CN114507744B

CN114507744B - Snp标记在近交系小鼠品系鉴定中的应用、引物序列

Info

Publication number: CN114507744B
Application number: CN202210407387.7A
Authority: CN
Inventors: 王妍; 张晓晴; 王喜顺; 耿波; 陈红; 谢飞
Original assignee: Spf Beijing Biotechnology Co ltd
Current assignee: Spf Beijing Biotechnology Co ltd
Priority date: 2022-04-19
Filing date: 2022-04-19
Publication date: 2022-07-12
Anticipated expiration: 2042-04-19
Also published as: CN114507744A

Abstract

本申请涉及小鼠品系鉴定的技术领域，具体公开了一种SNP标记在近交系小鼠品系鉴定中的应用、引物序列。具体地，SNP标记在近交系小鼠品系鉴定中的应用，所述SNP标记包括15个SNP位点；所述近交系小鼠品系选自C57BL/6J、C57BL/6N、BALB/c、FVB、DBA/2、CBA/CaJ和C3H。以及用于合成上述SNP位点的引物序列在近交系小鼠品系鉴定中的应用。本申请能够同时鉴别出C57BL/6J、C57BL/6N、BALB/c、FVB、DBA/2、CBA/CaJ和C3H 7种近交系小鼠品系，提高了近交系小鼠品系鉴定结果的准确性。

Description

SNP标记在近交系小鼠品系鉴定中的应用、引物序列

技术领域

本申请涉及小鼠品系鉴定的技术领域，具体地涉及一种SNP标记在近交系小鼠品系鉴定中的应用、引物序列。

背景技术

实验动物（laboratory animal）是指经人工饲育且对其携带的微生物实行控制、遗传背景明确或者来源清楚、用于科学研究、教学、生产、检定以及其他科学实验的动物。常见的实验动物有实验大鼠和实验小鼠。以实验小鼠为例，全球实验小鼠的品系有超过24000种，包括有数千种封闭群、近交系、重组同类系、重组近交系和突变系等品系。随着科研水平的提升，不断有新的人为小鼠品系或自发突变小鼠品系的产生。整体来说，小鼠品系的研发大多是在常见的、历史比较久的多种近交系小鼠品系和封闭群小鼠品系上进行的。

在常见的、历史比较久的多种近交系小鼠品系中，各小鼠品系之间的遗传差异较大。但是，在表观遗传学性状上差异却并不大，几乎无法单纯从外观上来鉴定近交系小鼠品系。随着生命医学的发展，科研人员和商业对实验动物质量的要求越来越高。因此，对近交系小鼠品系的鉴定成了亟待解决的问题。

基于上述，急需一种新的方法来对近交系小鼠品系进行鉴定。

发明内容

为了能够同时鉴别出C57BL/6J、C57BL/6N、BALB/c、FVB、DBA/2、CBA/CaJ和C3H 7种近交系小鼠品系，提高近交系小鼠品系鉴定结果的准确性，本申请提供一种SNP标记在近交系小鼠品系鉴定中的应用、引物序列。

第一方面，本申请提供一种SNP标记在近交系小鼠品系鉴定中的应用，采用如下的技术方案：

一种SNP标记在近交系小鼠品系鉴定中的应用，所述SNP标记包括15个SNP位点，分别为：SNP1、SNP2、SNP3、SNP4、SNP5、SNP6、SNP7、SNP8、SNP9、SNP10、SNP11、SNP12、SNP13、SNP14、SNP15；所述近交系小鼠品系选自C57BL/6J、C57BL/6N、BALB/c、FVB、DBA/2、CBA/CaJ和C3H。

进一步地，SNP1位于SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列的第357位，此处核苷酸分子的碱基为A或T。

SNP2位于SEQ ID NO：2所示的核苷酸序列的第137位，此处核苷酸分子的碱基为G或A。

SNP3位于SEQ ID NO：3所示的核苷酸序列的第337位，此处核苷酸分子的碱基为T或A。

SNP4位于SEQ ID NO：4所示的核苷酸序列的第191位，此处核苷酸分子的碱基为G或A。

SNP5位于SEQ ID NO：5所示的核苷酸序列的第244位，此处核苷酸分子的碱基为C或G。

SNP6位于SEQ ID NO：6所示的核苷酸序列的第187位，此处核苷酸分子的碱基为T或C。

SNP7位于SEQ ID NO：7所示的核苷酸序列的第68位，此处核苷酸分子的碱基为C或T。

SNP8位于SEQ ID NO：8所示的核苷酸序列的第360位，此处核苷酸分子的碱基为A或C。

SNP9位于SEQ ID NO：9所示的核苷酸序列的第173位，此处核苷酸分子的碱基为C或A。

SNP10位于SEQ ID NO：10所示的核苷酸序列的第440位，此处核苷酸分子的碱基为C或T。

SNP11位于SEQ ID NO：11所示的核苷酸序列的第431位，此处核苷酸分子的碱基为G或A。

SNP12位于SEQ ID NO：12所示的核苷酸序列的第454位，此处核苷酸分子的碱基为G或T。

SNP13位于SEQ ID NO：13所示的核苷酸序列的第354位，此处核苷酸分子的碱基为A或G。

SNP14位于SEQ ID NO：14所示的核苷酸序列的第224位，此处核苷酸分子的碱基为A或C。

SNP15位于SEQ ID NO：15所示的核苷酸序列的第95位，此处核苷酸分子的碱基为G或A。

本申请选择15个SNP位点组成进行近交系小鼠品系鉴定的SNP位点，该15个SNP位点位于小鼠11对染色体上。通过利用上述15个SNP位点，可以对多种近交系小鼠品系进行鉴定，尤其是可以鉴定C57BL/6J、C57BL/6N、BALB/c、FVB、DBA/2、CBA/CaJ和C3H，检测结果准确。尤其是对多个小鼠样本进行近交系小鼠品系鉴定时，可以大大提高检测结果的准确性，同时节省了鉴定花费的时间，提高了小鼠品系的检测效率，扩大了利用SNP位点进行小鼠品系鉴定的应用范围。

第二方面，本申请提供一种SNP标记在制备试剂盒或检测方法中的应用，采用如下技术方案：

一种SNP标记在制备试剂盒或检测方法中的应用，所述试剂盒或检测方法用于近交系小鼠品系鉴定；所述SNP标记包括15个SNP位点，分别为：SNP1、SNP2、SNP3、SNP4、SNP5、SNP6、SNP7、SNP8、SNP9、SNP10、SNP11、SNP12、SNP13、SNP14、SNP15；所述近交系小鼠品系选自C57BL/6J、C57BL/6N、BALB/c、FVB、DBA/2、CBA/CaJ和C3H。

通过采用上述方案，可利用上述SNP标记制备成鉴定近交系小鼠品系的试剂盒或利用上述SNP标记进行近交系小鼠品系的鉴定。

第三方面，本申请还提供一种引物序列，采用如下技术方案：

一种引物序列，所述引物序列用于近交系小鼠品系鉴定；所述引物序列选自引物序列SNP1、引物序列SNP2、引物序列SNP3、引物序列SNP4、引物序列SNP5、引物序列SNP6、引物序列SNP7、引物序列SNP8、引物序列SNP9、引物序列SNP10、引物序列SNP11、引物序列SNP12、引物序列SNP13、引物序列SNP14和引物序列SNP15；所述近交系小鼠品系为选自C57BL/6J、C57BL/6N、BALB/c、FVB、DBA/2、CBA/CaJ和C3H。

优选的，引物序列SNP1中，引物序列SNP1-F为5'-CTTCAGGCCCTTCACGAGTA-3'，引物序列SNP1-R为5'-GATTCCTATTGGCTGGCTTG-3'。

和/或，引物序列SNP2中，引物序列SNP2-F为5'-TAAATGGCCCGAATTCACAT-3''，引物序列SNP2-R为5'-TGTGCACCTTCCTTTGTTCA-3'。

和/或，引物序列SNP3中，引物序列SNP3-F为5'-AGGCTGTTGCCATATGTGAGT-3'，引物序列SNP3-R为5'-CACTCCCAGGGCTTCCTTAAA-3'。

和/或，引物序列SNP4中，引物序列SNP4-F为5'-GAAGTTCCTTTGTGCACCCG-3'，引物序列SNP4-R为5'-GGTCAGGGTGGATGATGTCC-3'。

和/或，引物序列SNP5中，引物序列SNP5-F为5'-AGACCTGTGCATGCTACCAA-3'，引物序列SNP5-R为5'-AGGGCCTTTGAAGGTTGTCA-3'。

和/或，引物序列SNP6中，引物序列SNP6-F为5'-CAGCCATACCACTCTGCTCC-3'，引物序列SNP6-R为5'-ACCAAGCACAGAACGCTGTA-3'。

和/或，引物序列SNP7中，引物序列SNP7-F为5’-TCCCTTTCATGTGCCTTAC-3’，引物序列SNP7-R为5’-GCAGTGCCATTTCATTCTC-3’。

和/或，引物序列SNP8中，引物序列SNP8-F为5’-TCATCCTTGGAACCACCTC-3’，引物序列SNP8-R为5’-CCATAAAGCCATTGACTAACAT-3’。

和/或，引物序列SNP9中，引物序列SNP9-F为5'- CCACATGCAGGATTTCCCAC-3'，引物序列SNP9-R为5'- ACAGCATGAATGTAAAGGGCG-3'。

和/或，引物序列SNP10中，引物序列SNP10-F为5’-CATCCTTGCCTGCACATTC-3’，引物序列SNP10-R为5’-GCCTTTCTCCAGGTCTTCC-3’。

和/或，引物序列SNP11中，引物序列SNP11-F为5'-TCCACCATACCCTGCATCTG-3'，引物序列SNP11-R为5'-CAGCACTTTCCACAGTTGGG-3'。

和/或，引物序列SNP12中，引物序列SNP12-F为5'-CCCTGACAAGCTTTTACCCCA-3'，引物序列SNP12-R为5'-GGGTTATCCGAAAGGACCCA-3'。

和/或，引物序列SNP13中，引物序列SNP13-F为5'-GTACCCCGGAGCTCTTGTCT-3'，引物序列SNP13-R为5'- TGGAGACACCAAGGTTGAGTT-3'。

和/或，引物序列SNP14中，引物序列SNP14-F为5'-CACTTCCGGTGACTTTGGGA-3'，引物序列SNP14-R为5'-TCACCTAACCCAGGCTGACT-3'。

和/或，引物序列SNP15中，引物序列SNP15-F为5’-CCCTGAACATAGGTGAACAA-3’，引物序列SNP15-R为5’-ACAGGAACCAAGACGGACTA-3’。

本申请还提供了上述15对引物序列，分别用于扩增上述SNP位点对应的序列。

第四方面，本申请提供上述引物序列在制备试剂盒或检测方法中的应用，该试剂盒或检测方法用于近交系小鼠品系鉴定。

第五方面，本申请提供利用上述引物序列扩增获得的DNA序列，上述DNA序列选自SEQ ID NO：1-SEQ ID NO：15。

利用引物序列SNP1扩增获得的DNA序列如SEQ ID NO：1所示。

利用引物序列SNP2扩增获得的DNA序列如SEQ ID NO：2所示。

利用引物序列SNP3扩增获得的DNA序列如SEQ ID NO：3所示。

利用引物序列SNP4扩增获得的DNA序列如SEQ ID NO：4所示。

利用引物序列SNP5扩增获得的DNA序列如SEQ ID NO：5所示。

利用引物序列SNP6扩增获得的DNA序列如SEQ ID NO：6所示。

利用引物序列SNP7扩增获得的DNA序列如SEQ ID NO：7所示。

利用引物序列SNP8扩增获得的DNA序列如SEQ ID NO：8所示。

利用引物序列SNP9扩增获得的DNA序列如SEQ ID NO：9所示。

利用引物序列SNP10扩增获得的DNA序列如SEQ ID NO：10所示。

利用引物序列SNP11扩增获得的DNA序列如SEQ ID NO：11所示。

利用引物序列SNP12扩增获得的DNA序列如SEQ ID NO：12所示。

利用引物序列SNP13扩增获得的DNA序列如SEQ ID NO：13所示。

利用引物序列SNP14扩增获得的DNA序列如SEQ ID NO：14所示。

利用引物序列SNP15扩增获得的DNA序列如SEQ ID NO：15所示。

第六方面，本申请提供如上述DNA序列在近交系小鼠品系鉴定中的应用。

（1）多种近交系小鼠品系的鉴定：将小鼠样本各SNP位点的碱基类型与已知小鼠品系各SNP位点的碱基类型进行比对，若小鼠样本15个SNP位点的碱基类型与已知小鼠品系各SNP位点的碱基类型均一致，则可初步判断该小鼠样本来源自对应的小鼠品系。

（2）近交系小鼠遗传监测：可选择群体内6-10个小鼠个体作为小鼠样本，获取各小鼠样本的基因组并进行15个SNP位点碱基类型的检测。若所有小鼠样本的15个SNP位点的碱基类型与该小鼠品系各SNP位点的碱基类型均一致，且均为单态/纯合子时，判断该群体为合格的近交系小鼠品系；若小鼠个体的1个及以上SNP位点的碱基类型与该小鼠品系对应SNP位点的碱基类型不一致，或为多态/杂合子时，该群体为不合格的近交系小鼠品系。

（3）已知多个小鼠样本为两种小鼠品系时，需要确定各小鼠样本对应的小鼠品系：

选择15个SNP位点中已知两种小鼠品系SNP位点的碱基类型不同的2-3个SNP位点，将小鼠样本的上述SNP位点进行扩增，并与已知小鼠品系上述SNP位点的碱基类型进行比对，若小鼠样本的上述SNP位点的碱基类型与已知小鼠品系上述SNP位点的碱基类型均一致，则可初步判断该小鼠样本来源自对应的小鼠品系。

综上所述，本申请具有以下有益效果：

1. 本申请通过利用上述15个SNP位点，可以对多种近交系小鼠品系进行鉴定，尤其是可以鉴定C57BL/6J、C57BL/6N、BALB/c、FVB、DBA/2、CBA/CaJ和C3H，检测结果准确。同时节省了鉴定花费的时间，提高了小鼠品系的检测效率，扩大了利用SNP位点进行小鼠品系鉴定的应用范围。

2. 本申请提供的SNP位点组合操作简单，技术难点低。

3. 本申请还提供了分别用于扩增上述SNP位点的15对引物序列，每对引物序列扩增出的序列都含有一个特定的SNP标记。

4. 本申请筛选出的15个SNP位点和提供的15对引物序列，不但可以用于近交系小鼠品系的鉴定，还可以用于近交系小鼠的遗传监测。

具体实施方式

本申请提供一种SNP标记在近交系小鼠品系鉴定中的应用，该SNP标记包括15个SNP位点，分别为：SNP1、SNP2、SNP3、SNP4、SNP5、SNP6、SNP7、SNP8、SNP9、SNP10、SNP11、SNP12、SNP13、SNP14、SNP15；近交系小鼠品系选自C57BL/6J、C57BL/6N、BALB/c、FVB、DBA/2、CBA/CaJ和C3H。

SNP1位于第7号染色体上。SNP1所在的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示。

SNP1位于SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列的第357位，此处核苷酸分子的碱基为A或T。其中，SEQ ID NO：1中第357位的核苷酸分子的碱基为A。

SNP2位于第8号染色体上。SNP2所在的核苷酸序列如SEQ ID NO：2所示。

SNP2位于SEQ ID NO：2所示的核苷酸序列的第137位，此处核苷酸分子的碱基为G或A。其中，SEQ ID NO：2中第137位的核苷酸分子的碱基为G。

SNP3位于第1号染色体上。SNP3所在的核苷酸序列如SEQ ID NO：3所示。

SNP3位于SEQ ID NO：3所示的核苷酸序列的第337位，此处核苷酸分子的碱基为T或A。其中，SEQ ID NO：3中第337位的核苷酸分子的碱基为T。

SNP4位于第18号染色体上。SNP4所在的核苷酸序列如SEQ ID NO：4所示。

SNP4位于SEQ ID NO：4所示的核苷酸序列的第191位，此处核苷酸分子的碱基为G或A。其中，SEQ ID NO：4中第191位的核苷酸分子的碱基为G。

SNP5位于第10号染色体上。SNP5所在的核苷酸序列如SEQ ID NO：5所示。

SNP5位于SEQ ID NO：5所示的核苷酸序列的第244位，此处核苷酸分子的碱基为C或G。其中，SEQ ID NO：5中第244位的核苷酸分子的碱基为C。

SNP6位于第5号染色体上。SNP6所在的核苷酸序列如SEQ ID NO：6所示。

SNP6位于SEQ ID NO：6所示的核苷酸序列的第187位，此处核苷酸分子的碱基为T或C。其中，SEQ ID NO：6中第187位的核苷酸分子的碱基为T。

SNP7位于第6号染色体上。SNP7所在的核苷酸序列如SEQ ID NO：7所示。

SNP7位于SEQ ID NO：7所示的核苷酸序列的第68位，此处核苷酸分子的碱基为C或T。其中，SEQ ID NO：7中第68位的核苷酸分子的碱基为C。

SNP8位于第4号染色体上。SNP8所在的核苷酸序列如SEQ ID NO：8所示。

SNP8位于SEQ ID NO：8所示的核苷酸序列的第360位，此处核苷酸分子的碱基为A或C。其中，SEQ ID NO：8中第360位的核苷酸分子的碱基为A。

SNP9位于第8号染色体上。SNP9所在的核苷酸序列如SEQ ID NO：9所示。

SNP9位于SEQ ID NO：9所示的核苷酸序列的第173位，此处核苷酸分子的碱基为C或A。其中，SEQ ID NO：9中第173位的核苷酸分子的碱基为C。

SNP10位于第1号染色体上。SNP10所在的核苷酸序列如SEQ ID NO：10所示。

SNP10位于SEQ ID NO：10所示的核苷酸序列的第440位，此处核苷酸分子的碱基为C或T。其中，SEQ ID NO：10中第440位的核苷酸分子的碱基为C。

SNP11位于第19号染色体上。SNP11所在的核苷酸序列如SEQ ID NO：11所示。

SNP11位于SEQ ID NO：11所示的核苷酸序列的第431位，此处核苷酸分子的碱基为G或A。其中，SEQ ID NO：11中第431位的核苷酸分子的碱基为G。

SNP12位于第5号染色体上。SNP12所在的核苷酸序列如SEQ ID NO：12所示。

SNP12位于SEQ ID NO：12所示的核苷酸序列的第454位，此处核苷酸分子的碱基为G或T。其中，SEQ ID NO：12中第454位的核苷酸分子的碱基为G。

SNP13位于第9号染色体上。SNP13所在的核苷酸序列如SEQ ID NO：13所示。

SNP13位于SEQ ID NO：13所示的核苷酸序列的第354位，此处核苷酸分子的碱基为A或G。其中，SEQ ID NO：13中第354位的核苷酸分子的碱基为A。

SNP14位于第2号染色体上。SNP14所在的核苷酸序列如SEQ ID NO：14所示。

SNP14位于SEQ ID NO：14所示的核苷酸序列的第224位，此处核苷酸分子的碱基为A或C。其中，SEQ ID NO：14中第224位的核苷酸分子的碱基为A。

SNP15位于第13号染色体上。SNP15所在的核苷酸序列如SEQ ID NO：15所示。

SNP15位于SEQ ID NO：15所示的核苷酸序列的第95位，此处核苷酸分子的碱基为G或A。其中，SEQ ID NO：15中第95位的核苷酸分子的碱基为G。

本申请还提供了一种SNP标记在制备试剂盒或检测方法中的应用，上述试剂盒或检测方法用于近交系小鼠品系鉴定。其中，SNP标记包括15个SNP位点，分别为：SNP1、SNP2、SNP3、SNP4、SNP5、SNP6、SNP7、SNP8、SNP9、SNP10、SNP11、SNP12、SNP13、SNP14、SNP15。其中，近交系小鼠品系选自C57BL/6J、C57BL/6N、BALB/c、FVB、DBA/2、CBA/CaJ和C3H。

另外，本申请还提供了一种引物序列，该引物序列用于近交系小鼠品系鉴定。其中，引物序列选自引物序列SNP1、引物序列SNP2、引物序列SNP3、引物序列SNP4、引物序列SNP5、引物序列SNP6、引物序列SNP7、引物序列SNP8、引物序列SNP9、引物序列SNP10、引物序列SNP11、引物序列SNP12、引物序列SNP13、引物序列SNP14和引物序列SNP15。其中，近交系小鼠品系为选自C57BL/6J、C57BL/6N、BALB/c、FVB、DBA/2、CBA/CaJ和C3H。

进一步地，本申请还提供了上述引物序列在制备试剂盒或检测方法中的应用，该试剂盒或检测方法用于近交系小鼠品系鉴定。再进一步地，本申请还提供了利用上述引物序列扩增获得的DNA序列以及上述DNA序列在近交系小鼠品系鉴定中的应用。上述DNA序列选自SEQ ID NO：1-SEQ ID NO：15。

近交系小鼠品系的鉴定方法，具体包括以下步骤：

1. 基因组DNA的提取

基因组DNA的提取方法可以采用酚-氯仿萃取法或采用基因组DNA提取试剂盒。其中，小鼠样本可以是小鼠细胞、小鼠组织或鼠尾尖。其中，当小鼠样本是小鼠细胞或小鼠组织时，取样量可以是0.1g；当小鼠样本是鼠尾尖时，取样量可以是2mm。

下面以采用基因组DNA提取试剂盒提取基因组DNA为例，具体阐述基因组DNA的提取方法。其中，基因组DNA提取试剂盒可以是血液/细胞/组织基因组DNA提取试剂盒（天根生化科技（北京）有限公司，DP304）。具体包括以下步骤：

（1）取小鼠样本放入1.5mL无菌离心管中，加入200μL Buffer GA和10μL蛋白酶K于56℃水浴锅中恒温放置12h，裂解；

（2）继续加入200μL Buffer GB，颠倒混匀，于70℃水浴锅中放置10min；

（3）继续加入200μL无水乙醇，震荡混匀，12000rmp离心10s去除挂壁的液体；

（4）将上一步处理后的无菌离心管内的液体全部转移到吸附柱中，12000rmp离心30s，弃废液；

（5）向吸附柱中加入500μL Buffer GD，12000rmp离心30s，弃废液；

（6）继续向吸附柱中加入600μL Buffer PW，12000rmp离心30s，弃废液；

（7）重复步骤（6）；

（8）将吸附柱于12000rmp离心2min，弃掉底部原2mL圆底离心管，将吸附柱放置在新的无菌EP管中，打开吸附柱管盖，室温静置5min；

（9）继续向吸附柱中加入60μL Buffer TE，室温静置5min，于12000rmp离心30s，弃废液，获得小鼠样本的基因组DNA。置于-20℃保存，备用。

2. 聚合酶链式反应（Polymerase Chain Reaction，PCR）扩增

以步骤1获得的小鼠样本的基因组DNA为模板，利用上述提供的SNP标记中各SNP位点的引物序列进行PCR扩增。

PCR体系：总反应体积为20μL，其中含2×PCR Mix：10μL，上下游引物（100pmol/μL）各1μL，基因组DNA：1μL，纯水（ddH2O）：7μL。

PCR反应程序为：95℃预变性，5min；95℃变性，30s；退火温度60℃，30s；72℃延伸，45s；30个循环；72℃继续延伸7min；扩增产物4℃保存。

3. PCR扩增产物的检测

通过1％琼脂糖凝胶电泳以及凝胶成像系统拍照检测PCR扩增产物。加样量为每孔加5μL PCR产物，电泳条件为121V恒压，电泳15min。电泳完成后在紫外线透射下观察结果。

4. PCR扩增产物的测序和结果判断

PCR扩增产物进行Sanger测序。用SnapGene软件读取和比对各SNP位点的测序峰图。

5. 小鼠品系的鉴定

至少可在以下3种情况下，鉴定小鼠品系或遗传监测：

以下结合制备例1-15、实施例1-3、对比例1-2对本申请作进一步详细说明。

制备例

制备例1-15

制备例1-15分别提供了一对引物序列。各制备例的不同之处在于：用于扩增的SNP位点不同。具体如表1所示。

引物序列的设计方法，具体包括以下步骤：

（1）在Ensembl网站（http：//asia.ensembl.org/index.html）查找SNP位点上下游核苷酸序列，并用在线引物设计网站Primer blast（https：//www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/index.cgi LINK_LOC=BlastHome）设计各SNP位点PCR扩增的引物序列，引物序列的设计结果如表1所示。其中，rs（reference snp）编号是基因的某位点上发生的某种突变，人类基因组计划里对这些特征的突变位点进行了编码，即为rs编号。

（2）引物设计完成后，委托第三方公司（北京天一辉远生物科技有限公司）完成引物的合成。

表1 制备例1-15对应的SNP位点以及设计的引物序列

实施例

实施例1

本实施例提供了一种近交系小鼠品系的鉴定方法。该实施例鉴定的小鼠样本有7种，分别对应不同的小鼠品系。上述小鼠样本均来源于自斯贝福（北京）生物技术有限公司。已知7种小鼠品系的15个SNP位点的类型如表2所示。

表2 7种小鼠品系的15个SNP位点的类型

近交系小鼠品系的鉴定方法，具体包括以下步骤：

1. 利用基因组DNA提取试剂盒进行基因组DNA的提取，所用的基因组DNA提取试剂盒为血液/细胞/组织基因组DNA提取试剂盒（天根生化科技（北京）有限公司，DP304）。具体包括以下步骤：

（1）取2mm鼠尾尖放入1.5mL无菌离心管中，加入200μL Buffer GA和10μL蛋白酶K于56℃水浴锅中恒温放置12h，裂解；

（5）向吸附柱中加入500μL Buffer GD，12000rmp离心30s，弃废液；

（7）重复步骤（6）；

2. PCR扩增

以步骤1获得的小鼠样本的基因组DNA为模板，利用制备例1-15提供的15个SNP标记的引物序列进行PCR扩增。

3. PCR扩增产物的检测——1％琼脂糖凝胶电泳

通过1％琼脂糖凝胶电泳以及凝胶成像系统拍照检测PCR扩增产物。加样量为每孔加5μL PCR产物，电泳条件为121V恒压，电泳15min。电泳完成后在紫外线透射下观察结果。电泳结果中目标条带全部单一明亮。说明获得SNP位点的扩增产物。

4. PCR扩增产物的测序和结果判断

将步骤3获得的PCR扩增产物进行Sanger测序。用SnapGene软件读取和比对SNP位点的测序峰图。7只小鼠样本的15个SNP位点的检测结果如表3所示，与表2中已知7种小鼠品系的15个SNP位点的类型对比，获得的鉴定结果如表4所示。

表3 实施例1中7个小鼠样本的15个SNP位点的检测结果

表4 实施例1中7个小鼠样本的鉴定结果

将表3中7个小鼠样本的15个SNP位点的检测结果与表2中7种小鼠品系的15个SNP位点对应的类型进行比对，由表4的鉴定结果可知，本实施例中小鼠样本编号1的小鼠品系为C57BL/6J，小鼠样本编号2的小鼠品系为C57BL/6N，小鼠样本编号3的小鼠品系为BALB/c，小鼠样本编号4的小鼠品系为FVB，小鼠样本编号5的小鼠品系为DBA/2，小鼠样本编号6的小鼠品系为CBA/CaJ，小鼠样本编号7的小鼠品系为C3H。

实施例2

本实施例提供了一种近交系小鼠品系的鉴定方法。本实施例与实施例1的不同之处在于：该实施例鉴定的小鼠样本有2个，已知小鼠样本为C57BL/6J和C57BL/6N两种小鼠品系，需要鉴定出小鼠样本具体对应的小鼠品系。上述小鼠样本均来源于自斯贝福（北京）生物技术有限公司。其他操作均与实施例1相同。

根据表2中，C57BL/6J和C57BL/6N两种小鼠品系之间SNP位点的对比，可知鉴定出SNP1、SNP2和SNP8的类型，即可判断出小鼠样本的小鼠品系。故仅进行上述3个SNP位点的PCR扩增。

本实施例中2只小鼠样本的3个SNP位点的检测结果和鉴定结果如表5所示。

表5 实施例2中2个小鼠样本的3个SNP位点的检测结果及鉴定结果

将表5中2个小鼠样本的3个SNP位点的检测结果与表2中对应SNP位点的类型进行比对，可知本实施例中小鼠样本编号1的小鼠品系为C57BL/6J，小鼠样本编号2的小鼠品系为C57BL/6N。

实施例3

本实施例提供了一种近交系小鼠品系的鉴定方法。本实施例与实施例2的不同之处在于：已知小鼠样本为BALB/c和FVB两种小鼠品系，需要鉴定出小鼠样本具体对应的小鼠品系。上述小鼠样本均来源于自斯贝福（北京）生物技术有限公司。其他操作均与实施例2相同。

根据表2中，BALB/c和FVB两种小鼠品系之间SNP位点的对比，可知鉴定出SNP3、SNP5和SNP11的类型，即可判断出小鼠样本的小鼠品系。故仅进行上述3个SNP位点的PCR扩增。

本实施例中2只小鼠样本的3个SNP位点的检测结果和鉴定结果如表6所示。

表6 实施例3中2个小鼠样本的3个SNP位点的检测结果及鉴定结果

将表6中2个小鼠样本的3个SNP位点的检测结果与表2中对应SNP位点的类型进行比对，可知本实施例中小鼠样本编号1的小鼠品系为BALB/c，小鼠样本编号2的小鼠品系为FVB。

对比例

对比例1

本对比例提供了一种近交系小鼠品系的鉴定方法。该对比例与实施例1的不同之处在于：以10个SNP位点作为鉴定小鼠品系的依据，具体如表7所示。其余操作均与实施例1相同。

表7 7种小鼠品系的10个SNP位点的类型

本对比例中7只小鼠样本的10个SNP位点的检测结果如表8所示，与表7中已知7种小鼠品系的10个SNP位点的类型对比，获得的鉴定结果如表9所示。

表8 7个小鼠样本的10个SNP位点的检测结果

表9 7个小鼠样本的鉴定结果

将表8中7个小鼠样本的10个SNP位点的检测结果与表7中7种小鼠品系的10个SNP位点对应的类型进行比对，由表9的鉴定结果可知，本对比例中小鼠样本编号1的小鼠品系为C57BL/6J，小鼠样本编号2的小鼠品系为C57BL/6N，小鼠样本编号3的小鼠品系为BALB/c，小鼠样本编号4的小鼠品系为FVB，小鼠样本编号5的小鼠品系为DBA/2。但是，小鼠样本编号6和小鼠样本编号7的小鼠品系不能确定。

对比例2

本对比例提供了一种近交系小鼠品系的鉴定方法。该对比例与实施例1的不同之处在于：以10个SNP位点作为鉴定小鼠品系的依据，具体如表10所示。其余操作均与实施例1相同。

表10 7种小鼠品系的10个SNP位点的类型

本对比例中7只小鼠样本的10个SNP位点的检测结果如表11所示，与表10中已知7种小鼠品系的10个SNP位点的类型对比，获得的鉴定结果如表12所示。

表11 7个小鼠样本的10个SNP位点的检测结果

表12 7个小鼠样本的鉴定结果

将表11中7个小鼠样本的10个SNP位点的检测结果与表10中7种小鼠品系的10个SNP位点对应的类型进行比对，由表12的鉴定结果可知，本对比例中小鼠样本编号1的小鼠品系为C57BL/6J，小鼠样本编号2的小鼠品系为C57BL/6N，小鼠样本编号3的小鼠品系为BALB/c，小鼠样本编号4的小鼠品系为FVB，小鼠样本编号5的小鼠品系为DBA/2。但是，小鼠样本编号1和小鼠样本编号2的小鼠品系不能确定。

因此，以本对比例提供的10个SNP位点的集合，不能完全鉴定出C57BL/6J、C57BL/6N、BALB/c、FVB、DBA/2、CBA/CaJ和C3H 7种小鼠品系。

可以理解的是，以上实施方式仅仅是为了说明本发明的原理而采用的示例性实施方式，然而本发明并不局限于此。对于本领域内的普通技术人员而言，在不脱离本发明的精神和实质的情况下，可以做出各种变型和改进，这些变型和改进也视为本发明的保护范围。

序列表

<110> 斯贝福（北京）生物技术有限公司

<120> SNP标记在近交系小鼠品系鉴定中的应用、引物序列

<130> 0

<160> 15

<170> SIPOSequenceListing 1.0

<210> 1

<211> 500

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<400> 1

cttcaggccc ttcacgagta cagccagtac cttccataaa tgtgagcctt cattctcaaa 60

agcaaaacaa gcacagaact ttaaaagctt ctgaatcaaa tataatgatt tatgcaggat 120

acttaaggaa tccccaagct tgagagatgg atcagtggtt aaaaatccct tgctgttctt 180

acagagaacc agtttggctc ccattgccca tgtcaggtga ctcacaactg ccacccctga 240

tccaacagat ccaatgacct catccacaag cacgtcacat ttgcgtgtgt gcatgcgtat 300

acctaaaata acaataaaaa tgttaattcc acaagataaa gaaaaaagca gttatcaata 360

tagtggaaaa tttggccgac tgcgcattaa ccaagttttc atcagctatg tagaacaaaa 420

tggcagaaag cagcatctgg ctccaggatc tttcttgccc agctgctgat ggaaaccaca 480

caagccagcc aataggaatc 500

<210> 2

<211> 523

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<400> 2

taaatggccc gaattcacat ctggatgaac catcctatct tgttctaaac acgtcctacc 60

cttaactcaa aggactgaat gacaacagac acttggcctt acaaattgca tgcatgttgg 120

accttctaga aaccctgagg gaatagcagc tgggggttgg gctgttgttc tgagactgac 180

tcagttgtaa gagagctgtt ttcctgggtg ttcctctggg cttcagttaa cttgagaaat 240

agtcttaagg gttagtagct tccagaaagg tagaaatatc ttcattgaat tgaccctgtt 300

taacctttct taatttaggc gccagagaga gagagaggga gagagagaga gagagagaga 360

gggagagaga gagagagagg atatggtctt taaagaccgg gaagacatta ctatattaat 420

aaaatcttat ctgattcact aaaactgact gagctctaaa gccaggatag ctgctggcca 480

catcctctgt ttgaaatcaa cattgaacaa aggaaggtgc aca 523

<210> 3

<211> 543

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<400> 3

aggctgttgc catatgtgag ttctttcagg ggcgggggtg gggggtgaat gaagatttag 60

tgagagaaca gagccccgag gactccctgg caactaatga gattgcaggt gggcagtgga 120

tgcatgcaag gagacacagg gaatgtatgg tggggagagc acacggcagc tggctgtgtt 180

gagagccttg ggtgttggta agagtggaaa gaggtgtgtg tgtgtgtgtg tgtgtgtgtt 240

cagagtccct tttattctag aaccaaatat tcagcctcct cctgaaggaa attgctgaga 300

gaacatggac caatgcttag aagggagtca gctctgttgt gcaccatgga gaatataatt 360

cccccaaatc ctcgcatctg gatcttgatt tttatatcga cataggagca gggagattct 420

tttagttgaa gttagttggt tacaaaggtg gtggcacttc gcatgggtgg gttggttgga 480

cctgactcta tagacttcca ccagtcagga atagttgact attttaagga agccctggga 540

gtg 543

<210> 4

<211> 400

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<400> 4

gaagttcctt tgtgcacccg acttcccttc ctggcttccc tatacacacc tctttatctg 60

aatatgctct ttcctgttga gggaccagct ccctccctcc cctgtgctca tggtgtagaa 120

atcaatagca taaaatatat acttggagaa ttatctggcc atacaggcct ggtagtactt 180

atctaccttg gaggaggact gtcttcagga agggaggctg catgactgac ccaggctgga 240

actcacctgc cacaggtgtg tgtggccagc atgggagagg tgaaacaggg cctagctttg 300

tatacagtat gctagagaat aggagacagc actcctataa tgaataccag gaatgacttc 360

agatgttttg ttttgtcttt ggacatcatc caccctgacc 400

<210> 5

<211> 571

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<400> 5

agacctgtgc atgctaccaa ggtctctacc aagctcaaac aggtgttgat cctgttgtat 60

gtagaagtca tggtttcctt ggtatcaccc atccccactg gcactcagaa tctttttaaa 120

gatgtactcg gagacaaaaa ggtaaataaa ctgtgtattt cttaacaaag ctcttcactc 180

ctcaagatct ttttgtgaat gagccaagag atgaatacat agctcaagga acatataaaa 240

tatctagtga aagataatct cttcatttgt gagacattaa acagtttaaa tacacttaca 300

actcatacag tccttaaaat aataccctat gagaaaactc tgacagaccc atttcacaga 360

ttcaccagag actttccttt tcctgtgatc gaaacacctg acaaagacaa cttagtgtaa 420

aaaatctttt ggcccttggt ctcagactgt caccaggggt gggggggggg gaggcaggat 480

ggagttcctg atggcaggag tgtatggcag tggctattgt cactgcagcg gacctagaag 540

aggaaagcag gtgacaacct tcaaaggccc t 571

<210> 6

<211> 402

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<400> 6

cagccatacc actctgctcc acgggccaag cacacagcac ctggaacagc ctggttatca 60

ttaacagtat ttctgggcag cagacggcca aggcaagaga caagccaagg cagatagatg 120

caggtaccca tcaaggacaa caaggaagca gtggggatga gaatggtcca cccccacagg 180

aatctctgat ggtagtagct aaatgactag tgtcccagga atgaaacaga tccaaccttc 240

ctgttttatt tgagccatgt aataagaaca gttgtggcca aagcctgact taagccatca 300

aatatgagga tcctgtcccc tagctgtttc cagtgttggc cagttctcct ggagcatgag 360

ctgtggccgt gtcactttca catacagcgt tctgtgcttg gt 402

<210> 7

<211> 530

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<400> 7

gcccttagtg cttcagggaa gtacttgaac ataccaattt ctgggctgca gaggctgcat 60

ttgcttgcgt aaatttaaat ttatgtataa cagtcttaaa gtttcatctc taagtgtgtg 120

aagtcattta acccgctttt aaaatacaca ttaaaattgt taagtttagg taaaatataa 180

catatatctg tatgtgtata atatacagct gcctttttaa aagttagtag agtatgctat 240

gatcttgact tttatgaacg gctgtgtaca gttactgtta catttcattt ccctaatact 300

atgtagtaac agcttgtttg gagtcagaat tttttcttcc tatggcacag agaatgaaat 360

ggcactgcat ggcctgtttc ttatcttatc tcattcctaa ccagtcatta aagtatcagc 420

acctttggtt tcagaatttc agtatgatgg tatttctttg tataataaaa taccatctat 480

tgaattcacc ccctttcttc ttaagtcaat gacctagccc tgagaacaca 530

<210> 8

<211> 510

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<400> 8

tcatccttgg aaccacctca tgggaagcct ttcctgataa aattctggat cttgaacctt 60

cagcactgct aacagcacct ctcagtttgt atcagagaaa gcctggccca tatgaatttt 120

aatacagtta tcttacttac tttattccag aacgctgcct tcctggaata aaacagatgg 180

gtatggaaaa catttcagag gaaaaatgag acagctttgt aactgatggg atacagaata 240

tgaaggaaag tgtcaacatg tggaaacttt gagacgtaaa gactgatgat gtcactgtcc 300

aatatgagca agacgttaag aggacctgga agcaaaacaa tgaaagtggt tttatcatga 360

tgattgtgca gtgttgtagg aacacccatg cctgtcagtc gcttcttgga atagtcagat 420

ccctaaatcc aagagaaatg tctatcttct ttatgttgtc taaagcgaga tgtacttggt 480

ctccttatat gttagtcaat ggctttatgg 510

<210> 9

<211> 504

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<400> 9

ccacatgcag gatttcccac caagggatgt ccccattgtg cgactgttca tttgtcattt 60

cctattgttt catttgatgt gattgctgtg tttgagttgc agggttttcc tgctctcctt 120

tttcctttct tgaagcaagc tctcaccctg tagcctttct agttcagaac ttcccattct 180

cctacctcag gttctaaggg ttaagatttc aactttgcac tgccctgcct ggctcattag 240

catttctctc tactttctgg ttaaattgat aagtctttgg ctgtaaaggc agtgagtact 300

tgtttctttc tctattccac agtcactgtc agactgtcat gtccagggaa cattgctaag 360

caactacagc agcagagtgg ctttactgca ctggtgcagt gacatcttag cttacatgta 420

tacacagtga gtgactactt agtcatctaa tataacagtg gcacagaagg gagttccttc 480

tatcgccctt tacattcatg ctgt 504

<210> 10

<211> 613

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<400> 10

catccttgcc tgcacattcc tctcatgttt gtgcagtaga cacattacct tcagagctat 60

ctttccagac cctcattttc cattgtaacc taaaatgttt accggtggaa ttgctatctc 120

agcaatcttt ccattctcat aataaggaaa caaacttaaa gtgactttca ttgacatatt 180

ttatagcctt ctgataaaaa ttaactagct tacacttttt aaaccacatg gagcaacaat 240

tattgctgag tcttgagccc cttaggaaaa attcttatct aatcaagctg gcaaacatca 300

tttaagcgtt tctgaataat tgctattgtc agttgtaaaa catcacactg tgcacatctg 360

gggctcatct gagtattaag tacaaagttg aaagtagcaa aagcattata aaagtgctgt 420

gaattaaaag tcaagaaaac agcaagagag agtgcaagaa aggagagttt tctcctaaga 480

agaacctgta gtatcgagac tcactgcatc acaagctcag aaaaacctag catcctgcca 540

agaaccatga gcagaaaggt tgctacagaa agaggtgcac agaagagcaa gagaggaaga 600

cctggagaaa ggc 613

<210> 11

<211> 551

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<400> 11

tccaccatac cctgcatctg caactacttc tctctctaat tttagttctt ccttatcaac 60

ttctttagaa accctatatc ccaatttgaa gtttgttggc cattctttta agtatccaaa 120

atgccatcct ccatatcatt ctgtataatt ctctcagtta agaagacttc taccttttgt 180

ctccatgtca accttttaaa tagtccttac cagactttac cttctaacat ctggctttat 240

gacttatata cctacgttgt ccgtctttat agcttatggg ttcttcagga aagaactgat 300

atctgggcca ctactttcac ttccaaagta ttcatacctc aataatcaat tgcaggccat 360

atgaatgcat taatacttaa aatcttttag ggcagaacaa caaggagact atatatctac 420

tttatgtgga ggctattttt cttatcagca atatggtggc ttaattgtga tatgatttct 480

ggagaacaaa ggagcctgac accacctcca aatgtctcaa gattccagta acccaactgt 540

ggaaagtgct g 551

<210> 12

<211> 599

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<400> 12

ccctgacaag cttttacccc aaaattgttc tattttcttt tgcattttat accaaattag 60

ccataaaatt atttgagaaa tggattagaa ccataaaaaa attccctaat attcccatga 120

ttatctcatt atatttatat ttcatactat aaattctgag caacctatag cttctcttcc 180

acattttccc tttagtaaca cagcagtgca agaatttact cttaaatgtt ggaaatgtgt 240

aactcttggc cctttctgta tactcaggta tacagtaagg aaatcttgtg agttttcact 300

cttgctggca agtgagcaga tgtagacaca ttgcttaaat ttgaggagca ttgtgattcc 360

atgatcacac ttcttttgaa attaccctct ataaatttgg tgggtaaggg ataactgtgg 420

ggacactact taaggtagaa agctaataaa atagattctc atgtaaatat agagaaagaa 480

attgcaatga cttccaggtt gaggcttctc aatagtcgtt caactatcag aagggctagt 540

atacatacag caagtatgta ctacatacca tccactaaat gggtcctttc ggataaccc 599

<210> 13

<211> 515

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<400> 13

gtaccccgga gctcttgtct ctagctgctt atgtatcaaa agatggccta gttggccatc 60

actggaaaga gaggcccatt ggacttgcaa actttatatg ccccagtaca ggggaatgcc 120

agggccaaaa agggggagtg ggtgggtagg ggagtggggg ggggtgggta tgtgggactt 180

ttggtatagc attggaaatg taaatgagct aaatacctaa taaaaaatgg aaaaaaaaag 240

attttgcctt ggtctcttgg catctggcat ctttcttgta tcttggtcct tttctccaaa 300

gtgagagggc acatgccgtt cttgaaaacc caactgacaa tcaggtagac catacagtga 360

taacgggcac ttgtatcaca tcccagagac atggtttgtt tttgttctct ataggggttc 420

tctctacaag ctccaaatga ctaacctagg acttggataa gactgagttc tgttaggctt 480

tatagaactc tgtaaactca accttggtgt ctcca 515

<210> 14

<211> 573

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<400> 14

cacttccggt gactttggga cacatggccg ctcacaactg aatagaaatc tcactaggaa 60

atggatgaca tattagtgtt ttcctcatga ggtcacttca taaactacca agagctcagt 120

aggacccctg gacccctttt ctctatttct tagtttgggg gaggaaccct gccctccttt 180

gcagagagga aaagatattc agagagttaa tttcctctgc agaattttcc aggctctcag 240

ttgtgctggt caaccccacc aaaccagttg gacctgtctt cctttgaggg catagtctta 300

gtgtggtgag tacccaggct gaaggttctt atcaggatat ccaatgtatg atgcctgcct 360

agctgaaggc gccatcccag aacccagctg agagacccag aaacaggatg gagttatagc 420

tctactggaa gagtgcatct ctagcattca caagatatgg gtttgatccc caggactgat 480

taaacttggt gtggtggtgc acacctgcaa tcccaacact tgggaggtgg agacaagagg 540

atcaagagtt caaagtcagc ctgggttagg tga 573

<210> 15

<211> 385

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<400> 15

ccctgaacat aggtgaacaa aacaaaaagc aagcaagcaa acaaacaaaa tacctcagca 60

aaatcttgca aactgacttc aagaaaatat caaggagtta atttatcatg actaagcagg 120

tttgttccag agattaggga gtgctgtttt gcttagattc tgtcaacttt acaccagcta 180

gcataatctg ggaacttcag ctaagtaatt cctcctatca gataggctta tgagcttgtg 240

tagaagcttc tactaatgta gaagaggact atggaacatg ctatccctga tcaagttgcc 300

ctggattgta taagagagca agcttagtca gacatgggga tcgagtcagt aagcagcact 360

ccccatagtc cgtcttggtt cctgt 385

Claims

1.一种SNP标记在近交系小鼠品系鉴定中的应用，其特征在于，所述SNP标记包括15个SNP位点，分别为：SNP1、SNP2、SNP3、SNP4、SNP5、SNP6、SNP7、SNP8、SNP9、NP10、SNP11、SNP12、SNP13、SNP14、SNP15；所述近交系小鼠品系选自C57BL/6J、57BL/6N、BALB/c、FVB、DBA/2、CBA/CaJ和C3H；

所述SNP1位于SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列的第357位，此处核苷酸分子的碱基为A或T；

所述SNP2位于SEQ ID NO：2所示的核苷酸序列的第137位，此处核苷酸分子的碱基为G或A；

所述SNP3位于SEQ ID NO：3所示的核苷酸序列的第337位，此处核苷酸分子的碱基为T或A；

所述SNP4位于SEQ ID NO：4所示的核苷酸序列的第191位，此处核苷酸分子的碱基为G或A；

所述SNP5位于SEQ ID NO：5所示的核苷酸序列的第244位，此处核苷酸分子的碱基为C或G；

所述SNP6位于SEQ ID NO：6所示的核苷酸序列的第187位，此处核苷酸分子的碱基为T或C；

所述SNP7位于SEQ ID NO：7所示的核苷酸序列的第68位，此处核苷酸分子的碱基为C或T；

所述SNP8位于SEQ ID NO：8所示的核苷酸序列的第360位，此处核苷酸分子的碱基为A或C；

所述SNP9位于SEQ ID NO：9所示的核苷酸序列的第173位，此处核苷酸分子的碱基为C或A；

所述SNP10位于SEQ ID NO：10所示的核苷酸序列的第440位，此处核苷酸分子的碱基为C或T；

所述SNP11位于SEQ ID NO：11所示的核苷酸序列的第431位，此处核苷酸分子的碱基为G或A；

所述SNP12位于SEQ ID NO：12所示的核苷酸序列的第454位，此处核苷酸分子的碱基为G或T；

所述SNP13位于SEQ ID NO：13所示的核苷酸序列的第354位，此处核苷酸分子的碱基为A或G；

所述SNP14位于SEQ ID NO：14所示的核苷酸序列的第224位，此处核苷酸分子的碱基为A或C；

所述SNP15位于SEQ ID NO：15所示的核苷酸序列的第95位，此处核苷酸分子的碱基为G或A。

2.如权利要求1所述的SNP标记在制备试剂盒或检测方法中的应用，其特征在于，所述试剂盒或检测方法用于近交系小鼠品系鉴定；所述SNP标记包括15个SNP位点，分别为权利要求1所述的SNP1、SNP2、SNP3、SNP4、SNP5、SNP6、SNP7、SNP8、SNP9、SNP10、SNP11、SNP12、SNP13、SNP14、SNP15；所述近交系小鼠品系选自C57BL/6J、C57BL/6N、BALB/c、FVB、DBA/2、CBA/CaJ和C3H。

3.一种用于扩增权利要求1所述的SNP标记的引物序列，其特征在于，所述引物序列用于近交系小鼠品系鉴定；所述引物序列包括引物序列SNP1、引物序列SNP2、引物序列SNP3、引物序列SNP4、引物序列SNP5、引物序列SNP6、引物序列SNP7、引物序列SNP8、引物序列SNP9、引物序列SNP10、引物序列SNP11、引物序列SNP12、引物序列SNP13、引物序列SNP14和引物序列SNP15；所述近交系小鼠品系为选自C57BL/6J、C57BL/6N、BALB/c、FVB、DBA/2、CBA/CaJ和C3H；

所述引物序列SNP1中，引物序列SNP1-F为5 '-CTTCAGGCCCTTCACGAGTA-3 '，引物序列SNP1-R为5 '-GATTCCTATTGGCTGGCTTG-3 '；

和/或，所述引物序列SNP2中，引物序列SNP2-F为5 '-TAAATGGCCCGAATTCACAT-3 ''，引物序列SNP2-R为5 '-TGTGCACCTTCCTTTGTTCA-3 '；

和/或，所述引物序列SNP3中，引物序列SNP3-F为5 '-AGGCTGTTGCCATATGTGAGT-3 '，引物序列SNP3-R为5 '-CACTCCCAGGGCTTCCTTAAA-3 '；

和/或，所述引物序列SNP4中，引物序列SNP4-F为5 '-GAAGTTCCTTTGTGCACCCG-3 '，引物序列SNP4-R为5 '-GGTCAGGGTGGATGATGTCC-3 '；

和/或，所述引物序列SNP5中，引物序列SNP5-F为5 '-AGACCTGTGCATGCTACCAA-3 '，引物序列SNP5-R为5 '-AGGGCCTTTGAAGGTTGTCA-3 '；

和/或，所述引物序列SNP6中，引物序列SNP6-F为5 '-CAGCCATACCACTCTGCTCC-3 '，引物序列SNP6-R为5 '-ACCAAGCACAGAACGCTGTA-3 '；

和/或，所述引物序列SNP7中，引物序列SNP7-F为5’-TCCCTTTCATGTGCCTTAC-3’，引物序列SNP7-R为5’-GCAGTGCCATTTCATTCTC-3’；

和/或，所述引物序列SNP8中，引物序列SNP8-F为5’-TCATCCTTGGAACCACCTC-3’，引物序列SNP8-R为5’-CCATAAAGCCATTGACTAACAT-3’；

和/或，所述引物序列SNP9中，引物序列SNP9-F为5 '-CCACATGCAGGATTTCCCAC-3 '，引物序列SNP9-R为5 '-ACAGCATGAATGTAAAGGGCG-3 '；

和/或，所述引物序列SNP10中，引物序列SNP10-F为5’-CATCCTTGCCTGCACATTC-3’，引物序列SNP10-R为5’-GCCTTTCTCCAGGTCTTCC-3’；

和/或，所述引物序列SNP11中，引物序列SNP11-F为5 '-TCCACCATACCCTGCATCTG-3 '，引物序列SNP11-R为5 '-CAGCACTTTCCACAGTTGGG-3 '；

和/或，所述引物序列SNP12中，引物序列SNP12-F为5 '-CCCTGACAAGCTTTTACCCCA-3 '，引物序列SNP12-R为5 '-GGGTTATCCGAAAGGACCCA-3 '；

和/或，所述引物序列SNP13中，引物序列SNP13-F为5 '-GTACCCCGGAGCTCTTGTCT-3 '，引物序列SNP13-R为5 '-TGGAGACACCAAGGTTGAGTT-3 '；

和/或，所述引物序列SNP14中，引物序列SNP14-F为5 '-CACTTCCGGTGACTTTGGGA-3 '，引物序列SNP14-R为5 '-TCACCTAACCCAGGCTGACT-3 '；

和/或，所述引物序列SNP15中，引物序列SNP15-F为5’-CCCTGAACATAGGTGAACAA-3’，引物序列SNP15-R为5’-ACAGGAACCAAGACGGACTA-3’。

4.如权利要求3所述的引物序列在制备试剂盒或检测方法中的应用，其特征在于，所述试剂盒或检测方法用于近交系小鼠品系鉴定。

5.利用权利要求3所述的引物序列扩增获得的DNA序列，其特征在于，所述DNA序列包括SEQ ID NO：1-SEQ ID NO：15。

6.如权利要求5所述的DNA序列在近交系小鼠品系鉴定中的应用。