DE20115610U1 - Leitfähigkeit-DNA/PNA-Hybridisierungs-Array - Google Patents

Leitfähigkeit-DNA/PNA-Hybridisierungs-Array

Info

Publication number
DE20115610U1
DE20115610U1 DE20115610U DE20115610U DE20115610U1 DE 20115610 U1 DE20115610 U1 DE 20115610U1 DE 20115610 U DE20115610 U DE 20115610U DE 20115610 U DE20115610 U DE 20115610U DE 20115610 U1 DE20115610 U1 DE 20115610U1
Authority
DE
Germany
Prior art keywords
dna
rna
conductivity
hybridization
sequences
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Expired - Lifetime
Application number
DE20115610U
Other languages
English (en)
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Individual
Original Assignee
Individual
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Individual filed Critical Individual
Priority to DE20115610U priority Critical patent/DE20115610U1/de
Publication of DE20115610U1 publication Critical patent/DE20115610U1/de
Anticipated expiration legal-status Critical
Expired - Lifetime legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N27/00Investigating or analysing materials by the use of electric, electrochemical, or magnetic means
    • G01N27/26Investigating or analysing materials by the use of electric, electrochemical, or magnetic means by investigating electrochemical variables; by using electrolysis or electrophoresis
    • G01N27/28Electrolytic cell components
    • G01N27/30Electrodes, e.g. test electrodes; Half-cells
    • G01N27/327Biochemical electrodes, e.g. electrical or mechanical details for in vitro measurements
    • G01N27/3275Sensing specific biomolecules, e.g. nucleic acid strands, based on an electrode surface reaction
    • G01N27/3276Sensing specific biomolecules, e.g. nucleic acid strands, based on an electrode surface reaction being a hybridisation with immobilised receptors

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Electrochemistry (AREA)
  • Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Investigating Or Analyzing Materials By The Use Of Electric Means (AREA)

Description

Leitfähigkeits- DNA/PNA-Hybridisierungs-Array Beschreibung
Funktionelle Genexpressionsanalysen spielen in Zukunft eine große Rolle. Zur Zeit untersuchen Forschergruppen die Regulation nur eines einzelnen Genes. Spätestens seit der Entschlüsselung des humanen Genoms (HUGO) ist jedoch bekannt, dass das menschliche Erbgut aus mindestens 40 000 Genen besteht. Nun würde es ein erheblich umfangreicheres Bild der molekularen Vorgänge physiologischer wie pathophysiologischer Vorgänge erlauben wenn man möglichst viele der 40 000 humanen Gene parallel analysieren könnte.
Einen vielversprechenden Ansatz hierzu liefern sogenannte RNA- bzw. DNA-Mikroarrays. Es sind dies eine regelmäßige matrixförmige Anordnung von spezifischen Oligonucleotiden aufgebracht und fixiert auf einer Festphase (sog. RNA- bzw. DNA-Chip).
Die erfolgreiche Hybridisierung (RNA sowie DNA) wird derzeit mit komplizierten Farbstoffen und optischen Systemen registriert.
Jede erfolgreiche DNA bzw. RNA - Hybridisierung geht mit einer Leitfähigkeitsänderung einher. Typischer Weise handelt es sich dabei um eine Leitfähigkeitsabnahme aufgrund einer Viskositätszunahme und einer Einschränkung der lonenbeweglichkeit. Dieser Erfindung liegt nun die Überlegung zugrunde diese Leitfähigkeitsabnahme bzw. elektrische Kapazitätsänderung als Parameter für eine erfolgreiche Hybridisierung und somit als RNA- bzw. DNA-Nachweis zu nutzen.
Zu diesem Zweck werden beispielsweise auf dem RNA- bzw. DNA-Mikroarray passend zu den Oligonucleotid - Sequenzen in regelmäßigen Abständen und Anordnungen Mikroelektroden aufgebracht.
Die registrierten Leitfähigkeiten stellen ein Maß für die Hybridisierung und somit für das Vorhandensein der fraglichen Sequenzen (RNA bzw. DNA) da. Die Hybridisierung von DNA eignet sich besonders auch für das Auffinden sogenannter single nucleotid polymorphismen (SNPs), denen besondere diagnostische Bedeutung zukommt.
Durch Temperaturerhöhung lassen sich die Hybridisierungen rückgängig machen und die DNA- bzw. RNA- Chips regenerieren.
Leitfähigkeits- DNA/PNA-Hybridisierungs-Array Zeichnung eines Ausführungsbeispiels
1.) Festphase („Chip") 2.) Mikroelektroden zur Leitfähigkeits- bzw. Kapazitätsmessung
3.) auf den „Chip" in regelmäßiger Anordnung (Matrix) aufgebrachte Oligonucleotide
4.) Mikroprozessor zur Auswertung

Claims (3)

1. Ein Apparat zur Detektion definierter RNA- bzw. DNA-Sequenzen mittels RNA- bzw. DNA-Hybridisierung, dadurch gekennzeichnet, dass die mit der RNA- bzw. DNA-Hybridisierung verbundene Leitfähigkeitsänderung registriert wird.
2. Ein Apparat zur Detektion definierter RNA- bzw. DNA-Sequenzen mittels auf Festphasen ("Chips") aufgebrachten Oligonucleotidsequenzen (sogenannten Mikroarrays, bzw. PNA- Sequenzen) und Hybridisierung dadurch gekennzeichnet, dass die mit der RNA- bzw. DNA-Hybridisierung verbundene Leitfähigkeitsänderung mittels Mikroelektroden jeweils in unmittelbarer Nähe eines jeden Oligonucleotids auf dem Chip registriert wird.
3. Ein Apparat zur Detektion definierter RNA- bzw. DNA-Sequenzen mittels auf Chips aufgebrachten Oligonucleotidsequenzen (sogenannten Mikroarrays), Hybridisierung und Leitfähigkeitsmessung entsprechend Schutzanspruch 2 zusätzlich dadurch gekennzeichnet, dass die RNA- bzw. DNA-Hybridisierung zur Erhöhung der Spezifität bei einer definierten Temperatur und/oder unter Pufferfluß durchgeführt wird.
DE20115610U 2001-09-22 2001-09-22 Leitfähigkeit-DNA/PNA-Hybridisierungs-Array Expired - Lifetime DE20115610U1 (de)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
DE20115610U DE20115610U1 (de) 2001-09-22 2001-09-22 Leitfähigkeit-DNA/PNA-Hybridisierungs-Array

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
DE20115610U DE20115610U1 (de) 2001-09-22 2001-09-22 Leitfähigkeit-DNA/PNA-Hybridisierungs-Array

Publications (1)

Publication Number Publication Date
DE20115610U1 true DE20115610U1 (de) 2002-02-21

Family

ID=7962008

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
DE20115610U Expired - Lifetime DE20115610U1 (de) 2001-09-22 2001-09-22 Leitfähigkeit-DNA/PNA-Hybridisierungs-Array

Country Status (1)

Country Link
DE (1) DE20115610U1 (de)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE10220935B3 (de) * 2002-05-10 2004-02-05 Siemens Ag Verfahren für die biochemische Analytik von DNA und zugehörige Anordnung

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE10220935B3 (de) * 2002-05-10 2004-02-05 Siemens Ag Verfahren für die biochemische Analytik von DNA und zugehörige Anordnung

Similar Documents

Publication Publication Date Title
DE112005000293B4 (de) Verfahren zum Analysieren einer Genpolymorphie
Karp et al. Molecular techniques in the assessment of botanical diversity
Imaizumi et al. A new database of mitochondrial DNA hypervariable regions I and II sequences from 162 Japanese individuals
EP1204765B1 (de) Verfahren zur relativen quantifizierung der methylierung von cytosin basen in dna-proben
ATE516371T1 (de) Oligonukleotide und deren verwendungen
EP1975246A1 (de) Markierungsfreie Sequenzierung auf einer Festphase mittels Feldeffekttransistoren
CA2497740A1 (en) Multiplexed analysis of polymorphic loci by probe elongation-mediated detection
CN102634587B (zh) Dna芯片组合延伸检测碱基连续突变的方法
Poulsen et al. Typing of Amerindian Kichwas and Mestizos from Ecuador with the SNPforID multiplex
DE10234524A1 (de) Nukleinsäurearray
DE20111754U1 (de) Leitfähigkeits-Hybridisierung
DE20115610U1 (de) Leitfähigkeit-DNA/PNA-Hybridisierungs-Array
WO2002020833A2 (de) Verfahren zur spezifischen bestimmung von dna-sequenzen mittels paralleler amplifikation
DE602006000713T2 (de) Verfahren zur Verbesserung der Unterscheidung von einer einzelnen Basenfehlanpaarung durch die Verwendung von "hurdle" DNAs und Sonden mit artifiziellen Fehlpaarungen
FR2793809B1 (fr) Procede d'analyse de la predisposition genetique d'un patient a au moins une maladie et amplification adaptee a un tel procede
CN101353692B (zh) Hla-b基因分型用微阵列芯片的制备及其用法
US20130183666A1 (en) Partial genotyping by differential hybridization
Ng et al. Spatially addressable bead-based biosensor for rapid detection of beta-thalassemia mutations
Song et al. A DNA chip-based spoligotyping method for the strain identification of Mycobacterium tuberculosis isolates
DE10316159A1 (de) 5`-3`-Exonuklease Assay zur Bestimmung der Konzentration von Nukleinsäuren
DE10220935B3 (de) Verfahren für die biochemische Analytik von DNA und zugehörige Anordnung
EP1481094B1 (de) Erhöhung der sensitivität und spezifität von hybridisierungsexperimenten mit nukleinsäure-chips
EP1546394B1 (de) Verfahren zum nachweis von snps auf polydimensionalen microarrays
CN108291254B (zh) 用于检测单核苷酸多态性的试剂盒和方法
Swiderek et al. Evaluation of custom-made DNA microarrays for multilocus sequence typing of Neisseria meningitidis

Legal Events

Date Code Title Description
R086 Non-binding declaration of licensing interest
R207 Utility model specification

Effective date: 20020328

R150 Utility model maintained after payment of first maintenance fee after three years

Effective date: 20050115

R151 Utility model maintained after payment of second maintenance fee after six years

Effective date: 20080314

R152 Utility model maintained after payment of third maintenance fee after eight years

Effective date: 20100331

R071 Expiry of right
R071 Expiry of right