CN115516090A - Trem组合物及其用途 - Google Patents
Trem组合物及其用途 Download PDFInfo
- Publication number
- CN115516090A CN115516090A CN202180028801.7A CN202180028801A CN115516090A CN 115516090 A CN115516090 A CN 115516090A CN 202180028801 A CN202180028801 A CN 202180028801A CN 115516090 A CN115516090 A CN 115516090A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- trem
- fragment
- absent
- domain
- independently
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 239000000203 mixture Substances 0.000 title claims description 249
- 238000012986 modification Methods 0.000 claims abstract description 378
- 230000004048 modification Effects 0.000 claims abstract description 377
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 373
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 347
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 claims description 156
- 239000002105 nanoparticle Substances 0.000 claims description 48
- 238000009472 formulation Methods 0.000 claims description 35
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims description 14
- RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-K thiophosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=S RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-K 0.000 claims description 12
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 claims description 6
- 125000001475 halogen functional group Chemical group 0.000 claims description 4
- 238000000034 method Methods 0.000 abstract description 141
- 239000012636 effector Substances 0.000 abstract description 5
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 596
- 108010064245 urinary gonadotropin fragment Proteins 0.000 description 246
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 177
- 108020004566 Transfer RNA Proteins 0.000 description 170
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 119
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 84
- 108091035707 Consensus sequence Proteins 0.000 description 74
- 125000002652 ribonucleotide group Chemical group 0.000 description 73
- YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N Dichloromethane Chemical compound ClCCl YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 69
- 125000005647 linker group Chemical group 0.000 description 66
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 63
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 61
- 108020005098 Anticodon Proteins 0.000 description 59
- 101000941029 Homo sapiens Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark Proteins 0.000 description 59
- -1 Methoxyethyl Chemical group 0.000 description 59
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 57
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 54
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 54
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 52
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 50
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 49
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 48
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 48
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 48
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 46
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 36
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 34
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 32
- HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N cholesterol Chemical compound C1C=C2C[C@@H](O)CC[C@]2(C)[C@@H]2[C@@H]1[C@@H]1CC[C@H]([C@H](C)CCCC(C)C)[C@@]1(C)CC2 HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N 0.000 description 32
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 30
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 27
- 230000006870 function Effects 0.000 description 26
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 25
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 25
- 229920002477 rna polymer Polymers 0.000 description 24
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 21
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 19
- 125000002091 cationic group Chemical group 0.000 description 19
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 19
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 17
- 235000012000 cholesterol Nutrition 0.000 description 16
- 125000000956 methoxy group Chemical group [H]C([H])([H])O* 0.000 description 16
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 15
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- 239000002585 base Substances 0.000 description 14
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 14
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 14
- 230000004962 physiological condition Effects 0.000 description 14
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 description 13
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 13
- 108091028664 Ribonucleotide Proteins 0.000 description 13
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 13
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 13
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 13
- 239000002336 ribonucleotide Substances 0.000 description 13
- 108020004485 Nonsense Codon Proteins 0.000 description 12
- 229930182558 Sterol Natural products 0.000 description 12
- 210000003494 hepatocyte Anatomy 0.000 description 12
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 12
- 150000008300 phosphoramidites Chemical class 0.000 description 12
- 150000003432 sterols Chemical class 0.000 description 12
- 235000003702 sterols Nutrition 0.000 description 12
- NYHBQMYGNKIUIF-UUOKFMHZSA-N Guanosine Chemical compound C1=NC=2C(=O)NC(N)=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O NYHBQMYGNKIUIF-UUOKFMHZSA-N 0.000 description 11
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 11
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 11
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 11
- XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N L-Cysteine Chemical compound SC[C@H](N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N 0.000 description 10
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 10
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 10
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 description 10
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 10
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 10
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 10
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 10
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 10
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Natural products CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 10
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 10
- 108700043045 nanoluc Proteins 0.000 description 10
- 150000003904 phospholipids Chemical class 0.000 description 10
- 241000894007 species Species 0.000 description 10
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 9
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 9
- LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N Ethylene glycol Chemical compound OCCO LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- JZNWSCPGTDBMEW-UHFFFAOYSA-N Glycerophosphorylethanolamin Natural products NCCOP(O)(=O)OCC(O)CO JZNWSCPGTDBMEW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 9
- 238000010511 deprotection reaction Methods 0.000 description 9
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 9
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 9
- GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N Adenine Chemical compound NC1=NC=NC2=C1N=CN2 GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 description 8
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 8
- 238000012377 drug delivery Methods 0.000 description 8
- 238000005538 encapsulation Methods 0.000 description 8
- 230000001124 posttranscriptional effect Effects 0.000 description 8
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 8
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 8
- RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N thymine Chemical compound CC1=CNC(=O)NC1=O RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 8
- 229930024421 Adenine Natural products 0.000 description 7
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 7
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P L-argininium(2+) Chemical compound NC(=[NH2+])NCCC[C@H]([NH3+])C(O)=O ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P 0.000 description 7
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 description 7
- 102000003960 Ligases Human genes 0.000 description 7
- 108090000364 Ligases Proteins 0.000 description 7
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 229960000643 adenine Drugs 0.000 description 7
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 229960003121 arginine Drugs 0.000 description 7
- 235000009697 arginine Nutrition 0.000 description 7
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 7
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 7
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 7
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 7
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N cytosine Chemical compound NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 7
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 7
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 235000004554 glutamine Nutrition 0.000 description 7
- 229960002743 glutamine Drugs 0.000 description 7
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N guanine Chemical compound O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 7
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 7
- 238000011068 loading method Methods 0.000 description 7
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 7
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 7
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 7
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 7
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 7
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 7
- 229960001153 serine Drugs 0.000 description 7
- 235000004400 serine Nutrition 0.000 description 7
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 7
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Chemical compound O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- BIABMEZBCHDPBV-MPQUPPDSSA-N 1,2-palmitoyl-sn-glycero-3-phospho-(1'-sn-glycerol) Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP(O)(=O)OC[C@@H](O)CO)OC(=O)CCCCCCCCCCCCCCC BIABMEZBCHDPBV-MPQUPPDSSA-N 0.000 description 6
- WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N Acetic anhydride Chemical compound CC(=O)OC(C)=O WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 description 6
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Chemical class O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 230000008859 change Effects 0.000 description 6
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 6
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 6
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 6
- 238000004020 luminiscence type Methods 0.000 description 6
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 6
- 210000003463 organelle Anatomy 0.000 description 6
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 6
- 238000001243 protein synthesis Methods 0.000 description 6
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 6
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 6
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 6
- 102000052866 Amino Acyl-tRNA Synthetases Human genes 0.000 description 5
- 108700028939 Amino Acyl-tRNA Synthetases Proteins 0.000 description 5
- MIKUYHXYGGJMLM-GIMIYPNGSA-N Crotonoside Natural products C1=NC2=C(N)NC(=O)N=C2N1[C@H]1O[C@@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1O MIKUYHXYGGJMLM-GIMIYPNGSA-N 0.000 description 5
- NYHBQMYGNKIUIF-UHFFFAOYSA-N D-guanosine Natural products C1=2NC(N)=NC(=O)C=2N=CN1C1OC(CO)C(O)C1O NYHBQMYGNKIUIF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N L-Proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 5
- BAVYZALUXZFZLV-UHFFFAOYSA-N Methylamine Chemical class NC BAVYZALUXZFZLV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 102000002508 Peptide Elongation Factors Human genes 0.000 description 5
- 108010068204 Peptide Elongation Factors Proteins 0.000 description 5
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 5
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-N Thiophosphoric acid Chemical group OP(O)(S)=O RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 5
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 5
- 125000001153 fluoro group Chemical group F* 0.000 description 5
- 229940029575 guanosine Drugs 0.000 description 5
- 125000005843 halogen group Chemical group 0.000 description 5
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 5
- RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N imidazole Natural products C1=CNC=N1 RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 150000003949 imides Chemical class 0.000 description 5
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 5
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 5
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 5
- 239000002777 nucleoside Substances 0.000 description 5
- 125000002467 phosphate group Chemical group [H]OP(=O)(O[H])O[*] 0.000 description 5
- WTJKGGKOPKCXLL-RRHRGVEJSA-N phosphatidylcholine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C)OC(=O)CCCCCCCC=CCCCCCCCC WTJKGGKOPKCXLL-RRHRGVEJSA-N 0.000 description 5
- 150000008104 phosphatidylethanolamines Chemical class 0.000 description 5
- 229920000765 poly(2-oxazolines) Polymers 0.000 description 5
- 229960002429 proline Drugs 0.000 description 5
- 238000003908 quality control method Methods 0.000 description 5
- 238000012552 review Methods 0.000 description 5
- 238000010532 solid phase synthesis reaction Methods 0.000 description 5
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 5
- 125000001731 2-cyanoethyl group Chemical group [H]C([H])(*)C([H])([H])C#N 0.000 description 4
- LRSASMSXMSNRBT-UHFFFAOYSA-N 5-methylcytosine Chemical compound CC1=CNC(=O)N=C1N LRSASMSXMSNRBT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 7H-purine Chemical compound N1=CNC2=NC=NC2=C1 KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 4
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 4
- HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N L-histidine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 4
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 4
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 4
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 4
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 4
- 229930185560 Pseudouridine Natural products 0.000 description 4
- PTJWIQPHWPFNBW-UHFFFAOYSA-N Pseudouridine C Natural products OC1C(O)C(CO)OC1C1=CNC(=O)NC1=O PTJWIQPHWPFNBW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 4
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000012190 activator Substances 0.000 description 4
- OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N adenosine group Chemical group [C@@H]1([C@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1)N1C=NC=2C(N)=NC=NC12 OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 4
- 229960003767 alanine Drugs 0.000 description 4
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 4
- 125000002947 alkylene group Chemical group 0.000 description 4
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 4
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 4
- 229960005261 aspartic acid Drugs 0.000 description 4
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 4
- WGDUUQDYDIIBKT-UHFFFAOYSA-N beta-Pseudouridine Natural products OC1OC(CN2C=CC(=O)NC2=O)C(O)C1O WGDUUQDYDIIBKT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 150000001841 cholesterols Chemical class 0.000 description 4
- 239000000356 contaminant Substances 0.000 description 4
- FPUGCISOLXNPPC-IOSLPCCCSA-N cordysinin B Chemical group CO[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C2=NC=NC(N)=C2N=C1 FPUGCISOLXNPPC-IOSLPCCCSA-N 0.000 description 4
- 229960002433 cysteine Drugs 0.000 description 4
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 4
- 239000005547 deoxyribonucleotide Substances 0.000 description 4
- ZPTBLXKRQACLCR-XVFCMESISA-N dihydrouridine Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(=O)NC(=O)CC1 ZPTBLXKRQACLCR-XVFCMESISA-N 0.000 description 4
- MWRBNPKJOOWZPW-CLFAGFIQSA-N dioleoyl phosphatidylethanolamine Chemical compound CCCCCCCC\C=C/CCCCCCCC(=O)OCC(COP(O)(=O)OCCN)OC(=O)CCCCCCC\C=C/CCCCCCCC MWRBNPKJOOWZPW-CLFAGFIQSA-N 0.000 description 4
- 239000002158 endotoxin Substances 0.000 description 4
- 229960002989 glutamic acid Drugs 0.000 description 4
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 4
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 4
- 229960002449 glycine Drugs 0.000 description 4
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229960002885 histidine Drugs 0.000 description 4
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 4
- 229960003136 leucine Drugs 0.000 description 4
- 229960003646 lysine Drugs 0.000 description 4
- 239000000463 material Substances 0.000 description 4
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 4
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 4
- 229960004452 methionine Drugs 0.000 description 4
- 150000003833 nucleoside derivatives Chemical class 0.000 description 4
- 238000002515 oligonucleotide synthesis Methods 0.000 description 4
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229960005190 phenylalanine Drugs 0.000 description 4
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 4
- PTJWIQPHWPFNBW-GBNDHIKLSA-N pseudouridine Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1C1=CNC(=O)NC1=O PTJWIQPHWPFNBW-GBNDHIKLSA-N 0.000 description 4
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 4
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 4
- 229960002898 threonine Drugs 0.000 description 4
- 229940113082 thymine Drugs 0.000 description 4
- 238000010361 transduction Methods 0.000 description 4
- 230000026683 transduction Effects 0.000 description 4
- 229960004799 tryptophan Drugs 0.000 description 4
- 229960004441 tyrosine Drugs 0.000 description 4
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229960004295 valine Drugs 0.000 description 4
- 239000004474 valine Substances 0.000 description 4
- SNKAWJBJQDLSFF-NVKMUCNASA-N 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine Chemical compound CCCCCCCC\C=C/CCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C)OC(=O)CCCCCCC\C=C/CCCCCCCC SNKAWJBJQDLSFF-NVKMUCNASA-N 0.000 description 3
- 125000002103 4,4'-dimethoxytriphenylmethyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C(*)(C1=C([H])C([H])=C(OC([H])([H])[H])C([H])=C1[H])C1=C([H])C([H])=C(OC([H])([H])[H])C([H])=C1[H] 0.000 description 3
- GONFBOIJNUKKST-UHFFFAOYSA-N 5-ethylsulfanyl-2h-tetrazole Chemical compound CCSC=1N=NNN=1 GONFBOIJNUKKST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108091027075 5S-rRNA precursor Proteins 0.000 description 3
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102000005427 Asialoglycoprotein Receptor Human genes 0.000 description 3
- 239000002126 C01EB10 - Adenosine Substances 0.000 description 3
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 3
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000713666 Lentivirus Species 0.000 description 3
- 239000004698 Polyethylene Substances 0.000 description 3
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 description 3
- 108700008625 Reporter Genes Proteins 0.000 description 3
- 125000002777 acetyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)=O 0.000 description 3
- 229960005305 adenosine Drugs 0.000 description 3
- 125000003545 alkoxy group Chemical group 0.000 description 3
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 3
- 108010006523 asialoglycoprotein receptor Proteins 0.000 description 3
- 229940106189 ceramide Drugs 0.000 description 3
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 3
- 238000011018 current good manufacturing practice Methods 0.000 description 3
- 229940104302 cytosine Drugs 0.000 description 3
- 238000005828 desilylation reaction Methods 0.000 description 3
- UAOMVDZJSHZZME-UHFFFAOYSA-N diisopropylamine Chemical compound CC(C)NC(C)C UAOMVDZJSHZZME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 3
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 3
- WGCNASOHLSPBMP-UHFFFAOYSA-N hydroxyacetaldehyde Natural products OCC=O WGCNASOHLSPBMP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000000787 lecithin Substances 0.000 description 3
- 235000010445 lecithin Nutrition 0.000 description 3
- 239000007791 liquid phase Substances 0.000 description 3
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 3
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 description 3
- 238000009126 molecular therapy Methods 0.000 description 3
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 3
- 125000004433 nitrogen atom Chemical group N* 0.000 description 3
- 230000037434 nonsense mutation Effects 0.000 description 3
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 3
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 3
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 3
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 description 3
- 239000000047 product Substances 0.000 description 3
- 230000004044 response Effects 0.000 description 3
- 239000002047 solid lipid nanoparticle Substances 0.000 description 3
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 3
- 230000006641 stabilisation Effects 0.000 description 3
- 238000011105 stabilization Methods 0.000 description 3
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 3
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 3
- 239000003981 vehicle Substances 0.000 description 3
- YIMATHOGWXZHFX-WCTZXXKLSA-N (2r,3r,4r,5r)-5-(hydroxymethyl)-3-(2-methoxyethoxy)oxolane-2,4-diol Chemical compound COCCO[C@H]1[C@H](O)O[C@H](CO)[C@H]1O YIMATHOGWXZHFX-WCTZXXKLSA-N 0.000 description 2
- KILNVBDSWZSGLL-KXQOOQHDSA-N 1,2-dihexadecanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C)OC(=O)CCCCCCCCCCCCCCC KILNVBDSWZSGLL-KXQOOQHDSA-N 0.000 description 2
- SLKDGVPOSSLUAI-PGUFJCEWSA-N 1,2-dihexadecanoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine zwitterion Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP(O)(=O)OCCN)OC(=O)CCCCCCCCCCCCCCC SLKDGVPOSSLUAI-PGUFJCEWSA-N 0.000 description 2
- NRJAVPSFFCBXDT-HUESYALOSA-N 1,2-distearoyl-sn-glycero-3-phosphocholine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C)OC(=O)CCCCCCCCCCCCCCCCC NRJAVPSFFCBXDT-HUESYALOSA-N 0.000 description 2
- LVNGJLRDBYCPGB-UHFFFAOYSA-N 1,2-distearoylphosphatidylethanolamine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OCC(COP([O-])(=O)OCC[NH3+])OC(=O)CCCCCCCCCCCCCCCCC LVNGJLRDBYCPGB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102100031251 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase PNPLA3 Human genes 0.000 description 2
- MCTWTZJPVLRJOU-UHFFFAOYSA-N 1-methyl-1H-imidazole Chemical compound CN1C=CN=C1 MCTWTZJPVLRJOU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IIZPXYDJLKNOIY-JXPKJXOSSA-N 1-palmitoyl-2-arachidonoyl-sn-glycero-3-phosphocholine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C)OC(=O)CCC\C=C/C\C=C/C\C=C/C\C=C/CCCCC IIZPXYDJLKNOIY-JXPKJXOSSA-N 0.000 description 2
- FPUGCISOLXNPPC-UHFFFAOYSA-N 2'-O-Methyladenosine Natural products COC1C(O)C(CO)OC1N1C2=NC=NC(N)=C2N=C1 FPUGCISOLXNPPC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NEZDNQCXEZDCBI-UHFFFAOYSA-N 2-azaniumylethyl 2,3-di(tetradecanoyloxy)propyl phosphate Chemical compound CCCCCCCCCCCCCC(=O)OCC(COP(O)(=O)OCCN)OC(=O)CCCCCCCCCCCCC NEZDNQCXEZDCBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- XIIAYQZJNBULGD-XWLABEFZSA-N 5α-cholestane Chemical compound C([C@@H]1CC2)CCC[C@]1(C)[C@@H]1[C@@H]2[C@@H]2CC[C@H]([C@H](C)CCCC(C)C)[C@@]2(C)CC1 XIIAYQZJNBULGD-XWLABEFZSA-N 0.000 description 2
- 102000011690 Adiponectin Human genes 0.000 description 2
- 108010076365 Adiponectin Proteins 0.000 description 2
- XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N Argon Chemical compound [Ar] XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000271566 Aves Species 0.000 description 2
- 241000537222 Betabaculovirus Species 0.000 description 2
- HMFHBZSHGGEWLO-SOOFDHNKSA-N D-ribofuranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H]1O HMFHBZSHGGEWLO-SOOFDHNKSA-N 0.000 description 2
- 241000702421 Dependoparvovirus Species 0.000 description 2
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N Diethyl ether Chemical compound CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 2
- 239000012630 HPLC buffer Substances 0.000 description 2
- 101001129184 Homo sapiens 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase PNPLA3 Proteins 0.000 description 2
- 239000012097 Lipofectamine 2000 Substances 0.000 description 2
- OVRNDRQMDRJTHS-KEWYIRBNSA-N N-acetyl-D-galactosamine Chemical compound CC(=O)N[C@H]1C(O)O[C@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1O OVRNDRQMDRJTHS-KEWYIRBNSA-N 0.000 description 2
- MBLBDJOUHNCFQT-UHFFFAOYSA-N N-acetyl-D-galactosamine Natural products CC(=O)NC(C=O)C(O)C(O)C(O)CO MBLBDJOUHNCFQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 2
- JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N Pyridine Chemical compound C1=CC=NC=C1 JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N Pyrimidine Chemical compound C1=CN=CN=C1 CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N Ribose Natural products OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N 0.000 description 2
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DRTQHJPVMGBUCF-XVFCMESISA-N Uridine Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(=O)NC(=O)C=C1 DRTQHJPVMGBUCF-XVFCMESISA-N 0.000 description 2
- 206010046865 Vaccinia virus infection Diseases 0.000 description 2
- ONFGSWFPYUVJQT-UHFFFAOYSA-N acetic acid;n,n-dimethylhexan-1-amine Chemical compound CC([O-])=O.CCCCCC[NH+](C)C ONFGSWFPYUVJQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000002252 acyl group Chemical group 0.000 description 2
- 230000002776 aggregation Effects 0.000 description 2
- 238000004220 aggregation Methods 0.000 description 2
- HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N alpha-D-Furanose-Ribose Natural products OCC1OC(O)C(O)C1O HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000004075 alteration Effects 0.000 description 2
- 150000001408 amides Chemical class 0.000 description 2
- 238000005571 anion exchange chromatography Methods 0.000 description 2
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 2
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 2
- MXYRUZAVJVIZOX-UHFFFAOYSA-N benzhydryloxy-chloro-bis(trimethylsilyloxy)silane Chemical compound C=1C=CC=CC=1C(O[Si](Cl)(O[Si](C)(C)C)O[Si](C)(C)C)C1=CC=CC=C1 MXYRUZAVJVIZOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000005415 bioluminescence Methods 0.000 description 2
- 230000029918 bioluminescence Effects 0.000 description 2
- 230000008499 blood brain barrier function Effects 0.000 description 2
- 210000001218 blood-brain barrier Anatomy 0.000 description 2
- 238000004422 calculation algorithm Methods 0.000 description 2
- 239000002775 capsule Substances 0.000 description 2
- 229920006317 cationic polymer Polymers 0.000 description 2
- 239000006143 cell culture medium Substances 0.000 description 2
- 230000033077 cellular process Effects 0.000 description 2
- 210000003763 chloroplast Anatomy 0.000 description 2
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 2
- 238000004891 communication Methods 0.000 description 2
- 229940125782 compound 2 Drugs 0.000 description 2
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 2
- 125000002637 deoxyribonucleotide group Chemical group 0.000 description 2
- 235000014113 dietary fatty acids Nutrition 0.000 description 2
- 241001493065 dsRNA viruses Species 0.000 description 2
- 238000002296 dynamic light scattering Methods 0.000 description 2
- 125000001495 ethyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 2
- 230000005284 excitation Effects 0.000 description 2
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 2
- 229930195729 fatty acid Natural products 0.000 description 2
- 239000000194 fatty acid Substances 0.000 description 2
- 150000004665 fatty acids Chemical class 0.000 description 2
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 2
- 238000004108 freeze drying Methods 0.000 description 2
- 230000030279 gene silencing Effects 0.000 description 2
- 238000012226 gene silencing method Methods 0.000 description 2
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 2
- 208000006454 hepatitis Diseases 0.000 description 2
- 231100000283 hepatitis Toxicity 0.000 description 2
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 2
- 238000007913 intrathecal administration Methods 0.000 description 2
- 229940067606 lecithin Drugs 0.000 description 2
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 2
- BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N methanoic acid Natural products OC=O BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JPVRJMGCWMBVMY-UHFFFAOYSA-N methylcarbamothioylsulfanyl n-methylcarbamodithioate Chemical compound CNC(=S)SSC(=S)NC JPVRJMGCWMBVMY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000000325 methylidene group Chemical group [H]C([H])=* 0.000 description 2
- 210000003470 mitochondria Anatomy 0.000 description 2
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 2
- 239000002086 nanomaterial Substances 0.000 description 2
- WWZKQHOCKIZLMA-UHFFFAOYSA-M octanoate Chemical compound CCCCCCCC([O-])=O WWZKQHOCKIZLMA-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 2
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 2
- SSZBUIDZHHWXNJ-UHFFFAOYSA-N palmityl stearate Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OCCCCCCCCCCCCCCCC SSZBUIDZHHWXNJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229950005564 patisiran Drugs 0.000 description 2
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 2
- 230000008569 process Effects 0.000 description 2
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 2
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 2
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 2
- 230000009711 regulatory function Effects 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- 239000002342 ribonucleoside Substances 0.000 description 2
- IXGZXXBJSZISOO-UHFFFAOYSA-N s-(2-phenylacetyl)sulfanyl 2-phenylethanethioate Chemical compound C=1C=CC=CC=1CC(=O)SSC(=O)CC1=CC=CC=C1 IXGZXXBJSZISOO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 2
- 239000000741 silica gel Substances 0.000 description 2
- 229910002027 silica gel Inorganic materials 0.000 description 2
- 150000003431 steroids Chemical class 0.000 description 2
- KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-L succinate(2-) Chemical compound [O-]C(=O)CCC([O-])=O KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 238000001308 synthesis method Methods 0.000 description 2
- 241001529453 unidentified herpesvirus Species 0.000 description 2
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 2
- 229940035893 uracil Drugs 0.000 description 2
- 208000007089 vaccinia Diseases 0.000 description 2
- 230000007332 vesicle formation Effects 0.000 description 2
- 210000002845 virion Anatomy 0.000 description 2
- 239000000277 virosome Substances 0.000 description 2
- 239000003643 water by type Substances 0.000 description 2
- 239000008215 water for injection Substances 0.000 description 2
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 2
- WWTBZEKOSBFBEM-SPWPXUSOSA-N (2s)-2-[[2-benzyl-3-[hydroxy-[(1r)-2-phenyl-1-(phenylmethoxycarbonylamino)ethyl]phosphoryl]propanoyl]amino]-3-(1h-indol-3-yl)propanoic acid Chemical compound N([C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)O)C(=O)C(CP(O)(=O)[C@H](CC=1C=CC=CC=1)NC(=O)OCC=1C=CC=CC=1)CC1=CC=CC=C1 WWTBZEKOSBFBEM-SPWPXUSOSA-N 0.000 description 1
- ASWBNKHCZGQVJV-UHFFFAOYSA-N (3-hexadecanoyloxy-2-hydroxypropyl) 2-(trimethylazaniumyl)ethyl phosphate Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OCC(O)COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C ASWBNKHCZGQVJV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JQMQKOQOLPGBBE-ZNCJEFCDSA-N (3s,5s,8s,9s,10r,13r,14s,17r)-3-hydroxy-10,13-dimethyl-17-[(2r)-6-methylheptan-2-yl]-1,2,3,4,5,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydrocyclopenta[a]phenanthren-6-one Chemical compound C([C@@H]1C(=O)C2)[C@@H](O)CC[C@]1(C)[C@@H]1[C@@H]2[C@@H]2CC[C@H]([C@H](C)CCCC(C)C)[C@@]2(C)CC1 JQMQKOQOLPGBBE-ZNCJEFCDSA-N 0.000 description 1
- 125000003161 (C1-C6) alkylene group Chemical group 0.000 description 1
- WRIDQFICGBMAFQ-UHFFFAOYSA-N (E)-8-Octadecenoic acid Natural products CCCCCCCCCC=CCCCCCCC(O)=O WRIDQFICGBMAFQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JUDOLRSMWHVKGX-UHFFFAOYSA-N 1,1-dioxo-1$l^{6},2-benzodithiol-3-one Chemical compound C1=CC=C2C(=O)SS(=O)(=O)C2=C1 JUDOLRSMWHVKGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FVXDQWZBHIXIEJ-LNDKUQBDSA-N 1,2-di-[(9Z,12Z)-octadecadienoyl]-sn-glycero-3-phosphocholine Chemical compound CCCCC\C=C/C\C=C/CCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C)OC(=O)CCCCCCC\C=C/C\C=C/CCCCC FVXDQWZBHIXIEJ-LNDKUQBDSA-N 0.000 description 1
- PORPENFLTBBHSG-MGBGTMOVSA-N 1,2-dihexadecanoyl-sn-glycerol-3-phosphate Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP(O)(O)=O)OC(=O)CCCCCCCCCCCCCCC PORPENFLTBBHSG-MGBGTMOVSA-N 0.000 description 1
- DSNRWDQKZIEDDB-SQYFZQSCSA-N 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phospho-(1'-sn-glycerol) Chemical compound CCCCCCCC\C=C/CCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP(O)(=O)OC[C@@H](O)CO)OC(=O)CCCCCCC\C=C/CCCCCCCC DSNRWDQKZIEDDB-SQYFZQSCSA-N 0.000 description 1
- TZCPCKNHXULUIY-RGULYWFUSA-N 1,2-distearoyl-sn-glycero-3-phosphoserine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP(O)(=O)OC[C@H](N)C(O)=O)OC(=O)CCCCCCCCCCCCCCCCC TZCPCKNHXULUIY-RGULYWFUSA-N 0.000 description 1
- HNSDLXPSAYFUHK-UHFFFAOYSA-N 1,4-bis(2-ethylhexyl) sulfosuccinate Chemical compound CCCCC(CC)COC(=O)CC(S(O)(=O)=O)C(=O)OCC(CC)CCCC HNSDLXPSAYFUHK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FJLUATLTXUNBOT-UHFFFAOYSA-N 1-Hexadecylamine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCN FJLUATLTXUNBOT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PAZGBAOHGQRCBP-ZCXUNETKSA-N 1-Palmitoyl-2-oleoylglycero-3-phosphoglycerol Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OCC(COP(O)(=O)OCC(O)CO)OC(=O)CCCCCCC\C=C/CCCCCCCC PAZGBAOHGQRCBP-ZCXUNETKSA-N 0.000 description 1
- RYCNUMLMNKHWPZ-SNVBAGLBSA-N 1-acetyl-sn-glycero-3-phosphocholine Chemical compound CC(=O)OC[C@@H](O)COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C RYCNUMLMNKHWPZ-SNVBAGLBSA-N 0.000 description 1
- XMTMNGJVSITJCN-UHFFFAOYSA-N 1-phosphanyloxy-n,n,n',n'-tetra(propan-2-yl)methanediamine Chemical compound CC(C)N(C(C)C)C(OP)N(C(C)C)C(C)C XMTMNGJVSITJCN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GVZJRBAUSGYWJI-UHFFFAOYSA-N 2,5-bis(3-dodecylthiophen-2-yl)thiophene Chemical compound C1=CSC(C=2SC(=CC=2)C2=C(C=CS2)CCCCCCCCCCCC)=C1CCCCCCCCCCCC GVZJRBAUSGYWJI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SJRSGWRVRYHUBT-UHFFFAOYSA-N 2-[bis(2-acetyloxyethoxy)methoxy]ethyl acetate Chemical compound CC(=O)OCCOC(OCCOC(C)=O)OCCOC(C)=O SJRSGWRVRYHUBT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NPRYCHLHHVWLQZ-TURQNECASA-N 2-amino-9-[(2R,3S,4S,5R)-4-fluoro-3-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-7-prop-2-ynylpurin-8-one Chemical compound NC1=NC=C2N(C(N(C2=N1)[C@@H]1O[C@@H]([C@H]([C@H]1O)F)CO)=O)CC#C NPRYCHLHHVWLQZ-TURQNECASA-N 0.000 description 1
- LQJBNNIYVWPHFW-UHFFFAOYSA-N 20:1omega9c fatty acid Natural products CCCCCCCCCCC=CCCCCCCCC(O)=O LQJBNNIYVWPHFW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZISVTYVLWSZJAL-UHFFFAOYSA-N 3,6-bis[4-[bis(2-hydroxydodecyl)amino]butyl]piperazine-2,5-dione Chemical compound CCCCCCCCCCC(O)CN(CC(O)CCCCCCCCCC)CCCCC1NC(=O)C(CCCCN(CC(O)CCCCCCCCCC)CC(O)CCCCCCCCCC)NC1=O ZISVTYVLWSZJAL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- TVZRAEYQIKYCPH-UHFFFAOYSA-N 3-(trimethylsilyl)propane-1-sulfonic acid Chemical compound C[Si](C)(C)CCCS(O)(=O)=O TVZRAEYQIKYCPH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 4-(3-methoxyphenyl)aniline Chemical compound COC1=CC=CC(C=2C=CC(N)=CC=2)=C1 OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HIQIXEFWDLTDED-UHFFFAOYSA-N 4-hydroxy-1-piperidin-4-ylpyrrolidin-2-one Chemical compound O=C1CC(O)CN1C1CCNCC1 HIQIXEFWDLTDED-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- TXLINXBIWJYFNR-UHFFFAOYSA-N 4-phenylpyridine-2-carbonitrile Chemical compound C1=NC(C#N)=CC(C=2C=CC=CC=2)=C1 TXLINXBIWJYFNR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RZIJZXUDFRSADE-UHFFFAOYSA-N 5-ethoxy-1,2,4-dithiazol-3-one Chemical compound CCOC1=NC(=O)SS1 RZIJZXUDFRSADE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LKDWQHQNDDNHSC-UHFFFAOYSA-N 5-phenyl-1,2,4-dithiazol-3-one Chemical compound S1SC(=O)N=C1C1=CC=CC=C1 LKDWQHQNDDNHSC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LIFHMKCDDVTICL-UHFFFAOYSA-N 6-(chloromethyl)phenanthridine Chemical compound C1=CC=C2C(CCl)=NC3=CC=CC=C3C2=C1 LIFHMKCDDVTICL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JQMQKOQOLPGBBE-UHFFFAOYSA-N 6-ketocholestanol Natural products C1C(=O)C2CC(O)CCC2(C)C2C1C1CCC(C(C)CCCC(C)C)C1(C)CC2 JQMQKOQOLPGBBE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QSBYPNXLFMSGKH-UHFFFAOYSA-N 9-Heptadecensaeure Natural products CCCCCCCC=CCCCCCCCC(O)=O QSBYPNXLFMSGKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000007469 Actins Human genes 0.000 description 1
- 108010085238 Actins Proteins 0.000 description 1
- 241001664176 Alpharetrovirus Species 0.000 description 1
- 241000710929 Alphavirus Species 0.000 description 1
- 241000024188 Andala Species 0.000 description 1
- 108020000948 Antisense Oligonucleotides Proteins 0.000 description 1
- 241000714230 Avian leukemia virus Species 0.000 description 1
- 241001485018 Baboon endogenous virus Species 0.000 description 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- 241000714266 Bovine leukemia virus Species 0.000 description 1
- XQRNWHMZFXXZKD-UHFFFAOYSA-N C(C)(C)(C)OO.[O] Chemical compound C(C)(C)(C)OO.[O] XQRNWHMZFXXZKD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000010453 CRISPR/Cas method Methods 0.000 description 1
- 108090000994 Catalytic RNA Proteins 0.000 description 1
- 102000053642 Catalytic RNA Human genes 0.000 description 1
- 241000711573 Coronaviridae Species 0.000 description 1
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 1
- 241000450599 DNA viruses Species 0.000 description 1
- BWGNESOTFCXPMA-UHFFFAOYSA-N Dihydrogen disulfide Chemical compound SS BWGNESOTFCXPMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 244000148064 Enicostema verticillatum Species 0.000 description 1
- 108010046276 FLP recombinase Proteins 0.000 description 1
- 241000714174 Feline sarcoma virus Species 0.000 description 1
- 241000710831 Flavivirus Species 0.000 description 1
- 208000000666 Fowlpox Diseases 0.000 description 1
- 241001663880 Gammaretrovirus Species 0.000 description 1
- 241000713813 Gibbon ape leukemia virus Species 0.000 description 1
- 102100031181 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Human genes 0.000 description 1
- ZWZWYGMENQVNFU-UHFFFAOYSA-N Glycerophosphorylserin Natural products OC(=O)C(N)COP(O)(=O)OCC(O)CO ZWZWYGMENQVNFU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HDIFHQMREAYYJW-XGXNLDPDSA-N Glyceryl Ricinoleate Chemical compound CCCCCC[C@@H](O)C\C=C/CCCCCCCC(=O)OCC(O)CO HDIFHQMREAYYJW-XGXNLDPDSA-N 0.000 description 1
- 108020005004 Guide RNA Proteins 0.000 description 1
- QCNWZROVPSVEJA-UHFFFAOYSA-N Heptadecanedioic acid Chemical compound OC(=O)CCCCCCCCCCCCCCCC(O)=O QCNWZROVPSVEJA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101100091360 Homo sapiens RNPC3 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000713673 Human foamy virus Species 0.000 description 1
- 241000701044 Human gammaherpesvirus 4 Species 0.000 description 1
- 241000701806 Human papillomavirus Species 0.000 description 1
- 241000714192 Human spumaretrovirus Species 0.000 description 1
- 206010061598 Immunodeficiency Diseases 0.000 description 1
- 208000029462 Immunodeficiency disease Diseases 0.000 description 1
- 239000000232 Lipid Bilayer Substances 0.000 description 1
- 239000012098 Lipofectamine RNAiMAX Substances 0.000 description 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 1
- 201000005505 Measles Diseases 0.000 description 1
- 241000712079 Measles morbillivirus Species 0.000 description 1
- 206010027626 Milia Diseases 0.000 description 1
- 241000713862 Moloney murine sarcoma virus Species 0.000 description 1
- 241000713333 Mouse mammary tumor virus Species 0.000 description 1
- 241000714177 Murine leukemia virus Species 0.000 description 1
- 241000711408 Murine respirovirus Species 0.000 description 1
- 241000714209 Norwalk virus Species 0.000 description 1
- REYJJPSVUYRZGE-UHFFFAOYSA-N Octadecylamine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCCN REYJJPSVUYRZGE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000005642 Oleic acid Substances 0.000 description 1
- ZQPPMHVWECSIRJ-UHFFFAOYSA-N Oleic acid Natural products CCCCCCCCC=CCCCCCCCC(O)=O ZQPPMHVWECSIRJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000012124 Opti-MEM Substances 0.000 description 1
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 1
- XYFCBTPGUUZFHI-UHFFFAOYSA-N Phosphine Chemical compound P XYFCBTPGUUZFHI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N Phosphorus Chemical compound [P] OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000709664 Picornaviridae Species 0.000 description 1
- KWYUFKZDYYNOTN-UHFFFAOYSA-M Potassium hydroxide Chemical compound [OH-].[K+] KWYUFKZDYYNOTN-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 241000125945 Protoparvovirus Species 0.000 description 1
- 206010037742 Rabies Diseases 0.000 description 1
- 241000711798 Rabies lyssavirus Species 0.000 description 1
- 241000702263 Reovirus sp. Species 0.000 description 1
- 241000712907 Retroviridae Species 0.000 description 1
- 241000714474 Rous sarcoma virus Species 0.000 description 1
- 206010039491 Sarcoma Diseases 0.000 description 1
- 229920005654 Sephadex Polymers 0.000 description 1
- 239000012507 Sephadex™ Substances 0.000 description 1
- 241000700584 Simplexvirus Species 0.000 description 1
- VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M Sodium acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 241000269319 Squalius cephalus Species 0.000 description 1
- NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N Sulfur Chemical compound [S] NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000000389 T-cell leukemia Diseases 0.000 description 1
- 208000028530 T-cell lymphoblastic leukemia/lymphoma Diseases 0.000 description 1
- 102000004338 Transferrin Human genes 0.000 description 1
- 108090000901 Transferrin Proteins 0.000 description 1
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 1
- 102000004243 Tubulin Human genes 0.000 description 1
- 108090000704 Tubulin Proteins 0.000 description 1
- 241000711975 Vesicular stomatitis virus Species 0.000 description 1
- NCCKLNBHGVLEFR-RORGUDSGSA-N [(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-1,3-diazinan-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxyphosphonamidous acid Chemical class O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](COP(O)N)O[C@H]1N1C(=O)NC(=O)CC1 NCCKLNBHGVLEFR-RORGUDSGSA-N 0.000 description 1
- DSNRWDQKZIEDDB-GCMPNPAFSA-N [(2r)-3-[2,3-dihydroxypropoxy(hydroxy)phosphoryl]oxy-2-[(z)-octadec-9-enoyl]oxypropyl] (z)-octadec-9-enoate Chemical compound CCCCCCCC\C=C/CCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP(O)(=O)OCC(O)CO)OC(=O)CCCCCCC\C=C/CCCCCCCC DSNRWDQKZIEDDB-GCMPNPAFSA-N 0.000 description 1
- CWRILEGKIAOYKP-SSDOTTSWSA-M [(2r)-3-acetyloxy-2-hydroxypropyl] 2-aminoethyl phosphate Chemical compound CC(=O)OC[C@@H](O)COP([O-])(=O)OCCN CWRILEGKIAOYKP-SSDOTTSWSA-M 0.000 description 1
- JLPULHDHAOZNQI-JLOPVYAASA-N [(2r)-3-hexadecanoyloxy-2-[(9e,12e)-octadeca-9,12-dienoyl]oxypropyl] 2-(trimethylazaniumyl)ethyl phosphate Chemical class CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C)OC(=O)CCCCCCC\C=C\C\C=C\CCCCC JLPULHDHAOZNQI-JLOPVYAASA-N 0.000 description 1
- LJGMGXXCKVFFIS-IATSNXCDSA-N [(3s,8s,9s,10r,13r,14s,17r)-10,13-dimethyl-17-[(2r)-6-methylheptan-2-yl]-2,3,4,7,8,9,11,12,14,15,16,17-dodecahydro-1h-cyclopenta[a]phenanthren-3-yl] decanoate Chemical compound C([C@@H]12)C[C@]3(C)[C@@H]([C@H](C)CCCC(C)C)CC[C@H]3[C@@H]1CC=C1[C@]2(C)CC[C@H](OC(=O)CCCCCCCCC)C1 LJGMGXXCKVFFIS-IATSNXCDSA-N 0.000 description 1
- RGAIHNZNCGOCLA-ZDSKVHJSSA-N [(Z)-non-2-enyl] 8-[2-(dimethylamino)ethylsulfanylcarbonyl-[8-[(Z)-non-2-enoxy]-8-oxooctyl]amino]octanoate Chemical compound CCCCCC\C=C/COC(=O)CCCCCCCN(CCCCCCCC(=O)OC\C=C/CCCCCC)C(=O)SCCN(C)C RGAIHNZNCGOCLA-ZDSKVHJSSA-N 0.000 description 1
- ATBOMIWRCZXYSZ-XZBBILGWSA-N [1-[2,3-dihydroxypropoxy(hydroxy)phosphoryl]oxy-3-hexadecanoyloxypropan-2-yl] (9e,12e)-octadeca-9,12-dienoate Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OCC(COP(O)(=O)OCC(O)CO)OC(=O)CCCCCCC\C=C\C\C=C\CCCCC ATBOMIWRCZXYSZ-XZBBILGWSA-N 0.000 description 1
- GSKVLVXXJRJNAN-UHFFFAOYSA-N [di(propan-2-yl)-$l^{3}-silanyl]oxy-di(propan-2-yl)silicon Chemical compound CC(C)[Si](C(C)C)O[Si](C(C)C)C(C)C GSKVLVXXJRJNAN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 1
- VUBTYKDZOQNADH-UHFFFAOYSA-N acetyl hexadecanoate Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC(C)=O VUBTYKDZOQNADH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000000397 acetylating effect Effects 0.000 description 1
- 230000021736 acetylation Effects 0.000 description 1
- 238000006640 acetylation reaction Methods 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 1
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 1
- 239000003513 alkali Substances 0.000 description 1
- AWUCVROLDVIAJX-UHFFFAOYSA-N alpha-glycerophosphate Natural products OCC(O)COP(O)(O)=O AWUCVROLDVIAJX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000006242 amine protecting group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 1
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 1
- 239000003957 anion exchange resin Substances 0.000 description 1
- 125000000129 anionic group Chemical group 0.000 description 1
- 239000000074 antisense oligonucleotide Substances 0.000 description 1
- 238000012230 antisense oligonucleotides Methods 0.000 description 1
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 1
- 150000001483 arginine derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 229910052786 argon Inorganic materials 0.000 description 1
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical compound [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000003236 benzoyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C(*)=O 0.000 description 1
- DRTQHJPVMGBUCF-PSQAKQOGSA-N beta-L-uridine Natural products O[C@H]1[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@@H]1N1C(=O)NC(=O)C=C1 DRTQHJPVMGBUCF-PSQAKQOGSA-N 0.000 description 1
- 239000012620 biological material Substances 0.000 description 1
- OWMVSZAMULFTJU-UHFFFAOYSA-N bis-tris Chemical compound OCCN(CCO)C(CO)(CO)CO OWMVSZAMULFTJU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000006227 byproduct Substances 0.000 description 1
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 101150038500 cas9 gene Proteins 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 239000013592 cell lysate Substances 0.000 description 1
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 1
- 230000005754 cellular signaling Effects 0.000 description 1
- 150000001783 ceramides Chemical class 0.000 description 1
- 229930183167 cerebroside Natural products 0.000 description 1
- 150000001784 cerebrosides Chemical class 0.000 description 1
- 238000007385 chemical modification Methods 0.000 description 1
- PCMNESDWYJJSOL-UHFFFAOYSA-N chloro-[[chloro-di(propan-2-yl)silyl]methyl]-di(propan-2-yl)silane Chemical compound CC(C)[Si](Cl)(C(C)C)C[Si](Cl)(C(C)C)C(C)C PCMNESDWYJJSOL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WORJEOGGNQDSOE-UHFFFAOYSA-N chloroform;methanol Chemical compound OC.ClC(Cl)Cl WORJEOGGNQDSOE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GGCLNOIGPMGLDB-GYKMGIIDSA-N cholest-5-en-3-one Chemical compound C1C=C2CC(=O)CC[C@]2(C)[C@@H]2[C@@H]1[C@@H]1CC[C@H]([C@H](C)CCCC(C)C)[C@@]1(C)CC2 GGCLNOIGPMGLDB-GYKMGIIDSA-N 0.000 description 1
- NYOXRYYXRWJDKP-UHFFFAOYSA-N cholestenone Natural products C1CC2=CC(=O)CCC2(C)C2C1C1CCC(C(C)CCCC(C)C)C1(C)CC2 NYOXRYYXRWJDKP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000010549 co-Evaporation Methods 0.000 description 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 1
- 229940125904 compound 1 Drugs 0.000 description 1
- 229940126208 compound 22 Drugs 0.000 description 1
- 230000001143 conditioned effect Effects 0.000 description 1
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 1
- 238000013267 controlled drug release Methods 0.000 description 1
- 239000011258 core-shell material Substances 0.000 description 1
- 238000012937 correction Methods 0.000 description 1
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 239000003599 detergent Substances 0.000 description 1
- 238000006642 detritylation reaction Methods 0.000 description 1
- 150000001982 diacylglycerols Chemical class 0.000 description 1
- RNPXCFINMKSQPQ-UHFFFAOYSA-N dicetyl hydrogen phosphate Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCOP(O)(=O)OCCCCCCCCCCCCCCCC RNPXCFINMKSQPQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940093541 dicetylphosphate Drugs 0.000 description 1
- 229940043279 diisopropylamine Drugs 0.000 description 1
- PSLWZOIUBRXAQW-UHFFFAOYSA-M dimethyl(dioctadecyl)azanium;bromide Chemical compound [Br-].CCCCCCCCCCCCCCCCCC[N+](C)(C)CCCCCCCCCCCCCCCCCC PSLWZOIUBRXAQW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 150000002016 disaccharides Chemical class 0.000 description 1
- ZGSPNIOCEDOHGS-UHFFFAOYSA-L disodium [3-[2,3-di(octadeca-9,12-dienoyloxy)propoxy-oxidophosphoryl]oxy-2-hydroxypropyl] 2,3-di(octadeca-9,12-dienoyloxy)propyl phosphate Chemical compound [Na+].[Na+].CCCCCC=CCC=CCCCCCCCC(=O)OCC(OC(=O)CCCCCCCC=CCC=CCCCCC)COP([O-])(=O)OCC(O)COP([O-])(=O)OCC(OC(=O)CCCCCCCC=CCC=CCCCCC)COC(=O)CCCCCCCC=CCC=CCCCCC ZGSPNIOCEDOHGS-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 238000004090 dissolution Methods 0.000 description 1
- VZAYEUGFBZPZGZ-UHFFFAOYSA-N dithiazole-5-thione Chemical compound S=C1C=NSS1 VZAYEUGFBZPZGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XSWSEQPWKOWORN-UHFFFAOYSA-N dodecan-2-ol Chemical compound CCCCCCCCCCC(C)O XSWSEQPWKOWORN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JRBPAEWTRLWTQC-UHFFFAOYSA-N dodecylamine Chemical compound CCCCCCCCCCCCN JRBPAEWTRLWTQC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000007876 drug discovery Methods 0.000 description 1
- 238000001035 drying Methods 0.000 description 1
- 230000002500 effect on skin Effects 0.000 description 1
- 239000012149 elution buffer Substances 0.000 description 1
- 210000002889 endothelial cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 230000001973 epigenetic effect Effects 0.000 description 1
- 210000003743 erythrocyte Anatomy 0.000 description 1
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 description 1
- 210000001808 exosome Anatomy 0.000 description 1
- 238000010195 expression analysis Methods 0.000 description 1
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 1
- 238000001125 extrusion Methods 0.000 description 1
- 229940014144 folate Drugs 0.000 description 1
- OVBPIULPVIDEAO-LBPRGKRZSA-N folic acid Chemical compound C=1N=C2NC(N)=NC(=O)C2=NC=1CNC1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 OVBPIULPVIDEAO-LBPRGKRZSA-N 0.000 description 1
- 235000019152 folic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000011724 folic acid Substances 0.000 description 1
- 235000019253 formic acid Nutrition 0.000 description 1
- 231100000221 frame shift mutation induction Toxicity 0.000 description 1
- 230000037433 frameshift Effects 0.000 description 1
- 239000012737 fresh medium Substances 0.000 description 1
- 230000005714 functional activity Effects 0.000 description 1
- 238000001476 gene delivery Methods 0.000 description 1
- 238000001415 gene therapy Methods 0.000 description 1
- 238000010362 genome editing Methods 0.000 description 1
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 1
- 108020004445 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- 229940116338 glyceryl ricinoleate Drugs 0.000 description 1
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 1
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000002431 hydrogen Chemical class 0.000 description 1
- IKGLACJFEHSFNN-UHFFFAOYSA-N hydron;triethylazanium;trifluoride Chemical compound F.F.F.CCN(CC)CC IKGLACJFEHSFNN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 1
- 239000005457 ice water Substances 0.000 description 1
- 230000007813 immunodeficiency Effects 0.000 description 1
- 238000011065 in-situ storage Methods 0.000 description 1
- 230000000415 inactivating effect Effects 0.000 description 1
- 239000005414 inactive ingredient Substances 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 230000036512 infertility Effects 0.000 description 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 1
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 1
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 description 1
- 238000007912 intraperitoneal administration Methods 0.000 description 1
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 1
- QXJSBBXBKPUZAA-UHFFFAOYSA-N isooleic acid Natural products CCCCCCCC=CCCCCCCCCC(O)=O QXJSBBXBKPUZAA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000400 lauroyl group Chemical group O=C([*])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 238000012454 limulus amebocyte lysate test Methods 0.000 description 1
- 238000001638 lipofection Methods 0.000 description 1
- 238000004895 liquid chromatography mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 239000012160 loading buffer Substances 0.000 description 1
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 1
- ZJEZSISCHHJCIO-UHFFFAOYSA-N methyl 4-(dimethylamino)butanoate Chemical class COC(=O)CCCN(C)C ZJEZSISCHHJCIO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 1
- 150000002772 monosaccharides Chemical class 0.000 description 1
- 125000001419 myristoyl group Chemical group O=C([*])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 231100000252 nontoxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000003000 nontoxic effect Effects 0.000 description 1
- 230000000269 nucleophilic effect Effects 0.000 description 1
- 125000003835 nucleoside group Chemical group 0.000 description 1
- ZQPPMHVWECSIRJ-KTKRTIGZSA-N oleic acid Chemical compound CCCCCCCC\C=C/CCCCCCCC(O)=O ZQPPMHVWECSIRJ-KTKRTIGZSA-N 0.000 description 1
- 125000002811 oleoyl group Chemical group O=C([*])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])/C([H])=C([H])\C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 229920001542 oligosaccharide Chemical class 0.000 description 1
- 150000002482 oligosaccharides Chemical class 0.000 description 1
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 1
- AICOOMRHRUFYCM-ZRRPKQBOSA-N oxazine, 1 Chemical compound C([C@@H]1[C@H](C(C[C@]2(C)[C@@H]([C@H](C)N(C)C)[C@H](O)C[C@]21C)=O)CC1=CC2)C[C@H]1[C@@]1(C)[C@H]2N=C(C(C)C)OC1 AICOOMRHRUFYCM-ZRRPKQBOSA-N 0.000 description 1
- 230000001590 oxidative effect Effects 0.000 description 1
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 1
- 125000001312 palmitoyl group Chemical group O=C([*])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- 239000000816 peptidomimetic Substances 0.000 description 1
- 229940124531 pharmaceutical excipient Drugs 0.000 description 1
- 239000000825 pharmaceutical preparation Substances 0.000 description 1
- 229940127557 pharmaceutical product Drugs 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 150000003905 phosphatidylinositols Chemical class 0.000 description 1
- OJMIONKXNSYLSR-UHFFFAOYSA-N phosphorous acid Chemical compound OP(O)O OJMIONKXNSYLSR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052698 phosphorus Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011574 phosphorus Substances 0.000 description 1
- 229940068065 phytosterols Drugs 0.000 description 1
- BASFCYQUMIYNBI-UHFFFAOYSA-N platinum Chemical compound [Pt] BASFCYQUMIYNBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920000058 polyacrylate Polymers 0.000 description 1
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 1
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 1
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 1
- 229920001282 polysaccharide Chemical class 0.000 description 1
- 239000005017 polysaccharide Chemical class 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- AJAMRCUNWLZBDF-UHFFFAOYSA-N propyl octadeca-9,12-dienoate Chemical compound CCCCCC=CCC=CCCCCCCCC(=O)OCCC AJAMRCUNWLZBDF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 description 1
- 230000012846 protein folding Effects 0.000 description 1
- 230000002685 pulmonary effect Effects 0.000 description 1
- 238000010298 pulverizing process Methods 0.000 description 1
- UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N pyridine Natural products COC1=CC=CN=C1 UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000010791 quenching Methods 0.000 description 1
- 230000000171 quenching effect Effects 0.000 description 1
- 230000035484 reaction time Effects 0.000 description 1
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 1
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 1
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 1
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 1
- 210000001995 reticulocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000001177 retroviral effect Effects 0.000 description 1
- 210000003705 ribosome Anatomy 0.000 description 1
- 108091092562 ribozyme Proteins 0.000 description 1
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 1
- 239000012488 sample solution Substances 0.000 description 1
- 238000013515 script Methods 0.000 description 1
- 230000011664 signaling Effects 0.000 description 1
- 239000002356 single layer Substances 0.000 description 1
- 238000002791 soaking Methods 0.000 description 1
- WRIKHQLVHPKCJU-UHFFFAOYSA-N sodium bis(trimethylsilyl)amide Chemical compound C[Si](C)(C)N([Na])[Si](C)(C)C WRIKHQLVHPKCJU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 1
- 210000000952 spleen Anatomy 0.000 description 1
- 230000002269 spontaneous effect Effects 0.000 description 1
- 125000003696 stearoyl group Chemical group O=C([*])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011593 sulfur Substances 0.000 description 1
- 230000000153 supplemental effect Effects 0.000 description 1
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 1
- 238000010189 synthetic method Methods 0.000 description 1
- 230000009885 systemic effect Effects 0.000 description 1
- CIHOLLKRGTVIJN-UHFFFAOYSA-N tert‐butyl hydroperoxide Chemical compound CC(C)(C)OO CIHOLLKRGTVIJN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FPGGTKZVZWFYPV-UHFFFAOYSA-M tetrabutylammonium fluoride Chemical compound [F-].CCCC[N+](CCCC)(CCCC)CCCC FPGGTKZVZWFYPV-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- DPKBAXPHAYBPRL-UHFFFAOYSA-M tetrabutylazanium;iodide Chemical compound [I-].CCCC[N+](CCCC)(CCCC)CCCC DPKBAXPHAYBPRL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 1
- 229940126585 therapeutic drug Drugs 0.000 description 1
- 238000004809 thin layer chromatography Methods 0.000 description 1
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 1
- 239000012096 transfection reagent Substances 0.000 description 1
- 239000012581 transferrin Substances 0.000 description 1
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000004043 trisaccharides Chemical class 0.000 description 1
- 238000004704 ultra performance liquid chromatography Methods 0.000 description 1
- 241000712461 unidentified influenza virus Species 0.000 description 1
- DRTQHJPVMGBUCF-UHFFFAOYSA-N uracil arabinoside Natural products OC1C(O)C(CO)OC1N1C(=O)NC(=O)C=C1 DRTQHJPVMGBUCF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940045145 uridine Drugs 0.000 description 1
- 230000017613 viral reproduction Effects 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
- A61K31/7088—Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
- A61K48/0008—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy characterised by an aspect of the 'non-active' part of the composition delivered, e.g. wherein such 'non-active' part is not delivered simultaneously with the 'active' part of the composition
- A61K48/0025—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy characterised by an aspect of the 'non-active' part of the composition delivered, e.g. wherein such 'non-active' part is not delivered simultaneously with the 'active' part of the composition wherein the non-active part clearly interacts with the delivered nucleic acid
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K9/00—Medicinal preparations characterised by special physical form
- A61K9/10—Dispersions; Emulsions
- A61K9/127—Liposomes
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K9/00—Medicinal preparations characterised by special physical form
- A61K9/48—Preparations in capsules, e.g. of gelatin, of chocolate
- A61K9/50—Microcapsules having a gas, liquid or semi-solid filling; Solid microparticles or pellets surrounded by a distinct coating layer, e.g. coated microspheres, coated drug crystals
- A61K9/51—Nanocapsules; Nanoparticles
- A61K9/5107—Excipients; Inactive ingredients
- A61K9/5123—Organic compounds, e.g. fats, sugars
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/67—General methods for enhancing the expression
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/30—Chemical structure
- C12N2310/31—Chemical structure of the backbone
- C12N2310/313—Phosphorodithioates
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/30—Chemical structure
- C12N2310/31—Chemical structure of the backbone
- C12N2310/315—Phosphorothioates
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/30—Chemical structure
- C12N2310/32—Chemical structure of the sugar
- C12N2310/321—2'-O-R Modification
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/30—Chemical structure
- C12N2310/32—Chemical structure of the sugar
- C12N2310/322—2'-R Modification
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/30—Chemical structure
- C12N2310/33—Chemical structure of the base
- C12N2310/334—Modified C
- C12N2310/3341—5-Methylcytosine
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/30—Chemical structure
- C12N2310/35—Nature of the modification
- C12N2310/352—Nature of the modification linked to the nucleic acid via a carbon atom
- C12N2310/3521—Methyl
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/30—Chemical structure
- C12N2310/35—Nature of the modification
- C12N2310/352—Nature of the modification linked to the nucleic acid via a carbon atom
- C12N2310/3525—MOE, methoxyethoxy
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/30—Chemical structure
- C12N2310/35—Nature of the modification
- C12N2310/353—Nature of the modification linked to the nucleic acid via an atom other than carbon
- C12N2310/3531—Hydrogen
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/30—Chemical structure
- C12N2310/35—Nature of the modification
- C12N2310/353—Nature of the modification linked to the nucleic acid via an atom other than carbon
- C12N2310/3533—Halogen
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Public Health (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Optics & Photonics (AREA)
- Nanotechnology (AREA)
- Dispersion Chemistry (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Acyclic And Carbocyclic Compounds In Medicinal Compositions (AREA)
- Medicinal Preparation (AREA)
- Detergent Compositions (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
本发明总体上涉及具有非天然存在的修饰的基于tRNA的效应子分子及其相关方法。
Description
相关申请的交叉引用
本申请要求2020年4月14日提交的美国临时申请63/009,669的优先权，该申请的全部内容特此通过引用并入。
背景技术
转移核糖核酸(tRNA)是复杂的、天然存在的RNA分子，其具有多种功能，包含蛋白质的起始和延伸。
发明内容
本披露的特征在于基于经修饰的tRNA的效应子分子(TREM，例如，TREM或TREM片段)以及相关组合物及其用途。如本文所披露，TREM是可以介导多种细胞过程的复杂分子。本文披露的TREM包含至少一个修饰(例如，非天然存在的修饰)，例如，在组分核苷酸(例如核酶或糖)上或在核苷酸间区域内，例如，TREM主链。在一个方面，本文提供了TREM，其包含式A的序列：[L1]-[ASt结构域1]-[L2]-[DH结构域]-[L3]-[ACH结构域]-[VL结构域]-[TH结构域]-[L4]-[ASt结构域2]，其中[L1]和[VL结构域]是独立地任选的；[L1]、[ASt结构域1]、[L2]-[DH结构域]、[L3]、[ACH结构域]、[VL结构域]、[TH结构域]、[L4]、和[ASt结构域2]包含含有非天然存在的修饰的核苷酸。
在实施例中，TREM：(a)能够：(i)支持蛋白质合成，(ii)被合成酶加载，(iii)被延长因子结合，(iv)将氨基酸引入肽链，(v)支持延长，或(vi)支持起始；(b)包含至少X个没有非天然存在的修饰的连续核苷酸，其中X大于3、4、5、6、7、8、9或10；(c)包含一种类型(例如A、T、C、G或U)的至少3个但少于所有的核苷酸包含相同的非天然存在的修饰；(d)包含一种类型(例如A、T、C、G或U)的至少X个不包含非天然存在的修饰的核苷酸，其中X＝1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49或50；(e)包含一种类型(例如A、T、C、G或U)的不超过5、10或15个包含非天然存在的修饰的核苷酸；和/或(f)包含一种类型(例如A、T、C、G或U)的不超过5、10或15个不包含非天然存在的修饰的核苷酸。
在实施例中，TREM包含特征(a)(i)。在实施例中，TREM包含特征(a)(ii)。在实施例中，TREM包含特征(a)(iii)。在实施例中，TREM包含特征(a)(iv)。在实施例中，TREM包含特征(a)(v)。在实施例中，TREM包含特征(a)(vi)。在实施例中，TREM包含特征(b)。在实施例中，TREM包含特征(c)。在实施例中，TREM包含特征(d)。在实施例中，TREM包含特征(e)。在实施例中，TREM包含特征(f)。在实施例中，TREM包含特征(a)-(f)中的所有及其组合。
在实施例中，包含非天然存在的修饰的TREM结构域具有功能，例如，本文所述的结构域功能。
在一个方面，本文提供TREM核心片段，其包含式B的序列：
[L1]y-[ASt结构域1]x-[L2]y-[DH结构域]y-[L3]y-[ACH结构域]x-[VL结构域]y-[TH结构域]y-[L4]y-[ASt结构域2]x，
其中x＝1并且y＝0或1；并且[ASt结构域1]、[ACH结构域]、和[ASt结构域2]之一包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
在实施例中，TREM具有支持蛋白质合成的能力。在实施例中，TREM具有能够被合成酶加载的能力。在实施例中，TREM具有被延长因子结合的能力。在实施例中，TREM具有将氨基酸引入肽链的能力。在实施例中，TREM具有支持延长的能力。在实施例中，TREM具有支持起始的能力；
在实施例中，包含非天然存在的修饰的[ASt结构域1]和/或[ASt结构域2]具有起始或延长多肽链的能力。
在实施例中，包含非天然存在的修饰的[ACH结构域]具有介导密码子配对的能力。
在实施例中，对于[L1]、[L2]、[DH结构域]、[L3]、[VL域]、[TH结构域]、[L4]中任一个、二个、三个、四个、五个、六个、全部或组合，y＝1。
在实施例中，对于[L1]、[L2]、[DH结构域]、[L3]、[VL域]、[TH结构域]、[L4]中任一个、二个、三个、四个、五个、六个、全部或组合，y＝0。
在实施例中，对于接头[L1]，y＝1，并且L1包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
在实施例中，对于接头[L2]，y＝1，并且L2包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
在实施例中，对于接头[DH结构域(DHD)]，y＝1，并且DHD包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。在实施例中，包含非天然存在的修饰的DHD具有通过介导识别氨酰基-tRNA合成酶的能力。
在实施例中，对于接头[L3]，y＝1，并且L3包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
在实施例中，对于接头[VL结构域(VLD)]，y＝1，并且VLD包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
在实施例中，对于接头[TH结构域(THD)]，y＝1，并且THD包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。在实施例中，包含非天然存在的修饰的THD具有介导识别核糖体的能力。
在实施例中，对于接头[L4]，y＝1，并且L4包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
另一方面，本披露提供了包含TREM部分的TREM片段，其中TREM包含式A的序列：
[L1]-[ASt结构域1]-[L2]-[DH结构域]-[L3]-[ACH结构域]-[VL域]-[TH结构域]-[L4]-[ASt结构域2]，并且其中TREM片段包含非天然存在的修饰。
在实施例中，TREM片段包含以下中的一种、两种、三种或全部或任何组合：(a)一半TREM(例如，来自ACH结构域中的切割，例如，在反密码子序列中的切割，例如，5'一半或3'一半)；(b)5'片段(例如，包含5'末端的片段，例如来自DH结构域或ACH结构域中的切割)；(c)3’片段(例如，包含3’末端的片段，例如来自TH结构中的切割)；或(d)内部片段(例如，来自ACH结构域、DH结构域或TH结构域中任何一个的切割)。
在实施例中，TREM片段包含(a)一半TREM，其包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
在实施例中，TREM片段包含(b)5’片段，其包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
在实施例中，TREM片段包含(c)3’片段，其包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
在实施例中，TREM片段包含(d)内部片段，其包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
在本文披露的TREM、TREM核心片段或TREM片段中的任一个的实施例中，TREM结构域包含多个各自具有非天然存在的修饰的核苷酸。在实施例中，非天然存在的修饰包含核苷碱基修饰，糖(例如，核糖)修饰或主链修饰。在实施例中，非天然存在的修饰是糖(例如，核糖)修饰。在实施例中，非天然存在的修饰是2’-核糖修饰，例如2’-OMe、2’-卤代(例如，2’-F)、2’-MOE、或2’-脱氧修饰。在实施例中，非天然存在的修饰是主链修饰，例如，硫代磷酸酯修饰。
在本文披露的TREM、TREM核心片段或TREM片段中的任一个的实施例中，TREM序列包含末端(例如3’末端)上的CCA序列。在实施例中，TREM序列不包含末端(例如，3’末端)上的CCA序列。
在本文披露的TREM、TREM核心片段或TREM片段中的任一个的实施例中，非天然存在的修饰是核苷酸的碱基或主链中的修饰，例如，选自表5、6、7、8或9中任一个的修饰。
在本文披露的TREM、TREM核心片段或TREM片段中的任一个的实施例中，非天然存在的修饰是选自表5列出的修饰中的碱基修饰。
在本文披露的TREM、TREM核心片段或TREM片段中的任一个的实施例中，非天然存在的修饰是选自表6列出的修饰中的碱基修饰。
在本文披露的TREM、TREM核心片段或TREM片段中的任一个的实施例中，非天然存在的修饰是选自表7列出的修饰中的碱基修饰。
在本文披露的TREM、TREM核心片段或TREM片段中的任一个的实施例中，非天然存在的修饰是选自表8列出的修饰中的主链修饰。
在本文披露的TREM、TREM核心片段或TREM片段中的任一个的实施例中，非天然存在的修饰是选自表9列出的修饰中的主链修饰。
在本文披露的TREM、TREM核心片段或TREM片段中的任一个的实施例中，TREM、TREM核心片段或TREM片段由表1中提供的序列(例如，SEQ ID NO 1-451中任一个)编码。
在本文披露的TREM、TREM核心片段或TREM片段中的任一个的实施例中，TREM、TREM核心片段或TREM片段由选自SEQ ID NO 562-621中任一个的共有序列编码。
在本文披露的TREM、TREM核心片段或TREM片段中的任一个的实施例中，TREM、TREM核心片段或TREM片段由表15-22中提供的序列(例如，SEQ ID NO:622-1187中任一个)编码。在实施例中，TREM、TREM核心片段或TREM片段由表15中提供的序列(例如，SEQ ID NO:622-698中任一个)编码。在实施例中，TREM、TREM核心片段或TREM片段由表16中提供的序列(例如，SEQ ID NO:699-774中任一个)编码。在实施例中，TREM、TREM核心片段或TREM片段由表17中提供的序列(例如，SEQ ID NO:775-841中任一个)编码。在实施例中，TREM、TREM核心片段或TREM片段由表18中提供的序列(例如，SEQ ID NO:842-917中任一个)编码。在实施例中，TREM、TREM核心片段或TREM片段由表19中提供的序列(例如，SEQ ID NO:918-992中任一个)编码。在实施例中，TREM、TREM核心片段或TREM片段由表20中提供的序列(例如，SEQ IDNO:993-1078中任一个)编码。在实施例中，TREM、TREM核心片段或TREM片段由表21中提供的序列(例如，SEQ ID NO:1079-1154中任一个)编码。在实施例中，TREM、TREM核心片段或TREM片段由表22中提供的序列(例如，SEQ ID NO:1155-1187中任一个)编码。
另一方面，本披露提供了包含TREM、TREM核心片段、或TREM片段的药物组合物。
另一方面，本披露提供了制备本文披露的TREM、TREM核心片段或TREM片段的方法，该方法包括连接第一核苷酸和第二核苷酸形成TREM。
在实施例中，TREM、TREM核心片段或TREM片段是非天然存在的(例如，合成的)。
在实施例中，TREM、TREM核心片段或TREM片段通过无细胞固相合成制备。
在另一个方面，本披露提供了调节细胞中的tRNA池的方法，该方法包括：提供本文披露的TREM、TREM核心片段或TREM片段，并使细胞与该TREM、TREM核心片段或TREM片段接触，从而调节该细胞中的该tRNA池。
在一个方面，本披露提供一种使细胞、组织或受试者与本文披露的TREM、TREM核心片段或TREM片段接触的方法，该方法包括：使该细胞、组织或受试者与该TREM、TREM核心片段或TREM片段接触，从而使该细胞、组织或受试者与该TREM、TREM核心片段或TREM片段接触。
在另一个方面，本披露提供将TREM、TREM核心片段或TREM片段递送至细胞、组织或受试者的方法，该方法包括：提供该细胞、组织或受试者，并该细胞、组织或受试者与本文披露的TREM、TREM核心片段或TREM片段接触。
在一个方面，本披露提供了调节包含内源开放阅读框(ORF)的细胞中的tRNA池的方法，该ORF包含具有第一序列的密码子，该方法包括：
任选地，获得(i)和(ii)中一个或两个的丰度的信息，例如获得该细胞中(i)和(ii)的相对量的信息，其中(i)是tRNA部分(第一tRNA部分)，该tRNA部分具有与该ORF中该具有第一序列的密码子配对的反密码子，并且(ii)是同工受体tRNA部分(第二tRNA部分)，该同工受体tRNA部分具有与该细胞中不是该具有第一序列的密码子的密码子配对的反密码子；
使细胞与本文披露的TREM、TREM核心片段或TREM片段接触，其中该TREM、TREM核心片段或TREM片段具有与以下配对的反密码子：具有第一序列的密码子；或具有第一序列的密码子以外的密码子，其量和/或时间足以调节细胞中第一tRNA部分和第二tRNA部分的相对量，
从而调节该细胞中的该tRNA池。
在另一个方面，本披露提供了一种调节具有ORF的受试者中的tRNA池的方法，该ORF包含具有第一序列的密码子，该方法包括：
任选地，获得(i)和(ii)中一个或两个的丰度的信息，例如获得该受试者中(i)和(ii)的相对量的信息，其中(i)是tRNA部分(第一tRNA部分)，该tRNA部分具有与该ORF中该具有第一序列的密码子配对的反密码子，并且(ii)是同工受体tRNA部分(第二tRNA部分)，该同工受体tRNA部分具有与该受试者中不是该具有第一序列的密码子的密码子配对的反密码子；
使受试者与本文披露的TREM、TREM核心片段或TREM片段接触，其中该TREM、TREM核心片段或TREM片段具有与以下配对的反密码子：具有第一序列的密码子；或具有第一序列的密码子以外的密码子，其量和/或时间足以调节受试者中第一tRNA部分和第二tRNA部分的相对量，
从而调节该受试者中的该tRNA池。
在一个方面，本披露提供了一种调节具有内源ORF的受试者中的tRNA池的方法，该ORF包含具有同义突变的密码子(同义突变密码子或SMC)，该方法包括：
提供包含本文披露的TREM、TREM核心片段或TREM片段的组合物，其中该TREM、TREM核心片段或TREM片段包含含有与SMC(TREM)配对的反密码子序列的同工受体tRNA部分；
使该受试者与该组合物接触，其量和/或时间足以调节该受试者中的该tRNA池，
从而调节该受试者中的该tRNA池。
在另一个方面，本披露提供了一种调节包含内源ORF的细胞中的tRNA池的方法，该内源ORF包含含有SMC的密码子，该方法包括：
提供包含本文披露的TREM、TREM核心片段或TREM片段的组合物，其中该TREM、TREM核心片段或TREM片段包含含有与SMC(TREM)配对的反密码子序列的同工受体tRNA部分；
使该细胞与包含TREM的该组合物接触，其量和/或时间足以调节该细胞中的tRNA池，
从而调节该细胞中的该tRNA池。
在一个方面，本披露提供了一种调节细胞中蛋白质表达的方法，其中该蛋白质由包含ORF的核酸编码，该ORF包含具有突变的密码子，该方法包括：
使细胞与包含本文披露的TREM、TREM核心片段或TREM片段的组合物以足以调节编码的蛋白质的表达的量和/或时间接触，
其中TREM、TREM核心片段或TREM片段具有与具有突变的密码子配对的反密码子，
从而调节细胞中蛋白质的表达。
在另一个方面，本披露提供了一种调节受试者中蛋白质表达的方法，其中该蛋白质由包含内源ORF的核酸编码，该内源ORF包含具有突变的密码子，该方法包括：
使受试者与包含本文披露的TREM、TREM核心片段或TREM片段的组合物以足以调节编码的蛋白质的表达的量和/或时间接触，
其中TREM、TREM核心片段或TREM片段具有与具有突变的密码子配对的反密码子，
从而调节受试者中蛋白质的表达。
在本文披露的任一方法的实施例中，ORF中的突变是无义突变，例如，选自UAA、UGA或UAG的提前终止密码子。在实施例中，终止密码子是UAA。在实施例中，终止密码子是UGA。在实施例中，终止密码子是UAG。
在本文披露的任一方法的实施例中，TREM包含与终止密码子配对的反密码子。
披露的TREM包括TREM、TREM核心片段和TREM片段。TREM、TREM核心片段或TREM片段可以用非天然存在的修饰来修饰以例如增加TREM的水平和/或活性(例如稳定性)。可以将药物TREM组合物(例如，包含具有非天然存在的修饰的TREM)施用于细胞、组织或受试者以调节这些功能，例如在体外或体内。本文披露了包含非天然存在的修饰的TREM、TREM核心片段或TREM片段，TREM组合物，制剂，制备TREM组合物和制剂的方法，以及使用它们的方法。
任何前述TREM、TREM核心片段、TREM片段、TREM组合物、制剂、制备TREM组合物和制剂的方法以及使用TREM组合物和制剂的方法的另外特征包括列举的实施例、附图、说明书、实例或权利要求书中的一个或多个特征。
本领域技术人员将认知到、或不使用过度常规实验就能够确定本文所述发明的特定实施例的许多等效实施例。此类等效物旨在被以下列举的实施例、附图、说明书、实例或权利要求书所涵盖。
附图说明
图1图解说明在示例性TREM序列(TREM-Arg-TGA)的每个位置含有2’-OMe、2’-F、2’-OME、2’-脱氧和PS修饰的经修饰TREM相对于未修饰TREM的活性(log2倍变化)，如实例11中所述。
列举的实施例
列举的实施例I
1.一种TREM，其包含式A的序列：
[L1]-[ASt结构域1]-[L2]-[DH结构域]-[L3]-[ACH结构域]-[VL结构域]-[TH结构域]-[L4]-[ASt结构域2]，
其中：
独立地，[L1]和[VL结构域]是任选的；
[L1]、[ASt结构域1]、[L2]-[DH结构域]、[L3]、[ACH结构域]、[VL结构域]、[TH结构域]、[L4]和[ASt结构域2]中之一包含具有非天然存在的修饰的核苷酸；并且
其中：
(a)该TREM具有以下能力：支持蛋白质合成，被合成酶加载，被延长因子结合，将氨基酸引入肽链，支持延长，或支持起始；
(b)该TREM包含至少X个没有非天然存在的修饰的连续核苷酸，其中X大于10；
(c)一种类型(例如A、T、C、G或U)的至少3个但少于所有的核苷酸包含相同的非天然存在的修饰；
(d)一种类型(例如A、T、C、G或U)的至少X个核苷酸不包含非天然存在的修饰，其中X＝1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49或50；
(e)一种类型(例如A、T、C、G或U)的不超过5、10或15个核苷酸包含非天然存在的修饰；和/或
(f)一种类型(例如A、T、C、G或U)的不超过5、10或15个核苷酸不包含非天然存在的修饰。
2.如实施例1所述的TREM，其包含实施例1(a)中提供的特征。
3.如实施例1所述的TREM，其包含实施例1(b)中提供的特征。
4.如实施例1所述的TREM，其包含实施例1(c)中提供的特征。
5.如实施例1所述的TREM，其包含实施例1(d)中提供的特征。
6.如实施例1所述的TREM，其包含实施例1(e)中提供的特征。
7.如实施例1所述的TREM，其包含实施例1(f)中提供的特征。
8.如实施例1所述的TREM，其包含实施例1(a)-(f)中提供的所有特征。
9.如实施例1-8中任一项所述的TREM，其中包含该非天然存在的修饰的结构域具有功能，例如，本文所述的结构域功能。
10.如实施例1-8中任一项所述的TREM，其包含[L1]。
11.如实施例1-8中任一项所述的TREM，其包含[VL结构域]。
12.如实施例1-8中任一项所述的TREM，其中：[L1]是包含具有非天然存在的修饰的核苷酸的接头。
13.如实施例1-8中任一项所述的TREM，其中[ASt结构域1(AstD1)]包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
14.如实施例1-8中任一项所述的TREM，其中[L2]是包含具有非天然存在的修饰的核苷酸的接头。
15.如实施例1-8中任一项所述的TREM，其中[DH结构域(DHD)]包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
16.如实施例1-8中任一项所述的TREM，其中[L3]是包含具有非天然存在的修饰的核苷酸的接头。
17.如实施例1-8中任一项所述的TREM，其中[ACH结构域(ACHD)]包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
18.如实施例1-8中任一项所述的TREM，其中[VL结构域(VLD)]包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
19.如实施例1-8中任一项所述的TREM，其中[TH结构域(THD)]包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
20.如实施例1-8中任一项所述的TREM，其中[L4]是包含具有非天然存在的修饰的核苷酸的接头。
21.如实施例1-8中任一项所述的TREM，其中：[ASt结构域2(AStD2)]包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
22.一种TREM核心片段，其包含式B的序列：
[L1]y-[ASt结构域1]x-[L2]y-[DH结构域]y-[L3]y-[ACH结构域]x-[VL结构域]y-[TH结构域]y-[L4]y-[ASt结构域2]x，
其中：
x＝1和y＝0或1；
[ASt结构域1]、[ACH结构域]、和[ASt结构域2]之一包含具有非天然存在的修饰的核苷酸；并且
TREM具有以下能力：支持蛋白质合成；能够被合成酶加载，被延长因子结合，将氨基酸引入肽链，支持延长，或支持起始。
23.如实施例22所述的TREM核心片段，其中AStD1和AStD2包含ASt结构域(AStD)。
24.如实施例22所述的TREM核心片段，其中包含该非天然存在的修饰的[ASt结构域1]和/或[ASt结构域2]具有起始或延长多肽链的能力。
25.如实施例中22所述的TREM核心片段，其中包含该非天然存在的修饰的[ACH结构域]具有介导密码子配对的能力。
26.如实施例22所述的TREM核心片段，其中对于[L1]、[L2]、[DH结构域]、[L3]、[VL域]、[TH结构域]、[L4]中任一个、二个、三个、四个、五个、六个、全部或组合，y＝1。
27.如实施例22所述的TREM核心片段，其中对于[L1]、[L2]、[DH结构域]、[L3]、[VL域]、[TH结构域]、[L4]中任一个、二个、三个、四个、五个、六个、全部或组合，y＝0。
28.如实施例22所述的TREM核心片段，其中对于接头[L1]，其中y＝1，并且L1包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
29.如实施例22所述的TREM核心片段，其中对于接头[L2]，其中y＝1，并且L2包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
30.如实施例22所述的TREM核心片段，其中对于接头[DH结构域(DHD)]，其中y＝1，并且DHD包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
31.如实施例中30所述的TREM核心片段，其中包含该非天然存在的修饰的DHD具有通过介导识别氨酰基-tRNA合成酶的能力。
32.如实施例22所述的TREM核心片段，其中对于接头[L3]，其中y＝1，并且L3包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
33.如实施例22所述的TREM核心片段，其中对于接头[VL结构域(VLD)]，其中y＝1，并且VLD包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
34.如实施例22所述的TREM核心片段，其中对于接头[TH结构域(THD)]，其中y＝1，并且THD包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
35.如实施例34所述的TREM核心片段，其中包含该非天然存在的修饰的THD具有介导识别核糖体的能力。
36.如实施例22所述的TREM核心片段，其中对于接头[L4]，其中y＝1，并且L4包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
37.一种TREM片段，其包含TREM的一部分，其中该TREM包含式A的序列：
[L1]-[ASt结构域1]-[L2]-[DH结构域]-[L3]-[ACH结构域]-[VL结构域]-[TH结构域]-[L4]-[ASt结构域2]，并且其中：
该TREM片段包含：
非天然存在的修饰；和
以下中的一种、两种、三种或全部或任何组合：
(a)一半TREM(例如，来自ACH结构域中的切割，例如，在反密码子序列中的切割，例如，5'一半或3'一半)；
(b)5'片段(例如，包含5'末端的片段，例如来自DH结构域或ACH结构域中的切割)；
(c)3’片段(例如，包含3’末端的片段，例如来自TH结构中的切割)；或者
(d)内部片段(例如，来自ACH结构域、DH结构域或TH结构域中任何一个的切割)。
38.如实施例37所述的TREM，其中该TREM片段包含(a)一半TREM，其包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
39.如实施例37所述的TREM，其中该TREM片段包含(b)5’片段，其包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
40.如实施例37所述的TREM，其中该TREM片段包含(c)3’片段，其包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
41.如实施例37所述的TREM，其中该TREM片段包含(d)内部片段，其包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
42.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段或如实施例37的TREM片段，其中该TREM结构域包含多个各自具有非天然存在的修饰的核苷酸。
43.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中AStD1的核苷酸中的至少X个具有非天然存在的修饰，其中X等于或大于1、2、3、4、5、6或7。
44.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中AStD1的核苷酸中的不超过X个具有非天然存在的修饰，其中X等于或大于1、2、3、4、5、6或7。
45.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中AStD2的核苷酸中的至少X个具有非天然存在的修饰，其中X等于或大于1、2、3、4、5、6或7。
46.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中AStD2的核苷酸中的不超过X个具有非天然存在的修饰，其中X等于或大于1、2、3、4、5、6或7。
47.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中ACHD的核苷酸中的至少X个具有非天然存在的修饰，其中X等于或大于1、2、3、4、5、6、7、8、9或10。
48.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中ACHD的核苷酸中的至少X个具有非天然存在的修饰，其中X等于或大于11、12、13、14、15、16或17。
49.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中ACHD的核苷酸中的不超过X个具有非天然存在的修饰，其中X等于或大于1、2、3、4、5、6、7、8、9或10。
50.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中ACHD的核苷酸中的不超过X个具有非天然存在的修饰，其中X等于或大于11、12、13、14、15或16。
51.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中THD的核苷酸中的至少X个具有非天然存在的修饰，其中X等于或大于1、2、3、4、5、6、7、8、9或10。
52.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中THD的核苷酸中的至少X个具有非天然存在的修饰，其中X等于或大于11、12、13、14、15、16或17。
53.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中THD的核苷酸中的不超过X个具有非天然存在的修饰，其中X等于或大于1、2、3、4、5、6、7、8、9或10。
54.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中THD的核苷酸中的不超过X个具有非天然存在的修饰，其中X等于或大于11、12、13、14、15或16。
55.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中DHD的核苷酸中的至少X个具有非天然存在的修饰，其中X等于或大于2、3、4、5、6、7、8、9或10。
56.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中DHD的核苷酸中的至少X个具有非天然存在的修饰，其中X等于或大于11、12、13、14、15、16、17、18或19。
57.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中DHD的核苷酸中的不超过X个具有非天然存在的修饰，其中X等于或大于1、2、3、4、5、6、7、8、9或10。
58.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中DHD的核苷酸中的不超过X个具有非天然存在的修饰，其中X等于或大于11、12、13、14、15、16、17或18。
59.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中VLD的核苷酸中的至少X个具有非天然存在的修饰，其中X等于或大于2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、50、100、150、200或271。
60.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段或如实施例37所述的TREM片段，其中AStD1、AStD2、ACHD、DHD和/或THD的所有核苷酸具有非天然存在的修饰。
61.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中AStD1和/或AStD2的核苷酸中的至少X个不具有非天然存在的修饰，其中X等于或大于1、2、3、4、5、6或7。
62.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中ACHD的核苷酸中的至少X个不具有非天然存在的修饰，其中X等于或大于1、2、3、4、5、6.7、8、9、10、11、12、13、14、15、16或17。
63.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中THD的核苷酸中的至少X个不具有非天然存在的修饰，其中X等于或大于1、2、3、4、5、6.7、8、9、10、11、12、13、14、15、16或17。
64.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中DHD的核苷酸中的至少X个不具有非天然存在的修饰，其中X等于或大于1、2、3、4、5、6.7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18或19。
65.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中VLD的核苷酸中的至少X个不具有非天然存在的修饰，其中X等于或大于1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、50、100、150、200或271。
66.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段或如实施例37的TREM片段，其中该TREM接头L2包含两个核苷酸，每个核苷酸具有非天然存在的修饰。
67.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中该TREM接头的核苷酸中至少X个不具有非天然存在的修饰，其中X等于1或2。
68.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中：
多个TREM结构域和接头中的每一个包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
69.如实施例68所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段，其中多个TREM结构域和接头之一包含多个核苷酸，每个核苷酸具有非天然存在的修饰。
70.如前述实施例中任一项所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段，其中该非天然存在的修饰是核苷酸的碱基或主链中的修饰，例如选自表5-9中任一个的修饰。
71.如前述实施例中任一项所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段，其中该非天然存在的修饰是选自表5中所列的修饰的碱基修饰。
72.如前述实施例中任一项所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段，其中该非天然存在的修饰是选自表6中所列的修饰的碱基修饰。
73.如前述实施例中任一项所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段，其中该非天然存在的修饰是选自表7中所列的修饰的碱基修饰。
74.如前述实施例中任一项所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段，其中该非天然存在的修饰是选自表8中所列的修饰的主链碱基修饰。
75.如前述实施例中任一项所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段，其中该非天然存在的修饰是选自表9中所列的修饰的主链修饰。
76.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其包含含有非天然存在的修饰的第一类型的核苷酸。
77.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段或如实施例37所述的TREM片段，其包含含有非天然存在的修饰的第一类型的核苷酸和第二类型的核苷酸。
78.如实施例77所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段，其中该第一类型的核苷酸上的该非天然存在的修饰和该第二类型的核苷酸上的该非天然存在的修饰是相同的非天然存在的修饰。
79.如实施例77所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段，其中该第一类型的核苷酸上的该非天然存在的修饰和该第二类型的核苷酸上的该非天然存在的修饰是不同的非天然存在的修饰。
80.如实施例76或77所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段，其中该第一类型的核苷酸选自：A、T、C、G或U。
81.如实施例76或77所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段，其中该第二类型的核苷酸选自：A、T、C、G或U。
82.如实施例76或77所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段，其中该第一类型的核苷酸是A。
83.如实施例76或77所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段，其中该第一类型的核苷酸是G。
84.如实施例76或77所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段，其中该第一类型的核苷酸是C。
85.如实施例76或77所述的TREM核心片段或TREM片段，其中该第一类型的核苷酸是T。
86.如实施例76或77所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段，其中该第一类型的核苷酸是U。
87.如实施例77所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段，其中当该第一类型的核苷酸是A时，该第二类型的核苷酸选自：T、C、G或U。
88.如实施例77所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段，其中当该第一类型的核苷酸是G时，该第二类型的核苷酸选自：T、C、A或U。
89.如实施例77所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段，其中当该第一类型的核苷酸是C时，该第二类型的核苷酸选自：T、A、G或U。
90.如实施例77所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段，其中当该第一类型的核苷酸是T时，该第二类型的核苷酸选自：A、C、G或U。
91.如实施例77所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段，其中当该第一类型的核苷酸是U时，该第二类型的核苷酸选自：T、C、G或A。
92.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段或如实施例37所述的TREM片段，其中该非天然修饰在嘌呤(A或G)中。
93.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段或如实施例37所述的TREM片段，其中该非天然修饰不在嘌呤(A或G)中。
94.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段或如实施例37所述的TREM片段，其中该非天然修饰在嘧啶(U、T或C)中。
95.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段或如实施例37所述的TREM片段，其中该非天然修饰不在嘧啶(U、T或C)中。
96.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中该DHD具有第一序列、第二序列和第三序列，任选地其中该第一序列和该第三序列形成茎，并且该第二序列形成环，例如在生理条件下。
97.如实施例96所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段，其中该DHD在该第一序列或该第三序列中，例如在该茎中包含非天然存在的修饰。
98.如实施例96所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段，其中该DHD在该第二序列中，例如在该环中包含非天然存在的修饰。
100.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中该ACHD具有第一序列、第二序列和第三序列，任选地其中该第一序列和该第三序列形成茎，并且该第二序列形成环，例如在生理条件下。
101.如实施例100所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段，其中该ACHD在该第一序列或该第三序列中，例如在该茎中包含非天然存在的修饰。
102.如实施例100所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段，其中该ACHD在该第二序列中，例如在该环中包含非天然存在的修饰。
103.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中该THD具有第一序列、第二序列和第三序列，任选地其中该第一序列和该第三序列形成茎，并且该第二序列形成环，例如在生理条件下。
104.如实施例103所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段，其中该THD在该第一序列或该第三序列中，例如在该茎中包含非天然存在的修饰。
105.如实施例103所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段，其中该THD在该第二序列中，例如在该环中包含非天然存在的修饰。
106.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段或如实施例37所述的TREM片段，其中该VLD包含具有1-271个核苷酸的可变区。
107.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中该TREM包含至少X个没有非天然存在的修饰的连续核苷酸，其中X大于10。
108.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中一种类型(例如，A、T、C、G或U)的至少3个但少于所有的核苷酸包含相同的非天然存在的修饰。
109.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中一种类型(例如A、T、C、G或U)的至少X个核苷酸不包含非天然存在的修饰，其中X＝1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49或50。
110.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中一种类型(例如，A、T、C、G或U)的不超过5、10或15个包含非天然存在的修饰。
111.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中一种类型(例如，A、T、C、G或U)的不超过5、10或15个不包含非天然存在的修饰。
112.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其指定X，其中X是选自以下的氨基酸：丙氨酸、精氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酰胺、谷氨酸、甘氨酸、组氨酸、异亮氨酸、甲硫氨酸、亮氨酸、赖氨酸、苯丙氨酸、脯氨酸、丝氨酸、苏氨酸、色氨酸、酪氨酸或缬氨酸。
113.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其识别表8或表9中提供的密码子。
114.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中该TREM是同源TREM。
115.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中该TREM是非同源TREM。
116.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中该TREM、TREM核心片段或TREM片段由表1中提供的序列(例如，SEQ ID NO 1-451中任一个)编码。
117.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中该TREM、TREM核心片段或TREM片段由选自SEQ ID NO 562-621中任一个的共有序列编码。
118.如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，其中该TREM、TREM核心片段或TREM片段由选自SEQ ID NO 622-1187中任一个的共有序列编码。
119.一种药物组合物，其包含如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段。
120.如实施例119所述的药物组合物，其包含药学上可接受的组分，例如赋形剂。
121.一种脂质纳米颗粒配制品，其包含如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段。
122.一种制备如实施例1-8任一项所述的TERM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段的方法，该方法包括连接第一核苷酸和第二核苷酸形成该TREM。
123.如实施例122所述的方法，其中该TREM、TREM核心片段或TREM片段是合成的(例如，非天然存在的)。
124.如实施例122或123所述的方法，其中该合成在体外进行。
125.如实施例122所述的方法，其中该TREM、TREM核心片段或TREM片段通过无细胞固相合成制备。
126.一种细胞，其包含如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段。
127.一种细胞，其包含根据如实施例122所述的方法制备的TREM、TREM核心片段或TREM片段。
128.一种在细胞中调节tRNA池的方法，该方法包括：
提供如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，并且
使该细胞与该TREM、TREM核心片段或TREM片段接触，
从而调节该细胞中的该tRNA池。
129.一种使细胞、组织或受试者与如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段或如实施例37所述的TREM片段接触的方法，该方法包括
使该细胞、组织或受试者与该TREM、TREM核心片段或TREM片段接触，
从而使该细胞、组织或受试者与该TREM、TREM核心片段或TREM片段接触。
130.一种将TREM、TREM核心片段或TREM片段呈递给具有TREM、TREM核心片段或TREM片段的细胞、组织或受试者的方法，该方法包括
使该细胞、组织或受试者与如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段或如实施例37所述的TREM片段接触，
从而将该TREM、TREM核心片段或TREM片段呈递给细胞、组织或受试者。
131.一种形成TREM、TREM核心片段或TREM片段接触的细胞、组织或受试者的方法，该方法包括
使该细胞、组织或受试者与如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段或如实施例37所述的TREM片段接触，
从而形成TREM、TREM核心片段或TREM片段接触的细胞、组织或受试者。
132.一种使用TREM、TREM核心片段或TREM片段的方法，该方法包括，
使该细胞、组织或受试者与如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段或如实施例37所述的TREM片段接触，
从而使用该TREM。
133.一种将TREM、TREM核心片段或TREM片段应用于细胞、组织或受试者的方法，该方法包括
使该细胞、组织或受试者与如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段或如实施例37所述的TREM片段接触，
从而将TREM、TREM核心片段或TREM片段应用于细胞、组织或受试者。
134.一种将细胞、组织或受试者暴露于TREM的方法，该方法包括
使该细胞、组织或受试者与如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段或如实施例37所述的TREM片段接触，
从而使细胞、组织或受试者暴露于TREM、TREM核心片段或TREM片段。
135.一种形成TREM、TREM核心片段或TREM片段与细胞、组织或受试者的混合物的方法，该方法包括
使该细胞、组织或受试者与如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段或如实施例37所述的TREM片段接触，
从而形成TREM、TREM核心片段或TREM片段与细胞、组织或受试者的混合物。
136.一种将TREM、TREM核心片段或TREM片段递送至细胞、组织或受试者的方法，该方法包括：
提供细胞、组织或受试者，并使该细胞、组织或受试者与如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段接触。
137.一种调节代谢的方法，例如离体方法，该代谢是例如细胞器的翻译能力，该方法包括：
提供细胞器例如线粒体或叶绿体的制剂，并使该细胞器与如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段接触。
138.一种治疗受试者的方法，例如，调节受试者中的新陈代谢，例如细胞的翻译能力，该方法包括：
提供，例如，向该受试者施用如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段、或如实施例37所述的TREM片段，
从而治疗该受试者。
139.一种调节包含内源开放阅读框(ORF)的细胞中的tRNA池的方法，该ORF包含具有第一序列的密码子，该方法包括：
任选地，获得(i)和(ii)中一个或两个的丰度的信息，例如获得该细胞中(i)和(ii)的相对量的信息，其中(i)是tRNA部分(第一tRNA部分)，该tRNA部分具有与该ORF中该具有第一序列的密码子配对的反密码子，并且(ii)是同工受体tRNA部分(第二tRNA部分)，该同工受体tRNA部分具有与该细胞中不是该具有第一序列的密码子的密码子配对的反密码子；
使该细胞与如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段或如实施例37所述的TREM片段接触，其中该TREM、TREM核心片段或TREM片段具有与以下配对的反密码子：具有第一序列的密码子；或具有第一序列的密码子以外的密码子，其量和/或时间足以调节该细胞中第一tRNA部分和第二tRNA部分的相对量，
从而调节该细胞中的该tRNA池。
140.一种调节具有内源开放阅读框(ORF)的受试者中的tRNA池的方法，该ORF包含具有第一序列的密码子，该方法包括：
任选地，获得(i)和(ii)中一个或两个的丰度的信息，例如获得该受试者中(i)和(ii)的相对量的信息，其中(i)是tRNA部分(第一tRNA部分)，该tRNA部分具有与该ORF中该具有第一序列的密码子配对的反密码子，并且(ii)是同工受体tRNA部分(第二tRNA部分)，该同工受体tRNA部分具有与该受试者中不是该具有第一序列的密码子的密码子配对的反密码子；
使该受试者与如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段或如实施例37所述的TREM片段接触，其中该TREM、TREM核心片段或TREM片段具有与以下配对的反密码子：具有第一序列的密码子；或具有第一序列的密码子以外的密码子，其量和/或时间足以调节该受试者中第一tRNA部分和第二tRNA部分的相对量，
从而调节该受试者中的该tRNA池。
141.一种调节具有内源开放阅读框(ORF)的受试者中的tRNA池的方法，该ORF包含具有同义突变的密码子(同义突变密码子或SMC)，该方法包括：
提供包含如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段或如实施例37所述的TREM片段的组合物，其中该TREM、TREM核心片段或TREM片段包含含有与SMC(TREM)配对的反密码子序列的同工受体tRNA部分；
使该受试者与该组合物接触，其量和/或时间足以调节该受试者中的该tRNA池，
从而调节该受试者中的该tRNA池。
142.一种调节包含内源开放阅读框(ORF)的细胞中的tRNA池的方法，该ORF包含具有同义突变的密码子(同义突变密码子或SMC)，该方法包括：
提供包含如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段或如实施例37所述的TREM片段的组合物，其中该TREM、TREM核心片段或TREM片段包含含有与SMC(TREM)配对的反密码子序列的同工受体tRNA部分；
使该细胞与包含TREM的该组合物接触，其量和/或时间足以调节该细胞中的该tRNA池，
从而调节该细胞中的该tRNA池。
143.一种调节细胞中蛋白质表达的方法，其中该蛋白质由包含内源开放阅读框(ORF)的核酸编码，该ORF包含具有突变的密码子，该方法包括：
使该细胞与包含如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段或如实施例37所述的TREM片段的组合物以足以调节编码的蛋白质的表达的量和/或时间接触，
其中TREM、TREM核心片段或TREM片段具有与具有突变的密码子配对的反密码子，
从而调节细胞中蛋白质的表达。
144.一种调节受试者中蛋白质表达的方法，其中该蛋白质由包含内源开放阅读框(ORF)的核酸编码，该ORF包含具有突变的密码子，该方法包括：
使该受试者与包含如实施例1-8中任一项所述的TREM、如实施例22所述的TREM核心片段或如实施例37所述的TREM片段的组合物以足以调节编码的蛋白质的表达的量和/或时间接触，
其中TREM、TREM核心片段或TREM片段具有与具有突变的密码子配对的反密码子，
从而调节受试者中蛋白质的表达。
145.如实施例143或144所述的方法，其中该ORF中的该突变是无义突变，例如，选自UAA、UGA或UAG的提前终止密码子。
146.如实施例143或144所述的方法，其中该TREM包含与终止密码子配对的反密码子。
列举的实施例II
1000.一种TREM，其包含含有非天然存在的修饰的核苷酸(在本文确定的位置)或缺乏非天然存在的修饰的核苷酸(在本文确定的位置)。
1001.如实施例1000所述的TREM，其包含以下结构：
[L1]-[ASt结构域1]-[L2]-[DH结构域]-[L3]-[ACH结构域]-[VL结构域]-[TH结构域]-[L4]-[ASt结构域2]。
1002.一种TREM，其包含式A的序列：
[L1]-[ASt结构域1]-[L2]-[DH结构域]-[L3]-[ACH结构域]-[VL结构域]-[TH结构域]-[L4]-[ASt结构域2]，
其中：
独立地，[L1]和[VL结构域]是任选的；
[L1]、[ASt结构域1]、[L2]-[DH结构域]、[L3]、[ACH结构域]、[VL结构域]、[TH结构域]、[L4]和[ASt结构域2]中之一包含具有非天然存在的修饰的核苷酸；并且
其中：
(a)TREM有以下能力：(i)支持蛋白质合成，(ii)被合成酶加载，(iii)被延长因子结合，(iv)将氨基酸引入肽链，(v)支持延长，或(vi)支持起始；
(b)该TREM包含X1个没有非天然存在的修饰的连续核苷酸，其中X1是3、4、5、6、7、8、9、10或更大；
(c)该TREM包含X2个非天然存在的修饰，其中X2是2、3、4或更大；
(d)该TREM包含X3个不同的非天然存在的修饰，其中X3是2、3、4或更大；
(e)3个核苷酸，其中一种类型(例如A、T、C、G或U)的少于所有核苷酸包含相同的非天然存在的修饰；
(f)一种类型(例如，A、T、C、G或U)的X4个核苷酸不包含非天然存在的修饰，其中X4等于或大于1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49或50；
(g)一种类型(例如A、T、C、G或U)的不超过5、10或15个核苷酸包含非天然存在的修饰；和/或
(h)一种类型(例如A、T、C、G或U)的不超过5、10或15个核苷酸不包含非天然存在的修饰；和/或该ACH结构域包含非延伸的反密码子。
1003.如任一前述实施例所述的TREM，其中：
(a)TREM有以下能力：(i)支持蛋白质合成，(ii)被合成酶加载，(iii)被延长因子结合，(iv)将氨基酸引入肽链，(v)支持延长，或(vi)支持起始。
1004.如任一前述实施例所述的TREM，其中：
(b)该TREM包含X1个没有非天然存在的修饰的连续核苷酸，其中X1是10或更大。
1005.如任一前述实施例所述的TREM，其中：该TREM包含X2个非天然存在的修饰，其中X2是2、3、4或更大。
1006.如任一前述实施例所述的TREM，其中：
(c)该TREM包含X3个不同的非天然存在的修饰，其中X3是2、3、4或更大。
1007.如任一前述实施例所述的TREM，其中：
(d)3个核苷酸，其中一种类型(例如A、T、C、G或U)的少于所有核苷酸包含相同的非天然存在的修饰。
1008.如任一前述实施例所述的TREM，其中：
(e)一种类型(例如，A、T、C、G或U)的X4个核苷酸不包含非天然存在的修饰，其中X4等于或大于1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49或50。
1009.如任一前述实施例所述的TREM，其中：
(f)一种类型(例如A、T、C、G或U)的不超过5、10或15个核苷酸包含非天然存在的修饰。
1010.如任一前述实施例所述的TREM，其中：
(g)一种类型(例如A、T、C、G或U)的不超过5、10或15个核苷酸不包含非天然存在的修饰；和/或该ACH结构域包含非延伸的反密码子。
1011.如任一前述实施例所述的TREM，其中该ACH结构域包含非延伸的反密码子或不包括延伸的反密码子。
1012.一种TREM片段，其包含TREM的一部分，其中该TREM包含式A的序列：
[L1]-[ASt结构域1]-[L2]-[DH结构域]-[L3]-[ACH结构域]-[VL结构域]-[TH结构域]-[L4]-[ASt结构域2]，并且其中：
该TREM片段包含：
非天然存在的修饰；和
以下中的一种、两种、三种或全部或任何组合：
(a)一半TREM(例如，来自ACH结构域中的切割，例如，在反密码子序列中的切割，例如，5'一半或3'一半)；
(b)5'片段(例如，包含5'末端的片段，例如来自DH结构域或ACH结构域中的切割)；
(c)3’片段(例如，包含3’末端的片段，例如来自TH结构中的切割)；或者
(d)内部片段(例如，来自ACH结构域、DH结构域或TH结构域中任何一个的切割)。
1013.如上述实施例中任一项所述的TREM或TREM片段，其包含在核苷酸糖部分(2'-修饰)上或在TREM主链中的非天然存在的修饰。
1014.如上述实施例中任一项所述的TREM或TREM片段，其包含在该糖部分上包含2'非天然存在的修饰的核苷酸。
1015.如上述实施例中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸对应于SEQID NO:622的核苷酸1-76、SEQ ID NO:993的核苷酸1-85或SEQ ID NO:1079的核苷酸1-75中的任一个被修饰。
1016.如实施例1000-1015所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该ASt结构域1中。
1017.如实施例1000-1016所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该DH结构域中。
1018.如实施例1000-1017所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该ACH结构域中。
1019.如实施例1000-1018所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该VL结构域中。
1020.如实施例1000-1019所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该TH结构域中。
1021.如实施例1000-1020所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该ASt结构域中2。
1022.如实施例1000-10021所述的TREM或TREM片段,其中该核苷酸在接头结构域中(例如，[L1]、[L2]、[L3]、或[L4])。
1023.如实施例1000-1022所述的TREM或TREM片段，其中对应于SEQ ID NO:622的核苷酸1、2、4、6、10、12、13、17、18、20、22、29、30、42、43、45、50、52、56、59、61、65、66、68、69、71、72和73中的任一个的核苷酸被修饰。
1024.如实施例1000-1022所述的TREM或TREM片段，其中对应于SEQ ID NO:622的核苷酸20、29、33、40、41、44、45、48、49、50、52、53、54、56、59、61、62、63、65、67、68、69、71、72、75和76中的任一个的核苷酸被修饰。
1025.如实施例1000-1022所述的TREM或TREM片段，其中对应于SEQ ID NO:622的核苷酸1、4、14、15、16、17、20、29、44、45、47、49、50、52、54、56、57、59、65、72和73中的任一个的核苷酸被修饰。
1026.如实施例1000-1022所述的TREM或TREM片段，其中对应于SEQ ID NO:622的核苷酸3、4、5、6、14、15、16、20、22、23、33、54、59、62、63、72和76中的任一个的核苷酸被修饰。
1027.如实施例1000-1022所述的TREM或TREM片段，其中对应于SEQ ID NO:622的核苷酸1、2、3、9、14、15、16、17、18、19、20、21、35、37、38、44、45、46、52、54、55、56、57、58、73和74中的任一个的核苷酸被修饰。
1028.如实施例1000-1022所述的TREM或TREM片段，其中对应于SEQ ID NO:622的核苷酸1、17、18、20、29、30、50、52和73中的任一个的核苷酸被修饰。
1029.如实施例1000-1022所述的TREM或TREM片段，其中对应于SEQ ID NO:993的核苷酸1、4、5、34、38、39、61、79、80和82中的任一个的核苷酸被修饰。
1030.如实施例1000-1022所述的TREM或TREM片段，其中对应于SEQ ID NO:1079的核苷酸1、4、12、13、17、18、23、28、29、30、38、39、41、44、48、49、51、52、53、58、60、61、63、64、65、66、68、69、71、72、73、74和75中的任一个的核苷酸被修饰。
1031.如实施例1000-1014所述的TREM或TREM片段，其中该2'非天然存在的修饰包含酯、卤代、氢、烷基基团。
1032.如实施例1000-1014所述的TREM或TREM片段，其中该2'非天然存在的修饰包含2'-OMe部分。
1033.如实施例1000-1024所述的TREM或TREM片段，其中该2'非天然存在的修饰包含2'-MOE部分。
1034.如实施例1000-1014所述的TREM或TREM片段，其中该2'非天然存在的修饰包含2'-卤素(例如，2'-F或2'Cl)。
1035.如实施例1000-1014所述的TREM或TREM片段，其中该2'非天然存在的修饰包含2'-脱氧基团(例如2'-H)。
1036.如实施例1000-1035中任一项所述的TREM或TREM片段，其包含缺少非天然存在的修饰的核苷酸，例如，在糖部分上缺少2'非天然存在的修饰。
1037.如实施例1036中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸对应于SEQID NO:622的核苷酸1-76中的任一个并且缺少非天然存在的修饰。
1038.如实施例1036所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该ASt结构域1中。
1039.如实施例1036所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该DH结构域中。
1040.如实施例1036所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该ACH结构域中。
1041.如实施例1036所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该VL结构域中。
1042.如实施例1036所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该TH结构域中。
1043.如实施例1036所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该ASt结构域2中。
1044.如实施例1036所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在接头结构域中(例如，[L1]、[L2]、[L3]、或[L4])。
1045.如实施例1036所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸对应于SEQ ID NO:622的核苷酸1-76中的任一个并且缺少非天然存在的修饰，例如糖上的2'非天然存在的修饰。
1046.如实施例1036所述的TREM或TREM片段，其中对应于SEQ ID NO:993的核苷酸1-85中的任一个的核苷酸缺少非天然存在的修饰，例如糖上的2'非天然存在的修饰。
1047.如实施例1036所述的TREM或TREM片段，其中对应于SEQ ID NO:1079的核苷酸1-75中的任一个的核苷酸缺少非天然存在的修饰，例如糖上的2'非天然存在的修饰。
1048.如实施例1000-1047中任一项所述的TREM或TREM片段，其包含含有2'OMe非天然存在的修饰的核苷酸。
1049.如实施例1000-1048所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸对应于SEQ IDNO:622的核苷酸1-76中的任一个被修饰。
1050.如实施例1048-1049中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该ASt结构域1中。
1051.如实施例1048-1049中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该DH结构域中。
1052.如实施例1048-1049中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该ACH结构域中。
1053.如实施例1048-1049中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该VL结构域中。
1054.如实施例1048-1049中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该TH结构域中。
1055.如实施例1048-1049中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该ASt结构域2中。
1056.如实施例1048-1049中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在接头结构域中(例如，[L1]、[L2]、[L3]、或[L4])。
1057.如实施例1048-1056中任一项所述的TREM或TREM片段，其中对应于SEQ IDNO:622的核苷酸1、2、4、6、10、12、13、17、18、20、22、29、30、42、43、45、50、52、56、59、61、65、66、68、69、71、72和73中的任一个的核苷酸被修饰(例如，表15中的序列)。
1058.如实施例1000-1047中任一项所述的TREM或TREM片段，其包含缺少非天然存在的修饰的核苷酸，例如，在糖部分上缺少2’OMe修饰。
1059.如实施例1058所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸对应于SEQ ID NO:622的核苷酸1-76中的任一个缺乏非天然存在的修饰，例如，在糖部分上缺少2’OMe修饰。
1060.如实施例1058-1059中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该ASt结构域1中。
1061.如实施例1058-1059中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该DH结构域中。
1062.如实施例1058-1059中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该ACH结构域中。
1063如实施例1058-1059中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该VL结构域中。
1064.如实施例1058-1059中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该TH结构域中。
1065.如实施例1058-1059中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该ASt结构域2中。
1066.如实施例1058-1059中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在接头结构域中(例如，[L1]、[L2]、[L3]、或[L4])。
1067.如实施例1000-1066中任一项所述的TREM或TREM片段，其包含含有2'卤代的核苷酸，例如糖部分上的2'氟、非天然存在的修饰。
1068.如实施例1067所述的TREM或TREM片段，其中该2'卤代是2'氟。
1069.如实施例1067-1068所述的TREM或TREM片段，其中对应于SEQ ID NO:622的核苷酸1-76中的任一个的核苷酸被修饰。
1070.如实施例1067-1068所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该ASt结构域1中。
1071.如实施例1067-1068所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该DH结构域中。
1072.如实施例1067-1068所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该ACH结构域中。
1073.如实施例1067-1068所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该VL结构域中。
1074.如实施例1067-1068所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该TH结构域中。
1075.如实施例1067-1068所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该ASt结构域2中。
1076.如实施例1067-1068中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在接头结构域中(例如，[L1]、[L2]、[L3]、或[L4])。
1077.如实施例1067-1076中任一项所述的TREM或TREM片段，其中对应于SEQ IDNO:622的核苷酸20、29、33、40、41、44、45、48、49、50、52、53、54、56、59、61、62、63、65、67、68、69、71、72、75和76中的任一个的核苷酸被修饰。
1078.如实施例1000-1035中任一项所述的TREM或TREM片段，其包含缺少非天然存在的修饰的核苷酸，例如缺少2'卤代，例如在糖部分上缺少2'氟、非天然存在的修饰。
1079.如实施例1078所述的TREM或TREM片段，其中2'卤代是2'氟。
1080.如实施例1078-1079中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸对应于SEQ ID NO:622的核苷酸1-76中的任一个并且缺少非天然存在的修饰。
1081.如实施例1078-1079中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该ASt结构域1中。
1082.如实施例1078-1079中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该DH结构域中。
1083.如实施例1078-1079中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该ACH结构域中。
1084.如实施例1078-1079中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该VL结构域中。
1085.如实施例1078-1079中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该TH结构域中。
1086.如实施例1078-1079中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该ASt结构域2中。
1087.如实施例1078-1079中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在接头结构域中(例如，[L1]、[L2]、[L3]、或[L4])。
1088.如实施例1000-1013中任一项所述的TREM或TREM片段，其中对应于SEQ IDNO:622的核苷酸20、29、33、40、41、44、45、48、49、50、52、53、54、56、59、61、62、63、67、68、69、71、72、75和76中的任一个的核苷酸缺少非天然存在的修饰，例如糖上的2'氟非天然存在的修饰。
1089.如实施例1000-1088中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该非天然存在的修饰包含2'脱氧核苷酸。
1090.如实施例1084所述的TREM或TREM片段，其中该2'脱氧核苷酸对应于SEQ IDNO:622的核苷酸1-76中的任一个被修饰。
1091.如实施例1089-1090中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该2'脱氧核苷酸在该ASt结构域1中。
1092.如实施例1089-1090中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该2'脱氧核苷酸在该DH结构域中。
1093.如实施例1089-1090中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该2'脱氧核苷酸在该ACH结构域中。
1094.如实施例1089-1090中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该2'脱氧核苷酸在该VL结构域中。
1095.如实施例1089-1090中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该2'脱氧核苷酸在该TH结构域中。
1096.如实施例1089-1090中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该2'脱氧核苷酸在该ASt结构域2中。
1097.如实施例1089-1090中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在接头结构域中(例如，[L1]、[L2]、[L3]、或[L4])。
1098.如实施例1089-1090中任一项所述的TREM或TREM片段，其中对应于SEQ IDNO:622的核苷酸3、4、5、6、14、15、16、20、22、23、33、54、59、62、63、72和76中的任一个的核苷酸是2'脱氧核苷酸。
1099.如实施例1000-1092中任一项所述的TREM或TREM片段，其包含2'-OH核苷酸。
1100.如实施例1099所述的TREM或TREM片段，其中该2'-OH核苷酸对应于SEQ IDNO:622的核苷酸1-76中的任一个。
1101.如实施例1099-1100中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该ASt结构域1中。
1102.如实施例1099-1100中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该DH结构域中。
1103.如实施例1099-1100中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该ACH结构域中。
1104.如实施例1099-1100中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该VL结构域中。
1105.如实施例1099-1100中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该TH结构域中。
1106.如实施例1099-1100中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该ASt结构域2中。
1107.如实施例1099-1100中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在接头结构域中(例如，[L1]、[L2]、[L3]、或[L4])。
1109.如实施例1000-1100中任一项所述的TREM或TREM片段，其中对应于SEQ IDNO:622的核苷酸3、4、5、6、14、15、16、20、22、23、33、54、59、62、63、72和76中的任一个的核苷酸是2'-OH核苷酸。
1110.如实施例1000-1109中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该非天然存在的修饰包含2'甲氧基乙基(MOE)核苷酸。
1111.如实施例1110所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸对应于SEQ ID NO:622的核苷酸1-76中的任一个。
1112.如实施例1110-1111中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该2’-MOE核苷酸在该ASt结构域1中。
1113.如实施例1110-1111中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该2’-MOE核苷酸在该DH结构域中。
1114.如实施例1110-1111中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该2’-MOE核苷酸在该ACH结构域中。
1115.如实施例1110-1111中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该2’-MOE核苷酸在该VL结构域中。
1116.如实施例1110-1111中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该2’-MOE核苷酸在该TH结构域中。
1117.如实施例1110-1111中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该2’-MOE核苷酸在该ASt结构域2中。
1118.如实施例1110-1111中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该2’-MOE核苷酸在接头结构域中(例如，[L1]、[L2]、[L3]、或[L4])。
1119.如实施例1110-1118中任一项所述的TREM或TREM片段，其中对应于SEQ IDNO:622的核苷酸1、4、14、15、16、17、20、29、44、45、47、49、50、52、54、56、57、59、65、72和73中的任一个的核苷酸是2'-MOE核苷酸。
1120.如实施例1000-1109中任一项所述的TREM或TREM片段，其包含缺少非天然存在的修饰的核苷酸，例如缺少2-MOE，例如在糖部分上缺少非天然存在的修饰。
1121.如实施例1120所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸对应于SEQ ID NO:622的核苷酸1-76中的任一个并且缺少非天然存在的修饰。
1122.如实施例1120-1121中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该ASt结构域1中。
1123.如实施例1120-1121中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该DH结构域中。
1124.如实施例1120-1121中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该ACH结构域中。
1125.如实施例1120-1121中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该VL结构域中。
1126.如实施例1120-1121中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该TH结构域中。
1127.如实施例1120-1121中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在该ASt结构域2中。
1128.如实施例1120-1121中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在接头结构域中(例如，[L1]、[L2]、[L3]、或[L4])。
1129.如实施例1120-1128中任一项所述的TREM或TREM片段，其中对应于SEQ IDNO:622的核苷酸1、4、14、15、16、17、20、29、44、45、47、49、50、52、54、56、57、59、65、72和73中的任一个的核苷酸缺少2'-MOE核苷酸。
1130.如实施例1000-1129中任一项所述的TREM或TREM片段，其包含经修饰的主链，例如附接至核苷酸的糖部分的5'或3'碳的磷酸酯部分的修饰。
1131.如实施例1130所述的TREM或TREM片段，其中附接至该5'碳的磷酸酯部分被修饰。
1132.如实施例1130所述的TREM或TREM片段，其中附接至该3'碳的磷酸酯部分被修饰。
1133.如实施例1130所述的TREM或TREM片段，其中该修饰包含硫代磷酸酯部分。
1134.如实施例1130-1133所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸对应于SEQ IDNO:622的核苷酸1-76中的任一个被修饰。
1135.如实施例1130-1133所述的TREM或TREM片段，其中该经修饰的核苷酸在该ASt结构域1中。
1136.如实施例1130-1133所述的TREM或TREM片段，其中该经修饰的核苷酸在该DH结构域中。
1137.如实施例1130-1133所述的TREM或TREM片段，其中该经修饰的核苷酸在该ACH结构域中。
1138.如实施例1130-1133所述的TREM或TREM片段，其中该经修饰的核苷酸在该VL结构域中。
1139.如实施例1130-1133所述的TREM或TREM片段，其中该经修饰的核苷酸在该TH结构域中。
1140.如实施例1130-1133所述的TREM或TREM片段，其中该经修饰的核苷酸在该ASt结构域2中。
1141.如实施例1130-1133中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该核苷酸在接头结构域中(例如，[L1]、[L2]、[L3]、或[L4])。
1142.如实施例1130-1133所述的TREM或TREM片段，其中对应于SEQ ID NO:622的核苷酸1、2、3、9、14、15、16、17、18、19、20、21、35、37、38、44、45、46、52、54、55、56、57、58、73和74中的任一个的核苷酸经主链修饰，例如用硫代磷酸酯部分修饰。
1142.如实施例1130-1141所述的TREM或TREM片段，其中对应于SEQ ID NO:622的核苷酸14、15、16、17、18、20、44、45、47、54、56、57和59中的任一个的核苷酸经主链修饰，例如用硫代磷酸酯部分修饰。
1143.如实施例1000-1142所述的TREM或TREM片段，其缺少主链修饰，例如硫代磷酸酯部分。
1144.如实施例1143所述的TREM或TREM片段，其中未经主链修饰的核苷酸对应于SEQ ID NO:622的核苷酸1-76中的任一个。
1145.如实施例1143所述的TREM或TREM片段，其中未经主链修饰的核苷酸在该ASt结构域1中。
1146.如实施例1143所述的TREM或TREM片段，其中未经主链修饰的核苷酸在该DH结构域中。
1147.如实施例1143所述的TREM或TREM片段，其中未经主链修饰的核苷酸在该ACH结构域中。
1148.如实施例1143所述的TREM或TREM片段，其中未经主链修饰的核苷酸在该VL结构域中。
1149.如实施例1143所述的TREM或TREM片段，其中未经主链修饰的核苷酸在该TH结构域中。
1150.如实施例1143所述的TREM或TREM片段，其中未经主链修饰的核苷酸在该ASt结构域2中。
1151.如实施例1143所述的TREM或TREM片段，其中未经主链修饰的核苷酸在接头结构域中(例如，[L1]、[L2]、[L3]、或[L4])。
1152.如实施例1000-1151中任一项所述的TREM或TREM片段，其中对应于SEQ IDNO:622的核苷酸1、2、3、9、14、15、16、17、18、19、20、21、35、37、38、44、45、46、52、54、55、56、57、58、73和74中的任一个的核苷酸未经主链修饰。
1153.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表15中序列的100nm的值为3的修饰位置对应的位置被2’-O Me修饰。
1154.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表15中序列的100nm的值为2的修饰位置对应的位置被2’-O Me修饰。
1155.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表15中序列的100nm的值为1的修饰位置对应的位置被2’-O Me修饰。
1156.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表15中序列的100nm的值为3的修饰位置对应的位置未被修饰。
1157.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表15中序列的100nm的值为2的修饰位置对应的位置未被修饰。
1158.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表15中序列的100nm的值为1的修饰位置对应的位置未被修饰。
1159.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表21中序列的100nm的值为3的修饰位置对应的位置被2’-O Me修饰。
1160.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表21中序列的100nm的值为2的修饰位置对应的位置被2’-O Me修饰。
1161.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表21中序列的100nm的值为1的修饰位置对应的位置被2’-O Me修饰。
1162.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表21中序列的100nm的值为3的修饰位置对应的位置未被修饰。
1163.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表21中序列的100nm的值为2的修饰位置对应的位置未被修饰。
1164.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表21中序列的100nm的值为1的修饰位置对应的位置未被修饰。
1165.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表22中序列的100nm的值为3的修饰位置对应的位置被2’-O Me修饰。
1166.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表22中序列的100nm的值为2的修饰位置对应的位置被2’-O Me修饰。
1167.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表22中序列的100nm的值为1的修饰位置对应的位置被2’-O Me修饰。
1168.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表22中序列的100nm的值为3的修饰位置对应的位置未被修饰。
1169.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表22中序列的100nm的值为2的修饰位置对应的位置未被修饰。
1170.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表22中序列的100nm的值为1的修饰位置对应的位置未被修饰。
1171如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表17中序列的100nm的值为3的修饰位置对应的位置被2’-MOE修饰。
1172.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表17中序列的100nm的值为2的修饰位置对应的位置被2'-MOE修饰。
1173.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表17中序列的100nm的值为1的修饰位置对应的位置被2’-MOE修饰。
1174.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表17中序列的100nm的值为3的修饰位置对应的位置未被修饰。
1175.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表17中序列的100nm的值为2的修饰位置对应的位置未被修饰。
1176.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表17中序列的100nm的值为1的修饰位置对应的位置未被修饰。
1177.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表16中序列的100nm的值为3的修饰位置对应的位置被2'-氟修饰。
1178.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表16中序列的100nm的值为2的修饰位置对应的位置被2'-氟修饰。
1179.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表16中序列的100nm的值为1的修饰位置对应的位置被2'-氟修饰。
1180.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表16中序列的100nm的值为3的修饰位置对应的位置未被修饰。
1181.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表16中序列的100nm的值为2的修饰位置对应的位置未被修饰。
1182.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表16中序列的100nm的值为1的修饰位置对应的位置未被修饰。
1183.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表18中序列的100nm的值为3的修饰位置对应的位置被修饰为2'-脱氧。
1184.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表18中序列的100nm的值为2的修饰位置对应的位置被修饰为2'-脱氧。
1185.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表18中序列的100nm的值为1的修饰位置对应的位置被修饰为2'-脱氧。
1186.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表18中序列的100nm的值为3的修饰位置对应的位置未被修饰。
1187.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表18中序列的100nm的值为2的修饰位置对应的位置未被修饰。
1188.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表18中序列的100nm的值为1的修饰位置对应的位置未被修饰。
1189.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表19中序列的100nm的值为3的修饰位置对应的位置包含硫代磷酸酯。
1190.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表19中序列的100nm的值为2的修饰位置对应的位置包含硫代磷酸酯。
1191.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表19中序列的100nm的值为1的修饰位置对应的位置包含硫代磷酸酯。
1192.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表19中序列的100nm的值为3的修饰位置对应的位置未被修饰。
1193.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表19中序列的100nm的值为2的修饰位置对应的位置未被修饰。
1194.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中与对于表19中序列的100nm的值为1的修饰位置对应的位置未被修饰。
1195.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该TREM包含对来自表1的氨基酸特异的反密码子。
1196.如实施例1000-1152中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该TREM包含表1的反密码子。
1197.如实施例1000-1196中任一项所述的TREM或TREM片段，其包含第一和第二非天然存在的修饰。
1198.如实施例1197所述的TREM或TREM片段，其包含包含第三非天然存在的修饰。
1199.如实施例1197-1198中任一项所述的或TREM片段，包含，其中该第一和第二非天然存在的修饰是相同的非天然存在的修饰。
1200.如实施例1197-1198中任一项所述的TREM或TREM片段，包含其中该第一和第二非天然存在的修饰是不同的非天然存在的修饰。
1201.如实施例1197-1198中任一项所述的TREM或TREM片段，包含其中该第一和第二非天然存在的修饰在相同的核苷酸上。
1202.如实施例1197-1198中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该第一和第二非天然存在的修饰在不同的核苷酸上。
1203.如实施例1197-1198中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该第一和第二非天然存在的修饰在相同的结构域中。
1204.如实施例1197-1198中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该第一和第二非天然存在的修饰在不同的结构域中。
1205.如前述实施例中任一项所述的TREM或TREM片段，其中包含该非天然存在的修饰的结构域具有功能，例如本文所述的结构域功能。
1206.如前述实施例中任一项所述的TREM或TREM片段，其中该TREM与本文所述的序列，例如与SEQ ID NO:622、SEQ ID NO:993或SEQ ID NO:1079，或与本文披露的共有序列，例如来自表9或10的共有序列具有至少X％的序列序列同一性，其中X＝60、70、75、80、85、90或95。
1207.如实施例1206所述的TREM或TREM片段，其中X＝60。
1208.如实施例1206所述的TREM或TREM片段，其中X＝70。
1209.如实施例1206所述的TREM或TREM片段，其中X＝75。
1210.如实施例1206所述的TREM或TREM片段，其中X＝80。
1211.如实施例1206所述的TREM或TREM片段，其中X＝85。
1212.如实施例1206所述的TREM或TREM片段，其中X＝90。
1213.如实施例1206所述的TREM或TREM片段，其中X＝95。
1214.如实施例1001-1213中任一项所述的TREM或TREM片段，其在与表15-22中任一个的行中的被修饰的位置对应的位置处具有经修饰的核苷酸。
1215.如实施例1001-1213中任一项所述的TREM或TREM片段，其在与表15中任一个的行中的被修饰的位置对应的位置处具有经修饰的核苷酸。
1216.如实施例1001-1213中任一项所述的TREM或TREM片段，其在与表16中任一个的行中的被修饰的位置对应的位置处具有经修饰的核苷酸。
1217.如实施例1001-1213中任一项所述的TREM或TREM片段，其在与表17中任一个的行中的被修饰的位置对应的位置处具有经修饰的核苷酸。
1218.如实施例1001-1213中任一项所述的TREM或TREM片段，其在与表18中任一个的行中的被修饰的位置对应的位置处具有经修饰的核苷酸。
1219.如实施例1001-1213中任一项所述的TREM或TREM片段，其在与表19中任一个的行中的被修饰的位置对应的位置处具有经修饰的核苷酸。
1220.如实施例1001-1213中任一项所述的TREM或TREM片段，其在与表20中任一个的行中的被修饰的位置对应的位置处具有经修饰的核苷酸。
1221.如实施例1001-1213中任一项所述的TREM或TREM片段，其在与表21中任一个的行中的被修饰的位置对应的位置处具有经修饰的核苷酸。
1222.如实施例1001-1213中任一项所述的TREM或TREM片段，其在与表22中任一个的行中的被修饰的位置对应的位置处具有经修饰的核苷酸。
1223.如实施例1001-1213中任一项所述的TREM或TREM片段，其在第一位置处具有经修饰的核苷酸并且在第二位置具有经修饰的核苷酸，其中该第一和第二位置对应于表22的任何一行中的被修饰的位置。
1224.一种药物组合物，其包含如前述实施例中任一项所述的TREM或TREM片段。
1225.如实施例1224所述的药物组合物，其包含药学上可接受的组分，例如赋形剂。
1226.一种脂质纳米颗粒配制品，其包含如实施例1000-1213中任一项所述的TREM或TREM片段，或如权利要求1224-1225中任一项所述的药物组合物。
1227.一种制备如实施例1000-1213中任一项所述的TERM或TREM片段的方法，该方法包括连接第一核苷酸和第二核苷酸形成该TREM或TREM片段。
1228.如实施例1227所述的方法，其中该TREM或TREM片段是非天然存在的(例如，合成的)。
1229.如实施例1227所述的方法，其中该合成在体外进行。
1230.如实施例1227所述的方法，其中该TREM或TREM片段通过无细胞固相合成制备。
1231.一种细胞，其包含如实施例1000-1213中任一项所述的TREM或TREM片段。
1232.一种在细胞中调节tRNA池的方法，该方法包括：
提供如实施例1000-1213中任一项所述的TREM或TREM片段，并且
使该细胞与该TREM接触，
从而调节该细胞中的该tRNA池。
1233.一种使细胞、组织或受试者与如实施例1000-1213中任一项所述的TREM或TREM片段接触的方法，该方法包括
使该细胞、组织或受试者与该TREM接触，
从而使该细胞、组织或受试者与该TREM接触。
1234.一种将TREM或TREM片段呈递至细胞、组织或受试者的方法，该方法包括：
使该细胞、组织或受试者与如实施例1000-1213中任一项所述的TREM或TREM片段接触，
从而将该TREM、TREM核心片段或TREM片段呈递给细胞、组织或受试者。
1235.一种形成与TREM接触的细胞、组织或受试者的方法，该方法包括：
使该细胞、组织或受试者与如实施例1000-1213中任一项所述的TREM或TREM片段接触，
从而形成与TREM接触的细胞、组织或受试者。
1236.一种使用TREM的方法，该方法包括
使细胞、组织或受试者与如实施例1000-1213中任一项所述的TREM或TREM片段接触，
从而使用该TREM。
1237.一种将TREM应用于细胞、组织或受试者的方法，该方法包括
使该细胞、组织或受试者与如实施例1000-1213中任一项所述的TREM或TREM片段接触，
从而将TREM应用于细胞、组织或受试者。
1238.一种将细胞、组织或受试者暴露于TREM的方法，该方法包括
使该细胞、组织或受试者与如实施例1000-1213中任一项所述的TREM或TREM片段接触，
从而使细胞、组织或受试者暴露于TREM。
1239.一种形成TREM和细胞、组织或受试者的混合物的方法，该方法包括
使该细胞、组织或受试者与如实施例1000-1213中任一项所述的TREM或TREM片段接触，
从而形成TREM和细胞、组织或受试者的混合物。
1240.一种将TREM递送至细胞、组织或受试者的方法，该方法包括：
提供细胞、组织或受试者，并使该细胞、组织或受试者与如实施例1000-1213中任一项所述的TREM或TREM片段接触。
1241.一种调节代谢的方法，例如离体方法，该代谢是例如细胞器的翻译能力，该方法包括：
提供细胞器的制剂，例如线粒体或叶绿体的制剂，并使该细胞器与如实施例1000-1213中任一项所述的TREM或TREM片段接触。
1242.一种治疗受试者的方法，例如，调节受试者中的新陈代谢，例如细胞的翻译能力，该方法包括：
提供，例如，向该受试者施用如实施例1000-1213中任一项所述的TREM或TREM片段，
从而治疗该受试者。
1243.一种调节包含内源开放阅读框(ORF)的细胞中的tRNA池的方法，该ORF包含具有第一序列的密码子，该方法包括：
任选地，获得(i)和(ii)中一个或两个的丰度的信息，例如获得该细胞中(i)和(ii)的相对量的信息，其中(i)是tRNA部分(第一tRNA部分)，该tRNA部分具有与该ORF中该具有第一序列的密码子配对的反密码子，并且(ii)是同工受体tRNA部分(第二tRNA部分)，该同工受体tRNA部分具有与该细胞中不是该具有第一序列的密码子的密码子配对的反密码子；
使该细胞与如实施例1000-1213中任一项所述的TREM或TREM片段接触，其中该TREM具有与以下配对的反密码子：具有第一序列的密码子；或具有第一序列的密码子以外的密码子，其量和/或时间足以调节该细胞中该第一tRNA部分和该第二tRNA部分的相对量，
从而调节该细胞中的该tRNA池。
1244.一种调节具有内源开放阅读框(ORF)的受试者中的tRNA池的方法，该ORF包含具有第一序列的密码子，该方法包括：
任选地，获得(i)和(ii)中一个或两个的丰度的信息，例如获得该受试者中(i)和(ii)的相对量的信息，其中(i)是tRNA部分(第一tRNA部分)，该tRNA部分具有与该ORF中该具有第一序列的密码子配对的反密码子，并且(ii)是同工受体tRNA部分(第二tRNA部分)，该同工受体tRNA部分具有与该受试者中不是该具有第一序列的密码子的密码子配对的反密码子；
使该受试者与如实施例1000-1213中任一项所述的TREM或TREM片段接触，其中该TREM具有与以下配对的反密码子：具有第一序列的密码子；或具有第一序列的密码子以外的密码子，其量和/或时间足以调节该受试者中该第一tRNA部分和该第二tRNA部分的相对量，
从而调节该受试者中的该tRNA池。
1245.一种调节具有内源开放阅读框(ORF)的受试者中的tRNA池的方法，该ORF包含具有同义突变的密码子(同义突变密码子或SMC)，该方法包括：
提供包含如实施例1000-1213中任一项所述的TREM或TREM片段的组合物，其中该TREM包含具有与该SMC配对的反密码子序列的同工受体tRNA部分(该TREM)；
使该受试者与该组合物接触，其量和/或时间足以调节该受试者中的该tRNA池，
从而调节该受试者中的该tRNA池。
1246.一种调节包含内源开放阅读框(ORF)的细胞中的tRNA池的方法，该ORF包含具有同义突变的密码子(同义突变密码子或SMC)，该方法包括：
提供包含如实施例1000-1213中任一项所述的TREM或TREM片段的组合物，其中该TREM包含具有与该SMC配对的反密码子序列的同工受体tRNA部分(该TREM)；
使该细胞与包含TREM的该组合物接触，其量和/或时间足以调节该细胞中的tRNA池，
从而调节该细胞中的该tRNA池。
1247.一种调节细胞中蛋白质表达的方法，其中该蛋白质由包含内源开放阅读框(ORF)的核酸编码，该ORF包含具有突变的密码子，该方法包括：
使该细胞与包含如实施例1000-1213中任一项所述的TREM或TREM片段的组合物接触，其量和/或时间足以调节编码的蛋白质的表达，
其中该TREM具有与具有该突变的密码子配对的反密码子，
从而调节该细胞中该蛋白质的表达。
1248.一种调节受试者中蛋白质表达的方法，其中该蛋白质由包含内源开放阅读框(ORF)的核酸编码，该ORF包含具有突变的密码子，该方法包括：
使该受试者与包含如实施例1000-1213中任一项所述的TREM或TREM片段的组合物接触，其量和/或时间足以调节编码的蛋白质的表达，
其中该TREM具有与具有该突变的密码子配对的反密码子，
从而调节受试者中蛋白质的表达。
1249.如实施例1247或1248所述的方法，其中该ORF中的该突变是无义突变，例如，选自UAA、UGA或UAG的提前终止密码子。
1250.如实施例1247或1248所述的方法，其中该TREM包含与终止密码子配对的反密码子。
本发明的其他特征、目的和优点将从说明书和权利要求中是显而易见。
除非另外定义，否则本文所用的所有技术和科学术语均具有与本发明所属领域的普通技术人员通常所理解的相同的含义。所有的公开案、专利申请、专利和本文提及的其他参考文献整体通过引用并入。另外，材料、方法和实例仅是说明性的而不旨在限制。
具体实施方式
本披露的特征在于包含非天然存在的修饰的基于tRNA的效应子分子(TREM)及其相关方法。如本文披露的，TREM是可以介导多种细胞过程的复杂分子。药物TREM组合物，例如包含非天然存在的修饰的TREM，可以施用于细胞、组织或受试者以调节这些功能。
定义
如本文所用的术语“核苷酸”是指包含糖的实体，通常是五聚体糖；核碱基；和磷酸连接基团。在实施例中，核苷酸包含天然存在的例如天然存在于人细胞中的核苷酸，例如腺嘌呤、胸腺嘧啶、鸟嘌呤、胞嘧啶或尿嘧啶核苷酸。
如本文所用的术语“修饰”是指核苷酸的修饰，是指主题核苷酸的化学结构的修饰，例如共价修饰。修饰可以是天然存在的或非天然存在的。在实施例中，修饰是非天然存在的。在实施例中，修饰是天然存在的。在实施例中，修饰是合成的修饰。在实施例中，修饰是表5、6、7、8或9中提供的修饰。
“非天然存在的修饰”，如本文所用的该术语参考核苷酸，是指如下修饰：(a)细胞，例如人细胞，不会在内源tRNA上产生该修饰；或(b)细胞，例如人细胞，可以在内源tRNA上进行该修饰，但其中这样的修饰位于天然tRNA上不发生的位置，例如，该修饰位于结构域、接头或臂中，或在核苷酸上和/或在结构域、接头或臂内的位置处，其天然上不具有这样的修饰。在任一种情况下，修饰是合成地添加的，例如在无细胞反应中，例如在固态或液相合成反应中。在实施例中，如果TREM的序列在哺乳动物细胞(例如HEK293细胞系)中表达，则非天然存在的修饰是不存在的修饰(在同一性、定位或位置方面)。示例性的非天然存在的修饰见表5、6、7、8或9。
如本文所用的术语“非天然修饰的核苷酸”是指包含糖、核碱基或磷酸酯部分的或在其上的非天然存在的修饰的核苷酸。
如本文所用的术语“天然存在的核苷酸”是指不包含非天然存在的修饰的核苷酸。在实施例中，它包括天然存在的修饰。
如本文所用的术语“基于tRNA的效应分子”或“TREM”是指包含来自以下(a)-(v)的结构或特性的RNA分子，并且其是重组TREM、合成的TREM，或从异源细胞表达的TREM。本发明中描述的TREM是合成分子并且例如在无细胞反应中制备，例如在固态或液相合成反应中。TREM在化学上是不同的，例如，就来自细胞(例如哺乳动物细胞，例如人细胞)中产生的内源tRNA分子的修饰的一级序列、类型或位置而言。TREM可以具有(a)-(v)中的多个(例如，2、3、4、5、6、7、8、9个)结构和功能。
在实施例中，TREM是非天然的，如通过其结构或制备方式所评估的。
在实施例中，TREM包含以下结构或特性中的一个或多个：
(a’)“共有序列”部分中提供的共有序列的任选接头区，例如，接头1区；
(a)结合氨基酸的氨基酸附接结构域，例如，接纳茎结构域(AStD)，其中AStD包含足够的RNA序列来介导，例如，当存在于在其他方面为野生型的tRNA中时，接受氨基酸，例如，其同源氨基酸或非同源氨基酸，以及在多肽链的起始或延伸中氨基酸(AA)的转移。通常，AStD包含3'-末端腺苷(CCA)，用于接纳茎负载，这是合成酶识别的一部分。在实施例中，AStD与天然存在的AStD(例如，由表1中的核酸编码的AStD)具有至少75％、80％、85％、85％、90％、95％或100％同一性。在实施例中，TREM可以包含AStD(例如，由表1中的核酸编码的AStD)的片段或类似物，该片段在实施例中具有AStD活性而在其他实施例中不具有AStD活性。(普通技术人员可以从表1中的核酸编码的序列确定本文提及的任何结构域、茎、环或其他序列特征的相关对应序列。例如，普通技术人员可以从表1中的核酸编码的tRNA序列中确定对应于AStD的序列。)
在实施例中，AStD属于“共有序列”部分中提供的共有序列的对应序列，或与共有序列的差异不超过1、2、5或10个位置；
在实施例中，AStD包含式IZZZ的残基R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7和残基R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71，其中ZZZ表示二十种氨基酸中的任一个；
在实施例中，AStD包含式IIZZZ的残基R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7和残基R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71，其中ZZZ表示二十种氨基酸中的任一个；
在实施例中，AStD包含式IIIZZZ的残基R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7和残基R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71，其中ZZZ表示二十种氨基酸中的任一个；
(a’-1)包含“共有序列”部分中提供的共有序列的残基R8-R9的接头，例如，接头2区；
(b)二氢尿苷发夹结构域(DHD)，其中DHD包含足够的RNA序列来介导，例如，当存在于在其他方面为野生型的tRNA中时，识别氨酰基-tRNA合成酶，例如，充当氨酰基-tRNA合成酶的识别位点，用于TREM的氨基酸负载。在实施例中，DHD介导TREM三级结构的稳定化。在实施例中，DHD与天然存在的DHD(例如，由表1中的核酸编码的DHD)具有至少75％、80％、85％、85％、90％、95％或100％同一性。在实施例中，TREM可以包含DHD(例如，由表1中的核酸编码的DHD)的片段或类似物，该片段在实施例中具有DHD活性而在其他实施例中不具有DHD活性。
在实施例中，DHD属于“共有序列”部分中提供的共有序列的对应序列，或与共有序列的差异不超过1、2、5或10个位置；
在实施例中，DHD包含式IZZZ的残基R10-R11-R12-R13-R14R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28，其中ZZZ表示二十种氨基酸中的任一个；
在实施例中，DHD包含式IIZZZ的残基R10-R11-R12-R13-R14R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28，其中ZZZ表示二十种氨基酸中的任一个；
在实施例中，DHD包含式IIIZZZ的残基R10-R11-R12-R13-R14R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28，其中ZZZ表示二十种氨基酸中的任一个；
(b’-1)包含“共有序列”部分中提供的共有序列的残基R29的接头，例如，接头3区；
(c)结合mRNA中相应密码子的反密码子，例如，反密码子发夹结构域(ACHD)，其中ACHD包含足够的序列，例如，反密码子三联体，以介导例如，当存在于在其他方面为野生型的tRNA中时，与密码子配对(有或没有摆动)；在实施例中，ACHD与天然存在的ACHD(例如，由表1中的核酸编码的ACHD)具有至少75％、80％、85％、85％、90％、95％或100％同一性。在实施例中，TREM可以包含ACHD(例如，由表1中的核酸编码的ACHD)的片段或类似物，该片段在实施例中具有ACHD活性而在其他实施例中不具有ACHD活性。
在实施例中，ACHD属于“共有序列”部分中提供的共有序列的对应序列，或与共有序列的差异不超过1、2、5或10个位置；
在实施例中，ACHD包含式IZZZ残基-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46，其中ZZZ表示二十种氨基酸中的任一个；
在实施例中，ACHD包含式IIZZZ的残基-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46，其中ZZZ表示二十种氨基酸中的任一个；
在实施例中，ACHD包含式IIIZZZ的残基-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46，其中ZZZ表示二十种氨基酸中的任一个；
(d)可变环结构域(VLD)，其中VLD包含足够的RNA序列来介导，例如，当存在于在其他方面为野生型的tRNA中时，识别氨酰基-tRNA合成酶，例如，充当氨酰基-tRNA合成酶的识别位点，用于TREM的氨基酸负载。在实施例中，VLD介导TREM三级结构的稳定化。在实施例中，VLD调节(例如，增加)TREM(例如，对于它的同源氨基酸)的特异性，例如，VLD调节TREM的同源衔接子功能。在实施例中，VLD与天然存在的VLD(例如，由表1中的核酸编码的VLD)具有至少75％、80％、85％、85％、90％、95％或100％同一性。在实施例中，TREM可以包含VLD(例如，由表1中的核酸编码的VLD)的片段或类似物，该片段在实施例中具有VLD活性而在其他实施例中不具有VLD活性。
在实施例中，VLD属于“共有序列”部分中提供的共有序列的对应序列。
在实施例中，VLD包含“共有序列”部分中提供的共有序列的残基-[R47]x，其中x＝1-271(例如x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)；
(e)胸腺嘧啶发夹结构域(THD)，其中THD包含足够的RNA序列，以介导例如，当存在于在其他方面为野生型的tRNA中时，识别核糖体，例如，充当核糖体的识别位点，在翻译过程中形成TREM-核糖体复合物。在实施例中，THD与天然存在的THD(例如，由表1中的核酸编码的THD)具有至少75％、80％、85％、85％、90％、95％或100％同一性。在实施例中，TREM可以包含THD(例如，由表1中的核酸编码的THD)的片段或类似物，该片段在实施例中具有THD活性而在其他实施例中不具有THD活性。
在实施例中，THD属于“共有序列”部分中提供的共有序列的对应序列，或与共有序列的差异不超过1、2、5或10个位置；
在实施例中，THD包含式IZZZ残基-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64，其中ZZZ表示二十种氨基酸中的任一个；
在实施例中，THD包含式IIZZZ的残基-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64，其中ZZZ表示二十种氨基酸中的任一个；
在实施例中，THD包含式IIIZZZ的残基-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64，其中ZZZ表示二十种氨基酸中的任一个；
(e’1)包含“共有序列”部分中提供的共有序列的残基R72的接头，例如，接头4区；
(f)在生理条件下，它包含茎结构和一个或多个环结构，例如，1、2或3个环。环可包含本文所述的结构域，例如，选自(a)-(e)的结构域。一个环可以包含一个或多个结构域。在实施例中，茎或环结构与天然存在的茎或环结构(例如，由表1中的核酸编码的茎或环结构)具有至少75％、80％、85％、85％、90％、95％或100％同一性。在实施例中，TREM可以包含茎或环结构(例如，由表1中的核酸编码的茎或环结构)的片段或类似物，该片段在实施例中具有茎或环结构的活性而在其他实施例中不具有茎或环结构的活性；
(g)三级结构，例如，L形三级结构；
(h)衔接子功能，即TREM介导氨基酸(例如，其同源氨基酸)的接受和AA在多肽链的起始或延伸中的转移；
(i)同源衔接子功能，其中TREM介导与TREM的反密码子天然相关的氨基酸(例如，同源氨基酸)的接受和掺入以启动或延长多肽链；
(j)非同源衔接子功能，其中在多肽链的起始或延长过程中，该TREM介导接受和掺入不同于与该TREM的反密码子天然相关的氨基酸的氨基酸(例如，非同源氨基酸)；
(k)调节性功能，例如，表观遗传功能(例如，基因沉默功能或信号传导通路调节功能)、细胞命运调节功能、mRNA稳定性调节功能、蛋白质稳定性调节功能、蛋白质转导调节功能、或蛋白质区室化功能；
(l)允许核糖体结合的结构；
(m)转录后修饰，例如天然存在的转录后修饰；
(n)抑制tRNA功能特性的能力，例如，tRNA具有的特性(h)-(k)中的任一个；
(o)调节细胞命运的能力；
(p)调节核糖体占用的能力；
(q)调节蛋白质翻译的能力；
(r)调节mRNA稳定性的能力；
(s)调节蛋白质折叠和结构的能力；
(t)调节蛋白质转导或区室化的能力；
(u)调节蛋白质稳定性的能力；或者
(v)调节信号传导通路的能力，例如，细胞信号传导通路。
在实施例中，TREM包含全长tRNA分子或其片段。
在实施例中，TREM包含以下特性：(a)-(e)。
在实施例中，TREM包含以下特性：(a)和(c)。
在实施例中，TREM包含以下特性：(a)、(c)和(h)。
在实施例中，TREM包含以下特性：(a)、(c)、(h)和(b)。
在实施例中，TREM包含以下特性：(a)、(c)、(h)和(e)。
在实施例中，TREM包含以下特性：(a)、(c)、(h)、(b)和(e)。
在实施例中，TREM包含以下特性：(a)、(c)、(h)、(b)、(e)和(g)。
在实施例中，TREM包含以下特性：(a)、(c)、(h)和(m)。
在实施例中，TREM包含以下特性：(a)、(c)、(h)、(m)和(g)。
在实施例中，TREM包含以下特性：(a)、(c)、(h)、(m)和(b)。
在实施例中，TREM包含以下特性：(a)、(c)、(h)、(m)和(e)。
在实施例中，TREM包含以下特性：(a)、(c)、(h)、(m)、(g)、(b)和(e)。
在实施例中，TREM包含以下特性：(a)、(c)、(h)、(m)、(g)、(b)、(e)和(q)。
在实施例中，TREM包含：
(i)结合氨基酸的氨基酸附接结构域(例如如本文(a)中所述AStD)；和
(ii)结合mRNA中相应密码子的反密码子(例如，ACHD，如本文(c)中所述)。
在实施例中，该TREM包含提供(i)至(ii)的共价连接的柔性RNA接头。
在实施例中，该TREM介导蛋白质翻译。
在实施例中，该TREM包含接头，例如，RNA接头，例如，柔性RNA接头，其提供第一和第二结构或结构域之间的共价连接。在实施例中，该RNA接头包含至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14或15个核糖核苷酸。TREM可以包含一个或多个接头，例如，在实施例中，包含(a)、(b)、(c)、(d)和(e)的TREM可以具有在第一和第二结构域之间的第一接头，以及在第三结构域和另一个结构域之间的第二接头。
在实施例中，TREM包含式A的序列：[L1]-[ASt结构域1]-[L2]-[DH结构域]-[L3]-[ACH结构域]-[VL结构域]-[TH结构域]-[L4]-[ASt结构域2]。
在实施例中，TREM包含与由表1中所列的DNA序列编码的RNA序列至少60％、65％、70％、75％、80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％或99％相同或差异不超过1、2、3、4、5、10、15、20、25或30个核糖核苷酸的RNA序列，或者其片段或功能片段。在实施例中，TREM包含由表1中所列的DNA序列编码的RNA序列，或者其片段或功能片段。在实施例中，TREM包含由与表1中所列的DNA序列至少60％、65％、70％、75％、80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％或99％相同的DNA序列编码的RNA序列，或者其片段或功能片段。在实施例中，TREM包含TREM结构域，例如，本文所述的结构域，该结构域与由表1中所列的DNA序列编码的RNA至少60％、65％、70％、75％、80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％或99％相同或差异不超过1、2、3、4、5、10或15个核糖核苷酸，或其片段或功能片段。在实施例中，TREM包括TREM结构域，例如，本文所述的结构域，该结构域包含由表1中所列的DNA序列编码的RNA序列，或其片段或功能片段。在实施例中，TREM包括TREM结构域，例如，本文所述的结构域，该结构域包含由与表1中所列的DNA序列至少60％、65％、70％、75％、80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％或99％相同的DNA序列编码的RNA序列，或其片段或功能片段。
在实施例中，TREM的长度为76-90个核苷酸。在实施例中，TREM或者其片段或功能片段是10-90个之间的核苷酸、10-80个之间的核苷酸、10-70个之间的核苷酸、10-60个之间的核苷酸、10-50个之间的核苷酸、10-40个之间的核苷酸、10-30个之间的核苷酸、10-20个之间的核苷酸、20-90个之间的核苷酸、20-80个之间的核苷酸、20-70个之间的核苷酸、20-60个之间的核苷酸、20-50个之间的核苷酸、20-40个之间的核苷酸、30-90个之间的核苷酸、30-80个之间的核苷酸、30-70个之间的核苷酸、30-60个之间的核苷酸或30-50个之间的核苷酸。
在实施例中，TREM被氨酰化，例如，通过氨酰基tRNA合成酶负载氨基酸。
在实施例中，TREM不负载氨基酸，例如，无负载的TREM(uTREM)。
在实施例中，TREM包含小于全长的tRNA。在实施例中，TREM可以对应于tRNA的天然存在的片段，或对应于非天然存在的片段。示例性片段包括：一半TREM(例如，来自ACHD中的切割，例如，在反密码子序列中，例如，5’一半或3’一半)，5'片段(例如，包含5’末端的片段，例如，来自DHD或ACHD中的切割)，3'片段(例如，包含3’末端的片段，例如，来自THD中的切割)，或内部片段(例如，来自ACHD、DHD或THD中的一个或多个的切割)。
“TREM核心片段”，如本文所使用的术语，指的是式B的序列的一部分：[L1]y-[ASt结构域1]x-[L2]y-[DH结构域]y-[L3]y-[ACH结构域]x-[VL结构域]y-[TH结构域]y-[L4]y-[ASt结构域2]x，其中：x＝1，y＝0或1。
本文所用的“TREM片段”是指TREM的一部分，其中TREM包含式A的序列：[L1]-[ASt结构域1]-[L2]-[DH结构域]-[L3]-[ACH结构域]-[VL结构域]-[TH结构域]-[L4]-[ASt结构域2]。
如本文所用的术语“同源衔接子功能TREM”是指TREM，其介导与TREM的反密码子天然相关联的AA(同源AA)的起始或延伸。
如本文所用的术语“减少的表达”是指与参考相比减少，例如在改变的控制区或药剂的添加导致受试者产物表达减少的情况下，相对于没有所述改变或添加的在其他方面类似的细胞，其表达减少。
如本文所用的术语“外源核酸”是指不存在于参考细胞中或与参考细胞中的最接近序列差异至少一个核苷酸的核酸序列，该参考细胞是例如外源核酸被引入的细胞。在实施例中，外源核酸包含编码TREM的核酸。
如本文所用的术语“外源TREM”是指具有以下TREM，该TREM：
(a)与参考细胞中最接近的序列tRNA差异至少有一个核苷酸或一个转录后修饰，该参考细胞是例如外源核酸被引入的细胞；
(b)已被引入不同于转录其的细胞的细胞；
(c)存在于其自然发生的细胞以外的细胞中；或者
(d)具有非野生型的表达谱，例如，水平或分布，例如，它的表达水平高于野生型。在实施例中，表达谱可以通过将变化引入调节表达的核酸或通过添加调节RNA分子表达的药剂来介导。在实施例中，外源TREM包括特性(a)-(d)中的1、2、3或4个。
如本文所用的术语“GMP级组合物”是指符合当前良好生产规范(cGMP)指南或其他类似要求的组合物。在实施例中，GMP级组合物可用作药物产品。
如本文所用，术语“增加”和“减少”是指相对于参考，调节分别产生特定指标的功能、表达或活性更大或更小的量。例如，在向细胞、组织或受试者施用本文所述的TREM之后，如本文所述的指标(例如，蛋白质翻译、mRNA稳定性、蛋白质折叠)的标志物的量可以相对于施用前标志物的量或相对于阴性对照剂的作用增加或减少至少5％、10％、15％、20％、25％、30％、35％、40％、45％、50％、55％、60％、65％、70％、75％、80％、85％、90％、95％或98％、2X、3X、5X、10X或更多。在施用已达到所述作用的时间，例如，在开始治疗后至少12小时、24小时、一周、一个月、3个月、或6个月时，测量施用后的指标。
如本文所用的术语“增加的表达”是指与参考相比增加，例如在改变的控制区或药剂的添加导致受试者产物表达增加的情况下，相对于没有所述改变或添加的在其他方面类似的细胞，其表达增加。
如本文所用的术语“非同源衔接子功能TREM”是指TREM，其介导与TREM的反密码子天然相关联的AA以外的AA(非同源AA)的起始或延伸。在实施例中，非同源衔接子功能TREM也被称为无负载的TREM(mTREM)。
如本文所用的术语“非天然存在的序列”是指序列，其中腺嘌呤被除腺嘌呤类似物以外的残基置换、胞嘧啶被除胞嘧啶类似物以外的残基置换、鸟嘌呤被鸟嘌呤类似物以外的残基置换，尿嘧啶被尿嘧啶类似物以外的残基置换。类似物是指核糖核苷酸A、G、C或U的任何可能的衍生物。在实施例中，具有核糖核苷酸A、G、C或U中任一个的衍生物的序列是非天然存在的序列。
如本文所用的术语“药物TREM组合物”是指适用于药物用途的TREM组合物。通常，药物TREM组合物包含药物赋形剂。在实施例中，TREM将是药物TREM组合物中唯一的活性成分。在实施例中，药物TREM组合物不含、基本上不含或具有少于药学上可接受量的宿主细胞蛋白，DNA，例如宿主细胞DNA，内毒素和细菌。
关于主题分子，例如，TREM、RNA或tRNA，如本文所用的术语“转录后加工”是指主题分子的共价修饰。在实施例中，共价修饰发生在转录后。在实施例中，共价修饰共转录地发生。在实施例中，修饰在体内进行，例如，在用于产生TREM的细胞中。在实施例中，修饰是在离体，例如，它是在从产生TREM的细胞中分离或获得的TREM上进行的。在实施例中，转录后修饰选自表2中列出的转录后修饰。
如本文所用，“合成的TREM”是指在具有编码TREM的内源核酸的细胞中的或由该细胞合成的TREM以外的TREM，例如，合成的TREM是通过无细胞固相合成来合成的。合成的TREM可以具有与天然tRNA相同或不同的序列或三级结构。
如本文所用的术语“重组TREM”是指在通过人为干预修饰具有介导TREM产生的修饰的细胞中表达的TREM，例如，细胞包含编码TREM的外源序列，或介导表达的修饰，例如，TREM的转录表达或转录后修饰。重组TREM可以与参考tRNA，例如，天然tRNA具有相同或不同的序列、转录后修饰组或三级结构。
如本文所用的术语“tRNA”是指以其天然状态的天然存在的转移核糖核酸。
如本文所用的术语“TREM组合物”是指包含多个TREM、多个TREM核心片段和/或多个TREM片段的组合物。TREM组合物可以包含一种或多种TREM、TREM核心片段或TREM片段。在实施例中，组合物仅包含单一种类的TREM、TREM核心片段或TREM片段。在实施例中，TREM组合物包含第一TREM、TREM核心片段或TREM片段种类；以及第二TREM、TREM核心片段或TREM片段种类。在实施例中，TREM组合物包含X个TREM、TREM核心片段或TREM片段种类，其中X＝2、3、4、5、6、7、8、9或10。在实施例中，TREM、TREM核心片段或TREM片段与表1中的核酸编码的序列具有至少70％、75％、80％、85％、90％或95％，或具有100％同一性。TREM组合物可以包含一种或多种TREM、TREM核心片段或TREM片段。在实施例中，TREM组合物是至少10％、20％、30％、40％、50％、60％、70％、80％、90％、95％或99％干重TREM(对于液体组合物，干重是指去除基本上所有液体，例如，冻干后)。在实施例中，该组合物是液体。在实施例中，该组合物是干燥的，例如，冻干的材料。在实施例中，该组合物是冷冻的组合物。在实施例中，该组合物是无菌的。在实施例中，该组合物包含至少0.5g、1.0g、5.0g、10g、15g、25g、50g、100g、200g、400g或500g TREM(例如，由干重确定)。
在实施例中，TREM组合物中至少X％的TREM在选定位置具有非天然存在的修饰，并且X为80、90、95、96、97、98、99或99.5。
在实施例中，TREM组合物中至少X％的TREM在第一位置具有非天然存在的修饰并且在第二位置具有非天然存在的修饰，并且X独立地为80、90、95、96、97、98、99或99.5。在实施例中，在第一和第二位置的修饰是相同的。在实施例中，第一和第二位置处的修饰是不同的。在实施例中，第一个和第二位置的核苷酸是相同的，例如，两者都是腺嘌呤。在实施例中，第一和第二位置的核苷酸不同，例如，一个是腺嘌呤，一个是胸腺嘧啶。
在实施例中，TREM组合物中至少X％的TREM在第一位置具有非天然存在的修饰并且少于Y％在第二位置具有非天然存在的修饰，其中X是80、90、95、96、97、98、99或99.5，Y是20、20、5、2、1、.1或.01。在实施例中，第一个和第二位置的核苷酸是相同的，例如，两者都是腺嘌呤。在实施例中，第一和第二位置的核苷酸不同，例如，一个是腺嘌呤，一个是胸腺嘧啶。
TREM、TREM核心片段和TREM片段
“基于tRNA的效应分子”或“TREM”是指包含一种或多种本文所述特性的RNA分子。TREM可以包含非天然存在的修饰，例如，如表4、5、6或7中提供的。
在实施例中，TREM包括含有式A的序列的TREM；含有式B的序列的TREM核心片段；或含有TREM(该TREM含有式A的序列)一部分的TREM片段。
在实施例中，TREM包含式A的序列：[L1]-[ASt结构域1]-[L2]-[DH结构域]-[L3]-[ACH结构域]-[VL结构域]-[TH结构域]-[L4]-[ASt结构域2]。在实施例中，[VL结构域]是任选的。在实施例中，[L1]是任选的。
在实施例中，TREM核心片段包含式B的序列：[L1]y-[ASt结构域1]x-[L2]y-[DH结构域]y-[L3]y-[ACH结构域]x-[VL结构域]y-[TH结构域]y-[L4]y-[ASt结构域2]x，其中：x＝1，y＝0或1。在实施例中，y＝0。在实施例中，y＝1。
在实施例中，TREM片段包含TREM的一部分，其中该TREM包含式A的序列：[L1]-[ASt结构域1]-[L2]-[DH结构域]-[L3]-[ACH结构域]-[VL结构域]-[TH结构域]-[L4]-[ASt结构域2]，并且其中TREM片段包含：以下中的一种、两种、三种或全部或任何组合：一半TREM(例如，来自ACH结构域中的切割，例如，在反密码子序列中的切割，例如，5'一半或3'一半)；5’片段(例如，包含5'末端的片段，例如来自DH结构域或ACH结构域中的切割)；3’片段(例如，包含3’末端的片段，例如来自TH结构中的切割)；或内部片段(例如，来自ACH结构域、DH结构域或TH结构域中任何一个的切割)。示例性的TREM片段包括TREM一半(例如，来自ACHD中的切割，例如，5’TREM一半或3’TREM一半)，5'片段(例如，包含5’末端的片段，例如，来自DHD或ACHD中的切割)，3'片段(例如，包含TREM的3’末端的片段，例如，来自THD中的切割)，或内部片段(例如，来自ACHD、DHD或THD中的一个或多个的切割)。
在实施例中，TREM、TREM核心片段或TREM片段可以带有氨基酸(例如，同源氨基酸)；带有非同源氨基酸(例如，误加载的TREM(mTREM))；或不带氨基酸(例如，未加载的TREM(uTREM))。在实施例中，TREM、TREM核心片段或TREM片段可以带有选自以下的氨基酸：丙氨酸、精氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酰胺、谷氨酸、甘氨酸、组氨酸、异亮氨酸、甲硫氨酸、亮氨酸、赖氨酸、苯丙氨酸、脯氨酸、丝氨酸、苏氨酸、色氨酸、酪氨酸或缬氨酸。
在一些实施例中，非延伸的反密码子是不超过三个核苷酸的反密码子。在实施例中，非延伸密码子对在被翻译的核酸上具有不超过三个密码子核苷酸。
在实施例中，TREM、TREM核心片段或TREM片段是同源TREM。在实施例中，TREM、TREM核心片段或TREM片段是非同源TREM。在实施例中，TREM、TREM核心片段或TREM片段识别表2或表3中提供的密码子。
表2：密码子列表
表3：氨基酸和相应的密码子
在实施例中，TREM包含由表1中披露的脱氧核糖核酸(DNA)序列(例如，表1中披露的SEQ ID NO:1-451中的任一个)编码的核糖核酸(RNA)序列。在实施例中，TREM包含与由表1中提供的DNA序列(例如，表1中披露的SEQ ID NO:1-451中的任一个)编码的RNA序列至少60％、65％、70％、75％、80％、82％、85％、87％、88％、90％、92％、95％、96％、97％、98％或99％相同的RNA序列。在实施例中，TREM包含由与表1中提供的DNA序列(例如，表1中披露的SEQ ID NO:1-451中的任一个)至少60％、65％、70％、75％、80％、82％、85％、87％、88％、90％、92％、95％、96％、97％、98％或99％相同的DNA序列编码的RNA序列。
在实施例中，TREM、TREM核心片段或TREM片段包含由表1中披露的DNA序列编码的RNA序列的至少5、10、15、20、25或30个连续核苷酸，例如，由表1中披露的SEQ ID NO:1-451中任一个编码的RNA序列的至少5、10、15、20、25或30个连续核苷酸。在实施例中，TREM、TREM核心片段或TREM片段包含与由表1中提供的DNA序列(例如，表1中披露的SEQ ID NO:1-451中的任一个)编码的RNA序列至少60％、65％、70％、75％、80％、82％、85％、87％、88％、90％、92％、95％、96％、97％、98％或99％相同的RNA序列的至少5、10、15、20、25或30个连续核苷酸。在实施例中，TREM、TREM核心片段或TREM片段包含与由表1中提供的DNA序列(例如，表1中披露的SEQ ID NO:1-451中的任一个)至少60％、65％、70％、75％、80％、82％、85％、87％、88％、90％、92％、95％、96％、97％、98％或99％相同的DNA序列编码的RNA序列的至少5、10、15、20、25或30个连续核苷酸。
在实施例中，TREM核心片段或TREM片段包含由表1中提供的DNA序列(例如，表1中公开的SEQ ID NO:1-451中的任一个)编码的RNA序列的至少5％、10％、15％、20％、25％、30％、35％、40％、50％、55％、60％、65％、70％、75％、80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％或99％。在实施例中，TREM核心片段或TREM片段包含与由表1中提供的DNA序列(例如，表1中公开的SEQ ID NO:1-451中的任一个)编码的RNA序列至少80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％、或99％相同的RNA序列的至少5％、10％、15％、20％、25％、30％、35％、40％、50％、55％、60％、65％、70％、75％、80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％或99％。在实施例中，TREM核心片段或TREM片段包含由与表1中提供的DNA序列(例如，表1中公开的SEQ ID NO:1-451中的任一个)至少80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％、或99％相同的DNA序列编码的RNA序列的至少5％、10％、15％、20％、25％、30％、35％、40％、50％、55％、60％、65％、70％、75％、80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％或99％。
在实施例中，TREM核心片段或TREM片段包含由表1中披露的DNA序列(例如，表1中公开的SEQ ID NO:1-451中的任一个)编码的RNA序列的至少5个核糖核苷酸(nt)、10nt、15nt、20nt、25nt、30nt、35nt、40nt、45nt、50nt、55nt或60nt(但小于全长)。在实施例中，TREM核心片段或TREM片段包含与由表1中提供的DNA序列(例如，表1中披露的SEQ ID NO:1-451中的任一个)编码的RNA序列至少80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％、99％或100％相同的RNA序列的至少5个核糖核苷酸(nt)、10nt、15nt、20nt、25nt、30nt、35nt、40nt、45nt、50nt、55nt或60nt(但小于全长)。在实施例中，TREM核心片段或TREM片段包含由与表1中提供的DNA序列(例如，表1中披露的SEQ ID NO:1-451中的任一个)具有至少80％、82％、85％、87％、88％、90％、92％、95％、96％、97％、98％、99％或100％同一性的DNA序列编码的RNA序列的至少5个核糖核苷酸(nt)、10nt、15nt、20nt、25nt、30nt、35nt、40nt、45nt、50nt、55nt或60nt(但小于全长)。
在实施例中，TREM核心片段或TREM片段包含长度10-90个核糖核苷酸(rnt)、10-80rnt、10-70rnt、10-60rnt、10-50rnt、10-40rnt、10-30rnt、10-20rnt、20-90rnt、20-80rnt,20-70rnt、20-60rnt、20-50rnt、20-40rnt、30-90rnt、30-80rnt、30-70rnt、30-60rnt或30-50rnt的序列。
表1：tRNA序列列表
非天然存在的修饰
本文所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段包含非天然存在的修饰，例如表5-9中任一项中所述的修饰。可以根据本领域已知的方法进行非天然存在的修饰。实例4-7中提供了进行非天然存在的修饰的示例性方法。
在实施例中，非天然存在的修饰是细胞例如人细胞不对内源tRNA进行的修饰。
在实施例中，非天然存在的修饰是细胞(例如人细胞)可以在内源tRNA上进行的修饰，但其中这样的修饰在天然tRNA上不发生的位置。在实施例中，非天然存在的修饰在天然地不具有这样的修饰的结构域、接头或臂中。在实施例中，非天然存在的修饰在天然地不具有这样的修饰的结构域、接头或臂中内的位置。在实施例中，非天然存在的修饰在天然地不具有这样的修饰的核苷酸上。在实施例中，非天然存在的修饰在天然地不具有这样的修饰的结构域、接头或臂中内的位置处的核苷酸上。
在实施例中，本文所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段包含表5中提供的非天然存在的修饰或其组合。
表5：示例性的非天然存在的修饰
在实施例中，本文所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段包含表6中提供的修饰或其组合。表6中提供的修饰天然存在于RNA中，并且在本文中用在合成的TREM、TREM核心片段或TREM片段上天然不存在的位置处。
表6：另外的示例性修饰
在实施例中，本文所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段包含表7中提供的非天然存在的修饰或其组合。
表7：另外的示例性非天然存在的修饰
在实施例中，本文所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段包含表8中提供的非天然存在的修饰或其组合。
表8：示例性主链修饰
在实施例中，本文所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段包含表9中提供的非天然存在的修饰或其组合。
表9：示例性的非天然存在的主链修饰
TREM、TREM核心片段和TREM片段融合物
在实施例中，本文披露的TREM、TREM核心片段或TREM片段包含另外的部分，例如，融合部分。在实施例中，融合部分可用于纯化以改变TREM、TREM核心片段或TREM片段的折叠或用作靶向部分。在实施例中，融合部分可以包含标签、接头，可以是可切割的或可以包括酶的结合位点。在实施例中，融合部分可以位于TREM的N末端或TREM、TREM核心片段或TREM片段的C末端。在实施例中，融合部分可由编码TREM、TREM核心片段或TREM片段的相同或不同核酸分子编码。
TREM共有序列
在实施例中，本文公开的TREM包含本文提供的共有序列。
在实施例中，本文公开的TREM包含式IZZZ的共有序列，其中ZZZ表示二十种氨基酸中的任一个且式I对应于所有物种。
在实施例中，本文公开的TREM包含式IIZZZ的共有序列的TREM，其中ZZZ表示二十种氨基酸中的任一个并且式II对应于哺乳动物。
在实施例中，本文公开的TREM包含式IIIZZZ的共有序列的TREM，其中ZZZ表示二十种氨基酸中的任一个并且式III对应于人。
在实施例中，ZZZ表示二十种氨基酸中的任一种：丙氨酸、精氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酰胺、谷氨酸、甘氨酸、组氨酸、异亮氨酸、甲硫氨酸、亮氨酸、赖氨酸、苯丙氨酸、脯氨酸、丝氨酸、苏氨酸、色氨酸、酪氨酸或缬氨酸。
在实施例中，本文公开的TREM包括选自以下的特性：
a)在生理条件下，残基R0形成接头区，例如，接头1区；
b)在生理条件下，残基R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7和残基R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71形成茎区，例如，AStD茎区；
c)在生理条件下，残基R8-R9形成接头区，例如，接头2区；
d)在生理条件下，残基-R10-R11-R12-R13-R14 R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28形成茎环区，例如，D臂区；
e)在生理条件下，残基-R29形成接头区，例如，接头3区；
f)在生理条件下，残基-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46形成茎环区，例如，AC臂区；
g)在生理条件下残基-[R47]x包含可变区，例如如本文所述的可变区；
h)在生理条件下，残基-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64形成茎环区，例如，T臂区；或者
i)在生理条件下，残基R72形成接头区，例如，接头4区。
丙氨酸TREM共有序列
在实施例中，本文公开的TREM包含式IALA的序列(SEQ ID NO:562)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72，其中R是核糖核苷酸残基并且Ala的共有序列是：R0＝不存在；R14、R57＝独立地是A或不存在；R26＝A、C、G或不存在；R5、R6、R15、R16、R21、R30、R31、R32、R34、R37、R41、R42、R43、R44、R45、R48、R49、R50、R58、R59、R63、R64、R66、R67＝独立地是N或不存在；R11、R35、R65＝独立地是A、C、U或不存在；R1、R9、R20、R38、R40、R51、R52、R56＝独立地是A、G或不存在；R7、R22、R25、R27、R29、R46、R53、R72＝独立地是A、G、U或不存在；R24、R69＝独立地是A、U或不存在；R70、R71＝独立地是C或不存在；R3、R4＝独立地是C、G或不存在；R12、R33、R36、R62、R68＝独立地是C、G、U或不存在；R13、R17、R28、R39、R55、R60、R61＝独立地是C、U或不存在；R10、R19、R23＝独立地为G或不存在；R2＝G、U或不存在；R8、R18、R54＝独立地是U或不存在；[R47]x＝N或不存在；其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIALA的序列(SEQ ID NO:563)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Ala共有的是：
R0、R18＝不存在；
R14、R24、R57＝独立地是A或不存在；
R15、R26、R64＝独立地是A、C、G或不存在；
R16、R31、R50、R59＝独立地是N或不存在；
R11、R32、R37、R41、R43、R45、R49、R65、R66＝独立地是A、C、U或不存在；
R1、R5、R9、R25、R27、R38、R40、R46、R51、R56＝独立地是A、G或不存在；
R7、R22、R29、R42、R44、R53、R63、R72＝独立地是A、G、U或不存在；
R6、R35、R69＝独立地是A、U或不存在；
R55、R60、R70、R71＝独立地是C或不存在；
R3＝C、G或不存在；
R12、R36、R48＝独立地是C、G、U或不存在；
R13、R17、R28、R30、R34、R39、R58、R61、R62、R67、R68＝独立地是C、U或不存在；
R4、R10、R19、R20、R23、R52＝独立地是G或不存在；
R2、R8、R33＝独立地是G、U或不存在；
R21、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIIALA的序列(SEQ ID NO:564)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Ala共有的是：
R0、R18＝不存在；
R14、R24、R57、R72＝独立地是A或不存在；
R15、R26、R64＝独立地是A、C、G或不存在；
R16、R31、R50＝独立地是N或不存在；
R11、R32、R37、R41、R43、R45、R49、R65、R66＝独立地是A、C、U或不存在；
R5、R9、R25、R27、R38、R40、R46、R51、R56＝独立地是A、G或不存在；
R7、R22、R29、R42、R44、R53、R63＝独立地是A、G、U或不存在；
R6、R35＝独立地是A、U或不存在；
R55、R60、R61、R70、R71＝独立地是C或不存在；
R12、R48、R59＝独立地是C、G、U或不存在；
R13、R17、R28、R30、R34、R39、R58、R62、R67、R68＝独立地是C、U或不存在；
R1、R2、R3、R4、R10、R19、R20、R23、R52＝独立地是G或不存在；
R33、R36＝独立地是G、U或不存在；
R8、R21、R54、R69＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
精氨酸TREM共有序列
在实施例中，本文披露的TREM包含式IARG的序列(SEQ ID NO:565)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Arg共有的是：
R57＝A或不存在；
R9、R27＝独立地是A、C、G或不存在；
R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R11、R12、R16、R21、R22、R23、R25、R26、R29、R30、R31、R32、R33、R34、R37、R42、R44、R45、R46、R48、R49、R50、R51、R58、R62、R63、R64、R65、R66、R67、R68、R69、R70、R71＝独立地是N或不存在；
R13、R17、R41＝独立地是A、C、U或不存在；
R19、R20、R24、R40、R56＝独立地是A、G或不存在；
R14、R15、R72＝独立地是A、G、U或不存在；
R18＝A、U或不存在；
R38＝C或不存在；
R35、R43、R61＝独立地是C、G、U或不存在；
R28、R55、R59、R60＝独立地是C、U或不存在；
R0、R10、R52＝独立地是G或不存在；
R8、R39＝独立地是G、U或不存在；
R36、R53、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIARG的序列(SEQ ID NO:566)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Arg共有的是：
R18＝不存在；
R24、R57＝独立地是A或不存在；
R41＝A、C或不存在；
R3、R7、R34、R50＝独立地是A、C、G或不存在；
R2、R5、R6、R12、R26、R32、R37、R44、R58、R66、R67、R68、R70＝独立地是N或不存在；
R49、R71＝独立地是A、C、U或不存在；
R1、R15、R19、R25、R27、R40、R45、R46、R56、R72＝独立地是A、G或不存在；
R14、R29、R63＝独立地是A、G、U或不存在；
R16、R21＝独立地是A、U或不存在；
R38、R61＝独立地是C或不存在；
R33、R48＝独立地是C、G或不存在；
R4、R9、R11、R43、R62、R64、R69＝独立地是C、G、U或不存在；
R13、R22、R28、R30、R31、R35、R55、R60、R65＝独立地是C、U或不存在；
R0、R10、R20、R23、R51、R52＝独立地是G或不存在；
R8、R39、R42＝独立地是G、U或不存在；
R17、R36、R53、R54、R59＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIIARG的序列(SEQ ID NO:567)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Arg共有的是：
R18＝不存在；
R15、R21、R24、R41、R57＝独立地是A或不存在；
R34、R44＝独立地是A、C或不存在；
R3、R5、R58＝独立地是A、C、G或不存在；
R2、R6、R66、R70＝独立地是N或不存在；
R37、R49＝独立地是A、C、U或不存在；
R1、R25、R29、R40、R45、R46、R50＝独立地是A、G或不存在；
R14、R63、R68＝独立地是A、G、U或不存在；
R16＝A、U或不存在；
R38、R61＝独立地是C或不存在；
R7、R11、R12、R26、R48＝独立地是C、G或不存在；
R64、R67、R69＝独立地是C、G、U或不存在；
R4、R13、R22、R28、R30、R31、R35、R43、R55、R60、R62、R65、R71＝独立地是C、U或不存在；
R0、R10、R19、R20、R23、R27、R33、R51、R52、R56、R72＝独立地是G或不存在；
R8、R9、R32、R39、R42＝独立地是G、U或不存在；
R17、R36、R53、R54、R59＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
天冬酰胺TREM共有序列
在实施例中，本文披露的TREM包含式IASN的序列(SEQ ID NO:568)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Asn共有的是：
R0、R18＝不存在；
R41＝A或不存在；
R14、R48、R56＝独立地是A、C、G或不存在；
R2、R4、R5、R6、R12、R17、R26、R29、R30、R31、R44、R45、R46、R49、R50、R58、R62、R63、R65、R66、R67、R68、R70、R71＝独立地是N或不存在；
R11、R13、R22、R42、R55、R59＝独立地是A、C、U或不存在；
R9、R15、R24、R27、R34、R37、R51、R72＝独立地是A、G或不存在；
R1、R7、R25、R69＝独立地是A、G、U或不存在；
R40、R57＝独立地是A、U或不存在；
R60＝C或不存在；
R33＝C、G或不存在；
R21、R32、R43、R64＝独立地是C、G、U或不存在；
R3、R16、R28、R35、R36、R61＝独立地是C、U或不存在；
R10、R19、R20、R52＝独立地是G或不存在；
R54＝G、U或不存在；
R8、R23、R38、R39、R53＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIASN的序列(SEQ ID NO:569)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Asn共有的是：
R0、R18＝不存在
R24、R41、R46、R62＝独立地是A或不存在；
R59＝A、C或不存在；
R14、R56、R66＝独立地是A、C、G或不存在；
R17、R29＝独立地是N或不存在；
R11、R26、R42、R55＝独立地是A、C、U或不存在；
R1、R9、R12、R15、R25、R34、R37、R48、R51、R67、R68、R69、R70、R72＝独立地是A、G或不存在；
R44、R45、R58＝独立地是A、G、U或不存在；
R40、R57＝独立地是A、U或不存在；
R5、R28、R60＝独立地是C或不存在；
R33、R65＝独立地是C、G或不存在；
R21、R43、R71＝独立地是C、G、U或不存在；
R3、R6、R13、R22、R32、R35、R36、R61、R63、R64＝独立地是C、U或不存在；
R7、R10、R19、R20、R27、R49、R52＝独立地是G或不存在；
R54＝G、U或不存在；
R2、R4、R8、R16、R23、R30、R31、R38、R39、R50、R53＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIIASN的序列(SEQ ID NO:570)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Asn共有的是：
R0、R18＝不存在
R24、R40、R41、R46、R62＝独立地是A或不存在；
R59＝A、C或不存在；
R14、R56、R66＝独立地是A、C、G或不存在；
R11、R26、R42、R55＝独立地是A、C、U或不存在；
R1、R9、R12、R15、R34、R37、R48、R51、R67、R68、R69、R70＝独立地是A、G或不存在；
R44、R45、R58＝独立地是A、G、U或不存在；
R57＝A、U或不存在；
R5、R28、R60＝独立地是C或不存在；
R33、R65＝独立地是C、G或不存在；
R17、R21、R29＝独立地是C、G、U或不存在；
R3、R6、R13、R22、R32、R35、R36、R43、R61、R63、R64、R71＝独立地是C、U或不存在；
R7、R10、R19、R20、R25、R27、R49、R52、R72＝独立地是G或不存在；
R54＝G、U或不存在；
R2、R4、R8、R16、R23、R30、R31、R38、R39、R50、R53＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
天冬氨酸TREM共有序列
在实施例中，本文披露的TREM包含式IASP的序列(SEQ ID NO:571)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R5 9-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Asp共有的是：
R0＝不存在
R24、R71＝独立地是A、C或不存在；
R33、R46＝独立地是A、C、G或不存在；
R2、R3、R4、R5、R6、R12、R16、R22、R26、R29、R31、R32、R44、R48、R49、R58、R63、R64、R66、R67、R68、R69＝独立地是N或不存在；
R13、R21、R34、R41、R57、R65＝独立地是A、C、U或不存在；
R9、R10、R14、R15、R20、R27、R37、R40、R51、R56、R72＝独立地是A、G或不存在；
R7、R25、R42＝独立地是A、G、U或不存在；
R39＝C或不存在；
R50、R62＝独立地是C、G或不存在；
R30、R43、R45、R55、R70＝独立地是C、G、U或不存在；
R8、R11、R17、R18、R28、R35、R53、R59、R60、R61＝独立地是C、U或不存在；
R19、R52＝独立地是G或不存在；
R1＝G、U或不存在；
R23、R36、R38、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIASP的序列(SEQ ID NO:572)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Asp共有的是：
R0、R17、R18、R23＝独立地是不存在；
R9、R40＝独立地是A或不存在；
R24、R71＝独立地是A、C或不存在；
R67、R68＝独立地是A、C、G或不存在；
R2、R6、R66＝独立地是N或不存在；
R57、R63＝独立地是A、C、U或不存在；
R10、R14、R27、R33、R37、R44、R46、R51、R56、R64、R72＝独立地是A、G或不存在；
R7、R12、R26、R65＝独立地是A、U或不存在；
R39、R61、R62＝独立地是C或不存在；
R3、R31、R45、R70＝独立地是C、G或不存在；
R4、R5、R29、R43、R55＝独立地是C、G、U或不存在；
R8、R11、R13、R30、R32、R34、R35、R41、R48、R53、R59、R60＝独立地是C、U或不存在；
R15、R19、R20、R25、R42、R50、R52＝独立地是G或不存在；
R1、R22、R49、R58、R69＝独立地是G、U或不存在；
R16、R21、R28、R36、R38、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIIASP的序列(SEQ ID NO:573)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Asp共有的是：
R0、R17、R18、R23＝不存在
R9、R12、R40、R65、R71＝独立地是A或不存在；
R2、R24、R57＝独立地是A、C或不存在；
R6、R14、R27、R46、R51、R56、R64、R67、R68＝独立地是A、G或不存在；
R3、R31、R35、R39、R61、R62＝独立地是C或不存在；
R66＝C、G或不存在；
R5、R8、R29、R30、R32、R34、R41、R43、R48、R55、R59、R60、R63＝独立地是C、U或不存在；
R10、R15、R19、R20、R25、R33、R37、R42、R44、R45、R49、R50、R52、R69、R70、R72＝独立地是G或不存在；
R22、R58＝独立地是G、U或不存在；
R1、R4、R7、R11、R13、R16、R21、R26、R28、R36、R38、R53、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
半胱氨酸TREM共有序列
在实施例中，本文披露的TREM包含式ICYS的序列(SEQ ID NO:574)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Cys共有的是：
R0＝不存在
R14、R39、R57＝独立地是A或不存在；
R41＝A、C或不存在；
R10、R15、R27、R33、R62＝独立地是A、C、G或不存在；
R3、R4、R5、R6、R12、R13、R16、R24、R26、R29、R30、R31、R32、R34、R42、R44、R45、R46、R48、R49、R58、R63、R64、R66、R67、R68、R69、R70＝独立地是N或不存在；
R65＝A、C、U或不存在；
R9、R25、R37、R40、R52、R56＝独立地是A、G或不存在；
R7、R20、R51＝独立地是A、G、U或不存在；
R18、R38、R55＝独立地是C或不存在；
R2＝C、G或不存在；
R21、R28、R43、R50＝独立地是C、G、U或不存在；
R11、R22、R23、R35、R35、R59、R60、R61、R71、R72＝独立地是C、U或不存在；
R1、R19＝独立地是G或不存在；
R17＝G、U或不存在；
R8、R53、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IICYS的序列(SEQ ID NO:575)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Cys共有的是：
R0、R18、R23＝不存在；
R14、R24、R26、R29、R39、R41、R45、R57＝独立地是A或不存在；
R44＝A、C或不存在；
R27、R62＝独立地是A、C、G或不存在；
R16＝A、C、G、U或不存在；
R30、R70＝独立地是A、C、U或不存在；
R5、R7、R9、R25、R34、R37、R40、R46、R52、R56、R58、R66＝独立地是A、G或不存在；
R20、R51＝独立地是A、G、U或不存在；
R35、R38、R43、R55、R69＝独立地是C或不存在；
R2、R4、R15＝独立地是C、G或不存在；
R13＝C、G、U或不存在；
R6、R11、R28、R36、R48、R49、R50、R60、R61、R67、R68、R71、R72＝独立地是C、U或不存在；
R1、R3、R10、R19、R33、R63＝独立地是G或不存在；
R8、R17、R21、R64＝独立地是G、U或不存在；
R12、R22、R31、R32、R42、R53、R54、R65＝独立地是U或不存在；
R59＝U，或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIICYS的序列(SEQ ID NO:576)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Cys共有的是：
R0、R18、R23＝不存在
R14、R24、R26、R29、R34、R39、R41、R45、R57、R58＝独立地是A或不存在；
R44、R70＝独立地是A、C或不存在；
R62＝A、C、G或不存在；
R16＝N或不存在；
R5、R7、R9、R20、R40、R46、R51、R52、R56、R66＝独立地是A、G或不存在；
R28、R35、R38、R43、R55、R67、R69＝独立地是C或不存在；
R4、R15＝独立地是C、G或不存在；
R6、R11、R13、R30、R48、R49、R50、R60、R61、R68、R71、R72＝独立地是C、U或不存在；
R1、R2、R3、R10、R19、R25、R27、R33、R37、R63＝独立地是G或不存在；
R8、R21、R64＝独立地是G、U或不存在；
R12、R17、R22、R31、R32、R36、R42、R53、R54、R59、R65＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
谷氨酰胺TREM共有序列
在实施例中，本文披露的TREM包含式IGLN的序列(SEQ ID NO:577)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Gln共有的是：
R0、R18＝不存在；
R14、R24、R57＝独立地是A或不存在；
R9、R26、R27、R33、R56＝独立地是A、C、G或不存在；
R2、R4、R5、R6、R12、R13、R16、R21、R22、R25、R29、R30、R31、R32、R34、R41、R42、R44、R45、R46、R48、R49、R50、R58、R62、R63、R66、R67、R68、R69、R70＝独立地是N或不存在；
R17、R23、R43、R65、R71＝独立地是A、C、U或不存在；
R15、R40、R51、R52＝独立地是A、G或不存在；
R1、R7、R72＝独立地是A、G、U或不存在；
R3、R11、R37、R60、R64＝独立地是C、G、U或不存在；
R28、R35、R55、R59、R61＝独立地是C、U或不存在；
R10、R19、R20＝独立地是G或不存在；
R39＝G、U或不存在；
R8、R36、R38、R53、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIGLN的序列(SEQ ID NO:578)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Gln共有的是：
R0、R18、R23＝不存在
R14、R24、R57＝独立地是A或不存在；
R17、R71＝独立地是A、C或不存在；
R25、R26、R33、R44、R46、R56、R69＝独立地是A、C、G或不存在；
R4、R5、R12、R22、R29、R30、R48、R49、R63、R67、R68＝独立地是N或不存在；
R31、R43、R62、R65、R70＝独立地是A、C、U或不存在；
R15、R27、R34、R40、R41、R51、R52＝独立地是A、G或不存在；
R2、R7、R21、R45、R50、R58、R66、R72＝独立地是A、G、U或不存在；
R3、R13、R32、R37、R42、R60、R64＝独立地是C、G、U或不存在；
R6、R11、R28、R35、R55、R59、R61＝独立地是C、U或不存在；
R9、R10、R19、R20＝独立地是G或不存在；
R1、R16、R39＝独立地是G、U或不存在；
R8、R36、R38、R53、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIIGLN的序列(SEQ ID NO:579)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Gln共有的是：
R0、R18、R23＝不存在
R14、R24、R41、R57＝独立地是A或不存在；
R17、R71＝独立地是A、C或不存在；
R5、R25、R26、R46、R56、R69＝独立地是A、C、G或不存在；
R4、R22、R29、R30、R48、R49、R63、R68＝独立地是N或不存在；
R43、R62、R65、R70＝独立地是A、C、U或不存在；
R15、R27、R33、R34、R40、R51、R52＝独立地是A、G或不存在；
R2、R7、R12、R45、R50、R58、R66＝独立地是A、G、U或不存在；
R31＝A、U或不存在；
R32、R44、R60＝独立地是C、G或不存在；
R3、R13、R37、R42、R64、R67＝独立地是C、G、U或不存在；
R6、R11、R28、R35、R55、R59、R61＝独立地是C、U或不存在；
R9、R10、R19、R20＝独立地是G或不存在；
R1、R21、R39、R72＝独立地是G、U或不存在；
R8、R16、R36、R38、R53、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
谷氨酸TREM共有序列
在实施例中，本文披露的TREM包含式IGLU的序列(SEQ ID NO:580)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Glu共有的是：
R0＝不存在；
R34、R43、R68、R69＝独立地是A、C、G或不存在；
R1、R2、R5、R6、R9、R12、R16、R20、R21、R26、R27、R29、R30、R31、R32、R33、R41、R44、R45、R46、R48、R50、R51、R58、R63、R64、R65、R66、R70、R71＝独立地是N或不存在；
R13、R17、R23、R61＝独立地是A、C、U或不存在；
R10、R14、R24、R40、R52、R56＝独立地是A、G或不存在；
R7、R15、R25、R67、R72＝独立地是A、G、U或不存在；
R11、R57＝独立地是A、U或不存在；
R39＝C、G或不存在；
R3、R4、R22、R42、R49、R55、R62＝独立地是C、G、U或不存在；
R18、R28、R35、R37、R53、R59、R60＝独立地是C、U或不存在；
R19＝G或不存在；
R8、R36、R38、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIGLU的序列(SEQ ID NO:581)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Glu共有的是：
R0、R18、R23＝不存在
R17、R40＝独立地是A或不存在；
R26、R27、R34、R43、R68、R69、R71＝独立地是A、C、G或不存在；
R1、R2、R5、R12、R21、R31、R33、R41、R45、R48、R51、R58、R66、R70＝独立地是N或不存在；
R44、R61＝独立地是A、C、U或不存在；
R9、R14、R24、R25、R52、R56、R63＝独立地是A、G或不存在；
R7、R15、R46、R50、R67、R72＝独立地是A、G、U或不存在；
R29、R57＝独立地是A、U或不存在；
R60＝C或不存在；
R39＝C、G或不存在；
R3、R6、R20、R30、R32、R42、R55、R62、R65＝独立地是C、G、U或不存在；
R4、R8、R16、R28、R35、R37、R49、R53、R59＝独立地是C、U或不存在；
R10、R19＝独立地是G或不存在；
R22、R64＝独立地是G、U或不存在；
R11、R13、R36、R38、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIIGLU的序列(SEQ ID NO:582)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Glu共有的是：
R0、R17、R18、R23＝不存在
R14、R27、R40、R71＝独立地是A或不存在；
R44＝A、C或不存在；
R43＝A、C、G或不存在；
R1、R31、R33、R45、R51、R66＝独立地是N或不存在；
R21、R41＝独立地是A、C、U或不存在；
R7、R24、R25、R50、R52、R56、R63、R68、R70＝独立地是A、G或不存在；
R5、R46＝独立地是A、G、U或不存在；
R29、R57、R67、R72＝独立地是A、U或不存在；
R2、R39、R60＝独立地是C或不存在；
R3、R12、R20、R26、R34、R69＝独立地是C、G或不存在；
R6、R30、R42、R48、R65＝独立地是C、G、U或不存在；
R4、R16、R28、R35、R37、R49、R53、R55、R58、R61、R62＝独立地是C、U或不存在；
R9、R10、R19、R64＝独立地是G或不存在；
R15、R22、R32＝独立地是G、U或不存在；
R8、R11、R13、R36、R38、R54、R59＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
甘氨酸TREM共有序列
在实施例中，本文披露的TREM包含式IGLY的序列(SEQ ID NO:583)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Gly共有的是：
R0＝不存在；
R24＝A或不存在；
R3、R9、R40、R50、R51＝独立地是A、C、G或不存在；
R4、R5、R6、R7、R12、R16、R21、R22、R26、R29、R30、R31、R32、R33、R34、R41、R42、R43、R44、R45、R46、R48、R49、R58、R63、R64、R65、R66、R67、R68＝独立地是N或不存在；
R59＝A、C、U或不存在；
R1、R10、R14、R15、R27、R56＝独立地是A、G或不存在；
R20、R25＝独立地是A、G、U或不存在；
R57、R72＝独立地是A、U或不存在；
R38、R39、R60＝独立地是C或不存在；
R52＝C、G或不存在；
R2、R19、R37、R54、R55、R61、R62、R69、R70＝独立地是C、G、U或不存在；
R11、R13、R17、R28、R35、R36、R71＝独立地是C、U或不存在；
R8、R18、R23、R53＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIGLY的序列(SEQ ID NO:584)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Gly共有的是：
R0、R18、R23＝不存在
R24、R27、R40、R72＝独立地是A或不存在；
R26＝A、C或不存在；
R3、R7、R68＝独立地是A、C、G或不存在；
R5、R30、R41、R42、R44、R49、R67＝独立地是A、C、G、U或不存在；
R31、R32、R34＝独立地是A、C、U或不存在；
R9、R10、R14、R15、R33、R50、R56＝独立地是A、G或不存在；
R12、R16、R22、R25、R29、R46＝独立地是A、G、U或不存在；
R57＝A、U或不存在；
R17、R38、R39、R60、R61、R71＝独立地是C或不存在；
R6、R52、R64、R66＝独立地是C、G或不存在；
R2、R4、R37、R48、R55、R65＝独立地是C、G、U或不存在；
R13、R35、R43、R62、R69＝独立地是C、U或不存在；
R1、R19、R20、R51、R70＝独立地是G或不存在；
R21、R45、R63＝独立地是G、U或不存在；
R8、R11、R28、R36、R53、R54、R58、R59＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIIGLY的序列(SEQ ID NO:585)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Gly共有的是：
R0、R18、R23＝不存在
R24、R27、R40、R72＝独立地是A或不存在；
R26＝A、C或不存在；
R3、R7、R49、R68＝独立地是A、C、G或不存在；
R5、R30、R41、R44、R67＝独立地是N或不存在；
R31、R32、R34＝独立地是A、C、U或不存在；
R9、R10、R14、R15、R33、R50、R56＝独立地是A、G或不存在；
R12、R25、R29、R42、R46＝独立地是A、G、U或不存在；
R16、R57＝独立地是A、U或不存在；
R17、R38、R39、R60、R61、R71＝独立地是C或不存在；
R6、R52、R64、R66＝独立地是C、G或不存在；
R37、R48、R65＝独立地是C、G、U或不存在；
R2、R4、R13、R35、R43、R55、R62、R69＝独立地是C、U或不存在；
R1、R19、R20、R51、R70＝独立地是G或不存在；
R21、R22、R45、R63＝独立地是G、U或不存在；
R8、R11、R28、R36、R53、R54、R58、R59＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
组氨酸TREM共有序列
在实施例中，本文披露的TREM包含式IHIS的序列(SEQ ID NO:586)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于His共有的是：
R23＝不存在；
R14、R24、R57＝独立地是A或不存在；
R72＝A、C或不存在；
R9、R27、R43、R48、R69＝独立地是A、C、G或不存在；
R3、R4、R5、R6、R12、R25、R26、R29、R30、R31、R34、R42、R45、R46、R49、R50、R58、R62、R32、R66、R67、R68＝独立地是N或不存在；
R13、R21、R41、R44、R65＝独立地是A、C、U或不存在；
R40、R51、R56、R70＝独立地是A、G或不存在；
R7、R32＝独立地是A、G、U或不存在；
R55、R60＝独立地是C或不存在；
R11、R16、R33、R64＝独立地是C、G、U或不存在；
R2、R17、R22、R28、R35、R53、R59、R61、R71＝独立地是C、U或不存在；
R1、R10、R15、R19、R20、R37、R39、R52＝独立地是G或不存在；
R0＝G、U或不存在；
R8、R18、R36、R38、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIHIS的序列(SEQ ID NO:587)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于His共有的是：
R0、R17、R18、R23＝不存在；
R7、R12、R14、R24、R27、R45、R57、R58、R63、R67、R72＝独立地是A或不存在；
R3＝A、C、U或不存在；
R4、R43、R56、R70＝独立地是A、G或不存在；
R49＝A、U或不存在；
R2、R28、R30、R41、R42、R44、R48、R55、R60、R66、R71＝独立地是C或不存在；
R25＝C、G或不存在；
R9＝C、G、U或不存在；
R8、R13、R26、R33、R35、R50、R53、R61、R68＝独立地是C、U或不存在；
R1、R6、R10、R15、R19、R20、R32、R34、R37、R39、R40、R46、R51、R52、R62、R64、R69＝独立地是G或不存在；
R16＝G、U或不存在；
R5、R11、R21、R22、R29、R31、R36、R38、R54、R59、R65＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIIHIS的序列(SEQ ID NO:588)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于His共有的是：
R0、R17、R18、R23＝不存在
R7、R12、R14、R24、R27、R45、R57、R58、R63、R67、R72＝独立地是A或不存在；
R3＝A、C或不存在；
R4、R43、R56、R70＝独立地是A、G或不存在；
R49＝A、U或不存在；
R2、R28、R30、R41、R42、R44、R48、R55、R60、R66、R71＝独立地是C或不存在；
R8、R9、R26、R33、R35、R50、R60、R68＝独立地是C、U或不存在；
R1、R6、R10、R15、R19、R20、R25、R32、R34、R37、R39、R40、R46、R51、R52、R62、R64、R69＝独立地是G或不存在；
R5、R11、R13、R16、R21、R22、R29、R31、R36、R38、R53、R54、R59、R65＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
异亮氨酸TREM共有序列
在实施例中，本文披露的TREM包含式IILE的序列(SEQ ID NO:589)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Ile共有的是：
R23＝不存在；
R38、R41、R57、R72＝独立地是A或不存在；
R1、R26＝独立地是A、C、G或不存在；
R0、R3、R4、R6、R16、R31、R32、R34、R37、R42、R43、R44、R45、R46、R48、R49、R50、R58、R59、R62、R63、R64、R66、R67、R68、R69＝独立地是N或不存在；
R22、R61、R65＝独立地是A、C、U或不存在；
R9、R14、R15、R24、R27、R40＝独立地是A、G或不存在；
R7、R25、R29、R51、R56＝独立地是A、G、U或不存在；
R18、R54＝独立地是A、U或不存在；
R60＝C或不存在；
R2、R52、R70＝独立地是C、G或不存在；
R5、R12、R21、R30、R33、R71＝独立地是C、G、U或不存在；
R11、R13、R17、R28、R35、R53、R55＝独立地是C、U或不存在；
R10、R19、R20＝独立地是G或不存在；
R8、R36、R39＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIILE的序列(SEQ ID NO:590)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Ile共有的是：
R0、R18、R23＝不存在
R24、R38、R40、R41、R57、R72＝独立地是A或不存在；
R26、R65＝独立地是A、C或不存在；
R58、R59、R67＝独立地是N或不存在；
R22＝A、C、U或不存在；
R6、R9、R14、R15、R29、R34、R43、R46、R48、R50、R51、R63、R69＝独立地是A、G或不存在；
R37、R56＝独立地是A、G、U或不存在；
R54＝A、U或不存在；
R28、R35、R60、R62、R71＝独立地是C或不存在；
R2、R52、R70＝独立地是C、G或不存在；
R5＝C、G、U或不存在；
R3、R4、R11、R13、R17、R21、R30、R42、R44、R45、R49、R53、R55、R61、R64、R66＝独立地是C、U或不存在；
R1、R10、R19、R20、R25、R27、R31、R68＝独立地是G或不存在；
R7、R12、R32＝独立地是G、U或不存在；
R8、R16、R33、R36、R39＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIIILE的序列(SEQ ID NO:591)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Ile共有的是：
R0、R18、R23＝不存在
R14、R24、R38、R40、R41、R57、R72＝独立地是A或不存在；
R26、R65＝独立地是A、C或不存在；
R22、R59＝独立地是A、C、U或不存在；
R6、R9、R15、R34、R43、R46、R51、R56、R63、R69＝独立地是A、G或不存在；
R37＝A、G、U或不存在；
R13、R28、R35、R44、R55、R60、R62、R71＝独立地是C或不存在；
R2、R5、R70＝独立地是C、G或不存在；
R58、R67＝独立地是C、G、U或不存在；
R3、R4、R11、R17、R21、R30、R42、R45、R49、R53、R61、R64、R66＝独立地是C、U或不存在；
R1、R10、R19、R20、R25、R27、R29、R31、R32、R48、R50、R52、R68＝独立地是G或不存在；
R7、R12＝独立地是G、U或不存在；
R8、R16、R33、R36、R39、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
甲硫氨酸TREM共有序列
在实施例中，本文披露的TREM包含式IMET的序列(SEQ ID NO:592)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Met共有的是：
R0、R23＝不存在；
R14、R38、R40、R57＝独立地是A或不存在；
R60＝A、C或不存在；
R33、R48、R70＝独立地是A、C、G或不存在；
R1、R3、R4、R5、R6、R11、R12、R16、R17、R21、R22、R26、R27、R29、R30、R31、R32、R42、R44、R45、R46、R49、R50、R58、R62、R63、R66、R67、R68、R69、R71＝独立地是N或不存在；
R18、R35、R41、R59、R65＝独立地是A、C、U或不存在；
R9、R15、R51＝独立地是A、G或不存在；
R7、R24、R25、R34、R53、R56＝独立地是A、G、U或不存在；
R72＝A、U或不存在；
R37＝C或不存在；
R10、R55＝独立地是C、G或不存在；
R2、R13、R28、R43、R64＝独立地是C、G、U或不存在；
R36、R61＝独立地是C、U或不存在；
R19、R20、R52＝独立地是G或不存在；
R8、R39、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIMET的序列(SEQ ID NO:593)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Met共有的是：
R0、R18、R22、R23＝不存在
R14、R24、R38、R40、R41、R57、R72＝独立地是A或不存在；
R59、R60、R62、R65＝独立地是A、C或不存在；
R6、R45、R67＝独立地是A、C、G或不存在；
R4＝N或不存在；
R21、R42＝独立地是A、C、U或不存在；
R1、R9、R27、R29、R32、R46、R51＝独立地是A、G或不存在；
R17、R49、R53、R56、R58＝独立地是A、G、U或不存在；
R63＝A、U或不存在；
R3、R13、R37＝独立地是C或不存在；
R48、R55、R64、R70＝独立地是C、G或不存在；
R2、R5、R66、R68＝独立地是C、G、U或不存在；
R11、R16、R26、R28、R30、R31、R35、R36、R43、R44、R61、R71＝独立地是C、U或不存在；
R10、R12、R15、R19、R20、R25、R33、R52、R69＝独立地是G或不存在；
R7、R34、R50＝独立地是G、U或不存在；
R8、R39、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIIMET的序列(SEQ ID NO:594)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Met共有的是：
R0、R18、R22、R23＝不存在
R14、R24、R38、R40、R41、R57、R72＝独立地是A或不存在；
R59、R62、R65＝独立地是A、C或不存在；
R6、R67＝独立地是A、C、G或不存在；
R4、R21＝独立地是A、C、U或不存在；
R1、R9、R27、R29、R32、R45、R46、R51＝独立地是A、G或不存在；
R17、R56、R58＝独立地是A、G、U或不存在；
R49、R53、R63＝独立地是A、U或不存在；
R3、R13、R26、R37、R43、R60＝独立地是C或不存在；
R2、R48、R55、R64、R70＝独立地是C、G或不存在；
R5、R66＝独立地是C、G、U或不存在；
R11、R16、R28、R30、R31、R35、R36、R42、R44、R61、R71＝独立地是C、U或不存在；
R10、R12、R15、R19、R20、R25、R33、R52、R69＝独立地是G或不存在；
R7、R34、R50、R68＝独立地是G、U或不存在；
R8、R39、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
亮氨酸TREM共有序列
在实施例中，本文披露的TREM包含式ILEU的序列(SEQ ID NO:595)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Leu共有的是：
R0＝不存在；
R38、R57＝独立地是A或不存在；
R60＝A、C或不存在；
R1、R13、R27、R48、R51、R56＝独立地是A、C、G或不存在；
R2、R3、R4、R5、R6、R7、R9、R10、R11、R12、R16、R23、R26、R28、R29、R30、R31、R32、R33、R34、R37、R41、R42、R43、R44、R45、R46、R49、R50、R58、R62、R63、R65、R66、R67、R68、R69、R70＝独立地是N或不存在；
R17、R18、R21、R22、R25、R35、R55＝独立地是A、C、U或不存在；
R14、R15、R39、R72＝独立地是A、G或不存在；
R24、R40＝独立地是A、G、U或不存在；
R52、R61、R64、R71＝独立地是C、G、U或不存在；
R36、R53、R59＝独立地是C、U或不存在；
R19＝G或不存在；
R20＝G、U或不存在；
R8、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IILEU的序列(SEQ ID NO:596)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Leu共有的是：
R0＝不存在
R38、R57、R72＝独立地是A或不存在；
R60＝A、C或不存在；
R4、R5、R48、R50、R56、R69＝独立地是A、C、G或不存在；
R6、R33、R41、R43、R46、R49、R58、R63、R66、R70＝独立地是N或不存在；
R11、R12、R17、R21、R22、R28、R31、R37、R44、R55＝独立地是A、C、U或不存在；
R1、R9、R14、R15、R24、R27、R34、R39＝独立地是A、G或不存在；
R7、R29、R32、R40、R45＝独立地是A、G、U或不存在；
R25＝A、U或不存在；
R13＝C、G或不存在；
R2、R3、R16、R26、R30、R52、R62、R64、R65、R67、R68＝独立地是C、G、U或不存在；
R18、R35、R42、R53、R59、R61、R71＝独立地是C、U或不存在；
R19、R51＝独立地是G或不存在；
R10、R20＝独立地是G、U或不存在；
R8、R23、R36、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIILEU的序列(SEQ ID NO:597)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Leu共有的是：
R0＝不存在
R38、R57、R72＝独立地是A或不存在；
R60＝A、C或不存在；
R4、R5、R48、R50、R56、R58、R69＝独立地是A、C、G或不存在；
R6、R33、R43、R46、R49、R63、R66、R70＝独立地是N或不存在；
R11、R12、R17、R21、R22、R28、R31、R37、R41、R44、R55＝独立地是A、C、U或不存在；
R1、R9、R14、R15、R24、R27、R34、R39＝独立地是A、G或不存在；
R7、R29、R32、R40、R45＝独立地是A、G、U或不存在；
R25＝A、U或不存在；
R13＝C、G或不存在；
R2、R3、R16、R30、R52、R62、R64、R67、R68＝独立地是C、G、U或不存在；
R18、R35、R42、R53、R59、R61、R65、R71＝独立地是C、U或不存在；
R19、R51＝独立地是G或不存在；
R10、R20、R26＝独立地是G、U或不存在；
R8、R23、R36、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
赖氨酸TREM共有序列
在实施例中，本文披露的TREM包含式ILYS的序列(SEQ ID NO:598)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Lys共有的是：
R0＝不存在
R14＝A或不存在；
R40、R41＝独立地是A、C或不存在；
R34、R43、R51＝独立地是A、C、G或不存在；
R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R11、R12、R16、R21、R26、R30、R31、R32、R44、R45、R46、R48、R49、R50、R58、R62、R63、R65、R66、R67、R68、R69、R70＝独立地是N或不存在；
R13、R17、R59、R71＝独立地是A、C、U或不存在；
R9、R15、R19、R20、R25、R27、R52、R56＝独立地是A、G或不存在；
R24、R29、R72＝独立地是A、G、U或不存在；
R18、R57＝独立地是A、U或不存在；
R10、R33＝独立地是C、G或不存在；
R42、R61、R64＝独立地是C、G、U或不存在；
R28、R35、R36、R37、R53、R55、R60＝独立地是C、U或不存在；
R8、R22、R23、R38、R39、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IILYS的序列(SEQ ID NO:599)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Lys共有的是：
R0、R18、R23＝不存在
R14＝A或不存在；
R40、R41、R43＝独立地是A、C或不存在；
R3、R7＝独立地是A、C、G或不存在；
R1、R6、R11、R31、R45、R48、R49、R63、R65、R66、R68＝独立地是N或不存在；
R2、R12、R13、R17、R44、R67、R71＝独立地是A、C、U或不存在；
R9、R15、R19、R20、R25、R27、R34、R50、R52、R56、R70、R72＝独立地是A、G或不存在；
R5、R24、R26、R29、R32、R46、R69＝独立地是A、G、U或不存在；
R57＝A、U或不存在；
R10、R61＝独立地是C、G或不存在；
R4、R16、R21、R30、R58、R64＝独立地是C、G、U或不存在；
R28、R35、R36、R37、R42、R53、R55、R59、R60、R62＝独立地是C、U或不存在；
R33、R51＝独立地是G或不存在；
R8＝G、U或不存在；
R22、R38、R39、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIILYS的序列(SEQ ID NO:600)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Lys共有的是：
R0、R18、R23＝不存在
R9、R14、R34、R41＝独立地是A或不存在；
R40＝A、C或不存在；
R1、R3、R7、R31＝独立地是A、C、G或不存在；
R48、R65、R68＝独立地是N或不存在；
R2、R13、R17、R44、R63、R66＝独立地是A、C、U或不存在；
R5、R15、R19、R20、R25、R27、R29、R50、R52、R56、R70、R72＝独立地是A、G或不存在；
R6、R24、R32、R49＝独立地是A、G、U或不存在；
R12、R26、R46、R57＝独立地是A、U或不存在；
R11、R28、R35、R43＝独立地是C或不存在；
R10、R45、R61＝独立地是C、G或不存在；
R4、R21、R64＝独立地是C、G、U或不存在；
R37、R53、R55、R59、R60、R62、R67、R71＝独立地是C、U或不存在；
R33、R51＝独立地是G或不存在；
R8、R30、R58、R69＝独立地是G、U或不存在；
R16、R22、R36、R38、R39、R42、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
苯丙氨酸TREM共有序列
在实施例中，本文披露的TREM包含式IPHE的序列(SEQ ID NO:601)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Phe共有的是：
R0、R23＝不存在
R9、R14、R38、R39、R57、R72＝独立地是A或不存在；
R71＝A、C或不存在；
R41、R70＝独立地是A、C、G或不存在；
R4、R5、R6、R30、R31、R32、R34、R12、R44、R45、R46、R48、R49、R58、R62、R63、R66、R67、R68、R69＝独立地是N或不存在；
R16、R61、R65＝独立地是A、C、U或不存在；
R15、R26、R27、R29、R40、R56＝独立地是A、G或不存在；
R7、R51＝独立地是A、G、U或不存在；
R22、R24＝独立地是A、U或不存在；
R55、R60＝独立地是C或不存在；
R2、R3、R21、R33、R43、R50、R64＝独立地是C、G、U或不存在；
R11、R12、R13、R17、R28、R35、R36、R59＝独立地是C、U或不存在；
R10、R19、R20、R25、R37、R52＝独立地是G或不存在；
R1＝G、U或不存在；
R8、R18、R53、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIPHE的序列(SEQ ID NO:602)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Phe共有的是：
R0、R18、R23＝不存在
R14、R24、R38、R39、R57、R72＝独立地是A或不存在；
R46、R71＝独立地是A、C或不存在；
R4、R70＝独立地是A、C、G或不存在；
R45＝A、C、U或不存在；
R6、R7、R15、R26、R27、R32、R34、R40、R41、R56、R69＝独立地是A、G或不存在；
R29＝A、G、U或不存在；
R5、R9、R67＝独立地是A、U或不存在；
R35、R49、R55、R60＝独立地是C或不存在；
R21、R43、R62＝独立地是C、G或不存在；
R2、R33、R68＝独立地是C、G、U或不存在；
R3、R11、R12、R13、R28、R30、R36、R42、R44、R48、R58、R59、R61、R66＝独立地是C、U或不存在；
R10、R19、R20、R25、R37、R51、R52、R63、R64＝独立地是G或不存在；
R1、R31、R50＝独立地是G、U或不存在；
R8、R16、R17、R22、R53、R54、R65＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIIPHE的序列(SEQ ID NO:603)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Phe共有的是：
R0、R18、R22、R23＝不存在
R5、R7、R14、R24、R26、R32、R34、R38、R39、R41、R57、R72＝独立地是A或不存在；
R46＝A、C或不存在；
R70＝A、C、G或不存在；
R4、R6、R15、R56、R69＝独立地是A、G或不存在；
R9、R45＝独立地是A、U或不存在；
R2、R11、R13、R35、R43、R49、R55、R60、R68、R71＝独立地是C或不存在；
R33＝C、G或不存在；
R3、R28、R36、R48、R58、R59、R61＝独立地是C、U或不存在；
R1、R10、R19、R20、R21、R25、R27、R29、R37、R40、R51、R52、R62、R63、R64＝独立地是G或不存在；
R8、R12、R16、R17、R30、R31、R42、R44、R50、R53、R54、R65、R66、R67＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
脯氨酸TREM共有序列
在实施例中，本文披露的TREM包含式IPRO的序列(SEQ ID NO:604)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Pro共有的是：
R0＝不存在
R14、R57＝独立地是A或不存在；
R70、R72＝独立地是A、C或不存在；
R9、R26、R27＝独立地是A、C、G或不存在；
R4、R5、R6、R16、R21、R29、R30、R31、R32、R33、R34、R37、R41、R42、R43、R44、R45、R46、R48、R49、R50、R58、R61、R62、R63、R64、R66、R67、R68＝独立地是N或不存在；
R35、R65＝独立地是A、C、U或不存在；
R24、R40、R56＝独立地是A、G或不存在；
R7、R25、R51＝独立地是A、G、U或不存在；
R55、R60＝独立地是C或不存在；
R1、R3、R71＝独立地是C、G或不存在；
R11、R12、R20、R69＝独立地是C、G、U或不存在；
R13、R17、R18、R22、R23、R28、R59＝独立地是C、U或不存在；
R10、R15、R19、R38、R39、R52＝独立地是G或不存在；
R2＝独立地是G、U或不存在；
R8、R36、R53、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIPRO的序列(SEQ ID NO:605)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Pro共有的是：
R0、R17、R18、R22、R23＝不存在；
R14、R45、R56、R57、R58、R65、R68＝独立地是A或不存在；
R61＝A、C、G或不存在；
R43＝N或不存在；
R37＝A、C、U或不存在；
R24、R27、R33、R40、R44、R63＝独立地是A、G或不存在；
R3、R12、R30、R32、R48、R55、R60、R70、R71、R72＝独立地是C或不存在；
R5、R34、R42、R66＝独立地是C、G或不存在；
R20＝C、G、U或不存在；
R35、R41、R49、R62＝独立地是C、U或不存在；
R1、R2、R6、R9、R10、R15、R19、R26、R38、R39、R46、R50、R51、R52、R64、R67、R69＝独立地是G或不存在；
R11、R16＝独立地是G、U或不存在；
R4、R7、R8、R13、R21、R25、R28、R29、R31、R36、R53、R54、R59＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIIPRO的序列(SEQ ID NO:606)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Pro共有的是：
R0、R17、R18、R22、R23＝不存在
R14、R45、R56、R57、R58、R65、R68＝独立地是A或不存在；
R37＝A、C、U或不存在；
R24、R27、R40＝独立地是A、G或不存在；
R3、R5、R12、R30、R32、R48、R49、R55、R60、R61、R62、R66、R70、R71、R72＝独立地是C或不存在；
R34、R42＝独立地是C、G或不存在；
R43＝C、G、U或不存在；
R41＝C、U或不存在；
R1、R2、R6、R9、R10、R15、R19、R20、R26、R33、R38、R39、R44、R46、R50、R51、R52、R63、R64、R67、R69＝独立地是G或不存在；
R16＝G、U或不存在；
R4、R7、R8、R11、R13、R21、R25、R28、R29、R31、R35、R36、R53、R54、R59＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
丝氨酸TREM共有序列
在实施例中，本文披露的TREM包含式ISER的序列(SEQ ID NO:607)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Ser共有的是：
R0＝不存在；
R14、R24、R57＝独立地是A或不存在；
R41＝A、C或不存在；
R2、R3、R4、R5、R6、R7、R9、R10、R11、R12、R13、R16、R21、R25、R26、R27、R28、R30、R31、R32、R33、R34、R37、R42、R43、R44、R45、R46、R48、R49、R50、R62、R63、R64、R65、R66、R67、R68、R69、R70＝独立地是N或不存在；
R18＝A、C、U或不存在；
R15、R40、R51、R56＝独立地是A、G或不存在；
R1、R29、R58、R72＝独立地是A、G、U或不存在；
R39＝A、U或不存在；
R60＝C或不存在；
R38＝C、G或不存在；
R17、R22、R23、R71＝独立地是C、G、U或不存在；
R8、R35、R36、R55、R59、R61＝独立地是C、U或不存在；
R19、R20＝独立地是G或不存在；
R52＝G、U或不存在；
R53、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IISER的序列(SEQ ID NO:608)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Ser共有的是：
R0、R23＝不存在
R14、R24、R41、R57＝独立地是A或不存在；
R44＝A、C或不存在；
R25、R45、R48＝独立地是A、C、G或不存在；
R2、R3、R4、R5、R37、R50、R62、R66、R67、R69、R70＝独立地是N或不存在；
R12、R28、R65＝独立地是A、C、U或不存在；
R9、R15、R29、R34、R40、R56、R63＝独立地是A、G或不存在；
R7、R26、R30、R33、R46、R58、R72＝独立地是A、G、U或不存在；
R39＝A、U或不存在；
R11、R35、R60、R61＝独立地是C或不存在；
R13、R38＝独立地是C、G或不存在；
R6、R17、R31、R43、R64、R68＝独立地是C、G、U或不存在；
R36、R42、R49、R55、R59、R71＝独立地是C、U或不存在；
R10、R19、R20、R27、R51＝独立地是G或不存在；
R1、R16、R32、R52＝独立地是G、U或不存在；
R8、R18、R21、R22、R53、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIISER的序列(SEQ ID NO:609)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Ser共有的是：
R0、R23＝不存在
R14、R24、R41、R57、R58＝独立地是A或不存在；
R44＝A、C或不存在；
R25、R48＝独立地是A、C、G或不存在；
R2、R3、R5、R37、R66、R67、R69、R70＝独立地是N或不存在；
R12、R28、R62＝独立地是A、C、U或不存在；
R7、R9、R15、R29、R33、R34、R40、R45、R56、R63＝独立地是A、G或不存在；
R4、R26、R46、R50＝独立地是A、G、U或不存在；
R30、R39＝独立地是A、U或不存在；
R11、R17、R35、R60、R61＝独立地是C或不存在；
R13、R38＝独立地是C、G或不存在；
R6、R64＝独立地是C、G、U或不存在；
R31、R42、R43、R49、R55、R59、R65、R68、R71＝独立地是C、U或不存在；
R10、R19、R20、R27、R51、R52＝独立地是G或不存在；
R1、R16、R32、R72＝独立地是G、U或不存在；
R8、R18、R21、R22、R36、R53、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
苏氨酸TREM共有序列
在实施例中，本文披露的TREM包含式ITHR的序列(SEQ ID NO:610)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Thr共有的是：
R0、R23＝不存在
R14、R41、R57＝独立地是A或不存在；
R56、R70＝独立地是A、C、G或不存在；
R4、R5、R6、R7、R12、R16、R26、R30、R31、R32、R34、R37、R42、R44、R45、R46、R48、R49、R50、R58、R62、R63、R64、R65、R66、R67、R68、R72＝独立地是N或不存在；
R13、R17、R21、R35、R61＝独立地是A、C、U或不存在；
R1、R9、R24、R27、R29、R69＝独立地是A、G或不存在；
R15、R25、R51＝独立地是A、G、U或不存在；
R40、R53＝独立地是A、U或不存在；
R33、R43＝独立地是C、G或不存在；
R2、R3、R59＝独立地是C、G、U或不存在；
R11、R18、R22、R28、R36、R54、R55、R60、R70＝独立地是C、U或不存在；
R10、R20、R38、R52＝独立地是G或不存在；
R19＝G、U或不存在；
R8、R39＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IITHR的序列(SEQ ID NO:611)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Thr共有的是：
R0、R18、R23＝不存在
R14、R41、R57＝独立地是A或不存在；
R9、R42、R44、R48、R56、R70＝独立地是A、C、G或不存在；
R4、R6、R12、R26、R49、R58、R63、R64、R66、R68＝独立地是N或不存在；
R13、R21、R31、R37、R62＝独立地是A、C、U或不存在；
R1、R15、R24、R27、R29、R46、R51、R69＝独立地是A、G或不存在；
R7、R25、R45、R50、R67＝独立地是A、G、U或不存在；
R40、R53＝独立地是A、U或不存在；
R35＝C或不存在；
R33、R43＝独立地是C、G或不存在；
R2、R3、R5、R16、R32、R34、R59、R65、R72＝独立地是C、G、U或不存在；
R11、R17、R22、R28、R30、R36、R55、R60、R61、R71＝独立地是C、U或不存在；
R10、R19、R20、R38、R52＝独立地是G或不存在；
R8、R39、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIITHR的序列(SEQ ID NO:612)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Thr共有的是：
R0、R18、R23＝不存在
R14、R40、R41、R57＝独立地是A或不存在；
R44＝A、C或不存在；
R9、R42、R48、R56＝独立地是A、C、G或不存在；
R4、R6、R12、R26、R58、R64、R66、R68＝独立地是N或不存在；
R13、R21、R31、R37、R49、R62＝独立地是A、C、U或不存在；
R1、R15、R24、R27、R29、R46、R51、R69＝独立地是A、G或不存在；
R7、R25、R45、R50、R63、R67＝独立地是A、G、U或不存在；
R53＝A、U或不存在；
R35＝C或不存在；
R2、R33、R43、R70＝独立地是C、G或不存在；
R5、R16、R34、R59、R64＝独立地是C、G、U或不存在；
R3、R11、R22、R28、R30、R36、R55、R60、R61、R71＝独立地是C、U或不存在；
R10、R19、R20、R38、R52＝独立地是G或不存在；
R32＝G、U或不存在；
R8、R17、R39、R54、R72＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
色氨酸TREM共有序列
在实施例中，本文披露的TREM包含式ITRP的序列(SEQ ID NO:613)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Trp共有的是：
R0＝不存在；
R24、R39、R41、R57＝独立地是A或不存在；
R2、R3、R26、R27、R40、R48＝独立地是A、C、G或不存在；
R4、R5、R6、R29、R30、R31、R32、R34、R42、R44、R45、R46、R49、R51、R58、R63、R66、R67、R68＝独立地是N或不存在；
R13、R14、R16、R18、R21、R61、R65、R70＝独立地是A、C、U或不存在；
R1、R9、R10、R15、R33、R50、R56＝独立地是A、G或不存在；
R7、R25、R72＝独立地是A、G、U或不存在；
R37、R38、R55、R60＝独立地是C或不存在；
R12、R35、R43、R64、R69、R70＝独立地是C、G、U或不存在；
R11、R17、R22、R28、R59、R62＝独立地是C、U或不存在；
R19、R20、R52＝独立地是G或不存在；
R8、R23、R36、R53、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IITRP的序列(SEQ ID NO:614)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Trp共有的是：
R0、R18、R22、R23＝不存在
R14、R24、R39、R41、R57、R72＝独立地是A或不存在；
R3、R4、R13、R61、R71＝独立地是A、C或不存在；
R6、R44＝独立地是A、C、G或不存在；
R21＝A、C、U或不存在；
R2、R7、R15、R25、R33、R34、R45、R56、R63＝独立地是A、G或不存在；
R58＝A、G、U或不存在；
R46＝A、U或不存在；
R37、R38、R55、R60、R62＝独立地是C或不存在；
R12、R26、R27、R35、R40、R48、R67＝独立地是C、G或不存在；
R32、R43、R68＝独立地是C、G、U或不存在；
R11、R16、R28、R31、R49、R59、R65、R70＝独立地是C、U或不存在；
R1、R9、R10、R19、R20、R50、R52、R69＝独立地是G或不存在；
R5、R8、R29、R30、R42、R51、R64、R66＝独立地是G、U或不存在；
R17、R36、R53、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIITRP的序列(SEQ ID NO:615)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Trp共有的是：
R0、R18、R22、R23＝不存在
R14、R24、R39、R41、R57、R72＝独立地是A或不存在；
R3、R4、R13、R61、R71＝独立地是A、C或不存在；
R6、R44＝独立地是A、C、G或不存在；
R21＝A、C、U或不存在；
R2、R7、R15、R25、R33、R34、R45、R56、R63＝独立地是A、G或不存在；
R58＝A、G、U或不存在；
R46＝A、U或不存在；
R37、R38、R55、R60、R62＝独立地是C或不存在；
R12、R26、R27、R35、R40、R48、R67＝独立地是C、G或不存在；
R32、R43、R68＝独立地是C、G、U或不存在；
R11、R16、R28、R31、R49、R59、R65、R70＝独立地是C、U或不存在；
R1、R9、R10、R19、R20、R50、R51、R69＝独立地是G或不存在；
R5、R8、R29、R30、R42、R51、R64、R66＝独立地是G、U或不存在；
R17、R36、R53、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
酪氨酸TREM共有序列
在实施例中，本文披露的TREM包含式ITYR的序列(SEQ ID NO:616)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Tyr共有的是：
R0＝不存在
R14、R39、R57＝独立地是A或不存在；
R41、R48、R51、R71＝独立地是A、C、G或不存在；
R3、R4、R5、R6、R9、R10、R12、R13、R16、R25、R26、R30、R31、R32、R42、R44、R45、R46、R49、R50、R58、R62、R63、R66、R67、R68、R69、R70＝独立地是N或不存在；
R22、R65＝独立地是A、C、U或不存在；
R15、R24、R27、R33、R37、R40、R56＝独立地是A、G或不存在；
R7、R29、R34、R72＝独立地是A、G、U或不存在；
R23、R53＝独立地是A、U或不存在；
R35、R60＝独立地是C或不存在；
R20＝C、G或不存在；
R1、R2、R28、R61、R64＝独立地是C、G、U或不存在；
R11、R17、R21、R43、R55＝独立地是C、U或不存在；
R19、R52＝独立地是G或不存在；
R8、R18、R36、R38、R54、R59＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IITYR的序列(SEQ ID NO:617)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Tyr共有的是：
R0、R18、R23＝不存在
R7、R9、R14、R24、R26、R34、R39、R57＝独立地是A或不存在；
R44、R69＝独立地是A、C或不存在；
R71＝A、C、G或不存在；
R68＝N或不存在；
R58＝A、C、U或不存在；
R33、R37、R41、R56、R62、R63＝独立地是A、G或不存在；
R6、R29、R72＝独立地是A、G、U或不存在；
R31、R45、R53＝独立地是A、U或不存在；
R13、R35、R49、R60＝独立地是C或不存在；
R20、R48、R64、R67、R70＝独立地是C、G或不存在；
R1、R2、R5、R16、R66＝独立地是C、G、U或不存在；
R11、R21、R28、R43、R55、R61＝独立地是C、U或不存在；
R10、R15、R19、R25、R27、R40、R51、R52＝独立地是G或不存在；
R3、R4、R30、R32、R42、R46＝独立地是G、U或不存在；
R8、R12、R17、R22、R36、R38、R50、R54、R59、R65＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIITYR的序列(SEQ ID NO:618)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Tyr共有的是：
R0、R18、R23＝不存在
R7、R9、R14、R24、R26、R34、R39、R57、R72＝独立地是A或不存在；
R44、R69＝独立地是A、C或不存在；
R71＝A、C、G或不存在；
R37、R41、R56、R62、R63＝独立地是A、G或不存在；
R6、R29、R68＝独立地是A、G、U或不存在；
R31、R45、R58＝独立地是A、U或不存在；
R13、R28、R35、R49、R60、R61＝独立地是C或不存在；
R5、R48、R64、R67、R70＝独立地是C、G或不存在；
R1、R2＝独立地是C、G、U或不存在；
R11、R16、R21、R43、R55、R66＝独立地是C、U或不存在；
R10、R15、R19、R20、R25、R27、R33、R40、R51、R52＝独立地是G或不存在；
R3、R4、R30、R32、R42、R46＝独立地是G、U或不存在；
R8、R12、R17、R22、R36、R38、R50、R53、R54、R59、R65＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
缬氨酸TREM共有序列
在实施例中，本文披露的TREM包含式IVAL的序列(SEQ ID NO:619)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Val共有的是：
R0、R23＝不存在；
R24、R38、R57＝独立地是A或不存在；
R9、R72＝独立地是A、C、G或不存在；
R2、R4、R5、R6、R7、R12、R15、R16、R21、R25、R26、R29、R31、R32、R33、R34、R37、R41、R42、R43、R44、R45、R46、R48、R49、R50、R58、R61、R62、R63、R64、R65、R66、R67、R68、R69、R70＝独立地是N或不存在；
R17、R35、R59＝独立地是A、C、U或不存在；
R10、R14、R27、R40、R52、R56＝独立地是A、G或不存在；
R1、R3、R51、R53＝独立地是A、G、U或不存在；
R39＝C或不存在；
R13、R30、R55＝独立地是C、G、U或不存在；
R11、R22、R28、R60、R71＝独立地是C、U或不存在；
R19＝G或不存在；
R20＝G、U或不存在；
R8、R18、R36、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIVAL的序列(SEQ ID NO:620)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Val共有的是：
R0、R18、R23＝不存在；
R24、R38、R57＝独立地是A或不存在；
R64、R70、R72＝独立地是A、C、G或不存在；
R15、R16、R26、R29、R31、R32、R43、R44、R45、R49、R50、R58、R62、R65＝独立地是N或不存在；
R6、R17、R34、R37、R41、R59＝独立地是A、C、U或不存在；
R9、R10、R14、R27、R40、R46、R51、R52、R56＝独立地是A、G或不存在；
R7、R12、R25、R33、R53、R63、R66、R68＝独立地是A、G、U或不存在；
R69＝A、U或不存在；
R39＝C或不存在；
R5、R67＝独立地是C、G或不存在；
R2、R4、R13、R48、R55、R61＝独立地是C、G、U或不存在；
R11、R22、R28、R30、R35、R60、R71＝独立地是C、U或不存在；
R19＝G或不存在；
R1、R3、R20、R42＝独立地是G、U或不存在；
R8、R21、R36、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
在实施例中，本文披露的TREM包含式IIIVAL的序列(SEQ ID NO:621)，
R0-R1-R2-R3-R4-R5-R6-R7-R8-R9-R10-R11-R12-R13-R14-R15-R16-R17-R18-R19-R20-R21-R22-R23-R24-R25-R26-R27-R28-R29-R30-R31-R32-R33-R34-R35-R36-R37-R38-R39-R40-R41-R42-R43-R44-R45-R46-[R47]x-R48-R49-R50-R51-R52-R53-R54-R55-R56-R57-R58-R59-R60-R61-R62-R63-R64-R65-R66-R67-R68-R69-R70-R71-R72
其中R为核糖核苷酸残基，且对于Val共有的是：
R0、R18、R23＝不存在
R24、R38、R40、R57、R72＝独立地是A或不存在；
R29、R64、R70＝独立地是A、C、G或不存在；
R49、R50、R62＝独立地是N或不存在；
R16、R26、R31、R32、R37、R41、R43、R59、R65＝独立地是A、C、U或不存在；
R9、R14、R27、R46、R52、R56、R66＝独立地是A、G或不存在；
R7、R12、R25、R33、R44、R45、R53、R58、R63、R68＝独立地是A、G、U或不存在；
R69＝A、U或不存在；
R39＝C或不存在；
R5、R67＝独立地是C、G或不存在；
R2、R4、R13、R15、R48、R55＝独立地是C、G、U或不存在；
R6、R11、R22、R28、R30、R34、R35、R60、R61、R71＝独立地是C、U或不存在；
R10、R19、R51＝独立地是G或不存在；
R1、R3、R20、R42＝独立地是G、U或不存在；
R8、R17、R21、R36、R54＝独立地是U或不存在；
[R47]x＝N或不存在；
其中，例如，x＝1-271(例如，x＝1-250、x＝1-225、x＝1-200、x＝1-175、x＝1-150、x＝1-125、x＝1-100、x＝1-75、x＝1-50、x＝1-40、x＝1-30、x＝1-29、x＝1-28、x＝1-27、x＝1-26、x＝1-25、x＝1-24、x＝1-23、x＝1-22、x＝1-21、x＝1-20、x＝1-19、x＝1-18、x＝1-17、x＝1-16、x＝1-15、x＝1-14、x＝1-13、x＝1-12、x＝1-11、x＝1-10、x＝10-271、x＝20-271、x＝30-271、x＝40-271、x＝50-271、x＝60-271、x＝70-271、x＝80-271、x＝100-271、x＝125-271、x＝150-271、x＝175-271、x＝200-271、x＝225-271、x＝1、x＝2、x＝3、x＝4、x＝5、x＝6、x＝7、x＝8、x＝9、x＝10、x＝11、x＝12、x＝13、x＝14、x＝15、x＝16、x＝17、x＝18、x＝19、x＝20、x＝21、x＝22、x＝23、x＝24、x＝25、x＝26、x＝27、x＝28、x＝29、x＝30、x＝40、x＝50、x＝60、x＝70、x＝80、x＝90、x＝100、x＝110、x＝125、x＝150、x＝175、x＝200、x＝225、x＝250或x＝271)，
前提是TREM具有以下一种或两种性质：不超过15％的残基是N；或不超过20个残基是不存在的。
可变区共有序列
在实施例中，本文披露的TREM在位置R47处包含可变区。在实施例中，该可变区的长度是1-271个核糖核苷酸(例如1-250、1-225、1-200、1-175、1-150、1-125、1-100、1-75、1-50、1-40、1-30、1-29、1-28、1-27、1-26、1-25、1-24、1-23、1-22、1-21、1-20、1-19、1-18、1-17、1-16、1-15、1-14、1-13、1-12、1-11、1-10、10-271、20-271、30-271、40-271、50-271、60-271、70-271、80-271、100-271、125-271、150-271、175-271、200-271、225-271、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、40、50、60、70、80、90、100、110、125、150、175、200、225、250或271个核糖核苷酸)。在实施例中，该可变区包含腺嘌呤、胞嘧啶、鸟嘌呤或尿嘧啶的任何一种、所有或组合。
在实施例中，该可变区包含由表4中披露的脱氧核糖核酸(DNA)序列(例如，表4中披露的SEQ ID NO:452-561中的任一个)编码的核糖核酸(RNA)序列。
表4：示例性可变区序列。
对应的核苷酸位置
为了确定候选序列中的选定核苷酸位置是否对应于参考序列(例如，SEQ ID NO:622，SEQ ID NO:993，SEQ ID NO:1079)中的选定位置，进行以下一项或多项评估。
评估A：
1.候选序列与表9和表10中的每个共有序列进行比对。选择具有最多比对的位置(并且其具有比对的候选序列的至少60％的位置)的一个或多个共有序列。
比对如下进行。当以来自表11的匹配得分(错配罚分为-1，空位开放罚分为-1，空位延伸罚分为-0.5，并且对末端空位没有罚分)运行时，来自表10A-10B的候选序列和等解码器共有序列基于使用Needleman-Wunsch算法计算的全局成对比对进行比对。然后使用具有最高总体比对得分的比对来确定候选序列和共有序列之间的百分比相似性，这是通过计算比对中匹配位置的数量，将其除以候选序列或共有序列中非N碱基数量中的较大者，并将结果乘以100。在多个比对(候选序列和单个共有序列)的得分并列的情况下，相似性百分比是根据并列的比对计算的最大相似性百分比。对候选序列与表10A-10B中剩余的等解码器共有序列中的每一个重复该过程，并选择导致最大相似性百分比的比对。如果该比对具有等于或大于60％的百分比相似性，则认为它是有效的比对并用于将候选序列中的位置与共有序列中的位置相关联，否则候选序列被认为没有与任何等解码器共有序列比对。如果此时存在并列，则所有关联的共有序列都将前进到分析中的步骤2。
2.使用从步骤1中选择的一个或多个共有序列，确定与候选序列中的选定位置(例如，经修饰的位置)比对的共有序列位置编号。然后将共有序列中比对位置的位置编号分配给候选序列中的选定位置，换句话说，候选序列中的选定位置根据共有序列的编号进行编号。如果步骤1中存在并列的共有序列，并且它们在此步骤2中给出不同的位置编号，则所有这些位置编号都将前进到步骤5。
3.参考序列与步骤1中选择的共有序列比对。按照步骤1中的说明进行比对。
4.从第3步的比对中，确定与参考序列中的选定位置(例如，经修饰的位置)比对的共有序列位置编号。然后将共有序列中比对位置的位置编号分配给参考序列中的选定位置，换句话说，参考序列中的选定位置根据共有序列的编号进行编号。如果此时存在并列，则所有关联的共有序列都将前进到分析中的步骤5。
5.如果在步骤2中为参考序列确定的位置编号的值与在步骤4中为候选序列确定的位置编号的值相同，则将位置定义为对应。
评估B：
参考序列(例如，本文所述的TREM序列)和候选序列相互比对。比对如下进行。
当以来自表11的匹配得分(错配罚分为-1，空位开放罚分为-1，空位延伸罚分为-0.5，并且对末端空位没有罚分)运行时，参考序列和候选序列基于使用Needleman-Wunsch算法计算的全局成对比对进行比对。然后使用具有最高总体比对得分的比对来确定候选序列和参考序列之间的百分比相似性，这是通过计算比对中匹配碱基的数量，将其除以候选序列或参考序列中非N碱基数量中的较大者，并将结果乘以100。在多个比对的得分并列的情况下，相似性百分比是根据并列的比对计算的最大相似性百分比。如果该比对具有等于或大于60％，则认为它是有效的比对并用于将候选序列中的位置与参考序列中的位置相关联，否则认为候选序列未与参考序列比对。
如果参考序列中的选定核苷酸位置(例如，经修饰的位置)与候选序列中的选定核苷酸位置(例如，经修饰的位置)配对，则这些位置被定义为对应的。
如果在评估A和B中的至少一个中发现参考序列和候选序列中的选定位置对应，则这些位置对应。因此，例如，如果在评估A下发现两个位置对应，但在评估B下不对应，则将这些位置定义为对应。
上面给出的编号是为了便于表示，并不意味着需要的顺序。如果进行了多个评估，则可以按任何顺序执行。
表10A.通过比对等解码器家族的成员为每个等解码器计算地生成的共有序列
表10B.通过比对等解码器家族的成员为每个等解码器计算地生成的共有序列
表11：得分值比对
制备TREM、TREM核心片段和TREM片段的方法
用于合成寡核苷酸的体外方法是本领域已知的，并且可以用于制备本文披露的TREM、TREM核心片段或TREM片段。例如，可以使用固态合成或液相合成来合成TREM、TREM核心片段或TREM片段。
在实施例中，根据本文披露的体外合成方法制备的TREM、TREM核心片段或TREM片段与从细胞中表达和分离的TREM相比或与天然存在的tRNA相比具有不同的修饰谱。
实例1中提供了一种用于制造经修饰的TREM的示例性方法。实例1中提供的方法也可用于制备合成的TREM核心片段或合成的TREM片段。实例4中提供了通过5'-甲硅烷基-2'-原酸酯(2'-ACE)化学制备合成TREM的其他示例性方法。实例4中提供的方法也可用于制备合成的TREM核心片段或合成的TREM片段。Hartsel SA等人,(2005)OligonucleotideSynthesis[寡核苷酸合成],033-050中披露了其他合成方法，其全部内容通过引用并入本文。
TREM组合物
在实施例中，TREM组合物，例如TREM药物组合物，包含药学上可接受的赋形剂。示例性赋形剂包括在FDA非活性成分数据库(https://www.accessdata.fda.gov/scripts/cder/iig/index.Cfm)中提供的那些。
在实施例中，TREM组合物，例如TREM药物组合物，包含至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、30、40、50、60、70、80、90、100或150克TREM、TREM核心片段或TREM片段。在实施例中，TREM组合物，例如TREM药物组合物，包含至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、30、40、50或100毫克TREM、TREM核心片段或TREM片段。
在实施例中，TREM组合物，例如TREM药物组合物，是至少10、20、30、40、50、60、70、80、90、95或99％干重TREM、TREM核心片段或TREM片段。
在实施例中，TREM组合物包含至少1x106个TREM分子、至少1x107个TREM分子、至少1x108个TREM分子或至少1x109个TREM分子。
在实施例中，TREM组合物包含至少1x106个TREM核心片段分子、至少1x107个TREM核心片段分子、至少1x108个TREM核心片段分子或至少1x109个TREM核心片段分子。
在实施例中，TREM组合物包含至少1x106个TREM片段分子、至少1x107个TREM片段分子、至少1x108个TREM片段分子或至少1x109个TREM片段分子。
在实施例中，可以使用本领域已知的体外负载反应，将通过本文公开的任何制备方法产生的TREM组合物负载氨基酸。
在实施例中，TREM组合物包含一个种类或多个种类的TREM、TREM核心片段或TREM片段。在实施例中，TREM组合物包含单一种类的TREM、TREM核心片段或TREM片段。在实施例中，TREM组合物包含第一TREM、TREM核心片段或TREM片段种类和第二TREM、TREM核心片段或TREM片段种类。在实施例中，该TREM组合物包含X个TREM、TREM核心片段或TREM片段种类，其中X＝2、3、4、5、6、7、8、9或10。
在实施例中，TREM、TREM核心片段或TREM片段与表1中的核酸编码的序列具有至少70％、75％、80％、85％、90％或95％，或具有100％同一性。
在实施例中，TREM包含本文提供的共有序列。
TREM组合物可配制成液体组合物、冻干组合物或冷冻组合物。
在一些实施例中，可以将TREM组合物配制成适用于药物用途，例如药物TREM组合物。在实施例中，药物TREM组合物基本上不含用于分离和/或纯化TREM、TREM核心片段或TREM片段的材料和/或试剂。
在一些实施例中，可以用注射用水配制TREM组合物。在一些实施例中，用注射用水配制的TREM组合物适用于药物用途，例如包含药物TREM组合物。
TREM表征
可以评估通过本文披露的任何方法生产的TREM、TREM核心片段或TREM片段，或TREM组合物，例如，药物TREM组合物读段与TREM、TREM核心片段或TREM片段或TREM组合物相关的特征，例如TREM、TREM核心片段或TREM片段的纯度、无菌性、浓度、结构、功能活性。任何上述特征都可以通过为特征提供值来评估，例如，通过评估或测试TREM、TREM核心片段或TREM片段、或TREM组合物或TREM组合物生产中的中间体。值还可以与标准值或参考值进行比较。响应于评估，可以对TREM组合物进行分类，例如，准备发布、符合人体试验的生产标准、符合ISO标准、符合cGMP标准、或符合其他制药标准。响应于评估，TREM组合物可以进行进一步处理，例如，它可以分成等份，例如，分成单剂量或多剂量，置于容器(例如，最终用途小瓶)中，被包装、运输或投入商业。在实施例中，响应于评估，可以调节、处理或再处理一种或多种特征以优化TREM组合物。例如，可以调制、加工或再加工TREM组合物以(i)增加TREM组合物的纯度；(ii)减少组合物中片段的量；(iii)减少组合物中内毒素的量；(iv)增加组合物的体外翻译活性；(v)增加组合物的TREM浓度；或(vi)灭活或去除组合物中存在的任何病毒污染物，例如，通过降低组合物的pH或通过过滤。
在实施例中，TREM、TREM核心片段或TREM片段(例如TREM组合物或TREM组合物生产中的中间体)具有至少30％、40％、50％、60％、70％、80％、85％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或99％的纯度，即按质量计。
在实施例中，TREM(例如TREM组合物或TREM组合物生产中的中间体)相对于全长TREM具有少于0.1％、0.5％、1％、2％、3％、4％、5％、6％、7％、8％、9％、10％、15％、20％、25％的TREM片段。
在实施例中，TREM、TREM核心片段或TREM片段(例如TREM组合物或TREM组合物生产中的中间体)具有低水平内毒素或不存在内毒素，例如通过鲎变形细胞裂解物(LAL)测试测量的阴性结果。
在实施例中，TREM、TREM核心片段或TREM片段(例如TREM组合物或TREM组合物生产中的中间体)具有体外翻译活性，如通过实例12-13中描述的测定所测量的。
在实施例中，TREM、TREM核心片段或TREM片段(例如TREM组合物或TREM组合物生产中的中间体)具有至少0.1ng/mL、0.5ng/mL、1ng/mL、5ng/mL、10ng/mL、50ng/mL、0.1ug/mL、0.5ug/mL、1ug/mL、2ug/mL、5ug/mL、10ug/mL、20ug/mL、30ug/mL、40ug/mL、50ug/mL、60ug/mL、70ug/mL、80ug/mL、100ug/mL、200ug/mL、300ug/mL、500ug/mL、1000ug/mL、5000ug/mL、10,000ug/mL或100,000ug/mL的TREM浓度。
在实施例中，TREM、TREM核心片段或TREM片段(例如TREM组合物或TREM组合物生产中的中间体)是无菌的，例如，在无菌条件下测试时，所述组合物或制剂支持少于100个活微生物的生长，所述组合物或制剂符合USP<71>的标准，和/或所述组合物或制剂符合USP<85>的标准。
在实施例中，TREM、TREM核心片段或TREM片段(例如TREM组合物或TREM组合物生产中的中间体)具有不可检测水平的病毒污染物，例如，无病毒污染物。在实施例中，存在于组合物中的任何病毒污染物，例如残留病毒，被灭活或去除。在实施例中，任何病毒污染物，例如残留病毒，被灭活，例如通过降低组合物的pH值。在实施例中，任何病毒污染物，例如残留病毒，被去除，例如通过过滤或本领域已知的其他方法。
TREM施用
本文所述的任何TREM组合物或药物组合物可以施用于细胞、组织或受试者，例如通过在体外、离体或体内直接施用于细胞、组织和/或器官。体内施用可以经由，例如，通过局部、全身和/或肠胃外途径，例如，静脉内、皮下、腹膜内、鞘内、肌内、眼、鼻、泌尿生殖器、皮内、真皮、肠内、玻璃体内、脑内、鞘内或硬膜外途径。
载体和载剂
在一些实施例中，使用载体将本文所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段或TREM组合物递送至细胞，例如哺乳动物细胞或人细胞。载体可以是，例如，质粒或病毒。在一些实施例中，递送是体内、体外、离体或原位的。在一些实施方案中，病毒是腺相关病毒(AAV)、慢病毒或腺病毒。在一些实施例中，系统或系统的组分与病毒样颗粒或病毒体一起被递送至细胞。在一些实施例中，递送使用一种以上的病毒、病毒样颗粒或病毒体。
载剂
本文所述的TREM、TREM组合物或药物TREM组合物可以包含载剂，可以与载剂一起配制，或者可以在载剂中递送。
病毒载体
载剂可以是病毒载体(例如，包含编码TREM、TREM核心片段或TREM片段的序列的病毒载体)。可将病毒载体施用于细胞或受试者(，例如，人类受试者或动物模型)以递送TREM、TREM核心片段或TREM片段、TREM组合物或药物TREM作品。病毒载体可以全身或局部施用(例如，注射)。病毒基因组提供了丰富的载体来源，可用于将外源基因有效递送到哺乳动物细胞中。本领域已知病毒基因组可用作递送的有用载体，因为包含在此类基因组中的多核苷酸典型地通过通用或特化转导掺入到哺乳动物细胞的核基因组中。这些过程是自然病毒复制周期的一部分，不需要添加蛋白质或试剂来诱导基因整合。病毒载体的实例包括逆转录病毒(例如，逆转录病毒科病毒载体)、腺病毒(例如，Ad5、Ad26、Ad34、Ad35和Ad48)、细小病毒(例如，腺相关病毒)、冠状病毒、负链RNA病毒(如正粘病毒(例如，流感病毒)、弹状病毒(例如，狂犬病和水泡性口炎病毒)、副粘病毒(例如，麻疹和仙台病毒))、正链RNA病毒(如微核糖核酸病毒和甲病毒)、以及双链DNA病毒(包括腺病毒、疱疹病毒(例如，单纯疱疹病毒1型和2型、爱泼斯坦-巴尔病毒、巨细胞病毒、复制缺陷疱疹病毒)和痘病毒(例如，牛痘、经修饰的安卡拉牛痘(MVA)、鸡痘和金丝雀痘))。其他病毒包括例如诺沃克病毒、披膜病毒、黄病毒、呼肠孤病毒、乳多空病毒、肝炎病毒、人乳头瘤病毒、人泡沫病毒和肝炎病毒。逆转录病毒的实例包括：禽白血病肉瘤，禽C型病毒，哺乳动物C型病毒、B型病毒、D型病毒，致癌反转录病毒，HTLV-BLV群，慢病毒，α逆转录病毒，γ逆转录病毒，泡沫病毒(Coffin,J.M.,Retroviridae:The viruses and their replication[逆转录病毒：病毒及其复制],Virology[病毒学](第三版)Lippincott-Raven[利平科特-瑞文],费城,1996)。其他实例包括鼠白血病病毒、鼠肉瘤病毒、小鼠乳腺肿瘤病毒、牛白血病病毒、猫白血病病毒、猫肉瘤病毒、禽白血病病毒、人T细胞白血病病毒、狒狒内源病毒、长臂猿白血病病毒、梅森辉瑞(Mason Pfizer)猴病毒、猴免疫缺陷病毒、猴肉瘤病毒、劳斯肉瘤病毒和慢病毒。载体的其他实例描述于例如美国专利号5,801,030中，其教导以引用方式并入本文。在一些实施例中，系统或系统的组分与病毒样颗粒或病毒体一起被递送至细胞。
基于细胞和囊泡的载剂
可以将本文所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段、TREM组合物或药物TREM组合物在囊泡或其他基于膜的载剂中施用于细胞。
在实施例中，本文所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段、或TREM组合物或药物TREM组合物在细胞、囊泡或其他基于膜的载剂中施用或经由其施用。在实施例中，TREM、TREM核心片段、TREM片段或TREM组合物或药物TREM组合物可以配制在脂质体或其他类似的囊泡中。脂质体是球形囊泡结构，这些球形囊泡结构由围绕内部水性隔室的单层或多层的脂质双层和相对不可渗透的外部亲脂性磷脂双层构成。脂质体可以是阴离子的、中性的或阳离子的。脂质体具有生物相容性，无毒，可以递送亲水性和亲脂性药物分子，保护其货物免受血浆酶的降解，并将其负载运输穿过生物膜和血脑屏障(BBB)(关于综述，参见，例如，Spuch和Navarro,Journal of Drug Delivery[药物递送杂志],第2011卷,文章ID 469679,第12页,2011.doi:10.1155/2011/469679)。
囊泡可以由几种不同类型的脂质制成；然而，磷脂最常用于产生脂质体作为药物载剂。用于制备多层囊泡脂质的方法在本领域中是已知的(参见例如美国专利号6,693,086，其关于多层囊泡脂质制剂的教导通过引用并入本文)。尽管当脂质膜与水溶液混合时，囊泡的形成是自发的，但也可以通过使用均质器、超声仪或挤压装置以振荡的形式施加力来加快囊泡的形成(有关综述，参见，例如，Spuch和Navarro,Journal of Drug Delivery[药物递送杂志],第2011卷,文章ID 469679,第12页,2011.doi:10.1155/2011/469679)。可以通过挤出通过具有减小尺寸的过滤器来制备挤出的脂质，如Templeton等人,NatureBiotech[自然生物技术],15:647-652,1997中所述，该文献关于挤出脂质制备的传授内容通过引用并入本文。
脂质纳米颗粒是为本文所述的TREM、TREM核心片段、TREM片段或TREM组合物或药物TREM组合物提供生物相容性和生物可降解递送系统的载剂的另一个实例。纳米结构化的脂质载剂(NLC)是经修饰的固体脂质纳米颗粒(SLN)，这些经修饰的固体脂质纳米颗粒保留了SLN的特征、改善了药物稳定性和负载能力、并且防止了药物泄漏。聚合物纳米颗粒(PNP)是药物递送的重要组成部分。这些纳米颗粒可以有效地将药物递送引导至特定靶标并且改善药物稳定性和受控的药物释放。也可以使用脂质聚合物纳米颗粒(PLN)，即一种组合了脂质体和聚合物的新型载剂。这些纳米颗粒具有PNP和脂质体的互补优势。PLN由核-壳结构构成；聚合物核提供了稳定的结构，磷脂壳提供了良好的生物相容性。这样，这两种组分增加了药物包封效率、促进了表面修饰、并且防止了水溶性药物的泄漏。对于综述，参见例如Li等人2017,Nanomaterials[纳米材料]7,122；doi:10.3390/nano 7060122。
示例性脂质纳米颗粒在国际申请PCT/US 2014/053907中披露，其全部内容通过引用并入本文。例如，PCT/US 2014/053907的第[403-406]或[410-413]段中描述的LNP可用作本文所述TREM、TREM核心片段、TREM片段或TREM组合物或药物TREM组合物的载剂。
其他示例性脂质纳米颗粒在美国专利10,562,849中披露，其全部内容通过引用并入本文。例如，美国专利10,562,849第1-3栏中描述的式(I)的LNP可用作本文所述TREM、TREM核心片段、TREM片段或TREM组合物或药物TREM组合物的载剂。
可用于形成纳米颗粒(例如，脂质纳米颗粒)的脂质包括例如WO 2019217941的表4中描述的那些，其通过引用并入-例如，含脂质的纳米颗粒可包含WO 2019217941的表4中的一种或多种脂质。脂质纳米颗粒可以包括另外的要素，诸如聚合物，诸如通过引用并入的WO2019217941的表5中描述的聚合物。
在一些实施例中，缀合的脂质，当存在时，可以包括以下的一种或多种：PEG-二酰基甘油(DAG)(诸如l-(单甲氧基-聚乙二醇)-2,3-二肉豆蔻酰甘油(PEG-DMG))、PEG-二烷氧基丙基(DAA)、PEG-磷脂、PEG-神经酰胺(Cer)、聚乙二醇化磷脂酰乙醇胺(PEG-PE)、PEG琥珀酸二酰基甘油(PEGS-DAG)(诸如4-0-(2',3'-二(十四烷酰氧基)丙基-l-0-(w-甲氧基(聚乙氧基)乙基)丁二酸酯(PEG-S-DMG))、PEG二烷氧基丙基氨基甲酸酯、N-(羰基-甲氧基聚乙二醇2000)-1,2-二硬脂酰-sn-甘油-3-磷酸乙醇胺钠盐，以及在WO 2019051289的表2中描述的那些(通过引用并入)和前述的组合。
在一些实施例中，可掺入脂质纳米颗粒中的固醇包括胆固醇或胆固醇衍生物中的一种或多种，诸如通过引用并入的W02009/127060或US 2010/0130588中的那些。另外的示例性固醇包括植物固醇，包括通过引用并入本文的Eygeris等人(2020)中描述的那些。
在一些实施例中，脂质颗粒包含可电离脂质、非阳离子脂质、抑制颗粒聚集的缀合脂质和固醇。这些组分的量可以独立地变化，以获得所需特性。例如，在一些实施例中，脂质纳米颗粒包含可电离脂质，其量为总脂质的约20mol％至约90mol％(在其他实施例中，其可为存在于脂质纳米颗粒中的总脂质的20％-70％(mol)、30％-60％(mol)或40％-50％(mol)；约50mol％至约90mol％)；非阳离子脂质，其量为总脂质的约5mol％至约30mol％；缀合脂质，其量为总脂质的约0.5mol％至约20mol％；以及固醇，其量为总脂质的约20mol％至约50mol％。总脂质与核酸的比率可以根据需要变化。例如，总脂质与核酸(质量或重量)的比率可为约10:1至约30:1。
在一些实施例中，脂质与核酸的比率(质量/质量比率；w/w比率)可以处于从约1:1至约25:1、从约10:1至约14:1、从约3:1至约15:1、从约4:1至约10:1、从约5:1至约9:1、或约6:1至约9:1的范围内。可以调节脂质和核酸的量以提供所需的N/P比，例如3、4、5、6、7、8、9、10或更高的N/P比。通常，脂质纳米颗粒配制品的总脂质含量可在约5mg/ml至约30mg/mL的范围内。
可用于(例如，与其他脂质组分组合)形成用于递送本文所述的组合物，例如本文所述的核酸(例如，RNA)的脂质纳米颗粒的脂质化合物的一些非限制性实例包括：
在一些实施例中，包含式(i)的LNP用于将本文所述的TREM组合物递送至肝脏和/或肝细胞。
在一些实施例中，包含式(ii)的LNP用于将本文所述的TREM组合物递送至肝脏和/或肝细胞。
在一些实施例中，包含式(iii)的LNP用于将本文所述的TREM组合物递送至肝脏和/或肝细胞。
在一些实施例中，包含式(v)的LNP用于将本文所述的TREM组合物递送至肝脏和/或肝细胞。
在一些实施例中，包含式(vi)的LNP用于将本文所述的TREM组合物递送至肝脏和/或肝细胞。
在一些实施例中，包含式(viii)的LNP用于将本文所述的TREM组合物递送至肝脏和/或肝细胞。
在一些实施例中，包含式(ix)的LNP用于将本文所述的TREM组合物递送至肝脏和/或肝细胞。
其中X1是O、NR1或直接键，X2是C2-5亚烷基，X3是C(＝O)或直接键，R1是H或Me，R3是Ci-3烷基，R2是Ci-3烷基，或R2与它所附接的氮原子和X2的1-3个碳原子一起形成4-元、5-元或6-元环，或X1是NR1，R1和R2与它们所附接的氮原子一起形成5-元或6-元环，或R2与R3和它们所附接的氮原子一起形成5-元、6-元或7-元环，Y1是C2-12亚烷基，Y2选自
(在任一取向上)，(在任一取向上)，(在任一取向上)，
n是0到3，R4是Ci-15烷基，Z1是C1-6亚烷基或直接键，Z2是
(在任一取向上)或不存在，前提是如果Z1是直接键，则Z2不存在；R5是C5-9烷基或C6-10烷氧基，R6是C5-9烷基或C6-10烷氧基，W是亚甲基或直接键，并且R7是H或Me或其盐，条件是如果R3和R2是C2烷基，X1是O，X2是直链C3亚烷基，X3是C(＝0)，Y1是直链Ce亚烷基，(Y2)n-R4是
R4是直链C5烷基，Z1是C2亚烷基，Z2不存在，W是亚甲基并且R7是H，则是R5和R6不是Cx烷氧基。
在一些实施例中，包含式(xii)的LNP用于将本文所述的TREM组合物递送至肝脏和/或肝细胞。
在一些实施例中，包含式(xi)的LNP用于将本文所述的TREM组合物递送至肝脏和/或肝细胞。
在一些实施例中，LNP包含式(xiii)的化合物和式(xiv)的化合物。
在一些实施例中，包含式(xv)的LNP用于将本文所述的TREM组合物递送至肝脏和/或肝细胞。
在一些实施例中，包含式(xvi)的配制品的LNP用于将本文所述的TREM组合物递送至肺内皮细胞。
在一些实施例中，用于形成用于递送本文所述组合物(例如本文所述的TREM)的脂质纳米颗粒的脂质化合物通过以下反应之一制备：
在一些实施例中，本文所述的组合物(例如，TREM组合物)在包含可电离脂质的LNP中提供。在一些实施例中，可电离脂质是十七烷-9-基8-((2-羟乙基)(6-氧代-6-(十一烷氧基)己基)氨基)辛酸酯(SM-102)；例如，如US 9,867,888的实例1中所述(通过引用以其整体并入本文)。在一些实施例中，可电离脂质是9Z,12Z)-3-((4,4-双(辛氧基)丁酰基)氧基)-2-((((3-(二乙基氨基)丙氧基)羰基)氧基)甲基)丙基十八碳-9,12-二烯酸酯(LP01)，例如，如WO 2015/095340(通过援引以其全文并入本文)的实例13中合成的。在一些实施例中，可电离脂质是9-((4-二甲基氨基)丁酰基)氧基)十七烷二酸二((Z)-壬-2-烯-1-基)酯(L319)，例如如US 2012/0027803(通过援引以其全文并入本文)的实例7、实例8或实例9中合成的。在一些实施例中，可电离脂质是1,1'-((2-(4-(2-((2-(双(2-羟基十二烷基)氨基)乙基)(2-羟基十二烷基)氨基)乙基)哌嗪-1-基)乙基)氮烷二基)双(十二烷-2-醇)(C12-200)，例如，如WO 2010/053572(通过援引以其全文并入本文)的实例14和实例16中合成的。在一些实施例中，可电离脂质是咪唑胆固醇酯(ICE)脂质(3S,10R,13R,17R)-10,13-二甲基-17-((R)-6-甲基庚-2-基)-2,3,4,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17-十四氢-1H-环戊烯并[a]菲-3-基3-(1H-咪唑-4-基)丙酸酯，例如来自WO 2020/106946(通过援引以其全文并入本文)的结构(I)。
在一些实施例中，可电离脂质可以是阳离子脂质、可电离阳离子脂质，例如可以根据pH以带正电荷的形式或中性形式存在的阳离子脂质，或可以容易地质子化的含胺脂质。在一些实施例中，阳离子脂质是例如在生理条件下能够带正电的脂质。示例性的阳离子脂质包括一个或多个带有正电荷的胺基。在一些实施例中，脂质颗粒包含与中性脂质、可电离含胺脂质、可生物降解的炔脂质、类固醇、包括多不饱和脂质的磷脂、结构脂质(例如固醇)、PEG、胆固醇和聚合物缀合脂质中的一种或多种配制的阳离子脂质。在一些实施例中，阳离子脂质可以是可电离的阳离子脂质。如本文所披露的示例性阳离子脂质可具有超过6.0的有效pKa。在实施例中，脂质纳米颗粒可包含具有与第一阳离子脂质不同的有效pKa(例如，大于第一有效pKa)的第二阳离子脂质。脂质纳米颗粒可包含40摩尔％至60摩尔％的包封在脂质纳米颗粒内或与脂质纳米颗粒缔合的阳离子脂质、中性脂质、类固醇、聚合物缀合的脂质和治疗剂(例如本文所述的TREM)。在一些实施例中，TREM与阳离子脂质共同配制。TREM可以吸附到LNP(例如包含阳离子脂质的LNP)的表面。在一些实施例中，TREM可以包封在LNP(例如包含阳离子脂质的LNP)中。在一些实施例中，脂质纳米颗粒可包含靶向部分，例如用靶向剂包被的靶向部分。在实施例中，LNP配制品是生物可降解的。在一些实施例中，包含一种或多种本文所述的脂质(例如式(i)、(ii)、(ii)、(vii)和/或(ix))的脂质纳米颗粒包封至少1％、至少5％、至少10％、至少20％、至少30％、至少40％、至少50％、至少60％、至少70％、至少80％、至少90％、至少92％、至少95％、至少97％、至少98％或100％的TREM。
可用于脂质纳米颗粒配制品中的示例性可电离脂质包括但不限于通过引用并入本文的WO 2019051289的表1中所列的那些。另外的示例性脂质包括但不限于下式中的一种或多种：US 2016/0311759的X；US 20150376115或US 2016/0376224中的I；US 20160151284的I、II或III；US 20170210967的I、IA、II或IIA；US 20150140070的I-c；US 2013/0178541的A；US 2013/0303587或US 2013/0123338的I；US 2015/0141678的I；US 2015/0239926的II、III、IV或V；US 2017/0119904的I；WO 2017/117528的I或II；US 2012/0149894的A；US2015/0057373的A；WO 2013/116126的A；US 2013/0090372的A；US 2013/0274523的A；US2013/0274504的A；US 2013/0053572的A；W02013/016058的A；W02012/162210的A；US 2008/042973的I；US 2012/01287670的I、II、III或IV；US 2014/0200257的I或II；US 2015/0203446的I、II或III；US 2015/0005363的I或III；US 2014/0308304的I、IA、IB、IC、ID、II、IIA、IIB、IIC、IID或III-XXIV；US 2013/0338210的；W02009/132131的I、II、III或IV；US2012/01011478的A；US 2012/0027796的I或XXXV；US 2012/0058144的XIV或XVII；US 2013/0323269的；US2011/0117125的I；US 2011/0256175的I、II或III；US 2012/0202871的I、II、III、IV、V、VI、VII、VIII、IX、X、XI、XII；US 2011/0076335的I、II、III、IV、V、VI、VII、VIII、X、XII、XIII、XIV、XV或XVI；US 2006/008378的I或II；US 2013/0123338的I；US 2015/0064242的I或X-A-Y-Z；US 2013/0022649的XVI、XVII或XVIII；US 2013/0116307的I、II或III；US 2013/0116307的I、II或III；US 2010/0062967的I或II；US 2013/0189351的I-X；US2014/0039032的I；US 2018/0028664的V；US 2016/0317458的I；US 2013/0195920的I；US10,221,127的5、6或10；WO 2018/081480的III-3；WO 2020/081938的I-5或I-8；US 9,867,888的18或25；US 2019/0136231的A；WO 2020/219876的II；US 2012/0027803的1；US 2019/0240349的OF-02；US 10,086,013的23；Miao等人(2020)的cKK-E12/A6；WO 2010/053572的C12-200；Dahlman等人(2017)的7C1；Whitehead等人的304-O13或503-O13；US 9,708,628的TS-P4C2；WO 2020/106946的I；WO 2020/106946的I。
在一些实施例中，可电离脂质是MC3(6Z,9Z,28Z,3lZ)-三十七烷-6,9,28,3l-四烯-l9-基-4-(二甲基氨基)丁酸酯(DLin-MC3-DMA或MC3)，例如，如WO 2019051289A9(通过引用以其全文并入本文)的实例9中所述。在一些实施例中，可电离脂质是脂质ATX-002，例如，如WO 2019051289 A9(通过引用以其全文并入本文)的实例10中所述。在一些实施例中，可电离脂质是(l3Z,l6Z)-A,A-二甲基-3-壬基二十二-l3,l6-二烯-l-胺(化合物32)，例如，如WO 2019051289 A9(通过引用以其全文并入本文)的实例11中所述。在一些实施例中，可电离脂质是化合物6或化合物22，例如，如WO 2019051289 A9(通过引用以其全文并入本文)的实例12中所述。
示例性非阳离子脂质包括但不限于二硬脂酰-sn-甘油基-磷酸乙醇胺、二硬脂酰磷脂酰胆碱(DSPC)、二油酰磷脂酰胆碱(DOPC)、二棕榈酰磷脂酰胆碱(DPPC)、二油酰磷脂酰胆碱(DOPG)、二棕榈酰磷脂酰甘油(DPPG)、二油酰磷脂酰乙醇胺(DOPE)、棕榈酰油酰磷脂酰胆碱(POPC)、棕榈酰油酰磷脂酰乙醇胺(POPE)、二油酰-磷脂酰乙醇胺4-(N-马来酰亚胺甲基)-环己烷-1-羧酸酯(DOPE-mal)、二棕榈酰磷脂酰乙醇胺(DPPE)、二肉豆蔻酰磷酸乙醇胺(DMPE)、二硬脂酰-磷脂酰-乙醇胺(DSPE)、单甲基-磷脂酰乙醇胺(诸如16-O-单甲基PE)、二甲基-磷脂酰乙醇胺(诸如16-O-二甲基PE)、l8-l-反式PE、l-硬脂酰-2-油酰-磷脂酰乙醇胺(SOPE)、氢化大豆磷脂酰胆碱(HSPC)、卵磷脂酰胆碱(EPC)、二油酰磷脂酰丝氨酸(DOPS)、神经鞘磷脂(SM)、二肉豆蔻酰磷脂酰胆碱(DMPC)、二肉豆蔻酰磷脂酰甘油(DMPG)、二硬脂酰磷脂酰甘油(DSPG)、二芥酰基磷脂酰胆碱(DEPC)、棕榈酰油酰磷脂酰甘油(POPG)、二反油烯酰-磷脂酰乙醇胺(DEPE)、卵磷脂、磷脂酰乙醇胺、溶血卵磷脂、溶血磷脂酰乙醇胺、磷脂酰丝氨酸、磷脂酰肌醇、鞘磷脂、卵鞘磷脂(ESM)、脑磷脂、心磷脂、磷脂酸、脑苷脂、双十六烷基磷酸、溶血磷脂酰胆碱、二亚油酰基磷脂酰胆碱或其混合物。应当理解，也可以使用其他二酰基磷脂酰胆碱和二酰基磷脂酰乙醇胺磷脂。这些脂质中的酰基基团优选为源自具有C10-C24碳链的脂肪酸的酰基基团，例如月桂酰基、肉豆蔻酰基、棕榈酰基、硬脂酰基或油酰基。在某些实施例中，另外的示例性脂质包括但不限于通过引用并入本文的Kim等人(2020)dx.doi.org/10.1021/acs.nanolett.0c01386中描述的那些。在一些实施例中，此类脂质包括发现会改善用mRNA进行肝脏转染的植物脂质(例如DGTS)。
适合用于脂质纳米颗粒中的非阳离子脂质的其他实例包括但不限于非磷脂质，例如硬脂胺、十二烷基胺、十六烷基胺、乙酰基棕榈酸酯、蓖麻酸甘油酯、硬脂酸十六烷基酯、肉豆蔻酸异丙酯、两性丙烯酸聚合物、三乙醇胺-月桂基硫酸盐、烷基-芳基硫酸盐、聚乙氧基化脂肪酸酰胺、双十八烷基二甲基溴化铵、神经酰胺、鞘磷脂等。其他非阳离子脂质在WO2017/099823或美国专利公开US 2018/0028664中描述，其内容通过引用以其全文并入本文。
在一些实施例中，非阳离子脂质是油酸或通过引用以其全文并入的US 2018/0028664的式I、II或IV的化合物。非阳离子脂质可以占脂质纳米颗粒中存在的总脂质的例如0-30％(摩尔)。在一些实施例中，非阳离子脂质含量是脂质纳米颗粒中存在的总脂质的5％-20％(摩尔)或10％-15％(摩尔)。在实施例中，可电离脂质与中性脂质的摩尔比为约2:1至约8:1(例如，约2:1、3:1、4:1、5:1、6:1、7:1或8:1)。
在一些实施例中，脂质纳米颗粒不包含任何磷脂。
在一些方面，脂质纳米颗粒可进一步包含诸如固醇的组分以提供膜完整性。可用于脂质纳米颗粒中的一种示例性固醇是胆固醇及其衍生物。胆固醇衍生物的非限制性实例包括极性类似物，例如5a-胆甾醇、53-粪甾醇、胆甾醇基-(2,-羟基)-乙基醚、胆甾醇基-(4'-羟基)-丁基醚、和6-酮胆甾烷醇；非极性类似物，例如5a-胆甾烷、胆甾酮、5a-胆甾烷酮、5p-胆甾烷酮和胆甾醇基癸酸酯；及其混合物。在一些实施例中，胆固醇衍生物是极性类似物，例如，胆甾醇基-(4'-羟基)-丁基醚。示例性的胆固醇衍生物在PCT公开W0 2009/127060和美国专利公开US 2010/0130588中描述，其中每个通过引用以其全文并入本文。
在一些实施例中，提供膜完整性的组分，诸如固醇，可占脂质纳米颗粒中存在的总脂质的0-50％(摩尔)(例如，0-10％、10％-20％、20％-30％、30％-40％或40％-50％)。在一些实施例中，此类组分是脂质纳米颗粒的总脂质含量的20％-50％(摩尔)、30％-40％(摩尔)。
在一些实施例中，脂质纳米颗粒可包含聚乙二醇(PEG)或缀合的脂质分子。通常，这些用于抑制脂质纳米颗粒的聚集和/或提供空间稳定。示例性的缀合脂质包括但不限于PEG-脂质缀合物、聚噁唑啉(POZ)-脂质缀合物、聚酰胺-脂质缀合物(诸如ATTA-脂质缀合物)、阳离子聚合物脂质(CPL)缀合物及其混合物。在一些实施例中，缀合脂质分子是PEG-脂质缀合物，例如(甲氧基聚乙二醇)缀合脂质。
示例性的PEG-脂质缀合物包括但不限于PEG-二酰基甘油(DAG)(诸如l-(单甲氧基-聚乙二醇)-2,3-二肉豆蔻酰甘油(PEG-DMG))、PEG-二烷氧基丙基(DAA)、PEG-磷脂、PEG-神经酰胺(Cer)、聚乙二醇化磷脂酰乙醇胺(PEG-PE)、PEG琥珀酸二酰基甘油(PEGS-DAG)(诸如4-0-(2',3'-二(十四烷酰氧基)丙基-l-0-(w-甲氧基(聚乙氧基)乙基)丁二酸酯(PEG-S-DMG))、PEG二烷氧基丙基氨基甲酸酯、N-(羰基-甲氧基聚乙二醇2000)-l,2-二硬脂酰-sn-甘油-3-磷酸乙醇胺钠盐或其混合物。另外的示例性PEG-脂质缀合物例如在US 5,885,6l3、US 6,287,59l、US 2003/0077829、US 2003/0077829、US 2005/0175682、US 2008/0020058、US 2011/0117125、US 2010/0130588、US 2016/0376224、US 2017/0119904和US/099823中描述，所有这些的内容通过引用以其全文并入本文。在一些实施例中，PEG-脂质是US 2018/0028664的式III、III-a-I、III-a-2、III-b-1、III-b-2或V的化合物，其内容通过引用以其全文并入本文。在一些实施例中，PEG-脂质具有US 20150376115或US 2016/0376224的式II，两者的内容通过引用以其全文并入本文。在一些实施例中，PEG-DAA缀合物可以是例如PEG-二月桂基氧基丙基、PEG-二肉豆蔻基氧基丙基、PEG-二棕榈基氧基丙基或PEG-二硬脂基氧基丙基。PEG-脂质可以是以下的一种或多种：PEG-DMG、PEG-二月桂基甘油、PEG-二棕榈酰甘油、PEG-二硬脂基甘油、PEG-二月桂基甘油脂酰胺、PEG-二肉豆蔻基甘油脂酰胺、PEG-二棕榈酰甘油脂酰胺、PEG-二硬脂基甘油脂酰胺、PEG-胆固醇(l-[8'-(胆甾-5-烯-3[β]-氧基)甲酰胺基-3',6'-二氧杂辛基]氨基甲酰基-[ω]-甲基-聚(乙二醇)、PEG-DMB(3,4-双十四烷氧基苄基-[ω]-甲基-聚(乙二醇)醚)和1,2-二肉豆蔻酰基-sn-甘油-3-磷酸乙醇胺-N-[甲氧基(聚乙二醇)-2000]。在一些实施例中，PEG-脂质包含PEG-DMG、1,2-二肉豆蔻酰基-sn-甘油-3-磷酸乙醇胺-N-[甲氧基(聚乙二醇)-2000]。在一些实施例中，PEG-脂质包含选自以下的结构：
在一些实施例中，与PEG以外的分子缀合的脂质也可用于代替PEG-脂质。例如，聚噁唑啉(POZ)-脂质缀合物、聚酰胺-脂质缀合物(诸如ATTA-脂质缀合物)和阳离子聚合物脂质(GPL)缀合物可用于代替PEG-脂质或与PEG-脂质一起使用。
示例性的缀合脂质，即PEG-脂质、(POZ)-脂质缀合物、ATTA-脂质缀合物和阳离子聚合物-脂质在WO 2019051289 A9的表2中列出的PCT和LIS专利申请中描述，所有这些的内容通过引用以其全文并入本文。
在一些实施例中，PEG或缀合脂质可以占脂质纳米颗粒中存在的总脂质的0-20％(摩尔)。在一些实施例中，PEG或缀合脂质的含量为脂质纳米颗粒中存在的总脂质的0.5％-10％或2％-5％(摩尔)。可电离脂质、非阳离子脂质、固醇和PEG/缀合脂质的摩尔比可以根据需要变化。例如，脂质颗粒可包含按组合物的摩尔或总重量计30％-70％的可电离脂质，按组合物的摩尔或总重量计0-60％的胆固醇，按组合物的摩尔或总重量计0-30％的非阳离子脂质和按组合物的摩尔或总重量计1％-10％的缀合脂质。优选地，组合物包含按组合物的摩尔或总重量计30％-40％的可电离脂质，按组合物的摩尔或总重量计40％-50％的胆固醇，和按组合物的摩尔或总重量计10％-20％的非阳离子脂质。在一些其他实施例中，该组合物是按组合物的摩尔或总重量计50％-75％的可电离脂质，按组合物的摩尔或总重量计20％-40％的胆固醇和按组合物的摩尔或总重量计5％至10％的非阳离子脂质以及按组合物的摩尔或总重量计1％-10％的缀合脂质。该组合物可以含有按组合物的摩尔或总重量计60％-70％的可电离脂质，按组合物的摩尔或总重量计25％-35％的胆固醇，以及按组合物的摩尔或总重量计5％-10％的非阳离子脂质。该组合物还可含有按组合物的摩尔或总重量计至多90％的可电离脂质和按组合物的摩尔或总重量计2％至15％的非阳离子脂质。该配制品还可以是脂质纳米颗粒配制品，例如包含按组合物的摩尔或总重量计8％-30％可电离脂质、按组合物的摩尔或总重量计5％-30％非阳离子脂质、和按组合物的摩尔或总重量计0-20％胆固醇；按组合物的摩尔或总重量计4％-25％可电离脂质、按组合物的摩尔或总重量计4％-25％非阳离子脂质、按组合物的摩尔或总重量计2％-25％胆固醇、按组合物的摩尔或总重量计10％至35％缀合脂质，和按组合物的摩尔或总重量计5％胆固醇；或按组合物的摩尔或总重量计2％-30％可电离脂质、按组合物的摩尔或总重量计2％-30％非阳离子脂质、按组合物的摩尔或总重量计1％-15％胆固醇、按组合物的摩尔或总重量计2％至35％缀合脂质，和按组合物的摩尔或总重量计1％-20％胆固醇；或按组合物的摩尔或总重量计甚至高达90％可电离脂质和按组合物的摩尔或总重量计2％-10％非阳离子脂质，或按组合物的摩尔或总重量计甚至100％阳离子脂质。在一些实施例中，脂质颗粒配制品包含摩尔比为50:10:38.5:1.5的可电离脂质、磷脂、胆固醇和聚乙二醇化脂质。在一些其他实施例中，脂质颗粒配制品包含摩尔比为60:38.5:1.5的可电离脂质、胆固醇和聚乙二醇化脂质。
在一些实施例中，脂质颗粒包含可电离脂质、非阳离子脂质(例如磷脂)、固醇(例如胆固醇)和聚乙二醇化脂质，其中可电离脂质的脂质摩尔比在20至70摩尔％的范围内，目标为40-60，非阳离子脂质的摩尔百分比在0至30的范围内，目标为0至15，固醇的摩尔百分比在20至70的范围内，目标为30至50，并且聚乙二醇化脂质的摩尔百分比在1至6的范围内，目标为2至5。
在一些实施例中，脂质颗粒包含摩尔比为50:10:38.5:1.5的可电离脂质/非阳离子脂质/固醇/缀合脂质。
在一个方面，本披露提供了包含磷脂、卵磷脂、磷脂酰胆碱和磷脂酰乙醇胺的脂质纳米颗粒配制品。
在一些实施例中，还可以包括一种或多种另外的化合物。那些化合物可以单独施用，或者另外的化合物可以包括在本发明的脂质纳米颗粒中。换言之，除核酸或至少第二核酸之外，脂质纳米颗粒可含有不同于第一核酸的其他化合物。非限制性地，其他另外的化合物可以选自由以下组成的组：小的或大的有机分子或无机分子、单糖、二糖、三糖、寡糖、多糖、肽、蛋白质、其肽类似物和衍生物、肽模拟物、核酸、核酸类似物和衍生物、由生物材料制成的提取物，或其任何组合。
在一些实施例中，通过添加靶向结构域将LNP定向至特定组织。例如，可以将生物配体展示在LNP的表面，以增强与展示同源受体的细胞的相互作用，从而推动与细胞表达受体的组织的缔合和向其中的载物递送。在一些实施例中，生物配体可以是驱动递送至肝脏的配体，例如展示GalNAc的LNP促使核酸载物递送至展示无唾液酸糖蛋白受体(ASGPR)的肝细胞。Akinc等人Mol Ther[分子治疗]18(7):1357-1364(2010)的工作传授了将三价GalNAc配体与PEG-脂质缀合(GalNAc-PEG-DSG)以产生依赖于ASGPR的LNP以获得可观察的LNP载物效应(参见，例如，Akinc等人2010,同上的图6)。其他展示配体的LNP配制品，例如掺入叶酸、转铁蛋白或抗体的配制品，在WO 2017223135中进行了讨论，其通过引用以其全文并入本文，此外还有在其中使用的参考文献也并入本文：即，Kolhatkar等人,Curr Drug DiscovTechnol[当代药物发现技术].2011 8:197-206；Musacchio and Torchilin,FrontBiosci.[生物科学前沿]2011 16:1388-1412；Yu等人,Mol Membr Biol.[分子膜生物学]2010 27:286-298；Patil等人,Crit Rev Ther Drug Carrier Syst.[治疗性药物载剂系统的重要评论]2008 25:1-61；Benoit等人,Biomacromolecules.[生物大分子]2011 12:2708-2714；Zhao等人,Expert Opin Drug Deliv.[药物递送专家观点]2008 5:309-319；Akinc等人,Mol Ther.[分子疗法]2010 18:1357-1364；Srinivasan等人,Methods MolBiol.[分子生物学方法]2012 820:105-116；Ben-Arie等人,Methods Mol Biol.[分子生物学方法]2012 757:497-507；Peer 2010J Control Release.[控释杂志]20:63-68；Peer等人,Proc Natl Acad Sci U S A.[美国国家科学院院刊]2007 104:4095-4100；Kim等人,Methods Mol Biol.[分子生物学方法]2011 721:339-353；Subramanya等人,Mol Ther.[分子疗法]2010 18:2028-2037；Song等人,Nat Biotechnol.[自然生物技术]2005 23:709-717；Peer等人,Science.[科学]2008 319:627-630；和Peer与Lieberman,Gene Ther.[基因疗法]2011 18:1127-1133。
在一些实施例中，通过将选择性器官靶向(Selective ORgan Targeting，SORT)分子添加至包含传统组分(例如可电离的阳离子脂质、两亲性磷脂、胆固醇和聚(乙二醇)(PEG))的配制品中来针对组织特异性活性对LNP进行选择。Cheng等人Nat Nanotechnol[自然纳米技术]15(4):313-320(2020)的传授内容证明，添加补充的“SORT”组分可根据SORT分子的百分比和生物物理特性精确地改变体内RNA递送谱并介导组织特异性(例如，肺、肝脏、脾脏)基因递送和编辑。
在一些实施例中，LNP包含生物可降解的可电离脂质。在一些实施例中，LNP包含(9Z,l2Z)-3-((4,4-双(辛氧基)丁酰基)氧基)-2-((((3-(二乙基氨基)丙氧基)羰基)氧基)甲基)丙基十八碳-9,l2-二烯酸酯，也称为3-((4,4-双(辛氧基)丁酰基)氧基)-2-((((3-(二乙基氨基)丙氧基)羰基)氧基)甲基)丙基(9Z,l2Z)-十八碳-9,l2-二烯酸酯)或另一种可电离脂质。参见，例如WO 2019/067992、WO/2017/173054、WO 2015/095340和WO 2014/136086，以及其中提供的参考文献的脂质。在一些实施例中，在LNP脂质的上下文中术语阳离子和可电离是可互换的，例如，其中可电离脂质根据pH是阳离子的。
在一些实施例中，LNP配制品的平均LNP直径可以在数十nm和数百nm之间，例如通过动态光散射(DLS)测量的。在一些实施例中，LNP配制品的平均LNP直径可以为约40nm至约150nm，诸如约40nm、45nm、50nm、55nm、60nm、65nm、70nm、75nm、80nm、85nm、90nm、95nm、100nm、105nm、110nm、115nm、120nm、125nm、130nm、135nm、140nm、145nm或150nm。在一些实施例中，LNP配制品的平均LNP直径可为约50nm至约100nm、约50nm至约90nm、约50nm至约80nm、约50nm至约70nm、约50nm至约60nm、约60nm至约100nm、约60nm至约90nm、约60nm至约80nm、约60nm至约70nm、约70nm至约100nm、约70nm至约90nm、约70nm至约80nm、约80nm至约100nm、约80nm至约90nm或约90nm至约100nm。在一些实施例中，LNP配制品的平均LNP直径可为约70nm至约100nm。在特定实施例中，LNP配制品的平均LNP直径可为约80nm。在一些实施例中，LNP配制品的平均LNP直径可为约100nm。在一些实施例中，LNP配制品的平均LNP直径范围为约l mm至约500mm、约5mm至约200mm、约10mm至约100mm、约20mm至约80mm、约25mm至约60mm、约30mm至约55mm、约35mm至约50mm，或约38mm至约42mm。
在一些情况下，LNP可以是相对均质的。多分散性指数可用于指示LNP的均质性，例如脂质纳米颗粒的粒度分布。小的(例如，小于0.3)多分散性指数通常指示窄的粒度分布。LNP的多分散性指数可为约0至约0.25，诸如0.01、0.02、0.03、0.04、0.05、0.06、0.07、0.08、0.09、0.10、0.11、0.12、0.13、0.14、0.15、0.16、0.17、0.18、0.19、0.20、0.21、0.22、0.23、0.24或0.25。在一些实施例中，LNP的多分散性指数可为约0.10至约0.20。
LNP的ζ电位可用于指示组合物的电动电位。在一些实施例中，ζ电位可以描述LNP的表面电荷。具有相对低电荷(正电荷或负电荷)的脂质纳米颗粒通常是期望的，因为更高电荷的物质可能不理想地与体内的细胞、组织和其他元素相互作用。在一些实施例中，LNP的ζ电位可为约-10mV至约+20mV、约-10mV至约+15mV、约-10mV至约+10mV、约-10mV至约+5mV、约-10mV至约0mV、约-10mV至约-5mV、约-5mV至约+20mV、约-5mV至约+15mV、约-5mV至约+10mV、约-5mV至约+5mV、约-5mV至约0mV、约0mV至约+20mV、约0mV至约+15mV、约0mV至约+10mV、约0mV至约+5mV、约+5mV至约+20mV、约+5mV至约+15mV或约+5mV至约+10mV。
TREM的包封效率描述了相对于所提供的初始量，在制备后被包封或以其他方式与LNP缔合的TREM的量。包封效率理想的是较高(例如，接近100％)。包封效率可以例如通过比较在用一种或多种有机溶剂或洗涤剂破碎脂质纳米颗粒之前和之后含有脂质纳米颗粒的溶液中TREM的量来测量。阴离子交换树脂可用于测量溶液中游离蛋白质或核酸(例如RNA)的量。荧光可用于测量溶液中游离TREM的量。对于本文所述的脂质纳米颗粒，TREM的包封效率可以是至少50％，例如50％、55％、60％、65％、70％、75％、80％、85％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％。在一些实施例中，包封效率可以是至少80％。在一些实施例中，包封效率可以是至少90％。在一些实施例中，包封效率可以是至少95％。
LNP可以任选地包含一层或多层包衣。在一些实施例中，LNP可以配制在具有包衣的胶囊、膜或片剂中。包含本文所述的组合物的胶囊、膜或片剂可具有任何可用的尺寸、拉伸强度、硬度或密度。
另外的示例性脂质、配制品、方法和LNP表征由WO 2020061457传授，其通过引用以其全文并入本文。
在一些实施例中，使用Lipofectamine MessengerMax(赛默飞世尔(ThermoFisher))或TransIT-mRNA转染试剂(米卢斯生物(Mirus Bio))进行体外或离体细胞脂质转染。在某些实施例中，使用GenVoy_ILM可电离脂质混合物(精密纳米系统(PrecisionNanoSystems))配制LNP。在某些实施例中，使用2,2-二亚油烯基-4-二甲基氨基乙基-[1,3]-二氧戊环(DLin-KC2-DMA)或二亚油烯基甲基-4-二甲基氨基丁酸酯(DLin-MC3-DMA或MC3)配制LNP，其配制和体内用途在Jayaraman等人Angew Chem Int Ed Engl[德国应用化学]51(34):8529-8533(2012)中传授，其通过引用以其全文并入本文。
优化用于递送CRISPR-Cas系统(例如Cas9-gRNA RNP、gRNA、Cas9mRNA)的LNP配制品在两者均通过引用并入的WO 2019067992和WO 2019067910中描述。
可用于递送核酸的另外的特定LNP配制品在两者均通过引用并入的US 8158601和US 8168775中描述，其包括帕替西兰(patisiran)中使用的以名称ONPATTRO销售的配制品。
外泌体也可用作本文所述的TREM、TREM核心片段、TREM片段或TREM组合物或药物TREM组合物的药物递送媒剂。对于综述，参见Ha等人,July 2016年7月.ActaPharmaceutica Sinica B[药学学报].第6卷,第4期,第287-296页；https://doi.org/10.1016/j.apsb.2016.02.001。
离体分化的红细胞也可用作本文所述的TREM、TREM核心片段、TREM片段或TREM组合物或药物TREM组合物的载剂。见，例如，WO 2015073587；WO 2017123646；WO 2017123644；WO 2018102740；WO 2016183482；WO 2015153102；WO 2018151829；WO 2018009838；Shi等人2014.Proc Natl Acad Sci USA[美国国家科学院院刊].111(28):10131-10136；美国专利9,644,180；Huang等人2017.Nature Communications[自然通讯]8:423；Shi等人2014.ProcNatl Acad Sci USA[美国国家科学院院刊].111(28):10131-10136。
融合体组合物，例如如WO 2018208728中所述，也可用作载剂以递送本文所述的TREM、TREM核心片段、TREM片段或TREM组合物或药物TREM组合物。
病毒体和病毒样颗粒(VLP)也可用作载剂以将本文所述的TREM、TREM核心片段、TREM片段或TREM组合物或药物TREM组合物递送至靶细胞。
植物纳米囊泡，例如，如WO 2011097480A1、WO 2013070324A1或WO 2017004526A1中所述，也可用作载剂以递送本文所述的TREM、TREM核心片段、TREM片段或TREM组合物或药物TREM组合物。
无载剂的情况下递送
TREM、TREM核心片段或TREM片段、TREM组合物或药物TREM组合物可以在没有载剂的情况下施用给细胞，例如通过TREM、TREM核心片段或TREM片段、TREM组合物或药物TREM组合物的裸递送。
在一些实施例中，如本文所用的裸递送是指无载剂的情况下递送。在一些实施例中，无载剂的情况下递送，例如裸递送，包括用部分例如靶向肽递送。
在一些实施例中，本文所述的TREM、TREM核心片段或TREM片段、或TREM组合物或药物TREM组合物在没有载剂的情况下被递送至细胞，例如通过裸递送。在一些实施例中，无载剂的情况下递送，例如裸递送，包括用部分例如靶向肽递送。
TREM的用途
TREM组合物(例如，本文所述的药物TREM组合物)可以调节细胞、组织或受试者的功能。在实施方案中，将本文所述的TREM组合物(例如药物TREM组合物)与细胞或组织接触，或以足以调节(增加或减少)以下参数中的一个或多个的量和时间施用给有需要的受试者：衔接子功能(例如，同源或非同源衔接子功能)，例如，多肽链起始或延伸的速率、效率、稳健性和/或特异性；核糖体结合和/或占用；调节性功能(例如，基因沉默或信号传导)；细胞命运；mRNA稳定性；蛋白质稳定性；蛋白质转导；蛋白质区室化。与参考组织、细胞或受试者(例如健康、野生型或对照细胞、组织或受试者)相比，可以将参数调节例如至少5％(例如，至少10％、15％、20％、25％、30％、40％、50％、60％、70％、80％、90％、100％、150％、200％或更多)。
本文引用的所有参考文献和出版物特此通过引用并入。
提供以下实例以进一步说明本发明的一些实施例，但无意于限制本发明的范围；通过它们的示例性性质将理解，可以替换地使用本领域技术人员已知的其他程序、方法或技术。
实例
实例内容列表：
实例1：经修饰的TREM的合成
通常，TREM分子(例如，经修饰的TREM)可以根据使用亚磷酰胺化学的标准固相合成方法通过HPLC化学合成和纯化。(例如，参见Scaringe S.等人(2004)Curr ProtocNucleic Acid Chem[核酸化学实验方案],2.10.1-2.10.16；Usman N.等人(1987)J.Am.Chem.Soc[美国化学学会杂志],109,7845-7854)。根据寡核苷酸合成中使用的固相亚磷酰胺技术，使用TREM-Arg-TGA、TREM-Ser-TAG或TREM-Gln-TAA序列作为框架，制备含有一个或多个2’-甲氧基(2’OMe)、2’-氟(2’F)、2’-甲氧基乙基(2’-MOE)或硫代磷酸酯(PS)修饰的单独修饰的TREM分子。为清楚起见，名为TREM-Arg-TGA的精氨酸非同源TREM分子包含ARG-UCU-TREM体的序列，但反密码子序列对应于UCA而不是UCU(即，SEQ ID NO:622)。类似地，名为TREM-Ser-TAG的丝氨酸非同源TREM分子包含SER-GCU-TREM体的序列，但反密码子序列对应于CUA而不是GCU(即，SEQ ID NO:993)。名为TREM-Gln-TAA的谷氨酰胺非同源TREM分子包含GLN-CUG-TREM体的序列，但反密码子序列对应于UUA而不是CUG(即，SEQ ID NO:1079)。
为了制备2'OMe修饰的TREM，使用了以下2'-O-甲基亚磷酰胺：(5'-O-二甲氧基三苯甲基-N6-(苯甲酰基)-2'-O-甲基-腺苷-3'-O-(2-氰基乙基-N,N-二异丙基氨基)亚磷酰胺、5'-O-二甲氧基-三苯甲基-N4-(乙酰基)-2'-O-甲基-胞苷-3'-O-(2-氰基乙基-N,N-二异丙基-氨基)亚磷酰胺、(5'-O-二甲氧基三苯甲基-N2-(异丁酰基)-2'-O-甲基-鸟苷-3'-O-(2-氰基-乙基-N,N-二异丙基氨基)-亚磷酰胺和5'-O-二甲氧基-三苯甲基-2'-O-甲基尿苷-3'-O-(2-氰基乙基-N,N-二异丙基氨基)亚磷酰胺。为了制备2'-脱氧和2'-F修饰的TREM，使用具有与2'-O-甲基RNA酰胺相同的保护基团的类似2'-脱氧和2'-氟-亚磷酰胺。为了制备2'-MOE修饰的TREM，使用了以下2'-MOE-亚磷酰胺：5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-2'-O-甲氧基乙基-N6-苯甲酰基-腺苷-3'-O-[(2-氰基乙基)-(N,N-二异丙基)]-亚磷酰胺、5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-2'-O-甲氧基乙基-5-甲基-N4-苯甲酰基-胞苷-3'-O-[(2-氰基乙基)-(N,N-二异丙基)]-亚磷酰胺、5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-2'-O-甲氧基乙基-N2-异丁酰基-鸟苷-3'-O-[(2-氰基乙基)-(N,N-二异丙基)]-亚磷酰胺、5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-2'-O-甲氧基乙基-5-甲基-尿苷-3'-O-[(2-氰基乙基)-(N,N-二异丙基)]-亚磷酰胺。
在通过亚磷酰胺方法合成寡核苷酸的过程中，通过使用硫转移试剂氧化亚磷酸三酯来引入硫代磷酸酯，该硫转移试剂例如四乙基秋兰姆二硫化物(TETD)、双(O,O-二异丙氧基膦酰硫酰基)二硫化物(Stec试剂)、3H-1,2-苯并二硫醇-3-酮-1,1,-二氧化物(Beaucage试剂)、苯基乙酰基二硫化物(PADS)、3-乙氧基-1,2,4-二噻唑啉-5-酮(EDITH)、1,2-二噻唑-5-硫酮(氢化呫吨烷或ADTT)、3-((二甲基氨基-亚甲基)氨基)-3H-1,2,4-二噻唑-3-硫酮(DDTT)、二甲基秋兰姆二硫化物(DTD)、3-苯基-1,2,4-二噻唑啉-5-酮(PolyOrg Sulfa或POS)。
下面的表15-22描述了根据该程序合成的一系列单修饰和多修饰的TREM。表中提供了这些TREM中的每一个的序列，其中r：核糖核苷酸；m：2'-OMe；*：PS连接；f：2'-氟；moe：2'-moe；d：脱氧核糖核苷酸；5MeC：5-甲基胞嘧啶。因此，例如，mA代表2'-O-甲基腺苷，moe5MeC代表带有5-甲基胞嘧啶核碱基的2'-MOE核苷酸，dA代表腺苷脱氧核糖核苷酸。
实例2：鸟苷2'-O-MOE亚磷酰胺的合成
这个实例描述了鸟苷2'-O-MOE亚磷酰胺的合成。根据先前公布的程序制备和纯化鸟苷2'-O-MOE亚磷酰胺(Wen K.等人(2002)The Journal of Organic Chemistry[有机化学杂志],67(22),7887-7889)。
简而言之，鸟苷和咪唑通过与吡啶共蒸发干燥，溶解在干DMF中，并在0℃下用滴加的双(二异丙基氯甲硅烷基)甲烷处理。温度逐渐升高至25℃，然后保持5小时。将反应混合物倒入冰水中，过滤沉淀的白色固体，得到化合物1。在-20℃向化合物1、BrCH2CH2OCH3和TBAI在DMF中的溶液中添加双(三甲基甲硅烷基)酰胺钠，并将混合物在氩气下搅拌4小时。用甲醇淬灭反应后，蒸发THF，将残余物在冰中沉淀，得到化合物2。在25℃将TBAF添加到化合物2的溶液中，然后将混合物在35℃搅拌5小时。然后在减压下蒸发溶剂，并将残余物在硅胶短垫中过滤(使用在二氯甲烷中的10％甲醇)，得到鸟苷2'-O-MOE亚磷酰胺。
实例3：5,6二氢尿苷的合成
本实例描述了5,6二氢尿苷的合成。根据先前公布的程序制备和纯化5,6二氢尿苷亚磷酰胺(Hanze AR等人,(1967)Journal of the American Chemical Society[美国化学学会杂志],89(25),6720-6725)。简而言之，在铂黑存在下，将氧气鼓泡通过尿苷溶液。反应后将反应混合物点样在硅胶薄层色谱板上，并在甲醇-氯仿(1:1)中显色。1小时后，将混合物冷却并离心，将澄清液体冻干，得到5,6二氢尿苷产物。
实例4：通过5'-甲硅烷基-2'-原酸酯(2'-ACE)化学合成TREM
本实例描述了通过5'-甲硅烷基-2'-原酸酯(2'-ACE)化学(总结自(Hartsel SA等人,(2005)Oligonucleotide Synthesis[寡核苷酸合成],033-050))合成TREM。
受保护的核糖核苷单体
根据先前公布的程序(Hartsel SA等人,(2005)Oligonucleotide Synthesis[寡核苷酸合成],033-050)制备和纯化5'-O-甲硅烷基-2'-O-ACE保护的亚磷酰胺。简而言之，单体合成从标准碱基保护的核糖核苷[rA(ibu)、rC(乙酰基)、rG(ibu)和U]开始。然后通过五个一般步骤完成正交5'-甲硅烷基-2'-ACE保护和亚酰胺制备：
1.用1,1,3,3四异丙基二硅氧烷(TIPS)同时短暂保护5'-和3'-羟基。
2.使用三(乙酰氧基乙基)原甲酸酯(ACE原甲酸酯)将2'-羟基区域特异性转化为2'-O-原酸酯。
3.去除5',3'-TIPS保护。
4.使用二苯甲基氧基双-(三甲基甲硅烷基氧基)-氯硅烷(BzH-Cl)引入5'-O-甲硅烷基醚保护基团。
5.用双(N,N’-二异丙基氨基)甲氧基膦将3'-OH磷酸化。
完全受保护的亚磷酸酯化单体是油。为便于处理和溶解，亚磷酰胺溶液在称重的烧瓶中蒸发至干，以便对产量进行定量。然后将亚磷酰胺油溶解在无水乙腈中，以1.0毫摩尔等分试样分配到合成小瓶中，并在氢氧化钾(KOH)和P2O5存在下真空蒸发至干。
寡核糖核苷的合成
表12
| 合成步骤 | 试剂 | 递送时间 | 反应时间 |
| 解嵌段 | 在DCM中的3％DCA | 35 | |
| 活化剂 | 0.5M S-乙基-四唑 | 6 | |
| 偶联 | 0.1M亚酰胺8.0 | 30 | |
| 0.5M S-乙基-四唑 | 8 | 30 | |
| 重复偶联 | |||
| 氧化 | 叔丁基过氧化氢 | 20 | 10 |
| 重复氧化递送 | |||
| 封端 | 1-甲基咪唑和乙酸酐 | 12 | 10 |
| 去甲硅烷基化 | TEAHF | 35 |
5'-甲硅烷基-2'-ACE寡核糖核苷酸的合成从通过3'-羟基连接到聚苯乙烯支持物上的适当修饰的3'-末端核苷开始。然后将包含在适当反应盒中的固体支持物放置在仪器上适当的柱位置上。使用表12中列出的递送时间和等待步骤创建合成循环。
1.初始去三苯甲基化：合成循环的第一步是使用DCM中的3％ DCA从核苷结合的聚苯乙烯支持物去除5’O-DMT。
2.偶联：将5-乙基硫代-1H-四唑溶液递送到固体支持物上，然后同时递送等量的活化剂和亚磷酰胺溶液。根据所需的序列和合成规模，过量的活化剂和活化剂加亚酰胺交替重复递送，以提高偶联效率，每个偶联反应通常超过99％。5-乙基硫代-1H-四唑通过质子化连接到三价磷上的二异丙胺来活化偶联。5-乙基硫代-1H-四唑的亲核攻击导致形成四唑内酯中间体，该中间体与支持物结合的核苷的游离5'-OH反应形成核苷酸间亚磷酸酯连接。
3.氧化：在链延长的下一步中，使用叔丁基氢过氧化物使磷(III)连接氧化10-20秒，形成更稳定且最终所期望的P(V)连接。
4.封端：尽管过量的活化剂和亚磷酰胺的递送提高了偶联效率，但一小部分未反应的核苷可能仍然与支持物结合。为了防止引入混合序列，未反应的5'-OH通过乙酰化伯羟基被“封端”或封闭。这种乙酰化是通过同时递送1-甲基咪唑和乙酸酐来实现的。
5.5'-去甲硅烷基化：在可以将序列中的下一个核苷添加到生长的寡核苷酸链之前，用氟离子去除5'-甲硅烷基团。这需要递送三乙胺三氢氟酸盐45秒。去甲硅烷基化是快速和定量的，不需要等待步骤。
对每个后续核苷酸重复步骤2-5，直到构建所期望的序列。
寡核苷酸去保护
采用两阶段快速去保护策略来去除磷酸主链保护，从固体支持物上释放寡核苷酸，并去除A、G和C上的环外胺保护基团。该处理还去除了乙酰氧基乙基原酸酯中的乙酰基部分，导致2'-双-羟基乙基保护的中间体，其现在对最终酸去保护的不稳定程度提高了10倍。在第一个去保护步骤中，S2Na2用于选择性地去除核苷酸间磷酸的甲基保护，而寡核糖核苷酸与聚苯乙烯支持物附接。这种配置允许在继续之前彻底冲洗掉任何残留的试剂。可替代地，也可以使用多柱歧管方法。
1.注射器筒附接到合成柱上的两个鲁尔接头之一。将2mL S2Na2试剂吸入第二注射器并附接到合成柱的相对侧。S2Na2试剂被轻轻推过柱并进入空注射器筒，继续来回几次。使装满试剂的柱在室温下静置10分钟。
2.从柱中去除S2Na2试剂。使用干净的注射器，用水彻底清洗柱。在第二去保护步骤中，使用在水中的40％1-甲胺将寡核糖核苷酸从固体支持物上释放出来，使环外碱基胺去保护，并使2'-原酸酯去酰化，留下去保护的物质。
N-甲胺去保护
1.将固体支持树脂从柱转移到4mL小瓶中
2.添加2mL 40％甲胺并在60℃加热12分钟。
3.除去甲胺并转移到新的小瓶中。
4.在SpeedVac或类似装置中将寡核苷酸溶液蒸发至干。
使用紫外(UV)分光光度计(260nm处的吸光度)测量寡核苷酸产率。
实例5：具有2'-O-MOE修饰的精氨酸TREM的合成
本实例描述了具有一个2'-O-MOE修饰的Arg TREM的合成。2'-O-MOE修饰可以放置在Arg TREM的任何结构域或接头上的核苷酸上，或位于所述结构域或接头中的任何位置。
在改进的Applied Biosystems 394DNA/RNA合成仪或类似仪器上进行2'-ACE RNA寡核糖核苷酸合成。如实例2合成2'-O-MOE亚酰胺。寡核苷酸序列：按照实例4中描述的方案合成GGCUCCGUGGCGCAAUGGAUAGCGCAUUGGACUUCUAAUUCAAAGGUUCCGGGUUCG(A-MOE)GUCCCGGCGGAGUCG。可以使用类似的方法在TREM(其指定其他19个氨基酸中的任何一个)上添加2'-O-MOE修饰。
实例6：具有假尿苷修饰的谷氨酰胺TREM的合成
本实例描述了具有假尿苷修饰的Gln TREM的合成。修饰可以放置在Gln TREM的任何结构域或接头上的核苷酸上，或位于所述结构域或接头中的任何位置。
在改进的Applied Biosystems 394DNA/RNA合成仪或类似仪器上进行2'-ACE RNA寡核糖核苷酸合成。从Glen Research或类似供应商处获得假尿苷(P)亚酰胺。寡核苷酸序列：
按照实例4中描述的方案合成GGUUCCAUGGUGPAAUGGUAAGCACUCUGGACUCTGAAUCCAGCGAUCCGAGUUCGAGUCUCGGUGGAACCUCCA。
可以使用类似的方法在TREM(其指定其他19个氨基酸中的任何一个)上添加假尿苷修饰。
实例7：经修饰的TREM的HPLC和MS分析
化学修饰的TREM分子可以通过HPLC进行分析，例如，以评估组合物的纯度和均匀性。使用Waters BEH C18柱(2.1mm x 50mm x 1.7μm)的Waters Aquity UPLC系统可用于该分析。可以通过将0.5nmol的TREM溶解在75μL的水中并注射2μL的溶液来制备样品。使用的缓冲液可以是50mM二甲基己基乙酸铵和10％ CH3CN(乙腈)作为缓冲液A和50mM二甲基己基乙酸铵和75％ CH3CN作为缓冲液B(梯度为经5分钟25％-75％缓冲液B)，在60℃下流速0.5mL/min。可在Thermo Ultimate 3000-LTQ-XL质谱仪上获取化学修饰的TREM的ESI-LCMS数据。
下面的表15-22描述了根据实例1中概述的方案合成的一系列单修饰和多修饰的TREM。如本文所述确定每个序列的计算分子量和检测分子量。
实例8：通过阴离子交换HPLC分析经修饰的TREM
本实例描述了通过阴离子交换HPLC对合成的TREM进行质量控制。使用DionexDNA-Pac-PA-100柱，使用HPLC缓冲液A和HPLC缓冲液B采用梯度。将溶解在H2O或Tris缓冲液(pH 7.5)中的0.5ODU样品注入梯度。采用的梯度基于寡核苷酸长度并且可根据表13施用。表14中提供的参数可用于在HPLC分析仪上编程线性梯度。
表13：寡核苷酸长度和梯度百分比
| 长度(碱基) | 梯度(％B) |
| 0-5 | 0-30 |
| 6-10 | 10-40 |
| 11-16 | 20-50 |
| 17-32 | 30-60 |
| 33-50 | 40-70 |
| >50 | 50-80 |
表14：HPLC分析仪上线性梯度的参数
实例9：通过PAGE纯化和分析对TREM的分析
本实例描述了通过PAGE纯化和分析对合成的TREM进行质量控制。2'-ACE保护的RNA的凝胶纯化和分析遵循变性PAGE的标准方案(Ellington和Pollard(1998)In CurrentProtocols in Molecular Biology[在当前的分子生物学方案中],Chanda,V)。简而言之，将2'-ACE保护的寡核苷酸重新悬浮在200mL凝胶加载缓冲液中。InvitrogenTMNuPAGETM4-12％ Bis-Tris凝胶或类似凝胶在凝胶装置中制备。加载样品并在50-120W下运行凝胶，将装置保持在40℃。完成时，将凝胶暴露在254nm的紫外线(UV)下，以使用UV阴影使RNA的纯度可视化。如有必要，用干净的剃须刀片切除所期望的凝胶带。将凝胶切片粉碎，向凝胶颗粒中添加0.3M NaOAc洗脱缓冲液，浸泡过夜。将混合物倾析并通过Sephadex柱如Nap-10或Nap-25过滤。
实例10：合成的TREM的去保护
本实例描述了根据体外合成方法制备的TREM的去保护。使用100mM乙酸，pH 3.8去除2'-保护基团。通过在60℃孵育30分钟，然后冻干或SpeedVac-ing干燥来去除甲酸和乙二醇副产物。在这个最后的去保护步骤之后，寡核苷酸已准备好使用。
实例11.用于读通报告蛋白中的提前终止密码子(PTC)的化学修饰的TREM的表征
本实例描述了测试非同源的化学修饰的TREM在表达具有PTC的报告蛋白的细胞系中读通PTC的能力的测定。本实例描述了化学修饰的精氨酸、丝氨酸和谷氨酰胺非同源TREM(即Arg-TGA、Ser-TAG和Gln-TAA)的分析，尽管指定任何一种其他氨基酸的非同源TREM也可以使用。
根据制造商的说明，可以使用FlpIn系统生成经过工程改造以稳定表达含有提前终止密码子(PTC)的NanoLuc报告构建体的细胞系。根据制造商的说明，使用lipofectamineRNAiMAX(赛默飞世尔科技公司(ThermoFisher Scientific)，USA)通过反转染反应将化学修饰的TREM递送到NanoLuc报告细胞中。简而言之，将5uL 2.5uM的化学修饰的TREM样品溶液稀释在20uL RNAiMAX/OptiMEM混合物中。在室温温和混合30分钟后，将25uL TREM/转染混合物添加到96孔板中，静置20-30分钟，然后添加细胞。收获NanoLuc报告细胞并在完全生长培养基中稀释至4×105细胞/mL，然后将100uL稀释的细胞悬浮液添加到含有TREM的板中并混合。24小时后，将100uL完全生长培养基添加到96孔板中以保持细胞健康。
为了监测化学修饰的TREM在TREM递送到细胞中后48小时读通报告构建体中的PTC的功效，可以根据制造商的说明进行NanoGlo生物发光测定(普洛麦格公司(Promega)，USA)。简而言之，更换细胞培养基并使其平衡至室温。通过将缓冲液与底物以50:1的比例混合来制备NanoGlo试剂。将50uL混合的NanoGlo试剂添加到96孔板中，并在振荡器上以600rpm混合10分钟。2分钟后，将板以1000g离心，然后在室温孵育5分钟，然后测量样品生物发光。作为阳性对照，使用表达无PTC的NanoLuc报道构建体的宿主细胞。作为阴性对照，使用表达带PTC的NanoLuc报告构建体的宿主细胞，但不转染TREM。以实验样品中的NanoLuc发光与阳性对照的NanoLuc发光的比率或实验样品中的NanoLuc发光与阴性对照的NanoLuc发光的比率来测量化学修饰的TREM的功效。预计如果样品TREM是功能性的，它可能能够读通NanoLuc报告基因中的终止突变，并产生比阴性对照中测量的发光读数更高的发光读数。如果样品TREM没有功能，终止突变不会被挽救，并且检测到小于或等于阴性对照的发光。
化学修饰类型和位置的影响在单修饰和多修饰的TREM序列中进行评估，如下表15-22中所述。表15-19描述了示例性化学修饰的TREM-Arg-TGA序列的活性，其中2'-OMe(表15)、2'-F(表16)、2'-MOE(表17)、2'-脱氧(表18)和PS(表19)修饰是在TREM序列中的每个位置。还在每个位置用2'-OMe修饰修饰了另外的TREM序列，即Ser-TAG(表20)和Gln-TAA(表21)。此外，根据实例1和9选择多修饰的TREM序列并如本文所述进行测试；这些数据汇总在表22中。在这些表中，序列注释如下：r：核糖核苷酸；m：2'-OMe；*：PS连接；f：2'-氟；moe：2'-moe；d：脱氧核糖核苷酸；5MeC：5-甲基胞嘧啶。因此，例如，mA代表2'-O-甲基腺苷，moe5MeC代表带有5-甲基胞嘧啶核碱基的2'-MOE核苷酸，dA代表腺苷脱氧核糖核苷酸。
此外，在这些表中，活性筛选的结果报告为与适当的未修饰的TREM相比的log2倍数变化，其中“1”表示小于-0.05log2倍数变化；“2”表示大于或等于-0.05且小于0.55log2倍数变化；并且“3”表示大于或等于0.55log2倍数变化。所有单修饰的TREM-Arg-TGA筛选的结果在图1中进行了比较。结果表明，某些修饰在许多位置是可耐受的，但特定位点对修饰敏感或在修饰时表现出改善的活性。例如，2'-OMe和2'-MOE在Arg-TGA序列中的位置33处都不能耐受，但2'-F和2'-脱氧(DNA)改善了位置33处的活性。在位置1和73处2'OMe特别有活性。2'-脱氧(DNA)在位置31处也良好耐受。当在位置35和36之间、在37和38之间、在38和39之间、在54和55之间以及在位置55和56之间并入时，PS修饰改善活性。
表15：2'OMe修饰的TREM(TREM-Arg-TGA)和相关数据
表16：2'F修饰的TREM(TREM-Arg-TGA)和相关数据
表17：2'MOE修饰的TREM(TREM-Arg-TGA)和相关数据
表18：2'-脱氧的TREM(TREM-Arg-TGA)和相关数据
表19：硫代磷酸酯修饰的TREM(TREM-Arg-TGA)和相关数据
表20：2'OMe修饰的TREM(TREM-Ser-TAG)和相关数据
表21：2'OMe修饰的TREM(TREM-Gln-TAA)和相关数据
表22：另外的经修饰的TREM(TREM-Arg-TGA)和相关数据
实例12：施用TREM校正ORF中的错义突变
本实例描述了施用TREM来纠正错义突变。在本实例中，TREM通过在蛋白质中掺入野生型(WT)氨基酸(在错义位置)将具有错义突变的报告基因翻译成WT蛋白质。
宿主细胞修饰
根据制造商的说明，使用FlpIn系统生成稳定表达含有错义突变(例如T203I或E222G)(它们防止在470nm和390nm波长处的GFP激发)的GFP报告构建体的细胞系。简而言之，使用Lipofectamine2000根据制造商的说明将HEK293T(293T
CRL-3216)细胞用含有具有错义突变的GFP报告基因的表达载体(例如pcDNA5/FRT-NanoLuc-TAA和pOG44Flp-重组酶表达载体)共转染。24小时后，用新鲜培养基更换培养基。第二天，将细胞以1:2的比例拆分，用100ug/mL潮霉素筛选5天。剩余的细胞被扩增并测试报告构建体表达。
TREM的合成与制备
TREM如实例1中所述合成，并执行如实例7-9中所述的质量控制方法。为确保正确折叠，TREM在85℃下加热2分钟，然后在4℃下快速冷却5分钟。
非同源TREM转染宿主细胞
为了将TREM递送至哺乳动物细胞，根据制造商的说明，使用lipofectamine 2000试剂将100nM的TREM转染到表达具有错义突变的ORF的细胞中。6-18小时后，去除转染培养基并更换为新鲜的完全培养基。
错义突变校正测定
为了监测TREM校正报告构建体中错义突变的功效，在TREM转染后24-48小时，更换细胞培养基并测量细胞荧光。作为阴性对照，细胞中没有转染TREM，作为阳性对照，表达WTGFP的细胞用于该测定。如果TREM是有功能的，则预期GFP蛋白在使用荧光计以390nm激发波长照射时会产生荧光，如在阳性对照中观察到的那样。如果TREM没有功能，则GFP蛋白仅在用470nm波长激发时才会产生荧光，如在阴性对照中所观察到的。
实例13：施用TREM评估含SMC的ORF的蛋白质表达水平
本实例描述了施用TREM以改变含有SMC的ORF的表达水平。
为了产生用于研究TREM施用对含有SMC的蛋白质(在本实例中，来自编码脂联素的PNPL3A基因)的蛋白质表达水平的影响的系统，将含有PNPL3A rs738408ORF序列的质粒转染到正常人肝细胞的细胞系THLE-3中，该细胞系由CRISPR/Cas编辑以在PNPLA3的编码外显子中含有移码突变以敲除内源PNPLA3(THLE-3_PNPLA3KO细胞)。作为对照，用含有野生型PNPL3A ORF序列的质粒转染THLE-3_PNPLA3KO细胞的等分试样。
TREM的合成与制备
精氨酸TREM如实例1中所述合成，并执行如实例7-9中所述的质量控制方法。为确保正确折叠，TREM在85℃下加热2分钟，然后在4℃下快速冷却5分钟。
含SMC的ORF的蛋白质水平的评估
将TREM递送至含有rs738408ORF序列的THLE-3_PNPLA3KO细胞中以及含有野生型PNPL3A ORF序列的THLE-3_PNPLA3KO细胞中。在本实例中，TREM含有具有AGG反密码子的脯氨酸同工受体，该AGG反密码子与CCT密码子碱基配对，即该TREM的序列为GGCUCGUUGGUCUAGGGGUAUGAUUCUCGCUUAGGGUGCGAGAGGUCCCGGGUUCAAAUCCCGGACGAGCCC。执行30分钟至6小时范围内的时程，其中包含长度为一个小时的间隔时间点。在各时间点，将细胞胰蛋白酶化、洗涤并裂解。通过Western印迹分析来分析细胞裂解物，并用针对脂联素蛋白的抗体探测印迹。还探测了总蛋白装载对照，诸如GAPDH、肌动蛋白或微管蛋白，作为装载对照。
本实例中描述的方法可以用于评价脂联素蛋白在含有rs738408ORF的细胞中的表达水平。
实例14：施用TREM调节含SMC的ORF的蛋白质翻译速率
本实例描述了施用TREM以改变含有SMC的ORF的蛋白质翻译速率。
为了监测TREM添加对翻译延伸速率的影响，使用一种体外翻译系统，在本实例中是来自普洛麦格公司(Promega)的RRL系统，其中报告基因(在本实例中是GFP)的荧光随时间的变化是翻译速率的替代指标。
TREM的合成与制备
精氨酸TREM如实例1中所述合成，并执行如实例7-9中所述的质量控制方法。为确保正确折叠，TREM在85℃下加热2分钟，然后在4℃下快速冷却5分钟。
含SMC的ORF的蛋白质翻译速率的评估
首先，产生了使用反义寡核苷酸耗尽内源tRNA的兔网织红细胞裂解物，该反义寡核苷酸靶向反密码子和可变环之间的序列(参见，例如，Cui等人,2018.Nucleic Acids Res[核酸研究].46(12):6387-6400)。在本实例中，除0.1-0.5ug/uL编码通过接头与GFP ORF融合的野生型TERT ORF的mRNA或编码通过接头与GFP ORF融合的rs2736098TERT ORF的mRNA之外，将TREM添加到体外翻译测定裂解物中，该TREM包含含有UGC反密码子的丙氨酸同工受体，该UGC反密码子与GCA密码子碱基配对，即该TREM的序列为GGGGAUGUAGCUCAGUGGUAGAGCGCAUGCUUUGCAUGUAUGAGGUCCCGGGUUCGAUCCCCGGCAUCUCCA。通过在37℃下使用λex485/λem528的酶标仪上的荧光增加监测GFP mRNA翻译的进程，其中数据点在1小时内每30秒收集一次。绘制荧光随时间的变化量以确定与添加和不添加TREM的rs2736098ORF相比野生型ORF的翻译延伸速率。本实例中描述的方法可以用于评价rs2736098ORF和野生型ORF在存在或不存在TREM的情况下的翻译速率。
Claims (24)
1.一种TREM，其包含式A的序列：
[L1]-[ASt结构域1]-[L2]-[DH结构域]-[L3]-[ACH结构域]-[VL结构域]-[TH结构域]-[L4]-[ASt结构域2]，其中：
独立地，[L1]和[VL结构域]是任选的；
[L1]、[ASt结构域1]、[L2]-[DH结构域]、[L3]、[ACH结构域]、[VL结构域]、[TH结构域]、[L4]和[ASt结构域2]中之一包含具有非天然存在的修饰的核苷酸，并且
该非天然存在的修饰存在于核苷酸(例如，经修饰的核苷酸)上与例如本文所述的表15-22的任一行中的经修饰的位置对应的位置处。
2.如权利要求1所述的TREM，其中该非天然存在的修饰存在于核苷酸糖的2'-位置上或核苷酸间区域内(例如，主链修饰)。
3.如权利要求2所述的TREM，其中该非天然存在的修饰选自2-O-甲基(2-OMe)、2'-卤代(例如2'F或2'Cl)、2'-O-甲氧基乙基(2'MOE)、或2'脱氧修饰。
4.如权利要求3所述的TREM，其中该非天然存在的修饰是2'OMe修饰。
5.如权利要求3所述的TREM，其中该非天然存在的修饰是2'卤代(例如，2'F或2'Cl)修饰。
6.如权利要求3所述的TREM，其中该非天然存在的修饰是2'MOE修饰。
7.如权利要求3所述的TREM，其中该非天然存在的修饰是2'-脱氧修饰。
8.如权利要求2所述的TREM，其中该非天然存在的修饰存在于该核苷酸间区域中(例如，主链修饰)。
9.如权利要求8所述的TREM，其中该非天然存在的修饰是硫代磷酸酯修饰。
10.如权利要求2所述的TREM，其中该非天然存在的修饰存在于SEQ ID NO:622的核苷酸1-76、SEQ ID NO:993的核苷酸1-85或SEQ ID NO:1079的核苷酸1-75的任一个上或内。
11.如权利要求2所述的TREM，其中该非天然存在的修饰存在于SEQ ID NO:622的核苷酸1-76的任一个上或内。
12.如权利要求10所述的TREM，其中该非天然存在的修饰存在于[ASt结构域1]或[ASt结构域2]中的核苷酸上或内。
13.如权利要求10所述的TREM，其中该非天然存在的修饰存在于[DH结构域]、[ACH结构域]、[VL结构域]或[TH结构域]中的核苷酸上或内。
14.如权利要求10所述的TREM，其中该非天然存在的修饰存在于接头结构域(例如，[L1]、[L2]、[L3]或[L4])内。
15.如权利要求1所述的TREM，其中该非天然存在的修饰存在于SEQ ID NO:622的核苷酸1、2、4、6、10、12、13、17、18、20、22、29、30、42、43、45、50、52、56、59、61、65、66、68、69、71、72和73的任一个上或内。
16.如权利要求1所述的TREM，其中该非天然存在的修饰存在于SEQ ID NO:622的核苷酸20、29、33、40、41、44、45、48、49、50、52、53、54、56、59、61、62、63、65、67、68、69、71、72、75和76的任一个上或内。
17.如权利要求1所述的TREM，其中该非天然存在的修饰存在于SEQ ID NO:622的核苷酸1、4、14、15、16、17、20、29、44、45、47、49、50、52、54、56、57、59、65、72和73的任一个上或内。
18.如权利要求1所述的TREM，其中该非天然存在的修饰存在于SEQ ID NO:622的核苷酸3、4、5、6、14、15、16、20、22、23、33、54、59、62、63、72和76的任一个上或内。
19.如权利要求1所述的TREM，其中该非天然存在的修饰存在于SEQ ID NO:622的核苷酸1、2、3、9、14、15、16、17、18、19、20、21、35、37、38、44、45、46、52、54、55、56、57、58、73和74的任一个上或内。
20.如权利要求1所述的TREM，其中该非天然存在的修饰存在于SEQ ID NO:622的核苷酸1、17、18、20、29、30、50、52和73的任一个上或内。
21.一种药物组合物，其包含如权利要求1所述的TREM。
22.如权利要求21所述的药物组合物，其进一步包含药学上可接受的组分，例如赋形剂。
23.一种脂质纳米颗粒配制品，其包含如权利要求1所述的TREM。
24.一种脂质纳米颗粒配制品，其包含如权利要求21所述的药物组合物。
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US202063009669P | 2020-04-14 | 2020-04-14 | |
| US63/009,669 | 2020-04-14 | ||
| PCT/US2021/027357 WO2021211762A2 (en) | 2020-04-14 | 2021-04-14 | Trem compositions and uses thereof |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CN115516090A true CN115516090A (zh) | 2022-12-23 |
Family
ID=78084504
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CN202180028801.7A Pending CN115516090A (zh) | 2020-04-14 | 2021-04-14 | Trem组合物及其用途 |
Country Status (12)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US20230054178A1 (zh) |
| EP (1) | EP4136230A2 (zh) |
| JP (1) | JP2023521832A (zh) |
| KR (1) | KR20230026992A (zh) |
| CN (1) | CN115516090A (zh) |
| AU (1) | AU2021255583A1 (zh) |
| BR (1) | BR112022020780A2 (zh) |
| CA (1) | CA3179869A1 (zh) |
| IL (1) | IL297243A (zh) |
| MX (1) | MX2022012955A (zh) |
| TW (1) | TW202204620A (zh) |
| WO (1) | WO2021211762A2 (zh) |
Families Citing this family (5)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CA3235264A1 (en) * | 2021-10-13 | 2023-04-20 | Flagship Pioneering Innovations Vi, Llc | Trem compositions and methods of use |
| EP4202045A1 (en) * | 2021-12-22 | 2023-06-28 | Universität Hamburg | Synthetic transfer rna with modified nucleotides |
| WO2023141261A1 (en) * | 2022-01-21 | 2023-07-27 | Hc Bioscience, Inc. | Modified transfer rna with improved activity |
| WO2023220083A1 (en) * | 2022-05-09 | 2023-11-16 | Flagship Pioneering Innovations Vi, Llc | Trem compositions and methods of use for treating proliferative disorders |
| WO2023250112A1 (en) * | 2022-06-22 | 2023-12-28 | Flagship Pioneering Innovations Vi, Llc | Compositions of modified trems and uses thereof |
Family Cites Families (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US9676810B2 (en) * | 2010-07-08 | 2017-06-13 | The Brigham And Women's Hospital, Inc. | Neuroprotective molecules and methods of treating neurological disorders and inducing stress granules |
| US10337065B2 (en) * | 2016-04-13 | 2019-07-02 | The Rockefeller University | tRNA quantification |
| MX2020004647A (es) * | 2017-11-02 | 2021-03-25 | Wistar Inst | Métodos de rescate de codones de detención por medio de reasignación genética con arn de transferencia editado anti-codones (ace-trna). |
| EP3911745A1 (en) * | 2019-01-18 | 2021-11-24 | Flagship Pioneering, Inc. | Trem compositions and uses thereof |
-
2021
- 2021-04-14 KR KR1020227039710A patent/KR20230026992A/ko active Search and Examination
- 2021-04-14 JP JP2022562314A patent/JP2023521832A/ja active Pending
- 2021-04-14 CN CN202180028801.7A patent/CN115516090A/zh active Pending
- 2021-04-14 IL IL297243A patent/IL297243A/en unknown
- 2021-04-14 CA CA3179869A patent/CA3179869A1/en active Pending
- 2021-04-14 MX MX2022012955A patent/MX2022012955A/es unknown
- 2021-04-14 TW TW110113465A patent/TW202204620A/zh unknown
- 2021-04-14 EP EP21789129.0A patent/EP4136230A2/en active Pending
- 2021-04-14 BR BR112022020780A patent/BR112022020780A2/pt unknown
- 2021-04-14 WO PCT/US2021/027357 patent/WO2021211762A2/en unknown
- 2021-04-14 AU AU2021255583A patent/AU2021255583A1/en active Pending
- 2021-11-04 US US17/519,120 patent/US20230054178A1/en active Pending
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| KR20230026992A (ko) | 2023-02-27 |
| EP4136230A2 (en) | 2023-02-22 |
| WO2021211762A3 (en) | 2021-11-18 |
| TW202204620A (zh) | 2022-02-01 |
| WO2021211762A2 (en) | 2021-10-21 |
| AU2021255583A1 (en) | 2022-11-10 |
| US20230054178A1 (en) | 2023-02-23 |
| IL297243A (en) | 2022-12-01 |
| JP2023521832A (ja) | 2023-05-25 |
| CA3179869A1 (en) | 2021-10-21 |
| BR112022020780A2 (pt) | 2022-11-29 |
| MX2022012955A (es) | 2023-02-23 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| CN115516090A (zh) | Trem组合物及其用途 | |
| CN107208095B (zh) | 用于使乙型肝炎病毒基因表达沉默的组合物和方法 | |
| JP4764426B2 (ja) | カチオン性脂質および使用方法 | |
| US7915399B2 (en) | Modified siRNA molecules and uses thereof | |
| US20060051405A1 (en) | Compositions for the delivery of therapeutic agents and uses thereof | |
| CN116018405A (zh) | Trem组合物及其相关方法 | |
| AU710170B2 (en) | Cationic virosomes as transfer system for genetic material | |
| KR20230135585A (ko) | 변형된 trem의 조성물 및 이의 용도 | |
| WO2023064513A2 (en) | Trem compositions and methods of use | |
| EP4158032A2 (en) | Trem compositions and methods relating thereto | |
| CN117083383A (zh) | 经修饰的trem的组合物及其用途 | |
| WO2023024230A1 (zh) | 一种含有C/EBPα-saRNA的组合物 | |
| WO2023225471A2 (en) | Helitron compositions and methods | |
| WO2023220083A1 (en) | Trem compositions and methods of use for treating proliferative disorders | |
| WO2023250112A1 (en) | Compositions of modified trems and uses thereof | |
| EP4377457A1 (en) | Trem compositions and uses thereof | |
| CN116916904A (zh) | 用于基因编辑的脂质制剂 | |
| AU2013202932A1 (en) | Novel lipid formulations for nucleic acid delivery |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| PB01 | Publication | ||
| PB01 | Publication | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination |