CN117672388A - 分子试验的运行管理方法及装置、介质 - Google Patents

分子试验的运行管理方法及装置、介质 Download PDF

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CN117672388A CN202311684423.5A CN202311684423A CN117672388A CN 117672388 A CN117672388 A CN 117672388A CN 202311684423 A CN202311684423 A CN 202311684423A CN 117672388 A CN117672388 A CN 117672388A
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弗雷德·帕森
丁文远
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Suzhou Tengmai Pharmaceutical Technology Co ltd
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Suzhou Tengmai Pharmaceutical Technology Co ltd
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Abstract

本公开涉及一种分子试验的运行管理方法及装置、介质,包括在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下,进行针对目标项目中各待选配体与受体的试验预测,得到试验结果,试验预测包括至少一个分子试验,各分子试验包括依次执行的至少一个子任务;基于试验结果展示运行管理界面,运行管理界面展示有各分子试验的运行结果和分子试验从开始运行到结束运行的过程中依次执行的全部子任务;在检测到针对运行管理界面中子任务的触发操作的情况下,展示结果界面,结果界面展示有子任务的子结果。根据本公开实施例的分子试验的运行管理方法及装置、介质能够及时响应分子试验并直观地展示运行结果,实现分子试验的运行管理。

Description

分子试验的运行管理方法及装置、介质
技术领域
本公开涉及药物研发技术领域,尤其涉及一种分子试验的运行管理方法及装置、介质。
背景技术
相关技术中,湿实验室药物发现模式需要设计并合成大量分子,并进行临床前研究。这是一个不断试错的过程,也只是一种定性的研究。在这个过程中,会消耗大量的资源进行多次分子试验,以在分子水平上深入研究蛋白质与药物待选配体的结合机理。
因此,如何便捷、直观、迅速地实现分子试验的运行管理,是亟待解决的技术问题。
发明内容
有鉴于此,本公开提出了一种分子试验的运行管理方法及装置、介质,使得用户通过简单的操作就能够便捷、直观、迅速地实现分子试验的运行管理。
根据本公开的一方面,提供了一种分子试验的运行管理方法,包括:
在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下,进行针对所述目标项目中各待选配体与受体的试验预测,得到试验结果,其中,所述试验预测包括至少一个分子试验,各所述分子试验包括依次执行的至少一个子任务,所述子任务包括分子姿态筛选、分子间力场分析、分子间相互关系分析、自由能计算、自由能分析,所述试验结果包括各所述分子试验中执行的各所述子任务的子结果;
基于所述试验结果展示运行管理界面,所述运行管理界面展示有各所述分子试验的运行结果和所述分子试验从开始运行到结束运行的过程中依次执行的全部子任务,所述运行结果为成功或失败;
在检测到针对所述运行管理界面中子任务的触发操作的情况下,展示结果界面,所述结果界面展示有所述子任务的子结果。
这样,通过在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下进行针对目标项目中各待选配体与受体的试验预测,可以得到试验结果,其中,试验预测包括至少一个分子试验,各分子试验包括依次执行的至少一个子任务,子任务包括分子姿态筛选、分子间力场分析、分子间相互关系分析、自由能计算、自由能分析,试验结果包括各分子试验中执行的各子任务的子结果;通过基于试验结果可以展示运行管理界面,运行管理界面展示有各分子试验的运行结果和分子试验从开始运行到结束运行的过程中依次执行的全部子任务;通过在检测到针对运行管理界面中子任务的触发操作的情况下可以展示结果界面,结果界面展示有子任务的子结果,在整个试验预测过程中,用户所需进行的操作少且简单,使得用户通过简单的操作就能够便捷、直观、迅速地实现分子试验的运行管理,方便用户根据运行管理界面查看子任务的子结果,有助于快速筛选出有效的药物待选配体,大大缩短新药开发流程,降低新药失败风险。
在一种可能的实现方式中,所述运行管理界面展示有运行示意图;所述基于所述试验结果展示运行管理界面,包括:根据所述试验结果,确定出各所述分子试验的运行结果以及各所述分子试验所执行的全部子任务;根据各所述分子试验的全部子任务和所述受体,构建各所述分子试验对应的运行路径,所述运行路径包括依次连接的多个节点,所述多个节点依次表征所述分子试验所用的受体以及已经依次执行的各子任务;以构建出的运行路径和所述运行结果形成运行示意图,并在所述运行管理界面中显示所述运行示意图,所述运行示意图中各运行路径的最后一个节点还用于表示对应的所述分子试验的运行结果。
这样,通过分子试验所执行的全部子任务和运行结果构建运行示意图,方便用户直观获取分子试验的运行情况,并在分子试验运行失败的情况下可以直观地确定出当前试验停在何子任务处。
在一种可能的实现方式中,所述根据所述试验结果,确定出各所述分子试验的运行结果以及各所述分子试验所执行的全部子任务,包括:若所述分子试验包括一个子任务,则以执行该子任务所得到的子结果作为所述分子试验的运行结果;若所述分子试验包括至少两个子任务且各子任务均成功执行,则以成功作为所述分子试验的运行结果;若所述分子试验包括至少两个子任务且部分子任务被执行,则以失败作为所述分子试验的运行结果。
这样,根据分子试验的子任务的执行情况确定出分子试验的运行情况,方便后续在运行管理界面中直观地展示分子试验的运行情况。
在一种可能的实现方式中,所述方法还包括:在检测到针对所述运行示意图的移动操作的情况下,改变所述运行示意图在所述运行管理界面中的位置;并且/或者,在检测到针对所述运行示意图的缩放操作的情况下,对所述运行示意图的显示尺寸进行放大或缩小。
这样,通过针对某一个节点进行移动操作,以便用户拖动其中某个节点至理想位置,操作简单,也可以通过针对运行示意图整体进行移动操作,以便用户拖动整个运行示意图至理想位置,操作简单。
在一种可能的实现方式中,所述方法还包括:在检测到针对自由能微扰控件的触发操作的情况下,展示用于试验预测的运行管理的初始界面,所述初始界面中展示有至少一个可选项目;在根据选择操作从所述至少一个可选项目中确定出所述目标项目的情况下,展示针对所述目标项目的试验信息输入提示,所述试验信息输入提示中展示有多个试验参数输入框和所述启动控件,不同的试验参数输入框用于进行不同试验参数的输入,其中,所述试验参数包括受体名称、记录受体结构的受体文件、自动运行、运行名称中的至少一种;根据检测到的针对各所述试验参数输入框的输入操作,在所述试验信息输入提示中展示确定出的针对所述目标项目的目标试验参数。
这样,在确定出目标项目的情况下,通过展示试验信息输入提示获取用户输入的针对目标项目的目标试验参数,以便在用户期望的目标试验参数下进行分子试验。
在一种可能的实现方式中,所述在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下,进行针对所述目标项目中各待选配体与受体的试验预测,得到试验结果,包括:在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下,根据确定出的针对所述目标项目的目标试验参数运行所述分子试验,得到所述试验结果;所述运行管理界面展示有运行信息;所述基于所述试验结果展示运行管理界面,还包括:根据所述目标项目、所述各待选配体、所述受体、所述运行名称构建运行列表,所述运行列表表征所述运行信息。
这样,可以在用户期望的目标试验参数下进行分子试验,并通过在运行管理界面中展示运行列表,可以方便用户直观获取各分子试验的运行信息。
在一种可能的实现方式中,所述方法还包括:在检测到针对所述目标项目的浏览控件的触发操作的情况下,根据历史运行的试验预测的试验结果展示所述运行管理界面,其中,所述浏览控件设置于用于分子试验的运行管理的初始界面和/或所述子任务对应的结果界面;并且/或者,在检测到针对所述目标项目的切换控件的触发操作的情况下,隐藏或显示所述运行示意图中的运行路径,其中,所述切换控件设置于所述运行管理界面。
这样,通过对浏览控件的触发操作的检测,可便捷快速浏览针对目标项目运行的分子试验的相关信息;通过对切换控件的触发操作的检测,方便用户自定义显示或隐藏部分分子试验。
在一种可能的实现方式中,所述方法还包括:在检测到针对所述分子试验的中止操作的情况下,在所述分子试验对应的运行路径中表征所述中止操作对应的子任务的节点处,展示该子任务处于中止状态;并且/或者,在检测到所述分子试验中的子任务处于待处理状态的情况下,在所述分子试验对应的运行路径中表征该子任务的节点处,展示该子任务处于待处理状态。
这样,通过在子任务的节点处标注运行状态,方便用户直观地获取到分子试验的当前运行情况。
根据本公开的另一方面,提供了一种分子试验的运行管理装置,包括:
试验预测模块,所述试验预测模块被配置为在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下,进行针对所述目标项目中各待选配体与受体的试验预测,得到试验结果,其中,所述试验预测包括至少一个分子试验,各所述分子试验包括依次执行的至少一个子任务,所述子任务包括分子姿态筛选、分子间力场分析、分子间相互关系分析、自由能计算、自由能分析,所述试验结果包括各所述分子试验中执行的各所述子任务的子结果;
第一展示模块,所述第一展示模块被配置为基于所述试验结果展示运行管理界面,所述运行管理界面展示有各所述分子试验的运行结果和所述分子试验从开始运行到结束运行的过程中依次执行的全部子任务,所述运行结果为成功或失败;
第二展示模块,所述第二展示模块被配置为在检测到针对所述运行管理界面中子任务的触发操作的情况下,展示结果界面,所述结果界面展示有所述子任务的子结果。
这样,通过在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下进行针对目标项目中各待选配体与受体的试验预测,可以得到试验结果,其中,试验预测包括至少一个分子试验,各分子试验包括依次执行的至少一个子任务,子任务包括分子姿态筛选、分子间力场分析、分子间相互关系分析、自由能计算、自由能分析,试验结果包括各分子试验中执行的各子任务的子结果;通过基于试验结果可以展示运行管理界面,运行管理界面展示有各分子试验的运行结果和分子试验从开始运行到结束运行的过程中依次执行的全部子任务;通过在检测到针对运行管理界面中子任务的触发操作的情况下可以展示结果界面,结果界面展示有子任务的子结果,在整个试验预测过程中,用户所需进行的操作少且简单,使得用户通过简单的操作就能够便捷、直观、迅速地实现分子试验的运行管理,方便用户根据运行管理界面查看子任务的子结果,有助于快速筛选出有效的药物待选配体,大大缩短新药开发流程,降低新药失败风险。
在一种可能的实现方式中,所述运行管理界面展示有运行示意图;所述基于所述试验结果展示运行管理界面,包括:根据所述试验结果,确定出各所述分子试验的运行结果以及各所述分子试验所执行的全部子任务;根据各所述分子试验的全部子任务和所述受体,构建各所述分子试验对应的运行路径,所述运行路径包括依次连接的多个节点,所述多个节点依次表征所述分子试验所用的受体以及已经依次执行的各子任务;以构建出的运行路径和所述运行结果形成运行示意图,并在所述运行管理界面中显示所述运行示意图,所述运行示意图中各运行路径的最后一个节点还用于表示对应的所述分子试验的运行结果。
这样,通过分子试验所执行的全部子任务和运行结果构建运行示意图,方便用户直观获取分子试验的运行情况,并在分子试验运行失败的情况下可以直观地确定出当前试验停在何子任务处。
在一种可能的实现方式中,所述根据所述试验结果,确定出各所述分子试验的运行结果以及各所述分子试验所执行的全部子任务,包括:若所述分子试验包括一个子任务,则以执行该子任务所得到的子结果作为所述分子试验的运行结果;若所述分子试验包括至少两个子任务且各子任务均成功执行,则以成功作为所述分子试验的运行结果;若所述分子试验包括至少两个子任务且部分子任务被执行,则以失败作为所述分子试验的运行结果。
这样,根据分子试验的子任务的执行情况确定出分子试验的运行情况,方便后续在运行管理界面中直观地展示分子试验的运行情况。
在一种可能的实现方式中,所述装置还包括:移动模块,所述移动模块被配置为在检测到针对所述运行示意图的移动操作的情况下,改变所述运行示意图在所述运行管理界面中的位置;并且/或者,缩放模块,所述缩放模块被配置为在检测到针对所述运行示意图的缩放操作的情况下,对所述运行示意图的显示尺寸进行放大或缩小。
这样,通过针对某一个节点进行移动操作,以便用户拖动其中某个节点至理想位置,操作简单,也可以通过针对运行示意图整体进行移动操作,以便用户拖动整个运行示意图至理想位置,操作简单。
在一种可能的实现方式中,所述装置还包括:试验信息输入模块,所述试验信息输入模块被配置为在检测到针对自由能微扰控件的触发操作的情况下,展示用于试验预测的运行管理的初始界面,所述初始界面中展示有至少一个可选项目;在根据选择操作从所述至少一个可选项目中确定出所述目标项目的情况下,展示针对所述目标项目的试验信息输入提示,所述试验信息输入提示中展示有多个试验参数输入框和所述启动控件,不同的试验参数输入框用于进行不同试验参数的输入,其中,所述试验参数包括受体名称、记录受体结构的受体文件、自动运行、运行名称中的至少一种;根据检测到的针对各所述试验参数输入框的输入操作,在所述试验信息输入提示中展示确定出的针对所述目标项目的目标试验参数。
这样,在确定出目标项目的情况下,通过展示试验信息输入提示获取用户输入的针对目标项目的目标试验参数,以便在用户期望的目标试验参数下进行分子试验。
在一种可能的实现方式中,所述在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下,进行针对所述目标项目中各待选配体与受体的试验预测,得到试验结果,包括:在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下,根据确定出的针对所述目标项目的目标试验参数运行所述分子试验,得到所述试验结果;所述运行管理界面展示有运行信息;所述基于所述试验结果展示运行管理界面,还包括:根据所述目标项目、所述各待选配体、所述受体、所述运行名称构建运行列表,所述运行列表表征所述运行信息。
这样,可以在用户期望的目标试验参数下进行分子试验,并通过在运行管理界面中展示运行列表,可以方便用户直观获取各分子试验的运行信息。
在一种可能的实现方式中,所述装置还包括:浏览模块,所述浏览模块被配置为在检测到针对所述目标项目的浏览控件的触发操作的情况下,根据历史运行的试验预测的试验结果展示所述运行管理界面,其中,所述浏览控件设置于用于分子试验的运行管理的初始界面和/或所述子任务对应的结果界面;并且/或者,切换模块,所述切换模块被配置为在检测到针对所述目标项目的切换控件的触发操作的情况下,隐藏或显示所述运行示意图中的运行路径,其中,所述切换控件设置于所述运行管理界面。
这样,通过对浏览控件的触发操作的检测,可便捷快速浏览针对目标项目运行的分子试验的相关信息;通过对切换控件的触发操作的检测,方便用户自定义显示或隐藏部分分子试验。
在一种可能的实现方式中,所述装置还包括:中止模块,所述中止模块被配置为在检测到针对所述分子试验的中止操作的情况下,在所述分子试验对应的运行路径中表征所述中止操作对应的子任务的节点处,展示该子任务处于中止状态;并且/或者,待处理模块,所述待处理模块被配置为在检测到所述分子试验中的子任务处于待处理状态的情况下,在所述分子试验对应的运行路径中表征该子任务的节点处,展示该子任务处于待处理状态。
这样,通过在子任务的节点处标注运行状态,方便用户直观地获取到分子试验的当前运行情况。
根据本公开的另一方面,提供了一种分子试验的运行管理装置,包括:处理器;用于存储处理器可执行指令的存储器;其中,所述处理器被配置为在执行所述存储器存储的指令时,实现上述分子试验的运行管理方法。
根据本公开的另一方面,提供了一种非易失性计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序指令,其中,所述计算机程序指令被处理器执行时实现上述分子试验的运行管理方法。
根据下面参考附图对示例性实施例的详细说明,本公开的其它特征及方面将变得清楚。
附图说明
包含在说明书中并且构成说明书的一部分的附图与说明书一起示出了本公开的示例性实施例、特征和方面,并且用于解释本公开的原理。
图1示出根据本公开实施例提供的分子试验的运行管理方法的流程图。
图2-图7示出根据本公开实施例提供的分子试验的运行管理方法中界面的示意图。
图8示出根据本公开实施例提供的分子试验的运行管理装置的框图。
图9示出根据本公开实施例提供的用于执行分子试验的运行管理方法的装置的框图。
具体实施方式
以下将参考附图详细说明本公开的各种示例性实施例、特征和方面。附图中相同的附图标记表示功能相同或相似的元件。尽管在附图中示出了实施例的各种方面,但是除非特别指出,不必按比例绘制附图。
在这里专用的词“示例性”意为“用作例子、实施例或说明性”。这里作为“示例性”所说明的任何实施例不必解释为优于或好于其它实施例。
另外,为了更好的说明本公开,在下文的具体实施方式中给出了众多的具体细节。本领域技术人员应当理解,没有某些具体细节,本公开同样可以实施。在一些实例中,对于本领域技术人员熟知的方法、手段、元件和电路未作详细描述,以便于凸显本公开的主旨。
为解决上述技术问题,本公开实施例提供一种分子试验的运行管理方法,通过在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下进行针对目标项目中各待选配体与受体的试验预测,得到试验结果,并基于试验结果展示运行管理界面,在检测到针对运行管理界面中子任务的触发操作的情况下展示结果界面,其中,试验预测包括至少一个分子试验,各分子试验包括依次执行的至少一个子任务,子任务包括分子姿态筛选、分子间力场分析、分子间相互关系分析、自由能计算、自由能分析,结果界面展示有子任务的子结果,这样,在整个试验预测过程中,用户所需进行的操作少且简单,使得用户通过简单的操作就能够便捷、直观、迅速地实现分子试验的运行管理,方便用户根据运行管理界面查看子任务的子结果,有助于快速筛选出有效的药物待选配体,大大缩短新药开发流程,降低新药失败风险。
图1示出根据本公开实施例提供的分子试验的运行管理方法的流程图。如图1所示,该运行管理方法可以包括下述步骤S101至步骤S103。
步骤S101、在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下,进行针对目标项目中各待选配体与受体的试验预测,得到试验结果。
步骤S102、基于试验结果展示运行管理界面;
步骤S103、在检测到针对运行管理界面中子任务的触发操作的情况下,展示结果界面。
这样,通过步骤S101在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下进行针对目标项目中各待选配体与受体的试验预测,可以得到试验结果,其中,试验预测包括至少一个分子试验,各分子试验包括依次执行的至少一个子任务,子任务包括分子姿态筛选、分子间力场分析、分子间相互关系分析、自由能计算、自由能分析,试验结果包括各分子试验中执行的各子任务的子结果;通过步骤S102基于试验结果可以展示运行管理界面,运行管理界面展示有各分子试验的运行结果和分子试验从开始运行到结束运行的过程中依次执行的全部子任务;通过步骤S103在检测到针对运行管理界面中子任务的触发操作的情况下展示结果界面,结果界面展示有子任务的子结果。这样,在整个试验预测过程中,用户所需进行的操作少且简单,使得用户通过简单的操作就能够便捷、直观、迅速地实现分子试验的运行管理,方便用户根据运行管理界面查看子任务的子结果,有助于快速筛选出有效的药物待选配体,大大缩短新药开发流程,降低新药失败风险。
图2-图7示出根据本公开实施例提供的分子试验的运行管理方法中界面的示意图。以下结合图1-图7对本公开实施例提供的分子试验的运行管理方法进行示意性说明。
在一种可能的实现方式中,如图2所示,在为用户展示首页I0的过程中,在检测到针对自由能微扰(free energy perturbation,FEP)控件W0的触发操作的情况下,可展示用于试验预测的运行管理的初始界面I1。其中,FEP控件W0中可展示有文字、符号、图像等与FEP相关的控件提示信息,以便用户可以直接通过控件提示信息确定FEP控件W0的实际功能。初始界面I1中区域A1可展示有至少一个可选项目以及相关描述信息。相关描述信息可以包括可选项目的数据集名称(Dataset)、更新信息(Updated)、可选项目的数据集中待选配体的数量(Size)、试验预测次数(Runs)等等与可选项目相关的信息。试验预测次数可以是针对目标项目所执行的试验预测的计算次数。举例来说,试验预测次数可通过阿拉伯数字描述,如图2所示,数据集名称为“test”的试验预测次数为0,数据集名称为“TYK2-16”的试验预测次数为13。
在为用户展示初始界面I1的过程中,可进行用户的选择操作的检测。举例来说,用户的选择操作可以是针对某一个可选项目的点击操作、双击操作等其他有针对性的选择操作。这样,在检测到用户针对某一个可选项目发出的选择操作的情况下,可以从至少一个可选项目中确定出目标项目。
在一种可能的实现方式中,在根据选择操作从至少一个可选项目中确定出目标项目的情况下,可在初始界面I1中突出显示目标项目,以使得用户可以从可选项目中确定其选择的目标项目。举例来说,突出显示目标项目的方式可以是加粗项目的相关描述信息、高亮项目的相关描述信息等等。例如,在用户选择数据集名称为“test000”的可选项目作为目标项目的情况下,如图3所示,数据集名称为“test000”的相关描述信息已经通加粗的方式突出显示。
在一种可能的实现方式中,在根据选择操作从至少一个可选项目中确定出目标项目的情况下,可在初始界面I1中展示目标项目中的各待选配体。如图3所示,在初始界面I1的区域A2,可展示目标项目中的各待选配体的相关信息,各待选配体的相关信息可以包括待选配体的结构式和名称。
在一种可能的实现方式中,在根据选择操作从至少一个可选项目中确定出目标项目的情况下,可展示针对目标项目的试验信息输入提示(Experimental Context)。如图3所示,在初始界面I1的区域A3中,可展示针对目标项目的试验信息输入提示。试验信息输入提示中可展示有多个试验参数输入框和启动控件W1(例如图3中的Creat)。不同的试验参数输入框可用于进行不同试验参数的输入。试验参数可包括受体名称(Receptor Name)、记录受体结构的受体文件(Receptor)、自动运行(Auto Run)、运行名称(Run Name)中的至少一种。
举例来说,如图3所示,在初始界面I1的区域A3中,可展示有目标项目中数据集信息“Dataset:test000,6Project Ligands,0Protomers/Tautomers”,用户基于这些数据集信息就可以确定目标项目有6个待选配体,原聚体/互变异构体的数量为0。在初始界面I1的区域A3中,可展示有分子试验的酸碱度(Experimental pH),pH值可采用统一预先设定的值,这样有助于后续在相同试验环境下筛选出有效的药物待选配体。在初始界面I1的区域A3中,可展示有用于输入受体名称的试验参数输入框和用于输入记录受体结构的受体文件的试验参数输入框。在初始界面I1的区域A3中,可展示有用于输入是否要自动运行(AutoRun)的试验参数输入框,该输入框输入的内容可根据勾选操作或不勾选操作确定,若在Auto Run对应的方框中进行勾选则该分子试验可依次执行各个子任务,比如勾选后可自动执行分子姿态筛选(TandemPose)、分子间力场分析(TandemForce)、分子间相互关系分析(TandemNetMap)、自由能计算(TandemEnergy)、自由能分析(TandemAnalytics)这五个子任务(详见后文);若在Auto Run后方的方框中不进行勾选操作则该分子试验执行当前单个子任务后便停止试验,这样,可便于用户选择是否要一次性完成所有子任务的分子试验以应对不同的试验需求,既可以通过一键勾选来自动完成分子试验的所有子任务,方便快捷,还可以在获取到子任务的子结果(详见后文)后选择性地执行后续子任务,更具灵活性。在初始界面I1的区域A3中,可展示有用于输入运行名称的试验参数输入框,用户可自由命名本次试验的名称。
在一种可能的实现方式中,在为用户展示试验信息输入提示后,可进一步进行用户的输入操作的检测,并根据检测到的针对各试验参数输入框的输入操作,可在试验信息输入提示中展示确定出的针对目标项目的目标试验参数。这样,在确定出目标项目的情况下,通过展示试验信息输入提示获取用户输入的针对目标项目的目标试验参数,以便在用户期望的目标试验参数下进行分子试验。
在一种可能的实现方式中,在确定出针对目标项目的目标试验参数后,步骤S101可以包括:在检测到针对目标项目的启动控件W1的触发操作的情况下,根据确定出的针对目标项目的目标试验参数运行分子试验,得到试验结果。这样,可以在用户期望的目标试验参数下进行分子试验。
分子试验可包括依次执行的至少一个子任务。在一种可能的实现方式中,子任务可包括分子姿态筛选、分子间力场分析、分子间相互关系分析、自由能计算、自由能分析。分子姿态筛选可以是指基于预设的算法(如TandemPose算法)对应的模块生成一定数量的配体分子的分子构象,不同配体分子的分子构象与受体分子之间在三维空间中具有相对的位置关系;以用于相对结合自由能(relative binding free energy,RBFE)、绝对结合自由能(absolute binding free energy,ABFE)等的计算,筛选出一定数量的优选构象。分子间力场分析可基于预设的算法(如TandemForce算法)生成配体分子与受体分子之间的力场模型,得到配体分子与受体分子之间的力场参数(力场参数是一种用于描述原子、分子或其他粒子之间相互作用的数学模型数据)。分子间相互关系分析可基于预设的算法(如TandemNetMap算法)完成分子之间的组网,构建出分子间相互关系图。自由能计算可基于预设的算法(如TandemEnergy算法)完成RBFE的计算,并生成分析结果。自由能分析可基于预设的算法(如TandemAnalytics算法)对分子间相互关系图的相对自由能计算结果进行排序转换,得出RBFE计算结果,并推测实际化合物与蛋白结合能力。上述五个子任务的执行顺序可以是分子姿态筛选、分子间力场分析、分子间相互关系分析、自由能计算、自由能分析。
在设置的分子试验包括单个子任务的情况下,该分子试验可以是分子姿态筛选、分子间力场分析、分子间相互关系分析、自由能计算、自由能分析这五个子任务中的任意一个。
在设置的分子试验包括多个子任务的情况下,该分子试验可以包括依次执行的多个子任务。例如,该分子试验可以包括依次执行的分子姿态筛选、分子间力场分析、分子间相互关系分析、自由能计算、自由能分析。再例如,该分子试验可以包括依次执行的分子姿态筛选、分子间力场分析。分子试验所包括的子任务可根据用户的实际需求设置,本公开实施例对此不做限制。
试验预测可包括至少一个分子试验。可为同一个目标项目设置多个不同的分子试验,从而可以得到针对同一个目标项目的不同分子试验的试验结果(例如图5中的运行示意图),有助于更好地比较筛选出有效的药物待选配体。针对同一目标项目的分子试验,可以同时进行这些分子试验,或者,也可以按照自定义顺序或默认顺序进行各分子试验。
试验结果包括各分子试验中执行的各子任务的子结果。执行子任务后,可得到该子任务的子结果,子结果为成功或失败。
如图4所示,在进行针对目标项目中各待选配体与受体的试验预测后,可以基于试验结果直接展示运行管理界面T2(Runs Explorer)。运行管理界面T2可以通过区域A3展示运行示意图,并且/或者,运行管理界面T2可以通过区域A4展示运行列表。
运行示意图可展示各分子试验的运行结果和分子试验从开始运行到结束运行的过程中依次执行的全部子任务。运行结果为成功或失败。不同的运行结果可通过不同的符号标记在运行示意图中,可以标注在分子试验运行至结束时所执行的子任务上。这样,通过在运行管理界面中展示运行示意图,可以方便用户直观获取分子试验的运行情况,并在分子试验运行失败的情况下可以直观地确定出当前试验停在何子任务处。
若分子试验包括一个子任务,则可以执行该子任务所得到的子结果作为分子试验的运行结果。若分子试验包括至少两个子任务且各子任务均成功执行,则可以成功作为分子试验的运行结果。若分子试验包括至少两个子任务且部分子任务被执行,则可以失败作为分子试验的运行结果。这样,根据分子试验的子任务的执行情况确定出分子试验的运行情况,方便后续在运行管理界面中直观地展示分子试验的运行情况。
在一种可能的实现方式中,步骤S102可以包括:根据试验结果,确定出各分子试验的运行结果以及各分子试验所执行的全部子任务;根据各分子试验的全部子任务和受体,构建各分子试验对应的运行路径,运行路径包括依次连接的多个节点,多个节点依次表征分子试验所用的受体以及已经依次执行的各子任务;以构建出的运行路径和运行结果形成运行示意图,并在运行管理界面中显示运行示意图,运行示意图中各运行路径的最后一个节点还用于表示对应的分子试验的运行结果。这样,通过分子试验所执行的全部子任务和运行结果构建运行示意图,方便用户直观获取分子试验的运行情况,并在分子试验运行失败的情况下可以直观地确定出当前试验停在何子任务处。
运行列表可展示各分子试验的运行信息。运行信息可以包括目标项目的相关信息和/或针对目标项目的分子试验信息。目标项目的相关信息可以是目标项目的名称和/或目标项目的所包括的配体数量。分子试验信息可以是受体名称和/或分子试验名称。这样,通过在运行管理界面中展示运行列表,可以方便用户直观获取各分子试验的运行信息。
在一种可能的实现方式中,步骤S102可以包括:根据目标项目、各待选配体、受体、运行名称构建运行列表。
以包括依次执行的分子姿态筛选、分子间力场分析、分子间相互关系分析、自由能计算这四个子任务的分子试验Run00且该分子试验Run00的各个子任务的子结果均为成功为例:根据分子试验Run00的各个子任务的子结果均为成功的试验结果,可以确定出分子试验Run00的运行结果为成功以及分子试验Run00所执行的全部子任务依次为分子姿态筛选、分子间力场分析、分子间相互关系分析、自由能计算;根据分子试验Run00对应的全部子任务和受体可构建分子试验Run00对应的运行路径,该运行路径可包括依次连接的表征分子试验Run00所用的受体4GIH的R节点以及表征已经依次执行完毕的上述四个子任务的T1节点、T2节点、T3节点、T4节点,并在T4节点处设置表示运行结果为成功的标记(在本例中为图4示出的形状为“√”的标记W2),以构建出的运行路径和运行结果形成图4所示的运行示意图,并在运行管理界面I2中区域A3显示该运行示意图。以及,根据目标项目、各待选配体、受体、运行名称构建图4所示的运行列表。这样,在展示运行管理界面T2的过程中,用户可以在区域A4中查看表示针对目标项目的分子试验的运行信息的运行列表,该运行列表反映针对目标项目的试验预测信息,这些信息可以包括目标项目的名称即TYK2-16、目标项目的所包括的配体数量即16以及在所用受体为4GIH下的多个分子试验名称,以及,用户还可以在区域A3中查看运行示意图,该运行示意图中,R节点表征分子试验Run00所用受体4GIH、T1节点表征分子试验Run00第一个执行的子任务TandemPose、T2节点表征分子试验Run00第二个执行的子任务TandemForce、T3节点表征分子试验Run00第三个执行的子任务TandemNetMap、T4节点表征分子试验Run00最后执行的子任务TandemEnergy,并通过标记在T4节点上的W4确定分子试验Run00的运行结果为成功。
在展示运行管理界面I2的过程中,在一种可能的实现方式中,在检测到针对运行示意图的移动操作的情况下,可以改变运行示意图在运行管理界面中的位置。移动操作可以是对光标的移动操作。移动操作可以针对某一个节点进行,以便用户拖动其中某个节点至理想位置,操作简单。移动操作也可以针对运行示意图整体进行,以便用户拖动整个运行示意图至理想位置,操作简单。
在展示运行管理界面I2的过程中,在一种可能的实现方式中,在检测到针对运行示意图的缩放操作的情况下,可对运行示意图的显示尺寸进行放大或缩小。缩放操作可以是对鼠标滚轮的滚动操作。缩放操作的响应范围可不限于运行示意图,还可包括运行示意图所在区域。这样,缩放操作不仅可以针对运行示意图本身进行,还可以针对用于展示运行示意图的整个区域进行,这有助于用户便捷快速地实现对运行示意图的缩放。
在展示运行管理界面I2的过程中,在检测到针对运行管理界面中子任务的触发操作的情况下,可展示结果界面。结果界面可展示有子任务的子结果。举例来说,如图5所示,在检测到针对运行管理界面I2中表征子任务的节点T的触发操作的情况下,可在结果界面I3中展示子任务的子结果。
在一种可能的实现方式中,在检测到针对目标项目的浏览控件(Browse Runs)的触发操作的情况下,可根据历史运行的试验预测的试验结果展示运行管理界面。其中,浏览控件可设置于用于分子试验的运行管理的初始界面和/或子任务对应的结果界面。比如浏览控件W3可设置于图5所示的结果界面I3中。再比如浏览控件W3可设置于图6所示的运行管理的初始界面I1的主页(Home页)中。这样,可便捷快速浏览针对目标项目运行的分子试验的相关信息。
在一种可能的实现方式中,在检测到针对目标项目的切换控件(Toggle runvisibility)的触发操作的情况下,可隐藏或显示运行示意图中的运行路径。其中,切换控件可设置于运行管理界面,例如图4所示的运行管理界面I2中。这样,方便用户自定义显示或隐藏部分分子试验。
在一种可能的实现方式中,在检测到针对分子试验的中止操作的情况下,可在分子试验对应的运行路径中表征中止操作对应的子任务的节点处,展示该子任务处于中止状态。例如,可通过图7所示的运行管理界面I2中形状为“-”的标记W4展示该子任务处于中止状态。
在一种可能的实现方式中,在检测到分子试验中的子任务处于待处理状态的情况下,可在分子试验对应的运行路径中表征该子任务的节点处,展示该子任务处于待处理状态。同理于中止状态,待处理状态也可以设置响应的标记来展现。这样,通过在子任务的节点处标注运行状态,方便用户直观地获取到分子试验的当前运行情况。
需要说明的是,尽管以“-”、“√”作为示例介绍了子任务所处的状态和分子试验的运行结果,但本领域技术人员能够理解,本公开应不限于此。事实上,用户完全可根据个人喜好和/或实际应用场景灵活设定不同子任务所处的状态的标号以及分子试验的不同运行结果的标号。
本公开实施例还提供了一种分子试验的运行管理装置。图8示出根据本公开实施例提供的分子试验的运行管理装置的框图。如图8所示,该分子试验的运行管理装置800可以包括:
试验预测模块801,所述试验预测模块801被配置为在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下,进行针对所述目标项目中各待选配体与受体的试验预测,得到试验结果,其中,所述试验预测包括至少一个分子试验,各所述分子试验包括依次执行的至少一个子任务,所述子任务包括分子姿态筛选、分子间力场分析、分子间相互关系分析、自由能计算、自由能分析,所述试验结果包括各所述分子试验中执行的各所述子任务的子结果;
第一展示模块802,所述第一展示模块802被配置为基于所述试验结果展示运行管理界面,所述运行管理界面展示有各所述分子试验的运行结果和所述分子试验从开始运行到结束运行的过程中依次执行的全部子任务,所述运行结果为成功或失败;
第二展示模块803,所述第二展示模块803被配置为在检测到针对所述运行管理界面中子任务的触发操作的情况下,展示结果界面,所述结果界面展示有所述子任务的子结果。
这样,通过试验预测模块在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下进行针对目标项目中各待选配体与受体的试验预测,可以得到试验结果,其中,试验预测包括至少一个分子试验,各分子试验包括依次执行的至少一个子任务,子任务包括分子姿态筛选、分子间力场分析、分子间相互关系分析、自由能计算、自由能分析,试验结果包括各分子试验中执行的各子任务的子结果;通过第一展示模块可以展示运行管理界面,运行管理界面展示有各分子试验的运行结果和分子试验从开始运行到结束运行的过程中依次执行的全部子任务;通过第二展示模块在检测到针对运行管理界面中子任务的触发操作的情况下可以展示结果界面,结果界面展示有子任务的子结果,在整个试验预测过程中,用户所需进行的操作少且简单,使得用户通过简单的操作就能够便捷、直观、迅速地实现分子试验的运行管理,方便用户根据运行管理界面查看子任务的子结果,有助于快速筛选出有效的药物待选配体,大大缩短新药开发流程,降低新药失败风险。
在一种可能的实现方式中,所述运行管理界面展示有运行示意图;所述基于所述试验结果展示运行管理界面,包括:根据所述试验结果,确定出各所述分子试验的运行结果以及各所述分子试验所执行的全部子任务;根据各所述分子试验的全部子任务和所述受体,构建各所述分子试验对应的运行路径,所述运行路径包括依次连接的多个节点,所述多个节点依次表征所述分子试验所用的受体以及已经依次执行的各子任务;以构建出的运行路径和所述运行结果形成运行示意图,并在所述运行管理界面中显示所述运行示意图,所述运行示意图中各运行路径的最后一个节点还用于表示对应的所述分子试验的运行结果。这样,通过分子试验所执行的全部子任务和运行结果构建运行示意图,方便用户直观获取分子试验的运行情况,并在分子试验运行失败的情况下可以直观地确定出当前试验停在何子任务处。
在一种可能的实现方式中,所述根据所述试验结果,确定出各所述分子试验的运行结果以及各所述分子试验所执行的全部子任务,包括:若所述分子试验包括一个子任务,则以执行该子任务所得到的子结果作为所述分子试验的运行结果;若所述分子试验包括至少两个子任务且各子任务均成功执行,则以成功作为所述分子试验的运行结果;若所述分子试验包括至少两个子任务且部分子任务被执行,则以失败作为所述分子试验的运行结果。这样,根据分子试验的子任务的执行情况确定出分子试验的运行情况,方便后续在运行管理界面中直观地展示分子试验的运行情况。
在一种可能的实现方式中,所述装置还包括:移动模块,所述移动模块被配置为在检测到针对所述运行示意图的移动操作的情况下,改变所述运行示意图在所述运行管理界面中的位置;并且/或者,缩放模块,所述缩放模块被配置为在检测到针对所述运行示意图的缩放操作的情况下,对所述运行示意图的显示尺寸进行放大或缩小。这样,通过针对某一个节点进行移动操作,以便用户拖动其中某个节点至理想位置,操作简单,也可以通过针对运行示意图整体进行移动操作,以便用户拖动整个运行示意图至理想位置,操作简单。
在一种可能的实现方式中,所述装置还包括:试验信息输入模块,所述试验信息输入模块被配置为在检测到针对自由能微扰控件的触发操作的情况下,展示用于试验预测的运行管理的初始界面,所述初始界面中展示有至少一个可选项目;在根据选择操作从所述至少一个可选项目中确定出所述目标项目的情况下,展示针对所述目标项目的试验信息输入提示,所述试验信息输入提示中展示有多个试验参数输入框和所述启动控件,不同的试验参数输入框用于进行不同试验参数的输入,其中,所述试验参数包括受体名称、记录受体结构的受体文件、自动运行、运行名称中的至少一种;根据检测到的针对各所述试验参数输入框的输入操作,在所述试验信息输入提示中展示确定出的针对所述目标项目的目标试验参数。这样,在确定出目标项目的情况下,通过展示试验信息输入提示获取用户输入的针对目标项目的目标试验参数,以便在用户期望的目标试验参数下进行分子试验。
在一种可能的实现方式中,所述在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下,进行针对所述目标项目中各待选配体与受体的试验预测,得到试验结果,包括:在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下,根据确定出的针对所述目标项目的目标试验参数运行所述分子试验,得到所述试验结果;所述运行管理界面展示有运行信息;所述基于所述试验结果展示运行管理界面,还包括:根据所述目标项目、所述各待选配体、所述受体、所述运行名称构建运行列表,所述运行列表表征所述运行信息。这样,可以在用户期望的目标试验参数下进行分子试验,并通过在运行管理界面中展示运行列表,可以方便用户直观获取各分子试验的运行信息。
在一种可能的实现方式中,所述装置还包括:浏览模块,所述浏览模块被配置为在检测到针对所述目标项目的浏览控件的触发操作的情况下,根据历史运行的试验预测的试验结果展示所述运行管理界面,其中,所述浏览控件设置于用于分子试验的运行管理的初始界面和/或所述子任务对应的结果界面;并且/或者,切换模块,所述切换模块被配置为在检测到针对所述目标项目的切换控件的触发操作的情况下,隐藏或显示所述运行示意图中的运行路径,其中,所述切换控件设置于所述运行管理界面。这样,通过对浏览控件的触发操作的检测,可便捷快速浏览针对目标项目运行的分子试验的相关信息;通过对切换控件的触发操作的检测,方便用户自定义显示或隐藏部分分子试验。
在一种可能的实现方式中,所述装置还包括:中止模块,所述中止模块被配置为在检测到针对所述分子试验的中止操作的情况下,在所述分子试验对应的运行路径中表征所述中止操作对应的子任务的节点处,展示该子任务处于中止状态;并且/或者,待处理模块,所述待处理模块被配置为在检测到所述分子试验中的子任务处于待处理状态的情况下,在所述分子试验对应的运行路径中表征该子任务的节点处,展示该子任务处于待处理状态。这样,通过在子任务的节点处标注运行状态,方便用户直观地获取到分子试验的当前运行情况。
在一些实施例中,本公开实施例提供的装置具有的功能或包含的模块可以用于执行上文方法实施例描述的方法,其具体实现可以参照上文方法实施例的描述,为了简洁,这里不再赘述。
本公开实施例还提出一种分子试验的运行管理装置,包括:处理器;用于存储处理器可执行指令的存储器;其中,所述处理器被配置为在执行所述存储器存储的指令时,实现上述分子试验的运行管理方法。
在一些实施例中,本公开实施例提供的分子试验的运行管理装置具有的功能或包含的模块可以用于执行上文方法实施例描述的方法,其具体实现可以参照上文分子试验的运行管理方法实施例的描述,为了简洁,这里不再赘述。
本公开实施例还提出一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序指令,所述计算机程序指令被处理器执行时实现上述分子试验的运行管理方法。计算机可读存储介质可以是易失性或非易失性计算机可读存储介质。
在一些实施例中,本公开实施例提供的计算机可读存储介质具有的功能或包含的模块可以用于执行上文方法实施例描述的方法,其具体实现可以参照上文分子试验的运行管理方法实施例的描述,为了简洁,这里不再赘述。
本公开实施例还提供了一种计算机程序产品,包括计算机可读代码,或者承载有计算机可读代码的非易失性计算机可读存储介质,当所述计算机可读代码在电子设备的处理器中运行时,所述电子设备中的处理器执行上述分子试验的运行管理方法。
在一些实施例中,本公开实施例提供的计算机程序产品具有的功能或包含的模块可以用于执行上文方法实施例描述的方法,其具体实现可以参照上文分子试验的运行管理方法实施例的描述,为了简洁,这里不再赘述。
图9示出根据本公开实施例提供的用于执行分子试验的运行管理方法的装置的框图。例如,装置1900可以被提供为一服务器或终端设备。参照图9,装置1900包括处理组件1922,其进一步包括一个或多个处理器,以及由存储器1932所代表的存储器资源,用于存储可由处理组件1922的执行的指令,例如应用程序。存储器1932中存储的应用程序可以包括一个或一个以上的每一个对应于一组指令的模块。此外,处理组件1922被配置为执行指令,以执行上述方法。
装置1900还可以包括一个电源组件1926被配置为执行装置1900的电源管理,一个有线或无线网络接口1950被配置为将装置1900连接到网络,和一个输入输出接口1958(I/O接口)。装置1900可以操作基于存储在存储器1932的操作系统,例如Windows ServerTM,MacOS XTM,UnixTM,LinuxTM,FreeBSDTM或类似。
在示例性实施例中,还提供了一种非易失性计算机可读存储介质,例如包括计算机程序指令的存储器1932,上述计算机程序指令可由装置1900的处理组件1922执行以完成上述方法。
本公开可以是系统、方法和/或计算机程序产品。计算机程序产品可以包括计算机可读存储介质,其上载有用于使处理器实现本公开的各个方面的计算机可读程序指令。
计算机可读存储介质可以是可以保持和存储由指令执行设备使用的指令的有形设备。计算机可读存储介质例如可以是――但不限于――电存储设备、磁存储设备、光存储设备、电磁存储设备、半导体存储设备或者上述的任意合适的组合。计算机可读存储介质的更具体的例子(非穷举的列表)包括:便携式计算机盘、硬盘、随机存取存储器(RAM)、只读存储器(ROM)、可擦式可编程只读存储器(EPROM或闪存)、静态随机存取存储器(SRAM)、便携式压缩盘只读存储器(CD-ROM)、数字多功能盘(DVD)、记忆棒、软盘、机械编码设备、例如其上存储有指令的打孔卡或凹槽内凸起结构、以及上述的任意合适的组合。这里所使用的计算机可读存储介质不被解释为瞬时信号本身,诸如无线电波或者其他自由传播的电磁波、通过波导或其他传输媒介传播的电磁波(例如,通过光纤电缆的光脉冲)、或者通过电线传输的电信号。
这里所描述的计算机可读程序指令可以从计算机可读存储介质下载到各个计算/处理设备,或者通过网络、例如因特网、局域网、广域网和/或无线网下载到外部计算机或外部存储设备。网络可以包括铜传输电缆、光纤传输、无线传输、路由器、防火墙、交换机、网关计算机和/或边缘服务器。每个计算/处理设备中的网络适配卡或者网络接口从网络接收计算机可读程序指令,并转发该计算机可读程序指令,以供存储在各个计算/处理设备中的计算机可读存储介质中。
用于执行本公开操作的计算机程序指令可以是汇编指令、指令集架构(ISA)指令、机器指令、机器相关指令、微代码、固件指令、状态设置数据、或者以一种或多种编程语言的任意组合编写的源代码或目标代码,所述编程语言包括面向对象的编程语言—诸如Smalltalk、C++等,以及常规的过程式编程语言—诸如“C”语言或类似的编程语言。计算机可读程序指令可以完全地在用户计算机上执行、部分地在用户计算机上执行、作为一个独立的软件包执行、部分在用户计算机上部分在远程计算机上执行、或者完全在远程计算机或服务器上执行。在涉及远程计算机的情形中,远程计算机可以通过任意种类的网络—包括局域网(LAN)或广域网(WAN)—连接到用户计算机,或者,可以连接到外部计算机(例如利用因特网服务提供商来通过因特网连接)。在一些实施例中,通过利用计算机可读程序指令的状态信息来个性化定制电子电路,例如可编程逻辑电路、现场可编程门阵列(FPGA)或可编程逻辑阵列(PLA),该电子电路可以执行计算机可读程序指令,从而实现本公开的各个方面。
这里参照根据本公开实施例的方法、装置(系统)和计算机程序产品的流程图和/或框图描述了本公开的各个方面。应当理解,流程图和/或框图的每个方框以及流程图和/或框图中各方框的组合,都可以由计算机可读程序指令实现。
这些计算机可读程序指令可以提供给通用计算机、专用计算机或其它可编程数据处理装置的处理器,从而生产出一种机器,使得这些指令在通过计算机或其它可编程数据处理装置的处理器执行时,产生了实现流程图和/或框图中的一个或多个方框中规定的功能/动作的装置。也可以把这些计算机可读程序指令存储在计算机可读存储介质中,这些指令使得计算机、可编程数据处理装置和/或其他设备以特定方式工作,从而,存储有指令的计算机可读介质则包括一个制造品,其包括实现流程图和/或框图中的一个或多个方框中规定的功能/动作的各个方面的指令。
也可以把计算机可读程序指令加载到计算机、其它可编程数据处理装置、或其它设备上,使得在计算机、其它可编程数据处理装置或其它设备上执行一系列操作步骤,以产生计算机实现的过程,从而使得在计算机、其它可编程数据处理装置、或其它设备上执行的指令实现流程图和/或框图中的一个或多个方框中规定的功能/动作。
附图中的流程图和框图显示了根据本公开的多个实施例的系统、方法和计算机程序产品的可能实现的体系架构、功能和操作。在这点上,流程图或框图中的每个方框可以代表一个模块、程序段或指令的一部分,所述模块、程序段或指令的一部分包含一个或多个用于实现规定的逻辑功能的可执行指令。在有些作为替换的实现中,方框中所标注的功能也可以以不同于附图中所标注的顺序发生。例如,两个连续的方框实际上可以基本并行地执行,它们有时也可以按相反的顺序执行,这依所涉及的功能而定。也要注意的是,框图和/或流程图中的每个方框、以及框图和/或流程图中的方框的组合,可以用执行规定的功能或动作的专用的基于硬件的系统来实现,或者可以用专用硬件与计算机指令的组合来实现。
以上已经描述了本公开的各实施例,上述说明是示例性的,并非穷尽性的,并且也不限于所披露的各实施例。在不偏离所说明的各实施例的范围和精神的情况下,对于本技术领域的普通技术人员来说许多修改和变更都是显而易见的。本文中所用术语的选择,旨在最好地解释各实施例的原理、实际应用或对市场中的技术改进,或者使本技术领域的其它普通技术人员能理解本文披露的各实施例。

Claims (11)

1.一种分子试验的运行管理方法,其特征在于,包括:
在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下,进行针对所述目标项目中各待选配体与受体的试验预测,得到试验结果,其中,所述试验预测包括至少一个分子试验,各所述分子试验包括依次执行的至少一个子任务,所述子任务包括分子姿态筛选、分子间力场分析、分子间相互关系分析、自由能计算、自由能分析,所述试验结果包括各所述分子试验中执行的各所述子任务的子结果;
基于所述试验结果展示运行管理界面,所述运行管理界面展示有各所述分子试验的运行结果和所述分子试验从开始运行到结束运行的过程中依次执行的全部子任务,所述运行结果为成功或失败;
在检测到针对所述运行管理界面中子任务的触发操作的情况下,展示结果界面,所述结果界面展示有所述子任务的子结果。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述运行管理界面展示有运行示意图;所述基于所述试验结果展示运行管理界面,包括:
根据所述试验结果,确定出各所述分子试验的运行结果以及各所述分子试验所执行的全部子任务;
根据各所述分子试验的全部子任务和所述受体,构建各所述分子试验对应的运行路径,所述运行路径包括依次连接的多个节点,所述多个节点依次表征所述分子试验所用的受体以及已经依次执行的各子任务;
以构建出的运行路径和所述运行结果形成运行示意图,并在所述运行管理界面中显示所述运行示意图,所述运行示意图中各运行路径的最后一个节点还用于表示对应的所述分子试验的运行结果。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述根据所述试验结果,确定出各所述分子试验的运行结果以及各所述分子试验所执行的全部子任务,包括:
若所述分子试验包括一个子任务,则以执行该子任务所得到的子结果作为所述分子试验的运行结果;
若所述分子试验包括至少两个子任务且各子任务均成功执行,则以成功作为所述分子试验的运行结果;
若所述分子试验包括至少两个子任务且部分子任务被执行,则以失败作为所述分子试验的运行结果。
4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述方法还包括:
在检测到针对所述运行示意图的移动操作的情况下,改变所述运行示意图在所述运行管理界面中的位置;
并且/或者,
在检测到针对所述运行示意图的缩放操作的情况下,对所述运行示意图的显示尺寸进行放大或缩小。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法还包括:
在检测到针对自由能微扰控件的触发操作的情况下,展示用于试验预测的运行管理的初始界面,所述初始界面中展示有至少一个可选项目;
在根据选择操作从所述至少一个可选项目中确定出所述目标项目的情况下,展示针对所述目标项目的试验信息输入提示,所述试验信息输入提示中展示有多个试验参数输入框和所述启动控件,不同的试验参数输入框用于进行不同试验参数的输入,其中,所述试验参数包括受体名称、记录受体结构的受体文件、自动运行、运行名称中的至少一种;
根据检测到的针对各所述试验参数输入框的输入操作,在所述试验信息输入提示中展示确定出的针对所述目标项目的目标试验参数。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下,进行针对所述目标项目中各待选配体与受体的试验预测,得到试验结果,包括:在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下,根据确定出的针对所述目标项目的目标试验参数运行所述分子试验,得到所述试验结果;
所述运行管理界面展示有运行信息;所述基于所述试验结果展示运行管理界面,还包括:根据所述目标项目、所述各待选配体、所述受体、所述运行名称构建运行列表,所述运行列表表征所述运行信息。
7.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述方法还包括:
在检测到针对所述目标项目的浏览控件的触发操作的情况下,根据历史运行的试验预测的试验结果展示所述运行管理界面,其中,所述浏览控件设置于用于分子试验的运行管理的初始界面和/或所述子任务对应的结果界面;
并且/或者,
在检测到针对所述目标项目的切换控件的触发操作的情况下,隐藏或显示所述运行示意图中的运行路径,其中,所述切换控件设置于所述运行管理界面。
8.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述方法还包括:
在检测到针对所述分子试验的中止操作的情况下,在所述分子试验对应的运行路径中表征所述中止操作对应的子任务的节点处,展示该子任务处于中止状态;
并且/或者,
在检测到所述分子试验中的子任务处于待处理状态的情况下,在所述分子试验对应的运行路径中表征该子任务的节点处,展示该子任务处于待处理状态。
9.一种分子试验的运行管理装置,其特征在于,包括:
试验预测模块,所述试验预测模块被配置为在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下,进行针对所述目标项目中各待选配体与受体的试验预测,得到试验结果,其中,所述试验预测包括至少一个分子试验,各所述分子试验包括依次执行的至少一个子任务,所述子任务包括分子姿态筛选、分子间力场分析、分子间相互关系分析、自由能计算、自由能分析,所述试验结果包括各所述分子试验中执行的各所述子任务的子结果;
第一展示模块,所述第一展示模块被配置为基于所述试验结果展示运行管理界面,所述运行管理界面展示有各所述分子试验的运行结果和所述分子试验从开始运行到结束运行的过程中依次执行的全部子任务,所述运行结果为成功或失败;
第二展示模块,所述第二展示模块被配置为在检测到针对所述运行管理界面中子任务的触发操作的情况下,展示结果界面,所述结果界面展示有所述子任务的子结果。
10.一种分子试验的运行管理装置,其特征在于,包括:
处理器;
用于存储处理器可执行指令的存储器;
其中,所述处理器被配置为在执行所述存储器存储的指令时,实现权利要求1至8中任意一项所述的方法。
11.一种非易失性计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序指令,其特征在于,所述计算机程序指令被处理器执行时实现权利要求1至8中任意一项所述的方法。
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