DE19618727C2 - Preparation of alkylated nucleoside 3'-phosphates - Google Patents
Preparation of alkylated nucleoside 3'-phosphatesInfo
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Description
Die Erfindung betrifft ein Verfahren zur Herstellung alkylierter Nucleosid-3'- Phosphate.The invention relates to a process for the preparation of alkylated nucleoside-3'- Phosphates.
Bei der Therapie von Tumoren werden oft Tumortherapeutika eingesetzt, deren Wirkung auf der Alkylierung von DNA beruht. Die Wirkung dieser Tumortherapeutika wird jedoch durch zelluläre Reparaturmechanismen, z. B. der O6- Alkyl-Guanosin-Transferase, vermindert oder sogar ganz verhindert. Um diesem entgegen treten zu können, könnte es nützlich sein, alkylierte Nucleosid-3'-Phosphate ergänzend zu den angesprochenen Tumortherapeutika zu verwenden. Alkylierte Nucleosid-3'-Phosphate stellen das Substrat für die O6-Alkyl-Guanosin-Transferase dar, wodurch diese in den Tumoren gebunden und von ihrer DNA-Reparatur- Aktivität abgehalten würde. Die Herstellung von alkylierten Nucleosid-3'-Phosphaten stellt sich allerdings als äußerst schwierig heraus.In the treatment of tumors, tumor therapeutics are often used, the effect of which is based on the alkylation of DNA. The effect of these tumor therapeutics is, however, affected by cellular repair mechanisms, e.g. B. the O 6 - alkyl guanosine transferase, reduced or even prevented. In order to counteract this, it could be useful to use alkylated nucleoside-3'-phosphates in addition to the tumor therapeutics mentioned. Alkylated nucleoside-3'-phosphates represent the substrate for the O 6 -alkyl guanosine transferase, whereby it would be bound in the tumors and prevented from their DNA repair activity. However, the production of alkylated nucleoside 3'-phosphates turns out to be extremely difficult.
Der vorliegenden Erfindung liegt somit die Aufgabe zugrunde, ein Verfahren bereitzustellen, mit dem alkylierte Nucleosid-3'-Phosphate hergestellt werden können.The present invention is therefore based on the object of a method provide with which alkylated nucleoside 3'-phosphates can be produced.
Erfindungsgemäß wird dies durch die Gegenstände in den Patentansprüchen erreicht.According to the invention, this is achieved by the subject matter in the claims.
Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist somit ein
Verfahren zur Herstellung eines alkylierten Nucleosid-3'-Phosphats, wobei das
Nucleosid-3'-Phosphat eine Nucleobase, eine Pentose und eine Phosphat-
Gruppe aufweist, umfassend die folgenden Schritte:
The present invention thus relates to a process for the preparation of an alkylated nucleoside 3'-phosphate, the nucleoside 3'-phosphate having a nucleobase, a pentose and a phosphate group, comprising the following steps:
- a) Umsetzen eines Schutzgruppen aufweisenden Nucleosid-3'-Phosphats mit einem Diazoalkan als Alkylierungsmittel unda) Implementation of a nucleoside-3'-phosphate having protecting groups with a diazoalkane as the alkylating agent and
- b) Abspalten der Schutzgruppen,b) splitting off the protective groups,
wobei die Schutzgruppen an der Pentose des Nucleosid-3'-Phosphats Di methoxytrityl-, Silyl- und/oder Acylgruppe sind, die Schutzgruppen an der Phosphat-Gruppe des Nucleosid-3'-Phosphats Cyanoethylgruppen sind und die Schutzgruppen an der Nucleobase des Nucleosid-3'-Phosphats Acyl gruppen sind. the protecting groups on the pentose of the nucleoside 3'-phosphate Di methoxytrityl, silyl and / or acyl group, the protecting groups on the Phosphate group of the nucleoside 3'-phosphate are cyanoethyl groups and the protecting groups on the nucleobase of the nucleoside 3'-phosphate acyl are groups.
Der Ausdruck "Nucleobasen" umfaßt jeden basisch reagierenden Heterocyclus, z. B. Purin, Pyrimidin oder Derivate von diesen, wie Adenin, Guanin, Cytosin, Uracil oder Thymidin.The term "nucleobases" encompasses any basic heterocycle, e.g. B. Purine, pyrimidine or derivatives thereof, such as adenine, guanine, cytosine, uracil or Thymidine.
Der Ausdruck "Pentose" umfaßt jedes Saccharid, das 5 Kohlenstoffatome aufweist, wie D-Ribofuranose und 2-Desoxy-D-ribofuranose. Die Pentose kann über ihr Kohlenstoff atom 1 β-glykosidisch an ein Stickstoffatom der Nucleobase gebunden sein.The term "pentose" includes any saccharide that has 5 carbon atoms, such as D-ribofuranose and 2-deoxy-D-ribofuranose. The pentose can over its carbon atom 1 must be β-glycosidically bound to a nitrogen atom of the nucleobase.
Der Ausdruck "Phosphat-Gruppe" umfaßt organische und anorganische Phosphate jeglicher Art, z. B. Mono-, Di- oder Triphosphate. Die Phosphat-Gruppe kann an das Kohlenstoffatom 3 und ggf. 5 der Pentose gebunden sein.The term "phosphate group" includes organic and inorganic phosphates of any kind, e.g. B. mono-, di- or triphosphates. The phosphate group can be attached to the Carbon atom 3 and possibly 5 of the pentose may be bound.
Bevorzugte Nucleosid-3'-Phosphate sind Adenosin-, Guanosin-, Cytidin-, Uridin-, 2'- Desoxyadenosin-, 2'-Desoxyguanosin-, 2'-Desoxycytosin- und Thymidin-3'-Phosphat, wobei deren Monophosphate ganz besonders bevorzugt sind.Preferred nucleoside 3'-phosphates are adenosine, guanosine, cytidine, uridine, 2'- Deoxyadenosine, 2'-deoxyguanosine, 2'-deoxycytosine and thymidine-3'-phosphate, their monophosphates are very particularly preferred.
Im erfindungsgemäßen Verfahren werden in Schritt (a) Schutzgruppen aufweisende Nucleosid-3'-Phosphate mit einem Diazoalkan als Alkylierungsmittel umgesetzt. Das Nucleosid-3'- Phosphat kann die Schutzgruppen an OH-Gruppen der Pentose, an OH-Gruppen der Phosphat-Gruppe(n) und ggf. an der Nucleobase aufweisen. Dabei ist es günstig, wenn alle OH-Gruppen der Pentose und der Phosphat-Gruppe(n) mit Schutzgruppen versehen sind. Erfindungsgemäß vorhandene Schutzgruppen an OH-Gruppen der Pentose sind Dimetoxytrityl-, Silyl- und/oder Acylgruppen, wie Phenylacetyl- und Acetylgruppen. Erfindungsgemäß vorhandene Schutzgruppen an OH-Gruppen der Phosphat-Gruppe(n) sind Cyanoethyl-Gruppen. Erfindungsgemäß vorhandene Schutzgruppen an der Nucleobase sind vorstehende Acylgruppen. Die Schutzgruppen an der Nucleobase können sich an jeder geeigneten Position der Nucleobase befinden, die nicht alkyliert werden soll, z. B. an einer Aminogruppe.In the process according to the invention, protective groups are used in step (a) Nucleoside 3'-phosphates reacted with a diazoalkane as an alkylating agent. The nucleoside 3'- Phosphate can be the protective groups on OH groups of pentose, on OH groups of Have phosphate group (s) and possibly on the nucleobase. It is beneficial if Protect all OH groups of the pentose and the phosphate group (s) are. Protecting groups present on OH groups of the pentose according to the invention are dimetoxytrityl, Silyl and / or acyl groups such as phenylacetyl and acetyl groups. According to the present Protecting groups on OH groups of the phosphate group (s) are cyanoethyl groups. Protective groups on the nucleobase according to the invention are the above Acyl groups. The protecting groups on the nucleobase can be attached to any suitable Position of the nucleobase that is not to be alkylated, e.g. B. on one Amino group.
Die Herstellung von Schutzgruppen aufweisenden Nucleosid-3'-Phosphaten sowie dazu notwendige Materialien sind dem Fachmann bekannt. Beispielsweise können diese von käuflichen Vorläufern erhalten werden (vgl. Umsetzung von 7 zu 8 in Fig. 2). Sie können auch aus den Nucleosiden (Pentose und Nucleobase) selbst hergestellt werden (vgl. Fig. 1). The preparation of nucleoside-3'-phosphates containing protective groups and the materials required for this purpose are known to the person skilled in the art. For example, these can be obtained from commercially available precursors (cf. implementation of 7 to 8 in FIG. 2). They can also be produced from the nucleosides (pentose and nucleobase) themselves (cf. FIG. 1).
Als Alkylierungsmittel in Schritt (a) des erfindungsgemäßen Verfahrens werden Diazoalkane verwendet, wie Diazomethan, Diazoethan und/oder Diazo-n-butan.As alkylating agents in step (a) of the process according to the invention Used diazoalkanes, such as diazomethane, Diazoethane and / or diazo-n-butane.
In Schritt (a) können durch die Alkylierung auch mehrere Alkylgruppen eingeführt werden, z. B. an verschiedenen Positionen. Die Alkylgruppen können gleich oder verschieden voneinander sein.In step (a), several alkyl groups can also be introduced by the alkylation be, e.g. B. in different positions. The alkyl groups can be the same or be different from each other.
Durch Schritt (a) werden alkylierte, Schutzgruppen aufweisende Nucleosid-3'-Phosphate erhalten.Step (a) produces alkylated, protecting group-containing nucleoside 3'-phosphates receive.
In Schritt (b) des erfindungsgemäßen Verfahrens erfolgt das Abspalten der Schutzgruppen. Günstigerweise geschieht dies unter milden Bedingungen, so daß die in Schritt (a) eingeführten Alkylgruppen nicht beeinflußt werden. Die Abspaltung von Dimethoxytritylgruppen kann z. B. mittels eines Ionenaustauschers in der H+-Form durchgeführt weden. Die Abspaltung von Silylgruppen kann mit Fluorid erfolgen. Acylgruppen können durch Behandlung mit Basen, z. B. Ammoniak oder OH-, abgespalten werden. Die Abspaltung von Cyanoethylgruppen oder deren Derivaten kann durch Inkubation mit Ammoniak geschehen. Die Schutzgruppen können nacheinander oder in einer "Eintopfreaktion" abgespalten werden.In step (b) of the process according to the invention, the protective groups are split off. This is advantageously carried out under mild conditions, so that the alkyl groups introduced in step (a) are not influenced. The elimination of dimethoxytrityl groups can, for. B. by means of an ion exchanger in the H + form. The silyl groups can be split off with fluoride. Acyl groups can be treated with bases, e.g. As ammonia or OH - are split off. Cyanoethyl groups or their derivatives can be split off by incubation with ammonia. The protective groups can be split off in succession or in a "one-pot reaction".
In einer bevorzugten Ausführungsform des erfindungemäßen Verfahrens kann vor und/oder nach Schritt (b) ein Reinigungs- und/oder Trennschritt erfolgen. Wird z. B. in Schritt (a) ein Isomerengemisch von alkylierten, Schutzgruppen aufweisenden Nucleosid- 3'-Phosphaten erhalten, so ist es günstig, dieses in die Isomeren zu trennen, bevor die Schutzgruppen abgespalten werden. Der Reinigungs- und/oder Trennschritt kann z. B. mit chromatographischen Methoden, wie präparativer HPLC, erfolgen.In a preferred embodiment of the inventive method can and / or after step (b) there is a cleaning and / or separation step. Is z. B. in Step (a) an isomer mixture of alkylated, protecting group-containing nucleoside Obtained 3'-phosphates, it is convenient to separate this into the isomers before the Protective groups are split off. The cleaning and / or separation step can e.g. B. with chromatographic methods, such as preparative HPLC.
Beispiele des erfindungegemäßen Verfahrens sind in den Fig. 1 und 2 dargestellt. Examples of the method according to the invention are shown in FIGS. 1 and 2.
Das erfindungsgemäße Verfahren zeichnet sich dadurch aus, daß alkylierte Nucleosid-3'- Phosphate in großen Mengen und hoher Reinheit erhalten werden. Ferner ist das Verfahren leicht durchführbar und kostengünstig.The process according to the invention is characterized in that alkylated nucleoside 3'- Phosphates can be obtained in large quantities and high purity. Furthermore, that is Procedure easy to perform and inexpensive.
Durch das erfindungsgemäße Verfahren sind alkylierte Nucleosid-3'- Phosphate, umfassend eine Nucleobase, eine Pentose und eine Phosphatgruppe, wie sie vorstehend definiert sind, wobei sich an der Nucleobase eine Alkylgruppe befindet, erhältlich.Alkylated nucleoside-3'- Phosphates comprising a nucleobase, a pentose and a phosphate group as they are are defined above, wherein there is an alkyl group on the nucleobase, available.
Alkylierte Nucleosid-3'-Phosphate können bei der Behandlung von Tumoren mit Tumortherapeutika, die z. B. die DNA alkylieren, verwendet werden. Damit kann erreicht werden, daß diese Tumortherapeutika ihre volle Wirkung entfalten. Ferner können alkylierte Nucleosid-3'-Phosphate alleine zur Behandlung von Tumoren eingesetzt werden.Alkylated nucleoside 3'-phosphates can be used in the treatment of tumors Tumor therapeutics, e.g. B. alkylating the DNA can be used. So that can be achieved become that these tumor therapeutics develop their full effect. Can also alkylated nucleoside 3'-phosphates can be used alone for the treatment of tumors.
Desweiteren können alkylierte Nucleosid-3'-Phosphate zur Analyse von DNA-Alkyl- Addukten eingesetzt werden, z. B. im 32P-Postlabeling-Verfahren. Alkylierende Verbindungen können Krebs verursachen, in dem sie Basen zellulärer DNA alkylieren, wodurch DNA-Alkyl-Addukte entstehen. Solche Addukte können mit dem 32P- Postlabeling-Verfahren nachgewiesen werden. Hierzu wird vorstehende DNA enzymatisch zu Nucleosid-3'-Phosphaten abgebaut, wodurch ein Gemisch von üblichen Nucleosid-3'- Phosphaten und alkylierten Nucleosid-3'-Phosphaten entsteht. Anschließend wird unter Verwendung von γ-32P-ATP enzymatisch an der 5'-Position eine radioaktive Phosphatgruppe eingeführt. Dabei ist es notwendig, daß die Nucleoside an der 3'-Position eine Phosphat-Gruppe tragen, da nur diese auf vorstehende Art markiert werden können. Das Gemisch der radioaktiv markierten Nucleoside wird dann in üblicher Weise getrennt und die radioactiv markierten Nucleoside werden nachgewiesen. Mit diesem Verfahren könne DNA-Alkyl-Addukte in sehr kleinen Mengen nachgewiesen werden (ca. 1 Addukt auf 109 normale Nucleoside). Wegen dieser geringen Menge ist ein Strukturbeweis der DNA--Alkyl-Addukte jedoch nicht möglich. Um die Struktur eines DNA-Addukts zu beweisen, ist die Bereitstellung von Substanzen notwendig, die als Vergleichssubstanzen im 32-Postlabeling-Verfahren eingesetzt weden können. Derartige Substanzen sind alkylierte Nucleosid-3'-Phosphate. Furthermore, alkylated nucleoside 3'-phosphates can be used for the analysis of DNA-alkyl adducts, e.g. B. in the 32 P post-labeling process. Alkylating compounds can cause cancer by alkylating bases of cellular DNA, creating DNA-alkyl adducts. Such adducts can be detected using the 32 P postlabeling method. For this purpose, the above DNA is degraded enzymatically to nucleoside 3'-phosphates, whereby a mixture of conventional nucleoside 3'-phosphates and alkylated nucleoside 3'-phosphates is formed. A radioactive phosphate group is then introduced enzymatically at the 5 'position using γ- 32 P-ATP. It is necessary for the nucleosides to have a phosphate group at the 3 'position, since only these can be labeled in the above manner. The mixture of the radioactively labeled nucleosides is then separated in a conventional manner and the radioactively labeled nucleosides are detected. With this method, DNA-alkyl adducts can be detected in very small amounts (approx. 1 adduct per 10 9 normal nucleosides). Because of this small amount, structural proof of the DNA - alkyl adducts is not possible. In order to prove the structure of a DNA adduct, it is necessary to provide substances that can be used as reference substances in the 32- postlabeling procedure. Such substances are alkylated nucleoside 3'-phosphates.
Neben dem 32P-Postlabeling-Verfahren werden DNA-Alkyl-Addukte auch mit monoklonalen Antikörpern nachgewiesen. Hierzu wird, wie vorstehend beschrieben, vorgegangen, wobei die alkylierten Nucleosid-3'-Phosphate mittels gegen sie gerichteter monoklonaler Antikörper nachgewiesen werden. Zur Gewinnung der monoklonalen Antikörper können alkylierte Nucleosid-3'-Phosphate verwendet werden.In addition to the 32 P postlabeling method, DNA-alkyl adducts are also detected with monoclonal antibodies. For this, the procedure is as described above, the alkylated nucleoside 3'-phosphates being detected by means of monoclonal antibodies directed against them. Alkylated nucleoside 3'-phosphates can be used to obtain the monoclonal antibodies.
Fig. 1 zeigt die Herstellung von O6-n-Butyl-2'-desoxyguanosin-3'-monophosphat, und Fig. 1 shows the preparation of O 6 -n-butyl-2'-deoxyguanosine-3'-monophosphate, and
Fig. 2 zeigt die Herstellung von 3 isomeren alkylierten 2'-Desoxythymidin-3'- monophosphaten. Fig. 2 shows the preparation of 3 isomeric alkylated 2'-deoxythymidine-3'-monophosphates.
Die Verbindung 8 wird aus der käuflichen Verbindung 7 in einer zweistufigen Eintopfreaktion (1. Tetrazol-katalysierte Kopplung mit Hydroxypropionnitril; 2. Oxidation mit Cumolhydroperoxid) hergestellt. Verbindung 8 wird dann direkt mit einem beliebigen Diazoalkan, z. B. Diazomethan, Diazoethan oder Diazo-n-Butan, umgesetzt. Bei dieser Reaktion entstehen gleichzeitig die 3 isomeren Verbindungen 9a-c. Die Verbindungen 9a-c werden mittels präparativer HPLC getrennt. Die Abspaltung der Schutzgruppen erfolgt für jedes Isomer getrennt. Die Dimethoxytrityl-Gruppen werden mit einem Ionenaustauscher in der H+- Form abgespalten. Die Abspaltung der Cyanoethylgruppen erfolgt durch Inkubation mit Ammoniak. Es werden die alkylierten Nucleosid-3'- monophosphate 10a-c erhalten, die mittels präperativer HPLC gereinigt werden. Compound 8 is prepared from commercially available compound 7 in a two-step one-pot reaction (1. tetrazole-catalyzed coupling with hydroxypropiononitrile; 2. oxidation with cumene hydroperoxide). Compound 8 is then directly with any diazoalkane, e.g. B. diazomethane, diazoethane or diazo-n-butane. In this reaction, the 3 isomeric compounds 9a-c are formed simultaneously. The compounds 9a-c are separated by means of preparative HPLC. The protecting groups are split off for each isomer separately. The dimethoxytrityl groups are split off in the H + form with an ion exchanger. The cyanoethyl groups are split off by incubation with ammonia. The alkylated nucleoside 3'-monophosphates 10a-c are obtained and are purified by preparative HPLC.
Das folgende Beispiel erläutert die Erfindung.The following example illustrates the invention.
Die Struktur und die Herstellung von O6-n-Butyl-desoxyguanosin-3'-monophosphat ist in Fig. 1 gezeigt.The structure and preparation of O 6 -n-butyl-deoxyguanosine-3'-monophosphate is shown in FIG. 1.
10 mmol (2,67 g) 2'-Desoxyguanosin 1 wurden in 2 × 30 ml Pyridin eingeengt und in 50 ml Pyridin suspendiert. Zu der Suspension wurden 50 mmol (6,5 ml) Trimethylchlorsilan langsam zugetropft. Nach 30 Minuten wurde das Gemisch mit Eis gekühlt.10 mmol (2.67 g) 2'-deoxyguanosine 1 was dissolved in 2 × 30 ml pyridine concentrated and suspended in 50 ml of pyridine. 50 mmol (6.5 ml) Trimethylchlorosilane slowly added dropwise. After 30 minutes it was Mix cooled with ice.
16,0 mmol (2,7 g) Hydroxybenzotriazol wurden mit Acetonitril (4 × 30 ml) eingeengt und in 5 ml Acetonitril suspendiert. Unter Luft- und Feuchtigkeitsausschluß wurden 15 mmol (2 ml) Phenylessigsäurechlorid zugetropft. Nach 30 Minuten wurde soviel Pyridin zugegeben, daß sich der Niederschlag löste (ca. 0,3 ml).16.0 mmol (2.7 g) of hydroxybenzotriazole were treated with acetonitrile (4 × 30 ml) and concentrated in 5 ml of acetonitrile. Under air and Exclusion of moisture was added dropwise 15 mmol (2 ml) phenylacetic acid chloride. After 30 minutes, enough pyridine was added to dissolve the precipitate (about 0.3 ml).
Lösung 2 wurde dann in die gekühlte Lösung 1 unter Luft- und Feuchtigkeitsauschluß getropft. Nach beendeter Zugabe wurde über Nacht (15 Stunden) auf Raumtemperatur erwärmt. Anschließend wurde das Reaktionsgemisch mit Eis gekühlt. Dann wurden 10 ml Wasser und nach 5 Minuten 20 ml konzentrierter Amoniak zugegeben. Nach weiteren 15 Minuten wurde im Vakuum zur Trockne eingeengt (Wasserbadtemperatur: 30°C). Der erhaltene Rückstand wurde in soviel Wasser (ca. 20 ml) aufgenommen, wie zum Lösen nötig war. Dann wurde mit 50 ml Diethylether ausgeschüttelt und die organische Phase dekantiert. Die wäßrige Phase wurde bei 4°C kristallisiert. Der kristallisierte Niederschlag wurde abfiltriert und im Vakuum getrocknet. Es wurden 3,0 g (78 %) 2 erhalten. Solution 2 was then placed in the cooled solution 1 under air and Exclusion of moisture dripped. After the addition had ended, the mixture was left overnight (15 Hours) warmed to room temperature. Then the reaction mixture chilled with ice. Then 10 ml of water and after 5 minutes 20 ml concentrated ammonia added. After a further 15 minutes it was in vacuo evaporated to dryness (water bath temperature: 30 ° C). The residue obtained was taken up in as much water (approx. 20 ml) as was necessary to dissolve. Then it was shaken with 50 ml of diethyl ether and the organic phase decanted. The aqueous phase was crystallized at 4 ° C. The crystallized Precipitate was filtered off and dried in vacuo. 3.0 g (78 %) 2 received.
Es wurden 5,7 mmol (2,18 g) 2 mit Pyridin (3 × 10 ml) eingeengt, in Pyridin (30 ml) suspendiert und auf 0°C abgekühlt. In diese Suspension wurden 6,3 mmol (2,13 g) Dimethoxytritylchlorid eingetragen. Es wurde über Nacht (ca. 15 Stunden) gerührt. Dann wurden 4 ml Methanol zugegeben. Nach 15 Minuten wurde im Vakuum eingeengt (Wassertemperatur 30°C). Der Rückstand wurde in Dichlormethan (100 ml) aufgenommen und mit 5%-iger wäßriger Natriumcarbonat-Lösung (3 × 75 ml) und Wasser (1 × 75 ml) gewaschen. Die organische Phase wurde dekantiert, über Natriumsulfat getrocknet und im Vakuum eingeengt. Das Rohprodukt wurde an Kieselgel mit Chloroform/Ethanol = 95/5 chromatographiert. Es wurden 2,9 g (74%) 3 erhalten.5.7 mmol (2.18 g) 2 were concentrated with pyridine (3 × 10 ml), in pyridine (30 ml) suspended and cooled to 0 ° C. 6.3 mmol (2.13 g) dimethoxytrityl chloride added. It was overnight (approx. 15 Hours) stirred. Then 4 ml of methanol was added. After 15 minutes was concentrated in vacuo (water temperature 30 ° C). The backlog was in Dichloromethane (100 ml) added and with 5% aqueous Washed sodium carbonate solution (3 x 75 ml) and water (1 x 75 ml). The organic phase was decanted, dried over sodium sulfate and in vacuo constricted. The crude product was on silica gel with chloroform / ethanol = 95/5 chromatographed. 2.9 g (74%) 3 were obtained.
Es wurden 1 mmol (0,68 g) 3 mit THF (2 × 10 ml) eingeengt und in THF (10 ml) gelöst. Unter Argonatmosphäre wurden 4 Äquvalente Hünigbase und danach 2 Äquivalente Cyanoethyl-(bis-isopropyl)amido-chlorphosphit zugetropft und bei Raumtemperatur gerührt. Nach 1 Stunde wurden zu dem Reaktionsgemisch 30 ml Essigester und 1,5 ml Triethylamin zugegeben. Die organische Lösung wurde mit 10%-iger Natriumcarbonat-Lösung (2 × 10 ml) und gesättigter Natriumchlorid- Lösung (10 ml) gewaschen, über Natriumsulfat getrocknet und unter Vakuum eingeengt. Die Reinigung des Rohprodukts erfolgte mittels Kieselgelsäulenchromatographie; Dichlormethan/Essigester/Triethylamin/Methanol = 45/45/10/2,5. Es wurden 0,6 g (67%) eines Zwischenprodukts erhalten.1 mmol (0.68 g) 3 was concentrated with THF (2 × 10 ml) and in THF (10 ml) solved. 4 equivalents of Hünig base and then 2 Equivalents of cyanoethyl (bis-isopropyl) amido chlorophosphite were added dropwise and at Room temperature stirred. After 1 hour, 30 ml was added to the reaction mixture Ethyl acetate and 1.5 ml of triethylamine were added. The organic solution was with 10% sodium carbonate solution (2 × 10 ml) and saturated sodium chloride Solution (10 ml) washed, dried over sodium sulfate and under vacuum constricted. The crude product was cleaned using Silica gel column chromatography; Dichloromethane / ethyl acetate / triethylamine / methanol = 45/45/10 / 2.5. 0.6 g (67%) of an intermediate product was obtained.
0,11 mmol (100 mg) dieses Zwischenprodukts wurden in ca. 10 ml Acetonitril gelöst, mit 0,25 mmol (18 mg) Hydroxypropionsäurenitril und mit 0,5 mmol (35 mg) Tetrazol versetzt. Nach 1 Stunde wurde 1 Äquivalent 3%-iger Cumolhydroperoxid-Lösung in Acetonitril zugegeben und bei Raumtemperatur gerührt (DC-Kontrolle, Kieselgel Chlorofrom/Methanol = 9/1). Nach ca. 1 Stunde wurde mit wenigen Tropfen Ethanol versetzt und unter Vakuum eingeengt. Der Rückstand wurde in Chloroform (30 ml) aufgenommen und mit 2%-iger Natriumhydrogencarbonat-Lösung gewaschen. Die organische Phase wurde über Natriumsulfat getrocknet und unter Vakuum eingeengt. Die Reinigung erfolgte über Säulenchromatographie an Kieselgel mit Chloroform/Methanol = 95/5). Es wurden 300 mg (61%) 4 erhalten.0.11 mmol (100 mg) of this intermediate were dissolved in about 10 ml of acetonitrile dissolved, with 0.25 mmol (18 mg) hydroxypropiononitrile and with 0.5 mmol (35 mg) tetrazole added. After 1 hour, 1 equivalent became 3% Cumene hydroperoxide solution added in acetonitrile and at room temperature stirred (TLC control, silica gel chlorofrom / methanol = 9/1). After about 1 hour a few drops of ethanol were added and the mixture was concentrated under vacuum. The Residue was taken up in chloroform (30 ml) and with 2% Washed sodium bicarbonate solution. The organic phase was over Dried sodium sulfate and concentrated in vacuo. The cleaning was done via column chromatography on silica gel with chloroform / methanol = 95/5). It 300 mg (61%) 4 were obtained.
115 µmol (100 mg) 4 wurden in 5 ml Methanol gelöst und mit 3 ml etherischer Diazo-n-butan-Lösung versetzt. Nach 30 Minuten wurde unter Vakuum eingeengt und anschließend an Kieselgel chromatorgaphiert (Chloroform/Ethanol = 98/2). Es wurden 40 mg (37%) 5 erhalten.115 µmol (100 mg) 4 were dissolved in 5 ml of methanol and ethereal with 3 ml Diazo-n-butane solution added. After 30 minutes, the mixture was concentrated under vacuum and then chromated on silica gel (chloroform / ethanol = 98/2). 40 mg (37%) 5 were obtained.
32 µmol (30 mg) des vollständig geschützten 5 wurden in 3 ml Nitromethan gelöst und mit einer an Zink(II)bromid gesättigten Lösung in 3 ml Nitromethan versetzt. Nach 15 Minuten wurde mit 50 ml Dichlormethan verdünnt und die organische Phase mit 30 ml 1 M Ammoniumacetat-Lösung ausgeschüttelt. Die organische Phase wurde mit Wasser und gesättigter Kochsalz-Lösung (je 10 ml) gewaschen und unter Vakuum eingeengt. Das Rohprodukt wurde in 5 ml Wasser gelöst und mit konzentriertem wäßrigen Ammoniak (10 ml) 15 Stunden bei Raumtemperatur grührt. Es wurde anschließend lyophilisiert, der Rückstand in wenig Wasser aufgenommen, mit 3 × 10 ml Chloroform ausgeschüttelt und die wäßrige Lösung erneut lyophilisiert.32 µmol (30 mg) of the fully protected 5 was dissolved in 3 ml of nitromethane and mixed with a solution saturated with zinc (II) bromide in 3 ml of nitromethane. After 15 minutes, the mixture was diluted with 50 ml of dichloromethane and the organic Phase shaken with 30 ml of 1 M ammonium acetate solution. The organic The phase was washed with water and saturated sodium chloride solution (10 ml each) and concentrated under vacuum. The crude product was dissolved in 5 ml of water and with concentrated aqueous ammonia (10 ml) for 15 hours at room temperature grows. It was then lyophilized, the residue in a little water added, shaken with 3 × 10 ml of chloroform and the aqueous solution lyophilized again.
Es wurden 4 mg von 6 erhalten.4 mg of 6 were obtained.
ESI: -Q1MS LMR UP LR; Infusion 5 µl/min, MeOH
M(C14 ESI: -Q1MS LMR UP LR; Infusion 5 µl / min, MeOH
M (C 14
H22 H 22
N5 N 5
O7 O 7
P)= 403; [M-H] 402.0 (100%)
1 P) = 403; [MH] 402.0 (100%)
1
H-NMR(D2 H-NMR (D 2
O, 250 Mhz) δ = 8,08 (s, 1H, NH); 6,37 (dd, 1H, 1'-H); 4,92 (m , 1H, 3'-H); 4,48 (m, 2H, O8 0.250 Mhz) δ = 8.08 (s, 1H, NH); 6.37 (dd, 1H, 1'-H); 4.92 (m, 1H, 3'-H); 4.48 (m, 2H, O 8
-CH2 -CH 2
); 4,33 (m, 1H, 4'-H); 3,84 (m, 2H, 5'-H); 2,70 (m, 2H, 2'-H2 ); 4.33 (m, 1H, 4'-H); 3.84 (m, 2H, 5'-H); 2.70 (m, 2H, 2'-H 2
); ) ;
1,80 (m, 2H, O8 1.80 (m, 2H, O 8
- C-CH2 - C-CH 2
); ) ;
1,50 (m, 2H, O8 1.50 (m, 2H, O 8
-C-C-CH2 -CC-CH 2
); 0,95 (t, 3H, O8 ); 0.95 (t, 3H, O 8
-C-C-C-CH3 -CCC-CH 3
))
Claims (6)
- a) Umsetzen eines Schutzgruppen aufweisenden Nucleosid-3'-Phosphats mit einem Diazoalkan als Alkylierungsmittel und
- b) Abspalten der Schutzgruppen,
- a) reacting a protecting group-containing nucleoside 3'-phosphate with a diazoalkane as alkylating agent and
- b) splitting off the protective groups,
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Biochemistry 14 (1985) 974-981 * |
Chem. Abstr. 109 (1988) 18258u * |
Chem. Abstr. 119 (1993) 153762a * |
J. Org. Chem. 39 (1974) 2187-2192 * |
J. Org. Chem. 47 (1982) 571-573 * |
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