CZ20012172A3 - Proteiny rodu Streptococcus skupiny B a jejich pouľití - Google Patents
Proteiny rodu Streptococcus skupiny B a jejich pouľití Download PDFInfo
- Publication number
- CZ20012172A3 CZ20012172A3 CZ20012172A CZ20012172A CZ20012172A3 CZ 20012172 A3 CZ20012172 A3 CZ 20012172A3 CZ 20012172 A CZ20012172 A CZ 20012172A CZ 20012172 A CZ20012172 A CZ 20012172A CZ 20012172 A3 CZ20012172 A3 CZ 20012172A3
- Authority
- CZ
- Czechia
- Prior art keywords
- pho3
- gene
- identified
- peptide
- infection
- Prior art date
Links
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title claims abstract description 121
- 241000194017 Streptococcus Species 0.000 title claims description 8
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 title description 20
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 claims abstract description 17
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 claims abstract description 15
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims abstract description 14
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims abstract description 5
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims description 37
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 27
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 claims description 8
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 claims description 6
- 238000011282 treatment Methods 0.000 claims description 5
- 229940079593 drug Drugs 0.000 claims description 3
- 208000019206 urinary tract infection Diseases 0.000 claims description 3
- 230000001018 virulence Effects 0.000 claims description 3
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 2
- 230000002265 prevention Effects 0.000 claims description 2
- 238000012216 screening Methods 0.000 claims description 2
- 208000035143 Bacterial infection Diseases 0.000 claims 1
- 208000035357 Focal Infection Diseases 0.000 claims 1
- 208000022362 bacterial infectious disease Diseases 0.000 claims 1
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 claims 1
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 claims 1
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims 1
- 241000193990 Streptococcus sp. 'group B' Species 0.000 abstract description 4
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 abstract description 4
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 abstract 1
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 40
- 208000035895 Guillain-Barré syndrome Diseases 0.000 description 32
- 101150009573 phoA gene Proteins 0.000 description 30
- 241000193996 Streptococcus pyogenes Species 0.000 description 26
- 101100084022 Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) lapA gene Proteins 0.000 description 20
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 16
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 16
- 241000194032 Enterococcus faecalis Species 0.000 description 12
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 12
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 12
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 9
- 235000014469 Bacillus subtilis Nutrition 0.000 description 8
- 241000194019 Streptococcus mutans Species 0.000 description 8
- 241000193998 Streptococcus pneumoniae Species 0.000 description 8
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 8
- 229940032049 enterococcus faecalis Drugs 0.000 description 8
- 229940031000 streptococcus pneumoniae Drugs 0.000 description 8
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 7
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 7
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 6
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 6
- 101150081160 dltB gene Proteins 0.000 description 6
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 6
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 6
- 229940023064 escherichia coli Drugs 0.000 description 5
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 5
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 5
- 101150015333 kup gene Proteins 0.000 description 5
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 5
- 244000063299 Bacillus subtilis Species 0.000 description 4
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 4
- 102000018697 Membrane Proteins Human genes 0.000 description 4
- ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N Potassium Chemical compound [K] ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 4
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 4
- 229910052700 potassium Inorganic materials 0.000 description 4
- 239000011591 potassium Substances 0.000 description 4
- 239000013615 primer Substances 0.000 description 4
- 241000589969 Borreliella burgdorferi Species 0.000 description 3
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 3
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 3
- 241000606768 Haemophilus influenzae Species 0.000 description 3
- 101100077927 Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) mrdA gene Proteins 0.000 description 3
- 108090001030 Lipoproteins Proteins 0.000 description 3
- 102000004895 Lipoproteins Human genes 0.000 description 3
- 108700020474 Penicillin-Binding Proteins Proteins 0.000 description 3
- 101100054091 Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) par2 gene Proteins 0.000 description 3
- 206010040047 Sepsis Diseases 0.000 description 3
- 241000191965 Staphylococcus carnosus Species 0.000 description 3
- 210000002421 cell wall Anatomy 0.000 description 3
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 3
- 229940047650 haemophilus influenzae Drugs 0.000 description 3
- RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N imidazole Natural products C1=CNC=N1 RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 3
- 102000005416 ATP-Binding Cassette Transporters Human genes 0.000 description 2
- 108010006533 ATP-Binding Cassette Transporters Proteins 0.000 description 2
- 206010053555 Arthritis bacterial Diseases 0.000 description 2
- 108010077805 Bacterial Proteins Proteins 0.000 description 2
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 2
- 241000193764 Brevibacillus brevis Species 0.000 description 2
- 108010078791 Carrier Proteins Proteins 0.000 description 2
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 2
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 2
- 125000000030 D-alanine group Chemical class [H]N([H])[C@](C([H])([H])[H])(C(=O)[*])[H] 0.000 description 2
- SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N D-mannomethylose Natural products CC1OC(O)C(O)C(O)C1O SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108090000860 Endopeptidase Clp Proteins 0.000 description 2
- 208000004575 Infectious Arthritis Diseases 0.000 description 2
- 206010061218 Inflammation Diseases 0.000 description 2
- SHZGCJCMOBCMKK-JFNONXLTSA-N L-rhamnopyranose Chemical compound C[C@@H]1OC(O)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O SHZGCJCMOBCMKK-JFNONXLTSA-N 0.000 description 2
- PNNNRSAQSRJVSB-UHFFFAOYSA-N L-rhamnose Natural products CC(O)C(O)C(O)C(O)C=O PNNNRSAQSRJVSB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 244000199866 Lactobacillus casei Species 0.000 description 2
- 206010061308 Neonatal infection Diseases 0.000 description 2
- 108010053775 Nisin Proteins 0.000 description 2
- NVNLLIYOARQCIX-MSHCCFNRSA-N Nisin Chemical compound N1C(=O)[C@@H](CC(C)C)NC(=O)C(=C)NC(=O)[C@@H]([C@H](C)CC)NC(=O)[C@@H](NC(=O)C(=C/C)/NC(=O)[C@H](N)[C@H](C)CC)CSC[C@@H]1C(=O)N[C@@H]1C(=O)N2CCC[C@@H]2C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]2C(NCC(=O)N[C@H](C)C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCSC)C(=O)NCC(=O)N[C@H](CS[C@@H]2C)C(=O)N[C@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H](CCSC)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]2C(N[C@H](C)C(=O)N[C@@H]3C(=O)N[C@@H](C(N[C@H](CC=4NC=NC=4)C(=O)N[C@H](CS[C@@H]3C)C(=O)N[C@H](CO)C(=O)N[C@H]([C@H](C)CC)C(=O)N[C@H](CC=3NC=NC=3)C(=O)N[C@H](C(C)C)C(=O)NC(=C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(O)=O)=O)CS[C@@H]2C)=O)=O)CS[C@@H]1C NVNLLIYOARQCIX-MSHCCFNRSA-N 0.000 description 2
- 101150012056 OPRL1 gene Proteins 0.000 description 2
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 2
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 2
- 241000589540 Pseudomonas fluorescens Species 0.000 description 2
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 2
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 2
- 241000607762 Shigella flexneri Species 0.000 description 2
- 241000264435 Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis Species 0.000 description 2
- 244000057717 Streptococcus lactis Species 0.000 description 2
- 241000194020 Streptococcus thermophilus Species 0.000 description 2
- 241000607477 Yersinia pseudotuberculosis Species 0.000 description 2
- 206010000269 abscess Diseases 0.000 description 2
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 2
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 2
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 2
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 2
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 2
- 210000000988 bone and bone Anatomy 0.000 description 2
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 2
- 239000003593 chromogenic compound Substances 0.000 description 2
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 2
- 102000004432 dTDP-4-dehydrorhamnose reductase Human genes 0.000 description 2
- 108010083506 dTDP-4-dehydrorhamnose reductase Proteins 0.000 description 2
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 2
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 2
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 2
- 108010060371 endo-N-acetylmuramidase Proteins 0.000 description 2
- 206010014801 endophthalmitis Diseases 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- 101150110946 gatC gene Proteins 0.000 description 2
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 2
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 2
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 description 2
- 208000004396 mastitis Diseases 0.000 description 2
- 238000000034 method Methods 0.000 description 2
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 2
- 239000004309 nisin Substances 0.000 description 2
- 235000010297 nisin Nutrition 0.000 description 2
- 101150055083 ospC gene Proteins 0.000 description 2
- 101150053585 perM gene Proteins 0.000 description 2
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 description 2
- 230000004260 plant-type cell wall biogenesis Effects 0.000 description 2
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 2
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 2
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 2
- 230000035935 pregnancy Effects 0.000 description 2
- 230000002797 proteolythic effect Effects 0.000 description 2
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 2
- 201000001223 septic arthritis Diseases 0.000 description 2
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 2
- 101150044856 spaR gene Proteins 0.000 description 2
- 229960000268 spectinomycin Drugs 0.000 description 2
- UNFWWIHTNXNPBV-WXKVUWSESA-N spectinomycin Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](NC)[C@@H](O)[C@H]([C@@H]([C@H]1O1)O)NC)[C@]2(O)[C@H]1O[C@H](C)CC2=O UNFWWIHTNXNPBV-WXKVUWSESA-N 0.000 description 2
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 2
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 2
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 2
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 2
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 2
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 2
- 101150086824 yutD gene Proteins 0.000 description 2
- QRXMUCSWCMTJGU-UHFFFAOYSA-L (5-bromo-4-chloro-1h-indol-3-yl) phosphate Chemical compound C1=C(Br)C(Cl)=C2C(OP([O-])(=O)[O-])=CNC2=C1 QRXMUCSWCMTJGU-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 101710088758 23kDa protein Proteins 0.000 description 1
- XZKIHKMTEMTJQX-UHFFFAOYSA-N 4-Nitrophenyl Phosphate Chemical compound OP(O)(=O)OC1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 XZKIHKMTEMTJQX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 1
- 241000893512 Aquifex aeolicus Species 0.000 description 1
- 101100455969 Bacillus subtilis (strain 168) mdxK gene Proteins 0.000 description 1
- 108700003860 Bacterial Genes Proteins 0.000 description 1
- 101710166119 Basic membrane protein Proteins 0.000 description 1
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091035707 Consensus sequence Proteins 0.000 description 1
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 1
- 239000003155 DNA primer Substances 0.000 description 1
- 241000238557 Decapoda Species 0.000 description 1
- 244000024708 Dioscorea cayenensis Species 0.000 description 1
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 1
- 101100053968 Escherichia coli (strain K12) znuC gene Proteins 0.000 description 1
- 101100173396 Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) fbpC1 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000590002 Helicobacter pylori Species 0.000 description 1
- 102000017727 Immunoglobulin Variable Region Human genes 0.000 description 1
- 108010067060 Immunoglobulin Variable Region Proteins 0.000 description 1
- 108090000862 Ion Channels Proteins 0.000 description 1
- 102000004310 Ion Channels Human genes 0.000 description 1
- 235000013958 Lactobacillus casei Nutrition 0.000 description 1
- 241000186840 Lactobacillus fermentum Species 0.000 description 1
- 241000186606 Lactobacillus gasseri Species 0.000 description 1
- 241000186604 Lactobacillus reuteri Species 0.000 description 1
- 241001625930 Luria Species 0.000 description 1
- FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N Magnesium Chemical compound [Mg] FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101710164702 Major outer membrane protein Proteins 0.000 description 1
- 102000003939 Membrane transport proteins Human genes 0.000 description 1
- 108090000301 Membrane transport proteins Proteins 0.000 description 1
- 201000009906 Meningitis Diseases 0.000 description 1
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 1
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 1
- 102100030176 Muscular LMNA-interacting protein Human genes 0.000 description 1
- 241000186359 Mycobacterium Species 0.000 description 1
- 108010062010 N-Acetylmuramoyl-L-alanine Amidase Proteins 0.000 description 1
- 229910002651 NO3 Inorganic materials 0.000 description 1
- NHNBFGGVMKEFGY-UHFFFAOYSA-N Nitrate Chemical compound [O-][N+]([O-])=O NHNBFGGVMKEFGY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 1
- 101710116435 Outer membrane protein Proteins 0.000 description 1
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 1
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 1
- 102000007079 Peptide Fragments Human genes 0.000 description 1
- 108010033276 Peptide Fragments Proteins 0.000 description 1
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 description 1
- 206010035664 Pneumonia Diseases 0.000 description 1
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 1
- 241000589517 Pseudomonas aeruginosa Species 0.000 description 1
- 241001123650 Schwanniomyces occidentalis Species 0.000 description 1
- 102100027287 Serpin H1 Human genes 0.000 description 1
- 108050008290 Serpin H1 Proteins 0.000 description 1
- 241000191967 Staphylococcus aureus Species 0.000 description 1
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 1
- 241000193985 Streptococcus agalactiae Species 0.000 description 1
- 235000014897 Streptococcus lactis Nutrition 0.000 description 1
- 241001464947 Streptococcus milleri Species 0.000 description 1
- 241000194024 Streptococcus salivarius Species 0.000 description 1
- 241000194021 Streptococcus suis Species 0.000 description 1
- 108010023191 Streptomycin 3''-adenylyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 1
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 1
- 108020005038 Terminator Codon Proteins 0.000 description 1
- 108010006886 Vitrogen Proteins 0.000 description 1
- 241000607447 Yersinia enterocolitica Species 0.000 description 1
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 1
- 230000002776 aggregation Effects 0.000 description 1
- 238000004220 aggregation Methods 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 1
- 230000000845 anti-microbial effect Effects 0.000 description 1
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 1
- 230000002238 attenuated effect Effects 0.000 description 1
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 1
- 239000001055 blue pigment Substances 0.000 description 1
- 239000002775 capsule Substances 0.000 description 1
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 1
- 230000032823 cell division Effects 0.000 description 1
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 229960005091 chloramphenicol Drugs 0.000 description 1
- WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N chloramphenicol Chemical compound ClC(Cl)C(=O)N[C@H](CO)[C@H](O)C1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N 0.000 description 1
- 239000013611 chromosomal DNA Substances 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 239000013599 cloning vector Substances 0.000 description 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 1
- 108060002399 dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase Proteins 0.000 description 1
- ZOSQFDVXNQFKBY-ZORVDHEWSA-N dTDP-rhamnose Chemical compound OC1C(O)C(O)C(C)OC1OP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@@H]1[C@@H](O)C[C@H](N2C(NC(=O)C(C)=C2)=O)O1 ZOSQFDVXNQFKBY-ZORVDHEWSA-N 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 210000002919 epithelial cell Anatomy 0.000 description 1
- 101150020570 fbpC gene Proteins 0.000 description 1
- 210000003754 fetus Anatomy 0.000 description 1
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 1
- 238000001415 gene therapy Methods 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 229940037467 helicobacter pylori Drugs 0.000 description 1
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 1
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 1
- 208000026278 immune system disease Diseases 0.000 description 1
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 1
- 239000003547 immunosorbent Substances 0.000 description 1
- 238000009169 immunotherapy Methods 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 1
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 1
- 230000009545 invasion Effects 0.000 description 1
- 229940017800 lactobacillus casei Drugs 0.000 description 1
- 229940001882 lactobacillus reuteri Drugs 0.000 description 1
- 231100000518 lethal Toxicity 0.000 description 1
- 230000001665 lethal effect Effects 0.000 description 1
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 1
- 238000009630 liquid culture Methods 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 229920002521 macromolecule Polymers 0.000 description 1
- 229910052749 magnesium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011777 magnesium Substances 0.000 description 1
- 101150003248 malK gene Proteins 0.000 description 1
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 1
- 229910021645 metal ion Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000004005 microsphere Substances 0.000 description 1
- 235000013336 milk Nutrition 0.000 description 1
- 239000008267 milk Substances 0.000 description 1
- 210000004080 milk Anatomy 0.000 description 1
- 101150064202 mrdA gene Proteins 0.000 description 1
- 238000011587 new zealand white rabbit Methods 0.000 description 1
- 101150005569 pbpA gene Proteins 0.000 description 1
- 101150028051 pbpC gene Proteins 0.000 description 1
- 229930029653 phosphoenolpyruvate Natural products 0.000 description 1
- DTBNBXWJWCWCIK-UHFFFAOYSA-N phosphoenolpyruvic acid Chemical compound OC(=O)C(=C)OP(O)(O)=O DTBNBXWJWCWCIK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 description 1
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 1
- 101150016899 potA gene Proteins 0.000 description 1
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 description 1
- 230000000644 propagated effect Effects 0.000 description 1
- 230000000069 prophylactic effect Effects 0.000 description 1
- 230000007065 protein hydrolysis Effects 0.000 description 1
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 1
- 238000010188 recombinant method Methods 0.000 description 1
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 1
- 230000004044 response Effects 0.000 description 1
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 1
- 101150017775 sgcC gene Proteins 0.000 description 1
- 230000035939 shock Effects 0.000 description 1
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 1
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 1
- 239000002344 surface layer Substances 0.000 description 1
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 1
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 1
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 1
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 1
- 241001515965 unidentified phage Species 0.000 description 1
- 210000004291 uterus Anatomy 0.000 description 1
- 229940098232 yersinia enterocolitica Drugs 0.000 description 1
- 101150034099 yubE gene Proteins 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/02—Bacterial antigens
- A61K39/09—Lactobacillales, e.g. aerococcus, enterococcus, lactobacillus, lactococcus, streptococcus
- A61K39/092—Streptococcus
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P13/00—Drugs for disorders of the urinary system
- A61P13/02—Drugs for disorders of the urinary system of urine or of the urinary tract, e.g. urine acidifiers
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P19/00—Drugs for skeletal disorders
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P19/00—Drugs for skeletal disorders
- A61P19/02—Drugs for skeletal disorders for joint disorders, e.g. arthritis, arthrosis
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P27/00—Drugs for disorders of the senses
- A61P27/02—Ophthalmic agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/04—Antibacterial agents
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/195—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
- C07K14/315—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Streptococcus (G), e.g. Enterococci
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/569—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for microorganisms, e.g. protozoa, bacteria, viruses
- G01N33/56911—Bacteria
- G01N33/56944—Streptococcus
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
- Y02A50/00—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
- Y02A50/30—Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Mycology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Hematology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Virology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Physical Education & Sports Medicine (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Pathology (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
Description
Proteiny rodu Streptococcus skupiny B a jejich použití
Oblast techniky
Vynález se týká identifikace bakteriálních genů a proteinů a jejich použití. Zvláště se vynález týká jejich použití v léčbě, pro imunizaci a screening léků.
Dosavadní stav techniky
Skupina B rodu Streptococcus (GBS), také známá jako Streptococcus agalactiae, je příčinou různých chorobných stavů. Konkrétně GBS způsobuje následující stavy:
Časná neonatální infekce
Tato infekce obvykle začíná v děloze a způsobuje vážnou otravu krve a zápal plic dětí, pokud není léčena, je letální a dokonce je-li léčena, je stále spojena s 10 až 20% stupněm úmrtnosti.
Pozdní neonatální infekce
Tato infekce se vyskytuje v období časně po porodu do stáří asi 3 měsíců. Způsobuje otravu krve, která je v 90 % případů komplikována meningitidou. Doprovází ji často další fekální infekce, včetně zánětu kosti a kostní dřeně, septické arthritidy, abscesů a endoftalmitidy.
Infekce dospělých
Tyto infekce se stávají stále častějšími a vyskytují se hlavně u žen, které právě porodily, starších a s poruchami imunity. Jsou charakterizovány otravou krve a fekálními infekcemi včetně zánětu kosti a kostní dřeně, septické arthritidy, abscesů a endoftalmitidy.
Infekce močového traktu
GBS jsou příčinou infekcí močového traktu a v těhotenství zapříčiňují asi 10 % všech infekcí.
Veterinární infekce
GBS způsobují chronickou mastitidu u krav. Ta vede ke snížené produkci mléka a je tedy velmi závažná z ekonomického hlediska.
GBS infekce mohou být léčeny antibiotiky. Imunizace je však výhodnější. Je tedy žádoucí vyvinout imunogen, který by mohl být použit v terapeuticky efektivní vakcíně.
Podstata vynálezu
Vynález je založen na identifikaci série genů GBS a také příbuzných organismů, jejichž produkty mohou být spojovány s vnějším povrchem organismu a mohou být tedy použity jako cíl imunoterapie.
Podle jednoho aspektu vynálezu je peptid kódován operonem obsahujícím kterýkoli z genů zde identifikovaných jako pho1-13, pho3-21, pho2-15, pho3-18, pho3-22, pho3-3, pho3-17, pho2-2, pho1-5, pho3-1, pho3-23, pho3-50, pho1-14, pho2-10, pho3-14, pho3-24 a pho3-29, které lze získat ze skupiny B rodu Streptococcus, nebo jejich homolog nebo jejich funkční fragment. Takový peptid je vhodný pro terapeutické použití, je-li izolován.
Termín „funkční fragmenty“ je zde použit pro definování části genu nebo peptidu, která si zachovala aktivitu celého genu nebo peptidu. Například může být funkční fragment peptidu použit jako antigenní determinant použitelný jako vakcína, nebo pro produkci protilátek.
Genový fragment může být použit pro kódování aktivního peptidu. Případně může mít genový fragment použití v genové terapii, se zacílením na gen divokého typu in-vivo k uplatnění terapeutického účinku.
Peptid podle vynálezu může zahrnovat kteroukoli z aminokyselinových sekvencí identifikovaných zde jako SEKV. ID. Č. 2, 4, 6, 8, 10, 11, 13, 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31, 33 a 35, nebo jejich funkční fragmenty.
Protože peptidy podle vynálezu jsou lokalizovány extracelulárně nebo na buněčném povrchu, mohou být vhodnými kandidáty pro produkci terapeuticky účinných vakcín proti GBS. Termín „terapeuticky účinný“ má zahrnovat profylaktický účinek vakcín. Například může vakcína obsahovat peptid podle vynálezu nebo prostředky pro jeho expresi pro léčbu infekcí.
Tato vakcína může být podávána ženám buď před nebo v průběhu těhotenství pro ochranu matky a plodu proti infekci GBS.
Podle dalšího aspektu vynálezu mohou být peptidy nebo geny použity pro screening potenciálních antimikrobiálních léků nebo pro detekci virulence.
Dalším aspektem vynálezu je použití některého ze zde uvedených produktů pro léčbu nebo prevenci stavů spojených s infekcí kmenem Streptococcus skupiny B.
• · · · ·· · · · · · · Λ ·········· ········· ···· ···· · · ·· · · · · · · · · ·
Ačkoli byl protein popsán pro léčbu lidí, veterinární použití produktů podle vynálezu je považováno za spadající do rozsahu vynálezu. Zvláště mohou být peptidy nebo vakcíny použity pro léčbu chronické mastitidy, a to zejména u krav.
Popis vynálezu
Vynález je popsán s odkazem na kmen Streptococcus skupiny B M732. Všechny kmeny GBS a mnoho dalších bakteriálních kmenů však pravděpodobně obsahují příbuzné peptidy nebo proteiny s aminokyselinovými sekvencemi homologickými s peptidem M732. Organismy, které pravděpodobně obsahují tyto peptidy, zahrnují, ale nejsou omezeny na S. pneumoniae, S. pyogenes, S. suis, S. millerí, Streptococci skupin C a G a Enterococci. Vakcíny proti uvedeným bakteriím mohou být připraveny stejným způsobem, jako je popsáno pro GBS.
S výhodou mají peptidy, které mohou být použity pro produkci vakcín, větší než 40% sekvenční podobnost se zde identifikovanými peptidy. Ještě výhodněji mají tyto peptidy větší než 60% sekvenční podobnost. Nejvýhodněji mají tyto peptidy větší než 80% sekvenční podobnost, například 95% podobnost.
Po charakterizaci genu podle vynálezu je možné použít sekvenci genu a určit homologie s jinými mikroorganismy. Tak je možné určit, zda další mikroorganismy mají na vnějším povrchu podobné produkty. Sekvenční homologie mohou být stanoveny prohledáváním existujících databází, například EMBL nebo Genbank.
Peptidy nebo proteiny podle vynálezu mohou být čištěny a izolovány metodami dobře známými odborníkům v oboru. Zvláště pak, identifikujeme-li genové sekvence, je možné užít rekombinantních technik pro expresy genů ve vhodném hostiteli. Aktivní fragmenty a homology mohou být identifikovány a mohou být užitečné v terapii. Například peptidy nebo jejich aktivní fragmenty mohou být použity jako antigenní determinanty ve vakcínách k vyvolání imunitní odpovědi. Mohou být rovněž použity pro přípravu protilátek, pro pasivní imunizaci nebo diagnostické aplikace. Vhodné protilátky zahrnují monoklonální protilátky nebo jejich fragmenty, včetně jednořetězcových Fv fragmentů. Způsoby přípravy protilátek jsou odborníkům v oboru známé.
Příprava vakcín založených na oslabených mikroorganismech je odborníkům v oboru známa. Kompozice vakcín mohou být formulovány s vhodnými nosiči nebo pomocnými látkami, např. ledkem, je-li to nezbytné nebo žádoucí, pro poskytnutí efektivní » · • · imunizace proti Streptococci skupiny B nebo jiným příbuzným mikroorganismům. Příprava formulací vakcíny je odborníkům v oboru známá.
Obecněji, což je rovněž dobře známo odborníkům v oboru, může být zvoleno vhodné množství aktivní komponenty podle vynálezu pro terapeutické použití, stejně jako nosiče nebo masťové základy a způsoby podání. Tyto faktory budou zvoleny nebo stanoveny podle známých kritérií jako je např. povaha/závažnost léčeného stavu, typ nebo zdravotní stav subjektu atd.
Produkty podle vynálezu byly identifikovány následovně:
Částečná genová knihovna chromozomální DNA GBS (kmen M732) byla připravena pomocí plasmidových vektorů pFW-phoA1, pFW-phoA2 a pFW-phoA3 (Podbielski, A. a kol. 1996. Gene 177: 137-147). Tyto plasmidy nesou konstitutivní signální znak spectinomycin adenyltransferázové antibiotické odolnosti, který dodává odolnost vůči vysokým hladinám spectinomycinu a je tedy velmi výhodný pro selekci. Dále tento vektor obsahuje zkrácený (bez vedoucí sekvence) gen Escherichia coli phoA pro alkalickou fosfatázu. Uvedené tři vektory se liší pouze čtecím rámcem, ve kterém leží gen phoA bez vedoucí sekvence, vzhledem k před ním umístěnému BamHI restrikčnímu místu. Jelikož uvedený zkrácený E. coli phoA gen postrádá příslušnou vedoucí sekvenci pro export tohoto enzymu přes bakteriální membránu, není přítomna extracelulární aktivita alkalické fosfatázy, je-li plasmid v propagován v mutantu E.coli phoA (např. kmen DH5a). Chromogenní substrát alkalické fosfatázy XP (5-bromo-4-chloro-3indolylfosfát) nevstupuje do neporušených bakteriálních buněk, takže může být detekována jen aktivita exportované nebo s povrchem spojené alkalické fosfatázy. Je-li přítomna aktivita exportované nebo s povrchem spojené alkalické fosfatázy, je chromogenní substrát XP štěpen za vzniku modrého pigmentu a odpovídající bakteriální kolonie tak mohou být identifikovány pomocí jejich modré barvy.
Plasmidová DNA byla zcela rozštěpena pomocí BamHI a defosforylována pomocí garnátí alkalické fosfatázy. GBS genomická DNA byla částečně štěpena Sau3AI, velikostně rozdělena v gradientu sacharózy a fragmenty o velikosti <1kb byly ligovány do připravených pFW-phoA vektorů. Jako hostitel pro klonování byl zvolen kmen DH5cc E.coli, jelikož postrádá funkční gen phoA. Rekombinantní plasmidy byly selektovány na Luria agaru obsahujícím 100 pg/ml spectinomycinu a 40 pg/ml chromogenního XP substrátu. E.coli transformanti nesoucí plasmidy obsahující DNA GBS insertu, která komplementuje signální sekvenci pro export u genu phoA bez vedoucí sekvence byly iden• · · · · · · · · · · · • · · ···· · · · • · · ♦ · · · · · · • · ·· ·· · · · · · tifikovány pomocí modré barvy kolonií. Takto bylo prověřeno asi 30 000 různých rekombinantních plasmidů obsahujících GBS insert a pro další studium bylo vybráno 83 rekombinantních plasmidů, které komplementovaly phoA bez vedoucí sekvence .
Z těchto experimentů bylo vybráno několik klonů, z nichž každý obsahoval plasmid obsahující gen (nebo jeho část), který komplementoval phoA bez vedoucí sekvence.
Po identifikaci genu v každém z klonů je pak možné získat sekvenci plné délky genu jak je uvedeno dále.
S využitím identifikovaného a sekvencovaného fragmentu genu byly navrženy oligonukleotidové primery pro sekvencování genomové DNA. Tyto primery byly navrženy tak, aby sekvencování probíhalo ve směru ven od získané sekvence. Poté bylo ♦
ověřeno, jestli v získané sekvenci bylo dosaženo 5' a 3' konce genu. Přítomnost těchto znaků byla zjištěna porovnáním s homologickými sekvencemi, a v případě konce 5' byla zkontrolována přítomnost startovacího kodonu (nebo jeho přijatelné alternativy), jemuž předcházela Shineova-Dalgarnova konvenční sekvence, a v případě konce 3'byla zkontrolována přítomnost kodonu terminace translace (stop kodon).
Na základě identifikace genu plné délky byly navrženy primery pro amplifikaci produktu plné délky. Použité primery zahrnují rozpoznávací místa pro restrikční enzymy (Ncol na 5' konci a EcoO109l na 3' konci) pro umožnění následného klonování produktu do použitého Lactococcal expresního systému.
PCR bylo provedeno pomocí těchto primerů a produkty byly klonovány do pCR 2.1 klonovacího vektoru (In Vitrogen). Po ověření přítomnosti klonovaného fragmentu byla DNA vystřižena pomocí restrikčních enzymů Ncol a EcoO109l.
Vektor, do kterého byl tento fragment vložen, byl modifikovanou verzí pNZ8048 (Kuipers, O.P. a kol. (1998) J. Biotech 64: 15-21). Tento vektor, nesoucí laktokokální počátek replikace, resistenci k chloramfenikolu, inducibilní promotor nisinu a multiklonovací místo, byl upraven nahrazením části multiklonovacího místa dvěma volnými konci 10X His, ohraničenými na 5' konci Ncol místem, přerušeným uprostřed multiklonovacím místem (zahrnujícím EcqO109I místo), a na 3' konci stop (terminačním) kodonem volného konce His.
Zkoumaný gen byl vložen tak, že volný konec 10x His byl na 3' konci vzhledem ke kódující oblasti.
·· ·· • · · · · ··· • · · · · ♦ ·
Po transformaci rekombinantního plasmidu do L.lactís (kmen NZ9000 - Kuipers, O.P. a kol. (1998), viz výše) bylo připraveno 400 ml tekuté kultury a translace proteinu byla indukována přídavkem nisinu do kultury. Po 2 hodinách inkubace byly buňky sklizeny a lyžovány třepáním se skleněnými mikrokuličkami. Výsledný lyzát byl vyčištěn centrifugací, poté nanesen na afinitní kolonu s imobilizovaným iontem kovu (Talon, Clonetech). Kolona byla promyta opakovaně a poté byl vázaný protein eluován imidazolem.
Pro identifikaci frakcí obsahujících His-zakončený rekombinantní protein byl z každé frakce odebrán alikvot a analyzován pomocí SDS-PAGE, Western blotu a identifikován anti-His protilátkou.
Získaný rekombinantní protein byl poté použit pro imunizaci novozélandských bílých králíků, před imunizací bylo odebráno pre-imunní sérum. Po propagaci byli králíci utraceni a bylo odebráno sérum. Toto sérum bylo použito pro Western bloty, ELISA a modely ochrany zvířat.
S použitím séra získaného z pokusů se zvířaty byly prováděny studie pomocí imunosorbce.
Streptococcus skupiny B byl pěstován ve 20 ml Todd Hewittovy živné půdy (THB) 8 hodin, sklizeny a opětovně suspendovány v 5 ml PBS. 50μΙ alikvoty byly použity pro pokrytí jamek 96-jamkové destičky (Nunc Immono-Sorb). Destička byla ponechána přes noc při 4 °C, aby došlo k adsorpci bakterií na destičku. Destičky byly dvakrát promyty PBS, poté blokovány 3% BSA v PBS 1 hodinu při 37 °C. Destičky byly znovu promyty. Byla připravena desetinná ředění séra v PBS a 50 μΙ těchto ředění byla přidána do jamek vždy dvojmo. Destičky byly zakryty a inkubovány 1 hodinu při 37 °C. Destičky byly promyty, poté bylo přidáno do každé jamky 50 μΙ anti-králičí sekundární protilátky konjugované s alkalickou fosfatázou v koncentraci 1 : 5000. Po inkubaci při 37 °C 1 hodinu byla destička znovu promyta. 50 μΙ substrátu (PNPP) bylo přidáno do každé jamky a reakce probíhala 30 minut a poté byla změřena absorbance při 405 nm.
Pro testování efektivity ochrany zvířat byly prováděny studie na imunizovaných králících.
GBS M732 byl napěstován na THB do střední logaritmické fáze, tj. asi 5 hodin. Buňky byly spočítány v počítací cele a bakterie byly naředěny na koncentraci 2x107 bakterií na ml v pre-imunním nebo testovacím séru. 50 μΙ této suspenze bylo injekto ···· · · 9 · · · ♦♦
-, ·······*·· / ·······♦· ···· · · · « ·· • · ·· ·· · 9 9 9 9 váno intraperitoneálně 0-1 den starým myším. Přežívání myší bylo pozorováno 48 hodin.
Následující příklady ilustrují vynález.
Příklad 1
První klon obsahující genovou sekvenci označenou zde jako SEKV. ID. č. 1 s aminokyselinovou sekvencí zde označenou jako SEKV. ID. č. 2 a klasifikovanou jako pho1-13.
Bylo provedeno srovnání aminokyselinových sekvencí pho1-13.
Homology GBS pho1-13 genového produktu mohou být identifikovány u Streptococcus pyogenes, S. pneumoniae, S. salivaríus, Escheríchia coli, Yersinia enterocolitica, Aquifex aeolicus, Helicobacter pylorí a Haemophilus influenzae. U S. pyogenes a
S. pneumoniae byly z jejich genomových sekvenčních dat identifikovány homology a nebyly k dispozici žádné informace týkající se totožnosti genu nebo genového produktu. Ve všech dalších případech mohou být výše uvedené homology identifikovány jako geny proteolytické podjednotky ATP-dependentní Clp proteázy. Katalytická aktivita Cíp proteáz vede k hydrolýze proteinů na malé peptidy, a to v přítomnosti ATP a hořčíku (Giffard, P.M. a kol. 1993. J. Gen. Microbiol. 139: 913-920). Dále bylo ukázáno, že složka ClpP Clp proteáz je indukována jako součást odpovědi na teplotní šok (Kroh, H.E. a L. D. Simon. 1990. J. Bacteriol. 172: 6026-6034), a je pravděpodobné, že tato podjednotka nebo kompletní proteolytická doména je spojena s bakteriálním povrchem.
Studie ochrany zvířat byly prováděny jak bylo popsáno výše. Výsledky byly následující:
| Léčba | počet zvířat | počet zvířat přežívajících v daném čase | |
| 24 hodin | 48 hodin | ||
| PBS | 10 | 7 | 0 |
| Pre-imunizovány | 37 | 13 | 0 |
| Imunizovány | 38 | 17 | 9 |
Příklad 2
Druhý vybraný klon obsahoval plasmid označený jako pho1-14. Tento plasmid obsahoval gen (nebo jeho část), který komplementoval phoA bez vedoucí sekvence.
• «
Nukleotidová a odvozená aminokyselinová sekvence jsou zde označeny jako SEKV. ID. č. 3, respektive 4.
Bylo provedeno srovnání aminokyselinové sekvence pho1-14.
Homology GBS pho1-14 genového produktu mohou být identifikovány u Streptococcus pyogenes, Enterococcus faecalis a Streptococcus pneumoniae. Byly identifikovány homology z genomových sekvenčních dat a nejsou k dispozici žádné informace týkající se totožnosti genu nebo genových produktů. Dále byly identifikovány dva možné homology také u Shigella flexnerí (SpaR) a Yersinia pseudotuberculosis (YscT). Tyto posledně zmíněné homology jsou příbuznými proteiny, o kterých se předpokládá, že jsou ukotveny v bakteriální membráně (Bergman, T. a kol. 1994. J. Bacteriol. 176: 2619-2626). V S. flexnerí bylo zjištěno, že produkt genu spaR je důležitý pro invazi do epitelových buněk (Sasakawa, C. a kol. 1993. J. Bacteriol. 175; 2334-2346). Dále je produkt genu spaR potřebný pro povrchovou presentaci antigenů ínvazního plasmidu. Analogický protein Y. pseudotuberculosis je složkou Yop sekrečního systému a je také důležitý pro virulenci v tomto organismu.
Příklad 3
Třetí vybraný klon obsahoval plasmid označený jako pho1-15. Tento plasmid obsahoval gen (nebo jeho část), který komplementoval phoA bez vedoucí sekvence. Nukleotidová a odvozená aminokyselinová sekvence jsou zde označeny jako SEKV. ID. Č. 5 a 6.
Bylo provedeno srovnání aminokyselinové sekvence pho1-5.
Homology GBS pho1-5 genového produktu mohou být identifikovány pouze u Streptococcus pyogenes a Staphylococcus carnosus (sceA). Homolog u S. pyogenes byl identifikován z genomových sekvenčních dat a není k dispozici žádná informace týkající se totožnosti genu nebo genových produktů. Nemnoho informací je k dispozici o funkci produktu sceA genu u S. carnosus. Produkt sceA genu u S. carnosus vykazuje určitou sekvenční podobnost k proteinu propagujícímu agregaci u Lactobacillus gasseri. Na základě analýzy produktu sceA genu bylo zjištěno, že molekula obsahuje dobře rozeznatelnou signální sekvenci a je zjevně sekretována nebo asociována s buněčným povrchem bakterie.
·····» ·· 9· ·· t · · ♦♦·· · · ·
Příklad 4
Další vybraný klon obsahoval plasmid označený jako pho3-3. Tento plasmid obsahoval gen (nebo jeho část), který komplementoval phoA bez vedoucí sekvence. Nukleotidová a odvozená aminokyselinová sekvence jsou zde označeny jako SEKV. ID. Č. 7 a 8.
Bylo provedeno srovnání aminokyselinové sekvence pho3-3.
Homology GBS pho3-3 genového produktu mohou být identifikovány u Streptococcus mutans (rmiC), (cpsM) S. pneumoniae a S. pyogenes. Homolog u S. pyogenes byl identifikován z genomových sekvenčních dat a není k dispozici žádná informace týkající se totožnosti genu nebo genových produktů. U S. pneumoniae může být homolog identifikován jako dTDP-4-keto-6-deoxyglukóza-3,5-epimeráza. V dalších dvou případech mohou být výše uvedené homology identifikovány jako dTDP-4-keto-L-rhamnózareduktáza (rmIC). U S. mutans je gen kódující enzym rmIC součástí rml loku, rml lokus se skládá ze třech genů, které vykazují významnou homologii s enzymy účastnícími se biosyntézy dTDP-rhamnózy, bezprostředního prekurzoru rhamnózové složky u polysacharidové kapsule S. mutans (Tsukioka, Y. a kol. 1997. J. Bacteriol. 179: 1126-1134). Analogický lokus byl také identifikován u S. pneumoniae (Coffey, T.J. a kol. 1998. Mol. Mircobiol. 17: 73-83). Téměř všichni zástupci Streptococcus charakteristicky obsahují rhamnózu ve svých polysacharidech spojených s buněčnou stěnou (Schleifer, K.H. a R. Kilper-Bálz. 1987. Syst. Appl. Microbiol. 10:1-19) a je vysoce pravděpodobné, že dTDP-4-keto-L-rhamnózareduktáza je spojena s vnějším povrchem Streptococci.
Příklad 5
Další vybraný klon obsahoval plasmid označený jako pho2-10. Tento plasmid obsahoval gen (nebo jeho část), který komplementoval phoA bez vedoucí sekvence.
Nukleotidová sekvence je zde označena jako SEKV. ID. Č. 9, ve které byla identifikována kódující oblasti proti směru exprese genu a po směru exprese genu a odvozené aminokyselinové sekvence byla označeny jako SEKV. ID. Č. 10 a 11.
Bylo provedeno srovnání aminokyselinových sekvencí pho2-10.
Homology GBS pho2-10 genového produktu mohou být identifikovány u Streptococcus pyogenes, Enterococcus faecalis, Debaryomyces occidentalis (hati) a Escherichia coli (trkD). Homology u S. pyogenes a E. faecalis byly identifikovány z genomo10 • φ· · ·♦ » φ vých sekvenčních dat a nebyla k dispozici žádná informace týkající se totožnosti genu nebo genového produktu. U kvasinek D. occidentalis, je gen hakl homologem genu trkDzE. coli (Banuelos, M. A. a kol. 1995. EMBO J. 14:3021-3027). Gen trkD z E. coli je částí kup systému pro příjem draslíku. Specifický, zde identifikovaný homolog je prptein kup systému příjmu draslíku, kup systém je konstitutivní systém příjmu draslíku u E. coli. Protein kup systému pro příjem draslíku obsahuje vysoce hydrofobní N-konec, u něhož bylo předpovězeno, že vede přes membránu nejméně 12krát. Kup není homologický s žádným známým membránovým proteinem. Nejsou známy žádné indikace možnosti vazby ATP a předpokládá se, že systém je poháněn chemiosmotickým gradientem (Schleyer, Μ. & E. P. Bakker, 1993. J. Bacteriol. 175:6925-6931).
Příklad 6
Další vybraný klon obsahoval plasmid označený jako pho2-15. Tento plasmid obsahoval gen (nebo jeho část), který komplementoval phoA bez vedoucí sekvence.
Nukleotidová a odvozená aminokyselinová sekvence je zde označena jako SEKV. ID. Č. 12 a 13.
Bylo provedeno srovnání aminokyselinové sekvence pho2-15.
Homology GBS pho2-15 genového produktu mohou být identifikovány u Streptococcus pyogenes, Streptococcus pneumoniae, Enterococcus faecalis a Escheríchia coli (gatC a SgcC). Homology u S. pyogenes a E. faecalis byly identifikovány z genomových sekvenčních dat a nebyly k dispozici žádné informace týkající se totožnosti genu nebo genových produktů. U E. coli byly gatC a sgcC genové produkty identifikovány jako IIC složka fosfoenolpyruvát-dependentní fosfotransferázového systému pro cukry (PTS), hlavního aktivního transportního systému pro cukry. U PTS systému se IIC složka obvykle účastní vazby extracelulárních cukrů a tvoří komplex s IID složkou za vzniku membránového kanálu (Nobelmann, B. a J.W. Lengeler. 1995. Biochim. Biophys. Acta 1262: 69-72).
Příklad 7
Další vybraný klon obsahoval plasmid označený jako pho2-2. Tento plasmid obsahoval gen (nebo jeho část), který komplementoval phoA bez vedoucí sekvence. Nukleotidová a odvozená aminokyselinová sekvence je zde označena jako SEKV. ID. Č. 14, respektive 15.
······ · · · · · · φ . . *···♦····♦♦ 11 ♦ · · ; · ♦· ; ; · • · · · · · · · · · * ·· ·· ·· ·· · ♦ ·♦·
Bylo provedeno srovnání aminokyselinové sekvence pho2-2.
Homology GBS pho2-2 genového produktu mohou být identifikovány u Enterocqccus faecalis, Escherichia coli (malK a afuC), Bacillus subtilis (glnO), Haemophilus influenzae (yebM a potA), Streptococcus pyogenes, Streptococcus pneumoniae a SaA monella typhimurium (malK). E faecalis, S. pyogenes a S. pneumoniae homology byly identifikovány na základě genomových sekvenčních dat a nejsou k dispozici žádné údaje týkající se totožnosti genu nebo genových produktů. Ve všech ostatních případech homology představují ATP-vázající transportní proteiny, které jsou součástí transportérů typu ABC. Mnoho ze složek transportérů typu ABC je spojeno s membránou nebp povrchem buňky, jelikož tyto systémy se účastní transportu makromolekul z extracelulárního prostředí do prostředí intracelulárního.
Příklad 8
Další vybraný klon obsahoval plasmid označený jako pho3-14. Tento plasmid obsahoval gen (nebo jeho část), který komplementoval phoA bez vedoucí sekvence. Nukleotidová a odvozená aminokyselinová sekvence je zde označena jako SEKV. ID. Č. 16 a 17.
Bylo provedeno srovnání aminokyselinové sekvence pho3-14 a prohledáváním veřejně přístupných databází nebyl nalezen žádný homolog. Jediný homolog GBS php3-14 genového produktu byl identifikován u Streptococcus pyogenes, ale tento homolog byl identifikován na základě genomových sekvenčních dat a nebyly k dispozici žádné údaje týkající se totožnosti genu nebo genového produktu. Když byl pro prohledávání veřejných databází použit tento homolog nalezený u S. pyogenes, neposkytly veřejné databáze žádnou další informaci. Jelikož produkt pho3-14 komplementoval phoA bez vedoucí sekvence, je možno předpokládat, že tento protein (nebo jeho část) je velmi pravděpodobně lokalizován extracelulárně.
Příklad 9
Další vybraný klon obsahoval plasmid označený jako pho3-17. Tento plasmid obsahoval gen (nebo jeho část), který komplementoval phoA bez vedoucí sekvence. Nukleotidová a odvozená aminokyselinová sekvence je zde označena jako SEKV. ID. Č. 18 a 19.
Bylo provedeno srovnání aminokyselinové sekvence pho3-17.
999· ··
9 • · * · · 9 • «999 9 9 · • 99 9 9·· 99 • ·· ·· ·· ·· ·
Homology GBS Pho3-17 genového produktu mohou být identifikovány u Streptococcus mutans a Lactococcus lactis, u kterých byla nalezena podobnost s N-acetylmuramidázou. Byla rovněž pozorována podobnost s neidentifikovaným genem yubE u Bacillus subtilis.
N-acetylmuramidáza je autolysinem, který se účastní buněčného dělení. Na základě této informace spolu s faktem, že pho3-17 komplementuje phoA gen bez vedoucí sekvence, je možno vyvodit, že tento protein (nebo jeho část) je velmi pravděpodobně lokalizován extracelulárně.
Příklad 10
Další vybraný klon obsahoval plasmid označený jako pho3-18. Tento plasmid obsahoval gen (nebo jeho část), který komplementoval phoA bez vedoucí sekvence. Nukleotidová a odvozená aminokyselinová sekvence je zde označena jako SEKV. ID. Č. 20 a 21.
Bylo provedeno srovnání aminokyselinové sekvence pho3-18.
Homology GBS pho3-18 genového produktu mohou být identifikovány u Streptococcus pyogenes a Streptococcus pneumoniae. Tyto homology byly identifikovány na základě genomových sekvenčních dat a nebyl k dispozici žádný údaj týkající se totožnosti genu nebo genových produktů. Pomocí těchto S. pyogenes a S. pneumoniae homologů byly prohledávány veřejné databáze sekvencí a byla ukázána určitá podobnost s proteiny vnějšího povrchu a proteiny vedoucími přes membránu. Jelikož produkt pho3-18 komplementuje phoA gen bez vedoucí sekvence, lze usuzovat, že tento protein (nebo jeho část) je velmi pravděpodobně lokalizován extracelulárně.
Příklad 11
Další vybraný klon obsahoval plasmid označený jako pho3-1. Tento plasmid obsahoval gen (nebo jeho část), který komplementoval phoA bez vedoucí sekvence. Nukleotidová a odvozená aminokyselinová sekvence je zde označena jako SEKV. ID. Č. 22 a 23.
Bylo provedeno srovnání aminokyselinové sekvence pho3-1.
Homology GBS pho3-1 genového produktu mohou být identifikovány u Streptococcus pyogenes, Streptococcus pneumoniae, Bacillus subtilis (yutd) a Enterococcus faecalis. Homology u S. pyogenes, S. pneumoniae a E faecalis byly identifikovány na
základě genomových sekvenčních dat a nejsou k dispozici žádné údaje týkající se totožnosti genů nebo genových produktů. U B.subtilis je funkce genového produktu genu yutD neznámá. Bylo však uvedeno, že gen yutD je lokalizován v chromosomu B.subtilis v oblasti, která se účastní syntézy buněčné stěny. Na základě faktu, že tato DNA sekvence komplementuje phoA gen bez vedoucí sekvence, je možno předpokládat, že tento protein (nebo jeho část) je velmi pravděpodobně lokalizován extracelulárně.
Příklad 12
Další vybraný klon obsahoval plasmid označený jako pho3-21. Tento plasmid obsahoval gen (nebo jeho část), který komplementoval phoA bez vedoucí sekvence. Nukleotidová a odvozená aminokyselinová sekvence je zde označena jako SEKV. ID. Č. 24 a 25.
Bylo provedeno srovnání aminokyselinové sekvence pho3-21.
Homology GBS pho3-1 genového produktu mohou být identifikovány u Streptococcus pyogenes, Streptococcus pneumoniae, Lacobacillus fermentum (bspA) a Lactobacillus reuteri (cnb). Homology u S. pyogenes a S. pneumoniae byly identifikovány na základě genomových sekvenčních dat a nejsou k dispozici žádné údaje týkající se totožnosti genů nebo genových produktů. U L. fermentum byl produkt genu bspA identifikován jako základní protein buněčného povrchu, který vykazuje určitou sekvenční podobnost s rodinou III bakteriálních proteinů vážících rozpuštěné látky (Turner, M. S. a kol. 1997. J. Bacteriol. 179: 3310-3316). U L reuteri, byl produkt genu cnb identifikován jako protein vážící kolagen, který vykazuje určitou sekvenční podobnost se složkou, která váže rozpuštěné látky, bakteriálních ABC transportérů (Roos, S. a kol. 1996. FEMS Microbiol. Lett. 144: 33-38).
Příklad 13
Další vybraný klon obsahoval plasmid označený jako pho3-22. Tento plasmid obsahoval gen (nebo jeho část), který komplementoval phoA bez vedoucí sekvence. Nukleotidová a odvozená aminokyselinová sekvence je zde označena jako SEKV. ID. Č. 26 a 27.
Bylo provedeno srovnání aminokyselinové sekvence pho3-22.
Homology GBS pho3-1 genového produktu mohou být identifikovány u Enterococcus faecalis, Streptococcus equisimilis (IppC), Pseudomonas fluorescens (oprl) a ···· toto *· toto toto · toto to to toto · · ··· • •••••to ·· · to· ··· to· ··· to · • toto· · · · · ·· · ·· ·· ·· ·♦ ·· ···
Streptococcus thermophilus (orf142). Homolog u E. faecalis byl identifikován na základě genomových sekvenčních dat a nebyly k dispozici žádné údaje týkající se totožnosti genů nebo genových produktů. U S. equisimilis byl produkt genu IppC identifikován jako lipoprotein, který je homologický k E(P4) vnějšímu membránovému proteinu z Haemophilus influenzae (Oase, K. a kol. 1997. Med. Microbiol. Immunol. 186: 63-73). Podobně gen oprl u P. fluorescens kóduje hlavní vnější membránový protein (Cornelis, P. a kol. 1989. Mol. Microbiol. 3:421-428). U S. thermophilus byl produkt genu orf142 nezaručeně identifikován jako povrchový lipoprotein, který je receptorem pro bakteriofágy TP-J34 a Sfi21 (Neve, H. a kol. 1998. Virology 241; 61-72). Produkt ORF3-22 vykazuje dobrou podobnost s výše uvedenými homology, zvláště na N-konci. Ten je velmi pravděpodobně oblastí, která komplementuje phoA gen bez vedoucí sekvence a slouží tedy sama jako vedoucí sekvence.
Příklad 14
Další vybraný klon obsahoval plasmíd označený jako pho3-23. Tento plasmid obsahoval gen (nebo jeho část), který komplementoval phoA bez vedoucí sekvence. Nukleotidová a odvozená aminokyselinová sekvence je zde označena jako SEKV. ID. Č. 28 a 29.
Bylo provedeno srovnání aminokyselinové sekvence pho3-23.
Homology GBS pho3-23 genového produktu mohou být identifikovány u Streptococcus pyogenes, Streptococcus pneumoniae, Enterococcus faecalis a Streptococcus mutans (perM). Homology u S. pyogenes, S. pneumoniae a E faecalis byly identifikovány na základě genomových sekvenčních dat a nebyly k dispozici žádné údaje týkající se totožnosti genu nebo genových produktů. U S. mutans byl genový produkt genu perM na základě domněnky identifikován jako permeáza, ale není k dispozici žádná další informace o funkci tohoto proteinu. Na základě faktu, že pho3-23 kóduje oblast, která komplementuje phoA gen bez vedoucí sekvence, je možno usuzovat, že produkt genu pho3-17 je velmi pravděpodobně lokalizován extracelulárně.
Příklad 15
Další vybraný klon obsahoval plasmid označený jako pho3-24. Tento pJasmid obsahoval gen (nebo jeho část), který komplementoval phoA bez vedoucí sekvence.
··♦· φ· • * • · • ·
Nukjeotidová a odvozená aminokyselinová sekvence je zde označena jako SEKV. ID. Č. 30 a 31.
Bylo provedeno srovnání aminokyselinové sekvence pho3-24.
Homology GBS pho3-24 genového produktu mohou být identifikovány u Streptococcus mutans (dltB), Streptococcus pneumoniae, Streptococcus pyogenes, Enterococcus faecalis, Lactobacillus casei (dltB) a Bacillus subtilis (dltB). Homology u S. ppeumoniae, S. pyogenes, a E faecalis byly identifikovány na základě genomových sekvenčních dat a nebyly k dispozici žádné údaje týkající se totožnosti genu nebo genových produktů. U S. mutans, L.casei a B. subtilis byly zjištěno, že produkt dltB genu je základním membránovým proteinem, který se účastní transportu aktivovaného D-alaninu přes buněčnou membránu. Produkt genu dltB se účastní biosyntézy D-alanylIipoteichové kyseliny (Heaton, M.P. a F.C. Neuhaus. 1992. J. Bacteriol. 174: 47Q7-4717). Má se za to, že u Lcasei a B. subtilis má produkt genu dltB nejméně 9 membránou vedoucích domén, což naznačuje, že protein nebo jeho část je exponována vně buňky.
Příklad 16
Další vybraný klon obsahoval plasmid označený jako pho3-29. Tento plasmid obsahoval gen (nebo jeho část), který komplementoval phoA bez vedoucí sekvence. Nukleotidová a odvozená aminokyselinová sekvence je zde označena jako SEKV. ID. Č. 32 a 33.
Bylo provedeno srovnání aminokyselinové sekvence pho3-29.
Homology GBS pho3-29 genového produktu mohou být identifikovány u Borrelia burgdorferi (p23 nebo ospC), Bacillus brevis (owp) a Pseudomonas aeruginosa (opři). Ačkoliv tyto homology nejsou navzájem příbuzné, všechny reprezentují hlavní proteiny vnějšího povrchu. U B. burgdorferi byl produkt genu ospC identifikován jako 23-kDa protein, který je imunodominantním antigenem povrchu této bakterie (Padula, S.J. a kol. 1993. Infect. Immun. 61: 5097-5105). Produkt genu owp z B. brevis je jedním ze dvpu hlavních proteinů buněčné stěny obsažených v mřížce povrchové vrstvy (Tsuboi, A. 1988. J. Bacteriol. 170: 935-945). Konečně gen oprl z P. aeruginosa kóduje prekurzor hlavního lipoproteinu vnější membrány (Saint-Onge, A. a kol. 1992. J. Gen. Microbiol. 138: 733-741).
•4444· 44 44 44 4 • 4 4 4 44 4 4 4 4 4
444 4 4 · 4 44 4 >444 4 4 4 4 44 4 • 4 44 ·· 44 4 · 444
Příklad 17
Další vybraný klon obsahoval plasmid označený jako pho3-50. Tento pJasmid obsahoval gen (nebo jeho část), který komplementoval phoA bez vedoucí sekvence. Nukleotidová a odvozená aminokyselinová sekvence je zde označena jako SEKV. ID. Č. 34 a 35.
Bylo provedeno srovnání aminokyselinové sekvence pho3-50.
Homology GBS pho3-50 genového produktu mohou být identifikovány u různých zástupců rodu Streptococcus (penA, pbp2B, pbpB2), Borrelia burgdorferi (pbp2), Enterococcus faecalis (pbpC), Staphylococcus aureus (pbpA), Mycobacterium Jeprae (pbpB) a Helicobacter pylori (pbp2). Ve všech případech byly výše uvedené homology identifikovány jako proteiny vážící penicilín (PBP). Geny kódující proteiny vážící penicilín jsou často umístěny ve shluku genů spojených se syntézou buněčné stěny (Pucci, M.JL a kol. 1997. J. Bacteriol. 179; 5632-5635). Navíc jsou PBS obvykle integrovány do buněčné stěny bakterií, přičemž některé nebo všechny tyto proteiny jsou exponovány na vnějším buněčném povrchu.
Claims (12)
- (upravené nároky pro další řízení)1. Peptid kódovaný operonem obsahujícím kterýkoli z genů zde identifikovaných jako pho1-13, pho3-21, pho2-15, pho3-18, pho3-22, pho3-3, pho3-17, pho2-2, pho1-5, pho3-1, pho3-23, pho3-50, pho1-14, pho2-10, pho3-14, pho3-24 a pho3-29, které lze získat ze skupiny B rodu Streptococcus, nebo jeho homolog nebo jeho funkční fragment pro terapeutické využití.
- 2. Peptid podle nároku 1 zahrnující kteroukoli z aminokyselinových sekvencí identifikovaných jako SEKV. ID. Č. 2, 4, 6, 8, 10, 11, 13, 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31, 33 a 35.
- 3. Peptid podle nároků 1 nebo 2 pro terapeutické užití.
- 4. Polynukleotid kódující peptid podle nároku 1 nebo 2 pro terapeutické užití.
- 5. Hostitel transformovaný tak, aby exprimoval peptid podle nároku 1 nebo 2.
- 6. Vakcína obsahující peptid podle nároku 1 nebo 2 nebo prostředky pro jeho expresi.
- 7. Použití produktu podle kteréhokoli z nároků 1 až 5 pro screening potenciálních léků nebo pro detekci virulence.
- 8. Použití produktu podle kteréhokoli z nároků 1 až 5 pro výrobu léčiva pro použití v léčbě nebo prevenci stavů spojených s bakteriální infekcí.
- 9. Použití podle nároku 8, kde tato infekce je infekce bakteriemi skupiny B rodu Streptococcus.
- 10. Použití podle nároku 8 nebo 9, kde tato infekce je infekce fokální.
- 11. Použití podle nároku 8 nebo 9, kde tato infekce je infekce močového traktu.
- 12. Protilátka vypěstovaná proti peptidu podle nároku 1 nebo 2.
Applications Claiming Priority (17)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| GBGB9828352.6A GB9828352D0 (en) | 1998-12-22 | 1998-12-22 | Protein and compositions containing it |
| GBGB9828345.0A GB9828345D0 (en) | 1998-12-22 | 1998-12-22 | Protein and compositions containing it |
| GBGB9828355.9A GB9828355D0 (en) | 1998-12-22 | 1998-12-22 | Protein and compositions containing it |
| GBGB9828354.2A GB9828354D0 (en) | 1998-12-22 | 1998-12-22 | Protein and compositions containing it |
| GBGB9828353.4A GB9828353D0 (en) | 1998-12-22 | 1998-12-22 | Protein and compositions containig it |
| GBGB9828349.2A GB9828349D0 (en) | 1998-12-22 | 1998-12-22 | Protein and compositions containing it |
| GBGB9828357.5A GB9828357D0 (en) | 1998-12-22 | 1998-12-22 | Protein and compositions containing it |
| GBGB9828350.0A GB9828350D0 (en) | 1998-12-22 | 1998-12-22 | Protein and compositions containing it |
| GBGB9828356.7A GB9828356D0 (en) | 1998-12-22 | 1998-12-22 | Protein and compositions containing it |
| GBGB9828359.1A GB9828359D0 (en) | 1998-12-22 | 1998-12-22 | Protein and compositions containing it |
| GBGB9900082.0A GB9900082D0 (en) | 1999-01-04 | 1999-01-04 | Protein and compositions containing it |
| GBGB9900086.1A GB9900086D0 (en) | 1999-01-04 | 1999-01-04 | Protein and compositions containing it |
| GBGB9900084.6A GB9900084D0 (en) | 1999-01-04 | 1999-01-04 | Protein and compositions containing it |
| GBGB9900085.3A GB9900085D0 (en) | 1999-01-04 | 1999-01-04 | Protein and compositions containing it |
| GBGB9900083.8A GB9900083D0 (en) | 1999-01-04 | 1999-01-04 | Protein and compositions containing it |
| GBGB9901922.6A GB9901922D0 (en) | 1999-01-28 | 1999-01-28 | Protein and compositions containing it |
| GBGB9901916.8A GB9901916D0 (en) | 1999-01-28 | 1999-01-28 | Protein and compositions containing it |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CZ20012172A3 true CZ20012172A3 (cs) | 2001-11-14 |
Family
ID=27585888
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CZ20012172A CZ20012172A3 (cs) | 1998-12-22 | 1999-12-22 | Proteiny rodu Streptococcus skupiny B a jejich pouľití |
Country Status (23)
| Country | Link |
|---|---|
| US (3) | US6812021B1 (cs) |
| EP (3) | EP2105504A3 (cs) |
| JP (1) | JP2002533083A (cs) |
| KR (3) | KR100790653B1 (cs) |
| CN (1) | CN101066447A (cs) |
| AP (1) | AP1502A (cs) |
| AT (1) | ATE353367T1 (cs) |
| AU (1) | AU776735B2 (cs) |
| CA (1) | CA2354135A1 (cs) |
| CY (1) | CY1106559T1 (cs) |
| CZ (1) | CZ20012172A3 (cs) |
| DK (1) | DK1141308T3 (cs) |
| EA (1) | EA004444B1 (cs) |
| ES (1) | ES2281977T3 (cs) |
| HK (1) | HK1039353A1 (cs) |
| HU (1) | HUP0104825A3 (cs) |
| NO (1) | NO20013102L (cs) |
| NZ (3) | NZ512297A (cs) |
| OA (1) | OA11734A (cs) |
| PL (1) | PL201887B1 (cs) |
| PT (1) | PT1141308E (cs) |
| SI (1) | SI1141308T1 (cs) |
| WO (1) | WO2000037646A2 (cs) |
Families Citing this family (14)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| KR100818815B1 (ko) * | 1998-12-22 | 2008-04-01 | 마이크로싸이언스 리미티드 | 외표면 단백질들, 그들의 유전자들 및 그들의 사용 |
| GB0105922D0 (en) * | 2001-03-09 | 2001-04-25 | Microscience Ltd | Genes and proteins, and their use |
| US6890539B2 (en) * | 1998-12-22 | 2005-05-10 | Microscience, Ltd. | Genes and proteins, and their use |
| SI1141308T1 (sl) * | 1998-12-22 | 2007-08-31 | Microscience Ltd | Streptokokni proteini skupine B in njihova uporaba |
| US6849407B2 (en) | 2000-08-31 | 2005-02-01 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Detection of varicella-zoster virus |
| GB0021977D0 (en) | 2000-09-07 | 2000-10-25 | Pyrosequencing Ab | Method of sequencing DNA |
| US7691571B2 (en) | 2001-01-31 | 2010-04-06 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Detection of bordetella |
| US7074598B2 (en) | 2002-09-25 | 2006-07-11 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Detection of vancomycin-resistant enterococcus spp. |
| US7365176B2 (en) | 2002-09-26 | 2008-04-29 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Detection of Epstein-Barr virus |
| EP1567868A4 (en) * | 2002-12-02 | 2008-02-06 | Biosynexus Inc | TEICHOIC ACID WALL AS A TARGET FOR THERAPIES AND ANTI-STAPHYLOCOCCAL VACCINES |
| US7427475B2 (en) | 2003-11-18 | 2008-09-23 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Detection of group B streptococcus |
| WO2008152448A2 (en) * | 2006-12-21 | 2008-12-18 | Emergent Product Development Uk Limited | Streptococcus proteins, and their use in vaccination |
| EP2850566B1 (en) | 2012-05-18 | 2023-09-13 | Tata Consultancy Services Limited | Method and system for determining and implementing a viable containment design of a data center |
| CN106822885B (zh) | 2017-02-16 | 2020-06-30 | 清华大学 | 肺炎链球菌疫苗 |
Family Cites Families (38)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5328996A (en) | 1989-03-29 | 1994-07-12 | University Of Florida Research Foundation, Inc. | Bacterial plasmin receptors as fibrinolytic agents |
| JPH07502896A (ja) | 1992-01-08 | 1995-03-30 | ザ ロックフェラー ユニバーシティ | 連鎖球菌の多官能性表面タンパク |
| US6015889A (en) | 1993-03-19 | 2000-01-18 | Gunnar Lindahl | Protein rib, a cell surface protein that confers immunity to many strains of the group B streptococcus: process for purification of the protein, reagent kit and pharmaceutical composition |
| HU217582B (hu) * | 1993-03-19 | 2000-02-28 | Gunnar Lindahl | Streptococcus B csoportba tartozó törzsek elleni immunitást biztosító, Rib fehérjenevű felületi protein, eljárás a protein tisztítására, reagenskészlet és gyógyszerkészítmény |
| US5807978A (en) * | 1995-06-07 | 1998-09-15 | Kokolus; William J. | Immunogenic peptides of prostate specific antigen |
| WO1998018931A2 (en) | 1996-10-31 | 1998-05-07 | Human Genome Sciences, Inc. | Streptococcus pneumoniae polynucleotides and sequences |
| US7196164B2 (en) | 1997-07-08 | 2007-03-27 | Human Genome Sciences, Inc. | Secreted protein HHTLF25 |
| US7153952B1 (en) * | 1997-07-02 | 2006-12-26 | sanofi pasteur limited/sanofi pasteur limitée | Nucleic acid and amino acid sequences relating to Streptococcus pneumoniae for diagnostics and therapeutics |
| US6800744B1 (en) | 1997-07-02 | 2004-10-05 | Genome Therapeutics Corporation | Nucleic acid and amino acid sequences relating to Streptococcus pneumoniae for diagnostics and therapeutics |
| US6380370B1 (en) | 1997-08-14 | 2002-04-30 | Genome Therapeutics Corporation | Nucleic acid and amino acid sequences relating to Staphylococcus epidermidis for diagnostics and therapeutics |
| HU228497B1 (en) | 1998-02-20 | 2013-03-28 | Id Biomedical Corp Quebec | Group b steptococcus antigens |
| US6248329B1 (en) * | 1998-06-01 | 2001-06-19 | Ramaswamy Chandrashekar | Parasitic helminth cuticlin nucleic acid molecules and uses thereof |
| CA2333578C (en) | 1998-07-14 | 2010-11-16 | American Cyanamid Company | Adjuvant and vaccine compositions containing monophosphoryl lipid a |
| WO2000006736A2 (en) | 1998-07-27 | 2000-02-10 | Microbial Technics Limited | Nucleic acids and proteins from group b streptococcus |
| IL142831A0 (en) | 1998-10-30 | 2002-03-10 | Janssen Pharmaceutica Nv | An unusual retrotransposon from the yeast candida albicans |
| AU1818200A (en) | 1998-11-05 | 2000-05-22 | Daniel Carucci | Chromosome 2 sequence of the human malaria parasite (plasmodium falciparum) and proteins of said chromosome useful in anti-malarial vaccines and diagnostic reagents |
| SI1141308T1 (sl) | 1998-12-22 | 2007-08-31 | Microscience Ltd | Streptokokni proteini skupine B in njihova uporaba |
| KR100818815B1 (ko) | 1998-12-22 | 2008-04-01 | 마이크로싸이언스 리미티드 | 외표면 단백질들, 그들의 유전자들 및 그들의 사용 |
| US6890539B2 (en) | 1998-12-22 | 2005-05-10 | Microscience, Ltd. | Genes and proteins, and their use |
| DE60028195T2 (de) | 1999-04-09 | 2007-03-15 | Heska Corp., Fort Collins | Proteine und nukleinsäuremoleküle des kopfes, des nervenkords, der tieferen darmabschnitte und des malpighi-gefässes des flohs und ihre verwendungen |
| US6605709B1 (en) | 1999-04-09 | 2003-08-12 | Genome Therapeutics Corporation | Nucleic acid and amino acid sequences relating to Proteus mirabilis for diagnostics and therapeutics |
| GB9921125D0 (en) | 1999-09-07 | 1999-11-10 | Microbial Technics Limited | Proteins |
| AU1478301A (en) | 1999-11-09 | 2001-06-06 | Glaxo Group Limited | Staphylococcus epidermidis nucleic acids and proteins |
| JP2004507217A (ja) | 2000-04-11 | 2004-03-11 | アンスティテュ・パストゥール | リステリア菌ゲノム、ポリペプチドおよびその使用 |
| US6974667B2 (en) | 2000-06-14 | 2005-12-13 | Gene Logic, Inc. | Gene expression profiles in liver cancer |
| EP2189473A3 (en) | 2000-10-27 | 2010-08-11 | Novartis Vaccines and Diagnostics S.r.l. | Nucleic and proteins from streptococcus groups A & B |
| AU2002306849A1 (en) | 2001-03-21 | 2002-10-08 | Elitra Pharmaceuticals, Inc. | Identification of essential genes in microorganisms |
| GB0107661D0 (en) | 2001-03-27 | 2001-05-16 | Chiron Spa | Staphylococcus aureus |
| GB0107658D0 (en) | 2001-03-27 | 2001-05-16 | Chiron Spa | Streptococcus pneumoniae |
| CA2444133A1 (en) | 2001-04-16 | 2002-10-24 | Wyeth Holdings Corporation | Novel streptococcus pneumoniae open reading frames encoding polypeptide antigens and uses thereof |
| WO2004030608A2 (en) | 2001-06-05 | 2004-04-15 | The Regents Of The University Of Michigan | Nanoemulsion vaccines |
| RU2323002C2 (ru) | 2001-07-26 | 2008-04-27 | Чирон Срл. | Вакцины, содержащие алюминиевые адъюванты и гистидин |
| GB0210128D0 (en) | 2002-05-02 | 2002-06-12 | Chiron Spa | Nucleic acids and proteins from streptococcus groups A & B |
| EP1551357B1 (en) | 2002-09-13 | 2014-07-16 | Novartis Vaccines and Diagnostics, Inc. | Group b streptococcus vaccine |
| US7438912B2 (en) | 2003-05-07 | 2008-10-21 | Intercell Ag | S.agalactiae antigens I + II |
| WO2005028618A2 (en) | 2003-09-15 | 2005-03-31 | Chiron Corporation | Immunogenic compositions for streptococcus agalactiae |
| CA2582137A1 (en) | 2004-10-05 | 2007-02-15 | Wyeth | Probe arrays for detecting multiple strains of different species |
| AU2005319174A1 (en) | 2004-12-22 | 2006-06-29 | J. Craig Venter Institute, Inc. | Group B Streptococcus |
-
1999
- 1999-12-22 SI SI9930959T patent/SI1141308T1/sl unknown
- 1999-12-22 NZ NZ512297A patent/NZ512297A/en unknown
- 1999-12-22 EP EP09159100A patent/EP2105504A3/en not_active Withdrawn
- 1999-12-22 NZ NZ526879A patent/NZ526879A/xx unknown
- 1999-12-22 KR KR1020017007911A patent/KR100790653B1/ko not_active IP Right Cessation
- 1999-12-22 ES ES99962422T patent/ES2281977T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1999-12-22 OA OA1200100163A patent/OA11734A/en unknown
- 1999-12-22 PL PL349320A patent/PL201887B1/pl not_active IP Right Cessation
- 1999-12-22 AT AT99962422T patent/ATE353367T1/de not_active IP Right Cessation
- 1999-12-22 US US09/868,352 patent/US6812021B1/en not_active Expired - Fee Related
- 1999-12-22 EP EP99962422A patent/EP1141308B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1999-12-22 EA EA200100700A patent/EA004444B1/ru not_active IP Right Cessation
- 1999-12-22 CN CNA2007101018407A patent/CN101066447A/zh active Pending
- 1999-12-22 CA CA002354135A patent/CA2354135A1/en not_active Abandoned
- 1999-12-22 AU AU18780/00A patent/AU776735B2/en not_active Ceased
- 1999-12-22 JP JP2000589700A patent/JP2002533083A/ja active Pending
- 1999-12-22 AP APAP/P/2001/002189A patent/AP1502A/en active
- 1999-12-22 NZ NZ535122A patent/NZ535122A/en unknown
- 1999-12-22 EP EP06019847A patent/EP1757696A3/en not_active Withdrawn
- 1999-12-22 DK DK99962422T patent/DK1141308T3/da active
- 1999-12-22 PT PT99962422T patent/PT1141308E/pt unknown
- 1999-12-22 HU HU0104825A patent/HUP0104825A3/hu unknown
- 1999-12-22 WO PCT/GB1999/004377 patent/WO2000037646A2/en active IP Right Grant
- 1999-12-22 CZ CZ20012172A patent/CZ20012172A3/cs unknown
-
2001
- 2001-06-21 NO NO20013102A patent/NO20013102L/no not_active Application Discontinuation
- 2001-12-20 HK HK01108928A patent/HK1039353A1/xx unknown
-
2004
- 2004-03-12 US US10/799,072 patent/US7419672B2/en not_active Expired - Fee Related
-
2007
- 2007-05-04 CY CY20071100589T patent/CY1106559T1/el unknown
- 2007-08-17 US US11/892,024 patent/US20090274717A1/en not_active Abandoned
- 2007-09-28 KR KR1020070098153A patent/KR20070101197A/ko not_active Application Discontinuation
-
2008
- 2008-05-09 KR KR1020080043336A patent/KR20080050550A/ko not_active Application Discontinuation
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| US20090274717A1 (en) | Genes and proteins, and their use | |
| Baums et al. | Surface-associated and secreted factors of Streptococcus suis in epidemiology, pathogenesis and vaccine development | |
| Seepersaud et al. | Characterization of a novel leucine-rich repeat protein antigen from group B streptococci that elicits protective immunity | |
| US20080226641A1 (en) | Outer surface proteins, their genes, and their use | |
| Morello et al. | Evidence for the sialylation of PilA, the PI-2a pilus-associated adhesin of Streptococcus agalactiae strain NEM316 | |
| US6890539B2 (en) | Genes and proteins, and their use | |
| AU2004201404B2 (en) | Genes and proteins, and their use | |
| NZ543923A (en) | Pho3-18 for a theraputic use, particulary in bacterial infection. | |
| EP1366068A1 (en) | Poynucleotide and polypeptide from group b streptococcus and use thereof for the preparation of a vaccine | |
| AU2007200004A1 (en) | Genes and proteins, and their use | |
| AU2005203729B2 (en) | Outer surface proteins, their genes, and their use | |
| ZA200104818B (en) | Genes and proteins, and their use. | |
| Burnham | Interactions of the Group B Streptococcus with epithelial cells: host-cell signal transduction pathways in Group B streptococcal invasion and the role of surface-associated Group B streptococcal phosphoglycerate kinase in pathogenesis | |
| PL195869B1 (pl) | Peptyd, szczepionka, zastosowanie tego peptydu i przeciwciało |