CZ2010230A3 - Efektivní zpusob biotinylace sloucenin s karboxylovou skupinou pomocí syntézy na pevné fázi pro potreby afinitní chromatografie - Google Patents

Efektivní zpusob biotinylace sloucenin s karboxylovou skupinou pomocí syntézy na pevné fázi pro potreby afinitní chromatografie Download PDF

Info

Publication number
CZ2010230A3
CZ2010230A3 CZ20100230A CZ2010230A CZ2010230A3 CZ 2010230 A3 CZ2010230 A3 CZ 2010230A3 CZ 20100230 A CZ20100230 A CZ 20100230A CZ 2010230 A CZ2010230 A CZ 2010230A CZ 2010230 A3 CZ2010230 A3 CZ 2010230A3
Authority
CZ
Czechia
Prior art keywords
derivative
dmf
solution
shaken
dcm
Prior art date
Application number
CZ20100230A
Other languages
English (en)
Other versions
CZ302510B6 (cs
Inventor
Soural@Miroslav
Hlavác@Jan
Hradil@Pavel
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed filed Critical
Priority to CZ20100230A priority Critical patent/CZ302510B6/cs
Publication of CZ2010230A3 publication Critical patent/CZ2010230A3/cs
Publication of CZ302510B6 publication Critical patent/CZ302510B6/cs

Links

Landscapes

  • Heterocyclic Carbon Compounds Containing A Hetero Ring Having Oxygen Or Sulfur (AREA)

Abstract

Imobilizované deriváty biotinu obecného vzorce 7, kde n predstavuje pocet ethylenoxy jednotek a nabývá hodnot 1-5 a symbol Pol predstavuje polystyrenovou pryskyrici tvorenou kopolymerem styrenu a divinylbenzenu, a zpusob jejich prípravy syntézou na pevné fázi.

Description

Efektivní způsob biotinylace sloučenin s karboxylovou skupinou pomocí syntézy na pevné fázi pro potřeby afinitní chromatografie.
Oblast techniky:
Vynález se týká přípravy a použití imobilizovaných derivátů biotinu s různě dlouhými řetězci polyethylenglykolu s využitím principu syntézy na pevné fázi. Popsaný koncept syntézy na pevné fázi umožňuje efektivní přípravu daných derivátů a jejich následné použití pro jednoduchou derivatizaci sloučenin obsahujících ve své struktuře karboxylovou skupinu. Takto derivatizované látky mohou být po odštěpení z pevné fáze použity pro zachycení na stacionární fázi pokrvlé avidinem Komplex vzniklý specifickou vazbou avidin-biotin případně streptavidin-biotin je pak metodou afinitní chromatografie využíván především vc farmaceutickém výzkumu při identifikaci molekulárních cílů potenciálních léčiv.
Dosavadní stav techniky
Derivatizace biologicky aktivních sloučenin molekulou biotinu je známý prostředek pro jejich studium za účelem identifikace enzymů, s kterými dané sloučeniny interagují, což výrazně přispívá ke zjištění mechanismu účinku těchto látek v buněčném systému. Biotinylované deriváty lze snadno mobilizovat metodou nekovalentní biospecifické interakce na chromatografické koloně vybavené stacionární fázi pokrytou avidinem/streptavidinem. Při následném použití mobilní fáze obsahující buněčný lyzát dochází k zachycení cílových enzymů na koloně, jejich následné eluci a identifikaci. Tento druh separační metody se nazývá afinitní chromatografie a patří mezi nej frekventovanější metody studia molekulárních cílů nových typů biologicky aktivních sloučenin (tj. potenciálních léčiv).
Za nej vhodnější typ derivátů biotinu používaných pro modifikaci látek za účelem jejich studia afinitní chromatografií jsou považovány deriváty obecné struktury 1, kde lineární řetězec (tzv. raménko) sestávající se z různého počtu ethylenoxy jednotek je na jednom konci derivatizován biotinem, přičemž druhý konec řetězce je zakončen vhodnou funkční skupinou umožňující derivatizaci příslušné látky. Vhodný počet ethylenoxy jednotek (tj. délka raménka) není přesně definován, neboť se jedná o proměnlivou veličinu závislou na způsobu interakce mezi studovanou látkou a cílovým enzymem.
• · > * • ·*· ·« · »
Χ = ΝΗ,0
Y = COOH, NH2 OH, OSO3Me, OSO3Ph...
Pro derivatizaci látek obsahujících ve své struktuře karboxylovou skupinu jsou v literatuře nejčastěji popisovány deriváty 1 (nebo jejich analoga s alternativní strukturou raménka) obsahující terminální primární aminoskupinu. Níže jsou uvedeny některé příklady takových derivátů.
V literatuře je hojně popsána příprava a použití derivátů 2 pomocí syntézy v roztoku. Některé z těchto derivátů jsou i komerčně dostupné.
Znázorněný typ raménka (tj. pouze na bázi uhlíkatého skeletu) však není považován pro účely afmitní chromatografie za zcela vhodný z důvodů jeho efektivního zkrácení způsobeného hydrofobními interakcemi methylenových skupin a nebude mu proto zde věnována další pozornost. Uvedeny budou pouze některé konkrétní příklady derivátů s raménkem na bázi ethylenoxy jednotek nebo deriváty s raménky podobné struktury, která jsou prostá hydrofobních interakcí a jsou obecně považována z pohledu struktury za optimální.
V literatuře je popsána příprava derivátu 3 s dvěma ethylenoxy jednotkami. Sloučenina je připravována pomocí syntézy v roztoku a to biotinylací příslušného mono-Boc chráněného diaminu s výtěžkem až 83%. Derivát 3 byl následně použit pro derivatizaci a studium různých typů látek pomocí afmitní chromatografie (Zhong, Chun-Long; Yao, Zhu-Jun, Huaxue Xuebao 2008, 66(9), 1074-1078; Sekine, Mitsuo; Okada, Kazuhisa; Seio, Kohji; Obata, Tohru; Sasaki, Takuma; Kakeya, Hideaki; Osada, Hiroyuki, Bioorganic & Medicinal Chemistry 2004, 12(24), 6343-6349).
• » » « » • · »
Popsána je rovněž příprava derivátu 4 s třemi ethylenoxy jednotkami připraveného biotinylaci 2-[2-[2-(2-azidoethoxy)ethoxy]ethoxy]-ethanaminu a následnou redukcí terminálního azidu trifenylfosfinem. Syntéza je opět prováděna v roztoku (Fusz, Stefan; Srivatsan, Seergazhi G.; Ackermann, Damian; Famulok, Michael, Journal of Organic Chemistry 2008, 73(13). 5069-5077).
Dále je popsána příprava a použití derivátu 5 s raménkem v kombinací ethylenoxy a propylenoxy jednotek. Daný derivát je připravován biotinylaci odpovídajícího diaminu v roztoku s výtěžkem pouhých 22% (Zhang, Zhidong; Edwards, Patrick J.; Roeske, Roger W.; Guo, Lili, Bioconjugate Chemistry 2005, 16(2), 458-464).
Podobný derivát 6 s kombinací ethylenoxy a propylenoxy jednotek byl rovněž připraven syntézou v roztoku a použit ke studiu derivátů nitrolotrioctové kyseliny (Huang, Zhaohua; Park, Joshua I.; Watson, Douglas S.; Hwang, Peter; Szoka, Francis C., Jr., Bioconjugate Chemistry 2006, 17(6), 1592-1600).
• « e
t
Podstata vynálezu
Předmětem předloženého vynálezu jsou imobilizované deriváty biotinu obecného vzorce 7
kde n přcdsta\'uje počet ethylenoxy jednotek a nabývá hodnot 1-5 a symbol Pol představuje polystyrénovou pryskyřici tvořenou kopolymerem styrenu a divinylbenzenu.
Podstatou vynálezu je dále příprava daných derivátů pomocí syntézy na pevné fázi, přičemž tato syntéza zahrnuje následující kroky (viz. Schéma 1):
• Imobilizaci 2-(2-aminoethoxy)-ethanolu pomocí reduktivní aminace na polymerní pryskyřici obsahující navázaný 4-oxy-2-methoxybenzaldehyd za vzniku derivátu 8 • Derivatizaci mobilizovaného 2-(2-aminoethoxy)-ethanolu fluorcnylmcthoxykarbonylovou protektivní skupinou za vzniku derivátu 9 • Acylaci hydroxyskupiny v derivátu 9 biotinem a následnou deprotekci aminoskupiny za vzniku derivátu 7a • Esterifikaci hydroxyskupiny ve sloučenině 9 pomocí chloridu kyseliny methansulfonové, p-toluensulfonové nebo trifluoromethansulfonanhydridem za vzniku sloučeniny 10 • Reakci esteru sulfonové kyseliny 10 s alkalickými solemi díethylenglykolu, triethylenglykolu nebo tetraethylenglykolu za vzniku sloučeniny 11
Derivatizaci sloučeniny 11 fluorenylmethoxykarbonylovou protektivní skupinou, následnou acylaci hydroxyskupiny bíotinem a deprotekci aminoskupiny za vzniku derivátu 7b-d
Pol /
I, H ~ ,OH
Pol
H 3-5
L ,comF - .OH
Schéma 1
Ve schématu bych přehodil comF za Fmoc - bylo-li by to v ChemDraw, udělal bych to.
Předmětem vynálezu je rovněž způsob použití derivátů 7a-d, kdy jsou tyto deriváty podrobeny reakci se sloučeninou obsahující karboxylovou skupinu za vzniku látek 12 a následně působením kyseliny trifluoroctové je odštěpen polymer za vzniku sloučenin 13 (viz. Schéma 2).
Schéma 2
Syntéza na pevné fází ve srovnání se syntézou v roztoku obecně poskytuje řadu výhod. Mezi největší výhody patří především jednoduché instrumentální vybavení a jednoduché experimentální provedení syntézy, dále snadná příprava malých množství látek (i při mnohastupňových syntézách) a zejména eliminace purifíkace jednotlivých meziproduktů velmi jednoduchá izolace produktů syntézy často bez nutnosti následnéhočištění. Zvláště poslední dvě jmenované výhody mají zásadní význam pro použití syntézy na pevné fázi pro účel popsaný ve vynálezu, neboť biotinylované látky pro studium afinitní chromatografií je často potřeba syntetizovat v omezeném množství, přičemž vlivem nepříznivých vlastností produktů může docházet ke značným ztrátám a obtížím při jejich izolaci, které se zvyšují při nutnosti jejich purifíkace.
To, že biotinylační jednotka je mobilizovaná na pevné fázi, tedy přináší výhody především v jednoduché a rychlé přípravě, snadné manipulaci s připravenými systémy a jednoduché finální izolaci cílových produktů. Vzhledem ktomu, že pouze některé typy biotinylačních jednotek pro derivatizaci látek v roztoku jsou komerčně dostupné a to většinou v malém množství za nepříznivou cenu, představuje popsaný vynález efektivní způsob alternativního řešení dané problematiky.
V neposlední řadě je výhodou popsané metodiky její variabilita. Volbou reaktantů lze měnit sterické parametry cílových derivátů, tj. délku raménka, která může při provedení afinitní chromatografie značným způsobem ovlivňovat kvalitu interakce mezi studovanou látkou a cílovým enzymem. Jednoduchým způsobem tedy lze připravit a kombinovat jednotlivé typy biotinylačních jednotek.
Popsaný koncept syntézy na pevné fázi, který přináší výše uvedené praktické výhody jak při vlastní přípravě, tak při použití derivátů 7, nebyl dosud v literatuře popsán.
Příklady provedení vynálezu
Podstata přípravy a použití derivátů podle vynálezu je blíže objasněna v následujících příkladech. Tyto příklady mají pouze ilustrativní charakter a v žádném případě neomezují rozsah vynálezu.
f,
Postup přípravy derivátů 7:
Příklad 1
Příprava imobilizovaného derivátu 7a (n = 1)
300 mg Aminomethylové pryskyřice vybavené BAL linkerem (loading systému 0.63 mmol/g) bylo suspendováno v roztoku 10% kyseliny octové v suchém ALV-dimethylformamidu (DMF) (3 ml) obsahujícího 1 mmol 2-(2-aminoethoxy)-ethanolu. Reakční směs byla třepána přes noc za laboratorní teploty. Poté byl přidán 1 mmol triacetoxyborohydridu sodného v roztoku 5% kyseliny octové v suchém DMF (1.5 ml). Reakční směs byla třepána 3 hodiny za laboratorní teploty, poté promyta 3 x DMF, následně třepána 10 min. s roztokem 10% piperidinu v DMF (3 ml), promyta 3 x DMF a 3 x dichloromethanem (DCM). Obdržená pryskyřice byla třepána v 0.2M roztoku fluorenylmethoxykarbonyl(hydroxysukcinimidu) (Fmoc-OSu) s ekvivalentem diisopropylethylaminu (DIEA) v DCM (3 ml) 2 hodiny za laboratorní teploty a pak promyta 3 x DCM. Obdržená pryskyřice byla třepána v DMF (3 ml) obsahující 1 mmol 1hydroxybenzotriazolu (BtOH), 1 mmol ALV'-diisopropylkarbodiimidu (DIC), 1 mmol biotinu a 1 mmol DIEA přes noc za laboratorní teploty, poté byla pryskyřice promyta 3 x DMF. Tento reakční krok byl následně zopakován za stejných podmínek. Obdržená pryskyřice byla suspendována v roztoku 10% piperidinu v DMF (3 ml), třepána 15 minut za laboratorní teploty, promyta 3 x DMF, 3 x DCM, 3 x MeOH a vysušena v proudu dusíku.
Analýza produktu: 10 mg pryskyřice bylo třepáno v 0.5M roztoku Fmoc-OSu a DIEA v DCM (1 ml) 30 min. za laboratorní teploty, pak byla pryskyřice promyta 3 x DCM a třepána v 50%ním roztoku kyseliny trifluoroctové (TFA) v DCM (0.5 ml). Poté byl vzorek odpařen dosucha v proudu dusíku a odparek analyzován pomocí HPLC-UV-MS. Detekován produkt 7a jako odpovídající Fmoc-derivát, ESI-MS m/z = 554.6, [M+H]+. čistota 98%.
* · a · » » » *
Příklad 2
Příprava imobilizovaného derivátu 7b (n = 3)
300 mg Aminomethylové pryskyřice vybavené BAL linkerem (loading 0.63 mmol/g) bylo suspendováno v roztoku 10% kyseliny octové v suchém DMF (3 ml) obsahujícího 1 mmol 2(2-aminoethoxy)-ethanolu. Reakční směs byla třepána přes noc za laboratorní teploty. Poté byl přidán 1 mmol triacetoxyborohydridu sodného v roztoku 5% kyseliny octové v suchém DMF (1.5 ml). Reakční směs byla třepána 3 hodiny za laboratorní teploty, poté promyta 3 x DMF, následně třepána 10 min. s roztokem 10% piperidinu v DMF (3 ml), promyta 3 x DMF a 3 x DCM. Obdržená pryskyřice byla suspendována v 0.2M roztoku Fmoc-OSu s ekvivalentem DIEA v DCM (3 ml), třepána 2 hodiny za laboratorní teploty a pak promyta 3 x DCM. Obdržená pryskyřice byla třepána v 0.2M roztoku methansulfonylchloridu v pyridinu (3 ml) dvě hodiny za laboratorní teploty, pak promyta 3 x DMF. Obdržená pryskyřice byla třepána v 1M roztoku diethylenglykolátu lithného v dimethylsulfoxidu (DMSO) (3 ml) (roztok byl připraven smícháním ekvivalentu BuLi a diethylenglykolu za laboratorní teploty), třepána přes noc za laboratorní teploty, poté promyta 3 x DMF, třepána 10 minut s 20%-ním roztokem kyseliny octové v DMF, 10 minut s 20%-ním roztokem piperidinu v DMF, promyta 3 x DMF a 3 x DCM. Obdržená pryskyřice byla třepána v 0.2M roztoku Fmoc-OSu s ekvivalentem DIEA v DCM (3 ml) 2 hodiny za laboratorní teploty a pak promyta 3x DCM. Obdržená pryskyřice byla třepána v DMF (3 ml) obsahující 1 mmol BtOH, 1 mmol DIC, 1 mmol biotinu a 1 mmol DIEA přes noc za laboratorní teploty, poté byla pryskyřice promyta 3 x DMF. Tento reakční krok byl následně zopakován za stejných podmínek. Obdržená pryskyřice byla suspendována v roztoku 10% piperidinu v DMF (3 ml), třepána 15 minut za laboratorní teploty, pak promyta 3 x DMF, 3 x DCM, 3 x MeOH a vysušena v proudu dusíku.
Analýza produktu: 10 mg pryskyřice bylo třepáno v 0.5M roztoku Fmoc-OSu a DIEA v DCM (1 ml) 30 min. za laboratorní teploty, pak byla pryskyřice promyta 3 x DCM a třepána v 50%ním roztoku TFA v DCM (0.5 ml). Poté byl vzorek odpařen dosucha v proudu dusíku a
O • * * · • · odparek analyzován pomocí HPLC-UV-MS. Detekován produkt 7b jako odpovídající Fmocderivát, ESI-MS m/z = 642.7, [M+H]+. čistota 95%.
Příklad 3
Příprava mobilizovaného derivátu 7c (n = 4)
300 mg Aminomethylové pryskyřice vybavené BAL linkerem (loading 0.63 mmol/g) bylo suspendováno v roztoku 10% kyseliny octové v suchém DMF (3 ml) obsahujícího 1 mmol 2(2-aminoethoxy)-ethanolu. Reakční směs byla třepána přes noc za laboratorní teploty. Poté byl přidán 1 mmol triacetoxyborohydridu sodného v roztoku 5% kyseliny octové v suchém DMF (1.5 ml). Reakční směs byla třepána 3 hodiny za laboratorní teploty, poté promyla 3 x DMF, následně třepána 10 min. s roztokem 10% piperidinu v DMF (3 ml), promyla 3 x DMF a 3 x DCM. Obdržená pryskyřice byla suspendována v 0.2M roztoku Fmoc-OSu s ekvivalentem DIEA v DCM (3 ml), třepána 2 hodiny za laboratorní teploty a pak promyta 3 x DCM. Obdržená pryskyřice byla třepána v 0.2M roztoku methansulfonylchloridu v pyridinu (3 ml) dvě hodiny za laboratorní teploty, pak promyta 3 x DMF. Obdržená pryskyřice byla suspendována v 1M roztoku triethylenglykolátu lithného v DMSO (3 ml) (roztok byl připraven smícháním ekvivalentu BuLi a triethylenglykolu za laboratorní teploty), třepána přes noc za laboratorní teploty, poté promyta 3 x DMF, třepána 10 minut s 20%-ním roztokem kyseliny octové v DMF, 10 minut s 20%-ním roztokem piperidinu v DMF, promyta 3 x DMF a 3 x DCM. Obdržená pryskyřice byla třepána v 0.2M roztoku Fmoc-OSu s ekvivalentem DIEA v DCM (3 ml) 2 hodiny za laboratorní teploty a pak promyla 3 x DCM. Obdržená pryskyřice byla třepána v DMF (3 ml) obsahující 1 mmol BtOH, 1 mmol DIC, 1 mmol biotinu a 1 mmol DIEA přes noc za laboratorní teploty, poté byla pryskyřice promyta 3 x DMF. Tento reakční krok byl následně zopakován 2x za stejných podmínek. Obdržená pry skyřice byla suspendována v roztoku 10% piperidinu v DMF (3 ml), třepána 15 minut za laboratorní teploty, pak promyta 3 x DMF, 3 x DCM, 3 x MeOH a vysušena v proudu dusíku.
• « « · • *
M t · ·
Analýza produktu: 10 mg pryskyřice bylo třepáno v 0.5M roztoku Fmoc-OSu a DIEA v DCM (1 ml) 30 min. za laboratorní teploty, pak byla pryskyřice promyta 3 x DCM a třepána v 50%ním roztoku TFA v DCM (0.5 ml). Poté byl vzorek odpařen dosucha v proudu dusíku a odparek analyzován pomocí HPLC-UV-MS. Detekován produkt 7c jako odpovídající Fmocderivát, ESI-MS m!z = 686.8, [M+H]+. čistota 95%.
Příklad 4
Příprava imobilizovaného derivátu 7d (n = 5)
300 mg Aminomethylové pryskyřice vybavené BAL linkerem (loading 0.63 mmol/g) bylo suspendováno v roztoku 10% kyseliny octové v suchém DMF (3 ml) obsahujícího 1 mmol 2(2-aminoethoxy)-ethanolu. Reakční směs byla třepána přes noc za laboratorní teploty. Poté byl přidán 1 mmol triacetoxyborohydridu sodného v roztoku 5% kyseliny octové v suchém DMF (1.5 ml). Reakční směs byla třepána 3 hodiny za laboratorní teploty, poté promyta 3 x DMF, následně třepána 10 min. s roztokem 10% piperidinu v DMF (3 ml), promyta 3 x DMF a 3 x DCM. Obdržená pryskyřice byla suspendována v 0.2M roztoku Fmoc-OSu s ekvivalentem DIEA v DCM (3 ml), třepána 2 hodiny za laboratorní teploty a pak promyta 3 x DCM. Obdržená pryskyřice byla třepána v 0.2M roztoku methansulfonylchloridu v pyridinu (3 ml) dvě hodiny za laboratorní teploty, pak promyta 3 x DMF. Obdržená pry skyřice byla suspendována v 2M roztoku tetraethylenglykolátu sodného v DMSO (3 ml) (roztok byl připraven smícháním ekvivalentu NaH a tetraethylenglykolu za laboratorní teploty), třepána přes noc za laboratorní teploty, poté promyta 3 x DMF, třepána 10 minut s 20%-ním roztokem kyseliny octové v DMF, 10 minut s 20%-ním roztokem piperidinu v DMF, promyta 3 x DMF a 3 x DCM. Obdržená pryskyřice byla třepána v 0.2M roztoku Fmoc-OSu s ekvivalentem DIEA v DCM (3 ml) 2 hodiny za laboratorní teploty a pak promyta 3 x DCM. Obdržená pryskyřice byla třepána v DMF (3 ml) obsahující 1 mmol BtOH, 1 mmol DIC, 1 mmol biotinu a 1 mmol DIEA přes noc za laboratorní teploty, poté byla pryskyřice promyta 3 x DMF. Tento reakční krok byl následně zopakován 3 x za stejných podmínek. Obdržená pryskyřice byla suspendována v roztoku 10% piperidinu v DMF (3 ml), třepána 15 minut za laboratorní teploty, pak promyta 3 x DMF, 3 x DCM, 3 x MeOFI a vysušena v proudu dusíku.
Analýza produktu: 10 mg pryskyřice bylo třepáno v 0.5M roztoku Fmoc-OSu a DIEA v DCM (1 ml) 30 min. za laboratorní teploty, pak byla pryskyřice promyta 3 x DCM a třepána v 50%ním roztoku TFA v DCM (0.5 ml). Poté byl vzorek odpařen dosucha v proudu dusíku a odparek analyzován pomocí HPLC-UV-MS. Detekován produkt 7d jako odpovídající Fmocderivát, ESI-MS m/z = 730.8, [M+H]+. čistota 90%.
Příklad 5
Postup použití derivátů 7:
Obecný postup derivatizace sloučenin s karboxylovou skupinou použitím mobilizovaných derivátů 7:
250 mg Výchozí aminomethylové pryskyřice bylo podrobeno syntéze derivátů 7 dle výše uvedených postupů. Výsledná pryskyřice byla třepána s roztokem 0.5 mmol příslušné karboxylové kyseliny, 0.5 mmol BtOH a 0.5 mmol DIC ve směsi DMF a DCM (1:1, 2.5 ml) přes noc za laboratorní teploty. Obdržená pryskyřice byla promyta 3 x DMF. 3 x DCM a poté třepána v 50%-ním roztoku TFA v DCM (2.5 ml). Poté byla pryskyřice odfiltrována, filtrát odpařen dosucha v proudu dusíku a odparek sonifíkován v diethyletheru. Vvsrážená pevná látka byla odsáta a promyta diethyletherem. V případě, že vzhledem k rozpustnosti látky nebylo možné produkt vysrážet diethyletherem, byl odparek rozpuštěn v chloroformu (5 ml) a protřepán s 5%-ním roztokem hydrogenuhličitanu sodného (5 ml). Organická vrstva byla oddělena, vysušena síranem sodným a zahuštěna dosucha. V obou případech se výtěžky pohybují v rozmezí 70-90% teorie.
Příklady použití:
Studovaná karboxylová kyselina Biotinylační jednotka Sloučenina 13 m/z ([M-H]*) (HPLC-UV-MS) Sloučenina 13 Čistota (%) (HPLC-UV-MS)
Fmoc-L-Ala 7a 625.7 95
Benzoová kyselina 7a 436.2 95
Nikotinová kyselina 7a 437.4 93
Propionová kyselina 7a 388.2 95
Fmoc-L-Ala 7b 713.8 92
Benzoová kyselina 7b 524.6 93
Nikotinová kyselina 7b 526.6 91
Propionová kyselina 7b 490.6 92
Fmoc-L-Ala 7c 757.8 93
Benzoová kyselina 7c 568.7 90
Nikotinová kyselina 7c 569.7 89
Propionová kyselina 7c 534.6 90
Fmoc-L-Ala 7d 801.8 88
Benzoová kyselina 7d 612.7 84
Nikotinová kyselina 7d 613.7 85
Propionová kyselina 7d 578.7 85
Struktura vybraných derivátů 13 byla potvrzena pomocí *H a l3C NMR spektroskopie.
Průmyslová využitelnost
Imobilizované deriváty obecného vzorce 7 jsou vhodné pro efektivní derivatizaci sloučenin obsahujících ve své struktuře karboxylovou skupinu a mohou tak sloužit k rutinní derivatizaci takových sloučenin a následnému studiu jejich vlastností pomocí afinitní chromatografie. To je využitelné zejména ve farmaceutickém výzkumu při určování molekulárního cíle biologicky aktivních látek.

Claims (4)

  1. Patentové nároky
    1. Imobilizované deriváty biotinu obecného vzorce 7 vyznačujících se tím, Pol\ /\H
    L N že n představuje počet ethylenoxy jednotek a nabývá hodnot 1-5 a symbol Pol představuje polystyrénovou pryskyřici tvořenou kopolymerem styrenu a divinylbenzenu.
  2. 2. Způsob přípravy derivátů podle nároku 1 vyznačující se tím, že sloučeniny obecného vzorce 7 se připravují syntézou na pevné fázi (polymeru).
  3. 3. Způsob přípravy podle nároku 2 vyznačující se tím, že syntéza zahrnuje kroky:
    • Imobilizaci 2-(2-aminoethoxy)-ethanolu pomocí reduktivní aminace na polymerní pryskyřici obsahující navázaný 4-oxy-2-methoxybenzaldehyd za vzniku derivátu 8 • Derivatizaci mobilizovaného 2-(2-aminocthoxy)-cthanolu fluorenylmethoxykarbonylovou protektivní skupinou za vzniku derivátu 9 • Acylaci hydroxyskupiny v derivátu 9 biotinem a následnou deprotekci aminoskupiny za vzniku derivátu 7a • Esterifikaci hydroxyskupiny ve sloučenině 9 pomocí chloridu kyseliny methansulfonové, p-toluensulfonové nebo trifluoromethansulfonanhydridem za vzniku sloučeniny 10 • Reakci esteru sulfonové kyseliny 10 s alkalickými solemi diethylenglykolu, triethylenglykolu nebo tetraethylenglykolu za vzniku sloučeniny 11 • Derivatizaci sloučeniny 11 fluorenylmethoxykarbonylovou protektivní skupinou, následnou acylaci hydroxyskupiny biotinem a deprotekci aminoskupiny za vzniku derivátu 7b-d,
  4. 4. Způsob použití derivátů podle nároku 1 vyznačující se tím, že sloučeniny typu 7 jsou podrobeny reakci se sloučeninou obsahující karboxylovou skupinu za vzniku látek 12 a následně působením kyseliny trifluoroctové je odštěpen polymer za vzniku sloučenin 13.
CZ20100230A 2010-03-29 2010-03-29 Efektivní zpusob biotinylace sloucenin s karboxylovou skupinou pomocí syntézy na pevné fázi pro potreby afinitní chromatografie CZ302510B6 (cs)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CZ20100230A CZ302510B6 (cs) 2010-03-29 2010-03-29 Efektivní zpusob biotinylace sloucenin s karboxylovou skupinou pomocí syntézy na pevné fázi pro potreby afinitní chromatografie

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CZ20100230A CZ302510B6 (cs) 2010-03-29 2010-03-29 Efektivní zpusob biotinylace sloucenin s karboxylovou skupinou pomocí syntézy na pevné fázi pro potreby afinitní chromatografie

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CZ2010230A3 true CZ2010230A3 (cs) 2010-09-08
CZ302510B6 CZ302510B6 (cs) 2011-06-22

Family

ID=42676575

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CZ20100230A CZ302510B6 (cs) 2010-03-29 2010-03-29 Efektivní zpusob biotinylace sloucenin s karboxylovou skupinou pomocí syntézy na pevné fázi pro potreby afinitní chromatografie

Country Status (1)

Country Link
CZ (1) CZ302510B6 (cs)

Family Cites Families (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4709037A (en) * 1987-02-17 1987-11-24 Hoechst Celanese Corporation Biotinylating agents
DE4302241A1 (de) * 1993-01-27 1994-07-28 Boehringer Mannheim Gmbh Neues Biotinylierungsreagenz
AU2052497A (en) * 1996-02-08 1997-08-28 Board Of Regents Of The University Of Washington, The Biotin-containing compounds, biotinylation reagents and methods
SE0002287D0 (sv) * 2000-06-16 2000-06-16 Department Of Radiation Oncolo Biotinderivat
FR2814463B1 (fr) * 2000-09-22 2002-11-15 Sanofi Synthelabo Nouveaux polysaccharides a activite antithrombotique comprenant au moins une liaison covalente avec la biotine ou un derive de la biotine
EP2013217A1 (en) * 2006-05-02 2009-01-14 Universita' degli Studi di Roma " Tor Vergata" Design and synthesis of biotinylated probes for n-acyl-ethanolamines

Also Published As

Publication number Publication date
CZ302510B6 (cs) 2011-06-22

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP5256043B2 (ja) 複数の置換基を有する抗菌4,5−置換アミノグリコシドアナログ
US20030176670A1 (en) Multivalent macrolide antibiotics
JP7296396B2 (ja) アマニチン類抗体複合物
Shih et al. Combinatorial approach toward synthesis of small molecule libraries as bacterial transglycosylase inhibitors
CN110407749A (zh) 一种含有二硫键的光亲和链接体及制备方法和应用
WO1999061583A2 (en) Carbohydrate-based scaffold compounds, combinatorial libraries and methods for their construction
Massarenti et al. Fluorous-tag assisted synthesis of bile acid–bisphosphonate conjugates via orthogonal click reactions: an access to potential anti-resorption bone drugs
Barbie et al. Total synthesis of desoxycyclomarin C and the cyclomarazines A and B
TR201819440T4 (tr) Yüklü çapraz bağlayıcıların hazırlanmasına yönelik yöntemler.
US20220251545A1 (en) Fragment-based screening to identify small molecules that selectively bind rna
EP3137898A2 (en) Fluorescent molecular sensor for targeting changes in protein surfaces, and methods of use thereof
CA3234324A1 (en) Peptide
Shaikh et al. Synthesis of glycocluster peptides
CZ2010230A3 (cs) Efektivní zpusob biotinylace sloucenin s karboxylovou skupinou pomocí syntézy na pevné fázi pro potreby afinitní chromatografie
Prats-Alfonso et al. Facile solid-phase synthesis of biotinylated alkyl thiols
CN116217655B (zh) 一种连接基药物偶联物的中间体的制备方法
CN110873772B (zh) 一种探针及其合成方法和应用
CN110483398A (zh) 一种含有生物可降解基团的光亲和链接体及制备方法和应用
Kukielski et al. Rapid solid-phase syntheses of a peptidic-aminoglycoside library
EP2627634B1 (en) A new dimedon derivative and a method for the purification of pna and peptide oligomers
CN113924304B (zh) 四官能性化学探针和使用所述探针鉴定来自于活细胞或活组织的靶膜蛋白的方法
Sucholeiki et al. An affinity chromatographic method for the purification of water-insoluble peptides
CZ2010229A3 (cs) Efektivní zpusob biotinylace aminosloucenin pomocí syntézy na pevné fázi pro potreby afinitní chromatografie
CN110218228B (zh) 用于固定蛋白的化合物和固定蛋白的方法
US20250147030A1 (en) Peptide-encoded libraries of small molecules for de novo drug discovery

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A Patent lapsed due to non-payment of fee

Effective date: 20160329