of the diagnostic indicator; it does not allow to distinguish the imbalance of the vaginal microflora of a different (non-anaerobic) genesis, as well as the state of reduction of bacterial contamination of the vagina.
Сущность изобретенияSUMMARY OF THE INVENTION
Задачами настоящего изобретения являются:The objectives of the present invention are:
создание надёжного и эффективного способа дифференциальной диагностики нарушений баланса вагинальной микрофлоры, основанного на количественном определении ДНК бактерий нормальной и условно-патогенной микрофлоры;creating a reliable and effective method for differential diagnosis of imbalances in the vaginal microflora, based on the quantitative determination of bacterial DNA of normal and conditionally pathogenic microflora;
повышение диагностической чувствительности и специфичности;increasing diagnostic sensitivity and specificity;
минимизация затрачиваемых для диагностики материальных и временных ресурсов посредством оптимального выбора бактерий-маркеров нарушений баланса вагинальной микрофлоры, т.е. выбора маркёров, необходимых и достаточных для чувствительной и специфичной диагностики;minimization of material and time resources spent for diagnostics through the optimal choice of bacteria-markers of vaginal microflora imbalance, i.e. selection of markers necessary and sufficient for sensitive and specific diagnostics;
повышение надёжности диагностики с использованием принципа количественной оценки бактерий нормальной и условно-патогенной микрофлоры не в абсолютных показателях, а по отношению к общему количеству бактерий в образце, что позволяет нивелировать значительный разброс в определении абсолютной концентрации микроорганизмов, связанный с качеством взятия биологического материала;improving the reliability of diagnosis using the principle of quantitative assessment of bacteria of normal and conditionally pathogenic microflora, not in absolute terms, but in relation to the total number of bacteria in the sample, which makes it possible to level the significant spread in determining the absolute concentration of microorganisms associated with the quality of taking biological material;
разработка экспертного алгоритма интерпретации получаемых результатов количественного анализа;development of an expert algorithm for interpreting the results of quantitative analysis;
валидация способа, включая алгоритм;method validation, including an algorithm;
- 3 025042 расширение арсенала современных методов лабораторной диагностики.- 3 025042 expansion of the arsenal of modern laboratory diagnostic methods.
В рамках настоящего изобретения был проведён анализ мировой научной литературы с целью оптимального выбора диагностических маркеров бактериального вагиноза, т.е. выбора таких условнопатогенных микроорганизмов, количественное определение которых необходимо и достаточно для чувствительной и специфичной диагностики этого состояния.In the framework of the present invention, an analysis of the world scientific literature was carried out with the aim of optimal selection of diagnostic markers of bacterial vaginosis, i.e. the choice of such conditionally pathogenic microorganisms, the quantitative determination of which is necessary and sufficient for a sensitive and specific diagnosis of this condition.
Оагйпегейа уад1пайк определяется у 99% женщин с бактериальным вагинозом [ВгайкЬате С.8. с1 а1. ТЬе аккошайоп оГ АЮроЬЫт уадтае апй Оагйпеге11а уадтайк \νί11ι Ьас1сг1а1 уадтопк апй гесиггепсе айег ога1 те1гоЫйа/о1е Легару. 1. 1пГес(. Όίκ. 2006 §ер 15; 194(6): 828-836]. Этот вид бактерий в отличие от других ассоциированных с бактериальным вагинозом видов сочетает в себе три фактора вирулентности: способность к адгезии к эпителиальным клеткам человека, способность образовывать биоплёнки и цитотоксичность [Райегкоп ТЬ. е1 а1. Апа1ук1к оГ айЬегепсе, Ыой1т Гогтайоп апй суЮохюйу киддек(к а дгеа1ег у1ги1епсе ро(епйа1 оГ Оагйпегейа уадтайк ге1айуе Ю о(Ьег Ьас(ейа1-уадшок1к-аккос1а(ей апаегоЬек. МюгоЬю1оду. 2010 РеЬ; 156(Р4 2): 392-399]. По последним данным Оагйпеге11а уадтайк является этиологическим агентом бактериального вагиноза [ЗсйетеЬке ТК. е( а1. Ко1е оГ Оагйпегейа уадтайк ш (Не РаЛодепеык оГ Вас(ейа1 Уадшоык: А Сопсер(иа1 Мойе1. 1. 1пГес(. Όίκ. 2014 Маг 31. [ЕриЬ аЬеай оГ рйп(]]. Стандартной терапией бактериального вагиноза является метронидазол. При этом обнаружение прочих представителей условно-патогенной микрофлоры не меняет тактику лечения бактериального вагиноза. Исключение составляет А(ороЬшт уадтае, для которой была продемонстрирована устойчивость к метронидазолу [Ие Васкег Е. е( а1. АпйЬюйс киксерйЬййу оГ А(ороЬшт уадтае. ВМС !пГес( Όίκ. 2006 Маг 16; 6:51]. Соответственно обнаружение этого вида бактерий в значительных количествах меняет тактику терапии.Oagypegeia urpike is determined in 99% of women with bacterial vaginosis [Vaigayate C.8. c1 a1. Thier Akkoshayop OG Ayurbyt Uadtay Apy Oagipege 11a Uadtayk \ νί11ι bas1sg1a1 uadtopk apy gesiggepse ayeg oga1 te1goYyya / o1e Legaru. 1. 1pGes (. Όίκ. 2006 § 15; 194 (6): 828-836]. This type of bacteria, unlike other species associated with bacterial vaginosis, combines three virulence factors: the ability to adhere to human epithelial cells, biofilms and cytotoxicity Reb; 156 (P4 2): 392-399]. According to the latest data from Oagipege 11a, wadtike is etiologically m agent of bacterial vaginosis [Zsjetie TK. e (a1. Ko1e oG Oagypegeya wadtayk sh (Not RaLodepeyk oG Vas (ua1 Wadshoyyk: A Sopcer (u1 Moie1. 1. 1pGes (. .κ. 2014 Mag. 31. ]. Metronidazole is the standard therapy for bacterial vaginosis, while the discovery of other representatives of conditionally pathogenic microflora does not change the tactics of treating bacterial vaginosis. The exception is A (anoxidum, for which resistance to metronidazole has been demonstrated [Ie Vaskeg E. e (a1. Apyuys kikseryyu oG A (orst uadtay. IUD! NGes (Mar. 2006 Mag. 16; 6:51]. Accordingly, the detection of this type of bacteria in significant quantities changes the tactics of therapy.
Таким образом, из всего многообразия видов условно-патогенной микрофлоры, ассоциированной с бактериальным вагинозом, в качестве количественных диагностических маркеров заболевания были выбраны два вида: Оагйпегейа уадтайк и А(ороЬЫт уадтае.Thus, from the entire variety of opportunistic microflora species associated with bacterial vaginosis, two species were selected as quantitative diagnostic markers of the disease: Oagypegea uadtayk and A (aryobacterium.
С целью оптимального выбора диагностических маркеров аэробного вагинита были проанализированы литературные данные и проведён ряд экспериментов.In order to optimally select diagnostic markers of aerobic vaginitis, literature data were analyzed and a number of experiments were carried out.
Известны следующие четыре рода/семейства возбудителей аэробного вагинита: Еп(егоЬас(ейасеае (представители ЕксЬейсЫа сой, К1еЬк1е11а крр., Рго(еик крр.), 8(арЬу1ососсик крр. (представитель 8(арЬу1ососсик аигеик), 8(гер(ососсик крр. (представители Огоир В §(гер(ососсик, он же 8(гер(ососсик ада1асйае, Огоир А §(гер(ососсик), ЕЫегососсик крр. [Иопйегк О.О.О. е( а1. ИейЫйоп оГ а (уре оГ аЬпогта1 уадта1 йога (Ьа( 1к й1кйпс( Ггот Ьас(ейа1 уадтокЫ аегоЫс уадйийк. ВГОО. 2002 1аи; 109(1): 34-43].The following four genera / families of pathogens of aerobic vaginitis are known: Ep (ebac (euacae (representatives of Exxeus soy, K1ebk1e11a krr., Prgo (eik krr.), 8 (apyuossossic krr. . (representatives of Ogoyr B § (ger (ossossik, aka 8 (ger (ossossik adaassaye, Ogoyr A § (ger (ossossik)), EEgosossik krr. [Iopyegk O.O.O.e (a1. Ieyyyop oG a (ur bogta1 uadta1 yoga (ba (1k baaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa ...)
Экспериментальным путём исследована информативность основных групп аэробных микроорганизмов на уровне родов/семейств (Еп(егоЬас(ейасеае, 8(арЬу1ососсик крр., 8(гер(ососсик крр., ЕЫегососсик крр.) и отдельных видов (ЕксЬейсЫа сой, 8(арЬу1ососсик аигеик, 8(гер(ососсик ада1асйае). Была продемонстрирована непригодность ЕЫегососсик крр. в качестве количественного диагностического маркера и установлена низкая чувствительность (48%) совокупности отдельных видов аэробных микроорганизмов для диагностики аэробного вагинита.The informativity of the main groups of aerobic microorganisms at the genus / family level was studied experimentally (En (efbac (eufoss, 8 (apfu1ossosscr., 8 (ger (ossossicus cfr., Ebossossiccrr.) 8 (ger (ossossic adaaciae). The unsuitability of EEgossossik krr. As a quantitative diagnostic marker was demonstrated and low sensitivity (48%) of the aggregate of certain types of aerobic microorganisms for the diagnosis of aerobic vaginitis was established.
Таким образом, из известных представителей условно-патогенной микрофлоры, ассоциированной с аэробным вагинитом, в качестве количественных диагностических маркеров заболевания были выбраны следующие три группы аэробных микроорганизмов на уровне родов/семейств: ЕЫегоЬас(ейасеае, 8(арЬу1ососсик крр., 8(гер(ососсик крр.Thus, from the known representatives of opportunistic microflora associated with aerobic vaginitis, the following three groups of aerobic microorganisms at the level of the genera / families were selected as quantitative diagnostic markers of the disease: EEgobac (euacaea, 8 (apu1ossosscr., 8 (ger (ossossic krr.
Задачи настоящего изобретения решены созданием способа дифференциальной диагностики нарушений баланса вагинальной микрофлоры, включающего определение концентрации ДНК всех бактерий, концентрации ДНК бактерии Оагйпегейа уадтайк, концентрации ДНК бактерии А(ороЬшт уад1пае, концентрации ДНК бактерий БаЫоЬасйЫк крр. в образце методом амплификации нуклеиновых кислот, отличающегося тем, что на основании полученных данных рассчитывают коэффициенты соотношений концентраций:The objectives of the present invention have been solved by creating a method for differential diagnosis of imbalances in the vaginal microflora, including determining the concentration of DNA of all bacteria, the concentration of DNA of the bacterium Oagypegeya wadtike, the concentration of DNA of the bacterium A. that based on the data obtained, the coefficients of the ratios of the concentrations are calculated:
КС1 = 1д [ДНК Бас] - 1д ([ДНК Оу] + [ДНК Ау]),KC1 = 1d [DNA Bas] - 1d ([DNA Oy] + [DNA Au]),
КС2 = 1д [ДНК Вас] - 1д [ДНК Бас],KC2 = 1d [DNA of you] - 1d [DNA of Bas],
КС3 = 1д [ДНК Вас] - 1д ([ДНК Оу] + [ДНК Ау]), где [ДНК Бас] - концентрация ДНК бактерий БаЫоЬасйЫк крр. в ГЭ/мл, [ДНК Оу] - концентрация ДНК бактерии Оагйпегейа уадтайк в ГЭ/мл, [ДНК Ау] - концентрация ДНК бактерии А(ороЫит уадтае в ГЭ/мл, [ДНК Вас] - концентрация ДНК всех бактерий в ГЭ/мл, при 1д [ДНК Вас]>5, КС1>1 и КС2<1 констатируют отсутствие бактериального вагиноза, при 1д [ДНК Вас]>5, 0,5<КС1<1, КС2<1 и КС3<2 констатируют промежуточное состояние микрофлоры, при 1д [ДНК Вас]>5, КС1<0,5 и КС3<2 диагностируют бактериальный вагиноз, а при 1д [ДНК Вас]<5 констатируют, что количество бактерий недостаточно для анализа.KC3 = 1d [DNA of You] - 1d ([DNA of Au] + [DNA of Au]), where [DNA of Bas] is the concentration of DNA of bacteria BaObacia krr. in GE / ml, [DNA Oy] - DNA concentration of the bacterium Oagepegeia wadtike in GE / ml, [DNA Au] - DNA concentration of the bacterium A (ooYuid uadtae in GE / ml, [DNA of you] - DNA concentration of all bacteria in GE / ml , with 1d [DNA of you]> 5, KC1> 1 and KC2 <1, the absence of bacterial vaginosis is noted, with 1d [DNA of you]> 5, 0.5 <KC1 <1, KC2 <1 and KC3 <2, an intermediate state of microflora is observed , with 1d [DNA of you]> 5, KC1 <0.5 and KC3 <2 diagnose bacterial vaginosis, and with 1d [DNA of you] <5, it is ascertained that the number of bacteria is insufficient for analysis.
В частном случае выполнения способ по изобретению характеризуется тем, что при отсутствии бактериального вагиноза и 5<1д [ДНК Вас]<6 констатируют снижение степени бактериальной обсеме- 4 025042 нённости влагалища.In the particular case of the method according to the invention, it is characterized in that in the absence of bacterial vaginosis and 5 <1d [DNA of you] <6, a decrease in the degree of bacterial contamination of the vagina is noted.
В частном случае выполнения способ по изобретению характеризуется тем, что дополнительно определяют концентрацию ДНК Еп1сгоЬас1спассас. концентрацию ДНК бактерий §Гарйу1ососси5 врр., концентрацию ДНК бактерий ЗГгерГососсив врр. в образце методом амплификации нуклеиновых кислот, при 1д [ДНК Вас]>6 и ([ДНК Εηί] + [ДНК 81арй] + [ДНК 8йер]) < [ДНК Ьас], где [ДНК Εηί] - концентрация ДНК Еп1егоЬас1епасеае в ГЭ/мл, [ДНК §Гарй] - концентрация ДНК бактерий §Гарйу1ососси5 врр. в ГЭ/мл, [ДНК §Ггер] - концентрация ДНК бактерий ЗГгерГососсив врр. в ГЭ/мл, и отсутствии бактериального вагиноза делают заключение: нарушений баланса вагинальной микрофлоры не выявлено.In the particular case of execution of the method according to the invention is characterized in that it further determines the concentration of DNA of Epilocobacillus passas. bacterial DNA concentration §Garyu1ossossi 5 VRR, bacterial DNA concentration ZGgerGossoss VRR. in the sample by the method of amplification of nucleic acids, with 1d [DNA of you]> 6 and ([DNA Εηί] + [DNA of 81 ayr] + [DNA of 8yr]) <[DNA of bac], where [DNA of асηί] is the concentration of the DNA of Epiloeuxepaseae in GE / ml, [DNA §Gary] - the concentration of DNA of bacteria §Garyu1ossossi 5 VRR. in GE / ml, [DNA §Gger] - DNA concentration of bacteria ZGgerGossoss vrr. in GE / ml, and in the absence of bacterial vaginosis, they conclude that there are no violations of the balance of vaginal microflora.
В частном случае выполнения способ по изобретению характеризуется тем, что дополнительно определяют концентрацию ДНК ЕпГегоЬасГег1асеае, концентрацию ДНК бактерий §Гарйу1ососси5 врр., концентрацию ДНК бактерий ЗГгерГососсив врр. в образце методом амплификации нуклеиновых кислот, при 1д ([ДНК Ον] + [ДНК Αν]) - 1д ([ДНК Εηί] + [ДНК 81арй] + [ДНК 8йер]) < 1, где [ДНК Εηί] - концентрация ДНК Еп1егоЬас1епасеае в ГЭ/мл, [ДНК §1арй] - концентрация ДНК бактерий §1арйу1ососсш врр. в ГЭ/мл, [ДНК §1гер] - концентрация ДНК бактерий §1гер1ососсив врр. в ГЭ/мл, диагноз бактериальный вагиноз уточняют как бактериальный вагиноз в сочетании с повышенным содержанием аэробной микрофлоры.In the particular case of the implementation of the method according to the invention is characterized in that it further determines the concentration of DNA of Epigotosacrilaceae, the concentration of bacterial DNA §Garyuossoss5 vr., The concentration of bacterial DNA ZggerGossoss vrr. in the sample by the method of amplification of nucleic acids, at 1d ([DNA Ον] + [DNA --ν]) - 1d ([DNA Εηί] + [DNA 81 ar] + [DNA 8pyr]) <1, where [DNA --ηί] is the concentration of the DNA Ep1goBac1epaceae in GE / ml, [DNA §1ary] - the concentration of DNA of bacteria §1aryu1ossss VRR. in GE / ml, [DNA §1ger] - the concentration of DNA of bacteria §1ger1ossiviv VRP. in GE / ml, the diagnosis of bacterial vaginosis is specified as bacterial vaginosis in combination with an increased content of aerobic microflora.
В частном случае выполнения способ по изобретению характеризуется тем, что при бактериальном вагинозе в сочетании с повышенным содержанием аэробной микрофлоры дополнительно определяют наличие клинических признаков воспаления у пациентки и соотношение полиморфно-ядерные лейкоциты:эпителиальные клетки при микроскопии образца и при наличии клинических признаков воспаления у пациентки и соотношении полиморфно-ядерные лейкоциты:эпителиальные клетки более 1 диагностируют бактериальный вагиноз в сочетании с аэробным вагинитом.In the particular case of performing the method according to the invention, it is characterized in that in case of bacterial vaginosis in combination with an increased content of aerobic microflora, the presence of clinical signs of inflammation in the patient and the ratio of polymorphonuclear leukocytes: epithelial cells during microscopy of the sample and in the presence of clinical signs of inflammation in the patient are additionally determined the ratio of polymorphonuclear leukocytes: epithelial cells more than 1 diagnose bacterial vaginosis in combination with aerobic vaginitis.
В частном случае выполнения способ по изобретению характеризуется тем, что дополнительно определяют концентрацию ДНК Εηίе^оЬасίе^^асеае, концентрацию ДНК бактерий §1арйу1ососсив врр., концентрацию ДНК бактерий §1гер1ососсив врр. в образце методом амплификации нуклеиновых кислот, при 1д [ДНК Вас]>5, ([ДНК Εηί] + [ДНК 81арй] + [ДНК 81гер]) > [ДНК Ьас], КС2>1 и КС3>2, где [ДНК Εηί] - концентрация ДНК Εηίе^оЬасίе^^асеае в ГЭ/мл, [ДНК 81арН| - концентрация ДНК бактерий 81арНу1ососсив врр. в ГЭ/мл, [ДНК δί гер] - концентрация ДНК бактерий ЕНгерЮсоссив врр. в ГЭ/мл, констатируют преобладание аэробной микрофлоры.In the particular case of the implementation of the method according to the invention is characterized in that it further determines the concentration of DNA Εηίе ^ о осίе ^^ асеее, the concentration of bacterial DNA §1арюуossossing time, the concentration of bacterial DNA §1ger1, saving time. in the sample by the method of amplification of nucleic acids, at 1d [DNA of you]> 5, ([DNA Εηί] + [DNA of 81 ar]] + [DNA of 81 ger])> [DNA of bac], KC2> 1 and KC3> 2, where [DNA Εηί ] is the concentration of DNA ίηίе ^ оБасίе ^^ асее in GE / ml, [DNA 81ArH | - the concentration of bacterial DNA 81arNu1ossiviv VRP. in GE / ml, [DNA δί ger] is the concentration of DNA of bacteria Engerususiviv rr. in GE / ml, ascertain the predominance of aerobic microflora.
В частном случае выполнения способ по изобретению характеризуется тем, что при преобладании аэробной микрофлоры дополнительно определяют наличие клинических признаков воспаления у пациентки и соотношение полиморфно-ядерные лейкоциты:эпителиальные клетки при микроскопии образца и при наличии клинических признаков воспаления у пациентки и соотношении полиморфно-ядерные лейкоциты:эпителиальные клетки более 1 диагностируют аэробный вагинит.In the particular case of performing the method according to the invention, it is characterized by the fact that, with the predominance of aerobic microflora, the presence of clinical signs of inflammation in the patient and the ratio of polymorphonuclear leukocytes: epithelial cells during microscopy of the sample and in the presence of clinical signs of inflammation in the patient and the ratio of polymorphonuclear leukocytes are additionally determined: epithelial cells more than 1 diagnose aerobic vaginitis.
В частном случае выполнения способ по изобретению характеризуется тем, что при констатации промежуточного состояния микрофлоры дополнительно определяют рН выделений пациентки и наличие жалоб на патологические выделения у пациентки и при рН<4,5 и отсутствии жалоб на патологические выделения пациентке рекомендуют повторить анализ в следующем менструальном цикле, а при рН>4,5 и наличии жалоб на патологические выделения у пациентки диагностируют бактериальный вагиноз.In the particular case of carrying out the method according to the invention, it is characterized in that when ascertaining the intermediate state of microflora, the pH of the patient’s discharge and the presence of complaints of pathological discharge in the patient are additionally determined, and at pH <4.5 and the absence of complaints of pathological discharge, the patient is recommended to repeat the analysis in the next menstrual cycle and at pH> 4.5 and the presence of complaints of pathological discharge, the patient is diagnosed with bacterial vaginosis.
В частном случае выполнения способ по изобретению характеризуется тем, что образец представляет собой влагалищный мазок.In the particular case of performing the method according to the invention is characterized in that the sample is a vaginal smear.
В частном случае выполнения способ по изобретению характеризуется тем, что метод амплификации нуклеиновых кислот представляет собой метод количественной полимеразной цепной реакции.In the particular case of performing the method according to the invention is characterized in that the method of amplification of nucleic acids is a method of quantitative polymerase chain reaction.
В частном случае выполнения способ по изобретению характеризуется тем, что метод количественной полимеразной цепной реакции представляет собой метод полимеразной цепной реакции с гибридизационно-флуоресцентной детекцией в режиме реального времени.In the particular case of performing the method according to the invention is characterized in that the method of quantitative polymerase chain reaction is a polymerase chain reaction method with hybridization-fluorescence detection in real time.
В частном случае выполнения способ по изобретению характеризуется тем, что полимеразная цепная реакция представляет собой мультиплексную полимеразную цепную реакцию.In the particular case of performing the method according to the invention is characterized in that the polymerase chain reaction is a multiplex polymerase chain reaction.
Изобретение позволяет надёжно и эффективно проводить дифференциальную диагностику нарушений баланса вагинальной микрофлоры. При осуществлении способа по изобретению достигается повышение чувствительности до 98,5% и специфичности до 97,4% для диагностики бактериального вагиноза при минимальных затратах материальных и временных ресурсов.The invention allows reliable and efficient differential diagnosis of imbalance in the vaginal microflora. When implementing the method according to the invention, an increase in sensitivity to 98.5% and specificity to 97.4% is achieved for the diagnosis of bacterial vaginosis with minimal material and time resources.
Созданное изобретение можно использовать как для первичной диагностики, подтверждения или опровержения ранее поставленных диагнозов и назначения терапии, так и для последующего контроля эффективности лечения и мониторинга критериев излеченности.The created invention can be used both for primary diagnosis, confirmation or refutation of previously diagnosed and prescribed therapy, and for subsequent monitoring of treatment effectiveness and monitoring of cure criteria.
- 5 025042- 5 025042
Перечень фигурList of figures
Фиг. 1. Распределение пациенток по общему количеству бактерий в образце (в 1д).FIG. 1. The distribution of patients by the total number of bacteria in the sample (in 1e).
Фиг. 2. Концентрации аэробных микроорганизмов у пациенток с аэробным вагинитом.FIG. 2. Concentrations of aerobic microorganisms in patients with aerobic vaginitis.
Сведения, подтверждающие возможность осуществления изобретенияInformation confirming the possibility of carrying out the invention
В исследование были включены 274 пациентки репродуктивного возраста, обратившиеся в НИИ акушерства и гинекологии им. Д.О. Отта Российской Академии Медицинских Наук. Средний возраст пациенток составил 30±5,7 лет. Каждая пациентка была обследована с использованием как клинических, так и лабораторных методов диагностики с целью дифференцировки различных нарушений баланса вагинальной микрофлоры: бактериального вагиноза, промежуточного состояния микрофлоры, бактериального вагиноза в сочетании с аэробным вагинитом, аэробного вагинита.The study included 274 patients of reproductive age who applied to the Institute of Obstetrics and Gynecology. BEFORE. Ott Russian Academy of Medical Sciences. The average age of the patients was 30 ± 5.7 years. Each patient was examined using both clinical and laboratory diagnostic methods to differentiate various imbalances in the vaginal microflora: bacterial vaginosis, intermediate microflora, bacterial vaginosis in combination with aerobic vaginitis, aerobic vaginitis.
Первый этап разработки способа дифференциальной диагностики нарушений баланса вагинальной микрофлоры включал в себя:The first stage of the development of a method for the differential diagnosis of imbalances in the vaginal microflora included:
1) определение критериев Амселя (наличие специфических выделений из влагалища, повышение рН>4,5, положительный аминный тест, наличие ключевых клеток при бактериоскопии);1) determination of Amsel’s criteria (the presence of specific vaginal discharge, an increase in pH> 4.5, a positive amine test, the presence of key cells during bacterioscopy);
2) микроскопию мазка, окрашенного по Граму, с оценкой баллов Ньюджента (0-3 балла - норма; 4-6 баллов - промежуточный тип микрофлоры; 7-10 баллов - бактериальный вагиноз);2) Gram stain microscopy with an assessment of Newgent scores (0-3 points - normal; 4-6 points - intermediate microflora type; 7-10 points - bacterial vaginosis);
3) определение концентрации ДНК всех бактерий, концентрации ДНК бактерии Сагбпеге11а уадшаПк, концентрации ДНК бактерии ЛЮроЪшт уадшае, концентрации ДНК бактерий БасЮЪасШщ 8рр. во влагалищном мазке методом амплификации нуклеиновых кислот - мультиплексной полимеразной цепной реакцией (ПЦР) с гибридизационно-флуоресцентной детекцией в режиме реального времени.3) determination of the concentration of DNA of all bacteria, the concentration of DNA of the bacterium Sagbpege 11a pars, the concentration of DNA of the bacterium Lactobacillus, the concentration of DNA of bacteria Bacillas spp. 8 pp. in a vaginal smear by nucleic acid amplification - multiplex polymerase chain reaction (PCR) with hybridization-fluorescence detection in real time.
Для проведения исследования методом мультиплексной ПЦР от каждой пациентки получали вагинальный образец (влагалищный мазок) в транспортной среде с муколитиком (ТСМ, ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, кат. № 953) объёмом 500 мкл. Далее проводили экстракцию нуклеиновых кислот с использованием комплекта реагентов для экстракции ДНК из клинического материала АмплиПрайм ДНК-Сорб-АМ (ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, кат. № 102-22). Для дальнейшей амплификации использовали 10 мкл полученного элюата, содержащего ДНК изучаемых микроорганизмов (объём полученного элюата после экстракции составлял 100 мкл).To conduct a multiplex PCR study, each patient received a vaginal sample (vaginal smear) in a transport medium with a mucolytic (TSM, FBSI Central Research Institute of Epidemiology of Rospotrebnadzor, Moscow, Cat. No. 953) with a volume of 500 μl. Next, nucleic acids were extracted using a set of reagents for the extraction of DNA from AmpliPrim DNA-Sorb-AM clinical material (Federal State Institution of Research Institute of Epidemiology of Rospotrebnadzor, Moscow, cat. No. 102-22). For further amplification, 10 μl of the obtained eluate containing DNA of the studied microorganisms was used (the volume of the obtained eluate after extraction was 100 μl).
Во время приготовления реакционной смеси использовали 100-кратный ТЕ-буфер для получения необходимой концентрации праймеров, зондов и дезоксирибонуклеозидтрифосфатов (6ΝΤΡ). Состав реакционной смеси приведён в табл. 1.During the preparation of the reaction mixture, a 100-fold TE buffer was used to obtain the necessary concentration of primers, probes, and deoxyribonucleoside triphosphates (6ΝΤΡ). The composition of the reaction mixture is given in table. one.
Таблица 1Table 1
Состав реакционной смеси (ПЦР-смесь-1)The composition of the reaction mixture (PCR mixture-1)
- 6 025042- 6 025042
Для получения реакционной смеси в пробирку вносили 10 мкл ПЦР-смеси-1 и 5 мкл ПЦР-смеси-2гсб (ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, кат. № 863).To obtain the reaction mixture, 10 μl of PCR-mixture-1 and 5 μl of PCR-mixture-2 gsb were added to the test tube (FBSI Central Research Institute of Epidemiology of Rospotrebnadzor, Moscow, Cat. No. 863).
Далее в каждую амплификационную пробирку вносили 15 мкл реакционной смеси и 10 мкл элюата ДНК. Кроме того, в каждой постановке использовали калибраторы для количественного анализа микроорганизмов (в соответствующие пробирки вносили по 10 мкл калибраторов). В каждой постановке участвовали 2 калибратора с концентрацией 105 и 103 копий/реакция.Then, 15 μl of the reaction mixture and 10 μl of DNA eluate were added to each amplification tube. In addition, calibrators were used in each formulation for the quantitative analysis of microorganisms (10 μl of calibrators were added to the corresponding tubes). Each formulation involved 2 calibrators with a concentration of 10 5 and 10 3 copies / reaction.
Состав калибраторов (РС1 и РС2).The composition of the calibrators (PC1 and PC2).
Калибраторы включают в себя два препарата, клонированных в фаг λ: концентрированный раствор положительный контрольный образец (КР ПКО) Оагбпеге11а уащпаПх и КР ПКО Ьас1оЬасШи5 5рр., и два препарата, клонированных в вектор рСет-Т: КР ПКО АЮроЬшт уащпае и КР ПКО ЕксЬепсЫа сой. Для разведения исходных КР используется ДНК-буфер с ро1у(А). Конечная концентрация каждого препарата для калибратора РС1 составляет 1-105 копий/реакция; для калибратора РС2 - 1-103 копий/реакция.Calibrators include two preparations cloned into phage λ: a concentrated solution, a positive control sample (CRP) of Oagbpege11a uaschpaPh and KR PKO bac1oacaci5 5pp. . For dilution of the initial RS, a DNA buffer with po1u (A) is used. The final concentration of each preparation for the PC1 calibrator is 1-10 5 copies / reaction; for the PC2 calibrator - 1-10 3 copies / reaction.
Амплификацию проводили на приборе Ко1от-Оеие О (ΟΙΑΟΕΝ, 1011132).Amplification was carried out on a Co1ot-Oeie O device (ΟΙΑΟΕΝ, 1011132).
Программа амплификации:Amplification program:
Далее проводилось сопоставление результатов, полученных тремя методами диагностики бактериального вагиноза. В связи с тем, что как критерии Амселя, так и оценка с использованием баллов Ньюджента подразумевают определённую долю субъективизма, в качестве расширенного золотого стандарта использовались оба метода. Оценка диагностических характеристик способа по изобретению проводилась по тем образцам, для которых заключение по критериям Амселя и баллам Ньюджента совпадали.Next, a comparison was made of the results obtained by three methods for diagnosing bacterial vaginosis. Due to the fact that both the Amsel criteria and the assessment using Newgent scores imply a certain amount of subjectivity, both methods were used as an expanded gold standard. Assessment of the diagnostic characteristics of the method according to the invention was carried out on those samples for which the conclusion on the Amsel criteria and Nugent scores coincided.
Результаты исследования образцов от 274 пациенток приведены в табл. 2. Для каждого образца приведены следующие данные:The results of the study of samples from 274 patients are given in table. 2. For each sample, the following data:
Оценка состояния вагинальной микрофлоры по критериям Амселя - бактериальный вагиноз (БВ) или отсутствие бактериального вагиноза (ОБВ);Assessment of the state of vaginal microflora according to Amsel’s criteria - bacterial vaginosis (BV) or the absence of bacterial vaginosis (OBV);
Оценка состояния вагинальной микрофлоры по баллам Ньюджента - бактериальный вагиноз (БВ), промежуточный тип микрофлоры (ПТ) или отсутствие бактериального вагиноза (ОБВ);Assessment of the state of vaginal microflora by Nugent scores - bacterial vaginosis (BV), an intermediate type of microflora (PT) or the absence of bacterial vaginosis (OBV);
концентрации бактерий, выраженные в единицах ГЭ/мл, определённые методом мультиплексной ПЦР в режиме реального времени: [ДНК Ον] - концентрация ДНК бактерии Оагйиеге11а να^ίηαΐίδ, [ДНК Αν] - концентрация ДНК бактерии АЮроЬшт νад^ηае, [ДНК Ьас] - концентрация ДНК бактерий Ьас1оЬасШи5 5рр., [ДНК Вас] - концентрация ДНК всех бактерий;bacterial concentrations, expressed in units of GE / ml, determined by the real-time multiplex PCR method: [DNA Ον] - DNA concentration of the bacterium Oagyiege11a να ^ ίηαΐίδ, [DNA Αν] - DNA concentration of the bacterium Ayurobst νad ^ ηае, [DNA bac] - the concentration of DNA of bacteria Lactobaculi 5 5 pp., [DNA of You] - the concentration of DNA of all bacteria;
рассчитанные коэффициенты соотношений концентраций бактерий: КС1 = 1д [ДНК Ьас] - 1д ([ДНК Ον] + [ДНК Αν]),calculated coefficients of ratios of bacterial concentrations: KC1 = 1d [DNA bac] - 1d ([DNA Ον] + [DNA Αν]),
КС2 = 1д [ДНК Вас] - 1д [ДНК Ьас],KC2 = 1d [DNA of you] - 1d [DNA of bac],
КС3 = 1д [ДНК Вас] - 1д ([ДНК Ον] + [ДНК Αν]).KC3 = 1d [DNA of you] - 1d ([DNA Ον] + [DNA Αν]).
- 7 025042- 7 025042
Таблица 2table 2
Результаты, полученные при обследовании 274 пациенток по критериям Амселя, по баллам Ньюджента и методом мультиплексной ПЦР в режиме реального времениThe results obtained during the examination of 274 patients according to Amsel’s criteria, Nugent scores and real-time multiplex PCR
- 8 025042- 8 025042
- 9 025042- 9 025042
- 10 025042- 10 025042
- 11 025042- 11 025042
- 12 025042- 12 025042
Далее для анализа были выбраны только те образцы, для которых были получены совпадающие результаты по данным критериев Амселя и баллов Ньюджента (БВ, N=66, ОБВ, N=156), табл. 3 и 4 соответственно.Further, for analysis, only those samples were selected for which matching results were obtained according to the Amsel criteria and Nugent scores (BV, N = 66, OBV, N = 156), Table. 3 and 4, respectively.
- 13 025042- 13 025042
Таблица 3Table 3
Результаты исследования методом мультиплексной ПЦР в режиме реального времени образцов от 66 пациенток с бактериальным вагинозом по критериям Амселя и по баллам НьюджентаReal-time multiplex PCR test results for samples from 66 patients with bacterial vaginosis according to Amsel criteria and Nugent scores
- 14 025042- 14 025042
- 15 025042- 15 025042
Таблица 4Table 4
Результаты исследования методом мультиплексной ПЦР в режиме реального времени образцов от 156 пациенток без бактериального вагиноза по критериям Амселя и по баллам НьюджентаResults of real-time multiplex PCR testing of samples from 156 patients without bacterial vaginosis according to Amsel criteria and Nugent scores
- 16 025042- 16 025042
- 17 025042- 17 025042
- 18 025042- 18 025042
Из табл. 2-4 видно, что для всех образцов значение показателя [ДНК Вас] превышает 105 ГЭ/мл, т.е. интерпретировать значения ниже этого порога не представляется возможным, поэтому в качестве нижнего порога валидности образцов было принято значение [ДНК Вас] 105 ГЭ/мл.From the table. 2-4 it is seen that for all samples the value of [DNA of you] exceeds 10 5 GE / ml, i.e. it is not possible to interpret values below this threshold; therefore, [DNA of you] 10 5 GE / ml was taken as the lower threshold of sample validity.
Далее было определено нормальное количество бактерий на слизистой влагалища женщины репродуктивного возраста. Для этого оценили распределение пациенток по общему количеству бактерий и путём отсечения пяти процентов наименьших значений была принята нижняя граница нормы [ДНК Вас] 106 ГЭ/мл (фиг. 1).Further, the normal number of bacteria on the vaginal mucosa of a woman of reproductive age was determined. To do this, we evaluated the distribution of patients by the total number of bacteria and by cutting off five percent of the smallest values, the lower limit of normal [DNA of you] 10 6 GE / ml was adopted (Fig. 1).
Таким образом, на основании вышеприведённых данных, а также статистической обработки рассчитанных коэффициентов соотношений концентраций бактерий были сформированы критерии дифференциальной диагностики отсутствия бактериального вагиноза, в том числе частного случая отсутствия бактериального вагиноза - снижения степени бактериальной обсеменённости влагалища, промежуточного состояния микрофлоры и бактериального вагиноза.Thus, based on the above data, as well as statistical processing of the calculated ratios of the concentrations of bacteria, the criteria for differential diagnosis of the absence of bacterial vaginosis were formed, including a special case of the absence of bacterial vaginosis - a decrease in the degree of bacterial contamination of the vagina, the intermediate state of microflora and bacterial vaginosis.
При 1§ [ДНК Вас]>5, КС1>1 и КС2<1 констатируют отсутствие бактериального вагиноза, при этом при 5<1д [ДНК Вас]<6 дополнительно констатируют снижение степени бактериальной обсеменённости влагалища.At 1§ [DNA of You]> 5, KC1> 1 and KC2 <1, the absence of bacterial vaginosis is noted, while at 5 <1d [DNA of You] <6, an additional decrease in the degree of bacterial contamination of the vagina is noted.
При 1§ [ДНК Вас]>5, 0,5<КС1<1, КС2<1 и КС3<2 констатируют промежуточное состояние микрофлоры.At 1§ [DNA of You]> 5, 0.5 <KC1 <1, KC2 <1 and KC3 <2, an intermediate state of microflora is observed.
При 1§ [ДНК Вас]>5, КС1<0,5 и КС3<2 диагностируют бактериальный вагиноз.At 1§ [DNA of you]> 5, KC1 <0.5 and KC3 <2, bacterial vaginosis is diagnosed.
При 1§ [ДНК Вас]<5 констатируют, что количество бактерий недостаточно для анализа.At 1§ [DNA of you] <5, it is noted that the number of bacteria is insufficient for analysis.
При констатации промежуточного состояния микрофлоры дополнительно определяют наличие у пациентки жалоб на патологические выделения и рН выделений. При рН<4,5 и отсутствии жалоб на патологические выделения пациентке рекомендуют повторить анализ в следующем менструальном цикле, а при рН>4,5 и наличии жалоб на патологические выделения у пациентки диагностируют бактериальный вагиноз.When stating the intermediate state of microflora, the patient is additionally determined to have complaints of pathological discharge and pH of the discharge. At pH <4.5 and the absence of complaints of pathological discharge, the patient is recommended to repeat the analysis in the next menstrual cycle, and at pH> 4.5 and the presence of complaints of pathological discharge, the patient is diagnosed with bacterial vaginosis.
Суммарные данные по распределению заключений, полученных с использованием расширенного золотого стандарта и способа по изобретению, представлены в табл. 5.The total data on the distribution of conclusions obtained using the extended gold standard and the method according to the invention are presented in table. 5.
- 19 025042- 19 025042
Совпадение результатов, полученных с использованием расширенного золотого стандарта и способа по изобретениюThe results obtained using the extended gold standard and the method according to the invention
Таблица 5Table 5
Таким образом, чувствительность способа по изобретению для диагностики бактериального вагиноза составила 98,5%, специфичность - 97,4%.Thus, the sensitivity of the method according to the invention for the diagnosis of bacterial vaginosis was 98.5%, specificity 97.4%.
На втором этапе разработки способа дифференциальной диагностики нарушений баланса вагинальной микрофлоры для дальнейшего анализа были выбраны образцы, снижение количества лактобактерий в которых не могло объясняться наличием БВ-ассоциированных микроорганизмов, N=22 (табл. 6).At the second stage of development of a method for differential diagnosis of imbalances in the vaginal microflora, samples were selected for further analysis, the decrease in the number of lactobacilli in which could not be explained by the presence of BV-associated microorganisms, N = 22 (Table 6).
Таблица 6Table 6
Результаты, полученные при обследовании 22 пациенток, у которых имеется нарушение баланса вагинальной микрофлоры, не объясняемое наличием БВ-ассоциированных микроорганизмов, с применением критериев Амселя, баллов Ньюджента и метода мультиплексной ПЦР в режиме реального времениThe results obtained in the examination of 22 patients who have a violation of the balance of the vaginal microflora, not explained by the presence of BV-associated microorganisms, using Amsel criteria, Nugent scores and real-time multiplex PCR method
Второй этап включал в себя следующее.The second stage included the following.
1. Диагностику аэробного вагинита, основанную на микроскопии нативных препаратов (влагалищных мазков) и подсчётом баллов аэробного вагинита (АВ баллы). Методика определения АВ баллов включает в себя оценку лактобациллярной степени и морфотипов сопутствующей флоры, а также подсчёт лейкоцитов и парабазальных эпителиоцитов |Эопбег8 О.О.О. с1 а1. ОсГпШюп оГ а 1уре оГ аЬпотта1 уадша1 йота 1Па1 ίδ άίδΐίικ! Ггот Ьас1епа1 уадшок1к: аетоЫс уад1тЙ8. ВГОС. 2002 1ап; 109(1): 34-43]. В соответствии с классификацией, предложенной Эопбег8 С.С.С. е! а1., при получении 3 АВ баллов и более у пациентки диагностируют аэробный вагинит.1. Diagnosis of aerobic vaginitis, based on microscopy of native drugs (vaginal smears) and calculation of aerobic vaginitis points (AV points). The technique for determining AV scores includes an assessment of the lactobacillary degree and morphotypes of concomitant flora, as well as the count of leukocytes and parabasal epithelial cells | Eopbeg8 O.O.O. c1 a1. OGGSHyup OGa 1ure OG aBotta1 Wadsha1 iota 1Pa1 ίδ άίδΐίικ! Goth bac1aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa: VGOS. 2002 1ap; 109 (1): 34-43]. In accordance with the classification proposed by Eopbeg8 S.S.S. e! A1., when receiving 3 AV points or more, the patient is diagnosed with aerobic vaginitis.
- 20 025042- 20 025042
2. Выбор оптимальных количественных диагностических маркеров аэробного вагинита:2. The selection of optimal quantitative diagnostic markers of aerobic vaginitis:
а) оценка информативности основных четырёх групп аэробных микроорганизмов (Ейег οЬас!е^^асеае, Б^рНу^^сс^ δρρ., Б!^еρ!οсοссиδ δρρ., Е^ею^сс^ !рр.) показала непригодность Е^ею^сс^ δρρ. в качестве количественного диагностического маркера аэробного вагинита (фиг. 2);a) an assessment of the informativeness of the four main groups of aerobic microorganisms (Eyeg ас bac! e ^^ aseae, B ^ pHu ^^ ss ^ δρρ., B! ^ eρ! οssoci δ δρρ., Е ^ еу ^ сс ^! рр.) showed the unsuitability of E ^ her ^ cc ^ δρρ. as a quantitative diagnostic marker for aerobic vaginitis (Fig. 2);
б) оценка возможности выявления отдельных видов аэробных микроорганизмов для диагностики аэробного вагинита ^сНепсЫа той, Б^рНу^^сс^ ангещ, Б^ерй^сс^ ада1асйае) установила низкую чувствительность (48%) данной совокупности маркеров для диагностики аэробного вагинита.b) an assessment of the possibility of identifying certain types of aerobic microorganisms for the diagnosis of aerobic vaginitis ^ cNepsyta, B ^ pH ^^ cc ^ angst, B ^ ery ^ cc ^ adaaciae) established a low sensitivity (48%) of this set of markers for the diagnosis of aerobic vaginitis.
Таким образом, в качестве количественных диагностических маркеров аэробного вагинита были выбраны следующие три группы аэробных микроорганизмов на уровне родов/семейств: ЕйегоЬайепасеае, Б^рНу^^сс^ δρρ., Б^ерй^сс^ δρρ.Thus, the following three groups of aerobic microorganisms at the level of the genera / families were chosen as quantitative diagnostic markers of aerobic vaginitis: Ejeobieepaseae, B ^ pHu ^^ ss ^ δρρ., B ^ eryu ss ^ δρρ.
3. Определение концентрации ДНК Ейег οЬас!е^^асеае, концентрации ДНК бактерий δ^^ο^οου! δρρ., концентрации ДНК бактерий БЛер^отсс^ !рр. во влагалищном мазке методом амплификации нуклеиновых кислот - мультиплексной полимеразной цепной реакцией (ПЦР) с гибридизационнофлуоресцентной детекцией в режиме реального времени.3. Determination of the DNA concentration Eyeg ο bac! E ^^ acae, the concentration of bacterial DNA δ ^^ ο ^ οου! δρρ., the concentration of DNA of bacteria BLER ^ otss ^! rr. in a vaginal smear by nucleic acid amplification - multiplex polymerase chain reaction (PCR) with hybridization fluorescence detection in real time.
Для проведения исследования методом мультиплексной ПЦР из ранее полученных вагинальных образцов проводили экстракцию нуклеиновых кислот с использованием комплекта реагентов для экстракции ДНК из клинического материала АмплиПрайм ДНК-Сорб-АМ (ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, кат. № 102-22). Для дальнейшей амплификации использовали 10 мкл полученного элюата, содержащего ДНК изучаемых микроорганизмов (объём полученного элюата после экстракции составлял 100 мкл).To conduct a multiplex PCR study from previously obtained vaginal samples, nucleic acids were extracted using a set of reagents for extracting DNA from AmpliPrim DNA-Sorb-AM clinical material (Federal State Budget Research Institute of Epidemiology of Rospotrebnadzor, Moscow, cat. No. 102-22). For further amplification, 10 μl of the obtained eluate containing DNA of the studied microorganisms was used (the volume of the obtained eluate after extraction was 100 μl).
Во время приготовления реакционной смеси использовали 100-кратный ТЕ-буфер для получения необходимой концентрации праймеров, зондов и дезоксирибонуклеозидтрифосфатов (άΝΤΡ). Состав реакционной смеси приведён в табл. 7.During the preparation of the reaction mixture, a 100-fold TE buffer was used to obtain the necessary concentration of primers, probes, and deoxyribonucleoside triphosphates (άΝΤΡ). The composition of the reaction mixture is given in table. 7.
Таблица 7Table 7
Состав реакционной смеси (ПЦР-смесь-1)The composition of the reaction mixture (PCR mixture-1)
Для получения реакционной смеси в пробирку вносили 10 мкл ПЦР-смеси-1 и 5 мкл ПЦР-смеси-2гей (ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, кат. № 863).To obtain the reaction mixture, 10 μl of PCR-mixture-1 and 5 μl of PCR-mixture-2-gey were added to the test tube (FBSI Central Research Institute of Epidemiology of Rospotrebnadzor, Moscow, Cat. No. 863).
Далее в каждую амплификационную пробирку вносили 15 мкл реакционной смеси и 10 мкл элюата ДНК. Кроме того, в каждой постановке использовали калибраторы для количественного анализа микроорганизмов (в соответствующие пробирки вносили по 10 мкл калибраторов). В каждой постановке участвовали 2 калибратора с концентрацией 10 и 103 копий/реакция.Then, 15 μl of the reaction mixture and 10 μl of DNA eluate were added to each amplification tube. In addition, calibrators were used in each formulation for the quantitative analysis of microorganisms (10 μl of calibrators were added to the corresponding tubes). Each formulation involved 2 calibrators with a concentration of 10 and 10 3 copies / reaction.
- 21 025042- 21 025042
Состав калибраторов (К1 и К2).The composition of the calibrators (K1 and K2).
Калибраторы включают в себя четыре препарата, клонированных в плазмиды: концентрированный раствор положительный контрольный образец (КР ПКО) Еп1егоЬас1епасеае, КР ПКО §1арку1ососсик крр., КР ПКО 81арЬу1ососсик каргоркуйсик, КР ПКО 81гер1ососсик крр. Для разведения исходных КР используется ДНК-буфер с ро1у(А). Конечная концентрация каждого препарата для калибратора К1 составляет 1 · 106 копий/мл; для калибратора К2 - 1 -104 копий/мл.Calibrators include four preparations cloned into plasmids: a concentrated solution, a positive control sample (CR PKO) Ep1goBac1epasee, KR PKO §1arcuosossik krr. For dilution of the initial RS, a DNA buffer with po1u (A) is used. The final concentration of each preparation for the K1 calibrator is 1 · 10 6 copies / ml; for K2 calibrator - 1 -10 4 copies / ml.
Амплификацию проводили на приборе КоЮг-Сепе О (ΟΙΑΟΕΝ, 1011132).Amplification was carried out on a CoYug-Sepa O device (ΟΙΑΟΕΝ, 1011132).
Программа амплификации:Amplification program:
Результаты исследования образцов от 22 пациенток приведены в табл. 8. Для каждого образца приведены следующие данные:The results of the study of samples from 22 patients are given in table. 8. For each sample, the following data:
оценка состояния вагинальной микрофлоры по критериям Амселя - бактериальный вагиноз (БВ) или отсутствие бактериального вагиноза (ОБВ);assessment of the state of vaginal microflora according to Amsel’s criteria - bacterial vaginosis (BV) or the absence of bacterial vaginosis (OBV);
оценка состояния вагинальной микрофлоры по баллам Ньюджента - бактериальный вагиноз (БВ), промежуточный тип микрофлоры (ПТ) или отсутствие бактериального вагиноза (ОБВ);assessment of the state of vaginal microflora by Nugent scores - bacterial vaginosis (BV), an intermediate type of microflora (PT) or the absence of bacterial vaginosis (OBV);
концентрации бактерий, выраженные в единицах ГЭ/мл, определенные методом мультиплексной ПЦР в режиме реального времени: [ДНК Су] - концентрация ДНК бактерии Сагбиеге11а уадтаПк, [ДНК Αν] - концентрация ДНК бактерии АЮроЬшт уадтае, [ДНК Бас] - концентрация ДНК бактерий БасЮЬасШик крр., [ДНК Вас] - концентрация ДНК всех бактерий, [ДНК Εηΐ] - концентрация ДНК ЕШегоЬааепасеае, [ДНК 5>1арк| - концентрация ДНК бактерий §1арку1ососсик крр., [ДНК 51гер| - концентрация ДНК бактерий §1гер1ососсик крр.;bacterial concentrations, expressed in units of GE / ml, determined by real-time multiplex PCR: [DNA Su] - DNA concentration of the bacterium Sagbiege11a uadtaPk, [DNA Αν] - DNA concentration of the bacterium Auropoctus uadtae, [DNA Bas] - DNA concentration of the bacteria crr., [DNA of You] - the concentration of DNA of all bacteria, [DNA Εηΐ] - the concentration of DNA of EXTERNAL aaaaaaaaa, [DNA 5> 1ark | - the concentration of bacterial DNA §1arcu1ossosscr. - the concentration of DNA of bacteria §1ger1ossoss krr .;
рассчитанные коэффициенты соотношений концентраций бактерий: КС1 = 1д [ДНК Бас] - 1д ([ДНК Су] + [ДНК Αν]), КС2 = 1д [ДНК Вас] - 1д [ДНК Бас], КС3 = 1д [ДНК Вас] - 1д ([ДНК Су] + [ДНК Αν]);the calculated coefficients of ratios of bacterial concentrations: KC1 = 1d [DNA Bas] - 1d ([DNA Su] + [DNA Αν]), KC2 = 1d [DNA Vas] - 1d [DNA Bas], KC3 = 1d [DNA Vas] - 1d ([DNA Su] + [DNA Αν]);
АВ баллы, определённые по методике Эопбегк С.С.С. е! а1.AV points determined by the method of Eopbegg S.S. e! a1.
- 22 025042- 22 025042
Таблица 8Table 8
Результаты, полученные при обследовании 22 пациенток, у которых имеется нарушение баланса вагинальной микрофлоры, не объясняемое наличиемThe results obtained during the examination of 22 patients who have an imbalance in the vaginal microflora, not explained by the presence of
БВ-ассоциированных микроорганизмов, с применением критериев Амселя, баллов Ньюджента, АВ баллов и метода мультиплексной ПЦР в режиме реального времениBV-associated microorganisms using the Amsel criteria, Nugent scores, AV scores and real-time multiplex PCR
Расчёты подтвердили, что во всех случая снижения количества лактобактерий в отсутствие бактериального вагиноза произошло замещение лактобактериий аэробными микроорганизмами. Во всех этих случаях у пациенток установлен аэробный вагинит по методике ΌοηάβΓδ О.О.О. с1 а1.The calculations confirmed that in all cases of a decrease in the number of lactobacilli in the absence of bacterial vaginosis, lactobacilli were replaced by aerobic microorganisms. In all these cases, aerobic vaginitis was established in patients according to the method of ΌοηάβΓδ O.O.O. c1 a1.
Таким образом, на основании статистической обработки полученных экспериментальных данных были сформированы критерии дифференциальной диагностики отсутствия нарушений баланса вагинальной микрофлоры, бактериального вагиноза в сочетании с повышенным содержанием аэробной микрофлоры и преобладания аэробной микрофлоры.Thus, based on the statistical processing of the obtained experimental data, criteria for differential diagnosis of the absence of imbalance in the vaginal microflora, bacterial vaginosis in combination with an increased content of aerobic microflora and the predominance of aerobic microflora were formed.
При 1д [ДНК Вас]>6, ([ДНК Εηΐ] + [ДНК 5>1арН] + [ДНК §1гер]) < [ДНК Бае] и отсутствии бактериального вагиноза делают заключение нарушений баланса вагинальной микрофлоры не выявлено.With 1d [DNA of You]> 6, ([DNA Εηΐ] + [DNA 5> 1arN] + [DNA §1ger]) <[DNA of Bae] and the absence of bacterial vaginosis, no imbalance of the vaginal microflora is concluded.
При 1д ([ДНК Ον] + [ДНК Αν]) - 1д ([ДНК Εηΐ] + [ДНК 5>1арН] + [ДНК 5>1гер|) < 1 диагноз бактериальный вагиноз уточняют как бактериальный вагиноз в сочетании с повышенным содержанием аэробной микрофлоры.When 1d ([DNA Ον] + [DNA Αν]) - 1d ([DNA Εηΐ] + [DNA 5> 1arN] + [DNA 5> 1ger |) <1, the diagnosis of bacterial vaginosis is specified as bacterial vaginosis in combination with an increased content of aerobic microflora.
При 1д [ДНК Вас]>5, ([ДНК Εηΐ] + [ДНК 81арП| + [ДНК 8£гер]) > [ДНК Бас], КС2>1 и КС3>2 констатируют преобладание аэробной микрофлоры.At 1d [DNA of You]> 5, ([DNA Εηΐ] + [DNA 81ArP | + [DNA 8 £ her])> [DNA Bas], KC2> 1 and KC3> 2 indicate the predominance of aerobic microflora.
Для постановки диагноза аэробный вагинит пациенткам с повышенным содержанием или преобладанием аэробной микрофлоры необходимо дополнительно оценить наличие местной воспалительной реакции. Для этого определяют наличие клинических признаков воспаления у пациентки и соотношение полиморфно-ядерные лейкоциты:эпителиальные клетки при микроскопии образца. При наличии клинических признаков воспаления и соотношении полиморфно-ядерные лейкоциты:эпителиальные клетки более 1 диагностируют аэробный вагинит.For the diagnosis of aerobic vaginitis, patients with an increased content or predominance of aerobic microflora need to additionally assess the presence of a local inflammatory reaction. To do this, determine the presence of clinical signs of inflammation in the patient and the ratio of polymorphonuclear leukocytes: epithelial cells by microscopy of the sample. In the presence of clinical signs of inflammation and the ratio of polymorphonuclear leukocytes: epithelial cells more than 1 diagnose aerobic vaginitis.
Claims (12)
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
EA201400641A EA025042B1 (en) | 2014-06-03 | 2014-06-03 | Method for differential diagnostics of vaginal microflora balance disorders |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
EA201400641A EA025042B1 (en) | 2014-06-03 | 2014-06-03 | Method for differential diagnostics of vaginal microflora balance disorders |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
EA201400641A1 EA201400641A1 (en) | 2016-01-29 |
EA025042B1 true EA025042B1 (en) | 2016-11-30 |
Family
ID=55174374
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
EA201400641A EA025042B1 (en) | 2014-06-03 | 2014-06-03 | Method for differential diagnostics of vaginal microflora balance disorders |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
EA (1) | EA025042B1 (en) |
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20100075306A1 (en) * | 2006-11-24 | 2010-03-25 | Universite De La Mediterranee (Aix-Marseille Ii) | Method for diagnosis of and following a bacterial vaginosis by molecular quantification |
WO2011068679A1 (en) * | 2009-12-03 | 2011-06-09 | Quest Diagnostics Investments Incorporated | Methods for the diagnosis of bacterial vaginosis |
-
2014
- 2014-06-03 EA EA201400641A patent/EA025042B1/en unknown
Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20100075306A1 (en) * | 2006-11-24 | 2010-03-25 | Universite De La Mediterranee (Aix-Marseille Ii) | Method for diagnosis of and following a bacterial vaginosis by molecular quantification |
WO2011068679A1 (en) * | 2009-12-03 | 2011-06-09 | Quest Diagnostics Investments Incorporated | Methods for the diagnosis of bacterial vaginosis |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
MENARD Jean-Pierre et al. Molecular Quantification of Gardnerella vaginalis and Atopobium vaginae Loads to Predict Bacterial Vaginosis. Molecular Diagnosis of BV, 2008, vol. 47, p. 33-43 * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
EA201400641A1 (en) | 2016-01-29 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Moreno et al. | The diagnosis of chronic endometritis in infertile asymptomatic women: a comparative study of histology, microbial cultures, hysteroscopy, and molecular microbiology | |
AU2015226203B2 (en) | Method for diagnosing colorectal cancer from a human feces sample by quantitative PCR, primers and kit | |
Hollman et al. | Screening for Trichomonas vaginalis in high-risk adolescent females with a new transcription-mediated nucleic acid amplification test (NAAT): associations with ethnicity, symptoms, and prior and current STIs | |
Gutierrez et al. | Detection and quantification of Toxoplasma gondii in ovine maternal and foetal tissues from experimentally infected pregnant ewes using real-time PCR | |
Menard et al. | Self-collected vaginal swabs for the quantitative real-time polymerase chain reaction assay of Atopobium vaginae and Gardnerella vaginalis and the diagnosis of bacterial vaginosis | |
JP2010509932A (en) | A method for diagnosis and follow-up of bacterial vaginosis by molecular level quantification | |
JP2017519514A (en) | Detection of bacterial taxa to predict adverse pregnancy outcomes | |
Muskens et al. | Dairy cows with metritis: Coxiella burnetii test results in uterine, blood and bulk milk samples | |
Gdoura et al. | Screening for bacterial pathogens in semen samples from infertile men with and without leukocytospermia | |
Shipitsyna et al. | Evaluation of polymerase chain reaction assays for the diagnosis of Trichomonas vaginalis infection in Russia | |
KR101848037B1 (en) | Compositions of human vaginal microbiota | |
JP7445980B2 (en) | Methods and kits for predicting outcomes of assisted reproductive techniques | |
Hashim et al. | Putative periodontal pathogens in the subgingival plaque of Sudanese subjects with aggressive periodontitis | |
RU2622028C1 (en) | Method for laboratory verification of vaginitis in girls with vulvitis at age of up to 8 years | |
EA025042B1 (en) | Method for differential diagnostics of vaginal microflora balance disorders | |
Sonmez et al. | Evaluation of symptomatic patients with resistant discharge | |
RU2563182C1 (en) | Integrated diagnostic technique for bacterial inflammatory process in vulva and vaginal in girls aged 0 to 8 years | |
Dong et al. | Urogenital tract and rectal microbiota composition and its influence on reproductive outcomes in infertile patients | |
RU2621863C2 (en) | Reagent kit for chlamydia trachomatis dna detection and its application | |
RU2545897C1 (en) | Method for centile assessment of vaginal mucosal microcenosis in girls aged 0 through 3 years old | |
RU2671561C2 (en) | Method for centile evaluation of microcenosis of vaginal mucosa in girls depending on stage of sexual maturation with use of tanner scale | |
Hall et al. | The presence of vaginal Lactobacillus species does not contribute to a measureable difference in amniotic fluid lactate levels collected from the vaginal tract of laboring women | |
RU2636619C1 (en) | Method for vaginal atrophy treatment in women in postmenopause considering vaginal epithelium and microbiocenosis state | |
Maftoon et al. | Isolation of Atopobium vaginae in Vaginal and Urine Samples of Iranian Women, the first report | |
TWI681057B (en) | Primer pair for detecting ureaplasma urealyticum serovar 10 and kit thereof |