CN114814230A - 一种生物标记物 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及用于评估病毒感染和/或由其所导致的病毒性肺炎的严重程度、评估疗法对病毒感染和/或由其所导致的病毒性肺炎的治疗效果的生物标记物。

Description

一种生物标记物
技术领域
本发明涉及用于评估病毒感染和/或由其所导致的病毒性肺炎的严重程度、评估疗法对病毒感染和/或由其所导致的病毒性肺炎的治疗效果的生物标记物。
背景技术
病毒感染经常在不同感染者中表现出不同的严重程度，例如，病毒感染可引起肺部炎症性病变，即病毒性肺炎，轻症可表现为发热、寒战、疲劳、咳嗽等症状，重症则可表现为呼吸困难、胸痛、心率加快、甚至死亡。因此需要对感染进行严重程度分层以避免或减少感染期间致命事件的发生和/或选择最合适的治疗方法来治疗该感染。然而，根据严重程度的分层往往基于患者的临床表型，而临床表型往往是由于患者内在环境的改变引起的，单独使用临床表型对患者的分型具有一定的滞后性。因此，通过内源性指标变化检测病毒感染的严重程度具有重要意义。本文所述的病毒感染可以包括例如由冠状病毒(如SARS-CoV-1、SARS-CoV-2或MERS)、流感病毒(例如甲型流感病毒)、呼吸道合胞病毒、腺病毒、鼻病毒或副流感病毒等呼吸道病毒导致的感染。
一个例子是SARS-CoV-2感染。SARS-CoV-2属于冠状病毒科的β冠状病毒属(Sarbecovirus亚属)，是一种有包膜的正意单链核糖核酸(RNA)病毒，也是被发现的第七种已知感染人类的冠状病毒(HCoV)。SARS-CoV-2感染可根据临床表现分为轻症、中症、重症和危重症。目前的诊断检测可以包括检测病毒本身(病毒RNA或抗原)，或检测人类对感染的免疫反应(抗体或其它生物标志物)。然而，目前临床上缺乏有效评估SARS-CoV-2感染的严重程度以及评估疗法对SARS-CoV-2感染有效性的生物标志物。
癌胚抗原(Carcinoembryonic antigen，CEA)是一种具有人类胚胎抗原特异决定簇的抗原，是重要的肿瘤相关抗原，早期胎儿中由内胚层衍生而来，由胎儿胃肠道上皮组织、胰和肝细胞所合成。1965年，Gold和Freedman首先从胎儿及结肠癌组织中发现，故将其称为癌胚抗原。CEA是一种广谱肿瘤标志物，常与其他肿瘤标志物结合检测。目前，癌胚抗原CEA的表达检测主要用于肿瘤的预测，并未有将其作为病毒感染标志物的任何相关报道。
发明内容
本申请的发明人出人意料地发现，在引起病毒性肺炎的病毒(例如呼吸道病毒)感染者中，CEA水平与疾病严重程度具有很好的相关性，CEA水平伴随病情的不断恶化而逐步升高，患者病情稳定及逆转后其水平逐步恢复正常水平。基于这些发现，本发明人开发了用于评估患有病毒感染和/或由其所导致的病毒性肺炎的受试者的疾病严重程度以及用于评估疗法对病毒感染和/或由其所导致的病毒性肺炎的受试者的治疗效果的生物标志物。
用于评估疾病严重程度
在一个方面，本发明提供了能够检测CEA水平的试剂在制备试剂盒中的用途，所述试剂盒用于评估患有病毒感染和/或由其所导致的病毒性肺炎的受试者的疾病严重程度。
在某些实施方案中，所述病毒选自能够导致病毒性肺炎的病毒。在某些实施方案中，所述病毒为呼吸道病毒，例如冠状病毒(例如SARS-CoV-1，SARS-CoV-2，或MERS-CoV)、流感病毒(例如甲型流感病毒)、呼吸道合胞病毒、腺病毒、鼻病毒或副流感病毒。
在某些实施方案中，所述病毒为SARS-CoV-2，所述病毒性肺炎是新型冠状病毒性肺炎(COVID-19)。
在某些实施方案中，所述病毒为SARS-CoV-1，所述病毒性肺炎是严重急性呼吸综合征(SARS)。
在某些实施方案中，所述病毒为MERS-CoV，所述病毒性肺炎是中东呼吸综合征(MERS)。
在某些实施方案中，所述病毒为流感病毒(例如甲型流感病毒)，所述病毒性肺炎是流感病毒肺炎。
在某些实施方案中，所述病毒为呼吸道合胞病毒，所述病毒性肺炎是呼吸道合胞病毒肺炎。
在某些实施方案中，所述病毒为腺病毒，所述病毒性肺炎是腺病毒肺炎。
在某些实施方案中，所述病毒为鼻病毒，所述病毒性肺炎是鼻病毒肺炎。
在某些实施方案中，所述病毒为副流感病毒，所述病毒性肺炎是副流感病毒肺炎。
在某些实施方案中，所述能够检测CEA水平的试剂可以通过本领域已知的任何合适的检测方法来测定CEA的水平。非限制性实例包括免疫学检测、质谱法或光谱法，等等。
在某些实施方案中，所述试剂通过免疫学检测来测定CEA的水平。在某些实施方案中，所述免疫学检测选自酶联免疫吸附测定法(ELISA)、电化学免疫分析法(ECIA)、化学发光免疫分析法(CLIA)、电化学发光免疫分析法(ECLIA)、荧光免疫分析法(FIA)或放射免疫测定法(RIA)。
在某些实施方案中，所述试剂包含能够特异性结合CEA的抗体。所述试剂所包含的抗体可以是一种，也可以是多种(例如2种或更多种)的组合。优选地，所述多种(例如2种或更多)抗体具有彼此不同的抗原结合位点。
在一些实施方案中，所述试剂包含一种能够特异性结合CEA的抗体，其具有抗原结合位点和可检测的标记。在某些实施方案中，所述可检测的标记选自酶(例如辣根过氧化物酶或碱性磷酸酶)、化学发光试剂(例如吖啶酯类化合物)、电化学发光试剂(例如三联吡啶钌)、电活性物质、荧光染料(例如FITC、TRITC、PE、德克萨斯红或花菁染料衍生物(例如Cy7、Alexa 750))、放射性核素(例如放射性碘)或生物素。
在另一些实施方案中，所述试剂包含多种(例如2种或更多)能够特异性结合CEA的抗体的组合。在某些实施方案中，所述试剂通过双抗体夹心法测定CEA的水平。在某些实施方案中，所述试剂包含能够特异性结合CEA的第一抗体作为捕获试剂，以及能够特异性结合CEA的第二抗体作为检测试剂。在某些实施方案中，所述第二抗体具有与第一抗体不同的抗原结合位点。在某些实施方案中，所述第二抗体带有可检测的标记。在某些实施方案中，所述可检测的标记选自酶(例如辣根过氧化物酶或碱性磷酸酶)、化学发光试剂(例如吖啶酯类化合物)、电化学发光试剂(例如三联吡啶钌)、电活性物质、荧光染料(例如FITC、TRITC、PE、德克萨斯红或花菁染料衍生物(例如Cy7、Alexa 750))、放射性核素(例如放射性碘)或生物素。
在某些实施方案中，所述试剂通过质谱法来测定CEA的水平。在某些实施方案中，所述质谱为基质辅助激光解吸离子化质谱，例如基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)。
在某些实施方案中，所述试剂通过光谱法来测定CEA的水平。在某些实施方案中，所述光谱法为紫外可见分光光度法。
在某些实施方案中，所述评估包括下述步骤：(1)测定来自所述受试者的样品中CEA的水平；(2)将所述水平与参考值相比较；和(3)评估所述受试者的疾病严重程度。
应理解步骤(1)和(2)中所述的“水平”包括所述生物标记物的绝对量、相对量或浓度以及与其相关或可以从其衍生的任何值或参数。
应理解步骤(2)中所述的“比较”通常指对应参数或值的比较，例如将绝对量与绝对参考量比较，而将浓度与参考浓度比较，或者将获自样品中生物标志物的强度信号与获自参考样品的相同类型的强度信号比较。比较可以手动或计算机辅助进行。获自个体或患者的样品中生物标志物的测量的或检测的水平和参考水平的值可以例如彼此比较，并且所述比较可以通过执行用于比较的算法的计算机程序自动进行。
应理解步骤(2)中所述的“参考值”指允许在患有病毒感染和/或由其所导致的病毒性肺炎的受试者中确定严重程度(例如轻症(mild)、中症(moderate)、重症(severe)和/或危重症(critical))的值。例如，当用于确定感染SARS-CoV-2和/或患有COVID-19的受试者时，所述严重程度可以包括轻症(mild)、中症(moderate)、重症(severe)和/或危重症(critical)。参考值可以是预先测定的，并设定以满足在例如特异性和/或灵敏性方面的常规要求。
基于本发明中给出的教导，获得这样的参考值在本领域普通技术人员的能力范围内。例如，可以对代表性群体测定本发明所述的生物标记物的水平，并通过合适的统计学方法(例如中值、平均值、分位数、PLS-DA、逻辑回归方法、随机森林分类或者其他给出阈值的方法)计算参考值。阈值应当考虑诊断和预后测试的灵敏性和特异性的希望的临床设定。
参考值可以来源于处于不同严重程度的受试者的样品。例如，如果要区分SARS-CoV-2感染或COVID-19的轻症(mild)、中症(moderate)、重症(severe)和危重症(critical)，那么参考值可以来源于(i)处于轻症的受试者，(ii)处于中症的受试者，(iii)处于重症的受试者，和/或(iv)处于危重症的受试者的样品。例如，如果要区分轻症(mild)/中症(moderate)与重症(severe)/危重症(critical)，那么参考值可以来源于(i)处于轻症的受试者的样品以及处于中症的受试者(例如两个群体中个体测定值的平均值或中值)，或(ii)处于重症的受试者的样品以及处于危重症的受试者的样品(例如两个群体中个体测定值的平均值或中值)。
在某些实施方案中，所述评估包括区分重症/危重症与轻症/中症(例如SARS-CoV-2感染或COVID-19的重症/危重症与轻症/中症)，所述参考值代表处于轻症/中症的受试者的样品中该生物标志物的水平。在某些实施方案中，如果所述水平高于参考值的话，则判断所述受试者患有重症/危重症或处于患有重症/危重症的风险中。
在某些实施方案中，所述评估包括区分轻症、中症、重症和危重症(例如SARS-CoV-2感染或COVID-19的轻症、中症、重症和危重症)，所述参考值可以代表处于上述不同严重程度的受试者的样品中该生物标志物的水平。
在某些实施方案中，所述样品为血液、唾液、鼻咽和/或口咽拭子、鼻咽或鼻腔冲洗/抽吸物，气管抽吸物、痰、尿液、粪便、腹水、灌洗液、脑脊液、活检组织(例如肺组织)。在某些实施方案中，所述样品选自血液样品，例如全血、血清或血浆。
用于评估疗效
在另一个方面，本发明提供了能够检测CEA水平的试剂在制备试剂盒中的用途，所述试剂盒用于评估疗法对患有病毒感染和/或由其所导致的病毒性肺炎的受试者的治疗效果。
在某些实施方案中，所述病毒选自能够导致病毒性肺炎的病毒。在某些实施方案中，所述病毒为呼吸道病毒，例如冠状病毒(例如SARS-CoV-1，SARS-CoV-2，或MERS-CoV)、流感病毒(例如甲型流感病毒)、呼吸道合胞病毒、腺病毒、鼻病毒或副流感病毒。
在某些实施方案中，所述病毒为SARS-CoV-2，所述病毒性肺炎是新型冠状病毒性肺炎(COVID-19)。
在某些实施方案中，所述病毒为SARS-CoV-1，所述病毒性肺炎是严重急性呼吸综合征(SARS)。
在某些实施方案中，所述病毒为MERS-CoV，所述病毒性肺炎是中东呼吸综合征(MERS)。
在某些实施方案中，所述病毒为流感病毒(例如甲型流感病毒)，所述病毒性肺炎是流感病毒肺炎。
在某些实施方案中，所述病毒为呼吸道合胞病毒，所述病毒性肺炎是呼吸道合胞病毒肺炎。
在某些实施方案中，所述病毒为腺病毒，所述病毒性肺炎是腺病毒肺炎。
在某些实施方案中，所述病毒为鼻病毒，所述病毒性肺炎是鼻病毒肺炎。
在某些实施方案中，所述病毒为副流感病毒，所述病毒性肺炎是副流感病毒肺炎。
在某些实施方案中，所述能够检测CEA水平的试剂可以通过本领域已知的任何合适的检测方法来测定CEA的水平。非限制性实例包括免疫学检测、质谱法或光谱法，等等。
在某些实施方案中，所述试剂通过免疫学检测来测定CEA的水平。在某些实施方案中，所述免疫学检测选自酶联免疫吸附测定法(ELISA)、电化学免疫分析法(ECIA)、化学发光免疫分析法(CLIA)、电化学发光免疫分析法(ECLIA)、荧光免疫分析法(FIA)或放射免疫测定法(RIA)。
在某些实施方案中，所述试剂包含能够特异性结合CEA的抗体。所述试剂所包含的抗体可以是一种，也可以是多种(例如2种或更多种)的组合。优选地，所述多种(例如2种或更多)抗体具有彼此不同的抗原结合位点。
在一些实施方案中，所述试剂包含一种能够特异性结合CEA的抗体，其具有抗原结合位点和可检测的标记。在某些实施方案中，所述可检测的标记选自酶(例如辣根过氧化物酶或碱性磷酸酶)、化学发光试剂(例如吖啶酯类化合物)、电化学发光试剂(例如三联吡啶钌)、电活性物质、荧光染料(例如FITC、TRITC、PE、德克萨斯红或花菁染料衍生物(例如Cy7、Alexa 750))、放射性核素(例如放射性碘)或生物素。
在另一些实施方案中，所述试剂包含多种(例如2种或更多)能够特异性结合CEA的抗体的组合。在某些实施方案中，所述试剂通过双抗体夹心法测定CEA的水平。在某些实施方案中，所述试剂包含能够特异性结合CEA的第一抗体作为捕获试剂，以及能够特异性结合CEA的第二抗体作为检测试剂。在某些实施方案中，所述第二抗体具有与第一抗体不同的抗原结合位点。在某些实施方案中，所述第二抗体带有可检测的标记。在某些实施方案中，所述可检测的标记选自酶(例如辣根过氧化物酶或碱性磷酸酶)、化学发光试剂(例如吖啶酯类化合物)、电化学发光试剂(例如三联吡啶钌)、电活性物质、荧光染料(例如FITC、TRITC、PE、德克萨斯红或花菁染料衍生物(例如Cy7、Alexa 750))、放射性核素(例如放射性碘)或生物素。
在某些实施方案中，所述试剂通过质谱法来测定CEA的水平。在某些实施方案中，所述质谱为基质辅助激光解吸离子化质谱，例如基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)。
在某些实施方案中，所述试剂通过光谱法来测定CEA的水平。在某些实施方案中，所述光谱法为紫外可见分光光度法。
在某些实施方案中，所述评估包括下述步骤：(1)提供第一样品和第二样品，其中，所述第一样品获得自所述受试者施用所述疗法之前，所述第二样品获得自所述受试者施用所述疗法之后；(2)测定所述第一样品和第二样品中CEA的水平；和，(3)将所述第一样品和第二样品中的CEA水平进行比较。
应理解步骤(2)和(3)中所述的“水平”包括所述生物标记物的绝对量、相对量或浓度以及与其相关或可以从其衍生的任何值或参数。
应理解步骤(3)中所述的“比较”通常指对应参数或值的比较，例如将绝对量与绝对参考量比较，而将浓度与参考浓度比较，或者将获自样品中生物标志物的强度信号与获自参考样品的相同类型的强度信号比较。比较可以手动或计算机辅助进行。获自个体或患者的样品中生物标志物的测量的或检测的水平和参考水平的值可以例如彼此比较，并且所述比较可以通过执行用于比较的算法的计算机程序自动进行。
在某些实施方案中，所述第一样品和第二样品选自血液、唾液、鼻咽和/或口咽拭子、鼻咽或鼻腔冲洗/抽吸物，气管抽吸物、痰、尿液、粪便、腹水、灌洗液、脑脊液、活检组织(例如肺组织)。在某些实施方案中，所述第一样品和第二样品选自血液样品，例如全血、血清或血浆。
在某些实施方案中，所述受试者是哺乳动物，例如病毒性肺炎患者或动物模型。在某些实施方案中，所述受试者是非人受试者。
在某些实施方案中，CEA的减少表明所述疗法对病毒感染和/或由其所导致的病毒性肺炎(例如SARS-CoV-2感染和/或COVID-19)有效。
试剂盒
在上述任一方面所述的用途中，可以在测定受试者的CEA水平之前，对其进行检测以诊断其是否患有病毒感染和/或由其所导致的病毒性肺炎(例如SARS-CoV-2感染和/或COVID-19)。
因此，在另一方面，本发明还提供了一种试剂盒，其包含：能够诊断病毒感染和/或由其所导致的病毒性肺炎(例如SARS-CoV-2感染和/或COVID-19)的第一试剂，以及能够检测CEA水平的第二试剂。
在某些实施方案中，所述病毒选自能够导致病毒性肺炎的病毒。在某些实施方案中，所述病毒为呼吸道病毒，例如冠状病毒(例如SARS-CoV-1，SARS-CoV-2，或MERS-CoV)、流感病毒(例如甲型流感病毒)、呼吸道合胞病毒、腺病毒、鼻病毒或副流感病毒。
在某些实施方案中，所述病毒为SARS-CoV-2，所述病毒性肺炎是新型冠状病毒性肺炎(COVID-19)。
在某些实施方案中，所述病毒为SARS-CoV-1，所述病毒性肺炎是严重急性呼吸综合征(SARS)。
在某些实施方案中，所述病毒为MERS-CoV，所述病毒性肺炎是中东呼吸综合征(MERS)。
在某些实施方案中，所述病毒为流感病毒(例如甲型流感病毒)，所述病毒性肺炎是流感病毒肺炎。
在某些实施方案中，所述病毒为呼吸道合胞病毒，所述病毒性肺炎是呼吸道合胞病毒肺炎。
在某些实施方案中，所述病毒为腺病毒，所述病毒性肺炎是腺病毒肺炎。
在某些实施方案中，所述病毒为鼻病毒，所述病毒性肺炎是鼻病毒肺炎。
在某些实施方案中，所述病毒为副流感病毒，所述病毒性肺炎是副流感病毒肺炎。
在某些实施方案中，所述第二试剂可以通过本领域已知的任何合适的检测方法来测定CEA的水平。非限制性实例包括免疫学检测、质谱法或光谱法，等等。
在某些实施方案中，所述第二试剂通过免疫学检测来测定CEA的水平。在某些实施方案中，所述免疫学检测选自酶联免疫吸附测定法(ELISA)、电化学免疫分析法(ECIA)、化学发光免疫分析法(CLIA)、电化学发光免疫分析法(ECLIA)、荧光免疫分析法(FIA)或放射免疫测定法(RIA)。
在某些实施方案中，所述第二试剂包含能够特异性结合CEA的抗体。所述试剂所包含的抗体可以是一种，也可以是多种(例如2种或更多种)的组合。优选地，所述多种(例如2种或更多)抗体具有彼此不同的抗原结合位点。
在一些实施方案中，所述第二试剂包含一种能够特异性结合CEA的抗体，其具有抗原结合位点和可检测的标记。在某些实施方案中，所述可检测的标记选自酶(例如辣根过氧化物酶或碱性磷酸酶)、化学发光试剂(例如吖啶酯类化合物)、电化学发光试剂(例如三联吡啶钌)、电活性物质、荧光染料(例如FITC、TRITC、PE、德克萨斯红或花菁染料衍生物(例如Cy7、Alexa 750))、放射性核素(例如放射性碘)或生物素。
在另一些实施方案中，所述第二试剂包含多种(例如2种或更多)能够特异性结合CEA的抗体的组合。在某些实施方案中，所述第二试剂通过双抗体夹心法测定CEA的水平。在某些实施方案中，所述第二试剂包含能够特异性结合CEA的第一抗体作为捕获试剂，以及能够特异性结合CEA的第二抗体作为检测试剂。在某些实施方案中，所述第二抗体具有与第一抗体不同的抗原结合位点。在某些实施方案中，所述第二抗体带有可检测的标记。在某些实施方案中，所述可检测的标记选自酶(例如辣根过氧化物酶或碱性磷酸酶)、化学发光试剂(例如吖啶酯类化合物)、电化学发光试剂(例如三联吡啶钌)、电活性物质、荧光染料(例如FITC、TRITC、PE、德克萨斯红或花菁染料衍生物(例如Cy7、Alexa 750))、放射性核素(例如放射性碘)或生物素。
在某些实施方案中，所述第二试剂通过质谱法来测定CEA的水平。在某些实施方案中，所述质谱为基质辅助激光解吸离子化质谱，例如基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)。
在某些实施方案中，所述第二试剂通过光谱法来测定CEA的水平。在某些实施方案中，所述光谱法为紫外可见分光光度法。
在某些实施方案中，所述第一试剂是能够检测病毒的存在的试剂。检测病毒的存在的方法是本领域技术人员已知的，例如可以通过检测独特的病毒序列(例如对于SARS-CoV-2而言的E、RdRP、N或S基因上的区域)，通过检测病毒抗原，或者通过检测病毒特异性抗体，来检测该病毒。
在某些实施方案中，所述第一试剂通过核酸检测测定病毒(例如SARS-CoV-2)的基因组序列或片段(例如，独特的病毒序列)来检测病毒(例如SARS-CoV-2)。在某些实施方案中，所述核酸检测是rRT-PCR。在某些实施方案中，所述第一试剂包括针对该病毒(例如SARS-CoV-2)基因组核酸特异性的引物和探针。
在某些实施方案中，所述第一试剂通过免疫学检测测定该病毒的病毒抗原或特异性抗体(即对该病毒特异性的抗体)来检测该病毒。在某些实施方案中，所述第一试剂通过免疫学检测测定SARS-CoV-2病毒抗原或SARS-CoV-2特异性抗体来检测SARS-CoV2。在某些实施方案中，所述免疫学检测选自酶联免疫吸附测定法(ELISA)、电化学免疫分析法(ECIA)、化学发光免疫分析法(CLIA)、电化学发光免疫分析法(ECLIA)、荧光免疫分析法(FIA)或放射免疫测定法(RIA)。
在某些实施方案中，所述第一试剂通过测定病毒抗原来检测该病毒，其包含能够特异性结合病毒抗原的抗体。在某些实施方案中，所述第一试剂通过测定SARS-CoV-2病毒抗原来检测SARS-CoV-2，其包含能够特异性结合SARS-CoV-2病毒抗原的抗体。
在某些实施方案中，所述第一试剂通过测定病毒特异性抗体来检测该病毒，其包含该病毒的病毒抗原或其片段。在某些实施方案中，所述第一试剂通过测定SARS-CoV-2特异性抗体来检测SARS-CoV-2，其包含SARS-CoV-2病毒抗原或其片段。在某些实施方案中，所述病毒特异性抗体是总抗体；优选地，所述能够检测病毒的第一试剂包含捕获抗原和检测抗原，所述捕获抗原和检测抗原各自独立地选自该病毒的病毒抗原或其片段，并且所述检测抗原带有可检测的标记。在某些实施方案中，所述病毒特异性抗体是IgG抗体和/或IgM抗体；优选地，所述能够检测病毒的第一试剂包含该病毒的病毒抗原或其片段作为捕获试剂，以及带有可检测的标记的抗-IgG抗体和/或抗-IgM抗体作为检测试剂。
在另一方面，本发明提供了本发明的试剂盒在制备用于在受试者中诊断病毒感染和/或由其所导致的病毒性肺炎的诊断试剂中的用途，所述诊断包括：确定受试者是否患有病毒感染和/或由其所导致的病毒性肺炎，以及评估确定为患有病毒感染和/或由其所导致的病毒性肺炎的受试者的严重程度。
在某些实施方案中，所述病毒选自能够导致病毒性肺炎的病毒。在某些实施方案中，所述病毒为呼吸道病毒，例如冠状病毒(例如SARS-CoV-1，SARS-CoV-2，或MERS-CoV)、流感病毒(例如甲型流感病毒)、呼吸道合胞病毒、腺病毒、鼻病毒或副流感病毒。
在某些实施方案中，所述病毒为SARS-CoV-2，所述病毒性肺炎是新型冠状病毒性肺炎(COVID-19)。
在某些实施方案中，所述病毒为SARS-CoV-1，所述病毒性肺炎是严重急性呼吸综合征(SARS)。
在某些实施方案中，所述病毒为MERS-CoV，所述病毒性肺炎是中东呼吸综合征(MERS)。
在某些实施方案中，所述病毒为流感病毒(例如甲型流感病毒)，所述病毒性肺炎是流感病毒肺炎。
在某些实施方案中，所述病毒为呼吸道合胞病毒，所述病毒性肺炎是呼吸道合胞病毒肺炎。
在某些实施方案中，所述病毒为腺病毒，所述病毒性肺炎是腺病毒肺炎。
在某些实施方案中，所述病毒为鼻病毒，所述病毒性肺炎是鼻病毒肺炎。
在某些实施方案中，所述病毒为副流感病毒，所述病毒性肺炎是副流感病毒肺炎。
在某些实施方案中，所述诊断包括以下步骤：(1)使用所述第一试剂测定来自所述受试者的第一样品中是否存在病毒以确定所述受试者是否患有病毒感染和/或由其所导致的病毒性肺炎；(2)测定来自确定为患有病毒感染和/或由其所导致的病毒性肺炎的受试者的第二样品中CEA的水平；和，(3)将所述水平与参考值相比较。
在某些实施方案中，所述第一样品选自鼻咽和/或口咽拭子，支气管肺泡灌洗液，气管抽吸物，鼻咽或鼻腔冲洗/抽吸物，痰，活检组织(例如肺组织)，血液样品(例如全血、血清或血浆)，粪便。
在某些实施方案中，所述第二样品选自鼻咽和/或口咽拭子，支气管肺泡灌洗液，气管抽吸物，鼻咽或鼻腔冲洗/抽吸物，痰，活检组织(例如肺组织)，血液样品(例如全血、血清或血浆)，粪便。在某些实施方案中，所述第二样品选自血液样品，例如全血、血清或血浆。
参考值可以来源于处于不同严重程度的受试者的样品。例如，如果要区分SARS-CoV-2感染或COVID-19的轻症(mild)、中症(moderate)、重症(severe)和危重症(critical)，那么参考值可以来源于(i)处于轻症的受试者，(ii)处于中症的受试者，(iii)处于重症的受试者，和/或(iv)处于危重症的受试者的样品。例如，如果要区分轻症(mild)/中症(moderate)与重症(severe)/危重症(critical)，那么参考值可以来源于(i)处于轻症的受试者的样品以及处于中症的受试者(例如两个群体中个体测定值的平均值或中值)，或(ii)处于重症的受试者的样品以及处于危重症的受试者的样品(例如两个群体中个体测定值的平均值或中值)。
在某些实施方案中，所述评估包括区分重症/危重症与轻症/中症(例如SARS-CoV-2感染或COVID-19的重症/危重症与轻症/中症)，所述参考值代表处于轻症/中症的受试者的样品中该生物标志物的水平。在某些实施方案中，如果所述水平高于参考值的话，则判断所述受试者患有重症/危重症或处于患有重症/危重症的风险中。
在某些实施方案中，所述评估包括区分轻症、中症、重症和危重症(例如SARS-CoV-2感染或COVID-19的轻症、中症、重症和危重症)，所述参考值可以代表处于上述不同严重程度的受试者的样品中该生物标志物的水平。
在另一方面，本发明提供了本发明的试剂盒在制备用于评估疗法对患有病毒感染和/或由其所导致的病毒性肺炎的受试者的治疗效果的检测试剂中的用途。
在某些实施方案中，所述病毒选自能够导致病毒性肺炎的病毒。在某些实施方案中，所述病毒为呼吸道病毒，例如冠状病毒(例如SARS-CoV-1，SARS-CoV-2，或MERS-CoV)、流感病毒(例如甲型流感病毒)、呼吸道合胞病毒、腺病毒、鼻病毒或副流感病毒。
在某些实施方案中，所述病毒为SARS-CoV-2，所述病毒性肺炎是新型冠状病毒性肺炎(COVID-19)。
在某些实施方案中，所述病毒为SARS-CoV-1，所述病毒性肺炎是严重急性呼吸综合征(SARS)。
在某些实施方案中，所述病毒为MERS-CoV，所述病毒性肺炎是中东呼吸综合征(MERS)。
在某些实施方案中，所述病毒为流感病毒(例如甲型流感病毒)，所述病毒性肺炎是流感病毒肺炎。
在某些实施方案中，所述病毒为呼吸道合胞病毒，所述病毒性肺炎是呼吸道合胞病毒肺炎。
在某些实施方案中，所述病毒为腺病毒，所述病毒性肺炎是腺病毒肺炎。
在某些实施方案中，所述病毒为鼻病毒，所述病毒性肺炎是鼻病毒肺炎。
在某些实施方案中，所述病毒为副流感病毒，所述病毒性肺炎是副流感病毒肺炎。
在某些实施方案中，所述评估包括以下步骤：(1)使用所述第一试剂测定来自受试者的第一样品中是否存在病毒以确定所述受试者是否患有病毒感染和/或由其所导致的病毒性肺炎；(2)对被确定为患有病毒感染和/或由其所导致的病毒性肺炎的受试者，提供第二样品和第三样品，其中，所述第二样品获得自所述受试者施用所述疗法之前，所述第三样品获得自所述受试者施用所述疗法之后；(3)测定所述第二样品和第三样品中CEA的水平；和，(4)将所述第二样品和第三样品中的CEA水平进行比较。
在某些实施方案中，所述第一样品选自鼻咽和/或口咽拭子，支气管肺泡灌洗液，气管抽吸物，鼻咽或鼻腔冲洗/抽吸物，痰，活检组织(例如肺组织)，血液样品(例如全血、血清或血浆)，粪便。
在某些实施方案中，所述第二样品和第三样品选自鼻咽和/或口咽拭子，支气管肺泡灌洗液，气管抽吸物，鼻咽或鼻腔冲洗/抽吸物，痰，活检组织(例如肺组织)，血液样品(例如全血、血清或血浆)，粪便。在某些实施方案中，所述第二样品和第三样品选自血液样品，例如全血、血清或血浆。
在某些实施方案中，所述受试者是哺乳动物，例如病毒性肺炎患者或动物模型。在某些实施方案中，所述受试者是非人受试者。
在某些实施方案中，CEA的减少表明所述疗法对病毒感染和/或由其所导致的病毒性肺炎(例如SARS-CoV-2感染和/或COVID-19)有效。
术语定义
在本发明中，除非另有说明，否则本文中使用的科学和技术名词具有本领域技术人员所通常理解的含义。并且，本文中所用的肿瘤学、分子遗传学、核酸化学、细胞培养、生物化学、细胞生物学等操作步骤均为相应领域内广泛使用的常规步骤。同时，为了更好地理解本发明，下面提供相关术语的定义和解释。
如本文中所使用的，“病毒性肺炎”是指由病毒感染所导致的肺部炎症性病变。能够引起病毒性肺炎的病毒是本领域技术人员熟知的，包括但不限于呼吸道病毒，例如冠状病毒(例如SARS-CoV-1，SARS-CoV-2，或MERS-CoV)、流感病毒(例如甲型流感病毒)、呼吸道合胞病毒、腺病毒、鼻病毒或副流感病毒等等。
如本文中所使用的，“严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acuterespiratory syndrome coronavirus 2，SARS-CoV-2)”，旧称为“新型冠状病毒”或“2019-nCov”，属于其β冠状病毒属，为含包膜的单链正义RNA病毒。SARS-CoV-2的基因组序列是本领域技术人员已知的，可参见例如GenBank：MN908947。
如本文中所使用的，术语“新型冠状病毒肺炎”和“COVID-19”是指，因SARS-CoV-2感染而导致的肺炎，二者具有相同的含义，可互换使用。COVID-19根据严重程度可分为轻症(mild)、中症(moderate)、重症(severe)、危重症(critical)。使用标准的临床方法容易地诊断患者所处于的严重程度，并且完全在本领域普通技术的临床医师的范围中。
(一)轻症
临床症状轻微，仅表现为低热，轻微乏力等，影像学未见肺炎表现。
(二)中症
具有发热、呼吸道等症状，影像学可见肺炎表现。
(三)重症
符合下列任何一条：
1.呼吸窘迫，RR≥30次/分；
2.静息状态下，指氧饱和度≤93％；
3.动脉血氧分压(PaO2)/吸氧浓度(FiO2)≤300mmHg(1mmHg＝0.133kPa)。
(四)危重症
符合以下情况之一者：
1.出现呼吸衰竭，且需要机械通气；
2.出现休克；
3.合并其他器官功能衰竭需ICU监护治疗。
如本文中所使用的，术语“可检测的标记”可以是可通过荧光、光谱、光化学、生物化学、免疫学、电学、光学或化学手段检测的任何物质。特别优选的是，此类标记能够适用于免疫学检测(例如，酶联免疫测定法、放射免疫测定法、荧光免疫测定法、化学发光免疫测定法、电化学免疫测定法、电化学发光免疫测定法等)。这类标记是本领域熟知的，包括但不限于，酶(例如，辣根过氧化物酶、碱性磷酸酶、β-半乳糖苷酶、脲酶、葡萄糖氧化酶，等)、放射性核素(例如，18F、3H、125I、131I、35S、14C或32P)、荧光染料(例如，异硫氰酸荧光素(FITC)、荧光素、异硫氰酸四甲基罗丹明(TRITC)、藻红蛋白(PE)、德克萨斯红、罗丹明、量子点或花菁染料衍生物(例如Cy7、Alexa 750))、化学发光试剂(例如鲁米诺或吖啶酯类化合物)、电活性物质(例如具有电化学氧化还原性质的金属离子或电活性的有机功能团)、电化学发光试剂(例如三联吡啶钌)、磁珠(例如，
Figure BDA0003462679510000171
)、测热标记物例如胶体金或有色玻璃或塑料(例如，聚苯乙烯、聚丙烯、乳胶，等)珠、以及用于结合上述标记物修饰的亲和素(例如，链霉亲和素)的生物素。
如本文中所使用的，术语“特异性结合”是指，两分子(即结合分子与靶分子)之间的非随机的结合反应，如抗体和其所针对的抗原之间的反应。两分子之间的结合亲和力可用KD值描述。KD值是指由kd(特定的结合分子-靶分子相互作用的解离速率；亦称为koff)与ka(特定结合分子-靶分子相互作用的缔合速率；亦称为kon)之比得到的解离常数，或者指表示为摩尔浓度(M)的kd/ka。KD值越小，两分子结合越紧密，亲和力越高。KD值可通过本领域熟知的方法确定，例如使用表面等离子体共振术(SPR)在BIACORE仪中测定。
如本文中所使用的，术语“免疫学检测”是指，利用抗原-抗体之间的特异性相互作用/结合亲和力来进行的测定，其一般可用于检测特定抗原或者抗体在样品中的存在或水平。此类免疫学检测是本领域技术人员公知的，包括但不限于，酶联免疫吸附测定法(ELISA)、电化学发光免疫分析法(ECLIA)、化学发光免疫分析法(CLIA)、荧光免疫分析法(FIA)或放射免疫测定法(RIA)等。以上所提及的检测方法均是免疫学中的经典方法，它们均是将已知的抗体或抗原标记上示踪物质(可检测的标记)，通过检测该标记物，实现对抗原-抗原复合物的间接测定。
酶联免疫吸附测定法(ELISA)利用酶标记的抗体或抗原进行特异性免疫反应，通过酶标仪测定酶分解底物产生的有色物质的光密度值(OD)，来评定抗原或抗体的含量。
化学发光免疫分析法(Chemiluminescent Immunoassay，CLIA)利用化学发光剂(例如鲁米诺或吖啶酯类化合物)标记的抗体或抗原进行特异性免疫反应，通过对发光标记物进行定量或定性检测来评定抗原或抗体的含量。
电化学发光免疫分析法(Electrochemiluminescence immunoassay，ECLIA)利用电化学发光剂(例如三联吡啶钌)标记的抗体或抗原进行特异性免疫反应，通过以三丙胺(TPA)做电子供体，在电场中电化学引发特异性化学发光反应，通过检测发光强度来评定抗原或抗体的含量。
电化学免疫分析法(Electrochemical immunoassay，ECIA)利用抗原-抗体的结合直接或间接引起接近电极的电活性物质的活性变化，通过实现对抗原或抗体的间接测定。在一些实施方案中，电化学免疫分析法包括使用电活性物质(例如具有电化学氧化还原性质的金属离子或电活性的有机功能团)标记的抗体或抗原进行特异性免疫反应。在一些实施方案中，电化学免疫分析法由电化学免疫传感器(electrochemical immunosensor)进行，抗原与抗体的结合使电极处的电活性物质产生活性变化，所述电极保持合适的电化学势以引起所述电活性物质的氧化或还原。关于电化学免疫传感器的综述，可参见M.J.Green(1987)Philos.Trans.R.Soc.Lond.B.Biol.Sci.316：135-142。
荧光免疫分析法(fluorescence immunoassay，FIA)利用荧光染料(例如FITC，PE等)标记的抗体或抗原进行特异性免疫反应，荧光染料在激发光作用下可直接发出荧光，通过荧光检测仪检测荧光信号来评定抗原或抗体的含量。
放射免疫测定法(Radioimmunoassay，RIA)利用放射性核素(例如放射性碘，如125I、131I)标记的抗体或抗原进行特异性免疫反应，通过检测放射性强度测定(放射性计数)来评定抗原或抗体的含量。
如本文中所使用的，术语“样品”可以是源自于患者或对象的含有核酸或多肽的任何生物样品。这样的样品的实例包括流体、组织、细胞样品、器官、活检样品等。样品可以按照常规技术来收集并直接用于诊断或储存。
如本文中所使用的，术语“受试者”可以是任何哺乳动物，优选为人类，无论其年龄或性别如何。在某些实施方案中，所述受试者患有或被确诊有病毒感染或由其所导致的病毒性肺炎，例如SARS-CoV-2感染或COVID-19。
发明的有益效果
本发明首次发现，病毒感染者血液中CEA伴随病情的不断恶化而逐步升高，从而能够用于评估病毒感染的严重程度，并且患者病情稳定及逆转后其水平逐步恢复正常水平，从而能够用于评估疗法对病毒感染的疗效，具有重大的临床价值。
下面将结合附图和实施例对本发明的实施方案进行详细描述，但是本领域技术人员将理解，下列附图和实施例仅用于说明本发明，而不是对本发明的范围的限定。根据附图和优选实施方案的下列详细描述，本发明的各种目的和有利方面对于本领域技术人员来说将变得显然。
附图说明
图1显示了192名新冠肺炎患者血浆中CEA含量与疾病程度的相关性，图1A为192名患者中轻症/中症患者与重症/危重症患者各自血浆CEA含量的统计图，图1B和图1C分别为其中年龄不超过60岁(图1B)和年龄超过60岁(图1C)的患者中轻症/中症患者与重症/危重症患者各自血浆CEA含量的统计图。
图2显示了新冠肺炎患者血浆中CEA含量随疾病发展的变化趋势。
图3显示了使用针对SARS-CoV-2 Spike S1、ACE2及CEA的特异性抗体对新冠肺炎患者尸检肺部病理切片进行免疫组化染色的结果。
具体实施方式
现参照下列意在举例说明本发明(而非限定本发明)的实施例来描述本发明。
除非特别指明，否则基本上按照本领域内熟知的以及在各种参考文献中描述的常规方法进行实施例中描述的实验和方法。实施例中未注明具体条件者，按照常规条件或制造商建议的条件进行。所用试剂或仪器未注明生产厂商者，均为可以通过市购获得的常规产品。本领域技术人员知晓，实施例以举例方式描述本发明，且不意欲限制本发明所要求保护的范围。本文中提及的全部公开案和其他参考资料以其全文通过引用合并入本文。
仪器与试剂
本申请示例性具体实施方式所用仪器与试剂如表1所示：
表1仪器与试剂
Figure BDA0003462679510000201
实施例1：ELISA检测新冠肺炎患者血浆中癌胚抗原(CEA)的表达
1.病人样本血液的采集：用5ml的采血管进行静脉采血。
2.血浆的分离与灭活:
(1)采集后的血液立即进行离心，离心力815g，时间4min，温度为4℃。
(2)在通风柜中用真空管吸取上层血浆，在水浴锅中56℃加热30min，进行血浆的灭活。剩余样本在高压锅中进行安全处理。
3.ELISA试剂盒检测CEA的表达
(1)每孔加入100μL标准品并取样到检测孔中，盖好并在室温下放置2.5h，或在4℃下过夜孵育。
(2)弃掉溶液，并用1X洗涤液洗涤4次，每孔300μL洗液。
(3)加入100μL 1X生物素化CEA检测抗体到每个孔，在室温下孵育1小时，并轻轻摇动。
(4)丢弃溶液，重复步骤(2)中的清洗。
(5)加入100μL 1X HRP-链霉亲和素溶液到每个孔，室温下孵育45min，并轻轻摇动。
(6)丢弃溶液，重复步骤(2)中的清洗。
(7)向每个孔中添加100μLTMB一步底物试剂。
(8)在黑暗中于室温下孵育30min，轻轻摇动。
(9)向每个孔中添加50μL终止溶液。在450nm处读取吸光度数值。
此外，如下设置平行样品测定实验：将上述步骤3-(1)中标准品替换为步骤2-(2)中获得的灭活血浆，并重复上述步骤3。对照标准品CEA浓度与吸光度数值，计算血浆中CEA的含量。
通过以上方法我们测定了处于疾病不同发展程度(轻症/中症或者重症/危重症)的新冠肺炎患者血浆中癌胚抗原(CEA)的表达，以及患者血浆中CEA含量随疾病发展的变化趋势。实验结果如表2、图1及图2所示，表2显示了新冠肺炎患者血浆中CEA的检测数值；图1显示了192名新冠肺炎患者血浆中CEA含量与疾病程度的相关性，图1A为192名患者中轻症/中症患者与重症/危重症患者各自血浆CEA含量的统计图，图1B和图1C分别为其中年龄不超过60岁(图1B)和年龄超过60岁(图1C)的患者中轻症/中症患者与重症/危重症患者各自血浆CEA含量的统计图；图2显示了新冠肺炎患者血浆中CEA含量随疾病发展的变化趋势。表2及图1的结果显示，CEA在重症/危重症患者中的表达要明显高于在轻症/中症患者中的表达，说明新冠肺炎患者的疾病严重程度与血浆中CEA的表达存在着联系，疾病程度越严重，血浆中CEA的表达越高。图2的结果显示，新冠肺炎患者随着病情的好转，其血浆中CEA的表达显著下降，说明CEA可以作为反应疾病程度的标志物。
表2：新冠肺炎患者血浆中CEA的检测数值
Figure BDA0003462679510000221
实施例2：免疫组化染色检测新冠肺炎患者肺部癌胚抗原(CEA)的表达
对新冠肺炎患者肺部组织样本进行石蜡切片
(1)固定：4％PFA浸泡组织，过夜固定。
(2)清洗：固定好的组织用PBS清洗3次。
(3)样本修剪：将样本修剪为合适大小，放到固定盒中。
(4)酒精梯度脱水：70％酒精1h，80％酒精1h，95％酒精1h，100％酒精40min，100％酒精40min。
(5)透明：二甲苯Ⅰ处理20min，二甲苯Ⅱ处理20min。
(6)浸蜡：二甲苯：石蜡(1:1)处理1h，石蜡Ⅰ处理1h，石蜡Ⅱ处理1h。
(7)包埋。
2.免疫组化染色
(1)脱蜡：二甲苯I、II，各处理10min；梯度酒精处理：100％无水乙醇，2min；95％无水乙醇，2min；80％无水乙醇，2min；70％无水乙醇，2min；
(2)水化：蒸馏水洗2次，每次5min(置于摇床)；
(3)石蜡切片脱蜡和水化后，用PBS冲洗3次，每次3min；
(4)抗原修复液(10mM pH 6.0柠檬酸钠缓冲液)的配制：
储备液：A液，29.41g二水柠檬酸三钠+1000mL蒸馏水；B液：21g柠檬酸+1000mL蒸馏水；
工作液：82mL A液+18mL B液+900mL蒸馏水；
(5)抗原修复：将切片放入盛有柠檬酸钠缓冲液的塑料或耐温玻璃容器内，淹没切片，使用微波炉中高或高档，加热5min；补充柠檬酸钠缓冲液，再使用微波炉中高或高档，加热5min；
(6)加试剂A(过氧化酶阻断溶液)，室温孵育10min，阻断内源性过氧化物酶的活性；后PBS冲洗3遍，每遍3min；
(7)弃去PBS，加1滴或50μL试剂B(正常非免疫动物血清)，室温孵育10min；
(8)弃去血清，加1滴或50μL一抗，4℃过夜或室温孵育60min；PBS冲洗3遍，每遍3min；
(9)弃去PBS，加1滴或50μL生物素标记的二抗(试剂C)，室温孵育10min；PBS冲洗3遍，每遍3min；
(10)弃去PBS，加1滴或50μL链霉菌抗生物素-过氧化物酶溶液(试剂D)，室温孵育10min；PBS冲洗3遍，每遍3min；
(11)弃去PBS，加2滴或100μL新鲜配制的DAB溶液，显微镜下观察3-10min；
(12)自来水冲洗，苏木素复染，PBS或自来水冲洗返蓝；
(13)使用DAB显色时，切片需经过梯度酒精脱水干燥，二甲苯透明，中性树胶封固；
(14)显微镜拍照。
实验结果如图3所示，图3显示了使用针对SARS-CoV-2 Spike S1、ACE2及CEA的特异性抗体对新冠肺炎患者尸检肺部病理切片进行免疫组化染色的结果。结果显示病毒与ACE2共定位表达，且发现CEA在II型肺泡上皮细胞中较强的表达，表明CEA可以作为判断新冠肺炎患者疾病严重程度的标志物，且推测，在肺纤维化、肺部疾病中，疾病的发张程度，可能都与CEA的表达呈正向关。
尽管本发明的具体实施方式已经得到详细的描述，但本领域技术人员将理解：根据已经公布的所有教导，可以对细节进行各种修改和变动，并且这些改变均在本发明的保护范围之内。本发明的全部分为由所附权利要求及其任何等同物给出。

Claims (12)

1.能够检测CEA水平的试剂在制备试剂盒中的用途，所述试剂盒用于评估患有病毒感染和/或由其所导致的病毒性肺炎的受试者的疾病严重程度；
优选地，所述病毒为呼吸道病毒，例如冠状病毒、流感病毒(例如甲型流感病毒)、呼吸道合胞病毒、腺病毒、鼻病毒或副流感病毒；
优选地，所述病毒为SARS-CoV-2，所述病毒性肺炎是新型冠状病毒性肺炎(COVID-19)。
2.能够检测CEA水平的试剂在制备试剂盒中的用途，所述试剂盒用于评估疗法对患有病毒感染和/或由其所导致的病毒性肺炎的受试者的治疗效果；
优选地，所述病毒为呼吸道病毒，例如冠状病毒、流感病毒(例如甲型流感病毒)、呼吸道合胞病毒、腺病毒、鼻病毒或副流感病毒；
优选地，所述病毒为SARS-CoV-2，所述病毒性肺炎是新型冠状病毒性肺炎(COVID-19)。
3.权利要求1或2所述的用途，其中，所述试剂通过体外检测来测定CEA的水平；
优先地，所述体外检测方法选自免疫学检测法、质谱法、光谱法；
优选地，所述免疫学检测选自酶联免疫吸附测定法(ELISA)、电化学免疫分析法(ECIA)、化学发光免疫分析法(CLIA)、电化学发光免疫分析法(ECLIA)、荧光免疫分析法(FIA)或放射免疫测定法(RIA)；
优选地，所述质谱为基质辅助激光解吸离子化质谱，例如基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)；
优选地，所述光谱法为紫外可见分光光度法。
4.权利要求3所述的用途，其中，所述试剂包含能够特异性结合CEA的抗体；
优选地，所述能够特异性结合CEA的抗体可以为一种抗体，或多种(例如2种或更多)抗体的组合；优选地，所述多种(例如2种或更多)抗体具有彼此不同的抗原结合位点；
优选地，所述试剂包含一种能够特异性结合CEA的抗体，其具有抗原结合位点和可检测的标记；
优选地，所述试剂包含多种(例如2种或更多)能够特异性结合CEA的抗体的组合；优选地，所述组合包含作为捕获试剂的第一抗体和作为检测试剂的第二抗体；优选地，所述第二抗体具有与第一抗体不同的抗原结合位点；优选地，所述第二抗体带有可检测的标记；
优选地，所述可检测的标记选自酶(例如辣根过氧化物酶或碱性磷酸酶)、化学发光试剂(例如吖啶酯类化合物)、电化学发光试剂(例如三联吡啶钌)、电活性物质、荧光染料(例如FITC、TRITC、PE、德克萨斯红或花菁染料衍生物(例如Cy7、Alexa 750))、放射性核素(例如放射性碘)或生物素。
5.权利要求1所述的用途，其中，所述评估包括下述步骤：(1)测定来自所述受试者的样品中CEA的水平；(2)将所述水平与参考值相比较；和(3)评估所述受试者的疾病严重程度；
优选地，所述样品为血液、唾液、鼻咽和/或口咽拭子、鼻咽或鼻腔冲洗/抽吸物，气管抽吸物、痰、尿液、粪便、腹水、灌洗液、脑脊液、活检组织(例如肺组织)；
优选地，所述样品选自血液样品，例如全血、血清或血浆；
优选地，所述严重程度包括轻症(mild)、中症(moderate)、重症(severe)和/或危重症(critical)；
优选地，所述评估包括区分轻症/中症、与重症/危重症；
优选地，所述病毒为SARS-CoV-2，所述病毒性肺炎是新型冠状病毒性肺炎(COVID-19)。
6.权利要求2所述的用途，其中，所述评估包括下述步骤：(1)提供第一样品和第二样品，其中，所述第一样品获得自所述受试者施用所述疗法之前，所述第二样品获得自所述受试者施用所述疗法之后；(2)测定所述第一样品和第二样品中CEA的水平；和，(3)将所述第一样品和第二样品中的CEA水平进行比较；
优选地，所述第一样品和第二样品为血液、唾液、鼻咽和/或口咽拭子、鼻咽或鼻腔冲洗/抽吸物，气管抽吸物、痰、尿液、粪便、腹水、灌洗液、脑脊液、活检组织(例如肺组织)；
优选地，所述第一样品和第二样品选自血液样品，例如全血、血清或血浆；
优选地，所述受试者是哺乳动物受试者，例如病毒性肺炎患者或动物模型；
优选地，CEA的减少表明所述疗法对病毒感染和/或由其所导致的病毒性肺炎有效；
优选地，所述病毒为呼吸道病毒，例如冠状病毒、流感病毒(例如甲型流感病毒)、呼吸道合胞病毒、腺病毒、鼻病毒或副流感病毒；
优选地，所述病毒为SARS-CoV-2，所述病毒性肺炎是新型冠状病毒性肺炎(COVID-19)。
7.试剂盒，其包含：能够诊断病毒感染和/或由其所导致的病毒性肺炎的第一试剂，以及能够检测CEA水平的第二试剂；
优选地，所述病毒为呼吸道病毒，例如冠状病毒、流感病毒(例如甲型流感病毒)、呼吸道合胞病毒、腺病毒、鼻病毒或副流感病毒；
优选地，所述病毒为SARS-CoV-2，所述病毒性肺炎是新型冠状病毒性肺炎(COVID-19)。
8.权利要求7所述的试剂盒，其中，所述第二试剂通过体外检测来测定CEA的水平；
优先地，所述体外检测选自免疫学检测法、质谱法或光谱法；
优选地，所述免疫学检测选自酶联免疫吸附测定法(ELISA)、电化学免疫分析法(ECIA)、化学发光免疫分析法(CLIA)、电化学发光免疫分析法(ECLIA)、荧光免疫分析法(FIA)或放射免疫测定法(RIA)；
优选地，所述质谱为基质辅助激光解吸离子化质谱，例如基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)；
优选地，所述光谱法为紫外可见分光光度法。
9.权利要求8所述的试剂盒，其中，所述第二试剂包含能够特异性结合CEA的抗体；
优选地，所述能够特异性结合CEA的抗体可以为一种抗体，或多种(例如2种或更多)抗体的组合；优选地，所述多种(例如2种或更多)抗体具有彼此不同的抗原结合位点；
优选地，所述试剂包含一种能够特异性结合CEA的抗体，其具有抗原结合位点和可检测的标记；
优选地，所述试剂包含多种(例如2种或更多)能够特异性结合CEA的抗体的组合；优选地，所述组合包含作为捕获试剂的第一抗体和作为检测试剂的第二抗体；优选地，所述第二抗体具有与第一抗体不同的抗原结合位点；优选地，所述第二抗体带有可检测的标记；
优选地，所述可检测的标记选自酶(例如辣根过氧化物酶或碱性磷酸酶)、化学发光试剂(例如吖啶酯类化合物)、电化学发光试剂(例如三联吡啶钌)、电活性物质、荧光染料(例如FITC、TRITC、PE、德克萨斯红或花菁染料衍生物(例如Cy7、Alexa 750))、放射性核素(例如放射性碘)或生物素。
10.权利要求7-9任一项所述的试剂盒，其中，所述第一试剂选自：通过核酸检测测定病毒的基因组核酸或其片段的试剂、通过免疫学检测测定病毒抗原的试剂、通过免疫学检测测定病毒特异性抗体的试剂、及其任意组合；
优选地，所述通过核酸检测测定病毒的基因组核酸或其片段的试剂包括针对病毒基因组核酸或其片段特异性的引物和探针；
优选地，所述通过免疫学检测测定病毒抗原的试剂包括特异性结合病毒抗原的抗体；
优选地，所述通过免疫学检测测定病毒特异性抗体的试剂包括病毒抗原或其片段。
11.权利要求7-10任一项所述的试剂盒在制备用于评估患有病毒感染和/或由其所导致的病毒性肺炎的受试者的疾病严重程度的检测试剂中的用途；
优选地，所述检测试剂用于确定受试者是否患有病毒感染和/或由其所导致的病毒性肺炎，以及评估确定为患有病毒感染和/或由其所导致的病毒性肺炎的受试者的严重程度；
优选地，所述病毒为呼吸道病毒，例如冠状病毒、流感病毒(例如甲型流感病毒)、呼吸道合胞病毒、腺病毒、鼻病毒或副流感病毒；
优选地，所述病毒为SARS-CoV-2，所述病毒性肺炎是新型冠状病毒性肺炎(COVID-19)。
12.权利要求7-10任一项所述的试剂盒在制备用于评估疗法对患有病毒感染和/或由其所导致的病毒性肺炎的受试者的治疗效果的检测试剂中的用途；
优选地，所述病毒为呼吸道病毒，例如冠状病毒、流感病毒(例如甲型流感病毒)、呼吸道合胞病毒、腺病毒、鼻病毒或副流感病毒；
优选地，所述病毒为SARS-CoV-2，所述病毒性肺炎是新型冠状病毒性肺炎(COVID-19)。
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