CN113901023A - 一种生物样本库综合性信息管理系统 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种生物样本库综合性信息管理系统,所述生物样本库综合性信息管理系统采用B/S体系架构,支持多账号登陆,服务器设置在本地,且与HIS系、LIS系统、PACS系统以及妇幼健康信息系统对接;所述生物样本库综合性信息管理系统包括科研项目管理模块、标本信息管理模块、标本管理模块、质控管理模块以及系统设置模块。本发明将人类遗传资源的采集、保藏、利用以及销毁的审批流程实现项目管理和流程管理线上审批,实现标本与患者的诊断信息、五级电子病历信息整合;将质控参数在系统中记录,便于后期质量追溯,可对生物样本进行实质性的规范管理,可对样本的信息进行整合和汇总统计,降低管理成本。
Description
技术领域
本发明涉及信息管理技术领域,具体为一种生物样本库综合性信息管理系统。
背景技术
生物样本库又称生物银行,主要是指标准化收集、处理、储存和应用健康和疾病生物体的生物大分子、细胞、组织和器官等样本以及与这些生物样本相关的临床、病理、治疗、随访、知情同意等资料及其质量控制、信息管理与应用系统。
随着生物样本库的不断发展状态,生物样本由于采集量大、实验操作繁多,实验周期长、保存条件不一等问题,管理难度很大,对于生物样本的管理工作愈显繁重,且由于缺乏实质性的规范管理,传统的管理方式难以满足对当前生物样本库的管理工作。同时,传统样本数据库分散在不同地区,研究者和管理者难以对样本的信息进行整合和汇总统计,造成管理成本高、实验结果无法追溯、操作随意等问题。
发明内容
本发明的目的在于提供一种生物样本库综合性信息管理系统,可对生物样本进行实质性的规范管理,可对样本的信息进行整合和汇总统计,降低管理成本,以解决上述背景技术中提出的问题。
为实现上述目的,本发明提供如下技术方案:
一种生物样本库综合性信息管理系统,所述生物样本库综合性信息管理系统采用B/S体系架构,支持多账号登陆,服务器设置在本地,且与HIS系、LIS系统、PACS系统以及妇幼健康信息系统对接;所述生物样本库综合性信息管理系统包括科研项目管理模块、标本信息管理模块、标本管理模块、质控管理模块以及系统设置模块;
所述科研项目管理模块用于拟使用和在库科研项目及其标本的管理;所述标本信息管理模块用于标本的信息管理;所述标本管理模块用于标本库工作人员对处理后的标本进行采集类型区分、入库、库存检索、出库、还库的具体操作;所述质控管理模块用于包括项目审批在内的所有流程管理和标本及其信息采集、保藏、出库、利用或者销毁在内的标本及其信息全生命周期管理的质控;所述系统设置模块用于该物样本库综合性信息管理系统的账号及权限管理、系统中的自定义设置。
作为本发明的一种生物样本库综合性信息管理系统优选的,所述科研项目管理模块包括项目审批、项目新建以及项目结题;
所述项目审批用于科研项目入库开展之前的审批;
所述项目新建用于完成项目的审批后,由生物样本库负责人完成项目的新建,录入项目的名称、类型、编号、资助金额、起止时间、来源单位及科室、项目负责人、联系方式、标本拟储存时间、标本对储存条件的特殊要求、标本的入库前处理参数并上传审批通过后的相关材料;
所述项目结题用于当项目结束后,由项目负责人发起结题申请,并说明剩余标本如何处理;
作为本发明的一种生物样本库综合性信息管理系统优选的,所述标本信息管理模块对接HIS系统、LIS系统、PACS系统以及妇幼健康信息系统,用于以登记号或者住院号为唯一识别信息一键抓取基本信息、诊断信息以及五级电子病历;
所述标本信息管理模块包括捐赠者信息、诊断信息以及家系信息;
所述捐赠者信息用于记录标本捐赠者的姓名、出生日期、身份证号、医院登记号、住院号、联系电话以及所属项目,并将知情同意书上传;
所述诊断信息用于HIS系统中抓取入组后的所有诊断信息,包括诊断的时间和诊断的内容,并可以随时手动更新;
所述家系信息用于添加子女及配偶的相关信息。
作为本发明的一种生物样本库综合性信息管理系统优选的,所述标本信息管理模块还包括数据安全管理,所述数据安全管理用于对数据信息进行预处理和数据优先级别确定处理,以此获得每一个信息的优先级别,并提取满足预设优先级别条件的数据信息,再对提取得到的数据信息进行加密处理,从而形成相应的加密数据信息;
所述数据安全管理具体包括:
S11、对数据信息进行计算机编码转换处理,以此将数据信息转换为计算机可识别的包含有若干具有不同信息特征的数据串数据串数组矩阵,并根据信息特征,将数据串数组矩阵拆分为若干特征子数据串;
S12、根据如下公式,确定特征子数据串对应的数据优先级别值:
其中,Qt,i表示第i个特征子数据串中属于第t种年份时间的数据串的数据优先级别值,D表示数据串数组矩阵包含的所有数据串的数量,Pi表示根据信息特征将数据串数组矩阵包含的所有数据串拆分成n个特征子数据串中的第i个特征子数据串中数据串的数量,Bt,i表示第i个特征子数据串中属于第t种年份时间的数据串的数量,n表示根据信息特征、将数据串数组矩阵包含的所有数据串拆分成特征子数据串后、特征子数据串的总数量,u表示数据串数组矩阵包含的所有数据串的年份时间总数量;
S13、将对应的数据优先级别值Qt,i小于或者等于预设数据优先级别阈值的特征子数据串进行提取,并对提取得到的特征子数据串进行加密处理,从而形成相应的加密特征子数据串。
作为本发明的一种生物样本库综合性信息管理系统优选的,所述标本管理模块包括储存空间管理、标本采集、标本入库、库存检索、标本出库以及标本还库;
所述储存空间管理用于储存设备的空间管理及项目的储存空间分配;
所述标本采集类型以出生缺陷标本为主,同时涵盖其他研究的标本类型;
所述标本入库用于将处理分装过后的标本与相应的捐赠者和所属项目相关联,并按照顺序和编码规则贴标签后入盒、入架、入库;
所述库存检索用于出库前的捐赠者的标本类型、数量、位置的查询;
所述标本出库用于标本使用或者销毁时出库;
所述标本还库用于标本使用后剩余标本的复存。
作为本发明的一种生物样本库综合性信息管理系统优选的,所述质控管理模块包括数据查询、质控记录、标本销毁记录以及账号操作日志;
所述数据查询用于各种审批记录查询,标本及其信息查询,入库前处理参数查询,出、入库查询,还库查询;
所述质控记录用于质控员上传质控的方案和总体质控结果;
所述标本销毁记录用于质控员记录销毁标本的种类、数量、所属项目、销毁的原因、销毁的方式方法、相关的图片记录;
所述账号操作日志用于记录所有的账号操作,标本及其信息的质量及安全追溯。
作为本发明的一种生物样本库综合性信息管理系统优选的,所述系统设置模块包括账号新建、角色分配以及自定义字段;
所述账号新建用于用户账号密码的新建;
所述角色分配用于为新建的账号分配角色,每个角色设置不同的权限;
所述自定义字段用于对某些特殊的标本类型、储存方案、处理量自定义字段或添加备注。
作为本发明的一种生物样本库综合性信息管理系统优选的,所述数据查询具体包括:
S21、接收特定语言格式的查询语句;
S22、对查询语句进行语法解析和校验生成查询计划;
S23、根据查询计划,确定与查询计划相对应的计算引擎和数据库,并将查询语句发送至计算引擎转换得到计算任务;
S24、接收由计算引擎发来的计算任务;
S25、对计算任务进行优化,并将优化后的计算任务发送至计算引擎,以使计算引擎对数据库发来的数据执行优化后的计算任务,并得到计算结果;
S26、接收由计算引擎发来的计算结果。
作为本发明的一种生物样本库综合性信息管理系统优选的,所述S25中对计算任务进行优化包括:
根据计算引擎接收的数据和计算引擎,确定计算引擎的并行计算指数和单行计算指数;
根据计算引擎的并行计算指数和单行计算指数表征的计算引擎执行计算任务的难易程度,对计算任务进行优化。
作为本发明的一种生物样本库综合性信息管理系统优选的,所述根据计算引擎接收的数据和计算引擎,确定计算引擎的并行计算指数和单行计算指数包括:
根据计算引擎接收的数据,确定数据的数据量、数据比重;
根据计算引擎,确定计算引擎中的物理单节点的个数和每一个物理单节点的可用内存;
根据数据的数据量、数据比重、计算引擎中的物理单节点的个数和每一个物理单节点的可用内存,利用如下公式确定计算引擎的并行计算指数:
其中,V表示并行计算指数,X表示所述数据的数据量,Y表示所述数据的数据比重,M表示每一个物理单节点的可用内存,G表示计算引擎中的物理单节点的个数;
根据数据的数据量、数据比重和每一个物理单节点的可用内存,利用如下公式确定计算引擎的单行计算指数:
其中,U表示单行计算指数,X表示数据的数据量,Y表示数据的数据比重,M表示每一个物理单节点的可用内存。
与现有技术相比,本发明的有益效果是:
将人类遗传资源的采集、保藏、利用以及销毁的审批流程,其中包括相关附件材料,如电子版伦理审查批件和知情同意书,实现项目管理和流程管理线上审批;将该生物样本库综合性信息管理系统与HIS系、LIS系统、PACS系统以及妇幼健康信息系统对接,实现标本与患者的诊断信息、五级电子病历信息整合;将质控参数在系统中记录,特别是样本的前处理参数,以及处理、出入库操作人员等系统操作日志,便于后期质量追溯。该生物样本库综合性信息管理系统可对生物样本进行实质性的规范管理,可对样本的信息进行整合和汇总统计,降低管理成本。
附图说明
图1为本发明的总体架构示意图;
图2为本发明的标本信息管理模块中数据安全管理的具体步骤示意图;
图3为本发明的质控管理模块中数据查询的具体步骤示意图。
具体实施方式
下面将结合本发明实施例中的附图,对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述,显然,所描述的实施例仅仅是本发明一部分实施例,而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例,本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例,都属于本发明保护的范围。
因此,以下对在附图中提供的本发明的实施方式的详细描述并非旨在限制要求保护的本发明的范围,而是仅仅表示本发明的选定实施方式。基于本发明中的实施方式,本领域普通技术人员在没有作出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施方式,都属于本发明保护的范围。
实施例1
请参阅图1,本发明提供一种生物样本库综合性信息管理系统,所述生物样本库综合性信息管理系统采用B/S体系架构,支持多账号登陆,服务器设置在本地,且与HIS系、LIS系统、PACS系统以及妇幼健康信息系统对接;所述生物样本库综合性信息管理系统包括科研项目管理模块、标本信息管理模块、标本管理模块、质控管理模块以及系统设置模块;
所述科研项目管理模块用于拟使用和在库科研项目及其标本的管理;所述标本信息管理模块用于标本的信息管理;所述标本管理模块用于标本库工作人员对处理后的标本进行采集类型区分、入库、库存检索、出库、还库的具体操作;所述质控管理模块用于包括项目审批在内的所有流程管理和标本及其信息采集、保藏、出库、利用或者销毁在内的标本及其信息全生命周期管理的质控;所述系统设置模块用于该物样本库综合性信息管理系统的账号及权限管理、系统中的自定义设置。
作为本发明的一种生物样本库综合性信息管理系统优选的,所述科研项目管理模块包括项目审批、项目新建以及项目结题;
所述项目审批用于科研项目入库开展之前的审批,用户需上传课题的研究方案、《标本采集申请表》、《标本入库备案表》、《伦理审查批件》、《知情同意书》等附件材料发起线上审批,由科研处负责人、分管院领导签批;
所述项目新建用于完成项目的审批后,由生物样本库负责人完成项目的新建,录入项目的名称、类型、编号、资助金额、起止时间、来源单位及科室、项目负责人、联系方式、标本拟储存时间、标本对储存条件的特殊要求、标本的入库前处理参数并上传审批通过后的相关材料;
所述项目结题用于当项目结束后,由项目负责人发起结题申请,并说明剩余标本如何处理,如发起销毁流程或者签订《泛知情同意书》后继续保存(视课题开展之前是否签订)。
作为本发明的一种生物样本库综合性信息管理系统优选的,所述标本信息管理模块对接HIS系统、LIS系统、PACS系统以及妇幼健康信息系统,用于以登记号或者住院号为唯一识别信息一键抓取基本信息、诊断信息以及五级电子病历;
所述标本信息管理模块包括捐赠者信息、诊断信息以及家系信息;
所述捐赠者信息用于记录标本捐赠者的姓名、出生日期、身份证号、医院登记号、住院号、联系电话以及所属项目,并将知情同意书上传;
所述诊断信息用于HIS系统中抓取入组后的所有诊断信息,包括诊断的时间和诊断的内容,并可以随时手动更新;
所述家系信息用于添加子女及配偶的相关信息,如出生缺陷队列可以添加子女的信息、配偶的信息,便于某些家系遗传病的研究。
作为本发明的一种生物样本库综合性信息管理系统优选的,所述标本管理模块包括储存空间管理、标本采集、标本入库、库存检索、标本出库以及标本还库;
所述储存空间管理用于深低温冰箱、液氮罐、蜡块柜等储存设备的空间管理及项目的储存空间分配;
所述标本采集类型以出生缺陷标本为主,同时涵盖其他研究的标本类型,主要分为血液、组织、体液三大类;第二层级类型分为外周血、脐带血、脐带、胎盘、胎膜、肿瘤组织、癌旁组织、正常组织、羊水、尿液、肺泡灌洗液、阴道分泌物;第三层级类型分为血清、血浆、全血,母体面胎盘、胎儿面胎盘、中间层胎盘、羊水上清、羊水沉淀;第四层级为各类细胞;第五层级为DNA、RNA、蛋白质;
所述标本入库用于将处理分装过后的标本与相应的捐赠者和所属项目相关联,并按照顺序和编码规则贴标签后入盒、入架、入库,标签根据编码规则进行加密设计,不出现患者隐私信息;
所述库存检索用于出库前的捐赠者的标本类型、数量、位置的查询;
所述标本出库用于标本使用或者销毁时出库,需提交《标本出库/销毁申请表》、《标本使用承诺书》等附件材料,发起出库申请;
所述标本还库用于标本使用后剩余标本的复存。
作为本发明的一种生物样本库综合性信息管理系统优选的,所述质控管理模块包括数据查询、质控记录、标本销毁记录以及账号操作日志;
所述数据查询用于各种审批记录查询,标本及其信息查询,入库前处理参数查询,出、入库查询,还库查询等质询功能;
所述质控记录用于质控员上传质控的方案和总体质控结果,质控的记录,包括质控的日期、抽样的标本信息、相关图片(DNA/RNA/蛋白质电泳图片等);
所述标本销毁记录用于质控员记录销毁标本的种类、数量、所属项目、销毁的原因、销毁的方式方法、相关的图片记录;
所述账号操作日志用于记录所有的账号操作,标本及其信息的质量及安全追溯。
作为本发明的一种生物样本库综合性信息管理系统优选的,所述系统设置模块包括账号新建、角色分配以及自定义字段;
所述账号新建用于用户账号密码的新建;
所述角色分配用于为新建的账号分配角色,每个角色设置不同的权限,科研处负责人、分管院领导有签批、查看在库科研项目、标本采集统计等权限;生物样本库负责人有部分签批、科研项目管理、标本信息管理、标本管理、系统设置、和质控管理等权限;生物样本库信息管理员有标本信息管理、标本管理、处理入库申请通知、出库申请通知等权限;生物样本库标本管理员有标本管理权限;生物样本库质控管理员有质控管理的权限;项目负责人有发起项目审批、项目结题、捐赠者信息查询、标本入库申请、库存检索、标本出库申请、还库申请等权限;
所述自定义字段用于对某些特殊的标本类型、储存方案、处理量自定义字段或添加备注。
实施例2
请参阅图2,与实施例1的不同之处在于:
所述标本信息管理模块还包括数据安全管理,所述数据安全管理用于对数据信息进行预处理和数据优先级别确定处理,以此获得每一个信息的优先级别,并提取满足预设优先级别条件的数据信息,再对提取得到的数据信息进行加密处理,从而形成相应的加密数据信息;
所述数据安全管理具体包括:
S11、对数据信息进行计算机编码转换处理,以此将数据信息转换为计算机可识别的包含有若干具有不同信息特征的数据串数据串数组矩阵,并根据信息特征,将数据串数组矩阵拆分为若干特征子数据串;
S12、根据如下公式,确定特征子数据串对应的数据优先级别值:
其中,Qt,i表示第i个特征子数据串中属于第t种年份时间的数据串的数据优先级别值,D表示数据串数组矩阵包含的所有数据串的数量,Pi表示根据信息特征将数据串数组矩阵包含的所有数据串拆分成n个特征子数据串中的第i个特征子数据串中数据串的数量,Bt,i表示第i个特征子数据串中属于第t种年份时间的数据串的数量,n表示根据信息特征、将数据串数组矩阵包含的所有数据串拆分成特征子数据串后、特征子数据串的总数量,u表示数据串数组矩阵包含的所有数据串的年份时间总数量;
S13、将对应的数据优先级别值Qt,i小于或者等于预设数据优先级别阈值的特征子数据串进行提取,并对提取得到的特征子数据串进行加密处理,从而形成相应的加密特征子数据串。
实施例3
请参阅图3,与实施例1的不同之处在于:
所述数据查询具体包括:
S21、接收特定语言格式的查询语句;
S22、对查询语句进行语法解析和校验生成查询计划;
S23、根据查询计划,确定与查询计划相对应的计算引擎和数据库,并将查询语句发送至计算引擎转换得到计算任务;
S24、接收由计算引擎发来的计算任务;
S25、对计算任务进行优化,并将优化后的计算任务发送至计算引擎,以使计算引擎对数据库发来的数据执行优化后的计算任务,并得到计算结果;
S26、接收由计算引擎发来的计算结果。
作为本发明的一种生物样本库综合性信息管理系统优选的,所述S25中对计算任务进行优化包括:
根据计算引擎接收的数据和计算引擎,确定计算引擎的并行计算指数和单行计算指数;
根据计算引擎的并行计算指数和单行计算指数表征的计算引擎执行计算任务的难易程度,对计算任务进行优化。
作为本发明的一种生物样本库综合性信息管理系统优选的,所述根据计算引擎接收的数据和计算引擎,确定计算引擎的并行计算指数和单行计算指数包括:
根据计算引擎接收的数据,确定数据的数据量、数据比重;
根据计算引擎,确定计算引擎中的物理单节点的个数和每一个物理单节点的可用内存;
根据数据的数据量、数据比重、计算引擎中的物理单节点的个数和每一个物理单节点的可用内存,利用如下公式确定计算引擎的并行计算指数:
其中,V表示并行计算指数,X表示所述数据的数据量,Y表示所述数据的数据比重,M表示每一个物理单节点的可用内存,G表示计算引擎中的物理单节点的个数;
根据数据的数据量、数据比重和每一个物理单节点的可用内存,利用如下公式确定计算引擎的单行计算指数:
其中,U表示单行计算指数,X表示数据的数据量,Y表示数据的数据比重,M表示每一个物理单节点的可用内存。
尽管已经示出和描述了本发明的实施例,对于本领域的普通技术人员而言,可以理解在不脱离本发明的原理和精神的情况下可以对这些实施例进行多种变化、修改、替换和变型,本发明的范围由所附权利要求及其等同物限定。
Claims (10)
1.一种生物样本库综合性信息管理系统,其特征在于:所述生物样本库综合性信息管理系统采用B/S体系架构,支持多账号登陆,服务器设置在本地,且与HIS系、LIS系统、PACS系统以及妇幼健康信息系统对接;所述生物样本库综合性信息管理系统包括科研项目管理模块、标本信息管理模块、标本管理模块、质控管理模块以及系统设置模块;
所述科研项目管理模块用于拟使用和在库科研项目及其标本的管理;所述标本信息管理模块用于标本的信息管理;所述标本管理模块用于标本库工作人员对处理后的标本进行采集类型区分、入库、库存检索、出库、还库的具体操作;所述质控管理模块用于包括项目审批在内的所有流程管理和标本及其信息采集、保藏、出库、利用或者销毁在内的标本及其信息全生命周期管理的质控;所述系统设置模块用于该物样本库综合性信息管理系统的账号及权限管理、系统中的自定义设置。
2.根据权利要求1所述的一种生物样本库综合性信息管理系统,其特征在于:所述科研项目管理模块包括项目审批、项目新建以及项目结题;
所述项目审批用于科研项目入库开展之前的审批;
所述项目新建用于完成项目的审批后,由生物样本库负责人完成项目的新建,录入项目的名称、类型、编号、资助金额、起止时间、来源单位及科室、项目负责人、联系方式、标本拟储存时间、标本对储存条件的特殊要求、标本的入库前处理参数并上传审批通过后的相关材料;
所述项目结题用于当项目结束后,由项目负责人发起结题申请,并说明剩余标本如何处理。
3.根据权利要求1所述的一种生物样本库综合性信息管理系统,其特征在于:所述标本信息管理模块对接HIS系统、LIS系统、PACS系统以及妇幼健康信息系统,用于以登记号或者住院号为唯一识别信息一键抓取基本信息、诊断信息以及五级电子病历;
所述标本信息管理模块包括捐赠者信息、诊断信息以及家系信息;
所述捐赠者信息用于记录标本捐赠者的姓名、出生日期、身份证号、医院登记号、住院号、联系电话以及所属项目,并将知情同意书上传;
所述诊断信息用于HIS系统中抓取入组后的所有诊断信息,包括诊断的时间和诊断的内容,并可以随时手动更新;
所述家系信息用于添加子女及配偶的相关信息。
4.根据权利要求3所述的一种生物样本库综合性信息管理系统,其特征在于:所述标本信息管理模块还包括数据安全管理,所述数据安全管理用于对数据信息进行预处理和数据优先级别确定处理,以此获得每一个信息的优先级别,并提取满足预设优先级别条件的数据信息,再对提取得到的数据信息进行加密处理,从而形成相应的加密数据信息;
所述数据安全管理具体包括:
S11、对数据信息进行计算机编码转换处理,以此将数据信息转换为计算机可识别的包含有若干具有不同信息特征的数据串数据串数组矩阵,并根据信息特征,将数据串数组矩阵拆分为若干特征子数据串;
S12、根据如下公式,确定特征子数据串对应的数据优先级别值:
其中,Qt,i表示第i个特征子数据串中属于第t种年份时间的数据串的数据优先级别值,D表示数据串数组矩阵包含的所有数据串的数量,Pi表示根据信息特征将数据串数组矩阵包含的所有数据串拆分成n个特征子数据串中的第i个特征子数据串中数据串的数量,Bt,i表示第i个特征子数据串中属于第t种年份时间的数据串的数量,n表示根据信息特征、将数据串数组矩阵包含的所有数据串拆分成特征子数据串后、特征子数据串的总数量,u表示数据串数组矩阵包含的所有数据串的年份时间总数量;
S13、将对应的数据优先级别值Qt,i小于或者等于预设数据优先级别阈值的特征子数据串进行提取,并对提取得到的特征子数据串进行加密处理,从而形成相应的加密特征子数据串。
5.根据权利要求1所述的一种生物样本库综合性信息管理系统,其特征在于:所述标本管理模块包括储存空间管理、标本采集、标本入库、库存检索、标本出库以及标本还库;
所述储存空间管理用于储存设备的空间管理及项目的储存空间分配;
所述标本采集类型以出生缺陷标本为主,同时涵盖其他研究的标本类型;
所述标本入库用于将处理分装过后的标本与相应的捐赠者和所属项目相关联,并按照顺序和编码规则贴标签后入盒、入架、入库;
所述库存检索用于出库前的捐赠者的标本类型、数量、位置的查询;
所述标本出库用于标本使用或者销毁时出库;
所述标本还库用于标本使用后剩余标本的复存。
6.根据权利要求1所述的一种生物样本库综合性信息管理系统,其特征在于:所述质控管理模块包括数据查询、质控记录、标本销毁记录以及账号操作日志;
所述数据查询用于各种审批记录查询,标本及其信息查询,入库前处理参数查询,出、入库查询,还库查询;
所述质控记录用于质控员上传质控的方案和总体质控结果;
所述标本销毁记录用于质控员记录销毁标本的种类、数量、所属项目、销毁的原因、销毁的方式方法、相关的图片记录;
所述账号操作日志用于记录所有的账号操作,标本及其信息的质量及安全追溯。
7.根据权利要求1所述的一种生物样本库综合性信息管理系统,其特征在于:所述系统设置模块包括账号新建、角色分配以及自定义字段;
所述账号新建用于用户账号密码的新建;
所述角色分配用于为新建的账号分配角色,每个角色设置不同的权限;
所述自定义字段用于对某些特殊的标本类型、储存方案、处理量自定义字段或添加备注。
8.根据权利要求6所述的一种生物样本库综合性信息管理系统,其特征在于:所述数据查询具体包括:
S21、接收特定语言格式的查询语句;
S22、对查询语句进行语法解析和校验生成查询计划;
S23、根据查询计划,确定与查询计划相对应的计算引擎和数据库,并将查询语句发送至计算引擎转换得到计算任务;
S24、接收由计算引擎发来的计算任务;
S25、对计算任务进行优化,并将优化后的计算任务发送至计算引擎,以使计算引擎对数据库发来的数据执行优化后的计算任务,并得到计算结果;
S26、接收由计算引擎发来的计算结果。
9.根据权利要求1所述的一种生物样本库综合性信息管理系统,其特征在于:所述S25中对计算任务进行优化包括:
根据计算引擎接收的数据和计算引擎,确定计算引擎的并行计算指数和单行计算指数;
根据计算引擎的并行计算指数和单行计算指数表征的计算引擎执行计算任务的难易程度,对计算任务进行优化。
10.根据权利要求1所述的一种生物样本库综合性信息管理系统,其特征在于:所述根据计算引擎接收的数据和计算引擎,确定计算引擎的并行计算指数和单行计算指数包括:
根据计算引擎接收的数据,确定数据的数据量、数据比重;
根据计算引擎,确定计算引擎中的物理单节点的个数和每一个物理单节点的可用内存;
根据数据的数据量、数据比重、计算引擎中的物理单节点的个数和每一个物理单节点的可用内存,利用如下公式确定计算引擎的并行计算指数:
其中,V表示并行计算指数,X表示所述数据的数据量,Y表示所述数据的数据比重,M表示每一个物理单节点的可用内存,G表示计算引擎中的物理单节点的个数;
根据数据的数据量、数据比重和每一个物理单节点的可用内存,利用如下公式确定计算引擎的单行计算指数:
其中,U表示单行计算指数,X表示数据的数据量,Y表示数据的数据比重,M表示每一个物理单节点的可用内存。
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CN117556841A (zh) * | 2024-01-11 | 2024-02-13 | 力盟生命科技(深圳)有限公司 | 一种生物样本核对追溯系统及方法 |
WO2024066877A1 (zh) * | 2022-09-29 | 2024-04-04 | 上海申博信息系统工程有限公司 | 一种移动方舱实验室的智能中控系统及其控制方法 |
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