CN117321419A - 用于脓毒症的早期检测的Presepsin标志物组 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及诊断领域。具体地,本发明涉及一种用于评定具有疑似感染的受试者的方法,所述方法包括以下步骤:确定在所述受试者的样品中第一生物标志物的量,所述第一生物标志物为Presepsin;确定在所述受试者的样品中第二生物标志物的量,其中所述第二生物标志物选自由以下组成的组:GDF‑15、肌酸酐、sFlt1、IGFBP7、sTREM1、胱抑素C和PSP(胰石蛋白),将所述生物标志物的量与所述生物标志物的参考进行比较和/或基于所述生物标志物的量来计算用于评定具有疑似感染的所述受试者的评分,并且基于比较和/或计算来评定所述受试者。本发明还涉及第一生物标志物和第二生物标志物或与所述第一生物标志物特异性结合的检测剂和与所述第二生物标志物特异性结合的检测剂用于评定具有疑似感染的受试者的用途,所述第一生物标志物为Presepsin,所述第二生物标志物选自由以下组成的组:GDF‑15、肌酸酐、sFlt1、IGFBP7、sTREM1、胱抑素C和PSP(胰石蛋白)。此外,本发明进一步涉及一种用于评定具有疑似感染的受试者的计算机实现方法以及用于评定具有疑似感染的受试者的装置和试剂盒。
Description
本发明涉及诊断领域。具体地,本发明涉及一种用于评定具有疑似感染的受试者的方法,该方法包括以下步骤:确定在受试者的样品中第一生物标志物的量,所述第一生物标志物为Presepsin;确定在受试者的样品中第二生物标志物的量,其中所述第二生物标志物选自由以下组成的组:GDF-15、肌酸酐、sFlt1、IGFBP7、sTREM1、胱抑素C和PSP(胰石蛋白),将生物标志物的量与所述生物标志物的参考进行比较和/或基于生物标志物的量来计算用于评定具有疑似感染的受试者的评分,并且基于比较和/或计算来评定所述受试者。本发明还涉及第一生物标志物和第二生物标志物或与所述第一生物标志物特异性结合的检测剂和与所述第二生物标志物特异性结合的检测剂用于评定具有疑似感染的受试者的用途,该第一生物标志物为Presepsin,该第二生物标志物选自由以下组成的组:GDF-15、肌酸酐、sFlt1、IGFBP7、sTREM1、胱抑素C和PSP(胰石蛋白)。此外,本发明进一步涉及一种用于评定具有疑似感染的受试者的计算机实现方法以及用于评定具有疑似感染的受试者的装置和试剂盒。
感染,特别是在具有更严重的体征和症状的患者(诸如在急诊室就诊的患者)身上发生的感染,有时可能发展成更危及生命的医疗状况,包括全身炎症反应综合征(SIRS)和脓毒症。
根据脓毒症-3定义,脓毒症被定义为由对感染的宿主反应失调引起的危及生命的器官功能障碍。由于脓毒症发展迅速,早期识别对于脓毒症患者管理和开始正确的治疗措施是重要的,该正确的治疗措施包括入院的第一小时内适当的抗生素治疗,以及开始利用静脉输液和血管活性药物复苏(2016年拯救脓毒症运动指南)。每延误一小时,发病率和死亡率就会逐渐增加。
脓毒症的诊断是基于并且很容易未被注意到的非特异性的临床体征和症状。因此,患者经常被误诊并且疾病的严重程度常常被低估。到目前为止,一般来说尚无诊断脓毒症的金标准,特别是在急诊科。在高收入国家,急诊室经常使用C反应蛋白(CRP)、降钙素原(PCT)和白细胞(WBC)计数来检测处于发展脓毒症的风险的血流感染患者,并与乳酸一起用来检测脓毒性休克。在低收入国家,诊断主要基于临床体征和症状,并且在某些情况下还基于SIRS和SOFA标准。然而,在最新的指南中,除了乳酸之外,没有列出用于诊断脓毒症的生物标志物(SOFA评分的临床化学、BGE和血液学组分除外)。然而,仅在有中等证据的情况下才建议PCT以潜在地降低抗生素治疗的剂量。PCT在脓毒症诊断中的局限性主要是敏感性和特异性中等。
WO 2007/009071公开了基于sFlt-1在测试受试者中诊断炎症反应的方法。所公开的方法进一步包括分析VEGF、PlGF、TNF-α、IL-6、D-二聚体、P-选择素、ICAM-I、VCAM-I、Cox-2或PAI-I中的至少一者的水平。
EP 2 174 143 B1公开了一种用于具有非感染原发性疾病的患者的预后的体外方法,该方法包括确定降钙素原的水平。
多种标志物已被认为可用于脓毒症的检测或诊断。其中包括PCT、Presepsin、GDF-15、sFLT、炎症标志物如CRP或白细胞介素,或器官衰竭特异性标志物(参见,例如,Spanuth,2014,Comparison of sCD14-ST(рresepsin)withеight biomarkers for mortalityprediction in patients admitted with acute heart failure,2014AACC AnnualMeeting Abstracts.B-331;van Engelen,2018,Crit Care Clin 34(1):139-152.)
WO2015/031996描述了用于早期确定对疾病和/或治疗反应的关键或危及生命的反应的生物标志物。
然而,仍然需要生物标志物,以便对表现出感染体征和症状的患者进行可靠且早期的评定。
因此,本发明提供了满足这些需要的工具和方法。
本发明涉及一种用于评定具有疑似感染的受试者的方法,该方法包括以下步骤:
(a)确定在受试者的样品中第一生物标志物的量,所述第一生物标志物为Presepsin;
(b)确定在受试者的样品中第二生物标志物的量,其中所述第二生物标志物选自由以下组成的组:GDF-15、肌酸酐、sFlt1、IGFBP7、sTREM1、胱抑素C和PSP(胰石蛋白);
(c)将生物标志物的量与所述生物标志物的参考进行比较和/或基于生物标志物的量来计算用于评定具有疑似感染的受试者的评分;以及
(d)基于在步骤(c)中进行的比较和/或计算来评定所述受试者。
应当理解,如在说明书和权利要求书中所使用的“一(a/an)”可以表示一个或多个,这取决于其使用的上下文。因此,例如,对“一”项目的引用可以意味着可以利用至少一个项目。
如下文所使用的,术语“具有”、“包括”或“包含”或其任意语法变型以非排他性方式使用。因此,这些术语既可以指除了由这些术语引入的特征之外,在此上下文中描述的实体中不存在其他特征的情况,也可以指存在一个或多个其他特征的情况。作为实例,表述“A具有B”、“A包括B”和“A包含B”既可以指其中除B之外,A中不存在其他要素的情况(即,其中A由B单独且唯一地组成的情况),也可以指其中除B之外,实体A中还存在一个或多个其他要素(诸如要素C、要素C和要素D或甚至其他要素)的情况。术语“包括”还涵盖仅存在所提及的项目的实施例,即,其在“由......组成”的意义上具有限制性含义。
此外,如下文所使用的,术语“特别地”、“更特别地”、“通常地”和“更通常地”或类似的术语与附加/替代特征结合使用,而不限制替代的可能性。因此,由这些术语引入的特征是附加/替代特征,并且无意以任何方式限制权利要求的范围。如技术人员将认识到的,本发明可以通过使用替代性特征来进行。类似地,由“在本发明的实施例中”引入的特征或类似表述意图成为附加/替代特征,而对本发明的替代实施例没有任何限制,对本发明的范围没有任何限制,并且对将以这种方式引入的特征与本发明的其他附加/替代或非附加/替代特征相结合的可能性也没有任何限制。
此外,应当理解,本文所使用的术语“至少一个”是指根据本发明可以使用该术语后提及的一个或多个项目。例如,如果该术语显示应当使用至少一个抽样单元,那么这可以被理解为一个抽样单元或多于一个抽样单元,即两个、三个、四个、五个或任何其他数量。根据该术语所指的项目,本领域技术人员理解该术语可能指的上限(如果有的话)。
本文使用的术语“约”是指相对于所述术语之后列举的任何数字,存在能够实现技术效果的区间精度。因此,本文所提及的约优选地是指精确数值或所述精确数值周围的±20%、优选地±15%、更优选地±10%、或甚至更优选地±5%的范围。
此外,说明书和权利要求中的术语“第一”、“第二”、“第三”等用于区分相似的要素,而不一定用于描述顺序或时间顺序。
本发明的方法可以由上述步骤组成,或者可以包括附加的步骤,诸如进一步评估在步骤(d)中获得的评定的步骤、推荐治疗措施诸如治疗的步骤等。此外,它可以包括步骤(a)之前的步骤,诸如与样品预处理有关的步骤。然而,优选地,设想上述方法是不需要在人体或动物体上实施任何步骤的离体方法。此外,该方法可通过自动化辅助。通常,生物标志物的确定可以由机器人设备支持,而比较和评定可以由数据处理设备诸如计算机支持。
本文使用的术语“评定”是指评定受试者是否患有脓毒症、是否处于患有脓毒症的风险、是否表现出关于总体健康状况或关于脓毒症或伴随脓毒症和/或感染的体征和症状而恶化的医疗状况。因此,本文所使用的评定包括诊断脓毒症、预测发展脓毒症的风险,和/或预测受试者健康状况的任何恶化,特别是关于伴随脓毒症和/或感染的体征和症状。
通常,根据本发明所提及的评定为对发展脓毒症的风险的评定(并且因此对发展脓毒症的风险的预测)。或者,评定为对受试者的(健康)状况恶化的风险的预测。此外,应当理解,如果预测发展脓毒症的风险或健康状况恶化的风险,则通常在预测窗口内进行预测。更典型地,所述预测窗口是优选地在获得样品之后约8小时、约10小时、约12小时、约16小时、约20小时、约24小时、约48小时、特别是至少约48小时。此外,优选地在获得测试样品之后,可以预测在24或48小时内发展脓毒症的风险。
在一个实施例中,预测在24小时内发展脓毒症的风险。
在替代实施例中,预测在48小时内发展脓毒症的风险。在实例部分中测试了48小时的时间。
在又一个实施例中,评定为对受试者的(健康)状况在未来恶化或不恶化的风险的预测。被怀疑患有感染和/或正在患有感染的受试者的术语“病况恶化”是本领域技术人员熟知的。该术语通常涉及病况恶化,最终可能导致进一步的药物治疗或其他干预。
优选地,如果受试者的疾病严重程度增加,如果受试者的抗生素治疗加强,如果受试者被送进ICU或另一个单元接受较高级别的护理,如果受试者需要紧急手术,如果受试者在医院中死亡,如果受试者在入院30天内死亡,如果受试者在出院30天内再次住院,如果受试者经历器官功能障碍或衰竭,例如利用SOFA评分测量,和/或如果受试者需要器官支持,则受试者的病况恶化。
本领域技术人员理解受试者的病况何时不会恶化。通常,如果受试者没有在上一段中提到的结果,受试者的病况不会恶化。
在一个实施例中,如果受试者具有以下结果中的一种或多种,则受试者的病况恶化:如果受试者被送进ICU,如果受试者在医院中死亡,如果受试者在入院30天内死亡,和/或如果受试者在出院30天内再次住院。
在一个实施例中,对受试者的病况将恶化的风险的预测为对受试者的抗生素治疗加强的风险的预测。
在一个实施例中,对受试者的病况将恶化的风险的预测为对受试者被送进ICU的风险的预测。因此,评定受试者是否有被送进ICU的风险。
在另一个实施例中,对受试者的病况将恶化的风险的预测为对受试者在医院中死亡的风险的预测。因此,评定受试者是否有在医院中死亡的风险。
在又一个实施例中,对受试者的病况将恶化的风险的预测是对受试者在入院30天内死亡的风险的预测。因此,评定受试者在入院30天内是否有死亡的风险。
在又一个实施例中,对受试者的病况将恶化的风险的预测是对受试者在出院30天内再次住院的风险的预测。因此,评定受试者在出院30天内是否有再次住院的风险。
在又一个实施例中,对受试者的病况将恶化的风险的预测为对受试者经历器官功能障碍或衰竭的风险的预测。器官功能障碍和衰竭可以是例如经由SOFA评分进行评定。因此,本发明进一步致力于预测受试者的SOFA评分将增加或不增加的风险(在获得测试样品之后)。SOFA评分的增加(诸如至少1分、至少2分、至少3分或至少4分等)被认为是病况恶化。相反,如果SOFA评分不增加(假设受试者没有最高的SOFA评分),则病况通常不会恶化。预测窗口可以为如上所述的用于预测发展脓毒症的风险的预测窗口。
序贯器官衰竭评定(SOFA)是一种经过验证的评分,结合临床评定和实验室测量,定量描述器官功能障碍/衰竭。呼吸、凝血、肝脏、心血管系统、中枢神经系统和肾脏功能障碍单独评分,并汇总为SOFA评分,范围为0至24。优选地,SOFA评分如Vincent 1996中所述的来确定(Vincent等人Intensive Care Med.1996Jul;22(7):707-10.doi:10.1007/BF01709751.PMID:8844239.)。
在又一个实施例中,对受试者的病况将恶化的风险的预测是对受试者需要器官支持的风险的预测,诸如对受试者需要血管活性治疗、血液动力学支持(诸如液体疗法)、供氧(例如通过通气或体外膜氧合)、和/或肾脏替代疗法。预测窗口可以是如上所述的用于预测发展脓毒症的风险的预测窗口,例如在获得样品后24或48小时内。。
在一个实施例中,术语“评定”是指脓毒症的诊断。因此,诊断具有疑似感染的受试者是否患有脓毒症。优选地,评定是指脓毒症的早期检测。
如本领域技术人员将理解的,根据本发明进行的评定虽然是优选的,但可能不会对100%的被研究的受试者都是正确的。该术语通常要求能够正确地评定受试者的具有统计学意义的部分。本领域技术人员可使用各种众所周知的统计评定工具(例如,确定置信区间、确定p值、学生t检验、曼-惠特尼检验等)毫不费力地确定一部分是否具有统计学意义。详细信息请参见Dowdy和Wearden,Statistics for Research,John Wiley&Sons,New York1983。通常设想的置信区间为至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少95%。p值通常为0.2、0.1、0.05。
本文所使用的术语“受试者”是指动物,优选地指哺乳动物,并且更典型地指人类。通过本发明的方法进行调查的受试者应当为具有疑似感染的受试者。本文所使用的术语“具有疑似感染”是指受试者应表现出感染的临床参数、体征和/或症状。因此,根据本发明的受试者通常为患有感染或疑似患有感染的受试者。通常,受试者为在急诊科就诊的受试者。有利地,样品已在就诊时获得。优选地,样品已在急诊科处就诊时获得。然而,样品也可以在基层医师处就诊时获得。
本文所使用的术语“样品”是指在生理条件下包含本文所提及的第一、第二和/或第三生物标志物的任何样品。更典型地,样品为体液样品,例如血液样品或从其衍生出的样品、尿液样品、唾液样品、淋巴液样品等。最典型地,所述样品为血液样品或从其衍生出的样品。因此,样品可以为血液、血清或血浆样品。血液样品通常包括毛细血管、静脉或动脉血液样品。
在一个实施例中,样品为间质液样品。
术语“脓毒症”在本领域是众所周知的。如本文所用,该术语指由宿主对感染反应失调引起的危及生命的器官功能障碍。例如,败血症的定义可以在Singer等人(Sepsis-3:The Third International Consensus Definitions for Sepsis和Septic Shock.JAMA2016;315:801-819)中找到,其全部公开内容通过引用并入本文。优选地,术语“脓毒症”是指根据在Singer等人(loc.cit.)中公开的脓毒症-3定义的脓毒症。
通常,待测试的受试者被怀疑患有感染。术语“感染”被技术人员很好地理解。如本文所用,术语“感染”优选地指由致病微生物侵对试者的身体组织的袭受、该微生物的增殖以及受试者的组织对该微生物的反应。在一个实施例中,感染为细菌感染。因此,应怀疑受试者患有细菌感染。
如本文别处阐述的,本发明允许早期鉴定处于风险的患者。在本文阐述的预测的一个实施例中,待测试的受试者因此在获得样品时未患有脓毒症。在特别优选的实施例中,待测试的受试者优选地在获得样品时未患有脓毒性休克。在Singer等人(loc.Cit.)中对术语“脓毒性休克”进行了定义。因此,如果满足以下标准,则受试者患有脓毒性休克。
·脓毒症,即疑似/记录的感染和感染后SOFA总评分变化≥2分
·并且持续性低血压需要升压药来维持MAP≥65mm Hg并且尽管进行了充分的容量复苏,但仍具有>2mmol/L(18mg/dL)的血清乳酸水平
此外,设想待测试受试者可能患有也可能未患有SARS-CoV-2。
本文所使用的术语“确定”是指对根据本发明提及的生物标志物的定性和定量确定,即该术语涵盖所述生物标志物的存在或不存在的确定或所述生物标志物的绝对或相对量的确定。
如本文所使用的术语“量”是指本文提及的化合物的绝对量、所述化合物的相对量或浓度以及与其相关或可从其导出的任何值或参数。此类值或参数包括来自通过直接测量从所述化合物获得的所有具体物理或化学性质的强度信号值,例如质谱或NMR谱中的强度值。此外,所包含的是通过在本说明书中别处指定的间接测量获得的所有值或参数,例如,响应于化合物或从特异性地结合的配体获得的强度信号而从生物读出系统确定的反应水平。应理解的是,与上述量或参数相关的值也可以通过所有标准数学运算获得。在生物标志物为一种酶的情况下,诸如丙氨酸转氨酶(ALAT)或天冬氨酸转氨酶(AST或ASAT),术语“量”也可以涵盖酶的活性。
在本发明的方法中确定量可以通过允许检测所述第二分子从第一分子释放时的存在或不存在或量的任何技术来进行。合适的技术取决于生物标志物的分子性质和特性,并且在本文别处更详细地讨论。
通常,根据本发明提及的生物标志物的量可以通过使用夹心、竞争或其他测定形式的免疫测定来确定。所述测定将发展指示生物标志物的存在或不存在或量的信号。其他合适方法包括测量生物标志物特有的物理或化学特性,诸如其精确的分子质量或NMR谱。所述方法优选地包括生物传感器、耦合到免疫测定的光学装置、生物芯片、分析装置(诸如质谱仪、NMR分析仪、表面等离子体共振测量设备或色谱装置)。此外,方法包括基于微孔板ELISA的方法、全自动或机器人免疫测定(例如可从Roche获得)。根据本发明的合适的测量方法还可以包括沉淀(特别是免疫沉淀)、电化学发光(电致化学发光)、RIA(放射免疫测定)、ELISA(酶联免疫吸附测定)、电化学发光夹心免疫测定(ECLIA)、解离增强镧系元素荧光免疫测定(DELFIA)、闪烁亲近测定(SPA)、比浊法、浊度法、乳胶增强比浊法或浊度法或固相免疫测试。本领域已知的其他方法诸如凝胶电泳、2D凝胶电泳、SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)或蛋白质印迹。更典型地,在下面的伴随实例中描述特别设想用于确定本文提及的生物标志物的技术。
根据本发明待确定的生物标志物在本领域中是众所周知的。此外,用于确定生物标志物的量的方法是已知的。例如,生物标志物可以如实例部分中所述的进行测量(参见实例1)。测试的生物标志物中的一些为酶(诸如天冬氨酸转氨酶)。还可以通过确定在样品中所述酶的活性来确定这些生物标志物的量。
生物标志物Presepsin也称为“可溶性CD14亚型”或“sCD14-ST”,衍生自sCD14(可溶性CD14),其中存在至少两种较高分子量的形式(49kDa和55kDa),并且其中sCD14-ST为片段。sCD14的蛋白水解导致Presepsin的形成。该标志物在本领域是众所周知的,例如在Erenler等人(Presepsin(sCD14-ST)as a biomarker of sepsis in clinical practiceand in emergency department:a mini review.2015J Lab Med 39:367-372)中综述的,其中在此通过引用并入本文。可使用特异性结合Presepsin的抗体,优选地不与sCD14结合的抗体(参见例如Okamura Y,Yokoi H.Development of apoint-of-care assay systemfor measurement of Presepsin(sCD14-ST).Clin Chim Acta.2011;412(23–24):2157–61)。
术语“生长分化因子-15”或“GDF-15”涉及一种多肽,该多肽为转化生长因子(TGF)细胞因子超家族的成员。术语多肽、肽和蛋白质在整个说明书中可互换使用。GDF-15最初被克隆为巨噬细胞抑制性细胞因子1,后来也被确定为胎盘转化生长因子-15、胎盘骨形态发生蛋白、非甾体抗炎药活化基因1和前列腺衍生因子(Bootcov loc cit;Hromas,1997Biochim Biophys Acta 1354:40-44;Lawton 1997,Gene 203:17-26;Yokoyama-Kobayashi1997,J Biochem(Tokyo),122:622-626;Paralkar 1998,J Biol Chem 273:13760-13767)。GDF-15的氨基酸序列公开于WO99/06445,WO00/70051,WO2005/113585,Bottner 1999,Gene 237:105-111,Bootcov loc.cit,Tan loc.cit.,Baek 2001,MolPharmacol 59:901-908,Hromas loc cit,Paralkar loc cit,Morrish 1996,Placenta17:431-441。
胰岛素样生长因子结合蛋白7(=IGFBP7)是由内皮细胞、血管平滑肌细胞、成纤维细胞和上皮细胞分泌的30kDa模块化糖蛋白(Ono,Y.等人,Biochem Biophys Res Comm 202(1994)1490-1496)。优选地,术语“IGFBP7”是指人类IGFBP7。蛋白质的序列在本领域中是众所周知的,并且例如可通过GenBank(NP_001240764.1)获得。
天冬氨酸转氨酶(AST或ASAT)催化从L-天冬氨酸到α-酮戊二酸的转氨作用,形成L-谷氨酸和草乙酸。形成的草乙酸通过苹果酸脱氢酶(MDH)还原为苹果酸,同时氧化还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)。由于NADH转化为NAD,吸光度随时间的变化与AST活性成正比,并且可以例如使用双色(340、700nm)速率技术来测量。
标志物胱抑素C(CysC)在本领域是众所周知的。胱抑素C由CST3基因编码,并且由所有有核细胞以恒定速率产生,并且人类的产生速率在整个生命周期内非常恒定。从循环中消除几乎完全经由肾小球滤过。因此,在1至50岁的年龄范围内,胱抑素C的血清浓度与肌肉质量和性别无关。因此,在血浆和血清中的胱抑素C已被认为是GFR更敏感的标志物。人胱抑素C多肽的序列可以经由Genbank评定(参见例如登录号NP_000090.1)。生物标志物可以通过颗粒增强免疫比浊测定来确定。人胱抑素C与涂有抗胱抑素C抗体的乳胶颗粒凝集。通过比浊法确定聚集体。
sTREM-1或可溶性TREM1(或STREM1)是TREM-1(髓样细胞触发性受体-1)的可溶形式。因此,该术语是指TREM-1的非细胞结合形式。TREM-1是一种已知在中性粒细胞和单核细胞/巨噬细胞上表达的免疫受体。它是最近发现的免疫球蛋白超家族的成员,参与先天免疫反应。TREM-1是一种约30kD的单体蛋白,合成为234个氨基酸前体,其具有16个氨基酸的信号肽、184个氨基酸的胞外结构域、29个氨基酸的跨膜结构域和5个氨基酸的短胞浆域。在感染期间,受体表达发生变化,并释放sTREM-1。因此,sTREM-1(17kDa)是从活化的吞噬细胞膜上脱落的TREM-1的可溶形式。通常,术语“sTREM-1”涵盖所有天然存在的切割或释放形式,其至少具有TREM-1的细胞外部分。
标志物“肌酸酐”在本领域是众所周知的。在肌肉代谢中,肌酸酐是由肌酸和磷酸肌酸内源性合成的。在肾功能正常的情况下,肌酸酐通过肾小球滤过排泄。肌酸酐确定被进行用于诊断和监测急性和慢性肾脏疾病以及监测肾透析。在尿液中的肌酸酐浓度可用作某些分析物(白蛋白、α-淀粉酶)排泄的参考值。肌酸酐可以如Popper等人(Popper H等人Biochem Z 1937;291:354)、Seel-ig和Wüst(Seelig HP,Wüst H.Arztl Labor 1969;15:34)或Bartels(Bartels H等人,Clin Chim Acta 1972;37:193)所述的进行确定。例如,将氢氧化钠和苦味酸添加到样品中以开始形成肌酸酐-苦味酸复合物。在碱性溶液中,肌酸酐与苦味酸盐形成黄橙色复合物。颜色强度与肌酸酐浓度成正比,并且可以通过光度测定来测量。
本文所使用的术语“可溶性Flt-1”或“sFlt-1”(“可溶性fms样酪氨酸激酶-1”的缩写)优选地是指作为VEGF受体Flt1的可溶性形式的多肽。在人脐静脉内皮细胞的条件培养基中对其进行了鉴定。内源性可溶性Flt1(sFlt-1)受体在色谱和免疫学上与重组人sFlt-1相似,并以相当高的亲和力结合[125I]VEGF。显示人sFlt-1在体外与KDR/Flk-1胞外结构域形成VEGF稳定的复合物。优选地,sFlt-1是指如Kendall 1996,Biochem Biophs ResCommun 226(2):324-328中所述的人sFlt-1(对于氨基酸序列,也参见例如用于人类的P17948,GI:125361和用于小鼠的BAA24499.1,GI:2809071sFlt-1)。
胰石蛋白(简称PSP)是胰腺分泌的一种蛋白质,是Lithostathine-1-α胰岛细胞再生因子(ICRF)或朗格汉斯再生蛋白胰岛(REG)。在人类中,PSP多肽由REG1A基因编码为144个氨基酸的单一多肽,进一步被胰蛋白酶切割,产生133个氨基酸,该氨基酸在苏氨酸27上进行O-连接糖基化。人PSP的氨基酸序列可经由UniProt访问(参见P05451(REG1A_HUMAN))。
在根据本发明的方法中,可以确定第三生物标志物。具体地,在本发明方法的步骤(b)中
(i)如果作为第二生物标志物确定GDF-15的量,则该方法将进一步包括作为第三生物标志物确定sFlt1、IGFBP7或sTREM1的量;或者
(ii)如果作为第二生物标志物确定胱抑素C的量,则该方法将进一步包括作为第三生物标志物确定天冬氨酸转氨酶的量。
因此,本发明涉及至少两种生物标志物(即,如本文所提及的第一和第二生物标志物)或至少三种生物标志物(即,如本文所提及的第一、第二和第三生物标志物)的确定。
第一生物标志物为Presepsin。第二生物标志物应选自GDF-15、肌酸酐、sFlt1、IGFBP7、sTREM1、胱抑素C和PSP(胰石蛋白)。
在一个实施例中,第二生物标志物为GDF-15。
在替代实施例中,第二生物标志物为胱抑素C。
在替代实施例中,第二生物标志物为肌酸酐。
在替代实施例中,第二生物标志物为sFlt1。
在替代实施例中,第二生物标志物为IGFPB7。
在替代实施例中,第二生物标志物为sTREM1。
在替代实施例中,第二生物标志物为PSP。
在GDF-15为第二标志物的情况下,该方法可以进一步包括作为第三生物标志物确定sFlt1、IGFBP7或sTREM1的量。
在一个实施例中,确定Presepsin、GDF-15和sFlt-1。
在替代实施例中,确定Presepsin、GDF-15和IGFBP7。
在替代实施例中,确定Presepsin、GDF-15和sTREM1。
如果作为第二生物标志物确定半胱抑素C的量,则该方法可以进一步包括作为第三生物标志物确定天冬氨酸转氨酶(ASAT)的量。由此,确定了Presepsin、胱抑素C和ASAT。
应当理解,本发明不限于上述标志物。相反,本发明可以涵盖附加标志物的确定。
本文所使用的术语“参考”是指允许将受试者分为患有某种疾病或病况或处于发展风险的受试者组,或未患有所述疾病或病况的或未处于发展风险的受试者组的量或值。此类参考可以是将这些组彼此分离的阈值量。因此,参考应当是允许将受试者分配到患有或未患有疾病或病况或处于发展该疾病或病况的风险的受试者组中的量或评分。例如,参考应为允许将受试者分配到处于发展脓毒症的风险或未处于发展序列风险的受试者组中的量或评分(在如上所述的预测窗口内,诸如约48小时内)。
基于来自已知患有疾病或病况或处于发展风险的受试者或受试者组的生物标志物的量,或来自已知未患有疾病或病况或未处于发展风险的受试者或受试者组的生物标志物的量,分离两组的合适阈值量可以通过本文别处提及的统计测试毫不费力地计算。适用于个体受试者的参考量可以根据各种生理参数诸如年龄、性别或亚群而变化。
通常,所述参考为来源于已知处于发展脓毒症的风险的至少一个受试者的每种生物标志物的参考,优选地其中生物标志物中的每一者的量与对应参考基本相同或相似指示受试者处于发展脓毒症的风险,而生物标志物中的每一者的量与对应参考不同则指示受试者未处于发展脓毒症的风险。
同样典型地,所述参考为来源于已知未处于发展脓毒症的风险的至少一个受试者的每种生物标志物的参考,优选地其中生物标志物中的每一者的量与对应参考基本相同或相似指示受试者未处于发展脓毒症的风险,而生物标志物中的每一者的量与对应参考不同则指示受试者处于发展脓毒症的风险。
术语“至少一个受试者”是指一个受试者或多于一个受试者,诸如至少10、50、100、200或1000个受试者。
在一个实施例中,生物标志物的量大于所述生物标志物的参考指示受试者处于风险(例如发展脓毒症)。此外,生物标志物的量低于所述生物标志物的参考指示受试者未处于风险。
原则上,可以基于给定参数(诸如生物标志物的量)的平均值或均值通过应用标准统计方法来计算受试者同期群的参考量。特别是,测试(诸如旨在诊断发生事件或未发生事件的方法)的准确性通过其接收器操作特性(ROC)而被最好地描述(特别地参见Zweig1993,Clin.Chem.39:561-577)。ROC曲线图是在观察到的整个数据范围内连续改变决策阈值所产生的所有灵敏度/特异性对的图。诊断方法的临床性能取决于其准确性,即其能够正确地将受试者分配到某一预后或诊断中。ROC曲线通过将适用于区分的整个阈值范围的敏感性对比1-特异性绘制成曲线而显示了两种分布之间的重叠。y轴上是敏感性,或真阳性分数,其被定义为真阳性测试结果数与真阳性测试结果数和假阴性测试结果数之积的比率。这也被称为存在疾病或病况时的阳性。其仅从受影响的子组计算。在x轴上为假阳性分数,或1-特异性,其被定义为假阳性结果数与真阴性结果数和假阳性结果数之积的比率。这是一个特异性指数,并且完全由未受影响的子组计算得出。由于真阳性分数和假阳性分数是完全分开计算的,所以通过使用来自两个不同子组的测试结果,ROC曲线与同期群中事件的患病率无关。在ROC曲线上的每一点代表与对应于特定决策阈值的灵敏感性/-特异性对。有完全区别(两种结果分布没有重叠)的测试具有穿过左上角的ROC曲线,其中真阳性分数为1.0或100%(完全敏感性),并且假阳性分数为0(完全特异性)。无区别(两个组的结果分布相同)的测试的理论曲线是从左下角到右上角的45°对角线。大多数曲线落在这两个极端之间。如果ROC曲线完全落到低于45°对角线,则可以通过将“阳性”的标准从“大于”逆转为“小于”或反之亦然来轻松纠正。定性地,曲线越接近左上角,则测试的总体准确性就越高。根据期望的置信区间,可以从ROC曲线导出阈值,从而允许分别在适当的敏感性和特异性平衡下对给定事件进行诊断或预测。因此,通常可以通过如上所述建立所述队列的ROC并从中得出阈值量,来生成用于本发明的上述方法的参考,即允许区分处于风险的受试者与未处于风险的受试者之间的阈值。根据诊断方法所需的敏感性和特异性,ROC曲线允许得出合适的阈值。应理解的是,最佳敏感性是排除风险增加或患有疾病的受试者(即排除)所需的,而最佳特异性是针对据评定风险增加或患有疾病的受试者(即确认)设想的。
本发明方法的步骤c)包括将生物标志物(即第一生物标志物、第二生物标志物和任选地第三生物标志物)的量与所述生物标志物的参考进行比较和/或基于生物标志物的量计算用于评定具有疑似感染的受试者的评分。
因此,第一生物标志物、第二生物标志物和任选的第三生物标志物的量可以分别与第一生物标志物的参考、第二生物标志物的参考和任选地第三生物标志物的参考进行比较。
或者,可以基于生物标志物的量,即基于第一生物标志物、第二生物标志物和任选地第三生物标志物的量来计算评分。所述评分应允许评定具有疑似感染的受试者,诸如用于预测发展脓毒症的风险。任选地,可以将所述评分与合适的参考评分进行比较。
本文所使用的术语“比较”涵盖将本文提及的生物标志物的确定量与参考进行比较。应当理解的是,本文所用的比较是指在量的值与参考之间进行的任何类型的比较。然而,应当理解的是,优选地,相同类型的值彼此比较,例如,如果确定绝对量并在本发明的方法中进行比较,则参考也应当是绝对量,如果在本发明的方法中确定并比较相对量,参考也应当是相对量等。或者,本文使用的术语“比较”涵盖将计算的评分与合适的参考核心进行比较。可手动或计算机辅助进行比较。例如,量的值与参考可以相互比较,并且可以由执行比较算法的计算机程序自动执行所述比较。执行所述评估的计算机程序将以适当的输出格式提供所需的评定。
如上所述,还设想基于第一和第二生物标志物或者第一、第二或第三生物标志物的量(即单个评分)计算评分(特别是单个评分),并且将该评分与参考评分进行比较。优选地,评分基于来自测试受试者的样品中第一和第二生物标志物的量,并且如果第三生物标志物的量被确定,则基于来自测试受试者的样品中第一、第二和第三生物标志物的量。
所计算的评分组合了关于至少两种或三种生物标志物的量的信息。此外,在评分中,优选地根据生物标志物对建立评定的贡献对生物标志物进行加权。因此,各个标志物的值通常是加权的,并且加权值用于计算评分。合适的系数(权重)可以由本领域技术人员毫不费力地确定。还可以根据已在至少两个生物标志物上训练的决策树或决策树集(集合)来计算评分。基于在本发明方法中应用的生物标志物的组合,各个生物标志物的权重以及决策树的结构可以是不同的。
该评分可以被视为用于评定本文所述的受试者的分类器参数。特别是,它使提供基于单个评分的评定的人能够进行评定。参考评分优选地为一个值,特别是一个截止值,其允许评定如本文所述的具有疑似感染的受试者。优选地,参考为单个值。因此,人们不必解释在各个生物标志物的量上的全部信息。使用如本文所述的评分系统,有利地,可以使用生物标志物的不同维度或单位的值,因为这些值将被数学地转换成评分。因此,例如绝对浓度的值可以与峰面积比组合成评分。可以基于期望的敏感性或期望的特异性来选择要应用的参考评分。如何选择合适的参考评分是本领域是众所周知的。
有利地,在本发明的研究中已经发现,第一生物标志物与第二生物标志物并且优选地第三生物标志物的组合允许对表现出感染体征和症状的患者进行可靠且早期的评定。例如,可以在获得测试样品后五小时内对受试者进行评定。在这些研究中,对在急诊科就诊的医疗(非手术)紧急情况的患者进行了调查。为此,将患者细分为极有可能患有脓毒症的患者和具有疑似感染但未患有脓毒症的患者。已经确定了各种生物标志物的量,并且经由逻辑回归分析对生物标志物进行了分析和数学组合。接收器操作特征下的面积(AUC)用于评估生物标志物的性能。AUC值为函数f(x)在区间[a][b]内的数学整数。还研究了生物标志物对和三联体的AUC。鉴定了生物标志物组合,其共同显示出优于最佳单一生物标志物AUC的AUC改进。结果在下面所附的实例中进行了描述。
特别是,如果这些患者在例如急诊部就诊,则早期评定发展严重并发症(诸如脓毒症、SIRS或整体健康状况普遍恶化)的风险对于开始治疗措施(包括药物管理、物理或其他治疗干预和/或住院治疗)具有决定性作用。这些治疗措施尤其可以包括,例如,广谱抗生素的快速施用、液体复苏、血管活性药物治疗、机械通气、其他器官支持(例如,连续血液滤过、体外膜氧合)。治疗措施还包括分诊到较高级别的护理(例如重症监护病房、过渡监护治疗病房)。在没有严重并发症的风险的情况下,患者可以出院回家并在门诊管理或较低水平的护理入院(例如普通病房)。由于本发明,可以防止危及生命的发展,因为可以在早期阶段通过生物标志物确定来评定患者。在本发明的研究中鉴定的生物标志物对和三联体是医疗决策的可靠基础,并且可以以时间和成本有效的方式进行评定。
因此,本发明的方法可以进一步包括建议或启用合适的治疗措施。通常,所述合适的治疗措施选自脓毒症管理的医学指南或建议,诸如International Guidelines forManagement of Sepsis and Septic Shock(Intensive Care Med,2017)。例如,治疗措施可以为治疗脓毒症或进一步的诊断调查或执业医师认为必要的护理的其他方面。
在一个实施方案中,如果患者已经被评估为有风险,则要建议或启用的治疗措施选自
·施用至少一种或多种广谱抗生素(诸如头孢菌素、β-内酰胺/β-内酰胺酶抑制剂(例如哌拉西林)和碳青霉烯)进行经验性广谱疗法,通常取决于可能被视为病原体和抗生素易感性的生物体
·液体复苏
·施用一种或多种血管加压药,诸如施用去甲肾上腺素,以及
·施用一种或多种皮质类固醇,例如施用氢化可的松
上文给出的定义比照适用于以下。
本发明还涉及一种用于评定具有疑似感染的受试者的计算机实现方法,该方法包括以下步骤:
(a)接收在受试者的样品中第一生物标志物的量的值,所述第一生物标志物为Presepsin;
(b)接收在受试者的样品中第二生物标志物的量的值,其中所述第二生物标志物选自由以下组成的组:GDF-15、肌酸酐、sFlt1、IGFBP7、sTREM1、胱抑素C和PSP(胰石蛋白)(诸如NTproBNP或BNP);
(c)将生物标志物的量的值与所述生物标志物的参考进行比较和/或基于生物标志物的量来计算用于评定具有疑似感染的受试者的评分;以及
(d)基于在步骤(c)中进行的比较和/或计算来评定所述受试者。
如本文所使用的术语“计算机实现的”意味着该方法以自动方式在数据处理单元上执行,该数据处理单元通常包括在计算机或类似的数据处理装置中。数据处理单元应接收生物标志物的量的值。这些值可以为量、相对量或反映如本文别处详细描述的量的任何其他计算值。因此,应当理解,上述方法不需要确定生物标志物的量,而是使用已经预定的量的值。
通常,在所述方法的步骤(b)中
(i)如果作为第二生物标志物接收GDF-15的量的值,则该方法将进一步包括作为第三生物标志物接收sFlt1、IGFBP7或sTREM1的量的值;或者
(ii)如果作为第二生物标志物接收胱抑素C的量的值,则该方法将进一步包括作为第三生物标志物接收天冬氨酸转氨酶的量的值。
原则上,本发明还考虑了一种计算机程序、计算机程序产品或具有有形嵌入所述计算机程序的计算机可读存储介质,其中该计算机程序包括指令,该指令当在数据处理装置或计算机上运行时执行本发明的上述方法。具体地,本公开还包括:
-计算机或计算机网络,其包括至少一个处理器,其中处理器被适配成执行根据本说明书中所描述的实施例之一的方法,
-计算机可加载数据结构,该计算机可加载数据结构适于当在计算机上执行该数据结构时,执行根据本说明书中所描述的实施例之一的方法,
-计算机脚本,其中该计算机程序适于当在计算机上执行该程序时,执行根据本说明书中所述的实施例之一的方法,
-计算机程序,其包括程序工具,该程序工具用于当在计算机上或在计算机网络上执行该计算机程序时,执行根据本说明书中所述的实施例之一的方法,
-计算机程序,其包括根据前述实施例的程序工具,其中这些程序工具存储在计算机可读的存储介质上,
-存储介质,其中数据结构存储在该存储介质上并且其中该数据结构适于在被加载到计算机或计算机网络的主存储装置和/或工作存储装置之后,执行根据本说明书中所述的实施例之一的方法,
-计算机程序产品,该计算机程序产品具有程序代码工具,其中这些程序代码工具可以存储或被存储在存储介质上,以用于在计算机上或在计算机网络上执行这些程序代码工具的情况下,执行根据本说明书中所述的实施例之一的方法,
-数据流信号,通常是加密的,包括本文别处定义的参数的数据,以及
-数据流信号,通常是加密的,其包括由本发明的方法提供的评定。
本发明涉及一种用于评定具有疑似感染的受试者的装置,该装置包括:
(a)测量单元,其用于确定在受试者的样品中的第一生物标志物和第二生物标志物的量,该第一生物标志物为Presepsin,该第二生物标志物选自由以下组成的组:GDF-15、肌酸酐、sFlt1、IGFBP7、sTREM1、胱抑素C和PSP(胰石蛋白),所述测量单元包括用于第一生物标志物和第二生物标志物的检测系统;和
(b)评估单元,其可操作地连接到测量单元,该评估单元包括具有第一生物标志物和第二生物标志物的存储的参考的数据库,优选地如上所指定,以及数据处理器,该数据处理器包括指令,该指令用于将第一生物标志物和第二生物标志物的量与参考进行比较和/或用于基于生物标志物的量对用于评定具有疑似感染的受试者进行评分计算,优选地如上所指定,以及用于基于比较来评定所述受试者,所述评估单元能够自动从测量单元接收生物标志物的量的值。
本文所用的术语“装置”涉及包括彼此可操作地连接的上述单元的系统,以允许根据本发明的方法确定生物标志物的量并对其进行评估,使得可以提供评定。
分析单元通常包括至少一个反应区,该反应区具有用于第一和第二生物标志物以及优选地还有第三生物标志物的生物标志物检测剂,其以固定形式固定在将与样品接触的固态支持物或载体上。此外,在反应区中,可以应用允许检测剂与在样品中包含的生物标志物特异性结合的条件。
反应区可以允许直接进行样品施加,或者可以连接到施加样品的加载区。在后一种情况下,样品可以经由加载区与反应区之间的连接主动或被动地输送到反应区。此外,反应区还应连接检测器。连接应使得检测器能够检测生物标志物与其检测剂的结合。合适的连接取决于用于测量生物标志物的存在或量的技术。例如,对于光学检测,在检测器与反应区之间可能需要光的传输,而对于电化学确定,例如在反应区与电极之间可能需要流体连接。
检测器应当适于检测生物标志物的量的确定。随后可以将所确定的量传送到评估单元。所述评估单元包括数据处理元件,诸如计算机,其具有用于确定在样品中存在的量的实现的算法。
根据本发明的方法所提及的处理单元通常包括中央处理单元(CPU)和/或一个或多个图形处理单元(GPU)和/或一个或多个专用集成电路(ASIC)和/或一个或多个张量处理单元(TPU)和/或一个或多个现场可编程门阵列(FPGA)等。例如,数据处理元件可以为通用计算机或便携式计算装置。还应当理解的是,多个计算装置可以诸如通过网络或其他传输数据的方法一起使用,用于执行本文公开的方法的一个或多个步骤。示例性计算装置包括台式计算机、膝上型计算机、个人数据助理(“PDA”)、蜂窝装置、智能或移动装置、平板计算机、服务器等。一般而言,数据处理元件包括能够执行多个指令(诸如软件程序)的处理器。
评估单元通常包括或可以访问存储器。存储器为计算机可读介质并且可以包括例如位于计算装置本地或者可通过网络访问计算装置的单个存储装置或多个存储装置。计算机可读介质可以是可由计算装置访问的任何可用介质并且包括易失性和非易失性介质。进一步,计算机可读介质可以是可移动和不可移动介质中的一者或两者。作为实例而非限制,计算机可读介质可以包括计算机存储介质。示例性计算机存储介质包括但不限于RAM、ROM、EEPROM、闪存或任何其他存储技术、CD-ROM、数字多功能盘(DVD)或其他光盘存储、磁带盒、磁带、磁盘存储器或其他磁存储装置,或者可以用于存储能够被计算装置访问并被计算装置的处理器执行的多个指令的任何其他介质。
根据本公开的实施例,软件可包括指令,当由计算装置的处理器执行时,该指令可执行本文公开的方法的一个或多个步骤。指令中的一些可以适于产生控制其他机器的操作的信号,并且因此可以通过这些控制信号来操作以转换远离计算机本身的材料。这些描述和表示为数据处理领域的技术人员所使用的工具,例如,用来最有效地将其的工作内容传达给本领域的其他技术人员。
多个指令还可以包括通常被认为是导致期望结果的自洽步骤序列的算法。这些步骤需要对物理量进行物理操作。通常,但不一定,这些量采用能够被存储、传输、转换、组合、比较和以其他方式操纵的电或磁脉冲或信号的形式。事实证明,主要出于常用的原因,有时将这些信号称为值、字符、显示数据、数字等,作为对此类信号所体现或表达的物理项目或表现形式的参考是方便的。然而,应该记住,所有这些和类似的术语都与适当的物理量相关联,并且在这里仅用作应用于这些量的方便标签。
评估单元还可以包括或者可以访问输出装置。示例性输出装置包括例如传真机、显示器、打印机和文件。根据本公开的一些实施例,计算装置可以执行本文公开的方法的一个或多个步骤,并且此后经由输出装置提供与该方法的结果、指示、比率或其他因素相关的输出。
通常,所述测量单元确定并包括第三生物标志物的检测系统,并且其中所述数据库包括第三生物标志物的存储的参考,
(i)在GDF-15为第二生物标志物的情况下,所述第三生物标志物为sFlt1、IGFBP7或sTREM1;或者
(ii)在胱抑素C为第二生物标志物的情况下,所述第三生物标志物为天冬氨酸转氨酶。
更典型地,所述检测系统包括能够特异性检测生物标志物中的每一者的至少一种检测剂。
本发明进一步考虑了一种用于评定具有疑似感染的受试者的装置,其包括评估单元,该评估单元包括:数据库,该数据库具有第一生物标志物和第二生物标志物的存储的参考,该第一生物标志物为Presepsin,该第二生物标志物选自由以下组成的组:GDF-15、肌酸酐、sFlt1、IGFBP7、sTREM1、胱抑素C和PSP(胰石蛋白),以及数据处理器,该数据处理器包括指令,该指令用于将第一生物标志物和第二生物标志物的量与参考进行比较,优选地如上所指定,并且用于基于比较来评定所述受试者,所述评估单元能够接收在受试者的样品中确定的生物标志物的量的值。
通常,所述数据库包括用于第三生物标志物的存储的参考,
(i)在GDF-15为第二生物标志物的情况下,所述第三生物标志物为sFlt1、IGFBP7或sTREM1;或者
(ii)在胱抑素C为所述第二生物标志物的情况下,所述第三生物标志物为天冬氨酸转氨酶。
原则上,本发明还涉及第一生物标志物和第二生物标志物的用途,该第一生物标志物为Presepsin,该第二生物标志物选自由以下组成的组:GDF-15、肌酸酐、sFlt1、IGFBP7、sTREM1、胱抑素C和PSP(胰石蛋白)。
本文所用的术语“检测剂”通常指与生物标志物特异性结合的任何药剂,即不与在样品中存在的其他组分发生交叉反应的药剂。通常,本文提及的特异性结合生物标志物的检测剂可以为抗体、抗体片段或衍生物、适体、生物标志物的配体、生物标志物的受体、已知结合和/或转化生物标志物的酶,或已知与生物标志物特异性结合的小分子。例如,本文中称为检测剂的抗体包括多克隆和单克隆抗体及其片段,诸如能够结合抗原或半抗原的Fv、Fab和F(ab)2片段。本发明还包括单链抗体和人源化杂合抗体,其中表现出所需抗原特异性的非人供体抗体的氨基酸序列与人受体抗体的序列组合。供体序列通常至少包括供体的抗原结合氨基酸残基,但也可以包括供体抗体的其他结构和/或功能相关的氨基酸残基。此类杂交体可以通过本领域熟知的几种方法来准备。适体检测剂,例如,可以为核酸或肽适体。准备此类适体的方法在本领域是众所周知的。例如,可以将随机突变引入作为适体基础的核酸或肽中。然后可以根据本领域已知的筛选程序,例如噬菌体展示,测试这些衍生物的结合。检测剂的特异性结合意味着它不应与待分析在样品中存在的另一种肽、多肽或物质实质上结合,即交叉反应。优选地,特异性结合的生物标志物应当以比样品的任何其他组分高至少3倍、更优选地至少10倍、并且甚至更优选地至少50倍的亲和力结合。如果非特异性结合仍然可以明确地区分和测量,例如根据其在蛋白质印迹上的大小,或通过其在样品中相对较高的丰度,则非特异性结合可能是可以容忍的。
检测剂可以永久地或可逆地融合或连接到可检测标签。合适的标签是本领域技术人员众所周知的。合适的可检测标签为通过合适的检测方法可检测的任何标签。典型的标签包括金颗粒、乳胶珠粒、吖啶酯(acridan ester)、鲁米诺、钌、酶活性标签、放射性标签、磁性标签(“例如磁珠”,包括顺磁标签和超顺磁标签)和荧光标签。酶活性标签包括例如辣根过氧化物酶、碱性磷酸酶、β-半乳糖苷酶、荧光素酶,以及它们的衍生物。用于检测的合适底物包括二氨基联苯胺(DAB)、3,3'-5,5'-四甲基联苯胺、NBT-BCIP(4-硝基蓝四唑氯化物和5-溴-4-氯-3-吲哚基磷酸盐,可作为现成储备溶液从Roche Diagnostics购得)、CDP-StarTM(Amersham Bio-sciences)、ECFTM(Amersham Biosciences)。合适的酶-底物组合可产生有色反应产物、荧光或化学发光,该有色反应产物、荧光或化学发光可根据本领域已知的方法(例如使用感光胶片或合适的摄像系统)来测量。对于酶反应的测量,上述给定的标准类似地适用。典型的荧光标记包括荧光蛋白(诸如GFP及其衍生物)、Cy3、Cy5、德克萨斯红、荧光素和Alexa染料(例如Alexa 568)。进一步的荧光标签可从Molecular Probes(Oregon)购得。同样,还考虑使用量子点作为荧光标签。典型的放射性标签包括35S、125I、32P、33P等。放射性标签可以通过任何已知且适当的方法检测,所述方法为例如感光胶片或磷光成像仪。合适的标签可以是或包括标记物,诸如生物素、洋地黄毒苷、His标记物、谷胱甘肽-S-转移酶、FLAG、GFP、myc标记物、甲型流感病毒血凝素(HA)、麦芽糖结合蛋白等。
用于生物标志物AST、ALT、胆红素和肌酸酐的检测剂为例如在实例中描述(参见实例1)。在生物标志物为酶的情况下,诸如AST或ALT,则检测剂可以为酶的底物。
本文所述的生物标志物的确定可以包括在分离步骤之后进行的质谱法(MS)(例如通过LC或HPLC)。本文所用的质谱法涵盖允许根据本发明确定对应于待确定的化合物(即生物标志物)的分子量(即质量)或质量变量的所有技术。优选地,本文使用的质谱法涉及GC-MS、LC-MS、直接输注质谱法、FT-ICR-MS、CE-MS、HPLC-MS、四极杆质谱法、任何顺序耦合质谱法诸如MS-MS或MS-MS-MS、ICP-MS、Py-MS、TOF或使用上述技术的任何组合法。如何应用这些技术是本领域技术人员众所周知的。此外,合适的装置是可商购的。更优选地,本文所用的质谱法涉及LC-MS和/或HPLC-MS,即涉及与先前的液相色谱分离步骤可操作地连接的质谱法。优选地,质谱法为串联质谱法(也称为MS/MS)。串联质谱法,也称为MS/MS,涉及两个或多个质谱步骤,在阶段之间发生碎裂。在串联质谱法中,两台质谱仪通过碰撞池串联连接。质谱仪与色谱装置耦合。通过色谱法分离的样品在第一质谱仪中进行分类和称重,然后在碰撞池中通过惰性气体碎裂,并且在第二质谱仪中分类和称重一块或多块。在第二台质谱仪中对片段进行分类和称重。通过MS/MS鉴定更准确。
在一个实施例中,本文所使用的质谱法涵盖四极MS。最优选地,所述四极MS如下进行:a)选择通过在质谱仪的第一分析四极中的电离产生的离子的质量/电荷商(m/z),b)离子的碎裂在步骤a)中通过在附加的后续四极中应用加速电压来选择,该四极填充有碰撞气体并充当碰撞室,c)在附件的后续四极中选择通过在步骤b)中的碎裂过程产生的离子的质量/电荷商,其中该方法的步骤a)至c)至少进行一次,并且分析由于电离过程而存在于物质混合物中的所有离子的质量/电荷商,其中四极充满碰撞气体,但分析期间没有应用加速电压。在根据本发明使用的所述最优选的质谱法上的细节可以在WO2003/073464中找到。
更优选地,所述质谱法为液相色谱法(LC)MS,诸如高效液相色谱法(HPLC)MS,特别是HPLC-MS/MS。本文所使用的液相色谱法是指允许在液相或超临界相中分离化合物(即代谢物)的所有技术。
对于质谱法,在样品中的分析物被电离以产生带电分子或分子片段。然后,测量电离分析物、特别是电离生物标志物或其片段的质荷比。在电离之前,样品可以通过蛋白酶例如胰蛋白酶经受切割。蛋白酶将蛋白质生物标志物切割成较小的片段。
因此,质谱法步骤优选地包括电离步骤,其中待确定的生物标志物被电离。当然,在样品/洗脱物中存在的其他化合物也被电离。生物标志物的电离可以通过任何认为合适的方法进行,特别是通过电子轰击电离、快原子轰击、电喷雾电离(ESI)、大气压化学电离(APCI)、基质辅助激光解吸电离(MALDI)。
在优选的实施例中,电离步骤(用于质谱法)通过电喷雾电离(ESI)进行。因此,质谱法优选地为ESI-MS(或者如果进行串联MS:ESI-MS/MS)。电喷雾为一种软电离方法,可在不破坏任何化学键的情况下形成离子。
更典型地,另外使用第三生物标志物或与所述第三生物标志物特异性结合的检测剂,
(i)在GDF-15为第二生物标志物的情况下,所述第三生物标志物为sFlt1、IGFBP7或sTREM1;或者
(ii)在胱抑素C为所述第二生物标志物的情况下,所述第三生物标志物为天冬氨酸转氨酶。
本发明还涉及用于评定具有疑似感染的受试者的试剂盒,该试剂盒包括与第一生物标志物特异性结合的检测剂和与第二生物标志物特异性结合的检测剂,该第一生物标志物为Presepsin,该第二生物标志物选自由以下组成的组:GDF-15、肌酸酐、sFlt1、IGFBP7、sTREM1、胱抑素C和PSP(胰石蛋白)。
如本文所用的术语“试剂盒”是指上述组分的集合,通常是单独提供或在单个容器内提供的。该容器通常还包括用于进行本发明方法的指令。这些指令可以是手册的形式,或者可以由计算机程序代码提供,当在计算机或数据处理装置上实现时,该计算机程序代码能够进行或支持在本发明的方法中提及的生物标志物的确定。计算机程序代码可提供于数据存储介质或装置诸如光学存储介质(例如,光盘)上或直接提供于计算机或数据处理装置上,或者可以以诸如到可访问服务器或云的链接下的下载格式被提供。此外,试剂盒通常可以包括用于校准目的的生物标志物参考量的标准,如本文别处详细描述的。根据本发明的试剂盒还可以包含进行本发明方法所必需的其他组分,诸如用于检测所释放的第二分子所需的溶剂、缓冲液、洗涤液和/或试剂。此外,其可以部分地或全部地包括本发明的装置。
更典型地,所述试剂盒进一步包括特异性结合第三生物标志物的检测剂,
(i)在GDF-15为第二生物标志物的情况下,所述第三生物标志物为sFlt1、IGFBP7或sTREM1;或者
(ii)在胱抑素C为所述第二生物标志物的情况下,所述第三生物标志物为天冬氨酸转氨酶。
应当理解的是,上述术语的定义和解释相应地适用于本说明书和所附权利要求中描述的所有实施例。以下实施例为根据本发明设想的具体实施例:
1.一种用于评定具有疑似感染的受试者的方法,该方法包括以下步骤:
(a)确定在所述受试者的样品中第一生物标志物的量,所述第一生物标志物为Presepsin;
(b)确定在所述受试者的样品中第二生物标志物的量,其中所述第二生物标志物选自由以下组成的组:GDF-15、肌酸酐、sFlt1、IGFBP7、sTREM1、胱抑素C和PSP(胰石蛋白);
(c)将所述生物标志物的量与所述生物标志物的参考进行比较和/或基于所述生物标志物的量来计算用于评定具有疑似感染的所述受试者的评分;以及
(d)基于在步骤(c)中进行的比较和/或计算来评定所述受试者。
2.根据实施例1所述的方法,其中在步骤(b)中
(i)如果作为第二生物标志物确定GDF-15的量,则所述方法将进一步包括作为第三生物标志物确定sFlt1、IGFBP7或sTREM1的量;或者
(ii)如果作为第二生物标志物确定胱抑素C的量,则所述方法将进一步包括作为第三生物标志物确定天冬氨酸转氨酶的量。
3.根据实施例1或2所述的方法,其中受试者为在急诊科就诊的受试者。
4.根据实施例1至3中任一项所述的方法,其中评定为对发展脓毒症的风险的评定和/或对受试者的病况将恶化的风险的评定。
5.根据实施例1至4中任一项所述的方法,其中所述参考为来源于已知处于发展脓毒症的风险的至少一个受试者的每种生物标志物的参考,优选地,其中生物标志物中的每一者的量与对应参考基本相同或相似指示受试者处于发展脓毒症的风险,而生物标志物中的每一者的量与对应参考不同则指示受试者未处于发展脓毒症的风险。
6.根据实施例1至4中任一项所述的方法,其中所述参考为来源于已知未处于发展脓毒症的风险的至少一个受试者的每种生物标志物的参考,优选地,其中生物标志物中的每一者的量与对应参考基本相同或相似指示受试者未处于发展脓毒症的风险,而生物标志物中的每一者的量与对应参考不同则指示受试者处于发展脓毒症的风险。
7.根据实施例1至6中任一项所述的方法,其中所述受试者患有感染或疑似患有感染。
8.根据实施例1至7中任一项所述的方法,其中所述样品为血液样品或从其衍生出的样品。
9.根据实施例1至8中任一项所述的方法,其中所述受试者为人。
10.一种用于评定具有疑似感染的受试者的计算机实现方法,该方法包括以下步骤:
(a)接收在所述受试者的样品中第一生物标志物的量的值,所述第一生物标志物为Presepsin;
(b)接收在所述受试者的样品中第二生物标志物的量的值,其中所述第二生物标志物选自由以下组成的组:GDF-15、肌酸酐、sFlt1、IGFBP7、sTREM1、胱抑素C和PSP(胰石蛋白);
(c)将所述生物标志物的量的值与所述生物标志物的参考进行比较和/或基于所述生物标志物的量来计算用于评定具有疑似感染的所述受试者的评分;以及
(d)基于在步骤(c)中进行的比较和/或计算来评定所述受试者。
11.根据实施例10所述的方法,其中在步骤(b)中
(i)如果作为所述第二生物标志物接收GDF-15的量的值,则所述方法将进一步包括作为第三生物标志物接收sFlt1、IGFBP7或sTREM1的量的值;或者
(ii)如果作为所述第二生物标志物接收胱抑素C的量的值,则所述方法将进一步包括作为第三生物标志物接收天冬氨酸转氨酶的量的值。
12.一种用于评定具有疑似感染的受试者的装置,该装置包括:
(a)测量单元,其用于确定在所述受试者的样品中的第一生物标志物和第二生物标志物的量,所述第一生物标志物为Presepsin,所述第二生物标志物选自由以下组成的组:GDF-15、肌酸酐、sFlt1、IGFBP7、sTREM1、胱抑素C和PSP(胰石蛋白),所述测量单元包括用于第一生物标志物和第二生物标志物的检测系统;和
(b)评估单元,其可操作地连接到测量单元,该评估单元包括具有第一生物标志物和第二生物标志物的存储的参考的数据库,优选地,如实施例1至9中任一项所指定,以及数据处理器,该数据处理器包括指令,该指令用于将第一生物标志物和第二生物标志物的量与参考进行比较和/或用于基于生物标志物的量对用于评定具有疑似感染的受试者进行评分计算,优选地如实施例1至9中任一项所指定,以及用于基于比较来评定所述受试者,所述评估单元能够自动从测量单元接收生物标志物的量的值。
13.实施例12的装置,其中所述测量单元确定并包括用于第三生物标志物的检测系统,并且其中所述数据库包括第三生物标志物的存储的参考,所述第三生物标志物
(i)在GDF-15为所述第二生物标志物的情况下,所述第三生物标志物为sFlt1、IGFBP7或sTREM1;或者
(ii)在胱抑素C为所述第二生物标志物的情况下,所述第三生物标志物为天冬氨酸转氨酶。
14.实施例12或13的装置,其中所述检测系统包括能够特异性检测生物标志物中的每一者的至少一种检测剂。
15.一种用于评定具有疑似感染的受试者的装置,该装置包括评估单元,该评估单元包括:数据库,该数据库具有第一生物标志物和第二生物标志物的存储的参考,该第一生物标志物为Presepsin,该第二生物标志物选自由以下组成的组:GDF-15、肌酸酐、sFlt1、IGFBP7、sTREM1、胱抑素C和PSP(胰石蛋白),以及数据处理器,该数据处理器包括指令,该指令用于将第一生物标志物和第二生物标志物的量与参考进行比较,优选地如实施例1至11中任一项所指定,并且用于基于比较来评定所述受试者,所述评估单元能够接收在受试者的样品中确定的生物标志物的量的值。
16.实施例15的装置,其中所述数据库包括用于第三生物标志物的存储的参考,所述第三生物标志物
(i)在GDF-15为所述第二生物标志物的情况下,所述第三生物标志物为sFlt1、IGFBP7或sTREM1;或者
(ii)在胱抑素C为所述第二生物标志物的情况下,所述第三生物标志物为天冬氨酸转氨酶。
17.第一生物标志物和第二生物标志物,或者与所述第一生物标志物特异性结合的检测剂和与所述第二生物标志物特异性结合的检测剂用于评定具有疑似感染的受试者的用途,该第一生物标志物为Presepsin,该第二生物标志物选自由GDF-15、肌酸酐、sFlt1、IGFBP7、sTREM1、胱抑素C和PSP(胰石蛋白)组成的组。
18.实施例17的用途,其中另外使用第三生物标志物或与所述第三生物标志物特异性结合的检测剂,所述第三生物标志物
(i)在GDF-15为所述第二生物标志物的情况下,所述第三生物标志物为sFlt1、IGFBP7或sTREM1;或者
(ii)在胱抑素C为所述第二生物标志物的情况下,所述第三生物标志物为天冬氨酸转氨酶。
19.一种用于评定具有疑似感染的受试者的试剂盒,该试剂盒包括与第一生物标志物特异性结合的检测剂和与第二生物标志物特异性结合的检测剂,该第一生物标志物为Presepsin,该第二生物标志物选自由GDF-15、肌酸酐、sFlt1、IGFBP7、sTREM1、胱抑素C和PSP(胰石蛋白)组成的组。
20.实施例19的试剂盒,其中所述试剂盒进一步包括特异性结合第三生物标志物的检测剂,所述第三生物标志物
(i)在GDF-15为所述第二生物标志物的情况下,所述第三生物标志物为sFlt1、IGFBP7或sTREM1;或者
(ii)在胱抑素C为所述第二生物标志物的情况下,所述第三生物标志物为天冬氨酸转氨酶。
本说明书通篇引用的所有参考文献均就上文具体提及的公开内容及其整体并入本文。
实例1:生物标志物的确定
下面简要介绍了用于确定GDF-15的电化学发光(ECL)技术和测定方法。GDF-15的浓度通过cobas e801分析仪确定。用cobas e801分析仪检测GDF-15是基于电化学发光(ECL)技术。简而言之,生物素标记和钌标记的抗体与相应量的未稀释样品结合,并在分析仪上温育。随后,在仪器上添加涂有链霉亲和素的磁性微粒并温育,以便促进生物素标记的免疫复合物的结合。在该温育步骤之后,将反应混合物转移到测量池中,在测量池中,磁珠被磁性捕获在电极的表面上。然后将含有用于后续ECL反应的三丙胺(TPA)的ProCell M缓冲液引入到测量池中,以便将结合的免疫测定复合物与游离的剩余颗粒分离。工作电极和对电极之间的电压感应然后引发反应,引致钌复合物以及TPA发射光子。所得的电化学发光信号由光电倍增管记录并转换为指示相应分析物的浓度水平的数值。
Presepsin(sCD14-ST)是利用商业化学发光(CLIA)测定法测量Presepsin(sCD14-ST)的,这是一种为Pathfast CLIA Magtration平台(LSI Medience,Japan)开发的夹心免疫测定。该测定包括涂有特异性结合Presepsin(sCD14-ST)的抗体的磁珠和特异性结合Presepsin(sCD14-ST)的碱性磷酸酶(ALP)耦合抗体。从每个血浆样品使用100μL,并在PathfastTM分析仪(Mitsubishi Chemical Europe,Germany/LSIM)上进行测量。简而言之,PATHFAST Presepsin的测试原理是基于非竞争性CLEIA与技术结合。在样品与碱性磷酸酶标记的抗presepsin多克隆抗体和涂有磁性颗粒的抗presepsin单克隆抗体孵育期间,样品的presepsin与抗presepsin抗体结合,形成具有酶标记抗体和涂有磁性颗粒的抗体的免疫复合物。通过/>技术去除未结合的物质后,加入化学发光底物。在短时间孵育之后,测量由酶反应产生的发光强度。发光强度与通过标准曲线的工具计算的样品的presepsin浓度相关。/>是B/F分离技术,在移液器吸头中清洗磁性颗粒,并且是Precision System Science的注册商标。
SFLT1或sFLT-1(可溶性fms样酪氨酸激酶-1)是用sFLT-1的商用ECLIA测定测量的,这是一种为cobasECLIA平台发展的夹心免疫测定(来自Roche Diagnostics,Germany的ECLIA测定)。该测定包括特异性结合sFLT-1的生物素化和钌化单克隆抗体。从每个血清样品中使用12μL,并在cobas e801分析仪(Roche Diagnostics,Germany)上不经稀释地测量。
GDF15(生长分化因子15)是用GDF-15的商用ECLIA测定测量的,这是一种为cobasECLIA平台发展的夹心免疫测定(来自Roche Diagnostics,Germany的ECLIA测定)。该测定包括特异性结合GDF-15的生物素化和钌化单克隆抗体。从每个血清样品中使用21μL,并在cobas e801分析仪(Roche Diagnostics,Germany)上不经稀释地测量。
CysC2(胱抑素C)针对CysC用商用PETIA(颗粒增强免疫比浊测定)进行测量,该分析仪是针对临床化学分析仪平台(Roche Diagnostics,Germany)发展的。该测定包括涂有特异性结合CysC的抗体的乳胶颗粒。将抗体试剂和样品混合并孵育后,在试剂中的涂有抗胱抑素C抗体的乳胶增强颗粒与在样品中的人胱抑素C凝集。由聚集体引起的浊度可以在546nm处通过比浊法确定,并且与在样品中的胱抑素C的量成正比。从每个血清样品中使用2μL,并在cobas c 501分析仪(Roche Diagnostics,Germany)上进行测量。
FERR(Ferritin)是用商用ECLIA测定测量的,这是一种为cobasECLIA平台发展的夹心免疫测定(来自Roche Diagnostics,Germany的ECLIA测定)。该测定包括特异性结合Ferritin的生物素化和钌化单克隆抗体。从每个血清样品中使用10μL,并在cobase801分析仪(Roche Diagnostics,Germany)上不经稀释地测量。
IGFBP7(胰岛素样生长因子结合蛋白7)是用IGFBP-7的稳健原型ECLIA测定测量的,这是一种内部为cobasECLIA平台发展的夹心免疫测定(来自RocheDiagnostics,Germany的ECLIA测定)。该测定包括特异性结合IGFBP-7的生物素化和钌化单克隆抗体。从每个血清样品中使用10μL,并在cobas e601分析仪(Roche Diagnostics,Germany)上不经稀释地测量。
STREM1或sTREM-1(可溶性髓样细胞触发性受体1)是用sTREM-1的稳健原型ECLIA测定测量的,这是一种内部为cobasECLIA平台发展的夹心免疫测定(来自RocheDiagnostics,Germany的ECLIA测定)。该测定包括特异性结合sTREM-1的生物素化和钌化单克隆抗体。从每个血清样品中使用50μL,并在cobas e601分析仪(Roche Diagnostics,Germany)上不经稀释地测量。
PSP(胰石蛋白)在商业Abionic平台(Abionic,Switzerland)上测量。纳米流体PSP(胰石蛋白)免疫测定从30μL EDTA血浆样品定量PSP。测试原理依赖于样品通过固定有抗PSP抗体的纳米尺寸的通道,该样品预先与含有荧光标记的检测抗体的溶液混合几秒钟。这些抗体捕获与荧光检测抗PSP抗体结合的PSP。abioSCOPE读取来自PSP传感器的荧光发射,并利用先进的信号处理,借助测定的嵌入式、特定批次校准将信号转换为浓度。
KL6(唾液酸化碳水化合物抗原KL-6):在样品中的唾液酸化糖抗原KL-6(KL-6)通过抗原抗体反应与涂有乳胶的小鼠KL-6单克隆抗体发生凝集。测量通过这种凝集引起的吸光度变化以确定KL-6水平。试剂来自Sekisui Medical Co.(Japan)。分析2.5μL血浆。样品在cobas c 501分析仪(Roche Diagnostics,Germany)上测量。
BILI(胆红素):重氮化的磺胺酸是由亚硝酸钠和磺胺酸在低pH值下组合形成的。在样品中的胆红素(未结合)通过在咖啡因/苯甲酸盐/乙酸盐/EDTA的混合物中稀释而溶解。在加入重氮化的磺胺酸后,包括结合的胆红素(单和二葡糖苷)的溶解的胆红素和δ形式2(共价结合到白蛋白的胆蛋白胆红素)转化为重氮胆红素,重氮胆红素为代表总胆红素的红色发色团,在540nm处吸收,并使用双色(540、700nm)终点技术进行测量。使用样品空白校正。
CREJ2(肌酸酐):该动力学比色测定基于Jaffé方法。在碱性溶液中,肌酸酐与苦味酸盐形成黄橙色复合物。染料形成的速率与在样品中的肌酸酐浓度成正比。该测定使用“速率冲裁”来最大限度地减少胆红素的干扰。来自Roche Diagnostics(Germany)的测定。使用7.5μL血浆进行确定。样品在cobas c 501分析仪(Roche Diagnostics,Germany)上测量。
ALAT(丙氨酸转氨酶):丙氨酸转氨酶催化L-丙氨酸到α-酮戊二酸(α-KG)的转氨作用,形成L-谷氨酸和丙酮酸。形成的丙酮酸通过乳酸脱氢酶(LDH)还原为乳酸,同时氧化还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)。吸光度的变化与丙氨酸转氨酶活性成正比,并使用双色(340、700 nm)速率技术来测量。
ASAT(天冬氨酸转氨酶):天冬氨酸转氨酶(AST)催化从L-天冬氨酸到α-酮戊二酸的转氨作用,形成L-谷氨酸和草乙酸盐。形成的草乙酸通过苹果酸脱氢酶(MDH)还原为苹果酸,同时氧化还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)。由于NADH转化为NAD,吸光度随时间的变化与AST活性成正比,并使用双色(340、700nm)速率技术来测量。
实例2:来自TRIAGE研究的患者分析
TRIAGE研究,瑞士Kantonsspital Aarau急诊科。(Schuetz 2013,BMC急诊医学,13(1),12)。
所有因医疗紧急情况而寻求急诊科(ED)护理的连续患者均被包括在急诊科入院时。从总共4000名患者中,选择了入院时具有疑似感染的患者子集,并根据以下条件分为极有可能脓毒症病例组或感染对照组:
·病例(N=64):如果已入住ICU或符合Rhee 2017,“Incidence and Trends ofSepsis in US Hospitals Using Clinical vs Claims Data,2009-2014.”的标准,则极有可能在ED就诊后48小时内脓毒症病例恶化/严重程度更高。JAMA 318(13):1241-1249。
·对照(N=207):具有疑似感染但在ED就诊后48h内无脓毒症的患者。
经由逻辑回归对标志物进行数学组合,并使用“接收器操作特征下的面积”(AUC)作为标志物性能的一般测量。
表1显示了与单个标志物相比AUC改进至少一个百分点的标志物对组合(双变量标志物组合)。
表1:双变量标志物组合及其联合性能(AUC.bi)、第一标志物(AUC.1)和第二标志物(AUC.2)的单变量性能,以及双变量标志物相对于最佳单个标志物(Impr.AUC)的性能改进。
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表2显示了与双变量标志物对以及所有三个单个标志物相比AUC改进至少一个百分点的标志物三联体组合(三变量标志物组合)。
表2:三变量标志物组合及其联合性能(AUC.tri),表1中列出的前两个标志物的双变量性能(AUC.bi),第一标志物的单变量性能(AUC.1),第二标志物的单变量性能(AUC.2)和第三标志物的单变量性能(AUC.3),以及与双变量标志物(Impr.AUC)相比三变量标志物的性能改进。
表3显示了与单个标志物相比没有改进的标志物的双变量组合的实例。
表3:双变量标志物组合及其联合性能(AUC.bi)、第一标志物(AUC.1)和第二标志物(AUC.2)的单变量性能,以及双变量标志物相对于最佳单个标志物(Impr.AUC)的性能改进。
标志物 | AUC.bi | AUC.1 | AUC.2 | Impr.AUC |
Presepsin+KL6 | 0.8410 | 0.8528 | 0.5569 | -0.0118 |
Presepsin+FERR | 0.8475 | 0.8528 | 0.6392 | -0.0054 |
Presepsin+ALAT | 0.8502 | 0.8528 | 0.6004 | -0.0026 |
Presepsin+BILI | 0.8515 | 0.8528 | 0.6829 | -0.0013 |
Claims (22)
1.一种用于评定具有疑似感染的受试者的方法,所述方法包括以下步骤:
(a)确定在所述受试者的样品中第一生物标志物的量,所述第一生物标志物为Presepsin;
(b)确定在所述受试者的样品中第二生物标志物的量,其中所述第二生物标志物选自由以下组成的组:GDF-15、肌酸酐、sFlt1、IGFBP7、sTREM1、胱抑素C和PSP(胰石蛋白);
(c)将所述生物标志物的量与所述生物标志物的参考进行比较和/或基于所述生物标志物的量来计算用于评定具有疑似感染的所述受试者的评分;以及
(d)基于在步骤(c)中进行的比较和/或计算来评定所述受试者。
2.根据权利要求1所述的方法,其中在步骤(b)中
(i)如果作为所述第二生物标志物确定GDF-15的量,则所述方法将进一步包括作为第三生物标志物确定sFlt1、IGFBP7或sTREM1的量;或者
(ii)如果作为所述第二生物标志物确定胱抑素C的量,则所述方法将进一步包括作为第三生物标志物确定天冬氨酸转氨酶的量。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其中所述受试者为在急诊科就诊的受试者。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的方法,其中所述评定为对发展脓毒症的风险的评定和/或对所述受试者的受试者病况将恶化的风险的评定。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的方法,其中所述参考为来源于已知处于发展脓毒症的风险的至少一个受试者的每种生物标志物的参考,优选地其中所述生物标志物中的每一者的量与对应参考基本相同或相似指示受试者处于发展脓毒症的风险,而所述生物标志物中的每一者的量与对应参考不同则指示受试者未处于发展脓毒症的风险。
6.根据权利要求1至4中任一项所述的方法,其中所述参考为来源于已知未处于发展脓毒症的风险的至少一个受试者的每种生物标志物的参考,优选地其中所述生物标志物中的每一者的量与对应参考基本相同或相似指示受试者未处于发展脓毒症的风险,而所述生物标志物中的每一者的量与对应参考不同则指示受试者处于发展脓毒症的风险。
7.根据权利要求1至6中任一项所述的方法,其中所述受试者患有感染或疑似患有感染。
8.根据权利要求1至7中任一项所述的方法,其中所述样品为血液、血清或血浆样品。
9.根据权利要求1至8中任一项所述的方法,其中所述受试者为人。
10.一种用于评定具有疑似感染的受试者的计算机实现方法,所述方法包括以下步骤:
(a)接收在所述受试者的样品中第一生物标志物的量的值,所述第一生物标志物为Presepsin;
(b)接收在所述受试者的样品中第二生物标志物的量的值,其中所述第二生物标志物选自由以下组成的组:GDF-15、肌酸酐、sFlt1、IGFBP7、sTREM1、胱抑素C和PSP(胰石蛋白);
(c)将所述生物标志物的量的值与所述生物标志物的参考进行比较和/或基于所述生物标志物的量来计算用于评定具有疑似感染的所述受试者的评分;以及
(d)基于在步骤(c)中进行的比较和/或计算来评定所述受试者。
11.根据权利要求10所述的方法,其中在步骤(b)中
(i)如果作为所述第二生物标志物接收GDF-15的量的值,则所述方法将进一步包括作为第三生物标志物接收sFlt1、IGFBP7或sTREM1的量的值;或者
(ii)如果作为所述第二生物标志物接收胱抑素C的量的值,则所述方法将进一步包括作为第三生物标志物接收天冬氨酸转氨酶的量的值。
12.一种用于评定具有疑似感染的受试者的装置,所述装置包括:
(a)测量单元,其用于确定在所述受试者的样品中的第一生物标志物和第二生物标志物的量,所述第一生物标志物为Presepsin,所述第二生物标志物选自由以下组成的组:GDF-15、肌酸酐、sFlt1、IGFBP7、sTREM1、胱抑素C和PSP(胰石蛋白),所述测量单元包括用于所述第一生物标志物和所述第二生物标志物的检测系统;和
(b)评估单元,其可操作地连接到所述测量单元,所述评估单元包括:具有所述第一生物标志物和所述第二生物标志物的存储的参考的数据库,优选地,如权利要求1至9中任一项所指定,以及数据处理器,所述数据处理器包括指令,所述指令用于将所述第一生物标志物和所述第二生物标志物的量与参考进行比较和/或用于基于所述生物标志物的量对用于评定具有疑似感染的所述受试者的评分进行计算,优选地,如权利要求1至9中任一项所指定,以及用于基于所述比较来评定所述受试者,所述评估单元能够自动从所述测量单元接收所述生物标志物的量的值。
13.根据权利要求12所述的装置,其中所述测量单元确定并包括用于第三生物标志物的检测系统,并且其中所述数据库包括第三生物标志物的存储的参考,
(i)在GDF-15为所述第二生物标志物的情况下,所述第三生物标志物为sFlt1、IGFBP7或sTREM1;或者
(ii)在胱抑素C为所述第二生物标志物的情况下,所述第三生物标志物为天冬氨酸转氨酶。
14.根据权利要求12或13所述的装置,其中所述检测系统包括能够特异性检测所述生物标志物中的每一者的至少一种检测剂。
15.一种用于评定具有疑似感染的受试者的装置,所述装置包括评估单元,所述评估单元包括:数据库,所述数据库具有第一生物标志物和第二生物标志物的存储的参考,所述第一生物标志物为Presepsin,所述第二生物标志物选自由以下组成的组:GDF-15、肌酸酐、sFlt1、IGFBP7、sTREM1、胱抑素C和PSP(胰石蛋白),以及数据处理器,所述数据处理器包括指令,所述指令用于将所述第一生物标志物和所述第二生物标志物的量与参考进行比较,优选地如权利要求1至11中任一项所指定,并且用于基于所述比较来评定所述受试者,所述评估单元能够接收在所述受试者的样品中确定的所述生物标志物的量的值。
16.根据权利要求15所述的装置,其中所述数据库包括用于第三生物标志物的存储的参考,
(i)在GDF-15为所述第二生物标志物的情况下,所述第三生物标志物为sFlt1、IGFBP7或sTREM1;或者
(ii)在胱抑素C为所述第二生物标志物的情况下,所述第三生物标志物为天冬氨酸转氨酶。
17.i)第一生物标志物和第二生物标志物,或者ii)与所述第一生物标志物特异性结合的检测剂和与所述第二生物标志物特异性结合的检测剂用于评定具有疑似感染的受试者的用途,所述第一生物标志物为Presepsin,所述第二生物标志物选自由GDF-15、肌酸酐、sFlt1、IGFBP7、sTREM1、胱抑素C和PSP(胰石蛋白)组成的组。
18.根据权利要求17所述的用途,其中另外使用第三生物标志物或与所述第三生物标志物特异性结合的检测剂,
(i)在GDF-15为所述第二生物标志物的情况下,所述第三生物标志物为sFlt1、IGFBP7或sTREM1;或者
(ii)在胱抑素C为所述第二生物标志物的情况下,所述第三生物标志物为天冬氨酸转氨酶。
19.一种用于评定具有疑似感染的受试者的试剂盒,所述试剂盒包括与第一生物标志物特异性结合的检测剂和与第二生物标志物特异性结合的检测剂,所述第一生物标志物为Presepsin,所述第二生物标志物选自由GDF-15、肌酸酐、sFlt1、IGFBP7、sTREM1、胱抑素C和PSP(胰石蛋白)组成的组。
20.根据权利要求19所述的试剂盒,其中所述试剂盒进一步包括与第三生物标志物特异性结合的检测剂,
(i)在GDF-15为所述第二生物标志物的情况下,所述第三生物标志物为sFlt1、IGFBP7或sTREM1;或者
(ii)在胱抑素C为所述第二生物标志物的情况下,所述第三生物标志物为天冬氨酸转氨酶。
21.根据前述权利要求中任一项所述的方法、装置、用途或试剂盒,其中所述评定为对发展脓毒症的风险的评定。
22.根据前述权利要求中任一项所述的方法、装置、用途或试剂盒,其中预测在48小时内发展脓毒症的风险。
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