CN1303413C - 蛋白质、病毒快速富集方法 - Google Patents

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CN1303413C CNB031294081A CN03129408A CN1303413C CN 1303413 C CN1303413 C CN 1303413C CN B031294081 A CNB031294081 A CN B031294081A CN 03129408 A CN03129408 A CN 03129408A CN 1303413 C CN1303413 C CN 1303413C
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Abstract

本发明涉及一种蛋白质、病毒富集方法。它需要解决的技术问题是提高浓缩和纯化速度,使蛋白质、病毒检出率和准确性提高。其步骤为:1)蛋白絮凝:稀释样品释放蛋白质、病毒颗粒,加90~100%饱和度的硫酸铵为凝集溶剂,使蛋白质、病毒颗粒和细胞形成凝集物;2)分相沉淀:加异丙醇∶无水乙醇=3~10∶1为分相溶剂,将蛋白质、病毒颗粒和细胞沉淀到相间;3)二次沉淀:加10~30%聚二醇6000为沉淀溶剂,将蛋白质、病毒颗粒和细胞沉淀到管底;4)弃清留沉:弃上清,洗涤,离心,再弃上清,再离心,吸尽上清得富集液;所述的样品体积∶凝集溶剂体积∶分相溶剂体积∶沉淀溶剂体积=5∶2~3∶6~8∶5~6。

Description

蛋白质、病毒快速富集方法
技术领域
本发明涉及一种蛋白质、病毒快速富集方法,适合从人或动物的各种样品(包括漱口液、培养上清、尿液、粪便抽提液、血清、咳痰抽提液、鼻拭子抽提液、咽拭子抽提液),以及其它动植物试样中快速富集并部分纯化蛋白质、病毒颗粒的方法。
背景技术
在化验所需的样品中,蛋白质、病毒的数量相差很大。如因病毒致患病人在不同病程的尿液、粪便、血清等临床样品以及潜伏期病人中的病毒数量就极少。目前的检验方法对样品体积大小都有一定的限制,不能从大体积的样品中提取蛋白质、病毒RNA,常常导致假阴性的检测结果。中国专利文献CN1285878公开了一种“用于富集和寻找微生物样品的方法和装置”,该方法对微生物的富集培养是在注射器或同等物中完成的,由于常规培养周期较长,不适应快速检测的需要。对蛋白质、病毒颗粒进行快速浓缩和部分纯化技术,中国医学文献和中国专利文献未见公开报道。
发明内容
本发明需要解决的技术问题是,克服已有技术所存在的不足,提供一种从大体积样品中对蛋白质、病毒颗粒浓缩和部分纯化速度快,浓缩率高的蛋白质、病毒快速富集方法,使蛋白质、病毒检出率和准确性大大提高。
本发明蛋白质、病毒富集方法,其特征在于在由以下操作步骤构成:
1)蛋白絮凝:稀释样品释放蛋白质、病毒颗粒,加凝集溶剂,使蛋白质、病毒颗粒和细胞形成凝集物;
2)分相沉淀:加分相溶剂,将蛋白质、病毒颗粒和细胞沉淀到相间;
3)二次沉淀:加沉淀溶剂,将蛋白质、病毒颗粒和细胞沉淀到管底;
4)弃清留沉:弃上清,洗涤,离心,再弃上清,再离心,吸尽上清得富集液。
上述操作步骤一般在10~20分钟完成。
在含蛋白质、病毒颗粒的样品中加入凝集溶剂,使蛋白质、病毒颗粒呈脱水状态或部分盐析而得到保护。加入分相溶剂后,立即形成二相体系,下相的水分被抽提到上相,而下相的凝集溶剂几乎达到100%的饱和度,蛋白质在两相中均不相容,而被有效地析出形成沉淀分布在相间,并在离心过程中沉淀到相间。加入沉淀溶剂消除两相,再经离心沉淀回收蛋白质、病毒颗粒。同时蛋白质、病毒颗粒也得到部分纯化(如粪便中的细菌、食物残渣及RT-PCR[逆转录-多聚酶链式样反应]抑制物都被去除),使检测灵敏性得到进一步的提高。用50%乙醇(或异丙醇)洗涤去除残留的盐离子后,蛋白质、病毒颗粒沉淀即可用于蛋白质、病毒RNA的纯化。另外,分相溶剂能直接杀死病毒,减少实验室感染的危险;凝集溶剂和分相溶剂均能抑制RNA酶活性,防止RNA的降解。
所述的蛋白质凝集溶剂是:90~100%饱和度的硫酸铵;
所述的分相溶剂是:异丙醇∶无水乙醇=3~10∶1;
所述的蛋白质沉淀溶剂是:10~30%聚乙二醇6000;
如果在蛋白质凝集溶剂中添加有80mM NaH2PO4和80mM Na2HPO4,在分相溶剂中添加有冰乙酸2~5ml/L则富集效果更好。这可以降低PH值,促使凝结块更加紧实,易于沉淀回收。
所述的分相溶剂和离心机预冷后使用,其分相效果更好,预冷通常不高于10℃。
根据不同的样品体积,它和三种溶剂一般有如下比例关系,即样品体积∶凝集溶剂体积∶分相溶剂体积∶沉淀溶剂体积=5∶2~3∶6~8∶5~6;操作中常用比例关系为5∶2∶6.5∶5。
为了规范操作,各样品体积都需要定量,并符合上述比例关系。I类样品5ml中凝集溶剂加量是2ml;分相溶剂加量是6.5ml,沉淀溶剂加量是5ml;II类样品2ml中凝集溶剂加量是0.8ml;分相溶剂加量是2.5ml,沉淀溶剂加量是2ml。上述I类样品是指:漱口液,培养上清,尿液,粪便抽提液;II类样品是指:血清,咳痰抽提液,鼻拭子抽提液,咽拭子抽提液。
本发明方法构思合理,操作简单易行,从大体积样品中对蛋白质、病毒颗粒浓缩和部分纯化速度快,可浓缩约100倍,使蛋白质、病毒检出率、准确率提高100~1000倍。特别是富集速度快,对于控制高传染性病毒流行具有重要意义。
具体实施方式
下面通过实施例,对本发明的技术方案作进一步具体的说明。
一、富集实验准备:
从所有样品中富集蛋白质、病毒颗粒需作如下准备:
1.含消毒液的废物缸。
2.吸管。
3.4℃预冷分相溶剂。
4.50%乙醇,4℃预冷。
5.将离心机预冷至4℃。
从各种样品中富集蛋白质、病毒颗粒分别作以下准备:
1.漱口液、培养上清、尿液:50ml离心管。
2.血清:15ml离心管。
3.粪便:50ml离心管;生理盐水或PBS。
4.咳痰:50ml离心管;生理盐水或PBS,使用前加乙酰半胱氨酸(acetylcysteine)至终浓度为1%。
5.鼻拭子:15ml离心管;生理盐水或PBS。
6.咽拭子:15ml和50ml离心管;生理盐水或PBS。
其中,生理盐水:0.9%NaCl;PBS:1.44g Na2HPO1·2H2O(或1.15g Na2HPO1),0.2g KH2PO4,0.2g KCl,8.0g NaCl,加水至1升,调节pH至7.2,高压灭菌。
本例的蛋白质、病毒凝集溶剂是96%饱和度的硫酸铵;分相溶剂是异丙醇∶无水乙醇=3∶1;蛋白质、病毒沉淀溶剂是10%聚二醇6000。
二、操作步骤
此操作步骤是按以下体积的样品为例而设计的:
A.5ml漱口液、培养上清、尿液、粪便抽提液;
B.2ml血清、咳痰抽提液、鼻拭子抽提液、咽拭子抽提液。
(一)从I类样品——漱口液、培养上清、尿液、粪便抽提液中富集蛋白质、病毒颗粒:
1、蛋白絮凝:释放蛋白质、病毒颗粒,加凝集溶剂
A.漱口液、培养上清、尿液取5ml样品,转入50ml离心管中,加2ml凝集溶剂。
B.新鲜粪便
(1)称取2克样品,转入50ml离心管中。
(2)加6ml生理盐水或PBS,用吸管搅拌捣碎,再反复吹打彻底混合均匀(注意,勿溅到管外),充分释放蛋白质、病毒颗粒。4℃,5000×g离心5分钟。
(3)吸取5ml上清,转入50ml离心管中,加2ml凝集溶剂。
2、分相沉淀:加6.5ml 4℃预冷的分相溶剂,用吸管反复吹打混匀,室温静置5分钟后剧烈振摇混合均匀。4℃,≥5000×g离心5分钟,将蛋白质、病毒颗粒和细胞沉淀到相间。
注意:分相溶剂能杀死蛋白质、病毒。为防止实验室污染,加入凝集溶剂和分相溶剂后勿先剧烈震摇,以免溅出,造成污染。宜用吸管吹打混匀,并等待分相溶剂作用5分钟杀死蛋白质、病毒颗粒后再剧烈振摇混合均匀。
3、二次沉淀:加5ml沉淀溶剂,混合均匀,4℃,≥5000×g离心3分钟,将蛋白质、病毒颗粒和细胞沉淀到管底。
4、弃清留沉:倒置离心管丢弃上清,加5ml 4℃预冷的50%乙醇,轻轻转动离心管洗下沾在管壁上的溶液(勿搅动管底沉淀)。4℃,≥5000×g离心3分钟。倒置离心管丢弃上清,简短离心,用滴头吸尽残留的上清。注意,勿吸走管底沉淀。
沉淀的蛋白质、病毒颗粒应立即用于RNA纯化,或置-20℃保存。
(二)从从II类样品——血清、咳痰抽提液、鼻拭子抽提液或咽拭子抽提液中富集蛋白质、病毒颗粒
1、蛋白絮凝:释放蛋白质、病毒颗粒,加凝集溶剂
A.血清
取2ml血清,加入15ml离心管中,加0.8ml凝集溶剂。
B.咳痰
(1)收集咳痰,转入50ml离心管中。
(2)加3ml含1%乙酰半胱氨酸(acetylcysteine)的生理盐水或PBS,旋涡振荡3~10分钟(旋涡振荡时间视咳痰的粘稠度而定),充分释放蛋白质、病毒颗粒。≥5000×g离心5分钟。
(3)吸取2ml上清,转入15ml离心管中,加0.8ml凝集溶剂。
C.鼻拭子
(1)将鼻拭子转入15ml离心管中。
(2)加3ml生理盐水或PBS,旋涡振荡1分钟充分释放蛋白质、病毒颗粒。用有齿镊夹持住鼻拭子,轻轻压在管壁上挤出残余抽提液,仔细取出(勿沾染到管的出口),丢弃到含消毒液的废物缸中。
(3)吸取2ml溶液,转入15ml离心管中,加0.8ml凝集溶剂。
D.咽拭子
(1)将咽拭子转入50ml离心管中。
(2)加3ml生理盐水或PBS,反复搅动咽拭子1~2分钟充分释放蛋白质、病毒颗粒。将咽拭子轻轻压在管壁上,挤出残余抽提液。取出咽拭子并丢弃到含消毒液的废物缸中。
(3)吸取2ml溶液,转入15ml离心管中,若溶液体积不足2ml,加生理盐水或PBS补足到2ml;加0.8ml凝集溶剂。
2、分相沉淀:加2.5ml 4℃预冷的分相溶剂,用吸管反复吹打混匀,室温静置5分钟后剧烈振摇混合均匀。4℃,≥5000×g离心5分钟,将蛋白质、病毒颗粒和细胞沉淀到相间。
3、二次沉淀:加2ml沉淀溶剂,混合均匀,4℃,≥5000×g离心3分钟,将蛋白质、病毒颗粒和细胞沉淀到管底。
4、弃清留沉:同上。

Claims (5)

1、一种蛋白质、病毒富集方法,其特征在于在由以下操作步骤构成:
1)蛋白絮凝:稀释样品释放蛋白质、病毒颗粒,加凝集溶剂,使蛋白质、病毒颗粒和细胞形成凝集物,所述的蛋白质凝集溶剂是90~100%饱和度的硫酸铵;
2)分相沉淀:加分相溶剂,将蛋白质、病毒颗粒和细胞沉淀到相间,所述的分相溶剂是异丙醇∶无水乙醇=3~10∶1;
3)二次沉淀:加沉淀溶剂,将蛋白质、病毒颗粒和细胞沉淀到管底,所述的蛋白质沉淀溶剂是10~30%聚二醇6000;
4)弃清留沉:弃上清,洗涤,离心,再弃上清,再离心,吸尽上清得富集液;
所述的样品体积:凝集溶剂体积∶分相溶剂体积∶沉淀溶剂体积=5∶2~3∶6~8∶5~6。
2、根据权利要求1所述的蛋白质、病毒富集方法,其特征在于:所述的蛋白质凝集溶剂中还含有80mM NaH2PO4和80mM Na2HPO4;所述的分相溶剂中还有冰乙酸2~5ml/L;
3、根据权利要求1或2所述的蛋白质、病毒富集方法,其特征在于所述的分相溶剂和离心机均预冷。
4、根据权利要求1或2所述的蛋白质、病毒富集方法,其特征在于:在I类样品即漱口液,培养上清,尿液,粪便抽提液中的一种5ml中凝集溶剂加量是2ml;分相溶剂加量是6.5ml,沉淀溶剂加量是5ml;在II类样品即血清,咳痰抽提液,鼻拭子抽提液,咽拭子抽提液中的一种2ml中凝集溶剂加量是0.8ml;分相溶剂加量是2.5ml,沉淀溶剂加量是2ml。
5、根据权利要求3所述的蛋白质、病毒富集方法,其特征在于:在I类样品即漱口液,培养上清,尿液,粪便抽提液中的一种5ml中凝集溶剂加量是2ml;分相溶剂加量是6.5ml,沉淀溶剂加量是5ml;在II类样品即血清,咳痰抽提液,鼻拭子抽提液,咽拭子抽提液中的一种2ml中凝集溶剂加量是0.8ml;分相溶剂加量是2.5ml,沉淀溶剂加量是2ml。
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