CZ304094B6 - Vyuzití polymethiniových solí jako mitochondriálních sond - Google Patents

Vyuzití polymethiniových solí jako mitochondriálních sond Download PDF

Info

Publication number
CZ304094B6
CZ304094B6 CZ20110782A CZ2011782A CZ304094B6 CZ 304094 B6 CZ304094 B6 CZ 304094B6 CZ 20110782 A CZ20110782 A CZ 20110782A CZ 2011782 A CZ2011782 A CZ 2011782A CZ 304094 B6 CZ304094 B6 CZ 304094B6
Authority
CZ
Czechia
Prior art keywords
salts
mitochondria
mitochondrial
cells
group
Prior art date
Application number
CZ20110782A
Other languages
English (en)
Other versions
CZ2011782A3 (cs
Inventor
Král@Vladimír
Bríza@Tomás
Kejík@Zdenek
Králová@Jarmila
Rimpelová@Silvie
Ruml@Tomás
Martásek@Pavel
Original Assignee
Vysoká skola chemicko-technologická v Praze
Ústav molekulární genetiky Akademie ved CR
Univerzita Karlova v Praze I. Lékarská Fakulta
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Vysoká skola chemicko-technologická v Praze, Ústav molekulární genetiky Akademie ved CR, Univerzita Karlova v Praze I. Lékarská Fakulta filed Critical Vysoká skola chemicko-technologická v Praze
Priority to CZ20110782A priority Critical patent/CZ304094B6/cs
Publication of CZ2011782A3 publication Critical patent/CZ2011782A3/cs
Publication of CZ304094B6 publication Critical patent/CZ304094B6/cs

Links

Landscapes

  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
  • Investigating Or Analysing Materials By The Use Of Chemical Reactions (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

Pouzití symetrických polymethiniových solí s gama heteroarylsubstitucí obecných vzorcu I a II, kde významy substituentu jsou uvedeny v popisné cásti, pro prípravu selektivních sond pro znacení mitochondrií, a to jak v zivých i mrtvých bunkách a pro znacení izolovaných mitochondrií.

Description

Oblast techniky
Vynález se týká použití systému založených na polymethiniových solích. Tyto systémy lze využít v oblasti selektivní intracelulámí lokalizace. Systémy jsou založeny na použití strukturního motivu polymethiniových solí připravených z příslušných malondialdehydů.
Dosavadní stav techniky
Mitochondrie jsou semiautonomní dynamické, pleomorfní organely (DiMauro, S., Schon. A. E. (2003): Mitochondrial respirátory chain diseases, N. Engl. J. Med,. 348, 2656-2668), které tvoří až 40 % cytoplazmy metabolicky aktivních eukaryotických buněk. Dynamika mitochondrií je dána jejich konstantním pohybem včetně jejich neustálého dělení a fúzování, což je doprovázeno změnami ve velikosti, tvaru, počtu a hmotě mitochondrií. (Niscdi, E., Carruba, M. O. (2006): Nitric oxide and mitochondrial biogenesis. J. Cell Sci. 119, 2855-2862).
Hlavní rolí mitochondrií v buňce je produkce energie ve formě adenosintrifosfátu (ATP) prostřednictvím elektronového transportního řetězce [ETC], (Anderson, S., Bankier, A. T., Barrell, B. G., de Bruijn, Μ. H., Coulson, A. R., Drouin, J., Eperon, C. I., Nierlich, D. P., Roe, A. B., Sanger, F., Schreier, Η. P., Smith, A. J., Staden, R., Young, G. O. (1981): Sequence and organization of the human mitochondrial genome. Nátuře 290, 457-465). Kromě produkce energie hrají mitochondrie klíčovou roli v řadě dalších funkcí týkajících se zprostředkování buněčné smrti apoptózy, termogeneze, translace a transkripce mitochondriálních genů. (Leonard, J. V., Schapira, A. Η. V. (2000): Mitochondrial respirátory chain disorders I: mitochondrial DNA defects. Lancet 335, 299-304). Navíc jsou v nich lokalizovány některé metabolické procesy, jako např. beta-oxidace, citrátový cyklus, degradace aminokyselin, biosyntéza hernu, metabolismus steroidů, močovinový cyklus, (Mancuso, M., Calsolaro, V., Orsucci, D., Carlesi, C., Choub, A., Piazza, S., Siciliano, G. (2009): Mitochondria, cognitive impairment, and Alzheimeťs disease. Int J Alzheimers Dis. Jul 6; 951548), udržení buněčného redoxně-oxidačního potenciálu, homeostáze vápenatých iontů a další. (Di Lisa, F., Bernardi, P. (1998): Mitochondrial function as a determinant of recovery or death in cell response to injury. Mol Cell Biochem. 184, 379-391).
Mitochondrie jsou křižovatkou na pomezí života a smrti buňky a jejich poškození je spojeno s řadou onemocnění. To je činí slibným cílem pro vývoj léků a nových terapeutických přístupů. (Anders, M. W., Robotham, J. L., Sheu, S. S. (2006): Mitochondria: new drug targets for oxidative stress-induced diseases. Expert Opin. Drug. Metab. Toxicol. 2, 71-79). Kromě výše jmenovaných funkcí jsou mitochondrie hlavními producenty intracelulárních reaktivních kyslíkových částic, které vznikají jako vedlejší produkt oxidační fosforylace. Díky různým deficiencím v oxidační fosforylaci je sníženo zásobování buněk energií a je zvýšena produkce reaktivních kyslíkových částic, která může indukovat mutace a oxidativní poškození mitochondriální DNA. (Larsen, Β. N., Ramussen, M., Ramussen, J. L. (2005). Nuclear and mitochondrial DNA repair: similar pathways? Mitochondrion 5, 89-108). Mnoho z těchto poškození mitochondriální DNA pravděpodobně přispívá ke vzniku rakoviny, stárnutí a neurodegenerativním onemocněním (Bohr, A. V. (2002): Repair of oxidative DNA damage in nuclear and mitochondrial DNA, and some changes with aging in mammalian cells. Free Rádie. Biol. Med. 32, 804-812).
Pro studium mitochondrií jsou využívány biochemické, genetické a elektronmikroskopické přístupy. Pro studium aktivity mitochondrií v buňkách, je využíváno dvou přístupů založených na jejich značení in šitu nebo izolaci mitochondrií uvolněných z buněk. Při jejich izolaci je tkáň mechanicky rozrušena a organely jsou purifikovány pomocí gradientově nebo diferenciální centrifugace. Izolované mitochondrie se však nemusejí chovat tak, jako za fyziologických podmínek a navíc může dojít ke zničení mitochondriální sítě. Během lyže buněk dochází k uvolnění
- 1 CZ 304094 B6 buněčných komponent včetně v nich obsažených proteáz, což může vést ke zničení anebo snížené regeneraci organel. Vývoj fluorescenčních značících technik v kombinaci s mikroskopií umožnil studium komplexní struktury a funkce neporušených organel in vivo. Použitím sond je možné se vyvarovat izolaci a purifikací organel a zachovat jejich strukturu. (Jakobs, S. (2006): High resolution imaging of live mitochondria. Biochim. Biophys. Acta 1763, 561-575). Nadějná je zejména mikroskopie buněk v reálném čase, která je nepostradatelným nástrojem pro objasnění časoprostorové mitochondriální dynamiky.
Obecně vzato jsou mitochondrie obtížně pozorovatelné pomocí fázového nebo Nomarského diferenciálního interferenčního kontrastu. Z tohoto důvodu je vyvíjena snaha nalézt vitální barviva pro specifické barvení mitochondrií v živých buňkách. Vstup většiny barviv do mitochondrií je závislý na membránovém potenciálu těchto organel v intaktním stavu. Některé z pozitivně nabitých, lipofilních fluorescenčních barviv mění svou emisi v závislosti na bezprostředním okolí a mohou být proto použity pro kvalitativní nebo dokonce kvantitativní měření mitochondriálního membránového potenciálu (Plasek, J., Sigler, K. (1996): Slow fluorescent indicators of membráně potential: a survey of different approaches to probe response analysis. J. Photochem. Photobiol. B. 33, 101-124). V současnosti jsou pro značení mitochondrií využívány zejména lipofilní kationické xantyliové deriváty jako tetrametylrosamin, rhodamin 123, rhodamin 6. (Rothe, G, Emmendórffer, A, Oser, A, Roesler, J, Válet, G. (1991): Flow cytometric measurement of the respirátory burst activity of phagocytes using dihydrorhodamine 123. J. Immunol. Methods 138, 133-135). Nicméně potenciál těchto fluorescenčních barviv je značně limitován. Nevýhodami jsou jejich nízká fotostabilita, nevhodné spektrální vlastnosti a vysoká fototoxicita. Navíc dochází při fixaci mitochondrií k vymytí barviva z buněk díky ztrátě membránového potenciálu. (Poot, M., Zhang, Y. Z., Kramer, A. J., Wells, K. S., Jones, J. L., Hanzel, D. K., Lugade, A. G., Singer, L. V., Haugland, P. R. (1996): Analysis of mitochondrial morphology and function with novel fixable fluorescent stains. J. Histochem. Cytochem., 44, 1363-1372).
U látek v dokumentu US 2010/0 143 960 Al byla sledována afinita polymethiniových solí vůči proteinům a jejich využití k fluorescenčnímu značení proteinů. Použití daných látek v tomto patentu se týká fluorescenčního značení proteinů, nikoli selektivní intracelulámí lokalizace v mitochondriích. Látky se musí synteticky opracovat například do stadia hydrazidů, aminů, tedy reaktivních struktur, které jsou v dalším kroku konjugovány s příslušným proteinem. V příkladech provedení jsou uvedeny pouze přípravy symetrických a nesymetrických pentamethiniových systémů bez gama aryl substituce. V rámci studia se autoři dokumentu US 2010/0 143 960 Al nezabývali blíže látkami typu symetrických polymethiniových solí s gama aryl substitucí.
Dokument WO 2007/028 118 A se týká polymethiniových solí ke značení proteinů a jiných biomolekul sNH2 skupinu. Právě přes tuto skupinu je k dané biomolekule či proteinu připojena fluorescenční proba, která jí propůjčuje dané optické vlastnosti. Tyto proteinové konjugáty lze využít jako fluorescenční proby pro buněčné organely (jádro, mitochondrie atd.) pouze při použití proteinu vyznačujícího se selektivitou k dané buněčné organele.
Dokument US 2005/0 208 534 A se týká interakce polymethiniových solí s DNA a RNA a rozpoznávání RNA vedle DNA.
Dokument US 6 291 203 se týká nesymetrických polymethiniových solí, podstatně náročnějších a dražších vzhledem kjejich přípravě. Tyto struktury vykazují pomalejší vstup do mitochondrií a horší optické vlastnosti (emise mezi 500 až 600 nm) absorpce (400 až 500).
Dokument WO 02/26 890 se týká aplikace polymethiniových solí jako fluorescenčních markérů biomolekul. Polymethiniové sole musí být konjugovány s danou biomolekulou pomocí aktivních esterů a pak jejich případná intracelulámí lokalizace související s rozlišováním buněk je funkcí daných biomolekul, nikoli však samotných solí.
. 7 .
ACTA Medica 2005, 48, 2,64 popisuje látky, které se vážou s mitochondriemi na základě membránového potenciálu. Absorpční maxima pro DIOC6 a JC-1 leží pod 500 nm. Emisní maximum DIOC6 a JC1 jsou okolo 500 nm a 590 nm. DIOC 6 a JC-1 patří do kategorie trimethiniových solí s výše zmíněnými rozdílnými spektrálními vlastnostmi a nejsou schopné zobrazovat mitochondrie mrtvých buněk.
Podstata vynálezu
Uvedené nevýhody odstraňuje využití symetrických polymethiniových solí s gama heteroarylsubstitucí, které vykazují velmi výraznou fluorescenci a vysokou afinitu pro mitochondrie, jako mitochondriálních sond.
Jedná se o polymethiniové sole obecného vzorce I
R kde obě koncové heteroaromatické skupiny methiniového řetězce jsou totožné a tvoří je benzthiazol, benzoimidazol, benzooxazol, benzoselenazol, jejichž konkrétní struktura je charakterizována skupinou A, Β, X, Y a s jednou nebo více skupinami R na obou koncích methiniové sole, kde skupina A jsou alkyl Cl až C12-substituenty, kde skupina B je 4-pyridyl, který může být dále substituován jedním či více stejnými nebo různými substituenty vybranými ze skupiny: fluor, chlor, brom, jod, hydroxy-, trifluormethyl, Omethyl, O-ethyl, O-propyl, O-trimethylsilyl, thiol, S-methyl, S-ethyl, S-propyl, amino, Nmethyl, N-ethyl, N-propyl, N-butyl, N-dimethyl, N-diethyl, N-dipropyl, N-dibutyl, N-bocyl, nitril, nitroso, azid, kyanát, kde v případě dvojnásobně nabitých solí, skupinu B tvoří /V-alkylpyridiniová skupina, kde alkyl je Cl až CIO, trimethylamoniový nebo dimethylsulfoniový substituent, kde skupina R je vodík, kde X je síra, kde Y je chlorid, bromid, jodid a polymethiniové sole obecného vzorce II (Π),
-3CZ 304094 B6 kde obě koncové heteroaromatické skupiny methiniového řetězce jsou totožné a tvoří je naftothiazol, naftoimidazol, naftooxazol, naftoselenazol a kde skupiny A, Β, X, Y a R mají vpředu uvedený význam.
Symetrické polymethiniové sole s gama heteroarylsubstitucí obecného vzorce I a II jsou vhodné pro přípravu selektivních buněčných sond pro značení mitochondrií, a to jak v živých i mrtvých buňkách. Polymethiniové sole jsou navíc zadrženy v mitochondriích i po fixaci různými činidly (např. formaldehyd, glutaraldehyd), popř. permeabilizaci (aceton, metanol).
Polymethiniové sole obecného vzorce I a II lze použít pro přípravu sond pro značení izolovaných mitochondrií.
Zjistili jsme, že tyto sole vykazují velmi výraznou fluorescenci. In vitro studie těchto látek zaměřené na jejich intracelulámí distribuci ukázaly jejich vysokou afinitu pro mitochondrie. Jejich mitochondriální lokalizace byla nalezena pro nejrůznější strukturní motivy těchto látek. Při vstupu, polymethiniových solí do mitochondrií dochází kjejich obarvení a díky jejich vysoké fluorescenci, jsou fluorescenčně značené mitochondrie snadno pozorovatelné a detekovatelné. Pro tento typ látek toto chování nebylo dosud pozorováno. Tento jev je způsoben jejich vysokou specifitou pro kardiolipin, kterýje hojně zastoupený ve vnitřní membráně mitochondrií.
Použití nových fluorescenčních vitálních barviv pro zobrazování mitochondrií by mohlo sloužit jako neinvazivní, finančně nenáročná a funkční alternativa komerčně dostupných barviv specifických pro mitochondrie. Tato barviva pro zobrazovací techniky mitochondrií by mohla být použita při studiu aktivity, morfologie a množství mitochondrií v buňce a sledování účinku farmakologických derivátů. Tyto sondy by tak umožnily monitorování klíčové intracelulámí organely v živých systémech v reálném čase a získat tak citlivý a specifický náhled do metabolismu, funkce, fyziologie a patofyziologie mitochondrií. Polymethiniové sole, které jsou předmětem tohoto patentu, jsou založeny na kondenzaci vhodného aromatického malondialdehydu se solí příslušného heteroaromátu (Schéma 1) tak, jak je příprava popsána pro podobné systémy. (Bříza, T., Kejík, Z., Císařová, I., Králová, J., Martásek, P., Král, V. (2008): Optical sensing of sulphate by plymethinium salt receptors: Colorimetric sensor for heparin. Chemical Communication. 1901-1903). Nesymetrické polymethiniové sole lze připravit dle námi, již dříve popsaných postupů týkajících se podobných struktur (Bříza T., Kejík Z., Králová J., Martásek P., Král V. Synthesis of unsymmetric cyanine dye via merocyaníne and their interaction with DNA. Coli. Czech. Chem. Comm. (2009), 74, 1081-1090) stím rozdílem, že je pro jejich syntézu využito neutrálního merocyaninového barviva, které je finálně kondenzováno se solí příslušného heteroaromátu (Schéma 1).
Dvakrát kvarternizované symetrické nebo nesymetrické polymethiniové sole se připravují tak, že se sůl kvarternizuje na příslušném heteroatomů do druhého stupně odpovídajícím alkylačním činidlem (Schéma 1).
-4CZ 304094 B6
Schéma 1
Přehled obrázků na výkresech
Obrázek 1
Lokalizace látky 1 v mitochondriích buněk myšího karcinomu mléčné žlázy 4T1. a, fázový kontrast; b, fluorescence látky 1; c, fluorescence mitochondriální sondy MitoTracker Green™; d, překryv snímků bac znázorňující jejich shodnou lokalizaci v mitochondriích.
Obrázek 2
Lokalizace látky 1 v mitochondriích v buněčné linii lidského osteosarkomu U2OS a, fázový kontrast; b, fluorescence látky 1; c, fluorescence jaderné sondy DAPI; d, překryv snímků bac.
Obrázek 3
Lokalizace látky 1 v mitochondriích primárních kuřecích fibroblastů CEF. a, fázový kontrast; b, fluorescence látky 1; c, fluorescence mitochondriální sondy MitoTracker Green™; d, překryv snímků bac znázorňující jejich shodnou lokalizaci v mitochondriích.
Vlastnosti a způsob přípravy nově připravených látek jsou doloženy následujícími příklady, aniž by jimi byly jakkoliv omezeny.
-5CZ 304094 B6
Příklady provedení vynálezu
Příklad 1
Příprava látky 1. Směs 2-quinaxolidinmalondialdehydu (50 mg), 2-methyl-3-propylbenzothiazolu (180 mg) a suchého n-butanolu (7 ml) byla za míchání zahřívána na 110 °C po dobu 18 h. Po ochlazení na laboratorní teplotu byla směs zfdtrována, pevný podíl promyt metanolem (3 ml) a sušen ve vakuu. Produkt byl získán ve formě zeleného kovově lesklého prášku. Výtěžek 136 mg, 81 %.
Struktura látky 1
Charakterizace: 'H-NMR: 8,65 (1H, s); 8,49 (1H, d, J = 14,1 Hz); 8,32 (1H, d, J = 14,1 Hz); 8,24 - 7,99 (7H, m); 7,82 - 7,58 (6H, m); 7,46 (1H, t, J = 7,3 Hz); 4,82 (2H, s), 4,68 (2H, s); 2,05 (4H, m); 1,20 (6H, m). 13C-NMR: 158,3; 149,0; 147,9; 141,2; 140,5; 139,1; 138,6; 129,1; 128,8; 128,5; 128,3; 127,9; 127,8; 126,9; 126,5; 125,6; 124,9; 123,8; 123,2; 119,0; 115,3; 114,1; 106,4; 48,7; 47,3; 21,5; 20,4; 11,3; 10,8.
ES-MS vypočteno: 547; nalezeno: 545 (M+-2H); HRMS nalezeno: 545,1823.
Elementární analýza: vypočteno: C 58,75 %; H 4,63 %; nalezeno: C 59,12 %; H 4,87 %.
Absorpční maxima látky 1 v různých prostředích
Prostředí Ámax Smax/100 000
dimetylsulfoxid 609 1,06
Methanol 608 1,34
Fosfátový pufr (pH 7,4) 493 0,33
Emisní maxima látky 1 v různých prostředích
Prostředí Ámax
dimetylsulfoxid 637
Methanol 630
Fosfátový pufr (pH 7,4) 627
-6CZ 304094 B6
Příklad 2
Příprava látky 2. Směs 2-(4-pyridyl)malondialdehydu (150 mg), 2-methyl-3-propylbenzo5 thiazolu (640 mg) a suchého n-butanolu (10 ml) byla za míchání zahřívána na 110 °C po dobu
h. Po ochlazení na laboratorní teplotu byla směs přefdtrována, pevný podíl promyt metanolem (3 ml) a sušen ve vakuu. Produkt byl získán ve formě zeleného kovově lesklého prášku. Výtěžek 498 mg, 79 %.
Struktura látky 2
Charakterizace: 'H-NMR: 8,94 (2H, d); 8,14 - 7,80 (8H, m); 7,58 (2H, t); 7,45 (2H, t); 6,20 (2H, 15 d); 4,28 (4H, bs), 1,71 (4H, m); 0,85 (6H, t). 13C-NMR: 156.9; 148,2; 143,6; 141,3; 128,2; 127,1;
125,5; 123,2; 114,0; 98,3; 47,5; 20,9; 10,8.
ES-MS vypočteno: 496,7, nalezeno: 496,3.
Elementární analýza: vypočteno: C 57,78 %; H 4,85 %; nalezeno: C 57,86 %; H 4,93 %. Absorpční maxima látky 2 v různých prostředích
prostředí ^max Smax/lOO 000
dimetylsulfoxid 656 0,76
metanol 645 0,82
fosfátový pufr (pH 7,4) 641 0,46
Emisní maxima látky 2 v různých prostředích
prostředí ^max
dimetylsulfoxid 665
metanol 662
fosfátový pufr (pH 7,4) 667
Příklad 3
Příprava látky 3. Látka 2 (55 mg) byla rozpuštěna v dimethylformamidu (5 ml) a byl přidán nadbytek methyljodidu (2M roztok v t—BuOMe, 0,5 ml). Směs byla uzavřena v tlakové ampuli
-7CZ 304094 B6 a zahřívána přes noc 60 °C. Druhý den byla reakční směs probublávána dusíkem, pro odstranění přebytečného methyljodidu. Poté byla směs odpařena dosucha. Pevný podíl byl promyt dietyléterem a sušen ve vakuu. Produkt byl získán ve formě kovově lesklého prášku. Výtěžek 63 mg, 94 %.
I ch3
Struktura látky 3
Charakterizace: 'H-NMR: 8,96 (2H, d); 7,98 - 8,16 (6H, m); 7,60 (2H, t); 7,48 (2H, t); 6,32 (2H, d); 4,35 (7H, bs), 1,72 (4H, sextet); 0,85 (6H, t). I3C-NMR: 166,4; 153,4; 147,9; 145,3; 141,4; 128,3; 127,8; 125,7; 125,6; 123,3; 114,2; 98,6; 47,7; 47,1; 34,4; 21,1; 10,9.
ES-MS vypočteno: 255,8, nalezeno: 255,6 (M2+/2).
Elementární analýza: vypočteno: C 48,64 %; H 4,34 %; nalezeno: C 48,93 %; H 4,56 %. Absorpční maxima látky 3 v různých prostředích
prostředí λχηβχ Smax/lOO 000
dimetylsulfoxid 645 0,33
metanol 631 0,40
fosfátový pufr (pH 7,4) 628 0,42
Emisní maxima látky 3 v různých prostředích
prostředí Ámax
dimetylsulfoxid 666
metanol 650
fosfátový pufr (pH 7,4) 654
Příklad 4
Příprava látky 4. Směs 2-(4-pyridyl)malondialdehydu (75 mg; 0,50mM), 2-methy 1-3-propyl anaftothiazolium jodidu (373 mg; 10,lmM) a suchého n-butanolu (10 ml) byla za míchání zahřívána na 110 °C po dobu 18 h. Po ochlazení na laboratorní teplotu byla směs přefiltrována,
-8CZ 304094 B6 pevný podíl promyt metanolem (3x5 ml) a sušen ve vakuu. Produkt byl získán ve formě zelené ho kovově lesklého prášku. Výtěžek 302 mg, 83 %.
Struktura látky 4
Charakterizace: ‘H-NMR: 8,98 (2H, d, J = 5,6 Hz); 8,2 - 7,9 (12H, m); 7,80 (2H, t, J = 7,3 Hz); 7,67 (2H, t, J = 7,5 Hz); 6,36 (2H, d, J = 11,6 Hz); 4,45 (4H, t, J = 6,5 Hz); 1,78 (4H, sextet, J = 7,2); 0,94 (6H, t, J = 7,3 Hz). 13C-NMR: 165,6; 140,2; 130,8; 130,1; 129,8; 129,4; 127,5; 126,6; 123,5; 122,1; 113,8; 48,5; 21,9; 11,3.
HRMS vypočteno: 569,2189 (M+); nalezeno: 596,2184 (M+)
Elementární analýza: vypočteno: C 63,06 %; H 4,74 %; nalezeno: C 63,11 %; H 4,80 %. Absorpční maxima látky 4 v různých prostředích
prostředí Ámax Smax/lOO 000
dimetylsulfoxid 686 0,99
Methanol 676 1,10
fosfátový pufr (pH 7,4) 600 0,32
Emisní maxima látky 4 v různých prostředích
prostředí Áinax
dimetylsulfoxid 707
Methanol 694
fosfátový pufr (pH 7,4) 699
Využití polymethiniových solí jako buněčné sondy pro selektivní mitochondriální lokalizaci.
Látky uvedené v tomto patentu vykazují selektivní lokalizací v mitochondriích řady buněčných linií. Nově připravené, pozitivně nabité, symetrické polymethiniové soli mají vhodné spektroskopické vlastnosti: úzké excitační i emisní spektra, minimální fluorescenci ve vodném médiu, maximální fluorescenci při inkorporaci do lipofilního prostředí membrán mitochondrií. Tato barviva navíc vykazují výrazně vyšší fotostabilitu v porovnání s xantyliovými barvivý, komerčně
-9CZ 304094 B6 používanými pro značení mitochondrií. Látky jsou navíc v mitochondriích zadržovány permanentně, což umožňuje jak výměnu média, tak fixaci a permeabilizaci buněk bez ztráty barvení.
Mitochondriální lokalizace námi připravených nových symetrických polymethiniových solí byla pozorována např. v buněčných liniích HeLa (odvozeny z karcinomu děložního čípku), LNCaP a PC-3 (buňky odvozeny z karcinomu prostaty), U2OS (buňky z osteosarkomu), MiaPaCa-2, BxPC-3, PaTu, CAPAN-2 (buňky odvozeny z adenokarcinomu pankreatu), HEK 293T (embryonální ledvinové buňky), HL-60 (buňky akutní myeloidní leukémie), KU-812 (buňky chronické myelogenní leukémie), myší buněčná linie 4T1 (buňky z karcinomu mléčné žlázy) a v primárních kuřecích embryonálních fibroblastech (CEF). Těmito příklady však není použití našich látek nijak omezeno. Tyto látky vykazují vysokou selektivitu pro mitochondrie, a to v odlišném principu než běžně používaná mitochondriální barviva jako například Mitotracker Green™. Vysoká selektivita mitochondriální lokalizace byla pozorována při použití těchto látek, např. 1^4, a to v případě všech testovaných linií (viz Obrázek 1). V případě buněk U2OS byla účinnost lokalizace v mitochondriích dokonce značně vyšší než pro komerčně dostupný MitoTracker Green™, jehož distribuce v mitochondriích byla slabá a neselektivní (Obrázek 2).
Příklad 1'
Příprava zásobního roztoku:
Vzhledem k nízké rozpustnosti našich sloučenin ve vodě byly sloučeniny rozpuštěny v dimethylsulfoxidu (popř. dimethylformamid, metanol, etanol). Koncentrace zásobních roztoků, které byly uchovávány ve tmě při -20 °C, byla 5mM. Před použitím byly vzorky za nepřístupu světla ustáleny na laboratorní teplotu cca 23 °C a řádně promíchány.
Přiklad 2'
Příprava buněk pro značení mitochondrií
Buňky linie HeLa (popř. U2OS, MiaPaCa-2, HEK 293T, 4T1) byly kultivovány v DMEM médiu (Dulbecco's Modified Eagle medium, Sigma USA), LNCaP v Iscove médiu (Sigma, USA), BxPC-3 (popř. HL-60, KU-812) vRPMI-1640 médiu (Sigma,USA), CAPAN-2 v McCoy médiu (Sigma, USA), PaTu v DMEM:F12 (1:1) médiu (Sigma, USA) doplněných o 10% fetální bovinní sérum (FBS, Invitrogen, USA), 2mM Glutamax™ (Invitrogen, USA) a 1% směs vitamínů (MEM vitamins solution, Invitrogen, USA). Buňky byly udržovány v logaritmické fázi růstu a kultivovány za standardních podmínek (37 °C, 5% CO2, 95% vlhkosti). Pro mikroskopické experimenty bylo inokulováno 100 000 buněk na kultivační misky se skleněným dnem (průměr 35 mm, MatTek, USA). Buňky byly inkubovány 16 až 24 h za standardních podmínek.
Příklad 3'
Barvení mitochondrií v živých buňkách
Buňky připraveny podle Příkladu 2 byly třikrát omyty fosfátovým pufrem (PBS; pH 7,4) a 10 min. inkubovány s 0 až 200 nM polymethiniovou solí rozpuštěnou v kompletním médiu. Pro dosažení co nejúčinnějšího barvení mitochondrií a minimálního nespecifického barvení byla typicky používána 20 až 50nM koncentrace polymethiniových solí. Po barvení byly buňky 2x omyty fosfátovým pufrem a inkubovány v čerstvém kompletním médiu bez fenolové červeni.
-10CZ 304094 B6
Příklad 4'
Fixace mitochondrií
Mitochondrie značené našimi novými fluorescenčními sondami je možno pozorovat nejen za nativních podmínek, ale lze je také fixovat. Fixace je možná např. 8% roztokem glutaraldehydu ve fosfátovém pufru; pH 7,4 při pokojové teplotě po 20 min. anebo 4% roztokem paraformaldehydu ve fosfátovém pufru za stejných podmínek a mikroskopovány.
Příklad 5'
Kolokalizace dvou mitochondriálních barviv
Buňky připravené podle Příkladu 2 byly nejprve barveny roztokem polymethiniových solí 1, 2, 3 nebo 4 s 20 až 50nM koncentrací. Po barvení byly buňky 2x omyty fosfátovým pufrem adobarvovány 120nM roztokem mitochondriální sondy MitoTracker Green™ (Molecular Probes) rozpuštěné v kompletním médiu, kultivace buněk probíhala za standardních podmínek (37 °C, 5% CO2, 95% vlhkost) po dobu 10 min. Buňky byly 2x omyty fosfátovým pufrem a inkubovány s čerstvým kompletním médiem bez fenolové červeni a mikroskopovány (viz Obrázek 1 a Obrázek 3).
Příklad 6'
Značení mitochondrií a jiných organel v buňce
Buňky připravené podle Příkladu 2 byly barveny 20 až 50nM roztokem polymethinových solí 1, 2, 3 nebo 4. Po barvení byly buňky 2x omyty fosfátovým pufrem a barveny po 20 min. 150nM roztokem sondy pro lysosomy LysoTracke Green (Molecular Probes) rozpuštěné v kompletním médiu za standardních kultivačních podmínek. Buňky byly 2x omyty fosfátovým pufrem a inkubovány 5 min. s roztokem jaderné sondy 4,6'-diamidino-2-fenylindolu (DAPI, 5 pg/ml) v kompletním médiu (viz Obrázek 2). Buňky byly 2x omyty fosfátovým pufrem a inkubovány v čerstvém kompletním médiu bez fenolové červeni. Barvení mitochondrií je možné kombinovat se značením dalších buněčných organel, jako je např. endoplazmatické retikulum anebo Golgiho komplex.
Příklad 7'
Mikroskopie
Buňky byly třikrát omyty fosfátovým pufrem a pozorovány pomocí inverzního fluorescenčního mikroskopu CellAR (Olympus, Japonsko) za použití 60x (numerická apertura 1,4), popř. lOOx imersního objektivu (Immersion oil 30cc, Olympus, Japonsko). V závislosti na spektroskopických vlastnostech testované látky byl použit filtr pro červený fluorescenční protein (RFP; ex. 535 až 555 nm / em. 570 až 625 nm, cut off 565 nm) anebo Cy5 filtr (ex. 590 až 650 nm / em. 663 až 738 nm, cut off 660 nm). Byla studována subbuněčná lokalizace polymethiniových solí v živých buňkách jednotlivých buněčných linií v reálném čase anebo fixovaných preparátů.
Mitochondriální značení našimi novými pozitivně nabitými symetrickými polymethiniovými solemi je možné kombinovat s barvením dalších studovaných proteinů pomocí fluorescenčně značených protilátek.
- 11 CZ 304094 B6
Průmyslová využitelnost
Polymethiniové soli jsou využitelné ve farmaceutickém průmyslu k přípravě mitochondriálních sond pro využití v medicíně.

Claims (2)

  1. PATENTOVÉ NÁROKY
    1. Použití symetrických polymethiniových solí s gama heteroarylsubstitucí obecného vzorce 1 kde obě koncové heteroaromatické skupiny methiniového řetězce jsou totožné a tvoří je benzothiazol, benzoimidazol, benzooxazol, benzoselenazol, jejichž konkrétní struktura je charakterizována skupinou A, Β, X, Y a jednou nebo více skupinami R na obou koncích methiniové sole, kde skupina A jsou alkyl Cl až Cl 2- substituenty, kde skupina B je 4-pyridyl, který může být dále substituován jedním či více stejnými nebo různými substituenty vybranými ze skupiny: fluor, chlor, brom, jod, hydroxy-, trifluormethyl, Omethyl, O-ethyl, O-propyl, O-trimethylsilyl, thiol, S-methyl, S-ethyl, S-propyl, amino, Nmethyl, N-ethyl, N-propyl, N-butyl, N-dimethyl, N-diethyl, N-dipropyl, N-dibutyl, N-bocyl, nitril, nitroso, azid, kyanát, kde v případě dvojnásobně nabitých solí, skupinu B tvoří Λ-alkylpyridiniová skupina, kde alkyl je Cl až CIO, trimethylamoniový nebo dimethylsulfoniový substituent, kde skupina R je vodík, kde X je síra, kde Y je chlorid, bromid, jodid, a polymethiniové sole obecného vzorce II (Π),
    12CZ 304094 B6 kde obě koncové heteroaromatické skupiny methiniového řetězce jsou totožné a tvoří je naftothiazol, naftoimidazol, naftooxazol, naftoselenazol a kde skupiny A, Β, X, Y a R mají vpředu uvedený význam,
    5 pro přípravu selektivních buněčných sond pro značení mitochondrií, a to jak v živých i mrtvých buňkách.
  2. 2. Použití symetrických polymethiniových solí s gama arylsubstitucí obecného vzorce 1 a II, podle nároku 1 pro přípravu sond pro značení izolovaných mitochondrií.
CZ20110782A 2011-12-01 2011-12-01 Vyuzití polymethiniových solí jako mitochondriálních sond CZ304094B6 (cs)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CZ20110782A CZ304094B6 (cs) 2011-12-01 2011-12-01 Vyuzití polymethiniových solí jako mitochondriálních sond

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CZ20110782A CZ304094B6 (cs) 2011-12-01 2011-12-01 Vyuzití polymethiniových solí jako mitochondriálních sond

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CZ2011782A3 CZ2011782A3 (cs) 2013-06-12
CZ304094B6 true CZ304094B6 (cs) 2013-10-16

Family

ID=48570609

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CZ20110782A CZ304094B6 (cs) 2011-12-01 2011-12-01 Vyuzití polymethiniových solí jako mitochondriálních sond

Country Status (1)

Country Link
CZ (1) CZ304094B6 (cs)

Cited By (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CZ305538B6 (cs) * 2014-05-06 2015-11-25 Vysoká škola chemicko- technologická v Praze Benzothiazolem substituované cyklobut-3-en-1,2-dion-3-hydrazony a jejich použití k léčbě leukémií a nádorových onemocnění
CZ306320B6 (cs) * 2014-04-01 2016-11-30 Vysoká škola chemicko - technologická v Praze Využití nových typů pentamethiniových solí s expandovanou chinoxalinovou jednotkou v protinádorové terapii
WO2018206126A1 (en) 2017-05-08 2018-11-15 Vysoká škola chemicko-technologická v Praze Imaging agents and methods
WO2023160737A1 (en) 2022-02-23 2023-08-31 Univerzita Karlova Polymethinium salts as inhibitors of dihydroorotate dehydrogenase

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6291203B1 (en) * 1995-11-13 2001-09-18 Molecular Probes, Inc. Cyanine dyes that stain cells and mitochondria
WO2002026891A1 (en) * 2000-09-29 2002-04-04 Molecular Probes, Inc. Modified carbocyanine dyes and their conjugates
US20050208534A1 (en) * 2003-12-05 2005-09-22 Dallwig Jason A Methine-substituted cyanine dye compounds
WO2007028118A2 (en) * 2005-09-02 2007-03-08 Visen Medical, Inc. Nicotinic acid and picolinic acid derived near-infrared fluorophores
US20100143960A1 (en) * 2007-03-09 2010-06-10 Cis Bio International Cyanine derivatives, fluorescent conjugates containing same and use thereof

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6291203B1 (en) * 1995-11-13 2001-09-18 Molecular Probes, Inc. Cyanine dyes that stain cells and mitochondria
WO2002026891A1 (en) * 2000-09-29 2002-04-04 Molecular Probes, Inc. Modified carbocyanine dyes and their conjugates
US20050208534A1 (en) * 2003-12-05 2005-09-22 Dallwig Jason A Methine-substituted cyanine dye compounds
WO2007028118A2 (en) * 2005-09-02 2007-03-08 Visen Medical, Inc. Nicotinic acid and picolinic acid derived near-infrared fluorophores
US20100143960A1 (en) * 2007-03-09 2010-06-10 Cis Bio International Cyanine derivatives, fluorescent conjugates containing same and use thereof

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Acta Medica (Hradec KralovÚ) Supplementum, 2005, svazek 48, cislo 2; str. 64 *

Cited By (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CZ306320B6 (cs) * 2014-04-01 2016-11-30 Vysoká škola chemicko - technologická v Praze Využití nových typů pentamethiniových solí s expandovanou chinoxalinovou jednotkou v protinádorové terapii
CZ305538B6 (cs) * 2014-05-06 2015-11-25 Vysoká škola chemicko- technologická v Praze Benzothiazolem substituované cyklobut-3-en-1,2-dion-3-hydrazony a jejich použití k léčbě leukémií a nádorových onemocnění
WO2018206126A1 (en) 2017-05-08 2018-11-15 Vysoká škola chemicko-technologická v Praze Imaging agents and methods
WO2023160737A1 (en) 2022-02-23 2023-08-31 Univerzita Karlova Polymethinium salts as inhibitors of dihydroorotate dehydrogenase

Also Published As

Publication number Publication date
CZ2011782A3 (cs) 2013-06-12

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US10264976B2 (en) Biocompatible flavonoid compounds for organelle and cell imaging
Prime et al. A ratiometric fluorescent probe for assessing mitochondrial phospholipid peroxidation within living cells
Neto et al. Selective mitochondrial staining with small fluorescent probes: importance, design, synthesis, challenges and trends for new markers
US9334281B2 (en) Fluorochromes for organelle tracing and multi-color imaging
JP6196988B2 (ja) チオールの選択的検出
CN110057804B (zh) 基于n-甲基邻苯二胺盐酸盐的荧光碳点在溶酶体靶向中的应用
Dong et al. Two-photon red-emissive fluorescent probe for imaging nitroxyl (HNO) in living cells and tissues
CZ304094B6 (cs) Vyuzití polymethiniových solí jako mitochondriálních sond
AU2019319901B2 (en) Silicon-substituted rhodamine dyes and dye conjugates
Dai et al. Red fluorescent probes based on a Bodipy analogue for selective and sensitive detection of selenols in solutions and in living systems
Wang et al. A multifunctional fluorescent probe for dual-color visualization of intracellular mitochondria and lipid droplets and monitoring of SO2 in vivo
US20080124751A1 (en) Combinatorial rosamine library and uses thereof
CN111004246B (zh) 监测线粒体自噬的罗丹明类pH荧光探针及制备和应用
Zhang et al. A two-photon endoplasmic reticulum-targeting fluorescent probe for the imaging of pH in living cells and zebrafish
Wang et al. A multiple acetal chalcone-BODIPY-based fluorescence: synthesis, physical property, and biological studies
Kurutos et al. Organelle-selective near-infrared fluorescent probes for intracellular microenvironment labeling
Hong et al. Synthesis and properties of a lysosome-targeting fluorescent ionophore based on coumarins and squaramides
Lynch et al. Water soluble bis (indolenine) squaraine salts for use as fluorescent protein-sensitive probes
US9670363B2 (en) Substituted anthraquinone dyes for cellular stains and enzyme detection
WO2008155593A2 (en) Phthalimide derivatives for labeling lipid droplets, and a method for visualization of cells and/or cellular organelles
Dahiwadkar et al. AIE active cyanostilbenes for live-cell imaging of lipid droplets
Ramu et al. New imaging reagents for lipid dense regions in live cells and the nucleus in fixed MCF-7 cells
Mondal et al. Julolidine-based small molecular probes for fluorescence imaging of RNA in live cells
Gao et al. Synthesis of a fluorinated pyronin that enables blue light to rapidly depolarize mitochondria
US11591476B2 (en) In-vivo probe for real time longitudinal monitoring of inducible nitric-oxide synthase in living cells and animals