CN117677399A - 用于降解免疫球蛋白和其他蛋白质的有效asgpr结合化合物 - Google Patents
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Landscapes
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Abstract
提供了具有与胞外蛋白靶向配体结合的有效脱唾液酸糖蛋白受体(ASGPR)结合配体的胞外蛋白降解剂和组合物,用于选择性降解靶胞外蛋白,例如体内免疫球蛋白,以治疗由所述胞外蛋白介导的疾病。
Description
相关申请的交叉引用
本申请要求2022年4月15日提交的美国临时申请号63/331,592、2021年12月23日提交的美国临时申请号63/293,447、2021年7月31日提交的美国临时申请号63/228,067以及2021年5月3日提交的美国临时申请号63/183,450的权益。这些申请中的每一个的全部内容为了所有目的通过引用并入本文。
技术领域
本发明提供了胞外蛋白降解剂和组合物,其具有与胞外蛋白靶向配体结合的脱唾液酸糖蛋白受体(asialoglycoprotein receptor,ASGPR)结合配体,用于在体内选择性降解靶胞外蛋白,例如免疫球蛋白或其他胞外蛋白,以治疗由该蛋白质介导的疾病。
通过引用并入
名为“19121-007WO1_SequenceListing_ST25”的文本文件的内容创建于2022年5月2日,大小为92.1KB,其全部内容通过引用并入本文。
背景技术
历史上,抑制蛋白质的治疗策略采用结合在酶口袋或变构位置的小分子抑制剂。那些非酶的蛋白质很难控制,有些被认为“不可成药”。然而,许多非酶蛋白由于在信号通路中的作用,仍然是药物开发的有价值的靶标。免疫球蛋白因为它们在全身免疫应答信号传导方面的作用是重要的非酶药物靶标。
脱唾液酸糖蛋白受体(ASGPR)是一种Ca2+依赖性凝集素,主要在实质肝细胞中表达。ASGPR的主要作用是通过介导脱唾液酸化糖蛋白的内吞作用来帮助调节血清糖蛋白水平。该受体与具有末端半乳糖或N-乙酰半乳糖胺的配体结合。脱唾液酸糖蛋白与ASGPR结合,然后通过受体介导的内吞作用被清除。受体和蛋白质在酸性内体区室中解离,并且蛋白质最终被溶酶体降解。描述ASGPR机制的多种用途的出版物包括:Pfizer Inc.的美国专利号9,340,553;9,617,293;10,039,778;10,376,531和10,813,942;Sanhueza等人(JACS,2017,139,3528);Petrov等人(Bioorganic和Medicinal Chemistry Letters,2018,28,382);Pfizer Inc.和Wave Life Sciences Ltd.的WO 2018/223073和WO2018/223081;WaveSciences Ltd.的WO 2018/223056;Schmidt等人(Nucleic Acids Research,2017,45,2294);Huang等人.(Bioconjugate Chem.2017,28,283);耶鲁大学的WO 2019/199621、WO2019/199634、WO 2021/072246和WO 2021/072269;小利兰·斯坦福大学董事会(The Boardof Trustees of the Leland Stanford Junior University)的WO2020/132100;Banik等人.(Nature,2020,584,291);以及Bertozzi小组发表在Nature Chemical Biology杂志上的一篇文章,题为LYTACs that engage the asialoglycoprotein receptor fortargeted protein degradation,”(Ahn,等人Nat.Chem.Biol.(2021))。
尽管在胞外蛋白的靶向降解领域已经取得了一些进展,但是仍然需要另外的治疗化合物以及它们的使用和制造方法,用于降解胞外蛋白以治疗由这些蛋白介导的疾病。
发明内容
提供了新颖的胞外蛋白降解剂及其药学上可接受的盐和其组合物,其降解靶胞外蛋白,例如IgG、IgA、IgE、TNF-α、因子XIa、补体因子D、补体因子B或如下所述的其他蛋白,以及此类胞外蛋白降解剂的起始材料和中间体及其使用和制造方法。本发明的胞外蛋白降解剂含有通过接头共价连接至胞外蛋白靶向配体的ASGPR结合配体。本文所述的降解剂中使用的ASGPR结合配体包括六碳吡喃糖部分的衍生物,特别是半乳糖和塔罗糖。如下所示,这两种糖仅在C2取代基的立体化学上有所不同。“下”C2构型对应于半乳糖的立体化学,而“上”构型中的C2取代基对应于塔罗糖的立体化学。已发现这两种糖的C2位置上的某些取代基改善配体ASGPR的结合。
在本发明的一些方面,胞外蛋白靶向配体靶向免疫球蛋白,例如IgG、IgA或IgE。
本文所述的免疫球蛋白降解化合物通过特定的连接基团将选择的免疫球蛋白的配体连接至有效的ASGPR结合剂来降解靶免疫球蛋白,例如IgG或IgA。在本发明的一个实施方案中,选择的免疫球蛋白降解剂降解IgG。
在一些实施方案中,另一些胞外蛋白可以如下文进一步描述的那样被降解。例如,在非限制性说明性实施方案中,可以例如在相关的情况下使用图1-7的选择的靶向配体或以其他已知方式靶向本文一般性描述的选择的胞外蛋白。
在本发明的一些方面,胞外蛋白降解剂使用3∶1或2∶1比例的ASGPR结合配体与胞外蛋白靶向配体。通过使用多个ASGPR结合配体,降解剂可以更紧密地结合ASGPR,因此可以具有增加的降解功效。
在本发明的另一些方面,本发明的胞外蛋白降解剂具有1∶1比例的ASGPR结合配体与胞外蛋白靶向配体。在一些方面,胞外蛋白降解剂包括在C2位置处的杂芳基胺取代基,其对ASGPR具有高结合效率。通过这些新发现的取代基,配体具有足够的ASGPR结合功效从而能够以1∶1的ASGPR结合配体与胞外蛋白靶向配体的比例降解分子。
虽然治疗与胞外蛋白相关的疾病的传统药物化学方法由于其细胞外循环、大小和/或缺乏活性位点而失败,但是本发明的胞外蛋白降解剂可以通过将蛋白运输到肝细胞来降解目标胞外蛋白。在一些实施方案中,这些免疫球蛋白降解剂的特征在于选择的ASGPR配体,其特征在于对ASGPR具有高结合亲和力(参见非限制性实例表4A和4B)。由于这种高ASGPR结合亲和力,与先前公开的免疫球蛋白降解剂相比,本发明的胞外蛋白降解剂通常可以以较低的剂量施用,具有较少的副作用、降低的副作用、增加的功效、更快的治疗效果、更长的代谢稳定性和/或更长的治疗益处。
在本发明的一些方面,提供了免疫球蛋白G(IgG)的选择性降解剂。在某些实施方案中,这些免疫球蛋白降解剂具有Fc结合肽如Fc-III和Fc-BP2或其衍生物。Fc结合肽结合IgG的Fc部分,从而促进IgG选择性募集至肝细胞进行降解。例如,在某些实施方案中,免疫球蛋白降解剂是:
或其药学上可接受的盐。
在另一些实施方案中,这些免疫球蛋白降解剂具有小分子或非肽IgG靶向配体。小分子IgG靶向配体的非限制性实例包括:
在本发明的一些方面,本发明的IgG降解剂使用2∶1比例的ASGPR结合配体与胞外蛋白靶向配体。
在本发明的另一些方面,本发明的IgG降解剂具有1∶1比例的ASGPR结合配体与IgG结合配体。例如,在某些实施方案中,免疫球蛋白降解剂是:
或其药学上可接受的盐。
当本发明用于治疗已知主要由IgG引起的疾病时,例如甲状腺眼病、重症肌无力、慢性炎性脱髓鞘性多发性神经病、温热自身免疫性溶血性贫血或1型自身免疫性胰腺炎,IgG的选择性靶向可特别有益。
在某些方面,提供由IgG介导的病症的治疗,包括向患者施用有效量的IgG降解剂或其药学上可接受的盐。在某些实施方案中,IgG病症选自抗磷脂抗体综合征、白塞综合征、桥本甲状腺炎、MGUS、坏死性黄色肉芽肿、类风湿关节炎、癌症,例如多发性骨髓瘤或外周多发性骨髓瘤、副蛋白血症、慢性荨麻疹、硬皮病、硬化粘液水肿、血小板减少症例如肝素诱导的血小板减少症、冷球蛋白血症、肉芽肿性多血管炎,例如ANCA相关性血管炎、特发性血小板减少性紫癜、血小板减少症、IgG4-RD、阵发性睡眠性血红蛋白尿(PNH)、温抗体型自身免疫性溶血性贫血、横纹肌溶解症、狼疮性肾炎、急性播散性脑脊髓炎、格林巴利综合征(Guillain-Barre syndrome)、慢性炎性脱髓鞘性多发性神经病变、米勒·费希尔综合征(Miller Fisher syndrome)、视神经脊髓炎谱系障碍、斜视眼阵挛肌阵挛综合征、与链球菌相关的小儿自身免疫性神经精神障碍(PANDAS)、周围神经病变、横贯性脊髓炎、纤维化、IPF/纤维化、和移植排斥。
在本发明的另一些方面,提供了免疫球蛋白A(IgA)的选择性降解剂。在某些实施方案中,免疫球蛋白降解剂具有来自Opt类型肽的IgA靶向配体。Opt类型配体对IgA具有高度选择性,因此有利于IgA选择性募集至肝细胞进行降解。例如,在某些实施方案中,免疫球蛋白降解剂是:
或其药学上可接受的盐。
在本发明的一些方面,IgA降解剂使用2∶1比例的ASGPR结合配体与IgA结合配体。
在本发明的另一些方面,本发明的IgA降解剂具有1∶1比例的ASGPR结合配体与IgA结合配体。例如,在某些实施方案中,免疫球蛋白降解剂是:
当本发明用于治疗已知主要由IgA引起的疾病,例如过敏性紫癜(Henoch-purpura),也称为IgA血管炎时,IgA的选择性靶向可以是特别有益的。IgA介导的其他疾病包括冷球蛋白血症、肉芽肿性多血管炎、血小板减少症、周围神经病、MGUS、IgA肾病、过敏性紫癜。
本文所述的免疫球蛋白降解剂可用于治疗由免疫球蛋白例如IgG或IgA介导的病症,包括例如自身免疫病症、其他免疫功能障碍、异常细胞增殖例如肿瘤和癌症、血液相关病症、肾病症、变应性疾病或肝脏疾病。在本发明的某些方面,提供了治疗由免疫球蛋白介导的病症的方法,其包括向有需要的宿主施用有效量的本文所述的免疫球蛋白降解剂或其药学上可接受的盐、前药、N-氧化物、和/或其药学上可接受的组合物,任选地在药学上可接受的载剂中。
虽然治疗与免疫球蛋白相关的疾病的传统药物化学方法由于其大尺寸、细胞外循环和/或缺乏活性位点而失败,但本发明的免疫球蛋白降解剂可以降解靶向的免疫球蛋白。在一些实施方案中,这些免疫球蛋白降解剂以新发现的ASGPR配体为特征,其特征在于对ASGPR的高结合亲和力(参见表4)。由于这种高ASGPR结合亲和力,与先前公开的免疫球蛋白降解剂相比,本发明的免疫球蛋白降解剂可以以更低的剂量施用,具有更少的副作用、增加的效力、更快的治疗效果、更长的代谢稳定性和/或降低的副作用。
在某些方面,胞外蛋白降解化合物降解TNF-α。例如,在某些实施方案中,本发明的化合物是:
在某些实施方案中,TNF-α靶向配体选自:
在某些方面,胞外蛋白降解化合物降解因子XIa。例如,在某些实施方案中,本发明的化合物是:
在某些实施方案中,因子XIa靶向配体选自:
在另一方面,提供式I、式II、式III、式IV、式V、式VI、式VII或式VIII的ASGPR结合配体:
或其药学上可接受的盐;
其中:
R1和R5独立地选自氢、杂烷基、C0-C6烷基-氰基、烷基、烯基、炔基、卤代烷基、F、Cl、Br、I、芳基、芳烷基、杂芳基、杂芳基烷基、杂环、杂环烷基、卤代烷氧基、C0-C6烷基-OR6、C0-C6烷基-SR6、C0-C6烷基-NR6R7、C0-C6烷基-C(O)R3、C0-C6烷基-S(O)R3、C0-C6烷基-C(S)R3、C0-C6烷基-S(O)2R3、C0-C6烷基-N(R8)-C(O)R3、C0-C6烷基-N(R8)-S(O)R3、C0-C6烷基-N(R8)-C(S)R3、C0-C6烷基-N(R8)-S(O)2R3C0-C6烷基-O-C(O)R3、C0-C6烷基-O-S(O)R3、C0-C6烷基-O-C(S)R3、-N=S(O)(R3)2、C0-C6烷基N3和C0-C6烷基-O-S(O)2R3,其各自任选被1、2、3或4个取代基取代;
R3在每次出现时独立地选自氢、烷基、杂烷基、卤代烷基、芳基烷基、杂芳基烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基、杂环、-OR8和-NR8R9;
R6和R7在每次出现时独立地选自氢、杂烷基、烷基、芳基烷基、杂芳基烷基、烯基、炔基、芳基、卤代烷基、杂芳基、杂环、-烷基-OR8、-烷基-NR8R9、C(O)R3、S(O)R3、C(S)R3和S(O)2R3;
R8和R9在每次出现时独立地选自氢、杂烷基、烷基、芳基烷基、杂芳基烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基和杂环;
R10选自氢、烷基、杂烷基、卤代烷基、芳基烷基、杂芳基烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基、杂环、C(O)R3、S(O)R3、C(S)R3和S(O)2R3;
R25选自由以下组成的组:杂烷基、C0-C6烷基-氰基、烷基、烯基、炔基、卤代烷基、F、Cl、Br、I、芳基、芳基烷基、杂芳基、杂芳基烷基、杂环、杂环烷基、卤代烷氧基、C0-C6烷基-OR6、C0-C6烷基-SR6、C0-C6烷基-NR6R7、C0-C6烷基-C(O)R3、C0-C6烷基-S(O)R3、C0-C6烷基-C(S)R3、C0-C6烷基-S(O)2R3、C0-C6烷基-N(R8)-C(O)R3、C0-C6烷基-N(R8)-S(O)R3、C0-C6烷基-N(R8)-C(S)R3、C0-C6烷基-N(R8)-S(O)2R3C0-C6烷基-O-C(O)R3、C0-C6烷基-O-S(O)R3、C0-C6烷基-O-C(S)R3、-N=S(O)(R3)2、C0-C6烷基N3和C0-C6烷基-O-S(O)2R3,其各自任选被1、2、3或4个取代基取代;
R65、R66和R67独立地选自氢、杂烷基、C0-C6烷基-氰基、烷基、烯基、炔基、卤代烷基、F、Cl、Br、I、杂环、杂环烷基、卤代烷氧基、C0-C6烷基-OR6、C0-C6烷基-SR6、C0-C6烷基-NR6R7、C0-C6烷基-C(O)R3、C0-C6烷基-S(O)R3、C0-C6烷基-C(S)R3、C0-C6烷基-S(O)2R3、C0-C6烷基-N(R8)-C(O)R3、C0-C6烷基-N(R8)-S(O)R3、C0-C6烷基-N(R8)-C(S)R3、C0-C6烷基-N(R8)-S(O)2R3C0-C6烷基-O-C(O)R3、C0-C6烷基-O-S(O)R3、C0-C6烷基-O-C(S)R3、-N=S(O)(R3)2、C0-C6烷基N3和C0-C6烷基-O-S(O)2R3,其各自任选被1、2、3或4个取代基取代;
R68、R69和R70独立地选自氢、烷基、烯基、炔基、F、Cl、Br、I、杂环、杂环烷基、卤代烷氧基、C0-C6烷基-OR6、C0-C6烷基-SR6、C0-C6烷基-NR6R7、C0-C6烷基-C(O)R3、C0-C6烷基-S(O)R3、C0-C6烷基-C(S)R3、C0-C6烷基-S(O)2R3、C0-C6烷基-N(R8)-C(O)R3、C0-C6烷基-N(R8)-S(O)R3、C0-C6烷基-N(R8)-C(S)R3、C0-C6烷基-N(R8)-S(O)2R3C0-C6烷基-O-C(O)R3、C0-C6烷基-O-S(O)R3、C0-C6烷基-O-C(S)R3、-N=S(O)(R3)2、C0-C6烷基N3、杂芳基、芳基和C0-C6烷基-O-S(O)2R3,其各自任选被1、2、3或4个取代基取代;以及
当化合物被“任选取代”时,其可在化合价允许的情况下被一个或更多个选自烷基(包括C1-C4烷基)、烯基(包括C2-C4烯基)、炔基(包括C2-C4炔基)、卤代烷基(包括C1-C4卤代烷基)、-OR6、F、Cl、Br、I、-NR6R7、杂烷基、杂环、杂芳基、芳基、氰基、硝基、羟基、叠氮基、酰胺、-SR3、-S(O)(NR6)R3、-NR8C(O)R3、-C(O)NR6R7、-C(O)OR3、-C(O)R3、-SF5、 取代基取代,其中选择任选的取代基以产生稳定的化合物。
在某些实施方案中,ASGPR结合配体选自:
或其药学上可接受的盐。
在另一个方面ASGPR结合配体具有下式:
或其药学上可接受的盐。
在某些方面,提供式IX、式X或式XI的胞外蛋白降解化合物:
其中
ASPGR结合配体是选自以下的化合物:
/>
其中R1或R5被至接头A的键替代并且所有其他变量如本文所定义;
接头A是将接头B、接头C或接头D共价连接至所述ASGPR结合配体的键或部分;
接头B是将接头A共价连接至胞外蛋白靶向配体的键或部分;
接头C是将每个接头A连接至胞外蛋白靶向配体的化学基团;
接头D是将每个接头A连接至胞外蛋白靶向配体的化学基团;并且
胞外蛋白靶向配体是与胞外蛋白结合的配体。
在某些方面,提供式IX-A、式X-A或式XI-A的免疫球蛋白降解化合物:
或其药学上可接受的盐,
其中:
免疫球蛋白靶向配体是与免疫球蛋白(例如IgG或IgA)结合的配体。
在某些实施方案中,ASGPR结合配体是选自以下的化合物:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,本发明的胞外蛋白降解剂作为同位素富集的胞外蛋白降解剂例如免疫球蛋白降解剂提供,其具有至少一个期望的原子同位素取代,其量高于同位素的天然丰度。例如,氘可以替代胞外蛋白降解剂中的一个或多个氢,并且13C可以替代一个或多个碳原子。在一种实施方式中,同位素取代位于ASGPR配体的一个或多个位置。在另一实施方案中,同位素取代位于分子的接头部分的一个或多个位置。在另一个实施方案中,同位素取代位于分子的胞外蛋白靶向配体部分的一个或多个位置。
因此,本发明至少包括以下特征:
(i)本文所述的胞外蛋白降解剂或本文所述的其药学上可接受的盐、前药、N-氧化物和/或其药物组合物;
(ii)本文所述的胞外蛋白降解剂用于治疗与免疫球蛋白相关的医学病症,例如自身免疫病症、其他免疫功能障碍、血液相关病症、肾脏病症、变应性疾病或肝脏病症;
(iii)本文所述的胞外蛋白降解剂的同位素富集衍生物或其药学上可接受的盐、前药、N-氧化物和/或其药物组合物;
(iv)一种用于制造旨在用于治疗或预防由胞外蛋白介导的病症的治疗用途的药物的方法,其特征在于本文所述的胞外蛋白降解剂用于所述制造中;
(v)经纯化或基本上纯的形式(例如,至少90%、95%、96%、97%、98%、99%、99.5%或99.9%)的上文所述的胞外蛋白降解剂或其本文所述的盐;
(vi)本文所述的胞外蛋白降解剂,用于治疗本文所述的病症;
(vii)一种用于制造本文所述的胞外蛋白降解剂的方法;
(viii)本文所述的免疫球蛋白降解剂或本文所述的其药学上可接受的盐、前药、N-氧化物和/或其药物组合物;
(ix)本文所述的免疫球蛋白降解剂用于治疗与免疫球蛋白相关的医学病症,例如自身免疫病症、其他免疫功能障碍、血液相关病症、肾脏病症、变应性疾病或肝脏病症;
(x)本文所述的免疫球蛋白降解剂的同位素富集衍生物或其药学上可接受的盐、前药、N-氧化物和/或其药物组合物;
(xi)一种用于制造旨在用于治疗或预防由免疫球蛋白介导的病症的治疗用途的药物的方法,其特征在于本文所述的免疫球蛋白降解剂用于所述制造中;
(xii)经纯化或基本上纯的形式(例如,至少90%、95%、96%、97%、98%、99%、99.5%或99.9%)的上文所述的免疫球蛋白降解剂或其本文所述的盐;
(xiii)本文所述的免疫球蛋白降解剂,用于治疗本文所述的病症;
(xiv)一种用于制造本文所述的免疫球蛋白降解剂的方法;以及
(xv)本文描述的ASGPR结合配体。
附图说明
胞外蛋白靶配体(“EPTL”)通过锚键(Anchor Bond)(EPTL与接头B、接头C或接头D之间的化学键)与ASGPR结合胞外蛋白降解剂化合物中的接头共价结合。该键可以放置在配体上的任何位置,只要不会不可接受地破坏EPTL与靶胞外蛋白结合的能力。图中胞外蛋白靶配体的非限制性实例上的锚键被描绘为:
图1A提供了靶向免疫球蛋白A(IgA)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1B提供了靶向免疫球蛋白G(IgG)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1C-1G提供了靶向免疫球蛋白E(IgE)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1H-1M提供了靶向肿瘤坏死因子α(TNF-α)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1N提供了靶向白介素1(IL-1)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1O-1S提供了靶向白介素-2(IL-2)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1T-1W提供了靶向白介素6(IL-6)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1X-1AA提供了靶向干扰素γ(IFN-γ)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1BB-1KK提供了靶向血管内皮生长因子(VEGF)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1LL提供了靶向转化生长因子β(TGF-β1)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1MM-1PP提供了靶向前蛋白转化酶枯草杆菌蛋白酶kexin 9(PCSK-9)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1QQ-1SS提供了靶向羧肽酶B2(CPB2)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1TT-1UU提供了靶向胆碱酯酶(ChE)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1VV-1WW提供了靶向C-C基序趋化因子配体2(CCL2)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1XX-1BBB提供了靶向凝血因子VII(因子VII)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1CCC-1FFF提供了靶向凝血因子IX(因子IX)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1GGG提供了靶向CD40配体(CD40L)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1HHH-1JJJ提供了靶向凝血因子Xa(因子Xa)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1KKK-1MMM提供了靶向凝血因子XI(因子XI)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1NNN和1OOO提供了靶向凝血因子XII(因子XII)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1PPP和1QQQ提供了靶向凝血因子XIII(因子XIII)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1RRR-1UUU提供了靶向成纤维细胞生长因子1(FGF1)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1VVV-1XXX提供了靶向成纤维细胞生长因子2(FGF2)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1YYY和1ZZZ提供了靶向纤连蛋白(FN1)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1AAAA和1BBBB提供了靶向白介素5(IL-5)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1CCCC提供了靶向白介素8(IL-8)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1DDDD和1EEEE提供了靶向白介素10(IL-10)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1FFFF和1GGGG提供了靶向白介素21(IL-21)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1HHHH和1IIII提供了靶向白介素22(IL-22)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1JJJJ-1NNNN提供了靶向激肽释放酶1的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1OOOO提供了靶向脂蛋白脂肪酶(LPL)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1PPPP和1QQQQ提供了靶向基质金属蛋白酶-1(MMP1)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1RRRR-1DDDDD提供了靶向巨噬细胞迁移抑制因子(MIF)(也称为糖基化抑制因子(GIF)、L-多巴色素异构酶或苯丙酮酸互变异构酶)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1EEEEE-1GGGGG提供了靶向中性粒细胞弹性蛋白酶(NE)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1HHHHH和1IIIII提供了靶向凝血酶原的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1JJJJJ-1NNNNN提供了靶向血浆激肽释放酶(KLKB1)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1OOOOO-1SSSSS提供了靶向纤溶酶原(PLG)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1TTTTT-1XXXXX提供了靶向纤溶酶原激活剂抑制剂-1(PAI-1)、内皮纤溶酶原激活剂抑制剂或丝氨酸蛋白酶抑制剂E1的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1YYYYY-1AAAAAA提供了靶向磷脂酶A2(例如1B型或1B组(PLA2、PA21B、PLA2G1B、PLA2-IB))的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1BBBBBB-1DDDDDD提供了靶向磷脂酶A2的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表,例如IIA型或IIA组(PLA2、PLA2A、PA2IIA、PLA2G2A、PLA2-IIA)。
图1EEEEEE-1NNNNNN提供了靶向胎盘生长因子(PGF)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1OOOOOO-1QQQQQQ提供了靶向纤溶酶原激活剂、组织类型(tPA、PLAT)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1RRRRRR提供了靶向转化生长因子β2(TGF-β2、TGFB2)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1SSSSSS提供了靶向血小板反应蛋白1(TSP1、TSP-1、THBS1)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图1TTTTTT-1XXXXXX提供了靶向尿激酶或尿激酶型纤溶酶原激活剂(UPA、uPA)的胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图2提供了靶向补体因子B的示例性胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图3A和3B提供了靶向补体因子D的示例性胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图4提供了靶向补体因子H的示例性胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图5提供了靶向补体成分5的示例性胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图6提供了靶向TNF-α的示例性胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图7提供了靶向因子XI的示例性胞外蛋白靶向配体的非限制性列表。
图8是不同浓度下化合物28的细胞摄取的图。y轴是平均荧光强度(MFI),x轴是以微摩尔测量的化合物28的浓度。实验过程如实施例3所述。
图9是化合物28、IgG和ASGPR在不同浓度的化合物28下形成三元复合物的图。y轴是三元复合物中的比率,x轴是以微摩尔测量的化合物28的浓度。实验过程如实施例4所述。
图10是展示化合物28对IgG-AF488的降解的蛋白质印迹。实验过程如实施例5所述。
图11是显示在化合物28存在下DNP-IgG的摄取的共定位图像。实验过程如实施例4所述。
图12是化合物4、IgG和ASGPR的三元复合物形成以及不同浓度的化合物4下IgG的细胞摄取的图。y轴是三元复合物形成的浓度,通过总平均荧光强度(MFI)(对于三元复合物形成)或IgG+与总细胞的比率(对于摄取)显示,x轴是化合物4的浓度以微摩尔测量。实验过程如实施例3所述。
图13是化合物4或非活性化合物、IgG和ASGPR在不同浓度的化合物4或非活性化合物下形成三元复合物的图。y轴是由总平均荧光强度(MFI)显示的三元复合物形成的浓度,x轴是以微摩尔测量的化合物4或非活性化合物的浓度。实验过程如实施例3所述。
图14是在不同浓度的化合物4或非活性化合物下细胞摄取IgG的图。y轴是IgG+与总细胞的比率,x轴是以微摩尔测量的化合物4或非活性化合物的浓度。实验过程如实施例3所述。
图15是在存在或不存在化合物4的情况下,化合物4、IgG和ASGPR与野生型细胞和ASGPR敲除细胞的三元复合物形成产生的表面IgG浓度的柱状图。y轴是通过总平均荧光强度(MFI)显示的表面IgG的浓度,并且x轴是化合物4的存在或不存在。实验过程如实施例3所述。
图16是在野生型或ASGPR敲除细胞中存在化合物4的情况下IgG随时间的细胞摄取的柱状图。y轴是总平均荧光强度(MFI)显示的IgG浓度,x轴是以分钟和小时为单位测量的时间。实验过程如实施例3所述。
图17是显示在化合物21存在下随着时间推移IgG降解产物的浓度的蛋白质印迹。实验过程如实施例6所述。
图18是显示在化合物21存在下全长IgG浓度随时间变化的蛋白质印迹。实验过程如实施例7所述。
图19是取自大鼠肝细胞裂解物的蛋白质印迹,显示了在化合物4存在下随着时间的推移IgG浓度。实验过程如实施例8所述。
图20是显示在化合物4存在下DNP-IgG的摄取的共定位图像。实验过程如实施例9所述。
图21是显示如实施例1中所述通过SPR测量的化合物4的ASGPR结合的线图。y轴是以单位测量的响应,x轴是以秒测量的时间。
图22是显示如实施例2中所述通过SPR测量的化合物4的IgG结合的线图。y轴是以单位测量的响应,x轴是以秒测量的时间。
图23是显示如实施例2中所述通过SPR测量的化合物36的TNFa结合的线图。y轴是以单位测量的响应,x轴是以秒测量的时间。
图24是显示0.5mM化合物36随时间推移TNF的降解的蛋白质印迹。实验过程如实施例11所述。
图25是显示在化合物36存在下ASGPR介导的TNF摄取的蛋白质印迹。实验过程如实施例12所述。
图26提供了本发明的公式的非限制性示例。
具体实施方式
提供了降解靶胞外蛋白例如IgG的新型胞外蛋白降解剂及其药学上可接受的盐和组合物,以及用于此类胞外蛋白降解剂的起始材料和中间体以及它们的使用和制造方法。这些胞外蛋白降解剂是ASGPR及其各自胞外蛋白靶点的高效结合剂。本发明的一些胞外蛋白降解剂使用高结合ASGPR结合配体。这种对ASGPR的结合亲和力的增加导致胞外蛋白降解剂比以前已知的胞外蛋白降解剂具有多种优势。例如,与其他胞外蛋白降解剂相比,本发明的胞外蛋白降解剂可以以更低的剂量、更低的频率、更少的副作用和/或增加的效力施用。在一些实施方案中,加入本文所述的高结合ASGPR配体之一的胞外蛋白降解剂可以以单齿化合物(即,治疗分子中胞外蛋白配体与ASGPR配体为1∶1)的形式具有足够的活性。
在某些实施方案中,胞外蛋白降解化合物降解免疫球蛋白。本文所述的免疫球蛋白降解剂通过将选择的免疫球蛋白的配体通过选择的连接基团与有效的ASGPR结合剂共价结合来降解选择的免疫球蛋白。根据本发明可以靶向的免疫球蛋白包括但不限于IgA、IgG、IgD、IgE和IgM及其突变体。在本发明的某些方面,选择的免疫球蛋白降解剂降解IgG。
I.化合物术语
胞外蛋白降解剂使用标准命名法进行描述。除非另外定义,本文所使用的所有技术和科学术语具有与本方面所属领域的技术人员通常所理解的相同的意义。
本文描述的所有胞外蛋白降解剂独立地包括对映异构体、对映异构体的混合物、非对映异构体、互变异构体、外消旋体和其他异构体,例如旋转异构体,如同各自被具体描述一样,除非另有说明或另外被上下文排除。
未使用数量词时不表示数量的限制,而是表示至少有一个引用的项的存在。术语“或”是指“和/或”。除非另外指示,否则本文有关值的范围的陈述仅意欲用作个别地提及在该范围内的每一独立值的简写方法,且每一独立值是并入说明书中,就如同在本文个别地陈述该值一般。所有范围的端点都包括在范围内并且可以独立地组合。在本文描述的所有方法能够以合适顺序进行,除非本文另外指明或另外与上下文明显相矛盾。示例或示例性语言(例如,“例如”)的应用仅旨在更好地说明本发明,而不对另外要求保护的本发明的范围做出限制。除非另有定义,本文中使用的技术和科学术语具有与本发明所属领域的技术人员通常理解的相同含义。
本发明包括具有至少一种期望的原子同位素取代的胞外蛋白降解剂,其量高于同位素的天然丰度,即富集。
可以掺入本发明的胞外蛋白降解剂中的同位素的实例包括氢、碳、氮、氧、磷、氟和氯的同位素,例如2H、3H、11C、13C、14C、15N、17O、18O、18F31P、32P、35S、36Cl和125I分别。在一个实施方案中,同位素标记到胞外蛋白降解剂中可以用于代谢研究(例如使用14C)、反应动力学研究(例如用2H或3H)、检测或成像技术(例如正电子发射断层扫描(PET)或单光子发射计算机断层扫描(SPECT),包括药物或底物组织分布测定),或用于患者的放射治疗。同位素标记到胞外蛋白降解剂及其前药中通常可以通过使用容易获得的同位素标记试剂代替非同位素标记试剂进行方案或实施例和下文描述的制备中公开的程序来制备。
作为一般示例而非限制,氢的同位素,例如氘(2H)和氚(3H)可以任选地用于所描述的结构中的任何地方,以实现期望的结果。备选地或另外地,可使用碳同位素,例如13C和14C。在一种实施方式中,同位素取代是通过在分子上的一个或多个位置用氘取代氢来实现的,以改善药物的性能,例如药效学、药代动力学、生物分布、半衰期、稳定性、AUC、Tmax、Cmax等。例如,氘可以在新陈代谢期间的键断裂位置(α-氘动力学同位素效应)或键断裂位点相邻或附近(β-氘动力学同位素效应)与碳结合。
同位素取代,例如氘取代,可以是部分的或完全的。部分同位素取代是指至少一个氢被氘取代。在某些实施例中,同位素在任何目的位置处富集80%、85%、90%、95%或99%或更多的同位素。在某些实施例中,氘在所期望位置富集80%、85%、90%、95%或99%。除非另有说明,任何点的富集都高于天然丰度,并且在一个实施例中足以改变药物在人中的可检测特性。
本发明的胞外蛋白降解剂可以与溶剂(包括水)形成溶剂化物。因此,在一个实施方案中,本发明包括活性胞外蛋白降解剂的溶剂化形式。术语“溶剂化物”是指本发明的胞外蛋白降解剂(包括其盐)与一种或多种溶剂分子的分子复合物。溶剂的非限制性实例是水、乙醇、二甲亚砜、丙酮和其他常见有机溶剂。术语“水合物”是指包含本发明的胞外蛋白降解剂和水的分子复合物。根据本发明的药学上可接受的溶剂化物包括其中结晶溶剂可以被同位素取代的那些,例如。D2O、d6-丙酮、d6-DMSO。溶剂化物可以是液体或固体形式。
“剂型”是指活性剂的施用单位。剂型的实例包括片剂、胶囊剂、注射剂、混悬剂、液体剂、乳液剂、植入剂、颗粒剂、球剂、乳膏剂、软膏剂、栓剂、吸入剂型、经皮剂型、含服剂、舌下剂、局部剂、凝胶剂、粘膜剂、植入剂等。
“药物组合物”是包含至少一种活性剂和至少一种其他物质如载剂的组合物。本发明包括所述胞外蛋白降解剂的药物组合物。
“药物组合”是至少两种活性剂的组合,其可以组合在单一剂型中或以单独的剂型一起提供。
“药学上可接受的盐”是所公开的胞外蛋白降解剂的衍生物,其中母体胞外蛋白降解剂通过制备其无机和有机、药学上可接受的酸或碱加成盐而被修饰。本发明的胞外蛋白降解剂的盐可以通过常规化学方法从含有碱性或酸性部分的亲本胞外蛋白降解剂合成。一般而言,这种盐可以通过使这些胞外蛋白降解物的游离酸形式与化学计量量的合适的碱(例如钠、钙、镁或钾的氢氧化物、碳酸盐、碳酸氢盐等)反应,或者通过使这些胞外蛋白降解物的游离碱形式与化学计量量的合适的酸反应来制备。这样的反应通常在水或有机溶剂或两者的混合物中进行。本发明的胞外蛋白降解剂的盐还包括胞外蛋白降解剂和胞外蛋白降解剂盐的溶剂化物。
药学上可接受的盐的实例包括但不限于碱性残基例如胺的无机或有机酸盐;酸性残基如羧酸的碱盐或有机盐;等等。药学上可接受的盐包括人类消费可接受的盐和例如由无机酸或有机酸形成的母体胞外蛋白降解剂的季铵盐。此类盐的实例包括衍生自无机酸的盐,例如盐酸、氢溴酸、硫酸、氨基磺酸、磷酸、硝酸等;以及衍生自无机酸的盐。以及由有机酸如乙酸、丙酸、琥珀酸、乙醇酸、硬脂酸、乳酸、苹果酸、酒石酸、柠檬酸、抗坏血酸、双羟萘酸、马来酸、羟基马来酸、苯乙酸、谷氨酸、苯甲酸、水杨酸、甲磺酸、乙磺酸、苯磺酸、磺胺酸制备的盐、2-乙酰氧基苯甲酸、富马酸、甲苯磺酸、甲磺酸、乙二磺酸、草酸、羟乙基磺酸、HOOC-(CH2)1-4-COOH等,或使用酸产生相同的抗衡离子。另外的合适的盐的列表可以在例如Remington’s Pharmaceutical Sciences,第17版,Mack Publishing Company,Easton,Pa.,第1418页(1985)中发现。
应用于本发明的药物组合物/组合的术语“载剂”是指提供活性胞外蛋白降解剂的稀释剂、赋形剂或媒介物。
“药学上可接受的赋形剂”是指可用于制备药物组合物/组合的赋形剂,该药物组合物/组合通常是安全的、人消费可接受的,并且在生物学上或其他方面均没有不适合施用于宿主,通常是人。在一个实施例中,使用兽医用途可接受的赋形剂。
“患者”或“宿主”或“受试者”是需要治疗或预防本文具体描述的任何病症的人类或非人类动物。通常,宿主、患者或受试者是人类。“患者”或“宿主”或“受试者”还指例如哺乳动物、灵长类动物(例如人)、牛、绵羊、山羊、马、狗、猫、兔、大鼠、小鼠、鸟和喜欢。
本发明的胞外蛋白降解剂、药物组合物或组合的“治疗有效量”是指当施用于宿主时提供治疗益处例如症状的改善或疾病本身的减少或减少的量。
在一个实施方案中,氢原子对氘原子的取代发生在任何可变基团内。例如,当任何可变基团是或包含例如通过取代甲基、乙基或甲氧基时,烷基残基可以是氘代的(在非限制性实施方案中,CDH2、CD2H、CD3、CD2CD3、CHDCH2D、CH2CD3、CHDCHD2、OCDH2、OCD2H或OCD3等)。在某些另一些实施方案中,可变基团具有“‘”或“a”名称,其在一个实施方案中可以是氘代的。在某些另一些实施方案中,当中心核心环的两个取代基组合形成环丙基环时,未取代的亚甲基碳可以被氘代。
术语“免疫球蛋白”通常是指大的Y形蛋白质(例如抗体),其识别并中和外来化合物或物体,例如病原体或疾病组织。免疫球蛋白的非限制性实例包括IgA、IgD、IgE、IgG和IgM。本文使用的免疫球蛋白还可以包括技术人员已知的结合片段。
不在两个字母或符号之间的破折号(“-”)用于指示取代基的附接点。例如,-(C=O)NH2通过酮基(C=O)基团的碳附接。
本文所用的术语“取代的”是指指定原子或基团上的任何一个或多个氢被选自指定基团的部分取代,条件是不超过指定原子的正常价态并且所得化合物是稳定的。例如,当取代基是氧代(即=O)时,原子上的两个氢被取代。例如,被氧代取代的吡啶基是吡啶酮。仅当取代基和/或变量的组合产生稳定的化合物或有用的合成中间体时,才是允许的。
“烷基”是支链、直链或环状饱和脂肪烃基团。在一个实施方案中,烷基含有1至约12个碳原子,更通常1至约6个碳原子、1至约4个碳原子、或1至3个碳原子。在一个实施例中,烷基含有1至约8个碳原子。在某些实施例中,烷基是C1-C2、C1-C3、C1-C4、C1-C5或C1-C6.本文所用的指定范围表示烷基,其被认为明确公开为单独的种类,该范围的每个成员被描述为独特的种类。例如,本文所用的术语C1-C6烷基表示具有1、2、3、4、5或6个碳原子的直链或支链烷基,并且“烷基”也可以是具有3、4、5或6个碳原子的碳环烷基,并且旨在表示这些中的每一个都被描述为独立的种类。例如,本文所用的术语C1-C4烷基表示具有1、2、3、或4个碳原子的直链或支链烷基,并且意指这些中的每一个都被描述为一个独立种类。当C0-Cn烷基在本文中与另一基团结合使用时,例如,(C3-C7环烷基)C0-C4烷基,或-C0-C4烷基(C3-C7环烷基),所示基团(在这种情况下为环烷基)直接通过单个共价键(C0烷基)连接,或者在这种情况下通过烷基链连接1、2、3或4个碳原子。烷基也可以通过其他基团连接,例如杂原子,如-O-C0-C4烷基(C3-C7环烷基)。烷基的实例包括但不限于甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、正戊基、异戊基、叔-戊基、新戊基、正己基、2-甲基戊烷、3-甲基戊烷、2,2-二甲基丁烷、2,3-二甲基丁烷和己基。
当使用包括“烷(alk)”的术语时,应理解“环烷基”或“碳环”可被视为定义的一部分,除非上下文明确排除。例如但不限于,术语烷基、烯基、炔基、烷氧基、烷酰基、烯氧基、卤代烷基等都可以被认为包括烷基的环状形式,除非上下文明确排除。
“烯基”是具有一个或多个可出现在沿链的稳定点处的碳-碳双键的支链或直链脂族烃基。非限制性实例是C2-C8烯基、C2-C7烯基、C2-C6烯基、C2-C5烯基和C2-C4烯基。如本文所用的指定范围表示具有作为独立种类描述的范围的每个成员的烯基,如上文针对烷基部分所述。烯基的实例包括但不限于乙烯基和丙烯基。
“炔基”是具有一个或多个可出现在沿链的任何稳定点处的碳-碳三键的支链或直链脂族烃基,例如C2-C8炔基或C2-C6炔基。如本文所用的指定范围表示具有作为独立种类描述的范围的每个成员的炔基,如上文针对烷基部分所述。炔基的实例包括但不限于乙炔基、丙炔基、1-丁炔基、2-丁炔基、3-丁炔基、1-戊炔基、2-戊炔基、3-戊炔基、4-戊炔基、1-己炔基、2-己炔基、3-己炔基、4-己炔基和5-己炔基。
“烷氧基”是通过氧桥(-O-)共价连接的如上所定义的烷基。烷氧基的实例包括但不限于甲氧基、乙氧基、正丙氧基、异丙氧基、正丁氧基、2-丁氧基、叔丁氧基、正戊氧基、2-戊氧基、3-戊氧基、异戊氧基、新戊氧基、正己氧基、2-己氧基、3-己氧基和3-甲基戊氧基。类似地,“烷硫基”或“硫代烷基”基团是具有通过硫桥(-S-)共价连接的指定数目的碳原子的如上所定义的烷基基团。在一种实施方式中,烷氧基任选地被取代,如上所述。
“卤代烷基”表示被1个或多个卤原子(直至最大允许卤原子数)取代的支链和直链烷基基团。卤代烷基的实例包括但不限于三氟甲基、单氟甲基、二氟甲基、2-氟乙基和五氟乙基。
“芳基”表示在一个或多个芳环中仅含有碳的芳族基团。在一种实施方式中,芳基含有1至3个单独的或稠合的环并且具有6至14或18个环原子,没有杂原子作为环成员。术语“芳基”包括其中饱和或部分不饱和的碳环基团与芳香环稠合的基团。术语“芳基”还包括其中饱和或部分不饱和的杂环基团与芳环稠合的基团,只要连接点是芳环即可。此类化合物可包括稠合至4至7或5至7元饱和或部分不饱和环状基团的芳环,所述环状基团任选地含有1、2或3个独立地选自N、O、B、P、Si和S的杂原子,以形成例如3,4-亚甲二氧基苯基。芳基包括例如苯基和萘基,包括1-萘基和2-萘基。在一个实施方案中,芳基是侧基。悬垂环的实例是被苯基基团取代的苯基基团。
术语“杂环”是指饱和和部分饱和的含杂原子的环基,其中杂原子可选自N、S和O。术语“杂环”包括单环3-12元环,以及双环5-16元环系统(可包括稠合、桥连或螺环双环系统)。它不包括含有-O-O-或-S-S-部分的环。饱和杂环基团的实例包括含有1至4个氮原子的饱和4至7元单环基团[例如吡咯烷基、咪唑烷基、哌啶基、吡咯啉基、氮杂环丁烷基、哌嗪基和吡唑烷基];含有1至2个氧原子和1至3个氮原子的饱和4至6元单环基团[例如吗啉基];含有1至2个硫原子和1至3个氮原子的饱和3至6元杂单环基团[例如噻唑烷基]。部分饱和的杂环基团的实例包括但不限于二氢噻吩基、二氢吡喃基、二氢呋喃基和二氢噻唑基。部分饱和和饱和杂环基团的实例包括但不限于吡咯烷基、咪唑烷基、哌啶基、吡咯啉基、吡唑烷基、哌嗪基、吗啉基、四氢吡喃基、噻唑烷基、二氢噻吩基、2,3-二氢-苯并[1,4]二噁烷基、吲哚啉基、异吲哚啉基、二氢苯并噻吩基、二氢苯并呋喃基、异色满基、色满基、1,2-二氢喹啉基、1,2,3,4-四氢-异喹啉基、1,2,3,4-四氢-喹啉基、2,3,4,4a,9,9a-六氢-1H-3-氮杂-芴基、5,6,7-三氢-1,2,4-三唑并[3,4-a]异喹啉基、3,4-二氢-2H-苯并[1,4]噁嗪基、苯并[1,4]二噁烷基、2,3-二氢-1H-1λ′-苯并[d]异噻唑-6-基、二氢吡喃基、二氢呋喃基和二氢噻唑基。“双环杂环”包括其中杂环基团与芳基稠合的基团,其中连接点是杂环。“双环杂环”还包括与碳环基团稠合或桥联的杂环基团。例如含有1个至5个氮原子的部分不饱和缩合杂环基,例如,二氢吲哚或异二氢吲哚;含有1个至2个氧原子和1个至3个氮原子的部分不饱和缩合杂环基;含有1个至2个硫原子和1个至3个氮原子的部分不饱和缩合杂环基;以及含有1个至2个氧原子或硫原子的饱和缩合杂环基。
双环杂环的非限制性实例包括:
除非另有说明或从上下文中清楚,术语“双环杂环”包括顺式和反式非对映体。手性双环杂环的非限制性实例包括:
在某些替代实施方案中,术语“杂环”是指饱和的和部分饱和的含杂原子的环基团,其中杂原子可以选自N、S、O、B、Si和P。
“杂芳基”是指稳定的单环、双环或多环芳环,其包含1至3个,或在一些实施方案中1、2或3个选自N、O、S、B和P(通常选自N、O和S)的杂原子,其余的环原子是碳,或稳定的双环或三环体系,其包含至少一个5、6或7元芳环,该芳环包含1至3个,或在一些实施方案中1至2个选自N、O、S、B或P的杂原子,其余的环原子是碳。在一个实施例中,唯一的杂原子是氮。在一个实施例中,唯一的杂原子是氧。在一个实施例中,唯一的杂原子是硫。单环杂芳基通常具有5或6个环原子。在一些实施方案中,双环杂芳基是8至10元杂芳基,即含有8或10个环原子的基团,其中一个5、6或7元芳环稠合至第二芳族或非芳族环其中连接点是芳香环。当杂芳基中S和O原子的总数超过1时,这些杂原子彼此不相邻。在一种实施方式中,杂芳基中的S和O原子的总数不超过2。在另一个实施方案中,芳族杂环中S和O原子的总数不超过1。杂芳基的实例包括但不限于吡啶基(包括例如2-羟基吡啶基)、咪唑基、咪唑并吡啶基、嘧啶基(包括例如4-羟基嘧啶基)、吡唑基、三唑基、吡嗪基、呋喃基、噻吩基、异噁唑基、噻唑基、噁二唑基、噁唑基、异噻唑基、吡咯基、喹啉基、异喹啉基、四氢异喹啉基、吲哚基、苯并咪唑基、苯并呋喃基、辛啉基、吲唑基、吲嗪基、酞嗪基、哒嗪基、三嗪基、异吲哚基、蝶啶基、嘌呤基、噁二唑基、三唑基、噻二唑基、噻二唑基、呋喃烷基、苯并呋喃基、苯并噻吩基、苯并噻唑基、苯并噁唑基、喹唑啉基、喹喔啉基、萘啶基、四氢呋喃基和呋喃并吡啶基。杂芳基任选独立地被一个或多个本文所述的取代基取代。“杂芳氧基”是通过氧-O-连接基与其取代的基团结合的所述杂芳基。
“杂芳基烷基”是被如本文所述的杂芳基取代的如本文所述的烷基。
“芳基烷基”是被如本文所述的芳基取代的如本文所述的烷基。
“杂环烷基”是被如本文所述的杂环基团取代的如本文所述的烷基。
术语“杂烷基”是指如本文所定义的烷基、烯基、炔基或卤代烷基部分,其中CH2基团被杂原子取代或碳原子被杂原子取代,例如胺、羰基、羧基、氧代、硫代、磷酸根、膦酸根、氮、磷、硅或硼。在一个实施例中,唯一的杂原子是氮。在一个实施例中,唯一的杂原子是氧。在一个实施例中,唯一的杂原子是硫。在一个实施方案中,“杂烷基”用于表示具有1-20个碳原子的杂脂肪族基团(环状、非环状、取代的、未取代的、支链或非支链的)。杂烷基部分的非限制性实例包括聚乙二醇、聚亚烷基二醇、酰胺、聚酰胺、聚丙交酯、聚乙交酯、硫醚、醚、烷基-杂环-烷基、-O-烷基-O-烷基、烷基-O-卤代烷基等。
当化合物被“任选取代”时,它们可以在化合价允许的情况下被选自烷基(包括C1-C4烷基)、烯基(包括C2-C4烯基)、炔基(包括C2-C4炔基)、卤代烷基(包括C1-C4卤代烷基)、-OR6、F、Cl、Br、I、-NR6R7、杂烷基、氰基、硝基、C(O)R3、的取代基取代,其中选择任选的取代基以产生稳定的化合物。例如/>可以被1或2个独立选自烷基、烯基、炔基、卤代烷基、-OR6、F、Cl、Br、I、-NR6R7、杂烷基、氰基、硝基、C(O)R3的基团取代,只要产生稳定的化合物,但仅选自/>中的一组,只要产生稳定的化合物。另一方面,/>只能被1或2个选自/> 的基团取代。
任选取代的CH2基团的非限制性实例包括:
任选取代的-S-基团的非限制性实例包括:
“烷基”的实施方案
在一个实施方案中,“烷基”是C1-C10烷基、C1-C9烷基、C1-C8烷基、C1-C7烷基、C1-C6烷基、C1-C5烷基、C1-C4烷基、C1-C3烷基、或C1-C2烷基。
在一个实施方案中,“烷基”具有一个碳。
在一个实施方案中,“烷基”具有两个碳。
在一个实施方案中,“烷基”具有三个碳。
在一个实施方案中,“烷基”具有四个碳。
在一个实施方案中,“烷基”具有五个碳。
在一个实施方案中,“烷基”具有六个碳。
“烷基”的非限制性实例包括:甲基、乙基、丙基、丁基、戊基和己基。
“烷基”的其他非限制性实例包括:异丙基、异丁基、异戊基和异己基。
“烷基”的其他非限制性实例包括:仲丁基、仲戊基和仲己基。
“烷基”的其他非限制性实例包括:叔丁基、叔戊基和叔己基。
“烷基”的其他非限制性实例包括:新戊基、3-戊基和活性戊基。
在一个替代实施方案中,“烷基”基团任选被取代。
在一个替代实施方案中,“烯基”基团任选被取代。
在一个替代实施方案中,“炔基”基团任选被取代。
“卤代烷基”的实施方案
在一个实施方案中,“卤代烷基”是C1-C10卤代烷基、C1-C9卤代烷基、C1-C8卤代烷基、C1-C7卤代烷基、C1-C6卤代烷基、C1-C5卤代烷基、C1-C4卤代烷基、C1-C3卤代烷基和C1-C2卤代烷基。
在一个实施方案中,“卤代烷基”具有一个碳。
在一个实施方案中,“卤代烷基”具有一个碳和一个卤素。
在一个实施方案中,“卤代烷基”具有一个碳和两个卤素。
在一个实施方案中,“卤代烷基”具有一个碳和三个卤素。
在一个实施方案中,“卤代烷基”具有两个碳。
在一个实施方案中,“卤代烷基”具有三个碳。
在一个实施方案中,“卤代烷基”具有四个碳。
在一个实施方案中,“卤代烷基”具有五个碳。
在一个实施方案中,“卤代烷基”具有六个碳。
“卤代烷基”的非限制性实例包括:
“卤代烷基”的其他非限制性实例包括:
“卤代烷基”的其他非限制性实例包括:
“卤代烷基”的其他非限制性实例包括:
“杂芳基”的实施方案
5元“杂芳基”基团的非限制性实例包括吡咯、呋喃、噻吩、吡唑、咪唑、三唑、异噁唑、噁唑、噁二唑、恶三唑、异噻唑、噻唑、噻二唑和噻三唑。
5元“杂芳基”基团的其他非限制性实例包括:
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在一个实施方案中,“杂芳基”是含有1、2或3个氮原子的6元芳香族基团(即吡啶基、哒嗪基、三嗪基、嘧啶基和吡嗪基)。
具有1个或2个氮原子的6元“杂芳基”基团的非限制性实例包括:
在一个实施方案中,“杂芳基”是含有1或2个选自氮、氧和硫的原子的9元双环芳香族基团。
双环的“杂芳基”基团的非限制性实例包括吲哚、苯并呋喃、异吲哚、吲唑、苯并咪唑、氮杂吲哚、氮杂吲唑、嘌呤、异苯并呋喃、苯并噻吩、苯并异噁唑、苯并异噻唑、苯并噁唑和苯并噻唑。
双环的“杂芳基”基团的其他非限制性实例包括:
双环的“杂芳基”基团的其他非限制性实例包括:
双环的“杂芳基”基团的其他非限制性实例包括:
在一个实施方案中,“杂芳基”是含有1或2个选自氮、氧和硫的原子的10元双环芳香族基团。
双环的“杂芳基”基团的非限制性实例包括喹啉、异喹啉、喹喔啉、酞嗪、喹唑啉、噌啉和萘啶。
双环的“杂芳基”基团的其他非限制性实例包括:
“杂环”的实施方案
在一个实施方案中,“杂环”是指具有一个氮和3、4、5、6、7或8个碳原子的环状环。
在一个实施方案中,“杂环”是指具有一个氮和一个氧以及3、4、5、6、7或8个碳原子的环状环。
在一个实施方案中,“杂环”是指具有两个氮和3、4、5、6、7或8个碳原子的环状环。
在一个实施方案中,“杂环”是指具有一个氧和3、4、5、6、7或8个碳原子的环状环。
在一个实施方案中,“杂环”是指具有一个硫和3、4、5、6、7或8个碳原子的环状环。
“杂环”的非限制性实例包括氮丙啶、环氧乙烷、硫杂环丙烷、氮杂环丁烷、1,3-二氮杂环丁烷、氧杂环丁烷和硫杂环丁烷。
“杂环”的其他非限制性实例包括吡咯烷、3-吡咯啉、2-吡咯啉、吡唑烷和咪唑烷。
“杂环”的其他非限制性实例包括四氢呋喃、1,3-二氧戊环、四氢噻吩、1,2-氧硫杂环戊烷和1,3-氧杂硫杂环戊烷。
“杂环”的其他非限制性实例包括哌啶、哌嗪、四氢吡喃、1,4-二噁烷、噻烷、1,3-二噻烷、1,4-二噻烷、吗啉和硫代吗啉。
“杂环”的其他非限制性实例包括二氢吲哚、四氢喹啉、四氢异喹啉和二氢苯并呋喃,其中每个基团的连接点在杂环上。
例如,是“杂环”基团。
然而,是“芳基”基团。
“杂环”的非限制性实例还包括:
“杂环”的其他非限制性实例包括:
“杂环”的其他非限制性实例包括:
“杂环”的非限制性实例还包括:
“杂环”的非限制性实例还包括:
“杂环”的其他非限制性实例包括:
“杂环”的其他非限制性实例包括:
芳基
在一个实施方案中,“芳基”是6碳芳香族基团(苯基)。
在一个实施方案中,“芳基”是10个碳的芳族基团(萘基)。
在一个实施方案中,“芳基”是与杂环稠合的6碳芳香族基团,其中连接点是芳基环。“芳基”的非限制性实例包括二氢吲哚、四氢喹啉、四氢异喹啉和二氢苯并呋喃,其中每个基团的连接点在芳香环上。
例如是“芳基”基团。
然而,是“杂环”基团。
“芳基烷基”的实施方案
“芳基烷基”的非限制性实例包括:
在一个实施方案中,“芳基烷基”是
在一个实施方案中,“芳基烷基”是指被芳基取代的2碳烷基。
“芳基烷基”的非限制性实例包括:
II.胞外蛋白降解
多种众所周知且已表征的胞外蛋白可以引起、调节或放大体内疾病,例如异常细胞增殖,例如肿瘤和癌症、自身免疫性疾病、炎症和衰老相关疾病。例如,生长因子、细胞因子和趋化因子等胞外蛋白与细胞表面受体结合,通常在例如癌症和炎症的多种疾病中引发异常信号传导。
本文所述的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的盐和/或其药学上可接受的组合物可用于治疗由与胞外蛋白靶向配体结合的靶胞外蛋白介导的病症。所描述的降解剂能够靶向介导的病理学病症的特定胞外蛋白以溶酶体降解。靶胞外蛋白可以通过作用机制调节人类的病症,例如生物途径、致病信号传导的修饰,或信号级联或细胞进入的调节。在一个实施方案中,靶胞外蛋白是在经典意义上不可成药的蛋白,因为它不具有可被抑制或以其他方式结合的结合袋或活性位点,并且不能容易地变构控制。在另一个实施方案中,靶胞外蛋白是在经典意义上可成药的蛋白质,但对于治疗目的,优选蛋白质的降解而不是抑制。靶胞外蛋白是用胞外蛋白靶向配体募集的,该配体是靶胞外蛋白的配体。通常,胞外蛋白靶向配体以非共价方式结合靶胞外蛋白。在另一个实施方案中,靶胞外蛋白以不可逆或可逆的共价方式与胞外蛋白靶向配体共价结合。
因此,在一些实施方案中,提供了一种治疗患有由靶胞外蛋白介导的疾病的宿主的方法,该方法包括将有效量的靶向靶胞外蛋白的降解剂任选地以药学上可接受的组合物形式施用于宿主,通常是人。
靶胞外蛋白可以是包含胞外蛋白靶向配体的降解剂可以结合的任何氨基酸序列,通过其降解,产生有益的治疗效果。在一个实施方案中,靶胞外蛋白是非内源肽,例如来自病原体或毒素的肽。在另一个实施方案中,靶胞外蛋白可以是介导病症的内源蛋白。内源蛋白可以是蛋白质的正常形式或异常形式。例如,靶胞外蛋白可以是胞外突变蛋白,或例如其中部分或全部功能获得或功能丧失由核苷酸多态性编码的蛋白质。在一些实施方案中,降解剂靶向蛋白质的异常形式而不靶向蛋白质的正常形式。
胞外蛋白靶向配体是与已选择用于溶酶体降解的靶胞外蛋白共价或非共价结合的配体。在某些实施方案中,胞外蛋白靶向配体是与靶胞外蛋白结合的小分子或部分(例如肽、核苷酸、抗体片段、适体、生物分子或其他化学结构),并且其中靶胞外蛋白是宿主中疾病的介导者,如下文详细描述。图中提供了示例性的胞外蛋白靶向配体。
锚键(Anchor Bond)
胞外蛋白靶向配体(“EPTL”)通过锚键(EPTL与接头B、接头C或接头D之间的化学键)与ASGPR结合胞外蛋白降解剂化合物中的接头共价结合。该键可以放置在配体上的任何位置,只要不会不可接受地破坏EPTL与靶胞外蛋白结合的能力。图中胞外蛋白靶配体的非限制性实例上的锚键被描绘为:
下面描述的许多用于医学治疗的示例性靶胞外蛋白在众所周知的蛋白质数据库(“PDB”)中具有特征性结构信息,该数据库是大生物分子如蛋白质和核酸的三维结构信息的数据库。PDB包括X射线晶体学和世界各地科学家提交的其他信息,并且可以免费访问。例如,参见www.rcsb.org;www.wwpdb.org和www.uniprot.org。使用例如在第**部分或数据库本身中提供的PDB编码,以及本文提供的或可公开获得的技术参考文献,技术人员可以确定EPTL可以通过锚键连接到接头B、接头C或接头D到ASGPR结合部分的合适位置。对于许多此类蛋白质,已发表的参考文献描述了一系列配体如何与目标胞外蛋白结合,并且根据这些信息,人们可以确定合理的锚键位置。
例如,技术人员可以使用可用的可视化工具,包括PDB网站上可用的可视化工具,以确定胞外蛋白靶向配体与靶胞外蛋白对接的位置。技术人员还可以将晶体结构和所选择的感兴趣的胞外蛋白靶向配体导入建模软件(包括例如PyMOL、Glide、Maestro、RasMol、Visual Molecular Dynamics、Jmol和AutoDock)中以确定胞外蛋白的哪一部分靶向配体与靶胞外蛋白结合。然后,ASGPR配体通过接头和锚键结合在不会过度不利地影响与靶胞外蛋白结合的点上。
任选的取代基
在某些实施方案中,本文所述的胞外蛋白靶向配体,例如在附图之一中,任选地被1、2、3或4个独立选自烷基(包括C1-C4烷基)、烯基(包括C2-C4烯基)、炔基(包括C2-C4炔基)、卤代烷基(包括C1-C4卤代烷基)、-OR6、F、Cl、Br、I、-NR6R7、杂烷基、氰基、硝基、C(O)R3、 的取代基取代,其中选择任选的取代基以产生稳定的化合物。
在某些实施方案中,靶胞外蛋白选自IgA、IgG、IgE、TNF-α、IL-1、IL-2、IL-6、IFN-γ、VEGF、TGF-β1、PCSK-9、CPB2、ChE、CCL2、因子VII、因子IX、CD40L、因子Xa、因子XI、因子XIa、因子XII、因子XIII、FGF1、FGF2、FN1、IL-5、IL-8、IL-10、IL-21、IL-22、激肽释放酶1、LPL、MMP1、MIF、GIF、L-多巴色素异构酶或苯丙酮酸互变异构酶、中性粒细胞弹性蛋白酶、凝血酶原、KLKB1、PLG、PAI-1、内皮纤溶酶原激活剂抑制剂、丝氨酸蛋白酶抑制剂E1、磷脂酶A2、PLA2、PA21B、PLA2G1B、PLA2-IB、PLA2、PLA2A、PA2IIA、PLA2G2A、PLA2-IIA、PGF,纤溶酶原激活剂、组织类型(tPA,PLAT)、转化生长因子β2(TGF-β2,TGFB2)、血小板反应蛋白1、尿激酶、尿激酶-型纤溶酶原激活剂、补体因子B、补体因子D、靶补体因子H和补体成分5。
在某些实施方案中,当靶胞外蛋白具有受体时,靶胞外蛋白可用于降解受体。
在某些实施方案中,胞外蛋白靶向配体选自IgA、IgG、IgE、TNF-α、IL-1、IL-2、IL-6、IFN-γ、VEGF、TGF-β1、PCSK-9、CPB2、ChE、CCL2、因子VII、因子IX、CD40L、因子Xa、因子XI、因子XIa、因子XII、因子XIII、FGF1、FGF2、FN1、IL-5、IL-8、IL-10、IL-21、IL-22、激肽释放酶1、LPL、MMP1、MIF、GIF、L-多巴色素异构酶或苯丙酮酸互变异构酶、中性粒细胞弹性蛋白酶、凝血酶原、KLKB1、PLG、PAI-1、内皮纤溶酶原激活剂抑制剂、丝氨酸蛋白酶抑制剂E1、磷脂酶A2、PLA2、PA21B、PLA2G1B、PLA2-IB、PLA2、PLA2A、PA2IIA、PLA2G2A、PLA2-IIA、PGF,纤溶酶原激活剂、组织类型(tPA,PLAT)、转化生长因子β2(TGF-β2,TGFB2)、血小板反应蛋白1、尿激酶、尿激酶-型纤溶酶原激活剂、补体因子B、补体因子D、靶补体因子H和补体成分5。
氨基酸
在某些实施方案中,胞外蛋白靶向配体包含一种或多种氨基酸。本发明考虑使用天然氨基酸、非天然氨基酸或其任何组合来实现所需的靶向配体特性。
术语“天然氨基酸”是指选自丙氨酸、精氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酰胺、谷氨酸、甘氨酸、组氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、苯丙氨酸、脯氨酸、丝氨酸、苏氨酸的氨基酸,色氨酸、酪氨酸和缬氨酸。
在某些实施方案中,天然氨基酸被相应的非天然氨基酸替代,例如用苯丙氨酸替代4-氯-苯丙氨酸。非天然氨基酸的非限制性实例包括:4-氯-苯丙氨酸、3-氟-苯丙氨酸、4-三氟甲基-苯丙氨酸、3,4-二氯-苯丙氨酸、4-苯基-苯丙氨酸、N-甲基丙氨酸、N-甲基谷氨酸、N-甲基苯丙氨酸和高丝氨酸。
非天然氨基酸的另一些实例包括:
/>
在某些实施方案中,胞外蛋白靶向配体是氨基酸序列。在某些实施方案中,氨基酸序列通过与末端胺的键连接至分子的接头部分。在某些实施方案中,氨基酸序列通过与末端羧酸(例如酯或酰胺)的键连接至分子的接头部分。在某些实施方案中,肽包括胺、羟基或羧酸侧链并且接头可以结合至这些侧链之一。
例如,当氨基酸序列是SEQ ID NO:1 MLKKIE时,其中肽可以附着至接头的位置的非限制性实例包括:
氨基酸序列可以用本文描述的化学方法和本领域已知的其他方法连接到接头上。例如,当期望的连接基团是酰胺时,接头可以与胺、羧酸、酯或其他酰胺前体一起存在,并且靶向配体可以通过酰胺偶联反应例如HATU或HBTU偶联反应连接。
作为氨基酸序列的胞外蛋白靶向配体的非限制性实例包括适体、抗体和肽。在某些实施方案中,序列表中列出的最左边的氨基酸是C末端。在另一些实施方案中,序列表中列出的最右边的氨基酸是C-末端。
在某些实施方案中,氨基酸序列是指没有特定手性的序列。在另一些实施方案中,氨基酸序列全部为D-、全部为L-、或D-和L-氨基酸的混合物。
当肽由本文所绘结构中的氨基酸序列表示时,除非上下文排除,否则肽的左侧通常是N末端并且右侧通常是C末端。例如,PIESESLK中的脯氨酸通过N末端的氮连接到以下结构中的接头。
为了清楚起见,作为酰胺一部分的NH是脯氨酸的一部分,CO是接头的一部分。
当PIESESLK中的赖氨酸通过C末端的羰基连接到以下结构中的接头时。
为了清楚起见,与赖氨酸结合的NH是接头的一部分,赖氨酸通过作为C末端一部分的羰基与NH结合。
肿瘤坏死因子-α(TNF-α)
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人TNF-α(UniProtKB-P01375(TNFA_人))。TNF-α是一种促炎细胞因子,在身体免疫应答和严重炎症性疾病中具有活性。TNF-α与许多疾病有关,包括但不限于类风湿性关节炎、炎症性肠病、移植物抗宿主病、强直性脊柱炎、牛皮癣、化脓性汗腺炎、难治性哮喘、系统性红斑狼疮、糖尿病和诱发恶病质。
蛋白质数据库网站提供可通过6RMJ搜索的TNF-α晶体结构(Valentinis,B.,等人,Int.J.Mol.Sci.,2019,20);5UUI(Carrington等人,Biophys J.,2017,113 371-380);6OOY,6OOZ和6OPO(O’Connell,J.,等人,Nat.Commun.,2019,10 5795-5795);和5TSW(Cha,S.S.,J Biol Chem.,1998,273 2153-2160);以及可通过5YOY搜索的TNF-α与各种化合物结合的晶体结构(Ono等人,Protein Sci.,2018,27 1038-1046);2AZ5(He.,M.M.,等人,Science,2005,310:1022-1025);5WUX(Lee,J.U.,Int J Mol Sci.,2017,18);5MU8(BleVitt等人,J Med Chem.,2017,60 3511-3517);4Y6O(Feldman J.L.,等人,Biochemistry,2015,54 3037-3050);3WD5(Hu,S.,等人,J Biol Chem,2013,288 27059-27067);和4G3Y(Liang,S.Y.,J Biol Chem.,2013,288 13799-13807)。
图1提供了代表性的TNF-α靶向配体。其他TNF-α靶向配体可参见例如美国专利8541572;J Chem Inf Model.2017年5月22日;57(5):1101-1111;其中每一个都通过引用并入本文。
在某些实施方案中,TNF-α靶向配体选自:
在某些实施方案中,TNF-α靶向配体选自:
TNFα降解化合物的非限制性实例包括:
/>
/>
/>
/>
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人白介素-1(IL-1)(UniProtKB-P01584(IL1B_人))。IL-1是一种有效的促炎细胞因子。最初被发现是主要的内源性热原,诱导前列腺素合成、中性粒细胞流入和激活、T细胞激活和细胞因子产生、B细胞激活和抗体产生、以及成纤维细胞增殖和胶原蛋白产生。IL-1促进T细胞的Th17分化,并与IL12/白介素-12协同作用,诱导T辅助细胞1(Th1)细胞合成IFNG。IL-1与许多自身炎症和自身免疫性疾病有关,包括但不限于布劳综合征、冷吡蛋白相关周期性综合征、家族性地中海热、马吉德综合征;甲羟戊酸激酶缺乏综合征、化脓性关节炎-坏疽性脓皮病-痤疮综合征、肿瘤坏死因子受体相关周期性综合征、白塞氏病、干燥综合征、痛风和软骨钙质沉着症、周期性发热、口疮性口炎、咽炎和颈腺炎(或PFAPA)综合征,类风湿性关节炎、2型糖尿病、急性心包炎、慢性间质性肺疾病(ILD)、斯蒂尔病、
蛋白质数据库网站提供了可通过9ILB搜索的IL-1晶体结构(Yu,B.,等人,ProcNatl Acad Sci U S A,1999,96 103-108);1I1B(Finzel,B.C.,等人,J Mol Biol.,1989,209 779-791);和3O4O(Wang等人,Nat.Immunol.,2010,11:905-911);以及可通过4G6J搜索的与各种化合物结合的IL-1的晶体结构(Blech,M.,等人,J Mol Biol.,2013,425 94-111);5BVP(Rondeau等人,MAbs,2015,7 1151-1160);和3LTQ(Barthelmes,K.,等人,J AmChem.Soc.,2011,133 808-819).此外,Guy等人深入了解了与1型白介素1受体结合的小拮抗剂肽的晶体结构(Guy等人,The Journal of Biological Chemistry,2000,275,36927-36933)。
潜在的IL-1直接或间接抑制剂如图1所示。另外的IL-1靶向配体可以在例如美国专利9694015中找到,每篇专利均通过引用并入本文。另外的结合配体包括rilanocept或其结合片段(J Rheumatol.2012;39:720-727(2012);和卡那奴单抗或其结合片段(JRheumatol.2004;31:1103-1111)。
在某些实施方案中,IL-1靶向配体选自
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人白介素-2(IL-2)(UniProtKB-P60568(IL2_人))。IL-2是一种有效的促炎细胞因子。IL-2与宿主抗移植物排斥和其他自身免疫性疾病有关。
蛋白质数据库网站提供了可通过1M4C和1M47搜索的IL-2晶体结构(Arkin,M.R.,等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,2003,100:1603-1608);以及可通过4NEJ和4NEM搜索的与各种化合物结合的IL-2的晶体结构(Brenke,R.等人);1QVN(Thanos,C.D.,等人,Proc NatlAcad Sci U S A,2006,103 15422-15427);1PW6和1PY2(Thanos,C.D.,等人,J Am ChemSoc.,2003,125 15280-15281);1NBP(Hyde,J.,等人,Biochemistry,2003,42 6475-6483);和1M48,1M49,1M4A,1M4B,和1M4C(Arkin,M.R.,等人,Proc Natl Acad Sci U S A,2003,100 1603-1608).此外,Stauber,D.J.等人深入了解了IL-2信号复合物的晶体结构:异三聚体细胞因子受体的范例(Stauber,D.J.,等人,PNAS,2006,103(8),2788-2793)。
图1提供了代表性的IL-2靶向配体。另外的IL-2靶向配体可以在例如美国专利8802721;美国专利9682976、美国专利9708268;Eur J Med Chem 83:294-306(2014),J MedChem 60:6249-6272(2017);Nature 450:1001-1009(2007)中找到;其中每一个都通过引用并入本文。
在某些实施方案中,IL-2靶向配体选自
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人白介素-6(IL-6)(UniProtKB-P05231(IL6_人))。IL-6是一种具有多种生物学功能的细胞因子。它是急性期反应的有效诱导剂,在B细胞最终分化为Ig分泌细胞中发挥着重要作用。它还参与淋巴细胞和单核细胞的分化。它还作用于B细胞、T细胞、肝细胞、造血祖细胞和CNS细胞,并且是生成T(H)17细胞所必需的。IL-6与许多炎症性疾病和癌症有关,包括但不限于卡斯尔曼病(Castleman’s disease、转移性去势相关前列腺癌、肾细胞癌、大细胞肺癌、卵巢癌、类风湿性关节炎、哮喘。
蛋白质数据库网站提供了可通过1P9M搜索的IL-6晶体结构(Boulanger,M.J.,等人,Science,2003,300:2101-2104);1ALU(Somers等人,EMBO J.,1997,16,989-997);1IL6和2IL6(Xu,G.Y.,等人,J Mol Biol.,1997,268 468-481)和1N26(Varghese等人,ProcNatl Acad Sci U S A.,2002,99 15959-15964);以及可通过4CNI搜索的与各种化合物结合的IL-6的晶体结构(Shaw,S.,等人,Mabs,2014,6:773);以及4NI7和4NI9(Gelinas等人,JBiol Chem.2014,289(12),8720-8734)。此外,Gelinas等人深入了解了白介素6与经修饰的核酸配体复合物的晶体结构(Gelinas,A.D.,等人,J Biol Chem.2014,289(12),8720-8734);Somers等人提供了对白介素6晶体结构的深入了解:对受体二聚化和信号传导的新模式的影响。
图1提供了潜在的IL-6直接或间接抑制剂。其他潜在的IL-6直接或间接抑制剂可参见例如美国专利8901310;美国专利10189796;美国专利9694015;每一个都通过引用并入本文。在另一个实施方案中,IL-6胞外靶向配体是AvimarC326或其结合片段,其描述于NatBiotechnol 23,1556-1561(2005)中。
IFN-γ
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人干扰素-γ(IFN-γ)(UniProtKB-Q14609(Q14609_人))。IFN-γ是一种免疫调节细胞因子。IFN-γ与许多自身免疫性疾病有关,包括但不限于类风湿性关节炎、多发性硬化症(MS)、角膜移植排斥反应和各种自身免疫性皮肤病,例如牛皮癣、斑秃、白癜风、寻常痤疮和其他。
蛋白质数据库网站提供可通过1HIG搜索的IFN-γ晶体结构(Ealick,S.E.,等人,Science 252,1991,698-702);以及可通过6E3K和6E3L搜索的与各种化合物结合的IFN-γ的晶体结构(Mendoza,J.L.,等人,Nature,2019,567 56-60)。此外,R和al等人深入了解了单体干扰素-γ的结构和活性:α-链受体信号复合物Randal,M.,等人,Structure,2001,9(2),155-163)。
代表性的IFN-γ靶向配体如图1所示。另外的IFN-γ靶向配体可以在例如J MedChem 57:4511-20(2014)中找到;其通过引用并入本文。
血管上皮生长因子(VEGF)
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人血管上皮生长因子(VEGF)(UniProt KB-P15692(VEGFA_人))。VEGF是一种在血管生成、血管发生和内皮细胞生长中活跃的生长因子。VEGF诱导内皮细胞增殖、促进细胞迁移、抑制细胞凋亡并诱导血管通透化。VEGF与肿瘤的血管化和血管生成有关。
蛋白质数据库网站提供了可通过3QTK搜索的VEGF晶体结构(Mandal,K.,等人,Angew Chem Int Ed Engl.,2011,508029-8033);和4KZN(Shen等人.);以及与可通过5O4E搜索的与各种化合物结合的VEGF的晶体结构(Lobner,E.,等人,MAbs,2017,9 1088-1104);4QAF(Giese,T.,等人,);5DN2(Tsai,Y.C.I.,等人,FEBS,2017,J 283 1921-1934);4GLS(Mandal,K.,等人,Proc Natl Acad Sci U S A,2012,109 14779-14784);和1KMX(Stauffer,M.E.等人,J Biomol NMR,2002,23 57-61).此外,Mueller,Y.A.等人提供了对VEGF激酶结构域受体结合位点的晶体结构和功能图谱的深入了解(Mueller,Y.A.等人,Proc Natl Acad Sci U S A.,1997年7月8日;94(14):7192-7197)。
图1提供了代表性的VEGF靶向配体。另外的VEGF靶向配体包括但不限于(全部引用并入本文作为参考)肽VEPNCDIHVMWEWECFERL-NH2(Biochemistry 1998,37,17754-177764)。另外的VEGF靶向配体提供于例如J Med Chem 57:3011-29(2014)、美国专利9884843、美国专利9446026、J Med Chem 53:1686-99(2010)、J Med Chem 48:8229-36(2005),J Nat Prod 76:29-35(2013)中,其各自通过引用并入本文。
转化生长因子-β1(TGF-β1)
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人转化生长因子-β1(TGF-β1)(UniProt KB-P01137(TGFB1_人))。TGF-β1是一种多功能蛋白,可调节多种细胞类型的生长和分化,并参与多种过程,如正常发育、免疫功能、小胶质细胞功能和对神经退行性变的反应。TGF-β1可以浓度依赖性方式促进辅助性T细胞17(Th17)或调节性T细胞(Treg)谱系分化。肿瘤微环境中的TGF-β1表达与不良预后相关,并且与TGF-β1通过T细胞排斥介导的肿瘤抑制有关。TGF-β1表达也与血液恶性肿瘤和纤维化有关。
蛋白质数据库网站提供了可通过5E8S、5E8T和5E8U搜索的TGF-β1晶体结构(Tebben,A.J.,等人,Acta Crystallogr D Struct Biol.,2016,72658-674);2L5S(Zuniga,J.E.,等人,J Mol Biol.,2011,412601-618);和2PJY(Groppe,J.,等人,MolCell,2008,29157-168);以及可通过5QIK、5QIL和5QIM搜索的TGF-β1与各种化合物结合的晶体结构(Zhang,Y.,等人,ACS Med Chem Lett.,2018,91117-1122);6B8Y(Harikrishnan,L.S.,等人,Bioorg Med Chem.,2018,261026-1034);5E8W,5E8X,5E8Z,和5E90(Tebben,A.J.,等人,Acta Crystallogr D Struct Biol.,2016,72658-674);3TZM(Ogunjimi,A.A.等人,Cell Signal,2012,24476-483);2X7O(Roth,G.J.,等人,J Med Chem.,2010,537287);3KCF(Guckian,K.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2010,20326-329);3FAA(Bonafoux,D.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2009,19 912-916);1VJY(Gellibert,F,J.,等人,J Med Chem.,2004474494-4506);和1PY5(Sawyer,J.S.,等人,Bioorg Med ChemLett.,2004,143581-3584).此外,Hinck等人深入了解TGF-β及其受体的结构研究,并进一步深入了解TGF-β超家族的进化(Hinck,A.,FEBS,2012,586(14),1860-1870)。
图1提供了代表性的TGF-β1靶向配体。在一些实施方案中,TGF-β1靶向配体是肽KRFK肽(J.Biol.Chem.Vol.274(No.19)第13586-13593页(1999)(通过引用并入本文)。另外的TGF-β1靶向配体提供于例如Bioorg Med Chem Lett 21:5642-5(2011)中,其通过引用并入本文。
前蛋白转化酶枯草杆菌蛋白酶/Kexin 9型(PCSK-9)
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人原蛋白转化酶枯草杆菌蛋白酶/kexin 9型(PCSK-9)(UniProtKB-Q8NBP7(PCSK9_人))。PCSK-9在调节血浆胆固醇稳态中发挥着重要作用。PCSK-9与低密度脂质受体家族成员结合:低密度脂蛋白受体(LDLR)、极低密度脂蛋白受体(VLDLR)、载脂蛋白E受体(LRP1/APOER)和载脂蛋白受体2(LRP8/APOER2),并促进它们在细胞内酸性区室中的降解。它通过非蛋白水解机制发挥作用,通过网格蛋白LDLRAP1/ARH介导的途径增强肝脏LDLR的降解,并可能阻止LDLR从内体循环到细胞表面或将其引导至溶酶体进行降解。PCSK-9与高血胆固醇和心血管疾病的发展有关。
蛋白质数据库网站提供了可通过2P4E搜索的PCSK-9晶体结构(Cunningham,D.,等人,Nat Struct Mol Biol.,2007,14413-419);以及可通过3BPS搜索的与各种化合物结合的PCSK-9的晶体结构(Kwon,H.J.,等人,Proc Natl Acad Sci U S A,2008,105 1820-1825);6U26,6U2N,6U2P,6U36,6U38,和6U3X(Petrilli,W.L.,等人,Cell Chem Biol.,2019,27 32-40.e3);5OCA(Gustafsen,C.,等人,Nat Commun.,2017,8 503-503);4NE9(Schroeder,C.I.,等人,Chem Biol.,2014,21 284-294);4OV6(Mitchell,T.,等人,JPharmacol Exp Ther.,2014,350 412-424);和4NMX(Zhang,Y.,等人,J Biol Chem.,2014,289 942-955).此外,Piper等人提供了对PCSK9晶体结构的深入了解(Piper,D.E.,等人,Structure,2007,15(5),545-52)。
图1中提供了代表性的PCSK-9靶向配体。在一些实施方案中,PCSK-9靶向配体是肽TVFTSWEEYLDWV(J.Bio.Chem.2014年1月;289(2):942-955,通过引用并入本文)。另外的PCSK-9靶向配体提供于例如美国专利9227956、J Biol Chem 289:942-55(2014)中,其各自通过引用并入本文。
在某些实施方案中,PCSK-9配体是WO2021/156792(通过引用并入)中描述的任何PCSK-9配体。
在某些实施方案中,提供了具有下式的化合物
或其药学上可接受的盐;
其中
ASGPR配体是本文所述的ASGPR配体;
PCSK-9靶向配体是WO2021/156792中描述的任何PCSK-9配体。
可用于本发明的任何式中的PCSK-9靶向配体的非限制性实例包括:
/>
/>
其中LA1是键、NR8或O。
在某些实施方案中,PCSK9靶向配体是下式的化合物:
/>
其中,
RB1是H;
RB2是(C1-C6)烷氧基、-LB1-或(C1-C6)烷基,其被-C(=O)OH取代;
RB3是H或(C1-C6)烷基;
RB6是H、(C1-C6)烷基或LB1;
RB7是H、(C1-C6)烷基或LB1;
或RB6和RB7与它们所连接的碳原子一起形成(C3-C7)环烷基;
RB9是H或(C1-C6)烷基,其任选被一个或多个RB27取代;
RB9’是H或(C1-C6)烷基;
RB10是被ORB13取代且任选被一个或多个C6-C10取代的(C6-C10)芳基;
R11是(C1-C6)烷基或LB1;
RB12是卤素、(C1-C6)烷基、(C1-C6)烷氧基、(C1-C6)卤代烷基、(C1-C6)卤代烷氧基、-OH或CN;
RB13是被RB16取代的(C6-C10)芳基;
每个RB14在每次出现时独立地是卤素、(C1-C6)烷基、(C1-C6)烷氧基、(C1-C6)卤代烷基、(C1-C6)卤代烷氧基、氧代、-OH或CN;
RB16是包含1-3个选自N、0和S的杂原子的5至7元杂芳基,任选被一个或多个RB26取代;
每个RB26在每次出现时独立地是任选被一个或多个RB29取代的(C1-C6)烷基;
每个RB27在每次出现时独立地是(C6-C10)芳基;
每个RB29在每次出现时独立地是-NRB31RB32或包含1-3个选自N、0、和S的杂原子的4-至7-元杂环基;
每个RB31独立地选自H和(C1-C6)烷基;
每个RB32独立地选自H和(C1-C6)烷基;
LB1是-(CH2)pNH-*,其中LB1的*表示接头(LA)的附接点,并且其中RB11、RB6或RB7中的至少一个是-LB1-;以及
n是1。
在某些实施方案中,PCSK9靶向配体是下式的化合物:
其中,
RC1是被-ORC10和一个或多个RC11取代的(C6-C10)芳基;
RC2是H、(C1-C6)烷基、-LC1或(C39)碳环基,其中该烷基被一个RC18取代,并且该碳环基被一个或多个RC19取代;
RC3是H或(C1-C6)烷基;
RC4是H或(C1-C6)烷基;或者
RC3和RC4与它们所连接的原子一起形成包含1-3个选自N、0和S的杂原子的5-至7元杂环基环;
RC5是H或(C1-C6)烷基;
RC6是(C1-C6)烷基或-LC1,其中该烷基任选被一个或多个各自独立选自-OH或(C1-C6)烷氧基的取代基取代;
RC8是H、(C1-C6)烷基或-LC1,
RC9是卤素;
RC10是被一个RC22取代的(C6-C10)芳基;
每个RC11在每次出现时独立地是卤素、(C1-C6)烷基、(C1-C6)烷氧基、(C1-C6)卤代烷基、(C1-C6)卤代烷氧基、-OH或CN;
RC18是(C6-C10)芳基;
每个RC19在每次出现时独立地是卤素、(C1-C6)烷基、(C1-C6)烷氧基、(C1-C6)卤代烷基、(C1-C6)卤代烷氧基、-OH或CN;
RC22是包含1-3个选自N、0和S的杂原子的5-或6-元杂芳基,其被一个或多个RC23取代;
每个RC23在每次出现时独立地是(C1-C6)烷基,其任选被-NRC24RC25取代,或是包含1-3个选自N、0和S的杂原子的4至7元杂环基;
RC24是H、(C1-C6)烷基;
RC25是H、(C1-C6)烷基,
LC1是-(CH2)pNH-*,其中LC1的*表示与接头的附接点(LA),并且其中RC2、RC6或RC8中的至少一个是-LC1;以及
p是1、2、3、4、5或6。
在某些实施方案中,可用于本发明的任何式中的PCSK-9靶向配体包括:
在某些实施方案中,可用于本发明的任何式中的PCSK-9靶向配体包括:
在某些实施方案中,本发明的化合物选自
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在某些实施方案中,本发明的化合物选自
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在某些实施方案中,PCSK9靶向配体选自:
PCSK-9降解化合物的非限制性实例包括:
FHR3
人补体因子H相关蛋白3(FHR-3)属于补体因子H(FH)家族。H因子(FH)是替代补体途径激活的主要负调节因子,属于一个家族,该家族还包括其他五个相关家族成员,这些成员被认为是由非等位基因同源重组和位点间基因转换产生的,包括:补体因子H相关蛋白1(FHR1)、补体因子H相关蛋白2(FHR2)、补体因子H相关蛋白3(FHR3)、补体因子H相关蛋白4及亚型4A和4B(FHR4A和FHR4B)和补体因子H相关蛋白5(FHR5)。
与H因子不同,FHR3缺乏补体失活所必需的补体调节结构域,并且还会与H因子竞争,导致补体过度激活。因此,本发明提供了在调节补体因子H-蛋白、特别是FHR3的浓度以去除因子H的竞争剂并由此恢复因子H介导的调节以治疗由过度补体激活引起的障碍中使用的化合物。
由于H因子在补体调节中发挥核心作用,异常的FH活性会产生许多临床意义。H因子的功能缺失突变增加了对肾病、非典型溶血性尿毒症综合征(aHUS)和致密沉积物病(ODD)的易感性,而补体因子H的多态性变异与重要的人类疾病密切相关,包括年龄相关性黄斑变性(AMO)和脑膜炎球菌败血症(Clin Exp lmmunol 151(2):210-230;lmmunobiology217(11):1034-1046)。
在某些实施方案中,本发明提供在治疗FHR3介导的疾病或病症中的用途。
在某些实施方案中,FHR3介导的疾病或病症是补体相关疾病、补体失调病症、自身免疫性疾病、肾病、视网膜退行性疾病、风湿性疾病、相关退行性疾病、自身免疫性肾病、致密沉积病(ODD)、和系统性自身免疫性疾病。
在某些实施方案中,FHR3介导的疾病或病症的非限制性实例包括肾病、年龄相关性黄斑变性、非典型溶血性尿毒症综合征(aHUS)、溶血性尿毒症综合征的自身免疫形式、肝细胞癌(HCC)、C3肾小球病、阵发性睡眠性血红蛋白尿、多肌痛风湿病、类风湿性关节炎、脑膜炎球菌败血症和SLE(系统性红斑狼疮)。
在某些实施方案中,本发明提供了利用受体介导的内吞作用来消除或降低血浆中补体因子H相关蛋白3(FHR3)水平的化合物。
在某些实施方案中,FHR3靶向配体选自:
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在某些实施方案中,FHR3化合物选自:
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Tau蛋白
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是tau蛋白。大脑中tau蛋白的积累会导致与阿尔茨海默病和其他tau蛋白病相关的聚集。
Tau蛋白靶向配体的非限制性实例包括:
IL-21
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人白介素-21(IL-21)(UniProtKB-Q9HBE4(IL21_人))。IL-21是一种免疫调节细胞因子。IL-21与许多自身免疫性疾病有关,包括干燥综合征、系统性红斑狼疮、1型糖尿病、多发性硬化症、类风湿性关节炎和炎症性肠病。
蛋白质数据库网站提供了可通过2OQP搜索的IL-21晶体结构(Bondensgaard,K.,等人,J Biol Chem.,2007,28223326-23336);和4NZD(Hamming等人);以及可通过3TGX搜索的IL-21与各种化合物结合的晶体结构(Hamming,O.J.,等人,J Biol Chem.,2012,287(12),9454-9460)。
代表性的IL-21靶向配体如图1所示。另外的IL-21靶向配体可以在例如美国专利9701663中找到,该专利通过引用并入本文。
IL-22
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人白介素-22(IL-22)(UniProtKB-Q9GZX6(IL22_人))。IL-22是IL-10家族细胞因子的成员,由许多不同类型的淋巴细胞(包括先天性和适应性免疫系统的淋巴细胞)产生。IL-22与许多自身免疫性疾病有关,包括但不限于移植物抗宿主病(GVHD)、牛皮癣、类风湿性关节炎、特应性皮炎和哮喘。
蛋白质数据库网站提供了可通过1M4R搜索的IL-22晶体结构(Nagem,R.A.P.,等人,Structure,2002,10 1051-1062);以及可通过3DGC搜索的与各种化合物结合的IL-22的晶体结构(Jones,B.C.等人,Structure,2008,161333-1344)。
代表性的IL-22靶向配体如图1所示。另外的IL-22靶向配体可以在例如美国专利9,701,663中找到,该专利通过引用并入本文。
IL-10
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人白介素-10(IL-10)(UniProtKB-P22301(IL10_人))。IL-10是一种炎症细胞因子。IL-10与肿瘤存活和细胞毒性化疗药物的保护有关。
蛋白质数据库网站提供了可通过2ILK搜索的IL-10晶体结构(Zdanov,A等人,Protein Sci.,1996,5 1955-1962);1ILK(Zdanov,A.等人,Structure,1995,3 591-601);2H24(Yoon,S.I.,等人,J Biol Chem.,2006,281 35088-35096)和3LQM(Yoon,S.I.,等人,Structure,2010,18 638-648).此外,Zdanov,A.等人提供了对IL-10晶体结构的深入了解(Zdanov A.,Current Pharmaceutical design,2004,10,3873-3884)。
图1提供了代表性的IL-10靶向配体。另外的IL-10靶向配体可以在例如ACS ChemBiol 11:2105-11(2016)中找到,其通过引用并入本文。
IL-5
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人白介素-5(IL-5)(UniProtKB-P05113(IL5_人))。IL-5是一种调节嗜酸性粒细胞成熟、募集和存活的细胞因子。IL-5与许多过敏性疾病有关,包括但不限于哮喘、鼻息肉病、特应性皮炎、嗜酸性粒细胞性食管炎、嗜酸性粒细胞增多综合征和Churg-Strauss综合征。
蛋白质数据库网站提供了可通过1HUL(Milburn,M.V.,Nature,1993,363,172-176)和3VA2(Kusano等人,Protein Sci.,2012,21(6),2012,21(6),850-864);以及可通过1OBX和1OBZ搜索的与各种化合物结合的IL-5的晶体结构(Kang,B.S.,等人,Structure,2003,11,845)。
图1中提供了代表性的IL-5靶向配体。另外的IL-5靶向配体可以在例如以下中找到:Bioorg Med Chem 18:4441-5(2010);Bioorg Med Chem 18:4625-9(2011);Bioorg MedChem 21:2543-50(2013);Eur J Med Chem 59:31-8(2013);Bioorg Med Chem 23:2498-504(2015);Bioorg Med Chem 20:5757-62(2012);其中每一个都通过引用并入本文。
IL8
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人白介素-8(IL-8)(UniProtKB-P10145(IL8_人))。IL-8是一种趋化因子,可吸引中性粒细胞、嗜碱性粒细胞和T细胞,但不吸引单核细胞。它还参与中性粒细胞激活。它是响应炎症刺激而从多种细胞类型中释放出来的。IL-8与促进肿瘤进展、免疫逃逸、上皮-间质转化和骨髓源性抑制细胞的募集有关。研究表明,高血清IL-8水平与许多恶性肿瘤的不良预后相关。临床前研究表明,IL-8阻断可能会减少肿瘤细胞的间质特征,从而降低它们对治疗的抵抗力。
蛋白质数据库网站提供了可通过3IL8搜索的IL-8晶体结构(Baldwin,E.T.,等人,Proc Natl Acad Sci U S A,1991,88,502-506);和1IL8和2IL8(Clore,G.M.,等人,Biochemistry,1990,29,1689-1696);以及可通过1ILP和1ILQ搜索的与各种化合物结合的IL-8的晶体结构(Skelton,N,J.,等人,Structure,1999,7,157-168);和1ROD(Sticht,H.,等人,Eur J Biochem.,1996,235,26-35);4XDX(Ostrov等人)和5WDZ(Beckamp,S.,JBiomol NMR,2017,69,111-121)。
图1中提供了代表性的IL-8靶向配体。另外的IL-8靶向配体可以在例如BioorgMed Chem Lett 19:4026-30(2009)中找到,其通过引用并入本文。
胆碱酯酶
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人胆碱酯酶(UniProtKB-P06276(CHLE_人))。胆碱酯酶有助于神经递质乙酰胆碱的失活。抑制胆碱酯酶会导致突触间隙(两个神经末梢之间的空间)中乙酰胆碱的水平增加。胆碱酯酶抑制剂的主要用途是治疗阿尔茨海默病患者的痴呆症。患有阿尔茨海默病的人大脑中的乙酰胆碱水平降低。胆碱酯酶抑制剂已被证明对认知等痴呆症状有影响。
蛋白质数据库网站提供了可通过1P0I和1P0Q搜索的胆碱酯酶的晶体结构(Nicolet,Y.,等人,J Biol Chem.,2003,278,41141-41147);以及与可通过1P0M和1P0P搜索的各种化合物结合的胆碱酯酶的晶体结构(Nicolet,Y.,等人,J Biol Chem.,2003,278,41141-41147);2J4C(Frasco,M.F.,等人,FEBS J.,2007,274 1849);4BDT,4BDS(Nachon,F.,等人,Biochem J,2013,453,393-399);1GQR和1GQS(Bar-on,P.,等人,Biochemistry,2002,41,3555);3DJY和3DKK(Carletti,E.,等人,J Am Chem Soc.,2008,130,16011-16020);4AXB,4B0O,4B0P,和4BBZ(W和hammer,M.,等人,Chem Biol Interact.,2013,203,19);1DX6(Greenblatt,H.M.,等人,FEBS Lett.,1999,463 321);1GPK和1GPN(Dvir,H.,等人,Biochemistry,2002,41,10810);6CQY(Bester,S.M.,等人,Chem Res Toxicol.,2018,31,1405-1417);1XLV和1XLW(Nachon,F.,等人,Biochemistry,2005,44,1154-1162);2Y1K(Carletti,E.,等人,Chem Res Toxicol.,2011,24,797);和2WIG,2WIJ,2WIK,2WIL,和2WSL(Carletti,E.,等人,Biochem J.,2009,421,97-106).此外,Ahmad等人深入了解了来自飞燕草的异他拉他嗪水合物的分离、晶体结构测定和胆碱酯酶抑制潜力(Ahmad H.等人,Joumal Pharmaceutical Biology,2016,55(1),680-686)。
图1提供了代表性的胆碱酯酶靶向配体。其他靶向配体可以在例如以下中找到:ACS Med Chem Lett 4:1178-82(2013);J Med Chem 49:3421-5(2006);Eur J Med Chem55:23-31(2012);J Med Chem 51:3154-70(2008);J Med Chem 46:1-4(2002);Eur J MedChem 126:652-668(2017);Biochemistry 52:7486-99(2013);Bioorg Med Chem 23:1321-40(2015);其各自通过引用并入本文。
C-C基序趋化因子配体2(CCL2)
Grygiel等人深入了解了人CCL2的天然化学连接合成和晶体结构(Grygiel,T.L.,等人,Biopolymers,2010,94(3),350-9)。
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人C-C基序趋化因子配体2(CCL2)(UniProtKB-P13500(CCL2_人))。CCL2充当C-C趋化因子受体CCR2的配体。CCL2通过结合和激活CCR2发出信号,并诱导强烈的趋化反应和细胞内钙离子的动员。CCL2对单核细胞和嗜碱性粒细胞表现出趋化活性,但对中性粒细胞或嗜酸性粒细胞没有趋化活性。
CCL2与动脉粥样硬化疾病过程中单核细胞募集到动脉壁有关。
图1提供了代表性的CCL2靶向配体。另外的CCL2靶向配体可以在例如J Med Chem56:7706-14(2013)中找到,其通过引用并入本文。
羧肽酶B2
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人羧肽酶B2(UniProtKB-Q96IY4(CBPB2_人))。羧肽酶B2,也称为凝血酶可激活的纤溶抑制剂(TAFIa),可从循环中的生物活性肽(如激肽或过敏毒素)中裂解C末端精氨酸或赖氨酸残基,从而调节其活性。它通过去除已被纤溶酶部分降解的纤维蛋白中的C末端赖氨酸残基来下调纤维蛋白溶解。羧肽酶B2已被证实可抑制血栓形成。
蛋白质数据库网站提供了可通过3D66搜索的羧肽酶B2(也称为凝血酶激活的纤溶抑制剂(TAFI))的晶体结构(Marx,P.F.,等人,Blood,2008,112,2803-2809);3DGV(An和,K.,等人,JBC,2008,283,29416-29423);和1KWM(Barbosa Pereira,P.J.,等人,J MolBiol.,2002,321,537-547);以及TAFI与可通过3D67搜索的各种化合物结合的晶体结构(Marx,P.F.,等人,Blood,2008,112,2803-2809);5HVF,5HVG,5HVH(Zhou,X.,等人,JThromb Haemost.,2016,14,1629-1638);和3LMS(Sanglas,L.,等人,J Thromb Haemost.,2010,8,1056-1065).此外,Schreuder等人深入了解了TAFI和anabaenopeptin(一种TAFI的高效抑制剂)的相互作用(Schreuder,H.,等人,Sci Rep.,2016,6,32958)。
图1提供了代表性的羧肽酶B2靶向配体。另外的羧肽酶B2靶向配体可以在例如以下中找到:Bioorg Med Chem Lett 20:92-6(2010)、J Med Chem 50:6095-103(2007)、Bioorg Med Chem Lett 14:2141-5(2004)、J Med Chem 58:4839-44(2015)、J Med Chem55:7696-705(2012)、J Med Chem 59:9567-9573(2016)、Bioorg Med Chem Lett 17:1349-54(2007)、美国专利9662310、美国专利8609710、美国专利9688645、J Med Chem 46:5294-7(2003),其各自通过引用并入本文。
中性粒细胞弹性蛋白酶
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人嗜中性粒细胞弹性蛋白酶(UniProtKB-P08246(ELNE_人))。中性粒细胞弹性蛋白酶改变自然杀伤细胞、单核细胞和粒细胞的功能。抑制C5a依赖性中性粒细胞酶的释放和趋化性。
中性粒细胞弹性蛋白酶与多种疾病有关,包括肺病、慢性阻塞性肺病、肺炎、呼吸窘迫、急性肺损伤(ALI)、囊性纤维化以及慢性肾病。
蛋白质数据库网站提供了可通过3Q76和3Q77搜索的与各种化合物结合的人中性粒细胞弹性蛋白酶的晶体结构(Hansen,G.,等人,J.Mol.Biol.,2011,409,681-691);5ABW(Von Nussbaum,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2015,25,4370-4381);1B0F(Cregge,R.J.,等人,J Med Chem.,1998,41,2461-2480);1H1B(Macdonald,S.J.F.,等人,J Med Chem.,2002,45,3878);2Z7F(Koizumi,M.,等人,J Synchrotron Radiat.,2008,15 308-311);5A09,5A0A,5A0B,和5A0C(Von Nussbaum,F.,等人,Chem Med Chem.,2015,10,1163-1173);5A8X,5A8Y和5A8Z(Von Nussbaum,F.,等人,ChemMedChem.,2016,11,199-206);1HNE(Navia,M.A.,等人,Proc Natl Acad Sci U S A,1989,86,7-11);6F5M(Hochscherf,J.,等人,Acta Crystallogr F Struct Biol Commun.,2018,74,480-489);和4WVP(Lechtenberg,B.C.,等人,ACS Chem Biol.,2015,10,945-951).
图1提供了代表性的中性粒细胞弹性蛋白酶靶向配体。另外的嗜中性粒细胞弹性蛋白酶靶向配体可以在例如以下中找到:J Med Chem 53:241-53(2010)、J Med Chem 38:739-44(1995)、J Med Chem 37:2623-6(1994)、J Med Chem 38:4687-92(1995)、J MedChem 45:3878-90(2002)、Bioorg Med Chem Lett 5:105-109(1995)、Bioorg Med ChemLett 11:243-6(2001)、J Med Chem 40:1906-18(1997)、Bioorg Med Chem Lett 25:4370-81(2015)、美国专利8569314、美国专利9174997、美国专利9290457,其各自通过引用并入本文。
Xa因子
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人因子Xa(UniProtKB-P00742(FA10_人))。Xa因子是一种维生素K依赖性糖蛋白,在血液凝固过程中,在存在Va因子、钙和磷脂的情况下,可将凝血酶原转化为凝血酶。
X因子与深静脉血栓形成和急性肺栓塞的发生以及非瓣膜性心房颤动患者中风和栓塞的风险有关。
蛋白质数据库网站提供了与各种化合物结合的因子Xa的晶体结构,可通过1G2L和1G2M搜索(Nar,H.,等人,Structure,2001,9,29-38);2PR3(Nan huis,C.A.,等人,ChemBiol Drug Des.,2007,69,444-450);2UWP(Young,R.J.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2007,17,2927);2VVC,2VVV,2VVU,2VWL,2VWM,2VWN和2VWO(Zbinden,K.G.,等人,Eur J MedChem.,2009,44,2787);4Y6D,4Y71,4Y7A,4Y7B,4zh8,4ZHA(Convery,M.A.等人.);4Y76,4Y79,2J94和2J95(Chan,C.,等人,J Med Chem.,2007,501546-1557);1FAX(Br和stetter,H.,等人,J Biol Chem.,1996,271,29988-29992);2JKH(Salonen,L.M.,等人,Angew ChemInt Ed Engl.,2009,48,811);2PHB(Kohrt,J.T.,等人,Chem Biol Drug Des.,2007,70,100-112);2W26(Roehrig,S.,等人,J Med Chem.,2005,48,5900);2Y5F,2Y5G和2Y5H(Salonen,L.M.,等人,Chemistry,2012,18,213);3Q3K(Yoshikawa,K.,等人,Bioorg MedChem Lett.,2011,21,2133-2140);2BMG(Matter,K.,等人,J Med Chem.,2005,48,3290);2BOH,2BQ6 2BQ7,和2BQW(Nazare,M.,等人,J Med Chem.,2005,48,4511);2CJI(Watson,N.S.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2006,16,3784);2J2U,2J34,2J38,2J41(Senger,S.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2006,16 5731);3IIT(Yoshikawa,K.,等人,Bioorg MedChem.,2009,17 8221-8233);1EZQ,1F0R和1F0S(Maignan,S.,等人,J Med Chem.,2000,43,3226-3232);1FJS(Adler,M.,等人,Biochemistry,2000,39,12534-12542);1KSN(Guertin,K.R.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2002,12,1671-1674);1NFU,1NFW,1NFX和1NFY(Maignan,S.,等人,J Med Chem.,2003,46,685-690);2XBV,2XBW,2XBX,2XBY,2XC0,2XC4和2XC5(Anselm,L.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2010,20,5313);4A7I(Nazare,M.,等人,Angew Chem Int Ed Engl.,2012,51,905);4BTI,4BTT和4BTU(Meneyrol,L.,等人,J MedChem.,2013,56,9441);3FFG,3KQB,3KQC,3KQD和3KQE(Quan,M.L.,等人,Bioorg Med ChemLett.,2010,20,1373-1377);2P93,2P94和2P95(Qiao,J.X.,等人,Bioorg Med ChemLett.,2007,17,4419-4427);1V3X(Haginoya,N.,等人,J Med Chem.,2004,47,5167-5182);2P16(Pinto,D.J.P.,等人,J Med Chem.,2007,50,5339-5356);2RA0(Lee,Y.K.,等人,J Med Chem.,2008,51,282-297);3SW2(Shi,Y.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2011,21,7516-7521);2VH6(Young,R.J.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2008,18,23);2WYG和2WYJ(Kleanthous,S.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2010,20,618);2Y7X(Watson,N.S.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2011,21,1588);2Y7Z,2Y80,2Y81和2Y82(Young,R.J.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2011,21,1582);3KL6(Fujimoto,T.,等人,J Med Chem.,2010,53,3517-3531);3LIW(Meuller,M.M.,等人,Biol.Chem.,2003,383,1185);5K0H(Schweinitz,A.,等人,Med Chem.,2006,2,349-361);1XKA和1XKB(Kamata,K.,等人,ProcNatl Acad Sci U S A,1998,95,6630-6635);2EI6和2EI7(Nagata,T.,等人,Bioorg MedChem Lett.,2007,17,4683-4688);2P3T(Ye,B.,等人,J Med Chem.,2007,50,2967-2980);1MQ5和1MQ6(Adler,M.,等人,BioChemistry,2002,41,15514-15523);3K9X和3HPT(Shi,Y.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2009,19,6882-6889);3CEN(Corte,J.R.,等人,Bioorg MedChem Lett.,2008,18,2845-2849);2W3I和2W3K(Van Huis,C.A.,等人,Bioorg Med Chem.,2009,17,2501);2H9E(Murakami,M.T.,等人,J Mol Biol.,2007,366,602-610);1WU1和2D1J(Komoriya,S.,等人,Bioorg Med Chem.,2005,13,3927-3954);2G00(Pinto,D.J.P.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2006,16,5584-5589);3M36和3M37(Pruitt,J.R.等人,JMed Chem.,2003,46,5298-5315);3CS7(Qiao,J.X.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2008,18,4118-4123);1Z6E(Quan,M.L.,等人,J Med Chem.,2005,48,1729-1744);2FZZ(Pinto,D.J.P.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2006,16,4141-4147);和3ENS(Shi,Y.,等人,J MedChem.,2008,51,7541-7551).
图1提供了代表性因子Xa靶向配体。另外的因子Xa靶向配体可以在例如以下中找到:Bioorg Med Chem Lett 20:5313-9(2010)、Bioorg Med Chem Lett 13:679-83(2003)、J Med Chem 44:566-78(2001)、J Med Chem 50:2967-80(2007)、J Med Chem 38:1511-22(1995)、Bioorg Med Chem Lett 18:2845-9(2008)、J Med Chem 53:6243-74(2010)、Bioorg Med Chem Lett 18:2845-9(2008)、Bioorg Med Chem 16:1562-95(2008),其各自通过引用并入本文。
因子XI
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人因子XI UniProtKB-P03951(FA11_人)。因子XI通过激活因子IX触发凝血内在途径的中间阶段。
XI因子与深静脉血栓形成和急性肺栓塞的发生以及非瓣膜性心房颤动患者中风和栓塞的风险有关。
蛋白质数据库网站提供了与各种化合物结合的因子XI的晶体结构,可通过以下进行搜索:1ZSL、1ZTJ、1ZTK和1ZTL(Nagafuji,P.,等人,);1ZOM(Lin,J.,等人,J Med Chem.,2006,49,7781-7791);5EOK和5EOD(Wong,S.S.,等人,Blood,2016,127,2915-2923);1ZHM,1ZHP和1ZHR(Jin,L.,等人,Acta Crystallogr D Biol Crystallogr.,2005,61,1418-1425);1ZMJ、1ZLR、1ZML和1ZMN(Lazarova,T.I.,Bioorg Med Chem Lett.,2006,16,5022-5027);1ZRK,1ZSJ和1ZSK(Guo,Z.,等人);4CRA,4CRB,4CRC,4CRD,4CRE,4CRF和4CRG(Fjellstrom,O.,等人,PLoS One,2015,10,13705);3SOR和3SOS(Fradera,X.,等人,ActaCrystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun.,2012,68,404-408);1ZPB、1ZPC、2FDA(Deng,H.,et.al.,Bioorg Med Chem Lett.,2006,16,3049-3054);5WB6(Wang,C.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2017,27,4056-4060);4NA7和4NA8(Quan,M.L.,等人,J MedChem.,2014,57,955-969);4WXI(Corte,J.R.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2015,25,925-930);5QTV,5QTW,5QTX和5QTY(Fang,T.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2020,126949-126949);6C0S(Hu,Z.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,28,987-992);5QQP和5QQO(Clark,C.G.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2019,29,126604-126604);5Q0D,5Q0E,5Q0F,5Q0G,和5Q0H(Corte,J.R.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2017,27,3833-3839);5QCK,5QCL,5QCM,和5QCN(Pinto,D.J.P.,等人,J Med Chem.,2017,60,9703-9723);5TKS和5TKU(Corte,J.R.,等人,J Med Chem.,2017,60,1060-1075);1XXD和1XX9(Jin,L.,等人,J Biol Chem.,2005,280,4704-4712);5QTT和5QTU(Corte,J.R.,等人,J Med Chem.,2019,63,784-803);4TY6,4TY7(Hangel和,J.J.,等人,J Med Chem.,2014,57,9915-9932);4X6M,4X6N,4X6O,和4X6P(Pinto,D.J.P.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2015,25,1635-1642);和5EXM(Corte,J.R.,等人,Bioorg Med Chem.,2016,24,2257-2272).此外,Al-Horani等人对有关Xia因子抑制剂的专利文献进行了综述(A1-Horani等人,Expert Opin Ther Pat.2016;26(3),323-345)。
图1中提供了代表性因子XI靶向配体。另外的因子XI靶向配体可见于例如美国专利9783530、美国专利10143681、美国专利10214512、ACS Med Chem Lett 6:590-5(2015)、JMed Chem 60:9703-9723(2017)、J Med Chem 60:9703-9723(2017)、美国专利9453018(2016)、J Med Chem 60:1060-1075(2017)、J Med Chem 57:955-69(2014),其各自通过以下参考并入本文。
在某些实施方案中,因子XI靶向配体选自:
/>
在某些实施方案中,因子XI靶向配体描述于J Med Chem 61(17),7425-7447(2018)或J Med Chem(2020)Structure-based design and pre-clinicalcharacterization of selective and orally bioavailable Factor Xia inhibitors:demonstrating the power of an integrated S1 protease family approach。
因子XI降解化合物的非限制性实例包括:
/>
/>
在某些非限制性实施方案中,本发明的因子XI降解化合物选自以下其二齿或三齿形式的化合物:
/>
/>
/>
或其药学上可接受的盐。
因子XII
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人因子XII(UniProtKB-P00748(FA12_人))。XII因子是一种血清糖蛋白,参与血液凝固、纤维蛋白溶解的启动以及缓激肽和血管紧张素的生成。前激肽释放酶被因子XII裂解形成激肽释放酶,激肽释放酶随后首先将因子XII裂解为α-因子XIIa,然后胰蛋白酶将其裂解为β-因子XIIa。α-因子XIIa将因子XI激活为因子XIa。
XII因子与深静脉血栓形成和急性肺栓塞的发生以及非瓣膜性心房颤动患者中风和栓塞的风险有关。
蛋白质数据库网站提供了可通过以下搜索的各种化合物结合的因子XII的晶体结构:4XDE和4XE4(Pathak,M.,等人,J Thromb Haemost.,2015,13(4),580-591);6GT6和6QF7(Pathak,M.,等人,Acta Crystallogr D Struct Biol.,2019,75,578-591);和6B74和6B77(Dementiev,A.A.,等人,Blood Adv.,2018,2,549-558).此外,Pathak等人深入了解了因子XII的晶体结构(Pathak,M.,等人,J Thromb Haemost.,2015,13(4),580-591)。
图1提供了代表性因子XII靶向配体。另外的因子XII靶向配体可以在例如以下中找到:J Med Chem 60:1151-1158(2017)、J Med Chem 48:2906-15(2005)、J Med Chem 50:5727-34(2007)、J Med Chem 50:5727-34(2007)、J Med Chem 50:5727-34(2007)。MedChem 50:1876-85(2007)、Chembiochem 18:387-395(2017),其各自通过引用并入本文。
因子XIII
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人因子XIII UniProtKB-P00488(F13A_人))。凝血酶和钙离子将因子XIII激活为转谷氨酰胺酶,催化纤维蛋白链之间形成γ-谷氨酰-ε-赖氨酸交联,从而稳定纤维蛋白凝块。还将α-2-纤溶酶抑制剂或纤连蛋白交联到纤维蛋白的α链上。
因子XIII与深静脉血栓形成和急性肺栓塞的发生以及非瓣膜性心房颤动患者中风和栓塞的风险有关。
蛋白质数据库网站提供了可通过以下搜索的因子XIII的晶体结构:1FIE(Yee,V.C.,等人,Thromb Res.,1995,78,389-397);和1F13(Weiss,M.S.,等人,FEBS Lett.,1998,423,291-296);以及与可通过以下搜索的各种化合物结合的因子XIII的晶体结构:1DE7(Sadasivan,C.,等人,J Biol Chem.,2000,275,36942-36948);和5MHL、5MHM、5MHN和5MHO(Stieler,M.等人)。此外,Gupta等人从结构/功能的角度深入了解了凝血因子XIII激活和调节的机制(Gupta,S.,等人,Sci Rep.,2016;6,30105);和Komaromi等人,提供了对因子XIII的新颖结构和功能方面的见解(Komaromi,Z.,等人,.J Thromb Haemost 2011,9,9-20)。
图1提供了代表性因子XIII靶向配体。另外的因子XIII靶向配体可以在例如Eur JMed Chem 98:49-53(2015)、J Med Chem 55:1021-46(2012)、J Med Chem 48:2266-9(2005)中找到,其中每一个都通过引用并入本文。
凝血酶原
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人凝血酶原(UniProtKB-P00734(THRB_人))。凝血酶在精氨酸和赖氨酸后裂解键,将纤维蛋白原转化为纤维蛋白,并激活因子V、VII、VIII、XIII,以及与血栓调节蛋白复合的蛋白C。在血液稳态、炎症和伤口愈合中发挥作用。
凝血酶参与血凝块形成、动脉和静脉血栓形成以及与心房颤动相关的血栓栓塞。
蛋白质数据库网站提供可通过3NXP搜索的凝血酶原晶体结构(Chen,Z.等人,ProcNatl Acad Sci U S A,2010,107,19278-19283);以及与可通过以下搜索的各种化合物结合的凝血酶原的晶体结构:2HPP和2HPQ(Ami,R.K.等人,Biochemistry,1993,32,4727-4737);6BJR,6C2W(Chinnaraj,M.,等人,Sci Rep.,2018,8,2945-2945);5EDK,5EDM(Pozzi,N.,等人,J Biol Chem.,2016,291,6071-6082);3K65(Adams,T.E.,等人,Biochimie,2016,122,235-242);和6BJR和6C2W(Chinnaraj,M.等人,Sci Rep.,2018,8,2945-2945)。此外,Pozzi等人深入了解了凝血酶原晶体结构的机制和构象灵活性(Pozzi,N.等人,J BiolChem.,2013,288(31),22734-22744);和Zhiwei等人提供了对凝血酶原-1晶体结构的深入了解(Zhiwei,C.等人,PNAS,2010,107(45),19278-19283)。
凝血酶原转化为凝血酶,因此蛋白质数据库网站提供了与可通过以下搜索的化合物结合的凝血酶的晶体结构:1XMN(Carter,W.J.等人,J.Biol.Chem.,2005,280,2745-2749);4CH2和4CH8(Lechtenberg,B.C.等人,J Mol Biol.,2014,426,881);3PO1(Karle,M.等人,Bioorg Med Chem Lett.,2012,22,4839-4843);3DA9(Nilsson,M.等人,J MedChem.,2009,52,2708-2715);2H9T和3BF6(Lima,L.M.T.R.等人,Biochim Biophys Acta.,2009,1794,873-881);3BEF和3BEI(G和hi,P.S.等人,Proc Natl Acad Sci U S A,2008,105,1832-1837);3BV9(Nieman,M.T.等人,J Thromb Haemost.,2008,6,837-845);2HWL(Pineda,A.O.等人,Biophys Chem.,2007,125,556-559);2AFQ(Johnson,D.J.D.等人,Biochem J.,2005,392,21-28);1SHH(Pineda,A.O.等人,J Biol Chem.,2004,279,31842-31853);1JWT(Levesque,S.等人,Bioorg Med Chem Lett.,2001,11,3161-3164);1G37(Bach和,B.等人,Bioorg Med Chem Lett.,2001,11,287-290);1EOJ和1EOL(Slon-Usakiewicz,J.J.等人,Biochemistry,2000,39,2384-2391);1AWH(Weir,M.P.等人,Biochemistry,1998,37,6645-6657);1DIT(Krishnan,R.等人,Protein Sci.,1996,5,422-433);1HAO和1HAP(Padmanabhan,K.等人,Acta Crystallogr D Biol Crystallogr.,1996,52,272-282);和1HBT(Rehse,P.H.等人,Biochemistry,1995,34,11537-11544)。
图1提供了代表性的凝血酶原靶向配体。另外的凝血酶原靶向配体可以在例如以下中找到:J Med Chem 46:3612-22(2003)、Bioorg Med Chem Lett 12:1017-22(2002)、JMed Chem 40:830-2(1997)、Bioorg Med Chem Lett 15:2771-5(2005)、J Med Chem 42:3109-15(1999)、J Med Chem 47:2995-3008(2004)、Bioorg Med Chem 16:1562-95(2008)、J Med Chem 42:3109-15(1999),其各自通过引用并入本文。
凝血因子VII
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人凝血因子VII(UniProtKB-P08709(FA7_人))。因子VII启动外源性凝血途径。它是一种丝氨酸蛋白酶,以酶原形式在血液中循环。因子VII通过因子Xa、因子XIIa、因子IXa或凝血酶通过轻微的蛋白水解转化为因子VIIa。在组织因子和钙离子存在的情况下,因子VIIa通过有限的蛋白水解将因子X转化为因子Xa。在组织因子和钙存在的情况下,因子VIIa也会将因子IX转化为因子IXa。
因子VII参与血凝块形成、动脉和静脉血栓形成以及与心房颤动相关的血栓栓塞。
蛋白质数据库网站提供了可通过以下搜索的各种化合物结合的因子VII的晶体结构:2F9B(Rai,R.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2006,16,2270-2273);5U6J(Wurtz,N.R.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2017,27,2650-2654);5L2Y,5L2Z,和5L30(Ladziata,.U.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2016,26,5051-5057);5146(Glunz,P.W.,等人,J MedChem.,2016,59,4007-4018);4YLQ,4Z6A,和4ZMA(Sorensen,A.B.,等人,J Biol Chem.,2016,291,4671-4683);4YT6和4YT7(Glunz,P.W.,等人,Bioorg Med Chem Lett,2015,25,2169-2173);4NA9(Quan,M.L.,等人,J Med Chem.,2014,57,955-969);4NG9(hang,X.,等人,ACS Med Chem Lett.,2014,5,188-192);4JZD,4JZE和4JZF(Bolton,S.A.,等人,BioorgMed Chem Lett.,2013,23,5239-5243);4JYU和4JYV(Glunz,P.W.,等人,Bioorg Med ChemLett.,2013,23,5244-5248);4ISH(Priestley,E.S.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2013,23,2432-2435);4ISI(Zhang,X.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2013,23,1604-1607);2ZZU(Shiraishi,T.,等人,Chem Pharm Bull(Tokyo),2010,58,38-44);1WV7和1WUN(Kadono,S.,等人,Biochem Biophys Res Commun.,2005,327,589-596);2ZWL,2ZP0,(Kadono,S.,等人.);2EC9(Krishan,R.,等人,Acta Crystallogr D Biol Crystallogr.,2007,63,689-697);2PUQ(Larsen,K.S.,等人,Biochem J.,2007,405,429-438);2FLR(Riggs,J.R.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2006,16,3197-3200);2C4F(Kohrt,J.T.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2006,16,1060);2AEI(Kohrt,J.T.等人,Bioorg Med ChemLett.,2005,15,4752-4756);1WTG(Kadono,S.,等人,Biochem Biophys Res Commun.,2005,326,859-865);1WSS(Kadono,S.,等人,Aeta Crystallogr Sect F Struct BiolCryst Commun.,2005,61,169-173);1W7X和1W8B(Zbinden,K.G.,等人,Bioorg Med ChemLett.,2005,15,5344);1WQV(Kadono,S.,等人,Biochem Biophys Res Commun.,2004,324,1227-1233);1Z6J(Schweitzer,B.A.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2005,15,3006-3011);1YGC(Olivero,A.G.,等人,J Biol Chem.,2005,280,9160-9169);6R2W(Sorensen,A.B.,等人,J Biol Chem.,2019,295,517-528);5PA8、5PA9、5PAA、5PAB、5PAC、5PAE、5PAF、5PAG、5PAI、5PAJ、5PAK、5PAM、5PAN、5PAO、5PAQ、5PAR、5PAS、5PAT、5PAU、5PABV、5PAW、5PAX、5PAY、5PB0、5PB1、5PB2、5PB3、5PB4、5PB5和5PB6(Mayweg,A.V.等人);和5L0S(Li,Z.,等人,Nat Commun.,2017,8,185-185).此外,Kemball-Cook等人深入了解了活性位点抑制因子VIIa的晶体结构(Kemball-Cook,G.,等人,J Struct Biol.,1999,127(3),213-23)。
图1提供了代表性因子VII靶向配体。另外的因子VII靶向配体可以在例如以下中找到:美国专利9174974、Bioorg Med Chem Lett 26:5051-5057(2016)、Bioorg Med ChemLett 11:2253-6(2001)、Bioorg Med Chem Lett 15:3006-11(2005),Bioorg Med ChemLett 12:2883-6(2002),其各自均通过引用并入本文。
凝血因子IX
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人凝血因子IX(UniProtKB-P00740(FA9_人))。因子IX因子IX是一种维生素K依赖性血浆蛋白,在Ca2+离子、磷脂和因子VIIIa存在的情况下,通过将因子X转化为其活性形式,参与血液凝固的内在途径。
因子IX参与血凝块形成、动脉和静脉血栓形成以及与心房颤动相关的血栓栓塞。
蛋白质数据库网站提供了可通过以下搜索的与各种化合物结合的因子IX的晶体结构:6MV4(Vadivel,K.,等人,J Thromb Haemost.,2019,17,574-584);4ZAE(Zhang,T.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2015,25,4945-4949);4YZU和4Z0K(Parker,D.L.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2015,25,2321-2325);5TNO和5TNT(Sakurada,I.,等人,BioorgMed Chem Lett.,2017,27,2622-2628);5JB8,5JB9,5JBA,5JBB和5JBC(Kristensen,L.H.,等人,Biochem J.,2016,473,2395-2411);3LC3(Wang,S.,等人,J Med Chem.,2010,53,1465-1472);3LC5(Wang,S.,等人,J Med Chem.,2010,53,1473-1482);3KCG(Johnson,D.J.D.,等人,Proc Natl Acad Sci U S A,2010,107,645-650);1NL0(Huang,M.,等人,JBiol Chem.,2004,279,14338-14346);1RFN(Hopfner,K.P.,等人,Structure,1999,7,989-996);和6RFK(Sendall,T.J.,等人)。
图1提供了代表性的因子IX靶向配体。其他因子IX靶向配体可见于例如美国专利9409908、Bioorg Med Chem Lett 25:5437-43(2015)、美国专利10189819,其各自均通过引用并入本文。
成纤维细胞生长因子1(FGF1)
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人成纤维细胞生长因子1(FGF1)(UniProtKB-P05230(FGF1_人))。FGF1在细胞存活、细胞分裂、血管生成、细胞分化和细胞迁移的调节中发挥重要作用。FGF1充当FGFR1和整联蛋白的配体,并在肝素存在的情况下与FGFR1结合,导致FGFR1二聚化,并通过酪氨酸残基上的连续自磷酸化激活,酪氨酸残基充当相互作用蛋白的对接位点,从而导致多个信号级联的激活。FGF1诱导FGFR1、FRS2、MAPK3/ERK1、MAPK1/ERK2和AKT1的磷酸化和激活。FGF1可以诱导血管生成。FGF1与肿瘤发生、癌细胞增殖、抗癌治疗耐药性和新血管生成有关。
蛋白质数据库网站提供了可通过以下搜索的FGF1晶体结构:2AFG(Blaber,M.,等人,Biochemistry,1996,35,2086-2094);和1BAR(Zhu,X.等人,Science,1991,251,90-93);以及可通过以下搜索的与各种化合物结合的FGF1的晶体结构:1AFC(Zhu,X.,等人,Structure,1993,1,27-34);1AXM和2AXM(DiGabriele,A.D.,等人,Nature,1998,393,812-817);1EVT(Plotnikov,A.N.,等人,Cell,2000,101,413-424);1E0O(Pellegrini,L.,等人,Nature,2000,407,1029);和2ERM(Canales,A.,等人,FEBS J,2006,273,4716-4727).
图1提供了代表性的FGF1靶向配体。另外的FGF1靶向配体可以在例如Bioorg MedChem Lett 18:344-9(2008)、Chembiochem 6:1882-90(2005)、J Med Chem 55:3804-13(2012)、J Med Chem 47:1683-93(2004)、J Med Chem 53:1686-99(2010,),其各自通过引用并入本文。
成纤维细胞生长因子2(FGF2)
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人成纤维细胞生长因子2(FGF2)(UniProtKB-P09038(FGF2_人))。FGF2充当FGFR1、FGFR2、FGFR3和FGFR4的配体。FGF2还作为FGF2信号传导所需的整合素配体,在细胞存活、细胞分裂、细胞分化和细胞迁移的调节中发挥重要作用。FGF2还诱导血管生成。FGF2与肿瘤发生、癌细胞增殖、抗癌治疗耐药性和新血管生成有关。
蛋白质数据库网站提供了可通过以下搜索的与各种化合物结合的FGF2的晶体结构:4OEE、4OEF和4OEG(Li,Y.C.,等人,ACS Chem Biol.,2014,9,1712-1717);1EV2(Plotnikov,A.N.,等人,Cell,2000,101,413-424);和5X1O(Tsao,Y.H.)。
图1提供了代表性的FGF2靶向配体。另外的FGF2靶向配体可见于例如美国专利8933099、Bioorg Med Chem Lett 12:3287-90(2002)、Chem Biol Drug Des 86:1323-9(2015)、Bioorg Med Chem Lett 25:1552-5(2015),其各自通过引用并入本文。
纤连蛋白-1
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人纤连蛋白1(FN1)(UniProtKB-P02751(FINC_人))。纤连蛋白(FN)聚合对于胶原基质沉积是必要的,并且是心脏损伤后心肌成纤维细胞(MF)丰度增加的关键因素。干扰FN聚合可能会减轻MF和纤维化,并改善缺血/再灌注(I/R)损伤后的心脏功能。
蛋白质数据库网站提供了可通过以下搜索的与各种化合物结合的纤连蛋白-1的晶体结构:3M7P(Graille,M.,等人,Structure,2010,18,710-718);3MQL(Erat,M.C.,等人,J Biol Chem.,2010,285,33764-33770);和3EJH(Erat,M.C.,等人,Proc Natl Acad Sci US A,2009,106,4195-4200)。
图1提供了代表性的FN靶向配体。另外的FN靶向配体可以在例如Bioorg Med ChemLett 18:2499-504(2008)中找到,其通过引用并入本文。
激肽释放酶-1(KLK1)
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人激肽释放酶-1(UniProtKB-P06870(KLK1_人))。腺激肽释放酶裂解激肽原中的Met-Lys和Arg-Ser键,释放Lys-缓激肽。激肽释放酶与遗传性血管性水肿(HAE)的不良反应有关。
蛋白质数据库网站提供了可通过1SPJ搜索的KLK1晶体结构(Laxmikanthan,G.,等人,Proteins,2005,58,802-814);以及可通过以下搜索的KLK1与各种化合物结合的晶体结构:5F8Z、5F8T、5F8X(Xu,M.,等人,);和6A8O(Xu,M.,等人,FEBS Lett.,2018,592,2658-2667).此外,Katz等人深入了解了激肽释放酶的晶体结构(Katz,B.A.,等人,ProteinSci.,1998,7(4),875-85)。
图1提供了代表性的激肽释放酶靶向配体。另外的激肽释放酶靶向配体可见于例如美国专利9783530、J Med Chem 38:2521-3(1995)、美国专利9234000、美国专利10221161、美国专利9687479、美国专利9670157、美国专利9834513、J Med Chem 38:1511-22(1995)、美国专利10214512,其各自通过引用并入本文。
血浆激肽释放酶
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人血浆激肽释放酶(UniProtKB-P03952(KLKB1_人))。血浆激肽释放酶裂解赖氨酸-精氨酸和精氨酸-丝氨酸键。它在与带负电的表面结合后,通过相互反应激活因子XII。它还从HMW激肽原中释放缓激肽,并且还可能通过将肾素原转化为肾素而在肾素-血管紧张素系统中发挥作用。血浆激肽释放酶与视网膜功能障碍、糖尿病性黄斑水肿和遗传性血管性水肿(HAE)的发生有关。
蛋白质数据库网站提供了可通过以下搜索的与各种化合物结合的血浆激肽释放酶的晶体结构:5TJX(Li,Z.,等人,ACS Med Chem Lett.,2017,8,185-190);6O1G和6O1S(Patridge,J.R.,等人,J Struct Biol.,2019,206,170-182);4OGX和4OGY(Kenniston,J.A.,等人,J Biol Chem.,2014,289,23596-23608);以及5F8T、5F8X和5F8Z(Xu,M.等人)。
图1提供了代表性血浆激肽释放酶靶向配体。其他血浆激肽释放酶靶向配体可以在例如以下中找到:J Med Chem 61:2823-2836(2018)、J Med Chem 55:1171-80(2012)、美国专利8598206、美国专利9738655、Bioorg Med Chem Lett 16:2034-6(2006)、美国专利9409908、美国专利10144746、美国专利9290485,其各自通过引用并入本文。
脂蛋白脂肪酶
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人脂蛋白脂肪酶(UniProtKB-P06858(LIPL_人))。脂蛋白脂肪酶是甘油三酯代谢的关键酶。它催化循环乳糜微粒和极低密度脂蛋白(VLDL)中甘油三酯的水解,从而在血流中的脂质清除、脂质利用和储存中发挥重要作用。脂蛋白脂肪酶介导毛细血管中富含甘油三酯的脂蛋白颗粒的边缘化。脂蛋白脂肪酶与心血管疾病和肥胖症的发生有关。
蛋白质数据库网站提供了可通过6E7K搜索的与各种化合物结合的脂蛋白脂肪酶的晶体结构(Birrane,G.,等人,Proc Natl Acad Sci U S A,2018 116 1723-1732)。
图1提供了代表性的脂蛋白脂肪酶靶向配体。另外的脂蛋白脂肪酶靶向配体可以在例如J Med Chem 47:400-10(2004)中找到,其通过引用并入本文。
基质金属肽酶1(MMP-1)
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人基质金属肽酶1(MMP-1)(UniProtKB-P03956(MMP1_人))。MMP-1在螺旋结构域的一个位点裂解I、II和III型胶原蛋白。它还可以裂解VII型和X型胶原蛋白。MMP-1与心血管疾病有关。
蛋白质数据库网站提供了可通过3SHI搜索的MMP-1晶体结构(Bertini,I.,等人,FEBS Lett.,2012,586,557-567);以及可通过以下搜索的与各种化合物结合的MMP-1的晶体结构:4AUO(Manka,S.W.,等人,Proc Natl Acad Sci U S A,2012,109,12461);3MA2(Grossman,M.,等人,Biochemistry,2010,49,6184-6192);和2J0T(Iyer,S.,等人,J.Biol.Chem.,2007,282,364).此外,Iyer等人深入了解了MMP-1活性形式的晶体结构(Iyer,S.,等人,J Mol Biol.,2006,362(1),78-88);和Lovejoy等人,提供了对MMP1晶体结构和胶原酶抑制剂选择性的深入了解(Lovejoy,B.,等人,Nat Struct Mol Biol.,1999,6,217-221)。
图1中提供了代表性的MMP-1靶向配体。另外的MMP-1靶向配体可以在例如以下中找到:Bioorg Med Chem Lett 5:1415-1420(1995)、Bioorg Med Chem Lett 16:2632-6(2006)、Bioorg Med Chem Lett 8:837-42(1999)、Eur J Med Chem 60:89-100(2013)、JMed Chem 54:4350-64(2011)、Bioorg Med Chem Lett 8:3251-6(1999)、J Med Chem 42:4547-62(1999)、J Med Chem 61:2166-2210(2018)、J Med Chem 41:1209-17(1998),其通过引用并入本文。
巨噬细胞迁移抑制因子(MIF)
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人巨噬细胞迁移抑制因子(MIF)(UniProtKB-P14174(MIF_人))。MIF是一种促炎细胞因子,参与对细菌病原体的先天免疫应答。MIF在炎症部位的表达表明其在调节宿主防御中巨噬细胞功能中发挥介质作用。它抵消糖皮质激素的抗炎活性。
MIF与以下有关:肿瘤进展;全身炎症;动脉粥样硬化;类风湿关节炎;和系统性红斑狼疮等。
蛋白质数据库网站提供了可通过1MIF搜索的MIF晶体结构(Sun,H-W.等人,ProcNatl Acad Sci U S A,1996,93,5191-5196);以及可通过以下搜索的与各种化合物结合的MIF的晶体结构:6PEG(Cirillo,P.F.等人);5XEJ(Fukushima,K);6FVE和6FVH(Sokolov,A.V.,等人,Biochemistry(Mosc),2018,83,701-707);6CB5,6CBF,6CBG,和6CBH(Trivedi-Parmar,V.,等人,ChemMedChem.,2018,13,1092-1097);6B1C,6B1K,6B2C,(Dawson,T.K.,等人,ACS Med Chem Lett.,2017,8,1287-1291);4Z15,4Z1T和4Z1U(Singh,A.K.,等人,JCell Mol Med.,2017,21,142-153);5HVS和5HVT(Cisneros,J.A.,等人,J Am Chem Soc.,2016,138,8630-8638);4PKK(Pantouris,G.,等人,);5J7P和5J7Q(Cisneros,J.A.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2016,26,2764-2767);5B4O(Kimura,H.,等人,Chem Biol.,2010,17,1282-1294);4PLU,4TRF,4P0H,和4P01(Pantouris,G.,等人,Chem Biol.,2015,22,1197-1205);4WR8和4WRB(Dziedzic,P.,等人,J Am Chem Soc.,2015,1372996-3003);4K9G(Ioannou,K.,等人,Int J Oncol.,2014,45,1457-1468);4OSF,3WNR,3WNS和3WNT(Spencer,E.S.,等人,Eur J Med Chem.,2015,93,501-510);4OYQ(Spencer,E.S.等人,);3SMB和3SMC(Crichlow,G.V.等人,Biochemistry,2012,51,7506-7514);3U18(Bai,F.,等人,J Biol Chem.,2012,287,30653-30663);4F2K(Tyndall,J.D.A.,等人,ActaCrystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun.,2012,68,999-1002);3IJG和3IJJ(Cho,Y.,等人,Proc Natl Acad Sci U S A,2010,107,11313-11318);3L5P,3L5R,3L5S,3L5T,3L5U,和3L5V(McLean,L.R.等人,Bioorg Med Chem Lett.,2010,20,1821-1824);3JSF,3JSG和3JTU(McLean,L.R.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2009,19,6717);3HOF(Crawley,L.,等人.);3CE4和3DJI(Crichlow G.V.,等人,Biochemistry,2009,48,132-139);3B9S(Winner,M.等人,Cancer Res.,2008,68,7253-7257);2OOH,2OOW和2OOZ(Crichlow,G.V.等人,J Biol Chem.,2007,282,23089-23095);1GCZ和1GD0(Orita,M.等人,J Med Chem.,2001,44,540-547);和1CA7,1CGQ和1P 1G(Lubetsky,J.B.等人,Biochemistry,1999,38,7346-7354).此外,Sun等人提供了对MIF晶体结构的深入了解(Proc Natl Acad Sci U S A.,1996,28;93(11),5191-6)。
图1提供了代表性的MIF靶向配体。另外的MIF靶向配体可以在例如以下中找到:ACS Med Chem Lett 8:124-127(2017)、J Med Chem 44:540-7(2001)、J Med Chem 52:416-24(2009)、J Med Chem 52:416-24(2009)、J Med Chem 50:1993-7(2007),其通过引用并入本文。
转化生长因子-β2(TGF-β2)
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人转化生长因子-β2(TGF-β2)(UniProtKB-P61812(TGFB2_人))。TGF-β2是一种多功能蛋白,可调节血管生成和心脏发育等多种过程。一旦LAP释放后被激活,TGF-β-2就会通过与TGF-β受体(TGFBR1和TGFBR2)结合来发挥作用,从而转导信号。肿瘤微环境中的TGF-β2表达与不良预后相关,并且与TGF-β2通过T细胞排斥介导的肿瘤抑制有关。TGF-β2表达也与血液恶性肿瘤和纤维化有关。
蛋白质数据库网站提供了可通过6I9J搜索的TGF-β2晶体结构(Del Amo-MaestroL.等人,Sci Rep.2019,9,8660-8660);以及可通过以下搜索的与各种化合物结合的TGF-β2的晶体结构:1M9Z(Boesen,C.C.,等人.Structure,2002,10,913-919);5QIN(Zhang,Y.等人,ACS Med Chem Lett.,2018,9,1117-1122);5E8V,5E8Y,5E91和5E92(Tebben,A.J.等人,Acta Crystallogr D Struct Biol.,2016,72,658-674);4P7U(Wangkanont,K.等人,Protein Expr Purif.,2015,115,19-25);4XJJ(Wangkanont等人.);和1KTZ(Hart,P.J.,等人,Nat Struct Biol.,2002,9,203-208)。
图1提供了代表性的TGF-β2靶向配体。
血小板反应蛋白-1(TSP-1)
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人血小板反应蛋白-1(TSP-1)(UniProt KB-P61812(TGFB2_人))。TSP1通过刺激内皮细胞凋亡、抑制内皮细胞迁移和增殖以及调节血管内皮生长因子的生物利用度和活性来充当血管生成抑制剂。TSP1影响肿瘤免疫应答、肿瘤细胞行为,包括粘附、侵袭、迁移、凋亡和增殖。
TSP-1表达与多种疾病有关,包括促进某些癌症,如乳腺癌、前列腺癌、黑色素瘤、SCLC、骨肉瘤、皮肤鳞状细胞癌、口腔鳞状细胞癌、甲状腺乳头状癌、甲状腺癌、髓母细胞瘤和纤维化疾病,如糖尿病、肝纤维化和多发性骨髓瘤。
蛋白质数据库网站提供了可通过以下搜索的TSP-1的晶体结构:1LSL(Tan,K.等人,J Cell Biol.,2002,159,373-382);2ES3(Tan,K.,等人,J Biol Chem.,2008,283,3932-3941);1Z78和2ERF(Tan,K.,等人,Structure,2006,14,33-42);和3R6B(Klenotic,P.A.,等人,Protein Expr Purif.,2011,80,253-259);以及与可通过以下搜索的各种化合物结合的TSP-1的晶体结构:2OUH和2OUJ(Tan,K.,等人,J Biol Chem.,2008,283,3932-3941);和1ZA4(Tan,K.,等人,Structure,2006,14,33-42)。
图1中提供了代表性的TSP-1靶向配体。
CD40配体(CD40L)
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人CD40配体(CD40L)(UniProtKB-P29965(CD40L_人))。CD40L是一种细胞因子,充当CD40/TNFRSF5的配体。它共刺激T细胞增殖和细胞因子产生。它在T细胞上的交联产生共刺激信号,与TCR/CD3连接和CD28共刺激一起增强IL4和IL10的产生。CD40L诱导T细胞中NFκB以及激酶MAPK8和PAK2的激活。它还诱导CD28亚型3的酪氨酸磷酸化。CD40L在没有共刺激的情况下介导B细胞增殖,在IL4存在的情况下介导IgE产生,并参与免疫球蛋白类别转换。
蛋白质数据库网站提供了可通过1ALY搜索的CD40L晶体结构(Karpusas,M.,等人,Structure,1995,3,1031-1039);以及与可通过以下搜索的各种化合物结合的CD40L的晶体结构:3QD6(An,H.J.,等人,J Biol Chem.,2011,286,11226-11235);和6BRB(Kamell,J.L.,等人,Sci Transl Med.,2019,11(489),6584)。
CD40L的表达与HIV相关的神经认知障碍和心血管并发症有关。图1中提供了代表性的CD40L靶向配体。
尿激酶型纤溶酶原激活剂(UPA)
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人尿激酶型纤溶酶原激活剂(UPA)(UniProtKB-P00749(UROK_人))。尿激酶型纤溶酶原激活剂(uPA)是一种丝氨酸蛋白酶,存在于血液和许多组织的细胞外基质中。该酶的主要生理底物是纤溶酶原,它是丝氨酸蛋白酶纤溶酶的无活性形式(酶原)。纤溶酶的激活会触发蛋白水解级联,根据生理环境,蛋白水解级联参与溶栓或细胞外基质降解。该级联与血管疾病和癌症进展有关。尿激酶和纤溶酶原激活系统的其他几种成分的表达水平升高被发现与肿瘤恶性肿瘤相关。
蛋白质数据库网站提供了可通过以下搜索的与各种化合物结合的UPA的晶体结构:5ZA7、5ZAJ、5ZA8、5ZA9、5ZAE、5ZAF、5ZAG、5ZAH和5ZC5(Buckley,B.J.等人,J MedChem.,2018,61,8299-8320);5LHP,5LHQ,5LHR,和5LHS(Kromann-Hansen,T.等人,SciRep.,2017,7,3385-3385);2VNT(Fish,P.V.等人.J Med Chem.,2007,50,2341);1OWD,1OWE,1OWH,1OWI,1OWJ,和1OWK(Wendt,M.D.等人,J Med Chem.,2004,47,303-324);1SQA,1SQO,和1SQT(Wendt,M.D.,等人,Bioorg Med Chem Lett.,2004,14,3063-3068);1U6Q(Bruncko,M.等人,Bioorg Med Chem Lett.,2005,15,93-98);3OX7,3OY5和3OY6(Jiang,L.G.等人,J Mol Biol.,2011,412,235-250);4OS1,4OS2,4OS4,4OS5,4OS6和4OS7(Chen,S.等人,Nat Chem.,2014,6,1009-1016);3IG6(West,C.W.等人,Bioorg Med Chem Lett.,2009,19,5712-5715);4X0W和4X1P(Jiang,L.等人,Int J Biochem Cell Biol.,2015,62,88-92);4X1N,4X1Q,4X1R和4X1S(Zhao,B.等人,PLoS One,2014,9,e115872-e115872);5WXO和5WXP(Jiang,L.等人,Biochim Biophys Acta.,2018,1862,2017-2023);4MNV,4MNW,4MNX,和4MNY(Chen,S.,等人,Angew Chem Int Ed Engl.,2014,53,1602-1606);4GLY(Chen,S.,等人,J Am Chem Soc.,2013,135,6562-6569);4JK5和4JK5(Chen,S.,等人,Chembiochem.,2013,14,1316-1322);3QN7(Angelini,A.等人,ACS Chem Biol.,2012,7,817-821);2NWN(Zhao,G.等人,J Struct Biol.,2007,160,1-10);6NMB(Wu,G.等人,BloodAdv.,2019,3,729-733);1W0Z,1W10,1W11,1W12,1W13,和1W14(Zeslawska,E.等人,J MolBiol.,2003,328,109);4DVA(Jiang,L等人,Biochem J.,2013,449,161-166);6A8G 6A8N(Wang,D.等人,J Med Chem.,2019,62,2172-2183);2VIN,2VIO,2VIP,2VIQ,2VIV,和2VIW(Frederickson,M.等人,J Med Chem.,2008,51,183);1EJN(Speri,S.,等人,Proc NatlAcad Sci U S A,2000,97,5113-5118);3PB1(Lin,Z.等人,J Biol Chem.,2011,286,7027-7032);3U73(Xu,X.等人,J Mol Biol.,2012,416,629-641);1C5W,1C5X,1C5Y和IC5Z(Katz,B.A.,等人,Chem Biol.,2000,7,299-312);5XG4(Xue,G.等人,Food Funct.,2017,8,2437-2443);5WXF(Jiang,L.等人,Biochim Biophys Acta.,2018,1862,2017-2023);5WXS,4ZKS,5WXQ,5WXT,5YC6,5YC7,5Z1C,(Jiang,L.等人.);4H42(Yu,H.Y.等人,);6AG3和6AG9(Buckley,B.等人);3KGP,3KHV,3KID,3M61,3MHW,和3MWI(Jiang,L.G.等人,);4ZKN,4ZKO和4ZKR(Jiang,L.等人.);2O8T,2O8U,2O8W(Zhao,G.等人,);和4FU7,4FU8,4FU9,4FUB,4FUC,4FUD,4FUE,4FUF,4FUG,4FUH,4FUI,和4FUJ(Kang,Y.N.等人)。
图1提供了代表性的UPA靶向配体。另外的UPA靶向配体提供于例如J Med Chem38:1511-22(1995)、Bioorg Med Chem Lett 11:2253-6(2001)、Bioorg Med Chem Lett14:3063-8(2004)、J Med Chem 52:3159-65(2009),CSAR 1:(2012)、Bioorg Med Chem 22:3187-203(2014)、J Med Chem 50:2341-51(2007)、J Mol Biol 329:93-120(2003)、BioorgMed Chem Lett2:1399-1404(1992)、J Med Chem 35:4297-305(1992)、J Med Chem 35:4150-9(1992)、J Med Chem 49:5785-93(2006)、Bioorg Med Chem 23:3696-704(2015)、Bioorg Med Chem Lett 10:983-7(2000)、J Med Chem 49:5785-93(2006),其各自通过引用并入本文。
组织型纤溶酶原激活剂(TPA)
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人纤溶酶原激活剂、组织类型(TPA)(UniProtKB-P00750(TPA_人))。TPA通过水解纤溶酶原中的单个Arg-Val键,将丰富但无活性的酶原纤溶酶原转化为纤溶酶。通过控制纤溶酶介导的蛋白水解,它在组织重塑和降解、细胞迁移和许多其他病理生理学事件中发挥重要作用。TPA在促进神经元迁移中发挥直接作用。PLA已被证明在包括口腔恶性肿瘤在内的多种癌症中被激活。
蛋白质数据库网站提供了可通过1VR1搜索的TPA晶体结构(Dekker,R.J.等人,JMol Biol.,1999,293,613-627);以及与可通过以下搜索的各种化合物结合的TPA的晶体结构:1RTF(Lamba,D.等人,J Mol Biol.,1996,258,117-135);1A5H(Renatus,M.等人,J BiolChem.,1997,272,21713-21719);和1BDA(Renatus,M.等人,EMBO J.,1997,16,4797-4805)。
图1提供了代表性的TPA靶向配体。另外的TPA靶向配体提供于例如Bioorg MedChem Lett 15:4411-6(2005)、Bioorg Med Chem Lett 13:2781-4(2003)、Bioorg MedChem Lett 6:2913-2918(1996)、J Med Chem 44:2753-71(2001)、J Med Chem 41:5445-56(1999)、Bioorg Med Chem Lett 12:3183-6(2002)、US Patent 10118930、J Biol Chem285:7892-902(2010),其各自通过引用并入本文。
纤溶酶原(PLG)
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人纤溶酶原(PLG)(UniProtKB-P00747(PLMN_人))。PLG溶解血栓中的纤维蛋白,并在胚胎发育、组织重塑、肿瘤侵袭和炎症等多种其他过程中充当蛋白水解因子。它激活尿激酶型纤溶酶原激活剂、胶原酶和多种补体酶原,例如C1和C5。它在组织重塑和肿瘤侵袭中的作用可能受到CSPG4的调节。
蛋白质数据库网站提供了可通过以下搜索的PLG晶体结构:1DDJ(Wang,X.等人,J.Mol.Biol.,2000,295,903-914);和4DUR和4DUU(Law,R.H.P.,等人,Cell Rep.,2012,1,185-190)。
图1提供了代表性的PLG靶向配体。另外的PLG靶向配体提供于例如J Med Chem35:4297-305(1992)、J Med Chem 38:1511-22(1995)、J Med Chem 56:820-31(2013)、USPatent 8598206、US Patent 8921319、J Med Chem 55:1171-80(2012)、Bioorg Med ChemLett 12:3183-6(2002)、Bioorg Med Chem 23:3696-704(2015)、Bioorg Med Chem Lett13:723-8(2003)、Bioorg Med Chem Lett 7:331-336(1997),其各自通过引用并入本文。
纤溶酶原激活剂抑制剂-1(PAI-1)
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人纤溶酶原激活物抑制剂1(PAI-1)(UniProtKB-P05121(PAI1_人))。PAI-1是一种丝氨酸蛋白酶抑制剂,也是组织型纤溶酶原激活剂(PLAT)和尿激酶型纤溶酶原激活剂(PLAU)的主要抑制剂。作为PLAT抑制剂,它是纤维蛋白溶解下调所必需的,并负责血凝块的受控降解。作为PLAU抑制剂,它参与细胞粘附和扩散的调节,并作为细胞迁移的调节剂,独立于其作为蛋白酶抑制剂的作用。PAI-1的过度表达有利于肿瘤中的血管生成、转移和不良预后,包括但不限于口腔癌和乳腺癌。
蛋白质数据库网站提供了可通过以下搜索的PAI-1晶体结构:3Q02和3Q03(Jensen,J.K.等人,J Biol Chem.,2011,286,29709-29717);1B3K(Sharp,A.M.等人,Structure,1999,7,111-118);1C5G(Tucker,H.M.等人,Nat Struct Biol.,1995,2,442-445);1DVM(Stout,T.J.等人,Biochemistry,2000,39,8460-8469);和3UT3(Lin,Z.H.等人,);以及可通过以下搜索的PAI-1与各种化合物结合的晶体结构:4AQH(Fjellstrom,O.等人,J Biol Chem.,2013,288,873);3R4L(Jankun,J.等人,Int J Mol Med.,2012,2961-64);1A7C(Xue,Y.,等人,Structure,1998,6,627-636);1OC0(Zhou,A.等人,Nat StructBiol.,2003,10,541);6I8S(Vousden,K.A.等人,Sci Rep.,2019,9,1605-1605);4G8O和4G8R(Li,S.H.等人,Proc Natl Acad Sci U S A,2013,110,E4941-E4949);6GWQ,6GWN和6GWP(Sillen,M.等人,J Thromb Haemost,2019);和4IC0(Hong,Z.B.等人)。
图1中提供了代表性的PAI-1靶向配体。另外的PAI-1靶向配体提供于例如J BiolChem 285:7892-902(2010)、美国专利9120744、Bioorg Med Chem Lett 13:3361-5(2003)、Bioorg Med Chem Lett 12:1063-6(2002)、Bioorg Med Chem Lett 13:1705-8(2003)、Bioorg Med Chem Lett 11:2589-92(2001)、美国专利9718760,其各自通过引用并入本文。
胎盘生长因子(PIGF)
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人胎盘生长因子(PGF)(UniProtKB-P49763(PLGF_人))。PGF是一种对血管生成和内皮细胞生长具有活性的生长因子,可刺激其增殖和迁移。它与受体FLT1/VEGFR-1结合。同种型PlGF-2以肝素依赖性方式结合NRP1/neuropilin-1和NRP2/neuropilin-2。PGF还促进细胞肿瘤生长,并与年龄相关性黄斑变性(AMD)和脉络膜新生血管(CNV)有关。
蛋白质数据库网站提供了可通过1FZV搜索的PIGF的晶体结构(Iyer,S.等人,JBiol Chem.,2001,276,12153-12161);以及与可通过1RV6搜索的各种化合物结合的PIGF的晶体结构(Christinger,H.W.,J Biol Chem.,2004,279,10382-10388)。此外,De Falco还深入介绍了胎盘生长因子的发现和生物活性(De Falco,Exp Mol Med.,2012,44,1-9)。
图1提供了代表性的PGF靶向配体。另外的PGF靶向配体提供于例如J Med Chem54:1256-65(2011)、J Nat Prod 76:29-35(2013)中,其各自通过引用并入本文。
磷脂酶A2,IB组(PA21B)
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人磷脂酶A2,IB组(PA21B)(UniProt KB-P04054(PA21B_人))。PA21B优先在sn-2位点裂解磷脂,释放游离脂肪酸和溶血磷脂。PA21B与多种疾病有关,包括心血管疾病、动脉粥样硬化、免疫紊乱和癌症。
蛋白质数据库网站提供了可通过3FVJ和3FVI搜索的PA21B晶体结构(Pan,Y.H.等人,Biochim.Biophys.Acta.,2010,1804,1443-1448)。
图1提供了代表性的PA21B靶向配体。另外的PA21B靶向配体提供于例如J MedChem 39:3636-58(1996)、Chembiochem 4:181-5(2003)、J Med Chem 39:5159-75(1997)、JMed Chem 51:4708-14(2008),其各自通过引用并入本文。
磷脂酶A2,IIA组(PA2GA)
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人磷脂酶A2,IIA组(PA2GA)(UniProtKB-P04054(PA21B_人))。PA2GA催化3-sn-磷酸甘油酯中2-酰基的钙依赖性水解。它被认为参与生物膜中磷脂代谢的调节,包括类二十烷酸的生物合成。与其催化活性无关,它还充当整合素的配体。PA2GA以整合素依赖性方式诱导细胞增殖。PA2GA与多种疾病有关,包括心血管疾病、动脉粥样硬化、免疫紊乱和癌症。
蛋白质数据库网站提供了可通过以下搜索的与各种化合物结合的PA2GA的晶体结构:2ARM和1SV3(Singh,N.等人,Proteins,2006,64,89-100);5G3M和5G3N(Giordanetto,F.,等人.ACS Med Chem Lett.,2016,7,884);1KQU(Jansford,K.A.,等人,Chembiochem.,2003,4,181-185);和1ZYX(Singh,N.等人,).此外,Singh等人深入了解了IIA族磷脂酶A2与两种天然抗炎剂茴香酸和阿托品的复合物的晶体结构,揭示了类似的结合模式(Singh,N.等人,Proteins,2006,64(1):89-100);Kitadokoro等人还深入了解了人分泌型磷脂酶A2-IIA与强效中氮茚抑制剂120-1032复合物的晶体结构(Kitadokoro,K.等人,J Biochem.,1998,123(4),619-23)。
图1提供了代表性的PA2GA靶向配体。另外的PA2GA靶向配体提供于例如J MedChem 48:893-6(2005)、J Med Chem 39:5159-75(1997)中,其各自通过引用并入本文。
因子B
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人补体因子B(UniProtKB-P00751(CFAB_人))。补体因子B是补体系统替代途径的一部分,被因子D切割成2个片段:巴和Bb。Bb(一种丝氨酸蛋白酶)随后与补体因子3b结合生成C3或C5转化酶。它还涉及预激活B淋巴细胞的增殖和分化、外周血单核细胞的快速扩散、刺激淋巴细胞母细胞发生和红细胞裂解。Ba抑制预激活B淋巴细胞的增殖。
蛋白质数据库网站提供了可通过2OK5搜索的补体因子B的晶体结构(Milder,F.J.,等人,Nat Struct Mol Bio 2007,14,224-228);以及可通过以下搜索的与各种化合物结合的补体因子B的晶体结构:6QSW、6QSX和6RAV(Schubart,A.,等人,Proc Natl AcadSci 2019,116,7926-7931);6T8U、6T8W和6T8V(Mainolfi,N.,等人,J Med Chem 2020,63,5697-5722);和7JTN(Xu,X.,等人,J Immunol 2021,206,doi:10.4049/jimmunol.2001260)。
图5提供了代表性补体因子B靶向配体。另外的补体因子B靶向配体提供于例如美国专利9682968B2、美国专利9475806B2、美国专利9452990B2、Proc Natl Acad Sci 116:7926-7931(2019)、J Med Chem 52:6042-6052(2009)、J Med Chem 63:5697-5722(2020),其各自通过引用并入本文。
在某些实施方案中,胞外靶向配体选自:
/>
其各自任选被1、2、3或4个独立地选自R21的取代基取代;
在某些实施方案中,因子B靶向配体选自以下中描述的配体:Mainolfi,N等人,Discovery of 4-((2S,4S)-4-Ethoxy-1-((5-Methoxy-7-Methyl-1H-Indol-4-Yl)Methyl)Piperidin-2-Yl)Benzoic Acid(LNP023),a Factor B Inhibitor SpecificallyDesigned To Be Applicable to Treating a Diverse Array of Complement MediatedDiseases.J.Med.Chem.2020,63(11),5697-5722;WO2020/016749;WO2018/005552;WO2013/192345;或WO2015009616。
在某些实施方案中,因子B靶向配体-接头选自:
/>
在某些实施方案中,本发明的化合物选自以下化合物或其二齿或三齿形式:
/>
因子D
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人补体因子D(UniProtKB-P00746(CFAD_人))。当因子B与因子C3b复合时,因子D裂解因子B,激活C3bbb复合物,然后该复合物成为替代途径的C3转化酶。其功能与经典途径中的C1s的功能同源。
蛋白质数据库网站提供了可通过以下搜索的与各种化合物结合的补体因子D的晶体结构:6FTZ、6FUT、6FUH、6FUG、6FUJ和6FUI(Vulpetti,A.,等人,ACS Med Chem Lett2018,9、490-495);5TCA和5TCC(Yang,C.Y.,等人,ACS Med Chem Lett 2016,7,1092-1096);5MT4(Vulpetti,A.,等人,J Med Chem 2017,60,1946-1958);1DFP(Cole,L.B.,等人,Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 1997,53,143-150);1DIC(Cole,L.B.,等人,Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 1998,54,711-717);6QMR和6QMT(Karki,R.G.,等人,J Med Chem 2019,62,4656-4668)。
图6提供了代表性补体因子D靶向配体。另外的补体因子D靶向配体提供于例如JMed Chem 60:5717-5735(2017)、Nat Chem Biol 12:1105-1110(2016)、US patent9598446B2、美国专利9643986B2、美国专利US9663543B2、美国专利US9695205B2、美国专利9732103B2、美国专利9732104B2、美国专利9758537B2、美国专利9796741B2、美国专利9828396B2、美国专利10000516B2、美国专利10005802B2、美国专利10011612B2、美国专利10081645B2、美国专利10087203B2、美国专利10092584B2、美国专利10100072B2、美国专利10106563B2、美国专利10138225B2、美国专利10189869B2、美国专利10253053B2、美国专利10287301B2、美国专利10301336B2、美国专利10370394B2、美国专利10385097B2、美国专利10428094B2、美国专利10428095B2、美国专利10464956B2、美国专利10550140B2、美国专利10660876B2、美国专利10662175B2、美国专利10689409B2、美国专利10807952B2、美国专利10822352B2、美国专利9464081B2和Hematological 102:466-475(2017),其各自通过引用并入本文。
在某些实施方案中,胞外靶向配体选自:
其中:
R21a、R21b、R21c、R21d、R21e、R21f和R21g在每次出现时独立地选自氢、烷基、烯基、炔基、F、Cl、Br、I、羟基、烷氧基、叠氮基、氨基、氰基、-NR6R7、-NR8SO2R3、-NR8S(O)R3、卤代烷基、杂烷基、芳基、杂芳基、杂环基、-SR3、-C(O)OR3、-C(O)NR6NR7、-OR3和杂环;
R201、R202、R202′和R203独立地选自氢、卤素、羟基、硝基、氰基、氨基、C1-C6烷基、C2-C6烯基、C]1-C6烷氧基,C2-C6炔基、C2-C6烷酰基、C1-C6硫代烷基、羟基C1-C6烷基、氨基C1-C6烷基、-C0-C4烷基NR9R10、-C(O)OR9、-OC(O)R9、-NR9C(O)R10、-C(O)NR9R10、-OC(O)NR9R10、-O(杂芳基)、-NR9C(O)OR10、C1-C2卤代烷基、-C0-C4烷基(C3-C7环烷基)和-O-C0-C4烷基(C3-C7环烷基)和C1-C2卤代烷氧基,其中R209和R210在每次出现时独立地选自氢、C1-C6烷基和(C3-C7环烷基)C0-C4烷基;
或R202和R202’可以一起形成3-至6-元螺环,任选地被1个或多个独立地选自卤素、羟基、氰基、-COOH、C1-C4烷基(特别包括甲基)、C2-C4烯基、C]2-C4炔基、C1-C4烷氧基、C2-C4烷酰基、羟基C1-C4烷基、(单-和二-C1-C4烷基氨基)C0-C4烷基,-C0-C4烷基(C3-C7环烷基)、-O-C0-C4烷基(C3-C7环烷基)、C1-C2卤代烷基和C1-C2卤代烷氧基的取代基取代。
或R201和R202可以一起形成3元碳环,任选被1、2或3个选自R21的取代基取代。
或R201和R202可以一起形成4-至6-元碳环或含有1或2个独立地选自N、O和S的杂原子的4-至6-元杂环,任选被1、2或3个选自R21的取代基取代。
R202和R203可以一起形成3-至6-元碳环或3-至6-元杂环,任选被1、2、或3个选自R21的取代基取代。
L100选自其中R217为氢或C16烷基并且R218和R218′独立地选自氢、卤素、羟甲基和甲基;m为0、1、2或3;
B100是环烷基、具有1、2、3或4个独立地选自N、O和S的杂原子的杂环基团、C2-C6烯基、C2-C6炔基、-(C0-C4烷基)(芳基)、-(C0-C4烷基)(杂芳基)或-(C0-C4烷基)(联苯),其各自任选被1、2、3或4个独立选自R21的取代基取代。
在某些实施方案中,胞外靶向配体选自:
/>
/>
/>
/>
/>
/>
其每个任选地被1、2、3或4个独立选自R21的取代基取代。
在某些实施方案中,因子D靶向配体选自美国专利9,796,74中描述的配体;美国专利10,011,612;WO2018/160889;WO2019/195720;WO2019/057946;Karki,R.G.等人.Design,Synthesis,and Preclinical Characterization of Selective Factor D InhibitorsTargeting the Altemative Complement Pathway.J.Med.Chem.2019,62(9),4656-4668;或Belanger,D.B.等人.;WO2015/009977。
在某些实施方案中,补体因子D靶向配体-接头-选自:
/>
/>
/>
在某些实施方案中,本发明的化合物选自以下化合物或其二齿或三齿形式:
/>
/>
在某些实施方案中,本发明的化合物选自以下化合物或其二齿或三齿形式:
在某些实施方案中,因子D靶向配体选自:
在某些非限制性实施方案中,本发明的因子D降解化合物选自以下化合物或其二齿或三齿形式:
/>
/>
补体因子D降解化合物的非限制性实例包括:
/>
因子H
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人补体因子H(UniProtKB-P08603(CFAH_人))。补体因子H是一种糖蛋白,通过调节补体激活来维持免疫应答的平衡,发挥着重要作用。作为补体的可溶性抑制剂,其与聚糖结构等自身标记的结合可防止细胞表面的补体激活和扩增。补体因子H加速补体旁路途径(AP)C3转化酶C3bBb的衰变,从而防止局部形成更多的C3b,而C3b是补体放大环路的核心参与者。作为丝氨酸蛋白酶因子I的辅助因子,CFH还调节已沉积的C3b的蛋白水解降解。此外,它还通过与特定受体的相互作用介导多种细胞反应。例如,CFH与CR3/ITGAM受体相互作用,从而介导人中性粒细胞与不同病原体的粘附。反过来,这些病原体被吞噬并消灭。
蛋白质数据库网站提供了可通过3KXV和3KZJ搜索的高度相似的补体因子H突变体的晶体结构(Bhattacharjee,A.,等人,MolImmunol 2010,47,1686-1691);以及与可通过以下搜索的与各种化合物结合的野生型补体因子H的晶体结构:2UWN(Prosser,B.E.,等人,JExp Med 2007,204,2277);5WTB(Zhang,Y.,等人,Biochem J 2017,474,1619-1631);5O32和5O35(Xue,X.,等人,Nat Struct Mol Biol 2017,24,643-651);4ONT(Blaum,B.S.,等人,Nat Chem Biol 2015,11,77-82);和4ZH1(Blaum,B.S.,等人,Glycobiology 2016,26,532-539)。
图7提供了代表性的补体因子H靶向配体。另外的补体因子H靶向配体在例如JImmunol 182:6394-6400(2009),PLoS Pathogens 4中提供:e1000250(2008),公共科学图书馆病原体6:e1001027(2010)、美国专利10865238B1、美国专利8962795B2、美国专利申请20160317573A1和美国专利申请20190315842A1,其各自通过引用并入本文。
补体成分5(C5)
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人补体成分5(C5)(UniProtKB-P01031(CO5_人))。C5转化酶激活C5会启动晚期补体成分C5-C9自发组装成膜攻击复合物。C5b具有C6的瞬时结合位点。C5b-C6复合物是裂解复合物组装的基础。
蛋白质数据库网站提供了可通过3CU7搜索的补体成分5的晶体结构(Fredslund,F.,Nat Immunol 2008,9,753-760);以及可通过5I5K搜索的与各种化合物结合的补体成分5的晶体结构(Schatz-Jakobsen,J.A.,等人,J Nutrition 2016,197,337-344);3PVM和3PRX(Laursen,N.S.等人,EMBO J 2011,30,606-616);和3KLS(Laursen,N.S.,等人,ProcNatl Acad Sci 2010,107,3681-3686)。
图8提供了代表性补体成分5靶向配体。另外的补体成分5靶向配体提供于,例如,JImmunol 197:337-344(2016)、Ther Adv Hematol 10:1-11(2019)、BioDrugs 34:149-158(2020)、Blood 135:884-885(2020)、美国专利申请20170342139A1和美国专利申请20200095307A1,其各自均通过引用并入本文。
在某些实施方案中,胞外靶向配体选自:
以及
其每个任选地被1、2、3或4个独立选自R21的取代基取代。
在某些实施方案中,补体C5靶向配体选自以下中描述的配体:Jendza,K.等人ASmall-Molecule Inhibitor of C5 Complement Protein.Nat Chem Biol 2019,15(7),666-668;或Zhang,M.;Yang,X.-Y.;Tang,W.;Groeneveld,T.W.L.;He,P.-L.;Zhu,F.-H.;Li,J.;Lu,W.;Blom,A.M.;Zuo,J.-P.;Nan,F.-J.Discovery and StructuralModification of 1-Phenyl-3-(1-Phenylethyl)Urea Derivatives as Inhibitors ofComplement.ACS Med.Chem.Lett.2012,3(4),317-321。
在某些实施方案中,C5靶向配体选自:
在某些实施方案中,C5靶向配体选自:
补体C5降解化合物的非限制性实例包括:
/>
补体C1s
在某些实施方案中,胞外靶向配体是C1s靶向配体。
在某些实施方案中,补体C1s靶向配体选自WO2020/198062或美国专利6,683,055中描述的配体。
在某些实施方案中,本发明的化合物选自以下化合物或其二齿或三齿形式:
MASP
在某些实施方案中,胞外靶向配体是MASP靶向配体。
在某些实施方案中,MASP靶向配体选自以下中描述的配体:Héja,D.等人Monospecific Inhibitors Show That Both Mannan-Binding Lectin-AssociatedSerine Protease-1(MASP-1)and-2 Are Essential for Lectin Pathway ActiVationand Reveal Structural Plasticity of MASP-2.Journal of Biological Chemistry2012,287(24),20290-20300;Dobó,J.;Kocsis,A.;Gál,P.Be on Target:Strategies ofTargeting Alternative and Lectin Pathway Components in Complement-MediatedDiseases.Front.Immunol.2018,9,1851;或WO 2014/144542。
在某些实施方案中,MSAP-1靶向配体是通过N末端或C末端连接的SGMI-1肽。
在某些实施方案中,MSAP-1靶向配体是通过N末端或C末端连接的SGMI-2肽。
在某些实施方案中,MSAP-1靶向配体是通过N末端或C末端连接的TFMI-3肽。
因子XIa
在某些实施方案中,胞外靶向配体是因子XIa靶向配体。
在某些实施方案中,因子XIa靶向配体选自以下中描述的配体:Lorthiois,E.等人.Structure-Based Design and Preclinical Characterization of Selective andOrally Bioavailable Factor XIa Inhibitors:Demonstrating the Power of anIntegrated S1 Protease Family Approach.J.Med.Chem.2020,63(15),8088-8113。
在某些实施方案中,因子XIa靶向配体选自以下中描述的配体:Quan,M.L.等人.Factor XIa Inhibitors as New Anticoagulants.J.Med.Chem.2018,61(17),7425-7447。
在某些实施方案中,因子XIa靶向配体选自以下中描述的配体:Yang,W.等人.Discovery of a High Affinity,Orally Bioavailable Macrocyclic FXIa Inhibitorwith Antithrombotic Activity in Preclinical Species.J.Med.Chem.2020,63(13),7226-7242。
在某些实施方案中,因子XIa靶向配体-接头是:
在某些实施方案中,本发明的化合物选自以下化合物或其二齿或三齿形式:
在某些实施方案中,选择因子Xia靶向配体,其中将锚键置于具有或不具有官能化的任何合适的位置。
在某些实施方案中,因子XIa靶向配体选自:
免疫球蛋白降解
免疫球蛋白例如IgG可以引起、调节或放大体内疾病,例如异常细胞增殖,例如肿瘤和癌症、自身免疫性疾病、炎症和衰老相关疾病。例如,免疫球蛋白与细胞表面受体结合,通常会在癌症和炎症等多种疾病中引发异常信号传导。
本文所述的免疫球蛋白降解剂或其药学上可接受的盐和/或药学上可接受的组合物可用于治疗由与免疫球蛋白靶向配体结合的免疫球蛋白介导的病症。所述降解剂能够靶向介导溶酶体降解病理学病症的免疫球蛋白。所选择的免疫球蛋白可以通过作用机制调节人类的病症,例如生物途径的修饰、致病信号传导、或信号级联或细胞进入的调节。免疫球蛋白是用免疫球蛋白靶向配体募集的,免疫球蛋白靶向配体是免疫球蛋白的配体。
因此,在一些实施方案中,提供了治疗患有由免疫球蛋白介导的病症的宿主的方法,所述方法包括向宿主(通常为人)施用有效量的靶向本文所述的免疫球蛋白或其药学上可接受的盐的降解剂,任选地药学上可接受的组合物。
免疫球蛋白可以是蛋白质的正常形式或异常形式。例如,免疫球蛋白可以是突变蛋白,或例如其中部分或全部功能获得或功能丧失由核苷酸多态性编码的蛋白质。
本发明通过使用特异性免疫球蛋白靶向配体来实现靶向特异性免疫球蛋白。本发明的靶免疫球蛋白可以包括但不限于免疫球蛋白G(IgG)、免疫球蛋白A(IgA)和免疫球蛋白E(IgE)。这些免疫球蛋白介导一系列可用有效量的本文所述的ASGPR结合免疫球蛋白降解剂治疗的疾病。
免疫球蛋白A(IgA)
免疫球蛋白A(IgA)的异常表达会介导一系列自身免疫性和免疫介导的疾病,包括IgA肾病(也称为伯格氏病)、乳糜泻、克罗恩病、过敏性紫癜(HSP)(也称为IgA血管炎)、IgA天疱疮、疱疹样皮炎、炎性肠病(IBD);干燥综合征、强直性脊柱炎、酒精性肝硬化、获得性免疫缺陷综合征、IgA多发性骨髓瘤、α链疾病、IgA单克隆丙种球蛋白病、意义不明的单克隆丙种球蛋白病(MGUS)、线性IgA大疱性皮肤病、类风湿关节炎、溃疡性结肠炎、和原发性肾小球肾炎,等等。
IgA的特异性降解可以通过使用IgA特异性免疫球蛋白靶向配体来完成。在某些实施方案中,使用的免疫球蛋白靶向配体是Opt肽。适合用作IgA特异性免疫球蛋白靶向配体的IgA特异性Opt肽的变体和衍生物描述于Hatanaka等人Journal of BiologicalChemistry,287(51)43126-43136。在某些实施方案中,IgA特异性免疫球蛋白靶向配体是Opt-1。在某些实施方案中,IgA特异性免疫球蛋白靶向配体是Opt-2。在某些实施方案中,IgA特异性免疫球蛋白靶向配体是Opt-3。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白靶向配体是:
蛋白质数据库网站提供了IgA的晶体结构,以及可通过以下搜索的与各种化合物结合的IgA的晶体结构:5E8E(Baglin,T.P.,等人,J.Thromb.Haemost.,2016,14:137-142)和2QTJ(Bonner,A.,等人,J.Immunol.,2008,180:1008-1018)。此外,Hatanaka T.等人对IgA与OPT-1肽的特异性和高结合亲和力提供了深入的见解(J Biol Chem.,2012,287(51),43126-43136.)。
图1提供了代表性的IgA靶向配体。
另一些代表性IgA靶向配体包括:
SEQ ID NO:1 MLKKIE(Jerlstrom等人Infect.Immun.1996年7月;64(7):2787-2793;
SEQ ID NO:2 Opt-1-HMVCLAYRGRPVCFAL(Hatanaka等人.J.Biol.Chem.Vol.287,No.51,pp.43126-43136,12月14日,2012)
SEQ ID NO:3 Opt-2-HMVCLSYRGRPVCFSL(Hatanaka等人.J.Biol.Chem.Vol.287,No.51,pp.43126-43136,12月14日,2012)
SEQ ID NO:4 Opt-3-HQVCLSYRGRPVCFST(Hatanaka等人.J.Biol.Chem.Vol.287,No.51,pp.43126-43136,12月14日,2012)
SEQ ID NO:5 QMRCLSYKGRRVCLWL(美国专利9593147)
SEQ ID NO:6 KRLCLQYKGSKVCFRL(美国专利9593147)
SEQ ID NO:7 RMRCLTYRGRRVCLEL(美国专利9593147)
SEQ ID NO:8 SMRCLQYRGSRVCLTL(美国专利9593147)
SEQ ID NO:9 HLRCLRYKGTRVCFSL(美国专利9593147)
SEQ ID NO:10 HVRCLSYKGREVCVQL(美国专利9593147)
SEQ ID NO:11 PRMCLFIYKGRRVCIPY(美国专利9593147)
SEQ ID NO:12 HMRCLHYKGRRVCFLL(美国专利9593147)
SEQ ID NO:13 HKRCLHYRGRMVCFLI(美国专利9593147)
SEQ ID NO:14 QKRCLKYKGSRVCFFL(美国专利9593147)
SEQ ID NO:15 HVRCLRYRGKNVCFLL(美国专利9593147)
SEQ ID NO:16 SDVCLRYRGRPVCFQV(美国专利9593147)
SEQ ID NO:17 RDVCLRYRGRPVCFQV(美国专利9593147)
SEQ ID NO:18 HDVCLRYRGRPVCFQV(美国专利9593147)
SEQ ID NO:19 SMVCLRYRGRPVCFQV(美国专利9593147)
SEQ ID NO:20 SAVCLRYRGRPVCFQV(美国专利9593147)
SEQ ID NO:21 SDVCLNYRGRPVCFQV(美国专利9593147)
SEQ ID NO:22 SDVCLHYRGRPVCFQV(美国专利9593147)
SEQ ID NO:23 SDVCLAYRGRPVCFQV(美国专利9593147)
SEQ ID NO:24 SDVCLRYRGRPVCFAV(美国专利9593147)
SEQ ID NO:25 SDVCLRYRGRPVCFQL(美国专利9593147)
SEQ ID NO:26 SDVCLRYRGRPVCFQA(美国专利9593147)
SEQ ID NO:27 HMVCLSYRGRPVCF(美国公开号20150044701)
SEQ ID NO:28 HMVCLSYRGRPVCFS(美国公开号20150044701)
SEQ ID NO:29 HQVCLSYRGQPVCFSL(美国公开号20150044701)
SEQ ID NO:30 HQVCLSYRGRPTCFSL(美国公开号20150044701)
SEQ ID NO:31 HQVCLSYRGRPVCYSL(美国公开号20150044701)
SEQ ID NO:32 HQVCLSYRGQPVCFST(美国公开号20150044701)
SEQ ID NO:33 HQVCLSYRGRPTCFST(美国公开号20150044701)
SEQ ID NO:34 HQVCLSYRGQPTCFST(美国公开号20150044701)
在某些实施方案中,IgA靶向配体是
IgA降解化合物的非限制性实例包括:
/>
/>
/>
/>
免疫球蛋白G(IgG)
免疫球蛋白G(IgG)介导一系列自身免疫性疾病、感染性疾病和代谢性疾病,包括全身性纤维炎症性疾病。此外,IgG4的过度表达与IgG4相关疾病有关,这些疾病通常涉及多个器官,包括1型自身免疫性胰腺炎、间质性肾炎、里德尔甲状腺炎(Riedel′sthyroiditis)、席纹状纤维化、米库利奇病、库特纳氏瘤(Küttner′s tumor)、炎性假瘤(在身体的各个部位)、纵隔纤维化、腹膜后纤维化(奥蒙德病(Ormond’s disease))、主动脉炎和主动脉周围炎、近端胆管狭窄、特发性低补体血症性肾小管间质性肾炎、多灶性纤维硬化症、硬脑膜炎、胰腺肿大、肿瘤样病变、心包炎、类风湿关节炎(RA)、炎症性肠病、多发性硬化、重症肌无力、强直性脊柱炎、原发性干燥综合征、银屑病关节炎、系统性红斑狼疮(SLE)、硬化性胆管炎、IgG单克隆丙种球蛋白病、意义不明的单克隆丙种球蛋白病(MGUS)、黑色素瘤、大疱性类天疱疮、古德帕斯彻氏病(Goodpasture′s disease)、脑炎、血栓性血小板减少性紫癜、免疫性血小板减少症、慢性炎症性多发性神经病变、边缘叶脑炎、神经肌强直、莫文综合征(Morvan syndrome)、落叶型天疱疮、寻常型天疱疮、REM和非REM异睡症、和膜性肾病、多发性硬化、甲亢格雷夫氏病、获得性大疱性表皮松解症、妊娠期类天疱疮、抗p200类天疱疮、和副肿瘤性天疱疮,等等。
IgG的特异性降解可以通过使用IgG特异性免疫球蛋白靶向配体来完成。在某些实施方案中,免疫球蛋白靶向配体结合至IgG的Fc区。在某些实施方案中,IgG特异性免疫球蛋白靶向配体是Fc结合肽。在某些实施方案中,IgG特异性免疫球蛋白靶向配体是Fc-BP2。在某些实施方案中,IgG特异性免疫球蛋白靶向配体是Fc-III。
在某些替代实施方案中,本文描述的在靶向配体中具有立体化学的任何化合物也描述为不具有立体化学。例如,在某些实施方案中:
是/> 是/>
在某些实施方案中,本发明的化合物是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,本发明的化合物是:
/>
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,本发明的化合物是:
/>
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,本发明的化合物是:
/>
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物是:
/>
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物选自以下化合物或其双齿或三齿形式;
/>
/>
其中胞外蛋白靶向配体是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物选自以下化合物或其双齿或三齿形式;
/>
/>
其中胞外蛋白靶向配体是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物选自以下化合物或其双齿或三齿形式;
/>
/>
其中胞外蛋白靶向配体是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白靶向配体是:
在某些实施方案中,免疫球蛋白靶向配体是:
在某些实施方案中,免疫球蛋白靶向配体是:
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物选自以下化合物或其双齿或三齿形式;
/>
/>
其中胞外蛋白靶向配体是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物选自以下化合物或其双齿或三齿形式;
/>
其中胞外蛋白靶向配体是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物选自以下化合物或其双齿或三齿形式;
/>
/>
其中胞外蛋白靶向配体是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物选自以下化合物或其双齿或三齿形式;
/>
/>
其中胞外蛋白靶向配体是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物选自以下化合物或其双齿或三齿形式;
/>
其中胞外蛋白靶向配体是:
或其药学上可接受的盐。
蛋白质数据库网站提供可通过以下搜索的IgG晶体结构:1H3X(Krapp,S.,等人,J.Mol.Biol.,2003,325:979);和5V43(Lee,C.H.,等人,Nat.Immunol.,2017,18:889-898);以及可通过以下搜索的与多种化合物结合的IgG的晶体结构:5YC5(Kiyoshi M.,等人,Sci.Rep.,2018,8:3955-3955);5XJE(Sakae Y.,等人,Sci.Rep.,2017,7:13780-13780);5GSQ(Chen,C.L.,等人,ACS Chem.Biol.,2017,12:1335-1345);和1HZH(Saphire E.O.,等人,Science,2001,293:1155-1159)。此外,Kiyoshi,M.等人深入了解了人IgG1与其高亲和力人受体FcγRI结合的结构基础。(Kiyosi M.,等人,Nat Commun.,2015,6,6866)。
图1提供了代表性的IgG靶向配体。
另一些代表性IgG靶向配体包括:
其中XR是O、S、NH或N-C1-C3烷基;以及
XM是O、S、NH或N-C1-C3烷基。
在另一些实施方案中,IgG靶向配体选自:
在一些实施方案中,IgG靶向配体是根据化学结构的基团:
其中RNO2是任选地通过CH2、S(O)、S(O)2、-S(O)2O、-OS(O)2或OS(O)2O连接的二硝基苯基基团。
在某些实施方案中,IgG靶向配体选自:
其中X100选自O、CH2、NH、N-C1-C3烷基、NC(O)C1-C3烷基、S(O)、S(O)2、-S(O)2O、-OS(O)2或OS(O)2O。
在一些实施方案中,IgG靶向配体是根据化学结构的3-吲哚乙酸基团:
其中k””是1-4(优选2-3,最常见的是3)或
基团。
在一些实施方案中,IgG靶向配体是肽。IgG靶向配体肽的非限制性实例包括:
SEQ ID NO:35 PAM(RTY)4K2KG(Fassina等人,J.Mol.Recognit.1996,9,564-569)
D-PAM,其中PAM序列的氨基酸均为D-氨基酸(Verdoliva等人,J.Immunol.Methods,2002,271,77-88)SEQ ID NO:36(RTY)4K2KG
D-PAM-Φ,其中PAM序列的氨基酸都是具有进一步修饰的D-氨基酸,其中四个N-末端精氨酸被苯乙酸乙酰化(Dinon,等人J.Mol.Recognit.2011,24,1087-1094)SEQ ID NO:37(RTY)4K2KG
SEQ ID NO:38 TWKTSRISIF(Krook,等人,.J.Immunol.Methods 1998,221,151-157)
SEQ ID NO:39 FGRLVSSIRY(Krook,等人,J.Immunol.Methods 1998,221,151-157)
SEQ ID NO:40 Fc-III(DCAWHLGELVWCT-NH2)(DeLano等人,Science 2000,287,1279-1283)
SEQ ID NO:41 FCBP-Ser DSAWHLGELWST(参见WO2014010813)
SEQ ID NO:42 DCHKRSFWADNCT(参见WO2014010813)
SEQ ID NO:43 DCRTQFRPNQTCT(参见WO2014010813)
SEQ ID NO:44 DCQLCDFWRTRCT(参见WO2014010813)
SEQ ID NO:45 DCFEDFNEQRTCT(参见WO2014010813)
SEQ ID NO:46 DCLAKFLKGKDCT(参见WO2014010813)
SEQ ID NO:47 DCWHRRTHKTFCT(参见WO2014010813)
SEQ ID NO:48 DCRTIQTRSCT(参见WO2014010813)
SEQ ID NO:49 DCIKLAQLHSVCT(参见WO2014010813)
SEQ ID NO:50 DCWRHRNATEWCT(参见WO2014010813)
SEQ ID NO:51 DCQNWIKDVHKCT(参见WO2014010813)
SEQ ID NO:52 DCAWHLGELVWCT(参见WO2014010813)
SEQ ID NO:53 DCAFHLGELVWCT(参见WO2014010813)
SEQ ID NO:54 DCAYHLGELVWCT(参见WO2014010813)
SEQ ID NO:55 FcBP-1 PAWHLGELVWP(Kang,等人,J.Chromatogr.A 2016,1466,105-1 12)
SEQ ID NO:56 FcBP-2 PDCAWHLGELVWCTP(Dias,等人,J.Am.Chem.Soc.2006,128,2726-2732)
SEQ ID NO:57 Fc-lll-4c CDCAWHLGELVWCTC(Gong,等人,Bioconjug.Chem.2016,27,1569-1573)
SEQ ID NO:58 EPIHRSTLTALL(Ehrlich,等人,J.Biochem.Biophys.Method 2001,49,443-454)
SEQ ID NO:59 APAR(Camperi等人,Biotechnol.Lett.2003,25,1545-1548)
SEQ ID NO:60 FcRM(CFHH)2KG(Fc受体模拟物,Verdoliva,等人,ChemBioChem2005,6,1242-1253)
SEQ ID NO:61 HWRGWV(Yang,等人,J Peptide Res.2006,66,1 10-137)
SEQ ID NO:62 HYFKFD(Yang,等人,J.Chromatogr.A 2009,1216,910-918)
SEQ ID NO:63 HFRRHL(Menegatti,等人,J.Chromatogr.A 2016,1445,93-104)
SEQ ID NO:64 HWCitGWV(Menegatti,等人,J.Chromatogr.A 2016,1445,93-104)
SEQ ID NO:65 HWmetCitGWmetV(US10,266,566)
SEQ ID NO:66 D2AAG(小合成肽配体,Lund,等人,J.Chromatogr.2012,1225,158-167)
SEQ ID NO:67 DAAG(小合成肽配体,Lund等人,J.Chromatogr.A 2012,1225,158-167);
SEQ ID NO:68环[(Nα-Ac)S(A)-RWHYFK-Lact-E](Menegatti,等人,Anal.Chem.2013,85,9229-9237);
SEQ ID NO:69环[(Nα-Ac)-Dap(A)-RWHYFK-Lact-E](Menegatti,等人,Anal.Chem.2013,85,9229-9237);
SEQ ID NO:70环[接头M-WFRHYK](Menegatti,等人,Biotechnol.Bioeng.2013,110,857-870);
SEQ ID NO:71 NKFRGKYK(Sugita,等人,Biochem.Eng.J.2013,79,33-40);
SEQ ID NO:72 NARKFYKG(Sugita,等人,Biochem.Eng.J.2013,79,33-40);
SEQ ID NO:73 FYWHCLDE(Zhao,等人,Biochem.Eng.J.2014,88,1-11);
SEQ ID NO:74 FYCHWALE(Zhao,等人,J Chromatogr.A 2014,1355,107-114);
SEQ ID NO:75 FYCHTIDE(Zhao,等人,Z Chromatogr.A 2014,1359,100-111);
SEQ ID NO:76双1/3(FYWHCLDE-FYCHTIDE)(Zhao,等人,J.Chromatogr.A 2014,1369,64-72);
SEQ ID NO:77 RRGW(Tsai,等人,Anal.Chem.2014,86,293 1-2938);
SEQ ID NO:78 KHRFNKD(Yoo和Choi,BioChip J.2015,10,88-94);
SEQ.ID NO:79 CPSTHWK(Sun等人Polymers 2018,10,778);
SEQ.ID NO:80 NVQYFAV(Sun等人Polymers 2018,10,778);
SEQ.ID NO:81 ASHTQKS(Sun等人Polymers 2018,10,778);
SEQ.ID NO:82 QPQMSHM(Sun等人Polymers 2018,10,778);
SEQ.ID NO:83 TNIESLK(Sun等人Polymers 2018,10,778);
SEQ.ID NO:84 NCHKCWN(Sun等人Polymers 2018,10,778);
SEQ.ID NO:85 SHLSKNF(Sun等人Polymers 2018,10,778).
在一些实施方案中,IgG靶向配体对IgG4具有特异性。
在一些实施方案中,Gunnarsson等人.Biomolecular Engineering 2006,23,111-117描述了IgG4特异性靶向配体。
在一些实施方案中,IgG4特异性靶向配体选自:
SEQ ID NO:86 FDLLEHFY和
SEQ ID NO:87 DLLHHFDYF。
另一些IgG靶向配体包括:
/>
IgG降解化合物的非限制性实例包括:
/>
/>
/>
/>
/>
/>
/>
/>
/>
/>
/>
/>
/>
在一些替代实施方案中,本文绘制的胞外蛋白靶向配体中的羟基、胺、酰胺或羧酸基团被保护基团封端。例如本实施方案中:
可以是/>
在一些替代实施方案中,本文绘制的胞外蛋白靶向配体中的羟基、胺、酰胺或羧酸基团代替绘制的连接点用作接头的连接点。例如本实施方案中:可以是/>
免疫球蛋白E(IgE)
免疫球蛋白E(IgE)是过敏性疾病的强介质,包括但不限于特应性哮喘、过敏性鼻炎、特应性皮炎、皮肤接触性超敏反应、IgE介导的食物过敏、IgE介导的动物过敏、过敏性结膜炎、过敏性荨麻疹、过敏性休克、鼻息肉病、角结膜炎、肥大细胞增多症、嗜酸性胃肠道疾病、大疱性类天疱疮、化疗引起的过敏反应、季节性过敏性鼻炎、间质性膀胱炎、嗜酸性食管炎、血管性水肿、急性间质性肾炎、特应性湿疹、嗜酸性支气管炎、慢性阻塞性肺病、胃肠炎、高IgE综合征(乔布氏综合征)、IgE单克隆丙种球蛋白病、意义不明的单克隆丙种球蛋白病(MGUS)、寻常型天疱疮、粘膜类天疱疮、慢性荨麻疹、自身免疫性葡萄膜炎、类风湿性关节炎、自身免疫性胰腺炎和过敏性鼻结膜炎等。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白降解化合物是:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,免疫球蛋白靶向配体是:
在某些实施方案中,IgE靶向配体选自
/>
/>
IgE降解化合物的非限制性实例包括:
/>
/>
/>
抗MAG IgM自身抗体
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是抗MAG IgM自身抗体。髓磷脂相关糖蛋白(MAG)是一种跨膜糖蛋白,其在神经系统中的胶质-轴突相互作用中发挥作用。在一些患者中,IgM抗MAG抗体的形成导致神经病变。抗体水平可能高达正常水平的四倍,导致潜在的肾病。抗MAG抗体水平降低与多发性神经病的临床反应相关。
与抗MAG IgM自身抗体结合的代表性靶向配体包括HSO3-3GlcAβ1-3Galβ1-4GlcNAcβ1-3Galβ1-4Glcβ1-Cer;HSO3-3GlcAβ1-3Galβ1-4GlcNAcβ1-3Galβ1-4GlcNAcβ1-3Galβ1-4Glcβ1-Cer;HSO3-3GlcAβ1-3Galβ1-4GlcNAc-X;
可用于本发明的另外的IgM自身抗体描述于Herrendorff,R.等人.2017 PNAS早期版本,doi/10.1073/pnas.1619386114;和WO2018/167,230。
IgM自身抗体降解化合物的非限制性实例包括:
/>
在某些非限制性实施方案中,IgM自身抗体降解化合物选自以下化合物或其双齿或三齿形式:
/>
或其药学上可接受的盐。
磷脂酶A2受体-1(PLA2R)自身抗体
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是结合PLA2R的自身抗体。磷脂酶A2受体-1(PLA2R)是自身免疫性膜性肾病的主要靶点。膜性肾病是肾病综合征的主要原因之一,大多数患者进展为终末期肾病。目前使用抗CD20抗体的治疗方案可能无法有效产生完全缓解。PLA2R是一种跨膜糖蛋白,具有富含半胱氨酸的N末端胞外结构域。该结构域包含自身抗体结合的表位。降低自身抗体水平可以缓解患者的症状,并且可能需要完全消除自身抗体才能产生持久的缓解。
蛋白质数据库提供了PLA2R CTLD7结构域的晶体结构,该区域是自身抗体结合的区域(6JLI;Yu等人J.Struct.Biol.207,295-300)。代表性的PLA2R自身抗体结合配体包括但不限于:
SEQ ID NO:88 GIFVIQSESLKKC(Fresquet等人J.Am.Soc.Nephrol 2015,26,302)SEQ.ID NO:89 SVLTLENCK(Fresquet等人J.Am.Soc.Nephrol 2015,26,302)
SEQ ID NO:90 SVLTLENC(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:91 SVLTLDNCK(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:92 SVLTEENC(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:93 SVLTEENS(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:94 SVLTDENC(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:95 SVLTDENS(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:96 PIQSESLKK(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:97 VIDSESLKK(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:98 PIDSESLKK(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:99 VIQSESLKK(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:100 PIESES-PEG-K-PEG-SVLTEENC(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:101 VIQSES-PEG-K-PEG-SVL TLENC(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:102 VIQSES-PEG-K-PEG-SVL TEENC(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:103 PIDDES-PEG-K-PEG-SVLTLENC(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:104 PIDDES-PEG-KPEG-SVLTEENC(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:105 VIQSESLKKCKSVLTLENC(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:106 PIQSESLKKCKSVLTLENC(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:107 VIESESLKKCKSVLTLENC(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:108 VIDSESLKKCKSVLTLENC(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:109 PIESESLKKCKSVLTLENC(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:110 VIQSESLKKCIQAGKLENC(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:111 PIQSESLKKCIQAGKLENC(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:112 VIESESLKKCIQAGKLENC(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:113 VIDSESLKKCIQAGKLENC(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:114 PIESESLKKCIQAGKLENC(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:115 PIQSESLKKCKSVLTLENK(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:116 VIESESLKKCKSVLTLENK(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:117 VIDSESLKKCKSVLTLENK(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:118 PIESESLKKCKSVLTLENK(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:119 VIQSESLKKCIQAGKLENK(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:120 PIQSESLKKCIQAGKLENK(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:121 VIESESLKKCIQAGKLENK(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:122 VIDSESLKKCIQAGKLENK(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:123 PIESESLKKCIQAGKLENK(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:124 PIESESGSVLTLENCK(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:125 PIESESGGSVLTLENCK(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:126 PIESESGGGSVLTLENCK(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:127 PIESESGGGGSVLTLENCK(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:128 PIESESGGGGGSVLTLENCK(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:129 VIQSESGSVLTLENCK(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:130 VIQSESGGSVLTLENCK(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:131 VIQSESGGGSVLTLENCK(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:132 VIQSESGGGGSVLTLENCK(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:133 VIQSESGGGGGSVLTLENCK(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:134 KGCFVIQSESLKKSIQAGKSVLTLENCK(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:135 LKKCIQAGKSVLTLENCKQAN(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:136 WQDKGIFVIQSESLKKCIQAGK(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:137 KGIFVIQSESLKKCIQAGKSVLTLENCK(Brenchley等人WO2019/081912)
SEQ ID NO:138 GIFVIQSESLKKC(Brenchley等人WO2015/185949)
SEQ ID NO:139 WSVLTLENCK(Brenchley等人WO2015/185949)
SEQ ID NO:140 WQDKGIFVIQSESLKKCIQAGKSVLTLENCK(Brenchley等人WO2015/185949)
SEQ ID NO:141 YDWIPSSAW(Glee等人,the journal of immunology,1999,163:826-833)
SEQ ID NO:142 AGAIWQRDW
SEQ ID NO:143 AGAIWQKDW
SEQ ID NO:144 VIQSESLK
SEQ ID NO:145 PIQSESLK
SEQ ID NO:146 PIESESLK
SEQ ID NO:147 SVLTEENCK
在某些实施方案中,提供了具有下式的化合物
或其药学上可接受的盐;
其中
PLA2R自身抗体是WO2019/081912中描述的任何PLA2R自身抗体。
在某些实施方案中,PLA2R自身抗体具有下式:
SEQ ID NO:148:S-V-L-T-XH1-E-N-XH2;
SEQ ID NO:149:XH3-I-XH4-XH5-E-XH6;
SEQ ID NO:150:XH1-E-N-XH2-K;
SEQ ID NO:151:S-V-L-T-XH1-E-N-C-K;
SEQ ID NO:152:XH3-I-XH4-XH5-E-XH6-L-K;或者
或通过接头-B基团连接的SEQ ID No:148、149、150、151或152的肽,在某些实施方案中,连接的序列是SEQ ID NO:148和SEQ ID NO:149或SEQ ID NO:148和SEQ ID NO:152;
其中XH1、XH2、XH3、XH4、XH5和XH6独立地是任何天然氨基酸或本文描述的其他氨基酸;
并且其中该序列在末端胺或羧酸处连接至本文所述的接头。
PLA2R降解化合物的非限制性实例包括:
/>
/>
/>
/>
补体C3
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是补体C3。补体C3是参与补体反应的主要蛋白质之一,是先天免疫和适应性免疫的重要因素。C3升高与阵发性睡眠性血红蛋白尿(PNH)、免疫复合物膜增生性肾小球肾炎(IC-MPGN)、C3肾小球病(C3G)、地理性(GA)、年龄相关性黄斑变性(AMD)、牙周炎、肌萎缩侧索硬化症(ALS)相关、造血干细胞移植相关的血栓性微血管病(HSCT-TMA)、冷凝集素病(CAD)和基因治疗中的宿主攻击。降低C3水平可能会改善这些炎症性疾病引起的一些症状或并发症。
蛋白质数据库网站提供了补体C3的晶体结构,可通过2A73搜索(Janssen,B.J.Nature,2005,505-511)。与纳米抗体抑制剂结合的补体C3可以通过PDB登录代码6EHG找到(Jensen,R.K.等人J Biol Chem,2018,293,6269-6281)。补体C3结合配体的非限制性实例包括
SEQ ID NO:153 D-Tyr-Ile-[Cys-Val-1MeTrp-Gln-Asp-Trp-Sar-Ala-His-Arg-Cys]-meIle(Zhang,Y.等人.2015,Immunobiology,220,993-998)
SEQ ID NO:154 ICVVQDWGHHRCTAGMANLTSHASAI,(Sahu,A.等人The Journal ofImmunology,1996,157,884-891).
SEQ ID NO:155 ICVVQDWGHHRCT,(Sahu,A.等人The Journal of Immunology,1996,157,884-891).
SEQ ID NO:156 CVVQDWGHHAC(Sahu,A.等人The Journal of Immunology,1996,157,884-891).
SEQ ID NO:157 Ac-ICVVQDWGHHRCT-NH2,(Sahu,The Journal of Immunology,2000,165,2491-2499);
SEQ ID NO:158 CVVQDWGHHRCT-NH2,(Sahu,The Journal of Immunology,2000,165,2491-2499);
SEQ ID NO:159 CVVQDWGHHRC-NH2,(Sahu,The Journal of Immunology,2000,165,2491-2499);
SEQ ID NO:160 Ac-ICVVGDWGHHRCT-NH2,(Sahu,The Journal of Immunology,2000,165,2491-2499);
SEQ ID NO:161 Ac-I*CVVQPWGHHRC*T-NH2,(Sahu,The Journal of Immunology,2000,165,2491-2499);
SEQ ID NO:162生物素-KYSSI*CVVQDWGHHRC*T-NH2,(Sahu,The Journal ofImmunology,2000,165,2491-2499);
SEQ ID NO:163 Ac-I*CVVQDWGHHRC*TAGHMANLTSHASAK-生物素,(Sahu,TheJournal of Immunology,2000,165,2491-2499);
SEQ ID NO:164 Ac-ICV(1mW)QDWGAHRCT,(Risitano等人.Blood,2014,123,2094)
SEQ ID NO:165 yICV(1mW)QDW-Sar-AHRC-mI,(Risitano等人.Blood,2014,123,2094)
SEQ ID NO:166 PEG-yICV(1mW)QDW-Sar-AHRC-mI(Risitano等人.Blood,2014,123,2094)
SEQ ID NO:167Ac-Ile-[Cys-Val-Trp-Gln-Asp-Trp-Gly-Ala-His-Arg-Cys]-Thr-NH2(Qu,H.等人.Immunobiology(2012)http://dx.doi.org/10.1016/j.imbio.2012.06.003)
SEQ ID NO:168 Ac-Ile-[Cys-Val-Trp(Me)-Gln-Asp-Trp-Sar-Ala-His-Arg-Cys]-Ile-NH2(Qu,H.等人.Immunobiology(2012)http://dx.doi.org/10.1016/j.imbio.2012.06.003)
SEQ ID NO:169 Ac-Ile-[Cys-Val-Trp(Me)-Gln-Asp-Trp-Sar-Ala-His-Arg-Cys]-mIle-NH2(Qu,H.等人.Immunobiology(2012)http://dx.doi.org/10.1016/j.imbio.2012.06.003)
SEQ ID NO:170 Ac-Ile-[Cys-Val-Trp(Me)-Gln-Asp-Trp-Gly-Ala-His-Arg-Cys]-Thr-NH2)(Qu,H.等人.Molecular Immunology,2011,48,481)
SEQ ID NO:171 Ac-Xaa1-[Cys2-Val3-Xaa4-Gln5-Asp6-Trp7-Gly8-Xaa9-Xaa10-Xaa11-Cys12]-Thr13-NH2(Mallik等人.J.Med.Chem.,2005,48,274-286)
SEQ ID NO:172 Ac-I[CVVQDWGHHRC]T-NH2(Mallik等人.J.Med.Chem.,2005,48,274-286)
SEQ ID NO:173 Ac-I[CVVQDWGAHRC]T-NH2(Mallik等人.J.Med.Chem.,2005,48,274-286)
SEQ ID NO:174 Ac-I[CVTQDWGHHRC]T-NH2(Mallik等人.J.Med.Chem.,2005,48,274-286)
SEQ ID NO:175 Ac-I[CVSQDWGHHRC]T-NH2(Mallik等人.J.Med.Chem.,2005,48,274-286)
SEQ ID NO:176 Ac-I[CVHQDWGHHRC]T-NH2,(Mallik等人.J.Med.Chem.,2005,48,274-286)
SEQ ID NO:177 Ac-I[CVFQDWGHHRC]T-NH2,(Mallik等人.J.Med.Chem.,2005,48,274-286)
SEQ ID NO:178 Ac-I[CVYQDWGAHRC]T-NH2,(Mallik等人.J.Med.Chem.,2005,48,274-286)
SEQ ID NO:179 Ac-I[CVWQDWGWHRC]T-NH2,(Mallik等人.J.Med.Chem.,2005,48,274-286)
SEQ ID NO:180 Ac-I[CVWQDWGHHRC]T-NH2,(Mallik等人.J.Med.Chem.,2005,48,274-286)
SEQ ID NO:181 Ac-I[CVWQDWGAHRC]T,(Mallik等人.J.Med.Chem.,2005,48,274-286)
SEQ ID NO:182 Ac-I[CVWQDWGAHRC]T-NH2,(Mallik等人.J.Med.Chem.,2005,48,274-286)
SEQ ID NO:183 Ac-I[CVWQDWGAdHRC]T,(Mallik等人.J.Med.Chem.,2005,48,274-286)
SEQ ID NO:184 Ac-I[CVWQDWGdAHRC]T,(Mallik等人.J.Med.Chem.,2005,48,274-286)
SEQ ID NO:185 Ac-dI[CVWQDWGAHRC]T,(Mallik等人.J.Med.Chem.,2005,48,274-286)
SEQ ID NO:186 Ac-I[CVWQDWGAHRC]dT,(Mallik等人.J.Med.Chem.,2005,48,274-286)
SEQ ID NO:187 Ac-I[CVWQDWGAHRC]T-NH2,(Lopez de Victoria,A.等人.ChemBiol Drug Des 2011,77,431-440)
SEQ ID NO:188 W[CVWQDWGTNRC]W-NH2,(Lopez de Victoria,A.等人.Chem BiolDrug Des 2011,77,431-440)
SEQ ID NO:189 Ac-D[CVWQDWGTNKC]W-NH2,(Lopez de Victoria,A.等人.ChemBiol Drug Des 2011,77,431-440)
SEQ ID NO:190 Q[CVWQDWGQNQC]W-NH2,(Lopez de Victoria,A.等人.Chem BiolDrug Des 2011,77,431-440)
SEQ ID NO:191 Ac-I[CVWQDWGAHRC]W-NH2,(Lopez de Victoria,A.等人.ChemBiol Drug Des 2011,77,431-440)
SEQ ID NO:192 Ac-W[CVWQDWGAHRC]T-NH2,(Lopez de Victoria,A.等人.ChemBiol Drug Des 2011,77,431-440)
SEQ ID NO:193 Ac-W[CVWQDWGAHRC]W-NH2,(Lopez de Victoria,A.等人.ChemBiol Drug Des 2011,77,431-440)
SEQ ID NO:194 Ac-Ile-[Ala-Val-Trp-Gln-Asp-Trp-Gly-Ala-His-Arg-Hcy]-Thr-NH2,(Knerr,P.等人.ACS Chem.Biol.,2011,6,753-760)
SEQ ID NO:195 Ac-Ile-[Cys-Val-Trp-Gln-Asp-Trp-Gly-Ala-His-Arg-Cys]-(NMeIle)-NH2,(Knerr,P.等人.ACS Chem.Biol.,2011,6,753-760)
SEQ ID NO:196 Ac-Ile-[Ala-Val-Trp-Gln-Asp-Trp-Gly-Ala-His-Arg-Hcy]-(NMeIle)-NH2,(Knerr,P.等人.ACS Chem.Biol.,2011,6,753-760)
SEQ ID NO:197 Ac-ICV(5fW)QDWGAHRCT-NH2,(Katragadda等人.J.Med.Chem.2006,49,4616-4622).
SEQ ID NO:198 Ac-ICV(5MeW)QDWGAHRCT-NH2,(Katragadda等人.J.Med.Chem.2006,49,4616-4622).
SEQ ID NO:199 Ac-ICV(2Nal)QDWGAHRCT-NH2,(Katragadda等人.J.Med.Chem.2006,49,4616-4622).
SEQ ID NO:200 Ac-ICVWQD(5fW)GAHRCT-NH2,(Katragadda等人.J.Med.Chem.2006,49,4616-4622).
SEQ ID NO:201 Ac-ICVWQD(5MeW)GAHRCT-NH2,(Katragadda等人.J.Med.Chem.2006,49,4616-4622).
SEQ ID NO:202 Ac-ICVWQD(1MeW)GAHRCT-NH2,(Katragadda等人.J.Med.Chem.2006,49,4616-4622).
SEQ ID NO:203 Ac-ICVYQDWGAHRCT-CONH2,(WO 2021/007,111)
SEQ ID NO:204 Ac-ICVWQDWGAHRCT-COOH,(WO 2021/007,111)
SEQ ID NO:205 Ac-ICVWQDWGAHRCT-CONH2,(WO 2021/007,111)
SEQ ID NO:206 Ac-ICVWQDWGAHRCdT-COOH,(WO 2021/007,111)
SEQ ID NO:207 Ac-ICV(2-Nal)QDWGAHRCT-CONH2,(WO 2021/007,111)
SEQ ID NO:208 Ac-ICV(2-Nal)QDWGAHRCT-COOH,(WO 2021/007,111)
SEQ ID NO:209 Ac-ICV(1-Nal)QDWGAHRCT-COOH,(WO 2021/007,111)
SEQ ID NO:210 Ac-ICV(2-lal)QDWGAHRCT-CONH2,(WO 2021/007,111)
SEQ ID NO:211 Ac-ICV(2-lal)QDWGAHRCT-COOH,(WO 2021/007,111)
SEQ ID NO:212 Ac-ICVDhtQDWGAHRCT-COOH,(WO 2021/007,111)
SEQ ID NO:213 Ac-ICV(Boa)QDWGAHRCT-COOH,(WO 2021/007,111)
SEQ ID NO:214 Ac-ICV(Bpa)QDWGAHRCT-CONH2,(WO 2021/007,111)
SEQ ID NO:215 Ac-ICV(Bta)QDWGAHRCT-COOH,(WO 2021/007,111)
SEQ ID NO:216 Ac-ICV(Bta)QDWGAHRCT-CONH2,(WO 2021/007,111)
SEQ ID NO:217 Ac-ICVWQDWG(2-Abu)HRCT-CONH2,(WO 2021/007,111)
SEQ ID NO:218 H-GICVWQDWGAHRCTAN-COOH,(WO 2021/007,111)
SEQ ID NO:219 Ac-ICV(5fW)QDWGAHRCT-CONH2,(WO 2021/007,111)
SEQ ID NO:220 Ac-ICV(5-甲基-W)QDWGAHRCT-CONH2,(WO 2021/007,111)
SEQ ID NO:221 Ac-ICV(1-甲基-W)QDWGAHRCT-CONH2,(WO 2021/007,111)
SEQ ID NO:222 Ac-ICVWQD(5fW)GAHRCT-CONH2,(WO 2021/007,111)
SEQ ID NO:223 Ac-ICV(5fW)QD(5fW)GAHRCT-CONH2,(WO 2021/007,111)
SEQ ID NO:224 Ac-ICV(5-甲基-W)QD(5fW)GAHRCT-CONH2,(WO 2021/007,111)
SEQ ID NO:225 Ac-ICV(1-甲基-W)QD(5fW)GAHRCT-CONH2,(WO 2021/007,111)
SEQ ID NO:226 H-GICV(6fW)QD(6fW)GAHRCTN-COOH,(WO 2021/007,111)
SEQ ID NO:227 Ac-ICV(1-甲酰基-W)QDWGAHRCT-CONH2,(WO 2021/007,111)
SEQ ID NO:228 Ac-ICV(1-甲氧基-W)QDWGAHRCT-CONH2,(WO 2021/007,111)
SEQ ID NO:229 H-GICV(5fW)QD(5fW)GAHRCTN-COOH,(WO 2021/007,111)
在某些实施方案中,补体C3靶向配体是
在某些实施方案中,补体C3靶向配体选自:
/>
补体C3降解化合物的非限制性实例包括:
/>
/>
在某些非限制性实施方案中,本发明的补体C3降解化合物选自以下化合物或其二齿或三齿形式:
/>
/>
/>
/>
/>
/>
补体C1q
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是补体C1q。补体系统是先天免疫系统的一部分,可以清除凋亡细胞和病原体。该途径的激活始于C1复合物与已与抗原结合的免疫球蛋白的结合。C1复合物由C1q和蛋白酶四聚体(C1r和C1s)组成。C1q介导补体与IgG或IgM的结合。结合事件后,蛋白酶被激活,它们裂解C4,从而启动以调理作用结束的途径的其余部分。该通路的过度活跃可导致许多炎症病理,包括同种异体移植排斥、视神经脊髓炎、全身重症肌无力和冷凝集素病。C1q的降解可能会减轻与这些炎症性疾病相关的症状。
蛋白质数据库网站提供了可通过2JG9搜索的补体C1q的晶体结构(Paidassi,H.等人,J.Immunol,2008,180,2329-2338)、1PK6(Gaboriaud,C.,J.Biol.Chem,2003,(278)46974-46982),5HZF(Moreau,C.等人,Front.Immunol,2016,(7)79),2WNV和2WNU(Garlatti,V.等人,J.Immunol.2010,(185),808)。PDB网站上还提供了可通过6Z67搜索的与配体结合的补体C1q的结构(Laursen,N.等人,Front.Immunol.,2020,(11),1504)。
补体C1q结合配体的非限制性实例包括
SEQ ID NO:230 Ac-Ala-Glu-Ala-Lys-Ala-Lys-Ala-CONH2(WO 88/07054)
SEQ ID NO:231 IALILEPICCQERAA(Sharp,J.A.等人PLoS ONE 10(7),e0132446)
SEQ ID NO:232 IALILEPICCQERAA-dPEG24(Sharp,J.A.等人PLoS ONE 10(7),e0132446)
SEQ ID NO:233 dPEG24-IALILEPICCQERAA(Sharp,J.A.等人.PLoS ONE 10(7),e0132446)
SEQ ID NO:234 RALILEPICCQERAA(Sharp,J.A.等人PLoS ONE 10(7),e0132446)
SEQ ID NO:235 IRLILEPICCQERAA(Sharp,J.A.等人PLoS ONE 10(7),e0132446)
SEQ ID NO:236 IARILEPICCQERAA(Sharp,J.A.等人PLoS ONE 10(7),e0132446)
SEQ ID NO:237 IALIREPICCQERAA(Sharp,J.A.等人PLoS ONE 10(7),e0132446)
SEQ ID NO:238 IALILEPICCRERAA(Sharp,J.A.等人PLoS ONE 10(7),e0132446)
SEQ ID NO:239 IALILEPICCQRRAA(Sharp,J.A.等人PLoS ONE 10(7),e0132446)
SEQ ID NO:240 IELILEPICCQERAA(Sharp,J.A.等人PLoS ONE 10(7),e0132446)
SEQ ID NO:241 IAEILEPICCQERAA(Sharp,J.A.等人PLoS ONE 10(7),e0132446)
SEQ ID NO:242 IALILEPICCQEEAA(Sharp,J.A.等人PLoS ONE 10(7),e0132446)
SEQ ID NO:243 IALILEPICCQEREA(Sharp,J.A.等人PLoS ONE 10(7),e0132446)
SEQ ID NO:244 IALILEEICCQERAA(Sharp,J.A.等人PLoS ONE 10(7),e0132446)
SEQ ID NO:245 IALILEPECCQERAA(Sharp,J.A.等人PLoS ONE 10(7),e0132446)
SEQ ID NO:246 PAICQRATATLGTVGSNTSGTTAIEACILL(Sharp,J.A.等人Frontiersin Immunology(2014)5,406)
SEQ ID NO:247 CEGPFGPRHDLTFCW(Roos,A.等人The Journal of Immunology,2001,167,7052)
SEQ ID NO:248 XbEGPFGPRHDLTFCW(Roos,A.等人.The Journal of Immunology,2001,167,7052)
SEQ ID NO:249 QYYPFSX(Messmer B.T.等人Molecular Immunology,2000,37,343)
SEQ ID NO:250 NPFNLAR(Messmer B.T.等人Molecular Immunology,2000,37,343)
SEQ ID NO:251 QLQDMTSSPFWL(Messmer B.T.等人Molecular Immunology,2000,37,343)
SEQ ID NO:252 NPFVIGRWHPPH(Messmer B.T.等人Molecular Immunology,2000,37,343)
SEQ ID NO:253 SLAKFLNPFLYR(Messmer B.T.等人Molecular Immunology,2000,37,343)
SEQ ID NO:254 ASTPRFEPFQLD(Messmer B.T.等人Molecular Immunology,2000,37,343)
SEQ ID NO:255 SLHSQPYSPFML(Messmer B.T.等人Molecular Immunology,2000,37,343)
SEQ ID NO:256 NILSSWSSPFVF(Messmer B.T.等人Molecular Immunology,2000,37,343)
SEQ ID NO:257 NLPSSWTNPFYL(Messmer B.T.等人Molecular Immunology,2000,37,343)
SEQ ID NO:258 SPFMLHP(Messmer B.T.等人Molecular Immunology,2000,37,343)
SEQ ID NO:259 PSPFMLT(Messmer B.T.等人Molecular Immunology,2000,37,343)
SEQ ID NO:260 IGPFHLH(Messmer B.T.等人Molecular Immunology,2000,37,343)
SEQ ID NO:261 TNPFMLN(Messmer B.T.等人Molecular Immunology,2000,37,343)
SEQ ID NO:262 NTTFLYP(Messmer B.T.等人Molecular ImmunoIogy,2000,37,343)
SEQ ID NO:263 SHYTQYL(Messmer B.T.等人Molecular Immunology,2000,37,343)
SEQ ID NO:264 NHHPNYW(Messmer B.T.等人Molecular Immunology,2000,37,343)
SEQ ID NO:265 VHYPLSW(Messmer B.T.等人Molecular Immunology,2000,37,343)
SEQ ID NO:266 HHLKYSDTSPPI(Messmer B.T.等人Molecular Immunology,2000,37,343)
SEQ ID NO:267 SHMHERWDTSPPI(Messmer B.T.等人Molecular Immunology,2000,37,343)
SEQ ID NO:268 SHMHERWDTSYQ(Messmer B.T.等人Molecular Immunology,2000,37,343)
SEQ ID NO:269 SHIHSNAAWRIT(Messmer B.T.等人Molecular Immunology,2000,37,343)
SEQ ID NO:270 WHYPHWQ(Messmer B.T.等人Molecular Immunology,2000,37,343)
SEQ ID NO:271 SHYLYTQ(Messmer B.T.等人Molecular Immunology,2000,37,343)
SEQ ID NO:272 AHYSFTQ(Messmer B.T.等人Molecular Immunology,2000,37,343)
SEQ ID NO:273 THYPTFY(Messmer B.T.等人Molecular Immunology,2000,37,343)
SEQ ID NO:274 EHNTSFW(Messmer B.T.等人Molecular Immunology,2000,37,343)
SEQ ID NO:275 NHYKLTW(Messmer B.T.等人Molecular Immunology,2000,37,343)
SEQ ID NO:276 NHSPYFQ(Messmer B.T.等人Molecular Immunology,2000,37,343)
SEQ ID NO:277 SHYQHYQ(Messmer B.T.等人Molecular Immunology,2000,37,343)
SEQ ID NO:278 PAICQRATATLGTVGSNTSGTTEIEACILL(Gronemus,J.Q.等人Molecular immunology,2010,48,305)
SEQ ID NO:279 WLGLGGGYGW(Lauvrak V.,Biol.Chem.1997,378,1509)
SEQ ID NO:280 FYGPFFLNDSLRGIW(Lauvrak V.,Biol.Chem.1997,378,1509)
SEQ ID NO:281 LRFLNPFSLDGSGFW(Lauvrak V.,Biol.Chem.1997,378,1509)
SEQ ID NO:282 HSPFCLGVLECFGLV(Lauvrak V.,Biol.Chem.1997,378,1509)
SEQ ID NO:283 TCGAFYLYHDPFICG(Lauvrak V.,Biol.Chem.1997,378,1509)
SEQ ID NO:284 MQHCLASHELYLPWC(Lauvrak V.,Biol.Chem.1997,378,1509)
SEQ ID NO:285 FFVFGSGDAFAFSDM(Lauvrak V.,Biol.Chem.1997,378,1509)
SEQ ID NO:286 PCVIIDTGSSRWCYL(Lauvrak V.,Biol.Chem.1997,378,1509)
SEQ ID NO:287 HSPFCLGVLECFGLV(Lauvrak V.,Biol.Chem.1997,378,1509)
SEQ ID NO:288 HAAFEPRGDVRHTLL(Lauvrak V.,Biol.Chem.1997,378,1509)
SEQ ID NO:289 CRWDGSWGEVRC(Lauvrak V.,Biol.Chem.1997,378,1509)
SEQ ID NO:290 CYWVGTWGEAVC(Lauvrak V.,Biol.Chem.1997,378,1509)
SEQ ID NO:291 RWFPCPNKEGCC SISV(Lauvrak V.,Biol.Chem.1997,378,1509)
SEQ ID NO:292 RSTYCNKNKDSCHIPE(Lauvrak V.,Biol.Chem.1997,378,1509)
SEQ ID NO:293 QPPQCIKDGGFVICRV(Lauvrak V.,Biol.Chem.1997,378,1509)
SEQ ID NO:294 KGKKCKPEEHPCNEPM(Lauvrak V.,Biol.Chem.1997,378,1509)
SEQ ID NO:295 NKMTCSDDGKLCWEHL(Lauvrak V.,Biol.Chem.1997,378,1509)
SEQ ID NO:296 PLGRPCPTCPLAPS(Lauvrak V.,Biol.Chem.1997,378,1509)
SEQ ID NO:297 QRMRPCPSCPLAPW(Lauvrak V.,Biol.Chem.1997,378,1509)
SEQ ID NO:298 WPSRPCPSCPEVPP(Lauvrak V.,Biol.Chem.1997,378,1509)
SEQ ID NO:299 SCTKDCPTCPLVPV(Lauvrak V.,Biol.Chem.1997,378,1509)
C1qNb75纳米抗体(Laursen,N.S.等人Frontiers in Immunology,2020,11,1504)
SEQ ID NO:300 IALILEPICCQERAA(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:301 PAICQRATATLGTVGSNTSGTTEIEACILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:302 PAIAQRATATLGTVGSNTSGTTEIEACILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:303 PAICQRATATLGTVGSNTSGTTEIEAAILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:304 PAICQRATATLGTVGSNTSGTTAIEACILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:305 PAICQRATATLGTVGSNTSGTTEIAACILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:306 PAICQRAEIEACILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:307 PAICQRAEIEACILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:308 PAIAQRAEIEAAILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:309 IALILEPICCQERAA(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:310 PAICQRATATLGTNTSGTTEIEACILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:311 PAICQRATATLSGTTEIEACILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:312 PAICQRATATTEIEACILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:313 PAICQRAEIEACILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:314 AICQRATATLGTVGSNTSGTTEIEACILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:315 ICQRATATLGTVGSNTSGTTEIEACILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:316 CQRATATLGTVGSNTSGTTEIEACILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:317 PAICQRATATLGTVGSNTSGTTEIEACIL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:318 PAICQRATATLGTVGSNTSGTTEIEACI(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:319 PAICQRATATLGTVGSNTSGTTEIEAC(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:320 Ac-IALILEPICCQERAA(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:321 Ac-PAICQRATATLGTVGSNTSGTTEIEACILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:322 Ac-PAIAQRATATLGTVGSNTSGTTEIEACILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:323 Ac-PAICQRATATLGTVGSNTSGTTEIEAAILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:324 Ac-PAICQRATATLGTVGSNTSGTTAIEACILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:325 Ac-PAICQRATATLGTVGSNTSGTTEIAACILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:326 Ac-PAICQRAEIEACILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:327 Ac-PAICQRAEIEACILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:328 Ac-PAIAQRAEIEAAILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:329 Ac-IALILEPICCQERAA(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:330 Ac-PAICQRATATLGTNTSGTTEIEACILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:331 Ac-PAICQRATATLSGTTEIEACILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:332 Ac-PAICQRATATTEIEACILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:333 Ac-PAICQRAEIEACILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:334 Ac-AICQRATATLGTVGSNTSGTTEIEACILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:335 Ac-ICQRATATLGTVGSNTSGTTEIEACILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:336 Ac-CQRATATLGTVGSNTSGTTEIEACILL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:337 Ac-PAICQRATATLGTVGSNTSGTTEIEACIL(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:338 Ac-PAICQRATATLGTVGSNTSGTTEIEACI(USP 8,906,845)
SEQ ID NO:339 Ac-PAICQRATATLGTVGSNTSGTTEIEAC(USP 8,906,845)
在某些实施方案中,接头通过氨基酸序列的C末端结合,例如
SEQ ID NO:231
在某些实施方案中,接头结合至N末端,例如
SEQ ID NO:231
补体C1q降解化合物的非限制性实例包括:
/>
IL-17
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人白介素-17(IL-17)(UniProtKB-Q16552(IL17_人))。白介素-17是一种35kDa同二聚体糖蛋白,是炎症反应的重要细胞因子。IL-17由一类独特的辅助T细胞(称为Th17细胞)分泌,可介导组织炎症。IL-17产生的一个特征效应是中性粒细胞的扩增,在健康组织中,它负责中性粒细胞的稳态。IL-17被认为是牛皮癣以及其他自身免疫性疾病的主要因素。IL-17疗法可能有益的其他疾病包括但不限于哮喘、类风湿性关节炎、银屑病关节炎、克罗恩病和炎症性肠病。IL-17引起的炎症已被证明会阻碍中风后的恢复。
蛋白质数据库网站提供了可通过以下搜索的IL-17的晶体结构(Zhang,B.等人.(2014)Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 70:1476-1483),4HSA(Liu,S.等人.(2013)Nat Commun 4:1888-1888),4QHU(未发表),6WIR(Lieu,R.等人.(2020)PLoS One15:e0232311-e0232311),5VB9(Ting,J.P.等人.(2018)PLoS One 13:e0190850-e0190850),4NUX(Zhang,等人.(2014)Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 70:1476-1483),3JVF(Ely,L.K.等人.(2009)Nat Immunol 10:1245-1251)、5N9B(未发表)、2VXS(Gerhardt,S.等人(2009)J Mol Biol394:905)。
IL-17靶向配体的非限制性实例可见于例如WO2012101263A1、WO2020163554A1、WO2021055376A1、WO2020146194A1、WO2020127685A1,US20150005319、WO2014066726A2、WO2019223718A1、WO2020135872A1、WO2020146194A1、WO2021027721A1、WO2021027724、WO2021027729A1、WO2021067191A1、CN104069102A、CN105601617B、CN108299256B、Liu等人.“Binding site elucidation and structure guided design ofmacrocyclic IL-17Aantagonists”2016,Scientific Reports,6:30859.,Liu等人.“Inhibiting complex IL-17AA and IL-17RA interactions with a linear peptide”2016,Scientific Reports6:26071。Wang,W.等人.“Artificial macrocycles as IL-17A/IL-17RA antagonists”.Med.Chem.Comm.2018,9,22.Liu,C.等人.“The flavonoid cyanidin blocks binding ofthe cytokine interleukin-17A to the IL-17RA subunit to alleviate inflammationin vivo”Science Signaling 10,eaaf8823(2017)。
另一些结合配体包括
SEQ ID NO:340 IVVTAPADLWDWIRA(Liu等人2016,Scientific Reports 6:26071)
SEQ ID NO:341 ITVTMPADLWDWIRA(Liu等人2016,Scientific Reports 6:26071)
SEQ ID NO:342 IVVTIPADLWDWIRA(Liu等人2016,Scientific Reports 6:26071)
SEQ ID NO:343 IVVTLPADLWDWIRA(Liu等人2016,Scientific Reports 6:26071)
SEQ ID NO:344 IVVTVPADLWDWIRA(Liu等人2016,Scientific Reports 6:26071)
SEQ ID NO:345 IVVTMPADLWDWIMA(Liu等人2016,Scientific Reports 6:26071)
SEQ ID NO:346 IVVTMPADLWDWINA(Liu等人2016,Scientific Reports 6:26071)
SEQ ID NO:347 IVVTMPADLWDWIQA(Liu等人2016,Scientific Reports 6:26071)
SEQ ID NO:348 IHVTIPADLWDWINK(Liu等人2016,Scientific Reports 6:26071)
SEQ ID NO:349 IHVTIPADLWDWIN(Liu等人2016,Scientific Reports 6:26071)
/>
/>
/>
其每个任选地被1、2、3或4个独立选自R21的取代基取代。
在某些实施方案中,提供了具有下式的化合物
或其药学上可接受的盐;
其中
IL-17靶向配体是以下中描述的任何IL-17配体:WO2020/146,194;WO2020/163,554;WO2020/127,685;和WO2021/055,376;其中每一个都通过引用并入。
在某些实施方案中,IL-17靶向配体具有下式:
其中,
XD是CH或N;
RD1为-CH3、-CH2F、-CHF2、-CF3、-CH2CH3、-CH2CF3、-CH(CH3)2、CH2CHF2、CH2CH2F、-CF(CH3)2、CF2CH3、-OCH3、
RD2是-H或-CH2OCH3。
在某些实施方案中,IL-17靶向配体具有下式:
其中,
RE1是烷基、取代的烷基、芳基、取代的芳基、杂芳基、取代的杂芳基、芳基烷基、取代的芳基烷基、杂芳基烷基、取代的杂芳基烷基-ORE8或-NRE9RE10或F袋取代基;
RE2是烷基、取代的烷基、杂环、取代的杂环、芳基、取代的芳基、稠合环烷基芳基、取代的稠合环烷基芳基、杂芳基、取代的杂芳基或D袋取代基;
每个RE3独立地是氢、(C1-C7)烷基、(C1-C7)取代的烷基或-ORE32;
mE为0、1或2;
每个RE4独立地是氢、(C1-C7)烷基、(C1-C7)取代的烷基、环烷基、取代的环烷基、杂环或取代的杂环;
kE为0或1;
XE1、XE2、XE3和XE4独立地是-N-或-CRE11-,条件是XE1、XE2、XE3和XE4中不超过两个是氮;
每个RE5独立地是氢、(C1-C7)烷基、(C1-C7)取代的烷基、杂环、取代的杂环、环烷基、取代的环烷基、杂环烷基、取代的杂环烷基、-NRE12RE13、-NRE14C(O)RE15、-NHSO2RE31、OH或B袋取代基;
RE6是氢或烷基;
RE7是杂环、取代的杂环、-(CHRE16)oRE17或-(CHRE18)pRE19或RE6和RE7与它们所连接的氮原子一起形成哌嗪,取代哌嗪、杂环或取代的杂环、或A袋取代基;
RE8是(C1-C7)烷基、(C1-C7)取代的烷基、芳基、取代的芳基、杂芳基或取代的杂芳基;
每个RE11独立地是氢、烷基、取代的烷基、-ORE20、-NRE21RE22、卤素、-CN、-CO2RE23、-CONRE24RE25或-SRE26;
nE为1、2或3;
oE为1、2或3;
pE为1、2或3;
每个RE16独立地是氢、(C1-C7)烷基或(C1-C7)取代的烷基
RE17是
每个RE18独立地是氢、(C1-C7)烷基或(C1-C7)取代的烷基;
RE19是-NRE27RE28;
RE27和RE28与它们所连接的氮原子一起形成杂环或取代的杂环或
RE9、RE10、RE12、RE13、RE14、RE15、RE18、RE19、RE20、RE21、RE22、RE23、RE24、RE25、RE26、RE30、RE31和RE32在每种情况下独立地选自氢、烷基、取代的烷基、杂环、取代的杂环、芳基、取代的芳基、杂芳基、取代的杂芳基,或备选地,RE9和RE10、RE21和RE22和RE24和RE25一起与它们所连接的原子形成环烷基、取代的环烷基、环杂烷基或取代的环杂烷基环;
RE28是氢或烷基;
A-口袋取代基选自由以下组成的组:
B-口袋取代基选自由以下组成的组:
D-口袋取代基选自由以下组成的组:
F-口袋取代基选自由以下组成的组:
其中上式的每个任选取代基独立地选自卤素、-ORF12、-SRF12、-N(RF12)2、-C(O)RF12、-C(O)N(RF12)2、N(RF12)C(O)RF12、-C(O)ORF12、-OC(O)RF12、-S(O)RF12、-S(O)2RF12、-NO2、=O、=S、=N(RF12)、-CN、C3-10碳环和3至10元杂环;其中C3-10碳环和3至10元杂环各自任选地被选自以下的一个或多个取代基取代:卤素、-ORF12、N(RF12)2、-C(O)RF12、-C(O)N(RF12)2、-N(RF12)C(O)RF12、-C(O)ORF12、-OC(O)RF12、-NO、=O、=N(RF11)和-CN。
在某些实施方案中,I-17靶向配体具有式:
在某些实施方案中,IL-17靶向配体具有下式:
其中,
选自任选取代的C3-12碳环和任选取代的3-至12-元杂环,其中环AF上的取代基在每次出现时独立选自:
卤素、-ORF11、-SRF11、-N(RF11)2、-C(O)RF11、-C(O)N(RF11)2、N(RF11)C(O)RF11、-N(RF11)S(O)2RF11、-C(O)ORF11、-OC(O)RF11、-S(O)RF11、-S(O)2RF11、-NO2、=O、=S、=N(RF11)、-CN;以及
C1-10烷基、C2-10烯基、C2-10炔基,其各自任选被一个或多个独立选自卤素、-ORF11、-SRF11、-N(RF11)2,-C(O)RF11的取代基取代,-C(O)N(RF11)2、N(RF11)C(O)RF11、-C(O)ORF11、-OC(O)RF11、-S(O)RF11、-S(O)2RF11、-NO2、=O、=S、=N(RF11)、-CN、C3-10碳环和3至10元杂环;其中C3-10碳环和3至10元杂环各自任选地被选自以下的一个或多个取代基取代:卤素、-ORF11、N(RF11)2、-C(O)RF11、-C(O)N(RF11)2、-N(RF11)C(O)RF11、-C(O)OR11、-OC(O)R11、-NO2、=O=N(R11和-CN·′和
C3-12碳环和3至12元杂环,各自任选被一个或多个独立选自以下的取代基取代:卤素、-ORF11、-SRF11、-N(RF11)2、-C(O)RF11、-C(O)N(RF11)2、N(RF11)C(O)RF11,-C(O)ORF11、-OC(O)RF11、-NO2、-CN、C1-6烷基和C1-6卤代烷基;
选自任选取代的C3-10碳环和任选取代的3-至12-元杂环,环B上的每个取代基在每次出现时独立选自:
卤素、-ORF12、-SRF12、-N(RF12)2、-C(O)RF12、-C(O)N(RF12)2-、N(RF12)C(O)RF12、-C(O)ORF12、-OC(O)RF12、-S(O)RF12、-S(0)2RF12、-N02、=O、=S、=N(RF12)、-CN;以及
C1-10烷基、C2-10烯基、C2-10炔基,其各自任选被一个或多个独立选自以下的取代基取代卤素、-ORF12、-SRF12、-N(RF12)2、-C(O)RF12、-C(O)N(RF12)2、N(RF12)C(O)RF12、-C(O)ORF12、-OC(O)RF12、-S(O)RF12、-S(O)2RF12、-NO2、=O、=S、=N(RF12)、-CN、C3-10碳环和3至10元杂环;其中C3-10碳环和3至10元杂环各自任选地被选自以下的一个或多个取代基取代:卤素、-ORF12、N(RF12)2、-C(O)RF12、-C(O)N(RF12)2、-N(RF12)C(O)RF12、-C(O)ORF12、-OC(O)RF12、-NO、=O、=N(RF11)和-CN;·
RF4选自-C(O)N(RF23)(RF24)和C(O)杂环,其中杂环任选被1、2、3或4个选自卤素、-ORF13、-SRF13的取代基取代,-N(RF13)2、-C(O)RF13、-C(O)N(RF13)2、-N(RF13)C(O)RF13、-C(O)ORF13、-OC(O)RF13、-S(O)RF13、-S(O)2RF13、-NO2、=O、=S、=N(RF13)-CN;以及
C1-10烷基、C2-10烯基、C2-10炔基,各自为其任选被一个或多个独立选自卤素、-ORF13、-SRF13、-N(RF13)2、-C(O)RF13、-C(O)N(RF13)2、N(RF13)C(O)RF13、-C(O)ORF13、-OC(O)RF13、-S(O)RF13、-S(O)2RF13、-NO2、=O、=S、=N(RF13)、-CN、C3-10碳环和3至10元杂环的取代基取代,其中C3-10碳环和3至10元杂环各自任选被取代具有一个或多个选自以下的取代基:卤素、-ORF13、-N(RF13)2、-C(O)RF13、-C(O)N(RF13)2、-N(RF13)C(O)RF13、-C(O)ORF13、-OC(O)RF13、-NO2、=O、=N(RF13)和-CN;
LF是键或选自-O-和-NH-;
RFA选自氢、卤素、-ORF14、-N(RF14)2、-C(O)RF14、-C(O)N(RF14)2、N(RF14)C(O)RF14、-C(O)ORF14、-OC(O)RF14、-NO2、-CN和C1-6烷基,其中C1-6烷基任选被一个或多个选自以下的取代基取代:卤素、ORF14、-N(RF14)2、-C(O)RF14、NO2、=O和-CN;
RFB选自氢、卤素、-ORF15、-N(RF15)2、-C(O)RF15、-C(O)N(RF15)2、N(RF15)C(O)RF15、-C(O)ORF15、-OC(O)RF15、-NO2、-CN和C1-6烷基,其中C1-6烷基任选被一个或多个选自以下的取代基取代:卤素、ORF15、-N(RF15)2、-C(O)RF15、NO2、=O和-CN,其中RA或RB中的至少一个不是氢;
RF′和RF″独立地选自:氢、卤素、-ORF16和C1-6烷基;其中C1-6烷基任选被一个或多个选自以下的取代基取代:卤素、-ORF16、-N(RF16)2、-C(O)RF16、-NO2、=O和-CN;
RF1选自-ORF21、-N(RF21)(RF22)、-N(R]F21)C(O)RF22、-N(RF21)C(O)ORF22、-N(RF21)C(O)N(RF21)(RF22)、-N(RF21)S(=O)2N(RF21)(RF22)、和-N(RF21)S(=O)2(RF22);
每个RF2和RF3独立地选自:氢、卤素、-ORF17、C1-6烷基和C3-6环烷基;其中C1-6烷基和C3-6环烷基任选被一个或多个选自以下的取代基取代:卤素、-ORF17、-N(RF17)2、-C(O)RF17、-NO2、=O和-CN;或者
RF2和RF3结合至同一碳一起形成C3-6环烷基,任选被一个或多个选自卤素、-ORF17、-N(RF17)2、-C(O)RF17、-NO2、=O和-CN的取代基取代;
RF21在每次出现时独立地选自氢和C1-C6烷基,任选地被一个或多个独立地选自卤素、-ORF17、-N(RF17)2、-C(O)RF17、-NO2、=O和-CN的取代基取代;
RF22选自:C1-10烷基,C2-10烯基,C2-10炔基,其各自任选被一个或多个独立选自卤素、-ORF18、-SRF18、-N(RF18)2、-C(O)RF18、-C(O)N(RF18)2、-N(RF18)C(O)RF18、-C(O)ORF18、-OC(O)RF18、-S(O)RF18、-S(O)2RF18、-NO2、=O、=S、=N(RF18)、-CN、C3-10碳环和3至10元杂环的取代基取代;其中C3-10碳环和3至10元杂环各自任选地被选自以下的一个或多个取代基取代:卤素、-ORF18、-N(RF18)2、-C(O)RF18、-C(O)N(RF18)2、N(RF18)C(O)RF18、-C(O)ORF18、-OC(O)RF18、-NO2、=O、=N(RF18)、和-CN;C3-12碳环和3-至12-元杂环,其各自任选被一个或多个独立选自以下的取代基取代:
卤素、-ORF18、-SRF18、-N(RF18)2、-C(O)RF18、-C(O)N(RF18)2、-N(RF18)C(O)RF18、-C(O)ORF18、-OC(O)RF18、-S(O)RF18、-S(O)2RF18、-NO2、=O、=S、=N(RF18)、-CN;以及
C1-10烷基、C2-10烯基、C2-10炔基,其各自任选被一个或多个独立选自卤素、-ORF18、-SRF18、-N(RF18)2、-C(O)RF18的取代基取代,-C(O)N(RF18)2、-N(RF18)C(O)RF18、-C(O)ORF18、-OC(O)RF18、-S(O)RF18、-S(O)2RF18、-NO2、=O、=S、=N(RF18)、-CN、C3-10碳环和3至10元杂环;其中C3-10碳环和3至10元杂环各自任选地被选自以下的一个或多个取代基取代:卤素、-ORF18、N(RF18)2、-C(O)RF18、-C(O)N(RF18)2、-N(RF18)C(O)RF18、-C(O)ORF18、-OC(O)RF18、-NO=O、=N(RF18)和-CN;以及
C3-10碳环和3至10元杂环各自任选被一个或多个选自以下的取代基取代:卤素、-ORF18、-N(RF18)2、-C(O)RF18、-C(O)N(RF18)2、N(RF18)C(O)RF18、-C(O)ORF18、-OC(O)RF18、-NO2、=O、=N(RF18)、和-CN;
RF23选自:
C1-6烷基任选被一个或多个取代基取代,所述取代基独立地选自卤素、-ORF19、-SRF19、-N(RF19)2、-NO2、-CN、C3-10碳环和3至10元杂环;其中C3-10碳环和3至10元杂环各自任选地被选自以下的一个或多个取代基取代:卤素、-ORF19、-N(RF19)2、=O、C1-C6烷基、C1-C6卤代烷基和-CN;以及
C3-12碳环和3至10元杂环,各自任选被一个或多个独立选自卤素、-ORF19、-N(RF19)2、=O、C1-C6烷基,C1-C6卤代烷基和-CN的取代基取代;
RF24选自氢和C1-6烷基,任选被一个或多个独立选自卤素、-ORF19、-SRF19、-N(RF19)2、-NO2、-CN、C3-6碳环和3至6元杂环的取代基取代;
RF11、RF12、RF13、RF14、RF15、RF16、RF17、RF18和RF19在每次出现时独立地选自
氢;以及
C1-6烷基,其任选被一个或多个独立选自卤素、-OH、-O-C1-C6烷基、-O-C1-C6卤代烷基-NH2、-NO2、=O、-CN、C3-10碳环和3至10元杂环的取代基取代;其中C3-10碳环和3至10元杂环各自任选地被选自以下的一个或多个取代基取代:卤素、-OH、-O-C1-C6烷基、-O-C1-C6卤代烷基-NH2、-NO2、=O和-CN;以及
C3-12碳环和3至12元杂环,各自任选被一个或多个独立选自以下的取代基取代:
卤素、-OH、-O-C1-C6烷基、-O-C1-C6卤代烷基-NH2、-NO2、=O、-CN;以及
C1-6烷基,其任选被一个或多个独立选自卤素、-OH、-O-C1-C6烷基、-O-C1-C6卤代烷基-NH2、-NO2、=O和-CN的取代基取代;
nF选自0和1;以及
mF选自0、1和2。
在某些实施方案中,IL-17靶向配体具有下式:
在某些实施方案中,IL-17靶向配体具有下式:
其中,
RG1选自由以下组成的组:5-或6-元杂芳基、9-或10元双环杂芳基、苯基、(C1-C6)烷氧基、(C3-C7)环烷氧基、(C1-C6)烷基、苯基-(C1-C4)烷基、(C3-C7)环烷基、4-6元杂环烷基和-NRGCRGD,其中所述5-或6-元杂芳基、9元或10元双环杂芳基、苯基、(C1-C6)烷氧基、(C3-C7)环烷氧基、(C1-C6)烷基、苯基-(C1-C4)烷基、(C3-C7)环烷基和4-6元杂环烷基任选被一个或多个独立选自RGA的取代基取代;
RGA表示氘、卤素、羟基、-NRGCRGD、(C1-C6)烷基、(C1-C6)烷基羰基、(C3-C7)环烷基、苯基、5-或6-元杂芳基或4-6元杂环烷基,其中所述(C1-C6)烷基、(C1-C6)烷基羰基、(C3-C7)环烷基、苯基、5-或6-元杂芳基或4-6-元杂环烷基任选被一个或多个独立选自氘、卤素、羟基、氰基、(C1-C4)烷基、(C3-C7)环烷基、(C1-C4)烷氧基、-SO2-(C1-C4)烷基和-NRGCRGD的取代基取代;
RG2选自由5-或6-元杂芳基组成的组,其中所述5-或6-元杂芳基任选被一个或多个独立选自RGB的取代基取代,其中所述5元或6元杂芳基可任选地含有-CO-作为环成员,并且其中当所述5元杂芳基含有氮作为环原子时,所述氮可任选地被选自RG8的取代基取代;
RGB表示氘、卤素、氰基、羟基、-NRGCRGD、(C1-C6)烷基、(C1-C6)烷氧基、(C1-C6)烷基-CO-O-(CH2)n-或(C3-C7)环烷基,其中n为1-4,并且其中所述(C]1-C6)烷基、(C1-C6)烷氧基或(C3-C7)环烷基任选被一个或多个独立地选自氘、卤素、氰基、羟基、-NRGCRGD和(C1-C4)烷氧基的取代基取代;
RGC和RGD各自独立地选自氢和(C1-C6)烷基,或RGC和RGD一起形成吡咯烷基或哌啶基,其中所述(C1-C6)烷基、吡咯烷基或哌啶基是任选地被一个或多个独立选自卤素、氰基和羟基的取代基取代;
RG8选自由-LG-PO(OH)2和-CHRGGO-(CO-A-NRGH))0或1)-CO-A-NRGHRG1组成的组;
LG选自由键或-CHRGGO-组成的组;
其中每个-CO-A-NRGH-独立地表示氨基酸残基,其中所述氨基酸残基选自D或L-形式或作为D和L形式的混合物的天然氨基酸,并且其中所述氨基酸残基可以在α-氨基上被取代基RGH取代;
RGG、RGH和RG1独立地选自氢和(C1-C6)烷基;
RG3选自由氢、氘、羟基和卤素组成的组;
RG4选自由氢、氘和卤素组成的组;
RG5选自-CHRG6RG7、(C3-C10)环烷基和GG,其中所述(C3-C10)环烷基和GG任选被一个或多个独立选自氘、卤素、氰基、羟基、(C1-C4)烷基和卤代(C1-C4)烷基的取代基取代;
GG表示以及
RG6和RG7各自独立地表示氢、苯基、(C1-C6)烷基或(C3-C7)环烷基,其中所述苯基、(C1-C6)烷基或(C3-C7)环烷基任选地被一个或多个独立地选自卤素、氰基、羟基和(C1-C4)烷基的取代基取代。
在某些实施方案中,IL-17靶向配体具有下式:
/>
白介素-6(IL-6)
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是人白介素-6(IL-6)(UniProtKB-P05231(IL6_人))。IL-6是一种具有多种生物学功能的细胞因子。它是急性期反应的有效诱导剂,在B细胞最终分化为Ig分泌细胞中发挥着重要作用。它还参与淋巴细胞和单核细胞的分化。它还作用于B细胞、T细胞、肝细胞、造血祖细胞和CNS细胞,并且是生成T(H)17细胞所必需的。IL-6与许多炎症性疾病和癌症有关,包括但不限于卡斯尔曼病、转移性去势相关前列腺癌、肾细胞癌、大细胞肺癌、卵巢癌、类风湿性关节炎、哮喘。
蛋白质数据库网站提供了可通过以下搜索的IL-6晶体结构:1P9M(Boulanger,M.J.,等人,Science,2003,300:2101-2104);1ALU(Somers等人,EMBO J.,1997,16,989-997);1IL6和2IL6(Xu,G.Y.等,J Mol Biol.,1997,268468-481)和1N26(Varghese等,ProcNatl Acad Sci U S A.,2002,9915959-15964);以及可通过以下搜索的与各种化合物结合的IL-6的晶体结构:4CNI(Shaw,S.,等人,Mabs,2014,6:773);以及4NI7和4NI9(Gelinas等人,J Biol Chem.2014,289(12),8720-8734)。此外,Gelinas等人深入了解了白介素6与修饰核酸配体复合物的晶体结构(Gelinas,A.D.,等人,J Biol Chem.2014,289(12),8720-8734);Somers等人提供了对白介素6晶体结构的深入了解:对受体二聚化和信号传导的新模式的影响。
图1中提供了IL-6直接或间接抑制剂的非限制性实例。另外的IL-6直接或间接抑制剂可参见例如美国专利8901310;美国专利10189796;美国专利9694015;每一个都通过引用并入本文。在另一个实施方案中,IL-6胞外靶向配体是AvimarC326或其结合片段,其描述于Nat Biotechnol 23,1556-1561(2005)中。
在一些实施方案中,靶胞外蛋白是白介素-6。白介素6(IL-6)是一种细胞因子,是急性期免疫应答的重要组成部分。IL-6配体与IL-6受体结合,然后异二聚体与IL6ST和gp130结合,刺激反应。在感染过程中,来自病原体的某些分子会与Toll样受体结合,从而激活巨噬细胞产生IL-6。除了刺激B细胞和中性粒细胞分化外,IL-6还介导发烧反应。
IL-6与许多炎症性疾病有关,包括多发性硬化症、视神经脊髓炎谱系疾病、糖尿病、动脉粥样硬化、抑郁症、阿尔茨海默病、系统性红斑狼疮、多发性骨髓瘤、前列腺癌、白塞氏病、类风湿性关节炎、系统性幼年特发性关节炎、和卡斯尔曼氏病。
IL-6信号传导对于肌肉骨骼系统也很重要。在骨骼中,它与VEGF相互作用,刺激血管生成。在运动过程中,肌肉细胞会大量产生IL-6。与刺激免疫系统的作用相反,运动期间IL-6具有抗炎作用。
蛋白质数据库网站提供了可通过1ALU搜索的白介素-6的晶体结构(Somers,W.S.等人.1.9A crystal structure ofinterleukin 6:对受体二聚化和信号传导的新模式的影响。(1997)EMBO J.16:989-997)、1IL6(Xu,G.Y.等人.Solution structure ofrecombinant human interleukin-6(1997)J Mol Biol 268:468-481),以及可通过1P9M搜索的在活性六聚体复合物中结合的IL-6的结构(Boulanger,M.J.等人.HexamericStructure and Assembly of the Interleukin-6/IL-6-alpha-Receptor/gp130Complex.(2003)Science 300:2101-2104)。
IL-6靶向配体的非限制性实例可见于例如USP 10633423、USP 10669314、US2004/0092720和Ranganath,S.等人.Discovery and Characterization of a PotentInterleukin-6 Binding Peptide with Neutralizing Activity In Vivo.PLoS ONE 10(11):e0141330。
SEQ ID NO:350 QSDChaDCIHRLLEAF(4-F)LDPNLTEEQRWEKIGlaKINDECE(Ranganath,S.等人.PLoS ONE 10(11):e0141330)
SEQ ID NO:351 QSDChaDCIHRLLEAF(4-F)LDPNLTEEQRWERIGlaK(PEG30L)INDECE(Ranganath,S.等人.PLoS ONE 10(11):e0141330)
SEQ ID NO:352 QSDChaDCIHRLLEAF(4-F)LDPNLTEEQRWERIGlaK(PEG20Br)INDECE(Ranganath,S.等人.PLoS ONE 10(11):e0141330)
SEQ ID NO:353 QSDChaDCIHRLLEAF(4-F)LDPNLTEEQRWERIGlaK(PEG40Br)INDECE(Ranganath,S.等人.PLoS ONE 10(11):e0141330)
SEQ ID NO:354 FDhLDCIHRLLEAFLDPNLTEQQRWEKIDKINDECE(Ranganath,S.等人.PLoS ONE 10(11):e0141330)
SEQ ID NO:355 QSDChaDCIHRLLEAF(4-F)LDPNLTEEQRWERIGlaKINDECE(Ranganath,S.等人.PLoS ONE 10(11):e0141330)
SEQ ID NO:356 SWQSDChaDCIHRLLEAFLDK-AcNLTEEQRWERIDKINDECE(Ranganath,S.等人PLoS ONE 10(11):e0141330)
SEQ ID NO:357 SWQSDChaDCIHRLLEAFLDK-PEG40BrNLTEEQRWERIDKINDECE(Ranganath,S.等人PLoS ONE 10(11):e0141330)
在某些实施方案中,IL-6靶向配体是SEQ ID NO:343,通过聚乙二醇化的赖氨酸残基与接头结合。
SEQ ID NO:358 EEX3X4AWX7EIHX11LPNLX16X17X18QX20X21AFIX25X26LX28X29(USP 10,633,423)
其中,彼此独立地,
X3选自A、F、H、K、Q、R、S、W和Y;
X4选自A、D、E、F、H、I、K、L、M、N、Q、R、S、T、V和Y;
X7选自F、H、I、K、L、M、N、R、S、T、V、W和Y;
X11选自A、I、K、L、M、N、R、S、T和V;
X16选自N和T;
X17选自A、I、T和V;
X18选自D、E、G、H、K、N、Q、R、S和T;
X20选自I、L、M、R、T和V;
X21选自A、S、T和V;
X25选自I、M、Q、S、T、V和W;
X26选自K和S,
X28选自F、L、M和Y;以及
X29选自D和R;
SEQ ID NO:359 EEX3X4AWX7EIHX11LPNLX16X17X18QX20X21AFIX25X26LX28X29(USP 10,669,314)
其中,彼此独立地,
X3选自A、F、H、K、Q、R、S、W和Y;
X4选自A、D、E、F、H、I、K、L、M、N、Q、R、S、T、V和Y;
X7选自F、H、I、K、L、M、N、R、S、T、V、W和Y;
X11选自A、I、K、L、M、N、R、S、T和V;
X16选自N和T;
X17选自A、I、T和V;
X18选自D、E、G、H、K、N、Q、R、S和T;
X20选自I、L、M、R、T和V;
X21选自A、S、T和V;
X25选自I、M、Q、S、T、V和W;
X26选自K和S;
X28选自F、L、M和Y;以及
X29选自D和R;
在某些实施方案中,用于治疗IL-6介导的疾病的靶向配体结合gp130。gp130靶向配体的非限制性实例可以在例如以下中找到:Ahn,S-H.等人.In vitro and in vivopharmacokinetic characterization of LMT-28 as a novel small molecularinterleukin-6 inhibitor 2020 Asian-Australas J Anim Sci.33:670-677,Aqel,S.I.Novel small molecule IL-6 inhibitor suppresses autoreactive Th17development and promotes Treg development.(2019)Clinical and ExperimentalImmunology,196:215-225,Hong,S.-S.等人.A Novel Small-Molecule InhibitorTargeting the IL-6 Receptor beta Subunit,Glycoprotein 130.2015 J Immunol 195:237-245
在某些实施方案中,gp130结合靶向配体选自
免疫球蛋白A1(IgA1)
免疫球蛋白A是一类抗体,常见于分泌物中,但也存在于血清中。IgA包含4条重链和4条轻链,呈二聚体形式。IgA存在两种同种型:IgA1和IgA2。IgA1在铰链区含有更多重复序列,是血清中发现的主要形式。虽然IgA的产生可以维持强大的粘膜免疫力并防御病原体,但它可能会变得有毒。IgA肾病,也称为伯杰氏病,是IgA抗体的病理性积聚,会降低肾功能。该疾病的病因尚不清楚,但有人认为铰链区的糖基化模式发挥了作用。由于适当的肾功能对整体健康很重要,IgA肾病与全身性疾病有关,如肝衰竭、癌症、乳糜泻、系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎、心力衰竭、反应性关节炎和强直性脊柱炎。
蛋白质数据库网站提供了IgA1的晶体结构,代表性实例包括PDB登录码1IGA(Boehm,M.K.1999,J.Mol.Bio.286 1421-1447)、2ESG(Almogren,A.2006 J.Mol.Biol.356,413-431)、6XJA,7JGJ,(Eisenmesser,E.Z.2020,Nat.Commun,11,6063-6063)和3CHN(Bonner,A.2009,Mucosal Immunol.,2,74-84)。
直接或间接IgA1结合分子包括Jacalin和
SEQ ID NO:360 YYALSDAKEEEPRYKALRGENQDLREKERKYQDKIKKLEEKEKNLEKKS.
接头的实施方案
在非限制性实施方案中,接头A和接头B独立地选自:
其中:
R11、R12、R13、R14、R15、R16、R17、R18、R19和R20在每次出现时独立地选自由以下组成的组:键、烷基、-C(O)-、-C(O)O-、-OC(O)-、-SO2-、-S(O)-、-C(S)-、-C(O)NR6-、-NR6C(O)-、-O-、-S-、-NR6-、-C(R21R21)-、-P(O)(R3)O-、-P(O)(R3)-、天然或非天然氨基酸的二价残基、烯基、炔基、卤代烷基、烷氧基、芳基、杂环、杂芳基、-CH2CH2-[O-(CH2)2]n-O-、-CH2CH2-[O-(CH2)2]n-NR6-、-CH2CH2-[O-(CH2)2]n-、-[-(CH2)2-O-]n-、-[O-(CH2)2]n-、-[O-CH(CH3)C(O)]n-、-[C(O)-CH(CH3)-O]n-、-[O-CH2C(O)]n-、-[C(O)-CH2-O]n-、脂肪酸的二价残基、不饱和或饱和的一元或二元羧酸的二价残基;其中各自任选被1、2、3或4个独立选自R21的取代基取代;
n在每种情况下独立地选自0、1、2、3、4、5、6、7、8、9或10;
R21在每次出现时独立地选自由以下组成的组:氢、烷基、烯基、炔基、F、Cl、Br、I、羟基、烷氧基、叠氮基、氨基、氰基、-NR6R7、-NR8SO2R3、-NR8S(O)R3、卤代烷基、杂烷基、芳基、杂芳基和杂环;
且其余变量如本文所定义。
在一个实施方案中,接头A是键并且接头B是
在一个实施方案中,接头B是键并且接头A是
在一个实施方案中,氨基酸的二价残基选自
其中氨基酸可以沿任一方向取向并且其中氨基酸可以是L-或D-形式。
在一个实施方案中,二羧酸的二价残基由亲核加成反应生成:
由亲核加成反应产生的二羧酸的二价残基的非限制性实施方案包括:
如本文实施方案中所使用的,xx独立地选自0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24和25。
如本文实施方案中使用的,yy独立地选自0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24和25。
在一个实施方案中,二羧酸的二价残基由缩合反应生成:
由缩合产生的二羧酸的二价残基的非限制性实施方案包括:
饱和二羧酸的二价残基的非限制性实施方案包括:
饱和二羧酸的二价残基的非限制性实施方案包括:
饱和一元羧酸的二价残基的非限制性实施方案选自丁酸(-OC(O)(CH2)2CH2-)、己酸(-OC(O)(CH2)4CH2-)、辛酸(-OC(O)(CH2)5CH2-)、癸酸(-OC(O)(CH2)])8CH2-)、月桂酸(-OC(O)(CH2)10CH2-)、肉豆蔻酸(-OC(O)(CH2)])12CH2-)、十五烷酸(-OC(O)(CH2)13CH2-)、棕榈酸(-OC(O)(CH2)14CH2-)、硬脂酸(-OC(O)(CH2)16CH2-)、山萮酸(-OC(O)(CH2)20CH2-)和二十四烷酸(-OC(O)(CH2)22CH2-);
脂肪酸的二价残基的非限制性实施方案包括选自亚油酸、棕榈油酸、异油酸、泡桐酸、油酸、反油酸、鲸鱼酸、钆油酸、神经酸、肉豆蔻脑酸和芥酸的残基:
脂肪酸二价残基的非限制性实施方案选自亚油酸(-C(O)(CH2)7(CH)2CH2(CH)2(CH2)4CH2-)、二十二碳六烯酸(-C(O)(CH2)2(CHCHCH2)6CH2-)、二十碳五烯酸(-C(O)(CH2)3(CHCHCH22)5CH2-)、α-亚麻酸(-C(O)(CH2)7(CHCHCH2)3CH2-)十八碳四烯酸(-C(O)(CH2)4(CHCHCH2)4CH2-)、γ-亚麻酸(-C(O)(CH2)4(CHCHCH22)3(CH2)3CH2-)、花生四烯酸(-C(O)(CH2)3、(CHCHCH2)4(CH2)4CH2-)、二十二碳四烯酸(-C(O)(CH2)5(CHCHCH2)4(CH2)4CH2-)、棕榈油酸(-C(O)(CH2)7CHCH(CH2)5CH2-)、异油酸(-C(O)(CH2)9CHCH(CH2)5CH2-)、泡桐酸(-C(O)(CH2)11CHCH(CH2)5CH2-)、油酸(-C(O)(CH2)7CHCH(CH2)7CH2-)、反油酸(-C(O)(CH2)7CHCH(CH2)7CH2-)、鲸鱼酸(-C(O)(CH2)9CHCH(CH2)7CH2-)、钆油酸(-C(O)(CH2)7CHCH(CH2)9CH2-)、神经酸(-C(O)(CH2)13CHCH(CH2)7CH2-)、米德酸(-C(O)(CH2)3(CHCHCH2)3(CH2)6CH2-)、肉豆蔻脑酸(-C(O)(CH2)7CHCH(CH2)3CH2-)和芥酸(-C(O)(CH2)11CHCH(CH2)7CH2-)。
在某些实施方案中,接头C选自:
其中:
R22在每次出现时独立地选自由以下组成的组:烷基,-C(O)N-、-NC(O)-、-N-、-C(R21)-、-P(O)O-、-P(O)-、-P(O)(NR6R7)N-、烯基、卤代烷基、芳基、杂环和杂芳基,其各自任选被1、2、3或4独立地选自R21取代取代基;
且其余变量如本文所定义。
在某些实施方案中,接头D选自:
其中:
R32在每次出现时独立地选自由以下组成的组:烷基,N+X-、-C-、烯基、卤代烷基、芳基、杂环和杂芳基,其各自任选被1、2、3或4个独立选自R21的取代基取代;
X-是阴离子基团,例如Br-或Cl-:以及
所有其他变量均如本文所定义。
在某些实施方案中,接头A选自:
其各自任选被1、2、3或4个如本文所定义的任选取代基取代。
在某些实施方案中,接头A选自:
其各自任选被1、2、3或4个如本文所定义的任选取代基取代。
在某些实施方案中,接头A选自:
其各自任选被1、2、3或4个如本文所定义的任选取代基取代。
在某些实施方案中,接头A选自:
其各自任选被1、2、3或4个如本文所定义的任选取代基取代。
在某些实施方案中,接头A选自:
其各自任选被1、2、3或4个如本文所定义的任选取代基取代。
在某些实施方案中,接头A选自:
其各自任选被1、2、3或4个如本文所定义的任选取代基取代。
在某些实施方案中,接头A选自:
其中每个杂芳基、杂环、环烷基和芳基可任选地被1、2、3或4个卤素、烷基、卤代烷基、芳基、杂芳基、杂环或环烷基的任意组合取代,如化合价所允许的。
在某些实施方案中,接头A选自:
其中每个杂芳基、杂环、环烷基和芳基可任选地被1、2、3或4个卤素、烷基、卤代烷基、芳基、杂芳基、杂环或环烷基的任意组合取代,如化合价所允许的。
在某些实施方案中,接头A选自:
其中每个杂芳基、杂环、环烷基和芳基可任选地被1、2、3或4个卤素、烷基、卤代烷基、芳基、杂芳基、杂环或环烷基的任意组合取代,如化合价所允许的。
在某些实施方案中,接头B选自:
在某些实施方案中,接头B选自:
/>
在某些实施方案中,接头B、接头C或接头D选自:
/>
其中tt独立地选自1、2或3并且ss是3减去tt。
在某些实施方案中,接头B、接头C或接头D选自:
其中tt和ss如本文所定义。
在某些实施方案中,接头B、接头C或接头D选自:
/>
/>
/>
/>
其中每个杂芳基、杂环、环烷基和芳基可以任选地被1、2、3或4个卤素、烷基、卤代烷基、芳基、杂芳基、杂环或环烷基的任意组合取代,如化合价允许;tt和ss如本文所定义。
在某些实施方案中,接头B、接头C或接头D选自:
/>
/>
其中每个杂芳基、杂环、环烷基和芳基可以任选地被1、2、3或4个卤素、烷基、卤代烷基、芳基、杂芳基、杂环或环烷基的任意组合取代,如化合价允许;tt和ss如本文所定义。
在某些实施方案中,接头B、接头C或接头D选自:
其中每个杂芳基和芳基可以任选地被1、2、3或4个卤素、烷基、卤代烷基、芳基、杂芳基、杂环或环烷基的任意组合取代,如化合价允许;tt和ss如本文所定义。
在某些实施方案中,接头A选自:
/>
在某些实施方案中,接头A选自:
在某些实施方案中,接头A选自:
在某些实施方案中,接头A选自:
/>
在某些实施方案中,接头B选自:
在某些实施方案中,接头B选自:
在某些实施方案中,接头B选自:
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在某些实施方案中,接头B选自:
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在某些实施方案中,接头C选自:
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在某些实施方案中,接头C选自:
在某些实施方案中,接头C选自:
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在某些实施方案中,接头C选自:
在某些实施方案中,接头C选自:
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在某些实施方案中,接头C选自:
在某些实施方案中,接头C选自:
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在某些实施方案中,接头C选自:
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在某些实施方案中,接头D选自:
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在某些实施方案中,接头D选自:
在某些实施方案中,接头D选自:
在某些实施方案中,接头D选自:
/>
在某些实施方案中,接头D选自:
在某些实施方案中,接头D选自:
在某些实施方案中,接头D选自:
/>
在某些实施方案中,接头A选自
在某些实施方案中,接头A选自
/>
在某些实施方案中,接头A选自
在某些实施方案中,接头A选自
/>
其中各自任选被1、2、3或4个选自R21的取代基取代。
在某些实施方案中,接头A选自:
在某些实施方案中,接头A选自:
在某些实施方案中,接头A选自:
在某些实施方案中,接头A选自:
在某些实施方案中,接头A选自:
在某些实施方案中,接头A选自:
在某些实施方案中,接头A选自:
在某些实施方案中,接头A选自:
/>
在某些实施方案中,接头A选自:
在某些实施方案中,接头A选自:
在某些实施方案中,接头A选自:
在某些实施方案中,接头A选自:
在某些实施方案中,接头A选自:
在某些实施方案中,接头B选自
在某些实施方案中,接头B选自
在某些实施方案中,接头B选自
其中各自任选被1、2、3或4个选自R21的取代基取代。
在某些实施方案中,接头B选自:
在某些实施方案中,接头B选自:
在某些实施方案中,接头B选自:
/>
在某些实施方案中,接头B选自:
在某些实施方案中,接头B选自:
在某些实施方案中,接头B选自:
在某些实施方案中,接头B选自:
/>
在某些实施方案中,接头B选自:
在某些实施方案中,接头B-接头A选自:
在某些实施方案中,接头B-接头A选自:
在某些实施方案中,接头C选自
在某些实施方案中,接头C选自
在某些实施方案中,接头C选自
在某些实施方案中,接头C选自
在某些实施方案中,接头C选自
/>
在某些实施方案中,接头C选自
/>
其中各自任选被1、2、3或4个选自R21的取代基取代。
在某些实施方案中,接头C选自:
/>
在某些实施方案中,接头C选自:
在某些实施方案中,接头C选自:
在某些实施方案中,接头C选自:
在某些实施方案中,接头C选自:
在某些实施方案中,接头C选自:
在某些实施方案中,接头C选自:
在某些实施方案中,接头C-(接头A)2选自:
在某些实施方案中,接头C-(接头A)2选自:
在某些实施方案中,接头C-(接头A)2选自:
/>
在某些实施方案中,接头C-(接头A)2选自:
在某些实施方案中,接头D选自
在某些实施方案中,接头D选自
在某些实施方案中,接头D选自
其中各自任选被1、2、3或4个选自R21的取代基取代。
在某些实施方案中,接头B-(接头A)选自
在某些实施方案中,接头C-(接头A)选自
/>
在某些实施方案中,接头D-(接头A)选自
/>
在某些实施方案中,接头B选自:
其中每个杂芳基、杂环、环烷基和芳基可任选地被1、2、3或4个卤素、烷基、卤代烷基、芳基、杂芳基、杂环或环烷基的任意组合取代,如化合价所允许的。
在某些实施方案中,接头B选自:
其中每个杂芳基、杂环、环烷基和芳基可任选地被1、2、3或4个卤素、烷基、卤代烷基、芳基、杂芳基、杂环或环烷基的任意组合取代,如化合价所允许的。
在某些实施方案中,接头B选自:
其中每个杂芳基、杂环、环烷基和芳基可任选地被1、2、3或4个卤素、烷基、卤代烷基、芳基、杂芳基、杂环或环烷基的任意组合取代,如化合价所允许的。
在某些实施方案中,接头B、接头C或接头D选自:
其中每个杂芳基、杂环、环烷基和芳基可任选地被1、2、3或4个卤素、烷基、卤代烷基、芳基、杂芳基、杂环或环烷基的任意组合取代,如化合价所允许的。
在某些实施方案中,接头A选自:
在某些实施方案中,接头A选自:
各自被1或2个任选的取代基取代。
在某些实施方案中,接头A是键。
在某些实施方案中,接头A的左侧连接至ASGPR结合配体并且右侧连接至接头B、接头或接头CD。
在某些实施方案中,接头A的右侧连接至ASGPR结合配体,并且右侧连接至接头B、接头或接头CD。
在某些实施方案中,接头B选自:
在某些实施方案中,接头B选自:
在某些实施方案中,接头B的左侧连接至胞外靶向配体并且右侧连接至接头A。
在某些实施方案中,接头B的右侧连接至胞外靶向配体并且左侧连接至接头A。
在某些实施方案中,接头B是键。
在一些替代实施方案中,如上所述提供接头,其中被/>替代,例如其中接头B被绘制为/>在本实施方案中为/>
在一些替代实施方案中,如上所述提供接头,其中被/>替代,例如其中接头B被绘制为/>在本实施方案中为/>
在一些替代实施方案中,如上所述提供接头,其中被/>替代。
ASGPR结合配体的实施方案
在某些实施方案中,ASGPR结合配体具有下式:
或其药学上可接受的盐,其中如果ASGPR结合配体是胞外蛋白降解化合物的一部分,则R5或R1被与接头A的键取代。
在某些实施方案中,ASGPR结合配体具有下式:
或其药学上可接受的盐,其中如果ASGPR结合配体是胞外蛋白降解化合物的一部分,则R5或R1被与接头A的键取代。
在某些实施方案中,ASGPR结合配体具有下式:
或其药学上可接受的盐,其中如果ASGPR结合配体是胞外蛋白降解化合物的一部分,则R5或R1被与接头A的键取代。
在某些实施方案中,ASGPR结合配体具有下式:
或其药学上可接受的盐,其中如果ASGPR结合配体是胞外蛋白降解化合物的一部分,则R5或R1被与接头A的键取代。
在某些实施方案中,ASGPR结合配体具有下式:
或其药学上可接受的盐,其中如果ASGPR结合配体是胞外蛋白降解化合物的一部分,则R5或R1被与接头A的键取代。
在某些实施方案中,ASGPR结合配体具有下式:
或其药学上可接受的盐,其中如果ASGPR结合配体是胞外蛋白降解化合物的一部分,则R5或R1被与接头A的键取代。
在某些实施方案中,ASGPR结合配体具有下式:
或其药学上可接受的盐,其中如果ASGPR结合配体是胞外蛋白降解化合物的一部分,则R5或R1被与接头A的键取代。
在某些实施方案中,ASGPR结合配体具有下式:
或其药学上可接受的盐,其中如果ASGPR结合配体是胞外蛋白降解化合物的一部分,则R5或R1被与接头A的键取代。
在某些实施方案中,ASGPR结合配体具有下式:
或其药学上可接受的盐,其中如果ASGPR结合配体是胞外蛋白降解化合物的一部分,则R5或R1被与接头A的键取代。
在某些实施方案中,ASGPR结合配体具有下式:
或其药学上可接受的盐,其中如果ASGPR结合配体是胞外蛋白降解化合物的一部分,则R5或R1被与接头A的键取代。
在某些实施方案中,ASGPR结合配体具有下式:
或其药学上可接受的盐,其中如果ASGPR结合配体是胞外蛋白降解化合物的一部分,则接头A连接至C5位置处的氮。
在某些实施方案中,ASGPR结合配体具有下式:
或其药学上可接受的盐,其中如果ASGPR结合配体是胞外蛋白降解化合物的一部分,则接头A连接至C5位置处的氧。
在某些实施方案中,ASGPR结合配体具有下式:
或其药学上可接受的盐,其中如果ASGPR结合配体是胞外蛋白降解化合物的一部分,则接头A连接至C5位置处的氮。
在某些实施方案中,ASGPR结合配体具有下式:
或其药学上可接受的盐,其中如果ASGPR结合配体是胞外蛋白降解化合物的一部分,则接头A连接至C5位置处的氮。
在某些方面,胞外蛋白降解化合物具有下式
或其药学上可接受的盐。
在某些方面,胞外蛋白降解化合物具有下式
或其药学上可接受的盐。
在某些方面,胞外蛋白降解化合物具有下式
或其药学上可接受的盐。
在某些方面,胞外蛋白降解化合物具有下式
或其药学上可接受的盐。
在某些方面,胞外蛋白降解化合物具有下式
或其药学上可接受的盐。
在某些方面,胞外蛋白降解化合物具有下式
或其药学上可接受的盐。
在某些实施方案中,ASGPR结合配体具有下式:
或其药学上可接受的盐,其中如果ASGPR结合配体是胞外蛋白降解化合物的一部分,则R5被与接头A的键取代;以及
其中R*选自:
在某些实施方案中,ASGPR结合配体具有下式:
或其药学上可接受的盐,其中如果ASGPR结合配体是胞外蛋白降解化合物的一部分,则R5*被与接头A的键取代;以及R5*是烷基、C(O)R3或氢。
在某些实施方案中,ASGPR结合配体具有式:
或其药学上可接受的盐,其中如果ASGPR结合配体是胞外蛋白降解化合物的一部分,则R1或R5被与接头A的键取代。
在某些实施方案中,R*选自:
R*的非限制性实例包括:
在某些实施方案中,ASGPR结合配体具有下式
或其药学上可接受的盐,其中如果ASGPR结合配体是胞外蛋白降解化合物的一部分,则R5被与基团A的键取代。
在某些实施方案中,ASGPR结合配体具有下式
或其药学上可接受的盐,其中如果ASGPR结合配体是胞外蛋白降解化合物的一部分,则R5被与基团A的键取代。
在某些实施方案中,ASGPR结合配体选自
或其药学上可接受的盐,其中如果ASGPR结合配体是胞外蛋白降解化合物的一部分,则C1或C5位置处的取代基与接头A键合。
在某些实施方案中,ASGPR结合配体选自:
或其药学上可接受的盐,其中如果ASGPR结合配体是胞外蛋白降解化合物的一部分,则C1或C5位置处的取代基与接头A键合。
在某些实施方案中,ASGPR结合配体选自:
或其药学上可接受的盐,其中如果ASGPR结合配体是胞外蛋白降解化合物的一部分,则C1或C5位置处的取代基与接头A键合。
在某些实施方案中,ASGPR结合配体选自:
/>
或其药学上可接受的盐,其中如果ASGPR结合配体是胞外蛋白降解化合物的一部分,则C1或C5位置处的取代基与接头A键合。
在某些实施方案中,胞外蛋白降解化合物选自:
以及/>
R1的实施方案
在某些实施方案中,R1是氢。
在某些实施方案中,R1是
在某些实施方案中,R1是
在某些实施方案中,R1是
在某些实施方案中,R1是
在某些实施方案中,R1是
在某些实施方案中,R1是
在某些实施方案中,R1是任选被1、2、3或4个取代基取代的杂烷基。
在某些实施方案中,R1是任选被1、2、3或4个取代基取代的C0-C6烷基-氰基。
在某些实施方案中,R1是任选被1、2、3或4个取代基取代的烷基。
在某些实施方案中,R1是任选被1、2、3或4个取代基取代的烯基。
在某些实施方案中,R1是任选被1、2、3或4个取代基取代的炔基。
在某些实施方案中,R1是任选被1、2、3或4个取代基取代的卤代烷基。
在某些实施方案中,R1是F。
在某些实施方案中,R1是Cl。
在某些实施方案中,R1是Br。
在某些实施方案中,R1是任选被1、2、3或4个取代基取代的芳基。
在某些实施方案中,R1是任选被1、2、3或4个取代基取代的芳基烷基。
在某些实施方案中,R1是任选被1、2、3或4个取代基取代的杂芳基。
在某些实施方案中,R1是任选被1、2、3或4个取代基取代的杂芳基烷基。
在某些实施方案中,R1是任选被1、2、3或4个取代基取代的杂环。
在某些实施方案中,R1是任选被1、2、3或4个取代基取代的杂环烷基。
在某些实施方案中,R1是任选被1、2、3或4个取代基取代的卤代烷氧基。
在某些实施方案中,R1是-O-烯基、-O-炔基、C0-C6烷基-OR6、C0-C6烷基-SR6、C0-C6烷基-NR6R7、C0-C6烷基-C(O)R3、C0-C6烷基-S(O)R3、C0-C6烷基-C(S)R3、C0-C6烷基-S(O)2R3、C0-C6烷基-N(R8)-C(O)R3、C0-C6烷基-N(R8)-S(O)R3、C0-C6烷基-N(R8)-C(S)R3、C0-C6烷基-N(R8)-S(O)2R3C0-C6烷基-O-C(O)R3、C0-C6烷基-O-S(O)R3、C0-C6烷基-O-C(S)R3、-N=S(O)(R3)2、C0-C6烷基N3、或C0-C6烷基-O-S(O)2R3,其各自任选被1、2、3或4个取代基取代。
R5的实施方案
在某些实施方案中,R5是氢。
在某些实施方案中,R5是
在某些实施方案中,R5是
在某些实施方案中,R5是
在某些实施方案中,R5是
在某些实施方案中,R5是
在某些实施方案中,R5是
在某些实施方案中,R5是任选被1、2、3或4个取代基取代的杂烷基。
在某些实施方案中,R5是任选被1、2、3或4个取代基取代的C0-C6烷基-氰基。
在某些实施方案中,R5是任选被1、2、3或4个取代基取代的烷基。
在某些实施方案中,R5是任选被1、2、3或4个取代基取代的烯基。
在某些实施方案中,R5是任选被1、2、3或4个取代基取代的炔基。
在某些实施方案中,R5是任选被1、2、3或4个取代基取代的卤代烷基。
在某些实施方案中,R5是F。
在某些实施方案中,R5是Cl。
在某些实施方案中,R5是Br。
在某些实施方案中,R5是任选被1、2、3或4个取代基取代的芳基。
在某些实施方案中,R5是任选被1、2、3或4个取代基取代的芳基烷基。
在某些实施方案中,R5是任选被1、2、3或4个取代基取代的杂芳基。
在某些实施方案中,R5是任选被1、2、3或4个取代基取代的杂芳基烷基。
在某些实施方案中,R5是任选被1、2、3或4个取代基取代的杂环。
在某些实施方案中,R5是任选被1、2、3或4个取代基取代的杂环烷基。
在某些实施方案中,R5是任选被1、2、3或4个取代基取代的卤代烷氧基。
在某些实施方案中,R5是-O-烯基、-O-炔基、C0-C6烷基-OR6、C0-C6烷基-SR6、C0-C6烷基-NR6R7、C0-C6烷基-C(O)R3、C0-C6烷基-S(O)R3、C0-C6烷基-C(S)R3、C0-C6烷基-S(O)2R3、C0-C6烷基-N(R8)-C(O)R3、C0-C6烷基-N(R8)-S(O)R3、C0-C6烷基-N(R8)-C(S)R3、C0-C6烷基-N(R8)-S(O)2R3C0-C6烷基-O-C(O)R3、C0-C6烷基-O-S(O)R3、C0-C6烷基-O-C(S)R3、-N=S(O)(R3)2、C0-C6烷基N3、或C0-C6烷基-O-S(O)2R3,其各自任选被1、2、3或4个取代基取代。
R10的实施方案
在某些实施方案中,R10是氢。
在某些实施方案中,R10是烷基。
在某些实施方案中,R10是卤代烷基。
在某些实施方案中,R10是C(O)R3。
R25的实施方案
在某些实施方案中,R25是氢。
在某些实施方案中,R25是/>
在某些实施方案中,R25是
在某些实施方案中,R25是
在某些实施方案中,R25是
在某些实施方案中,R25是
在某些实施方案中,R25是
在某些实施方案中,R25是任选被1、2、3或4个取代基取代的杂烷基。
在某些实施方案中,R25是任选被1、2、3或4个取代基取代的C0-C6烷基-氰基。
在某些实施方案中,R25是任选被1、2、3或4个取代基取代的烷基。
在某些实施方案中,R25是任选被1、2、3或4个取代基取代的烯基。
在某些实施方案中,R25是任选被1、2、3或4个取代基取代的炔基。
在某些实施方案中,R25是任选被1、2、3或4个取代基取代的卤代烷基。
在某些实施方案中,R25是F。
在某些实施方案中,R25是Cl。
在某些实施方案中,R25是Br。
在某些实施方案中,R25是任选被1、2、3或4个取代基取代的芳基。
在某些实施方案中,R25是任选被1、2、3或4个取代基取代的芳基烷基。
在某些实施方案中,R25是任选被1、2、3或4个取代基取代的杂芳基。
在某些实施方案中,R25是任选被1、2、3或4个取代基取代的杂芳基烷基。
在某些实施方案中,R25是任选被1、2、3或4个取代基取代的杂环。
在某些实施方案中,R25是任选被1、2、3或4个取代基取代的杂环烷基。
在某些实施方案中,R25是任选被1、2、3或4个取代基取代的卤代烷氧基。
R65、R66和R67的实施方案
1.在某些实施方案中,提供了本发明的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65、R66和R67独立地选自氢、杂烷基、C0-C6烷基-氰基、烷基、烯基、炔基、卤代烷基、F、Cl、Br、I、杂环、杂环烷基、卤代烷氧基、C0-C6烷基-OR6、C0-C6烷基-SR6、C0-C6烷基-NR6R7、C0-C6烷基-C(O)R3、C0-C6烷基-S(O)R3、C0-C6烷基-C(S)R3、C0-C6烷基-S(O)2R3、C0-C6烷基-N(R8)-C(O)R3、C0-C6烷基-N(R8)-S(O)R3、C0-C6烷基-N(R8)-C(S)R3、C0-C6烷基-N(R8)-S(O)2R3C0-C6烷基-O-C(O)R3、C0-C6烷基-O-S(O)R3、C0-C6烷基-O-C(S)R3、-N=S(O)(R3)2、C0-C6烷基N3,和C0-C6烷基-O-S(O)2R3,其各自任选被1、2、或3个取代基取代。
2.实施方案1的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65不被任选的取代基取代。
3.实施方案1的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65被1个任选的取代基取代。
4.实施方案1的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65被2个任选的取代基取代。
5.实施方案1的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65被3个任选的取代基取代。
6.实施方案1的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65是氢。
7.实施方案1的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65是-CF3。
8.实施方案1的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65是氰基。
9.实施方案1的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65是F。
10.实施方案1的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65是Cl。
11.实施方案1的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65是Br。
12.实施方案1-5中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65是卤代烷基。
13.实施方案1-5中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65是杂环。
14.实施方案1-5中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65是卤代烷氧基。
15.实施方案1-5中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65是C0-C6烷基-OR6。
16.实施方案1-5中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65是C0-C6烷基-SR6。
17.实施方案1-5中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65是C0-C6烷基-NR6R7。
18.实施方案1-5中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65是C0-C6烷基-C(O)R3。
19.实施方案1-5中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65是C0-C6烷基-S(O)R3。
20.实施方案1-5中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65是C0-C6烷基-C(S)R3。
21.实施方案1-5中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65是C0-C6烷基-S(O)2R3。
22.实施方案1-5中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65是C0-C6烷基-N(R8)-C(O)R3。
23.实施方案1-5中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65是C0-C6烷基-N(R8)-S(O)R3。
24.实施方案1-5中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65是C0-C6烷基-N(R8)-C(S)R3。
25.实施方案1-5中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65是C0-C6烷基-N(R8)-S(O)2R3。
26.实施方案1-5中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65是C0-C6烷基N3。
27.实施方案1-5中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65是C0-C6烷基-氰基。
28.实施方案15-27中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中C0-C6烷基是C0-烷基(即键)。
29.实施方案15-27中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中C0-C6烷基是C1-烷基。
30.实施方案15-27中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中C0-C6烷基是C2-烷基。
31.实施方案1-5中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65是-N=S(O)(R3)2。
32.实施方案1-5中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65是杂环烷基。
33.实施方案1-5中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R65是杂烷基。
34.实施方案1-33中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R66不被任选的取代基取代。
35.实施方案1-33中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R66被1个任选的取代基取代。
36.实施方案1-33中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R66被2个任选的取代基取代。
37.实施方案1-33中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R66被3个任选的取代基取代。
38.实施方案1-33中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R66是氢。
39.实施方案1-33中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R66是-CF3。
40.实施方案1-33中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R66是氰基。
41.实施方案1-33中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R66是F。
42.实施方案1-33中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R66是Cl。
43.实施方案1-33中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R66是Br。
44.实施方案1-37中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R66是卤代烷基。
45.实施方案1-37中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R66是杂环。
46.实施方案1-37中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R66是卤代烷氧基。
47.实施方案1-37中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R66是C0-C6烷基-OR6。
48.实施方案1-37中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R66是C0-C6烷基-SR6。
49.实施方案1-37中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R66是C0-C6烷基-NR6R7。
50.实施方案1-37中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R66是C0-C6烷基-C(O)R3。
51.实施方案1-37中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R66是C0-C6烷基-S(O)R3。
52.实施方案1-37中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R66是C0-C6烷基-C(S)R3。
53.实施方案1-37中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R66是C0-C6烷基-S(O)2R3。
54.实施方案1-37中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R66是C0-C6烷基-N(R8)-C(O)R3。
55.实施方案1-37中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R66是C0-C6烷基-N(R8)-S(O)R3。
56.实施方案1-37中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R66是C0-C6烷基-N(R8)-C(S)R3。
57.实施方案1-37中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R66是C0-C6烷基-N(R8)-S(O)2R3。
58.实施方案1-37中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R66是C0-C6烷基N3。
59.实施方案1-37中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R66是C0-C6烷基-氰基。
60.实施方案47-59中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中C0-C6烷基是C0-烷基(即键)。
61.实施方案47-59中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中C0-C6烷基是C1-烷基。
62.实施方案47-59中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中C0-C6烷基是C2-烷基。
63.实施方案1-33中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R66是-N=S(O)(R3)2。
64.实施方案1-33中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R66是杂环烷基。
65.实施方案1-33中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R66是杂烷基。
66.实施方案1-65中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R67不被任选的取代基取代。
67.实施方案1-65中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R67被1个任选的取代基取代。
68.实施方案1-65中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R67被2个任选的取代基取代。
69.实施方案1-65中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R67被3个任选的取代基取代。
70.实施方案1-65中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R67是氢。
71.实施方案1-65中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R67是-CF3。
72.实施方案1-65中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R67是氰基。
73.实施方案1-65中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R67是F。
74.实施方案1-65中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R67是Cl。
75.实施方案1-65中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R67是Br。
76.实施方案1-65中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R67是卤代烷基。
77.实施方案1-65中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R67是杂环。
78.实施方案1-65中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R67是卤代烷氧基。
79.实施方案1-65中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R67是C0-C6烷基-OR6。
80.实施方案1-65中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R67是C0-C6烷基-SR6。
81.实施方案1-65中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R67是C0-C6烷基-NR6R7。
82.实施方案1-65中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R67是C0-C6烷基-C(O)R3。
83.实施方案1-65中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R67是C0-C6烷基-S(O)R3。
84.实施方案1-65中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R67是C0-C6烷基-C(S)R3。
85.实施方案1-65中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R67是C0-C6烷基-S(O)2R3。
86.实施方案1-65中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R67是C0-C6烷基-N(R8)-C(O)R3。
87.实施方案1-65中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R67是C0-C6烷基-N(R8)-S(O)R3。
88.实施方案1-65中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R67是C0-C6烷基-N(R8)-C(S)R3。
89.实施方案1-65中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R67是C0-C6烷基-N(R8)-S(O)2R3。
90.实施方案1-65中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R67是C0-C6烷基N3。
91.实施方案1-65中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R67是C0-C6烷基-氰基。
92.实施方案79-91中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中C0-C6烷基是C0-烷基(即键)。
93.实施方案79-91中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中C0-C6烷基是C1-烷基。
94.实施方案79-91中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中C0-C6烷基是C2-烷基。
95.实施方案1-65中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R67是-N=S(O)(R3)2。
96.实施方案1-65中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R67是杂环烷基。
97.实施方案1-65中任一项的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R67是杂烷基。
98.在某些实施方案中,提供了本发明的ASGPR结合配体或胞外蛋白降解化合物,其中R68、R69和R70独立地选自65、R66和R67如上所述,其中R68、R69和R70不是氰基或CF3。
在某些实施方案中,R65、R66或R67是芳基。
在某些实施方案中,R65、R66或R67是杂芳基。
在某些实施方案中,R65、R66或R67是杂环。
另外的实施方案
1.在某些实施方案中,提供选自表1A或表1B的化合物或其药学上可接受的盐。
2.实施方案1的化合物选自:
/>
/>
/>
/>
/>
/>
/>
或其药学上可接受的盐。
3.实施方案1的化合物选自:
/>
/>
或其药学上可接受的盐。
4.实施方案1的化合物选自:
/>
5.实施方案1的化合物选自:
/>
/>
或其药学上可接受的盐。
6.实施方案1的化合物选自:
或其药学上可接受的盐。
7.一种药物组合物,其包含实施方案1-6中任一项的化合物和药学上可接受的赋形剂。
8.一种治疗由免疫球蛋白介导的病症的方法,所述方法包括向有需要的患者施用有效量的实施方案1-6中任一项的化合物或其药学上可接受的盐或实施方案7的药物组合物。
9.实施方案8的方法,其中所述病症由免疫球蛋白G(IgG)介导。
10.实施方案9的方法,其中所述病症选自1型自身免疫性胰腺炎、间质性肾炎、里德尔氏甲状腺炎、席纹状纤维化、米库利茨氏病、库特纳氏瘤、炎性假瘤、纵隔纤维化、腹膜后纤维化(奥蒙德氏病)、主动脉炎、主动脉周围炎、胆道狭窄、特发性低补体性肾小管间质性肾炎、多灶性纤维硬化症、厚脑膜炎、胰腺肿大、肿胀性病变、心包炎、类风湿性关节炎(RA)、炎症性肠病、多发性硬化症、重症肌无力、甲状腺眼病、慢性炎症性脱髓鞘性多发性神经病、温性自身免疫性溶血性贫血、强直性脊柱炎、原发性干燥综合征、银屑病关节炎和系统性红斑狼疮(SLE)、硬化性胆管炎和IgG单克隆丙种球蛋白病、意义未明的单克隆丙种球蛋白病(MGUS)。
11.实施方案8的方法,其中所述病症由免疫球蛋白A(IgA)介导。
12.实施方案11的方法,其中所述病症选自IgA肾病(伯杰病(Berger’sdisease))、乳糜泻、克罗恩病、过敏性紫癜(HSP)、大疱性IgA皮肤病、IgA天疱疮、疱疹样皮炎、炎性肠病(IBD)、干燥综合征、强直性脊柱炎、酒精性肝硬化、获得性免疫缺陷综合征、IgA多发性骨髓瘤、α链病、IgA单克隆丙种球蛋白病、意义不明的单克隆丙种球蛋白病(MGUS)和线性IgA大疱性皮肤病。
13.实施方案8-12中任一项的方法,其中所述患者是人。
14.在某些实施方案中,提供表2A或表2B的化合物或其盐。
III.本发明的胞外蛋白降解剂的药物组合物和剂型
本文公开的本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的盐、溶剂化物或前药可以作为纯化学品施用,但更通常作为药物组合物施用,所述药物组合物包含对需要这种治疗的宿主(通常是人)的有效量,以治疗由本文所述的靶胞外蛋白介导的疾病或对该靶胞外蛋白而言众所周知的疾病。
在某些实施方案中,本发明提供了药物组合物,其包含本发明的胞外蛋白降解剂或药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物例如其氘化衍生物或其前药,以及药学上可接受的赋形剂。在某些实施方案中,胞外蛋白降解剂以有效量存在,例如治疗有效量或预防有效量。
本发明的结合ASGPR的胞外蛋白降解剂可以以允许降解剂与免疫球蛋白(通常在血流中)结合并将其携带至肝脏上带有ASGPR的肝细胞进行内吞作用和降解的任何方式施用。因此,递送本发明的降解剂的方法的实例包括但不限于口服、静脉内、舌下、皮下、肠胃外、口腔、直肠、主动脉内、颅内、皮下或经鼻给药或通过其它方式,在含有一种或多种常规药学上可接受的载剂的剂量单位制剂中。
在某些实施方案中,本发明的胞外蛋白降解剂是静脉内施用的。通常,胞外蛋白降解剂将被配制为用于静脉内注射的液体剂型,例如缓冲溶液。用于静脉内注射的溶液的非限制性实例包括磷酸盐缓冲溶液和盐水缓冲溶液。在某些实施方案中,溶液用多种盐缓冲。
在某些实施方案中,本发明的胞外蛋白降解剂是口服施用的。通常,胞外蛋白降解剂将被配制为用于口服施用的固体剂型或作为含有凝胶的胶囊。固体剂型的非限制性实例包括胶囊、片剂和粉末。
在某些实施方案中,本发明的胞外蛋白降解剂皮下施用。通常,胞外蛋白降解剂将被配制为用于皮下注射的液体剂型,例如缓冲溶液。用于皮下注射的溶液的非限制性实例包括磷酸盐缓冲溶液和盐水缓冲溶液。在某些实施方案中,溶液用多种盐缓冲。
因此,本公开提供了用于其任何适当用途的药物组合物,其包含有效量的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的盐以及至少一种药学上可接受的载剂。药物组合物可以含有胞外蛋白降解剂或盐作为唯一的活性剂,或者在替代实施方案中,胞外蛋白降解剂和至少一种另外的活性剂。
在某些实施方案中,术语药学上可接受的盐是指所述胞外蛋白降解剂的盐,其在合理的医学判断范围内适合施用于宿主例如人而没有过度的毒性、刺激、过敏反应和例如,与合理的收益/风险比相称,并且对其预期用途有效。因此,术语“药学上可接受的盐”是指本发明公开的胞外蛋白降解剂的相对无毒的无机和有机酸加成盐。这些盐可以在胞外蛋白降解剂的最终分离和纯化过程中制备,或者通过单独使游离形式的纯化的胞外蛋白降解剂与合适的有机或无机酸反应,然后分离由此形成的盐来制备。碱性胞外蛋白降解剂能够与各种无机酸和有机酸形成多种不同的盐。碱性胞外蛋白降解剂的酸加成盐通过将游离碱形式与足够量的所需酸接触以以常规方式产生盐来制备。游离碱形式可以通过使盐形式与碱接触并以常规方式分离游离碱来再生。游离碱形式在某些物理性质(例如在极性溶剂中的溶解度)方面可能不同于它们各自的盐形式。药学上可接受的碱加成盐可以与金属或胺形成,例如碱金属和碱土金属氢氧化物,或者与有机胺形成。用作阳离子的金属的实例包括但不限于钠、钾、镁、钙等。合适的胺的实例包括但不限于N,N′-二苄基乙二胺、氯普鲁卡因、胆碱、二乙醇胺、乙二胺、N-甲基葡糖胺和普鲁卡因。酸性胞外蛋白降解剂的碱加成盐通过将游离酸形式与足够量的所需碱接触以常规方式产生盐来制备。游离酸形式可以通过使盐形式与酸接触并以常规方式分离游离酸来再生。游离酸形式在某些物理性质(例如在极性溶剂中的溶解度)方面可能与其各自的盐形式有些不同。
盐可以由无机酸(硫酸盐、焦硫酸盐、硫酸氢盐、亚硫酸盐、亚硫酸氢盐、硝酸盐、磷酸盐、磷酸一氢盐、磷酸二氢盐、偏磷酸盐、焦磷酸盐、氯化物、溴化物、碘化物、硝酸盐、磷酸盐、硫酸盐、氢溴酸、氢碘酸、磷酸等)制备。代表性的盐包括氢溴酸盐、盐酸盐、硫酸盐、硫酸氢盐、硝酸盐、乙酸盐、草酸盐、戊酸盐、油酸盐、棕榈酸盐、硬脂酸盐、月桂酸盐、硼酸盐、苯甲酸盐、乳酸盐、磷酸盐、甲苯磺酸盐、柠檬酸盐、马来酸盐、富马酸盐、琥珀酸盐、酒石酸盐、甲磺酸萘盐、葡庚糖酸盐、乳糖酸盐、月桂基磺酸盐和羟乙基磺酸盐等。盐也可由有机酸制备,例如脂族一元和二元羧酸、苯基取代的链烷酸、羟基链烷酸、链烷二酸、芳族酸、脂族和芳族磺酸等。代表性的盐包括乙酸盐、丙酸盐、辛酸盐、异丁酸盐、草酸盐、丙二酸盐、琥珀酸盐、辛二酸盐、癸二酸盐、富马酸盐、马来酸盐、扁桃酸盐、苯甲酸盐、氯苯甲酸盐、苯甲酸甲酯、二硝基苯甲酸盐、邻苯二甲酸盐、苯磺酸盐、甲苯磺酸盐、苯乙酸盐、柠檬酸盐、乳酸盐、马来酸盐、酒石酸盐、甲磺酸盐等。药学上可接受的盐可包括基于碱金属和碱土金属的阳离子,例如钠、锂、钾、钙、镁等,以及无毒的铵、季铵和胺阳离子,包括但不限于铵、四甲基铵、四乙基铵、甲胺、二甲胺、三甲胺、三乙胺、乙胺等。还考虑氨基酸的盐,例如精氨酸盐、葡萄糖酸盐、半乳糖醛酸盐等。参见,例如,Berge等人,J.Pharm.Sci.,1977,66,1-19,其通过引用并入本文。
药学上可接受的赋形剂包括惰性稀释剂、分散剂和/或造粒剂、表面活性剂和/或乳化剂、崩解剂、粘合剂、防腐剂、缓冲剂、润滑剂和/或油。另外可接受的赋形剂包括可可脂和栓剂蜡、着色剂、包衣剂、甜味剂、矫味剂、芳香剂等、以及它们的组合。
示例性的稀释剂包括碳酸钙、碳酸钠、磷酸钙、磷酸二钙、硫酸钙、磷酸氢钙、磷酸钠乳糖、蔗糖、纤维素、微晶纤维素、高岭土、甘露醇、山梨醇、肌醇、氯化钠、干淀粉、玉米淀粉、糖粉等及其组合。
示例性的造粒剂和/或分散剂包括马铃薯淀粉、玉米淀粉、木薯淀粉、羟基乙酸淀粉钠、粘土、海藻酸、瓜尔豆胶、柑橘浆、琼脂、膨润土、纤维素和木制品、天然海绵、阳离子交换树脂、钙碳酸盐、硅酸盐、碳酸钠、交联聚(乙烯基吡咯烷酮)(交联聚维酮)、羧甲基淀粉钠(羟基乙酸淀粉钠)、羧甲基纤维素、交联羧甲基纤维素钠(交联羧甲基纤维素)、甲基纤维素、预胶化淀粉(淀粉1500)、微晶淀粉、水不溶性淀粉、羧甲基纤维素钙、硅酸镁铝(Veegum)、十二烷基硫酸钠、季铵化合物等及其组合。
示例性的表面活性剂和/或乳化剂包括天然乳化剂(例如阿拉伯胶、琼脂、藻酸、藻酸钠、黄芪胶、软骨藻、胆固醇、黄原胶、果胶、明胶、蛋黄、酪蛋白、羊毛脂、胆固醇、蜡和卵磷脂)、胶体粘土(例如膨润土[硅酸铝]和Veegum[硅酸铝镁])、长链氨基酸衍生物、高分子量醇(例如硬脂醇、鲸蜡醇、油醇、单硬脂酸三醋精、二硬脂酸乙二醇、单硬脂酸甘油酯、和丙二醇单硬脂酸酯、聚乙烯醇)、卡波姆(例如羧基聚亚甲基、聚丙烯酸、丙烯酸聚合物和羧基乙烯基聚合物)、角叉菜胶、纤维素衍生物(例如羧甲基纤维素钠、粉末纤维素、羟甲基纤维素、羟丙基纤维素、羟丙基甲基纤维素、甲基纤维素)、脱水山梨糖醇脂肪酸酯(例如聚氧乙烯脱水山梨糖醇单月桂酸酯[Tween 20]、聚氧乙烯脱水山梨糖醇[Tween 60]、聚氧乙烯脱水山梨糖醇单油酸酯[Tween 80]、脱水山梨糖醇单棕榈酸酯[Span 40]、脱水山梨糖醇单硬脂酸酯[Span 60]、脱水山梨糖醇三硬脂酸酯[Span 65]、甘油单油酸酯、脱水山梨糖醇单油酸酯[Span 80])、聚氧乙烯酯(例如聚氧乙烯单硬脂酸酯[Myrj 45]、聚氧乙烯氢化蓖麻油、聚乙氧基化蓖麻油、聚氧亚甲基硬脂酸酯和Solutol)、蔗糖脂肪酸酯、聚乙二醇脂肪酸酯(例如Cremophor)、聚氧乙烯醚(例如聚氧乙烯月桂基醚[Brij 30]])、聚(乙烯基吡咯烷酮)、二甘醇单月桂酸酯、三乙醇胺油酸酯、油酸钠、油酸钾、油酸乙酯、油酸、月桂酸乙酯、十二烷基硫酸钠、Pluronic F 68、泊洛沙姆188、西曲溴铵、氯化十六烷基吡啶、苯扎氯铵氯化物、多库酯钠等和/或其组合。
示例性的粘合剂包括淀粉(例如玉米淀粉和淀粉糊)、明胶、糖(例如蔗糖、葡萄糖、右旋糖、糊精、糖蜜、乳糖、乳糖醇、甘露醇等)、天然和合成树胶(例如阿拉伯树胶、海藻酸钠、爱尔兰苔藓提取物、潘瓦胶、加蒂胶、伊萨波尔果壳粘液、羧甲基纤维素、甲基纤维素、乙基纤维素、羟乙基纤维素、羟丙基纤维素、羟丙基甲基纤维素、微晶纤维素、醋酸纤维素、聚(乙烯基吡咯烷酮)、32硅酸镁铝(Veegum)、和落叶松阿拉伯半乳聚糖)、藻酸盐、聚环氧乙烷、聚乙二醇、无机钙盐、硅酸、聚甲基丙烯酸酯、蜡、水、醇等,和/或它们的组合。
示例性的防腐剂包括抗氧化剂、螯合剂、抗微生物防腐剂、抗真菌防腐剂、醇防腐剂、酸性防腐剂等,和/或它们的组合。
示例性的抗氧化剂包括α生育酚、抗坏血酸、抗坏血酸棕榈酸酯、丁基化羟基苯甲醚、丁基化羟基甲苯、一硫代甘油、焦亚硫酸钾、丙酸、没食子酸丙酯、抗坏血酸钠、亚硫酸氢钠、焦亚硫酸钠和亚硫酸钠。
可以使用达到期望结果的任何剂型。在某些实施方案中,药物组合物是含有约0.1mg至约1500mg、约10mg至约1000mg、约100mg至约800mg、或约200mg至约600mg活性胞外蛋白降解剂和任选约0.1mg至约1500mg、约10mg至约1000mg、约100mg至约800mg、或约200mg至约600mg的另外的活性剂的呈单位剂型的剂型。实例是含有至少约0.1、1、5、10、25、50、100、200、250、300、400、500、600、700、750、800、850、900、950或1,000mg活性胞外蛋白降解剂或其盐的剂型。在某些实施方案中,剂型具有至多约0.1、1、5、10、25、50、100、200、250、300、400、500、600、700、750、800、850、900、950或1,000mg活性胞外蛋白降解剂或其盐。
在某些实施方案中,剂量范围为约0.01-100mg/kg患者体重,例如约0.01mg/kg、约0.05mg/kg、约0.1mg/kg、约0.5mg/kg、约1mg/kg、约1.5mg/kg、约2mg/kg、约2.5mg/kg、约3mg/kg、约3.5mg/kg、约4mg/kg、约4.5mg/kg、约5mg/kg、约10mg/kg、约15mg/kg、约20mg/kg、约25mg/kg、约30mg/kg、约35mg/kg、约40mg/kg、约45mg/kg、约50mg/kg、约55mg/kg、约60mg/kg、约65mg/kg、约70mg/kg、约75mg/kg、约80mg/kg、约85mg/kg、约90mg/kg、约95mg/kg或约100mg/kg。
在一些实施方案中,本文公开的或如所描述使用的胞外蛋白降解剂每天一次(QD)、每天两次(BID)或每天三次(TID)施用。在一些实施方案中,本文公开的或如所描述使用的胞外蛋白降解剂每天至少一次施用持续至少1天、至少2天、至少3天、至少4天、至少5天、至少6天、至少7天、至少8天、至少9天、至少10天、至少11天、至少12天、至少13天、至少14天、至少15天、至少16天、至少17天、至少18天、至少19天、至少20天、至少21天、至少22天、至少23天、至少24天、至少25天、至少26天、至少27天、至少28天、至少29天、至少30天、至少31天、至少35天、至少45天、至少60天、至少75天、至少90天、至少120天、至少150天、至少180天或更长。
在某些实施方案中,本发明的胞外蛋白降解剂每天施用一次、每天两次、每天三次或每天四次。
药物组合物可以配制为任何药学上有用的形式,例如丸剂、胶囊、片剂、注射剂或输注溶液、糖浆、吸入制剂、栓剂、含服或舌下制剂、肠胃外制剂或医疗装置。一些剂型,例如片剂和胶囊,可以细分为适当大小的单位剂量,其中含有适量的活性成分,例如达到所需目的的有效量。
载剂包括赋形剂和稀释剂,并且必须具有足够高的纯度和足够低的毒性,以使其适合施用于被治疗的患者。载剂可以是惰性的,或者它可以具有其自身的药学益处。与胞外蛋白降解剂结合使用的载剂的量足以提供用于每单位剂量的胞外蛋白降解剂施用的实际量的材料。如果以液体形式提供,它可以是溶液或悬浮液。
代表性载剂包括磷酸盐缓冲盐水、水、溶剂、稀释剂、pH调节剂、防腐剂、抗氧化剂、悬浮剂、润湿剂、粘度剂、张力剂、稳定剂及其组合。在一些实施方案中,载剂是水性载剂。水性载剂的实例包括但不限于水溶液或悬浮液,例如盐水、血浆、骨髓抽吸物、缓冲液,例如Hank′s缓冲盐溶液(HBSS)、HEPES(4-(2-羟乙基)-1-哌嗪乙磺酸)、Ringers缓冲液、稀释的/>用PBS稀释的/>Krebs缓冲液、Dulbecco PBS、普通PBS、透明质酸钠溶液(HA,PBS中5mg/mL)、柠檬酸盐缓冲液、模拟身体流体、血浆血小板浓缩物和组织培养基或包含有机溶剂的水溶液或悬浮液。可接受的溶液包括例如水、林格氏溶液和等渗氯化钠溶液。该制剂还可以是在无毒稀释剂或溶剂例如1,3-丁二醇中的无菌溶液、悬浮液或乳液。
可以将粘度剂添加到药物组合物中以根据需要增加组合物的粘度。有用的粘度剂的实例包括但不限于透明质酸、透明质酸钠、卡波姆、聚丙烯酸、纤维素衍生物、聚卡波非、聚乙烯吡咯烷酮、明胶、糊精、多糖、聚丙烯酰胺、聚乙烯醇(包括部分水解的聚乙酸乙烯酯)、聚乙烯醇乙酸酯、其衍生物及其混合物。
用于施用的溶液、悬浮液或乳液可以用维持适合于所选施用的pH所需的有效量进行缓冲。合适的缓冲剂是本领域技术人员众所周知的。有用的缓冲剂的一些实例是乙酸盐、硼酸盐、碳酸盐、柠檬酸盐和磷酸盐缓冲剂。用于局部例如眼部施用的溶液剂、混悬剂或乳液还可包含一种或多种张度剂以调节制剂的等渗范围。合适的张度剂是本领域众所周知的。一些例子包括甘油、甘露醇、山梨醇、氯化钠和其他电解质。
载剂的种类包括但不限于粘合剂、缓冲剂、着色剂、稀释剂、崩解剂、乳化剂、食用香料、助流剂、润滑剂、防腐剂、稳定剂、表面活性剂、压片剂和润湿剂。一些载剂可能被列在不止一类中,例如植物油可以在一些配制品中用作润滑剂,而在另一些配制品中用作稀释剂。示例性的药学上可接受的载剂包括糖、淀粉、纤维素、黄芪胶粉、麦芽、明胶、滑石粉和植物油。药物组合物中可以包含任选的活性剂,其基本上不干扰本发明的胞外蛋白降解剂的活性。
可以配制药物组合物/组合用于口服施用。这些组合物可含有实现所需结果的任何量的活性胞外蛋白降解剂,例如0.1至99重量%(wt.%)的胞外蛋白降解剂,并且通常至少约5wt.%的胞外蛋白降解剂。一些实施方案包含约25wt.%至约50wt.%或约5wt.%至约75wt.%的胞外蛋白降解剂。肠溶衣口服片剂也可用于增强口服给药途径的胞外蛋白降解剂的生物利用度。
适用于直肠施用的制剂通常以单位剂量栓剂形式存在。这些可以通过将活性胞外蛋白降解剂与一种或多种常规固体载剂例如可可脂混合,然后将所得混合物成型来制备。
本发明的胞外蛋白降解剂及其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药可以配制为剂量单位形式,以便于施用和剂量的均匀性。然而,应当理解,包含本文所述的胞外蛋白降解剂的组合物的总每日用量将由主治医师在合理的医学判断范围内决定。对于任何特定受试者或生物体的具体治疗有效剂量水平将取决于多种因素,包括所治疗的疾病、障碍或病症,以及病症的严重性;所使用的特定胞外蛋白降解剂的活性;使用的具体组合物;受试者的年龄、体重、总体健康、性别和饮食;所用特定胞外蛋白降解剂的施用时间、施用途径和排泄速率;治疗的持续时间;与所使用的特定胞外蛋白降解剂组合或同时使用的药物;以及医学领域众所周知的因素。
本文提供的胞外蛋白降解剂和组合物可以通过任何途径施用,包括肠内(例如,口服)、肠胃外、静脉内、肌内、动脉内、髓内、鞘内、皮下、心室内、经皮、皮间、直肠、阴道内、腹膜内、局部(如粉剂、软膏、乳膏和/或滴剂)、粘膜、鼻腔、口腔、舌下;通过气管内滴注、支气管滴注和/或吸入;和/或作为口腔喷雾剂、鼻喷雾剂和/或气雾剂。具体考虑的途径是口服施用、静脉内施用(例如全身静脉注射)、经由血液和/或淋巴供应的区域施用、和/或直接施用至受影响部位。一般而言,最合适的施用途径将取决于多种因素,包括药剂的性质(例如,其在胃肠道环境中的稳定性)、受试者的状况(例如,受试者是否能够耐受口服施用)。
达到有效量所需的胞外蛋白降解物的确切量因受试者而异,取决于例如受试者的物种、年龄和一般状况、副作用或障碍的严重程度、特定胞外蛋白降解剂的身份、施用方式等。可以使用医疗保健提供者确定的有用的任何频率来递送所需剂量,包括每天三次、每天两次、每天一次、每隔一天、每三天、每周、每两周、每三周或每四周一次。在某些实施例中,可以使用多次给予(例如,两次、三次、四次、五次、六次、七次、八次、九次、十次、十一次、十二次、十三次、十四次或更多次给予)来递送希望的剂量。
还应当理解,本文所述的胞外蛋白降解剂或组合物可以与一种或多种另外的治疗活性剂组合施用。胞外蛋白降解剂或组合物可以与另外的治疗活性剂组合施用,所述治疗活性剂改善它们的生物利用度、减少和/或改变它们的代谢、抑制它们的排泄、和/或改变它们在体内的分布。还应当理解,所采用的疗法可以实现对相同病症的期望效果(例如,胞外蛋白降解剂可以与抗炎剂、抗癌剂、免疫抑制剂等组合施用),和/或它可能实现不同的效果(例如,控制不良副作用,例如通过止吐剂控制呕吐)。
胞外蛋白降解剂或组合物可以与一种或多种另外的治疗活性剂同时、在其之前或在其之后施用。一般而言,每种药剂将以针对该药剂确定的剂量和/或时间表施用。还应当理解,用于该组合的另外的治疗活性剂可以在单一组合物中一起施用或在不同的组合物中单独施用。在方案中采用的具体组合将考虑本发明的胞外蛋白降解剂与另外的治疗活性剂的相容性和/或要实现的期望的治疗效果。一般而言,预期组合使用的另外的治疗活性剂的使用水平不超过它们单独使用的水平。在一些实施方案中,组合使用的水平将低于单独使用的水平。
示例性的另外的治疗活性剂包括但不限于有机小分子,例如药物化合物(例如,如联邦法规(CFR)中规定的由食品和药物管理局批准的化合物)、肽、蛋白质、碳水化合物、单糖、寡糖、多糖、核蛋白、粘蛋白、脂蛋白、合成多肽或蛋白质、与蛋白质连接的小分子、糖蛋白、类固醇、核酸、DNA、RNA、核苷酸、核苷、寡核苷酸、反义寡核苷酸、脂质、激素、维生素和细胞。在某些实施方案中,另外的治疗活性剂是抗癌剂,例如放射疗法和/或一种或多种化疗剂。
在某些方面,提供了治疗方案,其包括与至少组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物(例如氘代衍生物)或其前药与至少一种另外的治疗剂。可以施用组合和/或交替以获得在靶胞外蛋白介导的病症的治疗中的有益的、相加的或协同的效果。
IV.治疗方法
本发明的靶向胞外蛋白可包括但不限于免疫球蛋白、细胞因子、趋化因子、生长因子、凝血因子、细胞外基质蛋白和参与细胞外基质形成和/或降解的蛋白、酯酶、脂肪酶、肽酶、转化酶等。这些蛋白质介导一系列可用有效量的本文所述的结合ASGPR的胞外蛋白降解剂治疗的疾病。
免疫球蛋白介导的疾病
在某些方面,提供了治疗,所述治疗包括向患有免疫球蛋白介导的疾病的患者施用有效量的本发明的免疫球蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。
免疫球蛋白G IgG
免疫球蛋白G(IgG)是所有体液(例如血液和细胞外液)中发现的主要抗体类型,可防止细菌和病毒感染。它约占人类血清抗体的75%,因此是循环中最常见的抗体类型。IgG抗体是在抗体反应的类别转换和成熟之后产生的,因此它们主要参与二次免疫应答。(Vidarsson,Gestur;et al.,″IgG subclasses and allotypes:from structure toeffector functions″.Frontiers in Immunology,2014,5:520)。
IgG可分为4个不同的亚类(IgG1、IgG2、IgG3和IgG4)。在这两个种类中,IgG亚类在氨基酸水平上具有95%的相同性。相对较小的差异具有重要的功能差异。IgG子类开关的进化受到与T细胞相互作用的调节,并遵循单向方向(IgG3→IgG1→IgG2→IgG4)。(Valenzuela等人,“The Biology of IgG Subclasses and Their Clinical Relevanceto Transplantation”,Transplantation,;102(1S Suppl 1):S7-S13)差异主要在于铰链区的大小和构型、糖基化位点和结构,以及影响与补体和Fc相互作用的能力的一些关键氨基酸变化受体。这些变化,特别是铰链区的大小,对铰链处抗体的灵活性有影响。
IgG1和IgG3是单体(2条重链和2条轻链)和二价(2个可变区)。IgG2具有独特的二硫键模式,允许两个单体IgG2抗体通过独特的分子间二硫键形成二聚(和四价)结构。IgG4具有更独特的结构(同样由重链链内二硫键决定)。链内二硫键(有两个)可以被还原,从而生成单价结构。另外,单价结构可以重新形成二硫键,但可能不是相同的IgG4单价链;这意味着生成的IgG4将是二价单体,但具有两个不同的可变区。
通过结合病毒、细菌和真菌等多种病原体,IgG有助于保护身体免受感染。然而,异常的IgG活性与多种疾病有关,在这些疾病中,当本发明用于治疗已知主要由IgG引起的疾病时,如甲状腺眼病、重症肌无力、慢性炎性脱髓鞘性多发性神经病、温热自身免疫性溶血性贫血和1型自身免疫性胰腺炎,选择性靶向IgG可能特别有益。
在某些方面,提供由IgG介导的病症的治疗,包括向患者施用有效量的IgG降解剂或其药学上可接受的盐。在某些实施方案中,IgG病症选自抗磷脂抗体综合征、白塞综合征、桥本甲状腺炎、MGUS、坏死性黄色肉芽肿、类风湿关节炎、癌症例如多发性骨髓瘤或外周多发性骨髓瘤、副蛋白血症、慢性荨麻疹、硬皮病、硬化粘液水肿、血小板减少症例如肝素诱导的血小板减少症、冷球蛋白血症、肉芽肿性多血管炎例如ANCA相关性血管炎、特发性血小板减少性紫癜、血小板减少症、IgG4-RD、阵发性睡眠性血红蛋白尿(PNH)、温抗体型自身免疫性溶血性贫血、横纹肌溶解症、狼疮性肾炎、急性播散性脑脊髓炎、格林巴利综合征(Guillain-Barre syndrome)、慢性炎性脱髓鞘性多发性神经病变、米勒·费希尔综合征(Miller Fisher syndrome)、视神经脊髓炎谱系障碍、斜视眼阵挛肌阵挛综合征、与链球菌相关的小儿自身免疫性神经精神障碍(PANDAS)、周围神经病变、横贯性脊髓炎、纤维化、IPF/纤维化、和移植排斥。
在某些实施方案中,疾病由IgG介导。
免疫球蛋白G(IgG)介导一系列自身免疫性疾病、感染性疾病和代谢性疾病,包括全身性纤维炎症性疾病。此外,IgG4的过度表达与IgG4相关疾病有关,这些疾病通常涉及多个器官,包括1型自身免疫性胰腺炎、间质性肾炎、里德尔甲状腺炎(Riedel′sthyroiditis)、席纹状纤维化、米库利奇病、库特纳氏瘤(Küttner′s tumor)、炎性假瘤(在身体的各个部位)、纵隔纤维化、腹膜后纤维化(奥蒙德病(Ormond’s disease))、主动脉炎和主动脉周围炎、近端胆管狭窄、特发性低补体血症性肾小管间质性肾炎、多灶性纤维硬化症、硬脑膜炎、胰腺肿大、肿瘤样病变、心包炎、类风湿关节炎(RA)、炎症性肠病、多发性硬化、重症肌无力、强直性脊柱炎、原发性干燥综合征、银屑病关节炎、系统性红斑狼疮(SLE)、硬化性胆管炎、IgG单克隆丙种球蛋白病、意义不明的单克隆丙种球蛋白病(MGUS)、黑色素瘤、大疱性类天疱疮、古德帕斯彻氏病(Goodpasture′s disease)、脑炎、血栓性血小板减少性紫癜、慢性炎症性多发性神经病变、边缘叶脑炎、神经肌强直、莫文综合征(Morvansyndrome)、落叶型天疱疮、寻常型天疱疮、REM和非REM异睡症、和膜性肾病、多发性硬化、甲亢格雷夫氏病、获得性大疱性表皮松解症、妊娠期类天疱疮、抗p200类天疱疮、和副肿瘤性天疱疮,等等。
在某些实施方案中,疾病由IgA介导。
免疫球蛋白A(IgA)的异常表达会介导一系列自身免疫性和免疫介导的疾病,包括IgA肾病(也称为伯格氏病)、乳糜泻、克罗恩病、过敏性紫癜(HSP)(也称为IgA血管炎)、IgA天疱疮、疱疹样皮炎、炎性肠病(IBD);干燥综合征、强直性脊柱炎、酒精性肝硬化、获得性免疫缺陷综合征、IgA多发性骨髓瘤、α链疾病、IgA单克隆丙种球蛋白病、意义不明的单克隆丙种球蛋白病(MGUS)、线性IgA大疱性皮肤病、类风湿关节炎、溃疡性结肠炎、和原发性肾小球肾炎,等等。
免疫球蛋白E IgG
在某些实施方案中,疾病由IgE介导。
免疫球蛋白E(IgE)是过敏性疾病的强介质,包括但不限于特应性哮喘、过敏性鼻炎、特应性皮炎、皮肤接触性超敏反应、IgE介导的食物过敏、IgE介导的动物过敏、过敏性结膜炎、过敏性荨麻疹、过敏性休克、鼻息肉病、角结膜炎、肥大细胞增多症、嗜酸性胃肠道疾病、大疱性类天疱疮、化疗引起的过敏反应、季节性过敏性鼻炎、间质性膀胱炎、嗜酸性食管炎、血管性水肿、急性间质性肾炎、特应性湿疹、嗜酸性支气管炎、慢性阻塞性肺病、胃肠炎、高IgE综合征(乔布氏综合征(Job′s Syndrome))、IgE单克隆丙种球蛋白病、意义不明的单克隆丙种球蛋白病(MGUS)、寻常型天疱疮、粘膜类天疱疮、慢性荨麻疹、自身免疫性葡萄膜炎、类风湿性关节炎、自身免疫性胰腺炎和过敏性鼻结膜炎等。
另一些免疫球蛋白疾病
在某些实施方案中,疾病由多种免疫球蛋白介导。
免疫球蛋白介导的疾病的非限制性实例包括:系统性纤维炎性疾病、1型自身免疫性胰腺炎、间质性肾炎、里德尔甲状腺炎(Riedel′s thyroiditis)、席纹状纤维化、米库利奇病、库特纳氏瘤(Küttner′s tumor)、炎性假瘤(在身体的各个部位)、纵隔纤维化、腹膜后纤维化(奥蒙德病(Ormond’s disease))、主动脉炎和主动脉周围炎、近端胆管狭窄、特发性低补体血症性肾小管间质性肾炎、多灶性纤维硬化症、硬脑膜炎、胰腺肿大、肿瘤样病变、心包炎、类风湿关节炎(RA)、炎症性肠病、多发性硬化、重症肌无力、强直性脊柱炎、原发性干燥综合征、银屑病关节炎、系统性红斑狼疮(SLE)、硬化性胆管炎、IgG单克隆丙种球蛋白病、意义不明的单克隆丙种球蛋白病(MGUS)、黑色素瘤、大疱性类天疱疮、古德帕斯彻氏病(Goodpasture′s disease)、脑炎、血栓性血小板减少性紫癜、慢性炎症性多发性神经病变、边缘叶脑炎、神经肌强直、莫文综合征(Morvan syndrome)、落叶型天疱疮、寻常型天疱疮、REM和非REM异睡症、和膜性肾病、多发性硬化、甲亢格雷夫氏病、获得性大疱性表皮松解症、妊娠期类天疱疮、抗p200类天疱疮、副肿瘤性天疱疮、IgA肾病(也称为伯格氏病)、乳糜泻、克罗恩病、过敏性紫癜(HSP)(也称为IgA血管炎)、IgA天疱疮、疱疹样皮炎、炎性肠病(IBD);干燥综合征、强直性脊柱炎、酒精性肝硬化、获得性免疫缺陷综合征、IgA多发性骨髓瘤、α链疾病、IgA单克隆丙种球蛋白病、意义不明的单克隆丙种球蛋白病(MGUS)、线性IgA大疱性皮肤病、类风湿关节炎、溃疡性结肠炎、原发性肾小球肾炎、特应性哮喘、过敏性鼻炎、特应性皮炎、皮肤接触性超敏反应、IgE介导的食物过敏、IgE介导的动物过敏、过敏性结膜炎、过敏性荨麻疹、过敏性休克、鼻息肉病、角结膜炎、肥大细胞增多症、嗜酸性胃肠道疾病、大疱性类天疱疮、化疗引起的过敏反应、季节性过敏性鼻炎、间质性膀胱炎、嗜酸性食管炎、血管性水肿、急性间质性肾炎、特应性湿疹、嗜酸性支气管炎、慢性阻塞性肺病、胃肠炎、高IgE综合征(乔布氏综合征(Job′s Syndrome))、IgE单克隆丙种球蛋白病、意义不明的单克隆丙种球蛋白病(MGUS)、寻常型天疱疮、粘膜类天疱疮、慢性荨麻疹、自身免疫性葡萄膜炎、类风湿性关节炎、自身免疫性胰腺炎和过敏性鼻结膜炎等。
另一些疾病
免疫球蛋白还与各种复杂的蛋白质信号级联相关,例如补体级联,因此它们的降解可以治疗由这些蛋白质信号级联介导的疾病。可以通过本发明的化合物治疗的病症的另外的实例包括自身免疫、其它免疫功能障碍、补体介导的病症、异常细胞增殖、癌症、肿瘤、血液学相关病症、肾脏病症和肝脏病症。在某些实施方案中,所述病症由除免疫球蛋白之外的胞外蛋白介导,并且将降解该胞外蛋白的本发明化合物施用于有需要的患者。
在某些实施方案中,本文所述的降解剂或其盐或组合物用于治疗自身免疫性疾病。在一些方面,胞外蛋白是Ig,例如IgA或IgG。IgG降解可以治疗例如甲状腺眼病、重症肌无力、慢性炎症性脱髓鞘性多发性神经病和温热性自身免疫性溶血性贫血。
自身免疫性障碍的非限制性实例包括:狼疮、同种异体移植物排斥、自身免疫性甲状腺疾病(如格雷夫斯病和桥本甲状腺炎)、自身免疫性葡萄膜视网膜炎、巨细胞动脉炎、炎性肠病(包括克罗恩氏病(Crohn′s disease)、溃疡性结肠炎、局限性肠炎、肉芽肿性肠炎、回肠末端炎、局部性回肠炎、和末端回肠炎)、糖尿病、多发性硬化、恶性贫血、银屑病、类风湿关节炎、结节病、和硬皮病。
在一个实施方案中,本文所述的降解剂或其盐或组合物用于治疗狼疮。狼疮的非限制性实例包括红斑狼疮、皮肤狼疮、盘状红斑狼疮、冻疮红斑狼疮或红斑狼疮-扁平苔藓重叠综合征。红斑狼疮是包括全身性障碍和皮肤障碍的一般疾病类别。该疾病的全身形式可以具有皮肤和全身表现。然而,也有一些形式的疾病只是皮肤而没有全身受累。例如,SLE是一种病因不明的炎症性疾病,主要发生在女性中,其特征是关节症状、蝶形红斑、复发性胸膜炎、心包炎、全身淋巴结肿大、脾肿大以及中枢神经系统受累和进行性肾衰竭。大多数患者(超过98%)的血清含有抗核抗体,包括抗DNA抗体。高滴度的抗DNA抗体基本上对SLE具有特异性。这种疾病的常规治疗是施用皮质类固醇或免疫抑制剂。
有三种形式的皮肤狼疮:慢性皮肤狼疮(也称为盘状红斑狼疮或DLE)、亚急性皮肤狼疮和急性皮肤狼疮。DLE是毁容性慢性障碍,主要影响皮肤,具有界限分明的斑点和斑块,表现为红斑、毛囊堵塞、鳞屑、毛细血管扩张和萎缩。该病症常因日晒而诱发,早期病变为直径5至10mm的红斑性圆形鳞屑性丘疹,并且表现为滤泡性堵塞。DLE病变最常见于脸颊、鼻子、头皮和耳朵,但也可能泛发于躯干上部、四肢伸肌表面和口腔黏膜。如果不及时治疗,中央病变会萎缩并留下疤痕。与SLE不同,针对双链DNA的抗体(例如DNA结合测试)在DLE中几乎总是不存在。
多发性硬化症是一种自身免疫性脱髓鞘疾病,被认为是T淋巴细胞依赖性的。MS通常表现为复发-缓解过程或慢性进行性过程。MS的病因尚不清楚,但病毒感染、遗传易感性、环境和自身免疫似乎都与该疾病有关。MS患者的病变包含主要是T淋巴细胞介导的小胶质细胞和浸润性巨噬细胞的浸润。CD4+T淋巴细胞是这些病变中存在的主要细胞类型。MS病变的标志是斑块,这是与MRI扫描中常见的白质明显分界的脱髓鞘区域。MS斑块的组织学外观随疾病的不同阶段而变化。在活动性病变中,血脑屏障受损,从而允许血清蛋白外渗到细胞外空间。在血管周围袖套和整个白质中都可以看到炎性细胞。CD4+T细胞,尤其是Th1,聚集在斑块边缘的毛细血管后微静脉周围,也分散在白质中。在活动性病变中,还观察到粘附分子、以及淋巴细胞和单核细胞活化标志物(例如IL2-R和CD26)的上调。活动性病变中的脱髓鞘不伴有少突胶质细胞的破坏。相反,在疾病的慢性期,病变的特征是少突胶质细胞损失,因此血液中存在髓鞘少突胶质细胞糖蛋白(MOG)抗体。
糖尿病可以指1型或2型糖尿病。在一些实施方案中,以有效剂量提供本文所述的降解剂或其盐或组合物以治疗患有1型糖尿病的患者。在某些方面,以有效剂量提供本文所述的降解剂或其盐或组合物以治疗患有2型糖尿病的患者。
1型糖尿病是自身免疫性疾病。当身体抵抗感染的系统(免疫系统)转而对抗身体的一部分时,就会产生自身免疫性疾病。当胰腺受到免疫系统损害时,通常会发生1型糖尿病。受损的胰腺会产生很少的胰岛素或不产生胰岛素。
作为实例,本文所述的降解剂或其盐或组合物可用于治疗或预防选自以下的病症:自身免疫性卵巢炎、子宫内膜异位症、自身免疫性睾丸炎、奥德甲状腺炎、自身免疫性肠病、乳糜泻、桥本脑病、抗磷脂综合征(APLS)(Hughes综合征)、再生障碍性贫血、自身免疫性淋巴组织增生综合征(Canale-Smith综合征)、自身免疫性中性粒细胞减少症、埃文斯综合征、恶性贫血、纯红细胞再生障碍性贫血、血小板减少症、痛性脂肪病(Dercum病)、成人斯蒂尔病、强直性脊柱炎、CREST综合征、药物性狼疮、嗜酸性筋膜炎(舒尔曼综合征)、Felty综合征、IgG4相关疾病、混合结缔组织病(MCTD)、回文性风湿病(Hench-Rosenberg综合征)、Parry-Romberg综合征、Parsonage-Turner综合征、复发性多软骨炎(Meyenburg-Altherr-Uehlinger综合征)、腹膜后纤维化、风湿热、Schnitzler综合征、纤维肌痛、神经性肌强直(艾萨克病)、副肿瘤变性、自身免疫性内耳疾病、梅尼埃病、间质性膀胱炎、自身免疫性胰腺炎、寨卡病毒相关疾病、基孔肯雅病毒相关疾病、亚急性细菌性心内膜炎(SBE)、IgA肾病、IgA血管炎、风湿性多肌痛、类风湿性血管炎、斑秃、自身免疫性黄体酮皮炎、疱疹样皮炎、结节性红斑、妊娠性类天疱疮、化脓性汗腺炎、硬化性苔藓、线性IgA病(LAD)、硬斑病、肌炎、急性苔藓样糠疹、白癜风心肌梗塞后综合征(德累斯勒综合征)、心包切开术后综合征、自身免疫性视网膜病变、Cogan综合征、格雷夫斯眼病、木质结膜炎、蚕蚀性溃疡、眼阵挛性肌阵挛综合征、视神经炎、视网膜蜗脑血管病(Susac综合征)、交感性眼病、Tolosa-Hunt综合征、间质性肺病、抗合成酶综合征、阿狄森病、自身免疫性多内分泌综合征(APS)I型、自身免疫性多内分泌综合征(APS)II型、自身免疫性多内分泌综合征(APS)型III、播散性硬化症(多发性硬化症,II型)、急进性肾小球肾炎(RPGN)、幼年类风湿性关节炎、附着点炎相关性关节炎、反应性关节炎(赖特综合征)、自身免疫性肝炎或狼疮性肝炎、原发性胆汁性肝硬化(PBS)、原发性硬化症胆管炎、显微镜下结肠炎、潜伏性狼疮(未分化结缔组织病(UCTD))、急性播散性脑脊髓炎(ADEM)、急性运动轴突神经病、抗N-甲基-D-天冬氨酸受体脑炎、Balo同心圆硬化症(Schilders病)、Bickerstaff氏病脑炎、慢性炎症性脱髓鞘性多发性神经病、特发性炎症性脱髓鞘病、Lambert-Eaton肌无力综合征、奥什托兰综合征、与链球菌相关的小儿自身免疫性神经精神疾病(PANDAS)、进行性炎症性神经病、不宁腿综合征、僵人综合征、Sydenhem综合征、横贯性脊髓炎、狼疮性血管炎、白细胞破碎性血管炎、显微镜下多血管炎、多发性肌炎或眼部缺血再灌注损伤。
在一些方面,由本文所述的降解剂或其盐或组合物治疗的病症选自脂肪肝和源自脂肪肝的病症,例如非酒精性脂肪性肝炎(NASH)、肝脏炎症、肝硬化和肝衰竭。
在另一些实施方案中,本文所述的降解剂或其盐或组合物用于在手术或其他医疗程序之前或期间调节免疫应答。非限制性实例是与急性或慢性移植物抗宿主病相关的用途,其是同种异体组织移植导致的常见并发症,并且也可能由于输血而发生。
在某些实施方案中,本发明提供了通过向有需要的受试者施用有效量的本文所述的降解剂或其盐或组合物来治疗或预防皮肌炎的方法。
在某些实施方案中,本发明提供了通过向有需要的受试者施用有效量的本文所述的降解剂或其盐或组合物来治疗或预防肌萎缩侧索硬化症的方法。
在某些实施方案中,本发明提供了通过向有需要的受试者施用有效量的本文所述的降解剂或其盐或组合物来治疗或预防腹主动脉瘤、血液透析并发症、溶血性贫血或血液透析的方法。
在某些实施方案中,提供了通过施用有效量的如本文所述的降解物或其盐或组合物来治疗或预防宿主中响应于药物或生物治疗剂(例如CAR T细胞疗法或单克隆抗体疗法)的细胞因子或炎症反应的方法。多种类型的细胞因子或炎性反应可能会因多种因素而发生,例如生物治疗的施用。在某些方面,细胞因子或炎症反应是细胞因子释放综合征。在一种实施方式中,细胞因子或炎症反应是肿瘤溶解综合征(其也导致细胞因子释放)。细胞因子释放综合征的症状范围从发烧、头痛和皮疹到支气管痉挛、低血压甚至心脏骤停。严重的细胞因子释放综合征被描述为细胞因子风暴,并且可能是致命的。
在另一个实施方案中,障碍是巩膜外层炎、特发性巩膜外层炎、前巩膜外层炎或后巩膜外层炎。在一个实施方案中,所述病症是特发性前葡萄膜炎、HLA-B27相关葡萄膜炎、疱疹性角膜葡萄膜炎、Posner Schlossman综合征、Fuch氏异色性虹膜睫状体炎或巨细胞病毒前葡萄膜炎。
在另一个实施方案中,本发明提供了通过向有需要的受试者施用有效量的本文所述的降解剂或其盐或组合物来治疗或预防C3肾病的方法。在一种实施方式中,所述病症选自致密沉积病(DDD)和C3肾小球肾炎(C3GN)。
在又一个实施方案中,本发明提供了通过向有需要的受试者施用有效量的本文所述的降解剂或其盐或组合物来治疗或预防IC-MPGN的方法。
在另一个实施方案中,本发明提供了通过向有需要的受试者施用有效量的本文所述的降解剂或其盐或组合物来治疗或预防阵发性睡眠性血红蛋白尿(PNH)的方法。
在另一个实施方案中,本发明提供了通过向有需要的受试者施用有效量的本文所述的降解剂或其盐或组合物来治疗或预防年龄相关性黄斑变性(AMD)的方法。
在一个实施方案中,本发明提供了一种通过向有需要的受试者施用有效量的本文所述的降解剂或其盐或组合物来治疗或预防类风湿性关节炎的方法。
在一个实施方案中,本发明提供了一种通过向有需要的受试者施用有效量的本文所述的降解剂或其盐或组合物来治疗或预防多发性硬化症的方法。
在一个实施方案中,本发明提供了一种通过向有需要的受试者施用有效量的本文所述的降解剂或其盐或组合物来治疗或预防重症肌无力的方法。
在一个实施方案中,本发明提供了一种通过向有需要的受试者施用有效量的本文所述的降解剂或其盐或组合物来治疗或预防非典型溶血性尿毒症综合征(aHUS)的方法。
在一个实施方案中,本发明提供了一种通过向有需要的受试者施用有效量的本文所述的降解剂或其盐或组合物来治疗或预防视神经脊髓炎(NMO)的方法。
在另一些实施方案中,本发明提供了通过向有需要的受试者施用有效量的本文所述的降解剂或其盐或组合物来治疗或预防如下所述的病症的方法,包括:例如:玻璃体炎、结节病、梅毒、结核病、或莱姆病;视网膜血管炎、视网膜静脉周围炎、结核病、梅毒、或弓形虫病;视神经网膜炎、病毒性视网膜炎、或急性视网膜坏死;水痘带状疱疹病毒、单纯疱疹病毒、巨细胞病毒、EB病毒、扁平苔藓或登革热相关疾病(例如出血性登革热);伪装综合征、接触性皮炎、创伤引起的炎症、UVB引起的炎症、湿疹、环状肉芽肿、或痤疮。
在另外的实施方案中,该病症选自:急性心肌梗死、动脉瘤、心肺转流、扩张型心肌病、心肺转流手术中补体活化、冠状动脉疾病、支架置入后再狭窄、或经皮腔内冠状动脉成形术(PTCA);抗体介导的移植排斥、过敏性休克、过敏反应、异基因移植、体液和血管移植排斥反应、移植物功能不良、移植物抗宿主病、格雷夫斯病、药物不良反应、或慢性移植物血管病变;过敏性支气管肺曲霉病、过敏性神经炎、药物过敏、放射性肺损伤、嗜酸性粒细胞性肺炎、射线造影剂过敏、闭塞性细支气管炎、或间质性肺炎;帕金森症-痴呆症复合体、散发性额颞叶痴呆、与17号染色体相关的帕金森症额颞叶痴呆、额颞叶变性、缠结性痴呆、大脑淀粉样血管病、脑血管障碍、某些形式的额颞叶痴呆、慢性创伤性脑病变(CTE)、帕金森病痴呆(PDD)、嗜银颗粒痴呆、拳击员痴呆、路易体痴呆(DLB)、或多梗死性痴呆;克雅氏病、亨廷顿病、多灶性运动神经病(MMN)、朊病毒蛋白脑淀粉样血管病、多发性肌炎、脑炎后帕金森病、亚急性硬化性全脑炎、伴有神经原纤维缠结的非关岛运动神经元病、神经再生或伴有钙化的弥漫性神经原纤维缠结。
在进一步的实施方案中,该病症选自:特应性皮炎、皮炎、皮肌炎、大疱性类天疱疮、硬皮病、硬皮肌炎、银屑病关节炎、寻常型天疱疮、盘状红斑狼疮、皮肤狼疮、冻疮性红斑狼疮或红斑狼疮-扁平苔藓重叠综合征;冷球蛋白血症性血管炎、肠系膜/肠血管疾病、外周血管疾病、抗中性粒细胞胞质抗体(ANCA)相关性血管炎(AAV)、IL-2诱导的血管渗漏综合征或免疫复合物血管炎;血管性水肿、低血小板(HELLP)综合征、镰状细胞病、血小板难治性、红细胞管型或典型或传染性溶血性尿毒症综合征(tHUS);血尿、失血性休克、药物引起的血小板减少症、自身免疫性溶血性贫血(AIHA)、氮血症、血管和/或淋巴管炎症、冠状动脉旋磨术、或迟发性溶血性输血反应;英国型淀粉样血管病、布尔格氏病(Buerger′s disease)、大疱性类天疱疮、C1q肾病、癌症或灾难性抗磷脂综合征。
在另一些实施方案中,该病症选自:湿性(渗出性)AMD、干性(非渗出性)AMD、脉络膜视网膜变性、脉络膜新生血管(CNV)、脉络膜炎、RPE功能丧失、视觉丧失(包括视力或视野丧失)、AMD导致视觉丧失、光暴露引起的视网膜损伤、视网膜变性、视网膜脱离、视网膜功能障碍、视网膜新生血管(RNV)、早产儿视网膜病变、病理性近视、或RPE变性;假晶状体大疱性角膜病、症状性黄斑变性相关障碍、视神经变性、光感受器变性、锥体变性、光受体细胞丧失、睫状体平坦部炎、巩膜炎、增生性玻璃体视网膜病变、或形成眼黄斑;慢性荨麻疹、Churg-Strauss综合征、冷凝集素病(CAD)、皮质基底节变性(CBD)、冷球蛋白血症、睫状体炎、布鲁赫膜损伤(damage of the Bruch′s membrane)、德戈斯病(Degos disease)、糖尿病性血管病、肝酶升高、内毒素血症、大疱性表皮松解症或获得性大疱性表皮松解症;原发性混合冷球蛋白血症、血尿素氮过高、局灶节段性肾小球硬化、Gerstmann-Straussler-Scheinker病、巨细胞动脉炎、痛风、Hallervorden-Spatz病、桥本甲状腺炎、过敏性紫癜肾炎或尿沉渣异常;肝炎、甲型肝炎、乙型肝炎、丙型肝炎或人类免疫缺陷病毒(HIV),更一般地病毒感染,例如选自黄病毒科、逆转录病毒、冠状病毒科、痘病毒科、腺病毒科、疱疹病毒科、杯状病毒科、呼肠孤病毒科、小核糖核酸病毒科、披膜病毒科、正粘病毒科,弹状病毒科,或嗜肝DNA病毒科;脑膜炎奈瑟氏菌(Neisseria meningitidis)、志贺毒素大肠杆菌相关溶血性尿毒症综合征(STEC-HUS)、溶血性尿毒症综合征(HUS);链球菌,或链球菌后肾小球肾炎。
在进一步的实施方案中,该病症选自:高脂血症、高血压、低白蛋白血症、低血容量性休克、低互补性荨麻疹血管炎综合征、低磷酸盐血症(hypophosphastasis)、低血容量性休克、特发性肺炎综合征、或特发性肺纤维化;包涵体肌炎、肠缺血、虹膜睫状体炎、虹膜炎、青少年慢性关节炎、川崎病(动脉炎)、或脂肪尿;膜增生性肾小球肾炎(MPGN)I,显微镜下多血管炎、混合性冷球蛋白血症、A型钼辅因子缺乏症(MoCD)、胰腺炎、脂膜炎、皮克氏病(Pick′s disease)、结节性多动脉炎(PAN)、进行性皮质下胶质增生症、蛋白尿、肾小球滤过率降低(GFR)、或肾血管障碍;多器官衰竭、多系统萎缩(MSA)、强直性肌营养不良、尼曼-匹克氏病C型(Niemann-Pick disease type C)、慢性脱髓鞘疾病、或进行性核上性麻痹;脊髓损伤、脊髓性肌萎缩、脊柱关节病、莱特尔氏综合征(Reiter′s syndrome)、自发性流产、反复流产、先兆子痫、突触核蛋白病、高安动脉炎(Takayasu′s arteritis)、产后甲状腺炎、甲状腺炎、I型冷球蛋白血症、II型混合冷球蛋白血症、Type III混合性冷球蛋白血症、溃疡性结肠炎、尿毒症、荨麻疹、静脉气体栓塞(VGE)或韦格纳肉芽肿病;小脑视网膜血管瘤(vonHippel-Lindau disease)、眼组织胞浆菌病、硬性玻璃膜疣、软性玻璃膜疣、色素结块、或感光器和/或视网膜色素上皮细胞(RPE)损失。
可以根据本文公开的组合物和方法治疗的眼部病症的实例包括阿米巴角膜炎、真菌性角膜炎、细菌性角膜炎、病毒性角膜炎、盘盘性角膜炎、细菌性角结膜炎、病毒性角结膜炎、角膜营养不良性疾病、福克斯内皮营养不良、干燥综合征、史蒂文斯-约翰逊综合征、自身免疫性干眼病、环境性干眼病、角膜新生血管疾病、角膜移植后排斥反应的预防和治疗、自身免疫性葡萄膜炎、感染性葡萄膜炎、后葡萄膜炎(包括弓形虫病)、全葡萄膜炎、眼部炎症性疾病玻璃体或视网膜、眼内炎预防和治疗、黄斑水肿、黄斑变性、年龄相关性黄斑变性、增殖性和非增殖性糖尿病视网膜病变、高血压性视网膜病变、视网膜自身免疫性疾病、原发性和转移性眼内黑色素瘤、其他眼内转移性肿瘤、开放角型青光眼、闭角型青光眼、色素性青光眼及其组合。
在另一些实施方案中,所述病症选自青光眼、糖尿病性视网膜病、起泡性皮肤病(包括大疱性类天疱疮、天疱疮和大疱性表皮松解症)、眼部瘢痕性类天疱疮、葡萄膜炎、成人黄斑变性、糖尿病性视网膜病变、色素性视网膜炎、黄斑水肿、糖尿病性黄斑水肿、白塞葡萄膜炎(Behcet′s uveitis)、多灶性脉络膜炎、Vogt-Koyangi-Harada综合征、立即葡萄膜炎、鸟弹状视网膜脉络膜炎、交感性眼炎、眼部双尖性类天疱疮、眼部天疱疮、非动脉性缺血性视神经病变、术后炎症、视网膜静脉阻塞或视网膜中央静脉阻塞(CVRO)。
可以通过本文所述的降解剂或其盐或组合物治疗或预防的病症还包括但不限于:遗传性血管性水肿、毛细血管渗漏综合征、溶血性尿毒症综合征(HUS)、神经系统障碍、格林巴利综合征(Guillain Barre Syndrome)、中枢神经系统疾病和其他神经退行性病症、肾小球肾炎(包括膜增生性肾小球肾炎)、SLE肾炎、增生性肾炎、肝纤维化、组织再生和神经再生、或巴拉克尔-西蒙斯综合征(Barraquer-Simons Syndrome);脓毒症的炎症作用、全身炎症反应综合征(SIRS)、不适当或不希望的补体活化障碍、IL-2治疗期间白细胞介素2诱导的毒性、炎性障碍、自身免疫性疾病的炎症、系统性红斑狼疮(SLE)、狼疮性肾炎、关节炎、免疫复合物障碍和自身免疫性疾病、全身性狼疮、或红斑狼疮;缺血/再灌注损伤(I/R损伤)、心肌梗死、心肌炎、缺血后再灌注病症、球囊血管成形术、动脉粥样硬化、心肺转流或肾转流(renal bypass)中的泵后综合征、肾缺血、主动脉重建后的肠系膜动脉再灌注、抗磷脂综合征、自身免疫性心脏病、缺血再灌注损伤、肥胖症、或糖尿病;阿尔茨海默痴呆、中风、精神分裂症、创伤性脑损伤、创伤、帕金森病、癫痫、移植排斥、预防流产、生物材料反应(例如血液透析、植入)、超急性同种异体移植排斥、异种移植排斥、移植、牛皮癣、烧伤、热损伤,包括烧伤或冻伤,或挤压伤;哮喘、过敏、急性呼吸窘迫综合征(ARDS)、囊性纤维化、成人呼吸窘迫综合征、呼吸困难、咯血、慢性阻塞性肺病(COPD)、肺气肿、肺栓塞和梗塞、肺炎、纤维性粉尘病、惰性粉尘和矿物质(例如,硅、煤尘、铍和石棉)、肺纤维化、有机粉尘病、化学损伤(由于刺激性气体和化学品,例如氯、光气、二氧化硫、硫化氢、二氧化氮、氨和盐酸)、烟雾损伤、热损伤(例如烧伤、冻伤)、支气管收缩、过敏性肺炎、寄生虫病、古德帕斯彻综合征(Goodpasture′s Syndrome)(抗肾小球基底膜肾炎)、肺血管炎、少免疫性血管炎或免疫复合物相关炎症。
在另一个实施方案中,提供了治疗宿主中镰状细胞的方法,其包括施用有效量的本文所述的降解剂或其盐或组合物。在一个实施方案中,提供了一种治疗宿主的免疫性血小板减少性紫癜(ITP)、血栓性血小板减少性紫癜(TTP)或特发性血小板减少性紫癜(ITP)的方法,所述方法包括施用有效量的降解剂或其盐或如本文所述的组合物。在一个实施方案中,提供了一种用于治疗宿主中的ANCA-血管炎的方法,所述方法包括施用有效量的本文所述的降解剂或其盐或组合物。在一个实施方案中,提供了一种用于治疗宿主的IgA肾病的方法,所述方法包括施用有效量的本文所述的降解剂或其盐或组合物。在一个实施方案中,提供了一种治疗宿主的快速进展性肾小球肾炎(RPGN)的方法,所述方法包括施用有效量的本文所述的降解剂或其盐或组合物。在一个实施方案中,提供了一种治疗宿主的狼疮性肾炎的方法,所述方法包括施用有效量的本文所述的降解剂或其盐或组合物。在一个实施方案中,提供了一种治疗宿主的出血性登革热的方法,所述方法包括施用有效量的本文所述的降解剂或其盐或组合物。
在另一些方面,有效量的本文所述的降解剂或其盐或组合物用于治疗异常增殖病症例如肿瘤或癌症。
可以根据本发明治疗的癌症的非限制性实例包括但不限于听神经瘤、腺癌、肾上腺癌、肛门癌、血管肉瘤(例如,淋巴管肉瘤、淋巴管内皮肉瘤、血管肉瘤)、阑尾癌、良性癌单克隆丙种球蛋白病、胆管癌(例如胆管癌)、膀胱癌、乳腺癌(例如乳腺腺癌、乳腺乳头状癌、乳腺癌、乳腺髓样癌)、脑癌(例如脑膜瘤;神经胶质瘤,例如神经胶质瘤)、星形细胞瘤、少突胶质细胞瘤;髓母细胞瘤)、支气管癌、类癌、宫颈癌(例如宫颈腺癌)、绒毛膜癌、脊索瘤、颅咽管瘤、结直肠癌(例如结肠癌、直肠癌、结直肠腺癌)、上皮癌、室管膜瘤、内皮肉瘤(例如卡波西肉瘤)、多发性特发性出血性肉瘤)、子宫内膜癌(例如子宫癌、子宫肉瘤)、食道癌(例如食道腺癌、巴雷特腺癌)、尤文氏肉瘤、眼癌(例如眼内黑色素瘤、视网膜母细胞瘤)、熟悉的嗜酸性粒细胞增多症,胆囊癌、胃癌(例如胃腺癌)、胃肠道间质瘤(GIST)、头颈癌(例如头颈鳞状细胞癌)、口腔癌(例如口腔鳞状细胞癌(OSCC)、喉癌(例如,喉癌、咽癌、鼻咽癌、口咽癌))、造血系统癌症(例如白血病,如急性淋巴细胞白血病(ALL)-也称为急性淋巴细胞白血病或急性淋巴细胞白血病(例如B细胞ALL、T-细胞ALL)、急性粒细胞白血病(AML)(例如B细胞AML、T细胞AML)、慢性粒细胞白血病(CML)(例如B细胞CML、T细胞CML)和慢性淋巴细胞白血病(CLL)(例如B细胞CLL、T细胞CLL);淋巴瘤,例如霍奇金淋巴瘤(HL)(例如,B细胞HL、T细胞HL)和非霍奇金淋巴瘤(NHL)(例如,B细胞NHL,例如弥漫性大细胞淋巴瘤(DLCL)(例如,弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL))、滤泡性淋巴瘤、慢性淋巴细胞白血病/小淋巴细胞淋巴瘤(CLL/SLL)、套细胞淋巴瘤(MCL)、边缘区B细胞淋巴瘤(例如粘膜相关淋巴组织(MALT)淋巴瘤)、淋巴结边缘区B细胞淋巴瘤、脾边缘区B细胞淋巴瘤、原发性纵隔B细胞淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、淋巴浆细胞淋巴瘤(即“华氏巨球蛋白血症”)、毛细胞白血病(HCL)、免疫母细胞大细胞淋巴瘤、前体B淋巴母细胞淋巴瘤和原发性中枢神经系统(CNS)淋巴瘤;和T细胞NHL,例如前体T淋巴细胞淋巴瘤/白血病、外周T细胞淋巴瘤(PTCL)(例如皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)(例如蕈样肉芽肿、Sezary综合征)、血管免疫母细胞T细胞淋巴瘤、结外自然杀伤T细胞淋巴瘤、肠病型T细胞淋巴瘤、皮下脂膜炎样T细胞淋巴瘤、间变性大细胞淋巴瘤;如上所述的一种或多种白血病/淋巴瘤的混合物;和多发性骨髓瘤(MM))、重链疾病(例如α链疾病、γ链疾病、mu链疾病)、血管母细胞瘤、炎性肌纤维母细胞肿瘤、免疫细胞淀粉样变性、肾癌(例如肾母细胞瘤又名Wilms肿瘤、肾细胞癌)、肝癌(例如肝细胞癌(HCC)、恶性肝癌)、肺癌(例如支气管癌、小细胞肺癌(SCLC)、非小细胞肺癌(NSCLC)、肺腺癌)、平滑肌肉瘤(LMS)、肥大细胞增多症(例如系统性肥大细胞增多症)、骨髓增生异常综合征(MDS)、间皮瘤、骨髓增殖性疾病(MPD)(例如真性红细胞增多症(PV)、原发性血小板增多症(ET)、不明原因性骨髓化生(AMM),又称骨髓纤维化(MF)、慢性特发性骨髓纤维化、慢性粒细胞白血病(CML)、慢性中性粒细胞白血病(CNL)、嗜酸性粒细胞增多综合征(HES))、神经母细胞瘤、神经纤维瘤(例如,神经纤维瘤病(NF)1型或2型、神经鞘瘤病)、神经内分泌癌(例如,神经内分泌癌)、胃肠胰神经内分泌肿瘤(GEP-NET)、类癌)、骨肉瘤、卵巢癌(例如囊腺癌、卵巢胚胎癌、卵巢腺癌)、乳头状腺癌、胰腺癌(例如胰腺腺癌、导管内乳头状粘液性肿瘤(IPMN)、胰岛细胞瘤)、阴茎癌(如阴茎和阴囊佩吉特病)、松果体瘤、原始神经外胚层肿瘤(PNT)、前列腺癌(如前列腺腺癌)、直肠癌、横纹肌肉瘤、唾液腺癌、皮肤癌(如前列腺癌)、鳞状细胞癌(SCC)、角化棘皮瘤(KA)、黑色素瘤、基底细胞癌(BCC))、小肠癌(例如阑尾癌)、软组织肉瘤(例如恶性纤维组织细胞瘤(MFH)、脂肪肉瘤、恶性外周血神经鞘瘤(MPNST)、软骨肉瘤、纤维肉瘤、粘液肉瘤、皮脂腺癌、汗腺癌、滑膜瘤、睾丸癌(例如精原细胞瘤、睾丸胚胎癌)、甲状腺癌(例如甲状腺乳头状癌、甲状腺乳头状癌)(PTC)、甲状腺髓样癌)、尿道癌、阴道癌和外阴癌(例如外阴佩吉特病)。
在另一个实施方案中,该病症是骨髓增生异常综合征(MDS)。
在某些实施方案中,癌症是造血系统癌症。在某些实施方案中,造血系统癌症是淋巴瘤。在某些实施方案中,造血系统癌症是白血病。在某些实施方案中,白血病是急性粒细胞白血病(AML)。
在某些实施方案中,增殖性疾病是骨髓增殖性肿瘤。在某些实施方案中,骨髓增生性肿瘤(MPN)是原发性骨髓纤维化(PMF)。
在某些实施例中,癌症是实体瘤。如本文所用,实体瘤是指通常不包含囊肿或液体区域的异常组织块。不同类型的实体瘤因形成它们的细胞类型而命名。实体瘤类别的实例包括但不限于肉瘤、癌和淋巴瘤,如本文上文所述。实体瘤的其他实例包括但不限于鳞状细胞癌、结肠癌、乳腺癌、前列腺癌、肺癌、肝癌、胰腺癌和黑素瘤。
异常细胞增殖特别是过度增殖可由多种因素引起,包括基因突变、感染、接触毒素、自身免疫性疾病和良性或恶性肿瘤诱导。
有许多皮肤病与细胞过度增殖有关。例如,牛皮癣是人类皮肤的一种良性疾病,通常以斑块覆盖着增厚的鳞屑为特征。该疾病是由不明原因的表皮细胞增殖增加引起的。慢性湿疹也与表皮的显著过度增殖有关。由皮肤细胞过度增殖引起的其他疾病包括特应性皮炎、扁平苔藓、疣、寻常天疱疮、光化性角化病、基底细胞癌和鳞状细胞癌。
另一些过度增殖性细胞病症包括血管增殖病症、纤维化病症、自身免疫病症、移植物抗宿主排斥、肿瘤和癌症。
血管增殖病症包括血管生成性疾病和血管形成性疾病。在血管组织中形成斑块的过程中平滑肌细胞的增殖导致例如再狭窄、视网膜病和动脉粥样硬化。细胞迁移和细胞增殖都在动脉粥样硬化病变的形成中发挥作用。
纤维化疾病通常是由于细胞外基质的异常形成所致。纤维化病症的实例包括肝硬化和系膜增殖细胞病症。肝硬化的特征在于细胞外基质成分的增加导致肝疤痕的形成。肝硬化可引起肝的硬化等疾病。导致肝疤痕的细胞外基质增加也可能由病毒感染如肝炎引起。脂肪细胞似乎在肝硬化中起主要作用。
系膜疾病是由系膜细胞异常增殖引起的。系膜过度增殖性细胞病症包括各种人类肾脏疾病,例如肾小球肾炎、糖尿病肾病、恶性肾硬化、血栓性微血管病综合征、移植排斥和肾小球病。
另一种具有增殖成分的疾病是类风湿性关节炎。类风湿性关节炎通常被认为是一种自身免疫性疾病,被认为与自身反应性T细胞的活性有关,并且是由针对胶原蛋白和IgE产生的自身抗体引起的。
另一些可能包括异常细胞增殖成分的疾病包括Bechet综合征、急性呼吸窘迫综合征(ARDS)、缺血性心脏病、透析后综合征、白血病、获得性免疫缺陷综合征、血管炎、脂质组织细胞增生症、感染性休克和一般炎症。
在某些实施方案中,病症与免疫应答相关。
皮肤接触性超敏反应和哮喘只是可能与显著发病率相关的免疫反应的两个例子。其他包括特应性皮炎、湿疹、干燥综合征,包括继发于干燥综合征的干燥性角膜结膜炎、斑秃、因节肢动物咬伤反应引起的过敏反应、克罗恩病、口疮性溃疡、虹膜炎、结膜炎、角膜结膜炎、溃疡性结肠炎、皮肤红斑狼疮、硬皮病、阴道炎、直肠炎和药疹。这些情况可能会导致以下任何一种或多种症状或体征:瘙痒、肿胀、发红、水泡、结痂、溃疡、疼痛、鳞屑、开裂、脱发、疤痕或涉及皮肤、眼睛或粘膜的液体渗出。
在特应性皮炎和一般湿疹中,免疫介导的白细胞浸润(特别是单核细胞、淋巴细胞、中性粒细胞和嗜酸性粒细胞的浸润)进入皮肤对这些疾病的发病机制有重要贡献。慢性湿疹也与表皮的显著过度增殖有关。免疫介导的白细胞浸润也发生在皮肤以外的部位,例如哮喘的气道和干燥性角膜结膜炎的泪腺。
在另一些非限制性实施方案中,本发明的降解剂用作治疗接触性皮炎、特应性皮炎、湿疹性皮炎、银屑病、干燥综合征(包括干燥综合征继发的干燥性角膜结膜炎)、斑秃、由节肢动物叮咬反应引起的过敏反应、克罗恩病、口疮性溃疡、虹膜炎、结膜炎、角膜结膜炎、溃疡性结肠炎、哮喘、过敏性哮喘、皮肤红斑狼疮、硬皮病、阴道炎、直肠炎和药疹的局部药剂。这种新方法也可用于减少蕈样真菌病等疾病中恶性白细胞对皮肤的浸润。这些化合物也可用于治疗患者的缺水性干眼症(例如免疫介导的角膜结膜炎),方法是将化合物局部施用于眼部。
可以通过本发明公开的化合物单独或与至少一种另外的抗癌剂组合治疗的示例性癌症包括鳞状细胞癌、基底细胞癌、腺癌、肝细胞癌和肾细胞癌、膀胱癌、肠癌、乳房癌、子宫颈癌、结肠癌、食道癌、头部癌、肾癌、肝癌、肺癌、颈部癌、卵巢癌、胰腺癌、前列腺癌和胃癌;白血病;良性和恶性淋巴瘤,特别是伯基特淋巴瘤和非霍奇金淋巴瘤;良性和恶性黑色素瘤;骨髓增生性疾病;肉瘤,包括尤文肉瘤、血管肉瘤、卡波西肉瘤、脂肪肉瘤、肌肉瘤、周围神经上皮瘤、滑膜肉瘤、神经胶质瘤、星形细胞瘤、少突胶质细胞瘤、室管膜瘤、胶质母细胞瘤、神经母细胞瘤、神经节神经瘤、神经节胶质细胞瘤、髓母细胞瘤、松果体细胞瘤,脑膜瘤、脑膜肉瘤、神经纤维瘤、和神经鞘瘤;肠癌、乳腺癌、前列腺癌、宫颈癌、子宫癌、肺癌、卵巢癌、睾丸癌、甲状腺癌、星形细胞瘤、食道癌、胰腺癌、胃癌、肝癌、结肠癌、黑色素瘤;癌肉瘤、霍奇金病、肾母细胞瘤和畸胎癌。可以使用根据本发明公开的化合物治疗的另外的癌症包括例如急性粒细胞白血病、急性淋巴细胞白血病(ALL)、急性髓性白血病(AML)、腺癌、腺肉瘤、肾上腺癌、肾上腺皮质癌、肛门癌、间变性星形细胞瘤、血管肉瘤、阑尾癌、星形细胞瘤、基底细胞癌、B细胞淋巴瘤、胆管癌、膀胱癌、骨癌、骨髓癌、肠癌、脑癌、脑干胶质瘤、乳腺癌、三联(雌激素)、孕激素和HER-2)阴性乳腺癌、双阴性乳腺癌(雌激素、孕激素和HER-2中的两种阴性)、单阴性(雌激素、孕激素和HER-2中的一种阴性)、雌激素受体阳性、HER2阴性乳腺癌、雌激素受体阴性乳腺癌、雌激素受体阳性乳腺癌、转移性乳腺癌、管腔A型乳腺癌、管腔B型乳腺癌、Her2阴性乳腺癌、HER2阳性或阴性乳腺癌、孕激素受体-阴性乳腺癌、孕激素受体阳性乳腺癌、复发性乳腺癌、类癌、宫颈癌、胆管癌、软骨肉瘤、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性粒细胞性白血病(CML)、结肠癌、结直肠癌、颅咽管瘤、皮肤淋巴瘤、皮肤黑色素瘤、弥漫性星形细胞瘤、导管原位癌(DCIS)、子宫内膜癌、室管膜瘤、上皮样肉瘤、食道癌、尤文肉瘤、肝外胆管癌、眼癌、输卵管癌、纤维肉瘤、胆囊癌、胃癌、胃肠道癌、胃肠道类癌、胃肠道间质瘤(GIST)、生殖细胞肿瘤多形性胶质母细胞瘤(GBM)、神经胶质瘤、毛细胞白血病、头颈癌、血管内皮瘤、霍奇金淋巴瘤、下咽癌、浸润性导管癌(IDC)、浸润性小叶癌(ILC)、炎性乳腺癌(IBC)、肠癌、肝内胆管癌、侵袭性/浸润性乳腺癌、胰岛细胞癌、颌癌、卡波西肉瘤、肾癌、喉癌、平滑肌肉瘤、软脑膜转移瘤、白血病、唇癌、脂肪肉瘤、肝癌、小叶原位癌、低度星形细胞瘤、肺癌、淋巴结癌、淋巴瘤、男性乳腺癌、髓样癌、髓母细胞瘤、黑色素瘤、脑膜瘤、默克尔细胞癌、间质软骨肉瘤、间质瘤、间皮瘤、转移性乳腺癌、转移性黑色素瘤、转移性鳞状颈癌、混合性胶质瘤、单胚层畸胎瘤、口腔癌、粘液癌、粘膜黑色素瘤、多发性骨髓瘤、蕈样肉芽肿、骨髓增生异常综合征、鼻腔癌、鼻咽癌、颈部癌、神经母细胞瘤、神经内分泌癌肿瘤(NET)、非霍奇金淋巴瘤、非小细胞肺癌(NSCLC)、燕麦细胞癌、眼癌、眼黑色素瘤、少突胶质细胞瘤、口腔癌、口腔癌、口咽癌、成骨肉瘤、骨肉瘤、卵巢癌、卵巢上皮癌、卵巢生殖细胞肿瘤、卵巢原发性腹膜癌、卵巢性索间质瘤、佩吉特病、胰腺癌、乳头状癌、鼻窦癌、甲状旁腺癌、盆腔癌、阴茎癌、周围神经癌、腹膜癌、咽癌、嗜铬细胞瘤、毛细胞星形细胞瘤、松果体区肿瘤、松果体母细胞瘤、垂体癌、原发性中枢神经系统(CNS)淋巴瘤、前列腺癌、直肠癌、肾细胞癌、肾盂癌、横纹肌肉瘤、唾液腺癌、软组织肉瘤、骨肉瘤、肉瘤、鼻窦癌、皮肤癌、小细胞肺癌(SCLC)、小肠癌、脊柱癌、脊柱癌、脊髓癌症、鳞状细胞癌、胃癌、滑膜肉瘤、T细胞淋巴瘤、睾丸癌、喉癌、胸腺瘤/胸腺癌、甲状腺癌、舌癌、扁桃体癌、移行细胞癌、输卵管癌、管状癌、未确诊的癌症、输尿管癌、尿道癌、子宫腺癌、子宫癌、子宫肉瘤、阴道癌、外阴癌、T细胞谱系急性淋巴细胞白血病(T-ALL)、T细胞谱系淋巴母细胞淋巴瘤(T-LL)、外周T细胞淋巴瘤、成人T细胞白血病、Pre-B ALL、Pre-B淋巴瘤、大B细胞淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、B细胞ALL、费城染色体阳性ALL、费城染色体阳性CML、幼年粒单核细胞白血病(JMML)、急性早幼粒细胞白血病(AML的一个亚型)、大颗粒淋巴细胞白血病、成人T细胞慢性白血病、弥漫性大B细胞淋巴瘤、滤泡性淋巴瘤;粘膜相关淋巴组织淋巴瘤(MALT)、小细胞淋巴细胞淋巴瘤、纵隔大B细胞淋巴瘤、结节边缘区B细胞淋巴瘤(NMZL);脾边缘区淋巴瘤(SMZL);血管内大B细胞淋巴瘤;原发性渗出性淋巴瘤;或淋巴瘤样肉芽肿病;;B细胞幼淋巴细胞白血病;脾淋巴瘤/白血病,无法分类,脾弥漫性红髓小B细胞淋巴瘤;淋巴浆细胞淋巴瘤;重链疾病,例如,α重链疾病、γ重链疾病、Mu重链疾病、浆细胞骨髓瘤、骨孤立性浆细胞瘤;骨外浆细胞瘤;原发性皮肤滤泡中心淋巴瘤、富含T细胞/组织细胞的大B细胞淋巴瘤、与慢性炎症相关的DLBCL;EB病毒(EBV)+老年人DLBCL;原发性纵隔(胸腺)大B细胞淋巴瘤、原发性皮肤DLBCL、腿型、ALK+大B细胞淋巴瘤、浆母细胞淋巴瘤;HHV8相关的多中心性Castleman病引起的大B细胞淋巴瘤;B细胞淋巴瘤,无法分类,具有介于弥漫性大B细胞淋巴瘤之间的特征,或无法分类的B细胞淋巴瘤,具有介于弥漫性大B细胞淋巴瘤和经典霍奇金淋巴瘤之间的特征。
由胞外蛋白介导的病症的非限制性一般实例还包括但不限于:AMD、黄斑水肿、DME、糖尿病视网膜病变、mCNV;神经退行性疾病、转移性结直肠癌、非鳞状非小细胞肺癌、GMB、转移性肾细胞癌、宫颈癌、AA淀粉样变性、淀粉样轻链(AL)淀粉样变性、强直性脊柱炎、抗磷脂抗体综合征、哮喘、进展曼氏血吸虫寄生虫感染(IL-13)、ATTR淀粉样变性、白塞综合征、败血症、炎症、类风湿性关节炎、动脉粥样硬化、缺血/再灌注损伤;MGUS、坏死性黄色肉芽肿、JIA、银屑病关节炎、斑块状银屑病、克罗恩病、溃疡性结肠炎、化脓性葡萄膜炎;GvH病;Castleman病、肝纤维化、斯蒂尔病;皮肤皮肤病,包括特应性皮炎、移植排斥、多发性骨髓瘤、骨硬化性多发性骨髓瘤伴周围神经病变;胰腺肿瘤;副蛋白血症(NR)、前列腺癌、胃癌;多形性胶质母细胞瘤;急性冠状动脉综合征;高脂血症(罕见/广泛)、慢性荨麻疹、硬皮病、硬化粘液水肿、遗传性血管性水肿、凝血障碍、肝素诱导的血小板减少症;获得性血管性血友病(AVWD)、抗磷脂抗体综合征(APS或APLS);冷球蛋白血症;肉芽肿性多血管炎(韦格纳氏)-ANCA相关血管炎的亚型;特发性(免疫);血小板减少性紫癜;IgG4-RD;非IgM MGUS;X连锁低磷血症;多系统萎缩症(MSA)、帕金森病、恶病质、少肌症、散发性包涵体肌炎、肌营养不良症、慢性阻塞性肺病;横纹肌溶解症;透析相关淀粉样变性;局灶节段性肾小球硬化症(FSGS);IgA肾病(IgAN)和过敏性紫癜(HSP);急性播散性脑脊髓炎(ADEM);急性炎症性脱髓鞘性多发性神经病(AIDP);吉兰-巴利综合征(Guillaine-Barre Syndrome);阿尔茨海默病和FTD;慢性炎症性脱髓鞘性多发性神经病(CIDP);克雅氏病(CJD);亨廷顿氏病;米勒·费希尔综合症;视神经脊髓炎谱系障碍(NMOSD);眼阵挛-肌阵挛综合征;PANDAS综合征(与链球菌感染相关的儿童自身免疫性神经精神疾病);横贯性脊髓炎;肺气肿、呼吸衰竭;炭疽病;肉毒中毒;败血症;金黄色葡萄球菌中毒性休克综合征;破伤风葡萄球菌移植;肢端肥大症;库欣病;朊病毒病;继发性膜性肾病;和血管炎。
另一些胞外蛋白介导的疾病
在某些实施方案中,本发明的胞外蛋白降解化合物降解除免疫球蛋白之外的蛋白以治疗上述病症。病症和胞外蛋白的非限制性实例包括:
细胞因子/趋化因子
1)TNF-α介导多种疾病,包括但不限于类风湿性关节炎、炎症性肠病、移植物抗宿主病、强直性脊柱炎、牛皮癣、化脓性汗腺炎、难治性哮喘、系统性红斑狼疮、糖尿病和恶病质的诱发。
2)IL-2介导移植和自身免疫性疾病中的宿主对移植物排斥,包括但不限于多发性硬化症、特发性关节炎、虹膜炎、前葡萄膜炎、IL-2诱导的低血压、牛皮癣和其他自身免疫性疾病
3)IL-1介导多种自身炎症和自身免疫性疾病,包括但不限于布劳综合征、冷热蛋白相关周期性综合征、家族性地中海热、马吉德综合征(Majeed syndrome);甲羟戊酸激酶缺乏综合征、化脓性关节炎-坏疽性脓皮病-痤疮综合征、肿瘤坏死因子受体相关周期性综合征、白塞氏病、干燥综合征、痛风和软骨钙质沉着症、周期性发热、口疮性口炎、咽炎和颈腺炎(或PFAPA)综合征,类风湿性关节炎、2型糖尿病、急性心包炎、慢性间质性肺疾病(ILD)和斯蒂尔病(Still’s disease)等。
4)IFN-γ介导多种自身免疫性疾病,包括但不限于类风湿性关节炎、多发性硬化症(MS)、角膜移植排斥和各种自身免疫性皮肤病,例如牛皮癣、斑秃、白癜风、寻常痤疮等。
5)IL-21介导许多自身免疫性疾病,包括干燥综合征、系统性红斑狼疮、1型糖尿病、多发性硬化症、类风湿性关节炎和炎症性肠病。
6)IL-22介导许多自身免疫性疾病,包括但不限于移植物抗宿主病(GVHD)、牛皮癣、类风湿性关节炎、特应性皮炎和哮喘。
7)IL-10与肿瘤存活和细胞毒性化疗药物的保护有关。
8)IL-5与许多过敏性疾病有关,包括但不限于哮喘、鼻息肉病、特应性皮炎、嗜酸性粒细胞性食管炎、嗜酸性粒细胞增多综合征和Churg-Strauss综合征。
9)IL-6与许多炎症性疾病和癌症有关,包括但不限于卡斯尔曼病、转移性去势相关前列腺癌、肾细胞癌、大细胞肺癌、卵巢癌、类风湿性关节炎、哮喘。
10)IL-8与促进肿瘤进展、免疫逃逸、上皮-间质转化和骨髓源性抑制细胞的募集有关。研究表明,高血清IL-8水平与许多恶性肿瘤的不良预后相关。临床前研究表明,IL-8阻断可能会减少肿瘤细胞的间质特征,从而降低它们对治疗的抵抗力。
11)C-C基序趋化因子配体2(CCL2)与动脉粥样硬化疾病过程中单核细胞募集到动脉壁有关。
12)巨噬细胞迁移抑制因子(MIF)是肿瘤进展的介质;全身炎症;动脉粥样硬化;类风湿关节炎;和系统性红斑狼疮等。
生长因子
1)成纤维细胞生长因子1(FGF1)可诱导血管生成。FGF1与肿瘤发生、癌细胞增殖、抗癌治疗耐药性和新血管生成有关。
2)成纤维细胞生长因子2(FGF2)与肿瘤发生、癌细胞增殖、抗癌治疗耐药性和新血管生成有关。
3)血管上皮生长因子(VEGF-A)与肿瘤的血管化和血管生成有关。
4)肿瘤微环境中转化生长因子-β1(TGF-β1)的表达与不良预后相关,并且与TGF-β1通过T细胞排斥介导的肿瘤抑制有关。TGF-β1表达也与血液恶性肿瘤和纤维化有关。
5)肿瘤微环境中转化生长因子-β2(TGF-β2)的表达与不良预后相关,并且与TGF-β2通过T细胞排斥介导的肿瘤抑制有关。TGF-β2表达也与血液恶性肿瘤和纤维化有关。
6)胎盘生长因子(PGF)促进细胞肿瘤生长,并与年龄相关性黄斑变性(AMD)和脉络膜新生血管(CNV)有关。
酯酶
1)胆碱酯酶与痴呆和阿尔茨海默病等认知障碍有关。
凝血因子
1)羧肽酶B2已被证实可抑制血栓形成。
2)凝血因子Xa是深静脉血栓形成和急性肺栓塞发生以及非瓣膜性心房颤动患者中风和栓塞风险的介质。
3)凝血因子XI是深静脉血栓形成和急性肺栓塞的发生以及非瓣膜性心房颤动患者中风和栓塞风险的介质。
4)凝血因子XII与深静脉血栓形成和急性肺栓塞的发生以及非瓣膜性心房颤动患者中风和栓塞的风险有关。
5)凝血因子XIII与深静脉血栓形成和急性肺栓塞的发生以及非瓣膜性心房颤动患者中风和栓塞的风险有关。
6)凝血酶原参与血凝块形成、动脉和静脉血栓形成以及与心房颤动相关的血栓栓塞。
7)凝血因子VII参与血栓形成、动静脉血栓形成以及与心房颤动相关的血栓栓塞。
8)凝血因子IX参与血凝块形成、动脉和静脉血栓形成以及与心房颤动相关的血栓栓塞。
细胞外基质蛋白
1)中性粒细胞弹性蛋白酶-中性粒细胞弹性蛋白酶与多种疾病有关,包括肺病、慢性阻塞性肺病、肺炎、呼吸窘迫、急性肺损伤(ALI)、囊性纤维化以及慢性肾病。
2)纤连蛋白-1-干扰FN聚合可能会减弱肌成纤维细胞和纤维化,并改善缺血/再灌注(I/R)损伤后的心脏功能。
3)血小板反应蛋白-1-TSP-1与许多疾病有关,包括促进某些癌症,如乳腺癌、前列腺癌、黑色素瘤、SCLC、骨肉瘤、皮肤鳞状细胞癌、口腔鳞状细胞癌、乳头状甲状腺癌、甲状腺癌癌症、髓母细胞瘤和纤维化疾病,例如糖尿病、肝纤维化和多发性骨髓瘤。
4)尿激酶型纤溶酶原激活剂(UPA)-UPA与血管疾病和癌症进展有关。尿激酶和纤溶酶原激活系统的其他几种成分的表达水平升高被发现与肿瘤恶性肿瘤相关。
5)组织型纤溶酶原激活剂(TPA)-PLA已被证明在包括口腔恶性肿瘤在内的多种癌症中被激活。
6)纤溶酶原(PLG)-PLG与肿瘤侵袭和炎症有关。
7)纤溶酶原激活剂抑制剂-1(PAI-1)-PAI-1与肿瘤的血管生成、转移和不良预后有关,包括但不限于口腔癌和乳腺癌。
肽酶
1)激肽释放酶-1-激肽释放酶与遗传性血管性水肿(HAE)的不良反应有关。
2)血浆激肽释放酶-血浆激肽释放酶与视网膜功能障碍、糖尿病性黄斑水肿和遗传性血管性水肿(HAE)的发展有关。
3)基质金属肽酶-1-MMP-1与心血管疾病、纤维化发展以及某些癌症(如膀胱癌)的生长有关。
4)磷脂酶A2,IIA族(PA2GA)-PA2GA与多种疾病有关,包括心血管疾病、动脉粥样硬化、免疫紊乱和癌症。
脂肪酶
1)脂蛋白脂肪酶-脂蛋白脂肪酶与心血管疾病和肥胖症的发展有关。
2)磷脂酶A2IB组(PA21B)-PA21B与多种疾病有关,包括心血管疾病、动脉粥样硬化、免疫紊乱和癌症。
转化酶
1)前蛋白转化酶枯草杆菌蛋白酶/Kexin9型(PCSK-9)-PCSK-9与高血胆固醇和心血管疾病的发展有关。
某些靶向的胞外蛋白包括但不限于:SAA(血清淀粉样蛋白A)、淀粉样蛋白轻链、克雷伯氏菌二肽酶蛋白抗体;针对阴离子磷脂和β-2-糖蛋白-I的Ig抗体;IL-13;MIF;运甲状腺素蛋白(错误折叠)、甲状腺过氧化物酶IgG自身抗体、甲状腺球蛋白和TSH受体;肿瘤坏死因子-α;蛋白精氨酸脱亚胺酶(PAD、PAD4);瓜氨酸蛋白抗体(ACPA)的抗体;抗DNA抗体;IL-17;赖氨酰氧化酶2(LOXL2);IL-18;布莱斯;B细胞激活因子(BAFF);CD40(可溶性);CXCL12;可溶性PSMA;基质金属蛋白酶IX(MMP-9);激素敏感性脂肪酶;脂蛋白相关磷脂酶A2;Xa因子;DPP4;凝血酶;PCSK9;ApoB-100;补体成分C3b;PKK(前激肽释放酶);因子XI;PF4;抗vWF抗体;抗心磷脂抗体和狼疮抗凝物;FGF23(成纤维细胞生长因子23);1型纤溶酶原激活剂抑制剂(PAI-1);髓过氧化物酶(MPO)细胞外;肌肉生长抑制素;β2-m;suPAR(可溶性尿激酶纤溶酶原激活剂受体);抗神经节苷脂IgG;β淀粉样蛋白;Tau;克雅氏病相关朊病毒;抗神经节苷脂IgG;HTT;抗神经节苷脂IgG;突触核蛋白;弹性蛋白酶;PABA(炭疽杆菌保护性抗原);水肿因子;肉毒杆菌毒素;艰难梭菌毒素B;溶血素;破伤风毒素;IL-2;生长激素和ACTH。
V.联合治疗
在某些方面,提供了一种治疗方案,包括与至少一种用于治疗由靶胞外蛋白例如免疫球蛋白介导的疾病的另外的治疗剂组合或交替施用有效量的本发明的胞外蛋白降解物或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。可以施用本文公开的组合和/或替代以在胞外蛋白介导的病症的治疗中产生有益的、相加的或协同的效果。
在某些实施方案中,提供了用于治疗IgA肾病的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的免疫球蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是ACE抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是AT1R拮抗剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是血管紧张素受体阻断剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是omega-3脂肪酸。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是他汀类药物。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是利尿剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是免疫抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自AVB-S6-500、iptacopan、阿西西普、利妥昔单抗、BION-1301、麦考酚酸、吗替麦考酚酯、别嘌呤醇、比利莫德(blisibimod)、硼替佐米、帕立骨化醇、他克莫司、阿利吉仑、依那普利、西姆地西兰、厄贝沙坦、雷帕霉素、骨化三醇和拉维珠单抗。
在某些实施方案中,提供了用于治疗乳糜泻的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是铜补充剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是锌补充剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是铁补充剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是叶酸补充剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是维生素B12补充剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是维生素D补充剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是维生素K补充剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自硫唑嘌呤、布地奈德和氨苯砜。
在某些实施方案中,提供了用于治疗IgA血管炎的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的免疫球蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是抗炎剂。
在某些实施方案中,提供了用于治疗IgA天疱疮的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的免疫球蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是类维生素A。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自氨苯砜、秋水仙碱、吗替麦考酚酯和阿达木单抗。
在某些实施方案中,提供了用于治疗疱疹样皮炎的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是免疫抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是四环素。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自氨苯砜、柳氮磺吡啶、磺胺吡啶、磺胺甲氧基哒嗪、环孢菌素A、硫唑嘌呤、秋水仙碱、肝素、烟酰胺、麦考酚酯和利妥昔单抗。
在某些实施方案中,提供了用于治疗炎性肠病的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是氨基水杨酸盐。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是免疫抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自美沙拉嗪、巴柳氮、奥沙拉嗪、硫唑嘌呤、巯嘌呤、甲氨蝶呤、英夫利昔单抗、阿达木单抗、戈利木单抗、赛妥珠单抗、维多珠单抗和乌特克单抗。
在某些实施方案中,提供了用于治疗干燥综合征的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是非甾体抗炎药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是免疫抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自环孢菌素、利替格斯特、毛果芸香碱、西维美林、羟氯喹和甲氨蝶呤。
在某些实施方案中,提供了用于治疗强直性脊柱炎的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是非甾体抗炎药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是TNF阻断剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是IL-17抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自萘普生、吲哚美辛、阿达木单抗、聚乙二醇赛妥珠单抗、依那西普、戈利木单抗、英夫利昔单抗、苏金单抗、伊克珠单抗和托法替尼。
在某些实施方案中,提供了用于治疗酒精性肝硬化的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是糖皮质激素。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是抗氧化剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自己酮可可碱和英夫利昔单抗。
在某些实施方案中,提供了用于治疗获得性免疫缺陷综合征的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是非核苷逆转录酶抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是核苷或核苷酸逆转录酶抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是蛋白酶抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是整合酶抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是进入或融合抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自依非韦伦、利匹韦林、多拉韦林、阿巴卡韦、替诺福韦、恩曲他滨、拉米夫定、齐多夫定、阿扎那韦、达芦那韦、洛匹那韦、利托那韦、比克替拉韦、拉替拉韦、多替拉韦、恩夫韦肽和马拉韦罗。
在某些实施方案中,提供了用于治疗IgA多发性骨髓瘤的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的免疫球蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是HDAC抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是免疫调节药物。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是抗体药物。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是BCL2抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是蛋白酶体抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是核输出的选择性抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自泼尼松、环磷酰胺、美法仑、长春新碱、多柔比星、地塞米松、沙利度胺、硼替佐米、来那度胺、卡非佐米、泊马度胺、达雷木单抗、帕比司他、埃罗妥珠单抗、伊沙佐米、伊沙昔单抗、维奈托克、马佐米、奥普佐米和塞利尼索。
在某些实施方案中,提供了用于治疗IgA重链疾病的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的免疫球蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是抗生素。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是化疗药物。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自多柔比星、环磷酰胺、长春新碱、泼尼松、替尼泊苷、博来霉素、长春碱、丙卡巴肼和泼尼松龙。
在某些实施方案中,提供了用于治疗线性IgA大疱性皮肤病的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的免疫球蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是四环素。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是免疫球蛋白。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自红霉素、磺胺吡啶、秋水仙碱和吗替麦考酚酯。
在某些实施方案中,提供了用于治疗意义未定的单克隆丙种球蛋白病(MGUS)的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自阿仑膦酸盐、利塞膦酸盐、伊班膦酸盐和唑来膦酸。
在某些实施方案中,提供了用于治疗全身性纤维炎性疾病的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是糖皮质激素。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是钙调神经磷酸酶抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自泼尼松龙、甲氨蝶呤、硫唑嘌呤、麦考酚酯、吗替麦考酚酯、6-巯基嘌呤、环磷酰胺和利妥昔单抗。
在某些实施方案中,提供了用于治疗里德尔甲状腺炎的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是糖皮质激素。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是免疫抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自他莫昔芬、泼尼松和吗替麦考酚酯。
在某些实施方案中,提供了用于治疗炎性假瘤的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是环氧合酶2抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是抗炎剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是沙利度胺。
在某些实施方案中,提供了用于治疗纵隔纤维化的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是利妥昔单抗。
在某些实施方案中,提供了用于治疗腹膜后纤维化的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是免疫抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自吗替麦考酚酯、甲氨蝶呤、硫唑嘌呤、环磷酰胺、他莫昔芬、泼尼松和环孢菌素A。
在某些实施方案中,提供了用于治疗主动脉炎或主动脉周围炎的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是糖皮质激素。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是免疫抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自泼尼松、甲氨蝶呤、托珠单抗、环磷酰胺、硫唑嘌呤和环孢菌素A。
在某些实施方案中,提供了用于治疗近端胆管狭窄的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。
在某些实施方案中,提供了用于治疗胃肠炎的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。
在某些实施方案中,提供了用于治疗IgA单克隆丙种球蛋白病的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的免疫球蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。
在某些实施方案中,提供了用于治疗IgG单克隆丙种球蛋白病的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的免疫球蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。
在某些实施方案中,提供了用于治疗IgE单克隆丙种球蛋白病的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的免疫球蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。
在某些实施方案中,提供了用于治疗特发性低补体血症性肾小管间质性肾炎的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自泼尼松、利妥昔单抗和麦考酚酸。
在某些实施方案中,提供了用于治疗多灶性纤维硬化症的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是免疫抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自环孢菌素和泼尼松龙。
在某些实施方案中,提供了用于治疗厚脑膜炎的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自泼尼松、硫唑嘌呤、环磷酰胺、甲氨蝶呤和利妥昔单抗。
在某些实施方案中,提供了用于治疗胰腺肿大的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。
在某些实施方案中,提供了用于治疗肿胀性病变的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是免疫抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自利妥昔单抗和环磷酰胺。
在某些实施方案中,提供了用于治疗类风湿性关节炎的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是非类固醇抗炎药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是缓解疾病的抗风湿药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是生物药物。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是Janus相关激酶抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是阿片样物质。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自布洛芬、萘普生钠、泼尼松、甲氨蝶呤、来氟米特、羟氯喹、柳氮磺吡啶、阿巴西普、阿达木单抗、阿那白滞素、巴瑞替尼、赛妥珠单抗、依那西普、戈利木单抗、英夫利昔单抗、利妥昔单抗、萨里鲁单抗、托珠单抗、托法替布、米诺环素、塞来昔布、萘丁美酮、吡罗昔康、双氯芬酸、二氟尼柳、吲哚美辛、酮洛芬、依托度酸、非诺洛芬、氟比洛芬、酮咯酸、甲氯芬那酯、甲灭酸、美洛昔康、奥沙普秦、舒林酸、双水杨酯、托美丁、可待因、芬太尼、氢可完成,氢吗啡酮、吗啡、哌替啶、羟考酮、曲马多、倍他米松、地塞米松、可的松、氢化可的松、甲泼尼龙和泼尼松龙。
在某些实施方案中,提供了用于治疗多发性硬化症的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是干扰素β药物。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是生物药物。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是肌肉松弛剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自泼尼松、甲泼尼龙、奥瑞珠单抗、醋酸格拉替雷、干扰素β-1a、干扰素β-1b、芬戈莫德、富马酸二甲酯、富马酸地罗西美、特立氟胺、辛波尼莫德、克拉屈滨、奥瑞珠单抗、那他珠单抗、阿仑单抗、巴氯芬、替扎尼定、环苯扎林、金刚烷胺、莫达非尼、哌甲酯和达法吡啶。
在某些实施方案中,提供了用于治疗重症肌无力的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是胆碱酯酶抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是免疫抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是单克隆抗体。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自吡斯的明、新斯的明、硫唑嘌呤、吗替麦考酚酯、环孢菌素、甲氨蝶呤、他克莫司、利妥昔单抗和依库丽单抗。
在某些实施方案中,提供了用于治疗银屑病关节炎的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是非类固醇抗炎药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是缓解疾病的抗风湿药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是免疫抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是生物药物。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自阿普斯特、布洛芬、萘普生钠、甲氨蝶呤、来氟米特、柳氮磺吡啶、硫唑嘌呤、环孢菌素、阿巴西普、阿达木单抗、赛妥珠单抗、依那西普、戈利木单抗、英夫利昔单抗、伊塞珠单抗、苏金单抗、托法替尼、和乌司奴单抗。
在某些实施方案中,提供了用于治疗系统性红斑狼疮(SLE)的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是非类固醇抗炎药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是抗疟药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是免疫抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是生物药物。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自沃罗孢素、阿巴西普、阿尼鲁单抗、萘普生钠、布洛芬、羟氯喹、甲泼尼龙、硫唑嘌呤、麦考酚酯、甲氨蝶呤、环孢菌素、来氟米特、贝利尤单抗和利妥昔单抗。
在某些实施方案中,提供了用于治疗硬化性胆管炎的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是胆汁酸螯合剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是抗生素。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是抗组胺剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是阿片样物质拮抗剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自熊去氧胆酸、利福平、纳曲酮、考来烯胺、考来替泊和考来维仑。
在某些实施方案中,提供了用于治疗特应性哮喘的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是支气管扩张剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是白三烯调节剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是β激动剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自奥马珠单抗、氟替卡松、布地奈德、莫米松、环索奈德、孟鲁司特、扎鲁司特、齐留通、沙美特罗和福莫特罗。
在某些实施方案中,提供了用于治疗皮肤接触超敏反应的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是抗组胺剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。
在某些实施方案中,提供了用于治疗过敏性结膜炎的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是抗组胺剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是色甘酸。
在某些实施方案中,提供了用于治疗过敏性荨麻疹的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是抗组胺剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是组胺阻断剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是抗抑郁药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是单克隆抗体。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是免疫抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自他克莫司、环孢菌素、奥马珠单抗、扎鲁司特、孟鲁司特、多塞平、泼尼松、西咪替丁、法莫替丁、氯雷他定、非索非那定、西替利嗪和地氯雷他定。
在某些实施方案中,提供了用于治疗过敏性休克的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是抗组胺剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是β-激动剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自肾上腺素、可的松和沙丁胺醇。
在某些实施方案中,提供了用于治疗鼻息肉病的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是抗组胺剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自杜匹鲁单抗、泼尼松、氟替卡松、布地奈德、莫米松、曲安西龙、倍氯米松和环索奈德。
在某些实施方案中,提供了用于治疗角结膜炎的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是抗组胺剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是肥大细胞稳定剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是非类固醇抗炎药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是抗病毒剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自西多福韦、更昔洛韦、色甘酸钠、奈多罗米、钠、洛度沙胺、环孢菌素A、他克莫司、利替格斯特、多西环素和维生素A。
在某些实施方案中,提供了用于治疗肥大细胞增多症的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是抗组胺剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是白三烯调节剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是肥大细胞稳定剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是化疗药物。
在某些实施方案中,提供了用于治疗嗜酸性粒细胞性胃肠疾病的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是质子泵抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是免疫调节剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是生物药物。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是白三烯D4受体拮抗剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自孟鲁司特、色甘酸钠、奥美拉唑、兰索拉唑、右兰索拉唑、埃索美拉唑、泮托拉唑、雷贝拉唑、艾普拉唑、丙酸氟替卡松、布地奈德、泼尼松、硫唑嘌呤、6-巯基嘌呤、替马匹兰、美泊利单抗、decrekumab和申达奇单抗。
在某些实施方案中,提供了用于治疗大疱性类天疱疮的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是免疫抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自硫唑嘌呤、吗替麦考酚酯、利妥昔单抗、甲氨蝶呤和四环素。
在某些实施方案中,提供了用于治疗化疗引起的超敏反应的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是组胺1拮抗剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是组胺2拮抗剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是抗惊厥药。
在某些实施方案中,提供了用于治疗季节性变应性鼻炎的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是抗组胺剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是减充血剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是白三烯调节剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自非索非那定、苯海拉明、地氯雷他定、氯雷他定、左西替利嗪、西替利嗪、羟甲唑啉、伪麻黄碱、去氧肾上腺素、色甘酸钠、孟鲁司特和异丙托铵。
在某些实施方案中,提供了用于治疗间质性膀胱炎的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是非类固醇抗炎药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是三环抗抑郁药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是抗组胺剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自戊聚糖多硫酸钠、氯雷他定、阿米替林、丙咪嗪、布洛芬、萘普生钠、二甲亚砜和肝素。
在某些实施方案中,提供了用于治疗嗜酸性食管炎的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是质子泵抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是免疫调节剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是生物药物。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是白三烯D4受体拮抗剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自孟鲁司特、色甘酸钠、奥美拉唑、兰索拉唑、右兰索拉唑、埃索美拉唑、泮托拉唑、雷贝拉唑、艾普拉唑、丙酸氟替卡松、布地奈德、泼尼松、硫唑嘌呤、6-巯基嘌呤、替马匹兰、美泊利单抗、decrekumab和申达奇单抗。
在某些实施方案中,提供了用于治疗血管性水肿的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是抗组胺剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是免疫抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。
在某些实施方案中,提供了用于治疗急性间质性肾炎的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自环磷酰胺、环孢菌素和吗替麦考酚酯。
在某些实施方案中,提供了用于治疗特应性湿疹的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是钙调神经磷酸酶抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是生物药物。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自度普利尤单抗、泼尼松、他克莫司和吡美莫司。
在某些实施方案中,提供了用于治疗嗜酸性支气管炎的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是白三烯受体拮抗剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自布地奈德、氟替卡松和孟鲁司特。
在某些实施方案中,提供了用于治疗慢性阻塞性肺病的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的胞外蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是支气管扩张剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是磷酸二酯酶4抑制剂。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是抗生素。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂选自茶碱、阿奇霉素、罗氟司特、氟替卡松、布地奈德、沙丁胺醇、异丙托铵、左沙丁胺醇、阿地铵、阿福特罗、福莫特罗、茚达特罗、噻托铵、沙美特罗和乌地铵。
在某些实施方案中,提供了用于治疗高IgE综合征(乔布氏综合征)的治疗方案,其包括与至少一种另外的治疗剂组合或交替施用本发明的免疫球蛋白降解剂或其药学上可接受的组合物、盐、同位素类似物或前药。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是皮质类固醇。在某些实施方案中,至少一种另外的治疗剂是抗生素。
VI.制造过程
本发明的胞外蛋白降解剂可以根据以下工作实施例中描述的路线或如专利或科学文献中另外已知的路线以及如果合适的话由普通工人的知识或公知常识支持来制造。
本文所述的胞外蛋白降解剂中的一些碳是用指定的立体化学绘制的。其他碳的绘制没有立体化学名称。当在没有指定立体化学的情况下绘制时,该碳可以处于实现所需目的的任何所需立体化学构型。本领域技术人员将认识到纯的对映体、对映体富集的化合物、外消旋体和非对映体可以通过本领域已知的方法如本文提供的信息指导来制备。获得光学活性材料的方法的实施例至少包括以下:
i)手性液相色谱-一种利用非对映异构体与固定相的不同相互作用在液体流动相中分离非对映异构体的技术(包括西林瓶手性HPLC)。固定相可以由手性材料制成,或者流动相可以包含另外的手性材料以引发不同的相互作用;
ii)非对映体的非手性色谱-通常可以使用正常的非手性柱条件分离非对映体;
iii)手性气相色谱法-一种技术,其中外消旋物挥发,对映异构体根据它们在气态流动相中与含有固定非外消旋手性吸附相的柱的不同相互作用而分离;
iv)同步结晶-一种将单个非对映异构体从溶液中单独结晶的技术;
v)酶促拆分-一种通过与酶的不同反应速率来部分或完全分离非对映异构体的技术;
vi)化学不对称合成-一种合成技术,其中在产物中产生不对称性(即手性)的条件(这可以通过手性催化剂或手性助剂来实现)下,由非手性前体合成所需的非对映异构体;
vii)非对映异构体分离-一种技术,其中外消旋化合物与对映异构体纯的试剂(手性助剂)反应,所述试剂将单个对映异构体转化为非对映异构体。然后利用它们现在更明显的结构差异通过色谱法或结晶法分离得到的非对映异构体,并随后除去手性助剂以获得所期望对映异构体;以及
viii)手性溶剂萃取-一种通过非对映异构体在特定手性溶剂中相对于其他优先溶解而分离非对映异构体的技术。
适用于合成的工作实施例的一般程序:
所有试剂均购自商业供应商(Sigma-Aldrich、Alfa、Acros等),除非另有说明,否则无需进一步纯化即可使用。THF连续回流并在氮气下从钠和二苯甲酮中新蒸馏,二氯甲烷连续回流并在氮气下从CaH2中新蒸馏。
通过在硅胶60HSGF254渗滤板上(0.15-0.2mm SiO2)的TLC监测反应,并使用紫外光(254nm或365nm)可视化和/或用磷钼酸乙醇溶液(10g,在100mL乙醇中)染色,随后加热或通过LCMS监测。
LCMS在以下上进行:SHIMADZU LCMS-2010EV(Chromolith SpeedROD,RP-18e,50x4.6mm,流动相:溶剂A:CH3CN/H2O/HCOOH=10/90/0.05,溶剂B:CH3CN/H2O/HCOOH=90/10/0.05,0.8min@10%B,2.7min梯度(10-95%B),然后0.8min@95%B,流速:3mL/min,温度:40℃)。
如下进行制备型HPLC:方法A:SHIMADZU LC-8A(柱:YMC Pack ODS-A(150*30mm,10μm))或方法B:LC-6AD(柱:Shim=Pack PREP-ODS-H(250*20mm,10μm)),带UV检测,由LC解决方案Chemstation软件控制。指定的流速下的H2O(0.1%HCOOH)和MeOH(MeCN)作为流动相。
分析HPLC在以下上进行:SHIMADZU LC-2010A(Chromolith SpeedROD,RP-18e,50x4.6mm,流动相:溶剂A:CH3CN/H2O/HCOOH=10/90/0.05,溶剂B:CH3CN/H2O/HCOOH=90/10/0.05,0.8min@10%B,2.7min梯度(10-95%B),然后0.8min@95%B,流速:3mL/min,温度:40℃)。
手性HPLC在以下上进行:SHIMADZU LC-2010A(手性柱,流动相:溶剂A:己烷(或含0.1%二乙胺),溶剂B:乙醇或异丙醇;流速:0.8mL/min,温度:30℃)。
1H光谱在Bruker Avance II 400MHz上记录,化学位移(δ)以相对于四甲基硅烷的ppm报告(δ=0.000ppm),并且光谱根据氯仿(δ=7.26)、二甲亚砜(δ=2.50)、甲醇(δ=3.30)的残留溶剂信号进行校准。1H NMR谱的数据报告如下:化学位移(多重性、氢的数量)。缩写说明如下:s(单峰)、d(二重峰)、t(三重峰)、q(四重峰)、quant(五重峰)、m(多峰)、br(宽峰)。
试剂OPT-炔烃具有以下结构:
试剂FC-III肽-炔烃具有以下结构:
一般合成方法
本发明的胞外蛋白降解化合物可以使用本领域技术人员已知的多种技术来合成。例如,从具有胺的胞外蛋白靶向配体开始,可以在肽偶联条件下安装分子的ASGPR结合部分和接头。
该技术可用于合成本发明的各种胞外蛋白降解化合物,包括具有不同立构中心的那些化合物。
靶向配体的合成
中间体1,(S)-3-(((4R,7S,10S,13S,16S,22S,25S,28S,31S,34R)-25-((1H-咪唑-5-基)甲基)-7,28-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-4-(((2S,3R)-1-氨基-3-羟基-1-氧代丁-2-基)氨基甲酰基)-16-(2-羧乙基)-13,22-二异丁基-10-异丙基-31-甲基-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33-十氧代-1,2-二硫杂-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32-十氮杂环三十五烷-34-基)氨基甲酰基)-5,21-二氧代-8,11,14,17-四氧杂-4,20-二氮杂二十六-25-炔-1-烷酸的制备
步骤1:固相肽合成:
使用标准Fmoc化学合成肽。
1)树脂制备:将DMF(600mL)中的AM树脂(66.67g,20.00mmol,0.30mmol/g)在15℃用N2鼓泡混合30分钟。用DMF(600mL)洗涤树脂5次。然后添加20%哌啶的DMF(600mL)溶液,并将混合物在15℃下用N2鼓泡30分钟。过滤混合物以获得树脂。将树脂用DMF(600mL)洗涤5次,然后进行下一步。
2)偶联:将Fmoc-Thr(tBu)-OH(23.82g,60.00mmol,3.00当量)、HBTU(21.60g,57mmol,2.85当量)的DMF(300mL)溶液添加到树脂中,同时用N2鼓泡。然后将DIEA(22.11mL,120mmol,6.00当量)滴加至混合物中并在15℃下用N2鼓泡30分钟。通过茚三酮试验监测偶联反应,若显示无色则偶联完成。然后用DMF(600mL)洗涤树脂5次。
3)去保护:将20%哌啶的DMF(600mL)溶液添加到树脂中,并将混合物在15℃下用N2鼓泡30分钟。然后用DMF(600mL)洗涤树脂5次。去保护反应通过茚三酮试验监测,如果呈现蓝色或其他棕红色,则反应完成。
4)对所有其他氨基酸重复步骤2和3:(下表中的2-15)。
步骤2:肽切割和纯化:
1)在室温下将切割缓冲液(92.5%TFA/2.5%TIS/2.5%H2O/2.5%3-巯基丙酸)添加到含有侧链保护的肽的烧瓶中并搅拌2小时。
2)用冷异丙醚沉淀肽并离心(3000rpm 3分钟)。
3)用异丙醚另外洗涤两次。
4)将粗肽真空干燥2小时。
5)将粗肽在MeCN(10L)和H2O(10L)、碘(0.1M在AcOH中)中的混合物滴加到剧烈搅拌的肽溶液中,直至持续呈黄色。2分钟后,滴加硫代硫酸钠(0.1M水溶液)直至黄色消失。将混合物冻干,得到粗粉末。
6)通过制备型HPLC(A:H2O中的0.075%TFA,B:ACN)纯化粗肽,得到目标物49(5.9g,95.1%纯度,14.99%收率),为白色固体。化学式:C86H123N19O24S2;LCMS发现值:[M+H]+=1871.00;[M+2H]2+=936.10;[M+3H]3+=624.38;
步骤4:纯化条件。
纯化条件如下表所示。
所得化合物表征如下:
使用与中间体1相同的程序合成以下化合物
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中间体4,3-((6S,9R,12S,15S,18S,21S,27S,30S,33S,36S,39R,42S,44aS,46S,49aR)-30-((1H-咪唑-5-基)甲基)-12,33-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-42-(羧甲基)-6-((R)-1-羟乙基)-18,27-二异丁基-15-异丙基-36-甲基-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,49--十五氧代-46-(17-氧代-4,7,10,13-四氧杂-16-氮杂二十二-21-炔酰胺基)四十八氢-1H-9,39-(甲烷二硫代甲烷基)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-21-基)丙酸的制备
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步骤1:制备4-4的一般程序
固相肽合成:
使用标准Fmoc化学合成肽。
1)树脂制备:向含有CTC树脂(61.70g,50.00mmol,0.81mmol/g)和Fmoc-D-Pro-OH(16.87g,50.00mmol,1.00当量)的DCM(500mL)溶液的容器滴加DIEA(34.60mL,200.00mmol,4.00当量)并用N2在15℃下鼓泡混合2小时。然后添加MeOH(50.00mL)并用N2再鼓泡30分钟。将树脂用DMF(1L)洗涤5次。然后添加20%哌啶的DMF(1L)溶液,并将混合物在15℃下用N2鼓泡30分钟。过滤混合物以获得树脂。将树脂用DMF(1L)洗涤5次,然后进行下一步。
2)偶联:将Fmoc-Thr(tBu)-OH(59.63g,150.00mmol,3.00当量)、HBTU(16.11g,142.50mmol,2.85当量)的DMF(500mL)溶液添加到树脂中,同时用N2鼓泡。然后将DIEA(51.60mL,300mmol,6.00当量)滴加至混合物中并在15℃下用N2鼓泡30分钟。通过茚三酮试验监测偶联反应,若显示无色则偶联完成。然后用DMF(1L)洗涤树脂5次。
3)去保护:将20%哌啶的DMF(1L)溶液添加到树脂中,并将混合物在15℃下用N2鼓泡30分钟。然后用DMF(1L)洗涤树脂5次。去保护反应通过茚三酮试验监测,如果呈现蓝色或其他棕红色,则反应完成。
4)对所有其他氨基酸重复步骤2和3:
肽切割和纯化:
1)将切割缓冲液(20%HFIP/DCM,1.2L)添加到含有侧链保护的粗肽的烧瓶中。将混合物在室温下搅拌1小时,过滤后收集溶液。再次重复切割步骤。
2)过滤后合并溶液。
3)通过旋转蒸发浓缩溶液。
4)将粗肽冷冻干燥。
5)获得白色固体的4-3(47.00g,粗品)。
6)4-3(47.00g,16.00mmol,1.00当量)、HOBT(6.49g,48.00mmol,3.00当量)、DMAP(5.80g,48.00mmol,3.00当量)和EDCI(9.17g,48.00mmol,3.00当量)在DMF(16L)中的混合物在25℃下搅拌72小时。
7)过滤后合并溶液。
8)将混合物添加至0.50M HCl(冷,2L)中,并沉淀出白色固体。过滤后,将固体冻干,得到4-4(50.00g,粗品),为白色固体。化学式:C159H192N20O26S2,LCMS发现值:[M+2H]2+=1338.62;
步骤2:制备中间体5的一般程序
化合物4-4(50.0g,16.83mmol,1.00当量)在TFA/TIS/H2O(95%/2.5%2.5%,v/v/v,600mL)中的混合物在20℃下搅拌1小时。用冷异丙醚(3L)沉淀混合物。过滤后,将固体真空干燥2小时,得到3-5(32.00g)。3-5(32.00g)溶于ACN/H2O(1/1,v/v,17L)。在15℃下将I2/HOAc(0.1M)滴加到混合物中,直至浅黄色持续存在,然后用0.1M Na2S2O3逐滴淬灭混合物,直到浅黄色消失。过滤后,滤液直接通过制备型HPLC(酸性条件,TFA)纯化,得到中间体5(5.00g,2.15mmol,10.00%收率,85%纯度),为白色固体。化学式:C79H108N20O20S2,LCMS发现值:[M+H]1+=1722.00,[M+2H]2+=861.61。
步骤3:制备4-2的一般程序
4-1(8.00g,22.25mmol,1.00当量)、2,3,5,6-四氟苯酚(11.08g,66.75mmol,4.00当量)和EDCI(9.52g,33.23mmol,2.00当量)在DMF(224mL)中的混合物在25℃搅拌16小时。LCMS显示反应完成。通过快速(Flash)(TFA条件)和冻干纯化混合物,得到呈黄色油状的4-2(9.00g,17.73mmol,79.69%收率)。化学式:C23H29F4NO7,LCMS发现值:[M+H]1+=508.15。
步骤4:制备中间体4的一般程序
化合物4-6(705.61mg,0.4mmol,1.00当量)、化合物4-2(416.12mg,0.80mmol,2.00当量)和DIEA(0.725ml,4mmol,10.00当量)在DMF(10mL)中的混合物于0℃搅拌8小时。LCMS显示反应完成。将混合物调节为pH=5并直接通过制备型HPLC(TFA条件)纯化,得到白色固体状的中间体4(477.40mg,0.23mmol,57.50%收率,97.9%纯度)。化学式:C96H135N21O26S2,LCMS发现值:[M+2H]2+=1032.14,[M+3H]3+=688.41。
步骤5:纯化条件。
纯化条件如下表所示。
按照与中间体4相同的方法制备化合物中间体6、中间体7、中间体8和中间体9。
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中间体10,2-(2-(2-(2-((2,4-二硝基苯基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸的制备
步骤1:在0℃下分份向2-(2-(2-氨基乙氧基)乙氧基)乙-1-醇(5.0g,33mmol)在EtOH(60mL)中的溶液中添加TEA(61.5mL,442mmol)和二叔丁基碳酸氢酯(8.6mL,40mmol)。将混合物剧烈搅拌并缓慢升温至室温过夜(16小时)。真空蒸发溶剂并通过柱色谱法(SiO2,溶剂梯度:DCM至1∶9MeOH/DCM)纯化残余物,得到(2-(2-(2-羟基乙氧基)乙氧基)乙基)氨基甲酸叔丁酯,为无色油状物(4.5g,55%收率)。LC-MS(ESI)发现值:250[M+H]+。
步骤2:在0℃下分份向无色油状的(2-(2-(2-羟基乙氧基)乙氧基)乙基)氨基甲酸叔丁酯(72g,288mmol)在THF(100mL)中的溶液中添加2-碘乙酸(160g,866mmol)和NaOH(69g,1.7mol)。将混合物在室温搅拌2天。真空除去溶剂,然后添加NaOH水溶液。使用DCM洗涤混合物。然后在剧烈搅拌下用3N HCl溶液酸化水相直至pH 4。用DCM萃取并浓缩,得到呈淡黄色油状的2,2-二甲基-4-氧代-3,8,11,14-四氧杂-5-氮杂十六烷-16-烷酸(80g,90%收率)。LC-MS(ESI)发现值:308[M+H]+。
步骤3:向呈淡黄色油状的2,2-二甲基-4-氧代-3,8,11,14-四氧杂-5-氮杂十六烷-16-烷酸(42g,136mmol)在DCM(250mL)中的溶液中在0℃下添加TFA(51mL,683mmol)。将混合物在室温下搅拌2小时。将混合物浓缩,得到粗2-(2-(2-(2-氨基乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸(28g,99%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:208[M+H]+。
步骤4:在0℃下分份向2-(2-(2-(2-氨基乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸(28g,135mmol)在H2O(300mL)中的溶液中添加NaHCO3(34g,405mmol)和1-氯-2,4-二硝基苯(41g,203mmol)。将混合物在90℃下搅拌过夜。将混合物调节pH至6,用DCM萃取,用盐水洗涤,浓缩并通过硅胶柱纯化,得到2-(2-(2-(2-((2,4-二硝基苯基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸(中间体10,20g,40%收率),为黄色油状物。LC-MS(ESI)发现值:374[M+H]+。1H NMR(400MHz,MeOD):δ9.03(d,J=2.7Hz,1H),8.28(dd,J=9.6,2.7Hz,1H),7.22(d,J=9.6Hz,1H),4.10(s,2H),3.81(t,J=5.3Hz,2H),3.75-3.61(m,10H)。
中间体11:3-((6S,9R,12S,15S,18S,21S,27S,30S,33S,36S,39R,42S,44aS,46S,49aR)-30-((1H-咪唑-5-基)甲基)-12,33-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-46-氨基-42-(羧甲基)-6-((R)-1-羟乙基)-18,27-二异丁基-15-异丙基-36-甲基5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,49-十五氧代四十八氢-1H-9,39-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-21-基)丙酸的制备
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步骤1:固相肽合成:使用标准Fmoc化学合成肽。
5)树脂制备:向含有CTC树脂(200.00g,200.00mmol,1.00mmol/g)和Fmoc-D-Pro-OH(67.40g,200.00mmol,1.00当量)的DCM(3L)溶液的容器中滴加DIEA(139.46mL,800.00mmol,4.00当量),并用N2在15℃下鼓泡混合2小时。然后加入MeOH(200.00mL)并用N2再鼓泡30分钟。将树脂用DMF(3L)洗涤5次。然后添加20%哌啶的DMF(5L)溶液,并将混合物在15℃下用N2鼓泡30分钟。过滤混合物以获得树脂。将树脂用DMF(3L)洗涤5次,然后进行下一步。
6)偶联:Fmoc-Thr(tBu)-OH(238.20g,600.00mmol,3.00当量)、HBTU(216.03g,570.00mmol,2.85当量)的DMF(500mL)溶液添加到树脂中,同时鼓泡N2。然后将DIEA(209.18mL,1200.00mmol,6.00当量)滴加至混合物中并在15℃下用N2鼓泡30分钟。通过茚三酮试验监测偶联反应,若显示无色则偶联完成。然后用DMF(3L)洗涤树脂5次。
7)去保护:将20%哌啶的DMF(5L)溶液添加到树脂中,并将混合物在15℃下用N2鼓泡30分钟。然后用DMF(3L)洗涤树脂5次。通过茚三酮试验监测去保护反应,若显蓝色或其他棕红色,则反应完成。
8)对所有其他氨基酸重复步骤2和3:(表X中的2-15)。
表X.
肽切割和纯化:
1)将切割缓冲液(20%HFIP/DCM,8.0L)添加到含有侧链保护的粗肽的烧瓶中。将混合物在室温下搅拌1小时,过滤后收集溶液。再次重复切割步骤。
2)过滤后合并溶液。
3)通过旋转蒸发浓缩溶液。
4)将粗肽冷冻干燥。
5)获得N-(N-((S)-5-(叔丁氧基)-2-(2-((S)-2-((S)-2-((S)-2-((S)-2)-((R)-2-((S)-4-(叔丁氧基)-2-((2S,4S)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)吡咯烷-2-甲酰胺基)-4-氧代丁酰胺基)-3-(三苯甲基硫基)丙酰胺基)丙酰胺基)-3-(1H-吲哚-3-基)丙酰胺基)-3-(1-三苯甲基-1H-咪唑-5-基)丙酰胺基)-4-甲基戊酰胺基)乙酰胺基)-5-氧代戊酰基)-L-亮氨酰基-L-缬氨酰基-L-色氨酸-S-三苯甲基-L-半胱氨酰基)-O-(叔丁基)-L-苏氨酰基-D-脯氨酸(231.00g,粗品),为白色固体。
6)N-(N-((S)-5-(叔丁氧基)-2-(2-((S)-2-((S)-2-((S)-2-((S)-2-((R)-2-((S)-4-(叔丁氧基)-2-((2S,4S)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)吡咯烷-2-甲酰胺基)-4-氧代丁酰胺基)-3-(三苯甲基硫基)丙酰胺基)丙酰胺基)-3-(1H-吲哚-3-基)丙酰胺基)-3-(1-三苯甲基-1H-咪唑-5-基)丙酰胺基)-4-甲基戊酰胺基)乙酰胺基)-5-氧代戊酰基)-L-亮氨酰基-L-缬氨酰基-L-色氨酸-S-三苯甲基-L-半胱氨酰基)-O-(叔丁基)-L-苏氨酰基-D-脯氨酸(13.58g,4.99mmol,1.00当量)、2,4,6-三甲基吡啶(3.62g,29.98mmol,6.00当量)在DMF(5.0L)中的混合物中在25℃添加HATU(2.84g,7.49mmol,1.50当量)。然后将混合物在25℃搅拌3小时。一共17批,一一制作。
7)通过旋转蒸发浓缩溶液。
8)将残余物添加至0.50M HCl(冷,10L)中,并沉淀出白色固体。过滤后,将固体冻干,得到3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(2-(叔丁氧基)-2-氧代乙基)-11-((R)-1-(叔丁氧基)乙基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代-35-((1-三苯甲基-1H-咪唑-5-基)甲基)-14,44-双((三苯甲基硫基)甲基)四十八氢-5H-二吡咯并[1,2-a:1′,2’-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸叔丁酯(245.00g,粗品,17批),为白色固体。化学式:C159H192N20O26S2,LCMS发现值:[M+Na]2+=1370.88;[M+H-242]+=1239.42;
步骤2:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(2-(叔丁氧基)-2-氧代乙基)-11-((R)-1-(叔丁氧基)乙基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代-35-((1-三苯甲基-1H-咪唑-5-基)甲基)-14,44-双((三苯甲基硫基)甲基)四十八氢-5H-二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸叔丁酯(245.00g,粗品)在TFA/TIS/H2O/3-巯基丙酸(92.5%/2.5%/2.5%/2.5%,v/v/v,5L)中的混合物在20℃搅拌1.5小时。用冷异丙醚(30L)沉淀混合物。过滤后,将固体真空干燥2小时,得到3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-2-氨基-47-(2-(叔丁氧基)-2-氧代乙基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-14,44-双(巯甲基)-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(170.50g,粗品),其溶解在MeCN/H2O(1/1,v/v,100L)中。在25℃下将0.1M I2/HOAc滴加到混合物中,直到浅黄色持续存在,然后用0.1M Na2S2O3逐滴淬灭混合物,直至浅黄色消失。过滤后,滤液直接通过制备型HPLC(酸性条件,TFA)纯化,得到白色固体状的中间体11(21.10g,6.15%收率,87.06%纯度)。化学式:C79H108N20O20S2,LCMS发现值:[M+H]1+=1722.70,[M+2H]2+=861.50。
中间体12的制备:3-((6S,9R,12S,15S,18S,21S,27S,30S,33S,36S,39R,42S,44aS,46S,49aR)-30-((1H-咪唑-5-基)甲基)-12,33-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-46-氨基-6-((R)-1-羟乙基)-18,27-二异丁基-15-异丙基-36,42-二甲基-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,49-十五氧代四十八氢-1H-9,39-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-21-基)丙酸
/>
步骤1:固相肽合成:使用标准Fmoc化学合成肽。
1)树脂制备:向含有CTC树脂(0.50g,0.50mmol,1.00mmol/g)和Fmoc-Gly-OH(148.50mg,0.50mmol,1.00当量)的DCM(10mL)溶液的容器中滴加DIEA(348.64mL,2.00mmol,4.00当量)并用N2在25℃下鼓泡混合2小时。然后加入MeOH(0.50mL)并用N2再鼓泡30分钟。将树脂用DMF(20mL)5次洗涤。然后添加20%哌啶的DMF(20mL)溶液,并将混合物在25℃下用N2鼓泡30分钟。过滤混合物以获得树脂。将树脂用DMF(20mL)5次洗涤,然后进行下一步。
2)偶联:在N2鼓泡下将Fmoc-Glu(OtBu)-OH(637.5mg,1.50mmol,3.00当量)、HBTU(540.07mg,1.425mmol,2.85当量)在DMF(10mL)中的溶液添加到树脂中。然后将DIEA(522.97mL,3.00mmol,6.00当量)滴加到混合物中,并在25℃下用N2鼓泡30分钟。通过茚三酮试验监测偶联反应,若显示无色则偶联完成。然后用DMF(20mL)5次洗涤树脂。
3)去保护:将20%哌啶的DMF(20mL)溶液添加到树脂中,并将混合物在25℃下用N2鼓泡30分钟。然后用DMF(20mL)5次洗涤树脂。通过茚三酮试验监测去保护反应,若显蓝色或其他棕红色,则反应完成。
4)对所有其他氨基酸重复步骤2和3:(表Y中的2-15)。
表Y.
肽切割和纯化:
1)将切割缓冲液(1%TFA/DCM,30mL)添加到含有侧链保护的粗肽的烧瓶中。将混合物在室温下搅拌5分钟,过滤后收集溶液。再次重复切割步骤。
2)将合并的溶液用DCM稀释至500mL。
3)添加TBTU(321.00mg,1.00mmol,2.00当量)和HOBt(135.00mg,1.00mmol,2.00当量)并将混合物在25℃搅拌2小时。
4)将反应混合物用1M HCl(200mL)、H2O(200mL)、盐水(200mL)洗涤,用无水Na2SO4干燥,过滤并真空浓缩,得到3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-11-((R)-1-(叔丁氧基)乙基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41,47-二甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代-35-((1-三苯甲基-1H-咪唑-5-基)甲基)-14,44-双((三苯甲基硫基)甲基)四十八氢-5H-二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸叔丁酯(1.20g,粗品),为白色固体。化学式:C148H176N20O20S2,LCMS发现值:[M+Na]2+=1320.77。
步骤2:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-11-((R)-1-(叔丁氧基)乙基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41,47-二甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代-35-((1-三苯甲基-1H-咪唑-5-基)甲基)-14,44-双((三苯甲基硫基)甲基)四十八氢-5H-二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸叔丁酯酯(1.20g,粗品)在TFA/TIS/H2O/3-巯基丙酸((92.5%/2.5%/2.5%/2.5%,v/v/v,25mL)中的混合物在25℃下搅拌1.5小时。将混合物用冷异丙醚(150mL)沉淀并离心(3000rpm下3分钟)。将固体用异丙醚洗涤两次,真空干燥2小时,得到化合物3(900.0mg,粗品)。然后将化合物3(900.0mg,粗品)溶解于MeCN/H2O(1/1,v/v,500mL)中。在25℃下将I2/HOAc(0.1M)滴加到混合物中,直至浅黄色持续存在,然后滴加0.1M Na2S2O3淬灭混合物直至浅黄色消失。过滤后,滤液通过制备型HPLC(酸性条件,TFA)直接纯化,得到3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-2-氨基-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41,47-二甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(中间体12,144.00mg,16.64%收率,97.00%纯度),为白色固体。化学式:C78H108N20O18S2,LCMS发现值:[M+H]1+=1677.79,[M+2H]2+=839.39,[M+3H]3+=559.95。
中间体13-中间体28按照中间体12的制备中所述制备
中间体13:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-2-氨基-47-(2-氨基-2-氧代乙基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸
产率:230.3mg,纯度97.5%,26.0%,白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+H]+=1720.82,[M+2H]2+=860.90,[M+3H]3+=574.18。
中间体14:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-2-氨基-47-(羧甲基)-11-((R)-1-羟乙基)-41-(羟甲基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸
产率:252mg,纯度95.4%,27.6%,白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+H]+=1737.80,[M+2H]2+=869.43,[M+3H]3+=579.86。
中间体15:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚3-基)甲基)-2-氨基-11-((R)-1-羟乙基)-41-(羟甲基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-47-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸
产率:144.7mg,纯度96.1%。16.4%,白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+H]+=1693.80,[M+2H]2+=847.42,[M+3H]3+=565.19。
中间体16:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-2-氨基-47-(羧甲基)-11,41-双((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸
产率:276.3mg,纯度96.9%,30.5%,白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+H]+=1751.87,[M+2H]2+=876.47,[M+3H]3+=584.7。
中间体17:2-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-2-氨基-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-26,41-二甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-47-基)乙酸
产率:223.4mg,纯度95.0%,25.5%,白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+H]+=1663.77,[M+2H]2+=832.40,[M+3H]3+=555.01。
中间体18:2-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-2-氨基-26-(3-氨基-3-氧代丙基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-47-基)乙酸
产率:230.5mg,纯度96.2%,25.7%,白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+H]+=1720.89,[M+2H]2+=861.00,[M+3H]3+=574.29。
中间体19:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-38-((1H-吲哚-3-基)甲基)-2-氨基-47-(羧甲基)-17-((6-氯-1H-吲哚-3-基)甲基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸
产率:215.7mg,纯度95.1%,23.3%,白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+H]+=1755.81,[M+2H]2+=878.50。
中间体20:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-38-((1H-吲哚-3-基)甲基)-2-氨基-47-(羧甲基)-17-((5-氯-1H-吲哚-3-基)甲基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸
产率:161.7mg,纯度97.9%,18.0%,白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+H]+=1756.80,[M+2H]2+=878.41,[M+3H]3+=585.97。
中间体21:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-2-氨基-47-(羧甲基)-11-((R)-1-羟乙基)-41-(2-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸
产率:163.7mg,纯度98.0%,18.3%,白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+H]+=1751.81,[M+2H]2+=876.41,[M+3H]3+=584.62。
中间体22:2-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-2-氨基-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-26-(3-(甲基氨基)-3-氧代丙基)-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-47-基)乙酸
产率:153.3mg,纯度95.4%,16.8%,白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+H]+=1734.80,[M+2H]2+=867.92,[M+3H]3+=578.99。
/>
中间体23:2-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-2-氨基-26-(3-(二甲基氨基)-3-氧代丙基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-47-基)乙酸
产率:120.5mg,纯度96.2%,13.2%,白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+H]+=1748.90,[M+2H]2+=874.96,[M+3H]3+=583.60。
中间体24:3-((2S,5aR,11S,14R,17R,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-2-氨基-47-(羧甲基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸
产率:188.5mg,纯度95.6%,20.9%,白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+H]+=1721.80,[M+2H]2+=861.34,[M+3H]3+=574.61。
中间体25:(2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-2-氨基-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-26,41,47-三甲基三十四氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五酮
产率:163.5mg,纯度95.9%,19.1%,白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+H]+=1619.60,[M+2H]2+=810.50。
中间体26:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-2-氨基-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41,47-二甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)-N,N-二甲基丙酰胺
产率:34.9mg,纯度94.4%,6.4%,白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+H]+=1704.60,[M+2H]2+=853.00。
中间体27:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-2-氨基-47-(2-氨基-2-氧代乙基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)-N,N-二甲基丙酰胺
产率:119mg,纯度96.9%,22.0%,白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+H]+=1747.70,[M+2H]2+=874.60。
中间体28:2-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-2-氨基-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-26,41-二甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-47-基)乙酰胺
产率:159.8mg,纯度97.0%,18.6%,白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+H]+=1662.60,[M+2H]2+=832.10。
(4-(异喹啉-8-基)3-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基)苯基)甲醇的制备
2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)苯基)乙-1-醇的制备
步骤1:向2-(4-溴苯基)乙-1-醇(30g,149.21mmol,20.83mL,1当量)在二噁烷(200mL)中的溶液中添加BPD(45.47g,179.05mmol,1.2当量)、KOAc(29.29g,298.42mmol,2当量)和Pd(dppf)Cl2(5.46g,7.46mmol,0.05当量)。将反应混合物在85℃搅拌12小时。将残余物用水(200mL)稀释并用EtOAc(300mL x 2)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤,然后用Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。残余物无需纯化即可用于下一步反应。获得黑色油状物(35g,粗品)。
2-(4-(异喹啉-8-基)苯基)乙-1-醇的制备
步骤1:向2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)苯基)乙-1-醇(35g,141.06,1当量)和8-溴异喹啉(32.28g,155.16mmol,1.1当量)在二噁烷(300mL)中的溶液中添加碳酸二铯(91.92g,282.12mmol,2当量)和Pd(dppf)Cl2(2.06g,2.82mmol,0.02当量)。将混合物在95℃搅拌2小时。将反应混合物用水(100mL)稀释并用EtOAc(100mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到残余物。残余物通过快速硅胶色谱纯化(220g/>硅胶快速柱,0~60%乙酸乙酯/石油醚梯度洗脱液@80mL/min)。获得白色固体(13g,52.14mmol,收率36.97%)。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ=9.33(s,1H),8.55(d,J=5.6Hz,1H),7.81(br s,1H),7.83(d,J=8.3Hz,1H),7.78-7.68(m,2H),7.57-7.45(m,3H),7.44-7.36(m,2H),3.98(t,J=6.6Hz,2H),3.00(t,J=6.6Hz,2H)。
4-溴-3-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基)苯甲酸甲酯的制备
步骤1:在0℃向2-(4-(异喹啉-8-基)苯基)乙-1-醇(12.0g,48.13mmol,1当量)、4-溴-3-羟基-苯甲酸甲酯(13.35g,57.76mmol,1.2当量)、三苯基膦(25.25g,96.27mmol,2当量)在THF(120mL)中的混合物中添加DEAD(16.77g,96.27mmol,17.50mL,2当量),然后脱气并用N2吹扫3次。在N2气氛下,将混合物在15℃下搅拌12小时。将反应混合物用水(80mL)稀释并用EtOAc 150mL(50mL x 3)萃取。将合并的有机层用盐水60mL(20mL x 3)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到残余物。残余物通过快速硅胶色谱纯化(120g硅胶快速柱,0~50%乙酸乙酯/石油醚梯度洗脱液@50mL/min)。获得白色固体(16g,34.61mmol,收率71.90%)。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ=9.34(s,1H),8.55(d,J=5.1Hz,1H),7.87-7.80(m,1H),7.78-7.68(m,2H),7.66-7.60(m,1H),7.59-7.47(m,7H),4.32(q,J=7.0Hz,2H),3.92(d,J=1.0Hz,3H),3.30(t,J=6.5Hz,2H)。
4-(异喹啉-8-基)-3-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基)苯甲酸乙酯的制备
步骤1:将4-溴-3-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基)苯甲酸甲酯(50mg,108.15μmol,1当量)、8-异喹啉基硼酸(28.06mg,162.23μmol,1.5当量)、Na2CO3(28.66mg,270.38μmol,2.5当量)、二环己基-[2-(2,6-二甲氧基苯基)苯基]磷烷(8.88mg,21.63μmol,0.2当量)和二乙酰氧基钯(2.43mg,10.82μmol,0.1当量)在EtOH(4mL)中的混合物脱气并用N2吹扫3次,然后将混合物在N2气氛下在95℃搅拌12小时。将反应混合物用水1mL稀释并用EtOAc 20mL(10mLx2)萃取。将合并的有机层用盐水(4mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到残留物。通过制备型TLC(SiO2,EtOAc)纯化残余物。获得白色固体(30mg,58.76μmol,收率54.33%)。
(4-(异喹啉-8-基)-3-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基)苯基)甲醇的制备
步骤1:向4-(异喹啉-8-基)-3-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基)苯甲酸乙酯(20mg,39.17μmol,1当量)在THF(1mL)中的混合物在0℃添加LAH(2.97mg,78.34μmol,2当量)。将混合物脱气并用N2吹扫3次,然后将混合物在N2气氛下于20℃搅拌1小时。在0℃下通过添加溶剂MgSO4·0.04mL来淬灭反应混合物,然后通过硅藻土垫过滤混合物,并用Na2SO4干燥滤液,过滤并减压浓缩,得到残余物。通过制备型TLC(SiO2,EtOAc)纯化残余物,得到白色固体状的中间体25(2mg,3.81μmol,9.73%收率,92%纯度)。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ=9.18(s,1H),9.07(s,1H),8.58-8.47(m,2H),7.89-7.73(m,6H),7.54-7.46(m,2H),7.31(d,J=7.5Hz,1H),7.18(d,J=7.9Hz,2H),7.13-7.08(m,2H),6.88(d,J=7.5Hz,2H),4.82(s,2H),4.32-4.14(m,2H),2.91-2.78(m,2H),2.91-2.78(m,1H)。
2-(2-(2-((4-(异喹啉-8-基)-3-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基)苄基)氧基)乙氧基)乙氧基)乙-1-胺的制备
步骤1:向(2-(2-(2-羟基乙氧基)乙氧基)乙基)氨基甲酸叔丁酯(1g,4.01mmol,1当量)的DCM(10mL)溶液在0℃下添加MsCl(689.23mg,6.02mmol,465.69μL,1.5当量)和TEA(811.77mg,8.02mmol,1.12mL,2当量)。将混合物脱气并用N2吹扫3次,然后将混合物在N2气氛下在20℃搅拌2小时。将反应混合物用5mL NaHCO3饱和溶液淬灭,然后用20mL EtOAc(100mL x 2)萃取。将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到粗产物。粗产物不经纯化直接用于下一步。2,2-二甲基-4-氧代-3,8,11-三氧杂-5-氮杂十三-13-基甲磺酸酯(1.1g,3.36mmol,83.76%收率)作为浅黄色油状物获得。1H NMR(400MHz,氯仿-d)Shift=4.92(br s,1H),4.46-4.35(m,2H),3.78(dd,J=3.6,5.4Hz,2H),3.72-3.65(m,2H),3.65-3.59(m,2H),3.54(t,J=5.2Hz,2H),3.33(br s,2H),3.08(s,3H),1.46(s,9H)。
步骤2:向(4-(异喹啉-8-基)-3-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基)苯基)甲醇(100mg,207.22μmol,1当量)和2,2-二甲基-4-氧代-3,8,11-三氧杂-5-氮杂十三-13-基甲磺酸酯(135.69mg,414.44μmol,2当量)在DMF(1mL)中的混合溶液中在0℃下添加NaH(33.15mg,828.88μmol,60%纯度,4当量)。将混合物脱气并用N2吹扫3次,然后将混合物在N2气氛下在20℃搅拌12小时。通过在0℃下添加水(2mL)来淬灭反应混合物,然后用水(4mL)稀释并用EtOAc30mL(15mL x 2)萃取。将合并的有机层用盐水(5mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩得到残留物。通过制备型TLC(SiO2,EtOAc=1)纯化残余物。获得呈黄色固体的标题(2-(2-(2-((4-(异喹啉-8-基)-3-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基)苄基)氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)氨基甲酸叔丁酯(80mg,112.07μmol,54.0%收率)。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ=4.45-4.36(m,2H),3.83-3.77(m,2H),3.72-3.65(m,2H),3.65-3.60(m,2H),3.54(t,J=5.3Hz,2H),3.39-3.28(m,2H),3.08(s,3H),1.46(s,9H).LCMS:714.5。
步骤3:(2-(2-(2-((4-(异喹啉-8-基)-3-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基)苄基)氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)氨基甲酸叔丁酯(70mg,98.06μmol,1当量)的溶液添加到TFA(4.62g,40.52mmol,3mL,413.21当量)中。将混合物脱气并用N2吹扫3次,然后将混合物在N2气氛下在20℃搅拌1小时。将反应混合物过滤并且减压浓缩以得到残余物。将残余物通过备型HPLC纯化。获得2-(2-(2-((4-(异喹啉-8-基))-3-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基)苄基)氧基)乙氧基)乙氧基)乙-1-胺(10mg,16.29μmol,16.6%收率),为白色固体。1H NMR(400MHz,氯仿-d)位移=9.36-9.36(m,1H),9.36-9.34(m,1H),9.36-9.34(m,1H),9.42-9.29(m,1H),8.65(br d,J=6.3Hz,1H),8.40(br d,J=6.4Hz,1H),8.25-8.06(m,7H),7.85(t,J=6.8Hz,2H),7.34-7.29(m,2H),7.18(br d,J=7.6Hz,2H),6.96(br d,J=7.8Hz,2H),4.73-4.61(m,2H),4.47-4.38(m,1H),4.43(br d,J=8.3Hz,1H),4.23(br d,J=9.1Hz,1H),3.79(br d,J=9.8Hz,6H),3.68(br d,J=7.0Hz,4H),3.17(br s,2H),2.91-2.66(m,2H).LCMS:614.2。
8-(4-(2-(5-(哌嗪-1-基甲基)-2-(1H-吡咯并[3,2-c]吡啶-3-基)苯氧基)乙基)苯基)异喹啉的制备
步骤1:将4-溴-3-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基)苯甲酸甲酯(3g,6.49mmol,1当量)溶解在THF(30mL)中的溶液冷却至0℃,然后在0℃添加LAH(1M,7.14mL,1.1当量)。将反应混合物在0℃搅拌1小时。LC-MS(ET44471-11-P1A1、ET44471-11-P1X1)上显示了几个新峰,检测到所需化合物。TLC(石油醚∶乙酸乙酯=0∶1,Rf=0.32)。将残余物通过柱色谱法(SiO2,石油醚∶乙酸乙酯=0∶1)纯化。获得呈白色固体的(4-溴-3-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基)苯基)甲醇(1.64g,3.78mmol,收率58.19%)。
步骤2:向(4-溴-3-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基)苯基)甲醇(200mg,460.49μmol,1当量)在DCM(5mL)中的溶液中在0℃下添加SOCl2(547.84mg,4.60mmol,334.05μL,10当量)。将混合物在20℃搅拌12小时。将残余物用H2O 5mL稀释并用DCM(5mL x 3)萃取。减压浓缩合并的有机层得到残余物。获得8-(4-(2-(2-溴-5-(氯甲基)苯氧基)乙基)苯基)异喹啉(200mg,粗品),为黄色固体。
步骤3:向8-(4-(2-(2-溴-5-(氯甲基)苯氧基)乙基)苯基)异喹啉(200mg,441.73μmol,1当量)的二噁烷(4mL)溶液中加入哌嗪-1-甲酸叔丁酯(246.81mg,1.33mmol,3当量)。将混合物在80℃搅拌12小时。将残余物用H2O(10mL)稀释并用EtOAc(20mL x 3)萃取。减压浓缩合并的有机层得到残余物。通过制备型TLC(SiO2,石油醚∶乙酸乙酯=0∶1,Rf=0.28)纯化残余物。得到黄色油状的4-(4-溴-3-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基)苄基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(200mg,331.92μmol,75.14%收率)。
步骤4:4-(4-溴-3-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基)苄基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(133mg,220.72μmol,1当量)、3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡咯并[3,2-c]吡啶-1-甲酸叔丁酯(113.96mg,331.09μmol,1.5当量)、二叔丁基(环戊基)磷烷;Pd(dtbpf)Cl2(14.39mg,22.07μmol,0.1当量)、K3PO4(93.70mg,441.45μmol,2当量)在THF(4mL)和H2O(1mL)中的混合物脱气并用N2吹扫3次,然后将混合物在N2气氛下在80℃搅拌18小时。将反应混合物用H2O(4mL)稀释并用EtOAc(10mL x 3)萃取。减压浓缩合并的有机层得到残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2,石油醚∶乙酸乙酯=0∶1,Rf=0.47)纯化。获得3-(4-((4-(叔丁氧基羰基)哌嗪-1-基)甲基)-2-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基)苯基)-1H-吡咯并[3,2-c]吡啶-1-甲酸叔丁酯(160mg,216.25μmol,97.97%收率),为黑棕色油状物。
步骤5:3-(4-((4-(叔丁氧基羰基)哌嗪-1-基)甲基)-2-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基)苯基)-1H-吡咯并[3,2-c]吡啶-1-甲酸酯(150mg,202.73μmol,1当量)、TFA(69.35mg,608.19μmol,45.03μL,3当量)在DCM(5mL)中的混合物在20℃搅拌12小时。进行后处理并将合并的有机层减压浓缩,得到残余物。通过制备型HPLC(TFA条件(柱:Phenomenex luna C18100*40mm*5μm;流动相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:5%-35%,8min))纯化残余物。获得8-(4-(2-(5-(哌嗪-1-基甲基)-2-(1H-吡咯并[3,2-c]吡啶-3-基)苯氧基)乙基)苯基)异喹啉(14.55mg,22.26μmol,10.98%收率,TFA),为白色固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ=13.18(br s,1H),9.30(s,1H),9.18(s,1H),8.63(d,J=6.0Hz,1H),8.47(d,J=6.6Hz,1H),8.25-8.13(m,2H),8.08-7.99(m,3H),7.68(dd,J=2.7,7.1Hz,2H),7.43(t,J=7.9Hz,3H),7.38-7.32(m,2H),7.20(d,J=7.6Hz,1H),4.41(br t,J=6.7Hz,2H),4.22(br s,2H),3.36(brs,3H),3.27-3.07(m,5H),1.33-1.18(m,1H)。
8-[4-[2-[5-[(4-甲基哌嗪-1-基)甲基]-2-(1H-吡咯并[3,2-c]吡啶-3-基)苯氧基]乙基]苯基]异喹啉的制备
步骤1:向8-[4-[2-[5-(哌嗪-1-基甲基)-2-(1H-吡咯并[3,2-c]吡啶-3-基)苯氧基]乙基]苯基]异喹啉(50mg,92.65μmol,1)在MeOH(1mL)中的溶液中加入甲醛(3.34mg,111.18μmol,3.06uL,1.2当量),然后在0℃添加NaBH3CN(17.47mg,277.95μmol,3当量)和AcOH(5.56mg,92.65μmol,5.30μL,1当量)。将混合物在20℃搅拌12小时。处理反应混合物并将合并的有机层减压浓缩,得到残余物。将残余物通过备型HPLC纯化。获得白色固体的8-[4-[2-[5-[(4-甲基哌嗪-1-基)甲基]-2-(1H-吡咯并[3,2-c]吡啶-3-基)苯氧基]乙基]苯基]异喹啉(10.81mg,16.19μmol,17.4%收率,TFA盐)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ=13.11(br s,1H),9.31(s,1H),9.19(br s,1H),8.64(br d,J=5.6Hz,1H),8.48(d,J=6.7Hz,1H),8.20(br d,J=5.1Hz,1H),8.16(d,J=8.2Hz,1H),8.06(d,J=2.0Hz,1H),8.04(s,1H),8.03-7.99(m,1H),7.68(br d,J=7.1Hz,1H),7.64(d,J=7.7Hz,1H),7.45(d,J=8.1Hz,2H),7.40-7.34(m,3H),7.32(s,1H),7.14(br d,J=7.5Hz,1H),4.42(brt,J=6.5Hz,5H),3.94(br s,2H),3.15(br t,J=6.5Hz,4H),2.83(s,4H)。
其他胞外蛋白靶向配体的合成:
(3S)-4-(4-溴苯基)-3-(4-(4-(1-羟乙基)-2-甲氧基-5-硝基苯氧基)丁酰胺基)-N-(2-(2-(2-(甲基氨基)乙氧基)乙氧基)乙基)丁酰胺
N-(2-(2-(2-氨基乙氧基)乙氧基)乙基)-4-(((4-(二环[2.2.1]庚-2-基氨基)-6-((环己基甲基)氨基)-1,3,5-三嗪-2-基)氨基)甲基)苯甲酰胺
/>
降解剂的合成
A1,(2R,3R,4R,5R)-2-(羟甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
/>
步骤1:在0℃向2,2′-氧基双(乙-1-醇)(10.0g,90mmol)在吡啶(50mL)中的溶液中添加DMAP(22.0g,180.0mmol)和TBSCl(1.35g,9.0mmol)。将混合物在N2下在室温下搅拌16小时。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过柱纯化,得到2-(2-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)乙氧基)乙-1-醇(1.47g,7%收率),LC-MS(ESI)发现值:221[M+H]+。
步骤2:在0℃向2-(2-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)乙氧基)乙-1-醇(1.47g,6.7mmol)在THF(50.0mL)中的溶液中添加3-乙炔基苯酚(790.6mg,6.7mmol)、PPh3(2.1g,8.0mmol)和DEAD(1.4g,8.0mmol)。将混合物在室温下搅拌2小时。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过柱纯化,得到叔丁基(2-(2-(3-乙炔基苯氧基)乙氧基)乙氧基)二甲基硅烷(1.2g,60%收率)。LC-MS(ESI)发现值:321[M+H]+。
步骤3:向叔丁基(2-(2-(3-乙炔基苯氧基)乙氧基)乙氧基)二甲基硅烷(1.2g,4.0mmol)在MeOH(50mL)中的溶液中添加N-((3aS,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-4-(叠氮甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(1.5g,4.0mmol)、CuSO4(64.0mg,0.4mmol)、抗坏血酸钠(72.0mg,0.4mmol)和THPTA(144.0mg,0.4mmol)。将混合物在N2下于室温搅拌16小时。将混合物浓缩,得到粗产物,将其通过柱纯化,得到N-((3aS,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-4-((4-(3-(2-(2-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)乙氧基)乙氧基)苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(900.0mg,收率32%)。LC-MS(ESI)发现值:701[M+H]+。
步骤4:向N-((3aS,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-4-((4-(3-(2-(2-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)乙氧基)乙氧基)苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(900.0mg,1.29mmol)的THF(40.0mL)溶液中添加TBAF(2.58mL,1M的THF溶液),将混合物在室温下搅拌16小时。将混合物用乙酸乙酯(100mL)稀释并用水(60mL x 3)洗涤。将有机层经硫酸钠干燥,过滤,减压浓缩,得到粗产物,将其通过柱纯化,得到N-((3aS,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-4-((4-(3-(2-(2-羟基乙氧基)乙氧基)苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(586mg,77%收率)。LC-MS(ESI)发现值:587[M+H]+。
步骤5:向N-((3aS,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-4-((4-(3-(2-(2-羟基乙氧基)乙氧基)苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(586.0mg,1.0mmol)的DCM(30.0mL)溶液中添加TEA(303mg,3.0mmol)、DMAP(122.0mg,1.0mmol)和TsCl(229.0mg,1.20mmol)。将混合物在室温下搅拌16小时。将混合物用乙酸乙酯(100mL)稀释并用水(50mL x 3)洗涤,减压浓缩有机层得到粗产物,将其通过柱纯化得到2-(2-(3-(1-(((3aS,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-2,2-二甲基-7-(2,2,2-三氟乙酰胺基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)苯氧基)乙氧基)乙基4-甲基苯磺酸酯(584mg,79%收率)。LC-MS(ESI)发现值:741[M+H]+。
步骤6:向2-(2-(3-(1-(((3aS,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-2,2-二甲基-7-(2,2,2-三氟乙酰胺基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)苯氧基)乙氧基)乙基4-甲基苯磺酸酯(584mg,0.79mmol)在DMF(30.0mL)中溶液中添加NaN3(513.0mg,7.9mmol),将混合物在100℃下搅拌16小时。将混合物用乙酸乙酯(150.0mL)稀释并用水(100.0mL x 3)洗涤,减压浓缩有机层得到粗产物,将其通过柱纯化得到N-((3aS,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-4-((4-(3-(2-(2-叠氮基乙氧基)乙氧基)苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(427mg,88%收率)。LC-MS(ESI)发现值:612[M+H]+。
步骤7:将N-((3aS,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-4-((4-(3-(2-(2-叠氮基乙氧基)乙氧基)苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(427.0mg,0.70mmol)在NH3/MeOH(20mL,7M)中的溶液在80℃下搅拌16小时。将混合物减压浓缩,得到粗品(3aS,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-4-((4-(3-(2-(2-叠氮基乙氧基)乙氧基)苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-胺(309mg,收率85%)。LC-MS(ESI)发现值:516[M+H]+。
步骤8:向(3aS,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-4-((4-(3-(2-(2-叠氮基乙氧基)乙氧基)苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-胺(30.9mg,0.06mmol)在i-PrOH(30.0mL)中的溶液中添加2-氯-4-(三氟甲基)嘧啶(10.9mg,0.06mmol)和DIEA(23.6mg,1.8mmol)。将混合物在100℃下搅拌16小时。将混合物浓缩并通过柱纯化,得到N-((3aS,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-4-((4-(3-(2-(2-叠氮基乙氧基)乙氧基)苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-4-(三氟甲基)嘧啶-2-胺(36.3mg,93%收率)。LC-MS(ESI)发现值:662[M+H]+。
步骤9:向N-((3aS,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-4-((4-(3-(2-(2-叠氮基乙氧基)乙氧基)苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-4-(三氟甲基)嘧啶-2-胺(36.3mg,0.056mmol)在THF(2mL)中的溶液中添加HCl(2mL,2N在水中)。将混合物在室温下搅拌16小时。将混合物浓缩并通过柱纯化,得到(2R,3R,4R,5R,6S)-6-(烯丙氧基)-2-((4-(3-(2-(2-叠氮基乙氧基)乙氧基)苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A1,3.0mg,10%收率)。LC-MS(ESI)发现值:662[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.52(d,J=4.5Hz,1H),8.36(s,1H),7.42(dd,J=10.7,5.0Hz,2H),7.34(t,J=7.9Hz,1H),6.97-6.89(m,2H),5.63(m,1H),4.98(dd,J=27.9,14.3Hz,3H),4.74-4.66(m,3H),4.30(dd,J=8.2,4.5Hz,1H),4.22-4.17(m,2H),4.01(d,J=2.6Hz,1H),3.96(dd,J=10.8,3.1Hz,1H),3.88(dd,J=5.4,3.8Hz,2H),3.78-3.70(m,3H),3.68(d,J=5.6Hz,1H),3.43-3.37(m,2H).19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-72.34(s)。
A2,3,3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)丙酰胺)的制备
/>
步骤1:向(2R,3R,4R,5S)-2-(羟甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(800mg,2.6mmol)在DMF(10mL)中的溶液中添加咪唑(352mg,5.2mmol)和TBDPSC1(0.9mL,3.5mmol)。将反应搅拌过夜,用水淬灭,通过EA萃取三次。将合并的有机层干燥并浓缩,通过使用PE中的80%EA的柱纯化,得到(2R,3R,4R,5S)-2-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(613mg,43%收率),为黄色固体。LC-MS(ESI)发现值:548[M+H]+。
步骤2:向(2R,3R,4R,5S)-2-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(613mg,1.12mmol)在2,2-二甲氧基丙烷(10mL)中的溶液中添加对甲苯磺酸(20mg,0.11mmol)并将反应在室温下搅拌过夜。将混合物浓缩并通过柱用30%EA的PE溶液纯化以得到N-((3aR,4R,7S,7aR)-4-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(570mg,87%收率),为浅黄色油状物。LC-MS(ESI)发现值:588[M+H]+。
步骤3:向N-((3aR,4R,7S,7aR)-4-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(1.4g,2.4mmol)在THF(20mL)中的溶液中添加TBAF(3mL,1M的THF溶液)。将混合物在室温下搅拌12小时。将混合物浓缩并通过色谱法纯化(硅胶,0-10%甲醇的二氯甲烷溶液),得到((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲醇(750mg,90%收率),为固体。LC-MS(ESI)发现值:350[M+H]+。
步骤4:在0℃下将((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲醇(750mg,2.1mmol)的DMF(10mL)溶液中添加NaH(126mg,3.2mmol,60%重量,在矿物油中)。1小时后,将2-(2-(2-(2-叠氮基乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基4-甲基苯磺酸酯(962mg,2.6mmol)添加至溶液中,将混合物在室温下搅拌12小时。将混合物用H2O淬灭并用EA萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤。将滤液浓缩并通过色谱法纯化(硅胶,0-10%甲醇的二氯甲烷溶液),得到N-((3aR,4R,7S,7aR)-4-(13-叠氮基-2,5,8,11)-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(200mg,87%收率),为固体。LC-MS(ESI)发现值:551[M+H]+。
步骤5:N-((3aR,4R,7S,7aR)-4-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(200mg,0.4mmol)的甲醇(5mL)溶液中添加Pd/C(20mg,10%wt,60%湿)。将混合物在H2气球下于室温搅拌过夜。将混合物浓缩,得到粗品N-((3aR,4R,7S,7aR)-4-(13-氨基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(191mg,100%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:525[M+H]+。
步骤6:向3,3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))二丙酸(71mg,0.2mmol)、HATU(152mg,0.4mmol)和DIEA(77mg,0.6mmol)的溶液中在0℃下添加N-((3aR,4R,7S,7aR)-4-(13-氨基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(191mg,0.4mmol。将混合物在室温下搅拌过夜。将混合物用H2O淬灭并用EA萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤。将滤液浓缩并通过色谱法(硅胶,0-20%甲醇的二氯甲烷溶液)纯化,得到3,3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(80mg,29%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:1387[M+H]+。
步骤7:向3,3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)丙酰胺)(80mg,0.05mmol)在THF(5mL)中的溶液中添加HCl(0.1ml,1M),将混合物在室温下搅拌过夜。将混合物浓缩并通过C18纯化,得到3,3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)丙酰胺)(A2,60mg,80%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:1307[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.11(s,2H),8.00(s,2H),4.33(td,J=10.6,5.1Hz,2H),4.13-4.04(m,3H),3.92(d,J=2.9Hz,2H),3.74-3.58(m,36H),3.55(t,J=5.5Hz,4H),3.48(ddd,J=19.2,9.7,5.5Hz,4H),3.37(dd,J=11.1,5.7Hz,4H),3.28(d,J=6.8Hz,2H),3.12(t,J=10.8Hz,2H),2.45(dd,J=6.7,5.5Hz,4H),2.22(t,J=7.4Hz,2H),1.75-1.54(m,4H),1.46-1.31(m,2H).19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-70.25。
A3,1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃4-基)-20-(1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二烷-32-烷酸的制备
步骤1:在室温下向15-((2-羧基乙氧基)甲基)-3,13-二氧代-1-苯基-2,5,8,11,17-五氧杂-14-氮杂二十烷-20-烷酸(0.56g,1.06mmol)和HATU(1.2g,3.18mmol)在DMF(10mL)中的溶液中添加DIPEA(0.54g,4.24mmol)和(2R,3R,4R,5S)-2-(13-氨基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(1.07g,2.2mmol)。将反应混合物在室温下搅拌过夜。分离所得混合物并真空浓缩。通过快速色谱法(C18,0-80%,MeOH的H2O溶液)纯化粗产物,得到1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二烷-32-烷酸苄酯(1.1g,73%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:1463[M+H]+。
步骤2:向1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-烷酸苄酯(1.07g,0.75mmol)在DMF(5mL)中的溶液添加对-TsOH(0.03g,0.14mmol)和2,2-二甲氧基丙烷(1.56g,15mmol),并且将反应在室温下搅拌过夜。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过快速色谱法纯化(C18,0-80%,MeOH的H2O溶液),得到1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-20-(1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-烷酸甲酯(0.8g,72%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:1467[M+H]+。
步骤3:向1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-20-(1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-烷酸甲酯(0.8g,0.54mmol)在MeOH(10mL)中的溶液中加入一水合氢氧化锂(20mg,0.82mmol)并将反应在室温下搅拌过夜。将混合物的pH调节至5并用乙酸乙酯(50mL)稀释,然后用水(50mL x 3)洗涤。有机层经硫酸钠干燥,过滤,减压浓缩,得到粗产物,将其通过柱纯化,得到1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-20-(1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-烷酸(A3,0.6g,75%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:1453[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.51(d,J=4.7Hz,2H),6.90(d,J=4.9Hz,2H),4.31(s,2H),4.23(dt,J=6.2,3.1Hz,2H),4.21-4.15(m,2H),4.13(s,2H),4.00(s,2H),3.91(dd,J=10.9,5.6Hz,4H),3.78-3.59(m,41H),3.52(ddd,J=13.4,10.2,4.6Hz,8H),3.37(t,J=5.5Hz,4H),3.16(t,J=11.1Hz,2H),2.45(t,J=6.2Hz,4H),1.50(s,6H),1.30(d,J=13.2Hz,6H)。
A5,(2R,3R,4R,5R,6S)-2-((1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-6-(烯丙氧基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:将THPTA(20mg)和CuSO4(3mg)溶解在水(0.5mL)中。将混合物添加至N-((2S,3R,4R,5R,6R)-2-(烯丙氧基)-6-(叠氮基甲基)-4,5-二羟基四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(50mg,0.15mmol)和乙炔基三甲基硅烷(29mg,0.3mmol)在MeOH(4mL)中的溶液中。添加新制备的抗坏血酸钠(6mg)在水(0.5mL)中的溶液。将反应搅拌过夜。将所得混合物过滤。通过色谱法(硅胶,0-100%乙酸乙酯的石油醚溶液)纯化粗产物,得到N-((2S,3R,4R,5R,6R)-2-(烯丙氧基)-4,5-二羟基-6-((4-(三甲基甲硅烷基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(40mg,61%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:439[M+H]+。
步骤2:向N-((2S,3R,4R,5R,6R)-2-(烯丙氧基)-4,5-二羟基-6-((4-(三甲基甲硅烷基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(40mg,0.09mmol)在THF(3mL)中的溶液中添加TBAF(1mL,1M在THF中)。将混合物在40℃下搅拌过夜。将混合物浓缩并通过色谱法(硅胶,二氯甲烷中的0-20%甲醇)纯化残余物以得到N-((2S,3R,4R,5R,6R)-6-((1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-2-(烯丙氧基)-4,5-二羟基四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(25mg,76%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:367[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.01(s,1H),7.74(s,1H),5.67(ddd,J=22.5,10.9,5.9Hz,1H),5.10(dd,J=22.9,5.8Hz,2H),4.86(s,3H),4.69(d,J=2.3Hz,1H),4.67(s,1H),4.32(dd,J=10.8,3.7Hz,1H),4.26-4.20(m,1H),3.97(dd,J=10.9,3.3Hz,1H),3.93(d,J=3.0Hz,1H),3.70(dd,J=12.9,5.4Hz,1H),3.63(dd,J=12.9,6.2Hz,1H).19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-77.01。
步骤3:将N-((2S,3R,4R,5R,6R)-6-((1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-2-(烯丙氧基)-4,5-二羟基四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(20mg,0.05mmol)在NH3/MeOH(3mL,7mol/L)中的溶液在80℃在密封管中搅拌过夜。将混合物浓缩,得到粗品(2R,3R,4R,5R,6S)-2-((1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-6-(烯丙氧基)-5-氨基四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(14mg,100%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:271[M+H]+。
步骤4:将(2R,3R,4R,5R,6S)-2-((1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-6-(烯丙氧基)-5-氨基四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(14mg,0.05mmol)、2-氯-4-(三氟甲基)嘧啶(18mg,0.1mmol)和DIEA(26mg,0.2mmol)在异丙醇(3mL)中的溶液在80℃在密封管中搅拌过夜。将混合物浓缩并通过C18色谱纯化,得到(2R,3R,4R,5R,6S)-2-((1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-6-(烯丙氧基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A5,8.8mg,42%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:417[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.51(d,J=4.6Hz,1H),8.02(d,J=0.8Hz,1H),7.74(d,J=0.9Hz,1H),6.91(d,J=4.9Hz,1H),5.64(dd,J=10.7,5.7Hz,1H),5.07(d,J=17.2Hz,1H),5.00(d,J=10.4Hz,1H),4.96(s,1H),4.71(d,J=2.7Hz,1H),4.69(s,1H),4.55(s,1H),4.29-4.22(m,1H),4.01-3.88(m,2H),3.75-3.52(m,2H).19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-72.35。
A6,(2R,3R,4R,5R,6S)-6-(烯丙氧基)-2-(叠氮基甲基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:将N-((2S,3R,4R,5R,6R)-2-(烯丙氧基)-6-(叠氮基甲基)-4,5-二羟基四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(40mg,0.11mmol)的NH3/MeOH(3mL,7mol/L)溶液在密封管中在80℃下搅拌过夜。将混合物浓缩,得到粗制(2R,3R,4R,5R,6S)-6-(烯丙氧基)-5-氨基-2-(叠氮基甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(28mg,100%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:245[M+H]+。
步骤2:将(2R,3R,4R,5R,6S)-6-(烯丙氧基)-5-氨基-2-(叠氮基甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(28mg,0.11mmol)、2-氯-4-(三氟甲基)嘧啶(27mg,0.15mmol)和DIEA(26mg,0.2mmol)在异丙醇(3mL)中的溶液在密封管中在80℃下搅拌过夜。将混合物浓缩并通过C18柱色谱纯化,得到(2R,3R,4R,5R,6S)-6-(烯丙氧基)-2-(叠氮基甲基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A6,8.8mg,20%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:391[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.52(d,J=4.8Hz,1H),6.91(d,J=4.9Hz,1H),5.89(s,1H),5.28(d,J=17.2Hz,1H),5.12(d,J=10.5Hz,1H),5.04(s,1H),4.52(s,1H),4.22(ddt,J=13.0,5.0,1.3Hz,1H),4.08-3.97(m,2H),3.92(dd,J=10.8,3.2Hz,1H),3.86(d,J=2.5Hz,1H),3.62(dd,J=12.8,8.7Hz,1H),3.33(s,1H).19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-72.35。
A7,4-(((3S,4R,5R,6R)-4,5-二羟基-6-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)氨基)-6-(三氟甲基)嘧啶-2-甲腈的制备
步骤1:在室温下在N2向(2R,3R,4R,5S)-5-氨基-2-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇盐酸盐(500mg,3.1mmol)在i-PrOH(3.0mL)中的混合物中添加2,4-二氯-6-(三氟甲基)嘧啶(0.84mL,6.1mmol)和DIEA(1.5mL,9.2mmol)。在室温搅拌过夜后,将混合物浓缩并通过色谱法纯化(硅胶,0-30%甲醇的DCM溶液),得到(2R,3R,4R,5S)-5-((2-氯-6-(三氟甲基)嘧啶-4-基)氨基)-2-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(160mg,15%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:344[M+1]+。
步骤2:在室温在N2下向(2R,3R,4R,5S)-5-((2-氯-6-(三氟甲基)嘧啶-4-基)氨基)-2-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(20mg,0.058mmol)在DMF(3.0mL)中的混合物添加Zn(CN)2(4.1mg,0.035mmol)、dppf(16.2mg,0.028mmol)、Zn(3.3mg,0.31mmol)和Pd2(dba)3(26.6mg,0.18mmol)。在120℃下搅拌过夜后,将反应混合物浓缩并通过制备型TLC纯化,得到4-(((3S,4R,5R,6R)-4,5-二羟基-6-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)氨基)-6-(三氟甲基)嘧啶-2-甲腈(A7,2.4mg,12%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:333[M-H]-.1H NMR(400MHz,CD3OD):δ6.97(s,1H),4.57-4.48(m,1H),4.08(dd,J=11.1,5.2Hz,1H),3.92(d,J=2.8Hz,1H),3.76(dd,J=11.3,7.1Hz,1H),3.69(dd,J=11.4,4.9Hz,1H),3.62(dd,J=10.6,3.1Hz,1H),3.48-3.44(m,1H),3.14(t,J=10.9Hz,1H)。
A8,(2R,3R,4R,5S)-5-((5-氟-6-(三氟甲基)吡啶-2-基)氨基)-2-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:向(3S,4R,5R,6R)-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-胺(200.0mg,0.462mmol)在DMF(10.0mL)中的溶液中加入6-氯-3-氟-2-(三氟甲基)吡啶(91.9mg,0.462mmol)、Ruphos.Pd.G3(38.0mg,0.046mmol)、Ruphos(21.5mg,0.046mmol)和Cs2CO3(450.5mg,1.386mmol)。将混合物在N2下在70℃下搅拌16小时。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过柱纯化,得到N-((3S,4R,5R,6R)-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-5-氟-6-(三氟甲基)吡啶-2-胺(100.1mg,收率36%)。LC-MS(ESI)发现值:597[M+H]+。
步骤2:在0℃下向N-((3S,4R,5R,6R)-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-5-氟-6(三氟甲基)吡啶-2-胺(100.1mg,0.168mmol)的DCM(20.0mL)溶液中添加BCl3(1.68mL,1N的DCM溶液)。将混合物在室温下搅拌2小时。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过柱纯化,得到(2R,3R,4R,5S)-5-((5-氟-6-(三氟甲基)吡啶-2-基)氨基)-2-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A8,6.0mg,11%收率)。LC-MS(ESI)发现值:327[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ7.40(t,J=9.5Hz,1H),6.77(dd,J=9.2,2.7Hz,1H),4.30-4.11(m,2H),3.90(d,J=2.7Hz,1H),3.75(dd,J=11.4,7.1Hz,1H),3.68(dd,J=11.4,5.0Hz,1H),3.59(dd,J=10.1,3.2Hz,1H),3.48-3.41(m,1H),3.08(dd,J=15.1,5.7Hz,1H).19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-66.95(d,J=18.0Hz),-141.07--145.72(m)。
A9,(2R,3R,4R,5R)-2-(羟甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:向(3S,4R,5R,6R)-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-胺(200.0mg,0.462mmol)在DMF(10.0mL)中的溶液中加入2-氯-6-(三氟甲基)吡嗪(84.1mg,0.462mmol)、Ruphos.Pd.G3(38.0mg,0.046mmol)、Ruphos(21.5mg,0.046mmol)和Cs2CO3(450.5mg,1.386mmol)。将混合物在N2下在70℃下搅拌16小时。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过柱纯化,得到N-((3R,4R,5R,6R)-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(95mg,收率34%)。LC-MS(ESI)发现值:580[M+H]+。
步骤2:在0℃下向N-((3R,4R,5R,6R)-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(95mg,0.168mmol)的DCM(20.0mL)溶液中添加BCl3(1.68mL,1N的DCM溶液)。将混合物在室温下搅拌2小时。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过柱纯化,得到(2R,3R,4R,5R)-2-(羟甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A9,2.0mg,4%收率)。LC-MS(ESI)发现值:310[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.14(s,1H),7.98(s,1H),4.33(d,J=3.5Hz,1H),4.04(dd,J=12.0,2.0Hz,1H),3.98-3.90(m,1H),3.86(dd,J=4.6,3.2Hz,1H),3.80(dd,J=11.5,7.1Hz,1H),3.70(dd,J=11.5,4.7Hz,1H),3.59(dd,J=12.1,1.7Hz,1H),3.49-3.41(m,1H).19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-70.42(s)。
A10,(1S,2R,3R,4R,5S)-1-(羟甲基)-4-((5-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇的制备
步骤1:(1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(20mg,0.11mmol)、2-氯-5-(三氟甲基)吡嗪(19mg,0.11mmol)和DIPEA(20mg,0.16mmol)在NMP(1mL)中的溶液在80℃搅拌过夜。通过制备型HPLC纯化混合物,得到(1S,2R,3R,4R,5S)-1-(羟甲基)-4-((5-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(A10,5.4mg,15%收率),为黄色固体。LC-MS(ESI)发现值:338[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.26(s,1H),7.99(d,J=1.2Hz,1H),5.35(d,J=1.4Hz,1H),4.25(d,J=9.9Hz,1H),3.94(t,J=8.2Hz,2H),3.83(dt,J=10.6,6.5Hz,3H),3.71(d,J=7.9Hz,1H)。
A11,1-((3aR,4S,7S,8R,8aR)-8-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,2-二甲基四氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-4(5H)-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-醇的制备
步骤1:在0℃向((3aR,4S,7S,8R,8aR)-8-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,2-二甲基四氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-4(5H)-基)甲醇(100mg,0.29mmol)的DMF(3mL)溶液中添加NaH(23mg,0.58mmol,60%重量,在矿物油中)。在0℃搅拌20分钟后,添加2,2,3,3-四甲基-4,7,10,13-四氧杂-3-硅十五烷-15-基4-甲基苯磺酸酯(145mg,0.31mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜,然后用EA和H2O萃取。浓缩有机层并通过快速柱纯化残余物以得到3-氯-N-((3aR,4S,7S,8R,8aR)-2,2-二甲基-4-(15,15,16,16-四甲基-2,5,8,11,14-五氧杂-15-硅十七烷基)六氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-8-基)-1,2,4-噻二唑-5-胺(80mg,43%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:640[M+H]+。
步骤2:在0℃下向3-氯-N-((3aR,4S,7S,8R,8aR)-2,2-二甲基-4-(15,15,16,16-四甲基-2,5,8,11,14-五氧杂-15-硅十七烷基)六氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-8-基)-1,2,4-噻二唑-5-胺(80mg,0.12mmol)的THF(3mL)溶液中添加TBAF(0.1mL,1N THF溶液)。将混合物在0℃下搅拌1小时,然后浓缩。通过制备型HPLC纯化残余物,得到1-((3aR,4S,7S,8R,8aR)-8-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,2-二甲基四氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-4(5H)-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-醇(A11,10.7mg,16%收率),为白色固体。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ5.38(d,J=1.7Hz,1H),4.33(d,J=5.9Hz,1H),4.22(t,J=6.3Hz,1H),3.92(dd,J=18.4,9.0Hz,2H),3.83-3.77(m,2H),3.73-3.63(m,15H),3.56(dd,J=6.2,3.4Hz,2H),1.53(s,3H),1.35(s,3H)。
A12,3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-(苯基氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-2,3-二羟基-4-(2,2,2-三氟乙酰胺基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)丙酰胺)的制备
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步骤1:向2-(2-(2-(2-(甲苯磺酰氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯(550mg,1.32mmol)在DMF(5mL)中的溶液中添加苯胺(368mg,3.95mmol)和DIEA(0.87mL,5.26mmol),并将反应在100℃下搅拌16小时。将反应物用EA和水稀释。将有机层分离并真空浓缩。使用硅胶柱色谱法纯化残余物,用乙酸乙酯的石油醚溶液(40%)洗脱。收集有机层,真空浓缩,干燥,得到标题化合物2-(2-(2-(2-(苯基氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯(380mg,85%收率)。LC-MS(ESI)发现值:340[M+H]+。
步骤2:向2-(2-(2-(2-(苯基氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯(380mg,1.12mmol)在DCM(2mL)中的溶液中添加TFA(1mL),并且将反应物在室温下搅拌18小时。将反应物真空浓缩,得到标题化合物2-(2-(2-(2-(苯基氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸(300mg,95%收率)。LC-MS(ESI)发现值:284[M+H]+。
步骤3:向2-(2-(2-(2-(苯基氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸(300mg,1.06mmol)在DMF(3mL)中的溶液中添加DIEA(0.5mL,3.18mmol)和HATU(483mg,1.27mmol),并将反应在0℃下搅拌30分钟。添加3,3′-((2-氨基丙烷-1,3-二基)双(氧基))二丙酸二叔丁酯(441mg,1.27mmol),将反应在室温下搅拌16小时。将反应物用EA和水稀释。分离有机层,并真空浓缩。通过快速纯化残余物,得到13-((3-(叔丁氧基)-3-氧代丙氧基)甲基)-11-氧代-1-(苯基氨基)-3,6,9,15-四氧杂-12-氮杂十八-18-烷酸叔丁酯(400mg,收率62%)。LC-MS(ESI)发现值:613[M+H]+。
步骤4:向13-((3-(叔丁氧基)-3-氧代丙氧基)甲基)-11-氧代-1-(苯基氨基)-3,6,9,15-四氧杂-12-氮杂十八-18-烷酸叔丁酯(120mg,0.20mmol)的DCM(3mL)溶液中添加TFA(1mL,13mmol),并将反应在室温下搅拌18小时。将反应物真空浓缩,得到标题化合物13-((2-羧基乙氧基)甲基)-11-氧代-1-(苯基氨基)-3,6,9,15-四氧杂-12-氮杂十八-18-烷酸(98mg,收率99%)。LC-MS(ESI)发现值:501[M+H]+。
步骤5:向13-((2-羧基乙氧基)甲基)-11-氧代-1-(苯基氨基)-3,6,9,15-四氧杂-12-氮杂十八-18-烷酸(113mg,0.226mmol)在DMF(10mL)中的溶液中加入HATU(197mg,0.52mmol)和DIEA(0.26mL,1.58mmol),并将反应在0℃下搅拌30分钟。添加N-((3aR,4S,7S,8R,8aR)-4-(13-氨基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基六氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊二烯[4,5-d]氧杂环庚烷-8-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(250mg,0.50mmol)并将反应在室温下搅拌18小时。将反应物用EA和水稀释。将有机层分离并真空浓缩。使用硅胶柱色谱法纯化残余物,用(DCM∶MEOH=20∶1)洗脱,得到标题化合物3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-(苯基氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((3aR,4S,7S,8R,8aR)-2,2-二甲基-8-(2,2,2-三氟乙酰胺基)四氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-4(5H)-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(110mg,收率30%)。LC-MS(ESI)发现值:1470[M+H]+。
步骤6:向3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-(苯基氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((3aR,4S,7S,8R,8aR)-2,2-二甲基-8-(2,2,2-三氟乙酰胺基)四氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-4(5H)-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(100mg,0.068mmol)在THF(3mL)中的溶液中添加HCl(1.5mL,2M,溶于H2O),并将反应在室温下搅拌18小时。将反应物真空浓缩。通过制备型HPLC纯化残余物,得到标题化合物3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-(苯基氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-2,3-二羟基-4-(2,2,2-三氟乙酰胺基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(A12,11mg,12%收率)。LC-MS(ESI)发现值:1389[M+H]+。1H NMR(400MHz,MeOD):δ7.15-7.07(m,2H),6.71-6.59(m,3H),5.25(d,J=1.3Hz,2H),4.20(p,J=5.6Hz,1H),4.00(dd,J=11.9,9.4Hz,6H),3.90(q,J=4.0Hz,4H),3.81(d,J=8.1Hz,2H),3.69(dd,J=9.0,4.1Hz,18H),3.66-3.59(m,24H),3.56-3.48(m,8H),3.37(t,J=5.5Hz,4H),3.28(t,J=5.5Hz,2H),2.44(t,J=6.2Hz,4H)。
A13,3,3′-((2-氨基丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5)-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)丙酰胺)的制备
步骤1:在室温下向3,3′-((2-(((苄氧基)羰基)氨基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))二丙酸(0.72g,1.96mmol)和HATU(2.23g,5.88mmol)在DMF(20mL)中的溶液中添加DIPEA(1.0g,7.84mmol)和(2R,3R,4R,5S)-2-(13-氨基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(2.1g,4.33mmol)。将反应混合物在室温下搅拌过夜。分离所得混合物并真空浓缩。通过快速色谱法(C18,0-80%,MeOH的H2O溶液)纯化粗产物,得到(1,39-双((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15,25-二氧代-2,5,8,11,18,22,29,32,35,38-十氧杂-14,26-二氮杂三十九烷-20-基)氨基甲酸苄酯(1.2g,48%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:1303[M+H]+。1H NMR(400MHz,MeOD):δ8.50(d,J=4.8Hz,2H),7.41-7.25(m,5H),6.89(d,J=4.9Hz,2H),5.07(s,2H),4.43-4.27(m,2H),4.08(dd,J=10.9,5.2Hz,2H),3.91(d,J=3.0Hz,2H),3.88-3.82(m,1H),3.72-3.55(m,36H),3.55-3.42(m,8H),3.35(t,J=5.5Hz,4H),3.15(t,J=10.9Hz,2H),2.43(t,J=6.1,4H)。
步骤2:在室温下向(1,39-双((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15,25-二氧代-2,5,8,11,18,22,29,32,35,38-十氧杂-14,26-二氮杂三十九烷-20-基)氨基甲酸苄酯(1.2g,0.92mmol)在MeOH(10mL)中的溶液中添加Pd/C(120mg,10%重量,60%湿)。将反应混合物在H2气球下于室温搅拌过夜。分离所得混合物并真空浓缩。通过快速色谱法(C18,0-40%,MeOH的H2O溶液)纯化粗产物,得到3,3′-((2-氨基丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(800mg,74%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:1169[M+H]+。1H NMR(400MHz,MeOD):δ8.51(d,J=4.7Hz,2H),6.89(d,J=4.9Hz,2H),4.36(d,J=5.0Hz,2H),4.08(dd,J=11.0,5.1Hz,2H),3.89(t,J=17.0Hz,2H),3.79-3.52(m,40H),3.46(dt,J=20.7,10.3Hz,2H),3.37(td,J=8.5,4.9Hz,6H),3.13(dt,J=10.3,8.0Hz,3H),2.46(t,J=6.0Hz,4H)。
A14,3,3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)的制备
步骤1:3,3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))二丙酸(28mg,0.08mmol)和HATU(62.7mg,0.17mmol)在DMF(3mL)中的溶液在室温下搅拌30分钟。在室温下添加N-((3aR,4S,7S,8R,8aR)-4-(13-氨基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基六氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-8-基)-3-氯-1,2,4-噻二唑-5-胺(98mg,0.19mmol)和DIPEA(0.05mL,0.3mmol)。将反应搅拌过夜。将所得混合物真空浓缩。通过快速色谱法(硅胶,0-10%MeOH的DCM溶液)纯化粗产物,得到3,3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((3aR,4S,7S,8R,8aR)-8-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,2-二甲基四氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-4(5H)-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(50mg,48%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:1389[M+H]+。
步骤2:向3,3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((3aR,4S,7S,8R,8aR)-8-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,2-二甲基四氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-4(5H)-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(50mg,0.04mmol)的THF(3mL)溶液中添加HCl(1mL,2M,在H2O中)。将反应在室温下搅拌过夜。通过快速色谱法(硅胶,0-10%MeOH的DCM溶液)纯化粗产物,得到3,3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛-1-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(30mg,64%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:1309[M+H]+。1HNMR(400MHz,MeOD):δ5.39(s,2H),4.14-4.09(m,1H),4.00(d,J=9.6Hz,2H),3.93(d,J=4.1Hz,2H),3.83(d,J=8.0Hz,2H),3.77(dd,J=9.6,4.2Hz,2H),3.73-3.60(m,35H),3.56(t,J=5.5Hz,4H),3.52-3.45(m,4H),3.39(t,J=5.5Hz,4H),3.28(s,1H),2.46(dd,J=6.6,5.4Hz,4H),2.23(t,J=7.4Hz,2H),1.67-1.57(m,4H),1.44-1.36(m,2H)。
A15,6-叠氮基-N-(1,3-双((1-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲氧基)丙-2-基)己酰胺的制备
步骤1:向(1,3-双(丙-2-炔-1-基氧基)丙-2-基)氨基甲酸苄酯(80mg,0.27mmol)和(2R,3R,4R,5S)-2-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4二醇(300mg,0.58mmol)在MeOH(3mL)中的溶液中添加CuSO4(4.2mg,0.03mmol)和THPTA(20mg,0.004mmol)的H2O(0.5mL)溶液和抗坏血酸钠(11mg,0.05mmol)的H2O(0.5mL)溶液。将混合物在室温下搅拌过夜并浓缩。残余物通过快速纯化得到(1,3-双((1-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲氧基)丙-2-基)氨基甲酸苄酯(320mg,91%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:1322[M+H]+。1HNMR(400MHz,MeOD):δ8.49(d,J=4.8Hz,2H),8.01(s,2H),7.47-7.19(m,5H),6.88(d,J=4.9Hz,2H),5.07(s,2H),4.57(dd,J=9.5,4.6Hz,8H),4.35(d,J=5.1Hz,2H),4.06(dd,J=10.9,5.2Hz,2H),3.95-3.85(m,7H),3.69-3.63(m,6H),3.62-3.51(m,30H),3.13(t,J=10.9Hz,2H)。
步骤2:将(1,3-双((1-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲氧基)丙-2-基)氨基甲酸苄酯(300mg,0.23mmol)和Pd/C(30mg,10%wt,60%湿)在MeOH(5mL)中的溶液在H2气球下于室温搅拌过夜。将混合物通过硅藻土垫过滤,并将滤液浓缩,得到(2R,2′R,3R,3′R,4R,4′R,5S,5′S)-2,2′-(((((2-氨基丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(亚甲基))双(1H-1,2,3-三唑-4,1-二基))双(2,5,8,11-四氧杂十三烷-13,1-二基))双(5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇)(160mg,收率60%),为无色油状物。C-MS(ESI)发现值:1188[M+H]+。
步骤3:向6-叠氮基己酸(13mg,0.08mmol)在DMF(3mL)中的溶液中添加HATU(35mg,0.09mmol)和DIPEA(22mg,0.17mmol)。在室温搅拌30分钟后,添加(2R,2′R,3R,3′R,4R,4′R,5S,5′S)-2,2′-(((((2-氨基丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(亚甲基))双(1H-1,2,3-三唑-4,1-二基))双(2,5,8,11-四氧杂十三烷-13,1-二基))双(5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇)(147mg,0.12mmol)。将混合物在N2下在室温下搅拌过夜。将混合物浓缩并通过制备型HPLC(方法A)纯化残余物以得到6-叠氮基-N-(1,3-双((1-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲氧基)丙-2-基)己酰胺(36mg,33%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:1327[M+H]+。1H NMR(400MHz,MeOD):δ8.50(d,J=4.8Hz,2H),8.02(s,2H),6.89(d,J=4.9Hz,2H),4.67-4.53(m,8H),4.35(td,J=10.4,5.2Hz,2H),4.19(p,J=5.5Hz,1H),4.07(dd,J=10.9,5.2Hz,2H),3.89(t,J=4.9Hz,5H),3.69-3.50(m,37H),3.26(t,J=6.8Hz,2H),3.14(t,J=10.9Hz,2H),2.21(t,J=7.4Hz,2H),1.66-1.52(m,4H),1.45-1.27(m,2H)。
A18,3,3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)丙酰胺)的制备
步骤1:将6-叠氮己酸(0.54g,3.45mmol)和HATU(1.3g,3.45mmol)在DMF(10mL)中的溶液在室温下搅拌30分钟。在室温下添加3,3′-((2-氨基丙烷-1,3-二基)双(氧基))二丙酸二叔丁酯(1g,2.88mmol)和DIPEA(0.95mL,5.76mmol)。将反应搅拌过夜。将所得混合物用DCM(100mL)稀释,用H2O(50mL x 2)和盐水(20mL)洗涤,经Na2SO4干燥。将有机层分离并真空浓缩。通过快速色谱法(硅胶,PE中的0-80%EA)纯化粗产物,得到3,3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))二丙酸二叔丁酯(800mg,93%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:487[M+H]+。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ6.28(d,J=8.2Hz,1H),4.19-4.11(m,1H),3.74-3.62(m,4H),3.58(dd,J=9.6,4.0Hz,2H),3.40(dd,J=9.6,6.1Hz,2H),3.26(t,J=6.9Hz,2H),2.52-2.38(m,4H),2.20(t,J=7.5Hz,2H),1.67-1.63(m,4H),1.47-1.37(m,20H)。
步骤2:在0℃向3,3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))二丙酸酯(800mg,1.64mmol)在DCM(6mL)中的溶液中滴加TFA(2mL,26.93mmol)。将反应混合物在室温下搅拌3小时。将所得混合物过滤并真空浓缩。将粗制的3.3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))二丙酸(470mg,76%收率)用于下一步而无需进一步纯化。LC-MS(ESI)发现值:375[M+H]+。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ12.14(s,2H),7.64(d,J=8.2Hz,1H),4.00-3.86(m,1H),3.57(t,J=6.3Hz,4H),3.34(d,J=5.8Hz,4H),3.29(d,J=6.9Hz,2H),2.43(t,J=6.3Hz,4H),2.07(t,J=7.3Hz,2H),1.56-1.43(m,4H),1.33-1.23(m,2H)。
步骤3:将3,3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))二丙酸(70mg,0.19mmol)和HATU(163mg,0.43mmol)在DMF(5mL)中的溶液在室温下搅拌30分钟。在室温下添加(2R,3R,4R,5S)-2-(13-氨基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(208mg,0.43mmol)和DIPEA(73mg,0.56mmol)。将反应搅拌过夜。将所得混合物真空浓缩。通过快速色谱法(硅胶,0-10%MeOH的DCM溶液)纯化粗产物,得到3,3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(65mg,28%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:654[M+2H]2+。1H NMR(400MHz,MeOD):δ8.51(d,J=4.8Hz,2H),6.90(d,J=4.9Hz,2H),4.36(td,J=10.6,5.3Hz,2H),4.16-4.04(m,3H),3.92(d,J=2.9Hz,2H),3.73-3.60(m,36H),3.56(dt,J=10.6,3.0Hz,6H),3.51-3.43(m,4H),3.38(t,J=5.5Hz,4H),3.17(t,J=10.9Hz,2H),2.45(dd,J=6.7,5.4Hz,4H),2.23(t,J=7.5Hz,2H),1.67-1.57(m,4H),1.44-1.36(m,2H).19F NMR(377MHz,MeOD):δ-72.30(s)。
A16,1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊二烯[4,5-c]吡喃-4-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-烷酸的制备
步骤1:在室温下向N-((3aR,4R,7S,7aR)-4-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-4-(三氟甲基)嘧啶-2-胺(2.7g,4.59mmol)的DCM(50mL)溶液中添加三乙胺(3.1mL,22.97mmol)和DMAP(0.56g,4.59mmol)。然后向反应物中加入二碳酸二叔丁酯(di-tert-butyldecarbonate)(4.91mL,22.97mmol)并在室温下搅拌18小时。TLC(PE/EA=5/1)显示起始材料已消耗并且检测到一个主要斑点。将反应物浓缩并通过硅胶用PE/EA=5/1纯化,得到((3aR,4R,7S,7aR)-4-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)(4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基甲酸叔丁酯(2.4g,76%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:710[M+Na]+。
步骤2:在室温下向((3aR,4R,7S,7aR)-4-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)(4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基甲酸叔丁酯(2.4g,3.48mmol)在THF(50mL)中的溶液中添加TBAF(8.4mL,1M在THF中)。将反应在室温下搅拌1小时。TLC显示起始材料被消耗并且检测到一个主要斑点。将反应物浓缩并通过硅胶用PE/EA=1/1纯化以得到((3aR,4R,7S,7aR)-4-(羟甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)(4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基甲酸叔丁酯(1.3g,93%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:472[M+Na]+。
步骤3:在0℃下向((3aR,4R,7S,7aR)-4-(羟甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)(4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基甲酸叔丁酯(200mg,0.44mmol)的DMF(6mL)溶液中添加NaH(35.6mg,0.89mmol,60%wt.在矿物油中)。然后将反应在0℃下搅拌30分钟。然后添加2-(2-(2-(2-(甲苯磺酰氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸甲酯(150.9mg,0.40mmol)。将混合物在室温下搅拌3小时。LCMS显示起始材料被消耗并且检测到所需质量。然后用NH4Cl淬灭反应并用EA萃取。将有机层经Na2SO4干燥,过滤并浓缩,并通过硅胶用DCM/MeOH=7/3纯化,得到粗产物(60mg)。然后通过制备型HPLC纯化粗品,得到1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-烷酸(A16,18.5mg,收率7%)。LC-MS(ESI)发现值:540[M+H]+。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ8.60(s,1H),7.96(d,J=3.2Hz,1H),6.99(d,J=0.8Hz,1H),4.10-4.17(m,3H),3.50-3.80(m,17H),3.00-3.20(m,2H),1.41(s,3H),1.25(s,3H)。
A17:2-(4-((((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲氧基)甲基)苯氧基)乙酸和A19:2-(4-((((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲氧基)甲基)苯氧基)乙酸的制备
步骤1:在室温下向N-((3aR,4R,7S,7aR)-4-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(4g,6.8mmol)的DCM(40mL)溶液中添加TEA(137mg,13.6mmol)、DMAP(83mg,0.68mmol)和Boc2O(7.4g,34mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过快速色谱法纯化,得到((3aR,4R,7S,7aR)-4-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)(6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基甲酸叔丁酯(4g,87%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:688[M+H]+。
步骤2:向((3aR,4R,7S,7aR)-4-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)(6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基甲酸叔丁酯(4g,5.8mmol)在THF(100mL)中的溶液添加TBAF(11.6mL,1M在THF中)。将反应在室温下搅拌3小时。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过快速色谱法纯化,为((3aR,4R,7S,7aR)-4-(羟甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)(6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基甲酸叔丁酯(2g,77%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:450[M+H]+。
步骤3:在0℃向((3aR,4R,7S,7aR)-4-(羟甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)(6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基甲酸叔丁酯(100mg,0.22mmol)的DMF(10mL)溶液中添加NaH(18mg,0.45mmol,矿物油中60%重量)。1小时后,将2-(4-(溴甲基)苯氧基)乙酸甲酯(75mg,0.29mmol)添加至溶液中,并将混合物在室温下搅拌12小时。将混合物用H2O淬灭并用EA萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤。将滤液浓缩并通过C18纯化,得到2-(4-((((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲氧基)甲基)苯氧基)乙酸(A17,15mg,13%收率),为固体。LC-MS(ESI)发现值:514[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.10(s,1H),7.99(s,1H),7.28(d,J=8.5Hz,2H),6.92(d,J=8.6Hz,2H),5.09(s,1H),4.81(d,J=17.6Hz,1H),4.68(t,J=11.0Hz,1H),4.61-4.48(m,3H),4.30(d,J=5.0Hz,1H),3.91-3.70(m,4H),3.60(t,J=11.3Hz,1H),1.55(s,3H),1.32(s,3H).19FNMR(377MHz,CD3OD):δ-69.91。
步骤4:向2-(4-((((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲氧基)甲基)苯氧基)乙酸(9.2mg,0.02mmol)在THF(2mL)中的溶液中添加HCl(0.1mL,2N)。将混合物在室温下搅拌过夜。将混合物浓缩并通过C18纯化,得到2-(4-((((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲氧基)甲基)苯氧基)乙酸(A19,5mg,57%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:474[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.24(s,1H),8.10(s,1H),7.24(d,J=8.2Hz,2H),6.89(d,J=8.3Hz,2H),4.93(d,J=16.3Hz,1H),4.68(d,J=16.0Hz,1H),4.52(s,2H),4.20(s,1H),3.97(d,J=2.6Hz,1H),3.89(dd,J=10.8,5.0Hz,1H),3.73(dd,J=11.4,7.1Hz,1H),3.66(dd,J=11.4,4.9Hz,1H),3.45-3.41(m,1H).19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-70.04。
A20,1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊二烯[4,5-c]吡喃-4-基)-20-(1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-烷酸的制备
步骤1:在室温在H2气球下向N-((3aR,4R,7S,7aR)-4-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(230mg,0.42mmol)的MeOH(10mL)溶液中加入Pd/C 10%(20mg,10%wt.,60%湿)。将反应在室温下搅拌0.5小时。将所得混合物过滤并真空浓缩。粗产物无需进一步纯化即可用于下一步。LC-MS(ESI)发现值:525[M+H]+。
步骤2:将15-((2-羧基乙氧基)甲基)-3,13-二氧代-1-苯基-2,5,8,11,17-五氧杂-14-氮杂二十-20-烷酸(75mg,0.14mmol)、DIPEA(0.1mL,0.57mmol)和HATU(118.5mg,0.31mmol)在DMF(5mL)中的溶液在室温下搅拌30分钟。在室温下添加N-((3aR,4R,7S,7aR)-4-(13-氨基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(163.4mg,0.31mmol)。将反应搅拌过夜。将所得混合物真空浓缩。通过快速色谱法(硅胶,0-10%MeOH的DCM溶液)纯化粗产物,得到1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-20-(1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-烷酸苄酯(120mg,收率55%),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:1543[M+H]+。
步骤3:在室温下在H2气球下向1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-20-(1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪)-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-烷酸苄酯(120mg,0.08mmol)在MeOH(5mL)中的溶液中添加Pd/C(12mg,10%重量,60%湿)。将反应在室温下搅拌2小时。将所得混合物过滤并真空浓缩。通过快速色谱法(硅胶,0-15%MeOH的DCM溶液)纯化粗产物,得到1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-20-(1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-烷酸(A20,50mg,44%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:1453[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.10(s,2H),8.02(s,2H),4.33-4.25(m,4H),4.22-4.18(m,1H),4.14(dd,J=8.8,5.0Hz,2H),4.01(s,2H),3.95(dd,J=12.2,6.5Hz,6H),3.75-3.62(m,40H),3.57-3.51(m,8H),3.38(t,J=5.5Hz,4H),3.14(t,J=11.2Hz,2H),2.46(t,J=6.1Hz,4H),1.50(s,6H),1.33(s,6H).19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-70.31(s)。
A21,(2R,3R,4R,5S)-2-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:在室温下在N2气氛下向(2R,3R,4R,5S)-5-氨基-2-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(200mg,0.55mmol)和DIPEA(209mg,1.65mmol)在干DMF(20mL)中的溶液中添加2-氯-6-(三氟甲基)吡嗪(199mg,1.1mmol)和CsF(166mg,1.1mmol)。添加完成后,将反应在100℃下搅拌过夜。起始材料消耗后(TLC监测),将反应容器冷却至室温。将混合物减压浓缩。通过快速色谱法(硅胶,0-10%MeOH的DCM溶液)纯化粗产物,得到(2R,3R,4R,5S)-2-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A21,150mg,54%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:511[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.11(s,1H),8.00(s,1H),4.33(td,J=10.5,5.1Hz,1H),4.12(dd,J=11.0,5.2Hz,1H),3.92(d,J=2.6Hz,1H),3.74-3.53(m,19H),3.36(dd,J=9.4,4.6Hz,2H),3.12(t,J=10.8Hz,1H)。
A22,1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27-七氧杂-14,21-二氮杂二十九-29-烷酸的制备
/>
步骤1:将2,2′-(乙烷-1,2-二基双(氧基))二乙酸(1.0g,5.62mmol)和TEA(1.0g,9.9mmol)溶解在DMF(10mL)中,并将混合物冷却至0℃。向该溶液中添加溶解在DMF(10mL)中的苄基溴(860mg,5.03mmol)。然后将混合物在室温下搅拌16小时。除去溶剂,将残余物溶解在1M HCl中并通过EA萃取,经Na2SO4干燥。通过硅胶(PE∶EA=1∶2)纯化残余物,得到2-(2-(2-(苄氧基)-2-氧代乙氧基)乙氧基)乙酸(350mg,26%收率)。LC-MS(ESI)发现值:269[M+H]+。
步骤2:向2-(2-(2-(苄氧基)-2-氧代乙氧基)乙氧基)乙酸(5.8mg,0.02mmol)在DMF(1mL)中的溶液中添加HATU(12.3mg,0.03mmol)和DIPEA(39.42mg,0.06mmol)。将混合物在0℃下搅拌0.5小时。然后添加在DMF(0.5mL)中的3,3′-((2-氨基丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(21.2mg,0.02mmol)。将混合物在室温搅拌16小时。将反应混合物直接通过制备型HPLC纯化,得到1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基))吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基))吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27-七氧杂-14,21-二氮杂二十九-29-烷酸苄酯(10mg,收率39%)。LC-MS(ESI)发现值:710[M+2H]2+。
步骤3:向1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27-七氧杂-14,21-二氮杂二十九-29-烷酸苄酯(15mg,0.01mmol)在THF/H2O(3∶1,4mL)中的溶液中添加LiOH·H2O(3mg,0.07mmol)。然后将混合物在室温下搅拌2小时。除去溶剂,并通过制备型HPLC纯化残余物,得到1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基))氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27-七氧杂-14,21-二氮杂二十九-29-烷酸(A22,7.2mg,收率51%)。LC-MS(ESI)发现值:665[M+2H]2+.1H NMR(400MHz,CDCl3):δ8.17(s,2H),8.00(s,2H),7.61(s,2H),6.76(s,2H),4.28(d,J=10.4Hz,2H),4.11(d,J=52.9Hz,9H),3.81-3.51(m,43H),3.44(d,J=26.8Hz,8H),3.10(t,J=10.5Hz,2H),2.43(s,2H),2.01(s,1H),1.26(s,2H)。
A23,1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-烷酸的制备
步骤1:向1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-20-(1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-烷酸(110mg,0.08mmol)在THF(3mL)中的溶液中添加HCl(1mL,2N的H2O溶液)。将反应在室温下搅拌3小时。通过制备型HPLC纯化粗产物,得到1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-烷酸(A23,53mg,51%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:1373[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.51(d,J=4.5Hz,2H),6.90(d,J=4.9Hz,2H),4.36(d,J=4.9Hz,2H),4.23-4.18(m,1H),4.14-4.06(m,4H),4.01(s,2H),3.92(d,J=2.5Hz,2H),3.74-3.60(m,44H),3.57-3.50(m,8H),3.38(t,J=5.4Hz,4H),3.17(t,J=10.9Hz,2H),2.46(t,J=6.1Hz,4H).19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-72.30(s)。
A24,1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27-七氧杂-14,21-二氮二十九-29-烷酸的制备
步骤1:在室温下向12-((2-羧基乙氧基)甲基)-3,10-二氧代-1-苯基-2,5,8,14-四氧杂-11-氮杂十七-17-烷酸(200mg,0.41mmol)和HATU(467mg,1.23mmol)在DMF(20mL)中的溶液中添加DIPEA(209mg,1.65mmol)和(2R,3R,4R,5S)-2-(13-氨基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(440mg,0.9mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜。分离所得混合物并真空浓缩。通过快速色谱法(C18,0-60%,MeOH的H2O溶液)纯化粗产物,得到1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27-七氧杂-14,21-二氮杂二十九-29-烷酸苄酯(400mg,68%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:1419[M+H]+。
步骤2:在室温下向1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27-七氧杂-14,21-二氮杂二十九-29-烷酸苄酯(400mg,0.28mmol)在THF(10mL)的溶液中添加LiOH·H2O(14mg,0.56mmol)。将反应混合物在室温下搅拌3小时。分离所得混合物并真空浓缩。通过快速色谱法(C18,0-40%,MeOH的H2O溶液)纯化粗产物,得到1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27-七氧杂-14,21-二氮杂二十九-29-烷酸(A24,300mg,收率80%),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:1329[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.11(s,2H),8.00(s,2H),4.33(td,J=10.8,5.4Hz,2H),4.19(dd,J=14.8,9.5Hz,1H),4.16-4.07(m,4H),4.01(s,2H),3.92(d,J=2.3Hz,2H),3.79-3.45(m,48H),3.37(t,J=5.4Hz,4H),3.12(t,J=10.8Hz,2H),2.45(t,J=6.1Hz,4H)。
A25,1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-烷酸的制备:
步骤1:在室温下向1-((2R,3R,4R,5S)-5-氨基-3,4-二羟基四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-烷酸(100mg,0.28mmol)的DMF(5mL)溶液中添加2-氯-4-(三氟甲基)嘧啶(52mg,0.28mmol)和DIEA(0.14mL,0.85mmol)。将反应在室温下搅拌18小时。将反应物直接浓缩,残余物通过制备型HPLC纯化,得到1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-烷酸(A25,10mg,7%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:450[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.51(d,J=4.8Hz,1H),6.89(d,J=4.8Hz,1H),4.31-4.41(m,1H),4.07-4.10(m,3H),3.91(d,J=2.4Hz,1H),3.55-3.75(m,16H),3.17(t,J=11.2,1H)。
A26,1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-烷酸的制备
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步骤1:在室温下在H2气球下向(2R,3R,4R,5S)-2-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(300mg,0.59mmol)在MeOH(10mL)中的溶液中添加Pd/C(30mg,10%wt,60%湿)。将反应在室温下搅拌0.5小时。将所得混合物过滤并真空浓缩。粗产物无需进一步纯化即用于下一步。LC-MS(ESI)发现值:485[M+H]+。
步骤2:15-((2-羧基乙氧基)甲基)-3,13-二氧代-1-苯基-2,5,8,11,17-五氧杂-14-氮杂二十-20-烷酸(125mg,0.24mmol)、DIPEA(0.16mL,0.94mmol)和HATU(197mg,0.52mmol)在DMF(10mL)中的溶液在室温下搅拌30分钟。在室温下添加(2R,3R,4R,5S)-2-(13-氨基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(296mg,0.52mmol)。将反应搅拌过夜。将所得混合物真空浓缩。通过制备型HPLC纯化粗产物,得到1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-烷酸苄酯(250mg,0.17mmol),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:1463[M+H]+。
步骤3:在室温下向1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-烷酸苄酯(250mg,0.17mmol)的THF(5mL)和H2O(1.5mL)溶液中添加LiOH(21.5mg,0.51mmol)。将反应在室温下搅拌2小时。用2N HCl将反应调节至酸性。通过制备型HPLC纯化粗产物,得到1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-烷酸(A26,160mg,68%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:1373[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ:8.12(s,2H),8.00(s,2H),4.34(td,J=10.6,5.1Hz,2H),4.23-4.18(m,1H),4.14-4.09(m,4H),4.00(s,2H),3.93(d,J=2.4Hz,2H),3.73-3.61(m,44H),3.57-3.50(m,8H),3.38(t,J=5.4Hz,4H),3.12(t,J=10.8Hz,2H),2.45(t,J=6.1Hz,4H).19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-70.26(s)。
A27,1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-烷酸的制备
步骤1:在室温下向N-((3aR,4R,7S,7aR)-4-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)乙酰胺(7g,14.53mmol)在DCM(70mL)中的溶液中添加TEA(2.06mL,14.83mmol)、DMAP(0.12g,0.98mmol)和二碳酸二叔丁酯(3.17mL,14.83mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。起始材料消耗后(LCMS监测),将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过快速色谱法纯化,得到乙酰基((3aR,4R,7S,7aR)-4-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)氨基甲酸叔丁酯(7g,83%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:584[M+H]+。
步骤2:在室温下向乙酰基((3aR,4R,7S,7aR)-4-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)氨基甲酸叔丁酯(7g,11.9mmol)在THF(70mL)中的溶液中添加NaOH(40%,10mL,59.9mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。起始材料消耗后(LCMS监测),缓慢添加水(20mL)。将混合物用乙酸乙酯(100mL)稀释并用水(20mL x 3)洗涤。将有机层经硫酸钠干燥,过滤,减压浓缩,得到粗产物,将其通过快速色谱纯化,得到((3aR,4R,7S,7aR)-4-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)氨基甲酸叔丁酯(6g,93%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:542[M+H]+。
步骤3:向((3aR,4R,7S,7aR)-4-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)氨基甲酸叔丁酯(6g,11mmol)在THF(100mL)中的溶液中添加TBAF溶液(22mL,1M在THF中)。将反应在室温下搅拌3小时。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过快速色谱法纯化(硅胶,0-10%DCM的MeOH溶液),得到((3aR,4R,7S,7aR)-4-(羟甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)氨基甲酸叔丁酯(2.5g,76%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:304[M+H]+。
步骤4:在0℃下向((3aR,4R,7S,7aR)-4-(羟甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)氨基甲酸叔丁酯(2.5g,8.2mmol)的DMF(50mL)溶液中添加NaH(0.47g,60%重量,在矿物油中,12.3mmol)和2-(2-(2-(2-(甲苯磺酰氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸甲酯(2.6g,7.38mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。起始材料消耗后(LCMS监测),将反应容器再次冷却至0℃,缓慢添加水(10mL)并将反应混合物搅拌15分钟。将混合物用乙酸乙酯(100mL)稀释并用水(20mL x 3)洗涤。将有机层用硫酸钠干燥,减压浓缩,得到粗产物,将其通过快速色谱纯化,得到1-((3aR,4R,7S,7aR)-7-((叔丁氧基羰基)氨基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-烷酸(2.0g,51%),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:494[M+H]+。
步骤5:在室温下向1-((3aR,4R,7S,7aR)-7-((叔丁氧基羰基)氨基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-烷酸(2.0g,4.0mmol)的THF(20mL)溶液中添加HCl溶液(4mL,2N的H2O溶液)。将混合物在室温下搅拌3小时。将混合物减压浓缩,得到粗品1-((2R,3R,4R,5S)-5-氨基-3,4-二羟基四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-烷酸(1.0g,71%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:354[M+H]+。
步骤6:在N2气氛下在室温下向1-((2R,3R,4R,5S)-5-氨基-3,4-二羟基四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-烷酸(200mg,0.55mmol)和DIPEA(209mg,1.65mmol)在干DMF(10mL)中的溶液中添加2,4-二氯-6-甲氧基嘧啶(199mg,1.1mmol)。添加完成后,将反应在100℃下搅拌过夜。起始材料消耗后(TLC监测),将反应容器再次冷却至室温。将混合物用乙酸乙酯(100mL)稀释并用水(20mL x 3)洗涤。将有机层经硫酸钠干燥,减压浓缩,得到粗产物,将其通过快速色谱法纯化,得到1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-烷酸(A27,10mg,3.5%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:500[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.11(s,1H),7.99(s,1H),4.33(td,J=10.6,5.2Hz,1H),4.17-4.06(m,3H),3.92(d,J=3.0Hz,1H),3.74-3.52(m,16H),3.12(t,J=10.8Hz,1H)。
A28,1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24-六氧杂-14,21-二氮杂二十六-26-烷酸的制备
步骤1:向1,4-二噁烷-2,6-二酮(4.0g,34.5mmol)溶解在DCM(40mL)中的溶液中加入BnOH(3.7g,34.5mmol),然后加入TEA(3.48g,34.5mmol)。然后将混合物在室温下搅拌4小时。除去溶剂,并通过硅胶柱纯化残余物,得到2-(2-(苄氧基)-2-氧代乙氧基)乙酸(3.5g,45%收率)。LC-MS(ESI)发现值:225[M+H]+。
步骤2:向2-(2-(苄氧基)-2-氧代乙氧基)乙酸(42mg,0.19mmol)在DMF(2mL)中的溶液中添加HATU(107mg,0.28mmol)和DIPEA(72mg,0.56mmol)。将混合物在0℃下搅拌0.5小时。然后添加在DMF(0.5mL)中的3,3′-((2-氨基丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(200mg,0.17mmol)。将混合物在室温搅拌16小时。将反应混合物直接通过C18柱纯化,得到1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基))嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24-六氧杂-14,21-二氮杂二十六-26-烷酸苄酯(140mg,60%收率)。LC-MS(ESI)发现值:1375[M+H]+。
步骤3:向1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24-六氧杂-14,21-二氮杂二十六-26-烷酸苄酯(140mg,0.10mmol)在THF/H2O(3∶1,4mL)中的溶液中添加LiOH·H2O(7mg,0.17mmol)。将混合物在室温下搅拌2小时。除去溶剂,并通过制备型HPLC纯化残余物,得到1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24-六氧杂-14,21-二氮杂二十六-26-烷酸(A28,65mg,50%收率)。LC-MS(ESI)发现值:1285[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.51(d,J=4.5Hz,2H),6.89(d,J=4.9Hz,2H),4.36(d,J=4.9Hz,2H),4.19(d,J=9.6Hz,3H),4.13-4.03(m,4H),3.92(d,J=2.8Hz,2H),3.75-3.49(m,44H),3.37(t,J=5.3Hz,4H),3.16(t,J=10.9Hz,2H),2.45(t,J=6.0Hz,4H)。
A29,1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24-六氧杂-14,21-二氮杂二十六-26-烷酸的制备
步骤1:2-[2-(苄氧基)-2-氧代乙氧基]乙酸(50mg,0.22mmol)、DIPEA(0.1mL,0.67mmol)和HATU(101.8mg,0.27mmol)的DMF(5mL)溶液在室温下搅拌30分钟。在室温下添加3,3′-((2-氨基丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(261mg,0.22mmol)。将反应搅拌过夜。将所得混合物真空浓缩。粗产物经C18柱纯化,得到1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24-六氧杂-14,21-二氮杂二十六-26-烷酸苄酯(160mg,0.12mmol),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:1375[M+H]+。
步骤2:在室温向1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24-六氧杂-14,21-二氮杂二十六-26-烷酸苄酯(160mg,0.12mmol)在THF(4mL)和H2O(2mL)中的溶液中添加LiOH·H2O(15mg,0.35mmol)。将反应在室温下搅拌2小时。用2N HCl将反应调节至酸性。浓缩混合物并通过制备型HPLC纯化粗产物,得到1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24-六氧杂-14,21-二氮杂二十六-26-烷酸(A29,117mg,78%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:1285[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.12(s,2H),8.00(s,2H),4.34(td,J=10.6,5.1Hz,2H),4.19(d,J=6.2Hz,3H),4.14-4.08(m,4H),3.93(d,J=2.9Hz,2H),3.72-3.61(m,36H),3.53(dt,J=12.2,4.8Hz,8H),3.37(t,J=5.5Hz,4H),3.12(t,J=10.8Hz,2H),2.45(t,J=6.1Hz,4H).19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-70.26(s)。
A30,2-(2-(2-((((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)氨基)-2-氧代乙氧基)乙氧基)乙酸的制备
步骤1:向2-(2-(2-(苄氧基)-2-氧代乙氧基)乙氧基)乙酸(69mg,0.26mmol)在DMF(3mL)中的溶液中在室温下添加HATU(148mg,0.39mmol)和DIPEA(33mg,0.26mmol)。在室温下搅拌20分钟后,添加(2R,3R,4R,5S)-2-(氨基甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(80mg,0.26mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜,然后浓缩。通过快速纯化残余物,得到2-(2-(2-((((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)氨基)-2-氧代乙氧基)乙氧基)乙酸苄酯(100mg,69%收率),为黄色油状物。LC-MS(ESI)发现值:559[M+H]+。
步骤2:在室温下向2-(2-(2-((((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)氨基)-2-氧代乙氧基)乙氧基)乙酸苄酯(100mg,0.18mmol)在THF(2mL)和H2O(2mL)中的溶液中添加LiOH·H2O(15mg,0.36mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜,然后用HCl(1N)酸化至pH=3。将混合物浓缩,残余物通过C18柱纯化,得到2-(2-(2-((((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基))吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)氨基)-2-氧代乙氧基)乙氧基)乙酸(A30,54mg,66%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:469[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.10(s,1H),8.00(s,1H),4.32(d,J=5.1Hz,1H),4.16-4.08(m,3H),4.02(s,2H),3.86(d,J=3.2Hz,1H),3.75-3.70(m,4H),3.64(dd,J=10.6,3.2Hz,1H),3.55(dd,J=14.8,8.4Hz,2H),3.43(d,J=5.9Hz,1H),3.11(d,J=10.8Hz,1H)。
A31,(1,39-双((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15,25-二氧代-2,5,8,11,18,22,29,32,35,38-十氧杂-14,26-二氮杂三十九烷-20-基)甘氨酸的制备
步骤1:在室温下在N2下向3,3′-((2-氨基丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)丙酰胺)(1.1g,0.94mmol)和2-氧代乙酸乙酯(0.56mL,2.83mmol)在EtOH(8mL)中的溶液中添加AcOH(0.03mL,0.47mmol)。将反应在室温下搅拌3小时。在0℃下添加NaBH(OAc)3(595.9mg,2.83mmol)。将反应搅拌过夜。将所得混合物过滤并真空浓缩。通过制备型HPLC纯化粗产物,得到(1,39-双((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15,25-二氧代-2,5,8,11,18,22,29,32,35,38-十氧杂-14,26-二氮杂三十九烷-20-基)甘氨酸乙酯(850mg,收率72%),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:1255[M+H]+。
步骤2:在室温下向(1,39-双((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15,25-二氧代-2,5,8,11,18,22,29,32,35,38-十氧杂-14,26-二氮杂三十九烷-20-基)甘氨酸乙酯(1g,0.8mmol)在THF(6mL)和H2O(3mL)中的溶液中添加LiOH·H2O(0.1g,2.4mmol)。将反应在室温下搅拌2小时。用2N HCl将反应调节至pH=6。通过制备型HPLC纯化粗产物,得到(1,39-双((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15,25-二氧代-2,5,8,11,18,22,29,32,35,38-十氧杂-14,26-二氮杂三十九烷-20-基)甘氨酸(A31,600mg,62%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:1227[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.13(s,2H),7.99(s,2H),4.33(td,J=10.5,5.1Hz,2H),4.12(dd,J=11.0,5.1Hz,2H),3.88(dd,J=38.8,7.4Hz,2H),3.79-3.49(m,43H),3.44-3.35(m,4H),3.12(t,J=10.8Hz,2H),2.49(t,J=5.8Hz,4H).19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-70.20(s)。
A32,3-((((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)氨基)-3-氧代丙酸的制备
步骤1:3-(叔丁氧基)-3-氧代丙酸(272.5mg,1.72mmol)和HATU(818.7mg,2.15mmol)在DMF(5mL)中的溶液在室温下搅拌2小时。将N-((3aS,4R,7S,7aR)-4-(氨基甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(500mg,1.46mmol)和DIEA(371.04mg,1.87mmol)添加至上述混合物中。将反应混合物在室温下搅拌2小时。将反应混合物浓缩。通过快速色谱法(EA/PE=1∶1)纯化残余物,得到3-((((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基))吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基)氨基)-3-氧代丙酸叔丁酯,呈棕色油状(600mg,收率85%)。LC-MS(ESI)发现值:489[M+H]+。
步骤2:3-((((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基)氨基)-3-氧代丙酸叔丁酯(800mg,1.64mmol)和HCl水溶液(5mL,2N H2O溶液)在THF(3mL)中的溶液在室温下搅拌过夜。将反应混合物浓缩。通过反相快速色谱法(MeOH水溶液从5%至30%)纯化残余物,得到3-((((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)氨基)-3-氧代丙酸(A32,274mg,42%收率)。LC-MS(ESI)发现值:395[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.10(s,1H),8.00(s,1H),4.32(td,J=10.5,5.1Hz,1H),4.12(dd,J=11.0,5.2Hz,1H),3.87(d,J=2.8Hz,1H),3.64(dd,J=10.6,3.1Hz,1H),3.59-3.50(m,2H),3.37-3.33(m,1H),3.29(s,2H),3.10(t,J=10.8Hz,1H)。
A33,3-((1,15-双((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-3,13-二氧代-6,10-二氧杂-2,14-二氮杂十五烷-8-基)氨基)-3-氧代丙酸的制备
步骤1:在室温下向3,3′-((2-(3-(苄氧基)-3-氧代丙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))二丙酸(100mg,0.24mmol)在DMF(3mL)中的溶液中添加HATU(277mg,0.73mmol)和DIPEA(125mg,0.97mmol)。在室温下搅拌20分钟后,添加N-((3aS,4R,7S,7aR)-4-(氨基甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(186mg,0.54mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜,然后浓缩。残余物通过快速纯化,得到3-((1,15-双((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基))氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-3,13-二氧代-6,10-二氧杂-2,14-二氮杂十五烷-8-基)氨基)-3-氧代丙酸苄酯(150mg,58%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:1072[M+H]+。
步骤2:在室温下向3-((1,15-双((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-3,13-二氧代-6,10-二氧杂-2,14-二氮杂十五烷-8-基)氨基)-3-氧代丙酸苄酯(150mg,0.14mmol)的THF(3mL)溶液中添加HCl(0.5mL,2N的H2O溶液)。将混合物在室温下搅拌过夜,然后浓缩。通过快速纯化残余物,得到3-((1,15-双((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基))氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-3,13-二氧代-6,10-二氧杂-2,14-二氮杂十五烷-8-基)氨基)-3-氧代丙酸苄酯(100mg,72%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:992[M+H]+。
步骤3:向3-((1,15-双((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-3,13-二氧代-6,10-二氧杂-2,14-二氮杂十五烷-8-基)氨基)-3-氧代丙酸苄酯(100mg,0.10mmol)、NH4OH(0.1mL)和Pd/C(10mg,10%重量,60%湿)在MeOH(3mL)中的溶液在H2气球下在室温下搅拌30分钟。将混合物通过硅藻土垫过滤,并将滤液浓缩,得到粗产物。通过快速纯化粗产物,得到3-((1,15-双((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-3,13-二氧代-6,10-二氧杂-2,14-二氮杂十五烷-8-基)氨基)-3-氧代丙酸(A33,27mg,30%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:902[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.11(s,2H),7.98(s,2H),4.32(td,J=10.6,5.2Hz,2H),4.16-4.06(m,3H),3.86(s,2H),3.76-3.64(m,7H),3.52(t,J=7.0Hz,8H),3.34(s,2H),3.24(s,1H),3.11(s,2H),2.46(d,J=5.4Hz,4H)。
A34,1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十四-24-烷酸的制备
步骤1:向3-(苄氧基)-3-氧代丙酸(2.3g,11.8mmol)、DIPEA(5.9mL,35.5mmol)和HATU(6.76g,17.8mmol)的DMF(25mL)溶液在室温下搅拌30分钟。在室温下添加3,3′-((2-氨基丙烷-1,3-二基)双(氧基))二丙酸二叔丁酯(4.12g,11.8mmol)。将反应在室温下搅拌过夜。将混合物用DCM(200mL)稀释,用H2O(60mL x 2)和盐水(60mL)洗涤,经Na2SO4干燥。将混合物真空浓缩。通过快速色谱法(硅胶,PE中的0-20%EA)纯化粗产物,得到3,3′-((2-(3-(苄氧基)-3-氧代丙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))二丙酸二叔丁酯(850mg,14%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:525[M+H]+。
步骤2:在室温下向3,3′-((2-(3-(苄氧基)-3-氧代丙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))二丙酸二叔丁酯(850mg,1.6mmol)在DCM(10mL)中的溶液中添加TFA(3mL,40.4mmol)。将反应在室温下搅拌2小时。将所得混合物真空浓缩。通过制备型HPLC纯化粗产物,得到3,3′-((2-(3-(苄氧基)-3-氧代丙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))二丙酸(260mg,37%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:412[M+H]+。
步骤3:3,3′-((2-(3-(苄氧基)-3-氧代丙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))二丙酸(160mg,0.4mmol)、DIPEA(0.321mL,1.945mmol)和HATU(443.6mg,1.2mmol)的DMF(10mL)溶液在室温下搅拌30分钟。在室温下添加(2R,3R,4R,5S)-2-(13-氨基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃3,4-二醇(414.5mg,0.9mmol)。将反应搅拌过夜。将所得混合物真空浓缩。通过制备型HPLC纯化粗产物,得到1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十四-24-烷酸苄酯(210mg,50%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:1345[M+H]+。
步骤4:在室温下向1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十四-24-烷酸苄酯(210mg,0.2mmol)在THF(6mL)和H2O(2mL)中的溶液中添加LiOH·H2O(20mg,0.5mmol)。将反应在室温下搅拌2小时。用2N HCl将反应调节至酸性。通过制备型HPLC纯化粗产物,得到1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂四二十-24-烷酸(A34,96mg,49%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:1255[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.12(s,2H),8.00(s,2H),4.34(td,J=10.4,5.1Hz,2H),4.12(dd,J=10.7,5.0Hz,3H),3.93(d,J=2.6Hz,2H),3.74-3.59(m,38H),3.57-3.47(m,8H),3.38(t,J=5.3Hz,4H),3.12(t,J=10.8Hz,2H),2.45(t,J=5.9Hz,4H).19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-70.26(s)。
A35,2-(4-((4-(((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)哌嗪-1-基)甲基)苯氧基)乙酸的制备
步骤1:向2-(4-(溴甲基)苯氧基)乙酸甲酯(300mg,1.158mmol)的CH3CN(3mL)溶液中添加哌嗪-1-甲酸叔丁酯(259mg,1.389mmol)和TEA(0.5mL,3.597mmol)。将反应物在室温下搅拌2小时并通过LC-MS确保完成。然后将其浓缩并通过10%MeOH的DCM溶液纯化,得到4-(4-(2-甲氧基-2-氧代乙氧基)苄基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(400mg,95%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:365[M+H]+。
步骤2:向4-(4-(2-甲氧基-2-氧代乙氧基)苄基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(400mg,1.098mmol)在DCM(4mL)中的溶液中添加TFA(80μL,1.077mmol)。将反应在室温下搅拌2小时。然后浓缩,得到粗品2-(4-(哌嗪-1-基甲基)苯氧基)乙酸甲酯(250mg,86%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:265[M+H]+。
步骤3:向2-(4-(哌嗪-1-基甲基)苯氧基)乙酸甲酯(250mg,0.946mmol)在DMF(3mL)中的溶液中添加((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基4-甲基苯磺酸酯(160mg,0.318mmol)、K2CO3(44mg,0.318mmol)和NaI(48mg,0.318mmol)。将反应在80℃下搅拌3天。除去溶剂并通过50%MeOH的DCM溶液纯化残余物,以获得2-(4-((4-(((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基)哌嗪-1-基)甲基)苯氧基)乙酸(100mg,54%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:581[M+H]+。
步骤4:向2-(4-((4-(((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基)哌嗪-1-基)甲基)苯氧基)乙酸(100mg,0.172mmol)的THF(2mL)溶液中添加HCl(20μL,2N H2O溶液)。将反应搅拌2小时并通过LCMS确保完成。然后浓缩,残余物通过制备型HPLC纯化,得到2-(4-((4-(((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)哌嗪-1-基)甲基)苯氧基)乙酸(A35,45mg,48%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:541[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.11(s,1H),8.01(s,1H),7.30(d,J=7.2Hz,2H),6.95(s,2H),4.47(s,2H),4.32(d,J=5.2Hz,2H),4.14(dd,J=11.0,5.2Hz,2H),3.87(d,J=11.4Hz,2H),3.86(s,1H),3.70(dd,J=30.3,18.1Hz,3H),3.13(t,J=11.0Hz,3H),2.92(s,8H)。
A36,3-[[2-[3-[2-[2-[2-[2-[[(1S,2R,3R,4R,5S)-2,3-二羟基-4-[[6]-(三氟甲基)吡嗪-2-基]氨基]-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基]甲氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙基氨基]-3-氧代-丙氧基]-1-[[3-[2-[2-[2-[2-[[(1S,2R,3R,4R,5S)-2,3-二羟基-4-[[6-(三氟甲基)吡嗪-2-基]]氨基]-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛-1-基]甲氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙基氨基]-3-氧代-丙氧基]甲基]乙基]氨基]-3-氧代-丙酸的制备
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步骤1:在20℃下将HATU(617.65mg,1.62mmol,3当量)的溶液添加至3-[2-(苄氧基羰基氨基)-3-(2-羧基乙氧基)丙氧基]丙酸(200mg,541.47μmol,1当量)、N-[(1S,2R,6R,7R,8S)-1-[2-[2-[2-(2-氨基乙氧基])乙氧基]乙氧基]乙氧基甲基]-4,4-二甲基-3,5,9,11-四氧杂三环[6.2.1.02,6]十一烷-7-基]-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(839.17mg,1.25mmol,纯度82%,2.3当量)和DIPEA(279.92mg,2.17mmol,377.25μL,4当量)在DMF(8mL)中的混合物中,然后将混合物在20℃下搅拌1小时。LCMS显示化合物1被消耗并且检测到所需的质量。通过制备型HPLC纯化混合物(FA条件;柱:Phenomenex Luna C18 200*40mm*10μm;流动相:[水(FA)-ACN];B%:30%-70%,8min)。获得N-[2-[3-[2-[2-[2-[2-[[(1S,2R,6R,7R,8S)-4,4-二甲基-7-[[6-(三氟甲基)]吡嗪-2-基]氨基]-3,5,9,11-四氧杂三环[6.2.1.02,6]十一烷-1-基]甲氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙基氨基]-3-氧代-丙氧基]-1-[[3-[2-[2-[2-[2-[[(1S,2R,6R,7R,8S)-4,4-二甲基-7-[[6-(三氟甲基)吡嗪-2-基]氨基]-3,5,9,11-四氧杂三环[6.2.1.02,6]十一烷-1-基]甲氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙基氨基]-3-氧代-丙氧基]甲基]乙基]氨基甲酸苄酯(250mg,173.80umol,32.10%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:720.0[M/2+H]+。
步骤2:在N2下向N-[2-[3-[2-[2-[2-[2-[[(1S,2R,6R,7R,8S)-4,4-二甲基-7-[[6-(三氟甲基)吡嗪-2-基]氨基]-3,5,9,11-四氧杂三环[6.2.1.02,6]十一烷-1-基]甲氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙基氨基]-3-氧代-丙氧基]-1-[[3-[2-[2-[2-[2-[[(1S,2R,6R,7R,8S)-4,4-二甲基-7-[[6-(三氟甲基)吡嗪-2-基]氨基]-3,5,9,11-四氧杂三环[6.2.1.02,6]十一烷-1-基]甲氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙基氨基]-3-氧代-丙氧基]甲基]乙基]氨基甲酸苄酯(250mg,173.80μmol,1当量)的MeOH(20mL)溶液中添加Pd/C(100mg,10%纯度)。将悬浮液在真空下脱气并用H2吹扫数次。将混合物在H2(15psi)下于20℃搅拌4小时。过滤混合物并浓缩滤液,得到3-[2-氨基-3-[3-[2-[2-[2-[2-[[(1S,2R,6R,7R,8S)-4,4-二甲基-7-[[6-(三氟甲基)吡嗪-2-基]氨基]-3,5,9,11-四氧杂三环[6.2.1.02,6]十一烷-1-基]甲氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙基氨基]-3-氧代-丙氧基]丙氧基]-N-[2-[2-[2-[2-[[(1S,2R,6R,7R,8S)-4,4-二甲基-7-[[6-(三氟甲基)吡嗪-2-基]氨基]-3,5,9,11-四氧杂三环[6.2.1.02,6]十一烷-1-基]甲氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙基]丙酰胺(200mg,粗品),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:652.9[M/2+H]+。
步骤3:在20℃将HATU(64.14mg,168.68μmol,2当量)溶液添加到3-[2-氨基-3-[3-[2-[2-[2-[2-[[(1S,2R,6R,7R,8S)-4,4-二甲基-7-[[6-(三氟甲基)吡嗪-2-基]氨基]-3,5,9,11-四氧杂三环[6.2.1.02,6]十一烷-1-基]甲氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙基氨基]-3-氧代-丙氧基]丙氧基]-N-[2-[2-[2-[2-[[(1S,2R,6R,7R,8S)-4,4-二甲基-7-[[6-(三氟甲基)吡嗪-2-基]氨基]-3,5,9,11-四氧杂三环[6.2.1.02,6]十一烷-1-基]甲氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙基]丙酰胺(110mg,84.34μmol,1当量)、3-乙氧基-3-氧代-丙酸(13.37mg,101.21μmol,1.2当量)和DIEA(21.80mg,168.68μmol,29.38μL,2当量)在DMF(2mL)中的混合物中。然后将混合物在20℃搅拌1小时。LCMS显示化合物4被消耗并且检测到所需化合物。将水(10ml)加入到混合物中,并用EtOAc(10mL x 2)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤,经Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液,得到残余物。将残余物通过制备型TLC纯化(SiO2,EtOAc∶MeOH=10∶1)。获得白色固体状的3-[[2-[3-[2-[2-[2-[2-[[(1S,2R,6R,7R,8S)-4,4-二甲基-7-[[6-(三氟甲基])吡嗪-2-基]氨基]-3,5,9,11-四氧杂三环[6.2.1.02,6]十一烷-1-基]甲氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙基氨基]-3-氧代-丙氧基]-1-[[3-[2-[2-[2-[2-[[(1S,2R,6R,7R,8S)-4,4-二甲基-7-[[6-(三氟甲基)吡嗪-2-基]氨基]-3,5,9,11-四氧杂三环[6.2.1.02,6]十一烷-1-基]甲氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙基氨基]-3-氧代-丙氧基]甲基]乙基]氨基]-3-氧代-丙酸乙酯(100mg,70.50μmol,83.60%收率)。LC-MS(ESI)发现值:710.0[M/2+H]+。
步骤4:在20℃将NaOH/H2O(1M,112.80μL,2当量)溶液添加到3-[[2-[3-[2-[2-[2-[2-[[(1S,2R,6R,7R,8S)-4,4-二甲基-7-[[6-(三氟甲基)吡嗪-2-基]氨基]-3,5,9,11-四氧杂三环[6.2.1.02,6]十一烷-1-基]甲氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙基氨基]-3-氧代-丙氧基]-1-[[3-[2-[2-[2-[2-[[(1S,2R,6R,7R,8S)-4,4-二甲基-7-[[6-(三氟甲基)吡嗪-2-基]氨基]-3,5,9,11-四氧杂三环[6.2.1.02,6]十一烷-1-基]甲氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙基氨基]-3-氧代-丙氧基]甲基]乙基]氨基]-3-氧代-丙酸乙酯(80mg,56.40μmol,1当量)在THF(1mL)中的溶液中,然后将混合物在20℃搅拌1小时。3-[[2-[3-[2-[2-[2-[2-[[(1S,2R,6R,7R,8S)-4,4-二甲基-7-[[6-(三氟甲基)吡嗪-2-基]氨基]-3,5,9,11-四氧杂三环[6.2.1.02,6]十一烷-1-基]甲氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙基氨基]-3-氧代-丙氧基]-1-[[3-[2-[2-[2-[2-[[(1S,2R,6R,7R,8S)-4,4-二甲基-7-[[6-(三氟甲基)吡嗪-2-基]氨基]-3,5,9,11-四氧杂三环[6.2.1.02,6]十一烷-1-基]甲氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙基氨基]-3-氧代-丙氧基]甲基]乙基]氨基]-3-氧代-丙酸(78mg,粗品)在THF(1mL)中的混合物(黄色液体)直接用于下一步,无需后处理。LC-MS(ESI)发现值:696.0[M/2+H]+。
步骤5:在20℃将HCl溶液(2M,1mL,35.65当量)添加到3-[[2-[3-[2-[2-[2-[2-(1S,2R,6R,7R,8S)-4,4-二甲基-7-[[6-(三氟甲基)吡嗪-2-基]氨基]-3,5,9,11-四氧杂三环[6.2.1.02,6]十一烷-1-基]甲氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙基氨基]-3-氧代-丙氧基]-1-[[3-[2-[2-[2-[2]-[[(1S,2R,6R,7R,8S)-4,4-二甲基-7-[[6-(三氟甲基)吡嗪-2-基]氨基]-3,5,9,11-四氧杂三环[6.2.1.02,6]十一烷-1-基]甲氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙基氨基]-3-氧代-丙氧基]甲基]乙基]氨基]-3-氧代-丙酸(78mg,56.10μmol,1当量)在THF(1mL)中的溶液中并且搅拌2小时。通过制备型HPLC纯化混合物。获得3-[[2-[3-[2-[2-[2-[2-[[(1S,2R,3R,4R,5S)-2,3-二羟基-4-[[6-(三氟甲基)吡嗪-2-基]氨基]-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛-1-基]甲氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙基氨基]-3-氧代-丙氧基]-1-[[3-[2-[2-[2-[2-[[(1S,2R,3R,4R,5S)-2,3-二羟基-4-[[6-(三氟甲基)吡嗪-2-基]氨基]-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛-1-基]甲氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙基氨基]-3-氧代-丙氧基]甲基]乙基]氨基]-3-氧代-丙酸(A36,32mg,22.48μmol,40.08%收率,92.06%纯度),为无色油状物。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δppm 8.17(s,2H)8.01(s,2H)5.35(d,J=1.22Hz,2H)4.20(d,J=9.90Hz,2H)4.10-4.17(m,1H)4.01(d,J=9.54Hz,2H)3.96(d,J=4.28Hz,2H)3.81-3.87(m,4H)3.60-3.74(m,33H)3.46-3.58(m,8H)3.38(t,J=5.38Hz,4H)2.45(t,J=6.05Hz,4H)。
A37,(1S,2R,3R,4R,5S)-1-(羟甲基)-4-((3-(三氟甲基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-6-基)氨基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇的制备
步骤1:向(1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(100mg,523.06umol)和6-氯-3-(三氟甲基)-2H-吡唑并[3,4-d]嘧啶(174.62mg,784.60umol)的溶液中添加DIPEA(162.24mg,1.26mmol,218.65uL,2.4当量)和4-氯-2-(三氟甲基)嘧啶-5-甲酸乙酯(199.75mg,784.60umol,1.5当量)在100℃搅拌15小时。过滤反应混合物。滤液通过制备型HPLC纯化(TFA条件;柱:Phenomenex Luna C18 150*30mm*5um;流动相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%-45%,8min)。A37,(1S,2R,3R,4R,5S)-1-(羟甲基)-4-((3-(三氟甲基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-6-基)氨基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇,收率:84mg,43.1%,白色固体。LC-MS(ESI)发现值:378[M+H]+。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ=8.86(s,1H),5.47(br s,1H),4.27(br s,1H),4.02-3.81(m,6H),3.74(d,J=7.9Hz,1H)。
A38,2-[[(1S,2R,3R,4R,5S)-2,3-二羟基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛-4-基]氨基]-6-甲基-嘧啶-4-甲腈的制备
步骤1:向(1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(100mg,523.06umol)和2-氯-6-甲基-嘧啶-4-甲腈(120.49mg,784.60umol)的溶液中加入DIPEA(162.24mg,1.26mmol,218.65uL,2.4当量)和4-氯-2将-(三氟甲基)嘧啶-5-甲酸乙酯(199.75mg,784.60umol,1.5当量)在100℃搅拌15小时。过滤反应混合物。滤液通过制备型HPLC纯化(TFA条件;柱:Phenomenex Luna C18 150*30mm*5um;流动相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%-45%,8min)。A38,2-[[(1S,2R,3R,4R,5S)-2,3-二羟基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-4-基]氨基]-6-甲基-嘧啶-4-甲腈,收率:60.8mg,37.7%,白色固体。LC-MS(ESI)发现值:309[M+H]+。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ=6.92(br s,1H),5.37(br s,1H),4.22(br s,2H),4.04-3.65(m,7H),2.40(br s,3H)。
A39,3-[[(1S,2R,3R,4R,5S)-2,3-二羟基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛-4-基]氨基]哒嗪-4-甲腈的制备
步骤1:向(1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(100mg,523.06umol)和3-氯哒嗪-4-甲腈(109.48mg,784.60umol)的溶液中添加DIPEA(162.24mg,1.26mmol,218.65uL,2.4当量)和4-氯-2-(三氟甲基)嘧啶-5-甲酸乙酯(199.75mg,784.60umol,1.5当量)在100℃搅拌15小时。过滤反应混合物。滤液通过制备型HPLC纯化(TFA条件;柱:Phenomenex Luna C18 150*30mm*5um;流动相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%-45%,8min)。A39,3-[[(1S,2R,3R,4R,5S)-2,3-二羟基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-4-基]氨基]哒嗪-4-甲腈,收率:28.5mg,18.5%,白色固体。LC-MS(ESI)发现值:295[M+H]+。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ=8.67(d,J=4.9Hz,1H),7.74(d,J=4.9Hz,1H),5.50(d,J=1.4Hz,1H),4.56(dd,J=1.4,9.9Hz,1H),4.07(dd,J=4.3,9.8Hz,1H),4.01-3.95(m,2H),3.91-3.85(m,2H),3.76(d,J=7.9Hz,1H)。
A40:2-[[(1S,2R,3R,4R,5S)-2,3-二羟基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-4-基]氨基]-5-氟-吡啶-3-甲腈和A41:2-氯-5-[[(1S,2R,3R,4R,5S)-2,3-二羟基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛-4-基]氨基]吡啶-3-甲腈的制备:
步骤1:向(1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(100mg,523.06umol)和2-氯-5-氟-吡啶-3-甲腈(122.82mg,784.60umol)的溶液中加入DIPEA(162.24mg,1.26mmol,218.65uL,2.4当量)和4-氯-2-(三氟甲基)嘧啶-5-甲酸乙酯(199.75mg,784.60umol,1.5当量)在100℃搅拌15小时。过滤反应混合物。滤液通过制备型HPLC纯化(TFA条件;柱:Phenomenex Luna C18 150*30mm*5um;流动相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%-45%,8min)。A40:2-[[(1S,2R,3R,4R,5S)-2,3-二羟基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛-4-基]氨基]-5-氟-吡啶-3-甲腈收率:20.13mg,12.36%,黄色固体。LC-MS(ESI)发现值:312[M+H]+。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ=8.23(d,J=3.0Hz,1H),7.78(dd,J=3.1,7.9Hz,1H),5.40(d,J=1.3Hz,1H),4.34(br d,J=8.1Hz,1H),4.00-3.91(m,4H),3.88-3.82(m,2H),3.73(d,J=8.0Hz,1H).A41:2-氯-5-[[(1S,2R,3R,4R,5S)-2,3-二羟基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛-4-基]氨基]吡啶-3-甲腈收率:9.5mg,5.5%,白色固体。LC-MS(ESI)发现值:328[M+H]+。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ=8.08(d,J=3.1Hz,1H),7.50(d,J=3.1Hz,1H),5.31(d,J=1.4Hz,1H),4.00-3.90(m,2H),3.87-3.71(m,5H),3.63-3.57(m,1H)。
A42:(1S,2R,3R,4R,5S)-4-[[3-氟-4-(三氟甲基)-2-吡啶基]氨基]-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇和A43:(1S,2R,3R,4R,5S)-4-[[2-氯-4-(三氟甲基)-3-吡啶基]氨基]-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇的制备
步骤1:向(1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(100mg,523.06umol)和2-氯-3-氟-4-(三氟甲基)吡啶(156.13mg,784.60umol)的溶液中加入DIPEA(162.24mg,1.26mmol,218.65uL,2.4当量)和4-氯-2-(三氟甲基)嘧啶-5-甲酸乙酯(199.75mg,784.60umol,1.5当量)在100℃搅拌15小时。过滤反应混合物。滤液通过制备型HPLC纯化(TFA条件;柱:Phenomenex Luna C18 150*30mm*5um;流动相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%-45%,8min)。A116:(1S,2R,3R,4R,5S)-4-[[3-氟-4-(三氟甲基)-2-吡啶基]氨基]-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇,收率:8mg,4.3%,黄色固体。LC-MS(ESI)发现值:355[M+H]+。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ=8.03(d,J=5.0Hz,1H),7.51(d,J=5.1Hz,1H),5.44(d,J=1.1Hz,1H),4.35(br d,J=10.5Hz,1H),3.97-3.91(m,1H),3.86-3.74(m,6H)。A117:(1S,2R,3R,4R,5S)-4-[[2-氯-4-(三氟甲基)-3-吡啶基]氨基]-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇,收率:20mg,10.3%,黄色固体。LC-MS(ESI)发现值:371[M+H]+。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ=7.98(d,J=5.3Hz,1H),6.76(t,J=4.8Hz,1H),5.40(d,J=1.4Hz,1H),4.63(s,1H),4.34(br d,J=8.4Hz,1H),4.00-3.93(m,3H),3.88-3.82(m,2H),3.73(d,J=7.9Hz,1H)。
A44,(1S,2R,3R,4R,5S)-4-[(2,5-二氯-3-吡啶基)氨基]-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇的制备
步骤1:向(1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(100mg,523.06umol)和2,5-二氯-3-氟-吡啶(130.23mg,784.60umol)的溶液中添加DIPEA(162.24mg,1.26mmol,218.65uL,2.4当量)和4-氯-2-(三氟甲基)嘧啶-5-甲酸乙酯(199.75mg,784.60umol,1.5当量)在100℃搅拌15小时。过滤反应混合物。滤液通过制备型HPLC纯化(TFA条件;柱:Phenomenex Luna C18 150*30mm*5um;流动相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%-45%,8min)。A44:(1S,2R,3R,4R,5S)-4-[(2,5-二氯-3-吡啶基)氨基]-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇,收率:12.9mg,7.3%,白色固体。LC-MS(ESI)发现值:337[M+H]+。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ=7.62(d,J=2.3Hz,1H),7.35(d,J=2.1Hz,1H),5.32(d,J=1.3Hz,1H),4.01-3.92(m,3H),3.89-3.83(m,4H),3.76(d,J=8.0Hz,1H),3.72-3.66(m,1H)。
A45:(1S,2R,3R,4R,5S)-4-(苯并[d]噁唑-2-基氨基)-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇的制备
步骤1:向1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(100mg,523.06umol)和2-氯-1,3-苯并噁唑(120.49mg,784.60umol,89.25uL)的溶液中添加DIPEA(162.24mg,1.26mmol,218.65uL,2.4当量)和4-氯-2-(三氟甲基)嘧啶-5-甲酸乙酯(199.75mg,784.60umol,1.5当量)在100℃搅拌15小时。过滤反应混合物。滤液通过制备型HPLC纯化(TFA条件;柱:Phenomenex Luna C18 150*30mm*5um;流动相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%-45%,8min)。A45:(1S,2R,3R,4R,5S)-4-(苯并[d]噁唑-2-基氨基)-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇,产率:38.13mg,收率23.65%浅黄色固体。LC-MS(ESI)发现值:309[M+H]+。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ=7.41(d,J=7.9Hz,1H),7.37-7.33(m,1H),7.32-7.25(m,1H),7.24-7.18(m,1H),5.48(s,1H),4.00-3.93(m,2H),3.92(d,J=1.8Hz,2H),3.89-3.83(m,2H),3.76(d,J=8.1Hz,1H)。
A46:(1S,2R,3R,4R,5S)-1-(羟甲基)-4-((4-甲氧基-6-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇的制备
步骤1:(1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(50mg,0.26mmol)、2-氯-4-甲氧基-6-(三氟甲基)嘧啶(164mg,0.78mmol)和DIPEA(169mg,1.3mmol)在i-PrOH(1mL)中的溶液于80℃下搅拌过夜。浓缩混合物并通过制备型TLC纯化残余物,得到(1S,2R,3R,4R,5S)-1-(羟甲基)-4-((4-甲氧基-6-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(A46,12mg,13%收率),为黄色固体。LC-MS(ESI)发现值:368[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ6.34(s,1H),5.40(s,1H),4.20(d,J=6.8Hz,1H),4.04-3.89(m,5H),3.87-3.77(m,3H),3.71(d,J=7.9Hz,1H)。
A47:(1S,2R,3R,4R,5S)-1-(羟甲基)-4-((6-甲氧基-2-(三氟甲基)嘧啶-4-基)氨基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇的制备
步骤1:(1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(50mg,0.26mmol)、2-氯-4-甲氧基-6-(三氟甲基)嘧啶(164mg,0.78mmol)和DIPEA(169mg,1.3mmol)在i-PrOH(1mL)中的溶液于80℃下搅拌过夜。将混合物浓缩,残余物通过制备型TLC纯化,得到(1S,2R,3R,4R,5S)-1-(羟甲基)-4-((6-甲氧基-2-(三氟甲基)嘧啶-4-基)氨基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(A47,6mg,7%收率),为黄色固体。LC-MS(ESI)发现值:368[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ5.97(s,1H),5.32(s,1H),4.24(d,J=21.2Hz,1H),3.96-3.88(m,5H),3.85-3.76(m,3H),3.71(d,J=7.9Hz,1H)。
A48:2-(((3S,4R,5R,6R)-4,5-二羟基-6-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)氨基)-6-甲氧基嘧啶-4-碳亚胺甲酯的制备
步骤1:在室温下在N2气氛下向2-(((3S,4R,5R,6R)-4,5-二羟基-6-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)氨基)-6-甲氧基嘧啶-4-甲腈(30mg,0.01mol)的MeOH(5mL)的搅拌溶液中添加CH3ONa(36mg,0.2mmol)。添加完成后,将反应在室温下搅拌过夜。起始材料消耗后(LCMS监测),将混合物真空浓缩。粗产物在碱性条件下直接通过预HPLC纯化,得到2-(((3S,4R,5R,6R)-4,5-二羟基-6-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)氨基)-6-甲氧基嘧啶-4-甲酸甲酯,为白色固体(A48,1.5mg,5%收率)。LC-MS(ESI)发现值:329[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ6.43(s,1H),4.42(s,1H),4.13(dd,J=11.0,5.3Hz,1H),3.94(d,J=23.7Hz,4H),3.73(ddd,J=16.4,11.4,6.1Hz,2H),3.63(dd,J=10.6,3.2Hz,1H),3.51-3.40(m,1H),3.36-3.30(m,3H),3.14(dd,J=12.8,9.0Hz,1H)。
A49:(2R,3R,4R,5S)-2-(羟甲基)-5-(吡咯并[2,1-f][1,2,4]三嗪-4-基氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:向(2R,3R,4R,5S)-5-((2-氯吡咯并[2,1-f][1,2,4]三嗪-4-基)氨基)-2-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(50mg,0.20mmol)在甲醇(3mL)中的溶液中添加Pd/C(5mg,10%重量,60%湿)。将混合物在H2气球下于室温搅拌过夜。过滤后,浓缩溶剂并通过色谱法(硅胶,二氯甲烷中的0-20%甲醇)纯化残余物,得到(2R,3R,4R,5S)-2-(羟甲基)-5-(吡咯并[2,1-f][1,2,4]三嗪-4-基氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A49,7.1mg,16%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:281[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ7.80(s,1H),7.49(dd,J=2.4,1.5Hz,1H),6.87(dd,J=4.3,1.2Hz,1H),6.62(dd,J=4.3,2.7Hz,1H),4.65(td,J=10.7,5.2Hz,1H),4.12(dd,J=11.0,5.3Hz,1H),3.94(d,J=2.9Hz,1H),3.75(dtd,J=16.4,11.4,6.0Hz,3H),3.58-3.44(m,1H),3.26(t,J=10.9Hz,1H)。
A50:(2R,3R,4R,5R,6S)-5-叠氮基-2-(羟甲基)-6-甲基四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:在0℃向(2R,3R,4R)-3,4-双(苄氧基)-2-((苄氧基)甲基)-3,4-二氢-2H-吡喃(5g,12.00mmol)和TMSN3(4.14g,36.01mmol)在DCM(200mL)中的搅拌溶液中依次添加PhI(OCOCF3)2(10.32g,24.00mmol)、TEMPO(0.37g,2.40mmol)、Bu4NHSO4(0.81g,2.40mmol)和H2O(10.81mL,600.21mmol)。添加完成后,将反应混合物在0℃温度下搅拌35分钟。起始材料消耗后(TLC监测,反应混合物的猩红色变成浅黄色),加入饱和NaHCO3水溶液,并将反应混合物在0℃进一步搅拌15分钟。用CH2Cl2(3 x 50mL)萃取反应物,并用水(1 x 50mL)和盐水(1 x 50mL)洗涤合并的有机萃取物,经Na2SO4干燥并蒸发溶剂。将粗产物通过柱色谱纯化,得到粗产物(3.3g,37%收率)。LC-MS(ESI)发现值:498[M+Na]+。
步骤2:向(3R,4R,5R,6R)-3-叠氮基-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)四氢-2H-吡喃-2-醇(3.3g,6.95mmol)的DMSO(16mL)溶液中添加Ac2O(16mL)。将反应在室温下搅拌18小时。将反应物用EA和水稀释。分离有机层,真空浓缩。使用硅胶柱色谱法纯化残余物,用[PE∶EA=5∶1]洗脱得到标题化合物(3R,4R,5R,6R)-3-叠氮基-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)四氢-2H-吡喃-2-醇(1.8g,53%收率)。LC-MS(ESI)发现值:496[M+Na]+。
步骤3:(3R,4R,5R,6R)-3-叠氮基-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)四氢-2H-吡喃-2-醇(1.77g,3.74mmol)在甲苯(10mL)中的溶液中被冷却至-78℃。在剧烈搅拌下滴加MeLi(3.27mL,1.6M,在THF中)。将反应混合物在室温搅拌1小时,然后通过添加饱和NH4Cl溶液淬灭。将混合物用乙醚萃取,并将有机层干燥并浓缩,得到粗产物(1.8g)。LC-MS(ESI)发现值:490[M+H]+。
步骤4:在-40℃下向(2S,3S,4R,5R,6R)-3-叠氮基-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)-2-甲基四氢-2H-吡喃(1.82g,3.72mmol)在MeCN(40mL)中的溶液中缓慢加入三乙基硅烷(2.16g,18.60mmol)。将反应搅拌5分钟,然后添加BF3OEt2(3.17g,22.33mmol)。将混合物在室温下搅拌18小时。将反应用DCM和饱和NaHCO3水溶液稀释。将有机层分离并真空浓缩。使用硅胶柱色谱法纯化残余物,用石油醚中的乙酸乙酯洗脱,得到标题化合物(1.37g,78%收率)。LC-MS(ESI)发现值:496[M+Na]+。
步骤5:向(2S,3S,4R,5R,6R)-3-叠氮基-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)-2-甲基四氢-2H-吡喃(10mg,0.021mmol)在DCM(10mL)中的溶液中加入BCl3(7.93mL,1M在DCM中),将反应在0℃下搅拌3小时。将反应物用饱和Na2CO3水溶液稀释。将反应物用EA和水稀释。将有机层分离并真空浓缩。使用硅胶柱色谱法纯化残余物,用二氯甲烷中的甲醇洗脱,得到标题化合物(2R,3R,4R,5R,6S)-5-叠氮基-2-(羟甲基)-6-甲基四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A50,120mg,0.59mmol,74%收率)。LC-MS(ESI)发现值:226[M+Na]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ3.83(d,J=2.7Hz,1H),3.67(qd,J=11.3,6.1Hz,2H),3.53(dd,J=9.5,3.3Hz,1H),3.42(ddd,J=6.6,5.3,1.0Hz,1H),3.28-3.13(m,2H),1.30(d,J=5.9Hz,3H)。
A51:(2R,3R,4R,5R,6S)-5-氨基-2-(羟甲基)-6-甲基氧烷-3,4-二醇的制备
步骤1:向(2R,3R,4R,5R,6S)-5-叠氮基-2-(羟甲基)-6-甲基四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(120mg,0.59mmol)的MeOH(3mL)溶液中添加Pd/C(12mg,10%重量,60%湿)。将反应在H2气球下于室温搅拌1小时。过滤反应物。将残余物真空浓缩,得到标题化合物(2R,3R,4R,5R,6S)-5-氨基-2-(羟甲基)-6-甲基氧烷-3,4-二醇(A51,70mg,66%收率)。LC-MS(ESI)发现值:178[M+H]+。
A52的制备:(2R,3R,4R,5R,6S)-6-(烯丙氧基)-5-氨基-2-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇和A53:(2R,3R,4R,5R,6S)-6-(烯丙氧基)-5-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇
步骤1:N-((2S,3R,4R,5R,6R)-2-(烯丙氧基)-4,5-二羟基-6-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(200mg,0.6mmol)在NH3/MeOH(6mL,7M)中的溶液在密封管中于80℃搅拌过夜。将混合物浓缩并通过C18柱纯化,得到(2R,3R,4R,5R,6S)-6-(烯丙氧基)-5-氨基-2-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A52,50mg,36%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:220[M+H]+。
步骤2:向(2R,3R,4R,5R,6S)-6-(烯丙氧基)-5-氨基-2-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(30mg,0.1mmol)、3,5-二氯-1,2,4-噻二唑(31mg,0.2mmol)和DIEA(39mg,0.3mmol)在异丙醇(3mL)中的混合物在密封管中在80℃下搅拌过夜。将混合物浓缩并通过硅胶柱纯化(0-20%甲醇的二氯甲烷溶液),得到(2R,3R,4R,5R,6S)-6-(烯丙氧基)-5-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A53,1.1mg,2%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:338[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ5.93(ddd,J=21.9,10.8,5.7Hz,1H),5.30(dd,J=17.2,1.7Hz,1H),5.16(dd,J=10.4,1.6Hz,1H),5.01(d,J=3.6Hz,1H),4.22(dd,J=13.1,5.1Hz,2H),4.02(dd,J=13.0,6.2Hz,1H),3.92(d,J=2.8Hz,1H),3.89-3.83(m,2H),3.78-3.68(m,2H)。
A54:2-(((3S,4R,5R,6R)-4,5-二羟基-6-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)氨基)-4-(三氟甲基)噻唑-5-甲酰胺的制备
步骤1:向(2R,3R,4R,5R,6S)-6-(烯丙氧基)-5-氨基-2-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(100mg,0.60mmol)、2-氯-4-(三氟甲基)噻唑-5-甲酰胺(206mg,0.90mmol)和DIEA(232mg,1.8mmol)在异丙醇(3mL)中的溶液在管中在120℃下搅拌过夜。将混合物浓缩并通过色谱法纯化(硅胶,0-20%甲醇的二氯甲烷溶液),得到2-(((3S,4R,5R,6R)-4,5-二羟基-6-(羟甲基)四氢)-2H-吡喃-3-基)氨基)-4-(三氟甲基)噻唑-5-甲酰胺(A54,1.7mg,1%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:358[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ4.15(dd,J=11.0,5.2Hz,1H),4.05(td,J=10.4,5.0Hz,1H),3.89(d,J=3.0Hz,1H),3.74(dd,J=11.4,7.1Hz,1H),3.67(dd,J=11.4,5.0Hz,1H),3.57(dd,J=10.3,3.2Hz,1H),3.43(dd,J=6.2,5.2Hz,1H),3.14(t,J=10.8Hz,1H)。
A55:(2R,3R,4R,5R,6S)-2-(羟甲基)-6-甲基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:在室温下向(2R,3R,4R,5R,6S)-5-氨基-2-(羟甲基)-6-甲基四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(35mg,0.20mmol)的i-PrOH(2mL)溶液中加入2-氯-4-(三氟甲基)嘧啶(0.03mL,0.24mmol)和DIEA(0.10mL,0.59mmol),并将混合物在120℃下搅拌过夜。浓缩混合物并通过制备型TLC用10%MeOH的DCM溶液纯化残余物,得到(2R,3R,4R,5R,6S)-2-(羟甲基)-6-甲基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A55,10mg,16%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:324[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.49(d,J=4.7Hz,1H),6.86(d,J=4.8Hz,1H),4.18(s,1H),3.90(d,J=2.8Hz,1H),3.90(d,J=2.8Hz,1H),3.78-3.69(m,2H),3.72(ddd,J=16.5,11.3,6.1Hz,2H),3.67(d,J=5.3Hz,1H),3.51-3.48(m,1H),3.45(dd,J=12.4,6.2Hz,1H),1.22(d,J=6.2Hz,3H)。
A56:(2R,3R,4R,5R,6S)-5-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2-(羟甲基)-6-甲基四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:向(2R,3R,4R,5R,6S)-5-氨基-2-(羟甲基)-6-甲基四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(35mg,0.20mmol)的i-PrOH(2mL)溶液中加入二氯-1,2,4-噻二唑(0.02mL,0.24mmol)和DIEA(0.10mL,0.59mmol)并将混合物在100℃搅拌过夜。将混合物浓缩用于用40%MeOH的H2O溶液柱色谱法纯化,得到(2R,3R,4R,5R,6S)-5-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2-(羟甲基)-6-甲基四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A56,6mg,11%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:296[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ3.88(d,J=2.0Hz,1H),3.73(dd,J=11.3,6.9Hz,1H),3.69(d,J=5.2Hz,1H),3.63(dd,J=22.4,4.1Hz,1H),3.59-3.53(m,1H),3.48(d,J=5.7Hz,1H),3.44(dd,J=8.8,2.6Hz,1H),1.26(d,J=5.9Hz,3H)。
A57:N-((2S,3R,4R,5R,6R)-2-(烯丙氧基)-4,5-二羟基-6-((4-(3-甲氧基苯基)-1H-1,2,3-三唑-1)-基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺的制备
步骤1:在0℃下向N-((2S,3R,4R,5R,6R)-2-(烯丙氧基)-4,5-二羟基-6-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(2.5g,7.9mmol)在2,2-二甲氧基丙烷(40mL)中的溶液中添加TsOH(0.14g,0.8mmol)。将混合物在室温下搅拌3小时。剩余的TsOH用TEA中和。将混合物浓缩,残余物通过色谱法纯化(硅胶,0-100%乙酸乙酯的石油醚溶液),得到N-((3aR,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-4-(羟甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(1.7g,60%收率),为固体。LC-MS(ESI)发现值:354[M-H]-。
步骤2:在0℃下向N-((3aR,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-4-(羟甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(1.7g,4.8mmol)在DCM(30mL)中的溶液中加入TsCl(0.9g,4.8mmol)和TEA(2mL,14.4mmol)。将混合物在室温下搅拌12小时。将混合物浓缩,残余物通过色谱法纯化(硅胶,0-100%乙酸乙酯的石油醚溶液),得到((3aR,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-2,2-二甲基-7-(2,2,2-三氟乙酰胺基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基4-甲基苯磺酸酯(1.8g,74%收率),呈固体。LC-MS(ESI)发现值:509[M-H]-。
步骤3:向((3aR,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-2,2-二甲基-7-(2,2,2-三氟乙酰胺基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基4-甲基苯磺酸酯(1.8g,3.5mmol)的DMSO(10mL)溶液中添加NaN3(2.3g,35mmol)的H2O(4mL)溶液。将混合物在100℃下搅拌36小时。将混合物用H2O稀释,用EA萃取,通过色谱法纯化(硅胶,0-100%乙酸乙酯的石油醚溶液),得到N-((3aS,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-4-(叠氮基甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(640mg,48%收率),为固体。LC-MS(ESI)发现值:379[M-H]-。
步骤4:向N-((3aS,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-4-(叠氮基甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(640mg,1.7mmol)的THF(20mL)溶液中添加HCl(1mL,2M的H2O溶液),将混合物在室温下搅拌12小时。将混合物用饱和NaHCO3水溶液中和,用EA萃取,经Na2SO4干燥、通过色谱法纯化(硅胶,0-100%乙酸乙酯的石油醚溶液),得到N-((2S,3R,4R,5R,6R)-2-(烯丙氧基)-6-(叠氮基甲基)-4,5-二羟基四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(300mg,52%收率),为固体。LC-MS(ESI)发现值:339[M-H]-。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ9.38(s,1H),5.86(dddd,J=15.3,10.5,5.7,4.8Hz,1H),5.32(ddd,J=17.3,3.5,1.7Hz,1H),5.17(dd,J=10.5,1.7Hz,1H),5.00(d,J=4.4Hz,1H),4.83(t,J=4.9Hz,2H),4.19-4.05(m,2H),4.02-3.95(m,1H),3.93-3.82(m,2H),3.71(s,1H),3.53(dd,J=12.8,9.0Hz,1H),3.28(dd,J=12.8,3.6Hz,1H)。19F NMR(377MHz,DMSO-d6):δ-73.84。
步骤5:将THPTA(10mg,0.020mmol)和CuSO4(1mg,0.0040mmol)溶解在水(0.5mL)中。将混合物添加至N-((2S,3R,4R,5R,6R)-2-(烯丙氧基)-6-(叠氮基甲基)-4,5-二羟基四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(20mg,0.060mmol)和1-乙炔基-3-甲氧基苯(12mg,0.090mmol)在MeOH(4mL)中的溶液中。添加新鲜制备的抗坏血酸钠(2mg,0.010mmol)在水(0.5mL)中的溶液。将反应搅拌过夜。将所得混合物过滤。通过色谱法(硅胶,0-100%乙酸乙酯的石油醚溶液)纯化粗产物,得到N-((2S,3R,4R,5R,6R)-2-(烯丙氧基)-4,5-二羟基-6-((4-(3-甲氧基苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(A57,18mg,67%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:473[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.35(s,1H),7.55-7.22(m,3H),6.91(ddd,J=7.9,2.5,1.3Hz,1H),5.65(ddt,J=16.6,10.4,5.8Hz,1H),5.15-4.96(m,2H),4.89(d,J=3.7Hz,1H),4.72-4.66(m,2H),4.34(dd,J=10.5,3.7Hz,1H),4.28(dd,J=8.2,4.8Hz,1H),4.04-3.94(m,2H),3.84(s,3H),3.79-3.72(m,1H),3.67(dd,J=13.0,6.2Hz,1H)。19F NMR(377MHz,CD3OD)δ-77.00。
A58:N-((2S,3R,4R,5R,6R)-2-(烯丙氧基)-4,5-二羟基-6-((4-(3-甲氧基苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺的制备
步骤1:N-((2S,3R,4R,5R,6R)-2-(烯丙氧基)-4,5-二羟基-6-((4-(3-甲氧基苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(15mg,0.030mmol)的NH3/MeOH(3mL,7M)溶液。将混合物在密封管中于80℃搅拌过夜。将混合物浓缩,得到粗品(2R,3R,4R,5R,6S)-6-(烯丙氧基)-5-氨基-2-((4-(3-甲氧基苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(12mg),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:377[M+H]+。
步骤2:向(2R,3R,4R,5R,6S)-6-(烯丙氧基)-5-氨基-2-((4-(3-甲氧基苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(12mg,0.030mmol)、2-氯-4-(三氟甲基)嘧啶(9mg,0.050mmol)和DIEA(12mg,0.10mmol)的异丙醇(3mL)溶液在密封管中于120℃搅拌过夜。将混合物浓缩并通过色谱法纯化(硅胶,0-20%甲醇的二氯甲烷溶液),得到(2R,3R,4R,5R,6S)-6-(烯丙氧基)-2-((4-(3-甲氧基苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A58,1.7mg,1%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:523[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.51(d,J=4.5Hz,1H),8.36(s,1H),7.48-7.18(m,3H),7.02-6.78(m,2H),5.63(d,J=5.8Hz,1H),4.98(dd,J=28.5,14.0Hz,3H),4.74-4.69(m,2H),4.56(d,J=12.3Hz,1H),4.30(dd,J=8.2,4.7Hz,1H),4.01(d,J=2.7Hz,1H),3.96(dd,J=10.8,3.0Hz,1H),3.84(s,3H),3.74(dd,J=12.9,5.4Hz,1H),3.66(dd,J=12.7,5.9Hz,1H)。19F NMR(377MHz,CD3OD)δ-72.34.
A59:(2R,3R,4R,5S)-2-(叠氮基甲基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:在室温N2气氛下向(2R,3R,4R,5S)-2-(羟甲基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(200mg,0.65mol)在吡啶(20mL)中的搅拌溶液中添加TsCl(123mg,0.65mmol)。添加完成后,将反应在室温下搅拌过夜。起始材料消耗后(LCMS监测),将混合物真空浓缩。通过预HPLC纯化粗产物,得到(((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基4-甲基苯磺酸酯,为白色固体(100mg,收率33%)。LC-MS(ESI)发现值:464[M+H]+。
步骤2:在室温N2气氛下向(((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基4-甲基苯磺酸酯(200mg,0.22mol)在DMF(2mL)中的搅拌溶液中添加NaN3(140mg,2.2mmol)。添加完成后,将反应在100℃下搅拌过夜。起始材料消耗后(LCMS监测),将反应容器再次冷却至室温。将混合物过滤并真空浓缩。通过制备型HPLC纯化粗产物,得到(2R,3R,4R,5S)-2-(叠氮基甲基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A59,10mg,14%收率)。LC-MS(ESI)发现值:335[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.51(d,J=4.8Hz,1H),6.90(d,J=4.9Hz,1H),4.36(td,J=10.6,5.5Hz,1H),4.11(dd,J=11.0,5.2Hz,1H),3.83(d,J=3.1Hz,1H),3.67(dd,J=10.5,2.9Hz,1H),3.63-3.52(m,2H),3.34(d,J=8.5Hz,1H),3.26-3.08(m,1H)。
A60:(2R,3R,4R,5S)-2-(羟甲基)-5-(甲基(4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:向(2R,3R,4R,5S)-2-(羟甲基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(1g,3.2mmol)的DMF(20mL)溶液中添加咪唑(0.44g,6.46mmol)和TBDPSCl(1.26g,4.85mmol)。将反应在室温下搅拌过夜。将混合物用乙酸乙酯(150mL)稀释并用水(50mL x 3)洗涤。有机层经硫酸钠干燥,过滤,减压浓缩,得到粗产物,将其通过硅胶柱纯化,得到(2R,3R,4R,5S)-2-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(0.8g,45%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:548[M+H]+。
步骤2:向(2R,3R,4R,5S)-2-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(0.8g,1.46mmol)在2,2-二甲氧基丙烷(20mL)中的溶液中添加TsOH(0.03g,0.14mmol)。将反应在室温下搅拌过夜。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过硅胶柱纯化,得到N-((3aR,4R,7S,7aR)-4-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-4-(三氟甲基)嘧啶-2-胺(0.6g,70%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:588[M+H]+。
步骤3:向N-((3aR,4R,7S,7aR)-4-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-4-(三氟甲基)嘧啶-2-胺(100.0mg,0.307mmol)的DMF(10.0mL)溶液中添加NaH(25.0mg,0.614mmol,60%重量,在矿物油中)、MeI(52.0mg,0.368mmol)。将混合物在室温下搅拌1小时。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过柱纯化,得到N-((3aR,4R,7S,7aR)-4-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-N-甲基-4-(三氟甲基)嘧啶-2-胺(75mg,收率40%),LC-MS(ESI)发现值:602[M+H]+。
步骤4:向N-((3aR,4R,7S,7aR)-4-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-N-甲基-4-(三氟甲基)嘧啶-2-胺(75.1mg,0.125mmol)在THF(10mL)中的溶液中添加TBAF(5mL,1N在THF中)。将混合物在室温下搅拌16小时。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过柱纯化,得到((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-(甲基(4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲醇(36mg,80%收率)。LC-MS(ESI)发现值:364[M+H]+。
步骤5:向((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-(甲基(4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲醇(36.3mg,0.100mmol)的THF(10mL)溶液中添加HCl(5mL,2N的H2O溶液)。将混合物在室温下搅拌16小时。将混合物减压浓缩,通过柱纯化,得到(2R,3R,4R,5S)-2-(羟甲基)-5-(甲基(4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A60,5mg,15%收率)。LC-MS(ESI)发现值:324[M+H]+。1H NMR(400MHz,D2O):δ8.50(d,J=5.0Hz,1H),6.96(d,J=5.0Hz,1H),4.93(s,1H),4.12(d,J=9.4Hz,1H),3.99(d,J=3.2Hz,1H),3.84(dd,J=11.1,5.2Hz,1H),3.74-3.63(m,2H),3.61-3.49(m,2H),3.01(s,3H)。
A61:(2R,3R,4R,5S)-2-(1-(3-甲氧基苯基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:N-((3aR,4R,7S,7aR)-4-(羟甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)乙酰胺(300mg,1.2mmol)在DCM(5mL)中的溶液用DMSO(0.6mL,8.6mmol和Et3N(345mg,3.4mmol)处理。将混合物冷却至0℃。添加吡啶三氧化硫(584mg,3.7mmol)并将混合物在室温下搅拌过夜。将反应用盐水淬灭并用DCM稀释。将水相用DCM萃取三次,并将合并的有机层用盐水洗涤,干燥(Na2SO4),过滤并蒸发,得到粗N-((3aR,4S,7S,7aR)-4-甲酰基-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)乙酰胺(160mg,54%收率),为黄色油状物。LC-MS(ESI)发现值:244[M+H]+。
步骤2:向N-((3aR,4S,7S,7aR)-4-甲酰基-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)乙酰胺(160mg,0.66mmol)在MeOH(3mL)中的溶液中添加K2CO3(109mg,0.79mmol)。在室温搅拌10分钟后,添加(1-重氮-2-氧代丙基)膦酸二甲酯(189mg,0.98mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。将混合物浓缩,残余物通过快速柱纯化,得到N-((3aS,4R,7S,7aR)-4-乙炔基-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)乙酰胺(80mg,51%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:240[M+H]+。
步骤3:N-((3aS,4R,7S,7aR)-4-乙炔基-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)乙酰胺(80mg,0.33mmol)的DCM(5mL)溶液中添加Et3N(101mg,1.0mmol)、(Boc)2O(0.715mL,3.344mmol)和DMAP(4.08mg,0.033mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜,然后浓缩。通过快速柱纯化残余物,得到叔丁基乙酰基((3aS,4R,7S,7aR)-4-乙炔基-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)氨基甲酸酯(80mg,70%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:340[M+H]+。
步骤4:向叔丁基乙酰基((3aS,4R,7S,7aR)-4-乙炔基-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)氨基甲酸酯(80mg,0.23mmol)的THF(3mL)溶液中添加NaOH(24mg,0.59mmol)的H2O(1mL)溶液。将混合物在60℃下搅拌2小时,然后用EA和H2O萃取。浓缩有机层,得到粗((3aS,4R,7S,7aR)-4-乙炔基-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)氨基甲酸叔丁酯(60mg,68%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:298[M+H]+。
步骤5:向((3aS,4R,7S,7aR)-4-乙炔基-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)氨基甲酸叔丁酯(50mg,0.17mmol)在THF(3mL)中的溶液中添加HCl(1mL,2N H2O溶液)。将混合物在室温下搅拌过夜,然后浓缩,得到粗品((2R,3R,4R,5S)-5-氨基-2-乙炔基四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(10mg,38%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:158[M+H]+。
步骤6:(2R,3R,4R,5S)-5-氨基-2-乙炔基四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(10mg,0.06mmol)、2-氯-4-(三氟甲基)嘧啶(11mg,0.06mmol)和DIPEA(9mg,0.07mmol)在无水i-PrOH(2mL)中的溶液在80℃下搅拌过夜,然后蒸发。通过快速柱纯化残余物,得到(2R,3R,4R,5S)-2-乙炔基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(10mg,收率52%),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:304[M+H]+。
步骤7:向(2R,3R,4R,5S)-2-乙炔基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(10mg,0.03mmol)和1-叠氮基-3-甲氧基苯(5mg,0.03mmol)的MeOH(2mL)溶液中添加CuSO4(1mg,0.003mmol)、THPTA(7mg,0.017mmol)和抗坏血酸钠(A61,1.3mg,0.007mmol)。将混合物在室温搅拌过夜,然后通过C18柱纯化,得到(2R,3R,4R,5S)-2-(1-(3-甲氧基苯基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(1.8mg,12%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:453[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.57(s,2H),7.48(t,J=8.1Hz,1H),7.45-7.38(m,2H),7.06(dd,J=8.2,1.5Hz,1H),6.94(d,J=4.9Hz,1H),4.83(d,J=9.8Hz,1H),4.29(s,1H),4.22(dd,J=11.9,2.3Hz,1H),4.17(s,1H),4.14-4.10(m,1H),3.89(s,3H),3.82(d,J=11.8Hz,1H)。
A62:(2R,3R,4R,5S)-2-((4-(羟甲基)-1H-吡唑-1-基)甲基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:向N-((3aR,4R,7S,7aR)-4-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-4-(三氟甲基)嘧啶-2-胺(2.2g,3.7mmol)在THF(20mL)中的溶液中添加TBAF(5.6mL,1M在THF中)。将反应在室温下搅拌3小时。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过快速色谱法纯化(硅胶,MeOH中的0-10%DCM),得到((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲醇(1.1g,85%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:350[M+H]+。
步骤2:在室温下向((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲醇(1.1g,3.1mmol)的吡啶(100mL)溶液中添加TsCl(0.83g,4.6mmol)。将混合物在室温搅拌过夜。起始材料消耗后(LCMS监测),将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过快速色谱法纯化,得到((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基4-甲基苯磺酸酯(1.1g,73%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:504[M+H]+。
步骤3:((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基4-甲基苯磺酸酯(120mg,0.2mmol)、1H-吡唑-4-甲醛(28mg,0.3mmol)和Cs2CO3(196mg,0.6mmol)在DMF(5mL)中的溶液于100℃搅拌过夜。将混合物用H2O淬灭并用EA萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤。将混合物浓缩并通过色谱法纯化(硅胶,0-100%乙酸乙酯的石油醚溶液),得到1-(((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基)-1H-吡唑-4-甲醛(90mg,89%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:428[M+H]+。
步骤4:在0℃向1-(((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基)-1H-吡唑-4-甲醛(80mg,0.19mmol)的THF(5mL)溶液中添加NaBH4(80mg,0.19mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。将混合物用H2O淬灭并用EA萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤。将混合物浓缩并通过色谱法纯化(硅胶,0-100%乙酸乙酯的石油醚溶液),得到(1-(((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基)-1H-吡唑-4-基)甲醇(50mg,63%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:430[M+H]+。
步骤5:在0℃向(1-(((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基)-1H-吡唑-4-基)甲醇(50mg,0.12mmol)的THF(5mL)溶液中加入HCl(0.5mL,2M的H2O溶液)。将混合物在室温下搅拌过夜。将混合物浓缩并通过C18色谱纯化,得到(2R,3R,4R,5S)-2-((4-(羟甲基)-1H-吡唑-1-基)甲基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A62,2.5mg,5%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:390[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.50(d,J=4.7Hz,1H),7.61(s,1H),7.48(s,1H),6.89(d,J=4.9Hz,1H),4.49(s,2H),4.41-4.23(m,3H),4.05(dd,J=11.1,5.2Hz,1H),3.82-3.73(m,2H),3.66(dd,J=10.5,3.0Hz,1H),3.07(t,J=10.9Hz,1H)。19F NMR(377MHz,CD3OD)δ-72.39。
A63:N-((2S,3R,4R,5R,6R)-2-(烯丙氧基)-4,5-二羟基-6-((4-(羟甲基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺的制备
步骤1:将THPTA(10mg)和CuSO4(1mg)溶解在水(0.5mL)中。将混合物添加至N-((2S,3R,4R,5R,6R)-2-(烯丙氧基)-6-(叠氮基甲基)-4,5-二羟基四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(20mg,0.06mmol)和丙-2-炔-1-醇(5mg,0.09mmol)在MeOH(4mL)中的溶液。添加新鲜制备的抗坏血酸钠(2mg)在水(0.5mL)中的溶液。将反应搅拌过夜。将所得混合物过滤。通过色谱法(硅胶,0-100%乙酸乙酯的石油醚溶液)纯化粗产物,得到N-((2S,3R,4R,5R,6R)-2-(烯丙氧基)-4,5-二羟基-6-((4-(羟甲基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(A63,18mg,78%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:397[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ7.92(s,1H),5.77-5.59(m,1H),5.14(ddd,J=17.3,3.2,1.6Hz,1H),5.08(ddd,J=10.4,2.8,1.2Hz,1H),4.87(d,J=3.8Hz,1H),4.67(s,2H),4.65-4.62(m,2H),4.32(dd,J=11.0,3.7Hz,1H),4.26-4.21(m,1H),3.97(dd,J=11.0,3.2Hz,1H),3.92(d,J=2.6Hz,1H),3.81-3.72(m,1H),3.67(ddt,J=13.1,6.2,1.3Hz,1H)。19F NMR(377MHz,CD3OD)δ-77.01。
A64:(2R,3R,4R,5R,6S)-6-(烯丙氧基)-2-((4-(羟甲基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:向N-((2S,3R,4R,5R,6R)-2-(烯丙氧基)-4,5-二羟基-6-((4-(羟甲基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(15mg,0.03mmol)在NH3/MeOH(3mL,7M)中的溶液在密封管中于80℃搅拌过夜。将混合物浓缩,得到粗品(2R,3R,4R,5R,6S)-6-(烯丙氧基)-5-氨基-2-((4-(羟甲基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(11mg),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:301[M+H]+。
步骤2:(2R,3R,4R,5R,6S)-6-(烯丙氧基)-5-氨基-2-((4-(羟甲基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(11mg,0.03mmol)、2-氯-4-(三氟甲基)嘧啶(9mg,0.05mmol)和DIEA(12mg,0.1mmol)的异丙醇(3mL)溶液在密封管中于120℃搅拌过夜。将混合物浓缩并通过C18色谱纯化,得到(2R,3R,4R,5R,6S)-6-(烯丙氧基)-2-((4-(羟甲基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A64,8.8mg,68%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:447[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.51(d,J=4.7Hz,1H),7.94(s,1H),6.91(d,J=4.9Hz,1H),5.66(s,1H),5.10(d,J=17.9Hz,1H),5.04-4.95(m,2H),4.69-4.64(m,4H),4.55(s,1H),4.29-4.22(m,1H),3.97-3.91(m,2H),3.74(dd,J=13.0,5.1Hz,1H),3.67(d,J=5.3Hz,1H)。19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-72.36。
A65:(2R,3R,4R,5S)-2-((4-(3-甲氧基苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:将THPTA(35mg,0.081mmol)和CuSO4(4mg,0.025mmol)溶解在水(0.3mL)中,然后添加到(2R,3R,4R,5S)-2-(叠氮基甲基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(25mg,0.081mmol)和1-乙炔基-3-甲氧基苯(13mg,0.01mmol)的MeOH(2.0mL)溶液中。添加新制备的抗坏血酸钠(32mg,0.162mmol)在水(0.1mL)中的溶液并将反应混合物在室温下搅拌过夜。蒸发溶剂并通过柱色谱法用20%MeOH的DCM溶液纯化残余物,得到(2R,3R,4R,5S)-2-((4-(3-甲氧基苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A65,13mg,34%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:467[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.51(d,J=4.3Hz,1H),8.30(s,1H),7.41-7.29(m,3H),6.93-6.88(m,2H),4.69(d,J=6.1Hz,2H),4.41(td,J=10.6,4.9Hz,1H),4.10(dd,J=11.1,5.2Hz,1H),3.93(s,2H),3.77(s,1H),3.72(t,J=2.2Hz,1H),3.12(t,J=10.9Hz,1H)。
A66:(2R,3R,4R,5S)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)-2-((4-(三甲基甲硅烷基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇和A67:(2R,3R,4R,5S)-2-((1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:将THPTA(5.20mg,0.012mmol)和CuSO4(0.59mg,0.006mmol)溶解在水(0.1mL)中,然后添加到(2R,3R,4R,5S)-2-(叠氮基甲基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(20mg,0.060mmol)和乙炔基三甲基硅烷(7.1mg,0.072mmol)的MeOH(2mL)溶液。添加新制备的抗坏血酸钠(5.94mg,0.03mmol)在水(0.1mL)中的溶液并将反应混合物在室温下搅拌过夜。蒸发溶剂并通过制备型HPLC纯化产物,得到(2R,3R,4R,5S)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)-2-((4-(三甲基甲硅烷基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A66,6mg,26%收率)和(2R,3R,4R,5S)-2-((1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A67,3mg,13%收率),为白色固体。A66:LC-MS(ESI)发现值:433[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.51(d,J=4.7Hz,1H),7.97(s,1H),6.90(d,J=4.9Hz,1H),4.63(t,J=17.9Hz,2H),4.39(d,J=4.7Hz,1H),4.07(dd,J=11.2,5.3Hz,1H),3.87(t,J=4.4Hz,2H),3.78-3.67(m,1H),3.09(t,J=10.9Hz,1H),0.40-0.17(m,9H)。A67:LC-MS(ESI)发现值:361[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.51(d,J=4.5Hz,1H),7.98(s,1H),7.71(s,1H),6.90(d,J=4.9Hz,1H),4.67(d,J=6.3Hz,2H),4.40(s,1H),4.07(dd,J=11.0,5.2Hz,1H),3.93-3.79(m,2H),3.69(dd,J=10.5,3.2Hz,1H),3.09(dd,J=19.9,9.0Hz,1H)。
A68:6-(((3S,4R,5R,6R)-4,5-二羟基-6-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)氨基)-2-甲氧基嘧啶-4-甲酰胺的制备
步骤1:将THPTA(5.20mg,0.012mmol)和CuSO4(0.59mg,0.006mmol)溶解在水(0.1mL)中,然后添加到(2R,3R,4R,5S)-2-(叠氮甲基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(20mg,0.060mmol)和丙-2-炔-1-醇(4.0mg,0.072mmol)的MeOH(2mL)溶液。添加新制备的抗坏血酸钠(5.94mg,0.03mmol)在水(0.1mL)中的溶液并将反应混合物在室温下搅拌过夜。蒸发溶剂并通过制备型HPLC纯化产物以得到(2R,3R,4R,5S)-2-((4-(羟甲基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A68,10mg,43%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:391[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.51(d,J=4.7Hz,1H),7.90(s,1H),6.90(d,J=4.9Hz,1H),4.67(s,2H),4.63(d,J=6.4Hz,2H),4.39(d,J=4.6Hz,1H),4.06(dd,J=11.2,5.2Hz,1H),3.90(d,J=2.7Hz,1H),3.85(dd,J=6.9,5.9Hz,1H),3.69(dd,J=10.5,3.1Hz,1H),3.08(t,J=10.9Hz,1H)。
A69:(2R,3R,4R,5R,6S)-2-((1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-6-(烯丙氧基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:将THPTA(20mg)和CuSO4(3mg)溶解在水(0.5mL)中。将混合物添加至N-((2S,3R,4R,5R,6R)-2-(烯丙氧基)-6-(叠氮基甲基)-4,5-二羟基四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(50mg,0.15mmol)和乙炔基三甲基硅烷(29mg,0.3mmol)在MeOH(4mL)中的溶液中。添加新鲜制备的抗坏血酸钠(6mg)在水(0.5mL)中的溶液。将反应搅拌过夜。将所得混合物过滤。通过色谱法(硅胶,0-100%乙酸乙酯的石油醚溶液)纯化粗产物,得到N-((2S,3R,4R,5R,6R)-2-(烯丙氧基)-4,5-二羟基-6-((4-(三甲基甲硅烷基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(40mg,61%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:439[M+H]+。
步骤2:向N-((2S,3R,4R,5R,6R)-2-(烯丙氧基)-4,5-二羟基-6-((4-(三甲基甲硅烷基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(40mg,0.09mmol)的THF(3mL)溶液添加TBAF(1mL,1M的THF溶液)。将混合物在40℃下搅拌过夜。将混合物浓缩并通过色谱法(硅胶,二氯甲烷中的0-20%甲醇)纯化残余物以得到N-((2S,3R,4R,5R,6R)-6-((1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-2-(烯丙氧基)-4,5-二羟基四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(25mg,76%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:367[M+H]+。1HNMR(400MHz,CD3OD):δ8.01(s,1H),7.74(s,1H),5.67(ddd,J=22.5,10.9,5.9Hz,1H),5.10(dd,J=22.9,5.8Hz,2H),4.86(s,3H),4.69(d,J=2.3Hz,1H),4.67(s,1H),4.32(dd,J=10.8,3.7Hz,1H),4.26-4.20(m,1H),3.97(dd,J=10.9,3.3Hz,1H),3.93(d,J=3.0Hz,1H),3.70(dd,J=12.9,5.4Hz,1H),3.63(dd,J=12.9,6.2Hz,1H)。19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-77.01。
步骤3:N-((2S,3R,4R,5R,6R)-6-((1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-2-(烯丙氧基)-4,5-二羟基四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(20mg,0.05mmol)的NH3/MeOH(3mL,7mol/L)溶液在80℃下在密封管中搅拌过夜。将混合物浓缩,得到粗品(2R,3R,4R,5R,6S)-2-((1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-6-(烯丙氧基)-5-氨基四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(14mg,100%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:271[M+H]+。
步骤4:(2R,3R,4R,5R,6S)-2-((1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-6-(烯丙氧基)-5-氨基四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(14mg,0.05mmol)、2-氯-4-(三氟甲基)嘧啶(18mg,0.1mmol)和DIEA(26mg,0.2mmol)的异丙醇(3mL)溶液在80℃在密封管中搅拌过夜。将混合物浓缩并通过C18色谱纯化,得到(2R,3R,4R,5R,6S)-2-((1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-6-(烯丙氧基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A69,8.8mg,42%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:417[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.51(d,J=4.6Hz,1H),8.02(d,J=0.8Hz,1H),7.74(d,J=0.9Hz,1H),6.91(d,J=4.9Hz,1H),5.64(dd,J=10.7,5.7Hz,1H),5.07(d,J=17.2Hz,1H),5.00(d,J=10.4Hz,1H),4.96(s,1H),4.71(d,J=2.7Hz,1H),4.69(s,1H),4.55(s,1H),4.29-4.22(m,1H),4.01-3.88(m,2H),3.75-3.52(m,2H)。19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-72.35。
A70:N-((2S,3R,4R,5R,6R)-6-((1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-2-(烯丙氧基)-4,5-二羟基四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺和A71:(2R,3R,4R,5R,6S)-2-((1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-6-(烯丙氧基)-5-氨基四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:将THPTA(20mg)和CuSO4(3mg)溶解在水(0.5mL)中。将混合物添加至N-((2S,3R,4R,5R,6R)-2-(烯丙氧基)-6-(叠氮基甲基)-4,5-二羟基四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(50mg,0.15mmol)和乙炔基三甲基硅烷(29mg,0.3mmol)在MeOH(4mL)中的溶液中。添加新鲜制备的抗坏血酸钠(6mg)在水(0.5mL)中的溶液。将反应搅拌过夜。将所得混合物过滤。通过色谱法(硅胶,0-100%乙酸乙酯的石油醚溶液)纯化粗产物,得到N-((2S,3R,4R,5R,6R)-2-(烯丙氧基)-4,5-二羟基-6-((4-(三甲基甲硅烷基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(40mg,61%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:439[M+H]+。
步骤2:向N-((2S,3R,4R,5R,6R)-2-(烯丙氧基)-4,5-二羟基-6-((4-(三甲基甲硅烷基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(40mg,0.09mmol)的THF(3mL)溶液添加TBAF(1mL,1M的THF溶液)。将混合物在40℃下搅拌过夜。将混合物浓缩并通过色谱法纯化(硅胶,0-20%甲醇的二氯甲烷溶液),得到N-((2S,3R,4R,5R,6R)-6-((1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-2-(烯丙氧基)-4,5-二羟基四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(A70,25mg,76%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:367[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.01(s,1H),7.74(s,1H),5.67(ddd,J=22.5,10.9,5.9Hz,1H),5.10(dd,J=22.9,5.8Hz,2H),4.86(s,3H),4.69(d,J=2.3Hz,1H),4.67(s,1H),4.32(dd,J=10.8,3.7Hz,1H),4.26-4.20(m,1H),3.97(dd,J=10.9,3.3Hz,1H),3.93(d,J=3.0Hz,1H),3.70(dd,J=12.9,5.4Hz,1H),3.63(dd,J=12.9,6.2Hz,1H)。19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-77.01。
步骤3:N-((2S,3R,4R,5R,6R)-6-((1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-2-(烯丙氧基)-4,5-二羟基四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(20mg,0.05mmol)的NH3/MeOH(3mL,7mol/L)溶液在80℃下在密封管中搅拌过夜。将混合物浓缩,得到粗品(2R,3R,4R,5R,6S)-2-((1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-6-(烯丙氧基)-5-氨基四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(14mg,100%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:271[M+H]+。
步骤4:(2R,3R,4R,5R,6S)-2-((1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-6-(烯丙氧基)-5-氨基四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(14mg,0.05mmol)、2-氯-4-(三氟甲基)嘧啶(18mg,0.1mmol)和DIEA(26mg,0.2mmol)的异丙醇(3mL)溶液在80℃在密封管中搅拌过夜。将混合物浓缩并通过C18色谱纯化,得到(2R,3R,4R,5R,6S)-2-((1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-6-(烯丙氧基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(8.8mg,42%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:417[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.51(d,J=4.6Hz,1H),8.02(d,J=0.8Hz,1H),7.74(d,J=0.9Hz,1H),6.91(d,J=4.9Hz,1H),5.64(dd,J=10.7,5.7Hz,1H),5.07(d,J=17.2Hz,1H),5.00(d,J=10.4Hz,1H),4.96(s,1H),4.71(d,J=2.7Hz,1H),4.69(s,1H),4.55(s,1H),4.29-4.22(m,1H),4.01-3.88(m,2H),3.75-3.52(m,2H)。19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-72.35。
A72:(2R,3R,4R,5R,6S)-6-(烯丙氧基)-2-(叠氮基甲基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
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步骤1:N-((2S,3R,4R,5R,6R)-2-(烯丙氧基)-6-(叠氮基甲基)-4,5-二羟基四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(40mg,0.11mmol)的NH3/MeOH(3mL,7mol/L)溶液在密封管中于80℃搅拌过夜。将混合物浓缩,得到粗制(2R,3R,4R,5R,6S)-6-(烯丙氧基)-5-氨基-2-(叠氮基甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(28mg,100%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:245[M+H]+。
步骤2:(2R,3R,4R,5R,6S)-6-(烯丙氧基)-5-氨基-2-(叠氮基甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(28mg,0.11mmol)、2-氯-4-(三氟甲基)嘧啶(27mg,0.15mmol)和DIEA(26mg,0.2mmol)的异丙醇(3mL)溶液中在密封管中于80℃搅拌过夜。将混合物浓缩并通过C18柱色谱纯化,得到(2R,3R,4R,5R,6S)-6-(烯丙氧基)-2-(叠氮基甲基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A72,8.8mg,20%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:391[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.52(d,J=4.8Hz,1H),6.91(d,J=4.9Hz,1H),5.89(s,1H),5.28(d,J=17.2Hz,1H),5.12(d,J=10.5Hz,1H),5.04(s,1H),4.52(s,1H),4.22(ddt,J=13.0,5.0,1.3Hz,1H),4.08-3.97(m,2H),3.92(dd,J=10.8,3.2Hz,1H),3.86(d,J=2.5Hz,1H),3.62(dd,J=12.8,8.7Hz,1H),3.33(s,1H)。19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-72.35
A73:1-((3S,4R,5R,6R)-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)胍的制备
步骤1:向(3S,4R,5R,6R)-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-胺(400.0mg,0.923mmol)的二噁烷(10.0mL)和H2O(1.0mL)溶液中加入N-({[(叔丁氧基)羰基]氨基}(三氟甲磺酰亚氨基)甲基)氨基甲酸叔丁酯(360.9mg,0.923mmol),TEA(932.2mg,9.23mmol)。将混合物在室温下搅拌16小时。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过柱纯化,得到N-[(1Z)-{[(1S,2R,3S,4R)-2,3-双(苄氧基)-4-[(苄氧基)甲基]环己基]氨基}({[(叔丁氧基)羰基]亚氨基})甲基]氨基甲酸叔丁酯(200.0mg,0.296mmol)。LC-MS(ESI)发现值:676[M+H]+。
步骤2:向在烧瓶(50mL)中的N-[(1z)-{[(1S,2R,3S,4R)-2,3-双(苄氧基)-4-[(苄氧基)甲基]环己基]氨基}({[(叔丁氧基)羰基]亚氨基})甲基]氨基甲酸叔丁酯(200.0mg,0.296mmol)中添加HCl/二噁烷(10mL,1M)。将混合物在室温下搅拌16小时。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过柱纯化,得到1-((3S,4R,5R,6R)-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)胍(A73,20.0mg,0.042mmol)。LC-MS(ESI)发现值:476[M+H]+。1HNMR(400MHz,DMSO-d6):δ9.03(s,1H),7.60(s,3H),7.43-7.17(m,15H),4.77(dd,J=11.2,3.9Hz,2H),4.60(d,J=11.1Hz,1H),4.47(dd,J=18.7,12.5Hz,3H),4.06(d,J=1.8Hz,1H),3.92-3.75(m,2H),3.71-3.58(m,2H),3.52(d,J=6.1Hz,2H),3.11(t,J=10.3Hz,1H)。
A74:(1S,2R,3R,4R,5S)-1-(叠氮基甲基)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇的制备
步骤1:2,2,2-三氟-N-((3aR,4S,7S,8R,8aR)-4-(羟甲基)-2,2-二甲基六氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-8-基)乙酰胺(300mg,0.92mmol)在氨甲醇溶液(5mL,7M)中的溶液于60℃搅拌过夜。将所得混合物真空浓缩。粗品((3aR,4S,7S,8R,8aR)-8-氨基-2,2-二甲基四氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-4(5H)-基)甲醇(270mg,76%收率)用于下一步,无需进一步纯化。LC-MS(ESI)发现值:232[M+H]+。
步骤2:在室温下在N2下向((3aR,4S,7S,8R,8aR)-8-氨基-2,2-二甲基四氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-4(5H)-基)甲醇(270mg,1.2mmol)的i-PrOH(5mL)溶液中添加DIPEA(0.4mL,2.3mmol)。将反应在80℃搅拌过夜。将所得混合物真空浓缩。通过快速色谱法(硅胶,0-10%MeOH的DCM溶液)纯化粗产物,得到((3aR,4S,7S,8R,8aR)-8-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,2-二甲基四氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-4(5H)-基)甲醇(130mg,32%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:350[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ5.42(d,J=1.9Hz,1H),4.35(d,J=5.8Hz,1H),4.21(t,J=6.3Hz,1H),3.95-3.83(m,4H),3.80(d,J=7.8Hz,1H),1.53(s,3H),1.36(s,3H)。
步骤3:在0℃下在N2气氛下向((3aR,4S,7S,8R,8aR)-8-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,2-二甲基四氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-4(5H)-基)甲醇(120mg,0.3mmol)在TEA(0.1mL,0.7mmol)和干DCM(5mL)中的溶液中添加甲苯磺酰氯(85mg,0.5mmol)。将反应在室温下搅拌过夜。将所得混合物过滤并用DCM(50mL)稀释,用H2O(10mL x 2)和盐水(10mL)洗涤,经Na2SO4干燥。将有机层分离并真空浓缩。通过快速色谱法(硅胶,0-80%EA的PE溶液)纯化粗产物,得到((3aR,4R,7S,8R,8aR)-8-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,2-二甲基四氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-4(5H)-基)甲基4-甲基苯磺酸酯(120mg,70%收率),为无色固体。LC-MS(ESI)发现值:504[M+H]+。
步骤4:在室温下在N2下向((3aR,4R,7S,8R,8aR)-8-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,2-二甲基四氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-4(5H)-基)甲基4-甲基苯磺酸酯(120mg,0.24mmol)的DMF(5mL)溶液中添加叠氮化钠(0.1mL,2.4mmol)。将反应物在100℃搅拌24小时。将所得混合物用EA(100mL)稀释,用H2O(30mL x 2)和盐水(10mL)洗涤,经Na2SO4干燥。将有机层分离并真空浓缩。通过快速色谱法(硅胶,0-80%EA的PE溶液)纯化粗产物,得到N-((3aR,4S,7S,8R,8aR)-4-(叠氮基甲基)-2,2-二甲基六氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-8-基)-3-氯-1,2,4-噻二唑-5-胺(75mg,收率84%),为无色固体。LC-MS(ESI)发现值:375[M+H]+。
步骤5:向N-((3aR,4S,7S,8R,8aR)-4-(叠氮甲基)-2,2-二甲基六氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-8-基)-3-氯-1,2,4-噻二唑-5-胺(75mg,0.2mmol)的THF(4mL)溶液中添加HCl溶液(1mL,2M H2O溶液)。将反应在室温下搅拌过夜。通过制备型HPLC纯化粗产物,得到(1S,2R,3R,4R,5S)-1-(叠氮基甲基)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(A74,40mg,60%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:335[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ5.41(s,1H),3.86(d,J=12.9Hz,2H),3.82-3.76(m,3H),3.69(d,J=8.1Hz,1H),3.64(d,J=12.9Hz,1H)。
A75:(2R,3R,4R,5S)-2-(羟甲基)-5-((4-(三氟甲氧基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:向配备有磁力搅拌棒的干燥玻璃反应管中加入2-(甲硫基)嘧啶-4-醇(2.0g,14.1mmol)、1-(三氟甲基)-1l3-苯并[d][1,2]碘杂噁戊环-3(1H)-酮(1.5g,4.7mmol)和CH3NO2(20.0mL)。然后将反应混合物在100℃搅拌5小时。通过TLC监测反应。完成后,将反应混合物冷却至室温并通过硅藻土垫过滤并用乙酸乙酯洗涤。将合并的有机溶剂真空浓缩。将残余物通过色谱法纯化(硅胶,0-100%乙酸乙酯的石油醚溶液),得到2-(甲硫基)-4-(三氟甲氧基)嘧啶(80mg,3%收率),为固体。LC-MS(ESI)发现值:211[M+H]+。
步骤2:在0℃下向2-(甲硫基)-4-(三氟甲氧基)嘧啶(40mg,0.2mmol)在DCM(8mL)中的溶液中添加m-CPBA(69mg,0.4mmol),将混合物在室温下搅拌12小时。将混合物浓缩并通过色谱法纯化(硅胶,0-100%乙酸乙酯的石油醚溶液),得到2-(甲基磺酰基)-4-(三氟甲氧基)嘧啶(40mg,87%收率),为固体。LC-MS(ESI)发现值:243[M+H]+。
步骤3:(2R,3R,4R,5S)-5-氨基-2-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(50mg,0.3mmol)、2-(甲基磺酰基)-4-(三氟甲氧基)嘧啶(20mg,0.1mmol)和DIEA(39mg,0.3mmol)的异丙醇(3mL)溶液在密封管中在80℃下搅拌过夜。将混合物浓缩并通过C18色谱纯化,得到(2R,3R,4R,5S)-2-(羟甲基)-5-((4-(三氟甲氧基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A75,1.7mg,5%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:326[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.27(d,J=5.5Hz,1H),6.28(d,J=5.5Hz,1H),4.28(dd,J=28.4,16.0Hz,1H),4.10(dd,J=10.7,5.3Hz,1H),3.90(d,J=2.9Hz,1H),3.75(dd,J=11.4,7.1Hz,1H),3.68(dd,J=11.4,5.0Hz,1H),3.64(d,J=4.2Hz,1H),3.46-3.41(m,1H),3.16(t,J=10.9Hz,1H)。19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-57.54。
A76:(2R,3R,4R,5R,6S)-2-(羟甲基)-6-(环氧乙烷-2-基甲氧基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:向(2R,3R,4R,5R,6S)-6-(烯丙氧基)-2-(羟甲基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(200.0mg,0.548mmol)的DCM(20.0mL)溶液中添加m-CPBA(177.6mg,1.096mmol)。将混合物在室温下搅拌2小时。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过柱纯化,得到(2R,3R,4R,5R,6S)-2-(羟甲基)-6-(环氧乙烷-2-基甲氧基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A76,20.0mg,9%收率)。LC-MS(ESI)发现值:382[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.57(d,J=6.5Hz,1H),7.13(d,J=6.5Hz,1H),5.90(m,1H),5.28(dd,J=17.2,1.6Hz,1H),5.13(dd,J=10.5,1.3Hz,1H),5.03(d,J=3.7Hz,1H),4.56(dd,J=9.9,3.6Hz,1H),4.24(dd,J=13.1,5.1Hz,1H),4.07-3.96(m,3H),3.91(t,J=6.1Hz,1H),3.79-3.69(m,2H)。19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-70.68(s)。
A77:(2R,3R,4R,5S)-5-((3-氟-6-(三氟甲基)吡啶-2-基)氨基)-2-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:向(3S,4R,5R,6R)-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-胺(200.0mg,0.462mmol)在DMF中的溶液(10.0mL)中加入2-溴-3-氟-6-(三氟甲基)吡啶(112.2mg,0.462mmol)、Ruphos.Pd.G3(38.0mg,0.046mmol)、Ruphos(21.5mg,0.046mmol)、Cs2CO3(450.5mg,1.386mmol)。将混合物在N2下在70℃下搅拌16小时。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过柱纯化,得到N-((3S,4R,5R,6R)-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-3-氟-6-(三氟甲基)吡啶-2-胺(100.0mg,收率41%)。LC-MS(ESI)发现值:597[M+H]+。
步骤2:在0℃向N-((3S,4R,5R,6R)-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-3-氟-6-(三氟甲基)吡啶-2-胺(100.0mg,0.168mmol)的DCM(20.0mL)溶液中添加BCl3(1.68mL,1N的DCM溶液)。将混合物在室温下搅拌2小时。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过柱纯化,得到(2R,3R,4R,5S)-5-((3-氟-6-(三氟甲基)吡啶-2-基)氨基)-2-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A77,10.0mg,18%收率)。LC-MS(ESI)发现值:327[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ7.35(dd,J=10.7,8.1Hz,1H),6.94(dd,J=8.0,2.9Hz,1H),4.47(td,J=10.6,5.2Hz,1H),4.17(dd,J=10.9,5.2Hz,1H),3.92(d,J=2.9Hz,1H),3.81-3.62(m,3H),3.50-3.42(m,1H),3.17(t,J=10.8Hz,1H)。19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-69.34(s),-137.35(s)。
A78:(2R,3R,4R,5S)-5-((2-氯-6-(三氟甲基)嘧啶-4-基)氨基)-2-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇和A79:4-(((3S,4R,5R,6R)-4,5-二羟基-6-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)氨基)-6-(三氟甲基)嘧啶-2-甲腈的制备
步骤1:在室温下在N2下向(2R,3R,4R,5S)-5-氨基-2-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇盐酸盐(500mg,3.1mmol)在i-PrOH(3.0mL)中的混合物中添加2,4-二氯-6-(三氟甲基)嘧啶(0.84mL,6.1mmol)和DIEA(1.5mL,9.2mmol)。在室温搅拌过夜后,将混合物浓缩并通过色谱法纯化(硅胶,0-30%甲醇的DCM溶液),得到(2R,3R,4R,5S)-5-((2-氯-6-(三氟甲基)嘧啶-4-基)氨基)-2-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A78,160mg,15%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:344[M+1]+。
步骤2:在室温在N2下向(2R,3R,4R,5S)-5-((2-氯-6-(三氟甲基)嘧啶-4-基)氨基)-2-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(20mg,0.058mmol)在DMF(3.0mL)中的混合物中添加Zn(CN)2(4.1mg,0.035mmol)、dppf(16.2mg,0.028mmol)、Zn(3.3mg,0.31mmol)和Pd2(dba)3(26.6mg,0.18mmol)。在120℃下搅拌过夜后,将反应混合物浓缩并通过制备型TLC纯化,得到4-(((3S,4R,5R,6R)-4,5-二羟基-6-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)氨基)-6-(三氟甲基)嘧啶-2-甲腈(A79,2.4mg,12%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:333[M-H]-。1HNMR(400MHz,MeOD):δ6.97(s,1H),4.57-4.48(m,1H),4.08(dd,J=11.1,5.2Hz,1H),3.92(d,J=2.8Hz,1H),3.76(dd,J=11.3,7.1Hz,1H),3.69(dd,J=11.4,4.9Hz,1H),3.62(dd,J=10.6,3.1Hz,1H),3.48-3.44(m,1H),3.14(t,J=10.9Hz,1H)。
A80:((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲醇的制备
步骤1:向N-((3aR,4R,7S,7aR)-4-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-4-(三氟甲基)嘧啶-2-胺(50mg,0.085mmol)在THF(1mL)中的溶液中添加TBAF(108μL,1M在THF中)。将反应物在室温下搅拌三小时并通过LCMS确保完成。然后将反应浓缩并通过柱色谱法用20%甲醇的DCM溶液纯化以得到((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基))氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲醇(A80,18mg,61%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:350[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.51(d,J=4.8Hz,1H),6.90(d,J=4.9Hz,1H),4.31(s,1H),4.28-4.11(m,2H),3.91(dt,J=44.5,22.2Hz,1H),3.76(dt,J=13.7,6.7Hz,3H),3.16(t,J=11.2Hz,1H),1.50(s,2H),1.32(s,2H)。
A79:4-(((3S,4R,5R,6R)-4,5-二羟基-6-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)氨基)-6-(三氟甲基)嘧啶-2-甲腈的制备
步骤1:在室温下在N2下向(2R,3R,4R,5S)-5-氨基-2-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇盐酸盐(500mg,3.1mmol)在i-PrOH(3.0mL)中的混合物中添加2,4-二氯-6-(三氟甲基)嘧啶(0.84mL,6.1mmol)和DIEA(1.5mL,9.2mmol)。在室温搅拌过夜后,将混合物浓缩并通过色谱法纯化(硅胶,0-30%甲醇的DCM溶液),得到(2R,3R,4R,5S)-5-((2-氯-6-(三氟甲基)嘧啶-4-基)氨基)-2-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(160mg,15%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:344[M+1]+.
步骤2:在室温、N2下向(2R,3R,4R,5S)-5-((2-氯-6-(三氟甲基)嘧啶-4-基)氨基)-2-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(20mg,0.058mmol)在DMF(3.0mL)中的混合物中添加Zn(CN)2(4.1mg,0.035mmol)、dppf(16.2mg,0.028mmol)、Zn(3.3mg,0.31mmol)和Pd2(dba)3(26.6mg,0.18mmol)。在120℃下搅拌过夜后,将反应混合物浓缩并通过制备型TLC纯化,得到4-(((3S,4R,5R,6R)-4,5-二羟基-6-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)氨基)-6-(三氟甲基)嘧啶-2-甲腈(A81,2.4mg,12%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:333[M-H]-。1HNMR(400MHz,CD3OD):δ6.97(s,1H),4.57-4.48(m,1H),4.08(dd,J=11.1,5.2Hz,1H),3.92(d,J=2.8Hz,1H),3.76(dd,J=11.3,7.1Hz,1H),3.69(dd,J=11.4,4.9Hz,1H),3.62(dd,J=10.6,3.1Hz,1H),3.48-3.44(m,1H),3.14(t,J=10.9Hz,1H)。
A82:(2R,3R,4R,5S)-5-((5-氟-6-(三氟甲基)吡啶-2-基)氨基)-2-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:向(3S,4R,5R,6R)-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-胺(200.0mg,0.462mmol)在DMF(10.0mL)中的溶液中加入6-氯-3-氟-2-(三氟甲基)吡啶(91.9mg,0.462mmol)、Ruphos.Pd.G3(38.0mg,0.046mmol)、Ruphos(21.5mg,0.046mmol)和Cs2CO3(450.5mg,1.386mmol)。将混合物在N2下在70℃下搅拌16小时。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过柱纯化,得到N-((3S,4R,5R,6R)-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-5-氟-6-(三氟甲基)吡啶-2-胺(100.1mg,收率36%)。LC-MS(ESI)发现值:597[M+H]+。
步骤2:在0°下向N-((3S,4R,5R,6R)-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-5-氟-6-(三氟甲基)吡啶-2-胺(100.1mg,0.168mmol)的DCM(20.0mL)溶液中添加BCl3(1.68mL,1N的DCM溶液)。将混合物在室温下搅拌2小时。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过柱纯化,得到(2R,3R,4R,5S)-5-((5-氟-6-(三氟甲基)吡啶-2-基)氨基)-2-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A82,6.0mg,11%收率)。LC-MS(ESI)发现值:327[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ7.40(t,J=9.5Hz,1H),6.77(dd,J=9.2,2.7Hz,1H),4.30-4.11(m,2H),3.90(d,J=2.7Hz,1H),3.75(dd,J=11.4,7.1Hz,1H),3.68(dd,J=11.4,5.0Hz,1H),3.59(dd,J=10.1,3.2Hz,1H),3.48-3.41(m,1H),3.08(dd,J=15.1,5.7Hz,1H)。19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-66.95(d,J=18.0Hz),-141.07--145.72(m)。
A83:(2R,3R,4R,5R)-2-(羟甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:向(3S,4R,5R,6R)-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-胺(200.0mg,0.462mmol)在DMF(10.0mL)中的溶液中加入2-氯-6-(三氟甲基)吡嗪(84.1mg,0.462mmol)、Ruphos.Pd.G3(38.0mg,0.046mmol)、Ruphos(21.5mg,0.046mmol)和Cs2CO3(450.5mg,1.386mmol)。将混合物在N2下在70℃下搅拌16小时。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过柱纯化,得到N-((3R,4R,5R,6R)-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(95mg,收率34%)。LC-MS(ESI)发现值:580[M+H]+。
步骤2:在0℃下向N-((3R,4R,5R,6R)-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(95mg,0.168mmol)的DCM(20.0mL)溶液中添加BCl3(1.68mL,1N的DCM溶液)。将混合物在室温下搅拌2小时。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过柱纯化,得到(2R,3R,4R,5R)-2-(羟甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A83,2.0mg,4%收率)。LC-MS(ESI)发现值:310[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.14(s,1H),7.98(s,1H),4.33(d,J=3.5Hz,1H),4.04(dd,J=12.0,2.0Hz,1H),3.98-3.90(m,1H),3.86(dd,J=4.6,3.2Hz,1H),3.80(dd,J=11.5,7.1Hz,1H),3.70(dd,J=11.5,4.7Hz,1H),3.59(dd,J=12.1,1.7Hz,1H),3.49-3.41(m,1H)。19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-70.42(s)。
A84:(1S,2R,3R,4R,5S)-1-(羟甲基)-4-((5-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇的制备
步骤1:(1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(20mg,0.11mmol)、2-氯-5-(三氟甲基)吡嗪(19mg,0.11mmol)和DIPEA(20mg,0.16mmol)的NMP(1mL)溶液在80℃搅拌过夜。通过制备型HPLC纯化混合物,得到(1S,2R,3R,4R,5S)-1-(羟甲基)-4-((5-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(A84,5.4mg,15%收率),为黄色固体。LC-MS(ESI)发现值:338[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.26(s,1H),7.99(d,J=1.2Hz,1H),5.35(d,J=1.4Hz,1H),4.25(d,J=9.9Hz,1H),3.94(t,J=8.2Hz,2H),3.83(dt,J=10.6,6.5Hz,3H),3.71(d,J=7.9Hz,1H)。
A85:(2R,3R,4R,5R)-2-(羟甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
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步骤1:在0℃向2,2′-氧基双(乙-1-醇)(10.0g,90mmol)在吡啶(50mL)中的溶液中添加DMAP(22.0g,180.0mmol)和TBSCl(1.35g,9.0mmol)。将混合物在N2下在室温下搅拌16小时。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过柱纯化,得到2-(2-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)乙氧基)乙-1-醇(1.47g,7%收率),LC-MS(ESI)发现值:221[M+H]+。
步骤2:在0℃向2-(2-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)乙氧基)乙-1-醇(1.47g,6.7mmol)在THF(50.0mL)中的溶液中添加3-乙炔基苯酚(790.6mg,6.7mmol)、PPh3(2.1g,8.0mmol)和DEAD(1.4g,8.0mmol)。将混合物在室温下搅拌2小时。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过柱纯化,得到叔丁基(2-(2-(3-乙炔基苯氧基)乙氧基)乙氧基)二甲基硅烷(1.2g,60%收率)。LC-MS(ESI)发现值:321[M+H]+。
步骤3:向叔丁基(2-(2-(3-乙炔基苯氧基)乙氧基)乙氧基)二甲基硅烷(1.2g,4.0mmol)在MeOH(50mL)中的溶液中添加N-((3aS,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-4-(叠氮基甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(1.5g,4.0mmol)、CuSO4(64.0mg,0.4mmol)、抗坏血酸钠(72.0mg,0.4mmol)和THPTA(144.0mg,0.4mmol)。将混合物在N2下于室温搅拌16小时。将混合物浓缩,得到粗产物,将其通过柱纯化,得到N-((3aS,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-4-((4-(3-(2-(2-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)乙氧基)乙氧基)苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(900.0mg,收率32%)。LC-MS(ESI)发现值:701[M+H]+。
步骤4:向N-((3aS,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-4-((4-(3-(2-(2-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)乙氧基)乙氧基)苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(900.0mg,1.29mmol)的THF(40.0mL)溶液中添加TBAF(2.58mL,1M的THF溶液),将混合物在室温下搅拌16小时。将混合物用乙酸乙酯(100mL)稀释并用水(60mL x 3)洗涤。将有机层经硫酸钠干燥,过滤,减压浓缩,得到粗产物,将其通过柱纯化,得到N-((3aS,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-4-((4-(3-(2-(2-羟基乙氧基)乙氧基)苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(586mg,77%收率)。LC-MS(ESI)发现值:587[M+H]+。
步骤5:向N-((3aS,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-4-((4-(3-(2-(2-羟基乙氧基)乙氧基)苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(586.0mg,1.0mmol)的DCM(30.0mL)溶液中添加TEA(303mg,3.0mmol)、DMAP(122.0mg,1.0mmol)和TsCl(229.0mg,1.20mmol)。将混合物在室温下搅拌16小时。将混合物用乙酸乙酯(100mL)稀释并用水(50mL x 3)洗涤,减压浓缩有机层得到粗产物,将其通过柱纯化得到2-(2-(3-(1-(((3aS,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-2,2-二甲基-7-(2,2,2-三氟乙酰胺基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)苯氧基)乙氧基)乙基4-甲基苯磺酸酯(584mg,79%收率)。LC-MS(ESI)发现值:741[M+H]+。
步骤6:向2-(2-(3-(1-(((3aS,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-2,2-二甲基-7-(2,2,2-三氟乙酰胺基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)苯氧基)乙氧基)乙基4-甲基苯磺酸酯(584mg,0.79mmol)在DMF(30.0mL)中溶液中添加NaN3(513.0mg,7.9mmol),将混合物在100℃下搅拌16小时。将混合物用乙酸乙酯(150.0mL)稀释并用水(100.0mL x 3)洗涤,减压浓缩有机层得到粗产物,将其通过柱纯化得到N-((3aS,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-4-((4-(3-(2-(2-叠氮基乙氧基)乙氧基)苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(427mg,88%收率)。LC-MS(ESI)发现值:612[M+H]+。
步骤7:N-((3aS,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-4-((4-(3-(2-(2-叠氮基乙氧基)乙氧基)苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(427.0mg,0.70mmol)的NH3/MeOH(20mL,7M)溶液在80℃下搅拌16小时。将混合物减压浓缩,得到粗品(3aS,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-4-((4-(3-(2-(2-叠氮基乙氧基)乙氧基)苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-胺(309mg,收率85%)。LC-MS(ESI)发现值:516[M+H]+。
步骤8:向(3aS,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-4-((4-(3-(2-(2-叠氮基乙氧基)乙氧基)苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-胺(30.9mg,0.06mmol)在i-PrOH(30.0mL)中的溶液中添加2-氯-4-(三氟甲基)嘧啶(10.9mg,0.06mmol)和DIEA(23.6mg,1.8mmol)。将混合物在100℃下搅拌16小时。将混合物浓缩并通过柱纯化,得到N-((3aS,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-4-((4-(3-(2-(2-叠氮基乙氧基)乙氧基)苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-4-(三氟甲基)嘧啶-2-胺(36.3mg,93%收率)。LC-MS(ESI)发现值:662[M+H]+。
步骤9:向N-((3aS,4R,6S,7R,7aR)-6-(烯丙氧基)-4-((4-(3-(2-(2-叠氮基乙氧基)乙氧基)苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-4-(三氟甲基)嘧啶-2-胺(36.3mg,0.056mmol)在THF(2mL)中的溶液中添加HCl(2mL,2N在水中)。将混合物在室温下搅拌16小时。将混合物浓缩并通过柱纯化,得到(2R,3R,4R,5R,6S)-6-(烯丙氧基)-2-((4-(3-(2-(2-叠氮基乙氧基)乙氧基)苯基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)甲基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A85,3.0mg,10%收率)。LC-MS(ESI)发现值:662[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.52(d,J=4.5Hz,1H),8.36(s,1H),7.42(dd,J=10.7,5.0Hz,2H),7.34(t,J=7.9Hz,1H),6.97-6.89(m,2H),5.63(m,1H),4.98(dd,J=27.9,14.3Hz,3H),4.74-4.66(m,3H),4.30(dd,J=8.2,4.5Hz,1H),4.22-4.17(m,2H),4.01(d,J=2.6Hz,1H),3.96(dd,J=10.8,3.1Hz,1H),3.88(dd,J=5.4,3.8Hz,2H),3.78-3.70(m,3H),3.68(d,J=5.6Hz,1H),3.43-3.37(m,2H)。19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-72.34(s)。
A86:(2R,3R,4R,5S)-2-(叠氮基甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:在室温下向(2R,3R,4R,5S)-2-(羟甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(300mg,0.97mmol)和TEA(196mg,1.94mmol)在DMF(5mL)中的溶液中添加TsCl(276mg,1.5mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜。将所得混合物真空浓缩。通过制备型HPLC纯化粗产物,得到苄基3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-(2,5-二氧代吡咯烷-1-基)-2-氧代乙氧基)乙氧基)((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基4-甲基苯磺酸酯(150mg,43%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:464[M+H]+。
步骤2:在室温下向苄基3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-(2,5-二氧代吡咯烷-1-基)-2-氧代乙氧基)乙氧基)((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基4-甲基苯磺酸酯(150mg,0.32mmol)在DMF(5mL)中的溶液中添加NaN3(208mg,3.2mmol)。将反应混合物在120℃下搅拌过夜。过滤所得混合物并直接通过C18纯化滤液。然后通过制备型HPLC进一步纯化粗产物,得到(2R,3R,4R,5S)-2-(叠氮基甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A86,7mg,5.7%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:375[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.11(s,1H),8.00(s,1H),4.33(td,J=10.4,4.9Hz,1H),4.14(dd,J=11.0,5.2Hz,1H),3.84(d,J=3.2Hz,1H),3.66(dd,J=10.6,3.3Hz,1H),3.58(q,J=5.4Hz,2H),3.34(d,J=8.0Hz,1H),3.14(dd,J=13.8,7.8Hz,1H)。
A87:(1S,2R,3R,4R,5S)-1-(羟甲基)-4-((6-(三氟甲基吡啶-2-基)氨基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇的制备
步骤1:向(1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(100mg,0.523mmol)和2-溴-6-(三氟甲基)吡啶(177mg,0.785mmol)在DMF(5mL)中的溶液中添加RuPhos Pd G3(43mg,0.05mmol)、Ruphos(24mg,0.052mmol)和Cs2CO3(507mg,1.59mmol)。将反应物在70℃下搅拌18小时。将反应混合物通过硅藻土过滤,浓缩滤液并通过制备型HPLC纯化,得到(1S,2R,3R,4R,5S)-1-(羟甲基)-4-((6-(三氟甲基)吡啶-2-基)氨基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(A87,6mg,3%收率)。LC-MS(ESI)发现值:337[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.52(s,1H),7.53(t,J=7.9Hz,1H),6.89(d,J=7.2Hz,1H),6.77(d,J=8.5Hz,1H),5.41(s,1H),4.18(d,J=9.8Hz,1H),3.93(dd,J=11.8,7.8Hz,2H),3.87-3.76(m,3H),3.71(d,J=7.9Hz,1H)。
A88:(2R,3R,4R,5S)-2-((二甲基氨基)甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基4-甲基苯磺酸酯(200mg,0.43mmol)在二甲胺(2mL,2M的THF溶液)中的溶液在80℃下搅拌2小时。将混合物浓缩,残余物通过制备型HPLC纯化,得到(2R,3R,4R,5S)-2-((二甲基氨基)甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A88,11mg,8%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:337[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.11(s,1H),8.00(s,1H),4.32(td,J=10.5,5.1Hz,1H),4.13(dd,J=11.0,5.1Hz,1H),3.82(d,J=2.4Hz,1H),3.63(ddd,J=10.2,9.3,2.6Hz,2H),3.12(t,J=10.8Hz,1H),2.87(dd,J=13.3,8.3Hz,1H),2.63(dd,J=13.3,2.9Hz,1H),2.40(s,6H)。
A89:(2R,3R,4R,5S)-2-(氨基甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇和A90:N-(((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)乙酰胺的制备
步骤1:向(2R,3R,4R,5S)-2-(叠氮基甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(10mg,0.03mmol)和Pd/C(3mg,10%重量,60%湿)在MeOH(3mL)中的溶液在H2气球下在室温下搅拌过夜。将混合物通过硅藻土垫过滤,并将滤液浓缩,得到粗产物,将其通过制备型HPLC纯化,得到(2R,3R,4R,5S)-2-(氨基甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A89,6mg,65%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:309[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.11(s,1H),8.00(s,1H),4.33(d,J=5.1Hz,1H),4.16(dd,J=11.0,5.2Hz,1H),3.87(d,J=2.5Hz,1H),3.66(dd,J=10.5,3.1Hz,1H),3.44(dd,J=7.4,4.2Hz,1H),3.13(t,J=10.8Hz,1H),3.02(dd,J=13.2,7.9Hz,1H),2.84(dd,J=13.2,4.1Hz,1H)。
步骤2:(2R,3R,4R,5S)-2-(氨基甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(2.6mg,0.008mmol)、Et3N(1.2mg,0.01mmol)和N-乙酰氧基琥珀酰亚胺(2mg,0.012mmol)在MeOH(3mL)中的溶液在室温下搅拌过夜。将混合物直接通过制备型HPLC纯化,得到N-(((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)乙酰胺(A90,1.2mg,41%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:351[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.10(s,1H),8.00(s,1H),4.31(td,J=10.6,5.0Hz,1H),4.12(dd,J=11.0,5.1Hz,1H),3.83(d,J=2.8Hz,1H),3.63(dd,J=10.5,3.1Hz,1H),3.49(dd,J=12.4,7.6Hz,2H),3.27(d,J=10.6Hz,1H),3.09(t,J=10.9Hz,1H),1.95(s,3H)。
A91:(2R,3R,4R,5S)-2-(羟甲基)-5-(吡啶-2-基氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:向(3S,4R,5R,6R)-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-胺(200mg,0.462mmol)在DMF(10mL)中的溶液中添加Ruphos.Pd.G3(38.5mg,0.046mmol)、Ruphos(21.5mg,0.046mmol)、Cs2CO3(452mg,1.386mmol)。将混合物在N2下在80℃下搅拌16小时。将混合物用乙酸乙酯(40mL)稀释并用水(50mL x 3)洗涤。有机层经硫酸钠干燥,过滤,减压浓缩,得到粗产物,将其通过柱纯化,得到N-((3S,4R,5R,6R)-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)吡啶-2-胺(50mg,21%收率)。LC-MS(ESI)发现值:511[M+H]+。
步骤2:在0℃下向N-((3S,4R,5R,6R)-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)吡啶-2-胺(50mg,0.098mmol)的DCM(5mL)溶液中加入BCl3(0.98mL,1M在DCM中)。将混合物在室温下搅拌1小时。将混合物用NH3·H2O(0.5mL)淬灭。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过制备型HPLC纯化,得到(2R,3R,4R,5S)-2-(羟甲基)-5-(吡啶-2-基氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A91,5mg,21%收率)。LC-MS(ESI)发现值:241[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ7.93(d,J=8.3Hz,2H),7.63(d,J=2.8Hz,1H),4.28(td,J=10.5,5.2Hz,1H),4.10(dd,J=11.0,5.3Hz,1H),3.92(d,J=2.5Hz,1H),3.73(m,2H),3.62(dd,J=10.5,2.9Hz,1H),3.50-3.42(m,1H),3.13(t,J=10.9Hz,1H)。
A92:苄基(2R,3R,4R,5S)-2-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:向((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基4-甲基苯磺酸酯(120mg,0.26mmol)、1-甲基哌嗪(78mg,0.78mmol)和TEA(101mg,1mmol)的THF(3mL)溶液在80℃下在密封管中搅拌过夜。将混合物真空浓缩。粗产物经C18纯化,得到(2R,3R,4R,5S)-2-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A92,4mg,4%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:392[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.11(s,1H),7.99(s,1H),4.42-4.26(m,1H),4.11(dd,J=11.0,5.2Hz,1H),3.86(d,J=2.3Hz,1H),3.68-3.53(m,2H),3.09(t,J=10.8Hz,1H),2.76(dd,J=13.6,7.2Hz,2H),2.68-2.49(m,8H),2.29(s,3H)。19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-70.34。
A93:(2R,3R,4R,5S)-2-(羟甲基)-5-((5-(三氟甲基)-1H-吡唑-3-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:在室温下向(4S,5S,6R)-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)二氢-2H-吡喃-3(4H)-酮(200mg,0.46mmol)的EtOH(5mL)溶液中添加TFA(5.7mg,0.05mmol)、5-(三氟甲基)-1H-吡唑-3-胺(83mg,0.56mmol)和NaBH3CN(57mg,0.92mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。起始材料消耗后(LCMS监测),缓慢添加水(5mL)并将反应混合物搅拌15分钟。将混合物用乙酸乙酯(50mL)稀释并用水(5mL x 3)洗涤。将有机层用硫酸钠干燥,减压浓缩,得到粗产物,将其通过制备型HPLC纯化,得到N-((3S,4R,5R,6R)-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-5-(三氟甲基)-1H-吡唑-3-胺(20mg,7.6%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:568[M+H]+。
步骤2:在0℃下向N-((3S,4R,5R,6R)-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-5-(三氟甲基)-1H-吡唑-3-胺(20mg,0.035mmol)的DCM(5mL)溶液中添加BCl3(41mg,0.35mmol)。将反应在0℃下搅拌1小时。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过制备型HPLC纯化,得到(2R,3R,4R,5S)-2-(羟甲基)-5-((5-(三氟甲基)-1H-吡唑-3-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(6mg,60%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:298[M+H]+。1H NMR(400MHz,MeOD):δ5.70(s,1H),4.02(d,J=11.0Hz,1H),3.88(s,1H),3.83-3.74(m,2H),3.67(dd,J=11.5,4.7Hz,1H),3.58-3.47(m,2H),3.44-3.39(m,1H)。
A94:(2R,3R,4R,5S)-2-(6-溴-1H-苯并[d]咪唑-2-基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:室温下向N-((3aR,4R,7S,7aR)-4-(羟甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)乙酰胺(2g,8.15mmol)的DMF(25mL)溶液中添加RuCl3(0.17g,0.81mmol)和NaIO4(3.6g,16.3mmol)。将混合物在室温搅拌过夜,浓缩混合物并通过快速纯化残余物得到(3aR,4S,7S,7aR)-7-乙酰胺基-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-甲酸(1g,47%收率),为棕色油状物。LC-MS(ESI)发现值:260[M+H]+。
步骤2:在室温下向(3aR,4S,7S,7aR)-7-乙酰胺基-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-甲酸(200mg,0.77mmol)在DMF(2mL)中的溶液中添加HATU(440mg,1.16mmol)和DIPEA(199mg,1.54mmol)。在室温下搅拌20分钟后,添加4-溴代苯-1,2-二胺(144mg,0.77mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。将混合物浓缩并将残余物通过快速纯化得到(3aR,4S,7S,7aR)-7-乙酰胺基-N-(2-氨基-5-溴代苯基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-甲酰胺(91mg,28%收率),为黄色油状物。LC-MS(ESI)发现值:428&430[M+H]+。
步骤3:(3aR,4S,7S,7aR)-7-乙酰胺基-N-(2-氨基-5-溴苯基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃4-甲酰胺(90mg,0.21mmol)的AcOH(2mL)溶液在90℃下搅拌2小时,然后浓缩。残余物通过快速纯化得到N-((3S,4R,5R,6R)-6-(6-溴-1H-苯并[d]咪唑-2-基)-4,5-二羟基四氢-2H-吡喃-3-基)乙酰胺(30mg,39%收率),为黄色油状物。LC-MS(ESI)发现值:370&372[M+H]+。
步骤4:N-((3S,4R,5R,6R)-6-(6-溴-1H-苯并[d]咪唑-2-基)-4,5-二羟基四氢-2H-吡喃-3-基)乙酰胺(30mg,0.08mmol)在HCl(4mL,4N在H2O中)中的溶液在100℃下搅拌2小时。将混合物浓缩,得到粗品(2R,3R,4R,5S)-5-氨基-2-(6-溴-1H-苯并[d]咪唑-2-基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(10mg,收率38%),为黄色油状物。LC-MS(ESI)发现值:328&330[M+H]+。
步骤5:(2R,3R,4R,5S)-5-氨基-2-(6-溴-1H-苯并[d]咪唑-2-基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(10mg,0.03mmol)、2-氯-4-(三氟甲基)嘧啶(8mg,0.04mmol)和DIPEA(8mg,0.06mmol)在i-PrOH(1mL)中的溶液于80℃搅拌过夜。将混合物浓缩,残余物通过制备型HPLC纯化,得到(2R,3R,4R,5S)-2-(6-溴-1H-苯并[d]咪唑-2-基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A94,1.2mg,8%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:328&330[M+H]+。1H NMR(400MHz,MeOD):δ8.54(d,J=4.6Hz,1H),7.71(s,1H),7.47(d,J=8.4Hz,1H),7.34(dd,J=8.6,1.8Hz,1H),6.92(d,J=4.9Hz,1H),4.88(s,1H),4.52(s,1H),4.31(s,2H),3.92(d,J=10.4Hz,1H),3.40(t,J=11.0Hz,1H)。
A95:(2R,3R,4R,5S)-2-((苯基氨基)甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基4-甲基苯磺酸酯(50mg,0.11mmol)、苯胺(20mg,0.22mmol)和TEA(23mg,0.22mmol)的THF溶液在80℃搅拌过夜。将混合物浓缩,残余物通过制备型HPLC纯化,得到(2R,3R,4R,5S)-2-((苯基氨基)甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A95,1mg,2%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:385[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.10(s,1H),8.00(s,1H),7.11(dd,J=8.5,7.4Hz,2H),6.70-6.57(m,3H),4.36(td,J=10.7,5.3Hz,1H),4.15(dd,J=11.0,5.2Hz,1H),3.93(d,J=3.0Hz,1H),3.66-3.58(m,2H),3.36(dd,J=6.3,3.2Hz,2H),3.11(t,J=10.8Hz,1H)。
A96:(2R,3R,4R,5S)-2-(哌啶-1-基甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:向((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基4-甲基苯磺酸酯(70mg,0.08mmol)的THF(1mL)溶液中添加哌啶(80μL,0.80mmol)和TEA(115μL,0.80mmol)。将反应在密封管中于80℃搅拌过夜。将其浓缩并通过制备型HPLC纯化,得到(2R,3R,4R,5S)-2-(哌啶-1-基甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A96,2mg,4%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:377[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.10(d,J=27.8Hz,1H),8.02(s,1H),4.34(d,J=4.2Hz,1H),4.25-4.13(m,1H),3.92(d,J=8.4Hz,1H),3.87(s,1H),3.72(d,J=10.4Hz,1H),3.50-3.40(m,2H),3.22(d,J=10.7Hz,3H),3.16(s,1H),1.86(s,4H),1.67(s,2H)。
A97:(2R,3R,4R,5S)-2-(吡咯烷-1-基甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:在密封管中向((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基4-甲基苯磺酸酯(130mg,0.258mmol)在THF(2mL)的溶液中加入TEA(179μL,1.290mmol)和吡咯烷(106μL,1.290mmol)。将反应在80℃下搅拌过夜。将混合物浓缩,得到粗N-((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-4-(吡咯烷-1-基甲基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(100mg,96%收率),为黄色油状物。LC-MS(ESI)发现值:403[M+H]+。
步骤2:向N-((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-4-(吡咯烷-1-基甲基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(100mg,0.248mmol)的THF(1mL)溶液中添加HCl(372μL,2N在H2O中)。将反应搅拌过夜并浓缩。通过制备型HPLC纯化粗产物,得到(2R,3R,4R,5S)-2-(吡咯烷-1-基甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A97,75mg,84%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:363[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.11(s,1H),8.00(s,1H),4.35-4.23(m,1H),4.16(dd,J=11.1,5.1Hz,1H),3.86(d,J=2.8Hz,1H),3.67(dd,J=10.5,3.3Hz,1H),3.13(t,J=10.9Hz,1H),2.91(s,1H),2.88(s,1H),1.90(s,1H)。
A98:苄基(2R,3R,4R,5S)-2-((甲基氨基)甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基4-甲基苯磺酸酯(100mg,0.2mmol)、甲胺(1mL,1mmol,1M THF溶液)和TEA(101mg,1mmol)的THF(2mL)溶液在密封管中于80℃搅拌过夜。将混合物真空浓缩。粗产物经C18纯化,得到N-((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-4-((甲基氨基)甲基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(10mg,14%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:363[M+H]+。
步骤2:向N-((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-4-((甲基氨基)甲基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(10mg,0.03mmol)的THF(2mL)溶液中添加HCl(0.1mL,1N的H2O溶液)。将混合物在室温下搅拌过夜。将混合物浓缩并通过C18纯化,得到(2R,3R,4R,5S)-2-((甲基氨基)甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A98,2.2mg,25%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:323[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.11(s,1H),8.00(s,1H),4.33(td,J=10.4,5.0Hz,1H),4.15(dd,J=11.0,5.2Hz,1H),3.86(d,J=2.7Hz,1H),3.67(dd,J=10.6,3.1Hz,1H),3.60(dd,J=7.7,3.2Hz,1H),3.13(t,J=10.8Hz,1H),3.04(dd,J=12.7,8.2Hz,1H),2.83(dd,J=12.7,3.6Hz,1H),2.48(s,3H)。19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-70.35。
A99:(2R,3R,4R,5S)-2-((甲基(苯基)氨基)甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基4-甲基苯磺酸酯(100mg,0.2mmol)、N-甲基苯胺(0.032mL,0.3mmol)、NaI(45mg,0.3mmol)和K2CO3(82.35mg,0.6mmol)的DMF(1mL)悬浮液在100℃下搅拌过夜。将反应混合物冷却,用水(2mL)稀释并用DCM(2mL x 3)萃取。合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并浓缩。通过制备型TLC(EA/PE=1∶1)纯化残余物,得到N-((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-4-((甲基(苯基)氨基)甲基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺,为黄色油状物(40mg,收率46%)。LC-MS(ESI)发现值:439[M+H]+。
步骤2:向N-((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-4-((甲基(苯基)氨基)甲基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(40mg,0.09mmol)的THF(2mL)溶液中加入稀HCl(0.5mL,2N的H2O溶液)。将反应混合物在室温下搅拌30分钟。将反应混合物浓缩并通过制备型TLC(MeOH/DCM=1∶10)纯化以得到(2R,3R,4R,5S)-2-((甲基(苯基)氨基)甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇,为白色固体(A99,2.5mg,7%收率)。LC-MS(ESI)发现值:399[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.09(s,1H),7.99(s,1H),7.17(t,J=8.0Hz,2H),6.76(d,J=8.2Hz,2H),6.64(t,J=7.3Hz,1H),4.58(s,1H),4.36(td,J=10.5,5.2Hz,1H),4.12(dd,J=11.0,5.2Hz,1H),3.86(d,J=2.8Hz,1H),3.69-3.58(m,3H),3.56-3.49(m,1H),3.06(t,J=10.9Hz,1H),2.99(s,3H)。
A100:苄基叔丁基(2R,3R,4R,5R,6S)-6-(烯丙氧基)-2-(羟甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:(2R,3R,4R,5R,6S)-6-(烯丙氧基)-5-氨基-2-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(50mg,0.22mmol)、2-氯-6-(三氟甲基)吡嗪(80mg,0.44mmol)和DIEA(85mg,0.66mmol)在DMF(3mL)中的溶液在密封管中于100℃搅拌过夜。将混合物浓缩并通过C18色谱纯化,得到(2R,3R,4R,5R,6S)-6-(烯丙氧基)-2-(羟基甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A100,31.8mg,40%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:366[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.18(s,1H),7.98(s,1H),5.88(ddd,J=22.2,10.8,5.6Hz,1H),5.26(d,J=17.2Hz,1H),5.10(d,J=10.4Hz,1H),5.03(d,J=3.6Hz,1H),4.50(dd,J=10.5,3.6Hz,1H),4.20(dd,J=13.2,5.0Hz,1H),3.93(ddd,J=16.1,13.0,6.0Hz,4H),3.80-3.67(m,2H)。19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-70.32。
A101:(2R,3R,4R,5S)-2-(羟甲基)-5-((3-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:向(3S,4R,5R,6R)-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-胺(200mg,0.462mmol)在DMF(10mL)中的溶液中加入2-氯-3-(三氟甲基)吡嗪(84.1mg,0.462mmol)、Ruphos.Pd.G3(38.4mg)、Ruphos(21.5mg,0.046mmol)、Cs2CO3(1.35g.4.158mmol)。将混合物在N2下在100℃下搅拌2小时。将混合物用乙酸乙酯(15mL)稀释并用水(15mL x 3)洗涤。将有机层减压浓缩,得到粗产物,将其通过柱纯化,得到N-((3S,4R,5R,6R)-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-3-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(70mg,26%收率)。LC-MS(ESI)发现值:580[M+H]+。
步骤2:向N-((3S,4R,5R,6R)-4,5-双(苄氧基)-6-((苄氧基)甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-3-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(70mg,0.121mmol)的DCM(20mL)溶液中添加BCl3(1.2mL,1M的DCM溶液)。将混合物在室温下搅拌3小时。将混合物用NH3·H2O(1mL)淬灭并浓缩,得到粗产物,将其通过柱纯化得到(2R,3R,4R,5S)-2-(羟甲基)-5-((3-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A101,7mg,18%收率)。LC-MS(ESI)发现值:310[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.27(s,1H),7.85(d,J=2.2Hz,1H),4.56(td,J=10.5,5.2Hz,1H),4.15(dd,J=10.9,5.2Hz,1H),3.91(d,J=2.6Hz,1H),3.76(dd,J=14.3,4.8Hz,2H),3.69(dd,J=11.4,5.0Hz,1H),3.48(t,J=5.9Hz,1H),3.21(t,J=10.8Hz,1H)。19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-68.82(s)。
A102:N-(((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)双环[1.1.1]戊烷-1-甲酰胺的制备
步骤1:将双环[1.1.1]戊烷-1-甲酸(4.83mg,0.043mmol)和HATU(24.56mg,0.07mmol)在DMF(1mL)中的溶液在室温下搅拌2小时。向反应混合物中加入DIEA(11.1mg,0.09mmol)和N-((3aS,4R,7S,7aR)-4-(氨基甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(15mg,0.043mmol)。将所得混合物在室温下搅拌2小时。将反应混合物浓缩。通过制备型TLC(EA/PE=2∶1)纯化残余物,得到N-(((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基)双环[1.1.1]戊烷-1-甲酰胺,为无色油状物(15mg,79%收率)。LC-MS(ESI)发现值:433[M+H]+。
步骤2:N-(((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基)双环[1.1.1]戊烷-1-甲酰胺(20mg,0.045mmol)和稀释的HCl水溶液(1mL,2N在H2O中)在THF(2mL)中的溶液在室温下搅拌30分钟。将反应混合物浓缩。通过反相快速色谱法(C18,MeOH水溶液,从10%至70%)纯化残余物,得到N-(((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)双环[1.1.1]戊烷-1-甲酰胺,为白色固体(A102,7.9mg,43%收率)。LC-MS(ESI)发现值:401[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.10(s,1H),8.00(s,1H),4.31(td,J=10.7,5.2Hz,1H),4.11(dd,J=11.0,5.2Hz,1H),3.81(d,J=2.9Hz,1H),3.63(dd,J=10.6,3.2Hz,1H),3.52-3.44(m,2H),3.30-3.24(m,2H),3.08(t,J=10.8Hz,1H),2.43(s,1H),2.05(s,6H)。
A103:苄基叔丁基4-((((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)氨基甲酰基)哌嗪-1-甲酸酯的制备
步骤1:向N-((3aS,4R,7S,7aR)-4-(叠氮基甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(20mg,0.05mmol)的MeOH(3mL)溶液中添加Pd/C(4mg,10%重量,60%湿)。将混合物在H2气球下在室温下搅拌1小时。将混合物过滤并浓缩,得到粗品N-((3aS,4R,7S,7aR)-4-(氨基甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(18mg),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:349[M+H]+。
步骤2:在0℃向三光气(15mg,0.05mmol)和吡啶(7.9mg,0.1mmol)在THF(3mL)中的溶液中添加N-((3aS,4R,7S,7aR)-4-(氨基甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(18mg,0.05mmol)。1小时后,将哌嗪-1-甲酸叔丁酯(9mg,0.05mmol)加入到反应中,将混合物在室温下搅拌12小时。将混合物浓缩并通过二氧化硅纯化,得到4-((((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基)氨基甲酰基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(15mg,54%收率),为固体。LC-MS(ESI)发现值:561[M+H]+。
步骤3:向4-((((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基)氨基甲酰基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(15mg,0.03mmol)的THF(5mL)溶液添加至HCl(一滴,2N的H2O溶液中)。将混合物在室温下搅拌4小时。混合物用NH3·H2O中和,浓缩并通过C18纯化,得到4-((((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)氨基甲酰基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(A103,4.3mg,收率31%),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:521[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.10(s,1H),7.99(s,1H),4.32(td,J=10.4,5.1Hz,1H),4.11(dd,J=10.9,5.2Hz,1H),3.84(d,J=3.0Hz,1H),3.63(dd,J=10.5,3.1Hz,1H),3.53-3.35(m,11H),3.08(t,J=10.8Hz,1H),1.46(s,9H)。19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-70.33。
A104:N-((2R,3R,4R,5R,6R)-4,5-二羟基-6-(羟甲基)-2-(2-甲氧基乙氧基)四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺的制备
步骤1:在0℃下向(3R,4R,5R,6R)-6-(乙酰氧基甲基)-3-(2,2,2-三氟乙酰胺基)四氢-2H-吡喃-2,4,5-三基三乙酸酯(1g,2.3mmol)的DCM(30mL)溶液中加入2-甲氧基乙-1-醇(515mg,6.9mmol)和四氯化锡(1.5g,5.8mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。将混合物缓慢倒入冰冷的水中,分离有机层,用NaHCO3洗涤,干燥浓缩,硅胶纯化,得到(2R,3R,4R,5R,6R)-2-(乙酰氧基甲基)-6-(2-甲氧基乙氧基)-5-(2,2,2-三氟乙酰胺基)四氢-2H-吡喃-3,4-二基二乙酸酯(500mg,47%收率),为固体。LC-MS(ESI)发现值:458[M-H]-。
步骤2:在0℃下向(2R,3R,4R,5R,6R)-2-(乙酰氧基甲基)-6-(2-甲氧基乙氧基)-5-(2,2,2-三氟乙酰胺基)四氢-2H-吡喃-3,4-二基二乙酸酯(500mg,1.1mmol)的MeOH(10ml)溶液中添加NaOMe(1mL,5M的MeOH溶液)。将混合物在室温下搅拌3小时。将混合物用Amberlite IR120(H+)形式的离子交换树脂酸化并浓缩,得到粗N-((2R,3R,4R,5R,6R)-4,5-二羟基-6-(羟甲基)-2-(2-甲氧基乙氧基)四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(A104,200mg,55%收率),为固体。LC-MS(ESI)发现值:332[M-H]-。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ4.50(d,J=8.4Hz,1H),3.96(ddd,J=14.0,11.2,7.5Hz,2H),3.85(d,J=2.8Hz,1H),3.82-3.63(m,4H),3.51(dd,J=9.9,5.5Hz,3H),3.32(s,3H)。19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-77.31。
A105:苄基叔丁基(2R,3R,4R,5R,6R)-2-(羟甲基)-6-(2-甲氧基乙氧基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:N-((2R,3R,4R,5R,6R)-4,5-二羟基-6-(羟甲基)-2-(2-甲氧基乙氧基)四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(150mg,0.45mmol)的NH3/MeOH(3mL,7M)的溶液在管中于80℃搅拌过夜。将混合物浓缩,得到粗制(2R,3R,4R,5R,6R)-5-氨基-2-(羟甲基)-6-(2-甲氧基乙氧基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(107mg),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:238[M+H]+。
步骤2:(2R,3R,4R,5R,6R)-5-氨基-2-(羟甲基)-6-(2-甲氧基乙氧基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(50mg,0.21mmol)、2-氯-6-(三氟甲基)吡嗪(76mg,0.42mmol)和DIEA(81mg,0.63mmol)在DMF(3mL)中的溶液在管中于100℃搅拌过夜。将混合物浓缩并通过C18色谱纯化,得到(2R,3R,4R,5R,6R)-2-(羟甲基)-6-(2-甲氧基乙氧基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A105,5.7mg,7%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:384[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):1H NMR(400MHz,CD3OD)δ8.15(s,1H),7.99(s,1H),4.53(d,J=8.3Hz,1H),4.17-4.07(m,1H),3.93(ddd,J=16.9,10.5,3.1Hz,2H),3.84-3.71(m,3H),3.67-3.51(m,2H),3.46-3.34(m,2H),3.14(s,3H)。19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-70.19。
A106:(2R,3R,4R,5S)-2-(((3-甲氧基苯基)(甲基)氨基)甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基4-甲基苯磺酸酯(500mg,0.99mmol)、3-甲氧基-N-甲基苯胺(204mg,1.49mmol)、K2CO3(411mg,2.98mmol)和NaI(224mg,1.49mmol)在DMF(5mL)中的悬浮液在100℃搅拌过夜。将反应混合物冷却并浓缩。通过制备型TLC(MeOH/DCM=1∶10)纯化残余物,得到N-((3aS,4R,7S,7aR)-4-(((3-甲氧基苯基)(甲基)氨基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺,为白色固体(40mg,收率9%)。LC-MS(ESI)发现值:469[M+H]+。
步骤2:向N-((3aS,4R,7S,7aR)-4-(((3-甲氧基苯基)(甲基)氨基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(40mg,0.085mmol)和稀HCl水溶液(1mL,2N H2O溶液)在THF(2mL)中的溶液在室温下搅拌30分钟。将反应混合物浓缩。通过制备型TLC(MeOH/DCM=1∶10)和快速反相色谱法(C18,MeOH水溶液从10%至80%)纯化残余物,得到(2R,3R,4R,5S)-2-(((3-甲氧基苯基)(甲基)氨基)甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇,为白色固体(A106,0.8mg,2%收率)。LC-MS(ESI)发现值:439[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.09(s,1H),7.99(s,1H),7.08(t,J=8.2Hz,1H),6.38(d,J=7.8Hz,1H),6.32-6.19(m,2H),4.36(td,J=10.4,5.2Hz,1H),4.12(dd,J=11.1,5.1Hz,1H),3.85(d,J=2.8Hz,1H),3.75(s,3H),3.67-3.59(m,3H),3.55-3.48(m,1H),3.06(t,J=10.8Hz,1H),2.98(s,3H)。
A107:(2R,3R,4R,5S)-2-((吡嗪-2-基氨基)甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:N-((3aS,4R,7S,7aR)-4-(氨基甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(50mg,0.14mmol)、2-氟吡嗪(21mg,0.21mmol)和DIPEA(37mg,0.28mmol)的DMF(2mL)溶液在100℃下搅拌过夜。将混合物浓缩并将残余物通过快速纯化得到N-((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-4-((吡嗪-2-基氨基)甲基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(30mg,49%收率),为黄色固体。LC-MS(ESI)发现值:427[M+H]+。
步骤2:在室温下向N-((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-4-((吡嗪-2-基氨基)甲基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(30mg,0.07mmol)的THF(3mL)溶液中添加HCl(0.5mL,2N的H2O溶液)。将混合物在室温下搅拌过夜,然后浓缩。通过快速纯化残余物,得到(2R,3R,4R,5S)-2-((吡嗪-2-基氨基)甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A107,14.5mg,53%收率),为黄色固体。LC-MS(ESI)发现值:387[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.10(s,1H),8.00(s,1H),7.93(d,J=5.2Hz,2H),7.64(d,J=2.9Hz,1H),4.34(s,1H),4.14(dd,J=11.0,5.3Hz,1H),3.89(d,J=2.8Hz,1H),3.69-3.58(m,3H),3.54-3.48(m,1H),3.11(t,J=10.9Hz,1H)。
A108:(1R,2R)-N-(((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)-2-氟环丙烷-1-甲酰胺的制备
步骤1:向N-((3aS,4R,7S,7aR)-4-(氨甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(100mg,0.287mmol)的DMF(2mL)溶液中添加(1R,2R)-2-氟环丙烷-1-甲酸(60mg,0.574mmol)、HATU(131mg,0.345mmol)和DIEA(150μL,0.861mmol)。将溶液在室温下搅拌过夜并浓缩以通过5%MeOH的DCM溶液纯化以得到(1R,2R)-N-(((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基)-2-氟环丙烷-1-甲酰胺(100mg,80%收率),为浅黄色油状物。LC-MS(ESI)发现值:435[M+H]+
步骤2:(1R,2R)-N-(((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基)-2-氟环丙烷-1-甲酰胺(100mg,0.230mmol)的THF(2mL)溶液中添加HCl(20μL,H2O中的2N)。将反应搅拌2小时并通过LC-MS确保反应完成。然后浓缩,残余物通过制备型HPLC纯化,得到(1R,2R)-N-(((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基))吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)-2-氟环丙烷-1-甲酰胺(A108,53mg,58%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:395[M+H]+。1HNMR(400MHz,CD3OD):δ8.10(s,1H),7.99(s,1H),4.83-4.62(m,1H),4.36-4.25(m,1H),4.13(dd,J=11.0,5.2Hz,1H),3.85(d,J=2.8Hz,1H),3.64(dd,J=10.6,3.0Hz,1H),3.58(dd,J=13.4,4.9Hz,1H),3.54-3.49(m,1H),3.35(s,1H),3.10(t,J=10.8Hz,1H),1.80(dt,J=9.2,6.9Hz,1H),1.64(dtd,J=23.0,7.1,3.7Hz,1H),1.14-1.01(m,1H)。
A109:(1S,2S)-N-(((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基)-2-氟环丙烷-1-甲酰胺的制备
步骤1:将(1S,2S)-2-氟环丙烷-1-甲酸(5.98mg,0.06mmol)和HATU(32.75mg,0.08mmol)在DMF(0.5mL)中的溶液在室温下搅拌2小时。N-((3aS,4R,7S,7aR)-4-(氨基甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(20mg,0.06mmol)和DIEA(15mg,0.12mmol)添加至上述溶液中。将反应混合物在室温下搅拌2小时。将反应浓缩。通过制备型TLC(MeOH/DCM=1∶10)纯化残余物,得到(1S,2S)-N-(((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基)-2-氟环丙烷-1-甲酰胺,为无色油状物(20mg,80%收率)。LC-MS(ESI)发现值:435[M+H]+。
步骤2:(1S,2S)-N-(((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基)-2-氟环丙烷-1-甲酰胺(20mg,0.046mmol)和稀HCl水溶液(1mL,2N H2O溶液)在THF(2mL)中的溶液在室温下搅拌30分钟。将反应混合物浓缩。通过反相快速色谱法(C18,MeOH水溶液,从10%至70%)纯化残余物,得到(1S,2S)-N-(((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基)-2-氟环丙烷-1-甲酰胺,为白色固体(A109,6.1mg,34%收率)。LC-MS(ESI)发现值:395[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.10(s,1H),7.99(s,1H),4.82-4.63(m,1H),4.32(td,J=10.5,5.1Hz,1H),4.13(dd,J=11.0,5.2Hz,1H),3.84(d,J=2.8Hz,1H),3.66-3.55(m,2H),3.50-3.47(m,1H),3.34(d,J=7.9Hz,1H),3.09(t,J=10.9Hz,1H),1.85-1.77(m,1H),1.70-1.60(m,1H),1.12-1.01(m,1H)。
A110:4-(((1S,2R,3R,4R,5S)-2,3-二羟基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛-4-基)氨基)-2-(三氟甲基)嘧啶-5-甲酸乙酯的制备
步骤1:向(1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(100mg,523.06μmol,1当量)的DMSO(1mL)溶液中加入DIPEA(162.24mg,1.26mmol,218.65μL,2.4当量)和4-氯-2-(三氟甲基)嘧啶-5-甲酸乙酯(199.75mg,784.60μmol,1.5当量)在100℃搅拌15小时。过滤反应混合物。滤液通过制备型HPLC纯化(TFA条件;柱:Phenomenex Luna C18 150*30mm*5um;流动相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%-45%,8min)。4-[[(1S,2R,3R,4R,5S)-2,3-二羟基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-4-基]氨基]-2-(三氟甲基)嘧啶-5-甲酸乙酯(A110,74mg,160.72μmol,30.73%收率,88.9%纯度),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:410[M+H]+。HNMR(ET44412-94-P1P2)1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ=8.93(s,1H),8.48(d,J=8.4Hz,1H),5.32(d,J=1.3Hz,1H),4.38(q,J=7.0Hz,3H),4.34-4.23(m,2H),3.87-3.78(m,3H),3.74(dd,J=4.2,9.6Hz,1H),3.66-3.55(m,2H),1.35(s,3H)。
A111:(1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇的制备
步骤1:向(1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(100mg,523.06umol)和2-氯-6-甲基-4-(三氟甲基)烟腈(173.07mg,784.60umol,1.5当量)的溶液中添加DIPEA(162.24mg,1.26mmol,218.65uL,2.4当量)和4-氯-2-(三氟甲基)嘧啶-5-甲酸乙酯(199.75mg,784.60umol,1.5当量)在100℃搅拌15小时。过滤反应混合物。滤液通过制备型HPLC纯化(TFA条件;柱:Phenomenex Luna C18 150*30mm*5um;流动相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%-45%,8min)。A111:(1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇。收率:5.28mg,2.69%收率黄色固体。LC-MS(ESI)发现值:376[M+H]+。1H NMR(400MH[z,甲醇-d4)δ=6.92(s,1H),5.40(d,J=1.3Hz,1H),4.88(s,8H),3.99-3.94(m,2H),3.88-3.82(m,1H),3.73(d,J=7.9Hz,1H),2.50(s,2H)。
A112:6-氯-2-(((1S,2R,3R,4R,5S)-2,3-二羟基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛-4-基)氨基)烟酸乙酯的制备
步骤1:向1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(100mg,523.06umol)和2,6-二氯烟酸乙酯(172.65mg,784.60umol)的溶液中加入DIPEA(162.24mg,1.26mmol,218.65uL,2.4当量)和4-氯-2-(三氟甲基)嘧啶-5-甲酸乙酯(199.75mg,784.60umol,1.5当量)在100℃搅拌15小时。过滤反应混合物。滤液通过制备型HPLC纯化(TFA条件;柱:Phenomenex Luna C18 150*30mm*5um;流动相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%-45%,8min)。A112:6-氯-2-(((1S,2R,3R,4R,5S)-2,3-二羟基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛-4-基)氨基)烟酸乙酯,收率:11.31mg,黄色固体收率5.77%。LC-MS(ESI)发现值:375[M+H]+。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ=8.10(d,J=8.2Hz,1H),6.61(d,J=8.1Hz,1H),5.39(d,J=1.3Hz,1H),4.54-4.12(m,3H),3.97-3.91(m,2H),3.87-3.78(m,3H),3.72(d,J=7.9Hz,1H),3.31(s,1H),1.36(t,J=7.1Hz,3H)。
A113:(1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇的制备
步骤1:向(1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(100mg,523.06umol)和5-氯-1-甲基-4-硝基-1H-吡唑(126.75mg,784.60umol)的溶液中添加DIPEA(162.24mg,1.26mmol,218.65uL,2.4当量)和4-氯-2-(三氟甲基)嘧啶-5-甲酸乙酯(199.75mg,784.60umol,1.5当量)在100℃搅拌15小时。过滤反应混合物。滤液通过制备型HPLC纯化(TFA条件;柱:Phenomenex Luna C18 150*30mm*5um;流动相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%-45%,8min)。A113:(1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇。收率:5.41mg,黄色固体收率3.27%。LC-MS(ESI)发现值:317[M+H]+。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ=7.91(s,1H),5.44(d,J=1.2Hz,1H),3.97-3.92(m,1H),3.91-3.87(m,1H),3.87-3.81(m,6H),3.80-3.75(m,2H)。
A114:(1S,2R,3R,4R,5S)-4-((2-氯-5-(三氟甲基)嘧啶-4-基)氨基)-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇和A115:(1S,2R,3R,4R,5S)-4-((4-氯-5-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇的制备
步骤1:向(1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(100mg,523.06umol)和2,4-二氯-5-(三氟甲基)嘧啶(170.24mg,784.60umol)的溶液中添加DIPEA(162.24mg,1.26mmol,218.65uL,2.4当量)和4-氯-2-(三氟甲基)嘧啶-5-甲酸乙酯(199.75mg,784.60umol,1.5当量)在100℃搅拌15小时。过滤反应混合物。滤液通过制备型HPLC纯化(TFA条件;柱:Phenomenex Luna C18 150*30mm*5um;流动相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%-45%,8min)。A114:(1S,2R,3R,4R,5S)-4-((2-氯-5-(三氟甲基)嘧啶-4-基)氨基)-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇收率:5.25mg,收率2.7%黄色固体LC-MS(ESI)发现值:372[M+H]+。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ=8.48(d,J=10.4Hz,1H),5.42-5.28(m,1H),4.23(br t,J=9.5Hz,1H),4.00-3.66(m,7H)。A115:(1S,2R,3R,4R,5S)-4-((4-氯-5-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇收率:19.99mg,收率10.28%黄色固体LC-MS(ESI)发现值:372[M+H]+。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ=8.35(s,1H),5.37(d,J=1.2Hz,1H),4.51(d,J=9.9Hz,1H),4.06(dd,J=4.3,9.9Hz,1H),3.97-3.90(m,2H),3.86-3.80(m,2H),3.72(d,J=7.9Hz,1H)。
(1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2].1]辛烷-2,3-二醇和A116:(1R,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-1-(((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氧基)甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇的制备
步骤1:向(1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(100mg,523.06umol)和3,5-二氯-1,2,4-噻二唑(243.23mg,1.57mmol)的溶液中添加DIPEA(162.24mg,1.26mmol,218.65uL,2.4当量)和4-氯-2-(三氟甲基)嘧啶-5-甲酸乙酯(199.75mg,784.60umol,1.5当量)在100℃搅拌15小时。过滤反应混合物。滤液通过制备型HPLC纯化(TFA条件;柱:Phenomenex Luna C18 150*30mm*5um;流动相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%-45%,8min)。(1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇,收率:11.1mg,白色固体。LC-MS(ESI)发现值:310[M+H]+。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ=5.49(s,1H),5.38(s,1H),3.96-3.89(m,2H),3.84(s,1H),3.82-3.75(m,2H),3.74-3.70(m,1H)。A116:(1R,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-1-(((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氧基)甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇收率:8.8mg,收率8.2%白色固体。LC-MS(ESI)发现值:310[M+H]+。1HNMR(400MHz,甲醇-d4)δ=5.44(s,1H),4.92(s,2H),3.96-3.92(m,2H),3.91(s,1H),3.85-3.79(m,2H)。
A117:(2R,3R,4R,5S)-2-(羟甲基)-5-((2-(甲基磺酰基)-6-(三氟甲基)嘧啶-4-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
步骤1:向4-氯-2-(甲基硫基)-6-(三氟甲基)嘧啶(330mg,1.44mmol)在AcOH(1mL)中的溶液中添加H2O2(0.5mL,30%wt.,在H2O中)并将溶液在100℃下加热3小时。将混合物用NaHCO3淬灭并用EA萃取。将合并的有机层干燥并浓缩以通过柱色谱法进一步纯化,使用己烷中的20%EtOAc,得到4-氯-2-甲磺酰基-6-(三氟甲基)嘧啶(300mg,80%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:261[M+H]+。
步骤2:向(2R,3R,4R,5S)-5-氨基-2-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇盐酸盐(50mg,0.34mmol)的i-PrOH(3mL)溶液加入4-氯-2-甲磺酰基-6-(三氟甲基)嘧啶(88mg,0.34mmol)和DIEA(0.17mL,1.02mmol)。将混合物搅拌并在120℃下加热过夜。然后将混合物浓缩并通过柱色谱法用10%DCM的甲醇溶液纯化以得到(2R,3R,4R,5S)-2-(羟甲基)-5-((2-(甲磺酰基)-6-(三氟甲基)嘧啶-4-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(A117,7mg,5%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:388[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ6.97(s,1H),4.55(td,J=10.6,5.1Hz,1H),4.12(dd,J=11.0,5.2Hz,1H),3.92(d,J=3.1Hz,1H),3.76(dd,J=11.3,7.1Hz,1H),3.69(dd,J=11.4,5.0Hz,1H),3.64(dd,J=10.6,3.2Hz,1H),3.48-3.44(m,1H),3.33(s,3H),3.16(t,J=10.9Hz,1H)。
化合物1,(S)-3-(((4R,7S,10S,13S,16S,22S,25S,28S,31S,34R)-25-((1H-咪唑-5-基)甲基)-7,28-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-4-(((2S,3R)-1-氨基-3-羟基-1-氧代丁-2-基)氨基甲酰基)-16-(2-羧乙基)-13,22-二异丁基-10-异丙基-31-甲基-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33-十氧代-1,2-二硫杂-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32-十氮杂环三十五烷-34-基)氨基甲酰基)-23-(1-(20-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-20-氧代-7,10,13,16-四氧杂-4,19-二氮杂二十三烷酸的制备
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步骤1 THPTA(13mg,0.03mmol)和CuSO4(0.38mg,0.0015mmol)溶解在水(0.1mL)中,然后添加到3,3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(A14,20mg,0.015mmol)和(S)-3-(((4R,7S,10S,13S,16S,22S,25S,28S,31S,34R)-25-((1H-咪唑-5-基)甲基)-7,28-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-4-(((2S,3R)-1-氨基-3-羟基-1-氧代丁-2-基)氨基甲酰基)-16-(2-羧乙基)-13,22-二异丁基-10-异丙基-31-甲基-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33-十氧代-1,2-二硫杂-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32-十氮杂环三十五烷-34-基)氨基甲酰基)-20-氧代-7,10,13,16-四氧杂-4,19-二氮杂二十五-24-炔酸(中间体3,27.6mg,0.015mmol)的DMF(2mL)的溶液中。添加新制备的抗坏血酸钠(2.64mg,0.015mmol)在水(0.1mL)中的溶液并将反应混合物在室温下搅拌过夜。蒸发溶剂并通过制备型HPLC纯化产物以得到(S)-3-(((4R,7S,10S,13S,16S,22S,25S,28S,31S,34R)-25-((1H-咪唑-5-基)甲基)-7,28-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-4-(((2S,3R)-1-氨基-3-羟基-1-氧代丁-2-基)氨基甲酰基)-16-(2-羧乙基)-13,22-二异丁基-10-异丙基-31-甲基-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33-十氧代-1,2-二硫杂-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32-十氮杂环三十五烷-34-基)氨基甲酰基)-23-(1-(20-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-20-氧代-7,10,13,16-四氧杂-4,19-二氮杂二十三烷酸(化合物1,7mg,14.5%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:1052[M+3H]3+.1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.69(s,1H),7.74(s,1H),7.49-7.38(m,2H),7.34-7.26(m,2H),7.08(s,2H),6.98(s,3H),5.38(s,2H),3.99(d,J=9.6Hz,2H),3.93(d,J=4.4Hz,3H),3.81(d,J=8.2Hz,6H),3.73-3.57(m,58H),3.51(d,J=24.6Hz,20H),3.36(dd,J=11.3,5.8Hz,15H),3.13(s,5H),2.70-2.64(m,1H),2.44(s,5H),2.22(d,J=18.1Hz,4H),2.02-1.82(m,5H),1.66-1.53(m,6H),1.29(s,4H),1.23(s,3H),1.15(d,J=6.3Hz,4H),0.93(dd,J=18.0,6.5Hz,18H)。
化合物2,(S)-4-(((4R,7S,10S,13S,16S,22S,25S,28S,31S,34R)-25-((1H-咪唑-5-基)甲基)-7,28-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-4-(((2S,3R)-1-氨基-3-羟基-1-氧代丁-2-基)氨基甲酰基)-16-(23-(1-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-3,20-二氧代-7,10,13,16-四氧杂-4,19-二氮杂二十三烷基)-13,22-二异丁基-10-异丙基-31-甲基-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33-十氧代-1,2-二硫杂-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32-十氮杂环三十五烷-34-基)氨基)-3-氨基-4-氧代丁酸的制备
步骤1:将THPTA(3.15mg,0.007mmol)和CuSO4(1.16mg,0.007mmol)溶解在水(0.5mL)中,然后添加到3,3′-((2-(6-叠氮己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶)-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(19mg,0.015mmol)和(S)-4-(((4R,7S,10S,13S,16S,22S,25S,28S,31S,34R)-25-((1H-咪唑-5-基)甲基)-7,28-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-4-(((2S,3R)-1-氨基-3-羟基-1-氧代丁烷-2-基)氨基甲酰基)-16-(3,20-二氧代-7,10,13,16-四氧杂-4,19-二氮杂二十五-24-炔-1-基)-13,22-二异丁基-10-异丙基-31-甲基-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33-十氧代-1,2-二硫杂-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32-十氮杂环三十五烷-34-基)氨基)-3-氨基-4-氧代丁酸(30.0mg,0.015mmol)的MeOH(5mL)溶液中。添加新制备的抗坏血酸钠(1.44mg,0.007mmol)在水(0.5mL)中的溶液并将反应混合物在35℃下搅拌16小时。通过制备型HPLC纯化反应物,得到(S)-4-(((4R,7S,10S,13S,16S,22S,25S,28S,31S,34R)-25-((1H-咪唑-5-基)甲基)-7,28-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-4-(((2S,3R)-1-氨基-3-羟基-1-氧代丁-2-基)氨基甲酰基)-16-(23-(1-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-3,20-二氧代-7,10,13,16-四氧杂-4,19-二氮杂二十三烷基)-13,22-二异丁基-10-异丙基-31-甲基-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33-十氧代-1,2-二硫杂-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32-十氮杂环三十五烷-34-基)氨基)-3-氨基-4-氧代丁酸(化合物2,15.1mg,收率33%)。LC-MS(ESI)发现值:1051[M+3H]3+.1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.71(s,1H),8.50(d,J=4.8Hz,2H),7.73(s,1H),7.46(d,J=7.9Hz,1H),7.41(d,J=6.7Hz,1H),7.32(d,J=7.9Hz,2H),7.24(d,J=8.0Hz,1H),7.07-6.86(m,8H),4.51(d,J=30.6Hz,4H),4.34(dd,J=12.8,5.9Hz,7H),4.17(d,J=16.7Hz,2H),4.08(dd,J=10.0,4.5Hz,3H),3.91(d,J=3.0Hz,3H),3.70-3.47(m,60H),3.38-3.31(m,9H),3.14(dd,J=20.4,9.4Hz,7H),2.93(dd,J=38.3,12.3Hz,7H),2.70(t,J=7.5Hz,2H),2.44(t,J=6.1Hz,4H),2.30-2.17(m,7H),2.08(s,1H),2.00-1.76(m,6H),1.72-1.42(m,9H),1.30(s,3H),1.20(s,6H),0.98-0.80(m,15H),0.74(d,J=5.4Hz,3H)。
化合物3,(S)-4-(((4R,7S,10S,13S,16S,22S,25S,28S,31S,34R)-25-((1H-咪唑-5-基)甲基)-7,28-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-4-(((2S,3R)-1-氨基-3-羟基-1-氧代丁-2-基)氨基甲酰基)-16-(23-(1-(20-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-3,20-二氧代-7,10,13,16-四氧杂-4,19-二氮杂二十三烷基)-13,22-二异丁基-10-异丙基-31-甲基-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33-十氧代-1,2-二硫杂-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32-十氮杂环三十五烷-34-基)氨基)-3-氨基-4-氧代丁酸的制备
步骤1:将THPTA(3.15mg,0.007mmol)和CuSO4(1.16mg,0.007mmol)溶解在水(0.5mL)中,然后添加到3,3′-((2-(6-叠氮己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)丙酰胺)(A14,19mg,0.015mmol)和(S)-4-(((4R,7S,10S,13S,16S,22S,25S,28S,31S,34R)-25-((1H-咪唑-5-基)甲基)-7,28-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-4-(((2S,3R)-1-氨基-3-羟基-1-氧代丁-2-基)氨基甲酰基)-16-(3,20-二氧代-7,10,13,16-四氧杂-4,19-二氮杂二十五-24-炔-1-基)-13,22-二异丁基-10-异丙基-31-甲基-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33-十氧代-1,2-二硫杂-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32-十氮杂环三十五烷-34-基)氨基)-3-氨基-4-氧代丁酸(26.76mg,0.015mmol)的MeOH(5mL)溶液。添加新制备的抗坏血酸钠(1.44mg,0.007mmol)在水(0.5mL)中的溶液并将反应混合物在35℃下搅拌24小时。通过制备型HPLC纯化反应物,得到(S)-4-(((4R,7S,10S,13S,16S,22S,25S,28S,31S,34R)-25-((1H-咪唑-5-基)甲基)-7,28-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-4-(((2S,3R)-1-氨基-3-羟基-1-氧代丁-2-基)氨基甲酰基)-16-(23-(1-(20-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-3,20-二氧代-7,10,13,16-四氧杂-4,19-二氮杂二十三烷基)-13,22-二异丁基-10-异丙基-31-甲基-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33-十氧代-1,2-二硫杂-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32-十氮杂环三十五烷-34-基)氨基)-3-氨基-4-氧代丁酸(化合物3,13.8mg,30%收率)。LC-MS(ESI)发现值:1051[M+3H]3+.1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.17(s,1H),7.73(s,1H),7.46(d,J=7.7Hz,1H),7.36(dd,J=33.3,7.8Hz,3H),7.24(d,J=8.1Hz,1H),6.99-6.95(m,6H),5.38(s,2H),4.70-4.43(m,4H),4.43-4.30(m,4H),4.24-4.06(m,3H),3.96(dd,J=23.4,6.8Hz,7H),3.84-3.74(m,5H),3.73-3.41(m,60H),3.36(dd,J=12.1,6.3Hz,8H),3.28-3.20(m,1H),3.18-3.06(m,4H),3.05-2.89(m,5H),2.85(d,J=7.1Hz,2H),2.70(t,J=7.5Hz,2H),2.51-2.40(m,4H),2.32-2.15(m,7H),2.09(s,1H),2.00-1.80(m,5H),1.67-1.49(m,7H),1.41-1.28(m,4H),1.20(d,J=6.3Hz,6H),0.98-0.69(m,18H)。
化合物4,3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(20-(1-(1-((2R,3R,4R,5S))-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-17-氧代-4,7,10,13-四氧杂-16-氮杂二十烷酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2’-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
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步骤1:将THPTA(2mg)和CuSO4(1mg)溶解在水(0.5mL)中。将混合物添加至3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代-2-(17-氧代-4,7,10,13-四氧杂-16-氮杂二十二-21-炔酰胺基)四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷基)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(15mg)和3,3′-((2-(6-叠氮己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(A2,9mg)的DMSO(3mL)溶液中。添加新制备的抗坏血酸钠(2mg)在水(0.5mL)中的溶液。将反应搅拌过夜。将所得混合物过滤。通过制备型HPLC纯化粗产物,得到3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(20-(1-(1-((2R,3R,4R,5S))-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-17-氧代-4,7,10,13-四氧杂-16-氮杂二十烷酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2’-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(化合物4,5.2mg,37%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:843[M+4H]4+.1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.72(s,1H),8.29(s,1H),8.11(s,2H),7.99(s,2H),7.75(s,1H),7.68(d,J=8.7Hz,1H),7.48(d,J=9.2Hz,1H),7.41(s,1H),7.30(d,J=8.0Hz,1H),7.18-7.10(m,2H),7.05(t,J=7.1Hz,1H),6.98(t,J=7.5Hz,1H),6.90(dd,J=15.2,7.4Hz,1H),6.85(d,J=4.8Hz,1H),5.81(d,J=17.0Hz,1H),5.49(d,J=8.6Hz,1H),5.35(d,J=3.1Hz,1H),4.69-4.57(m,3H),4.48(d,J=21.3Hz,2H),4.41-4.25(m,9H),4.15-4.02(m,7H),3.92(d,J=2.9Hz,2H),3.78-3.55(m,56H),3.56-3.39(m,12H),3.36(t,J=4.7Hz,7H),3.27-3.15(m,4H),3.12(dd,J=13.6,8.0Hz,3H),3.06-2.67(m,8H),2.45(dd,J=13.8,6.7Hz,8H),2.22(dt,J=19.2,7.5Hz,6H),2.10-1.85(m,10H),1.75-1.51(m,8H),1.43-1.27(m,3H),1.15(dd,J=11.4,6.6Hz,6H),1.05-0.78(m,18H)。19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-70.21,-77.13,-77.18.
化合物5,3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(17-(1-(((1S,2R,3R,4R,5S))-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)甲基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-14-氧代-4,7,10-三氧杂-13-氮杂十七酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
步骤1:将THPTA(1.94mg,0.004mmol)和CuSO4(0.72mg,0.004mmol)溶解在水(0.5mL)中,然后添加到(1S,2R,3R,4R,5S)-1-(叠氮甲基)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(3mg,0.009mmol)和3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代-2-(14-氧代-4,7,10-三氧杂-13-氮杂十九-18-炔酰胺基)四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷基)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(中间体9,20.0mg,0.009mmol)的MeOH(5mL)溶液中。添加新制备的抗坏血酸钠(0.35mg,0.002mmol)在水(0.5mL)中的溶液,并将反应混合物在室温下搅拌24小时。蒸发溶剂并通过制备型HPLC(TFA/MeOH)纯化粗物质以得到3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(17-(1-(((1S,2R,3R,4R,5S))-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)甲基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-14-氧代-4,7,10-三氧杂-13-氮杂十七酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(化合物5,6mg,28%收率)。LC-MS(ESI)发现值:1178[M+2H]2+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ7.78(s,1H),7.68(d,J=8.2Hz,1H),7.47(d,J=8.6Hz,1H),7.41(s,1H),7.32(dd,J=17.8,7.7Hz,2H),7.18-7.10(m,2H),7.05(t,J=7.5Hz,1H),6.98(t,J=7.4Hz,1H),6.94-6.82(m,3H),5.38(d,J=0.9Hz,1H),4.89(d,J=5.5Hz,4H),4.76(d,J=7.7Hz,2H),4.69-4.63(m,1H),4.59(dd,J=8.8,4.3Hz,1H),4.48(ddd,J=14.5,5.2,3.2Hz,2H),4.32(ddd,J=22.3,11.5,5.5Hz,5H),4.13-4.02(m,2H),3.90(dd,J=36.3,5.6Hz,2H),3.80-3.70(m,6H),3.61(dt,J=7.6,4.3Hz,11H),3.54(t,J=5.4Hz,2H),3.46(s,1H),3.36(t,J=5.3Hz,3H),3.26-3.11(m,4H),3.08-2.84(m,4H),2.73(t,J=7.6Hz,3H),2.49(dd,J=24.6,18.4Hz,6H),2.25(t,J=7.4Hz,6H),2.13(dd,J=13.2,6.2Hz,1H),2.04-1.89(m,7H),1.85-1.71(m,3H),1.69-1.54(m,2H),1.29(s,2H),1.19-1.10(m,6H),1.00-0.90(m,15H),0.85(d,J=6.9Hz,3H)。
化合物6,3-((2S,SaR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(3-(2-(4-(1-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)丁酰胺基)乙氧基)丙酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d1[1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
/>
步骤1:将THPTA(13mg,0.03mmol)和CuSO4(0.38mg,0.0015mmol)溶解在水(0.1mL)中,然后添加到3,3′-((2-(6-叠氮己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶)-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(20mg,0.015mmol)和3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H)-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(3-(2-(己-5-炔酰胺基)乙氧基)丙酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(中间体7,28.9mg,0.015mmol)的MeOH(2mL)溶液中。添加新制备的抗坏血酸钠(2.64mg,0.015mmol)在水(0.1mL)中的溶液并将反应混合物在室温下搅拌过夜。蒸发溶剂并通过制备型HPLC纯化产物以得到3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(3-(2-(4-(1-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)丁酰胺基)乙氧基)丙酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(化合物6,7mg,14.3%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:1081[M+3H]3+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.50(d,J=4.6Hz,2H),7.75(s,1H),7.69(d,J=8.3Hz,1H),7.48(d,J=7.6Hz,1H),7.41(s,1H),7.34(s,1H),7.30(d,J=8.0Hz,1H),7.19-7.10(m,2H),7.04(d,J=8.0Hz,1H),6.98(d,J=7.4Hz,1H),6.94-6.80(m,5H),4.69-4.44(m,4H),4.35(t,J=6.9Hz,9H),4.06(d,J=6.8Hz,5H),3.91(d,J=3.2Hz,2H),3.76-3.50(m,49H),3.49-3.40(m,5H),3.36(t,J=5.4Hz,9H),3.20-3.11(m,4H),3.09-2.78(m,5H),2.72(t,J=7.6Hz,3H),2.44(t,J=6.0Hz,11H),2.33-2.12(m,8H),2.04-1.85(m,12H),1.63(s,4H),1.30(s,6H),1.20-1.09(m,6H),0.94-0.90(m,18H)。
化合物7,3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(3-(2-(4-(1-(((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)甲基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)丁酰胺基)乙氧基)丙酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
步骤1:将THPTA(2mg)和CuSO4(1mg)溶解在水(0.5mL)中。将混合物添加至3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑)-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(3-(2-(己-5-炔酰胺基)乙氧基)丙酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(中间体7,30mg)和(1S,2R,3R,4R,5S)-1-(叠氮甲基)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(5mg)的DMSO(3mL)溶液中。添加新制备的抗坏血酸钠(2mg)在水(0.5mL)中的溶液。将反应搅拌过夜。将所得混合物过滤。通过制备型HPLC纯化粗产物,得到3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(3-(2-(4-(1-(((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)甲基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)丁酰胺基)乙氧基)丙酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(化合物7,5.2mg,37%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:1133[M+2H]2+.1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.72(s,1H),8.20(s,2H),7.78(s,1H),7.71(d,J=8.1Hz,1H),7.41(t,J=18.1Hz,2H),7.30(d,J=8.1Hz,1H),7.14(s,1H),7.05(t,J=7.2Hz,1H),6.98(t,J=7.4Hz,1H),6.91(dd,J=14.5,6.8Hz,1H),6.86(s,1H),5.82(s,1H),5.51(s,1H),5.35(d,J=24.0Hz,2H),5.03-4.86(m,5H),4.85-4.74(m,2H),4.70-4.58(m,2H),4.43(d,J=34.4Hz,4H),4.26(d,J=6.0Hz,2H),4.16-3.99(m,2H),3.89(d,J=32.2Hz,2H),3.82-3.58(m,8H),3.55-3.34(m,8H),3.22(dd,J=14.9,6.2Hz,4H),3.08-2.63(m,8H),2.58-2.38(m,6H),2.27(dd,J=13.8,6.4Hz,4H),2.18-2.08(m,1H),2.06-1.86(m,6H),1.83-1.48(m,5H),1.16(d,J=6.1Hz,6H),1.02-0.75(m,18H)。19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-77.099(s)。
化合物8,3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(17-(1-(20-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛-1-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-14-氧代-4,7,10-三氧杂-13-氮杂十七酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
步骤1:将THPTA(2mg)和CuSO4(1mg)溶解在水(0.5mL)中。将混合物添加至3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑)-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代-2-(14-氧代-4,7,10-三氧杂-13-氮杂十九-18-炔酰胺基)四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(中间体9,30mg)和3,3′-((2-(6-叠氮己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)丙酰胺)(A14,20mg)的DMSO(3mL)溶液中。添加新制备的抗坏血酸钠(2mg)在水(0.5mL)中的溶液。将反应搅拌过夜。将所得混合物过滤。通过制备型HPLC纯化粗产物,得到3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(17-(1-(20-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛-1-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-14-氧代-4,7,10-三氧杂-13-氮杂十七酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(化合物8,21.7mg,44%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:832[M+4H]4+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.73(s,2H),8.20(s,1H),7.76(s,1H),7.69(s,1H),7.44(d,J=19.0Hz,2H),7.30(d,J=8.1Hz,1H),7.14(s,1H),7.05(t,J=7.5Hz,1H),6.98(t,J=7.4Hz,1H),6.88(s,2H),5.81(s,1H),5.50(s,1H),5.38(s,2H),4.89(d,J=1.7Hz,5H),4.81(d,J=1.9Hz,5H),4.69-4.19(m,11H),4.08(dd,J=15.3,9.9Hz,3H),3.99(d,J=9.6Hz,2H),3.93(d,J=4.1Hz,2H),3.87(s,2H),3.80(dd,J=12.3,6.2Hz,3H),3.74(dd,J=14.5,5.3Hz,4H),3.71-3.57(m,40H),3.54-3.46(m,11H),3.36(dd,J=10.2,4.9Hz,7H),3.28-3.20(m,2H),3.14-2.62(m,8H),2.45(dd,J=14.0,7.6Hz,10H),2.23(dt,J=19.8,7.4Hz,8H),2.04-1.47(m,16H),1.31(s,2H),1.16(s,5H),0.92(dd,J=28.9,22.5Hz,18H)。19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-77.379(s)。
化合物9,3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(3-(2-(4-(1-(20-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)丁酰胺基)乙氧基)丙酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
步骤1:向3,3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((1S,2R,3R,4R,5S))-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)丙酰胺)(A14,15mg,0.01mmol)和3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(3-(2-(己-5-炔酰胺基)乙氧基)丙酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(中间体7,25mg,0.01mmol)的DMSO(2mL)溶液中添加CuSO4(2mg)、THPTA(3mg)的H2O(0.1mL)溶液和抗坏血酸钠(2mg)的H2O(0.1mL)溶液。将混合物在40℃下搅拌过夜。溶液直接经C18柱纯化得到3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(3-(2-(4-(1-(20-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)丁酰胺基)乙氧基)丙酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(化合物9,10mg,25%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:1080[M+3H]3+.1H NMR(400MHz,CD3OD):δ7.75(s,1H),7.69(d,J=8.4Hz,1H),7.48(d,J=7.8Hz,1H),7.41(s,1H),7.38-7.28(m,2H),7.21-6.76(m,7H),5.38(d,J=1.3Hz,2H),4.70-4.28(m,12H),4.15-3.59(m,54H),3.57-3.35(m,18H),3.23-2.69(m,10H),2.55-2.09(m,20H),2.08-1.74(m,12H),1.63(s,4H),1.39-1.07(m,10H),1.04-0.80(m,18H)。
化合物10,(S)-3-(((4R,7S,10S,13S,16S,22S,25S,28S,31S,34R)-25-((1H-咪唑-5-基)甲基)-7,28-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-4-(((2S,3R)-1-氨基-3-羟基-1-氧代丁-2-基)氨基甲酰基)-16-(2-羧乙基)-13,22-二异丁基-10-异丙基-31-甲基-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33-十氧代-1,2-二硫杂-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32-十氮杂环三十五烷-34-基)氨基甲酰基)-23-(1-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-20-氧代-7,10,13,16-四氧杂-4,19-二氮杂二十三烷酸的制备
步骤1:将THPTA(3.4mg)和CuSO4(0.3mg)溶解在水(0.2mL)中。将混合物添加至3,3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)丙酰胺)(21mg)和FC-III肽-炔烃(29.6mg)的MeOH(5mL)溶液中。添加新制备的抗坏血酸钠(0.6mg)在水(0.2mL)中的溶液。将反应搅拌过夜。将所得混合物过滤。通过制备型HPLC纯化粗产物,得到(S)-3-(((4R,7S,10S,13S,16S,22S,25S,28S,31S,34R)-25-((1H-咪唑-5-基)甲基)-7,28-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-4-(((2S,3R)-1-氨基-3-羟基-1-氧代丁-2-基)氨基甲酰基)-16-(2-羧乙基)-13,22-二异丁基-10-异丙基-31-甲基-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33-十氧代-1,2-二硫杂-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32-十氮杂环三十五烷-34-基)氨基甲酰基)-23-(1-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-20-氧代-7,10,13,16-四氧杂-4,19-二氮杂二十三烷酸(化合物10,11.8mg,23.2%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:788[M+4H]4+.1H NMR(400MHz,DMSO):δ10.71(s,2H),8.50(d,J=61.1Hz,8H),8.05(s,2H),7.89(dd,J=14.6,8.9Hz,4H),7.82(s,1H),7.65-7.50(m,5H),7.41(d,J=7.7Hz,1H),7.27(d,J=7.7Hz,2H),7.13(t,J=24.1Hz,4H),7.03-6.97(m,2H),6.95(d,J=4.9Hz,2H),6.91(t,J=7.4Hz,2H),6.81(s,1H),4.56(d,J=82.6Hz,10H),4.26(t,J=7.1Hz,5H),4.07(d,J=23.3Hz,3H),3.93(s,2H),3.83(s,3H),3.69(s,2H),3.58-3.46(m,54H),3.38(dd,J=5.8,3.1Hz,14H),3.21-3.17(m,8H),3.03-2.89(m,8H),2.59(dd,J=28.4,20.7Hz,4H),2.31(t,J=6.5Hz,6H),2.09(dt,J=14.1,7.4Hz,7H),1.88-1.70(m,7H),1.55-1.32(m,8H),1.24-1.11(m,6H),1.03(d,J=6.1Hz,3H),0.93-0.50(m,21H)。19F NMR(377MHz,DMSO):δ-69.47(s),-73.41(s)。
化合物11,3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(17-(1-(1-((2R,3R,4R,5S))-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-14-氧代-4,7,10-三氧杂-13-氮杂十七酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
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步骤1:将THPTA(1.99mg,0.005mmol)和CuSO4(0.73mg,0.005mmol)溶解在水(0.5mL)中,然后添加到3,3′-((2-(6-叠氮己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶)-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(12mg,0.009mmol)和3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H)-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧杂-2-(14-氧代-4,7,10-三氧杂-13-氮杂十九-18-炔酰胺基)四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(中间体9,20mg,0.009mmol)的MeOH(10mL)溶液中。添加新制备的抗坏血酸钠(0.69mg,0.004mmol)在水(0.5mL)中的溶液并将反应混合物在35℃下搅拌16小时。除去溶剂并通过制备型HPLC纯化,得到3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(17-(1-(1-((2R,3R,4R,5S))-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-14-氧代-4,7,10-三氧杂-13-氮杂十七酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(化合物11,4.3mg,13%收率)。LC-MS(ESI)发现值:1110[M+3H]3+.1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.50(d,J=4.6Hz 2H),8.39(s,1H),7.73(s,1H),7.53(s,1H),7.33-7.53(m,2H),7.16(s,1H),7.10-6.91(m,6H),6.88(d,J=4.9Hz,3H),4.62(s,3H),4.49(s,4H),4.40-4.31(m,6H),4.13-4.02(m,6H),3.91(d,J=2.6Hz,3H),3.75(s,3H),3.67(d,J=7.9Hz,9H),3.61(dt,J=13.4,4.3Hz,39H),3.52(dd,J=11.8,6.4Hz,9H),3.49-3.42(m,6H),3.37(d,J=5.4Hz,6H),3.19-3.11(m,6H),2.74-2.67(m,3H),2.54(s,3H),2.44(t,J=5.7Hz,6H),2.29-2.16(m,10H),2.03(d,J=5.5Hz,5H),1.97-1.84(m,8H),1.60(s,9H),1.21(s,6H),0.92-0.72(m,18H)。
化合物12,3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(3-(2-(2-(4-(1-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)丁酰胺基)乙氧基)乙氧基)丙酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
/>
步骤1:3,3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)丙酰胺)(12.5mg,0.01mmol)和3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(3-(2-(2-(己-5-炔酰胺基)乙氧基)乙氧基)丙酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(中间体6,20mg,0.01mmol)的MeOH(5mL)溶液中添加H2O(0.1mL)中的CuSO4(2mg)和THPTA(3mg),以及H2O(0.1mL)中的抗坏血酸钠(2mg)。将混合物在35℃下搅拌过夜,然后浓缩。通过制备型HPLC纯化残余物,得到3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(3-(2-(2-(4-(1-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)丁酰胺基)乙氧基)乙氧基)丙酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(化合物12,10.8mg,33%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:1095[M+3H]3+.1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.50(d,J=5.2Hz,2H),8.26(s,1H),7.73(s,1H),7.55-7.48(m,1H),7.24(s,4H),6.95(s,6H),6.88(d,J=4.9Hz,1H),6.87(s,1H),4.62(s,3H),4.53-4.49(m,2H),4.34(t,J=7.3Hz,6H),4.08(d,J=9.2Hz,5H),3.91(d,J=2.9Hz,2H),3.75(s,3H),3.70-3.66(m,12H),3.61(dd,J=11.3,6.3Hz,36H),3.54(dd,J=10.6,5.1Hz,9H),3.48(d,J=3.2Hz,2H),3.46-3.42(m,3H),3.36(t,J=5.4Hz,6H),3.16(d,J=10.8Hz,3H),3.13(d,J=1.8Hz,2H),3.01-2.92(m,3H),2.86-2.76(m,4H),2.70(t,J=7.5Hz,3H),2.56-2.51(m,3H),2.44(t,J=6.0Hz,6H),2.23(dt,J=25.8,7.4Hz,8H),2.02(d,J=8.5Hz,1H),1.97-1.84(m,8H),1.62(s,5H),1.30(s,3H),1.21(s,6H),0.87(s,14H),0.75(s,6H)。
化合物13,3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(3-(2-(2-(4-(1-(((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)甲基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)丁酰胺基)乙氧基)乙氧基)丙酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
步骤1:将THPTA(1.94mg,0.004mmol)和CuSO4(0.14mg,0.001mmol)溶解在水(0.5mL)中,然后添加到(1S,2R,3R,4R,5S)-1-(叠氮甲基)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(3mg,0.009mmol)和3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(3-(2-(2-(己-5-炔酰胺基)乙氧基)乙氧基)丙酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(中间体6,15mg,0.009mmol)的MeOH(10mL)溶液中。添加新制备的抗坏血酸钠(0.35mg,0.002mmol)在水(0.5mL)中的溶液并将反应混合物在35℃下搅拌12小时。蒸发溶剂并通过制备型HPLC纯化粗物质,得到3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(3-(2-(2-(4-(1-(((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)甲基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)丁酰胺基)乙氧基)乙氧基)丙酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(化合物13,2.6mg,13%收率)。LC-MS(ESI)发现值:1156[M+2H]2+.1H NMR(400MHz,CD3OD):δ7.78(s,1H),7.68(d,J=8.4Hz,1H),7.47(d,J=7.6Hz,1H),7.41(s,1H),7.33(s,1H),7.30(d,J=8.0Hz,1H),7.15(s,1H),7.12(d,J=7.8Hz,1H),7.05(t,J=7.6Hz,1H),6.98(t,J=7.2Hz,1H),6.91(s,1H),6.88-6.82(m,2H),5.38(s,1H),4.70-4.56(m,3H),4.48(s,2H),4.33(d,J=45.2Hz,6H),4.07(dd,J=21.1,9.4Hz,2H),3.95(s,1H),3.87-3.71(m,8H),3.66(s,1H),3.62(s,5H),3.54(t,J=5.7Hz,2H),3.50-3.42(m,2H),3.13(d,J=1.7Hz,1H),2.94(d,J=65.8Hz,3H),2.83-2.77(m,1H),2.76-2.67(m,3H),2.55(s,1H),2.46(t,J=6.0Hz,5H),2.28-2.12(m,6H),2.06-1.88(m,9H),1.70(d,J=81.3Hz,6H),1.30(s,9H),1.20-1.11(m,6H),1.00-0.90(m,15H),0.85(d,J=6.7Hz,3H)。
化合物14,3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(20-(1-(20-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛-1-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-17-氧代-4,7,10,13-四氧杂-16-氮杂二十烷酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
步骤1:将THPTA(1.52mg,0.004mmol)和CuSO4(0.56mg,0.004mmol)溶解在水(0.5mL)中,然后添加到3,3′-((2-(6-叠氮己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)丙酰胺)(A14,9.5mg,0.007mmol)和3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代-2-(17-氧代-4,7,10,13-四氧杂-16-氮杂二十二-21-炔酰胺基)四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(中间体4,15mg,0.007mmol)的MeOH(10mL)溶液中。添加新制备的抗坏血酸钠(0.69mg,0.004mmol)在水(0.5mL)中的溶液并将反应混合物在35℃下搅拌16小时。蒸发溶剂并通过制备型HPLC纯化粗物质,得到3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(20-(1-(20-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛-1-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-17-氧代-4,7,10,13-四氧杂-16-氮杂二十烷酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(化合物14,1.7mg,收率6.9%)。LC-MS(ESI)发现值:1125[M+3H]3+.
化合物15,3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(20-(1-(((1S,2R,3R,4R,5S))-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)甲基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-17-氧代-4,7,10,13-四氧杂-16-氮杂二十烷酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
步骤1:将THPTA(3.25mg,0.007mmol)和CuSO4(0.24mg,0.002mmol)溶解在水(0.5mL)中,然后添加到(1S,2R,3R,4R,5S)-1-(叠氮甲基)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(5mg,0.015mmol)和3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代-2-(17-氧代-4,7,10,13-四氧杂-16-氮杂二十二-21-炔酰胺基)四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(30.80mg,0.015mmol)的MeOH(10mL)溶液中。添加新制备的抗坏血酸钠(0.59mg,0.002mmol)在水(0.5mL)中的溶液并将反应混合物在35℃下搅拌16小时。蒸发溶剂并通过制备型HPLC纯化粗物质,得到3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(20-(1-(((1S,2R,3R,4R,5S))-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)甲基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-17-氧代-4,7,10,13-四氧杂-16-氮杂二十烷酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(化合物15,4.7mg,13%收率)。LC-MS(ESI)发现值:1200[M+2H]2+.1H NMR(400MHz,CD3OD):δ7.78(s,1H),7.66(s,1H),7.48(d,J=7.8Hz,1H),7.41(s,1H),7.34(s,1H),7.30(d,J=7.8Hz,1H),7.19-7.09(m,2H),7.05(t,J=7.8Hz,1H),6.98(t,J=7.2Hz,1H),6.90(d,J=7.5Hz,1H),6.84(s,1H),5.38(s,1H),4.95-4.86(m,5H),4.77(dd,J=13.6,2.6Hz,3H),4.71-4.56(m,3H),4.54-4.43(m,2H),4.42-4.22(m,5H),4.08(t,J=13.1Hz,2H),3.93(dd,J=10.9,6.0Hz,1H),3.88-3.66(m,8H),3.63(s,13H),3.53(t,J=5.5Hz,2H),3.51-3.41(m,2H),3.35(t,J=5.5Hz,3H),3.29-3.10(m,6H),3.07-2.89(m,3H),2.87-2.69(m,4H),2.63-2.05(m,14H),2.03-1.90(m,6H),1.88-1.49(m,6H),1.15(dd,J=13.8,7.2Hz,6H),1.02-0.90(m,12H),0.85(d,J=6.5Hz,3H)。
化合物16,3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(20-(1-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-17-氧代-4,7,10,13-四氧杂-16-氮杂二十烷酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
/>
步骤1:向3,3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)丙酰胺)(15mg,0.01mmol)和3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代-2-(17-氧代-4,7,10,13-四氧杂-16-氮杂二十二-21-炔酰胺基)四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(中间体4,25mg,0.01mmol)的MeOH溶液(5mL)中加入CuSO4(2mg)、THPTA(3mg)的H2O(0.1mL)溶液和抗坏血酸钠(2mg)的H2O(0.1mL)。将混合物在35℃下搅拌过夜,然后浓缩。通过快速柱纯化残余物,得到3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(20-(1-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-17-氧代-4,7,10,13-四氧杂-16-氮杂二十烷酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(化合物16,8.2mg,20%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:1125[M+3H]3+.1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.72(s,1H),8.69-8.64(m,1H),8.50(d,J=4.8Hz,2H),7.76(s,1H),7.69-7.64(m,1H),7.47(s,1H),7.41(s,1H),7.33(d,J=9.6Hz,1H),7.30(d,J=8.1Hz,1H),7.17-7.10(m,2H),7.04(d,J=8.1Hz,1H),6.98(d,J=7.7Hz,1H),6.89(s,1H),6.88(s,1H),6.85(s,1H),4.35(t,J=7.1Hz,7H),4.13-4.03(m,6H),3.91(d,J=2.8Hz,2H),3.74(d,J=6.0Hz,2H),3.71-3.66(m,14H),3.64-3.58(m,46H),3.53(t,J=5.3Hz,7H),3.45(dd,J=12.7,6.9Hz,4H),3.36(t,J=4.6Hz,8H),3.18-3.12(m,4H),2.70(d,J=9.9Hz,3H),2.44(t,J=6.6Hz,9H),2.23(dt,J=19.1,7.5Hz,6H),2.01-1.82(m,10H),1.63(s,5H),1.49(s,3H),1.46(d,J=2.0Hz,9H),1.31(s,5H),1.14(d,J=6.1Hz,5H),1.00-0.94(m,5H),0.97-0.89(m,9H),0.85(d,J=6.7Hz,3H)。
化合物17,3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(3-(2-(2-(4-(1-(20-(1-((1S,2R,3R,4R,5S))-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)丁酰胺基)乙氧基)乙氧基)丙酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
步骤1:将THPTA(0.51mg,0.01mmol)和CuSO4(0.04mg,0.0002mmol)溶解在水(0.5mL)中。然后将混合物添加至3,3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(A14,3.1mg,0.002mmol)和3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(3-(2-(2-(己-5-炔酰胺基)乙氧基)乙氧基)丙酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(5mg,0.002mmol)的MeOH(5mL)溶液中。添加新制备的抗坏血酸钠(0.09mg,0.0004mmol)在水(0.5mL)中的溶液并将反应混合物在35℃下搅拌16小时。蒸发溶剂并通过制备型HPLC(方法A)纯化粗物质,得到3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(3-(2-(2-(4-(1-(20-(1-((1S,2R,3R,4R,5S))-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)丁酰胺基)乙氧基)乙氧基)丙酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(化合物17,4.7mg,60%收率)。LC-MS(ESI)发现值:1642[M+2H]2+.1H NMR(400MHz,CD3OD):δ7.75(s,1H),7.69(d,J=9.4Hz,1H),7.46(s,1H),7.35(s,1H),7.30(d,J=8.0Hz,1H),7.13(d,J=9.7Hz,2H),7.05(t,J=7.7Hz,1H),6.98(t,J=7.3Hz,1H),6.94-6.83(m,3H),5.38(s,2H),4.66(d,J=6.7Hz,1H),4.59(dd,J=9.1,4.3Hz,1H),4.49(s,1H),4.36(dd,J=14.1,7.0Hz,4H),4.26(s,1H),4.15-3.96(m,6H),3.92-3.73(m,12H),3.71-3.58(m,40H),3.57-3.49(m,7H),3.46(dt,J=9.7,4.3Hz,5H),3.36(dd,J=10.0,4.9Hz,7H),3.24(d,J=16.8Hz,4H),3.03(dd,J=42.9,32.9Hz,4H),2.83(s,1H),2.72(t,J=7.5Hz,3H),2.63-2.39(m,11H),2.37-2.09(m,10H),2.07-1.67(m,13H),1.62(dd,J=15.5,7.8Hz,4H),1.38-1.26(m,4H),1.15(d,J=6.0Hz,6H),1.01-0.80(m,18H)。
化合物18,(S)-2-((S)-2-((1H-咪唑-5-基)甲基)-23-(1-(((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-4,20-二氧代-7,10,13,16-四氧杂-3,19-二氮杂二十三酰胺基)-N1-((S)-1-(((3S,6R,11R,14S,17S,20S,23S,29S,34aS)-6-(((S)-1-(((S)-1-(((2S,3R)-1-氨基-3-羟基-1-氧代丁-2-基)氨基)-3-羟基-1-氧代丙烷-2-基)氨基)-1-氧代-3-苯基丙-2-基)氨基甲酰基)-23,29-双(3-胍基丙基)-20-(4-羟基苄基)-17-(羟甲基)-14-异丁基-3-异丙基-1,4,12,15,18,21,24,27,30-九氧代三十氢-1H,10H-吡咯并[2,1-j][1,2]二硫[5,8,11,14,17,20,23,26,29]九氮杂环三十二烷-11-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)戊二酰胺的制备
步骤1:将THPTA(6.5mg)和CuSO4(0.5mg)溶解在水(0.1mL)中。将混合物添加至(2R,3R,4R,5S)-2-(叠氮基甲基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(10mg)和OPT-炔烃(59mg)在MeOH(3mL)中的溶液中。添加新制备的抗坏血酸钠(1.2mg)在水(0.1mL)中的溶液。将反应搅拌过夜。将所得混合物过滤。通过制备型HPLC纯化粗产物,得到(S)-2-((S)-2-((1H-咪唑-5-基)甲基)-23-(1-(((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-4,20-二氧代-7,10,13,16-四氧杂-3,19-二氮杂二十三酰胺基)-N1-((S)-1-(((3S,6R,11R,14S,17S,20S,23S,29S,34aS)-6-(((S)-1-(((S)-1-(((2S,3R)-1-氨基-3-羟基-1-氧代丁-2-基)氨基)-3-羟基-1-氧代丙烷-2-基)氨基)-1-氧代-3-苯基丙-2-基)氨基甲酰基)-23,29-双(3-胍基丙基)-20-(4-羟基苄基)-17-(羟甲基)-14-异丁基-3-异丙基-1,4,12,15,18,21,24,27,30-九氧代三十氢-1H,10H-吡咯并[2,1-j][1,2]二硫[5,8,11,14,17,20,23,26,29]九氮杂环三十二烷-11-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)戊二酰胺(化合物18,8mg,11%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:632[M+4H]4+.1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.51(d,J=4.5Hz,1H),8.35(s,4H),7.98(s,1H),7.77(s,1H),7.10(dt,J=13.3,5.8Hz,8H),6.90(d,J=4.9Hz,1H),6.74(d,J=8.4Hz,2H),5.79(dd,J=43.7,10.3Hz,2H),5.27-5.08(m,3H),4.61(d,J=5.6Hz,2H),4.50(s,2H),4.42-4.33(m,3H),4.18(d,J=17.2Hz,1H),4.10-4.05(m,1H),3.95-3.67(m,11H),3.62-3.50(m,17H),3.24(t,J=7.2Hz,2H),3.15-2.81(m,12H),2.70(dd,J=15.9,8.7Hz,3H),2.51(d,J=5.4Hz,2H),2.32-2.15(m,6H),1.96(ddd,J=21.1,13.1,5.9Hz,12H),1.74(s,6H),1.36-1.19(m,8H),0.97(ddd,J=46.2,22.9,5.2Hz,21H)。19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-72.28(s),-76.92(s)。
化合物19,(S)-2-((S)-2-((1H-咪唑-5-基)甲基)-23-(1-(20-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛-1-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-4,20-二氧代-7,10,13,16-四氧杂-3,19-二氮杂二十三烷酰胺基)-N1-((S)-1-(((3S,6R,11R,14S,17S,20S,23S,29S,34aS)-6-(((S)-1-(((S)-1-(((2S,3R)-1-氨基-3-羟基-1-氧代丁烷-2-基)氨基)-3-羟基-1-氧代丙烷-2-基)氨基)-1-氧代-3-苯基丙-2-基)氨基甲酰基)-23,29-双(3-胍基丙基)-20-(4-羟基苄基)-17-(羟甲基)-14-异丁基-3-异丙基-1,4,12,15,18,21,24,27,30-九氧代三十氢-1H,10H-吡咯并[2,1-j][1,2]二硫[5,8,11,14,17,20,23,26,29]九氮杂环三十二烷-11-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)戊二酰胺的制备
步骤1:将THPTA(18.3mg)和CuSO4(1.3mg)溶解在水(0.25mL)中。将混合物添加至3,3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(A14,110mg)和OPT-炔烃(140mg)在MeOH(5mL)中的溶液中。添加新制备的抗坏血酸钠(3.3mg)在水(0.25mL)中的溶液。将反应搅拌过夜。将所得混合物过滤。通过制备型HPLC纯化粗产物,得到(S)-2-((S)-2-((1H-咪唑-5-基)甲基)-23-(1-(20-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛-1-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-4,20-二氧代-7,10,13,16-四氧杂-3,19-二氮杂二十三烷酰胺基)-N1-((S)-1-(((3S,6R,11R,14S,17S,20S,23S,29S,34aS)-6-(((S)-1-(((S)-1-(((2S,3R)-1-氨基-3-羟基-1-氧代丁烷-2-基)氨基)-3-羟基-1-氧代丙烷-2-基)氨基)-1-氧代-3-苯基丙-2-基)氨基甲酰基)-23,29-双(3-胍基丙基)-20-(4-羟基苄基)-17-(羟甲基)-14-异丁基-3-异丙基-1,4,12,15,18,21,24,27,30-九氧代三十氢-1H,10H-吡咯并[2,1-j][1,2]二硫[5,8,11,14,17,20,23,26,29]九氮杂环三十二烷-11-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)戊二酰胺(化合物19,13mg,4%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:701[M+5H]5+.1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.48(s,2H),7.76(s,1H),7.65(s,1H),7.16-7.07(m,7H),6.93(s,1H),6.74(d,J=8.4Hz,2H),5.76(d,J=34.0Hz,2H),5.39(s,2H),5.24-5.06(m,3H),4.94(s,2H),4.75(s,6H),4.44-4.33(m,6H),4.29(d,J=8.3Hz,1H),4.19(d,J=17.0Hz,1H),4.10(d,J=5.3Hz,1H),4.00(d,J=9.6Hz,2H),3.94(d,J=4.0Hz,2H),3.83(d,J=8.1Hz,3H),3.71-3.54(m,58H),3.46(dd,J=9.6,3.7Hz,4H),3.37(dd,J=10.0,5.3Hz,7H),3.23(s,2H),3.13(d,J=5.0Hz,4H),2.98(dd,J=26.6,11.0Hz,8H),2.72(s,2H),2.46(dd,J=13.9,8.0Hz,6H),2.22(dt,J=24.6,7.5Hz,8H),2.02-1.89(m,12H),1.72(s,4H),1.68-1.59(m,4H),1.32(s,3H),1.23(d,J=6.2Hz,4H),1.03-0.94(m,12H),0.87(t,J=5.9Hz,9H)。
化合物20,(S)-2-((S)-34-((1H-咪唑-5-基)甲基)-1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-20-(1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22,32-三氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21,33-三氮杂三十五烷-35-酰胺基)-N1-((S)-1-(((3S,6R,11R,14S,17S,20S,23S,29S,34aS)-6-(((S)-1-(((S)-1-(((2S,3R)-1-氨基-3-羟基-1-氧代丁-2-基)氨基)-3-羟基-1-氧代丙-2-基)氨基)-1-氧代-3-苯基丙-2-基)氨基甲酰基)-23,29-双(3-胍基丙基)-20-(4-羟基苄基)-17-(羟甲基)-14-异丁基-3-异丙基-1,4,12,15,18,21,24,27,30-九氧代三十氢-1H,10H-吡咯并[2,1-j][1,2]二硫基[5,8,11,14,17,20,23,26,29]九氮杂三十二烷-11-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)戊二酰胺的制备
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步骤1:向(1,39-双((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15,25-二氧代-2,5,8,11,18,22,29,32,35,38-十氧杂-14,26-二氮杂三十九烷-20-基)氨基甲酸苄酯(400mg,0.31mmol)和CSA(7.0mg,0.03mmol)的DMF(5mL)溶液中在室温下添加2,2-二甲氧基丙烷(161.1mg,1.55mmol)。将反应混合物在室温下搅拌过夜。将所得混合物用EA(20mL)稀释,用H2O(5mL x 2)和盐水(5mL)洗涤,经Na2SO4干燥。将有机层分离并真空浓缩。通过快速色谱法(MeOH的DCM溶液)纯化粗产物,得到(1,39-双((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-15,25-二氧代-2,5,8,11,18,22,29,32,35,38-十氧杂-14,26-二氮杂三十九烷-20-基)氨基甲酸苄酯(300mg,71%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:1382[M+H]+。
步骤2:在室温下向(1,39-双((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-15,25-二氧代-2,5,8,11,18,22,29,32,35,38-十氧杂-14,26-二氮杂三十九烷-20-基)氨基甲酸苄酯(200mg,0.15mmol)的MeOH(5mL)溶液中添加Pd/C(20mg,10%重量,60%湿),并将反应混合物在室温下搅拌过夜。将混合物浓缩并减压,得到粗产物。通过快速色谱法(MeOH的DCM溶液)纯化粗产物,得到3,3′-((2-氨基丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(150mg,83%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:1247[M+H]+。
步骤3:在0℃下向(13S,16S,19S)-13-((1H-咪唑-5-基)甲基)-19-(((3S,6R,11R,14S,17S,20S,23S,29S,34aS)-6-(((S)-1-(((S)-1-(((2S,3R)-1-氨基-3-羟基-1-氧代丁烷-2-基)氨基)-3-羟基-1-氧代丙烷-2-基)氨基)-1-氧代-3-苯基丙-2-基)氨基甲酰基)-23,29-双(3-胍基丙基)-20-(4-羟基苄基)-17-(羟甲基)-14-异丁基-3-异丙基-1,4,12,15,18,21,24,27,30-九氧杂三十氢-1H,10H-吡咯并[2,1-j][1,2]二硫基[5,8,11,14,17,20,23,26,29]九氮杂环三十二烷-11-基)氨基甲酰基)-16-(3-氨基-3-氧代丙基)-20-甲基-11,14,17-三氧代-3,6,9-三氧杂-12,15,18-三氮杂二十一烷酸(69mg,0.029mmol)的DMF(2mL)溶液中添加HATU(13mg,0.035mmol)、DIEA(0.029mL,0.173mmol)。将反应在0℃下搅拌30分钟。添加3,3′-((2-氨基丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)丙酰胺)(40mg,0.032mmol),并将混合物在室温下搅拌16小时。通过制备型HPLC纯化混合物,得到(S)-2-((S)-34-((1H-咪唑-5-基)甲基)-1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-20-(1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22,32-三氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21,33-三氮杂三十五烷-35-酰胺基)-N1-((S)-1-(((3S,6R,11R,14S,17S,20S,23S,29S,34aS)-6-(((S)-1-(((S)-1-(((2S,3R)-1-氨基-3-羟基-1-氧代丁-2-基)氨基)-3-羟基-1-氧代丙烷-2-基)氨基)-1-氧代-3-苯基丙-2-基)氨基甲酰基)-23,29-双(3-胍基丙基)-20-(4-羟基苄基)-17-(羟甲基)-14-异丁基-3-异丙基-1,4,12,15,18,21,24,27,30-九氧代三十氢-1H,10H-吡咯并[2,1-j][1,2]二硫[5,8,11,14,17,20,23,26,29]九氮杂环三十二烷-11-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)戊二酰胺(25mg,26%收率)。LC-MS(ESI)发现值:822[M+4H]4+.
步骤4:(S)-2-((S)-34-((1H-咪唑-5-基)甲基)-1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-20-(1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22,32-三氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21,33-三氮杂三十五烷-35-氨基)-N1-((S)-1-(((3S,6R,11R,14S,17S,20S,23S,29S,34aS)-6-(((S)-1-(((S)-1-(((2S,3R)-1-氨基-3-羟基-1-氧代丁烷-2-基)氨基)-3-羟基-1-氧代丙烷-2-基)氨基)-1-氧代-3-苯基丙-2-基)氨基甲酰基)-23,29-双(3-胍基丙基)-20-(4-羟基苄基)-17-(羟甲基)-14-异丁基-3-异丙基-1,4,12,15,18,21,24,27,30-九氧代三十氢-1H,10H-吡咯并[2,1-j][1,2]二硫[5,8,11,14,17,20,23,26,29]九氮杂环三十二烷-11-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)戊二酰胺(20mg,0.006mmol)溶解在TFA/MeCN溶液(2mL,1%wt.)中。将反应在室温下搅拌18小时。将反应物真空浓缩。残余物通过制备型HPLC纯化,得到标题化合物(S)-2-((S)-34-((1H-咪唑-5-基)甲基)-1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-20-(1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22,32-三氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21,33-三氮杂三十五烷-35-酰胺基)-N1-((S)-1-(((3S,6R,11R,14S,17S,20S,23S,29S,34aS)-6-(((S)-1-(((S)-1-(((2S,3R)-1-氨基-3-羟基-1-氧代丁-2-基)氨基)-3-羟基-1-氧代丙-2-基)氨基)-1-氧代-3-苯基丙-2-基)氨基甲酰基)-23,29-双(3-胍基丙基)-20-(4-羟基苄基)-17-(羟甲基)-14-异丁基-3-异丙基-1,4,12,15,18,21,24,27,30-九氧代三十氢-1H,10H-吡咯并[2,1-j][1,2]二硫基[5,8,11,14,17,20,23,26,29]九氮杂三十二烷-11-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)戊二酰胺(化合物20,6mg,收率31%)。LC-MS(ESI)发现值:802[M+4H]4+.1H NMR(400MHz,MeOD):δ8.81(d,J=1.2Hz,1H),8.51(d,J=4.9Hz,2H),7.38(s,1H),7.11(ddd,J=18.2,14.7,8.3Hz,7H),6.89(d,J=4.9Hz,2H),6.74(d,J=8.5Hz,2H),5.74(d,J=28.6Hz,2H),5.12(d,J=6.3Hz,2H),5.03(d,J=8.1Hz,1H),4.94(d,J=6.4Hz,1H),4.77-4.65(m,3H),4.48(d,J=2.8Hz,1H),4.36(d,J=9.0Hz,4H),4.29-4.16(m,3H),4.14-3.98(m,6H),3.91(t,J=6.4Hz,3H),3.83(d,J=7.7Hz,2H),3.71-3.59(m,42H),3.51(ddd,J=9.4,8.1,3.6Hz,11H),3.37(t,J=5.5Hz,5H),3.25-3.12(m,6H),3.05-2.85(m,7H),2.78(t,J=12.5Hz,2H),2.67(d,J=12.0Hz,1H),2.45(t,J=6.1Hz,4H),2.18(dd,J=29.7,22.2Hz,4H),2.07-1.84(m,9H),1.69(t,J=27.4Hz,7H),1.30(s,4H),1.20(d,J=6.4Hz,4H),1.05-0.92(m,10H),0.90-0.80(m,9H)。
化合物21,(S)-3-(((4R,7S,10S,13S,16S,22S,25S,28S,31S,34R)-25-((1H-咪唑-5-基)甲基)-7,28-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-4-(((2S,3R)-1-氨基-3-羟基-1-氧代丁-2-基)氨基甲酰基)-16-(2-羧乙基)-13,22-二异丁基-10-异丙基-31-甲基-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33-十氧代-1,2-二硫杂-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32-十氮杂环三十五烷-34-基)氨基甲酰基)-24-(1-(20-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-5,21-二氧代-8,11,14,17-四氧杂-4,20-二氮杂二十四烷酸的制备
步骤1:THPTA(3.3mg,0.0076mmol)和CuSO4(0.3mg,0.0012mmol)溶解在水(0.1mL)中。将混合物添加至3,3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(A14,20mg,0.015mmol)和FC-III肽-炔烃(25.7mg)的MeOH(2mL)溶液中。添加新制备的抗坏血酸钠(0.6mg,0.0030mmol)在水(0.1mL)中的溶液。将反应搅拌过夜。将所得混合物过滤。通过制备型HPLC纯化粗产物,得到(S)-3-(((4R,7S,10S,13S,16S,22S,25S,28S,31S,34R)-25-((1H-咪唑-5-基)甲基)-7,28-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-4-(((2S,3R)-1-氨基-3-羟基-1-氧代丁-2-基)氨基甲酰基)-16-(2-羧乙基)-13,22-二异丁基-10-异丙基-31-甲基-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33-十氧代-1,2-二硫杂-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32-十氮杂环三十五烷-34-基)氨基甲酰基)-24-(1-(20-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-5,21-二氧代-8,11,14,17-四氧杂-4,20-二氮杂二十四烷酸(化合物21,14mg,28%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:1591[M+2H]2+.1H NMR(400MHz,CD3OD):δ7.70(s,1H),7.51(d,J=7.7Hz,1H),7.27(s,2H),7.20(s,2H),6.99(d,J=25.8Hz,7H),5.38(s,2H),4.34(dd,J=22.4,15.1Hz,6H),4.11-4.08(m,1H),3.99(d,J=9.6Hz,2H),3.92(d,J=4.1Hz,2H),3.82-3.75(m,5H),3.70-3.66(m,12H),3.64-3.56(m,40H),3.53(t,J=5.6Hz,6H),3.49(d,J=5.7Hz,2H),3.46(d,J=3.8Hz,2H),3.37(t,J=5.5Hz,6H),3.04(ddd,J=79.3,27.9,5.4Hz,14H),2.68(t,J=7.6Hz,4H),2.44(t,J=6.1Hz,8H),2.25-2.17(m,6H),1.96-1.84(m,6H),1.67-1.52(m,6H),1.29(s,8H),0.84(s,21H)。
化合物22,(S)-3-(((4R,7S,10S,13S,16S,22S,25S,28S,31S,34R)-25-((1H-咪唑-5-基)甲基)-7,28-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-4-(((2S,3R)-1-氨基-3-羟基-1-氧代丁-2-基)氨基甲酰基)-16-(2-羧乙基)-13,22-二异丁基-10-异丙基-31-甲基-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33-十氧代-1,2-二硫杂-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32-十氮杂环三十五烷-34-基)氨基甲酰基)-24-(1-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-5,21-二氧代-8,11,14,17-四氧杂-4,20-二氮杂二十四烷酸的制备
步骤1:将THPTA(1.7mg,0.0040mmol)和CuSO4(0.3mg,0.0010mmol)溶解在水(0.05mL)中。将混合物添加至3,3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)丙酰胺)(15mg,0.015mmol)和FC-III肽-炔烃(10mg)的MeOH(1mL)溶液中。添加新制备的抗坏血酸钠(0.4mg,0.0020mmol)在水(0.05mL)中的溶液。将反应搅拌过夜。将所得混合物过滤。通过制备型HPLC纯化粗产物,得到(S)-3-(((4R,7S,10S,13S,16S,22S,25S,28S,31S,34R)-25-((1H-咪唑-5-基)甲基)-7,28-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-4-(((2S,3R)-1-氨基-3-羟基-1-氧代丁-2-基)氨基甲酰基)-16-(2-羧乙基)-13,22-二异丁基-10-异丙基-31-甲基-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33-十氧代-1,2-二硫杂-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32-十氮杂环三十五烷-34-基)氨基甲酰基)-24-(1-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-5,21-二氧代-8,11,14,17-四氧杂-4,20-二氮杂二十四烷酸(化合物22,2.5mg,10%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:795[M+4H]4+.1H NMR(400MHz,D2O):δ8.42(d,J=4.6Hz,2H),8.37(s,14H),7.55(s,1H),7.41(dd,J=12.5,8.8Hz,2H),7.33(t,J=8.3Hz,4H),7.07(d,J=14.5Hz,4H),6.98(d,J=11.5Hz,2H),6.94(d,J=5.1Hz,2H),4.27-4.12(m,4H),4.06-3.93(m,4H),3.90(d,J=2.9Hz,2H),3.77-3.45(m,70H),3.38(dd,J=7.1,1.7Hz,4H),3.32-3.21(m,6H),3.22-3.08(m,5H),2.97(d,J=8.9Hz,4H),2.82(dd,J=21.3,9.1Hz,3H),2.68-2.52(m,4H),2.48(d,J=6.5Hz,3H),2.39(t,J=5.6Hz,4H),2.22-2.05(m,5H),1.87-1.76(m,3H),1.71(d,J=11.9Hz,3H),1.54-1.41(m,4H),1.32-1.17(m,6H),1.16-1.04(m,7H),0.79(d,J=6.0Hz,3H),0.75-0.65(m,10H),0.63-0.57(m,5H)。19F NMR(377MHz,D2O)δ-70.54,-75.60.
化合物23,((S)-2-((S)-2-((1H-咪唑-5-基)甲基)-23-(1-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-4,20-二氧代-7,10,13,16-四氧杂-3,19-二氮杂二十三酰胺基)-N1-((S)-1-(((3S,6R,11R,14S,17S,20S,23S,29S,34aS)-6-(((S)-1-(((S)-1-(((2S,3R)-1-氨基-3-羟基-1-氧代丁烷-2-基)氨基)-3-羟基-1-氧代丙烷-2-基)氨基)-1-氧代-3-苯基丙-2-基)氨基甲酰基)-23,29-双(3-胍基丙基)-20-(4-羟基苄基)-17-(羟甲基)-14-异丁基-3-异丙基-1,4,12,15,18,21,24,27,30-九氧代三十氢-1H,10H-吡咯并[2,1-j][1,2]二硫[5,8,11,14,17,20,23,26,29]九氮杂环三十二烷-11-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)戊二酰胺)的制备
步骤1:将THPTA(1.7mg,0.0007mmol)和CuSO4(0.3mg,0.002mmol)溶解在水(0.05mL)中。将混合物添加至3,3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)丙酰胺)(5mg,0.003mmol)和OPT-炔烃(8.4mg,0.003mmol)的MeOH(1mL)溶液中。添加抗坏血酸钠(0.4mg,0.002mmol)在水(0.05mL)中的溶液。将反应搅拌过夜。将所得混合物过滤。通过制备型HPLC(方法A)纯化粗产物,得到((S)-2-((S)-2-((1H-咪唑-5-基)甲基)-23-(1-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-4,20-二氧代-7,10,13,16-四氧杂-3,19-二氮杂二十三酰胺基)-N1-((S)-1-(((3S,6R,11R,14S,17S,20S,23S,29S,34aS)-6-(((S)-1-(((S)-1-(((2S,3R)-1-氨基-3-羟基-1-氧代丁烷-2-基)氨基)-3-羟基-1-氧代丙烷-2-基)氨基)-1-氧代-3-苯基丙-2-基)氨基甲酰基)-23,29-双(3-胍基丙基)-20-(4-羟基苄基)-17-(羟甲基)-14-异丁基-3-异丙基-1,4,12,15,18,21,24,27,30-九氧代三十氢-1H,10H-吡咯并[2,1-j][1,2]二硫[5,8,11,14,17,20,23,26,29]九氮杂环三十二烷-11-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)戊二酰胺(化合物23,2.5mg,18%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:701[M+5H]5+.1H NMR(400MHz,MeOD):δ8.55(s,1H),8.51(d,J=4.8Hz,2H),7.76(s,1H),7.57(s,1H),7.16-7.07(m,7H),6.89(d,J=4.9Hz,2H),6.74(d,J=8.5Hz,2H),5.75(d,J=48.2Hz,2H),5.26-5.05(m,3H),4.91(d,J=17.5Hz,2H),4.76(s,6H),4.58(s,2H),4.45-4.28(m,9H),4.16(s,1H),4.08(dd,J=10.2,4.6Hz,3H),3.92(d,J=3.0Hz,2H),3.69-3.53(m,58H),3.48-3.43(m,4H),3.38-3.33(m,7H),3.22(d,J=6.7Hz,2H),3.19-3.07(m,6H),3.05-2.94(m,6H),2.71(s,2H),2.46(dd,J=14.5,8.5Hz,6H),2.22(dt,J=13.3,7.0Hz,8H),2.05-1.87(m,14H),1.73(d,J=6.2Hz,4H),1.66-1.57(m,4H),1.35-1.28(m,4H),1.23(d,J=6.4Hz,3H),1.04-0.92(m,12H),0.87(t,J=5.9Hz,9H)。19F NMR(377MHz,MeOD):δ-72.26(s)。
化合物24,(2R,3R,4R,5R)-5-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2-(13-((2,4-二硝基苯基)氨基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇的制备
/>
步骤1:向2-(2-(2-(2-((2,4-二硝基苯基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基4-甲基苯磺酸酯(100mg,0.31mmol)在DMF(10.0mL)中的溶液中添加NaH(25.0mg,0.61mmol,60%wt.,在矿物油中)、2,2,2-三氟-N-((3aR,4R,7R,7aR)-4-(羟甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)乙酰胺(110mg,0.37mmol)。将混合物在室温下搅拌16小时。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过柱纯化,得到N-((3aR,4R,7R,7aR)-4-(13-((2,4-二硝基苯基)氨基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(80mg,0.13mmol),LC-MS(ESI)发现值:641[M+H]+。
步骤2:向N-((3aR,4R,7R,7aR)-4-(13-((2,4-二硝基苯基)氨基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(80mg,0.13mmol)的THF(10mL)溶液中加入HCl(2N水溶液)(5mL)。将混合物在室温下搅拌16小时。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过柱纯化,得到N-((3R,4R,5R,6R)-6-(13-((2,4-二硝基苯基)氨基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-4,5-二羟基四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(化合物25,60mg,0.10mmol)。LC-MS(ESI)发现值:601[M+H]+。
步骤3:N-((3R,4R,5R,6R)-6-(13-((2,4-二硝基苯基)氨基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-4,5-二羟基四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(60mg,0.10mmol)和NH3/MeOH(10mL,7N)的混合物在80℃下搅拌16小时。将混合物减压浓缩,残余物通过柱纯化,得到(2R,3R,4R,5R)-5-氨基-2-(13-((2,4-二硝基苯基)氨基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(40mg,0.079mmol)。LC-MS(ESI)发现值:505[M+H]+。
步骤4:向(2R,3R,4R,5R)-5-氨基-2-(13-((2,4-二硝基苯基)氨基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(40mg,0.079mmol)的DMF(5mL)中的溶液向添加DIEA(31mg,0.24mmol)和3,5-二氯-1,2,4-噻二唑(16mg,0.10mmol)。将混合物在室温下搅拌2小时。将混合物减压浓缩,残余物通过制备型HPLC纯化,得到(2R,3R,4R,5R)-5-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2-(13-((2,4-二硝基苯基)氨基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(化合物24,5.0mg,10%的收率)。LC-MS(ESI)发现值:623[M+H]+。1HNMR(400MHz,CD3OD):δ9.04(d,J=2.7Hz,1H),8.29(dd,J=9.6,2.7Hz,1H),7.23(d,J=9.6Hz,1H),4.11(d,J=2.7Hz,1H),3.93-3.86(m,2H),3.81(dd,J=6.6,3.7Hz,3H),3.72-3.53(m,18H)。
化合物27,(1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-1-(13-((2,4)-二硝基苯基)氨基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇的制备
步骤1:将NaH(49mg,在矿物油中60%wt.)添加到2,2,2-三氟-N-((3aR,4S,7S,8R,8aR)-4-(羟甲基)-2,2-二甲基六氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-8-基)乙酰胺(200mg,0.61mmol)的无水DMF(5mL)悬浮液中。将混合物在室温下搅拌1.5小时。然后将2-(2-(2-(2-((2,4-二硝基苯基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基4-甲基苯磺酸酯(267mg,0.52mmol)添加至上述溶液中。将混合物在室温下进一步搅拌16小时。向混合物中加入NH4Cl(水溶液)并除去溶剂。然后残余物通过快速纯化(DCM∶MeOH=15∶1)得到N-((3aR,4S,7S,8R,8aR)-4-(13-((2,4-二硝基苯基)氨基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基六氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-8-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(215mg,收率53%)。LC-MS(ESI)发现值:670[M+H]+。
步骤2:N-((3aR,4S,7S,8R,8aR)-4-(13-((2,4-二硝基苯基)氨基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基六氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-8-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(215mg,0.322mmol)的THF(2mL)溶液中添加HCl(1mL,2M的H2O溶液)。将反应在室温下搅拌18小时。除去溶剂并通过制备型HPLC(MEOH/水)纯化,得到N-((1S,2R,3R,4R,5S)-1-(13-((2,4-二硝基苯基)氨基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-4-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(120mg,59%收率)。LC-MS(ESI)发现值:629[M+H]+。1H NMR(400MHz,MeOD):δ9.04(d,J=2.7Hz,1H),8.29(dd,J=9.6,2.7Hz,1H),7.23(d,J=9.6Hz,1H),5.22(d,J=1.5Hz,1H),3.98(t,J=9.7Hz,2H),3.91-3.84(m,2H),3.83-3.77(m,3H),3.67(ddd,J=7.8,4.1,2.2Hz,8H),3.65-3.60(m,8H)。
步骤3:N-((1S,2R,3R,4R,5S)-1-(13-((2,4-二硝基苯基)氨基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-4-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(100mg,0.159mmol)的NH3/MeOH(5mL,7M)溶液,将反应物在70℃下搅拌18小时。将反应物真空浓缩,得到(1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-1-(13-((2,4-二硝基苯基)氨基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(74mg,收率87%)。LC-MS(ESI)发现值:533[M+H]+。
步骤4:向(1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-1-(13-((2,4-二硝基苯基)氨基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(74mg,0.139mmol)的i-PrOH(3mL)溶液中添加DIEA(0.14mL,0.834mmol)和二氯-1,2,4-噻二唑(108mg,0.695mmol),并将反应在80℃下搅拌18小时。将反应物真空浓缩。通过制备型HPLC纯化残余物,得到(1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-1-(13-((2,4-二硝基苯基)氨基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(化合物27,36mg,收率40%)。LC-MS(ESI)发现值:651[M+H]+。1H NMR(400MHz,MeOD):δ9.03(d,J=2.7Hz,1H),8.28(dd,J=9.6,2.7Hz,1H),7.23(d,J=9.6Hz,1H),5.35(d,J=0.9Hz,1H),3.97(d,J=9.6Hz,1H),3.91(d,J=4.1Hz,1H),3.88-3.78(m,4H),3.75(dd,J=9.6,4.3Hz,1H),3.71-3.65(m,9H),3.64-3.60(m,7H)。
化合物34,N-((1S,2R,3R,4R,5S)-1-(22-((2,4-二硝基苯基)氨基)-2,5,8,11,14,17,20-七氧杂二十二烷基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-4-基)-2,2,2-三氟乙酰胺和化合物26,(1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-1-(22-((2,4-二硝基苯基)氨基)-2,5,8,11,14,17,20-七氧杂二十二烷基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇的制备
按照与化合物27相同的程序,使用20-((2,4-二硝基苯基)氨基)-3,6,9,12,15,18-六氧杂二十烷基4-甲基苯磺酸酯作为起始材料制备化合物。
化合物34:LC-MS(ESI)发现值:761[M+H]+。1H NMR(400MHz,MeOD):δ9.11-8.81(m,1H),8.28(dd,J=9.6,2.7Hz,1H),7.23(d,J=9.6Hz,1H),5.23(d,J=1.3Hz,1H),3.99(t,J=9.2Hz,2H),3.92-3.86(m,2H),3.81(dd,J=6.4,4.3Hz,3H),3.70-3.64(m,10H),3.61(d,J=2.4Hz,18H)。
化合物26:LC-MS(ESI)发现值:783[M+H]+。1H NMR(400MHz,MeOD):δ9.03(d,J=2.7Hz,1H),8.29(dd,J=9.6,2.7Hz,1H),7.23(d,J=9.6Hz,1H),5.37(s,1H),3.99(d,J=9.6Hz,1H),3.92(d,J=4.1Hz,1H),3.81(dd,J=9.5,4.6Hz,3H),3.78-3.74(m,1H),3.71-3.64(m,10H),3.62(d,J=2.9Hz,19H)。
化合物28,3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-((2,4-二硝基苯基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5R)-5-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-3,4-二羟基四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)的制备
/>
步骤1:在0℃下向N-((3R,4R,5R,6R)-4,5-二羟基-6-(羟甲基)四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(2.8g,10.8mmol)的DMF(30mL)溶液中添加咪唑(1.46mL,21.6mmol)和叔丁基氯二苯基硅烷(4.45g,16.2mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。将所得混合物用DCM(100mL)稀释,用H2O(30mL x 2)和盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥。将有机层分离并真空浓缩。通过快速色谱法(硅胶,0-80%EA的PE溶液)纯化粗产物,得到N-((3R,4R,5R,6R)-6-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-4,5-二羟基四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(5.2g,96%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:520[M+Na]+。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ8.17(d,J=8.4Hz,1H),7.72-7.62(m,4H),7.49-7.36(m,6H),4.28(dd,J=8.3,4.0Hz,1H),4.23(d,J=1.3Hz,1H),4.16(d,J=1.4Hz,1H),4.06-3.91(m,3H),3.80(s,1H),3.51(dd,J=12.4,1.5Hz,1H),3.34-3.29(m,1H),3.01(d,J=7.6Hz,1H),1.06(s,9H)。19FNMR(377MHz,CDCl3):δ-76.16(s)。
步骤2:在室温下在N2下向N-((3R,4R,5R,6R)-6-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-4,5-二羟基四氢-2H-吡喃-3-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(5.4g,10.9mmol)的2,2-二甲氧基丙烷(20mL,161.3mmol)的溶液中添加PTSA(0.19g,1.1mmol)。将反应在室温下搅拌过夜。将所得混合物用DCM(150mL)稀释,用H2O(50mL x 2)和盐水(30mL)洗涤,经Na2SO4干燥。将有机层分离并真空浓缩。通过快速色谱法(硅胶,0-80%EA的PE溶液)纯化粗产物,得到N-((3aR,4R,7R,7aR)-4-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(4.6g,78%收率),为无色油。LC-MS(ESI)发现值:538[M+H]+。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ7.72-7.64(m,4H),7.46-7.35(m,6H),6.69(d,J=8.6Hz,1H),4.42-4.36(m,2H),4.35-4.28(m,1H),3.92-3.77(m,4H),3.54(dd,J=11.4,2.9Hz,1H),1.47(s,3H),1.36(s,3H),1.05(s,9H)。
步骤3:在室温下向N-((3aR,4R,7R,7aR)-4-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(4.6g,8.6mmol)的THF(50mL)溶液中添加TBAF(17mL,1M的THF溶液),搅拌3小时。将所得混合物用DCM(100mL)稀释,用H2O(30mL x 2)和盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥。将有机层分离并真空浓缩。通过快速色谱法(硅胶,0-10%MeOH的DCM溶液)纯化粗产物,得到2,2,2-三氟-N-((3aR,4R,7R,7aR)-4-(羟甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)乙酰胺(2.2g,85%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:300[M+H]+。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ9.05(s,1H),4.71(t,J=5.6Hz,1H),4.48(dd,J=7.6,3.6Hz,1H),4.30(ddd,J=12.8,8.3,3.5Hz,2H),3.81(t,J=9.7Hz,1H),3.64(ddd,J=16.0,8.4,3.7Hz,2H),3.44(td,J=6.2,4.5Hz,2H),1.41(s,3H),1.28(s,3H)。
步骤4:0℃下向2,2,2-三氟-N-((3aR,4R,7R,7aR)-4-(羟甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)乙酰胺(300mg,1mmol)的DMF(8mL)溶液中加入NaH(80mg,2mmol)并在N2下搅拌1小时。在0℃下加入2-(2-(2-(2-叠氮基乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基4-甲基苯磺酸酯(664mg,2mmol)并在N2下在室温下搅拌2小时。将所得混合物用DCM(80mL)和水(10mL)稀释。将水相用DCM(50mL x 2)萃取。分离有机层,经Na2SO4干燥并真空浓缩。通过快速色谱法(硅胶,0-10%MeOH的DCM溶液)纯化粗产物,得到N-((3aR,4R,7R,7aR)-4-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(250mg,54%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:501[M+H]+。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ9.09(d,J=6.9Hz,1H),4.48(dd,J=7.5,3.6Hz,1H),4.36-4.25(m,2H),3.88-3.76(m,2H),3.65(dd,J=10.1,5.8Hz,1H),3.62-3.58(m,2H),3.58-3.46(m,13H),3.44-3.36(m,3H),1.41(s,3H),1.28(s,3H)。
步骤5:N-((3aR,4R,7R,7aR)-4-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(900mg,1.8mmol)在氨甲醇溶液(6mL,7M MeOH溶液)中的溶液于70℃搅拌过夜。将所得混合物真空浓缩。通过快速色谱法(硅胶,0-10%MeOH的DCM溶液)纯化粗产物,得到(3aR,4R,7R,7aR)-4-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-胺(400mg,55%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:405[M+H]+。
步骤6:在室温下在N2下向(3aR,4R,7R,7aR)-4-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-胺(420mg,1.0mmol)和二氯-1,2,4-噻二唑(322mg,2.1mmol)在i-PrOH(6mL)中的溶液中添加DIPEA(0.5mL,3.1mmol)。将反应在80℃搅拌过夜。将所得混合物真空浓缩。通过快速色谱法(硅胶,0-10%MeOH的DCM溶液)纯化粗产物,得到N-((3aR,4R,7R,7aR)-4-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-3-氯-1,2,4-噻二唑-5-胺(480mg,88%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:524[M+H]+。1H NMR(400MHz,MeOD):δ5.49(s,1H),4.52(dd,J=6.8,4.7Hz,1H),4.36-4.19(m,2H),3.95(ddd,J=7.2,5.0,2.3Hz,1H),3.85(dd,J=10.9,6.4Hz,1H),3.75(dd,J=10.9,4.0Hz,1H),3.71-3.67(m,4H),3.66-3.63(m,12H),3.40-3.35(m,2H),1.43(s,3H),1.33(s,3H)。
步骤7:向N-((3aR,4R,7R,7aR)-4-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-3-氯-1,2,4-噻二唑-5-胺(480mg,0.92mmol)在THF(9mL)和H2O(3mL)中的溶液中添加PPh3(481mg,1.84mmol)。将混合物在80℃搅拌过夜。将所得混合物真空浓缩。通过快速色谱法(硅胶,0-10%MeOH的DCM溶液)纯化粗产物,得到N-((3aR,4R,7R,7aR)-4-(13-氨基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-3-氯-1,2,4-噻二唑-5-胺(330mg,72%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:497[M+H]+。
步骤8:13-((2-羧基乙氧基)甲基)-1-((2,4-二硝基苯基)氨基)-11-氧代-3,6,9,15-四氧杂-12-氮杂十八-18-烷酸(120mg,0.2mmol)和HATU(170mg,0.45mmol)在DMF(5mL)中的溶液在室温下搅拌30分钟。然后在室温下添加N-((3aR,4R,7R,7aR)-4-(13-氨基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-3-氯-1,2,4-噻二唑-5-胺(303mg,0.6mmol)和DIPEA(0.12mL,0.7mmol)。将反应搅拌过夜。将所得混合物用DCM(100mL)稀释,用H2O(50mL x 2)和盐水(20mL)洗涤,经Na2SO4干燥。将有机层分离并真空浓缩。通过快速色谱法(硅胶,0-10%MeOH的DCM溶液)纯化粗产物,得到3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-((2,4-二硝基苯基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((3aR,4R,7R,7aR)-7-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(250mg,79%收率),为黄色油状物。LC-MS(ESI)发现值:775[M+2H]2+.
步骤9:向3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-((2,4-二硝基苯基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((3aR,4R,7R,7aR)-7-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(250mg,0.16mmol)的THF(6mL)的溶液中添加HCl(3mL,2M的H2O溶液)。将反应在室温下搅拌3小时。通过快速色谱法(硅胶,0-10%MeOH的DCM溶液)纯化粗产物,得到3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-((2,4-二硝基苯基))氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5R)-5-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-3,4-二羟基四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(化合物28,105mg,44%收率),为黄色固体。LC-MS(ESI)发现值:735[M+2H]2+.1H NMR(400MHz,MeOD):δ9.04(d,J=2.7Hz,1H),8.30(dd,J=9.6,2.7Hz,1H),7.23(d,J=9.6Hz,1H),4.21-4.17(m,1H),4.06(d,J=1.9Hz,1H),4.03(d,J=1.8Hz,1H),3.99(s,2H),3.90(d,J=3.1Hz,2H),3.85-3.80(m,4H),3.75-3.46(m,56H),3.36(t,J=5.5Hz,4H),2.44(t,J=6.2Hz,4H)。
化合物29,(N-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)-3-((14-((2,4-二硝基苯基)氨基)-4-氧代-6,9,12-三氧杂-3-氮杂十四烷基)氧基)丙烯酰胺)的制备
步骤1:N-((3aR,4S,7S,8R,8aR)-4-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基六氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-8-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(100mg,0.19mmol)的NH3甲醇溶液(5mL,7M)在70℃下搅拌过夜。将混合物浓缩,得到粗品(3aR,4S,7S,8R,8aR)-4-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基六氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-8-胺(70mg,收率86%),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:341[M+H]+。
步骤2:(3aR,4S,7S,8R,8aR)-4-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基六氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-8-胺(70mg,0.16mmol)、3,5-二氯-1,2,4-噻二唑(35mg,0.22mmol)和DIPEA(48mg,0.37mmol)在i-PrOH(2mL)中的溶液在80℃下搅拌过夜,然后蒸发。通过制备型TLC纯化残余物,得到N-((3aR,4S,7S,8R,8aR)-4-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基六氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-8-基)-3-氯-1,2,4-噻二唑-5-胺(90mg,收率88%),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:551[M+H]+。
步骤3:向N-((3aR,4S,7S,8R,8aR)-4-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基六氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-8-基)-3-氯-1,2,4-噻二唑-5-胺(90mg,0.16mmol)在THF(3mL)和H2O(1mL)中的溶液中添加PPh3(86mg,0.33mmol)。将混合物在70℃下搅拌过夜,然后蒸发。通过制备型TLC纯化残余物,得到N-((3aR,4S,7S,8R,8aR)-4-(13-氨基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基六氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-8-基)-3-氯-1,2,4-噻二唑-5-胺(70mg,收率82%),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:525[M+H]+。
步骤4:1-((2,4-二硝基苯基)氨基)-11-氧代-3,6,9,15-四氧杂-12-氮杂十八-18-烷酸(72mg,0.15mmol)在DMF(2mL)中的溶液用HATU(158mg,0.42mmol)和DIPEA(52mg,0.40mmol)处理。将混合物冷却至0℃并保持30分钟。添加N-((3aR,4S,7S,8R,8aR)-4-(13-氨基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基六氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-8-基)-3-氯-1,2,4-噻二唑-5-胺(70mg,0.13mmol),并将混合物在室温下搅拌过夜。将混合物通过制备型TLC纯化,然后通过C18纯化,得到N-(1-((3aR,4S,7S,8R,8aR)-8-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,2-二甲基四氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-4(5H)-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)-3-((14-((2,4-二硝基苯基)氨基)-4-氧代-6,9,12-三氧杂-3-氮杂十四烷基)氧基)丙酰胺(70mg,53%收率),为黄色油状物。LC-MS(ESI)发现值:995[M+H]+。
步骤5:在室温下向N-(1-((3aR,4S,7S,8R,8aR)-8-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,2-二甲基四氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-4(5H)-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)-3-((14-((2,4-二硝基苯基)氨基)-4-氧代-6,9,12-三氧杂-3-氮杂十四烷基)氧基)丙酰胺(70mg,0.07mmol)在THF中(3mL)中的溶液中添加HCl(0.3mL,2M的H2O溶液)。将混合物在室温下搅拌过夜,将混合物通过制备型HPLC(方法A)纯化,得到N-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)-3-((14-((2,4-二硝基苯基)氨基)-4-氧代-6,9,12-三氧杂-3-氮杂十四烷基)氧基)丙酰胺(化合物29,43mg,65%收率),为黄色固体。LC-MS(ESI)发现值:955[M+H]+。1H NMR(400MHz,MeOD):δ9.03(d,J=2.7Hz,1H),8.29(dd,J=9.6,2.7Hz,1H),7.23(d,J=9.6Hz,1H),5.37(d,J=1.0Hz,1H),3.98(d,J=9.7Hz,3H),3.92(d,J=4.1Hz,1H),3.81(dd,J=6.6,4.7Hz,3H),3.76(dd,J=9.6,4.2Hz,1H),3.72-3.66(m,16H),3.65-3.61(m,11H),3.53(dt,J=10.9,5.5Hz,4H),3.38(dt,J=8.4,5.5Hz,4H),2.44(t,J=6.2Hz,2H)。
化合物30,(3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-((2,4-二硝基苯基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺))的制备
步骤1:向3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-((2,4-二硝基苯基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(20mg,0.016mmol)的异丙醇(3mL)溶液中添加DIEA(0.003mL,0.016mmol)和3,5-二氯-1,2,4-噻二唑(19mg,0.124mmol)。将反应在80℃下搅拌18小时。将反应物真空浓缩。通过制备型TLC和制备型HPLC(方法A)纯化残余物,得到3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-((2,4-二硝基苯基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-((3-氯-1,2,4-噻二唑-5-基)氨基)-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)丙酰胺)(化合物30,2.7mg,11%收率)。LC-MS(ESI)发现值:1525[M+H]+。1H NMR(400MHz,MeOD):δ9.04(d,J=2.7Hz,1H),8.29(dd,J=9.6,2.7Hz,1H),7.23(d,J=9.6Hz,1H),5.38(s,2H),4.19(t,J=5.5Hz,1H),3.99(t,J=4.8Hz,4H),3.92(d,J=4.1Hz,2H),3.82(dd,J=9.2,3.1Hz,6H),3.76(dd,J=9.6,4.2Hz,2H),3.68(ddd,J=6.4,4.1,1.5Hz,22H),3.64-3.60(m,20H),3.52(ddd,J=15.2,10.4,4.9Hz,8H),3.37(t,J=5.5Hz,4H),2.44(t,J=6.2Hz,4H)。
化合物31,(3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-((2,4-二硝基苯基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-2,3-二羟基-4-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛-1-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺))的制备
步骤1:向13-((2-羧基乙氧基)甲基)-1-((2,4-二硝基苯基)氨基)-11-氧代-3,6,9,15-四氧杂-12-氮杂十八-18-烷酸(914mg,1.548mmol)的DMF(10mL)溶液中添加HATU(1.5g,3.869mmol)和DIPEA(1.0g,7.739mmol)。将反应混合物在冰水中搅拌0.5小时。添加N-((3aR,4S,7S,8R,8aR)-4-(13-氨基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基六氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊二烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-8-基)-2,2,2-三氟乙酰胺(1.7g,3.405mmol),将反应混合物在室温下搅拌16小时。添加EA,用水洗涤混合物。分离有机相,浓缩并通过快速纯化(DCM∶MeOH=20∶1),得到3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-((2,4-二硝基苯基))氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((3aR,4S,7S,8R,8aR)-2,2-二甲基-8-(2,2,2-三氟乙酰胺基)四氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-4(5H)-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(600mg,25%收率)。LC-MS(ESI)发现值:1560[M+H]+。
步骤2:3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-((2,4-二硝基苯基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((3aR,4S,7S,8R,8aR)-2,2-二甲基-8-(2,2,2-三氟乙酰胺基)四氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-4(5H)-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(50mg,0.032mmol)溶解在HCl(0.5ml,2M的H2O中)和THF(1mL)的混合物中。将混合物在室温下搅拌14小时。蒸发溶剂,并将残余物与甲苯共蒸发两次。通过制备型HPLC(方法A)纯化粗物质以得到3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-((2,4-二硝基苯基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-2,3-二羟基-4-(2,2,2-三氟乙酰胺基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛-1-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(30mg,63%收率)。LC-MS(ESI)发现值:1480[M+H]+。
步骤3:3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-((2,4-二硝基苯基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-2,3-二羟基-4-(2,2,2-三氟乙酰胺基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(30mg,0.020mmol)溶解在NH3溶液(3mL,7M在MeOH中)中,并将反应物在70℃下搅拌18小时。将反应物真空浓缩,得到粗3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-((2,4-二硝基苯基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(26mg,99%收率)。LC-MS(ESI)发现值:1288[M+H]+。
步骤4:向3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-((2,4-二硝基苯基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-2,3-二羟基-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(20mg,0.016mmol)的异丙醇(3mL)溶液中添加DIEA(0.021mL,0.124mmol)和2-氯-4-(三氟甲基)嘧啶(23mg,0.124mmol)。将反应在80℃下搅拌18小时。将反应物真空浓缩。通过制备型TLC和制备型HPLC(方法A)纯化残余物,得到3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-((2,4-二硝基苯基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-2,3-二羟基-4-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(化合物31,3.1mg,13%收率)。LC-MS(ESI)发现值:1580[M+H]+。1H NMR(400MHz,MeOD):δ9.03(d,J=2.7Hz,1H),8.52(d,J=4.9Hz,2H),8.28(dd,J=9.6,2.7Hz,1H),7.22(d,J=9.6Hz,1H),6.91(d,J=4.9Hz,2H),5.36(d,J=1.3Hz,2H),4.23-4.14(m,3H),4.03-3.96(m,4H),3.94(d,J=4.3Hz,2H),3.90-3.79(m,6H),3.72-3.65(m,22H),3.64-3.58(m,20H),3.52(ddd,J=15.2,10.3,4.8Hz,8H),3.36(t,J=5.5Hz,4H),2.44(t,J=6.2Hz,4H)。
化合物32,(3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-((2,4-二硝基苯基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙烯酰胺))的制备
步骤1:向N-[(3S,4R,5R,6R)-4,5-二羟基-6-(羟甲基)氧杂-3-基]乙酰胺(10g,48.7mmol)在DMF(100mL)中的溶液中加入咪唑(6.6g,97.5mmol)和TBDPS氯化物(19g,73.1mmol),并将反应在室温下搅拌过夜。将混合物用乙酸乙酯(300mL)稀释并用水(100mLx 3)洗涤。将有机层经硫酸钠干燥并减压浓缩,得到粗产物,将其通过快速色谱法纯化(硅胶,0-10%DCM的MeOH溶液),得到N-((3S,4R,5R,6R)-6-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-4,5-二羟基四氢-2H-吡喃-3-基)乙酰胺(15g,69%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:444[M+H]+。
步骤2:向N-((3S,4R,5R,6R)-6-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-4,5-二羟基四氢-2H-吡喃-3-基)乙酰胺(15g,33.8mmol)的2,2-二甲氧基丙烷(100mL)溶液中添加TsOH(0.58g,3.38mmol),并将反应物在室温下搅拌过夜。将混合物减压浓缩,得到粗产物N-((3aR,4R,7S,7aR)-4-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)乙酰胺(15g,93%收率),为黄色油状物。LC-MS(ESI)发现值:484[M+H]+。
步骤3:向N-((3aR,4R,7S,7aR)-4-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)乙酰胺(15g,31mmol)的THF(100mL)溶液中添加TBAF溶液(20mL,2M THF溶液),并将反应物在室温下搅拌过夜。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过快速色谱法纯化(硅胶,0-10%DCM的MeOH溶液),得到N-((3aR,4R,7S,7aR)-4-(羟甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)乙酰胺(7g,92%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:246[M+H]+。
步骤4:在0℃下向N-((3aR,4R,7S,7aR)-4-(羟甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)乙酰胺(3.5g,14.3mmol)的DMF(100mL)溶液中添加NaH(0.68g,60%wt.,在矿物油中),然后将混合物在室温下搅拌过夜。起始材料消耗后(LCMS监测),将反应容器再次冷却至0℃,缓慢添加水(10mL)并将反应混合物搅拌15分钟。将混合物用乙酸乙酯(200mL)稀释并用水(200mL x 3)洗涤。将有机层经硫酸钠干燥,减压浓缩,得到粗产物,将其通过快速色谱法纯化,得到N-((3aR,4R,7S,7aR)-4-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)乙酰胺(3.5g,收率58%),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:447[M+H]+。
步骤5:在0℃下向N-((3aR,4R,7S,7aR)-4-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)乙酰胺(4g,14.5mmol)的THF(200mL)溶液中添加TEA(2.1mL,14.8mmol)、DMAP(0.12g,0.98mmol)和二碳酸二叔丁酯(3.2mL,14.8mmol),然后将混合物在室温下搅拌过夜。起始材料消耗后(LCMS监测),将反应容器再次冷却至0℃,缓慢添加水(20mL)并将反应混合物搅拌15分钟。将混合物用乙酸乙酯(200mL)稀释并用水(200mL x 3)洗涤。将有机层经硫酸钠干燥并减压浓缩,得到粗产物,将其通过快速色谱纯化,得到叔丁基乙酰基((3aR,4R,7S,7aR)-4-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)氨基甲酸酯(4.0g,82%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:547[M+H]+。
步骤6:在室温下向叔丁基乙酰基((3aR,4R,7S,7aR)-4-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]向二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)氨基甲酸酯(4g,8.9mmol)的THF(200mL)溶液中添加NaOH(40%重量,在H2O中,12mL),然后将混合物在室温下搅拌过夜。起始材料消耗后(LCMS监测),缓慢添加水(20mL)。将混合物用乙酸乙酯(200mL)稀释并用水(200mL x 3)洗涤。将有机层经硫酸钠干燥,过滤,减压浓缩,得到粗产物,将其通过快速色谱法纯化,得到((3aR,4R,7S,7aR)-4-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)氨基甲酸叔丁酯(3.2g,收率89%),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:505[M+H]+。
步骤7:在室温下向((3aR,4R,7S,7aR)-4-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)氨基甲酸叔丁酯(3.2g,6.9mmol)在DCM(100mL)中的溶液中添加TFA(10mL),然后将混合物在60℃下搅拌过夜。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过快速色谱纯化,得到(2R,3R,4R,5S)-5-氨基-2-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(1.5g,65%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:365[M+H]+。
步骤8:在室温下在N2气氛下向(2R,3R,4R,5S)-5-氨基-2-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(200mg,0.55mmol)和DIPEA(209mg,1.65mmol)在干i-PrOH(2mL)中的溶液中添加2-氯-4-(三氟甲基)嘧啶(199mg,1.1mmol)。添加完成后,将反应物在80℃下搅拌过夜。起始材料消耗后(TLC监测),将反应容器再次冷却至室温。将混合物减压浓缩。粗产物通过快速色谱法纯化(硅胶,0-10%MeOH的DCM溶液),得到(2R,3R,4R,5S)-2-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(150mg,54%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:365[M+H]+。
步骤9:向(2R,3R,4R,5S)-2-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(14mg,0.027mmol)的MeOH(2mL)溶液中添加Pd/C(4mg,10%wt,60%湿)。将混合物在H2气球下在室温下搅拌0.5小时。将混合物过滤并浓缩,得到粗品(2R,3R,4R,5S)-2-(13-氨基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(13mg,97%收率),为黄色油状物。LC-MS(ESI)发现值:459[M+H]+。
步骤10:在0℃下向(2R,3R,4R,5S)-2-(13-氨基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(13.1mg,0.027mmol)和6-((2-羧基乙氧基)甲基)-19-(2,4-二硝基苯基)-8-氧代-4,10,13,16-四氧杂-7-氮杂十九烷酸(7.0mg,0.012mmol)的DMF(1mL)溶液中添加HATU(6.7mg,0.018mmol)和DIPEA(4.6mg,0.036mmol)。将混合物在室温下搅拌12小时。将混合物浓缩并通过HPLC(方法A)纯化,得到3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-((2,4-二硝基苯基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶)-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(化合物32,6.1mg,收率34%),为黄色油状物。LC-MS(ESI)发现值:1523[M+H]+。1H NMR(400MHz,MeOD):δ9.03(d,J=2.7Hz,1H),8.50(d,J=4.7Hz,2H),8.29(dd,J=9.6,2.7Hz,1H),7.23(d,J=9.6Hz,1H),6.89(d,J=4.9Hz,2H),4.35(d,J=5.0Hz,2H),4.23-4.13(m,1H),4.08(dd,J=10.9,5.2Hz,2H),3.99(s,2H),3.91(d,J=3.0Hz,2H),3.81(t,J=5.2Hz,2H),3.74-3.48(m,54H),3.36(t,J=5.5Hz,4H),3.16(t,J=10.9Hz,2H),2.44(t,J=6.2Hz,4H)。
化合物33,(3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-((2,4-二硝基苯基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5R)-5-乙酰胺基-3,4-二羟基四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺))的制备
步骤1:0℃下向N-((3aR,4R,7R,7aR)-4-(羟甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)乙酰胺(120mg,0.49mmol)的DMF(3mL)溶液中加入NaH(23.5mg,0.98mmol)并且在N2下搅拌1小时。然后在0℃下加入2-(2-(2-(2-叠氮基乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基4-甲基苯磺酸酯(274.04mg,0.73mmol)并在N2下在室温下搅拌2小时。将所得混合物用DCM(30mL)和水(10mL)稀释。将水相用DCM(10mL x 2)萃取。分离有机层,经Na2SO4干燥并真空浓缩。通过快速色谱法(硅胶,0-10%MeOH的DCM溶液)纯化粗产物,得到N-((3aR,4R,7R,7aR)-4-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)乙酰胺(90mg,45%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:447[M+H]+。
步骤2:在室温下在H2气球下向N-((3aR,4R,7R,7aR)-4-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)乙酰胺(90mg,0.2mmol)的MeOH(5mL)溶液中添加Pd/C(10mg,10%重量,60%湿)。将反应物在室温下搅拌1.5小时。将所得混合物过滤并真空浓缩。粗产物N-((3aR,4R,7R,7aR)-4-(13-氨基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)乙酰胺(60mg,71%收率)用于下一步,无需进一步纯化。LC-MS(ESI)发现值:421[M+H]+。
步骤3:13-((2-羧基乙氧基)甲基)-1-((2,4-二硝基苯基)氨基)-11-氧代-3,6,9,15-四氧杂-12-氮杂十八-18-烷酸(10mg,0.02mmol)和HATU(16.2mg,0.043mmol)在DMF(2mL)中的溶液在室温下搅拌30分钟,然后在室温下添加N-((3aR,4R,7R,7aR)-4-(13-氨基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基四氢-3aH-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)乙酰胺(21.4mg,0.05mmol)和N,N-二异丙基乙胺(0.01mL,0.07mmol)。将反应搅拌过夜。通过制备型HPLC(方法A)纯化残余物,得到3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-((2,4-二硝基苯基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((3aR,4R,7R,7aR)-7-乙酰胺基-2,2-二甲基四氢-3aH-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(15mg,64%收率),为黄色油状物。LC-MS(ESI)发现值:1396[M+H]+。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ9.12(d,J=2.7Hz,1H),8.81(s,1H),8.27(dd,J=9.4,2.6Hz,1H),7.12(d,J=8.8Hz,1H),7.07(t,J=5.3Hz,2H),6.98(d,J=9.5Hz,1H),5.94(dd,J=8.2,4.4Hz,2H),4.38(dd,J=7.8,3.0Hz,4H),4.25(dd,J=7.1,2.0Hz,2H),3.99(s,2H),3.87(d,J=2.0Hz,2H),3.82(d,J=5.4Hz,2H),3.70(dd,J=8.1,4.5Hz,15H),3.65-3.61(m,30H),3.54(dd,J=6.8,3.8Hz,6H),3.46-3.40(m,6H),2.43(dd,J=12.7,6.7Hz,4H),2.00(s,6H),1.49(s,6H),1.33(s,6H)。
步骤4:向3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-((2,4-二硝基苯基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((3aR,4R,7R,7aR)-7-乙酰胺基-2,2-二甲基四氢-3aH-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-2,5,8,11-四氧杂十三碳-13-基)丙酰胺)(15mg,0.01mmol)的THF(3mL)溶液中添加HCl(0.1mL,1M,在H2O中)。将反应物在室温下搅拌3小时。通过制备型HPLC(方法A)纯化粗产物,得到3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-((2,4-二硝基苯基)氨基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5R)-5-乙酰胺基-3,4-二羟基四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(化合物33,2.9mg,21%收率),为黄色油状物。LC-MS(ESI)发现值:1316[M+H]+。1H NMR(400MHz,MeOD):δ9.05(d,J=2.7Hz,1H),8.31(dd,J=9.6,2.7Hz,1H),7.24(d,J=9.6Hz,1H),4.19(t,J=5.6Hz,1H),4.07(d,J=3.5Hz,2H),3.99(s,2H),3.89-3.85(m,4H),3.82(t,J=5.2Hz,2H),3.76-3.74(m,2H),3.71-3.66(m,16H),3.65-3.61(m,26H),3.56-3.50(m,12H),3.37(t,J=5.5Hz,4H),2.44(t,J=6.2Hz,4H),2.00(s,6H)。
化合物36:3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-(4-(3-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基))-4-(1H-吡咯并[3,2-c]吡啶-3-基)苄基)哌嗪-1-基)-2-氧代乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)的制备
步骤1:向1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-20-(1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-烷酸(20mg,13.77μmol,1当量)、8-[4-[2-[5-(哌嗪-1-基甲基)-2-(1H-吡咯并[3,2-c]吡啶-3-基)苯氧基]乙基]苯基]异喹啉(8.17mg,15.15μmol,1.1当量)和DIEA(3.56mg,27.54μmol,4.80μL,2当量)的DCM(1mL)混合物中添加T3P(13.14mg,41.31μmol,12.28μL,3当量),将混合物在20℃搅拌10.5小时。进行后处理并将合并的有机层减压浓缩,得到残余物3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-(4-(3-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基)-4-(1H-吡咯并[3,2-c]吡啶-3-基)苄基)哌嗪-1-基)-2-氧代乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(25mg,粗品),为黄色油状物。
步骤2:3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-(4-(3-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基)-4-(1H-吡咯并[3,2-c]吡啶-3-基)苄基)哌嗪-1-基)-2-氧代乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)丙酰胺)(23mg,11.65μmol,1当量)的HCl(2mL)混合物在20℃下搅拌3小时。将反应混合物减压浓缩,得到残余物。通过制备型HPLC(FA条件(柱:Phenomenex Luna C18 150*30mm*5μm;流动相:[水(0.2%FA)-ACN];B%:20%-60%,8min))纯化残余物,得到3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-(4-(3-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基))-4-(1H-吡咯并[3,2-c]吡啶-3-基)苄基)哌嗪-1-基)-2-氧代乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(化合物36,1.5mg,7.92e-1μmol,6.80%收率),为白色固体。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ=8.89(br s,1H),8.38(br s,3H),8.03-7.60(m,6H),7.43(br s,3H),7.29-6.91(m,6H),6.77(br d,J=4.5Hz,2H),4.26(br s,3H),4.20-4.14(m,2H),4.14-4.03(m,2H),3.95(br s,3H),3.88(br s,2H),3.81(br s,3H),3.58(br d,J=5.6Hz,21H),3.52(br s,27H),3.41(br d,J=5.0Hz,10H),3.25(br s,7H),3.10-2.98(m,3H),2.33(br s,5H)。
化合物37:3-((4-(异喹啉-8-基)-3-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基)苄基)氧基)丙酸和3,3′-((2-(3-((4-(异喹啉-8-基)-3-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基)苄基)氧基)丙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)的制备
步骤1:向(4-(异喹啉-8-基)-3-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基)苯基)甲醇(200mg,414.45μmol,1当量)和叔丁基丙-2-烯酸酯(159.36mg,1.24mmol,180.47μL,3当量)的t-BuOH(5mL)溶液中添加Cs2CO3(270.07mg,828.89μmol,2当量)。将混合物在55℃搅拌5小时。将反应混合物用H2O10mL稀释并用乙酸乙酯10mL*3萃取。将合并的有机层用Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。将残余物通过制备型TLC(SiO2,石油醚∶乙酸乙酯=1∶1)纯化。得到3-((4-(异喹啉-8-基)-3-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基)苄基)氧基)丙酸叔丁酯(130mg,212.86μmol,51.36%收率),为白色固体。
步骤2:向3-((4-(异喹啉-8-基)-3-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基)苄基)氧基)丙酸叔丁酯(130mg,212.86μmol,1当量)的DCM(2mL)溶液中添加TFA(1.05g,9.24mmol,684.21μL,43.42当量)。将混合物在15℃搅拌1小时。LCMS:将反应混合物减压浓缩,得到残余物。将粗产物通过反相HPLC纯化(柱:Waters Xbridge BEH C18 100*30mm*10μm;流动相:[水(0.05%NH3H2O+10mM NH4HCO3)-ACN];B%:15%-65%,8min@100mL/min)。获得3-((4-(异喹啉-8-基)-3-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基)苄基)氧基)丙酸(3.52mg,6.28μmol,2.95%收率,98.9%纯度),为白色固体。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ=9.03(s,1H),8.85(s,1H),8.46(br d,J=5.6Hz,1H),8.35(d,J=5.6Hz,1H),7.96-7.79(m,6H),7.52(br d,J=7.0Hz,1H),7.48(br d,J=7.0Hz,1H),7.28(d,J=7.6Hz,1H),7.23(s,1H),7.13-7.05(m,3H),6.79(d,J=7.8Hz,2H),4.65(s,2H),4.34-4.28(m,1H),4.21(br dd,J=5.3,7.8Hz,1H),3.85(t,J=6.9Hz,2H),2.87-2.73(m,2H),2.55(t,J=6.9Hz,2H),1.32(br d,J=6.6Hz,1H)。
步骤3:向3-((4-(异喹啉-8-基)-3-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基)苄基)氧基)丙酸(6mg,10.82μmol,1当量)的DCM(1mL)溶液中添加DIEA(4.19mg,32.45μmol,5.65μL,3当量)和HATU(6.17mg,16.23μmol,1.5当量)。然后添加3-[2-氨基-3-[3-[2-[2-[2-[2-[[(2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-[[4-(三氟甲基)嘧啶-2-基]氨基]四氢吡喃-2-基]甲氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙基氨基]-3-氧代丙氧基]丙氧基]-N-[2-[2-[2-[2-[[(2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-[[4-(三氟甲基)嘧啶-2-基]氨基]四氢吡喃-2-基]甲氧基]乙氧基]乙氧基]乙氧基]乙基]丙酰胺(16.43mg,14.06μmol,1.3当量),将混合物在15℃搅拌2小时。将反应混合物减压浓缩,得到残余物。将粗产物通过反相HPLC纯化(柱:Phenomenex Luna 80*30mm*3um;流动相:[水(0.1%TFA)-乙腈];B%:15%-50%,8min@100mL/min)。获得3,3′-((2-(3-((4-(异喹啉-8-基))-3-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基)苄基)氧基)丙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(化合物37,3.13mg,1.67μmol,15.47%收率,91.12%纯度),为白色固体。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ=9.31-9.21(m,1H),9.18-9.06(m,1H),8.65-8.43(m,4H),8.40-8.31(m,2H),8.27-8.09(m,3H),7.89-7.70(m,1H),7.46-7.32(m,1H),7.31-7.09(m,3H),6.97-6.77(m,3H),4.72-4.60(m,4H),4.46-3.97(m,13H),3.95-3.81(m,7H),3.74-3.54(m,45H),3.20-2.78(m,8H),2.66-2.33(m,7H)。
化合物38:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
/>
/>
步骤1:2,3,5,6-四氟苯酚(45.74mg,275.40μmol,4.00当量)、1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-20-(1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-烷酸(100mg,68.85μmol,1当量)在DMF(2.0mL)中的混合物冷却至0℃。然后在0℃下向混合物中加入EDCI(39.60mg,206.55μmol,3.00当量)并在0℃下搅拌2小时。通过制备型HPLC(酸性条件,TFA)纯化反应混合物,得到TFP酯2,3,5,6-四氟苯基1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-20-(1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-烷酸酯(50mg,31.24umol,45.37%收率),为无色油状物。化学式:C67H95F10N9O24,LCMS发现值:[M+H]1+=1600.70,[M+2H]2+=801.00,[M+3H]3+=534.40.
步骤2:向3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-2-氨基-47-(2-(叔丁氧基)-2-氧代乙基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(53.7mg,31.24μmol,1.00当量)、2,3,5,6-四氟苯基1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-20-(1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-烷酸酯(50.0mg,31.24μmol,1.00当量)、DIEA(16.1mg,124.96μmol,21.77μL,4.00当量)在DMF(0.5mL)中的混合物在25℃下搅拌1小时。通过制备型HPLC(酸性条件,TFA)纯化反应混合物,得到3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-20-(1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二烷-32-酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(70.0mg,19.74μmol,收率63.1%,纯度90.0%),为白色固体。化学式:C140H201F6N29O43S2,LCMS发现值:[M+2H]2+=1578.60,[M+3H]3+=1052.90,[M+4H]4+=727.00.
步骤3:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基))甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-20-(1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二烷-32-酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(70.0mg,22.18μmol,1.00当量)在HCl(0.1M,0.7mL,3.16当量)和MeCN(0.7mL)中的混合物在25℃搅拌0.5小时。通过制备型HPLC(酸性条件,TFA)直接纯化混合物,得到白色固体状的化合物38(57.0mg,99.3%纯度,82.96%收率)。化学式:C134H193F6N29O43S2,LCMS发现值:[M+2H]2+=1538.7,[M+H+Na]2+=1549.7,[M+3H]3+=1026.3,[M+4H]4+=769.6.
化合物39:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,23-二氧代-2,5,8,11,18,24-六氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
化合物39按照制备化合物38中所述的程序制备,其中用于制备化合物39的起始材料是1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,23-二氧代-2,5,8,11,18,24-六氧杂-14,21-二氮杂二十七-27-烷酸。产率:2.7mg,纯度83.0%,9.0%,白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+2H]2+=1502.10,[M+H+Na]2+=1513.60,[M+3H]3+=1002.00.
化合物40:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二烷-32-酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
化合物40根据制备化合物38中所述的程序制备,其中用于制备化合物40的起始材料是1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-烷酸。产率:4.1mg,纯度95.8%,16.6%白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+2Na]2+=1562.10,[M+H+Na]2+=1550.50,[M+2H]2+=1539.00,[M+3H]3+=1026.70.
化合物41:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27-七氧杂-14,21-二氮杂二十九烷-29-酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
化合物41根据制备化合物38中所述的程序制备,其中用于制备化合物41的起始材料是1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27-七氧杂-14,21-二氮杂二十九-29-烷酸。产率:14.2mg,纯度98.2%,13.5%白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+H+Na]2+=1527.4,[M+2H]2+=1516.3,[M+3H]3+=1011.3.
化合物42:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(2-(2-(2-((((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)氨基)-2-氧代乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)-11-((R)-1-羟基乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
化合物42根据制备化合物38中所述的程序制备,其中用于制备化合物42的起始材料是2-(2-(2-((((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)氨基)-2-氧代乙氧基)乙氧基)乙酸。产率:17.9mg,纯度99.1%,33.5%白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+2H]2+=1086.6,[M+3H]3+=725.1.
化合物43:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24-六氧杂-14,21-二氮杂二十六烷-26-酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
化合物43按照制备化合物38中所述的程序制备,其中用于制备化合物43的起始材料是1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24-六氧杂-14,21-二氮杂二十六-26-烷酸。产率:19.7mg,纯度96.9%,30.5%白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+2H]2+=1086.6,[M+3H]3+=725.1。
化合物44:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(2-(4-((4-(((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)哌嗪-1-基)甲基)苯氧基)乙酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
化合物44根据制备化合物38中所述的程序制备,其中用于制备化合物44的起始材料是2-(4-((4-(((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)哌嗪-1-基)甲基)苯氧基)乙酸。产率:7.7mg,纯度96.6%,22.8%白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+H+Na]2+=1134.7,[M+2H]2+=1123.1,[M+3H]3+=749.1。
化合物48:(3S,6R,11R,14S,17S,20S,23S,29S,34aS)-11-((S)-2-((S)-2-((S)-2-氨基-3-(1H-咪唑-5-基)丙酰胺基)-4-(甲硫基)丁酰胺基)-3-甲基丁酰胺基)-N-((S)-1-(((S)-1-(((S)-1-氨基-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基)氨基)-3-羟基-1-氧代丙烷-2-基)氨基)-1-氧代-3-苯基丙-2-基)-23,29-双(3-胍基丙基)-20-(4-羟基苄基)-17-(羟甲基)-14-异丁基-3-异丙基-1,4,12,15,18,21,24,27,30-九氧代三十二氢吡咯并[2,1-j][1,2,5,8,11,14,17,20,23,26,29]二硫杂九氮杂环三十二-6-甲酰胺的制备
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步骤1:固相肽合成:使用标准Fmoc化学合成肽。
1)树脂制备:向含有AM树脂(3.33g,1.00mmol,0.30mmol/g)的DMF(30mL)溶液的容器中用N2在25℃下鼓泡混合30分钟。将树脂用DMF(30mL)5次洗涤。然后添加20%哌啶的DMF(30mL)溶液,并将混合物在25℃下用N2鼓泡30分钟。过滤混合物以获得树脂。将树脂用DMF(30mL)5次洗涤,然后进行下一步。
2)偶联:在N2鼓泡下将Fmoc-Leu-OH(1.06g,3.00mmol,3.00当量)、HBTU(1.08g,2.85mmol,2.85当量)的DMF(15mL)溶液加入树脂。然后将DIEA(1.05mL,6.00mmol,6.00当量)滴加至混合物中并在25℃下用N2鼓泡30分钟。通过茚三酮试验监测偶联反应,若显示无色则偶联完成。然后用DMF(30mL)5次洗涤树脂。
3)去保护:将20%哌啶的DMF(30mL)溶液添加到树脂中,并将混合物在25℃下用N2鼓泡30分钟。然后用DMF(30mL)5次洗涤树脂。通过茚三酮试验监测去保护反应,若显蓝色或其他棕红色,则反应完成。
4)对所有其他氨基酸重复步骤2和3:(表Z中的2-16)。
表Z.
步骤2:肽切割和纯化:
7)在室温下(25℃)将切割缓冲液(92.5%TFA/2.5%TIS/2.5%H2O/2.5%3-巯基丙酸)添加到含有侧链保护肽的烧瓶中并搅拌2小时。
8)用冷异丙醚沉淀肽并离心(3000rpm 3分钟)。
9)用异丙醚另外洗涤两次。
10)将粗肽真空干燥2小时。
11)向粗肽在MeCN(500mL)和H2O(500mL)中的混合物中滴加I2(0.1M,在AcOH中),剧烈搅拌肽溶液直至黄色持续存在。2分钟后,滴加硫代硫酸钠(0.1M水溶液)直至黄色消失。将混合物冻干,得到粗粉末。
12)通过制备型HPLC纯化粗肽(A:H2O中的0.075%TFA,B:ACN),得到(3S,6R,11R,14S,17S,20S,23S,29S,34aS)-11-((S)-2-((S)-2-((S)-2-氨基-3)-(1H-咪唑-5-基)丙酰胺基)-4-(甲硫基)丁酰胺基)-3-甲基丁酰胺基)-N-((S)-1-(((S)-1-(((S)-1)-氨基-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基)氨基)-3-羟基-1-氧代丙烷-2-基)氨基)-1-氧代-3-苯基丙-2-基)-23,29-双(3-胍基丙基)-20-(4-羟基苄基)-17-(羟甲基)-14-异丁基-3-异丙基-1,4,12,15,18,21,24,27,30-九氧代三十氢-1H,10H-吡咯并[2,1-j][1,2]二硫[5,8,11,14,17,20,23,26,29]九氮杂环三十二-6-甲酰胺(1.40g,91.4%纯度,68.60%收率),为白色固体。化学式:C82H129N25O19S3;LCMS发现值:[M+2H]2+=933.17;[M+3H]3+=622.5。
步骤3:在25℃向(3S,6R,11R,14S,17S,20S,23S,29S,34aS)-11-((S)-2-((S)-2-((S)-2-氨基-3)-(1H-咪唑-5-基)丙酰胺基)-4-(甲硫基)丁酰胺基)-3-甲基丁酰胺基)-N-((S)-1-(((S)-1-(((S)-1)-氨基-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基)氨基)-3-羟基-1-氧代丙烷-2-基)氨基)-1-氧代-3-苯基丙-2-基)-23,29-双(3-胍基丙基)-20-(4-羟基苄基)-17-(羟甲基)-14-异丁基-3-异丙基-1,4,12,15,18,21,24,27,30-九氧代三十氢-1H,10H-吡咯并[2,1-j][1,2]二硫[5,8,11,14,17,20,23,26,29]九氮杂环三十二-6-甲酰胺(520.0mg,278.78umol,1.00当量)和1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-烷酸苄酯(382.58mg,278.78umol,1.00当量)的DMF(10.0mL)溶液中添加HOBt(113.01mg,836.35umol,3.00当量)和EDCI(160.33mg,836.35umol,3.00当量)。将混合物在25℃搅拌1小时。通过制备型HPLC(酸性条件,TFA)纯化混合物,得到3,3′-((2-((13S,16S,19S)-13-((1H-咪唑-5-基)甲基)-19-(((3S,6R,11R,14S,17S,20S,23S,29S,34aS)-6-(((S)-1-(((S)-1-(((S)-1-氨基-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基)氨基)-3-羟基-1-氧代丙烷-2-基)氨基)-1-氧代-3-苯基丙-2-基)氨基甲酰基)-23,29-双(3-胍基丙基)-20-(4-羟基苄基)-17-(羟甲基)-14-异丁基-3-异丙基-1,4,12,15,18,21,24,27,30-九氧代三十氢-1H,10H-吡咯并[2,1-j][1,2]二硫[5,8,11,14,17,20,23,26,29]九氮杂环三十二烷-11-基)氨基甲酰基)-20-甲基-16-(2-(甲硫基)乙基)-11,14,17-三氧代-3,6,9-三氧杂-12,15,18-三氮杂二十一酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)丙酰胺)(化合物48,388.1mg,96.5%纯度,43.2%收率),为白色固体。化学式:C137H214F6N34O42S3;LCMS发现值:[M+H+Na]2+=1621.3;[M+2H]2+=1609.7;[M+3H]3+=1074.0,[M+4H]4+=805.7。
化合物49:3-((6S,9R,12S,15S,18S,21S,27S,30S,33S,36S,39R,42S,44aS,46S,49aR)-30-((1H-咪唑-5-基)甲基)-12,33-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-42-(羧甲基)-46-(20-(1-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-17-氧代-4,7,10,13-四氧杂-16-氮杂二十烷酰胺基)-6-((R)-1-羟乙基)-18,27-二异丁基-15-异丙基-36-甲基-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,49-十五烷氧代四十八氢-1H-9,39-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五烷-21-基)丙酸的制备
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步骤1:17-氧代-4,7,10,13-四氧杂-16-氮杂二十二-21-炔酸(8.00g,22.25mmol,1.00当量)、2,3,5,6-四氟苯酚(11.08g,66.75mmol,4.00当量)和EDCI(9.52g,33.23mmol,2.00当量)在DMF(224mL)中的混合物于25℃搅拌16小时。LCMS显示反应物1完全消耗,主峰上是所需的MS。通过快速(C18,TFA条件)纯化混合物并冻干,得到2,3,5,6-四氟苯基17-氧代-4,7,10,13-四氧杂-16-氮杂二十二-21-炔酸酯(9.00g,17.73mmol,79.6%收率),为黄色油状物。化学式:C23H29F4NO7,LCMS发现值:[M+H]1+=508.15。
步骤2:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基))甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-2-氨基-47-(羧甲基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(3.00g,1.74mmol,1.00当量)、2,3,5,6-四氟苯基17-氧代-4,7,10,13-四氧杂-16-氮杂二十二-21-炔酸酯(1.77g,3.48将1mmol,2.00当量)和DIEA(3.03mL,17.42mmol,10.00当量)在DMF(30mL)中的溶液在0℃搅拌8小时。将混合物调节至pH=5并通过制备型HPLC(TFA条件)直接纯化以得到3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代-2-(17-氧代-4,7,10,13-四氧杂-16-氮杂二十二-21-炔酰胺基)四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(1.30g,纯度95.1%,34.3%收率),为白色固体。化学式:C96H135N21O26S2,LCMS发现值:[M+2H]2+=1032.10,[M+3H]3+=688.40.
步骤3:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代-2-(17-氧代-4,7,10,13-四氧杂-16-氮杂二十二-21-炔酰胺基)四十八碳氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(402.1mg,194.9umol,1.00当量)、3,3′-((2-(6-叠氮己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(254.8mg,194.91umol,1.00当量)的DMF(8mL)溶液冷却至0℃,脱气并用N2吹扫3次。然后在0℃下将新鲜制备的CuSO4(0.4M,487.27uL,1.00当量)、抗坏血酸钠(0.5M,1.56mL,4.00当量)和THPTA(86.34mg,194.91umol,1.00当量)添加至反应混合物中。将混合物脱气并用N2吹扫3次,在N2气氛下在0℃搅拌2小时。将混合物直接通过制备型HPLC(酸性条件,TFA)纯化并冻干,得到3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(20-(1-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-17-氧代-4,7,10,13-四氧杂-16-氮杂二十烷酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(495.0mg,纯度92.0%,收率71.70%),为浅黄色固体。化学式:C149H219F6N33O45S2,LCMS发现值:[M+2H]2+=1686.80,[M+3H]3+=1125.00,[M+4H]4+=843.90,[M+5H]5+=675.40。
化合物53:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(4-(1-(1-((2R,3R,4R,5S))-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)丁酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
化合物53根据制备化合物49中所述的程序制备,其中用于制备化合物53的起始材料是3,3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)收率:49.1mg,纯度97.5%,收率66.7%,白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+2H]2+=1562.17,[M+3H]3+=1041.65,[M+4H]4+=781.50,[M+5H]5+=625.30。
化合物52:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(4-(1-(1-((2R,3R,4R,5S))-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)丁酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
化合物52根据制备化合物49中所述的程序制备,其中用于制备化合物52的起始材料是3,3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺),收率:7.6mg,纯度90.9%,收率26.29%,白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+2H]2+=1562.00,[M+3H]3+=1041.71,[M+4H]4+=781.49,[M+5H]5+=625.51。
化合物51:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(4-(1-(((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)丁酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
化合物51根据制备化合物49中所述的程序制备,其中用于制备化合物51的起始材料是(2R,3R,4R,5S)-2-(叠氮甲基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇,收率:38.7mg,纯度98.5%,收率58.5%,白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+2H]2+=1075.60,[M+3H]3+=717.45.
化合物40:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二烷-32-酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
/>
步骤1:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-2-氨基-47-(羧甲基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(3.0g,87.0%纯度)的HCl/MeOH(4M,60mL)溶液在25℃下搅拌2小时。减压除去溶剂。通过制备型HPLC(酸性条件,TFA)纯化残余物,得到3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-2-氨基-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-47-(2-甲氧基-2-氧代乙基)-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸甲酯(1.5g,95.7%纯度,53.8%收率),为白色固体。化学式:C81H112N20O20S2,LCMS发现值:[M+H]1+=1749.88,[M+2H]2+=875.59.
步骤2:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-2-氨基-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-47-(2-甲氧基-2-氧代乙基)-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸甲酯)(58.81mg,42.86umol,1.00当量)、EDCI(16.43mg,85.71umol,2.00当量)、HOBt(11.58mg,85.71umol,2.00当量)在DMF(0.5mL)中的溶液在0℃搅拌1小时。通过制备型HPLC(酸性条件,TFA)纯化混合物,得到3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-2-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二烷-32-酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-47-(2-甲氧基-2-氧代乙基)-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸甲酯(60.0mg,98.8%纯度,44.5%收率),为白色固体。化学式:C136H197F6N29O43S2,LCMS发现值:[M+H+Na]2+=1564.20,[M+2H]2+=1552.70,[M+3H]3+=1035.4,[M+4H]4+=777.00。
步骤3:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-2-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二烷-32-酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-47-(2-甲氧基-2-氧代乙基)-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸甲酯(55.0mg,17.72umol,1.00当量)在THF(0.5mL)、H2O(0.3mL)中的溶液中加入LiOH.H2O(1M,70.87uL,4.00当量)并将混合物在25℃搅拌1小时。将混合物用1M HCl酸化至pH=3,然后通过制备型HPLC(酸性条件,TFA)直接纯化,得到3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二烷-32-酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(化合物40,11.7mg,96.6%纯度,20.7%收率),为白色固体。化学式:C134H193F6N29O43S2,LCMS发现值:[M+H+Na]2+=1549.8,[M+2H]2+=1538.7,[M+3H]3+=1026.2,[M+4H]4+=769.8。
化合物50:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十三烷-23-酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
化合物50根据上述程序制备,其中用于制备化合物50的起始材料是(1,39-双((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15,25-二氧代-2,5,8,11,18,22,29,32,35,38-十氧杂-14,26-二氮杂三十九烷-20-基)甘氨酸,收率:2.7mg,纯度97.4%,收率20.5%,白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+2H]2+=1465.59,[M+3H]3+=977.25.
化合物47:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27-七氧杂-14,21-二氮杂二十九烷-29-酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
化合物47按照上述方法制备,其中用于制备化合物47的起始材料为1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27-七氧杂-14,21-二氮杂二十九-29-烷酸,收率:2.8mg,纯度96.8%,收率23.4%,白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+2Na]2+=1562.10,[M+H+Na]2+=1550.50,[M+2H]2+=1539.00,[M+3H]3+=1026.70。
化合物46:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24-六氧杂-14,21-二氮杂二十六烷-26-酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
化合物46根据上述程序制备,其中制备化合物46的起始材料为1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24-六氧杂-14,21-二氮杂二十六-26-烷酸,收率:5.8mg,纯度93.2%,收率35.0%,白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+H+Na]2+=1505.7,[M+2H]2+=1494.7,[M+3H]3+=996.7,[M+4H]3+=747.9。
化合物45:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十三烷-23-酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
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化合物45根据上述程序制备,其中用于制备化合物45的起始材料是(1,39-双((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15,25-二氧代-2,5,8,11,18,22,29,32,35,38-十氧杂-14,26-二氮杂三十九烷-20-基)甘氨酸,收率:63.0mg,纯度94.1%,66.5%白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+H+Na]2+=1476.7,[M+2H]2+=1465.3,[M+3H]3+=977.3。
化合物60:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
化合物60按照制备化合物38中所述的程序制备,其中用于制备化合物60的起始材料是1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-烷酸。产率:8.8mg,纯度93.1%,59.7%白色固体。LC-MS(ESI)发现值:[M+H+Na]2+=1550.50,[M+2H]2+=1102.70,[M+3H]3+=735.80。
中间体11:3-((6S,9R,12S,15S,18S,21S,27S,30S,33S,36S,39R,42S,44aS,46S,49aR)-30-((1H-咪唑)-5-基)甲基)-12,33-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-46-氨基-42-(羧甲基)-6-((R)-1-羟乙基)-18,27-二异丁基-15-异丙基-36-甲基5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,49-十五氧代四十八氢-1H-9,39-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-21-基)丙酸的制备
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固相肽合成:
使用标准Fmoc化学合成肽。
1)树脂制备:向含有CTC树脂(200.00g,200.00mmol,1.00mmol/g)和Fmoc-D-Pro-OH(67.40g,200.00mmol,1.00当量)的DCM(3L)溶液的容器中添加滴加DIEA(139.46mL,800.00mmol,4.00当量),并用N2在15℃下鼓泡混合2小时。然后加入MeOH(200.00mL)并用N2再鼓泡30分钟。将树脂用DMF(3L)5次洗涤。然后添加20%哌啶的DMF(5L)溶液,并将混合物在15℃下用N2鼓泡30分钟。过滤混合物以获得树脂。将树脂用DMF(3L)5次洗涤,然后进行下一步。
2)偶联:Fmoc-Thr(tBu)-OH(238.20g,600.00mmol,3.00当量)、HBTU(216.03g,570.00mmol,2.85当量)的DMF(500mL)溶液添加到树脂中,同时鼓泡N2。然后将DIEA(209.18mL,1200.00mmol,6.00当量)滴加至混合物中并在15℃下用N2鼓泡30分钟。通过茚三酮试验监测偶联反应,若显示无色则偶联完成。然后用DMF(3L)5次洗涤树脂。
3)去保护:将20%哌啶的DMF(5L)溶液添加到树脂中,并将混合物在15℃下用N2鼓泡30分钟。然后用DMF(3L)5次洗涤树脂。通过茚三酮试验监测去保护反应,若显蓝色或其他棕红色,则反应完成。
4)对所有其他氨基酸重复步骤2和3:(表1中的2-15)。
表1.
肽切割和纯化:
1)将切割缓冲液(20%HFIP/DCM,8.0L)添加到含有侧链保护的粗肽的烧瓶中。将混合物在室温下搅拌1小时,过滤后收集溶液。再次重复切割步骤。
2)过滤后合并溶液。
3)通过旋转蒸发浓缩溶液。
4)将粗肽冷冻干燥。
5)获得呈白色固体状的化合物1(231.00g,粗品)。
6)化合物1(13.58g,4.99mmol,1.00当量)、2,4,6-三甲基吡啶(3.62g,29.98mmol,6.00当量)的DMF(5.0L)的混合物在25℃下添加HATU(2.84g,7.49mmol,1.50当量)。然后将混合物在25℃搅拌3小时。一共17批,一一制作。
7)通过旋转蒸发浓缩溶液。
8)将残余物添加至0.50M HCl(冷,10L)中,并沉淀出白色固体。过滤后,将固体冻干,得到化合物2(245.00g,粗品,17批),为白色固体。化学式:C159H192N20O26S2,LCMS发现值:[M+H+Na]2+=1370.88;[M+2H-242]2+=1239.42;
步骤3-4:中间体11的制备
/>
化合物2(245.00g,粗品)在TFA/TIS/H2O/3-巯基丙酸(92.5%/2.5%/2.5%/2.5%,v/v/v,5L)中的混合物在20℃搅拌1.5小时。用冷异丙醚(30L)沉淀混合物。过滤后,将固体真空干燥2小时,得到化合物3(170.50g,粗品)。将化合物3(170.50g,粗品)溶解于MeCN/H2O(1/1,v/v,100L)中。在25℃下将0.1M I2/HOAc滴加到混合物中,直至浅黄色持续存在,然后用0.1M Na2S2O3逐滴淬灭混合物直至浅黄色消失。过滤后,滤液直接通过制备型HPLC(酸性条件,TFA)纯化,得到白色固体状的中间体11(21.10g,6.15%收率,87.06%纯度)。化学式:C79H108N20O20S2,LCMS发现值:[M+H]1+=1722.70,[M+2H]2+=861.50。
化合物61:3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-47-(羧甲基)-2-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二烷-32-酰胺基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸的制备
步骤1:TFP酯(化合物4)的制备:
2,3,5,6-四氟苯酚(105.50mg,639.44umol,4.00当量)、2-(4-(2-((((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)氨基)-2-氧代乙基)苯氧基)乙酸(80.0mg,159.86umol,1.00当量)在DMF(1.0mL)中的混合物冷却至0℃。然后在0℃下向混合物添加EDCI(61.29mg,319.73umol,2.00当量)并在0℃下搅拌2小时。通过制备型HPLC(酸性条件,TFA)纯化反应混合物,得到TFP酯4(15mg,23.13umol,14.47%收率),为无色油状物。化学式:C27H23F7N4O7,LCMS发现值:[M+H]+=649.10。
步骤2:化合物61的制备:
中间体11(27.72mg,16.10umol,1.20当量)、化合物4(8.7mg,13.42umol,1.00当量)、DIEA(5.20mg,40.25umol,7.01uL,3.00当量)在DMF(0.3mL)中的混合物在25℃搅拌1小时。通过制备型HPLC(酸性条件,TFA)纯化反应混合物,得到白色固体状的化合物61(14.6mg,6.55umol,98.9%纯度,48.8%收率)。化学式:C100H129F3N24O26S2,LCMS发现值:[M+2H]2+=1103.1,[M+H+Na]2+=1114.5,[M+3H]3+=735.6
化合物化合物62、化合物63、化合物64、化合物65、化合物66、化合物67、化合物68、化合物69、化合物45、化合物70、化合物71、化合物72、化合物42、化合物73、化合物74、化合物75根据与化合物61相同的程序,使用下表中列出的起始材料来制备。
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化合物68:3-((6S,9R,12S,15S,18S,21S,27S,30S,33S,36S,39R,42S,44aS,46S,49aR)-30-((1H-咪唑-5-基)甲基)-12,33-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-42-(羧甲基)-46-(4-(4-((4-(((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)哌嗪-1-基)甲基)哌啶-1-基)苯甲酰胺基)-6-((R)-1-羟乙基)-18,27-二异丁基-15-异丙基-36-甲基-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,49-十五氧代四十八氢-1H-9,39-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五烷-21-基)丙酸的制备
蛋白质靶配体的合成:
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固相肽合成:
使用标准Fmoc化学合成肽。
1)树脂制备:向含有CTC树脂(100.00g,100.00mmol,1.00mmol/g)和Fmoc-Gly-OH(29.70g,100.00mmol,1.00当量)的DCM(1.5L)溶液的容器中滴加DIEA(51.60g,69.73mL,400.00mmol,4.00当量)并用N2在15℃下鼓泡混合2小时。然后加入MeOH(100.00mL)并用N2再鼓泡30分钟。将树脂用DMF(3L)5次洗涤。然后添加20%哌啶的DMF(3L)溶液,并将混合物在15℃下用N2鼓泡30分钟。过滤混合物以获得树脂。将树脂用DMF(3L)5次洗涤,然后进行下一步。
2)偶联:向树脂中伴随N2鼓泡添加Fmoc-Leu-OH(105.90g,300.00mmol,3.00当量)、HBTU(108.15g,285.00mmol,2.85当量)在DMF(1.5L)中的溶液。然后将DIEA(77.40g,104.58mL,600.00mmol,6.00当量)滴加至混合物中并在15℃下用N2鼓泡30分钟。通过茚三酮试验监测偶联反应,若显示无色则偶联完成。然后用DMF(3L)5次洗涤树脂。
3)去保护:将20%哌啶的DMF(3L)溶液添加到树脂中,并将混合物在15℃下用N2鼓泡30分钟。然后用DMF(3L)5次洗涤树脂。通过茚三酮试验监测去保护反应,若显蓝色或其他棕红色,则反应完成。
4)对所有其他氨基酸重复步骤2和3:表1中的编号#2-15。
5)所有步骤完成后,用DMF(3L)x 5、MeOH(3L)x 5洗涤树脂,然后减压干燥,得到树脂结合的肽树脂(100mmol)。
表1.
肽切割、头尾环化、TFA去保护、二硫键形成和纯化:
5)切割:将切割溶液(1%TFA/DCM,v/v,1.0L)添加到含有侧链保护的粗肽树脂(20mmol)的烧瓶中。将混合物在室温下搅拌10分钟,过滤后收集溶液。再次重复切割步骤。合并的溶液得到切割溶液中的化合物1(20mmol)。
6)头尾环化:将合并的溶液(化合物1,20mmol)用DCM稀释至20L。然后添加TBTU(12.84g,40.00mmol,2.00当量)和HOBt(5.40mg,40.00mmol,2.00当量),混合物在25℃下用DIEA碱化至pH=8。将反应混合物在15℃搅拌2小时。LCMS显示具有所需MS的一个主峰。将混合物用1M HCl(5L)、H2O(5L)、盐水(5L)洗涤,用无水Na2SO4干燥,过滤并真空浓缩,得到化合物2(38.10g,粗品),为白色固体。化学式:C153H184N20O22S2,LCMS发现值:[M+2H]2+=1360.77;
7)TFA去保护:化合物2(38.10g,粗品)在TFA/TIS/H2O/3-巯基丙酸(92.5/2.5/2.5/2.5,v/v/v/v,400mL)中的混合物在15℃下搅拌1.5小时。用冷异丙醚(2L)沉淀混合物。过滤后,将固体真空干燥2小时,得到白色固体状的化合物3(28.40g,粗品,TFA盐)。
8)二硫化物的形成:将化合物3(28.40g,粗品,TFA盐)溶解于MeCN/H2O(1/1,v/v,70L)中。在15℃下将0.1M I2/HOAc滴加到混合物中,直至浅黄色持续存在,然后用0.1MNa2S2O3逐滴淬灭混合物直至浅黄色消失。
9)纯化:过滤后,滤液直接通过制备型HPLC(酸性条件,TFA)纯化,然后冻干,得到中间体5(6.25g,纯度88.3%,收率18.1%,TFA盐),为白色固体。化学式:C79H108N20O20S2,LCMS发现值:[M+H]+=1722.8,[M+2H]2+=861.6.
10)重复上述步骤1-5,总共进行4批(20mmol*4),得到标题化合物(25.00g,TFA盐),为白色固体。
ASGPR结合配体:2,3,5,6-四氟苯基4-(4-((4-(((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)哌嗪-1-基)甲基)哌啶-1-基)苯甲酸酯的制备
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步骤1:4-氟苯甲酸叔丁酯(1g,4.7mmol)、哌啶-4-基甲醇(0.65mg,5.6mmol)和K2CO3(0.65g,4.7mmol)的DMF(5mL)悬浮液在100℃下搅拌过夜。将反应混合物冷却并且浓缩。通过快速色谱法(EA/PE=1∶2)纯化残余物,得到4-(4-(羟甲基)哌啶-1-基)苯甲酸叔丁酯(1g,70%收率),为粉红色固体。LC-MS(ESI)发现值:291[M+H]+。
步骤2:向4-(4-(羟甲基)哌啶-1-基)苯甲酸叔丁酯(200mg,0.7mmol)和TEA(0.19mL,1.4mmol)在DCM(3mL)中的溶液中添加TsCl(140mg,1.4mmol)。将反应混合物在室温下搅拌2小时。然后将反应浓缩,得到粗制4-(4-((甲苯磺酰氧基)甲基)哌啶-1-基)苯甲酸叔丁酯(306mg),为棕色油状物。
步骤3:N-((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-4-(哌嗪-1-基甲基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(200mg,0.48mmol)、4-(4-((甲苯磺酰氧基)甲基)哌啶-1-基)苯甲酸叔丁酯(255mg,0.6mmol)和K2CO3(198mg,1.4mmol)在DMF(3mL)中的悬浮液于100℃搅拌3小时。将反应冷却并浓缩。通过快速色谱法(DCM/MeOH=10∶1)纯化残余物,得到4-(4-((4-(((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基)哌嗪-1-基)甲基)哌啶-1-基)苯甲酸叔丁酯(120mg,收率36%),为黄色油状物。LC-MS(ESI)发现值:691[M+H]+。
步骤4:4-(4-((4-(((3aS,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)甲基)哌嗪-1-基)甲基)哌啶-1-基)苯甲酸叔丁酯(100mg,0.14mmol)在稀HCl水溶液(3mL,3M水溶液)中的溶液在50℃搅拌1h。将反应溶液冷却,用NH3.H2O中和并浓缩,得到粗混合物。通过制备型HPLC纯化粗混合物,得到4-(4-((4-(((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2)-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)哌嗪-1-基)甲基)哌啶-1-基)苯甲酸(30mg,34%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:595[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.11(s,1H),8.00(s,1H),7.82(d,J=8.6Hz,2H),6.52(d,J=8.7Hz,2H),4.32(td,J=10.3,5.0Hz,1H),4.12(dd,J=10.9,5.1Hz,1H),3.87(d,J=2.7Hz,1H),3.68-3.60(m,2H),3.56-3.51(m,1H),3.44(t,J=7.6Hz,1H),3.37-3.33(m,1H),3.11(t,J=10.8Hz,1H),2.98(t,J=8.7Hz,1H),2.87-2.54(m,12H),2.35-2.27(m,1H),2.25-2.16(m,1H),1.79-1.66(m,3H)。
步骤5:TFP酯的制备
在0℃下向4-(4-((4-(((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)哌嗪-1-基)甲基)哌啶-1-基)苯甲酸(250.00mg,420.43umol,1.00当量)、2,3,5,6-四氟苯酚(418.94mg,2.52mmol,6.00当量)的DMF(0.5mL)混合物中添加EDCI(201.49mg,1.05mmol,2.5当量)。然后将混合物在0℃搅拌3小时。将反应混合物直接通过制备型HPLC(酸性条件,TFA)纯化,然后冻干,得到化合物4(TFP酯,183.00mg,90%纯度,73.2%收率),为白色固体。化学式:C34H37F7N6O5,LCMS发现值:[M+H]+=743.29.
步骤6:ASGPR结合配体与蛋白质靶配体的偶联:
3-((2S,5aR,11S,14R,17S,20S,23S,26S,32S,35S,38S,41S,44R,47S,49aS)-35-((1H-咪唑-5-基)甲基)-17,38-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-2-氨基-47-(羧甲基)-11-((R)-1-羟乙基)-23,32-二异丁基-20-异丙基-41-甲基-5,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49-十五氧代四十八氢-5H-14,44-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-26-基)丙酸(183.00mg,246.40umol,1.00当量)、2,3,5,6-四氟苯基4-(4-((4-(((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)哌嗪-1-基)甲基)哌啶-1-基)苯甲酸酯(466.73mg,271.04umol,1.10当量)、DIEA(159.23mg,214.60uL,1.23mmol,5.00当量)在DMF(5.0mL)中的混合物在45℃下搅拌16小时。将反应混合物冷却至室温,用1M HCl酸化至pH=5,直接通过制备型HPLC(酸性条件,TFA)纯化,然后冻干,得到化合物68(112.00mg,18.4%收率,93.3%纯度),为白色固体。化学式:C107H143F3N26O24S2,LCMS发现值:[M+2H]2+=1150.3,[M+3H]3+=767.6
中间体12:3-((6S,9R,12S,15S,18S,21S,27S,30S,33S,36S,39R,42S,44aS,46S,49aR)-30-((1H-咪唑)-5-基)甲基)-12,33-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-46-氨基-6-((R)-1-羟乙基)-18,27-二异丁基-15-异丙基-36,42-二甲基-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,49-十五氧代四十八氢-1H-9,39-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-21-基)丙酸的制备
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步骤1:(2)的制备:
固相肽合成:
使用标准Fmoc化学合成肽。
1)树脂制备:向含有CTC树脂(0.50g,0.50mmol,1.00mmol/g)和Fmoc-Gly-OH(148.50mg,0.50mmol,1.00当量)的DCM(10mL)溶液的容器中滴加DIEA(348.64mL,2.00mmol,4.00当量)并用N2在25℃下鼓泡混合2小时。然后加入MeOH(0.50mL)并用N2再鼓泡30分钟。将树脂用DMF(20mL)5次洗涤。然后添加20%哌啶的DMF(20mL)溶液,并在25℃下用N2向混合物鼓泡30分钟。过滤混合物以获得树脂。将树脂用DMF(20mL)5次洗涤,然后进行下一步。
2)偶联:在N2鼓泡下将Fmoc-Glu(OtBu)-OH(637.5mg,1.50mmol,3.00当量)、HBTU(540.07mg,1.425mmol,2.85当量)在DMF(10mL)中的溶液添加到树脂中。然后将DIEA(522.97mL,3.00mmol,6.00当量)滴加至混合物中并在25℃下用N2鼓泡30分钟。通过茚三酮试验监测偶联反应,若显示无色则偶联完成。然后用DMF(20mL)5次洗涤树脂。
3)去保护:将20%哌啶的DMF(20mL)溶液添加到树脂中,并将混合物在25℃下用N2鼓泡30分钟。然后用DMF(20mL)5次洗涤树脂。通过茚三酮试验监测去保护反应,若显蓝色或其他棕红色,则反应完成。
4)对所有其他氨基酸重复步骤2和3:(表2中的2-15)。
表2.
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肽切割和纯化:
1)将切割缓冲液(1%TFA/DCM,30mL)添加到含有侧链保护的粗肽的烧瓶中。将混合物在室温下搅拌5分钟,过滤后收集溶液。再次重复切割步骤。
2)将合并的溶液用DCM稀释至500mL。
3)添加TBTU(321.00mg,1.00mmol,2.00当量)和HOBt(135.00mg,1.00mmol,2.00当量),并将混合物在25℃下搅拌2小时。
4)将反应混合物用1M HCl(200mL)、H2O(200mL)、盐水(200mL)洗涤,用无水Na2SO4干燥,过滤并真空浓缩,得到化合物2(1.20g,粗品),为白色固体。化学式:C148H176N20O20S2,LCMS发现值:[M+Na]2+=1320.77;
中间体12的制备:
化合物2(1.20g,粗品)在TFA/TIS/H2O/3-巯基丙酸(92.5%/2.5%/2.5%/2.5%,v/v/v,25mL)中的混合物在25℃搅拌1.5小时。将混合物用冷异丙醚(150mL)沉淀并离心(3000rpm 3分钟)。将固体用异丙醚洗涤两次,真空干燥2小时,得到化合物3(900.0mg,粗品)。然后将化合物3(900.0mg,粗品)溶解于MeCN/H2O(1/1,v/v,500mL)中。在25℃下将I2/HOAc(0.1M)滴加到混合物中,直至浅黄色持续存在,然后用0.1M Na2S2O3逐滴淬灭混合物直至浅黄色消失。过滤后,滤液直接通过制备型HPLC(酸性条件,TFA)纯化,得到中间体12(144.00mg,16.64%收率,97.00%纯度),为白色固体。化学式:C78H108N20O18S2,LCMS发现值:[M+H]1+=1677.79,[M+2H]2+=839.39,[M+3H]3+=559.95.
按照与中间体12相同的程序制备中间体中间体13-中间体28。
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化合物76:3,3′-((2-((2-(((6S,9R,12S,15S,18S,21S,27S,30S,33S,36S,39R,42S,44aS,46S,49aR)-30-((1H-咪唑-5-基)甲基)-12,33-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-6-((R)-1-羟乙基)-18,27-二异丁基-15-异丙基-21,36,42-三甲基-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,49-十五氧代四十八氢-1H-9,39-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五烷-46-基)氨基)-2-氧代乙基)氨基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)丙酰胺)的制备
化合物76的制备:
在0℃向中间体25(50.0mg,30.87umol,1.00当量)、A31(41.6mg,33.95umol,1.10当量)、HOBt(6.26mg,46.30umol,1.50当量)和DIEA(3.9mg,30.87umol,5.38uL,1.00当量)的DMF(0.5mL)的搅拌溶液中添加EDCI(8.8mg,46.30umol,1.50当量)。然后将混合物在0℃搅拌2小时。通过制备型HPLC(酸性条件,TFA)直接纯化混合物,得到呈白色固体的化合物76(38.4mg,95.2%纯度,41.8%收率)。化学式:C125H181F6N29O35S2;LCMS发现值:[M+H+Na]2+=1426.3,[M+2H]2+=1415.1;[M+3H]3+=943.4。
按照与化合物76相同的程序制备化合物77、化合物78、化合物79。
中间体48:3-((6S,9R,12S,15S,18S,21S,27S,30S,33S,36S,39R,42S,44aS,46S,49aR)-30-((1H-咪唑-5-基)甲基)-12,33-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-42-(羧甲基)-46-(己-5-炔酰胺基)-6-((R)-1-羟乙基)-18,27-二异丁基-15-异丙基-36-甲基-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,49-十五氧代四十八氢-1H-9,39-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-21-基)丙酸的制备
步骤1:2,3,5,6-四氟苯基己-5-炔酸酯(化合物2)的制备
化合物1(2.00g,17.84mmol,1.94mL,1.00当量)和TFP(5.92g,35.67mmol,2.00当量)在DMF(15.0mL)中的混合物中添加EDCI(6.84g,35.67mmol,2.00当量)。将混合物在20℃搅拌2小时。LCMS显示化合物1完全消耗,并且主峰上是所需的MS。通过快速(C18,TFA条件)纯化混合物并冻干,得到无色油状的化合物2(1.2g,24.1%收率)。化学式:C12H8F4O2,LCMS发现值:[M+H]+=260.92.
步骤2:中间体48的制备:
中间体5(5g,2.90mmol,1.00当量)、化合物2(1.13g,4.36mmol,1.50当量)和DIEA(1.50g,11.61mmol,2.02mL,4.00当量)在DMF(50mL)中的混合物于0℃搅拌8小时。将混合物用0.1M HCl酸化至pH=5,并通过制备型HPLC(TFA条件)直接纯化,得到白色固体状的中间体48(1.97g,97.8%纯度,36.54%收率)。化学式:C85H114N20O21S2,LCMS发现值:[M+H]+=1817.1,[M+2H]2+=908.7。
3-((6S,9R,12S,15S,18S,21S,27S,30S,33S,36S,39R,42S,44aS,46S,49aR)-30-((1H-咪唑-5-基)甲基)-12,33-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-46-(4-(1-(((2R,3R,4R,5R)-5-乙酰胺基-3,4-二羟基-6-甲氧基四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)丁酰胺基)-42-(羧甲基)-6-((R)-1-羟乙基)-18,27-二异丁基-15-异丙基-36-甲基-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,49-十五氧代四十八氢-1H-9,39-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-21-基)丙酸的制备
中间体48(97.7mg,53.80umol,1.00当量))、N-((3R,4R,5R,6R)-6-(叠氮甲基)-4,5-二羟基-2-甲氧基四氢-2H-吡喃-3-基)乙酰胺(A146(14.0mg,53.80umol,1当量)在DMF(0.5mL)中的混合物冷却至0℃,脱气并用N2吹扫3次。然后在0℃下将新鲜制备的CuSO4(0.4M,134.49uL,1.00当量)、抗坏血酸钠(0.5M,430.36uL,4.00当量)和THPTA(23.83mg,53.80umol,1.00当量)的混合物添加到反应混合物中。将混合物脱气并用N2吹扫3次,在N2气氛下在0℃搅拌2小时。将混合物通过制备型HPLC(酸性条件,TFA)直接纯化并冻干,得到呈白色固体状的化合物81(74.8mg,97.7%纯度,66.8%收率)。化学式:C94H130N24O26S2,LCMS发现值:[M+2H]2+=1039.2,[M+3H]3+=693.1。
化合物53、化合物52、化合物51和化合物80按照与化合物81相同的程序制备,用下表中列出的起始材料替换N-((3R,4R,5R,6R)-6-(叠氮甲基)-4,5-二羟基-2-甲氧基四氢-2H-吡喃-3-基)乙酰胺。
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中间体4:3-((6S,9R,12S,15S,18S,21S,27S,30S,33S,36S,39R,42S,44aS,46S,49aR)-30-((1H-咪唑-5-基)甲基)-12,33-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-42-(羧甲基)-46-(20-(1-(1-((2R,3R,4R,5S))-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-17-氧代-4,7,10,13-四氧杂-16-氮杂二十烷酰胺基)-6-((R)-1-羟乙基)-18,27-二异丁基-15-异丙基-36-甲基-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,49-十五氧代四十八氢-1H-9,39-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-21-基)丙酸的制备
步骤1:化合物1的制备:
固相肽合成:
使用标准Fmoc化学合成肽。
5)树脂制备:向含有CTC树脂(37.00g,30.00mmol,0.81mmol/g)和Fmoc-NH2-PEG4-CH2CH2COOH(14.61g,30.00mmol,1.00当量)的DCM(300mL)溶液的容器中滴加DIEA(20.91mL,120.00mmol,4.00当量)并用N2在15℃下鼓泡混合2小时。然后添加MeOH(30.00mL)并用N2再鼓泡30分钟。将树脂用DMF(600mL)5次洗涤。然后添加20%哌啶的DMF(600mL)溶液,并将混合物在15℃下用N2鼓泡30分钟。过滤混合物以获得树脂。将树脂用DMF(600mL)5次洗涤,然后进行下一步。
6)偶联:将己-5-炔酸(6.72g,60.00mmol,2.00当量)、HBTU(21.94g,57.00mmol,1.90当量)在DMF(300mL)中的溶液添加到树脂中,同时鼓泡N2。然后将DIEA(20.91mL,120.00mmol,4.00当量)滴加至混合物中,并在15℃下用N2鼓泡30分钟。通过茚三酮试验监测偶联反应,若显示无色则偶联完成。然后将树脂用DMF(600mL)5次、MeOH(600mL)5次洗涤,减压干燥。
表1.
肽切割和纯化:
1)将切割缓冲液(20%HFIP/DCM,500mL)添加到含有侧链保护的粗肽的烧瓶中。将混合物在室温下搅拌1小时,过滤后收集溶液。再次重复切割步骤。
2)过滤后合并溶液。
3)通过旋转蒸发浓缩溶液。
4)将粗肽冻干,得到化合物1(8.00g,粗品),为无色油状物。化学式:C17H29NO7,LCMS发现值:[M+H]+=360.40;
步骤2:2,3,5,6-四氟苯基17-氧代-4,7,10,13-四氧杂-16-氮杂二十二-21-炔酸酯(化合物2)的制备
化合物1(8.00g,22.25mmol,1.00当量)、2,3,5,6-四氟苯酚(11.08g,66.75mmol,4.00当量)和EDCI(9.52g,33.23mmol,2.00当量)在DMF(224mL)中的混合物在25℃搅拌16小时。LCMS显示反应物1完全消耗,主峰上是所需的MS。将混合物通过快速纯化(C 18,TFA条件)并冻干,得到呈黄色油状的化合物2(9.00g,17.73mmol,79.6%收率)。化学式:C23H29F4NO7,LCMS发现值:[M+H]+=508.15.
步骤3:中间体4的制备:
中间体5(3.00g,1.74mmol,1.00当量)、化合物2(1.77g,3.48mmol,2.00当量)和DIEA(3.03mL,17.42mmol,10.00当量)在DMF(30mL)中的混合物于0℃搅拌8小时。将混合物调节至pH=5并通过制备型HPLC(TFA条件)直接纯化,得到呈白色固体状的中间体4(1.30g,95.1%纯度,34.3%收率)。化学式:C96H135N21O26S2,LCMS发现值:[M+2H]2+=1032.10,[M+3H]3+=688.40.
化合物4:3-((6S,9R,12S,15S,18S,21S,27S,30S,33S,36S,39R,42S,44aS,46S,49aR)-30-((1H-咪唑-5-基)甲基)-12,33-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-42-(羧甲基)-46-(20-(1-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基*5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-17-氧代-4,7,10,13-四氧杂-16-氮杂二十烷酰胺基)-6-((R)-1-羟乙基)-18,27-二异丁基-15-异丙基-36-甲基-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,49-十五氧代四十八氢-1H-9,39-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-21-基)丙酸的制备
中间体4(402.1mg,194.9umol,1.00当量)、A2(254.8mg,194.91umol,1.00当量)在DMF(8mL)中的混合物冷却至0℃,脱气并用N2吹扫3次。然后在0℃下将新鲜制备的CuSO4(0.4M,487.27uL,1.00当量)、抗坏血酸钠(0.5M,1.56mL,4.00当量)和THPTA(86.34mg,194.91umol,1.00当量)的混合物添加到反应混合物中。将混合物脱气并用N2吹扫3次,在N2气氛下在0℃搅拌2小时。将混合物直接通过制备型HPLC(酸性条件,TFA)纯化并冻干,得到化合物4(495.0mg,92.0%纯度,71.70%收率),为浅黄色固体。化学式:C149H219F6N33O45S2,LCMS发现值:[M+2H]2+=1686.80,[M+3H]3+=1125.00,[M+4H]4+=843.90,[M+5H]5+=675.40.
化合物16、化合物82、化合物83、化合物84、化合物85、和化合物86按照与化合物4相同的程序使用如下表所示的起始材料制备。
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中间体1(S)-3-(((4R,7S,10S,13S,16S,22S,25S,28S,31S,34R)-25-((1H-咪唑-5-基)甲基)-7,28-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-4-(((2S,3R)-1-氨基-3-羟基-1-氧代丁-2-基)氨基甲酰基)-16-(2-羧乙基)-13,22-二异丁基-10-异丙基-31-甲基-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33-十氧代-1,2-二硫杂-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32-十氮杂环三十五烷-34-基)氨基甲酰基)-24-(1-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-5,21-二氧代-8,11,14,17-四氧杂-4,20-二氮杂二十四-1-烷酸的制备
步骤1:制备中间体1的一般程序
固相肽合成:
使用标准Fmoc化学合成肽。
1)树脂制备:含有AM树脂(66.67g,20.00mmol,0.30mmol/g)的DMF(600mL)溶液的容器用N2鼓泡在15℃下混合30分钟。将树脂用DMF(600mL)5次洗涤。然后添加20%哌啶的DMF(600mL)溶液,并将混合物在15℃下用N2鼓泡30分钟。过滤混合物以获得树脂。将树脂用DMF(600mL)5次洗涤,然后进行下一步。
2)偶联:将Fmoc-Thr(tBu)-OH(23.82g,60.00mmol,3.00当量)、HBTU(21.60g,57mmol,2.85当量)的DMF(300mL)溶液添加到树脂中,同时用N2鼓泡。然后将DIEA(22.11mL,120mmol,6.00当量)滴加到混合物中,并在15℃下用N2鼓泡30分钟。通过茚三酮试验监测偶联反应,若显示无色则偶联完成。然后用DMF(600mL)5次洗涤树脂。
3)去保护:将20%哌啶的DMF(600mL)溶液添加到树脂中,并将混合物在15℃下用N2鼓泡30分钟。然后用DMF(600mL)5次洗涤树脂。去保护反应通过茚三酮试验监测,如果呈现蓝色或其他棕红色,则反应完成。
4)对所有其他氨基酸重复步骤2和3:(表4中的2-15)。
表4.
肽切割和纯化:
1)在室温下将切割缓冲液(TFA/TIS/H2O/3-巯基丙酸,92.5/2.5/2.5/2.5,v/v/v/v,1L)添加到含有侧链保护的肽的烧瓶中并搅拌2小时。
2)用冷异丙醚沉淀肽。
3)过滤后,将固体用异丙醚再洗涤两次。
4)将粗肽真空干燥2小时。
5)将粗肽溶解于MeCN(10L)和H2O(10L)中,然后将碘(0.1M AcOH溶液)滴加到剧烈搅拌的混合物中,直至持续呈黄色。2分钟后,滴加硫代硫酸钠(0.1M水溶液)直至黄色消失。将混合物冻干以得到粗粉末。
6)通过制备型HPLC纯化粗粉(A:H2O中的0.075%TFA,B:ACN)得到中间体1(5.90g,95.1%纯度,14.9%收率),为白色固体。化学式:C86H123N19O24S2;LCMS发现值:[M+H]+=1871.00,[M+2H]2+=936.10,[M+3H]3+=624.38.
中间体32按照与中间体1相同的程序制备。
化合物22:(S)-3-(((4R,7S,10S,13S,16S,22S,25S,28S,31S,34R)-25-((1H-咪唑-5-基)甲基)-7,28-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-4-(((2S,3R)-1-氨基-3-羟基-1-氧代丁-2-基)氨基甲酰基)-16-(2-羧乙基)-13,22-二异丁基-10-异丙基-31-甲基-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33-十氧代-1,2-二硫杂-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32-十氮杂环三十五烷-34-基)氨基甲酰基)-24-(1-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-5,21-二氧代-8,11,14,17-四氧杂-4,20-二氮杂二十四-1-烷酸的制备
/>
中间体1(3.53g,1.79mmol,1.00当量)、A18(2.34g,1.79mmol,1.00当量)、抗坏血酸钠(1.42g,7.16mmol,4.00当量)、CuSO4(0.40M,4.47mL,1.00当量)和THPTA(792.95mg,1.79mmol,1.00当量)在DMF(30mL)中的混合物脱气并用N2吹扫3次,然后将混合物在N2气氛下于15℃搅拌2小时。LCMS显示中间体1完全消耗,并且一个主峰具有所需的m/z。通过制备型HPLC(TFA条件)直接纯化混合物,得到白色固体状的化合物22(4.31g,97.3%纯度,73.7%收率)。化学式:C86H123N19O24S2;LCMS发现值:[M+2H]2+=1590.0,[M+3H]3+=1060.4,[M+4H]4+=795.7。
按照与化合物22相同的步骤合成化合物化合物87、化合物88、化合物89、化合物90和化合物23。
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中间体30:3-[(1R,4S,7S,10S,13S,19S,22S,25S,28S,31R,34S,40R,44R,46S,49S)-44-氨基-49-(羧甲基)-34-[(1R)-1-羟乙基]-10-(1H-咪唑-5-基甲基)-7,28-双(1H-吲哚-3-基甲基)-13,22-二异丁基-25-异丙基-4-甲基-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,41,47,50-十五氧代-53,54-二硫杂-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,42,48,51-十五氮杂四环[29.20.4.036,40.042,46]五十五-19-基]丙酸的制备
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步骤1:(2)的制备。
固相肽合成:
使用标准Fmoc化学合成肽。
1)树脂制备:向含有CTC树脂(76.92g,40.00mmol,0.65mmol/g)和Fmoc-Gly-OH(11.88g,40.00mmol,1.00当量)的DCM(500mL)溶液的容器中滴加DIEA(26.46mL,160.00mmol,4.00当量)并用N2在15℃下鼓泡混合2小时。然后加入MeOH(76.00mL)并用N2再鼓泡30分钟。将树脂用DMF(1.00L)5次洗涤。然后添加20%哌啶的DMF(1.00L)溶液,并将混合物在15℃下用N2鼓泡30分钟。过滤混合物以获得树脂。将树脂用DMF(1.00L)5次洗涤,然后进行下一步。
2)偶联:将Fmoc-Leu-OH(42.36g,120.00mmol,3.00当量)、HBTU(43.32g,114.00mmol,2.85当量)在DMF(500mL)中的溶液添加至树脂伴随N2鼓泡。然后将DIEA(39.69mL,240mmol,6.00当量)滴加至混合物中并在15℃下用N2鼓泡30分钟。通过茚三酮试验监测偶联反应,若显示无色则偶联完成。然后用DMF(1L)5次洗涤树脂。
3)去保护:将20%哌啶的DMF(1L)溶液添加到树脂中,并将混合物在15℃下用N2鼓泡30分钟。然后用DMF(1L)5次洗涤树脂。通过茚三酮试验监测去保护反应,若显蓝色或其他棕红色,则反应完成。
4)对所有其他氨基酸重复步骤2和3:(表5中的2-15)。
表5.
肽切割和纯化:
1)将切割溶液(1%TFA/DCM,300mL)添加到含有侧链保护的粗肽(5.0mmol)的烧瓶中。将混合物在室温下搅拌5分钟。
2)过滤后,收集溶液。
3)再次重复步骤1-2。
4)合并溶液(含有化合物1)。
5)将合并的溶液用DCM(4.50L)稀释,然后添加HOBT(1.35g,10.0mmol,2.00当量)、TBTU(3.21g,10.0mmol,2.00当量)并通过DIEA调节pH至8。将混合物在15℃搅拌2小时。
6)将混合物减压浓缩以除去溶剂。
7)将残余物添加至0.50M HCl(冷,2L)中,并沉淀出白色固体。过滤后,将固体冻干,得到化合物2(9.37g,粗品),为白色固体。化学式:C153H184N20O22S2,LCMS发现值:[M+H+Na]2+=1370.4;
8)注意:按照与步骤1~7相同的步骤合成另外7批。总共8批,得到化合物2(75.0g,粗品),为白色固体。
步骤2-3:制备中间体30的一般程序。
将化合物2(75.0g,27.58mmol)在TFA/TIS/H2O(95/2.5/2.5,v/v/v,1.5L)中的混合物在15℃下搅拌2小时。用冷异丙醚(15L)沉淀混合物。过滤后,将固体真空干燥2小时,得到化合物3(51.72g,粗品)。将化合物3(25.00g,粗品)溶解在MeCN/H2O(1/1,v/v,5L)中。在15℃下将I2/HOAc(0.1M)滴加到混合物中,直至浅黄色持续存在,并在15℃下搅拌5分钟。然后用0.1M Na2S2O3逐滴淬灭混合物,直至浅黄色消失。使用相同的过程进行2批。过滤后,滤液直接通过制备型HPLC(酸性条件,TFA)纯化,得到中间体30(10.2g,纯度91.06%,收率19.7%,2批),为白色固体。化学式:C79H108N20O20S2,LCMS发现值:[M+H]+=1722.00,[M+2H]2+=861.61.
3-((6S,9R,12S,15S,18S,21S,27S,30S,33S,36S,39R,42S,44aS,46R,49aR)-30-((1H-咪唑-5-基)甲基)-12,33-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-42-(羧甲基)-46-(2-(2-(2-((((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)氨基)-2-氧代乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)-6-((R)-1-羟乙基)-18,27-二异丁基-15-异丙基-36-甲基-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,49-十五氧代四十八氢-1H-9,39-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-21-基)丙酸的制备
步骤1:TFP酯(化合物1)的制备:
A30(60.0mg,128.10umol,1.00当量)、2,3,5,6-四氟苯酚(85.1mg,512.40umol,4.00当量)在DMF(1.0mL)中的混合物冷却至0℃。然后在0℃下向混合物添加EDCI(49.1mg,256.20umol,2.00当量)并在0℃下搅拌2小时。将反应混合物通过制备型HPLC纯化(酸性条件,TFA)并冻干,得到TFP酯化合物1(68.0mg,约70%纯度,含有2,3,5,6-四氟苯酚),为无色油状物。化学式:C23H23F7N4O8,LCMS发现值:[M+H]+=617.20.
步骤2:化合物91的制备:
中间体30(208.9mg,121.34umol,1.10当量)、化合物4(68.0mg,110.31umol,1.00当量)、DIEA(57.0mg,441.24umol,76.86uL,4.00当量)在DMF(3.00mL)中的混合物在15℃下搅拌1小时。通过制备型HPLC(酸性条件,TFA)纯化反应混合物并冻干,得到化合物91(125.2mg,99.5%纯度,51.9%收率),为白色固体。化学式:C96H129F3N24O27S2,LCMS发现值:[M+2H]2+=1086.8,[M+3H]3+=724.9。
化合物92和化合物93根据与化合物91相同的程序制备。
中间体31:3-[(1R,4S,7S,10S,13S,19S,22S,25S,28S,31R,34S,40R,44R,46S,49S)-44-氨基-49-(羧甲基)-34-[(1R)-1-羟乙基]-10-(1H-咪唑-5-基甲基)-7,28-双(1H-吲哚-3-基甲基)-13,22-二异丁基-25-异丙基-4-甲基-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,41,47,50-十五氧代-53,54-二硫杂-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,42,48,51-十五氮杂四环[29.20.4.036,40.042,46]五十五-19-基]丙酸的制备
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步骤1:(2)的制备。
固相肽合成:
使用标准Fmoc化学合成肽。
1)树脂制备:向含有CTC树脂(0.77g,0.50mmol,0.65mmol/g)和Fmoc-Gly-OH(0.15g,0.50mmol,1.00当量)的DCM(0.5mL)溶液的容器中滴加DIEA(0.33mL,2.00mmol,4.00当量),并用N2在15℃下鼓泡混合2小时。然后加入MeOH(0.50mL)并用N2再鼓泡30分钟。将树脂用DMF(10mL)5次洗涤。然后添加20%哌啶的DMF(10mL)溶液,并将混合物在15℃下用N2鼓泡30分钟。过滤混合物以获得树脂。将树脂用DMF(10mL)5次洗涤,然后进行下一步。
2)偶联:将Fmoc-Leu-OH(0.53g,1.50mmol,3.00当量)、HBTU(0.54g,1.42mmol,2.85当量)在DMF(5mL)中的溶液添加至树脂伴随N2鼓泡。然后将DIEA(0.50mL,3.0mmol,6.00当量)滴加至混合物中并在15℃下用N2鼓泡30分钟。通过茚三酮试验监测偶联反应,若显示无色则偶联完成。然后用DMF(10mL)5次洗涤树脂。
3)去保护:将20%哌啶的DMF(10mL)溶液添加到树脂中,并将混合物在15℃下用N2鼓泡30分钟。然后用DMF(10mL)5次洗涤树脂。通过茚三酮试验监测去保护反应,若显蓝色或其他棕红色,则反应完成。
4)对所有其他氨基酸重复步骤2和3:(表5中的2-15)。
表5.
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肽切割和环化:
1)将切割溶液(20%HFIP/DCM,20mL)添加到含有侧链保护的粗肽(0.5mmol)的烧瓶中。将混合物在室温下搅拌1小时。
2)过滤后,收集溶液。
3)再次重复步骤1-2。
4)将合并的溶液(含有0.5mmol粗肽)用DCM(500mL)稀释,然后添加HOBT(135mg,1.00mmol,2.00当量)、TBTU(321mg,1.00mmol,2.00当量)并通过DIEA将pH调节至8。将混合物在15℃搅拌2小时。
5)将混合物减压浓缩以除去溶剂。
6)将残余物添加至0.50M HCl(冷,50mL)中,并沉淀出白色固体。过滤后,将固体冻干,得到化合物2(190.0mg,粗品),为白色固体。化学式:C111H145N19O20,LCMS发现值:[M+2H]2+=1033.62;
步骤2:(3)的制备。
(2)(190.0mg,粗品,1.00当量)、Grubbs′1st(75.6mg,1.00当量)在干燥DCM(50mL)中的混合物在微波下于60℃搅拌4小时。然后将混合物用0.5M HCl、H2O、盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥,减压浓缩,得到化合物3(160.5mg,粗品),为棕色固体。化学式:C109H141N19O20,LCMS发现值:[M+2H]2+=1019.35;
步骤2:中间体31的制备。
(3)(160.0mg,粗品)在TFA/TIS/H2O(95/2.5/2.5,v/v/v,5mL)中的混合物在15℃下1小时。然后将混合物用异丙醚(50mL)沉淀并离心(3000rpm下3分钟)。将固体用异丙醚洗涤两次,真空干燥2小时。通过制备型HPLC(TFA条件)纯化残余物,得到中间体31(42.7mg,纯度95.2%,总收率5.0%),为白色固体。化学式:C82H111N19O20,LCMS发现值:[M+2H]2+=1684.0,[M+2H]2+=843.2;
A134:3,3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((3aR,4S,7S,8R,8aR))-2,2-二甲基-8-(2,2,2-三氟乙酰胺基)六氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-4-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)的制备
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步骤1:(2)的制备
向(1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(5.00g,26.1mmol,1.00当量)在MeOH(50.0mL)中的溶液中添加化合物1(48.30g,339mmol,46.9mL,13.00当量)。将混合物在40℃下搅拌36小时。TLC(二氯甲烷/甲醇=7/1)显示(1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(Rf=0)没有保留,并且检测到一个主要的新斑点(Rf=0.30)。将反应混合物减压浓缩,得到残余物。将残余物通过柱色谱(SiO2,石油醚/乙酸乙酯=1/0至0/1,二氯甲烷/甲醇=7/1,Rf=0.30)直接纯化,得到化合物2(4.50g,15.6mmol,59.9%收率),为无色油状物。化学式:C9H12F3NO6。1HNMR:400MHz,DMSO-d6δ:9.50(d,J=7.2Hz,1H),4.92-4.72(m,3H),3.83-3.72(m,4H),3.65-3.57(m,3H)。
步骤2:(4)的制备。
向化合物2(4.50g,15.6mmol,1.00当量)在DMF(45.0mL)中的溶液中添加CSA(1.96g,7.83mmol,0.50当量)和化合物3(8.16g,78.35mmol,9.60mL,5.00当量)。将混合物在80℃搅拌12小时。LC-MS显示检测到所需质量(Rt=0.39分钟)。将反应混合物减压浓缩,得到残余物。将残余物通过柱色谱法纯化(SiO2,石油醚/乙酸乙酯=1/0至0/1,二氯甲烷∶甲醇=7/1,Rf=0.66)。将残余物通过柱色谱纯化(SiO2,石油醚/乙酸乙酯=1/0至0/1,二氯甲烷/甲醇=7/1,Rf=0.66)得到化合物4(4.50g,13.7mmol,87.7%收率),为黄色油状物。化学式:C12H16F3NO6,LCMS发现值:[M+H]+=328.0.1H NMR:400MHz,DMSO-d6δ:9.72(d,J=8.4Hz,1H),5.26(s,1H),5.16-5.13(m,1H),4.41-4.38(m,1H),4.32(d,J=6.0Hz,1H),3.81-3.66(m,5H),1.40(s,3H),1.28(s,3H)。
步骤3:(5B)的制备。
向化合物5A(5.00g,22.8mmol,1.00当量)在DCM(50.0mL)中的溶液中添加TEA(2.77g,27.3mmol,3.81mL,1.20当量)和甲基磺酰基甲磺酸酯(5.16g,29.6mmol,1.30当量)。将混合物在25℃搅拌12小时。TLC(石油醚/乙酸乙酯=0/1)表明化合物5A(Rf=0.20)被保留,并且检测到一个主要的新斑点(Rf=0.50)。通过添加H2O(50.0mL)淬灭反应混合物,然后用DCM(30.0mL*2)萃取。将合并的有机层用盐水(50.0mL x 3)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2,石油醚/乙酸乙酯=100/1至0/1,石油醚/乙酸乙酯=0/1,Rf=0.50)纯化,得到化合物5B(4.80g,16.1mmol,70.7%收率),为无色油状物。化学式:C9H19N3O6S。1H NMR:400MHz,CDCl3δ:4.39-4.36(m,2H),3.78-3.75(m,2H),3.69-3.65(m,10H),3.40-3.37(m,2H),3.07(s,3H)。
步骤4:(5)的制备
向化合物4(2.00g,6.11mmol,1.00当量)在DMF(20.0mL)中的溶液中添加NaH(977mg,24.4mmol,60.0%纯度,4.00当量)。将混合物在25℃搅拌1.5小时。然后添加化合物5B(2.00g,6.72mmol,1.10当量)和NaI(183mg,1.22mmol,0.200当量)并将混合物在60℃搅拌14.5小时。LC-MS(EC492-348-P1A)显示检测到所需化合物(Rt=0.64分钟)。通过添加饱和NH4Cl 25.0mL淬灭反应混合物,然后用EtOAc(25.0mL*3)萃取。将合并的有机层用盐水(20.0mL x 3)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2,石油醚/乙酸乙酯=1/0至0/1,石油醚/乙酸乙酯=3/1,Rf=0.50)纯化,得到化合物5(3.00g,5.68mmol,92.8%收率,100%纯度),为浅黄色油状物。化学式:C20H31F3N4O9,LCMS发现值:[M+Na]+=551.1;1H NMR:400MHz,CDCl3δ:7.03(s,1H),4.24(d,J=6.0Hz,1H),4.18-4.15(m,1H),4.05(d,J=1.6Hz,1H),3.95(d,J=10.0Hz,1H),3.83-3.77(m,3H),3.73-3.61(m,15H),3.38-3.36(m,2H),1.53(s,3H),1.34(s,3H)。
步骤5:(6)的制备。
化合物5(2.50g,4.73mmol,1.00当量)、Pd/C(250mg,4.73mmol,10.0%纯度,1.00当量)在MeOH(25.0mL)中的混合物脱气并用H2吹扫3次,然后将混合物在H2(15.0psi)气氛下于25℃搅拌2小时。LC-MS显示检测到所需质量(Rt=0.50分钟)。过滤反应混合物并减压浓缩以除去MeOH,得到化合物6(1.60g,3.18mmol,67.3%收率),为无色油状物。化学式:C20H33F3N2O9,LCMS发现值:[M+H]+=503.1.1H NMR:400MHz,CD3ODδ:8.52(s,1H),5.29(s,1H),4.92(S,1H),4.37-4.30(m,2H),3.95(d,J=6.8Hz,1H),3.88(d,J=8.4Hz,3H),3.81(d,J=7.6Hz,1H),3.74-3.61(m,15H),3.13-3.11(m,2H),1.49(s,3H),1.34(s,3H)。
步骤6:(8)的制备。
化合物7(3.87g,42.4mmol,1.00当量)、化合物7a(15.7g,123mmol,17.8mL,2.90当量)、NaOH(5.00M,849uL,0.100当量)在DMSO(40.0mL)中的混合物在20℃搅拌12小时。TLC(二氯甲烷/甲醇=10/1)显示化合物7(Rf=0.050)完全消耗,并且一个主要新斑点(Rf=0.600)形成。将混合物用H2O(2.50mL)洗涤并用EtOAc(10.0mL*3)萃取。将合并的有机层用盐水(10.0mL*3)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。将残余物通过柱色谱纯化(SiO2,二氯甲烷/甲醇=1/0至10/1,二氯甲烷/甲醇=10/1,Rf=0.600)得到化合物8(14.7g,粗品),为黄色固体。
步骤7:(9)的制备。
向化合物8a(1.00g,6.36mmol,1.00当量)在DMF(10.0mL)中的溶液中添加HATU(5.44g,14.3mmol,2.25当量)。将混合物在20℃搅拌0.5小时。添加DIEA(3.29g,25.4mmol,4.43mL,4.00当量)和化合物8(2.65g,7.64mmol,1.20当量)。将混合物在20℃搅拌1小时。LCMS显示化合物8a完全消耗,并检测到所需质量(Rt=0.66分钟)。将反应混合物用1M HCl(10.0mL)洗涤并用EtOAc(10.0mL x 3)萃取。将合并的有机层用H2O(10.0mL x 3)、盐水(10.0mL x 3)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。将残余物通过柱色谱纯化(SiO2,石油醚/乙酸乙酯=1/0至1/1,石油醚/乙酸乙酯=1/1,Rf=0.350),得到化合物9(2.58g,5.30mmol,83.3%收率),为黄色油状物。化学式:C23H42N4O7,LCMS发现值:[M+H]+=487.2.1H NMR:400MHz,CDCl3δ:6.27(d,J=8.0Hz,1H),4.19-4.14(m,1H),3.73-3.63(m,4H),3.61-3.57(m,2H),3.42-3.38(m,2H),3.29-3.25(t,J=8.0Hz,2H),2.53-2.41(m,4H),2.22-2.19(t,J=8.0Hz,2H),1.71-1.58(m,5H),1.46(s,18H)
步骤8:(10)的制备。
向化合物9(2.00g,4.11mmol,1.00当量)的溶液中添加TFA(15.48g,135mmol,10.0mL,33.0当量)。将混合物在20℃搅拌2小时。LCMS显示化合物8完全消耗并达到所需质量(Rt=0.50分钟)。将混合物减压浓缩以除去TFA,得到残余物。通过制备型HPLC(FA条件)纯化残余物,得到化合物10(84.0mg,220umol,5.36%收率,98.2%纯度),为呈黄色油状物。化学式:C15H26N4O7,LCMS发现值:[M+H]+=375.1.1H NMR:400MHz,CDCl3δ:6.16(d,J=8.0Hz,1H),4.22-4.20(m,1H),3.75-3.73(m,4H),3.61-3.58(m,2H),3.48-3.44(m,2H),3.30-3.27(t,J=12.0Hz,2H),2.61-2.58(m,4H),2.23-2.19(t,J=16.0Hz,2H),1.70-1.59(m,4H),1.46-1.37(m,2H)
步骤9:A134的制备
向化合物10(81.0mg,212umol,98.2%纯度,1.00当量)在DMF(1.00mL)中的溶液中添加HATU(181mg,478umol,2.25当量)。将混合物在20℃下搅拌0.5hr。添加DIEA(109mg,849umol,148uL,4.00当量)和化合物6(241.0mg,478umol,99.3%纯度,2.25当量)。将混合物在20℃搅拌2小时。LCMS显示化合物10完全消耗并发现一个具有所需质量的主峰。通过添加FA(0.500mL)淬灭反应混合物。通过制备型HPLC(FA条件)纯化反应混合物,得到A134(129.0mg,98.0%纯度,44.3%收率),为棕色油状物。化学式:C55H88F6N8O23,LCMS发现值:[M+H]+=1343.9.
化合物94:3-((6S,9R,12S,15S,18S,21S,27S,30S,33S,36S,39R,42S,44aS,46S,49aR)-30-((1H-咪唑-5-基)甲基)-12,33-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-42-(羧甲基)-46-(20-(1-(20-(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-2,3-二羟基-4-(2,2,2-三氟乙酰胺基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-1-((1S,2R,3R,4R,5S)-2,3-二羟基-4-(2,2,2-三氟乙酰胺基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十七烷-27-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-17-氧代-4,7,10,13-四氧杂-16-氮杂二十烷酰胺基)-6-((R)-1-羟乙基)-18,27-二异丁基-15-异丙基-36-甲基-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,49-十五氧代四十八氢-1H-9,39-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-21-基)丙酸的制备
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步骤1:化合物11的制备。
在0℃的N2下向中间体4(20.0mg,9.69umol,1.00当量)、A134(13.2mg,9.69umol,98.0%纯度,1.00当量)的DMF(0.50mL)溶液中添加新鲜的CuSO4(0.40M,24.2uL,1.00当量)、抗坏血酸钠(0.40M,96.9uL,4.00当量)和THPTA(4.21mg,9.69umol,1.00当量)溶液。将混合物在0℃搅拌2小时。LCMS显示一个主峰是所需质量。反应混合物通过制备型HPLC(HCl条件)直接纯化,得到化合物11(26.0mg,粗品),为白色固体。化学式:C151H223F6N29O49S2,LCMS发现值:[M+3H]3+=1136.3。
步骤2:化合物94的制备。
化合物11(20.0mg,5.87umol,1.00当量)在HCl(1M,2.00mL,340.67当量)中的溶液在20℃搅拌2小时。LCMS显示化合物11完全消耗并发现一个具有所需质量的主峰。通过制备型HPLC(HCl条件)纯化反应混合物,得到化合物94(10.0mg,2.93umol,97.4%纯度,49.8%收率),为呈棕色油状物。化学式:C145H215F6N29O49S2,LCMS发现值:[M+3H]3+=1109.6.1H NMR:400MHz,MeODδ:8.21-8.20(m,1H),7.74(s,1H),7.49-6.89(m,10H),5.29-5.25(m,2H),4.66-4.55(m,3H),4.50-4.41(m,2H),4.40-4.32(m,3H),4.26-4.19(m,2H),4.14-3.97(m,8H),3.92-3.88(m,4H),3.81-3.79(m,3H),3.77-3.58(m,52H),3.55-3.51(m,7H),3.48-3.42(m,5H),3.38-3.34(m,11H),3.27-3.12(m,4H),3.04-2.83(m,4H),2.75-2.69(m,2H),2.60-2.38(m,11H),2.35-2.18(m,7H),2.15-2.06(m,2H),2.05-1.55(m,16H),1.35-1.16(m,8H),1.06-0.79(m,18H)
A136:3,3′-((2-(6-叠氮基己酰胺基)-2-(1-((3aR,4S,7S,8R,8aR)-2,2-二甲基-8-(2,2,2-三氟乙酰胺基)六氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-4-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((3aR,4S,7S,8R,8aR)-2,2-二甲基-8-(2,2,2-三氟乙酰胺基)六氢-4,7-环氧[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-d]氧杂环庚烷-4-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)的制备
步骤6:化合物8的制备。
化合物7(10.0g,82.5mmol,11.9mL,1.00当量)、化合物7a(47.6g,371mmol,53.9mL,4.50当量)和NaOH(5M,1.65mL,0.100当量)的DMSO(25.0mL)混合物在20℃搅拌16小时。LCMS显示检测到所需质量(Rt=0.524分钟)。通过添加H2O(30.0mL)淬灭反应混合物,然后用EtOAc(30.0mL*3)萃取。将合并的有机层用盐水(30.0mL x 3)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2,石油醚/乙酸乙酯=100/1至0/1,二氯甲烷/甲醇=10/1,Rf=0.30)纯化,得到化合物8(22.0g,43.5mmol,52.7%收率),为无色油状物。化学式:C25H47NO9,LCMS发现值:[M+H]+=506.2。1H NMR:400MHz,DMSO-d6δ:3.58-3.53(m,6H),3.17(s,6H),2.40-2.37(s,6H),1.39(s,27H)。
步骤7:化合物9的制备。
向化合物8a(300.0mg,1.91mmol,1.00当量)在DCM(10.0mL)中的溶液中添加HATU(2.25g,5.92mmol,3.10当量)并在20℃搅拌0.5小时。然后添加DIEA(1.23g,9.54mmol,1.66mL,5.00当量)和化合物8(1.16g,2.29mmol,1.20当量)。将混合物在20℃搅拌1.5小时。LCMS显示一个主峰是所需化合物。通过添加1N HCl(10.0mL)淬灭反应混合物,然后用EtOAc(10.0mL*3)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL x 2)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。将残余物通过柱色谱法(SiO2,石油醚/乙酸乙酯=1/0至0/1,石油醚/乙酸乙酯=3/1,Rf=0.65)纯化,得到化合物9(960.0mg,99.7%纯度,76.1%收率),为无色油状物。化学式:C31H56N4O10,LCMS发现值:[M+H]+=645.3。
步骤8:化合物10的制备。
将化合物9(960.0mg,1.48mmol,99.7%纯度)在DCM(10.0mL)和TFA(68.3mg,1.48mmol,56.0uL,1.00当量)中的溶液在20℃下搅拌12小时。LCMS显示一个主峰是所需质量。将反应混合物减压浓缩,得到残余物。残余物通过制备型HPLC纯化(FA条件)并冻干,得到化合物10(281.0mg,98.7%纯度,39.2%收率),为无色油状物。化学式:C19H32N4O10,LCMS发现值:[M+H]+=477.1。1H NMR:400MHz,DMSO-d6δ:6.94(s,1H),3.57-3.53(m,12H),3.31-3.28(m,2H),2.43-2.40(m,6H),2.07-2.03(m,2H),1.55-1.42(m,4H),1.31-1.23(m,2H)。
步骤9:A136的制备。
向化合物10(190mg,398umol,1.00当量)在DCM(10.0mL)中的溶液添加DIEA(257mg,1.99mmol,347uL,5.00当量)并在20℃搅拌10分钟,然后添加HATU(470mg,1.24mmol,3.10当量)和化合物6(651mg,1.30mmol,3.25当量)。将混合物在20℃搅拌2小时。LCMS显示检测到所需质量(Rt=0.64分钟)。通过添加1M HCl(5.00mL)淬灭反应混合物,然后用DCM(5.00mL*3)萃取。将合并的有机层用盐水(5.00mL x 3)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。通过制备型HPLC(FA条件)纯化残余物,得到呈棕色油状的化合物A136(122.0mg,97.2%纯度,15.41%收率)。化学式:C79H125F9N10O34,LCMS发现值:[M+H]+=1930.4.1H NMR:400MHz,DMSO-d6δ:9.72(s,2H),7.91-7.88(m,3H),7.00(s,1H),4.41-4.38(m,3H),4.31(d,J=5.6Hz,3H),3.84-3.66(m,14H),3.64-3.51(m,44H),3.42-3.37(m,6H),3.29-3.28(m,4H),3.24-3.17(m,5H),2.34-2.28(m,5H),2.09-2.05(m,2H),1.55-1.43(m,4H),3.64-3.51(m,44H),1.40(s,9H),1.28(s,9H)。
化合物95:3-((6S,9R,12S,15S,18S,21S,27S,30S,33S,36S,39R,42S,44aS,46S,49aR)-30-((1H-咪唑-5-基)甲基)-12,33-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-46-(20-(1-(20,20-双(1-((1S,2R,3R,4R,5S)-2,3-二羟基-4-(2,2,2-三氟乙酰胺基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-1-((1S,2R,3R,4R,5S)-2,3-二羟基-4-(2,2,2-三氟乙酰胺基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14,21-二氮杂二十六烷-26-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-17-氧代-4,7,10,13-四氧杂-16-氮杂二十烷酰胺基)-42-(羧甲基)-6-((R)-1-羟乙基)-18,27-二异丁基-15-异丙基-36-甲基-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,49-十五氧代四十八氢-1H-9,39-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-21-基)丙酸的制备
/>
步骤1:化合物11的制备。
在0℃在N2下向化合物中间体4(20.0mg,9.69umol,1.00当量),A136(19.25mg,9.69umol,1.00当量)的DMF(0.50mL)溶液中添加CuSO4(0.4M,24.2uL,1.00当量)、抗坏血酸钠(0.4M,96.9uL,4.00当量)和THPTA(4.21mg,9.69umol,1.00当量)。将混合物在0℃搅拌2小时。LCMS显示一个主峰是所需质量。通过制备型HPLC纯化反应混合物,得到呈白色固体的化合物11(13.0mg,2.63umol,80.8%纯度,27.1%收率)。化学式:C175H260F9N31O60S2,LCMS发现值:[M+3H]3+=1331.6。
步骤2:化合物95的制备。
将化合物11(11.0mg,2.23umol,80.8%纯度,1.00当量)在HCl(1M,0.2mL)中的溶液在20℃下搅拌2小时。LCMS显示一个主峰是所需质量。通过制备型HPLC(FA条件)纯化反应混合物,得到化合物95(7.00mg,94.7%纯度,81.2%收率),为棕色油状物。化学式:C166H248F9N31O60S2,LCMS发现值:[M+3H]3+=1291.6。
化合物96:3-((6S,9R,12S,15S,18S,21S,27S,30S,33S,36S,39R,42S,44aS,46S,49aR)-30-((1H-咪唑-5-基)甲基)-12,33-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-42-(羧甲基)-46-(4-(1-(((1S,2R,3R,4R,5S))-2,3-二羟基-4-(2,2,2-三氟乙酰胺基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-1-基)甲基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)丁酰胺基)-6-((R)-1-羟乙基)-18,27-二异丁基-15-异丙基-36-甲基-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,49-十五氧代四十八氢-1H-9,39-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五烷-21-基)丙酸的制备
步骤1:化合物1的制备。
向(1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇(500.0mg,1.64mmol,1.00当量)的MeOH(5.00mL)溶液中添加TEA(497mg,4.91mmol,684uL,3.00当量)和(Boc)2O(536mg,2.46mmol,564uL,1.50当量)。将混合物在20℃搅拌12小时。LC-MS显示(1S,2R,3R,4R,5S)-4-氨基-1-(羟甲基)-6,8-二氧杂双环[3.2.1]辛烷-2,3-二醇消耗,一个主峰是所需的质量。通过制备型HPLC(TFA条件)纯化粗产物,得到化合物1(300.0mg,粗品),为白色固体。化学式:C12H21NO7,LCMS发现值:[M+Na]+=314.0。1HNMR:400MHz,DMSO-d6δ:6.73(d,J=7.6Hz,1H),5.07(s,1H),4.87(s,1H),4.65(s,1H),4.48(s,1H),3.75-3.72(m,1H),3.65(s,1H),3.58-3.49(m,4H),3.40-3.37(m,1H),1.38(s,9H)。
步骤2:化合物3的制备。
向化合物1(300.0mg,1.03mmol,1.00当量)和化合物2(536.0mg,5.15mmol,630uL,5.00当量)的DMF(3.00mL)溶液中添加CAS:5872-08-2(128.0mg,514.0umol,0.50当量)。将混合物在80℃搅拌12小时。LC-MS显示化合物1被消耗,并检测到所需质量(Rt=0.54分钟)。通过制备型HPLC(TFA条件)纯化粗产物,得到化合物3(300.0mg,87.91%收率),为黄色固体。化学式:C15H25NO7,LCMS发现值:[M+Na]+=354.1.1H NMR:400MHz,DMSO-d6δ:7.08(d,J=8.0Hz,1H),5.14(s,1H),5.06(t,J=5.6Hz,1H),4.21-4.20(m,1H),4.13(t,J=5.6Hz,1H),3.74-3.61(m,4H),3.37(t,J=5.6Hz,1H),1.38(s,12H),1.26(s,3H)。
步骤3:化合物4的制备。
向化合物3(200.0mg,603.0umol,1.00当量)的DCM(0.50mL)溶液中添加TEA(79.4mg,784umol,109uL,1.30当量)和甲基磺酰基甲磺酸酯(126.0mg,724.0umol,1.20当量)。将混合物在20℃搅拌1小时。LC-MS显示化合物3被消耗并且检测到所需的质量。将混合物倒入H2O(2.0mL)中。将水性混合物用DCM(10.00mL*3)萃取,将合并的有机层用盐水(3.00mL*3)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。将残余物通过制备型TLC纯化(SiO2,DCM∶MeOH=10∶1,Rf=0.40),得到化合物4(140mg,粗品),为白色固体。化学式:C16H27NO9S,LCMS发现值:[M+Na]+=432.0.1H NMR:400MHz,CDCl3δ:5.40(s,1H),4.75-4.77(m,1H),4.61-4.53(m,2H),4.15(d,J=6.4Hz,1H),4.04(t,J=6.4Hz,1H),3.86-3.84(m,1H),3.79-3.77(m,1H),3.09(s,3H),1.56(s,3H),1.45(s,9H),1.36(s,3H)。
步骤4:化合物5的制备。
在20℃和N2下向化合物4(140mg,341umol,粗纯度,1.00当量)在DMF(1.40mL)中的溶液中添加NaN3(70.0mg,1.08mmol,3.15当量)。在N2下将混合物在90℃下搅拌24小时。LC-MS显示化合物4被保留并且检测到所需的质量。将混合物冷却至20℃并倒入饱和Na2CO3(2.00mL)。将水性混合物用EtOAc(10.00mL*3)萃取,将合并的有机层用饱和Na2CO3(2.00mL5次)、盐水(3.00mL*3)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。通过制备型HPLC(FA条件)纯化粗产物,得到化合物5(60.0mg,粗品),为白色固体。化学式:C15H24N4O6,LCMS发现值:[M+Na]+=379.1。1H NMR:EC6537-20-P1B,400MHz,CDCl3δ:5.37(s,1H),4.79-4.77(m,1H),4.12-4.10(d,J=6.0Hz,1H),4.00(t,J=6.0Hz,1H),3.77-3.67(m,5H),1.55(s,3H),1.43(s,9H),1.35(s,3H)。
步骤5:化合物6的制备。
将化合物5(30.0mg,84.1umol,1.00当量)在DCM(0.01mL)和TFA(1.50mL)中的溶液在50℃搅拌1小时。LC-MS显示检测到所需质量。将混合物减压浓缩,得到残余物。通过制备型HPLC(FA条件)纯化粗产物,得到化合物6(16.0mg,粗品),为白色固体。化学式:C7H12N4O4,LCMS发现值:[M+Na]+=217.1.1H NMR:400MHz,CD3ODδ:5.48(s,1H),3.89-3.82(m,4H),3.74(d,J=8.4Hz,1H),3.62(d,J=13.2Hz,1H),3.19(d,J=8.8Hz,1H)。
步骤6:化合物8的制备。
向化合物6(16.0mg,74.0umol,1.00当量)在MeOH(0.10mL)中的溶液中添加化合物7(31.5mg,222umol,30.6uL,3.00当量)。将混合物在50℃搅拌2小时。LC-MS显示化合物6被消耗并且检测到所需的质量。将混合物减压浓缩,得到化合物8(10.0mg,43.28%收率),为白色固体。化学式:C9H11F3N4O5,LCMS发现值:[M-96]+=217.1。1H NMR:400MHz,DMSO-d6δ:5.48(s,1H),3.89-3.82(m,4H),3.74(d,J=8.4Hz,1H),3.62(d,J=13.2Hz,1H),3.19(d,J=8.8Hz,1H)。
步骤7:化合物96的制备。
在0℃和N2下向化合物8(5.00mg,16.0umol,1.10当量)和中间体48(12.6mg,29.1umol,2.00当量)的DMF(0.05mL)溶液中添加CuSO4(0.40M,72.8uL,2.00当量)、抗坏血酸钠(0.40M,145uL,4.00当量)和THPTA(12.6mg,29.1umol,2.00当量)。将混合物在0℃搅拌12小时。LC-MS显示化合物8被消耗并检测到所需质量。通过制备型HPLC(FA条件)纯化粗产物,得到化合物96(15.0mg,98.2%纯度,46.53%收率,FA),为白色固体。化学式:C94H125F3N24O26S2,LCMS发现值:[M-96]+=1016.7.
中间体32:3-((6S,9R,12S,15S,18S,21S,27S,30S,33S,36S,39S,42S,44aS,49aR)-30-((1H-咪唑-5-基)甲基)-12,33-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-42-(羧甲基)-6-((R)-1-羟乙基)-18,27-二异丁基-15-异丙基-36-甲基-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,49-十五氧代四十八氢-1H-39,9-(乙烷硫基甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-21-基)丙酸的制备
/>
/>
步骤1:化合物2的制备。
将化合物1(20.0g,48.61mmol,1.00当量)、NMM(5.90g,58.33mmol,6.41mL,1.20当量)的THF(200mL)溶液冷却至0℃,然后在0℃下向混合物滴加IBCF(7.97g,58.33mmol,7.66mL,1.20当量)。将反应混合物在20℃搅拌1小时。过滤混合物并将滤液冷却至0℃。然后慢慢添加NaBH4(2.88g,76.13mmol,1.57当量)在H2O(20mL)中的溶液。将反应混合物在0℃搅拌0.5小时。将反应混合物减压浓缩,并将残余物用EtOAc(200mL)稀释,用1M HCl(50mL)、H2O(50mL)、盐水(50mL)洗涤,用Na2SO4干燥,减压浓缩,得到化合物2(16.53g,粗品),为白色固体。化学式:C23H27NO5,LCMS发现值:[M+Na]+=420.2。
步骤2:化合物3的制备。
在0℃下向化合物2(16.53g,41.59mmol,1.00当量)、PPh3(16.36g,62.38mmol,1.50当量)和咪唑(4.25g,62.38mmol,1.50当量)的THF(500mL)溶液中滴加I2(15.83g,62.38mmol,12.57mL,1.50当量)的THF(200mL)溶液。然后将反应混合物温热至20℃并搅拌4小时。LC-MS显示化合物2完全消耗,并且一个主峰是所需的m/z。过滤混合物并减压浓缩。将残余物通过柱色谱法(SiO2,石油醚/乙酸乙酯=50/1至5/1)纯化以得到呈白色固体的化合物3(18.35g,86.96%收率)。化学式:C23H26INO4,LCMS发现值:[M+Na]+=530.09。
步骤3:化合物4的制备。
化合物3(1.20g,2.37mmol,1.00当量)、Boc-Cys-OH(785.03mg,3.55mmol,1.50当量)、NaOMe(5.4M,875.99uL,2.00当量)的MeOH(50mL)混合物在15℃下搅拌2小时。LCMS发现所需的MS。用1M HCl将混合物酸化至pH=5。然后通过快速(C18,TFA条件)直接纯化混合物,得到化合物4(1.10g,77.42%收率),为白色固体。化学式:C31H40N2O8S,LCMS发现值:[M+H-Boc]+=501.3,[M+H-Boc-tBu]+=445.2。
步骤4-5:化合物6的制备。
固相肽合成:
使用标准Fmoc化学合成肽。
1)树脂制备:向含有CTC树脂(3.08g,2.00mmol,0.65mmol/g)和Fmoc-Pro-OH(674.0g,2.00mmol,1.00当量)的DCM(20.0mL)溶液的容器中滴加DIEA(1.39mL,8.00mmol,4.00当量),并用N2在20℃下鼓泡混合2小时。然后加入MeOH(2.00mL)并用N2再鼓泡30分钟。将树脂用DMF(40mL)5次洗涤。然后添加20%哌啶的DMF(40mL)溶液,并将混合物在20℃下用N2鼓泡30分钟。过滤混合物以获得树脂。将树脂用DMF(400mL)5次洗涤,然后进行下一步。
2)偶联:Fmoc-D-Pro-OH(2.02g,6.00mmol,3.00当量)、HBTU(2.19g,5.70mmol,2.85当量)在DMF(20.0mL)中的溶液添加到树脂中伴随N2鼓泡。然后将DIEA(2.09mL,12.0mmol,6.00当量)滴加至混合物中并在20℃下用N2鼓泡30分钟。通过茚三酮试验监测偶联反应,若显示无色则偶联完成。然后用DMF(40mL)5次洗涤树脂。
3)去保护:将20%哌啶的DMF(40mL)溶液添加到树脂中,并将混合物在20℃下用N2鼓泡30分钟。然后用DMF(40mL)5次洗涤树脂。通过茚三酮试验监测去保护反应,若显蓝色或其他棕红色,则反应完成。
4)对所有其他氨基酸重复步骤2和3:(表5中的2-4)。
表5.
肽切割和环化:
1)将切割溶液(1%TFA/DCM,40mL)添加到含有侧链保护的粗肽(2.00mmol)的烧瓶中。将混合物在室温下搅拌3分钟。
2)过滤后,收集溶液。
3)再次重复步骤1-2。
4)将合并的溶液(含有2.00mmol粗肽)用DCM(200mL)稀释,然后添加HOBT(540.0mg,4.00mmol,2.00当量)、TBTU(1.28g,4.00mmol,2.00当量)并通过DIEA将pH调节至8。将混合物在20℃搅拌2小时。
5)将混合物用1M HCl(50mL)、盐水(50mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并减压浓缩,得到化合物6(1.78g,粗品),为白色固体。化学式:C41H66N6O12S,LCMS发现值:[M+H]+=868.03.
步骤6:化合物7的制备。
将化合物6(1.78g,粗品)在TFA/H2O(95/5,v/v,30mL)中的混合物在20℃下搅拌2小时。然后减压除去溶剂。将残余物溶解于THF(20mL)、H2O(10mL)中,用饱和NaHCO3水溶液碱化至pH=8,然后在20℃向混合物中加入Fmoc-OSu(1.38g,2.00当量)。将混合物在20℃搅拌2小时。LCMS显示化合物6完全消耗并且一个主峰是所需的MS。减压除去THF。将残余物通过1M HCl酸化至pH=5,用DCM(50mL)萃取,用盐水(10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,在减压下浓缩。将残余物通过制备型HPLC(TFA条件)纯化,得到化合物7(716.0mg,纯度90%,总收率40.8%),为白色固体。化学式:C43H52N6O12S,LCMS发现值:[M+H]+=877.53.
步骤7-8:化合物9的制备。
固相肽合成:
使用标准Fmoc化学合成肽。
1)树脂制备:向含有CTC树脂(0.77g,0.50mmol,0.65mmol/g)和Fmoc-Gly-OH(148.0mg,0.50mmol,1.00当量)的DCM(5.0mL)溶液的容器中滴加DIEA(348.6uL,2.00mmol,4.00当量)并用N2在20℃下鼓泡混合2小时。然后加入MeOH(2.00mL)并用N2再鼓泡30分钟。将树脂用DMF(40mL)5次洗涤。然后添加20%哌啶的DMF(100mL)溶液,并将混合物在20℃下用N2鼓泡30分钟。过滤混合物以获得树脂。将树脂用DMF(10mL)5次洗涤,然后进行下一步。
2)偶联:Fmoc-Leu-OH(529.5mg,1.50mmol,3.00当量)、HBTU(548.6mg,1.42mmol,2.85当量)在DMF(5.0mL)中的溶液添加至树脂中伴随N2鼓泡。然后将DIEA(0.53mL,3.0mmol,6.00当量)滴加至混合物中并在20℃下用N2鼓泡30分钟。通过茚三酮试验监测偶联反应,若显示无色则偶联完成。然后用DMF(10mL)5次洗涤树脂。
3)去保护:将20%哌啶的DMF(10mL)溶液添加到树脂中,并将混合物在20℃下用N2鼓泡30分钟。然后用DMF(10mL)5次洗涤树脂。通过茚三酮试验监测去保护反应,若显蓝色或其他棕红色,则反应完成。
4)对所有其他氨基酸重复步骤2和3:(表5中的2-15)。
表5.
肽切割、环化和去保护:
1)将切割溶液(1%TFA/DCM,20mL)添加到含有侧链保护的粗肽(0.50mmol)的烧瓶中。将混合物在室温下搅拌3分钟。
2)过滤后,收集溶液。
3)再次重复步骤1-2。
4)将合并的溶液(含有0.50mmol粗肽)用DCM(50mL)稀释,然后添加HOBT(135.0mg,1.00mmol,2.00当量)、TBTU(320mg,1.00mmol,2.00当量)并通过DIEA将pH调节至8。将混合物在20℃搅拌2小时。
5)将混合物用1M HCl(20mL)、盐水(20mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并减压浓缩,得到化合物7(0.50mmol,粗品),为白色固体。
6)将化合物7(0.50mmol,粗品)在TFA/TIS/H2O(95/2.5/2.5,20mL)中的混合物在20℃下搅拌1小时。
7)用异丙醚(冷,100mL)沉淀混合物并离心(3000rpm 3分钟)。将固体用异丙醚洗涤两次,真空干燥2小时。
8)将残余物通过制备型HPLC(TFA条件)纯化,得到化合物9(53.0mg,纯度90%,总收率6.1%)。化学式:C83H113N19O20S,LCMS发现值:[M+2H]2+=865.9.
步骤9:化合物中间体32的制备。
化合物9(53.0mg,30.65umol,1.00当量)、Pd(PPh3)4(14.1mg,12.26umol,0.40当量)、苯基硅烷(66.3mg,613.08umol,75.65uL,20.00当量)的DMF(0.50mL)混合物脱气并用N2吹扫3次,然后将混合物在N2气氛下于20℃搅拌1小时。通过制备型HPLC(TFA条件)直接纯化混合物,得到中间体32(21.8mg,94.4%纯度,42.1%收率),为白色固体。化学式:C83H113N19O20S,LCMS发现值:[M+H]+=1690.0,[M+2H]2+=845.6。
另外的合成方案
化合物97:N-((S)-1-环庚基-2-((4-((R)-1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基))吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-(4-甲基哌嗪-1-羰基)-13-氧代-2,5,8,11-四氧杂-14-氮杂十六烷-16-基)苯基)氨基)-2-氧代乙基)-1-乙基-1H-吡唑-5-甲酰胺的制备
1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-烷酸的制备
步骤1:在室温下向N-((3aR,4R,7S,7aR)-4-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)乙酰胺(7g,14.53mmol)在DCM(70mL)中的溶液中添加TEA(2.06mL,14.83mmol)、DMAP(0.12g,0.98mmol)和二碳酸二叔丁酯(3.17mL,14.83mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。起始材料消耗后(LCMS监测),将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过快速色谱法纯化,得到叔丁基乙酰基((3aR,4R,7S,7aR)-4-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)氨基甲酸酯(7g,83%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:584[M+H]+。
步骤2:在室温下向叔丁基乙酰基((3aR,4R,7S,7aR)-4-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)氨基甲酸酯(7g,11.9mmol)在THF(70mL)中的溶液中添加NaOH(40%,10mL,59.9mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。起始材料消耗后(LCMS监测),缓慢添加水(20mL)。将混合物用乙酸乙酯(100mL)稀释并用水(20mL x 3)洗涤。将有机层经硫酸钠干燥,过滤,减压浓缩,得到粗产物,将其通过快速色谱纯化,得到((3aR,4R,7S,7aR)-4-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)氨基甲酸叔丁酯(6g,93%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:542[M+H]+。
步骤3:向((3aR,4R,7S,7aR)-4-(((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)氨基甲酸叔丁酯(6g,11mmol)的THF(100mL)中的溶液中添加TBAF溶液(22mL,1M在THF中)。将反应在室温下搅拌3小时。将混合物减压浓缩,得到粗产物,将其通过快速色谱法纯化(硅胶,0-10%DCM的MeOH溶液),得到((3aR,4R,7S,7aR)-4-(羟甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)氨基甲酸叔丁酯(2.5g,76%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:304[M+H]+。
步骤4:在0℃下向((3aR,4R,7S,7aR)-4-(羟甲基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基溶液)氨基甲酸叔丁酯(2.5g,8.2mmol)的DMF(50mL)溶液中添加NaH(0.47g,60%重量,在矿物油中,12.3mmol)和2-(2-(2-(2-(甲苯磺酰氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸甲酯(2.6g,7.38mmol)。将混合物在室温下搅拌过夜。起始材料消耗后(LCMS监测),将反应容器再次冷却至0℃,缓慢添加水(10mL)并将反应混合物搅拌15分钟。将混合物用乙酸乙酯(100mL)稀释并用水(20mL x 3)洗涤。将有机层用硫酸钠干燥,减压浓缩,得到粗产物,将其通过快速色谱纯化,得到1-((3aR,4R,7S,7aR)-7-((叔丁氧基羰基)氨基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-烷酸(2.0g,51%),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:494[M+H]+。
步骤5:在室温下向1-((3aR,4R,7S,7aR)-7-((叔丁氧基羰基)氨基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-烷酸(2.0g,4.0mmol)的THF(20mL)溶液中添加HCl溶液(4mL,2N的H2O溶液)。将混合物在室温下搅拌3小时。将混合物减压浓缩,得到粗品1-((2R,3R,4R,5S)-5-氨基-3,4-二羟基四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-烷酸(1.0g,71%收率),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:354[M+H]+。
步骤6:在N2气氛下在室温下向1-((2R,3R,4R,5S)-5-氨基-3,4-二羟基四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-烷酸(209mg,1.65mmol)和DIPEA(209mg,1.65mmol)在干DMF(10mL)中的溶液中添加2,4-二氯-6-甲氧基嘧啶(199mg,1.1mmol)。添加完成后,将反应在100℃下搅拌过夜。起始材料消耗后(TLC监测),将反应容器再次冷却至室温。将混合物用乙酸乙酯(100mL)稀释并用水(20mL x 3)洗涤。将有机层用硫酸钠干燥,减压浓缩,得到粗产物,将其通过快速色谱法纯化,得到1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-烷酸(10mg,收率3.5%),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:500[M+H]+。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.11(s,1H),7.99(s,1H),4.33(td,J=10.6,5.2Hz,1H),4.17-4.06(m,3H),3.92(d,J=3.0Hz,1H),3.74-3.52(m,16H),3.12(t,J=10.8Hz,1H)。
步骤1:TFP酯(化合物4)的制备:
将2,3,5,6-四氟苯酚、酸1在DMF中的混合物冷却至0℃。然后在0℃下向混合物中添加EDCI并在0℃下搅拌2小时。通过制备型HPLC纯化反应混合物,得到TFP酯2。
步骤2:中间体(3)的制备:
(S)-2-环庚基-2-(1-乙基-1H-吡唑-5-甲酰胺基)乙酸甲酯
向(S)-2-氨基-2-环庚基乙酸甲酯(1.0mmol)在DMF(10mL)中的溶液中添加1-乙基-1H-吡唑-5-甲酸(1.15mmol,1.15当量)。接下来,添加2mmol DIPEA和1.2mmol HATU。将反应搅拌1小时,然后添加水。使用乙酸乙酯(3 x 25mL)从水层中萃取产物,然后合并有机物并浓缩。通过二氧化硅色谱法(100%乙酸乙酯)纯化粗物质并通过UV可视化。
(S)-2-环庚基-2-(1-乙基-1H-吡唑-5-甲酰胺基)乙酸
将(S)-2-环庚基-2-(1-乙基-1H-吡唑-5-甲酰胺基)乙酸甲酯(1mmol)溶解在10mLTHF和10mL水中。接下来,添加10mmol氢氧化锂并在室温下搅拌反应直至起始材料耗尽(LC-MS)。将反应物用1M HCl酸化至pH 2,然后用乙酸乙酯萃取。合并有机物并浓缩,然后无需进一步纯化即可用于下一步。
(R)-(3-(4-(苄氨基)苯基)-1-(4-甲基哌嗪-1-基)-1-氧代丙烷-2-基)氨基甲酸叔丁酯
向(R)-3-(4-(苄基氨基)苯基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸(1.0mmol)在DMF(10mL)中的溶液中添加N-甲基哌嗪(1.15mmol,1.15当量)。接下来,添加2mmol DIPEA和1.2mmol HATU。将反应搅拌1小时,然后添加水。使用乙酸乙酯(3 x 25mL)从水层中萃取产物,然后合并有机物并浓缩。通过二氧化硅色谱法(100%乙酸乙酯)纯化粗物质并通过UV可视化。
(R)-(3-(4-氨基苯基)-1-(4-甲基哌嗪-1-基)-1-氧代丙烷-2-基)氨基甲酸叔丁酯
向三颈圆底烧瓶中加入(R)-(3-(4-(苄基氨基)苯基)-1-(4-甲基哌嗪-1-基)-1-氧代丙烷-2-基)氨基甲酸叔丁酯(1mmol)、0.1mmol碳载钯(5%,Degussa)、5mL乙醇和5mLTHF。接下来,将烧瓶的顶部空间抽真空并重新填充氢气。将氢气球安装在烧瓶的颈部之一。将反应在氢气下搅拌12小时,然后通过硅藻土过滤。通过旋转蒸发除去溶剂并且无需进一步纯化即可使用。
((R)-3-(4-((S)-2-环庚基-2-(1-乙基-1H-吡唑-5-甲酰胺基)乙酰胺基)苯基)-1-(4-甲基哌嗪-1-基)-1-氧代丙烷-2-基)氨基甲酸叔丁酯
向(R)-(3-(4-氨基苯基)-1-(4-甲基哌嗪-1-基)-1-氧代丙烷-2-基)氨基甲酸叔丁酯(1.0mmol)的DMF(10mL)溶液中加入(S)-2-环庚基-2-(1-乙基-1H-吡唑-5-甲酰胺基)乙酸(1.15mmol,1.15当量)。接下来,添加2mmol DIPEA和1.2mmol HATU。将反应搅拌1小时,然后添加水。使用乙酸乙酯(3 x 25mL)从水层中萃取产物,然后合并有机物并浓缩。通过二氧化硅色谱法(100%乙酸乙酯)纯化粗物质并通过UV可视化。
N-((S)-2-((4-((R)-2-氨基-3-(4-甲基哌嗪-1-基)-3-氧代丙基)苯基)氨基)-1-环庚基-2-氧代乙基)-1-乙基-1H-吡唑-5-甲酰胺
((R)-3-(4-((S)-2-环庚基-2-(1-乙基-1H-吡唑-5-甲酰胺基)乙酰胺基)苯基)-1-(4-甲基哌嗪-1-基)-1-氧代丙-2-基)氨基甲酸叔丁酯(1.0mmol)溶解在10mL DCM中,然后添加20mmol三氟乙酸。将反应在室温下搅拌四小时,然后浓缩成粗固体。通过HPLC纯化固体,得到标题化合物。
/>
步骤3化合物97的制备:将氨基中间体3、TFP酯2、DIEA在DMF中的混合物在25℃下搅拌1小时。通过HPLC纯化反应混合物,得到标题化合物。
N-((S)-1-环庚基-2-((4-((R)-1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-(4-甲基哌嗪-1-羰基)-13-氧代-2,5,8,11-四氧杂-14-氮杂十六烷-16-基)苯基)氨基)-2-氧代乙基)-1-异丙基-1H-吡唑-5-甲酰胺(化合物98),N-((S)-2-((4-((R)-2)-乙酰胺基-3-(4-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-酰基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基)苯基)氨基)-1-环庚基-2-氧代乙基)-1-乙基-1H-吡唑-5-甲酰胺(化合物99)和N-((S)-2-((4-((R)-2-乙酰胺基-3-(4-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-酰基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基)苯基)氨基)-1-环庚基-2-氧代乙基)-1-异丙基-1H-吡唑-5-甲酰胺(化合物100)的制备
以下化合物化合物98、化合物99和化合物100按照与化合物97相同的程序制备,使用酸中间体1和相应的氨基中间体,N-((S)-2-((4-((R)-2-氨基-3-(4-甲基哌嗪-1-基)-3-氧代丙基)苯基)氨基)-1-环庚基-2-氧代乙基)-1-异丙基-1H-吡唑-5-甲酰胺,(N-((S)-2-((4-((R)-2-乙酰胺基-3-氧代-3-(哌嗪-1-基)丙基)苯基)氨基)-1-环庚基-2-氧代乙基)-1-乙基-1H-吡唑-5-甲酰胺和N-((S)-2-((4-((R)-2-乙酰胺基-3-氧代-3-(412-哌嗪-1-基)丙基)苯基)氨基)-1-环庚基-2-氧代乙基)-1-异丙基-1H-吡唑-5-甲酰胺。
/>
3,3′-((2-((R)-2-(4-((S)-2-环庚基-2-(1-乙基-1H-吡唑-5-甲酰胺基)乙酰胺基)苄基)-1-(4-甲基哌嗪-1-基)-1,4-二氧代-6,9,12-三氧杂-3-氮杂酸十四烷-14-酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)(化合物101)的制备
1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-烷酸的制备
步骤1:在室温下在H2气球下向(2R,3R,4R,5S)-2-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(300mg,0.59mmol)在MeOH(10mL)中的溶液中添加Pd/C(30mg,10%wt,60%湿)。将反应在室温下搅拌0.5小时。将所得混合物过滤并真空浓缩。粗产物无需进一步纯化即可用于下一步。LC-MS(ESI)发现值:485[M+H]+。
步骤2:15-((2-羧基乙氧基)甲基)-3,13-二氧代-1-苯基-2,5,8,11,17-五氧杂-14-氮杂二十-20-烷酸(125mg,0.24mmol)、DIPEA(0.16mL,0.94mmol)和HATU(197mg,0.52mmol)的DMF(10mL)溶液在室温下搅拌30分钟。在室温下添加(2R,3R,4R,5S)-2-(13-氨基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇(296mg,0.52mmol)。将反应搅拌过夜。将所得混合物真空浓缩。通过制备型HPLC纯化粗产物,得到1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-烷酸苄酯(250mg,0.17mmol),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:1463[M+H]+.
步骤3:在室温下向1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-烷酸苄酯(250mg,0.17mmol)的THF(5mL)和H2O(1.5mL)溶液中添加LiOH(21.5mg,0.51mmol)。将反应在室温下搅拌2小时。用2N HCl将反应调节至酸性。通过制备型HPLC纯化粗产物,得到1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-20-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-烷酸(160mg,68%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:1373[M+H]+.1H NMR(400MHz,CD3OD):δ:8.12(s,2H),8.00(s,2H),4.34(td,J=10.6,5.1Hz,2H),4.23-4.18(m,1H),4.14-4.09(m,4H),4.00(s,2H),3.93(d,J=2.4Hz,2H),3.73-3.61(m,44H),3.57-3.50(m,8H),3.38(t,J=5.4Hz,4H),3.12(t,J=10.8Hz,2H),2.45(t,J=6.1Hz,4H)。19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-70.26(s)。
化合物101的制备
N-((S)-2-((4-((R)-2-氨基-3-(4-甲基哌嗪-1-基)-3-氧代丙基)苯基)氨基)-1-环庚基-2-氧代乙基)-1-乙基-1H-吡唑-5-甲酰胺、EDCI、HOBt在DMF中的混合物在0℃下搅拌1小时。通过制备型HPLC(酸性条件,TFA)纯化混合物,得到Dice 5。
以下化合物化合物102、化合物103和化合物104按照与化合物101相同的程序制备,使用相应的相应的氨基中间体,N-((S)-2-((4-((R)-2-氨基-3-(4-甲基哌嗪-1-基)-3-氧代丙基)苯基)氨基)-1-环庚基-2-氧代乙基)-1-异丙基-1H-吡唑-5-甲酰胺、(N-((S)-2-((4-((R)-2-乙酰胺基-3-氧代-3-(哌嗪-1-基)丙基)苯基)氨基)-1-环庚基-2-氧代乙基)-1-乙基-1H-吡唑-5-甲酰胺和N-((S)-2-((4-((R)-2-乙酰胺基-3-氧代-3-(412-哌嗪-1-基)丙基)苯基)氨基)-1-环庚基-2-氧代乙基)-1-异丙基-1H-吡唑-5-甲酰胺。
化合物104
化合物105:N-((2S)-1,1-二环丙基-3-((4-(1-(1-((4R,7S))-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)-3,5-二甲基-1H-吡唑-4-基)苯基)氨基)-3-氧代丙烷-2-基)-1-异丙基-1H-吡唑-5-甲酰胺的合成
化合物106:3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-(4-(4-((S)-3,3-二环丙基-2-(1-异丙基-1H-吡唑-5-甲酰胺基)丙酰胺基)苯基)-3,5-二甲基-1H-吡唑-1-基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)的合成
化合物107:N-((S)-(4,4-二氟环己基)(7-((S)-1-((S)-3-(1-((2R,3R,4R,5S))-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)-2-氧代-4-(三氟甲基)咪唑啉-1-基)-2-甲氧基乙基)咪唑并[1,2-b]哒嗪-2-基)甲基)-4-甲基-1,2,5-噁二唑-3-甲酰胺的合成
/>
化合物108:3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-((S)-3-((S)-1-(2-((S)-(4,4-二氟环己基)(4-甲基-1,2,5-噁二唑-3-甲酰胺基)甲基)咪唑并[1,2-b]哒嗪-7-基)-2-甲氧基乙基)-2-氧代-5-(三氟甲基)咪唑啉-1-基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)丙酰胺)的合成
/>
化合物109:N-((S)-(4,4-二氟环己基)(7-((S)-1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基))吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-16-((S)-2-氧代-4-(三氟甲基)咪唑啉-1-基)-2,5,8,11,14-五氧杂十六烷-16-基)咪唑并[1,2-b]哒嗪-2-基)甲基)-4-甲基-1,2,5-噁二唑-3-甲酰胺
1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-20-(1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-烷酸的制备
步骤1:在室温在H2气球下向N-((3aR,4R,7S,7aR)-4-(13-叠氮基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(230mg,0.42mmol)的MeOH(10mL)溶液中加入Pd/C 10%(20mg,10%wt.,60%湿)。将反应在室温下搅拌0.5小时。将所得混合物过滤并真空浓缩。粗产物无需进一步纯化即可用于下一步。LC-MS(ESI)发现值:525[M+H]+。
步骤2:15-((2-羧基乙氧基)甲基)-3,13-二氧代-1-苯基-2,5,8,11,17-五氧杂-14-氮杂二十-20-烷酸(75mg,0.14mmol)、DIPEA(0.1mL,0.57mmol)和HATU(118.5mg,0.31mmol)在DMF(5mL)中的溶液在室温下搅拌30分钟。在室温下添加(N-((3aR,4R,7S,7aR)-4-(13-氨基-2,5,8,11-四氧杂十三烷基)-2,2-二甲基四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-7-基)-6-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(163.4mg,0.31mmol)。将反应搅拌过夜。将所得混合物真空浓缩。通过快速色谱法(硅胶,0-10%MeOH的DCM溶液)纯化粗产物,得到1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-20-(1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-烷酸苄酯(120mg,收率55%),为无色油状物。LC-MS(ESI)发现值:1543[M+H]+。
步骤3:在室温下在H2气球下向1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-20-(1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪)-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-烷酸苄酯(120mg,0.08mmol)在MeOH(5mL)中的溶液中添加Pd/C(12mg,10%重量,60%湿)。将反应在室温下搅拌2小时。将所得混合物过滤并真空浓缩。通过快速色谱法(硅胶,0-15%MeOH的DCM溶液)纯化粗产物,得到1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-20-(1-((3aR,4R,7S,7aR)-2,2-二甲基-7-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-4H-[1,3]二氧杂环戊烯并[4,5-c]吡喃-4-基)-15-氧代-2,5,8,11,18-五氧杂-14-氮杂十九烷-19-基)-15,22-二氧代-2,5,8,11,18,24,27,30-八氧杂-14,21-二氮杂三十二-32-烷酸(50mg,44%收率),为白色固体。LC-MS(ESI)发现值:1453[M+H]+.1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.10(s,2H),8.02(s,2H),4.33-4.25(m,4H),4.22-4.18(m,1H),4.14(dd,J=8.8,5.0Hz,2H),4.01(s,2H),3.95(dd,J=12.2,6.5Hz,6H),3.75-3.62(m,40H),3.57-3.51(m,8H),3.38(t,J=5.5Hz,4H),3.14(t,J=11.2Hz,2H),2.46(t,J=6.1Hz,4H),1.50(s,6H),1.33(s,6H)。19F NMR(377MHz,CD3OD):δ-70.31(s)。
中间体33(S)-4-(((4R,7S,10S,13S,16S,22S,25S,28S,31S,34R)-25-((1H-咪唑-5-基)甲基)-7,28-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-4-(((2S,3R)-1-乙酰胺基-3-羟基-1-氧代丁-2-基)氨基甲酰基)-16-(3,17-二氧代-7,10,13-三氧杂-4,16-二氮杂二十二-21-炔-1-基)-13,22-二异丁基-10-异丙基-31-甲基-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33-十氧代-1,2-二硫杂-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32-十氮杂环三十五烷-34-基)氨基)-3-氨基-4-氧代丁酸的合成
步骤1:固相肽合成:
该肽是使用标准Fmoc化学合成的。
6)树脂制备:将AM树脂(66.67g,20.00mmol,0.30mmol/g)的DMF(600mL)溶液用N2鼓泡在15℃混合30分钟。用DMF(600mL)5次洗涤树脂。然后添加20%哌啶的DMF(600mL)溶液,并在15℃下用N2鼓泡混合物30分钟。过滤混合物以获得树脂。在进行下一步之前,用DMF(600mL)5次洗涤树脂。
7)偶联:将Fmoc-Thr(tBu)-OH(23.82g,60.00mmol,3.00当量)、HBTU(21.60g,57mmol,2.85当量)的DMF(300mL)溶液添加到树脂中伴随N2鼓泡。然后将DIEA(22.11mL,120mmol,6.00当量)滴加至混合物中并在15℃下用N2鼓泡30分钟。通过茚三酮试验监测偶联反应,若显示无色则偶联完成。然后用DMF(600mL)5次洗涤树脂。
8)去保护:将20%哌啶的DMF(600mL)溶液添加到树脂中,并将混合物在15℃下用N2鼓泡30分钟。然后用DMF(600mL)5次洗涤树脂。去保护反应通过茚三酮试验监测,若显蓝色或其他棕红色,则反应完成。
9)对所有其他氨基酸重复步骤2和3:(下表中的2-15)。
步骤2:肽切割和纯化:
7)在室温下将切割缓冲液(92.5%TFA/2.5%TIS/2.5%H2O/2.5%3-巯基丙酸)添加到含有侧链保护的肽的烧瓶中并搅拌2小时。
8)用冷异丙醚沉淀肽并离心(3000rpm,3分钟)。
9)用异丙醚另外洗涤两次。
10)将粗肽真空干燥2小时。
11)将粗制肽在MeCN(10L)和H2O(10L)、碘(0.1M在AcOH中)中的混合物滴加到剧烈搅拌的肽溶液中,直至持续呈黄色。2分钟后,滴加硫代硫酸钠(0.1M水溶液)直至黄色消失。将混合物冻干,得到粗粉末。
12)粗肽通过制备型HPLC纯化(A:H2O中的0.075%TFA,B:ACN),得到标题化合物,为白色固体。
步骤3:炔烃与肽的偶联
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所得化合物表征如下:
使用与中间体33相同的程序合成中间体34,在固相肽合成的步骤3中用Fmoc-Trp-OH代替Fmoc-Trp(1-Me)-OH。
中间体35:(S)-4-(((4R,7S,10S,13S,16S,22S,25S,28S,31S,34R)-25-((1H-咪唑-5-基)甲基)-7-((1H-吲哚-3-基)甲基)-4-(((2S,3R)-1-乙酰胺基-3-羟基-1-氧代丁烷-2-基)氨基甲酰基)-16-(2-羧乙基)-13,22-二异丁基-10-异丙基-31-甲基-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33-十氧代-28-((1-(2-(2-(2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)-1H-吲哚-3-基)甲基)-1,2-二硫杂-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32-十氮杂环三十五烷-34-基)氨基)-3-乙酰胺基-4-氧代丁酸的合成
第1部分:官能化色氨酸的合成:
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步骤1:固相肽合成:
使用标准Fmoc化学合成肽:。
10)树脂制备:将AM树脂(66.67g,20.00mmol,0.30mmol/g)的DMF(600mL)溶液用N2鼓泡在15℃混合30分钟。用DMF(600mL)5次洗涤树脂。然后添加20%哌啶的DMF(600mL)溶液,并在15℃下用N2鼓泡混合物30分钟。过滤混合物以获得树脂。在进行下一步之前,用DMF(600mL)5次洗涤树脂。
11)偶联:将Fmoc-Thr(tBu)-OH(23.82g,60.00mmol,3.00当量)、HBTU(21.60g,57mmol,2.85当量)的DMF(300mL)溶液添加到树脂中伴随N2鼓泡。然后将DIEA(22.11mL,120mmol,6.00当量)滴加至混合物中并在15℃下用N2鼓泡30分钟。通过茚三酮试验监测偶联反应,若显示无色则偶联完成。然后用DMF(600mL)5次洗涤树脂。
12)去保护:将20%哌啶的DMF(600mL)溶液添加到树脂中,并将混合物在15℃下用N2鼓泡30分钟。然后用DMF(600mL)5次洗涤树脂。去保护反应通过茚三酮试验监测,若显蓝色或其他棕红色,则反应完成。
13)对所有其他氨基酸重复步骤2和3:(下表中的2-15)。
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步骤2:肽切割和纯化:
13)在室温下将切割缓冲液(92.5%TFA/2.5%TIS/2.5%H2O/2.5%3-巯基丙酸)添加到含有侧链保护的肽的烧瓶中并搅拌2小时。
14)用冷异丙醚沉淀肽并离心(3000rpm,3分钟)。
15)用异丙醚另外洗涤两次。
16)将粗肽真空干燥2小时。
17)将粗肽在MeCN(10L)和H2O(10L)、碘(0.1M在AcOH中)中的混合物滴加到剧烈搅拌的肽溶液中,直至持续呈黄色。2分钟后,滴加硫代硫酸钠(0.1M水溶液)直至黄色消失。将混合物冻干,得到粗粉末。
18)粗肽通过制备型HPLC纯化(A:H2O中的0.075%TFA,B:ACN),得到标题化合物,为白色固体。
中间体36,2-((6S,9R,12S,15S,18S,21S,27S,30S,33S,36S,39R,42S,44aS,46S,49aR)-30-((1H-咪唑-5-基)甲基)-12,33-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-46-氨基-21-(3,17-二氧代-7,10,13-三氧杂-4,16-二氮杂二十二-21-炔-1-基)-6-((R)-1-羟乙基)-18,27-二异丁基-15-异丙基-36-甲基-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,49-十五氧代四十八氢-1H-9,39-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五烷-42-基)乙酸的制备
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中间体36的固相肽合成
中间体37:3-((6S,9R,12S,15S,18S,21S,27S,30S,33S,36S,39R,42S,44aS,46S,50aR)-30-((1H-咪唑-5-基)甲基)-12,33-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-46-氨基-42-(2,16-二氧代-6,9,12-三氧杂-3,15-二氮杂二十一-20-炔-1-基)-6-((R)-1-羟乙基)-18,27-二异丁基-15-异丙基-36-甲基-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,50-十五氧代四十八氢-1H-9,39-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-b:1′,2′-r1][1]氧杂[2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44]十五氮杂环四十六-21-基)丙酸的制备
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中间体37的固相肽合成:
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中间体38:3-((6S,9R,12S,15S,18S,21S,27S,30S,33S,36S,39R,42S,44aS,46S,50aR)-30-((1H-咪唑-5-基)甲基)-12-((1H-吲哚-3-基)甲基)-46-氨基-42-(羧甲基)-6-((R)-1-羟乙基)-18,27-二异丁基-15-异丙基-36-甲基-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,50-十五氧代-33-((1-(2-(2-(2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)-1H-吲哚-3-基)甲基)四十八氢-1H-9,39-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-b:1′,2′-r1][1]氧杂[2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44]十五氮杂环四十六-21-基)丙酸的制备
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中间体38的固相肽合成:
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中间体39:N-(15-((6S,9R,12S,15S,18S,21S,27S,30S,33S,36S,39R,42S,44aS,46S,49aR)-30-((1H-咪唑-5-基)甲基)-12,33-双((1H-吲哚-3-基)甲基)-46-氨基-6-((R)-1-羟乙基)-18,27-二异丁基-15-异丙基-36,42-二甲基-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,49-十五氧代四十八氢-1H-9,39-(甲烷二硫代甲烷)二吡咯并[1,2-a:1′,2′-d][1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43]十五氮杂环四十五-21-基)-13-氧代-3,6,9-三氧杂-12-氮杂十五烷基)己-5-炔酰胺的制备
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中间体39的固相肽合成
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中间体40的制备:
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中间体40的固相肽合成:
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3,3′-((2-(2-(2-(2-(2-((S)-7-(5-(1-((2-氰基吡啶-3-基)甲基)-2,2-二甲基-3-氧代-2,3-二氢-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-6-基)嘧啶-2-基)-3-氧代六氢咪唑并[1,5-a]吡嗪-2(3H)-基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)丙酰胺)的合成
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3,3′-((2-(6-(4-(1-((S))-7-(5-(1-((2-氰基吡啶-3-基)甲基)-2,2-二甲基-3-氧代-2,3-二氢-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-6-基)嘧啶-2-基)-3-氧代六氢咪唑并[1,5-a]吡嗪-2(3H)-基)-15-氧代-4,7,10-三氧杂-14-氮杂十八烷-18-基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)己酰胺基)丙烷-1,3-二基)双(氧基))双(N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((4-(三氟甲基)嘧啶-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三烷-13-基)丙酰胺)
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N-(3-((S)-7-(5-(1-((2-氰基吡啶-3-基)甲基)-2,2-二甲基-3-氧代-2,3-二氢-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-6-基)嘧啶-2-基)-3-氧代六氢咪唑并[1,5-a]吡嗪-2(3H)-基)丙基)-2-(4-((4-(((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)哌嗪-1-基)甲基)苯氧基)乙酰胺
/>
N1-(2-(2-((S)-7-(5-(1-((2-氰基吡啶-3-基)甲基)-2,2-二甲基-3-氧代-2,3-二氢-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-6-基)嘧啶-2-基)-3-氧代六氢咪唑并[1,5-a]吡嗪-2(3H)-基)乙氧基)乙基)-N4-(((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)甲基)对苯二甲酰胺
3-((11-((11-氧杂环烷基)甲基)-1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-18-(2-(2-(2-(2-(4-(3-(4-(异喹啉-8-基)苯乙氧基)-4-(1H-吡咯并[3,2-c]吡啶-3-基)苄基)哌嗪-1-基)-2-氧代乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)-13-氧代-2,5,8,16-四氧杂-12-氮杂十九烷-19-基)氧基)-N-(1-((2R,3R,4R,5S)-3,4-二羟基-5-((6-(三氟甲基)吡嗪-2-基)氨基)四氢-2H-吡喃-2-基)-2,5,8,11-四氧杂十三-13-基)丙酰胺
表1A.本发明的胞外蛋白降解化合物
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其他代表性免疫球蛋白降解剂
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表2A.本发明的ASGPR配体
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表2B.本发明的ASGPR配体
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表3A.测试的中间体
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表3B.测试的中间体
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实施例1.使用表面等离子共振(SPR)测量免疫球蛋白降解剂对ASGPR的亲和力
使用Biacore 8K仪器(GE Healthcare)在25℃通过表面等离子体共振测量本文所述的化合物对ASGP受体的解离常数(Kd)。将生物素化的ASGPR(20μg/ml)以5μl/min的流速固定在SA传感器芯片(GE Healthcare)上90秒,达到500-3000共振单位(RU)的固定水平。运行缓冲液为50mM HEPES,pH7.5,150mM NaCl,50mM CaCl2,0.01%P20,3%DMSO。化合物的浓度取决于Kd值从2mM到5nM。这些化合物被稀释2或3倍,有8个浓度点。含有连续稀释化合物的溶液以40μL/min的流速注入150-300秒,然后针对每个浓度进行90-300秒的解离阶段。使用50mM HEPES、pH7.5、150mMNaCl、5mM EDTA、0.01%P20、3%DMSO再生表面。
使用Biacore 8K中的分析软件处理数据,以执行背景扣除、双重参考和溶剂校正。以解离常数(Kd)表示的亲和力值通过使用以下方程将稳态结合响应(RU)拟合为浓度([化合物])的函数来确定:RU=RUmax/(KD+[化合物]),其中RU max是计算的最大响应。在适当的情况下,使用1∶1结合模型拟合双参考数据进行动力学分析。获得的数据总结于下表4中。该测定也用于生成图21中的数据。
表4A.选定化合物的ASGPR结合
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在上表中,Kd值>=1000nM=+、<1000nM=++、<500nM=+++和<100nM=++++
表4B.另外的ASGPR结合配体的ASGPR结合
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在上表中,Kd值>=100μM=+、<100μM=++、<10μM=+++,且<1μM=++++
表4C.所选化合物的ASGPR和IgG亲和力
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在上表中,Kd值为>=1000nM=*、<1000nM=**、<500nM=***和<100nM=****
实施例2使用表面等离子共振(SPR)测量化合物对IgG的亲和力
使用Biacore 8K仪器(GE Healthcare)在25℃通过表面等离振子共振(SPR)测量本文所述的化合物对IgG的解离常数(Kd)。使用NHS/EDC化学方法在pH 5.5的乙酸钠中,以5μl/min的流速将IgG(2μg/ml)固定在CM5传感器芯片(GE Healthcare)上290秒。获得的固定水平范围为1000-1300共振单位(RU)。运行缓冲液为10mM HEPES、pH 7.4、400mM NaCl、0.005%P20、3%DMSO。化合物的初始浓度取决于Kd值在500nM至100nM之间。这些化合物被稀释2或3倍,有8个浓度点。含有连续稀释化合物的溶液以50μL/min的流速注入90秒,然后每个浓度的解离阶段为500秒。
使用Biacore 8K中的分析软件处理数据,以执行背景扣除、双重参考和溶剂校正。使用1∶1结合模型进行动力学分析,或使用稳态结合响应(RU)作为浓度([化合物])的函数,使用以下方程拟合双参考数据:RU=RUmax/(KD+[化合物]),其中RU max是计算的最大响应。该测定还用于生成图22中的数据并适用于生成图23中的数据。
表5.选择的化合物的IgG结合
/>
在上表中,Kd值>=1000nM=+、<1000nM=++、<500nM=+++和<100nM=++++
实施例3三元复合物形成和HepG2细胞摄取
三元复合物形成测定
三元复合物形成测定旨在确定降解剂、恒定浓度的荧光标记抗体和细胞表面的ASGPR受体之间形成复合物所需的降解剂浓度。峰值平均荧光强度(MFI)出现在三元复合物形成的最佳降解剂浓度下。降解剂的次优浓度(过多或过少)导致形成的复合物减少并降低MFI。
按照制造商的说明,使用Alexa FluorTM488蛋白质标记试剂盒(Thermo Fisher,A10235)用Alexa Fluor 488共价标记人IgG(Sigma-Aldrich,I4506)。HepG2细胞(ATCC,HB-8065)培养至约70%汇合并通过胰蛋白酶消化收获。将HepG2细胞的单细胞悬浮液以1 x105细胞/孔铺在细胞培养基(补充有10%FBS的DMEM)中的96孔板中,并置于4℃下。对于使用人IgG的研究,将细胞与100nM AF488标记的抗人IgG和基于IgG的降解剂的连续稀释液在4℃下孵育1小时。对于使用DNP的研究,将细胞与100nM AF488标记的多克隆兔抗二硝基苯基(DNP)抗体(ThermoFisher)和基于DNP的降解剂的连续稀释液在4℃下孵育1小时。用含有0.1%BSA和0.1%叠氮化钠的冰冷PBS洗涤一次后,将细胞重悬于150uL PBS+0.1%BSA中,并使用iQueScreener PLUS流式细胞仪(IntelliCyt)通过流式细胞术测量细胞相关的AF488荧光。数据显示测量的MFI。图1显示随着化合物28浓度的增加,结合的AF488标记的DNP抗体在HepG2细胞的细胞表面上形成三元复合物。EC50测量为化合物28相对于峰值MFI(0.0047mM)的半数最大浓度。测试化合物的EC50结果总结于下表6中。该程序还用于生成图12化合物4和图13(化合物4与非活性化合物)中的数据。非活性化合物不具有C3和C4羟基取代基。当用ASGPR敲除细胞重复该测定时,没有以明显的浓度发生三元复合物形成(参见图15)。
非活性化合物
细胞摄取测定
细胞摄取测定旨在测量与ASGPR受体形成三元复合物并将整个复合物内吞到细胞中后化合物介导的荧光标记抗体的细胞摄取。化合物的最佳浓度将导致具有细胞内抗体的细胞的最大数量,并表示为抗体阳性细胞与细胞总数的峰值比率。与三元复合物形成测定一样,过多或过少的化合物将导致复合物形成不理想,并且较少的细胞将具有可测量的细胞内荧光。
按照制造商的说明,使用Alexa FluorTM 488蛋白质标记试剂盒(Thermo Fisher,A10235)用Alexa Fluor 488共价标记人IgG(Sigma-Aldrich,I4506)。将HepG2细胞接种于补充有10%FBS的DMEM 96孔微量滴定板中,每孔5000个细胞,并在37℃/5%CO2下孵育约18小时。对于使用人IgG的研究,将100nM AF488标记的人IgG抗体和基于IgG的降解剂(0.1%DMSO最终浓度)的系列稀释液添加到细胞中,并将混合物在37℃下孵育6小时。对于使用DNP的研究,将100nM AF488标记的DNP抗体和基于DNP的降解剂(0.1%DMSO最终浓度)的系列稀释液添加到细胞中,并将混合物在37℃下孵育6小时。HepG2细胞在-20℃下于100%甲醇中固定20分钟,用PBS洗涤3次,然后用DAPI(Thermo,Cat#H3570)染色。使用Operetta CLS高含量分析系统(PerkinElmer)对HepG2细胞进行DAPI和Alexa Fluor 488成像。数据以hIgG或DNP(AF-488荧光)阳性细胞数比总细胞数(通过DAPI测量)的比率表示。图2显示随着化合物28浓度的增加DNP抗体的细胞摄取。EC50测量为化合物28相对于抗体阳性细胞的峰值比率(0.0038mM)的半数最大浓度。测试化合物的EC50结果总结于下表6中。该程序用于生成图12(化合物4)和图14(化合物4与非活性化合物)中的数据。当用ASGPR敲除细胞重复测定时,IgG摄取显著降低(见图16)。
表6.三元复合物的形成和选定化合物的摄取
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在上表中,EC50值为>=1000nM=+、<1000nM=++、<500nM=+++和<100nM=++++
实施例4细胞共定位研究
为了确认DNP-IgG在被HepG2细胞摄取后被转运至溶酶体,用溶酶体标记物LAMP2对细胞进行染色,并通过免疫荧光显微镜观察AF488标记的DNP-IgG的亚细胞位置。
HepG2细胞接种于补充有10%FBS的DMEM中,在37℃/5%CO2下孵育约18小时。将AF488标记的DNP抗体(100nM)和DMSO或100nM化合物28添加到细胞中,并在37℃下再孵育8小时。将细胞用100%甲醇在-20℃下固定20分钟,然后用封闭缓冲液(1XPBS,含有5%正常山羊血清和0.1%Triton X-100)在室温下孵育1小时。将细胞用抗LAMP2(Abcam)在4℃染色约18小时,然后用山羊抗小鼠IgG-AF647在室温处理2小时。细胞核用DAPI染色。照片是在Leica荧光显微镜上以40倍放大倍数拍摄。
在用DNP-IgG和100nM化合物28处理的HepG2细胞中,DNP-IgG被摄取到细胞中并与溶酶体标记物LAMP2共定位(图4,化合物28,下图)。相比之下,在不存在化合物28(DMSO)的情况下添加到HepG2细胞中的DNP-IgG没有显示出细胞摄取,因为在HepG2细胞中未检测到AF488荧光(图4,DMSO,上图)。
实施例5细胞降解测定:
为了观察细胞中IgG的降解,将荧光标记的DNP抗体和化合物的混合物添加到HepG2细胞中,并经16小时发生细胞摄取。然后洗涤细胞以去除细胞外抗体和化合物,并在摄取后的不同时间点取样以检测抗体重链和轻链的完整和/或蛋白水解片段随时间的水平,作为抗体降解的动力学测量。
HepG2细胞接种在补充有10%FBS的DMEM中,以每孔20,000个细胞的最终数量接种到12孔板中。孵育约18小时后,将1μM抗DNP-AF488抗体和/或0.2μM化合物28添加到细胞中并孵育16小时。第二天,用细胞培养基洗涤细胞一次,并更换为缺乏抗DNP-AF488抗体或化合物28的细胞培养基,并分别孵育0、1、2、4和8小时。洗涤并在含有蛋白酶抑制剂的RIPA缓冲液中裂解细胞。通过SDS-PAGE分离细胞裂解物,并通过iBright 1500凝胶读数器(ThermoFisher)观察荧光抗DNP-AF488抗体降解产物。结果数据如图3所示。HepG2细胞摄取16小时后,观察到DNP-IgG的细胞内重链和轻链。分别在1小时和8小时后观察到完整重链和轻链的丢失,表明细胞内DNP-IgG被HepG2细胞降解。
实施例6另外的IgG细胞降解测定
将HepG2细胞接种在补充有10%FBS的DMEM中,接种到6孔板中,最终数量为每孔1x106细胞。孵育约18小时后,将1mg/mL人IgG和/或1μM化合物21添加到细胞中并孵育0、1、4、8、16、24和48小时。用PBS洗涤细胞两次,并在含有蛋白酶抑制剂的RIPA缓冲液中裂解。通过SDS-PAGE分离细胞裂解物,并使用抗人IgG抗体通过蛋白质印迹法观察IgG降解产物,并使用LiCOR成像仪观察。还在SDS-PAGE上分离了人IgG(5和25ng)作为全长IgG的阳性对照。该测定用于产生图17中的数据。
实施例7通过免疫印迹检测全长IgG和IgG降解产物
将HepG2细胞接种在补充有10%FBS的DMEM中,接种到6孔板中,最终数量为每孔1x106细胞。孵育约18小时后,将1mg/mL人IgG和/或1μM化合物21添加到细胞中并孵育1小时。将细胞用细胞培养基洗涤一次并更换为新鲜细胞培养基并孵育0、0.5、1、2或4小时。将细胞在含有蛋白酶抑制剂的RIPA缓冲液中裂解。通过SDS-PAGE分离细胞裂解物,并使用抗人IgG抗体通过蛋白质印迹法观察IgG降解产物,并使用LiCOR成像仪可视化。还在SDS-PAGE上分离了人IgG(5和25ng)作为全长IgG的阳性对照。该测定用于产生图18中的数据。
实施例8大鼠肝细胞中的IgG降解
将大鼠肝细胞以每孔1x 106个细胞接种在OptiPlate培养基中,接种到胶原蛋白包被的6孔板中。4小时后,用OptiCulture培养基更换培养基。孵育约18小时后,将100nM人IgG和/或20nM化合物4添加到细胞中并孵育1小时。用OptiCulture培养基洗涤细胞一次,然后更换为新鲜培养基,并孵育0、1、2或4小时。用PBS洗涤细胞3次,并在含有蛋白酶抑制剂的RIPA缓冲液中裂解。巴弗洛霉素A处理的样品:肝细胞用150nM巴弗洛霉素A预处理1小时,然后与20nM化合物4+100nM人IgG和150nM BafA孵育1小时,洗涤细胞,孵育4小时,然后裂解。通过SDS-PAGE分离细胞裂解物,并使用抗人IgG抗体或肌动蛋白抗体或LC3抗体通过蛋白质印迹来可视化IgG降解产物,并使用LiCOR成像仪进行可视化。该测定用于产生图19中的数据。
实施例9另外的细胞共定位研究
为了确认IgG在被HepG2细胞摄取后被转运至溶酶体,用溶酶体标记物LAMP2对细胞进行染色,并通过免疫荧光显微镜观察AF488标记的DNP-IgG的亚细胞位置。
HepG2细胞以10,000个细胞/孔接种在96孔胶原蛋白包被的黑色板中。细胞用30nMBafA预处理1小时,或不预处理。HepG2细胞与100nM IgG、20nM化合物4/DMSO一起孵育1小时。用PBS洗涤细胞,然后将洗涤后T=0、1小时、2小时、4小时的样品用4%PFA在室温下固定15分钟,然后对IgG、DAPI、Lamp2(内溶酶体标记)进行染色。该测定用于产生图20中的数据。
实施例10 TNF细胞测定
TNF FP测定
将TNF(20nM)和化合物36在47mM HEPES pH 6.5、47mM NaCl、0.9mM EDTA、0.007%Triton X-100中于25℃孵育2小时。使用Envision读取荧光数据,并将其与化合物36浓度作图,并拟合单点结合模型。该测定用于计算表7中的FP数据。
TNF三元复合物测定
His标签化的TNF(300nM)、生物素化的ASGPR(25nM)和测试化合物在50mM Tris、pH7.5、150mM NaCl、0.01%Tween-20中于25℃孵育4小时。然后添加链霉亲和素-Tb穴状化合物(PerkinElmer 610SATLA)和抗-His-d2(Perkin Elmer 61HISDLA)并孵育2小时或过夜。使用Envision读取荧光数据,并绘制655nm/615nm信号比与测试化合物浓度的关系图。
表7-化合物36生化和细胞属性
生化/细胞属性 | 化合物36 |
ASGPR KD(nM) | <1 |
ASGPR kd(s-1) | <10x 10-3 |
TNFαFP IC50KD(nM) | <500 |
实施例11 HepG2细胞中化合物36对TNF的降解
化合物36和人TNF在磷酸盐缓冲盐水(pH 7.4)(ThermoFisher 10010023)中预孵育18小时,以形成二元复合物。化合物36/TNF复合物或单独的TNF在杜贝尔科改良伊戈尔培养基中生长的HepG2细胞上孵育2小时,16-24小时至接近汇合。用杜贝尔科改良伊戈尔培养基、10%胎牛血清洗涤细胞。然后将细胞与不含试剂的细胞培养基一起孵育0-3小时。洗涤并使用含有RIPA(Sigma R0278)和蛋白酶抑制剂(ThermoScientific 1861279)的磷酸盐缓冲盐水裂解细胞进行蛋白质印迹分析。样品在4-20%梯度SDS-PAGE凝胶(Biorad 5678094)上跑胶,然后转移到PVDF上,并用LI-COR封闭溶液封闭1小时。分别用抗IgG和抗肌动蛋白抗体以及800cw缀合的二抗检测TNF和肌动蛋白,并用LI-COR读取。化合物36和人TNF预孵育18小时以形成二元复合物。化合物36 TNF复合物或单独的TNF在HepG2细胞上孵育2小时。洗涤细胞,与不合试剂的细胞培养基一起孵育0-24小时,随后洗涤并裂解以进行蛋白质印迹分析。分别用抗IgG和抗肌动蛋白抗体以及800cw缀合的二抗检测TNF和肌动蛋白。该测定用于产生图24中的数据。
实施例12.通过化合物36在HepG2细胞中ASGPR介导的TNF摄取
化合物36和人TNF在磷酸盐缓冲盐水(pH 7.4)(ThermoFisher 10010023)中预孵育18小时,以形成二元复合物。化合物36/TNF复合物或单独的TNF在杜贝尔科改良伊戈尔培养基中生长的HepG2细胞上孵育0-3小时,16-24小时至接近汇合。洗涤并使用含有RIPA(Sigma R0278)和蛋白酶抑制剂(ThermoScientific 1861279)的磷酸盐缓冲盐水裂解细胞进行蛋白质印迹分析。样品在4-20%梯度SDS-PAGE凝胶(Biorad 5678094)上跑胶,然后转移到PVDF上,并用LI-COR封闭溶液封闭1小时。分别用抗IgG和抗肌动蛋白抗体以及800cw缀合的二抗检测TNF和肌动蛋白,并用LI-COR读取。分别用抗IgG和抗肌动蛋白抗体以及800cw缀合的二抗检测TNF和肌动蛋白。
将0.5μM化合物36和0.5μM人TNF预孵育18小时,以形成稳定的复合物。化合物36TNF复合物或单独的TNF在HepG2细胞上孵育0-3小时。洗涤并裂解细胞以进行蛋白质印迹分析。分别用抗IgG和抗肌动蛋白抗体以及800cw缀合的二抗检测TNF和肌动蛋白。该测定用于产生图25中的数据。
本说明书中引用的所有出版物和专利申请均通过引用并入本文,就如同每个单独的出版物或专利申请都具体且单独地指明通过引用并入一样。
尽管为了清楚理解的目的,已经通过图示和实施例的方式详细描述了前述发明,但是对于本领域普通技术人员来说,根据本发明的教导,在不脱离本发明的精神或范围的情况下,可以对其进行某些改变或修改是显而易见的。此外,本领域技术人员将认识到,或能够仅使用常规试验确定本文所描述的具体实施例和方法的许多等效内容。此类等效内容意在由本申请的范围涵盖。
Claims (212)
1.一种下式的ASGPR结合性胞外蛋白降解剂化合物:
其中
ASGPR结合配体是选自以下的化合物或其药学上可接受的盐:
其中:
R1或R5被至接头A的键替代;
如果R1被至接头A的键替代,则R5独立地选自氢、杂烷基、C0-C6烷基-氰基、烷基、烯基、炔基、卤代烷基、F、Cl、Br、I、芳基、芳基烷基、杂芳基、杂芳基烷基、杂环、杂环烷基、卤代烷氧基、C0-C6烷基-OR6、C0-C6烷基-SR6、C0-C6烷基-NR6R7、C0-C6烷基-C(O)R3、C0-C6烷基-S(O)R3、C0-C6烷基-C(S)R3、C0-C6烷基-S(O)2R3、C0-C6烷基-N(R8)-C(O)R3、C0-C6烷基-N(R8)-S(O)R3、C0-C6烷基-N(R8)-C(S)R3、C0-C6烷基-N(R8)-S(O)2R3C0-C6烷基-O-C(O)R3、C0-C6烷基-O-S(O)R3、C0-C6烷基-O-C(S)R3、-N=S(O)(R3)2、C0-C6烷基N3和C0-C6烷基-O-S(O)2R3,其各自任选被1、2、3或4个取代基取代;
如果R5被至接头A的键替代,则R1独立地选自氢、杂烷基、C0-C6烷基-氰基、烷基、烯基、炔基、卤代烷基、F、Cl、Br、I、芳基、芳基烷基、杂芳基、杂芳基烷基、杂环、杂环烷基、卤代烷氧基、C0-C6烷基-OR6、C0-C6烷基-SR6、C0-C6烷基-NR6R7、C0-C6烷基-C(O)R3、C0-C6烷基-S(O)R3、C0-C6烷基-C(S)R3、C0-C6烷基-S(O)2R3、C0-C6烷基-N(R8)-C(O)R3、C0-C6烷基-N(R8)-S(O)R3、C0-C6烷基-N(R8)-C(S)R3、C0-C6烷基-N(R8)-S(O)2R3C0-C6烷基-O-C(O)R3、C0-C6烷基-O-S(O)R3、C0-C6烷基-O-C(S)R3、-N=S(O)(R3)2、C0-C6烷基N3和C0-C6烷基-O-S(O)2R3,其各自任选被1、2、3或4个取代基取代;
R3在每次出现时独立地选自由以下组成的组:氢、烷基、杂烷基、卤代烷基、芳基烷基、杂芳基烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基、杂环、-OR8和-NR8R9;
R6和R7在每次出现时独立地选自由以下组成的组:氢、杂烷基、烷基、芳基烷基、杂芳基烷基、烯基、炔基、芳基、卤代烷基、杂芳基、杂环、-烷基-OR8、-烷基-NR8R9、C(O)R3、S(O)R3、C(S)R3和S(O)2R3;
R8和R9在每次出现时独立地选自由以下组成的组:氢、杂烷基、烷基、芳基烷基、杂芳基烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基和杂环;
R10是氢、烷基、杂烷基、卤代烷基、芳基烷基、杂芳基烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基、杂环、C(O)R3、S(O)R3、C(S)R3或S(O)2R3;
R65、R66和R67独立地选自氢、杂烷基、C0-C6烷基-氰基、烷基、烯基、炔基、卤代烷基、F、Cl、Br、I、杂环、杂环烷基、卤代烷氧基、C0-C6烷基-OR6、C0-C6烷基-SR6、C0-C6烷基-NR6R7、C0-C6烷基-C(O)R3、C0-C6烷基-S(O)R3、C0-C6烷基-C(S)R3、C0-C6烷基-S(O)2R3、C0-C6烷基-N(R8)-C(O)R3、C0-C6烷基-N(R8)-S(O)R3、C0-C6烷基-N(R8)-C(S)R3、C0-C6烷基-N(R8)-S(O)2R3C0-C6烷基-O-C(O)R3、C0-C6烷基-O-S(O)R3、C0-C6烷基-O-C(S)R3、-N=S(O)(R3)2、C0-C6烷基N3和C0-C6烷基-O-S(O)2R3,其各自任选被1、2、3或4个取代基取代;
胞外蛋白靶向配体是与胞外蛋白结合的配体;
接头A是将接头B、接头C或接头D共价连接至所述ASGPR结合配体的键或部分;
接头B是将接头A共价连接至胞外蛋白靶向配体的键或部分;
接头C是将每个接头A连接至胞外蛋白靶向配体的化学基团;
接头D是将每个接头A连接至胞外蛋白靶向配体的化学基团;以及
所述任选的取代基各自独立地选自由以下组成的组:烷基、烯基、炔基、卤代烷基、-OR6、F、Cl、Br、I、-NR6R7、杂烷基、杂环、杂芳基、芳基、氰基、硝基、羟基、叠氮基、酰胺、-SR3、-S(O)(NR6)R3、-NR8C(O)R3、-C(O)NR6R7、-C(O)OR3、-C(O)R3、-SF5、所述任选的取代基选择化合价所允许的并且其中选择所述任选的取代基以产生稳定的化合物。
2.权利要求1所述的化合物,其中R65、R66和R67独立地选自氢、C0-C6烷基-氰基、烷基、烯基、炔基、卤代烷基、F、Cl、Br、I、杂环、杂环烷基和卤代烷氧基。
3.权利要求1或2所述的化合物,其中R67是CF3。
4.权利要求1-3中任一项所述的化合物,其中R65是氢。
5.权利要求1-4中任一项所述的化合物,其中R66是氢。
6.权利要求1所述的化合物,其中R65没有被任选的取代基取代。
7.权利要求1所述的化合物,其中R65被1个任选的取代基取代。
8.权利要求1所述的化合物,其中R65是氢。
9.权利要求1所述的化合物,其中R65是-CF3。
10.权利要求1所述的化合物,其中R65是氰基。
11.权利要求1所述的化合物,其中R65是F。
12.权利要求1所述的化合物,其中R65是Cl。
13.权利要求1所述的化合物,其中R65是Br。
14.权利要求1所述的化合物,其中R65是卤代烷基。
15.权利要求1所述的化合物,其中R65是杂环。
16.权利要求1所述的化合物,其中R65是卤代烷氧基。
17.权利要求1所述的化合物,其中R65是杂环烷基。
18.权利要求1所述的化合物,其中R65是杂烷基。
19.权利要求1所述的化合物,其中R65是C0-C6烷基-OR6。
20.权利要求1所述的化合物,其中R65是C0-C6烷基-SR6。
21.权利要求1所述的化合物,其中R65是C0-C6烷基-NR6R7。
22.权利要求1所述的化合物,其中R65是C0-C6烷基-C(O)R3。
23.权利要求1所述的化合物,其中R65是C0-C6烷基-N(R8)-C(O)R3。
24.权利要求19-23中任一项所述的化合物,其中C0-C6烷基是键。
25.权利要求19-23中任一项所述的化合物,其中C0-C6烷基为C1。
26.权利要求19-23中任一项所述的化合物,其中C0-C6烷基为C2。
27.权利要求6-26中任一项所述的化合物,其中R66没有被任选的取代基取代。
28.权利要求6-26中任一项所述的化合物,其中R66被1个任选的取代基取代。
29.权利要求6-26中任一项所述的化合物,其中R66是氢。
30.权利要求6-26中任一项所述的化合物,其中R66是-CF3。
31.权利要求6-26中任一项所述的化合物,其中R66是氰基。
32.权利要求6-26中任一项所述的化合物,其中R66是F。
33.权利要求6-26中任一项所述的化合物,其中R66是Cl。
34.权利要求6-26中任一项所述的化合物,其中R66是Br。
35.权利要求6-26中任一项所述的化合物,其中R66是卤代烷基。
36.权利要求6-26中任一项所述的化合物,其中R66是杂环。
37.权利要求6-26中任一项所述的化合物,其中R66是卤代烷氧基。
38.权利要求6-26中任一项所述的化合物,其中R66是杂环烷基。
39.权利要求6-26中任一项所述的化合物,其中R66是杂烷基。
40.权利要求6-26中任一项所述的化合物,其中R66是C0-C6烷基-OR6。
41.权利要求6-26中任一项所述的化合物,其中R66是C0-C6烷基-SR6。
42.权利要求6-26中任一项所述的化合物,其中R66是C0-C6烷基-NR6R7。
43.权利要求6-26中任一项所述的化合物,其中R66是C0-C6烷基-C(O)R3。
44.权利要求6-26中任一项所述的化合物,其中R66是C0-C6烷基-N(R8)-C(O)R3。
45.权利要求40-44中任一项所述的化合物,其中C0-C6烷基是键。
46.权利要求40-44中任一项所述的化合物,其中C0-C6烷基为C1。
47.权利要求40-44中任一项所述的化合物,其中C0-C6烷基为C2。
48.权利要求6-47中任一项所述的化合物,其中R67没有被任选的取代基取代。
49.权利要求6-47中任一项所述的化合物,其中R67被1个任选的取代基取代。
50.权利要求6-47中任一项所述的化合物,其中R67是氢。
51.权利要求6-47中任一项所述的化合物,其中R67是-CF3。
52.权利要求6-47中任一项所述的化合物,其中R67是氰基。
53.权利要求6-47中任一项所述的化合物,其中R67是F。
54.权利要求6-47中任一项所述的化合物,其中R67是Cl。
55.权利要求6-47中任一项所述的化合物,其中R67是Br。
56.权利要求6-47中任一项所述的化合物,其中R67是卤代烷基。
57.权利要求6-47中任一项所述的化合物,其中R67是杂环。
58.权利要求6-47中任一项所述的化合物,其中R67是卤代烷氧基。
59.权利要求6-47中任一项所述的化合物,其中R67是杂环烷基。
60.权利要求6-47中任一项所述的化合物,其中R67是杂烷基。
61.权利要求6-47中任一项所述的化合物,其中R67是C0-C6烷基-OR6。
62.权利要求6-47中任一项所述的化合物,其中R67是C0-C6烷基-SR6。
63.权利要求6-47中任一项所述的化合物,其中R67是C0-C6烷基-NR6R7。
64.权利要求6-47中任一项所述的化合物,其中R67是C0-C6烷基-C(O)R3。
65.权利要求6-47中任一项所述的化合物,其中R67是C0-C6烷基-N(R8)-C(O)R3。
66.权利要求61-65中任一项所述的化合物,其中C0-C6烷基是键。
67.权利要求61-65中任一项所述的化合物,其中C0-C6烷基为C1。
68.权利要求61-65中任一项所述的化合物,其中C0-C6烷基为C2。
69.权利要求1-68中任一项所述的化合物,其中R10是氢、烷基、杂烷基、芳基烷基、杂芳基烷基、杂环、C(O)R3、S(O)R3或S(O)2R3。
70.权利要求1-68中任一项所述的化合物,其中R10是氢。
71.权利要求1-70中任一项所述的化合物,其中所述ASGPR结合配体是
72.权利要求1-70中任一项所述的化合物,其中所述ASGPR结合配体是
73.权利要求1-70中任一项所述的化合物,其中所述ASGPR结合配体是
74.权利要求1-70中任一项所述的化合物,其中所述ASGPR结合配体是
75.权利要求1-70中任一项所述的化合物,其中所述ASGPR结合配体是
76.权利要求1-70中任一项所述的化合物,其中所述ASGPR结合配体是
77.权利要求1-70中任一项所述的化合物,其中所述ASGPR结合配体是
78.权利要求1-70中任一项所述的化合物,其中所述ASGPR结合配体是
79.权利要求1-70中任一项所述的化合物,其中所述ASGPR结合配体是
80.权利要求1-70中任一项所述的化合物,其中所述ASGPR结合配体是
81.权利要求1-70中任一项所述的化合物,其中所述ASGPR结合配体是
82.权利要求1-70中任一项所述的化合物,其中所述ASGPR结合配体是
83.权利要求1-70中任一项所述的化合物,其中所述ASGPR结合配体是
84.权利要求1-70中任一项所述的化合物,其中所述ASGPR结合配体是
85.权利要求1-70中任一项所述的化合物,其中所述ASGPR结合配体是
86.权利要求1所述的化合物,其中所述ASGPR结合配体是
87.权利要求1所述的化合物,其中所述ASGPR结合配体是
88.权利要求1所述的化合物,其中所述ASGPR结合配体是
89.权利要求1-88中任一项所述的化合物,其中R1不与接头A结合,并且选自氢、杂烷基、烷基、烯基、炔基、芳基烷基、C0-C6烷基-OR6、C0-C6烷基-SR6和C0-C6烷基-NR6R7,其各自任选被1、2、3或4个取代基取代。
90.权利要求1-88中任一项所述的化合物,其中R5不与接头A结合,并且选自氢、杂烷基、烷基、烯基、炔基、芳基烷基、C0-C6烷基-OR6、C0-C6烷基-SR6和C0-C6烷基-NR6R7,其各自任选被1、2、3或4个取代基取代。
91.权利要求1-90中任一项所述的化合物,其中接头A和接头B在每种情况下独立地是:
其中:
R11、R12、R13、R14、R15、R16、R17、R18、R19和R20在每次出现时独立地选自由以下组成的组:键、烷基、-C(O)-、-C(O)O-、-OC(O)-、-SO2-、-S(O)-、-C(S)-、-C(O)NR6-、-NR6C(O)-、-O-、-S-、-NR6-、-C(R21R21)-、-P(O)(R3)O-、-P(O)(R3)-、天然或非天然氨基酸的二价残基、烯基、炔基、卤代烷基、烷氧基、芳基、杂环、杂芳基、-CH2CH2-[O-(CH2)2]n-O-、-CH2CH2-[O-(CH2)2]n-NR6-、-CH2CH2-[O-(CH2)2]n-、-[-(CH2)2-O-]n-、-[O-(CH2)2]n-、-[O-CH(CH3)C(O)]n-、-[C(O)-CH(CH3)-O]n-、-[O-CH2C(O)]n-、-[C(O)-CH2-O]n-、脂肪酸的二价残基以及不饱和或饱和的一元或二元羧酸的二价残基;其各自任选被1、2、3或4个独立地选自R21的取代基取代;
n在每种情况下独立地选自0、1、2、3、4、5、6、7、8、9或10;
R21在每次出现时独立地选自由以下组成的组:氢、烷基、烯基、炔基、F、Cl、Br、I、羟基、烷氧基、叠氮基、氨基、氰基、-NR6R7、-NR8SO2R3、-NR8S(O)R3、卤代烷基、杂烷基、芳基、杂芳基和杂环。
92.权利要求1-91中任一项所述的化合物,其中接头A选自:
其中xx是0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25。
93.权利要求1-91中任一项所述的化合物,其中接头A选自:
其各自任选被1、2、3或4个权利要求1中所定义的任选的取代基取代。
94.权利要求1-91中任一项所述的化合物,其中接头A选自:
95.权利要求1-94中任一项所述的化合物,其中所述化合物具有下式:
或其药学上可接受的盐。
96.权利要求1-94中任一项所述的化合物,其中所述化合物具有下式:
或其药学上可接受的盐。
97.权利要求96所述的化合物,其中接头C是:
其中:
R11、R12、R13、R14、R15、R16、R17、R18、R19和R20在每次出现时独立地选自由以下组成的组:键、烷基、-C(O)-、-C(O)O-、-OC(O)-、-SO2-、-S(O)-、-C(S)-、-C(O)NR6-、-NR6C(O)-、-O-、-S-、-NR6-、-C(R21R21)-、-P(O)(R3)O-、-P(O)(R3)-、天然或非天然氨基酸的二价残基、烯基、炔基、卤代烷基、烷氧基、芳基、杂环、杂芳基、-CH2CH2-[O-(CH2)2]n-O-、-CH2CH2-[O-(CH2)2]n-NR6-、-CH2CH2-[O-(CH2)2]n-、-[-(CH2)2-O-]n-、-[O-(CH2)2]n-、-[O-CH(CH3)C(O)]n-、-[C(O)-CH(CH3)-O]n-、-[O-CH2C(O)]n-、-[C(O)-CH2-O]n-、脂肪酸的二价残基、不饱和或饱和的一元或二元羧酸的二价残基;其各自任选被1、2、3或4个独立地选自R21的取代基取代;
n在每种情况下独立地选自0、1、2、3、4、5、6、7、8、9和10;
R21在每次出现时独立地选自由以下组成的组:氢、烷基、烯基、炔基、F、Cl、Br、I、羟基、烷氧基、叠氮基、氨基、氰基、-NR6R7、-NR8SO2R3、-NR8S(O)R3、卤代烷基、杂烷基、芳基、杂芳基和杂环;和
R22在每次出现时独立地选自由以下组成的组:烷基,-C(O)N-、-NC(O)-、-N-、-C(R21)-、-P(O)O-、-P(O)-、-P(O)(NR6R7)N-、烯基、卤代烷基、芳基、杂环和杂芳基,其各自任选被1、2、3或4个独立地选自R21的取代基取代。
98.权利要求96所述的化合物,其中接头C选自:
99.权利要求1-94中任一项所述的化合物,其中所述化合物具有下式:
100.权利要求99所述的化合物,其中接头D选自:
/>
101.权利要求1-100中任一项所述的化合物,其中所述胞外蛋白靶向配体结合IgG。
102.权利要求101所述的化合物,其中靶向所述IgG的胞外蛋白靶向配体是Fc-BP-2。
103.权利要求101所述的化合物,其中靶向所述IgG的胞外蛋白靶向配体是Fc-III。
104.权利要求1和91-94中任一项所述的化合物,其中所述化合物具有下式:
/>
/>
/>
/>
或其药学上可接受的盐。
105.权利要求1和91-94中任一项所述的化合物,其中所述化合物具有下式:
/>
/>
/>
/>
/>
/>
或其药学上可接受的盐。
106.一种化合物,其选自:
/>
/>
或其药学上可接受的盐。
107.权利要求1-100中任一项所述的化合物,其中所述胞外蛋白靶向配体结合IgA。
108.权利要求1-100中任一项所述的化合物,其中所述胞外蛋白靶向配体结合IgM。
109.权利要求108所述的化合物,其中所述IgM蛋白是抗髓磷脂相关糖蛋白抗体。
110.权利要求1-100中任一项所述的化合物,其中所述胞外蛋白靶向配体结合IgG4。
111.权利要求1-100中任一项所述的化合物,其中所述胞外蛋白靶向配体结合IgE。
112.权利要求1-100中任一项所述的化合物,其中所述胞外蛋白靶向配体结合TNF-α。
113.权利要求1-100中任一项所述的化合物,其中所述胞外蛋白靶向配体结合白细胞介素-1。
114.权利要求1-100中任一项所述的化合物,其中所述胞外蛋白靶向配体结合白细胞介素-2。
115.权利要求1-100中任一项所述的化合物,其中所述胞外蛋白靶向配体结合白细胞介素-6。
116.权利要求1-100中任一项所述的化合物,其中所述胞外蛋白靶向配体结合白细胞介素-17。
117.权利要求1-100中任一项所述的化合物,其中所述胞外蛋白靶向配体结合血管内皮生长因子(VEGF)。
118.权利要求1-100中任一项所述的化合物,其中所述胞外蛋白靶向配体结合转化生长因子β(TGF-β1)。
119.权利要求1-100中任一项所述的化合物,其中所述胞外蛋白靶向配体结合前蛋白转化酶枯草杆菌蛋白酶KEXIN9(PCSK-9)。
120.权利要求1-100中任一项所述的化合物,其中所述胞外蛋白靶向配体结合凝血因子VII(因子VII)。
121.权利要求1-100中任一项所述的化合物,其中所述胞外蛋白靶向配体结合凝血因子IX(因子IX)。
122.权利要求1-100中任一项所述的化合物,其中所述胞外蛋白靶向配体结合凝血因子XI(因子XI)。
123.权利要求1-100中任一项所述的化合物,其中所述胞外蛋白靶向配体结合补体因子B。
124.权利要求1-100中任一项所述的化合物,其中所述胞外蛋白靶向配体结合补体因子D。
125.一种具有以下结构的化合物:
或其药学上可接受的盐。
126.一种具有以下结构的化合物:
或其药学上可接受的盐。
127.一种具有以下结构的化合物:
或其药学上可接受的盐。
128.一种具有以下结构的化合物:
或其药学上可接受的盐。
129.一种具有以下结构的化合物:
或其药学上可接受的盐。
130.一种药物组合物,其包含权利要求1-129中任一项所述的化合物和药学上可接受的载剂。
131.权利要求130所述的药物组合物,其中所述化合物是:
或其药学上可接受的盐。
132.权利要求130所述的药物组合物,其中所述化合物是:
或其药学上可接受的盐。
133.权利要求130所述的药物组合物,其中所述化合物是:
或其药学上可接受的盐。
134.权利要求130所述的药物组合物,其中所述化合物是:
或其药学上可接受的盐。
135.权利要求130所述的药物组合物,其中所述化合物是:
或其药学上可接受的盐。
136.一种治疗由胞外蛋白介导的疾病的方法,所述方法包括向有此需要的患者施用有效量的权利要求1-129中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐或药物组合物,所述化合物包含与所述胞外蛋白结合的胞外靶向蛋白配体。
137.权利要求136所述的方法,其中所述胞外蛋白是IgG并且所述疾病选自抗磷脂抗体综合征、白塞综合征、桥本甲状腺炎、MGUS、坏死性黄色肉芽肿、类风湿关节炎、癌症例如多发性骨髓瘤或外周多发性骨髓瘤、副蛋白血症、慢性荨麻疹、硬皮病、硬化粘液水肿、血小板减少症例如肝素诱导的血小板减少症、冷球蛋白血症、肉芽肿性多血管炎例如ANCA相关性血管炎、特发性血小板减少性紫癜、血小板减少症、IgG4-RD、阵发性睡眠性血红蛋白尿(PNH)、温抗体型自身免疫性溶血性贫血、横纹肌溶解症、狼疮性肾炎、急性播散性脑脊髓炎、格林巴利综合征(Guillain-Barre syndrome)、慢性炎性脱髓鞘性多发性神经病变、米勒费希尔综合征(Miller Fisher syndrome)、视神经脊髓炎谱系疾病、斜视眼阵挛肌阵挛综合征(opsoclonus-myoclonus syndrome)、与链球菌感染相关的小儿自身免疫性神经精神疾病(PANDAS)、周围神经病变、横贯性脊髓炎、纤维化、IPF/纤维化和移植排斥。
138.权利要求136或137所述的方法,其中所述化合物是
或其药学上可接受的盐。
139.权利要求136或137所述的方法,其中所述化合物是
或其药学上可接受的盐。
140.权利要求136或137所述的方法,其中所述化合物是
或其药学上可接受的盐。
141.权利要求136或137所述的方法,其中所述化合物是
或其药学上可接受的盐。
142.权利要求136所述的方法,其中所述胞外蛋白是IgG4并且所述疾病选自1型自身免疫性胰腺炎、间质性肾炎、里德尔甲状腺炎(Riedel′s thyroiditis)、席纹状纤维化、米库利奇病、库特纳氏瘤(Küttner′s tumor)、炎性假瘤(在身体的多个部位)、纵隔纤维化、腹膜后纤维化(奥蒙德病(Ormond’s disease))、主动脉炎和主动脉周围炎、近端胆管狭窄、特发性低补体血症性肾小管间质性肾炎、多灶性纤维硬化症、硬脑膜炎、胰腺肿大、肿瘤样病变(tumefactive lesions)、心包炎、类风湿关节炎(RA)、炎症性肠病、多发性硬化、重症肌无力、强直性脊柱炎、原发性干燥综合征、银屑病关节炎、系统性红斑狼疮(SLE)、硬化性胆管炎、IgG单克隆丙种球蛋白病、意义未明的单克隆丙种球蛋白病(monoclonal gammopathyof undetermined significance,MGUS)、黑色素瘤、大疱性类天疱疮、古德帕斯彻氏病(Goodpasture′s disease)、脑炎、血栓性血小板减少性紫癜、慢性炎性多发性神经病变、边缘叶脑炎、神经肌强直、莫文综合征(Morvan syndrome)、落叶型天疱疮、寻常型天疱疮、REM和非REM异睡症,和膜性肾病、多发性硬化、甲亢格雷夫氏病、获得性大疱性表皮松解症、妊娠期类天疱疮、抗p200类天疱疮和副肿瘤性天疱疮。
143.权利要求136所述的方法,其中所述胞外蛋白是IgA并且所述疾病选自包括IgA肾病(也称为伯格氏病)、乳糜泻、克罗恩病、过敏性紫癜(HSP)(也称为IgA血管炎)、IgA天疱疮、疱疹样皮炎、炎性肠病(IBD);干燥综合征、强直性脊柱炎、酒精性肝硬化、获得性免疫缺陷综合征、IgA多发性骨髓瘤、α-链病、IgA单克隆丙种球蛋白病、意义未明的单克隆丙种球蛋白病(MGUS)、线性IgA大疱性皮肤病、类风湿关节炎、溃疡性结肠炎和原发性肾小球肾炎。
144.一种具有下式的化合物:
/>
或其药学上可接受的盐;
其中:
R1和R5独立地选自氢、杂烷基、C0-C6烷基-氰基、烷基、烯基、炔基、卤代烷基、F、Cl、Br、I、芳基、芳基烷基、杂芳基、杂芳基烷基、杂环、杂环烷基、卤代烷氧基、C0-C6烷基-OR6、C0-C6烷基-SR6、C0-C6烷基-NR6R7、C0-C6烷基-C(O)R3、C0-C6烷基-S(O)R3、C0-C6烷基-C(S)R3、C0-C6烷基-S(O)2R3、C0-C6烷基-N(R8)-C(O)R3、C0-C6烷基-N(R8)-S(O)R3、C0-C6烷基-N(R8)-C(S)R3、C0-C6烷基-N(R8)-S(O)2R3C0-C6烷基-O-C(O)R3、C0-C6烷基-O-S(O)R3、C0-C6烷基-O-C(S)R3、-N=S(O)(R3)2、C0-C6烷基N3和C0-C6烷基-O-S(O)2R3,其各自任选被1、2、3或4个取代基取代;
R3在每次出现时独立地选自氢、烷基、杂烷基、卤代烷基、芳基烷基、杂芳基烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基、杂环、-OR8和-NR8R9;
R6和R7在每次出现时独立地选自氢、杂烷基、烷基、芳基烷基、杂芳基烷基、烯基、炔基、芳基、卤代烷基、杂芳基、杂环、-烷基-OR8、-烷基-NR8R9、C(O)R3、S(O)R3、C(S)R3和S(O)2R3;
R8和R9在每次出现时独立地选自氢、杂烷基、烷基、芳基烷基、杂芳基烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基和杂环;
R10选自氢、烷基、杂烷基、卤代烷基、芳基烷基、杂芳基烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基、杂环、C(O)R3、S(O)R3、C(S)R3和S(O)2R3;
R25选自由以下组成的组:杂烷基、C0-C6烷基-氰基、烷基、烯基、炔基、卤代烷基、F、Cl、Br、I、芳基、芳基烷基、杂芳基、杂芳基烷基、杂环、杂环烷基、卤代烷氧基、C0-C6烷基-OR6、C0-C6烷基-SR6、C0-C6烷基-NR6R7、C0-C6烷基-C(O)R3、C0-C6烷基-S(O)R3、C0-C6烷基-C(S)R3、C0-C6烷基-S(O)2R3、C0-C6烷基-N(R8)-C(O)R3、C0-C6烷基-N(R8)-S(O)R3、C0-C6烷基-N(R8)-C(S)R3、C0-C6烷基-N(R8)-S(O)2R3C0-C6烷基-O-C(O)R3、C0-C6烷基-O-S(O)R3、C0-C6烷基-O-C(S)R3、-N=S(O)(R3)2、C0-C6烷基N3和C0-C6烷基-O-S(O)2R3,其各自任选被1、2、3或4个取代基取代;
R65、R66和R67独立地选自氢、杂烷基、C0-C6烷基-氰基、烷基、烯基、炔基、卤代烷基、F、Cl、Br、I、杂环、杂环烷基、卤代烷氧基、C0-C6烷基-OR6、C0-C6烷基-SR6、C0-C6烷基-NR6R7、C0-C6烷基-C(O)R3、C0-C6烷基-S(O)R3、C0-C6烷基-C(S)R3、C0-C6烷基-S(O)2R3、C0-C6烷基-N(R8)-C(O)R3、C0-C6烷基-N(R8)-S(O)R3、C0-C6烷基-N(R8)-C(S)R3、C0-C6烷基-N(R8)-S(O)2R3C0-C6烷基-O-C(O)R3、C0-C6烷基-O-S(O)R3、C0-C6烷基-O-C(S)R3、-N=S(O)(R3)2、C0-C6烷基N3和C0-C6烷基-O-S(O)2R3,其各自任选被1、2、3或4个取代基取代;
R68、R69和R70独立地选自氢、烷基、烯基、炔基、F、Cl、Br、I、杂环、杂环烷基、卤代烷氧基、C0-C6烷基-OR6、C0-C6烷基-SR6、C0-C6烷基-NR6R7、C0-C6烷基-C(O)R3、C0-C6烷基-S(O)R3、C0-C6烷基-C(S)R3、C0-C6烷基-S(O)2R3、C0-C6烷基-N(R8)-C(O)R3、C0-C6烷基-N(R8)-S(O)R3、C0-C6烷基-N(R8)-C(S)R3、C0-C6烷基-N(R8)-S(O)2R3C0-C6烷基-O-C(O)R3、C0-C6烷基-O-S(O)R3、C0-C6烷基-O-C(S)R3、-N=S(O)(R3)2、C0-C6烷基N3、杂芳基、芳基和C0-C6烷基-O-S(O)2R3,其各自任选被1、2、3或4个取代基取代;并且
所述任选的取代基选自烷基、烯基、炔基、卤代烷基、-OR6、F、Cl、Br、I、-NR6R7、杂烷基、杂环、杂芳基、芳基、氰基、硝基、羟基、叠氮基、酰胺、-SR3、-S(O)(NR6)R3、-NR8C(O)R3、-C(O)NR6R7、-C(O)OR3、-C(O)R3、-SF5、所述任选的取代基选择化合价所允许的并且其中选择所述任选的取代基以产生稳定的化合物。
145.权利要求144所述的化合物,其中R65没有被任选的取代基取代。
146.权利要求144所述的化合物,其中R65被1个任选的取代基取代。
147.权利要求144所述的化合物,其中R65是氢。
148.权利要求144所述的化合物,其中R65是-CF3。
149.权利要求144所述的化合物,其中R65是氰基。
150.权利要求144所述的化合物,其中R65是F。
151.权利要求144所述的化合物,其中R65是Cl。
152.权利要求144所述的化合物,其中R65是Br。
153.权利要求144所述的化合物,其中R65是卤代烷基。
154.权利要求144所述的化合物,其中R65是杂环。
155.权利要求144所述的化合物,其中R65是卤代烷氧基。
156.权利要求144所述的化合物,其中R65是杂环烷基。
157.权利要求144所述的化合物,其中R65是杂烷基。
158.权利要求144所述的化合物,其中R65是C0-C6烷基-OR6。
159.权利要求144所述的化合物,其中R65是C0-C6烷基-SR6。
160.权利要求144所述的化合物,其中R65是C0-C6烷基-NR6R7。
161.权利要求144所述的化合物,其中R65是C0-C6烷基-C(O)R3。
162.权利要求144所述的化合物,其中R65是C0-C6烷基-N(R8)-C(O)R3。
163.权利要求158-162中任一项所述的化合物,其中C0-C6烷基是键。
164.权利要求158-162中任一项所述的化合物,其中C0-C6烷基为C1。
165.权利要求158-162中任一项所述的化合物,其中C0-C6烷基为C2。
166.权利要求144-165中任一项所述的化合物,其中R66没有被任选的取代基取代。
167.权利要求144-165中任一项所述的化合物,其中R66被1个任选的取代基取代。
168.权利要求144-165中任一项所述的化合物,其中R66是氢。
169.权利要求144-165中任一项所述的化合物,其中R66是-CF3。
170.权利要求144-165中任一项所述的化合物,其中R66是氰基。
171.权利要求144-165中任一项所述的化合物,其中R66是F。
172.权利要求144-165中任一项所述的化合物,其中R66是Cl。
173.权利要求144-165中任一项所述的化合物,其中R66是Br。
174.权利要求144-165中任一项所述的化合物,其中R66是卤代烷基。
175.权利要求144-165中任一项所述的化合物,其中R66是杂环。
176.权利要求144-165中任一项所述的化合物,其中R66是卤代烷氧基。
177.权利要求144-165中任一项所述的化合物,其中R66是杂环烷基。
178.权利要求144-165中任一项所述的化合物,其中R66是杂烷基。
179.权利要求144-165中任一项所述的化合物,其中R66是C0-C6烷基-OR6。
180.权利要求144-165中任一项所述的化合物,其中R66是C0-C6烷基-SR6。
181.权利要求144-165中任一项所述的化合物,其中R66是C0-C6烷基-NR6R7。
182.权利要求144-165中任一项所述的化合物,其中R66是C0-C6烷基-C(O)R3。
183.权利要求144-165中任一项所述的化合物,其中R66是C0-C6烷基-N(R8)-C(O)R3。
184.权利要求179-183中任一项所述的化合物,其中C0-C6烷基是键。
185.权利要求179-183中任一项所述的化合物,其中C0-C6烷基为C1。
186.权利要求179-183中任一项所述的化合物,其中C0-C6烷基为C2。
187.权利要求144-186中任一项所述的化合物,其中R67没有被任选的取代基取代。
188.权利要求144-186中任一项所述的化合物,其中R67被1个任选的取代基取代。
189.权利要求144-186中任一项所述的化合物,其中R67是氢。
190.权利要求144-186中任一项所述的化合物,其中R67是-CF3。
191.权利要求144-186中任一项所述的化合物,其中R67是氰基。
192.权利要求144-186中任一项所述的化合物,其中R67是F。
193.权利要求144-186中任一项所述的化合物,其中R67是Cl。
194.权利要求144-186中任一项所述的化合物,其中R67是Br。
195.权利要求144-186中任一项所述的化合物,其中R67是卤代烷基。
196.权利要求144-186中任一项所述的化合物,其中R67是杂环。
197.权利要求144-186中任一项所述的化合物,其中R67是卤代烷氧基。
198.权利要求144-186中任一项所述的化合物,其中R67是杂环烷基。
199.权利要求144-186中任一项所述的化合物,其中R67是杂烷基。
200.权利要求144-186中任一项所述的化合物,其中R67是C0-C6烷基-OR6。
201.权利要求144-186中任一项所述的化合物,其中R67是C0-C6烷基-SR6。
202.权利要求144-186中任一项所述的化合物,其中R67是C0-C6烷基-NR6R7。
203.权利要求144-186中任一项所述的化合物,其中R67是C0-C6烷基-C(O)R3。
204.权利要求144-186中任一项所述的化合物,其中R67是C0-C6烷基-N(R8)-C(O)R3。
205.权利要求200-204中任一项所述的化合物,其中C0-C6烷基是键。
206.权利要求200-204中任一项所述的化合物,其中C0-C6烷基为C1。
207.权利要求200-204中任一项所述的化合物,其中C0-C6烷基为C2。
208.权利要求144-207中任一项所述的化合物,其中R10是氢、烷基、杂烷基、芳基烷基、杂芳基烷基、杂环、C(O)R3、S(O)R3或S(O)2R3。
209.权利要求144-207中任一项所述的化合物,其中R10是氢。
210.权利要求144所述的化合物,其中所述化合物选自:
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或其药学上可接受的盐。
211.一种药物组合物,其包含权利要求144-210中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,以及药学上可接受的载剂。
212.一种治疗由ASGPR介导的疾病的方法,所述方法包括向有此需要的患者施用有效量的权利要求144-210中任一项或其药学上可接受的盐。
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