CN114555069A - 寡核苷酸和用于治疗神经学疾病的方法 - Google Patents
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Abstract
本文公开了反义寡核苷酸序列,以及用于治疗神经学疾病的方法。本文描述了寡核苷酸抑制剂。在各种实施方案中,寡核苷酸靶向转录物以治疗神经学疾病,包括运动神经元疾病和/或神经病。例如,转录物的抑制剂可以用于治疗PD、ALS、FTD和ALS伴FTD。
Description
交叉引用
本申请要求2019年6月3日提交的美国临时专利申请号62/856,264;于2019年10月11日提交的美国临时专利申请号62/914,252;以及于2019年12月18日提交的美国临时专利申请号62/949,817的权益和优先权,出于所有目的,其每一个的全部公开内容在此通过引用整体并入。
序列表
本申请含有序列表,其已经以ASCII格式电子提交,并在此通过引用整体并入。所述ASCII拷贝创建于2020年5月29日,命名为QRL-002WO_SL.txt,并且大小为378,978字节。
发明领域
本申请涉及包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂,其包括STMN2反义寡核苷酸序列,以及治疗神经学疾病的方法。
发明背景
运动神经元疾病是一类导致运动神经元(协调大脑肌肉的随意运动的那些神经元)变性和死亡的神经学疾病。运动神经元疾病可能是散发性或遗传性的,并且可能影响上运动神经元和/或下运动神经元。运动神经元疾病包括肌萎缩侧索硬化、进行性延髓麻痹、假性延髓麻痹、原发性侧索硬化、进行性肌萎缩、脊髓性肌萎缩和脊髓灰质炎后综合征。
肌萎缩侧索硬化(ALS)是一组运动神经元疾病,在美国影响约15,000人。ALS的特征在于上和下运动神经元的变性和死亡,导致随意肌控制的丧失。运动神经元死亡伴随着肌肉肌束震颤和萎缩。ALS的早期症状包括肌痛性痉挛、肌痉挛、肌无力(例如,影响手臂、腿、颈部或横膈膜)、口齿不清和鼻音,以及咀嚼或吞咽困难。最终发生力量丧失和对运动(包括说话、进食和呼吸所必需的那些)的控制。疾病进展可能伴随着体重减轻、营养不良、焦虑、抑郁、增加的肺炎风险、肌痛性痉挛、神经病变和可能的痴呆。大多数诊断患有ALS的个体在首次出现症状后五年内死于呼吸衰竭。目前,对于ALS没有有效的治疗方法。
ALS发生在所有年龄的个体中,但在55至75岁之间的个体中最常见,且男性中的发病率略高。ALS可以表征为散发性或家族性。散发性ALS似乎是随机发生的,占所有ALS发病率的90%以上。家族性ALS占所有ALS发病率的5-10%。
FTD是指由大脑额叶和颞叶中的神经元丧失引起的一连串的进行性神经退行性疾病。FTD的特征在于行为和人格的改变,以及语言功能障碍。FTD的形式包括行为变异FTD(bvFTD)、语义变异原发性进行性失语症(svPPA)和非流利变异原发性进行性失语症(nfvPPA)。ALS伴FTD的特征在于与FTD相关的症状,以及ALS的症状,诸如肌无力、萎缩、肌束震颤、痉挛、言语损伤(构音障碍)和无法吞咽(吞咽困难)。个体通常在5到10年内死于FTD,而ALS伴FTD通常会在首次疾病症状出现后2到3年内导致死亡。
与ALS一样,没有已知的对于FTD或ALS伴FTD的治愈,也没有已知的预防或延缓这两种疾病进展的治疗。
因此,迫切需要鉴定能够预防、改善和治疗神经学疾病,诸如肌萎缩侧索硬化(ALS)、额颞叶痴呆(FTD)、阿尔茨海默病(AD)、帕金森病(PD),亨廷顿病、臂丛损伤、外周神经损伤、进行性核上性麻痹(PSP)、脑外伤、脊髓损伤、皮质基底节变性(CBD)和/或神经病诸如化学疗法诱导的神经病的化合物。
RNA结合蛋白反式反应DNA结合蛋白43(TDP-43)参与基本的RNA加工活动,包括RNA转录、剪接和转运。TDP-43与数以千计的前信使RNA/mRNA靶标结合,对富含GU的序列具有高亲和力,包括通过与3’非翻译区结合来自动调节其自身的mRNA。来自其他正常成人神经系统中的TDP-43的减少改变了1,500多种RNA,包括含有长内含子的转录物的剪接或表达水平。参见Melamed et al.,Nat Neurosci.(2019),22(2):180-190。
在大多数ALS的病例中和约45%的患有FTD的患者中的受累神经元中,已经报道了TDP-43的细胞质累积和核损失。参见Melamed et al.,Nat Neurosci.(2019),22(2):180-190。此外,已经显示TDP-43调节神经元生长相关因子抑微管装配蛋白-2的表达。参见Melamed(2019);也参见Klim et al.,Nat Neurosci.(2019),22(2):167-179。TDP-43破坏显示驱动抑微管装配蛋白-2前mRNA的内含子1中的过早多腺苷酸化和异常剪接,产生截短的mRNA和功能性STMN2蛋白的丧失。参见Melamed(2019)。STMN2编码正常运动神经元外生长和修复所必需的蛋白质。参见Melamed(2019);也参见Klim(2019)。
将抑微管装配蛋白-2基因注释为包含五个组成型外显子(Refseq ID:NM_001199214.1)外加在外显子4和5之间提出的备选外显子。参见Melamed(2019);也参见Klim(2019)。TDP-43的减少或突变诱导新的剪接外显子,其定位在内含子1内。参见Melamed(2019);也参见Klim(2019)。当TDP-43经消减或内源性TDP-43具有N352突变时,这种新的外显子(表示为“外显子2a”或“隐蔽外显子”)出现在STMN2前mRNA中。参见Melamed(2019);也参见Klim(2019)。STMN2前mRNA中的隐蔽外显子含有隐蔽的多腺苷酸化序列,其导致前mRNA过早的多腺苷酸化。参见Melamed(2019);也参见Klim(2019)。这种过早多腺苷酸化的RNA包括227个源于隐蔽外显子的核苷酸,其中其预测的16个氨基酸翻译产物起始于外显子1中的正常AUG密码子,并将11个密码子结束于隐蔽外显子中。参见Melamed(2019);也参见Klim(2019)。
本发明提供了包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂,用于治疗神经学疾病或病症。
发明概述
本文描述了寡核苷酸抑制剂。在各种实施方案中,寡核苷酸靶向转录物以治疗神经学疾病,包括运动神经元疾病,和/或神经病。例如,转录物抑制剂可以用于治疗PD、ALS、FTD和ALS伴FTD。在各种实施方案中,寡核苷酸抑制剂是反义寡核苷酸。在各种实施方案中,寡核苷酸抑制剂靶向抑微管装配蛋白-2(Stathmin-2,STMN2)转录物。在一些实施方案中,STMN2转录物包括隐蔽外显子,诸如具有以下在SEQ ID NO:447中鉴定的序列的隐蔽外显子。
本文另外公开了包含寡核苷酸的化合物,该寡核苷酸包含具有至少19个连续核碱基序列的连接核苷,该序列与具有与SEQ ID NO:944至少90%(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)同一性的转录物的等长部分或与SEQ IDNO:944的连续19至50个核碱基部分至少90%(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)互补,其中连接核苷的至少一个核苷键联是非天然键联。本文另外公开了寡核苷酸,其包含具有至少19个连续核碱基序列的连接核苷,该序列与具有与SEQ ID NO:944至少90%(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)同一性的转录物的等长部分或与SEQ ID NO:944的连续19至50个核碱基部分至少90%(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)互补,其中连接核苷的至少一个核苷键联是非天然键联。
在各种实施方案中,核碱基序列包含至少10个连续核碱基的部分,该部分与SEQID NO:1-446、SEQ ID NO:894-918、SEQ ID NO:945-1390或SEQ ID NO:1392-1432中任一个的等长部分共享至少90%(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)同一性。在各种实施方案中,核碱基序列包含至少11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25个连续核碱基的部分,该部分与SEQ ID NO:1-446、SEQ ID NO:894-918、SEQ ID NO:945-1390或SEQ ID NO:1392-1432中任一个的等长部分共享至少90%(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)同一性。
在各种实施方案中,核碱基序列包含至少10个连续核碱基的部分,该部分与SEQID NO:31、36、41、46、55、144、146、150、169、170、171、172、173、177、181、185、197、203、209、215、237、244、249、252、380、385、390、395、400、975、980、985、999、1088、1090、1094、1113、1114、1115、1116、1117、1121、1125、1129、1141、1147、1153、1159、1181、1188、1193、1196、1324、1329、1334、1339或1344中任一个的等长部分共享至少90%(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)同一性,其中连接核苷的至少一个核苷键联是非天然键联。在各种实施方案中,核碱基序列包含至少11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25个连续核碱基的部分,该部分与SEQ ID NO:31、36、41、46、55、144、146、150、169、170、171、172、173、177、181、185、197、203、209、215、237、244、249、252、380、385、390、395、400、975、980、985、999、1088、1090、1094、1113、1114、1115、1116、1117、1121、1125、1129、1141、1147、1153、1159、1181、1188、1193、1196、1324、1329、1334、1339或1344中任一个的等长部分共享至少90%(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)同一性。
本文另外公开了包含寡核苷酸的化合物,该寡核苷酸包含具有至少19个连续核碱基序列的连接核苷,其中核碱基序列包含至少10个连续核碱基的部分,该部分与SEQ IDNO:894-918或SEQ ID NO:1392-1432中任一个的等长部分共享至少90%(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)同一性。本文另外公开了寡核苷酸,其包含具有至少19个连续核碱基序列的连接核苷,其中核碱基序列包含至少10个连续核碱基的部分,该部分与SEQ ID NO:894-918或SEQ ID NO:1392-1432中任一个的等长部分共享至少90%(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)同一性。在各种实施方案中,核碱基序列包含至少11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25个连续核碱基的部分,该部分与SEQ ID NO:894-918或SEQ ID NO:1392-1432中任一个共享至少90%(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)同一性。
本文另外公开了包含寡核苷酸的化合物,该寡核苷酸包含具有至少19个连续核碱基序列的连接核苷,其中核碱基序列包含与在SEQ ID NO:944的121-144、144-168、146-170、150-170、150-172、150-170、150-172、150-174、169-193、169-189、169-191、170-190、170-192、171-191、171-193、172-192、172-194、170-194、171-195、172-196、173-197、185-209、197-221、237-261、249-273、252-276或276-300位中任一个内的核碱基的等长部分至少90%(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)互补的至少10个连续核碱基的部分。本文另外公开了寡核苷酸,其包含具有至少19个连续核碱基序列的连接核苷,其中核碱基序列包含与在SEQ ID NO:944的121-144、144-168、146-170、150-170、150-172、150-174、169-193、169-189、169-191、170-190、170-192、171-191、171-193、172-192、172-194、170-194、171-195、172-196、173-197、185-209、197-221、237-261、249-273、252-276或276-300位中任一个内的核碱基的等长部分至少90%(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)互补的至少10个连续核碱基的部分。
在各种实施方案中,核碱基序列的部分与在SEQ ID NO:944的121-144、144-168、146-170、150-170、150-172、150-174、169-193、169-189、169-191、170-190、170-192、171-191、171-193、172-192、172-194、170-194、171-195、172-196、173-197、185-209、197-221、237-261、249-273、252-276或276-300位中任一个内的核碱基的等长部分100%互补。在各种实施方案中,核碱基序列的部分与在SEQ ID NO:944的144-164、144-166、145-167、146-166、146-168、147-165或148-168位中任一个内的核碱基的等长部分100%互补。在各种实施方案中,核碱基序列的部分与在SEQ ID NO:944的173-191、173-193、173-195、173-197、175-195、175-197、177-197或179-197位中任一个内的核碱基的等长部分100%互补。
在各种实施方案中,核碱基序列的部分与在SEQ ID NO:944的185-205、187-209、189-209、185-207、197-217、197-219或191-209位中任一个内的核碱基的等长部分100%互补。在各种实施方案中,核碱基序列的部分与在SEQ ID NO:944的237-255、237-257、237-259、239-259、239-261、241-261、237-257、249-269、249-271、252-272、252-274或243-261位中任一个内的核碱基的等长部分100%互补。在各种实施方案中,核碱基序列包含至少11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25个连续核碱基的部分,该部分与在SEQID NO:944的121-144、144-168、146-170、150-170、150-172、150-174、169-193、169-189、169-191、170-190、170-192、171-191、171-193、172-192、172-194、170-194、171-195、172-196、173-197、185-209、197-221、237-261、249-273、252-276或276-300位中任一个内的核碱基的等长部分互补。在各种实施方案中,核碱基序列包含至少11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25个连续核碱基的部分,该部分与在SEQ ID NO:944的144-164、144-166、145-167、146-166、146-168、147-165、148-168、173-191、173-193、173-195、173-197、175-195、175-197、177-197、179-197、185-205、185-207、197-217、197-219、187-209、189-209、191-209、237-255、237-257、237-259、239-259、239-261、241-261、237-257、249-269、249-271、252-272、252-274或243-261位中任一个内的核碱基的等长部分互补。
在各种实施方案中,寡核苷酸为19和40个核苷长度。在各种实施方案中,寡核苷酸包含至少一个选自下组的核苷键联:磷酸二酯键联、硫代磷酸酯(phosphorothioate)键联、烷基磷酸酯键联、烷基膦酸酯键联、3-甲氧基丙基膦酸酯键联、二硫代磷酸酯键联、磷酸三酯键联、甲基膦酸酯键联、氨基烷基磷酸三酯键联、亚烷基膦酸酯键联、亚膦酸酯键联、氨基磷酸酯键联、硫代氨基磷酸酯键联、二氨基磷酸酯(例如,包括二氨基磷酸酯吗啉代(PMO)、3’氨基核糖或5’氨基核糖)键联、氨基烷基氨基磷酸酯键联、硫代氨基磷酸酯键联、硫代烷基膦酸酯键联、硫代烷基磷酸三酯键联、硫化磷酸酯(thiophosphate)键联、硒代磷酸酯键联和硼代磷酸酯键联,或其任何组合。在各种实施方案中,寡核苷酸的至少两个、三个或四个核苷间键联是磷酸二酯核苷间键联。在各种实施方案中,寡核苷酸包含至少两个、三个或四个修饰的核苷间键联。
在各种实施方案中,寡核苷酸的修饰的核苷间键联中的每一个独立地选自硫代磷酸酯键联、氨基磷酸酯键联、硫代氨基磷酸酯键联、二氨基磷酸酯键联。在各种实施方案中,寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联。在各种实施方案中,硫代磷酸酯核苷间键联处于Rp构型或Sp构型中的一种。在各种实施方案中,寡核苷酸包含至少一个修饰的核碱基。在各种实施方案中,至少一个修饰的核碱基是5-甲基胞嘧啶、假尿苷或5-甲氧基尿苷。
在各种实施方案中,寡核苷酸包含至少一个修饰的糖部分。在各种实施方案中,修饰的糖部分是2’-OMe(2’-OCH3或2’-O-甲基)修饰的糖部分、双环糖部分、2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-O(CH2)2OCH3(2’MOE))、2’-脱氧-2’-氟核苷、2’-氟-β-D-阿糖核苷、锁核酸(LNA)、受约束的乙基2’-4’-桥接核酸(cEt)、S-cEt、己糖醇核酸(HNA)和三环类似物(例如,tcDNA)中的一种。
在各种实施方案中,其中寡核苷酸包含在5’末端通过磷酸二酯核苷间键联连接的三个连接核苷和在3’末端通过磷酸二酯核苷间键联连接的三个连接核苷。在各种实施方案中,寡核苷酸包含通过硫代磷酸酯核苷间键联连接的一个或多个2’-O-(2-甲氧基乙基)核苷。在一些实施方案中,本发明的STMN2反义寡核苷酸中的所有胞嘧啶核苷包括包含2’-MOE的修饰的糖部分,所有核苷包含修饰的核碱基5-甲基胞嘧啶,并且所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联。在各种实施方案中,寡核苷酸包含在5’末端通过硫代磷酸酯核苷间键联连接的三个连接核苷和在3’末端通过硫代磷酸酯核苷间键联连接的三个连接核苷。在各种实施方案中,寡核苷酸包含通过磷酸二酯核苷间键联连接的五个连接核苷。在各种实施方案中,五个连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。在各种实施方案中,寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
在各种实施方案中,寡核苷酸展现出全长STMN2转录物或STMN2蛋白的至少30%、40%、50%、60%、70%、80%或90%的增加。在各种实施方案中,寡核苷酸展现出全长STMN2转录物或STMN2蛋白的至少100%的增加。在各种实施方案中,寡核苷酸展现出全长STMN2转录物或STMN2蛋白的至少200%的增加。在各种实施方案中,寡核苷酸展现出全长STMN2转录物或STMN2蛋白的至少300%的增加。在各种实施方案中,寡核苷酸展现出全长STMN2转录物或STMN2蛋白的至少400%的增加。在各种实施方案中,与使用TDP43反义寡核苷酸实现的全长STMN2蛋白的降低水平相比,测量全长STMN2蛋白的增加。在各种实施方案中,寡核苷酸展现出全长STMN2转录物或STMN2蛋白的至少10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或100%的挽救。在各种实施方案中,寡核苷酸展现出具有隐蔽外显子的STMN2转录物的至少50%、60%、70%、80%或90%的减少。
本文另外公开了药物组合物,其包含一种或多种以上所描述的寡核苷酸,或其药学上可接受的盐和药学上可接受的赋形剂。本文另外公开了在由此需要的患者中治疗神经学疾病和/或神经病的方法,该方法包括向患者施用以上所描述的寡核苷酸中的任何寡核苷酸或其药学上可接受的盐,或以上所描述的药物组合物。
在各种实施方案中,神经学疾病选自由肌萎缩侧索硬化(ALS)、额颞叶痴呆(FTD)、阿尔茨海默病(AD)、帕金森病(PD)、亨廷顿病、臂丛损伤、周围神经损伤、进行性核上性麻痹(PSP)、脑外伤、脊髓损伤和皮质基底节变性(CBD)组成的组。在各种实施方案中,神经病是化学疗法诱发的神经病。
本文另外公开了恢复神经元的轴突外生长和/或再生的方法,该方法包括将运动神经元暴露于以上所描述的寡核苷酸中的任何寡核苷酸或其药学上可接受的盐,或以上所描述的药物组合物。本文另外公开增加、促进、稳定或维持神经元中STMN2表达和/或功能的方法,该方法包括将细胞暴露于以上所描述的寡核苷酸中的任何寡核苷酸或其药学上可接受的盐,或以上所描述的药物组合物。在各种实施方案中,神经元是需要治疗神经学疾病和/或神经病的患者的神经元。在各种实施方案中,神经学疾病选自由肌萎缩侧索硬化(ALS)、额颞叶痴呆(FTD)、阿尔茨海默病(AD)、帕金森病(PD)、亨廷顿病、臂丛损伤、周围神经损伤、进行性核上性麻痹(PSP)、脑外伤、脊髓损伤和皮质基底节变性(CBD)组成的组。在各种实施方案中,神经病是化学疗法诱发的神经病。
在各种实施方案中,暴露在体内或离体进行。在各种实施方案中,暴露包括将本文所公开的STMN2寡核苷酸(STMN2 AON)或其药物组合物施用于有此需要患者。在各种实施方案中,STMN2寡核苷酸或其药物组合物经局部、胃肠外(例如,皮下、肌内、皮内、十二指肠内或静脉内)、病灶内、鞘内、脑池内、口服、直肠、颊、舌下、阴道、肺、气管内、鼻内、经皮或十二指肠内施用。在各种实施方案中,STMN2寡核苷酸或其药物组合物经口服施用。在各种实施方案中,治疗有效量的STMN2寡核苷酸或其药物组合物经鞘内或脑池内施用。
在各种实施方案中,患者是人。在多个实施方案中,药物组合物适用于局部、鞘内、脑池内、胃肠外(例如皮下、肌内、皮内、十二指肠内或静脉内)、病灶内、口服、肺、气管内、鼻内、经皮、直肠、颊、舌下、阴道或十二指肠内施用。
本文另外公开了STMN2寡核苷酸或其药学上可接受的盐或以上所描述的药物组合物在制备用于治疗神经学疾病或神经病的药物中的用途。在各种实施方案中,神经学疾病选自由肌萎缩侧索硬化(ALS)、额颞叶痴呆(FTD)、阿尔茨海默病(AD)、帕金森病(PD)、亨廷顿病、臂丛损伤、周围神经损伤、进行性核上性麻痹(PSP)、脑外伤、脊髓损伤和皮质基底节变性(CBD)组成的组。在各种实施方案中,神经病是化学疗法诱发的神经病。
本文另外公开了在有此需要的患者中治疗神经学疾病或神经病的方法,该方法包括向有此需要的患者施用治疗有效量的STMN2寡核苷酸或其药学上可接受的盐,或以上所描述的药物组合物。在各种实施方案中,神经学疾病选自由肌萎缩侧索硬化(ALS)、额颞叶痴呆(FTD)、阿尔茨海默病(AD)、帕金森病(PD)、亨廷顿病、臂丛损伤、周围神经损伤、进行性核上性麻痹(PSP)、脑外伤、脊髓损伤和皮质基底节变性(CBD)组成的组。在各种实施方案中,神经病是化学疗法诱发的神经病。在各种实施方案中,药物组合物经局部、胃肠外(例如,皮下、肌内、皮内、十二指肠内或静脉内)、病灶内、口服、肺、直肠、颊、舌下、阴道、气管内、鼻内、脑池内、鞘内、经皮或十二指肠内施用。在各种实施方案中,药物组合物经鞘内或脑池内施用。在各种实施方案中,治疗有效量的STMN2寡核苷酸或其药物组合物经鞘内或脑池内施用。在各种实施方案中,患者是人。
本文另外公开了STMN2寡核苷酸或其药学上可接受的盐,其用作治疗神经学疾病或神经病的药物。在某些实施方案中,本公开提供了STMN2寡核苷酸或其药学上可接受的盐,其用于治疗神经学疾病或神经病。在各种实施方案中,神经学疾病选自由肌萎缩侧索硬化(ALS)、额颞叶痴呆(FTD)、阿尔茨海默病(AD)、帕金森病(PD)、亨廷顿病、臂丛损伤、周围神经损伤、进行性核上性麻痹(PSP)、脑外伤、脊髓损伤和皮质基底节变性(CBD)组成的组。在各种实施方案中,神经病是化学疗法诱发的神经病。
本文另外公开了STMN2寡核苷酸,其包含具有SEQ ID NO:1-446、SEQ ID NO:894-918、SEQ ID NO:945-1390或SEQ ID NO:1392-1432中任一个的核碱基序列的连接核苷,或其药学上可接受的盐;其中寡核苷酸包含至少一个选自下组的核苷键联:磷酸二酯键联、硫代磷酸酯键联、烷基磷酸酯键联、烷基膦酸酯键联、3-甲氧基丙基膦酸酯键联、二硫代磷酸酯键联、磷酸三酯键联、甲基膦酸酯键联、氨基烷基磷酸三酯键联、亚烷基膦酸酯键联、亚膦酸酯键联、氨基磷酸酯键联、硫代氨基磷酸酯键联、二氨基磷酸酯键联、氨基烷基氨基磷酸酯键联、硫代氨基磷酸酯键联、硫代烷基膦酸酯键联、硫代烷基磷酸三酯键联、硫化磷酸酯键联、硒代磷酸酯键联和硼代磷酸酯键联,和/或其中连接核苷的至少一个核苷经选自下组的组分取代:2’-O-(2-甲氧基乙基)核苷(2’-O-甲氧基乙基核糖核苷(2’-MOE))、2’-O-甲基核苷、2’-脱氧-2’-氟核苷、2’-氟-β-D-阿糖核苷、锁核酸(LNA)、受约束的甲氧基乙基(cMOE)、受约束的乙基(cET)和肽核酸(PNA)。
在各种实施方案中,寡核苷酸的至少一个核苷间键联是硫代磷酸酯键联。在各种实施方案中,寡核苷酸包含在5’末端通过磷酸二酯核苷间键联连接的三个连接核苷和在3’末端通过磷酸二酯核苷间键联连接的三个连接核苷。在各种实施方案中,寡核苷酸包含通过硫代磷酸酯核苷间键联连接的一个或多个2’-O-(2-甲氧基乙基)核苷。在各种实施方案中,寡核苷酸包含通过磷酸二酯核苷间键联连接的五个连接核苷。在各种实施方案中,五个连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。在各种实施方案中,寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。在各种实施方案中,寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,任选地其中寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
本文另外公开了药物组合物,其包含以上所描述的寡核苷酸中的任何寡核苷酸或其药学上可接受的盐和药学上可接受的赋形剂。本文另外公开了STMN2寡核苷酸或其药学上可接受的盐,其能够在细胞或神经学疾病或病症的人患者中增加、恢复或稳定能够翻译功能性STMN2的STMN2 mRNA的表达和/或STMN2蛋白的活性和/或功能,其中表达和/或活性和/或功能的增加、恢复或稳定的水平足以将该寡核苷酸用作治疗神经学疾病或病症的药物。在各种实施方案中,其中寡核苷酸包含一个或多个手性中心和/或双键。在各种实施方案中,寡核苷酸作为选自几何异构体、对映异构体和非对映异构体的立体异构体存在。
本文另外公开了在有此需要的患者中治疗神经学疾病和/或神经病的方法,该方法包括向有此需要的患者施用治疗有效量的STMN2寡核苷酸或其药学上可接受的盐或以上所描述的药物组合物,联合选自以下的第二治疗剂:利鲁唑(Rilutek)、依达拉奉(Radicava)、卡巴拉汀、多奈哌齐、加兰他敏、选择性血清素重摄取抑制剂、抗精神病药剂、胆碱酯酶抑制剂、美金刚、苯二氮卓类抗焦虑药、AMX0035(ELYBRIO)、ZILUCOPLAN(RA101495)、双重AON鞘内施用(例如,BIIB067、BIIB078)、BIIB100、左旋多巴/卡比多巴、多巴胺能药剂(例如,罗匹尼罗、普拉克索、罗替戈汀)、甲羟孕酮、KCNQ2/KCNQ3开放剂、抗惊厥剂和精神兴奋剂,和/或疗法(例如,选自呼吸护理、物理疗法、职业疗法、言语疗法、营养支持),用于治疗所述神经学疾病。
在各种实施方案中,神经学疾病选自由肌萎缩侧索硬化(ALS)、额颞叶痴呆(FTD)、阿尔茨海默病(AD)、帕金森病(PD)、亨廷顿病、臂丛损伤、周围神经损伤、进行性核上性麻痹(PSP)、脑外伤、脊髓损伤和皮质基底节变性(CBD)组成的组。在各种实施方案中,神经病是化学疗法诱发的神经病。
附图简述
图1A是STMN2转录物的部分和设计用于靶向STMN2转录物某些部分的STMN2反义寡核苷酸的示意图。图1B是STMN2转录物的部分和设计用于靶向SY5Y细胞中的STMN2转录物的某些部分的STMN2反义寡核苷酸的另一个示意图。图1C是STMN2转录物的部分和设计用于靶向人运动神经元中的STMN2转录物的某些部分的STMN2反义寡核苷酸的又一示意图。在图1A、1B和1C的每一个中,实线表示测试的STMN 2AON与单独处理的TDP43 AON相比增加STMN2-FL mRNA表达超过50%。虚线表示测试的STMN2 AON与单独处理的TDP43 AON相比增加STMN2-FL(全长)mRNA小于50%。
图2是条形图,其显示了在TDP43反义物存在下TDP43和STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及在6种不同STMN2反义寡核苷酸(QSN-36、QSN-55、QSN-177、QSN-203、QSN-244和QSN-395)存在下全长STMN2转录物的恢复。
图3是条形图,其显示了在TDP43反义物存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及在6种不同STMN2反义寡核苷酸(QSN-173、QSN-181、QSN-197、QSN-215、QSN-385和QSN-400)存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。
图4是条形图,其显示了在TDP43反义物存在下STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及在6种不同STMN2反义寡核苷酸(QSN-173、QSN-181、QSN-197、QSN-215、QSN-385和QSN-400)存在下全长STMN2转录物的恢复。
图5A是条形图,其显示了在TDP43反义物存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及在6种不同STMN2反义寡核苷酸(QSN-185、QSN-209、QSN-237、QSN-252、QSN-380和QSN-390)存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。
图5B是条形图,其显示了在TDP43反义物存在下STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及在6种不同STMN2反义寡核苷酸(QSN-185、QSN-209、QSN-237、QSN-252、QSN-380和QSN-390)存在下全长STMN2转录物的恢复。
图6A是条形图,其显示了在TDP43反义物存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及在两次重复实验中,在2种不同STMN2反义寡核苷酸(QSN-144和QSN-237)存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。
图6B是条形图,其显示了在TDP43反义物存在下STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及在两次重复实验中,在2种不同STMN2反义寡核苷酸(QSN-144和QSN-237)存在下全长STMN2转录物的恢复。
图7A是条形图,其显示了在TDP43反义物存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及在5种不同STMN2反义寡核苷酸(QSN-36、QSN-173、QSN-177、QSN-181和QSN-185)存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。
图7B是条形图,其显示了在TDP43反义物存在下STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及在5种不同STMN2反义寡核苷酸(QSN-36、QSN-173、QSN-177、QSN-181和QSN-185)存在下全长STMN2转录物的恢复。
图8A是条形图,其显示了在TDP43反义物存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及在5种不同STMN2反义寡核苷酸(QSN-197、QSN-203、QSN-237、QSN-380和QSN-395)存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。
图8B是条形图,其显示了在TDP43反义物存在下STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及在5种不同STMN2反义寡核苷酸(QSN-197、QSN-203、QSN-237、QSN-380和QSN-395)存在下全长STMN2转录物的恢复。
图9A是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及在3种不同STMN2反义寡核苷酸(QSN-144、QSN-173和QSN-237)存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。
图9B是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下TDP43和STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及在3种不同STMN2反义寡核苷酸(QSN-144、QSN-173和QSN-237)存在下全长STMN2转录物的恢复。
图10A是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及在不同剂量的QSN-181STMN2反义寡核苷酸中具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。
图10B是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下TDP43和STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及在不同剂量的QSN-181STMN2反义寡核苷酸中全长STMN2转录物的恢复。
图11A是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及在不同剂量的QSN-185STMN2反义寡核苷酸中具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。
图11B是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下TDP43和STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及在不同剂量的QSN-185STMN2反义寡核苷酸中全长STMN2转录物的恢复。
图12A是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及在不同剂量的QSN-197STMN2反义寡核苷酸中具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。
图12B是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下TDP43和STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及在不同剂量的QSN-197STMN2反义寡核苷酸中全长STMN2转录物的恢复。
图13A是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及在不同剂量的QSN-144STMN2反义寡核苷酸中具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。
图13B是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下TDP43和STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及在不同剂量的QSN-144STMN2反义寡核苷酸中全长STMN2转录物的恢复。
图14A是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及在不同剂量的QSN-173STMN2反义寡核苷酸中具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。
图14B是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下TDP43和STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及在不同剂量的QSN-173STMN2反义寡核苷酸中全长STMN2转录物的恢复。
图15A是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及在不同剂量的QSN-237STMN2反义寡核苷酸中具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。
图15B是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下TDP43和STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及在不同剂量的QSN-237STMN2反义寡核苷酸中全长STMN2转录物的恢复。
图16是蛋白印迹法和定量条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下STMN2全长mRNA水平的归一化量,以及对于2种不同STMN2反义寡核苷酸(QSN-173和QSN237),全长STMN2转录物的恢复。
图17A是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及使用QSN-237STMN2反义寡核苷酸的不同变体的具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。
图17B是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下TDP43和STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及使用QSN-237STMN2反义寡核苷酸的不同变体的全长STMN2转录物的恢复。
图18A是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及使用QSN-185STMN2反义寡核苷酸的不同变体的具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。
图18B是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下TDP43和STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及使用QSN-185STMN2反义寡核苷酸的不同变体的全长STMN2转录物的恢复。
图19A是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及使用QSN-173STMN2反义寡核苷酸的不同变体的具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。
图19B是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下TDP43和STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及使用QSN-173STMN2反义寡核苷酸的不同变体的全长STMN2转录物的恢复。
图20A是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及使用QSN-237STMN2反义寡核苷酸的不同变体的具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。
图20B是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下TDP43和STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及使用QSN-237STMN2反义寡核苷酸的不同变体的全长STMN2转录物的恢复。
图21A是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及使用QSN-173STMN2反义寡核苷酸的不同变体的具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。
图21B是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下TDP43和STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及使用QSN-173STMN2反义寡核苷酸的不同变体的全长STMN2转录物的恢复。
图22A是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及使用QSN-144STMN2反义寡核苷酸的不同变体的具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。
图22B是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下TDP43和STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析的结果,以及使用QSN-144STMN2反义寡核苷酸的不同变体的全长STMN2转录物的恢复。
图23显示了剂量反应曲线,说明随着STMN2 AON浓度的增加,全长STMN2转录物的恢复增加。
图24A显示了证明全长STMN2蛋白响应更高浓度的STMN2 AON的定性增加的Western印迹测定法。
图24B显示了响应不同浓度的STMN2 AON的归一化至GAPDH的全长STMN2蛋白的定量水平。
图25A是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的RT-qPCR分析结果,以及使用不同QSN-144STMN2 AON和AON变体的具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。
图25B是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下TDP43和STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析结果,以及使用不同QSN-144STMN2 AON和AON变体的全长STMN2转录物的恢复。
图26A是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的RT-qPCR分析结果,以及使用不同QSN-173STMN2 AON和AON变体的具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。
图26B是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下TDP43和STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析结果,以及使用不同QSN-173STMN2 AON和AON变体的全长STMN2转录物的恢复。
图27A是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的RT-qPCR分析结果,以及使用不同QSN-185STMN2 AON和AON变体的具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。
图27B是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下TDP43和STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析结果,以及使用不同QSN-185STMN2 AON和AON变体的全长STMN2转录物的恢复。
图28A是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的RT-qPCR分析结果,以及使用不同的QSN-237STMN2 AON和AON变体的具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。
图28B是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下TDP43和STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析结果,以及使用不同QSN-237STMN2 AON和AON变体的全长STMN2转录物的恢复。
图29A是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的RT-qPCR分析结果,以及使用不同STMN2 AON(QSN-31、QSN-41和QSN-46)的具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。
图29B是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下TDP43和STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析结果,以及使用不同STMN2AON(QSN-31、QSN-41和QSN-46)的全长STMN2转录物的恢复。
图30是条形图,其显示使用QSN-237STMN2反义寡核苷酸的人运动神经元中隐蔽外显子诱导的逆转,即使考虑到增加的蛋白酶体抑制。
图31A和31B显示的条形图显示了具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平和STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析结果,其证明了使用不同的STMN2 AON和AON变体的具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低和全长STMN2转录物的恢复。
图32是显示STMN2蛋白水平的western印迹法分析结果的条形图,其证明了使用不同STMN2 AON和AON变体的全长STMN2蛋白的恢复。
图33A是显示人运动神经元中具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA表达的RT-qPCR分析结果的条形图,其证明了使用不同STMN2 AON(QSN-31、QSN-41和QSN-46)的具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。
图33B是显示STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析结果的条形图,其证明了使用不同STMN2 AON(QSN-31、QSN-41和QSN-46)的全长STMN2转录物的恢复。
图34A是显示人运动神经元中具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA表达的RT-qPCR分析结果的条形图,其证明了使用不同STMN2 AON(QSN-146、QSN-150和QSN-169)的具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。
图34B是显示STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析结果的条形图,其证明了使用不同STMN2 AON(QSN-146、QSN-150和QSN-169)的全长STMN2转录物的恢复。
图34C是显示人运动神经元中具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA表达的RT-qPCR分析结果的条形图,其证明了使用不同STMN2 AON(QSN-170、QSN-171和QSN-172)的具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。
图34D是显示STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析结果的条形图,其证明了使用不同STMN2 AON(QSN-170、QSN-171和QSN-172)的全长STMN2转录物的恢复。
图34E是显示人运动神经元中具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA表达的RT-qPCR分析结果的条形图,其证明了使用不同STMN2 AON(QSN-249)的具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。
图34F是显示STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析结果的条形图,其证明了使用不同STMN2 AON(QSN-249)的全长STMN2转录物的恢复。
发明详述
现在将更具体地描述本公开的特征和其他细节。此处收集了说明书、实施例和所附权利要求中采用的某些术语。这些定义应该根据本公开的其余部分来解读,并为本领域技术人员所理解。除非另有定义,否则本文使用的所有技术和科学术语具有与本领域普通技术人员通常理解的相同含义。
本文使用的术语“治疗”等通常意指获得期望的药理学和/或生理学效果。该效果在部分或完全治愈疾病和/或归因于该疾病的不良反应方面可以是治疗性的。如本文所用,术语“治疗”覆盖在哺乳动物,特别是人中的疾病的任何治疗,并且包括:(a)抑制疾病,即防止疾病的严重性或范围增加;(b)缓解疾病,即引起疾病的部分或完全改善;(c)防止疾病复发,即防止疾病在先前成功治疗疾病的症状或治疗疾病后恢复到活跃状态。
“预防”包括延迟在受试者中发展的状态、病症、疾病或病况的临床症状、并发症或生化指标的发作,该受试者可能患有或易感染该状态、病症、疾病或病况但尚未经历或表现出状态、病症、疾病或病况的临床或亚临床症状。“预防”包括防治性治疗受试者中或在受试者中发展的状态、病症、疾病或病况,其包括防治性治疗受试者中或在受试者中发展的状态、病症、疾病或病况的临床症状、并发症或生化指标。
如本文所用,术语“药学上可接受的载体”或“药学上可接受的赋形剂”可互换地指与药物施用相容的任何和所有溶剂、分散介质、包衣、等渗剂和吸收延迟剂等。将此类介质和试剂用于药物活性物质在本领域中是众所周知的。该组合物还可以含有提供补充的、额外的或增强的治疗功能的其他活性化合物。
如本文所用,术语“药物组合物”是指包含至少一种生物活性化合物的组合物,例如本文公开的STMN2反义寡核苷酸(AON),与一种或多种药学上可接受的赋形剂一起配制。
“个体”、“患者”或“受试者”可互换使用并且包括任何动物,包括哺乳动物,优选小鼠、大鼠、其他啮齿动物、兔、狗、猫、猪、牛、绵羊、马或非人灵长类,并且最优选人。本发明的化合物可以施用于哺乳动物,诸如人,但也可以是其他哺乳动物,诸如需要兽医治疗的动物,例如家养动物(例如狗、猫等)、农场动物(例如,牛、绵羊、猪、马等)和实验室动物(例如,大鼠、小鼠、豚鼠、非人灵长类等)。在一些实施方案中,在本发明的方法中治疗的哺乳动物理想地是需要调控STMN2表达和/或活性的哺乳动物。
术语“STMN2寡核苷酸”、“STMN2反义寡核苷酸”或“STMN2 AON”是指能够增加、恢复或稳定全长STMN2活性,例如全长STMN2表达,例如,全长STMN2 mRNA和/或全长STMN2蛋白表达的寡核苷酸。通常,STMN2寡核苷酸通过靶向包含隐蔽外显子的STMN2转录物来降低具有隐蔽外显子的成熟STMN2转录物的水平。患有ALS、FTD、ALS伴FTD或另一种神经或运动神经元疾病的患者可以是被诊断为患有该疾病或表现出该疾病症状的患者。患有ALS、FTD、ALS伴FTD或其他神经或运动神经元疾病的患者可以是先前患有该疾病并且在康复或经历疾病和/或疾病症状的完全或部分改善后经历疾病或疾病症状的完全或部分复发的患者。患有ALS、FTD、ALS伴FTD或其他神经或运动神经元疾病或病症的患者可以是携带与疾病或病症表现相关的基因突变的患者。例如,患有ALS的患者可以是携带以下任何中的基因突变的患者:SOD1、C9orf72、共济蛋白2(ATXN2)、带电多泡体蛋白2B(CHMP2B)、动力蛋白激活蛋白1(DCTN1)、人表皮生长因子受体4(ERBB4)、FIG4磷酸肌醇5-磷酸酶(FIG4)、NIMA相关激酶1(NEK1)、核内不均一核糖核蛋白A1(HNRNPA1)、重神经丝(NEFH)、外周蛋白(PRPH)、TAR DNA结合蛋白43(TDP43或TARDBP)、融合肉瘤(Fused in Sarcoma,FUS)、泛醌蛋白2(UBQLN2)、驱动蛋白家族成员5A(KIF5A)、含缬酪肽蛋白(VCP)、Alsin(ALS2)、Senataxin(SETX)、σ非阿片样物质细胞内受体1(SIGMAR1)、运动神经元存活1,端粒(Survival of Motor Neuron 1,Telomeric,SMN1)、痉挛性截瘫11,常染色体隐性(SPG11)、瞬时受体电位阳离子通道亚家族成员7(TRPM7)、囊泡相关膜蛋白相关蛋白B/C(VAPB)、血管生成素(ANG)、前纤维蛋白1(PFN1)、基质蛋白3(MATR3)、含10个(CHCHD10)的的卷曲螺旋-螺旋-卷曲螺旋-螺旋结构域、微管蛋白,α4A(TUBA4A)、TBK1、C21orf2、Sequestosome-1(SQSTM1,也称为泛素结合蛋白p62)和/或视神经蛋白(OPTN),特别是当该突变与ALS或发展ALS的高风险有关。
患有ALS、FTD、ALS伴FTD或另一种神经或运动神经元疾病风险的患者可以包括具有该疾病的家族史或该疾病的遗传易感性的那些患者(例如,例如,携带与高疾病风险相关的基因突变的患者)或暴露于增加疾病风险的环境因素的患者。例如,如果患者携带编码SOD1、C9orf72、ATXN2、CHMP2B、DCTN1、ERBB4、FIG4、HNRNPA1、NEFH、PRPH、NEK1、TDP43、FUS、UBQLN2、KIF5A、VCP、ALS2、SETX、SIGMAR1、SMN1、SPG11、TRPM7、VAPB、ANG、PFN1、MATR3、CHCHD10、TUBA4A、TBK1、SQSTM1、C21orf2和/或OPTN,特别是当突变与ALS或发展ALS的高风险相关时,患者可能处于ALS风险下。处于风险下的患者还可以包括那些诊断出与ALS、FTD、ALS伴FTD或另一种神经或运动神经元疾病具有高共病的疾病或病症的患者(例如,患有痴呆症的患者,其与ALS、FTD和延髓发作ALS家族史的几率更高(参见Trojsi,F.,et al.(2017)“Comorbidity of dementia with amyotrophic lateral sclerosis(ALS):insights from a large multicenter Italian cohort”J Neurol 264:2224-31))。
如本文所用,“STMN2”(也称为上颈神经节-10蛋白、抑微管装配蛋白样2、SCGN10、SCG10、神经元生长相关蛋白、神经元特异性生长相关蛋白或蛋白SCG10(上颈神经节NEAR神经特异性10))是指由Entrez Gene ID No.11075鉴定的基因或基因产物(例如,由该基因编码的蛋白质或mRNA转录物(包括前mRNA))及其等位基因变体,以及在非人物种(例如,非人灵长类或小鼠)中发现的直系同源物。
在本说明书中,术语“治疗有效量”是指包括隐蔽外显子的STMN2转录物的受试抑制剂的量,其将引发研究人员、兽医、医生或其他临床医生正在寻求的组织、系统、动物或人的生物学或医学反应。以治疗有效量施用包括本发明的隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂以治疗和/或预防疾病、病况、病症或状态,例如ALS、FTD、ALS伴FTD或另一种运动神经元疾病或神经学疾病或病况。或者,包括隐蔽外显子的STMN2转录物抑制剂的治疗有效量是实现期望治疗和/或防治效果所需的量,诸如导致预防或减少与运动神经元中STMN2活性降低相关的疾病相关的症状的量。
短语“靶向STMN2转录物的寡核苷酸”是指与STMN2转录物结合的寡核苷酸。在各种实施方案中,寡核苷酸与STMN2转录物的区域结合。STMN2转录物的示例区域显示在表1中,其显示对应于分支点区域(例如,分支点1、2和3)、3’剪接受体区、ESE结合区、TDP43结合位点、隐蔽外显子和PolyA区的序列。在各种实施方案中,寡核苷酸与具有隐蔽外显子的STMN2转录物的区域结合,该区域位于分支点(例如,分支点1、2和3)、3’剪接受体区、ESE结合区、TDP43结合位点、隐蔽外显子和PolyA区中任一个的上游或下游少于75个核碱基处。
如本文所用,术语“药学上可接受的盐”是指酸性或碱性基团的盐,其可以存在于用于本组合物的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂中。包括在本发明组合物中的、性质上是碱性的、包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂能够与各种无机酸和有机酸形成多种盐。可以用于制备此类碱性化合物的药学上可接受的酸加成盐的酸是形成无毒酸加成盐的那些,无毒酸加成盐即含有药学上可接受的阴离子的盐,包括但不限于苹果酸盐、草酸盐、氯化物、溴化物、碘化物,硝酸盐,硫酸盐,硫酸氢盐,磷酸盐,酸性磷酸盐,异烟酸盐,醋酸盐,乳酸盐,水杨酸盐,柠檬酸盐,酒石酸盐,油酸盐,鞣酸盐,泛酸盐,酒石酸氢盐,抗坏血酸盐,琥珀酸盐,马来酸盐,龙胆酸盐,延胡索酸盐,葡萄糖酸盐,葡萄糖醛酸盐,糖酸盐,甲酸盐,苯甲酸盐、谷氨酸盐、甲磺酸盐、乙磺酸盐、苯磺酸盐、对甲苯磺酸盐和双羟萘酸盐(即,1,1’-亚甲基-双-(2-羟基-3-萘甲酸盐))。除了上述酸之外,包含氨基部分的本组合物中包括的包含隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂可以与各种氨基酸形成药学上可接受的盐。本组合物中包括、性质上是酸性的化合物能够与各种药学上可接受的阳离子形成碱盐。此类盐的实例包括碱金属或碱土金属盐,特别是钙、镁、钠和锂盐。本公开的药学上可接受的盐包括例如STMN2 AON的药学上可接受的盐,其包括SEQ ID NO:1-446、SEQ ID NO:894-918、SEQ ID NO:945-1390或SEQ ID NO:1392-1432中任一个的核碱基序列。
包含本公开的隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂可以包含一个或多个手性中心、基团、键联和/或双键,因此,作为立体异构体存在,诸如几何异构体、对映异构体或非对映异构体。本文使用的术语“立体异构体”由所有几何异构体、对映异构体或非对映异构体组成。这些化合物可以由符号“R”或“S”(或“Rp”或“Sp”)标示,这取决于立体原子,例如立体碳、磷或硫原子周围的取代基的构型。在一些实施方案中,化合物的一个或多个键联可以具有Rp或Sp构型(例如,一个或多个硫代磷酸酯键联具有Rp或Sp构型)。每个硫代磷酸酯键联的构型可以独立于另一个硫代磷酸酯键联(例如,一个硫代磷酸酯键联具有Rp构型,而第二硫代磷酸酯键联具有Sp构型)。本发明涵盖这些化合物的各种立体异构体及其混合物。立体异构体包括对映异构体和非对映异构体。对映异构体或非对映异构体的混合物按命名法可以称为“(±)”,但本领域技术人员将认识到结构可以隐含地表示手性中心。包括本发明的隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂的单个立体异构体可以是由含有不对称或立体中心的市售起始原料合成制备,或通过制备外消旋混合物然后通过本领域普通技术人员熟知的拆分方法制备。这些拆分方法有以下范例:(1)将对映异构体混合物附接到手性助剂上,通过重结晶或色谱法分离所得非对映异构体混合物,并从助剂中释放光学纯产物,(2)采用光学活性拆分剂形成盐,或(3)在手性色谱柱上直接分离光学对映体混合物。立体异构体混合物也可以通过众所周知的方法拆分成其组分立体异构体,诸如手性相气相色谱法、手性相超临界流体色谱法、手性相模拟移动床色谱法、手性相高效液相色谱法、结晶化合物作为手性盐复合物,或在手性溶剂中结晶化合物。立体异构体也可以通过众所周知的不对称合成方法从立体异构纯的中间体、试剂和催化剂中获得。
本文公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂可以与药学上可接受的溶剂诸如水、乙醇等以溶剂化和非溶剂化形式存在,并且本发明意图包括溶剂化和非溶剂化形式。
本公开还包括同位素标记的本发明化合物(即同位素标记的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂),其与本文所列的那些相同,除了一个或多个原子经具有与自然界中大量发现的原子质量或质量数不同的原子质量或质量数的原子所替换。可以掺入本发明化合物的同位素的实例包括氢、碳、氮、氧、磷、氟和氯的同位素,诸如,分别为2H、3H、11C、13C、14C、15N、18O、17O、31P、32P、33P、35S、18F和36Cl。
某些同位素标记的所公开化合物(例如,用3H和14C标记的那些)可用于化合物和/或底物组织分布测定。特别优选氚化(即3H)和碳14(即14C)同位素,因为它们易于制备和可检测。此外,用较重的同位素(诸如氘(即2H))取代可以提供某些治疗优势,这是由于更高的代谢稳定性(例如,增加的体内半衰期或减少的剂量需求),并因此在某些情况下可能是优选的。
如本文所用,“2’-O-(2-甲氧基乙基)”(也为2’-MOE和2’-O(CH2)2OCH3和MOE)是指呋喃糖环的2’位置的O-甲氧基乙基修饰。在本公开中,2’-O-(2-甲氧基乙基)可互换地用作“2’-O-甲氧基乙基”。用2’-MOE修饰的核苷中的糖部分是修饰糖。
如本文所用,“2’-MOE核苷”(也为2’-O-(2-甲氧基乙基)核苷)意指包含经2’-MOE修饰的糖部分的核苷。
如本文所用,“2’-取代核苷”意指在呋喃糖环的2’-位置包含除H或OH之外的取代基的核苷。在某些实施方案中,2’取代的核苷包括具有双环糖修饰的核苷。
如本文所用,“5-甲基胞嘧啶”(5-MeC)意指用附接到5位置的甲基修饰的胞嘧啶。5-甲基胞嘧啶(5-MeC)是修饰的核碱基。
如本文所用,“双环糖”意指通过两个原子的桥接来修饰的呋喃糖环。双环糖是修饰糖。
如本文所用,“双环核苷”(也为BNA)意指具有糖部分的核苷,该糖部分包含连接糖环的两个碳原子的桥,从而形成双环体系。在某些实施方案中,桥连接糖环的4’-碳和2’-碳。
如本文所用,“帽结构”或“端帽部分”意指化学修饰,其已经掺入在反义化合物的任一端。
如本文所用,“cEt”或“受约束的乙基”意指具有糖部分的双环核苷,该糖部分包含连接4’-碳和2’-碳的桥,其中该桥具有式:4’-CH(CH3)—O-2’。
如本文所用,“受约束的乙基核苷”(也为cEt核苷)意指包含双环糖部分的核苷,该双环糖部分包含4’-CH(CH3)—O-2’桥。
如本文所用,“核苷间键联”是指寡核苷酸中相邻核苷之间的共价键联。在一些实施方案中,如本文所用,“非天然键联”是指“修饰的核苷间键联”。
如本文所用,在寡核苷酸背景下的“连续”是指彼此紧接相邻的核苷、核碱基、糖部分或核苷间键联。例如,“连续的核碱基”是指在序列中彼此紧接相邻的核碱基。
如本文所用,“锁核酸”或“LNA”或“LNA核苷”意指核酸单体具有连接核苷糖单元的4’和2’位置之间的两个碳原子的桥(例如,亚甲基、亚乙基、氨基氧基或氧亚氨基桥),从而形成双环糖。此类双环糖的实例包括但不限于A)α-L-亚甲基氧基(4’-CH2-O-2’)LNA、(B)β-D-亚甲基氧基(4’-CH2-O-2’)LNA、(C)乙氧基(4’-(CH2)2-O-2’)LNA、(D)氨基氧基(4’-CH2-O-N(R)-2’)LNA和(E)氧氨基(4’-CH2-N(R)-O-2’)LNA。
如本文所用,LNA化合物包括但不限于在糖的4’和2’位置之间具有至少一个桥的化合物,其中桥中的每一个独立地包含1个或2至4个独立地选自—[C(R1)(R2)]n—,—C(R1)=C(R2)—,—C(R1)=N—,—C(=NR1)—,—C(=O)—,—C(=S)—,—O—,—Si(R1)2—,—S(=O)x—和—N(R1)—的连接基团;其中:x为0、1或2;n为1、2、3或4;每个R1和R2独立地为H、保护基团、羟基、C1-C12烷基、取代的C1-C12烷基、C2-C12烯基、取代的C2-C12烯基、C2-C12炔基、取代的C2-C12炔基、C5-C20芳基、取代的C5-C20芳基、杂环基、取代的杂环基、杂芳基、取代的杂芳基、C5-C7脂环基、取代的C5-C7脂环基、卤素、OJ1、NJ1J2、SJ1、N3、COOJ1、酰基(C(=O)-H)、取代的酰基、CN、磺酰基(S(=O)2-J1)或亚磺酰基(S(=O)-J1);每个J1和J2独立地为H、C1-C12烷基、取代的C1-C12烷基、C2-C12烯基、取代的C2-C12烯基、C2-C12炔基、取代的C2-C12炔基、C5-C20芳基、取代的C5-C20芳基、酰基(C(=O)-H)、取代的酰基、a杂环基、取代的杂环基、C1-C12氨基烷基、取代的C1-C12氨基烷基或保护基。
涵盖在LNA定义内的4’-2’桥接基团的实例包括但不限于下式之一:—[C(R1)(R2)]n—、—[C(R1)(R2)]n—O—、—C(R1R2)—N(R1)—O—或—C(R1R2)—O—N(R1)—。此外,涵盖在LNA定义中的其他桥接基团是4’-CH2-2’、4’-(CH2)2-2’、4’-(CH2)3-2’、4’-CH2—O-2’、4’-(CH2)2—O-2’、4’-CH2—O—N(R1)-2’和4’-CH2—N(R1)—O-2’-桥,其中每个R1和R2独立地为H、保护基团或C1-C12烷基。
还包括在根据本发明的LNA的定义内的是LNA,其中核糖基糖环的2’-羟基与糖环的4’碳原子连接,从而形成桥以形成双环糖部分。桥也可以是连接2’氧原子和4’碳原子的亚甲基(-CH2-)基团,对于其使用术语亚甲基氧基(4’-CH2-O-2’)LNA。此外,至于在该位置具有亚乙基桥接基团的双环糖部分,使用术语亚乙基氧基(4’-CH2CH2-O-2’)LNA。α-L-亚甲氧基(4’-CH2-O-2’),亚甲氧基(4’-CH2-O-2’)LNA的异构体也涵盖在如本文所用的LNA的定义内。
如本文所用,“热点区域”是靶核酸上的一系列核碱基,其服从于寡聚化合物介导的靶核酸剪接的调控。
如本文所用,“杂交”意指互补寡核苷酸和/或核酸的配对或退火。虽然不限于特定机制,最常见的杂交机制涉及氢键合,其可以是互补核碱基之间的Watson-Crick、Hoosteen或反向Hoosteen氢键合。
如本文所用,“增加活性的量”是指相对于未处理或对照样品的转录表达或活性,更多的转录表达、更准确的剪接导致全长成熟mRNA和/或蛋白质表达,和/或更多活性。
如本文所用,“错配”或“非互补核碱基”是指第一核酸的核碱基不能与第二或靶核酸的相应核碱基配对的情况。
如本文所用,“连接核苷”是通过连续序列中的核苷间键联连接的核苷(即,在连接核苷之间不存在额外的核苷)。
如本文所用,“修饰的核苷间键联”是指天然存在的核苷间键联(例如,磷酸二酯核苷间键)的取代或任何变化。“硫代磷酸酯键联”是修饰的核苷间键联,其中磷酸二酯核苷间键联的非桥连氧原子之一经硫原子替换。
如本文所用,“修饰的核碱基”意指除腺嘌呤、胞嘧啶、鸟嘌呤、胸苷或尿嘧啶之外的任何核碱基。修饰的核碱基的实例包括5-甲基胞嘧啶、假尿苷或5-甲氧基尿苷。“未修饰的核碱基”意指嘌呤碱基腺嘌呤(A)和鸟嘌呤(G),以及嘧啶碱基胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)和尿嘧啶(U)。
如本文所用,“修饰的核苷”意指独立地具有修饰的糖部分和/或修饰的核碱基的核苷。通用碱基是修饰的核碱基,可以与五种未修饰的核碱基中的任一种配对。修饰的核苷包括无碱基核苷,其缺乏核碱基。
如本文所用,“修饰的寡核苷酸”意指包含至少一个修饰的核苷间键联、修饰的糖和/或修饰的核碱基的寡核苷酸。
如本文所用,“修饰的糖”或“修饰的糖部分”意指修饰的呋喃糖基糖部分或具有除呋喃糖基部分以外的可以将核碱基连接至另一基团的修饰的糖部分,诸如寡核苷酸中的核苷间键联、缀合基团或端基。
如本文所用,“单体”意指寡聚物的单个单元。单体包括但不限于核苷和核苷酸,无论是天然存在的还是修饰的。
如本文所用,“基序”意指反义化合物中未修饰和修饰的核苷的模式。
如本文所用,“天然糖部分”意指存在于DNA(2’-H)或RNA(2’-OH)中的糖部分。
如本文所用,“天然存在的核苷间键联”意指3’至5’磷酸二酯键联。
如本文所用,“非互补核碱基”是指彼此不形成氢键或以其他方式支持杂交的核碱基对。
如本文所用,“核酸”是指由单体核苷酸组成的分子。核酸包括但不限于核糖核酸(RNA)、脱氧核糖核酸(DNA)、单链核酸、双链核酸、小干扰核糖核酸(siRNA)、短发夹RNA(shRNA)和微小RNA(miRNA)。
如本文所用,“核碱基”意指能够与另一核酸的碱基配对的杂环部分。
如本文所用,“核碱基互补性”是指能够与另一核碱基进行碱基配对的核碱基。例如,在DNA中,腺嘌呤(A)与胸腺嘧啶(T)互补。例如,在RNA中,腺嘌呤(A)与尿嘧啶(U)互补。在某些实施方案中,互补核碱基是指能够与其靶核酸的核碱基进行碱基配对的反义化合物的核碱基。例如,如果处于反义化合物的某个位置的核碱基能够与处于靶核酸的某个位置的核碱基氢键合,则认为寡核苷酸与靶核酸之间的氢键合位置在该核碱基对处互补。
如本文所用,“核碱基序列”意指独立于任何糖、键联和/或核碱基修饰的连续核碱基的顺序。
如本文所用,“核苷”意指与糖连接的核碱基。术语“核苷”还包括“修饰的核苷”,其独立地具有修饰的糖部分和/或修饰的核碱基。
如本文所用,“核苷模拟物”包括用于在寡聚化合物的一个或多个位置处替换糖或糖和碱基和不必需地键联的那些结构,诸如例如具有吗啉代、环己烯基、环己基、四氢吡喃基、双环或三环糖模拟物(例如非呋喃糖单元)的核苷模拟物。核苷酸模拟物包括用于在寡聚化合物一个或多个位置处替换核苷和键联的那些结构,诸如例如肽核酸或吗啉代(通过-N(H)-C(=O)-O-或其他非磷酸二酯键联连接的吗啉代)。糖替代物与略宽的术语核苷模拟物重叠,但仅意图指示糖单元(呋喃糖环)的替换。本文提供的四氢吡喃环是糖替代物实例的举例说明,其中呋喃糖基团已经用四氢吡喃环体系所替换。“模拟物”是指取代糖、核碱基和/或核苷间键联的基团。通常,使用模拟物代替糖或糖-核苷间键联组合,并且保留核碱基以与所选靶标杂交。
如本文所用,“核苷酸”意指具有与核苷的糖部分共价连接的磷酸基团的核苷。
如本文所用,“寡聚化合物”或“寡聚物”意指能够与核酸分子的至少一个区域杂交的连接的单体亚基的聚合物。
如本文所用,“寡核苷酸”意指连接核苷的聚合物,连接核苷中的每一个可以经修饰或未经修饰,彼此独立。
修饰
核苷是碱基-糖组合。核苷的核碱基(也称为碱基)部分通常是杂环碱基部分。核苷酸是进一步包括与核苷的糖部分共价连接的磷酸基团的核苷。对于包含呋喃戊糖的那些核苷,磷酸基团可以与糖的2’、3’或5’羟基部分连接。寡核苷酸通过相邻核苷彼此共价连接,以形成线性聚合寡核苷酸来形成。在寡核苷酸结构内,通常将磷酸基团称为形成寡核苷酸的核苷间键联。
对反义化合物的修饰涵盖对核苷间键联、糖部分或核碱基的取代或改变。因为期望的特性,诸如增强的细胞摄取、增强的对核酸靶标的亲和力、增加的核酸酶存在下的稳定性或增加的抑制活性,修饰的反义化合物通常比天然形式更优选。
也可以采用化学修饰的核苷以增加缩短或截短的反义寡核苷酸对其靶核酸的结合亲和力。因此,通常可以用具有此类化学修饰核苷的较短反义化合物获得可比较的结果。
修饰的核苷间键联
RNA和DNA的天然存在的核苷间键联是3’至5’磷酸二酯键联。因为期望的特性诸如,例如增强的细胞摄取、增强的对靶核酸的亲和力和增加的核酸酶存在下的稳定性,相比于具有天然存在的核苷间键联的反义化合物,通常选择具有一个或多个修饰的(即非天然存在的)核苷间键联的反义化合物。
具有修饰的核苷间键联的寡核苷酸包括保留磷原子的核苷间键联以及不具有磷原子的核苷间键联。代表性的含磷核苷间键联包括但不限于磷酸二酯、磷酸三酯、甲基膦酸酯、氨基磷酸酯和硫代磷酸酯。制备含磷和不含磷的键联的方法是众所周知的。
在某些实施方案中,靶向STMN2核酸的反义化合物包含一个或多个修饰的核苷间键联。在某些实施方案中,修饰的核苷间键联散布在整个反义化合物中。在某些实施方案中,修饰的核苷间键联是硫代磷酸酯键联。在某些实施方案中,反义化合物的每个核苷间键联是硫代磷酸酯核苷间键联。在某些实施方案中,靶向STMN2核酸的反义化合物包含至少一个磷酸二酯键联和至少一个硫代磷酸酯键联。
修饰的糖部分
反义化合物可以任选地含有一种或多种核苷,其中糖基已经修饰。这种糖修饰的核苷可以赋予反义化合物增强的核酸酶稳定性、增加的结合亲和力或一些其他有益的生物学特性。在某些实施方案中,核苷包含化学修饰的呋喃核糖环部分。化学修饰的呋喃核糖环的实例包括但不限于添加取代基团(包括5’和2’取代基团)、桥接非双环原子以形成双环核酸(BNA)、用S、N(R)或C(R1)(R2)(每个R、R1和R2独立地是H、C1-C12烷基或保护基团)替换核糖基环氧原子及其组合。化学修饰糖的实例包括2’-F-5’-甲基取代的核苷(关于其他公开的5’,2’-双取代核苷,参见2008年8月21日公布的PCT国际申请WO2008/101157)或用S或CF2替换核糖环氧原子并在2’-位置进一步取代(参见2005年6月16日公布的美国专利申请US2005-0130923)或可替代地BNA的5’-取代(参见2007年11月22日公布的PCT国际申请WO2007/134181,其中LNA经例如5’-甲基或5’-乙烯基取代)。
具有修饰的糖部分的核苷的实例包括但不限于包含5’-乙烯基、5’-甲基(R或5)、4’-S、2’-F、2’-OCH3、2’-OCH2CH3、2’-O CH2 CH2F和2’-O(CH2)2OCH3取代基团的核苷。2’位的取代基还可以选自烯丙基、氨基、叠氮基、硫代、O-烯丙基、O—C1-C10烷基、OCF3、OCH2F、O(CH2)2S CH3、O(CH2)2—O—N(Rm)(Rn)、O—CH2—C(=O)—N(Rm)(Rn)和O—CH2—C(=O)—N(R1)—(CH2)2—N(Rm)(Rn)-其中每个Rl、Rm和Rn独立地是H或取代或未取代的C1-C10烷基。
修饰的糖部分的其他实例包括2’-OMe修饰的糖部分、双环糖部分、2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’MOE)、2’-脱氧-2’-氟核苷、2’-氟-β-D-阿糖核苷、锁核酸(LNA)、受约束的乙基2’-4’-桥接核酸(cEt)(4’-CH(CH3)-O-2’)、S-受约束的乙基(S-cEt)2’-4’-桥连核酸、4’-CH2-O-CH2-2’、4’-CH2-N(R)-2’、4’-CH(CH2OCH3)-O-2’(“受约束的MOE”或“cMOE”)、己糖醇核酸(HNA)和三环类似物(例如,tcDNA)。
如本文所用,“双环核苷”是指包含双环糖部分的修饰核苷。双环核苷的实例包括但不限于包含在4’和2’核糖基环原子之间的桥的核苷。在某些实施方案中,本文提供的反义化合物包括一种或多种包含4’至2’桥的双环核苷。此类4’至2’桥连双环核苷的实例,包括但不限于下式之一:4’-(CH2)—O-2’(LNA);4’-(CH2)—S-2’;4’-(CH2)2—O-2’(ENA);4’-CH(CH3)—O-2’和4’-CH(CH2OCH3)—O-2’(及其类似物参见2008年7月15日发布的美国专利号7,399,845);4’-C(CH3)(CH3)—O-2’(及其类似物参见2009年1月8日公布的已公开国际申请WO/2009/006478);4’-CH2-N(OCH3)-2’(及其类似物参见2008年12月11日公布的已公开国际申请WO/2008/150729,);4’-CH2-O-N(CH3)-2’(参见2004年9月2日公布的已公开美国专利申请US2004-0171570);4’-CH2—N(R)-O-2’,其中R是H、C1-C12烷基或保护基团(参见2008年9月23日发布的美国专利号7,427,672);4’-CH2—C(H)(CH3)-2’(参见Chattopadhyaya et al.,J.Org.Chem.,2009,74,118-134);和4’-CH2—C—(=CH2)-2’(及其类似物参见2008年12月8日公布的已公开国际申请WO2008/154401)。
与双环核苷相关的进一步报道也可以在已发表的文献中找到(参见例如:Singhet al.,Chem.Commun.,1998,4,455-456;Koshkin et al.,Tetrahedron,1998,54,3607-3630;Wahlestedt et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.,2000,97,5633-5638;Kumar etal.,Bioorg.Med.Chem.Lett.,1998,8,2219-2222;Singh et al.,J.Org.Chem.,1998,63,10035-10039;Srivastava et al.,J.Am.Chem.Soc.,2007,129(26)8362-8379;Elayadi etal.,Curr.Opinion Invest.Drugs,2001,2,558-561;Braasch et al.,Chem.Biol.,2001,8,1-7;和Orum et al.,Curr.Opinion Mol.Ther.,2001,3,239-243;美国专利号6,268,490;6,525,191;6,670,461;6,770,748;6,794,499;7,034,133;7,053,207;7,399,845;7,547,684;和7,696,345;美国专利公开号US2008-0039618;US2009-0012281;美国专利系列号60/989,574;61/026,995;61/026,998;61/056,564;61/086,231;61/097,787;和61/099,844;已发表的PCT国际申请WO 1994/014226;WO 2004/106356;WO 2005/021570;WO 2007/134181;WO 2008/150729;WO 2008/154401;和WO 2009/006478。前述双环核苷中的每一个可以制备具有一种或多种立体化学糖构型,包括例如α-L-呋喃核糖和β-D-呋喃核糖(参见于1999年3月25日公布为WO 99/14226的PCT国际申请PCT/DK98/00393)。
在某些实施方案中,BNA核苷的双环糖部分包括但不限于在呋喃戊糖部分的4’和2’位置之间具有至少一个桥的化合物,其中这些桥独立地包含1个或2至4个独立选自—[C(Ra)(Rb)]n—、—C(Ra)=C(Rb)—、—C(Ra)=N—、—C(=O)—、—C(=NRa)—、—C(=S)—、—O—、—Si(Ra)2—、—S(=O)x—和—N(Ra)—的连接基团;其中:
x为0、1或2;
n为1、2、3或4;
每个Ra和Rb独立地为H、保护基团、羟基、C1-C12烷基、取代的C1-C12烷基、C2-C12烯基、取代的C2-C12烯基、C2-C12炔基、取代的C2-C12炔基、C5-C20芳基、取代的C5-C20芳基、杂环基、取代的杂环基、杂芳基、取代的杂芳基、C5-C7脂环基、取代的C5-C7脂环基、卤素、OJ1、NJ1J2、SJ1、N3、COOJ1、酰基(C(=O)-H)、取代的酰基、CN、磺酰基(S(=O)2-J1)或亚磺酰基(S(=O)-J1);和
每个J1和J2独立地为H、C1-C12烷基、取代的C1-C12烷基、C2-C12烯基、取代的C2-C12烯基、C2-C12炔基、取代的C2-C12炔基、C5-C20芳基、取代的C5-C20芳基、酰基(C(=O)-H)、取代的酰基、杂环基、取代的杂环基、C1-C12氨基烷基、取代的C1-C12氨基烷基或保护基团。
在某些实施方案中,双环糖部分的桥是—[C(Ra)(Rb)]n—、—[—[C(Ra)(Rb)]n—O—、—C(RaRb)—N(R)—O—或—C(RaRb)—O—N(R)—。在某些实施方案中,桥是4’-CH2-2’、4’-(CH2)2-2’、4’-(CH2)3-2’、4’-CH2-O-2’、4’-(CH2)2-O-2’、4’-CH2-ON(R)-2’和4’-CH2-N(R)-O-2’-其中每个R独立地为H、保护基团或C1-C12烷基,每个Ra和Rb独立地为H、保护基团、羟基、C1-C12烷基、取代的C1-C12烷基、C2-C12烯基、取代的C2-C12烯基、C2-C12炔基、取代的C2-C12炔基、C5-C20芳基、取代的C5-C20芳基、杂环基、取代的杂环基、杂芳基、取代的杂芳基、C5-C7脂环基、取代的C5-C7脂环基、卤素、OJ1、NJ1J2、SJ1、N3、COOJ1、酰基(C(=O)--H)、取代的酰基、CN、磺酰基(S(=O)2-J1)或亚磺酰基(S(=O)-J1)。
在某些实施方案中,双环核苷进一步由异构构型定义。例如,包含4’-2’亚甲氧基桥的核苷可以是α-L构型或β-D构型。以前,α-L-亚甲氧基(4’-CH2-O-2’)BNA’s已掺入显示反义活性的反义寡核苷酸中(Frieden et al.,Nucleic Acids Research,2003,21,6365-6372)。
在某些实施方案中,双环核苷包括但不限于α-L-亚甲氧基(4’-CH2—O-2’)BNA、β-D-亚甲氧基(4’-CH2—O-2’)BNA、环氧乙烷(4’-(CH2)2—O-2)BNA、氨基氧基(4’-CH2—O—N(R)-2’)BNA、氧氨基(4’-CH2—N(R)—O-2’)BNA、甲基(亚甲氧基)(4’-CH(CH3)—O-2’)BNA、亚甲基硫基(4’-CH2—S-2’)BNA、亚甲基氨基(4’-CH2—N(R)-2’)BNA、甲基碳环(4’-CH2—CH(CH3)-2’)BNA和丙烯碳环(4’-(CH2)3-2’)BNA。
在一些实施方案中,本公开提供了用于治疗、改善或预防神经学疾病诸如但不限于ALS、FTD或ALS伴FTD,或治疗、改善或预防以神经学疾病诸如但不限于ALS、FTD或ALS伴FTD相关的症状为特征的神经学疾病、病况或病症的方法,包括向患者施用药学上可接受的组合物,例如药学上可接受的配制剂,其包括一种或多种包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂的方法。包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂可以增加、恢复或稳定STMN2活性,例如,STMN2活性,和/或STMN2表达水平,例如,STMN2 mRNA和/或蛋白质表达。
本公开还提供了药物组合物,其包含与一种或多种药学上或化妆品上可接受的赋形剂一起配制的本文所公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂。这些配制剂包括适合于口服、舌下、气管内、鼻内、透皮、肺、鞘内、脑池内、胃肠外(例如,皮下、肌内、皮内、十二指肠内或静脉内)或病灶内、施用、经粘膜(例如,颊、阴道、和直肠),或用于局部使用的那些,例如,作为适用于局部应用于皮肤和/或粘膜的组合物的部分,例如凝胶、糊剂、蜡剂、乳膏、喷雾剂、液体、泡沫、洗剂、软膏、局部溶液、透皮贴剂、粉末、蒸气或酊剂。尽管在任何给定情况下最合适的施用形式将取决于所治疗病况的程度和严重性以及所使用的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的特定抑制剂的性质。
本公开还提供了药物组合物,其包含包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂或其药学上可接受的盐(例如,包括SEQ ID NO:1-446、SEQ ID NO:894-918、SEQ ID NO:945-1390或SEQ ID NO:1392-1432中任一个的核碱基序列的STMN2 AON)。
本公开还提供了包括使用药物组合物的方法,该药物组合物包含本文所公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂(例如,SEQ ID NO:1-446、SEQ ID NO:1-446、SEQ IDNO:894-918、SEQ ID NO:945-1390或SEQ ID NO:1392-1432中任一个的STMN2 AON)与一种或多种药学上可接受的赋形剂一起配制。本文提供的示例性组合物包括包含如上所述的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂和一种或多种药学上可接受的赋形剂的组合物。配制剂包括适用于口服、舌下、气管内、鼻内、透皮、肺、鞘内、脑池内、胃肠外(例如,皮下、肌内、皮内、十二指肠内或静脉内)或病灶内、施用、经粘膜(例如,颊、阴道和直肠),或局部使用。在任何给定情况下,最合适的施用形式将取决于个体试图在受试者中预防的状态、病症、疾病或病况的临床症状、并发症或生化指标;个体试图在受试者中预防的状态、病症、疾病或病况;和/或所使用的特定化合物和/或组合物的性质。
包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂
在某些实施方案中,可以使用靶向包括隐蔽外显子的STMN2基因产物(例如,STMN2前mRNA)的化合物或组合物来增加、恢复或稳定STMN2水平(例如,STMN2 mRNA或全长STMN2蛋白水平)和/或活性(例如,生物活性,例如,STMN2活性)。
在一些实施方案中,包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂可以是但不限于基于核苷酸的STMN2抑制剂(例如,STMN2 shRNA、STMN2 siRNA、STMN2 PNA、STMN2 LNA、2’-O-甲基(2’OMe)STMN2反义寡核苷酸(AON)、2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’MOE)STMN2 AON或STMN2吗啉代寡聚物(例如,二氨基磷酸酯吗啉代(PMO)),或包括此类化合物的组合物。在一些实施方案中,STMN2抑制剂是反义寡核苷酸(AON),其包含2’OMe(例如,包含一种或多种2’OMe修饰糖的STMN2 AON)、MOE(例如,包含一种或多种MOE修饰糖(例如,2’-MOE)的STMN2 AON)、PNA(例如,包含一个或多个由酰胺键或羰基亚甲基键联连接的N-(2-氨基乙基)-甘氨酸单元作为重复单元代替糖-磷酸主链的STMN2 AON)、LNA(例如,包含一种或多种锁核糖的STMN2 AON,并且可以是2’-脱氧核苷酸或2’OMe核苷酸的混合物)、c-ET(例如,包含一种或多种cET糖的STMN2 AON),cMOE(例如,包含一种或多种cMOE糖的STMN2 AON)、吗啉代寡聚物(例如,包括包含一种或多种PMO的主链的STMN2 AON)、脱氧-2’-氟核苷(例如,包含一种或多种的2’-氟-β-D-阿糖核苷的STMN2 AON)、ENA(例如,包含一种或多种ENA修饰糖的STMN2AON)、HNA(例如,包含一种或多种HNA修饰糖的STMN2 AON)或tcDNA(例如,包含一种或多种tcDNA修饰糖的STMN2 AON)。在一些实施方案中,STMN2 AON包含一个或多个硫代磷酸酯键联、磷酸二酯键联、磷酸三酯键联、甲基膦酸酯键联、氨基磷酸酯键联、二氨基磷酸酯吗啉代(PMO)键联(“吗啉代键联”)、肽核酸(PNA)键联,或者硫代磷酸酯键联、磷酸二酯键联、磷酸三酯键联、甲基膦酸酯键联、氨基磷酸酯键联、二氨基磷酸酯吗啉代(PMO)(吗啉代)键联和PNA键联的任何组合。在一些实施方案中,STMN2 AON包含一个或多个硫代磷酸酯键联、磷酸二酯键联,或者硫代磷酸酯键联和磷酸二酯键联的组合。
STMN2反义治疗剂
反义治疗剂是一类基于核酸的化合物,其可以用于调节STMN2 mRNA或STMN2转录物(例如,包含隐蔽外显子的STMN2前mRNA)。反义治疗剂可以是基于单链或双链脱氧核糖核酸(DNA)、基于核糖核酸(RNA)或DNA/RNA化学类似物的化合物。一般而言,设计反义治疗剂以包括与从给定基因转录的mRNA或前mRNA序列互补或几乎互补的核碱基序列,以促进反义治疗剂与前mRNA或mRNA之间的结合。在某些实施方案中,反义治疗剂通过与mRNA或前mRNA结合,从而抑制蛋白质翻译、改变前mRNA剪接成成熟mRNA(例如,通过阻止适当的蛋白质诸如剪接激活蛋白结合),和/或引起mRNA的破坏起作用。在某些实施方案中,反义治疗性核碱基序列与靶定基因或mRNA的有义序列的部分互补。在某些实施方案中,本文所述的STMN2反义治疗剂是基于寡核苷酸的化合物,其包括与前mRNA有义物互补的寡核苷酸序列或其部分。在某些实施方案中,本文所述的STMN2反义治疗剂也可以是基于核苷酸化学类似物的化合物。合成寡核苷酸作为治疗剂已经发展为涉及多种方式的广泛应用。这些应用包括核酶、小干扰RNA(siRNA)、微小RNA、适体、非编码RNA、剪接调控、靶向毒性重复、基因编辑和免疫调控。本公开的STMN2寡核苷酸(STMN2 AON)通过靶向STMN2转录物(例如,STMN2前mRNA(例如,SEQ ID NO:944))来防止异常或错误剪接。
反义寡核苷酸(AON)是基于短寡核苷酸的序列,其包括与靶RNA序列互补的寡核苷酸序列。在某些实施方案中,AON在8至50个核苷酸长度之间,例如,8、10、15、20、25、30、35、40、45或45个核苷酸长度。在某些实施方案中,AON是25个核苷酸长度。在某些实施方案中,AON可以包括化学修饰的核苷(例如,2’-O-甲基化核苷或2’-O-(2-甲氧基乙基)核苷(2’-O-甲氧基乙基核糖核苷(2’-MOE)))以及修饰的核苷间键联(例如,硫代磷酸酯键联)。在某些实施方案中,本文所述的STMN2 AON包括与STMN2 RNA序列互补的寡核苷酸序列。在某些实施方案中,本文所述的STMN2 AON可以包括化学修饰的核苷和修饰的核苷间键联(例如,硫代磷酸酯键联)。
肽核酸(PNA)是短的、人工合成的具有模拟DNA或RNA结构的聚合物。PNA包括由通过肽键连接的重复N-(2-氨基乙基)-甘氨酸单元组成的主链。在某些实施方案中,本文所述的STMN2 PNA可以用作反义治疗剂,其以高特异性结合STMN2 RNA序列并增加、恢复和/或稳定STMN2水平(例如,STMN2mRNA或蛋白质水平)和/或活性(例如,生物活性,例如STMN2活性)。
锁核酸(LNA)是包括一个或多个修饰的RNA核苷酸的寡核苷酸序列,其中核糖部分经连接2’氧和4’碳的额外桥修饰。认为LNA比类似寡核苷酸序列具有更高的Tm。在某些实施方案中,本文所述的STMN2 LNA可以用作反义治疗剂,其以高特异性结合STMN2 RNA序列并抑制STMN2前mRNA的过早多腺苷酸化,并增加、恢复和/或稳定STMN2水平(例如,STMN2 mRNA或蛋白质水平)和/或活性(例如生物活性,例如STMN2活性)。
吗啉代寡聚物是寡核苷酸化合物,其包括附接到通过二氨基磷酸酯基团连接的亚甲基吗啉环的主链上的DNA碱基。在某些实施方案中,本发明的吗啉代寡聚物可以设计为与感兴趣的特定STMN2前mRNA序列结合,从而抑制前mRNA的过早多腺苷酸化,并增加、恢复和/或稳定STMN2水平(例如,STMN2mRNA或蛋白质水平)和/或活性(例如,生物活性,例如STMN2活性)。在某些实施方案中,本文所述的STMN2吗啉代寡聚物可用作反义治疗剂,其以高特异性结合STMN2前mRNA序列并抑制STMN2前mRNA的过早多腺苷酸化,并增加、恢复和/或稳定STMN2水平(例如,STMN2 mRNA或蛋白质水平)和/或活性(例如,生物活性,例如,STMN2活性)。在某些实施方案中,本文所述的STMN2吗啉代寡聚物还可以用于结合STMN2前mRNA序列,改变STMN2前mRNA剪接和STMN2基因表达,以及增加、恢复和/或稳定STMN2水平(例如,STMN2 mRNA或蛋白质)水平)和/或活性(例如,生物活性,例如STMN2活性)。
在一些实施方案中,STMN2反义治疗剂包括包含以下的STMN2 AON:2’OMe(例如,包含一种或多种2’OMe修饰糖的STMN2 AON)、MOE(例如,包含一种或多种MOE修饰糖(例如,2’-MOE)的STMN2 AON)、PNA(例如,包含一个或多个由酰胺键或羰基亚甲基键联连接的N-(2-氨基乙基)-甘氨酸单元作为重复单元代替糖-磷酸主链的STMN2 AON)、LNA(例如,包含一种或多种锁核糖的STMN2 AON,并且可以是2’-脱氧核苷酸或2’OMe核苷酸的混合物)、c-ET(例如,包含一种或多种cET糖的STMN2 AON),cMOE(例如,包含一种或多种cMOE糖的STMN2AON)、吗啉代寡聚物(例如,包括包含一种或多种PMO的主链的STMN2 AON)、脱氧-2’-氟核苷(例如,包含一种或多种的2’-氟-β-D-阿糖核苷的STMN2 AON)、ENA(例如,包含一种或多种ENA修饰糖的STMN2 AON)、HNA(例如,包含一种或多种HNA修饰糖的STMN2 AON)或tcDNA(例如,包含一种或多种tcDNA修饰糖的STMN2 AON)。在一些实施方案中,STMN2 AON包含一个或多个硫代磷酸酯键联、磷酸二酯键联、磷酸三酯键联、甲基膦酸酯键联、氨基磷酸酯键联、吗啉代键联、PNA键联,或者硫代磷酸酯键联、磷酸二酯键联、磷酸三酯键联、甲基膦酸酯键联、氨基磷酸酯键联、吗啉代键联和PNA键联的任何组合。在一些实施方案中,STMN2 AON包含一个或多个硫代磷酸酯键联、磷酸二酯键联,或者硫代磷酸酯键联和磷酸二酯键联的组合。
STMN2反义寡核苷酸
在某些实施方案中,STMN2反义寡核苷酸,诸如本文公开的,可以是5至100个核苷酸长度,例如10至40个核苷酸长度、例如14至40个核苷酸长度、10至30个核苷酸长度、例如14至30个核苷酸长度、例如14至25或15至22个核苷酸长度,或18、19、20、21、22、23、24或25个核苷酸长度的寡核苷酸序列。在某些实施方案中,AON是25个核苷酸长度。在某些实施方案中,本文所述的STMN2反义寡核苷酸(AON)是与STMN2转录物(例如前mRNA)、STMN2转录物的部分或STMN2基因序列互补的短合成寡核苷酸序列。
在一些实施方案中,STMN2 AON包括与包括隐蔽外显子的STMN2转录物(例如,STMN2前mRNA)80%、85%、90%、95%或100%互补的核碱基序列。在一些实施方案中,STMN2反义寡核苷酸的核碱基序列是10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25个连续核碱基,其与包括隐蔽外显子的STMN2转录物部分中的等长核碱基部分80%、85%、90%、95%或100%互补。AON结合特异性可以通过测量参数诸如解离常数、解链温度(Tm),或其他标准诸如蛋白质或RNA表达水平的变化或测量STMN2活性或表达的其它测定法来评估。
在一些实施方案中,STMN2 AON可以包括非双链寡核苷酸。在一些实施方案中,STMN2 AON可以包括两个寡核苷酸的双链体,其中第一寡核苷酸包括与STMN2前mRNA序列完全或几乎完全互补的核碱基序列,并且第二寡核苷酸包括与第一寡核苷酸的核碱基序列互补的核碱基序列。
在一些实施方案中,STMN2 AON可以靶向由一种或多种物种的STMN2基因生产的包括隐蔽外显子的STMN2前mRNA。例如,STMN2 AON可以靶向哺乳动物STMN2基因,例如,人(即智人)STMN2基因的STMN2前mRNA,其包括隐蔽外显子。在特定实施方案中,STMN2 AON靶向人STMN2前mRNA,其包括隐蔽外显子。在一些实施方案中,STMN2 AON包括与STMN2基因或STMN2前mRNA(其包括隐蔽外显子)的核碱基序列互补的核碱基序列,或其部分。
本文所述的STMN2 AON包括反义寡核苷酸,其包含下表1中列出的寡核苷酸序列:
表1.STMN2 AON序列
*核碱基序列的至少一个核苷键联选自硫代磷酸酯键联、烷基磷酸酯键联、二硫代磷酸酯键联、磷酸三酯键联、烷基膦酸酯键联、3-甲氧基丙基膦酸酯键联、甲基膦酸酯键联、氨基烷基磷酸三酯键联、亚烷基膦酸酯键联、亚膦酸酯键联、氨基磷酸酯键联、硫代氨基磷酸酯键联、二氨基磷酸酯(例如,包含二氨基磷酸酯吗啉代(PMO)、3’氨基核糖或5’氨基核糖)键联、氨基烷基氨基磷酸酯键联、硫代氨基磷酸酯键联、硫代烷基膦酸酯键联、硫代烷基磷酸三酯键联、硫化磷酸键联、硒代磷酸键联和硼代磷酸键联。
下面的表2标识了其它STMN2 AON序列:
表2.其他STMN2 AON序列
*核碱基序列的至少一个核苷键联选自硫代磷酸酯键联、烷基磷酸酯键联、二硫代磷酸酯键联、磷酸三酯键联、烷基膦酸酯键联、3-甲氧基丙基膦酸酯键联、甲基膦酸酯键联、氨基烷基磷酸三酯键联、亚烷基膦酸酯键联、亚膦酸酯键联、氨基磷酸酯键联、硫代氨基磷酸酯键联、二氨基磷酸酯键联、氨基烷基氨基磷酸酯键联、硫代氨基磷酸酯键联、硫代烷基膦酸酯键联、硫代烷基磷酸三酯键联、硫化磷酸键联、硒代磷酸键联和硼代磷酸键联。。
下面的表3标识了示例性STMN2 AON序列:
表3.示例性STMN2 AON序列
*核碱基序列的至少一个核苷键联选自硫代磷酸酯键联、烷基磷酸酯键联、二硫代磷酸酯键联、磷酸三酯键联、烷基膦酸酯键联、3-甲氧基丙基膦酸酯键联、甲基膦酸酯键联、氨基烷基磷酸三酯键联、亚烷基膦酸酯键联、亚膦酸酯键联、氨基磷酸酯键联、硫代氨基磷酸酯键联、二氨基磷酸酯(例如,包含二氨基磷酸酯吗啉代(PMO)、3’氨基核糖或5’氨基核糖)键联、氨基烷基氨基磷酸酯键联、硫代氨基磷酸酯键联、硫代烷基膦酸酯键联、硫代烷基磷酸三酯键联、硫化磷酸键联、硒代磷酸键联和硼代磷酸键联。
在一些实施方案中,表3中列出的STMN2 AON寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且每个“C经5-MeC替换。例如,在一些实施方案中,QSN-31STMN2 AON(SEQ ID NO:31)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷且每个“C经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-36STMN2 AON(SEQ ID NO:36)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷且每个“C经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-55STMN2 AON(SEQ ID NO:55)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷且每个“C经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-144STMN2 AON(SEQ ID NO:144)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷且每个“C经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-173STMN2AON(SEQ ID NO:173)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷且每个“C经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-177STMN2AON(SEQ ID NO:177)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷且每个“C经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-181STMN2 AON(SEQ ID NO:181)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷且每个“C经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-185STMN2 AON(SEQ ID NO:185)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷且每个“C经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-197STMN2 AON(SEQ IDNO:197)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷且每个“C经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-203STMN2 AON(SEQ ID NO:203)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷且每个“C经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-209STMN2 AON(SEQ ID NO:209)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷且每个“C经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-215STMN2AON(SEQ ID NO:215)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷且每个“C经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-237STMN2AON(SEQ ID NO:237)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷且每个“C经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-244STMN2 AON(SEQ ID NO:244)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷且每个“C经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-252STMN2 AON(SEQ ID NO:252)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷且每个“C经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-380STMN2 AON(SEQ IDNO:380)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷且每个“C经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-385STMN2 AON(SEQ ID NO:385)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷且每个“C经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-390STMN2 AON(SEQ ID NO:390)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷且每个“C经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-395STMN2AON(SEQ ID NO:395)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷且每个“C经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-400STMN2AON(SEQ ID NO:400)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷且每个“C经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-169STMN2 AON(SEQ ID NO:169)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷且每个“C经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-170STMN2 AON(SEQ ID NO:170)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷且每个“C经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-171STMN2 AON(SEQ IDNO:171)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷且每个“C经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-172STMN2 AON(SEQ ID NO:172)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷且每个“C经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-249STMN2 AON(SEQ ID NO:249)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷且每个“C经5-MeC替换。
在一些实施方案中,表3中列出的STMN2 AON寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且不是所有或没有“C”经5-MeC替换。例如在一些实施方案中,QSN-31STMN2 AON(SEQ IDNO:31)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且不是所有或没有“C”经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-36STMN2 AON(SEQ ID NO:36)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。在一些实施方案中,QSN-55STMN2 AON(SEQ ID NO:55)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且不是所有或没有“C”经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-144STMN2 AON(SEQ ID NO:144)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且不是所有或没有“C”经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-173STMN2 AON(SEQ ID NO:173)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且不是所有或没有“C”经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-177STMN2 AON(SEQ ID NO:177)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且不是所有或没有“C”经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-181STMN2 AON(SEQ ID NO:181)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且不是所有或没有“C”经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-185STMN2 AON(SEQ ID NO:185)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且不是所有或没有“C”经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-197STMN2 AON(SEQ ID NO:197)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且不是所有或没有“C”经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-203STMN2 AON(SEQ ID NO:203)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且不是所有或没有“C”经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-209STMN2 AON(SEQ ID NO:209)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且不是所有或没有“C”经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-215STMN2 AON(SEQ ID NO:215)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且不是所有或没有“C”经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-237STMN2 AON(SEQ ID NO:237)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且不是所有或没有“C”经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-244STMN2 AON(SEQ ID NO:244)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且不是所有或没有“C”经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-252STMN2 AON(SEQ ID NO:252)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且不是所有或没有“C”经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-380STMN2 AON(SEQ ID NO:380)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且不是所有或没有“C”经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-385STMN2 AON(SEQ ID NO:385)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且不是所有或没有“C”经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-390STMN2 AON(SEQ ID NO:390)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且不是所有或没有“C”经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-395STMN2 AON(SEQ ID NO:395)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且不是所有或没有“C”经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-400STMN2 AON(SEQ ID NO:400)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且不是所有或没有“C”经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-169STMN2 AON(SEQ ID NO:169)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且不是所有或没有“C”经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-170STMN2 AON(SEQ ID NO:170)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且不是所有或没有“C”经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-171STMN2 AON(SEQ ID NO:171)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且不是所有或没有“C”经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-172STMN2 AON(SEQ ID NO:172)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且没有“C”经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-249STMN2 AON(SEQID NO:249)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且不是所有或没有“C”经5-MeC替换。
下面的表4标识了其他示例性STMN2 AON序列:
表4.其他示例性STMN2 AON序列
*核碱基序列的至少一个核苷键联选自硫代磷酸酯键联、烷基磷酸酯键联、二硫代磷酸酯键联、磷酸三酯键联、烷基膦酸酯键联、3-甲氧基丙基膦酸酯键联、甲基膦酸酯键联、氨基烷基磷酸三酯键联、亚烷基膦酸酯键联、亚膦酸酯键联、氨基磷酸酯键联、硫代氨基磷酸酯键联、二氨基磷酸酯(例如,包含二氨基磷酸酯吗啉代(PMO)、3’氨基核糖或5’氨基核糖)键联、氨基烷基氨基磷酸酯键联、硫代氨基磷酸酯键联、硫代烷基膦酸酯键联、硫代烷基磷酸三酯键联、硫化磷酸键联、硒代磷酸键联和硼代磷酸键联。
全长STMN2转录物
如本文所述,本公开提供了在细胞中恢复全长STMN2转录物表达的方法,其中该方法包括将细胞暴露于包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂或使细胞与包括隐蔽外显子的STMN2转录物的STMN2抑制剂接触。这种抑制剂可以在空间上阻断剪接机制,在空间上模拟TDP43结合,和/或抑制STMN2前mRNA的过早多腺苷酸化,并增加、恢复和/或稳定全长STMN2转录物的水平。
在各种实施方案中,全长STMN2转录物包含具有登录号NM_001199214.2的序列,以下标识为SEQ ID NO:1433。
(SEQ ID NO:1433)
在各种实施方案中,全长STMN2蛋白包含具有登录号NP_001186143.1的氨基酸序列,以下标识为SEQ ID NO:1434。
(SEQ ID NO:1434)
在各种实施方案中,全长STMN2转录物包含具有登录号NM_007029.4的序列,以下标识为SEQ ID NO:1435。
(SEQ ID NO:1435)
在各种实施方案中,全长STMN2蛋白包含具有登录号NP_008960.2的氨基酸序列,以下标识为SEQ ID NO:1436。
(SEQ ID NO:1436)
在各种实施方案中,全长STMN2转录物包含具有登录号XM_005251142.2的序列,以下标识为SEQ ID NO:1437。
(SEQ ID NO:1437)
在各种实施方案中,全长STMN2蛋白包含具有登录号XP_005251199的氨基酸序列,以下标识为SEQ ID NO:1438。
(SEQ ID NO:1438)
具有隐蔽外显子的STMN2转录物
在一个实施方案中,具有隐蔽外显子的STMN2转录物可以包含提供为SEQ ID NO:944的序列。
(SEQ ID NO:944)
在一个实施方案中,具有隐蔽外显子的STMN2转录物可以包含前mRNA STMN2转录物。在一个实施方案中,具有隐蔽外显子的STMN2转录物可以包含提供为SEQ ID NO:1391的序列。
AGCTCCTAGGAAGCTTCAGGGCTTAAAGCTCCACTCTACTTGGACTGTACTATCAGGCCCCCAAAATGGGGGGAGCCGACAGGGAAGGACTGATTTCCATTTCAAACTGCATTCTGGTACTTTGTACTCCAGCACCATTGGCCGATCAATATTTAATGCTTGGAGATTCTGACTCTGCGGGAGTCATGTCAGGGGACCTTGGGAGCCAATCTGCTTGAGCTTCTGAGTGATAATTATTCATGGGCTCCTGCCTCTTGCTCTTTCTCTAGCACGGTCCCACTCTGCAGACTCAGTGCCTTATTCAGTCTTCTCTCTCGCTCTCTCCGCTGCTGTAGCCGGACCCTTTGCCTTCGCCACTGCTCAGCGTCTGCACATCCCTACAATGGCTAAAACAGCAATGGTAAGGCACTGCGCCTCGTTCTCCGTCGGCTCTACCTGGAGCCCACCTCTCACCTCCTCTCTTGAGCTCTAGAAGCATTCAGAGATATTTTATAAAGAAAAAGATGTTAATGGTAACACAGGACCAGGAAGGACAGGGCAGTTCTGGGGGAGGTGGGAGGGCAGAGAAGAGGTCTATGGAAATCTAAAGCGAAGAATTTCTTTTAAAAGGTAGAAGCGGGTAAGTTGCCCTCCTATGGGTAGAGAATTTATTCTGTTTCCATATTTAAAATTAGGACTCAATCGTGAGGGGAGGAAGCTACCTTAACTGTTTGCCTTAAATGGGCTTAAGGGACATTTTGGAAAGTGCTTTATAACGACCTTTTTTTTTTTTATTTCTTCTCTAGTTTAAGAAGAAAATAGGAAAGGGGTAAAGGGAAGGTGGGAGAAAGGAAAAAGAAAATTGCAAAGTCAAAGCGGTCCCATCCCGCTGTTTGAAAGATGGGTGGAGACGGGGGGAGGGGATGGAGAGAACTGGGCACATTTTACGGTATTGTCTCGTCGAAGAAACCGCTAGTCCTGGGGTGCGGTGCAGGGAGGTAAGACGGCGGGGGACAGGGTGGGGGTAGGACCTCCGCTCCTTTGTTTTAGGGCAAGGGAGGGGAAGGAGAGAGGAAGTCGCGGAGGGCGTGGAGGGCGCGGGTGGGCAGCTGCAGGGGCGGGGAAGCGCGCGGCAGGGAGGGGTGGAGGGACAGCGGCTTCGAAGGCGCTGGGGTGGGGTTTCTTTGTGTGCGGACCAGCGGTCCCGGGGGGAGGCACCTGCAGCGCTGGGCGCACAATGCGGACAGCCCCACCCAGTGCGGAACCGCGCAGCCCCGCCCCCCCGCCCGGTGCTGCATCTTCATTCGAAAGGGGGTCGGGTGGGGAGCGCAGCGTGACACCCAGGAGCCCAACCCTGCGGGGACAGCGGCGCCACGCCCCGCGCTCCCCGCTCCCGACTCCCCGCCGCGGCTTCCAAGAGAGACCTGACCACTGACCCCGCCCTCCCCACGCTGGCCTCATTGTTCTGCTTTTAAGAGAGATGGGAAAAGTGGGTTAACATTTTTCTTTTCGGAAGCAAATTACATAGAGTGTTTAGACATAGACACAGATAAAGGGTTCTTTGAAGACCTTTGATCGTTTGCGGGAAAAGCTTCTAGAACCTAGACATGTGTATGTATAATAATAGAGATGACATGAAATCGTATATAAAGCAAAAGAGGTCAAAGTCTTAAGTTAAGCCACGCGAAATTTCCGTTTTGTGGGTCAGACAGTGCCAAATATCGGCAATTTCATAAGCTCAGAGAGACAAGACAGTGGAGACACAGGATGACCGGAAAAGATTCTGGATTCAGGGCCTTCATCCGCAATTGGTCTTGTGCCTTGAGTGCCCACGGTTCTGGCGCTCAGTGGCCCCGGGGTGAAAAGGCAGGGTGGGGCCTGGGGTCCTGTGGCAGCTGGAAGCACGTGTCCCCCGGGACTTGGTTGCAGGATGCGGAGACAGGGAAAGCTGCCGAAAGGACTCCATCTGCGCGGCTCCGCCCTGCCCTACCCTCCCCGCGGAGCCGGGGAGACCTCAGGCTCCGAGACTGGCGGGGAAGAGGAATATGGGAGGGGCAGTTGAGCTGTATGCAGTCCTGGAACCTCTTTTTTCAGCCCCGCAGTCCACAACGGCCCGAGCACCCCTTGATGTGCGCAGACCCCCGGCGTGGCTCTCAGCCCCAGCACCGAGCCCCTCCCAGCCAAGCGGGTGGCTCTGCAGAAAAGCTGGCTCGAGCCCCGCCCGGCCACACAAAGGCGCGGCCCCACCCAGCCCGGGCGCGAGACCGCAGAGGTGACCCCCTTCCCAGGGATTCAGGGAGGGCTGTCTCTTCTCGCCCACCCACGGTCCGCGGAGCTCGGGGCTTTTTTTCCCCCAGCCCAAGCCCCCCGCCCACCCTCTGTTCTCTATGATTTTCCAGAATGGAGACCCCGCGAGGGGCTTCTCTAAGGGAGACCCTCGCTCCTCCAGCGGGGCGCGGCTCGGCCCCACCCCTCCCAGCTGAGGCCCAGAGCCGCCTACCGCTGGCCGGGTGGGGGCGCACGTGGCGACTGGGTGTGTGGAGCGCAGCCAGCCCTGCAGAGCCCCGCGCCGCGCCCTGCGCTCCCCTCCCCGGAGTTGGGCGCTCGCCCCCGCGGTGCAGCCGGGGAGACCGGTTTCTGCGCAGTGTCCTGAGCTACCCCCGCTTTCCACAATTCGCAGTTCACTCGCACGTCCAGAAAGGTTCTGAGAATGGGTGGTGGGGGCGATCTCGCCTCGCTTTCTGCACCCCTCAGAAAGGTTTCCGCTGCAGGCTAGTGGCTGCAAACTCATCGTCATCATCAGTATTATTATCATTTCAAATCGTTGTTATTATTTAATGATTCAGTAGCCTTGTTTGTTCTCATTTGTTCAAAAGGGACGTGGATTGCTCTTGGTTAAGGATTAACCCTTGTTGCGTTCGCTTTGCTTCCTCCTAATTGCCCTCATCCCTTTCCCCCACAAAAAGGTAAATTTGTCTCCAGTTGTTCATTTTAAGTTATAAAGCAAATATATTTTTGCTTCCTGCCAGGATTATGTATGTTCATGTGGCTAAGATACATGTGCAAGTGCTTGCTAAGAGCAGGGTTTGTGTGCCAACGATTGCTGGAAAATTCTCTGCAAAGAATTGTTTGTGGCTGCAATGGGTGAGAATACACATATATAATTGAGATGATCTTCAACATAAGGTTATATCTATAAATATATAAATATAGTTTATGCACAAAATTTTAAGTTTTTTCCCCTGAAACTGTTCTTCCAACTGCTGATTCTTGATACAGCCTCAATCCTACACAGATACATGGATCGTGAAATGGTAGCCGCCATCCAAATAAAAATCCCACCCCAAATATGACAAACGCAAGCATCCTTTCTGGCCATAATTTAACTGCATTTGCAAATCATGAAAAAAACACTACTTCTGCAGTATTAAAATAATAGATTTTGAAATTAATTCCAATTTCAAAGATAATTAATTATCAGGGCGAGTGCTTTTTTCCTGATTCATTAAACAATTATGTATTCAGCATGATTGTAAGAGGTGCATATAATATTCCCCATTATCTTTTCTAATGAAGTGGGCACCTTCTGAATGGATATATAAGTAACTAGAAATGAAAAGCTGAGGATTTGGTCAGAATTTCAGGATAAAACTGAAAGAAATGGCAGTAGTTTATCAATTAATCTCATGTATTTAGTTTATACCAGGTGAGTAAGCTGAGCCTGCAATAAACACTCTCTGTCCCAGTGTAACACGTCGCAGGTAGCTAGAATGATAGGATAAATTAATAGACCTTGTGGTGTTTGTCTATGCACGTTAAAATTCTCTGAGAGAAAGTATATTTTAAAATGATAATTAAGATTGGACATTTGTGCTATTAAAATCTACAACTTTAGTCAAAATTCACAATGGTTTTTTTTTACAATAATGTGACTTACAGATTTGTAGTAAATTATTCTATTCTAAAAGAGAAATGAGTGTTTTTATTGTTACAGCTATTACCTCATTAATATTTTTAGCAAACTTTTATTTGTTGCATTGAAAGCAGTTTTAATTACTTTGGGTTTTTATTTTTCAAATTACTAATGGATAGATGGTGGAATAAGCATTTAATCATTTGGCACAATATGACTTCCATCAAATAGCTCATTCTCAGTGATTAAAAAATGCTACAAGAGGCTACAATTTACTCAGATTCAGGAAATGTCCTTTCAGAGTGCCATAAGGCTGATTCATATAATAAAATAGTTTTCTTCCCTATAATTTAAGATCAAATAGTTACTTAGTTCTGTGAATACCTAGCAGTAGCTATCAAACAGAATTTTAAAGTTAAATCTGTACAACTAACAATGAAGTGGAGGATGAATCGATACATATTGAATGGAAGACTTTGTCATTGATAAATTCAGGCCATCTTTAGGAAAATTCCGGATTTATCAATCACCATTATTTTTTACTTCAACTGAGTGTGACTGATCACATGCTCAGGCTACCTTGGTAGCTCATTGCTCACAGGAGGCTGAAAAAAGCTGGCCTCCGAGCAGGAGGAAGCTCAGAGCACAAACCTAGGCCTGGGCGTGGCCACTGGGAGCTGCTGATAGCGAACCCCAGCTCACACCAGTTTCTTTTTTGGTCGTGGGAAGAAAAACACATATTATCCTGTTGTCACAAGATCTGTGACCTTATATGAAAAAATGCTAGAATTTTTTCATTAAAAAAGAAAATACTGAACTAGCCAGTGACCCAGATGTTTTCAGAACCTAGACTGGTTCTGTCCATTGGAAAACCTCGGTGTCTGCATTAACTTTTCACCACACTAGAGGGCAATCATGTTCTCTAAAAAAGCAGATGATTGATGTAAACCTAGTTCCAAATATTAACTGTTTAATAAAATCTTTTCTTTTACCAGGAACATTCAAGTGTTTATTCAATAAGCTGATGCCATGCTTTACCCTAGTGGATGAACAGAGCTTGTACAATTTTCAAGGAGACAGGATGAAATGAGTGGTCATAATCTGAAAG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CCCCACAAGTCTCTAAAGTCCATTATATCACTCTTATATCTTTGCATACTCATAGCTTAGCTCCCACTTATGAGAACATATGATAGTTAGTGCTCAATTCCTGAGTTACTTCACTTAGAATAATGGCCTCCAGCTCCACCCAAGTTGCTGCAAAAGACACTATTTAGTTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTACATGGTGTATATATACCACATTTTATTTATCCACTTGTTGGTCAATGGACACTTAACATTAGTTCCATATCTTTGTAATTTCAAGTTGTGCTGCTATAAGCATGCATGAGCCTGTGTCTTTTTCATATAATTACTTCTTTTCCTTTGGGTAGATACCCAGCAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATAGTTCTACTTTCAGTTCTTTATGTTTTCCACAGTGGTCATACTAATTTACATTCCCATCAACAGTGTAAAGTGTTCCCTTTTCATCACACCCATGCCAACACCTATTGTTTTTTGACTTTTTAATTACGGCCATTCTTGCAGGAGTAAGGTGGTATTTCATTGTGGTTTTAATTTGCATTTCCCTGATGTTGACAATATTTAACTCTTTAGTTATAGATTCCAGCTATTATCAATTTACACCTATTGCATTCTTCTCATCTTTTGTTTTCTTGTGATTCTGATGCACAAATATCATTTGTGCAACCACTTACTGTTGAACATGTCTGATGAACACTTACTATTGAACATGTCTGATGAATGAATAATGAAATAGGAAAAGGGATTAAAACTAGCCTTTATTAATTGTTTGCTATAGGCCAGACATTTTTGGATGTACTATCACATTTCATCCAAACAACAACCTAAAAGAAAATACTGTGATTATCCCCATTTCACATCTAAGGAACCTGGTCTTTAGGAAGATTAAGTCATTTGGCCAAGATCACAAGTAGACCACAGAGACTAGATTTGAATGCAAGTCTGTTTGACTCCAAACCTTTTTACTATCTGCCCATGACCCCTGATCACCAACATCTCAATGTATGAACATGTGCTTTCTTAGCTCACACAACTCACTCCTGACCCCTTTTTTATATTGCAAGTGCATAGTCATTAGTAAAAAGAAGGATTTTTGATGATACTGACCTCATCTTGAATTTAATTAGGCTCATATGACAGAATTCCATAGATGGAATTGACATCCTAGGTCATATAGTCCAAGTCCTTGTTTATATTTGATACCTAGTGAGATTAAAGGGACATTAAAAAGTAAAGAAAGGAAAGACCTCATATTTCTTACCTTCCAGTAGAGAAATCTTTCTATGAAATCAGAGGAAAGAATTAGAGGACCAGAATTTTTCCTAAAATCAACTTTCATACATCTTTTTTCATATAAAAGGCATAGCTGCATACAATGCTAAAATATTGTATTACATTTCCTTTATATTGATGGGAGGAAGGGGGTAAATTGCAGAAAACATTGTAAATTTAGATATGCTTGGGCCTCTGACAGTGCCTAGCAAATATCAGGAGATCAATAATGAAATAAATATTATCAAAGAGTAGTCTTCTTGATGAACCTTCTCTGAGTATCACAACTGCTTTAGGAACCTCTAGATTCAAGGTCTAGTAATTGCAAACAGTGAGCTGATAAGAAAAACAGACTGTATGGGAAATTACATGCTTCCTGCATGACTGCCTTTTGTTCTCCCACATTTTGATATAAAGTCACATTAACAGTTCATGAGTAAATATTCGATAATGTGAACGTAAAGTGTTCAAATAATAGAGTGACTAAAATGCCTGAAAACAAATAATTTTTAATTAGAAACTCATAATCATTTATTTTCTCTTTTTCCACATTATCTCAAGCTCACAAATTATATTTATTCTTTCCTATGGCAAAATCCATTTTGTTAACACTAATTTTGAGTTTAACAAGAAGTGTACTCCAAAGTAGCCTAATAATACTAATTATAATGTTTCCTGCTATGTTATCAGTTTGAATTTATATGAATCTTTAGACTTGAGGCTTCTTTTTCCTAGCATAGTGATGGTCTGGGCTTTTTCTCAATTTTTGCCAGAGCTCAGCTCTCACTAATTAGTTTCTTTCTGCATGAGAAAAAGATTTTGCTTCATCTTTTTCCTTATAATAGCAGAACAAAAAGAAGAATCAGCTGCATCCATGCTAATTTCCCCTGTGACATTTCCAAACAGGATTTGATTTCTCTATGCATGCCTCTTTCCTTCTCTTCATGGTTTTTGAACATATACAAAAGCTCATTTAAACCAATTAAATAAAATTGTTTTTAATCTCTTTCTCTAGAGTCAACTTCCTGCTTACTCCAACTCTGTATCTTTGAAGGAAGTATAGGGTGGTCTATGCCTTTTTTCTCCCAGAATCTACACTTGAAAAGACACATTTTTCCATGCAACTATAAAATGTTCTCCTCACTCAACATTGAAATTGTATAGCAGTGATTAAGAGAGTGAGCTGTAGAGCCAGGTTCCCTGGGTTTAAATCCCACTTGTTAGTATCATGAAGATGGGCAAGTTACTTACCCTTCCTGTGTTTCAGTTTCTTCATCTGCAAAATGGGGACAATAATAGAATGTCCACTATAAGATTATTGTGAGGATTAAGGGAATTAATACAGGTAAAACGTGTACTGATGCAGGTCTGGTACACATTAAGTGCCTAATAAATATTCAGTATTATGATATAAAGAACCCTATAAGTGTAGACTCCTTGAGATTAATAGAGTTTAACGATAAGTTTTACTTTATAGCTGGTCAAGTTTATTTCTTCTGAACTAAAAGAATCTATAGAGTCTCAATTTCTGGAGCTTCAGAGGGAAGGAGAGAAGCAATGTAAGCAACATTCTACAGAAATATAAATAATACTACTAATAATTAGCATCTTAAAATTTCAATTCAATGAACATTTATTTAGCGCCTATGATATATGCAAGACAGTTTGATTTTAGTCATCTGATGTATAGCCACATACTAAAAAATACTGATTTTAGTCATCTGATGTATAGCCACATACTAAAAAATACTTCCTCCATCAGTTCCCTCCTCAGGAAGTTCAGTTCCCAATCCCAGGCTAGTACCTTGGTTCCTTATGTAAATAAACATCCACCAATTACATGCTATCTGCAAAGCACTCTGCTAGGCCCTGCAAATGGAAAAAAAAATGATAAAACATAGTCCAGGCCCTCAATGAGCTTACAGTCAAATATAATAGAGGAGACAAGAACAGAGAGGCTCATAATACAACTAGAATAAAATGACTGCCGAATAAAAGGAAAGATTTATGCAGGTGTTCAAATGGAAAGTGAGATAAGTTTGCAGGTTAGTCTTTGCAGTCTCATAAAAATCTTTATGGAGAAAAGGACAATGGTCATAGGGCTTAAAGAGTAAGTTTATAATCCTGACCAGTGGAGATGAAAGACTAGCATTGAAAATTGCATGACAAGACAATTCCATTAAACTGAAACATCAAGTGTGTGTAGGAAAAGATGGGGGTTATGACTGGAAACGTCACTTGGACTGCAATTATGAAGGGCCTTGACAAACAGGTCAAGAGTTTAAGAAGCAGTATAGAAAGTCTTCGTCCTGGATCTAGCCCTCCCAGAGTGTCCATCAGGATTATAAAGTCCTTAAAATATTAGTCAAAAGGAACGACATCATTAGAAATGATAGAGAAACAATAATGTGATGTTTTATTACCTTTCTCTGGATTTATACTCTGATCCTAATATTCAAAACTATCTTAATAACATGAACTTTTGGTCATAGTTTTAAACAAAAACAGTGTTAAATATATTTTTTAAAACACAGTAAGTCTTGTAAGATCTTTTCTAACATGACATTTTGCAGGGCCCATATTTTCCTTCTGAAATGGGAAAAATTCATAAAAGTAGACACCAAACTGGGTTACTTCTAGTCAAGCGCATGGTACGCAAAGGACCAGACAAAAAGGGCCTGTGACATTTCTTCTTCCTTTTGTGTTTTTTAGGAGAGGCATGCTGCGGAGGTGCGCAGGAACAAGGAACTCCAGGTTGAACTGTCTGGCTGAAGCAAGGGAGGGTCTGGCACGCCCCACCAATAGTAAATCCCCCTGCCTATATTATAATGGATCATGCGATATCAGGATGGGGAATGTATGACATGGTTTAAAAAGAACTCATTATAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAATCAAAAATTAAAAAAAATCAATGCGGTCTCTTTGCAGAATGTTTTGCTTGATGTTTAAAAAATACCTTGGATCTTATTTTGTAAATACTTACATTTTTGTTAAAAAATACAAGTATTGCATTATGCAAGTTATTTCATAATCTTACATGTCCTGTAACAGGCTTTTGATGTTGTGTCTTTCCACTCAAATGAATTTGCTAGGTCTGTTCTTTTTGAAGCTCCCCATGTCTAACTCCATTCCAAAAGAAAAATGAGGTCAGTAGACAGTCTATGGTGCTAGAAACCCACCATTGCCTAATGACCTAGAAGGCTTTGTTGTCTCTGAGCTTGACTAAGACCATACCTAGATCACAGGTATTATGACTCCACATGAACCTTCACATTTGTTCGCTCATAATCTACTTACTGCCTAAAAACTACAAAACCAGGCTAAGAAATACCACCAGTCATAGCATTTACTTCTGCTTCTCCTGGATTATGTGCTACAAATGTGCTTTGGCTTTAGAAAGGGATGGATGAGAAGACAGACCTGAGACCAATCTGGGTAGAAGCAAAAAGTTGAACCTTTTAAAGTGCTGAACACAAATCCAAATTCGAATGGTTCAAGCAGCCGTGAAATCGCTCTTCATAAAGTGGGCTTAATTCTCTAGTTTAAGTTCTTTTGATGGAATGAATTAATTAATGTGTCAGGTGGCTTATTTGTGGATGCCATGATTGATGATGTTCATTTTAAGCTCTTACCTATAGTACAAGTACATGATGCTACTGAATATTTTTCCACTTGGAAACTGTGAGCTGGTTGTTGCATTAAAACACACATACAAACAAAATCAAAAACACTGCGGACTTTCACTCAAGCTGGTCTTTCTTCCCCAGTGTAAGGCAATCCTGCCTACTAACAACACCAACAACAAAACACTCCATCTGTGAAGCTGACGCAGTTAAGGGGGCTAGGCAGGGCATTTGTGCCAACTAAGAATCACCAGATACCCACCATAAGTACCTATCGCAGTTTTGAAGTCGTTTCTCCCCAACTCCCAACTCCTGAAGGTTGCTGCCTGCATATTTACTCTTCATTAGTGCTATTTTCCTGTATGTCATTGTGAGCAAGCTGTGATTAATAAAGAATTGGAGTTCTGTGAACTAATAAAGGTTTGGTCTGTT
(SEQ ID NO:1391)
STMN2转录物内的STMN2隐蔽外显子序列提供为SEQ ID NO:447。
(SEQ ID NO:447)(来源:NCBI参照序列:NC_000008.11)。
在各种实施方案中,具有隐蔽外显子的STMN2转录物与SEQ ID NO:944共享90-100%之间的同一性。在各种实施方案中,具有隐蔽外显子的STMN2转录物与SEQ ID NO:944共享至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%的同一性。
靶向STMN2转录物的部分的STMN2反义寡核苷酸
在各种实施方案中,本文公开的STMN2 AON靶向包括隐蔽外显子的STMN2转录物的特定部分。如上所示,SEQ ID NO:944描述了包括隐蔽外显子STMN2转录物的一个实例。在一些实施方案中,包括隐蔽外显子的STMN2转录物可以与SEQ ID NO:944的核碱基序列共享至少80%、85%、90%、95%或100%的同一性。
在一些实施方案中,STMN2 AON靶向STMN2转录物的特定部分,STMN2转录物的特定部分具有10个核碱基的长度。在一些实施方案中,STMN2 AON靶向STMN2转录物的特定部分,STMN2转录物的特定部分具有11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22的长度、23、24或25个核碱基长度。
在一些实施方案中,STMN2 AON靶向STMN2转录物的特定部分,STMN2转录物的特定部分包含SEQ ID NO:944的121-144、144-168、146-170、150-170、150-172、150-174、169-193、169-189、169-191、170-190、170-192、171-191、171-193、172-192、172-194、170-194、171-195、172-196、173-197、185-209、197-221、237-261、249-273、252-276或276-300位中的任一个。在一些实施方案中,STMN2 AON靶向STMN2转录物的特定部分,STMN2转录物的特定部分包含SEQ ID NO:944的144-164、144-166、145-167、146-166、146-168、147-165或148-168位中的任一个。在一些实施方案中,STMN2 AON靶向STMN2转录物的特定部分,STMN2转录物的特定部分包含SEQ ID NO:944的173-191、173-193、173-195、173-197、175-195、175-197、177-197或179-197位中的任一个。在一些实施方案中,STMN2 AON靶向STMN2转录物的特定部分,STMN2转录物的特定部分包含SEQ ID NO:944的185-205、187-209、189-209、185-207、197-217、197-219或191-209位中的任一个。在一些实施方案中,STMN2 AON靶向STMN2转录物的特定部分,STMN2转录物的特定部分包含SEQ ID NO:944的237-255、237-257、237-259、239-259、239-261、241-261、237-257、249-269、249-271、252-272、252-274或243-261位中的任一个。
在一些实施方案中,STMN2 AON靶向STMN2转录物的特定部分,STMN2转录物的特定部分由SEQ ID NO:944的121-144、144-168、146-170、150-170、150-172、150-174、169-193、169-189、169-191、170-190、170-192、171-191、171-193、172-192、172-194、170-194、171-195、172-196、173-197、185-209、197-221、237-261、249-273、252-276或276-300位中的任一个组成。在一些实施方案中,STMN2 AON靶向STMN2转录物的特定部分,STMN2转录物的特定部分由SEQ ID NO:944的144-164、144-166、145-167、146-166、146-168、147-165或148-168位中的任一个组成。在一些实施方案中,STMN2 AON靶向STMN2转录物的特定部分,STMN2转录物的特定部分由SEQ ID NO:944的173-191、173-193、173-195、173-197、175-195、175-197、177-197或179-197位中的任一个组成。在一些实施方案中,STMN2 AON靶向STMN2转录物的特定部分,STMN2转录物的特定部分由SEQ ID NO:944的185-205、187-209、189-209、185-207、197-217、197-219或191-209位中的任一个组成。在一些实施方案中,STMN2 AON靶向STMN2转录物的特定部分,STMN2转录物的特定部分由SEQ ID NO:944的237-255、237-257、237-259、239-259、239-261、241-261、237-257、249-269、249-271、252-272、252-274或243-261位中的任一个组成。
在各种实施方案中,STMN2 AON包含核碱基序列,该序列包含至少10个连续核碱基的部分,该部分与在SEQ ID NO:944的144-164、144-166、145-167、146-166、146-168、147-165、148-168、173-191、173-193、173-195、173-197、175-195、175-197、177-197、179-197、185-205、185-207、197-217、197-219、187-209、189-209、191-209、237-255、237-257、237-259、239-259、239-261、241-261、237-257、249-269、249-271、252-272、252-274或243-261位中任一个内的核碱基的等长部分互补。在各种实施方案中,STMN2 AON包含核碱基序列,该序列包含至少11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25个连续核碱基的部分,该部分与在SEQ ID NO:944的144-164、144-166、145-167、146-166、146-168、147-165、148-168、173-191、173-193、173-195、173-197、175-195、175-197、177-197、179-197、185-205、185-207、197-217、197-219、187-209、189-209、191-209、237-255、237-257、237-259、239-259、239-261、241-261、237-257、249-269、249-271、252-272、252-274或243-261位中任一个内的核碱基的等长部分互补。
在各种实施方案中,寡核苷酸包含具有至少19个连续核碱基序列的连接核苷,该序列与具有与SEQ ID NO:944至少90%同一性(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性)的转录物的等长部分或与SEQ ID NO:944的连续19至50个核碱基部分至少90%互补(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%互补),其中连接核苷的至少一个核苷键联是非天然键联。在各种实施方案中,寡核苷酸包含具有至少19、20、21、22、23、24或25个连续核碱基序列的连接核苷,该序列与具有与SEQ ID NO:944至少90%同一性(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性)的转录物的等长部分或与SEQ ID NO:944的连续19至50个核碱基部分至少90%(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)互补,其中连接核苷的至少一个核苷键联是非天然键联。
在各种实施方案中,寡核苷酸包含具有至少19个连续核碱基序列的连接核苷,该序列包含至少10个连续核碱基的部分,该部分与SEQ ID NO:1-446、SEQ ID NO:894-918、SEQ ID NO:945-1390或SEQ ID NO:1392-1432中任一个的等长部分共享至少90%同一性(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性)。在各种实施方案中,寡核苷酸包含具有至少19个连续核碱基序列的连接核苷,该包含至少11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25个连续核碱基的部分,该部分与SEQ ID NO:1-446、SEQ ID NO:894-918、SEQ ID NO:945-1390或SEQ ID NO:1392-1432中任一个的等长部分共享至少90%同一性(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性)。
在各种实施方案中,寡核苷酸包含具有至少19个连续核碱基序列的连接核苷,该序列包含至少10个连续核碱基的部分,该部分与SEQ ID NO:31、36、41、46、55、144、146、150、169、170、171、172、173、177、181、185、197、203、209、215、237、244、249、252、380、385、390、395、400、975、980、985、999、1088、1090、1094、1113、1114、1115、1116、1117、1121、1125、1129、1141、1147、1153、1159、1181、1188、1193、1196、1324、1329、1334、1339或1344中任一个的等长部分共享至少90%同一性(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性),其中连接核苷的至少一个核苷键联是非天然键联。在各种实施方案中,寡核苷酸包含具有至少19个连续核碱基序列的连接核苷,该序列包含至少11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25个连续核碱基的部分,该部分与SEQID NO:31、36、41、46、55、144、146、150、169、170、171、172、173、177、181、185、197、203、209、215、237、244、249、252、380、385、390、395、400、975、980、985、999、1088、1090、1094、1113、1114、1115、1116、1117、1121、1125、1129、1141、1147、1153、1159、1181、1188、1193、1196、1324、1329、1334、1339或1344中任一个的等长部分共享至少90%同一性(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性),其中连接核苷的至少一个核苷键联是非天然键联。
在各种实施方案中,寡核苷酸包含具有至少19个连续核碱基序列的连接核苷,其中核碱基序列包含至少10个连续核碱基的部分,该部分与SEQ ID NO:894-918或SEQ IDNO:1392-1432中任一个的等长部分共享至少90%同一性(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性)。在各种实施方案中,寡核苷酸包含具有至少20、21、22、23、24或25个连续核碱基序列的连接核苷,其中核碱基序列包含至少10个连续核碱基的部分,该部分与SEQ ID NO:894-918或SEQ ID NO:1392-1432中任一个的等长部分共享至少90%同一性(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性)。
在各种实施方案中,寡核苷酸包含具有至少19个连续核碱基序列的连接核苷,其中核碱基序列包含至少10个连续核碱基的部分,该部分与SEQ ID NO:894-918或SEQ IDNO:1392-1432中任一个的等长部分共享至少90%同一性(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性)。在各种实施方案中,寡核苷酸包含具有至少20、21、22、23、24或25个连续核碱基序列的连接核苷,其中核碱基序列包含至少10个连续核碱基的部分,该部分与SEQ ID NO:894-918或SEQ ID NO:1392-1432中任一个的等长部分共享至少90%同一性(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性)。
在各种实施方案中,寡核苷酸包含具有至少19个连续核碱基序列的连接核苷,核碱基序列包含至少11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25个连续核碱基的部分,该部分与SEQ ID NO:894-918或SEQ ID NO:1392-1432中任一个的等长部分共享至少90%同一性(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性)。
在各种实施方案中,核碱基序列包含与在SEQ ID NO:944的121-144、144-168、146-170、150-170、150-172、150-170、150-172、150-174、169-193、169-189、169-191、170-190、170-192、171-191、171-193、172-192、172-194、170-194、171-195、172-196、173-197、185-209、197-221、237-261、249-273、252-276或276-300位中任一个内的核碱基的等长部分至少90%互补(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%互补)的至少10个连续核碱基的部分。在各种实施方案中,核碱基序列包含至少11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25个连续核碱基的部分,该部分与在SEQ ID NO:944的121-144、144-168、146-170、150-170、150-172、150-170、150-172、150-174、169-193、169-189、169-191、170-190、170-192、171-191、171-193、172-192、172-194、170-194、171-195、172-196、173-197、185-209、197-221、237-261、249-273、252-276或276-300位中任一个内的核碱基的等长部分至少90%互补(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%互补)。
在各种实施方案中,核碱基序列包含与在SEQ ID NO:944的121-144、144-168、146-170、150-170、150-172、150-170、150-172、150-174、169-193、169-189、169-191、170-190、170-192、171-191、171-193、172-192、172-194、170-194、171-195、172-196、173-197、185-209、197-221、237-261、249-273、252-276或276-300位中任一个内的核碱基的等长部分至少90%互补(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%互补)的至少10个连续核碱基的部分。在各种实施方案中,核碱基序列包含至少11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25个连续核碱基的部分,该部分与在SEQ ID NO:944的121-144、144-168、146-170、150-170、150-172、150-170、150-172、150-174、169-193、169-189、169-191、170-190、170-192、171-191、171-193、172-192、172-194、170-194、171-195、172-196、173-197、185-209、197-221、237-261、249-273、252-276或276-300位中任一个内的核碱基的等长部分至少90%互补(例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%互补)。
在各种实施方案中,核碱基序列的部分与在SEQ ID NO:944的121-144、144-168、146-170、150-170、150-172、150-170、150-172、150-174、169-193、169-189、169-191、170-190、170-192、171-191、171-193、172-192、172-194、170-194、171-195、172-196、173-197、185-209、197-221、237-261、249-273、252-276或276-300位中任一个内的核碱基的等长部分100%互补。在各种实施方案中,核碱基序列的部分与在SEQ ID NO:944的144-164、144-166、145-167、146-166、146-168、147-165或148-168位中任一个内的核碱基的等长部分100%互补。在各种实施方案中,核碱基序列的部分与在SEQ ID NO:944的173-191、173-193、173-195、173-197、175-195、175-197、177-197或179-197位中任一个内的核碱基的等长部分100%互补。在各种实施方案中,核碱基序列的部分与在SEQ ID NO:944的185-205、187-209、189-209、185-207、197-217、197-219或191-209位中任一个内的核碱基的等长部分100%互补。在各种实施方案中,核碱基序列的部分与在SEQ ID NO:944的237-255、237-257、237-259、239-259、239-261、241-261、237-257、249-269、249-271、252-272、252-274或243-261位中任一个内的核碱基的等长部分100%互补。
STMN2反义寡核苷酸变体
在各种实施方案中,STMN2 AON包括不同的变体,以下称为STMN2 AON变体。STMN2AON变体可以是5至100个核苷酸长度,例如10至40个核苷酸长度,例如14至40个核苷酸长度,10至30个核苷酸长度,例如14至30个核苷酸的寡核苷酸序列核苷酸长度,例如,16至28个核苷酸长度,例如,19至23个核苷酸长度,例如,21至23个核苷酸长度,或18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30个核苷酸长度的寡核苷酸序列。STMN2AON变体可以是与STMN2前mRNA序列或STMN2基因序列的部分互补的寡核苷酸序列。
在各种实施方案中,STMN2 AON变体代表相应STMN2 AON的修饰型式,其包括选自SEQ ID NO:1-446或SEQ ID NO:945-1390中任一个的核碱基序列。在一些实施方案中,STMN2 AON变体包括核碱基序列,其代表选自SEQ ID NO:1-446或SEQ ID NO:945-1390中任一者的STMN2 AON的核碱基序列的缩短形式。作为一个示例,如果STMN2 AON包括25mer(例如,25个核苷酸长度),则变体(例如,STMN2变体)可以包括25mer STMN2 AON的较短型式(例如,15mer、16mer、17mer、18mer、19mer、20mer、21mer、22mer、23mer或24mer)。在一个实施方案中,STMN2 AON变体的核碱基序列与相应的STMN2 AON核碱基序列的不同之处在于从STMN2 AON的核碱基序列的3’和5’末端之一或两者中除去了1、2、3、4、5或6个核苷酸。在一个实施方案中,相应的STMN2AON变体可以包括23mer,其中从STMN2 AON中包括的25mer的3’和5’末端之一除去两个核苷酸。在一个实施方案中,相应的STMN2 AON变体可以包括23mer,其中从STMN2 AON中包括的25mer的3’和5’末端中的每一个除去一个核苷酸。在一个实施方案中,相应的STMN2 AON变体可以包括21mer,其中从STMN2 AON中包括的25mer的3’和5’末端中的每一个除去两个核苷酸。在一个实施方案中,相应的STMN2 AON变体可以包括21mer,其中从STMN2 AON中包括的25mer的3’和5’末端中任一个除去四个核苷酸。在一个实施方案中,相应的STMN2 AON变体可以包括19mer,其中从STMN2 AON中包括的25mer的3’和5’末端中的每一个除去三个核苷酸。在一个实施方案中,相应的STMN2 AON变体可以包括19mer,其中从STMN2 AON中包括的25mer的3’和5’末端中任一个除去六个核苷酸。
STMN2 AON变体的示例性序列如下表3所示。示例性STMN2 AON变体各自与描述STMN2 AON变体和相应STMN2 AON之间差异的标识符相关联。例如,STMN2 AON变体包括SEQID NO:894,并使用标识符:QSN-144-1/5-1/3加以标识。标识符“QSN-144”的第一部分表示STMN2 AON变体是包括SEQ ID NO:144的QSN-144STMN2 AON的修饰型式。此外,包括数字指示符“1/5-1/3”的标识符的第二部分表示从QSN-144STMN2 AON中包括的核碱基序列的5’端和3’端中的每一个除去一个核苷酸(例如,从SEQ ID NO:144的3’和5’端中的每一个除去1个核苷酸)。为了提供另一个示例,STMN2 AON变体包括SEQ ID NO:895并且标识为QSN-144-2/3。此STMN2 AON变体是QSN-144STMN2 AON的修饰型式。“2/3”的数字指示符表示从QSN-144STMN2 AON的核碱基序列的3’端除去了两个核苷酸(例如,从SEQ ID NO:144的3’端去除了2个碱基)。
在一些实施方案中,STMN2 AON变体与对应的STMN2 AON的不同之处在于STMN2AON变体的一个或多个核苷间键联是磷酸二酯键联。在这样的实施方案中,STMN2 AON变体的长度可以与对应的STMN2 AON的长度相同(例如,25个核苷酸长度)。在一些实施方案中,磷酸二酯核苷间键联连接两个、三个、四个、五个、六个、七个、八个、九个或十个连续核苷酸。
在一些实施方案中,磷酸二酯核苷间键联连接位于3’或5’末端之一或两者的核苷酸。例如,在3’或5’末端之一或两者处的两个、三个、四个、五个、六个、七个、八个、九个或十个连续核苷酸通过磷酸二酯核苷间键联连接。
在一些实施方案中,磷酸二酯核苷间键联连接位于核碱基序列内的核苷酸。例如,在25mer STMN2 AON变体内,6-15位之间的连续核苷酸可以通过磷酸二酯核苷间键联连接。在一些实施方案中,7-15、8-14或9-13位中任一个之间的连续核苷酸通过磷酸二酯核苷间键联连接。
下面的表5标识了STMN2 AON序列的变体:
表5.STMN2反义寡核苷酸变体序列
*除非有相反说明(例如,在表5中的SEQ ID NO:1417、1418、1419、1420、1421、1422、1423和1424中),核碱基序列的至少一个核苷键联选自硫代磷酸酯键联、烷基磷酸酯键联、二硫代磷酸酯键联、磷酸三酯键联、烷基膦酸酯键联、3-甲氧基丙基膦酸酯键联、甲基膦酸酯键联、氨基烷基磷酸三酯键联、亚烷基膦酸酯键联、亚膦酸酯键联、氨基磷酸酯键联、硫代氨基磷酸酯键联、二氨基磷酸酯(例如,包含二氨基磷酸酯吗啉代(PMO)、3’氨基核糖或5’氨基核糖)键联、氨基烷基氨基磷酸酯键联、硫代氨基磷酸酯键联、硫代烷基膦酸酯键联、硫代烷基磷酸三酯键联、硫化磷酸键联、硒代磷酸键联和硼代磷酸键联。在一些实施方案中,除非有相反说明(例如,在表5中的SEQ ID NO:1417、1418、1419、1420、1421、1422、1423和1424中),每个核苷键联是硫代磷酸酯键联。1符号“-”表示在表5中的SEQ ID NO:1417、1418、1419、1420、1421、1422、1423和1424中存在磷酸二酯键联。
下面的表6标识了STMN2 AON序列的其他变体:
表6.其他STMN2反义寡核苷酸变体序列
*除非有相反说明(例如,在表6中的SEQ ID NO:1425、1426、1427、1428、1429、1430、1431、和1432中),核碱基序列的至少一个核苷键联选自硫代磷酸酯键联、烷基磷酸酯键联、二硫代磷酸酯键联、磷酸三酯键联、烷基膦酸酯键联、3-甲氧基丙基膦酸酯键联、甲基膦酸酯键联、氨基烷基磷酸三酯键联、亚烷基膦酸酯键联、亚膦酸酯键联、氨基磷酸酯键联、硫代氨基磷酸酯键联、二氨基磷酸酯(例如,包含二氨基磷酸酯吗啉代(PMO)、3’氨基核糖或5’氨基核糖)键联、氨基烷基氨基磷酸酯键联、硫代氨基磷酸酯键联、硫代烷基膦酸酯键联、硫代烷基磷酸三酯键联、硫化磷酸键联、硒代磷酸键联和硼代磷酸键联。在一些实施方案中,除非有相反说明(例如,在表6中的SEQ ID NO:1425、1426、1427、1428、1429、1430、1431、和1432中),每个核苷键联是硫代磷酸酯键联。
1符号-表示在表6中的SEQ ID NO:1425、1426、1427、1428、1429、1430、1431、和1432中存在磷酸二酯连接。
STMN2反义寡核苷酸和变体的性能
通常,STMN2 AON和STMN2 AON变体可以靶向具有隐蔽外显子的STMN2转录物,以增加、恢复、挽救或稳定能够翻译产生功能性STMN2蛋白(例如,全长STMN2)的STMN2 mRNA的表达水平。在各种实施方案中,STMN2 AON和STMN2 AON变体可以展现出全长STMN2蛋白的至少60%、70%、80%或90%的增加。在各种实施方案中,STMN2 AON和STMN2 AON变体可以展现出全长STMN2蛋白的至少100%、200%、300%或400%的增加。在一些实施方案中,与使用TDP43反义寡核苷酸实现的降低的全长STMN2蛋白水平相比,全长STMN2蛋白的百分比增加是增加的。例如,TDP43反义寡核苷酸可以用于消减全长STMN2蛋白,然后使用STMN2 AON或STMN2AON变体增加全长STMN2蛋白。
在一些实施方案中,STMN2 AON和STMN2 AON变体降低了具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平。在各种实施方案中,STMN2 AON和STMN2 AON变体可以展现出具有隐蔽外显子的STMN2转录物的至少50%、60%、70%、80%、90%、95%、96%、97%、98%或99%的降低。在一些实施方案中,与使用TDP43反义寡核苷酸实现的增加的隐蔽外显子水平相比,隐蔽外显子水平的百分比降低是降低的。例如,TDP43反义寡核苷酸可以用于增加隐蔽外显子水平,然后使用STMN2 AON或STMN2 AON变体降低隐蔽外显子水平。
在一些实施方案中,STMN2 AON和STMN2 AON变体可以展现出全长STMN2蛋白的至少10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或100%的挽救。在一些实施方案中,全长STMN2的挽救百分比是指使用TDP43反义寡核苷酸消减和使用STMN2 AON或STMN2 AON变体处理后全长STMN2相对于阴性对照(例如,未进行消减或处理的细胞或用媒介溶液处理的细胞)的%。
在一些实施方案中,STMN2 AON和AON变体展现出全长STMN2的50%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,STMN2 AON和AON变体展现出全长STMN2的60%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,STMN2 AON和AON变体展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,STMN2 AON和AON变体展现出全长STMN2的80%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,STMN2 AON和AON变体展现出全长STMN2的90%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,STMN2 AON和AON变体展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在一些实施方案中,STMN2 AON和AON变体展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在一些实施方案中,STMN2 AON和AON变体展现出全长STMN2的60%到80%之间的挽救。
在特定的实施方案中,QSN-31STMN2 AON(SEQ ID NO:31)展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-31STMN2 AON(SEQ ID NO:31)展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-31STMN2 AON(SEQ ID NO:31)展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-31STMN2 AON(SEQID NO:31)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且每个“C”经5-MeC替换。
在特定的实施方案中,QSN-36STMN2 AON(SEQ ID NO:36)展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-36STMN2 AON(SEQ ID NO:36)展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-36STMN2 AON(SEQ ID NO:36)展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-36STMN2 AON(SEQID NO:36)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。在一些实施方案中,QSN-36STMN2 AON(SEQID NO:36)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷并且每个“C”经5-MeC替换。
在特定的实施方案中,QSN-41STMN2 AON(SEQ ID NO:41)展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-41STMN2 AON(SEQ ID NO:41)展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-41STMN2 AON(SEQ ID NO:41)展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-41STMN2 AON(SEQID NO:41)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且每个“C”经5-MeC替换。
在特定的实施方案中,QSN-46STMN2 AON(SEQ ID NO:46)展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-46STMN2 AON(SEQ ID NO:46)展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-46STMN2 AON(SEQ ID NO:46)展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-46STMN2 AON(SEQID NO:46)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且每个“C”经5-MeC替换。
在特定的实施方案中,QSN-55STMN2 AON(SEQ ID NO:55)展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-55STMN2 AON(SEQ ID NO:55)展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-55STMN2 AON(SEQ ID NO:55)展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-55STMN2 AON(SEQID NO:55)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。在一些实施方案中,QSN-55STMN2 AON(SEQID NO:55)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷并且每个“C”经5-MeC替换。
在特定的实施方案中,QSN-144STMN2 AON(SEQ ID NO:144)展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-144STMN2AON(SEQ ID NO:144)展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-144STMN2 AON(SEQ IDNO:144)展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-144STMN2AON(SEQ ID NO:144)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。在一些实施方案中,QSN-144STMN2AON(SEQ ID NO:144)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷并且每个“C”经5-MeC替换。
在特定的实施方案中,QSN-146STMN2 AON(SEQ ID NO:146)展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-146STMN2AON(SEQ ID NO:146)展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-146STMN2 AON(SEQ IDNO:146)展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-146STMN2AON(SEQ ID NO:146)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且每个“C”经5-MeC替换。
在特定的实施方案中,QSN-150STMN2 AON(SEQ ID NO:150)展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-150STMN2AON(SEQ ID NO:150)展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-150STMN2 AON(SEQ IDNO:150)展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-150STMN2AON(SEQ ID NO:150)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且每个“C”经5-MeC替换。
在特定的实施方案中,QSN-169STMN2 AON(SEQ ID NO:169)展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-169STMN2AON(SEQ ID NO:169)展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-169STMN2 AON(SEQ IDNO:169)展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-169STMN2AON(SEQ ID NO:169)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且每个“C”经5-MeC替换。
在特定的实施方案中,QSN-170STMN2 AON(SEQ ID NO:170)展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-170STMN2AON(SEQ ID NO:170)展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-170STMN2 AON(SEQ IDNO:170)展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-170STMN2AON(SEQ ID NO:170)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且每个“C”经5-MeC替换。
在特定的实施方案中,QSN-171STMN2 AON(SEQ ID NO:171)展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-171STMN2AON(SEQ ID NO:171)展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-171STMN2 AON(SEQ IDNO:171)展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-171STMN2AON(SEQ ID NO:171)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且每个“C”经5-MeC替换。
在特定的实施方案中,QSN-172STMN2 AON(SEQ ID NO:172)展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-172STMN2AON(SEQ ID NO:172)展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-172STMN2 AON(SEQ IDNO:172)展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-172STMN2AON(SEQ ID NO:172)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且每个“C”经5-MeC替换。
在特定的实施方案中,QSN-173STMN2 AON(SEQ ID NO:173)展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-173STMN2AON(SEQ ID NO:173)展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-173STMN2 AON(SEQ IDNO:173)展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-173STMN2AON(SEQ ID NO:173)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。在一些实施方案中,QSN-173STMN2AON(SEQ ID NO:173)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷并且每个“C”经5-MeC替换。
在特定的实施方案中,QSN-177STMN2 AON(SEQ ID NO:177)展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-177STMN2AON(SEQ ID NO:177)展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-177STMN2 AON(SEQ IDNO:177)展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-177STMN2AON(SEQ ID NO:177)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。在一些实施方案中,QSN-177STMN2AON(SEQ ID NO:177)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2'-MOE)核苷并且每个“C”经5-MeC替换。在特定的实施方案中,QSN-181STMN2 AON(SEQ ID NO:181)展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-181STMN2 AON(SEQ ID NO:181)展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-181STMN2AON(SEQ ID NO:181)展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-181STMN2 AON(SEQ ID NO:181)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。在一些实施方案中,QSN-181STMN2 AON(SEQ ID NO:181)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷并且每个“C”经5-MeC替换。
在特定的实施方案中,QSN-185STMN2 AON(SEQ ID NO:185)展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-185STMN2AON(SEQ ID NO:185)展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-185STMN2 AON(SEQ IDNO:185)展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-185STMN2AON(SEQ ID NO:185)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷并且每个“C”经5-MeC替换。在一些实施方案中,QSN-185STMN2 AON(SEQ ID NO:185)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。在特定的实施方案中,QSN-197STMN2AON(SEQ ID NO:197)展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-197STMN2 AON(SEQ ID NO:197)展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-197STMN2 AON(SEQ ID NO:197)展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-197STMN2 AON(SEQ ID NO:197)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。在一些实施方案中,QSN-197STMN2 AON(SEQ IDNO:197)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷并且每个“C”经5-MeC替换。
在特定的实施方案中,QSN-203STMN2 AON(SEQ ID NO:203)展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-203STMN2AON(SEQ ID NO:203)展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-203STMN2 AON(SEQ IDNO:203)展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-203STMN2AON(SEQ ID NO:203)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。在一些实施方案中,QSN-203STMN2AON(SEQ ID NO:203)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷并且每个“C”经5-MeC替换。在特定的实施方案中,QSN-209STMN2 AON(SEQ ID NO:209)展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-209STMN2 AON(SEQ ID NO:209)展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-209STMN2 AON(SEQ ID NO:209)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。在特定的实施方案中,QSN-209STMN2 AON(SEQ ID NO:209)展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-209STMN2 AON(SEQ ID NO:209)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷并且每个“C”经5-MeC替换。
在特定的实施方案中,QSN-215STMN2 AON(SEQ ID NO:215)展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-215STMN2AON(SEQ ID NO:215)展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-215STMN2 AON(SEQ IDNO:215)展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-215STMN2AON(SEQ ID NO:215)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。在一些实施方案中,QSN-215STMN2AON(SEQ ID NO:215)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷并且每个“C”经5-MeC替换。在特定的实施方案中,QSN-237STMN2 AON(SEQ ID NO:237)展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-237STMN2 AON(SEQ ID NO:237)展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-237STMN2AON(SEQ ID NO:237)展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-237STMN2 AON(SEQ ID NO:237)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。在一些实施方案中,QSN-237STMN2 AON(SEQ ID NO:237)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷并且每个“C”经5-MeC替换。
在特定的实施方案中,QSN-244STMN2 AON(SEQ ID NO:244)展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-244STMN2AON(SEQ ID NO:244)展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-244STMN2 AON(SEQ IDNO:244)展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-244STMN2AON(SEQ ID NO:244)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。在一些实施方案中,QSN-244STMN2AON(SEQ ID NO:244)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷并且每个“C”经5-MeC替换。
在特定的实施方案中,QSN-249STMN2 AON(SEQ ID NO:249)展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-249STMN2AON(SEQ ID NO:249)展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-249STMN2 AON(SEQ IDNO:249)展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-249STMN2AON(SEQ ID NO:249)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,并且每个“C”经5-MeC替换。
在特定的实施方案中,QSN-252STMN2 AON(SEQ ID NO:252)展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-252STMN2AON(SEQ ID NO:252)展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-252STMN2 AON(SEQ IDNO:252)展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-252STMN2AON(SEQ ID NO:252)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。在一些实施方案中,QSN-252STMN2AON(SEQ ID NO:252)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷并且每个“C”经5-MeC替换。
在特定的实施方案中,QSN-380STMN2 AON(SEQ ID NO:380)展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-380STMN2AON(SEQ ID NO:380)展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-380STMN2 AON(SEQ IDNO:380)展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-380STMN2AON(SEQ ID NO:380)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。在一些实施方案中,QSN-380STMN2AON(SEQ ID NO:380)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷并且每个“C”经5-MeC替换。在特定的实施方案中,QSN-385STMN2 AON(SEQ ID NO:385)展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-385STMN2 AON(SEQ ID NO:385)展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-385STMN2AON(SEQ ID NO:385)展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-385STMN2 AON(SEQ ID NO:385)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。在一些实施方案中,QSN-385STMN2 AON(SEQ ID NO:385)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷并且每个“C”经5-MeC替换。
在特定的实施方案中,QSN-390STMN2 AON(SEQ ID NO:390)展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-390STMN2AON(SEQ ID NO:390)展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-390STMN2 AON(SEQ IDNO:390)展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-390STMN2AON(SEQ ID NO:390)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。在一些实施方案中,QSN-390STMN2AON(SEQ ID NO:390)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷并且每个“C”经5-MeC替换。在特定的实施方案中,QSN-395STMN2 AON(SEQ ID NO:395)展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-395STMN2 AON(SEQ ID NO:395)展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-395STMN2AON(SEQ ID NO:395)展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-395STMN2 AON(SEQ ID NO:395)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。在一些实施方案中,QSN-395STMN2 AON(SEQ ID NO:395)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷并且每个“C”经5-MeC替换。在特定的实施方案中,QSN-400STMN2 AON(SEQ ID NO:400)展现出全长STMN2的50%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-400STMN2 AON(SEQ ID NO:400)展现出全长STMN2的60%到90%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-400STMN2 AON(SEQ ID NO:400)展现出全长STMN2的70%到100%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-400STMN2 AON(SEQ ID NO:400)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。在一些实施方案中,QSN-400STMN2 AON(SEQ ID NO:400)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷并且每个“C”经5-MeC替换。
在特定的实施方案中,QSN-144-1/5-1/3(SEQ ID NO:894)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-144-1/5-1/3(SEQ ID NO:894)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-144-1/5-1/3(SEQ ID NO:894)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-144-2/3(SEQID NO:895)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-144-2/3(SEQ ID NO:895)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-144-2/3(SEQ ID NO:895)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-144-2/3STMN2 AON(SEQ ID NO:895)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
在特定的实施方案中,QSN-144-2/5(SEQ ID NO:896)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-144-2/5(SEQ ID NO:896)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-144-2/5(SEQ ID NO:896)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-144-2/5(SEQ ID NO:896)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
在特定的实施方案中,QSN-144-2/5-2/3(SEQ ID NO:897)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-144-2/5-2/3(SEQ ID NO:897)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-144-2/5-2/3(SEQ ID NO:897)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-144-2/5-2/3STMN2 AON(SEQ ID NO:897)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
在特定的实施方案中,QSN-144-3/5-3/3(SEQ ID NO:898)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-144-3/5-3/3(SEQ ID NO:898)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-144-3/5-3/3(SEQ ID NO:898)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-144-3/5-3/3(SEQ ID NO:898)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
在特定的实施方案中,QSN-144-4/3(SEQ ID NO:899)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-144-4/3(SEQ ID NO:899)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-144-4/3(SEQ ID NO:899)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-144-4/3STMN2 AON(SEQ IDNO:899)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
在特定的实施方案中,QSN-144-4/5(SEQ ID NO:900)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-144-4/5(SEQ ID NO:900)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-144-4/5(SEQ ID NO:900)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-144-4/5(SEQ ID NO:900)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
在特定的实施方案中,QSN-173-2/3(SEQ ID NO:901)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-173-2/3(SEQ ID NO:901)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-173-2/3(SEQ ID NO:901)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-173-2/3STMN2 AON(SEQ IDNO:901)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
在特定的实施方案中,QSN-173-2/5(SEQ ID NO:902)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-173-2/5(SEQ ID NO:902)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-173-2/5(SEQ ID NO:902)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-173-2/5(SEQ ID NO:902)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
在特定的实施方案中,QSN-173-2/5-2/3(SEQ ID NO:903)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-173-2/5-2/3(SEQ ID NO:903)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-173-2/5-2/3(SEQ ID NO:903)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-173-2/5-2/3(SEQ ID NO:903)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
在特定的实施方案中,QSN-173-4/3(SEQ ID NO:904)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-173-4/3(SEQ ID NO:904)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-173-4/3(SEQ ID NO:904)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-173-4/3(SEQ ID NO:904)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
在特定的实施方案中,QSN-173-4/5(SEQ ID NO:905)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-173-4/5(SEQ ID NO:905)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-173-4/5(SEQ ID NO:905)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-173-4/5(SEQ ID NO:905)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
在特定的实施方案中,QSN-173-6/3(SEQ ID NO:906)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-173-6/3(SEQ ID NO:906)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-173-6/3(SEQ ID NO:906)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-173-6/3(SEQ ID NO:906)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
在特定的实施方案中,QSN-173-6/5(SEQ ID NO:907)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-173-6/5(SEQ ID NO:907)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-173-6/5(SEQ ID NO:907)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-173-6/5(SEQ ID NO:907)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
在特定的实施方案中,QSN-185-2/5(SEQ ID NO:908)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-185-2/5(SEQ ID NO:908)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-185-2/5(SEQ ID NO:908)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-185-2/5(SEQ ID NO:908)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
在特定的实施方案中,QSN-185-4/3(SEQ ID NO:909)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-185-4/3(SEQ ID NO:909)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-185-4/3(SEQ ID NO:909)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-185-4/3(SEQ ID NO:909)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
在特定的实施方案中,QSN-185-4/5(SEQ ID NO:910)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-185-4/5(SEQ ID NO:910)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-185-4/5(SEQ ID NO:910)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-185-4/5(SEQ ID NO:910)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
在特定的实施方案中,QSN-185-6/5(SEQ ID NO:911)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-185-6/5(SEQ ID NO:911)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-185-6/5(SEQ ID NO:911)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-185-6/5(SEQ ID NO:911)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
在特定的实施方案中,QSN-237-2/3(SEQ ID NO:912)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-237-2/3(SEQ ID NO:912)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-237-2/3(SEQ ID NO:912)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-237-2/3(SEQ ID NO:912)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
在特定的实施方案中,QSN-237-2/5(SEQ ID NO:913)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-237-2/5(SEQ ID NO:913)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-237-2/5(SEQ ID NO:913)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-237-2/5(SEQ ID NO:913)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
在特定的实施方案中,QSN-237-2/5-2/3(SEQ ID NO:914)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-237-2/5-2/3(SEQ ID NO:914)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-237-2/5-2/3(SEQ ID NO:914)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-237-2/5-2/3(SEQ ID NO:914)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
在特定的实施方案中,QSN-237-4/3(SEQ ID NO:915)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-237-4/3(SEQ ID NO:915)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-237-4/3(SEQ ID NO:915)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-237-4/3(SEQ ID NO:915)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
在特定的实施方案中,QSN-237-4/5(SEQ ID NO:916)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-237-4/5(SEQ ID NO:916)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-237-4/5(SEQ ID NO:916)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-237-4/5(SEQ ID NO:916)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
在特定的实施方案中,QSN-237-6/3(SEQ ID NO:917)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-237-6/3(SEQ ID NO:917)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-237-6/3(SEQ ID NO:917)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-237-6/3(SEQ ID NO:917)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
在特定的实施方案中,QSN-237-6/5(SEQ ID NO:918)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-237-6/5(SEQ ID NO:918)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-237-6/5(SEQ ID NO:918)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。在一些实施方案中,QSN-237-6/5(SEQ ID NO:918)寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
在特定的实施方案中,QSN-173-po3(SEQ ID NO:1417)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-173-po3(SEQ ID NO:1417)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-173-po3(SEQ ID NO:1417)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-173-po5(SEQ ID NO:1418)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-173-po5(SEQ IDNO:1418)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-173-po5(SEQ ID NO:1418)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。
在特定的实施方案中,QSN-144-po3(SEQ ID NO:1419)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-144-po3(SEQ ID NO:1419)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-144-po3(SEQ ID NO:1419)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-144-po5(SEQ ID NO:1420)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-144-po5(SEQ IDNO:1420)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-144-po5(SEQ ID NO:1420)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。
在特定的实施方案中,QSN-185-po3(SEQ ID NO:1421)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-185-po3(SEQ ID NO:1421)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-185-po3(SEQ ID NO:1421)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-185-po5(SEQ ID NO:1422)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-185-po5(SEQ IDNO:1422)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-185-po5(SEQ ID NO:1422)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。
在特定的实施方案中,QSN-237-po3(SEQ ID NO:1423)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-237-po3(SEQ ID NO:1423)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-237-po3(SEQ ID NO:1423)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-237-po5(SEQ ID NO:1424)展现出全长STMN2的30%到100%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-237-po5(SEQ IDNO:1424)展现出全长STMN2的40%到80%之间的挽救。在特定的实施方案中,QSN-237-po5(SEQ ID NO:1424)展现出全长STMN2的50%到60%之间的挽救。
其他化学修饰的STMN2反义寡核苷酸
本文所述的STMN2 AON可以包括化学修饰的核苷,包括修饰的核糖核苷和修饰的脱氧核糖核苷。化学修饰的核苷包括但不限于尿嘧啶、尿嘧啶、尿苷、2’-O-(2-甲氧基乙基)修饰,例如2’-O-(2-甲氧基乙基)鸟苷、2’-O-(2-甲氧基乙基)腺苷、2’-O-(2-甲氧基乙基)胞嘧啶和2’-O-(2-甲氧基乙基)胸苷。在某些实施方案中,混合形态,例如STMN2肽核酸(PNA)和STMN2锁核酸(LNA)的组合。化学修饰的核苷还包括但不限于锁核酸(LNA)、2’-MOE、2’-O-甲基、2’-氟和2’-氟-β-D-阿糖核苷酸(FANA),以及氟环己烯基核酸(F-CeNA)修饰。可以包含在本文所述的STMN2 AON中的化学修饰核苷在Johannes and Lucchino,(2018)“Current Challenges in Delivery and Cytosolic Translocation of TherapeuticRNAs”Nucleic Acid Ther.28(3):178–93;Rettig and Behlke,(2012)“Progress towardin vivo use of siRNAs-II”Mol Ther 20:483–512;和Khvorova and Watts,(2017)“Thechemical evolution of oligonucleotide therapies of clinical utility”NatBiotechnol.,35(3):238-48中描述,每篇的内容通过引用并入本文。
本文所述的STMN2 AON可以包括促进寡核苷酸末端5’-磷酸酯稳定化的化学修饰和5’-磷酸酯的磷酸酶抗性类似物。促进寡核苷酸末端5’-磷酸酯稳定化的化学修饰或其为5’-磷酸酯的磷酸酶抗性类似物,包括但不限于5’-甲基膦酸酯、5’-亚甲基膦酸酯、5’-亚甲基膦酸酯类似物、5’-E-乙烯基膦酸酯(5’-E-VP)、5’-硫代磷酸酯和5’-C-甲基类似物。Khvorova and Watts,(2017)“The chemical evolution of oligonucleotide therapiesof clinical utility”Nat Biotechnol.,35(3):238-48中描述了促进AON末端5’-磷酸酯稳定化的化学修饰和5’-磷酸酯的磷酸酶抗性类似物,其内容通过引用并入本文。
在本文所述的一些实施方案中,本文所述的STMN2 AON可以包括化学修饰的核苷,例如2’O-甲基核糖核苷,例如2’O-甲基胞苷、2’O-甲基鸟苷、2’O-甲基尿苷和/或2’O-甲基腺苷。本文所述的STMN2 AON可以包括一种或多种化学修饰的碱基,包括5-甲基嘧啶,例如5-甲基胞嘧啶,和/或5-甲基嘌呤,例如5-甲基鸟嘌呤。化学修饰的碱基还可以包括假尿苷或5’甲氧基尿苷。本文所述的STMN2 AON可以包括以下任何化学修饰的核苷:5-甲基-2’-O-甲基胞苷、5-甲基-2’-O-甲基胸苷、5-甲基胞苷、5-甲基尿苷和/或5-甲基2’-脱氧胞苷。
本文所述的STMN2 AON可以包括磷酸主链,其中一个或多个寡核苷键联是磷酸酯键联。本文所述的STMN2 AON可以包括修饰的寡核苷酸主链,其中核碱基序列的一个或多个核苷键联选自硫代磷酸酯键联、烷基磷酸酯键联、二硫代磷酸酯键联、磷酸三酯键联、烷基膦酸酯键联、3-甲氧基丙基膦酸酯键联、甲基膦酸酯键联、氨基烷基磷酸三酯键联、亚烷基膦酸酯键联、亚膦酸酯键联、氨基磷酸酯键联、氨基磷酸酯键联、二氨基磷酸酯(例如,包含二氨基磷酸酯吗啉(PMO)、3’氨基核糖或5’氨基核糖)键联、氨基烷基氨基磷酸酯键联、硫代氨基磷酸酯键联、硫代烷基膦酸酯键联、硫代烷基磷酸三酯键联、硫化磷酸酯键联、硒代磷酸酯键联和硼代磷酸酯键联。在本文所述的STMN2 AON的一些实施方案中,核碱基序列的至少一个核苷间键联是硫代磷酸酯键联。例如,在本文所述的STMN2 AON的一些实施方案中,核碱基序列的一个、两个、三个或更多个核苷间键联是硫代磷酸酯键联。在本文所述的STMN2 AON的优选实施方案中,核碱基序列的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联。因此,在一些实施方案中,SEQ ID NO:1-446、SEQ ID NO:894-918、SEQ ID NO:945-1390或SEQ IDNO:1392-1432中任一个的STMN2 AON的所有核苷酸键联是硫代磷酸酯键联。在一些实施方案中,SEQ ID NO:1-446、SEQ ID NO:894-918、SEQ ID NO:945-1390或SEQ ID NO:1392-1432中任一个的STMN2 AON的一个或多个核苷酸键联是硫代磷酸酯键联。
预期在一些实施方案中,所公开的STMN2 AON可以任选地具有至少一个修饰的核碱基,例如5-甲基胞嘧啶,和/或至少一种甲基膦酸核苷酸,其被放置,例如在5’或3’末端中的仅一个处或在5’和3’末端两者处或沿着寡核苷酸序列。在一些实施方案中,本公开的STMN2 AON寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,并且寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷并且每个“C”经5-MeC替换。
预期的STMN2 AON可以任选地包括至少一个修饰的糖。例如,构成寡核苷酸的至少一个核苷酸的糖部分是核糖,其中2’-OH基团可以经选自由OR、R、R′OR、SH、SR、NH2、NR2、N3、CN、F、Cl、Br和I(其中R是烷基或芳基,R′是亚烷基)组成的组中的任一种替换。修饰的糖部分的实例包括2’-OMe修饰的糖部分、双环糖部分、2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’MOE)、2’-脱氧-2’-氟核苷、2’-氟-β-D-阿糖核苷、锁核酸(LNA)、受约束的乙基2’-4’-桥接核酸(cEt)、S-cEt、己糖醇核酸(HNA)和三环类似物(例如tcDNA)。
在一些实施方案中,STMN2 AON包含2’OMe(例如,包含一种或多种2’OMe修饰糖的STMN2 AON)、MOE(例如,包含一种或多种MOE修饰糖(例如,2’-MOE)的STMN2 AON)、PNA(例如,包含一个或多个由酰胺键或羰基亚甲基键联连接的N-(2-氨基乙基)-甘氨酸单元作为重复单元代替糖-磷酸主链的STMN2 AON)、LNA(例如,包含一种或多种锁核糖的STMN2 AON,并且可以是2’-脱氧核苷酸或2’OMe核苷酸的混合物)、c-ET(例如,包含一种或多种cET糖的STMN2 AON),cMOE(例如,包含一种或多种cMOE糖的STMN2 AON)、吗啉代寡聚物(例如,包括包含一种或多种PMO的主链的STMN2 AON)、脱氧-2’-氟核苷(例如,包含一种或多种的2’-氟-β-D-阿糖核苷的STMN2 AON)、ENA(例如,包含一种或多种ENA修饰糖的STMN2 AON)、HNA(例如,包含一种或多种HNA修饰糖的STMN2 AON)或tcDNA(例如,包含一种或多种tcDNA修饰糖的STMN2 AON)。在一些实施方案中,STMN2 AON包含一个或多个硫代磷酸酯键联、磷酸二酯键联、磷酸三酯键联、甲基膦酸酯键联、氨基磷酸酯键联、吗啉代键联、PNA键联,或者硫代磷酸酯键联、磷酸二酯键联、磷酸三酯键联、甲基膦酸酯键联、氨基磷酸酯键联、吗啉代键联和PNA键联的任何组合。在一些实施方案中,STMN2 AON包含一个或多个硫代磷酸酯键联、磷酸二酯键联,或者硫代磷酸酯键联和磷酸二酯键联的组合。
运动神经元疾病
运动神经元疾病是一组以运动神经元功能丧失为特征的疾病,运动神经元通过大脑协调肌肉的随意运动。运动神经元疾病可能影响上和/或下运动神经元,并且可能具有散发性或家族性起源。运动神经元疾病包括肌萎缩侧索硬化(ALS或Lou Gehrig病)、进行性延髓麻痹、假性延髓麻痹、进行性肌肉萎缩、原发性侧索硬化、脊髓性肌萎缩、脊髓灰质炎后综合征和ALS伴额颞叶痴呆。
运动神经元疾病的症状包括肌肉衰变或衰弱、肌肉疼痛、痉挛、口齿不清、吞咽困难、肌肉控制丧失、关节痛、四肢僵硬、呼吸困难、流口水和肌肉控制,包括在呼吸、吞咽、进食、说话和肢体运动等基本功能上的完全丧失。这些症状有时还伴有抑郁、记忆丧失、计划困难、语言缺陷、行为改变以及难以评估空间关系和/或人格变化。
运动神经元疾病可以由熟练的临床医生,例如神经科医生,使用各种工具和测试来评估和诊断。例如,可以使用血液和尿液测试(例如,测定肌酐激酶存在的测试)、磁共振成像(MRI)、肌电图(EMG)、神经传导检查(NCS)、脊椎抽液、腰椎穿刺和/或肌肉活检来评估和诊断发展运动神经元疾病的存在和风险。运动神经元疾病可以借助身体检查和/或神经系统检查来诊断,以评估运动和感觉技能、神经功能、听力和言语、视力、协调和平衡、精神状态以及情绪或行为的变化。
肌萎缩侧索硬化
ALS是进行性运动神经元疾病,其破坏所有随意肌的信号。ALS导致上和下运动神经元的萎缩。ALS的症状包括延髓肌肉衰弱和消瘦、全身和双侧力量丧失、痉挛、肌肉痉挛、肌肉痛性痉挛、肌束震颤、口齿不清、呼吸困难或呼吸能力丧失。一些患有ALS的个体也患有认知下降。在分子水平上,ALS的特征是运动神经元细胞质中的蛋白质和RNA聚集体,包括RNA结合蛋白TDP43的聚集体。
ALS最常见于40岁以上的男性,尽管它也可能发生在妇女和儿童中。在吸烟、暴露于诸如铅的化学品或曾在军队服役的个体中ALS的风险也会提高。大多数ALS病例是散发性的,而只有约10%的病例是家族性的。ALS的原因包括散发性或遗传性基因突变、高谷氨酸水平、蛋白质处理不当。与ALS相关的基因突变包括基因SOD1、C9orf72、TARDBP、FUS、ANG、ATXN2、CHCHD10、CHMP2B、DCTN1、ErbB4、FIG4、HNRPA1、MATR3、NEFH、OPTN、PFN1、PRPH、SETX、SIGMAR1、SMN1、SPG11、SQSTM1、TBK1、TRPM7、TUBA4A、UBQLN2、VAPB和VCP中的突变。
额颞叶痴呆
额颞叶痴呆(FTD)是累及大脑额叶和颞叶的痴呆形式。它具有比阿尔茨海默病更早的平均发病年龄——40岁。FTD的症状包括行为和性格的极端变化、言语和语言问题,以及与运动相关的症状,如震颤、强直、肌肉痉挛、无力和吞咽困难。FTD的亚型包括行为变异性额颞叶痴呆(bvFTD),其特征在于人格和行为变化,以及原发性进行性失语症(PPA),其影响语言技能、说话、写作和理解能力的。FTD与tau蛋白积累(Pick小体)和改变的TDP43功能有关。约30%的FTD病例是家族性的,并且除了疾病的家族史之外,没有其他危险因素是已知的。与FTD相关的基因突变包括基因C9orf72、颗粒蛋白前体(GRN)、微管相关蛋白tau(MAPT)、UBQLN2、VPC、CHMP2B、TARDBP、FUS、ITM2B、CHCHD10、SQSTM1、PSEN1、PSEN2、CTSF、CYP27A1、TBK1和TBP。
肌萎缩侧索硬化伴额颞叶痴呆
肌萎缩侧索硬化伴额颞叶痴呆(ALS伴FTD)是其中FTD和ALS发生在同一个体中的临床综合征。有趣的是,C9orf72突变是家族性ALS和/或FTD的最常见原因。此外,TBK1、VCP、SQSTMI、UBQLN2和CHMP2B的突变也与ALS伴FTD相关。ALS伴FTD的症状包括人格的急剧变化,以及肌无力、肌肉萎缩、肌束震颤、痉挛、构音障碍、吞咽困难,以及脊髓、运动神经元以及大脑额叶和颞叶的退化。在分子水平上,ALS伴FTD的特征在于TDP-43和/或FUS蛋白在细胞质中的积累。TBK1突变与ALS、FTD和ALS伴FTD相关。
治疗方法
本公开部分地考虑了治疗神经学疾病(例如,肌萎缩侧索硬化(ALS)、额颞叶痴呆(FTD)、阿尔茨海默病(AD)、帕金森病(PD)、亨廷顿病、臂丛神经损伤、外周神经损伤、进行性核上性麻痹(PSP)、脑外伤、脊髓损伤、皮质基底节变性(CBD)和/或神经病诸如在有此需要的患者中化疗诱导的神经病,去包括施用公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂,例如STMN2 AON。在一些实施方案中,本文提供了在有此需要的患者中治疗神经学疾病的方法,包括施用所公开的STMN2 AON。在本公开的一些实施方案中,可以将有效量的所公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂施用于有此需要的患者,以治疗神经学疾病和/或增加、恢复或稳定能够翻译以产生功能性STMN2蛋白的STMN2 mRNA的表达,从而增加、恢复或稳定STMN2活性和/或功能。
在一些实施方案中,治疗神经学疾病包括至少改善或减轻与神经学疾病相关的症状(例如,减轻ALS患者的肌无力)。提供了在患有神经学疾病的患者中治疗此疾病(例如,ALS、FTD或ALS伴FTD)的方法,其包括施用公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂,例如STMN2 AON。在一些实施方案中,提供了减缓神经学疾病,例如运动神经元疾病进展的方法。
本文提供了在有此需要的受试者中治疗、降低发生神经学疾病的风险或延迟其发作的方法,其包括施用公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂,例如STMN2 AON。该方法包括,例如,治疗处于发展神经学疾病风险的受试者;例如,向受试者施用有效量的所公开的STMN2 AON。可以以这种方式治疗的神经学疾病包括运动神经元疾病、ALS、FTD、ALS伴FTD、进行性延髓麻痹、假性延髓麻痹、进行性肌萎缩、原发性侧索硬化、脊髓性肌萎缩和脊髓灰质炎后综合征。
预防或治疗神经学疾病(例如,PD、ALS、FTD和ALS伴FTD)的方法构成本公开的部分。此类方法可以包括向有此需要的患者或处于风险中的患者施用包含STMN2 AON诸如本文公开的STMN2 AON的药物制剂。例如,提供了预防或治疗神经学疾病的方法,其包括向有此需要的患者施用本文公开的STMN2 AON。
使用上述方法治疗的患者可能经历STMN2 mRNA表达的增加、恢复和稳定,其能够翻译产生至少约5%、10%、20%、30%、40%或甚至50%的功能性STMN2蛋白,从而增加、恢复或稳定靶细胞(例如,运动神经元)中的STMN2活性和/或功能,在施用包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂后,例如1天、2天、1周、2周、3周、4周、5周、6周、7周、8周、1个月、2个月、3个月、4个月、5个月或6个月或者更长后。可以例如至少每天施用这种包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂。可以口服施用包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂。在一些实施方案中,包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂经鞘内或脑池内施用。例如,在本文所述的一个实施方案中,大约每3个月经鞘内或脑池内施用包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂。与未施用包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂(诸如本文公开的一种)的患者相比,由于施用本文公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂,患者中的神经学疾病临床表现的延迟或改善可以是至少例如6个月、1年、18个月或甚至2年或更长,。
本发明的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂,例如STMN2 AON,可以单独使用或彼此联合使用,由此至少两种本发明的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂以单一组合物或作为治疗方案的部分一起使用。STMN2寡核苷酸可以单独使用或彼此联合使用,由此至少两种STMN2寡核苷酸以单一组合物或作为治疗方案的部分一起使用。本发明的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂也可以与其他药物联合使用以治疗神经学疾病或病症。
治疗和评估
如本文所述,患者是指处于神经学疾病风险下、患有或诊断为神经学疾病的任何动物,包括但不限于哺乳动物、灵长类和人。在某些实施方案中,患者可以是非人哺乳动物,诸如,例如猫、狗或马。在某些实施方案中,患者是人。患者可以是诊断有发展神经学疾病的高风险个体、已经诊断有神经学疾病的人、先前患有神经学疾病的人,或评估了神经学疾病的症状或指征的个体,例如,与神经学疾病相关的任何体征或症状,例如肌萎缩侧索硬化(ALS)、额颞叶痴呆(FTD)、阿尔茨海默病(AD)、帕金森病(PD)、亨廷顿病、臂丛神经损伤、周围神经损伤,进行性核上性麻痹(PSP)、脑外伤、脊髓损伤、皮质基底节变性(CBD)和/或神经病,例如化疗诱导的神经病。
如本文所用,“有此需要的患者”是指患有神经学疾病的任何症状或表现的患者,可能患有神经学疾病的任何症状或表现的患者,或可能受益于用于治疗神经学疾病的本公开的方法的任何患者。有此需要的患者可以包括诊断出有神经学疾病风险的患者、过去患有神经学疾病的患者或之前曾接受过神经学疾病治疗的患者。
如本文所用,“有效量”是指当向患者施用时足以至少部分治疗病况的药剂的量。治疗有效量将根据病况的严重性、组分的施用途径以及受治疗患者的年龄、体重等而变化。因此,所公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂的有效量是在患者中治疗神经学疾病所需要的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂的量,使得施用该药剂可以预防神经学疾病在受试者中发生,阻止神经学疾病进展(例如,阻止神经系统症状,诸如肌肉减弱、痉挛或肌束震颤的发作或严重性增加),或缓解或完全改善神经学疾病的所有相关症状,即导致疾病的消退。
可以通过评估与神经学疾病相关的大体症状、组织组织学分析、生化测定、成像方法诸如,例如磁共振成像或其他已知方法来评估治疗的功效。例如,在向患有神经学疾病的患者施用所公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂后,可以通过分析疾病的总体症状,诸如肌肉力量的变化和控制或与神经学疾病相关的大体病理学的其他方面来评估治疗的功效。
还可以在组织或细胞水平评估治疗的功效,例如,通过获得组织活检(例如,脑、脊髓、肌肉或运动神经元组织活检)和评估大体组织或细胞形态或染色特性。检查蛋白质或RNA表达的生化测定也可以用于评估治疗的功效。例如,人们可以通过免疫细胞化学、免疫组织化学、Western印迹法或Northern印迹法方法或用于评估RNA水平的方法,诸如定量或半定量聚合酶链(例如数字PCR(DigitalPCR、dPCR或dePCR)、qPCR等)反应来评估解离细胞或未解离组织中指示神经学疾病的蛋白质或基因产物的水平。人们还可以评估在脊髓液、脑脊液、细胞外囊泡(例如,轻神经丝(NEFL)、重神经丝(NEFH)、TDP-43或p75细胞外结构域(p75ECD))的存在或表达水平(例如,外泌体样脑脊液细胞外囊泡(“CSF外泌体”),诸如在Welton et al.,(2017)“Cerebrospinal fluid extracellular vesicle enrichment forprotein biomarker discovery in neurological disease;multiple sclerosis”JExtracell Vesicles.,6(1):1-10;和Street et al.,(2012)“Identification andproteomic profiling of exosomes in human cerebrospinal fluid”JTransl.Med.,10:5中描述的那些)、尿液、粪便、淋巴体液、血液、血浆或血清中发现的有用生物标志物的存在或表达水平,以评估疾病状态和治疗效果。人们还可以评估在血浆、神经元胞外囊泡/外泌体中发现的有用生物标志物的存在或表达水平。功效的其他测量可能包括强度持续时间常数(SDTC)、短间隔皮层抑制(SICI)、测力法、肢体等长肌力的准确测试(ATLIS)、复合肌肉动作电位(bio)和ALSFRS-R。在某些实施方案中,尿神经营养因子受体p75胞外结构域(p75ECD)是肌萎缩侧索硬化(ALS)中的疾病进展和预后生物标志物。脑脊液(CSF)中的磷酸化神经丝重链(pNFH)预测C9ORF72相关肌萎缩侧索硬化(c9ALS)患者的疾病状态和生存。CSF pNFH作为临床试验的预后生物标志物,这将增加成功开发c9ALS治疗方法的可能性。
在评估治疗功效时,可以选择合适的对照以确保有效评估。例如,可以人们可以将施用所公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂之后在患有神经学疾病的患者中评估的症状与同一患者在治疗之前或在治疗过程的较早时间点的那些症状,或在另一名未诊断出神经学疾病的患者中的那些症状进行比较。或者,人们可以将施用所公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂之后组织的生化或组织学分析结果与来自同一患者或来自未诊断出神经学疾病的个体或来自施用包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂之前的同一患者的组织的那些结果进行比较。此外,人们可以将施用包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂之后的血液、血浆、血清、细胞、尿液、淋巴液、脊髓液、脑脊液或粪便样本与来自未诊断出神经学疾病的个体或来自施用包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂之前的同一患者的可比样品进行比较。在一些实施方案中,人们可以将施用包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂之后的细胞外囊泡(例如CSF外泌体),与来来自未诊断出神经学疾病的个体或来自施用包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂之前的同一患者的细胞外囊泡进行比较。
可以通过直接或间接评估STMN2表达水平或活性来确定对包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制的验证。例如,测量STMN2蛋白或RNA表达的生化测定可以用于评估对包括隐蔽外显子的STMN2转录物的整体抑制。例如,人们可以通过Western印迹法测量细胞或组织中的STMN2蛋白水平,以评估整体STMN2水平。人们还可以通过Northern印迹法或定量聚合酶链反应测量STMN2 mRNA水平,以确定对包括隐蔽外显子的STMN2转录物的总体抑制。人们还可以通过免疫细胞化学或免疫组织化学方法在解离细胞、未解离组织、细胞外囊泡(例如,CSF外泌体)、血液、血清或粪便中评估STMN2蛋白水平或指示STMN2信号传导活性的另一种蛋白水平。
还可以通过测量参数诸如自噬、内吞作用、蛋白质聚集,以及在血浆、脊髓液、脑脊液、细胞外囊泡(例如,脑脊液外泌体)、血液、尿液、淋巴液、粪便或组织中发现的有用生物标志物(例如,神经丝轻(NEFL)、神经丝重(NEFH)、TDP-43或p75ECD)的存在或水平来间接评估包括隐蔽外显子的STMN2转录物的剪接的调控,以评估对包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制功效。也可以通过测量参数诸如自噬、内吞作用、蛋白质聚集,以及生理生物标志物(诸如复合肌肉动作电位(bio))的存在或表达水平来间接评估包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制。其他测量可能包括强度持续时间常数(SDTC)、短间隔皮层抑制(SICI)、测力法、肢体等长肌力的准确测试(ATLIS)、复合肌肉动作电位和ALSFRS-R。在某些实施方案中,尿神经营养因子受体p75细胞外结构域(p75ECD)是肌萎缩侧索硬化(ALS)中的疾病进展和预后生物标志物。脑脊液(CSF)中的磷酸化神经丝重链(pNFH)预测c9ALS患者的疾病状态和生存。CSF pNFH作为临床试验的预后生物标志物,这将增加成功开发c9ALS治疗方法的可能性。
在一些实施方案中,本公开提供了校正具有隐蔽外显子的STMN2转录物的剪接并由此恢复患有神经学疾病的患者的细胞中的全长STMN2蛋白表达的方法。STMN2转录物的剪接可以在发生STMN2表达或活动的任何细胞中得到校正,包括神经系统细胞(包括中枢神经系统、周围神经系统、运动神经元、大脑、脑干、额叶、颞叶、脊髓)、肌肉骨骼系统、脊髓液和脑脊液的细胞。肌肉骨骼系统的细胞包括骨骼肌细胞(例如,肌细胞)。运动神经元包括上运动神经元和下运动神经元。
药物组合物和施用途径
本公开还提供了通过施用药物组合物治疗神经学疾病的方法,该药物组合物包含所公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂。在另一个方面,本公开提供了用于治疗神经学疾病的药物组合物。药物组合物可以由所公开的靶向包括隐蔽外显子的STMN2转录物的反义寡核苷酸和药学上可接受的载体组成。如本文所用,术语“药物组合物”意指,例如,为了治疗神经学疾病,在药学上可接受的载体中含有特定量,例如治疗有效量的,待施用于哺乳动物,例如人的治疗化合物的混合物。在一些实施方案中,本文考虑了包含所公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂和药学上可接受的载体的药物组合物。在另一个方面,本公开提供了所公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂在制备用于治疗神经学疾病的药物中的用途。如本文所用,“药物”与术语“药物组合物”具有基本相同的含义。
如本文所用,“药学上可接受的载体”意指适用于与人类和动物的组织接触而没有过度毒性、刺激、过敏反应或其他问题或并发症的缓冲剂、载体和赋形剂,与合理的收益/风险比相称。载体在与配制剂的其他成分相容且对受体无害的意义上应该是“可接受的”。药学上可接受的载体包括与药物施用相容的缓冲剂、溶剂、分散介质、涂层、等渗剂和吸收延迟剂等。此类介质和试剂用于药物活性物质的用途在本领域中是已知的。在一个实施方案中,该药物组合物经口服施用,并且包括适用于调节消化系统或肠道内包囊物质的吸收部位的肠溶包衣。例如,肠溶包衣可以包括丙烯酸乙酯-甲基丙烯酸共聚物。
在一个实施方案中,所公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂及其任何药物组合物可以通过一种或多种途径施用,包括经局部、鞘内、脑池内、胃肠外(例如,皮下、肌内、皮内、十二指肠内或静脉内)、病灶内、口服、直肠、颊、舌下、阴道、肺、气管内、鼻内、经皮或十二指肠内。如本文所用,术语胃肠外包括皮下注射、胰内施用、静脉内、脑池内、鞘内、肌内、腹膜内、胸骨内注射或输注技术。例如,可以将所公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂经皮下施用于受试者。在另一个实例中,可以将所公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂经口服施用于受试者。在另一个实例中,所公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂可以直接施用于神经系统或神经系统的特定区域或细胞(例如,脑、脑干、下运动神经元、脊髓、上运动神经元)通过胃肠外给药,例如,所公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂可以经鞘内或脑池内施用。
在一些实施方案中,可以将包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂例如STMN2AON包囊在纳米颗粒包衣中。人们认为纳米颗粒包囊防止AON降解并增强细胞摄取。例如,在一些实施方案中,将包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂包囊在阳离子聚合物,例如,合成聚合物(例如,聚-L-赖氨酸、聚酰胺胺、聚(β-氨基酯))和聚乙烯亚胺)或天然存在的聚合物(例如壳聚糖和鱼精蛋白)的包衣中。在一些实施方案中,将包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂包囊在脂质或脂质样材料中,例如阳离子脂质、阳离子脂质样材料或仅在酸性pH下带正电荷的可电离脂质。例如,在一些实施方案中,将包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂包囊在在脂质纳米颗粒中,该脂质纳米颗粒包括疏水部分,例如胆固醇和/或聚乙二醇(PEG)脂质。
在一些实施方案中,包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂例如STMN2 AON与生物活性配体缀合。例如,在本文所述的一些实施方案中,包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂诸如STMN2 AON与肽、脂质、N-乙酰半乳糖胺(GalNAc)、胆固醇、维生素E、抗体或细胞穿透肽(例如,转录反式激活因子(TAT)和渗透剂)。
含有所公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂的药物组合物,诸如本文公开的那些,可以以剂量单位形式存在并且可以通过任何合适的方法制备。药物组合物应配制成与其预期的施用途径相容。可以通过制药领域熟知的方法制备有用的配制剂。例如,参见Remington's Pharmaceutical Sciences,18th ed.(Mack Publishing Company,1990)。
在一些实施方案中,药物配制剂是无菌的。可以例如通过无菌过滤膜过滤来完成灭菌。在组合物经冻干时,可以在冻干和重构之前或之后进行过滤灭菌。
胃肠外施用
本公开的药物组合物可以配制用于胃肠外施用,例如配制用于通过静脉内、脑池内、肌内、皮下、鞘内、病灶内或腹膜内途径注射。鉴于本公开内容,本领域技术人员将知道水性组合物,诸如含有所公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂的水性药物组合物的制备。通常,此类组合物可以制备为可注射剂,或者作为液体溶液或悬浮液;也可以制备适用于在注射前添加液体后制备溶液或悬浮液的固体形式;并且制剂也可以是乳化的。
适合注射使用的药物形式包括无菌水溶液或分散剂;配制剂包括生理盐水、磷酸盐缓冲盐水、人工脑脊液、芝麻油、花生油或丙二醇水溶液;用于临时制备无菌注射溶液或分散剂的无菌粉末。在所有情况下,该形式必须是无菌的,并且必须是流体以达到有容易的可注射性的程度。它制备和储存条件下必须在是稳定的,并且必须防止微生物诸如细菌和真菌的污染作用。
作为游离碱或药学上可接受的盐的活性化合物的溶液可以在与表面活性剂诸如羟丙基纤维素适当混合的水中制备。也可以在甘油、液体聚乙二醇及其混合物和油中制备分散剂。此外,可以采用无菌的固定油作为溶剂或悬浮介质。为此目的,可以使用任何温和的固定油,包括合成的甘油单酯或甘油二酯。此外,脂肪酸诸如油酸可以用于注射剂的制备。无菌可注射制剂也可以是在无毒的胃肠外可接受的稀释剂或溶剂中的无菌可注射溶液、悬浮液或乳液,例如在1,3-丁二醇中的溶液。可以采用的可接受的媒介物和溶剂包括水、林格氏溶液、U.S.P.和等渗氯化钠溶液。在一个实施方案中,所公开的STMN2反义寡核苷酸可以悬浮在包含1%(w/v)羧甲基纤维素钠和0.1%(v/v)TWEENTM80的载液中。在通常的贮存和使用条件下,这些制剂含有防腐剂以阻止微生物的生长。
可注射制剂,例如无菌可注射水性或油性悬浮液,可以根据已知技术使用合适的分散剂或润湿剂和悬浮剂来配制。通常,分散剂是通过将各种已灭菌的活性成分掺入无菌媒介物中来制备的,该媒介物含有基本分散介质和来自上述列举的那些所需的其他成分。本公开内容的无菌可注射溶液可以通过将所公开的STMN2反义寡核苷酸(例如,包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂)掺入所需量的根据需要具有上面列举的各种其他成分的适当溶剂中来制备,然后通过过滤灭菌。至于于制备无菌注射溶液的无菌粉末,优选的制备方法是真空干燥和冷冻干燥技术,其从其先前无菌过滤的溶液中产生活性成分加上任何其他期望成分的粉末。可注射配制剂可以经过灭菌,例如,通过保菌滤器过滤。
还考虑了制备更多或高度浓缩的用于肌肉注射的溶液。在这方面,优选使用DMSO作为溶剂,因为这将导致极快的渗透,将高浓度的所公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂递送至小区域。
用于这种溶液的合适的防腐剂包括苯扎氯铵、苄索氯铵、氯丁醇、硫柳汞等。合适的缓冲剂包括硼酸、碳酸氢钠和碳酸氢钾、硼酸钠和硼酸钾、碳酸钠和碳酸钾、乙酸钠、磷酸氢钠等,以足以将pH维持在约pH 6和pH 8之间,例如,在约pH 7和pH 7.5之间的量。合适的张度剂是葡聚糖40、葡聚糖70、右旋糖、甘油、氯化钾、丙二醇、氯化钠等,使得溶液的氯化钠当量在0.9加减0.2%的范围内。合适的抗氧化剂和稳定剂包括亚硫酸氢钠、焦亚硫酸钠、硫代亚硫酸钠、硫脲等。合适的润湿剂和澄清剂包括聚山梨酯80、聚山梨酯20、泊洛沙姆282和泰洛沙泊。合适的增粘剂包括葡聚糖40、葡聚糖70、明胶、甘油、羟乙基纤维素、羟甲基丙基纤维素、羊毛脂、甲基纤维素、凡士林、聚乙二醇、聚乙烯醇、聚乙烯吡咯烷酮、羧甲基纤维素等。
口服施用
在一些实施方案中,本文考虑了适合于口服递送所公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂的组合物,例如,包括肠溶包衣例如抗胃包衣的片剂,使得该组合物可以将包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂递送至例如患者的胃肠道。
例如,所提供的用于口服施用的片剂包含颗粒(例如,至少部分地由颗粒形成),其包括所公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂,例如,STMN2反义寡核苷酸,例如,由SEQ ID NO:1-446、SEQ ID NO:894-918、SEQ ID NO:945-1390或SEQ ID NO:1392-1432中的任一个代表的STMN2反义寡核苷酸,以及药学上可接受的赋形剂。这种片剂可以用肠溶包衣包被。预期的片剂可以包括药学上可接受的赋形剂,诸如填充剂、粘合剂、崩解剂和/或润滑剂,以及着色剂、脱模剂、包衣剂、甜味剂、调味剂诸如冬青、橙、木糖醇、山梨醇、果糖和麦芽糖糊精,和加香剂、防腐剂和/或抗氧化剂。
在一些实施方案中,预期的药物配制剂包括颗粒内相,其包括所公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂,例如STMN2反义寡核苷酸,例如由SEQ ID NO:1-446、SEQID NO:894-918、SEQ ID NO:945-1390或SEQ ID NO:1392-1432中的任一个代表的STMN2反义寡核苷酸和药学上可接受的盐,例如STMN2反义寡核苷酸,例如由SEQ ID NO:1-446、SEQID NO:894-918、SEQ ID NO:945-1390或SEQ ID NO:1392-1432中的任一个代表的反义寡核苷酸和药学上可接受的填充剂。例如,所公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂和填充剂可以任选地与其他赋形剂混合在一起,并形成颗粒。在一些实施方案中,可以使用湿法制粒形成颗粒内相,例如,将液体(例如,水)添加到混合的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂和填充剂中,然后将该组合干燥、研磨和/或筛分以产生颗粒。本领域技术人员将理解,可以使用其他方法来实现颗粒内相。
在一些实施方案中,预期的配制剂包括颗粒外相,其可以包括一种或多种药学上可接受的赋形剂,并且可以与颗粒内相混合以形成所公开的配制剂。
所公开的配制剂可以包括含有填充剂的颗粒内相。示例性填充剂包括但不限于纤维素、明胶、磷酸钙、乳糖、蔗糖、葡萄糖、甘露醇、山梨醇、微晶纤维素、果胶、聚丙烯酸酯、右旋糖、醋酸纤维素、羟丙基甲基纤维素、部分预胶化淀粉、碳酸钙,以及包括其组合的其他。
在一些实施方案中,所公开的配制剂可以包括颗粒内相和/或包括粘合剂的颗粒外相,粘合剂通常可以起将药物配制剂的成分保持在一起的作用。本公开的示例性粘合剂可以包括但不限于以下:淀粉、糖、纤维素或改性纤维素诸如羟丙基纤维素、乳糖、预胶化玉米淀粉、聚乙烯吡咯烷酮、羟丙基纤维素、羟丙基甲基纤维素、低取代羟丙基纤维素、羧甲基纤维素钠、甲基纤维素、乙基纤维素、糖醇和包括其组合的其他。
预期的,例如,包括颗粒内相和/或颗粒外相的配制剂,可以包括崩解剂,诸如但不限于淀粉、纤维素、交联聚乙烯吡咯烷酮、羟基乙酸淀粉钠、羧甲基纤维素钠、藻酸盐、玉米淀粉、交联纤维素钠、交联羧甲基纤维素、低取代羟丙基纤维素、阿拉伯胶和包括其组合的其他。例如,颗粒内相和/或颗粒外相可以包括崩解剂。
在一些实施方案中,预期的配制剂包括颗粒内相,其包含所公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂和选自以下的赋形剂:甘露醇、微晶纤维素、羟丙基甲基纤维素和羟基乙酸淀粉钠或其组合,以及包含以下中的一种或多种的颗粒外相:微晶纤维素、羟基乙酸淀粉钠和硬脂酸镁或其混合物。
在一些实施方案中,预期的配制剂可以包括润滑剂,例如颗粒外相可以含有润滑剂。润滑剂包括但不限于滑石、二氧化硅、脂肪、硬脂、硬脂酸镁、磷酸钙、二氧化硅、硅酸钙、磷酸钙、胶体二氧化硅、金属硬脂酸盐、氢化植物油、部分氢化植物油、玉米淀粉、苯甲酸钠、聚乙二醇、乙酸钠、硬脂酸钙、十二烷基硫酸钠、氯化钠、十二烷基硫酸镁、滑石和硬脂酸。
在一些实施方案中,药物配制剂包含肠溶包衣。通常,肠溶包衣为口服药物创建屏障,控制药物沿消化道吸收的位置。肠溶包衣可以包括根据pH以不同速率崩解的聚合物。肠溶包衣可以包括例如邻苯二甲酸乙酸纤维素、丙烯酸甲酯-甲基丙烯酸共聚物、乙酸琥珀酸纤维素、邻苯二甲酸羟丙基甲基纤维素、甲基丙烯酸甲酯-甲基丙烯酸共聚物、丙烯酸乙酯-甲基丙烯酸共聚物、甲基丙烯酸共聚物C型、聚乙酸乙烯酯-邻苯二甲酸酯和邻苯二甲酸乙酸纤维素。
示例性肠溶包衣包括AMB,级。在一些实施方案中,肠溶包衣可以包含按重量计约5%至约10%、约5%至约20%、8%至约15%、约8%至约20%、约10%至约20%、或约12至约20%,或约18%的预期片剂。例如,肠溶包衣可以包括丙烯酸乙酯-甲基丙烯酸共聚物。
例如,在预期的实施方案中,提供了包含或基本上由以下组成的片剂:按重量计约0.5%至约70%,例如约0.5%至约10%,或约1%至约20%的所公开的STMN2反义寡核苷酸或其药学上可接受的盐。此类片剂可以包括例如按重量计约0.5%至约60%的甘露醇,例如按重量计约30%至约50%的甘露醇,例如按重量计约40%的甘露醇;和/或按重量计约20%至约40%的微晶纤维素,或按重量计约10%至约30%的微晶纤维素。例如,所公开的片剂可以包含颗粒内相,其包括按重量计约30%至约60%,例如约45%至约65%,或可替代地,按重量计约5%至约10%的所公开的STMN2反义寡核苷酸,按重量计约30%至约50%,或可替代地,约5%至约15%的甘露醇,按重量计约5%至约15%的微晶纤维素,约0%至约4%或约1%至约7%的羟丙基甲基纤维素和约0%至约4%,例如约2%至约4%的羟基乙酸淀粉钠。
在另一个预期的实施方案中,用于口服施用所公开的包含隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂的药物片剂配制剂包括颗粒内相,其中该颗粒内相包含所公开的STMN2 AON或其药学上可接受的盐(诸如钠盐)和药学上可接受的填充剂,并且还可以包括颗粒外相,其可以包括药学上可接受的赋形剂诸如崩解剂。颗粒外相可以包括选自微晶纤维素、硬脂酸镁及其混合物的组分。药物组合物还可以包括按片剂重量计约12%至20%的肠溶包衣。例如,用于口服使用的药学上可接受的片剂可以包含按重量计约0.5%至10%的所公开的STMN2AON,例如所公开的STMN2 AON或其药学上可接受的盐,按重量计约30%至50%甘露醇,按重量计约10%至30%的微晶纤维素,和包含丙烯酸乙酯-甲基丙烯酸共聚物的肠溶包衣。
在另一个实例中,用于口服使用的药学上可接受的片剂可以包含颗粒内相,其包含按重量计约5%至约10%的所公开的STMN2 AON,例如所公开的STMN2 AON或其药学上可接受的盐,按重量计约40%甘露醇、按重量计约8%微晶纤维素、按重量计约5%羟丙基甲基纤维素和按重量计约2%羟基乙酸淀粉钠;颗粒外相,其包含按重量计约17%微晶纤维素、按重量计约2%羟基乙酸淀粉钠、按重量计约0.4%硬脂酸镁;以及片剂上包含丙烯酸乙酯-甲基丙烯酸共聚物的肠溶包衣。
包衣溶解和活性成分释放的速率是它的溶出速率。在实施方案中,期望的片剂可以具有,例如当在pH为7.2的磷酸盐缓冲液中以100rpm和37℃在USP/EP2型设备(桨)中测试时,在约120分钟至约240分钟后,例如180分钟后,约50%至约100%的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂释放的溶出曲线。在另一个实施方案中,期望的片剂可以具有,例如当在pH为1.0的稀HCl中以100rpm和37℃在USP/EP2型设备(桨式)中进行测试时,在120分钟后基本上没有释放包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂的溶出曲线。在另一个实施方案中,期望的片剂可以具有,例如当在pH为6.6的磷酸盐缓冲液中以100rpm和37℃在USP/EP2型设备(桨)中进行测试时,在30分钟后约10%至约30%,或不超过约50%的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂释放的溶出曲线。
在一些实施方案中,本文提供的方法可以进一步包括施用至少一种其他药剂,其针对本文所公开的疾病和病症的治疗。在一个实施方案中,可以共同施用预期的其他药剂(例如,顺次或同时)。
施用剂量和频率
下面描述的剂量或量是指寡核苷酸或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中,配制剂包括包含以下的剂型:至少1μg、至少5μg、至少10μg、至少20μg、至少30μg、至少40μg、至少50μg、至少60μg、至少70μg、至少80μg、至少90μg或至少100μg的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂,例如,STMN2反义寡核苷酸。在一些实施方案中,配制剂包括包含以下的剂型:从10mg至500mg、从1mg至10mg、从10mg至20mg、从20mg至30mg、从30mg至40mg、从40mg至50mg、从50mg至60mg、从60mg至70mg、从70mg至80mg、从80mg至90mg、从90mg至100mg、从100mg至150mg、从150mg至200mg、从200mg至250mg、从250mg至300mg、从300mg至350mg、从350mg至400mg、从400mg至450mg、从450mg至500mg、从500mg至600mg、从600mg至700mg、从700mg至800mg、从800mg至900mg、从900mg至1g、从1mg至50mg、从20mg至40mg或从1mg至500mg的STMN2反义寡核苷酸。
在一些实施方案中,配制剂包括包含约10mg至约500mg的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂,例如STMN2 AON或基本由其组成的剂型。例如,本文预期的配制剂包括约10mg、15mg、20mg、25mg、30mg、35mg、40mg、50mg、60mg、70mg、80mg、90mg、100mg、110mg、120mg、130mg、140mg、150mg、160mg、170mg、180mg、190mg、200mg、250mg、300mg、350mg、400mg、450mg、500mg、600mg、700mg、800mg、900mg、1g、1.5g、2.0g、2.5g、3.0g、3.5g、4.0g、4.5g或5.0g的所公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂。在一些实施方案中,配制剂可以包括约40mg、80mg或160mg的所公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂。在一些实施方案中,配制剂可以包括至少100μg的所公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂。例如,配制剂可以包括约0.1mg、0.2mg、0.3mg、0.4mg、0.5mg、1mg、5mg、10mg、15mg、20mg、25mg或30mg的所公开的包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂。所施用的量取决于变量,诸如待治疗的疾病或指征的类型和程度、患者的整体健康和体型、包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂的体内效力、药物配制剂和施用途径。初始剂量可以增加超过上限,以快速达到期望的血液水平或组织水平。或者,初始剂量可以小于最佳,并且可以在治疗过程中逐渐增加剂量。可以优化人剂量,例如,在常规的I期剂量递增研究中。给药频率可以变化,这取决于因素诸如施用途径、剂量和所治疗的疾病。示例性的给药频率是每天一次、每周一次和每两周一次。在一些实施方案中,给药是每天一次,持续7天。在一些实施方案中,给药是每4周一次、每5周一次、每6周一次、每7周一次、每8周一次、每9周一次、每10周一次、每11周一次或每12周一次。在一些实施方案中,给药是每月一次至每三个月一次。
组合疗法
在各种实施方案中,本文所公开的STMN2 AON可以联合一种或多种额外的疗法施用。在一些实施方案中,所公开的寡核苷酸和一种或多种额外疗法的组合疗法可以协同治疗肌萎缩侧索硬化(ALS)、额颞叶痴呆(FTD)、阿尔茨海默病(AD)、帕金森病(PD)、亨廷顿病、臂丛神经损伤、周围神经损伤、进行性核上性麻痹(PSP)、脑外伤、脊髓损伤、皮质基底节变性(CBD)和/或神经病诸如化疗诱导的神经病中的任何一种。
示例性额外疗法包括利鲁唑(Rilutek)、依达拉奉(Radicava)、卡巴拉汀、多奈哌齐、加兰他敏、选择性血清素重摄取抑制剂、抗精神病药剂、胆碱酯酶抑制剂、美金刚、苯二氮卓类抗焦虑药、AMX0035(ELYBRIO)、ZILUCOPLAN(RA101495)、双重AON鞘内施用(例如,BIIB067、BIIB078)、BIIB100、左旋多巴/卡比多巴、多巴胺能药剂(例如,罗匹尼罗、普拉克索、罗替戈汀)、甲羟孕酮、KCNQ2/KCNQ3开放剂、抗惊厥剂和精神兴奋剂。额外疗法还可以包括呼吸护理、物理疗法、职业疗法、言语疗法和营养支持。在各种实施方案中,额外疗法可以是第二反义寡核苷酸。例如,第二反义寡核苷酸可以靶向STMN2转录物(例如,STMN2前mRNA、成熟STMN2 mRNA)以调控全长STMN2蛋白的表达水平。
在各种实施方案中,所公开的寡核苷酸和一种或多种额外疗法可以彼此缀合并且以缀合形式提供。下文描述了关于涉及所公开寡核苷酸的缀合物的进一步描述。在各种实施方案中,共同提供所公开的寡核苷酸和一种或多种额外疗法。在各种实施方案中,同时提供所公开的寡核苷酸和一种或多种额外疗法。在各种实施方案中,顺次提供所公开的寡核苷酸和一种或多种额外疗法。
缀合物
在某些实施方案中,本文提供的是寡聚化合物,其包含寡核苷酸(例如,STMN2寡核苷酸)和任选地一个或多个缀合基团和/或端基。缀合基团包括一个或多个缀合部分和将缀合部分与寡核苷酸连接的缀合接头。缀合基团可以附接到寡核苷酸的末端之一或两者和/或任何内部位置。在某些实施方案中,缀合基团附接至修饰的寡核苷酸的核苷的2’-位置。在某些实施方案中,附接到寡核苷酸的末端之一或两者的缀合基团是端基。在某些此类实施方案中,缀合基团或端基附接在寡核苷酸的3’和/或5’末端处。在某些此类实施方案中,缀合基团(或端基)附接在寡核苷酸的3’末端处。在某些实施方案中,缀合基团附接在寡核苷酸的3’末端附近。在某些实施方案中,缀合基团(或端基)附接在寡核苷酸的5’末端处。在某些实施方案中,缀合基团附接在寡核苷酸的5’末端附近。
端基的实例包括但不限于缀合基团、封端基团、磷酸酯部分、保护基团、修饰或未修饰的核苷,以及独立修饰或未修饰的两个或更多个核苷。
缀合基团
在某些实施方案中,STMN2 AON共价附接到一个或多个缀合基团。在某些实施方案中,缀合基团改变所附接寡核苷酸的一种或多种性质,包括但不限于药效学、药代动力学、稳定性、结合、吸收、组织分布、细胞分布、细胞摄取、电荷和清除。在特定实施方案中,缀合基团改变(例如,增加)寡核苷酸在血流中的循环时间,使得增加浓度的寡核苷酸递送至大脑。在特定实施方案中,缀合基团改变寡核苷酸在靶器官(例如,脑)中的停留时间(例如,增加停留时间),使得增加的寡核苷酸的停留时间改善了它们的性能(例如,功效)。在特定实施方案中,缀合基团增加寡核苷酸通过血脑屏障和/或脑实质(例如,通过受体介导的胞吞作用)向脑的递送。在特定实施方案中,缀合基团使寡核苷酸能够靶向特定器官(例如,脑)。在某些实施方案中,缀合基团赋予所附接寡核苷酸新的特性,例如能够检测寡核苷酸的荧光团或报道基团。先前已经描述了某些缀合基团和缀合部分,例如:胆固醇部分(Letsingeret al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,1989,86,6553-6556)、胆酸(Manoharan et al.,Bioorg.Med.Chem.Lett.,1994,4,1053-1060),硫醚,例如己基-S-三苯甲基硫醇(Manoharan et al.,Ann.NY.Acad.Sci.,1992,660,306-309;Manoharan et al.,Bioorg.Med.Chem.Lett.,1993,3,2765-2770)、巯基胆固醇(Oberhauser et al.,Nucl.Acids Res.,1992,20,533-538)、脂肪链,例如,十二烷基二醇或十一烷基残基(Saison-Behmoaras et al.,EMBO J,1991,10,1111-1118;Kabanov et al.,FEBS Lett.,1990,259,327-330;Svinarchuk et al.,Biochimie,1993,75,49-54)、磷脂,例如二-十六烷基-外消旋-甘油或1,2-二-O-十六烷基-外消旋-甘油-3-H-膦酸三乙基-铵(Manoharanet al.,Tetrahedron Lett.,1995,36,3651-3654;Shea et al.,Nucl.Acids Res.,1990,18,3777-3783)、聚胺或聚乙二醇链(Manoharan et al.,Nucleosides&Nucleotides,1995,14,969-973),或金刚烷乙酸棕榈基部分(Mishra et al.,Biochim.Biophys.Acta,1995,1264,229-237)、十八胺或己基氨基-羰基-氧基胆固醇部分(Crooke et al.,J.Pharmacol.Exp.Ther.,1996,277,923-937)、生育酚基团(Nishina et al.,MolecularTherapy Nucleic Acids,2015,4,e220;和Nishina et al.,Molecular Therapy,2008,16,734-740),或GalNAc簇(例如,WO2014/179620)。
缀合部分
缀合部分包括但不限于嵌入剂、报告分子、聚胺、聚酰胺、肽、碳水化合物、维生素部分、聚乙二醇、硫醚、聚醚、胆固醇、巯基胆固醇、胆酸部分、叶酸、脂质、磷脂、生物素、吩嗪、啡啶、蒽醌、金刚烷、吖啶、荧光素、罗丹明、香豆素、荧光团和染料。在特定实施方案中,缀合部分选自肽、脂质、N-乙酰半乳糖胺(GalNAc)、胆固醇、维生素E、硫辛酸、泛酸、聚乙二醇、抗体(例如,用于穿过血脑屏障的抗体,诸如抗转铁蛋白受体抗体),或细胞穿透肽(例如,转录反式激活因子(TAT)和渗透剂)。
在某些实施方案中,缀合部分包含活性原料药,例如,阿司匹林、华法林、保泰松、布洛芬、舒洛芬、芬布芬、酮洛芬、(S)-(+)-普拉洛芬、卡洛芬、丹磺酰肌氨酸、2,3,5-三碘苯甲酸、芬戈莫德、氟芬那酸、亚叶酸、苯并噻二嗪、氯噻嗪、二氮杂卓、茚甲新、巴比妥、头孢菌素、磺胺类药、抗糖尿病药、抗菌药或抗生素。
缀合接头
缀合部分通过缀合接头附接至STMN2 AON。在某些寡聚化合物中,缀合接头是单个化学键(即,缀合部分通过单键直接附接至寡核苷酸)。在某些实施方案中,缀合接头包含链结构、重复单元诸如乙二醇、核苷或氨基酸单元的寡聚物。
在某些实施方案中,缀合接头包含一个或多个选自烷基、氨基、氧代、酰胺、二硫化物、聚乙二醇、醚、硫醚和羟氨基的基团。在某些此类实施方案中,缀合接头包含选自烷基、氨基、氧代、酰胺和醚基团的基团。在某些实施方案中,缀合接头包含选自烷基和酰胺基团的基团。在某些实施方案中,缀合接头包含选自烷基和醚基团的基团。在某些实施方案中,缀合接头包含至少一个磷部分。在某些实施方案中,缀合接头包含至少一个磷酸基团。在某些实施方案中,缀合接头包括至少一个中性连接基团。
在某些实施方案中,缀合接头,包括上述缀合接头,是双功能连接部分,例如,本领域已知可用于将缀合基团附接至母体化合物的那些,诸如本文所提供的寡核苷酸。通常,双功能连接部分包含至少两个官能团。选择其中一个官能团与母体化合物上的特定位点结合并且选择另一个与缀合基团结合。用于双功能连接部分的官能团的实例包括但不限于用于与亲核基团反应的亲电体和用于与亲电基团反应的亲核体。在某些实施方案中,双功能连接部分包含选自氨基、羟基、羧酸、巯基、烷基、烯基和炔基的一个或多个基团。
缀合接头的实例包括但不限于吡咯烷、8-氨基-3,6-二氧辛酸(ADO)、琥珀酰亚胺基4-(N-马来酰亚胺甲基)环己烷-1-羧酸酯(SMCC)和6-氨基己酸(AHEX或AHA)。其他缀合接头包括但不限于取代或未取代的C1-C10烷基、取代或未取代的C2-C10烯基或取代或未取代的C2-C10炔基,其中优选的取代基的非限制性列表包括羟基、氨基、烷氧基、羧基、苄基、苯基、硝基、巯基、硫代烷氧基、卤素、烷基、芳基、烯基和炔基。
在某些实施方案中,缀合接头包含1-10个接头-核苷。在某些实施方案中,缀合接头包含2-5个接头-核苷。在某些实施方案中,缀合接头包含3个接头-核苷。
在某些实施方案中,此类接头-核苷是修饰的核苷。在某些实施方案中,此类接头-核苷包含修饰的糖部分。在某些实施方案中,接头-核苷是未修饰的。在某些实施方案中,接头-核苷包含选自嘌呤、取代的嘌呤、嘧啶或取代的嘧啶的任选地保护杂环碱基。在某些实施方案中,可切割部分是选自尿嘧啶、胸腺嘧啶、胞嘧啶、4-N-苯甲酰基胞嘧啶、5-甲基胞嘧啶、4-N-苯甲酰基-5-甲基胞嘧啶、腺嘌呤、6-N-苯甲酰基腺嘌呤、鸟嘌呤和2-N-异丁酰鸟嘌呤地核苷。通常期望接头-核苷在其到达靶组织后从寡聚化合物上切割下来。因此,接头-核苷通常彼此连接并且通过可切割键与寡聚化合物的其余部分连接。在某些实施方案中,此类可切割键是磷酸二酯键。
在本文中,不认为接头-核苷是寡核苷酸的部分。因此,在实施方案中,其中寡聚化合物包含由特定数目或范围的连接核苷和/或对参照核酸的特定百分比互补性组成的寡核苷酸并且寡聚化合物还包含由包含接头-核苷的缀合接头组成的缀合基团,那些接头-核苷不计入寡核苷酸的长度,并且不用于确定对于参照核酸的寡核苷酸百分比互补性。
在某些实施方案中,期望从STMN2 AON上切割缀合基团。例如,在某些情况下,包含特定缀合部分的寡聚化合物更好地由特定细胞类型吸收,但是一旦寡聚化合物经吸收,则期望切割缀合基团以释放未缀合的或母体寡核苷酸。因此,某些缀合接头可以包含一个或多个可切割部分。在某些实施方案中,可切割部分是可切割键。在某些实施方案中,可切割部分是包含至少一个可切割键的原子组。在某些实施方案中,可切割部分包含具有一个、两个、三个、四个或多于四个可切割键的原子组。在某些实施方案中,可切割部分在细胞或亚细胞区室(诸如溶酶体)内选择性切割。在某些实施方案中,可切割部分由内源酶如核酸酶选择性切割。
在某些实施方案中,可裂解键选自:酰胺、酯、醚、磷酸二酯的一种或两种酯、磷酸酯、氨基甲酸酯或二硫化物。在某些实施方案中,可切割键是磷酸二酯的一种或两种酯。在某些实施方案中,可切割部分包含磷酸酯或磷酸二酯。在某些实施方案中,可切割部分是寡核苷酸和缀合部分或缀合基团之间的磷酸键联。
在某些实施方案中,可切割部分包含一种或多种接头-核苷或由其组成。在某些此类实施方案中,一种或多种接头-核苷通过可切割键彼此连接和/或与寡聚化合物的其余部分连接。在某些实施方案中,此类可切割键是未修饰的磷酸二酯键。在某些实施方案中,可切割部分是2’-脱氧核苷,其通过磷酸核苷间键联附接至寡核苷酸的3’或5’端核苷,并通过磷酸酯或硫代磷酸酯键联共价附接至缀合接头或缀合部分的其余部分。在某些此类实施方案中,可切割部分是2’-脱氧腺苷。
端基
在某些实施方案中,寡聚化合物包含一个或多个端基。在某些此类实施方案中,寡聚化合物包含稳定的5’-磷酸酯。稳定的5’-磷酸酯包括但不限于5’-膦酸酯,包括但不限于5’-乙烯基膦酸酯。在某些实施方案中,端基包含一种或多种无碱基核苷和/或反式核苷。在某些实施方案中,端基包含一个或多个2’-连接的核苷。在某些此类实施方案中,2’-连接的核苷是无碱基核苷。
诊断方法
本公开还提供了诊断患有神经学疾病的患者的方法,该方法依赖于检测患者的一个或多个生物样品中的STMN2表达信号的水平。如本文所用,术语“STMN2表达信号”可以指STMN2基因表达或基因或基因产物活性的任何指示。STMN2基因产物包括RNA(例如mRNA)、肽和蛋白质。可以评估的STMN2基因表达指标包括但不限于STMN2基因或染色质状态、STMN2基因与调节基因表达的细胞组分的相互作用、STMN2基因产物表达水平(例如,包括隐蔽外显子的STMN2转录物的表达水平、STMN2蛋白表达水平),或STMN2 RNA或蛋白与转录、翻译或翻译后加工机制的相互作用。
STMN2表达信号的检测可以通过体内、体外或离体方法完成。在优选的实施方案中,本公开的方法可以在体外进行。检测方法可以涉及在患者的血液、血清、粪便、组织、脑脊液、脊髓液、细胞外囊泡(例如,CSF外泌体)或细胞中。可以通过在全组织、组织外植体、细胞培养物、解离细胞、细胞提取物、细胞外囊泡(例如,CSF外泌体)或体液(包括血液、脊髓体液、脑脊液、尿液、淋巴液或血清)中测量包括隐蔽外显子的STMN2转录物的表达信号来实现检测。预期的检测方法包括测量STMN2基因产物表达水平的测定法,诸如Western印迹法、FACS、ELISA、其他定量结合测定法、细胞或组织生长测定法、Northern印迹法、定量或半定量聚合酶链反应、dPCR、由珠技术支持Quanterix SR-XTM超灵敏生物标志物检测系统、医学成像方法(例如MRI)或免疫染色方法(例如免疫组织化学或免疫细胞化学)。
额外的实施方案
本文公开了包含寡核苷酸的化合物,该寡核苷酸包含与转录物的至少10个连续核碱基至少90%互补的核碱基序列,该转录物包含与SEQ ID NO:1391或SEQ ID NO:944至少90%同一性的序列,或SEQ ID NO:1391或SEQ ID NO:944的连续15至50个核碱基部分,其中核碱基序列的至少一个核苷键联是非天然键联。本文还公开了寡核苷酸,其包含与转录物的至少10个连续核碱基至少90%互补的核碱基序列,该转录物包含与SEQ ID NO:1391或SEQ ID NO:944至少90%同一性的序列,或SEQ ID NO:1391或SEQ ID NO:944的连续15至50个核碱基部分,其中核碱基序列的至少一个核苷键联是非天然键联。
在一方面,寡核苷酸包含至少一个连续的10个核碱基序列,其与SEQ ID NO:1-446、SEQ ID NO:894-918、SEQ ID NO:945-1390,或SEQ ID NO:1392-1432中任一个的等长部分具有90%同一性。在一个方面,寡核苷酸包含至少一个连续的11、12、13、14、15、16或17个核碱基序列,其与SEQ ID NO:1-446、SEQ ID NO:894-918、SEQ ID NO:945-1390,或SEQID NO:1392-1432中任一个的等长部分共享至少90%的同一性。在一方面,寡核苷酸包含至少一个连续的10个核碱基序列,其与SEQ ID NO:31、36、41、46、55、144、146、150、169、170、171、172、173、177、181、185、197、203、209、215、237、244、249、252、380、385、390、395、400、975、980、985、999、1088、1090、1094、1113、1114、1115、1116、1117、1121、1125、1129、1141、1147、1153、1159、1181、1188、1193、1196、1324、1329、1334、1339或1344、1339或1344中任一个的等长部分具有至少90%的同一性,其中核碱基序列的至少一个核苷键联是非天然键联。在一方面,核苷酸包含至少一个连续的11、12、13、14、15、16或17个核碱基序列,其与SEQID NO:31、36、41、46、55、144、146、150、169、170、171、172、173、177、181、185、197、203、209、215、237、244、249、252、380、385、390、395、400、975、980、985、999、1088、1090、1094、1113、1114、1115、1116、1117、1121、1125、1129、1141、1147、1153、1159、1181、1188、1193、1196、1324、1329、1334、1339或1344中任一个的等长部分共享至少90%的同一性。
本文另外公开了寡核苷酸,其包含与转录物的至少10个连续核碱基至少90%互补的核碱基序列,该转录物包含与SEQ ID NO:944至少90%同一性,或其连续的20至50个核碱基部分,其中核碱基序列的至少一个核苷键联是非天然键联。一方面,寡核苷酸包含至少一个连续的10个核碱基序列,其与SEQ ID NO:1-446或SEQ ID NO:894-918中任一个的等长部分共享90%的同一性。在一方面,寡核苷酸包含至少一个连续的11、12、13、14、15、16或17个核碱基序列,其与SEQ ID NO:1-446或SEQ ID NO:894-918中任一个的等长部分共享90%的同一性。在一方面,寡核苷酸包含至少一个连续的10个核碱基序列,其与SEQ ID NO:31、36、41、46、55、144、146、150、169、170、171、172、173、177、181、185、197、203、209、215、237、244、249、252、380、385、390、395、400、975、980、985、999、1088、1090、1094、1113、1114、1115、1116、1117、1121、1125、1129、1141、1147、1153、1159、1181、1188、1193、1196、1324、1329、1334、1339或1344中任一个的等长部分共享90%的同一性,其中核碱基序列的至少一个核苷键联是非天然键联。在一方面,寡核苷酸包含至少一个连续的11、12、13、14、15、16或17个核碱基序列,其与SEQ ID NO:31、36、41、46、55、144、146、150、169、170、171、172、173、177、181、185、197、203、209、215、237、244、249、252、380、385、390、395、400、975、980、985、999、1088、1090、1094、1113、1114、1115、1116、1117、1121、1125、1129、1141、1147、1153、1159、1181、1188、1193、1196、1324、1329、1334、1339或1344中任一个的等长部分共享90%的同一性。
本文另外公开了抑微管装配蛋白-2(STMN2)反义寡核苷酸,其包含与包含隐蔽外显子的STMN2转录物的连续10个核碱基序列至少90%互补的核酸序列,该转录物包含与SEQID NO:447至少90%相同的核苷酸序列或其连续的20至50个核碱基部分,其中核苷酸序列的至少一个核苷键联是非天然键联。本文还公开了抑微管装配蛋白-2(STMN2)反义寡核苷酸,其包含与SEQ ID NO:1-446中任一个的连续10个核碱基序列共享至少90%同一性的核酸序列,其中核苷酸序列至少一个核苷键联是非天然连接。在一方面,核酸序列与SEQ IDNO:1-446中任一个的连续11、12、13、14、15、16或17个核碱基序列共享至少90%的同一性。
本文另外公开了抑微管装配蛋白-2(STMN2)反义寡核苷酸,其包含与SEQ ID NO:31、36、41、46、55、144、146、150、169、170、171、172、173、177、181、185、197、203、209、215、237、244、249、252、380、385、390、395、400、975、980、985、999、1088、1090、1094、1113、1114、1115、1116、1117、1121、1125、1129、1141、1147、1153、1159、1181、1188、1193、1196、1324、1329、1334、1339或1344中任一个的连续10个核碱基序列共享至少90%同一性的核酸序列,其中核苷酸序列的至少一个核苷键联是非天然键联。在一方面,核酸序列与SEQ ID NO:31、36、41、46、55、144、146、150、169、170、171、172、173、177、181、185、197、203、209、215、237、244、249、252、380、385、390、395、400、975、980、985、999、1088、1090、1094、1113、1114、1115、1116、1117、1121、1125、1129、1141、1147、1153、1159、1181、1188、1193、1196、1324、1329、1334、1339或1344中任一个的连续11、12、13、14、15、16或17个核碱基序列共享至少90%同一性。
一般修改
虽然本文描述的某些化合物、组合物和方法已经根据某些实施方案进行了具体描述,以下实施例仅用于说明本文所述的化合物,并不意图对其进行限制。本申请中所列的参考文献、GenBank登录号等中的每一个均通过引用整体并入本文。
尽管本申请随附的序列表根据需要将每个序列标识为“RNA”或“DNA”,但实际上,这些序列可以用化学修饰的任何组合进行修饰。本领域技术人员将容易理解,在某些情况下,描述修饰的寡核苷酸的诸如“RNA”或“DNA”这样的名称是任意的。例如,包括包含2’-OH糖部分和胸腺嘧啶碱基的核苷的寡核苷酸可以描述为具有修饰糖(2’-OH代替DNA的一个2’-H)的DNA或具有修饰的碱基(胸腺嘧啶(甲基化尿嘧啶)代替RNA的尿嘧啶)的RNA。因此,本文提供的核酸序列,包括但不限于序列表中的那些,旨在涵盖含有天然或修饰的RNA和/或DNA的任何组合的核酸,包括但不限于具有修饰核碱基的核酸。作为进一步的实例且非限制性的,具有核碱基序列“ATCGATCG”的寡聚化合物涵盖具有此类核碱基序列的任何寡聚化合物,无论是修饰的还是未修饰的,包括但不限于含有RNA碱基的此类化合物,诸如具有序列“AUCGAUCG”的那些和具有一些DNA碱基和一些RNA碱基,诸如“AUCGATCG”的那些和具有其他修饰核碱基诸如“ATmCGAUCG”的寡聚化合物,其中mC表示在5位处包含甲基的胞嘧啶碱基。
本文所述的某些化合物(例如,修饰的寡核苷酸)具有一个或多个不对称中心并因此产生对映异构体、非对映异构体和其他立体异构体构型,其可以按照绝对立体化学定义为(R)或(S),诸如对于糖端基异构体为α或β,或诸如对于氨基酸为(D)或(L),等等。绘制或描述为具有某些立体异构构型的本文提供的化合物仅包括指定的化合物。除非另有说明,以未定义的立体化学绘制或描述的本文提供的化合物包括所有此类可能的异构体,包括它们的立体随机和光学纯形式。同样,除非另有说明,也包括本文化合物的所有互变异构形式。除非另有说明,本文所述的化合物旨在包括相应的盐形式。
本文所述的化合物包括其中一个或多个原子经指定元素的非放射性同位素或放射性同位素替换的变体。例如,本文中包含氢原子的化合物涵盖每个1H氢原子的所有可能的氘取代。由本文化合物涵盖的同位素取代包括但不限于:2H或3H代替1H、13C或14C代替12C、15N代替14N、17O或18O代替16O、以及33S、34S、35S或36S代替32S。在某些实施方案中,非放射性同位素取代可以赋予寡聚化合物新的特性,其有利于用作治疗或研究工具。
实施例
本公开通过以下实施例进一步说明。提供这些实施例仅为了说明目的,并且不应被解释为以任何方式限制本公开的范围或内容。
实施例1:STMN2反义寡核苷酸的初始设计和选择
设计并测试了与STMN2 RNA互补的反义寡核苷酸,以鉴定能够充当包括隐蔽外显子的STMN2转录物的抑制剂的STMN2反义寡核苷酸(AON)。
图1A-1C描绘了STMN2转录物的部分和设计用于靶向STMN2转录物的某些部分的STMN2反义寡核苷酸。具体而言,STMN2转录物的区域包括分支点(例如,分支点1、2和3)、3’剪接受体区域、ESE结合区域、TDP43结合位点和PolyA区域。STMN2反义寡核苷酸是根据STMN2反义寡核苷酸对应的STMN2转录物的位置来鉴定的。例如,图1A描绘了靶向STMN2转录物的36至60位的STMN2反义寡核苷酸,其包括分支点1。类似地,不同的STMN2反义寡核苷酸靶向STMN2转录物的144至178位,其包括分支点3。可以使用以上公开的任何序列(例如,SEQID NO:1-446、894-918、945-1390或1392-1432)设计其他STMN2反义寡核苷酸。
通常,STMN2反义寡核苷酸的长度为25个核苷酸。然而,STMN2反义寡核苷酸的变体也设计为具有不同长度(例如,23mers、21mers或19mers)。为测试而设计和开发的特定STMN2 AON和AON变体如下表7所示。
实施例2:评估STMN2反义寡核苷酸的方法
在SY5Y细胞和人运动神经元中评估STMN2反义寡核苷酸。具体而言,下面的实施例3、4和5描述了从SY5Y细胞中STMN2反义寡核苷酸的评估产生的结果。下面的实施例6和7描述了从人运动神经元中STMN2反义寡核苷酸的评估产生的结果。
在SY5Y细胞中评估了STMN2反义寡核苷酸。将细胞铺板在6孔或96孔板中并培养至80%汇合。用RNAiMax(Thermo Fisher Scientific,Waltham,MA,USA)转染TDP43的反义寡核苷酸(AON)以表达隐蔽外显子,从而阻止全长STMN2(STMN2-FL)产物的转录。单独用RNAiMax处理媒介物。阳性对照包括单独用TDP43 siRNA(“siRNA TDP43”)和/或单独用TDP43 AON(“AON TDP43”或“TDP43 AON”)处理的细胞。siRNA TDP43作为ON-TARGETplusHuman TARDBP(23435)siRNA –SMARTpool(#L-012394-00-0005)从Horizo n/Dharmacon购买。TARDBP(23435)siRNA包括四个单独的siRNA,靶向四个独立的序列:
1)靶序列1:GCUCAAGCAUGGAUUCUAA (SEQ ID NO:1439)
2)靶序列2:CAAUCAAGGUAGUAAUAUG(SEQ ID NO:1440)
3)靶序列3:GGGCUUCGCUACAGGAAUC(SEQ ID NO:1441)
4)靶序列4:CAGGGUGGAUUUGGUAAUA(SEQ ID NO:1442)
TDP43 AON是gapmer寡核苷酸,具有以下序列和化学性质:
5’A*A*G*G*C*T*T*C*A*T*A*T*T*G*T*A*C*T*T*T 3’(SEQ ID NO:1443)
其中*=硫代磷酸酯,下划线=DNA,其他=2’MOE RNA;每个“C”是5-MeC。
为了评估STMN2 AON恢复STMN2-FL的能力,STMN2的反义寡核苷酸与TDP43 AON在RNAiMax中共温育。96小时后,使用Taqman通过RT-qPCR检测转录水平(例如,STMN2全长转录物、具有隐蔽外显子的STMN2转录物或TDP43转录物)。具体而言,使用Thermofisher TaqMan基因表达检测Hs03929097_g1进行RT-qPCR检测GAPDH。使用以下引物序列进行RT-qPCR以检测具有隐蔽外显子的STMN2转录物:1)正向引物:5’-CTCAGTGCCTTATTCAGTCTTCTC-3’(SEQID NO:1444),2)反向引物:5’-TCTTCTGCCGAGTCCCATTT-3’(SEQ ID NO:1445)和3)探针:5’-/56-FAM/TCAGCGTCTGCACATCCCTACAAT/3BHQ_1/-3’(SEQ ID NO:1446)。使用以下引物序列进行RT-qPCR以检测全长STMN2转录物:1)正向引物:5’–CCACGAACTTTAGCTTCTCCA–3’(SEQID NO:1447),2)反向引物:5’–GCCAATTGTTTCAGCACCTG–3’(SEQ ID NO:1448),和3)探针:5’-/56-FAM/ACTTTCTTCTTTCCTCTGCAGCCTCC/3BHQ_1/-3’(SEQ ID NO:1449)。
在Applied7500实时PCR系统上进行RT-qPCR。进行一个在50℃的温度下持续5分钟的逆转录循环。进行一个在95℃的温度下持续20秒的RT灭活/初始变性循环。进行四十五个在95℃的温度下持续1秒,然后在60℃的温度下持续20秒的扩增循环。
将STMN2-FL或STMN2隐蔽信号(Ct)归一化至GAPDH(deltaCt)。为了可视化定量变化(例如,STMN-FL的%增加),将归一化的STMN2-FL信号进一步归一化至载体(仅用RNAiMax处理,deltadeltaCt)。使用方程RQ=2-deltadeltaCt计算转录水平的相对量,并用于描述治疗情况与正常健康水平(1.0)的比较。
使用以下方程计算具有隐蔽外显子的STMN2表达的百分比减少:
使用以下方程计算全长STMN2 mRNA转录物的百分比增加:
还在人运动神经元中评估了STMN2反义寡核苷酸在减少隐蔽外显子和增加STMN2全长转录物方面的效力。iCell人运动神经元(Cellular Dynamics International)在96孔板中以15x 103个细胞/孔接种,用于RT-qPCRRNA定量,或在6孔板中以3x 105个细胞/孔接种,用于western印迹法蛋白定量。制造商的说明。使用endoporter(GeneTools,LLC.)用TDP43 AON和/或STMN2AON转染神经元,或单独用endoporter处理神经元。在生物一式三份(qRT-PCR)或一式两份(western印迹法)孔中测试治疗情况。在此使用上述的相同TDP43AON用于评估人运动神经元。TDP43 AON是gapmer寡核苷酸,并具有以下序列和化学:
5’A*A*G*G*C*T*T*C*A*T*A*T*T*G*T*A*C*T*T*T 3’(SEQ ID NO:1443)
其中*=磷硫代酸盐,下划线=DNA,其他=2’MOE RNA;每个“C”是5-MeC。
72小时后,清洗反义寡核苷酸和endoporter并用新鲜培养基替换。在额外的72小时后,从96孔板中收集RNA用于RT-qPCR,或从6孔板中收集蛋白质用于western印迹法。分离RNA,生成cDNA,并使用taqman探针进行多重RT-qPCR测定,用于STMN2隐蔽外显子、STMN2全长转录物和参照GAPDH定量。如上文提及SY5Y细胞所述,用于检测GAPDH、具有隐蔽外显子的STMN2转录物和全长STMN2的相同引物,在此应用于进行对人运动神经元的RT-qPCR。对于蛋白质定量,将蛋白质收集物的可溶部分变性并通过SDS-PAGE分离,转移到聚偏二氟乙烯膜上并用针对GAPDH(Proteintech,60004-1-1g)、TDP-43(Proteintech,10782-2-AP)和抑微管装配蛋白-2(ThermoFisher,PA5-23049)的抗体探测。
测试了STMN2反义寡核苷酸在TDP43沉默细胞(例如SY5Y细胞和人运动神经元)中增加或恢复全长STMN2 mRNA(即从其翻译全长STMN2的mRNA)水平的能力。在某些情况下,测试了STMN2反义寡核苷酸减少具有隐蔽外显子的STMN2转录物的能力。如下文所进一步描述,根据对照组(例如,用500nM TDP43 AON处理的细胞)中STMN-FL和/或具有隐蔽外显子的STMN2转录物的水平,描述定量的STMN2-FL的百分比增加/恢复和/或具有隐蔽外显子的STMN2转录物的百分比减少。
实施例3:STMN2反义寡核苷酸在SY5Y细胞中恢复全长STMN2并减少具有隐蔽外显子的STMN2转录物
图1B和1C展示了STMN2 AON靶向具有隐蔽外显子的STMN2转录物不同区域的有效性。特别地,图1B描述了在SY5Y细胞中设计和评估的STMN2 AON。图1C描绘了在人运动神经元中设计和评估的STMN2 AON。与单独处理的TDP43 AON相比,用实线表示的STMN2 AON产生具有增加STMN2-FL mRNA表达超过50%的细胞。与单独处理的TDP43 AON相比,用虚线表示的STMN2 AON产生具有增加STMN2-FL(全长)mRNA小于50%的细胞。
关于图2,当用500nM TDP43 AON处理时,TDP43转录物减少了约52%,STMN2-FL减少了约57%。具有SEQ ID NO:36的STMN2 AON的500nM处理使TDP43水平增加了25%,并使STMN-FL水平增加了55%(挽救至67%)。具有SEQ ID NO:177的STMN2 AON的50nM和500nM处理分别使STMN-FL水平增加了58%(挽救至68%)和53%(挽救至66%)。具有SEQ ID NO:203的STMN2 AON的500nM处理使TDP43水平增加了15%以及STMN-FL水平增加了72%(挽救至74%)。具有SEQ ID NO:395的STMN2 AON的50nM和500nM处理分别使STMN-FL水平增加了49%(挽救至64%)和37%(挽救至59%)。虚线表示响应500nM TDP43 AON的FL-STMN2的表达水平。
关于图3,当用500nM TDP43 AON处理时,具有隐蔽外显子的STMN2转录物的数量增加超过20倍。具有SEQ ID NO:173的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了68%。具有SEQ ID NO:181的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了65%。具有SEQ ID NO:197的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了39%。具有SEQ ID NO:215的STMN2AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了31%。具有SEQ ID NO:385的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了53%。具有SEQ ID NO:400的STMN2 AON的500nM处理将具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了74%。虚线表示响应500nM TDP43AON的具有隐蔽外显子的STMN2的表达水平。
关于图4,当用500nM TDP43 AON处理时,STMN2-FL降低了约59%。具有SEQ ID NO:173的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到166%(挽救至68%)。具有SEQ ID NO:197的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到146%(挽救至60%)。虚线表示响应500nM TDP43AON的FL-STMN2的表达水平。
关于图5A,当用500nM TDP43 AON处理时,具有隐蔽外显子的STMN2转录物的数量增加超过36倍。具有SEQ ID NO:185的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了58%。具有SEQ ID NO:237的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了87%。具有SEQ ID NO:380的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了70%。具有SEQ ID NO:390的STMN2AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了58%。虚线表示响应500nM TDP43 AON的具有隐蔽外显子的STMN2的表达水平。
关于图5B,当用500nM TDP43 AON处理时,STMN2-FL降低了66%。具有SEQ ID NO:185的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到209%(挽救至71%)。具有SEQ ID NO:237的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到347%(挽救至118%)。虚线表示响应500nM TDP43AON的FL-STMN2的表达水平。
关于图6A,当用500nM TDP43 AON(两种不同的合成物)处理时,具有隐蔽外显子的STMN2转录物的数量增加超过20倍。具有SEQ ID NO:144的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低83%至88%。具有SEQ ID NO:237的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低92%至93%。虚线表示响应500nM TDP43 AON的具有隐蔽外显子的STMN2的表达水平。
关于图6B,当用500nM TDP43 AON处理时,STMN2-FL降低了约80%。具有SEQ IDNO:144的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到376%和429%之间(挽救至79%到90%之间)。具有SEQ ID NO:237的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到490%和538%之间(挽救至103%到113%)。虚线表示响应500nM TDP43 AON的FL-STMN2的表达水平。
关于图7A,当用500nM TDP43 AON处理时,具有隐蔽外显子的STMN2转录物的数量增加超过23倍。具有SEQ ID NO:173的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了83%。具有SEQ ID NO:177的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了83%。具有SEQ ID NO:181的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了72%。虚线表示响应500nM TDP43AON的具有隐蔽外显子的STMN2的表达水平。
关于图7B,当用500nM TDP43 AON处理时,STMN2-FL降低了约58%。具有SEQ IDNO:173的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到219%(挽救至92%)。具有SEQ IDNO:181的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到188%(挽救至79%)。具有SEQ IDNO:185的STMN2AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到174%(挽救至73%)。虚线表示响应500nM TDP43 AON的FL-STMN2的表达水平。
关于图8A,当用500nM TDP43 AON处理时,具有隐蔽外显子的STMN2转录物的数量增加超过20倍。具有SEQ ID NO:197的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了65%。具有SEQ ID NO:237的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了94%。虚线表示响应500nM TDP43 AON的具有隐蔽外显子的STMN2的表达水平。
关于图8B,当用500nM TDP43 AON处理时,STMN2-FL降低了59%。具有SEQ ID NO:197的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到185%(挽救至76%)。具有SEQ ID NO:237的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到227%(挽救至93%)。具有SEQ ID NO:380的STMN2AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到171%(挽救至70%)。虚线表示响应500nM TDP43 AON的FL-STMN2的表达水平。
关于图9A,当用500nM TDP43 AON处理时,具有隐蔽外显子的STMN2转录物的数量增加超过50倍。具有SEQ ID NO:144的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了92%。具有SEQ ID NO:173的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了82%。具有SEQ ID NO:237的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了96%。虚线表示响应500nM TDP43AON的具有隐蔽外显子的STMN2的表达水平。
关于图9B,当用500nM TDP43 AON处理时,STMN2-FL降低了67%。具有SEQ ID NO:144的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平提高到235%(挽救至87%)。具有SEQ ID NO:173的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平提高到232%(挽救至86%)。具有SEQ ID NO:237的STMN2AON的500nM处理使STMN-FL水平提高到243%(挽救至90%)。虚线表示响应500nM TDP43 AON的FL-STMN2的表达水平。
关于图10A,当用500nM TDP43 AON处理时,具有隐蔽外显子的STMN2转录物的数量增加超过65倍。具有SEQ ID NO:181的STMN2 AON的200nM处理将具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了50%。具有SEQ ID NO:181的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了73%。关于图10B,当用500nM TDP43 AON处理时,STMN2-FL降低了67%。具有SEQ ID NO:181的STMN2 AON的50nM处理使STMN-FL水平增加到215%(挽救至71%)。具有SEQ ID NO:181的STMN2 AON的200nM处理使STMN-FL水平增加到197%(挽救至65%)。具有SEQ ID NO:181的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到194%(挽救至64%)。
关于图11A,当用500nM TDP43 AON处理时,具有隐蔽外显子的STMN2转录物的数量增加超过26倍。具有SEQ ID NO:185的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了47%。关于图11B,当用500nM TDP43 AON处理时,STMN2-FL降低了74%。具有SEQ ID NO:185的STMN2 AON的50nM处理使STMN-FL水平增加到173%(挽救至45%)。具有SEQ ID NO:185的STMN2 AON的200nM处理使STMN-FL水平增加到346%(挽救至90%)。具有SEQ ID NO:185的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到265%(挽救至69%)。
关于图12A,当用500nM TDP43 AON处理时,具有隐蔽外显子的STMN2转录物的数量增加超过41倍。具有SEQ ID NO:197的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了51%。关于图12B,当用500nM TDP43 AON处理时,STMN2-FL降低了65%。具有SEQ ID NO:197的STMN2 AON的20nM处理使STMN-FL水平增加到186%(挽救至65%)。具有SEQ ID NO:197对STMN2 AON进行50nM处理使STMN-FL水平增加到231%(挽救至81%)。具有SEQ ID NO:197的STMN2 AON的200nM处理将STMN-FL水平提高到254%(挽救至89%)。具有SEQ ID NO:197对STMN2AON进行500nM处理使STMN-FL水平增加到269%(挽救至94%)。
关于图13A,当用500nM TDP43 AON处理时,具有隐蔽外显子的STMN2转录物的数量增加超过41倍。具有SEQ ID NO:144的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了93%。关于图13B,当用500nM TDP43 AON处理时,STMN2-FL降低了84%。具有SEQ ID NO:144的STMN2 AON的50nM处理使STMN-FL水平增加到175%(挽救至28%)。具有SEQ ID NO:144的STMN2 AON的200nM处理将STMN-FL水平增加到360%(挽救至57%)。具有SEQ ID NO:144的STMN2 AON的500nM处理将STMN-FL水平增加到544%(挽救至87%)。
关于图14A,当用500nM TDP43 AON处理时,具有隐蔽外显子的STMN2转录物的数量增加超过70倍。具有SEQ ID NO:173的STMN2 AON的200nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了59%。具有SEQ ID NO:173的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了70%。关于图14B,当用500nM TDP43 AON处理时,STMN2-FL降低了62%。具有SEQ ID NO:173的STMN2 AON的200nM处理使STMN-FL水平增加了100%(挽救至76%)。具有SEQ ID NO:173的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加了158%(挽救至98%)。
关于图15A,当用500nM TDP43 AON处理时,具有隐蔽外显子的STMN2转录物的数量增加超过70倍。具有SEQ ID NO:237的STMN2 AON的200nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了78%。具有SEQ ID NO:237的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了92%。关于图15B,当用500nM TDP43 AON处理时,STMN2-FL降低了77%。具有SEQ ID NO:237的STMN2 AON的50nM处理使STMN-FL水平增加到187%(挽救至43%)。具有SEQ ID NO:237的STMN2 AON的200nM处理使STMN-FL水平增加到235%(挽救至54%)。具有SEQ ID NO:237的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到309%(挽救至71%)。
关于图16,当用500nM TDP43 AON处理时,STMN2-FL降低了44%。具有SEQ ID NO:173的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到152%。具有SEQ ID NO:237的STMN2AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到134%。
关于图17A,当用500nM TDP43 AON处理时,具有隐蔽外显子的STMN2转录物的数量增加超过30倍。具有SEQ ID NO:237的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了96%。具有SEQ ID NO:912的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了97%。具有SEQ ID NO:913的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了97%。具有SEQ ID NO:916的STMN2AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了71%。
关于图17B,当用500nM TDP43 AON处理时,STMN2-FL降低了76%。具有SEQ ID NO:237的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到338%(挽救至81%)。具有SEQ ID NO:912的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到163%(挽救至39%)。具有SEQ ID NO:915的STMN2AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到196%(挽救至47%)。具有SEQ ID NO:916的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到225%(挽救至54%)。
关于图18A,当用500nM TDP43 AON处理时,具有隐蔽外显子的STMN2转录物的数量增加超过19倍。具有SEQ ID NO:185的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了83%。具有SEQ ID NO:908的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了85%。具有SEQ ID NO:910的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了78%。具有SEQ ID NO:911的STMN2AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了78%。
关于图18B,当用500nM TDP43 AON处理时,STMN2-FL降低了82%。具有SEQ ID NO:185的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到261%(挽救至47%)。具有SEQ ID NO:908的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到244%(挽救至44%)。具有SEQ ID NO:909的STMN2AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到228%(挽救至41%)。具有SEQ ID NO:910的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到244%(挽救至44%)。具有SEQ ID NO:911的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到283%(挽救至51%)。
关于图19A,当用500nM TDP43 AON处理时,具有隐蔽外显子的STMN2转录物的数量增加超过23倍。具有SEQ ID NO:173的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了81%。具有SEQ ID NO:901的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了86%。具有SEQ ID NO:904的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了81%。具有SEQ ID NO:906的STMN2AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了75%。
关于图19B,当用500nM TDP43 AON处理时,STMN2-FL降低了83%。具有SEQ ID NO:173的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到365%(挽救至62%)。具有SEQ ID NO:901的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到306%(挽救至52%)。具有SEQ ID NO:904的STMN2AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到312%(挽救至53%)。具有SEQ ID NO:905的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到188%(挽救至32%)。具有SEQ ID NO:906的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到288%(挽救至49%)。
关于图20A,当用500nM TDP43 AON处理时,具有隐蔽外显子的STMN2转录物的数量增加超过35倍。具有SEQ ID NO:237的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了91%。增加SEQ ID NO:912的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了94%。增加SEQ ID NO:913的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了96%。增加SEQ ID NO:917的STMN2AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了82%。增加SEQ ID NO:918的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了38%。具有SEQ ID NO:914的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了33%。
关于图20B,当用500nM TDP43 AON处理时,STMN2-FL降低了80%。具有SEQ ID NO:237的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到425%(挽救至85%)。具有SEQ ID NO:912的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到450%(挽救至90%)。具有SEQ ID NO:918的STMN2AON的500nM处理使STMN-FL水平增加到205%(挽救至41%)。
关于图21A,当用500nM TDP43 AON处理时,具有隐蔽外显子的STMN2转录物的数量增加超过11倍。具有SEQ ID NO:173的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了72%。具有SEQ ID NO:902的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了85%。具有SEQ ID NO:903的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了55%。具有SEQ ID NO:1417的STMN2AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了49%。具有SEQ ID NO:1418的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了57%。
关于图21B,当用500nM TDP43 AON处理时,STMN2-FL降低了73%。具有SEQ ID NO:173的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加了85%(挽救至50%)。具有SEQ ID NO:903的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加了85%(挽救至50%)。具有SEQ ID NO:1417的STMN2AON的500nM处理使STMN-FL水平增加了74%(挽救至47%)。具有SEQ ID NO:1418的STMN2 AON的500nM处理将STMN-FL水平增加了89%(挽救至51%)。
关于图22A,当用500nM TDP43 AON处理时,具有隐蔽外显子的STMN2转录物的数量增加超过13倍。具有SEQ ID NO:144的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了91%。具有SEQ ID NO:896的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了80%。具有SEQ ID NO:894的STMN2 AON的500nM处理使具有隐蔽外显子的STMN2转录物水平降低了85%。
关于图22B,当用500nM TDP43 AON处理时,STMN2-FL降低了65%。具有SEQ ID NO:144的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加了94%(挽救至68%)。具有SEQ ID NO:896的STMN2 AON的500nM处理使STMN-FL水平增加了114%(挽救至75%)。
实施例4:证明STMN2反义寡核苷酸在SY5Y细胞中恢复全长STMN2并减少具有隐蔽外显子的STMN2转录物的额外实验
图25A是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的RT-qPCR分析结果,以及使用不同QSN-144STMN2 AON和AON变体的具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。图25B是条形图,其显示了在TDP43siRNA和TDP43反义物存在下TDP43和STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析结果,以及使用不同QSN-144STMN2 AON和AON变体的全长STMN2转录物的恢复。特别地,测试的STMN2 AON和AON变体包括:QSN-144(SEQ ID NO:144)、QSN-144-2/3(SEQ ID NO:895)、QSN-144-4/3(SEQID NO:899)、QSN-144-2/5(SEQ ID NO:896)、QSN-144-1/5 1/3(SEQ ID NO:894)、QSN-144-2/5 2/3(SEQ ID NO:897)、QSN-144-3/5 3/3(SEQ ID NO:898)、QSN-144-po3(SEQ ID NO:1419)和QSN-144-po5(SEQ ID NO:1420)。
用500nM TDP43 AON处理导致具有隐蔽外显子的STMN2转录物41.7倍的增加和70%STMN2-FL的降低。响应每个分别的STMN2和AON变体的500nM处理的具有隐蔽外显子的STMN2转录物的百分比减少和全长STMN2的百分比增加显示在表8中。
表8:QSN-144STMN2 AON和QSN-144AON变体的500nM处理的效果
图26A是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的RT-qPCR分析结果,以及使用不同QSN-173STMN2 AON和AON变体的具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。图26B是条形图,其显示了在TDP43siRNA和TDP43反义物存在下TDP43和STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析结果,以及使用不同QSN-173STMN2 AON和AON变体的全长STMN2转录物的恢复。特别地,测试的STMN2 AON和AON变体包括:QSN-173(SEQ ID NO:173)、QSN-173-2/3(SEQ ID NO:901)、QSN-173-4/3(SEQID NO:904)、QSN-173-6/3(SEQ ID NO:906)、QSN-173-4/5(SEQ ID NO:905)、QSN-173-2/5(SEQ ID NO:902)、QSN-173-6/5(SEQ ID NO:907)、QSN-173-2/5 2/3(SEQ ID NO:903)、QSN-173-po3(SEQ ID NO:1417)和QSN-173-po5(SEQ ID NO:1418)。用500nM TDP43 AON处理导致具有隐蔽外显子的STMN2转录物15.4倍的增加和71%STMN2-FL的降低。响应每个分别的STMN2和AON变体的500nM处理的具有隐蔽外显子的STMN2转录物的百分比减少和全长STMN2的百分比增加显示在表9中。
表9:QSN-173STMN2 AON和QSN-173AON变体的500nM处理的效果。
图27A是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的RT-qPCR分析结果,以及使用不同QSN-185STMN2 AON和AON变体的具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。图27B是条形图,其显示了在TDP43siRNA和TDP43反义物存在下TDP43和STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析结果,以及使用不同QSN-185STMN2 AON和AON变体的全长STMN2转录物的恢复。特别地,测试的STMN2 AON和AON变体包括:QSN-185(SEQ ID NO:185)、QSN-185-2/5(SEQ ID NO:908)、QSN-185-4/5(SEQID NO:910)、QSN-185-6/5(SEQ ID NO:911)、QSN-185-4/3(SEQ ID NO:909)、QSN-185-po3(SEQ ID NO:1421)和QSN-185-po5(SEQ ID NO:1422)。用500nM TDP43 AON处理导致具有隐蔽外显子的STMN2转录物32.1倍的增加和71%的STMN2-FL降低。响应每个分别的STMN2和AON变体的500nM处理的具有隐蔽外显子的STMN2转录物的百分比减少和全长STMN2的百分比增加显示在表10中。
表10:QSN-185STMN2 AON和QSN-185AON变体的500nM处理的效果。
图28A是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的RT-qPCR分析结果,以及使用不同的QSN-237STMN2 AON和AON变体的具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。图28B是条形图,其显示了在TDP43siRNA和TDP43反义物存在下TDP43和STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析结果,以及使用不同QSN-237STMN2 AON和AON变体的全长STMN2转录物的恢复。特别地,测试的STMN2 AON和AON变体包括:QSN-237(SEQ ID NO:237)、QSN-237-2/3(SEQ ID NO:912)、QSN-237-4/3(SEQID NO:915)、QSN-237-2/5(SEQ ID NO:913)、QSN-237-4/5(SEQ ID NO:916)、QSN-237-6/3(SEQ ID NO:917)、QSN-237-6/5(SEQ ID NO:918)、QSN-237-2/5 2/3(SEQ ID NO:914)、QSN-237-po3(SEQ ID NO:1423)和QSN-237-po5(SEQ ID NO:1424)。用500nM TDP43 AON处理导致具有隐蔽外显子的STMN2转录物15.7倍的增加和65%STMN2-FL的降低。响应每个分别的STMN2和AON变体的500nM处理的具有隐蔽外显子的STMN2转录物的百分比减少和全长STMN2的百分比增加显示在表11中。
表11:QSN-237STMN2 AON和QSN-237AON变体的500nM处理的效果。
图29A是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的RT-qPCR分析结果,以及使用不同STMN2 AON(QSN-31、QSN-41和QSN-46)的具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。图29B是条形图,其显示了在TDP43 siRNA和TDP43反义物存在下TDP43和STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析结果,以及使用不同STMN2 AON(QSN-31、QSN-41和QSN-46)的全长STMN2转录物的恢复。特别地,测试的STMN2 AON和AON变体包括:QSN-31(SEQ ID NO:31)、QSN-41(SEQ ID NO:41)和QSN-46(SEQID NO:46)。用500nM TDP43 AON处理导致具有隐蔽外显子的STMN2转录物10.4倍的增加和59%STMN2-FL的降低。响应每个分别的STMN2和AON变体的500nM处理的具有隐蔽外显子的STMN2转录物的百分比减少和全长STMN2的百分比增加显示在表12中。
表12:QSN-31、QSN-41和QSN-46STMN2 AON的500nM处理的效果。
实施例5:使用抑微管装配蛋白-2隐性剪接调控物的全长STMN2 mRNA和STMN2蛋白的剂量响应恢复
如前所述在人神经母细胞瘤SY5Y细胞中进行实验。将细胞铺板在6孔或96孔板中并培养至80%汇合。使用对TDP43的AON敲低细胞中TDP-43表达以表达隐蔽外显子,从而阻止全长STMN2(STMN2-FL)产物的转录。此外,以不同剂量(5nM、50nM、100nM、200nM和500nM)用STMN2 ASO(具体地,QSN-237-2/3(SEQ ID NO:912))共转染细胞。分离RNA和蛋白质用于QPCR和western印迹法分析。
图23显示了剂量反应曲线,说明随着STMN2 AON浓度的增加,全长STMN2转录物的恢复增加。通常,增加的STMN2 AON浓度增加了全长STMN2 mRNA,降低了隐蔽外显子水平。具体地,STMN2 ASO的5nM处理导致全长STMN2转录物约40%的恢复。STMN2 ASO的500nM处理导致全长STMN2转录物的接近100%恢复。此外,STMN2 ASO的500nM处理导致隐蔽外显子的显著减少(接近0%)。
图24A显示了证明全长STMN2蛋白响应更高浓度的STMN2 AON的定性增加的Western印迹测定法。图24B显示了响应不同浓度的STMN2 AON的归一化至GAPDH的全长STMN2蛋白的定量水平。一般来说,图24A和24B两者都显示了增加的STMN2 AON浓度导致增加的全长STMN2蛋白浓度。具体地,如图24B所示,较低的STMN2 AON浓度(5nM和50nM)导致约对照组(仅细胞)60%的全长STMN2蛋白浓度。值得注意的是,STMN2 ASO的500nM处理导致全长STMN2蛋白接近100%恢复(与仅细胞对照组相比)。
实施例6:化疗诱导的神经病作为可以被抑微管装配蛋白-2隐蔽剪接调节剂靶向的适应症
关于图30,它展示了条形图,其显示使用QSN-237STMN2反义寡核苷酸的人运动神经元中隐蔽外显子诱导的逆转,即使考虑到增加的蛋白酶体抑制。作为对照,单独用endoporter(无AON)处理并且然后随后用MG132(在所有浓度的MG132中)处理的细胞展现出高的隐蔽外显子水平。这是人运动神经元中由蛋白酶体抑制诱导的TDP-43病理学的指示物。MG132导致TDP43错误定位,其导致STMN2错误剪接和增加的隐蔽外显子表达。添加QSN-237(SEQ ID NO:237)反义寡核苷酸以高效力(IC50<5nM)逆转隐蔽外显子诱导。如图所示。如图30所示,增加的QSN-237浓度(从5nM到500nM的范围)显著降低了隐蔽外显子相对数量。
总体而言,该数据建立了QSN-237反义寡核苷酸(SEQ ID NO:237)防护隐蔽外显子表达的蛋白毒性压力诱导。这适用于保护神经元免受由其他疗法(诸如化学疗法)导致的蛋白毒性压力的环境。
实施例7:STMN2反义寡核苷酸在人运动神经元中恢复全长STMN2并减少具有隐蔽外显子的STMN2转录物
图31A和图31B显示的条形图显示了具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平和STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析结果,其证明了使用不同的STMN2 AON和AON变体的具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低和全长STMN2转录物的恢复。特别地,测试的STMN2 AON和AON变体包括:QSN-36(SEQ ID NO:36)、QSN-55(SEQ ID NO:55)、QSN-144(SEQID NO:144)、QSN-144-2/5(SEQ ID NO:896)、QSN-173(SEQ ID NO:173)、QSN-173-2/5-2/3(SEQ ID NO:903)、QSN-237(SEQ ID NO:237)、QSN-237-2/3(SEQ ID NO:912)、QSN 185(SEQID NO:185)、QSN-185-2/5(SEQ ID NO:908)和QSN-252(SEQ ID NO:252)。
表13显示了STMN2 AON对具有隐蔽外显子的STMN2的表达水平的剂量依赖性影响(百分比降低)。此外,表14显示了STMN2 AON对全长STMN2转录物水平恢复的剂量依赖性影响。
表13:STMN2 AON对具有隐蔽外显子的STMN2表达水平的剂量依赖性影响。值显示为具有隐蔽外显子的STMN2的表达水平相对于衍生自经500nM TDP43 AON处理的细胞的相应值的百分比降低。
剂量 | QSN-237 | QSN-237-2-3p | QSN-185 | QSN-185-2-5p | QSN-252 |
5 | 99 | 98 | 11 | -1 | 22 |
20 | 99 | 100 | 28 | 10 | 28 |
50 | 100 | 100 | 28 | 44 | 71 |
200 | 100 | 100 | 42 | 71 | 95 |
500 | 100 | 100 | 66 | 86 | 98 |
表14:STMN2 AON对全长STMN2转录物表达水平的剂量依赖性影响。
图32是显示STMN2蛋白水平的western印迹法分析结果的条形图,其证明了使用不同STMN2 AON和AON变体的全长STMN2蛋白的恢复。特别地,测试的STMN2 AON和AON变体包括:QSN-144(SEQ ID NO:144)、QSN-144-2/5(SEQ ID NO:896)、QSN-173(SEQ ID NO:173)、QSN-173-2/5-2/3(SEQ ID NO:903)、QSN-185(SEQ ID NO:185)、QSN-185-2/5(SEQ ID NO:908)、QSN-237(SEQ ID NO:237)和QSN-237-2/3(SEQ ID NO:912)。
下面的表15显示了STMN2蛋白相对于对照组(endoporter和TDP43 ASO)的表达水平。STMN2 AON和AON变体中的每一个增加了与TDP43 ASO相关的STMN2蛋白的表达水平。在某些情况下,STMN2 AON(例如,QSN-144和QSN-173)和AON变体(例如,QSN-173-2/5-2/3)使STMN2蛋白的表达水平恢复到高于endoporter对照的水平。
表15:用STMN2 AON或AON变体处理的人运动神经元的全长STMN2表达。
组 | endoporter的百分比 |
Endoporter | 100 |
TDP43ASO | 40 |
QSN-144 | 113 |
QSN-144-2/5 | 87 |
QSN-173 | 206 |
QSN-173-2/5-2/3 | 131 |
QSN-185 | 82 |
QSN-185-2/5 | 71 |
QSN-237 | 76 |
QSN-237-2/3 | 65 |
图33A是显示了响应使用不同STMN2 AON处理的人运动神经元中具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA表达的RT-qPCR分析结果的条形图。图33B是显示了响应使用不同STMN2AON处理的STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析结果的条形图。特别地,测试的STMN2 AON包括:QSN-31(SEQ ID NO:31)、QSN-41(SEQ ID NO:41)和QSN-46(SEQ ID NO:46)。
表16显示了STMN2 AON对具有隐蔽外显子的STMN2的表达水平的剂量依赖性影响(降低百分比)。此外,表17显示了STMN2 AON对全长STMN2转录物水平的恢复的剂量依赖性影响。
表16:STMN2 AON对具有隐蔽外显子的STMN2的表达水平的剂量依赖性影响。值显示为具有隐蔽外显子的STMN2的表达水平相对于衍生自经500nM TDP43 AON处理的细胞的相应值的百分比降低。
剂量 | QSN-31 | QSN-41 | QSN-46 |
5 | -62 | -19 | 27 |
20 | -26 | 18 | 57 |
50 | -12 | 45 | 57 |
200 | -60 | 17 | 44 |
500 | -36 | -7 | 18 |
表17:STMN2 AON对全长STMN2转录物的表达水平的剂量依赖性影响。
图34A、34C和34E是显示人运动神经元中具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA表达的RT-qPCR分析结果的条形图,其证明了使用不同STMN2AON的具有隐蔽外显子的STMN2转录物mRNA水平的降低。图34B、34D和34F是显示STMN2全长mRNA水平的RT-qPCR分析结果的条形图,其证明了使用不同STMN2 AON的全长STMN2转录物的恢复。特别地,测试的STMN2 AON包括:QSN-146(SEQ ID NO:146)、QSN-150(SEQ ID NO:150)、QSN-169(SEQ ID NO:169)、QSN-170(SEQ ID NO:170)、QSN-171(SEQ ID NO:171)、QSN-172(SEQ ID NO:172)和QSN-249(SEQID NO:249)。虚线表示仅500nM TDP43 ASO的表达水平。
表18显示了STMN2 AON对具有隐蔽外显子的STMN2的表达水平的剂量依赖性影响(百分比降低)。此外,表19显示了STMN2 AON对全长STMN2转录物水平的恢复的剂量依赖性影响。
表18:STMN2 AON对具有隐蔽外显子的STMN2表达水平的剂量依赖性影响。值显示为具有隐蔽外显子的STMN2的表达水平相对于衍生自经500nM TDP43 AON处理的细胞的相应值的百分比降低。
剂量 | QSN-146 | QSN-150 | QSN-169 | QSN-170 | QSN-171 | QSN-172 | QSN-249 |
5 | 2 | 18 | 4 | 8 | 14 | 20 | -1 |
20 | 33 | 40 | 50 | -10 | 29 | 18 | 19 |
50 | 34 | 62 | 27 | 47 | 20 | 20 | 35 |
200 | 83 | 87 | 77 | 64 | 76 | 71 | 80 |
500 | 66 | 82 | 92 | 53 | 77 | 75 | 92 |
表19:STMN2 AON对全长STMN2转录物的表达水平的剂量依赖性影响
通过引用并入
出于所有目的,本文引用的专利文件和科学文章中的每一篇的全部公开通过引用并入。
等同物
本公开可以以其他特定形式实施而不偏离其基本特征。因此,将认为前述实施方案是说明性的,而不是对本文描述的公开的限制。本公开的范围由所附权利要求而不是由前述描述表明,并且落入权利要求的等同的意义和范围内的所有变化都意图包含在其中。
序列表
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<120> 寡核苷酸和用于治疗神经学疾病的方法
<130> QRL-002WO
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<150> 62/856,264
<151> 2019-06-03
<160> 1449
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 25
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<213> 人工序列
<220>
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寡核苷酸
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aagacataat accagagctt accag 25
<210> 26
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 26
taagacataa taccagagct tacca 25
<210> 27
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 27
ttaagacata ataccagagc ttacc 25
<210> 28
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 28
gttaagacat aataccagag cttac 25
<210> 29
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 29
tgttaagaca taataccaga gctta 25
<210> 30
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 30
atgttaagac ataataccag agctt 25
<210> 31
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 31
aatgttaaga cataatacca gagct 25
<210> 32
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 32
aaatgttaag acataatacc agagc 25
<210> 33
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 33
aaaatgttaa gacataatac cagag 25
<210> 34
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 34
aaaaatgtta agacataata ccaga 25
<210> 35
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 35
taaaaatgtt aagacataat accag 25
<210> 36
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 36
ttaaaaatgt taagacataa tacca 25
<210> 37
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 37
tttaaaaatg ttaagacata atacc 25
<210> 38
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 38
atttaaaaat gttaagacat aatac 25
<210> 39
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 39
gatttaaaaa tgttaagaca taata 25
<210> 40
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 40
agatttaaaa atgttaagac ataat 25
<210> 41
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 41
tagatttaaa aatgttaaga cataa 25
<210> 42
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 42
atagatttaa aaatgttaag acata 25
<210> 43
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 43
catagattta aaaatgttaa gacat 25
<210> 44
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 44
ccatagattt aaaaatgtta agaca 25
<210> 45
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 45
accatagatt taaaaatgtt aagac 25
<210> 46
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 46
taccatagat ttaaaaatgt taaga 25
<210> 47
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 47
ttaccataga tttaaaaatg ttaag 25
<210> 48
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 48
attaccatag atttaaaaat gttaa 25
<210> 49
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 49
gattaccata gatttaaaaa tgtta 25
<210> 50
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 50
agattaccat agatttaaaa atgtt 25
<210> 51
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 51
aagattacca tagatttaaa aatgt 25
<210> 52
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 52
aaagattacc atagatttaa aaatg 25
<210> 53
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 53
taaagattac catagattta aaaat 25
<210> 54
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 54
gtaaagatta ccatagattt aaaaa 25
<210> 55
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 55
tgtaaagatt accatagatt taaaa 25
<210> 56
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 56
ttgtaaagat taccatagat ttaaa 25
<210> 57
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 57
tttgtaaaga ttaccataga tttaa 25
<210> 58
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 58
ttttgtaaag attaccatag attta 25
<210> 59
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 59
attttgtaaa gattaccata gattt 25
<210> 60
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 60
tattttgtaa agattaccat agatt 25
<210> 61
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 61
atattttgta aagattacca tagat 25
<210> 62
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 62
aatattttgt aaagattacc ataga 25
<210> 63
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 63
aaatattttg taaagattac catag 25
<210> 64
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 64
aaaatatttt gtaaagatta ccata 25
<210> 65
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 65
taaaatattt tgtaaagatt accat 25
<210> 66
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 66
gtaaaatatt ttgtaaagat tacca 25
<210> 67
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 67
agtaaaatat tttgtaaaga ttacc 25
<210> 68
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 68
aagtaaaata ttttgtaaag attac 25
<210> 69
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 69
gaagtaaaat attttgtaaa gatta 25
<210> 70
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 70
ggaagtaaaa tattttgtaa agatt 25
<210> 71
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 71
cggaagtaaa atattttgta aagat 25
<210> 72
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 72
tcggaagtaa aatattttgt aaaga 25
<210> 73
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 73
ttcggaagta aaatattttg taaag 25
<210> 74
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 74
gttcggaagt aaaatatttt gtaaa 25
<210> 75
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 75
agttcggaag taaaatattt tgtaa 25
<210> 76
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 76
gagttcggaa gtaaaatatt ttgta 25
<210> 77
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 77
tgagttcgga agtaaaatat tttgt 25
<210> 78
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 78
atgagttcgg aagtaaaata ttttg 25
<210> 79
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 79
tatgagttcg gaagtaaaat atttt 25
<210> 80
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 80
atatgagttc ggaagtaaaa tattt 25
<210> 81
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 81
tatatgagtt cggaagtaaa atatt 25
<210> 82
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 82
gtatatgagt tcggaagtaa aatat 25
<210> 83
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 83
ggtatatgag ttcggaagta aaata 25
<210> 84
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 84
aggtatatga gttcggaagt aaaat 25
<210> 85
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 85
caggtatatg agttcggaag taaaa 25
<210> 86
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 86
ccaggtatat gagttcggaa gtaaa 25
<210> 87
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 87
cccaggtata tgagttcgga agtaa 25
<210> 88
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 88
ccccaggtat atgagttcgg aagta 25
<210> 89
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 89
tccccaggta tatgagttcg gaagt 25
<210> 90
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 90
atccccaggt atatgagttc ggaag 25
<210> 91
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 91
aatccccagg tatatgagtt cggaa 25
<210> 92
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 92
aaatccccag gtatatgagt tcgga 25
<210> 93
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 93
aaaatcccca ggtatatgag ttcgg 25
<210> 94
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 94
taaaatcccc aggtatatga gttcg 25
<210> 95
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 95
ataaaatccc caggtatatg agttc 25
<210> 96
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 96
aataaaatcc ccaggtatat gagtt 25
<210> 97
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 97
taataaaatc cccaggtata tgagt 25
<210> 98
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 98
gtaataaaat ccccaggtat atgag 25
<210> 99
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 99
agtaataaaa tccccaggta tatga 25
<210> 100
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 100
gagtaataaa atccccaggt atatg 25
<210> 101
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 101
agagtaataa aatccccagg tatat 25
<210> 102
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 102
cagagtaata aaatccccag gtata 25
<210> 103
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 103
ccagagtaat aaaatcccca ggtat 25
<210> 104
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 104
cccagagtaa taaaatcccc aggta 25
<210> 105
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 105
tcccagagta ataaaatccc caggt 25
<210> 106
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 106
ttcccagagt aataaaatcc ccagg 25
<210> 107
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 107
attcccagag taataaaatc cccag 25
<210> 108
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 108
aattcccaga gtaataaaat cccca 25
<210> 109
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 109
taattcccag agtaataaaa tcccc 25
<210> 110
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 110
ataattccca gagtaataaa atccc 25
<210> 111
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 111
cataattccc agagtaataa aatcc 25
<210> 112
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 112
acataattcc cagagtaata aaatc 25
<210> 113
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 113
cacataattc ccagagtaat aaaat 25
<210> 114
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 114
acacataatt cccagagtaa taaaa 25
<210> 115
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 115
aacacataat tcccagagta ataaa 25
<210> 116
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 116
gaacacataa ttcccagagt aataa 25
<210> 117
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 117
agaacacata attcccagag taata 25
<210> 118
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 118
cagaacacat aattcccaga gtaat 25
<210> 119
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 119
gcagaacaca taattcccag agtaa 25
<210> 120
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 120
ggcagaacac ataattccca gagta 25
<210> 121
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 121
gggcagaaca cataattccc agagt 25
<210> 122
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 122
ggggcagaac acataattcc cagag 25
<210> 123
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 123
tggggcagaa cacataattc ccaga 25
<210> 124
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 124
atggggcaga acacataatt cccag 25
<210> 125
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 125
gatggggcag aacacataat tccca 25
<210> 126
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 126
tgatggggca gaacacataa ttccc 25
<210> 127
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 127
gtgatggggc agaacacata attcc 25
<210> 128
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 128
agtgatgggg cagaacacat aattc 25
<210> 129
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 129
gagtgatggg gcagaacaca taatt 25
<210> 130
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 130
agagtgatgg ggcagaacac ataat 25
<210> 131
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 131
gagagtgatg gggcagaaca cataa 25
<210> 132
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 132
agagagtgat ggggcagaac acata 25
<210> 133
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 133
gagagagtga tggggcagaa cacat 25
<210> 134
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 134
agagagagtg atggggcaga acaca 25
<210> 135
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 135
aagagagagt gatggggcag aacac 25
<210> 136
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 136
taagagagag tgatggggca gaaca 25
<210> 137
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 137
ttaagagaga gtgatggggc agaac 25
<210> 138
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 138
attaagagag agtgatgggg cagaa 25
<210> 139
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 139
aattaagaga gagtgatggg gcaga 25
<210> 140
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 140
caattaagag agagtgatgg ggcag 25
<210> 141
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 141
ccaattaaga gagagtgatg gggca 25
<210> 142
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 142
tccaattaag agagagtgat ggggc 25
<210> 143
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 143
atccaattaa gagagagtga tgggg 25
<210> 144
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 144
aatccaatta agagagagtg atggg 25
<210> 145
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 145
aaatccaatt aagagagagt gatgg 25
<210> 146
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 146
aaaatccaat taagagagag tgatg 25
<210> 147
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 147
aaaaatccaa ttaagagaga gtgat 25
<210> 148
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 148
taaaaatcca attaagagag agtga 25
<210> 149
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 149
ttaaaaatcc aattaagaga gagtg 25
<210> 150
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 150
tttaaaaatc caattaagag agagt 25
<210> 151
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 151
ttttaaaaat ccaattaaga gagag 25
<210> 152
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 152
attttaaaaa tccaattaag agaga 25
<210> 153
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 153
aattttaaaa atccaattaa gagag 25
<210> 154
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 154
taattttaaa aatccaatta agaga 25
<210> 155
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 155
ataattttaa aaatccaatt aagag 25
<210> 156
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 156
tataatttta aaaatccaat taaga 25
<210> 157
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 157
atataatttt aaaaatccaa ttaag 25
<210> 158
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 158
aatataattt taaaaatcca attaa 25
<210> 159
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 159
gaatataatt ttaaaaatcc aatta 25
<210> 160
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 160
tgaatataat tttaaaaatc caatt 25
<210> 161
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 161
atgaatataa ttttaaaaat ccaat 25
<210> 162
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 162
tatgaatata attttaaaaa tccaa 25
<210> 163
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 163
atatgaatat aattttaaaa atcca 25
<210> 164
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 164
aatatgaata taattttaaa aatcc 25
<210> 165
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 165
caatatgaat ataattttaa aaatc 25
<210> 166
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 166
gcaatatgaa tataatttta aaaat 25
<210> 167
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 167
tgcaatatga atataatttt aaaaa 25
<210> 168
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 168
ctgcaatatg aatataattt taaaa 25
<210> 169
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 169
cctgcaatat gaatataatt ttaaa 25
<210> 170
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 170
tcctgcaata tgaatataat tttaa 25
<210> 171
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 171
gtcctgcaat atgaatataa tttta 25
<210> 172
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 172
agtcctgcaa tatgaatata atttt 25
<210> 173
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 173
gagtcctgca atatgaatat aattt 25
<210> 174
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 174
cgagtcctgc aatatgaata taatt 25
<210> 175
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 175
ccgagtcctg caatatgaat ataat 25
<210> 176
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 176
gccgagtcct gcaatatgaa tataa 25
<210> 177
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 177
tgccgagtcc tgcaatatga atata 25
<210> 178
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 178
ctgccgagtc ctgcaatatg aatat 25
<210> 179
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 179
tctgccgagt cctgcaatat gaata 25
<210> 180
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 180
ttctgccgag tcctgcaata tgaat 25
<210> 181
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 181
cttctgccga gtcctgcaat atgaa 25
<210> 182
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 182
tcttctgccg agtcctgcaa tatga 25
<210> 183
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 183
gtcttctgcc gagtcctgca atatg 25
<210> 184
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 184
ggtcttctgc cgagtcctgc aatat 25
<210> 185
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 185
aggtcttctg ccgagtcctg caata 25
<210> 186
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 186
aaggtcttct gccgagtcct gcaat 25
<210> 187
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 187
gaaggtcttc tgccgagtcc tgcaa 25
<210> 188
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 188
cgaaggtctt ctgccgagtc ctgca 25
<210> 189
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 189
tcgaaggtct tctgccgagt cctgc 25
<210> 190
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 190
ctcgaaggtc ttctgccgag tcctg 25
<210> 191
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 191
tctcgaaggt cttctgccga gtcct 25
<210> 192
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 192
ctctcgaagg tcttctgccg agtcc 25
<210> 193
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 193
tctctcgaag gtcttctgcc gagtc 25
<210> 194
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 194
ttctctcgaa ggtcttctgc cgagt 25
<210> 195
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 195
tttctctcga aggtcttctg ccgag 25
<210> 196
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 196
ctttctctcg aaggtcttct gccga 25
<210> 197
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 197
cctttctctc gaaggtcttc tgccg 25
<210> 198
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 198
acctttctct cgaaggtctt ctgcc 25
<210> 199
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 199
tacctttctc tcgaaggtct tctgc 25
<210> 200
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 200
ctacctttct ctcgaaggtc ttctg 25
<210> 201
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 201
tctacctttc tctcgaaggt cttct 25
<210> 202
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 202
ttctaccttt ctctcgaagg tcttc 25
<210> 203
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 203
tttctacctt tctctcgaag gtctt 25
<210> 204
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 204
ttttctacct ttctctcgaa ggtct 25
<210> 205
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 205
attttctacc tttctctcga aggtc 25
<210> 206
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 206
tattttctac ctttctctcg aaggt 25
<210> 207
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 207
ttattttcta cctttctctc gaagg 25
<210> 208
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 208
cttattttct acctttctct cgaag 25
<210> 209
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 209
tcttattttc tacctttctc tcgaa 25
<210> 210
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 210
ttcttatttt ctacctttct ctcga 25
<210> 211
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 211
attcttattt tctacctttc tctcg 25
<210> 212
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 212
aattcttatt ttctaccttt ctctc 25
<210> 213
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 213
aaattcttat tttctacctt tctct 25
<210> 214
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 214
caaattctta ttttctacct ttctc 25
<210> 215
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 215
ccaaattctt attttctacc tttct 25
<210> 216
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 216
gccaaattct tattttctac ctttc 25
<210> 217
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 217
agccaaattc ttattttcta ccttt 25
<210> 218
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 218
gagccaaatt cttattttct acctt 25
<210> 219
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 219
agagccaaat tcttattttc tacct 25
<210> 220
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 220
gagagccaaa ttcttatttt ctacc 25
<210> 221
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 221
agagagccaa attcttattt tctac 25
<210> 222
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 222
cagagagcca aattcttatt ttcta 25
<210> 223
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 223
acagagagcc aaattcttat tttct 25
<210> 224
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 224
cacagagagc caaattctta ttttc 25
<210> 225
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 225
acacagagag ccaaattctt atttt 25
<210> 226
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 226
cacacagaga gccaaattct tattt 25
<210> 227
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 227
tcacacagag agccaaattc ttatt 25
<210> 228
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 228
ctcacacaga gagccaaatt cttat 25
<210> 229
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 229
gctcacacag agagccaaat tctta 25
<210> 230
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 230
tgctcacaca gagagccaaa ttctt 25
<210> 231
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 231
atgctcacac agagagccaa attct 25
<210> 232
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 232
catgctcaca cagagagcca aattc 25
<210> 233
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 233
acatgctcac acagagagcc aaatt 25
<210> 234
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 234
cacatgctca cacagagagc caaat 25
<210> 235
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 235
acacatgctc acacagagag ccaaa 25
<210> 236
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 236
cacacatgct cacacagaga gccaa 25
<210> 237
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 237
gcacacatgc tcacacagag agcca 25
<210> 238
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 238
cgcacacatg ctcacacaga gagcc 25
<210> 239
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 239
acgcacacat gctcacacag agagc 25
<210> 240
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 240
cacgcacaca tgctcacaca gagag 25
<210> 241
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 241
acacgcacac atgctcacac agaga 25
<210> 242
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 242
cacacgcaca catgctcaca cagag 25
<210> 243
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 243
acacacgcac acatgctcac acaga 25
<210> 244
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 244
cacacacgca cacatgctca cacag 25
<210> 245
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 245
gcacacacgc acacatgctc acaca 25
<210> 246
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 246
cgcacacacg cacacatgct cacac 25
<210> 247
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 247
tcgcacacac gcacacatgc tcaca 25
<210> 248
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 248
ctcgcacaca cgcacacatg ctcac 25
<210> 249
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 249
tctcgcacac acgcacacat gctca 25
<210> 250
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 250
ctctcgcaca cacgcacaca tgctc 25
<210> 251
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 251
tctctcgcac acacgcacac atgct 25
<210> 252
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 252
ctctctcgca cacacgcaca catgc 25
<210> 253
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 253
tctctctcgc acacacgcac acatg 25
<210> 254
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 254
ctctctctcg cacacacgca cacat 25
<210> 255
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 255
tctctctctc gcacacacgc acaca 25
<210> 256
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 256
ctctctctct cgcacacacg cacac 25
<210> 257
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 257
tctctctctc tcgcacacac gcaca 25
<210> 258
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 258
gtctctctct ctcgcacaca cgcac 25
<210> 259
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 259
tgtctctctc tctcgcacac acgca 25
<210> 260
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 260
ctgtctctct ctctcgcaca cacgc 25
<210> 261
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 261
tctgtctctc tctctcgcac acacg 25
<210> 262
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 262
gtctgtctct ctctctcgca cacac 25
<210> 263
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 263
tgtctgtctc tctctctcgc acaca 25
<210> 264
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 264
ctgtctgtct ctctctctcg cacac 25
<210> 265
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 265
gctgtctgtc tctctctctc gcaca 25
<210> 266
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 266
ggctgtctgt ctctctctct cgcac 25
<210> 267
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 267
aggctgtctg tctctctctc tcgca 25
<210> 268
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 268
caggctgtct gtctctctct ctcgc 25
<210> 269
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 269
gcaggctgtc tgtctctctc tctcg 25
<210> 270
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 270
ggcaggctgt ctgtctctct ctctc 25
<210> 271
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 271
aggcaggctg tctgtctctc tctct 25
<210> 272
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 272
taggcaggct gtctgtctct ctctc 25
<210> 273
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 273
ttaggcaggc tgtctgtctc tctct 25
<210> 274
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 274
cttaggcagg ctgtctgtct ctctc 25
<210> 275
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 275
tcttaggcag gctgtctgtc tctct 25
<210> 276
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 276
ttcttaggca ggctgtctgt ctctc 25
<210> 277
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 277
cttcttaggc aggctgtctg tctct 25
<210> 278
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 278
tcttcttagg caggctgtct gtctc 25
<210> 279
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 279
ttcttcttag gcaggctgtc tgtct 25
<210> 280
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 280
tttcttctta ggcaggctgt ctgtc 25
<210> 281
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 281
atttcttctt aggcaggctg tctgt 25
<210> 282
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 282
catttcttct taggcaggct gtctg 25
<210> 283
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 283
tcatttcttc ttaggcaggc tgtct 25
<210> 284
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 284
ttcatttctt cttaggcagg ctgtc 25
<210> 285
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 285
attcatttct tcttaggcag gctgt 25
<210> 286
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 286
cattcatttc ttcttaggca ggctg 25
<210> 287
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 287
acattcattt cttcttaggc aggct 25
<210> 288
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 288
cacattcatt tcttcttagg caggc 25
<210> 289
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 289
tcacattcat ttcttcttag gcagg 25
<210> 290
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 290
ttcacattca tttcttctta ggcag 25
<210> 291
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 291
attcacattc atttcttctt aggca 25
<210> 292
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 292
cattcacatt catttcttct taggc 25
<210> 293
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 293
gcattcacat tcatttcttc ttagg 25
<210> 294
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 294
cgcattcaca ttcatttctt cttag 25
<210> 295
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 295
ccgcattcac attcatttct tctta 25
<210> 296
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 296
gccgcattca cattcatttc ttctt 25
<210> 297
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 297
agccgcattc acattcattt cttct 25
<210> 298
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 298
aagccgcatt cacattcatt tcttc 25
<210> 299
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 299
caagccgcat tcacattcat ttctt 25
<210> 300
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 300
acaagccgca ttcacattca tttct 25
<210> 301
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 301
cacaagccgc attcacattc atttc 25
<210> 302
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 302
ccacaagccg cattcacatt cattt 25
<210> 303
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 303
gccacaagcc gcattcacat tcatt 25
<210> 304
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 304
tgccacaagc cgcattcaca ttcat 25
<210> 305
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 305
gtgccacaag ccgcattcac attca 25
<210> 306
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 306
tgtgccacaa gccgcattca cattc 25
<210> 307
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 307
ctgtgccaca agccgcattc acatt 25
<210> 308
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 308
actgtgccac aagccgcatt cacat 25
<210> 309
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 309
aactgtgcca caagccgcat tcaca 25
<210> 310
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 310
caactgtgcc acaagccgca ttcac 25
<210> 311
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 311
tcaactgtgc cacaagccgc attca 25
<210> 312
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 312
gtcaactgtg ccacaagccg cattc 25
<210> 313
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 313
tgtcaactgt gccacaagcc gcatt 25
<210> 314
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 314
ttgtcaactg tgccacaagc cgcat 25
<210> 315
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 315
cttgtcaact gtgccacaag ccgca 25
<210> 316
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 316
ccttgtcaac tgtgccacaa gccgc 25
<210> 317
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 317
tccttgtcaa ctgtgccaca agccg 25
<210> 318
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 318
atccttgtca actgtgccac aagcc 25
<210> 319
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 319
catccttgtc aactgtgcca caagc 25
<210> 320
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 320
tcatccttgt caactgtgcc acaag 25
<210> 321
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 321
atcatccttg tcaactgtgc cacaa 25
<210> 322
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 322
tatcatcctt gtcaactgtg ccaca 25
<210> 323
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 323
ttatcatcct tgtcaactgt gccac 25
<210> 324
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 324
tttatcatcc ttgtcaactg tgcca 25
<210> 325
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 325
atttatcatc cttgtcaact gtgcc 25
<210> 326
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 326
gatttatcat ccttgtcaac tgtgc 25
<210> 327
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 327
tgatttatca tccttgtcaa ctgtg 25
<210> 328
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 328
ttgatttatc atccttgtca actgt 25
<210> 329
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 329
attgatttat catccttgtc aactg 25
<210> 330
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 330
tattgattta tcatccttgt caact 25
<210> 331
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 331
ttattgattt atcatccttg tcaac 25
<210> 332
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 332
attattgatt tatcatcctt gtcaa 25
<210> 333
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 333
cattattgat ttatcatcct tgtca 25
<210> 334
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 334
gcattattga tttatcatcc ttgtc 25
<210> 335
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 335
tgcattattg atttatcatc cttgt 25
<210> 336
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 336
ttgcattatt gatttatcat ccttg 25
<210> 337
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 337
cttgcattat tgatttatca tcctt 25
<210> 338
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 338
gcttgcatta ttgatttatc atcct 25
<210> 339
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 339
agcttgcatt attgatttat catcc 25
<210> 340
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 340
aagcttgcat tattgattta tcatc 25
<210> 341
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 341
taagcttgca ttattgattt atcat 25
<210> 342
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 342
gtaagcttgc attattgatt tatca 25
<210> 343
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 343
agtaagcttg cattattgat ttatc 25
<210> 344
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 344
tagtaagctt gcattattga tttat 25
<210> 345
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 345
atagtaagct tgcattattg attta 25
<210> 346
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 346
gatagtaagc ttgcattatt gattt 25
<210> 347
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 347
tgatagtaag cttgcattat tgatt 25
<210> 348
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 348
atgatagtaa gcttgcatta ttgat 25
<210> 349
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 349
aatgatagta agcttgcatt attga 25
<210> 350
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 350
aaatgatagt aagcttgcat tattg 25
<210> 351
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 351
taaatgatag taagcttgca ttatt 25
<210> 352
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 352
ataaatgata gtaagcttgc attat 25
<210> 353
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 353
cataaatgat agtaagcttg catta 25
<210> 354
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 354
tcataaatga tagtaagctt gcatt 25
<210> 355
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 355
ttcataaatg atagtaagct tgcat 25
<210> 356
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 356
attcataaat gatagtaagc ttgca 25
<210> 357
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 357
tattcataaa tgatagtaag cttgc 25
<210> 358
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 358
ctattcataa atgatagtaa gcttg 25
<210> 359
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 359
gctattcata aatgatagta agctt 25
<210> 360
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 360
tgctattcat aaatgatagt aagct 25
<210> 361
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 361
ttgctattca taaatgatag taagc 25
<210> 362
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 362
attgctattc ataaatgata gtaag 25
<210> 363
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 363
tattgctatt cataaatgat agtaa 25
<210> 364
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 364
gtattgctat tcataaatga tagta 25
<210> 365
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 365
agtattgcta ttcataaatg atagt 25
<210> 366
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 366
cagtattgct attcataaat gatag 25
<210> 367
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 367
tcagtattgc tattcataaa tgata 25
<210> 368
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 368
ttcagtattg ctattcataa atgat 25
<210> 369
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 369
cttcagtatt gctattcata aatga 25
<210> 370
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 370
tcttcagtat tgctattcat aaatg 25
<210> 371
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 371
ttcttcagta ttgctattca taaat 25
<210> 372
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 372
tttcttcagt attgctattc ataaa 25
<210> 373
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 373
atttcttcag tattgctatt cataa 25
<210> 374
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 374
aatttcttca gtattgctat tcata 25
<210> 375
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 375
taatttcttc agtattgcta ttcat 25
<210> 376
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 376
ttaatttctt cagtattgct attca 25
<210> 377
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 377
tttaatttct tcagtattgc tattc 25
<210> 378
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 378
ttttaatttc ttcagtattg ctatt 25
<210> 379
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 379
gttttaattt cttcagtatt gctat 25
<210> 380
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 380
tgttttaatt tcttcagtat tgcta 25
<210> 381
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 381
ttgttttaat ttcttcagta ttgct 25
<210> 382
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 382
tttgttttaa tttcttcagt attgc 25
<210> 383
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 383
ttttgtttta atttcttcag tattg 25
<210> 384
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 384
cttttgtttt aatttcttca gtatt 25
<210> 385
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 385
tcttttgttt taatttcttc agtat 25
<210> 386
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 386
atcttttgtt ttaatttctt cagta 25
<210> 387
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 387
aatcttttgt tttaatttct tcagt 25
<210> 388
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 388
caatcttttg ttttaatttc ttcag 25
<210> 389
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 389
gcaatctttt gttttaattt cttca 25
<210> 390
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 390
agcaatcttt tgttttaatt tcttc 25
<210> 391
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 391
cagcaatctt ttgttttaat ttctt 25
<210> 392
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 392
acagcaatct tttgttttaa tttct 25
<210> 393
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 393
gacagcaatc ttttgtttta atttc 25
<210> 394
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 394
agacagcaat cttttgtttt aattt 25
<210> 395
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 395
gagacagcaa tcttttgttt taatt 25
<210> 396
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 396
tgagacagca atcttttgtt ttaat 25
<210> 397
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 397
ttgagacagc aatcttttgt tttaa 25
<210> 398
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 398
attgagacag caatcttttg tttta 25
<210> 399
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 399
tattgagaca gcaatctttt gtttt 25
<210> 400
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 400
atattgagac agcaatcttt tgttt 25
<210> 401
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 401
tatattgaga cagcaatctt ttgtt 25
<210> 402
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 402
atatattgag acagcaatct tttgt 25
<210> 403
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 403
gatatattga gacagcaatc ttttg 25
<210> 404
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 404
agatatattg agacagcaat ctttt 25
<210> 405
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 405
aagatatatt gagacagcaa tcttt 25
<210> 406
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 406
taagatatat tgagacagca atctt 25
<210> 407
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 407
ataagatata ttgagacagc aatct 25
<210> 408
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 408
tataagatat attgagacag caatc 25
<210> 409
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 409
atataagata tattgagaca gcaat 25
<210> 410
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 410
aatataagat atattgagac agcaa 25
<210> 411
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 411
aaatataaga tatattgaga cagca 25
<210> 412
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 412
taaatataag atatattgag acagc 25
<210> 413
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 413
ataaatataa gatatattga gacag 25
<210> 414
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 414
aataaatata agatatattg agaca 25
<210> 415
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 415
taataaatat aagatatatt gagac 25
<210> 416
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 416
ataataaata taagatatat tgaga 25
<210> 417
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 417
aataataaat ataagatata ttgag 25
<210> 418
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 418
aaataataaa tataagatat attga 25
<210> 419
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 419
taaataataa atataagata tattg 25
<210> 420
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 420
gtaaataata aatataagat atatt 25
<210> 421
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 421
ggtaaataat aaatataaga tatat 25
<210> 422
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 422
tggtaaataa taaatataag atata 25
<210> 423
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 423
ttggtaaata ataaatataa gatat 25
<210> 424
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 424
tttggtaaat aataaatata agata 25
<210> 425
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 425
atttggtaaa taataaatat aagat 25
<210> 426
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 426
aatttggtaa ataataaata taaga 25
<210> 427
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 427
taatttggta aataataaat ataag 25
<210> 428
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 428
ataatttggt aaataataaa tataa 25
<210> 429
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 429
aataatttgg taaataataa atata 25
<210> 430
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 430
gaataatttg gtaaataata aatat 25
<210> 431
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 431
agaataattt ggtaaataat aaata 25
<210> 432
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 432
tagaataatt tggtaaataa taaat 25
<210> 433
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 433
ttagaataat ttggtaaata ataaa 25
<210> 434
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 434
cttagaataa tttggtaaat aataa 25
<210> 435
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 435
tcttagaata atttggtaaa taata 25
<210> 436
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 436
ctcttagaat aatttggtaa ataat 25
<210> 437
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 437
actcttagaa taatttggta aataa 25
<210> 438
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 438
tactcttaga ataatttggt aaata 25
<210> 439
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 439
atactcttag aataatttgg taaat 25
<210> 440
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 440
aatactctta gaataatttg gtaaa 25
<210> 441
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 441
aaatactctt agaataattt ggtaa 25
<210> 442
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 442
gaaatactct tagaataatt tggta 25
<210> 443
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 443
agaaatactc ttagaataat ttggt 25
<210> 444
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 444
aagaaatact cttagaataa tttgg 25
<210> 445
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 445
gaagaaatac tcttagaata atttg 25
<210> 446
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 446
ggaagaaata ctcttagaat aattt 25
<210> 447
<211> 227
<212> DNA
<213> 智人
<400> 447
gactcggcag aagaccttcg agagaaaggt agaaaataag aatttggctc tctgtgtgag 60
catgtgtgcg tgtgtgcgag agagagagac agacagcctg cctaagaaga aatgaatgtg 120
aatgcggctt gtggcacagt tgacaaggat gataaatcaa taatgcaagc ttactatcat 180
ttatgaatag caatactgaa gaaattaaaa caaaagattg ctgtctc 227
<210> 448
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 448
acttgtaata tacaggtatc cctcc 25
<210> 449
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 449
cttgtaatat acaggtatcc ctcct 25
<210> 450
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 450
ttgtaatata caggtatccc tcctg 25
<210> 451
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 451
tgtaatatac aggtatccct cctgg 25
<210> 452
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 452
gtaatataca ggtatccctc ctggt 25
<210> 453
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 453
taatatacag gtatccctcc tggta 25
<210> 454
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 454
aatatacagg tatccctcct ggtaa 25
<210> 455
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 455
atatacaggt atccctcctg gtaag 25
<210> 456
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 456
tatacaggta tccctcctgg taagc 25
<210> 457
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 457
atacaggtat ccctcctggt aagct 25
<210> 458
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 458
tacaggtatc cctcctggta agctc 25
<210> 459
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 459
acaggtatcc ctcctggtaa gctct 25
<210> 460
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 460
caggtatccc tcctggtaag ctctg 25
<210> 461
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 461
aggtatccct cctggtaagc tctgg 25
<210> 462
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 462
ggtatccctc ctggtaagct ctggt 25
<210> 463
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 463
gtatccctcc tggtaagctc tggta 25
<210> 464
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 464
tatccctcct ggtaagctct ggtat 25
<210> 465
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 465
atccctcctg gtaagctctg gtatt 25
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<211> 25
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aaattaaaac aaaagattgc tgtct 25
<210> 842
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 842
aattaaaaca aaagattgct gtctc 25
<210> 843
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 843
attaaaacaa aagattgctg tctca 25
<210> 844
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 844
ttaaaacaaa agattgctgt ctcaa 25
<210> 845
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 845
taaaacaaaa gattgctgtc tcaat 25
<210> 846
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 846
aaaacaaaag attgctgtct caata 25
<210> 847
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 847
aaacaaaaga ttgctgtctc aatat 25
<210> 848
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 848
aacaaaagat tgctgtctca atata 25
<210> 849
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 849
acaaaagatt gctgtctcaa tatat 25
<210> 850
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 850
caaaagattg ctgtctcaat atatc 25
<210> 851
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 851
aaaagattgc tgtctcaata tatct 25
<210> 852
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 852
aaagattgct gtctcaatat atctt 25
<210> 853
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 853
aagattgctg tctcaatata tctta 25
<210> 854
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 854
agattgctgt ctcaatatat cttat 25
<210> 855
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 855
gattgctgtc tcaatatatc ttata 25
<210> 856
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 856
attgctgtct caatatatct tatat 25
<210> 857
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 857
ttgctgtctc aatatatctt atatt 25
<210> 858
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 858
tgctgtctca atatatctta tattt 25
<210> 859
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 859
gctgtctcaa tatatcttat attta 25
<210> 860
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 860
ctgtctcaat atatcttata tttat 25
<210> 861
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 861
tgtctcaata tatcttatat ttatt 25
<210> 862
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 862
gtctcaatat atcttatatt tatta 25
<210> 863
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 863
tctcaatata tcttatattt attat 25
<210> 864
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 864
ctcaatatat cttatattta ttatt 25
<210> 865
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 865
tcaatatatc ttatatttat tattt 25
<210> 866
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 866
caatatatct tatatttatt attta 25
<210> 867
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 867
aatatatctt atatttatta tttac 25
<210> 868
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 868
atatatctta tatttattat ttacc 25
<210> 869
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 869
tatatcttat atttattatt tacca 25
<210> 870
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 870
atatcttata tttattattt accaa 25
<210> 871
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 871
tatcttatat ttattattta ccaaa 25
<210> 872
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 872
atcttatatt tattatttac caaat 25
<210> 873
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 873
tcttatattt attatttacc aaatt 25
<210> 874
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 874
cttatattta ttatttacca aatta 25
<210> 875
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 875
ttatatttat tatttaccaa attat 25
<210> 876
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 876
tatatttatt atttaccaaa ttatt 25
<210> 877
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 877
atatttatta tttaccaaat tattc 25
<210> 878
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 878
tatttattat ttaccaaatt attct 25
<210> 879
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 879
atttattatt taccaaatta ttcta 25
<210> 880
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 880
tttattattt accaaattat tctaa 25
<210> 881
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 881
ttattattta ccaaattatt ctaag 25
<210> 882
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 882
tattatttac caaattattc taaga 25
<210> 883
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 883
attatttacc aaattattct aagag 25
<210> 884
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 884
ttatttacca aattattcta agagt 25
<210> 885
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 885
tatttaccaa attattctaa gagta 25
<210> 886
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 886
atttaccaaa ttattctaag agtat 25
<210> 887
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 887
tttaccaaat tattctaaga gtatt 25
<210> 888
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 888
ttaccaaatt attctaagag tattt 25
<210> 889
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 889
taccaaatta ttctaagagt atttc 25
<210> 890
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 890
accaaattat tctaagagta tttct 25
<210> 891
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 891
ccaaattatt ctaagagtat ttctt 25
<210> 892
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 892
caaattattc taagagtatt tcttc 25
<210> 893
<211> 25
<212> DNA
<213> 智人
<400> 893
aaattattct aagagtattt cttcc 25
<210> 894
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 894
atccaattaa gagagagtga tgg 23
<210> 895
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 895
aatccaatta agagagagtg atg 23
<210> 896
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 896
tccaattaag agagagtgat ggg 23
<210> 897
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 897
tccaattaag agagagtgat g 21
<210> 898
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 898
ccaattaaga gagagtgat 19
<210> 899
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 899
aatccaatta agagagagtg a 21
<210> 900
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 900
caattaagag agagtgatgg g 21
<210> 901
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 901
gagtcctgca atatgaatat aat 23
<210> 902
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 902
gtcctgcaat atgaatataa ttt 23
<210> 903
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 903
gtcctgcaat atgaatataa t 21
<210> 904
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 904
gagtcctgca atatgaatat a 21
<210> 905
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 905
cctgcaatat gaatataatt t 21
<210> 906
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 906
gagtcctgca atatgaata 19
<210> 907
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 907
tgcaatatga atataattt 19
<210> 908
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 908
gtcttctgcc gagtcctgca ata 23
<210> 909
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 909
aggtcttctg ccgagtcctg c 21
<210> 910
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 910
cttctgccga gtcctgcaat a 21
<210> 911
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 911
tctgccgagt cctgcaata 19
<210> 912
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 912
gcacacatgc tcacacagag agc 23
<210> 913
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 913
acacatgctc acacagagag cca 23
<210> 914
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 914
acacatgctc acacagagag c 21
<210> 915
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 915
gcacacatgc tcacacagag a 21
<210> 916
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 916
acatgctcac acagagagcc a 21
<210> 917
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 917
gcacacatgc tcacacaga 19
<210> 918
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 918
atgctcacac agagagcca 19
<210> 919
<211> 23
<212> DNA
<213> 智人
<400> 919
ccatcactct ctcttaattg gat 23
<210> 920
<211> 23
<212> DNA
<213> 智人
<400> 920
catcactctc tcttaattgg att 23
<210> 921
<211> 23
<212> DNA
<213> 智人
<400> 921
cccatcactc tctcttaatt gga 23
<210> 922
<211> 21
<212> DNA
<213> 智人
<400> 922
catcactctc tcttaattgg a 21
<210> 923
<211> 19
<212> DNA
<213> 智人
<400> 923
atcactctct cttaattgg 19
<210> 924
<211> 21
<212> DNA
<213> 智人
<400> 924
tcactctctc ttaattggat t 21
<210> 925
<211> 21
<212> DNA
<213> 智人
<400> 925
cccatcactc tctcttaatt g 21
<210> 926
<211> 23
<212> DNA
<213> 智人
<400> 926
attatattca tattgcagga ctc 23
<210> 927
<211> 23
<212> DNA
<213> 智人
<400> 927
aaattatatt catattgcag gac 23
<210> 928
<211> 21
<212> DNA
<213> 智人
<400> 928
attatattca tattgcagga c 21
<210> 929
<211> 21
<212> DNA
<213> 智人
<400> 929
tatattcata ttgcaggact c 21
<210> 930
<211> 21
<212> DNA
<213> 智人
<400> 930
aaattatatt catattgcag g 21
<210> 931
<211> 19
<212> DNA
<213> 智人
<400> 931
tattcatatt gcaggactc 19
<210> 932
<211> 19
<212> DNA
<213> 智人
<400> 932
aaattatatt catattgca 19
<210> 933
<211> 23
<212> DNA
<213> 智人
<400> 933
tattgcagga ctcggcagaa gac 23
<210> 934
<211> 21
<212> DNA
<213> 智人
<400> 934
gcaggactcg gcagaagacc t 21
<210> 935
<211> 21
<212> DNA
<213> 智人
<400> 935
tattgcagga ctcggcagaa g 21
<210> 936
<211> 19
<212> DNA
<213> 智人
<400> 936
tattgcagga ctcggcaga 19
<210> 937
<211> 23
<212> DNA
<213> 智人
<400> 937
gctctctgtg tgagcatgtg tgc 23
<210> 938
<211> 23
<212> DNA
<213> 智人
<400> 938
tggctctctg tgtgagcatg tgt 23
<210> 939
<211> 21
<212> DNA
<213> 智人
<400> 939
gctctctgtg tgagcatgtg t 21
<210> 940
<211> 21
<212> DNA
<213> 智人
<400> 940
tctctgtgtg agcatgtgtg c 21
<210> 941
<211> 21
<212> DNA
<213> 智人
<400> 941
tggctctctg tgtgagcatg t 21
<210> 942
<211> 19
<212> DNA
<213> 智人
<400> 942
tctgtgtgag catgtgtgc 19
<210> 943
<211> 19
<212> DNA
<213> 智人
<400> 943
tggctctctg tgtgagcat 19
<210> 944
<211> 470
<212> DNA
<213> 智人
<400> 944
acttgtaata tacaggtatc cctcctggta agctctggta ttatgtctta acatttttaa 60
atctatggta atctttacaa aatattttac ttccgaactc atatacctgg ggattttatt 120
actctgggaa ttatgtgttc tgccccatca ctctctctta attggatttt taaaattata 180
ttcatattgc aggactcggc agaagacctt cgagagaaag gtagaaaata agaatttggc 240
tctctgtgtg agcatgtgtg cgtgtgtgcg agagagagag acagacagcc tgcctaagaa 300
gaaatgaatg tgaatgcggc ttgtggcaca gttgacaagg atgataaatc aataatgcaa 360
gcttactatc atttatgaat agcaatactg aagaaattaa aacaaaagat tgctgtctca 420
atatatctta tatttattat ttaccaaatt attctaagag tatttcttcc 470
<210> 945
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 945
ggagggauac cuguauauua caagu 25
<210> 946
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 946
aggagggaua ccuguauauu acaag 25
<210> 947
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 947
caggagggau accuguauau uacaa 25
<210> 948
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 948
ccaggaggga uaccuguaua uuaca 25
<210> 949
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 949
accaggaggg auaccuguau auuac 25
<210> 950
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 950
uaccaggagg gauaccugua uauua 25
<210> 951
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 951
uuaccaggag ggauaccugu auauu 25
<210> 952
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 952
cuuaccagga gggauaccug uauau 25
<210> 953
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 953
gcuuaccagg agggauaccu guaua 25
<210> 954
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 954
agcuuaccag gagggauacc uguau 25
<210> 955
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 955
gagcuuacca ggagggauac cugua 25
<210> 956
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 956
agagcuuacc aggagggaua ccugu 25
<210> 957
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 957
cagagcuuac caggagggau accug 25
<210> 958
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 958
ccagagcuua ccaggaggga uaccu 25
<210> 959
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 959
accagagcuu accaggaggg auacc 25
<210> 960
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 960
uaccagagcu uaccaggagg gauac 25
<210> 961
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 961
auaccagagc uuaccaggag ggaua 25
<210> 962
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 962
aauaccagag cuuaccagga gggau 25
<210> 963
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 963
uaauaccaga gcuuaccagg aggga 25
<210> 964
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 964
auaauaccag agcuuaccag gaggg 25
<210> 965
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 965
cauaauacca gagcuuacca ggagg 25
<210> 966
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 966
acauaauacc agagcuuacc aggag 25
<210> 967
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 967
gacauaauac cagagcuuac cagga 25
<210> 968
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 968
agacauaaua ccagagcuua ccagg 25
<210> 969
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 969
aagacauaau accagagcuu accag 25
<210> 970
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 970
uaagacauaa uaccagagcu uacca 25
<210> 971
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 971
uuaagacaua auaccagagc uuacc 25
<210> 972
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 972
guuaagacau aauaccagag cuuac 25
<210> 973
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 973
uguuaagaca uaauaccaga gcuua 25
<210> 974
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 974
auguuaagac auaauaccag agcuu 25
<210> 975
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 975
aauguuaaga cauaauacca gagcu 25
<210> 976
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 976
aaauguuaag acauaauacc agagc 25
<210> 977
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 977
aaaauguuaa gacauaauac cagag 25
<210> 978
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 978
aaaaauguua agacauaaua ccaga 25
<210> 979
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 979
uaaaaauguu aagacauaau accag 25
<210> 980
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 980
uuaaaaaugu uaagacauaa uacca 25
<210> 981
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 981
uuuaaaaaug uuaagacaua auacc 25
<210> 982
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 982
auuuaaaaau guuaagacau aauac 25
<210> 983
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 983
gauuuaaaaa uguuaagaca uaaua 25
<210> 984
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 984
agauuuaaaa auguuaagac auaau 25
<210> 985
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 985
uagauuuaaa aauguuaaga cauaa 25
<210> 986
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 986
auagauuuaa aaauguuaag acaua 25
<210> 987
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 987
cauagauuua aaaauguuaa gacau 25
<210> 988
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 988
ccauagauuu aaaaauguua agaca 25
<210> 989
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 989
accauagauu uaaaaauguu aagac 25
<210> 990
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 990
uaccauagau uuaaaaaugu uaaga 25
<210> 991
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 991
uuaccauaga uuuaaaaaug uuaag 25
<210> 992
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 992
auuaccauag auuuaaaaau guuaa 25
<210> 993
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 993
gauuaccaua gauuuaaaaa uguua 25
<210> 994
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 994
agauuaccau agauuuaaaa auguu 25
<210> 995
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 995
aagauuacca uagauuuaaa aaugu 25
<210> 996
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 996
aaagauuacc auagauuuaa aaaug 25
<210> 997
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 997
uaaagauuac cauagauuua aaaau 25
<210> 998
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 998
guaaagauua ccauagauuu aaaaa 25
<210> 999
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 999
uguaaagauu accauagauu uaaaa 25
<210> 1000
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1000
uuguaaagau uaccauagau uuaaa 25
<210> 1001
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1001
uuuguaaaga uuaccauaga uuuaa 25
<210> 1002
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1002
uuuuguaaag auuaccauag auuua 25
<210> 1003
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1003
auuuuguaaa gauuaccaua gauuu 25
<210> 1004
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1004
uauuuuguaa agauuaccau agauu 25
<210> 1005
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1005
auauuuugua aagauuacca uagau 25
<210> 1006
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1006
aauauuuugu aaagauuacc auaga 25
<210> 1007
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1007
aaauauuuug uaaagauuac cauag 25
<210> 1008
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1008
aaaauauuuu guaaagauua ccaua 25
<210> 1009
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1009
uaaaauauuu uguaaagauu accau 25
<210> 1010
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1010
guaaaauauu uuguaaagau uacca 25
<210> 1011
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1011
aguaaaauau uuuguaaaga uuacc 25
<210> 1012
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1012
aaguaaaaua uuuuguaaag auuac 25
<210> 1013
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1013
gaaguaaaau auuuuguaaa gauua 25
<210> 1014
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1014
ggaaguaaaa uauuuuguaa agauu 25
<210> 1015
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1015
cggaaguaaa auauuuugua aagau 25
<210> 1016
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1016
ucggaaguaa aauauuuugu aaaga 25
<210> 1017
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1017
uucggaagua aaauauuuug uaaag 25
<210> 1018
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1018
guucggaagu aaaauauuuu guaaa 25
<210> 1019
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1019
aguucggaag uaaaauauuu uguaa 25
<210> 1020
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1020
gaguucggaa guaaaauauu uugua 25
<210> 1021
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1021
ugaguucgga aguaaaauau uuugu 25
<210> 1022
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1022
augaguucgg aaguaaaaua uuuug 25
<210> 1023
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1023
uaugaguucg gaaguaaaau auuuu 25
<210> 1024
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1024
auaugaguuc ggaaguaaaa uauuu 25
<210> 1025
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1025
uauaugaguu cggaaguaaa auauu 25
<210> 1026
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1026
guauaugagu ucggaaguaa aauau 25
<210> 1027
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1027
gguauaugag uucggaagua aaaua 25
<210> 1028
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1028
agguauauga guucggaagu aaaau 25
<210> 1029
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1029
cagguauaug aguucggaag uaaaa 25
<210> 1030
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1030
ccagguauau gaguucggaa guaaa 25
<210> 1031
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1031
cccagguaua ugaguucgga aguaa 25
<210> 1032
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1032
ccccagguau augaguucgg aagua 25
<210> 1033
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1033
uccccaggua uaugaguucg gaagu 25
<210> 1034
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1034
auccccaggu auaugaguuc ggaag 25
<210> 1035
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1035
aauccccagg uauaugaguu cggaa 25
<210> 1036
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1036
aaauccccag guauaugagu ucgga 25
<210> 1037
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1037
aaaaucccca gguauaugag uucgg 25
<210> 1038
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1038
uaaaaucccc agguauauga guucg 25
<210> 1039
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1039
auaaaauccc cagguauaug aguuc 25
<210> 1040
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1040
aauaaaaucc ccagguauau gaguu 25
<210> 1041
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1041
uaauaaaauc cccagguaua ugagu 25
<210> 1042
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1042
guaauaaaau ccccagguau augag 25
<210> 1043
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1043
aguaauaaaa uccccaggua uauga 25
<210> 1044
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1044
gaguaauaaa auccccaggu auaug 25
<210> 1045
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1045
agaguaauaa aauccccagg uauau 25
<210> 1046
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1046
cagaguaaua aaauccccag guaua 25
<210> 1047
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1047
ccagaguaau aaaaucccca gguau 25
<210> 1048
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1048
cccagaguaa uaaaaucccc aggua 25
<210> 1049
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1049
ucccagagua auaaaauccc caggu 25
<210> 1050
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1050
uucccagagu aauaaaaucc ccagg 25
<210> 1051
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1051
auucccagag uaauaaaauc cccag 25
<210> 1052
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1052
aauucccaga guaauaaaau cccca 25
<210> 1053
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1053
uaauucccag aguaauaaaa ucccc 25
<210> 1054
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1054
auaauuccca gaguaauaaa auccc 25
<210> 1055
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1055
cauaauuccc agaguaauaa aaucc 25
<210> 1056
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1056
acauaauucc cagaguaaua aaauc 25
<210> 1057
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1057
cacauaauuc ccagaguaau aaaau 25
<210> 1058
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1058
acacauaauu cccagaguaa uaaaa 25
<210> 1059
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1059
aacacauaau ucccagagua auaaa 25
<210> 1060
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1060
gaacacauaa uucccagagu aauaa 25
<210> 1061
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1061
agaacacaua auucccagag uaaua 25
<210> 1062
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1062
cagaacacau aauucccaga guaau 25
<210> 1063
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1063
gcagaacaca uaauucccag aguaa 25
<210> 1064
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1064
ggcagaacac auaauuccca gagua 25
<210> 1065
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1065
gggcagaaca cauaauuccc agagu 25
<210> 1066
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1066
ggggcagaac acauaauucc cagag 25
<210> 1067
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1067
uggggcagaa cacauaauuc ccaga 25
<210> 1068
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1068
auggggcaga acacauaauu cccag 25
<210> 1069
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1069
gauggggcag aacacauaau uccca 25
<210> 1070
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1070
ugauggggca gaacacauaa uuccc 25
<210> 1071
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1071
gugauggggc agaacacaua auucc 25
<210> 1072
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1072
agugaugggg cagaacacau aauuc 25
<210> 1073
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1073
gagugauggg gcagaacaca uaauu 25
<210> 1074
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1074
agagugaugg ggcagaacac auaau 25
<210> 1075
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1075
gagagugaug gggcagaaca cauaa 25
<210> 1076
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1076
agagagugau ggggcagaac acaua 25
<210> 1077
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1077
gagagaguga uggggcagaa cacau 25
<210> 1078
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1078
agagagagug auggggcaga acaca 25
<210> 1079
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1079
aagagagagu gauggggcag aacac 25
<210> 1080
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1080
uaagagagag ugauggggca gaaca 25
<210> 1081
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1081
uuaagagaga gugauggggc agaac 25
<210> 1082
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1082
auuaagagag agugaugggg cagaa 25
<210> 1083
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1083
aauuaagaga gagugauggg gcaga 25
<210> 1084
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1084
caauuaagag agagugaugg ggcag 25
<210> 1085
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1085
ccaauuaaga gagagugaug gggca 25
<210> 1086
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1086
uccaauuaag agagagugau ggggc 25
<210> 1087
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1087
auccaauuaa gagagaguga ugggg 25
<210> 1088
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1088
aauccaauua agagagagug auggg 25
<210> 1089
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1089
aaauccaauu aagagagagu gaugg 25
<210> 1090
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1090
aaaauccaau uaagagagag ugaug 25
<210> 1091
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1091
aaaaauccaa uuaagagaga gugau 25
<210> 1092
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1092
uaaaaaucca auuaagagag aguga 25
<210> 1093
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1093
uuaaaaaucc aauuaagaga gagug 25
<210> 1094
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1094
uuuaaaaauc caauuaagag agagu 25
<210> 1095
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1095
uuuuaaaaau ccaauuaaga gagag 25
<210> 1096
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1096
auuuuaaaaa uccaauuaag agaga 25
<210> 1097
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1097
aauuuuaaaa auccaauuaa gagag 25
<210> 1098
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1098
uaauuuuaaa aauccaauua agaga 25
<210> 1099
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1099
auaauuuuaa aaauccaauu aagag 25
<210> 1100
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1100
uauaauuuua aaaauccaau uaaga 25
<210> 1101
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1101
auauaauuuu aaaaauccaa uuaag 25
<210> 1102
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1102
aauauaauuu uaaaaaucca auuaa 25
<210> 1103
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1103
gaauauaauu uuaaaaaucc aauua 25
<210> 1104
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1104
ugaauauaau uuuaaaaauc caauu 25
<210> 1105
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1105
augaauauaa uuuuaaaaau ccaau 25
<210> 1106
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1106
uaugaauaua auuuuaaaaa uccaa 25
<210> 1107
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1107
auaugaauau aauuuuaaaa aucca 25
<210> 1108
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1108
aauaugaaua uaauuuuaaa aaucc 25
<210> 1109
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1109
caauaugaau auaauuuuaa aaauc 25
<210> 1110
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1110
gcaauaugaa uauaauuuua aaaau 25
<210> 1111
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1111
ugcaauauga auauaauuuu aaaaa 25
<210> 1112
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1112
cugcaauaug aauauaauuu uaaaa 25
<210> 1113
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1113
ccugcaauau gaauauaauu uuaaa 25
<210> 1114
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1114
uccugcaaua ugaauauaau uuuaa 25
<210> 1115
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1115
guccugcaau augaauauaa uuuua 25
<210> 1116
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1116
aguccugcaa uaugaauaua auuuu 25
<210> 1117
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1117
gaguccugca auaugaauau aauuu 25
<210> 1118
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1118
cgaguccugc aauaugaaua uaauu 25
<210> 1119
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1119
ccgaguccug caauaugaau auaau 25
<210> 1120
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1120
gccgaguccu gcaauaugaa uauaa 25
<210> 1121
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1121
ugccgagucc ugcaauauga auaua 25
<210> 1122
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1122
cugccgaguc cugcaauaug aauau 25
<210> 1123
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1123
ucugccgagu ccugcaauau gaaua 25
<210> 1124
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1124
uucugccgag uccugcaaua ugaau 25
<210> 1125
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1125
cuucugccga guccugcaau augaa 25
<210> 1126
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1126
ucuucugccg aguccugcaa uauga 25
<210> 1127
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1127
gucuucugcc gaguccugca auaug 25
<210> 1128
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1128
ggucuucugc cgaguccugc aauau 25
<210> 1129
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1129
aggucuucug ccgaguccug caaua 25
<210> 1130
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1130
aaggucuucu gccgaguccu gcaau 25
<210> 1131
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1131
gaaggucuuc ugccgagucc ugcaa 25
<210> 1132
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1132
cgaaggucuu cugccgaguc cugca 25
<210> 1133
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1133
ucgaaggucu ucugccgagu ccugc 25
<210> 1134
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1134
cucgaagguc uucugccgag uccug 25
<210> 1135
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1135
ucucgaaggu cuucugccga guccu 25
<210> 1136
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1136
cucucgaagg ucuucugccg agucc 25
<210> 1137
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1137
ucucucgaag gucuucugcc gaguc 25
<210> 1138
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1138
uucucucgaa ggucuucugc cgagu 25
<210> 1139
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1139
uuucucucga aggucuucug ccgag 25
<210> 1140
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1140
cuuucucucg aaggucuucu gccga 25
<210> 1141
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1141
ccuuucucuc gaaggucuuc ugccg 25
<210> 1142
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1142
accuuucucu cgaaggucuu cugcc 25
<210> 1143
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1143
uaccuuucuc ucgaaggucu ucugc 25
<210> 1144
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1144
cuaccuuucu cucgaagguc uucug 25
<210> 1145
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1145
ucuaccuuuc ucucgaaggu cuucu 25
<210> 1146
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1146
uucuaccuuu cucucgaagg ucuuc 25
<210> 1147
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1147
uuucuaccuu ucucucgaag gucuu 25
<210> 1148
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1148
uuuucuaccu uucucucgaa ggucu 25
<210> 1149
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1149
auuuucuacc uuucucucga agguc 25
<210> 1150
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1150
uauuuucuac cuuucucucg aaggu 25
<210> 1151
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1151
uuauuuucua ccuuucucuc gaagg 25
<210> 1152
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1152
cuuauuuucu accuuucucu cgaag 25
<210> 1153
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1153
ucuuauuuuc uaccuuucuc ucgaa 25
<210> 1154
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1154
uucuuauuuu cuaccuuucu cucga 25
<210> 1155
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1155
auucuuauuu ucuaccuuuc ucucg 25
<210> 1156
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1156
aauucuuauu uucuaccuuu cucuc 25
<210> 1157
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1157
aaauucuuau uuucuaccuu ucucu 25
<210> 1158
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1158
caaauucuua uuuucuaccu uucuc 25
<210> 1159
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1159
ccaaauucuu auuuucuacc uuucu 25
<210> 1160
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1160
gccaaauucu uauuuucuac cuuuc 25
<210> 1161
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1161
agccaaauuc uuauuuucua ccuuu 25
<210> 1162
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1162
gagccaaauu cuuauuuucu accuu 25
<210> 1163
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1163
agagccaaau ucuuauuuuc uaccu 25
<210> 1164
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1164
gagagccaaa uucuuauuuu cuacc 25
<210> 1165
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1165
agagagccaa auucuuauuu ucuac 25
<210> 1166
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1166
cagagagcca aauucuuauu uucua 25
<210> 1167
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1167
acagagagcc aaauucuuau uuucu 25
<210> 1168
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1168
cacagagagc caaauucuua uuuuc 25
<210> 1169
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1169
acacagagag ccaaauucuu auuuu 25
<210> 1170
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1170
cacacagaga gccaaauucu uauuu 25
<210> 1171
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1171
ucacacagag agccaaauuc uuauu 25
<210> 1172
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1172
cucacacaga gagccaaauu cuuau 25
<210> 1173
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1173
gcucacacag agagccaaau ucuua 25
<210> 1174
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1174
ugcucacaca gagagccaaa uucuu 25
<210> 1175
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1175
augcucacac agagagccaa auucu 25
<210> 1176
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1176
caugcucaca cagagagcca aauuc 25
<210> 1177
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1177
acaugcucac acagagagcc aaauu 25
<210> 1178
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1178
cacaugcuca cacagagagc caaau 25
<210> 1179
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1179
acacaugcuc acacagagag ccaaa 25
<210> 1180
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1180
cacacaugcu cacacagaga gccaa 25
<210> 1181
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1181
gcacacaugc ucacacagag agcca 25
<210> 1182
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1182
cgcacacaug cucacacaga gagcc 25
<210> 1183
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1183
acgcacacau gcucacacag agagc 25
<210> 1184
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1184
cacgcacaca ugcucacaca gagag 25
<210> 1185
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1185
acacgcacac augcucacac agaga 25
<210> 1186
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1186
cacacgcaca caugcucaca cagag 25
<210> 1187
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1187
acacacgcac acaugcucac acaga 25
<210> 1188
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1188
cacacacgca cacaugcuca cacag 25
<210> 1189
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1189
gcacacacgc acacaugcuc acaca 25
<210> 1190
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1190
cgcacacacg cacacaugcu cacac 25
<210> 1191
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1191
ucgcacacac gcacacaugc ucaca 25
<210> 1192
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1192
cucgcacaca cgcacacaug cucac 25
<210> 1193
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1193
ucucgcacac acgcacacau gcuca 25
<210> 1194
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1194
cucucgcaca cacgcacaca ugcuc 25
<210> 1195
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1195
ucucucgcac acacgcacac augcu 25
<210> 1196
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1196
cucucucgca cacacgcaca caugc 25
<210> 1197
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1197
ucucucucgc acacacgcac acaug 25
<210> 1198
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1198
cucucucucg cacacacgca cacau 25
<210> 1199
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1199
ucucucucuc gcacacacgc acaca 25
<210> 1200
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1200
cucucucucu cgcacacacg cacac 25
<210> 1201
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1201
ucucucucuc ucgcacacac gcaca 25
<210> 1202
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1202
gucucucucu cucgcacaca cgcac 25
<210> 1203
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1203
ugucucucuc ucucgcacac acgca 25
<210> 1204
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1204
cugucucucu cucucgcaca cacgc 25
<210> 1205
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1205
ucugucucuc ucucucgcac acacg 25
<210> 1206
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1206
gucugucucu cucucucgca cacac 25
<210> 1207
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1207
ugucugucuc ucucucucgc acaca 25
<210> 1208
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1208
cugucugucu cucucucucg cacac 25
<210> 1209
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1209
gcugucuguc ucucucucuc gcaca 25
<210> 1210
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1210
ggcugucugu cucucucucu cgcac 25
<210> 1211
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1211
aggcugucug ucucucucuc ucgca 25
<210> 1212
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1212
caggcugucu gucucucucu cucgc 25
<210> 1213
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1213
gcaggcuguc ugucucucuc ucucg 25
<210> 1214
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1214
ggcaggcugu cugucucucu cucuc 25
<210> 1215
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1215
aggcaggcug ucugucucuc ucucu 25
<210> 1216
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1216
uaggcaggcu gucugucucu cucuc 25
<210> 1217
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1217
uuaggcaggc ugucugucuc ucucu 25
<210> 1218
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1218
cuuaggcagg cugucugucu cucuc 25
<210> 1219
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1219
ucuuaggcag gcugucuguc ucucu 25
<210> 1220
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1220
uucuuaggca ggcugucugu cucuc 25
<210> 1221
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1221
cuucuuaggc aggcugucug ucucu 25
<210> 1222
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1222
ucuucuuagg caggcugucu gucuc 25
<210> 1223
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1223
uucuucuuag gcaggcuguc ugucu 25
<210> 1224
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1224
uuucuucuua ggcaggcugu cuguc 25
<210> 1225
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1225
auuucuucuu aggcaggcug ucugu 25
<210> 1226
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1226
cauuucuucu uaggcaggcu gucug 25
<210> 1227
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1227
ucauuucuuc uuaggcaggc ugucu 25
<210> 1228
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1228
uucauuucuu cuuaggcagg cuguc 25
<210> 1229
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1229
auucauuucu ucuuaggcag gcugu 25
<210> 1230
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1230
cauucauuuc uucuuaggca ggcug 25
<210> 1231
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1231
acauucauuu cuucuuaggc aggcu 25
<210> 1232
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1232
cacauucauu ucuucuuagg caggc 25
<210> 1233
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1233
ucacauucau uucuucuuag gcagg 25
<210> 1234
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1234
uucacauuca uuucuucuua ggcag 25
<210> 1235
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1235
auucacauuc auuucuucuu aggca 25
<210> 1236
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1236
cauucacauu cauuucuucu uaggc 25
<210> 1237
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1237
gcauucacau ucauuucuuc uuagg 25
<210> 1238
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1238
cgcauucaca uucauuucuu cuuag 25
<210> 1239
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1239
ccgcauucac auucauuucu ucuua 25
<210> 1240
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1240
gccgcauuca cauucauuuc uucuu 25
<210> 1241
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1241
agccgcauuc acauucauuu cuucu 25
<210> 1242
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1242
aagccgcauu cacauucauu ucuuc 25
<210> 1243
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1243
caagccgcau ucacauucau uucuu 25
<210> 1244
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1244
acaagccgca uucacauuca uuucu 25
<210> 1245
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1245
cacaagccgc auucacauuc auuuc 25
<210> 1246
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1246
ccacaagccg cauucacauu cauuu 25
<210> 1247
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1247
gccacaagcc gcauucacau ucauu 25
<210> 1248
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1248
ugccacaagc cgcauucaca uucau 25
<210> 1249
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1249
gugccacaag ccgcauucac auuca 25
<210> 1250
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1250
ugugccacaa gccgcauuca cauuc 25
<210> 1251
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1251
cugugccaca agccgcauuc acauu 25
<210> 1252
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1252
acugugccac aagccgcauu cacau 25
<210> 1253
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1253
aacugugcca caagccgcau ucaca 25
<210> 1254
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1254
caacugugcc acaagccgca uucac 25
<210> 1255
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1255
ucaacugugc cacaagccgc auuca 25
<210> 1256
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1256
gucaacugug ccacaagccg cauuc 25
<210> 1257
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1257
ugucaacugu gccacaagcc gcauu 25
<210> 1258
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1258
uugucaacug ugccacaagc cgcau 25
<210> 1259
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1259
cuugucaacu gugccacaag ccgca 25
<210> 1260
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1260
ccuugucaac ugugccacaa gccgc 25
<210> 1261
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1261
uccuugucaa cugugccaca agccg 25
<210> 1262
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1262
auccuuguca acugugccac aagcc 25
<210> 1263
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1263
cauccuuguc aacugugcca caagc 25
<210> 1264
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1264
ucauccuugu caacugugcc acaag 25
<210> 1265
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1265
aucauccuug ucaacugugc cacaa 25
<210> 1266
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1266
uaucauccuu gucaacugug ccaca 25
<210> 1267
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1267
uuaucauccu ugucaacugu gccac 25
<210> 1268
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1268
uuuaucaucc uugucaacug ugcca 25
<210> 1269
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1269
auuuaucauc cuugucaacu gugcc 25
<210> 1270
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1270
gauuuaucau ccuugucaac ugugc 25
<210> 1271
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1271
ugauuuauca uccuugucaa cugug 25
<210> 1272
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1272
uugauuuauc auccuuguca acugu 25
<210> 1273
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1273
auugauuuau cauccuuguc aacug 25
<210> 1274
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1274
uauugauuua ucauccuugu caacu 25
<210> 1275
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1275
uuauugauuu aucauccuug ucaac 25
<210> 1276
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1276
auuauugauu uaucauccuu gucaa 25
<210> 1277
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1277
cauuauugau uuaucauccu uguca 25
<210> 1278
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1278
gcauuauuga uuuaucaucc uuguc 25
<210> 1279
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1279
ugcauuauug auuuaucauc cuugu 25
<210> 1280
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1280
uugcauuauu gauuuaucau ccuug 25
<210> 1281
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1281
cuugcauuau ugauuuauca uccuu 25
<210> 1282
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1282
gcuugcauua uugauuuauc auccu 25
<210> 1283
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1283
agcuugcauu auugauuuau caucc 25
<210> 1284
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1284
aagcuugcau uauugauuua ucauc 25
<210> 1285
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1285
uaagcuugca uuauugauuu aucau 25
<210> 1286
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1286
guaagcuugc auuauugauu uauca 25
<210> 1287
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1287
aguaagcuug cauuauugau uuauc 25
<210> 1288
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1288
uaguaagcuu gcauuauuga uuuau 25
<210> 1289
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1289
auaguaagcu ugcauuauug auuua 25
<210> 1290
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1290
gauaguaagc uugcauuauu gauuu 25
<210> 1291
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1291
ugauaguaag cuugcauuau ugauu 25
<210> 1292
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1292
augauaguaa gcuugcauua uugau 25
<210> 1293
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1293
aaugauagua agcuugcauu auuga 25
<210> 1294
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1294
aaaugauagu aagcuugcau uauug 25
<210> 1295
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1295
uaaaugauag uaagcuugca uuauu 25
<210> 1296
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1296
auaaaugaua guaagcuugc auuau 25
<210> 1297
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1297
cauaaaugau aguaagcuug cauua 25
<210> 1298
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1298
ucauaaauga uaguaagcuu gcauu 25
<210> 1299
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1299
uucauaaaug auaguaagcu ugcau 25
<210> 1300
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1300
auucauaaau gauaguaagc uugca 25
<210> 1301
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1301
uauucauaaa ugauaguaag cuugc 25
<210> 1302
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1302
cuauucauaa augauaguaa gcuug 25
<210> 1303
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1303
gcuauucaua aaugauagua agcuu 25
<210> 1304
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1304
ugcuauucau aaaugauagu aagcu 25
<210> 1305
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1305
uugcuauuca uaaaugauag uaagc 25
<210> 1306
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1306
auugcuauuc auaaaugaua guaag 25
<210> 1307
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1307
uauugcuauu cauaaaugau aguaa 25
<210> 1308
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1308
guauugcuau ucauaaauga uagua 25
<210> 1309
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1309
aguauugcua uucauaaaug auagu 25
<210> 1310
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1310
caguauugcu auucauaaau gauag 25
<210> 1311
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1311
ucaguauugc uauucauaaa ugaua 25
<210> 1312
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1312
uucaguauug cuauucauaa augau 25
<210> 1313
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1313
cuucaguauu gcuauucaua aauga 25
<210> 1314
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1314
ucuucaguau ugcuauucau aaaug 25
<210> 1315
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1315
uucuucagua uugcuauuca uaaau 25
<210> 1316
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1316
uuucuucagu auugcuauuc auaaa 25
<210> 1317
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1317
auuucuucag uauugcuauu cauaa 25
<210> 1318
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1318
aauuucuuca guauugcuau ucaua 25
<210> 1319
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1319
uaauuucuuc aguauugcua uucau 25
<210> 1320
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1320
uuaauuucuu caguauugcu auuca 25
<210> 1321
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1321
uuuaauuucu ucaguauugc uauuc 25
<210> 1322
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1322
uuuuaauuuc uucaguauug cuauu 25
<210> 1323
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1323
guuuuaauuu cuucaguauu gcuau 25
<210> 1324
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1324
uguuuuaauu ucuucaguau ugcua 25
<210> 1325
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1325
uuguuuuaau uucuucagua uugcu 25
<210> 1326
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1326
uuuguuuuaa uuucuucagu auugc 25
<210> 1327
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1327
uuuuguuuua auuucuucag uauug 25
<210> 1328
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1328
cuuuuguuuu aauuucuuca guauu 25
<210> 1329
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1329
ucuuuuguuu uaauuucuuc aguau 25
<210> 1330
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1330
aucuuuuguu uuaauuucuu cagua 25
<210> 1331
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1331
aaucuuuugu uuuaauuucu ucagu 25
<210> 1332
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1332
caaucuuuug uuuuaauuuc uucag 25
<210> 1333
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1333
gcaaucuuuu guuuuaauuu cuuca 25
<210> 1334
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1334
agcaaucuuu uguuuuaauu ucuuc 25
<210> 1335
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1335
cagcaaucuu uuguuuuaau uucuu 25
<210> 1336
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1336
acagcaaucu uuuguuuuaa uuucu 25
<210> 1337
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1337
gacagcaauc uuuuguuuua auuuc 25
<210> 1338
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1338
agacagcaau cuuuuguuuu aauuu 25
<210> 1339
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1339
gagacagcaa ucuuuuguuu uaauu 25
<210> 1340
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1340
ugagacagca aucuuuuguu uuaau 25
<210> 1341
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1341
uugagacagc aaucuuuugu uuuaa 25
<210> 1342
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1342
auugagacag caaucuuuug uuuua 25
<210> 1343
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1343
uauugagaca gcaaucuuuu guuuu 25
<210> 1344
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1344
auauugagac agcaaucuuu uguuu 25
<210> 1345
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1345
uauauugaga cagcaaucuu uuguu 25
<210> 1346
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1346
auauauugag acagcaaucu uuugu 25
<210> 1347
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1347
gauauauuga gacagcaauc uuuug 25
<210> 1348
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1348
agauauauug agacagcaau cuuuu 25
<210> 1349
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1349
aagauauauu gagacagcaa ucuuu 25
<210> 1350
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1350
uaagauauau ugagacagca aucuu 25
<210> 1351
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1351
auaagauaua uugagacagc aaucu 25
<210> 1352
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1352
uauaagauau auugagacag caauc 25
<210> 1353
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1353
auauaagaua uauugagaca gcaau 25
<210> 1354
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1354
aauauaagau auauugagac agcaa 25
<210> 1355
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1355
aaauauaaga uauauugaga cagca 25
<210> 1356
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1356
uaaauauaag auauauugag acagc 25
<210> 1357
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1357
auaaauauaa gauauauuga gacag 25
<210> 1358
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1358
aauaaauaua agauauauug agaca 25
<210> 1359
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1359
uaauaaauau aagauauauu gagac 25
<210> 1360
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1360
auaauaaaua uaagauauau ugaga 25
<210> 1361
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1361
aauaauaaau auaagauaua uugag 25
<210> 1362
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1362
aaauaauaaa uauaagauau auuga 25
<210> 1363
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1363
uaaauaauaa auauaagaua uauug 25
<210> 1364
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1364
guaaauaaua aauauaagau auauu 25
<210> 1365
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1365
gguaaauaau aaauauaaga uauau 25
<210> 1366
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1366
ugguaaauaa uaaauauaag auaua 25
<210> 1367
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1367
uugguaaaua auaaauauaa gauau 25
<210> 1368
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1368
uuugguaaau aauaaauaua agaua 25
<210> 1369
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1369
auuugguaaa uaauaaauau aagau 25
<210> 1370
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1370
aauuugguaa auaauaaaua uaaga 25
<210> 1371
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1371
uaauuuggua aauaauaaau auaag 25
<210> 1372
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1372
auaauuuggu aaauaauaaa uauaa 25
<210> 1373
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1373
aauaauuugg uaaauaauaa auaua 25
<210> 1374
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1374
gaauaauuug guaaauaaua aauau 25
<210> 1375
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1375
agaauaauuu gguaaauaau aaaua 25
<210> 1376
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1376
uagaauaauu ugguaaauaa uaaau 25
<210> 1377
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1377
uuagaauaau uugguaaaua auaaa 25
<210> 1378
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1378
cuuagaauaa uuugguaaau aauaa 25
<210> 1379
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1379
ucuuagaaua auuugguaaa uaaua 25
<210> 1380
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1380
cucuuagaau aauuugguaa auaau 25
<210> 1381
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1381
acucuuagaa uaauuuggua aauaa 25
<210> 1382
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1382
uacucuuaga auaauuuggu aaaua 25
<210> 1383
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1383
auacucuuag aauaauuugg uaaau 25
<210> 1384
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1384
aauacucuua gaauaauuug guaaa 25
<210> 1385
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1385
aaauacucuu agaauaauuu gguaa 25
<210> 1386
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1386
gaaauacucu uagaauaauu uggua 25
<210> 1387
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1387
agaaauacuc uuagaauaau uuggu 25
<210> 1388
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1388
aagaaauacu cuuagaauaa uuugg 25
<210> 1389
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1389
gaagaaauac ucuuagaaua auuug 25
<210> 1390
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1390
ggaagaaaua cucuuagaau aauuu 25
<210> 1391
<211> 55361
<212> DNA
<213> 智人
<400> 1391
agctcctagg aagcttcagg gcttaaagct ccactctact tggactgtac tatcaggccc 60
ccaaaatggg gggagccgac agggaaggac tgatttccat ttcaaactgc attctggtac 120
tttgtactcc agcaccattg gccgatcaat atttaatgct tggagattct gactctgcgg 180
gagtcatgtc aggggacctt gggagccaat ctgcttgagc ttctgagtga taattattca 240
tgggctcctg cctcttgctc tttctctagc acggtcccac tctgcagact cagtgcctta 300
ttcagtcttc tctctcgctc tctccgctgc tgtagccgga ccctttgcct tcgccactgc 360
tcagcgtctg cacatcccta caatggctaa aacagcaatg gtaaggcact gcgcctcgtt 420
ctccgtcggc tctacctgga gcccacctct cacctcctct cttgagctct agaagcattc 480
agagatattt tataaagaaa aagatgttaa tggtaacaca ggaccaggaa ggacagggca 540
gttctggggg aggtgggagg gcagagaaga ggtctatgga aatctaaagc gaagaatttc 600
ttttaaaagg tagaagcggg taagttgccc tcctatgggt agagaattta ttctgtttcc 660
atatttaaaa ttaggactca atcgtgaggg gaggaagcta ccttaactgt ttgccttaaa 720
tgggcttaag ggacattttg gaaagtgctt tataacgacc tttttttttt ttatttcttc 780
tctagtttaa gaagaaaata ggaaaggggt aaagggaagg tgggagaaag gaaaaagaaa 840
attgcaaagt caaagcggtc ccatcccgct gtttgaaaga tgggtggaga cggggggagg 900
ggatggagag aactgggcac attttacggt attgtctcgt cgaagaaacc gctagtcctg 960
gggtgcggtg cagggaggta agacggcggg ggacagggtg ggggtaggac ctccgctcct 1020
ttgttttagg gcaagggagg ggaaggagag aggaagtcgc ggagggcgtg gagggcgcgg 1080
gtgggcagct gcaggggcgg ggaagcgcgc ggcagggagg ggtggaggga cagcggcttc 1140
gaaggcgctg gggtggggtt tctttgtgtg cggaccagcg gtcccggggg gaggcacctg 1200
cagcgctggg cgcacaatgc ggacagcccc acccagtgcg gaaccgcgca gccccgcccc 1260
cccgcccggt gctgcatctt cattcgaaag ggggtcgggt ggggagcgca gcgtgacacc 1320
caggagccca accctgcggg gacagcggcg ccacgccccg cgctccccgc tcccgactcc 1380
ccgccgcggc ttccaagaga gacctgacca ctgaccccgc cctccccacg ctggcctcat 1440
tgttctgctt ttaagagaga tgggaaaagt gggttaacat ttttcttttc ggaagcaaat 1500
tacatagagt gtttagacat agacacagat aaagggttct ttgaagacct ttgatcgttt 1560
gcgggaaaag cttctagaac ctagacatgt gtatgtataa taatagagat gacatgaaat 1620
cgtatataaa gcaaaagagg tcaaagtctt aagttaagcc acgcgaaatt tccgttttgt 1680
gggtcagaca gtgccaaata tcggcaattt cataagctca gagagacaag acagtggaga 1740
cacaggatga ccggaaaaga ttctggattc agggccttca tccgcaattg gtcttgtgcc 1800
ttgagtgccc acggttctgg cgctcagtgg ccccggggtg aaaaggcagg gtggggcctg 1860
gggtcctgtg gcagctggaa gcacgtgtcc cccgggactt ggttgcagga tgcggagaca 1920
gggaaagctg ccgaaaggac tccatctgcg cggctccgcc ctgccctacc ctccccgcgg 1980
agccggggag acctcaggct ccgagactgg cggggaagag gaatatggga ggggcagttg 2040
agctgtatgc agtcctggaa cctctttttt cagccccgca gtccacaacg gcccgagcac 2100
cccttgatgt gcgcagaccc ccggcgtggc tctcagcccc agcaccgagc ccctcccagc 2160
caagcgggtg gctctgcaga aaagctggct cgagccccgc ccggccacac aaaggcgcgg 2220
ccccacccag cccgggcgcg agaccgcaga ggtgaccccc ttcccaggga ttcagggagg 2280
gctgtctctt ctcgcccacc cacggtccgc ggagctcggg gctttttttc ccccagccca 2340
agccccccgc ccaccctctg ttctctatga ttttccagaa tggagacccc gcgaggggct 2400
tctctaaggg agaccctcgc tcctccagcg gggcgcggct cggccccacc cctcccagct 2460
gaggcccaga gccgcctacc gctggccggg tgggggcgca cgtggcgact gggtgtgtgg 2520
agcgcagcca gccctgcaga gccccgcgcc gcgccctgcg ctcccctccc cggagttggg 2580
cgctcgcccc cgcggtgcag ccggggagac cggtttctgc gcagtgtcct gagctacccc 2640
cgctttccac aattcgcagt tcactcgcac gtccagaaag gttctgagaa tgggtggtgg 2700
gggcgatctc gcctcgcttt ctgcacccct cagaaaggtt tccgctgcag gctagtggct 2760
gcaaactcat cgtcatcatc agtattatta tcatttcaaa tcgttgttat tatttaatga 2820
ttcagtagcc ttgtttgttc tcatttgttc aaaagggacg tggattgctc ttggttaagg 2880
attaaccctt gttgcgttcg ctttgcttcc tcctaattgc cctcatccct ttcccccaca 2940
aaaaggtaaa tttgtctcca gttgttcatt ttaagttata aagcaaatat atttttgctt 3000
cctgccagga ttatgtatgt tcatgtggct aagatacatg tgcaagtgct tgctaagagc 3060
agggtttgtg tgccaacgat tgctggaaaa ttctctgcaa agaattgttt gtggctgcaa 3120
tgggtgagaa tacacatata taattgagat gatcttcaac ataaggttat atctataaat 3180
atataaatat agtttatgca caaaatttta agttttttcc cctgaaactg ttcttccaac 3240
tgctgattct tgatacagcc tcaatcctac acagatacat ggatcgtgaa atggtagccg 3300
ccatccaaat aaaaatccca ccccaaatat gacaaacgca agcatccttt ctggccataa 3360
tttaactgca tttgcaaatc atgaaaaaaa cactacttct gcagtattaa aataatagat 3420
tttgaaatta attccaattt caaagataat taattatcag ggcgagtgct tttttcctga 3480
ttcattaaac aattatgtat tcagcatgat tgtaagaggt gcatataata ttccccatta 3540
tcttttctaa tgaagtgggc accttctgaa tggatatata agtaactaga aatgaaaagc 3600
tgaggatttg gtcagaattt caggataaaa ctgaaagaaa tggcagtagt ttatcaatta 3660
atctcatgta tttagtttat accaggtgag taagctgagc ctgcaataaa cactctctgt 3720
cccagtgtaa cacgtcgcag gtagctagaa tgataggata aattaataga ccttgtggtg 3780
tttgtctatg cacgttaaaa ttctctgaga gaaagtatat tttaaaatga taattaagat 3840
tggacatttg tgctattaaa atctacaact ttagtcaaaa ttcacaatgg ttttttttta 3900
caataatgtg acttacagat ttgtagtaaa ttattctatt ctaaaagaga aatgagtgtt 3960
tttattgtta cagctattac ctcattaata tttttagcaa acttttattt gttgcattga 4020
aagcagtttt aattactttg ggtttttatt tttcaaatta ctaatggata gatggtggaa 4080
taagcattta atcatttggc acaatatgac ttccatcaaa tagctcattc tcagtgatta 4140
aaaaatgcta caagaggcta caatttactc agattcagga aatgtccttt cagagtgcca 4200
taaggctgat tcatataata aaatagtttt cttccctata atttaagatc aaatagttac 4260
ttagttctgt gaatacctag cagtagctat caaacagaat tttaaagtta aatctgtaca 4320
actaacaatg aagtggagga tgaatcgata catattgaat ggaagacttt gtcattgata 4380
aattcaggcc atctttagga aaattccgga tttatcaatc accattattt tttacttcaa 4440
ctgagtgtga ctgatcacat gctcaggcta ccttggtagc tcattgctca caggaggctg 4500
aaaaaagctg gcctccgagc aggaggaagc tcagagcaca aacctaggcc tgggcgtggc 4560
cactgggagc tgctgatagc gaaccccagc tcacaccagt ttcttttttg gtcgtgggaa 4620
gaaaaacaca tattatcctg ttgtcacaag atctgtgacc ttatatgaaa aaatgctaga 4680
attttttcat taaaaaagaa aatactgaac tagccagtga cccagatgtt ttcagaacct 4740
agactggttc tgtccattgg aaaacctcgg tgtctgcatt aacttttcac cacactagag 4800
ggcaatcatg ttctctaaaa aagcagatga ttgatgtaaa cctagttcca aatattaact 4860
gtttaataaa atcttttctt ttaccaggaa cattcaagtg tttattcaat aagctgatgc 4920
catgctttac cctagtggat gaacagagct tgtacaattt tcaaggagac aggatgaaat 4980
gagtggtcat aatctgaaag tagatacacg ccctggttaa ttattccctg atggttttac 5040
ttctcagttt tattacattg ttattataat accatttatg ttacttctga gattttgtag 5100
tggataaata gtagaaaaat gtcagtagta atagcaaagt tatttagcag ccgaatattt 5160
taatgcttaa aaataaagga ataaattaaa gaaaatcatt gtttacttct tcatcgattg 5220
aaatgtgccc cctgttcaga gcacatctga atatcagagt ctccacctgc agagaacatg 5280
cagcttagcg agtaaaacag gcaggtatgt gatactgagg aggtgtacca aaaactgact 5340
gctgttattt ttcccatctt ctaagtctgt ctttcttttc catttaaaga taccttttta 5400
aatctaatcc aatgtgattt caatctagtt ttatcagatt tcaacaatta ttgagcatct 5460
ccttgtagtg gttttctgtt tattagaaaa tcgatgttaa ttttaacgaa gtaagaagaa 5520
atatataagt ataaactaat tttgggtatc atcaaaagtg gattttttaa atatgcattg 5580
atagaattat tttttgatta cattttatgt aattctaatc cagctataaa atatttaata 5640
gtgtcatatt actgtgttcc tcaaactttg atgtgcatat gaattacctt tgattttcat 5700
taaaatgcaa attctgattc aatacatctg gcttgaggca gacattctgt cttccgaaca 5760
agctcccaga tgatgctgat tctgaccact aaacacatca gttttaggga tattaacttg 5820
taatatacag gtatccctcc tggtaagctc tggtattatg tcttaacatt tttaaatcta 5880
tggtaatctt tacaaaatat tttacttccg aactcatata cctggggatt ttattactct 5940
gggaattatg tgttctgccc catcactctc tcttaattgg atttttaaaa ttatattcat 6000
attgcaggac tcggcagaag accttcgaga gaaaggtaga aaataagaat ttggctctct 6060
gtgtgagcat gtgtgcgtgt gtgcgagaga gagagacaga cagcctgcct aagaagaaat 6120
gaatgtgaat gcggcttgtg gcacagttga caaggatgat aaatcaataa tgcaagctta 6180
ctatcattta tgaatagcaa tactgaagaa attaaaacaa aagattgctg tctcaatata 6240
tcttatattt attatttacc aaattattct aagagtattt cttcctgaat accatgtgag 6300
aaaattctta agaatttatt gagtatgact gtatatttga aaagagtgtt ttcttctgct 6360
tatctaagcc aataaaggat cttcattatt caattctaac tttctaagga agtcaaccta 6420
cagatcagaa agaggatctt caaggaatag catcaaagac atagtcaggt ctcccatgca 6480
gtgactggct gaccatgcag ccattaccac ctttctggaa atattatgct gcaaaaatga 6540
tacaatacac gaaatatctc aaattaaaaa atataacatt tcccaaatag ggcactaaaa 6600
acatgatccc aaataaaact agcttcaggg tttgcagaat atactgttac tcaacacaaa 6660
gttggactaa gtctcaaagt tagccattca gttgttgtta acagttcatt tcagggtctc 6720
tcagaagctg ggaaactttc catttttgca atttcttgta cattgaagga aaggaagaca 6780
cacttaagac agcattacaa aagtaattca tgttttaaat gtttaattct ggcagtcggg 6840
cagggctctc tgtataacct catttggaga tgacaaaaat ctaaacttga gggcctcgag 6900
ccaataagtc ttcctatttc tttactcaaa cattttcccg caatggtgct ttctttcaac 6960
tgtttttctg gtgtattcat aaattccaga ttctctatgg gaagtaactt ttattgattg 7020
atttaaccct tgtatagcac atataacatg caaggcattg ttctaagaac tttccacata 7080
ttaactgtgt taatcactta ataatcctaa gtaggttcta ttacagatat ggaaactgag 7140
gcacagaaag ttgaagtatc ttactcaagg tcacacagtt agtcagatcc agaatttggg 7200
cccaggccat ctggcttcgg aatccatctt tcaccgattg ctgctagtct catatctgtt 7260
ccatgttaga ggtgagctcc cattgcagag gtcacacctg tgatatcacc attttattta 7320
aacagaccag agatggtctt ctcctttctg atcacagact caccttgaag agaaaatact 7380
tccaaattga tgcctagttt taatagctta cctggggctt attcaaataa ttgccatgat 7440
ttaggctttg ggagaaagag agctatgagg ccgtgtgggt tgtaacgtat gagacacatg 7500
gcgttctgca ggctcagcac agcatcgatt tctggtggga acacactctg atgaccagtt 7560
ccagaaataa cattgactta atctcctcag tcccatcatg gttagcacat ttcaaaatgc 7620
ctccttaact acttccatag gccagagata tttagtttta acattttgtt gaataaaata 7680
aatttacaca ttcacattta atataactat tagatgttat ttcaagattc tcttcatatt 7740
accatcaaag caggcaggca ggcaggagag aactgtagga aggttttgaa tcccttgtga 7800
aacattttta attatctttt aataaaggaa tcaggccctg tcatttgtca aggagacatt 7860
tgcagtagta aagcttgtgt ttataatatc catttttatt agtcatgatt aaagataaca 7920
tttgtgtaca tttgttctca caaaacactt ttatatgagt gtaaaggtta attaatgcat 7980
ttcagccatc attttgctgg tcatgtggaa atatagcttc tttaggaatt gtacttagag 8040
taggagccac atattatact ataaaaccat aacaaaaata ttttaagttt gttctcactt 8100
gttgttgacc tccagagtaa aatatttaat actctggaaa gttatgggtt tcaaaattta 8160
ttttatggca agaaatagat aattacagtt ctcatagagc acatttaaaa taatttattt 8220
ttatagggca aaaatattgc ctaggactga atgatttttt tttttttaca aagattgtaa 8280
agcaacgcct gcaagagtgc ccatttagca gttattcttc tggaataatt gtattttgga 8340
tgttggagtt cgcacattaa ccattagtac aagtacccaa tataacaata gatcatcagg 8400
ataataaatc tgtccatctt ttagttgtat gtctttatat caggataaag agaattgagt 8460
gaaatttatc taaacctagt cccacaaata cttttacaag agagcatgtt aaagtgtaaa 8520
ttaaattttt attagcattc tactctgtct ttggaagttt tttttcctta tgaaatgcag 8580
ccataaagtt taacttccat taacaaagct gctcacagta aacctattat aataatagtt 8640
tcccagtttg ggcttcctag tgaggagcaa cctaactcac acgaaacaac cccaacttat 8700
aatatattga ctgttacaaa actgagacca gaaaatccca tcaagatggt actgttatca 8760
tttccagact ctcgggaaga acattaatca tctcaggcac ttttaggata gacttattgc 8820
agcctccctg ggaactctgc ttcagaacat aattattttt attaatgcag agttactttt 8880
tatttccaac aaaaatatct attgttatta tttaagtctt acagctttat ctgagaaatt 8940
ccaattagca cccttctcat aataaatatt caaacacatg aaaaattacc aaagttgttc 9000
tagtctttta atgacatatt acatgatcct gcactcttgt cactttaaaa attatctttt 9060
tattatattt ctgatgattt ttttcttata tagtttttta aaaggagcag gcaagcatag 9120
aagactaaaa aatgttcaaa agaaaaatta aatcgcatga tctatctata tgggaccttg 9180
tcatttttag aaaacattca cctgcttcat ccttttgaat cttcatataa tccctctgag 9240
atgggcatac tatacaagtt gtcttattta aagattggta aatttaagct caaataattt 9300
attcagtggc aagcctcaga ggcagactcg gaacacaggt ctaatatata ttatatatat 9360
attataacat ataatatata tattacatat aataaagttg tgtatattat ttacctatca 9420
aaatatttat atgtaatata taaatatgtt atatatcatg tatgtgccta tttcatacat 9480
atatacacat tcatgcaaaa taaggtttag cactccctcc actgtcctgt aataaaacat 9540
gcacagtgag aatagtcata cacgaggcat atttgtcttc agtttaaagt cattgatagt 9600
cagtgtcact aactaaagta aaatagattg gagcaccaac tttgttctga agcctgtgcc 9660
aggtattatg agaacaaaaa taaaaatgtt cctcaccctt ggtggattta gtcttttgca 9720
gaaaaaaaga tcctgtacat gtcagaaagt tcaatagtaa taatggtaat ttataactat 9780
aaatggaagt caccatctca caatttcacc atcttaacaa ttttgttaaa ctgccctaca 9840
atattacaag atagtacata atgatacact agtaacatca actaggaagt accaagatcc 9900
accaaaaggc tgaaaaattt aaatatttaa tgagtccatc aaccaatctg gccagagaat 9960
tctttaatta aaatgcttcc caaattttac tgagaatcag cagcgtttga ggagctagcc 10020
tccaccccca gaggttctca ctctattagg tctgaagcag gtcccatgga tttgcatttc 10080
taacaagctc ccaggtggtg ctgatgaggc tgattcagaa ccacacttgg agtagaccta 10140
aaacagcagt gacctgtagg gtccccaagc agcaggccag gacagcatgt gagttacgtc 10200
ctctgtggag ctctgcaaca aggcgtcaag aggtcagagt ctaagtcccc atcagctctg 10260
cccttctcca ccagtgctgc tggtgctgca tggaaggaag agcccagaag ggattctgag 10320
tttcagtctt tactcttgct gacgcacctt ggtcaggtca attttcctgt ttgttcctct 10380
aattcagcat ctgtaaaata gccatgtgaa ctgccttgtc catatcagag ggtctttttc 10440
agactcaagg aaaaaaacgt gaaagtgatt agtgtctgtc aagtagtata taaatgcaag 10500
aagttgagtt tttaaattgt cattagatat aaatacccat gtgcatgcat ttagaatgag 10560
taaagaggga acaaggagcg caatcaaaaa ctgcgtcatt tgctttttga aaaatacttt 10620
ctatgtaatg aaaagtgaaa taaaatgtta attgagtccc tctgacaaca gcatcagacg 10680
ttttgcagtt cttgtgatta gaacccacct ggccagccct tcttcctcct aaagaagagc 10740
cttcttcttc ttaaatgaag gttggctcag aagaagcaat taactcattc aacgttttgt 10800
tacagtcaat ccacatccaa cttttcccca actcaatctg ctttaaggga aggatggtaa 10860
gtggtggccc aagatggcaa ccatcaagct tagagaatct ctagaagcag gggtgtcccc 10920
agcaagtaga cactgaaaat atgagagggc tgataagcca gagataaaac tcagtactta 10980
ctttgcttct agtccatgtc tacccctttc ttggcaccac cttgacacta ccctctgagt 11040
ccaccttcct gagatggtac aaactctgct tagacaaagc agcccatgtc caaaggtgtt 11100
agggctcagt ttaaagctgc cttcaaaagt taaaacagaa gtgtaaagtt ctgtgcaatt 11160
aaaaataatc agcttgtctt ggaactcaaa cgaatgtaaa atcctatgaa aattaaaaag 11220
cagtaccaca agttacccca aaagtcctta ggtcagtaac tgttcctgtt acaggtaaga 11280
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ttactagaat gagcctctct ctctggtaat catgtctgct tccactaatt ccatctgttt 25680
cctctctctc cctcctatcc tgctagatct taattccttc gaccttcctt tgtttttcta 25740
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acatgaactt ttggtcatag ttttaaacaa aaacagtgtt aaatatattt tttaaaacac 53820
agtaagtctt gtaagatctt ttctaacatg acattttgca gggcccatat tttccttctg 53880
aaatgggaaa aattcataaa agtagacacc aaactgggtt acttctagtc aagcgcatgg 53940
tacgcaaagg accagacaaa aagggcctgt gacatttctt cttccttttg tgttttttag 54000
gagaggcatg ctgcggaggt gcgcaggaac aaggaactcc aggttgaact gtctggctga 54060
agcaagggag ggtctggcac gccccaccaa tagtaaatcc ccctgcctat attataatgg 54120
atcatgcgat atcaggatgg ggaatgtatg acatggttta aaaagaactc attataaaaa 54180
aaaaaaaaca aaaaaaatca aaaattaaaa aaaatcaatg cggtctcttt gcagaatgtt 54240
ttgcttgatg tttaaaaaat accttggatc ttattttgta aatacttaca tttttgttaa 54300
aaaatacaag tattgcatta tgcaagttat ttcataatct tacatgtcct gtaacaggct 54360
tttgatgttg tgtctttcca ctcaaatgaa tttgctaggt ctgttctttt tgaagctccc 54420
catgtctaac tccattccaa aagaaaaatg aggtcagtag acagtctatg gtgctagaaa 54480
cccaccattg cctaatgacc tagaaggctt tgttgtctct gagcttgact aagaccatac 54540
ctagatcaca ggtattatga ctccacatga accttcacat ttgttcgctc ataatctact 54600
tactgcctaa aaactacaaa accaggctaa gaaataccac cagtcatagc atttacttct 54660
gcttctcctg gattatgtgc tacaaatgtg ctttggcttt agaaagggat ggatgagaag 54720
acagacctga gaccaatctg ggtagaagca aaaagttgaa ccttttaaag tgctgaacac 54780
aaatccaaat tcgaatggtt caagcagccg tgaaatcgct cttcataaag tgggcttaat 54840
tctctagttt aagttctttt gatggaatga attaattaat gtgtcaggtg gcttatttgt 54900
ggatgccatg attgatgatg ttcattttaa gctcttacct atagtacaag tacatgatgc 54960
tactgaatat ttttccactt ggaaactgtg agctggttgt tgcattaaaa cacacataca 55020
aacaaaatca aaaacactgc ggactttcac tcaagctggt ctttcttccc cagtgtaagg 55080
caatcctgcc tactaacaac accaacaaca aaacactcca tctgtgaagc tgacgcagtt 55140
aagggggcta ggcagggcat ttgtgccaac taagaatcac cagataccca ccataagtac 55200
ctatcgcagt tttgaagtcg tttctcccca actcccaact cctgaaggtt gctgcctgca 55260
tatttactct tcattagtgc tattttcctg tatgtcattg tgagcaagct gtgattaata 55320
aagaattgga gttctgtgaa ctaataaagg tttggtctgt t 55361
<210> 1392
<211> 23
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1392
auccaauuaa gagagaguga ugg 23
<210> 1393
<211> 23
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1393
aauccaauua agagagagug aug 23
<210> 1394
<211> 23
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1394
uccaauuaag agagagugau ggg 23
<210> 1395
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1395
uccaauuaag agagagugau g 21
<210> 1396
<211> 19
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1396
ccaauuaaga gagagugau 19
<210> 1397
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1397
aauccaauua agagagagug a 21
<210> 1398
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1398
caauuaagag agagugaugg g 21
<210> 1399
<211> 23
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1399
gaguccugca auaugaauau aau 23
<210> 1400
<211> 23
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1400
guccugcaau augaauauaa uuu 23
<210> 1401
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1401
guccugcaau augaauauaa u 21
<210> 1402
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1402
gaguccugca auaugaauau a 21
<210> 1403
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1403
ccugcaauau gaauauaauu u 21
<210> 1404
<211> 19
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1404
gaguccugca auaugaaua 19
<210> 1405
<211> 19
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1405
ugcaauauga auauaauuu 19
<210> 1406
<211> 23
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1406
gucuucugcc gaguccugca aua 23
<210> 1407
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1407
aggucuucug ccgaguccug c 21
<210> 1408
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1408
cuucugccga guccugcaau a 21
<210> 1409
<211> 19
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1409
ucugccgagu ccugcaaua 19
<210> 1410
<211> 23
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1410
gcacacaugc ucacacagag agc 23
<210> 1411
<211> 23
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1411
acacaugcuc acacagagag cca 23
<210> 1412
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1412
acacaugcuc acacagagag c 21
<210> 1413
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1413
gcacacaugc ucacacagag a 21
<210> 1414
<211> 21
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1414
acaugcucac acagagagcc a 21
<210> 1415
<211> 19
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1415
gcacacaugc ucacacaga 19
<210> 1416
<211> 19
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1416
augcucacac agagagcca 19
<210> 1417
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1417
gagtcctgca atatgaatat aattt 25
<210> 1418
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1418
gagtcctgca atatgaatat aattt 25
<210> 1419
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1419
aatccaatta agagagagtg atggg 25
<210> 1420
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1420
aatccaatta agagagagtg atggg 25
<210> 1421
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1421
aggtcttctg ccgagtcctg caata 25
<210> 1422
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1422
aggtcttctg ccgagtcctg caata 25
<210> 1423
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1423
gcacacatgc tcacacagag agcca 25
<210> 1424
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1424
gcacacatgc tcacacagag agcca 25
<210> 1425
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1425
gaguccugca auaugaauau aauuu 25
<210> 1426
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1426
gaguccugca auaugaauau aauuu 25
<210> 1427
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1427
aauccaauua agagagagug auggg 25
<210> 1428
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1428
aauccaauua agagagagug auggg 25
<210> 1429
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1429
aggucuucug ccgaguccug caaua 25
<210> 1430
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1430
aggucuucug ccgaguccug caaua 25
<210> 1431
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1431
gcacacaugc ucacacagag agcca 25
<210> 1432
<211> 25
<212> RNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<400> 1432
gcacacaugc ucacacagag agcca 25
<210> 1433
<211> 564
<212> DNA
<213> 智人
<400> 1433
atggctaaaa cagcaatggc ctacaaggaa aaaatgaagg agctgtccat gctgtcactg 60
atctgctctt gcttttaccc ggaacctcgc aacatcaaca tctatactta cgatgatatg 120
gaagtgaagc aaatcaacaa acgtgcctct ggccaggctt ttgagctgat cttgaagcca 180
ccatctccta tctcagaagc cccacgaact ttagcttctc caaagaagaa agacctgtcc 240
ctggaggaga tccagaagaa actggaggct gcagaggaaa gaagaaagtc tcaggaggcc 300
caggtgctga aacaattggc agagaagagg gaacacgagc gagaagtcct tcagaaggct 360
ttggaggaga acaacaactt cagcaagatg gcggaggaaa agctgatcct gaaaatggaa 420
caaattaagg aaaaccgtga ggctaatcta gctgctatta ttgaacgtct gcaggaaaag 480
ctggtcaagt ttatttcttc tgaactaaaa gaatctatag agtctcaatt tctggagctt 540
cagagggaag gagagaagca atga 564
<210> 1434
<211> 187
<212> PRT
<213> 智人
<400> 1434
Met Ala Lys Thr Ala Met Ala Tyr Lys Glu Lys Met Lys Glu Leu Ser
1 5 10 15
Met Leu Ser Leu Ile Cys Ser Cys Phe Tyr Pro Glu Pro Arg Asn Ile
20 25 30
Asn Ile Tyr Thr Tyr Asp Asp Met Glu Val Lys Gln Ile Asn Lys Arg
35 40 45
Ala Ser Gly Gln Ala Phe Glu Leu Ile Leu Lys Pro Pro Ser Pro Ile
50 55 60
Ser Glu Ala Pro Arg Thr Leu Ala Ser Pro Lys Lys Lys Asp Leu Ser
65 70 75 80
Leu Glu Glu Ile Gln Lys Lys Leu Glu Ala Ala Glu Glu Arg Arg Lys
85 90 95
Ser Gln Glu Ala Gln Val Leu Lys Gln Leu Ala Glu Lys Arg Glu His
100 105 110
Glu Arg Glu Val Leu Gln Lys Ala Leu Glu Glu Asn Asn Asn Phe Ser
115 120 125
Lys Met Ala Glu Glu Lys Leu Ile Leu Lys Met Glu Gln Ile Lys Glu
130 135 140
Asn Arg Glu Ala Asn Leu Ala Ala Ile Ile Glu Arg Leu Gln Glu Lys
145 150 155 160
Leu Val Lys Phe Ile Ser Ser Glu Leu Lys Glu Ser Ile Glu Ser Gln
165 170 175
Phe Leu Glu Leu Gln Arg Glu Gly Glu Lys Gln
180 185
<210> 1435
<211> 540
<212> DNA
<213> 智人
<400> 1435
atggctaaaa cagcaatggc ctacaaggaa aaaatgaagg agctgtccat gctgtcactg 60
atctgctctt gcttttaccc ggaacctcgc aacatcaaca tctatactta cgatgatatg 120
gaagtgaagc aaatcaacaa acgtgcctct ggccaggctt ttgagctgat cttgaagcca 180
ccatctccta tctcagaagc cccacgaact ttagcttctc caaagaagaa agacctgtcc 240
ctggaggaga tccagaagaa actggaggct gcagaggaaa gaagaaagtc tcaggaggcc 300
caggtgctga aacaattggc agagaagagg gaacacgagc gagaagtcct tcagaaggct 360
ttggaggaga acaacaactt cagcaagatg gcggaggaaa agctgatcct gaaaatggaa 420
caaattaagg aaaaccgtga ggctaatcta gctgctatta ttgaacgtct gcaggaaaag 480
gagaggcatg ctgcggaggt gcgcaggaac aaggaactcc aggttgaact gtctggctga 540
<210> 1436
<211> 179
<212> PRT
<213> 智人
<400> 1436
Met Ala Lys Thr Ala Met Ala Tyr Lys Glu Lys Met Lys Glu Leu Ser
1 5 10 15
Met Leu Ser Leu Ile Cys Ser Cys Phe Tyr Pro Glu Pro Arg Asn Ile
20 25 30
Asn Ile Tyr Thr Tyr Asp Asp Met Glu Val Lys Gln Ile Asn Lys Arg
35 40 45
Ala Ser Gly Gln Ala Phe Glu Leu Ile Leu Lys Pro Pro Ser Pro Ile
50 55 60
Ser Glu Ala Pro Arg Thr Leu Ala Ser Pro Lys Lys Lys Asp Leu Ser
65 70 75 80
Leu Glu Glu Ile Gln Lys Lys Leu Glu Ala Ala Glu Glu Arg Arg Lys
85 90 95
Ser Gln Glu Ala Gln Val Leu Lys Gln Leu Ala Glu Lys Arg Glu His
100 105 110
Glu Arg Glu Val Leu Gln Lys Ala Leu Glu Glu Asn Asn Asn Phe Ser
115 120 125
Lys Met Ala Glu Glu Lys Leu Ile Leu Lys Met Glu Gln Ile Lys Glu
130 135 140
Asn Arg Glu Ala Asn Leu Ala Ala Ile Ile Glu Arg Leu Gln Glu Lys
145 150 155 160
Glu Arg His Ala Ala Glu Val Arg Arg Asn Lys Glu Leu Gln Val Glu
165 170 175
Leu Ser Gly
<210> 1437
<211> 525
<212> DNA
<213> 智人
<400> 1437
atggcctaca aggaaaaaat gaaggagctg tccatgctgt cactgatctg ctcttgcttt 60
tacccggaac ctcgcaacat caacatctat acttacgatg atatggaagt gaagcaaatc 120
aacaaacgtg cctctggcca ggcttttgag ctgatcttga agccaccatc tcctatctca 180
gaagccccac gaactttagc ttctccaaag aagaaagacc tgtccctgga ggagatccag 240
aagaaactgg aggctgcaga ggaaagaaga aagtctcagg aggcccaggt gctgaaacaa 300
ttggcagaga agagggaaca cgagcgagaa gtccttcaga aggctttgga ggagaacaac 360
aacttcagca agatggcgga ggaaaagctg atcctgaaaa tggaacaaat taaggaaaac 420
cgtgaggcta atctagctgc tattattgaa cgtctgcagg aaaaggagag gcatgctgcg 480
gaggtgcgca ggaacaagga actccaggtt gaactgtctg gctga 525
<210> 1438
<211> 174
<212> PRT
<213> 智人
<400> 1438
Met Ala Tyr Lys Glu Lys Met Lys Glu Leu Ser Met Leu Ser Leu Ile
1 5 10 15
Cys Ser Cys Phe Tyr Pro Glu Pro Arg Asn Ile Asn Ile Tyr Thr Tyr
20 25 30
Asp Asp Met Glu Val Lys Gln Ile Asn Lys Arg Ala Ser Gly Gln Ala
35 40 45
Phe Glu Leu Ile Leu Lys Pro Pro Ser Pro Ile Ser Glu Ala Pro Arg
50 55 60
Thr Leu Ala Ser Pro Lys Lys Lys Asp Leu Ser Leu Glu Glu Ile Gln
65 70 75 80
Lys Lys Leu Glu Ala Ala Glu Glu Arg Arg Lys Ser Gln Glu Ala Gln
85 90 95
Val Leu Lys Gln Leu Ala Glu Lys Arg Glu His Glu Arg Glu Val Leu
100 105 110
Gln Lys Ala Leu Glu Glu Asn Asn Asn Phe Ser Lys Met Ala Glu Glu
115 120 125
Lys Leu Ile Leu Lys Met Glu Gln Ile Lys Glu Asn Arg Glu Ala Asn
130 135 140
Leu Ala Ala Ile Ile Glu Arg Leu Gln Glu Lys Glu Arg His Ala Ala
145 150 155 160
Glu Val Arg Arg Asn Lys Glu Leu Gln Val Glu Leu Ser Gly
165 170
<210> 1439
<211> 19
<212> RNA
<213> 智人
<400> 1439
gcucaagcau ggauucuaa 19
<210> 1440
<211> 19
<212> RNA
<213> 智人
<400> 1440
caaucaaggu aguaauaug 19
<210> 1441
<211> 19
<212> RNA
<213> 智人
<400> 1441
gggcuucgcu acaggaauc 19
<210> 1442
<211> 19
<212> RNA
<213> 智人
<400> 1442
caggguggau uugguaaua 19
<210> 1443
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
寡核苷酸
<220>
<223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic
寡核苷酸
<400> 1443
aaggcttcat attgtacttt 20
<210> 1444
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
引物
<400> 1444
ctcagtgcct tattcagtct tctc 24
<210> 1445
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
引物
<400> 1445
tcttctgccg agtcccattt 20
<210> 1446
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
探针
<400> 1446
tcagcgtctg cacatcccta caat 24
<210> 1447
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
引物
<400> 1447
ccacgaactt tagcttctcc a 21
<210> 1448
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
引物
<400> 1448
gccaattgtt tcagcacctg 20
<210> 1449
<211> 26
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
探针
<400> 1449
actttcttct ttcctctgca gcctcc 26
Claims (91)
1.包含寡核苷酸的化合物,所述寡核苷酸包含具有至少19个连续核碱基序列的连接核苷,所述序列与具有与SEQ ID NO:944至少90%同一性的转录物的等长部分或与SEQ IDNO:944的连续19至50个核碱基部分至少90%互补,其中所述连接核苷的至少一个核苷键联是非天然键联。
2.寡核苷酸,其包含具有至少19个连续核碱基序列的连接核苷,所述序列与具有与SEQID NO:944至少90%同一性的转录物的等长部分或与SEQ ID NO:944的连续19至50个核碱基部分至少90%互补,其中所述连接核苷的至少一个核苷键联是非天然键联。
3.权利要求1或2所述的寡核苷酸,其中所述核碱基序列包含至少10个连续核碱基的部分,所述部分与SEQ ID NO:1-446、SEQ ID NO:894-918、SEQ ID NO:945-1390或SEQ ID NO:1392-1432中任一个的等长部分共享至少90%同一性。
4.权利要求1-3中任一项所述的寡核苷酸,其中所述核碱基序列包含至少11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25个连续核碱基的部分,所述部分与SEQ ID NO:1-446、SEQ ID NO:894-918、SEQ ID NO:945-1390或SEQ ID NO:1392-1432中任一个的等长部分共享至少90%同一性。
5.权利要求1-3中任一项所述的寡核苷酸,其中所述核碱基序列包含至少10个连续核碱基的部分,所述部分与SEQ ID NO:31、36、41、46、55、144、146、150、169、170、171、172、173、177、181、185、197、203、209、215、237、244、249、252、380、385、390、395、400、975、980、985、999、1088、1090、1094、1113、1114、1115、1116、1117、1121、1125、1129、1141、1147、1153、1159、1181、1188、1193、1196、1324、1329、1334、1339或1344中任一个的等长部分共享至少90%同一性。
6.权利要求1-5中任一项所述的寡核苷酸,其中所述核碱基序列包含至少11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25个连续核碱基的部分,所述部分与SEQ ID NO:31、36、41、46、55、144、146、150、169、170、171、172、173、177、181、185、197、203、209、215、237、244、249、252、380、385、390、395、400、975、980、985、999、1088、1090、1094、1113、1114、1115、1116、1117、1121、1125、1129、1141、1147、1153、1159、1181、1188、1193、1196、1324、1329、1334、1339或1344中任一个的等长部分共享至少90%同一性。
7.包含寡核苷酸的化合物,所述寡核苷酸包含具有至少19个连续核碱基序列的连接核苷,其中所述核碱基序列包含至少10个连续核碱基的部分,所述部分与SEQ ID NO:894-918或SEQ ID NO:1392-1432中任一个的等长部分共享至少90%同一性。
8.寡核苷酸,其包含具有至少19个连续核碱基序列的连接核苷,其中所述核碱基序列包含至少10个连续核碱基的部分,所述部分与SEQ ID NO:894-918或SEQ ID NO:1392-1432中任一个的等长部分共享至少90%同一性。
9.权利要求7或8所述的寡核苷酸,其中所述核碱基序列包含至少11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25个连续核碱基的部分,所述部分与SEQ ID NO:894-918或SEQ ID NO:1392-1432中任一个共享至少90%同一性。
10.包含寡核苷酸的化合物,所述寡核苷酸包含具有至少19个连续核碱基序列的连接核苷,其中所述核碱基序列包含与SEQ ID NO:944的121-144、144-168、146-170、150-170、150-172、150-174、169-193、169-189、169-191、170-190、170-192、171-191、171-193、172-192、172-194、170-194、171-195、172-196、173-197、185-209、197-221、237-261、249-273、252-276或276-300位中任一个内的核碱基的等长部分至少90%互补的至少10个连续核碱基的部分。
11.寡核苷酸,其包含具有至少19个连续核碱基序列的连接核苷,其中所述核碱基序列包含与在SEQ ID NO:944的121-144、144-168、146-170、150-170、150-172、150-174、169-193、169-189、169-191、170-190、170-192、171-191、171-193、172-192、172-194、170-194、171-195、172-196、173-197、185-209、197-221、237-261、249-273、252-276或276-300位中任一个内的核碱基的等长部分至少90%互补的至少10个连续核碱基的部分。
12.权利要求10或11所述的寡核苷酸,其中所述核碱基序列的部分与SEQ ID NO:944的121-144、144-168、146-170、150-170、150-172、150-174、169-193、169-189、169-191、170-190、170-192、171-191、171-193、172-192、172-194、170-194、171-195、172-196、173-197、185-209、197-221、237-261、249-273、252-276或276-300位中任一个内的核碱基的等长部分100%互补。
13.权利要求12所述的寡核苷酸,其中所述核碱基序列的部分与SEQ ID NO:944的144-164、144-166、145-167、146-166、146-168、147-165或148-168位中任一个内的核碱基的等长部分100%互补。
14.权利要求12所述的寡核苷酸,其中所述核碱基序列的部分与SEQ ID NO:944的173-191、173-193、173-195、173-197、175-195、175-197、177-197或179-197位中任一个内的核碱基的等长部分100%互补。
15.权利要求12所述的寡核苷酸,其中所述核碱基序列的部分与SEQ ID NO:944的185-205、187-209、189-209、185-207、197-217、197-219或191-209位中任一个内的核碱基的等长部分100%互补。
16.权利要求12所述的寡核苷酸,其中所述核碱基序列的部分与SEQ ID NO:944的237-255、237-257、237-259、239-259、239-261、241-261、237-257、249-269、249-271、252-272、252-274或243-261位中任一个内的核碱基的等长部分100%互补。
17.权利要求10或11所述的寡核苷酸,其中所述核碱基序列包含至少11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25个连续核碱基的部分,所述部分与SEQ ID NO:944的121-144、144-168、146-170、150-170、150-172、150-174、169-193、169-189、169-191、170-190、170-192、171-191、171-193、172-192、172-194、170-194、171-195、172-196、173-197、185-209、197-221、237-261、249-273、252-276或276-300位中任一个内的核碱基的等长部分互补。
18.权利要求10或11所述的寡核苷酸,其中所述核碱基序列包含至少11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25个连续核碱基的部分,所述部分与SEQ ID NO:944的144-164、144-166、145-167、146-166、146-168、147-165、148-168、173-191、173-193、173-195、173-197、175-195、175-197、177-197、179-197、185-205、185-207、197-217、197-219、187-209、189-209、191-209、237-255、237-257、237-259、239-259、239-261、241-261、237-257、249-269、249-271、252-272、252-274或243-261位中任一个内的核碱基的等长部分互补。
19.权利要求1-18中任一项所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸为19和40个核苷长度。
20.上述权利要求中任一项所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含至少一个选自下组的核苷键联:磷酸二酯键联、硫代磷酸酯(phosphorothioate)键联、烷基磷酸酯键联、烷基膦酸酯键联、3-甲氧基丙基膦酸酯键联、二硫代磷酸酯键联、磷酸三酯键联、甲基膦酸酯键联、氨基烷基磷酸三酯键联、亚烷基膦酸酯键联、亚膦酸酯键联、氨基磷酸酯键联、硫代氨基磷酸酯键联、二氨基磷酸酯(例如,包括二氨基磷酸酯吗啉代(PMO)、3’氨基核糖或5’氨基核糖)键联、氨基烷基氨基磷酸酯键联、硫代氨基磷酸酯键联、硫代烷基膦酸酯键联、硫代烷基磷酸三酯键联、硫化磷酸酯(thiophosphate)键联、硒代磷酸酯键联和硼代磷酸酯键联,或其任何组合。
21.上述权利要求中任一项所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸的至少两个、三个或四个核苷间键联是磷酸二酯核苷间键联。
22.权利要求1-20中任一项所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含至少两个、三个或四个修饰的核苷间键联。
23.权利要求22所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸的修饰的核苷间键联中的每一个独立地选自硫代磷酸酯键联、氨基磷酸酯键联、硫代氨基磷酸酯键联、二氨基磷酸酯键联。
24.权利要求22或23所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联。
25.权利要求23所述的寡核苷酸,其中所述硫代磷酸酯核苷间键联处于Rp构型或Sp构型中的一种。
26.前述权利要求中任一项的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含至少一个修饰的核碱基。
27.权利要求26所述的寡核苷酸,其中所述至少一个修饰的核碱基是5-甲基胞嘧啶、假尿苷或5-甲氧基尿苷。
28.前述权利要求中任一项所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含至少一个修饰的糖部分。
29.权利要求28所述的修饰的寡核苷酸,其中所述修饰的糖部分是2’-OMe修饰的糖部分、双环糖部分、2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’MOE)、2’-脱氧-2’-氟核苷、2’-氟-β-D-阿糖核苷、锁核酸(LNA)、受约束的乙基2’-4’-桥接核酸(cEt)、S-cEt、己糖醇核酸(HNA)和三环类似物(例如,tcDNA)中的一种。
30.权利要求1-23中任一项所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含在5’末端通过磷酸二酯核苷间键联连接的三个连接核苷和在3’末端通过磷酸二酯核苷间键联连接的三个连接核苷。
31.权利要求1-20和22-29中任一项所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含通过硫代磷酸酯核苷间键联连接的一个或多个2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,任选地其中所述寡核苷酸中的所有核苷包括包含2’-MOE的修饰的糖部分;进一步任选地,其中所述寡核苷酸中的所有胞嘧啶核苷包含修饰的核碱基5-甲基胞嘧啶;并且进一步任选地,其中所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联。
32.权利要求1-23和25-29中任一项所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含在5’末端通过硫代磷酸酯核苷间键联连接的三个连接核苷和在3’末端通过硫代磷酸酯核苷间键联连接的三个连接核苷。
33.权利要求32所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含通过磷酸二酯核苷间键联连接的五个连接核苷。
34.权利要求33所述的寡核苷酸,其中所述五个连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
35.权利要求33或34所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
36.权利要求1-35中任一项所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸展现出全长STMN2转录物或STMN2蛋白的至少30%、40%、50%、60%、70%、80%或90%增加,任选地其中所述增加是与将神经元暴露于所述寡核苷酸之前的水平相比。
37.权利要求1-36中任一项所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸展现出全长STMN2转录物或STMN2蛋白的至少100%增加,任选地其中所述增加是与将神经元暴露于所述寡核苷酸之前的水平相比。
38.权利要求1-37中任一项所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸展现出全长STMN2转录物或STMN2蛋白的至少200%增加,任选地其中所述增加是与将神经元暴露于所述寡核苷酸之前的水平相比。
39.权利要求1-38中任一项所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸展现出全长STMN2转录物或STMN2蛋白的至少300%增加,任选地其中所述增加是与将神经元暴露于所述寡核苷酸之前的水平相比。
40.权利要求1-39中任一项所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸展现出全长STMN2转录物或STMN2蛋白的至少400%增加,任选地其中所述增加是与将神经元暴露于所述寡核苷酸之前的水平相比。
41.权利要求36-40中任一项所述的寡核苷酸,其中与使用TDP43反义寡核苷酸实现的全长STMN2蛋白的降低水平相比,测量所述全长STMN2蛋白的增加。
42.权利要求1-35中任一项所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸展现出全长STMN2转录物或STMN2蛋白的至少10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或100%挽救,任选地其中所述增加是与将神经元暴露于所述寡核苷酸之前的水平相比。
43.权利要求1-35和42中任一项所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸展现出具有隐蔽外显子的STMN2转录物的至少50%、60%、70%、80%或90%减少。
44.药物组合物,其包含一种或多种权利要求1-43中任一项所述的寡核苷酸,或其药学上可接受的盐和药学上可接受的赋形剂。
45.在有此需要的患者中治疗神经学疾病和/或神经病的方法,所述方法包括向所述患者施用权利要求1-43中任一项的寡核苷酸或其药学上可接受的盐,或权利要求44的药物组合物。
46.权利要求45所述的方法,其中所述神经学疾病选自由肌萎缩侧索硬化(ALS)、额颞叶痴呆(FTD)、阿尔茨海默病(AD)、帕金森病(PD)、亨廷顿病、臂丛损伤、周围神经损伤、进行性核上性麻痹(PSP)、脑外伤、脊髓损伤和皮质基底节变性(CBD)组成的组。
47.权利要求45所述的方法,其中所述神经病是化学疗法诱发的神经病。
48.恢复运动神经元的轴突外生长和/或再生的方法,所述方法包括将所述运动神经元暴露于权利要求1-43中任一项的寡核苷酸或其药学上可接受的盐,或权利要求44的药物组合物。
49.增加、促进、稳定或维持神经元中STMN2表达和/或功能的方法,所述方法包括将所述神经元暴露于权利要求1-43中任一项的寡核苷酸或其药学上可接受的盐,或权利要求44的药物组合物。
50.权利要求48或49所述的方法,其中所述神经元是需要治疗神经学疾病和/或神经病的患者的神经元。
51.权利要求50所述的方法,其中所述神经学疾病选自由肌萎缩侧索硬化(ALS)、额颞叶痴呆(FTD)、阿尔茨海默病(AD)、帕金森病(PD)、亨廷顿病、臂丛损伤、周围神经损伤、进行性核上性麻痹(PSP)、脑外伤、脊髓损伤和皮质基底节变性(CBD)组成的组。
52.权利要求50所述的方法,其中所述神经病是化学疗法诱发的神经病。
53.权利要求48-52中任一项所述的方法,其中所述暴露在体内或离体进行。
54.权利要求48-52中任一项所述的方法,其中所述暴露包括将所述寡核苷酸施用于经确定具有包含SEQ ID NO:447的隐蔽外显子序列的转录物的患者。
55.权利要求45-54中任一项所述的方法,其中所述寡核苷酸经局部、胃肠外、鞘内、脑池内、口服、直肠、颊、舌下、阴道、肺、气管内、鼻内、病灶内、经皮或十二指肠内施用。
56.权利要求54所述的方法,其中所述寡核苷酸经口服施用。
57.权利要求45-54中任一项所述的方法,其中治疗有效量的所述寡核苷酸经鞘内或脑池内施用。
58.权利要求45-46或50-57中任一项所述的方法,其中所述患者是人。
59.权利要求44所述的药物组合物,其中所述药物组合物适用于局部、鞘内、脑池内、胃肠外(例如皮下、肌内、皮内、十二指肠内或静脉内)、病灶内、口服、肺、气管内、鼻内、经皮、直肠、颊、舌下、阴道或十二指肠内施用。
60.权利要求1-43中任一项的寡核苷酸或其药学上可接受的盐,或权利要求44的药物组合物在制备用于治疗神经学疾病或神经病的药物中的用途。
61.权利要求60所述的用途,其中所述神经学疾病选自由肌萎缩侧索硬化(ALS)、额颞叶痴呆(FTD)、阿尔茨海默病(AD)、帕金森病(PD)、亨廷顿病、臂丛损伤、周围神经损伤、进行性核上性麻痹(PSP)、脑外伤、脊髓损伤和皮质基底节变性(CBD)组成的组。
62.权利要求60所述的用途,其中所述神经病是化学疗法诱发的神经病。
63.在有此需要的患者中治疗神经学疾病或神经病的方法,所述方法包括向有此需要的患者施用治疗有效量的权利要求1-43中任一项的寡核苷酸或其药学上可接受的盐,或权利要求44的药物组合物。
64.权利要求63所述的方法,其中所述神经学疾病选自由肌萎缩侧索硬化(ALS)、额颞叶痴呆(FTD)、阿尔茨海默病(AD)、帕金森病(PD)、亨廷顿病、臂丛损伤、周围神经损伤、进行性核上性麻痹(PSP)、脑外伤、脊髓损伤和皮质基底节变性(CBD)组成的组。
65.权利要求63所述的方法,其中所述神经病是化学疗法诱发的神经病。
66.权利要求63-65中任一项所述的方法,其中所述寡核苷酸或所述药物组合物经局部、胃肠外(例如,皮下、肌内、皮内、十二指肠内或静脉内)、病灶内、口服、肺、直肠、颊、舌下、阴道、气管内、鼻内、脑池内、鞘内、经皮或十二指肠内施用。
67.权利要求63-65中任一项所述的方法,其中所述寡核苷酸或所述药物组合物经鞘内或脑池内施用。
68.权利要求63-67中任一项所述的方法,其中治疗有效量的所述寡核苷酸或所述药物组合物经鞘内或脑池内施用。
69.权利要求63-68中任一项所述的方法,其中所述患者是人。
70.权利要求1-43中任一项的寡核苷酸或其药学上可接受的盐,其用作治疗神经学疾病或神经病的药物。
71.权利要求1-43中任一项的寡核苷酸或其药学上可接受的盐,其用于治疗神经学疾病或神经病。
72.权利要求70或71使用的所述寡核苷酸,其中所述神经学疾病选自由肌萎缩侧索硬化(ALS)、额颞叶痴呆(FTD)、阿尔茨海默病(AD)、帕金森病(PD)、亨廷顿病、臂丛损伤、周围神经损伤、进行性核上性麻痹(PSP)、脑外伤、脊髓损伤和皮质基底节变性(CBD)组成的组。
73.权利要求70或71使用的所述寡核苷酸,其中所述神经病是化学疗法诱发的神经病。
74.寡核苷酸,其包含具有SEQ ID NO:1-446、SEQ ID NO:894-918、SEQ ID NO:945-1390或SEQ ID NO:1392-1432中任一个的核碱基序列的连接核苷,或其药学上可接受的盐;
其中寡核苷酸包含至少一个选自下组的核苷键联:磷酸二酯键联、硫代磷酸酯键联、烷基磷酸酯键联、烷基膦酸酯键联、3-甲氧基丙基膦酸酯键联、二硫代磷酸酯键联、磷酸三酯键联、甲基膦酸酯键联、氨基烷基磷酸三酯键联、亚烷基膦酸酯键联、亚膦酸酯键联、氨基磷酸酯键联、硫代氨基磷酸酯键联、二氨基磷酸酯键联、氨基烷基氨基磷酸酯键联、硫代氨基磷酸酯键联、硫代烷基膦酸酯键联、硫代烷基磷酸三酯键联、硫化磷酸酯键联、硒代磷酸酯键联和硼代磷酸酯键联;和/或
其中所述连接核苷的至少一个核苷经选自下组的组分取代:2’-O-(2-甲氧基乙基)核苷(2’-O-甲氧基乙基核糖核苷(2’-MOE))、2’-O-甲基核苷、2’-脱氧-2’-氟核苷、2’-氟-β-D-阿糖核苷、锁核酸(LNA)、受约束的甲氧基乙基(cMOE)、约束乙基(cET)和肽核酸(PNA)。
75.权利要求74所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸的至少一个核苷间键联是硫代磷酸酯键联。
76.权利要求74或75所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含在5’末端通过磷酸二酯核苷间键联连接的三个连接核苷和在3’末端通过磷酸二酯核苷间键联连接的三个连接核苷。
77.权利要求74-76中任一项所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含通过硫代磷酸酯核苷间键联连接的一个或多个2’-O-(2-甲氧基乙基)核苷。
78.权利要求74或75所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含通过磷酸二酯核苷间键联连接的五个连接核苷。
79.权利要求78所述的寡核苷酸,其中所述五个连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
80.权利要求74-79中任一项所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷。
81.权利要求74或75所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸的所有核苷间键联是硫代磷酸酯键联,任选地其中所述寡核苷酸的连接核苷中的每一个是2’-O-(2-甲氧基乙基)(2’-MOE)核苷,进一步任选地,其中所述寡核苷酸包含至少一个5-甲基胞嘧啶修饰的核碱基。
82.药物组合物,其包含权利要求73-81中任一项的寡核苷酸或其药学上可接受的盐和药学上可接受的赋形剂。
83.权利要求1-43任一项的寡核苷酸或其药学上可接受的盐,其能够在细胞或患有神经学疾病或病症的人患者中增加、恢复或稳定能够翻译功能性STMN2的STMN2 mRNA的表达和/或STMN2蛋白的活性和/或功能,其中表达和/或活性和/或功能的增加、恢复或稳定的水平足以将所述寡核苷酸用作治疗神经学疾病或病症的药物。
84.权利要求1-43中任一项所述的寡核苷酸,其包含一个或多个手性中心和/或双键。
85.权利要求84所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸作为选自几何异构体、对映异构体和非对映异构体的立体异构体存在。
86.在有此需要的患者中治疗神经学疾病和/或神经病的方法,所述方法包括向有此需要的患者施用治疗有效量的权利要求1-43中任一项的寡核苷酸或其药学上可接受的盐,或权利要求44的药物组合物,联合选自以下的第二治疗剂:利鲁唑(Rilutek)、依达拉奉(Radicava)、卡巴拉汀、多奈哌齐、加兰他敏、选择性血清素重摄取抑制剂、抗精神病药剂、胆碱酯酶抑制剂、美金刚、苯二氮卓类抗焦虑药、AMX0035(ELYBRIO)、ZILUCOPLAN(RA101495)、双重AON鞘内施用(例如,BIIB067、BIIB078)、BIIB100、左旋多巴/卡比多巴、多巴胺能药剂(例如,罗匹尼罗、普拉克索、罗替戈汀)、甲羟孕酮、KCNQ2/KCNQ3开放剂、抗惊厥剂和精神兴奋剂,和/或疗法(例如,选自呼吸护理、物理疗法、职业疗法、言语疗法、营养支持),用于治疗所述神经学疾病。
87.权利要求86所述的方法,其中所述神经学疾病选自由肌萎缩侧索硬化(ALS)、额颞叶痴呆(FTD)、阿尔茨海默病(AD)、帕金森病(PD)、亨廷顿病、臂丛损伤、周围神经损伤、进行性核上性麻痹(PSP)、脑外伤、脊髓损伤和皮质基底节变性(CBD)组成的组。
88.权利要求86所述的方法,其中所述神经病是化学疗法诱发的神经病。
89.权利要求45-58、63-69和86-88中任一项所述的方法,其中要治疗的患者通过测量血浆、脊髓液、脑脊液、细胞外囊泡(例如CSF外泌体)、血液、尿液、淋巴液、粪便物,或所述患者的组织中轻神经丝(NEFL)、重神经丝(NEFH)、磷酸化神经丝重链(pNFH)、TDP-43或p75ECD的存在或水平来鉴定。
90.权利要求89所述的方法,其中要治疗的所述患者通过测量脑脊液(CSF)中的磷酸化神经丝重链(pNFH)来鉴定。
91.权利要求90所述的方法,其中所述患者的CSF中的所述pNFH用于在初始施用后和/或进行治疗期间预测C9ORF72相关肌萎缩侧索硬化(c9ALS)患者的疾病状态和生存。
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