CN115932238A - 一种用于sfts病毒核酸检测的探针和试纸条及使用方法 - Google Patents

一种用于sfts病毒核酸检测的探针和试纸条及使用方法 Download PDF

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陈琳
邹明园
吴超
沈瀚
黄睿
杨玥
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Abstract

本发明公开了一种用于SFTS病毒核酸检测的探针和试纸条及使用方法,包括探针H1和探针H2,用于特异性检测SFTS病毒;本发明还公开了一种用于SFTS病毒核酸检测的试纸条及使用方法,配合上述探针,通过层析法高效检测SFTS病毒。本发明通过特异性探针配合侧向免疫层析试纸条,对SFTS病毒进行检测,能够在15分钟内获得检测结果,无需RNA提取等繁琐步骤,操作方便高效,且特异性强,灵敏度高。

Description

一种用于SFTS病毒核酸检测的探针和试纸条及使用方法
技术领域
本发明属于生物技术领域,具体涉及一种用于SFTS病毒核酸检测的探针和试纸条及使用方法。
背景技术
严重发热伴血小板减少综合征病毒(SFTSV)是一种新型布尼亚病毒。近年来,SFTSV感染病例数稳步增长。由于SFTSV可以在人与人之间传播,它将使公众面临感染风险。在2018年重点疾病蓝图清单年度审查中,世界卫生组织将SFTSV感染列为紧急情况下研发的重点疾病。然而,SFTSV的发病机制仍不清楚,还没有特定的治疗方法或疫苗来对抗SFTSV的感染。因此严重发热伴血小板减少综合征病毒的检测对SFTS感染防治具有重要意义,预防病症,控制病毒传播,有效管理患者。
目前,临床实验室检查主要以核酸检测和血清抗体检测为主。血清抗体检测主要用于严重发热伴血小板减少综合征的筛查,但是易出现假阴性结果。对于新型布尼亚病毒IgG抗体阳性者应进一步检SFTSV-RNA,以确定是否为现症感染,然而核酸PCR方法复杂,对于环境和技术人员要求严格。发热伴血小板减少综合征防治指南(2010版)指出,SFTSV的实验室检查仍然以SFTSV-RNA检测作为金标准,应用最为广泛的q-PCR方法虽然技术成熟,特异性高。但是,q-PCR需要在精密的大型荧光定量PCR仪上进行长时操作,对于操作人员有一定的技术要求,其仪器昂贵,耗时较长很难在小型医院及偏远地区开展检测,因此PCR很难实现现场即时检测(P OCT)。
发明内容
有鉴于此,本发明期望提供一种用于SFTS病毒核酸检测的探针和试纸条及使用方法,通过侧向免疫层析试纸条,无需RNA提取,在等温无酶环境下快速、高特异性、高灵敏度地检测SFTS核酸,实现SFTS现场即时检测。
为达到上述目的,本发明的技术方案是这样实现的:
一种用于SFTS病毒核酸检测的探针H1和探针H2序列分别如下:
H1:CTGTTGACTCCTCTTTGTTCTTCAACAGTCACCCCAGAACAAAGA GGAG
H2:TTGTTCTGGGGTGACTGTTGAAGAACAAAGAGGAGTCAACAGTC ACCCC
进一步地,所述探针H1和探针H2均为发夹结构,探针H1的5’端由地高辛修饰,探针H2的5’端由生物素修饰。
进一步地,所述探针与目的检测序列混合,形成H1+H2杂交双链。
本发明还另外提供一种用于SFTS病毒核酸检测的试纸条,所述试纸条为侧向免疫层析试纸条,检测上述H1+H2杂交双链。
进一步地,所述试纸条依次设置样品垫、结合垫、硝酸纤维素膜和吸收垫。
进一步地,所述结合垫上包被AlexaFluor647荧光素和亲和素双标记的纳米微球;所述硝酸纤维素膜标有检测线和质控线。
这里,检测线(test line)标记为“T”,质控线(control line)标记为“C”。
进一步地,所述样品垫、结合垫为玻璃纤维材质;所述吸收垫为纤维素材质。
进一步地,所述检测线上喷洒抗地高辛,所述质控线上涂抹生物素。
本发明还另外提供一种用于SFTS病毒核酸检测的试纸条的使用方法,使用上述试纸条,包括以下步骤:
1)层析:在样品垫滴加反应液,反应液随着层析作用缓慢向结合垫处流动;
2)荧光检测:15分钟后,使用荧光免疫定量分析仪进行读取,如在检测线检测到阳性信号,说明存在目标链,样本为阳性;如检测线处没有阳性信号,说明目标链不存在,样本为阴性。
这里,当目标序列存在时,反应液形成H1+H2杂交双链,此时,结合垫处标记的纳米微球捕获H2标记的生物素,形成亲和素-纳米微球-H1+H2 杂交双链复合物;反应液继续向前流动,在检测线处,包被的抗地高辛抗体捕获H1标记的地高辛,形成亲和素-纳米微球-H1+H2杂交双链-抗地高辛复合物,在试纸上形成荧光线,使用荧光免疫定量分析仪Getein1100进行读取,检测线和质控线均显示荧光,检测信号为阳性,说明存在目标链。当目标序列不存在时,两条探针不能结合,质控线处捕获H2探针,只有质控线处显示荧光,则样本为阴性,不存在目标链。
这里,本发明通过特异性探针配合侧向免疫层析试纸条,对SFTS病毒进行检测,能够在15分钟内获得检测结果,无需提取RNA等繁琐步骤,操作方便高效,且特异性强,灵敏度高。
本发明有益效果如下:1)本发明通过特异性探针配合侧向免疫层析试纸条,高效地对SFTS病毒进行核酸检测,操作简单方便,降低了检测难度; 2)本发明方法检测过程中无需RNA提取,在等温无酶环境下即可快速、高特异性、高灵敏度地检测SFTS病毒,实现SFTS病毒即时检测,大大提高了检测效率。
附图说明
图1为本发明实施例1中探针H1和探针H2二级结构图;
图2为本发明实施例2中琼脂糖凝胶电泳图;
图3为本发明实施例3中荧光定量PCR结果图;
图4为本发明实施例4中SFTS临床阳性样本荧光定量PCR结果图;
图5为本发明实施例5中一种用于SFTS病毒核酸检测的试纸条的结构示意图;
图6为本发明实施例5中使用试纸条进行SFTS病毒核酸的检测流程图;
其中,1是样品垫、2是结合垫、3是硝酸纤维素膜、4是吸收垫。
具体实施方式
为了能够更加详尽地了解本发明的特点与技术内容,下面结合附图对本发明的实现进行详细阐述,所附附图仅供参考说明之用,并非用来限定本发明。
实施例1探针检测管制备
S11、根据SFTSV-5’UTR保守区进行多序列比对,并选出含有21个碱基的保守序列作为目标检测序列(Target),序列详细如下:
Target:AGAACAAAGAGGAGTCAACAG
S12、根据目标检测序列设计两条发夹探针H1和H2,其二级结构如图 1所示,序列分别为:
H1:CTGTTGACTCCTCTTTGTTCTTCAACAGTCACCCCAGAACAAA GAGGAG
H2:TTGTTCTGGGGTGACTGTTGAAGAACAAAGAGGAGTCAACA GTCACCCC
并分别用地高辛(Digoxin)修饰H1的5’端,生物素(Biotin)修饰H2的5’端,当目标检测序列存在时,由目标检测序列触发反应,依次打开发夹探针H1和探针H2,由于序列互补形成H1+H2杂交双链。
S13、将探针H1和H2分别用TNaK+Mg2+(20×10-3M Tris,pH7.5;140 ×10-3M NaCl;5×10-3MKCl,5×10-3MMgCl)缓冲液溶解至10μM,并进行退火,在95℃下处理10分钟后逐渐降至室温2小时,并放置-20℃冰箱备用。
实施例2电泳验证催化发夹自组装系统可行性
通过琼脂糖凝胶电泳验证系统进行验证,步骤如下:
S21、各取探针H1、探针H2和目标序列各10μL充分混匀,终浓度为 1μM,在37℃金属浴中反应30分钟,得到反应液;
S22、取S21中反应液10μL和loading buffer 2μL进行混合,取10μ L混合液上样进行电泳,电泳完毕后,取凝胶于凝胶成像系统中拍照并保存,电泳结果如图2所示,泳道1-4号条带从左到右依次为:H1+H2、H1+H2+T、 H1、H2,这里T为Target,下同。
如图2所示,不存在目标检测序列时,两个发夹探针H1和H2不能够互相结合,只有当目标检测序列与两种探针同时存在时,两个探针H1和H 2的发夹结构才能依次打开,并结合形成H1+H2杂交双链。
实施例3荧光双重验证催化发夹自组装系统可行性
通过q-PCR荧光双重验证系统进行验证,步骤如下:
S31、在H2暴露的5’端标记荧光素FAM,3’端标记淬灭基团BHQ-1。将探针H1、H2经过退火处理并将探针与目标检测序列稀释至10μM,设定 6个不同反应管,分别为:H1、H2、T、H1+H2、H1+T、H1+H2+T。反应体系为30μL,终浓度为1μM,再实时荧光定量PCR仪设定37℃恒温反应进行扩增,荧光定量PCR结果如图3所示。
图3表明,H1、T和H1+T曲线因为无标记序列,因此检测不到荧光值。H2由FAM和BHQ-1修饰,检测显示微弱荧光强度;没有目标检测链 T时,探针H1+H2反应曲线的荧光值与H2反应曲线没有明显差异,表明它们稳定共存并保持二级结构。在目标检测链T存在的情况下,触发与H1 末端暴露的toehold区域结合反应,当H1打开时,H2与其余暴露的碱基结构域结合形成H1-H2双链复合物。由于H2既标记有荧光基团FAM又标记淬灭基团BHQ-1,产生荧光能够被有效淬灭,但反应进行得很快,所以后期呈现稳定趋势。
实施例4催化发夹自组装系统检测SFTS临床阳性样本可行性验证
S41、收集2例SFTSV核酸检测阳性样本,各取10μL血清核酸提取样本,分别加入步骤S31的检测管中,充分混匀,在实时荧光定量PCR仪设定37℃恒温反应进行扩增。
取反应15分钟的荧光值进行对比,结果如图4所示,测得2例阳性样本荧光值均与阴性均值存在倍数差异。结果表明该检测方法可用于检测SF TS临床样本。
实施例5用于SFTS病毒核酸检测的试纸条检测SFTS临床阳性样本
本实施例提供一种用于SFTS病毒核酸检测的试纸条,所述试纸条为侧向免疫层析试纸条,其结构示意图如图5所示,从左到右依次设置样品垫、结合垫、硝酸纤维素膜和吸收垫,样品垫上设置加样孔;所述结合垫上包被AlexaFluor647荧光素和亲和素双标记的纳米微球;所述硝酸纤维素膜标有检测线和质控线;所述检测线上喷洒抗地高辛,所述质控线上涂抹生物素;所述样品垫、结合垫为玻璃纤维材质;所述吸收垫为纤维素材质。
本实施例中,检测线(test line)标记为“T”,质控线(control line)标记为“C”。
检测时,选取一例临床阳性样本和阴性样本制备反应液:取10μL血清样本和阴性样本分别加入90μL H1与H2浓度比为1:3的检测液中。这里,所述检测液包括如下组分:1μMH1,3μM H2,20×10-3m Tris,pH 7.5;140 ×10-3m NaCl;5×10-3m KCl;5mM MgCl2,充分混匀,在37℃水浴锅中反应 30分钟得到反应液,分别取80μL反应液滴加在样品垫上,反应液随着层析作用缓慢向结合垫处流动。
一方面,阳性存在目标链target,其反应原理如图6所示,形成H1+H2 杂交双链,此时,结合垫处标记的纳米微球捕获H2标记的生物素,形成亲和素-纳米微球-H1+H2杂交双链复合物;反应液继续向前流动,在检测线处,包被的抗地高辛抗体捕获H1标记的地高辛,形成亲和素-纳米微球 -H1+H2杂交双链-抗地高辛复合物。
本实施例中,在滴加反应液样本1min后,检测到试纸条上的荧光值很低,这是因为滴加的80μL反应液未能全部流动至检测窗口,还有残余液体未能与包被物结合。
随着层析时间的增加,检测线处及质控线处能检出的荧光值逐渐上升,并在15min左右荧光值趋于稳定,反应达到平台期。结果表明,试纸条上发生的抗原抗体反应需要一定的时间,检测反应在滴定后15min左右才能全部完成,因此,将反应液滴定至LFIA试纸条上静置15min再读取荧光值,是较为合适的。
另一方面,阴性样本不存在目标序列,两条探针不能结合,质控线处捕获H2探针,只有质控线处能检测到阳性信号,检测线处无阳性信号。以上显示和描述了本发明的基本原理、主要特征和本发明的优点。以上所涉及仪器的具体型号不作限制及详细描述,作为公知常识,本领域的技术人员能够理解。以上所述,仅为本发明的较佳实施例而已,并非用于限定本发明的保护范围,凡在本发明的精神和原则之内所作的任何修改、等同替换和改进等,均应包含在本发明的保护范围之内。

Claims (9)

1.一种用于SFTS病毒核酸检测的探针,其特征在于,包括探针H1和探针H2,序列分别如下:
H1:CTGTTGACTCCTCTTTGTTCTTCAACAGTCACCCCAGAACAAAGAGGAG
H2:TTGTTCTGGGGTGACTGTTGAAGAACAAAGAGGAGTCAACAGTCACCCC。
2.根据权利要求1所述的一种用于SFTS病毒核酸检测的探针,其特征在于,所述探针H1和探针H2均为发夹结构,探针H1的5’端由地高辛修饰,探针H2的5’端由生物素修饰。
3.根据权利要求1或2所述的一种用于SFTS病毒核酸检测的探针,其特征在于,所述探针与目的检测序列混合,形成H1+H2杂交双链。
4.一种用于SFTS病毒核酸检测的试纸条,其特征在于,所述试纸条为侧向免疫层析试纸条,检测如权利要求3所述的H1+H2杂交双链。
5.根据权利要求4所述的一种用于SFTS病毒核酸检测的试纸条,其特征在于,所述试纸条依次设置样品垫、结合垫、硝酸纤维素膜和吸收垫。
6.根据权利要求5所述的一种用于SFTS病毒核酸检测的试纸条,其特征在于,所述结合垫上包被AlexaFluor647荧光素和亲和素双标记的纳米微球;所述硝酸纤维素膜标有检测线和质控线。
7.根据权利要求5所述的一种用于SFTS病毒核酸检测的试纸条,其特征在于,所述样品垫、结合垫为玻璃纤维材质;所述吸收垫为纤维素材质。
8.根据权利要求6所述的一种用于SFTS病毒核酸检测的试纸条,其特征在于,所述检测线上喷洒抗地高辛,所述质控线上涂抹生物素。
9.一种用于SFTS病毒核酸检测的试纸条的使用方法,其特征在于,使用如权利要求8所述的试纸条,包括以下步骤:
1)层析:在样品垫滴加反应液,反应液随着层析作用缓慢向结合垫处流动;
2)荧光检测:15分钟后,使用荧光免疫定量分析仪进行读取,如在检测线检测到阳性信号,说明存在目标链,样本为阳性;如检测线处没有阳性信号,说明目标链不存在,样本为阴性。
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