DE06253001T1 - Verfahren und Vorrichtung zur Abbildung und Verarbeitung von Proben in biologischen Probenbehältern - Google Patents
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Abstract
Halter
zum Halten eines biologischen Probenbehälters in einer Vorrichtung
zur Verarbeitung von biologischen Proben, wobei der Halter aufweist:
ein Vakuumbett mit einer ebenen Oberfläche für die Aufnahme einer unteren Fläche eines biologischen Probenbehälters,
ein Umfangsabschnitt, der eine Dichtung aufweist, die das Vakuumbett umgibt, wobei die Dichtung dimensioniert ist, um die untere Umfangskante eines Behälters für biologische Proben aufzunehmen, und
einen Abzugsauslaß für das Evakuieren eines Volumens, das von dem Vakuumbett, dem Umfangsabschnitt und einem Behälter für eine biologische Probe, der auf der Dichtung aufgenommen wird, festgelegt wird, so daß die untere Fläche des Behälters für die biologische Probe sich flach gegen die ebene Oberfläche des Vakuumbehälters drückt.
ein Vakuumbett mit einer ebenen Oberfläche für die Aufnahme einer unteren Fläche eines biologischen Probenbehälters,
ein Umfangsabschnitt, der eine Dichtung aufweist, die das Vakuumbett umgibt, wobei die Dichtung dimensioniert ist, um die untere Umfangskante eines Behälters für biologische Proben aufzunehmen, und
einen Abzugsauslaß für das Evakuieren eines Volumens, das von dem Vakuumbett, dem Umfangsabschnitt und einem Behälter für eine biologische Probe, der auf der Dichtung aufgenommen wird, festgelegt wird, so daß die untere Fläche des Behälters für die biologische Probe sich flach gegen die ebene Oberfläche des Vakuumbehälters drückt.
Claims (101)
- Halter zum Halten eines biologischen Probenbehälters in einer Vorrichtung zur Verarbeitung von biologischen Proben, wobei der Halter aufweist: ein Vakuumbett mit einer ebenen Oberfläche für die Aufnahme einer unteren Fläche eines biologischen Probenbehälters, ein Umfangsabschnitt, der eine Dichtung aufweist, die das Vakuumbett umgibt, wobei die Dichtung dimensioniert ist, um die untere Umfangskante eines Behälters für biologische Proben aufzunehmen, und einen Abzugsauslaß für das Evakuieren eines Volumens, das von dem Vakuumbett, dem Umfangsabschnitt und einem Behälter für eine biologische Probe, der auf der Dichtung aufgenommen wird, festgelegt wird, so daß die untere Fläche des Behälters für die biologische Probe sich flach gegen die ebene Oberfläche des Vakuumbehälters drückt.
- Halter nach Anspruch 1, bei dem der Behälter für die biologische Probe eine Mikrotiterplatte ist.
- Halter nach Anspruch 2, bei dem die ebene Oberfläche eine Planheit hat, die um weniger als 50 μm variiert.
- Halter nach Anspruch 1, 2 oder 3, bei dem zumindest ein Abschnitt des Vakuumbettes transparent ist, um das Abbilden der Proben in dem Behälter für eine biologische Probe von unten zu erlauben.
- Halter nach Anspruch 4, bei dem das Vakuumbett aus Glas hergestellt ist.
- Halter nach einem der Ansprüche 1 bis 5, bei dem der Abzugsauslaß im Umfangsabschnitt lokalisiert ist.
- Halter nach einem der Ansprüche 1 bis 6, der weiterhin einen Befestigungsabschnitt aufweist, wobei das Vakuumbett und der Umfangsabschnitt einstellbar im Befestigungsabschnitt montiert sind, wobei der Befestigungsabschnitt betreibbar ist, um die Position des Vakuumbettes und des Umfangsabschnittes relativ zu dem Befestigungsabschnitt einzustellen.
- Halter nach Anspruch 7, bei dem der Befestigungsabschnitt ein kardanisches System für das Einstellen der relativen Position des Vakuumbetts und des Umfangsabschnittes aufweist.
- Halter nach Anspruch 7, wobei der Befestigungsabschnitt angepaßt ist, so daß er fest mit einem Abschnitt der Vorrichtung zur Verarbeitung von biologischen Proben verbunden werden kann.
- Vorrichtung zur Verarbeitung einer biologischen Probe, die aufweist: ein Hauptbett, einen Halter nach einem der Ansprüche 1 bis 9, der auf dem Hauptbett montiert ist, und eine Pumpe, die mit dem Abzugsauslaß verbindbar ist und betreibbar ist, um das Volumen zu evakuieren.
- Vorrichtung nach Anspruch 10, die weiterhin eine abbildende Kamera aufweist, die betreibbar ist, um die Abfragen in einem biologischen Probenbehälter, der von dem Halter gehalten wird, abzubilden.
- Vorrichtung nach Anspruch 11, bei dem der Halter einstellbar auf dem Hauptbett montiert ist, um zu erlauben, daß die Position eines biologischen Probenbehälters, der von dem Halter gehalten wird, relativ zu der abbildenden Kamera eingestellt wird.
- Vorrichtung nach Anspruch 11 oder 12, bei der zumindest ein Abschnitt des Vakuumbetts transparent ist und die abbildende Kamera unter dem Hauptbett angeordnet ist und betreibbar ist, um die Proben in einem biologischen Probenbehälter, der von dem Halter gehalten wird, durch das Vakuumbett abzubilden.
- Vorrichtung nach Anspruch 11, 12 oder 13, wobei die Vorrichtung betreibbar ist, um eine relative Bewegung zwischen der abbildenden Kamera und einem biologischen Probenbehälter, der von dem Halter gehalten wird, bereitzustellen, so daß Proben in unterschiedlichen Bereichen des biologischen Probenbehälters abgebildet werden können.
- Vorrichtung nach Anspruch 14, bei der die abbildende Kamera eine Autofokusfähigkeit aufweist, die betreibbar ist, um die abbildende Kamera auf einer Probe in einem biologischen Probenbehälter, der von dem Halter gehalten wird, zu fokussieren.
- Vorrichtung nach Anspruch 15, die weiterhin einen Controller aufweist, der betreibbar ist, um: die abbildende Kamera und einen biologischen Probencontainer, der von dem Halter gehalten wird, relativ zueinander zu positionieren, so daß die abbildende Kamera in einer Position ist für das Abbilden eines Bereiches des biologischen Probencontainers, die Autofokusfunktion zu betätigen, um die Brennweite zu bestimmen, um die abbildende Kamera auf eine Probe in dem einen Bereich zu fokussieren, die abbildende Kamera bei der Brennweite, die von der Autofokusfunktion bestimmt wurde, zu sichern und wiederholt die abbildende Kamera und den biologischen Probencontainer relativ zueinander zu positionieren, um Abbildungen von Proben in einer Mehrzahl von Regionen des biologischen Probenbehälters zu erhalten.
- Vorrichtung nach Anspruch 15, die weiterhin einen Controller aufweist, der betreibbar ist, um: für jeden Bereich einer Untergruppe von Bereichen eines biologischen Probenbehälters, der von dem Halter gehalten wird, die abbildende Kamera und den biologischen Probenbehälter relativ zueinander zu positionieren, so daß die abbildende Kamera in einer Position für das Abbilden des Bereiches und das Betreiben der Autofokusfunktion ist, um eine Brennweite zu bestimmen, um die abbildende Kamera auf eine Probe in dem Bereich zu fokussieren, eine durchschnittliche Brennweite aus den bestimmten Brennweiten zu berechnen, die abbildende Kamera bei der durchschnittlichen Brennweite zu arretieren und wiederholt die abbildende Kamera und den biologischen Probenbehälter relativ zueinander zu positionieren, um Abbildungen von Proben in einer Mehrzahl von Bereichen des biologischen Probenbehälters zu behalten, wobei die Mehrzahl größer als die Untergruppe ist.
- Vorrichtung nach Anspruch 17, bei der der biologische Probenbehälter eine Mikrotiterplatte ist, wobei jedes Well der Mikrotiterplatte einen Bereich des biologischen Probenbehälters aufweist und die Untergruppe von Bereichen des biologischen Probenbehälters jeweils eine Mehrzahl von Wells der Mikrotiterplatte aufweist.
- Verfahren zum Halten eines biologischen Probenbehälters, um die Verarbeitung von Proben in den biologischen Probenbehältern unter Verwendung der Verarbeitungsvorrichtung für eine biologische Probe zu erleichtern, wobei das Verfahren aufweist: Bereitstellen eines Vakuumbetts mit einer ebenen Oberfläche für die Aufnahme einer unteren Oberfläche eines biologischen Probenbehälters, Positionieren eines biologischen Probenbehälters, so daß dessen untere Fläche neben dem Vakuumbett liegt, und Reduzieren des Drucks zwischen dem Vakuumbett und dem biologischen Probenbehälter, um die untere Fläche des biologischen Probenbehälters gegen die ebene Fläche des Vakuumbetts zu drücken.
- Verfahren nach Anspruch 19, das das Reduzieren des Druckes zwischen dem Vakuumbett und dem biologischen Probenbehälter aufweist, bis die Planheit der unteren Fläche des biologischen Probenbehälters soweit verbessert wird, bis die Planheit um weniger als 50 μm variiert.
- Verfahren nach Anspruch 19, das das Umgeben des Vakuumbettes mit einer Dichtung aufweist, die in der Weise dimensioniert ist, um eine untere Umfangskante des biologischen Probenbehälters aufzunehmen, wenn der Behälter mit seiner unteren Fläche neben dem Vakuumbett positioniert wird.
- Verfahren nach Anspruch 19, das weiterhin nach dem Reduzieren des Druckes aufweist: Fokussieren einer abbildenden Kamera, um eine Brennweite für das Abbilden einer Probe in einem Bereich des biologischen Probenbehälters zu bestimmen, Arretieren der abbildenden Kamera bei der bestimmten Brennweite, wiederholtes, relatives Positionieren der abbildenden Kamera und des biologischen Probebehälters, um Bilder von Proben in einer Mehrzahl von Bereichen des biologischen Probenbehälters zu erhalten.
- Verfahren nach Anspruch 19, das weiterhin nach dem Reduzieren des Druckes aufweist: Fokussieren einer abbildenden Kamera, um die Brennweiten für das Abbilden von Proben in einer Untergruppe von Bereichen des biologischen Probenbehälters zu bestimmen, Berechnen einer durchschnittlichen Brennweite aus den bestimmten Brennweiten, Arretieren der abbildenden Kamera bei der durchschnittlichen Brennweite und wiederholtes, relatives Positionieren der abbildenden Kamera und des biologischen Probebehälters, um Bilder von Proben in einer Mehrzahl von Bereichen des biologischen Probenbehälters zu erhalten, wobei die Mehrzahl größer als die Untergruppe ist.
- Verfahren nach Anspruch 23, bei dem der biologische Probenbehälter eine Mikrotiterplatte ist, wobei jedes Well der Mikrotiterplatte einen Bereich des biologischen Probenbehälters aufweist und die Untergruppe von Bereichen des biologischen Probenbehälters jeweils eine Mehrzahl von Wells der Mikrotiterplatte aufweisen.
- Verfahren nach Anspruch 22, bei dem zumindest ein Abschnitt der Vakuumplatte transparent ist, wobei die abbildende Kamera unterhalb des biologischen Probenbehälters positioniert ist und die Bilder durch das Vakuumbett erhalten werden.
- Verfahren zum Abbilden einer biologischen Probe in einem Well einer Mikrotiterplatte, wobei das Well festgelegt wird durch eine Seitenwand und eine Basis, wobei das Verfahren aufweist: Beleuchten der Basis des Wells durch Richten eines Lichtstrahls auf die Basis des Wells, so daß zumindest ein Teil der Basis durch Lichtstrahlen in den Strahl, der auf die Basis auftrifft, die nicht zunächst durch einen Teil der Wellplatte hindurchgetreten sind, beleuchtet wird, und in dem Fall, daß nur ein Teil der Basis so beleuchtet wird, Neupositionieren des Wells und/oder des Strahls, um den Strahl auf einen weiteren Teil der Basis zu richten, so häufig wie notwendig, so daß jeder Teil der Basis auf diese Art beleuchtet wird, und Aufnehmen eines Bildes der biologischen Probe zu dem Zeitpunkt oder zu jedem Zeitpunkt, wenn die Basis beleuchtet wird.
- Verfahren nach Anspruch 26, bei dem der Lichtstrahl auf die Basis gerichtet wird, so daß kein Lichtstrahl in dem Strahl, der auf die Basis fällt, zunächst durch einen Teil der Mikrotiterplatte fällt.
- Verfahren nach Anspruch 26, bei dem der Lichtstrahl auf die Basis gerichtet wird, so daß zumindest einige Lichtstrahlen in dem Strahl auf die Basis mit einem schiefen Winkel auftreffen, und wobei das oder jedes Bild in einer Dunkelfeldkonfiguration aufgenommen wird, in der kein Licht von dem Strahl, falls es nicht gestreut wird, zu dem Bild beiträgt.
- Verfahren nach Anspruch 26, bei dem der Lichtstrahl eine Propagationsachse hat und Lichtstrahlen aufweist, die in einem Fokus auf der Propagationsachse zusammenlaufen, wobei der Strahl festgelegt ist in einer Ebene parallel zu der Propagationsachse durch einen ersten Lichtstrahl parallel zu der Propagationsachse und einen zweiten Lichtstrahl mit einem Winkel zu der Propagationsachse und wobei das Ausrichten das Positionieren des Wells in dem Strahl vor dem Fokus aufweist, so daß der erste Lichtstrahl im wesentlichen parallel zu der Seitenwand des Wells ist.
- Verfahren nach Anspruch 29, das weiterhin aufweist das Bilden des Lichtstrahls durch Erzeugen eines Lichtstrahls mit einer Propagationsachse und Anordnen in dem Strahl einer konvergenten Linse, die auf der Propagationsachse zentriert ist und eine Aperturverschiebung von der Propagationsachse, die einen Teil des Lichtstrahls passieren läßt.
- Verfahren nach Anspruch 30, wobei die konvergierende Linse und die Apertur positioniert werden und die Apertur geformt und dimensioniert ist, um einen Bruchteil des Strahls, der näherungsweise einen Quadranten der Basis belichtet, durchzulassen.
- Verfahren nach Anspruch 31, bei dem die Apertur halbmondförmig ist, wobei die Propagationsachse innerhalb der Kurve des Halbmondes, jedoch außerhalb der Apertur ist.
- Verfahren nach Anspruch 29, bei dem der Lichtstrahl viermal auf die Basis gerichtet wird und jedes Mal einen anderen Quadranten der Basis beleuchtet, und das Neupositionieren des Wells und/oder des Strahls das Neupositionieren des Strahls durch Drehen der Apertur um die Propagati onsachse um 90, 180 oder 270°, und das Neupositionieren des Wells durch lineare Bewegung der Mikrotiterplatte aufweist, um die anderen Quadranten in Ausrichtung mit dem neu positionierten Strahl zu bringen.
- Verfahren nach Anspruch 26, das weiterhin aufweist das Wiederholen des Belichtens und das Aufnehmen für eine Mehrzahl von Wells in der Mikrotiterplatte.
- Verfahren nach Anspruch 26, bei dem das Beleuchten jedes Teils der Basis zwei oder mehr Teile der Basis, die zu belichten sind, erfordert, und das Verfahren weiterhin aufweist das Wiederholen des Beleuchtens und des Aufzeichnens für viele oder alle Wells in der Mikrotiterplatte.
- Verfahren nach Anspruch 35, das aufweist: Belichten und Aufzeichnen eines Bildes für einen ersten Teil des Wells der vielen oder allen Wells, Belichten und Aufnehmen eines Bildes für einen zweiten Teil von jedem Well der vielen oder allen Wells und falls notwendig, Wiederholen des Belichtens und Aufnehmen für weitere Teile von jedem der vielen oder allen Wells bis jeder Teil von jedem der vielen oder allen Wells beleuchtet wurde.
- Verfahren nach Anspruch 35, bei dem die Mikrotiterplatte eine Anordnung von Wells, die in Reihen angeordnet sind, aufweist, und das Verfahren aufweist: Belichten und Aufnehmen eines Bildes für einen ersten Teil jedes Wells in einer ersten Reihe, Belichten und Aufnehmen eines Bildes für einen zweiten Teil von jedem Well in der ersten Reihe, falls notwendig, Wiederholen des Belichtens und Aufnehmens für weitere Teile von jedem Well in der ersten Reihe bis jeder Teil von jedem Well in der ersten Reihe belichtet wurde, Belichten und Aufnehmen eines Bildes für einen ersten Teil von jedem Well in einer zweiten Reihe, Belichten und Aufnehmen eines Bildes für einen zweiten Teil von jedem Well in der zweiten Reihe, falls notwendig Wiederholen des Belichtens und Aufnehmens für weitere Teile jedes Wells in der zweiten Reihe bis jeder Teil von jedem Well in der zweiten Reihe belichtet wurde, und Wiederholen des Belichtens und Aufnehmens für jede weitere Reihe in der Mikrotiterplatte.
- Verfahren nach Anspruch 33, bei dem die Mikrotiterplatte eine Anordnung von Wells aufweist, die in Reihen angeordnet sind, und wobei das Verfahren aufweist: Belichten und Aufnehmen eines Bildes für einen ersten Quadranten jedes Wells in einer ersten Reihe in einer aufeinanderfolgenden Sequenz in einer ersten Richtung entlang der Reihe, Umpositionieren der Mikrotiterplatte und/oder des Strahls, um einen zweiten Quadranten jedes Wells zu belichten, Belichten und Aufzeichnen eines Bildes für den zweiten Quadranten jedes Wells in der ersten Reihe in einer aufeinanderfolgenden Sequenz in einer zweiten Richtung entlang der Reihe entgegengesetzt zu der ersten Richtung, Neupositionieren der Mikrotiterplatte und/oder des Strahls, um einen dritten Quadranten jedes Wells zu belichten, Belichten und Aufnehmen eines Bildes für den dritten Quadranten von jedem Well in der ersten Reihe in einer aufeinanderfolgenden Sequenz in der ersten Richtung entlang der Reihe, Neupositionieren der Mikrotiterplatte und/oder des Strahls, um einen vierten Quadranten jedes Wells zu belichten, Belichten und Aufzeichnen eines Bildes für den vierten Quadranten jedes Wells in der ersten Reihe in einer aufeinanderfolgenden Sequenz in der zweiten Richtung und Wiederholen des Belichtens und Aufnehmens für jede weitere Reihe in der Mikrotiterplatte.
- Verfahren nach Anspruch 26, bei dem der Lichtstrahl eine Wellenlänge hat, die ausgewählt wird, um einen interessierenden Farbstoff, mit dem die Probe markiert wurde, anzuregen.
- Verfahren nach Anspruch 39, bei dem das Bild aufgenommen wird durch selektives Sammeln von Licht mit Wellenlängen, die mit Fluoreszenz, Autofluoreszenz oder Ramanemission von dem interessierenden Farbstoff verknüpft sind.
- Verfahren nach Anspruch 40, bei dem die Probe zumindest eine Zelle ist.
- Verfahren nach Anspruch 41, bei dem der Farbstoff in der zumindest einen Zelle enthalten ist.
- Verfahren nach Anspruch 42, bei dem die zumindest eine Zelle in einem Medium enthalten ist, das mit dem Farbstoff markiert ist, dessen optische Aktivität modifiziert wird durch Absondern von der zumindest einen Zelle.
- Verfahren nach Anspruch 43, wobei die Absonderung ein Protein, eine Nukleinsäure, ein Lipid, ein Zucker, ein Stoffwechselprodukt oder ein Arzneimittel ist.
- Verfahren nach Anspruch 41, bei dem der Farbstoff ein inhärenter Teil der zumindest einen Zelle ist.
- Verfahren nach Anspruch 41, bei dem die zumindest eine Zelle eine Tierzelle ist.
- Verfahren nach Anspruch 46, bei dem die zumindest eine Tierzelle ein biologisches Molekül von Interesse ausdrückt.
- Verfahren nach Anspruch 47, bei dem das biologische Molekül von Interesse ausgewählt wird aus der Gruppe, die besteht aus: einem Peptid, einem Polypeptid, einer Nukleinsäure, einem Lipid, einem Metabolit, einem glycosidierten oder nicht glycosidierten Protein und einem biopharmazeutischen Protein.
- Verfahren nach Anspruch 39, bei dem der Farbstoff ausgewählt wird aus der Gruppe, die besteht aus: einem Protein, einer Nukleinsäure, einem Lipid, einem Zucker, einem Metabolit und einem Arzneimittel.
- Verfahren nach Anspruch 41, bei dem die zumindest eine Zelle ein Protein, eine Nukleinsäure, ein Lipid, Zucker oder Metabolit ist.
- Verfahren nach Anspruch 41, bei dem die zumindest eine Zelle ein Mittel absondert, das durch weißes Licht, Infrarot oder Ramanspektroskopie erfaßt wird.
- Verfahren nach Anspruch 41, bei dem die zumindest eine Zelle ein Mittel absondert, das durch die Hinzufügung zu der zumindest einen Zelle einer Verbindung, die durch Autofluoreszenz erfaßt wird, erfaßt wird.
- Verfahren nach Anspruch 41, wobei die zumindest eine Zelle ein Mittel enthält, das erfaßt wird durch die Hinzufügung zu der zumindest einen Zelle einer Verbindung, welche durch Fluoreszenz, Weißlicht-, Infrarot-, Ramanspektroskopie oder Autofluoreszenz erfaßt wird.
- Verfahren nach Anspruch 41, bei dem die zumindest eine Zelle ein Mittel absondert, das erfaßt wird durch Hinzufügen zu der zumindest einen Zelle einer Verbindung, die erfaßt wird durch Fluoreszenz, weißes Licht, Infrarot, Ramaspektroskopie oder Autofluoreszenz.
- Verfahren nach Anspruch 41, bei dem die zumindest eine Zelle eine Membran hat, die ein Mittel enthält, das erfaßt wird durch Hinzufügen zu der zumindest einen Zelle einer Verbindung, welche durch Fluoreszenz, Weißlicht, Infrarot, Ramanspektroskopie oder Autofluoreszenz erfaßt wird.
- Vorrichtung für das Abbilden einer biologischen Probe in einem Well einer Mikrotiterplatte, wobei das Well festgelegt wird durch eine Seitenwand und eine Basis, wobei die Vorrichtung aufweist: einen Halter, der betreibbar ist, um eine Mikrotiterplatte zu halten, die das Well aufweist, welches die Probe enthält, eine optische Strahlquelle, die betreibbar ist, um einen Lichtstrahl zu erzeugen und den Lichtstrahl auf die Basis des Wells zu richten, wenn die Mikrotiterplatte von dem Halter gehalten wird, so daß die gesamte Basis durch die Lichtstrahlen in dem Strahl, die auf die Basis fallen, die nicht zunächst durch einen Teil der Mikrotiterplatte hindurchgetreten sind, belichtet wird, und eine abbildende Kamera, die betreibbar ist, um ein Bild der biologischen Probe aufzunehmen, wenn die Basis belichtet wird.
- Vorrichtung für das Abbilden einer biologischen Probe in einem Well einer Mikrotiterplatte, wobei das Well festgelegt wird durch eine Seitenwand und eine Basis, wobei die Vorrichtung aufweist: einen Halter, der betreibbar ist, um eine Mikrotiterplatte zu halten, die das Well aufweist, das die Probe hält, eine optische Strahlquelle, die betreibbar ist, um einen Lichtstrahl zu erzeugen und den Lichtstrahl auf die Basis des Wells zu richten, wenn die Mikrotiterplatte von dem Halter gehalten wird, so daß ein Teil der Basis durch Lichtstrahlen in dem Strahl, der auf die Basis auffällt, die nicht zunächst durch einen Teil der Mikrotiterplatte hindurchgetreten sind, belichtet wird, wobei die Vorrichtung betreibbar ist, um die Mikrotiterplatte, die von dem Halter gehalten wird, und/oder den Lichtstrahl neu zu Positionieren, um den Lichtstrahl auf einen weiteren Teil oder Teile der Basis zu richten, wobei das Teil und das weitere Teil oder die Teile zusammen die gesamte Basis aufweisen, und eine abbildende Kamera, die betreibbar ist, um ein Bild der biologischen Probe aufzunehmen und zwar jedes Mal, wenn die Basis belichtet wird.
- Vorrichtung nach Anspruch 57, bei der die optische Strahlquelle betreibbar ist, um: den Lichtstrahl zu erzeugen, so daß der Lichtstrahl eine Propagationsachse hat und Strahlen aufweist, die auf einen Fokus auf der Propagationsachse gerichtet sind, wobei der Fokus hinter dem Well positioniert ist, und der Strahl begrenzt wird in einer Ebene parallel zu der Propagationsachse durch einen ersten Lichtstrahl, der parallel zur Propagationsachse verläuft und einen zweiten Lichtstrahl mit einem Winkel zu der Propagationsachse, und den Strahl auszurichten, so daß der erste Lichtstrahl im wesentlichen parallel zu der Seitenwand des Wells verläuft.
- Vorrichtung nach Anspruch 57 oder 58, bei der die optische Strahlquelle eine konvergierende Linse aufweist, die auf der Propagationsachse zentriert ist, und eine Aperturverschiebung von der Propagationsachse aufweist, die einen Bruchteil des Strahls passieren läßt.
- Vorrichtung nach Anspruch 59, bei dem die konvergierende Linse und die Apertur positioniert sind und die Apertur geformt und dimensioniert ist, um einen Bruchteil des Strahls passieren zu lassen, der näherungsweise einen Quadranten der Basis belichtet.
- Vorrichtung nach Anspruch 60, bei der die Apertur halbmondförmig ist, wobei die Propagationsachse innerhalb der Kurve des Halbmondes, jedoch außerhalb der Apertur lokalisiert ist.
- Vorrichtung nach Anspruch 60, bei dem die Vorrichtung betreibbar ist, um die Mikrotiterplatte, die von dem Halter gehalten wird, und/oder die Basis neu zu positionieren durch Drehen der Apertur um die Propagationsachse von 90, 180 oder 270°, um den Strahl neu zu positionieren und durch Bewegen des Halters, der die Mikrotiterplatte hält, um einen anderen Quadrant in Ausrichtung mit dem neu positionierten Strahl zu bringen.
- Vorrichtung nach Anspruch 56, die weiterhin aufweist einen Controller, der betreibbar ist, um den Halter, die optische Strahlquelle und die abbildende Kamera zu steuern, um: den Halter, die optische Strahlquelle und die abbildende Kamera relativ zueinander neu zu positionieren für das Belichten und Abbilden jedes Wells in einer Mikrotiterplatte, die von dem Halter gehalten wird, jedes Well zu belichten und ein Bild von jedem Well aufzunehmen.
- Vorrichtung nach Anspruch 57, die weiterhin aufweist einen Controller, der betreibbar ist, um den Halter, die optische Strahlquelle und die abbildende Kamera zu steuern, um: den Halter, die optische Strahlquelle und die abbildende Kamera für das Belichten und Abbilden von jedem Teil und dem weiteren Teil oder Teilen der Basis von jedem Well in einer Mikrotiterplatte, die von dem Halter gehalten wird, relativ zueinander neu zu positionieren, jedes Teil und das weitere Teil oder die weiteren Teile zu belichten und ein Bild von jedem Teil und dem weiteren Teil oder den weiteren Teilen aufzunehmen.
- Vorrichtung nach Anspruch 64, bei der der Controller weiterhin betreibbar ist, um den Halter, die optische Strahlquelle und die abbildende Kamera zu steuern, um: ein Bild für einen ersten Teil von jedem Well zu belichten und aufzunehmen, ein Bild für einen zweiten Teil von jedem Well zu belichten und aufzunehmen und, falls notwendig, das Belichten und Aufnehmen für weitere Teile von jedem Well zu wiederholen, bis jeder Teil von jedem Well belichtet und abgebildet wurde.
- Vorrichtung nach Anspruch 64, bei der der Halter betreibbar ist, um eine Mikrotiterplatte zu halten, die eine Anordnung von Wells, die in Reihen angeordnet sind, aufweist, und der Controller weiterhin betreibbar ist, um den Halter, die optische Strahlquelle und die abbildende Kamera zu steuern, um: zu belichten und ein Bild aufzunehmen für einen ersten Teil von jedem Well in einer ersten Reihe, zu belichten und ein Bild aufzunehmen für einen zweiten Teil von jedem Well in der ersten Reihe, falls notwendig, das Belichten und Aufnehmen für weitere Teile jedes Wells in der ersten Reihe zu wiederholen, bis jeder Teil von jedem Well in der ersten Reihe belichtet und abgebildet wurde, Belichten und Aufnehmen eines Bilds für einen ersten Teil jedes Wells in einer zweiten Reihe, Belichten und Aufnehmen eines Bildes für einen zweiten Teil von jedem Well in der zweiten Reihe, falls notwendig, Wiederholen des Belichtens und Aufnehmens für weitere Teile jedes Wells in der zweiten Reihe, bis jeder Teil von jedem Well in der ersten Reihe belichtet und abgebildet wurde, und Wiederholen des Belichtens und Aufnehmens für jede weitere Reihe in der Mikrotiterplatte.
- Vorrichtung nach Anspruch 64, bei der der Halter betreibbar ist, um eine Mikrotiterplatte zu halten, die eine Anordnung von Wells, die in Reihen angeordnet sind, aufweist, wobei die optische Strahlquelle betreibbar ist, um einen Quadranten der Basis zu belichten, und der Controller weiterhin betreibbar ist, um den Halter, die optische Strahlquelle und die abbildende Kamera zu steuern, um: zu belichten und ein Bild aufzunehmen für einen ersten Quadranten von jedem Well in einer ersten Reihe in einer aufeinanderfolgenden Sequenz in einer ersten Richtung entlang der Reihe, Neupositionieren der Mikrotiterplatte und/oder des Strahls, um einen zweiten Quadranten jedes Wells zu belichten, Belichten und Aufnehmen eines Bildes für den zweiten Quadranten von jedem Well in der ersten Reihe in einer aufeinanderfolgenden Sequenz in einer zweiten Richtung entlang der Reihe entgegengesetzt zu der ersten Richtung, Neupositionieren der Mikrotiterplatte und/oder des Strahls, um einen dritten Quadranten jedes Wells zu belichten, Belichten und Aufnehmen eines Bildes für den dritten Quadranten von jedem Well in der ersten Reihe in einer aufeinanderfolgenden Sequenz in der ersten Richtung entlang der Reihe, Neupositionieren des Wells und/oder des Strahls, um einen vierten Quadranten jedes Wells zu belichten, Belichten und Aufnehmen eines Bildes für den vierten Quadranten von jedem Well in der ersten Reihe in einer aufeinanderfolgenden Sequenz in der zweiten Richtung und Wiederholen des Belichtens und Aufnehmens für jede weitere Reihe in der Mikrotiterplatte.
- Verfahren zum Abbilden biologischer Proben in Wells einer Mikrotiterplatte, wobei das Verfahren aufweist: Festlegen eines Pfades durch die Mikrotiterplatte, die jedes Well, das eine abzubildende Probe enthält, beinhaltet, Bewegen der Mikrotiterplatte in Bezug auf eine optische Strahlquelle, die betreibbar ist, um einen Lichtstrahl zu erzeugen, um die Probe in einem Well zu belichten, und eine abbildende Kamera, die betreibbar ist, um ein Bild der Probe in einem Well aufzunehmen, wenn es belichtet ist, um jedes Well in dem Pfad wiederum in eine Position zu bringen, in der die Probe belichtet und abgebildet werden kann, wobei die Bewegung kontinuierlich von einem Start bis zu einem Ende des Pfades erfolgt, und Betreiben der optischen Strahlquelle und der abbildenden Kamera, um die Probe in einem Well zu belichten und abzubilden, wenn jedes Well in dem Pfad in einer Position ist, in der es belichtet und abgebildet werden kann.
- Verfahren nach Anspruch 68, bei dem das Betreiben der abbildenden Kamera das Öffnen eines Shutters der abbildenden Kamera für eine Zeitperiode Δtc aufweist, und das Betreiben der optischen Strahlquelle das Erzeugen des Lichtstrahls während einer Zeitperiode Δt1 aufweist, wobei Δtc > Δt1 und Δt1 innerhalb von Δtc liegt.
- Verfahren nach Anspruch 69, bei dem Δtc mindestens zwei oder drei Größenordnungen größer als Δt1 ist.
- Verfahren nach Anspruch 68, bei dem die Bewegung der Mikrotiterplatte eine im wesentlichen konstante Geschwindigkeit hat und die optische Strahlquelle und die abbildende Kamera mit einer im wesentlichen konstanten und gleichen Wiederholungsrate betrieben wird.
- Verfahren nach Anspruch 68, bei dem die optische Strahlquelle und die abbildende Kamera betreibbar sind, um nur einen Teil jedes Wells in jedem Betrieb der optischen Strahlquelle und der abbildenden Kamera zu belichten und abzubilden, und weiterhin betreibbar sind, um einen weiteren Teil oder Teile des Wells in weiteren Operationen zu belichten, und das Verfahren aufweist: Festlegen eines Pfades über die Mikrotiterplatte, die jeden Teil jedes Wells, das eine abzubildende Probe enthält, beinhaltet, Bewegen der Mikrotiterplatte, um jedes Teil in dem Pfad wiederum in eine Position zu bringen, in der die Probe belichtet und abgebildet werden kann, und Betreiben der optischen Strahlquelle und der abbildenden Kamera, um die Probe in einem Well zu belichten und abzubilden, wenn jedes Teil in der Position ist, in der es belichtet und abgebildet werden kann.
- Verfahren nach Anspruch 68, bei dem die Mikrotiterplatte in einem Vakuumhalter angeordnet ist, der ein Bett mit einer ebenen Oberfläche aufweist, so daß eine untere Fläche der Mikrotiterplatte durch Vakuumdruck gegen die ebene Oberfläche des Vakuumbetts gedrückt wird, wodurch sichergestellt wird, daß die Wells der Mikrotiterplatte koplanar sind.
- Verfahren nach Anspruch 73, bei dem der Pfad mit einem festen Fokus der abbildenden Kamera durchlaufen wird, wenn die Bilder von den Wells entlang des Pfades aufgenommen werden.
- Verfahren nach Anspruch 74, bei dem der Pfad mit jedem einer Mehrzahl von festen Brennpunkten der abbildenden Kamera durchlaufen wird, die auf unterschiedliche Tiefen in den Wells fokussiert ist, so daß mehrere Sätze von Bildern von den Wells entlang jedes Pfades entsprechend den mehreren Welltiefen aufgenommen werden.
- Verfahren nach Anspruch 68, bei dem der Lichtstrahl eine Wellenlänge hat, die ausgewählt wird, um einen Farbstoff von Interesse, mit dem die Probe markiert wurde, anzuregen.
- Verfahren nach Anspruch 76, bei dem das Bild aufgezeichnet wird durch selektives Sammeln von Licht der Wellenlängen, die mit Fluoreszenz, Autofluoreszenz oder Ramanemission von dem Farbstoff von Interesse verknüpft sind.
- Verfahren nach Anspruch 77, bei dem die Probe zumindest eine Zelle ist.
- Verfahren nach Anspruch 78, bei dem der Farbstoff in der zumindest einen Zelle enthalten ist.
- Verfahren nach Anspruch 79, bei dem die zumindest eine Zelle in einem Medium enthalten ist, das mit dem Farbstoff markiert ist, dessen optische Aktivität durch Absonderung von der zumindest einen Zelle modifiziert wird.
- Verfahren nach Anspruch 80, wobei die Absonderung ein Protein, eine Nukleinsäure, ein Lipid, Zucker, Metabolit oder ein Arzneimittel ist.
- Verfahren nach Anspruch 78, bei dem der Farbstoff ein inhärenter Teil der zumindest einen Zelle ist.
- Verfahren nach Anspruch 78, wobei die zumindest eine Zelle eine Tierzelle ist.
- Verfahren nach Anspruch 83, bei dem die zumindest eine Tierzelle ein biologisches Molekül von Interesse zum Ausdruck bringt.
- Verfahren nach Anspruch 84, bei dem das biologische Molekül von Interesse ausgewählt wird aus der Gruppe, die besteht aus: einem Peptid, einem Polypeptid, einer Nukleinsäure, einem Lipid, einem Metabolit, einem glycosidierten oder nicht glycosidierten Protein und einem biopharmazeutischen Protein.
- Verfahren nach Anspruch 76, bei dem der Farbstoff ausgewählt wird aus der Gruppe, die besteht aus: einem Protein, einer Nukleinsäure, einem Lipid, einem Zucker, einem Metabolit und einem Wirkstoff.
- Verfahren nach Anspruch 78, bei dem die zumindest eine Zelle ein Protein, eine Nukleinsäure, ein Lipid, ein Zucker oder ein Metabolit ist.
- Verfahren nach Anspruch 78, bei dem die zumindest eine Zelle ein Mittel absondert, das durch Weißlicht, Infrarot oder Ramanspektroskopie erfaßt wird.
- Verfahren nach Anspruch 78, bei dem die zumindest eine Zelle ein Mittel absondert, das erfaßt wird durch Hinzufügen zu zumindest einer Zelle einer Verbindung, die durch Autofluoreszenz erfaßt wird.
- Verfahren nach Anspruch 78, bei dem die zumindest eine Zelle ein Mittel enthält, das durch Hinzufügen zu der zumindest einen Zelle einer Verbindung erfaßt ist, welche durch Fluoreszenz, Weißlicht, Infrarot, Ramanspektroskopie oder Autofluoreszenz erfaßt wird.
- Verfahren nach Anspruch 78, bei dem die zumindest eine Zelle ein Mittel absondert, welches durch Hinzufügen zu der zumindest einen Zelle einer Verbindung erfaßt wird, die erfaßt wird durch Fluoreszenz, Weißlicht, Infrarot, Ramanspektroskopie oder Autofluoreszenz.
- Verfahren nach Anspruch 78, bei dem die zumindest eine Zelle eine Membran hat, die ein Mittel enthält, das erfaßt wird durch Hinzufügen zu zumindest einer Zelle einer Verbindung, die erfaßt wird durch Fluoreszenz, Weißlicht, Infrarot, Ramanspektroskopie oder Autofluoreszenz.
- Vorrichtung für das Abbilden biologischer Proben in Wells einer Mikrotiterplatte, wobei die Vorrichtung aufweist: eine optische Strahlquelle, die betreibbar ist, um einen Lichtstrahl zu erzeugen für das Belichten einer Probe in einem Well einer Mikrotiterplatte, eine abbildende Kamera, die betreibbar ist, um ein Bild der Probe aufzunehmen, wenn es belichtet wird, und einen Halter für das Halten einer Mikrotiterplatte, die Wells enthält, die Proben enthalten, die abzubilden sind, wobei der Halter betreibbar ist, um die Mikrotiterplatte in Bezug auf die optische Strahlquelle und die abbildende Kamera zu bewegen, um jedes Well in einem Pfad, der auf der Mikrotiterplatte festgelegt ist und jedes Well, das eine abzubildende Probe enthält, beinhaltet, in eine Position zu bringen, in der die Probe belichtet und abgebildet werden kann, wobei die Bewegung kontinuierlich von einem Start zu einem Ende des Pfades erfolgt, die optische Achse Strahlquelle und die abbildende Kamera sind weiterhin betreibbar, so daß die Probe in einem Well belichtet und abgebildet wird, wenn jedes Welt in dem Pfad in der Position ist, in der es belichtet und abgebildet werden kann.
- Vorrichtung nach Anspruch 93, bei der die abbildende Kamera betreibbar ist durch Öffnen eines Shutters der abbildenden Kamera für eine Zeitperiode Δtc, und wobei die optische Strahlquelle betreibbar ist, um den Lichtstrahl während einer Zeitperiode Δt1 zu erzeugen, wobei Δtc > Δt1 ist und Δt1 innerhalb von Δtc liegt.
- Vorrichtung nach Anspruch 94, bei dem Δtc zumindest zwei oder drei Größenordnungen größer als Δt1 ist.
- Vorrichtung nach Anspruch 93, bei dem der Halter betreibbar ist, um die Mikrotiterplatte mit im wesentlichen konstanter Geschwindigkeit zu bewegen und die optische Strahlquelle und die abbildende Kamera betreibbar sind, um mit im wesentlichen konstanter und gleicher Wiederholungsrate zu belichten und abzubilden.
- Vorrichtung nach Anspruch 93, bei der die optische Strahlquelle und die abbildende Kamera betreibbar sind, um nur einen Teil jedes Wells in jeder Operation zu belichten und abzubilden und die optische Strahlquelle und die abbildende Kamera weiterhin betreibbar sind, um einen weiteren Teil oder Teile des Wells in weiteren Operationen zu belichten, der Halter ist betreibbar, um die Mikrotiterplatte zu bewegen, um jedes Teil jedes Wells in einen Pfad zu bringen, der auf der Mikrotiterplatte festgelegt ist und jedes Teil von jedem Well, das eine abzubildende Probe enthält, festgelegt ist, in eine Position zu bringen, in der die Probe belichtet und abgebildet werden kann, und die optische Strahlquelle und die abbildende Kamera weiterhin betreibbar sind, um die Probe in einem Well zu belichten und abzubilden, wenn jedes Teil in dem Pfad in der Position ist, in der es belichtet und abgebildet werden kann.
- Vorrichtung nach Anspruch 93, wobei der Halter aufweist: ein Vakuumbett mit einer ebenen Fläche für das Aufnehmen einer unteren Fläche einer Mikrotiterplatte, ein Umfangsabschnitt, der eine Dichtung aufweist, welche das Vakuumbett umgibt, wobei die Dichtung dimensioniert ist, um eine untere Umfangskante einer Mikrotiterplatte aufzunehmen, und ein Auslaß für das Evakuieren eines Volumens, das durch das Vakuumbett, den Umfangsabschnitt und eine Mikrotiterplatte, die auf der Dichtung aufgenommen wurde, so daß die untere Fläche der Mikrotiterplatte gegen die ebene Oberfläche des Vakuumbetts gedrückt wird, festgelegt wird.
- Vorrichtung nach Anspruch 98, bei der die abbildende Kamera eine Fokusfähigkeit aufweist, die betreibbar ist, um die abbildende Kamera auf eine Probe in einem Well einer Mikrotiterplatte, die von dem Halter gehalten wird, zu fokussieren.
- Vorrichtung nach Anspruch 99, die weiterhin aufweist einen Controller, der betreibbar ist, um: die abbildende Kamera und eine Mikrotiterplatte, die von dem Halter gehalten wird, derart relativ zueinander zu positionieren, daß die abbildende Kamera in einer Position ist für das Abbilden eines Wells der Mikrotiterplatte, Betreiben der Fokussierungsfähigkeit, um eine Brennweite zu bestimmen, um die abbildende Kamera auf eine Probe in dem einen Well zu fokussieren, und Arretieren der abbildenden Kamera bei der Brennweite, die durch die Fokusfähigkeit vermittelt wurde, während des Abbildens der Proben entlang des Bewegungspfades.
- Vorrichtung nach Anspruch 99, die weiterhin aufweist einen Controller, der betreibbar ist, um: die abbildende Kamera und eine Mikrotiterplatte, die von dem Halter gehalten wird, so relativ zueinander zu positionieren, daß die abbildende Kamera in einer Position für das Abbilden eines Wells auf der Mikrotiterplatte ist, die Fokusfähigkeit zu betreiben, um mehrere Brennweiten zu bestimmen, um die abbildende Kamera in dem einen Well zu fokussieren, und Arretieren der abbildenden Kamera bei jeder der mehreren Brennweiten, die durch die Fokusfähigkeit bestimmt wurden, während des Abbildens der Proben entlang des Bewegungspfades, so daß der Pfad wiederholt bei jeder Brennweite durchquert wird und mehrere Sätze von Bildern von den Wells entlang jedes Pfades entsprechend mehrerer Welltiefen aufgezeichnet werden.
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