CN108776748A - 一种基因检测系统及其检测方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种基因检测系统，包括分布式行为跟踪组件、数据库单元、文件服务器、搜索引擎、数据分析单元、报告创建单元、报告编写单元、样本跟踪管理单元、项目跟踪管理单元、权限管理单元和信息检索单元；一种基于基因检测系统的检测方法，包括如下步骤：S1、输入基因检测样本；S2、进行检测实验；S3、进行分析；S4、更新样本状态；S5、编写检测报告；S6、生成PDF检测报告；S7、对PDF检测报告进行审核；S8、输出合格的PDF检测报告并发送给检测请求者。本发明整合了基因检测、样本跟踪管理和数据分析的功能，解决了现有技术信息传递步骤繁琐、效率低、人力投入大、实用性低以及检测效果差的问题。
Description
技术领域
本发明涉及基因检测技术领域，具体涉及一种基因检测系统及其检测方法。
背景技术
基因是遗传的基本单元，携带有遗传信息的DNA或RNA序列，通过复制，把遗传信息传递给下一代，指导蛋白质的合成来表达自己所携带的遗传信息，从而控制生物个体的性状表达。基因检测是通过血液、其他体液、或细胞对DNA进行检测的技术，是取被检测者外周静脉血或其他组织细胞，扩增其基因信息后，通过特定设备对被检测者细胞中的DNA分子信息作检测，分析它所含有的基因类型和基因缺陷及其表达功能是否正常的一种方法，从而使人们能了解自己的基因信息，明确病因或预知身体患某种疾病的风险。
基因检测可以诊断疾病，也可以用于疾病风险的预测。疾病诊断是用基因检测技术检测引起遗传性疾病的突变基因。目前应用最广泛的基因检测是新生儿遗传性疾病的检测、遗传疾病的诊断和某些常见病的辅助诊断。
在现有的基因检测业务中，样本管理、基因测序数据的分析和报告分析编写往往是独立的环节，可能由多个不同的人负责，而这些人分别独立使用自己熟悉的软件和系统来完成工作，这些软件和系统往往是一些业界开源的软件，彼此之间无任何关系，导致了使用人员在使用过程中需要口头或者借助一些特别低效的工具手段进行信息的传递和分享，在这往往会导致如下一些问题。
(1)首先，样本信息特别是患者的临床症状信息在不同环节之间传递时步骤繁琐，容易出错，如丢失了部分关键信息、甚至是信息和人的匹配错误，从而导致报告错误。
(2)其次，为了尽可能地减少上面的错误，不同环节之间的人需要反复确认和沟通样本信息，效率十分低下，造成了人力资源的极大浪费。
(3)再次，不同环节都可能会编辑样本信息，但没有人知道最新的信息，信息成为孤岛，实时性低，最终可能会导致交付的基因检测报告和预期的不一致。
(4)还有，不同的数据分析人员使用的软件和数据库版本可能也存在差异，导致了分析结果在不可重复性错误。
(5)最后，不同的报告编写人员之间因个人风格的差异导致最终交付的报告风格不完全一致，即便采用最老式的word模板，也无法杜绝此问题，实用性低。
可见，现有的基因检测公司内部的这种协作模式低效、容易出错并不利于遗传疾病的诊断。
发明内容
针对现有技术中的上述不足，本发明提供的一种整合了基因检测、样本跟踪管理和数据分析功能的信息传递方便、效率高、节约人力投入、保证了可重复性、实时性高以及实用性高的基因检测系统及其检测方法，解决了现有技术信息传递步骤繁琐、效率低、人力投入大、实用性低以及检测效果差的问题。
为了达到上述发明目的，本发明采用的技术方案为：
一种基因检测系统，包括：
分布式行为跟踪组件，用于跟踪并记录用户操作行为；
数据库单元，用于存储账号信息、样本信息、报告信息和项目信息；
文件服务器，用于统一管理以图片的形式提供的文件和信息；
搜索引擎，用于提供知识库信息的检索接口，并管理知识库；
数据分析单元，整合异构的基因数据分析系统和模块，用于进行基因检测数据的分析；
报告创建单元，用于创建PDF检测报告并下载分发给用户；
报告编写单元，用于检测报告的编写与修改；
样本跟踪管理单元，用于对基因检测样本进行跟踪管理，并进行样本状态的查询和更新；
项目跟踪管理单元，用于统一跟踪管理项目；
权限管理单元，用于账号管理以及根据用户权限提供对应操作与显示对应信息；
信息检索单元，用于提供进行数据分析的知识库访问接口；
所述分布式行为跟踪组件分别与报告创建单元、数据分析单元、数据库单元、文件服务器和搜索引擎通信连接；
报告创建单元与报告编写单元通信连接，数据分析单元与样本跟踪管理单元通信连接，数据库单元分别与报告编写单元、样本跟踪管理单元、项目跟踪管理单元和权限管理单元通信连接，搜索引擎与信息检索单元通信连接。
进一步地，单元之间通过统一规格的应用程序编程接口API进行交互和通信，同时提供加密通道。
一种基于基因检测系统的检测方法，包括如下步骤：
S1：将接收到的基因检测样本输入到基因检测系统中，并将样本信息保存到数据库单元；
S2：根据基因检测样本进行检测实验，得到检测数据，并将检测数据保存到数据库单元；
S3：使用数据分析单元读取检测数据进行分析，得到分析结果；
S4：将对应的基因检测样本的样本状态更新至分析结束；
S5：根据分析结果，使用报告编写单元进行检测报告编写；
S6：检测报告编写完毕，使用报告创建单元生成PDF检测报告；
S7：对PDF检测报告进行审核，判断PDF检测报告的内容是否合格，若是则进入步骤S8，否则进入步骤S5；
S8：输出合格的PDF检测报告并发送给检测请求者。
进一步地，步骤S1中，图片的形式提供的文件和信息保存到文件服务器。
进一步地，步骤S2中，检测实验包括提取DNA、建立对应文库和进行基因测序。
进一步地，步骤S5中，在编写检测报告时，通过搜索引擎使用信息检索单元查询知识库。
本方案的有益效果为：
(1)针对信息传递的问题，本系统提供了整合基因检测样本跟踪管理和数据分析的系统，所有环节上的使用者均使用同一套系统，能够共享数据，各自均能查看最新的数据及其样本的状态，提高了实时性，方便了信息传递，大大减少了依靠传统方式传递和分享信息所带来的问题，同时提高了效率；
(2)针对不同的数据分析人员使用不同的数据分析软件和数据版本的差异问题，本系统整合一套完整的数据分析系统，所有分析人员均使用相同的分析模块和算法，避免了分析结果错误，保证了可重复性，提高了实用性和检测效果；
(3)针对最终交付报告因人而异的问题，本系统提供了报告编辑和自动生成PDF报告的功能，这样报告编写者只需专注于报告内容，而报告的最终形式则由系统根据统一的样式自动生成，避免了检测报告错误，不仅减轻了报告编辑人员的工作量，减少了人力投入，进一步提高了效率，同时还保证了交付报告的风格一致性，让检测公司的服务显得更加专业可靠。
附图说明
图1为基因检测系统结构框图；
图2为检测方法流程图。
具体实施方式
下面对本发明的具体实施方式进行描述，以便于本技术领域的技术人员理解本发明，但应该清楚，本发明不限于具体实施方式的范围，对本技术领域的普通技术人员来讲，只要各种变化在所附的权利要求限定和确定的本发明的精神和范围内，这些变化是显而易见的，一切利用本发明构思的发明创造均在保护之列。
本发明实施例中，一种基因检测系统，如图1所示，包括：
分布式行为跟踪组件，用于跟踪并记录用户操作行为，便于审计和当出现异常事件时进行详细的用户跟踪；
数据库单元，用于存储账号信息、样本信息、报告信息和项目信息；
文件服务器，用于统一管理以图片的形式提供的文件和信息；
搜索引擎，用于提供知识库信息的检索接口，并管理知识库；
数据分析单元，用于进行基因检测数据的分析，对分析用户提供统一和一致的分析能力；
报告创建单元，用于创建PDF检测报告并下载分发给用户；
报告编写单元，用于检测报告的编写与修改，保证了对外交付的报告的一致性，同时也让使用者把精力专注于报告内容的准备上，而非样式上；
样本跟踪管理单元，用于对基因检测样本进行跟踪管理，并进行样本状态的查询和更新，提供统一的管理界面，避免了不同的用户掌握不同的信息，也避免不同的用户彼此之间用低效且容易出错的方式传递样本信息，使用者通过该单元查询和更新信息，保证了信息额一致性与实时性，避免了信息的不对称；
项目跟踪管理单元，用于统一跟踪管理项目，使项目清晰可见；
权限管理单元，用于根据用户权限提供对应操作与显示对应信息，保证数据的安全性和私密性；
信息检索单元，用于提供进行数据分析的知识库，提高了信息检索的效率，进一步提高了报告编写的效率；
分布式行为跟踪组件分别与报告创建单元、数据分析单元、数据库单元、文件服务器和搜索引擎通信连接；
报告创建单元与报告编写单元通信连接，数据分析单元与样本跟踪管理单元通信连接，数据库单元分别与报告编写单元、样本跟踪管理单元、项目跟踪管理单元和权限管理单元通信连接，搜索引擎与信息检索单元通信连接。
本实施例中，单元之间通过统一规格的应用程序编程接口API进行交互和通信，同时提供加密通道。
一种基于基因检测系统的检测方法，如图2所示，包括如下步骤：
S1：将接收到的基因检测样本输入到基因检测系统中，并将样本信息保存到数据库单元；
S2：根据基因检测样本进行检测实验，得到检测数据，并将检测数据保存到数据库单元；
S3：使用数据分析单元读取检测数据进行分析，得到分析结果；
S4：将对应的基因检测样本的样本状态更新至分析结束；
S5：根据分析结果，使用报告编写单元进行检测报告编写；
S6：检测报告编写完毕，使用报告创建单元生成PDF检测报告；
S7：对PDF检测报告进行审核，判断PDF检测报告的内容是否合格，若是则进入步骤S8，否则进入步骤S5；
S8：输出合格的PDF检测报告并发送给检测请求者。
本实施例中，步骤S1中，图片的形式提供的文件和信息保存到文件服务器。
本实施例中，步骤S2中，检测实验包括提取DNA、建立对应数据库和进行基因测序。
本实施例中，步骤S5中，在编写检测报告时，通过搜索引擎使用信息检索单元查询知识库。
本发明提供的一种整合了基因检测、样本跟踪管理和数据分析功能的信息传递方便、效率高、节约人力投入、保证了可重复性、实时性高以及实用性高的基因检测系统及其检测方法，大大提高了效率，减少了出错概率、保障了被检测者的数据安全、有利于塑造公司的专业形象和提升服务水准，提高了基因检测公司的竞争力，同时解决了现有技术信息传递步骤繁琐、效率低、人力投入大、实用性低以及检测效果差的问题。
Claims (6)
1.一种基因检测系统，其特征在于，包括：
分布式行为跟踪组件，用于跟踪并记录用户操作行为；
数据库单元，用于存储账号信息、样本信息、报告信息和项目信息；
文件服务器，用于统一管理以图片的形式提供的文件和信息；
搜索引擎，用于提供知识库信息的检索接口，并管理知识库；
数据分析单元，整合异构的基因数据分析系统和模块，用于进行基因检测数据的分析；
报告创建单元，用于创建PDF检测报告并下载分发给用户；
报告编写单元，用于检测报告的编写与修改；
样本跟踪管理单元，用于对基因检测样本进行跟踪管理，并进行样本状态的查询和更新；
项目跟踪管理单元，用于统一跟踪管理项目；
权限管理单元，用于账号管理以及根据用户权限提供对应操作与显示对应信息；
信息检索单元，用于提供进行数据分析的知识库访问接口；
所述分布式行为跟踪组件分别与报告创建单元、数据分析单元、数据库单元、文件服务器和搜索引擎通信连接；
所述报告创建单元与报告编写单元通信连接，所述数据分析单元与样本跟踪管理单元通信连接，所述数据库单元分别与报告编写单元、样本跟踪管理单元、项目跟踪管理单元和权限管理单元通信连接，所述搜索引擎与信息检索单元通信连接。
2.根据权利要求1所述的基因检测系统，其特征在于，单元之间通过统一规格的应用程序编程接口API进行交互和通信，同时提供加密通道。
3.一种基于权利要求1-2任一所述基因检测系统的检测方法，其特征在于，包括如下步骤：
S1：将接收到的基因检测样本输入到基因检测系统中，并将样本信息保存到数据库单元；
S2：根据基因检测样本进行检测实验，得到检测数据，并将检测数据保存到数据库单元；
S3：使用数据分析单元读取检测数据进行分析，得到分析结果；
S4：将对应的基因检测样本的样本状态更新至分析结束；
S5：根据分析结果，使用报告编写单元进行检测报告编写；
S6：使用报告创建单元生成PDF检测报告；
S7：对PDF检测报告进行审核，判断PDF检测报告的内容是否合格，若是则进入步骤S8，否则进入步骤S5；
S8：输出合格的PDF检测报告并发送给检测请求者。
4.根据权利要求3所述的检测方法，其特征在于，所述步骤S1中，图片的形式提供的文件和信息保存到文件服务器。
5.根据权利要求3所述的检测方法，其特征在于，所述步骤S2中，检测实验包括提取DNA、建立对应文库和进行基因测序。
6.根据权利要求3所述的检测方法，其特征在于，所述步骤S5中，在编写检测报告时，通过搜索引擎使用信息检索单元查询知识库。
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