CN115697485A - 作为ddr抑制剂的苄胺衍生物 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及抑制DDR1和DDR2的式(I)的化合物,特别地,本发明涉及为苄胺衍生物的化合物、制备这类化合物的方法、包含它们的药物组合物及其治疗用途。本发明的化合物可以用于治疗与DDR失调相关的疾病或病症,特别是纤维化。

Description

作为DDR抑制剂的苄胺衍生物
发明领域
一般而言,本发明涉及抑制盘状结构域受体的化合物(下文DDR抑制剂);本发明涉及化合物(其为苄胺衍生物)、制备该化合物的方法、包含该化合物的药物组合物及该化合物的治疗用途。
本发明的化合物可以用于例如治疗许多与DDR机制相关的疾病。
发明背景
盘状结构域受体(DDR)家族包含两个不同的成员DDR1和DDR2。DDR是I型跨膜受体酪氨酸激酶(RTK),其展示出与RTK家族的许多成员相似的整体结构组织。它们最初在20世纪90年代早期通过基于它们的催化激酶结构域(KD)的同源克隆发现(参见Johnson,J.D.(1993)Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.90,5677–5681;Di Marco,E.(1993)J.Biol.Chem.268,24290–24295;Zerlin,M.(1993)Oncogene 8,2731–2739;Perez,J.L.(1996)Oncogene 12,1469–1477)。
随后,胶原蛋白被鉴定为DDR的配体(参见Vogel,W.(1997)Mol.Cell 1,13–23;Shrivastava A.Mol Cell.1997;1:25–34.),因此,在RTK超家族的其他成员中确立了这些受体的独特特征,其典型地由可溶性肽样生长因子活化。
所有DDR均为单通过I型跨膜糖蛋白,其特征在于存在六个不同的结构域:盘菌素(discoidin)(DS)结构域、DS样结构域、胞外近膜(EJXM)区、跨膜(TM)区段、长胞内近膜(IJXM)区和胞内激酶结构域(KD)。所述N-末端DS和DS样结构域的存在是DDR RTK亚家族的定义特征。
DS结构域包含胶原蛋白结合区,并且负责介导对纤维状和非纤维状胶原蛋白的DDR特异性(参见Curat,C.A.(2001)J.Biol.Chem.276,45952–45958;Leitinger,B.(2003)J.Biol.Chem.278,16761–16769;Abdulhussein,R.(2004)J.Biol.Chem.279,31462–31470;Xu,H.(2011)Matrix Biol.30,16–26)。DDR的DS样结构域的功能尚未完全了解,但公布的数据表明它有助于胶原蛋白诱导的受体活化(参见Carafoli,F.(2012)Structure 20,688–697)。
连接DS结构域与TM片段的人DDR的EJXM区(DDR1中的49个残基和DDR2中的31个残基)具有未知的结构。EJXM区包含几个推定的N-糖基化和O-糖基化位点,其可以调节受体运输、周转和/或配体诱导的活化(参见Curat,C.(2001)J.Biol.Chem.276,45952–45958)。
短的TM螺旋片段(~20个残基)连接DDR的胞外域和胞内结构域。TM片段在受体二聚化中起作用(参见Noordeen,N.A.(2006)J.Biol.Chem.281,22744–22751)。
异常大的(130-140个残基)IJXM区将TM区段与KD连接。IJXM区包含几个酪氨酸残基,其用作信号转导所必需的细胞质效应物和调节物的停靠位点。经典的KD(~300个残基)在DDR1和DDR2二者中的IJXM区之后。
DDR1亚家族由五种膜锚定的同种型组成,并且DDR2亚家族由单一蛋白质代表。通过选择性剪接产生五种DDR1同种型。它们共同具有胞外和跨膜结构域,但在胞质区不同。在五种DDR1同种型中,三种(DDR1a、DDR1b、DDR1c)为功能性受体(参见Valiathan,R.R.(2012)Cancer Metastasis Rev.31,295–321;Alves,F.(2001)FASEB J.15,1321–1323)。
DDR在RTK中是独特的,因为它们被胞外基质蛋白胶原蛋白激活。DDR仅以其天然的三螺旋构象结合胶原蛋白,并且不识别热变性的胶原蛋白(明胶)(参见Vogel,W.(1997)Mol.Cell 1,13–23;Leitinger,B.(2003)J.Biol.Chem.278,16761–16769)。
两种DDR均显示出广泛的胶原特异性,并且被许多不同的胶原类型激活,其中纤维胶原(I-III和V)充当两种受体的配体(参见Vogel,W.(1997)Mol.Cell 1,13–23;Shrivastava A.Mol Cell.1997;1:25–34)。DDR对某些类型的胶原蛋白具有不同的偏好。DDR1而不是DDR2结合基膜胶原蛋白IV,而DDR2显然优先结合胶原蛋白II和胶原蛋白X(参见Leitinger B.J Mol Biol.2004;344(4):993–1003;Leitinger B.Matrix Biol.2006;25(6):355–364)。与胶原蛋白结合整联蛋白类似,DDR识别胶原蛋白中的特定氨基酸基元。利用三螺旋肽文库的详细研究揭示了六个氨基酸基元GVMGFO作为两种DDR的结合基元(参见Farndale RW等人Biochem Soc Trans.2008;36(Pt 2):241–250)。
DDR是不常见的RTK,因为它们形成非共价连接的配体非依赖性稳定二聚体(参见Noordeen,N.A.(2006)J.Biol.Chem.281,22744–22751;Mihai C.J Mol Biol.2009;385:432–445)。DDR二聚体可能在生物合成期间形成,并且在配体结合之前存在于细胞表面上。在胶原蛋白结合时,DDR经历酪氨酸自磷酸化。DDR磷酸化动力学的两个区别特征在于延迟和持续响应。尽管典型的RTK在数秒至数分钟内被激活,但最大DDR激活通常仅在用胶原蛋白刺激后数小时达到,并且可以在刺激后至多几天保持可检测到(参见Vogel,W.(1997)Mol.Cell 1,13–23;Shrivastava A.Mol Cell.1997;1:25–34)。对DDR磷酸化的这两个富有吸引力特征的分子基础和生物学效应知之甚少。
活化的DDR的胞内结构域内的酪氨酸残基的磷酸化产生包含SH2、SH3和PTB结构域的蛋白质的停靠位点(参见Wang,C.Z.,(2006)Mol.Biol.Cell 17,2839–2852);Lemeer,S.,(2012)J.Proteomics 75,3465–3477;L’
Figure BDA0003960532040000031
C.G.(2002)FASEB J.16,234–236;Koo,D.H.(2006)FEBS Lett.580,15–22;Yang,G.,(2009)Proteomics 9,4944–4961)。
迄今为止的证据表明,用胶原蛋白刺激DDR1与PI3K/Akt和Ras/ERK MAPK级联的激活偶联(参见Lu,K.(2011)Cardiovasc.Pathol.20,71–76;Suh,H.N.,J.Cell.Phyisiol.226,3422–3432;Ongusaha,P.P.,EMBO J.22,1289–1301)。
在DDR2的情况下,证据指向Src作为DDR2信号传导的下游效应物和调节物的作用(参见Ikeda,K.,(2002)J.Biol.Chem.277,19206–19212;Olaso,E.(2011)FibrogenesisTissue Repair 4,5;Yang,K.,J.Biol.Chem.280,39058–39066)。
DDR敲除小鼠的表型证明了DDR作为胶原蛋白受体的重要性。尽管DDR1和DDR2敲除小鼠都是存活的,但与野生型同窝出生仔相比,它们的尺寸小(参见Vogel WF,Mol CellBiol.2001;21(8):2906–2917;Labrador JP.EMBO Rep.2001;2(5):446–452.)。DDR1敲除小鼠的腓骨矿化不良。在DDR2敲除小鼠中,侏儒症与由于软骨细胞增殖减少而产生的较短的长骨有关。在人类中,DDR2突变与多种骨骼缺陷相关,包括短肢和异常钙化。除了尺寸更小之外,DDR敲除/突变小鼠表现出繁殖缺陷。DDR1敲除小鼠由于异常的乳腺形态发生而不能泌乳。另外,DDR1敲除小鼠表现出改变的肾结构和受损的原代系膜细胞与ECM的粘附(参见Gross O,Kidney Int.2004;66(1):102–111;Curat CA,J Am Soc Nephrol.2002;13(11):2648–2656)。这些小鼠也不能控制它们的耳朵运动,并且表现出听觉功能丧失,在整个耳蜗管中具有显著的结构变化(参见Meyer zumGottesberge AM,Lab Invest.2008;88(1):27–37)。相反,DDR2敲除小鼠在泌乳、肾结构或听觉功能方面没有显示缺陷。而这些小鼠由于增殖、侵袭、蛋白水解活性和皮肤成纤维细胞的ECM重塑缺陷而表现出受损的皮肤伤口愈合(参见Olaso E,J Biol Chem.2002;277(5):3606–3613)。
尽管在DDR缺失小鼠中发现了一些发育缺陷,但这些小鼠在低估这些受体在多种疾病(包括肺纤维化)中的作用方面是有价值的。
DDR1缺失在肺纤维化中的保护作用的第一个证据是由Vogel博士的研究组在2006年产生的(参见Avivi-Green C,Am J Respir Crit Care Med 2006;174:420–427)。作者证明了DDR1缺乏小鼠在很大程度上被保护免受博来霉素(BLM)诱导的损伤。此外,与它们的野生型对应物相比,这些动物中的肌成纤维细胞扩增和细胞凋亡低得多。通过灌洗细胞计数和细胞因子ELISA证实敲除小鼠中不存在炎症。这些结果表明DDR1表达是肺部炎症和纤维化发生的先决条件。
Wang Z.等人使用药理学方法(和治疗方案)证实了上述结果(参见Wang,Z.,J.Med.Chem.2016,59,5911-5916)。在BLM诱导的纤维化损伤发作后,用化合物6j(四氢异喹啉衍生物)处理小鼠。化合物6j以剂量依赖性方式防止BLM诱导的病理变化(即,肺泡腔减少和ECM沉积)。该组织学结果伴随着纤维化标志物纤连蛋白、α-SMA和胶原蛋白的表达水平降低。
DDR2在器官纤维化中的作用知之甚少,并且存在争议。DDR2缺失小鼠在慢性肝损伤后具有增加的肝纤维化(参见Olaso E,Am J Pathol 2011;179:2894–2004)。另一方面,DDR2缺乏或下调减少博来霉素诱导的肺纤维化(参见Zhao H,Bian H,Bu X,Zhang S,ZhangP,Yu J等人Mol Ther 2016;24:1734–1744)。Zhao等人证明DDR2在肺中诱导纤维化和血管生成中起关键作用。作者表明DDR2与转化生长因子(TGF)-β协同诱导肌成纤维细胞分化。此外,他们表明用针对DDR2的特异性siRNA处理损伤小鼠表现出针对肺纤维化的治疗功效。在第二个出版物中,Jia等人证实,缺乏DDR2的小鼠被保护免受博来霉素诱导的肺纤维化(参见Jia S,Am J Respir Cell Mol Biol 2018;59:295–305)。作者证明,在博来霉素处理后,DDR2缺失小鼠呈现出显著保留的肺泡结构,其中空气空间没有大量细胞浸润。此外,无DDR2的成纤维细胞显著比野生型成纤维细胞更倾向于凋亡,这支持了其中成纤维细胞对凋亡的抗性对于纤维化进展至关重要的范例。
文献中已经描述了不同化合物作为DDR1或DDR2拮抗剂。
WO2015004481(Astex)公开了作为DDR1和DDR2抑制剂的双环化合物,其可用于治疗例如癌症这样的疾病。
WO2017005583(F.Hoffmann-La Roche)公开了作为DDR1抑制剂的三氮杂螺衍生物,其可用于治疗肾脏病症、肝脏病症、炎性病症、血管病症、心血管病症、纤维化疾病、癌症以及急性和慢性器官移植排斥。
WO2014032755(Merck)公开了可用于治疗和/或预防生理和/或病理生理状态的化合物,在所述生理和/或病理生理状态的触发下DDR2牵涉,特别是用于治疗和/或预防骨关节炎。
WO2013161851(Chugai)公开了作为DDR1拮抗剂的苯甲酰胺衍生物,其可用于治疗纤维化和/或炎症。
WO2015060373(Chugai)公开了作为DDR1拮抗剂的喹唑啉酮和异喹啉酮衍生物,其可用于治疗纤维化和/或炎症。
WO2016064970(Guangzhou)公开了作为DDR1抑制剂的异喹啉衍生物,其可用作预防和治疗炎症、肝纤维化、肾纤维化、肺纤维化、皮肤瘢痕、动脉粥样硬化和癌症的治疗剂。
WO2005092896(Jeil Pharmaceutical)公开了作为DDR2抑制剂的呋喃并嘧啶衍生物,其可用于治疗由DDR2酪氨酸激酶活性引起的疾病,例如肝硬化、类风湿性关节炎或癌症。
WO2010062038(Legochem)公开了作为DDR1和DDR2抑制剂的化合物,其可用于治疗已知主要由DDR1和DDR2过度激活引起的疾病,例如癌症、肝硬化、动脉硬化、类风湿性关节炎、骨关节炎。
WO2017038870(Toray)公开了作为DDR1抑制剂的脲衍生物,其可用于治疗其中涉及DDR1受体的疾病。
Daniel E.Jeffries等人,在“Discovery of VU6015929:A Selective DiscoidinDomain Receptor 1/2(DDR1/2)Inhibitor to Explore the Role of DDR1 inAntifibrotic Therapy”,Med.Chem.Lett.2020,11,29-33中公开了选择性双重DDR1/2抑制剂7e(VU6015929),并建议DDR1抑制作为抗纤维化疗法的刺激靶标。
值得注意的是,拮抗DDR受体可用于治疗纤维化和由纤维化引起的疾病、障碍和病症,更甚至拮抗受体DDR1和DDR2二者在治疗上述疾病、障碍和病症中可能特别有效。
在过去几年中已经进行了几种努力来开发可用于治疗几种疾病的新型DDR1和DDR2受体拮抗剂,并且这些化合物中的一些也在人类中显示出功效。
尽管有上文引用的现有技术,但仍然存在开发受体DDR1和DDR2二者的抑制剂的潜力,所述抑制剂可用于治疗与DDR受体失调相关的疾病或病症,特别是纤维化。
在这方面,现有技术没有描述或提示对受体DDR具有拮抗剂活性的本发明通式(I)的苄胺衍生物,其代表了对上述需求的解决方案。
发明概述
在第一方面,本发明涉及式(I)的化合物
Figure BDA0003960532040000071
其中
L和L1不同且独立地选自-C(O)和NH;L2不存在或为NH,其中当L和L2均为NH时,L1为-C(O);
Z不存在或选自-CH2和-C(O);
R1为H或选自-O(C1-C4)烷基、
Figure BDA0003960532040000072
n为1-3的整数,
R选自(C1-C4)烷基、卤素、(C1-C4)卤代烷基和
(C3-C6)环烷基;
R2选自杂芳基和杂环烷基看,其中所述杂芳基和杂环烷基各自可以任选地被一个或多个-C(O)NHR6,-CN,(C1-C4)烷基、卤素、-NHC(O)R6、杂芳基和-NR7R8取代;
R3选自(C1-C4)烷基、(C1-C4)卤代烷基、(C3-C6)环烷基和-O(C1-C4)卤代烷基;
R4为H或选自(C1-C4)烷基、卤素和(C3-C6)环烷基;
R5为H或选自(C1-C4)烷基和杂芳基(C1-C4)烷基-;
R6为H或(C1-C4)烷基;
R7和R8每次出现时独立地为H或选自(C1-C4)烷基、(C3-C8)环烷基、(C1-C6)卤代烷基和卤素;
及其药学上可接受的盐。
在第二方面,本发明涉及药物组合物,其包含与一种或多种药学上可接受的载体或赋形剂混合的式(I)的化合物。
在第三方面,本发明涉及式(I)的化合物,其用作药物。
在另一方面,本发明涉及式(I)的化合物,其用于治疗与DDR失调相关的疾病、障碍或病症。
在另一方面,本发明涉及式(I)的化合物,其用于预防和/或治疗纤维化和/或牵涉纤维化的疾病、障碍或病症。
在另一方面,本发明涉及式(I)的化合物,其用于预防和/或治疗特发性肺纤维化(IPF)。
在另一方面,本发明涉及式VIII的化合物
Figure BDA0003960532040000081
其优选用作制备一系列式(I)的化合物的中间体,其中R、R1、R3、R4、L、L1和L2如上对式(I)所示。
在另一方面,本发明涉及式VII的化合物
Figure BDA0003960532040000082
其优选用作制备一系列式(I)的化合物的中间体,其中Z不存在、为CH2或-C(O),R、R1、R2、R3、R4、L、L1和L2如上对式(I)所示。
发明详述
除非另有说明,否则预想本发明式(I)的化合物也包括其立体异构体、互变异构体或药学上可接受的盐或溶剂化物。
如本申请中所用,术语“药学上可接受的盐”是指式(I)化合物的衍生物,其中通过将任何游离酸或碱性基团(如果存在的话)用常规预期为药学上可接受的任何碱或酸转化为相应的加成盐,适当修饰母体化合物。
因此,所述盐的合适实例可包括碱性残基如氨基的无机或有机酸加成盐,以及酸残基如羧基的无机或有机碱加成盐。
可适用于制备盐的无机碱的阳离子包括碱金属或碱土金属如钾、钠、钙或镁的离子。
通过使起碱作用的主要化合物与无机或有机酸反应形成盐而获得的盐包括例如盐酸、氢溴酸、硫酸、磷酸、甲磺酸、樟脑磺酸、乙酸、草酸、马来酸、富马酸、琥珀酸和柠檬酸的盐。
术语“溶剂化物”意指本发明的化合物与一个或多个溶剂分子(无论是有机的还是无机的)的物理结合。这种物理结合包括氢键合。在某些情况下,溶剂化物将能够分离,例如,当一个或多个溶剂分子掺入结晶固体的晶格中时。溶剂化物可以包含化学计量或非化学计量的溶剂分子。
术语“立体异构体”是指相同组成的异构体,其原子的空间排列不同。对映异构体和非对映异构体是立体异构体的实例。
术语“对映异构体”是指彼此为镜像且不可重叠的一对分子结构之一。
术语“非对映异构体”是指不是镜像的立体异构体。
术语“外消旋体”或“外消旋混合物”是指由等摩尔量的两种对映体结构组成的组合物,其中所述组合物不含旋光性。
符号“R”和“S”表示手性碳原子周围的取代基的构型。异构描述符号“R”和“S”如本申请中所述用于表示相对于核心分子的原子构型,并且预想如文献中所定义的那样使用(IUP AC Recommendations 1996,Pure and Applied Chemistry,68:2193-2222(1996))。
术语“互变异构体”是指化合物的两种或更多种异构体中的每一种,其以平衡的方式一起存在并且通过分子内的原子或基团的迁移而容易地互换。
如本申请中所用,术语“卤素”或“卤原子”或“卤代”包括氟、氯、溴和碘原子。
术语“(Cx-Cy)烷基”,其中x和y为整数,是指具有x-y个碳原子的直链或支链烷基。因此,例如,当x为1且y为6时,该术语包括甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、正戊基和正己基。
表述“(Cx-Cy)卤代烷基”,其中x和y为整数,是指上文定义的“Cx-Cy烷基”,其中一个或多个氢原子被一个或多个卤素原子(其可以相同或不同)替代。因此,所述“(Cx-Cy)卤代烷基”基团的实例可以包括卤代的、多卤代的和完全卤代的烷基基团,其中所有氢原子被卤素原子替代,例如三氟甲基。
术语“芳基”是指单环碳环系统,其中环是芳族的。合适的芳基单环环系的实例包括例如苯基。
术语“杂芳基”是指包含有一个或多个选自S、N和O的杂原子的5至12个环原子的单环或双环芳族环系,并且包括具有两个这样的单环,或一个这样的单环和一个单环芳基环的基团,其通过共用键稠合。杂芳基的实例为吡啶基、嘧啶基、咪唑基、吡唑基、三唑基、噁唑基、噁二唑基、噻唑基、噻二唑、吲唑基、苯并[d][1,2,3]三唑基、咪唑并[1,5-a]吡啶基、吡唑并[3,4-b]吡啶基、吡唑并[4,3-b]吡啶基和四唑并[1,5-a]吡啶基。
单环杂芳基的具体实例为嘧啶基和吡啶基。
双环杂芳基的具体实例为咪唑并[1,2-a]吡啶基、1H-吡咯并[2,3-b]吡啶基、吡唑并[1,5-a]嘧啶基、1H-吲唑基、吲唑基、苯并[d]噻唑基。
术语“杂环烷基”是指包含一个或多个选自N、S或O的杂原子的3-10个环原子的饱和或部分不饱和单环或双环环系。在具体的实施方案中,杂环烷基是包含一个或多个选自N、S或O的杂原子的7-9个环原子的部分不饱和双环环系。双环部分不饱和杂环烷基的具体实例为4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]嘧啶基。
术语“(Cx-Cy)环烷基”,其中x和y为整数,是指具有x至y个环碳原子的单价饱和单环或双环烃基。在具体实施方案中,环烷基是指3至8个环碳原子的一价饱和单环烃基。双环意指由共有一个或多个碳原子的两个饱和碳环组成。特别的环烷基是单环的。单环环烷基的实例是环丙基、环丁基、环戊基、环己基或环庚基。
术语“-O(Cx-Cy)环烷基”,其中x和y为整数,是指上文所定义的“(Cx-Cy)环烷基”基团,其中碳原子与氧原子连接。实例包括例如环丙氧基。
术语“(Cx-Cy)氨基烷基”,其中x和y为整数,是指如上所定义的“(C1-C6)烷基”,其中一个或多个氢原子被一个或多个氨基替代。
在本申请中结构式中使用的指向波浪线或波浪线的键,例如
Figure BDA0003960532040000111
描述作为部分或取代基与核心或骨架结构的连接点的键。
不在两个字母或符号之间的破折号(“-”)意指表示取代基的连接点。
在本申请中羰基优选表示为-C(O)-,作为其他常见表示如-CO-、-(CO)-或-C(=O)-的替代表示。
通常,括号内的基团是不包括在链中的侧基,并且当认为有用时,使用括号来帮助消除线性化学式的歧义;例如,磺酰基-SO2-也可以表示为-S(O)2-以消除例如关于亚磺酰基-S(O)O-的歧义。
每当碱性氨基或季铵基团存在于式(I)的化合物中时,可以存在生理学上可接受的阴离子,其选自氯离子、溴离子、碘离子、三氟乙酸根、甲酸根、硫酸根、磷酸根、甲磺酸根、硝酸根、马来酸根、乙酸根、柠檬酸根、富马酸根、酒石酸根、草酸根、琥珀酸根、苯甲酸根、对甲苯磺酸根、双羟萘酸根和萘二磺酸根。同样,在酸性基团如COOH基团的存在下,也可以存在相应的生理阳离子盐,例如包括碱金属或碱土金属离子。
术语“半数最大抑制浓度”(IC50)表示在体外获得生物过程的50%抑制所需的特定化合物或分子的浓度。IC50值可以被对数转换为pIC50值(-log IC50),其中较高的值表示指数更大效力。IC50值不是绝对值,而是取决于实验条件,例如所用的浓度。可以使用Cheng-Prusoff方程(Biochem.Pharmacol.(1973)22:3099)将IC50值转化为绝对抑制常数(Ki)。
如上所述,本发明涉及如下文详细描述的由式(I)表示的一系列化合物,其对受体DDR1和DDR2具有抑制活性。
有利地,拮抗受体DDRI和DDR2二者可在治疗其中DDR受体在发病机理中起相关作用的那些疾病(例如纤维化和由纤维化引起的疾病、障碍和病症)中特别有效。
本发明的式(I)的化合物能够以实质性且有效性的方式充当DDR1和DDR2受体二者的拮抗剂,本领域技术人员在寻找可用于治疗纤维化,特别是特发性肺纤维化的合适且有效的化合物时特别理解这一点。
如实验部分所示,事实上,本发明的式(I)的化合物对受体DDR1和DDR2均具有活性,如表2中所示,其中对于每种化合物,报告了表示为抑制常数(Ki)的效力。
可以理解,根据表2的本发明的化合物在对受体DDR1和DDR2的抑制活性方面显示出低于约1000nM,甚至对于大部分化合物低于300nM的显著效力,这证实它们能够拮抗主要涉及纤维化和由纤维化引起的疾病的DDR受体的两种同工型。
此外,根据基于细胞的测定,本发明的一些化合物关于其对DDR1和DDR2受体的抑制活性根据效力(IC50)在表4中进行了分类。
因此,在寻找可用于治疗纤维化,特别是特发性肺纤维化的合适且有效的化合物时,本领域技术人员特别理解本发明的化合物。
因此,在一方面,本发明涉及作为DDR1和DDR2拮抗剂的式(I)的化合物
Figure BDA0003960532040000131
其中
L和L1不同且独立地选自-C(O)和NH;L2不存在或NH,其中当L和L2均为NH时,L1为-C(O);
Z不存在或选自-CH2和-C(O);
R1为H或选自-O(C1-C4)烷基、
Figure BDA0003960532040000132
n为1-3的整数,
R选自(C1-C4)烷基、卤素、(C1-C4)卤代烷基和(C3-C6)环烷基;
R2选自杂芳基和杂环烷基,其中所述杂芳基和杂环烷基各自就可以任选地被一个或多个-C(O)NHR6、-CN、(C1-C4)烷基、卤素、-NHC(O)R6、杂芳基和-NR7R8取代;
R3选自(C1-C4)烷基、(C1-C4)卤代烷基、(C3-C6)环烷基和-O(C1-C4)卤代烷基;
R4为H或选自(C1-C4)烷基、卤素和(C3-C6)环烷基;
R5为H或选自(C1-C4)烷基和杂芳基(C1-C4)烷基-;
R6为H或(C1-C4)烷基;
R7和R8每次出现时独立地为H或选自(C1-C4)烷基、(C3-C8)环烷基、(C1-C6)卤代烷基和卤素;
及其药学上可接受的盐。
在一个优选的实施方案中,本发明涉及通式(I)的化合物
Figure BDA0003960532040000141
其中
L和L1不同且独立地选自-C(O)和NH;L2不存在或NH;
Z不存在或选自-CH2和-C(O);
R1选自-O(C1-C4)烷基、
Figure BDA0003960532040000142
n为1;
R选自(C1-C4)烷基和卤素;
R2选自杂芳基和杂环烷基,其中所述杂芳基和杂环烷基各自可以任选地被一个或多个-C(O)NHR6和CN取代;
R3选自(C1-C4)卤代烷基和-O(C1-C4)卤代烷基;
R4为H;
R5为H或选自(C1-C4)烷基和杂芳基(C1-C4)烷基-;
R6为H或(C1-C4)烷基;
及其药学上可接受的盐。
在另一个优选的实施方案中,本发明涉及通式(I)的化合物,其中R1位于相对于该分子的其余部分的间位上,n为1,L2不存在,且R4为H,该化合物由式(Ia)表示,
Figure BDA0003960532040000143
其中
L和L1不同且独立地选自-C(O)和NH;Z不存在或选自-CH2和-C(O);
R1选自-O(C1-C4)烷基、
Figure BDA0003960532040000151
n为1;
R为(C1-C4)烷基;
R2选自杂芳基和杂环烷基,其中所述杂芳基和杂环烷基各自可以任选地被一个或多个-C(O)NHR6和CN取代;
R3为(C1-C4)卤代烷基;
R5为H或选自(C1-C4)烷基和杂芳基(C1-C4)烷基-;
R6为H或(C1-C4)烷基;
及其药学上可接受的盐。
在另一个优选的实施方案中,R2选自嘧啶基、吡啶基、咪唑并[1,2-a]吡啶基、1H-吡咯并[2,3-b]吡啶基、吡唑并[1,5-a]嘧啶基、1H-吲唑基、吲唑基、4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]嘧啶基和苯并[d]噻唑基。
在另一个优选的实施方案中,本发明涉及通式(Ia)的化合物,其中L和L1不同且独立地选自-C(O)和NH;
Z不存在或选自-CH2和-C(O);
R1选自-OCH3
Figure BDA0003960532040000152
n为1;
R选自甲基、乙基、丙基和异丙基;
R2选自嘧啶基、吡啶基、咪唑并[1,2-a]吡啶基、1H-吡咯并[2,3-b]吡啶基、吡唑并[1,5-a]嘧啶基、1H-吲唑基、吲唑基、4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]嘧啶基和苯并[d]噻唑基,其中所述杂芳基和杂环烷基各自可以任选地被一个或多个-C(O)NHR6和CN取代;
R3为三氟甲基;
R5为H或选自甲基、乙基和3-甲基咪唑并[1,2-a]吡啶基;
R6为H或甲基;
及其药学上可接受的盐。
根据优选的实施方案,本发明涉及下表1中列出的化合物的至少一种;如表2中所示,那些化合物对DDR1和DDR2受体具有活性。
表1式(I)的优选化合物列表
Figure BDA0003960532040000161
Figure BDA0003960532040000171
Figure BDA0003960532040000181
Figure BDA0003960532040000191
Figure BDA0003960532040000201
Figure BDA0003960532040000211
Figure BDA0003960532040000221
Figure BDA0003960532040000231
在另一个优选的实施方案中,本发明涉及通式(Ia)的化合物,其中R1
Figure BDA0003960532040000232
该化合物由通式(Ib)表示,
Figure BDA0003960532040000241
其中
L和L1不同且独立地选自-C(O)和NH;
Z不存在或选自-CH2和-C(O);
R为(C1-C4)烷基;
R2选自杂芳基和杂环烷基,其中所述杂芳基和杂环烷基各自可以任选地被一个或多个-C(O)NHR6和CN取代;
R3为(C1-C4)卤代烷基;
R5为H或选自(C1-C4)烷基和杂芳基(C1-C4)烷基-;
R6为H或(C1-C4)烷基;
及其药学上可接受的盐。
在另一个优选的实施方案中,本发明涉及式(Ib)的化合物,其中L和L1不同且独立地选自-C(O)和NH;
Z不存在或为C(O);
R为甲基或丙基;
R2选自咪唑并[1,2-a]吡啶基、嘧啶基、吡啶基、1H-吡咯并[2,3-b]吡啶基、吡唑并[1,5-a]嘧啶基、1H-吲唑基、苯并[d]噻唑基和4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]嘧啶基、其中所述杂芳基和杂环烷基各自可以任选地被一个或多个-C(O)NHR6和CN取代;
R3为三氟甲基;
R5为H或乙基;
R6为甲基。
在另一个优选的实施方案中,本发明涉及式(Ia)的化合物,其中R1
Figure BDA0003960532040000251
该化合物由通式(Ic)表示,
Figure BDA0003960532040000252
其中
L和L1不同且独立地选自-C(O)和NH;
Z不存在或选自-CH2和-C(O);
R为(C1-C4)烷基;
R2选自选自杂芳基和杂环烷基,其中所述杂芳基和杂环烷基各自可以任选地被一个或多个-C(O)NHR6和CN取代;
R3为(C1-C4)卤代烷基;
R5为H或选自(C1-C4)烷基和杂芳基(C1-C4)烷基-;
R6为H或(C1-C4)烷基;
及其药学上可接受的盐。
在另一个优选的实施方案中,本发明涉及式(Ic)的化合物,其中L和L1不同且独立地选自-C(O)和NH;
Z不存在或选自-CH2和-C(O);
R选自甲基、丙基和异丙基;
R2选自咪唑并[1,2-a]吡啶基、嘧啶基、吡啶基、1H-吡咯并[2,3-b]吡啶基和吡唑并[1,5-a]嘧啶基,其中所述杂芳基和杂环烷基各自可以任选地被一个或多个-C(O)NHR6取代;
R3为三氟甲基;
R5为H或3-甲基咪唑并[1,2-a]吡啶基;
R6为甲基;
及其药学上可接受的盐。
在另一个实施方案中,本发明涉及通式(I)的化合物,其中L2不存在,n为1,R1为-O(C1-C4)烷基且位于相对于L1的对位上,且R4为H,该化合物由通式(Id)表示
Figure BDA0003960532040000261
其中
L和L1不同且独立地选自-C(O)和NH;
Z不存在或选自-CH2和-C(O);
R为(C1-C4)烷基;
R2选自选自杂芳基和杂环烷基,其中所述杂芳基和杂环烷基各自可以任选地被一个或多个-C(O)NHR6和CN取代;
R3为(C1-C4)卤代烷基;
R5为H或选自(C1-C4)烷基和杂芳基(C1-C4)烷基-;
R6为H或(C1-C4)烷基;
及其药学上可接受的盐。
在另一个实施方案中,本发明涉及式(Id)的化合物,其中L和L1不同且独立地选自-C(O)和NH;
Z不存在或选自-CH2和-C(O);
R选自甲基、丙基和异丙基;
R2选自咪唑并[1,2-a]吡啶基、嘧啶基、吡啶基、1H-吡咯并[2,3-b]吡啶基和吡唑并[1,5-a]嘧啶基,其中所述杂芳基和杂环烷基各自可以任选地被一个或多个-C(O)NHR6取代;
R3为三氟甲基;
R5为H或3-甲基咪唑并[1,2-a]吡啶基;
R6为甲基;
及其药学上可接受的盐。
在另一个实施方案中,本发明涉及通式(Id)的化合物,其中L2不存在,n为1,R1为-OCH3且位于相对于L1的对位上,且R4为H,该化合物由通式(Ie)表示
Figure BDA0003960532040000271
其中
L和L1不同且独立地选自-C(O)和NH;
Z不存在或选自-CH2和-C(O);
R为(C1-C4)烷基;
R2选自选自杂芳基和杂环烷基,其中所述杂芳基和杂环烷基各自可以任选地被一个或多个-C(O)NHR6和CN取代;
R3为(C1-C4)卤代烷基;
R5为H或选自(C1-C4)烷基和杂芳基(C1-C4)烷基-;
R6为H或(C1-C4)烷基;
及其药学上可接受的盐。
在另一个优选的实施方案中,本发明涉及式(Ie)的化合物,其中L和L1不同且独立地选自-C(O)和NH;
Z不存在或选自-CH2和-C(O);
R选自甲基、丙基和异丙基;
R2选自咪唑并[1,2-a]吡啶基、嘧啶基、吡啶基、1H-吡咯并[2,3-b]吡啶基和吡唑并[1,5-a]嘧啶基,其中所述杂芳基和杂环烷基各自可以任选地被一个或多个-C(O)NHR6取代;
R3为三氟甲基;
R5为H或3-甲基咪唑并[1,2-a]吡啶基;
R6为甲基;
及其药学上可接受的盐。
在另一个优选的实施方案中,本发明涉及通式(I)的化合物,其中L2不存在,R4和R5为-H,Z不存在,该化合物由式(If)表示,
Figure BDA0003960532040000281
其中
L为-C(O);L1为-NH;
R1为H或选自-O(C1-C4)烷基和
Figure BDA0003960532040000282
R选自(C1-C4)烷基和卤素;
R2选自
Figure BDA0003960532040000283
R3选自(C1-C4)卤代烷基和-O(C1-C4)卤代烷基;
及其药学上可接受的盐。
在另一个实施方案中,本发明涉及通式(If)的化合物,其中L为-C(O);L1为-NH;
R1为H或选自-OCH3
Figure BDA0003960532040000291
R选自甲基和氟;
R2选自
Figure BDA0003960532040000292
R3选自三氟甲基和三氟甲氧基;
及其药学上可接受的盐。
在还另一个优选的实施方案中,本发明涉及通式(If)的化合物,其中L为-C(O),L1为-NH,R1为H或-OCH3,R选自甲基和氟,R2选自
Figure BDA0003960532040000293
R3为三氟甲基;
及其药学上可接受的盐。
在另一个优选的实施方案中,本发明涉及下表3中列出的化合物的至少一种。如表2和4中所示,那些化合物对受体DDR1和DDR2具有活性。
表3式(If)的优选化合物列表
Figure BDA0003960532040000294
Figure BDA0003960532040000301
本发明的化合物,包括上文列出的所有化合物,可以使用以下一般方法和程序或通过使用本领域普通技术人员容易获得的略微修改的方法由容易获得的原料制备。尽管本申请中可能示出或描述了本发明的特定实施方案,但是本领域技术人员将认识到,本发明的所有实施方案或方面可以使用本申请中所述的方法或通过使用其他已知的方法、试剂和原料来获得。当给出典型或优选的工艺条件(即反应温度、时间、反应物的摩尔比、溶剂、压力等)时,也可以使用其他工艺条件,另有说明的除外。虽然最佳反应条件可以根据所用的特定反应物或溶剂的不同而变化,但是本领域技术人员可以通过常规优化方法容易地确定这些条件。
因此,下文所述和以下方案中所报道的方法不应被视为限制可用于制备本发明化合物的合成方法的范围。
在一些情况下,根据化学的一般原理(Protective group in organicsyntheses,第3版T.W.Greene,P.G.M.Wuts),当需要掩蔽或保护敏感或反应性部分时,可以使用通常已知的保护基(PG)。
如下所述和以下方案中所报道的制备方法不应被视为限制可用于制备本发明化合物的合成方法的范围。
式(I)的化合物,包括上文列出的所有化合物,通常可以根据以下方案中所示的方法制备。如果某个具体合成步骤与一般方案中描述的不同时,其已在具体实施例和/或另外的方案中详细描述。
式(I)的化合物包含至少一个立体原性中心,该中心在下图中用星号*标记。
Figure BDA0003960532040000311
对映体纯的化合物可以通过手性色谱法由相应的外消旋体制备。每当在式(I)化合物中存在两个或更多个立体中心时,则该结构的特征在于不同的立体异构体。立体化学纯的化合物可以通过手性分离获得,或逐步通过非对映异构体的色谱分离,随后进一步手性分离成单一立体异构体。
式(I)的化合物可以根据下文所述的方案1制备,从而提供了用于制备所有实施例的至少一种非限制性合成途径。
方案1
Figure BDA0003960532040000321
根据方案1,中间体III可以通过X1与X2之间的最具反应性离去基上的钯催化的交叉偶联由中间体II获得,其中X1和X2可以为例如氯、溴、碘、OMs或OTs。例如,该反应可以通过使双卤化芳基中间体II与烷基硼酸或烷基三氟硼酸钾按照经典的Suzuki程序,在合适的有机溶剂如二噁烷或THF中,在无机碱如K2PO4或碳酸铯存在下,用合适的钯催化体系如Pd2(dppf)Cl2或另一种钯源/基于膦的配体,在高温(约100℃)下反应几小时来进行。
可以使用例如叔丁醇钾或甲醇钠作为促进剂,在合适的有机溶剂如THF或二噁烷中,在室温下持续几小时,在中间体III与中间体IXa之间进行酯的直接酰胺化(氨解),获得中间体IV。
在不同的方法中,可以在合适的酰胺偶联反应条件下从中间体IX开始通过一步合成来制备中间体IV。例如,可以在活化剂如COMU或HATU存在下,使中间体IX和IXa与有机碱如DIPEA或TEA,在合适的有机溶剂如DCM或DMF中,并且在一般约室温的温度下反应几小时至过夜。
当R4=H时,可以从中间体IV开始进行芳基卤化物的钯催化还原羰基化以制备中间体V。例如,甲酸或甲酰基糖精可以用作CO源,硅烷或甲酸本身用作氢供体,合适的钯催化体系如乙酸钯/Ph3P或乙酸钯/双(二苯基膦基)丁烷或另一种钯源/基于膦的配体、TEA或Na2CO3作为碱,在合适的溶剂如甲苯或DMF中,在60至100℃的温度下几小时。
或者,可以如对中间体IV的制备所述,在合适的酰胺偶联反应条件下,由中间体XX制备中间体V。中间体V也可以由中间体XX如下制备:在合适的溶剂如DCM中,使用例如亚硫酰氯或草酰氯,将其转化为酰氯XXI,随后在合适的溶剂如DCM或DMF中,在室温下,使用合适的碱如DIPEA或TEA进行酰胺偶联。
在不同的方法中,当R=CHF2时,可以由中间体XXV通过例如酯水解,使用LiOH,在合适的溶剂如THF或二噁烷中,在室温下制备中间体XX。
可以在合适的溶剂如DCM中应用例如臭氧流并进行合适的还原后处理,例如使用Ph3P或Me2S,在合适的温度(例如零度)下,经由臭氧分解获得中间体XXV。
中间体XXII的脱氧氟化以得到中间体XXIII可以在溶剂如DCM或DMF中,在氟化剂如DAST或Deoxo-Fluor试剂的存在下,在合适的温度如室温下进行。可以通过使卤化物-芳基中间体XXIII(其中卤化物是X3)与烷基硼酸或烷基三氟硼酸钾按照经典的Suzuki程序在合适的有机溶剂如二噁烷或THF中,在无机碱如K2PO4或碳酸铯存在下,与合适的钯催化体系如Pd2(dppf)Cl2或另一种钯源/基于膦的配体在高温(约100℃)反应几小时反应以得到中间体XXIV,进行Pd催化的交叉偶联。中间体V与胺R2-NH2(当R4=H时)的还原胺化得到中间体VII,可以在溶剂如1,2-二氯乙烷或DCM中,在还原剂如NaBH3CN或Na(OAc)3BH存在下,在室温下进行。
不同地,中间体VII可以经由两步合成制备,其中首先使中间体V与胺R2-NH2在合适的溶剂如1,2-二氯乙烷、DCM或甲苯中在室温下或在回流下(如果需要的话)反应来形成亚胺中间体VI。脱水剂的存在可以有助于形成亚胺,然后通过加入如上所述的还原剂将其转化为VII。
当R4=烷基或环烷基时,中间体VI也可用于制备中间体VII,其通过在78℃至室温的温度下1,2-加成合适的有机金属试剂如格氏试剂或有机锂试剂来进行。
在另一种方法中,中间体VII(当R4=烷基或环烷基时)可以如下制备:将中间体V转化为胺中间体VIII,用氨源(如乙酸铵或氨溶液)和还原剂(如NaBH3CN或NaBH4),在合适的溶剂(如MeOH或EtOH)中,在室温至50℃的温度下进行还原氨基化。然后中间体VIII可以与卤化物或三氟甲磺酸酯R2-X(当R2=杂芳基时),在合适的有机溶剂如二噁烷或甲苯中,在无机碱如K2PO4或碳酸铯的存在下,用合适的钯催化体系如Pd(dba)2/RuPhos或另一种钯源/基于膦的配体,在高温(约100℃)下进行Buchwald-Hartwig交叉偶联反应几小时至过夜的时间段。
或者,R2-X的离去基团(当R2=杂芳基时)被中间体VIII的胺基的Ipso-取代以得到中间体VII,可以在高沸点有机溶剂如DMSO或DMA中,在等于或高于100℃的温度下,并且在无机碱如tBuOK或K2CO3的存在下进行。
当R5=H时,中间体VII无需进一步反应以转化成化合物I。
当R5不为H且Z不存在或为CH2时,中间体VII可以通过用烷醛R5-CHO的还原氨基化转化为式(I)的化合物,所述还原氨基化以与从中间体V制备中间体VII所述的类似方式进行。
或者,可以根据下文所述的方案2制备式(I)的化合物,其提供了用于制备所有实施例的至少一种非限制性合成途径。
方案2
Figure BDA0003960532040000351
根据方案2,中间体XVIII可以如下转化为中间体XV:通过Negishi、Stille或Suzuki交叉偶联进行芳基溴的Pd催化烷基化,使XVIII与烷基锌卤化物或烷基锡烷在合适的有机溶剂如THF或甲苯的存在下,用合适的钯催化体系如Pd(OAc)2/CPhos或另一种钯源/基于膦的配体在高温(约100℃)下反应几小时至过夜的时间段。
或者,中间体XV可以通过中间体XVII来制备,中间体XVII按照Suzuki方案从中间体XVIII开始获得,使用例如烯基硼酸或乙烯基三氟硼酸酯与合适的钯催化体系如PdCl2(dppf),在无机碱如TEA或碳酸铯的存在下,在合适的溶剂如二噁烷或iPrOH中,在高温(约100℃)持续几小时至过夜的时间段。然后可以通过在氢气气氛下在合适的催化剂(例如Pd/C)存在下在合适的溶剂(例如但不限于EtOH)中在室温还原几小时,将中间体XVII转化为中间体XV。
在不同的方法中,中间体XV可以由中间体XVI获得,使用例如氰化锌,在合适的溶剂如DMF或DMA和合适的Pd催化剂如Pd(PPh3)4或Xantphos-PdCl2中,在高温(约100℃)下,进行芳基卤化物的Pd催化氰化。
中间体XV的催化氢化得到中间体XIV可以在氢气气氛下使用例如阮内镍或二氧化铂和氨或KOH在合适的溶剂如MeOH或iPrOH中在室温下进行。
中间体XIV可以转化为中间体XIII,当Z不存在时,使用卤化物或三氟甲磺酸酯R2-X(当R2=杂芳基时),在合适的有机溶剂如二噁烷或甲苯中,在无机碱如K2PO4或碳酸铯存在下,用合适的钯催化体系如Pd(dba)2/RuPhos或另一种钯源/基于膦的配体,在高温(约100℃)下进行Buchwald-Hartwig交叉偶联反应数小时至过夜的时间段。当Z=CO时,酰胺偶联可以使用活化剂如COMU或HATU,与有机碱如DIPEA或TEA在合适的有机溶剂如DCM或DMF中,并且在一般约室温的温度下,进行几小时至过夜的时间段。
使用无机碱如LiOH或Ba(OH)2,在有机溶剂如THF和/或甲醇与水的混合物中,一般在室温下,持续1小时至过夜的时间段,中间体XIII酯水解可以得到中间体XII。中间体XII可以通过与胺IXa的酰胺偶联反应转化为中间体VII,使用活化剂如BTFFH或T3P,与有机碱如DIPEA或TEA,在合适的有机溶剂如DCM或DMF中,并且在一般约室温的温度下,持续几小时至过夜的时间段。
使用例如叔丁醇钾或甲醇钠作为促进剂,在合适的有机溶剂如THF或二噁烷中,在室温下反应几小时,可以在中间体XIII与中间体IXa之间进行酯的直接酰胺化(氨解),以得到中间体VII。
当R5=H时,中间体VII无需进一步反应以转化成式(I)的化合物。
中间体VII可以转化为式(I)的化合物,当R5不为H并且Z为CO时,在合适的溶剂如DMSO或DMF中,使用例如烷基卤化物或烷基三氟甲磺酸酯R5-X与合适的碱如KOH或NaH对酰胺氮进行烷基化。
在不同的方法中,可以根据下文所述的方案3制备式(I)的化合物,其提供了用于制备全部实施例的至少一种非限制性合成途径。
方案3
Figure BDA0003960532040000371
根据方案3,可以以与从中间体V制备中间体VII所述类似的方式,使用杂芳基醛R2-CHO,通过还原氨基化将中间体VIII转化为中间体VII。
可以以与上述制备中间体XIII类似的方式从中间体VIII开始进行Buchwald-Hartwig氨基化,获得中间体VII(当Z不存在时)。
或者,中间体VII可以如下制备:使中间体VIII和氟芳基R2-X反应,使用例如LiOH作为碱,在合适的高沸点溶剂如DMF中,在室温至100℃的温度下进行ipso-取代。
以与上述制备中间体XIV类似的方式进行中间体XI上的氰基的催化氢化,可以得到中间体VIII。当L=NH且L2不存在时,中间体XI可以通过使用中间体X和羧酸Xa以与上述制备中间体XIII类似的方式进行酰胺偶联来获得。
当L2=NH时,中间体XI可以在两步法中制备,其使用对硝基氯甲酸酯与合适的碱例如吡啶或TEA在合适的溶剂例如DCM中在室温下形成对硝基氨基甲酸酯,然后使用胺IXa、合适的溶剂如DCM或DMF和碱如DIPEA或TEA在室温下形成脲。
在不同的方法中,当L2=CO时,中间体XI可以经由与中间体IXa的酰胺偶联以与上述制备中间体XIII类似的方式直接从中间体XIX获得。
在另一种替代方法中,中间体XI可以经由Pd催化的氰化由中间体IV以与上述制备中间体XV类似的方式制备。
当R5=H时,中间体VII无需进一步反应以转化为式(I)的化合物。
当R5不为H且Z为CO时,中间体VII可以转化为式(I)的化合物,使用例如烷基卤化物或烷基三氟甲磺酸酯R5-X与合适的碱如KOH或NaH在合适的溶剂如DMSO或DMF中对酰胺氮进行烷基化。
或者,当R5不为H且Z不存在或为CH2时,中间体VII可以经由用与从中间体V制备中间体VII所述类似的方式进行的用烷基醛R5-CHO的还原氨基化,转化为式(I)的化合物。
如上所述,本发明的式(I)的化合物可以通过使用由式VII和VIII的化合物表示的共同中间体便利地进行制备。
在另一方面,本发明涉及式VIII的化合物
Figure BDA0003960532040000381
其中R,R1,R3和R4如上所示。
在另一方面,本发明涉及式VII的化合物
Figure BDA0003960532040000391
其中Z不存在,为CH2或-C(O),R、R1、R2、R3和R4如上所示。
在另一方面,本发明涉及化合物VII作为制备式(I)的化合物的中间体的用途,其中Z不存在,为CH2或-C(O),且R、R1、R2、R3和R4如上所示。
在另一方面,本发明涉及化合物VIII作为制备式(I)的化合物的中间体的用途。
令人惊讶地发现,本发明的式(I)化合物有效地抑制受体DDR1和DDR2二者。有利地,受体DDR1和DDR2的抑制可以导致其中涉及DDR受体的疾病或病症的有效治疗。
特别是在这方面,现在已经发现,本发明的式(I)的化合物具有表示为对DDR1和DDR2的抑制常数(Ki)的拮抗剂药物效力,如本申请实验部分中所示,其显示出低于1000nM的Ki值,并且对于本发明的绝大部分化合物,Ki甚至低于300nM。优选地,本发明的化合物对DDR1和DDR2具有小于或等于30nM的Ki。
此外,已经发现,本发明的一些式(I)化合物对DDR1和DDR2具有表示为IC50的抑制性药物效力,其IC50低于15nM且甚至更优选低于10nM。
在一方面,本发明涉及用作药物的式(I)化合物。
在一个优选的实施方案中,本发明涉及式(I)的化合物,其用于治疗与DDR受体机制相关的病症。
在另一个实施方案中,本发明涉及式(I)的化合物,其用于治疗与DDR受体相关的疾病、障碍或病症。
在一个实施方案中,本发明涉及式(I)的化合物,其可用于预防和/或治疗纤维化和/或涉及纤维化的疾病、障碍或病症。
如本申请中所用,术语“纤维化”或“纤维化病症”是指与细胞和/或纤连蛋白和/或胶原蛋白的异常蓄积和/或成纤维细胞募集增加相关的病症,并且包括但不限于个体器官或组织如心脏、肾、肝、关节、肺、胸膜组织、腹膜组织、皮肤、角膜、视网膜、肌肉骨骼和消化道的纤维化。
优选地,本发明的式(I)的化合物可用于治疗和/或预防纤维化,例如肺纤维化、特发性肺纤维化(IPF)、肝纤维化、肾纤维化、眼纤维化、心脏纤维化、动脉纤维化和系统性硬化症。更优选地,本发明的式(I)的化合物可用于治疗IPF。
在一方面,本发明还涉及用于预防和/或治疗与DDR受体机制相关的病症的方法,所述方法包括向需要这种治疗的患者施用治疗有效量的式(I)的化合物。
在另一方面,本发明涉及本发明的式(I)的化合物用于治疗与DDR受体机制相关的病症的用途。
在一方面,本发明涉及式(I)的化合物在制备用于治疗与DDR受体机制相关的病症的药物中的用途。
在另一方面,本发明涉及用于预防和/或治疗与DDR受体1和受体2失调相关的障碍或病症的方法,其向需要这种治疗的患者施用治疗有效量的式(I)的化合物。
在另一方面,本发明涉及式(I)的化合物用于治疗与DDR受体1和受体2失调相关的疾病、障碍或病症的用途。
如本申请中所用,关于式(I)化合物或其药学上可接受的盐或其他药物-活性剂的“安全和有效的量”意指足以治疗患者病症但低以足够避免严重副作用的化合物的量,并且其仍然可以由本领域技术人员通过常规方法确定。
式(I)的化合物可以一次施用或根据给药方案施用,其中在给定的一段时间期限内以不同的时间间隔施用多个剂量。典型的日剂量可以根据所选择的施用途径的不同而变化。
本发明还涉及药物组合物,其包含与至少一种或多种药学上可接受的载体或赋形剂混合的式(I)化合物。
在一个实施方案中,本发明涉及式(I)化合物与一种或多种药学上可接受的载体或赋形剂混合的药物组合物,所述载体或赋形剂例如在Remington’s PharmaceuticalSciences Handbook,XVII Ed.,Mack Pub.,N.Y.,U.S.A中所述的那些。
本发明化合物及其药物组合物的施用可以根据患者需要完成,例如通过口服、鼻内、肠胃外(皮下、静脉内、肌内、胸骨内和通过输注)和通过吸入。
优选地,本发明的化合物通过口服或吸入施用。
在一个优选的实施方案中,包含式(I)化合物的药物组合物为固体口服剂型,例如片剂、软胶囊、胶囊、胶囊形片剂、颗粒、锭剂和散装粉末。
在一个实施方案中,包含式(I)化合物的药物组合物为片剂。
本发明的化合物可以单独施用或与各种药学上可接受的载体、稀释剂(例如蔗糖、甘露糖醇、乳糖、淀粉)和已知的赋形剂组合施用,所述赋形剂包括助悬剂、增溶剂、缓冲剂、粘合剂、崩解剂、防腐剂、着色剂、矫味剂、润滑剂等。
在另一个实施方案中,包含式(I)化合物的药物组合物为液体口服剂型,例如水溶液和非水溶液、乳剂、混悬剂、糖浆剂和酏剂。此类液体剂型还可以包含合适的已知惰性稀释剂(例如水)和合适的已知赋形剂(例如防腐剂、润湿剂、甜味剂、调味剂)以及用于乳化和/或悬浮本发明化合物的试剂。
在另一个实施方案中,包含式(I)化合物的药物组合物为可吸入制剂,例如可吸入粉末、含推进剂的计量气雾剂或不含推进剂的可吸入制剂。
对于作为干粉施用,可以使用现有技术已知的单剂量或多剂量吸入器。在这种情况下,可以将粉末填充在明胶、塑料或其他胶囊、药筒或泡罩包装中或储存器中。
可以将对本发明化合物呈化学惰性的稀释剂或载体,例如乳糖或适于改善可吸入分数的任何其他添加剂加到粉末状的本发明化合物中。
包含推进剂气体如氢氟烷烃的吸入气雾剂可以包含溶液或分散形式的本发明化合物。推进剂驱动的制剂还可以包含其他成分,例如共溶剂、稳定剂和任选的其他赋形剂。
包含本发明化合物的不含推进剂的可吸入制剂可以是在水、醇或水醇介质中的溶液或混悬液的形式,并且它们可以通过现有技术已知的喷射或超声雾化器或通过软雾雾化器递送。
本发明的化合物可以作为唯一的活性剂或与其他药物活性成分组合施用。
本发明化合物的剂量取决于多种因素,其中包括待治疗的具体疾病、症状的严重程度、施用途径等。
本发明还涉及包含药物组合物的装置,该药物组合物包含根据本发明的式(I)的化合物,该装置呈单剂量或多剂量干粉吸入器或定量吸入器的形式。
上文对于式(I)化合物所述的所有优选基团或实施方案可以彼此组合,并且进必要的调整也可以彼此适用。
本申请中描述的本发明的各方面通过以下实施例进行说明,这些实施例不意味着以任何方式限制本发明。
中间体和实施例的制备
化合物的化学名称使用PerkinElmer ChemDraw Professional 18.1的StructureTo Name Place IUPAC Name产生。
本发明的化合物可以使用以下一般方法和程序或通过使用本领域普通技术人员容易获得的其他信息由容易获得的原料制备。尽管本申请中可能显示或描述了本发明的特定实施方案,但是本领域技术人员将认识到,本发明的所有实施方案或方面可以使用本申请中所述的方法或通过使用本领域技术人员已知的其他方法、试剂和原料来制备。还应当理解,在给出典型或优选的工艺条件(即,反应温度、时间、反应物的摩尔比、溶剂、压力等)的情况下,除非另有说明,否则也可以使用其他工艺条件。虽然最佳反应条件可以根据所用的特定反应物或溶剂而变化,但是本领域技术人员可以通过常规优化方法容易地确定这些条件。
缩写
Et3N=三乙胺;TEA=三乙胺;HATU=(二甲基氨基)-N,N-二甲基(3H-[1,2,3]三唑并[4,5-b]吡啶-3-基氧基)甲胺鎓六氟磷酸盐;DAST=三氟化二乙氨基硫;DMAP=4-二甲基氨基吡啶;DMF=二甲基甲酰胺;Me2S或(CH3)2S=甲基硫;MnO2=二氧化锰(IV);EtOAc=乙酸乙酯;RT=室温;THF=四氢呋喃;DCM=二氯甲烷;MeOH=甲醇;LCMS=液相色谱法/质谱法;HPLC=高压液相色谱法;TLC=薄层色谱法;d-DMSO=氘代二甲亚砜;CDCl3=氘代氯仿;NMR=核磁共振;DIPEA=N,N-二异丙基乙胺;UPLC=超高效液相色谱法;tBu XPhos=2-二叔丁基膦基-2′,4′,6′-三异丙基联苯;Pd2(dba)3=三(二亚苄基丙酮)二钯(0);iPrOH=异丙醇;PdCl2(dppf)=[1,1′-双(二苯基膦基)二茂铁]二氯钯(II);atm=大气压;RuPhos=2-二环己基膦基-2′,6′-二异丙氧基联苯;Pd(dba)2=双(二亚苄基丙酮)钯(0);BINAP=(±)-2,2′-双(二苯基膦基)-1,1′-联萘;STAB=三乙酰氧基硼氢化钠;CPhos=2-二环己基膦基-2′,6′-双(N,N-二甲基氨基)联苯;Pd(OAc)2=乙酸钯(II);AcOH=乙酸;Py=吡啶;T3P=丙膦酸酐;prepHPLC=制备型高压液相色谱法;NaBH4=硼氢化钠;Na2SO4=硫酸钠;BTFFH=氟-二吡咯烷基碳鎓六氟磷酸盐;pTLC=制备型薄层色谱法;FCC=急骤柱色谱法;amu=原子质量单位;tR=保留时间;FA=甲酸
一般实验细节
NMR表征
在Bruker Avance III HD 400MHz或Bruker Fourier 300MHz上记录1H NMR光谱。化学位移报告为相对于作为内标的四甲基硅烷(TMS)的以ppm计的δ值。偶合常数(J值)以赫兹(Hz)给出,并且使用以下缩写报告多重性(s=单峰,d=双峰,t=三重峰,q=四重峰,m=多重峰,br=宽峰,nd=未测定)。
LC/UV/MS分析方法
估计LC/MS保留时间受到±0.5min的实验误差影响。
方法1(LCMS-019-20-80-95-6-1-25-UV-BCM)
仪器:带有DAD检测器/Thermo Scientific MSQ Plus的Dionex UHPLC Ultimate3000
柱:
Figure BDA0003960532040000441
2.6μm XB-C18(4.6x50mm),110A,柱编号00B-4496-E0,内柱编号019
试剂:
甲酸≥98%,Sigma-Aldrich
HPLC UV/梯度级乙腈,Baker
用于LCMS的μQ-水
HPLC条件:
波长范围:(190–340)nm±4nm
流速:1.0ml/min
柱温:25℃
自动采样器温度:20℃
注射体积:2.0μl
分析时间:6min
洗脱:梯度
Figure BDA0003960532040000442
Figure BDA0003960532040000451
流动相A:0.1%v/v甲酸水溶液
流动相B:0.1%v/v甲酸的乙腈溶液
注射器洗涤溶液:20%MeOH
MS条件:
质量范围:100–1000m/z
电离:交替
扫描速度:12000amu/秒
方法2(LCMS-019-10-60-95-6-1-25-UV)
仪器:带有DAD检测器/Thermo Scientific MSQ Plus的Dionex UHPLC Ultimate3000
柱:
Figure BDA0003960532040000452
2.6μm XB-C18(4.6x50mm),110A,柱编号00B-4496-E0,内柱编号019
试剂:
甲酸≥98%,Sigma-Aldrich
HPLC UV/梯度级乙腈,Baker
用于LCMS的μQ-水
HPLC条件:
波长范围:(190–340)nm±4nm
流速:1.0ml/min
柱温:25℃
自动采样器温度:20℃
注射体积:2.0μl
分析时间:6min
洗脱:梯度
时间[min] 流动相A[%] 流动相B[%] 流速[ml/min]
0.0 90 10 1.0
3.35 40 60 1.0
3.75 40 60 1.0
3.9 5 95 1.0
4.75 5 95 1.0
5.0 90 10 1.0
6.0 90 10 1.0
流动相A:0.1%v/v甲酸水溶液
流动相B:0.1%v/v甲酸的乙腈溶液
注射器洗涤溶液:20%MeOH
MS条件:
质量范围:100–1000m/z
电离:交替
扫描速度:12000amu/秒
方法3(LCMS-019-5-80-80-7-1-25-UV-Rot)
仪器:带有DAD检测器/Thermo Scientific MSQ Plus的Dionex UHPLC Ultimate3000
柱:
Figure BDA0003960532040000461
2.6μm XB-C18(4.6x50mm),110A,柱编号OOB-4496-E0,内柱编号019
试剂:
甲酸≥98%,Sigma-Aldrich
HPLC UV/梯度级乙腈,Baker
用于LCMS的μQ-水
HPLC条件:
波长范围:(190–340)nm±4nm
流速:1.0ml/min
柱温:25℃
自动采样器温度:20℃
分析时间:7min
洗脱:梯度
时间[min] 流动相A[%] 流动相B[%] 流速[ml/min]
0.0 95 5 1.0
1.0 95 5 1.0
4.75 20 80 1.0
5.25 20 80 1.0
6.0 95 5 1.0
7.0 95 5 1.0
流动相A:0.1%v/v甲酸水溶液
流动相B:0.1%v/v甲酸的乙腈溶液
注射器洗涤溶液:20%MeOH
MS条件:
质量范围:100–1000m/z
电离:交替
扫描速度:12000amu/秒
方法4(LCMS-019-10-70-95-6-1-25-UV)
仪器:带有DAD检测器/Thermo Scientific MSQ Plus的Dionex UHPLC Ultimate3000
柱:
Figure BDA0003960532040000471
2.6μm XB-C18(4.6x50mm),110A,柱编号00B-4496-E0,内柱编号019
试剂:
甲酸≥98%,Sigma-Aldrich
HPLC UV/梯度级乙腈,Baker
用于LCMS的μQ-水
HPLC条件:
波长范围:(190–340)nm±4nm
流速:1.0ml/min
柱温:25℃
自动采样器温度:20℃
注射体积:2.0μl
分析时间:6min
洗脱:梯度
时间[min] 流动相A[%] 流动相B[%] 流速[ml/min]
0.0 90 10 1.0
3.35 30 70 1.0
3.75 30 70 1.0
3.9 5 95 1.0
4.75 5 95 1.0
5.0 90 10 1.0
6.0 90 10 1.0
流动相A:0.1%v/v甲酸水溶液
流动相B:0.1%v/v甲酸的乙腈溶液
注射器洗涤溶液:20%MeOH
MS条件:
质量范围:100–1000m/z
电离:交替
扫描速度:12000amu/秒
方法5(LCMS-005-1-30-50-10-05-55-UV)
仪器:带有DAD检测器/Thermo Scientific MSQ Plus的Dionex UHPLC Ultimate3000
柱:ACQUITY UPLC BEH C8 1.7μm(2.1x150mm),130A,柱编号186003377,内柱编号005
试剂:
甲酸≥98%,Sigma-Aldrich
HPLC UV/梯度级乙腈,Baker
用于LCMS的μQ-水
HPLC条件:
波长范围:(190–340)nm±4nm
流速:0.5ml/min
柱温:55℃
自动采样器温度:20℃
分析时间:10min
洗脱:梯度
时间[min] 流动相A[%] 流动相B[%] 流速[ml/min]
0.0 99 1 0.5
0.5 99 1 0.5
3.0 70 30 0.5
6.5 50 50 0.5
7.5 20 80 0.5
8.0 20 80 0.5
8.1 99 1 0.5
10.0 99 1 0.5
流动相A:0.1%v/v甲酸水溶液流动相B:0.1%v/v甲酸的乙腈溶液
注射器洗涤溶液:20%MeOH
MS条件:
质量范围:100–1000m/
电离:交替
扫描速度:12000amu/秒
方法6:(LCMS-019-30-80-95-6-1-25-UV)
仪器:带有DAD检测器/Thermo Scientific MSQ Plus的Dionex UHPLC Ultimate3000
柱:
Figure BDA0003960532040000501
2.6μm XB-C18(4.6x50mm),110A,柱编号00B-4496-E0,内柱编号019
试剂:
甲酸≥98%,Sigma-Aldrich
HPLC UV/梯度级乙腈,Baker
用于LCMS的μQ-水
HPLC条件:
波长范围:(190–340)nm±4nm
流速:1.0ml/min
柱温:25℃
自动采样器温度:20℃
分析时间:6min
洗脱:梯度
时间[min] 流动相A[%] 流动相B[%] 流速[ml/min]
0.0 70 30 1.0
3.35 20 80 1.0
3.75 20 80 1.0
3.90 5 95 1.0
4.75 5 95 1.0
5.00 70 30 1.0
6.00 70 30 1.0
流动相A:0.1%v/v甲酸水溶液
流动相B:0.1%v/v甲酸的乙腈溶液
注射器洗涤溶液:20%MeOH
MS条件:
质量范围:100–1000m/z
电离:交替
扫描速度:12000amu/秒
如果没有描述原料的制备,这些原料是可商购的、文献中已知的或本领域技术人员使用标准方法容易获得的。所有溶剂均购自商业来源,并且无需另外纯化即可使用。
在Merck硅胶60F254 TLC板上进行了薄层色谱法。
制备型薄层色谱法(pTLC)用单板1000微米或500微米硅胶板进行。在InterchimPuriFlash 450和520Plus系统上使用预填充的硅胶柱进行急骤色谱法。
当提及使用“相似”或“类似”方法时,如本领域技术人员将理解的,这样的方法可以涉及微小的变化,例如反应温度、试剂/溶剂量、反应时间、后处理条件或色谱纯化条件。除非另有说明,否则所有最终化合物均以游离碱形式获得。
用于酰胺偶联的一般方法A
在氩气气氛中将羧酸或羧酸盐(1.0eq)、胺(1.0eq.)和DIPEA(6.0eq)溶于无水DCM。接下来加入T3P(50%的EtOAc溶液,1.5eq.),将该反应体系在RT搅拌过夜。使该反应混合物分配在DCM与水之间。用DCM(3x)萃取水相,浓缩合并的有机相,得到粗产物,通过所显示的方法纯化了该粗产物。
用于酰胺偶联的一般方法B
在氩气气氛中将羧酸或羧酸盐(1.0eq)溶于无水DMF,然后加入BTFFH(3.0eq)和DIPEA(4.5eq)。接下来加入胺(1.5eq),将该反应体系在80℃搅拌过夜。然后将该反应混合物真空浓缩至干,使残余物分配在EtOAc与水之间。用EtOAc(3x)萃取水相,用盐水洗涤合并的有机相,浓缩,得到粗产物,通过所显示的方法纯化了该粗产物。
用于酰胺偶联的一般方法C:
将羧酸盐(1.0eq)和胺(1.0eq.)溶于DMF:DCM(1:3)的混合物,然后添加DIPEA(8.0eq.)和HATU(2.0eq.)。将该反应体系在RT搅拌过夜,然后使该反应混合物分配在DCM与饱和NaHCO3之间。用DCM(3x)萃取水相,用Na2SO4干燥合并的有机层,真空浓缩,得到粗产物,通过所显示的方法纯化了该粗产物。
用于制备中间体3-[(4-甲基哌嗪-1-基)甲基]-5-(三氟甲基)苯甲酸锂的方案
Figure BDA0003960532040000521
步骤1:3-溴-5-(三氟甲基)苯甲酸甲酯的制备
Figure BDA0003960532040000522
在0℃向3-溴-5-(三氟甲基)苯甲酸(75.0g,279mmol)在MeOH(282mL)中的溶液中滴加SOCl2(81.0mL,1115mmol)。接下来将该反应混合物回流下搅拌过夜,此时真空除去挥发性物质。向残余物中加入水(200mL),用EtOAc(2x250mL)萃取水层。用NaHCO3的饱和溶液(2x200mL)洗涤合并的有机层,用Na2SO4干燥,真空浓缩,得到产物(74.5g,94%),为浅褐色固体。
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ8.30(dt,J=1.8,0.8Hz,2H),8.13(td,J=1.6,0.8Hz,1H),3.90(s,3H)。
步骤2:3-[(4-甲基哌嗪-1-基)甲基]-5-(三氟甲基)苯甲酸甲酯的制备
Figure BDA0003960532040000523
将3-溴-5-(三氟甲基)苯甲酸酯(47.5g,168mmol)、Cs2CO3(164g,503mmol)、1-甲基-4-三氟硼酸甲基哌嗪(40.6g,184.6mmol)混悬于THF(100mL)和水(11mL)的混合物。给该混悬液脱气,然后加入Pd(OAc)2(3.76g,16.8mmol)和XPhos(16.0g,33.5mmol),使反应在80℃进行24h。用水(100mL)稀释该反应混合物,用EtOAc(2x150mL)萃取。浓缩合并的有机相,真空干燥,得到粗产物,通过柱色谱法纯化(DCM:MeOH,9:1),得到标题化合物,为棕色油状物(25.3g,48%)。
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ8.16(d,J=1.7Hz,1H),8.07(t,J=1.8Hz,1H),7.97–7.86(m,1H),3.90(s,3H),3.62(s,2H),2.38(s,8H),2.15(s,3H)。
步骤3:3-[(4-甲基哌嗪-1-基)甲基]-5-(三氟甲基)苯甲酸锂的制备
Figure BDA0003960532040000531
将3-[(4-甲基哌嗪-1-基)甲基]-5-(三氟甲基)苯甲酸甲酯(25.3g,80.0mmol)溶于MeOH(700mL)。向该反应混合物中加入1M LiOH溶液(3.8g,160mL),在RT搅拌过夜。真空除去溶剂,将粗物质与乙醚(2x)一起研磨,过滤。采集固体,得到标题产物,为固体(26.0g,100%)。
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ8.02(s,2H),7.49(s,1H),3.51(s,2H),2.32(s,8H),2.14(s,3H)。
用于制备中间体5-(1-甲基-1H-吡唑-3-基)吡啶-3-胺的方案
Figure BDA0003960532040000532
步骤1:5-(1-甲基-1H-吡唑-3-基)吡啶-3-胺的制备
将5-溴吡啶-3-胺(0.5g,2.89mmol)、1-甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-1H-吡唑(0.782g,3.76mmol)和Cs2CO3(2.82g,8.67mmol)混悬于二噁烷(11.42ml)和水(1.142ml)。用Ar吹扫该混合物15min,然后加入Pd(dppf)Cl2(0.211g,0.289mmol)。将该反应混合物在90℃搅拌3h,然后冷却至RT,浓缩。通过FCC纯化粗物质(洗脱系统:100%至10%MeOH的DCM溶液)。将化合物与Et2O一起研磨,得到期望的产物(468mg,93%)。
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ8.20–8.10(m,1H),7.84(d,J=2.6Hz,1H),7.73(d,J=2.2Hz,1H),7.31(dd,J=2.6,1.8Hz,1H),6.62(d,J=2.3Hz,1H),5.33(s,2H),3.87(s,3H)。
实施例1
4-甲基-N-(3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)-3-((吡唑并[1,5-a]嘧啶-6-基氨基)甲基)苯甲酰胺
Figure BDA0003960532040000541
步骤1:3-碘-4-甲基-N-[3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基]苯甲酰胺的制备
Figure BDA0003960532040000542
将3-碘-4-甲基苯甲酸(7.00g,26.7mmol)在SOCl2(47mL)中的溶液回流2h,然后真空蒸发以除去残留的SOCl2。将残余物溶于无水THF(25mL),滴加到DIPEA(4.14g,32.0mmol)、3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯胺(6.44g,26.7mmol)和DMAP(130mg,1.06mmol)在无水THF(48mL)中的溶液中。将该反应混合物在RT搅拌17h,真空蒸发。将残余物溶于EtOAc(200mL)。加入水(180mL),用1M NaOH将pH调节至8。然后分离各层,用DCM/MeOH 100:5(100mL x5)萃取水层。真空蒸发合并的有机萃取物,得到终产物,为黄白色固体(13.05g,100%)。
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ10.67(s,1H),8.46(d,J=1.9Hz,1H),8.27(t,J=1.9Hz,1H),8.21(d,J=1.4Hz,1H),8.13(d,J=1.8Hz,1H),7.94(dd,J=7.9,1.9Hz,1H),7.74(d,J=1.8Hz,1H),7.53(d,J=8.0Hz,1H),7.49(d,J=1.6Hz,1H),2.46(s,3H),2.18(d,J=1.0Hz,3H)。
步骤2:3-甲酰基-4-甲基-N-[3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基]苯甲酰胺的制备
Figure BDA0003960532040000551
将PPh3(1.62g,6.2mmol)、I2(1.57g,6.2mmol)和甲苯(20mL)加到配备了搅棒的100mL密封试管中,在RT搅拌10min。然后将3-碘-4-甲基-N-[3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基]苯甲酰胺(2.50g,5.15mmol)、Pd(OAc)2(34.7mg,3mol%)和Et3N(3.13g,30.9mmol)加入该溶液。接下来加入HCOOH(0.95g,20.6mmol),即刻密封试管,将该混合物在80℃搅拌4h。将该反应混合物冷却至RT,用EtOAc(150mL)稀释,用0.01M NaOH洗涤。用EtOAc(150mL x 2)萃取水层,用Na2SO4干燥合并的萃取物,过滤,减压浓缩。通过硅胶柱色谱法纯化得到的残余物(DCM/MeOH 100:1至100:4),得到产物,为黄色固体(1.055g,53%)。
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ10.83(s,1H),10.35(s,1H),8.48(d,J=2.1Hz,1H),8.30(d,J=2.0Hz,1H),8.22(d,J=1.4Hz,1H),8.18(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),8.16–8.14(m,1H),7.75(s,1H),7.59(s,1H),7.50(t,J=1.3Hz,1H),2.73(s,3H),2.18(d,J=1.0Hz,3H)。
步骤3:4-甲基-N-(3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)-3-((吡唑并[1,5-a]嘧啶-6-基氨基)甲基)苯甲酰胺的制备
Figure BDA0003960532040000561
将3-甲酰基-4-甲基-N-[3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5(三氟甲基)苯基]苯甲酰胺(190mg,0.49mmol)和吡唑并[1,5-a]嘧啶-6-胺(65.8mg,0.49mmol)溶于冰AcOH(2.0mL)。将棕色溶液在RT搅拌3h。接下来加入STAB(208mg,0.98mmol),将该反应混合物在RT搅拌过夜。减压蒸发AcOH,将残余物溶于1M NaOH(25mL),用EtOAc(50mL)和DCM:MeOH 100:5(50mL x2)萃取产物。减压蒸发合并的萃取物,通过柱色谱法纯化固体残余物(DCM:MeOH,100:4至100:8),得到产物,为黄色固体(215mg,86%)。
Figure BDA0003960532040000562
实施例2
3-((乙基(吡唑并[1,5-a]嘧啶-6-基)氨基)甲基)-4-甲基-N-(3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺
Figure BDA0003960532040000563
将4-甲基-N-(3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)-3-((吡唑并[1,5-a]嘧啶-6-基氨基)甲基)苯甲酰胺(实施例1)(30.0mg,0.059mmol)溶于冰AcOH(0.4mL),在RT加入乙醛(0.10mL,1.78mmol)。接下来加入STAB(25.2mg,0.12mmol),将该反应混合物在RT搅拌过夜。用0.1M NaOH(10mL)处理该反应混合物,用DCM(30mL x 3)萃取产物。用Na2SO4干燥合并的萃取物,过滤,减压蒸发。通过制备型HPLC纯化固体残余物,得到产物,为淡黄色固体(5mg,16%)。
Figure BDA0003960532040000571
通过对实施例1步骤1-3所述的还原氨基化,在步骤3中应用相应的商购胺,制备了下列化合物。
Figure BDA0003960532040000581
Figure BDA0003960532040000591
实施例6
4-甲基-N-(3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)-3-(((4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]嘧啶-6-基)氨基)甲基)苯甲酰胺
Figure BDA0003960532040000592
将4-甲基-N-(3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)-3-((吡唑并[1,5-a]嘧啶-6-基氨基)甲基)苯甲酰胺(实施例1)(30.0mg,0.059mmol)溶于冰AcOH(0.4mL),在RT加入NaBH4(9mg,0.24mmol)。将该反应混合物在RT搅拌过夜。减压蒸发AcOH,将残余物溶于0.4M NaOH(7mL),用DCM(20mL x 3)萃取产物。减压蒸发合并的萃取物,通过pTLC(DCM:MeOH,100:4)纯化固体残余物,得到产物,为无色固体(16mg,53%)。
Figure BDA0003960532040000601
实施例7
3-(((2-氰基吡啶-4-基)氨基)甲基)-4-甲基-N-(3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺
Figure BDA0003960532040000602
步骤1:3-氰基-4-甲基-N-(3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺的制备
Figure BDA0003960532040000603
将如实施例1步骤1中所述制备的3-碘-4-甲基-N-(3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺(7g,14.43mmol)、氰化锌(2.028g,17.31mmol)和Pd(PPh3)4(0.834g,0.721mmol)溶于DMF(48.1ml)。将该反应混合物在80℃搅拌4hr。用EtOAc稀释该混合物,用水洗涤。然后减压除去有机溶剂。通过干急骤色谱法纯化粗物质(己烷:EtOAc,9:1),得到产物,为浅褐色粉末(6.7g,定量)
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ10.78(s,1H),8.42(d,J=1.9Hz,1H),8.27(t,J=1.9Hz,1H),8.22(d,J=1.4Hz,1H),8.19(dd,J=8.1,2.0Hz,1H),8.13(d,J=1.9Hz,1H),7.77(d,J=2.2Hz,1H),7.69(d,J=8.2Hz,1H),7.51(t,J=1.3Hz,1H),2.59(s,3H),2.19(d,J=1.0Hz,3H)。
步骤2:3-(氨基甲基)-4-甲基-N-(3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺的制备
Figure BDA0003960532040000611
将3-氰基-4-甲基-N-(3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺(2.2g,5.72mmol)溶于MeOH(45.8ml)和氨(11.45ml,),然后加入阮内镍(2ml,5.72mmol)。将该反应混合物在氢气气氛中(球囊)搅拌,历时3d。通过硅藻土垫过滤该反应混合物,浓缩,真空干燥,得到粗产物(1.62g,67.6%),其未经进一步纯化被用于下一步。
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ10.59(s,1H),8.31(s,1H),8.19(d,J=14.4Hz,2H),8.03(s,1H),7.78(d,J=7.4Hz,1H),7.72(s,1H),7.50(s,1H),7.33(d,J=7.9Hz,1H),3.80(s,2H),2.36(s,3H),2.18(s,3H)。
步骤3:3-(((2-氰基吡啶-4-基)氨基)甲基)-4-甲基-N-(3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺(实施例7)的制备
Figure BDA0003960532040000612
将3-(氨基甲基)-4-甲基-N-(3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺(0.1g,0.257mmol)和4-氟吡啶-2-甲腈(0.038g,0.309mmol)溶于DMF(0.52ml)。然后加入LiOH(0.013g,0.548mmol),将该反应混合物在RT搅拌过夜。用水稀释反应混合物,用AcOEt(x3)萃取。合并有机层,用Na2SO4干燥,过滤,浓缩。通过FCC纯化粗物质(100%DCM至10%MeOH的DCM溶液),得到期望的产物,为白色固体(67mg,53%)。
Figure BDA0003960532040000621
根据上述方案,使用适合的氟-芳基胺制备了实施例8。
Figure BDA0003960532040000622
Figure BDA0003960532040000631
实施例9
N-(4-甲基-3-((嘧啶-5-基氨基)甲基)苯基)-3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯甲酰胺
Figure BDA0003960532040000632
步骤1:N-(3-氰基-4-甲基苯基)-3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯甲酰胺的制备
Figure BDA0003960532040000633
将5-氨基-2-甲基苄腈(0.500g,3.78mmol)和3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯甲酸锂(1.166g,3.78mmol)溶于DCM(38mL),然后加入DIPEA(3.96mL,22.70mmol)和50%T3P的EtOAc溶液(3.34mL,5.67mmol)。将该反应混合物在40℃搅拌24h,此后,用DCM稀释,用水(3x50mL)洗涤。然后用DCM(3x50mL)萃取水相。用盐水(100mL)洗涤合并的有机层,真空浓缩。通过柱色谱法纯化粗物质(DCM:MeOH,100:0至90:10),得到标题化合物(0.342g,22%收率),为粉红色-白色固体。
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ10.67(s,1H),8.26-8.13(m,3H),7.97-7.87(m,2H),7.49(d,J=8.5Hz,1H),3.65(s,2H),2.47(s,3H),2.38(d,J=21.9Hz,8H),2.16(s,3H)。
步骤2:N-(3-(氨基甲基)-4-甲基苯基)-3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯甲酰胺的制备
Figure BDA0003960532040000641
将N-(3-氰基-4-甲基苯基)-3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯甲酰胺(0.345g,0.828mmol)在MeOH(8.28mL)中的溶液加到阮内镍(1.6ml,0.828mmol)中,在RT在氢气气氛存在下(球囊)搅拌16h。通过硅藻土垫过滤该反应混合物,浓缩,真空干燥,得到粗产物(334mg,96%收率),为黄色固体,其未经额外的纯化被用于随后步骤。
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ10.41(d,J=10.1Hz,1H),8.19(d,J=9.4Hz,2H),7.84(s,1H),7.70(d,J=2.2Hz,1H),7.59(dd,J=8.1,2.3Hz,1H),7.11(d,J=8.3Hz,1H),3.71(s,2H),3.63(s,2H),2.37(m,8H),2.24(s,3H),2.24(m,2H),2.15(s,3H)。
步骤3:N-(4-甲基-3-((嘧啶-5-基氨基)甲基)苯基)-3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯甲酰胺(实施例9)的制备
Figure BDA0003960532040000642
将N-(3-(氨基甲基)-4-甲基苯基)-3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯甲酰胺(110mg,0.262mmol)、5-溴嘧啶(49.9mg,0.314mmol)和Cs2(CO)3(256mg,0.785mmol)混悬于甲苯(2mL)。用氩气给该混合物脱气,然后加入RuPhos(24.42mg,0.052mmol)和Pd(dba)2(15.04mg,0.026mmol),将该反应体系在110℃搅拌16h。使该反应体系分配在水与DCM之间,用DCM(x3)萃取产物,用盐水洗涤合并的有机层,真空浓缩,得到粗物质,通过FCC(DCM:MeOH,100:0至90:10)纯化,得到标题化合物(18.00mg,14%收率),为黄色固体。
Figure BDA0003960532040000651
实施例10
N-甲基-4-((2-甲基-5-(3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯甲酰氨基)苄基)氨基)吡啶酰胺
Figure BDA0003960532040000652
将如实施例9步骤1-2中所述制备的N-(3-(氨基甲基)-4-甲基苯基)-3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯甲酰胺(110mg,0.262mmol)、4-溴-N-甲基吡啶酰胺(67.5mg,0.314mmol)和Cs2(CO)3(256mg,0.785mmol)混悬于甲苯(2mL)。用氩气给该混合物脱气,然后加入BINAP(32.6mg,0.052mmol和Pd(dba)2(15.04mg,0.026mmol),将该反应体系在110℃搅拌16h。使反应体系分配在水与DCM之间,用DCM(x3)萃取化合物,用盐水洗涤合并的有机层,真空浓缩,得到粗物质,通过FCC(DCM:MeOH,100:0至90:10)纯化,然后与戊烷一起研磨,得到标题化合物(0.04g,28%收率),为浅褐色固体。
Figure BDA0003960532040000653
Figure BDA0003960532040000661
实施例11
N-(4-甲基-3-(((嘧啶-5-基甲基)氨基)甲基)苯基)-3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯甲酰胺
Figure BDA0003960532040000662
混合如实施例9步骤1-2中所述制备的N-(3-(氨基甲基)-4-甲基苯基)-3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯甲酰胺(0.07g,0.166mmol)和嘧啶-5-甲醛(0.018g,0.166mmol),给试管反充氩气(x3)。向该混合物中加入THF(1.7mL),然后加入Ti(OEt)4(0.070mL,0.333mmol)。将该反应混合物冷却至0℃,加入STAB(0.141g,0.666mmol)。将该反应混合物温热至RT,搅拌16h。向该反应混合物中加入1M NaOH溶液。然后用EtOAc(3x10mL)萃取期望的产物,用盐水(1x10mL)洗涤合并的有机层,真空浓缩,得到粗物质,通过柱色谱法纯化(DCM:MeOH,100:0-90:10),得到标题化合物(22.98mg,27%收率),为黄色固体。
Figure BDA0003960532040000663
Figure BDA0003960532040000671
通过对实施例11所述的还原氨基化,使相应的商购醛反应,制备了下列化合物。
Figure BDA0003960532040000672
Figure BDA0003960532040000681
Figure BDA0003960532040000691
实施例16
4-异丙基-N-(3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5(三氟甲基)苯基)-3-((吡唑并[1,5-a]嘧啶-6-基氨基)甲基)苯甲酰胺
Figure BDA0003960532040000692
步骤1:3-氰基-4-(丙-2-基)苯甲酸酯;3-氰基-4-丙基苯甲酸甲甲酯的制备
Figure BDA0003960532040000701
在0℃向4-溴-3-氰基苯甲酸甲酯(4.00g,16.67mmol)、CPhos(0.146g,0.333mmol)和Pd(OAc)2(0.037g,0.167mmol)在THF(67mL)中的混合物中逐滴加入0.5M溴化异丙基锌(II)在THF中的溶液(40ml,20.00mmol)。使反应在RT进行3h,然后真空浓缩该反应混合物。使残余物分配在EtOAc与水之间,用EtOAc(2x30mL)萃取期望的化合物,用水(30mL)、然后用盐水(30mL)洗涤合并的有机相,然后用Na2SO4干燥,真空浓缩。通过柱色谱法(己烷:EtOAc,98:2至96:4)纯化得到的粗产物,得到异构体混合物(1:1之比),为淡黄色油状物(2.76g,81%)。
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ8.26(dd,J=3.7,1.8Hz,2H),8.18(ddd,J=9.9,8.2,1.9Hz,2H),7.73(d,J=8.3Hz,1H),7.65(d,J=8.2Hz,1H),3.88(s,6H),3.30(dd,J=14.1,7.2Hz,1H),2.84(dd,J=8.4,6.8Hz,2H),1.75–1.60(m,2H),1.30(d,J=6.9Hz,6H),0.93(t,J=7.3Hz,3H)。
步骤2:3-氰基-4-(丙-2-基)苯甲酸;3-氰基-4-丙基苯甲酸的制备
Figure BDA0003960532040000702
在0℃将1M LiOH(8.61mL)加到3-氰基-4-丙基苯甲酸甲酯和甲基-3-氰基-4-异丙基苯甲酸酯(1.75g,8.62mmol,1:1之比)在THF(17.5mL)中的混合物中,使反应在RT进行16h。使该反应混合物分配在EtOAc与水之间。用EtOAc(2x30mL)洗涤水层,弃去有机相。接下来用1M HCl酸化水层,用EtOAc(3x50mL)萃取产物。用Na2SO4干燥合并的有机层,真空浓缩,得到标题异构体混合物,为白色固体(1:1之比,1.25g,77%)。
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δiPr 13.40(s,1H,OH),8.26-8.12(m,2H,CH),7.70(d,J=8.2Hz,1H,CH),3.32-3.21(m,1H,CHMe2),1.30(d,J=6.9Hz,6H,CH3)δnPr 13.40(s,1H,OH),8.26-8.12(m,2H,CH),7.62(d,J=8.1Hz,1H,CH),2.84(dd,J=8.5,6.7Hz,2H,CH2),1.77-1.60(m,2H,CH2),0.93(t,J=7.3Hz,3H,CH3)。
步骤3:3-氰基-N-{3-[(4-甲基哌嗪-1-基)甲基]-5-(三氟甲基)苯基}-4-(丙-2-基)苯甲酰胺;3-氰基-N-{3-[(4-甲基哌嗪-1-基)甲基]-5-(三氟甲基)苯基}-4-丙基苯甲酰胺的制备
Figure BDA0003960532040000711
在氩气气氛中将DMF(8.18μl,0.106mmol)和草酰氯(0.370ml,4.23mmol)加到3-氰基-4-丙基苯甲酸和3-氰基-4-异丙基苯甲酸(0.40g,2.12mmol,1:1之比)在DCM(4mL)中的溶液中,将该混合物在RT搅拌4h。接下来,减压除去溶剂,将残余物溶于无水DCM(2mL)。在0℃将得到的溶液滴加到3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯胺(0.636g,2.325mmol)和三乙胺(0.589ml,4.23mmol)在无水DCM(2mL)中的溶液中,在RT搅拌16h。用DCM稀释该反应体系,用水(25mL)洗涤,然后用DCM(3x25mL)萃取水相。用盐水(50mL)洗涤合并的有机层,用Na2SO4干燥,真空浓缩,得到粗产物,通过柱色谱法纯化(DCM:MeOH,100:0-90:10),得到异构体混合物,为白色固体(1:1之比,0.672g,72%)。
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δiPr 10.63(s,1H),8.41(m,1H),8.28-8.15(m,2H),8.00(s,1H),7.75(d,J=8.4Hz),7.38(s,1H),3.56(s,2H),3.29(m,1H),2.38(m,8H),2.16(s,3H),1.33(d,J=6.9Hz,6H)。δnPr 10.63(s,1H),8.41(m,1H),8.28-8.15(m,2H),8.00(s,1H),7.68(d,J=8.1Hz,1H),7.38(s,1H),3.56(s,2H),2.86(t,J=7.6Hz,2H),2.38(m,8H),2.16(s,3H),1.69(p,J=7.4Hz,2H),0.95(t,J=7.3Hz,3H)。
步骤4:3-(氨基甲基)-N-{3-[(4-甲基哌嗪-1-基)甲基]-5-(三氟甲基)苯基}-4-(丙-2-基)苯甲酰胺;3-(氨基甲基)-N-{3-[(4-甲基哌嗪-1-基)甲基]-5-(三氟甲基)苯基}-4-丙基苯甲酰胺的制备
Figure BDA0003960532040000721
向3-氰基-N-(3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)-4-丙基苯甲酰胺和3-氰基-4-异丙基-N-(3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺(0.672g,1.51mmol,1:1之比)在MeOH(30mL)中的溶液加入阮内镍(3mL,3.02mmol),在RT在氢气气氛存在下(球囊)搅拌3d。通过硅藻土垫过滤该反应混合物,浓缩,真空干燥,得到异构体混合物,为绿-黄色固体(iPr:nPr之比3:1,0.589g,87%),其未经进一步纯化被用于下一步。
1H NMR(300MHz,甲醇-d4)δiPr 8.10(s,1H),7.95(d,J=2.2Hz,2H),7.85(dd,J=8.1,2.1Hz,1H),7.50(d,J=8.2Hz,1H),7.45(s,1H),4.05-3.93(m,2H),3.63(s,2H),2.55(m,8H),2.30(s,3H)1.30(d,J=6.8Hz,6H)。CH iPr被溶剂峰掩蔽。ΔnPr 8.10(s,1H),7.95(d,J=2.2Hz,1H),7.80(dd,J=8.1,2.1Hz,1H),7.45(s,1H),7.37(d,J=8.0Hz,2H),4.05-3.93(m,2H),3.63(d,J=9.8Hz,2H),2.83-2.68(m,2H),2.55(m,8H)2.30(s,3H),1.69(m,2H),1.04(t,J=7.3Hz,3H)。
步骤5:4-异丙基-N-(3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)-3-((吡唑并[1,5-a]嘧啶-6-基氨基)甲基)苯甲酰胺(实施例16)和N-(3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)-4-丙基-3-((吡唑并[1,5-a]嘧啶-6-基氨基)甲基)苯甲酰胺(实施例17)的制备。
Figure BDA0003960532040000722
Figure BDA0003960532040000731
将3-(氨基甲基)-4-异丙基-N-(3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺和3-(氨基甲基)-N-(3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)-4-丙基苯甲酰胺的混合物(200mg,0.446mmol,iPr:nPr之比3:1)溶于无水甲苯(5ml)。加入6-溴吡唑并[1,5-a]嘧啶(161mg,0.813mmol)和叔丁醇钠(65.1mg,0.678mmol),随后加入Pd2(dba)3(62.1mg,0.068mmol)和tBuXPhos(57.6mg,0.136mmol)。将该反应体系在80℃搅拌17hr,然后通过硅藻土过滤该反应混合物。接下来用水洗涤滤液,浓缩有机相。通过FCC纯化粗物质(DCM:MeOH 1:0至0:1),随后通过制备型HPLC(ACN,H2O+0.1%NH3)纯化,得到4-异丙基-N-(3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)-3-((吡唑并[1,5-a]嘧啶-6-基氨基)甲基)苯甲酰胺(实施例16)(0.029g,15%)和N-(3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)-4-丙基-3-((吡唑并[1,5-a]嘧啶-6-基氨基)甲基)苯甲酰胺(实施例17)(0.009g,14%),为白色固体。
Figure BDA0003960532040000732
Figure BDA0003960532040000741
实施例18
4-甲基-N-(3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5(三氟甲基)苯基)-3-((吡唑并[1,5-a]嘧啶-6-基氨基)甲基)苯甲酰胺
Figure BDA0003960532040000742
步骤1:3-氰基-4-甲基苯甲酸甲酯的制备
Figure BDA0003960532040000743
在3-颈烧瓶中,将3-溴-4-甲基苯甲酸甲酯(10.0g,48.7mmol)和氰化锌(6.9g,58.5mmol)溶于无水DMF(150mL)。在氩气气氛中给该溶液脱气。加入Pd(PPh3)4(2.8g,2.4mmol),将该反应体系在100℃搅拌过夜。此后,通过硅藻土垫过滤该反应混合物,真空浓缩滤液。通过FCC(己烷:EtOAc,98:2-95:5)纯化粗产物,得到标题化合物,为白色固体(7.47g,86%)。
1H NMR(300MHz,CDCl3)δ8.30(d,J=1.7Hz,1H),8.16(dd,J=1.8,8.3Hz,1H),7.44(d,J=8.1Hz,1H),3.97(s,3H),2.64(s,3H)。
步骤2:3-(氨基甲基)-4-甲基苯甲酸甲酯的制备
Figure BDA0003960532040000751
向3-氰基-4-甲基苯甲酸甲酯(6.99g,39.9mmol)在MeOH(399mL)中的溶液中加入阮内镍(80mL,50%在水中的分散液),在RT在氢气气氛存在下(球囊)搅拌过夜。通过硅藻土垫过滤该反应混合物,浓缩,真空干燥,得到粗物质,通过FCC纯化(己烷:EtOAc,50:50至MeOH:EtOAc:NH3 10:89:1),得到标题化合物,为黄色油状物(3.63g,47%)。
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ8.03(s,1H),7.72(dd,J=1.9,7.7Hz,1H),7.27(d,J=7.7Hz,1H),3.84(s,3H),3.74(s,2H),2.32(s,3H),2.01(br s,2H)
步骤3:4-甲基-3-((吡唑并[1,5-a]嘧啶-6-基氨基)甲基)苯甲酸的制备
Figure BDA0003960532040000752
向6-溴吡唑并[1,5-a]嘧啶(0.398g,2.01mmol)和叔丁醇钠(0.483g,5.02mmol)的混合物中加入3-(氨基甲基)-4-甲基苯甲酸甲酯(0.300g,1.67mmol)在无水甲苯(6mL)中的溶液。在氩气气氛中给该混合物脱气,然后加入tBuXPhos(0.142g,0.335mmol)和Pd2(dba)3(0.153g,0.167mmol)。使反应在110℃进行过夜,然后通过硅藻土垫过滤,浓缩,真空干燥,得到粗物质,通过FCC(MeOH:DCM,5:95至20:80)纯化,得到标题物质,为红色固体(0.059g,11%)
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ12.43(s,1H),8.41(s,1H),7.96–7.84(m,2H),7.78(d,J=8.1Hz,1H),7.35(d,J=7.8Hz,2H),6.54(s,1H),6.41(t,J=5.6Hz,1H),4.30(d,J=5.4Hz,2H),2.43(s,3H)。
步骤4:4-甲基-N-(3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)-3-((吡唑并[1,5-a]嘧啶-6-基氨基)甲基)苯甲酰胺(实施例18)的制备
Figure BDA0003960532040000761
根据用于酰胺偶联的一般方法A,使4-甲基-3-((吡唑并[1,5-a]嘧啶-6-基氨基)甲基)苯甲酸(0.03g)与所需的胺反应得到黄色固体(0.006g;11%),制备了实施例18。
Figure BDA0003960532040000762
实施例19
4-甲基-N-(3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)-3-((嘧啶-5-基氨基)甲基)苯甲酰胺
Figure BDA0003960532040000763
步骤1:4-甲基-3-((嘧啶-5-基氨基)甲基)苯甲酸的制备
Figure BDA0003960532040000771
将如实施例18步骤1-3中所述制备的3-(氨基甲基)-4-甲基苯甲酸甲酯)(0.500g,2.79mmol,Cs2CO3(2.73g,8.37mmol)和5-溴嘧啶(1.06g,6.67mmol)混悬于无水甲苯(9.0mL)。给该混悬液脱气,然后加入RuPhos(0.520g,1.11mmol)和Pd(dba)2(0.320g,0.557mmol),使反应在100℃进行24h。通过硅藻土垫过滤该反应混合物,浓缩,真空干燥,得到粗物质,通过柱色谱法纯化(DCM:3.5M NH3的MeOH溶液,80:20至50:50),得到标题化合物,为黄色油状物(0.755g,100%)。
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ8.64(s,1H),8.39(s,1H),8.13(s,2H),7.76–7.67(m,2H),7.25(dd,J=7.7,5.1Hz,2H),4.33(d,J=5.7Hz,2H),2.37(d,J=2.3Hz,3H)。
步骤2:4-甲基-N-(3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)-3-((嘧啶-5-基氨基)甲基)苯甲酰胺(实施例19)、4-甲基-N-(3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)-3-((嘧啶-5-基氨基)甲基)苯甲酰胺(实施例20)、N-(4-甲氧基-3-(三氟甲基)苯基)-4-甲基-3-((嘧啶-5-基氨基)甲基)苯甲酰胺(实施例31)和4-甲基-3-((嘧啶-5-基氨基)甲基)-N-(3-(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺(实施例32)的制备。
使4-甲基-3-((嘧啶-5-基氨基)甲基)苯甲酸与所需的胺反应得到下列化合物,根据一般方法A制备了实施例19和实施例20,同时根据一般方法C制备了实施例31和实施例32:
Figure BDA0003960532040000781
Figure BDA0003960532040000791
实施例21
N-(2-甲基-5-((3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)氨基甲酰基)苄基)咪唑并[1,2-a]吡啶-3-甲酰胺
Figure BDA0003960532040000801
步骤1:3-((咪唑并[1,2-a]吡啶-3-甲酰氨基)甲基)-4-甲基苯甲酸甲酯的制备
Figure BDA0003960532040000802
向如实施例18步骤1-2中所述制备的3-(氨基甲基)-4-甲基苯甲酸甲酯(0.7g,3.91mmol)、咪唑并[1,2-a]吡啶-3-甲酸(0.760g,4.69mmol)和HATU(1.49g,3.91mmol,1eq)的混合物中加入无水DCM(13mL),然后加入DIPEA(1.4mL,7.81mmol)。将该反应体系在RT搅拌过夜,然后使该反应混合物分配在DCM(15mL)与水(15mL)之间,用DCM(2x15mL)萃取期望的化合物。用水(15mL)、盐水(15mL)洗涤合并的有机相,然后用Na2SO4干燥,过滤,浓缩。通过FCC(MeOH:DCM,1:99至5:95)纯化粗物质,得到标题化合物(1.26g,66%),为黄白色固体。
1H NMR(300MHz,CDCl3)δ9.69(d,J=6.7Hz,1H,CH),8.26(br s,1H,CH),8.03(s,1H,CH),7.90(dd,J=7.9,1.6Hz,1H,CH),7.76(d,J=8.9Hz,1H,CH),7.46(t,J=7.6Hz,1H,CH),7.31(s,1H,CH),7.07(t,J=6.9Hz,1H,CH),6.93(br s,1H,NH),4.72(d,J=5.5Hz,2H,CH2),3.90(s,3H,CH3),2.48(s,3H,CH3)。
步骤2:3-((咪唑并[1,2-a]吡啶-3-甲酰氨基)甲基)-4-甲基苯甲酸锂的制备
Figure BDA0003960532040000803
将3-((咪唑并[1,2-a]吡啶-3-甲酰氨基)甲基)-4-甲基苯甲酸甲酯(0.416g,1.29mmol)溶于THF(13mL),加入1M LiOH溶液(2mL,1.93mmol)。将该反应体系在60℃搅拌16h。真空除去溶剂,将粗物质与乙醚(30mL)一起研磨,过滤。采集固体,得到标题产物,为黄白色固体(0.348g,86%)。
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ9.54(d,J=7.0Hz,1H),9.02(br s,1H),8.45(s,1H),7.80(s,1H),7.69(m,1H),7.69(m,1H),7.45(ddd J=8.7,6.8,1.3Hz,1H),7.10(m,1H),7.10(m,1H),4.49(s,2H),2.32(s,3H)。
步骤3:N-(2-甲基-5-((3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)氨基甲酰基)苄基)咪唑并[1,2-a]吡啶-3-甲酰胺(实施例21)和N-(2-甲基-5-((3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)氨基甲酰基)苄基)咪唑并[1,2-a]吡啶-3-甲酰胺(实施例22)的制备。
根据用于酰胺偶联的一般方法A,使4 3-((咪唑并[1,2-a]吡啶-3-甲酰氨基)甲基)-4-甲基苯甲酸锂与所需的胺反应得到下列化合物,制备了实施例21和实施例22:
Figure BDA0003960532040000811
Figure BDA0003960532040000821
实施例23
N-甲基-4-((2-甲基-5-((3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)氨基甲酰基)苄基)氨基)吡啶酰胺
Figure BDA0003960532040000822
步骤1:4-甲基-3-(((2-(甲基氨基甲酰基)吡啶-4-基)氨基)甲基)苯甲酸的制备
Figure BDA0003960532040000823
向如实施例18步骤1-2中所述制备的4-溴-N-甲基吡啶-2-甲酰胺(0.720g,3.35mmol)和Cs2CO3(2.73g,8.37mmol)中加入甲基-3-(氨基甲基)-4-甲基-苯甲酸酯(0.500g,2.79mmol)在无水甲苯(9mL)中的溶液。给该反应混合物脱气,加入BINAP(0.347g,0.558mmol)和Pd(dba)2(0.160g,0.279mmol),将该反应体系在100℃搅拌过夜。通过硅藻土垫过滤该反应混合物,浓缩,真空干燥,得到粗物质,通过FCC(MeOH:DCM,10:90-50:50)纯化该粗物质,得到黄色固体形式的标题产物(0.650g,78%)。
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ8.56(q,J=4.6Hz,1H),8.06(d,J=5.7Hz,1H),7.82-7.78(m,2H),7.78-7.72(m,1H),7.39(t,J=5.6Hz,1H),7.33(d,J=7.9Hz,1H),7.24(s,1H),6.63(d,J=5.4Hz,1H),4.38(d,J=5.5Hz,2H),2.76(d,J=4.9Hz,3H),2.40(s,3H)。
步骤2:N-甲基-4-((2-甲基-5-((3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)氨基甲酰基)苄基)氨基)吡啶酰胺(实施例23)和N-甲基-4-((2-甲基-5-((3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)氨基甲酰基)苄基)氨基)吡啶酰胺(实施例24)的制备
根据用于酰胺偶联的一般方法A,使4-甲基-3-(((2-(甲基氨基甲酰基)吡啶-4-基)氨基)甲基)苯甲酸与所需的胺反应得到下列化合物,制备了实施例23和实施例24。
Figure BDA0003960532040000831
Figure BDA0003960532040000841
实施例25
N-(2-甲基-5-((3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5(三氟甲基)苯基)氨基甲酰基)苄基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-甲酰胺
Figure BDA0003960532040000842
步骤1:4-甲基-3-(((1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-基)甲酰氨基)甲基)苯甲酸甲酯的制备
Figure BDA0003960532040000843
向如实施例18步骤1-2中所述制备的3-(氨基甲基)-4-甲基苯甲酸甲酯(0.300g,1.67mmol)、1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-甲酸(0.324g,2.01mmol)和HATU(0.636g,1.67mmol)在无水DCM(5mL)中的溶液中加入DIPEA(0.6mL,3.35mmol),然后将该混合物在RT搅拌16h。通过添加饱和NaHCO3使反应淬灭,然后用DCM(x3)萃取。用Na2SO4干燥有机层,蒸发至干。通过柱色谱法纯化粗产物(DCM:MeOH,98:2-96:4),得到标题酰胺,为黄白色固体(0.323g.60%)。
NMR(d-DMSO,300MHz):δ11.93(s,1H),9.04(t,J=5.7Hz,1H),8.78(d,J=2.1Hz,1H),8.50(d,J=2.0Hz,1H),7.91(d,J=1.5Hz,1H),7.77(dd,J=7.8,1.8Hz,1H),7.58(dd,J=3.5,2.3Hz,1H),7.34(d,J=7.9Hz,1H),6.63–6.55(m,1H),4.54(d,J=5.7Hz,2H),3.80(s,3H),2.43(s,3H)。
步骤2:3-((1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-甲酰氨基)甲基)-4-甲基苯甲酸锂的制备
Figure BDA0003960532040000851
将4-甲基-3-(((1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-基)甲酰氨基)甲基)苯甲酸甲酯(323mg,0.999mmol)溶于THF(10mL),然后加入1M LiOH水溶液(3.0mL),将该反应混合物在RT搅拌3天。接下来真空浓缩该反应混合物,将残余物与乙醚一起研磨,得到标题化合物,为亮黄色固体(238mg,76%)。
NMR(d-DMSO,300MHz):δ8.58(d,J=5.7Hz,1H),8.55(d,J=2.3Hz,1H),8.25(d,J=2.3Hz,1H),7.86(d,J=1.6Hz,1H),7.66(dd,J=7.6,1.7Hz,1H),7.47(d,J=2.6Hz,1H),7.05(d,J=7.7Hz,1H),6.25(d,J=2.6Hz,1H),4.45(d,J=5.3Hz,2H),2.32(s,3H)。
步骤3:N-(2-甲基-5-((3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)氨基甲酰基)苄基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-甲酰胺(实施例25)和N-(2-甲基-5-((3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)氨基甲酰基)苄基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-甲酰胺(实施例26)的制备使3-((1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-甲酰氨基)甲基)-4-甲基苯甲酸锂与所需的胺反应得到下列化合物,根据于酰胺偶联的一般方法A制备了实施例25和实施例26:
Figure BDA0003960532040000861
实施例27
N-(2-异丙基-5-((3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)氨基甲酰基)苄基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-甲酰胺
Figure BDA0003960532040000871
步骤1:3-(氨基甲基)-4-异丙基苯甲酸甲酯的制备
Figure BDA0003960532040000872
向如实施例16步骤1-2中所述制备的3-氰基-4-异丙基苯甲酸甲酯和3-氰基-4-丙基苯甲酸甲酯(2.76g,13.6mmol,1:1之比)在MeOH(200mL)中的混合物中加入阮内镍(4ml,6.80mmol)。在氢气气氛中(7atm.)将该反应混合物放入Parr仪器中。使反应在RT进行60h,然后通过硅藻土垫过滤,浓缩,真空干燥,得到粗产物,通过柱色谱法纯化(DCM:5.5M NH3的MeOH溶液,99:1至90:10)),得到异构体混合物(异构体之比1:1,1.33g,94%),为亮黄色油状物。
1H NMR(d-DMSO,300MHz):iPrδ7.77(ddd,J=15.1,8.0,2.0Hz,2H),3.83(s,3H),3.82(s,2H),3.25(七重峰,J=6.8Hz,1H),2.07(br,2H),1.20(d,J=6.8Hz,6H)nPrδ8.04(dd,J=11.3,1.9Hz,2H),7.27(d,J=7.9Hz,1H),3.83(s,3H),3.78(s,2H),2.71-2.59(m,2H),2.07(s,2H),1.57(六重峰,J=7.3Hz,2H),0.94(t,J=7.3Hz,3H)。
步骤2:3-((1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-甲酰氨基)甲基)-4-异丙基苯甲酸甲酯的制备
Figure BDA0003960532040000881
向1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-甲酸(250mg,1.54mmol)和HATU(488mg,1.283mmol)的混合物中加入3-(氨基甲基)-4-异丙基苯甲酸甲酯和3-(氨基甲基)-4-丙基苯甲酸甲酯(266mg,1.28mmol,1:1之比)在DCM(4.3mL)中的溶液,然后添加DIPEA(448μl,2.57mmol)。使反应在RT进行16h,然后用DCM稀释,用水洗涤,再用DCM萃取期望的化合物。浓缩合并的有机相,真空干燥,得到粗产物,通过FCC(己烷:EtOAc,100:0-50:50)纯化该粗产物,得到异构体混合物。接下来使异构体进行制备型HPLC分离,得到期望的异构体(105mg,47%),为白色结晶固体。
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ11.95(s,1H),9.06(t,J=5.7Hz,1H),8.77(d,J=2.1Hz,1H),8.49(d,J=2.1Hz,1H),7.95(d,J=1.9Hz,1H),7.85(dd,J=8.1,1.9Hz,1H),7.58(d,J=3.4Hz,1H),7.49(d,J=8.1Hz,1H),6.58(d,J=3.5Hz,1H),4.62(d,J=5.6Hz,2H),3.82(s,3H),3.38(s,1H),1.24(d,J=6.8Hz,6H)。
步骤3:3-((1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-甲酰氨基)甲基)-4-异丙基苯甲酸的制备
Figure BDA0003960532040000882
将3-((1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-甲酰氨基)甲基)-4-异丙基苯甲酸甲酯(0.105g,0.299mmol)溶于THF(3ml),向该溶液中加入1M LiOH溶液(0.65ml,0.448mmol),在35℃搅拌,历时60h。真空浓缩该反应体系,将得到的残余物溶于水,用10%KHSO4溶液酸化至pH=4。用EtOAc萃取产物,用Na2SO4干燥合并的有机层,真空浓缩,得到标题化合物(0.043g,43%),其未经额外的纯化被用于下一步。
1H NMR(300MHz,甲醇-d4)δ8.76(d,J=2.1Hz,1H),8.52(d,J=2.1Hz,1H),8.06(d,J=1.9Hz,1H),7.95(dd,J=8.1,1.9Hz,1H),7.51-7.46(m,2H),6.62(d,J=3.5Hz,1H),4.76(s,2H),3.41(p,J=7.0Hz,1H),1.32(d,J=6.8Hz,6H)。
步骤4:N-(2-异丙基-5-((3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)氨基甲酰基)苄基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-甲酰胺(实施例27)的制备
Figure BDA0003960532040000891
向3-((1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-甲酰氨基)甲基)-4-异丙基苯甲酸(0.043g,0.127mmol)在DMF(0.1mL)中的溶液中加入BTFFH(0.121g,0.382mmol)和DIPEA(0.100ml,0.574mmol)。将该混合物搅拌15分钟,然后加入3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯胺(0.052g,0.191mmol),将该反应混合物在80℃搅拌18h。然后用EtOAc稀释该混合物,用水洗涤。然后用盐水洗涤有机层,真空浓缩。通过制备型HPLC(ACN+0.1%FA,H2O+0.1%FA),随后通过制备型TLC(DCM:MeOH,90:10)纯化粗物质,得到标题化合物的甲酸盐。将得到的物质溶于MeOH,与Amberlite IRN-78一起搅拌2h,过滤,真空浓缩,得到标题化合物(0.003g,4%收率),为白色固体。
Figure BDA0003960532040000892
实施例28
N-(5-((3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)氨基甲酰基)-2-丙基苄基)咪唑并[1,2-a]吡啶-3-甲酰胺甲酸盐
Figure BDA0003960532040000901
步骤1:3-氰基-4-(丙-1-烯-2-基)苯甲酸甲酯;3-氰基-4-[(1E)-丙-1-烯-1-基]苯甲酸甲酯的制备
Figure BDA0003960532040000902
向4-溴-3-氰基苯甲酸甲酯(2.00g,8.33mmol)和异丙烯三氟硼酸钾(2.47g,16.7mmol)在iPrOH(21mL)中的溶液中加入TEA(4.7mL,33.3mmol),然后加入PdCl2(dppf)(0.305g,0.417mmol)。用氩气给该混合物脱气,在110℃搅拌过夜。接下来将该反应混合物浓缩至干,使其分配在EtOAc与水之间。用EtOAc(3x20mL)萃取水相,用水(3x20mL)和盐水(20mL)洗涤。用Na2SO4干燥合并的有机层,真空浓缩,得到粗产物,通过FCC(己烷:EtOAc,99:1-90:10)纯化给粗产物,得到产物,为异构体混合物(1:1之比,1.68g,56%)
1H NMR(d-DMSO,300MHz):δiPr 8.23(m,2H),7.96(d,J=8.4Hz,1H),5.52(t,J=1.5Hz,1H),5.33(s,1H,CH),3.90(s,3H),2.17(s,3H)δnPr 8.23(m,2H),7.70(m,1H),6.76(m,2H),3.90(s,3H),1.98(dd,J=6.2,1.1Hz,3H)。
步骤2:3-氰基-4-(丙-2-基)苯甲酸甲酯;3-氰基-4-丙基苯甲酸甲酯的制备
Figure BDA0003960532040000911
在Parr仪器中将3-氰基-4-(丙-1-烯-2-基)苯甲酸甲酯和3-氰基-4-[(1E)-丙-1-烯-1-基]苯甲酸甲酯的混合物(500mg,2.49mmol,1:1之比)溶于乙醇(100mL)。将10%披钯碳(5.89mg,0.05mmol)加到该反应混合物中,在氢气气氛中(7atm)搅拌16h。通过硅藻土过滤该反应混合物,真空浓缩,未经进一步纯化将3-氰基-4-(丙-2-基)苯甲酸甲酯和3-氰基-4-丙基苯甲酸甲酯的混合物(1:1之比,506mg,100%)用于下一步。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δiPr 8.26(dd,J=4.8,1.8Hz,2H),7.72(d,J=8.3Hz,1H),3.88(s,3H),3.29(m,1H),1.29(d,J=6.9Hz,6H)。δnPr 8.18(ddd,J=13.0,8.2,1.9Hz,2H),7.64(d,J=8.1Hz,1H),3.88(s,3H),2.84(dd,J=8.4,6.8Hz,2H),1.67(m,2H),0.93(t,J=7.4Hz,3H)。
步骤3:3-(氨基甲基)-4-(丙-2-基)苯甲酸甲酯;3-(氨基甲基)-4-丙基苯甲酸甲酯的制备
Figure BDA0003960532040000912
在Parr仪器中将3-氰基-4-(丙-2-基)苯甲酸甲酯和3-氰基-4-丙基苯甲酸甲酯的混合物(1:1之比,505mg,2.485mmol)溶于乙醇(300mL)。将阮内镍(5mL)加到该反应混合物中,在氢气气氛中(7atm)搅拌16h。通过硅藻土过滤该反应混合物,真空浓缩,得到粗物质,通过柱色谱法(DCM:5.5M NH3的MeOH溶液,99:1-98:2)纯化,得到3-(氨基甲基)-4-(丙-2-基)苯甲酸甲酯和3-(氨基甲基)-4-丙基苯甲酸甲酯的混合物(比例:1:1,118mg,23%)。
1H NMR(d-DMSO,400MHz):iPr:δ8.02(d,J=1.9Hz,1H),7.79(dd,J=8.1,2.0Hz,1H),7.41(d,J=8.1Hz,1H),3.84(s,3H),3.79(s,2H),3.26(七重峰,J=6.9Hz,1H),1.84(m,2H),1.20(d,J=6.8Hz,6H)。nPr:δ8.06(d,J=2.0Hz,1H),7.74(dd,J=7.9,2.0Hz,1H),7.27(d,J=7.9Hz,1H),3.84(s,3H),3.83(s,2H)2.64(m,2H),1.57(m,2H),0.94(t,J=7.3Hz)
步骤4:3-[({咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基}甲酰氨基)甲基]-4-(丙-2-基)苯甲酸甲酯;3-[({咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基}甲酰氨基)甲基]-4-丙基苯甲酸甲酯的制备
Figure BDA0003960532040000921
向3-(氨基甲基)-4-异丙基苯甲酸甲酯和3-(氨基甲基)-4-丙基苯甲酸甲酯(1:1之比,0.156g,0.748mmol)、咪唑并[1,2-a]吡啶-3-甲酸(0.146g,0.897mmol)和HATU(0.284g,0.748mmol)在DCM(7.5mL)中的溶液中加入DIPEA(0.26mL,1.50mmol),将该混合物在RT搅拌16h。通过添加水使反应淬灭,然后用DCM(3x25mL)萃取。用水(25mL)、盐水(20mL)洗涤合并的有机层,用Na2SO4干燥,过滤,真空浓缩。通过柱色谱法(DCM:MeOH,98:2),随后通过制备型HPLC纯化粗物质,得到异丙基(93mg,71%)和正丙基(108mg,82%)异构体。
1H NMR(300MHz,d-DMSO):δ(3-((咪唑并[1,2-a]吡啶-3-甲酰氨基)甲基)-4-异丙基苯甲酸甲酯)9.48(d,J=6.9Hz,1H),9.03(t,J=5.7Hz,1H),8.41(s,1H),7.95(d,J=1.9Hz,1H),7.86(dd,J=8.1,1.9Hz,1H),7.73(dt,J=9.0,1.2Hz,1H),7.54-7.43(m,2H),7.13(td,J=6.9,1.3Hz,1H),4.62(d,J=5.6Hz,2H),3.82(s,3H,),3.40(d,J=6.7Hz,1H),1.23(d,J=6.8Hz,6H)。
δ(3-((咪唑并[1,2-a]吡啶-3-甲酰氨基)甲基)-4-丙基苯甲酸甲酯)9.48(dt,J=7.0,1.2Hz,1H,CH),9.05(t,J=5.8Hz,1H,NH),8.42(s,1H,CH),7.95(d,J=1.9Hz,1H,CH),7.80(dd,J=7.9,1.9Hz,1H,CH),7.73(dt,J=9.1,1.2Hz,1H,CH),7.47(ddd,J=9.1,6.8,1.4Hz,1H,CH),7.36(d,J=8.0Hz,1H,CH),7.13(td,J=6.9,1.3Hz,1H,CH),4.59(d,J=5.7Hz,2H,CH2),3.81(s,3H,OCH3),2.79-2.70(m,2H,CH2),1.68-1.53(m,2H),0.94(t,J=7.3Hz,3H)。
步骤5:3-((咪唑并[1,2-a]吡啶-3-甲酰氨基)甲基)-4-丙基苯甲酸锂的制备
Figure BDA0003960532040000931
将3-((咪唑并[1,2-a]吡啶-3-甲酰氨基)甲基)-4-异丙基苯甲酸甲酯(108mg,0.293mmol)溶于THF(3mL),加入1M LiOH H2O溶液(0.70mL,0.700mmol),将该反应混合物在RT搅拌,历时3d。真空浓缩该反应混合物,与乙醚一起研磨,得到标题产物,为黄白色固体(114mg,100%)。
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ9.54(d,J=7.0Hz,1H),8.96(s,1H),8.42(s,1H),7.85(d,J=1.5Hz,1H),7.71(d,J=9.0Hz,1H),7.66(dd,J=7.8,1.6Hz,1H),7.49-7.41(m,1H),7.11(t,J=7.0Hz,1H),7.05(d,J=7.7Hz,1H),4.53(s,2H),2.68-2.59(m,2H),1.64-1.50(m,2H),0.92(t,J=7.3Hz,3H)。
步骤6:N-(5-((3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)氨基甲酰基)-2-丙基苄基)咪唑并[1,2-a]吡啶-3-甲酰胺甲酸盐(实施例28)的制备
根据用于酰胺偶联的一般方法B,使3-((咪唑并[1,2-a]吡啶-3-甲酰氨基)甲基)-4-丙基苯甲酸锂与所需的胺反应得到下列化合物,制备了实施例28:
Figure BDA0003960532040000941
实施例29
N-(3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)-4-丙基-3-((嘧啶-5-基氨基)甲基)苯甲酰胺
Figure BDA0003960532040000942
步骤1:4-丙基-3-((嘧啶-5-基氨基)甲基)苯甲酸和4-异丙基-3-((嘧啶-5-基氨基)甲基)苯甲酸的制备
向如实施例16步骤1-2中所述制备的3-(氨基甲基)-4-异丙基苯甲酸甲酯和3-(氨基甲基)-4-丙基苯甲酸甲酯(1:1之比,200mg,0.964mmol)的混合物中加入5-溴嘧啶(184mg,1.158mmol)和Cs2(CO)3(943mg,2.89mmol),随后加入甲苯(2mL)。给该混合物脱气,加入RuPhos(90mg,0.193mmol)和Pd(dba)2(55.5mg,0.096mmol),将该反应混合物在110℃搅拌过夜。通过硅藻土过滤该反应混合物,真空浓缩,得到粗产物,通过柱色谱法(DCM:MeOH,99:1-0:100),随后通过制备型HPLC纯化,得到异丙基异构体(69mg,53%)和正丙基(87mg,67%)异构体。
1H NMR iPr(300MHz,DMSO-d6)δ8.40(s,1H),8.14(s,2H),7.86(d,J=1.7Hz,1H),7.84-7.77(m,1H),7.38(d,J=8.0Hz,1H),6.56(t,J=5.5Hz,1H),4.36(d,J=5.2Hz,2H),3.23(sept.,J=6.8Hz,1H),1.22(d,J=6.8Hz,6H)。1H NMR nPr(300MHz,DMSO-d6)δ9.32(s,1H),8.38(s,1H),8.12(s,2H),7.82(d,J=1.7Hz,1H),7.69(dd,J=7.8,1.7Hz,1H),7.12(d,J=7.8Hz,1H),6.58(t,J=5.5Hz,1H),4.29(d,J=5.4Hz,2H),2.63(dd,J=8.9,6.5Hz,2H),1.68-1.49(m,2H),0.93(t,J=7.3Hz,3H)。
步骤2:N-(3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)-4-丙基-3-((嘧啶-5-基氨基)甲基)苯甲酰胺(实施例29)和4-异丙基-N-(3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)-3-((嘧啶-5-基氨基)甲基)苯甲酰胺(实施例30)的制备。
根据用于酰胺偶联的一般方法B,使4-丙基-3-((嘧啶-5-基氨基)甲基)苯甲酸和4-异丙基-3-((嘧啶-5-基氨基)甲基)苯甲酸与所需的胺反应得到下列化合物,制备了实施例29和实施例30:
Figure BDA0003960532040000961
Figure BDA0003960532040000971
实施例33
3-(((1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-基)氨基)甲基)-4-氟-N-(3-(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺
Figure BDA0003960532040000972
步骤1:4-氟-3-甲酰基-N-(3-(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺的制备
将4-氟-3-甲酰基苯甲酸(200mg,1.190mmol)在SOCl2(2.386ml,32.7mmol)中的溶液回流2h,然后真空蒸发以除去残留的SOCl2。将棕色固体残余物溶于无水THF(4.0ml),滴加到DIPEA(0.249ml,1.428mmol)、3-(三氟甲基)苯胺(192mg,1.190mmol)和DMAP(5.81mg,0.048mmol)在无水THF(2.0ml)中的溶液中。将该反应混合物在RT搅拌18h。通过添加至水(20mL)中使反应混合物淬灭。加入1M NaOH(4mL)以调节pH至10。用AcOEt(3×25mL)萃取产物,真空蒸发合并的有机萃取物,得到粗产物(548mg)。通过柱色谱法(己烷/DCM,1:3-0:1)纯化粗产物,得到标题产物(265mg,72%)。
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ10.76(s,1H),10.30(s,1H),8.51(dd,J=6.7,2.5Hz,1H),8.35(ddd,J=8.7,5.0,2.5Hz,1H),8.23(d,J=2.2Hz,1H),8.07(d,J=8.3Hz,1H),7.67–7.58(m,2H),7.52–7.46(m,1H)。
步骤2:3-(((1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-基)氨基)甲基)-4-氟-N-(3-(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺的制备
在氩气气氛中将4-氟-3-甲酰基-N-(3-(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺(80mg,0.257mmol)和1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-胺(34.2mg,0.257mmol)放入圆底烧瓶。加入冰AcOH(1.0ml),将反应混合物在RT搅拌3h。用冰水冷却反应混合物,然后加入STAB(163mg,0.771mmol)作为在冰醋酸中的混悬液(1.0ml),将反应混合物在RT搅拌72h。将反应混合物加到1M NaOH(50mL)中,用AcOEt(3×25mL)萃取水层,合并有机层,干燥(Na2SO4),过滤,蒸发,得到粗产物(126mg)。通过制备型TLC(SiO2,DCM/MeOH 100:5)纯化粗产物,得到标题化合物(35.26mg.32%)。
Figure BDA0003960532040000981
实施例34
4-甲基-3-((吡啶-3-基氨基)甲基)-N-(3-(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺
Figure BDA0003960532040000991
步骤1:3-甲酰基-4-甲基苯甲酰氯的制备
将3-甲酰基-4-甲基苯甲酸(1g,6.09mmol)溶于DCM(20.31ml)。将该溶液冷却至0℃,然后加入草酰氯(1.569ml,18.27mmol)和DMF(催化量)。将该反应混合物在冰浴中搅拌3h。通过用MeOH(甲酯)淬灭反应证实了酰氯的形成。浓缩该混合物,得到期望的产物(1.1g,99%),未经进一步纯化将该粗物质用于下一步。
步骤2:3-甲酰基-4-甲基-N-(3-(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺的制备
将3-甲酰基-4-甲基苯甲酰氯(1g,5.48mmol)溶于THF(5.37ml),将该溶液加到3-(三氟甲基)苯胺(0.684ml,5.48mmol)、DIPEA(1.145ml,6.57mmol)和DMAP(0.027g,0.219mmol)在THF(10.74ml)中的溶液中。将该混合物在RT搅拌过夜。浓缩该反应混合物。将粗物质溶于饱和NaHCO3,用DCM(x3)萃取。用5%柠檬酸洗涤全部合并的有机层,用Na2SO4干燥,过滤,浓缩。通过FCC(100%己烷至30%AcOEt的己烷溶液)纯化粗物质,得到期望的产物(1.13g,67%)。
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ10.68(s,1H),10.33(s,1H),8.46(d,J=2.1Hz,1H),8.25(d,J=2.0Hz,1H),8.16(dd,J=8.0,2.1Hz,1H),8.07(dt,J=7.9,2.3Hz,1H),7.62(t,J=8.0Hz,1H),7.54(d,J=8.0Hz,1H),7.51–7.44(m,1H),2.71(s,3H)。
步骤3:4-甲基-3-((吡啶-3-基氨基)甲基)-N-(3-(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺的制备
将3-甲酰基-4-甲基-N-(3-(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺(0.1g,0.325mmol)和吡啶-3-胺(0.031g,0.325mmol)溶于MeOH(1.63ml)和AcOH(0.06ml)。将该混合物在50℃搅拌1h,然后将反应混合物冷却至RT,加入NaBH3CN(0.092g,1.464mmol)。将该溶液在50℃搅拌1h。将该反应混合物冷却至RT,用1M NaOH水溶液淬灭,用AcOEt(x3)萃取产物。用Na2SO4干燥全部合并的有机层,过滤,浓缩。通过FCC(DCM 100%-10%MeOH的DCM溶液)纯化粗物质,然后通过制备型HPLC(ACN+0.1%FA,H2O+0.1%FA)再纯化。用饱和NaHCO3洗涤得到的产物以除去甲酸,得到期望的产物(48mg.38%)。
Figure BDA0003960532040001001
实施例35
4-氟-3-(((5-(1-甲基-1H-吡唑-3-基)吡啶-3-基)氨基)甲基)-N-(3-(三氟甲氧基)苯基)苯甲酰胺
Figure BDA0003960532040001002
步骤1:4-氟-3-甲酰基苯甲酰氯的制备
将4-氟-3-甲酰基苯甲酸(0.2g,1.190mmol)溶于DCM(5.95ml)。将该溶液冷却至0℃,然后加入草酰氯(0.306ml,3.57mmol)和DMF(催化量)。将该混合物在冰浴中搅拌3h。通过用MeOH(甲酯)淬灭反应证实了酰氯的形成。浓缩该反应混合物(222mg,100%),未经进一步纯化将该物质用于下一步。
步骤2:4-氟-3-甲酰基-N-(3-(三氟甲氧基)苯基)苯甲酰胺的制备
将4-氟-3-甲酰基苯甲酰氯(0.2g,1.072mmol)溶于THF(1.083ml),向该溶液中加入3-(三氟甲氧基)苯胺(0.172ml,1.286mmol)、DIPEA(0.224ml,1.286mmol)和DMAP(5.24mg,0.043mmol)在THF(2.166ml)中的溶液。将该混合物在RT搅拌过夜。用饱和NaHCO3稀释该反应混合物,用AcOEt(x3)萃取。用5%柠檬酸洗涤全部合并的有机层,用Na2SO4干燥,过滤,浓缩。通过FCC(100%己烷-50%AcOEt的己烷溶液)纯化粗物质,得到期望的产物(227mg,65%)。
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ10.71(s,1H),10.29(s,1H),8.48(dd,J=6.7,2.4Hz,1H),8.33(ddd,J=8.7,5.0,2.5Hz,1H),7.92(dq,J=2.3,1.1Hz,1H),7.78(ddd,J=8.3,2.0,0.9Hz,1H),7.61(dd,J=10.3,8.7Hz,1H),7.51(t,J=8.2Hz,1H),7.12(ddt,J=8.2,2.4,1.1Hz,1H)。
步骤3:4-氟-3-(((5-(1-甲基-1H-吡唑-3-基)吡啶-3-基)氨基)甲基)-N-(3-(三氟甲氧基)苯基)苯甲酰胺的制备
将4-氟-3-甲酰基-N-(3-(三氟甲氧基)苯基)苯甲酰胺(0.1g,0.306mmol)和5-(1-甲基-1H-吡唑-3-基)吡啶-3-胺(0.053g,0.306mmol)溶于MeOH(1.528ml)和AcOH(0.053ml,0.917mmol)。将该混合物在50℃搅拌1h,然后冷却至RT,然后加入NaBH3CN(0.086g,1.375mmol)。将该溶液在50℃搅拌1h。将该反应混合物冷却至RT,用饱和NaHCO3淬灭,用AcOEt(x3)萃取产物。用Na2SO4干燥全部合并的有机层,过滤,浓缩。通过FCC(100%DCM至10%MeOH的DCM溶液)纯化粗物质,然后通过制备型HPLC(ACN+0.1%NH3,H2O+0.1%NH3)纯化,得到期望的产物(47mg,32%)。
Figure BDA0003960532040001011
Figure BDA0003960532040001021
如对实施例35步骤1-3所述,在步骤3中应用商购胺并且使用STAB作为还原剂,通过还原氨基化制备了下列化合物。
Figure BDA0003960532040001022
实施例36
4-(二氟甲基)-N-(3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)-3-((嘧啶-5-基氨基)甲基)苯甲酰胺
Figure BDA0003960532040001031
步骤1:3-溴-4-(二氟甲基)苯甲酸甲酯的制备
将3-溴-4-甲酰基苯甲酸甲酯(5g,20.57mmol)溶于无水DCM(103ml),冷却至0℃。接下来加入DAST(4.08ml,30.9mmol),将该反应混合物在RT搅拌过夜。用饱和NaHCO3使该混合物淬灭,用DCM(x3)进行萃取。用Na2SO4干燥全部有机层,过滤,真空浓缩,得到期望的产物,其未经进一步纯化被用于下一步(5.37g,98%)。
1H NMR(300MHz,氯仿-d)δ8.28(q,J=1.4Hz,1H),8.07(dt,J=8.1,1.0Hz,1H),7.73(d,J=8.1Hz,1H),6.92(t,J=54.5Hz,1H),3.95(s,3H)。
步骤2:4-(二氟甲基)-3-乙烯基苯甲酸甲酯的制备
在烘干的压力反应器中,放入3-溴-4-(二氟甲基)苯甲酸甲酯(5.37g,20.26mmol)、三氟(乙烯基)硼酸钾(5.43g,40.5mmol)、K2CO3(7.00g,50.7mmol),在氩气气氛中经由注射器加入二噁烷(57.9ml)。给溶液充氩气(10分钟),然后加入Pd(dppf)Cl2(1.482g,2.026mmol)。密封试管,在110℃加热过夜。使该反应混合物通过硅藻土垫,用AcOEt洗涤。浓缩滤液,通过自动化FCC(洗脱系统:100%己烷至10%AcOEt的己烷溶液)纯化粗物质,得到期望的产物(2.49g,58%)。
1H NMR(300MHz,氯仿-d)δ8.23(t,J=1.2Hz,1H),8.01(dt,J=8.1,1.1Hz,1H),7.64(d,J=8.1Hz,1H),7.07(d,J=1.6Hz,1H),6.84(t,J=54.9Hz,2H),5.82(dd,J=17.4,0.9Hz,1H),5.52(dd,J=11.1,0.9Hz,1H),3.95(s,3H)。
步骤3:4-(二氟甲基)-3-甲酰基苯甲酸甲酯的制备
将4-(二氟甲基)-3-乙烯基苯甲酸甲酯(2.37g,11.17mmol)溶于无水DCM(55.8ml),冷却至-78℃。然后用臭氧使该反应体系起泡20min。此后,用氩气流替代臭氧气流。然后加入Me2S(1.230ml,16.75mmol),将该混合物在-78℃搅拌30min,随后在RT再搅拌30min。蒸发溶剂,通过FCC(100%己烷至30%AcOEt的己烷溶液)纯化粗物质,得到期望的产物(1.73,72%)。
1H NMR(300MHz,氯仿-d)δ10.21(s,1H),8.58(s,1H),8.36(dd,J=8.1,1.8Hz,1H),7.93(d,J=8.0Hz,1H),7.47(t,J=54.6Hz,1H),4.00(s,3H)。
步骤4:4-(二氟甲基)-3-(羟基甲基)苯甲酸和4-(二氟甲基)异酞酸混合物的制备
将4-(二氟甲基)-3-甲酰基苯甲酸甲酯(1.73g,8.08mmol)溶于MeOH(40.4ml),然后向该溶液中加入1M LiOH(32.3ml,32.3mmol)。将该混合物在RT搅拌1h。得到醇和羧酸的混合物,因为发生了Cannizzaro歧化。用AcOEt:1M HCl萃取粗产物。浓缩醇(0.76g,46%)和酸(0.76g,44%)的混合物,并将其原样用于下一步。
步骤5:4-(二氟甲基)-3-甲酰基苯甲酸的制备
将4-(二氟甲基)-3-(羟基甲基)苯甲酸(1.42g,7.02mmol)溶于乙腈(46.8ml),然后加入MnO2(1.832g,21.07mmol)。将该混合物在80℃搅拌过夜,然后将该反应混合物冷却至RT,通过硅藻土垫过滤。浓缩滤液,通过FCC(100%DCM至10%MeOH的DCM溶液)纯化粗物质,得到期望的产物(197mg,14%)。
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ13.65(s,1H),10.24(s,1H),8.58(d,J=1.5Hz,1H),8.34(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),7.96(d,J=8.1Hz,1H),7.65(t,J=54.5Hz,1H)。
步骤6:4-(二氟甲基)-3-甲酰基苯甲酰氯的制备
将4-(二氟甲基)-3-甲酰基苯甲酸(0.19g,0.949mmol)溶于DCM(4.75ml)。将该溶液冷却至0℃,然后加入草酰氯(0.245ml,2.85mmol)和DMF(催化量)。将该反应混合物在冰浴中搅拌3h,然后浓缩,未经进一步纯化将该物质用于下一步。
步骤7:4-(二氟甲基)-3-甲酰基-N-(3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺的制备
将4-(二氟甲基)-3-甲酰基苯甲酰氯(0.19g,0.869mmol)溶于THF(0.852ml),将该溶液加到3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯胺(0.210g,0.869mmol)、DIPEA(0.182ml,1.043mmol)和DMAP(4.25mg,0.035mmol)在THF(1.704ml)中的溶液中。将反应混合物在RT搅拌过夜。浓缩该反应混合物,将粗物质溶于1M NaOH,用AcOEt(x3)萃取。用Na2SO4干燥合并的有机层,过滤,浓缩,通过FCC(100%DCM至10%MeOH的DCM溶液)纯化粗物质,得到期望的化合物(146mg,40%)。
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ11.02(s,1H),10.30(d,J=1.2Hz,1H),8.66(d,J=1.7Hz,1H),8.41(dd,J=8.1,1.9Hz,1H),8.29(d,J=2.0Hz,1H),8.23(d,J=1.4Hz,1H),8.14(d,J=1.8Hz,1H),8.04(d,J=8.1Hz,1H),7.79(d,J=1.9Hz,1H),7.51(t,J=1.2Hz,1H),2.19(d,J=1.0Hz,3H)。
步骤8:4-(二氟甲基)-N-(3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)-3-((嘧啶-5-基氨基)甲基)苯甲酰胺的制备
将4-(二氟甲基)-3-甲酰基-N-(3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺(0.06g,0.142mmol)和嘧啶-5-胺(0.013g,0.142mmol)溶于MeOH(0.71ml)和AcOH(0.024ml)。加入分子筛,将该混合物在50℃搅拌过夜。此后,将反应混合物冷却至RT,加入NaBH3CN(0.040g,0.638mmol)。将该溶液在50℃搅拌1h。将该反应混合物冷却至RT,用1MNaOH水溶液淬灭,用AcOEt(x3)萃取产物,用Na2SO4干燥全部合并的有机层,过滤,浓缩。通过FCC(100%DCM至10%MeOH的DCM溶液)纯化粗物质,然后再通过制备型HPLC(ACN+0.1%NH3,H2O+0.1%NH3)再纯化,得到期望的产物,为白色固体(30mg,42%)。
Figure BDA0003960532040001061
实施例37
4-甲基-3-((嘧啶-5-基氨基)甲基)-N-(3-(三氟甲氧基)苯基)苯甲酰胺
Figure BDA0003960532040001062
步骤1:3-甲酰基-4-甲基-N-(3-(三氟甲氧基)苯基)苯甲酰胺的制备
将如实施例34步骤1中制备的3-甲酰基-4-甲基苯甲酰氯(0.6g,3.29mmol)溶于THF(3.22ml),将该溶液加到3-(三氟甲氧基)苯胺(0.582g,3.29mmol)、DIPEA(0.687ml,3.94mmol)和DMAP(0.016g,0.131mmol)在THF(6.44ml)中的溶液中。将该反应混合物在RT搅拌过夜。浓缩该反应混合物,将粗物质溶于饱和NaHCO3,用DCM萃取(x3)。用5%柠檬酸洗涤全部合并的有机层,用Na2SO4干燥,过滤,浓缩。通过FCC(100%己烷至30%AcOEt的己烷溶液)纯化粗物质,得到期望的产物(450mg,42%)。
1H NMR(300MHz,氯仿-d)δ10.37(s,1H),8.29(d,J=2.0Hz,1H),8.06(dd,J=8.0,2.0Hz,1H),8.01(s,1H),7.73(s,1H),7.56–7.50(m,1H),7.46–7.35(m,2H),7.07–7.00(m,1H),2.76(s,3H)。
步骤2:4-甲基-3-((嘧啶-5-基氨基)甲基)-N-(3-(三氟甲氧基)苯基)苯甲酰胺的制备
将3-甲酰基-4-甲基-N-(3-(三氟甲氧基)苯基)苯甲酰胺(0.1g,0.309mmol)和嘧啶-5-胺(0.029g,0.309mmol)溶于MeOH(1.547ml)和AcOH(0.053ml,0.928mmol)。将该混合物在50℃搅拌1h,将该反应混合物冷却至RT,然后加入NaBH3CN(0.087g,1.392mmol)。将该溶液在50℃搅拌1h。将该反应混合物冷却至RT,用DCM稀释。用饱和NaHCO3萃取溶液,用DCM(x2)洗涤水层。合并全部有机相,用Na2SO4干燥,过滤,浓缩。通过FCC(100%DCM至5%MeOH的DCM溶液)纯化粗物质,得到期望的产物(63mg,51%)。
Figure BDA0003960532040001071
本发明化合物的药理学活性
体外测定
结合测定
使用Life Technologies LanthaScreenTM铕激酶结合测定进行了DDR1和DDR2结合测定。将化合物与5nM DDR1(Carna Biosciences)或5nM DDR2(Life Technologies)在室温下在白色384孔Optiplate(PerkinElmer)中孵育1小时,所述Optiplate分别包含在测定缓冲液(50mM HEPES pH 7.5,10mM MgCI2,1mM EGTA和0.01%BRIJ35)中的20nM或10nM激酶示踪剂178和2nM铕标记的抗-GST抗体(Life Technologies)。
使用Tecan Spark 20M读板器获得在340nm激发后665nm/615nm荧光发射的比率。在GraphPad Prism 7.0软件中,使用4参数模型:log(抑制剂)与响应,确定了IC50值。使用Cheng-Prusoff方程(Ki=IC50/(1+[Tracer]/Kd),将IC50值转换为Ki。
DDR1基于细胞的测定
根据制造商的说明书,通过
Figure BDA0003960532040001081
U2OS DDR1测定法(EurofinsDiscoverX)评估了化合物对DDR1受体活化的抑制。简言之,将U2OS-DDR1细胞以5000个细胞/孔的密度接种在白色384孔板中,并且在37℃和5%CO2下孵育2小时。然后用不同浓度的化合物处理细胞并孵育30分钟,然后用20μg/ml牛II型胶原蛋白刺激并在37℃和5%CO2下孵育过夜。根据DiscoverX提供的方案制备了PathHunter检测试剂,并向每个孔中加入20μL/孔的该混合物。在室温下在黑暗中孵育板1小时后,用读板器获得发光信号。将原始数据相对于介质对照(用于校准的0%)和阳性对照(用于校准的100%;用20μg/ml胶原II处理细胞)校准,并使用具有可变斜率的S形剂量-响应曲线拟合,在GraphPad Prism 8.0软件中计算了IC50参数。
DDR2基于细胞的测定
通过磷酸-ELISA测定法在HEK293T-DDR2重组细胞中评估了化合物对DDR2磷酸化的抑制。简言之,将HEK293T-DDR2细胞以250.000个细胞/孔的密度接种在聚-D-赖氨酸包被的24孔板中,并在37℃和5%CO2下在DMEM+10%FBS中孵育1.5小时。此后,将培养基更换为无血清DMEM,并将细胞孵育3小时。然后在用50μg/ml牛II型胶原蛋白再刺激3小时前30分钟加入不同浓度的测试化合物。对于DDR2磷酸-ELISA测定法(DuoSet IC Human Phospho-DDR2;R&D Systems),通过添加60μL/孔的根据制造商的说明书制备的裂解缓冲液来获得蛋白质提取物。通过BCA测定法测定样品中的蛋白质浓度,并根据R&D Systems指示测定磷酸-DDR2的水平。将原始数据对最大抑制对照(校准的0%)和阳性对照(校准的100%;用20μg/ml胶原蛋白II处理的细胞)校准,并且使用具有可变斜率的S形剂量-响应曲线拟合,在GraphPad Prism 8.0软件中计算了IC50参数。
下表2中提供了个体化合物的结合测定的结果,其中根据关于其抑制活性的效力将这些化合物进行了分类,所述抑制活性表示为对DDR1和DDR2的Ki:
表2
Figure BDA0003960532040001091
Figure BDA0003960532040001101
DDR1
+:Ki包含1000至300nM
++:Ki包含300至30nM
+++:Ki低于30nM
DDR2
+:Ki包含1000至300nM
++:Ki包含300至30nM
+++:Ki低于30nM
在下表4中,根据基于细胞的测定,根据关于它们对DDR1和DDR2受体的抑制活性的效力(IC50)对本发明的一些化合物进行了分类。
表4
实施例编号 IC<sub>50</sub> DDR1 IC<sub>50</sub> DDR2
实施例20 ++ +
实施例31 ++ ++
实施例32 ++ ++
实施例34 ++ ++
实施例37 ++ +
实施例38 ++ +
实施例35 ++ ++
DDR1
+:IC50包含15至10nM
++:IC50低于10nM
DDR2
+:IC50包含15至10nM
++:IC50低于10nM
正如可以理解的,表2和表4的化合物显示出作为DDR1和DDR2受体拮抗剂的良好活性。因此,本发明的化合物可以有效地用于治疗与DDR受体相关的疾病、障碍或病症,例如纤维化,例如肺纤维化、特发性肺纤维化(IPF)、肝纤维化、肾纤维化、眼纤维化、心脏纤维化、动脉纤维化和系统性硬化症。

Claims (16)

1.式(I)的化合物,
Figure FDA0003960532030000011
其中
L和L1不同且独立地选自-C(O)和NH;L2不存在或为NH;
Z不存在或选自-CH2和-C(O);
R1选自-O(C1-C4)烷基、
Figure FDA0003960532030000012
n为1;
R选自(C1-C4)烷基和卤素;
R2选自选自杂芳基和杂环烷基,其中所述杂芳基和杂环烷基各自可以任选地被一个或多个-C(O)NHR6和CN取代;
R3选自(C1-C4)卤代烷基和-O(C1-C4)卤代烷基;
R4为H;
R5为H或选自(C1-C4)烷基和杂芳基(C1-C4)烷基-;
R6为H或(C1-C4)烷基;
及其药学上可接受的盐。
2.根据权利要求1所述的式(I)的化合物,其中R1位于相对于该分子其余部分的间位上,n为1,L2不存在,且R4为H,该化合物由通式(Ia)表示
Figure FDA0003960532030000021
其中
L和L1不同且独立地选自-C(O)和NH;
Z不存在或选自-CH2和-C(O);
R1选自-O(C1-C4)烷基、
Figure FDA0003960532030000022
n为1;
R为(C1-C4)烷基;
R2选自选自杂芳基和杂环烷基,其中所述杂芳基和杂环烷基各自可以任选地被一个或多个-C(O)NHR6和CN取代;
R3为(C1-C4)卤代烷基;
R5为H或选自(C1-C4)烷基和杂芳基(C1-C4)烷基-;
R6为H或(C1-C4)烷基;
及其药学上可接受的盐。
3.根据权利要求2所述的化合物,其中L和L1不同且独立地选自-C(O)和NH;
Z不存在或选自-CH2和-C(O);
R1选自-OCH3
Figure FDA0003960532030000023
n为1;
R选自甲基、乙基、丙基和异丙基;
R2选自嘧啶基、吡啶基、咪唑并[1,2-a]吡啶基、1H-吡咯并[2,3-b]吡啶基、吡唑并[1,5-a]嘧啶基、1H-吲唑基、吲唑基、4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]嘧啶基和苯并[d]噻唑基,其中所述杂芳基和杂环烷基各自可以任选地被一个或多个-C(O)NHR6和CN取代;
R3为三氟甲基;
R5为H或选自甲基、乙基和3-甲基咪唑并[1,2-a]吡啶基;
R6为H或甲基;
及其药学上可接受的盐。
4.根据权利要求2所述的化合物,其中R1
Figure FDA0003960532030000031
该化合物由式(Ib)表示
Figure FDA0003960532030000032
其中
L和L1不同且独立地选自-C(O)和NH;
Z不存在或选自-CH2和-C(O);
R为(C1-C4)烷基;
R2选自选自杂芳基和杂环烷基,其中所述杂芳基和杂环烷基各自可以任选地被一个或多个-C(O)NHR6和CN取代;
R3为(C1-C4)卤代烷基;
R5为H或选自(C1-C4)烷基和杂芳基(C1-C4)烷基-;
R6为H或(C1-C4)烷基;
及其药学上可接受的盐。
5.根据权利要求2所述的化合物,其中R1
Figure FDA0003960532030000041
该化合物由式(Ic)表示
Figure FDA0003960532030000042
其中
L和L1不同且独立地选自-C(O)和NH;
Z不存在或选自-CH2和-C(O);
R为(C1-C4)烷基;
R2选自杂芳基和杂环烷基,其中所述杂芳基和杂环烷基各自可以任选地被一个或多个-C(O)NHR6和CN取代;
R3为(C1-C4)卤代烷基;
R5为H或选自(C1-C4)烷基和杂芳基(C1-C4)烷基-;
R6为H或(C1-C4)烷基;
及其药学上可接受的盐。
6.根据权利要求1所述的化合物,其中L2不存在,R4和R5为-H,Z不存在,该化合物由式(If)表示
Figure FDA0003960532030000051
其中
L为-C(O);L1为-NH;
R1为H或选自-O(C1-C4)烷基和
Figure FDA0003960532030000052
R选自(C1-C4)烷基和卤素;
R2选自
Figure FDA0003960532030000053
R3选自(C1-C4)卤代烷基和-O(C1-C4)卤代烷基;
及其药学上可接受的盐。
7.根据权利要求6所述的化合物,其中L为-C(O);L1为-NH;R1为H或选自-OCH3
Figure FDA0003960532030000054
R选自甲基和氟;
R2选自
Figure FDA0003960532030000055
R3选自三氟甲基和三氟甲氧基;
及其药学上可接受的盐。
8.根据权利要求7所述的化合物,其中L为-C(O),L1为-NH,R1为H或-OCH3,R选自甲基和氟,R2选自
Figure FDA0003960532030000061
R3为三氟甲基;
及其药学上可接受的盐。
9.根据权利要求1至8所述的式(I)的化合物,选自如下化合物中的至少一种:
N-(2-甲基-5-((3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)氨基甲酰基)苄基)咪唑并[1,2-a]吡啶-3-甲酰胺;
4-甲基-N-(3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)-3-((嘧啶-5-基氨基)甲基)苯甲酰胺;
N-甲基-4-((2-甲基-5-((3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)氨基甲酰基)苄基)氨基)吡啶酰胺;
N-甲基-4-((2-甲基-5-((3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)氨基甲酰基)苄基)氨基)吡啶酰胺;
N-(2-甲基-5-((3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)氨基甲酰基)苄基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-甲酰胺;
N-(2-甲基-5-((3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)氨基甲酰基)苄基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-甲酰胺;
N-(2-甲基-5-((3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)氨基甲酰基)苄基)咪唑并[1,2-a]吡啶-3-甲酰胺
4-甲基-N-(3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)-3-((嘧啶-5-基氨基)甲基)苯甲酰胺;
4-甲基-N-(3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)-3-((吡唑并[1,5-a]嘧啶-6-基氨基)甲基)苯甲酰胺;
4-甲基-N-(3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)-3-((吡唑并[1,5-a]嘧啶-6-基氨基)甲基)苯甲酰胺;
N-(5-((3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)氨基甲酰基)-2-丙基苄基)咪唑并[1,2-a]吡啶-3-甲酰胺甲酸盐;
4-异丙基-N-(3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)-3-((嘧啶-5-基氨基)甲基)苯甲酰胺;
N-(3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)-4-丙基-3-((嘧啶-5-基氨基)甲基)苯甲酰胺;
N-甲基-4-((2-甲基-5-(3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯甲酰氨基)苄基)氨基)吡啶酰胺;
N-(2-异丙基-5-((3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)氨基甲酰基)苄基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-甲酰胺;
N-(4-甲基-3-((嘧啶-5-基氨基)甲基)苯基)-3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯甲酰胺;
4-异丙基-N-(3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5(三氟甲基)苯基)-3-((吡唑并[1,5-a]嘧啶-6-基氨基)甲基)苯甲酰胺;
N-(3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯基)-4-丙基-3-((吡唑并[1,5-a]嘧啶-6-基氨基)甲基)苯甲酰胺;
N-(4-甲基-3-(((嘧啶-5-基甲基)氨基)甲基)苯基)-3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯甲酰胺;
N-(3-((双(咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基甲基)氨基)甲基)-4-甲基苯基)-3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯甲酰胺;
N-甲基-4-(((2-甲基-5-(3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯甲酰氨基)苄基)氨基)甲基)吡啶酰胺;
N-(3-((((1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-基)甲基)氨基)甲基)-4-甲基苯基)-3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯甲酰胺;
3-((乙基(吡唑并[1,5-a]嘧啶-6-基)氨基)甲基)-4-甲基-N-(3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺;
4-甲基-N-(3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)-3-(((4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]嘧啶-6-基)氨基)甲基)苯甲酰胺;
3-(((1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-基)氨基)甲基)-4-甲基-N-(3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺;
3-(((1H-吲唑-5-基)氨基)甲基)-4-甲基-N-(3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺;
3-(((5-氰基吡啶-2-基)氨基)甲基)-4-甲基-N-(3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺;
3-(((2-氰基吡啶-4-基)氨基)甲基)-4-甲基-N-(3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺;
3-((苯并[d]噻唑-6-基氨基)甲基)-4-甲基-N-(3-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)-5-(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺;
N-(3-(((咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基甲基)氨基)甲基)-4-甲基苯基)-3-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)-5-(三氟甲基)苯甲酰胺;
N-(4-甲氧基-3-(三氟甲基)苯基)-4-甲基-3-((嘧啶-5-基氨基)甲基)苯甲酰胺;
3-(((1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-基)氨基)甲基)-4-氟-N-(3(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺;
4-甲基-3-((嘧啶-5-基氨基)甲基)-N-(3-(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺;
4-氟-3-(((5-(1-甲基-1H-吡唑-3-基)吡啶-3-基)氨基)甲基)-N-(3-(三氟甲氧基)苯基)苯甲酰胺。
10.药物组合物,包含与一种或多种药学上可接受的载体或赋形剂混合的根据权利要求1至9任一项所述的式(I)的化合物。
11.根据权利要求10所述的药物组合物,其用于经口施用或通过吸入施用。
12.根据权利要求1至9任一项所述的式(I)的化合物或根据权利要求10和11所述的药物组合物,其用作药物。
13.根据权利要求12所述应用的式(I)的化合物或药物组合物,其用于治疗与DDR1和DDR2失调相关的疾病、障碍或病症。
14.根据权利要求12和13所述应用的式(I)的化合物或药物组合物,其用于预防和/或治疗纤维化和/或牵涉纤维化的疾病、障碍或病症。
15.根据权利要求14所述应用的式(I)的化合物或药物组合物,其用于预防和/或治疗纤维化,包括肺纤维化、特发性肺纤维化(IPF)、肝纤维化、肾纤维化、眼纤维化、心脏纤维化、动脉纤维化和系统性硬化病。
16.根据权利要求15所述应用的式(I)的化合物或药物组合物,其用于预防和/或治疗特发性肺纤维化(IPF)。
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