DE20115610U1 - Leitfähigkeit-DNA/PNA-Hybridisierungs-Array - Google Patents
Leitfähigkeit-DNA/PNA-Hybridisierungs-ArrayInfo
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Description
Leitfähigkeits- DNA/PNA-Hybridisierungs-Array Beschreibung
Funktionelle Genexpressionsanalysen spielen in Zukunft eine große Rolle. Zur Zeit untersuchen Forschergruppen die Regulation nur eines einzelnen Genes. Spätestens seit der Entschlüsselung des humanen Genoms (HUGO) ist jedoch bekannt, dass das menschliche Erbgut aus mindestens 40 000 Genen besteht. Nun würde es ein erheblich umfangreicheres Bild der molekularen Vorgänge physiologischer wie pathophysiologischer Vorgänge erlauben wenn man möglichst viele der 40 000 humanen Gene parallel analysieren könnte.
Einen vielversprechenden Ansatz hierzu liefern sogenannte RNA- bzw. DNA-Mikroarrays. Es sind dies eine regelmäßige matrixförmige Anordnung von spezifischen Oligonucleotiden aufgebracht und fixiert auf einer Festphase (sog. RNA- bzw. DNA-Chip).
Die erfolgreiche Hybridisierung (RNA sowie DNA) wird derzeit mit komplizierten Farbstoffen und optischen Systemen registriert.
Jede erfolgreiche DNA bzw. RNA - Hybridisierung geht mit einer Leitfähigkeitsänderung einher. Typischer Weise handelt es sich dabei um eine Leitfähigkeitsabnahme aufgrund einer Viskositätszunahme und einer Einschränkung der lonenbeweglichkeit. Dieser Erfindung liegt nun die Überlegung zugrunde diese Leitfähigkeitsabnahme bzw. elektrische Kapazitätsänderung als Parameter für eine erfolgreiche Hybridisierung und somit als RNA- bzw. DNA-Nachweis zu nutzen.
Zu diesem Zweck werden beispielsweise auf dem RNA- bzw. DNA-Mikroarray passend zu den Oligonucleotid - Sequenzen in regelmäßigen Abständen und Anordnungen Mikroelektroden aufgebracht.
Die registrierten Leitfähigkeiten stellen ein Maß für die Hybridisierung und somit für das Vorhandensein der fraglichen Sequenzen (RNA bzw. DNA) da. Die Hybridisierung von DNA eignet sich besonders auch für das Auffinden sogenannter single nucleotid polymorphismen (SNPs), denen besondere diagnostische Bedeutung zukommt.
Durch Temperaturerhöhung lassen sich die Hybridisierungen rückgängig machen und die DNA- bzw. RNA- Chips regenerieren.
Leitfähigkeits- DNA/PNA-Hybridisierungs-Array Zeichnung eines Ausführungsbeispiels
1.) Festphase („Chip") 2.) Mikroelektroden zur Leitfähigkeits- bzw. Kapazitätsmessung
3.) auf den „Chip" in regelmäßiger Anordnung (Matrix) aufgebrachte Oligonucleotide
4.) Mikroprozessor zur Auswertung
Claims (3)
1. Ein Apparat zur Detektion definierter RNA- bzw. DNA-Sequenzen mittels RNA- bzw. DNA-Hybridisierung, dadurch gekennzeichnet, dass die mit der RNA- bzw. DNA-Hybridisierung verbundene Leitfähigkeitsänderung registriert wird.
2. Ein Apparat zur Detektion definierter RNA- bzw. DNA-Sequenzen mittels auf Festphasen ("Chips") aufgebrachten Oligonucleotidsequenzen (sogenannten Mikroarrays, bzw. PNA- Sequenzen) und Hybridisierung dadurch gekennzeichnet, dass die mit der RNA- bzw. DNA-Hybridisierung verbundene Leitfähigkeitsänderung mittels Mikroelektroden jeweils in unmittelbarer Nähe eines jeden Oligonucleotids auf dem Chip registriert wird.
3. Ein Apparat zur Detektion definierter RNA- bzw. DNA-Sequenzen mittels auf Chips aufgebrachten Oligonucleotidsequenzen (sogenannten Mikroarrays), Hybridisierung und Leitfähigkeitsmessung entsprechend Schutzanspruch 2 zusätzlich dadurch gekennzeichnet, dass die RNA- bzw. DNA-Hybridisierung zur Erhöhung der Spezifität bei einer definierten Temperatur und/oder unter Pufferfluß durchgeführt wird.
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Publications (1)
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DE20115610U1 true DE20115610U1 (de) | 2002-02-21 |
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DE20115610U Expired - Lifetime DE20115610U1 (de) | 2001-09-22 | 2001-09-22 | Leitfähigkeit-DNA/PNA-Hybridisierungs-Array |
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Country | Link |
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DE (1) | DE20115610U1 (de) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DE10220935B3 (de) * | 2002-05-10 | 2004-02-05 | Siemens Ag | Verfahren für die biochemische Analytik von DNA und zugehörige Anordnung |
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2001
- 2001-09-22 DE DE20115610U patent/DE20115610U1/de not_active Expired - Lifetime
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R071 | Expiry of right | ||
R071 | Expiry of right |