CN114438206B - 胃癌分子分型dna探针池、制备方法、试剂盒及使用方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了胃癌分子分型DNA探针池,包括如下种类:所述用于EBV型胃癌分型的探针设计包括EBV病毒的全部序列信息;所述用于MSI型胃癌分型的探针设计包括RNF43、DOCK3、PIP5K1A、ATRN、MSH3、MORC1、TEAD2、ESRP1、IMPDH1、LMAN1、WRN、FAM115A、ZBTB20、ZFC3H1、TBC1D5、GPR107基因的若干个区域组合;所述用于CIN型胃癌分型的探针设计包括ERBB2、VEGFA、EGFR、ERBB2、ERBB3、MET、TP53、CCNE1、CCND1、CDK4、CDK6、CDK12基因的若干个区域组合;所述用于GS型胃癌分型的探针设计包括CDH1、CDH2、RHOA、RHOAR、RHOB、CLDN18、ARHGAP基因的若干个区域组合,本发明的优点在于结合使用靶向二代测序法一次性便可检测4种常见的胃癌分子分型,通量高,精度高,成本低,时效性更好,为胃癌分子分型诊断及辅助用药指导提供了技术保障。
Description
技术领域
本发明是关于胃癌分子分型领域,具体地说,是胃癌分子分型DNA探针池、制备方法、试剂盒及使用方法。
背景技术
胃癌是最常见的消化道恶性肿瘤之一,在全球肿瘤死亡原因中排名第3位。我国胃癌发病率和死亡率均位居前3位,2015 年新发胃癌40.3万,占全世界的45%以上。胃癌具有高度异质性,手术、放化疗等传统手段对胃癌的疗效有限,且多数胃癌初诊时已处于中晚期,预后极差。胃癌分子分型作为胃癌分子诊断的重要内容,根据其基因、肿瘤免疫微环境(TiME)等特征,可对胃癌免疫治疗优势人群的界定和筛选提供指导意义。
经典的胃癌病理分型主要依据大体及组织学形态,以及细胞生物学特性进行分类,包括Borrmann分型、Lauren分型和世界卫生组织(WHO)分型。Borrmann分型将胃癌分为息肉型、局限溃疡型、浸润溃疡型和弥漫浸润型;Lauren分型是目前国际上广泛应用的病理分型体系,从形态学上将胃癌分为肠型、弥漫型和混合型,其中弥漫型预后最差。WHO分型将胃癌分为乳头状腺癌、管状腺癌、黏液腺癌、印戒细胞癌、鳞腺癌、鳞状细胞癌、小细胞癌和未分化癌。但对于指导精准化免疫治疗或靶向药物仍需结合进一步的分子特征。
近年来随着分子诊断技术的发展,特别是高通量测序和基因芯片技术的发展,提出了一些新的胃癌分子分型策略。2014年根据癌症基因组图谱(TCGA)计划工作的研究成果,利用包括全外显子测序(WES)等6种技术平台,分析了来自全球多中心的从未接受过放疗或化疗的295例患者的新鲜冰冻组织及血液样本,提出4种分子亚型:EB病毒感染型(EBV)、微卫星不稳定型(MSI)、染色体不稳定型(CIN)以及基因组稳定型(GS)。其中,EBV型和MSI型是免疫治疗可能获益类型,而CIN和GS型对免疫治疗发生反应的可能性较小。
因此,开发一种用于检测精度高、通量高、检测速度快的胃癌分子分型检测试剂盒是本领域急需解决的问题。
公开于该背景技术部分的信息仅仅旨在增加对本发明的总体背景的理解,而不应当被视为承认或以任何形式暗示该信息构成已为本领域一般技术人员所公知的现有技术。
发明内容
本发明的目的在于提供了胃癌分子分型DNA探针池、制备方法、试剂盒及使用方法,其能够提供一种检测精度高、通量高、检测速度快的胃癌分子分型检测解决方案。
为实现上述目的,本发明的实施例提供了胃癌分子分型DNA探针池,该胃癌分子分型DNA探针池中的探针包括如下种类:
1)用于EBV型胃癌分型的探针设计;2)用于MSI型胃癌分型的探针设计;3)用于CIN型胃癌分型的探针设计;4)用于GS型胃癌分型的探针设计;
所述用于EBV型胃癌分型的探针设计包括EBV病毒的全部序列信息;
所述用于MSI型胃癌分型的探针设计包括RNF43、DOCK3、PIP5K1A、ATRN、MSH3、MORC1、TEAD2、ESRP1、IMPDH1、LMAN1、WRN、FAM115A、ZBTB20、ZFC3H1、TBC1D5、GPR107基因的若干个区域组合;
所述用于CIN型胃癌分型的探针设计包括ERBB2、VEGFA、EGFR、ERBB2、ERBB3、MET、TP53、CCNE1、CCND1、CDK4、CDK6、CDK12基因的若干个区域组合;
所述用于GS型胃癌分型的探针设计包括CDH1、CDH2、RHOA、RHOAR、RHOB、CLDN18、ARHGAP基因的若干个区域组合。
作为优选的,所述用于EBV型胃癌分型的探针设计包括EBV病毒全部编码区序列。
作为优选的,所述用于MSI型胃癌分型的探针设计包括RNF43、DOCK3、PIP5K1A、ATRN、MSH3、MORC1、TEAD2、ESRP1、IMPDH1、LMAN1、WRN、FAM115A、ZBTB20、ZFC3H1、TBC1D5、GPR107基因10个以上外显子区域或内含子区域组合。
作为优选的,所述用于CIN型胃癌分型的探针设计包括ERBB2、VEGFA、EGFR、ERBB2、ERBB3、MET、TP53、CCNE1、CCND1、CDK4、CDK6、CDK12基因的5个以上外显子区域组合。
作为优选的,所述用于GS型胃癌分型的探针设计包括CDH1、CDH2、RHOA、RHOAR、RHOB、CLDN18、ARHGAP基因的2个以上外显子或内含子区域组合。
作为优选的,所述胃癌分子分型DNA探针池中共有165条寡核苷酸探针,所述胃癌分子分型DNA探针池中每个所述寡核苷酸探针的浓度均为50-250 fmole/μL。
作为优选的,所述胃癌分子分型DNA探针池的每个所述寡核苷酸探针的5’端均有生物素化修饰,3’端均有硫代化修饰,所述165条寡核苷酸探针的核苷酸序列分别如SEQ IDNO.1~SEQ ID NO.165所示。
胃癌分子分型DNA探针池的制备方法,包括以下步骤:
S1、选择多个基因或病毒基因组区域,并按照碱基互补原则进行探针设计,人基因组库选取hg19;
S2、区域探针序列需要避开重复区域位置;
S3、探针需去除在人基因组hg19上匹配次数大于1-200的探针;
S4、探针调整窗口大小在10-30nt之间;
S5、探针调整长度100-160nt后,形成最终探针序列,随后进行探针合成,形成探针池。
采用胃癌分子分型DNA探针池的试剂盒,所述试剂盒包含所述胃癌分子分型DNA探针。
作为优选的,所述试剂盒还包括DNA提取和二代文库构建的常规组件,所述常规组件包括DNA提取试剂盒、建库预混液、引物混合液、接头预混液和杂交预混液。
使用胃癌分子分型DNA探针池的试剂盒的使用方法,包括以下步骤:
S1、提取胃癌组织样本中DNA,胃癌组织样本是福尔马林浸泡样本或蜡块、石蜡切片;
S2、构建DNA二代测序文库;
S3、DNA二代测序文库与所述胃癌分子分型DNA探针池或胃癌分子分型DNA探针池试剂盒的杂交;
S4、二代测序及数据分析获得检测结果。
本发明相比于现有技术具有以下有益效果:(1)结合使用靶向二代测序法一次性便可检测4种常见的胃癌分子分型,通量高,精度高,成本低,时效性更好,为胃癌分子分型诊断及辅助用药指导提供了技术保障;
设计时考虑了充分考虑了4种不同分子分型之间的影响,主要是不同物种间干扰及不同GC含量区域间的干扰构成,同时该方法在设计时避开了目的区域中的高可变区域,提高检测的准确度和灵敏度。
具体实施方式
下面结合附图,对本发明的具体实施方式进行详细描述,但应当理解本发明的保护范围并不受具体实施方式的限制。
除非另有其它明确表示,否则在整个说明书和权利要求书中,术语“包括”或其变换如“包含”或“包括有”等等将被理解为包括所陈述的元件或组成部分,而并未排除其它元件或其它组成部分。
胃癌分子分型DNA探针池,该胃癌分子分型DNA探针池中的探针包括如下种类:
1)用于EBV型胃癌分型的探针设计;2)用于MSI型胃癌分型的探针设计;3)用于CIN型胃癌分型的探针设计;4)用于GS型胃癌分型的探针设计;
用于EBV型胃癌分型的探针设计包括EBV病毒的全部序列信息;
用于MSI型胃癌分型的探针设计包括RNF43、DOCK3、PIP5K1A、ATRN、MSH3、MORC1、TEAD2、ESRP1、IMPDH1、LMAN1、WRN、FAM115A、ZBTB20、ZFC3H1、TBC1D5、GPR107基因的若干个区域组合;
用于CIN型胃癌分型的探针设计包括ERBB2、VEGFA、EGFR、ERBB2、ERBB3、MET、TP53、CCNE1、CCND1、CDK4、CDK6、CDK12基因的若干个区域组合;
用于GS型胃癌分型的探针设计包括CDH1、CDH2、RHOA、RHOAR、RHOB、CLDN18、ARHGAP基因的若干个区域组合。
具体的,用于EBV型胃癌分型的探针设计包括EBV病毒全部编码区序列;用于MSI型胃癌分型的探针设计包括RNF43、DOCK3、PIP5K1A、ATRN、MSH3、MORC1、TEAD2、ESRP1、IMPDH1、LMAN1、WRN、FAM115A、ZBTB20、ZFC3H1、TBC1D5、GPR107基因10个以上外显子区域或内含子区域组合;用于CIN型胃癌分型的探针设计包括ERBB2、VEGFA、EGFR、ERBB2、ERBB3、MET、TP53、CCNE1、CCND1、CDK4、CDK6、CDK12基因的5个以上外显子区域组合;用于GS型胃癌分型的探针设计包括CDH1、CDH2、RHOA、RHOAR、RHOB、CLDN18、ARHGAP基因的2个以上外显子或内含子区域组合。这一技术方案的优点在于结合使用靶向二代测序法一次性便可检测4种常见的胃癌分子分型,通量高,精度高,成本低,时效性更好,为胃癌分子分型诊断及辅助用药指导提供了技术保障。
上述胃癌分子分型DNA探针池中共有165条寡核苷酸探针,其中,每个寡核苷酸探针的浓度均为50-250 fmole/μL,且5’端均有生物素化修饰,3’端均有硫代化修饰,165条寡核苷酸探针的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.165所示。具体实施时,核苷酸序列委托IDT公司合成,返回所有寡核苷酸序列的混合液;在该混合液中,每条寡核苷酸序列的浓度均为3 pmole,配置本探针池时需稀释至50-250 fmole/μL,探针采用化学合成方式合成,每根探针浓度均一,准确度高,大大降低了探针池抓取目的序列的脱靶可能,提高检测准确度。
胃癌分子分型DNA探针池的制备方法,包括以下步骤:
S1、选择多个基因或病毒基因组区域,并按照碱基互补原则进行探针设计,人基因组库选取hg19;
S2、区域探针序列需要避开重复区域位置;
S3、探针需去除在人基因组hg19上匹配次数大于1-200的探针;
S4、探针调整窗口大小在10-30nt之间;
S5、探针调整长度100-160nt后,形成最终探针序列,随后进行探针合成,形成探针池。
本发明的探针设计原则具有一定的先进性,在设计时考虑了充分考虑了4种不同分子分型之间的影响,主要是不同物种间干扰及不同GC含量区域间的干扰构成,同时该方法在设计时避开了目的区域中的高可变区域,提高检测的准确度和灵敏度。
采用胃癌分子分型DNA探针池的试剂盒,试剂盒包含胃癌分子分型DNA探针。
试剂盒还包括DNA提取和二代文库构建的常规组件,常规组件包括DNA提取试剂盒、建库预混液、引物混合液、接头预混液和杂交预混液,其中,DNA提取试剂盒由Qiagen(USA)公司提供;建库预混液、引物混合液、接头预混液由KAPA Biosystem(USA)公司提供;杂交预混液由IDT(USA)公司提供。
本发明提供的试剂盒组成成分均是市面上已经上市很久的商用试剂盒,经过严格测试质量优、稳定性佳,从基础上保障了本发明所设计并使用的探针池可以有效地对胃癌样本进行分子分型,保证该方法的准确性和稳定性。
使用胃癌分子分型DNA探针池的试剂盒的使用方法,包括以下步骤:
S1、提取胃癌组织样本中DNA;
S2、构建DNA二代测序文库;
S3、DNA二代测序文库与探针池杂交;
S4、二代测序及数据分析获得检测结果。
其中,S1中胃癌组织样本是福尔马林浸泡样本或蜡块、石蜡切片;二代测序及数据分析所用仪器是Hiseq 2000、Hiseq2500、Hiseq 3000、Hiseq4000、Hiseq X、NovaSeq 6000、MGI 200、MGI 2000、MGI T7、DELL R910、DELL R970、HP DL580、HUAWEI 5885H中的任意1-2个;数据分析用到的软件是BWA、VARSCAN2、GATK4、PICARD、GenomeScan、DELLY2、STAR-Fusion软件组合。
本发明所述的数值范围不仅包括上述列举的点值,还包括没有列举出的上述数值范围之间的任意的点值,限于篇幅及出于简明的考虑,本发明不再穷尽列举所述范围包括的具体点值。
实施例1
本实施例提供一种胃癌分子分型DNA探针池,探针池中包含165条寡核苷酸探针,其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.165所示。
其制备方法包括如下步骤:
(1)选择多个基因或病毒基因组区域,并按照碱基互补原则进行探针设计,人基因组库选取hg19,病毒基因组选取最新EBV病毒基因组参考序列;
(2)探针序列需要避开重复区域的位置,首选应当选取重复区域上下游不超过30-50nt的位置进行位移,如果反复调整仍然无法有效的获取探针,则增大窗口大小,最大不超过100nt;
(3)探针需去除在人基因组hg19上匹配次数大于1-200的探针,并标记成风险探针,形成风险探针池,原则上风险探针池是不用于后续分析检测,但可按照实际情况适当保留少量探针;
(4)探针调整窗口大小在10-30nt之间;
(5)探针调整长度100-160nt后,形成最终探针序列,并委托IDT(USA)公司进行探针合成,形成探针池;
(6)获得探针池后,需要加每条探针对应体积的去离子水进行稀释,再根据不同区域的比重进行混合后方可使用。
实施例2
本实施例验证实施例1制备的胃癌分子分型DNA探针池用于胃癌分子分型的检测准确度,具体方法与步骤如下:
使用CNV、EBV慢病毒及突变标准品各100ngDNA;
采用KAPA HyperDNA Library Preparation Kit进行二代测序文库构建,文库构建操作完全按照该试剂盒的操作手册进行;
将每个文库中分别取单个文库的200ng,混合成共计1 μg的混合文库;
将混合文库与本发明提供的探针池进行杂交,杂交捕获试剂采用IDT xGen DNACapture Kit,操作步骤完全按照该试剂盒的操作手册进行;
杂交捕获完毕的文库按标准程序进行NovaSeq6000上机测序,混合文库总产出约5Gb数据量;
使用软件VARSCAN2、GATK4、STAR-Fusion得到的标准品样本突变、CNV及融合情况如下表1所示:
表1
样本名称 | 标准品分子信息 | 本发明检出情况 |
标准品1 | ERBB2 CNVGain | 检出 |
标准品2 | TP53 R175H | 检出 |
标准品3 | MSI-H | 检出 |
标准品4 | EBV阳性 | 检出 |
标准品5 | CLDN18-ARHGAP融合 | 检出 |
通过上表可以得知,本发明提供的胃癌分子分型DNA探针池得到的检测结果与标准品提供分子信息完全一致,说明DNA探针池在胃癌分子分型上的准确度好。
实施例3
本实施例验证实施例1制备的胃癌分子分型DNA探针池与胃癌分子分型的检测临床一致性评价,具体方法与步骤如下:
收集4种临床上已经用其他方法验证结果的胃癌样本各5例,共计20例样本;
使用QIAamp DNA FFPE Tissue Kit(德国QIAGEN公司,Cat No.56404)进行样本DNA提取,DNA提取操作完全按照该试剂盒的操作手册进行;
采用KAPA Hyper DNA Library Preparation Kit进行二代测序文库构建,文库构建操作完全按照该试剂盒的操作手册进行;
将每个文库中分别取单个文库的200 ng,混合成共计1μg的混合文库,共计4个混合文库;
将混合文库与本发明提供的探针池进行杂交,杂交捕获试剂采用IDT xGen DNACapture Kit,操作步骤完全按照该试剂盒的操作手册进行;
杂交捕获完毕的文库按标准程序进行NovaSeq6000上机测序,每个混合文库总产出约5Gb数据量,共计约20Gb数据量;
使用软件VARSCAN2、GATK4、STAR-Fusion得到的标准品样本突变、CNV及融合情况,并根据分型方法对胃癌样本进行分子分型,分型结果如表2所示:
表2
样本名称 | 样本临床分型结果 | 本发明检出结果 | 本发明分子分型 | 结果一致性 |
样本1 | EBV型 | EBV阳性 | EBV型 | 一致 |
样本2 | EBV型 | EBV阳性 | EBV型 | 一致 |
样本3 | EBV型 | EBV阳性 | EBV型 | 一致 |
样本4 | EBV型 | EBV阳性 | EBV型 | 一致 |
样本5 | EBV型 | EBV阳性 | EBV型 | 一致 |
样本6 | MSI型 | MSI-H | MSI型 | 一致 |
样本7 | MSI型 | MSI-H | MSI型 | 一致 |
样本8 | MSI型 | MSI-H | MSI型 | 一致 |
样本9 | MSI型 | MSI-H | MSI型 | 一致 |
样本10 | MSI型 | MSI-H | MSI型 | 一致 |
样本11 | CIN型 | TP53 R175H | CIN型 | 一致 |
样本12 | CIN型 | ERBB2 Mut | CIN型 | 一致 |
样本13 | CIN型 | ERBB2 CNV | CIN型 | 一致 |
样本14 | CIN型 | EGFR CNV | CIN型 | 一致 |
样本15 | CIN型 | MET CNV | CIN型 | 一致 |
样本16 | GS型 | CDH1 Mut | GS型 | 一致 |
样本17 | GS型 | CDH1 Mut | GS型 | 一致 |
样本18 | GS型 | RHOA Mut | GS型 | 一致 |
样本19 | GS型 | CLDN18-ARHGAP | GS型 | 一致 |
样本20 | GS型 | CLDN18-ARHGAP | GS型 | 一致 |
通过上表可以得知,本发明提供的胃癌分子分型DNA探针池检测胃癌分子分型的结果与临床上的其他方法检测结果完全一致,说明胃癌分子分型DNA探针池在胃癌分子分型检测上的临床一致性评价高。
综上所述,本发明提供的胃癌分子分型DNA探针池结合相关二代测序检测试剂盒一起并采用二代测序可以一次性对胃癌常见的分子分型进行检测,较经典的IHC及FISH方法来说准确度更高,成本低且检测通量大,同时检测周期也较经典多个方法结合起来看,周期可以缩短。
综上所述,本发明提供了一种检测胃癌分子分型的探针池设计及应用。所述DNA探针池包含:1)检测EBV病毒的探针池设计,用于EBV型胃癌分型;2)检测微卫星不稳定性的探针池设计,用于MSI型胃癌分型;3)ERBB2、TP53等基因的外显子区域探针池设计,用于CIN型胃癌分型;4)CDH1、RHOA等基因的外显子及内含子区域探针池设计,用于GS型胃癌分型。本探针池结合使用靶向二代测序法一次性便可检测4种常见的胃癌分子分型,通量高,精度高,成本低,时效性更好,为胃癌分子分型诊断及辅助用药指导提供了技术保障。
前述对本发明的具体示例性实施方案的描述是为了说明和例证的目的。这些描述并非想将本发明限定为所公开的精确形式,并且很显然,根据上述教导,可以进行很多改变和变化。对示例性实施例进行选择和描述的目的在于解释本发明的特定原理及其实际应用,从而使得本领域的技术人员能够实现并利用本发明的各种不同的示例性实施方案以及各种不同的选择和改变。本发明的范围意在由权利要求书及其等同形式所限定。
序列表
<110> 苏州方科生物科技有限公司
<120> 胃癌分子分型DNA探针池、制备方法、试剂盒及使用方法
<160> 165
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 1
ctttctgaac agagaacaga tacagaaaac atggaggatt gccagaatct cttgaagcca 60
tgtagcttat gtgagaaaag accacgagac gggaacatta ttcatggaag gacgggccat 120
<210> 2
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 2
cttgtcactt gttttcactg tgccagaaga ctaaagaagg ctggggcttc atgccctatt 60
tgcaagaaag agattcagct ggttattaag gtttttatag cataatggta gtacgaacat 120
<210> 3
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 3
ttcagccaca ggctcccaga catgacagcc atcatcaaag agatcgttag cagaaacaaa 60
aggagatatc aagaggatgg attcgactta gacttgacct gtatccattt ctgcggctgc 120
<210> 4
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 4
cttaactaaa gtactcagat atttatccaa acattattgc tatgggattt cctgcagaaa 60
gacttgaagg cgtatacagg aacaatattg atgatgtagt aaggtaagaa tgctttgatt 120
<210> 5
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 5
ttgcacaata tccttttgaa gaccataacc caccacagct agaacttatc aaaccctttt 60
gtgaagatct tgaccaatgg ctaagtgaag atgacaatca tgttgcagca attcactgta 120
<210> 6
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 6
aagctggaaa gggacgaact ggtgtaatga tatgtgcata tttattacat cggggcaaat 60
ttttaaaggc acaagaggcc ctagatttct atggggaagt aaggaccaga gacaaaaagg 120
<210> 7
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 7
atggaacatt ttttttcaat ttggcttctc ttttttttct gtccaccagg gagtaactat 60
tcccagtcag aggcgctatg tgtattatta tagctacctg ttaaagaatc atctggatta 120
<210> 8
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 8
tagaccagtg gcactgttgt ttcacaagat gatgtttgaa actattccaa tgttcagtgg 60
cggaacttgc agtaagtgct tgaaattctc atccttccat gtattggaac agttttctta 120
<210> 9
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 9
ctgtgaaata atactggtat gtatttaacc atgcagatcc tcagtttgtg gtctgccagc 60
taaaggtgaa gatatattcc tccaattcag gacccacacg acgggaagac aagttcatgt 120
<210> 10
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 10
actttgagtt ccctcagccg ttacctgtgt gtggtgatat caaagtagag ttcttccaca 60
aacagaacaa gatgctaaaa aaggtttgta ctttactttc attgggagaa atatccaaaa 120
<210> 11
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 11
ttttttagga caaaatgttt cacttttggg taaatacatt cttcatacca ggaccagagg 60
aaacctcaga aaaagtagaa aatggaagtc tatgtgatca agaaatcgat agcatttgca 120
<210> 12
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 12
gtatagagcg tgcagataat gacaaggaat atctagtact tactttaaca aaaaatgatc 60
ttgacaaagc aaataaagac aaagccaacc gatacttttc tccaaatttt aaggtcagtt 120
<210> 13
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 13
tctggagaaa aaacagaatc atctcctgaa gaacaagaac ttcttgtgtc agggtaacta 60
ggtgaatact gttcgagagg ttggctgagg tccaagtatt cctgaaagaa gggaagagag 120
<210> 14
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 14
ttcttacctc attggttgtg agagtgagaa ttcgatccaa gtcttctacc aactgcttga 60
acgttggtct ctgggagggc actgcatgcc aacagtccct catcatcatg tacctgggaa 120
<210> 15
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 15
ctggtgtggc aagtccactg gggcaccggc aggaaagaca acagccctta cagttcgttg 60
gtgcagttgg ctggcttatc cattctgtgt ccttccttca gcagcttaaa aagttcctcc 120
<210> 16
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 16
gtcataggag tactccatcc cgggtggcct ccgggctcgg aggtattctc ggaggttgcc 60
tttagaggca tactcaacta tgacatagag aggccctgtt gaggaagaag agaagctccc 120
<210> 17
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 17
aactctttat ctactttctg ttacctgtct ccgcaggggg atacgtttgg tcagcttgtg 60
cacagccggc tggctgctga agtctggctt cttggtcgtg ttcttcattc ggcacaggat 120
<210> 18
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 18
tcaaccaaga aaagggaaaa aaacccagag agaaagaaca gtatatacct ggcagaactg 60
tcaaccatgc agagtgaaag gatatcccaa tagaattacc cgccaagcac gtatattccc 120
<210> 19
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 19
cctttagatt cagaaagtcc tcaccttgag aaccttgagg tagggcagcc cgtcgggccc 60
gtatttactg ccgttctttt ccacgtgctt gatccactgg atgtggggct gggcatcact 120
<210> 20
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 20
gcggaggaga cctgcgcgcc ctcggtgtcc tacttcaaat gtgtgcagaa ggaggtcctg 60
ccgtccatgc ggaagatcgt cgccacctgg atgctggagg tgcggggctt cgggcggctc 120
<210> 21
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 21
ggggccactt gcatgttcgt ggcctctaag atgaaggaga ccatccccct gacggccgag 60
aagctgtgca tctacaccga caactccatc cggcccgagg agctgctggt aaccactgga 120
<210> 22
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 22
tctatgaaca aaacttttta aaacgatgac tgtatttttt cccttaactc tgttagggat 60
ttggatcctg ctcctaatcc acctcatttt ccatcgcatg tgattaaagc aacatttgcc 120
<210> 23
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 23
tatatcagca attgtcataa aaccaagtta aaaagcattt tagaaattct ttccaaaagc 60
cctgtaagta tacatgatga gtttaataat agaacattcc ttctttttta gctaaaaaaa 120
<210> 24
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 24
tcacaccaac attcacaatt ggtaagaaaa ataagaagta atcaactgca tgcaccaaaa 60
gccccaagac agaaatctta ggtattcagt ttctttttca caggcattgc tagttcaaaa 120
<210> 25
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 25
accaaaactc tgggaatact ggcacttaga ggaaaaaaaa acttccactg tcattttaaa 60
ataagcattt aaggtaaaag ctaacagtct gcatggagca ggaaaaaaat taggtaatgc 120
<210> 26
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 26
taaaacaaat gctaataatt tagtgtaatg tacaaaaatt accacttgta ctagtatgcc 60
ttaagaaaaa agtacaaatt gtatttacat aattacacac tttgtctttg acttcttttt 120
<210> 27
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 27
ttgcagaaaa cagatctgta tttatttcag tgttacttac ctgtcttgtc tttgctgatg 60
tttcaataaa aggaattcca taacttcttg ctaagtcctg agcctgtttt gtgtctactg 120
<210> 28
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 28
ttctagaagg caaatcacat ttatttccta ctaggaccat aggtacatct tcagagtcct 60
taactctttt aatttgttct ctgggaaaga aaaaaaagtt atagcacagt cattagtaac 120
<210> 29
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 29
gtcagcttat tatattcaat ttaaacccac ctataatggt gaatatcttc aaatgattta 60
gtattattta tggcaaatac acaaagaaag ccctccccag tcctcatgta ctggtccctc 120
<210> 30
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 30
attgcactgt actcctcttg acctgctgtg tcgagaatat ccaagagaca ggtttctcca 60
tcaattacta cttgcttcct gtaggaatcc tgagaaggga gaaacacagt ctggattatt 120
<210> 31
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 31
tttatctgta tcaaagaatg gtcctgcacc agtaatatgc atattaaaac aagatttacc 60
tctattgttg gatcatattc gtccacaaaa tgattctgaa ttagctgtat cgtcaaggca 120
<210> 32
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 32
ctcttgccta cgccaccagc tccaactacc acaagtttat attcagtcat tttcagcagg 60
ccttataata aaaataatga aaatgtgact atattagaac atgtcacaca taaggttaat 120
<210> 33
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 33
aaccagaacc cattttggta ccatctttct actgaccacg ggtgtaagtg ccatctggta 60
gctgtagatt ctggccaggc caaagtcagc cagcttgact gttccaccac ttgtcaccag 120
<210> 34
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 34
gggccacaaa gtggccactg tggggatcac gggccttgta cactgtccca taggcaccga 60
caccaatttc agccactggc tcatatcgag aggtagccat tctcagatca agggagaccc 120
<210> 35
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 35
ctaaatgctt aggaccttgt acaagagctt caggaagaga aaccttcatc ttcacatttg 60
gtttctagac catctacctc atctagaagg agagcaatta gtgagacagg tatatatgaa 120
<210> 36
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 36
gaagaaaccc aagacaaaga agagagtgtg gaatctagtt tgccccttaa tgccattgaa 60
ccttgtgtga tttgtcaagg tcgacctaaa aatggttgca ttgtccatgg caaaacagga 120
<210> 37
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 37
gcggagcctg agcaaggagc gggtccgtcg cggagccgga gggcgggagg aacatgacat 60
cgcggaggtg aggagccccg aggggcccgg cgcgggcctc ggcccggcca ccgccgcgtt 120
<210> 38
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 38
ccattggcca tggccatggc aacatgctca gttaaaacag caaagactaa gtcagcatta 60
tctctgagtc caccagaagt tgtgcattaa acaacttcat cctggctctg cagtttctcc 120
<210> 39
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 39
attcctccgc ctcttcctcc tcctccccat ctctttcctc ctcatcgtcc tcattttcct 60
gctcatcctc tgctccccct gctttctggg agtcttgctg taacacatga gacaacgcgg 120
<210> 40
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 40
gggagccctc acctctccgt gacaggggag ccctcgggct tgcgggagat gatgtagcgg 60
caactcagcc ctgcatcctt gaccatctgg tctcccagga actcggccag gcgctttgct 120
<210> 41
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 41
ccatctggat gcgtgcacac ggcagcaggg gcagccggga tgtggcttac gtgcctgggg 60
ctgctccgtg gccatccggc acatgtcctc cgggtctagc tccacgggat catagcctag 120
<210> 42
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 42
cccctcacct tggtcaggtg gtgtgatggt gatcatctgg gccgtgaact cctcatcaaa 60
atacctggtg tcagtctccg acgtgacctg gggcttgaag ggtgggctga gctgcagagg 120
<210> 43
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 43
ggcggccctc acctctgctt ggggtccttc ttgagcagcc ctgaaagcaa ggacttggcc 60
tcgggaccaa gcgtgcgcgg gaagcggatc tcctccatga ggatgagctc aaaaagcttc 120
<210> 44
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 44
agcgccatag aagcgggccc ggtcctcgga gaacacacgc tcccgggaca ggtggaagaa 60
cagctgcggg aggcgcaacc tgaggcacag ccgtggctcg ggcctctgcc cccatggcct 120
<210> 45
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 45
ccatcccccg cagccccagc ccctacctcg cccccgttgg cgtactccat gacaaagcag 60
aggcggtcgt gggtctggaa agagtacttc agggcctgca aggaagggga gctggaactg 120
<210> 46
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 46
tgagctgcca ccccgcaccc tcatctccac cctgccccac cgccccggcc ccaccttggc 60
cacgatgact tccttcttga ggatcttcat ggcgtagtag cggcctgtgg ccttctcctt 120
<210> 47
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 47
acctggggca caagcacacc tggggaacac atacctgggg cacagccaca cctacagcac 60
gtacaccctg agggctgtgg gaacgtgcgg ggccctgaga ggtgtgagtg agtggagtgt 120
<210> 48
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 48
gcgcgttacc cgggtccaaa atgcccaaga agaagccgac gcccatccag ctgaacccgg 60
cccccgacgg ctctgcagtt aacgggacca gctctgcgga gtaagtatgg ggcgggcggt 120
<210> 49
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 49
ctgaaggatg acgactttga gaagatcagt gagctggggg ctggcaatgg cggtgtggtg 60
ttcaaggtct cccacaagcc ttctggcctg gtcatggcca gaaaggtgag tttgccttga 120
<210> 50
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 50
gtctggtatt ctcgatctta ggatggaggt tctctggatc aagtcctgaa gaaagctgga 60
agaattcctg aacaaatttt aggaaaagtt agcattgctg tgagtatgtt atgaagtttt 120
<210> 51
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 51
tctcttcccc aatctacctg tgtcagttcc ctccttttct attttctctt ccctgcagat 60
gtcaagccct ccaacatcct agtcaactcc cgtggggaga tcaagctctg tgactttggg 120
<210> 52
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 52
tccagatgcc aaggagctgg agctgatgtt tgggtgccag gtggaaggag atgcggctga 60
gaccccaccc aggccaagga cccccgggag gccccttagc tgtgagtagc ctggtgtgtc 120
<210> 53
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 53
gtattttttc tttttataaa atttgtagca tacggaatgg acagccgacc tcccatggca 60
atttttgagt tgttggatta catagtcaac gaggtaagta ctgcctggtt tccttcacct 120
<210> 54
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 54
atttttctta tctcaacatg tgtttgcagc ctcctccaaa actgcccagt ggagtgttca 60
gtctggaatt tcaagatttt gtgaataaat ggtaagttgg ctccttgttc tctggaagcg 120
<210> 55
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 55
caggttcatg cttttatcaa gagatctgat gctgaggaag tggattttgc aggttggctc 60
tgctccacca tcggccttaa ccagcccagc acaccaaccc atgctgctgg cgtctaagtg 120
<210> 56
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 56
cactctctgt agtgaacttc cggtacatga tgctttcagg aggcatccag cgaatgggga 60
gcatggtgtg tcctcccacc taaaaggggt tgagatagag gcacacagag tgaccagatg 120
<210> 57
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 57
gattcgctcc aaccaggcag ttcctggtgg ccaggtctcg gtgcacaaag tgctgggagg 60
ccaggtacac catacccgag gcgatctgac tggcaatgtg gagcatttgg gagagcccca 120
<210> 58
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 58
gggtcaggtg caggggaaga caatccttgc ttacctgagg aacttattca ggtctccatg 60
cttcatgtat tcaaagacca tgatgagggg gtccccatcg ccgcacactc catagaactt 120
<210> 59
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 59
gacaatgtgc tcatgctgca ggttggtgag cagctcggcc tccctctgga aatccttccg 60
ggcagccagg gtgggatcct tcagggccta ggaacaatgc aggacacagg tgtttaacaa 120
<210> 60
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 60
tcaccttctg gtgctcccga tagtggcggg tgacggtccc atgagcggcc tcagcctcaa 60
tcgtcttccc atcagggcag accaggacgg acgtcatcag gccaagggag ccaaagcctg 120
<210> 61
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 61
catttttttg ccttgtgcct ccaaacttac aggtgaagta aatctaatgt tttttaggtc 60
gtgagtagta agttcactgc tacctttagg aggaatgtgt tcaaggtgct gactactacc 120
<210> 62
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 62
aactcctcag agtcagacaa agaccaggac tatgactact tgaacgaatg gggcaatcgc 60
ttcaagaagc tggctgacat gtacggaggc ggcgaggacg actaggggac tcgagagagg 120
<210> 63
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 63
atatttcagt cgcccttaca caaacaaagt cattactttg tggtaccgac ctccagaact 60
actgctagga gaggaacgtt acacaccagc catagatgtt tggagctgtg ggtaaggttc 120
<210> 64
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 64
agccgacttt gtggtagccc ttgtccagct gtgtggcctg atgttatcaa actgccctac 60
ttcaacacca tgaaaccgaa gaagcaatat cgaaggcgtc tacgagaaga attctctttg 120
<210> 65
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 65
gccactttgt aagctcattc ttggggtcct gtggctctgt acctgtggct ggctgcagtc 60
agtagtggct gtgggggatc tggggtatca ggtaggtgtc cagctcctgg cactggtaga 120
<210> 66
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 66
aaaaaaaaag aaaagaagaa gaagaagaag aagaaaacaa atggttttac caaggaagga 60
ttttcgggtt cactctgtag aagtcttttg gcacggtttc tgtagcccat actttggatg 120
<210> 67
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 67
acactcttgt gctgacttac cagatgggac actctaagat tttctgcata gcattaatga 60
cattttgtac ttcttcaacg cgaagagcag ataaatccat ttctttctgt tccaatgaac 120
<210> 68
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 68
ggggccgggg ggcggcggcg ggcaggcggc cgcgtcggcc ggggccggga cgatgactct 60
ggagtccatg atggcgtgtt gcctgagcga tgaggtgaag gagtccaagc ggatcaacgc 120
<210> 69
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 69
gccccagcga gctctcgacg tctcccctgc ccgccctcgc aggccaatgc gctcctgatc 60
cgggaggtgg acgtggagaa ggtgaccacc ttcgagcatc agtacgtcag tgccatcaag 120
<210> 70
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 70
accctgtggg aggacccggg catccaggaa tgctacgacc gcaggcgcga gtaccagctc 60
tccgactctg ccaagtagta agtgcggccg caccgctggc ggcctgggga cggcagctgc 120
<210> 71
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 71
ctgtcctgcc cccccacccc cggcagccgg cctgagcacc caccgctgtg ttgcagctac 60
ctgaccgacg ttgaccgcat cgccaccttg ggctacctgc ccacccagca ggacgtgctg 120
<210> 72
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 72
catccatcat gtttctcgtc gccctcagcg aatacgacca agtcctggtg gagtcggaca 60
acgaggtggg ccctgccctg agcaggggca gcgttggggg ccgggccttc cccacctgcc 120
<210> 73
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 73
tggggagggc ccctctgatt ccctctgcct tcgctcccgc cagaaccgga tggaggagag 60
caaagccctg ttccggacca tcatcaccta cccctggttc cagaactcct ccgtcatcct 120
<210> 74
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 74
cttcctcaac aagaaggacc tgctggagga caagatcctg tactcgcacc tggtggacta 60
cttccccgag ttcgatggtg cgccgggctg cggcatgggg aggggctcgc gggcagggcc 120
<210> 75
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 75
cgtgtgccac cgacacggag aacatccgct tcgtgttcgc ggccgtgaag gacaccatcc 60
tgcagctcaa cctcaaggag tacaacctgg tctgagcgcc caggcccagg gagacgggat 120
<210> 76
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 76
actgtcacac ggcggtgcgc gtgggtgtgc cgggctggtt cagccgcagg gttttacaca 60
accagccggc aaaatccact tcttccacct cggaccgctt gatgaaggtg tggttctgca 120
<210> 77
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 77
aggggtgtgg gcagcccggc tccacctacc atttattgac aaactcctgg aagtcggggg 60
tgaacacacc gttgggcagc ttaggaggtg gctgtggagg agaacagagg gtggggtcag 120
<210> 78
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 78
attcaggccg taccgctgac ggggcgcccg gggggcctcg gccgaggcga gatgctgtga 60
ggctctcctt cttccccgtc gaccacgggc cggccaaaga tggcctccag ctctttggcg 120
<210> 79
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 79
gagcttgggg gagagcagca gggaggagag ctggagggga gagccagcgg ggactcacag 60
ccatgtagga gcgcgtgccc acgaaggagt tggccatgga gtcgatgagc tggccgctca 120
<210> 80
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 80
ccccgaagtc acacagcttg atctcccctc tagagttcac gaggatgttg gagggcttca 60
catctggagg cggcaggctg cgggtgaggg gcgcccaaca gttgcctgcc ggcccccggg 120
<210> 81
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 81
cccggggctc tggggagggc gggctgggcc ttacctcggt gcatgatctg gtgcttctct 60
cggaggtacg ccaagccccg gagaacctgc aggggagcgc ggagggagtc acgggacaag 120
<210> 82
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 82
gtgggtctgc ggtggactca ccgcgatgct gactttcccc aggatctcct cgggaatcct 60
cttggcctct ttcagcacct ggtccaggga gccgccgtcc tagagggcac acaaggagtg 120
<210> 83
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 83
tgttccgtgg aggccctgcc cctgcccctg ccccggacgc actcaccatg tgttccatgc 60
aaatgctgat ctccccgtca ctgtagaagg ccccgtagaa gcccacgatg tacggcgagt 120
<210> 84
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 84
tgcattcgtg caggacctgc agctcgcgga tgatctggtt ccggatggcc ggcttgatct 60
caaggtggat cagctgcaag gggagagggg cgagactggc ttggggggtg cccgaaaacg 120
<210> 85
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 85
cccgcagtgc tcaccttcct ggccatgatg aggcccgagg gtctgtgctg gactttggtg 60
accaccccgc cgttgcccgc gcccagctct gagatccttt cgaagtcatc gtctttgagt 120
<210> 86
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 86
ccctgcccac tcactcggag gcgccctcgc tggtagggga tgggccctcg gcgatggtag 60
ggttgatggt gagcgccggc agcaccggct tcctccgggc cagcatcggg gctccgcggg 120
<210> 87
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 87
gtttgtttgt ttaactttgt gtcgctacct cagtttgccc ccatgtccct tacacacacg 60
caaaatactc cttcagcgga gcgaagaggt ggcggatgac tggcacgctc catgaccggc 120
<210> 88
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 88
agaggttcta gacgctggag ctgaccttgg ctatcctgcc atgctccaga cactcctgca 60
gctccagctt atcattcaca gtggatgcca acggcctagg aggcagaaga gagactgtaa 120
<210> 89
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 89
caggagcttt caccaacctg ttcataccgg gaaggttacc ccagaagtag cgggccctgt 60
gtgcagctga cacttctttg gcatcaatca tcacagggtt ggactacaaa acaggagacg 120
<210> 90
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 90
ggcgatcatc tccctccttg ggccgcgcat catgcaggag gcggtagaac tcaaagaaga 60
gccggccagt gccctctgag aggtcggaag agaaagccat cagctggggc tgtctgcata 120
<210> 91
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 91
cgcacatgta gcagttccag gggtcttcct taatggctgc ctgggcagcc cccggcccca 60
ccaagaggtc cacacactcc acgcaaaagc acctggaagg agacccagtg agcagaggag 120
<210> 92
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 92
tcacctgcag cagttgttgt ttccgcacat gagcacctca cggcccccac agcagatggt 60
gcagtaggac tggtagccgt cgtcgtcgta ctggtacgca cactccagaa agcagttcta 120
<210> 93
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 93
actcacctgc aggacctcgt agatggcttt gcggtacatg ggctgcttgt tgtacgtggc 60
ctggtggaac gcactgcaaa acgagctcag cggcatcagc ttctcaacac acacctgggg 120
<210> 94
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 94
acacaatgcg gcctggccac caggagaagc cccgcagttt cccccacacc agctccccaa 60
tgccaaagcc ccggccgtcc tggagcccca aggagcagaa atcattacac agtggtcacg 120
<210> 95
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 95
ctgctgcaca gcaggagggc tggcctcctc caccttctga gactccccgg gcccctggtt 60
ttcttccaca gcattcattc ctgcaatgac cttggctttc ttctcagcct ggggaaacaa 120
<210> 96
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 96
ttttctcctt ttcaatacag gttaaaggtg aatccttgtt tcattctaag aaaatggacc 60
tgacagtaaa tggggaacaa ctggatctgg atcctggtca aactttaatt tattatgttg 120
<210> 97
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 97
atgaaaaagc acctgaattc tcaatgcagg gtctaaaagc tggtgttatt gctgttattg 60
tggttgtggt gatagcagtt gttgctggaa ttgttgtgct ggtgagtaca gaacaagtaa 120
<210> 98
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 98
attatttaga atttttttct gtgctttttc ctgtttcaga taaaggagat gggtgagatg 60
catagggaac tcaatgcata actatataat ttgaagatta tagaagaagg gaaatagcaa 120
<210> 99
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 99
gctcaggtat gaacttaaag tttggcctga gctagtttga tcttcaagtt ttctccaagt 60
ttatccatga actcaaatgt attcaagtag tcagaacgtt gcacactaac gggaaggaaa 120
<210> 100
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 100
ttaatttgac catagaaact agggcatctt atacttactt gggtaaacct ttaatgcaag 60
cagccaagtc cttggtcatg aagccagcct caattgtctc aatagagact tcttccaaag 120
<210> 101
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 101
catttgcaaa gaaggcaagc tctttattgt tatcaagctt tgctctgtgg gctaaccctc 60
tggtccaggc aaaaatggaa gctaaaagag gggaaaaaaa acacaacact ccaatcatcc 120
<210> 102
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 102
tgctttggag agcactctct ggtgagaaat caatgtaaac accatcttac caatgggatt 60
ggtggacgtc tcctgtcctt tctggtacat gcggtagtga cgggttacag tcccgtgggc 120
<210> 103
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 103
agcctctgct tctactgtct tgccatctgg acaaaccagc acgctggtca tcatgccgag 60
agagccatac cctgtaagta gtggagcatg aagcgttggg tccaactgca tgaagagcac 120
<210> 104
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 104
cctggaatga ccctgttcct acaggccagg ctccacctct gtaccttggg ccacagagtc 60
cgactgcacg tcaccatcat agtttttaca ggcccagatg aagcctccct ctgatttcat 120
<210> 105
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 105
agcttgggcc accatgtcgt cgatgagcct atgctcatac cagatctttt gagcttcaaa 60
ctgggacttg tactgcctgg gaaacaaaag gtaaaagaga ataataataa agaaaattga 120
<210> 106
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 106
aaagaaaaag ttaaaaaaga actatagtta cttgtcatat atctcctgaa agatgtcttt 60
aaaacgccca tcatatttct tcagaatagt gtttttggtg ctcagataca aaggccaacc 120
<210> 107
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 107
cttagacaga gccatttgga aggaactgtg tgcaaaatct tcaattgact tatcttgatt 60
atacatcccc atggcaacac caccaccttc tgtagaggag aagccagtga gaggaaaaaa 120
<210> 108
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 108
tacatacctt caaagttatg taccaggtat gtcacctttt gggttccgtc acttggtgtg 60
taggttatct ctacttttcc aggcccagga acaacaaaat cagttgctct gtactgtgta 120
<210> 109
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 109
catgcaaaat cacattattg ccaacatgac ttacttgatc cccataagca tgacgaccta 60
tgatgatagg ttttacccat ccactcacaa gccgggggat atttttgcag ataatggctt 120
<210> 110
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 110
ctctgaagac cgtgccaccc agaatatttc gtatggtgcc atttggtgat ttccacattt 60
gtttcaactt gaactcctca accctcttct catcaggagt gatagtggca catttgacgc 120
<210> 111
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 111
caacattatg cttctttata gcttctgcag catccttggt gacttggtcg ttggtggcat 60
cacgattctc tatgcctaaa tcatagcttg aaagagaaaa attagaagca aagtttttca 120
<210> 112
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 112
accatgccca gccagattat cctttctgag tttgctacac ggaggggtaa ctcatttacc 60
tatgtagatc caattccacg tagggaaaaa tgagtttctc tttaatcaat tcccaaatga 120
<210> 113
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 113
ttcgtgtcat ttcatctcct tgcatctcta ccacagaacc gccactgatt tttttggaca 60
ttttgacttc aataaaccta aaaagaaaaa aaaaatacat gccttgtcat ttatttcatt 120
<210> 114
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 114
tacggatccc ctgccgccgg ggcagcctca gcggataccg ctgccagggc agcccctgca 60
gccccagccg atcctgactc cggggcaacc ccagaagatc ccgactccgg gacagcacca 120
<210> 115
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 115
aagatcgaga agcagctgca gaaggacaag caggtctacc gggccacgca ccgcctgctg 60
ctgctgggta agggcgggcg gggggcgccg gccccggccc gggggccctc gaagggcgcc 120
<210> 116
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 116
ttcactttca ggaattctat gagcatgcca aggctctgtg ggaggatgaa ggagtgcgtg 60
cctgctacga acgctccaac gagtaccagc tgattgactg tgcccagtag taagtaaccg 120
<210> 117
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 117
tcctggcgag ggtgtcactg acaagtcccc ttgtttgtgc ccgcagagga tcagcactgc 60
cagtggagat gggcgtcact actgctaccc tcatttcacc tgcgctgtgg acactgagaa 120
<210> 118
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 118
gggccaccgt gcccagccac cggtgtggct ctttaacaac ctttgcttgt cccgataggt 60
cacctttggc tcttcagaga tgcagggaca cacgatgggc ttctggttaa ccaaactgaa 120
<210> 119
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 119
gcccttccag tgtatactct gaaagagcga tgcctccagg ttgtccggag cctagtcaag 60
cctgagaatt acaggagact ggacatcgtc aggtcgctct acgaagatct ggaagaccac 120
<210> 120
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 120
catccagagg acagagccag taggttgttc aacctgctga gaaccactcc agcgtgactt 60
tactgttgcc aaaccaaaat ctccaatttt cactgttaag ccttcatgga gaaatatatc 120
<210> 121
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 121
ggtcccagag aggcatcaga ccatctactc actccattcc ctgagccgtc tgccgggcaa 60
tgtcaattag ctggaacatc tgaaacttgg tctcctggac atgcaggtgt ttgtagaggc 120
<210> 122
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 122
caacttacaa agttgtgtgt tgtgagggga acatgatcca ggaaatctac ttgaagttct 60
tctccaatca aagacgcagc atcagtattc caatctaagc gtgctttttt actagaaagg 120
<210> 123
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 123
ttaccctttg tgttcgtgga gaagtctgaa cactgcacag cactctggtt gcaggcccct 60
caccttgagt gctttcataa ggcagtcatg caagctcatt ccatttcgca cattgaccta 120
<210> 124
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 124
gtggtggtta ataaggctgc agttatggtc catcagcttt ctaaaaagga agcttccaga 60
cacgctatca tgcgttctcc tcagatggtg tctgctattg tacgtaccat gcagaataca 120
<210> 125
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 125
atctccatag gaagggatgg aaggtctcct tgggactctt gttcagcttc tgggttcaga 60
tgatataaat gtggtcacct gtgcagctgg aattctttct aacctcactt gcaataatta 120
<210> 126
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 126
tatccagttg atgggctgcc agatctgggg catgcccagg acctcatgga tgggctgcct 60
ccaggtgaca gcaatcagct ggcctggttt gatactgacc tgtaaatcat cctttaggta 120
<210> 127
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 127
atccagaggg gaaaaatatg acaaagaaag ctatataaga tattatttta ttttacagag 60
taacagacta gctagagaca atgaattaag ggaaaatgac aaagaacagc tcaaagcaat 120
<210> 128
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 128
ttctacacga gatcctctct ctgaaatcac tgagcaggag aaagattttc tatggagtca 60
caggtaagtg ctaaaatgga gattctctgt ttctttttct ttattacaga aaaaataact 120
<210> 129
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 129
ttttgtttct cccacacaga cactattgtg taactatccc cgaaattcta cccaaattgc 60
ttctgtctgt taaatggaat tctagagatg aagtagccca ggtaaatgta tgtttgagat 120
<210> 130
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 130
cccctttaaa tatgatttat tgtctttctc atacacagat gtattgcttg gtaaaagatt 60
ggcctccaat caaacctgaa caggctatgg aacttctgga ctgtaattac ccagatccta 120
<210> 131
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 131
tggttcgagg ttttgctgtt cggtgcttgg aaaaatattt aacagatgac aaactttctc 60
agtatttaat tcagctagta caggtaaaat aatgtaaaat agtaaataat gtttaattac 120
<210> 132
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 132
tcacctaggt cctaaaatat gaacaatatt tggataactt gcttgtgaga tttttactga 60
agaaagcatt gactaatcaa aggattgggc actttttctt ttggcattta aagtaagtct 120
<210> 133
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 133
tatatatatt tttaattttg cacgattctt ttagatctga gatgcacaat aaaacagtta 60
gccagaggtt tggcctgctt ttggagtcct attgtcgtgc atgtgggatg tatttgaagc 120
<210> 134
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 134
acctgaatag gcaagtcgag gcaatggaaa agctcattaa cttaactgac attctcaaac 60
aggagaagaa ggatgaaaca caaaaggtgt gtgactctag tttgtgtttg agactctttt 120
<210> 135
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 135
cgggtttggg ggtgcctgcc tcatggttgc ccatcttccc cacagaagtc ccgggcccag 60
agcccggcca gcaggagcag ttggtcttcg gcagcgggga tgctgtggag ctgagctgtc 120
<210> 136
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 136
cctggcaggc gcggtggttg ctgcctccgc tcactcaccc gcccgcgtcc cggtgcagct 60
gcggcatcag cagtggagcc tggtcatgga aagcgtggtg ccctcggacc gcggcaacta 120
<210> 137
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 137
gtgacgcaca gccccacatc cagtggctca agcacgtgga ggtgaatggc agcaaggtgg 60
gcccggacgg cacaccctac gttaccgtgc tcaaggtggg ccaccgtgtg cacgtgggtg 120
<210> 138
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 138
cgtctgagga gcccgtgtcc ccagggcccc tgtacgtgct ggtggagtac gcggccaagg 60
gtaacctgcg ggagtttctg cgggcgcggc ggcccccggg cctggactac tccttcgaca 120
<210> 139
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 139
cctgcaagcc gcccgaggag cagctcacct tcaaggacct ggtgtcctgt gcctaccagg 60
tggcccgggg catggagtac ttggcctccc agaaggtggg cagggcggca ggtgtgggtg 120
<210> 140
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 140
ctgggagcag cggggagagg tggagaggct tcagccctgc ctcccacccc ttccccagtg 60
catccacagg gacctggctg cccgcaatgt gctggtgacc gaggacaacg tgatgaagat 120
<210> 141
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 141
caccgccttc ccacaccctc ccagggccgg ctgcccgtga agtggatggc gcctgaggcc 60
ttgtttgacc gagtctacac tcaccagagt gacgtgtacg tgtcctgcag agctcaggct 120
<210> 142
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 142
ggtgtctgtc ctgggagtct caggacagcc tgacctcacc ttcccctgca gctggtcctt 60
tggggtcctg ctctgggaga tcttcacgct ggggggctcc ccgtaccccg gcatccctgt 120
<210> 143
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 143
acagccacgg ccagatccag tgaaaaacaa gctctcatgt ctgaactgaa gataatgact 60
cacctggggc cacatttgaa cattgtaaac ttgctgggag cctgcaccaa gtcaggtggg 120
<210> 144
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 144
agcaggcatc acagaagagt gataaccaat cctagttaaa atagtctcag gagtcagtgc 60
agaagccctg gagaagagag aagagcattg atcagcacag ggtatcctgg tgggcctgcc 120
<210> 145
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 145
cctcttatac ctgtgcctcc ccacactgga tcatggctga aatattacct gctggtggag 60
gcccttgagg tcttacaaaa ggaagttatg cagagaaagg tctcattaca caaacagcca 120
<210> 146
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 146
aatctgtcac cgagcagacc agcaggttgt ggtggttgag ggcctctgtc ctggatgggg 60
agatggtcac tgtgggctcc actgagggca gtaacagaca ggaaaagaca taggagtgag 120
<210> 147
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 147
ggtctcggcc aagggtgggc ctcacggagg ggcgacgacg ctcacctctc ctctgcaaga 60
tcccgcggaa cgccacctcg tagttgtgtc tgcacaccgt gtccaactcc gcccgggtcc 120
<210> 148
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 148
atctggtcac aagacgcacg cgctccgtcc cgttggtgaa gtagcacatg cccttaaact 60
ggaacacgaa atcctctgcg gggaatcacc ggccggtcag tcaggcccca gcccggccgc 120
<210> 149
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 149
acttaccggg agagtctctg ccctcagcca gtagggagct cagcatcgcc agcatcaagg 60
tgacagttgc tacccgaagg tctccgggga tccgcaaagc cttcttccaa gacataactg 120
<210> 150
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 150
actgtgcagt gtgcaatgac tatgcttcag gctaccatta tggagtctgg tcctgtgagg 60
gctgcaaggc cttcttcaag agaagtattc aaggtaatag tgtgttgaaa acgacttcta 120
<210> 151
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 151
aggacataac gactatatgt gtccagccac caaccagtgc accattgata aaaacaggag 60
gaagagctgc caggcctgcc ggctccgtaa atgctacgaa gtgggaatga tgaaaggtgg 120
<210> 152
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 152
agtaacaaag gcatggagca tctgtacagc atgaagtgca agaacgtggt gcccctctat 60
gacctgctgc tggagatgct ggacgcccac cgcctacatg cgcccactag ccgtggaggg 120
<210> 153
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 153
aacataaaaa tctgcgataa aaccaattat tccatacagt gactacggtc agttctgaga 60
aatgacaccc aggttggcga tgtgtctcat ggttggcctt ccatggggac agttccaggg 120
<210> 154
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 154
gtggtccatc tcccccatgt gggtgatcag tttcttcatc tcgcttgtgt taagagcagt 60
cccaatcatc acctgagtgt gagacacaat ggttcaacgt tttagtagtt ttttgacgtc 120
<210> 155
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 155
gcagctgagc tgacagccag gctttcttta cttaccgact tccggcaggc tctggaggca 60
aacatctgct tgactcggga aggccggcac atgaccccag ggctgtcgct cagcatgaag 120
<210> 156
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 156
atcagttcat cgacgtcctg gggtccgaag gtccagtttt tactagttgg caaggaaatc 60
agtttagccc tttcagtgac tggagctaaa agaatacaat tttgagaaaa atccatgact 120
<210> 157
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 157
aataacttac cattttcatc gataacaaaa tcaaagccat tctttctaaa tatttccaga 60
ttttctatca gaacagcttc attaacagca gttaagttga gagtctgagg tctgaaaaac 120
<210> 158
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 158
agggggagtc tgggaatgaa cactaaacac actcacgcta tgagcctctg cccctggagc 60
acggtgtgct gctgcagcat ctcgaagtta tacttctcgt ccgtggcatg ctggtccact 120
<210> 159
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 159
atgaagatat cctcattcag tttggttatt ataaatccca ggttaaactg accaatgatt 60
tccatttctg caaacatcgt tttactgcag gtagaaaatg ttaattatca gacattttac 120
<210> 160
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 160
gtgatatgca cagacaggct gctgtcaaat tatgtagaca ttcattgtcc cgctgagagc 60
ttcttctgcc ttctcaactt tgctgtgctt tgcattccat tatatcaaaa tgttcacaga 120
<210> 161
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 161
aaaatgggct taaaccctgc aaccttgcca gccatatcaa tcttctaggt tttggaacat 60
caataatgaa gaaaacagca cttgaattaa tatccccctt gatgaattgt tgaggtttat 120
<210> 162
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 162
gtgttactca catttgtcaa cagtgatttt tctggcaaag tgaaaaggct tttgaaaaat 60
tacctgtggt gctttttact gcttctacgc ttaatcctcc cctcgctccc caaacaagag 120
<210> 163
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 163
ctcattccct tgcaatctgt tacattggag ttggggggtt taattggaga ggtttaggaa 60
aggaaagggt atcccttagt gaggaaggag aagcagagag caaatcactt ggttggactc 120
<210> 164
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 164
tttaagtgag ggcttcgctg tgtacttggc agaagattca aagtctgaat ttgggaatct 60
caagttgtct tctaggtatc agcctcctca aaaatgattg aatgctgctc tgatgttcat 120
<210> 165
<211> 120
<212> DNA
<213> 人工序列(人工序列)
<400> 165
gaacttcaga gcatcctggg ccaggggaga gtcagagaag aaagcaactg gggtcaatgc 60
atttctaatg gttccagggg ctccagaagg aaatattgct ggatctctga cagcacgtgg 120
Claims (8)
1.胃癌分子分型DNA探针池,其特征在于,该胃癌分子分型DNA探针池中的探针包括如下种类:
1)用于检测EBV型胃癌分型的探针;2)用于检测MSI型胃癌分型的探针;3)用于检测CIN型胃癌分型的探针;4)用于检测GS型胃癌分型的探针;
所述用于检测EBV型胃癌分型的探针针对EBV病毒的全部序列信息设计;
所述用于检测MSI型胃癌分型的探针针对RNF43、DOCK3、PIP5K1A、ATRN、MSH3、MORC1、TEAD2、ESRP1、IMPDH1、LMAN1、WRN、FAM115A、ZBTB20、ZFC3H1、TBC1D5、GPR107基因的若干个区域组合设计;
所述用于检测CIN型胃癌分型的探针针对ERBB2、VEGFA、EGFR、ERBB2、ERBB3、MET、TP53、CCNE1、CCND1、CDK4、CDK6、CDK12基因的若干个区域组合设计;
所述用于检测GS型胃癌分型的探针针对CDH1、CDH2、RHOA、RHOAR、RHOB、CLDN18、ARHGAP基因的若干个区域组合设计;
所述胃癌分子分型DNA探针池中共有165条寡核苷酸探针,所述胃癌分子分型DNA探针池中每个所述寡核苷酸探针的浓度均为50-250 fmole/μL,所述165条寡核苷酸探针的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.165所示。
2.如权利要求1所述的一种胃癌分子分型DNA探针池,其特征在于,所述用于检测EBV型胃癌分型的探针针对EBV病毒全部编码区序列设计。
3.如权利要求1所述的一种胃癌分子分型DNA探针池,其特征在于,所述用于检测MSI型胃癌分型的探针针对RNF43、DOCK3、PIP5K1A、ATRN、MSH3、MORC1、TEAD2、ESRP1、IMPDH1、LMAN1、WRN、FAM115A、ZBTB20、ZFC3H1、TBC1D5、GPR107基因10个以上外显子区域或内含子区域组合设计。
4.如权利要求1所述的一种胃癌分子分型DNA探针池,其特征在于,所述用于检测CIN型胃癌分型的探针针对ERBB2、VEGFA、EGFR、ERBB2、ERBB3、MET、TP53、CCNE1、CCND1、CDK4、CDK6、CDK12基因的5个以上外显子区域组合设计。
5.如权利要求1所述的一种胃癌分子分型DNA探针池,其特征在于,所述用于针对GS型胃癌分型的探针针对CDH1、CDH2、RHOA、RHOAR、RHOB、CLDN18、ARHGAP基因的2个以上外显子或内含子区域组合设计。
6.如权利要求1所述的一种胃癌分子分型DNA探针池,其特征在于,所述胃癌分子分型DNA探针池的每个所述寡核苷酸探针的5’端均有生物素化修饰,3’端均有硫代化修饰。
7.包含如权利要求1-6任一项所述的胃癌分子分型DNA探针池的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括DNA提取和二代文库构建的常规组件,所述常规组件包括DNA提取试剂盒、建库预混液、引物混合液、接头预混液和杂交预混液。
8.如权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒的使用方法包括以下步骤:
S1、提取胃癌组织样本中DNA,胃癌组织样本是福尔马林浸泡样本或蜡块、石蜡切片;
S2、构建DNA二代测序文库;
S3、DNA二代测序文库与权利要求1-6所述胃癌分子分型DNA探针池杂交;
S4、二代测序及数据分析获得检测结果。
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