CN116235276A - 用于在质谱法中进行电荷状态分配的系统和方法 - Google Patents

Abstract

描述了用于将电荷状态分配给从质量分析仪器检测到的离子的装置和方法。在其中一种方法中，可以例如通过评估检测器响应信号来分配电荷状态，检测器响应信号包括与由离子检测器针对由检测器捕获的每个离子到达事件生成的单独离子响应相关的信息。然后可以结合对应于离子到达事件的一个或多个附加特征来评估检测器响应信号，以为该离子到达事件分配电荷状态。

Description

用于在质谱法中进行电荷状态分配的系统和方法

相关案例的交叉引用

本申请于2021年8月6日作为PCT国际专利申请提交，并要求于2020年8月6日提交的美国专利申请序列号63/062,231的优先权权益，该美国专利申请的全部内容通过引用整体并入本文。

背景技术

在为具有相似质荷比(m/z)的离子生成的质量信号之间进行区分可能是质谱法中的难题。

例如，在自上而下的质谱法(MS)蛋白质分析中，质谱中质量或质荷比(m/z)峰的重叠是个重大问题。在这种类型的分析中，会产生宽范围的不同片段或产物离子，包括长度为1-200个氨基酸并具有1-50种不同电荷状态的产物离子。产物离子峰在单个谱中彼此严重重叠。此外，重叠可能非常广泛，使得即使是具有最高质量分辨率的质谱仪(傅里叶变换离子回旋加速器共振(FT-ICR)或轨道阱)也无法对此类重叠峰解卷积。因此，在自上而下的蛋白质分析中经常丢失大的产物离子，从而限制了大蛋白质的序列覆盖。

对于化合物识别，质谱通常被转换为对应于不同化合物的单一同位素质量的列表。为了找到这样的质量，通常采用以下策略：首先，将质谱中的每个峰分配给对应的同位素簇并且找到这种簇的电荷状态。在此之后，找到每个簇的最低m/z峰，这是对应于单一同位素质量的峰。知道了簇电荷，每个簇的单一同位素峰就可以转换为单一同位素质量的零电荷列表，然后可以将其用于将质谱峰归因于化学化合物的后续算法。实际上，将电荷状态正确分配给质谱中的特征(同位素簇)可以是朝着化合物识别的关键一步。

通常，m/z域中的电荷解卷积算法用于电荷状态识别。然而，如果存在严重的谱重叠，包括叉指峰和峰重叠，则此方法具有挑战性。对于混合物的复杂谱或大型生物聚合物的产物离子谱，例如自上而下的分析谱，通常就是这种情况。图1是图示CA2的ECD自上而下谱中的多个重叠特征的示例的图线，其中常规算法容易出错。

长期以来已经认识到，电子倍增器或像电荷检测系统的检测响应可以与测量的离子的电荷状态成比例(例如，参见PCT/IB2020/050795中列出的参考文献，其通过引用并入本文)。因此，理论上可以通过仔细研究这种强度来确定电荷状态。有趣的是，很少有人尝试利用这种现象来推断电荷状态。这是因为其在技术上具有挑战性。

第一，来自多次采集的检测事件通常被汇总到单个谱中以压缩数据。然而，这种压缩会阻止对每个单独离子事件的检测器响应进行任何进一步分析，从而无法推断电荷状态。因此，对于此类分析，每个离子检测事件强度及其质谱特征(例如飞行时间或振荡频率)的完整记录是优选的。替代的数据压缩策略也可用于保留单独检测器响应的一些信息，同时仍保持数据压缩。例如，可以将每个检测事件共同添加到形成检测器响应带的多谱，类似于通过引用整体并入本文的PCT/IB2020/050795中描述的方法。

第二，多个共同检测的离子可以生成检测器响应，其基本上是由每个共同到达的离子生成的检测器响应的总和。因此，并不总是可以仅使用检测信号的检测器响应强度来推断离子的电荷状态。一般而言，对于使用检测器响应来确定电荷状态而言，足够低的离子通量是优选的，使得具有共同到达离子的检测事件的数量被最小化。

第三，此类方法中的另一个挑战是每种特定类型离子的检测器响应分布很宽，并且对于不同种类经常重叠。图2是图示与具有7+电荷的离子相比当检测具有3+电荷的离子时检测器响应分布的示例的图线。如图所示，具有3+电荷的离子的检测器响应与具有7+电荷的离子相比是不同的。因此，由检测器针对具有相同m/z(本示例中的m/z为517)的离子观察到的脉冲高度分布很宽且重叠。如此宽的脉冲高度分布使得基于检测器响应强度的任何常规电荷状态分配方法都较差，因为难以区分m/z相同但电荷不同的离子。

认识到使用检测响应强度直接识别电荷状态的宽强度分布问题，并对使用基于像电荷的检测器的质谱仪提出了一些策略来处理该问题。在这样的系统中，宽的分布主要可归因于测量期间与残留中性分子的碰撞，这会抑制所关注离子的相干振荡并有效地停止对其信号的检测，使其贡献取决于实际离子测量时间。因此，有人提出过滤归因于在采集期间经历碰撞的离子的检测事件(Kafader等人，《分析化学》2019年第91卷第4期第2776–2783页)。然而，这种方法会导致大量离子被丢弃，从而充分增加了获得良好离子统计数据的时间。此外，还提出过减少基础压强和降低离子速度的方法，但这些方法会对质量分析器特性产生不利影响。最后，有人提出采用复杂的数据处理技术来检测碰撞的确切时间，从而根据实际检测时间缩放测得的信号强度(Kafader等人，《美国质谱学会期刊》2019年第11卷第2200-2203页)。

对于使用电子倍增器检测器的质谱仪，二次发射电子的平均数量是针对具有特定m/z和电荷的每个离子明确定义的，但是定义观察到的响应的幅度的一次发射电子的确切数量是个概率量。泊松统计描述了二次发射产额和与浴气的碰撞，但该过程的底层物理却大不相同。因此，为给采用像电荷感应检测器的质谱仪处理宽分布而提出的技术均不适用于具有基于电子倍增器的检测系统的质谱仪。

因此，需要解决该问题的方法。

发明内容

在一些实施例中，提供了一种用于分配电荷状态的方法。在一些方面，该方法可以包括基于分配的电荷状态分配分子量。

在一些实施例中，该方法可以包括从检测器捕获对应于多个离子到达事件的检测器响应信号。所述检测器响应信号包括与由所述检测器针对每个离子到达事件生成的单独离子响应相关的信息。该方法可以进一步包括将检测器响应信号与对应于离子到达事件的一个或多个附加特征组合以为该离子到达事件分配电荷状态。在一些方面，所述一个或多个附加特征可以选自包括如下项的组：m/z；离子迁移率；DMS参数；色谱时间。在一些实施例中，该方法可以进一步包括基于分配的电荷状态和对应于离子到达事件的m/z计算对应于那些离子到达事件的质量。

在一些实施例中，将检测器响应信号与一个或多个附加特征组合可以包括：基于所述特征中的一个或多个特征对m/z箱(bin)进行分组，并根据该检测器响应信号和该一个或多个特征的组合产生简化质谱。

在一些方面，该一个或多个特征包括记录的检测器响应。

在一些方面，分组包括对检测器响应信号应用主成分分析(PCA)。

在一些方面，分组包括：生成基本检测器响应轮廓和对应的m/z箱的列表，识别归因于独特化合物的检测器响应轮廓，以及基于识别的归因于独特化合物的检测器响应轮廓来分解一个或多个剩余的检测器响应轮廓和对应的m/z箱。

在一些方面，分组包括：生成独特检测器响应轮廓的列表，找到归因于基本特征的基本检测器响应轮廓，以及将剩余的混合组归因于所述基本特征。

在一些方面，分组包括：生成独特检测器响应轮廓的列表，识别归因于所述基本特征的基本检测器响应轮廓，以及将剩余的混合组归因于所述基本特征。

在一些方面，分组可以进一步包括基于所述对应的基本检测器响应轮廓的贡献来更新生成的列表。

在一些方面，分组包括应用分组算法，并且其中该方法还包括：识别独特的组；基于基本特征从所述独特的组中识别离子组；以及将剩余的混合组归因于所述基本特征。

在一些实施例中，提供了一种用于分配电荷状态的装置。该装置可以包括：至少一个处理元件；以及存储程序代码的非暂时性存储器，所述程序代码在由所述至少一个处理元件执行时使所述装置进行如下操作：捕获对应于多个离子到达事件的检测器响应信号，所述检测器响应信号包括与由所述检测器针对每个离子到达事件生成的单独离子响应相关的信息；以及将检测器响应信号与对应于离子到达事件的一个或多个附加特征组合以为该离子到达事件分配电荷状态。

在一些方面，该装置可以进一步操作以：基于分配的电荷状态和对应于离子到达事件的m/z计算对应于那些离子到达事件的质量。所述一个或多个附加特征可以例如选自包括如下项的组：m/z；离子迁移率；DMS参数；以及，色谱时间。

在一些方面，该装置可以进一步操作以：进一步操作以：基于分配的电荷状态和对应于离子到达事件的m/z计算对应于那些离子到达事件的质量。

所述一个或多个附加特征可以包括例如m/z域信息。

在一些实施例中，可以提供一种用于分配电荷状态的装置。该装置例如可以包括：至少一个处理元件；存储程序代码的非暂时性存储器，所述程序代码在由所述至少一个处理元件执行时使所述装置进行如下操作：根据质量分析数据生成多个检测器响应轮廓，每个检测器响应轮廓包括包含从所述质量分析数据中提取的质谱的一部分的m/z范围；评估所述多个检测器响应轮廓以将相似的检测器响应轮廓分组；将每组相似的检测器响应轮廓约简为代表该组的简化质谱；以及将每个简化质谱与对应的化合物和相关的电荷状态相关联。

该装置可以操作以将一个或多个附加的分离域与所述检测器响应轮廓相关联。所述附加的分离域可以例如选自包括如下项的组：保留时间、漂移时间、以及DMS操作参数。

在一些实施例中，提供了一种用于分配电荷状态的装置。该装置例如可以包括：至少一个处理元件；存储程序代码的非暂时性存储器，所述程序代码在由所述至少一个处理元件执行时使所述装置进行如下操作：根据质量分析数据生成多个检测器响应轮廓，每个检测器响应轮廓包括包含从所述质量分析数据中提取的质谱的一部分的m/z范围；以及将所述检测器响应轮廓与先前生成的检测器响应轮廓库进行比较，以识别相关联化合物和相关电荷状态中的至少一种。

在一些方面，先前生成的检测器响应轮廓库包括多个简化质谱。

附图说明

图1是图示CA2的ECD自上而下谱中的多个重叠特征的示例的图线。

图2是图示与具有7+电荷的离子相比当检测具有3+电荷的离子时检测器响应分布的示例的图线。

图3是图示将m/z箱范围应用于捕获的检测器响应轮廓的示例的图线。

图4是指示响应于以相对于采集周期的不同速率到达的相同离子类型的示例性检测器响应分布的图线。

图5是示例性离子收集事件的具有m/z和检测器响应维度的代表性热图。

图6至图9是用于电荷状态分配的工作流程图的实施例。

图10描绘了用于执行质谱法的示例系统。

具体实施方式

尽管检测器响应轮廓不足以准确确定电荷状态，但检测器响应轮廓可以非常有助于分离源自不同化合物的信号。如果将常规的电荷确定算法与用于确定电荷状态的检测器响应域联合，则结合准确的电荷状态信息被编码在m/z域中的事实，可以显著提高性能。

重要的是，因为分离发生在质谱法分析的最后一步，所以该方法可适用于替代方法将不起作用的一些情况。具体来说，LC方法可以提供化合物的分离；然而，它们对于分离源自同一前体的产物离子几乎没有用处，而来自同一前体的片段仍然可以基本重叠。类似地，通常在碎裂之前执行的离子迁移率分离(例如微分迁移率分离(DMS))需要进行重大修改以设置碎裂后分离。

一种提高常规电荷确定算法性能的方法是利用检测器响应轮廓对数据进行分组。同一种化学化合物通常有形成同位素簇的多个同位素，这些同位素可能会或可能不会在m/z域中被解析。在某些情况下，对应于那些同位素的位置的m/z箱将具有相似的检测响应轮廓。例如，如果满足至少两个条件，则检测器响应轮廓将会相似。第一，信号不重叠(即m/z箱不包含来自多个不同种类的信号)；第二，对于包含来自这些同位素的信号的所有m/z箱，信号是在主要为单离子到达的条件下采集的。这允许对包含来自同一化合物的信息的m/z箱进行分组，从而有效地在多个通道之间拆分信号。这产生了大大简化的谱，以用于通过常规算法进行后续电荷检测分析。

图3是图示将质谱拆分到m/z“箱”中的示例的图线。每个m/z“箱”表示一m/z范围并包含可以称为检测器响应轮廓的质谱的一部分。然后基于各种m/z箱的检测器响应轮廓的相似性对各种m/z箱进行分组，从而形成大大简化的谱。出于进行图形表示的目的，这些谱可以用不同颜色(例如“红色”、“黑色”、“深蓝色”、“浅蓝色”)示出。使用箭头示出对应于形成这些简化质谱的m/z箱的检测器响应轮廓。在质谱系统包括附加的分离域(例如LC分离的保留时间、漂移时间、DMS操作参数，诸如用于离子迁移率域的补偿电压和/或分离/分散电压等)的情况下，也可以单独或组合使用这些分离域中的一个或多个来对信号进行分组。在一些方面，分离域的组合可用于将信号分组成多个特定子组。

可以通过各种分组算法执行信号分组，诸如例如主成分分析(PCA)、k均值聚类或本领域已知的其他已知分组算法。

在一些实施例中，可以执行附加的步骤，其可以包括例如使用充分表征的化合物生成检测器响应轮廓及其相关联电荷状态的库。该库可以是通用库，可适用于多种仪器，或者可替代地，该库可以是为特定仪器生成的自定义库。每个充分表征的化合物的检测器响应轮廓及其相关联电荷状态的库提供了参考模板，其可以被存储并且然后被后来访问以在后续分析中进行比较。例如，在后续的分析中，将捕获的检测器响应轮廓与检测器响应轮廓库中存储的检测器响应轮廓进行比较，以识别对应的存储的检测器响应轮廓，从而识别捕获的检测器响应轮廓的相关联的电荷状态。

可选地，化合物的m/z位置可以存储在与所关注化合物相关联的检测器响应轮廓及其相关联电荷状态的库中。在这个实施例中，电荷状态分配的步骤是基于以下两者之间的相似度来执行的：根据为所关注化合物捕获的捕获质量分析数据生成的捕获的检测器响应轮廓；和，与该化合物相关联的库中存储的检测器响应轮廓。定义了一个或多个m/z箱的m/z位置归因于化合物的对应一个或多个相邻电荷状态。在随后的步骤中，然后可以从捕获质量分析数据中共同提取所定义的一个或多个m/z箱用于后续分析。

通常，重叠特征不仅具有叉指峰，而且还具有重叠峰，其中单个m/z箱包含源自到达检测器的多个不同种类的信号。在一些情况下，这样的信号可以准确地归因于那些重叠的特征。实际上，如果没有共同检测到的事件，则总信号是源自不同种类的各种贡献的总和，因此可以使用常规的线性代数算法(诸如例如非负最小二乘算法以及其他分解技术)分解为单独的贡献。将源自单一种类并在单离子到达条件下记录的检测器响应轮廓称为基本检测器响应轮廓很方便。在一些方面，可以捕获多个检测器响应轮廓。多个检测器响应轮廓中的每一个对应于其自身的基本检测器响应轮廓，或对应于基本检测器响应轮廓的相关联组合。在任何一种情况下，对应于重叠峰的每个检测响应轮廓都可以分解为其(一个或多个)基本检测器响应轮廓。

在并非每个离子都满足单离子到达条件的情况下，存在这样的到达事件：其中包含来自相同类型离子的信号的m/z箱将具有不同的检测器响应分布，这取决于在该事件到达的离子的数量。事实上，信号在检测器上被有效地求和，并且使多个离子同时到达将导致检测器响应分布的强度向右偏移。

图4是指示响应于以相对于采集周期的不同速率到达的相同离子类型的示例性检测器响应轮廓(即，分布)的图线。在图4的示例中，离子传输速率对应于平均数量＝每次TOF推动有0.2个离子(每个采集周期主要是单离子到达)和平均数量＝每次推动有6个离子(每个采集周期主要是多离子到达)。如所指示的，多离子到达可以防止此类离子的有效分组。在某些情况下，很难对每种所采集类型的离子都满足单离子到达条件。如果不同离子种类的总计数存在很大差异，则这将特别是个问题。在这种情况下，将需要很长的采集时间来针对低丰度离子采集具有足够统计性的数据，同时满足高丰度离子的单离子到达条件。因此，期望有一种策略可以容忍一定数量的离子到达多重性。

重要的是，可以通过简单检查m/z箱中观察到的检测事件的频率来区分单离子到达和多离子到达。该过程可以例如使用泊松分布并通过简单计算特定m/z箱的“未检出”的发生来建模，可以计算同一箱中每种离子多重性的频率。这样的频率然后可以用作分组算法的输入，以帮助将具有不同多重性的离子分配为同一组离子。

可以使用贝叶斯框架或其他合适的技术来解决较高多重性的重叠特征的情况。

替代方法是在单个算法中使用检测器响应轮廓和m/z位置信息。图5是示例性离子收集事件的具有m/z和检测器响应维度的代表性热图。该数据表示可以经历各种模式识别算法和可分组的特征。这些模式识别算法例如可以是机器学习算法或图像识别算法。

基于构建块，许多不同的实施例是可行的，其组合了m/z和检测器响应域并解决了电荷状态确定问题。

图6是用于使用检测器响应轮廓进行电荷状态分配的工作流程图的实施例。在图6的实施例的步骤6010中，以原始模式采集的数据(保留关于每个检测事件的信息)随后在步骤6020中使用检测器响应带(如PCT/IB2020/050795中所述并通过引用并入本文)汇总成多个谱。步骤6010和6020可以在数据采集期间被组合并执行。在这些步骤之后，每个m/z箱根据它们的检测器响应轮廓进行分组(步骤6030)。该步骤可以使用例如分组算法来执行，诸如PCA或K最近邻算法。在该步骤之后，形成大大简化的质谱并将其用作m/z电荷确定算法的输入(步骤6040)。该步骤可以使用m/z空间中的电荷解卷积算法执行，并在之后描述的过程中将电荷分配给特征。可选地，作为步骤6040的一部分，表示该特征的信号可以被转换为零电荷信号并且共同添加以形成质谱。

图7是用于使用检测器响应轮廓进行电荷状态分配的工作流程图的实施例。在图7的实施例中，步骤7010-7030与之前实施例中描述的步骤类似，步骤7040进一步对分组质量进行评分，其表示对某一组或某些组的m/z箱定量相似度。生成的分组和评分输出然后用作m/z空间中电荷状态确定算法的输入，优选地基于贝叶斯框架，例如UniDec算法(Marty等人，《化学分析》2015年第87卷第8期第4370-4376页，其通过引用并入本文)，例如，其可以受益于附加的置信度信息(步骤7050)。

图8是用于使用检测器响应轮廓进行电荷状态分配的工作流程图的实施例。在图8的实施例中，步骤8010-8030类似于图6和图7的实施例。步骤8040涉及识别具有归因于基本检测器响应轮廓的信号的m/z箱。对此的一个示例性方法是检查每个组中包含的m/z箱是否类似于完整的或部分的同位素簇，该同位素簇中归属有至少两个同位素。来自所述组内的那些m/z箱的对应检测器响应可归因于基本检测器响应。步骤8050暂时将8040中未归属的所有其他非零m/z箱归因于重叠信号。在步骤8060中，使用已知算法(诸如例如NNLS)将来自8050的每个重叠信号分解为来自8040的基本信号。可选地，为每个组暂时识别电荷状态。该识别可以例如基于形成同位素簇的峰的相对距离。

可以使用包括至少一个处理元件的计算装置来实施这些方法，该至少一个处理元件可操作以执行存储在非暂时性存储器中的程序代码。所述程序代码在被执行时使计算装置可操作以执行上述任何方法。计算装置可以通信地联接到质谱系统，或者可以与其集成。图10描绘了这样的用于执行质谱法的示例系统，其包括执行本文描述的方法所需的处理元件和存储器。在一些示例中，系统1000可以是质谱仪。示例系统1000包括离子源装置1001、解离装置1002、质量分析器1003、检测器1004和计算元件(诸如处理器1005和存储器1006)。离子源装置1001例如可以是电喷雾离子源(ESI)装置。离子源装置1001被示为质谱仪的一部分或者可以是单独的装置。例如，解离装置1002可以是基于电子的解离(ExD)装置或碰撞诱导解离(CID)装置。基于电子的解离(ExD)、紫外光解离(UVPD)、红外光解离(IRMPD)和碰撞诱导解离(CID)通常用作串联质谱法(MS/MS)的碎裂技术。ExD可以包括但不限于电子捕获解离(ECD)或电子转移解离(ETD)。CID是串联质谱仪中最常规的解离技术。如上所述，在自上而下和自中而下的蛋白质组学中，完整的或消化的蛋白质被电离并经历串联质谱法。例如，ECD是一种优先解离肽和蛋白质主链的解离技术。因此，该技术是使用自上而下和自中而下的蛋白质组学方法分析肽或蛋白质序列的理想工具。

质量分析器1003可以是用于所需技术的任何类型的质量分析器，例如飞行时间(TOF)、离子阱或四极质量分析器。检测器1004可以是用于检测离子和生成本文讨论的信号的适当检测器。例如，检测器1004可包括电子倍增器检测器，其可包括模数转换(ADC)电路系统。检测器1004可以为检测到的离子产生检测脉冲。检测器1004也可以是像电荷感应检测器。

系统1000的计算元件(诸如处理器1005和存储器1006)可以被包括在质谱仪本身中、位于质谱仪附近、或者位于远离质谱仪的位置。通常，系统的计算元件可以与检测器1004电子通信，使得计算元件能够接收从检测器1004生成的信号。处理器1005可以包括多个处理器并且可以包括用于处理信号和生成本文讨论的结果的任何类型的合适的处理组件。取决于确切的配置，存储器1006(除其他外，存储质量分析程序和指令以执行本文公开的操作)可以是易失性的(诸如RAM)、非易失性的(诸如ROM、闪存等)，或这两者的某种组合。其他计算元件也可以被包括在系统1000中。例如，系统1000可以包括存储装置(可移除和/或不可移除)，包括但不限于固态装置、磁盘或光盘或磁带。系统1000还可以具有(一个或多个)输入装置(诸如触摸屏、键盘、鼠标、笔、语音输入等)和/或(一个或多个)输出装置(诸如显示器、扬声器、打印机等)。诸如局域网(LAN)、广域网(WAN)、点对点、蓝牙、RF等之类的一个或多个通信连接也可以并入系统1000中。

Claims (15)

1.一种用于分配电荷状态的方法，所述方法包括：

检测器捕获对应于多个离子到达事件的检测器响应信号，所述检测器响应信号包括与由所述检测器针对每个离子到达事件生成的单独离子响应相关的信息；以及

将检测器响应信号与对应于离子到达事件的一个或多个附加特征组合以为该离子到达事件分配电荷状态。

2.根据权利要求1所述的方法，还包括：基于分配的电荷状态和对应于离子到达事件的m/z计算对应于那些离子到达事件的质量。

3.根据权利要求1或权利要求2所述的方法，其中，所述一个或多个附加特征选自包括如下项的组：m/z；离子迁移率；DMS参数；以及，色谱时间。

4.根据权利要求1至3中任一项所述的方法，还包括：

基于分配的电荷状态和对应于离子到达事件的m/z计算对应于那些离子到达事件的质量。

5.根据权利要求1至4中任一项所述的方法，其中，所述一个或多个附加特征包括m/z域信息。

6.一种用于分配电荷状态的装置，所述装置包括：

至少一个处理元件；

存储程序代码的非暂时性存储器，所述程序代码在由所述至少一个处理元件执行时使所述装置进行如下操作：

捕获对应于多个离子到达事件的检测器响应信号，所述检测器响应信号包括与由所述检测器针对每个离子到达事件生成的单独离子响应相关的信息；以及

将检测器响应信号与对应于离子到达事件的一个或多个附加特征组合以为该离子到达事件分配电荷状态。

7.根据权利要求6所述的装置，所述装置进一步操作以：基于分配的电荷状态和对应于离子到达事件的m/z计算对应于那些离子到达事件的质量。

8.根据权利要求6或权利要求7所述的装置，其中，所述一个或多个附加特征选自包括如下项的组：m/z；离子迁移率；DMS参数；以及，色谱时间。

9.根据权利要求6至8中任一项所述的装置，所述装置进一步操作以：

基于分配的电荷状态和对应于离子到达事件的m/z计算对应于那些离子到达事件的质量。

10.根据权利要求6至9中任一项所述的装置，其中，所述一个或多个附加特征包括m/z域信息。

11.一种用于分配电荷状态的装置，所述装置包括：

至少一个处理元件；

存储程序代码的非暂时性存储器，所述程序代码在由所述至少一个处理元件执行时使所述装置进行如下操作：

根据质量分析数据生成多个检测器响应轮廓，每个检测器响应轮廓包括包含从所述质量分析数据中提取的质谱的一部分的m/z范围；

评估所述多个检测器响应轮廓以将相似的检测器响应轮廓分组；将每组相似的检测器响应轮廓约简为代表该组的简化质谱；以及

将每个简化质谱与对应的化合物和相关的电荷状态相关联。

12.根据权利要求11所述的装置，所述装置进一步操作以将一个或多个附加的分离域与检测器响应轮廓相关联。

13.根据权利要求12所述的装置，其中，所述附加的分离域选自包括如下项的组：保留时间、漂移时间、以及DMS操作参数。

14.一种用于分配电荷状态的装置，所述装置包括：

至少一个处理元件；

存储程序代码的非暂时性存储器，所述程序代码在由所述至少一个处理元件执行时使所述装置进行如下操作：

根据质量分析数据生成多个检测器响应轮廓，每个检测器响应轮廓包括包含从所述质量分析数据中提取的质谱的一部分的m/z范围；以及

将检测器响应轮廓与先前生成的检测器响应轮廓库进行比较，以识别相关联化合物和相关电荷状态中的至少一种。

15.根据权利要求14所述的装置，其中先前生成的检测器响应轮廓库包括多个简化质谱。

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