CZ307163B6 - Helquaty s heteroaromatickými substituenty, jejich příprava a použití jako stabilizátory G-kvadruplexů - Google Patents

Helquaty s heteroaromatickými substituenty, jejich příprava a použití jako stabilizátory G-kvadruplexů Download PDF

Info

Publication number
CZ307163B6
CZ307163B6 CZ2014-369A CZ2014369A CZ307163B6 CZ 307163 B6 CZ307163 B6 CZ 307163B6 CZ 2014369 A CZ2014369 A CZ 2014369A CZ 307163 B6 CZ307163 B6 CZ 307163B6
Authority
CZ
Czechia
Prior art keywords
vinyl
phenanthroline
trifluoromethanesulfonate
diium trifluoromethanesulfonate
tetrahydrodipyrido
Prior art date
Application number
CZ2014-369A
Other languages
English (en)
Other versions
CZ2014369A3 (cs
Inventor
Filip Teplý
Miroslav Hájek
Erika Kužmová
Jaroslav Kozák
Veronika Komárková
Pavla Hubálková
- Gutiérrez Paul Eduardo Reyes
Michael Jirásek
Monoj R. Sonawane
Vishwas D. Joshi
Lukáš Severa
Jana Novotná
Original Assignee
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v.v.i.
Vysoká škola chemicko - technologická v Praze
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Ăšstav organickĂ© chemie a biochemie AV ÄŚR, v.v.i., Vysoká škola chemicko - technologická v Praze filed Critical Ăšstav organickĂ© chemie a biochemie AV ÄŚR, v.v.i.
Priority to CZ2014-369A priority Critical patent/CZ307163B6/cs
Priority to EP15729750.8A priority patent/EP3148997B1/en
Priority to PCT/CZ2015/000052 priority patent/WO2015180701A1/en
Priority to US15/313,492 priority patent/US9932339B2/en
Publication of CZ2014369A3 publication Critical patent/CZ2014369A3/cs
Publication of CZ307163B6 publication Critical patent/CZ307163B6/cs

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D471/00Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, at least one ring being a six-membered ring with one nitrogen atom, not provided for by groups C07D451/00 - C07D463/00
    • C07D471/22Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, at least one ring being a six-membered ring with one nitrogen atom, not provided for by groups C07D451/00 - C07D463/00 in which the condensed systems contains four or more hetero rings
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D471/00Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, at least one ring being a six-membered ring with one nitrogen atom, not provided for by groups C07D451/00 - C07D463/00
    • C07D471/02Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, at least one ring being a six-membered ring with one nitrogen atom, not provided for by groups C07D451/00 - C07D463/00 in which the condensed system contains two hetero rings
    • C07D471/04Ortho-condensed systems

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Nitrogen Condensed Heterocyclic Rings (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)

Description

Vynález se týká nových helquatů s heteroaromatickými substituenty, způsobu jejich přípravy, jejich využití jako léčiv k léčbě onemocnění souvisejících se zvýšenou proliferací buněk a pro stabilizaci G-kvadruplexů.
Dosavadní stav techniky
Originální látky využitelné v terapii rakoviny jsou předmětem zájmu průmyslu i akademických laboratoří [Avendano, C, Menendez, J. C. (2008) Medicinal Chemistry of Anticancer Drugs, Elsevier Science, 1. vydání].
Zhoubná nádorová onemocnění jsou jednou z nejčastějších příčin úmrtí [Siegel R. a spol. (2012), CA Cancer J. Clin. 62, 10-29], Jedná se o nekontrolovaný buněčný růst, jehož vznik bývá podmíněn jak negativními vnějšími vlivy během života, tak genetickou výbavou. Pro vznik a vývoj nádorového onemocnění je potřeba akumulace několika různých genetických nebo epigenetických změn vedoucích k transformaci zdravé buňky v plně maligní fenotyp [Stratton M. R. (2011), Science 331, 1553-1558], Jedná se především o mutace v genech kódujících proteiny, které se podílejí na regulaci dělení a diferenciaci buněk, replikaci a opravách DNA, na regulaci apoptózy poškozených buněk, na mezibuněčné komunikaci a přenosu signálů uvnitř buňky [Hanahan D., Weinberg R. A. (2000), Cell 100, 57-70]. Maligní (zhoubné) buňky mají na rozdíl od benigních schopnost prorůstat do okolní normální tkáně (invazivita) a také schopnost uvolňovat shluky buněk primárního nádoru, které cestují krevním nebo mízním řečištěm do vzdálených míst, kde se usazují a zakládají nová nádorová ohniska (proces metastázování) [Nguyen D. X. a spol. (2009), Nat. Rev. Cancer 9, 274-284].
Cílem protinádorové terapie je selektivně indukovat apoptózu u nežádoucích nádorových buněk, bez současného poškození okolní zdravé tkáně. Cytotoxické léky působí tak, že poškozují DNA nebo mikrotubuly a jejich specifičnost vůči nádorovým buňkám v lidském těle spočívá v jejich schopnosti přednostně zabíjet rychle proliferující buňky. Tato selektivita může být doložena jejich cytostatickými účinky v buněčné kultuře in vitro [Chabner B. A., Roberts T. G (2005), Nat. Rev. Cancer 5, 65-72; Lullmann H. a spol. (2005), Farmakologie a toxikologie, Grada, 15. Vydání],
Limitujícím faktorem pro docílení co nejvyšší selektivity cytotoxického účinku je však skutečnost, že nádorové buňky jsou odvozeny od buněk vlastního organizmu. Citlivost nádorových buněk vůči cytostatiku je pak dána růstovou frakcí nádoru (poměrem proliferujících a neproliferujících buněk nádoru), pozicí buňky v rámci buněčného cyklu a přirozenou a získanou rezistencí nádorových buněk vůči cytostatiku.
G-kvadruplexy jsou považovány za atraktivní molekulární cíle protinádorové terapie budoucnosti [Neidle S. (2011), Therapeutic Applications of Quadruplex Nucleic Acids, Academie Press, 1. vydání]. Ovlivnění stability DNA G-kvadruplexů bylo identifikováno jako jeden z mechanismů regulace klíčových procesů na buněčné úrovni. Originální látky využitelné pro ovlivnění stability G-kvadruplexů jsou tedy předmětem zájmu průmyslu i mnoha akademických laboratoří. Důležitým stimulem pro hledání terapeuticky využitelných stabilizátorů těchto DNA struktur jsou nedávno zveřejněné důkazy jejich existence na buněčné úrovni [Biffi G. a spol. (2013), Nátuře Chemistry, 5, 182—186; Biffi G. a spol. (2014), Nátuře Chemistry, 6, 75] i významného zastoupení sekvencí tvořících G-kvadruplexy v lidském genomu [Yi E. a spol. (2013), Nátuře Communications, 4, 1796].
- 1 CZ 307163 B6
Četný výskyt G-kvadruplexů byl zaznamenán v promotorových oblastech genů, přičemž jejich fyzikálně-chemické a strukturní charakteristiky z nich činí zajímavé terapeutické cíle. Represe transkripce onkogenů v důsledku stabilizace těchto čtyřvláknových DNA struktur v promotorových oblastech genů malými molekulami je tak jednou ze sledovaných strategií protinádorové terapie [Balasubramanian S. a spol. (2011), Nátuře Reviews Drug Discovery 10, 261-275],
Další oblastí, kde sehrávají G-kvadruplexy klíčovou roli, jsou telomerické konce chromozomu [Neidle S. (2010), FEBS Joumal 277, 1118-1125], Lidské telomery jsou nukleoproteinové komplexy, které obsahují opakující se DNA sekvenci (5'GGGTTA3')n (n = 100 až 4000), která má jednovláknový přesah o délce 24 až 400 bází na 3'-konci [Cimino-Reale G. a spol. (2001) Nucleic Acids Res. 29, E35J. Telomerická DNA se každým cyklem buněčného dělení postupně zkracuje (tzv. end replication problém). Tento proces určuje limit celkového počtu dělení, které normální (nerakovinné) buňky můžou podstoupit. Většina rakovinných buněk tento takzvaný end replication problém překonává pomocí telomerázou zprostředkované extenze telomerických konců DNA. Stabilizace G-kvadruplexů v telomerách prostřednictvím malých molekul může vést k účinné inhibici aktivity telomerázy a obnovení limitace dělení buňky.
Cílení telomerických G-kvadruplexů však může ovlivnit funkci telomer i jinak než prostřednictvím inhibice telomerázy. Konce chromozomů jsou asociované se širokou škálou proteinů, které se na ně váží. Tento nukleoproteinový komplex (tzv. shelterin complex) je zodpovědný za strukturní integritu telomer in vivo. Malé molekuly, které se váží na v oblasti telomer, mohou uvolnit proteiny ze shelterinového komplexu a způsobit tak destabilizaci telomer. Tento proces může vést k apoptóze nebo replikativní senescenci.
Podobně jako zacílení na G-kvadruplexy v promotorech genů, je zacílení na telomerické konce chromozomu bohaté na G-kvadruplexy sledovanou strategií protirakovinné terapie.
V současnosti jsou hledány malé molekuly, které by byly schopné indukovat tvorbu komplexů G-kvadruplexu a ligandu. Takové molekuly by vedly k selektivní inhibici růstu nádorové buňky [Ou T.-M. a spol. (2008), ChemMedChem, 3, 690-713; Phatak P. a spol. (2007), Br. J. Cancer, 96, 1223-1233; Di Leva F. S. a spol. (2013) J. Med. Chem., 56, 9646-54], Příkladem malé organické molekuly, která se používá na stabilizaci G-kvadruplexů in vitro a in vivo, je TMPyP4 [Balasubramanian S. a spol. (2011), Nátuře Reviews Drug Discovery 10, 261-275]. Problémem je ovšem nízká selektivita této látky vůči G-kvadruplexu v přítomnosti dvouvláknové DNA.
V současné době existuje celá řada stabilizátorů G-kvadruplexu, z nichž několik bylo i klinicky testováno. Ačkoliv tyto látky slibně omezovaly růst rakovinných buněk, žádná z nich nebyla uvedena do klinické praxe. Například quarfloxin nevykazoval dostatečnou biologickou dostupnost [Quarfloxin (CX—3543); Phase II clinical trials; NCT00780663].
Vývoj nových stabilizátorů G-kvadruplexu je stále velmi sledovanou oblastí. Žádoucí jsou zejména originální malé molekuly, účinné například pro represi transkripce onkogenů a zároveň vykazující únosné množství nepříznivých vedlejších účinků při aplikaci.
Vynález otevírá snadnou cestu k získání skupiny zcela nových látek, použitelných jako léčiva pro onemocnění, související se zvýšenou proliferací buněk a pro stabilizaci G-kvadruplexů. Strukturně se tyto látky řadí do rodiny helquatů, organických kationtů na bázi kvartérního atomu dusíku, u nichž bylo navrženo i neléčebné použití, například ve formě sensibilizátorů ve fotografii [Táni T. (1995) Photographic Sensitivity, Theory and Mechanisms, OUP, Oxford],
Helikální extendované diquaty (helquaty) [Adriaenssens a spol. (2009), Chem. Eur. J. 15, 1072— 1076; Severa a spol. (2010), Tetrahedron 66, 3537-3552; Vávra a spol. (2012), Eur. J. Org. Chem. 489-499] představují novou a téměř neprobádanou třídu látek s dikationickým helikálním skeletem. Popsané základní skelety helquatů jsou vystavěny tak, že každý obsahuje dvě kvartémí
-2CZ 307163 B6
N-heteroaromatické jednotky, které vnáší do systému dvě kladně nabitá centra, například v podobě pyridiniových, chinoliniových, nebo isochinoliniových kationických jednotek. Celé uskupení typického helquatu se tak pojí s dikationicitou a zároveň i helikální chiralitou, což je kombinace, která dříve nebyla na úrovni malých aromatických organických molekul studována.
Předchozí práce, zabývající se helquaty, poskytly vzhledem ke skutečnosti, že se každá připravovaná látka budovala vícestupňovou syntézou de novo, jen omezenou variabilitu struktur [PV2009-237], Další přihláška vynálezu (PV 2013-32, PCT/CZ2014/000009) předložila nejen nové deriváty helquatů, ale také způsob jejich přípravy jednokrokovou diverzifikací stávajících methyl-substituovaných helquatů pomocí Knoevenagelovy kondenzace s arylaldehydy.
Nyní předkládaný vynález popisuje úplně novou skupinu helquatů, odlišujících se přítomností heteroarylového substituentu. Připraveny byly opět pomocí jednokrokové diverzifikace methyl— substituovaných helquatů pomocí Knoevenagelovy kondenzace, ovšem se substituovanými či nesubstituovanými heteroarylaldehydy.
Podstata vynálezu
Předmětem předkládaného vynálezu jsou helquaty obecného vzorce I
kde substituenty R1 a R2 jsou nezávisle na sobě vybrány ze skupiny, zahrnující H a C] až C4 alkyl, nejvýše tři páry sousedících atomů v polohách 1 a 2, 3 a 4, 1' a 2', 3' a 4'jsou případně přemostěny spojkou S a zároveň jeden až čtyři atomy se sudým deskriptorem (tj. 2, 4, 2', 4') jsou substituovány substituentem R’ obecného vzorce II —CH=CH—R4 (II), přičemž R4 je substituovaný, či nesubstituovaný heteroaryl.
1 7 34 14
S S S ’ a S'’ 'je spojka tvořená uhlovodíkovým řetězcem o 3 až 6 atomech uhlíku, s výhodou uhlovodíkovým řetězcem o 4 atomech uhlíku, přičemž struktura jednotlivých spojek S je vzájemně nezávislá, a
- D CZ 307163 B6
T1 a T2 jsou spojky, které přemosťují atomy Ν' s C8 a Nť' s C8', kde uvedená spojka je tvořena uhlovodíkovým řetězcem o 2 až 5 atomech uhlíku, s výhodou o 2 nebo 3 atomech uhlíku, přičemž struktura jednotlivých spojek T je vzájemně nezávislá, kde heteroaryl je aromatická karbocyklická skupina obsahující 4 až 26 uhlíkových atomů a alespoň jeden aromatický kruh nebo kondenzované aromatické kruhy, kde alespoň jeden atom uhlíku aromatického kruhu je nahrazen heteroatomem vybraným ze skupiny N, S, O, přičemž heteroaryl může obsahovat 1 až 5 substituentů, vybraných ze skupiny, zahrnující C; až C6 alkyl, C| až C6 halogenalkyl, C; až C|2 alkoxy, aryloxy, benzyloxy, C; až C6 alkylthio, arylthio, halogen, -OH, -SH, -NH2, C, až C6 alkylamino, arylamino, C| až C2, acylamino, -CN, -SO3H, nitro, -COORn, -C(=O)N(Rn)2, kde Rn je vodík nebo C| až C6 alkyl nebo aryl;
a anionty (X1) a (X ) jsou na sobě nezávislé anionty solí, s výhodou anionty ťarmaceuticky přijatelných solí.
Uvedené soli zahrnují soli s alkalickými kovy, soli s anorganickými či organickými anionty a zejména, ne však výhradně, farmaceuticky přijatelné soli vhodné pro fyziologické podání.
Farmaceuticky přijatelné soli mohou být soli odvozené od anorganických či organických kyselin. Osoba znalá oboru bude schopná určit, které soli jsou farmaceuticky přijatelné; obzvláště se jedná o soli, mající jednu či více žádoucích fyzikálních vlastností jako zvýšenou farmaceutickou stabilitu při různých teplotách a vlhkostech, požadovanou rozpustnost ve vodě či oleji, anebo nejsou toxické.
Vhodné farmaceuticky přijatelné soli látek podle tohoto vynálezu s výhodou zahrnují anionty odvozené od anorganických kyselin, jako je kyselina chlorovodíková, bromovodíková, fluorovodíková, boritá, fluorboritá, fosforečná, metafosforečná, dusičná, uhličitá, siřičitá a sírová, a od organických kyselin, jako je kyselina octová, benzensulfonová, benzoová, citrónová, ethansulfonová, fumarová, glukonová, glykolová, isethionová, mléčná, laktobionová, maleinová, malonová, methansulfonová, trifluormethansulfonová, jantarová, toluensulfonová, vinná a trifluoroctová. Vhodné organické kyseliny obecně zahrnují například následující třídy organických kyselin: alifatické, cykloalifatické, aromatické, arylalifatické, heterocyklické, karboxylové a sulfonové kyseliny.
Specifické příklady vhodných organických kyselin zahrnují acetát, trifluoracetát, formiát, propionát, sukcinát, glykolát, glukonát, diglukonát, laktát, malát, tartarát, citrát, askorbát, glukuronát, maleát, fumarát, pyruvát, aspartát, glutamát, benzoát, anthranilát, stearát, salicylát, p-hydroxybenzoát, fenylacetát, mandelát, pamoát, methansulfonát, ethansulfonát, benzensulfonát, pantothenát, toluensulfonát, 2-hydroxyethansulfonát, sulfanilát, cyklohexylaminosulfonát, 13hydroxybutyrát, galaktarát, galakturonát, adipát, alginát, butyrát, kafrát, kafrsulfonát, cyklopentanpropionát, dodecylsulfát, glykoheptanoát, glycerofosfát, heptanoát, hexanoát, nikotinát, 2naftalensulfonát, oxalát, palmoát, pektinát, 3-fenylpropionát, pikrát, pivalát, thiokyanát a undekanoát.
Předmětem vynálezu jsou rovněž následující helquaty:
2,4—bis((2i)—2—(thiofen—3—yljvinyl)—6,7,10,1 l-tetrahydrodipyrido[2,l-a:l',2'-k][2,9]fenantrolin-
5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. HTA-C5-9 (E)-2-(2-(dibenzo[b,d]furan-4-yl)vinyl)-6,7,10,l l-tetrahydrodipyrido[2,l-a:l',2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. USA-C13-8
-4CZ 307163 B6 (£)-13-(2-( 5-(ethoxy karbony 1)-1 H-pyrrol-3-yl)vinyl)-6,7-dimethyl-4,5,8,9-tetrahydroisochinolino[l,2-a]pyrido[l,2-k][2,9]fenantrolin-3,IO-diium trifluormethansulfonát, tj. MJA-C828 (£)-13-(2-(5-brom-l//-indol-3-yl)vinyl)-6,7-dimethyM,5,8,9-tetrahydroisochinolino[l,2a]pyrido[l,2-k][2,9]fenantrolin-3,10-diium trifluormethansulfonát, tj. MJA-C9-30
2.13- bis((£)-2-(5-bromthiofen-2-yl)vinyl)-8,9-dimethyl-6,7,10,11 -tetrahydrodipyrido[2,1 a:r,2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. MJB-C5-3
2.13- bis((£)-2-(2,6-dimethoxypyridin-3-yl)vinyl)-8,9-dimethyl-6,7,10,1 l-tetrahydrodipyrido[2,l-a: r,2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. MJB-C8-27
19—((£)—2—( 1 —methy 1— 1 TY—indol—2—y l)vi ny 1)—6,7,8,11,12,13-hexahydropyrido[ 1 '2': 1 ,2]azepino[4,3:5',6']benzo[r,2':3,4]azepino[l,2-a]chinolin-5,14-diium trifluormethansulfonát, tj. MSC-C10-10
19—((£)—2—(2—methy 1— 1 £7—i ndol—3—y I )v i ny 1)—6,7,8,11,12,13-hexahydropyrido[ 1 ',2': 1 ,2]azepino[4,3,5',6']benzo[ 1 ',2':3,4]azepino[ 1,2—a] ch inol i n—5,14-diium trifluormethansulfonát, tj. MSC-C 10-11
19—((£)—2—( 177-benzo[g]indol-3-yl)vinyl)-6,7,8,11,12,13-hexahydropyrido[ 1 ',2': 1 ,2]azepino[4,3,5',6']benzo[ 1 ',2':3,4]azepino[ 1,2-a]chinolin-5,14-diium trifluormethansulfonát, tj. MSC-C 13-16
19—((£)—2—(2—feny 1— 1 £7—indo I—3—y l)viny 1)—6,7,8,11,12,13-hexahydropyrido[ 1 ',2': 1 ,2]azepino[4,3:5',6']benzo[l',2':3,4]azepino[l,2-a]chinolin-5,l 4-diium trifluormethansulfonát, tj. MSC-C 15-8
19—((£>-2—(1 ££—indol—5—y l)viny 1)—6,7,8,11,12,13-hexahydropyrido[ I '.2': I ,2]azepino[4,3:5',6']benzo[l',2':3,4]azepino[l,2-a]chinolin-5,l 4-diium trifluormethansulfonát, tj. MSCC9-10
19-((£)-2-(5-brom-l/f-indol-3-yl)vinyl)-6,7,8,11,12,13-hexahydropyrido[ 1 ',2': 1 ,2]azepino[4,3:5',6']benzo[l',2':3,4]azepino[l,2-a]chinolin-5,l 4-diium trifluormethansulfonát, tj. MSC-C9-30
4.15— bis((£)—4—(py rid in—2—y 1 )sty ry I)—6,7,8,11,12,13-hexahydrodipyrido[ 1,2-a: 1 ',2'-a']benzo[2,l-c:3,4-c']bisazepindiium trifluormethansulfonát, tj. PRA-C12-5
2,4,15,17-tetra( (£)-(2-( 1 -methyl-1 H-\ndo 1- 2-y 1 )vi ny 1)-6,7,8,11,12,13-hexahydrodipyrido[l,2-a:l',2'-a']benzo[2,l-c:3,4-c']bisazepindiium trifluormethansulfonát, tj. PRC-C10-10 (£)-l l-(2-([2,2':5',2-terthiofen]-5-yl)vinyl)-6,7-dimethyl-4,5,8,9-tetrahydroisochinolino[l,2-a]pyrido[l,2-k][2,9]fenantrolin-3,10-diium trifluormethansulfonát, tj. VDJA-C13-6 (£)-l l-(2-(dibenzo[b,d]furan-4-yl)vinyl)-6,7-dimethyI-4,5,8,9-tetrahydroisochinolino[l,2a]pyrido[l,2-k][2,9]fenantrolin-3,10-diium trifluormethansulfonát, tj. VDJA-C13-8
2.15- bis((£)-2-(2,6-dimethoxypyridin-3-yl)vinyl)-6,7,10,1 l-tetrahydrodipyrido[2,1-a: 1 ’,2'— k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. PDA-C8-27 (£)-2-(2-(5-brom-177-indol-3-yl)vinyl)-6,7,10,1 l-tetrahydrodipyrido[2,l-a: l',2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát,’tj. LSA-C9-30
- 5 CZ 307163 B6 (£)-13-(2-(dibenzo[b,d]furan-4-yl)vinyl)-4,5,8,9-tetrahydroisochinolino[l,2-a]pyrido[l,2k][2,9]fenantrolin-3,l0-diium trifluormethansulfonát, tj. MSB-C13-8
2.15- bis((E)-2-(2-methyl-1 H-indol-3-yl)vinyl)-6,7,10,11 -tetrahydrodipyrido[2,1 -a: 1 ',2'k][2,9][fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. PDA-C10-11
2.15- bis((E)-2-( 1-methyl-1H-indol- 3-yljviny 1)-6,7,10,1 l-tetrahydrodipyrido[2,1-a: l',2'k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. PDA-C10-13
2.15- bis((E)-2-(2-fenyl-l H—indol—3—yljviny 1)-6,7,10,1 l-tetrahydrodipyrido[2,1 —a: l',2'k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. PDA-C15-8
2.15- bis((E)-2-(5-brom-l H indol 3—yljviny 1)-6,7,10,1 l-tetrahydrodipyrido[2,l-a: l',2'k][2,9][fenantrolin-5,!2-diium trifluormethansulfonát, tj. PDA-C9-30 (rac)-(E)-13-(2-(dibenzo[b,d]furan-4-yl)vinyl)-6,7-dimethyl-4,5,8,9-tetrahydroisochinolino[l,2-a]pyrido[l,2-k][2,9]fenantrolin-3,10-diium trifluormethansulfonát, tj. MJA-C13-8
8.9- dimethyl-2,15-bis((E)-2-(2-methyl-l H indol—3—yIjvinyl)—6,7,10,11-tetrahydrodipyrido[2,1-a: r,2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. PDB-C10-11
2.15- b i s((E)2-(1 H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)vinyl)-8,9-dimethyl-6,7,10,11 -tetrahydrodipyrido[2,l-a:l',2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. PDB-C8-14
2.4- bis((E)-2-( IH—i ndo 1—2—y 1) vi ny I)—6,7,10,11 -tetrahydrodipyrido[2,1 -a: 1 ’,2'-k] [2,9]fenantrolin—5,12—diium trifluormethansulfonát, tj. HTA-C10-10
2.4- bis((E)-2-([2,2- bith iofen]-5-y 1 )vi ny I)-6,7,10,1 l-tetrahydrodipyrido[2,1 —a: 1 ',2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. HTA-C9-16
2.4- bis((E)-2-(benzofuran-2-yl)vinyl)-6,7,10,l l-tetrahydrodipyrido[2,l-a: l',2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. HTA-C9-17 (E)-2-(2( [2,2- bith iofen]-5-y 1) v i ny I)-6,7,10,1 l-tetrahydrodipyrido[2,1 —a: 1 ',2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. LSA-C9-16 (E)-13-(2-(5-hexylthiofen-2-yl)vinyl)-6,7-dimethyl-4,5,8,9-tetrahydroisochinolino[l,2a]pyrido[l,2-k][2,9]fenantrolin-3,l 0-diium trifluormethansulfonát, tj. MJA-C11-25 (E)—13—(4—(9//karbazol-9-yljsty ryl)-6,7-dimethy 1-4,5,8,9—tetrahydroisochinolino[l,2-a]pyrido[l,2-k][2,9]fenantrolin-3,l0-diium trifluormethansulfonát, tj. MJA-C19-4
8.9- dimethyl-2,13-bis((E)-2-(4-methyl-l H-imidazol-5-yl)vinyl)-6,7,10,11-tetrahydrodipyrido[2,l-a:r,2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. MJB-C5-11
19-((E)-2-(3-methylbenzo[b]thiofen-2-yl)vinyl)-6,7,8,11,12,13-hexahydropyrido[ 1 ',2': 1 ,2]azepino[4,3: 5',6']benzo[ 1 ',2':3,4]azepino[ 1,2-a]chinolin-5,14-diium trifluormethansulfonát, tj. MSC-C10-36
19—((E)—2—([2,2'—bith iofen]—5—yl)v i ny 1)-6,7,8,11,12,13-hexahydropyrido[ 1 ',2': 1 ,2]azepino[4,3:5',6']benzo[l',2':3,4]azepino[l,2-a]chinolin-5,l4-diium trifluormethansulfonát, tj. MSCC9-16
-6CZ 307163 B6
19-((7)-2-(6-brom-l //-indol-3-yl )vinyl >6.7.8,11,12,13-hexahydropyrido[ 1 '2': 1 ,2]azepino[4,3:5',6']benzo[l',2':3,4]azepino[l,2-a]chinolin-5,14-diium trifluormethansulfonát, tj.
MSC-C9-18
2.15- bis((E)-2-(4-methyl-l 7f-imidazol-5-yl)viny 1)-6,7,10,1 l-tetrahydrodipyrido[2,1-a: l',2'k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. PDA-C5-11
2.15- bis((£’)-2-(dibenzo[b,d]furan=:l-yl)vinyl)-8,9-dimethyl-6,7,10,11-tetrahydrodipyrido[2,l-a:l',2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. PDB-C13-8 (rac)-2,4,13,15-tetrakis((E)-2-(thiofen-3-yl)vinyl)-6,7,8,11,12,13-hexahydrodipyrido[ 1,2a:r,2'-a']benzo[2,l-c:3,4-c']bisazepindiium trifluormethansulfonát, tj. PRC-C5-9 (Ti)—1 3-(2-(dibenzo[b,d]furan-2-yl)vinyl)-6,7-dimethyl-4,5,8,9-tetrahydroisochinolino[ 1,2a]pyrido[l,2-k][2,9]fenantrolin-3,10-diium trifluormethansulfonát, tj. MJA-C13-22 (E)-13-(2-(4-fenylthiofen-2-yl)vinyl)-4,5,8,9-tetrahydroisochinolino[l,2-a]pyrido[l,2k][2,9]fenantrolin-3,10-diium trifluormethansulfonát, tj. MSB-C11-7 (E)-l 3-(2-( l/7-benzo[g] indol—3—yl)vinyl)—4,5,8,9-tetrahydroisochinolino[1.2-a]pyrido[ 1,2— k][2,9]fenantrolin-3,10-diium trifluormethansulfonát, tj. MSB-C13-16
19-((7)-2-( 7-methy 1-1 H-indol-3-y 1 )v i ny 1)—6,7,8,11,12,13-hexahydopyrido[ 1 ',2': 1 ,2]azepino[4,3:5',6']benzo[r,2':3,4]azepino[l,2-a]chinolin-5,14-diium trifluormethansulfonát, tj. MSC-C10-31 (£)-1 l-(2-(dibenzo[b,d]thiofen-4-yl)vinyl)-6,7-dimethyl-4,5,8,9-tetrahydroisochinolino[l,2a]pyrido[l,2-k][2,9]fenantrolin-3,10-diium trifluormethansulfonát, tj. VDJA-C13-20 (rac)-(7)-13-(2-(9-ethyl-9H-karbazol-3-yl)vinyl)-6.7-dimethyl-4,5,8,9-tetrahydroisochinolino[l,2-a]pyrido[l,2-k][2,9]fenantrolin-3,10-diium trifluormethansulfonát, tj. MJA-C15I (rac)-8,9-dimethyl-2,l3-bis((E)-2-(thiofen-3-yl)vinyl)-6,7,10,l l-tetrahydrodipyrido[2,la: 1 ',2'- k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. MJB-C5-9 (rac)-2,15—bis((jE7>—2—(1 H-indol-3-yl)vinyl)-6,7,8,11,12,13-hexahydrodipyrido[ 1,2-a: 1 ',2'a']benzo[2,l-c:3,4-c']bisazepindiium trifluormethansulfonát, tj. MJC-C9-7
4,13-bis((E)-2-(2-methyl-l H—indol—3—y l)vinyl)—6,7,10,1 l-tetrahydrodipyrido[2.1-a: l',2'k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. VDJC-C10-11 (7)—1 l-(2-(benzo[d]thiazol-2-yl)vinyl)-6,7-dimethyl-4,5,8,9-tetrahydroisochinolino[l ,2a]pyrido[l,2-k][2,9]fenantrolin-3,10-diium trifluormethansulfonát, tj.VDJA-C8-5 (E)-6,7-dimethyl-l l-(2-(5-fenylthiofen-2-yl)vinyl)-4,5,8,9-tetrahydroisochinolino[l,2a]pyrido[l,2-k][2,9]fenantrolin-3,10-diium trifluormethansulfonát, tj.VDJA-Cl 1-13 (rac)-(7)-2-(2-(4-nitro-l 77—i ndo 1—3—y 1) vi ny 1)-6,7,10,11 -tetrahydrodipyrido[2,1 -a: 1 ',2'— £][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. LSA-C9-32 (rac)—(7)2-(2-( 6-isopropy 1—1 Z/-indol-3-yl)vinyl)-6,7,8,11,12,13-hexahydrodipyrido[ 1,2a: l',2'-a']benzo[2, l-c:3,4-c']bisazepindiium trifluormethansulfonát, tj. PSA-C12-6
- 7 CZ 307163 B6 (racj-2,17-bis((E)-2-( 1 H—i ndol—5—y 1 )v iny 1)—6,7,8,11,12,13-hexahydrodipyrido[ 1,2-a: 1 ',2'a']benzo[2,l-c:3,4-c']bisazepindiium trifluormethansulfonát, tj. PRB-C9-10 (rac)-4,15-bis((£j-2-(2,5—dimethy 1—1 —(3—(trifluormethyl)fenyl)—1H—pyrrol—3—yl)vinyl)—
6,7,8,11,12,13-hexahydrodipyrido[ 1,2-a: 1 ',2'-a']benzo[2,l-c:3,4-c']bisazepindiium trifluormethansulfonát, tj. PRA-C14-6
8,9—dimethyl—2,15—bis((A·)—2—(2—fenyl— 1H—indol—3—yl)vinyl)~6,7,10,11-tetrahydrodipyrido[2,1—a: 1 ',2'—k][2,9]fenantrolin—5,12—diium trifluormethansulfonát, tj. PDB-C15-8 (rac)-2,4,15,17-tetrakis((E)-2-( 1 //—i ndo 1—2—y 1)—6,7,8,11,12,13-hexahydro-dipyrido[ 1,2a: r,2'-a']benzo[2,l-c:3,4-c']bisazepindiium trifluormethansulfonát, tj. PRC-C9-11 (rac)-2,4-bis((E)-2-( 1 -methyl -1H-pyrrol- 2-y l)vinyl)—6,7,10,1 l-tetrahydrodipyrido[2,la:l',2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. HTA-C6-4 (rac)-2,4-bis((E)-2-(4-methyl-l/7-imidazol-5-yl)vinyl)-6,7,10,l l-tetrahydrodipyrido[2,la:l',2'-k][2,9]fenantrolin-5,l2-diium trifluormethansulfonát, tj. HTA-C5-11
2,4,13,15-tetrakis((E)-2-( 1 -methy 1-1 H-indol-3-y 1) v iny 1)—6,7,10,11 -tetrahydrodipyrido[2,1 -a: l',2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. TKA-C10-13
Dále jsou předmětem vynálezu helquaty obecného vzorce I nebo konkrétní výše uvedené helquaty podle tohoto vynálezu, či jejich farmaceuticky přijatelné soli, pro použití jako léčiva.
Předmětem vynálezu jsou dále helquaty obecného vzorce I nebo konkrétní výše uvedené helquaty podle tohoto vynálezu, či jejich farmaceuticky přijatelné soli, pro použití ke stabilizaci G-kvadruplexů.
Dalším předmětem předkládaného vynálezu jsou helquaty obecného vzorce I nebo konkrétní výše uvedené helquaty podle tohoto vynálezu, či jejich farmaceuticky přijatelné soli, pro použití jako léčiva k léčbě onkologických onemocnění.
Helquaty obecného vzorce I podle nároku 1 nebo konkrétní výše uvedené helquaty podle tohoto vynálezu, či jejich farmaceuticky přijatelné soli, pro použití k léčbě onemocnění souvisejících se zvýšenou proliferací buněk a k léčbě, vyžadující ovlivnění G-kvadruplexu, s výhodou v telomerách nebo v promotorech genů.
Předmětem vynálezu je také farmaceutický prostředek, obsahující alespoň jeden helquat obecného vzorce I podle tohoto vynálezu, nebo jeho farmaceuticky přijatelnou sůl.
Význakem tohoto vynálezu je rovněž farmaceutický prostředek, který obsahuje alespoň jeden helquat obecného vzorce I podle tohoto vynálezu, nebo jeho farmaceuticky přijatelnou sůl, případně i další aktivní složku a popřípadě alespoň jeden farmaceuticky přijatelný nosič, plnivo nebo ředidlo.
Předmětem vynálezu je dále farmaceutický prostředek, obsahující alespoň jeden helquat obecného vzorce 1 podle tohoto vynálezu, nebo jeho farmaceuticky přijatelnou sůl, pro použití k léčbě onkologických onemocnění, nemocí souvisejících se zvýšenou proliferací buněk a k léčbě, vyžadující ovlivnění G-kvadruplexu, s výhodou v telomerách nebo v promotorech genů.
Předmětem vynálezu je také použití helquatů obecného vzorce I podle nároku 1, nebo jejich farmaceuticky přijatelných solí, pro přípravu léčiva.
- 8 CZ 307163 B6
Dalším předmětem předkládaného vynálezu je i použití helquatů obecného vzorce I podle tohoto vynálezu, nebo jejich farmaceuticky přijatelných solí, pro výrobu léčiva k léčbě onkologických onemocnění, onemocnění souvisejících se zvýšenou proliferací buněk a k léčbě, vyžadující ovlivnění G-kvadruplexu, s výhodou v telomerách nebo v promotorech genů.
Vývoj nových stabilizátorů G-kvadruplexu je stále velmi žádoucí. Uplatní se zejména originální malé molekuly, účinné pro represi transkripce onkogenů a vykazující současně únosné množství nepříznivých vedlejších účinků. Pro komerční přípravu a využití nových stabilizátorů G-kvadruplexu je rovněž důležitou otázkou snadnost syntézy takových látek. Výhodou zde předkládaných helquatů je skutečnost, že jejich izolaci lze provést bez použití chromatografie, což přináší úspory času i materiálu.
Nově připravené helquaty překvapivě prokázaly významnou účinnost při stabilizaci G-kvadruplexů. Představují tak velmi nadějnou novou skupinu látek, vhodných pro aplikace spojené se stabilizací G—kvadruplexu. Jsou využitelné k ovlivnění exprese proteinů, spojených s procesy nezbytnými pro vznik a rozvoj nádorových onemocnění, jako jsou např. proliferace, růst, invazi vita, metastázování, přežití/odolnost vůči apoptóze, angiogeneze, a podobně. Mezi takové proteiny patří transkripční faktory c-myc, c-inyb. HIFI a (hypoxia-inducible factor la), vaskulární endotelový růstový faktor (VEGF, vascular endothelial growth factor), destičkový růstový faktor (PDGFA, platelet-derived growth factor oc polypeptide), KRAS, protein BCL-2 (B cell lymphoma 2), receptor pro destičkový růstový faktor (PDGFRp, PDGF receptor β polypeptide), proteinová podjednotka lidské telomerázy (TERT, human telomerase reverse transcriptase), ADAM15.
Schopnost stabilizace G-kvadruplexu byla demonstrována pomocí in vitro experimentů: FRET analýzy a ECD spektroskopie.
Ovlivnění exprese proteinů použitím helquatů, které jsou předmětem vynálezu, byla demonstrována pomocí duální luciferázové reportérové (DLR) analýzy a Western Blotu.
Měření interakce G-kvadruplexu s ligandem pomocí FRET analýzy je zavedeným a běžně používaným přístupem pro stanovení schopnosti ligandu stabilizovat G-kvadruplex. Tato metoda zároveň umožňuje stanovit selektivitu ligandu vůči G-kvadruplexu ve srovnání s dvouvláknovou DNA [De Cian A. a spol. (2007) Methods, 42, 183-195], Řada takto testovaných helquatů prokázala schopnost významně stabilizovat G-kvadruplexy, které se tvoří v důležité části regulační sekvence promotoru c-myc genu (tab. 1) a v lidských telomerách (tab. 2) a to i v přítomnosti nadbytku kompetitoru, představujícího dvouvláknovou DNA (ds26). Bylo zjištěno, že ve srovnání s G-kvadruplexovým ligandem TMPyP4, který se běžně používá jako pozitivní kontrola, stabilizují helquaty podle tohoto vynálezu G-kvadruplex s podstatně větší selektivitou.
Měření ECD spekter je další z citlivých metod, umožňující určit míru stabilizace G-kvadruplexu v přítomnosti ligandu. ECD spektroskopie potvrdila schopnost vybraných helquatů (tab. 4) významně stabilizovat c-myc promotorovy G-kvadruplex. Dokládají to experimenty používající modelový oligonukleotid c-Myc27, který má stejnou sekvenci jako NHE III, segment v c-myc regulační oblasti.
Pomocí duální luciferázové analýzy byla na buněčné úrovni zjištěna neobvykle vysoká schopnost helquatů inhibovat expresi luciferázy, která je řízena regulační oblastí c-myc genu obsahující NHE IIIi segment. NHE 111] obsahuje G-bohatou sekvenci schopnou tvorby paralelního Gkvadruplexu. Je prokázáno, že stabilizace c-myc promotorového G-kvadruplexu v NHE IIIi segmentu vede ke snížení exprese c-myc transkripčního faktoru, případně reportérového enzymu (firefly luciferáza), jehož exprese je touto regulační oblastí řízena [Siddiqui-Jain A. a spol. (2002) PNAS, 99, 11593—11598; Brooks T. A. (2010), Genes & Cancer, 1, 641—649. Analýza například ukázala, že pět helquatů (VDJA-CI3-6, LSA-C13-8, MJA-C9-30, MJA-C13-8, MSC-C9-10) inhibovalo expresi firefly luciferázy více než o 40 % ve srovnání s kontrolou (tab. 5). V případě
-9CZ 307163 B6 látky VDJA-CI3-6 se jednalo o inhibici exprese o více než 70 %). Devět helquatů (VDJA-C138, MSC-C10-11, MSC-C9-30, MJB-C5-9, MJB-C5-3, LSA-C9-32, MJA-C8-28, MSCC15-8, PDA-C8-27) inhibovalo expresi o více než 20 % a dalších pět látek (HTA-C5-9, MJBC8-27, MSC-C 13-16, MSC-C10 10. PRA-C12-5) o více než 10% ve srovnání s kontrolou. Výsledky byly potvrzeny minimálně dvěma nezávislými experimenty (každý v tetraplikátu). U dvou látek, MJA-C13-8 a VDJA-C13-6, byla také prokázána koncentrační závislost uvedeného inhibičního efektu (tab. 6). Detailní výsledky jsou uvedeny níže, v sekci nazvané Stabilizace G-kvadruplexu promotorové oblasti c-myc genu.
Pomocí metody imunodetekce byl na buněčné úrovni stanoven krátkodobý (24 hodin) vliv helquatů na expresi c-myc proteinu. V experimentech byla použita nádorová buněčná linie HGC-27 overexprimující c-myc protein. Helquaty uvedené v tabulce 7 snižovaly množství c-myc proteinu minimálně o 15 % a u více než poloviny látek bylo zjištěno snížení ve srovnání s kontrolou převyšující 40 %. Výsledky byly potvrzeny minimálně dvěma nezávislými experimenty. U nezanedbatelného počtu helquatů (MSC-C9-30, LSA-CI3-8, MJA-C8-28, MJB-C5-9, MJA-C138, MSC-C 15-8, PRC-C10-10, VDJA-C13-8) tak byla zjištěna shoda mezi výsledky ovlivnění exprese reportérového enzymu řízeného c-myc regulační oblastí získanými v duální luciferázové analýze a výsledky stanovení množství c-myc proteinu v nádorových buňkách.
Antiproliferační účinky helquatů byly testovány pomocí XTT cytotoxicitního/proliferačního testu na nádorové buněčné linii CCRF-CEM a normální (nenádorové) buněčné linii endoteliálních buněk z unbilikální vény HUVEC po dobu 72 hodin. Helquaty uvedené v tabulce 9 byly výrazně toxičtější vůči nádorové buněčné linii a netoxické, nebo méně toxické, vůči linii nenádorové. Deset testovaných helquatů (MSC-C 13-16, MSC-C9-30, MJA-C13-22, MSC-C9-16, MSCC9-I0, MSC-C 10-10, MSB-C11-7, MSC-C 10-11, VDJA-C13-20, LSA-C9-32) bylo toxických vůči CCRF-CEM buňkám v koncentraci nižší než 25 μηιοΙ.Γ1 a netoxických vůči HUVEC buňkám v koncentraci vyšší než 100 μηιοΙ.ΓNaměřené hodnoty ICso byly získány z minimálně tří nezávislých experimentů.
Vynález bude dále ozřejměn příklady provedení, které ho však žádným způsobem nelimitují.
Objasnění výkresů
Obr. 1 znázorňuje spektra ECD oligonukleotidu c-Myc27 při teplotách 25 °C a 95 °C; svislá čára odpovídá maximálnímu rozdílu signálu spekter a určuje vlnovou délku zvolenou pro sledování tání struktury G-kvadruplexu.
Obr. 2 znázorňuje závislost intenzity ECD detekované u 263 nm na teplotě roztoku oligonukleotidu c—Myc27 v přítomnosti ligandu PDB-C10—1 1 (molární poměr oligonukleotid : ligand =1:1).
Příklady uskutečnění vynálezu
Číselné údaje chemických posunů v NMR spektrech jsou uvedeny v ppm.
Notace v NMR spektrech: s (singlet), d (dublet), t (triplet), q (kvartet), m (multiplet).
Seznam zkratek:
ATCC/LGC BCA metoda Američan Type Cell Collection dle LGC standardů metoda stanovení množství proteinu založená na použití 2,2'—bichinolin— 4.4'-dikarboxylové kyseliny
- 10 CZ 307163 B6
c-myc gen kódující transkripční faktor c-myc (avian myelocytomatosis virus oneogene cellular homolog)
c-myc DMSO ds26 transkripční faktor c-myc dimethylsulfoxid oligonukleotid tvořící dvouvláknovou vlásenku
ATm ECD EDTA EGF F21T rozdíl teplot tání elektronický cirkulární dichroismus disodná sůl ethylendiamintetraoctové kyseliny epidermální růstový faktor sekvence z lidské telomery dlouhá 21 nukleotidů, značená na 5'- konci FAM a na 3'-konci TAMRA
FAM firefly luciferáza Fmyc27T fluorescein luciferáza odvozená z luciferázy světlušek sekvence z promotoru c-myc genu dlouhá 27 nukleotidů, schopná vytvářet G-kvadruplex, značená na 5'-konci FAM a na 3'-konci TAMRA
FBS fetální hovězí sérum
FRET Forsterův rezonanční přenos energie
G c-Myc27 guanin sekvence z promotoru c-myc genu dlouhá 27 nukleotidů, schopná vytvářet G-kvadruplex
h HGC-27 hodina lidská buněčná linie odvozená z metastatické lymfatické uzliny pacienta se žaludečním nádorem
NHE III1 nukleázový hypersenzitivní element (NHE) III 1 v oblasti promotoru cmyc genu
HRP křenová peroxidáza
HSV-TK promotor thymidin kinázy viru herpes simplex (HSV)
IC5O koncentrace testované látky, působící pokles počtu viabilních buněk na polovinu (tj. 50% zpomalení dělení buněk) vzhledem ke kontrolní, neovlivněné populaci
PBS PCR pGL4.10 (luc2) pGL4.10-myc (luc2) PhIC PMS fosfátem pufrovaný fyziologický roztok polymerázová řetězová reakce vektor kódujícífirefly luciferázu bez promotoru vektor kódujícífirefly luciferázu s regulační oblastí c-myc směs inhibitorů fosfatáz phenazine methosulfate
PrIC pRL-TK směs inhibitorů proteáz savčí ko-reporterový vektor s nízkou konstitutivní expresí Renilla luciferázy
PVDF membrána RIPA membrána z polyvinyliden difluoridu radioimunoprecipitační pufr (radioimmunoprecipitation assay buffer)
SD směrodatná odchylka
SDS-PAGE TAMRA polyakryiamidový gel s dodecylsíranem sodným pro elektroforézu karboxytetramethylrhodamin
- 11 CZ 307163 B6
TBS-T roztok tris(hydroxymethyl)aminomethanu, chloridu sodného a Tween-20 (50 mmol.l1 Tris, 150 mmol.l 1 NaCI, 0,05% Tween-20
I. Syntéza látek
Struktury výchozích helquatů A až Q jsou následovně:
G
E
F
- 12 CZ 307163 B6
Příklad 1 (rac)-(E)-l 3-(2-(Dibenzo[b,d]furan-4-yl)vinyl)-6,7-dimethylA,5,8,9-tetrahydroisochinolin[l,2-a]pyrido[l,2-k][2,9]fenantrolin-3,10-diium trifluormethansulfonát, tj. MJA-C13-8
Výchozí helquat A (40 mg, 1 ekv., 59 pmol), dibenzo[b,d]furan-4-karbaldehyd (60 mg, 5 ekv., 306 pmol), pyrrolidin (30 mg, 35 μΙ, 7 ekv., 419 μηιοί) a suchý methanol (1 ml) byly umístěny do baňky o objemu 5 ml a směs byla míchána pod argonem po dobu 2 h za teploty místnosti. Postup reakce byl sledován pomocí tenkovrstvé chromatografie. Surový produkt byl vysrážen z reakční směsi přidáním diethyletheru (40 ml). Suspenze byla odstředěna a kapalný podíl byl oddělen od pevné látky. Pevný podíl byl částečně rozpuštěn v methanolu (3 ml), směs byla promíchána a rozpuštěný produkt byl vysrážen přidáním diethyletheru (40 ml). Následovalo odstředění této suspenze, odstranění kapalného podílu a se získaným pevným podílem byla tato procedura ještě dvakrát zopakována. Pevný podíl byl poté vysušen pod vakuem za použití olejové pumpy. Takto bylo získáno 36 mg (42 pmol, 71% výtěžek) světle žluté pevné látky MJA-C13-8.
2CF,SO,'
'H NMR (400 MHz, aceton-d6): 2.67 (s, 3H), 2,67 (s, 3H). 3,31 (m, 2H), 3,69 (dq, J = 5,4, 1,9 Hz, 1H), 3,73 (ddd, J = 7,5, 3,4, 1,7 Hz, IH), 5,04 (m, 3H), 5,21 (ddd, J = 13,9, 4,5, 1,6 Hz, 1H), 7,16 (d, J = 1,8 Hz, 1H), 7,35 (d, J = 16.4 Hz. IH), 7.43 (d, J = 16,4 Hz, IH), 7,57 (t, J =
7.6 Hz, IH), 7,60 (td, J = 7,7, 0,9 Hz, IH), 7,69 (dd, J = 7,7, 0,8 Hz, IH), 7,76 (ddd, J = 9,7, 6,7, 1,3 Hz, 2H), 7,82 (dd, J = 6,6, 1,9 Hz, IH), 8,15 (d, J = 8,0 Hz, IH), 8,24 (dd, J = 7,7, 0,5 Hz, 1H), 8,25 (dd, J = 7,6, 1,2 Hz, 1H). 8,49 (d, J = 6,7 Hz, 1H). 8,68 (d, J = 6,6 Hz, 1H), 8,90 (d, J =
6.7 Hz, IH).
Příklad 2 (rac)-(£)-13-(2-(9-Ethyl-9H-karbazol-3-yl)vinyl)-6,7-dimethyl-4,5,8,9-tetrahydroisochinolino[l,2-a]pyrido[l,2-k][2,9]fenantrolin-3,10-diium trifluormethansulfonát, tj. MJA-C15-
Výchozí helquat A (100 mg, 1 ekv., 148 pmol), 9-ethyl-9H-karbazol-3-karbaldehyd (66 mg, ekv., 296 pmol), pyrrolidin (74 mg, 86 pl, 7 ekv., 1,035 mmol) a suchý methanol (1 ml) byly umístěny do baňky o objemu 5 ml a směs byla míchána pod argonem po dobu 2 h za teploty místnosti. Postup reakce byl sledován pomocí tenkovrstvé chromatografie. Surový produkt byl vysrážen z reakční směsi přidáním diethyletheru (40 ml). Suspenze byla odstředěna a kapalný podíl byl oddělen od pevné látky. Pevný podíl byl částečně rozpuštěn v methanolu (5 ml), směs byla promíchána a rozpuštěný produkt byl vysrážen přidáním diethyletheru (40 ml). Následovalo odstředění této suspenze, odstranění kapalného podílu a se získaným pevným podílem byla tato procedura ještě dvakrát zopakována. Pevný podíl byl poté vysušen pod vakuem za použití olejové pumpy. Takto bylo získáno 67 mg (76 pmol, 51 % výtěžek) světle žluté pevné látky M.IAC15-1.
- 13 CZ 307163 B6
'Η NMR (400 MHz, aceton-d6) δ 1,45 (t, J = 7,2 Hz, 3H), 2,12 (s, 3H), 2,32 (s, 3H), 3,11 (td, J = 16,0, 4,5 Hz, IH), 3,26 (m, 2H), 3,58 (dd, J = 15,3, 1,6 Hz, 1H), 4,58 (q, J = 7,2 Hz, 2H), 5,00 (td, J = 14,1, 3,6 Hz, 1H), 5,13 (dd, J = 13,8, 3,7 Hz, 1H), 5,29 (m, 2H), 6,77 (d, J = 16,2 Hz, 1H), 7,31 (d, J = 1,5 Hz, 1H), 7,35 (t, J = 7,4 Hz, 1H), 7,43 (d, J = 16,2 Hz, 1H), 7,60 (m, 4H), 7,69 (t, J = 8,2 Hz, 1H), 7,78 (dd, J = 6,7, 1,8 Hz, 1H), 7,82 (t, J = 7,2 Hz, 1H), 7,90 (d, J =
8,7 Hz, 1H), 8,03 (d, J = 8,1 Hz, 1H), 8,27 (d, J = 7,7 Hz, 1H), 8,40 (s, 1H), 8,41 (d, J = 6,6 Hz, IH), 8,74 (d, J = 6,6 Hz, 1H), 8,97 (d, J = 6,7 Hz, 1H).
Příklad 3 (rac)-8,9-dimethyl-2,13-bis(E)-2-(thiofen-3-y l)viny 1)-6,7,10,1 l-tetrahydrodipyrido[2,la: r,2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. MJB-C5-9
Výchozí helquat M (40 mg, 1 ekv., 62 μιηοΙ), thiofen-3-karbaldehyd (210 mg, 30 ekv., 1,873 mmol), pyrrolidin (67 mg, 78 μΙ, 15 ekv.. 937 μιηοΙ) a suchý methanol (1 ml) byly umístěny do baňky o objemu 5 ml a směs byla míchána pod argonem po dobu 12 h za teploty místnosti. Postup reakce byl sledován pomocí tenkovrstvé chromatografie. Surový produkt byl vysrážen z reakční směsi přidáním diethyletheru (40 ml). Suspenze byla odstředěna a kapalný podíl byl oddělen od pevné látky. Pevný podíl byl částečně rozpuštěn v methanolu (5 ml), směs byla promíchána a rozpuštěný produkt byl vysrážen přidáním diethyletheru (40 ml). Následovalo odstředění této suspenze, odstranění kapalného podílu a se získaným pevným podílem byla tato procedura ještě dvakrát zopakována. Pevný podíl byl poté vysušen pod vakuem za použití olejové pumpy. Takto bylo získáno 48 mg (43 μιηοΙ, 69% výtěžek) světle žluté pevné látky MJB-C5-9.
'H NMR (400 MHz, acetonitril-d,) δ 2,44 (s, 3H), 2,44 (s, 3H), 3,03 (m, 2H), 3,45 (m, 2H), 4,53 (td, J = 14,6, 3,4 Hz, 1H), 4,61 (td, J = 15,6, 15,2, 3,7 Hz, 1H), 4,83 (dd, J = 14,0, 4,0 Hz, IH), 5,30 (dd, J = 14,2,3,3 Hz, 1H), 6,96 (d, J = 16,3 Hz, 1H), 7,38 (dd, J = 5,1, 1,0 Hz, 1H), 7,46 (dd, J = 5,1, 2,9 Hz, 1H), 7,50 (d, J = 15,9 Hz, 1 H), 7,53 (d, J = 16,2 Hz, 1H), 7,60 (dd, J = 5,4,
3,2 Hz, 1H), 7,62 (d, J = 2,1 Hz, 1H), 7,66 (d, J = 1,9 Hz, 1H), 7,69 (d, J = 6,4 Hz, 2H), 7,73 (d, J = 15,9 Hz, 1H), 7,88 (dd, J = 7,3, 2,5 Hz, 1H), 7,89 (dd, 2,9, 1,0 Hz, 1H), 8,00 (t, J = 8,0 Hz, 1H), 8,06 (dd, J = 8,2, 1,4 Hz, 1H), 8,56 (d, J = 6,6 Hz, IH).
- 14CZ 307163 B6
Příklad 4 (rac)-2,15-bis((E)-2-( 1 H—i ndol—3 —y 1 )v iny 1)—6,7,8,11,12,13-hexahydrodipyrido[ 1,2-a: I ',2 — a']benzo[2,l-c:3,4-c']bisazepindiium trifluormethansulfonát, tj. MJC-C9-7
Výchozí helquat J (35 mg, 1 ekv., 55 μιηοΙ), 1 H-indol-3-karbaldehyd (238 mg, 30 ekv., 1,639 mmol), pyrrolidin (58 mg, 68 μΙ, 15 ekv., 820 μηιοί) a suchý methanol (1 ml) byly umístěny do baňky o objemu 5 ml a směs byla míchána pod argonem po dobu 16 h za teploty místnosti. Postup reakce byl sledován pomocí tenkovrstvé chromatografie. Surový produkt byl vysrážen z reakční směsi přidáním diethyletheru (40 ml). Suspenze byla odstředěna a kapalný podíl byl oddělen od pevné látky. K pevnému podílu byl přidán diethylether (35 ml), suspenze byla promíchána a odstředěna. Získaný pevný podíl byl částečně rozpuštěn v methanolu (3 ml), směs byla promíchána a rozpuštěný produkt byl vysrážen přidáním diethyletheru (40 ml). Následovalo odstředění této suspenze, odstranění kapalného podílu a se získaným pevným podílem byla tato procedura ještě dvakrát zopakována. Pevný podíl byl poté vysušen pod vakuem za použití olejové pumpy. Takto bylo získáno 32 mg (36 pmol, 66% výtěžek) červené pevné látky MJC-C9-7.
H NMR (400 MHz, acetonitril-d3) δ 2,34 (m, 2H), 2,49 (m, 2H), 2,61 (m. IH), 2,80 (m, IH), 2,99 (dd, J = 14,1, 6,5 Hz, IH), 3,07 (m, IH), 4,35 (td, J = 13,4, 5,0 Hz, IH), 4,40 (dd, J = 15,6, 5,3 Hz, IH), 4,58 (dd, J = 13,9, 6,3 Hz, IH), 5,13 (dd, J = 14,6, 5,5 Hz, IH), 6,98 (dd, J = 7,7,
1,1 Hz, 1H), 7,03 (d, J = 16,2 Hz, IH), 7,12 (d, J = 1,9 Hz, 1H), 7,15 (d, J = 8,0 Hz, 1H), 7,22 (t, J = 7,6 Hz, IH), 7,30 - 7,38 (m,3H), 7,50 (d, J = 8,1 Hz. IH), 7,59 (dd, J = 6,0, 2,8 Hz, IH), 7,68 (d, J = 7,8 Hz, IH), 7,70 (d, J = 7,8 Hz. IH), 7.73 (s. IH), 7,88 - 8,01 (m, 5H), 8,02 - 8,06 (m, 1 H), 8,09 (d, J = 15,6 Hz, I H), 8,20 (d, J = 8,5 I Iz, 1 H), 8.5 I (d,J = 6,8 Hz, 1 H).
Příklad 5
4,13-bis((£')-2-(2-methyl-l H—i ndo 1—3—y I) v i ny 1)—6,7,10,11 -tetrahydrodipyrido[2,1 -a: 1 ’,2'— k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. VDJC-C10-11
Výchozí racemický helquat N (10 mg, 16,3 μπιοί), 2-methyl-l H-indoI-3-karbaldehyd (78 mg,
489,7 μιηοΙ), pyrrolidin (20 μΙ, 244,8 μιτιοΙ), a suchý methanol (1 ml) byly dány do 10 ml baňky a výsledná směs byla míchána pod argonem 24 h za laboratorní teploty. Postup reakce byl monitorován tenkovrstvou chromatografií. Surový produkt byl vysrážen z reakční směsi přidáním diethyletheru (8 ml). Vzniklá suspenze byla odstředěna a supernatant byl oddělen od pevného podílu. Pevný podíl byl rozpuštěn v acetonitrilu (6 ml) a čistý produkt byl vysrážen přidáním diethyletheru (36 ml). Potom odstředění této suspenze, odstranění supernatantu a vysušení pevného produktu na vakuu olejové pumpy vedlo k 8,7 mg (9,8 μιτιοΙ, 60% výtěžek) oranžové pevné látky VDJC-C10-11.
- 15 CZ 307163 B6
'H NMR (400 MHz, acetonitril-d3): 2,68 (s, 6H), 3,08-3,23 (m, 4H), 4,31-4,58 (m, 2H), 5,165,36 (m, 2H), 7,27-7,33 (m, 6H), 7,48 (dd, .7= 2,1, 5,6 Hz, 2H), 7,50 (dd, /=1,3, 7,9 Hz 2H), 7,69 (s, 2H), 7,91 (t, J= 8,1 Hz, 2H), 7,99 (d, J= 15,5 Hz, 2H), 8,06 (dd, J= 2,0, 5,4 Hz, 2H), 8,21 (dd, J = 1,1,8,4 Hz, 2H), 10,15 (bs,2H).
Příklad 6 (E)-l l-(2-(benzo[d]thiazol-2-yl)vinyl)-6,7-dimethyl-4,5,8,9-tetrahydro isochinolino[l,2a]pyrido[l,2-k][2,9]fenantrolin-3,IO-diium trifluormethansulfonát, tj. VDJA-C8-5
Výchozí racemický helquat B (20 mg, 29,6 pmol), benzo[d]thiazol-2-karbaldehyd (121 mg, 739 pmol), pyrrolidin (30 μΐ, 367,2 μιηοΐ) a suchý acetonitril (2 ml) byly dány do 10 ml baňky a výsledná směs byla míchána pod argonem 1 h za laboratorní teploty. Postup reakce byl monitorován tenkovrstvou chromatografií. Surový produkt byl vysrážen z reakční směsi přidáním diethyletheru (16 ml). Suspenze byla odstředěna a supernatant byl oddělen od pevného podílu. Pevný podíl byl rozpuštěn v methanolu (2 ml) a čistý produkt byl vysrážen přidáním diethyletheru (12 ml). Potom odstředění této suspenze, odstranění supernatantu a vysušení pevného produktu na vakuu olejové pumpy vedlo k 14 mg (17,0 pmol, 58% výtěžek) oranžové pevné látky VDJA-C 8-5.
'H NMR (400 MHz, acetone-d6): 2,67 (s, 3H), 2,68 (s, 3H), 3,49-3,54 (m, 2H), 3,82 (dq, J= 1,7,
17,1 Hz, 1H), 3,89 (dq, .7= 1,7, 17,1 Hz, 1H), 5,17 (dt, .7= 3,4, 14,6 Hz, 1H), 5,33 (dt, J= 3,7, 14,0 Hz, 1H), 5,40 (dd, .7 = 1,6, 13,9 Hz, 1H), 5,75 (dd, .7 = 1,6, 13,9 Hz, 1H),7,61 (dt, J =
1,2,7,2 Hz, 1H), 7,64 (dt, .7 = 1,3, 8,2 Hz, 1 H),7,69 (dt, J = 1,3, 7,2 Hz, 1H), 7,88 (dt, J= 1,2, 6,8 Hz, 1 H),7,91 (t,.7=8,l Hz, 1H), 8,00 (d,<7= 15,8 Hz, 1H), 8,02 (t, J= 1,2 Hz, 1H), 8,17 (dq, J = 0,7, 8,1 Hz, 1H), 8,18 (dd, J = 0,8, 8,7 Hz, IH), 8,22 (dq, .7 = 0,7, 8,1 Hz, 1H), 8,24 (dd, J = 1,3, 8,1 Hz, 1H), 8,31 (d, J= 9,2 Hz, 1H), 8,41 (d, .7 = 15,9 Hz, 1H), 8,58 (d, .7= 6,7 Hz, 1H), 9,06 (d, ,7 = 6,7 Hz, 1H).
Příklad 7 (E)-6,7-dimethyl-l l-(2-(5-fenylthiofen-2-yl)vinyl)-4,5,8,9-tetrahydro isochinolino[l,2-a]pyrido[l,2-k][2,9]fenantrolin-3,10-diium trifluormethansulfonát, tj.VDJA-Cl 1-13
Výchozí racemický helquat B (10 mg, 14,78 pmol), 5-fenylthiofen-2-karbaldehyd (53,87 mg,
147,8 pmol), pyrrolidin (15 μΙ, 183,6 pmol), a suchý methanol (I ml) byly dány do 10 ml baňky
- 16CZ 307163 B6 a výsledná směs byla míchána pod argonem 2 h za laboratorní teploty. Postup reakce byl monitorován tenkovrstvou chromatografií. Surový produkt byl vysrážen z reakční směsi přidáním diethyletheru (8 ml). Suspenze byla odstředěna a supernatant byl oddělen od pevného podílu. Pevný podíl byl rozpuštěn v methanolu (2 ml) a čistý produkt byl vysrážen přidáním diethyletheru (16 ml). Odstředění této suspenze, odstranění supernatantu a vysušení pevného produktu na vakuu olejové pumpy vedlo k zisku 9,0 mg (10,6 pmol. 72% výtěžek) žluté pevné látky VDJACll-13.
'H NMR (400 MHz, acetone-d6): 2,64 (s, 3H), 2,65 (s, 3H), 3,11-3,31 (m, 2H), 3,62 (dd, J= 2,0,
17.2 Hz, 1H), 3,66 (dd, J = 1,7, 17,4 Hz, IH), 4,80 (dt, J = 2,6, 13,0 Hz, 1H), 4,89 (dt, J = 2,6, 13,0 Hz, 1H), 5,10 (dd, J= 2,1, 13,9 Hz, 1H), 5,39 (dd, 7=2,1, 13,9 Hz, 1H), 6,95 (dd, J = 1,1,
6,8 Hz, 1H), 7,44 (d, J = 15,7 Hz, 1H), 7,54 (dt, J = 7,3, 1,4, 2,16 Hz, 1H), 7,59 (dd, J= 1,5,
2.2 Hz, 1H), 7,61 (d, .7 = 3,9, 1H), 7,63 (d,./=3,9 Hz, 1H), 7,64 (d,J=3,9 Hz, 1H), 7,66 (d,J = 3,9, 1H), 7,76 (dd, J= 1,2, 7,3 Hz, 1H), 7,86-7,91 (m, 5H), 7,99 (dd,7 = 1,1,7,1 Hz, 1H), 8,22 (d, .7=9,3 Hz, 1H), 8,40 (d, .7= 6,7 Hz, 1H), 8,70 (d,.7=6,8 Hz, 1H).
Příklad 8 {racý-(E)~2-(2-(4-nitro-1 //-indol-3-yl)viny 1)-6,7,10,1 l-tetrahydrodipyrido[2,l-r/: Γ,2'Áj[2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. LSA-C9-32
Výchozí racemický helquat E (12,7 mg, 21,2 μιηοΙ, 1 ekv.), 4-nitro-l//-indol-3-karbaldehyd (52,3 mg, 275,0 pmol, 13 ekv.), piperidin (25 μΐ, 21,7 mg, 254,6 pmol, 12 ekv.) a suchý methanol (1 ml) byly dány do Schlenkovy zkumavky a výsledná směs byla míchána pod argonem 6 h za laboratorní teploty. Postup reakce byl monitorován tenkovrstvou chromatografií. Surový produkt byl vysrážen z reakční směsi přidáním diethyletheru (15 ml). Suspenze byla odstředěna a supernatant byl oddělen od pevného podílu. Pevný podíl byl rozpuštěn v methanolu (1 ml) a čistý produkt vysrážen přidáním diethyletheru (15 ml) celkem dvakrát. Odstředění této suspenze, odstranění supernatantu a vysušení pevného produktu LSA-C9-32 na vakuu olejové pumpy vedlo k zisku 13,1 mg (17,0 pmol, 80% výtěžek) tmavé pevné látky.
'H NMR (400 MHz, aceton itril-d3-l.94): 3,25-3,33 (m, 4H), 4,60-4,98 (m, 4H), 6,82 (d, J = 16,0, 1H), 7,32 (t, 7 = 8,0; 8,0 Hz, 1 H), 7,68-7,70 (m, 4H), 7,87-7,91 (m, 2H), 7,96 (dd, J = 8,0; 1,0 Hz, 1H), 7,98 (dd,7 = 15,9; 0,7 Hz, 1 H), 8,06 (dd, J= 8,3; 1,5 Hz, 1H), 8,11 (s, 1H), 8,20 (td, 7=7,9; 7,9; 1,5 Hz, 1H), 8,45 (d,7=7,3 Hz, 1H), 8,86 (dd. 7=6,4; 1,3 Hz, 1H).
- 17CZ 307163 B6
Příklad 9 (rac)-(E)-2-(2-(6-isopropyl-l /7 i ndoI—3—y 1)v i ny 1)-6,7,8,11,12,13-hexahydrodipyrido[ 1,2a: l',2'- a']benzo[2,l-c:3,4-c']bisazepindiium trifluormethansulfonát, tj. PSA-C12-6
Výchozí racemický helquat F (14,2 mg, 22,7 μιηοΙ, I ekv.), 6-isopropyl-l//-indol-3-karbaldehyd (63,2 mg, 337,5 pmol, 15 ekv.), pyrrolidin (15 μΙ, 12,9 mg, 181,3 pmol, 8 ekv.) a suchý methanol (1 ml) byly dány do Schlenkovy zkumavky a výsledná směs byla míchána pod argonem 1,5 h za laboratorní teploty. Postup reakce byl monitorován tenkovrstvou chromatografií. Surový produkt byl vysrážen z reakční směsi přidáním diethyletheru (15 ml). Suspenze byla odstředěna a supernatant oddělen od pevného podílu. Pevný podíl byl rozpuštěn v acetonitrilu (1 ml) a čistý produkt vysrážen přidáním diethyletheru (15 ml) celkem dvakrát. Odstředění této suspenze, odstranění supernatantu a vysušení pevného produktu na vakuu olejové pumpy vedlo k zisku 13,7 mg (17,2 pmol, 76% výtěžek) hnědé pevné látky PSA-C12-6.
'HNMR (400 MHz, acetonitril-ds-l .94): 1,28 (d, J= 6,9 Hz, 6H), 2,26-2,72 (m), 2,96-3,06 (m), 4,28-4,36 (m, 1H), 4,53 (dd, J= 14,0; 6,1 Hz, 1H), 4,63 (td, J= 13,4; 13,2; 5,6 Hz, 1H), 4,86 (dd, J = 13,6; 6,3 Hz, 1H), 6,90 (d, J = 16,0, 1H), 6,93 (d, ./=2,2 Hz, 1H), 7,16 (dd, J= 8,3; 1,6 Hz, 1H), 7,39-7,41 (m, 2H), 7,69 (s, 2H), 7,71 (s, 1H), 7,83-7,90 (m, 3H), 7,93 (ddd, J= 7,8; 6,2; 1,5 Hz, 1H), 8,23 (td, J = 7,9; 7,9; 1,5 Hz, 1H), 8,45 (d, J = 6,9 Hz, 1H), 8,91 (dd, J = 6,2;
1,8 Hz, 1H).
Příklad 10 (rac)-2,17-bis((E)-2-( 1H indol—5—yI)viny 1)—6,7,8,11,12,13-hexahydrodipyrido[ 1,2-a: 1 ',2'a']benzo[2,l-c:3,4-cjbisazepindiium trifluormethansulfonát, tj. PRB-C9-10
Výchozí racemický helquat H (30 mg, 47 pmol, 1 ekv.), 1 H-indol-5-karbaldehyd (204 mg, 1.40 mmol, 30 ekv.), piperidin (74 ml, 750 pmol) a suchý methanol (1 ml) byly dány do 10 ml baňky a výsledná směs byla míchána pod argonem 1 h za laboratorní teploty. Postup reakce byl monitorován tenkovrstvou chromatografií. Surový produkt byl vysrážen z reakční směsi přidáním diethyletheru (34 ml). Suspenze byla odstředěna a supernatant oddělen od pevného podílu. Pevný podíl byl rozpuštěn v methanolu (2 ml) a čistý produkt vysrážen přidáním diethyletheru (34 ml) celkem čtyřikrát. Odstředění této suspenze, odstranění supernatantu a vysušení pevného produktu na vakuu olejové pumpy vedlo k zisku 24 mg (27 pmol, 57% výtěžek) oranžové pevné látky PRB-C9-10.
- 18CZ 307163 B6 'H NMR (400 MHz, acetonitril-d3): 2,34-2,44 (m, IH), 2,46-2,67 (m, IH), 2,60-2,69 (m, IH),
3,01 (dd, .7=6,2, 13,7 Hz, IH), 4,46 (td,.7=5,6, 13,2 Hz, IH), 4,71 (dd, .7=6,2, 13,8 Hz, IH),
6,53-6,54 (m, IH), 7,09 (d, J = 16,2 Hz, 1H), 7,14 (d, J = 1.8 Hz, 1H), 7,3 1-7,32 (m, 1H), 7,437,50 (m,2H), 7,70 (s, IH), 7,72 (d, J= 16,1 Hz, IH), 7,83 (s, IH), 7,99 (dd,.7= 1,9, 6,7 Hz, IH),
8,66 (d, J= 6,7 Hz, 1H), 9,63 (bs, 1H).
Příklad 11 (rac)-4,15-bis((£)-2-(2,5-dimethyl-l-(3-(trifluormethyl)fenyl)-lH-pyrrol-3-yl)vinyl)6,7,8,11,12,13-hexhydrodipyrido[ 1,2-a: 1 ',2'-a']benzo[2,1 -c:3,4-c']bisazepindiium trifluormethansulfonát, tj. PRA-C14-6
Výchozí racemický helquat G (30 mg, 47 pmol, 1 ekv.), 2,5-dimethyl-l-(3-(trifluormethyl)fenyl)-lH-pyrrol-3-karbaldehyd (375 mg, 1,40 mmol, 30 ekv.), pyrrolidin (62,5 ml, 750 pmol) a suchý methanol (1 ml) byly dány do 10 ml baňky a výsledná směs byla míchána pod argonem 30 min za laboratorní teploty. Postup reakce byl monitorován tenkovrstvou chromatografií. Surový produkt byl vysrážen z reakční směsi přidáním diethyletheru (34 ml). Suspenze byla odstředěna a supernatant oddělen od pevného podílu. Pevný podíl byl rozpuštěn v methanolu (2 ml) a čistý produkt vysrážen přidáním diethyletheru (34 ml) celkem čtyřikrát. K pevnému podílu byl přidán THF (0,5 ml) a suspenze byla odstředěna. Po odstranění supernatantu byl pevný podíl přečištěn dvakrát diethyletherem (5 ml). Odstředění této suspenze, odstranění supernatantu a vysušení pevného produktu na vakuu olejové pumpy vedlo k zisku 34 mg (30 pmol, 64% výtěžek) žluté pevné látky PRA-C14-6.
'H NMR (400 MHz, acetonitril-d3): 2,04 (s, 3H), 2,20 (s, 3H), 2,29-2,38 (m, IH), 2,41-2,49 (m, IH), 2,70 (tt, J= 5,9, 13,0 Hz, IH), 3,03 (dd, .7 = 5,9, 13,8 Hz, IH), 4,28 (id, J= 5,0, 14,1 Hz, IH), 4,99 (dd, .7 = 5,6, 14,5 Hz, IH), 6,62 (s, 1 H), 6,93 (dd, J = 1,3, 7,7 Hz, IH), 6,99 (d, J =
15,1 Hz, IH), 7,57-7,60 (m, IH), 7,67-7,68 (m, 2H), 7,78 (t, J= 7,9 Hz, IH), 7,84-7,91 (m, 3H), 8,24 (dd, 7 = 1,0, 8,6 Hz, IH).
Příklad 12
2,15-bis((E)-2-(2,6-dimethoxypyridin-3-yl)vinyl)-6,7,10,11 -tetrahydrodipyrido[2,1 -a: 1 ’,2'— k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. PDA-C8-27
Výchozí racemický helquat K (30 mg, 49,0 pmol), 2,6-dimethoxynicotinaldehyd (245,6 mg, 1,47 mmol), piperidin (72 ml, 734,6 pmol) a suchý methanol (2 ml) byly dány do lOml baňky a výsledná směs byla míchána pod argonem 6 h za laboratorní teploty. Postup reakce byl monitorován tenkovrstvou chromatografií. Surový produkt byl vysrážen z reakční směsi přidáním diethyletheru (30 ml). Suspenze byla odstředěna a supernatant byl oddělen od pevného podílu. Pevný podíl byl rozpuštěn v methanolu (1 ml) a čistý produkt vysrážen přidáním diethyletheru (30 ml). Odstředění této suspenze, odstranění supernatantu a vysušení pevného produktu na vakuu olejové pumpy vedlo k 35 mg (38,4 pmol, 78% výtěžek) žluté pevné látky PDA-C8-27.
- 19CZ 307163 B6
'Η NMR (400 MHz, acetonitril-d3): 3,26-3,30 (m, 4H), 3,94 (s, 6H), 3,99 (s, 6H), 4,68-4,72 (m, 2H), 4,78-4,81 (m, 2H), 6,37 (d, J = 8,32 Hz, 2H), 7,04 (d, J = 16,32 Hz, 2H), 7,37 (d, J = 16,32 Hz, 2H), 7,68-7,71 (m, 4H), 7,85 (dd, = 1,93 Hz, Λ = 6,64 Hz, 2H), 7,98 (d, J = 1,85 Hz, 2H), 8,60 (d, J = 6,64 Hz, 2H)
Příklad 13
2,15-bis((£)-2-(1 - methyl-1 H-indol-3- yl)vinyl)—6,7,10,1 l-tetrahydrodipyrido[2,l-a:l',2’k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. PDA-C10-I3
Výchozí racemický helquat K (30 mg, 49,0 μιηοΙ), l-methyl-lH-indol-3-karbaldehyd (233,9 mg, 1,47 mmol), piperidin (72 ml, 734,6 μιηοΙ) a suchý methanol (2 ml) byly dány do lOml baňky a výsledná směs byla míchána pod argonem 6 h za laboratorní teploty. Postup reakce byl monitorován tenkovrstvou chromatografií. Surový produkt byl vysrážen z reakční směsi přidáním diethyletheru (30 ml). Suspenze byla odstředěna a supernatant oddělen od pevného podílu. Pevný podíl byl rozpuštěn v methanolu (1 ml) a čistý produkt vysrážen přidáním diethyletheru (30 ml). Odstředění této suspenze, odstranění supernatantu a vysušení pevného produktu na vakuu olejové pumpy vedlo k zisku 37 mg (41,3 μιηοΙ, 84% výtěžek) tmavě červené pevné látky PDA-CI0-13.
'H NMR (400 MHz, acetonitril-d3): 3,27-3,30 (m, 4H), 3,77 (s, 6H), 4,64-4,68 (m, 2H), 4,764,78 (m, 2H), 6,91 (d, J= 10,70 Hz, 2H), 7.20-7,23 (m, 2H), 7,29-7,32 (m, 2H), 7,43 (d, J = 5,47 Hz, 2H), 7,48 (s, 2H), 7,63 (d, J= 10,69 Hz, 2H), 7,68 (s, 2H), 7,80-7,83 (m, 4H), 7,92 (d, J = 1,3 Hz, 2H), 8,52 (d, 7 = 4,48 Hz, 2H).
Příklad 14
8,9-dimethyl-2a5-bis((£)- 2-(2- fenyl-1H-indol- 3-yl)vinyl)-6,7,10,1 l-tetrahydrodipyrido[2,la: l',2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. PDB-C15-8
Výchozí racemický helquat L (30 mg, 46,8 μιηοΙ), 2-fenyl-lH-indol-3-karbaldehyd (310,8 mg, 1,40 mmol), piperidin (69 ml, 702,4 μηιοΙ) a suchý methanol (2 ml) byly dány do lOml baňky a výsledná směs byla míchána pod argonem 6 h za laboratorní teploty. Postup reakce byl monito-20CZ 307163 B6 rován tenkovrstvou chromatografií. Surový produkt byl vysrážen z reakční směsi přidáním diethyletheru (30 ml). Suspenze byla odstředěna a supernatant oddělen od pevného podílu. Pevný podíl byl rozpuštěn v methanolu (1 ml) a čistý produkt vysrážen přidáním diethyletheru (30 ml).
Odstředění této suspenze, odstranění supernatantu a vysušení pevného produktu na vakuu olejové pumpy vedlo k získání 49 mg (46,8 μιηοΙ, 81% výtěžek) tmavě červené pevné látky PDB-C15-8.
'H NMR (400 MHz, acetonitril-d3): 2,43 (s, 6H), 3,01-3,10 (m, 2H), 3,42-3,46 (m, 2H), 4,524,59 (m, 2H), 4,71-4,75 (m, 2H), 7,02 (d, J=16 Hz, 2H), 7,18 (t, J= 7,3 Hz, 2H), 7,28 (t, J =
7,1 Hz, 2H), 7,38 (d, J= 7,4 Hz, 2H), 7,46-7,62 (m, 14H), 7,68 (d, J= 1,49 Hz, 2H), 7,87 (d,./ = 8 Hz, 2H), 8,20 (d, 7 = 6,68 Hz, 2H).
Příklad 15
8,9-dimethyl-2,15-bis((E)-2-(2-methyl-l H-indol-3-y l)vinyl)-6,7,10,11 -tetrahydrodipyrido[2,l-a:l',2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. PDB-C10-11
Výchozí racemický helquat L (30 mg, 46,8 μιηοΙ), 2-methyl-lH-indol-3-karbaldehyd (223,6 mg, 1,40 mmol), piperidin (69 ml, 702,4 μιηοΙ) a suchý methanol (2 ml) byly dány do lOml baňky a výsledná směs byla míchána pod argonem 6 h za laboratorní teploty. Postup reakce byl monitorován tenkovrstvou chromatografií. Surový produkt byl vysrážen z reakční směsi přidáním diethyletheru (30 ml). Suspenze byla odstředěna a supernatant oddělen od pevného podílu. Pevný podíl byl rozpuštěn v methanolu (1 ml) a čistý produkt vysrážen přidáním diethyletheru (30 ml). Odstředění této suspenze, odstranění supernatantu a vysušení pevného produktu na vakuu olejové pumpy vedlo k získání 38 mg (41,2 μιηοΙ, 88% výtěžek) tmavě červené pevné látky PDB-C10-11.
'H NMR (400 MHz, acetonitril-d3): 2,43 (s, 12H), 3,02-3,10 (m, 2H), 3,42-3,46 (m, 2H), 4,604,66 (m, 2H), 4,76-4,79 (m, 2H), 6,89 (d, J = 16 Hz, 2H), 7,12-7,19 (m, 4H), 7,36 (d, J = 8,16 Hz, 2H), 7,63 (d, J= 16 Hz, 2H), 7,78-7,85 (m, 6H), 8,46 (d. J= 6,74 Hz, 2H).
Příklad 16
2,15—bis((2T)—2—(1H—pyrrolo[2,3—b]pyridin—3—yl)—vinyl—8,9—dimethyl—6,7,10,11-tetrahydrodipyrido[2,l-a:l',2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. PDB-C8-14
Výchozí racemický helquat L (30 mg, 46,8 μιηοΙ), 1 H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-karbaldehyd (205,3 mg, 1,40 mmol), piperidin (69 ml, 702,4 μιηοΙ) a suchý methanol (2 ml) byly dány do lOml baňky a výsledná směs míchána pod argonem 6 h za laboratorní teploty. Postup reakce byl monitorován tenkovrstvou chromatografií. Surový produkt byl vysrážen z reakční směsi přidáním diethyletheru (30 ml). Suspenze byla odstředěna a supernatant oddělen od pevného podílu. Pevný podíl byl rozpuštěn v methanolu (I ml) a čistý produkt vysrážen přidáním diethyletheru (30 ml). Odstředění této suspenze, odstranění supematantu a vysušení pevného produktu na vakuu olejové pumpy vedlo k zisku 31 mg (34,6 μιηοΙ, 74% výtěžek) žluté pevné látky PDB-C8-14.
'H NMR (400 MHz, acetonitril-d3): 2,45 (s, 6H), 3,05-3,12 (m, 1H), 3,42-3,49 (m, 2H), 4,624,70 (m, 1H), 4,80-4,85 (m, 2H), 6,94 (d, J= 16,21 Hz, 2H), 7,17-7,20 (m, 2H), 7,60 (d, J = 16,21 Hz, 2H), 7,68-7,72 (m, 4H), 7,84 (dd, J, = 1,34 Hz, Λ = 6,46 Hz, 2H), 8,20 (dd, J, = 1,26 Hz, J2 = 8,03 Hz, 2H), 8,3 1-8,32 (m, 2H), 8,54 (d, J= 6,79 Hz, 2H).
Příklad 17 (rac)-2,4,15,17-tetraki s((£)-2- (1 H-indol-2-y 1)-6,7,8,11,12,13-hexahydro-dipyrido[ 1,2a;l',2'-a']benzo[2,l-c:3,4-c']bisazepindiium trifluormethansulfonát, tj. PRC-C9-11
Výchozí racemický helquat Q (10,0 mg, 14,9 μιηοΙ), l//-indol-2-karbaldehyd (138 mg, 957 μιηοΙ), pyrrolidin (39 ml, 478 μιηοΙ) a suchý methanol (0,5 ml) byly dány do 10 ml baňky a výsledná směs míchána pod argonem 1 h za laboratorní teploty. Postup reakce byl monitorován tenkovrstvou chromatografií. Surový produkt byl vysrážen z reakční směsi přidáním diethyletheru (5 ml). Suspenze byla odstředěna a supernatant oddělen od pevného podílu. Pevný podíl byl rozpuštěn v methanolu (0,5 ml) a čistý produkt vysrážen přidáním diethyletheru (5 ml). Stejná procedura byla zopakována s tetrahydrofuranem (0,5 ml) - diethyletherem (5 ml) a acetonitrilem (0,3 ml) - diethyletherem (5 ml). Odstředění této suspenze, odstranění supematantu a vysušení pevného produktu na vakuu olejové pumpy vedlo k získání 12,9 mg (10,9 pmol, 73% výtěžek) tmavě fialové pevné látky PRC-C9-11.
-22 CZ 307163 B6
'H NMR (400 MHz, dimethysulfoxid-d6): 2,31-2,35 (m, IH), 2,52-2,53 (m, IH), 2,67-2,78 (m, IH), 3,11-3,13 (m, IH), 4.55 (m, IH), 5,00-5,03 (m, IH), 6,61 (s, IH), 6,76 (d,J= 1,04 Hz, IH), 6,866 (s, IH), 6,97-7,04 (m, IH), 7,08-7,12 (m, IH), 7,146 (dd, J= 1,28, 8,32 Hz, IH), 7,157,19 (m, IH), 7,29-7,34 (m, 2H), 7,47 (d, J = 7,92 Hz, IH), 7,53 (dd, J = 1,0, 8,96 Hz, IH), 7,59-7,70 (m, 2H), 7,75 (d, J = 16.92 Hz, 1H). 7,82 (d, J = 9,72 Hz, 1H), 8,18 (d, J = 15,52 Hz, IH), 8,58 (d,J= 1,84 Hz, IH), 11,61 (s, lHfor-NH), 11,90 (s, lHfor-NH).
Příklad 18 (rac)-2,4,13,15-tetrakis((E)-2-(thiofen-3-yl)vinyl)-6,7,8,11,12,13-hexahydro-dipyrido[ 1,2a;r,2'-a']benzo[2,l-c:3,4-c']bisazepindiium trifluormethansulfonát, tj. PRC-C5-9
Výchozí racemický helquat Q (10,0 mg, 14,9 μιηοΙ), thiofen-3-karbaldehyd (107 mg, 957 μιηοΙ), pyrrolidin (39 ml, 478 μιτιοί) a suchý methanol (0,5 ml) byly dány do lOml baňky a výsledná směs byla míchána pod argonem 5 min za laboratorní teploty. Postup reakce byl monitorován tenkovrstvou chromatografií. Surový produkt byl vysrážen z reakční směsi přidáním diethyletheru (5 ml). Suspenze byla odstředěna a supematant oddělen od pevného podílu. Pevný podíl byl rozpuštěn v methanolu (0,5 ml) a čistý produkt vysrážen přidáním diethyletheru (5 ml). Stejná procedura byla zopakována s tetrahydrofuranem (0,5 ml) - diethyletherem (5 ml) a acetonitrilem (0,3 ml) - diethyletherem (5 ml). Odstředění této suspenze, odstranění supernatantu a vysušení pevného produktu na vakuu olejové pumpy poskytlo 13,1 mg (12,5 μιτιοί, 84% výtěžek) žluté pevné látky PRC-C5-9.
'H NMR (400 MHz, acetonitril-d3): 2,32-3.38 (m, IH). 2.45-2,54 (m, IH), 2,67-2,72 (m, IH), 3,01-3,06 (dd, J= 6,44. 14,04 Hz, IH), 4,24-4,32 (td, J = 5,32, 14,04 Hz, IH), 5,013 (dd, J =
-23 CZ 307163 B6
5,72, 14,68 Hz, 1H), 6,97 (d, J= 16,28 Hz, 1H), 6,98 (d, J = 1,96 Hz, 1H), 7,316 (d, J = 15,8 Hz,
H),7,37 (dd, J= 1,28,5,16 Hz, 1H), 7,48 (dd, J= 2,80, 5,08, IH), 7,60 (dd, J= 2,88, 5,16 Hz,
IH), 7,65-7,71 (m. 4H), 7,83 (d, .7 = 15,76 Hz, 1H),7,88 (dd, J = 1,24, 2,88 Hz, 1H), 8,24 (d, J =
2,04, 1H).
Příklad 19 (rac)-2,4-bis((7T)-2-(l-methyl-l//-pyrrol-2-yl)vinyl)-6,7,10,l l-tetrahydro-dipyrido[2,la: 1 ',2'—k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. HTA-C6^l
Výchozí racemický helquat O (10,0 mg, 16,3 pmol), 1 -methyl-I Tf-pyrrol-2-karbaldehyd (57 mg, 522 pmol), pyrrolidin (22 ml, 261 pmol) a suchý methanol (0,5 ml) byly dány do lOml baňky a výsledná směs byla míchána pod argonem 1 h za laboratorní teploty. Postup reakce byl monitorován tenkovrstvou chromatografií. Surový produkt byl vysrážen z reakční směsi přidáním diethyletheru (5 ml). Suspenze byla odstředěna a supernatant oddělen od pevného podílu. Pevný podíl byl rozpuštěn v methanolu (0,5 ml) a čistý produkt vysrážen přidáním diethyletheru (5 ml). Stejná procedura byla zopakována s tetrahydrofuranem (0,5 ml) - diethyletherem (5 ml) a acetonitrilem (0,3 ml) - diethyletherem (5 ml). Odstředění této suspenze, odstranění supernatantu a vysušení pevného produktu na vakuu olejové pumpy poskytlo 10,1 mg (12,7 pmol, 78% výtěžek) oranžové pevné látky HTA-C6-4.
'H NMR (400 MHz, acetonitril-d3): 3,08-3,33 (m, 4H), 3,68 (s, 3H), 3,84 (s, 3H), 4.22-4.26 (m, 1H), 4,89^,90 (m, 2H), 5,02-5,05 (m, 1H), 6,17-6,19 (m, 1H), 6,26-6,28 (m, 1H), 6,73 (d, J = 16,4 Hz, 1H) 6,71 (t, 1.6 Hz, 1H), 6,91 (t, J = 2,04 Hz, 1H), 6,98-7,00 (m, 2H), 7,13 (d, J = 15,56 Hz, 1H), 7,37 (d, .7= 15,96 Hz, IH), 7,44 (d, J= 1,96, 1H), 7,16-7,71 (m, 3H), 7,85 (td, J = 1,44, 2,96, 7,64 Hz, 1H), 7,99 (dd, J = 1,4, 8,48 Hz, 1H), 8,08 (d, .7 = 1,96 Hz, 1H), 8,15 (td, J = 1,48, 1,92, 8,48, IH), 8,78 (dd, J= 1,36, 5,68/7,16 Hz, IH).
Příklad 20 (rac)-2,4-bis((E)-2-(4-methyl-l/7-imidazol-5-yl)vinyl)-6,7,10,l l-tetrahydro-dipyrido[2,la:l',2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. HTA-C5-11
Výchozí racemický helquat O (10,0 mg, 16,3 μιηοΙ), l-methyl-177-pyrrol-2-karbaldehyd (57 mg, 522 pmol), pyrrolidin (22 ml, 261 pmol) a suchý methanol (0,5 ml) byly dány do lOml baňky a výsledná směs byla míchána pod argonem 1 h za laboratorní teploty. Postup reakce byl monitorován tenkovrstvou chromatografií. Surový produkt byl vysrážen z reakční směsi přidáním diethyletheru (5 ml). Suspenze byla odstředěna a supernatant oddělen od pevného podílu. Pevný podíl byl rozpuštěn v methanolu (0,5 ml) a čistý produkt vysrážen přidáním diethyletheru (5 ml). Stejná procedura byla zopakována s tetrahydrofuranem (0,5 ml) - diethyletherem (5 ml) a acetonitrilem (0,3 ml) - diethyletherem (5 ml). Odstředění této suspenze, odstranění supernatantu a vy-24 CZ 307163 B6 sušení pevného produktu na vakuu olejové pumpy poskytlo 10,1 mg (12,7 pmol, 78% výtěžek) tmavě žluté pevné látky HTA-C5-11.
'H NMR (400 MHz, acetonitril-d,): 2,32 (s, 3H), 2,46 (s, 3H), 3,12-3,43 (m, 4H), 4,27-4,31 (m, 1H), 4,80-4.88 (m, 2H), 5,05 (m, 1H). 7,01 (d, J= 16,04 Hz, 1H), 7,44-7,52 (m, 4H), 7,62-7,76 (m, 4H), 7,83-7,96 (m, 2H), 8,13-8,17 (m, 1H), 8,026 (d, J= 1,96 Hz, 1H), 8,77 (dd, J= 2,12, 6,32 Hz, 1H), 10,38 (broad s, 2H for-NH).
Příklad 21
2,4,13,15-tetrakis((£)-2-(1 - methyl- \H- indol- 3-yl)vinyl)-6,7,10,1 l-tetrahydrodipyrido[2,la:r,2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, tj. TKA-C10-13
Výchozí helquat P (10 mg, 15,6 pmol), l-methyl-l//-indol-3-karbaldehyd (149,1 mg, 936,6 pmol), pyrrolidin (41 μΙ, 499,5 pmol) a suchý methanol (0,5 ml) byly umístěny do vialky se šroubovacím uzávěrem o objemu 10 ml a směs byla míchána pod argonem po dobu 45 min za teploty místnosti. Postup reakce byl sledován pomocí tenkovrstvé chromatografie. Surový produkt byl vysrážen z reakční směsi přidáním diethyletheru (5 ml). Suspenze byla odstředěna a kapalný podíl oddělen od pevné látky. Pevný podíl byl rozpuštěn v tetrahydrofuranu (0,3 ml) a produkt vysrážen přidáním diethyletheru (5 ml). Následovalo odstředění této suspenze a odstranění kapalného podílu. Tato procedura byla opakována ještě třikrát za použití methanolu (0,5 ml) místo tetrahydrofuranu a poté ještě dvakrát jenom s diethyletherem (5 ml). Následovalo vysušení pevného produktu pod vakuem za použití olejové pumpy. Takto bylo získáno 12,3 mg (10,2 μιηοΐ, 65% výtěžek) temně červené pevné látky TKA—C 1 0—13.
-25 CZ 307163 B6 ‘H NMR (400 MHz, dimethylsulfoxid-d6): 3,23-3,41 (m, 4H), 3,72 (s, 6H), 3,97 (s, 6H), 4,54 (t,
J= 12,4; 12,4 Hz, 2H), 5,24 (d, J= 11,1 Hz, 2H), 6,93 (dd, J= 15,1; 0,1 Hz, 2H), 6,95 (d, J =
16,2 Hz, 2H), 7,13 (ddd, 8,2; 7,2; 1.1 Hz, 2H), 7,33-7,42 (m, 4H), 7,45 (d, J= 8,4 Hz, 2H),
7,53 (d, J= 16,7 Hz, 2H), 7,65-7,70 (m, 6H), 7,77-7,79 (m, 4H), 8,07 (d, J= 1,8 Hz, 2H), 8,198,23 (m, 6H), 8,30 (d, J= 1,9 Hz, 2H).
Metody biologické charakterizace látek
Kvantifikace míry interakce helquatů s G-kvadruplexy v modelových oligonukleotidech pomocí metody FRET
Pro zjištění míry in vitro interakce helquatů s G-kvadruplexem byly použity oligonukleotidy obsahující na guanin bohaté sekvence lidské teíomery (F21T) a NHE IIIi oblasti promotoru onkogenu c-myc (Fmyc27T). Oba oligonukleotidy schopné tvorby intramolekulárního G-kvadruplexu byly na koncích značené vhodnými fluorofory tak, aby vznikl donor-akceptorový FRET pár (5FAM a 3-TAMRA). Pokud je oligonukleotid sbalen do struktury G-kvadruplexu, donor se nachází v blízkosti akceptoru a dochází k nezářivému přenosu energie na akceptor. S rostoucí teplotou reakční směsi dochází k postupné denaturaci struktury G-kvadruplexu a tím i vzdalování donoru a akceptoru (FAM-TAMRA). Dochází tak k růstu fluorescence donoru (FAM) a poklesu fluorescence akceptoru (TAMRA). Výsledkem měření je křivka intenzity fluorescence donoru v závislosti na teplotě. Pokud je G-kvadruplex stabilizován ligandem, dojde ke zvýšení teploty tání. Teplota tání G-kvadruplexu odpovídá teplotě, kdy je denaturováno 50% původního množství sbaleného G-kvadruplexu. Výsledkem měření je stanovení rozdílu teplot tání (A7jn) samotného G-kvadruplexu a G-kvadruplexu stabilizovaného ligandem. Experimenty byly prováděny v 10 mmol 1 kakodylátovém pufru (pH=7,2) s 5 mmol”1 K.C1 a 95 mmol.F1 LiCI v případě oligonukleotidu Fmyc27T a v 10 mmol 1 kakodylátovém pufru (pH=7,2) s 25 mmol.F1 KCI a 75 mmol.Γ1 LiCI v případě oligonukleotidu F21T. Oba oligonukleotidy byly denaturovány 5 minut při 95 °C a následně ponechány ve vypnutém termobloku až do vychladnutí na teplotu místnosti (3 hodiny). Finální koncentrace oligonukleotidu v reakční směsi byla 0,2 μιηοΙ.Γ1. Testované helquaty byly přítomny v koncentraci 1 pmol.lCelkový objem reakční směsi byl 30 μΙ. Teplota tání samotných oligonukleotidů (bez přítomnosti helquatů) byl za těchto podmínek 58,1 ± 0,2 °C pro F21T a 64,7 ± 0,4 °C pro Fmyc27T. Pro stanovení selektivity vazby helquatů na G-kvadruplex ve srovnání s dvouvláknovou DNA se do reakce přidával 50násobný nadbytek dvouvláknové DNA (10 mmol.Γ 1 neznačený kompetitor ds26 tvořící vlásenku). Po přídavku do reakční směsi soutěží ds26 se značeným oligonukleotidem (Fmyc27T, či F21T) o vazbu ligandu. Pokud je testovaný ligand selektivní vůči G-kvadruplexu nedojde v přítomnosti kompetitoru ds26 k poklesu ATm oproti ATm měřené bez ds26 kompetitoru. Teplota tání samotných oligonukleotidu v přítomnosti kompetitoru je 59,4 ± 0,5 °C pro F21T a 66,3 ± 0,6 °C pro Fmyc27T.
Fluorescence donoru FAM byla měřena pomocí real-time PCR přístroje Opticon 2 (excitace 470 až 505 nm a emise 523 až 543 nm) v teplotních krocích 0,5 a v rozmezí 25 až 95 °C. Vyhodnocení sigmoidních křivek intenzity fluorescence v závislosti na teplotě bylo provedeno v programu GraphPad Prism 5 (GraphPad Software, lne., USA). Pomocí nelineární pěti parametrické regrese byl vypočítán inflexní bod křivky, který odpovídá teplotě tání (Tm) G-kvadruplexu za daných podmínek. Uvedené hodnoty byly získány z nejméně tří nezávislých měření.
ds26: 5 '-CAATCGGATCGAATTCGATCCGATTG-3'
F2IT: 5'- FAM-GGGTTAGGGTTAGGGTTAGGG-TAMRA-3'
Fmyc27T: 5-FAM TGGGGAGGGTGGGGAGGGTGGGGAAGG-T AMRA-3'
-26CZ 307163 B6
Tabulka 1: Změna teploty tání G-kvadruplexu oligonukleotidu Fmyc27T v přítomnosti různých ligandů; hodnoty určeny metodou FRET
označení látky ATm(°C) Fmyc27T SD Fmyc27T ATm(° C) Fmyc27T/ds26 (° C) SD Fmyc27T/ds26
LSA-C9-30 10,5 0,4 8,2 0,4
LSA-C9-32 10,4 0,5 8,1 0,2
MJA-C13-8 11,0 1,1 4,9 1,2
MJB-C8-27 9,7 1,0 10,0 1,3
MSB-C13-8 12,6 0,2 7,7 0,9
PDA-C10-11 14,9 0,4 13,9 0,7
PDA-C10-13 13,8 0,9 13,6 1,1
PDA-C15-8 18,8 1,3 19,9 0,4
PDA-C8-27 11,8 0,6 9,6 0,3
PDA-C9-30 14,6 0,8 16,0 1,1
PDB-C10-11 14,2 0,9 13,1 1,1
PDB-C15-8 15,7 1,5 14,5 1,3
PDB-C8-14 11,5 0,7 9,3 0,7
PRA-C12-5 11,3 0,2 8,6 0,5
Tabulka 2: Změna teploty tání G-kvadruplexu oligonukleotidu F21T v přítomnosti různých ligandů; hodnoty určeny metodou FRET
označení látky A7m (°C) F21T SD F21T ATm(°C) F21T/ds26 SD F21T/ds26
PDA-C10-11 12,9 0,2 12,3 0,4
PDA-C10-13 9,7 1,2 9,1 0,3
PDA-C15-8 17,2 1,2 17,3 1,0
PDA-C9-30 12,3 2,0 13,1 2,0
PDB-C10-11 13,0 0,8 10,7 1,0
PDB-C15-8 11,3 1,2 11,1 1,2
PDB-C8-14 8,4 1,0 5,0 0,1
LSA-C9-30 8,6 0,4 5,5 0,9
LSA-C9-32 9,3 0,1 6,6 0,2
MJA-C13-8 7,4 0,1 1,4 1,0
MJB-C8-27 8,0 0,8 5,2 0,8
MSB-C13-8 9,0 0,3 3,4 0,3
PDA-C8-27 9,3 0,5 7,0 0,6
PRA-C12-5 8,8 0,3 5,4 0,7
Hodnoty teplot tání c-myc promotorového (Fmyc27T) a telomerického (F21T) G-kvadruplexu (tab. 1 a tab. 2) ukazují na nečekaně významnou schopnost testovaných látek stabilizovat tyto
-27 CZ 307163 B6 struktury. Zároveň helquaty mají výrazně vyšší selektivitu vůči G-kvadruplexům ve srovnání s dvouvláknovou DNA než pozitivní kontrola TMPyP4.
Kvantifikace míry interakce helquatů s G-kvadruplexem v modelových oligonukleotidech pomo5 cí metody ECD
Spektrometr ECD
Spektra ECD byla měřena na spektrometru J-815 (Jasco, Japan). Nastavení parametrů měření 10 (tab. 3), ukládání spekter a odečítání pozadí bylo prováděno v programu Spectra Manager (Jasco, Japan).
Tabulka 3: Nastavení parametrů pro měření spekter ECD a křivky tání měřené pro zvolenou 15 vlnovou délku
Parametr Nastavení
spektrum křivka tání
počátek 800 nm 25 °C
konec 210 nm 95 °C
šířka pásu 1 nm 1 nm
odpověď 1 s 1 s
citlivost standard standard
přírůstek 1 nm 1 °C
rychlost skenu 200 nm min-1 -
akumulace 5 -
monitorovaná vlnová délka - 263 nm
nárůst teploty - 1 “C.min“1
Pro měření teplotních závislostí byly kyvety v kyvetovém prostoru umístěny do Peltierova nástavce, teplota byla řízena programem Spectra Manager. Křivky tání byly měřeny při vlnové délce, která odpovídala maximálnímu rozdílu intenzity signálu ECD spektra oligonukleotidu při teplotě 25 a 95 °C, jak je ukázáno na obr. 1. Před i po měření křivek tání byla změřena spektra ECD v krajních teplotách, aby byla ověřena stabilita studovaného systému.
Zpracování ECD spekter
Zpracování spekter bylo provedeno pomocí programu Spectra Manager (Jasco, Japonsko). Výsledná spektra byla získána tak, že od naměřeného spektra vzorku bylo odečteno spektrum 30 pozadí, kterým bylo spektrum rozpouštědla. Měření spektra vzorku a pozadí probíhala za identických podmínek. Spektra ECD jsou uváděna jako elipticita, značená v obrázcích CD [mdeg], jejíž číselná hodnota souvisí s bezrozměrným cirkulárním dichroismem AA (CDV = 32980 AAV). Toto značení CD zachovává zvyklosti mezinárodních časopisů, v nichž jsou publikovány články z oboru.
Roztoky oligonukleotidu
Z oligonukleotidu c-Myc27 byl připraven zásobní roztok o koncentraci 100 μιηοΙ.Γ1 rozpuštěním v EEO. Kyveta o tloušťce 1 mm byla plněna 7 μΙ roztoku oligonukleotidu a 133 μΐ Li+-kakodylá40 tovém pufru. Roztok oligonukleotidu byl v kyvetě převrstven minerálním olejem, aby se při
-28CZ 307163 B6 měření teplotních závislostí omezily koncentrační změny způsobené odpařováním rozpouštědla při vyšších teplotách.
c-Myc27: 5 '-TGGGGAGGGTGGGGAGGGTGGGGAAGG-3'
Roztoky ligandu
Ze zásobních roztoků racemických směsí ligandu v DMSO o koncentraci 10 mmol Γ1 byly připraveny roztoky o koncentraci 140 pmol Γ1 rozpuštěním v H2O. Ligandy byly přidávány do roztoku oligonukleotidu pod rozhraní pufr/minerální olej mikrostříkačkou Hamilton (5 pl roztoku o koncentraci 140 pmol Γ1). Výsledný molární poměr oligonukleotid ligand byl 1:1.
Postup měření
Kyveta naplněná roztokem oligonukleotidu c-Myc27 v Li -kakodylátovém pufru (cc..Myc27 = 5 pmol Γ’) byla nejprve ohřátá 5 minut na 95 °C, při této teplotě bylo změřeno spektrum ECD. Poté byl vzorek ochlazen na 25 °C, ponechán 10 min ke stabilizaci a poté bylo opět změřeno spektrum ECD. Poté byla změřena křivka tání ECD oligonukleotidu při 263 nm v rozmezí teplot 25 až 95 °C a pro ověření stability vzorku byla opět změřena spektra při 95 a 25 °C. Pod olejovou vrstvu byl k roztoku oligonukleotidu přidán roztok ligandu (cilgai,d = 5 pmol Γ1), vzorek byl důkladně promíchán a bylo změřeno spektrum ECD při 25 °C, křivka tání a opět kontrolní spektra při 95 a 25 °C.
Výsledky
Na obr. I jsou spektra ECD oligonukleotidu c-Myc27 v Li*-kakodylátovém pufru (cc Mvc27 = 5 pmol 1 ') při teplotách 25 a 95 °C. Při teplotě 25 °C byly pozorovány pásy u 210(+), 240(-) a 263(+). Tento spektrální průběh odpovídá paralelní konformaci G-kvadruplexu [Vorlickova M. a spol. (2012) Methods, 57, 64; Sun, D. a spol. (2010) Methods in moleculctr biology, 608, 65; Yang D. a spol. (2010) Future Med. Chem., 2, 619], Na základě podobnosti spekter ECD by se nabízelo, že i při teplotě 95 °C roztok obsahuje strukturu paralelně uspořádaného G-kvadruplexu. Po změření křivky tání (sigmoidální průběh, obr. 2) však bylo evidentní, že s rostoucí teplotou došlo k rozložení G-kvadruplexu. Zachování tvaru signálu ECD, zejména přítomnost pásu u 263 nm odpovídá interakci sousedních bází v řetězci oligonukleotidu [Kypr J. a spol. (2002) Biopolymers, 67, 275; Kypr J. a spol. (2007) Biopolymers, 87, 218; Kejnovska 1. a spol. (2007) Biopolymers, 85, 19],
Interakce G-kvadruplex/ligand: teplotní experiment
Rozklad struktury G-kvadruplexu v přítomnosti ligandu vlivem teploty byl sledován při vlnové délce, která odpovídala maximálnímu rozdílu intenzit signálů ECD systému oligonukleotid/ligand při teplotách 25 a 95 °C, tj. při 263 nm. Teplotní stabilita G-kvadruplexu byla sledována v rozmezí 25 až 95 °C, a to v molárním poměru oligonukleotid ligand =1:1. Příklad vlivu studovaného ligandu na stabilitu G-kvadruplexu tvořeného oligonukleotidem c-Myc27 je znázorněn na obr. 2. Tento obrázek ukazuje zvýšení teploty tání G-kvadruplexu v přítomnosti ligandu PDB-C10-11.
Za míru stabilizace G-kvadruplexu byla zvolena změna teploty tání G-kvadruplexu způsobená přítomností ligandu (ATm):
XTm Tm.oligimukleoliíl ligimil'TiH.oliffmiklwiiil (1),
-29CZ 307163 B6 kde r!Kímíi)& teplota tání molekulárního systému tvořeného oligonukleotidem a ligandem a je teplota tání samotného oligonukleotidu. V tab. 4 jsou shrnuty změny teploty tání G-kvadruplexu oligonukleotidu c-Myc27 v přítomnosti studovaných ligandu.
Tabulka 4: Změna teploty tání G-kvadruplexu oligonukleotidu c-Myc27 v přítomnosti různých ligandu; hodnoty určeny metodou ECD
označení látky ATm (°C)
MJA-C13-8 6,8
PDB-C10-11 9,8
PDB-C8-14 5,0
PDA-C15-8 10,1
LSA-C9-30 6,4
PDA-C10-11 8,2
Výsledky této části studie ukazují, že helquaty způsobují překvapivě vysokou míru stabilizace Gkvadruplexu. Tyto výsledky také dokumentují citlivost spektroskopie ECD k sekundárním strukturám oligonukleotidu a ukazují, že pomocí měření křivek tání ECD lze charakterizovat stabilizační schopnosti ligandu vůči struktuře G-kvadruplexu.
Stabilizace G-kvadruplexu promotorové oblasti c-myc genu
K stanovení míry stabilizace G-kvadruplexu v promotorové oblasti c-myc genu na buněčné úrovni byla využita duální luciferázová analýza. Stabilizace G-kvadruplexu je vyjádřená poměrem exprese dvou luciferáz (firefly a Renilla) z kotransfekovaných vektorů pGL4.10-myc (Iuc2) a pRL-TK (Remlla) do buněčné linie HGC-27 exprimující c-myc protein. Exprese reportérového genu (firefly luciferázy) z pGL4.10-myc vektoru je řízena c-myc regulační oblastí o délce 860 bp (v rozsahu od -306 do +554). Tato vložená sekvence obsahuje NHE III| segment, který tvoří G-kvadruplex [Yang D. a spol. (2010), Future Med Chem., 2, 619] a je zodpovědný až za 90% transkripční aktivity c-myc genu.
Míra exprese firefly luciferázy, reportérového genu, tak odpovídá aktivitě promotoru c-myc a tím i míře stabilizace G-kvadruplexu. Signál je normalizován na expresi Renilla luciferázy z pRLTK vektoru, která je pod kontrolou konstitutivního virového thymidin kinázového (HSV-TK) promotoru. Míra exprese Renilla luciferázy slouží jako vnitřní kontrola pro normalizaci firefly signálu na účinnost transfekce v měřeném vzorku.
Plasmidy pGL4.10-myc (luc2) a pRL-TK byly namnoženy v bakterii Escherichia coli (kmen DH5a) a purifikovány pomocí Qiagen Plasmid Mini a Midi kitu. Buňky byly kultivovány za standardních podmínek a v exponenciální fázi růstu byly vysazeny do bílých 96-jamkových mikrotitračních destiček. Transfekce byla provedena pomocí transfekčního činidla X-tremeGENE HP DNA v médiu OptiMEM po dobu dvou hodin. Poměr reportérového a kontrolního vektoru byl 1:1a transfekčního činidla k celkovému množství DNA byl 1:1.2 hodiny po transfekci byly přidány helquaty v koncentraci 50 pmol.l '. Množství firefly a Renilla luciferázy v jednotlivých vzorcích bylo stanoveno 24 hodin po transfekci. Duální luciferázová analýza byla prováděna pomocí komerčně dostupného kitu (Promega, kat. č. EI960) podle instrukcí od výrobce. Luminiscence byla měřena pomocí luminometru EnSpire Alpha Plate Reader. Získaná data byla normalizována na signál Renilla luciferázy a poté byly hodnoty vztaženy ke kontrole. Výsledky stabilizace G-kvadruplexu a inhibice exprese firefly luciferázy jsou shrnuty v tabulce 5. Tabulka 6 uvádí koncentrační závislosti pro dva vybrané helquaty (MJA-C13-8 a VDJAC13-6).
-30CZ 307163 B6
Tabulka 5: Výsledky inhibiční studie exprese luciferázy v luciferázové duální analýze s plasmidem pGL4.10-myc (luc2) při koncentraci helquatů 50 μνηοΙ.Ι 1 vztažené ke kontrole (kontrola =
100%)
označení látky 50 junoU·1 [%]
VDJA-C13-6 27
VDJA-C13-8 76
LSA-C13-8 58
MJA-C9-30 55
MSC-C10-11 74
MSC-C9-30 68
MJA-C13-8 56
MJB-C5-9 75
MSC-C9-10 56
MJB-C5-3 65
LSA-C9-32 74
HTA-C5-9 85
MJA-C8-28 72
MSC-C 15-8 76
MJB-C8-27 88
MSC-C13-16 85
MSC-C 10-10 85
PRA-C12-5 86
PDA-C8-27 77
Tabulka 6: Koncentrační závislosti inhibice exprese luciferázy v luciferázové duální analýze s plasmidem pGL4.10-myc (11102) pro helquaty MJA-C13-8 a VDJA-C13-6 vztažené ke kontrole (kontrola = 100%)
označení látky Koncentrace μιηοΙ.Γ1 % exprese vzhledem ke kontrole
MJA-C13-8 10 79,3 ± 6,7
50 69,8 ± 6,0
150 57,9 ±2,5
VDJA-C13-6 10 59,0 ±17,9
50 27,1 ±0,8
150 15,3 ±2,9
Imunodetekce proteinu c-myc
Stanovení změny exprese proteinu (transkripčního faktoru) c—myc v buněčných lyzátech připravených z nádorové buněčné linie HGC-27 po ovlivnění testovanými helquaty (tab. 7) bylo provedeno imunodetekcí po separaci proteinů dle jejich velikosti pomocí gelové elektroforézy (SDS-PAGE) a jejich přenosu na membránu.
-31 CZ 307163 B6
Pro zjištění vlivu helquatů na expresi c-myc proteinu byly buňky kultivovány za standardních podmínek a v exponenciální fázi růstu byly vysazeny do kultivačních lahví v hustotě 25 000 buněk/cm2. Další den byly přidány vybrané helquaty o koncentraci 50 pmol.!1. Po 24 hodinové inkubaci byly získány buněčné pelety a po přidání RIPA pufru s inhibitory proteáz (PrIC) a fosfatáz (PhIC) (složení viz tab. 8) byly připraveny buněčné lyzáty. Na 107 buněk bylo použito 150 pl RIPA pufru. Koncentrace proteinů v lyzátech byla změřena pomocí BCA metody. Separace proteinů v lyzátech proběhla na 12% denaturačním polyakrylamidovém gelu. Rozdělené proteiny byly přeneseny na PVDF membránu metodou Western blot. Inkubace s primární monoklonální myší protilátkou proti proteinu c-myc (ředění 1:1000 v SignalBoost činidle) probíhala přes noc při 4 °C, a poté s primární myší protilátkou proti β-aktinu (ředění 1:5000 v 5% mléce v TBS-T pufru) při laboratorní teplotě 2 hodiny. Následně byla použita sekundární koňská monoklonální protilátka konjugovaná s křenovou peroxidázou (ředěna 1:2000 v 5% mléce v TBS-T pufru) vázající se na myší protilátky typu IgG. Proteiny c-myc a β-aktin navázané na membráně byly vizualizovány pomocí detekčního kitu (SuperSignaí*West Femto Maximum Sensitivity Substráte, kat.č. 34095, Thermo Fisher Scientifíc, lne., USA) snímáním chemiluminiscence v detekčním sytému ImageQuant LAS 4000 Mini (kat.č. 28-9558-13, GE Healthcare Life Sciences, USA). Množství proteinu bylo kvantifikováno denzitometricky v programu Quantity One. Množství c-myc v jednotlivých vzorcích bylo normalizováno k P-aktinu a následně vztaženo ke kontrolnímu vzorku.
Tabulka 7: Testované helquaty; výsledky inhibice exprese proteinu c-myc vůči kontrole (kontrola = 100 %) při celkové koncentraci 50 pmol.Γ 1
označení látky 50 pmol.r1 [%]
MSC-C9-30 14
LSA-C13-8 15
MJB-C5-11 23
MJA-C8-28 23
LSA-C9-16 28
MJB-C5-9 30
MSC-C9-18 31
HTA-C9-16 32
PRC-C5-9 34
MSC-C9-16 36
HTA-C9-17 44
MJA-C 13-8 58
MSC-C15-8 58
MJA-C11-25 66
PRC-C10-10 71
HTA-C10-10 75
VDJA-C13-8 77
PDA-C5-11 80
MJA-C 19-4 81
PDB-C13-8 83
MSC-C10-36 85
-32 CZ 307163 B6
Tabulka 8: Složení lyzačního pufru
RIPA pufr:
mmol.r1 TRIS-HC1
1% Nonidet-40
150 mmol.r1 NaCl
0,5% deoxycholát sodný
0,1% SDS inhibitor proteázy a fosfatázy:
PrIC 2,5 μ1/100 μΐ RIPA pufru
PhIC 1 μΐ/ΐ00 μΐ RIPA pufru
Stanovení viability pomocí XTT testu
Vliv testovaných látek na viabilitu (proliferaci) použitých buněčných linií byl zkoumán v koncentracích 0 až 100 mmol.r
Charakterizace použitých buněčných linií
Pro zhodnocení antiproliferačních účinků testovaných látek in vitro byla použita nádorová buněčná linie CCRF-CEM odvozená od akutní lymfoblastické leukémie a normální (zdravá) buněčná linie HUVEC endoteliálních buněk z umbilikální vény. Obě uvedené buněčné linie byly kultivovány za podmínek optimálních pro jejich růst v příslušném médiu v plastových lahvích nebo plastových Petriho miskách o různé velikosti (TPP, BD Biosciences) při 37 °C, 5% CO2 a 95% vzdušné vlhkosti. Buňky HUVEC byly získány od BD Biosciences. CCRF-CEM buněčná linie byla získána z ATCC/LGC Standards (Američan Type Cell Collection).
CCRF-CEM (kat. č. ATCC CCL-119)
Suspenzní buněčná linie CCRF-CEM je permanentní in vitro kultura akutní lymfoblastické leukémie. Linie CCRF-CEM byla kultivována v RPMI 1640 médiu (Sigtna-Aldrich. kat. č. R8758) s přídavkem 2 mmol.!1 glutaminu (Invitrogen, kat. č. 35050-038), 10% fetálního hovězího séra (FBS, Sigma-Aldrich, kat. č. F9665), 100 IU/ml penicilinu, 100 pg/ml streptomycinu (SigmaAldrich, kat. č. P0781). Pasážování probíhalo 2 až 3x týdně. Doba zdvojení populace CCRFCEM za použitých kultivačních podmínek je 20 hodin.
HUVEC (BD Biosciences, kat. č. 354151)
Normální lidské endoteliální buňky z umbi I ikální vény jsou adherentní buňky, které byly kultivované v plastových Petriho miskách potažených kolagenem I. Do kultivačního média (E-STIM™; BD Biosciences, kat. č. 355054) již obsahujícího 2% FBS (fetální bovinní sérum), hydrokortizon a heparin byl dále přidán epidermální růstový faktor (EGF, 5 mg) a směs faktorů podporujících růst endoteliálních buněk (ECGS, 100 mg). Použité kultivační médium neobsahovalo antibiotika. Buňky byly pasážovány po dosažení 90% monovrstvy uvolněním inkubací s 0,25% roztokem trypsinu s EDTA (1 ml: 3 min; 37 °C). Poté bylo přidáno 5 ml kompletního kultivačního média E-STIM™ a buňky byly odstředěny (180 x g, 7 min), resuspendovány a přeneseny v požadovaném množství do nové Petriho misky s čerstvým médiem. V experimentech byly používány buňky mezi pasážemi 3 a 8 po rozmražení. Doba zdvojení populace HUVEC za použitých kultivačních podmínek je 38 hodin.
- jj CZ 307163 B6
Zhodnocení viability nádorových a normálních buněk po působení různých koncentrací testovaných látek
Při testování citlivosti buněčných linii na studované helquaty byl použit XTT cytotoxicitní/proliferační test pro stanovení buněčné viability. Tato metoda je založena na schopnosti metabolicky aktivních buněk redukovat žlutou tetrazoliovou sůl XTT na oranžový formazan. Míra této přeměny je měřena jako nárůst absorbance při 492 nm a je úměrná enzymatické aktivitě mitochondriálních dehydrogenáz a tedy i počtu metabolicky aktivních (viabilních) buněk. Výstupem je hodnota 1C50, která odpovídá koncentraci testované látky, působící pokles počtu viabilních buněk na polovinu (tj. 50% zpomalení dělení buněk) vzhledem ke kontrolní, neovlivněné populaci. Odráží tedy účinnost testované látky vzhledem k dané buněčné linii.
Buňky v exponenciální fázi růstu byly vysety na 96-jamkovou mikrotitrační destičku v koncentraci 3000 buněk na jamku. Každá jamka obsahovala 90 μΙ buněčné suspenze. Následující den bylo přidáno vždy po 10 μΐ 10 x koncentrovaných testovaných látek. Účinek helquatů byl zkoumán v rozsahu koncentrací 1 až 100 μιηοΐ.1 1 (popřípadě 1; 2,5; 5; 7,5; 10; 15; 25; 50 a 100 μιηοΙ.Γ1). Kromě části obsahující uvedenou koncentrační řadu zkoumaných látek byly na destičce vždy přítomny 2 kontrolní sloupce, první s čistým médiem (tzv. blank) a druhý s buňkami v médiu bez testovaných látek (kontrola). Do kontroly i blanku byl přidán objem rozpouštědla (vody) totožný s objemem přidávaných látek. Po 72 hodinách působení látek bylo provedeno stanovení viability dle návodu výrobce. Ve stručnosti: Do každé jamky 96-jamkové mikrotitrační destičky bylo přidáno 50 μΙ připraveného pracovního roztoku XTT (detekčního činidla) a poté byla mikrotitrační destička vrácena do CO2 inkubátoru. Po 2 hodinách byla změřena v každé jamce absorbance při 492 nm (referenční vlnová délka 690 nm) pomocí multifunkčního readeru (Tecan Genios, Rakousko).
Pracovní roztok XTT byl připraven smícháním 5 ml XTT reagens a 100 μΙ roztoku PMS. Příprava obou složek je uvedena níže:
XTT reagens
Roztok XTT byl připraven rozpuštěním 500 mg sodné soli XTT (Sigma-Aldrich, kat. č. X4626) v 500 ml RPMI-1640 média (Sigma-Aldrich, kat. č. R7509) a následném ohřevu 10 min při 60 °C. Z takto připraveného roztoku byly připraveny alikvoty po 5 ml a uchovány při -20 °C. Před použitím byl alikvot rozpouštěn ve vodní lázni o teplotě 37 °C.
Roztok PMS (phenazine methosulfate)
Roztok PMS byl připraven rozpuštěním 0,383 mg PMS (Sigma-Aldrich, kat. č. P9625) v 1 ml fosfátového pufru (PBS). V 100 ml alikvotech byl skladován při -20 °C.
Výsledky stanovení viability nádorových a normálních buněk po působení různých koncentrací testovaných látek jsou shrnuty v tabulce 9. IC50 udává koncentraci testované látky, která způsobila 50% pokles počtu viabilních buněk (inhibici růstu buněk) po 72 hodinách ovlivnění. Každá koncentrace helquatu byla testována v triplikátech v rámci jednoho stanovení hodnoty IC50. Každé z těchto stanovení hodnoty 1C5O bylo opakováno minimálně ve třech nezávislých experimentech. Hodnoty nad 100 μιηοΙ.Γ1 byly získány extrapolací dat naměřených v rozsahu koncentrací 0-100 pmol.!1 daného helquatu.
-34CZ 307163 B6
Tabulka 9
IC50
označení látky CCRF CEM HUVEC
MSC-C13-16 **** > 100
MSC-C9-30 **** > 100
MJA-C13-22 >100
MSC-C9-16 **** > 100
MSC-C9-10 **** >100
MSC-C10-10 *** > 100
MSB-C11-7 *** > 100
MSC-C10-11 *** > 100
VDJA-C13-20 *** >100
LSA-C9-32 *** >100
MJA-C13-8 ** >100
MSB-C13-8 ** > 100
MSC-C10-36 **** *
MSB-C13-16 *** *
MSC-C 10-31 *** *
VDJA-C 13-6 *** *
MSC-C 15-8 *** *
MSC-C9-18 *** *
HTA-C9-16 *** **
HTA-C9-17 ** *
hodnota IC50 leží v rozmezí μιηοΙ. 1 _ 1 $ $ * $ < 10 μιηοΙ.I až 25 μιηοΙ.Γ1 až 50 μιηοΙ.Γ1 > 51 μηιοΙ.Γ1 >100 μιηοΙ.Γ’ >100
Použité buněčné linie, reagencie, programy a přístroje:
Buněčné linie:
CCRF-CEM (kat. č. CCL-119, ATCC/LGS Standards-American Type Cell Collection)
HUVEC (kat. č. 354151, BD Biosciences, USA)
HGC-27 (kat. č. 94042256, Sigma-Aldrich, USA)
Reagencie:
Kultivace buněk
Minimum Essential Medium Eagle (kat.č. M2279, Sigma-Aldrich, USA)
-35 CZ 307163 B6
RPMI-1640 medium (kat. č. R7509, R7638 a R8758, Sigma-Aldrich, USA)
Dulbecco's Phosphate Buffered Salině (kat.č. D8537, Sigma-AIdMCh, USA) Penicillin-Streptomycin (kat.č. P0781, Sigma-Aldrich, USA) fetální hovězí sérum (kat.č. F9665, Sigma-Aldrich, USA)
L-glutamin, roztok (kat.č. G7513, Sigma-Aldrich, USA)
MEM Non-essential Amino Acid Solution (kat. č. M7145, Sigma-Aldrich, USA)
0,25% trypsin-EDTA solution (kat.č. T4049, Sigma-Aldrich, USA) kultivační médium pro HUVEC E-STIM™ (kat. č. 355054, BD Biosciences, USA)
Petriho misky potažené kolagenem I (kat. č. 354450, BD Biosciences, USA)
Transfekce buněk a Luciferázová reportérova analýza
Dual-Luci terase Reportér Assay Systém (kat.č. El960, Promega, USA) pGL4.10 (luc2) Vector (kat.č. E665A, Promega, USA) pRL-TK Vector (kat.č. E2241. Promega, USA)
X-tremeGENE HP DNA transfekční činidlo (kat.č. 06366236001, Roche, Švýcarsko)
Opti-MEMB I Reduced Sérum Medium (kat.č. 31985-062, Life Technologies, USA)
96-ti jamková destička Nunclon Delta Surface MicroWell Plates (kat.č. 136101, Thermo Fisher Scientific, lne., USA)
Qiagen Plasmid Mini Kit (100) (kat.č. 12125, Qiagen, Německo)
Qiagen Plasmid Midi Kit (25) (kat.č. 12143, Qiagen, Německo)
Western Blot
Protease Inhibitor Cocktail - PrIC - (kat.č. P8340, Sigma-Aldrich, USA)
Halt Phosphatase Inhibitor Cocktail - PhIC (kat.č. 78420, Thermo Fisher Scientific, lne., USA) QuantiPro™ BCA Assay Kit (kat.č. QPBCA, Sigma-Aldrich, USA) lmmobilon-P Membráně (kat.č. 1PVH00010, EMD Millipore Corporation, USA) Monoklonální myší anti-MYC protilátka (kat.č. 11—433—C100, EXBIO, Praha)
Anti-mouse IgG, HRP-konjugovaná protilátka (kat.č. 7076, Cell Signaling Technology, lne., USA)
Monoklonální anti-p-Actin protilátka (kat.č. A5441, Sigma-Aldrich, USA)
SuperSigna®West Femto Maximum Sensitivity Substráte (kat.č. 34095, Thermo Fisher Scientific, lne., USA)
Nonfat Dry Milk (kat.č. 9999, Cell Signaling Technology, lne., USA) SignalBoost™Immunoreaction Enhancer Kit (kat.č. 407207, EMD Millipore Corporation, USA)
XTT stanovení
PMS (kat. č. P9625, Sigma-Aldrich, USA)
XTT (kat. č. X4626, Sigma-Aldrich, USA)
Programy:
Microsoft Excel 2010 (Microsoft, USA)
Quantity One software V.4.6.9 (Bio-Rad, USA).
GraphPad Prism 5 V.5.04. (GraphPad Software, USA)
-36CZ 307163 B6
Přístroje:
EnSpire Alpha Plate Reader (kat.č. 2300—001 A, Perkin Elmer. USA)
ImageQuant LAS 4000 mini (kat.č. 28-9558-13, GE Healthcare Life Sciences, USA)
Fastblot B33 (kat.č. 014-100, Biometra, Německo)
Opticon 2 (kat.č. 200232, MJ Research, USA)
Průmyslová využitelnost
Nové helquaty s heteroaromatickými substituenty mohou být využity k přípravě léčiv pro léčbu onemocnění, souvisejících se zvýšenou proliferací buněk a pro stabilizaci G-kvadruplexů. Další oblast jejich možného využití zahrnuje senzibilizační činidla ve fotografii.

Claims (10)

1. Helquaty obecného vzorce 1 kde substituenty R1 a R2 jsou nezávisle na sobě vybrány ze skupiny, zahrnující H a Ci až C4 alkyl, nejvýše tři páry sousedících atomů v polohách 1 a 2, 3 a 4, 1' a 2', 3' a 4' jsou případně přemostěny spojkou S a zároveň jeden až čtyři atomy se sudým deskriptorem (tj. 2, 4, 2', 4') jsou substituovány substituentem R’ obecného vzorce II —CH=CH—R4 (II), přičemž R4 je substituovaný, či nesubstituovaný heteroaryl.
-37CZ 307163 B6
S12, S1',2', S’·4 a S14' je spojka tvořená uhlovodíkovým řetězcem o 3 až 6 atomech uhlíku, s výhodou uhlovodíkovým řetězcem o 4 atomech uhlíku, přičemž struktura jednotlivých spojek S je vzájemně nezávislá, a
T1 a T2jsou spojky, které přemosťují atomy N’sC8a N5' s C8', kde uvedená spojka je tvořena uhlovodíkovým řetězcem o 2 až 5 atomech uhlíku, s výhodou o 2 nebo 3 atomech uhlíku, přičemž struktura jednotlivých spojek Tje vzájemně nezávislá, kde heteroaryl je aromatická karbocyklická skupina obsahující 4 až 26 uhlíkových atomů a alespoň jeden aromatický kruh, nebo kondenzované aromatické kruhy, v níž je alespoň jeden atom uhlíku aromatického kruhu nahrazen heteroatomem vybraným ze skupiny N, S, O, přičemž heteroaryl může obsahovat I až 5 substituentů, vybraných ze skupiny, zahrnující C6 až C^aryl, C6 až C|6 arylalkyl, C6 až C|6 arylhalogenalkyl, Cj až C6 alkyl, C| až C& halogenalkyl, C| až C12 alkoxy, benzyloxy, C| až C6 alkylthio, halogen, -OH, -SH, -NH2, C| až C6 alkylamino, C| až C6 acylamino, -CN, -SO3H, nitro, -COORn, -C(=O)N(Rn)2, kde Rn je vodík nebo Ci až C6 alkyl;
anionty (X1) a (X2) jsou na sobě nezávislé anionty solí, ajejich ťarmaceuticky přijatelné soli.
2. Helquaty obecného vzorce I podle nároku 1, zvolené ze skupiny, zahrnující:
2,4-bis((£)-2-(thiofen-3-yljvinyl)-6,7,10,1 l-tetrahydrodipyrido[2,l-a:l',2'-k][2,9]fenantrolin-
5.12- diium trifluormethansulfonát, (£)-2-(2-(dibenzo[b,d]furan-4-yl)vinyl)-6,7,10,1 l-tetrahydrodipyrido[2,l-a: l',2'-k][2,9]fenantrolin—5,12-diium trifluormethansulfonát, (£)-13-(2-(5-(ethoxykarbonyl)-l H-pyrrol-3-yl)vinyl)-6,7-dimethyl-4,5,8,9-tetrahydroisochinolino[l,2-a]pyrido[l,2-k][2,9]fenantrolin-3,10-diium trifluormethansulfonát, (£)-13-(2-(5-brom-l//-indol-3-yl)vinyl)-6,7-dimethyM,5,8,9-tetrahydroisochinolino[l,2a]pyrido[l,2-k][2,9]fenantrolin-3,10-diium trifluormethansulfonát,
2.13- bis((£')-2-(5-bromthiofen-2-yl)vinyl)-8,9-dimethyl-6,7,10,1 l-tetrahydrodipyrido[2,la: 1 ',2'—k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát,
2.13- bis((£')-2-(2,6-dimethoxypyridin-3-y l)vinyl)-8,9-dimethyl-6,7,10,11 -tetrahydrodipyrido[2,l-a: l',2'-k][2,9]fenantrolin-5,l2-diium trifluormethansulfonát,
19—((£>—2—(1 —methy 1— 177—indol—2—y 1 jviny 1)—6,7,8,11,12,13-hexahydropyrido[l',2':l,2]azepino[4,3:5',6']benzo[l',2':3,4]azepino[l,2-a]chinolin-5,14-diium trifluormethansulfonát,
19-((E)-2-(2-methyl-l 77—i ndol—3—y 1) vi ny 1)-6,7,8,11,12,13-hexahydropyrido[l',2':l,2]azepino[4,3:5',6']benzo[r,2':3,4]azepino[l,2-a]chinolin-5,14-diium trifluormethansulfonát,
19-((7)-2-( 1 //-benzolg] indol—3—y l)v i ny 1)—6,7,8,11,12,13-hexahydropyrido[T,2': 1 ,2]azepino[4,3:5',6']benzo[l',2':3,4]azepino[l,2-a]chinolin-5,14-diium trifluormethansulfonát,
-38CZ 307163 B6
19—((ΖΓ)—2—(2—feny 1— 177—i ndo 1—3—y 1 )v i ny 1)—6,7,8,11,12,13hexahydropyrido[ 1 ',2': 1 ,2]azepino[4,3:5',6']benzo[l ',2':3,4]azepino[ 1,2-a]chinolin-5,14-diium trifluormethansulfonát,
19-((7)-2-( I //-indol-5-yl)vinyl)-6,7,8,11,12,13-hexahydropyrido[ 1 ',2': 1 ,2]azepino[4,3:5',6']benzo[ 1 ',2':3,4]azepino[ 1,2-a]chinolin-5,14-diium trifluormethansulfonát,
19-((£)-2-(5-brom-l Λ/ i ndo 13y I )v iny l > 6.7,8,11,12,13-hexahydropyrido[ 1 ',2': 1 ,2]azepino[4,3:5',6']benzo[ 1 ’,2':3,4]azepino[ 1,2-a]chinolin-5,14-diium trifluormethansulfonát,
4.15- bis((£)-4-(pyridin-2-yl)styryl)-6,7,8,11,12,13-hexahydrodipyrido[ 1,2-a: 1 ',2'-a']benzo[2, l-c:3,4-c']bisazepindiium trifluormethansulfonát,
2,4,15,17-tetra((£)-(2-( l-methyl-l/7-indol-2-yl)vinyl)-6,7,8,11,12,13-hexahydrodipyrido[l,2-a:l',2’-a']benzo[2,l-c:3.4-c’]bisazepindiium trifluormethansulfonát, (£)-l l-(2-([2,2':5',2-terthiofen]-5-yl)vinyl)-6,7-dimethyl-4,5,8,9-tetrahydroisochinolino[1,2-a]pyrido[ 1,2-k][2,9]fenantrolin-3,10-diium trifluormethansulfonát, (£)-l l-(2-(dibenzo[b,d]furan-4-yl)vinyl)-6,7-dimethyl-4,5,8,9-tetrahydroisochinolino[l,2a]pyrido[l,2-k] [2,9]fenantrolin-3,l 0-diium trifluormethansulfonát,
2.15- bis((£)-2-(2,6-dimethoxypyridin-3-yl)vinyl)-6,7,10,1 l-tetrahydrodipyrido[2,1-a: 1 ',2'k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, (£)-2-(2-(5-brom-l/7-indol-3-yl)viny 1)-6,7,10,11- tetrahydrodipyrido[2,1- a: 1 ',2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, (£)-13-(2-(dibenzo[b,d]furan-4-yl)vinyl)-4,5,8,9-tetrahydroisochinolino[l,2-a]pyrido[l,2k][2,9]fenantrolin-3,l 0-diium trifluormethansulfonát,
2.15- b is((7f )-2-(2-methyl-l H-indol-3-yl)viny 1)-6,7,10,1 l-tetrahydrodipyrido[2,1-a: 1 ',2'k][2,9] [fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát,
2.15- b is((£)—2—( 1-methyl-l H-indol-3-yl)vinyl)-6,7,10,11 -tetrahydrodipyrido[2,1-a: 1 ',2'k][2,9]fenantrolin-5,l 2-diium trifluormethansulfonát,
2.15- bis((£)-2-(2-fenyl-l H-indol-3-yl)vinyl)-6,7,10,1 l-tetrahydrodipyrido[2,1-a: 1 ',2'k][2,9]fenantrolin-5,l2-diium trifluormethansulfonát,
2.15- bis((£)-2-(5-brom-1 H-indol-3-yl)viny 1)-6,7,10,1 l-tetrahydrodipyrido[2,l-a:l',2'-
k][2,9][fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, (rac)-(£)-13-(2-(dibenzo[b,d]furan-4-yl)vinyl)-6,7-dimethyl-4,5,8,9-tetrahydroisochinolino[ 1,2-a]pyrido[ 1,2-k][2,9]fenantrolin-3,10-diium trifluormethansulfonát,
8,9-dimethyl-2,l 5-bis((£)-2-(2-methyl-l H—indol—3—y l)vinyl)~6,7,10,11-tetrahydrodipyrido[2,1-a:l',2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát,
2.15- bis((£)2-( 1 H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)vinyl)-8,9-dimethyl-6,7,10,11-tetrahydrodipyrido[2,l-a:l',2'-k][2,9]fenantrolin-5,l2-diium trifluormethansulfonát,
2,4—bis((£)—2—(1H—indol—2—yl)vinyl)—6,7,10,11—tetrahydrodipyrido[2,1—a: 1 ',2'—k][2,9]fenantro1 in—5,12-diium trifluormethansulfonát.
-39CZ 307163 B6
2.4- bis((E)-2-([2,2'-bithiofen]-5-yl)vinyl)-6,7,10,1 ltetrahydrodipyrido|2.1-a: l',2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát,
2.4- bis((E)-2-(benzofuran-2-yl)vinyl )-6,7,10,1 l-tetrahydrodipyrido[2,l-a:l',2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, (2Γ)—2—(2—([2,2'—bith iofen]—5—y l)viny 1)—6,7,10,1 l-tetrahydrodipyrido[2,l-a: l',2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, (E)-13-(2-(5-hexylthiofen-2-yl)vinyl)-6,7-dimethyl-4,5,8,9-tetrahydroisochinolino[l,2a]pyrido[l,2-k][2,9]fenantrolin-3,10-diium trifluormethansulfonát, (E)-l 3-(4-(9J/-karbazol-9-yl)styryl)-6,7-dimethyl-4,5,8,9-tetrahydroisochinolino[ 1,2-a]pyrido[l ,2-k] [2,9]fenantrolin-3,l 0-diium trifluormethansulfonát,
8,9-dimethyl-2,13-bis((E)-2-(4-methyl-l H-imidazol-5-yl)vinyl)-6,7,10,l 1-tetrahydrodipyrido[2,l-a:l',2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát,
19-((E)-2-(3-methy lbenzo[b]thiofen-2-y l)viny 1)-6,7,8,11,12,13-hexahydropyrido[ 1 ',2': 1 ,2]azepino[4,3: 5',6']benzo[ 1 ',2':3,4]azepino[ 1,2-a]chinolin-5,14-diium trifluormethansulfonát,
19-((E)-2-([2,2'-bithiofen]-5-yl)vinyl)-6,7,8,11,12,13-hexahydropyrido[ 1 ',2': 1 ,2]azepino[4,3:5',6']benzo[l',2':3,4]azepino[l,2-a]chinolin-5,l 4-diium trifluormethansulfonát,
19-((E)-2-(6-brom-l H-indol-3-y l)vinyl)-6,7,8,11,12,13-hexahydropyrido[l'2': 1 ,2]azepino[4,3:5',6']benzo[l',2':3,4]azepino[l,2-a]chinolin-5,l4-diium trifluormethansulfonát,
2.15- bis((E)-2-(4-methyl-l//-imidazol-5-yl)vinyl)-6,7,10,l l-tetrahydrodipyrido[2,l-a:l',2'-
k] [2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát,
2.15- bis((E)-2-(dibenzo[b,d]furan^4-yl)vinyl)-8,9-dimethyl-6,7,10,l 1-tetrahydrodipyrido- [2,1 —a: 1 ',2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, (rac)-2,4,13,15-tetrakis((E)-2-(thiofen-3-yl)vinyl)-6,7,8,11,12,13-hexahydrodipyrido[ 1,2a:l',2'-a']benzo[2,l-c:3,4-c']bisazepindiium trifluormethansulfonát, (£)-13-(2-(dibenzo[b,d]furan-2-yl)viny))-6,7-dimethy)-4,5,8,9-tetrahydroisochinolino[l,2a]pyrido[l,2-k][2,9]fenantrolin-3,l0-diium trifluormethansulfonát, (E)-13-(2-(4-fenylthiofen-2-yl)vinyl)-4,5,8,9-tetrahydroisochinolino[l,2-a]pyrido[l,2k][2,9]fenantrolin-3,l 0-diium trifluormethansulfonát, (E)-l 3-(2-( l/7-benzo[g]indol-3-yl)vinyl)-4,5,8,9-tetrahydroisochinolino[l,2-a]pyrido[l,2k][2,9]fenantrolin-3,l0-diium trifluormethansulfonát,
19-((E)-2-(7-methyl-l /7-indol-3-yl)viny 1)-6,7,8,11,12,13-hexahydopyrido[ 1 ',2': 1 ,2]azepino[4,3:5',6']benzo[ 1 ',2':3,4]azepino[ 1,2-a]chinolin-5,14-diium trifluormethansulfonát, (E)-l l-(2-(dibenzo[b,d]thiofen^4-yl)vinyl)-6,7-dimethyl-4,5,8,9-tetrahydroisochinolino[l,2a]pyrido[ 1,2—k][2,9]fenantrolin—3,10-diium trifluormethansulfonát, (rac)-(E)-13-(2-(9-ethyl-9H-karbazol-3-yl)vinyl)-6,7-dimethyl-4,5,8,9-tetrahydroisochinolino[l,2-a]pyrido[l,2-k][2,9]fenantrolin-3,l0-diium trifluormethansulfonát,
-40CZ 307163 B6 (rac)-8,9-dimethyl-2,13 - bi s((E)~2-(th i ofen- 3 - y 1) v i ny 1)-6,7,10,11 -tetrahydrodipyrido[2,1a: 1 '.2' -k][2,9]fčnantrolin 5.12-diium trifluormethansulfonát, (rac)-2,15-bis((E)-2-( 1 H-indol-3-yl)viny 1)-6,7,8,11,12,13-hexahydrodipyrido[ 1,2-a: 1 ',2'a']benzo[2,l-c:3,4-c']bisazepindiium trifluormethansulfonát,
4.13- bis((E)-2-(2-methyl-l H—indol—3—y l)v iny I)—6,7,10.1 l-tetrahydrodipyrido[2,1-a: 1 ',2'— k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, (E)-l l-(2-(benzo[d]thiazol-2-yl)vinyl)-6,7-dimethyl-4,5,8,9-tetrahydroisochinormo[l,2a]pyrido[ 1,2-k][2,9]fenantrolin-3,10-diium trifluormethansulfonát, (E)-6,7-dimethyl-l l-(2-(5-fenylthiofen-2-yl)vinyl)-4,5,8,9-tetrahydroisochinolino[l ,2a]pyrido[ 1,2-k][2,9]fenantrolin-3,10-diium trifluormethansulfonát, (rac)-(E)-2-(2-(4-nitro-l 77-indol-3-yl)vinyl)-6,7,10,1 l-tetrahydrodipyrido[2,1 -α·. 1 ',2'Ř][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, (rac)-(E)-2-(2-(6-isopropyl-l//-indol-3-yl)viny 1)-6,7,8,1 l,12,13-hexahydrodipyrido[l,2a:l',2'-a']benzo[2,l-c:3,4-c']bisazepindiium trifluormethansulfonát, (rac)-2,17-bis((E)-2-( 1H—i ndol—5—y l)v iny 1)—6,7,8,11,12,13-hexahydrodipyrido[ 1,2-a: 1 ',2'a']benzo[2,l-c:3,4-c’]bisazepindiium trifluormethansulfonát, (rac)-4,15-bis((E)-2-(2,5-dimethyl-l-(3-(trifluormethyl)fenyl)-l H-pyrrol-3-yl)vinyl)-
6.7.8.11.12.13- hexahydrodipyrido[ 1,2-a: 1 ',2'-a']benzo[2, l-c:3,4-c']bisazepindiium trifluormethansulfonát,
8,9-dimethyl-2,l 5-bis((E)-2-(2-fenyl-l H—indol—3—y l)v inyl)—6,7,10,11-tetrahydrodipyrido- [2,1-a: r,2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, (rac)-2,4,15,17-tetrakis((E)-2-( 1H- i ndo I- 2-y I)-6,7,8,1 1,12,13-hexahydrodipyrido[ 1,2-a: 1 ',2'a']benzo[2,l-c:3,4-c']bisazepindiium trifluormethansulfonát, (racj-2,4-bis((E)-2-( 1-methyl-l 77—pyrrol—2—yljviny 1)-6,7,10,1 l-tetrahydrodipyrido[2,1a:l',2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát, (r«c)-2,4-bis((E)-2-(4-methyl-l 77-imidazol-5-yl)vinyl)-6,7,10,11 -tetrahydrodipyrido[2,la: l',2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát.
2,4,13,15-tetrakis((E)-2-( 1-methyl-l H—i ndol—3—y 1) v iny 1)—6,7,10,1 l-tetrahydrodipyrido[2,1 -a: l',2'-k][2,9]fenantrolin-5,12-diium trifluormethansulfonát.
3. Helquaty obecného vzorce I podle nároku 1 nebo helquaty podle nároku 2, či jejich farmaceuticky přijatelné soli, pro použití jako léčiva.
4. Helquaty obecného vzorce I podle nároku 1 nebo helquaty podle nároku 2, či jejich farmaceuticky přijatelné soli, pro použití ke stabilizaci G-kvadruplexů.
5. Helquaty obecného vzorce I podle nároku 1 nebo helquaty podle nároku 2, či jejich farmaceuticky přijatelné soli, pro použití k léčbě onkologických onemocnění.
6. Helquaty obecného vzorce I podle nároku 1 nebo helquaty podle nároku 2, či jejich farmaceuticky přijatelné soli, pro použití k léčbě onemocnění, souvisejících se zvýšenou proliferací
-41 CZ 307163 B6 buněk a k léčbě, vyžadující ovlivnění G-kvadruplexu, s výhodou v telomerách nebo v promotorech genů.
7. Farmaceutický prostředek, vyznačující se t í m , že obsahuje alespoň jeden helquat obecného vzorce I podle nároku I nebo helquat podle nároku 2, či jeho farmaceuticky přijatelnou sůl.
8. Farmaceutický prostředek podle nároku 8, vyznačující se tím, že případně dále obsahuje i další aktivní složku a popřípadě alespoň jeden farmaceuticky přijatelný nosič, plnivo nebo ředidlo.
9. Farmaceutický prostředek podle nároku 8 nebo 9 pro použití k léčbě onemocnění, souvisejících se zvýšenou proliferací buněk a k léčbě, vyžadující ovlivnění G-kvadruplexu, s výhodou v telomerách, nebo v promotorech genů.
10. Použití helquatů obecného vzorce 1 podle nároku 1 nebo helquatů podle nároku 2, či jejich farmaceuticky přijatelných solí, pro výrobu léčiva k léčení onemocnění, souvisejících se zvýšenou proliferací buněk, onkologických onemocnění a k léčbě, vyžadující ovlivnění G-kvadruplexu, s výhodou v telomerách nebo v promotorech genů.
1 výkres
CZ2014-369A 2014-05-29 2014-05-29 Helquaty s heteroaromatickými substituenty, jejich příprava a použití jako stabilizátory G-kvadruplexů CZ307163B6 (cs)

Priority Applications (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CZ2014-369A CZ307163B6 (cs) 2014-05-29 2014-05-29 Helquaty s heteroaromatickými substituenty, jejich příprava a použití jako stabilizátory G-kvadruplexů
EP15729750.8A EP3148997B1 (en) 2014-05-29 2015-05-26 Helquats with heteroaromatic substituents, preparation thereof, and use thereof as g-quadruplex stabilizers
PCT/CZ2015/000052 WO2015180701A1 (en) 2014-05-29 2015-05-26 Helquats with heteroaromatic substituents, preparation thereof, and use thereof as g-quadruplex stabilizers
US15/313,492 US9932339B2 (en) 2014-05-29 2015-05-26 Helquats with heteroaromatic substituents, preparation thereof, and use thereof as G-quadruplex stabilizers

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CZ2014-369A CZ307163B6 (cs) 2014-05-29 2014-05-29 Helquaty s heteroaromatickými substituenty, jejich příprava a použití jako stabilizátory G-kvadruplexů

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CZ2014369A3 CZ2014369A3 (cs) 2015-12-09
CZ307163B6 true CZ307163B6 (cs) 2018-02-14

Family

ID=53432909

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CZ2014-369A CZ307163B6 (cs) 2014-05-29 2014-05-29 Helquaty s heteroaromatickými substituenty, jejich příprava a použití jako stabilizátory G-kvadruplexů

Country Status (4)

Country Link
US (1) US9932339B2 (cs)
EP (1) EP3148997B1 (cs)
CZ (1) CZ307163B6 (cs)
WO (1) WO2015180701A1 (cs)

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CZ2009237A3 (cs) * 2009-04-16 2010-10-27 Ústav organické chemie a biochemie Akademie ved Ceské republiky, v. v. i. Nové helquaty, jejich prekurzory a zpusob jejich prípravy
CZ201332A3 (cs) * 2013-01-17 2014-07-30 Ústav Organické Chemie A Biochemie Akademie Věd Čr, V.V.I. Deriváty helquatů, jejich příprava a použití jako léčiva

Family Cites Families (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AUPS234402A0 (en) * 2002-05-15 2002-06-13 Auckland Uniservices Limited Anti-tumour polycyclic carboxamides

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CZ2009237A3 (cs) * 2009-04-16 2010-10-27 Ústav organické chemie a biochemie Akademie ved Ceské republiky, v. v. i. Nové helquaty, jejich prekurzory a zpusob jejich prípravy
CZ201332A3 (cs) * 2013-01-17 2014-07-30 Ústav Organické Chemie A Biochemie Akademie Věd Čr, V.V.I. Deriváty helquatů, jejich příprava a použití jako léčiva

Also Published As

Publication number Publication date
EP3148997B1 (en) 2018-06-27
WO2015180701A1 (en) 2015-12-03
EP3148997A1 (en) 2017-04-05
US20170096433A1 (en) 2017-04-06
US9932339B2 (en) 2018-04-03
CZ2014369A3 (cs) 2015-12-09

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Li et al. Indole-nitroimidazole conjugates as efficient manipulators to decrease the genes expression of methicillin-resistant Staphylococcus aureus
Kamal et al. Synthesis of 1, 2, 3-triazole-linked pyrrolobenzodiazepine conjugates employing ‘click’chemistry: DNA-binding affinity and anticancer activity
US6462069B2 (en) Compounds, pharmaceutical compositions, and methods for inhibiting protein kinases
AU780241B2 (en) Benzazole derivatives and their use as JNK modulators
Kundu et al. Discovery and mechanistic study of tailor-made quinoline derivatives as topoisomerase 1 poison with potent anticancer activity
TWI527800B (zh) 作為聚(二磷酸腺苷酸-核醣)聚合酶(parp)之抑制劑之1-(芳基甲基)喹唑啉-2,4(1h,3h)-二酮及其應用
ES2231725T3 (es) 3,5-diamino-1,2,4-triazoles como agentes inhibidores de cinasas.
Che et al. Discovery of novel schizocommunin derivatives as telomeric G-quadruplex ligands that trigger telomere dysfunction and the deoxyribonucleic acid (DNA) damage response
MXPA05006437A (es) Derivados de piridino[2,3-d]pirimidina como inhibidores selectivos de kdr y fgfr.
MXPA05001526A (es) Pirimidinas macrociclicas, produccion de las mismas y su uso como medicamentos.
Palluotto et al. Quinolino [3, 4-b] quinoxalines and pyridazino [4, 3-c] quinoline derivatives: synthesis, inhibition of topoisomerase IIα, G-quadruplex binding and cytotoxic properties
KR20050086770A (ko) 단백질 키나제 억제제로서의티에노[3,2-b]피리딘-6-카보니트릴 및티에노[2,3-b]피리딘-5-카보니트릴
KR20070015575A (ko) 단백질 키나제 억제제로서의티에노[3,2-b]피리딘-6-카보니트릴
US20190209548A1 (en) Linked diaryl compounds with anticancer properties and methods of using the same
Long et al. Molecular recognition and imaging of human telomeric G-quadruplex DNA in live cells: a systematic advancement of thiazole orange scaffold to enhance binding specificity and inhibition of gene expression
Babushkina et al. Efficient synthesis and evaluation of antiviral and antitumor activity of novel 3-phosphonylated thiazolo [3, 2-a] oxopyrimidines
Verga et al. Polyheteroaryl oxazole/pyridine-based compounds selected in vitro as G-quadruplex ligands inhibit rock kinase and exhibit antiproliferative activity
Hu et al. Design, synthesis and biological evaluation of methylenehydrazine-1-carboxamide derivatives with (5-((4-(pyridin-3-yl) pyrimidin-2-yl) amino)-1H-indole scaffold: Novel potential CDK9 inhibitors
US20100063046A1 (en) Tetracyclic imidazole analogs
Singu et al. Benzimidazole-1, 2, 3-triazole hybrid molecules: Synthesis and study of their interaction with G-quadruplex DNA
Stolić et al. Effect of 3, 4-ethylenedioxy-extension of thiophene core on the DNA/RNA binding properties and biological activity of bisbenzimidazole amidines
CA2411928A1 (en) Pyrazole-thiazole compounds, pharmaceutical compositions containing them, and methods of their use for inhibiting cyclindependent kinases
CZ307163B6 (cs) Helquaty s heteroaromatickými substituenty, jejich příprava a použití jako stabilizátory G-kvadruplexů
CN111732584A (zh) 二芳基取代稠杂环类化合物及其制备方法和在制药中的用途
Huang et al. Discovery of novel benzofuro [3, 2-b] quinoline derivatives as dual CDK2/Topo I inhibitors

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A Patent lapsed due to non-payment of fee

Effective date: 20230529