CN115297860A - 新型n-芳基草氨酸 - Google Patents

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Abstract

本公开内容涉及基于新型N‑芳基草氨酸的结核分枝杆菌蛋白酪氨酸磷酸酶B(mPTPB)抑制剂,并涉及制备和使用基于新型N‑芳基草氨酸的抑制剂的方法。更具体地,在本公开内容中提供的化合物可以被用于抑制结核分枝杆菌蛋白酪氨酸磷酸酶B(mPTPB)和治疗具有结核病的患者。

Description

新型N-芳基草氨酸
政府权利
本发明在美国国立卫生研究院(NIH)授予的授予号RO1 CA207288下于政府支持下完成。美国政府对本发明享有一定权利。
技术领域
本公开内容涉及基于新型N-芳基草氨酸的结核分枝杆菌(mycobacteriumtuberculosis)蛋白酪氨酸磷酸酶B (mPTPB)抑制剂,并涉及制备和使用基于新型N-芳基草氨酸的抑制剂的方法。
背景
本节介绍了可有助于促进对本公开内容的更好理解的方面。因此,这些陈述应当从这个角度来阅读,而不应被理解为承认什么是或不是现有技术。
蛋白酪氨酸磷酸酶(PTP)抗衡蛋白酪氨酸激酶(PTK)的活性,并因此,这两个酶家族在决定细胞内蛋白酪氨酸磷酸化的状态中具有核心作用。蛋白的磷酸化可以改变其酶活性、亚细胞定位、大分子相互作用、稳定性,并最终控制正常的细胞稳态和疾病过程。PTP的调节异常与多种疾病相关,并且PTP家族的许多成员已经被认为是潜在的治疗靶标。PTP的有效且选择性的抑制剂对于探究PTP的生物学功能至关重要,并且它们可最终被开发为治疗几种病理性人类病症(包括癌症、自身免疫障碍和感染性疾病)的有价值的治疗剂。
结核病(TB)是由被称作结核分枝杆菌(Mtb)的细菌造成的传染性疾病,是全球人类死亡的十大原因之一。在2017年,估计有1000万人患有TB,和160万人死于TB(包括30万患有HIV相关TB的人)。还估计,世界人口的大约四分之一患有潜伏性TB(人们已经感染了TB,但(尚)未患病)。TB治疗的主要障碍是抗生素抗性;由于患者在漫长而复杂的治疗过程中缺乏服从性。多药抗性(MDR)和广泛药物抗性(XDR) TB的快速出现要求开发具有新型分子靶标和作用机制的新治疗剂。抗毒力策略目前正在成为替代治疗方案,以对抗包括TB在内的多种微生物感染的抗生素抗性。结核分枝杆菌蛋白酪氨酸磷酸酶B (mPTPB)是分泌到宿主巨噬细胞中的毒力因子。mPTPB对于动物模型巨噬细胞内Mtb的存活和感染的持续性至关重要。mPTPB的缺失对病原体本身的生长没有影响,但降低了感染的巨噬细胞中Mtb的细胞内存活率,并降低了TB感染的豚鼠模型中的细菌负荷。一旦进入宿主细胞,mPTPB通过阻断ERK1/2和p38激酶介导的细胞因子产生以及通过Akt途径促进细胞存活来破坏先天性免疫应答。用小分子抑制剂抑制mPTPB可以逆转细菌磷酸酶诱导的宿主免疫应答改变,并损害人巨噬细胞中MDR-TB的存活,以及降低豚鼠模型中的感染负担。mPTPB的选择性抑制也增加了一线抗生素利福平和异烟肼的细胞内杀伤效果,表明它们对于联合疗法的适合性。这些结果为mPTPB的特异性抑制剂可以充当有效的抗-TB剂的想法提供了重要的概念证明。靶向毒性mPTPB有望特异性破坏病原体-宿主相互作用,而不对细菌生长产生不利影响,因此对抗药性施加的选择压力更小。更重要的是,人类直向同源物的缺乏(对宿主的最小副作用)使得mPTPB成为用于TB特异性治疗的有吸引力的药物靶标。此外,mPTPB抑制剂在宿主巨噬细胞胞质溶胶内起作用,并且在机制上不与现有抗-TB剂重叠;它们可以补充/协同6至9个月的长期标准TB治疗。最后,由于mPTPB在细菌外部起作用,因此mPTPB抑制剂不需要穿过厚的疏水且蜡质的分枝杆菌细胞壁,这对传统抗细菌剂的有效递送提出了重大挑战。
具有最佳效能、选择性和药理学特性的PTP抑制剂的设计和合成仍然是一项具有挑战性的工作,主要是由于PTP活性位点高度保守和荷正电的性质。
概述
本公开内容涉及基于新型N-芳基草氨酸的结核分枝杆菌蛋白酪氨酸磷酸酶B(mPTPB)抑制剂,并涉及制备和使用基于新型N-芳基草氨酸的抑制剂的方法。
在一个实施方案中,本公开内容提供了式I的化合物:
Figure 727703DEST_PATH_IMAGE001
或其立体异构体、互变异构体、溶剂化物、药学上可接受的盐,其中:
(R1)n代表1-3个连接至苯环的独立的R1,其中n是1-3,其中所述1-3个R1中的每个都独立地代表H、F、Cl、Br、I、-CN、-OR2、-COOR3、-NR4R5、-CO-R6、-SO2NR7R8、任选取代的C1-C8分支或未分支的烷基链、任选取代的C3-C8环烷基、任选取代的芳基或任选取代的包含一个或多个O、N或S的杂芳基,或当n是2时,两个独立的R1可以连接在一起以与苯环形成稠合二环;且
R2 - R8各自独立地代表H、任选取代的C1-C8分支或未分支的烷基链、任选取代的C3-C8环烷基、任选取代的芳基或任选取代的包含一个或多个O、N或S的杂芳基或氮保护基。
详细描述
为了促进对本公开内容原理的理解的目的,现在将参考在附图中所示的实施方案,并且将使用特定语言来描述它们。尽管如此,应当理解,并不预期由此限制本公开内容的范围。
在本公开内容中,术语“约”可以允许值或范围的一定程度的变化性,例如在规定值或规定范围限度的10%内、5%内或1%内。
在本公开内容中,术语“实质上”可以允许值或范围的一定程度的变化性,例如在规定值或规定范围限度的90%以内、95%以内或99%以内。
如本文使用的,术语“取代”是指其中包含在当中的一个或多个氢原子被一个或多个非氢原子替代的官能团。如本文使用的,术语“官能团”或“取代基”是指可以被或被取代到分子上的基团。取代基或官能团的实例包括但不限于卤素(例如F、Cl、Br和I);诸如羟基基团、烷氧基基团、芳氧基基团、芳烷氧基基团、氧代(羰基)基团、羧基基团(包括羧酸、羧酸盐和羧酸酯)等基团中的氧原子;诸如硫醇基团、烷基和芳基硫化物基团、亚砜基团、砜基团、磺酰基基团和磺酰胺基团等基团中的硫原子;诸如胺、叠氮化物、羟胺、氰基、硝基基团、N-氧化物、酰肼和烯胺等基团中的氮原子;以及各种其它基团中的其它杂原子。
可以键合至取代的碳(或其它的诸如氮)原子的取代基的非限制性实例包括F、Cl、Br、I、OR、OC(O)N(R)2、CN、NO、NO2、ONO2、叠氮基、CF3、OCF3、R、O (氧代)、S (硫羰)、C(O)、S(O)、亚甲基二氧基、亚乙基二氧基、N(R)2、SR、SOR、SO2R、SO2N(R)2、SO3R、(CH2)0-2P(O)OR2、C(O)R、C(O)C(O)R、C(O)CH2C(O)R、C(S)R、C(O)OR、OC(O)R、C(O)N(R)2、OC(O)N(R)2、C(S)N(R)2、(CH2)0-2N(R)C(O)R、(CH2)0-2N(R)C(O)OR、(CH2)0-2N(R)N(R)2、N(R)N(R)C(O)R、N(R)N(R)C(O)OR、N(R)N(R)CON(R)2、N(R)SO2R、N(R)SO2N(R)2、N(R)C(O)OR、N(R)C(O)R、N(R)C(S)R、N(R)C(O)N(R)2、N(R)C(S)N(R)2、N(COR)COR、N(OR)R、C(=NH)N(R)2、C(O)N(OR)R或C(=NOR)R,其中R可以是氢或碳基部分,且其中所述碳基部分本身可以进一步被取代;例如,其中R可以是氢、烷基、酰基、环烷基、芳基、芳烷基、杂环基、杂芳基或杂芳基烷基,其中任何烷基、酰基、环烷基、芳基、芳烷基、杂环基、杂芳基或杂芳基烷基或R可以是独立地单取代或多取代的;或其中键合至一个氮原子或邻近氮原子的两个R基团可以与所述一个或多个氮原子一起形成杂环基,其可以是单取代的或独立地多取代的。
如本文使用的,术语“芳基”表示环中不含有杂原子的取代或未取代的环状芳烃。因此,芳基基团包括但不限于苯基、薁基、庚搭烯基、联苯基、引达省基(indacenyl)、芴基、菲基、三亚苯基、芘基、并四苯基、䓛基、亚联苯基、蒽基和萘基基团。在一些实施方案中,芳基基团在基团的环部分中含有约6至约14个碳(C6-C14)或6-10个碳原子(C6-C10)。芳基基团可以是未取代或取代的,如本文所定义的。代表性的取代芳基可以是单取代的或多于一次取代的,例如但不限于2-、3-、4-、5-或6-取代的苯基或2-8取代的萘基,其可以被诸如本文列出的那些碳或非碳基团所取代。
“杂芳基”代表包含至少一个诸如N、S、O或Se的杂原子的芳族环。本公开内容中的杂芳基可以是任何杂芳基。本公开内容中的杂芳基可以是但不限于吡咯烷基、氮杂环丁基、哌啶基(piperidynyl)、哌嗪基、吗啉基、色满基、吲哚啉酮基、异吲哚啉酮基、呋喃基、吡咯烷基、吡啶基、吡嗪基、嘧啶基、三嗪基、噻吩基、四氢呋喃基、吡咯基、噁唑基、噁二唑基、咪唑基、三唑基(triazyolyl)、四唑基、苯并噁唑啉基、苯并噻唑啉基、苯并咪唑啉基基团或其任意组合。
如本文使用的,术语“卤”、“卤素”或“卤化物”基团本身或作为另一个取代基的部分,除非另有说明,否则意指氟、氯、溴或碘原子。本文所述化合物可以含有一个或多个手性中心,或可以在其它方面能够作为多个立体异构体存在。应当理解,在一个实施方案中,本文描述的发明不限于任何特定立体化学要求,并且化合物以及包括它们的组合物、方法、用途和药物可以是光学纯的,或者可以是多种立体异构的混合物中的任何一种,包括对映异构体的外消旋混合物和其它混合物、非对映异构体的其它混合物等。还应当理解,立体异构体的此类混合物可以包括在一个或多个手性中心处的单一立体化学构型,同时包括在一个或多个其它手性中心处的立体化学构型的混合物。
类似地,本文所述化合物可以包括几何中心,诸如顺式、反式、E和Z双键。应当理解,在另一个实施方案中,本文描述的发明不限于任何特定几何异构体要求,并且化合物以及包括它们的组合物、方法、用途和药物可以是纯的,或者可以是多种几何异构体混合物中的任何一种。还应当理解,几何异构体的此类混合物可以包括在一个或多个双键处的单一构型,同时包括在一个或多个其它双键处的几何形状的混合物。
所本文使用的,术语“任选取代的”或“任选取代基”意指目标基团是未取代的或被一个或多个指定取代基取代。当目标基团被超过一个取代基取代时,所述取代基可以相同或不同。当使用术语“独立地”、“独立地是”和“独立地选自”时,意指目标基团可以相同或不同。本文定义的某些术语可以在结构中出现超过一次,且在这样的出现后,每个术语应彼此独立地进行定义。
具有最佳效能、选择性和药理学特性的PTP抑制剂的设计和合成仍然是一项具有挑战性的工作,主要是由于PTP活性位点高度保守和荷正电的性质。为了能够与荷正电的活性位点口袋接合,已报道许多含有荷负电官能团的化合物,诸如羧酸、水杨酸、氨基磺酸、α-磺苯基乙酰胺(SPAA)和2-草氨基苯甲酸(OBA),作为用于抑制PTP家族的各种成员的不可水解的磷酸酪氨酸(pTyr)模拟物。报道了OBA为蛋白-酪氨酸磷酸酶1B (PTP1B)的竞争性可逆抑制剂,并且还描述了这种化学类型的共晶结构(方案1)。通过基于结构的设计进一步优化OBA以产生几种高效PTP1B抑制剂,诸如化合物II、III和IV (方案1)。尽管有效(K i值在nM范围内),但这些化合物的高极性表面积(PSA)、分子量和电荷使进一步优化变得困难。使用高通量X-射线晶体学技术将化合物V鉴定为PTP1B抑制剂。该化合物表现出针对PTP1B的86 μM的IC 50,并且作者没有报道V的选择性研究或进一步修饰。报道了化合物(草氨基亚甲基)-噻吩磺酰胺(OMTS, VI)为mPTPB的竞争性抑制剂。化合物VI显示出440±50 nM的IC 50,以及相对于六种人类PTP为60倍以上的对mPTPB的选择性,尽管未提供VI的细胞活性数据。
Figure 644844DEST_PATH_IMAGE003
方案1: 以前报道的用于PTP抑制的基于草氨酸的pTyr模拟物
在本公开内容中,预见到选择性且细胞可渗透的PTP活性位点定向的抑制剂应当具有较小的分子量(< 400 Da)和不超过一个负电荷。为此目的,荷单个电荷的N-芳基草氨酸衍生物已经被设计为用于mPTPB的活性位点定向的抑制的pTyr模拟物。该研究导致用于mPTPB抑制的几种高效且选择性的N-芳基草氨酸类似物的开发。在它们中,抑制剂4t表现出对mPTPB的2.7 nM的K i和相对于一组25种哺乳动物PTP超过4,500倍的选择性。重要的是,此处报告的抑制剂显示出分子量< 400 Da、logD7.4< 2.5、配体效率(LE) > 0.43以及良好的水溶解度和微粒体稳定性。另外,所述抑制剂有效地阻断小鼠巨噬细胞中mPTPB介导的信号传递,这进一步验证了可以开发小分子mPTPB抑制剂来治疗结核病的概念。该工作进一步证实,获得活性位点定向的、极性但可渗透细胞的PTP抑制剂是可行的。
mPTPB抑制剂的设计和合成.
为了鉴定用于mPTPB的最佳的基于N-芳基草氨酸的pTyr模拟物,首先制备了含有苯基、联苯基、苯基乙炔基、炔基苯基和喹啉的草氨酸(表1)。
表1. 各种草氨酸衍生物针对mPTPB、PTP1B和SHP2的IC50
Figure 424581DEST_PATH_IMAGE004
通过在N,N-二异丙基乙胺/四氢呋喃反应中对应的芳基胺和氯氧代乙酸甲酯之间的反应,随后使用1N KOH/THF (1:1 v/v)溶液进行轻度水解,来制备化合物1-8。
合成其它的基于二环(萘基、苯并噁唑和苯并噻唑)的草氨酸的努力导致具有差溶解度概况的化合物,可能是由于较高程度的分子平面性。在针对mPTPB、PTP1B和SHP2磷酸酶的对硝基苯基磷酸酯(pNPP)测定中测量了1-8的半数抑制浓度值(IC 50)。在表1中所示的化合物中,与联苯基、烷基或二环类似物(2、3、6、7和8)相比,含有苯基乙炔基的类似物(4和5)表现出对mPTPB优异的抑制和选择性。重要的是,对位衍生物4表现出是间位衍生物5的2倍的更高效能,且在化合物6和7的情况下观察到类似的趋势。这些结果提示,对于mPTPB抑制,相较于间位取代,优选对位取代。结果,制备了化合物4的几种类似物以进一步改善其针对mPTPB的活性。取决于起始材料(芳基卤和芳基炔烃)的商业可得性,使用两种不同的合成策略来制备4的类似物。在第一种策略中,在N,N-二异丙基乙胺/四氢呋喃反应中用氯氧代乙酸甲酯处理4-乙炔基或3-乙炔基苯胺以产生对应的草氨酸酯。随后,将草氨酸酯使用Pd(PPh3)Cl2、CuI、Na2CO3和二甲基甲酰胺(DMF)在Sonogashira偶联反应中用各种芳基卤处理,以良好产率提供草氨酸苯基乙炔酯。使用1N KOH/THF对这些酯的轻度水解以优秀产率提供了最终的化合物(方案2A)。在第二种策略中,在N,N-二异丙基乙胺/四氢呋喃反应中用氯氧代乙酸甲酯处理4-碘苯胺以产生2-((4-碘苯基)氨基)-2-氧代乙酸甲酯(方案1B)。进行酯与炔烃的Sonogashira偶联反应,随后轻度水解,以优秀产率提供最终化合物。
Figure 819790DEST_PATH_IMAGE005
方案2. 用于合成mPTPB抑制剂的策略。A) 从乙炔基苯胺合成苯基乙炔基草氨酸。B) 从4-碘苯胺合成苯基乙炔基草氨酸。
首先在4的远侧苯环上引入几种在大小和极性方面不同的取代基,以改善与mPTPB活性位点残基的结合相互作用。如表2中所示,诸如COOMe、OH、NMe2等取代基(4a至4d)的引入提供了具有与母体化合物4相比改善超过10倍的结合亲和力的抑制剂。与单取代的类似物相比,双-和三-取代的化合物针对mPTPB表现出相似或更小的活性。重要的是,与中性官能团相比,诸如COOH等荷负电的官能团(4f和4g)对mPTPB结合表现出有害作用。在草酰胺基团间位具有芳基炔烃取代的化合物4e和4g分别表现出与它们的对位对应物4d和4f相比低至大约2分之一的活性。这与在化合物4和5的情况下观察到的结果一致(表1)。令人感兴趣的是,将CF3的位置从间位(4j)变化至对位(4k)使IC 50改善了3.5倍。另外,与仅具有一个CF3的4j相比,具有两个CF3基团的4p没有表现出亲和力的改善。因此,评价了仅在对位位置的几种取代基。用tBu、OCF3或NHBoc替换CF3基团导致有效性低至2分之一的抑制剂(4h、4i和4s)。具有诸如OH、COOH、SO2NH2、CN等极性官能团的抑制剂(4f、4l、4m、4n和4o)表现出针对mPTPB的弱活性(表1)。在4的远侧苯环的位置中具有萘(4q)或苄氧基苯(4r)的化合物表现出差的溶解度和选择性(表2)。
表2. 化合物4、4a-4s针对一组PTP的IC50
Figure 447212DEST_PATH_IMAGE006
Figure 269674DEST_PATH_IMAGE007
Figure 536707DEST_PATH_IMAGE008
获得对mPTPB具有15 nM的IC 50的有效抑制剂4k以后,努力试图通过在远侧苯环中安装额外的取代基来进一步改善其活性。卤素,主要是较轻的卤素氟和氯,含有氯、溴或碘的化合物可以形成R−X···Y−R (卤素键)型相互作用,其中X是卤素(充当路易斯酸),且Y可以是任何电子供体部分。在蛋白-配体环境中,可以在配体中的卤素原子和任何附近的在蛋白质中的路易斯碱(诸如主链羰基氧)之间形成卤素键。此外,可以与诸如-OH (Ser、Thr和Tyr)、-COOH (Asp和Glu)、硫(Cys和Met)、氮(His)和π表面(Tyr、Phe、Try和His)等存在于侧链中的基团形成卤素键。此外,已知诸如氟等卤素改变化合物的物理化学特性并增加药物分子的代谢稳定性。为此目的,合成了分别具有在4k的CF3的间位的氯、溴和氟原子的化合物4t、4u和4v。这产生了具有改善的亲和力的化合物(表3)。与4k相比,类似物4t和4u显示出约2倍的结合改善,这也代表与母体化合物4相比44倍的活性增加(表2)。尽管4t和4u两者对于mPTPB都显示出相似的亲和力,但4t显示出优异的水溶解度、LogD、cLogP和选择性(表4)。另一方面,与4k相比,含腈的类似物4w表现出效能的降低。
表3. 4k类似物针对一组PTP的IC50
Figure 735608DEST_PATH_IMAGE009
表4. 所选化合物的计算的和确定的物理化学特性
Figure 404486DEST_PATH_IMAGE010
最后,为了评价三键的重要性,使用加氢反应制备具有双键或单键的化合物(表5)。为了合成化合物9和10,使用了Lindlar催化剂(5% Pd/BaSO4,喹啉,H2气体)。另一方面,使用10% Pd/C、甲醇和H2气体来合成含有单键的类似物11和12 (方案3)。含有双键或单键的衍生物的效能急剧下降。与它们的对应炔烃类似物4和4k相比,化合物9和10分别表现出低至3分之一和45分之一的效能。类似地,与4和4k相比,化合物11和12分别表现出低至5分之一和13分之一的活性。这些观察指示在N-芳基草氨酸核心的对位位置处的三键取代的刚度和方向性对于与mPTPB的最佳相互作用而言的重要性。
Figure 460167DEST_PATH_IMAGE011
方案3. 4和4k的基于烯烃和烷烃的衍生物的合成。
表5. 4和4k的含有烯烃和烷烃的类似物针对mPTPB、SHP2和PTP1B的IC50值。
Figure 214496DEST_PATH_IMAGE012
抑制剂选择性研究。
为了能够将mPTPB作为新型抗-TB靶标进行药理学评估,mPTPB抑制剂的特异性至关重要。使化合物4g、4k和4t经受对于mPTPB相对于一大组PTP的特异性分析,所述PTP包括细菌PTP,mPTPA (Mtb基因组中唯一的其它PTP)和来自耶尔森菌属(Yersinia)的YopH;非受体PTP,SHP1、SHP2、PTP1B、TC-PTP、MEG2、HePTP、STEP、FAP1和LYP;受体-样PTP,CD45、PTPσ、PTPα、PTPμ、PTPγ和PTPε;以及双重特异性磷酸酶(DSP) Laforin、VHR、MKP3、MKP5和Cdc14A。使化合物4g经受对于mPTPB相对于一组超过25种PTP的特异性分析。该化合物针对大多数PTP没有表现出抑制,即使在50 μM下,除了SHP1、SHP2、PTP1B、LMWPTP和PTPβ以外(表5)。另一方面,当在30 μM下筛选时,化合物4k和4t针对所测试的PTP没有表现出抑制,表明相比于其它PTP分别大于2,000和4,500倍的对mPTPB的选择性。
改变底物pNPP和抑制剂浓度,在动力学测定中确定了这些化合物对mPTPB的抑制的模式。这些抑制剂的Lineweaver Burk图显示它们为典型的竞争性抑制剂,影响表观K m值,而Vmax不变。由于N-芳基草氨酸部分的pTyr模拟特性,该观察与这些化合物结合mPTPB的活性位点的预期一致。化合物4t、4u和4v分别显示出2.7±0.2、1.2±0.1和4.9±0.6 nM的抑制常数(K i)值。为了排除混杂抑制的可能性,在缓冲液和时间依赖性抑制中使用和不使用0.01% (v/v)的Triton X-100进行了4p和4v的IC 50 实验(在IC 50 测定前将酶和抑制剂预温育30分钟)。这些实验表明,所测试的抑制剂的IC 50 值没有显著差异,表明它们是mPTPB的有效活性位点定向的抑制剂。
分子对接研究.
为了理解这些抑制剂和mPTPB之间的潜在相互作用,使用Glide进行了分子对接研究。PTP的活性位点结构荷正电,这促进其与荷负电的分子(诸如具有高亲和力的pTyr模拟物)的相互作用。所有PTP在约240个氨基酸的催化结构域中共享HCX5R的保守活性位点特征基序。磷酸结合环(P-环)在HCX5R基序中包含催化半胱氨酸(mPTPB中的Cys160)。P-环序列HCFAGKDR是mPTPB所特有的,并将该酶与PTP家族的其它成员区分开。与其哺乳动物PTP对应物相比,mPTPB具有相对更深和更宽的活性位点,这与其磷酸肌醇活性一致。极性草氨酸的头部基团用各种极性相互作用占据P-环口袋,而携有CF3的疏水远侧苯环填充疏水口袋。如建模工作所预测的,抑制剂4t结合到mPTPB的活性位点口袋中,与P-环残基Phe161、Ala162、Lys164、Asp165和Arg166发生关键氢键合相互作用。草酰胺基团形成到Asp165、Arg166、以及Phe161、Gly-163和Asp165的主链的氢键的复杂网络。在mPTPB中,Phe161与催化半胱氨酸相邻,与4t中的苯环发生疏水接触,而人类PTP,诸如PTP1B、SHP1、SHP2、TcPTP和HePTP,在该位置具有Ser。最重要的是,与4t发生氢键合相互作用的三个P-环氨基酸Phe161、Lys164和Asp165不存在于其它哺乳动物PTP中。内部炔烃在两个芳族环之间提供所需的空间,这允许远侧苯环与Phe98发生疏水相互作用。此外,在4t的CF3中的氟原子与疏水口袋(Ile203、Met206和Ile207)发生有利的相互作用。因此,4k、4t、4u和4v的高亲和力可以归因于所提出的CF3中氟原子与疏水口袋的疏水相互作用。因此,这些分子通过利用mPTPB活性位点的亲水和疏水区域二者中的非保守区域来实现其高效性和选择性。上述观察结果提示,除了此处筛选的化合物(表6)以外,相比于其它PTP,预计这些化合物表现出对mPTPB的特异性。
表6.4g、4k和4t对mPTPB相对于一大组PTP的特异性
Figure 951508DEST_PATH_IMAGE013
物理化学特性
鉴于这些抑制剂的优异效能和选择性,对所选化合物测量了物理化学特性。4b、4h、4k、4t、4u和4v的物理化学特性,诸如拓扑极性表面积(tPSA)、cLogP、LogD和水溶解度,在表4中表示。所有这些化合物都表现出在18-68 μM范围内的中度水溶解度(pH=7.4 PBS缓冲液)。已经提出,配体效率(LE)可以是用于根据分子的每个重原子的平均结合能来对比分子的方法。它是评估配体分子质量的有力工具,因为较大分子由于较大数目的相互作用而倾向于表现出较好的效能,但未必是最有效的。因此,需要更小但更有效的分子,因为它们在先导优化过程中具有更高的成功推进概率。亲脂配体效率(LLE)是分子与靶标结合相对于分配到正辛醇内的特异性的估计。所提出的药物候选物的LE和LLE的可接受值为LE >0.3和LLE > 5。表4中显示的所有化合物显示出> 0.42的LE值和> 5.3的LLE值。重要的是,这些化合物也遵循GSK 4/400规则(如果MW > 400和cLogP > 4,则具有较高的脱靶相互作用和毒性风险),提示了它们可以充当药物开发的潜在候选物。
用于小鼠体内研究的理想化合物应当是可溶的,具有良好的吸收,并且必须表现出代谢稳定性。足够的口服剂量必须在到达其生物靶标之前在通过肝脏的首过清除后存留。大多数药物/异源物经历I期代谢,其由主要在肝脏中的血红素-硫醇盐蛋白的细胞色素P450 (CYP450)家族介导。虽然小鼠肝微粒体(MLM)稳定性研究不是体内代谢清除研究的完美替代品,但它们充当初始的基于细胞的模型系统,该系统可以在小鼠中与人类肝微粒体(HLM)稳定性和体内活性良好关联。为此目的,令化合物4h、4k、4t、4u和4v与小鼠肝微粒体反应,并确定随时间变化的剩余母体化合物的分数。与所有其它含CF3的化合物相比,如在最后一个时间点所测的,含叔丁基的化合物4h是最不稳定的。向药物候选物中掺入氟通常会改善其效能、生物利用度和代谢稳定性。此外,氟化的分子通常是无毒的,并在其立体电子特性上模拟相应的非氟代类似物,因此药物对受体的亲和力要么保持不变,要么在某些情况下增加。与4h相比,含有CF3的4k、4t、4u和4v的代谢稳定性改善,部分由于C-F键与C-H相比更强(分别为116和99 kcal mol−1),这使得C-F键对代谢降解更不敏感。重要的是,无辅因子微粒体反应的分析表明,所有这些类似物都在37℃稳定一小时。因此,此处测试的化合物损失仅归因于氧化阶段I代谢。可以在药理学上利用这些化合物的高微粒体稳定性。
细胞渗透性研究.
细胞渗透性是开发活性位点定向的PTP抑制剂的主要障碍。大多数报道的pTyr模拟物携带一个或多个负电荷用于与荷正电的PTP活性位点结合,细胞膜渗透性不足,这限制了此类化合物作为药物候选物的进一步发展。用化合物4k、4t、4u和4v处理Raw264.7细胞,并使用基于LC-MS的方法测定我们的化合物的细胞渗透性潜力。细胞生物利用度研究表明,这些化合物可以容易地被Raw264.7细胞吸收。
化合物4t在阻断mPTPB介导的信号传递中的细胞活性
在于Raw264.7细胞中评价这些化合物的细胞渗透性以后,研究了化合物4t的细胞效力。一旦进入宿主巨噬细胞,mPTPB便活化Akt信号传递并阻断ERK1/2和p38活化以防止巨噬细胞凋亡并增加细胞因子产生。如所发现的,化合物4t增加了IFN-γ诱导的ERK1/2和p38的磷酸化,但以剂量依赖性方式降低了mPTPB转染的Raw264.7细胞中的Akt活性。观察到4t在基于细胞的测定中表型模拟几种结构上不相关的小分子mPTPB抑制剂,这强烈提示在巨噬细胞中检测到的4t的细胞效应确实来自mPTPB的特异性抑制。特别值得注意的是,发现4t的细胞活性与在生化测定中用纯化的重组mPTPB测量的其IC50值良好吻合。总之,这些结果指示,4t在阻断细胞内mPTPB活性方面非常有效。
结论
鉴于PTP在调节细胞信号传递(singling)和稳态中的重要性,对于为广泛范围的疾病开发基于PTP的治疗剂的兴趣越来越大,所述疾病包括癌症、糖尿病、自身免疫障碍和感染性疾病。作为宿主巨噬细胞内Mtb存活的关键毒力因子,mPTPB作为新型抗-TB靶标已得到了大量关注。重要的是,mPTPB的人类直向同源物的缺乏使其成为开发新型抗-TB候选物的极具吸引力的靶标。然而,获得具有适合于体内实验和临床转化的特性的高效特异性且有效的PTP抑制剂已被证明是困难的,主要由于PTP活性位点高度保守和荷正电的性质。本公开内容已经表明,通过基于片段的方案,诸如水杨酸和α-磺苯基乙酰胺等荷负电的pTyr模拟物可被转化为高效且选择性的活性位点定向的PTP抑制剂,其具有稳健的体内效力。尽管如此,带最小电荷的稳定且高亲和力的不可水解pTyr替代物的设计通常已获得有限的成功,并且这对开发基于PTP的新型治疗剂提出了重大挑战。
在此,本公开内容已将N-苯基草氨酸鉴定为用于mPTPB抑制的高效且选择性的基于单酸的pTyr模拟物。SAR研究通过改变苯环上的取代基来进行,并发现含4-苯基乙炔基的类似物(化合物4)为用于进一步修饰的最佳核心结构。合成了化合物4的几种单-、二-和三-取代的类似物,在它们中,化合物4t显示出对mPTPB的2.7 nM的K i,相对于25种PTP具有大于4,500倍的偏好。动力学和分子对接分析证实这些化合物为mPTPB的活性位点定向的可逆抑制剂。重要的是,这些N-苯基草氨酸抑制剂穿透细胞膜并抑制细胞内的mPTPB。这些基于草氨酸的抑制剂能够逆转由细菌磷酸酶诱导的改变的宿主细胞免疫应答。此外,报道的mPTPB抑制剂具有高度紧凑的结构,分子量< 400 Da,cLogP < 4,LogD7.4 < 2.5,LE > 0.42,并具有良好的药物样特性。总的来说,该结果指示N-苯基草氨酸药效团具有足够的极性来结合PTP活性位点,但仍然能够有效地穿过细胞膜,提供具有高亲和力和选择性以及优异细胞效力两者的PTP抑制剂。该结果还提供了通过利用不同PTP活性位点的特定结构特征来开发荷电最少、高效且选择性的活性位点定向的PTP抑制剂的另一个实例。这项工作不仅为评价mPTPB抑制作为结核病治疗提供了其它机会,还将激发对靶向其它mPTPB直向同源物的兴趣,所述其它mPTPB直向同源物存在于超过50种人类病原体中,包括单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes)。
实验部分
一般合成程序和试剂。除非另外指出,否则所有试剂都购自商业供应商并不经进一步纯化地使用。使用玻璃预涂布的Merck硅胶60 F254平板进行薄层色谱法(TLC)。使用KP-SIL硅胶(Biotage, 美国)进行柱色谱法,并使用自动化的快速色谱法系统BiotageIsolera One在Biotage预充柱上进行快速柱色谱法。使用旋转蒸发在40-45℃下蒸发有机溶剂。使用CDCl3或DMSO (d 6)作为溶剂,在Bruker AVANCE 500 MHz频谱仪上记录1H-和13CNMR频谱。化学位移以ppm (δ标尺)表达,并参考残余质子化溶剂。使用下述缩写报告峰多重性:s (单峰),d (双峰),t (三重峰),q (四重峰),m (多重峰),或br (宽单峰)。使用Agilent Technologies 6470系列,三重四极LC/MS获得低分辨率质谱和纯度数据。所有最终的测试化合物的纯度都被确定为>95% (UV, λ= 254 nm)。在Agilent 6550 iFunnel Q-TOF质量LC/MS上进行高分辨率质量分析。
苯胺氧代乙酸(1)的合成。向苯胺(300 mg, 3.22 mmol)和N,N-二异丙基乙胺(1.11 mL, 6.44 mmol)在15 mL无水CH2Cl2中的搅拌溶液中逐滴加入氯氧代乙酸甲酯(327μL, 3.54 mmol)。将所得溶液在室温下在N2气体下搅拌30 min。将反应混合物用15 mL去离子水和15 mL盐水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥并在真空中蒸发。使用12 mL 1N KOH/THF (1:1 v/v)在室温下使粗制的酯经受水解1小时。结束以后,将THF蒸发并将水层使用3NHCL酸化至pH ~2,并将所得固体过滤。使用硅胶和在二氯甲烷中的10%的甲醇作为洗脱剂进行残余物的柱色谱纯化,得到作为白色固体的产物(490 mg, 92%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 ,500 MHz) δ 10.68 (s, 1H), δ 7.74 (d, J = 7.5 Hz, 2H), δ 7.33 (t, J = 7.5 Hz,2H), δ 7.11 (t, J = 7.5 Hz, 1H);13C NMR (DMSO-d 6 , 125 MHz) δ 162.6, 157.3,138.1, 129.2, 125.0, 120.8;质谱(ESI): m/e 164 (M - H)-。C8H6NO3的HRMS (ESI-TOF,[M - H]-) m/z计算值164.0348,实测164.0354。
2-((4-乙炔基苯基)氨基)-2-氧代乙酸甲酯(核心1)的合成。在N2气氛下向4-乙炔基苯基胺(4.0 g, 34.14 mmol)和N,N-二异丙基乙胺(11.82 mL, 68.29 mmol)在100 mL无水CH2Cl2中的冰冷溶液中逐滴加入氯氧代乙酸甲酯(3.46 mL, 37.56 mmol)。将所得溶液在室温下搅拌1小时。将反应混合物用100 mL去离子水和100 mL盐水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥并在真空中蒸发。然后使用乙酸乙酯-己烷类的混合物作为洗脱剂,将产物在硅胶上通过柱色谱法纯化。白色粉末;(6.2 g, 96%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ10.94 (s, 1H), δ 7.77 (d, J = 9.0 Hz, 2H) δ 7.45 (d, J = 9.0 Hz, 2H), δ 4.11(s, 1H), δ 3.84 (s, 3H);13C NMR (DMSO-d 6 , 125 MHz) δ 161.3, 155.7, 138.5,132.8, 120.8, 118.2, 83.7, 80.9, 53.7。质谱(ESI): m/e 202 (M - H)-。C11H9NO3的HRMS (ESI-TOF, [M - H]-) m/z计算值202.0504,实测202.0510。
2-((3-乙炔基苯基)氨基)-2-氧代乙酸甲酯(核心2)的合成。在N2气氛下向3-乙炔基苯基胺(2.0 g, 17.07 mmol)和N,N-二异丙基乙胺(5.91 mL, 34.14 mmol)在50 mL无水CH2Cl2中的冰冷溶液中逐滴加入氯氧代乙酸甲酯(1.73 mL, 18.78 mmol)。将所得溶液在室温下搅拌1小时。将反应混合物用50 mL去离子水和50 mL盐水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥并在真空中蒸发。然后将产物在硅胶上通过柱色谱法纯化,用乙酸乙酯-己烷类的混合物洗脱。灰白色粉末;(3.0 g, 93%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.88 (s, 1H),δ 7.90 (s, 1H), δ 7.75-7.77 (m, 1H) δ 7.35 (t, J = 8.0 Hz, 1H), δ 7.24 (d, J= 7.5 Hz, 1H), δ 4.18 (s, 1H), δ 3.84 (s, 3H);13C NMR (DMSO-d 6 , 125 MHz) δ161.3, 155.8, 138.2, 129.7, 128.4, 123.7, 122.5, 121.6, 83.6, 81.3, 53.7。质谱(ESI): m/e 202 (M - H)-。C11H9NO3的HRMS (ESI-TOF, [M - H]-) m/z计算值202.0504,实测202.0510。
2-((4-碘苯基)氨基)-2-氧代乙酸甲酯(核心3)的合成。在N2气氛下向4-碘苯胺(3.0 g, 13.7 mmol)和N,N-二异丙基乙胺(3.0 mL, 20.55 mmol)在60 mL无水CH2Cl2中的冰冷溶液中逐滴加入氯氧代乙酸甲酯(1.5 mL, 16.44 mmol)。将所得溶液在室温下搅拌1小时。将反应混合物用60 mL去离子水和60 mL盐水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥并在真空中蒸发。然后将产物在硅胶上通过柱色谱法纯化,用乙酸乙酯-己烷类的混合物洗脱。白色粉末;(4.0 g, 96%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.88 (s, 1H), δ 7.68 (d,J = 8.5 Hz, 2H), δ 7.57 (d, J = 8.5 Hz, 2H), δ 3.83 (s, 3H);13C NMR (DMSO-d 6 ,125 MHz) δ 161.3, 155.7, 137.9, 137.8, 123.0, 89.4, 53.7。质谱(ESI): m/e 304(M - H)-
2-((4-乙炔基苯基)氨基)-2-氧代乙酸(2)的合成。将核心1 (100mg)在8 mL 1NKOH/THF (1:1 v/v)中的搅拌溶液在室温下搅拌1小时。结束以后,将THF完全蒸发,并将水层使用3N HCL酸化至pH ~2,并将所得固体过滤以产生作为灰白色固体的纯化合物2 (90mg, 95%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.85 (s, 1H), δ 7.78 (d, J = 8.5 Hz,2H), δ 7.44 (d, J = 8.5 Hz, 2H), δ 4.11 (s, 1H);13C NMR (DMSO-d 6 , 125 MHz) δ162.4, 157.5, 138.7, 132.8, 120.6, 117.9, 83.8, 80.9。质谱(ESI): m/e 188 (M -H)-
2-((4-(3-((叔丁氧基羰基)氨基)丙-1-炔-1-基)苯基)氨基)-2-氧代乙酸(3)的合成。向2-((4-碘苯基)氨基)-2-氧代乙酸甲酯(400 mg, 1.0当量)在5 mL无水DMF中的搅拌溶液中加入丙-2-炔-1-基氨基甲酸叔丁酯(224 mg, 1.1当量)、碳酸钠(278 mg, 2.0当量)、Pd(PPh3)2Cl2 (5 mol%)和碘化亚铜(5 mol%),将所得混合物在室温下在N2气氛下搅拌。通过LC-MS监测反应。反应结束以后,使用高真空完全除去DMF。将残余物溶解在70 mL乙酸乙酯中,并用50 mL去离子水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥并蒸发溶剂。使用1N KOH/THF (1:1 v/v)在室温下使粗制的酯经受水解1小时。结束以后,将THF蒸发并将水层使用冷的1N HCL酸化至pH ~3,并将所得固体过滤。将化合物3使用甲醇-二氯甲烷的混合物作为洗脱剂在硅胶(固定相)上通过柱色谱法纯化为灰白色粉末(351 mg, 84%产率)。1H NMR(DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.59 (s, 1H), δ 7.76 (d, J = 8.5 Hz, 2H), 7.33 (d, J =8.5 Hz, 2H), 3.94 (d, J = 5.5 Hz, 2H), δ 1.38 (s, 9H);13C NMR (DMSO-d 6 , 125MHz) δ 162.8, 160.4, 155.8, 138.8, 132.3, 120.2, 117.9, 87.4, 81.9, 78.7,30.6, 28.7;质谱(ESI): m/e 317 (M - H)-。C16H17N2O5的HRMS (ESI-TOF, [M - H]-) m/z计算值317.1132,实测317.1134。
用于合成化合物4、4a-4x和5的一般程序。向2-((4-乙炔基苯基)氨基)-2-氧代乙酸甲酯(200 mg, 1.0当量)在3 mL无水DMF中的搅拌溶液中加入芳基碘(1.1当量)、碳酸钠(2.0当量)、Pd(PPh3)2Cl2 (5 mol%)和碘化亚铜(5 mol%),将所得混合物在室温下在N2气氛下搅拌。通过LC-MS监测反应。反应结束以后,使用高真空完全除去DMF。将残余物溶解在50mL乙酸乙酯中,并用40 mL去离子水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥并蒸发溶剂。使用1NKOH/THF (1:1 v/v)在室温下使粗制的酯经受水解1小时。结束以后,将THF蒸发并将水层使用3N HCL酸化至pH ~2,并将所得固体过滤。然后将产物在硅胶上通过柱色谱法纯化,用甲醇-二氯甲烷的混合物洗脱。
用于制备化合物9和10的一般程序。向4或4k (50 mg)在4 mL THF/甲醇(1:1 v/v)中的搅拌溶液中加入5 mg 5% Pd/BaSO4和50 μL喹啉,然后令混合物在H2气氛下在室温下搅拌12 h。反应结束以后(通过LC-MS监测),将混合物穿过硅藻土垫过滤,并将滤液在减压下浓缩。使用甲醇/二氯甲烷混合物作为洗脱剂,将残余物通过柱色谱法纯化,以>70%产率提供化合物9和10。
用于制备化合物11和12的一般程序。向4或4k (50 mg)在乙醇(4 mL)中的搅拌溶液中加入5mg的10% Pd/C,并令混合物在室温下在H2气氛下搅拌4 h。反应结束以后(通过LC-MS监测),将混合物穿过硅藻土垫过滤,并将滤液在减压下浓缩。使用甲醇/二氯甲烷混合物作为洗脱剂,将残余物通过柱色谱法纯化,以>90%产率提供化合物11和12。
2-氧代-2-((4-(苯基乙炔基)苯基)氨基)乙酸(4)。白色固体;(235 mg, 90%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.62 (s, 1H), δ 7.82 (d, J = 8.5 Hz, 2H), δ7.48-7.53 (m, 4H), δ 7.38-7.41 (m, 3H);13C NMR (DMSO-d 6 , 125 MHz) δ 162.7,160.7, 139.2, 132.2, 131.7, 129.2, 129.1, 122.9, 120.2, 117.7, 89.9, 89.2。质谱(ESI): m/e 264 (M - H)-。C16H10NO3的HRMS (ESI-TOF, [M - H]-) m/z计算值264.0661,实测264.0670。
2-((4-((4-(甲氧基羰基)苯基)乙炔基)苯基)氨基)-2-氧代乙酸(4a)。白色粉末;(249 mg, 78%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.58 (s, 1H), δ 7.95 (d, J =8.5 Hz, 2H) δ 7.86 (d, J = 9.0 Hz, 2H), δ 7.65 (d, J = 8.5 Hz, 2H), δ 7.52(d, J = 8.5 Hz, 2H);13C NMR (DMSO-d 6 , 125 MHz) δ 166.1, 163.8, 162.7, 139.8,132.6, 131.9, 129.9, 129.5, 127.8, 120.1, 116.9, 93.2, 88.4, 52.8。质谱(ESI):m/e 322 (M - H)-。C18H12NO5的HRMS (ESI-TOF, [M - H]-) m/z计算值322.0715,实测322.0712。
2-((4-((4-羟基-3-(甲氧基羰基)苯基)乙炔基)苯基)氨基)-2-氧代乙酸(4b)。淡黄色固体;(238 mg, 71%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.79 (s, 1H), δ 10.70(s, 1H), δ 7.87 (d, J = 2.0 Hz, 1H) δ 7.81 (d, J = 7.0 Hz, 2H), δ 7.62 (d, J= 8.5 Hz, 1H), δ 7.49 (d, J = 9.0 Hz, 2H), δ 7.01 (d, J = 8.5 Hz, 1H), 3.87(s, 3H);13C NMR (DMSO-d 6 , 125 MHz) δ 168.4, 162.5, 160.1, 158.3, 138.6, 138.2,133.7, 132.3, 120.5, 118.7, 118.3, 114.7, 113.8, 88.7, 88.4。质谱(ESI): m/e338 (M - H)-。C18H14NO6的HRMS (ESI-TOF, [M + H]+) m/z计算值340.0815,实测340.0815。
2-((4-((3-羟基-4-(甲氧基羰基)苯基)乙炔基)苯基)氨基)-2-氧代乙酸(4c)。淡黄色固体;(240 mg, 72%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.87 (s, 1H), δ 10.57(s, 1H), δ 7.87 (br, 2H), δ 7.76 (d, J = 8.5 Hz, 1H), δ 7.55 (d, J = 6.5 Hz,2H), δ 7.10 (s, 1H), δ 7.06 (d, J = 8.5 Hz, 1H), δ 3.87 (s, 3H);13C NMR (DMSO-d 6 , 125 MHz) δ 168.8, 159.9, 132.8, 130.9, 129.5, 122.7, 120.6, 120.0, 117.6,113.9, 92.7, 88.4, 53.0。质谱(ESI): m/e 338 (M - H)-。C18H14NO6的HRMS (ESI-TOF,[M + H]+) m/z计算值340.0815,实测340.0815。
2-((4-((2-(二甲基氨基)-4-羟基-5-(甲氧基羰基)苯基)乙炔基)苯基)氨基)-2-氧代乙酸(4d)。淡黄色固体;(264 mg, 70%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.71(s, 1H), δ 7.85 (br, 1H), δ 7.78 (s, 1H), δ 7.59 (s, 1H), δ 7.48 (s, 1H), δ6.29 (s, 1H), δ 3.84 (s, 3H), δ 3.08 (s, 6H);13C NMR (DMSO-d 6 , 125 MHz) δ169.0, 161.9, 158.9, 137.2, 133.7, 131.7, 120.8, 119.3, 103.9, 103.5, 103.0,92.7, 88.8, 52.6。质谱(ESI): m/e 381 (M - H)-。C20H19N2O6的HRMS (ESI-TOF, [M + H]+)m/z计算值383.1237,实测383.1236。
2-((3-((2-(二甲基氨基)-4-羟基-5-(甲氧基羰基)苯基)乙炔基)苯基)氨基)-2-氧代乙酸(4e)。白色粉末;(259 mg, 69%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.72 (s,1H), δ 7.94 (s, 1H), δ 7.93 (s, 1H), δ 7.75 (d, J = 8.5 Hz, 1H) δ 7.35 (t, J= 8.0 Hz, 1H), δ 7.23 (d, J = 10.0 Hz, 1H), δ 6.30 (s, 1H), δ 3.84 (s, 3H), δ3.09 (s, 6H);13C NMR (DMSO-d 6 , 125 MHz) δ 168.9, 162.5, 162.1, 158.9, 158.2,138.6, 137.4, 129.7, 126.9, 123.7, 122.4, 120.5, 104.0, 103.2, 103.0, 92.5,89.2, 52.5;质谱(ESI): m/e 381 (M - H)-。C20H19N2O6的HRMS (ESI-TOF, [M + H]+) m/z计算值383.1237,实测383.1236。
5-((4-(羧基甲酰氨基)苯基)乙炔基)-4-(二甲基氨基)-2-羟基苯甲酸(4f)。灰白色固体;(245 mg, 68%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.81 (s, 1H), δ 7.81 (d,J = 7.5 Hz, 2H), δ 7.76 (s, 1H), δ 7.46 (d, J = 8.0 Hz, 2H), δ 6.27 (s, 1H),δ 3.06 (s, 6H);13C NMR (DMSO-d 6 , 125 MHz) δ 171.6, 162.9, 159.0, 137.4, 133.6,131.6, 120.7, 119.3, 104.7, 103.3, 103.0, 92.5, 89.1, 42.6;质谱(ESI): m/e 367(M - H)-。C19H17N2O6的HRMS (ESI-TOF, [M + H]+) m/z计算值369.1081,实测369.1081。
5-((3-(羧基甲酰氨基)苯基)乙炔基)-4-(二甲基氨基)-2-羟基苯甲酸(4g)。灰白色固体;(238 mg, 66%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.57 (s, 1H), δ 7.95 (s,1H), δ 7.78 (s, 1H), δ 7.75 (d, J = 7.5 Hz, 1H), δ 7.33 (t, J = 7.5 Hz, 1H),δ 7.20 (d, J = 7.5 Hz, 1H), δ 6.26 (s, 1H), δ 3.04 (s, 6H);13C NMR (DMSO-d 6 ,125 MHz) δ 171.7, 163.4, 158.9, 138.9, 137.4, 129.6, 126.6, 123.9, 122.2,120.2, 106.4, 103.2, 102.8, 92.3, 89.7, 42.7。质谱(ESI): m/e 367 (M - H)-。C19H17N2O6的HRMS (ESI-TOF, [M + H]+) m/z计算值369.1081,实测369.1081。
2-((4-((4-(叔丁基)苯基)乙炔基)苯基)氨基)-2-氧代乙酸(4h)。淡黄色固体;(259 mg, 82%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.30 (s, 1H), δ 7.80 (d, J =9.0 Hz, 2H) δ 7.42 (q, J = 9.0, 8.0 Hz, 6H), δ 1.27 (s, 9H);13C NMR (DMSO-d 6 ,125 MHz) δ 164.8, 162.7, 151.6, 139.9, 132.3, 131.5, 126.0, 120.1, 119.5,116.9, 89.6, 88.9, 35.0, 31.4。质谱(ESI): m/e 320 (M - H)-。C20H18NO3的HRMS (ESI-TOF, [M - H]-) m/z计算值320.1281,实测320.1280。
2-氧代-2-((4-((4-(三氟甲氧基)苯基)乙炔基)苯基)氨基)乙酸(4i)。浅黄色粉末;(268 mg, 78%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.69 (s, 1H), δ 7.83 (d, J =8.5 Hz, 2H) δ 7.65 (d, J = 8.5 Hz, 2H), δ 7.51 (d, J = 8.5 Hz, 2H), δ 7.40(d, J = 8.0 Hz, 2H);13C NMR (DMSO-d 6 , 125 MHz) δ 162.6, 159.9, 148.5, 139.4,133.8, 132.5, 122.3, 121.84, 120.3, 117.4, 90.9, 87.8。质谱(ESI): m/e 348 (M -H)-。C17H9F3NO4的HRMS (ESI-TOF, [M - H]-) m/z计算值348.0485,实测348.0482。
2-氧代-2-((4-((3-(三氟甲基)苯基)乙炔基)苯基)氨基)乙酸(4j)。白色固体;(267 mg, 81%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.89 (s, 1H), δ 7.82-7.87 (m,4H) δ 7.74 (d, J = 8.0 Hz, 1H), δ 7.64 (t, J = 8.0 Hz, 1H), δ 7.56 (d, J =8.5 Hz, 2H);13C NMR (DMSO-d 6 , 125 MHz) δ 1162.4, 157.6, 139.0, 135.6, 132.7,130.5, 130.2, 129.9, 129.7, 128.2, 125.6, 125.3, 124.0, 123.1, 120.7, 117.8,91.4, 87.9。质谱(ESI): m/e 332 (M - H)-。C17H9F3NO3的HRMS (ESI-TOF, [M - H]-) m/z计算值332.0534,实测332.0532。
2-氧代-2-((4-((4-(三氟甲基)苯基)乙炔基)苯基)氨基)乙酸(4k)。灰白色固体;(263 mg, 80%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.91 (s, 1H), δ 7.85 (d, J =8.5 Hz, 2H) δ 7.75 (dd, J = 15.0, 9.0 Hz, 4H), δ 7.57 (t, J = 7.0 Hz, 2H);13CNMR (DMSO-d 6 , 125 MHz) δ 162.3, 157.5, 139.1, 132.7, 132.5, 129.3, 129.1,128.8, 128.6, 127.2, 126.1, 125.5, 123.4, 120.7, 117.7, 92.3, 88.1。质谱(ESI):m/e 332 (M - H)-。C17H9F3NO3的HRMS (ESI-TOF, [M - H]-) m/z计算值332.0534,实测332.0532。
2-氧代-2-((4-((4-氨磺酰基苯基)乙炔基)苯基)氨基)乙酸(4l)。灰白色固体;(226 mg, 67%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.79 (s, 1H), δ 7.82-7.86 (m,2H) δ 7.71 (d, J = 8.5 Hz, 1H), δ 7.53-7.62 (m, 3H), δ 7.45 (s, 1H);13C NMR(DMSO-d 6 , 125 MHz) δ 162.5, 159.0, 144.1, 139.4, 133.6, 132.7, 132.5, 132.2,132.0, 131.9, 129.3, 129.2, 126.5, 126.3, 120.5, 117.4, 92.3, 88.3。质谱(ESI):m/e 343 (M - H)- 367 (M + Na)+。C16H12N2O5S的HRMS (ESI-TOF, [M - H]-) m/z计算值343.0388,实测343.0391。
2-((4-((4-羟基苯基)乙炔基)苯基)氨基)-2-氧代乙酸(4m)。白色固体;(230 mg,83%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.78 (s, 1H), δ 7.80 (d, J = 8.5 Hz, 2H)δ 7.45 (d, J = 8.5 Hz, 2H), δ 7.34 (d, J = 8.5 Hz, 2H), δ 6.78 (d, J = 8.5Hz, 2H);13C NMR (DMSO-d 6 , 125 MHz) δ 162.5, 158.5, 158.1, 138.2, 133.4, 132.1,120.56, 119.0, 116.2, 113.0, 90.1, 87.7;质谱(ESI): m/e 280 (M - H)-。C16H12NO4的HRMS (ESI-TOF, [M + H]+) m/z计算值282.0761,实测282.0759。
2-((4-((3-溴-4-羟基苯基)乙炔基)苯基)氨基)-2-氧代乙酸(4n)。淡黄色粉末;(261 mg, 74%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.83 (s, 1H), δ 7.81 (d, J =8.5 Hz, 2H) δ 7.64 (d, J = 2.0 Hz, 1H), δ 7.47 (d, J = 8.5 Hz, 2H), δ 7.35(dd, J = 8.5, 2.0 Hz, 1H), δ 6.96 (d, J = 8.5 Hz, 1H);13C NMR (DMSO-d 6 , 125MHz) δ 162.5, 157.7, 155.3, 138.4, 136.0, 132.5, 132.2, 120.6, 118.6, 116.9,114.7, 109.7, 88.7, 88.4;质谱(ESI): m/e 358 (M - H)-。C16H9NO4的HRMS (ESI-TOF,[M - H]-) m/z计算值357.9715,实测357.9727。
2-((4-((4-氰基苯基)乙炔基)苯基)氨基)-2-氧代乙酸(4o)。白色粉末;(226 mg,79%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.92 (s, 1H), δ 7.86 (d, J = 8.5 Hz,4H), δ 7.70 (d, J = 8.5 Hz, 2H), δ 7.57 (d, J = 8.0 Hz, 2H);13C NMR (DMSO-d 6 ,125 MHz) δ 162.5, 157.5, 139.3, 133.1, 132.8, 132.5, 127.8, 120.7, 118.9,117.6, 111.3, 93.9, 88.2。质谱(ESI): m/e 289 (M - H)-。C17H11N2O3的HRMS (ESI-TOF,[M + H]+) m/z计算值291.0764,实测291.0764。
2-((4-((3,5-双(三氟甲基)苯基)乙炔基)苯基)氨基)-2-氧代乙酸(4p)。灰白色固体;(305 mg, 77%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.53 (s, 1H), δ 8.22 (s,2H) δ 8.09 (s, 1H), δ 7.87 (d, J = 8.5 Hz, 2H), δ 7.55 (d, J = 8.5 Hz, 2H);13CNMR (DMSO-d 6 , 125 MHz) δ 162.8, 162.7, 140.4, 132.8, 132.2, 131.7, 131.4,131.2, 130.9, 125.8, 124.5, 122.3, 122.1, 119.9, 116.0, 93.7, 86.3。质谱(ESI):m/e 400 (M - H)-。C18H8F6NO3的HRMS (ESI-TOF, [M - H]-) m/z计算值400.0408,实测400.0413。
2-((4-(萘-2-基乙炔基)苯基)氨基)-2-氧代乙酸(4q)。灰白色固体;(249 mg,80%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.70 (s, 1H), δ 8.15 (s, 1H), δ 7.92-7.95 (m, 3H), δ 7.85 (d, J = 8.5 Hz, 2H), δ 7.54-7.59 (m, 5H);13C NMR (DMSO-d 6 , 125 MHz) δ 162.5, 139.3, 133.1, 132.8, 132.5, 131.5, 128.8, 128.5, 128.2,127.5, 127.3, 120.3, 117.8, 90.3, 89.6。质谱(ESI): m/e 314 (M - H)-。C20H12NO3的HRMS (ESI-TOF, [M - H]-) m/z计算值314.0811,实测314.0812。
2-((4-((4-(苄氧基)苯基)乙炔基)苯基)氨基)-2-氧代乙酸(4r)。白色粉末;(245mg, 67%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.69 (s, 1H), δ 7.84 (br, 2H), δ7.55 (d, J = 8.0 Hz, 2H), δ 7.43-7.47 (m, 5H), δ 7.38 (t, J = 8.5 Hz, 2H), δ7.33 (t, J = 7.5 Hz, 2H), δ 7.03 (d, J = 8.5 Hz, 2H), δ 5.12 (s, 2H);13C NMR(DMSO-d 6 , 125 MHz) δ 159.0,137.2, 133.6, 133.3, 132.2, 128.9, 128.4, 128.3,120.4, 118.4, 115.7, 115.1, 89.4, 88.6, 69.8。质谱(ESI): m/e 370 (M - H)-。C23H16NO4的HRMS (ESI-TOF, [M - H]-) m/z计算值370.1076,实测370.1076。
2-((4-((4-((叔丁氧基羰基)氨基)苯基)乙炔基)苯基)氨基)-2-氧代乙酸(4s)。淡黄色固体;(275 mg, 73%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.80 (s, 1H), δ 9.57(s, 1H), δ 7.81 (d, J = 8.5 Hz, 2H) δ 7.40-7.50 (m, 6H), δ 1.46 (s, 2H);13CNMR (DMSO-d 6 , 125 MHz) δ 162.5, 158.2, 153.0, 140.5, 138.4, 132.3, 132.2,120.6, 118.7, 118.4, 115.9, 89.8, 88.6, 79.9, 28.5。质谱(ESI): m/e 379 (M -H)-。C21H19N2O5的HRMS (ESI-TOF, [M - H]-) m/z计算值379.1294,实测379.1300。
2-((4-((2-氯-4-(三氟甲基)苯基)乙炔基)苯基)氨基)-2-氧代乙酸(4t)。灰白色粉末;(280 mg, 77%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.78 (s, 1H), δ 8.00 (s,1H), δ 7.87 (t, J = 9.0 Hz, 3H) δ 7.74 (d, J = 8.5 Hz, 1H), δ 7.57 (d, J =8.5 Hz, 2H);13C NMR (DMSO-d 6 , 125 MHz) δ 162.5, 159.6, 139.9, 135.7, 134.5,132.8, 130.3, 130.1, 126.9, 126.7, 124.7, 122.5, 120.4, 116.7, 97.7, 84.9。质谱(ESI): m/e 366 (M - H)-。C17H7ClF3NO3的HRMS (ESI-TOF, [M - H]-) m/z计算值366.0145,实测366.0143。
2-((4-((2-溴-4-(三氟甲基)苯基)乙炔基)苯基)氨基)-2-氧代乙酸(4u)。灰白色粉末;(302 mg, 74%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.65 (s, 1H), δ 8.12 (s,1H), δ 7.82-7.88 (m, 3H), δ 7.78 (d, J = 8.5 Hz, 1H), δ 7.56 (d, J = 8.5 Hz,2H);13C NMR (DMSO-d 6 , 125 MHz) δ 162.6, 161.0, 140.2, 134.3, 132.8, 129.6,129.2, 125.6, 125.1, 120.2, 116.4, 97.2, 86.9。质谱(ESI): m/e 410 (M - H)-。C17H8BrF3NO3的HRMS (ESI-TOF, [M - H]-) m/z计算值409.9640,实测409.9636。
2-((4-((2-氟-4-(三氟甲基)苯基)乙炔基)苯基)氨基)-2-氧代乙酸(4v)。白色固体;(292 mg, 84%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.76 (s, 1H), δ 7.87 (d, J =9.0 Hz, 2H) δ 7.79 (t, J = 8.0 Hz, 1H), δ 7.70 (d, J = 11.5 Hz, 1H), δ 7.55(d, J = 8.5 Hz, 3H);13C NMR (DMSO-d 6 , 125 MHz) δ 162.6, 160.2, 159.7, 158.1,139.8, 132.8, 129.8, 129.7, 128.4, 128.2, 123.9, 121.8, 120.4, 120.0, 119.8,116.7, 93.8, 86.9。质谱(ESI): m/e 350 (M - H)-。C17H8F4NO3的HRMS (ESI-TOF, [M -H]-) m/z计算值350.0435,实测350.0442。
2-((4-((2-氰基-4-(三氟甲基)苯基)乙炔基)苯基)氨基)-2-氧代乙酸(4w)。淡黄色固体;(250 mg, 71%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.78 (s, 1H), δ 8.41 (s,1H) δ 8.07 (d, J = 8.5 Hz, 1H), δ 7.94 (d, J = 11.5 Hz, 1H), δ 7.90 (d, J =8.5 Hz, 2H), δ 7.58 (d, J = 8.5 Hz, 2H);13C NMR (DMSO-d 6 , 125 MHz) δ 162.6,160.1, 140.4, 133.4, 133.1, 130.7, 130.4, 129.8, 129.5, 129.3, 129.0, 124.5,122.4, 120.5, 116.8, 115.9, 115.4, 98.7, 85.0;质谱(ESI): m/e 357 (M - H)-。C18H8F3N2O3的HRMS (ESI-TOF, [M - H]-) m/z计算值357.0487,实测357.0493。
2-((4-((2,4-双(三氟甲基)苯基)乙炔基)苯基)氨基)-2-氧代乙酸(4x)。白色粉末;(275 mg, 73%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.87 (s, 1H), δ 8.10 (s,2H), δ 8.01 (d, J = 8.5 Hz, 1H), δ 7.88 (d, J = 8.5 Hz, 2H), δ 7.55 (d, J =8.5 Hz, 2H);13C NMR (DMSO-d 6 , 125 MHz) δ 162.4, 158.6, 139.9, 135.4, 132.8,130.1, 125.2, 123.6, 120.7, 116.7, 98.3, 84.2;质谱(ESI): m/e 400 (M - H)-。C18H8F6NO3的HRMS (ESI-TOF, [M - H]-) m/z计算值400.0408,实测400.0415。
2-氧代-2-((3-(苯基乙炔基)苯基)氨基)乙酸(5)。灰白色固体;(229 mg, 88%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.73 (s, 1H), δ 8.00 (s, 1H), δ 7.74-7.77 (m,1H) δ 7.54.7.56 (m, 2H), δ 7.39-7.43 (d, 3H), δ 7.37 (d, J = 7.5 Hz, 2H), δ7.29 (d, J = 7.5 Hz, 1H);13C NMR (DMSO-d 6 , 125 MHz) δ 162.6, 158.6, 138.7,131.9, 129.7, 129.4, 129.3, 127.7, 122.9, 122.6, 121.1, 89.7, 89.6。质谱(ESI):m/e 264 (M - H)-。C16H10NO3的HRMS (ESI-TOF, [M - H]-) m/z计算值264.0661,实测264.0670。
2-([1,1'-联苯]-4-基氨基)-2-氧代乙酸(6)的合成。在N2气氛下向4-联苯胺(300mg, 1.77 mmol)和N,N-二异丙基乙胺(613 μL, 3.55 mmol)在20 mL无水CH2Cl2中的搅拌溶液中逐滴加入氯氧代乙酸甲酯(180 μL, 1.95 mmol)。将所得溶液在室温下搅拌30 min。将反应混合物用20 mL去离子水和20 mL盐水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥并在真空中蒸发。使用15 mL 1N KOH/THF (1:1 v/v)在室温下使粗制的酯经受水解1小时。结束以后,将THF蒸发并将水层使用3N HCL酸化至pH ~2,并将所得固体过滤。然后将产物在硅胶上通过柱色谱法纯化,用甲醇-二氯甲烷的混合物洗脱。白色固体;(374 mg, 87%产率)。1H NMR(DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.80 (s, 1H), δ 7.86 (d, J = 8.5 Hz, 2H), δ 7.63-7.66(m, 4H), δ 7.43 (t, J = 7.5 Hz, 2H), δ 7.32 (t, J = 7.5 Hz, 1H);13C NMR (DMSO-d 6 , 125 MHz) δ 162.6, 157.4, 139.9, 137.6, 136.6, 129.4, 127.7, 127.4, 126.8,121.1。质谱(ESI): m/e 240 (M - H)-。C14H10NO3的HRMS (ESI-TOF, [M - H]-) m/z计算值240.0661,实测240.0669。
2-([1,1'-联苯]-3-基氨基)-2-氧代乙酸(7)的合成。在N2气氛下向3-联苯胺(300mg, 1.77 mmol)和N,N-二异丙基乙胺(613 μL, 3.55 mmol)在20 mL无水CH2Cl2中的冰冷溶液中逐滴加入氯氧代乙酸甲酯(180 μL, 1.95 mmol)。将所得溶液在室温下搅拌30 min。将反应混合物用20 mL去离子水和20 mL盐水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥并在真空中蒸发。使用15 mL 1N KOH/THF (1:1 v/v)在室温下使粗制的酯经受水解1小时。结束以后,将THF蒸发并将水层使用3N HCL酸化至pH ~2,并将所得固体过滤。然后将产物在硅胶上通过柱色谱法纯化,用甲醇-二氯甲烷的混合物洗脱。白色粉末;(360 mg, 84%产率)。1H NMR(DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.75 (s, 1H), δ 8.08 (s, 1H), δ 7.78 (dt, J = 7.0, 2.0Hz, 2H), δ 7.61 (d, J = 9.5 Hz, 1H), δ 7.41-7.48 (m, 4H), δ 7.36 (t, J = 7.0Hz, 1H);13C NMR (DMSO-d 6 , 125 MHz) δ 162.6, 157.7, 141.2, 140.4, 138.8, 129.8,129.5, 128.1, 127.1, 123.3, 119.7, 119.1。质谱(ESI): m/e 240 (M - H)-。C14H10NO3的HRMS (ESI-TOF, [M - H]-) m/z计算值240.0661,实测240.0669。
2-氧代-2-(喹啉-3-基氨基)乙酸(8)的合成。在N2气氛下向3-氨基喹啉(400 mg,2.77 mmol)和N,N-二异丙基乙胺(960 μL, 5.55 mmol)在25 mL无水CH2Cl2中的搅拌溶液中逐滴加入氯氧代乙酸甲酯(281 μL, 3.05 mmol)。将所得溶液在室温下搅拌30 min。将反应混合物用25 mL去离子水和25 mL盐水洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥并在真空中蒸发。使用20 mL 1N KOH/THF (1:1 v/v)在室温下使粗制的酯经受水解1小时。结束以后,将THF蒸发并将水层使用3N HCL酸化至pH ~2,并将所得固体过滤。然后将化合物7在硅胶上通过柱色谱法纯化,用甲醇-二氯甲烷的混合物洗脱。黄色粉末;(450 mg, 75%产率)。1H NMR(DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 11.35 (s, 1H), δ 9.25 (s, 1H), δ 8.97 (s, 1H), δ 8.07(t, J = 7.0 Hz, 2H), δ 7.78 (t, J = 7.0 Hz, 1H), δ 7.67 (t, J = 7.0 Hz, 1H);13C NMR (DMSO-d 6 , 125 MHz) δ 161.9, 158.0, 143.8, 142.2, 132.3, 130.4, 128.7,128.5, 128.2, 127.1, 126.7。质谱(ESI): m/e 215 (M - H)-。C11H7N2O3的HRMS (ESI-TOF, [M - H]-) m/z计算值215.0457,实测215.0464。
(Z)-2-氧代-2-((4-苯乙烯基苯基)氨基)乙酸(9)。灰白色粉末;(37 mg, 74%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.67 (s, 1H), δ 7.64 (d, 8.5 Hz, 2H), δ 7.24(d, 8.5 Hz, 2H), δ 7.19-7.22 (m, 3H), δ 7.16 (d, J = 8.5 Hz, 1H), δ 6.57 (s,2H);13C NMR (DMSO-d 6 , 125 MHz) δ 162.6, 157.9, 137.4, 137.3, 133.3, 130.1,129.9, 129.4, 129.0, 128.9, 128.8, 128.7, 127.7, 120.4。质谱(ESI): m/e 266 (M- H)-。C17H12NO3的HRMS (ESI-TOF, [M - H]-) m/z计算值266.0817,实测266.0826。
(Z)-2-氧代-2-((4-(4-(三氟甲基)苯乙烯基)苯基)氨基)乙酸(10)。灰白色粉末;(32 mg, 72%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.71 (s, 1H), δ 7.68 (d, J = 8.0Hz, 2H), δ 7.61 (d, J = 8.0 Hz, 2H), δ 7.41 (d, J = 8.5 Hz, 2H), δ 7.17 (d, J= 8.5 Hz, 2H), δ 6.72 (d, J = 12 Hz, 1H), δ 7.64 (d, J = 12 Hz, 1H);13C NMR(DMSO-d 6 , 125 MHz) δ 162.5, 157.8, 141.7, 137.6, 132.7, 132.1, 129.7, 129.5,128.6, 125.8, 120.5。质谱(ESI): m/e 334 (M - H)-。C17H11F3NO3的HRMS (ESI-TOF, [M- H]-) m/z计算值334.0691,实测334.0702。
2-氧代-2-((4-苯乙基苯基)氨基)乙酸(11)。白色晶体;(47 mg, 93%产率)。1HNMR (MeOH-d 4 , 500 MHz) δ 7.56 (d, J = 8.5 Hz, 2H), δ 7.21-7.24 (m, 2H), δ7.12-7.16 (m, 5H), δ 2.88 (s, 4H);13C NMR (MeOH-d 4, 125 MHz) δ 141.5, 138.2,135.0, 128.5, 128.2, 127.9, 125.5, 119.8, 37.6, 37.2。质谱(ESI): m/e 268 (M -H)-。C16H15NO3的HRMS (ESI-TOF, [M - H]-) m/z计算值268.0968,实测268.0980。
2-氧代-2-((4-(4-(三氟甲基)苯乙基)苯基)氨基)乙酸(12)。白色晶体;(45mg,90%产率)。1H NMR (DMSO-d 6 , 500 MHz) δ 10.61 (s, 1H), δ 7.59-7.64 (m, 4H) δ 7.42(d, J = 8.0 Hz, 2H), δ 7.18 (d, J = 8.5 Hz, 2H), δ 2.93-2.96 (m, 2H), δ 2.84-2.88 (m, 2H);13C NMR (DMSO-d 6 , 125 MHz) δ 162.6, 157.2, 146.9, 137.7, 136.1,129.7, 129.1, 127.5, 127.2, 126.9, 126.7, 126.0, 125.5, 125.4, 123.8, 120.7,37.0, 36.4。质谱(ESI): m/e 336 (M - H)-。C17H14F3NO3的HRMS (ESI-TOF, [M - H]-) m/z计算值336.0848,实测336.0852。
分子建模研究。使用先前公布的与OMTS复合的mPTPB的晶体结构(PDB代码:2OZ5)进行分子建模研究。将Schrodinger分子建模套件2019-4 (Schrodinger, LLC, New York,NY, 2019)用于建模研究,其程序与之前描述的那些类似。将Extra precision Glide(Glide-XP)用于对接研究。简言之,使用蛋白制备模块制备蛋白-配体复合物的结构,并基于天然配体(OMTS)定义配体结合位点。使用Ligprep模块构建和制备在本研究中描述的抑制剂用于对接。使用软件的Maestro界面进行数据分析。
LogD的确定。为了确定我们的抑制剂的亲脂性,使用摇瓶法测量在pH 7.4下的LogD。将测试化合物的10 mM DMSO储备溶液的等分试样加入含有2 mL正辛醇和pH=7.4的磷酸盐缓冲盐水(1:1 v/v)的Eppendorf中,以产生100 μM的终浓度。将试管摇动8小时,在10000 rpm下离心5分钟,然后分离正辛醇和磷酸盐缓冲盐水层。两层都使用LC-MS(Agilent Technologies 6470系列,三重四极LC/MS)进行分析。将峰的AUC比率用于根据以下方程式计算Log D:
Log D = Log10(辛醇层的AUC/磷酸盐缓冲盐水层的AUC)。
动力学溶解度的确定。通过以下来测量化合物(4b、4h、4k、4t、4u和4v)的动力学溶解度:在玻璃管形瓶中在25℃下将10 μL的20 mM DMSO储备液稀释到990 μL的pH=7.4的PBS缓冲液中(200 μM最终抑制剂浓度)。将所得混合物在500 rpm下搅拌90分钟,并然后使用0.45 μm PVDF膜过滤器过滤。过滤后,通过HPLC确定对应化合物的浓度,并将获得的AUC与来自化合物的标准溶液的AUC进行对比。数据代表一式三份进行的三个单独实验的平均值(±标准差,SD)。
小鼠肝微粒体测定。小鼠(CD-1)合并肝微粒体购自Fisher Scientific, IL, USA(0.5 mg/mL, Corning Gentest 3P, 目录号452702),并按照先前所报告的进行测定程序。将小鼠肝微粒体和1 mM的辅因子NADPH在1 ml磷酸盐缓冲盐水(pH = 7.4)中的溶液在Eppendorf管中预热至37℃。然后加入10 μL测试溶液(10 mM DMSO储备液)以启动反应。将盐酸维拉帕米用作阳性对照。进行了另一组对照无活性微粒体实验(没有辅因子NADPH)。将温育混合物保持在37℃,并在0、5、10、15、30或60 min的时间时取50 μL等分试样。使用200μL冰冷的乙腈淬灭每个等分试样。将混合物剧烈涡旋并离心以除去沉淀的蛋白,并通过Agilent Technologies 6470系列,三重四极LC/MS频谱仪分析上清液,以定量剩余的母体化合物。由下式计算剩余母体化合物的百分比:
% 剩余母体化合物= (在60 min的浓度/在0 min的浓度) * 100。
IC50的确定和Ki的确定。使用磷酸对硝基苯酯(pNPP)测定系统,在Cary100 UV-Vis分光光度计中,通过监测在405 nm处所形成产物对硝基苯酚(pNP)的吸光度增加,针对mPTPB来测试化合物。通过将mPTPB加入最终体积为200 μL的主混合物中开始反应,所述主混合物含有pH 7.0的戊二酸3,3-二甲酯缓冲液(50.0 mM, 1mM EDTA, 0.15M NaCl), 3.0mM pNPP。通过在固定酶浓度下改变抑制剂浓度并通过将剂量-响应数据拟合到GraphPadprism 7.02的四参数逻辑曲线(eq 1)模型中,确定每种化合物的IC50值,如下所示。
AI/A0 = IC50/(IC50 + [I])
其中AI是含有抑制剂的样品在405 nm处的吸光度;A0是无抑制剂在405 nm处的吸光度;以及[I]是抑制剂的浓度。
对于选择性研究,从大肠杆菌(BL21)表达和纯化PTP的催化结构域,包括SHP2、SHP1、PTP1B、mPTPA、TCPTP、FAP1、LAR、CD45-D1D2、PTPγ-D1D2、VHR、Cdc14A、LYP、PTP-MEG2、HePTP、PTPα-D1D2、Laforin、DEP-1-D1、MKP3、MKP5、YopH、PTP-PEST、STEP、PTPσ-D1D2、PTPβ-D1、PTP μ-D1、PTPε和LMWPTP。除了使用与所研究的PTP的Km相对应的不同pNPP浓度以外,在与mPTPB相同的条件下进行这些PTP的抑制测定。
在pH 7.0和25℃下测定了抑制剂针对mPTPB的抑制常数(K i)。在抑制剂的各种固定浓度下,通过如上所述跟踪对硝基苯酚(在405 nm处的UV吸光度)的产生,测量一系列pNPP浓度的初始速率,范围为表观Km值的0.2至5倍。使用SigmaPlot-酶动力学来拟合数据,以获得抑制常数并评估抑制模式。
细胞渗透性研究。使用Teuscher等人以前报道的方案在Raw264.7细胞中确定新型化合物的细胞内浓度。参见Teuscher, K.B.; Zhang, M.; Ji, H., A Versatile Methodto Determine the Cellular Bioavailability of Small-Molecule Inhibitors.J Med Chem 2017,60 (1), 157-169。化合物的校正曲线显示在补充图S48至S50中。HPLC分析的结果显示在补充图S50至S53中。将输入浓度设定至20 μM。在分别含有10% FBS(Invitrogen)、青霉素(50单位/mL)和链霉素(50 μg/mL)的Dulbecco改良Eagle培养基(DMEM)培养基中温育2h以后,确定4k、4s、4t和4u在37℃的细胞结合浓度。在这些实验中,将化合物9用作阳性对照。在相同条件下,所有这些化合物都表现出比化合物9更好的细胞渗透性。
细胞培养和转染。在含有5% CO2的增湿气氛下在37℃在补充有10% FBS(Invitrogen)、青霉素(50单位/mL)和链霉素(50 μg/mL)的Dulbecco改良Eagle培养基(DMEM)中培养Raw264.7小鼠巨噬细胞。将如先前报道的,将转染的Raw264.7细胞(Vector,WT-mPTPB)以2×104个细胞/孔的密度接种在24-孔板中。参见He, R.; Yu, Z.-H.; Zhang,R.-Y.; Wu, L.; Gunawan, A.M.; Zhang, Z.-Y., Cefsulodin Inspired Potent andSelective Inhibitors of mPTPB, a Virulent Phosphatase from Mycobacteriumtuberculosis.ACS Medicinal Chemistry Letters 2015,6 (12), 1231-1235。48小时以后,将细胞用不同浓度的mPTPB抑制剂4t处理2h,并然后用IFN-γ(20ng/ml)刺激1 h (化合物9作为我们的阳性对照)。然后将细胞用冰冷的磷酸盐缓冲盐水洗涤,并用裂解缓冲液在冰上裂解30 min。将细胞裂解物通过在13000 rpm下离心15 min来澄清。通过蛋白质印迹法检测ERK1/2、p38和Akt的磷酸化。
在一个实施方案中,本公开内容提供了式I的化合物:
Figure 474894DEST_PATH_IMAGE014
或其立体异构体、互变异构体、溶剂化物、药学上可接受的盐,
其中:
(R1)n代表1-3个连接至苯环的独立的R1,其中n是1-3,其中所述1-3个R1中的每个都独立地代表H、F、Cl、Br、I、-CN、-OR2、-COOR3、-NR4R5、-CO-R6、-SO2NR7R8、任选取代的C1-C8分支或未分支的烷基链、任选取代的C3-C8环烷基、任选取代的芳基或任选取代的包含一个或多个O、N或S的杂芳基,或当n是2时,两个独立的R1可以连接在一起以与苯环形成稠合二环;且
R2 - R8各自独立地代表H、任选取代的C1-C8分支或未分支的烷基链、任选取代的C3-C8环烷基、任选取代的芳基或任选取代的包含一个或多个O、N或S的杂芳基或氮保护基。
在关于式I的化合物的本公开内容的一个实施方案中,其中-HN-C(O)-COOH在直接连接的苯基基团的对位位置上。
在关于式I的化合物的本公开内容的一个实施方案中,其中在R1 - R8上的一个或多个氢可以任选地被一个或多个-OH、-F、-Cl、-Br、-CN或C1-C4烷氧基或任选取代的苯基基团所取代。
在关于式I的化合物的本公开内容的一个实施方案中,其中所述1-3个R1中的每个都独立地代表H、F、Cl、Br、I、-CN、-CF3、-OH、-OCF3、-COCF3、-COOCH3、-COOH、-N(CH3)2、-NHBoc、-SO2NH2、-OCH2Ph,或两个R1基团共同形成环,以与R1直接连接的苯基基团产生萘环。
在关于式I的化合物的本公开内容的一个实施方案中,其中所述化合物选自:
Figure 904738DEST_PATH_IMAGE015
Figure 457948DEST_PATH_IMAGE016
Figure DEST_PATH_IMAGE017
在一个实施方案中,本公开内容提供了用式I的化合物或其立体异构体、互变异构体、溶剂化物、药学上可接受的盐治疗具有结核病的患者的方法。
在关于治疗具有结核病的患者的方法的本公开内容的一个实施方案中,其中所述式I的化合物抑制结核分枝杆菌蛋白酪氨酸磷酸酶B (mPTPB)。
本领域技术人员将认识到,可以对上述具体实现做出众多修改。所述实现不应限于所描述的特定限制。其他实现也是可能的。

Claims (8)

1.式I的化合物:
Figure DEST_PATH_IMAGE002
或其立体异构体、互变异构体、溶剂化物、药学上可接受的盐,其中:
(R1)n代表1-3个连接至所述苯环的独立的R1,其中n是1-3,其中所述1-3个R1中的每个都独立地代表H、F、Cl、Br、I、-CN、-OR2、-COOR3、-NR4R5、-CO-R6、-SO2NR7R8、任选取代的C1-C8分支或未分支的烷基链、任选取代的C3-C8环烷基、任选取代的芳基或任选取代的包含一个或多个O、N或S的杂芳基,或当n是2时,两个独立的R1可以连接在一起以与所述苯环形成稠合二环;且
R2 - R8各自独立地代表H、任选取代的C1-C8分支或未分支的烷基链、任选取代的C3-C8环烷基、任选取代的芳基或任选取代的包含一个或多个O、N或S的杂芳基或氮保护基。
2.权利要求1的化合物,其中-HN-C(O)-COOH在所述直接连接的苯基基团的对位位置上。
3.权利要求1的化合物,其中在R1 - R8上的一个或多个氢可以任选地被一个或多个-OH、-F、-Cl、-Br、-CN或C1-C4烷氧基或任选取代的苯基基团取代。
4.权利要求1的化合物,其中所述1-3个R1中的每个都独立地代表H、F、Cl、Br、I、-CN、-CF3、-OH、-OCF3、-COCF3、-COOCH3、-COOH、-N(CH3)2、-NHBoc、-SO2NH2、-OCH2Ph,或两个R1基团共同形成环,以与所述R1直接连接的苯基基团产生萘环。
5.权利要求1的化合物,其中所述化合物选自:
Figure DEST_PATH_IMAGE004
Figure DEST_PATH_IMAGE006
Figure DEST_PATH_IMAGE008
6.用权利要求1的化合物或其立体异构体、互变异构体、溶剂化物、药学上可接受的盐治疗具有结核病的患者的方法。
7.权利要求6的方法,其中所述权利要求1的化合物抑制结核分枝杆菌蛋白酪氨酸磷酸酶B (mPTPB)。
8.权利要求6的方法,其中所述化合物选自权利要求5的一种或多种化合物。
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