CN114990158B - Scara3基因敲除仓鼠模型的构建方法 - Google Patents
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Abstract
本发明适用于疾病动物模型构建领域,提供了SCARA3基因敲除仓鼠模型的构建方法,包括以下步骤:步骤A、sgRNA的制备;步骤B、CAS9mRNA的制备;步骤C、供卵鼠及代孕鼠准备;步骤D、受精卵的收集及培养;步骤E、显微注射及回输;步骤F、子代仓鼠突变检测;步骤G、基因工程仓鼠品系构建。本发明构建SRA3敲除动物模型对病毒感染、肿瘤、脂肪肝、动脉粥样硬化疾病等疾病的深入研究具有重要的现实意义。
Description
技术领域
本发明属于疾病动物模型构建领域,尤其涉及SCARA3基因敲除仓鼠模型的构建方法。
背景技术
SRA3在许多其他组织及细胞中均有表达,是胞浆蛋白,表达于内质网-高尔基体核膜区域,在受到氧化应激后,更多弥散表达于胞浆中。
SRA3有三个可能的结构:跨膜区、a螺旋线圈样线圈结构域、类胶原结构,其中类胶原结构域能够和许多分子结合,包括脂质、血浆成分(纤维连接蛋白、层粘连蛋白、胶原、纤维蛋白原等),以及各种带负电的分子。
既往研究发现SRA3与病毒感染、肿瘤、脂肪肝、动脉粥样硬化疾病等疾病密切相关,但目前对SRA3的具体作用机制尚不明确。
因此,针对以上现状,迫切需要开发SCARA3基因敲除仓鼠模型的构建方法,以克服当前实际应用中的不足。
发明内容
本发明的目的在于提供SCARA3基因敲除仓鼠模型的构建方法,旨在解决上述背景中提到的问题。
本发明是这样实现的,SCARA3基因敲除仓鼠模型的构建方法,包括以下步骤:
步骤A、sgRNA的制备;
步骤B、CAS9mRNA的制备;
步骤C、供卵鼠及代孕鼠准备;
步骤D、受精卵的收集及培养;
步骤E、显微注射及回输;
步骤F、子代仓鼠突变检测;
步骤G、基因工程仓鼠品系构建。
进一步的技术方案,步骤A包括以下步骤:
a1)sgRNA靶点设计;
a2)sgRNA模板扩增;
a3)切胶回收纯化;
a4)蛋白酶K处理;
a5)酚仿醇抽提纯化;
a6)体外转录;
a7)质量检测;
a8)RNA纯化及保存。
进一步的技术方案,在步骤a1)中,利用NCBI网站获得仓鼠scara3基因组信息,选择其第二外显子;利用CRISPR设计网站选择适合位点,综合评价打靶效率及脱靶概率后,sgRNA的靶点序列确定为:GAGATCAGCTGGCGGTGACAG;在步骤a2)中,含有T7启动子、目的基因靶序列及sgRNA骨架结构的上下游模板链如下:F:TTAATACGACTCACTATAGGAGATCAGCTGGCGGTGACAGTTTTAGAGCTAGAAATAGCAAGT;R:TAAAATAAGGCTAGTCCGTTATCAACTTGAAAAAGTGGCACCGAGTCGGTGCTTTT;利用PCR体系合成sgRNA模板;在步骤a3)中,配制2%琼脂糖凝胶;产物电泳,120V 30分钟;将100~110bp处胶切下并纯化其中产物;检测浓度及吸光度比值OD260/OD280,OD260/OD230;在步骤a4)中,配制消化体系;50℃孵育30分钟;在步骤a5)中,加入300μL ddH2O,混合均匀;加入400μL三氯甲烷,垂直混悬器翻转5分钟;12000rpm,4℃离心15分钟;吸取上清,加入等体积三氯甲烷,垂直混悬器翻转5分钟;12000rpm,4℃离心15分钟;取上清,加入2.5倍体积在-20℃预冷的无水乙醇及1/10体积3mol/L醋酸钠溶液,混匀;-20℃静置20分钟;12000rpm,4℃离心15分钟;弃去上清,500μL-20℃预冷的70%乙醇洗涤两遍;室温晾干,加入10μL ddH2O溶解;检测浓度及吸光度比值OD260/OD280,OD260/OD230;在步骤a6)中,按照MEGAshortscriptTM T7kit说明书配制转录体系;37℃孵育4小时;加入1μLTURBO DNase,37℃孵育15分钟;在步骤a7)中,检测浓度及吸光度比值OD260/OD280,OD260/OD230;配制2%琼脂糖凝胶,120V电泳产物30分钟,拍照;在步骤a8)中,使用MEGAclearTMkit试剂盒对产物进行纯化;检测浓度及吸光度比值OD260/OD280,OD260/OD230;将浓度调整至50ng/μL,分装保存于-80℃环境。
进一步的技术方案,步骤B包括以下步骤:
b1)质粒线性化;
b2)蛋白酶K处理;
b3)酚仿醇抽提纯化;
b4)体外转录;
b5)质量检测;
b6)RNA纯化及保存。
进一步的技术方案,在步骤b1)中,配制酶切体系;37℃孵育4小时;加入5μL终止液;加入138μL-20℃预冷后的无水乙醇;-20℃冷却30分钟;12000rpm,4℃离心12分钟;在步骤b2)中,配制消化体系;50℃孵育30分钟;在步骤b3)中,加入300μLddH2O,混合均匀;加入400μL三氯甲烷,垂直混悬器翻转5分钟;12000rpm,4℃离心15分钟;吸取上清,加入等体积三氯甲烷,垂直混悬器翻转5分钟;12000rpm,4℃离心15分钟;取上清,加入2.5倍体积在-20℃预冷的无水乙醇及1/10体积3mol/L醋酸钠溶液,混匀;-20℃静置20分钟;12000rpm,4℃离心15分钟;弃去上清,500μL-20℃预冷的70%乙醇洗涤两遍;室温晾干,加入10μL ddH2O溶解;检测浓度及吸光度比值OD260/OD280,OD260/OD230;在步骤b4)中,按照mMESSAGEmMACHINE T7 kit说明书配制转录体系;37℃孵育2小时;加入1μL TURBO DNase,37℃孵育15分钟;在步骤b5)中,检测浓度及吸光度比值OD260/OD280,OD260/OD230;配制0.8%琼脂糖凝胶,120V电泳产物30分钟,拍照;在步骤b6)中,加入15μL醋酸铵缓冲液及165μL无RNase水,混合均匀;加入等体积酚仿醇抽提液,垂直混悬器翻转2分钟;12000rpm,4℃离心10分钟;取上清,加入等体积三氯甲烷,垂直混悬器翻转2分钟;12000rpm,4℃离心10分钟;取上清,加入等体积异丙醇,上下颠倒混匀;-20℃静置15分钟;12000rpm,4℃离心10分钟;弃去上清,200μL-20℃预冷的70%乙醇洗涤两遍;室温晾干,加入50μL无RNase水溶解;检测浓度及吸光度比值OD260/OD280,OD260/OD230;调整浓度至250ng/μL,分装保存于-80℃环境中。
进一步的技术方案,步骤C包括以下步骤:
c1)仓鼠动情周期为4天,其中第二天阴道分泌物为白色粘稠液体,可以此为标准判断其动情周期;
c2)在周期第二天中午11:00,及发情症状消失后,对供卵鼠腹腔注射20IU孕马血清促性腺激素(PMSG),同时挑选同样处于周期第二天的代孕鼠;
c3)至下一动情周期的第一天晚7:00,即雌鼠开始发情后,将供卵鼠及代孕鼠分别与雄鼠合笼交配。
进一步的技术方案,步骤D包括以下步骤:
d1)雌鼠与雄鼠交配合笼后第二天,用生理盐水冲洗供卵鼠及代孕鼠阴道,显微镜下观察有无精子,检测交配是否成功;
d2)选择交配成功供卵鼠,腹腔注射3%戊巴比妥钠麻醉,收集其输卵管;
d3)在解剖显微镜下,将输卵管置于M2培养基中,将其膨大的壶腹部撕开,挤出含受精卵的堆积物;
d4)分拣出受精卵,将受精卵治愈用石蜡油覆盖的HECM-10培养基中培养;培养温度为37.5℃,CO2浓度为10%。
进一步的技术方案,步骤E包括以下步骤:
e1)用无RNase水将CAS9 mRNA及sgRNA混合,其中CAS9 mRNA终浓度为100ng/μL,sgRNA终浓度为25ng/μL;
e2)在注射皿中,加入100μLM2培养基,用石蜡油覆盖;
e3)受精卵转移至注射皿中,将CAS9 mRNA及sgRNA注射入受精卵内;
e4)将注射后的受精卵转移回HECM-10培养基中,培养30分钟;
e5)选择交配成功代孕鼠,腹腔注射3%戊巴比妥钠麻醉,背部开口暴露其输卵管;
e6)将状态较好的注射后受精卵回输入输卵管壶腹部,每侧输卵管回输约15个受精卵。
进一步的技术方案,步骤F包括以下步骤:
f1)仓鼠怀孕周期为17天,待幼鼠出生后一周,收集少量脚趾组织;
f2)仓鼠组织DNA提取;
f3)PCR扩增目的片段;
其中,在步骤f2)中,将仓鼠脚趾组织放入离心管中,加入300μL DNA消化缓冲液和20μL蛋白酶K溶液(20mg/mL);55℃消化4小时;加入300μL双蒸水和600ul酚仿醇抽提液,涡旋10分钟;12000rpm,4℃离心30分钟;吸取400μL上清,加入400μL三氯甲烷,涡旋2分钟;12000rpm,4℃离心30分钟;吸取350μL上清,加入350μL异丙醇,上下颠倒混匀;室温静置10分钟;12000rpm,4℃离心15分钟;70%乙醇洗涤沉淀两次;自然晾干,加入20μL双蒸水溶解DNA;在步骤f3)中,配制PCR反应体系;产物送测序确定具体序列;比对分析是否发生突变;由于突变仓鼠目的基因处往往发生多种突变,因此测序结果显示为双峰;选择scara3基因发生突变仓鼠,记为Founder。
进一步的技术方案,步骤G包括以下步骤:
g1)Founder鼠与WT鼠交配,其子代记为F1;
g2)检测F1是否出现基因突变;
g3)将F1杂合子仓鼠互相交配,其子代记为F2;
g4)检测F2是否出现基因突变纯合子个体;
g5)纯合子个体互相交配,扩大品系;
其中,在步骤g2)中,提取F1代组织DNA并PCR扩增目的片段(方法同步骤F);配制4%琼脂糖凝胶,120V电泳产物1小时,检测有无杂合子。
本发明提供的SCARA3基因敲除仓鼠模型的构建方法,是研究基因功能及其与疾病关系的重要工具,巨噬细胞A类清道夫受体3(SCARA3/SRA3)能清除氧自由基及其氧化应激副产物,对紫外线放射和氧化应激造成的细胞损伤具有保护作用,构建SRA3敲除动物模型对病毒感染、肿瘤、脂肪肝、动脉粥样硬化疾病等疾病的深入研究具有重要的现实意义。
附图说明
图1为Scara3基因敲除模型构建示意图;
图2为SRA3基因敲除仓鼠DNAPCR电泳基因型鉴定结果;
图3为SRA3基因敲除纯合子仓鼠血浆TG;
图4为SRA3基因敲除纯合子仓鼠血浆TC;
图5为SRA3基因敲除纯合子仓鼠体重;
图6为SRA3基因敲除仓鼠肝组织切片天狼星红染色照片;
图7为SRA3基因敲除仓鼠肝脏脂质成分测定结果;
图8为SRA3基因敲除oral fat load实验结果;
图9为SRA3基因敲除仓鼠血浆血糖实验结果;
图10为SRA3基因敲除仓鼠糖耐量实验结果;
图11为SRA3基因敲除仓鼠胰岛素耐量结果;
图12为SRA3基因敲除VLDL分泌结果。
具体实施方式
为了使本发明的目的、技术方案及优点更加清楚明白,以下结合附图及实施例,对本发明进行进一步详细说明。应当理解,此处所描述的具体实施例仅仅用以解释本发明,并不用于限定本发明。
以下结合具体实施例对本发明的具体实现进行详细描述。
如图1-12所示,为本发明一个实施例提供的SCARA3基因敲除仓鼠模型的构建方法,包括以下步骤:
步骤A、sgRNA的制备;
a1)sgRNA靶点设计;
利用NCBI网站获得仓鼠scara3基因组信息(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ nuccore/NW_004801657.1?report=genbank&from=2484888&to=2514120),选择其第二外显子;
1)利用CRISPR设计网站(http://crispr.mit.edu/)选择适合位点,综合评价打靶效率及脱靶概率后,sgRNA的靶点序列确定为:GAGATCAGCTGGCGGTGACAG;
a2)sgRNA模板扩增;
1)含有T7启动子、目的基因靶序列及sgRNA骨架结构的上下游模板链如下:
F:TTAATACGACTCACTATAGGAGATCAGCTGGCGGTGACAGTTTTAGAGCTAGAAATAGCAAGT;
R:TAAAATAAGGCTAGTCCGTTATCAACTTGAAAAAGTGGCACCGAGTCGGTGCTTTT;
2)利用PCR体系合成sgRNA模板:
3)PCR程序如下:
a3)切胶回收纯化;
1)配制2%琼脂糖凝胶;
2)产物电泳,120V 30分钟;
3)将100~110bp处胶切下并纯化其中产物;
4)检测浓度及吸光度比值OD260/OD280,OD260/OD230;
a4)蛋白酶K处理;
1)配制消化体系:
2)50℃孵育30分钟;
a5)酚仿醇抽提纯化;
1)加入300μL ddH2O,混合均匀;
2)加入400μL三氯甲烷,垂直混悬器翻转5分钟;
3)12000rpm,4℃离心15分钟;
4)吸取上清,加入等体积三氯甲烷,垂直混悬器翻转5分钟;
5)12000rpm,4℃离心15分钟;
6)取上清,加入2.5倍体积在-20℃预冷的无水乙醇及1/10体积3mol/L醋酸钠溶液,混匀;
7)-20℃静置20分钟;
8)12000rpm,4℃离心15分钟;
9)弃去上清,500μL-20℃预冷的70%乙醇洗涤两遍;
10)室温晾干,加入10μL ddH2O溶解;
11)检测浓度及吸光度比值OD260/OD280,OD260/OD230;
a6)体外转录;
1)按照MEGAshortscriptTM T7 kit说明书配制转录体系:
2)37℃孵育4小时;
3)加入1μL TURBO DNase,37℃孵育15分钟;
a7)质量检测;
1)检测浓度及吸光度比值OD260/OD280,OD260/OD230;
2)配制2%琼脂糖凝胶,120V电泳产物30分钟,拍照;
a8)RNA纯化及保存;
1)使用MEGAclearTM kit试剂盒对产物进行纯化;
2)检测浓度及吸光度比值OD260/OD280,OD260/OD230;
3)将浓度调整至50ng/μL,分装保存于-80℃环境。
步骤B、CAS9mRNA的制备;
本研究所用PXT7质粒上含有人源化CAS9 cDNA,可作为CAS9 mRNA模板;含有氨苄抗性位点,可用于质粒扩增;含有XbaI酶切位点,可用于质粒线性化。
b1)质粒线性化;
1)配制酶切体系:
2)37℃孵育4小时;
3)加入5μL终止液;
4)加入138μL-20℃预冷后的无水乙醇;
5)-20℃冷却30分钟;
6)12000rpm,4℃离心12分钟;
b2)蛋白酶K处理;
1)配制消化体系:
2)50℃孵育30分钟;
b3)酚仿醇抽提纯化;
1)加入300μLddH2O,混合均匀;
2)加入400μL三氯甲烷,垂直混悬器翻转5分钟;
3)12000rpm,4℃离心15分钟;
4)吸取上清,加入等体积三氯甲烷,垂直混悬器翻转5分钟;
5)12000rpm,4℃离心15分钟;
6)取上清,加入2.5倍体积在-20℃预冷的无水乙醇及1/10体积3mol/L醋酸钠溶液,混匀;
7)-20℃静置20分钟;
8)12000rpm,4℃离心15分钟;
9)弃去上清,500μL-20℃预冷的70%乙醇洗涤两遍;
10)室温晾干,加入10μL ddH2O溶解;
11)检测浓度及吸光度比值OD260/OD280,OD260/OD230;
b4)体外转录;
1)按照mMESSAGEmMACHINE T7 kit说明书配制转录体系:
2)37℃孵育2小时;
3)加入1μL TURBO DNase,37℃孵育15分钟;
b5)质量检测;
1)检测浓度及吸光度比值OD260/OD280,OD260/OD230;
2)配制0.8%琼脂糖凝胶,120V电泳产物30分钟,拍照;
b6)RNA纯化及保存;
1)加入15μL醋酸铵缓冲液及165μL无RNase水,混合均匀;
2)加入等体积酚仿醇抽提液,垂直混悬器翻转2分钟;
3)12000rpm,4℃离心10分钟;
4)取上清,加入等体积三氯甲烷,垂直混悬器翻转2分钟;
5)12000rpm,4℃离心10分钟;
6)取上清,加入等体积异丙醇,上下颠倒混匀;
7)-20℃静置15分钟;
8)12000rpm,4℃离心10分钟;
9)弃去上清,200μL-20℃预冷的70%乙醇洗涤两遍;
10)室温晾干,加入50μL无RNase水溶解;
11)检测浓度及吸光度比值OD260/OD280,OD260/OD230;
12)调整浓度至250ng/μL,分装保存于-80℃环境中。
步骤C、供卵鼠及代孕鼠准备;
c1)仓鼠动情周期为4天,其中第二天阴道分泌物为白色粘稠液体,可以此为标准判断其动情周期;
c2)在周期第二天中午11:00,及发情症状消失后,对供卵鼠腹腔注射20IU孕马血清促性腺激素(PMSG),同时挑选同样处于周期第二天的代孕鼠;
c3)至下一动情周期的第一天晚7:00,即雌鼠开始发情后,将供卵鼠及代孕鼠分别与雄鼠合笼交配。
步骤D、受精卵的收集及培养;
d1)雌鼠与雄鼠交配合笼后第二天,用生理盐水冲洗供卵鼠及代孕鼠阴道,显微镜下观察有无精子,检测交配是否成功;
d2)选择交配成功供卵鼠,腹腔注射3%戊巴比妥钠麻醉,收集其输卵管;
d3)在解剖显微镜下,将输卵管置于M2培养基中,将其膨大的壶腹部撕开,挤出含受精卵的堆积物;
d4)分拣出受精卵,将受精卵治愈用石蜡油覆盖的HECM-10培养基中培养;培养温度为37.5℃,CO2浓度为10%。
步骤E、显微注射及回输;
e1)用无RNase水将CAS9 mRNA及sgRNA混合,其中CAS9 mRNA终浓度为100ng/μL,sgRNA终浓度为25ng/μL;
e2)在注射皿中,加入100μLM2培养基,用石蜡油覆盖;
e3)受精卵转移至注射皿中,将CAS9 mRNA及sgRNA注射入受精卵内;
e4)将注射后的受精卵转移回HECM-10培养基中,培养30分钟;
e5)选择交配成功代孕鼠,腹腔注射3%戊巴比妥钠麻醉,背部开口暴露其输卵管;
e6)将状态较好的注射后受精卵回输入输卵管壶腹部,每侧输卵管回输约15个受精卵。
步骤F、子代仓鼠突变检测;
f1)仓鼠怀孕周期为17天,待幼鼠出生后一周,收集少量脚趾组织;
f2)仓鼠组织DNA提取;
1)将仓鼠脚趾组织放入离心管中,加入300μL DNA消化缓冲液和20μL蛋白酶K溶液(20mg/mL);
2)55℃消化4小时;
3)加入300μL双蒸水和600ul酚仿醇抽提液,涡旋10分钟;
4)12000rpm,4℃离心30分钟;
5)吸取400μL上清,加入400μL三氯甲烷,涡旋2分钟;
6)12000rpm,4℃离心30分钟;
7)吸取350μL上清,加入350μL异丙醇,上下颠倒混匀;
8)室温静置10分钟;
9)12000rpm,4℃离心15分钟;
10)70%乙醇洗涤沉淀两次;
11)自然晾干,加入20μL双蒸水溶解DNA。
f3)PCR扩增目的片段;
1)配制PCR反应体系:
2)按照以下程序进行PCR:
3)产物送测序确定具体序列;
4)比对分析是否发生突变;由于突变仓鼠目的基因处往往发生多种突变,因此测序结果显示为双峰;
5)选择scara3基因发生突变仓鼠,记为Founder。
步骤G、基因工程仓鼠品系构建;
g1)Founder鼠与WT鼠交配,其子代记为F1;
g2)检测F1是否出现基因突变;
1)提取F1代组织DNA并PCR扩增目的片段(方法同步骤F);
2)配制4%琼脂糖凝胶,120V电泳产物1小时,检测有无杂合子;
g3)将F1杂合子仓鼠互相交配,其子代记为F2;
g4)检测F2是否出现基因突变纯合子个体;
g5)纯合子个体互相交配,扩大品系。
本发明提出的SCARA3基因敲除仓鼠模型的构建方法,是研究基因功能及其与疾病关系的重要工具,巨噬细胞A类清道夫受体3(SCARA3/SRA3)能清除氧自由基及其氧化应激副产物,对紫外线放射和氧化应激造成的细胞损伤具有保护作用,构建SRA3敲除动物模型对病毒感染、肿瘤、脂肪肝、动脉粥样硬化疾病等疾病的深入研究具有重要的现实意义。
以上所述仅为本发明的较佳实施例而已,并不用以限制本发明,凡在本发明的精神和原则之内所作的任何修改、等同替换和改进等,均应包含在本发明的保护范围之内。
Claims (8)
1.SCARA3基因敲除仓鼠模型的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:
步骤A、sgRNA的制备;
步骤B、CAS9mRNA的制备;
步骤C、供卵鼠及代孕鼠准备;
步骤D、受精卵的收集及培养;
步骤E、显微注射及回输;
步骤F、子代仓鼠突变检测;
步骤G、基因工程仓鼠品系构建;
其中,步骤A包括以下步骤:
a1)sgRNA靶点设计;
a2)sgRNA模板扩增;
a3)切胶回收纯化;
a4)蛋白酶K处理;
a5)酚仿醇抽提纯化;
a6)体外转录;
a7)质量检测;
a8)RNA纯化及保存;
在步骤a1)中,利用NCBI网站获得仓鼠scara3基因组信息,选择其第二外显子;利用CRISPR设计网站选择适合位点,综合评价打靶效率及脱靶概率后,sgRNA的靶点序列确定为:GAGATCAGCTGGCGGTGACAG;
在步骤a2)中,含有T7启动子、目的基因靶序列及sgRNA骨架结构的上下游模板链如下:
F:TTAATACGACTCACTATAGGAGATCAGCTGGCGGTGACAGTTTTAGAGCTAGAAATAGCAAGT;R:TAAAATAAGGCTAGTCCGTTATCAACTTGAAAAAGTGGCACCGAGTCGGTGCTTTT;利用PCR体系合成sgRNA模板;
在步骤a3)中,配制2%琼脂糖凝胶;产物电泳,120V 30分钟;将100~110bp处胶切下并纯化其中产物;检测浓度及吸光度比值OD260/OD280,OD260/OD230;
在步骤a4)中,配制消化体系;50℃孵育30分钟;
在步骤a5)中,加入300μL ddH2O,混合均匀;加入400μL三氯甲烷,垂直混悬器翻转5分钟;12000rpm,4℃离心15分钟;吸取上清,加入等体积三氯甲烷,垂直混悬器翻转5分钟;12000rpm,4℃离心15分钟;取上清,加入2.5倍体积在-20℃预冷的无水乙醇及1/10体积3mol/L醋酸钠溶液,混匀;-20℃静置20分钟;12000rpm,4℃离心15分钟;弃去上清,500μL-20℃预冷的70%乙醇洗涤两遍;室温晾干,加入10μL ddH2O溶解;检测浓度及吸光度比值OD260/OD280,OD260/OD230;
在步骤a6)中,按照MEGAshortscriptTM T7 kit说明书配制转录体系;37℃孵育4小时;加入1μL TURBO DNase,37℃孵育15分钟;
在步骤a7)中,检测浓度及吸光度比值OD260/OD280,OD260/OD230;配制2%琼脂糖凝胶,120V电泳产物30分钟,拍照;
在步骤a8)中,使用MEGAclearTM kit试剂盒对产物进行纯化;检测浓度及吸光度比值OD260/OD280,OD260/OD230;将浓度调整至50ng/μL,分装保存于-80℃环境。
2.根据权利要求1所述的SCARA3基因敲除仓鼠模型的构建方法,其特征在于,步骤B包括以下步骤:
b1)质粒线性化;
b2)蛋白酶K处理;
b3)酚仿醇抽提纯化;
b4)体外转录;
b5)质量检测;
b6)RNA纯化及保存。
3.根据权利要求2所述的SCARA3基因敲除仓鼠模型的构建方法,其特征在于,在步骤b1)中,配制酶切体系;37℃孵育4小时;加入5μL终止液;加入138μL-20℃预冷后的无水乙醇;-20℃冷却30分钟;12000rpm,4℃离心12分钟;
在步骤b2)中,配制消化体系;50℃孵育30分钟;
在步骤b3)中,加入300μLddH2O,混合均匀;加入400μL三氯甲烷,垂直混悬器翻转5分钟;12000rpm,4℃离心15分钟;吸取上清,加入等体积三氯甲烷,垂直混悬器翻转5分钟;12000rpm,4℃离心15分钟;取上清,加入2.5倍体积在-20℃预冷的无水乙醇及1/10体积3mol/L醋酸钠溶液,混匀;-20℃静置20分钟;12000rpm,4℃离心15分钟;弃去上清,500μL-20℃预冷的70%乙醇洗涤两遍;室温晾干,加入10μL ddH2O溶解;检测浓度及吸光度比值OD260/OD280,OD260/OD230;
在步骤b4)中,按照mMESSAGEmMACHINE T7 kit说明书配制转录体系;37℃孵育2小时;加入1μL TURBO DNase,37℃孵育15分钟;
在步骤b5)中,检测浓度及吸光度比值OD260/OD280,OD260/OD230;配制0.8%琼脂糖凝胶,120V电泳产物30分钟,拍照;
在步骤b6)中,加入15μL醋酸铵缓冲液及165μL无RNase水,混合均匀;加入等体积酚仿醇抽提液,垂直混悬器翻转2分钟;12000rpm,4℃离心10分钟;取上清,加入等体积三氯甲烷,垂直混悬器翻转2分钟;12000rpm,4℃离心10分钟;取上清,加入等体积异丙醇,上下颠倒混匀;-20℃静置15分钟;12000rpm,4℃离心10分钟;弃去上清,200μL-20℃预冷的70%乙醇洗涤两遍;室温晾干,加入50μL无RNase水溶解;检测浓度及吸光度比值OD260/OD280,OD260/OD230;调整浓度至250ng/μL,分装保存于-80℃环境中。
4.根据权利要求1所述的SCARA3基因敲除仓鼠模型的构建方法,其特征在于,步骤C包括以下步骤:
c1)仓鼠动情周期为4天,其中第二天阴道分泌物为白色粘稠液体,可以此为标准判断其动情周期;
c2)在周期第二天中午11:00,及发情症状消失后,对供卵鼠腹腔注射20IU孕马血清促性腺激素,同时挑选同样处于周期第二天的代孕鼠;
c3)至下一动情周期的第一天晚7:00,即雌鼠开始发情后,将供卵鼠及代孕鼠分别与雄鼠合笼交配。
5.根据权利要求1所述的SCARA3基因敲除仓鼠模型的构建方法,其特征在于,步骤D包括以下步骤:
d1)雌鼠与雄鼠交配合笼后第二天,用生理盐水冲洗供卵鼠及代孕鼠阴道,显微镜下观察有无精子,检测交配是否成功;
d2)选择交配成功供卵鼠,腹腔注射3%戊巴比妥钠麻醉,收集其输卵管;
d3)在解剖显微镜下,将输卵管置于M2培养基中,将其膨大的壶腹部撕开,挤出含受精卵的堆积物;
d4)分拣出受精卵,将受精卵治愈用石蜡油覆盖的HECM-10培养基中培养;培养温度为37.5℃,CO2浓度为10%。
6.根据权利要求1所述的SCARA3基因敲除仓鼠模型的构建方法,其特征在于,步骤E包括以下步骤:
e1)用无RNase水将CAS9 mRNA及sgRNA混合,其中CAS9 mRNA终浓度为100ng/μL,sgRNA终浓度为25ng/μL;
e2)在注射皿中,加入100μLM2培养基,用石蜡油覆盖;
e3)受精卵转移至注射皿中,将CAS9 mRNA及sgRNA注射入受精卵内;
e4)将注射后的受精卵转移回HECM-10培养基中,培养30分钟;
e5)选择交配成功代孕鼠,腹腔注射3%戊巴比妥钠麻醉,背部开口暴露其输卵管;
e6)将状态较好的注射后受精卵回输入输卵管壶腹部,每侧输卵管回输约15个受精卵。
7.根据权利要求1所述的SCARA3基因敲除仓鼠模型的构建方法,其特征在于,步骤F包括以下步骤:
f1)仓鼠怀孕周期为17天,待幼鼠出生后一周,收集少量脚趾组织;
f2)仓鼠组织DNA提取;
f3)PCR扩增目的片段;
其中,在步骤f2)中,将仓鼠脚趾组织放入离心管中,加入300μL DNA消化缓冲液和20μL浓度为20mg/mL的蛋白酶K溶液;55℃消化4小时;加入300μL双蒸水和600ul酚仿醇抽提液,涡旋10分钟;12000rpm,4℃离心30分钟;吸取400μL上清,加入400μL三氯甲烷,涡旋2分钟;12000rpm,4℃离心30分钟;吸取350μL上清,加入350μL异丙醇,上下颠倒混匀;室温静置10分钟;12000rpm,4℃离心15分钟;70%乙醇洗涤沉淀两次;自然晾干,加入20μL双蒸水溶解DNA;
在步骤f3)中,配制PCR反应体系;产物送测序确定具体序列;比对分析是否发生突变;由于突变仓鼠目的基因处往往发生多种突变,因此测序结果显示为双峰;选择scara3基因发生突变仓鼠,记为Founder。
8.根据权利要求1所述的SCARA3基因敲除仓鼠模型的构建方法,其特征在于,步骤G包括以下步骤:
g1)Founder鼠与WT鼠交配,其子代记为F1;
g2)检测F1是否出现基因突变;
g3)将F1杂合子仓鼠互相交配,其子代记为F2;
g4)检测F2是否出现基因突变纯合子个体;
g5)纯合子个体互相交配,扩大品系;
其中,在步骤g2)中,提取F1代组织DNA并PCR扩增目的片段,方法同步骤F;配制4%琼脂糖凝胶,120V电泳产物1小时,检测有无杂合子。
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