CN114525344A - 一种用于检测或辅助检测肿瘤相关基因变异的试剂盒及其应用 - Google Patents
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Abstract
一种用于检测或辅助检测肿瘤相关基因变异的试剂盒及其应用,包括成套DNA探针,所述成套DNA探针包括SEQ ID NO:1‑SEQ ID NO:320所示的DNA探针。本发明是可以检测80基因的试剂盒(Panel产品),可一次性对目前已经美国食品药品监督管理局(FDA)/国家药品监督管理局(NMPA)批准上市的实体瘤靶向药物或免疫检查点抑制剂所对应的生物标志物进行检测。通过采集受检者的肿瘤组织样本及全血样本,进行肿瘤含量评估、DNA提取、建库、捕获、测序、生物信息学分析、医学解读,从而找到可用于指导精准治疗的生物标志物。
Description
技术领域
本发明涉及生物医药领域,具体涉及一种用于检测或辅助检测肿瘤相关基因变异的试剂盒及其应用。
背景技术
根据国家癌症中心统计,2015年我国新发癌症病例为186.39/10万,死亡率为105.84/10万,严重威胁人类健康。临床研究将肿瘤归为一种基因病,主要是由于原癌基因的激活或抑制基因的失活所导致。随着高通量测序(NGS)和生物技术的巨大进步,已发现多个与癌症发生发展相关的驱动基因以及可用于指导肿瘤治疗的生物标志物,且针对驱动基因和生物标志物开发了多款药物,在临床治疗中可根据检测到的驱动基因突变或生物标志物进行精准治疗,至此肿瘤的治疗模式从传统治疗转变为精准治疗。
现已有的可以用于精准治疗的技术手段包括Sanger测序(一代测序)、RT-PCR(荧光定量PCR)、IHC(免疫组织化学法)、FISH(荧光原位杂交)等。但上述技术中都存在相应的弊端。例如Sanger测序,虽然是测序的金标准,但由于该测序技术一个反应只能得到一条序列,因此测序通量低;虽然单个反应价格低廉,但是获得大量测序的成本高;且检测灵敏度较低,一般只能检测突变丰度在20%以上的突变,所以对于一些低频突变存在漏检的可能。而RT-PCR只能对已知位点进行检测,不能发现未知位点,不利于新靶点的探索。IHC主要用于检测蛋白表达,不能检测基因的点突变(SNV)、小片段插入缺失(Indel)等,需要根据基因SNV/Indel指导用药的检测不能通过IHC实现。同理,FISH检测虽是鉴定基因融合(Fusion)、扩增(CNV)的金标准,但同样不适用SNV/Indel的检测,应用面存在局限。
发明内容
本发明要解决的技术问题在于克服Sanger测序(一代测序)、RT-PCR(荧光定量PCR)、IHC(免疫组织化学法)、FISH(荧光原位杂交)技术中检测基因变异的缺陷,从而提供一种用于准确检测肿瘤相关基因变异的试剂盒及其应用。
本发明提供一种用于检测或辅助检测肿瘤相关基因变异的试剂盒,包括成套DNA探针,所述成套DNA探针包括SEQ ID NO:1-SEQ ID NO:320所示的DNA探针。
优选的,所述试剂盒还包括杂交反应液。
杂交反应液包括xGen® 2x Hybridization Buffer和xGen® 2x Hyb BufferEnhancer。
成套探针包括SEQ ID NO:1-SEQ ID NO:320所示的DNA探针等摩尔混合。
上述的成套DNA探针。
上述用于检测或辅助检测肿瘤相关基因变异的试剂盒或上述的成套DNA探针在如下1)-4)任一种中的应用:
1) 检测或辅助检测肿瘤相关基因变异;
2) 辅助预测或预测肿瘤患者精准治疗方式;
3)辅助诊断肿瘤患者;
4)预测受检者肿瘤发病风险。
上述的试剂盒或上述的成套DNA探针在制备如下1)-4)中任一种产品中的应用:
1) 检测或辅助检测肿瘤相关基因变异;
2) 辅助预测或预测肿瘤患者精准治疗方式;
3)辅助诊断肿瘤患者;
4)预测受检者肿瘤发病风险。
所述精准治疗为靶向或免疫治疗等。
精准治疗指的是根据肿瘤细胞的分子生物学改变选择相应的药物进行治疗。
优选的,所述变异为点突变、小片段插入缺失、拷贝数变异、基因融合和/或微卫星不稳定性。
优选的,在上述应用中,所述肿瘤为肾癌、胃癌和/或肠癌。
一种检测或辅助检测与肿瘤相关基因变异的方法,包括如下步骤:
(1)构建目的基因组DNA文库;
(2)将前所述的成套DNA探针与所述DNA文库杂交,得到杂交产物;
(3)对所述杂交产物进行二代测序,根据测序结果分析目的基因组DNA的变异情况。
优选的,在上述方法中,所述肿瘤为肾癌、胃癌和/或肠癌。
本发明具有如下优点:
1、本发明是可以检测80基因的试剂盒(Panel产品),可以精确检测肿瘤相关基因变异,可一次性对目前已经美国食品药品监督管理局(FDA)/国家药品监督管理局(NMPA)批准上市的实体瘤靶向药物或免疫检查点抑制剂所对应的生物标志物进行检测。通过采集受检者的肿瘤组织样本及全血样本,进行肿瘤含量评估、DNA提取、建库、捕获、测序、生物信息学分析、医学解读,从而找到可用于指导精准治疗的生物标志物。其次,还可以对患者的新辅助治疗进行评估,精准指导患者新辅助治疗方案的选择。最后,还可以对受检者进行遗传性肿瘤的评估,用于提示家族遗传风险,做到早发现、早诊断、早治疗。
2、本发明采用高通量测序(NGS)技术的优势包括通量高(一次检测数个基因到数百个基因乃至全外显子组)、灵敏度高、检测限更低、探索能力更强,可发现未知突变、一次检测多种突变类型(SNV/Indel/Fusion/CNV)、还可以检测基因组生物标志物(微卫星不稳定性等)。弥补了现有检测的不足,仅通过一次检测可实现对精准治疗的全面指导。
3、本发明检测对象包括目前已上市靶向药物、免疫检查点抑制剂所对应的生物标志物,可充分指导肿瘤的精准治疗。
同时本发明可以检测普瑞基准与北肿团队独家发现的胃癌新辅助化疗应答标志物(Li Z , Gao X , Peng X , et al. Multi-omics characterization of molecularfeatures of gastric cancer correlated with response to neoadjuvantchemotherapy[J]. Science advances, 6(9):eaay4211.),可精准指导胃癌新辅助治疗方案的选择。
4、本发明还针对肾癌、胃癌、肠癌的遗传性肿瘤相关基因进行优化,充分评估遗传性肿瘤风险。当受检者存在胚系致病或可能致病遗传易感基因突变,建议家族中尚未发病的健康人进行遗传评估,有助于提前了解相应肿瘤的发病风险。
5、本发明包括了与肾癌、胃癌、肠癌发生发展机制相关的基因,实用性要高于全外显子组测序。在临床用药指导以及在后续生物标志物探索方面,都可以提供有价值的信息。
具体实施方式
实施例
一、用于检测肿瘤相关基因变异的试剂盒
用于检测肿瘤相关基因变异的试剂盒,包括SEQ ID NO:1-SEQ ID NO:320所示的320条DNA探针。
探针的获得过程为:
为了实现对肾癌、胃癌、肠癌的精准治疗,本发明采用目标区域捕获二代测序技术,经过分析、选择得到与肿瘤个体化用药及遗传风险相关的80个(见表1)基因的全部外显子区域、部分基因的热点区域,以及化疗药物相关SNP位点。从而检测与肾癌、胃癌、肠癌有明确临床意义的基因点突变(SNV)、小片段插入缺失(Indel)、拷贝数变异(CNV)、基因融合(Fusion)以及微卫星不稳定性(MSI)等生物标志物,进一步指导肿瘤的精准治疗。同时也可以根据肿瘤患者检测到的基因突变辅助入组相应的临床试验。对临床治疗、诊断以及新靶点的发现提供指导意义。
根据上述与肿瘤个体化用药及遗传风险相关基因的全部外显子区域、部分基因的热点区域,以及化疗药物相关SNP位点,设计探针。探针的设计方法如下:利用IDT公司的在线探针设计工具(https://sg.idtdna.com/sessionTimeout.aspx),参数为1X tilling和120个核苷酸长度。对IDT完成设计的探针进行探针覆盖度的评估,对低覆盖度的区域使用多X tilling的策略重新设计探针,力争使所有的目标区域都有探针覆盖。
表1 80个基因列表
AKT1 | AKT2 | AKT3 | ALK | APC | AR | ARAF | ARID1A | B2M | BMPR1A |
BRAF | BRCA1 | BRCA2 | C10orf71 | CCNE1 | CDH1 | CDK4 | CDK6 | CDKN2A | CTNNB1 |
EGFR | EPCAM | ERBB2 | ESR1 | ESR2 | FGF19 | FGFR1 | FGFR2 | FGFR3 | FGFR4 |
FH | FLCN | FLT1 | FLT4 | HOXB13 | HRAS | IDH1 | IDH2 | JAK1 | JAK2 |
KDR | KIT | KRAS | MAP2K1 | MDM2 | MDM4 | MET | MLH1 | MSH2 | MSH6 |
MTOR | MUTYH | MYC | NF1 | NF2 | NRAS | NTRK1 | NTRK2 | NTRK3 | PBRM1 |
PDGFRA | PGR | PIK3CA | PMS2 | POLD1 | POLE | PTEN | RB1 | RET | RHOA |
ROS1 | SDHB | SDHC | SDHD | SMAD4 | STK11 | TP53 | TSC1 | TSC2 | VHL |
二、利用试剂盒检测肿瘤相关基因变异
步骤1:提取检测样本DNA(样本DNA为血液样本DNA或肿瘤组织样本DNA)。
步骤2:检测样本DNA文库的构建。主要步骤有:DNA打断、末端修复、接头连接、文库扩增、纯化。
(一)DNA文库的构建包括如下步骤
1、样本制备
对于石蜡包埋组织样本,使用 QIAGEN 公司 QIAamp DNA FFPE Tissue Kit,血液样本使用QIAamp DNA Blood Mini Kit,严格按照说明书步骤进行。所提 DNA 需要进行定量检测,提取后的 DNA 使用 Qubit® dsDNA HS Assay Kit 及配套仪器进行检测,提取总量应不少于 50ng。
2、DNA文库构建
使用商品化文库构建试剂盒IDT xGEN Prism DNA Library Prep Kit(IDT,catNo.10006203)按照如下流程进行文库构建。
2.1 取样打断
1)打断体系如表2所示。
表2
打断方式 | 打断体系(μL) | DNA投入量(μL) | 补TE体积(μL) |
Covaris打断 | 50 | X | 50-X |
Bioruptor打断 | 60 | X | 60-X |
QIAamp DNA FFPE Tissue Kit 提取的DNA(简称FFPE DNA)使用Covaris打断,血液基因组DNA使用Covaris打断或Bioruptor打断。
2)Covaris打断操作的打断参数如表3所示。
3)Bioruptor打断操作如下:
a. 打断仪打断参数如表4所示。
b.打断后的DNA用2%琼脂糖凝胶电泳质检,使用50bp和D2000 ladder,电压150V,电泳条带在200bp-300bp为合格。
2.2 末端修复
1)按照表5,配制End Repair Mix。
2)参照表6,设置End Repair反应程序,调节热盖温度为40℃。
3)将样本放入PCR仪,运行End Repair反应程序。
4)将使用后的试剂放回原试剂盒中并-20℃保存。
2.3 配制Ligation 1 Mix
按照表7,配制Ligation 1 Mix。
2.4 末端修复后纯化
1)从4℃冰箱取出AMPure XP磁珠,室温平衡30min。
2)取147.5μL(2.5×)AMPure XP磁珠加入到末端修复样品中,充分混匀。
3)室温静置10min,转移至磁力架,静置5min至液体完全澄清,弃上清,注意勿吸到磁珠。
4) 沿管侧壁缓慢加入160μL 80%(v/v)乙醇,静置30s, 使用移液器移弃上清。
5) 重复步骤4)一次。
6) 用10μL移液器吸除残留的乙醇,室温放置3min晾干。
7) 向样品管中加入30μL Ligation 1 Mix,震荡混匀,瞬时离心。
2.5 Ligation 1
1)参照表8,设置Ligation 1反应程序,调节PCR仪热盖温度为70℃。
2)运行Ligation 1反应程序。
2.6 Ligation 2
1)按照表9,配制Ligation 2 Mix。
2)从PCR仪上取出Ligation 1 的PCR反应管,瞬时离心后置于冰上。向每个反应管中分装10μL Ligation 2 Mix,振荡混匀,瞬时离心。
3)参照表10,设置Ligation 2反应程序,调节PCR仪热盖温度为70℃。
4)将样本放入PCR仪,运行Ligation 2反应程序。
2.7 Adaptor连接后纯化
1)取100μL(2.5×)PEG/NaCl加入到Ligation 2反应后的样品中,充分混匀。
2)室温静置10min,转移至磁力架,静置5min至液体完全澄清,弃上清,注意勿吸到磁珠。
3) 沿管侧壁缓慢加入160μL 80%(v/v)乙醇,静置30s, 使用移液器移弃上清。
4) 重复步骤3)一次。
5)用10μL移液器吸除残留的乙醇,室温放置3min晾干。
6) 向样品管中加入20μL 无核酸酶水 ,震荡混匀,瞬时离心。
2.8 PCR扩增
1)按照以下表11体系在PCR管中配制PCR反应体系。
2)振荡混匀,瞬时离心使全部反应液置于PCR管底部。
PCR扩增程序如表12。
2.9 文库纯化与定量
1) 从4℃冰箱取出AMPure XP磁珠,室温平衡30min。
2) 将PCR产物从PCR仪中拿出,瞬时离心,放在磁力架上静置5min,将上清液转移至新管中。
3)取65μL(1.3×)AMPure XP磁珠加入到PCR产物中,用移液器(量程65μL)吹打20下,充分混匀。
4) 室温静置10min,转移至磁力架,静置5min至液体完全澄清,弃上清,注意勿吸到磁珠。
5)沿管侧壁缓慢加入160μL 80%(v/v)乙醇,静置30s, 使用移液器移弃上清。
注:若弃废液时吸到磁珠,需静置2min,待磁珠被吸附后,弃上清。
6) 重复步骤5)一次。
7) 用10μL移液器吸除残留的乙醇,室温放置3min晾干。
8) 向样品管中加入32μL TE Buffer PH 8.0,震荡混匀,瞬时离心,室温孵育8min。
9) 将样品管置于磁力架上5min,至液体完全澄清,使用移液器小心将30μL上清转移至新的1.5ml离心管中。
10)使用Qubit 4.0荧光定量仪对文库Qubit进行定量。
2.10 文库质检
结果如表13所示。
2.11 文库保存,将文库放入扩增区-20℃冰箱存放。
步骤3:将探针(SEQ ID NO:1-SEQ ID NO:320),与DNA文库杂交捕获、洗脱、纯化并测序。探针由生物公司合成。
文库杂交步骤如下:
1、将 Human Cot DNA和 xGen® Universal Blockers-TS Mix振荡混匀,瞬时离心。
2、按照表14,配制杂交反应液Mix。
表14
Human Cot DNA | 5μL |
xGen®Universal Blockers-TS Mix | 2μL |
Total | 7μL |
3、向离心管中加入7μL Mix以及500ng-1ug DNA文库,震荡混匀,瞬时离心。并放入真空浓缩仪中干燥,备用。
4、按照表15,将xGen® 2x Hybridization Buffer 和xGen® 2x Hyb BufferEnhancer振荡混匀,瞬时离心,得到杂交反应液。
表15
xGen® 2x Hybridization Buffer | 8.5μL |
xGen® 2x Hyb Buffer Enhancer | 2.7μL |
Total | 11.2μL |
5、向蒸干后的样本中加入上述杂交反应液、4μL探针,于恒温混匀仪上25℃孵育10min。
6、放入PCR仪中,点击程序,开始运行。PCR程序如表16:
文库洗脱步骤如下:
1、链霉亲和素磁珠清洗
1)将xGen® 2x Hybridization Buffer和xGen® 2X Hyb Buffer Enhancer振荡混匀,瞬时离心。
2)按照表17,配制磁珠悬浮液Mix
表17
xGen® 2x Hybridization Buffer | 8.5μL |
xGen® 2X Hyb Buffer Enhancer | 2.7μL |
Nuclease-Free Water | 5.8μL |
Total | 17μL |
3)将Dynabeads M-270 Streptavidin 振荡混匀。每个文库Dynabeads M-270Streptavidin 的用量为50μL。
4)每个文库 1XBead Wash Buffer(Nuclease-Free Water和xGen® 2x BeadWash Buffer按1:1比例配制)的用量为100μL,向管中加入相应体积的1X Bead WashBuffer振荡混匀(n×100 μL),瞬时离心,置于磁力架1min,待液体完全澄清,使用移液器吸弃上清。
5)重复步骤4)两次。
6)用移液器将残留液体吸出。
7)每个文库磁珠悬浮液的用量为17μL,向管中加入相应体积的磁珠悬浮液悬浮。
8)准备相应个数的PCR管,每个管中分装17μL的磁珠与悬浮液的混合液。
9)将含有磁珠悬浮液的PCR管放入PCR仪中孵育5min。
2、链霉亲和素磁珠捕获
1)4-16h杂交反应后,将重悬的链霉亲和素磁珠混匀后分两次加到杂交体系中。将样本管转移至正在运行PCR仪中,并点击下一步。
2)65℃孵育45min,每15min振荡混匀一次,确保磁珠完全重悬。
3、热洗脱
1)打开PCR仪设置程序如表18。
2)将分装好的装有1X Wash BufferⅠ( Nuclease-Free Water和xGen® 10x WashBufferⅠ按1:9比例配制)和1X Stringent Wash Buffer(Nuclease-Free Water和xGen®10x Stringent Wash Buffer按1:9比例配制)的PCR管放在PCR仪中预热。
3)45min 65℃孵育结束后,将与链霉亲和素磁珠捕获后的杂交样本转移至装有1XWash BufferⅠ的PCR管中混匀。将PCR管置于磁力架上1min,待液体完全澄清后,用移液器彻底移弃上清。
4)将1X Stringent Wash Buffer转移至装有样本磁珠的PCR管中,混匀,盖紧管盖,放入PCR仪中65℃孵育5min。到时间后将装有样本的PCR管置于磁力架上至澄清,用移液器彻底移弃上清。
5)重复步骤4)一次。
4、常温洗脱
1)将装有样本的PCR管从磁力架取下,用移液器从分装管中吸取150ul 1X WashBufferⅡ(Nuclease-Free Water和xGen® 10x Wash BufferⅡ按1:9比例配制)加入装有磁珠的PCR管中,室温孵育2min,期间于恒温混匀仪上混匀30s后静置30s,交替进行,确保充分混匀。将PCR管瞬时离心后于磁力架静置1min,用移液器彻底移弃上清。
2)将装有样本的PCR管从磁力架取下,瞬时离心后上磁力架,用移液器移去少量残余Buffer。
3)向管中加入21μL Nuclease-Free Water,吹吸混匀。
4)提前15-20min将KAPA HiFi HotStart ReadyMix、引物FCF(10μM)和FCR(10μM)置于4℃融解。
5)按照表19,在PCR管或离心管进行反应体系配制。
6)将配置好的MIX分装到标记样本序号的PCR管中。
7)用移液器转移20μL带磁珠产物至对应关系的PCR管中,混匀。
8)在PCR仪上启动如表20程序。
文库纯化步骤如下:
1)将AMPure XP磁珠振荡混匀,吸取60μL加入至做好标记的PCR管中。
2)PCR扩增后,取出PCR管并置于磁力架2min,待液体完全澄清后,将上清转移至磁力架的PCR管中。
3)振荡混匀,室温孵育10min。
4)将PCR管瞬时离心后置于磁力架上5min,待液体完全澄清后,移弃上清(留5-10μL液体)。
5)沿PCR管侧壁缓慢加入200μL 80%乙醇,静置30s, 使用移液器移弃上清。
6)重复步骤5)一次。
7)将PCR管从磁力架取出,瞬时离心后置于磁力架上,使用移液器移去少量残留乙醇,注意勿吸到磁珠。
8)打开PCR管盖,使磁珠置于室温干燥,磁珠表面无液体反光,注意不能过度干燥。
9)向PCR管加入31μL TE Buffer pH 8.0,振荡混匀,室温孵育5min。
10)将PCR管瞬时离心后置于磁力架上1-2min,至液体完全澄清,用移液器小心将30μL上清转移至新的1.5mL离心管中,注意勿吸到磁珠。
11)进行文库质检,合格后上机测序。
步骤4:对测序结果进行生物信息学分析,获得检测样本的突变结果。
使用fastp(v0.19.4)软件去除实验及测序环节引入的接头序列及低质量碱基序列获得高质量测序数据。其中,要求数据质量满足Q30≥80%,否则判定为质控不通过。
使用bwa(0.7.17)序列比对软件将上述满足要求的数据比对至hg19(GRCh37)参考基因组上,生成记录比对结果的BAM格式文件。然后使用Samtools(v1.9)和GenomeAnalysisTK(v4.1.0)工具对BAM文件进行排序、去重及碱基质量校正,获得最终BAM文件,并基于此文件进行后续突变分析。
其中,参考基因组比对率需≥90%,对照样本目标区域平均测序深度需≥100×,肿瘤样本目标区域平均测序深度需≥500×,目标区域内深度大于平均深度×0.2的位点比例需≥90%,肿瘤和对照样本配对一致性需≥90%。以上任一条件不满足均判定质控不通过,需要重新实验。
使用GenomeAnalysisTK(v4.1.0)的变异鉴定模块对样本中的点突变、插入缺失突变进行分析;使用融合分析模块对样本中的基因融合事件进行分析;使用拷贝数变异分析模块(包含cnvkit(v0.9.6)软件和过滤模块)对样本中的拷贝数变异进行分析。得到最终能够进入注释流程的突变。
对得到的突变采用如下方法进行注释:使用基于Annovar(v2018.04.16)搭建的变异注释模块对点突变、小片段插入缺失、基因融合及拷贝数变异进行注释,注释使用的数据库包括clinvar、cosmic、1000genomes等。
另外,使用微卫星不稳定性分析模块对样本的微卫星不稳定性(MSI)进行分析。
步骤5:对突变结果进行注释,判断突变的致病性,为临床提供相应信息。
基于步骤4中对变异的注释结果,针对检出的非良性/可能良性变异,根据《ACMG遗传变异分类标准与指南》规定的变异分类标准以及美国病理协会(AMP)/美国临床肿瘤学会(ACSO)/美国病理学家协会(CAP)联合发布的癌症变异解读指南(Standards andGuidelines for the Interpretation and Reporting of Sequence Variants inCancer)对变异进行分类。
以肾癌患者为例进行以下说明:
按照上述步骤对某肾癌患者进行检测,结果为:微卫星不稳定性高(MSI-H),根据美国食品药品监督管理局(FDA)批准,微卫星不稳定性高实体瘤(包括肾癌)患者可以从可瑞达(帕博丽珠单抗)中获益。
按照上述步骤对某胃癌患者进行检测,结果为:微卫星不稳定性高(MSI-H)。根据美国食品药品监督管理局(FDA)批准,微卫星不稳定性高的实体瘤(包括胃癌)患者可以从可瑞达(帕博丽珠单抗)中获益。
按照上述步骤对某结直肠癌患者进行检测,结果为:检测到KRAS c.35G>A p.G12D体细胞错义变异,变异丰度为24.91%。根据结直肠癌美国国立癌症综合网络(NCCN)指南以及中国临床肿瘤学会(CSCO)结直肠癌诊疗指南,存在该变异的患者不能使用西妥昔单抗和帕尼单抗进行治疗。患者可考虑其余方式进行治疗,例如常规化疗。
三、对上述试剂盒性能进行了充分验证,具体验证情况如下:
1、建库起始量评估
评估不同起始量对检测结果的影响。选取3例样本,分别使用30ng、50ng和100ngDNA起始建库,每个样本做三次重复。对比起始量对检测结果的影响。从而评估不同起始量下样本质控是否通过及目标变异是否检测出。结果显示30ng条件下样本质控通过且目标变异全部检出,因此最低投入量为30ng。
2、阳性符合率
检测22例样本,变异类型包含单核苷酸变异(SNV)、小片段插入缺失(Indel)和拷贝数变异(CNV)。所有变异均用数字PCR或一代测序、QPCR等方法验证。结果显示所有目标变异全部检出,即阳性位点符合率为100%。
3、阴性符合率
检测20例阴性样本,评估有无目标阳性变异检出。结果显示目标变异均为检出,即阴性符合率为100%。
4、最低检测限
选择3例样本,变异类型包括单核苷酸变异(SNV)、小片段插入缺失(Indel)、拷贝数变异(CNV)和融合(Fusion),样本来源为标准品和临床样本。每一个突变频率各做3次平行。变异频率设置:SNV和Indel设置的期望频率为1%、2%、5%,CNV设置的期望拷贝数为2.5拷贝数、3拷贝数、3.5拷贝数,Fusion设置期望频率为1%、2%、5%。最终以变异位点全部检出的最低期望频率作为最低检测限。
最终结果显示:
1)SNV变异位点频率在2%以上的位点全部检出,因此SNV的最低检测限为2%。
2)Indel变异位点频率在5%以上的位点全部检出,因此Indel的最低检测限为5%。
3)CNV变异拷贝数在3以上的全部检出,因此CNV最低检测限为3。
4)Fusion变异位点频率在5%以上的位点全部检出,因此Fusion的最低检测限为5%。
5、重复性
选择6例临床样本,进行3次批内重复及3次批间重复检测。结果显示同一样本批次内及批次间重复性检测结果一致。
6、干扰物分析
选取6例样本,分别添加干扰物质胆红素(浓度342μM)、甘油三酯(浓度37mM)、血红蛋白(浓度2g/L)及80%(v/v)乙醇,每例样本每个处理做3个重复。结果显示:胆红素(浓度342μM)、甘油三酯(浓度342mM)、血红蛋白(浓度2g/L)、80%乙醇均对检测结果无影响。
7、DNA质量评估
选19例不同质量等级的样本,使用100ng DNA建库。从而评估不同质量的样本对变异检出的影响。DNA主条带>500bp的样本,变异位点均可被检出。
8、肿瘤细胞占比评估
经验证的组织样本,肿瘤含量均在20%-90%之间,所有阳性位点均被检出。即本试剂盒(panel)可对肿瘤含量≥20%的样本进行检测。
显然,上述实施例仅仅是为清楚地说明所作的举例,而并非对实施方式的限定。对于所属领域的普通技术人员来说,在上述说明的基础上还可以做出其它不同形式的变化或变动。这里无需也无法对所有的实施方式予以穷举。而由此所引申出的显而易见的变化或变动仍处于本发明创造的保护范围之中。
序列表
<110> 普瑞基准科技(北京)有限公司
普瑞基准生物医药(苏州)有限公司
北京普康瑞仁医学检验所有限公司
<120> 一种用于检测或辅助检测肿瘤相关基因变异的试剂盒及其应用
<160> 320
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 1
tcctgcggtg ccttcctcga gtctggcctg ctttccatcc tgctaagtac ttggggcatt 60
tccctctttg ggtaaggtgt ggtcttccct gtcctggcat tagacacaag gcagtgggcc 120
<210> 2
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 2
gggtgggggg acatccagag gtctttgagt ccagccctct gcctccaggc cacgcccact 60
cagtgtcgtc agagccccct gtgcctgagg cgtgcgcggc tcggagccct gccctcggag 120
<210> 3
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 3
gcggcctcca gcccggcccc gcccagcgcc ggcccgcggg gatgcggagc ggcgggcgcc 60
ggaggccgcg gcccggctag gcccgcgctc gcgcccggac gcggcggccc ggtgagtccc 120
<210> 4
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 4
cccagcgcac gcagcgcggc ccgaagacgg gagcaggcgg ccgagcaccg agcgctgggc 60
accgggcacc gagcggcggc ggcacgcgag gcccggcccc gagcagcgcc cccgcccgcc 120
<210> 5
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 5
gcctcctgca tgtcctgctg ccctgagctg tcccgagcta ggtgacagcg taccacgctg 60
ccaccatgaa tgaggtgtct gtcatcaaag aaggctggct ccacaagcgt ggtaagaggc 120
<210> 6
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 6
gtgggcagaa cagccagagg gcctcagagc ccggcgtcct cagggaaggg gctggtgtgg 60
aatcccctcc cgccctgacc agctcctctc ttgtcttgca gactgtgccc tgtccacggt 120
<210> 7
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 7
cagcgtggcg atgggcgggg gtagagcccc gccggagagg ctgggcggct gccggtgaca 60
ggtgagtgcg ccagcgcgtg tccccgaacg ccccccccac gatggtcgcg tccgggcccc 120
<210> 8
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 8
gggcgggggg ggccgcgccg tgctagccgt tgggcctgcc tcggaggagg cgtcgccgcc 60
gccgctgccg ctgccggcgc cgttgccgct gccgggaaac acaaggaaag ggaaccagcg 120
<210> 9
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 9
gaaattacag ggatttaggg caattaactt tcattctctt ccctcttcac ctcaaataca 60
catcaccaaa caaattttct ctattatttg ggtaggcgtg actggttttc ttaagacttt 120
<210> 10
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 10
gaggggggac ccccgagtcg ccccctctcc tccccccgcc cccccccggc tccatcctcc 60
gccgccgccc gagcagctgc ggggccgcca ccgccgccgc cgccgttgca ggtaacagcc 120
<210> 11
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 11
ccggccggct ccctccctcc ctcccctgca gcccttcgct tgccctcccg ccggccgcac 60
cgggctccag gaggccagag gctctgtggg gtggggggag gacaggaggg gaggaggagg 120
<210> 12
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 12
tccctcttcc ccgaggtgca gggggtgggg tcggcttctg gactgctccg cgctctccgg 60
tccctacctc attgggcacc gcccacttcg tgggcttcca ggtgcgagcc ctcgcgccgg 120
<210> 13
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 13
cagaagttca gcaggcagac agtccgaagc cttcccgcag cggagagata gcttgagggt 60
gcgcaagacg gcagcctccg ccctcggttc ccgcccagac cgggcagaag agcttggagg 120
<210> 14
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 14
gaacgccctc agctgctgcc gccggggccg ctccagtgcc tgcgaactct gaggagccga 60
ggcgccggtg agagcaagga cgctgcaaac ttgcgcagcg cgggggctgg gattcacgcc 120
<210> 15
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 15
tgttcggagg gtcgcggggc accgaggtgc tttccggccg ccctctggtc ggccacccaa 60
agccgcgggc gctgatgatg ggtgaggagg gggcggcaag atttcgggcg cccctgccct 120
<210> 16
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 16
cccctccctg cgcgcgctcg cgcggctcag ccagctgcaa gtggcgggcg cccaggcaga 60
tgcgatccag cggctctggg ggcggcagcg gtggtagcag ctggtacctc ccgccgcctc 120
<210> 17
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 17
aaattaattt tcaatattga aggaaaaaag aaataagaag agagagagaa agaaagcatc 60
acacaaagat tttcttaaaa gaaacaattt tgcttgaaat ctctttagat ggggctcatt 120
<210> 18
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 18
tctcacggtg gcacttggcc tccactgggc agcaggacca gctccaagcg ctagtgttct 60
gttctctttt tgtaatcttg gaatcttttg ttgctctaaa tacaattaaa aatggcagaa 120
<210> 19
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 19
acttgtttgt tggactacat gtgtgacttt gggtctgtct ctgcctctgc tttcagaaat 60
gtcatccatt gtgtaaaata ttggcttact ggtctgccag ctaaaacttg gccacatccc 120
<210> 20
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 20
ctgttatggc tgcaggatcg agttattgtt aacaaagaga cccaagaaaa gctgctaatg 60
tcctcttatc attgttgtta atttgttaaa acataaagaa atctaaaatt tcagatgaat 120
<210> 21
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 21
gttttaaaag atcagagggt gactgatgat acatgcatac atatttgttg aataaatgaa 60
aatttatttt tagtgataag attcatacac tctgtatttg gggagggaaa acctttttaa 120
<210> 22
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 22
gcatggtggg gcactcagat aggagtgaat acacctacct ggtgccttga aaatcacatc 60
aagtagttaa ttatctaccc cttacctgtg tttataactt ccaggtaatg agaatgattt 120
<210> 23
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 23
tttttaaagc taaaatgcca gtaaataaaa gtgctatgac ttgagctaag atatttgact 60
ccaatgcctg tactgtgtct actgcaccac tttgtaaaca cttcaattta ctatctttga 120
<210> 24
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 24
aatgattgac ctttaaattt ttgccaaatg ttatctgaaa ttgtctatga ataccatcta 60
cttctgttgt tttcccaggc ttccataaac aatggagata catgcatata ggtcatactg 120
<210> 25
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 25
gactcgatgg agcggggccc agcccttgga gcagccctca ggatctgtgc tgtggatggt 60
gagttgggcc aggctggatg gggggcacat ggggacgtgg gctccgggat tggggtgtgt 120
<210> 26
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 26
tgtaccctgt gtggccagtg ggatctggga ctgtggacca gccatttgct gacctccgtg 60
gtccccctgc ctggtctggc ctgttgtagg cagctgaggt gatccgtatg caggacccga 120
<210> 27
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 27
actgcctcaa gttccagcgg gaggagcggc ccctcttccc ccaggtgggc tgggtagggg 60
gctggacacc ttgggtgggt gactctggga tagaggaaga ctgagatgga ggcagatgtg 120
<210> 28
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 28
agcgcagccc gccttgtgcc ttaggccccg cccaagccac cagggagcca atctcagccc 60
tccacgccaa ggagccttgc ccaccagcca atcaatgttc gtctctgccc tgatgctgcc 120
<210> 29
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 29
tcactggaga ggcctgtgca gtagagtgta gaccctttca tgtactgtac tgtacacctg 60
atactgtaaa catactgtaa taataatgtc tcacatggaa acagaaaacg ctgggtcagc 120
<210> 30
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 30
agcaagctgt agtttttaaa aatgttttta gttaaacgtt gaggagaaaa aaaaaaaagg 60
cttttccccc aaagtatcat gtgtgaacct acaacaccct gacctctttc tctcctcctt 120
<210> 31
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 31
gattgtatga ataaccctga gatcacctct tagaactggt tttaaccttt agctgcagcg 60
gctacgctgc cacgtgtgta tatatatgac gttgtacatt gcacataccc ttggatcccc 120
<210> 32
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 32
acagtttggt cctcctccca gctacccctt tatagtatga cgagttaaca agttggtgac 60
ctgcacaaag cgagacacag ctatttaatc tcttgccaga tatcgcccct cttggtgcga 120
<210> 33
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 33
gggttataat aatgttaaca tggacatgat cttctttata attctacttt gagtgctgtc 60
tccatgtttg atgtatctga gcaggttgct ccacaggtag ctctaggagg gctggcaact 120
<210> 34
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 34
tagaggtggg gagcagagaa ttctcttatc caacatcaac atcttggtca gatttgaact 60
cttcaatctc ttgcactcaa agcttgttaa gatagttaag cgtgcataag ttaacttcca 120
<210> 35
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 35
atttacatac tctgcttaga atttggggga aaatttagaa atataattga caggattatt 60
ggaaatttgt tataatgaat gaaacatttt gtcatataag attcatattt acttcttata 120
<210> 36
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 36
catttgataa agtaaggcat ggttgtggtt aatctggttt atttttgttc cacaagttaa 60
ataaatcata aaacttgatg tgttatctct tatatctcac tcccactatt acccctttat 120
<210> 37
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 37
ctaagctttt actgtgcttt ttactgaaca agtttctgat gtataaaact tgcatctgat 60
ttctttggaa atattttcac aaaagttatt ttaatcagta tttttacatt gcctttccag 120
<210> 38
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 38
tgtccagaag tgtttctaaa cttagaaagt gacctatagt tttttaaaat tatgttttcc 60
tagaacgtgc caaattttga tttactctaa caatcagtac ttttcttcag atgctttgtt 120
<210> 39
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 39
ctgtttagaa caaaaatgca ctatagtttt taaagaatca tgcatctttg ggttggccca 60
ggatcaaatt tgatattgaa taatttattc cagggcagct ttcataaaca tacttcatag 120
<210> 40
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 40
ctttgagtca ggtgttaaaa tagcagtgcc acagctcgtc tcttgcctta gtgtgctgct 60
gtgagagtca cagtggaaac tgcagggagg aggtgtgttc ctaagaacca aaatccagca 120
<210> 41
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 41
gttggtccga gaaggtcacg attggctgaa gtatccagct ctgcatctct gtggggtggg 60
ggcggcggcg gcctcgacgt ggaggatata ggttagttgc tggggctgag acaacagccc 120
<210> 42
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 42
ctccgcctcc gcctccgcct cccccagctc tccgcctccc ttccccctcc ccgcccgaca 60
gcggccgctc gggccccggc tctcggttat aagatggcgg cgctgagcgg tggcggtggt 120
<210> 43
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 43
cctcaggctc ggctgcgccc ggggccgcgg gccggtacct gaggtggccc aggcgccctc 60
cgcccgcggc gccgcccggg ccgctcctcc ccgcgccccc cgcgcccccc gctcctccgc 120
<210> 44
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 44
ccggggtgac gtcacgaccg tgacacgcgg gtgacgccgt tgccgcggcg acttctcgtc 60
gtctccgccc ccttcccccg ctcccccccg cacccccgcc tagcgtcctt cccccaatcc 120
<210> 45
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 45
agcatacata gggtttctct tggtttcttt gattataatt catacatttt tctctaactg 60
caaacataat gttttccctt gtattttaca gatgcaaaca gctataattt tgcaaaaaag 120
<210> 46
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 46
aggagcctac aagaaagtac gagatttagt caacttgttg aagagctatt gaaaatcatt 60
tgtgcttttc agcttgacac aggtttggag tgtaagtgtt gaatatccca agaatgacac 120
<210> 47
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 47
ttataattta tagattttgc atgctgaaac ttctcaacca gaagaaaggg ccttcacagt 60
gtcctttatg taagaatgat ataaccaaaa ggtatataat ttggtaatga tgctaggttg 120
<210> 48
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 48
tctttttctc cccccctacc ctgctagtct ggagttgatc aaggaacctg tctccacaaa 60
gtgtgaccac atattttgca agtaagtttg aatgtgttat gtggctccat tattagcttt 120
<210> 49
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 49
tcagcatgat tataagaaaa atagaaccct cagtgtaact ctaattcctt tttactattc 60
cagtgtgatc tctgaaatta aattacttca actaaaaatt caaatacttt aaatcagaag 120
<210> 50
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 50
atttcatagt taatttattt tttttttcaa caaaatggtc atccaaactc aaacttgaga 60
aaatatcttg ctttcaaatt ggcactgatt ctgcctgctt tatttttagc gctatcacag 120
<210> 51
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 51
ggcgtgagcc actgtgcccg gccaatattt gttactttct taggtttaat agagaaaagg 60
gataaaacat ttctaactgg gagttaattg catggagaag gtcttaaatc agatgtttta 120
<210> 52
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 52
atgccttaaa tgtctgtata atatcatgtt ttcaaatcta attataaata cgtttaaagc 60
caagaataaa tcttttaaaa aattgacttg tttccttcca taactctgag ccatgatttt 120
<210> 53
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 53
actgcttgct tggcccggtc ccctccgtgc cagttcccag gcgcactcta ctccagccct 60
tctccctccc tcccttcctc cctctcctgg cccaccctgc tcttccctcg ccctgcaaat 120
<210> 54
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 54
taggtgggtg tggcaagggc accgcctggt cccaagtgtc cctctgtacc cacacccacc 60
cactcacttg taagctcctt gatgagcaaa cccctaaggc ccccagctca gactcagcag 120
<210> 55
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 55
gcattcaggt caactcaggc agactggcta aggaccagcc cagggcaatt ttgcagaaat 60
gatcatttgc acagaatggg tttccttcac agggagaaac ttgcctctga aagctatttt 120
<210> 56
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 56
ctgatcaaga aaaggcccac tttttaaaaa gtgaaacaag tttgcagata cggttctctt 60
cctggactcc tgtcttcctt ctgtgggcag taggggtcag ggctgacaga gccacctccc 120
<210> 57
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 57
gtgtcggtgc ctatgggaca gtgtacaagg cccgtgatcc ccacagtggc cactttgtgg 60
ccctcaagag tgtgagagtc cccaatggag gaggaggtgg aggaggcctt cccatcagca 120
<210> 58
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 58
gctgcaggct cataccatcc taactctgta agcgactttt ggtgatagga gtctgtgatt 60
gtagggtctc ccttgatctg agaatggcta cctctcgata tgagccagtg gctgaaattg 120
<210> 59
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 59
aggaaccggc tccggggccc cgataacggg ccgcccccac agcaccccgg gctggcgtga 60
ggtaagtgca gtcccttccc aggaatgaga accagtgccc gcccccctca cagctttcca 120
<210> 60
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 60
tggcagctgg tcacatggtg agggtggggg tgagggggcc tctctagctt gcggcctgtg 60
tctatggtcg ggccctctgc gtccagctgc tccggaccga gctcgggtgt atggggccgt 120
<210> 61
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 61
aaggatatgt tctactctaa tgtgttgtcc cttttattct taccaacagg acaaagcccg 60
agcaaagaaa gccatgttgt ctgaacaaaa tagggcttct cctctcccca gtgggctcct 120
<210> 62
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 62
caccccgcca cagagcggta agaagcagag cagcgggccg gaaatggcgt gaccacccca 60
tccttctcca ccaaagacag ttgcgcgcct gctccacgtt ctcttctgtc tgttgcagcg 120
<210> 63
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 63
gaggcgtgcg tttgctttta cagatatctg aatggaagag tgtttcttcc acaacagaag 60
tatttctgtg gatggcatca aacagggcaa agtgtttttt attgaatgct tataggtttt 120
<210> 64
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 64
ttttaaataa gtgggtcaag tacaccagcc acctccagac accagtgcgt gctcccgatg 60
ctgctatgga aggtgctact tgacctaagg gactcccaca acaacaaaag cttgaagctg 120
<210> 65
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 65
ctgaacacat ttgcccaatt ccaggtgtgc acagaaaacc gagaatattc aaaattccaa 60
atttttttct taggagcaag aagaaaatgt ggccctaaag ggggttagtt gaggggtagg 120
<210> 66
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 66
gggtagtgag gatcttgatt tggatctctt tttatttaaa tgtgaatttc aacttttgac 60
aatcaaagaa aagacttttg ttgaaatagc tttactgttt ctcaagtgtt ttggagaaaa 120
<210> 67
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 67
aaatcaaccc tgcaatcact ttttggaatt gtcttgattt ttcggcagtt caagctatat 60
cgaatatagt tctgtgtaga gaatgtcact gtagttttga gtgtatacat gtgtgggtgc 120
<210> 68
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 68
tgataattgt gtattttctt tgggggtgga aaaggaaaac aattcaagct gagaaaagta 60
ttctcaaaga tgcattttta taaattttat taaacaattt tgttaaacca ttgtcaaatt 120
<210> 69
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 69
ggaagaggag ggatcggctc gctcctccgg cggcggcggc ggcggcgact ctgcaggcgg 60
agtttcgcgg cggcggcacc agggttacgc cagccccgcg gggaggtctc tccatccagc 120
<210> 70
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 70
ctgattgcac tttcttctta tcctcccgtc tcctccttta ggtgcaatga ttctggactg 60
agacgcgctt gggcagaggc tatgtaatcg tgtctgtgtt gaggacttcg cttcgaggag 120
<210> 71
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 71
gctcggcacg ccccctcccg ttccactgcg tcccgcgccg ctcgctcatc cccgaggggc 60
ccctgcaacc tctccgcgcg aagacggctt cagccctgca gggaaagaaa agtaacttcg 120
<210> 72
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 72
ccagagtctg attacctgct ccgcgaggcc gcggacacgt gcggagagcc gactgacact 60
cgcagccccc tcgggaggcc cgacgcgact gggcccctca ggtgaggagc tgtgcgctcg 120
<210> 73
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 73
ctcctgattg gcggatagag caatgagatg acctcgcttt cctttcttcc tttttcattt 60
ttaaataatc tagtttgaag aatggaagac tttcgacgag gggagccagg aataaaataa 120
<210> 74
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 74
cagcgccgcg ccgtgtccag atgtcgcgtc agaggcgtgc agcggtttag tttaatttcg 60
cttgttttcc aaatctagaa gaggagcgga gcggctttta gttcaaaact gacattcagc 120
<210> 75
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 75
gcgccctcgg cgacgcgggc agctgggagg ggaatgggcg cccggaccca gctgggaccc 60
ccgggtgcga ctccacctac ctagtccggc gccaggccgg gtcgacagct ccggcagcgc 120
<210> 76
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 76
gggagcgcgg gggaagagga aagaggaaga agcgctcaga tgctccgcgg ctgtcgtgaa 60
ggttaaaacc gaaaataaaa atgggctaga cacaaaggac tcggtgcttg tcccagccag 120
<210> 77
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 77
agtgactcaa gaagtgaaga atgcacaaga atggatcaca agatggaatt tatcaaaccc 60
tagccttgct tgttaaattt tttttttttt ttttttaaga atatctgtaa tggtactgac 120
<210> 78
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 78
tttgcttgct ttgaagtagc tctttttttt tttttttttt tttttttgca gtaactgttt 60
tttaagtctc tcgtagtgtt aagttatagt gaatactgct acagcaattt ctaattttta 120
<210> 79
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 79
agaattgagt aatggtgtag aacactaatt cataatcact ctaattaatt gtaatctgaa 60
taaagtgtaa caattgtgta gcctttttgt ataaaataga caaatagaaa atggtccaat 120
<210> 80
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 80
ttttggacag tttaccagtt gccttttatc ccaaagttgt tgtaacctgc tgtgatacga 60
tgcttcaaga gaaaatgcgg ttataaaaaa tggttcagaa ttaaactttt aattcattcg 120
<210> 81
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 81
aatctgtgca tacatttctg gatgcattta cttatcttta aaaaaaaagg aatcctatga 60
cctgatttgg ccacaaaaat aatcttgctg tacaatacaa tctcttggaa attaagagat 120
<210> 82
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 82
cctatggatt tgatgactgg tattagaggt gacaatgtaa ccgattaaca acagacagca 60
ataacttcgt tttagaaaca ttcaagcaat agctttatag cttcaacata tggtacgttt 120
<210> 83
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 83
taaccttgaa agttttgcaa tgatgaaagc agtatttgta caaatgaaaa gcagaattct 60
cttttatatg gtttatactg ttgatcagaa atgttgattg tgcattgagt attaaaaaat 120
<210> 84
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 84
tagatgtata ttattcattg ttctttactc ctgagtacct tataataata ataatgtatt 60
ctttgttaac aatgccatgt tggtactagt tattaatcat atctaaccaa ctgtaggtgt 120
<210> 85
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 85
actttatagc tggatcatca ttgaactaaa acacaaagca agagaaaaac cttatgatag 60
taaaagtttg cggacgtaag tgcaattaaa tgcatcatat tcttgcacag ttggtggctc 120
<210> 86
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 86
tctttacagt gcacttcaga aggagatcac aacgcgttat caactggatc caaaatttat 60
cacgagtatt ttggtatgat tttttaataa gtgagcttta gcagacagtt ggtgagacag 120
<210> 87
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 87
tttccccagt atgagaataa tgttatcact attgatctgg ttcaaaattc ttctcaaaaa 60
actcagaatg atgtggacat agctgatgtg gcttattatt ttgaaaaaga tgtgagtatc 120
<210> 88
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 88
ttgtctttct tccactcagg ttatttccag aaagaagaga atggcaaagt atgagaaggc 60
tgaggtaaat ggattactta cctaaataga aaggccctgt tgaatctctt actcctaatc 120
<210> 89
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 89
ctcgttggaa gaggaacagc actggggagt ctttgtggat tctgaggccc tgcccaatga 60
gactctaggg tccagtggat gccacagccc agcttggccc tttccttcca gatcctgggt 120
<210> 90
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 90
actgaaagcc ttagggaagc tggcctgaga ggggaagcgg ccctaaggga gtgtctaaga 60
acaaaagcga cccattcaga gactgtccct gaaacctagt actgcccccc atgaggaagg 120
<210> 91
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 91
aacagcaatg gtgtcagtat ccaggctttg tacagagtgc ttttctgttt agtttttact 60
ttttttgttt tgttttttta aagatgaaat aaagacccag ggggagaatg ggtgttgtat 120
<210> 92
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 92
ggggaggcaa gtgtgggggg tccttctcca cacccacttt gtccatttgc aaatatattt 60
tggaaaacag ctaggcaccg gcctatgtct gggggtggct ctgtgccatc ccttcctgct 120
<210> 93
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 93
gaaacaatgc ggagagcaga tagacgcaat atttgggaac caaagagtga ctgctgttgg 60
cgttgcatca taacataagc gctttccccc ttctcgtcac tatcatttgt atcaaccaaa 120
<210> 94
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 94
gaactgatct ctggtatcct cgaaggaatg ctgtggggat attcttcatc tctgttcatg 60
gtacatcagc aatttgtggg gaaaagatgg actatataac acaatgatct gcctaaaaga 120
<210> 95
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 95
aactgtctct acttataggg ggctgagcaa accttagagc atctgcggat gctcgtcatt 60
atcttcaaaa gtccccaaga gtttttctcc atactttatt attgctattt tgtttaggct 120
<210> 96
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 96
agaaaaaaaa aaactcataa aattgtcttc aaaccaaacc aaaggaaatg aaaagaaaaa 60
aaaaaacagt acagggaggt ctaaaaccag agaacatatg aaaatacgtt ctgcctgact 120
<210> 97
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 97
aagagtaatt aactgttaaa tgttacagac tgatcaaata aaatgaagac tgagaatggc 60
ctgtttgtaa ggtaataaaa atacataaaa tcttatgata gaaatattta tacataaagt 120
<210> 98
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 98
ttcaaggaga tgagaaggaa acaggaggga agattgaaaa gaagagtcca gtgtgttatg 60
aggaaaaccc caagagcatg ctgccttaca agacaggtga aaaatgtgtt ctgtgaaaga 120
<210> 99
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 99
tagacatcca agtggagata tggcatttaa attcatgaga ttggatgaga tcccaccaaa 60
ggaacaggtt taggtggaga caaccaaata ccgatgccta ggacactgca gtgtttagaa 120
<210> 100
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 100
tcgcgggggg tggacggggc ggtctgcggg gagggggggc ggtctgcggg gagggggacg 60
gggcggcctc gcgggaggga ggacagtttc gcgggttcgg gcggcgagtc tcccggatgc 120
<210> 101
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 101
gctctccagc tgcttcctgc gcatccgtgc cgacggcgtc gtggactgcg cgcggggcca 60
gagcgcgcac agtgagtgcc cgccagcacc cccgcccgcc ccgccgcgcg caccccaccc 120
<210> 102
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 102
cggcctctgg ctggccgtgg ccgggcgccc cctcgccttc tcggacgcgg ggccccacgt 60
gcactacggc tggggcgacc ccatccgcct gcggcacctg tacacctccg gcccccacgg 120
<210> 103
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 103
cccgcagcgc atcccggtcg ccgcccagcc tcccgcaccc ccatcgccgg agctgcgccg 60
agagccccag ggaggtgcca tgcggagcgg gtgtgtggtg gtccacgtat ggatcctggc 120
<210> 104
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 104
ccgtggggcc cgtaaggcgc tactatataa ggctgccggc ccggagccgc cgcgccgtca 60
gagcaggagc gctgcgtcca ggatctaggg ccacgaccat cccaacccgg cactcacagc 120
<210> 105
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 105
ggtctgcaag gaaagtgagg cgccgccgct gcgttctgga ggaggggggc acaaggtctg 60
gagaccccgg gtggcggacg ggagccctcc ccccgccccg cctccggggc accagctccg 120
<210> 106
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 106
agccgcggaa cccaaggact tttctccggt ccgagctcgg ggcgccccgc agggcgcacg 60
gtacccgtgc tgcagtcggg cacgccgcgg cgccggggcc tccgcagggc gatggagccc 120
<210> 107
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 107
gcgcggagga acccgggtgt gccgggagct gggcggccac gtccggacgg gaccgagacc 60
cctcgtagcg cattgcggcg acctcgcctt ccccggccgc gagcgcgccg ctgcttgaaa 120
<210> 108
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 108
agagcgagcc ctcgcgcccc gccggcgcat agcgctcgga gcgctcttgc ggccacaggc 60
gcggcgtcct cggcggcggg cggcagctag cgggagccgg gacgccggtg cagccgcagc 120
<210> 109
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 109
catcccgacc cacgcggggc gcggggacaa cacaggtcgc ggaggagcgt tgccattcaa 60
ggtaatcgcc gcgcaagacg cctcggggag cttcgccagc cggggacgtg ggcgccacgg 120
<210> 110
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 110
gcgctcctcc gcagcctggg gtacgcgtga agcccgggag gcttggcgcc ggcgaagacc 60
caaggaccac tcttctgcgt ttggagttgc tccccgcaac cccgggctcg tcgctttctc 120
<210> 111
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 111
tgcctgcgcg ctctgagcct tcgcaactcg cgagcaaagt ttggtggagg caacgccaag 60
cctgagtcct ttcttcctct cgttccccaa atccgagggc agcccgcggg cgtcatgccc 120
<210> 112
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 112
cggccgccac aaagctcggg cgccgcgggg ctgcatgcgg cgtacctggc ccggcgcggc 60
gactgctctc cgggctggcg ggggccggcc gcgagccccg ggggccccga ggccgcagct 120
<210> 113
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 113
gaggatcccc tccaagccta aaaggttgtt aatagttgga ggtgattcca gtgaagatat 60
tttatttcct ttgtcctttt tcaggagaat tagatttcta taggattttt ctttaggaga 120
<210> 114
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 114
tttatttttt ggacttcaaa gcaagctggt attttcatac aaattcttct aattgctgtg 60
tgtcccaggc agggagacgg tttccaggga ggggccggcc ctgtgtgcag gttccgatgt 120
<210> 115
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 115
tattagatgt tacaagttta tatatatcta tatatataat ttattgagtt tttacaagat 60
gtatttgttg tagacttaac acttcttacg caatgcttct agagttttat agcctggact 120
<210> 116
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 116
gctacctttc aaagcttgga gggaagccgt gaattcagtt ggttcgttct gtactgttac 60
tgggccctga gtctgggcag ctgtcccttg cttgcctgca gggccatggc tcagggtggt 120
<210> 117
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 117
gggccttggg gctcagccac agcctgacac agtgctcgac cttgatagca tggggcccct 60
ggcccagagt tgctgtgccg tgtccaaggg ccgtgccctt gcccttggag ctgccgtgcc 120
<210> 118
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 118
tgtgtcctga tggcccaaat gtcagggttc tgctcggctt cttggacctt ggcgcttagt 60
ccccatcccg ggtttggctg agcctggctg gagagctgct atgctaaacc tcctgcctcc 120
<210> 119
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 119
caataccagc aggaggttct gggcctctga accccctttc cccacacctc cccctgctgc 60
tgctgcccca gcgtcttgac gggagcattg gcccctgagc ccagagaagc tggaagcctg 120
<210> 120
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 120
ccgaaaacag gagcaaatgg cgttttataa attatttttt tgaaataaag ctctgtgtgc 60
ctgggtcttc cctgagcaac atggagtggg gtgaggtgga gggatccctc cagcagagtt 120
<210> 121
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 121
tcaggatcta gttcaggttc aaaattaaaa gatcctgaac tgagtttaaa aggcacccag 60
cacatcatgc aagcaggcca gacactgcat ctccaatgca ggtaagtggc tgtgttggtt 120
<210> 122
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 122
ccgcggggag cgcgggcacc gggcgagcag gccgcgtcgc gctcaccatg gtcagctact 60
gggacaccgg ggtcctgctg tgcgcgctgc tcagctgtct gcttctcaca ggtgaggcgc 120
<210> 123
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 123
tggcggcgag gattacccgg ggaagtggtt gtctcctggc tggagccgcg agacgggcgc 60
tcagggcgcg gggccggcgg cggcgaacga gaggacggac tctggcggcc gggtcgttgg 120
<210> 124
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 124
tcatcgaggt ccgcgggagg ctcggagcgc gccaggcgga cactcctctc ggctcctccc 60
cggcagcggc ggcggctcgg agcgggctcc ggggctcggg tgcagcggcc agcgggcgcc 120
<210> 125
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 125
actaaaggtg ccaaatgata agtattatgg cgcccagacc gtgagatcta cgatgaactt 60
taagattgga ggtgtgacag aacgcatgcc agtaagtggc atttgtggaa atgttggcta 120
<210> 126
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 126
acagctgata agatgcgatt acttttgatc ctgggtttct tttcaacttg taatagtgtt 60
gtattcttgt ctttaggcaa gccaaaattc cttccggata gaatatgata cctttggtga 120
<210> 127
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 127
ccttagcttc ggctcccggc ttgggtggcg cggccgtgcc ctcgttttgg cctccgaacg 60
cggctcgaat ggtgagcgca ggccgccatc ccccggcctc cccgcagtga ccttcagccc 120
<210> 128
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 128
accggcgtgg aggcgtggcc acagccgccc agaaattcta cccaagctcc ctcagcacca 60
tgtaccgagc acttcggctc ctcgcgcgct cgcgtcccct cgtgcgggct ccagccgcag 120
<210> 129
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 129
tcccttctcc caggttttgt cttcgctctg tttggaggag agggtgtgtg tcatcctctt 60
ctcccagttt ggcgttcagg agggtcctct gatgcgctaa tagggtagca ccgtgtcctc 120
<210> 130
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 130
agcgaccacc tacccagcgc agtcaggggc ggggctggga cccagagcgg gaccccggct 60
gccgagtcca ggtgtcccgc gggcctcgat ttggggagca ggtaggcggg ggtctgaggg 120
<210> 131
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 131
cctggttctg ccagctcccc tgagagcctg aacccgggct tgagagcctc gccaccccgg 60
gtgacatccc tgccgtgggc ttgggggctc tgggtgtgat tccgccggtc cgggtcccgc 120
<210> 132
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 132
tgcaggacgc gctcggacgg ctcccgcacc cccaccgcag tgttgggtgg tggtacggct 60
cagggagtca cgcgcctggg tgtcggcggg gctgcgggac cgcgagtgag tgtggtcgct 120
<210> 133
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 133
catgggctgc cctggggccc acctgaccac tcctgtcctc tgccagggga cagcaccccc 60
tcgagtgggc ttggccagga gctcaggagg cgccagccac cggagacaag gacagcgagg 120
<210> 134
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 134
gtctcccacc ccaggcctgg tgagtggcta ctccatgacc cccccgacct tgaacatcac 60
ggaggagtca cacgtcatcg acaccggtga cagcctgtcc atctcctgca ggtactgggt 120
<210> 135
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 135
cgactgtggc tctgcctggg actcctggac ggtgagcgcg gcgaacgggc cacccgcccg 60
agcgtggggc tggccgggga gggggtaccg cgcacctggg gcgggcgctg agaccgctcc 120
<210> 136
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 136
ccccgccccg ccccaggcca gccggcgccc gcgcggacac tttcagcccc gagccgcggc 60
cgctcgggtc ggacccacgc gcagcggccg gagatgcagc ggggcgccgc gctgtgcctg 120
<210> 137
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 137
aagcaatgcc acccatgccc tggggtgccc caggggacgt ccccagctcc cgtgccttat 60
ggttactttg gaggcgggta ctactcctgc cgagtgtccc ggagctcgct gaaaccctgt 120
<210> 138
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 138
gcgggagggg ggcggaatct ggtcgcccac tcccctctga ccagccaccc agcggcgcct 60
acgctgatgc ctgctgtcaa ctatgccccc ttggatctgc caggctcggc ggagccgcca 120
<210> 139
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 139
gcgagctggg tgccccctag attccccgcc cccgcacctc atgagccgac cctcggctcc 60
atggagcccg gcaattatgc caccttggat ggagccaagg atatcgaagg cttgctggga 120
<210> 140
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 140
cgcgcgtgcc cgggcccctg cgtctcttgc gtcaagacgg ccgtgctgag cgaatgcagg 60
cgacttgcga gctgggagcg atttaaaacg ctttggattc ccccggcctg ggtggggaga 120
<210> 141
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 141
tgggcaagag tgcgctgacc atccagctga tccagaacca ttttgtggac gaatacgacc 60
ccactataga ggtgagcctg gcgccgccgt ccaggtgcca gcagctgctg cgggcgagcc 120
<210> 142
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 142
ctggctgagc agggccctcc ttggcaggtg gggcaggaga ccctgtagga ggaccccggg 60
ccgcaggccc ctgaggagcg atgacggaat ataagctggt ggtggtgggc gccggcggtg 120
<210> 143
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 143
ccccggcctc ggccccggcc ctggccccgg gggcagtcgc gcctgtgaac ggtgagtgcg 60
ggcagggatc ggccgggccg cgcgccctcc tcgcccccag gcggcagcaa tacgcgcggc 120
<210> 144
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 144
gggcgtgcgc aggcccgccc gagtctccgc cgcccgtgcc ctgcgcccgc aacccgagcc 60
gcacccgccg cggacggagc ccatgcgcgg ggcgaaccgc gcgcccccgc ccccgccccg 120
<210> 145
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 145
aaacaccccc gccagttccg ggtgcctgga gtttaaaagg tcccagcacc agcgagggga 60
ggggagggga ggggcgggcg tggagacctg gaaggaggta ccgatccagc cttgattgca 120
<210> 146
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 146
aggcggcgag gaatagcctt gaagccgatc cctcgcgtcc gccagggggc gtggaggggc 60
ggagctccag cggccttcag aggggtcgct aggccacacg gggcgagagg gggctggggg 120
<210> 147
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 147
gagtctgagc ttgtgagcgg ctgtggcgcc ccaactcttc gccagcatat catcccggca 60
ggtaacctca ggctccaagg ggcggccccg gtccctggct gtggaggggt ggctctaatt 120
<210> 148
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 148
ggggacaaag ccgggaagag gaaaagctcg gacctaccct gtggtcccgg gtttctgcag 60
agtctacttc agaagcggag gcactgggag tccggtttgg gattgccagg ctgtggttgt 120
<210> 149
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 149
tgcttctaga tgccgacaaa aggatcaagg tggcgaagcc cgtggtggag atggatggtg 60
atgagatgac ccgtattatc tggcagttca tcaaggagaa ggtagtgccc cctcctgaag 120
<210> 150
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 150
ccccgtgtct ttgctgcctg gtaattcctg cacgcatctt ttcctatttt gcaacgccat 60
aggcttccag cgactgctgg tgatgtttct ggtaagttag agcttggggc agtgcggacc 120
<210> 151
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 151
gcgggtcgtg cgctcgctct gcagagcctc aggctcgcgg ccggcctggg cgccggcggc 60
cctgacagcc cccacctcgc aagagcagcc gcggcgccac tgtgagtgcc gcgcggaggg 120
<210> 152
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 152
gcggccagcg cccgccaggc ccagcgttag cccgcggcca ggcagccggg aggagcggcg 60
cgcgctcgga cctctcccgc cctgctcgtt cgctctccag cttgggatgg ccggctacct 120
<210> 153
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 153
tgctccacta gctcctctcc tactgagctg gggtaagaag cggagcgtat acggaggagg 60
cgggatgcat ttctgcatcg agcgcacaaa ggtgtggcgg agggggctcc agagctggga 120
<210> 154
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 154
gcggcggtcc ggagagaggg cgagccccgc gcggcgccgg ggaccgggcg ctaccacgag 60
gccgggacgc tggagtctgg ggtaggaggg agaacgggca cggggcggga agaggggtcc 120
<210> 155
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 155
agagcctgga tgttgtttac atgaaggatc cggcgggagg agtctaagag gaggaggcgg 60
cggtgccgga ggaggaggag gagggaggga gaagagagga agaccggagt ccccgcggcg 120
<210> 156
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 156
cccccgccat ctatcacatg gcagagatag aataaaaaca gaaaaatggc gacggtcacg 60
ttgtggcgag ccttgctgcg tcattagata atcctcatgc aaatagcggg aagaacaaag 120
<210> 157
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 157
taatgtacta agaatcagtt tgctgtatat tagaataaat agtaacagta agtcagcagg 60
attatccaaa caaaagacta ggttttatga gataagcttg atttaagaaa aaaacaatta 120
<210> 158
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 158
aagtatgaat atcagaaata ctgtgtgttt actctcagat tttagttggt tggatttaat 60
atcaagataa ctagctgcta agcgtttcat aattctcaca gtgatattag atttcaaaat 120
<210> 159
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 159
gacactgaga gaactgaaaa actacatcag tcaaattcat gtatgtatat catatagcct 60
ttaacttttt acattaatca gattcttagt aaaatgcaga ctgtatacct aaatattaaa 120
<210> 160
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 160
atatttactt ttataatctt accttttatt tcaatataaa taaaattctt cttaggttaa 60
aaaattaatt tcagttgtgt ttatgccaga tggcattgct tagttggtgc aagctctcaa 120
<210> 161
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 161
cgccctgtgg ctctgcgtgg agacccgggc cgcctctgtg ggtaaggagc ccactctgga 60
ggaggaaggc agacaggtcg ggtgagggcg gagaggacct gaaagccaga tctaactcgg 120
<210> 162
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 162
cgagttccac ctccgcgcct ccttctctag acaggcgctg ggagaaagaa ccggctcccg 60
agttctgggc atttcgcccg gctcgaggtg caggatgcag agcaaggtgc tgctggccgt 120
<210> 163
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 163
agtccgtctg gcagcctgga tatcctctcc taccggcacc cgcagacgcc cctgcagccg 60
cggtcggcgc ccgggctccc tagccctgtg cgctcaactg tcctgcgctg cggggtgccg 120
<210> 164
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 164
ctctagagtt tcggcaccag ctcccaccct gcactgagtc ccgggacccc gggagagcgg 60
tcaatgtgtg gtcgctgcgt ttcctctgcc tgcgccgggc atcacttgcg cgccgcagaa 120
<210> 165
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 165
tgtgttgtca cccaagagat tgttgtttgc catactttgt ctgaaaaatt cctttgtgtt 60
tctattgact tcaatgatag taagaaaagt ggttgttagt tatagatgtc taggtacttc 120
<210> 166
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 166
aggggcactt cattgagagt tttgtcttgg atattcttga aagtttatat ttttataatt 60
ttttcttaca tcagatgttt ctttgcagtg gcttaatgtt tgaaattatt ttgtggcttt 120
<210> 167
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 167
ttttgtaaat attgaaatgt agcaataatg tcttttgaat attcccaagc ccatgagtcc 60
ttgaaaatat tttttatata tacagtaact ttatgtgtaa atacataagc ggcgtaagtt 120
<210> 168
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 168
taaaggatgt tggtgttcca cgtgttttat tcctgtatgt tgtccaattg ttgacagttc 60
tgaagaattc taataaaatg tacatatata aatcaagtgg agtcatttga ttgttgagat 120
<210> 169
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 169
gcaagaagtt atggaattcc ttttattgaa acatcagcaa agacaagaca ggtaagtaac 60
actgaaataa atacagatct gttttctgca aaatcataac tgttatgtca tttaatatat 120
<210> 170
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 170
ttgatagtgt attaacctta tgtgtgacat gttctaatat agtcacattt tcattatttt 60
tattataagg cctgctgaaa atgactgaat ataaacttgt ggtagttgga gctggtggcg 120
<210> 171
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 171
gcgagcgcgg cgcaggcact gaaggcggcg gcggggccag aggctcagcg gctcccaggt 60
gcgggagaga ggtacggagc ggaccacccc tcctgggccc ctgcccgggt cccgaccctc 120
<210> 172
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 172
agctcgattt tcctaggcgg cggccgcggc ggcggaggca gcagcggcgg cggcagtggc 60
ggcggcgaag gtggcggcgg ctcggccagt actcccggcc cccgccattt cggactggga 120
<210> 173
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 173
gcttctatgg tgcgttctac agcgatggcg agatcagtat ctgcatggag cacatggtat 60
gtgacaccct ctcagcctct ggagcaatgg ccttaagagt tgggtggctc tggcctaatc 120
<210> 174
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 174
tacattccct ttcctctagg taataaaagg cctgacatat ctgagggaga agcacaagat 60
catgcacaga ggtaagaagt tatttgctag ttattttgct ttgaatttta gatataatcc 120
<210> 175
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 175
atgctgatcc ttctcttccc caatctacct gtgtcagttc cctccttttc tattttctct 60
tccctgcaga tgtcaagccc tccaacatcc tagtcaactc ccgtggggag atcaagctct 120
<210> 176
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 176
gccaggcaac agctcttacc ttgtctttct tcctttaagc ttaataaaaa accccgcaga 60
gagagcagat ttgaagcaac tcatggtgag tctatttatt ccggattctt acagtacctg 120
<210> 177
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 177
gagtcactac gcttggtaga ctcttaacag cgctgagaga ccactccaag agagcagaga 60
aataatagtt ctattctcag ttgtcaaaca gcaaacaaaa aacccttggc tggggggtga 120
<210> 178
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 178
aattctcttg aaaacagaga aactatttcc tgtttatttt ctaaattgag acgtcacttt 60
ttaaaaattg gtacctgtaa tttagccatt tcctactcag caatgtctca tttaaactat 120
<210> 179
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 179
tatttgttta gcgtgtttca aagagcagat gtaagcttga gcccatcctc tgtcctatga 60
ctaagtcgat attagcaggg gttaggactg ttagttttcc agttcctact ggaggcaaat 120
<210> 180
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 180
tctttgttta ccactgttct ctgtatttca aaagcacctg gaaatcaata aaatttgtta 60
ttcagaacaa aagccttctc tatatatcag tatttcccaa aatgtgtttg gaaatatagg 120
<210> 181
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 181
tggaagctga gcactagctc ccctttattg cctgcctggc agagcctgtt tgattactgc 60
aggccctttt acccatgctt ctagtttagg tattctttct ttgatatgag gctcttgacc 120
<210> 182
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 182
agaaaagagt tctttctcta ggtgttctga gagaagtttg taaatttgga tagtacattc 60
tatcctgata aaaccacctt gctgtggtct tgatgtacaa aaaaaaattt tttttttgag 120
<210> 183
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 183
ctaataataa taataataat aataataaca acaacttatt gaatgtggcc agctcactag 60
atgaggaaag aggaaggcat tttctgcatt cttgcctagt tttccttata agcaccacta 120
<210> 184
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 184
agttaatagc tctgtctttt tggtgtttgc actatgtaat gcttttaata ctttttaatt 60
gtgctttttt atgtattaaa tgtttttcct tttgccattg tgtgttgtca ttatttttga 120
<210> 185
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 185
acaatccaaa tattgccgtt tcataaatgt aataagtaat actaattcac agagtattgt 60
aaatggtgga tgacaaaaga aaatctgctc tgtggaaaga aagaactgtc tctaccaggg 120
<210> 186
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 186
tcaagagcat gaacgcatca atagaaagaa ctcggggaaa catcccatca acaggactac 60
acacttgtat atacattctt gagaacactg caatgtgaaa atcacgtttg ctatttataa 120
<210> 187
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 187
acttgtcctt agattaatgt gtctggacag attgtgggag taagtgattc ttctaagaat 60
tagatacttg tcactgccta tacctgcagc tgaactgaat ggtacttcgt atgttaatag 120
<210> 188
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 188
ttgttctgat aaatcatgca attaaagtaa agtgatgcaa catcttgtat actgatagtg 60
gttattgcca gtcatgcttg attacctgca tttgcataat gatagaggaa gcctaagatg 120
<210> 189
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 189
tgcacatccc atcagccagg acaccagtgt atgttgggat gcaaacaggg aggcttatga 60
catctaatgt gttttccaga gtgaagtgcc tggctccatt ccaaactcct ggaagtggac 120
<210> 190
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 190
tgtggaacac attgtctata aagccttgcg ctcacacatt ctgcctccta aacatttcac 60
agaagatgga aatatcctgc agcttgctaa cctgcctgat ctatacaaag tctttgagag 120
<210> 191
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 191
gtgttaaata tggttattta tgcactgtgg gatgtgttct tctttctctg tattccgata 60
caaagtgttg tatcaaagtg tgatatacaa agtgtaccaa cataagtgtt ggtagcactt 120
<210> 192
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 192
aagacttata cttgccttct gatagtattc ctttatacac agtggattga ttataaataa 60
atagatgtgt cttaacataa tttcttattt aattttatta tgtatatatt gtgtcagttc 120
<210> 193
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 193
tactaatggg acattcacat gtgtttcagc aaggtgaaaa aattattcag gagttcctgt 60
ccaaggtgaa acaaatgccc tttactgaaa tgtcagaaga aaacatcaca ataaagttaa 120
<210> 194
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 194
aacagctaaa agctgaagta atagcaaaga ataatagctt tgtaaatgaa atcatttcac 60
gaataaaagt tactacgtga aaaatcccag taatggaatg aaggtaatat tgataagcta 120
<210> 195
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 195
ttgtctgtaa tagttttata ttgttttata ttaacccttt ttccatagtg ttaactgtca 60
gtgcccatgg gctatcaact taataagata tttagtaata ttttactttg aggacatttt 120
<210> 196
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 196
caaagatttt tattttgaaa aatgagagct gtaactgagg actgtttgca attgacatag 60
gcaataataa gtgatgtgct gaattttata aataaaatca tgtagtttgt ggaatttgag 120
<210> 197
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 197
tttcttaagg catgcatggt agaaaatgaa tgtgaagacc ccagccagga gactattacg 60
ttcctctata aattcattaa gggagcttgt cctaaaagct atggctttaa tgcagcaagg 120
<210> 198
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 198
cttgctaatc tcccagagga agttattcaa aagggacata gaaaagcaag agaatttgag 60
aagatgaatc agtcactacg attatttcgg taactaacta actataatgg aattataact 120
<210> 199
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 199
aattttaagg gaagtttgcc tggctagtga aaggtcaact gtagatgctg aagctgtcca 60
taaattgctg actttgatta aggaattata gactgactac attggaagct ttgagttgac 120
<210> 200
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 200
ttctgacaaa ggtggtaaat tcagacaaca ttatgatcta ataaacttta ttttttaaaa 60
atgaccattt ttccattttc tttctaggaa attaaaccct tttaattctt atctaccttc 120
<210> 201
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 201
agatgagtca agaggagtct actcgcttct atgaccaact gaaccatcac atttttgaat 60
tggtttccag ctcagatgcc aatgagagga aaggtggcat cttggccata ggtaaggaca 120
<210> 202
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 202
gtttgccagt ggcctaaaga gccggaatga ggaaaccagg gccaaagccg ccaaggagct 60
ccagcactat gtcaccatgg aactccgaga ggtgcttctg ggatctgggg ccagtcattg 120
<210> 203
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 203
ttatccagaa tattaaagga aacttctctc taaagaacct cagggcaaga tgcttggaac 60
cggacctgcc gccgccacca ccgctgccac cacatctagc aatgtgagcg tcctgcagca 120
<210> 204
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 204
cctcgctccc ggcttagagg acagcgggga aggcgggcgg tggggcaggg ggcctgaagc 60
ggcggtaccg gtgctggcgg cggcagctga ggccttggcc gaagccgcgc ggtgagtcta 120
<210> 205
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 205
gtgtaaaatt tgacaaaaaa agtatattta ctatactgta aatatatgtg atgatatatt 60
gtattatttt gcttttttgt aaagcagtta gttgctgcac atggataaca acaaaaattt 120
<210> 206
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 206
gattattctc gtgttagtat tgttaacttc tttttgcgac tgcgttacat catttaaaga 60
aaatgctgtg tattgtaaac ttaaattgta tatgataact tactgtcctt tccatccggg 120
<210> 207
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 207
cctaaacttt ggcagttcct ttgtctacaa ccttgttaat actgtaaaca gttgtacgcc 60
agcaggaaaa atactgccca acagacaaaa tcgatcattg taggggaaaa tcatagaaat 120
<210> 208
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 208
ccatttcaga tctttattgt tcctcacccc attttcctcc ttgtgtatgt acttccccca 60
cccccctttt tttaagtaaa atgtaaattc aatctgctct aagatatgag gagttattta 120
<210> 209
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 209
gccggaaagc cgggcgcgct agagctcgcg ggaggtaatc tttctctcct gctctcgcgg 60
cgggaacgcg gggcctccgt gttctgctgt cttcatcagc gtgggccgcg ggtagcgggt 120
<210> 210
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 210
cttccgttca gacgtcccgg gtccggcgcg gggaaggcag cctggcgcgc gctaattgcc 60
tattggcctg tgctgccggc tcgcagcccg ggtggacccg agccacgccc cctggagtgc 120
<210> 211
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 211
aggctacctc tgggaagccg ctcaccgtcg gaagctgcgg gagctgaaac tgcgccatcg 60
tcactgtcgg cggccatgac accgctcgtc tcccgcctga gtcgtctgtg ggtacgctgg 120
<210> 212
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 212
acggaacttg tagtctcctc gtggctagtt caggcggaag gagcagtcct ctgaagcttg 60
aggagcctct agaactatga gcccgaggcc ttcccctctc ccagagcgca gaggctttga 120
<210> 213
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 213
tgtttaattt ttccttttac aatgagaagg tcaccatctt gactcctacc ttagccattt 60
gttgaatcag actcatgacg gctcctggga agaagccagt tcagatcata aaataaaaca 120
<210> 214
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 214
tatttattct ttgtcatggg agtcattatt ttagaaacta caaactctcc ttgcttccat 60
ccttttttac atactcatga cacatgctca tcctgagtcc ttgaaaaggt atttttgaac 120
<210> 215
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 215
atgtgtatta attataagcc tctgaaaacc tatggcccaa accagaaatg atgttgatta 60
tataggtaaa tgaaggatgc tattgctgtt ctaattacct cattgtctca gtctcaaagt 120
<210> 216
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 216
aggtcttcag ctccctgtac tttgggattt taatctacca ccacccataa atcaataaat 60
aattactttc tttgactctg actcctagaa taatctattc aaaaccttaa tgtctttttc 120
<210> 217
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 217
attacataac acttcatgag tggctgtgtc ttgtaatttt ggggacaggt ttctctcttt 60
ccctctcttt tttttgtcaa aagcccagag actgacaacc agctgcagtg tctaagtgtt 120
<210> 218
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 218
cctcactgac agggtggggc ctcaccaccc ctggagggag cagcgttggc agggagacag 60
cctggcccag tgaccctggg cccaagccag cccctccagg gctttcaggg aagcgccatc 120
<210> 219
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 219
cattttcaaa gatgtcaaac gtcacttctt cctgtagggc ccgagtcctg cctcctatca 60
gggccagatc atagaaggct attttctatt ctggggaacg attataactt aaatgattgt 120
<210> 220
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 220
tttaataaaa attctaagct ggaaaatact tgccttgggc ttcctcagtt tgcctgttgc 60
tcaggccatt gaggcgtcaa gaacacggct gggtggtggg gctgtcttgt ggttctgtgg 120
<210> 221
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 221
cgcactgaca atccagctaa tccagaacca ctttgtagat gaatatgatc ccaccataga 60
ggtgaggccc agtggtagcc cgctgacctg atcctgtctc tcacttgtcg gatcatcttt 120
<210> 222
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 222
aaagtactgt agatgtggct cgccaattaa ccctgattac tggtttccaa caggttcttg 60
ctggtgtgaa atgactgagt acaaactggt ggtggttgga gcaggtggtg ttgggaaaag 120
<210> 223
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 223
ttccggggtc tccaacattt ttcccggctg tggtcctaaa tctgtccaaa gcagaggcag 60
tggagcttga ggtaagttta tctcatgcat agtgttcggc tttgggctgt ggaatgttca 120
<210> 224
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 224
tgactcgtgg ttcggaggcc cacgtggccg gggcggggac tcaggcgcct ggggcgccga 60
ctgattacgt agcgggcggg gccggaagtg ccgctccttg gtgggggctg ttcatggcgg 120
<210> 225
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 225
tggccccagg caatcgactg catcacgcag ggacgtgagt tggagcggcc acgtgcctgc 60
ccaccagagg tctacgccat catgcggggc tgctggcagc gggagcccca gcaacgccac 120
<210> 226
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 226
agcatcaagg atgtgcacgc ccggctgcaa gccctggccc aggcacctcc tgtctacctg 60
gatgtcctgg gctagggggc cggcccaggg gctgggagtg gttagccgga atactggggc 120
<210> 227
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 227
ctgccctcag catcccccat agctcccagc agccccaggg tgatctcaaa gtatctaatt 60
caccctcagc atgtgggaag ggacaggtgg gggctgggag tagaggatgt tcctgcttct 120
<210> 228
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 228
ctaggcaagg tcccgtcata gcaattatat ttattatccc ttggctgtgt ctcttgccag 60
ttattgggat gacgtcgttc caggagggag gcattgggat tcaggtaggg ggacagctct 120
<210> 229
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 229
aactattgct ccctgcgttc tttgatcatt acctatgact tacaaatctg cctggagatg 60
tggacattct gcatttgctt ctgtatctgg agagatgttt gtatatatcc aggccgtata 120
<210> 230
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 230
cacacacatt tccatatctc tctacagata tatttcccct tcaatcgtga cctggtattt 60
ggaactctcc ttttcatttg gcttatcttc cttttaatgt gatgtctctg tgctaatact 120
<210> 231
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 231
taccagttct tgttttgcaa tctgttttga ggtccattgc tttactaaga cccactgcat 60
cttggctgat ttcaaagtga cacctgaata cagtgtttaa aaaaaaaaaa gttttgtttg 120
<210> 232
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 232
taaatcatgt gaccagcttc tctcaacctg acatggaaag tctcttgtac tacagtgtat 60
ttaataaaaa tgatgtctta caataaataa catactccaa aagagagact aaaaatgaca 120
<210> 233
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 233
accccacccc cctctcctct cctcctcctc ttttttagaa gcagcgatcg gagatggatg 60
tctctctttg cccagccaag tgtagtttct ggcggatttt cttgctggga agcgtctggc 120
<210> 234
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 234
ctcctcgcgg ctcccacccg gcggcggcgg cggcggcggc ggcgtccgcg atggtttcag 60
acgctgaagg attttgcatc tgatcgctcg gcgtttcaaa ggcagaggcc ccccctcccc 120
<210> 235
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 235
tgttgcaacc ctgcaaagtc tcggagtcgg agagcgcgcc tcgcttccag agcccccgga 60
cccggcgagt cagcgatcgc cgagccggcc accatgcccg gcagaccgcg ccactaggcg 120
<210> 236
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 236
tcggagcact tgtacatttc tgcagccgcg cggcgagcca ttcgcggcgg ctgctgcagc 60
tcctactgca tcttccttct cttcctttcc tcgggctccg ggtgtgtgta tgtgtgagag 120
<210> 237
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 237
gggacaaagg cgcactacgg gtcggaaact ccccgcgctc ctctttcccg ctcgtcgcgg 60
ggcagcttca aagctgtcaa cgtttccctc agtccccaat accagtgaca ggtcgggaaa 120
<210> 238
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 238
cgcggcggaa gccccgcccc ggccgtgggg acgcgcgggt cgggccgggc gcgcggggtt 60
gggcggggcg cggcggctgg cctccggatg ggcccagtag ccttgtcgca cctgccggca 120
<210> 239
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 239
atagcagcag ccgtggcggc cacggggcgg ggcgcggcgg tcggtgaccg cggccggggc 60
tgcaggcggc ggagcggctg ggtaaggccg ggcccagggc gggtggggcc gctccccctt 120
<210> 240
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 240
cgcgcggagc agggatcgct tggcggccgc gggactggtt ttgcggcggc accgggaggg 60
gtaagggagg tgagggcggc gggtgccgaa gcgacggcag cggccgcggc cggaggagca 120
<210> 241
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 241
gaggccggat gaaacttctc agtccagcag tttccagtcc taacaaatgc tcccacctga 60
atttgtatat gactgcattt gtgtgtgtgt gtgtgttttc agcaaattcc agatttgttt 120
<210> 242
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 242
ccttttggcc tcctgcaaag tctccagaag aaaatttgcc aatctttcct actttctatt 60
tttatgatga caatcaaagc cggcctgaga aacactattt gtgacttttt aaacgattag 120
<210> 243
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 243
tttagaaata ataaaaagaa agatacttac atgttcccaa aacaatggtg tggtgaatgt 60
gtgagaaaaa ctaacttgat agggtctacc aatacaaaat gtattacgaa tgcccctgtt 120
<210> 244
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 244
catgtttttg ttttaaaacg tgtaaatgaa gatctttata tttcaataaa tgatatataa 60
tttaaagtta tactaaggtt tcagcatttt tgtttttagt ttaatcataa gaattaaagc 120
<210> 245
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 245
agccgcagcc actcaagtgc cggacttgtg agtactctgc gtctccagtc ctcggacaga 60
agttggagaa ctctcttgga gaactccccg agttaggaga cgagatctcc taacaattac 120
<210> 246
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 246
gttttagtga gggggcagtg gaactcagcg agggactgag agcttcacag catgcacgag 60
tttgatgcca gagaaaaagt cgggagataa aggagccgcg tgtcactaaa ttgccgtcgc 120
<210> 247
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 247
tgctcccgca ctactgggat ctgagatctt cggagatgac tgtcgcccgc agtacggagc 60
cagcagaagt ccgacccttc ctgggaatgg gctgtaccga gaggtccgac tagccccagg 120
<210> 248
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 248
cagtccacag ctgtcactaa tcggggtaag ccttgttgta tttgtgcgtg tgggtggcat 60
tctcaatgag aactagcttc acttgtcatt tgagtgaaat ctacaacccg aggcggctag 120
<210> 249
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 249
agccacttct gggtacttca gtatcagaga tcagttctcg tggtttagac agttcctatc 60
tatagctgac tatccttgtc cttgaatatg gtgtaactga ctattggctc tacagtttta 120
<210> 250
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 250
ttgggccact taagaaatat ttccttgaat aattattttg agaaaaagtc taaaagtaat 60
aaaaataatt ttaaacacac tgtagtaaga aatgactgtt ggaaaattat gctttcactt 120
<210> 251
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 251
tctaccatat tctcagctat acaaaaccat ttattttgaa gatttttaga ctactgttaa 60
tttgaaatct gttactctta ttgtggaatt tgttttttta aaaaagatgt ttctaattgg 120
<210> 252
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 252
atttttaaaa gaagaatgga atttggttgc tattttacaa tagaacctaa gctttttgtg 60
gttcttagtg tcctatgtaa aacttagtgt caaagtaatc aactttgaga ttttcccttc 120
<210> 253
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 253
atgttgaata gcatctcagg tttcatttca caatgcacgc atggagttgg aaggagttca 60
acagacagac agtttttctt tatcaaccgg cggccttgtg acccagcaaa ggtatttaaa 120
<210> 254
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 254
cagttgcaaa gcctcattcc ttttgttcag ctgcccccta gtgactccgt gtgtgaagag 60
tacggtttga gctgttccga tgctctgcat aatctttttt agtaagtaga ttgctggcaa 120
<210> 255
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 255
ggaagcccca gcataaagga aaatatcggc tctgtgtttg ggcagaagca ggtagtgatg 60
gccggttact tcaacgcctc ttattgctct agtgattata gcgggtttcc attgtccctt 120
<210> 256
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 256
caggagtatg ccaaaatggt ccaggtctta catgcatact gtatcatttc agcaggcatc 60
cgtgtaagtt gcaccaatca gcttggacaa ggaaaacgac agcctgtggt atgcacaggt 120
<210> 257
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 257
ctgacccgcc tccccacagg agccgtgtgt gagttctgcc agccccggga gtctgagctg 60
tatcagaagg aggtgagagg gccgggaggt gaggaggggc caggtgggga ggcgggggcg 120
<210> 258
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 258
cgtccccagg tatcccatct gaatgccctg gaggagcgct tctcgcgcct ctggacgcag 60
tgccagcgct gccagggcag cctgcacgag gacgtcatct gcaccaggtg tgtgccatgt 120
<210> 259
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 259
ggcactgggc cttggctggt cctgaccctg cccctgcccc cacccgcagc cgggactgcc 60
ccatcttcta catgcgcaag aaggtgcgga aggacctgga agaccaggag cagctcctgc 120
<210> 260
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 260
ggcgcttcgg accccctgga cctgaggcct ggtgaccttg caagcatccc atggggcggg 60
ggcgggacca gggagaatta ataaagttct ggacttttgc tatatggtgc tttgtggtct 120
<210> 261
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 261
gttgactgat tctcttgtag accgagattt tagatgaaga taagcgctta ggcagtgcag 60
tggattacta ctttattcaa gatgacggaa gcagatttaa ggtaagcccc tgactgcgac 120
<210> 262
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 262
gaagacaggc tggctcatta acatgcatcc tgtaagcact aggtccttct cccacccagg 60
aatatggctg caacccttct ggtcatagcg tggtccttat ctaaagagtg ggggacacat 120
<210> 263
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 263
ttcactcagg gatgatggcg ccacttcctc agtttcggca ctcaagcgcc tggaacggag 60
tcagtggacg gataagatgg atttgcggtt tggttttgag cggctgaagg agcctggtga 120
<210> 264
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 264
ctgaagcaga ggtggtagcc aacggctcca tgtctctgag gagcggcggg cggcggcgcg 60
cggacccagg cgcggatggc gaggccagca ggtgaggggc gccctcctga ggctctcggg 120
<210> 265
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 265
cctacatttt acaaatgccc tttcagtttc tattttcttt ttccattaaa ttgccctcat 60
gtcctaatgt gcagtttgta agtgtgtgtg tgtgtgtctg tgtgtgtgtg aatttgattt 120
<210> 266
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 266
tcaagagtgc tagacttcca atttgagaga ttaaataatt taattcaggc aaacattttt 60
cattggaatt tcacagttca ttgtaatgaa aatgttaatc ctggatgacc tttgacatac 120
<210> 267
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 267
agtaatgaat cttggatatt aatgaatttg ttagtagcat cttgatgtgt gttttaatga 60
gttattttca aagttgtgca ttaaaccaaa gttggcatac tggaagtgtt tatatcaagt 120
<210> 268
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 268
tccatttggc tactgatgga caaaaaatag aaatgccttc ctatggagag tatttttcct 60
ttaaaaaatt aaaaaggtta attattttga ctattcggtt ttaaactttt tattcaacaa 120
<210> 269
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 269
atatttaagg tagcttcagc tagcttttag gaaaatcact ttgtctaact cagaattatt 60
tttaaaaaga aatctggtct tgttagaaaa caaaatttta ttttgtgctc atttaagttt 120
<210> 270
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 270
caaacttact attttgacag ttattttgat aacaatgaca ctagaaaact tgactccatt 60
tcatcattgt ttctgcatga atatcataca aatcagttag tttttaggtc aagggcttac 120
<210> 271
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 271
tatttctggg tcttttgcta ctaagttcac attagaatta gtgccagaat tttaggaact 60
tcagagatcg tgtattgaga tttcttaaat aatgcttcag atattattgc tttattgctt 120
<210> 272
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 272
ttttgtattg gttaaaactg tacatttaaa attgctatgt tactattttc tacaattaat 60
agtttgtcta ttttaaaata aattagttgt taagagtctt aatggtctga tgttgtgttc 120
<210> 273
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 273
aagttctttt acaaatatct atagacatgg taaacttttg gttttcagat atgcttaatg 60
atagtcttac taaatgcaga aataagaata aactttctca aattattaaa aatgcctaca 120
<210> 274
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 274
cagtaagtgt gaattgctgc aacaggtttg ttctcaggag ggtaagaact ccaggtctaa 60
acagctgacc cagtgatggg gaatttatcc ttgaccaatt tatccttgac caataaccta 120
<210> 275
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 275
attgtctatt cctgagttat aaaagtcccc atccttatta gctctactgg aattttcata 60
cacgtaaatg cagaagttac taagtattaa gtattactga gtattaagta gtaatctgtc 120
<210> 276
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 276
agttattaaa atttgtaaaa tctatttatg aaaggtcatt aaaccagatc atgttccttt 60
ttttgtaatc aaggtgacta agaaaatcag ttgtgtaaat aaaatcatgt atcataaaat 120
<210> 277
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
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ataccgatgt tatactgatg tgtttttcca tcgacagccc tgatagttta ggtgagtggc 60
cctgcaccct gatatttgtc actgcctgtg tagctagttg gcatctggtt tctgggcatc 120
<210> 278
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 278
ggtgtatgtg cccacagtgt ttgagaacta tgtggcagat atcgaggtgg atggaaagca 60
ggtgagtata cttttcataa caactgatgc cattttccat gttagaatat ttatggagca 120
<210> 279
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 279
gtcttcagct acccgccttc gtctccgagt ttgcgactcg cggaccggcg tccccggcgc 60
gaagaggctg gactcggatt cgttgcctga ggtgagcgga agggttccct ccaggcgccg 120
<210> 280
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 280
gggcactcgg aggcgcgcac gtcgttcccc gccctcccgc cgccgcccgc cctcgctctc 60
tcgcgctacc ctcccgccgc ccgcggtcct ccgtcggttc tctcgttagt ccacggtctg 120
<210> 281
<211> 120
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 281
tactgtctta ttccgaagct tgtcaatttt gcaactcttg gctgcctatg gatttctgtg 60
gtgcagtgta cagttttaaa tagctgccta aagtcgtgtg taactaatct ggtaagtctc 120
<210> 282
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<212> DNA
<213> Homo sapiens
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aaaatccatc agctactcct ccaattgaag tgatgaagcc caaataattc atatagcaaa 60
atggagaaaa ttagaccggc catctaaaaa tctgccattg gtgaagtgat gaagaacatt 120
<210> 283
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<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 283
gttatgaaat agctcttatg gaactgttac aagctttcaa gcattcaaag gtctaaatga 60
aaaaggctaa gtattatttc aaaaggcaag tatatcctaa tatagcaaaa caaacaaagc 120
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agactgcatg tgtcacaccc ttgctgaaat acaattcgtt ttctttaatt tccatgtgaa 60
gtgcacttct aagaactaac ctttagtcac tgggtgactt tatgggagta aaaggaagct 120
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<212> DNA
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ggaagccgcg cggccgcttt ggttttttgt ttggttggtt ccattttctt tttttctttt 60
tttttttaag aaaaaataaa aggtggattt gagctgtggc tgtgaggggt gtttgggagc 120
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<213> Homo sapiens
<400> 286
tgctgggtgg caggggggct gtggggtcgg gctcacgtcg cggccgcctt tgcgctctcg 60
ggtcaccctg ctttggcggc ccggccggag ggcaggaccc tcacctctcc cccaaggcca 120
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<212> DNA
<213> Homo sapiens
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ctgcgctctt gggaccccag agaaaacccg gagcaagcag gagtgtgcgg tcaatattta 60
tatcatccag aaaagaaaaa cacgagaaac gccatcgcgg gatggtgcag acgcggcggg 120
<210> 288
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<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 288
gactcggagg gtgccgtgcg ggcgaggccg cccaaatttg gcaataaata aagcttggga 60
agcttggacc tggccgtctg ggttttgttc gcgtctcaac gtggatgggg cggcagcggg 120
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<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 289
ggaggagccg cagtcagatc ctagcgtcga gccccctctg agtcaggaaa cattttcaga 60
cctatggaaa ctgtgagtgg atccattgga agggcaggcc caccaccccc accccaaccc 120
<210> 290
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<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 290
ggtgttgggg gagggggttc cttctctgca ggcccaggtg acccagggtt ggaagtgtct 60
catgctggat ccccactttt cctcttgcag cagccagact gccttccggg tcactgccat 120
<210> 291
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<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 291
ggctccgggg acactttgcg ttcgggctgg gagcgtgctt tccacgacgg tgacacgctt 60
ccctggattg ggtaagctcc tgactgaact tgatgagtcc tctctgagtc acgggctctc 120
<210> 292
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<213> Homo sapiens
<400> 292
ggagcctcgc aggggttgat gggattgggg ttttcccctc ccatgtgctc aagactggcg 60
ctaaaagttt tgagcttctc aaaagtctag agccaccgtc cagggagcag gtagctgctg 120
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<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 293
agagaatggc ccaacaagca aatgtcgggg agcttcttgc catgctggac tcccccatgc 60
tgggtgtgcg ggacgacgtg acagctgtct ttaaagagaa cctcaattct ggttagcaaa 120
<210> 294
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<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 294
gaaaaatggg gccatttagt gactgttcat cttccttttt ctcagtttgg tagtggcccc 60
aatgaagaac cttcagaacc tgtagcacac gtcctggagc cagcacagcg ccttcgagcg 120
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<213> Homo sapiens
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tccttcagtg accatgaaag acaccaggtt gacagcactg gaaactgaag taccagttgt 60
cgctagaaca ggtaagctat aaccaggcca gtggttagag gaagatggga gggaattatc 120
<210> 296
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<213> Homo sapiens
<400> 296
acgacggggg aggtgctgta cgtccaagat ggcggcgccc tgtaggctgg agggactgtg 60
aggtaaacag ctgaggggga ggagacggtg ggtgagtatg ggggtgtctc cccctccttt 120
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<212> DNA
<213> Homo sapiens
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ctggcctggg gcaagggagg atgacaaggc ctctggggtg atgagagtgc ctggcagaca 60
gctgtgcccc cagcaccggc ccaaggccaa gctcgcatcc aagcagcagc cgggctgcca 120
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taacgccacc acacctacca agcgcagcag gtgttggggg aggccagctc tgggcgcagg 60
cccctcagcc ctagtgaaaa tagtgacata caaaaatata cacattttaa caccatataa 120
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attactgaca cgagacacac agtgagacgg tgcagggagt acggtaggaa ctggagaggt 60
aataacttag gggcagggtg gcggcggtgc aggctaaccc tccctgaagc cagcagcctt 120
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agcagtgggg gacatctgcc cagggggtgg ggccgggcac agcccgctgt acctgaggac 60
tcggggaaat aaattagcat ctcagaggct agaaaccgtc caatactgct gtgtccttcc 120
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<213> Homo sapiens
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gttagatgtg gccccatggt attggatgct ttaatcaaga ttaagaatga agttgactct 60
actttgacct tccgaagatc atgcagagaa ggtgagcatt tcattcctgt tgggctccag 120
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<213> Homo sapiens
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gaccttaata agtgagtatc tctgtgaaag ccagctattg aaggagagtt cttgatttga 60
tttagggaca tgcttttcac atccttggaa ggcttaaaaa tctgagatca tccgatggct 120
<210> 303
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<212> DNA
<213> Homo sapiens
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caggcctccc gaggagccca gacagctgca gccacagctc cccgtatcaa gaaatttgcc 60
atctatcgat gggacccaga caaggctgga gacaaacctc atatgcagac ttatgaagtt 120
<210> 304
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aaggggtggg gctgacgtca ggagccaaga tggcggcggt ggtcgccctc tccttgaggc 60
gccggttgcc ggccacaacc cttggcggag cctgcctgca ggtgagtcct ggagcctcag 120
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<213> Homo sapiens
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agctactggc caaattttga actattcaaa caccctggtt tttgtagatt tccttatagg 60
aaatgaaggc gtagttctga cccctgaaga gatgcatggc tacaaatgta aaagctatag 120
<210> 306
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<213> Homo sapiens
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tttcaaaact tctctataga gttaaaatag ctgatccagt tttctttcct gagactaagg 60
ctccctctct cggagactgc tgttacatct ctcctttcca ctgacaatac cacaaaagaa 120
<210> 307
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<213> Homo sapiens
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taatattctt gataagatcc ccttcctgag gagccaaaga acaagctttg tatactcccc 60
acacactgcc tatggggtag ccctctctgc agcattcata gagctattta acactatttc 120
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<213> Homo sapiens
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ataggatatc ttggctatgt gctttaacaa tatacaggtt gaccatgaag tctggaaata 60
gatactatta ttttatcatg tatttaaata tattaataaa ccattaatat gtattcatta 120
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<213> Homo sapiens
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tcaccgagcc accattgtat gttctctcca tcgctgctgc tttctgggct ctagccatct 60
ttaccttcac taatggtcat gcctttagca ggacttccta cctgtagggg ggactcttgt 120
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<213> Homo sapiens
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ccctggctgc agccctcact cttcatggtc actggcaagt atagcaattc caaatatagt 60
tgtctgctca gtttgtttgc tgtgagcttg tcttatgtat tatatatgag ggagaagttg 120
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<213> Homo sapiens
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accacacaga cctttccaaa taaaagattc cagttgcata tgaaatatta gatcacaagt 60
acagtaagta atatttctct aacatgtcat ccctcttgaa ggagctgtct ataatgtgct 120
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<213> Homo sapiens
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tatgaaaata atttttttaa ataaaatgtt atataataaa agtgtcttct atgcttttat 60
atattagcta tcagtagttt tattcattag aattaggtgt ccattgcatc cacagcatga 120
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ctttcttcaa gtattgagtt ctgttcaatg cattggacat gtgatttaag ggaaaagtgt 60
gaatgcttat agatgatgaa aacctggtgg gctgcagagc ccagtttaga agaagtgagt 120
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tgggggttgg ggacagattt ggtggtggta tttcccaact gtttcctccc ctaaattcag 60
aggaatgcag ctatgccaga agccagagaa gagccactcg tagcttctgc tttggggaca 120
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actggtcagt tgaaagtccc aggagttcct ttgtggcttt ctgtatactt ttgcctggtt 60
aaagtctgtg gctaaaaaat agtcgaacct ttcttgagaa ctctgtaaca aagtatgttt 120
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ttgattaaaa gagaaagcca actaaatcat tatgtgctca ttctttttct taagcttgtg 60
gatgtcttgg atctggaaag ggtttctgat cacttagaga attttcaaac tttaggtcaa 120
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actgtttcat agttttctaa atgtacaaat tcttataggc tagacttaga ttcattaact 60
caaattcaat gcttctatca gactcagttt tttgtaacta atagattttt ttttccactt 120
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ttgttctact ccttccctaa tagcttttta aaaaaatctc cccagtagag aaacatttgg 60
aaaagacaga aaactaaaaa ggaagaaaaa agatccctat tagatacact tcttaaatac 120
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aatcacatta acattttgag ctatttcctt ccagcctttt tagggcagat tttggttggt 60
ttttacatag ttgagattgt actgttcata cagttttata ccctttttca tttaacttta 120
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taacttaaat attgctctat gttagtataa gcttttcaca aacattagta tagtctccct 60
tttataatta atgtttgtgg gtatttcttg gcatgcatct ttaattcctt atcctagcct 120
Claims (9)
1.一种用于检测或辅助检测肿瘤相关基因变异的试剂盒,其特征在于,包括成套DNA探针,所述成套DNA探针包括SEQ ID NO:1-SEQ ID NO:320所示的DNA探针。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括杂交反应液。
3.权利要求1或2中所述的成套DNA探针。
4.权利要求1或2中所述的用于检测或辅助检测肿瘤相关基因变异的试剂盒或权利要求3所述的成套DNA探针在如下1)-3)任一种中的应用:
1) 检测或辅助检测肿瘤相关基因变异;
2) 辅助预测或预测肿瘤患者精准治疗方式;
3)预测受检者肿瘤发病风险。
5.权利要求1或2所述的用于检测或辅助检测肿瘤相关基因变异的试剂盒或权利要求3所述的成套DNA探针在制备如下1)-4)中任一种产品中的应用:
1) 检测或辅助检测肿瘤相关基因变异;
2) 辅助预测或预测肿瘤患者精准治疗方式;
3)辅助诊断肿瘤患者;
4)预测受检者肿瘤发病风险。
6.根据权利要求4或5所述的应用,其特征在于,所述变异为点突变、小片段插入缺失、拷贝数变异、基因融合和/或微卫星不稳定性。
7.根据权利要求4或5所述的应用,其特征在于,所述肿瘤为肾癌、胃癌和/或肠癌。
8.一种检测或辅助检测肿瘤相关基因变异的方法,包括如下步骤:
(1)构建目的基因组DNA文库;
(2)将权利要求3中所述的成套DNA探针与所述DNA文库杂交,得到杂交产物;
(3)对所述杂交产物进行二代测序,根据测序结果分析目的基因组DNA的变异情况。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述肿瘤为肾癌、胃癌和/或肠癌。
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Legal Events
Date | Code | Title | Description |
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PB01 | Publication | ||
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SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
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RJ01 | Rejection of invention patent application after publication |
Application publication date: 20220524 |
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