CN113544122A - 作为抗病毒药的环戊基核苷类似物 - Google Patents

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Abstract

本文描述了式(I)的环戊基核苷类似物、包含一种或多种环戊基核苷类似物的药物组合物以及使用它们来治疗HBV、HDV和/或HIV的方法：

Description

作为抗病毒药的环戊基核苷类似物
技术领域
本申请涉及化学、生物化学和医学领域。更具体地，本文公开了环戊基核苷类似物、包含一种或多种环戊基核苷类似物的药物组合物以及合成它们的方法。本文还公开了用环戊基核苷类似物单独或以与一种或多种其他试剂的组合疗法来治疗病毒性疾病和/或病症的方法。
说明
核苷类似物是一类已被证实既能在体外又能在体内发挥抗病毒活性的化合物，因此成为治疗病毒感染的广泛研究主题。核苷类似物可通过宿主或病毒酶被转化成其相应的活性部分，活性部分继而可抑制参与病毒或细胞增殖的聚合酶。活化通过多种机制发生，诸如加入一个或多个磷酸基团和/或与其他代谢过程组合。
发明内容
本文所述的一些实施方案涉及式(I)的化合物、或其药学上可接受的盐。本文所述的其他实施方案涉及药物组合物，该药物组合物包含式(I)的化合物、或其药学上可接受的盐。
本文所述的一些实施方案涉及治疗HBV和/或HDV感染的方法，该方法可包括向鉴定为患有该HBV和/或HDV感染的受试者施用有效量的本文所述的化合物(例如式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)、或包含有效量的本文所述的化合物(诸如式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物。本文所述的其他实施方案涉及使用本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)用于制造用于治疗HBV和/或HDV感染的药物。本文所述的其他实施方案涉及本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)或包含本文所述的化合物(诸如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物用于治疗HBV和/或HDV感染的用途。
本文所公开的一些实施方案涉及治疗HBV和/或HDV感染的方法，该方法可包括使感染上HBV和/或HDV的细胞与有效量的本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)、或包含有效量的本文所述的化合物的药物组合物接触。本文所述的其他实施方案涉及将本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)用于制造用于治疗HBV和/或HDV感染的药物，该治疗可包括使感染上HBV和/或HDV的细胞与有效量的所述化合物和/或药物组合物接触。本文所述的其他实施方案涉及本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)、或包含本文所述的化合物的药物组合物用于治疗HBV和/或HDV感染的用途，其中所述用途包括使感染上HBV和/或HDV的细胞与有效量的所述化合物和/或药物组合物接触。
本文所公开的一些实施方案涉及抑制HBV和/或HDV的复制的方法，该方法可包括使感染上HBV和/或HDV的细胞与有效量的本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)、或包含本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物接触。本文所述的其他实施方案涉及使用本文所述的化合物(诸如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)用于制造用于抑制HBV和/或HDV的复制的药物，该治疗可包括使感染上HBV和/或HDV的细胞与有效量的所述化合物和/或药物组合物接触。本文所述的其他实施方案涉及本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)、或包含有效量的本文所述的化合物(诸如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物用于抑制HBV和/或HDV的复制的用途，其中所述用途包括使感染上HBV和/或HDV的细胞与有效量的所述化合物和/或药物组合物接触。
本文所述的一些实施方案涉及治疗HIV感染的方法，该方法可包括向鉴定为患有该HIV感染的受试者施用有效量的本文所述的化合物(例如式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)、或包含有效量的本文所述的化合物(诸如式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物。本文所述的其他实施方案涉及使用本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)用于制造用于治疗HIV感染的药物。本文所述的其他实施方案涉及本文所述的化合物(诸如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)或包含本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物用于治疗HIV感染的用途。
本文所公开的一些实施方案涉及治疗HIV感染的方法，该方法可包括使感染上HIV的细胞与有效量的本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)、或包含有效量的本文所述的化合物的药物组合物接触。本文所述的其他实施方案涉及使用本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)用于制造用于治疗HIV感染的药物，该治疗可包括使感染上HIV的细胞与有效量的所述化合物和/或药物组合物接触。本文所述的其他实施方案涉及本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)、或包含本文所述的化合物的药物组合物用于治疗HIV感染的用途，其中所述用途包括使感染上HIV的细胞与有效量的所述化合物和/或药物组合物接触。
本文所公开的一些实施方案涉及抑制HIV的复制的方法，该方法可包括使感染上HIV的细胞与有效量的本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)、或包含本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物接触。本文所述的其他实施方案涉及使用本文所述的化合物(诸如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)用于制造用于抑制HIV的复制的药物，该治疗可包括使感染有HIV的细胞与有效量的所述化合物和/或药物组合物接触。本文所述的其他实施方案涉及本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)、或包含有效量的本文所述的化合物(诸如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物用于抑制HIV的复制的用途，其中所述用途包括使感染上HIV的细胞与有效量的所述化合物和/或药物组合物接触。
附图说明
图1示出了示例性非核苷逆转录酶抑制剂(NNRTI)。
图2示出了示例性核苷逆转录酶抑制剂(NRTI)。
图3A示出了示例性HIV蛋白酶抑制剂。图3B示出了附加的HIV、HBV和/或HDV蛋白酶抑制剂。
图4A示出了HIV融合/进入抑制剂。图4B示出了HBV和/或HDV融合/进入抑制剂。
图5示出了HIV整合酶链转移抑制剂(INSTI)。
图6A示出了附加的HIV抗病毒化合物。图6B示出附加的抗病毒化合物。
图7示出了示例性HIV、HBV和/或HDV病毒成熟抑制剂。
图8示出了示例性HIV、HBV和/或HDV衣壳组装调节剂。
图9示出了示例性抗HBV和/或抗HDV法尼醇X受体(FXR)激动剂。
图10示出了示例性抗HBV和/或抗HDV肿瘤坏死因子(TNF)/亲环蛋白抑制剂。
图11示出了示例性抗HBV和/或抗HDV toll样受体(TLR)激动剂。
图12示出了示例性HBV和/或HDV聚合酶抑制剂。
图13示出了示例性HBV和/或HDV疫苗。
具体实施方式
嗜肝病毒家族是一种使用部分双链、部分单链的循环DNA基因组的包壳病毒家族。该家族包括一组病毒，所述病毒在各种生物体中引起肝脏疾病，并且其在两个属之间分裂：影响鸟类的Avihepadnaviruses和影响哺乳动物的Orthohepdnaviruses。乙型肝炎为急性/慢性肝炎的致病物并且具有部分双链的3.2kb环状DNA，由其合成了四种蛋白质：芯、聚合酶、表面抗原和X-基因产物。
在肝炎感染期间，HBV病毒体通过受体介导的方法进入肝细胞。病毒复制通过多步骤机制进行。首先，通过宿主细胞机构转录环状、部分双链DNA基因组，并且然后将全长RNA转录物包装到病毒前衣壳中。然后利用P蛋白的固有蛋白质引发活性，通过P蛋白在衣壳内逆转录所述转录物。然后通过P蛋白的固有RNA酶H活性将RNA组分降解，以产生全长负链环状DNA。最后，合成随后的部分正链DNA以产生最终病毒基因组组件。
病毒衣壳还可释放环状、部分双链基因组进入宿主细胞的细胞核，其中完成互补链对单链区的合成，并且连接剩余病毒末端以形成共价闭合环状DNA(cccDNA)，其在宿主细胞核中持续存在，并可在细胞分裂过程中传递给子细胞。cccDNA的存在产生病毒在宿主生物的整个寿命期间重新出现的风险。另外，HBV携带者可传播疾病多年。免疫抑制的个体尤其处于建立持续性(慢性)或潜伏的HBV感染的风险。
HDV是HBV的亚病毒卫星，并且因此只可在HBV的存在下传播。参见例如，Shieh等人，Nature，329(6137)，第343-346页(1987)。单链环状RNA HDV基因组的复制产生两种形式的RNA结合蛋白，其被称为长δ抗原(Ag)和小δ抗原(Ag)。进入肝细胞后，该病毒未包被，并且核衣壳易位至细胞核。然后该病毒使用宿主细胞的RNA聚合酶，由于其三级结构，RNA聚合酶将RNA基因组视为dsDNA。在复制过程中产生三种形式的RNA：环状基因组RNA、环状互补反基因组RNA和直链聚腺苷酸化反基因组RNA。
HBV和HDV主要通过血液或粘膜传播，包括通过性活动传播。由HBV和/或HDV感染导致在急性肝炎(包括暴发性肝功能衰竭)至慢性肝炎、硬化症和肝细胞癌。急性HBV和/或HDV感染可以是无症状的，或者存在有症状的性急性效应，包括发烧、头痛、关节疼痛和腹泻，从而导致与共轭高胆红素血症和胆汁淤积相关联的更严重的肝脏肿大和/或黄疸的症状。大多数感染病毒的成年人恢复，但5％-10％不能清除病毒并成为慢性感染者。许多慢性感染的个体患有持续的轻度肝脏疾病(潜伏的HBV和/或HDV)，表现为淋巴聚集物和胆管损伤、脂肪变性和/或可能导致肝硬化的纤维化增加。患有慢性HBV和/或HDV感染的其他人会出现活动性疾病，这可能导致危及生命的病症，诸如肝硬化和肝癌。一些具有潜在的HBV和/或HDV的受治疗者可能复发并发展成急性肝炎。
HIV是属于逆转录病毒家族的慢病毒属。HIV是一种有包膜病毒，其核由阳性单链RNA的两个拷贝组成。HIV依赖于逆转录酶将RNA逆转录成DNA，后者作为原病毒整合到宿主基因组中。HIV使用病毒糖蛋白120(gp 120)来结合并感染CD4+T淋巴细胞。病毒血浆负荷的增加对应于CD4+T淋巴细胞计数的减少。正常的CD4+T淋巴细胞水平为约500至1,200个细胞/mL。已经表征了两种类型的HIV，HIV-1和HIV-2。HIV-1具有更大毒性和更大感染性，并且具有全球流行性，然而HIV-2具有较少毒性并且是地理位置受限的。
定义
除非另有定义，否则本文所用的所有技术和科学术语均具有与本领域普通技术人员通常所理解的相同的含义。除非另有说明，否则本文引用的所有专利、申请、已公开的申请和其他公开均以引用方式全文并入。在本文的术语存在多个定义的情况下，除非另有说明，否则以该部分中的术语为准。
如本文所用，任何″R″基团，诸如但不限于R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15、R16、R17、R18、R19、R20、R21、R22和R23表示可连接到所指示的原子的取代基。R基团可为取代或未取代的。如果两个″R″基团被描述为″合在一起″，则R基团和它们所连接的原子可形成环烷基、环烯基、芳基、杂芳基或杂环基。例如但不限于，如果NRaRb基团的Ra和Rb被表示为″合在一起″，则意味着它们彼此是共价键合的以形成环：
Figure BDA0003208444450000061
此外，作为替代，如果两个″R″基团被描述为与它们所连接的原子″合在一起″以形成环，则当R基团未合在一起时，R基团不限于先前定义的变量或取代基。
每当基团被描述为″任选取代的″时，该基团可以是未取代的，或者被一个或多个所指示的取代基取代。同样，当基团被描述为″未取代或取代的″，如果是取代的，则取代基可以选自一个或多个所指示的取代基。如果没有指示取代基，则意味着所指示的″任选取代的″或″取代的″基团可被一个或多个基团取代，该一个或多个基团单独且独立地选自烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)、杂环基(烷基)、羟基、烷氧基、酰基、氰基、卤素、硫代羰基、O-氨甲酰基、N-氨甲酰基、O-硫代氨甲酰基、N-硫代氨甲酰基、C-酰胺基、N-酰胺基、S-磺酰胺基、N-磺酰胺基、C-羧基、O一羧基、异氰酸基、硫氰酸基、异硫氰酸基、硝基、甲硅烷基、亚氧硫基、亚磺酰基、磺酰基、卤代烷基、卤代烷氧基、三卤甲烷磺酰基、三卤甲烷磺酰胺基、氨基、单取代的胺基团和双取代的胺基团。除非另有说明，否则本段的每个基团中存在的原子的数目和类型如本文所定义。
如本文所用，″Ca至Cb″(其中″a″和″b″为整数)是指烷基、烯基或炔基基团中的碳原子数，或环烷基、环烯基、芳基、杂芳基或杂环基基团的环中的碳原子数。也就是说，烷基、烯基、炔基、环烷基的环、环烯基的环、芳基的环、杂芳基的环或杂环基的环可含有″a″至″b″(包括″a″和″b″)个碳原子。因此，例如，″C1至C4烷基″基团是指具有1至4个碳的所有烷基基团，即CH3-、CH3CH2-、CH3CH2CH2-、(CH3)2CH-、CH3CH2CH2CH2-、CH3CH2CH(CH3)-和(CH3)3C-。如果没有指定有关烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基或杂环基基团的″a″和″b″，则假定这些定义中描述的是最宽范围。
如本文所用，″烷基″是指包含完全饱和的(无双键或三键)烃基团的直链或支链烃链。烷基基团可具有1至20个碳原子(在本文中出现时，诸如″1至20″的数值范围是指给定范围中的每个整数；例如，″1至20个碳原子″意指该烷基基团可由1个碳原子、2个碳原子、3个碳原子等组成，至多包含20个碳原子，但本发明的定义还涵盖在未指定数值范围的情况下出现的术语″烷基″)。烷基基团也可以是具有1至10个碳原子的中等大小的烷基。烷基基团也可以是具有1至6个碳原子的低级烷基。化合物的烷基基团可被指定为″C1-C4烷基″或类似的指定。仅以举例的方式，″C1-C4烷基″表示烷基链中存在一至四个碳原子，即烷基链选自甲基、乙基、丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基和叔丁基。典型的烷基基团包括但决不限于甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基、异丁基、叔丁基、戊基和己基。烷基基团可为取代或未取代的。
如本文所用，″烯基″是指直链或支链烃链中含有一个或多个双键的烷基基团。烯基可包含2至20个碳原子、2至10个碳原子或2至6个碳原子。烯基基团的示例包括丙二烯基、乙烯基甲基和乙烯基。烯基基团可为取代或未取代的。
如本文所用，″炔基″是指直链或支链烃链中含有一个或多个三键的烷基基团。炔基可包含2至20个碳原子、2至10个碳原子或2至6个碳原子。炔基的示例包括乙炔基和丙炔基。炔基基团可为未取代的或取代的。
如本文所用，″环烷基″是指完全饱和的(无双键或三键)单环或多环烃环系。当环由两个或更多个环构成时，这些环可以稠合的方式合在一起。环烷基基团可在环中含有3至10个原子，在环中含有3至8个原子，或者在环中含有3至6个原子。环烷基基团可为未取代的或取代的。典型的环烷基基团包括但决不限于环丙基、环丁基、环戊基、环己基、环庚基和环辛基。
如本文所用，″环烯基″是指单环或多环烃环系，其在至少一个环中包含一个或多个双键；但如果存在多于一个，则所述双键不能在所有环中形成完全离域的π-电子体系(否则所述基团将是″芳基″，如本文所定义的)。当环由两个或更多个环构成时，这些环可以稠合的方式连接在一起。环烯基基团可在环中含有3至10个原子，或者在环中含有3至8个原子。环烯基基团可为未取代的或取代的。
如本文所用，″芳基″是指在所有环中具有完全离域π电子体系的碳环(所有碳)单环或多环的芳环系(包括其中两个碳环共享化学键的稠环系)。芳基基团中的碳原子数可以是变化的。例如，芳基基团可以是C6-C14芳基基团、C6-C10芳基基团或C6芳基基团。芳基基团的示例包括但不限于苯基、萘基和薁。芳基基团可为取代或未取代的。
如本文所用，″杂芳基″是指含有一个或多个杂原子(例如，1至5个杂原子)的单环、双环和三环芳环系(具有完全离域π电子体系的环系)，杂原子即不同于碳的元素，包括但不限于氮、氧和硫。杂芳基基团的环中的原子数可以是变化的。例如，杂芳基基团可在环中含有4至14个原子，在环中含有5至10个原子，或者在环中含有5至6个原子。另外，术语″杂芳基″包括其中两个环(诸如，至少一个芳基环和至少一个杂芳基环，或至少两个杂芳基环)共享至少一个化学键的稠环系。杂芳基环的示例包括但不限于呋喃、呋咱、噻吩、苯并噻吩、酞嗪、吡咯、噁唑、苯并噁唑、1，2，3-噁二唑、1，2，4-噁二唑、噻唑、1，2，3-噻二唑、1，2，4-噻二唑、苯并噻唑、咪唑、苯并咪唑、吲哚、吲唑、吡唑、苯并吡唑、异噁唑、苯并异噁唑、异噻唑、三唑、苯并三唑、噻二唑、四唑、吡啶、哒嗪、嘧啶、吡嗪、嘌呤、蝶啶、喹啉、异喹啉、喹唑啉、喹喔啉、噌啉和三嗪。杂芳基基团可为取代或未取代的。
如本文所用，″杂环基″或″杂脂环基″是指三元、四元、五元、六元、七元、八元、九元、十元、至多18元单环、双环和三环系，其中碳原子与1至5个杂原子一起构成所述环系。杂环可任选地含有一个或多个以完全离域π电子体系不会在所有环中发生的这种方式定位的不饱和键。杂原子是不同于碳的元素，包括但不限于氧、硫和氮。杂环还可含有一个或多个羰基或硫代羰基官能团，以便使该定义包括氧代-体系和硫代-体系，诸如内酰胺、内酯、环状酰亚胺、环状硫代酰亚胺和环状氨基甲酸酯。当环由两个或更多个环构成时，这些环可以稠合的方式合在一起。另外，杂脂环中的任何氮可以是季铵化的。杂环基或杂脂环基基团可为未取代的或取代的。这类″杂环基″或″杂脂环基″基团的示例包括但不限于1，3-二噁英、1，3-二噁烷、1，4-二噁烷、1，2-二氧杂环戊烷、1，3-二氧杂环戊烷、1，4-二氧杂环戊烷、1，3-氧硫杂环己烷、1，4-氧硫杂环己二烯、1，3-氧硫杂环戊烷、1，3-二硫杂环戊二烯、1，3-二硫戊环、1，4-氧硫杂环己烷、四氢-1，4-噻嗪、2H-1，2-噁嗪、马来酰亚胺、琥珀酰亚胺、巴比妥酸、硫代巴比妥酸、二氧代哌嗪、乙内酰脲、二氢尿嘧啶、三噁烷、六氢-1，3，5-三嗪、咪唑啉、咪唑烷、异噁唑啉、异噁唑烷、噁唑啉、噁唑烷、噁唑烷酮、噻唑啉、噻唑烷、吗啉、环氧乙烷、哌啶N-氧化物、哌啶、哌嗪、吡咯烷、吡咯烷酮、吡咯烷二酮、4-哌啶酮、吡唑啉、吡唑啶、2-氧代吡咯烷、四氢吡喃、4H-吡喃、四氢噻喃、噻吗啉、噻吗啉亚砜、噻吗啉砜以及它们的苯并稠合类似物(例如，苯并咪唑啉酮、四氢喹啉和3，4-亚甲基二氧基苯基)。
如本文所用，″芳基(烷基)″是指通过烷亚基基团连接作为取代基的芳基基团。芳基(烷基)的烷亚基和芳基基团可为取代或未取代的。示例包括但不限于苄基、2-苯基(烷基)、3-苯基(烷基)和萘基(烷基)。
如本文所用，″杂芳基(烷基)″是指通过烷亚基基团连接作为取代基的杂芳基基团。杂芳基(烷基)的烷亚基和杂芳基基团可为取代或未取代的。示例包括但不限于2-噻吩基(烷基)、3-噻吩基(烷基)、呋喃基(烷基)、噻吩基(烷基)、吡咯基(烷基)、吡啶基(烷基)、异噁唑基(烷基)、咪唑基(烷基)和它们的苯并稠合类似物。
″(杂环基)烷基″是指通过烷亚基基团连接作为取代基的杂环基团。(杂环基)烷基的烷亚基和杂环基可为取代或未取代的。示例包括但不限于四氢-2H-吡喃-4-基(甲基)、哌啶-4-基(乙基)、哌啶-4-基(丙基)、四氢-2H-噻喃-4-基(甲基)和1，3-噻嗪烷-4-基(甲基)。
″烷亚基基团″是具有形成键以经由其末端碳原子连接分子片段的一个和十个之间的碳原子、一个至五个碳原子或一个至三个碳原子的直链-CH2-系链基团。示例包括但不限于亚甲基(-CH2-)、亚乙基(-CH2CH2-)、亚丙基(-CH2CH2CH2-)和亚丁基(-CH2CH2CH2CH2-)和亚戊基(-CH2CH2CH2CH2CH2-)。烷亚基基团可通过以下方式被取代：用根据定义″任选取代的″所列出的取代基来替代烷亚基基团中的一个或多个氢。
如本文所用，″烷氧基″是指式-OR，其中R是本文定义的烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳烷基、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)。烷氧基的非限制性列表包括甲氧基、乙氧基、正丙氧基、1-甲基乙氧基(异丙氧基)、正丁氧基、异丁氧基、仲丁氧基、叔丁氧基、苯氧基和苯甲酰氧基。烷氧基可为取代或未取代的。
如本文所用，″酰基″是指经由羰基基团连接作为取代基的氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、环烷基(烷基)、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)。示例包括甲酰基、乙酰基、丙酰基、苯甲酰基和丙烯酰基。酰基可为取代或未取代的。
如本文所用，″羟烷基″是指其中氢或氘原子中的一个或多个被羟基基团替代的烷基基团。示例性羟烷基基团包括但不限于2-羟乙基、3-羟丙基、2-羟丙基和2，2-二羟乙基。羟烷基可为取代或未取代的。
如本文所用，″卤代烷基″是指其中氢原子中的一个或多个被卤素替代的烷基基团(例如，单卤代烷基、二卤代烷基和三卤代烷基)。这类基团包括但不限于氯甲基、氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、1-氯-2-氟甲基和2-氟异丁基。卤代烷基可为取代或未取代的。
如本文所用，″卤代烷氧基″是指其中氢原子中的一个或多个被卤素替代的-O-烷基基团(例如，单卤代烷氧基、二卤代烷氧基和三卤代烷氧基)。这类基团包括但不限于氯甲氧基、氟甲氧基、二氟甲氧基、三氟甲氧基、1-氯-2-氟甲氧基和2-氟异丁氧基。卤代烷氧基可为取代或未取代的。
″亚氧硫基″基团是指其中R可以是氢、氘、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)的″-SR″基团。亚氧硫基可为取代或未取代的。
″亚磺酰基″基团是指其中R可与关于亚氧硫基所定义的相同的″-S(＝O)-R″基团。亚磺酰基可为取代或未取代的。
″磺酰基″基团是指其中R可与关于亚氧硫基所定义的相同的″SO2R″基团。磺酰基可为取代或未取代的。
″O-羧基″基团是指其中R可以是本文所定义的氢、氘、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)的″RC(＝O)O-″基团。O-羧基可为取代或未取代的。
术语″酯″和″C-羧基″是指其中R可与关于O-羧基所定义的相同的″-C(＝O)OR″基团。酯和C-羧基可为取代或未取代的。
″硫代羰基″基团是指其中R可与关于O-羧基所定义的相同的″-C(＝S)R″基团。硫代羰基可为取代或未取代的。
″三卤甲磺酰基″基团是指其中每个X均为卤素的″X3CSO2-″基团。
″三卤甲烷磺酰胺基″基团是指其中每个X均为卤素并且RA为氢、氘、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)的″X3CS(O)2N(RA)-″基团。
如本文所用，术语″氨基″是指-NH2基团。
如本文所用，术语″羟基″是指-OH基团。
″氰基″基团是指″-CN″基团。
如本文所用，术语″叠氮基″是指-N3基团。
″异氰酸基″基团是指″-NCO″基团。
″氰硫基″基团是指″-CNS″基团。
″异硫氰基″基团是指″-NCS″基团。
″巯基″基团是指″-SH″基团。
″羰基″基团是指C＝O基团。
″S-磺酰胺基″基团是指其中RA和RB可独立地为氢、氘、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)的″-SO2N(RARB)″基团。S-磺酰胺基可为取代或未取代的。
″N-磺酰胺基″基团是指其中R和RA可独立地为氢、氘、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)的″RSO2N(RA)-″基团。N-磺酰胺基可为取代或未取代的。
″O-氨甲酰基″基团是指其中RA和RB可独立地为氢、氘、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)的″-OC(＝O)N(RARB)″基团。O-氨甲酰基可为取代或未取代的。
″N-氨甲酰基″基团是指其中R和RA可独立地为氢、氘、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)的″ROC(＝O)N(RA)-″基团。N-氨甲酰基可为取代或未取代的。
″O-硫代氨甲酰基″基团是指其中RA和RB可独立地为氢、氘、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)的″-OC(＝S)-N(RARB)″基团。O-硫代氨甲酰基可为取代或未取代的。
″N-硫代氨甲酰基″基团是指其中R和RA可独立地为氢、氘、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)的″ROC(＝S)N(RA)-″基团。N-硫代氨甲酰基可为取代或未取代的。
″C-酰胺基″基团是指其中RA和RB可独立地为氢、氘、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)的″-C(＝O)N(RARB)″基团。C-酰胺基可为取代或未取代的。
″N-酰氨基″基团是指其中R和RA可独立地为氢、氘、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)的″RC(＝O)N(RA)-″基团。N-酰胺基可为取代或未取代的。
″单取代的胺″基团是指其中RA可为如本文所定义的烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、环烷基(烷基)、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)的″-NHRA″基团。RA可为取代或未取代的。单取代的胺基团的示例包括但不限于-NH(甲基)、-NH(乙基)、-NH(异丙基)、-NH(苯基)、-NH(苄基)等。
″二取代的胺″基团是指其中RA和RB可独立地为如本文所定义的烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、环烷基(烷基)、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)的″-NRARB″基团。RA和RB可独立地为取代或未取代的。二取代的氨基基团的示例包括但不限于-N(甲基)2、-N(苯基)(甲基)、-N(乙基)(甲基)、-N(乙基)2、-N(异丙基)2等。
如本文所用，术语″卤素原子″或″卤素″是指元素周期表第7列中放射性稳定的原子中的任一个，诸如氟、氯、溴和碘。
当未指定取代基的数目(例如，卤代烷基)时，可存在一个或多个取代基。例如，″卤代烷基″可包括相同或不同的卤素中的一个或多个。又如，″C1-C3烷氧基苯基″可包括相同或不同的含有一个、两个或三个原子的烷氧基基团中的一个或多个。
如本文所用，除非另有说明，否则任何化学化合物的缩写符合其通用用法、公认缩写形式或IUPAC-IUB委员会的生物化学命名规则参见Biochem.11：942-944(1972)。
如本文所用，术语″N-连接的杂环碱基″是指可经由环氮连接的任选取代的含氮杂环基或任选取代的含氮杂芳基。N-连接的杂环碱基可为单环或多环的(诸如二环的)。当环由两个或更多个环构成时，这些环可以稠合的方式连接。在一些实施方案中，N-连接的杂环碱基可为任选取代的N-连接的嘌呤碱基或任选取代的N-连接的嘧啶碱基。术语″嘌呤碱基″以本领域技术人员所理解的普通含义用于本文，并且包括其互变异构体。类似地，术语″嘧啶碱基″以本领域技术人员所理解的普通含义用于本文，并且包括其互变异构体。任选取代的嘌呤碱基的非限制性列表包括嘌呤、腺嘌呤、鸟嘌呤、次黄嘌呤、黄嘌呤、异亮氨酸、7-烷基鸟嘌呤(例如7-甲基鸟嘌呤)、可可碱、咖啡因、尿酸和异鸟嘌呤。嘧啶碱基的示例包括但不限于胞嘧啶、胸腺嘧啶、尿嘧啶、5，6-二氢尿嘧啶和5-烷基胞嘧啶(例如5-甲基胞嘧啶)。杂环碱基的其他非限制性示例包括二氨基嘌呤，8-氧代-N6-烷基腺嘌呤(例如8-氧代-N6-甲基腺嘌呤)、7-脱氮黄嘌呤、7-脱氮鸟嘌呤、7-脱氮腺嘌呤、N4，N4-乙胞嘧啶、N6，N6-乙酰-2，6-二氨基嘌呤、5-卤尿嘧啶(例如5-氟尿嘧啶和5-溴尿嘧啶)、假异胞嘧啶、异胞嘧啶、异鸟嘌呤，和美国专利5,432,272和7,125,855中所述的其他杂环碱基，其出于公开的附加杂环碱基的限制性目的以引用方式并入本文。
如本文所用，术语″C-连接的杂环碱基″是指可经由环碳连接的任选取代的含氮杂环基或任选取代的含氮杂芳基。C-连接的杂环碱基可为单环或多环的(例如二环的)。当环由两个或更多个环构成时，这些环可以稠合的方式连接。在一些实施方案中，C-连接的杂环碱基可为任选取代的咪唑并[2，1-f][1，2，4]三嗪碱基或任选取代的吡唑并[1，5-a][1，3，5]三嗪碱基。在一些实施方案中，N-连接的杂环碱基和/或C-连接的杂环碱基可包括氨基或烯醇保护基团。
术语″-N-连接的α-氨基酸″是指通过主链氨基或单取代的胺基基团连接到所指示部分的α-氨基酸。δ-N-连接的α-氨基酸可经由作为主链氨基或单取代胺基团的一部分的氢之一连接，使得-N-连接的α-氨基酸δ经由主链氨基或单取代胺基团的氮连接。N-连接的α-氨基酸可为取代或未取代的。
术语″-N-连接的α-氨基酸酯衍生物″是指其中主链羧酸基团已被转换为酯基团的α-氨基酸。在一些实施方案中，酯基团具有选自烷基-O-C(＝O)-、环烷基-O-C(＝O)-、芳基-O-C(＝O)-和芳基(烷基)-O-C(＝O)-的式。酯基团的非限制性列表包括下列基团的取代和未取代的型式：甲基-O-C(＝O)-、乙基-O-C(＝O)-、正丙基-O-C(＝O)-、异丙基-O-C(＝O)-、正丁基-O-C(＝O)-、异丁基-O-C(＝O)-、叔丁基-O-C(＝O)-、新戊基-O-C(＝O)-、环丙基-O-C(＝O)-、环丁基-O-C(＝O)-、环戊基-O-C(＝O)-、环己基-O-C(＝O)-、苯基-O-C(＝O)-、苄基-O-C(＝O)-和萘基-O-C(＝O)-。N-连接的α-氨基酸酯衍生物可为取代或未取代的。
术语″-O-连接的α-氨基酸″是指通过来自其主链羧酸基团的羟基连接到所指示部分的α-氨基酸。-O-连接的α-氨基酸可经由作为来自其主链羧酸基团的羟基的一部分的氢连接，使得-O-连接的α-氨基酸经由氧或主链羧酸基团连接。O-连接的α-氨基酸可为取代或未取代的。
如本文所用，术语″α-氨基酸″是指任何氨基酸(标准和非标准氨基酸两者)。合适的α-氨基酸的示例包括但不限于丙氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、脯氨酸、丝氨酸、酪氨酸、精氨酸、组氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、苯丙氨酸、苏氨酸、色氨酸和缬氨酸。合适的α-氨基酸的附加示例包括但不限于鸟氨酸、羧腐胺赖氨酸(hypusine)、2-氨基异丁酸、脱氢丙氨酸、瓜氨酸和正亮氨酸。
如本文所用，术语″磷酸酯″以本领域技术人员所理解的普通含义使用，并且包括其质子化形式(例如，
Figure BDA0003208444450000151
)。如本文所用，术语″单磷酸酯″、″二磷酸酯″和″三磷酸酯″以本领域技术人员所理解的普通含义使用，并且包括质子化形式。
如本文所用，术语″保护基团″和″多个保护基团″是指添加到分子中以防止分子中的现有基团经受不希望的化学反应的任何原子或原子团。保护基团部分的示例在″T.W.Greene和P.G.M.Wuts，《Protective Groups in Organic Synthesis》第3版，JohnWiley&Sons，1999″和″J.F.W.McOmie，《Protective Groups in Organic Chemistry》，Plenum Press，1973″中有所描述，这两本书以引用方式并入本文用于公开合适的保护基团的限制性目的。可以一定方式选择保护基团部分，使得它们在某些反应条件下是稳定的，并且在方便的阶段可使用本领域已知的方法将它们轻松移除。保护基团的非限制性列表包括苄基；取代的苄基；烷基羰基和烷氧基羰基(例如，叔丁氧基羰基(BOC)、乙酰基或异丁酰基)；芳基烷基羰基和芳基烷氧基羰基(例如，苄氧基羰基)；取代的甲醚(例如甲氧基甲基醚)；取代的乙醚；取代的苄基醚；四氢吡喃醚；甲硅烷基(例如，三甲基甲硅烷基、三乙基甲硅烷基、三异丙基甲硅烷基、叔丁基二甲基甲硅烷基、三异丙基甲硅烷基氧基甲基、[2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基]甲基或叔丁基二苯基甲硅烷基)；酯(例如，苯甲酸酯)；碳酸酯(例如，甲氧基甲基碳酸酯)；磺酸酯(例如，甲苯磺酸酯或甲磺酸酯)；无环缩酮(例如，二甲基缩醛)；环状缩酮(例如，1，3-二氧杂环己烷、1，3-二氧杂环戊烷和本文所述的那些)；无环缩醛；环状缩醛(例如，本文所述的那些)；无环半缩醛；环状半缩醛；环状二硫代缩酮(例如1，3-二噻烷或1，3-二硫戊环)；原酸酯(例如，本文所述的那些)和三芳基甲基基团(例如三苯甲基；单甲氧基三苯甲基(MMTr)；4，4′-二甲氧基三苯甲基(DMTr)；4，4′，4″-三甲氧基三苯甲基(TMTr)；以及本文所述的那些)。
术语″药学上可接受的盐″是指对所施用的生物体不会引起显著刺激并且不会消除化合物的生物活性和性质的化合物的盐。在一些实施方案中，盐是化合物的酸加成盐。药物盐可以通过使化合物与无机酸(诸如氢卤酸(例如，盐酸或氢溴酸)、硫酸、硝酸和磷酸)反应而获得。药物盐也可以通过使化合物与有机酸(诸如脂族酸或芳族羧酸或磺酸，例如甲酸、乙酸、琥珀酸、乳酸、苹果酸、酒石酸、柠檬酸、抗坏血酸、烟酸、甲磺酸、乙磺酸、对甲苯磺酸、水杨酸或萘磺酸)反应而获得。药物盐也可通过使化合物与碱反应形成盐(诸如，铵盐、碱金属盐(如钠盐或钾盐)、碱土金属盐(如钙盐或镁盐)、有机碱的盐(如二环己胺、N-甲基-D-葡糖胺、三(羟甲基)甲胺、C1-C7烷基胺、环己胺、三乙醇胺、乙二胺)，以及具有氨基酸(如精氨酸和赖氨酸)的盐)而获得。
除非另有明确说明，否则本申请中所用的术语和短语以及其变型，特别是所附权利要求中所用的术语和短语以及其变型应被解释为与限制性相反的开放式。作为上述的示例，术语″包括′应被理解为″包括，但不限于″、″包括但不限于″等；如本文所用，术语″包含″与″包括″、″含有″或″其特征在于″同义，并且是包括端值在内或末端开放的，并且以及不排除附加的、未列出的元素或方法步骤；术语″具有″应被解释为″至少具有″；术语″包括″应被解释为″包括但不限于″；术语″示例″用于提供讨论中项目的示例性实例，而不是其详尽或限制性列表；术语″优选地″、″优选的″、″所需的″或″期望的″和具有类似含义的词不应当理解为意味着某些特征对于结构或功能是关键性的、必需的、或甚至是重要的，而是仅仅旨在突出显示可能或可能不用于特定实施方案中的另选的或附加的特征。此外，术语″包含″应被解释为与短语″至少具有″或″至少包括″同义。当在过程的上下文中使用时，术语″包含″意指该过程至少包括所列举的步骤，但可包括另外的步骤。当在化合物、组合物或装置的上下文中使用时，术语″包含″意指该化合物、组合物或装置至少包括所列举的特征或组分，但也可包括另外的特征或组分。
对于本文中使用的基本上任何复数和/或单数术语，本领域技术人员可从复数转换成单数和/或从单数转换成复数，只要适合于上下文和/或应用即可。为清楚起见，各种单数/复数置换可在本文中明确表述。不定冠词″一″或″一个″不排除多个。在相互不同的从属权利要求中列举某些措施这一不争事实并不表示不能有利地使用这些措施的组合。权利要求中的任何参考标记不应被解释为限制范围。
应当理解，在本文所述的具有一个或多个手性中心的任何化合物中，如果没有明确指出绝对立体化学结构，则每个中心可独立地具有R-构型或S-构型或它们的混合物。当本文所述的化合物具有至少一个手性中心时，它们可作为对映体相应地存在。如果化合物具有两个或更多个手性中心，则它们另外可以非对映体形式存在。因此，本文提供的化合物可以是对映体纯的、对映体富集的、外消旋混合物、非对映体纯的、非对映体富集的或立体异构体混合物。另外，应当理解，在本文所述的具有一个或多个双键(其产生可被定义为E或Z的几何异构体)的任何化合物中，每个双键可独立地为E或Z、它们的混合物。应当理解，所有的此类异构体及其混合物涵盖在内，除非另有说明。
同样，应当理解，在所述的任何化合物中，还包括所有互变异构形式。例如，包括本领域已知的杂环碱基的所有互变异构体，包括天然和非天然嘌呤碱基和嘧啶碱基的互变异构体。
应当理解，如果本文所公开的化合物具有未填充的化合价时，则该化合价要用氢或其同位素(例如，氢-1(氕)和氢-2(氘))来填充。
应当理解，本文所述的化合物可用同位素标记。此外，用同位素诸如氘进行取代可提供由更大的代谢稳定性所带来的某些治疗优势，诸如例如增长体内半衰期或降低剂量要求。在化合物结构中表示的每种化学元素可包括所述元素的任何同位素。例如，在化合物的可存在氢原子的任何位置处，氢原子可以是氢的任何同位素，包括但不限于氢-1(氕)和氢-2(氘)。因此，本文提及化合物包括所有潜在的同位素形式，除非上下文另有明确规定。
应当理解，本文所述的化合物、方法和组合包括结晶形式(也称为多晶型，其包括化合物的相同元素组成的不同晶体堆积排列)、无定形相、溶剂化物和水合物。在一些实施方案中，本文所述的化合物(包括在方法和组合中描述的那些)与药学上可接受的溶剂，诸如，水、乙醇等以溶剂化形式存在。在其他示例中，本文所述的化合物(包括在方法和组合中描述的那些)以非溶剂化的形式存在。溶剂化物含有化学计量或非化学计量的溶剂，并且可用药学上可接受的溶剂(诸如，水、乙醇等)在结晶的过程中形成。当溶剂为水时，形成水合物，或者当溶剂为醇时，形成醇化物。一般来讲，出于本文提供的化合物和方法的目的，溶剂化形式被认为等同于非溶剂化形式。
在提供值范围的情况下，应当理解，上限和下限以及该范围的上限和下限之间的每个中间值均包括在实施方案中。
化合物
本文所公开的一些实施方案涉及式(I)的化合物、或其药学上可接受的盐：
Figure BDA0003208444450000181
其中：B1可为任选取代的C-连接的杂环碱基或任选取代的N-连接的杂环碱基；R1可选自氢、卤素、氰基、任选取代的C1-6烷基、未取代的C2-6烯基和未取代的C2-6炔基，其中当所述C1-6烷基被取代时，所述C1-6烷基可被至少一个卤素取代；R2可为氢或氟；R3可为氢或氟；R4可选自氢、卤素、羟基、氰基和任选取代的C1-4烷基，其中当所述C1-4烷基被取代时，所述C1-4烷基可被羟基或至少一个卤素取代；R5可为氢或羟基；R6可选自氢、卤素、氰基、任选取代的C1-4烷基、任选取代的C2-4烯基和未取代的C2-4炔基，其中当所述C1-4烷基或所述C2-4烯基被取代时，所述C1-4烷基和所述C2-4烯基可独立地被至少一个卤素取代；R7可选自氢、任选取代的酰基、任选取代的O-连接的α-氨基酸、
Figure BDA0003208444450000191
R10和R11可独立地选自不存在、氢、
Figure BDA0003208444450000192
和
Figure BDA0003208444450000193
或者R10可为
Figure BDA0003208444450000194
并且R11可不存在或为氢；R12可不存在、为氢、任选取代的芳基或任选取代的杂芳基；R13可为任选取代的N-连接的α-氨基酸或任选取代的N-连接的α-氨基酸酯衍生物；R14和R15可独立地为任选取代的N-连接的α-氨基酸或任选取代的N-连接的α-氨基酸酯衍生物；R16、R17、R19和R20可独立地选自氢、任选取代的C1-24烷基和任选取代的芳基；R18和R21可独立地选自氢、任选取代的C1-24烷基、任选取代的芳基、任选取代的-O-C1-24烷基、任选取代的-O-芳基；R22可选自氢、任选取代的C1-24烷基和任选取代的芳基；R23、R24和R25可独立地不存在或为氢；R8和R9独立地为氢或卤素；并且m可为0或1。
附接到环戊基环的取代基的取向可变化。例如，下式(Ia)、(Ib)、(Ic)和(Id)各自为式(I)的化合物的实施方案的示例。
Figure BDA0003208444450000201
Figure BDA0003208444450000202
或前述物质中任一种的药学上可接受的盐。
多种基团可附接到环戊基环。在一些实施方案中，R6可为卤素。例如，R6可为氟。在其他实施方案中，R6可为氰基。在其他实施方案中，R6可为包含1至4个碳的取代或未取代的、饱和或不饱和的烃。在一些实施方案中，R6可为任选取代的C1-4烷基，其中当C1-4烷基被取代时，C1-4烷基可被至少一个卤素取代。合适的C1-4烷基的示例包括甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基和叔丁基。在一些实施方案中，R6可为未取代的C1-4烷基，诸如本文所述的那些。在其他实施方案中，R6可为取代的C1-4烷基，其中C1-4烷基可被至少一个卤素取代。例如，R6可为被1个、2个或3个卤素(诸如氟或氯)取代的C1-4烷基。当R6被一个卤素(例如，F或Cl)取代时，R6可为单取代的卤代C1-4烷基。在一些实施方案中，R6可为氟取代的C1-4烷基。在其他实施方案中，R6可为氯取代的C1-4烷基。卤素取代的C1-4烷基的非限制性列表包括-CH2F或-CH2Cl。在一些实施方案中，R6处的烃可包含双键和/或三键。例如，在一些实施方案中，R6可为任选取代的C2-4烯基，其中当C2-4烯基被取代时，C2-4烯基可被卤素取代。当取代的C1-4烷基基团存在于R6处时，取代的C2-4烯基可被1个、2个或3个卤素(诸如氟或氯)取代。例如，在一些实施方案中，R6可为任选取代的C2-4烯基。在其他实施方案中，R6可为氯取代的C2-4烯基。在一些实施方案中，R6可为未取代的C2-4烯基。示例性C2-4烯基包括乙烯基、1-丙烯基、2-丙烯基、1-丁烯基、2-丁烯基和3-丁烯基。在一些实施方案中，R6可为氢。
附接到环戊基环的2′-位置的基团可变化。在一些实施方案中，R2可为氢。在其他实施方案中，R2可为氟。在一些实施方案中，R3可为氢。在其他实施方案中，R3可为氟。在一些实施方案中，R2和R3可各自为氢。在其他实施方案中，当R2和R3各自为氟时，2′-位置可被二取代。在其他实施方案中，R2可为氢；并且R3可为氟。在其他实施方案中，R2可为氟；并且R3可为氢。
附接到环戊基环的3′-位置的基团也可变化。在一些实施方案中，R4可为卤素。卤素可为F、Cl、Br或I。在一些实施方案中，R4可为F。在其他实施方案中，R4可为Cl。在一些实施方案中，R4可为羟基(-OH)。在其他实施方案中，R4可为氰基(-CN)。在其他实施方案中，R4可为任选取代的C1-4烷基，其中当C1-4烷基被取代时，C1-4烷基可被羟基或至少一个卤素取代。在一些实施方案中，R4可为未取代的C1-4烷基(诸如甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基或叔丁基)。在其他实施方案中，R4可为取代的C1-4烷基，其中C1-4烷基可被至少一个卤素取代。例如，R4可为被1个、2个或3个卤素(诸如氟或氯)取代的C1-4烷基。当R4被一个卤素(例如，F或Cl)取代时，R4可为单取代的卤代C1-4烷基。在一些实施方案中，R4可为氟取代的C1-4烷基。在其他实施方案中，R4可为氯取代的C1-4烷基。在各种实施方案中，氟取代的C1-4烷基可为单取代的、氟取代的C1-4烷基，诸如CH2F。在各种其他实施方案中，氯取代的C1-4烷基可为单取代的、氯取代的C1-4烷基，诸如CH2Cl。在一些实施方案中，R4可为被一个或多个羟基基团取代的C1-4烷基。作为示例，R4可被羟基单取代。在各种实施方案中，R4可为-CH2OH。在一些实施方案中，R4可为被1个或2个羟基基团和1个或2个卤素(诸如F或Cl)取代的C1-4烷基。在一些实施方案中，R4可为氢。在各种实施方案(包括该段落的那些实施方案)中，R5可为氢。在其他各种实施方案(包括该段落的那些实施方案)中，R5可为羟基。
如本文所述，R8和R9可独立地为氢或卤素。在一些实施方案中，R8和R9可各自为氢，使得附接到环戊基环的取代基为＝CH2。在其他实施方案中，R8和R9可各自为卤素。当R8和R9各自为卤素时，卤素可为相同的或不同的。例如，R8和R9可各自为氟，或者R8和R9中的一者可为氟，并且R8和R9中的另一者可为氯。在其他实施方案中，R8和R9中的一者可为氢，并且R8和R9中的另一者可为卤素。在各种实施方案中，当R8和R9中的一者或两者为卤素时，该卤素可为氟。附接到包含卤素的环戊基环的取代基的示例包括但不限于以下各项：＝CF2、＝CCl2、＝CFH、＝CClH和＝CClF。
与环戊基环上的其他位置一样，B1所附接的碳可进一步为取代或未取代的。在一些实施方案中，R1可为氢。在其他实施方案中，R1可为卤素。本文描述了合适的卤素。例如，R1可为氟。在其他实施方案中，R1可为氰基；在其他实施方案中，R1可为任选取代的C1-6烷基，其中当所述C1-6烷基被取代时，所述C1-6烷基可被至少一个卤素取代。在本文所述的各种实施方案中，当R1为未取代的C1-6烷基时，R1可为甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、戊基(支链或直链的)或己基(支链或直链的)。在各种实施方案中，当R1被取代时，C1-6烷基可被一个或多个卤素(诸如1个、2个、3个、4个、5个或6个卤素)取代。本文描述了合适的卤素的示例。在一些实施方案中，R1可为单卤代的C1-6烷基。在其他实施方案中，R1可为全卤代的C1-6烷基。R1的示例性卤代C1-6烷基包括-CH2F、-CH2Cl、-CHF2、-CHCl2、-CF3、-CCl3、-CH2CH2F、CH2CF3、-CH2CHClF、-CHFCH2F和-CHClCH2F。在一些实施方案中，R1可为未取代的C2-6烯基。在其他实施方案中，R1可为未取代的C2-6炔基。当R1为不饱和的C2-6烃时，在各种实施方案中，R1可为乙烯基、乙炔基或-CH2-CH＝CH2。
式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可被称为环戊基核苷类似物。在一些实施方案中，R7可为氢。当R7为氢时，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可为环戊基核苷。
在一些实施方案中，R7可为
Figure BDA0003208444450000221
其中m可为0或1；并且R10、R11、R23、R24和R25可独立地不存在或为氢。当R7为
Figure BDA0003208444450000222
其中m可为0或1；R7可为
Figure BDA0003208444450000231
并且R11、R23、R24和R25可独立地不存在或为氢时，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可为环戊基核苷酸单磷酸盐、二磷酸盐和/或三磷酸盐。本领域的技术人员理解，当R7为
Figure BDA0003208444450000232
并且R10和R11独立地不存在或为氢时，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可为单磷酸盐。本领域的技术人员还理解，当R7为
Figure BDA0003208444450000233
R10为
Figure BDA0003208444450000234
R11、R23、R24和R25可独立地不存在或为氢；并且m为0或1时，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可为二磷酸盐(m为0)或三磷酸盐(m为1)。当R10、R11、R23、R24和R25中的任一者不存在时，本领域技术人员理解，R10、R11、R23、R24和R25显示所附接的相应氧将具有相关负电荷。例如，当R10和R11各自不存在时，R7可为
Figure BDA0003208444450000235
作为另外的示例，当R7为
Figure BDA0003208444450000236
R10为
Figure BDA0003208444450000237
R11、R23、R24和R25不存在；并且m为0或1时，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐、R7可具有以下结构：
Figure BDA0003208444450000238
(m为0)和
Figure BDA0003208444450000239
(m为1)。
式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可包括前药基团。前药基团可存在于相当于R7的位置处。在一些实施方案中，R7可为任选取代的酰基。在一些实施方案中，酰基可为未取代的。在其他实施方案中，酰基可为取代的。任选取代的酰基的示例性结构可为-C(＝O)R26，其中R26可为任选取代的C1-12烷基、任选取代的单环C3-8环烷基或任选取代的苯基。在一些实施方案中，R26可为未取代的C1-12烷基。在其他实施方案中，R26可为未取代的单环C3-8环烷基。在其他实施方案中，R26可为未取代的苯基。在一些实施方案中，R7可为-C(＝O)R26，其中R26可为未取代的C1-6烷基。
在一些实施方案中，R7可为任选取代的O-连接的α-氨基酸。O-连接的α-氨基酸的示例包括丙氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、脯氨酸、丝氨酸、酪氨酸、精氨酸、组氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、苯丙氨酸、苏氨酸、色氨酸和缬氨酸。在各种实施方案中，O-连接的α-氨基酸可为未取代的。在各种其他实施方案中，O-连接的α-氨基酸可为取代的。在一些实施方案中，R7可选自未取代的O-连接的丙氨酸、未取代的O-连接的缬氨酸、未取代的O-连接的亮氨酸和未取代的O-连接的甘氨酸。α-氨基酸可为天然的α-氨基酸。合适的任选取代的O-连接的α-氨基酸的示例包括以下各项：
Figure BDA0003208444450000241
Figure BDA0003208444450000242
在一些实施方案中，R7可为
Figure BDA0003208444450000243
其中R10和R11中的一者可不存在、为氢或
Figure BDA0003208444450000244
R10和R11中的另一者可为
Figure BDA0003208444450000245
R16和R17可独立地选自氢、任选取代的C1-24烷基和任选取代的芳基；并且R18可选自氢、任选取代的C1-24烷基、任选取代的芳基、任选取代的-O-C1-24烷基、任选取代的-O-芳基。在其他实施方案中，R7可为
Figure BDA0003208444450000251
其中R10和R11可各自为
Figure BDA0003208444450000252
在各种实施方案中，当R10和R11中的一者或两者为
Figure BDA0003208444450000253
时，R16和R17可各自为氢；并且R18可为未取代的C1-24烷基。在其他实施方案中，R16和R17中的至少一者可为任选取代的C1-24烷基或任选取代的芳基。在一些实施方案中，R18可为任选取代的C1-24烷基。在一些实施方案中，R18可为未取代的C1-4烷基。在其他实施方案中，R18可为任选取代的芳基。在其他实施方案中，R18可为任选取代的-O-C1-24烷基、任选取代的-O-芳基、任选取代的-O-杂芳基或任选取代的-O-单环杂环基。在一些实施方案中，R18可为未取代的-O-C1-4烷基。
在一些实施方案中，R7可为
Figure BDA0003208444450000254
其中R10和R11中的一者可不存在、为氢或
Figure BDA0003208444450000255
R10和R11中的另一者可为
Figure BDA0003208444450000256
R19和R20可独立地选自氢、任选取代的C1-24烷基和任选取代的芳基；并且R21可选自氢、任选取代的C1-24烷基、任选取代的芳基、任选取代的-O-C1-24烷基、任选取代的-O-芳基。在其他实施方案中，R7可为
Figure BDA0003208444450000257
其中R10和R11可各自为
Figure BDA0003208444450000258
在各种实施方案中，当R10和R11中的一者或两者为
Figure BDA0003208444450000261
时，R19和R20可各自为氢；并且R21可为未取代的C1-24烷基。在各种其他实施方案中，当R10和R11中的一者或两者为
Figure BDA0003208444450000262
时，R19和R20可各自为氢；并且R21可为未取代的-O-C1-24烷基。在一些实施方案中，R19和R20可为氢。在其他实施方案中，R19和R20中的至少一者可为任选取代的C1-24烷基或任选取代的芳基。在一些实施方案中，R21可为任选取代的C1-24烷基。在一些实施方案中，R21可为未取代的C1-4烷基。在其他实施方案中，R21可为任选取代的芳基。在其他实施方案中，R21可为任选取代的-O-C1-24烷基、任选取代的-O-芳基、任选取代的-O-杂芳基或任选取代的-O-单环杂环基。在一些实施方案中，R21可为未取代的-O-C1-4烷基。在一些实施方案中，R10和R11中的一者或两者可为新戊酰氧基甲基(POM)基团。在一些实施方案中，R10和R11可各自为新戊酰氧基甲基(POM)基团，并且形成双(新戊酰氧基甲基)(双(POM))前药。在一些实施方案中，R10和R11中的一者或两者可为异丙氧基羰氧基甲基(POC)基团。在一些实施方案中，R10和R11各自可为异丙氧基羰氧基甲基(POC)基团，并且形成双(异丙氧基羰氧基甲基)(双(POC))前药。
在一些实施方案中，R7可为
Figure BDA0003208444450000263
其中R10和R11中的一者可不存在、为氢或
Figure BDA0003208444450000264
R10和R11中的另一者可为
Figure BDA0003208444450000265
并且R22可选自氢、任选取代的C1-24烷基和任选取代的芳基。在其他实施方案中，R7可为
Figure BDA0003208444450000271
其中R10和R11可各自为
Figure BDA0003208444450000272
在各种实施方案中，R22可为取代的C1-24烷基。在各种其他实施方案中，R22可为未取代的C1-24烷基。在各种其他实施方案中，R22可为未取代的C1-4烷基。在一些实施方案中，R10和R11可各自为S-酰基硫代乙基(SATE)基团，并且形成SATE酯前药。在一些实施方案中，Ri0和R11可各自为
Figure BDA0003208444450000273
在一些实施方案中，R7可为
Figure BDA0003208444450000274
其中R12可不存在、为氢、任选取代的芳基或任选取代的杂芳基；并且R13可为任选取代的N-连接的α-氨基酸或任选取代的N-连接的α-氨基酸酯衍生物。在一些实施方案中，R12可为任选取代的苯基。在其他实施方案中，R12可为任选取代的萘基。在其他实施方案中，R12可为未取代的苯基。在其他实施方案中，R12可为未取代的萘基。在一些实施方案中，R12可为任选取代的杂芳基，诸如任选取代的单环杂芳基。
在一些实施方案中，R13可为任选取代的N-连接的α-氨基酸。在一些实施方案中，R13可为任选取代的N-连接的α-氨基酸酯衍生物。各种α-氨基酸是本领域技术人员已知的，并且包括丙氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、脯氨酸、丝氨酸、酪氨酸、精氨酸、组氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、苯丙氨酸、苏氨酸、色氨酸和缬氨酸。N-连接的α-氨基酸酯衍生物的酯衍生物可具有以下结构中的一种：C1-6烷基-O-C(＝O)-、C3-6环烷基-O-C(＝O)-、苯基-O-C(＝O)-、萘基-O-C(＝O)-和苄基-O-C(＝O)-。在一些实施方案中，N-连接的α-氨基酸酯衍生物可为丙氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、脯氨酸、丝氨酸、酪氨酸、精氨酸、组氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、苯丙氨酸、苏氨酸、色氨酸或缬氨酸的C1-6烷基、C3-6环烷基、苯基、萘基或苄基酯。在一些实施方案中，R13可为N-连接的丙氨酸、N-连接的丙氨酸异丙酯、N-连接的丙氨酸环己酯或N-连接的丙氨酸新戊酯。在一些实施方案中，R12可为未取代的苯基。并且R13可为N-连接的丙氨酸、N-连接的甘氨酸、N-缬氨酸、N-连接的亮氨酸或N-连接的异亮氨酸的C1-6烷基-O-C(＝O)-、C3-6环烷基-O-C(＝O)-、苯基-O-C(＝O)-、萘基-O-C(＝O)-或苄基-O-C(＝O)-酯。在一些实施方案中，当R7为
Figure BDA0003208444450000281
时，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可为氨基磷酸酯前药，诸如芳基氨基磷酸酯前药。
在一些实施方案中，R7可为
Figure BDA0003208444450000282
其中R14和R15可独立地为任选取代的N-连接的α-氨基酸酯衍生物。在各种实施方案中，任选取代的N-连接的α-氨基酸酯衍生物的α-氨基酸部分可选自丙氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、脯氨酸、丝氨酸、酪氨酸、精氨酸、组氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、苯丙氨酸、苏氨酸、色氨酸和缬氨酸。如本文所述，α-氨基酸酯衍生物的酯部分可具有多种结构。在一些实施方案中，N-连接的α-氨基酸酯衍生物的酯衍生物可具有以下结构中的一种：C1-6烷基-O-C(＝O)-、C3-6环烷基-O-C(＝O)-、苯基-O-C(＝O)-、萘基-O-C(＝O)-和苄基-O-C(＝O)-。在一些实施方案中，R14和R15可独立地选自N-连接的丙氨酸、N-连接的丙氨酸异丙酯、N-连接的丙氨酸环己酯或N-连接的丙氨酸新戊酯。在一些实施方案中，R14和R15可各自独立地为N-连接的丙氨酸、N-连接的甘氨酸、N-缬氨酸、N-连接的亮氨酸或N-连接的异亮氨酸的C1-6烷基-O-C(＝O)-、C3-6环烷基-O-C(＝O)-、苯基-O-C(＝O)-、萘基-O-C(＝O)-或苄基-O-C(＝O)-酯。在一些实施方案中，R14和R15可为相同的。在其他实施方案中，R14和R15可为不同的。在一些实施方案中，当R7可为
Figure BDA0003208444450000291
时，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可为任选取代的膦酸二酰胺前药。
可存在于R13、R14和/或R15的合适的N-连接的α-氨基酸酯衍生物基团的示例包括以下各项：
Figure BDA0003208444450000292
Figure BDA0003208444450000293
存在于式(I)的化合物或其药学上可接受的盐上的杂环碱基B1可通过氮(任选取代的N-连接的杂环碱基)或碳(任选取代的C-连接的杂环碱基)连接。在一些实施方案中，B1可为任选取代的N-连接的杂环碱基。在一些实施方案中，B1可为任选取代的C-连接的杂环碱基。
当B1为任选取代的N-连接的杂环碱基时，B1在各种实施方案中可为任选取代的嘌呤。在其他各种实施方案中，B1可为任选取代的嘧啶。在一些实施方案中，B1可为取代的鸟嘌呤、取代的腺嘌呤、取代的胸腺嘧啶、取代的胞嘧啶或取代的尿嘧啶。在其他实施方案中，B1可为未取代的鸟嘌呤、未取代的腺嘌呤、未取代的胸腺嘧啶、未取代的胞嘧啶或未取代的尿嘧啶。
在一些实施方案中，B1可选自：
Figure BDA0003208444450000301
其中：RA2可选自氢、卤素和NHRJ2，其中RJ2可选自氢、-C(＝O)RK2和-C(＝O)ORL2；RB2可为卤素或NHRw2，其中RW2可选自氢、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基、任选取代的C3-8环烷基、-C(＝O)RM2和-C(＝O)ORN2；RC2可为氢或NHRO2，其中RO2可选自氢、-C(＝O)RP2和-C(＝O)ORQ2；RD2可选自氢、氘、卤素、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基和任选取代的C2-6炔基；RE2可选自氢、羟基、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C3-8环烷基、-C(＝O)RR2和-C(＝O)ORS2；RF2可选自氢、卤素、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基和任选取代的C2-6炔基；Y1、Y2和Y4可独立地为N(氮)或C(碳)，前提条件是Y1、Y2和Y4中的至少一者为N；Y3可为N(氮)或CRI2，其中RI2可选自氢、卤素、未取代的C1-6-烷基、未取代的C2-6-烯基和未取代的C2-6-炔基；Y5和Y6可独立地为N(氮)或CH；每个
Figure BDA0003208444450000302
可独立地为单键或双键，前提条件是单键和双键位于环中使得每个环为芳族的；RG2可为任选取代的C1-6烷基；RH2可为氢或NHRT2，其中RT2可独立地选自氢、-C(＝O)RU2和-C(＝O)ORV2；并且RK2、RL2、RM2、RN2、RP2、RQ2 RR2、RS2、RU2和RV2可独立地选自未取代的C1-6烷基、未取代的C2-6烯基、未取代的C2-6炔基、任选取代的C3-6环烷基、任选取代的C3-6环烯基、任选取代的C6-10芳基、任选取代的杂芳基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基(C1-6烷基)、任选取代的杂芳基(C1-6烷基)和任选取代的杂环基(C1-6烷基)。
合适的B1基团的示例包括以下各项：
Figure BDA0003208444450000311
Figure BDA0003208444450000312
其中RA2、RB2、RC2、RD2、RE2、RF2、RG2、RH2、Y1、Y2、Y3和Y5在本文提供。在一些实施方案中，B1可为
Figure BDA0003208444450000313
在其他实施方案中，B1可为
Figure BDA0003208444450000314
在其他实施方案中，B1可为
Figure BDA0003208444450000315
在其他实施方案中，B1可为
Figure BDA0003208444450000316
在一些实施方案中，B1可为
Figure BDA0003208444450000317
在其他实施方案中，B1可为
Figure BDA0003208444450000318
在其他实施方案中，B1可为
Figure BDA0003208444450000321
在其他实施方案中，B1可为
Figure BDA0003208444450000322
在一些实施方案中，B1可为
Figure BDA0003208444450000323
在其他实施方案中，B1可为
Figure BDA0003208444450000324
在其他实施方案中，B1可为
Figure BDA0003208444450000325
当B1为
Figure BDA0003208444450000326
时，在各种实施方案中，RG2可为未取代的乙基，并且RH2可为NH2。
当B1为任选取代的C-连接的杂环碱基时，在各种实施方案中，B1可具有结构
Figure BDA0003208444450000327
在一些实施方案中，B1可选自
Figure BDA0003208444450000328
Figure BDA0003208444450000329
例如，B1可为
Figure BDA00032084444500003210
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可具有选自以下的结构：
Figure BDA0003208444450000331
Figure BDA0003208444450000332
或前述物质中任一种的药学上可接受的盐。在该段落的一些实施方案中，B1可为任选取代的N-连接的杂环碱基。在该段落的一些实施方案中，B1可为任选取代的C-连接的杂环碱基。在该段落的一些实施方案中，B1可为任选取代的嘌呤碱基。在该段落的其他实施方案中，B1可为任选取代的嘧啶碱基。在该段落的一些实施方案中，B1可为鸟嘌呤。在该段落的其他实施方案中，B1可为胸腺嘧啶。在该段落的其他实施方案中，B1可为胞嘧啶。在该段落的其他实施方案中，B1可为尿嘧啶。在该段落的一些实施方案中，B1可为腺嘌呤。在该段落的一些实施方案中，R7可为氢。在该段落的其他实施方案中，R7可为任选取代的酰基。在该段落的其他实施方案中，R7可为单磷酸盐、二磷酸盐或三磷酸盐。在该段落的其他实施方案中，R7可为氨基磷酸酯前药，诸如芳基氨基磷酸酯前药。在该段落的一些实施方案中，R7可为酰氧基烷基酯磷酸酯前药。在该段落的其他实施方案中，R7可为S-酰基硫代乙基(SATE)前药。在其他实施方案中，R7可为膦酸二酰胺前药。在该段落的一些实施方案中，R7可为任选取代的O-连接的α-氨基酸，诸如本文所述的那些中的一种。在该段落的一些实施方案中，R6可选自卤素、氰基、任选取代的C1-4烷基、任选取代的C2-4烯基和未取代的C2-4炔基，其中当C1-4烷基或C2-4烯基被取代时，C1-4烷基和C2-4烯基独立地被至少一个卤素取代；在该段落的一些实施方案中，R6可选自氟、氰基、未取代的C1-4烷基、-(CH2)1-4F)(诸如-CH2F)、-(CH2)1-4Cl(诸如-CH2Cl)、未取代的C2-4烯基和未取代的C2-4炔基。
合适的式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的示例包括但不限于以下各项：
Figure BDA0003208444450000341
Figure BDA0003208444450000351
Figure BDA0003208444450000361
Figure BDA0003208444450000362
或前述物质中任一种的药学上可接受的盐。
合适的式(I)的化合物的附加示例包括但不限于以下各项：
Figure BDA0003208444450000363
Figure BDA0003208444450000371
Figure BDA0003208444450000372
或前述物质中任一种的药学上可接受的盐。
合适的式(I)的化合物的甚至进一步的示例包括但不限于以下各项：
Figure BDA0003208444450000381
Figure BDA0003208444450000391
Figure BDA0003208444450000392
或前述物质中任一种的药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐不是(i)的化合物或其药学上可接受的盐，其中当R1为氢；R2为氢或氟；R3为氢或氟；R4为羟基；R5为氢；R6为氢或氟；R8和R9各自为氢，并且B1选自：
Figure BDA0003208444450000401
Figure BDA0003208444450000402
时；则R7不选自：(a)氢；(b)
Figure BDA0003208444450000403
其中R10和R11各自为氢或各自不存在；(c)
Figure BDA0003208444450000404
其中R10为
Figure BDA0003208444450000405
R11、R23、R24或R25独立地不存在或为氢，并且m为0或1；以及(d)
Figure BDA0003208444450000406
其中R12为未取代的苯基或未取代的萘基，并且R13为丙氨酸异丙酯、丙氨酸异丁酯或丙氨酸新戊酯。在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐不是(ii)的化合物或其药学上可接受的盐，当R1为氢；R4为羟基；R5为氢；R6为氢；R8和R9各自为氢；B1选自：
Figure BDA0003208444450000407
Figure BDA0003208444450000411
Figure BDA0003208444450000412
时；R7选自：(a)
Figure BDA0003208444450000413
其中R10为
Figure BDA0003208444450000414
R11、R23、R24或R25独立地不存在或为氢，并且m为1；以及(b)
Figure BDA0003208444450000415
其中R12为未取代的苯基，并且R13为丙氨酸异丙酯，则(a)当R3为氟时，R2不为氢；并且(b)当R3为氢时，R2不为氟。在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐不是(iii)的化合物或其药学上可接受的盐，当R1为氢；R4为羟基；R5为氢；R6为氢；R7为氢，并且R8和R9各自为氢时；则B1不选自：
Figure BDA0003208444450000416
Figure BDA0003208444450000417
Figure BDA0003208444450000421
在一些实施方案中，B1不为尿苷。在一些实施方案中，B1不为胞嘧啶。在一些实施方案中，B1不为胸腺嘧啶。在一些实施方案中，B1不为鸟嘌呤在一些实施方案中，B1不为腺嘌呤。在一些实施方案中，B1不为取代的尿苷。在一些实施方案中，R8和R9不各自为氢。在一些实施方案中，R7不为
Figure BDA0003208444450000422
其中R12为取代或未取代的苯基或取代或未取代的萘基。在一些实施方案中，R7不为
Figure BDA0003208444450000423
其中R12为未取代的苯基或未取代的萘基；并且R13为N-连接的丙氨酸或N-连接的丙氨酸的酯衍生物(诸如N-连接的丙氨酸异丙酯、N-连接的丙氨酸异丁酯和N-连接的丙氨酸新戊酯)。在一些实施方案中，R7为氢。在一些实施方案中，R2不为氢。在一些实施方案中，R2不为氟。在一些实施方案中，R3不为氢。在一些实施方案中，R3不为氟。在一些实施方案中，当R3为氟时，R2不为氢。在一些实施方案中，当R3为氢时，R2不为氟。在一些实施方案中，R2和R3不各自为氟。在一些实施方案中，R6不为氢。在一些实施方案中，R6不为卤素(例如，氟)。在一些实施方案中，R5不为羟基。在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐不是在以下文献中提供的化合物或其药学上可接受的盐：WO 2017/040895(2017年3月9日公布)、WO 2017040892(2017年3月9日公布)、WO 2016/182936(2016年11月17日公布)、WO2016/182935(2016年11月17日公布)、WO 2016/134056(2016年8月25日公布)、WO 2016/134054(2016年8月25日公布)、WO 2017/165489(2017年9月28日公布)、WO 2015/077360(2015年5月28日公布)、美国公布号2016/0280729(2016年9月29日公布)、WO 2012/094248(2012年7月12日公布)、美国专利号9,156,874(2012年8月15日公布)、WO 2012/094248(2012年7月12日公布)、美国专利号9,095,599(2015年8月4日公布)、美国公布号US 2014/0038916(2014年2月6日公布)WO 2010/091386(2010年8月12日公布)、美国专利号8,609,627(2013年12月17日公布)、美国专利号9,173,893(2015年11月3日公布)、WO 2010/036407(2010年4月1日公布)、WO 2010/030858(2010年3月18日公布)、美国专利号8,163,707(2012年4月24日公布)、WO 2008/089105(2008年7月24日公布)、美国专利号8,440,813(2013年5月14日公布)、WO 2003/072757(2003年9月4日公布)、美国专利号7,285,658(2007年10月23日公布)、美国专利号7,598,230(2009年10月6日公布)和/或美国专利号7,807,653(2010年10月5日公布)。
现在将参考说明性合成方案来描述可用于本文所提供的方法中的示例性化合物，以用于下文的它们的一般性制备和后面的具体实施例。本领域的普通技术人员将认识到，为了获得本文的多种化合物，可适当地选择原料，使得在根据需要进行保护或不保护的情况下，在整个反应方案中将携带最终需要的取代基，以得到期望的产物。另选地，可能需要或者希望采用适宜的基团代替最终期望的取代基，所述适宜的基团可经历整个反应方案，并且在适当情况下用所期望的取代基代替。除非另外指明，否则变量均如上文针对式(I)所定义。反应可在溶剂的熔点和回流温度之间进行，并且优选在介于0℃和溶剂的回流温度之间进行。可采用常规加热或微波加热来加热反应。反应还可在密闭压力容器中在高于溶剂的正常回流温度下进行。
现在将参考说明性合成方案来描述可用于本文所提供的方法中的示例性化合物，以用于下文的它们的一般性制备和后面的具体实施例。
方案1
Figure BDA0003208444450000441
根据方案1，式(IV)的手性环戊醇化合物通过可商购获得或可合成获得的式(III)(其中Ra为三苯甲基(三苯基甲基))的环戊烯酮化合物的对称还原来制备。例如，催化手性催化剂诸如甲基-CBS催化剂和硼氢化物还原剂诸如硼烷二甲基硫醚(BMS：BH3.Me2S)产生(S)-2-((三苯甲基氧基)甲基)环戊-2-烯-1-醇。在0℃至室温范围内的温度下，在合适的溶剂诸如DMF等、四丁基碘化铵(TBAI)中，使用苄基溴或苄基氯和合适的碱金属氢化物碱诸如NaH、KH或LiH(优选NaH)对式(IV)的化合物进行苄基保护，得到苄基保护的醇。使用三氟乙酸和三乙基硅烷对三苯甲基保护基团进行去保护，之后进行后续的Bn保护，得到式(V)(其中Rb为Bn)的双苄基保护的化合物。
方案2
Figure BDA0003208444450000442
根据方案2，式(V)(其中Rb为Bn)的化合物的碳-碳双键的氧化用氧化剂进行，该氧化剂提供碳-碳双键的选择性羟基化以得到式(VIa)和(VIb)的1，2-二醇化合物。优选地，在环境温度下，在溶剂混合物诸如THF/水中，使用四氧化锇作为催化剂以及氧化剂诸如NMO(N-甲基吗啉-N-氧化物)来实现二羟基化。在合适的溶剂诸如THF等中，例如使用[氯(二苯基)甲基]苯(三苯基甲基氯、三苯甲基氯或(TrCl))、催化剂诸如AgNO3、叔有机碱诸如吡啶、可力丁等根据本领域技术人员已知的程序来实现式(VIa和VIb)的化合物的醇混合物的三苯甲基保护。随后通过在合适的溶剂诸如DCM等中用氟化剂诸如DAST处理进行氟化，得到式(VII)(其中Rb为Bn，并且Ra为Trt)的化合物。
方案3
Figure BDA0003208444450000451
根据方案3，使用本领域技术人员已知的方法，对式(VII)(其中Rb为Bn，并且Ra为Trt)的化合物进行一系列去保护和再保护步骤，得到式(VIII)(其中Rc为TBS)的化合物。例如，使用三氟乙酸/三乙基硅烷实现Trt的去保护；使用TBS-Cl/咪唑实现相应醇的TBS保护；在氢解条件下实现Bn去保护；以及最终实现TBS保护。用合适的氧化剂诸如Dess-Martin过碘烷实现式(VIII)(其中Rc为TBS)的醇化合物的氧化。在一个优选的实施方案中，在约0℃至约25℃范围内的温度下，在合适的溶剂诸如二氯甲烷等中，将式(VIII)的化合物用Dess-Martin过碘烷处理大约0.5小时至4小时的时间，得到式(IX)的化合物。在有机溶剂诸如THF、甲苯等中，使用烯烃化试剂诸如Tebbe试剂或Wittig型试剂诸如甲基三苯基溴化鏻与碱诸如叔丁醇钾、叔戊醇钾等由式(IX)的化合物制备式(X)的烯烃化合物。在一个优选的方法中，溶剂为甲苯，并且碱为叔戊醇钾。
方案4
Figure BDA0003208444450000452
根据方案4，使式(IX)(其中Rc为TBS)的化合物如前所述在Wittig型烯化反应中反应，得到式(X)的烯烃化合物。式(X)的化合物的羟基化优选地在以二氧化硒作为氧化剂的合适溶剂中进行。在约0℃至25℃范围内的温度下，在合适的溶剂诸如二氯甲烷、氯仿或吡啶或它们的混合物中，该反应在存在或不存在氢过氧化物(例如过氧化氢)或烷基氢过氧化物(例如叔丁基氢过氧化物(TBHP))的情况下进行2小时至24小时的时间，得到式(XIa)和(XIb)的化合物。通过首先用对硝基苯甲酸(PNBA)保护基团保护羟基部分，然后用氨/MeOH去保护，将式(XIa)的化合物转化为(XIb)的化合物。
以类似的方式，使(2R，3S)-3-(苄氧基)-2-((苄氧基)甲基)-2-氟环戊-1-酮如前所述在Wittig型烯化反应中反应，得到((((1R，2S)-2-(苄氧基)-1-氟-5-亚甲基环戊基)甲氧基)甲基)苯。采用前述条件的后续羟基化得到(3R，4S)-4-(苄氧基)-3-((苄氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊-1-醇。
方案5
Figure BDA0003208444450000461
根据方案5，采用本领域技术人员已知的条件，还原可商购获得或可合成获得的式(XII)(其中Rd为保护基团诸如新戊酰基(Piv)、TIPS(三异丙基甲硅烷基)等)的化合物。例如，在约-70℃的温度下，在合适的溶剂诸如THF等中，采用还原剂诸如二异丁基氢化铝(DIBAL-H)还原式(XII)的化合物，得到式(XIII)(其中Rd为Piv或TIPS(三异丙基甲硅烷基))的内半缩醛化合物。在-70℃至30℃范围内的温度下，在合适的溶剂诸如THF中，通过式(XIII)的内半缩醛化合物与乙炔基溴化镁反应制备式(XIV)的二醇化合物。在约0℃的温度下，在合适的溶剂诸如DCM中，通过与氯甲酸乙酯、碱诸如吡啶等反应来保护式(XIV)的炔丙醇化合物得到式(XV)(其中Re为CO2Et)的化合物。
在合适的有机溶剂诸如DMF、DCM等中，在存在碱诸如咪唑的情况下，通过多种合适的试剂(包括叔丁基-氯-二甲基-硅烷)来保护式(XIV)的炔丙醇化合物，得到式(XV)(其中Re为TBS)的化合物。
以类似的方式，使2，3-O-异亚丙基-β-D-呋喃核糖如前所述与乙炔基溴化镁反应，得到1-((4S，5R)-5-((R)-1-羟基-2-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)乙基)-2，2-二甲基-1，3-二氧戊环-4-基)丙-2-炔-1-醇。如前所述进行TBS保护得到(1R)-1-((4R，5R)-5-(1-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)丙-2-炔-1-基)-2，2-二甲基-1，3-二氧戊环-4-基)-2-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)乙-1-醇。
方案6
Figure BDA0003208444450000471
根据方案6，在合适的溶剂诸如DCM等中，通过式(XVI)的化合物与1，1′-硫代羰基咪唑(TCDI)反应来实现式(XVI)(其中Rd为TIPS)的化合物到式(XVII)的硫代羰基咪唑化物衍生物化合物的转化，得到式(XVII)的硫代羰基咪唑化物化合物。随后进行Barton自由基脱氧得到式(XVIII)的化合物。例如，在30℃至110℃范围内的温度下，在合适的溶剂诸如甲苯等中，使式(XVII)的化合物与自由基引发剂诸如偶氮二异丁腈(AIBN)等、三正丁基氢化锡反应，得到所需的式(XVIII)的化合物。采用本领域技术人员已知的条件对式(XVIII)的化合物进行去保护，得到式(XIXa)和(XIXb)的化合物。
方案7
Figure BDA0003208444450000481
根据方案7，采用如前所述的Dess-Martin过碘烷条件氧化式(XV)(其中Rd为新戊酰基(Piv)，并且Rc为TBS)的化合物。随后采用如前所述的条件对α-羟基酮化合物进行烯化，得到式(XX)的化合物。例如，在合适的溶剂诸如THF中，与溴甲基三苯基膦、碱诸如n-BuLi反应，得到式(XX)的化合物。在0℃至45℃范围内的温度下，在合适的溶剂诸如DCM中，用试剂诸如m-CPBA等实现式(XX)的化合物的末端烯烃的环氧化，得到式(XXI)的化合物。
以类似的方式，采用如前所述的Dess-Martin过碘烷条件氧化(1R)-1-((4R，5R)-5-(1-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)丙-2-炔-1-基)-2，2-二甲基-1，3-二氧戊环-4-基)-2-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)乙-1-醇，得到1-((4S，5R)-5-((S)-1-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)丙-2-炔-1-基)-2，2-二甲基-1，3-二氧戊环-4-基)-2-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)乙-1-酮。在如前所述的条件下对1-((4S，5R)-5-((S)-1-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)丙-2-炔-1-基)-2，2-二甲基-1，3-二氧戊环-4-基)-2-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)乙-1-酮进行烯化，得到叔丁基(((S)-1-((4R，5R)-5-(3-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)丙-1-烯-2-基)-2，2-二甲基-1，3-二氧戊环-4-基)丙-2-炔-1-基)氧基)二甲基硅烷。在如前所述的条件下对叔丁基(((S)-1-((4R，5R)-5-(3-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)丙-1-烯-2-基)-2，2-二甲基-1，3-二氧戊环-4-基)丙-2-炔-1-基)氧基)二甲基硅烷进行环氧化，得到叔丁基(((1S)-1-((4R，5S)-5-(2-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)环氧乙烷-2-基)-2，2-二甲基-1，3-二氧戊环-4-基)丙-2-炔-1-基)氧基)二甲基硅烷。
方案8
Figure BDA0003208444450000491
根据方案8，在存在Mn/2，4，6-可力丁HCl或Zn/2，4，6-可力丁/三甲基甲硅烷基氯的情况下，使用二氯二茂钛(Cp2TiCl2)作为催化剂，使式(XXI)(其中Rd为Piv，并且Rc为TBS)的化合物进行催化自由基环化，得到式(XXIIa)和(XXIIb)的化合物。在合适的溶剂诸如DCM等中，在存在吡啶、二甲基吡啶或2，4，6-三甲基吡啶(可力丁)、AgNO3的情况下，通过与4，4′-二甲氧基三苯甲基氯(DMTrCl)反应来实现DMTr保护。采用本领域技术人员已知的条件对TBS保护基团进行去保护，得到式(XIIIa)和(XIIIb)(其中Rd为Piv，并且Rf为DMTr)的化合物。
以类似的方式，使叔丁基(((1S)-1-((4R，5S)-5-(2-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)环氧乙烷-2-基)-2，2-二甲基-1，3-二氧戊环-4-基)丙-2-炔-1-基)氧基)二甲基硅烷如前所述进行催化自由基环化，得到((3aR，4S，6S，6aR)-6-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-4-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)-2，2-二甲基-5-亚甲基四氢-4H-环戊并[d][1，3]二氧杂环戊烯-4-基)甲醇。
方案9
Figure BDA0003208444450000492
根据方案9，在如前所述的条件下氧化式(XXIV)(其中Rg为MMTr(单甲氧基三苯甲基)，并且Rc为TBS)的醇化合物，得到醛中间体。随后采用本领域技术人员已知的条件形成肟，得到式(XXV)的化合物。例如，在溶剂诸如吡啶中，使醛中间体与羟胺盐酸盐反应，得到式(XXV)的醛肟化合物。采用常规的肟脱水方法对式(XXV)的肟化合物进行脱水。例如，在0℃至30℃范围内的温度下，在合适的溶剂诸如ACN等中，使式(XXV)的肟化合物与1，1′-羰基二咪唑(CDI)反应，得到式(XXVI)(其中Rg为MMTr(单甲氧基三苯甲基)，并且Rc为TBS)的腈化合物。
以类似的方式，采用如前所述的条件氧化1-((1S，3S，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮，得到(1S，3S，5S)-5-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲醛。采用如前所述的条件形成肟，得到(E)-5-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲醛肟。对肟进行脱水得到(1S，3S，5S)-5-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲腈。
方案10
Figure BDA0003208444450000501
根据方案10，采用本领域技术人员已知的或如前所述的条件，使式(XXVI)(其中Rg为MMTr(单甲氧基三苯甲基)并且Rc为TBS)的环状缩醛化合物进行去保护和再保护，以形成式(XXVII)(其中Rh为Bz(苯甲酰基))的环状甲硅烷基醚化合物。由式(XXVII)的化合物两步形成式(XXVIII)的化合物。在第一步中，采用如前所述的条件形成硫代羰基咪唑化物，然后采用如前所述的条件进行第二步自由基脱氧，得到式(XXVIII)(其中Rh为Bz(苯甲酰基))的化合物。采用本领域技术人员已知的条件对苯甲酰基保护基团进行去保护，得到(6aS，8R，9aS)-8-羟基-2，2，4，4-四异丙基-7-亚甲基四氢环戊并[f][1，3，5，2，4]三氧杂二硅辛-6a(6H)-甲腈。
方案11
Figure BDA0003208444450000511
采用已确立的方法(诸如T.W.Greene and P.G.M.Wuts，″Protective Groups inOrganic Synthesis，″第3版，John Wiley&Sons，1999中所述的那些方法)对可商购获得或可合成获得的式环B的核碱基、经修饰的核碱基或核碱基类似物进行保护(和去保护)。
例如，在溶剂诸如THF等中，采用苯甲酰氯(BzCl)、碱诸如吡啶对胸腺嘧啶进行苯甲酰基保护，得到双Bz保护的1，3-二苯甲酰基-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮。在溶剂诸如二氧杂环己烷中，使用K2CO3来实现Bz保护基团中的一个的选择性去保护，得到3-苯甲酰基-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮。
在本领域技术人员已知的条件下实现7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-胺的环外氨基基团的选择性氨基甲酸酯保护。例如，在合适的溶剂诸如THF等中，使7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-胺与二碳酸二叔丁酯(Boc2O)、DMAP反应，得到三-BOC保护的化合物N，N，N-Tri-BOC-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-胺。在合适的溶剂诸如MeOH中，使用NaHCO3水溶液来实现BOC保护基团中的一个BOC保护基团的选择性温和去保护，得到N，N-Di-BOC-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-胺。
在合适的溶剂诸如DMF中，在30℃至155℃范围内的温度下，通过例如用异丁酸酐处理约4小时的时间来选择性地保护鸟嘌呤的环外胺，得到N-(6-氧代-6，9-二氢-1H-嘌呤-2-基)异丁酰胺。在合适的溶剂诸如DMF中，采用选自酰基衍生物、酰基卤(诸如乙酰氯等)和酸酐(诸如乙酸酐、丙酸酐等)的酰化试剂对N-(6-氧代-6，9-二氢-1H-嘌呤-2-基)异丁酰胺进行酰化，得到N-(9-乙酰基-6-氧代-6，9-二氢-1H-嘌呤-2-基)异丁酰胺。通过使用例如二苯基氨基甲酰氯将N-(9-乙酰基-6-氧代-6，9-二氢-1H-嘌呤-2-基)异丁酰胺的4-氧代部分保护为二苯基氨基甲酸酯物质，得到9-乙酰基-2-异丁酰胺基-9H-嘌呤-6-基二苯基氨基甲酸酯。在约100℃的温度下在EtOH/水中实现乙酰基保护基团的去保护，持续约2小时的时间，得到2-异丁酰胺基-9H-嘌呤-6-基二苯基氨基甲酸酯。
根据方案11，在Mitsonobu条件下，使式(XXXIV)的化合物(以及式(XIa)、(XIb)、(XIXa)、(XIXb)、(XXIIIa)、(XXIIIb)和(6aS，8R，9aS)-8-羟基-2，2，4，4-四异丙基-7-亚甲基四氢环戊并[f][1，3，5，2，4]三氧杂二硅辛-6a(6H)-甲腈)(其中PG为合适的保护基团，并且R1a为H、F、CH2O-DMTr、CN)与环B(其中环B为氮连接的核碱基、经修饰的核碱基或核碱基类似物)反应。例如，在25℃至110℃范围内的温度下，在溶剂诸如THF、ACN、二氧杂环己烷或它们的混合物中，使用三苯基膦、碱诸如偶氮二甲酸二叔丁酯(DIAD)、偶氮二甲酸二乙酯(DEAD)等，得到式(XXXV)的化合物。
方案12
Figure BDA0003208444450000521
采用方案9中所述的方法，采用如前所述的条件氧化式(XXIX)(其中Rf为DMTr，并且环B为氮连接的核碱基、经修饰的核碱基或核碱基类似物)的化合物。如前所述的肟形成和脱水方法得到式(XXX)的氰基化合物。
方案13
Figure BDA0003208444450000531
根据方案13，在合适的溶剂诸如DCM等中，用三氟甲磺酸酐(TfO2)、吡啶活化式(XXXI)的醇化合物(其中Rd为Piv，并且环B为氮连接的核碱基、经修饰的核碱基或核碱基类似物，诸如6-氯-912-嘌呤、腺嘌呤、胸腺嘧啶、尿嘧啶等(各自任选地被合适的保护基团诸如Bz、BOC等保护))，得到式(XXXII)的化合物。随后采用本领域技术人员已知的方法使式(XXXII)的磺酸盐化合物进行亲核取代反应，得到式(XXXIIII)的化合物。例如，在合适的溶剂诸如THF等中，与四丁基氟化铵(TBAF)反应得到式(XXXIII)(其中Hal为F)的化合物。在约40℃的温度下，在溶剂诸如DMF等中，使式(XXXII)的化合物与LiCl反应，得到式(XXXIII)(其中Hal为Cl)的化合物。
方案14
Figure BDA0003208444450000532
根据方案14，通过以下过程由(XXXIII)(其中Rd为Piv，Hal为F，并且环B为核碱基尿嘧啶)的化合物制备4-氨基-1-((1S，3S，4S)-3-(氟甲基)-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)嘧啶-2(1H)-酮：首先在合适的溶剂诸如乙腈等中，在存在二甲基氨基吡啶(DMAP)的情况下，与2，4，6-三异丙基苯磺酰氯(TPSCl)反应；随后在约10℃至50℃范围内的温度下，在存在合适的惰性有机溶剂的情况下，用氢氧化铵、NH3·H2O或强胺氨解1小时至12小时。采用本领域技术人员已知的且如所述的条件对Piv保护基团进行去保护，得到4-氨基-1-((1S，3S，4S)-3-(氟甲基)-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)嘧啶-2(1H)-酮。
在约10℃至50℃范围内的温度下，在合适的溶剂诸如THF中，在例如与氨反应的氨解条件下，使式(XXXIII)(其中Rd为Piv，Hal为F，并且环B为核碱基类似物6-氯-9λ2-嘌呤)的化合物反应约1小时至12小时。随后对Piv保护基团进行去保护得到(1S，2S，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-(氟甲基)-2-(羟甲基)-3-亚甲基环戊-1-醇。
方案15
Figure BDA0003208444450000541
按照已确立的方法(诸如T.W.Greene和P.G.M.Wuts，″Protective Groups inOrganic Synthesis″第3版，John Wiley&Sons，1999中所述的那些方法)对具有保护基团的式(XXXV)的化合物进行去保护，得到式(I)的化合物。
例如，在标准酸性条件(诸如TFA、HCl等)下裂解具有BOC保护基团的化合物。采用四丁基氟化铵(TBAF)来实现TBS的去保护。在-2℃至100℃、优选25℃至80℃的温度下，用氨或碱金属醇盐的醇溶液、优选氨的甲醇溶液或醇钠的甲醇溶液中实现Bz的去保护，持续5分钟至3天、优选30分钟至4小时的时间。在氢解条件下实现苄基基团的去保护。在碱性条件(诸如将酯暴露于甲醇钠、NaOH/MeOH等的甲醇溶液)下实现酯(Piv、CO2Et等)裂解。在本领域技术人员已知的条件下实现单甲氧基三苯甲基(MMtr)和4，4-二甲氧基三苯甲基(DMTr)的温和脱三苯甲基化。例如，在室温下，在合适的溶剂诸如DCM等中，采用酸诸如三氯乙酸(TCA)、三氟乙酸(TFA)等，持续1小时至3小时的时间。在中性或温和碱性条件(诸如NaOH/MeOH下)实现氨基甲酸异丁酯的去保护。
方案16
Figure BDA0003208444450000551
根据方案16，采用本领域技术人员已知的条件由式(I)的核苷化合物制备式(IB)的三磷酸核苷化合物。例如，式(I)的核苷与磷酸三甲酯、磷酸三乙酯等、磷酰氯以及N-甲基咪唑反应，得到相应的单磷酸核苷中间体。单磷酸核苷与焦磷酸的四丁基铵盐在合适的溶剂诸如DMF等中进行后续反应，得到式(IB)的三磷酸酯。
方案17
Figure BDA0003208444450000552
根据方案17，通过以下过程制备式(IC)的芳氧基氨基磷酸酯核苷前药化合物：将式(I)的核苷化合物与氯磷酸酯偶联，该偶联过程通过用NMI(N-甲基咪唑)激活咪唑鎓中间体或通过用isoPrMgCl、t-BuMgCl等对核苷进行5′-去质子化随后用氯氨基磷酸酯取代来进行。值得注意的是，这些不同的合成方法一般产生作为磷中心处的非对映异构体(Sp和Rp异构体)的式(IC)的化合物的大约1∶1混合物；其中Ri为C1-8烷基。
式(I)的化合物可使用本领域普通技术人员已知的方法转变成它们相应的盐。例如，将式(I)的胺用三氟乙酸、HCl或柠檬酸在诸如Et2O、CH2Cl2、THF、MeOH、氯仿或异丙醇的溶剂中进行处理，以提供相应的盐形式。或者，通过反相HPLC纯化条件，获得三氟乙酸或甲酸盐。用极性溶剂(包括极性溶剂的混合物和极性溶剂的水性混合物)或用非极性溶剂(包括非极性溶剂的混合物)，通过重结晶可以获得式(I)的化合物的药学上可接受的盐的结晶形式。
如果根据本发明的化合物具有至少一个手性中心，则它们可以对映体形式相应地存在。如果化合物具有两个或更多个手性中心，则它们另外可以非对映体形式存在。应当理解，所有的此类异构体及其混合物涵盖在本发明的范围内。
根据上述方案制备的化合物可以通过形式特异性合成或者通过拆分来作为单一形式，诸如单一对映体获得。作为另外一种选择，根据上述方案制备的化合物可作为各种形式的混合物，诸如外消旋混合物(1∶1)或非外消旋混合物(非1∶1)获得。在获得对映体的外消旋混合物和非外消旋混合物的情况中，可以使用本领域普通技术人员已知的常规分离方法如手性层析、重结晶、非对映体盐形成法、衍生成非对映体加合物、生物转化或酶促转化来分离单一对映体。在获得区域异构体混合物或非对映体混合物的情下，如适用，可以使用常规方法如层析法或结晶来分离单一异构体。
在一些实施方案中，改变本文所述的化合物(诸如式(I)的化合物，或其药学上可接受的盐)上的取代基，可导致磷为手性中心。在一些实施方案中，磷可以呈(R)-构型。在一些实施方案中，磷可以呈(S)-构型。两种构型的示例为：
Figure BDA0003208444450000561
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可以富含关于磷的(R)或(S)构型。例如，关于磷原子的(R)和(S)构型中的一种相比于关于磷原子的(R)和(S)构型中的另一种的量可以＞50％、≥75％、≥90％、≥95％或≥99％的量存在。
通过中和式(I)的膦酸酯部分或其要学上可接受的盐上的电荷，由于化合物的亲油性增加，可以促进细胞膜的渗透。一旦在细胞内吸收和获取，连接到磷的基团就可容易地通过酯酶、蛋白酶和/或其他酶移除。在一些实施方案中，连接到磷的基团可通过简单水解移除。在细胞内，由此释放的膦酸酯可被细胞酶代谢为单磷酸酯或活性二磷酸酯(例如，膦酰基二磷酸酯)。此外，在一些实施方案中，改变本文所述的化合物(诸如式(I)的化合物，或其药学上可接受的盐)上的取代基，可有助于通过减少不可取的效应来维持化合物的功效。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可用作病毒的链终止子并抑制病毒的复制，其中所述病毒可为HBV、HDV和/或HIV。例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可结合到病毒(诸如HBV、HDV和/或HIV)的DNA链中，然后观察不到进一步的伸长发生。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可具有增加的代谢和/或血浆稳定性。在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可更耐水解和/或更耐酶转化。例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可具有增加的代谢稳定性、增加的血浆稳定性，和/或可更耐水解。在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可具有改善的特性。示例性特性的非限制性列表包括但不限于增加的生物学半衰期、增加的生物利用率、增加的效能、持续的体内反应、增加的给药间隔、减小的给药量、减小的细胞毒性、用于治疗病症所需的量减少、病毒载量减少、血浆病毒载量减少、CD4+T淋巴细胞计数增加、血清转化时间减少(即病毒血清中检测不到病毒)、增加的持续病毒反应、临床结果的发病率或死亡率降低、机会性感染的减少或预防、增加的受治疗者依从性和与其它药物的相容性。在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可具有大于24小时的生物半衰期。在一些实施方案中，相比于当前的标准护理，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可具有更强的抗病毒活性(例如，HIV、HBV和/或HDV复制子测定中的较低EC50)。
药物组合物
本文所述的一些实施方案涉及药物组合物，所述药物组合物可包含有效量的一种或多种本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)以及药学上可接受的载体、稀释剂、赋形剂或它们的组合。
在一些实施方案中，药物组合物可包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的单一非对映体(例如，相比于其它非对映体的总浓度，单一非对映体以大于99％的浓度存在于药物组合物中)。在其他实施方案中，药物组合物可包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的非对映体的混合物。例如，相比于其他非对映体的总浓度，药物组合物可包含＞50％、≥60％、≥70％、≥80％、≥90％、≥95％或≥98％的一种非对映体的浓度。在一些实施方案中，药物组合物包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的两种非对映体的1∶1混合物。
术语″药物组合物″是指本文公开的一种或多种化合物与其他化学组分(诸如，稀释剂或载体)的混合物。药物组合物有助于将化合物施用于生物体。药物组合物也可通过使化合物与无机或有机酸(诸如，盐酸、氢溴酸、硫酸、硝酸、磷酸、甲磺酸、乙磺酸、对甲苯磺酸和水杨酸)反应而获得。一般将根据特定的预期施用途径来调整药物组合物。药物组合物适用于人和/或兽医应用。
术语″生理上可接受的″定义了不消除化合物的生物活性和特性的载体、稀释剂或赋形剂。
如本文所用，″载体″是指促进化合物并入细胞或组织中的化合物。例如但不限于，二甲基亚砜(DMSO)是促进许多有机化合物摄入受试者的细胞或组织中的常用载体。
如本文所用，″稀释剂″是指药物组合物中缺乏药理活性但可能是药学上必需的或需要的成分。例如，稀释剂可用于增加对于制备和/或施用而言质量太小的强效药物的体积。稀释剂还可为用于溶解待通过注射、摄入或吸入而施用的药物的液体。本领域中稀释剂的常见形式是缓冲水溶液，诸如但不限于模拟人类血液组成的磷酸盐缓冲盐水。
如本文所用，″赋形剂″是指添加到药物组合物中以为组合物提供(但不限于)体积、稠度、稳定性、结合能力、润滑性、崩解能力等的惰性物质。″稀释剂″是一类赋形剂。
本文所述的药物组合物可按原样或以药物组合物施用于人类患者，在以药物组合物施用时，它们与其他活性成分(如在联合治疗中)或载体、稀释剂、赋形剂或它们的组合混合。合适的制剂取决于所选择的施用途径。本文所述的化合物的配制和施用技术是本领域技术人员已知的。
本文公开的药物组合物可以本身已知的方式(例如，通过常规混合、溶解、制粒、制糖衣、研磨、乳化、包封、包埋或制锭方法)制备。此外，含有有效量的活性成分以实现其预期的目的。用于本文公开的药物组合中的许多化合物可作为盐与药学上相容的抗衡离子一起提供。
本领域存在多种施用化合物的技术，包括但不限于口服递送、直肠递送、局部递送、气雾剂递送、注射递送和肠胃外递送，肠胃外递送包括肌内注射、皮下注射、静脉内注射、髓内注射、囊内注射、直接心室内注射、腹膜内注射、鼻内注射和眼内注射。
还可以局部方式而非系统方式施用化合物，例如通常通过将化合物以贮库或持续释放制剂的形式直接注射到感染区域中。此外，可以靶向药物递送系统(例如，以用组织特异性抗体包覆的脂质体)施用化合物。脂质体可被靶向器官并且被器官选择性摄取。
如果需要，组合物可存在于包装或分配器装置中，该包装或分配器装置可包含一种或多种含有活性成分的单位剂量。包装可例如包括金属或塑料箔，诸如泡罩包装。包装或分配器装置可附有施用说明书。包装或分配器还可附有与管理药物的生产、使用或销售的政府机构所规定的形式的容器有关的注意事项，其中注意事项反映了该机构批准药物施用于人类或兽类的形式。此类注意事项例如可为经美国食品药品监督管理局批准的处方药的标签或批准的产品插页。也可制备在相容的药物载体中配制的包含本文所述的化合物的组合物，将该组合物放置在合适的容器中并且标记用于治疗指定的病症。
使用方法
本文所公开的一些实施方案涉及治疗和/或改善疾病或病症的方法，所述方法可包括向受治疗者施用有效量的一种或多种本文所述的化合物，诸如式(I)的化合物或其药学上可接受的盐、或包含本文所述的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物。本文所公开的其它实施方案涉及治疗和/或改善疾病或病症的方法，所述方法可包括向鉴定为患有疾病或病症的受治疗者施用有效量的一种或多种本文所述的化合物，诸如式(I)的化合物或其药学上可接受的盐、或包含本文所述的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物。
本文所述的一些实施方案涉及治疗HBV和/或HDV感染的方法，该方法可包括向鉴定为患有该HBV和/或HDV感染的受试者施用有效量的本文所述的化合物(例如式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)、或包含有效量的本文所述的化合物(诸如式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物。本文所述的其他实施方案涉及使用本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)用于制造用于治疗HBV和/或HDV感染的药物。本文所述的其他实施方案涉及本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)或包含本文所述的化合物(诸如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物用于治疗HBV和/或HDV感染的用途。
本文所公开的一些实施方案涉及治疗HBV和/或HDV感染的方法，该方法可包括使感染上HBV和/或HDV的细胞与有效量的本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)、或包含有效量的本文所述的化合物的药物组合物接触。本文所述的其他实施方案涉及使用本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)用于制造用于治疗HBV和/或HDV感染的药物，该治疗可包括使感染上HBV和/或HDV的细胞与有效量的所述化合物和/或本文所述的药物组合物接触。本文所述的其他实施方案涉及本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)、或包含本文所述的化合物的药物组合物用于治疗HBV和/或HDV感染的用途，其中所述用途包括使感染上HBV和/或HDV的细胞与有效量的所述化合物和/或本文所述的药物组合物接触。
本文所公开的一些实施方案涉及抑制HBV和/或HDV的复制的方法，该方法可包括使感染上HBV和/或HDV的细胞与有效量的本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)、或包含本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物接触。本文所述的其他实施方案涉及使用本文所述的化合物(诸如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)用于制造用于抑制HBV和/或HDV的复制的药物，该治疗可包括使感染上HBV和/或HDV的细胞与有效量的所述化合物和/或本文所述的药物组合物接触。本文所述的其他实施方案涉及本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)、或包含有效量的本文所述的化合物(诸如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物用于抑制HBV和/或HDV的复制的用途，其中所述用途包括使感染上HBV和/或HDV的细胞与有效量的所述化合物和/或本文所述的药物组合物接触。
在一些实施方案中，HBV感染可为急性HBV感染。在一些实施方案中，HBV感染可为慢性HBV感染。
本文所公开的一些实施方案涉及治疗因为HBV和/或HDV感染而发展的肝硬化的方法，该方法可包括向患有肝硬化的受试者施用和/或使患有肝硬化的受试者中的感染上HBV和/或HDV的细胞与有效量的本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)、或包含有效量的本文所述的化合物的药物组合物接触。本文所述的其他实施方案涉及使用本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)用于制造用于用有效量的所述化合物和/或本文所述的药物组合物治疗肝硬化的药物。本文所述的其他实施方案涉及本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)或包含本文所述的化合物的药物组合物用于治疗肝硬化的用途。
本文所公开的一些实施方案涉及治疗因为HBV和/或HDV感染而发展的肝癌(诸如肝细胞癌)的方法，该方法可包括向患有肝癌的受试者施用和/或使患有肝癌的受试者中的感染上HBV和/或HDV的细胞与有效量的本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)、或包含有效量的本文所述的化合物的药物组合物接触。本文所述的其他实施方案涉及使用本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)用于制造用于用有效量的所述化合物和/或本文所述的药物组合物治疗肝癌(诸如肝细胞癌)的药物。本文所述的其他实施方案涉及本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)或包含本文所述的化合物的药物组合物用于治疗肝癌(诸如肝细胞癌)的用途。
本文所公开的一些实施方案涉及治疗因为HBV和/或HDV感染而发展的肝功能衰竭的方法，该方法可包括向患有肝功能衰竭的受试者施用和/或使患有肝功能衰竭的受试者中的感染上HBV和/或HDV的细胞与有效量的本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)、或包含有效量的本文所述的化合物的药物组合物接触。本文所述的其他实施方案涉及使用本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)用于制造用于用有效量的所述化合物和/或本文所述的药物组合物治疗肝功能衰竭的药物。本文所述的其他实施方案涉及本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)或包含本文所述的化合物的药物组合物用于治疗肝功能衰竭的用途。
用于确定治疗HBV和/或HDV感染的方法的有效性的各种指标也是本领域技术人员已知的。合适的指标的示例包括但不限于由HBV DNA(或载量)、HBV表面抗原(HBsAg)和HBVe-抗原(HBeAg)减少所指示的病毒载量减少、血浆病毒载量减少、病毒复制减少、血清转换时间减少(病人血清中检测不到病毒)、病毒对治疗的持续反应率增加、肝功能改善、和/或临床结果发病率或死亡率降低。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的有效量为将HBV和/或HDV病毒载量有效减少至不可检测的水平，例如减少到约10至约50、或约15至约25国际单位/mL血清，或小于约20国际单位/mL血清的量。在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的有效量为相比于提供式(I)的化合物或其药学上可接受的盐之前的HBV和/或HDV病毒载量，有效减少HBV和/或HDV病毒载量的量。在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的有效量可为将HBV和/或HDV病毒载量减少至低于约20国际单位/mL血清的量。在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的有效量为与提供本文所述的式(I)的化合物或其药学上可接受的盐之前的病毒载量相比，有效实现受治疗者血清中的HBV和/或HDV病毒载量减少至检测不到的含量和/或在约1.5-log至约2.5-log、约3-log至约4-log范围内或大于约5-log范围内的量。例如，可在提供式(I)的化合物或其药学上可接受的盐之前测量HBV和/或HDV病毒载量，并且在完成利用式(I)的化合物，或其药学上可接受的盐的治疗方案的至少一部分之后(例如，引发或完成之后1个月)再次测量HBV和/或HDV病毒载量。
在一些实施方案中，相对于受治疗者的治疗前水平，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可导致HBV和/或HDV的复制减少至少1、2、3、4、5、10、15、20、25、50、75、100倍或更多，如在完成治疗方案或完成治疗方案的至少一部分之后(例如在引发或完成之后1个月)所测定的。在一些实施方案中，相对于治疗前的水平，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可导致HBV和/或HDV的复制的减少在多于1倍、约2至约5倍、约10至约20倍、约15至约40倍或约50至约100倍的范围内。在一些实施方案中，相比于根据标准护理施用的由HBV和/或HDV的标准护理所实现的HBV和/或HDV复制的减少，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可导致HBV和/或HDV复制的减少在多于0.5log、1至1.5log、1.5log至2log、2log至2.5log、2.5至3log、3log至3.5log或3.5至4log以上的范围内，或相比于在标准护理治疗六个月之后实现的减少，可在较短时间段内，例如在一个月内、两个月内、或三个月内，实现与标准护理治疗相同的减少。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的有效量为有效实现持续病毒反应的量，例如在治疗停止之后，不可检测或基本上不可检测的HBV和/或HDV DNA载量(例如，小于约25、或小于约15国际单位/毫升血清)存在于受治疗者的血清中并持续至少约一个月、至少约两个月、至少约三个月、至少约四个月、至少约五个月、或至少约六个月的时间。
在一些实施方案中，相比于未治疗的受试者或安慰剂治疗的受试者中用标准护理治疗的受试者的病毒载量，有效量的式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可将HBV和/或HDV病毒载量减少至少约10％、至少约20％、至少约25％、至少约30％、至少约35％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约55％、至少约60％、至少约65％、至少约70％、至少约75％、或至少约80％或更多。检测HBV和/或HDV病毒载量的方法是本领域技术人员已知的，并且包括基于免疫学方法，例如酶联免疫吸附测定法(ELISA)、放射免疫测定法等，其检测HBV和/或HDV抗体以及指示HBV和/或HDV病毒载量的其它标记、以及它们的组合。
本文所述的一些实施方案涉及抑制HIV活性的方法，所述方法可包括使由HIV感染的细胞与有效量的式(I)的化合物或其药学上可接受的盐接触。本文所述的一些实施方案涉及抑制HIV活性的方法，所述方法可包括向由HIV感染的受治疗者施用有效量的式(I)的化合物或其药学上可接受的盐。在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可抑制病毒逆转录酶，并且因此抑制HIV RNA向DNA的转录。在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可抑制HIV整合酶。在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可抑制病毒包壳糖蛋白120(gp 120)。
本文所述的一些实施方案涉及治疗HIV感染的方法，该方法可包括向鉴定为患有该HIV感染的受试者施用有效量的本文所述的化合物(例如式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)、或包含有效量的本文所述的化合物(诸如式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物。本文所述的其他实施方案涉及使用本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)用于制造用于治疗HIV感染的药物。本文所述的其他实施方案涉及本文所述的化合物(诸如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)或包含本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物用于治疗HIV感染的用途。
本文所公开的一些实施方案涉及治疗HIV感染的方法，该方法可包括使感染上HIV的细胞与有效量的本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)、或包含有效量的本文所述的化合物的药物组合物接触。本文所述的其他实施方案涉及使用本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)用于制造用于治疗HIV感染的药物，该治疗可包括使感染上HIV的细胞与有效量的所述化合物和/或药物组合物接触。本文所述的其他实施方案涉及本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)、或包含本文所述的化合物的药物组合物用于治疗HIV感染的用途，其中所述用途包括使感染上HIV的细胞与有效量的所述化合物和/或药物组合物接触。
本文所公开的一些实施方案涉及抑制HIV的复制的方法，该方法可包括使感染上HIV的细胞与有效量的本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)、或包含本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物接触。本文所述的其他实施方案涉及使用本文所述的化合物(诸如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)用于制造用于抑制HIV的复制的药物，该治疗可包括使感染有HIV的细胞与有效量的所述化合物和/或药物组合物接触。本文所述的其他实施方案涉及本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)、或包含有效量的本文所述的化合物(诸如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物用于抑制HIV的复制的用途，其中所述用途包括使感染上HIV的细胞与有效量的所述化合物和/或药物组合物接触。
在本文所述的一些实施方案中，当感染由HIV引起，和/或病毒是HIV时，受治疗者患有机会性感染(OI)。OI利用受治疗者免疫功能低下。在本文所述的一些实施方案中，CD4+T淋巴细胞计数小于约200个细胞/mL的受治疗者形成OI的风险增加。在一些实施方案中，当CD4+T淋巴细胞计数小于约500个细胞/mL时，发生OI。在一些实施方案中，当HIV病毒载量大于约100,000个拷贝/mL时，发生OI。在一些实施方案中，HIV病毒载量和/或CD4+T淋巴细胞计数可通过常规标准护理方法来确定，例如，通过用于检测HIV抗体和/或HIV p24抗原的HIV免疫测定检测试验(HIV immunoassay detection assays)。
本文所述的一些实施方案涉及治疗选自下列的与HIV感染有关的OI的方法：念珠菌病、支气管炎、肺炎、食管炎、浸润性宫颈癌、球孢子菌病、隐球菌病、慢性肠隐孢子虫病、巨细胞病毒病、脑病、单纯疱疹、组织胞浆菌病、慢性肠道等孢球虫病、卡波西肉瘤、淋巴瘤、鸟分枝杆菌复症、肺结核、卡氏肺囊虫(pneumocystis carinii)肺炎、进行性多灶性脑白质病、沙门氏菌败血症、脑的弓形体病、以及患有上述病症中的一种或多种的受试者的消耗综合征，所述方法可包括向所述受试者提供有效量的本文所述的化合物或药物组合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)。本文所述的一些实施方案涉及预防和治疗具有HIV感染的受治疗者中的一种或多种OI的方法，所述方法可包括向受治疗者提供有效量的本文所述的化合物或药物组合物(例如，式(I)的化合物、或其药学上可接受的盐)。还设想了用于减少或消除具有HIV感染的患者中的一种或多种OI的方法，其通过向受治疗者提供有效量的本文所述的化合物或药物组合物(例如，式(I)的化合物、或其药学上可接受的盐)来进行。在一些实施方案中，该方法可包括减慢或停止OI的进展。在其它实施方案中，可逆转OI的过程，并且设想感染的停滞或改善。在一些实施方案中，可通过使被HIV感染的细胞与有效量的本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)接触来治疗下列中的一种或多种：念珠菌病、支气管炎、肺炎、食管炎、浸润性宫颈癌、球孢子菌病、隐球菌病、慢性肠隐孢子虫病、巨细胞病毒病、脑病、单纯疱疹、组织胞浆菌病、慢性肠道异孢子虫、卡波西肉瘤、淋巴瘤、鸟分枝杆菌复症、肺结核、卡氏肺孢子虫肺炎、进行性多灶性白质脑病、沙门氏菌败血症、脑的弓形虫病、以及消耗综合征。
已经表征了两种类型的HIV，HIV-1和HIV-2。HIV-1具有更大毒性和更大感染性，并且具有全球流行性，然而HIV-2具有较少毒性并且是地理位置受限的。在一些实施方案中，有效量的式(I)的化合物或其药学上可接受的盐，或包含有效量的式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物可有效治疗HIV-1。在一些实施方案中，有效量的式(I)的化合物或其药学上可接受的盐，或包含有效量的式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物可有效治疗HIV-2。在一些实施方案中，本文所述的化合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)可有效治疗HIV的两种基因型(HIV-1和HIV-2)。
用于确定治疗HIV感染的方法的有效性的各种指标是本领域技术人员已知的。合适指标的示例包括但不限于病毒载量减少、血浆病毒载量减少，CD4+T淋巴细胞计数增加、病毒复制减少、血清转化时间减少(患者血清中检测不到病毒)、病毒对治疗的持续反应率增加、临床结果中的发病率或死亡率的减少和/或机会性感染率减少。类似地，利用有效量的本文所述的化合物或药物组合物(例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐)的成功治疗可减低HIV感染的受治疗者的机会性感染的发生率。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的有效量为将HIV病毒滴度有效减少至不可检测的水平，例如减少到约10至约50、或约15至约25国际单位/mL血清，或小于约20国际单位/mL血清的量。在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的有效量为相比于提供式(I)的化合物或其药学上可接受的盐之前的HIV病毒载量，有效减少HIV病毒载量的量。在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的有效量可为将HIV病毒载量减少至低于约20国际单位/mL血清的量。在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的有效量为与提供本文所述的式(I)的化合物或其药学上可接受的盐之前的病毒载量相比，有效实现受治疗者血清中的HIV病毒滴度减少在约1.5-log至约2.5-log、约3-log至约4-log范围内或大于约5-log范围内的量。例如，可在提供式(I)的化合物或其药学上可接受的盐之前测量HIV病毒载量，并且在完成利用式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的治疗方案之后(例如，完成之后1个月)再次测量HIV病毒载量。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的有效量为将CD4+T淋巴细胞计数从小于约200个细胞/mL有效增加至大于约1200个细胞/mL的量。在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的有效量为将CD4+T淋巴细胞计数从小于约200个细胞/mL有效增加至大于约500个细胞/mL的量。
在一些实施方案中，相对于受治疗者的治疗前水平，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可导致人体免疫缺损病毒的复制减少至少1、2、3、4、5、10、15、20、25、50、75、100倍或更多，如在完成治疗方案之后(例如完成之后1个月)所测定的。在一些实施方案中，相对于治疗前的水平，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可导致人体免疫缺陷病毒的复制的减少在约2至约5倍、约10至约20倍、约15至约40倍或约50至约100倍的范围内。在一些实施方案中，相比于由标准护理治疗(诸如包括利托那韦与依曲韦林的组合的治疗)所实现的人体免疫缺陷病毒复制的减少，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可导致人免疫缺陷病毒复制的减少在1至1.5log、1.5log至2log、2log至2.5log、2.5log至3log、3log至3.5log或3.5log至4log以上的范围内，或相比于标准护理治疗六个月之后实现的减少，可在较短时间段内，例如在一个月内、两个月内、或三个月内，实现与标准护理治疗相同的减少。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的有效量为有效实现持续病毒反应的量，例如在治疗停止之后，不可检测或基本上不可检测的HIV RNA(例如，小于约25、或小于约15国际单位/毫升血清)存在于受治疗者的血清中并持续至少约一个月、至少约两个月、至少约三个月、至少约四个月、至少约五个月、或至少约六个月的时间。
在一些实施方案中，相比于未治疗的受治疗者或安慰剂治疗的受治疗者中的病毒载量，有效量的式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可将HIV病毒载量减少至少约10％、至少约20％、至少约25％、至少约30％、至少约35％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约55％、至少约60％、至少约65％、至少约70％、至少约75％、或至少约80％或更多。检测HIV病毒载量的方法是本领域技术人员已知的，并且包括基于免疫学方法，例如酶联免疫吸附测定法(ELISA)、放射免疫测定法等，其检测HIV-1抗体和/或HIV-2抗体、HIV-1p24抗原以及指示HIV病毒载量的其它标记、以及它们的组合。
临床诊断有HBV、HDV和/或HIV感染的受试者包括″初始″受试者(例如，以前未治疗HBV、HDV和/或HIV的受试者，具体地讲以前未接受针对HIV的ART，包括基于利托那韦的疗法的那些)以及先前对HBV、HDV和/或HIV治疗失败的个体(″治疗失败″的受试者)。治疗失败的受试者包括″无反应者″(对于HIV，这些是通过先前对HIV的治疗(≤0.5log IU/mL)，例如先前的ART，包括利托那韦或其他疗法，其HIV滴度不显著或充分减少的受试者)；和″复发者″(对于HIV，先前治疗过HIV的受试者，例如，接受先前的ART，其HIV滴度降低，但随后增加的受试者)。受试者的另外示例包括患有急性HBV和/或HDV感染的受试者、患有慢性HBV和/或HDV的受试者、以及无症状的受试者。
在一些实施方案中，可将式(I)的化合物或其药学上可接受的盐提供给患有HBV、HDV和/或HIV的治疗失败的受试者。在一些实施方案中，可将式(I)的化合物或其药学上可接受的盐提供给患有HBV、HDV和/或HIV的无反应受试者。在一些实施方案中，可将式(I)的化合物或其药学上可接受的盐提供给患有HBV、HDV和/或HIV的复发受试者。在一些实施方案中，受试者可为无症状的，例如，受试者可感染上HBV和/或HDV，但不表现出病毒感染的任何症状。在一些实施方案中，受治疗者可为免疫失能的。在一些实施方案中，受治疗者患有HIV、HBV和/或HDV中的至少一种。
在一些实施方案中，可将式(I)的化合物或其药学上可接受的盐提供给患有慢性HBV和/或HDV的受治疗者。在一些实施方案中，可将式(I)的化合物或其药学上可接受的盐提供给患有急性HBV和/或HDV的受治疗者。
一段时间后，感染剂可对一种或多种治疗剂形成抗性。本文所用的术语″抗性″是指病毒株对治疗剂表现出延迟、减弱和/或无效的应答。在一些情况下，病毒有时突变或产生对某些药物具有抗性或部分抗性的变体。例如，在用抗病毒剂治疗后，与已感染非抗性菌株的受治疗者所表现出的病毒载量减少量相比，已感染抗性病毒的受治疗者的病毒载量可减少至更小的程度。在一些实施方案中，可将式(I)的化合物或其药学上可接受的盐提供给由HBV和/或HDV菌株感染的受治疗者，所述HBV和/或HDV菌株耐受一种或多种不同的抗HBV和/或抗HDV试剂(例如，用于常规标准护理的试剂)。在一些实施方案中，相比于耐受其它HBV和/或HDV药物(诸如用于常规标准护理的试剂)的HBV和/或HDV菌株的发展，当用式(I)的化合物或其药学上可接受的盐治疗受治疗者时，耐HBV和/或HDV菌株的发展延迟。在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可提供给由HIV菌株感染的受治疗者，所述HIV菌株耐受一种或多种不同的抗HIV试剂(例如，用于常规标准护理的试剂)。在一些实施方案中，相比于耐受其它HIV药物(诸如用于常规标准护理的试剂)的HIV菌株的发展，当用式(I)的化合物或其药学上可接受的盐治疗受治疗者时，耐HIV菌株的发展延迟。
在一些实施方案中，可将有效量的式(I)的化合物或其药学上可接受的盐提供给禁用其他抗HBV、抗HDV和/或抗HIV药物的受试者。在一些实施方案中，可将式(I)的化合物或其药学上可接受的盐提供给对抗病毒剂高度过敏的受试者。
正在治疗HBV、HDV和/或HIV的一些受试者经历病毒载量回弹。如本文所用，术语″病毒载量回弹″是指在治疗结束之前病毒载量持续增加(诸如对于HIV，≥0.5log IU/mL)超过最低点。对于HIV，最低点为相对于基线降低≥0.5log IU/mL。在一些实施方案中，可将式(I)的化合物或其药学上可接受的盐提供给经历病毒载量回弹的受治疗者，或可在用于治疗受治疗者时预防此类病毒载量回弹。
治疗HBV、HDV和/或HIV的标准护理已经与多种副作用(也称为不良反应)相关。在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可减少在用特定病毒诸如HBV、HDV和HIV的标准护理治疗的受试者中观察到的副作用的数量和/或严重性。接受HBV和/或HDV治疗的受试者的副作用的示例包括但不限于消化不良、神经病变、咳嗽、食欲不振、乳酸酸中毒、脂肪代谢障碍、腹泻、疲劳、失眠、皮疹、发烧、不适、心动过速、发冷、头痛、关节痛、肌痛、冷漠、恶心、呕吐、认知改变、虚弱和嗜睡。在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可减少副作用的数量和/或严重性。例如，在根据标准护理用ART治疗的HIV受试者中观察到的副作用的数量和/或严重性。接受HIV治疗的受试者的副作用的示例包括但不限于食欲不振、脂肪代谢障碍、腹泻、疲劳、升高的胆固醇和甘油三酯、皮疹、失眠、发烧、不适、心动过速、发冷、头痛、关节痛、肌痛、冷漠、恶心、呕吐、认知改变、虚弱、嗜睡、缺乏主动性、烦躁、精神错乱、抑郁、严重抑郁、自杀意念、贫血、白细胞计数低和毛发稀疏。在一些实施方案中，可将式(I)的化合物或其药学上可接受的盐提供给由于与一种或多种其他抗HBV、抗HDV和/或抗HIV药剂(例如，用于常规标准护理的药剂)相关的一种或多种不良反应或副作用而中断HBV、HDV和/或HIV治疗的受试者。
表1提供与针对HBV、HDV和/或HIV的标准护理相比，使用式(I)的化合物或其药学上可接受的盐获得的改善百分比的一些实施方案。示例包括以下：在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐导致无反应者的百分比比接受标准护理的无反应者的百分比小10％。在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐导致与由接受标准护理的受治疗者经历的副作用数相比，小约10％至约30％范围内的副作用数；并且在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐导致与由接受标准护理的受治疗者经历的相同副作用的严重度相比，小25％的副作用如本文所述的那些中的一种)的严重度。用于定量副作用的严重性的方法是本领域技术人员已知的。
表1
Figure BDA0003208444450000701
Figure BDA0003208444450000711
如本文所用，″受试者″是指为治疗、观察或实验的对象的动物。″动物″包括冷血和温血脊椎动物和无脊椎动物，诸如鱼、贝类、爬行动物，并且具体地哺乳动物。″哺乳动物″包括但不限于小鼠、大鼠、兔、豚鼠、狗、猫、绵羊、山羊、牛、马、灵长类动物如猴子、黑猩猩和猿，并且具体地人。在一些实施方案中，受试者是人。
如本文所用，术语″治疗″或″治疗性的″不一定是指疾病或病症的完全治愈或消除。疾病或病症的任何不希望病征或症状的任何程度的减轻都可被认为是治疗。此外，治疗可包括可能使患者的整体健康或外貌感觉恶化的行为。
术语″治疗有效量″和″有效量″用来指示引起所指示的生物或药物应答的活性化合物或药剂的量。例如，化合物的有效量可为预防、缓解或改善疾病症状或延长所治疗受治疗者的存活所需的量。该反应可在组织、系统、动物或人中发生，并且包括缓解所治疗疾病的体征或症状。鉴于本文提供的公开内容，有效量的确定完全在本领域技术人员的能力范围内。作为剂量所需的本文公开的化合物的有效量将取决于施用途径、被治疗的动物(包括人)的类型以及所考虑的特定动物的物理特性。可调整剂量以获得期望的效果，但剂量将取决于多种因素，诸如体重、饮食、并行药物和医学领域技术人员将认识到的其他因素。
对本领域技术人员显而易见的是，待施用的有用的体内剂量和具体的施用方式将根据年龄、体重、病痛的严重性和被治疗的哺乳动物种类、所使用的具体化合物以及使用这些化合物的特定用途而变化。有效剂量水平(即实现所需效果所需的剂量水平)的确定可由本领域技术人员使用常规方法(例如，人类临床试验和体外研究)来完成。
剂量的范围可比较广泛，具体取决于所需效果和治疗适应证。另选地，如本领域技术人员所理解，剂量可基于患者的表面积并且根据患者的表面积计算而得。尽管精确的剂量将基于各个药物来确定，但在大多数情况下，可对剂量进行一些概括。成人患者的每日剂量方案可为例如每种活性成分介于0.01mg和3000mg之间、优选地介于1mg和700mg之间(例如，5至200mg)的口服剂量。根据受试者的需要，剂量可以是在一天或多天的过程中给予的单一剂量或一系列的两个或更多个剂量。在一些实施方案中，化合物将被施用一个连续治疗周期，例如一周或多周，或者数月或数年。在一些实施方案中，相比于在标准护理中的试剂的给药频率，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐以更少频率给药。在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可以每天给药一次。例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可每天一次给药于患有HIV感染的受治疗者。在一些实施方案中，利用式(I)的化合物，或其药学上可接受的盐的治疗方案的总时间可以少于利用标准护理的治疗方案的总时间。
在已经针对至少一些病症建立化合物的人类剂量的情况下，可使用那些相同的剂量，或者介于所建立的人类剂量的约0.1％和500％之间、更优选地介于约25％和250％之间的剂量。在未建立人类剂量的情况下(如新发现的药物组合物的情况)，合适的人类剂量可根据ED50或ID50值或者来源于体外或体内研究的其他适当值推断而得，以上值通过在动物中进行毒性研究和功效研究获得。
在施用药学上可接受的盐的情况下，剂量可以游离碱计算。如本领域技术人员将理解，在某些情况下，可能需要以超过或甚至远远超过上述优选剂量范围的量施用本文公开的化合物，以便有效且积极地治疗尤其是具有侵袭性疾病或感染。
可单独调节剂量和间隔，以提供足以维持调节作用或最低有效浓度(MEC、)的活性部分的血浆水平。每种化合物的MEC将发生变化，但可根据体外数据估算而得。实现MEC所需的剂量将取决于个体特征和施用途径。然而，HPLC测定或生物测定可用于确定血浆浓度。剂量间隔也可使用MEC值确定。应当使用保持血浆水平高于MEC持续10％至90％、优选地30％至90％、最优选地50％至90％的时间的方案施用组合物。在局部施用或选择性摄取的情况下，药物的有效局部浓度可能与血浆浓度无关。
应当注意，主治医师将知道如何以及何时因毒性或器官功能障碍而终止、中断或调节施用。相反，如果临床应答不充分(排除毒性)，主治医师也将知道将治疗调节至更高水平。在控制所关注的病症中施用的剂量大小将随待治疗的病症的严重性和施用途径而变化。病症的严重性可例如部分地通过标准预后评估方法进行评估。此外，剂量和可能的剂量频率也将根据个体患者的年龄、体重和应答而变化。与上面讨论的程序相当的程序可用于兽医学。
可使用已知方法来评估本文所公开的化合物的功效和毒性。例如，可通过测定对细胞系(诸如，哺乳动物细胞系、并且优选人类细胞系)的体外毒性来建立共享某些化学部分的具体化合物或化合物子集的毒理学。这类研究的结果通常会预测在动物(诸如，哺乳动物，或更具体地人类)中的毒性。另选地，可使用已知方法来测定具体化合物在动物模型(诸如，小鼠、大鼠、兔或猴)中的毒性。可使用多种公认的方法(诸如，体外方法、动物模型或人类临床试验)来确定具体化合物的功效。当选择模型来确定功效时，本领域技术人员可通过现有技术水平的指导来选择合适的模型、剂量、施用途径和/或方案。
联合疗法
在一些实施方案中，本文所公开的化合物，诸如式(I)的化合物或其药学上可接受的盐，或包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物可与一种或多种附加试剂组合使用。可与式(I)的化合物或其药学上可接受的盐，或包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物组合使用的附加试剂的示例可为目前用于治疗HIV、HBV和/或HDV的常规标准护理中的试剂。在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐，或包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物可与本文所述的一种、两种、三种或更多种附加试剂一起使用。
在一些实施方案中，当感染由HBV、HBV和/或HIV引起时，附加的治疗剂可为抗逆转录病毒疗法(ART)药剂诸如非核苷逆转录酶抑制剂(NNRTI)、核苷逆转录酶抑制剂(NRTI)、聚合酶抑制剂、蛋白酶抑制剂(PI)、融合/进入抑制剂、干扰素、病毒成熟抑制剂、衣壳组装调节剂、FXR激动剂、TNF/亲环蛋白抑制剂、TLR激动剂、疫苗、siRNA或ASO共价闭合环状DNA(cccDNA)抑制剂、基因沉默剂、HBx抑制剂、表面抗原(sAg)分泌抑制剂(例如，HBsAg)、其他HBV抗病毒化合物、其他HDV抗病毒化合物和/或其他HIV抗病毒化合物、或前述物质中任一种的药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐，或包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物可与目前用于护理治疗的常规标准中的试剂组合使用。例如，为治疗HBV和/或HDV，本文所公开的化合物可与干扰素治疗组合使用。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐，或包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物可替代目前用于护理治疗的常规标准中的试剂。例如，为了治疗HIV，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐、或包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物可用于替代常规ART抑制剂。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐，或包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物可与非核苷逆转录酶抑制剂(NNRTI)组合使用。在一些实施方案中，NNRTI可抑制HBV和/或HDV逆转录酶。合适的NNRTI的示例包括但不限于地拉韦啶
Figure BDA0003208444450000741
依法韦仑
Figure BDA0003208444450000742
依曲韦林
Figure BDA0003208444450000743
奈韦拉平
Figure BDA0003208444450000744
利匹韦林
Figure BDA0003208444450000745
doravirine和前述物质中任一种的药学上可接受的盐，和/或它们的组合。示例性NNRTI的非限制性列表包括图1中编号为1001-1006的化合物。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐，或包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物可与核苷逆转录酶抑制剂(NRTI)组合使用。在一些实施方案中，NRTI可抑制HBV和/或HDV逆转录酶。合适的NRTI的示例包括但不限于阿巴卡韦
Figure BDA0003208444450000746
阿德福韦
Figure BDA0003208444450000747
氨多索韦、阿立他滨、censavudine、地达诺新
Figure BDA0003208444450000751
艾夫他滨、恩曲他滨
Figure BDA0003208444450000752
恩替卡韦
Figure BDA0003208444450000753
拉米夫定
Figure BDA0003208444450000754
拉西韦、stampidine、司他夫定
Figure BDA0003208444450000755
替诺福韦地索普西(包括
Figure BDA0003208444450000756
)、替诺福韦艾拉酚胺、扎西他滨
Figure BDA0003208444450000757
齐多夫定
Figure BDA0003208444450000758
和前述物质中任一种的药学上可接受的盐、和/或它们的组合。示例性NRTI的非限制性列表包括图2中编号为2001-2017的化合物。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐，或包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物可与蛋白酶抑制剂组合使用。在一些实施方案中，蛋白酶抑制剂可抑制HBV和/或HDV蛋白酶，例如NS3/4A。示例性蛋白酶抑制剂的非限制性列表包括下列：安普那韦
Figure BDA0003208444450000759
阿那匹韦
Figure BDA00032084444500007510
阿扎那韦
Figure BDA00032084444500007511
博赛泼维
Figure BDA00032084444500007512
地瑞纳韦
Figure BDA00032084444500007513
夫沙那韦
Figure BDA00032084444500007514
Figure BDA00032084444500007515
格佐普韦、茚地那韦
Figure BDA00032084444500007516
洛匹那韦
Figure BDA00032084444500007517
奈非那韦
Figure BDA00032084444500007518
利托那韦
Figure BDA00032084444500007519
沙奎那韦
Figure BDA00032084444500007520
Figure BDA00032084444500007521
西咪匹韦
Figure BDA00032084444500007522
特拉匹韦
Figure BDA00032084444500007523
丹诺瑞韦、替拉那韦
Figure BDA00032084444500007524
ABT-450(paritaprevir)、BILN-2061(西鲁瑞韦)、BI-201335(faldaprevir)、GS-9256、vedroprevir(GS-9451)、IDX-320、ACH-1625(sovaprevir)、ACH-2684以及前述物质中任一种的药学上可接受的盐和/或它们的组合。示例性蛋白酶抑制剂的非限制性列表包括图3A中编号为3001-3010和图3B中编号为3011-3023的化合物。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐，或包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物可与HIV融合/进入抑制剂组合使用。在一些实施方案中，HIV融合/进入抑制剂可阻止HIV进入CD4+T淋巴细胞。在一些实施方案中，融合/进入抑制剂(也称为CCR5拮抗剂)可阻止HIV细胞进入所需的CD4+T淋巴细胞上的蛋白质。合适的融合/进入抑制剂包括但不限于恩夫韦地
Figure BDA00032084444500007525
马拉维若
Figure BDA00032084444500007526
立韦罗、cenicriviroc、fostemsavir、ibalizumab、PRO140，以及前述物质中任一种的药学上可接受的盐、和/或它们的组合。示例性HIV融合/进入抑制剂的非限制性列表包括图4A中编号为4001-4007的化合物。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐，或包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物可与HBV和/或HDV融合/进入抑制剂组合使用。在一些实施方案中，融合/进入抑制剂可阻止HBV和/或HDV进入肝细胞。在一些实施方案中，HBV和/或HDV融合/进入抑制剂可阻止HBV和/或HDV细胞进入所需的肝细胞上的蛋白质。在一些实施方案中，HBV和/或HDV融合/进入抑制剂可结合到牛磺胆酸钠共转运多肽。合适的HBV和/或HDV融合/进入抑制剂的示例包括但不限于myrcludex B、环孢菌素A、依泽替米贝、和SCYX1454139、HBIG、Ma18/7、KR127、17.1.41/19.79.5、肝素、苏拉明、SALP、牛磺酸衍生物、以及前述物质中任一种所述的药学上可接受的盐、和/或它们的组合。示例性HBV和/或HDV融合/进入抑制剂的非限制性列表包括图4B中编号为4008-4019的化合物。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐，或包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物可与HIV整合酶链转移抑制剂(INSTI)组合使用。在一些实施方案中，INSTI可阻止HIV整合酶。INSTI的示例包括但不限于度鲁特韦(
Figure BDA0003208444450000761
)、埃替格韦
Figure BDA0003208444450000762
雷特格韦
Figure BDA0003208444450000763
BI 224436、globoidnan A，cabotegravir、bictegravir、MK-2048、以及前述物质中任一种的药学上可接受的盐、和/或它们的组合。示例性HIV INSTI的非限制性列表包括图5中编号为5001-5008的化合物。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐，或包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物可与其它抗病毒化合物组合使用。其他抗病毒化合物的示例包括但不限于贝韦立马(bevirimat)、BIT225、calanolide A、羟基碳酰胺、米替福新、塞利西利、蓝藻抗病毒蛋白(cyanovirin-N)、格瑞弗森(griffithsin)、scytovirin、BCX4430、法维拉韦、GS-5734、美西他滨(mericitabine)、MK-608(7-脱氮杂-2′-C-甲基腺苷)、NITD008、吗啉胍、利巴韦林、他立韦林、三氮唑核苷(triazavirin)、ARB-1467、ARB-1740、ARC-520、ARC-521、ALN-HBV、TG1050、Tre重组酶、AT-61、AT-130、BCX4430、法维拉韦、阿比朵尔(umifenovir)、布罗福韦酯(brincidofovir)、FGI-104、LJ-001、FGI-106、以及前述物质中任一种的药学上可接受的盐、和/或它们的组合。示例性其它抗病毒化合物的非限制性列表包括图6A中编号为6001-6010和图6B中编号为6011-6033的化合物。其它抗病毒化合物的附加示例包括但不限于抗体酶、酶、蛋白质或抗体。其它抗病毒化合物的附加示例包括但不限于ceragenins，包括CSA-54、二芳基嘧啶、协同增强剂和锌指蛋白转录因子、以及前述物质中任一种的药学上可接受的盐、和/或它们的组合。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐，或包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物可与病毒成熟抑制剂组合使用。在一些实施方案中，病毒成熟抑制剂可抑制HBV和/或HDV的成熟。病毒成熟抑制剂的示例包括但不限于bevimirat、BMS-955176、MPC-9055、以及前述物质中任一种的药学上可接受的盐、和/或它们的组合。示例性病毒成熟抑制剂的非限制性列表包括图7中编号为7001-7003的化合物。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐，或包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物可与衣壳组装调节剂组合使用。在一些实施方案中，衣壳组装调节剂可稳定衣壳。在一些实施方案中，衣壳组装调节剂可促进过量的衣壳组装。在一些实施方案中，衣壳组装调节剂可诱导衣壳肽的非衣壳聚合物形成。在一些实施方案中，衣壳组装调节剂可误导衣壳组装(例如，降低衣壳稳定性)。在一些实施方案中，衣壳组装调节剂可结合到HBV和/或HDV芯蛋白。衣壳组装调节剂的示例包括但不限于NVR-3-778、AB-423、GLS-4、Bayer 41-4109、HAP-1、AT-1以及前述物质中任一种的药学上可接受的盐、和/或它们的组合。示例性衣壳组装调节剂的非限制性列表包括图8中编号为8001-8006的化合物。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐，或包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物可与FXR激动剂组合使用。FXR激动剂的示例包括但不限于：咖啡醇；鹅脱氧胆酸；胆酸；奥贝胆酸；熊去氧胆酸；fexaramine；
Figure BDA0003208444450000781
Figure BDA0003208444450000791
Figure BDA0003208444450000801
Figure BDA0003208444450000802
前述物质中任一种的药学上可接受的盐，和/或它们的组合。附加的示例性FXR激动剂的非限制性列表包括图9中编号为9001-9006的化合物。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐，或包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物可与亲环蛋白/TNF抑制剂组合使用。亲环蛋白/TNF抑制剂的示例包括但不限于英夫利昔单抗
Figure BDA0003208444450000803
阿达木单抗
Figure BDA0003208444450000804
妥珠单抗
Figure BDA0003208444450000805
戈利木单抗
Figure BDA0003208444450000806
依那西普
Figure BDA0003208444450000807
沙利度胺
Figure BDA0003208444450000808
来那度胺
Figure BDA0003208444450000809
泊马度胺
Figure BDA00032084444500008010
环孢菌素A、NIM811、Alisporivir(DEB-025)、SCY-635、DEB-064、CRV-431、以及前述物质中任一种的药学上可接受的盐、和/或它们的组合。示例性TNF/亲环蛋白抑制剂的非限制性列表包括图10中编号为10001-10014的化合物。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐，或包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物可与TLR激动剂组合使用。TLR激动剂的示例包括但不限于GS-9620、ARB-1598、ANA-975、RG-7795(ANA-773)、MEDI-9197、PF-3512676、IMO-2055、艾沙托立宾、tremelimumab、SM360320、AZD-8848、以及前述物质中任一种的药学上可接受的盐、和/或它们的组合。示例性TLR激动剂的非限制性列表包括图11中编号为11001-11013的化合物。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐，或包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物可与聚合酶抑制剂组合使用。聚合酶抑制剂的示例包括但不限于替比夫定、beclabuvir、dasabuvir、deleobuvir、filibuvir、setrobuvir、索非布韦、radalbuvir、RG7128(mericitabine)、PSI-7851、INX-189、PSI-352938、PSI-661、GS-6620、IDX-184、TMC649128、setrobuvir、lomibuvir、nesbuvir、GS-9190(tegobuvir)、VX-497(merimepodib)、利巴韦林、阿昔洛韦、atevirapine、泛昔洛韦、伐昔洛韦、更昔洛韦、缬更昔洛韦、西多福韦、JK-05、以及前述物质中任一种的药学上可接受的盐、和/或它们的组合。示例性聚合酶抑制剂的非限制性列表包括图12中编号为12001-12030的化合物。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐，或包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物可与疫苗组合使用。疫苗的示例包括但不限于
Figure BDA0003208444450000811
ABX-203、INO-1800、以及前述物质中任一种的药学上可接受的盐、和/或它们的组合。示例性疫苗的非限制性列表包括图13中编号为13001-13003的那些。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐，或包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物可与干扰素组合使用。干扰素的示例包括但不限于α-干扰素、β-干扰素、δ-干扰素、ω-干扰素、τ干扰素、x-干扰素、共有干扰素和唾液酸-干扰素。具体的非限制性示例包括干扰素α1A、干扰素α1B、干扰素α2A、干扰素α2B、聚乙二醇化干扰素α2a(
Figure BDA0003208444450000812
Roche)、重组干扰素α2a(
Figure BDA0003208444450000813
Roche)、吸入干扰素α2b(
Figure BDA0003208444450000814
Aradigm)、聚乙二醇化干扰素α2b(
Figure BDA0003208444450000815
Human Genome Sciences/Novartis，
Figure BDA0003208444450000816
Schering)、重组干扰素α2b(
Figure BDA00032084444500008111
Schering)、聚乙二醇化干扰素α2b(
Figure BDA0003208444450000818
Schering，VIRAFERONPEG，Schering)、干扰素β-1a(
Figure BDA0003208444450000819
Serono，Inc.和Pfizer)、共有序列干扰素α(
Figure BDA00032084444500008110
ValeantPharmaceutical)。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐，或包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物可与siRNA或ASO cccDNA抑制剂组合使用。在一些实施方案中，siRNA或ASO cccDNA抑制剂可预防cccDNA形成、消除现有的cccDNA、破坏现有的cccDNA、和/或使cccDNA转录沉默。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐，或包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物可与基因沉默剂组合使用。在一些实施方案中，基因沉默剂减少一种或多种目标基因的转录。在一些实施方案中，基因沉默剂减少一种或多种目标基因的翻译。在一些实施方案中，基因沉默剂可为寡聚核苷酸、核酶、siRNA、吗啉、或前述物质中任一种的组合。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐，或包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物可与HBx抑制剂组合使用。HBx是由嗜肝病毒编码的多肽，其有助于病毒感染。在一些实施方案中，HBx抑制剂降低HBx反式激活活性。在一些实施方案中，HBx抑制剂阻止或减少HBx与哺乳动物细胞蛋白的结合。在一些实施方案中，HBx抑制剂减少HBx阻止或减少激酶的募集。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐，或包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物可与HBsAg分泌抑制剂组合使用。HBV和HDV表面抗原是存在于新HBV颗粒和亚病毒颗粒两者上的蛋白质。亚病毒颗粒是非感染性的，并且以对感染性病毒而言显著过量来分泌，从而潜在地使受治疗者的免疫系统衰竭。在一些实施方案中，HBsAg分泌抑制剂可由于表面抗原减少受治疗者的免疫衰竭。在一些实施方案中，HBsAg分泌抑制剂可促进受治疗者对HBV和/或HDV的免疫应答。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐，或包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物可与共价闭合环状DNA(cccDNA)抑制剂组合使用。在一些实施方案中，cccDNA抑制剂可直接结合cccDNA，可抑制松弛环状DNA(rcDNA)转化为cccDNA，可减少或沉默cccDNA的转录，和/或可促进现有cccDNA的消除。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐、或包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物可与在2017年3月9日提交的PCT公开号WO 2017/156262中所述的式(I)的化合物或其药学上可接受的盐组合使用。
本文所述的一些实施方案涉及治疗HBV和/或HDV感染的方法，所述方法可包括使感染上HBV和/或HDV的细胞与有效量的式(I)的化合物或其药学上可接受的盐与一种或多种附加试剂(诸如本文所述的那些)的组合接触。本文所述的其他实施方案涉及治疗HBV和/或HDV感染的方法，所述方法可包括向患有HBV和/或HDV感染的受试者施用有效量的式(I、)的化合物或其药学上可接受的盐与一种或多种附加试剂(诸如本文所述的那些)的组合。本文所述的其他实施方案涉及抑制HBV和/或HDV的复制的方法，所述方法可包括使感染上HBV和/或HDV的细胞与有效量的式(I、)的化合物或其药学上可接受的盐与一种或多种附加试剂(诸如本文所述的那些)的组合接触。本文所述的其他实施方案涉及抑制HBV和/或HDV的复制的方法，所述方法可包括向感染上HBV和/或HDV的受试者施用有效量的式(I)的化合物或其药学上可接受的盐与一种或多种附加试剂(诸如本文所述的那些)的组合。附加试剂的示例包括本文所述的那些，诸如聚合酶抑制剂、蛋白酶抑制剂(PI)、融合/进入抑制剂、干扰素、FXR激动剂、TLR激动剂、病毒成熟抑制剂、衣壳组装调节剂、亲环蛋白/TNF抑制剂、疫苗、siRNA或ASO cccDNA抑制剂、基因沉默剂、HBx抑制剂、HBsAg分泌抑制剂和另一种抗病毒化合物、或前述物质中任一种的药学上可接受的盐。
本文所述的一些实施方案涉及治疗HIV感染的方法，所述方法可包括使感染上HIV感染的细胞与有效量的式(I)的化合物或其药学上可接受的盐与一种或多种附加试剂(诸如本文所述的那些)的组合接触。本文所述的其他实施方案涉及治疗HIV感染的方法，所述方法可包括向患有HIV感染的受试者施用有效量的式(I)的化合物或其药学上可接受的盐与一种或多种附加试剂(诸如本文所述的那些)的组合。本文所述的其他实施方案涉及抑制HIV的复制的方法，所述方法可包括使感染上HIV的细胞与有效量的式(I)的化合物或其药学上可接受的盐与一种或多种附加试剂(诸如本文所述的那些)的组合接触。本文所述的其他实施方案涉及抑制HIV的复制的方法，所述方法可包括向感染上HIV的受试者施用有效量的式(I)的化合物或其药学上可接受的盐与一种或多种附加试剂(诸如本文所述的那些)的组合。附加试剂的示例包括本文所述的那些，诸如抗逆转录病毒疗法(ART)药剂，诸如非核苷逆转录酶抑制剂(NNRTI)、核苷逆转录酶抑制剂(NRTI)、蛋白酶抑制剂(PI)、融合/进入抑制剂(也称为CCR5拮抗剂)、整合酶链转移抑制剂(INSTI)和HIV其他抗逆转录病毒疗法化合物、或前述物质中任一种的药学上可接受的盐。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可与一种或多种附加试剂一起以单一药物组合物形式施用。在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可与一种或多种附加试剂以两种或更多种单独的药物组合物形式施用。例如，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可以一种药物组合物形式施用，并且附加试剂中的至少一种可以第二药物组合物形式施用。如果存在至少两种附加试剂，则附加试剂中的一种或多种可以在包括式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的第一药物组合物中，并且其他附加试剂中的至少一种可以在第二药物组合物中。
当使用式(I)的化合物或其药学上可接受的盐，或包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐、和一种或多种附加试剂的药物组合物时，给药量和给药方案在本领域技术人员的知识范围内。例如，当使用本领域公认的给药量和给药方案进行常规护理治疗标准时，除了所述治疗之外，还可使用如本文所述的有效量或给药方案施用式(I)的化合物或其药学上可接受的盐，或包含式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物，或替代组合疗法的一种试剂。
式(I)的化合物或其药学上可接受的盐与一种或多种附加试剂的施用顺序可改变。在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可在所有附加试剂之前施用。在其他实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可在至少一种附加试剂之前施用。在其他实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可与一种或多种附加试剂同时施用。在其他实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可在施用至少一种附加试剂之后施用。在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可在施用所有附加试剂之后施用。
在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐与图1-图13中的一种或多种附加试剂(包括前述物质中任一种的药学上可接受的盐和前药)的组合可导致加成效应。在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐与图1-图13中的一种或多种附加试剂(包括前述物质中任一种的药学上可接受的盐和前药)的组合可导致协同效应。在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐与图1-图13中的一种或多种附加试剂(包括前述物质中任一种的药学上可接受的盐和前药)的组合可导致强协同效应。在一些实施方案中，式(I)的化合物或其药学上可接受的盐与图1-图13中的一种或多种附加试剂(包括前述物质中任一种的药学上可接受的盐和前药)的组合是不拮抗的。
如本文所用，术语″拮抗的″意指相比于单独测定每种化合物的活性时(即，作为单一化合物)以组合形式的化合物的总和，化合物的组合的活性较低。如本文所用，术语″协同效应″意指化合物的组合的活性大于在单独测定每种化合物的活性时以组合形式的化合物的单独活性的总和。如本文所用，术语″加成效应″意指化合物的组合的活性约等于在单独测定每种化合物的活性时以组合形式的化合物的单独活性的总和。
利用式(I)的化合物，或其药学上可接受的盐与图1-图13中的一种或多种附加试剂(包括前述物质中任一种的药学上可接受的盐)的组合的潜在优点可为，相比于在不具有式(I)的化合物，或其药学上可接受的盐的情况下，施用图1-图13的一种或多种化合物(包括前述物质中任一种的药学上可接受的盐)时实现相同治疗效果所需的量，有效治疗本文所公开的病症(例如，HBV、HDV和/或HIV)所需的图1-图13的一种或多种化合物(包括前述物质中任一种的药学上可接受的盐)量减少。例如，当以单一疗法施用时，相比于图1-图13的化合物(包括前述物质中任一种的药学上可接受的盐)的量，实现相同病毒载量所需的图1-图13的一种或多种化合物(包括前述物质中任一种的药学上可接受的盐)的量可更少。利用式(I)的化合物或其药学上可接受的盐与图1-图13中的一种或多种附加试剂(包括前述物质中任一种的药学上可接受的盐)组合的另一潜在优点是，与作为单一疗法施用一种化合物时产生的屏障相比，使用具有不同作用机制的两种或更多种化合物可产生针对抗性病毒株发展的更高屏障。
利用式(I)的化合物或其药学上可接受的盐与图1-图13中的一种或多种附加试剂(包括前述物质中任一种的药学上可接受的盐)组合的附加优点可包括式(I)的化合物或其药学上可接受的盐和图1-图13的一种或多种附加试剂(包括前述物质中任一种的药学上可接受的盐)之间的减少至不具有交叉抗性；用于清除式(I)的化合物或其药学上可接受的盐和图1-图13中的一种或多种附加试剂(包括前述物质中任一种的药学上可接受的盐)的不同途径；在式(I)的化合物或其药学上可接受的盐和图1-图13中的一种或多种附加试剂(包括前述物质中任一种的药学上可接受的盐)之间几乎没有重叠毒性；对细胞色素P450具有较少至不具有显著影响；在式(I)的化合物或其药学上可接受的盐和图1-图13中的一种或多种附加试剂(包括前述物质中任一种的药学上可接受的盐)之间几乎没有药代动力学相互作用；与当化合物以单一疗法施用时相比，实现持续病毒反应的受试者的更大百分比，和/或与当化合物以单一疗法施用时相比，实现持续病毒反应的治疗时间的减少。
实施例
提供如下具体实施例来进一步说明本文所述的各种实施方案。
在获得下文实施例中描述的化合物和相应的分析数据时，除非另外指明，否则遵循以下实验和分析方案。
除非另外指明，否则反应混合物均在室温(r.t.)和氮气气氛下进行磁力搅拌。在将溶液″干燥″的情况下，它们通常是经诸如Na2SO4或MgSO4之类的干燥剂进行干燥。在将混合物、溶液和提取物″浓缩″的情况下，它们通常是在旋转蒸发仪上进行减压浓缩。
使用预充填管柱，在硅胶(SiO2)上进行正相硅胶色谱(FCC)。
在具有Xtimate Prep RP18柱(5μM，25×150mm)或YMC-Actus Triart C18柱(5μM，30×100mm)的Gilson 281/215HPLC上进行制备型反相高效液相色谱(RP HPLC)，并且使在0.225％FA中的1％ACN的流动相保持1min，然后梯度为在9min内1％-23％ACN，接着在95％ACN保持2min，其中流量为25mL/min。
在Agilent G1969A LCMS-TOF上获得质谱(MS)。流动相：在水中的0.1％FA(甲酸)(溶剂A)和在ACN中的0.1％FA(溶剂B)；洗脱梯度：在3分钟内0％-30％(溶剂B)，并以1mL/分钟的流速在30％下保持1分钟；柱：Xbridge Shield RP 18 5um，2.1*50mm，离子源：ESI源；离子模式：正；
喷雾气体：氮气；干燥气体(N2)流：51/min；喷雾器压力：30psig；气体温度：325℃；毛细管电压：3.5KV；碎裂电压：50V。
在Bruker 400MHz或Varian 400MHz光谱仪上获得核磁共振(NMR)谱。多重度的定义如下：s＝单峰，d＝双重峰，t＝三重峰，q＝四重峰，m＝多重峰，br＝宽峰。应当理解，对于包含可交换质子的化合物而言，所述质子在NMR光谱中可能可见或可能不可见，这取决于用于进行NMR光谱的溶剂的选择以及溶液中化合物的浓度。
使用ChemDraw Ultra 12.0，ChemDraw Ultra 14.0(CambridgeSoft Corp.，Cambridge，MA)或ACD/Name10.01版(Advanced Chemistry)，生成化学名称。
命名为R*或S*的化合物是绝对构型未确定的对映体纯化合物。
中间体1：(1R，3R，4S)-2-亚甲基-4-((三异丙基甲硅烷基)氧基)-3-(((三异丙基 甲硅烷基)氧基)甲基)环戊-1-醇和(1S，3R，4S)-2-亚甲基-4-((三异丙基甲硅烷基)氧基)- 3-(((三异丙基甲硅烷基)氧基)甲基)环戊-1-醇。
Figure BDA0003208444450000871
步骤A：(4S，5R)-4-((三异丙基甲硅烷基)氧基)-5-(((三异丙基甲硅烷基)氧基) 甲基)二氢呋喃-2(3H)-酮。根据PCT公布号WO 2015/056213(2015年4月23日公布)中所述的程序制备标题化合物。
步骤B：(4S，5R)-4-((三异丙基甲硅烷基)氧基)-5-(((三异丙基甲硅烷基)氧基) 甲基)四氢呋喃-2-醇。在-70℃和N2下，在1小时内向(4S，5R)-4-((三异丙基甲硅烷基)氧基)-5-(((三异丙基甲硅烷基)氧基)甲基)二氢呋喃-2(3H)-酮(10g，22.48mmol)在THF(四氢呋喃)(100mL)中的溶液中滴加DIBAL-H(二异丁基氢化铝)溶液(1M，56.21mL)。将温度保持低于-55℃。将反应混合物在-70℃下再搅拌2小时。将反应混合物用MeOH(甲醇)(50mL)缓慢淬灭，并用EA(乙酸乙酯)(100mL)稀释。将无机物质过滤，并将滤饼用EA(100mL*3)洗涤。将滤液真空浓缩，得到无色油状物。纯化(FCC，SiO2，PE/EA＝100/1至20/1)得到标题化合物(8.2g，81.63％产率)，为无色油状物。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝5.61-5.30(m，1H)，4.77-4.50(m，1H)，4.33(m，1H)，4.20-4.02(m，1H)，3.87-3.59(m，2H)，3.44(m，1H)，2.24-2.01(m，1H)，1.16-1.03(m，42H)。
步骤C：(2R，3S)-1，3-双((三异丙基甲硅烷基)氧基)庚-6-炔-2，5-二醇。在-70℃和N2下，在0.5小时内，向(4S，5R)-4-((三异丙基甲硅烷基)氧基)-5-(((三异丙基甲硅烷基)氧基)甲基)四氢呋喃-2-醇(8.04g，17.99mmol)在THF(80mL)中的溶液中滴加溴(乙炔基)镁溶液(0.5M，107.94mL)。将温度保持低于-55℃。将反应混合物自然温热至30℃，并在30℃下再搅拌2小时。将反应用饱和NH4Cl溶液(50mL)缓慢淬灭，然后用EA(100mL)稀释。将有机层用盐水(50mL)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。纯化(FCC，SiO2，PE/EA＝100/1至20/1)得到标题化合物(3.1g，36.44％产率)。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝4.69-4.70(m，1H)，4.13-4.14(m，1H)，3.83-3.85(m，2H)，3.27-3.29(m，1H)，2.73-2.74(m，1H)，2.44-2.45(m，1H)，2.09(s，1H)，2.04-2.09(m，2H)，1.05-1.09(m，42H)。
步骤D：((5S，6R)-6-羟基-5，7-双((三异丙基甲硅烷基)氧基)庚-1-炔-3-基)碳酸 乙酯。向(2R，3S)-1，3-双((三异丙基甲硅烷基)氧基)庚-6-炔-2，5-二醇(1g，2.11mmol)和吡啶(501.85mg，6.34mmol，512.09μL)在CH2Cl2(10mL)中的混合物中添加氯甲酸乙酯(900mg，8.29mmol，789.47μL)，并在0℃下搅拌2小时。将反应用饱和NaHCO3溶液(20mL)缓慢淬灭，然后用DCM(二氯甲烷)(30mL)萃取。将有机层用盐水(50mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。纯化(FCC，SiO2，PE/EA＝100/1至20/1)得到呈无色油状物的标题化合物(800mg，69.42％产率)，为无色油状物。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝5.48-5.50(m，1H)，4.20-4.25(m，3H)，3.74-3.77(m，3H)，2.45-2.52(s，2H)，1.30-1.31(m，2H)，1.01-1.10(m，3H)，1.05-1.07(m，42H)。LCMS；ESI-MS：m/z567.20[M+Na]+。
步骤E：O-((6R，7S)-9-乙炔基-3，3-二异丙基-2-甲基-11-氧代-7-((三异丙基甲 硅烷基)氧基)-4，10，12-三氧杂-3-硅杂十四烷-6-基)1H-咪唑-1-硫代甲酸酯。向((5S，6R)-6-羟基-5，7-双((三异丙基甲硅烷基)氧基)庚-1-炔-3-基)碳酸乙酯(28.00g，51.38mmol)在DCM(250mL)中的溶液中添加TCDI(1，1′-硫代羰基二咪唑)(91.57g，513.85mmol)。将混合物在25℃下搅拌12小时。将反应用水(200mL)淬灭，并用盐水(50mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。纯化(FCC，SiO2，PE/EA＝20/1至5/1)得到标题化合物(10.4g，30.90％产率)，为无色油状物。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝8.33(d，J＝5.60Hz，1H)，7.61(d，J＝8.40Hz，1H)，7.10-6.94(m，1H)，5.75-5.64(m，1H)，5.47-5.35(dd，J＝8.40Hz，J＝5.20Hz，1H)，4.73-4.51(m，1H)，4.31-4.18(m，2H)，4.18-4.09(m，1H)，3.94(dd，J＝7.00，10.60Hz，1H)，2.56-2.57(m，1H)，2.49-2.07(m，2H)，1.39-1.31(m，3H)，1.14-0.98(m，42H)。LCMS：ESI-MS：m/z 655.40[M+1]+。
步骤F：((3R，4S)-2-亚甲基-4-((三异丙基甲硅烷基)氧基)-3-(((三异丙基甲硅 烷基)氧基)甲基)环戊基)碳酸乙酯。在25℃下，向O-((6R，7S)-9-乙炔基-3，3-二异丙基-2-甲基-11-氧代-7-((三异丙基甲硅烷基)氧基)-4，10，12-三氧杂-3-硅杂十四烷-6-基)1H-咪唑-1-硫代甲酸酯(6.00g，9.16mmol)在甲苯(100mL)中的溶液添加AIBN(偶氮二异丁腈)(752.04mg，4.58mmol)和三正丁基氢化锡(10.66g，36.64mmol，9.69mL)。在N2下，将混合物在105℃下搅拌3小时。将反应用KF(1.0M，100mL)溶液缓慢淬灭，然后用EA(100mL)萃取。将有机层用盐水(100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤，减压浓缩。纯化(FCC，SiO2，PE/EA＝300/1至100/1)得到标题化合物(3.7g，76.37％产率)，为无色油状物。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝5.27(br，d，J＝3.4Hz，3H)，4.49-4.35(m，1H)，4.15-4.09(m，1H)，3.84-3.72(m，2H)，3.71-3.52(m，2H)，2.53-2.39(m，1H)，2.22(br，d，J＝6.8Hz，1H)，1.35-1.31(m，3H)，1.06-0.94(m，42H)。
步骤G：(1R，3R，4S)-2-亚甲基-4-((三异丙基甲硅烷基)氧基)-3-(((三异丙基甲 硅烷基)氧基)甲基)环戊-1-醇和(1S，3R，4S)-2-亚甲基-4-((三异丙基甲硅烷基)氧基)-3- (((三异丙基甲硅烷基)氧基)甲基)环戊-1-醇。向((3R，4S)-2-亚甲基-4-((三异丙基甲硅烷基)氧基)-3-(((三异丙基甲硅烷基)氧基)甲基)环戊基)碳酸乙酯(900mg，1.70mmol)在EtOH(乙醇)(3mL)中的溶液中添加NaOEt(289.49mg，4.25mmol)。将混合物在25℃下搅拌1小时。将反应混合物减压浓缩。通过柱色谱法(SiO2，石油醚/乙酸乙酯＝100/1至5/1)纯化残余物，得到(1R，3R，4S)-2-亚甲基-4-((三异丙基甲硅烷基)氧基)-3-(((三异丙基甲硅烷基)氧基)甲基)环戊-1-醇(230mg，29.59％产率)，为无色油状物：1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝5.43(s，1H)，5.18(s，1H)，4.56(s，1H)，4.37(dd，J＝5.40，10.00Hz，1H)，3.65(dd，J＝5.40，10.40Hz，1H)，3.48-3.33(m，1H)，3.09(d，J＝11.00Hz，1H)，2.88(s，1H)，2.08-1.94(m，2H)，1.17-1.05(m，42H)；以及(1S，3R，4S)-2-亚甲基-4-((三异丙基甲硅烷基)氧基)-3-(((三异丙基甲硅烷基)氧基)甲基)环戊-1-醇(95mg，12.22％产率)，为无色油状物：1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝5.28(s，1H)，5.11(s，1H)，4.58(d，J＝7.60Hz，1H)，4.54-4.48(m，1H)，3.87-3.81(m，1H)，3.84(dd，J＝4.40，9.80Hz，1H)，3.76-3.69(m，1H)，2.62(s，1H)，2.15(d，J＝7.80Hz，1H)，1.99-1.94(m，1H)，1.10-1.01(m，42H)；以及80mg标题化合物的混合物。
中间体2：(1R，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔丁基二甲基甲 硅烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊-1-醇。
Figure BDA0003208444450000901
方法A：
步骤A.2-(羟甲基)环戊-2-烯-1-酮。向环戊-2-烯-1-酮(10g，121.80mmol，10.20mL)在CHCl3(150mL)和MeOH(100mL)的混合物中的溶液中添加HCHO(13.05g，160.78mmol，11.97mL)。然后将Me2PPh(苯基二甲基膦)(841.33mg，6.09mmol)在CHCl3(100mL)中的溶液添加到上述混合物中。将混合物在25℃下搅拌1小时。将所得混合物真空浓缩。纯化(FCC，
Figure BDA0003208444450000902
40g
Figure BDA0003208444450000903
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为10％-70％的乙酸乙酯/石油醚，速度为40mL/min)，得到标题化合物(24g，87.87％产率)，为白色固体。将该反应分两批进行。1H-NMR(400MHz，CDCl3)，δ＝7.51(dd，J＝1.2，2.5Hz，1H)，4.32-4.19(m，2H)，3.09(br s，1H)，2.58(td，J＝2.0，4.4Hz，2H)，2.42-2.30(m，2H)。
步骤B.2-((三苯甲基氧基)甲基)环戊-2-烯-1-酮。向2-(羟甲基)环戊-2-烯-1-酮(2g，17.84mmol)在DCM(20mL)中的溶液中添加DMAP(4-二甲基氨基吡啶)(392.24mg，3.21mmol)、TrtCl(三苯基氯甲烷)(5.22g，18.73mmol)和Et3N(2.71g，26.76mmol，3.72mL)。将混合物在25℃下搅拌16小时。通过添加H2O(50mL)来淬灭反应混合物，然后用DCM(50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤，经无水MgSO4干燥，并过滤。将滤液减压浓缩。纯化(FCC，
Figure BDA0003208444450000904
12g
Figure BDA0003208444450000905
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为5％-30％的乙酸乙酯/石油醚，速度为40mL/min)，得到标题化合物(4.8g，75.92％产率)，为白色固体。1H-NMR(400MHz，CDCl3)，δ7.79(t，J＝1.8Hz，1H)，7.51-7.37(m，6H)，7.32-7.16(m，9H)，3.87(q，J＝2.6Hz，2H)，2.72-2.55(m，2H)，2.47-2.31(m，2H)ESI-MS：m/z 377.0[M+Na]+。
步骤C.(S)-2-((三苯甲基氧基)甲基)环戊-2-烯-1-醇。在0℃下，将BH3-Me2S(硼烷二甲基硫醚)(10M，5.64mL，2当量)溶解在DCM(35mL)中。将(3aR)-1-甲基-3，3-二苯基-3a，4，5，6-四氢吡咯并[1，2-c][1，3，2]噁唑硼烷(1M，5.64mL)添加到上述溶液中并搅拌1小时。之后，在0℃下，在2小时时滴加2-((三苯甲基氧基)甲基)环戊-2-烯-1-酮(10g，28.21mmol)在DCM(75mL)中的溶液。将反应混合物用H2O(100mL)淬灭，然后用DCM(2×100mL)萃取。将合并的有机层用H2O(200mL)洗涤，经MgSO4干燥，并过滤。将所得溶液减压浓缩。纯化(FCC，
Figure BDA0003208444450000911
40g
Figure BDA0003208444450000912
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为5％-15％的乙酸乙酯/石油醚，速度为30mL/min)，得到标题化合物(48g，79.55％)，为无色油状物。将该反应分6批进行。1H-NMR(400MHz，CDCl3)，δ7.47-7.46(m，2H)，7.44(d，J＝0.7Hz，3H)，7.33-7.20(m，10H)，5.94-5.76(m，1H)，4.78(br d，J＝6.6Hz，1H)，3.88-3.76(m，2H)，2.60-2.43(m，1H)，2.35-2.19(m，2H)，2.14(br s，1H)，1.85-1.73(m，1H)。ESI-MS：m/z 379.1[M+Na]+。
步骤D.(S)-(((5-(苄氧基)环戊-1-烯-1-基)甲氧基)甲烷三基)三苯。在0℃下，将(S)-2-((三苯甲基氧基)甲基)环戊-2-烯-1-醇(46g，129.05mmol)的DMF(二甲基甲酰胺)(460mL)溶液用NaH(8.26g，206.48mmol，60％纯度)和TBAI(四丁基碘化铵)(23.83g，64.52mmol)处理，并在0℃下搅拌1小时。在0℃下添加苄基溴(BnBr)(26.49g，154.86mmol，18.39mL)。将反应混合物在25℃下搅拌12小时。将反应混合物用水(300mL)淬灭，并用EA(3×300mL)萃取。将有机层用盐水/水(V/V＝250mL/250mL)洗涤。之后，将有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。纯化(FCC，
Figure BDA0003208444450000913
40g
Figure BDA0003208444450000914
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为2％-10％的乙酸乙酯/石油醚，速度为35mL/min)，得到(S)-(((5-(苄氧基)环戊-1-烯-1-基)甲氧基)甲烷三基)三苯(110g，95.44％产率)，为无色油状物。将该反应分2批进行。1H-NMR(400MHz，CDCl3)，δ＝7.50-7.48(m，2H)，7.48-7.46(m，3H)，7.39-7.16(m，15H)，6.02(d，J＝0.9Hz，1H)，4.72-4.64(m，1H)，4.57(s，1H)，4.53-4.47(m，1H)，3.85-3.77(m，1H)，3.73-3.65(m，1H)，2.57-2.45(m，1H)，2.38-2.26(m，1H)，2.25-2.15(m，1H)，1.93(tdd，J＝4.0，9.0，13.2Hz，1H)。LCMS：ESI-MS：m/z 469.1[M+Na]+。
步骤E.(S)-(5-(苄氧基)环戊-1-烯-1-基)甲醇。将(S)-(((5-(苄氧基)环戊-1-烯-1-基)甲氧基)甲烷三基)三苯(15g，33.59mmol)在DCM(47mL)中的溶液用三乙基硅烷(Et3SiH)(6.86g，59.03mmol，9.43mL)和三氟乙酸(TFA)(3.83g，33.59mmol，2.49mL)处理，并将混合物在0℃下搅拌0.5小时。然后添加另外的TFA(1.91g，16.79mmol，1.24mL)，并在0℃下搅拌0.5小时。将反应混合物用饱和NaHCO3溶液(300mL)洗涤，然后用DCM(200mL)萃取。将合并的有机层用盐水(300mL)洗涤，经无水MgSO4干燥，过滤并减压浓缩。纯化(FCC，
Figure BDA0003208444450000921
12g
Figure BDA0003208444450000922
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为0％-30％的乙酸乙酯/石油醚，速度为30mL/min)，得到(S)-(5-(苄氧基)环戊-1-烯-1-基)甲醇(15g，57.21％产率)，为无色油状物。将该反应分4批进行。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ7.38-7.18(m，5H)，5.94-5.73(m，1H)，4.71-4.66(m，1H)，4.62(d，J＝11.7Hz，1H)，4.47(d，J＝11.7Hz，1H)，4.32-4.20(m，2H)，2.55-2.42(m，1H)，2.34-2.17(m，2H)，2.14(br，s，1H)，1.96-1.86(m，1H)。ESI-MS：m/z226.8[M+Na]+。
步骤F.(S)-(((5-(苄氧基)环戊-1-烯-1-基)甲氧基)甲基)苯。在0℃下，向(S)-(5-(苄氧基)环戊-1-烯-1-基)甲醇(30g，146.87mmol)的二甲基甲酰胺(DMF)(300mL)溶液中添加NaH(8.81g，220.30mmol，60％纯度)和TBAI(27.12g，73.43mmol)。将混合物在0℃下搅拌1小时，然后在0℃下添加BnBr(37.68g，220.30mmol，26.17mL)。将混合物在25℃下搅拌12小时。将反应混合物用水(50mL)淬灭，并用EA(100mL)萃取。将有机层用水/盐水(V/V＝200mL/200mL)洗涤，并经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450000923
80g
Figure BDA0003208444450000924
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为0％-30％的乙酸乙酯/石油醚，速度为40mL/min)纯化残余物，得到(S)-(((5-(苄氧基)环戊-1-烯-1-基)甲氧基)甲基)苯(50g，粗制品)，为无色油状物。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝7.37-7.23(m，10H)，5.93(d，J＝1.1Hz，1H)，4.70-4.64(m，1H)，4.61-4.53(m，2H)，4.52-4.46(m，2H)，4.25-4.10(m，2H)，2.55-2.44(m，1H)，2.34-2.25(m，1H)，2.25-2.14(m，1H)，1.98-1.87(m，1H)。ESI-MS：m/z 317.0[M+Na]+。
步骤G.(1S，2S，5S)-5-(苄氧基)-1-((苄氧基)甲基)环戊烷-1，2-二醇和(1R，2R， 5S)-5-(苄氧基)-1-((苄氧基)甲基)环戊烷-1，2-二醇。在25℃下，将OsO4(0.1M，254.77mL)和N-甲基-吗啉-N-氧化物(NMO)(12.93g，110.40mmol，11.65mL)的样品依次添加到(S)-(((5-(苄氧基)环戊-1-烯-1-基)甲氧基)甲基)苯(25g，84.92mmol)在THF(400mL)和H2O(62mL)中的溶液中。在25℃下搅拌16小时后，通过添加Na2SO3(200g)、H2O(500mL)和EtOAc(1000mL)来淬灭反应。将有机相分离，并将水相用EtOAc(500mL)萃取。将合并的有机萃取物经无水Na2SO4干燥，过滤并减压蒸发。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450000931
40g
Figure BDA0003208444450000932
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为0％-30％的乙酸乙酯/石油醚，速度为30mL/min)纯化残余物，得到(1S，2S，5S)-5-(苄氧基)-1-((苄氧基)甲基)环戊烷-1，2-二醇和(1R，2R，5S)-5-(苄氧基)-1-((苄氧基)甲基)环戊烷-1，2-二醇(50g，89.64％产率)，为黄色油状物。将该反应分2批进行。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ7.39-7.32(m，4H)，7.31-7.23(m，6H)，4.59-4.51(m，3H)，4.61(s，1H)，4.47-4.39(m，1H)，4.14(br d，J＝2.6Hz，1H)，3.88-3.85(m，1H)，3.84(d，J＝9.5Hz，1H)，3.71(d，J＝9.7Hz，1H)，3.10(s，1H)，1.66-1.55(m，3H)，1.70-1.52(m，1H)。ESI-MS：m/z 351.0[M+Na]+。
步骤H.(1R，2S，5S)-2-(苄氧基)-1-((苄氧基)甲基)-5-(三苯甲基氧基)环戊-1- 醇。向(1S，2S，5S)-5-(苄氧基)-1-((苄氧基)甲基)环戊烷-1，2-二醇和(1R，2R，5S)-5-(苄氧基)-1-((苄氧基)甲基)环戊烷-1，2-二醇(25g，76.13mmol)在DCM(250mL)中的溶液中添加AgNO3(25.86g，152.25mmol)和2，4，6-三甲基吡啶(27.67g，228.38mmol，30.18mL)和[氯(二苯基)甲基]苯(25.47g，91.35mmol)。将混合物在25℃下搅拌1.5小时。将反应混合物用水(500mL)淬灭，并用DCM(500mL)萃取，并将有机层用10％乙酸(AcOH)(500mL)和饱和NaHCO3溶液(500mL)洗涤。之后，将有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450000933
40g
Figure BDA0003208444450000934
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为0％-15％的乙酸乙酯/石油醚，速度为35mL/min)纯化残余物，得到(1R，2S，5S)-2-(苄氧基)-1-((苄氧基)甲基)-5-(三苯甲基氧基)环戊-1-醇(60g，55.93％产率，81％纯度)，为黄色油状物。将该反应分2批进行。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝7.46-7.23(m，25H)，4.52(s，2H)，4.43(s，2H)，4.06(t，J＝6.9Hz，1H)，3.90-3.81(m，1H)，3.22(s，2H)，1.99-1.87(m，1H)，1.44-1.33(m，3H)。LCMS：MS：m/z 593.2[M+Na]+。
步骤I.((((1S，2R，3S)-3-(苄氧基)-2-((苄氧基)甲基)-2-氟环戊基)氧基)甲烷 三基)三苯。向(1R，2S，5S)-2-(苄氧基)-1-((苄氧基)甲基)-5-(三苯甲基氧基)环戊-1-醇(10g，17.52mmol)在DCM(73mL)中的溶液中添加三氟化二乙氨基硫(DAST)(7.06g，43.80mmol，5.79mL)。将混合物在-15℃下搅拌1.5小时。将反应混合物用饱和NaHCO3溶液(600mL)洗涤，并用DCM(200mL)萃取。将所得溶液用盐水(200mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450000941
120g
Figure BDA0003208444450000942
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为0％-5％的乙酸乙酯/石油醚，速度为25mL/min)纯化残余物，得到((((1S，2R，3S)-3-(苄氧基)-2-((苄氧基)甲基)-2-氟环戊基)氧基)甲烷三基)三苯(3.6g，11.24％产率，94％纯度)，为黄色油状物。将该反应分3批进行。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ7.54-7.19(m，25H)，4.50-4.45(m，4H)，4.16-4.12(m，2H)，3.54-3.46(m，1H)，3.32-3.22(m，1H)，2.03-1.95(m，1H)，1.38-1.31(m，3H)。19F NMR(376MHz，CDCl3)δ＝-177.68(s，1F)；LCMS：ESI-MS，m/z595.1[M+Na]+。
步骤J.(1S，2S，3S)-3-(苄氧基)-2-((苄氧基)甲基)-2-氟环戊-1-醇。将((((1S，2R，3S)-3-(苄氧基)-2-((苄氧基)甲基)-2-氟环戊基)氧基)甲烷三基)三苯(3.5g，6.11mmol)在DCM(10mL)中的溶液用Et3SiH(1.25g，10.76mmol，1.72mL)和TFA(696.81mg，6.11mmol，452.48μL)处理。将混合物在0℃下搅拌0.5小时。然后添加另外的TFA(348.41mg，3.06mmol，226.24μL)，并在0℃下搅拌0.5小时。将反应混合物用饱和NaHCO3溶液(100mL)洗涤，然后用DCM(2×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤，经无水MgSO4干燥，过滤并减压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450000943
12g
Figure BDA0003208444450000944
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为0％-30％的乙酸乙酯/石油醚，速度为30mL/min)纯化残余物，得到(1S，2S，3S)-3-(苄氧基)-2-((苄氧基)甲基)-2-氟环戊-1-醇(3g，74.29％产率，100％纯度)，为无色油状物。将该反应分两批进行。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝7.40-7.18(m，10H)，4.96(d，J＝6.3Hz，1H)，4.57-4.50(m，3H)，4.49-4.43(m，1H)，4.04-3.85(m，2H)，3.83-3.62(m，2H)，2.08-1.87(m，2H)，1.61-1.44(m，2H)。LCMS：ESI-MS：m/z 352.9[M+Na]+。
步骤K：(((1S，2R，3S)-3-(苄氧基)-2-((苄氧基)甲基)-2-氟环戊基)氧基)(叔丁 基)二甲基硅烷。向(1S，2S，3S)-3-(苄氧基)-2-((苄氧基)甲基)-2-氟环戊-1-醇(3.0g，9.08mmol)的DMF(10mL)溶液中添加咪唑(3.71g，54.48mmol)和叔丁基二甲基甲硅烷基氯化物(TBSCl)(3.42g，22.70mmol)。将混合物在25℃下搅拌12小时。将反应用H2O(50mL)淬灭，并用EA(50mL*2)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并低压浓缩。通过柱色谱法(SiO2，石油醚/乙酸乙酯＝100/1至10/1)纯化残余物，得到(((1S，2R，3S)-3-(苄氧基)-2-((苄氧基)甲基)-2-氟环戊基)氧基)(叔丁基)二甲基硅烷(3.96g，98.08％产率)，为无色油状物。LCMS：ESI-MS：m/z 445.2，[M+H]+，467.1[M+Na]+。
步骤L：(1S，2R，3S)-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2-氟-2-(羟甲基)环戊- 1-醇。向(((1S，2R，3S)-3-(苄氧基)-2-((苄氧基)甲基)-2-氟环戊基)氧基)(叔丁基)二甲基硅烷(2.0g，4.50mmol)在MeOH(100mL)中的溶液中添加Pd/C(1.5g，10％纯度)和乙酸(HOAc)(675.27mg，11.24mmol，643.11μL)。将悬浮液在真空下脱气并用H2吹扫几次。在H2气球(15psi)下，将混合物在25℃下搅拌12小时。将反应混合物滤出，并将滤液低压浓缩。通过柱色谱法(SiO2，石油醚(PE)/乙酸乙酯＝100/1至5/1)纯化残余物，得到(1S，2R，3S)-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2-氟-2-(羟甲基)环戊-1-醇(1.1g，92.49％产率)，为黄色油状物。1H NMR(400MHz，CD3OD)δ＝4.29-4.10(m，2H)，3.91-3.67(m，2H)，2.28-2.13(m，1H)，2.11-1.97(m，1H)，1.65(dddd，J＝1.8，7.4，12.6，18.1Hz，1H)，1.53-1.38(m，1H)，1.00-0.84(m，9H)，0.07--0.07(m，6H)。19F NMR(376MHz，CD3OD)δ＝-185.71(br，dd，J＝15.8，28.2Hz，1F)。
步骤M：(1S，2R，3S)-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2-(((叔丁基二甲基甲硅 烷基)氧基)甲基)-2-氟环戊-1-醇。向(1S，2R，3S)-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2-氟-2-(羟甲基)环戊-1-醇(1.1g，4.16mmol)在DMF(5mL)中的溶液中添加咪唑(1.13g，16.64mmol)和TBSCl(940.55mg，6.24mmol)。将混合物在25℃下搅拌12小时。将反应用H2O(5mL)淬灭。将所得溶液用乙酸乙酯(EA)(2×50mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并低压浓缩。通过柱色谱法(SiO2，石油醚/乙酸乙酯＝100/1至10/1)纯化残余物，得到(1S，2R，3S)-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-2-氟环戊-1-醇(0.912g，57.89％产率)，为无色油状物。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝4.43-4.20(m，1H)，4.20-3.96(m，2H)，3.05(br，s，1H)，2.37-2.17(m，1H)，2.04-1.93(m，1H)，1.80-1.66(m，1H)，1.60-1.40(m，1H)，1.37-1.22(m，1H)，1.02-0.83(m，18H)，0.25-0.01(m，12H)。19FNMR(376MHz，CDCl3)δ＝-179.49(s，1F)。
步骤N：(2S，3S)-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2-(((叔丁基二甲基甲硅烷 基)氧基)甲基)-2-氟环戊-1-酮。向(1S，2R，3S)-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-2-氟环戊-1-醇(760mg，2.01mmol)在DCM(15mL)中的溶液中添加1，1，1-三乙酰氧基-1，1-二氢-1，2-苯碘酰-3(1H)-酮(Dess-Martin过碘烷/或DMP)(1.70g，4.01mmol)。将混合物在25℃下搅拌2小时。将反应混合物低压浓缩。将残余物在EA/PE(10mL，10/1)中搅拌并滤出。将滤液低压浓缩。通过柱色谱法(SiO2，石油醚/乙酸乙酯＝100/0至30/1)纯化残余物，得到(2S，3S)-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-2-氟环戊-1-酮(0.750g，99.21％产率)，为无色油状物。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝4.54-4.42(m，1H)，3.84-3.70(m，2H)，2.60-2.44(m，1H)，2.27-2.09(m，2H)，2.09-1.92(m，1H)，0.88(d，J＝4.5Hz，18H)，0.15-0.05(m，12H)。19F NMR(376MHz，CDCl3)δ＝-182.78(s，1F)。
步骤O：叔丁基(((1S，2S)-2-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-1-氟-5-亚甲基环 戊基)甲氧基)二甲基硅烷。向溴化甲基(三苯基)鏻(2.13g，5.97mmol)在甲苯(5mL)中的溶液中添加2-甲基丁-2-醇钾(3.02g，5.97mmol，3.47mL，25％纯度)，并在25℃下搅拌1小时。然后添加(2S，3S)-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-2-氟环戊-1-酮(750mg，1.99mmol)的甲苯(4mL)溶液，并将混合物在25℃下搅拌4小时。将反应混合物用饱和NH4Cl水溶液(30mL)淬灭，并用EA(50mL*2)萃取。将所得溶液经无水Na2SO4干燥，并低压浓缩。纯化(FCC，SiO2，PE)得到叔丁基(((1S，2S)-2-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-1-氟-5-亚甲基环戊基)甲氧基)二甲基硅烷(686mg，91.95％产率)，为无色油状物。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ5.30-5.24(m，1H)，5.16(td，J＝2.1，4.3Hz，1H)，4.22(td，J＝5.9，11.1Hz，1H)，3.82-3.58(m，2H)，2.64-2.47(m，1H)，2.21-2.16(m，1H)，2.07-1.97(m，1H)，1.88-1.68(m，1H)，0.93-0.83(m，18H)，0.14-0.00(m，12H)。19F NMR(376MHz，CDCl3)δ-182.77(s，1F)。
步骤P：(1S，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅 烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊-1-醇和(1R，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基) 氧基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊-1-醇。在25℃下，向CH3COOH(6.73mg，112.10μmol，6.41μL)在DCM(3mL)中的溶液中添加二氧化硒(12.44mg，112.10μmol)和2-氢过氧基-2-甲基丙烷(5.5M，407.62μL)，并在25℃下搅拌30分钟。添加叔丁基(((1S，2S)-2-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-1-氟-5-亚甲基环戊基)甲氧基)二甲基硅烷(420mg，1.12mmol)在DCM(2mL)中的溶液，并搅拌72小时。将反应用DCM(5mL)稀释，并添加1.0g硅胶。将所得混合物低压浓缩。通过柱色谱法(SiO2，石油醚/乙酸乙酯＝200/1至20/1)纯化残余物，得到(1S，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊-1-醇(98mg，22.38％产率)，为无色油状物：1H NMR(400MHz，CDCl3)δ5.54-5.45(m，2H)，4.74(br，t，J＝5.8Hz，1H)，4.43(td，J＝5.4，7.7Hz，1H)，3.86-3.57(m，2H)，2.21-2.07(m，1H)，1.89-1.74(m，1H)，0.89(d，J＝3.0Hz，18H)，0.18--0.05(m，12H)；19F NMR(376MHz，CDCl3)δ＝-167.29(s，1F)；以及(1R，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊-1-醇(50mg，11.84％产率)，为无色油状物：1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝5.62(dd，J＝1.1，3.3Hz，1H)，5.49(dd，J＝1.8，2.6Hz，1H)，4.47-4.35(m，1H)，4.33(br d，J＝9.7Hz，1H)，3.67(dd，J＝11.7，13.2Hz，1H)，3.54-3.39(m，1H)，2.76(d，J＝11.2Hz，1H)，2.13-2.00(m，1H)，1.97-1.82(m，1H)，0.89(d，J＝3.1Hz，18H)，0.15--0.04(m，12H)；19F NMR(376MHz，CDCl3)δ＝-167.63(br，1F)。
方法B：
(1R，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基) 氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊-1-醇。
步骤A：(1R，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅 烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基4-硝基苯甲酸酯。在0℃下，向(1S，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊-1-醇(方法A，步骤P的产物，185mg，473.53μmol)和对硝基苯甲酸(PNBA)(126.62mg，757.66μmol)在THF(2mL)中的溶液中添加偶氮二甲酸二异丙酯(DIAD)(287.26mg，1.42mmol，276.21μL)和三苯基膦(PPh3)(372.60mg，1.42mmol)。将混合物在25℃下搅拌12小时。将反应混合物减压浓缩。通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝100/1至70/1)纯化残余物，得到(1R，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基4-硝基苯甲酸酯(150mg，58.68％产率)，为无色油状物。LCMS：ESI-MS：m/z 562.2[M+Na]+。
步骤B：(1R，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅 烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊-1-醇。将(1R，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基4-硝基苯甲酸酯(75mg，138.94μmol)用NH3(7M，2mL，在CH3OH中)处理。将混合物在25℃下搅拌1小时。将反应混合物减压浓缩。通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝100/1至70/1)纯化残余物，得到(1R，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊-1-醇(51mg，46.98％产率)，为无色油状物。
中间体3：(3R，4S)-4-(苄氧基)-3-((苄氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊-1-醇。
Figure BDA0003208444450000981
步骤A：(2R，3S)-3-(苄氧基)-2-((苄氧基)甲基)-2-氟环戊-1-酮。将Dess-Martin过碘烷(3.72g，8.78mmol)添加到(1S，2S，3S)-3-(苄氧基)-2-((苄氧基)甲基)-2-氟环戊-1-醇(中间体2，步骤J的产物，1.45g，4.39mmol)在DCM(20mL)中的溶液中。将所得混合物在28℃下搅拌2小时。将反应混合物用水(2×100mL)洗涤。将所得有机层分离，并用饱和碳酸氢钠溶液(150mL)和盐水(80mL)洗涤，并经无水硫酸钠干燥。将所得溶液低压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450000991
12g
Figure BDA0003208444450000992
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为0％-10％的乙酸乙酯/石油醚，速度为20mL/min)纯化残余物，得到(2R，3S)-3-(苄氧基)-2-((苄氧基)甲基)-2-氟环戊-1-酮(1.29g，89.51％产率)，为无色油状物。ESI-MS：m/z 351.0[M+Na]+。
步骤B：((((1R，2S)-2-(苄氧基)-1-氟-5-亚甲基环戊基)甲氧基)甲基)苯。在25℃下，向溴化甲基(三苯基)鏻(2.77g，7.77mmol)在甲苯(16mL)中的溶液中添加2-甲基丁-2-醇钾(3.92g，7.77mmol，4.51mL，25％纯度)，并在25℃下搅拌1小时。在0℃下添加(2R，3S)-3-(苄氧基)-2-((苄氧基)甲基)-2-氟环戊-1-酮(850.00mg，2.59mmol)的甲苯(6mL)溶液，并在25℃下再搅拌2小时。将反应用饱和NH4Cl水溶液(50mL)淬灭，并用EA(20mL*2)萃取。将有机层用盐水(50mL)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，低压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450000993
12g
Figure BDA0003208444450000994
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为0％-20％的乙酸乙酯/石油醚，速度为20mL/min)纯化残余物，得到((((1R，2S)-2-(苄氧基)-1-氟-5-亚甲基环戊基)甲氧基)甲基)苯(798mg，94.45％产率)，为无色油状物。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝7.36-7.23(m，10H)，5.34-5.28(m，1H)，5.22-5.17(m，1H)，4.67-4.58(m，4H)，4.18-4.13(m，1H)，3.90-3.80(m，2H)，2.53-2.44(m，2H)，2.02-1.92(m，1H)，1.90-1.79(m，1H)。LCMS：ESI-MS：m/z349.1[M+Na]+。
步骤C：(3R，4S)-4-(苄氧基)-3-((苄氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊-1-醇。
在25℃下，向SeO2(13.26mg，119.48μmol)在DCM(4mL)中的溶液中添加叔丁基氢过氧化物(TBHP)(5.5M，434.49μL)和CH3COOH(4.78mg，79.66μmol，4.56μL)，并在25℃下搅拌30分钟。添加((((1R，2S)-2-(苄氧基)-1-氟-5-亚甲基环戊基)甲氧基)甲基)苯(260.00mg，796.56μmol)的DCM(2mL)溶液，并搅拌50小时。将反应混合物用DCM(6mL)稀释，并添加2g硅胶。将混合物低压浓缩。通过柱色谱法(SiO2，石油醚/乙酸乙酯＝30/1至8/1)纯化残余物，得到(3R，4S)-4-(苄氧基)-3-((苄氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊-1-醇(0.115g，42.16％产率)，为无色油状物。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝7.41-7.18(m，10H)，5.74-5.47(m，2H)，4.84-4.55(m，5H)，4.41-4.23(m，1H)，3.93-3.43(m，3H)，2.38-2.17(m，1H)，1.98-1.86(m，1H)。LCMS：ESI-MS：m/z 365.1[M+Na]+。
中间体4.N，N-Di-BOC-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-胺。
Figure BDA0003208444450001001
步骤A：N，N，N-Tri-BOC-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-胺。向7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-胺(500mg，3.73mmol)在THF(10mL)中的溶液中添加4-二甲基氨基吡啶(DMAP)(45.54mg，372.75μmol)和二碳酸二叔丁酯(Boc2O)(4.07g，18.64mmol，4.28mL)。将混合物在25℃下搅拌12小时。将反应混合物低压浓缩。将残余物溶解在EA(10mL)中。将所得溶液用0.5N HCl(10mL)和盐水(10mL)洗涤，并低压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001002
12g
Figure BDA0003208444450001003
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为0％-30％的乙酸乙酯/石油醚，速度为25mL/min)纯化残余物，得到标题化合物(0.68g，41.99％产率，100％纯度)，为白色固体。1H NMR(400MHz，CD3OD)δ＝8.85(s，1H)，7.90(d，J＝4.3Hz，1H)，6.63(d，J＝4.0Hz，1H)，1.70(s，9H)，1.42-1.31(m，18H)。LCMS：ESI-MS：m/z 435.2，[M+H]+；457.1[M+Na]+。
步骤B：N，N-Di-BOC-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-胺。向N，N，N-Tri-BOC-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-胺(0.650g，1.50mmol)在MeOH(20mL)中的溶液中添加饱和NaHCO3水溶液(10mL)，并在50℃下搅拌1小时。将反应混合物用水(10mL)稀释，并用EA(10mL*3)萃取。将有机层用盐水(10mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并低压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001004
4g
Figure BDA0003208444450001005
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为0％-30％的乙酸乙酯/石油醚，速度为20mL/min)纯化残余物，得到N，N-Di-BOC-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-胺(366mg，73.17％产率)，为白色固体。1H NMR(400MHz，CD3OD)δ＝8.65(s，1H)，7.55(d，J＝3.5Hz，1H)，6.49(d，J＝3.5Hz，1H)，1.46-1.27(m，18H)。
中间体5：2-异丁酰胺基-9H-嘌呤-6-基二苯基氨基甲酸酯。
Figure BDA0003208444450001011
步骤A：N-(6-氧代-6，9-二氢-1H-嘌呤-2-基)异丁酰胺。在30℃和N2下，向2-氨基-1，9-二氢-6H-嘌呤-6-酮(5g，33.08mmol)在DMF(50mL)中的溶液中一次性添加异丁酸酐(14.13g，89.33mmol，14.81mL)。将反应混合物在155℃下搅拌4小时。将反应混合物冷却至室温，并将沉淀过滤，得到白色固体。将滤饼用EtOH/H2O(1∶1，50mL*3)洗涤，并减压干燥。得到N-(6-氧代-6，9-二氢-1H-嘌呤-2-基)异丁酰胺(13.7g，2批，61.93mmol，93.59％产率)，为白色固体。1H NMR(400MHz，DMSO)δ＝13.26(br，1H)，12.06(br，1H)，11.52(br，1H)，8.01(s，1H)，2.78-2.71(m，1H)，1.12-1.10(m，6H)。
步骤B：N-(9-乙酰基-6-氧代-6，9-二氢-1H-嘌呤-2-基)异丁酰胺。在30℃和N2下，向N-(6-氧代-6，9-二氢-1H-嘌呤-2-基)异丁酰胺(3.6g，16.27mmol)在DMF(20mL)中的溶液中一次性添加乙酸乙酰脂(4.32g，42.31mmol，3.96mL)。将反应混合物在100℃下搅拌2小时。通过减压蒸发完全除去溶剂，得到白色固体。将残余物悬浮在EtOH(20mL)中，过滤，并将沉淀用EtOH(5mL*3)洗涤，得到白色固体。得到N-(9-乙酰基-6-氧代-6，9-二氢-1H-嘌呤-2-基)异丁酰胺(2.9g，11.02mmol，67.69％产率)，为白色固体。1H NMR(400MHz，DMSO)δ＝12.28(br，1H)，11.72(br，1H)，8.46(s，1H)，2.83-2.74(m，4H)，1.15(s，3H)，1.13(s，3H)。
步骤C：9-乙酰基-2-异丁酰胺基-9H-嘌呤-6-基二苯基氨基甲酸酯。在25℃和N2下，向N-(9-乙酰基-6-氧代-6，9-二氢-1H-嘌呤-2-基)异丁酰胺(2.9g，11.02mmol)在吡啶(60mL)中的悬浮液中一次性添加N，N-二异丙基乙胺(Hünig碱或DIPEA或DIEA)(2.85g，22.03mmol，3.84mL)。在添加二苯基氨基甲酰氯(2.81g，12.12mmol)后，将反应混合物在25℃下搅拌2小时。将水(4mL)添加到反应混合物中，并将所得混合物搅拌10分钟。通过减压蒸发完全除去溶剂，得到棕色固体。将粗产物直接用于下一步骤中，无需进一步纯化。得到9-乙酰基-2-异丁酰胺基-9H-嘌呤-6-基二苯基氨基甲酸酯(6g，粗制物)，为棕色固体。
步骤D：2-异丁酰胺基-9H-嘌呤-6-基二苯基氨基甲酸酯。将9-乙酰基-2-异丁酰胺基-9H-嘌呤-6-基二苯基氨基甲酸酯(5.05g，11.02mmol)在EtOH(40mL)和H2O(40mL)中的混合物在100℃下搅拌2小时。将反应物冷却至室温，并将沉淀过滤，得到棕色固体。将残余物悬浮在EtOH(30mL)中，过滤，并将滤饼用EtOH(10mL*3)洗涤，得到白色固体。得到2-异丁酰胺基-9H-嘌呤-6-基二苯基氨基甲酸酯(3.9g，9.37mmol，84.98％产率)，为白色固体。1HNMR(400MHz，DMSO)δ＝10.59(br，1H)，8.43(s，1H)，7.48-7.30(m，11H)，2.80-7.77(m，1H)，1.09(s，3H)，1.07(s，3H)。
中间体6：3-苯甲酰基-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮。
Figure BDA0003208444450001021
步骤A：1，3-二苯甲酰基-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮。在30℃和N2下，向5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(5g，39.65mmol)在CH3CN(100mL)中的溶液中分批添加吡啶(14.70g，185.84mmol，15.00mL)。在添加苯甲酰氯(BzCl)(19.51g，138.76mmol，16.12mL)后，将反应混合物在30℃下搅拌12小时。真空除去溶剂，得到黄色油状物。通过硅胶柱色谱法(石油醚∶乙酸乙酯＝3∶1至1∶1)纯化残余物，得到1，3-二苯甲酰基-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(25g，2批，74.78mmol，94.30％产率)，为淡黄色固体。LCMS：ESI-MS：m/z＝357.0[M+Na]+。
步骤B：3-苯甲酰基-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮。在30℃和N2下，向1，3-二苯甲酰基-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(6g，17.95mmol)在二氧杂环己烷(40mL)中的溶液中一次性添加K2CO3(0.5M，17.95mL)。将反应混合物在30℃下搅拌1小时。减压除去二氧杂环己烷。通过从乙腈(5mL)和水(50mL)中重结晶纯化残余物，得到3-苯甲酰基-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(3.8g，16.51mmol，91.97％产率，100％纯度)，为白色固体。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝11.40(bs，1H)，7.94(br，d，J＝7.6Hz，2H)，7.77-7.76(m，1H)，7.62-7.54(m，3H)，1.82(s，3H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝252.9[M+Na]+。
中间体7.((1S，3R，5S)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-羟基-2- 亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯。
Figure BDA0003208444450001031
步骤A：(4S，5R)-4-羟基-5-(羟甲基)二氢呋喃-2(3H)-酮。在0℃下，向(4S，5R)-5-(羟甲基)四氢呋喃-2，4-二醇(35g，260.94mmol)在H2O(400mL)中的溶液中添加Br2(125.10g，782.82mmol，40.36mL)，并在25℃下搅拌16小时。通过在0℃下添加Na2SO3(固体)来淬灭反应，得到澄清的黄色溶液，在35℃下将其减压浓缩以除去溶剂。将残余物溶解在EtOH(500mL)中，并使用Na2SO3(固体)调节至pH＝7，然后过滤。将滤液真空浓缩。将残余物溶解在DCM/EtOH(900mL/300mL)中，并在25℃下搅拌30分钟，并过滤。将滤液真空浓缩，得到粗制(4S，5R)-4-羟基-5-(羟甲基)二氢呋喃-2(3H)-酮(126g，953.72mmol，91.37％产率)，为无色油状物。(4批)。1H NMR(400MHz，D2O)δ＝4.53-4.45(m，2H)，3.85-3.76(m，1H)，3.75-3.65(m，1H)，2.98(dd，J＝7.0，18.6Hz，1H)，2.58-2.45(m，1H)。
步骤B：(2R，3S)-5-氧代-2-((新戊酰氧基)甲基)四氢呋喃-3-基新戊酸酯。在0℃下，向(4S，5R)-4-羟基-5-(羟甲基)二氢呋喃-2(3H)-酮(20g，151.38mmol)在吡啶(60mL)中的溶液中滴加2，2-二甲基丙酰氯(41.98g，348.18mmol，42.84mL)。将混合物在45℃下搅拌12小时。将反应混合物用MeOH(40mL)淬灭。将反应混合物减压浓缩。将残余物溶解在EA(100mL)中，并将所得溶液用H2O(100mL*2)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过柱色谱法(35/1至5/1的PE/EA)纯化残余物，得到的(2R，3S)-5-氧代-2-((新戊酰氧基)甲基)四氢呋喃-3-基新戊酸酯(35g，116.53mmol，76.98％产率)，为白色固体。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝5.25(td，J＝1.7，7.4Hz，1H)，4.63(dt，J＝1.4，3.1Hz，1H)，4.41-4.34(m，1H)，4.31-4.24(m，1H)，3.02(dd，J＝7.6，18.9Hz，1H)，2.61(dd，J＝1.8，18.7Hz，1H)，1.22-1.18(m，18H)。
步骤C：(2R，3S)-5-羟基-2-((新戊酰氧基)甲基)四氢呋喃-3-基新戊酸酯。在-60℃下，向(2R，3S)-5-氧代-2-((新戊酰氧基)甲基)四氢呋喃-3-基新戊酸酯(10g，33.29mmol)在THF(100mL)中的溶液中添加二异丁基氢化铝(DIBAL-H、DIBAL)(1M，99.88mL，3当量)，并在-60℃下搅拌3小时。将反应在-30℃下用MeOH(50mL)淬灭，并用EA(100mL)稀释。将反应混合物过滤，并将滤液减压浓缩。通过柱色谱法(PE/EA＝30/1至3/1)纯化残余物，得到(2R，3S)-5-羟基-2-((新戊酰氧基)甲基)四氢呋喃-3-基新戊酸酯(4.2g，13.89mmol，41.72％产率)，为无色油状物。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝5.59-5.65(m，1H)，5.12-5.23(m，1H)，4.38-4.39(m，1H)，4.13-4.24(m，2H)，2.33-2.39(m，1H)，2.04-2.07(m，1H)，1.19-1.26(m，18H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝604.3[2M+H]+。
步骤D：(2R，3S)-2，5-二羟基庚-6-炔-1，3-二基双(2，2-二甲基丙酸酯)。在-78℃下，向(2R，3S)-5-羟基-2-((新戊酰氧基)甲基)四氢呋喃-3-基新戊酸酯(4.2g，13.89mmol)在THF(40mL)中的溶液中滴加溴乙炔基镁(0.5M，83.34mL)。将混合物在25℃下搅拌2小时。通过添加饱和NH4Cl溶液(50mL)以达到pH＝7来淬灭反应混合物。将所得混合物用EA(30mL)萃取，并用盐水(2*30mL)洗涤。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过柱色谱法(PE/EA＝15/1至3/1)纯化残余物，得到(2R，3S)-2，5-二羟基庚-6-炔-1，3-二基双(2，2-二甲基丙酸酯)(4g，12.18mmol，87.69％产率)，为无色油状物。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝5.03-5.11(m，1H)，4.34-4.56(m，1H)，4.21-4.25(m，1H)，4.11-4.16(m，1H)，3.94-3.99(m，1H)，2.95-3.02(br，s，1H)，2.46-2.49(dd，J＝6.15，2.13Hz，1H)，1.98-2.25(m，3H)，1.20-1.23(m，18H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝351.1[M+Na]+。
步骤E：(2R，3S)-5-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2-羟基庚-6-炔-1，3-二基双 (2，2-二甲基丙酸酯)。向(2R，3S)-2，5-二羟基庚-6-炔-1，3-二基双(2，2-二甲基丙酸酯)(4g，12.18mmol)在DMF(6mL)中的溶液中添加咪唑(2.49g，36.54mmol)和叔丁基-氯-二甲基-硅烷(2.75g，18.27mmol，2.24mL)，并在25℃下搅拌12小时。将反应混合物用MeOH(10mL)淬灭，并用EA(30mL)萃取。将所得的溶液用盐水(15mL*2)洗涤。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过柱色谱法(PE/EA＝35/1至3/1)纯化残余物，得到(2R，3S)-5-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2-羟基庚-6-炔-1，3-二基双(2，2-二甲基丙酸酯)(2.5g，5.65mmol，46.37％产率)，为黄色油状物。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝5.03-5.15(m，1H)，4.40-4.53(m，1H)，4.06-4.17(m，2H)，3.96-4.01(m，1H)，2.73-2.91(m，1H)，2.42-2.45(dd，J＝11.04，2.26Hz，1H)，2.02-2.20(m，2H)，1.19-1.27(m，18H)，0.89-0.91(m，9H)，0.09-0.19(m，6H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝465.1[M+Na]+。
步骤F：(3S)-5-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2-氧代庚-6-炔-1，3-二基双(2， 2-二甲基丙酸酯)。在0℃下，向(2R，3S)-5-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2-羟基庚-6-炔-1，3-二基双(2，2-二甲基丙酸酯)(16g，36.15mmol)在DCM(100mL)中的溶液中添加Dess-Martin过碘烷(45.99g，108.44mmol，33.57mL)，并在25℃下搅拌2小时。通过添加饱和NaHCO3和Na2SO3溶液(1∶1，100mL)来淬灭反应混合物。将所得溶液用盐水(100mL*2)洗涤。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过硅胶柱(PE/EA＝250/1至20/1)纯化残余物，得到(3S)-5-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2-氧代庚-6-炔-1，3-二基双(2，2-二甲基丙酸酯)(15g，34.04mmol，94.18％产率)，为无色油状物。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝5.24-5.10(m，1H)，4.53-4.40(m，1H)，4.23-3.98(m，1H)，3.00-2.86(m，1H)，2.79-2.64(m，1H)，2.41-2.27(m，1H)，2.24-2.00(m，2H)，1.24-1.02(m，18H)，0.88-0.70(m，9H)，0.15-0.07(m，6H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝463.2[M+Na]+。
步骤G：(3S)-5-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2-亚甲基庚-6-炔-1，3-二基双 (2，2-二甲基丙酸酯)。在0℃和N2下，向溴甲基三苯基膦(648.55mg，1.82mmol)在THF(2.5mL)中的溶液中滴加n-BuLi(2.5M，680.82μL)。将混合物在0℃下搅拌0.5小时。在0℃下，滴加(3S)-5-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2-氧代庚-6-炔-1，3-二基双(2，2-二甲基丙酸酯)(0.5g，1.13mmol)在THF(2.5mL)中的溶液。将反应用饱和NH4Cl溶液(2mL)缓慢淬灭。将所得混合物用EA(20mL*2)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤。将滤液真空浓缩，得到黑色油状物。通过柱色谱法(SiO2，石油醚/乙酸乙酯＝100/1至20/1)纯化残余物，得到(3S)-5-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2-亚甲基庚-6-炔-1，3-二基双(2，2-二甲基丙酸酯)(0.3g，683.88μmol，60.27％产率)，为无色油状物。1H-NMR(400MHz，CDCl3)δ＝5.33(dd，J＝4.2，9.3Hz，1H)，5.17-5.01(m，2H)，4.54-4.43(m，2H)，4.33(ddd，J＝2.1，6.0，8.3Hz，1H)，2.34-2.27(m，1H)，2.08-1.89(m，2H)，1.19-0.99(m，18H)，0.84-0.70(m，9H)，0.02(d，J＝13.0Hz，6H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝461.2[M+Na]+。
步骤H：(1S)-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-1-((R)-2-((新戊酰氧基)甲基) 环氧乙烷-2-基)戊-4-炔-1-基新戊酸酯。在0℃下，向(3S)-5-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2-亚甲基庚-6-炔-1，3-二基双(2，2-二甲基丙酸酯)(1.3g，2.96mmol)在DCM(20mL)中的溶液中添加间氯过氧苯甲酸(m-CPBA)(1.80g，8.89mmol，85％纯度)。将混合物在45℃下搅拌12小时。将反应混合物用DCM(15mL)稀释，并用饱和NaHCO3溶液(10mL)淬灭。将有机相用盐水(20mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过柱色谱法(PE/EA＝70/1至20/1)纯化残余物，得到(1S)-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-1-((R)-2-((新戊酰氧基)甲基)环氧乙烷-2-基)戊-4-炔-1-基新戊酸酯(1g，2.20mmol，74.2％产率)，为无色油状物。1HNMR(400MHz，CDCl3)δ＝5.22-5.07(m，1H)，4.48-4.38(m，1H)，4.36-4.28(m，1H)，4.27-4.19(m，1H)，2.88-2.72(m，2H)，2.47-2.40(m，1H)，2.13-2.04(m，2H)，1.26-1.18(m，18H)，0.93-0.85(m，9H)，0.12(d，J＝10.0Hz，6H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝455.2[M+H]+。
步骤I：((1S，3R，5S)-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-1-(羟甲基)-2-亚甲基- 5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯。在Ar下，将Zn(2.59g，39.59mmol)和Cp2TiCl2(3.28g，13.19mmol，3当量)在THF(70mL)中的混合物在25℃下搅拌1小时。在Ar下，添加(1S)-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-1-((R)-2-((新戊酰氧基)甲基)环氧乙烷-2-基)戊-4-炔-1-基新戊酸酯(2g，4.40mmol)的THF(90mL)溶液，并将混合物在25℃下搅拌16小时。将混合物用饱和NH4Cl溶液(50mL)淬灭并搅拌2小时。将所得溶液用EA(60mL*2)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001061
12g
Figure BDA0003208444450001062
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为0％-6.7％的乙酸乙酯/石油醚，速度为35mL/min)纯化残余物，得到((1S，3R，5S)-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-1-(羟甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.55g，1.20mmol，13.69％产率)，为无色油状物；1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝5.33(d，J＝2.0Hz，1H)，5.15-5.13(m，1H)，5.12(d，J＝2.2Hz，1H)，4.51-4.41(m，1H)，4.14-4.01(m，2H)，3.76(s，2H)，2.54-2.44(m，1H)，1.76-1.66(m，1H)，1.20-1.16(m，12H)，0.93-0.87(m，12H)，0.12-0.06(m，9H)；LCMS：ESI-MS：m/z＝479.3[M+H]+；以及((1R，3R，5S)-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-1-(羟甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(1.8g，3.94mmol，44.80％产率)，为无色油状物。
步骤J：((1S，3R，5S)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-((叔丁基二 甲基甲硅烷基)氧基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯。向((1S，3R，5S)-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-1-(羟甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(1.1g，2.41mmol)在DCM(12mL)中的溶液中添加AgNO3(818.32mg，4.82mmol，810.21μL)、2，4，6-三甲基吡啶(可力丁)(583.76mg，4.82mmol，636.60μL)和4，4′-二甲氧基三苯甲基氯(DMTrCl)(1.22g，3.61mmol)。将混合物在25℃下搅拌2小时。将混合物用MeOH(1mL)淬灭，并低压除去溶剂。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001071
4g
Figure BDA0003208444450001072
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为0％-5％的乙酸乙酯/石油醚，速度为22mL/min)纯化残余物，得到((1S，3R，5S)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(1.38g，1.82mmol，75.48％产率，100％纯度)，为白色泡沫。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝7.27-7.43(m，7H)，7.17-7.24(m，2H)，6.78-6.81(m，4H)，5.26-5.45(m，2H)，5.04-5.08(dd，J＝9.16，6.40Hz，1H)，4.45-4.50(m，1H)，4.24-4.26(d，J＝11.04Hz，1H)，3.95-4.01(m，1H)，3.78(s，6H)，3.37-3.39(d，J＝9.03Hz，1H)，3.21-3.23(d，J＝9.29Hz，1H)，2.34-2.40(dt，J＝12.55，6.53Hz，1H)，1.66-1.73(dt，J＝12.05，8.91Hz，1H)，1.06-1.14(m，9H)，0.89-1.04(m，18H)，0.05-0.12(m，6H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝781.4[M+Na]+。
步骤K：((1S，3R，5S)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-羟基-2-亚 甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯。将((1S，3R，5S)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(1.38g，1.82mmol)用四正丁基氟化铵(TBAF)(1M，5.45mL)在25℃下处理1.5小时。将混合物用EA(50mL)萃取，并用盐水(50mL)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001081
12g
Figure BDA0003208444450001082
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为3％-17％的乙酸乙酯/石油醚，速度为35mL/min)纯化残余物，得到((1S，3R，5S)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-羟基-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.989g，1.49mmol，81.84％产率，97％纯度)，为无色油状物。1H-NMR(400MHz，CDCl3)，δ＝7.40-7.39(m，2H)，7.29-7.21(m，7H)，6.82-6.80(m，4H)，5.47-5.42(m，2H)，5.15-5.11(m，1H)，4.53-4.47(m，2H)，4.22-4.06(m，2H)，3.78(s，6H)，3.42-3.32(m，2H)，2.49-2.42(m，1H)，1.80-1.71(m，1H)，1.14(s，9H)，0.97(s，9H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝667.2[M+Na]+。
中间体8.1-((4S，5R)-5-((S)-1-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)丙-2-炔-1- 基)-2，2-二甲基-1，3-二氧戊环-4-基)-2-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)乙-1-酮。
Figure BDA0003208444450001083
步骤A：1-((4S，5R)-5-((R)-1-羟基-2-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)乙基)-2， 2-二甲基-1，3-二氧戊环-4-基)丙-2-炔-1-醇。将干燥的2，3-O-异亚丙基-β-D-呋喃核糖(根据Mandal，Sukhendu B.and Achari，Basude Synthetic Communications，23(9)，1239-44；1993制备)(7.6g，16mmol)溶解在160mL 0.5M乙炔基溴化镁的THF溶液中，并在室温下放置过夜。将反应用NH4Cl溶液淬灭，并将产物用EtOAc萃取。将有机层经NaSO4干燥，蒸发，并使用10％至40％的EtOAc的己烷溶液梯度通过柱色谱法进行纯化。得到7.47g标题化合物(93.7％)，为单一异构体。1H-NMR(dmso-d6)δ：7.44-7.40(m，4H)，7.38-7.28(m，8H)，6.84-6.82(m，2H)，5.87(s，1H)，4.42-4.40(d，1H)，4.18-3.90(m，3H)，3.65(s，3H)，3.21(s，1H)，3.08-2.98(m，2H)，1.22(s，3H)，1.18(s，3H)。
步骤B.(1R)-1-((4R，5R)-5-(1-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)丙-2-炔-1-基)- 2，2-二甲基-1，3-二氧戊环-4-基)-2-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)乙-1-醇。向1-((4S，5R)-5-((R)-1-羟基-2-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)乙基)-2，2-二甲基-1，3-二氧戊环-4-基)丙-2-炔-1-醇(7.3g，15mmol)在无水DMF(100mL)中的溶液中添加咪唑(1.5g，22.5mmol)和TBSCl(3.4g，22mmol)。将反应混合物在室温下放置过夜，用水淬灭，并将产物用EtOAc萃取。将有机层经NaSO4干燥，过滤并减压浓缩。纯化(FCC，SiO2，使用0％至25％的EtOAc的己烷溶液梯度)得到标题化合物(7.8g，86％)。1H-NMR(DMSO-d6)δ：7.45-7.41(m，4H)，7.36-7.24(m，8H)，6.88-6.82(m，2H)，5.30(br.s，1H)，4.80(s，1H)，4.20-3.95(m，3H)，3.70(s，3H)，3.36(s，1H)，3.05-2.95(m，2H)，1.38(s，3H)，1.18(s，3H)，0.90(s，9H)，0.10(s，6H)。
步骤C.1-((4S，5R)-5-((S)-1-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)丙-2-炔-1-基)- 2，2-二甲基-1，3-二氧戊环-4-基)-2-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)乙-1-酮。将(1R)-1-((4R，5R)-5-(1-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)丙-2-炔-1-基)-2，2-二甲基-1，3-二氧戊环-4-基)-2-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)乙-1-醇(7.8g，13mmol)和Dess-Martin过碘烷(8.3g，20mmol)在DCM(70mL)中的溶液在室温下搅拌过夜。将反应混合物用Na2S2O3和NaHCO3的溶液淬灭，并用EtOAc萃取。将有机相经NaSO4干燥，过滤并减压浓缩。纯化(FCC，SiO2，0％至25％的EtOAc的己烷溶液梯度)得到标题化合物(6.6g，85％)。1H-NMR(dmso-d6)δ：7.40-7.20(m，12H)，6.88-6.81(m，2H)，4.60(d，1H)，4.47(s，1H)，4.36-4.31(m，1H)，3.68(s，3H)，3.19(s，1H)，1.98(s，1H)，1.25(s，3H)，1.10(s，3H)，0.87(s，9H)，0.00(s，6H)。
中间体9.(6aS，8R，9aS)-8-羟基-2，2，4，4-四异丙基-7-亚甲基四氢环戊并[f][1， 3，5，2，4]三氧杂二硅辛-6a(6H)-甲腈。
Figure BDA0003208444450001091
步骤A：叔丁基(((S)-1-((4R，5R)-5-(3-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)丙-1- 烯-2-基)-2，2-二甲基-1，3-二氧戊环-4-基)丙-2-炔-1-基)氧基)二甲基硅烷。向冷却至0℃的甲基三苯基溴化鏻(3.69g，10.3mmol)在THF(12mL，0.87M)中的悬浮液中滴加正丁基锂(n-BuLi)(2.5M己烷，3.8mL，9.49mmol)。在0℃下30分钟后，经由插管滴加1-((4S，5R)-5-((S)-1-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)丙-2-炔-1-基)-2，2-二甲基-1，3-二氧戊环-4-基)-2-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)乙-1-酮(中间体8，1.07g，1.88mmol)在THF(18.8mL，0.100M)中的溶液。将异质黄色溶液在室温下搅拌过夜。将现在的棕色异质溶液冷却至0℃，并用MeOH和盐水淬灭，并用EtOAc萃取。将有机层干燥(Na2SO4)，过滤并真空浓缩，得到黄色油状物。纯化(FCC，SiO2，0％-15％EtOAc/己烷)得到叔丁基(((S)-1-((4R，5R)-5-(3-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)丙-1-烯-2-基)-2，2-二甲基-1，3-二氧戊环-4-基)丙-2-炔-1-基)氧基)二甲基硅烷，为无色油状物(0.97g，91％)。1H NMR(400MHz，CDCl3)：δ7.46-7.20(m，12H)，6.83-6.81(m，2H)，5.42(d，J＝0.8，1H)，4.76(d，J＝6.0，1H)，4.22(dd，J＝7.2，2.0，1H)，3.92(dd，J＝7.2，5.6，1H)，3.79(s，3H)，3.67(d，J＝12，1H)，3.59(d，J＝12，1H)，2.36(d，J＝2.0，1H)，1.43(s，3H)，1.37(s，3H)，0.76(s，9H)，0.06(s，3H)，-0.05(s，3H)。
步骤B.叔丁基(((1S)-1-((4R，5S)-5-(2-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基) 环氧乙烷-2-基)-2，2-二甲基-1，3-二氧戊环-4-基)丙-2-炔-1-基)氧基)二甲基硅烷。向冷却至0℃的叔丁基(((S)-1-((4R，5R)-5-(3-((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)丙-1-烯-2-基)-2，2-二甲基-1，3-二氧戊环-4-基)丙-2-炔-1-基)氧基)二甲基硅烷(4.74g，7.92mmol)在CH2Cl2(58mL，0.15M)中的溶液中一次性添加3-氯过苯甲酸(2.13g，9.50mmol)。将无色溶液在室温下搅拌过夜。将反应混合物用NaHCO3(饱和水溶液)淬灭，并分离两层，并将水层用EtOAc萃取。将合并的有机萃取物干燥(Na2SO4)，过滤并真空浓缩，得到粗制黄色油状物。纯化(FCC，SiO2，0％-15％EtOAc/己烷)得到叔丁基(((1S)-1-((4R，5S)-5-(2-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)环氧乙烷-2-基)-2，2-二甲基-1，3-二氧戊环-4-基)丙-2-炔-1-基)氧基)二甲基硅烷、主要环氧化物(2.93g，60％)(为无色油状物)和次要环氧化物(1.38g，28％)(为无色油状物)。主要环氧化物：1H NMR(400MHz，CDCl3)：δ7.47-7.44(m，4H)，7.35-7.21(m，8H)，6.84-6.82(m，2H)，4.83(d，J＝5.6，1H)，4.38(dd，J＝6.4，2.0，1H)，3.96(t，J＝6.0，1H)，3.79(s，3H)，3.61(d，J＝11，1H)，3.18(d，J＝5.2，1H)，3.12(d，J＝10，1H)，2.78(d，J＝5.2，1H)，2.32(d，J＝1.6，1H)，1.44(s，3H)，1.40(s，3H)，0.78(s，9H)，0.00(s，6H)。
步骤C.((3aR，4S，6S，6aR)-6-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-4-(((4-甲氧基苯 基)二苯基甲氧基)甲基)-2，2-二甲基-5-亚甲基四氢-4H-环戊并[d][1，3]二氧杂环戊烯- 4-基)甲醇。在氩气下向RBF(注：使用的所有RBF均用热风枪真空干燥，并在Ar(g)流下冷却。将THF脱气)中装入二(环戊二烯基)二氯化钛(IV)(Cp2TiCl2)(2.41g，9.40mmol)，并干燥搅拌5-10分钟，然后抽空，填充Ar(g)。重复该过程3次，注意不要干扰固体。添加脱气的THF(63mL，0.15M)，将所得Cp2TiCl2的THF溶液抽空，再填充Ar，并重复该过程3次。接下来添加锌(1.84g，28.2mmol)，再次将所得异质溶液脱气一次或两次。将所得深绿色溶液搅拌1小时。经由插管以缓流形式添加叔丁基(((1S)-1-((4R，5S)-5-(2-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)环氧乙烷-2-基)-2，2-二甲基-1，3-二氧戊环-4-基)丙-2-炔-1-基)氧基)二甲基硅烷(1.93g，3.13mmol)在脱气THF(31.3mL，0.10M)中的溶液，然后进行2次冲洗。添加起始材料后，将所得深蓝色溶液最后一次脱气，并搅拌24小时，在此期间它变成非常深的蓝色溶液。向冷却至0℃的该加深的蓝色溶液中添加50mL饱和NH4Cl水溶液，并在室温下剧烈搅拌过夜。将反应混合物过滤并真空浓缩以移除有机层，并用EtOAc萃取(2-3次)，经Na2SO4干燥，过滤并真空浓缩，得到黄色泡沫油状物。将该粗制油状物((3aR，4S，6S，6aR)-6-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-4-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)-2，2-二甲基-5-亚甲基四氢-4H-环戊并[d][1，3]二氧杂环戊烯-4-基)甲醇用于下一步骤中，无需进一步纯化。1HNMR(400MHz，CDCl3)：δ7.38-7.36(m，4H)，7.29-7.19(m，8H)，6.83-6.80(m，2H)，5.29(d，J＝2.0，1H)，4.90(d，J＝2.8，1H)，4.84(m，1H)，4.58(t，J＝5.6，1H)，4.45(d，J＝5.6，1H)，3.79(s，3H)，3.77(dd，J＝9.6，4.8，1H)，3.65(dd，J＝9.6，9.6，1H)，3.29(d，J＝8.4，1H)，3.16(d，J＝8.4，1H)，2.36(dd，J＝9.6，4.8，1H)，1.44(s，3H)，1.32(s，3H)，0.95(s，9H)，0.15(s，3H)，0.12(s，3H)。
步骤D.(3aR，4S，6S，6aR)-6-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-4-(((4-甲氧基苯 基)二苯基甲氧基)甲基)-2，2-二甲基-5-亚甲基四氢-4H-环戊并[d][1，3]二氧杂环戊烯- 4-甲醛。向冷却至0℃的((3aR，4S，6S，6aR)-6-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-4-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)-2，2-二甲基-5-亚甲基四氢-4H-环戊并[d][1，3]二氧杂环戊烯-4-基)甲醇(1.93g，3.13mmol)在CH2Cl2(31.3mL，0.10M)中的无色溶液中添加Dess-Martin过碘烷(1.68g，3.76mmol)。将反应混合物在室温下搅拌2小时，然后通过
Figure BDA0003208444450001121
过滤，用10mL 0.4M NaHCO3/0.4M NaS2O3洗涤，用CH2Cl2反萃取，干燥(Na2SO4)，真空浓缩，得到粗制油状物。纯化(FCC，SiO2，10％EtOAc/己烷)得到(3aR，4S，6S，6aR)-6-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-4-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)-2，2-二甲基-5-亚甲基四氢-4H-环戊并[d][1，3]二氧杂环戊烯-4-甲醛，为无色油状物。将该无色油状物用于下一步骤中(1.92g，3.13mmol)。
步骤E.(E)-6-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-4-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧 基)甲基)-2，2-二甲基-5-亚甲基四氢-4H-环戊并[d][1，3]二氧杂环戊烯-4-甲醛肟。向(3aR，4S，6S，6aR)-6-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-4-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)-2，2-二甲基-5-亚甲基四氢-4H-环戊并[d][1，3]二氧杂环戊烯-4-甲醛(1.92g，3.13mmol)在吡啶(pyr)(31mL，0.10M)中的溶液中一次性添加羟胺盐酸盐(0.87g，12.5mmol)，并搅拌过夜。将反应混合物真空浓缩，并在EtOAc/H2O之间分配。将水层用EtOAc萃取(2次)，并将合并的有机萃取物干燥(Na2SO4)，过滤并真空浓缩，得到浅黄色油状物。纯化(FCC，SiO2，0％-20％EtOAc/己烷)得到(E)-6-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-4-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)-2，2-二甲基-5-亚甲基四氢-4H-环戊并[d][1，3]二氧杂环戊烯-4-甲醛肟，为无色油状物(1.97g，3.13mmol)。
步骤F.(3aR，4S，6S，6aR)-6-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-4-(((4-甲氧基苯 基)二苯基甲氧基)甲基)-2，2-二甲基-5-亚甲基四氢-4H-环戊并[d][1，3]二氧杂环戊烯- 4-甲腈。向冷却至0℃的(E)-6-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-4-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)-2，2-二甲基-5-亚甲基四氢-4H-环戊并[d][1，3]二氧杂环戊烯-4-甲醛肟(1.97g，3.13mmol)在乙腈(ACN)(31.3mL，0.10M)中的溶液中一次性添加1，1′-羰基二咪唑(CDI)(0.761g，4.70mmol)。将反应混合物在室温下搅拌过夜。然后，将体积减小至初始体积的约1/2，并将反应混合物加热至35℃以加速反应。加热2小时后，将反应混合物冷却并真空浓缩，并在EtOAc/3-4mL H2O之间分配。将水层用EtOAc萃取，干燥(Na25O4)，过滤并真空浓缩，得到粗制油状物。纯化(FCC，SiO2，0％-10％EtOAc/己烷)得到(3aR，4S，6S，6aR)-6-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-4-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)-2，2-二甲基-5-亚甲基四氢-4H-环戊并[d][1，3]二氧杂环戊烯-4-甲腈，为无色油状物(4个步骤内，1.29g，67％)。
步骤G.(3aR，4S，6S，6aS)-6-羟基-4-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)-2， 2-二甲基-5-亚甲基四氢-4H-环戊并[d][1，3]二氧杂环戊烯-4-甲腈。向冷却至0℃的(3aR，4S，6S，6aR)-6-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-4-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)-2，2-二甲基-5-亚甲基四氢-4H-环戊并[d][1，3]二氧杂环戊烯-4-甲腈(1.29g，2.11mmol)在THF(21mL，0.10M)中的溶液中滴加TBAF(1.0M THF，3.16mL，3.16mmol)。将反应混合物在室温下搅拌1.5小时。将反应混合物用硅胶淬灭，过滤并真空浓缩，得到粗制油状物。纯化(FCC，SiO2，0％-50％EtOAc/己烷)得到(3aR，4S，6S，6aS)-6-羟基-4-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)-2，2-二甲基-5-亚甲基四氢-4H-环戊并[d][1，3]二氧杂环戊烯-4-甲腈，为无色油状物(0.957g，91％)。1H NMR(400MHz，CDCl3)：δ7.41-7.23(m，12H)，6.84(m，2H)，5.64(s，1H)，5.59(s，1H)，4.47(t，J＝5.2，1H)，4.42(d，J＝5.2，1H)，4.38(m，1H)，3.81(s，3H)，3.31(d，J＝9.6，1H)，3.12(d，J＝9.6，1H)，2.32(d，J＝12，1H)，1.47(s，3H)，1.33(s，3H)。
步骤H.(3aR，4S，6S，6aR)-6-氰基-6-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)-2， 2-二甲基-5-亚甲基四氢-4H-环戊并[d][1，3]二氧杂环戊烯-4-基苯甲酸酯。向冷却至0℃的(3aR，4S，6S，6aS)-6-羟基-4-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)-2，2-二甲基-5-亚甲基四氢-4H-环戊并[d][1，3]二氧杂环戊烯-4-甲腈(0.957g，1.93mmol)在含DMAP(0.047g，0.385mmol)的THF(7.7mL，0.25M)以及三乙胺(TEA)(2.69mL，19.3mmol)中的无色溶液中滴加苯甲酰氯(0.268mL，2.31mmol)。将异质溶液在室温下剧烈搅拌过夜。将反应混合物用NaHCO3(饱和水溶液)淬灭，并将水层用EtOAc萃取。将合并的有机萃取物干燥(NaSO4)，过滤并真空浓缩，得到粗制油状物。纯化(FCC，SiO2，0％-25％EtOAc/己烷)得到(3aR，4S，6S，6aR)-6-氰基-6-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)-2，2-二甲基-5-亚甲基四氢-4H-环戊并[d][1，3]二氧杂环戊烯-4-基苯甲酸酯，为白色泡沫状固体(0.917g，79％)。
步骤I.(1S，3S，4R，5R)-3-氰基-4，5-二羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基苯甲酸 酯。在0℃下，在良好搅拌下向装有(3aR，4S，6S，6aR)-6-氰基-6-(((4-甲氧基苯基)二苯基甲氧基)甲基)-2，2-二甲基-5-亚甲基四氢-4H-环戊并[d][1，3]二氧杂环戊烯-4-基苯甲酸酯(0.100g，0.166mmol)的圆底烧瓶(RBF)中滴加TFA：H2O(2.66mL：2.66mL，0.031M)。在室温下2.5小时后，将反应混合物与各2mL甲苯和EtOH共蒸发，并重复该过程。将如此获得的粗制油状物吸收在EtOH中，并在0℃下搅拌，用0.50g树脂键合的胺碱(约10当量)淬灭。将反应混合物在室温下搅拌5分钟，过滤并用EtOH冲洗，真空浓缩，得到黄色油状物。纯化(FCC，SiO2，3％-10％MeOH/DCM)，得到(1S，3S，4R，5R)-3-氰基-4，5-二羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基苯甲酸酯，为无色油状物(0.0391g，81％)。1H NMR(400MHz，CDCl3)：δ8.02(d，J＝8.0，1H)，7.49(t，J＝7.6，1H)，7.36(t，J＝8.00，2H)，5.60(m，1H)，5.55(s，1H)，5.48(s，1H)，4.82(d，J＝7.2，1H)，4.47(m，1H)，4.40(m，1H)，4.31(m，1H)，4.01(m，1H)，3.91(dd，J＝11.6，5.2，1H)，3.77(dd，J＝11.6，5.2，1H)。
步骤J.(6aS，8S，9S，9aR)-6a-氰基-9-羟基-2，2，4，4-四异丙基-7-亚甲基六氢环 戊并[f][1，3，5，2，4]三氧杂二硅辛-8-基苯甲酸酯。向冷却至0℃的(1S，3S，4R，5R)-3-氰基-4，5-二羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基苯甲酸酯(0.352g，1.22mmol)在吡啶(4mL，0.3M)的无色溶液中滴加1，1，3，3-四异丙基-1，3-二氯二硅氧烷(0.438mL，1.33mmol)。在20分钟内将反应混合物缓慢温热至室温。将反应混合物在室温下搅拌过夜。减压除去吡啶，在H2O和EtOAc之间分配。将有机层用NaHCO3(饱和水溶液)洗涤，并干燥(Na2SO4)，过滤并真空浓缩，得到无色油状物。纯化(FCC，SiO2，0％-15％5CV，15％2CV，15％-30％5CV)得到(6aS，8S，9S，9aR)-6a-氰基-9-羟基-2，2，4，4-四异丙基-7-亚甲基六氢环戊并[f][1，3，5，2，4]三氧杂二硅辛-8-基苯甲酸酯，为无色油状物(0.287g，44％)。1H NMR(400MHz，CDCl3)：δ8.15(d，J＝6.8，1H)，7.61(t，J＝6.8，1H)，7.48(t，J＝7.2，2H)，5，64-5.59(m，3H)，4.46(m，1H)，4.36(m，1H)，4.16(d，J＝11，1H)，3.96(d，J＝11，1H)，1.15-1.07(m，29H)。
步骤K.(6aS，8S，9S，9aR)-9-((1H-咪唑-1-硫代碳基)氧基)-6a-氰基-2，2，4，4-四 异丙基-7-亚甲基六氢环戊并[f][1，3，5，2，4]三氧杂二硅辛-8-基苯甲酸酯。将(6aS，8S，9S，9aR)-6a-氰基-9-羟基-2，2，4，4-四异丙基-7-亚甲基六氢环戊并[f][1，3，5，2，4]三氧杂二硅辛-8-基苯甲酸酯(0.0306g，0.0575mmol)在含1，1′-硫代羰基二咪唑(0.051g，0.287mmol)和4-(二甲基氨基)吡啶(0.015g，0.017mmol)的二氯乙烷(0.6mL，0.1M)中的溶液回流加热30分钟，冷却至0℃，并在搅拌下添加1-2mL MeOH。将反应混合物真空浓缩以除去大部分溶剂，用EtOAc稀释，并用H2O洗涤。将水层用EtOAc萃取，并将合并的有机萃取物干燥(Na2SO4)，过滤并真空浓缩，得到黄色油状物。纯化(0％-30％EtOAc/己烷)得到(6aS，8S，9S，9aR)-9-((1H-咪唑-1-硫代碳基)氧基)-6a-氰基-2，2，4，4-四异丙基-7-亚甲基六氢环戊并[f][1，3，5，2，4]三氧杂二硅辛-8-基苯甲酸酯，为无色油状物(0.033g，89％)。1H NMR(400MHz，CDCl3)：δ8.49(s，1H)，7.91(m，2H)，7.85(bs，1H)，7.57(m，1H)，7.40(m，1H)，7.06(m，1H)，6.49(t，J＝4.0，1H)，6.18(m，1H)，5.71(s，1H)，5.63(s，1H)，4.63(d，J＝4.0，1H)，4.25(d，J＝11，1H)，4.10(d，J＝11，1H)，1.11-1.03(m，28H)。
步骤L.(6aS，8R，9aS)-6a-氰基-2，2，4，4-四异丙基-7-亚甲基六氢环戊并[f][1， 3，5，2，4]三氧杂二硅辛-8-基苯甲酸酯。将(6aS，8S，9S，9aR)-9-((1H-咪唑-1-硫代碳基)氧基)-6a-氰基-2，2，4，4-四异丙基-7-亚甲基六氢环戊并[f][1，3，5，2，4]三氧杂二硅辛-8-基苯甲酸酯(0.259g，0.403mmol)在含偶氮二异丁腈(AIBN)(0.020g，0.121mmol)和三丁基氢化锡(0.324mL，1.21mmol)的甲苯(tol)(13.5mL，0.03M)中的溶液回流加热1.3小时，并冷却至室温，并真空浓缩，得到粗制油状物。纯化(FCC，SiO2，0％-10％EtOAc/己烷)得到(6aS，8R，9aS)-6a-氰基-2，2，4，4-四异丙基-7-亚甲基六氢环戊并[f][1，3，5，2，4]三氧杂二硅辛-8-基苯甲酸酯，为无色油状物(0.208g，定量产率)。1H NMR(400MHz，CDCl3)：δ8.09-8.07(m，2H)，7.60-7.56(m，1H)，7.47-7.44(m，2H)，5.70(m，1H)，5.65-5.64(m，1H)，5.55(m，1H)，4.25(dd，J＝12，6.4，1H)，4.17(d，J＝12，1H)，4.10(d，J＝12，1H)，2.77-2.71(m，1H)，2.31-2.23(m，1H)，1.14-1.04(m，28H)。
步骤M.(6aS，8R，9aS)-8-羟基-2，2，4，4-四异丙基-7-亚甲基四氢环戊并[f][1，3， 5，2，4]三氧杂二硅辛-6a(6H)-甲腈。向冷却至0℃的(6aS，8R，9aS)-6a-氰基-2，2，4，4-四异丙基-7-亚甲基六氢环戊并[f][1，3，5，2，4]三氧杂二硅辛-8-基苯甲酸酯(0.127g，0.245mmol)在MeOH(6.5mL，0.037M)中的溶液中滴加NaOMe/MeOH(0.44M，0.14mL，0.061mmol)。将反应混合物在室温下搅拌6小时。将反应混合物用NH4Cl(饱和水溶液)淬灭，用EtOAc萃取，干燥(Na2SO4)，过滤并真空浓缩，得到标题化合物，为白色残余物。将该粗产物与从前一批获得的粗制油状物(0.0132g)混合。纯化(FCC，SiO2，23％EtOAc/己烷)得到(6aS，8R，9aS)-8-羟基-2，2，4，4-四异丙基-7-亚甲基四氢环戊并[f][1，3，5，2，4]三氧杂二硅辛-6a(6H)-甲腈(0.069g，62％)。1H NMR(400MHz，CDCl3)：δ5.61-5.60(m，1H)，5.48(d，J＝2.0，1H)，4.45-4.37(m，1H)，4.15(dd，J＝11，6.0，1H)，4.12(d，J＝12，1H)，3.98(d，J＝12，1H)，2.53(m，1H)，2.01(m，1H)，1.70(d，J＝8，1H)，1.13-1.03(m，28H)。
中间体10.N，N-Di-BOC-6-氯-9H-嘌呤-2-胺。
Figure BDA0003208444450001161
根据Porcheddu等人，European Journal of Organic Chemistry(2008)34：5786-5797制备标题化合物。
实施例1：(1S，2S，4S)-4-(4-氨基-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-7-基)-2-氟-2-(羟甲基)-3亚甲基环戊-1-醇。
Figure BDA0003208444450001162
步骤A：N，N-Di-BOC-7-((1S，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔 丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基)-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-胺。在0℃下，向(1R，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊-1-醇(中间体2，250mg，639.91μmol)和N，N-Di-BOC-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-胺(中间体4，288.86mg，863.88μmol)在THF(6mL)中的溶液中添加PPh3(503.53mg，1.92mmol，3当量)，然后添加DIAD(388.19mg，1.92mmol，373.26μL，3当量)的溶液。将混合物在25℃下搅拌12小时。将反应用EA(10mL)稀释，并添加1.5g硅胶。将所得混合物低压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001171
；4g
Figure BDA0003208444450001172
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为0％-30％的乙酸乙酯/石油醚，速度为18mL/min)纯化残余物，得到N，N-Di-BOC-7-((1S，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基)-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-胺(320mg，70.73％产率)，为无色油状物。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝8.74(s，1H)，7.22(d，J＝3.8Hz，1H)，6.41(d，J＝3.8Hz，1H)，5.94(br，s，1H)，5.52(br，d，J＝3.3Hz，1H)，5.05(br，s，1H)，4.61(br，d，J＝6.5Hz，1H)，4.11-3.83(m，2H)，2.48-2.27(m，2H)，1.44(s，18H)，0.98-0.89(m，18H)，0.24-0.04(m，12H)。19F NMR(376MHz，CDCl3)δ＝-165.66ppm LCMS：ESI-MS：m/z 707.20[M+1]+，729.20[M+Na]+。
步骤B：N，N-Di-BOC-(1S，2S，4S)-4-(4-氨基-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-7-基)-2- 氟-2-(羟甲基)-3-亚甲基环戊-1-醇。将N，N-Di-BOC-7-((1S，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基)-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-胺(300mg，424.31μmol)在THF(1mL)中的溶液用TBAF(1M，848.62μL)处理。将混合物在25℃下搅拌2小时。将反应混合物用EA(20mL)稀释。将所得溶液用水(20mL*2)洗涤，经无水Na2SO4干燥，并低压浓缩。通过柱色谱法(SiO2，石油醚/乙酸乙酯＝100/1至1/2)纯化残余物，得到N，N-Di-BOC-(1S，2S，4S)-4-(4-氨基-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-7-基)-2-氟-2-(羟甲基)-3-亚甲基环戊-1-醇(185mg，91.12％产率)，为无色油状物。LCMS：ESI-MS：m/z 479.2，[M+1]+，501.2[M+Na]+。
步骤C：(1S，2S，4S)-4-(4-氨基-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-7-基)-2-氟-2-(羟甲 基)-3-亚甲基环戊-1-醇。向N，N-Di-BOC-(1S，2S，4S)-4-(4-氨基-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-7-基)-2-氟-2-(羟甲基)-3-亚甲基环戊-1-醇(180mg，376.17μmol)在DCM(2mL)中的溶液中添加TFA(770.00mg，6.75mmol，0.5mL)。将混合物在25℃下搅拌4小时。将反应混合物用DCM(5mL)稀释，并添加硅胶(500mg)，并低压浓缩。通过柱色谱法(SiO2，DCM/MeOH＝100/1至10/1)纯化残余物，得到粗制标题化合物；并通过Prep-HPLC(柱：Xtimate C18150*25mm*5um；流动相：[水(0.225％FA)-ACN]；B％：1％-23％，9分钟)进一步纯化，得到(1S，2S，4S)-4-(4-氨基-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-7-基)-2-氟-2-(羟甲基)-3-亚甲基环戊-1-醇(37mg，34.88％产率，98.69％纯度)(为白色固体)和另一种粗制期望产物(9.0mg)(为白色固体)。1H NMR(400MHz，CD3OD)δ＝8.06(s，1H)，7.11(d，J＝3.5Hz，1H)，6.58(d，J＝3.8Hz，1H)，5.87(br，d，J＝2.8Hz，1H)，5.58(t，J＝3.3Hz，1H)，5.11-5.00(m，1H)，4.49(q，J＝4.9Hz，1H)，4.02-3.76(m，2H)，2.44-2.24(m，2H)。19F NMR(376MHz，CD3OD)δ＝-168.82ppm(s，1F)。LCMS：ESI-MS：m/z 279.1[M+1]+。
实施例2：2-氨基-7-((1S，3R，4S)-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-3，7-二 氢-4H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-酮。
Figure BDA0003208444450001181
步骤A：4-氯-7-((1S，3R，4S)-2-亚甲基-4-((三异丙基甲硅烷基)氧基)-3-(((三 异丙基甲硅烷基)氧基)甲基)环戊基)-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-2-胺。在0℃下，向(1R，3R，4S)-2-亚甲基-4-((三异丙基甲硅烷基)氧基)-3-(((三异丙基甲硅烷基)氧基)甲基)环戊-1-醇(中间体1，450mg，985.01μmol)和4-氯-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-2-胺(332.11mg，1.97mmol)在THF(10mL)中的溶液中添加PPh3(775.06mg，2.96mmol)和DIAD(597.53mg，2.96mmol，574.55μL)。将混合物在25℃下搅拌12小时。将反应混合物减压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001182
4g
Figure BDA0003208444450001183
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为0％-5％的乙酸乙酯/石油醚，速度为20mL/min)纯化残余物，得到标题化合物(350mg，2批，576.21μmol，29.25％产率)，为无色油状物。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝6.88-6.84(m，1H)，6.41-6.37(m，1H)，5.89-5.72(m，1H)，5.14(s，1H)，4.88(s，1H)，4.70(s，1H)，4.58(s，1H)，3.91-3.82(m，1H)，3.82-3.73(m，1H)，2.80(s，1H)，2.30-2.15(m，2H)，1.13-1.09(m，36H)，0.96-0.81(m，6H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝607.10[M+H]+。
步骤B：2-氨基-7-((1S，3R，4S)-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-3，7-二 氢-4H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-酮。将4-氯-7-((1S，3R，4S)-2-亚甲基-4-((三异丙基甲硅烷基)氧基)-3-(((三异丙基甲硅烷基)氧基)甲基)环戊基)-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-2-胺(400mg，658.53μmol)用HCl溶液(10mL，6M)和THF(10mL)处理，并在80℃下搅拌12小时。将混合物用MeOH稀释，并通过用饱和NaHCO3水溶液处理将pH调节至7。将溶液过滤，并减压浓缩。通过柱色谱法(SiO2，DCM/MeOH＝20/1至10/1)纯化残余物，并通过Prep-HPLC(柱：YMC-Actus Triart C18100*30mm*5um；流动相：[水(0.05％HCl)-ACN]；B％：0％-30％，10分钟)进一步纯化，得到标题化合物(45.2mg，163.60μmol，24.84％产率，100％纯度)，为白色固体。1H NMR(400MHz，CD3OD)δ：6.95(d，J＝3.5Hz，1H)，6.56(d，J＝3.5Hz，1H)，5.52(t，J＝9.20Hz，1H)，5.37(s，1H)，4.41-4.35(m，1H)，3.95(dd，J＝3.4，10.7Hz，1H)，3.85(dd，J＝5.3，10.5Hz，1H)，2.73(s，1H)，2.33-2.20(m，2H)LCMS：ESI-MS：m/z＝276.90[M+H]+。
实施例3：1-((1S，3S，4S)-3-氟-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-5-甲基嘧 啶-2，4(1H，3H)-二酮。
Figure BDA0003208444450001191
步骤A：3-苯甲酰基-1-((1S，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔 丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基)-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮 和3-苯甲酰基-2-(((1S，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔丁基二甲基 甲硅烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基)氧基)-5-甲基嘧啶-4(3H)-酮。在0℃下，向(1R，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊-1-醇(中间体2，200mg，511.93μmol)和3-苯甲酰基-5-甲基-1H-嘧啶-2，4-二酮(185.32mg，804.97μmol)在THF(5mL)中的溶液中添加PPh3(421.62mg，1.61mmol)和双(1，1-二甲基乙基)偶氮二甲酸酯(DBAD)(370.70mg，1.61mmol)。将混合物在25℃下搅拌12小时。将反应混合物用EA(10mL)稀释，并添加1.0g硅胶。将混合物低压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001192
4g*2
Figure BDA0003208444450001193
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为0％-40％的乙酸乙酯/石油醚，速度为20mL/min)纯化残余物，得到3-苯甲酰基-1-((1S，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基)-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(188mg，60.91％产率)，为白色固体；1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝7.92(d，J＝7.3Hz，2H)，7.75-7.58(m，1H)，7.58-7.45(m，2H)，7.05(d，J＝1.0Hz，1H)，5.67(br，s，1H)，5.64(br，d，J＝3.0Hz，1H)，5.34(t，J＝2.9Hz，1H)，4.39(q，J＝4.2Hz，1H)，3.82(d，J＝14.1Hz，2H)，2.39-2.15(m，1H)，2.00(ddd，J＝4.4，9.2，13.2Hz，1H)，1.93(s，3H)，0.90(d，J＝19.3Hz，18H)，0.17-0.05(m，12H)。19F NMR(376MHz，CDCl3)δ＝-163.92ppm；LCMS：ESI-MS：m/z 625.1[M+Na]+；以及3-苯甲酰基-2-(((1S，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基)氧基)-5-甲基嘧啶-4(3H)-酮(155mg，粗制品)，为无色油状物：1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝7.81(d，J＝7.3Hz，2H)，7.73-7.63(m，1H)，7.62(d，J＝0.8Hz，1H)，7.54-7.47(m，2H)，5.94(br，t，J＝5.9Hz，1H)，5.46(br，s，1H)，5.36(br，s，1H)，4.22-4.13(m，1H)，3.52-3.30(m，2H)，2.27(br，s，1H)，2.07-1.98(m，3H)，1.71(br s，1H)，0.83(d，J＝10.8Hz，18H)，0.04--0.06(m，12H)。19F NMR(376MHz，CDCl3)δ＝-168.52ppm。LCMS：ESI-MS：m/z 625.1[M+Na]+。
步骤B：1-((1S，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔丁基二甲基 甲硅烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基)-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮。将3-苯甲酰基-1-((1S，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基)-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(70mg，116.11μmol)在MeOH(0.2mL)中的溶液用NH3·MeOH(7M，2mL)处理。将混合物在25℃下搅拌12小时。将反应混合物低压浓缩。通过柱色谱法(SiO2，石油醚/乙酸乙酯＝10/1至112)纯化残余物，得到1-((1S，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基)-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(0.051g，88.06％产率，100％纯度)，为白色固体。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝8.06(s，1H)，6.94(s，1H)，5.70-5.49(m，2H)，5.33-5.12(m，1H)，4.41(q，J＝4.4Hz，1H)，3.90-3.80(m，2H)，2.31-2.18(m，1H)，2.08-1.95(m，1H)，1.90(s，3H)，0.91(d，J＝8.8Hz，18H)，0.13-0.08(m，12H)。19F NMR(376MHz，CDCl3)δ＝-164.18ppm。LCMS：ESI-MS：m/z 499.3[M+H]+。
步骤C：1-((1S，3S，4S)-3-氟-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-5-甲基嘧 啶-2，4(1H，3H)-二酮。将1-((1S，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基)-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(190mg，380.93μmol)在THF(0.2mL)中的溶液用TBAF(1M，3.80mL)处理。将混合物在25℃下搅拌1小时。将反应混合物低压浓缩。通过柱色谱法(SiO2，EA/丙酮＝20/1至2/1)纯化残余物两次，得到1-((1S，3S，4S)-3-氟-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(75mg，71.40％产率，98.01％纯度)，为白色固体。1H NMR(400MHz，CD3OD)δ＝7.35(s，1H)，5.66-5.55(m，2H)，5.28(t，J＝3.0Hz，1H)，4.38(q，J＝5.0Hz，1H)，3.93-3.73(m，2H)，2.29-2.10(m，2H)，1.85(s，3H)。19F NMR(376MHz，CD3OD)δ＝-168.28ppm。LCMS：ESI-MS：m/z271.1[M+H]+。
实施例4：2-氨基-9-((1S，3S，4S)-3-氟-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)- 1，9-二氢-6H-嘌呤-6-酮。
Figure BDA0003208444450001211
步骤A：9-((1S，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔丁基二甲基 甲硅烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基)-2-异丁酰胺基-9H-嘌呤-6-基二苯基氨基 甲酸酯。向(1R，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊-1-醇(中间体2，140mg，358.35μmol)和2-异丁酰胺基-9H-嘌呤-6-基二苯基氨基甲酸酯(根据Milecki等人，Journal of Labelled Compounds andRadiopharmaceuticals(2001)44：763-783制备)(223.84mg，537.53μmol)在THF(5mL)和二氧杂环己烷(5mL)中的溶液中添加PPh3(281.97mg，1.08mmol)，然后滴加DIAD(217.39mg，1.08mmol，209.03μL)。将混合物在25℃下搅拌12小时。将反应混合物低压浓缩。通过柱色谱法(SiO2，PE/EA＝100/1至10/1)纯化残余物，得到9-((1S，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基)-2-异丁酰胺基-9H-嘌呤-6-基二苯基氨基甲酸酯(272mg，粗制品)，为白色固体。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝7.98-7.89(m，2H)，7.51-7.31(m，8H)，7.26-7.20(m，2H)，5.67(br d，J＝2.0Hz，1H)，5.63-5.56(m，1H)，5.14(br s，1H)，4.63(q，J＝4.7Hz，1H)，4.15-4.01(m，1H)，3.87(t，J＝12.3Hz，1H)，2.99(br s，1H)，2.51(br d，J＝7.8Hz，1H)，2.40-2.28(m，1H)，1.29-1.28(m，6H)，0.92(d，J＝7.3Hz，18H)，0.33--0.13(m，12H)。19F NMR(376MHz，CDCl3)δ＝-165.80(s，1F)。LCMS：ESI-MS：m/z 789.4[M+H]+。
步骤B：N-(9-((1S，3S，4S)-3-氟-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-6-氧代- 6，9-二氢-1H-嘌呤-2-基)异丁酰胺。将9-((1S，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基)-2-异丁酰胺基-9H-嘌呤-6-基二苯基氨基甲酸酯(135mg，171.08μmol)用TBAF(1M，1.71mL)处理。在N2气氛下，将混合物在25℃下搅拌2小时。(将反应分两批进行)。将反应混合物减压浓缩。通过柱色谱法(SiO2，DCM/MeOH＝40/1至10/1)纯化残余物，得到N-(9-((1S，3S，4S)-3-氟-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-6-氧代-6，9-二氢-1H-嘌呤-2-基)异丁酰胺(0.051g，40.39％产率，99％纯度)，为无色油状物。1H NMR(400MHz，CD3OD)δ＝7.99(s，1H)，5.75-5.69(m，1H)，5.66(br，d，J＝3.5Hz，1H)，5.24(d，J＝2.6Hz，1H)，4.56-4.46(m，1H)，3.99-3.82(m，2H)，2.72(td，J＝6.9，13.8Hz，1H)，2.46-2.36(m，2H)，1.22(d，J＝6.8Hz，6H)。19F NMR(376MHz，CD3OD)δ＝-168.90(s，1F)。LCMS：ESI-MS：m/z 366.1[M+H]+。
步骤C：2-氨基-9-((1S，3S，4S)-3-氟-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-1， 9-二氢-6H-嘌呤-6-酮。将N-(9-((1S，3S，4S)-3-氟-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-6-氧代-6，9-二氢-1H-嘌呤-2-基)异丁酰胺(51mg，139.59μmol)在MeOH(0.5mL)中的溶液用NH3·MeOH(7M，510.00μL)处理，并将混合物在25℃下搅拌2小时。将反应混合物减压浓缩。将残余物用DCM(10mL)研磨并滤出。将滤饼溶解在水(20mL)中，并将水相用EA(10mL)反萃取。将水相冷冻干燥，得到2-氨基-9-((1S，3S，4S)-3-氟-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-1，9-二氢-6H-嘌呤-6-酮(32.3mg，78.01％产率，99.55％纯度)，为白色固体。1HNMR(400MHz，CD3OD)δ＝7.75(s，1H)，5.60(d，J＝3.3Hz，1H)，5.60-5.53(m，1H)，5.23-5.14(m，1H)，4.50(q，J＝5.0Hz，1H)，4.07-3.92(m，1H)，3.93-3.76(m，1H)，2.52-2.40(m，1H)，2.40-2.27(m，1H)。19F NMR(376MHz，CD3OD)δ＝-169.02(s，1F)。LCMS：ESI-MS：m/z 296.1[M+H]+。
实施例5：2-氨基-9-((1R，3R，4S)-3-氟-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)- 1，9-二氢-6H-嘌呤-6-酮。
Figure BDA0003208444450001231
步骤A：6-(苄氧基)-9-((3R，4S)-4-(苄氧基)-3-((苄氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基 环戊基)-9H-嘌呤-2-胺。在0℃下，向(3R，4S)-4-(苄氧基)-3-((苄氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊-1-醇(中间体3，160.00mg，467.29μmol)和PPh3(367.69mg，1.40mmol，3当量)和6-苄氧基-9H-嘌呤-2-胺(169.10mg，700.94μmol)在无水THF(5mL)中的溶液中添加DIAD(283.47mg，1.40mmol，272.57μL)。添加后，将反应在25℃下搅拌12小时。将反应混合物用水(10mL)淬灭，并用EA(10mL*2)萃取。将有机层用盐水(10mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤，低压浓缩。通过柱色谱法(SiO2，石油醚/乙酸乙酯＝100/1至1/1)纯化残余物，得到6-(苄氧基)-9-((3R，4S)-4-(苄氧基)-3-((苄氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-2-胺(0.057g，21.17％产率，98.15％纯度)，为白色固体。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝7.65(d，J＝16.6Hz，1H)，7.50(d，J＝7.0Hz，2H)，7.42-7.27(m，10H)，5.63-5.46(m，4H)，5.24-5.08(m，1H)，4.81(s，2H)，4.73-4.59(m，4H)，4.41(br，dd，J＝5.5，9.5Hz，1H)，4.39-4.32(m，1H)，4.29-4.19(m，1H)，4.09-3.87(m，2H)，2.73-2.53(m，1H)，2.32-2.16(m，1H)。19F NMR(377MHz，CDCl3)δ＝-147.42(s，1F)，-149.82(s，1F)。LCMS：ESI-MS：m/z 566.3[M+H]+。
步骤B：2-氨基-9-((1R，3R，4S)-3-氟-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-1， 9-二氢-6H-嘌呤-6-酮。在-78℃下，向6-(苄氧基)-9-((3R，4S)-4-(苄氧基)-3-((苄氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-2-胺(40.00mg，70.72μmol)在DCM(2mL)中的溶液中添加BCl3(1M，636.45μL)。将混合物在-78℃下搅拌2小时。将反应用1M NH3/MeOH(5mL)淬灭。将反应混合物低压浓缩。通过柱色谱法(SiO2，DCM/MeOH＝100/1至5/1)纯化残余物，并通过Prep-HPLC(柱：Waters Xbridge 150*25 5u；流动相：[水(10mM NH4HCO3)-ACN]；B％：0％-25％，6分钟)进一步纯化，得到白色固体状2-氨基-9-((1R，3R，4S)-3-氟-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-1，9-二氢-6H-嘌呤-6-酮(0.005g，23.85％产率，99.58％纯度)。1H NMR(400MHz，CD3OD)δ＝7.82(s，1H)，5.67-5.58(m，1H)，5.49(br，s，1H)，5.12(d，J＝3.5Hz，1H)，4.42-4.34(m，1H)，4.12-4.02(m，2H)，2.74-2.66(m，1H)，2.23-2.14(m，1H)。19FNMR(377MHz，CD3OD)δ＝-154.86(s，1F)。LCMS：ESI-MS：m/z 296.1[M+H]+。
实施例6：(1S，2S，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-氟-2-(羟甲基)-3-亚甲基环 戊-1-醇。
Figure BDA0003208444450001241
步骤A：N，N-Di-BOC-9-((1S，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔 丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-胺。在0℃下，向(1R，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊-1-醇(中间体2，方法A，步骤P的产物，50.00mg，127.98μmol)和a(64.38mg，191.97μmol)在THF(1mL)中的溶液中添加PPh3(100.71mg，383.95μmol)，然后添加DIAD(77.64mg，383.95μmol，74.65μL)的THF(0.3mL)溶液。将混合物在25℃下搅拌12小时。将反应用水(10mL)淬灭，并用EA(15mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，并低压浓缩。通过柱色谱法(SiO2，石油醚/乙酸乙酯＝100/1至3/1)纯化残余物，得到N，N-Di-BOC-9-((1S，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-胺(42mg，46.35％产率)，为无色油状物。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝8.81(s，1H)，8.11(s，1H)，5.81-5.71(m，1H)，5.61-5.56(m，1H)，5.12(br s，1H)，4.71-4.62(m，1H)，4.05-3.95(m，1H)，3.88(t，J＝12.0Hz，1H)，2.60-2.47(m，1H)，2.39(dt，J＝3.6，8.7Hz，1H)，1.45(s，18H)，0.93(d，J＝7.5Hz，18H)，0.22-0.02(m，12H)。19F NMR(376MHz，CDCl3)δ＝-165.83(s，1F)。
步骤B：N，N-Di-BOC-(1S，2S，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-氟-2-(羟甲基)- 3-亚甲基环戊-1-醇。将N，N-Di-BOC-9-((1S，3S，4S)-4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-胺(42.00mg，59.32μmol)溶解在THF(0.2mL)中，然后添加TBAF(1M，118.64μL)。将混合物在25℃下搅拌30分钟。将反应用EA(10mL)稀释，并将反应混合物用盐水(5mL*2)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，并低压浓缩。通过柱色谱法(SiO2，石油醚/乙酸乙酯＝100/1至0/1)纯化残余物，得到N，N-Di-BOC-(1S，2S，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-氟-2-(羟甲基)-3-亚甲基环戊-1-醇(22mg，76.96％产率，99.5％纯度)，为浅黄色油状物。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝8.76(s，1H)，8.14(s，1H)，5.82-5.64(m，2H)，5.17(br，s，1H)，4.73-4.53(m，1H)，4.30(br，s，1H)，4.23-4.14(m，1H)，4.08-3.97(m，1H)，2.86-2.63(m，1H)，2.86-2.63(m，1H)，2.57-2.46(m，1H)，1.50-1.46(m，18H)。19F NMR(376MHz，CDCl3)δ＝-164.14(s，1F)。
步骤C：(1S，2S，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-氟-2-(羟甲基)-3-亚甲基环 戊-1-醇。向N，N-Di-BOC-(1S，2S，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-氟-2-(羟甲基)-3-亚甲基环戊-1-醇(220mg，458.81μmol)在DCM(3mL)中的溶液中添加TFA(0.2mL)。将混合物在25℃下搅拌1小时。将反应混合物低压浓缩。将残余物溶解在MeOH(10mL)中。通过添加2滴NH3·MeOH(7.0M)将所得溶液调节至pH＝7～8。添加300mg硅胶，并将混合物减压浓缩。通过柱色谱法(SiO2，DCM/MeOH＝40/1至5/1)纯化残余物，得到约130mg粗产物，为黄色油状物，通过Prep-HPLC(柱：Waters Xbridge 150*255u；流动相：[水(10mM NH4HCO3)-ACN]；B％：3％-23％，6.2分钟)对其进行进一步纯化，得(1S，2S，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-氟-2-(羟甲基)-3-亚甲基环戊-1-醇(90mg，70.24％产率，100％纯度)，为白色固体。1H NMR(400MHz，CD3OD)δ＝8.18-8.15(m，2H)，5.80-5.75(m，1H)，5.67-5.66(m，1H)，5.22-5.21(m，1H)，4.56-4.52(m，1H)，4.13-4.05(m，1H)，3.94-3.87(m，1H)，2.57-2.46(m，1H)，2.45-2.42(m，1H)。19F NMR(376MHz，CD3OD)δ＝-168.30(s，1F)。LCMS：ESI-MS：m/z 279.8[M+1]+。
实施例7：(1S，2R，4R)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-氟-2-(羟甲基)-3-亚甲基环 戊-1-醇。
Figure BDA0003208444450001261
步骤A：N，N-Di-BOC-9-((1R，3R，4S)-4-(苄氧基)-3-((苄氧基)甲基)-3-氟-2-亚 甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-胺和N，N-Di-BOC-9-((1S，3R，4S)-4-(苄氧基)-3-((苄氧基)甲 基)-3-氟-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-胺。在0℃下，向(3R，4S)-4-(苄氧基)-3-((苄氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊-1-醇(中间体3，470.00mg，1.37mmol)和PPh3(1.08g，4.12mmol)以及N-叔丁氧羰基-N-(9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯(690.49mg，2.06mmol)在无水THF(8mL)中的溶液中添加DIAD(832.69mg，4.12mmol，800.66μL)在THF(2mL)中的溶液，并在25℃下搅拌12小时。将反应混合物用水(2mL)淬灭，并用EA(15mL*2)萃取。将有机层用盐水(10mL)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，并低压浓缩。通过柱色谱法(SiO2，石油醚/乙酸乙酯＝100/1至1/1)纯化残余物，得到两种纯异构体，通过Prep-TLC(甲苯/EA＝5/1)再次对其进行纯化，得到N，N-Di-BOC-9-((1R，3R，4S)-4-(苄氧基)-3-((苄氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-胺(210mg，22.26％产率，96％纯度)，为白色固体：1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝8.84(s，1H)，8.18(s，1H)7.41-7.20(m，10H)，5.79(br，s，1H)，5.66(br，s，1H)，5.26-5.08(m，1H)，4.76-4.60(m，4H)，4.36-4.21(m，1H)，4.20-4.05(m，1H)，3.92(br，dd，J＝10.2，18.2Hz，1H)，2.85-2.67(m，1H)，2.35-2.17(m，1H)，1.46(s，18H)。19F NMR(376MHz，CDCl3)δ＝-149.82(s，1F)；LCMS：ESI-MS：m/z 660.2[M+H]+；以及N，N-Di-BOC-9-((1S，3R，4S)-4-(苄氧基)-3-((苄氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-胺(255mg，23.85％)，为白色固体：1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝8.75(s，1H)，7.97(s，1H)，7.39-7.28(m，10H)，5.79(br，s，1H)，5.66(br s，1H)，5.18(br，s，1H)，5.11-4.94(m，1H)，4.73-4.54(m，4H)，4.43(br，d，J＝9.8Hz，1H)，4.10-3.80(m，2H)，2.75-2.56(m，1H)，2.38-2.24(m，1H)，1.65-1.48(m，18H)；19F NMR(376MHz，CDCl3)δ＝-147.36(s，1F)；LCMS：ESI-MS：m/z660.2[M+H]+。
步骤B：9-((1R，3R，4S)-4-(苄氧基)-3-((苄氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基)- 9H-嘌呤-6-胺。以类似于实施例1步骤C的方式，使用N，N-Di-BOC-9-((1R，3R，4S)-4-(苄氧基)-3-((苄氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-胺代替N，N-Di-BOC-(1S，2S，4S)-4-(4-氨基-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-7-基)-2-氟-2-(羟甲基)-3-亚甲基环戊-1-醇来制备标题化合物。
步骤C：(1S，2R，4R)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-氟-2-(羟甲基)-3-亚甲基环 戊-1-醇。在-78℃下，向9-((1R，3R，4S)-4-(苄氧基)-3-((苄氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-胺(29.00mg，63.11μmol)在DCM(1mL)中的溶液中添加BCl3(1M，189.33μL)。将混合物在-78℃下搅拌1小时。将反应物倾注到稀释的NH3/MeOH(约1M，5mL)中，并低压浓缩。通过柱色谱法(SiO2，DCM/MeOH＝100/1至20/1)纯化残余物，得到(1S，2R，4R)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-氟-2-(羟甲基)-3-亚甲基环戊-1-醇(5mg，29％产率)，为白色固体。1H NMR(400MHz，CD3OD)δ＝8.22(s，1H)，8.21-8.15(m，1H)，5.79-5.50(m，2H)，5.23-5.00(m，1H)，4.45-4.34(m，1H)，4.19-4.00(m，2H)，2.84-2.72(m，1H)，2.30-2.15(m，1H)。19F NMR(376MHz，CD3OD)δ＝-154.89(s，1F)。LCMS：ESI-MS：m/z 280.1[M+H]+。
实施例8：(1S，2R，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-氟-2-(羟甲基)-3-亚甲基环 戊-1-醇。
Figure BDA0003208444450001271
步骤A：9-((1S，3R，4S)-4-(苄氧基)-3-((苄氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基)- 9H-嘌呤-6-胺。在0℃下，向N，N-Di-BOC-9-((1S，3R，4S)-4-(苄氧基)-3-((苄氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-胺(实施例7，步骤A的产物B，330.00mg，500.19μmol)在DCM(4mL)中的溶液中添加TFA(1mL)。将混合物在25℃下搅拌2小时。将反应混合物用DCM(2mL)稀释，并添加500mg硅胶，并低压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001281
4g
Figure BDA0003208444450001282
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为0％-5％的DCM/MeOH，速度为20mL/min)纯化残余物，得到9-((1S，3R，4S)-4-(苄氧基)-3-((苄氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-胺(216mg，93.98％产率)，为白色固体。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝8.83-8.15(m，1H)，8.07-7.75(m，1H)，7.62-7.14(m，10H)，6.03-5.50(m，4H)，5.34-5.08(m，1H)，4.84-4.60(m，4H)，4.52-4.34(m，1H)，4.06-3.76(m，2H)，2.66(ddd，J＝2.8，8.5，13.6Hz，1H)，2.41-2.21(m，1H)。19F NMR(377MHz，CDCl3)δ＝-147.23(s，1F)。
步骤B：(1S，2R，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-氟-2-(羟甲基)-3-亚甲基环 戊-1-醇。在-78℃下，向9-((1S，3R，4S)-4-(苄氧基)-3-((苄氧基)甲基)-3-氟-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-胺(60.00mg，130.57μmol)在DCM(2mL)中的溶液中添加BCl3(1M，783.44μL)，并在-78℃下搅拌1小时。将反应混合物倾注到NH3/MeOH(约1.0M，3mL)中，并低压浓缩。通过柱色谱法(SiO2，DCM/MeOH＝100/1至10/1)纯化残余物，得到(1S，2R，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-氟-2-(羟甲基)-3-亚甲基环戊-1-醇(25mg，68.56％产率，100％纯度)，为白色固体。1H NMR(400MHz，CD3OD)δ＝8.20(s，1H)，8.07(s，1H)，5.75(br，s，1H)，5.64(dd，J＝2.6，5.1Hz，1H)，5.10(dd，J＝2.0，4.5Hz，1H)，4.59-4.49(m，1H)，4.09-3.90(m，2H)，2.49-2.42(m，2H)。19F NMR(377MHz，CDCl3)δ＝-147.23(s，1F)。LCMS：ESI-MS：m/z 280.1[M+H]+。
实施例9：(1S，2R，4S)-4-(4-氨基-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-7-基)-2-(羟甲基)-3- 亚甲基环戊-1-醇。
Figure BDA0003208444450001283
步骤A：4-氯-7-((1S，3R，4S)-2-亚甲基-4-((三异丙基甲硅烷基)氧基)-3-(((三 异丙基甲硅烷基)氧基)甲基)环戊基)-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶。在25℃下，向(1R，3R，4S)-2-亚甲基-4-((三异丙基甲硅烷基)氧基)-3-(((三异丙基甲硅烷基)氧基)甲基)环戊-1-醇(中间体1，470mg，1.03mmol)和4-氯-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶(315.98mg，2.06mmol)在THF(10mL)中的溶液中添加PPh3(809.51mg，3.09mmol)和DIAD(624.09mg，3.09mmol，600.09μL)。将反应混合物在25℃下搅拌12小时。将反应混合物减压浓缩。纯化(FCC，SiO2，洗脱剂为梯度为0％-30％的乙酸乙酯/石油醚，速度为18mL/min)，得到4-氯-7-((1S，3R，4S)-2-亚甲基-4-((三异丙基甲硅烷基)氧基)-3-(((三异丙基甲硅烷基)氧基)甲基)环戊基)-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶(412mg，67.60％产率)，为无色油状物。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝8.61(s，1H)，7.27-7.25(m，1H)，6.64-6.55(m，1H)，6.04-5.92(m，1H)，5.14(t，J＝2.2Hz，1H)，4.64(t，J＝2.2Hz，1H)，4.59(br，s，1H)，3.90-3.79(m，2H)，2.81(br，s，1H)，2.34-2.23(m，2H)，1.19-0.98(m，42H)。LCMS：ESI-MS：m/z 592.1[M+1]+。
步骤B：7-((1S，3R，4S)-2-亚甲基-4-((三异丙基甲硅烷基)氧基)-3-(((三异丙基 甲硅烷基)氧基)甲基)环戊基)-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-胺。向4-氯-7-((1S，3R，4S)-2-亚甲基-4-((三异丙基甲硅烷基)氧基)-3-(((三异丙基甲硅烷基)氧基)甲基)环戊基)-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶(250mg，422.01μmol)在二氧杂环己烷(1mL)中的溶液中添加NH3·H2O(16.25g，267.17mmol，17.86mL，28％纯度)。将混合物在100℃下搅拌12小时。将反应混合物减压浓缩。纯化(FCC，SiO2，石油醚/乙酸乙酯＝1001至2/1)得到7-((1S，3R，4S)-2-亚甲基-4-((三异丙基甲硅烷基)氧基)-3-(((三异丙基甲硅烷基)氧基)甲基)环戊基)-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-胺(0.198g，40.94％产率)，为无色油状物。1H NMR(400MHz，CD3OD)δ＝8.06(s，1H)，7.03(d，J＝3.4Hz，1H)，6.60-6.57(m，1H)，5.87(br，dd，J＝7.9，10.4Hz，1H)，5.21-5.13(m，1H)，4.70-4.66(m，2H)，3.92-3.86(m，2H)，2.82(br，s，1H)，2.42-2.29(m，1H)，2.29-2.18(m，1H)，1.21-1.05(m，42H)。LCMS：ESI-MS：m/z 573.2[M+1]+。
步骤C：(1S，2R，4S)-4-(4-氨基-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-7-基)-2-(羟甲基)-3-亚 甲基环戊-1-醇。向7-((1S，3R，4S)-2-亚甲基-4-((三异丙基甲硅烷基)氧基)-3-(((三异丙基甲硅烷基)氧基)甲基)环戊基)-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-胺(190mg，331.61μmol)在MeOH(6mL)中的溶液添加NH4F(245.63mg，6.63mmol)。将混合物在80℃下搅拌12小时。将反应混合物冷却，并将所得固体滤出。将滤液减压浓缩。纯化(FCC，SiO2，100/1至10/1的DCM/MeOH)并通过SFC分离(柱：DAICEL CHIRALPAK AD-H(250mm*30mm，5um)；流动相：[0.1％NH3.H2O，MeOH]；B％：30％-30％，min，RT＝4.488分钟)进一步纯化，得到(1S，2R，4S)-4-(4-氨基-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-7-基)-2-(羟甲基)-3-亚甲基环戊-1-醇(32mg，37.07％产率，100％纯度)，为白色固体。1H NMR(400MHz，CD3OD)δ＝8.04(s，1H)，7.12(d，J＝3.7Hz，1H)，6.58(d，J＝3.7Hz，1H)，5.90-5.71(m，1H)，5.19(br，s，1H)，4.65(t，J＝2.2Hz，1H)，4.46-4.30(m，1H)，3.89-3.66(m，2H)，2.70(br s，1H)，2.42-2.28(m，1H)，2.28-2.15(m，1H)。LCMS：ESI-MS：m/z 261.1[M+1]+。
实施例10：2-氨基-9-((1S，3S，4S)-3-(氟甲基)-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环 戊基)-1，9-二氢-6H-嘌呤-6-酮。
Figure BDA0003208444450001301
步骤A：((1S，3S，5S)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(6-((二苯 基氨基甲酰基)氧基)-2-异丁酰胺基-9H-嘌呤-9-基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基) 甲基新戊酸酯。在25℃和N2下，向((1S，3R，5S)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-羟基-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(中间体7，900mg，1.40mmol)和2-异丁酰胺基-9H-嘌呤-6-基二苯基氨基甲酸酯(中间体5，871.88mg，2.09mmol)在THF(20mL)和二氧杂环己烷(20mL)中的溶液中一次性添加PPh3(1.10g，4.19mmol)。在25℃下滴加DIAD(846.73mg，4.19mmol，814.17μL)后，将反应混合物在25℃下搅拌12小时。真空除去溶剂，得到黄色油状物。通过硅胶柱色谱法(石油醚∶乙酸乙酯＝5/1至3/1)纯化残余物。得到((1S，3S，5S)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(6-((二苯基氨基甲酰基)氧基)-2-异丁酰胺基-9H-嘌呤-9-基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(900mg，819.59μmol，58.72％产率，95％纯度)，为淡黄色泡沫。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝8.63(s，1H)，7.95(s，1H)，7.41-7.35(m，12H)，7.29-7.23(m，7H)，6.83-6.81(m，4H)，5.61(d，J＝2.8Hz，1H)，5.43-5.36(m，2H)，5.24(br d，J＝11.6Hz，1H)，4.85(d，J＝2.4Hz，1H)，4.45(d，J＝11.8Hz，1H)，3.79(m，6H)，3.46(d，J＝8.8Hz，1H)，3.31(d，J＝9.0Hz，1H)，3.01-2.95(m，2H)，2.22-2.15(m，1H)，1.28-1.26(m，6H)，1.23(s，9H)，1.01(s，9H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝1043.5[M+H]+。
步骤B：((1S，3S，5S)-3-(6-((二苯基氨基甲酰基)氧基)-2-异丁酰胺基-9H-嘌呤- 9-基)-1-(羟甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯。在0℃和N2下，向((1S，3S，5S)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(6-((二苯基氨基甲酰基)氧基)-2-异丁酰胺基-9H-嘌呤-9-基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(200.00mg，191.72μmol)在DCM(2mL)中的溶液中一次性添加TFA(154.00mg，1.35mmol，0.1mL)。将反应混合物在0℃下搅拌20分钟。将反应混合物倾注到饱和NaHCO3水溶液中，以将其调节至pH＞8。将混合物用EA(30mL*3)萃取。将所得溶液经无水Na2SO4干燥。真空除去溶剂，得到黄色油状物。通过硅胶柱色谱法(石油醚/乙酸乙酯＝3/1至1/1)纯化残余物。得到((1S，3S，5S)-3-(6-((二苯基氨基甲酰基)氧基)-2-异丁酰胺基-9H-嘌呤-9-基)-1-(羟甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(320mg，3批，414.66μmol，72.10％产率，96％纯度)，为淡黄色泡沫。LCMS：ESI-MS：m/z＝741.4[M+H]+。
步骤C：((1R，3S，5S)-3-(6-((二苯基氨基甲酰基)氧基)-2-异丁酰胺基-9H-嘌呤- 9-基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)-1-((((三氟甲基)磺酰基)氧基)甲基)环戊基)甲基新戊 酸酯。在0℃和N2下，向((1S，3S，5S)-3-(6-((二苯基氨基甲酰基)氧基)-2-异丁酰胺基-9H-嘌呤-9-基)-1-(羟甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(170mg，229.47μmol)和吡啶(181.51mg，2.29mmol，185.21μL)在DCM(2mL)中的溶液中滴加三氟甲基磺酸酐(Tf2O或三氟甲磺酸酐)(97.11mg，344.20μmol，56.79μL)。将反应混合物在0℃下搅拌1小时。真空除去溶剂，得到黄色油状物。通过硅胶柱色谱法(石油醚/乙酸乙酯＝1/2至0/1)纯化残余物。得到((1R，3S，5S)-3-(6-((二苯基氨基甲酰基)氧基)-2-异丁酰胺基-9H-嘌呤-9-基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)-1-((((三氟甲基)磺酰基)氧基)甲基)环戊基)甲基新戊酸酯(140mg，96.23μmol，41.94％产率，60％纯度)，为淡黄色油状物。LCMS：ESI-MS：m/z＝873.3[M+H]+。
步骤D：((1S，3S，5S)-1-(氟甲基)-3-(2-异丁酰胺基-6-氧代-1，6-二氢-9H-嘌呤- 9-基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯。在25℃和N2下，向((1R，3S，5S)-3-(6-((二苯基氨基甲酰基)氧基)-2-异丁酰胺基-9H-嘌呤-9-基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)-1-((((三氟甲基)磺酰基)氧基)甲基)环戊基)甲基新戊酸酯(320mg，366.59μmol)在THF(0.5mL)中的溶液中一次性添加TBAF(1M，3.2mL)。将反应混合物在25℃下搅拌12小时。真空除去溶剂，得到黄色油状物。通过硅胶柱色谱法(石油醚/乙酸乙酯＝1/2至0/1)纯化残余物。得到((1S，3S，5S)-1-(氟甲基)-3-(2-异丁酰胺基-6-氧代-1，6-二氢-9H-嘌呤-9-基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(100mg，182.61μmol，49.81％产率)，为淡黄色泡沫。LCMS：ESI-MS：m/z＝548.2[M+H]+。
步骤E：2-氨基-9-((1S，3S，4S)-3-(氟甲基)-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊 基)-1，9-二氢-6H-嘌呤-6-酮。在25℃和N2下，向((1S，3S，5S)-1-(氟甲基)-3-(2-异丁酰胺基-6-氧代-1，6-二氢-9H-嘌呤-9-基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(100mg，182.61μmol)在MeOH(5mL)中的溶液中添加NaOH(1M，1.00mL)。将反应混合物在25℃下搅拌12小时。用1.0MHCl溶液将反应混合物调节至pH＝6～7，并真空除去溶剂，得到300mg粗产物，为黄色油状物。通过prep-HPLC(柱：Waters Xbridge 150*25 5u；流动相：[水(10mMNH4HCO3)-ACN]；B％：0％-23％，6分钟)纯化470mg粗产物。得到2-氨基-9-((1S，3S，4S)-3-(氟甲基)-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-1，9-二氢-6H-嘌呤-6-酮(47.9mg，96％纯度，54.8％产率)，为白色固体。1H NMR(400MHz，CD3OD)δ＝7.79(s，1H)，5.59-5.54(m，1H)，5.23(d，J＝2.8Hz，1H)，4.82(d，J＝2.4Hz，1H)，4.77-4.47(m，2H)，4.40(d，J＝3.0Hz，1H)，3.79(s，2H)，2.54(ddd，J＝4.8，11.0，13.0Hz，1H)，2.24(dd，J＝8.2，12.8Hz，1H)。19F NMR(376MHz，CD3OD)δ＝-232.9。LCMS：ESI-MS：m/z＝310.1[M+H]+。
实施例11：4-氨基-1-((1S，3S，4S)-3-(氟甲基)-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环 戊基)嘧啶-2(1H)-酮。
Figure BDA0003208444450001331
步骤A：((1S，3S，5S)-3-(3-苯甲酰基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-1- ((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸 酯。在0℃下，向((1S，3R，5S)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-羟基-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(中间体7，0.0516g，80.03μmol)、PPh3(41.98mg，160.05μmol)和3-苯甲酰基-1H-嘧啶-2，4-二酮(25.95mg，120.04μmol)在THF(1mL)中的溶液中添加DIAD(32.36mg，160.05μmol，31.12μL)。将混合物在25℃下搅拌12小时。在减压下除去溶剂，得到残余物。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001332
；4g
Figure BDA0003208444450001333
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为4％-25％的乙酸乙酯/石油醚，速度为20mL/min)纯化残余物。得到((1S，3S，5S)-3-(3-苯甲酰基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.026g，30.84μmol，38.54％产率)，为白色泡沫。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝8.00-7.91(m，1H)，7.91-7.84(m，1H)，7.71-7.61(m，1H)，7.57-7.48(m，2H)，7.43-7.35(m，2H)，7.34-7.28(m，3H)，7.25-7.17(m，4H)，6.84-6.77(m，5H)，5.88(d，J＝8.2Hz，1H)，5.73-5.62(m，2H)，5.30-5.25(m，1H)，5.14(s，1H)，4.43-4.31(m，2H)，3.81(d，J＝2.8Hz，1H)，3.78(d，J＝0.8Hz，6H)，3.31(s，1H)，2.26-2.13(m，1H)，1.87-1.85(m，1H)，1.22-1.17(m，9H)，0.97-0.92(m，9H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝865.5[M+Na]+。
步骤B：((1S，3S，5S)-3-(3-苯甲酰基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-1- (羟甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯。向((1S，3S，5S)-3-(3-苯甲酰基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.026g，30.84μmol)在DCM(0.5mL)中的溶液中添加2，2-二氯乙酸(39.77mg，308.43μmol，25.33μL)。将混合物在0℃下搅拌0.5小时。将混合物用饱和NaHCO3水溶液(1mL)淬灭，并用DCM(5mL*2)萃取。将合并的有机层用盐水(5mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001341
4g
Figure BDA0003208444450001342
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为15％-30％的乙酸乙酯/石油醚，速度为20mL/min)纯化残余物。得到((1S，3S，5S)-3-(3-苯甲酰基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-1-(羟甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.01g，18.50μmol，59.97％产率)，为白色泡沫。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝7.97-7.91(m，2H)，7.71-7.63(m，1H)，7.56-7.49(m，2H)，7.33(d，J＝8.2Hz，1H)，5.92-5.87(m，1H)，5.70(s，1H)，5.40(d，J＝2.6Hz，1H)，5.32-5.28(m，1H)，5.14(d，J＝2.2Hz，1H)，4.38(d，J＝11.6Hz，1H)，4.22(d，J＝11.6Hz，1H)，3.74-3.68(m，1H)，3.65-3.59(m，1H)，2.31(dd，J＝8.2，12.6Hz，1H)，2.25-2.14(m，1H)，1.26-1.23(m，9H)，1.22-1.18(m，9H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝563.2[M+Na]+。
步骤C：((1R，3S，5S)-3-(3-苯甲酰基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2- 亚甲基-5-(新戊酰氧基)-1-((((三氟甲基)磺酰基)氧基)甲基)环戊基)甲基新戊酸酯。在0℃下，向((1S，3S，5S)-3-(3-苯甲酰基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-1-(羟甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.08g，147.98μmol)在DCM(0.5mL)中的溶液中添加吡啶(117.05mg，1.48mmol，119.44μL)和Tf2O(83.50mg，295.97μmol，48.83μL，2当量)。将混合物在0℃下搅拌1小时。将混合物用饱和NaHCO3溶液(5mL)淬灭，并用DCM(5mL*2)萃取。将合并的有机层用盐水(5mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。将粗制品用于下一步骤中，无需纯化。得到((1R，3S，5S)-3-(3-苯甲酰基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)-1-((((三氟甲基)磺酰基)氧基)甲基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.09g，粗制品)，为棕色油状物。LCMS：ESI-MS：m/z＝673.1[M+H]+，695.1[M+Na]+。
步骤D：((1S，3S，5S)-3-(2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-1-(氟甲基)-2- 亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯。向((1R，3S，5S)-3-(3-苯甲酰基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)-1-((((三氟甲基)磺酰基)氧基)甲基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.09g，133.80μmol)在THF(1mL)中的溶液中添加TBAF(1M，401.39μL)。将混合物在60℃下搅拌3小时。将混合物用EA(5mL)稀释，并用H2O(5mL*2)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001343
4g
Figure BDA0003208444450001344
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为0％-1％的MeOH/DCM，速度为20mL/min)纯化残余物。得到((1S，3S，5S)-3-(2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-1-(氟甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.035g，79.82μmol，59.66％产率)，为白色泡沫。LCMS：ESI-MS：m/z＝461.1[M+Na]+。
步骤E：((1S，3S，5S)-3-(4-氨基-2-氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-1-(氟甲基)- 2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯。向((1S，3S，5S)-3-(2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-1-(氟甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.035g，79.82μmol)在CH3CN(0.4mL)中的溶液中添加DMAP(19.50mg，159.64μmol)、Et3N(16.15mg，159.64μmol，22.22μL)和2，4，6-三异丙基苯磺酰氯(48.35mg，159.64μmol)。将混合物在25℃下搅拌0.5小时。将NH3·H2O(413.64mg，10.39mmol，454.55μL，28％纯度)添加到混合物中，将其在25℃下搅拌1.5小时。将混合物用EA(5mL)稀释，并用NH4Cl(3mL*3)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001351
4g
Figure BDA0003208444450001352
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为0％-3.2％的MeOH/DCM，速度为20mL/min)纯化残余物。得到((1S，3S，5S)-3-(4-氨基-2-氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-1-(氟甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)新戊酸甲酯(0.025g，57.14μmol，71.59％产率)，为白色泡沫。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝7.13(d，J＝7.4Hz，1H)，6.04(d，J＝6.6Hz，1H)，5.69(s，1H)，5.30-5.27(m，1H)，5.17(s，1H)，4.89(s，1H)，4.61-4.42(m，2H)，4.28-4.20(m，1H)，2.83(td，J＝6.9，13.8Hz，1H)，2.15(d，J＝7.4Hz，1H)，1.21(s，9H)，1.18(s，9H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝438.1[M+H]+。
步骤F：4-氨基-1-((1S，3S，4S)-3-(氟甲基)-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊 基)嘧啶-2(1H)-酮。向((1S，3S，5S)-3-(4-氨基-2-氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-1-(氟甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.078g，178.28μmol)在MeOH(1mL)中的溶液中添加NaOH(1M，1.56mL)。将混合物在25℃下搅拌12小时。将混合物用HCl溶液(1mL，1M)中和，并减压除去溶剂。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001353
4g
Figure BDA0003208444450001354
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为3％-18％的MeOH/DCM，速度为20mL/min)纯化残余物。通过Prep-HPLC(柱：Waters Xbridge 150*25 5u；流动相：[水(10mM NH4HCO3)-ACN]；B％：0％-25％，6分钟)进一步纯化产物。得到4-氨基-1-((1S，3S，4S)-3-(氟甲基)-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)嘧啶-2(1H)-酮(0.018g，66.85μmol，37.49％产率，100％纯度)，为白色固体。1H NMR(400MHz，CD3OD)δ＝7.58(d，J＝7.3Hz，1H)，5.88(d，J＝7.3Hz，1H)，5.74(s，1H)，5.23(d，J＝3.0Hz，1H)，4.75-4.58(m，1H)，4.57-4.40(m，1H)，4.31(d，J＝2.8Hz，1H)，3.78-3.64(m，2H)，2.24-2.07(m，2H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝270.2[M+H]+，539.3[2M+H]+。
实施例12：1-((1S，3S，4S)-3-(氟甲基)-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)- 5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮。
Figure BDA0003208444450001361
步骤A：((1S，3S，5S)-3-(3-苯甲酰基-5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)- 基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基 新戊酸酯。在25℃和N2下，向((1S，3R，5S)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-羟基-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(中间体7，500mg，775.44μmol)和3-苯甲酰基-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(中间体6，267.78mg，1.16mmol)在THF(10mL)中的溶液中一次性添加PPh3(508.47mg，1.94mmol)。在0℃下滴加DIAD(392.00mg，1.94mmol，376.93μL)后，将反应混合物在25℃下搅拌12小时。将反应混合物低压浓缩。通过硅胶柱色谱法(石油醚/乙酸乙酯＝10/1至3/1)纯化残余物。得到((1S，3S，5S)-3-(3-苯甲酰基-5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(200mg，233.37μmol，30.10％产率)，为淡黄色泡沫。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝7.94(d，J＝8Hz，2H)，7.70(m，1H)，7.53-7.51(m，2H)，7.38-7.36(m，2H)，7.30-7.25(m，7H)，7.24(s，1H)，6.83-6.81(m，4H)，5.71(s，1H)，5.57(s，1H)，5.28(s，1H)，5.10(s，1H)，4.41(s，2H)，3.78(s，6H)，3.58-3.29(m，2H)，2.19-2.16(d，J＝10Hz，2H)，1.98(s，3H)，1.20(s，9H)，0.96(s，9H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝879.5[M+Na]+。
步骤B：((1S，3S，5S)-3-(3-苯甲酰基-5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)- 基)-1-(羟甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯。在0℃和N2下，向((1S，3S，5S)-3-(3-苯甲酰基-5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(90.00mg，105.02μmol)在DCM(1mL)中的溶液中一次性添加TFA(77.00mg，675.30μmol，0.05mL)。将反应混合物在0℃下搅拌1小时。将反应混合物倾注到饱和NaHCO3水溶液(10mL)中，并用EA(20mL*3)萃取。将合并的有机相用盐水(10mL)洗涤，经Na2SO4干燥，并真空浓缩，得到黄色油状物。通过硅胶柱色谱法(石油醚/乙酸乙酯＝3/1至2/1)纯化残余物。得到((1S，3S，5S)-3-(3-苯甲酰基-5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-1-(羟甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(33mg，59.50μmol，56.66％产率，100％纯度)，为淡黄色油状物。LCMS：ESI-MS：m/z＝577.2[M+Na]+。
步骤C：((1R，3S，5S)-3-(3-苯甲酰基-5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)- 基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)-1-((((三氟甲基)磺酰基)氧基)甲基)环戊基)甲基新戊酸 酯。在0℃和N2下，向((1S，3S，5S)-3-(3-苯甲酰基-5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-1-(羟甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(200mg，360.60μmol)和吡啶(285.23mg，3.61mmol，291.06μL)在DCM(5mL)中的溶液中滴加Tf2O(203.48mg，721.20μmol，118.99μL)。将反应混合物在0℃下搅拌1小时。将反应混合物低压浓缩。通过硅胶柱色谱法(石油醚∶乙酸乙酯＝3∶1至2∶1)纯化残余物。得到((1R，3S，5S)-3-(3-苯甲酰基-5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)-1-((((三氟甲基)磺酰基)氧基)甲基)环戊基)甲基新戊酸酯(220mg，320.38μmol，88.85％产率)，为淡黄色泡沫。LCMS：ESI-MS：m/z＝709.2[M+Na]+。
步骤D：((1S，3S，5S)-1-(氟甲基)-3-(5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)- 基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯。在25℃和N2下，将((1R，3S，5S)-3-(3-苯甲酰基-5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)-1-((((三氟甲基)磺酰基)氧基)甲基)环戊基)甲基新戊酸酯(210mg，305.81μmol)在THF(1mL)中的溶液用TBAF(1M，4mL)处理。将反应混合物在25℃下搅拌12小时。将反应混合物低压浓缩。通过硅胶柱色谱法(石油醚/乙酸乙酯＝2/1至1/1)纯化残余物。得到((1S，3S，5S)-1-(氟甲基)-3-(5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(95mg，178.45μmol，58.35％产率，85％纯度)，为淡黄色油状物。LCMS：ESI-MS：m/z＝453.2[M+H]+。
步骤E：1-((1S，3S，4S)-3-(氟甲基)-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-5-甲 基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮。在25℃和N2下，向((1S，3S，5S)-1-(氟甲基)-3-(5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(95mg，209.94μmol)在MeOH(5mL)中的溶液中添加NaOH(1M，945.82μL)。将反应混合物在25℃下搅拌12小时。通过添加1.0M HCl溶液将反应混合物调节至pH＝6～7。将所得混合物真空浓缩，得到200mg粗产物，为淡黄色固体。通过Prep-HPLC(柱：Waters Xbridge 150*25 5u；流动相：[水(10mM NH4HCO3)-ACN]；B％：0％-27％，6分钟)纯化500mg粗产物，得到白色固体。通过SFC(柱：DAICEL CHIRALPAK IC(250mm*30mm，5um)；流动相：[0.1％NH3H2O IPA]；B％：45％-45％，min)再次纯化固体。得到1-((1S，3S，4S)-3-(氟甲基)-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(52.7mg，98％纯度)，为白色固体。1H NMR(400MHz，CD3OD)δ＝7.40(d，J＝1.2Hz，1H)，5.68(br，dd，J＝8.4，11.0Hz，1H)，5.26(d，J＝3.0Hz，1H)，4.96(d，J＝2.6Hz，1H)，4.72-4.41(m，2H)，4.31(d，J＝3.4Hz，1H)，3.79-3.67(m，2H)，2.25-2.21(m，1H)，2.12-2.09(m，1H)，1.86(d，J＝1.0Hz，3H)。19F NMR(376MHz，CD3OD)δ＝-232.41。LCMS：ESI-MS：m/z＝285.1[M+H]+。
实施例13：(1S，2S，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-(氟甲基)-2-(羟甲基)-3- 亚甲基环戊-1-醇。
Figure BDA0003208444450001381
步骤A：((1S，3S，5S)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(6-氯-9H- 嘌呤-9-基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯。在0℃下，向((1S，3R，5S)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-羟基-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(中间体7，0.989g，1.53mmol)、6-氯-9H-嘌呤(711.19mg，4.60mmol)和PPh3(61.02mg，232.63μmol)在THF(15mL)中的溶液中缓慢滴加DIAD(930.47mg，4.60mmol，894.68μL)的THF(15mL)溶液。将混合物在0℃下搅拌3小时，然后在25℃下搅拌12小时。将反应混合物低压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001391
4g
Figure BDA0003208444450001392
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为5％-26％的乙酸乙酯/石油醚，速度为22mL/min)，得到((1S，3S，5S)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(6-氯-9H-嘌呤-9-基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.760g，972.70μmol，63.42％产率)，为无色油状物。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝8.78-8.75(m，1H)，8.20(s，1H)，7.42-7.37(m，2H)，7.33-7.27(m，6H)，7.26-7.20(m，1H)，6.83(d，J＝8.4Hz，4H)，6.38-6.27(m，1H)，5.64(t，J＝9.2Hz，1H)，5.55(d，J＝2.6Hz，1H)，5.46(dd，J＝3.6，5.4Hz，1H)，4.83(d，J＝2.2Hz，1H)，4.64(d，J＝11.5Hz，1H)，4.42(d，J＝11.7Hz，1H)，3.80(s，6H)，3.39(s，2H)，2.81-2.69(m，1H)，2.34(ddd，J＝3.6，8.4，13.7Hz，1H)，1.28(d，J＝6.4Hz，9H)，1.19(s，9H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝781.3[M+H]+。
步骤B：((1S，3S，5S)-3-(6-氯-9H-嘌呤-9-基)-1-(羟甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰 氧基)环戊基)甲基新戊酸酯。在0℃下，向((1S，3S，5S)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(6-氯-9H-嘌呤-9-基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.736g，941.98μmol)在DCM(20mL)中的溶液中添加TFA(770.00mg，6.75mmol，0.5mL)和Et3SiH(1.46g，12.52mmol，2mL)。将混合物在0℃下搅拌0.5小时。将混合物用吡啶(1mL)淬灭，并将反应混合物低压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001393
4g
Figure BDA0003208444450001394
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为10％-45％的乙酸乙酯/石油醚，速度为22mL/min)纯化残余物，得到((1S，3S，5S)-3-(6-氯-9H-嘌呤-9-基)-1-(羟甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.3g，626.35μmol，66.49％产率，100％纯度)，为白色泡沫。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝8.74(s，1H)，8.23(s，1H)，5.75-5.65(m，1H)，5.49(d，J＝3.8Hz，1H)，5.38(d，J＝2.5Hz，1H)，4.84(d，J＝2.0Hz，1H)，4.56-4.47(m，1H)，4.46-4.38(m，1H)，3.82-3.60(m，2H)，2.88(ddd，J＝5.0，11.0，13.9Hz，1H)，2.41(ddd，J＝1.5，8.0，13.9Hz，1H)，1.27(s，9H)，1.24(s，9H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝479.1[M+H]+。
步骤C：((1R，3S，5S)-3-(6-氯-9H-嘌呤-9-基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)-1- ((((三氟甲基)磺酰基)氧基)甲基)环戊基)甲基新戊酸酯。在0℃下，向((1S，3S，5S)-3-(6-氯-9H-嘌呤-9-基)-1-(羟甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.272g，567.89μmol)在DCM(3mL)中的溶液中添加Tf2O(240.33mg，851.83μmol，140.55μL)和吡啶(224.60mg，2.84mmol，229.18μL)。将混合物在0℃下搅拌2小时。将混合物用DCM(5mL)稀释，并用NaHCO3(5mL*2)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001401
4g
Figure BDA0003208444450001402
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为3％-19％的乙酸乙酯/石油醚，速度为22mL/min)纯化残余物，得到((1R，3S，5S)-3-(6-氯-9H-嘌呤-9-基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)-1-((((三氟甲基)磺酰基)氧基)甲基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.235g，384.60umol，67.72％产率)，为无色油状物。LCMS：ESI-MS：m/z＝611.1[M+H]+。
步骤D：((1S，3S，5S)-3-(6-氯-9H-嘌呤-9-基)-1-(氟甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰 氧基)环戊基)新戊酸甲酯。向((1R，3S，5S)-3-(6-氯-9H-嘌呤-9-基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)-1-((((三氟甲基)磺酰基)氧基)甲基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.235g，384.60μmol)在THF(2mL)中的溶液中添加TBAF(1M，1.15mL)。将混合物在25℃下搅拌12小时。将混合物用EA(5mL)稀释，并用饱和NH4Cl溶液(3mL)洗涤。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001403
4g
Figure BDA0003208444450001404
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为5％-20％的乙酸乙酯/石油醚，速度为22mL/min)纯化残余物。用SFC(ES5716-281-P1_G2)分析产物，并通过SFC(柱：OJ(250mm*30mm，5um)；流动相：[0.1％NH3H2O ETOH]；B％：20％-20％，min，RT＝1.492分钟)进一步分离，得到((1S，3S，5S)-3-(6-氯-9H-嘌呤-9-基)-1-(氟甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.083g，150.14μmol，39.04％产率，87％纯度)，为白色泡沫。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝8.77-8.72(m，1H)，8.22(s，1H)，5.75-5.62(m，1H)，5.51(d，J＝3.1Hz，1H)，5.39-5.22(m，1H)，4.88(s，1H)，4.72-4.64(m，1H)，4.61-4.51(m，1H)，4.42(s，2H)，2.92-2.81(m，1H)，2.42(dd，J＝7.8，13.8Hz，1H)，1.26(d，J＝10.8Hz，18H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝481.1[M+H]+。
步骤E：((1S，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-1-(氟甲基)-2-亚甲基-5-(新戊 酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯。向((1S，3S，5S)-3-(6-氯-9H-嘌呤-9-基)-1-(氟甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.083g，172.57μmol)在THF(1mL)中的溶液中添加NH3的THF(88.17mg，5.18mmol，7M，15mL)溶液。将混合物在25℃下搅拌12小时。将反应混合物低压浓缩，得到((1S，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-1-(氟甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.053g，114.84μmol，66.54％产率)，为白色固体。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝8.32(s，1H)，7.84(s，1H)，5.67-5.56(m，1H)，5.69-5.55(m，2H)，5.47(d，J＝3.5Hz，1H)，5.32-5.22(m，2H)，4.88(s，1H)，4.68-4.57(m，1H)，4.44-4.29(m，2H)，2.78(ddd，J＝5.2，11.1，14.1Hz，1H)，2.36(dd，J＝8.2，13.9Hz，1H)，1.23(d，J＝6.6Hz，18H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝462.3[M+H]+。
步骤F：(1S，2S，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-(氟甲基)-2-(羟甲基)-3-亚甲 基环戊-1-醇。向((1S，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-1-(氟甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.053g，114.84μmol)在MeOH(0.5mL)中的溶液中添加CH3ONa(18.61mg，344.51μmol)。将混合物在85℃下搅拌12小时。低压除去溶剂。通过柱色谱法(SiO2，DCM/MeOH＝30/1至15/1)纯化残余物，并通过Prep-HPLC(柱：Phenomenex KinetexXB-C18 150mm*30mm，5μm；流动相：[水(10mM NH4HCO3)-ACN]；B％：1％-28％，8min)进一步纯化，得到(1S，2S，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-(氟甲基)-2-(羟甲基)-3-亚甲基环戊-1-醇(0.023g，78.42μmol，68.29％产率，100％纯度)，为白色固体。1H NMR(400MHz，CD3OD)δ＝8.22(s，1H)，8.16(s，1H)，5.73(t，J＝9.0Hz，1H)，5.25(s，1H)，4.72-4.55(m，1H)，4.71-4.55(m，1H)，4.53-4.37(m，2H)，3.85(s，2H)，2.73-2.55(m，1H)，2.40-2.21(m，1H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝293.9[M+H]+。
实施例14：(1S，2S，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-(氯甲基)-2-(羟甲基)-3- 亚甲基环戊-1-醇。
Figure BDA0003208444450001421
步骤A：N，N-Di-BOC-((1S，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-1-((双(4-甲氧基 苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯。在0℃下，向((1S，3R，5S)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-羟基-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(中间体7，1.1g，1.71mmol)、N-叔丁氧羰基-N-(9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯(1.72g，5.12mmol)和PPh3(61.02mg，232.63μmol)在THF(15mL)中的溶液中缓慢滴加DIAD(1.03g，5.12mmol，995.08μL)的THF(15mL)溶液。将混合物在0℃下搅拌3小时，然后在25℃下搅拌12小时。低压除去溶剂。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001422
40g
Figure BDA0003208444450001423
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为5％-26％的乙酸乙酯/石油醚，速度为35mL/min)纯化残余物。得到N，N-Di-BOC-((1S，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.895g，902.32μmol，52.89％产率，97％纯度)，为无色油状物。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝8.87(s，1H)，8.14(s，1H)，7.43-7.37(m，2H)，7.33-7.29(m，2H)，7.33-7.29(m，1H)，7.28(d，J＝1.8Hz，3H)，7.24(d，J＝7.1Hz，1H)，6.83(dd，J＝1.4，8.9Hz，4H)，5.67(t，J＝9.0Hz，1H)，5.53(d，J＝2.6Hz，1H)，5.46(dd，J＝3.4，5.4Hz，1H)，4.81(d，J＝2.4Hz，1H)，4.63(d，J＝11.5Hz，1H)，4.41(d，J＝11.7Hz，1H)，3.80(s，6H)，3.42-3.32(m，2H)，2.80-2.67(m，1H)，2.39-2.27(m，1H)，1.45(s，18H)，1.19(s，9H)，1.06-1.00(m，9H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝962.5[M+H]+。
步骤B：N，N-Di-BOC((1S，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-1-(羟甲基)-2-亚甲 基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯。在0℃下，向N，N-Di-BOC-((1S，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.775g，805.50μmol)在DCM(5mL)中的溶液中添加TFA(765.06mg，6.71mmol，496.79μL)。将混合物在0℃下搅拌5小时。将混合物用饱和NaHCO3水溶液(5mL)淬灭，并用DCM(5mL*2)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001431
12g
Figure BDA0003208444450001432
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为10％-45％的乙酸乙酯/石油醚，速度为35mL/min)纯化残余物。得到N，N-Di-BOC((1S，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-1-(羟甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.19g，287.98μmol，35.75％产率)，为白色泡沫。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝8.84(s，1H)，8.16(s，1H)，5.71(dd，J＝8.2，10.9Hz，1H)，5.50(d，J＝3.8Hz，1H)，5.35(d，J＝2.8Hz，1H)，4.81(d，J＝2.3Hz，1H)，4.57-4.48(m，1H)，4.46-4.39(m，1H)，3.82-3.74(m，1H)，3.70-3.63(m，1H)，2.88(ddd，J＝5.1，11.0，13.9Hz，1H)，2.41(dd，J＝8.5，13.3Hz，1H)，1.47(s，18H)，1.28(s，9H)，1.25(s，9H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝660.3[M+H]+。
步骤C：N，N-Di-BOC-((1R，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-亚甲基-5-(新戊 酰氧基)-1-((((三氟甲基)磺酰基)氧基)甲基)环戊基)甲基新戊酸酯。向N，N-Di-BOC((1S，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-1-(羟甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.220g，333.45μmol)在DCM(1.1mL)中的溶液中添加吡啶(263.76mg，3.33mmol，269.14μL)和Tf2O(188.16mg，666.90μmol，110.03μL)。将混合物在0℃下搅拌2小时。将混合物用DCM(2mL)稀释，并用NaHCO3(3mL*2)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001435
；4g
Figure BDA0003208444450001436
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为5％-19％的乙酸乙酯/石油醚，速度为20mL/min)纯化残余物。得到N，N-Di-BOC-((1R，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)-1-((((三氟甲基)磺酰基)氧基)甲基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.175g，221.01μmol，66.28％产率)，为轻质油状物。LCMS：ESI-MS：m/z＝792.5[M+H]+。
步骤D：N，N-Di-BOC-((1S，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-1-(氯甲基)-2-亚 甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯。向N，N-Di-BOC-((1R，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)-1-((((三氟甲基)磺酰基)氧基)甲基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.175g，221.01μmol)在DMF(1.5mL)中的溶液中添加LiCl(37.47mg，884.03μmol，18.10μL)。将混合物在40℃下搅拌2小时。将混合物用EA(5mL)稀释，并用H2O(5mL*2)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001433
4g
Figure BDA0003208444450001434
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为3％-30％的乙酸乙酯/石油醚，速度为40mL/min)纯化残余物。得到N，N-Di-BOC-((1S，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-1-(氯甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.06g，88.47umol，40.03％产率)，为轻质油状物。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝8.82(s，1H)，8.16(s，1H)，5.76-5.64(m，1H)，5.39(d，J＝4.2Hz，1H)，5.31(s，1H)，4.88(s，1H)，4.60(d，J＝11.2Hz，1H)，4.42(d，J＝11.2Hz，1H)，3.90-3.71(m，2H)，2.87-2.72(m，1H)，2.52-2.33(m，1H)，1.53-1.44(m，18H)，1.33-1.28(m，9H)，1.22(s，9H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝700.5[M+Na]+。
步骤E：((1S，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-1-(氯甲基)-2-亚甲基-5-(新戊 酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯。将N，N-Di-BOC-((1S，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-1-(氯甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.045g，66.35μmol)溶解于TFA(154.00mg，1.35mmol，0.1mL)在DCM(0.5mL)中的溶液中，并将混合物在25℃下搅拌3小时。将混合物用饱和NaHCO3溶液(3mL)淬灭，并用DCM(5mL*2)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001441
4.0g
Figure BDA0003208444450001442
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为0％-6％的MeOH/DCM，速度为20mL/min)纯化残余物。得到((1S，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-1-(氯甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.025g，52.30μmol，78.83％产率)，为白色固体。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝8.30(s，1H)，7.87(s，1H)，5.70(s，2H)，5.62(dd，J＝8.3，11.1Hz，1H)，5.36(d，J＝3.7Hz，1H)，5.31-5.27(m，1H)，4.91(d，J＝2.2Hz，1H)，4.57(d，J＝11.5Hz，1H)，4.40(d，J＝11.2Hz，1H)，3.91-3.68(m，2H)，2.72(ddd，J＝4.9，11.5，14.1Hz，1H)，2.39(dd，J＝7.7，14.6Hz，1H)，1.28(s，9H)，1.21(s，9H)。
LCMS：ESI-MS：m/z＝478.4[M+H]+。
步骤F：(1S，2S，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-(氯甲基)-2-(羟甲基)-3-亚甲 基环戊-1-醇。向((1S，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-1-(氯甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(0.045g，94.15μmol)在MeOH(0.5mL)中的溶液中添加CH3ONa(10.17mg，188.29μmol)。将混合物在25℃下搅拌12小时。低压除去溶剂。通过柱色谱法(SiO2，DCM/MeOH＝30/1至20/1)纯化残余物。通过Prep-HPLC(柱：Waters Xbridge 150*255μ；流动相：[水(10mM NH4HCO3)-ACN]；B％：0％-30％，6分钟)进一步纯化粗制品。得到(1S，2S，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-(氯甲基)-2-(羟甲基)-3-亚甲基环戊-1-醇(0.0124g，39.63μmol，42.10％产率，99％纯度)，为白色固体。1H NMR(400MHz，CD3OD)δ＝8.22(s，1H)，8.17(s，1H)，5.80-5.68(m，1H)，5.28(d，J＝2.8Hz，1H)，4.83(d，J＝2.3Hz，1H)，4.34(d，J＝3.3Hz，1H)，3.94-3.84(m，3H)，3.84-3.76(m，1H)，2.62(ddd，J＝4.5，10.9，13.2Hz，1H)，2.33(dd，J＝8.9，12.2Hz，1H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝309.9[M+H]+。
实施例15：(1S，3S，5S)-5-羟基-1-(羟甲基)-3-(5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧 啶-1(2H)-基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲腈。
Figure BDA0003208444450001451
步骤A：((1R，3S，5S)-3-(3-苯甲酰基-5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)- 基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基 新戊酸酯。在25℃和N2下，向((1S，3R，5S)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-羟基-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(中间体7，120mg，186.11μmol)和3-苯甲酰基-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(中间体6，64.27mg，279.16μmol)在THF(3mL)中的溶液中添加PPh3(122.03mg，465.27μmol)。在0℃下滴加DIAD(94.08mg，465.27μmol，90.46μL)后，将反应混合物在25℃下再搅拌12小时。真空除去溶剂，得到黄色油状物。通过硅胶柱色谱法(石油醚/乙酸乙酯＝10/1至3/1)纯化残余物。得到((1R，3S，5S)-3-(3-苯甲酰基-5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(100mg，61.44％产率，98％纯度)，为白色泡沫。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝7.93-7.91(m，2H)，7.68-7.60(m，1H)，7.55-7.44(m，2H)，7.49-7.37(m，2H)，7.31-7.26(m，7H)，7.15(d，J＝1.0Hz，1H)，6.84(d，J＝8.8Hz，4H)，5.78-5.75(m，1H)，5.56(br，d，J＝4.0Hz，1H)，5.12(dd，J＝2.3，19.6Hz，2H)，4.11-4.02(m，2H)，3.80-3.77(m，6H)，3.60-3.58(m，1H)，3.29(d，J＝9.0Hz，1H)，2.63(s，3H)，2.45-2.43(m，1H)，2.24(br，dd，J＝8.8，13.1Hz，1H)，1.13(s，9H)，1.03(s，9H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝879.3[M+Na]+。
步骤B：1-((1S，3S，4S)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-4-羟基-3- (羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮。在25℃和N2下，向((1R，3S，5S)-3-(3-苯甲酰基-5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(4.4g，5.13mmol)在MeOH(90mL)中的溶液中添加NaOH溶液(4M，44.00mL)。将反应混合物在60℃下搅拌4小时。用4MHCl溶液将反应混合物调节至pH约为8。将所得混合物用EA(70mL*3)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，并真空浓缩，得到黄色油状物。通过硅胶柱色谱法(DCM/MeOH＝50/1至20/1)纯化残余物。得到1-((1S，3S，4S)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(3g，5.13mmol，99.94％产率)，为白色泡沫。LCMS：ESI-MS：m/z＝607.1[M+Na]+。
步骤C：1-((1S，3R，4S)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(((叔丁 基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-4-羟基-2-亚甲基环戊基)-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二 酮。在20℃和N2下，向1-((1S，3S，4S)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(3g，5.13mmol)和1-咪唑(1.05g，15.39mmol)在DMF(9mL)中的溶液中添加TBSCl(928.06mg，6.16mmol，754.52μL)。将反应混合物在20℃下搅拌12小时。将反应倾注到水(50mL)中，并用EA(70mL*3)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，并真空浓缩，得到黄色油状物。通过硅胶柱色谱法(石油醚/乙酸乙酯＝3/1至1/1)纯化残余物。得到1-((1S，3R，4S)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-4-羟基-2-亚甲基环戊基)-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(3.3g，4.58mmol，89.26％产率，97％纯度)，为白色泡沫。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝8.37(br，s，1H)，7.44-7.43(m，2H)，7.36-7.32(m，7H)，7.12(d，J＝1.2Hz，1H)，6.91-6.88(m，4H)，5.93-5.89(m，1H)，4.93(m，2H)，4.58(br d，J＝2.5Hz，1H)，3.86(s，6H)，3.82(d，J＝10.2Hz，1H)，3.68(d，J＝8.8Hz，1H)，3.54(d，J＝10.2Hz，1H)，3.34(s，1H)，3.18(d，J＝8.6Hz，1H)，2.38-2.31(m，2H)，1.50(s，3H)，0.87(s，9H)，0.06(s，3H)，0.00(s，3H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝721.3[M+Na]+。
步骤D：1-((1S，3R，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基 苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-2-亚甲基环戊基)- 5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮。在20℃和N2下，向1-((1S，3R，4S)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-4-羟基-2-亚甲基环戊基)-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(3.3g，4.72mmol)和可力丁(1.43g，11.80mmol，1.56mL)在DCE(60mL)中的溶液中添加AgNO3(2.01g，11.80mmol，1.99mL)。在添加4，4′-二甲氧基三苯甲基氯(DMTrCl)(3.20g，9.44mmol)后，将反应混合物在60℃下搅拌4小时。将反应混合物倾注到水(50mL)中，并将无机材料滤出。分离滤液，并将水相用DCM(70mL*2)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，并真空浓缩，得到黄色油状物。通过硅胶柱色谱法(石油醚/乙酸乙酯＝5/1至2/1)纯化残余物。得到1-((1S，3R，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-2-亚甲基环戊基)-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(3.3g，3.26mmol，69.10％产率，99％纯度)，为淡黄色泡沫。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝8.12(s，1H)，7.50-7.03(m，18H)，6.74-6.60(m，8H)，6.42(s，1H)，5.68(br s，1H)，4.93(br s，1H)，4.66(m，1H)，4.09-4.02(m，2H)，3.99(br d，J＝9.9Hz，1H)，3.86-3.83(m，1H)，3.76-3.69(m，12H)，3.43-3.41(m，1H)，2.72(br，d，J＝8.8Hz，1H)，1.90-1.84(m，1H)，1.45(s，3H)，0.83(s，9H)，0.01(m，6H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝1024.8[M+Na]+。
步骤E：1-((1S，3S，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基 苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二 酮。将1-((1S，3R，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-2-亚甲基环戊基)-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(700mg，699.11μmol)在TBAF(1M，20mL)和AcOH(882.00mg，14.69mmol，840μL)中的溶液在50℃下搅拌12小时。将TEA(5mL)添加到反应混合物中。将所得混合物真空浓缩，得到黄色油状物。通过硅胶柱色谱法(石油醚∶乙酸乙酯＝1∶1至0∶1)纯化残余物。得到1-((1S，3S，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(1g，2批，1.08mmol，77.40％产率，96％纯度)，为淡黄色泡沫。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝11.21(br，s，1H)，7.41(m，2H)，7.29-7.19(m，12H)，7.07(m，4H)，6.88-6.78(m，8H)，6.44(s，1H)，5.40(m，1H)，4.83(d，J＝2.3Hz，1H)，4.68(m，2H)，4.00-3.96(m，2H)，3.92-3.84(m，2H)，3.71(s，12H)，2.86(br d，J＝9.0Hz，1H)，1.80-1.75(m，1H)，1.43(s，3H)。
LCMS：ESI-MS：m/z＝909.8[M+Na]+。
步骤：F(1S，3S，5S)-5-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-1-((双(4-甲氧基苯 基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基环 戊烷-1-甲醛。在20℃下，向1-((1S，3S，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(100mg，112.74μmol)在DCM(2mL)和TEA(34.22mg，338.21μmol，47.07μL)中的溶液中一次性添加DMP(143.45mg，338.21μmol，104.71μL)。将反应混合物在20℃下搅拌4小时。将反应混合物用DCM(20mL)稀释，然后倾注到饱和Na2S2O3溶液(5mL)和饱和NaHCO3溶液(5mL)中，并搅拌5分钟。分离有机相，并用盐水(5mL)洗涤，并经无水Na2SO4干燥。真空除去溶剂，得到淡黄色泡沫。得到(1S，3S，5S)-5-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲醛(120mg，粗制品)，为淡黄色泡沫，将其直接用于下一步骤中，无需进一步纯化。LCMS：ESI-MS：m/z＝907.4[M+Na]+。
步骤G：(E)-5-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基) 甲氧基)甲基)-3-(5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲 醛肟。在20℃和N2下，向(1S，3S，5S)-5-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲醛(110mg，124.29μmol)在吡啶(1mL)中的溶液中一次性添加NH2OH·HCl(17.27mg，248.59μmol)。将反应混合物在20℃下搅拌12小时。低压除去溶剂，并将残余物用EA(20mL)稀释，用水(5mL)和盐水(5mL)洗涤。将有机相经无水Na2SO4干燥，并真空浓缩，得到黄色泡沫。得到(E)-5-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲醛肟(85mg，94.44μmol，75.98％产率)，为淡黄色泡沫，将其直接用于下一步骤中，无需进一步纯化。LCMS：ESI-MS：m/z＝922.8[M+Na]+。
步骤H：(1S，3S，5S)-5-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-1-((双(4-甲氧基苯 基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基环 戊烷-1-甲腈。在20℃和N2下，向(E)-5-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲醛肟(800mg，888.87μmol)在ACN(10mL)中的溶液中一次性添加CDI(288.26mg，1.78mmol)。将反应混合物在30℃下搅拌36小时。将反应混合物用EA(100mL)稀释，并将所得溶液用水(30mL)、盐水(30mL)洗涤，并经无水Na2SO4干燥。将所得溶液真空浓缩，得到黄色油状物。通过硅胶柱色谱法(石油醚/乙酸乙酯＝2/1至1/1)纯化残余物。得到(1S，3S，5S)-5-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲腈(500mg，63.14％产率，99％纯度)，为淡黄色泡沫。LCMS：ESI-MS：m/z＝904.5[M+Na]+。
步骤I：(1S，3S，5S)-5-羟基-1-(羟甲基)-3-(5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶- 1(2H)-基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲腈。在20℃下，向(1S，3S，5S)-5-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲腈(400mg，453.51μmol)在DCM(4mL)中的溶液中添加TFA(616.00mg，5.40mmol，0.4mL)，并在20℃下搅拌2小时。真空除去溶剂。将残余物溶解在乙腈(20mL)中，并用饱和NaHCO3溶液将溶液调节pH为8。将所得混合物真空浓缩，得到600mg粗产物，为黄色油状物。通过硅胶柱色谱法(DCM/MeOH＝15/1至10/1)纯化900mg粗产物。得到(1S，3S，5S)-5-羟基-1-(羟甲基)-3-(5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲腈(152.2mg，97.75％纯度，80.7％产率)，为白色固体。1H NMR(400MHz，CD3OD)δ＝7.34(s，1H)，5.64-5.58(m，2H)，5.23(s，1H)，4.43(d，J＝3.8Hz，1H)，3.87-3.84(m，1H)，3.79-3.86(m，1H)，2.34-2.29(m，1H)，2.28-2.18(m，1H)，1.86(s，3H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝278.1[M+H]+。
实施例16：(1S，3S，5S)-3-(4-氨基-2-氧代嘧啶-1(2H)-基)-5-羟基-1-(羟甲基) 2-亚甲基环戊烷-1-甲腈。
Figure BDA0003208444450001501
步骤A：((1R，3S，5S)-3-(3-苯甲酰基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-1- ((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸 酯。在0℃下，向((1S，3R，5S)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-羟基-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(中间体7，3g，4.65mmol)、PPh3(2.44g，9.31mmol)和3-苯甲酰基-1H-嘧啶-2，4-二酮(1.51g，6.98mmol)在THF(60mL)中的溶液中添加DIAD(1.88g，9.31mmol，1.81mL)。将混合物在25℃下搅拌12小时。减压除去溶剂。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001502
4g
Figure BDA0003208444450001503
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为6％-23％的乙酸乙酯/石油醚，速度为20mL/min)纯化残余物。得到((1R，3S，5S)-3-(3-苯甲酰基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(3.3g，3.91mmol，84.14％产率)，为白色泡沫。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝7.99-7.90(m，2H)，7.69-7.63(m，1H)，7.57-7.49(m，2H)，7.43-7.36(m，2H)，7.27(s，7H)，7.06(d，J＝8.2Hz，1H)，6.86(d，J＝8.8Hz，4H)，5.70(t，J＝9.0Hz，1H)，5.48(d，J＝8.0Hz，2H)，5.23(d，J＝2.2Hz，1H)，5.11(d，J＝2.0Hz，1H)，4.27(d，J＝11.0Hz，1H)，4.11-4.05(m，1H)，3.82(s，6H)，3.47-3.37(m，2H)，2.25-2.18(m，1H)，2.13(dd，J＝4.8，10.4Hz，1H)，1.16(s，9H)，1.09(s，9H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝865.5[M+Na]+。
步骤B：1-((1S，3S，4S)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-4-羟基-3- (羟甲基)-2-亚甲基环戊基)嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮。向((1R，3S，5S)-3-(3-苯甲酰基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(1.73g，2.05mmol)在MeOH(40mL)中的溶液中添加NaOH(4M，7.70mL)。将混合物在60℃下搅拌12小时。将反应混合物用HCl溶液(1M)中和，并用EA(20mL*3)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001511
4g
Figure BDA0003208444450001512
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为0％-2％的MeOH/DCM，速度为20mL/min)纯化残余物。得到1-((1S，3S，4S)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(0.793g，1.39mmol，67.71％产率)，为白色泡沫。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝8.95(s，1H)，7.40(d，J＝7.6Hz，2H)，7.35-7.28(m，6H)，7.27-7.21(m，1H)，6.89(d，J＝8.0Hz，1H)，6.86(d，J＝8.6Hz，4H)，5.78-5.62(m，1H)，5.48(d，J＝8.0Hz，1H)，4.93(d，J＝2.6Hz，1H)，4.86(d，J＝2.0Hz，1H)，4.56(d，J＝3.6Hz，1H)，3.83-3.76(m，8H)，3.41(d，J＝9.2Hz，1H)，3.24(d，J＝9.2Hz，1H)，2.25(dd，J＝8.8，12.2Hz，1H)，1.96-1.80(m，1H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝593.1[M+Na]+。
步骤C：1-((1S，3R，4S)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(((叔丁 基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-4-羟基-2-亚甲基环戊基)嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮。在0℃下，向1-((1S，3S，4S)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(0.793g，1.39mmol)在DMF(1.8mL)中的溶液中添加咪唑(283.82mg，4.17mmol)和TBSCl(314.18mg，2.08mmol，255.43μL)。将混合物在25℃下搅拌2小时。将混合物用EA(15mL)稀释，并用H2O(10mL*2)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001513
4g
Figure BDA0003208444450001514
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为0％-1％的MeOH/DCM，速度为20mL/min)纯化残余物。得到1-((1S，3R，4S)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-4-羟基-2-亚甲基环戊基)嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(0.825g，1.20mmol，86.68％产率)，为白色泡沫。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝8.40(s，1H)，7.42-7.35(m，2H)，7.33-7.27(m，4H)，7.26-7.19(m，3H)，7.04(d，J＝8.0Hz，1H)，6.84(d，J＝8.8Hz，4H)，5.86-5.72(m，1H)，5.42(dd，J＝2.3，8.0Hz，1H)，4.97(d，J＝2.8Hz，1H)，4.88(d，J＝2.2Hz，1H)，4.45-4.39(m，1H)，3.83-3.80(m，6H)，3.76(d，J＝10.0Hz，1H)，3.70-3.64(m，1H)，3.46(d，J＝8.8Hz，1H)，3.21(dd，J＝3.1，5.4Hz，2H)，2.33-2.23(m，1H)，2.04-1.98(m，1H)，0.84(s，9H)，0.03(s，3H)，-0.01(s，3H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝707.2[M+Na]+。
步骤D：1-((1S，3R，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基 苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-2-亚甲基环戊基) 嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮。向1-((1S，3R，4S)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-4-羟基-2-亚甲基环戊基)嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(0.1g，146.01μmol)在二氯乙烷(DCE)(0.3mL)中的溶液中添加AgNO3(49.61mg，292.02μmol，49.11L)、可力丁(35.39mg，292.02μmol，38.59μL)和1-[氯-(4-甲氧基苯基)-苯基-甲基]-4-甲氧基-苯(74.21mg，219.01μmol)。将混合物在50℃下搅拌1小时。将混合物用MeOH(2mL)淬灭，并低压除去溶剂。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001521
4g
Figure BDA0003208444450001522
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为15％-45％的乙酸乙酯/石油醚，速度为20mL/min)纯化残余物。得到1-((1S，3R，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-2-亚甲基环戊基)嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(0.108g，107.21μmol，73.42％产率，98％纯度)，为白色泡沫。1H NMR(400MHz，CD3OD)δ＝7.48(d，J＝7.0Hz，2H)，7.35(dd，J＝9.0，13.8Hz，4H)，7.30-7.21(m，6H)，7.19-7.18(m，1H)，7.15(d，J＝8.0Hz，2H)，7.09(dd，J＝6.0，8.8Hz，4H)，6.85-6.70(m，8H)，5.38(s，1H)，5.11(d，J＝8.0Hz，1H)，4.94(d，J＝2.2Hz，1H)，4.92-4.90(m，1H)，4.20(t，J＝6.8Hz，1H)，4.07(s，1H)，3.96(d，J＝9.8Hz，1H)，3.76(dd，J＝2.4，6.8Hz，12H)，3.54(d，J＝9.6Hz，1H)，3.06(d，J＝9.6Hz，1H)，2.09-2.03(m，1H)，1.28(d，J＝5.8Hz，1H)，0.89(s，9H)，0.07(d，J＝4.2Hz，6H)。
步骤E：1-((1S，3S，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基 苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮。将1-((1S，3R，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-2-亚甲基环戊基)嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(0.1g，101.29μmol)用TBAF(2M，3mL)处理。[将TBAF用CH3COOH(176.40mg，2.94mmol，168.00μL)中和]。将反应混合物在50℃下搅拌12小时。将混合物用EA(5mL)稀释，并用H2O(5mL*2)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001531
4g
Figure BDA0003208444450001532
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为0％-2％的MeOH/DCM，速度为20mL/min)纯化残余物。得到1-((1S，3S，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(0.06g，68.73μmol，67.85％产率)，为白色泡沫。1H NMR(400MHz，CD3OD)δ＝7.53(d，J＝7.0Hz，2H)，7.40(dd，J＝8.8，13.8Hz，4H)，7.35-7.27(m，5H)，7.20-7.09(m，8H)，6.93-6.77(m，8H)，5.59(s，1H)，5.32(s，1H)，5.08(d，J＝8.0Hz，1H)，4.96(d，J＝1.8Hz，1H)，4.83(d，J＝2.0Hz，1H)，4.23(dd，J＝6.0，8.5Hz，1H)，4.03-3.90(m，2H)，3.86-3.74(m，12H)，3.61(d，J＝9.6Hz，1H)，3.19(d，J＝9.6Hz，1H)，2.13-2.06(m，1H)，1.37-1.30(m，1H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝895.3[M+Na]+。
步骤F：(1S，3S，5S)-5-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-1-((双(4-甲氧基苯 基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基环戊烷-1- 甲醛。向1-((1S，3S，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(0.06g，68.73μmol)在DCM(0.7mL)中的溶液中添加DMP(58.30mg，137.46μmol，42.56μL)。将混合物在25℃下搅拌1小时。将混合物用饱和NaHCO3溶液(1mL)和饱和Na2S2O3溶液(1mL)淬灭。将混合物用DCM(10mL*2)萃取，并将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤。将所得溶液经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到残余物(1S，3S，5S)-5-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲醛(0.06g，粗制品)，为白色泡沫。LCMS：ESI-MS：m/z＝893.8[M+Na]+。
步骤G：(E)-5-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基) 甲氧基)甲基)-3-(2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲醛肟。向(1S，3S，5S)-5-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲醛(60mg，68.89μmol)在吡啶(0.7mL)中的溶液中添加羟胺盐酸盐(9.57mg，137.78μmol)。将混合物在25℃下搅拌0.5小时。将反应混合物减压浓缩。将残余物用H2O(5mL)稀释，并用EA(5mL*2)萃取。将合并的有机层用盐水(15mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到粗制品(E)-5-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲醛肟(60mg，粗制品)，为棕色泡沫。LCMS：ESI-MS：m/z＝908.3[M+Na]+。
步骤H：(1S，3S，5S)-5-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-1-((双(4-甲氧基苯 基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基环戊烷-1- 甲腈。向(E)-5-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲醛肟(0.71g，801.36μmol)在CH3CN(8mL)中的溶液中添加CDI(259.88mg，1.60mmol)。将混合物在45℃下搅拌16小时。将混合物用EA(20mL)稀释，并用H2O(15mL*2)洗涤。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001541
12g
Figure BDA0003208444450001542
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为17％-62％的乙酸乙酯/石油醚，速度为30mL/min)纯化残余物。得到(1S，3S，5S)-5-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲腈(0.57g，656.70μmol，81.95％产率)，为白色固体。1H NMR(400MHz，CD3OD)δ＝7.51(d，J＝7.5Hz，2H)，7.44-7.37(m，4H)，7.34(d，J＝8.8Hz，2H)，7.30-7.18(m，10H)，7.00(d，J＝8.0Hz，1H)，6.80(ddd，J＝2.8，4.1，9.0Hz，8H)，5.55(s，1H)，5.44(d，J＝8.0Hz，1H)，5.21-5.11(m，2H)，4.05(t，J＝3.5Hz，1H)，3.77(d，J＝1.0Hz，6H)，3.72(d，J＝9.3Hz，6H)，3.41-3.35(m，1H)，3.29(s，1H)，1.06-0.97(m，1H)，0.95-0.84(m，1H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝890.3[M+Na]+。
步骤I：(1S，3S，5S)-3-(4-氨基-2-氧代嘧啶-1(2H)-基)-5-(双(4-甲氧基苯基) (苯基)甲氧基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲腈。向(1S，3S，5S)-5-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲腈(0.57g，656.70μmol)在CH3CN(3mL)中的溶液中添加Et3N(132.90mg，1.31mmol，182.81μL)、DMAP(160.46mg，1.31mmol)和2，4，6-三异丙基苯磺酰氯(397.77mg，1.31mmol)。将混合物在25℃下搅拌0.5小时。将NH3·H2O(1.82g，14.54mmol，2mL，28％纯度，22.14当量)添加到混合物中，并将反应混合物在25℃下搅拌1.5小时。将混合物用EA(30mL)稀释，并用饱和NH4Cl溶液(15mL*4)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001551
20g
Figure BDA0003208444450001552
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为0％-3.2％的MeOH/DCM，速度为30mL/min)纯化残余物。得到(1S，3S，5S)-3-(4-氨基-2-氧代嘧啶-1(2H)-基)-5-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲腈(0.439g，496.22μmol，75.56％产率，98％纯度)，为白色泡沫。1H NMR(400MHz，METHANOL-d4)δ＝7.51(d，J＝7.3Hz，2H)，7.43-7.37(m，4H)，7.34(d，J＝8.8Hz，2H)，7.30-7.16(m，10H)，7.01(d，J＝7.5Hz，1H)，6.84-6.75(m，8H)，5.64(d，J＝7.3Hz，1H)，5.48(d，J＝1.5Hz，1H)，5.18(s，1H)，5.02(s，1H)，4.07-4.03(m，1H)，3.77(d，J＝1.8Hz，6H)，3.72(d，J＝8.5Hz，6H)，3.41-3.33(m，2H)，1.16-1.09(m，1H)，1.01-0.90(m，1H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝867.2[M+H]+。
步骤J：(1S，3S，5S)-3-(4-氨基-2-氧代嘧啶-1(2H)-基)-5-羟基-1-(羟甲基)-2- 亚甲基环戊烷-1-甲腈。向(1S，3S，5S)-3-(4-氨基-2-氧代嘧啶-1(2H)-基)-5-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲腈(389.00mg，448.68μmol)在DCM(2mL)中的溶液中添加TFA(7.67g，13.46mmol，4.98mL，20％纯度)。将混合物在25℃下搅拌0.5小时。将混合物用NH3(7M，在MeOH中，1mL)淬灭，并减压除去溶剂。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001553
4g
Figure BDA0003208444450001554
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为5％-17％的MeOH/DCM，速度为20mL/min)纯化残余物。通过Pre-HPLC(柱：WatersXbridge 150*25 5u；流动相：[水(10mM NH4HCO3)-ACN]；B％：0％-25％，6分钟)进一步纯化粗制品。得到(1S，3S，5S)-3-(4-氨基-2-氧代嘧啶-1(2H)-基)-5-羟基-1-(羟甲基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲腈(0.0998g，376.73μmol，83.96％产率，99％纯度)，为白色固体。1H NMR(400MHz，CD3OD)δ＝7.54(d，J＝7.3Hz，1H)，5.88(d，J＝7.3Hz，1H)，5.63(t，J＝9.2Hz，1H)，5.55(d，J＝2.3Hz，1H)，5.15(s，1H)，4.43(d，J＝3.5Hz，1H)，3.90-3.83(m，1H)，3.80-3.73(m，1H)，2.40-2.28(m，1H)，2.25-2.16(m，1H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝263.1154[M+H]+。
实施例17：(1S，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-5-羟基-1-(羟甲基)-2-亚甲 基环戊烷-1-甲腈。
Figure BDA0003208444450001561
步骤A：((1R，3R，5S)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-((叔丁基二 甲基甲硅烷基)氧基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯。在30℃和N2下，向((1R，3R，5S)-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-1-(羟甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(中间体7，步骤I的产物，8.8g，19.27mmol)在DCM(90mL)中的溶液中一次性添加AgNO3(6.55g，38.54mmol，6.48mL)和可力丁(4.67g，38.54mmol，5.09mL)。在30℃下，将1-[氯-(4-甲氧基苯基)-苯基-甲基]-4-甲氧基-苯(9.79g，28.90mmol)添加到混合物中。将反应混合物在30℃下搅拌1小时。通过过滤除去无机材料，并将滤饼用DCM(100mL*2)洗涤。将滤液用水(50mL*2)和盐水(50mL)洗涤。将有机相经无水Na2SO4干燥，过滤并真空浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001562
80g
Figure BDA0003208444450001563
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为0％-7％的乙酸乙酯/石油醚)纯化残余物，得到((1R，3R，5S)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(10.2g，12.63mmol，65.55％产率，94％纯度)，为黄色油状物。1H-NMR(400MHz，CDCl3)δ＝7.40-7.15(m，9H)，6.85-6.75(d，J＝8.8Hz，4H)，5.30-5.22(d，J＝2Hz，1H)，5.15-5.05(dd，J＝6.4，8Hz，1H)，5.00-4.95(d，J＝2.8Hz，1H)，4.50-4.40(m，1H)，4.30-4.20(q，J＝10.8Hz，2H)，3.80(s，6H)，3.04(s，2H)，2.50-2.40(m，1H)，1.75-1.62(m，1H)，1.20-1.00(m，18H)，0.95-0.85(m，9H)，0.10-0.04(d，J＝10Hz，6H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝781.40[M+Na]+。
步骤B：((1R，3R，5S)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-羟基-2-亚 甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯。在30℃下，向((1R，3R，5S)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(17.9g，23.58mmol)在THF(230mL)中的混合物中添加TBAF(1M，35.37mL)。将反应混合物在30℃下搅拌1小时。减压除去溶剂。通过硅胶柱色谱法(石油醚/乙酸乙酯＝5/1至4/1)纯化残余物，得到((1R，3R，5S)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-羟基-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(14g，21.28mmol，90.23％产率，98％纯度)，为黄色油状物。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝7.40-7.15(m，9H)，6.85-6.75(d，J＝8.8Hz，4H)，5.50-5.45(d，J＝1.6Hz，1H)，5.20-5.08(m，2H)，4.55-4.40(m，2H)，4.20-4.13(d，J＝11.2Hz，1H)，3.80(s，6H)，3.10-3.03(dd，J＝8.8，14Hz，2H)，2.46-2.41(m，1H)，1.78-1.68(m，1H)，1.20-1.00(m，18H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝667.20[M+Na]+。
步骤C：N，N-Di-BOC-((1R，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-1-((双(4-甲氧基 苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯。在30℃下，向((1R，3R，5S)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-羟基-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(9g，13.96mmol)在THF(180mL)中的溶液中添加PPh3(9.52g，36.29mmol)和N，N-Di-BOC-9H-嘌呤-6-胺(14.00g，41.75mmol)，然后在0℃下滴加DIAD(7.34g，36.29mmol，7.06mL)。将混合物在30℃下搅拌12小时。减压除去溶剂。通过硅胶柱色谱法(石油醚/乙酸乙酯＝4/1)纯化残余物，得到N，N-Di-BOC-((1R，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(15g，10.76mmol，77.07％产率，69％纯度)，为黄色油状物。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝8.77(s，1H)，7.79(s，1H)，7.45-7.20(m，16H)，6.85-6.78(d，J＝8.8Hz，6H)，6.376(s，4H)，5.80-5.70(m，1H)，5.55-5.45(m，1H)，5.22(s，1H)，4.40-4.33(m，2H)，4.28-4.21(d，J＝10.8Hz，1H)，3.79(s，9H)，3.45(s，2H)，2.54-2.36(m，2H)，2.32-2.23(m，2H)，1.50-1.40(m，27H)，1.30-1.17(m，57H)，1.10(s，11H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝962.50[M+H]+。
步骤D：(9-((1S，3S，4S)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-4-羟基-3- (羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯。向N，N-Di-BOC-((1R，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-1-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-2-亚甲基-5-(新戊酰氧基)环戊基)甲基新戊酸酯(10g，10.39mmol)在MeOH(150mL)中的溶液中添加NaOH溶液(4M，33.33mL)，并在25℃下搅拌12小时。添加H2O(100mL)，并将混合物用EA(200mL*4)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001581
80g
Figure BDA0003208444450001582
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为0％-3％的MeOH/DCM，速度为60mL/min)纯化残余物，得到(9-((1S，3S，4S)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯(3.7g，5.33mmol，51.28％产率)，为白色泡沫。LCMS：ESI-MS：m/z＝694.3[M+H]+。
步骤E：(9-((1S，3R，4S)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(((叔丁 基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-4-羟基-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁 酯。在0℃下，向(9-((1S，3S，4S)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯(3.5g，5.04mmol)在DMF(7mL)中的溶液中添加咪唑(1.03g，15.13mmol)和叔丁基-氯-二甲基-硅烷(1.14g，7.57mmol，927.26μL)。将混合物在25℃下搅拌2小时。将混合物用EA(50mL)稀释，并用H2O(50mL*2)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001583
20g
Figure BDA0003208444450001584
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为0％-2％的MeOH/DCM，速度为35mL/min)纯化残余物，得到(9-((1S，3R，4S)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-4-羟基-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯(3.7g，4.21mmol，83.50％产率，92％纯度)，为白色泡沫。LCMS：ESI-MS：m/z＝808.5[M+H]+。
步骤F：(9-((1S，3R，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基 苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-2-亚甲基环戊基)- 9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯。向(9-((1S，3R，4S)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-4-羟基-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯(4.7g，5.82mmol)在DCE(13mL)中的溶液中添加AgNO3(1.98g，11.63mmol，1.96mL)、可力丁(1.41g，11.63mmol，1.54mL)和1-[氯-(4-甲氧基苯基)-苯基-甲基]-4-甲氧基-苯(2.96g，8.72mmol)。将混合物在50℃下搅拌2小时。将混合物用MeOH(10mL)淬灭，并低压除去溶剂。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001585
40g
Figure BDA0003208444450001586
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为8％-30％的乙酸乙酯/石油醚，速度为40mL/min)纯化残余物，得到(9-((1S，3R，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯(5.8g，5.12mmol，88.01％产率，98％纯度)，为白色泡沫。1H NMR(400MHz，CDCl3)δ＝8.67(s，1H)，8.08(s，1H)，7.64(s，1H)，7.48-7.42(m，2H)，7.32(dd，J＝8.8，13.2Hz，4H)，7.25-7.17(m，7H)，7.17-7.07(m，5H)，6.79-6.65(m，8H)，5.57(t，J＝6.9Hz，1H)，5.04(s，1H)，4.76(d，J＝1.8Hz，1H)，4.27-4.17(m，2H)，4.01(d，J＝9.5Hz，1H)，3.77(d，J＝2.0Hz，6H)，3.74-3.69(m，6H)，3.54(d，J＝9.5Hz，1H)，3.05-2.99(m，1H)，2.12-2.06(m，1H)，1.56(s，9H)，1.50-1.40(m，1H)，0.99-0.86(m，9H)，0.10(d，J＝5.3Hz，6H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝1110.6[M+H]+。
步骤G：(9-((1S，3S，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基 苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁 酯。将(9-((1S，3R，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯(4.4g，3.96mmol，1当量)用TBAF(1.5M，40mL，15.14当量)处理，并在50℃下搅拌3小时。将混合物用EA(40mL)稀释，并用H2O(30mL*2)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001591
40g
Figure BDA0003208444450001592
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为20％-55％的乙酸乙酯/石油醚，速度为40mL/min)纯化残余物，得到(9-((1S，3S，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯(2.8g，2.70mmol，68.10％产率，96％纯度)，为白色泡沫。1H NMR(400MHz，CD3OD)δ＝8.45(s，1H)，7.86(s，1H)，7.43(dd，J＝1.4，8.0Hz，2H)，7.32-7.17(m，12H)，7.15-7.08(m，4H)，6.79-6.66(m，8H)，5.41(d，J＝4.4Hz，1H)，5.06(d，J＝1.5Hz，1H)，4.97(d，J＝1.5Hz，1H)，4.28(dd，J＝6.0，9.0Hz，1H)，4.15-4.12(m，1H)，4.08-4.05(m，1H)，3.76(d，J＝2.4Hz，6H)，3.72(d，J＝3.3Hz，6H)，3.48(d，J＝9.5Hz，1H)，3.35-3.32(m，1H)，2.21(td，J＝8.7，13.9Hz，1H)，1.76-1.64(m，1H)，1.59(s，9H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝996.4[M+H]+。
步骤H：(9-((1S，3S，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基 苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-甲酰基-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯。向(9-((1S，3S，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯(0.4g，401.55μmol)在DCM(4mL)中的溶液中添加DMP(340.62mg，803.09μmol，248.63μL)。将混合物在25℃下搅拌1小时。将混合物用饱和NaHCO3溶液(5mL)和饱和Na2S2O3溶液(5mL)淬灭。将反应混合物用DCM(20mL*2)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到粗制品(9-((1S，3S，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-甲酰基-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯(0.39g，粗制品)，为黄色泡沫。LCMS：ESI-MS：m/z＝994.5[M+H]+。
步骤I：(9-((1S，3S，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基 苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-((E)-(羟基亚氨基)甲基)-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6- 基)氨基甲酸叔丁酯。向(9-((1S，3S，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-甲酰基-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯(0.39g，392.30μmol)在吡啶(4mL)中的溶液中添加NH2OH·HCl(54.52mg，784.60μmol)。将混合物在25℃下搅拌0.5小时。将反应混合物减压浓缩。将残余物用H2O(5mL)稀释，并用EA(5mL*2)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到(9-((1S，3S，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-((E)-(羟基亚氨基)甲基)-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯(0.39g，粗制品)，为黄色泡沫。LCMS：ESI-MS：m/z＝1009.4[M+H]+。
步骤J：(9-((1S，3S，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基 苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-氰基-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯。向(9-((1S，3S，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-((E)-(羟基亚氨基)甲基)-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯(0.45g，445.92μmol)在CH3CN(4mL)中的搅拌溶液中添加CDI(144.61mg，891.84μmol)。将混合物在25℃下搅拌12小时。将混合物用EA(5mL)稀释，并用H2O(5mL*2)洗涤。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过柱色谱法(SiO2，石油醚/乙酸乙酯＝5/1至2/1)纯化残余物，并通过Prep-HPLC(柱：Waters Xbridge 150*25 5u；流动相：[水(10mMNH4HCO3)-ACN]；B％：70％-100％，6分钟)进一步纯化，得到(9-((1S，3S，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-氰基-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯(0.34g，336.18μmol，75.39％产率，98％纯度)，为白色固体。1H NMR(400MHz，CD3OD)δ＝8.14(s，1H)，8.06(s，1H)，7.55(d，J＝7.3Hz，2H)，7.46-7.40(m，4H)，7.37(d，J＝9.0Hz，2H)，7.31-7.15(m，10H)，6.84-6.75(m，8H)，5.62(s，1H)，5.49(br t，J＝8.4Hz，1H)，4.97(s，1H)，4.59(br，s，1H)，4.41(t，J＝4.0Hz，1H)，3.76(s，6H)，3.72(d，J＝2.0Hz，6H)，3.67(d，J＝9.9Hz，1H)，3.39(d，J＝9.9Hz，1H)，1.70(ddd，J＝4.7，8.7，13.9Hz，1H)，1.56(s，9H)，1.23-1.15(m，1H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝991.5[M+H]+。
步骤K：(1S，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-5-羟基-1-(羟甲基)-2-亚甲基环 戊烷-1-甲腈。向(9-((1S，3S，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-氰基-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯(0.34g，343.04μmol)在DCM(3mL)中的溶液中添加TFA(4.62g，8.10mmol，3mL，20％纯度)。将混合物在25℃下搅拌2小时。将混合物用NH3(7M，在MeOH中，2mL)淬灭，并减压除去溶剂。通过柱色谱法(SiO2，DCM/MeOH＝30/1至15/1)纯化残余物，并通过Prep-HPLC(柱：WatersXbridge 150*25 5u；流动相：[水(10mM NH4HCO3)-ACN]；B％：0％-30％，6分钟)进一步纯化，得到(1S，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-5-羟基-1-(羟甲基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲腈(0.062g，216.56μmol，63.13％产率，100％纯度)，为白色固体。1H NMR(400MHz，CD3OD)δ＝8.20(s，1H)，8.16(s，1H)，5.85-5.72(m，1H)，5.58(d，J＝1.8Hz，1H)，5.06(s，1H)，4.57(br，J＝3.1Hz，1H)，4.11(d，J＝11.5Hz，1H)，3.87(d，J＝11.5Hz，1H)，2.80(ddd，J＝4.5，10.8，13.3Hz，1H)，2.39(ddd，J＝1.7，8.2，13.5Hz，1H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝287.1294[M+H]+。
实施例18：(1S，3S，5S)-3-(2-氨基-6-氧代-1，6-二氢-9H-嘌呤-9-基)-5-羟基-1- (羟甲基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲腈。
Figure BDA0003208444450001611
步骤A：N，N-Di-BOC-(6aS，8S，9aS)-8-(2-氨基-6-氯-9H一嘌呤-9-基)-2，2，4，4- 四异丙基-7-亚甲基四氢环戊并[f][1，3，5，2，4]三氧杂二硅辛-6a(6H)-甲腈。向(6aS，8R，9aS)-8-羟基-2，2，4，4-四异丙基-7-亚甲基四氢环戊并[f][1，3，5，2，4]三氧杂二硅辛-6a(6H)-甲腈(中间体9，0.054g，0.131mmol)、N，N-Di-BOC-6-氯-9H-嘌呤-2-胺(中间体10，0.145g，0.393mmol)和三苯基膦(0.103g，0.393mmol)在THF(1.3mL，0.1M)中的溶液中添加偶氮二甲酸二异丙酯(0.080mL，0.393mmol)。将反应混合物回流加热1小时10分钟，然后冷却并真空浓缩，得到橙色油状物。合并两批并纯化(FCC，SiO2，0％-30％EtOAc/己烷)，得到N，N-Di-BOC-(6aS，8S，9aS)-8-(2-氨基-6-氯-9H-嘌呤-9-基)-2，2，4，4-四异丙基-7-亚甲基四氢环戊并[f][1，3，5，2，4]三氧杂二硅辛-6a(6H)-甲腈，为泡沫状白色固体(0.108g)。
步骤B：(1S，3S，5S)-3-(2-氨基-6-氧代-1，6-二氢-9H-嘌呤-9-基)-5-羟基-1-(羟 甲基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲腈。向装有冷却至0℃的N，N-Di-BOC-(6aS，8S，9aS)-8-(2-氨基-6-氯-9H-嘌呤-9-基)-2，2，4，4-四异丙基-7-亚甲基四氢环戊并[f][1，3，5，2，4]三氧杂二硅辛-6a(6H)-甲腈(0.108g，0.141mmol)的圆底烧瓶中滴加TFA/H2O(1.25mL：1.25mL，0.0566M)。将无色溶液在室温下搅拌48小时，然后与EtOH共蒸发(3次)，真空浓缩并吸收在THF中。在0℃下，向该溶液中添加TBAF(1当量)，然后在室温下搅拌。2小时后添加另一当量的TBAF，然后在1小时后真空浓缩，得到粘稠的黄色油状物。在反相HPLC PhenomenexSynergyi 4微米Hydro-RP 80A 250×21.2mm(0％-50％乙腈与三乙基乙酸铵(TEAA)缓冲液的H2O溶液与TEAA缓冲液)上纯化粗制油状物，得到(1S，3S，5S)-3-(2-氨基-6-氧代-1，6-二氢-9H-嘌呤-9-基)-5-羟基-1-(羟甲基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲腈，为白色固体(2个步骤内，0.0277g，59％)。1H NMR(400MHz，CDCl3)：δ7.77(s，1H)，5.64(m，1H)，5.56(d，J＝2.8，1H)，5.53(m，1H)，5.08(d，J＝2.8，1H)，4.01(d，J＝12，1H)，3.82(d，J＝12，1H)，2.66(m，1H)，2.34(m，1H)。MS，m/Z 302.95[M+1]+。
实施例19：(1S，2R，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-乙炔基-2-(羟甲基)-3-亚 甲基环戊-1-醇。
Figure BDA0003208444450001631
步骤A：(9-((1S，3S，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基 苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-甲酰基-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯。向(9-((1S，3S，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯(实施例17，步骤G的产物，0.4g，401.55μmol)在DCM(4mL)中的溶液中添加DMP(340.62mg，803.09μmol，248.63μL)。将混合物在25℃下搅拌1小时。将反应混合物过滤，并通过添加饱和NaHCO3溶液和饱和Na2SO3溶液(1∶1，5mL)淬灭。将所得溶液用盐水(2mL*5)洗涤。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。纯化(FCC，SiO2，石油醚/乙酸乙酯＝10/1至1/1)得到(9-((1S，3S，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-甲酰基-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯(388mg，390.29μmol，97.20％产率)，为白色泡沫。LCMS：ESI-MS：m/z＝994.5[M+H]+。
步骤B：(9-((1S，3R，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基 苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-乙炔基-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯。在25℃和N2下，向K2CO3(187.68mg，1.36mmol)在MeCN中的溶液中添加1-二甲氧基磷酰基丙-2-酮(75.19mg，452.65μmol，62.14μL)和TosN3(89.27mg，452.65μmol)将混合物在25℃下搅拌2小时。添加(9-((1S，3S，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-甲酰基-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯(0.225g，226.33μmol)的MeOH(0.3mL)和MeCN(0.3mL)溶液。将混合物在25℃下搅拌48小时。将混合物用H2O(3mL)淬灭，并用EA(5mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。纯化(FCC，SiO2，石油醚/乙酸乙酯＝20/1至2/1)得到(9-((1S，3R，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-乙炔基-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯(100mg，96.96μmol，42.84％产率，96％纯度)，为白色泡沫。LCMS：ESI-MS：m/z＝990.5[M+H]+。
步骤C：(1S，2R，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-乙炔基-2-(羟甲基)-3-亚甲基 环戊-1-醇。在25℃下，向(9-((1S，3R，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-乙炔基-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯(100mg，101.00μmol)在DCM(0.6mL)中的溶液中添加TFA(770.00mg，6.75mmol，0.5mL)和DCM(0.1mL)(VTFA∶VDCM＝5∶1)。将混合物在25℃下搅拌2小时。用NH3的MeOH(7M)溶液将混合物中和至pH＝7。将所得溶液减压浓缩。通过快速硅胶色谱法(SiO2，DCM/MeOH＝30/1至10/1)纯化残余物，并通过Prep-HPLC(柱：Xbridge BEH C18，250*50mm，10μm；流动相：[水(10mM NH4HCO3)-ACN]；B％：0％-30％，9分钟)进一步纯化，得到(1S，2R，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-乙炔基-2-(羟甲基)-3-亚甲基环戊-1-醇(33.1mg，100％纯度)，为白色固体。1H NMR(400MHz，CD3OD)δ＝8.24(s，1H)，8.18(s，1H)，5.80-5.73(m，1H)，5.51(d，J＝2.5Hz，1H)，4.99(d，J＝2.5Hz，1H)，4.45-4.42(m，1H)，3.98(d，J＝11.3Hz，1H)，3.82(d，J＝11.0Hz，1H)，2.72-2.62(m，2H)，2.41(ddd，J＝3.0，8.4，13.2Hz，1H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝285.9[M+H]+。
实施例20：(1S，2R，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-(羟甲基)-3-亚甲基-2-乙 烯基环戊-1-醇。
Figure BDA0003208444450001641
步骤A：(9-((1S，3R，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基 苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-2-亚甲基-3-乙烯基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯。在25℃下，向溴化甲基(三苯基)鏻(280.28mg，784.60μmol)在甲苯(0.5mL)中的溶液中添加2-甲基-2-丁醇钾(396.19mg，784.60μmol，455.39μL，25％纯度)，并在25℃下搅拌1小时。然后，将(9-((1S，3S，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-甲酰基-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯(0.26g，261.53μmol)在甲苯(0.5mL)中的溶液添加到混合物中，并将混合物在25℃下搅拌4小时。将混合物用饱和NH4Cl溶液(5mL)淬灭，并用EA(5mL*2)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。通过快速硅胶色谱法(
Figure BDA0003208444450001651
；4g
Figure BDA0003208444450001652
二氧化硅快速柱，洗脱剂为梯度为20％-40％的乙酸乙酯/石油醚，速度为20mL/min)纯化残余物，得到(9-((1S，3R，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-2-亚甲基-3-乙烯基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯(0.18g，177.79μmol，67.98％产率，98％纯度)，为白色泡沫。1H NMR(400MHz，CD3OD)δ＝8.44(s，1H)，7.86(s，1H)，7.45(d，J＝7.3Hz，2H)，7.31-7.08(m，16H)，6.79-6.64(m，8H)，6.58(dd，J＝10.6，17.6Hz，1H)，5.42(d，J＝10.8Hz，1H)，5.31(br d，J＝6.0Hz，1H)，5.23(d，J＝17.2Hz，1H)，5.07(s，1H)，4.81(s，1H)，4.28(dd，J＝5.2，9.6Hz，1H)，3.75(dd，J＝6.0，7.9Hz，12H)，3.60(d，J＝9.7Hz，1H)，3.22(d，J＝9.7Hz，1H)，1.96-1.83(m，1H)，1.69(br，d，J＝13.2Hz，1H)，1.59(s，9H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝992.4[M+H]+。
步骤B：(1S，2R，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-(羟甲基)-3-亚甲基-2-乙烯基 环戊-1-醇。向(9-((1S，3R，4S)-4-(双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)-3-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-2-亚甲基-3-乙烯基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)氨基甲酸叔丁酯(0.4g，403.16μmol)在DCM(2mL)中的溶液中添加TFA(7.00g，12.28mmol，4.55mL，20％纯度)。将混合物在25℃下搅拌8小时。将混合物用NH3(7M，在MeOH中，4mL)淬灭，并减压除去溶剂。通过柱色谱法(SiO2，DCM/MeOH＝30/1至15/1)纯化残余物，得到(1S，2R，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-(羟甲基)-3-亚甲基-2-乙烯基环戊-1-醇(0.09g，310.11μmol，76.92％产率，99％纯度)，为白色固体。1H NMR(400MHz，CD3OD)δ＝8.33(s，1H)，8.26(s，1H)，6.06(dd，J＝10.9，17.5Hz，1H)，5.72-5.60(m，1H)，5.35-5.22(m，3H)，5.06(d，J＝2.2Hz，1H)，4.57(t，J＝6.2Hz，1H)，3.80(d，J＝2.0Hz，2H)，2.49-2.39(m，1H)，2.27(ddd，J＝6.5，8.4，13.3Hz，1H)。LCMS：ESI-MS：m/z＝287.9[M+H]+。
实施例21：5′-三磷酸核苷的合成。
将无水核苷(0.05mmol)溶解在无水PO(OMe)3(1mL)中。添加N-甲基咪唑(0.009mL，0.11mmol)，随后添加POCl3(0.009mL，0.11mmol)。将反应混合物在室温下搅拌20-40分钟。通过LCMS(通过出现相应的5′-单磷酸核苷)监测反应。在反应完成后，添加焦磷酸的四丁基铵盐(150mg)，随后添加DMF(0.5mL)，得到均质的溶液。将反应混合物在室温下搅拌1.5小时，然后用水(10mL)稀释。纯化(具有Q Sepharose高效的柱HiLoad 16/10：以50mM TRIS缓冲液(pH7.5)中的ON(缓冲液A)至1N(缓冲液B)NaCl的线性梯度进行分离。以75％-80％的缓冲液B洗脱三磷酸酯。浓缩相应的级分。通过RP HPLC在Synergy 4微米Hydro-RP柱(Phenominex)上实现脱盐。使用溶于10mM三乙基乙酸铵缓冲液(pH 7.5)的0％至30％乙腈的线性梯度进行洗脱。合并相应的级分，浓缩并冻干3次除去过量的缓冲液，以提供所需的5′-三磷酸核苷。
实施例22：((1R，3S，5S)-3-(4-氨基-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-7-基)-5-羟基-2-亚 甲基环戊基)甲基四氢三磷酸盐。
Figure BDA0003208444450001661
以类似于实施例21的方式，使用(1S，2R，4S)-4-(4-氨基-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-7-基)-2-(羟甲基)-3-亚甲基环戊-1-醇作为核苷起始材料来制备标题化合物。
实施例23.((1R，3S，5S)-3-(2-氨基-4-氧代-3，4-二氢-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶- 7-基)-5-羟基-2-亚甲基环戊基)甲基四氢三磷酸盐。
Figure BDA0003208444450001662
以类似于实施例12的方式，使用2-氨基-7-((1S，3R，4S)-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-3，7-二氢-4H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-酮(实施例2)作为核苷起始材料来制备标题化合物。
实施例24.((1S，3S，5S)-1-氟-5-羟基-3-(5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1 (2H)-基)-2-亚甲基环戊基)甲基四氢三磷酸盐。
Figure BDA0003208444450001671
以类似于实施例21的方式，使用1-((1S，3S，4S)-3-氟-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(实施例3)作为核苷起始材料来制备标题化合物。
实施例25.((1S，3S，5S)-3-(2-氨基-6-氧代-1，6-二氢-9H-嘌呤-9-基)-1-氟-5- 羟基-2-亚甲基环戊基)甲基四氢三磷酸盐。
Figure BDA0003208444450001672
以类似于实施例21的方式，使用2-氨基-9-((1S，3S，4S)-3-氟-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-1，9-二氢-6H-嘌呤-6-酮(实施例4)作为核苷起始材料来制备标题化合物。
实施例26.((1S，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-1-氟-5-羟基-2-亚甲基环戊 基)甲基四氢三磷酸盐。
Figure BDA0003208444450001673
以类似于实施例21的方式，使用(1S，2S，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-氟-2-(羟甲基)-3-亚甲基环戊-1-醇(实施例6)作为核苷起始材料来制备标题化合物。
实施例27：((1S，3S，5S)-3-(4-氨基-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-7-基)-1-氟-5-羟 基-2-亚甲基环戊基)甲基四氢三磷酸盐。
Figure BDA0003208444450001681
以类似于实施例21的方式，使用(1S，2S，4S)-4-(4-氨基-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-7-基)-2-氟-2-(羟甲基)-3-亚甲基环戊-1-醇(实施例1)作为核苷起始材料来制备标题化合物。
实施例28.((1S，3S，5S)-3-(2-氨基-6-氧代-1，6-二氢-9H-嘌呤-9-基)-1-(氟甲 基)-5-羟基-2-亚甲基环戊基)甲基四氢三磷酸盐。
Figure BDA0003208444450001682
以类似于实施例21的方式，使用2-氨基-9-((1S，3S，4S)-3-(氟甲基)-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-1，9-二氢-6H-嘌呤-6-酮(实施例10)作为核苷起始材料来制备标题化合物。
实施例29.((1S，3S，5S)-3-(4-氨基-2-氧代嘧啶-1(2H)-基)-1-(氟甲基)-5-羟 基-2-亚甲基环戊基)甲基四氢三磷酸盐。
Figure BDA0003208444450001683
以类似于实施例21的方式，使用4-氨基-1-((1S，3S，4S)-3-(氟甲基)-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)嘧啶-2(1H)-酮(实施例11)作为核苷起始材料来制备标题化合物。
实施例30.((1S，3S，5S)-1-(氟甲基)-5-羟基-3-(5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢 嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基环戊基)甲基四氢三磷酸盐。
Figure BDA0003208444450001691
以类似于实施例21的方式，使用1-((1S，3S，4S)-3-(氟甲基)-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-5-甲基嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮(实施例12)作为核苷起始材料来制备标题化合物。
实施例31.((1S，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-1-(氯甲基)-5-羟基-2-亚甲 基环戊基)甲基四氢三磷酸盐。
Figure BDA0003208444450001692
以类似于实施例21的方式，使用(1S，2S，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-(氯甲基)-2-(羟甲基)-3-亚甲基环戊-1-醇(实施例14)作为核苷起始材料来制备标题化合物。
实施例32.((1S，3S，5S)-1-氰基-5-羟基-3-(5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶- 1(2H)-基)-2-亚甲基环戊基)甲基四氢三磷酸盐。
Figure BDA0003208444450001693
以类似于实施例21的方式，使用(1S，3S，5S)-5-羟基-1-(羟甲基)-3-(5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲腈(实施例15)作为核苷起始材料来制备标题化合物。
实施例33.((1S，3S，5S)-3-(4-氨基-2-氧代嘧啶-1(2H)-基)-1-氰基-5-羟基-2- 亚甲基环戊基)甲基四氢三磷酸盐。
Figure BDA0003208444450001701
以类似于实施例21的方式，使用(1S，3S，5S)-3-(4-氨基-2-氧代嘧啶-1(2H)-基)-5-羟基-1-(羟甲基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲腈(实施例16)作为核苷起始材料来制备标题化合物。
实施例34.((1S，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-1-氰基-5-羟基-2-亚甲基环 戊基)甲基四氢三磷酸盐。
Figure BDA0003208444450001702
以类似于实施例21的方式，使用(1S，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-5-羟基-1-(羟甲基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲腈(实施例17)作为核苷起始材料来制备标题化合物。
实施例35.((1S，3S，5S)-3-(2-氨基-6-氧代-1，6-二氢-9H-嘌呤-9-基)-1-氰基- 5-羟基-2-亚甲基环戊基)甲基四氢三磷酸盐。
Figure BDA0003208444450001703
以类似于实施例21的方式，使用(1S，3S，5S)-3-(2-氨基-6-氧代-1，6-二氢-9H-嘌呤-9-基)-5-羟基-1-(羟甲基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲腈(实施例18)作为核苷起始材料来制备标题化合物。
实施例36.((1R，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-1-乙炔基-5-羟基-2-亚甲基 环戊基)甲基四氢三磷酸盐。
Figure BDA0003208444450001711
以类似于实施例21的方式，使用(1S，2R，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-乙炔基-2-(羟甲基)-3-亚甲基环戊-1-醇(实施例19)作为核苷起始材料来制备标题化合物。
实施例37.((1R，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-5-羟基-2-亚甲基-1-乙烯基 环戊基)甲基四氢三磷酸盐。
Figure BDA0003208444450001712
以类似于实施例21的方式，使用(1S，2R，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-(羟甲基)-3-亚甲基-2-乙烯基环戊-1-醇(实施例20)作为核苷起始材料来制备标题化合物。
表1
Figure BDA0003208444450001713
Figure BDA0003208444450001721
实施例38.((((1R，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-1-乙炔基-5-羟基-2-亚甲 基环戊基)甲氧基)(苯氧基)磷酰基)-L-丙氨酸异丙酯。
Figure BDA0003208444450001722
步骤A.(E)-N′-(9-((1S，3R，4S)-3-乙炔基-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊 基)-9H-嘌呤-6-基)-N，N-二甲基甲脒。向(1S，2R，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-乙炔基-2-(羟甲基)-3-亚甲基环戊-1-醇(实施例19，11.6mg，0.0419mmol)在MeOH(1.0mL)中的室温溶液中添加N，N-二甲基甲酰胺二甲基缩醛(0.1mL，89.4mg，0.75mmol)。将反应混合物用Ar吹扫，并在室温下搅拌16小时。蒸发溶剂，得到标题化合物，将其在高真空下进一步干燥过夜。将粗制品(E)-N′-(9-((1S，3R，4S)-3-乙炔基-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)-N，N-二甲基甲脒用于下一步骤中，无需进一步纯化。
步骤B.((((1R，3S，5S)-3-(6-(((E)-(二甲基氨基)亚甲基)氨基)-9H-嘌呤-9- 基)-1-乙炔基-5-羟基-2-亚甲基环戊基)甲氧基)(苯氧基)磷酰基)-L-丙氨酸异丙酯。将(E)-N′-(9-((1S，3R，4S)-3-乙炔基-4-羟基-3-(羟甲基)-2-亚甲基环戊基)-9H-嘌呤-6-基)-N，N-二甲基甲脒溶解在无水THF(1.0mL)中，并在室温下添加N-甲基咪唑(NMI)(30mg，29μL，0.36mmol)。然后将(2S)-2-((氯(苯氧基)磷酰基)氨基)丙酸异丙酯(45mg，0.22mmol)添加到反应混合物中，并将反应混合物在室温下搅拌16小时。将反应混合物在35℃下减压浓缩，然后在高真空下干燥。将标题化合物作为磷中心处异构体的混合物(Rp和Sp)分离：将粗制品((((1R，3S，5S)-3-(6-(((E)-(二甲基氨基)亚甲基)氨基)-9H-嘌呤-9-基)-1-乙炔基-5-羟基-2-亚甲基环戊基)甲氧基)(苯氧基)磷酰基)-L-丙氨酸异丙酯用于下一步骤中，无需进一步纯化。
步骤C.((((1R，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-1-乙炔基-5-羟基-2-亚甲基 环戊基)甲氧基)(苯氧基)磷酰基)-L-丙氨酸异丙酯。将((((1R，3S，5S)-3-(6-(((E)-(二甲基氨基)亚甲基)氨基)-9H-嘌呤-9-基)-1-乙炔基-5-羟基-2-亚甲基环戊基)甲氧基)(苯氧基)磷酰基)-L-丙氨酸异丙酯和0.377M TFA溶液在MeOH-H2O(2.0mL)中的溶液在室温下搅拌16小时。将反应混合物减压浓缩。纯化(FCC，SiO2，MeOH/DCM，0％至20％)和制备型HPLC(CH3CN-H2O，5％至95％，包括0.1％甲酸)得到标题化合物，为磷中心处异构体的混合物(Rp和Sp)，为白色蓬松固体(4.4mg)。31P NMR(400MHz，CDCl3)：δ3.36，3.13。MS，m/Z 555.6(M+1)+。
实施例39.((((1S，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-1-氟-5-羟基-2-亚甲基环 戊基)甲氧基)(苯氧基)磷酰基)-L-丙氨酸新戊酯。
Figure BDA0003208444450001731
步骤A：N，N-Di-BOC-(1S，2S，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-氟-2-(羟甲基)- 3-亚甲基环戊-1-醇。以类似于(1S，2S，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-氟-2-(羟甲基)-3-亚甲基环戊-1-醇(实施例6)的方式制备标题化合物。
步骤B：N，N-Di-BOC-((((1S，3S，5S)-3-(6-氧基-9H-嘌呤-9-基)-1-氟-5-羟基-2- 亚甲基环戊基)甲氧基)(苯氧基)磷酰基)-L-丙氨酸酯。向N，N-Di-BOC-(1S，2S，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-氟-2-(羟甲基)-3-亚甲基环戊-1-醇(1.0当量)在无水THF中的溶液中添加isoPrMgCl(异丙基氯化镁)(1.0M的THF溶液，1.5当量)，然后添加溶解在无水THF(3mL)中的适当氯磷酸酯(2.0当量)。将反应混合物搅拌5小时，用水淬灭，并用乙酸乙酯萃取。将有机层干燥(Na2SO4)，过滤并减压浓缩。纯化(FCC，SiO2，2％至15％的MeOH/DCM)得到标题化合物，为磷中心处异构体的混合物(Rp和Sp)：N，N-Di-BOC-((((1S，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-1-氟-5-羟基-2-亚甲基环戊基)甲氧基)(苯氧基)磷酰基)-L-丙氨酸酯(13％)。MS(M-1)651.3。
步骤C.((((1S，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-1-氟-5-羟基-2-亚甲基环戊 基)甲氧基)(苯氧基)磷酰基)-L-丙氨酸新戊酯。在室温下，将N，N-Di-BOC-((((1S，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-1-氟-5-羟基-2-亚甲基环戊基)甲氧基)(苯氧基)磷酰基)-L-丙氨酸酯用乙腈和HCl/二氧杂环己烷9∶1(v/v)的混合物处理9小时。将反应混合物减压浓缩。纯化(反相HPLC，Phenomenex Synergi 4微米Hydro-RP 80A 250×21.2cm，梯度为25％至95％的乙腈水溶液，10mM TEAA)得到标题化合物，为磷中心处异构体的混合物(Rp和Sp)。P31-NMR(CD3OD)δδppm δ3.44，3.77。MS[M-1]578.2。
实施例40.((((1S，3S，5S)-3-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-1-(氟甲基)-5-羟基-2-亚 甲基环戊基)甲氧基)(苯氧基)磷酰基)-L-丙氨酸异丙酯。
Figure BDA0003208444450001741
将(1S，2S，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-(氯甲基)-2-(羟甲基)-3-亚甲基环戊-1-醇(实施例13，11mg，0.037mmol)溶解在无水乙腈(0.9mL)和N-甲基咪唑(0.1mL)的混合物中。添加(2S)-2-((氯(苯氧基)磷酰基)氨基)丙酸异丙酯(根据J.Med.Chem.2014，57，1531-1542制备)(30mg，0.1mmol)。将反应混合物加热至60℃保持4小时，然后继续在40℃下再加热48小时。将反应混合物用乙酸乙酯(30mL)稀释。将有机相用10％柠檬酸、盐水洗涤，干燥(Na2SO4)，过滤并减压浓缩。纯化(FCC，SiO2，2％至10％的MeOH的DCM溶液)，然后再纯化(在Synergy 4微米Hydro-RP柱(Phenominex)上进行反相HPLC/使用线性梯度为30％至100％的乙腈的10mM三乙基乙酸铵缓冲液(pH7.5)溶液进行洗脱)，得到标题化合物，为磷中心处异构体的混合物(Rp和Sp)，总产率为10％。P31-NMR(CD3OD)δδppm δ3.06，3.31。MS[M-1]564.6。
实施例41.((((1S，3S，5S)-1-氰基-5-羟基-3-(5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧 啶-1(2H)-基)-2-亚甲基环戊基)甲氧基)(苯氧基)磷酰基)-L-丙氨酸异丙酯。
Figure BDA0003208444450001751
以类似于实施例38步骤B的方式，在步骤B中使用(1S，3S，5S)-5-羟基-1-(羟甲基)-3-(5-甲基-2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲腈(实施例15)来制备作为磷中心处异构体的混合物(Rp和Sp)的标题化合物。31P NMR(400MHz，CDCl3)：δ3.20，3.01。MS，m/Z 547.1[M+1]+。
实施例42.((((1S，3S，5S)-3-(4-氨基-2-氧代嘧啶-1(2H)-基)-1-氰基-5-羟基- 2-亚甲基环戊基)甲氧基)(苯氧基)磷酰基)-L-丙氨酸异丙酯。
Figure BDA0003208444450001752
以类似于实施例38的方式，在步骤A中使用(1S，3S，5S)-3-(4-氨基-2-氧代嘧啶-1(2H)-基)-5-羟基-1-(羟甲基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲腈(实施例16)代替(1S，2R，4S)-4-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-2-乙炔基-2-(羟甲基)-3-亚甲基环戊-1-醇(实施例19)来制备作为磷中心处异构体的混合物(Rp和Sp)的标题化合物。31P NMR(400MHz，CDCl3)：δ3.12，2.95。MS，m/Z 532.0(M+1)+。
实施例43.((R*)-(((1S，3S，5S)-3-(2-氨基-6-氧代-1，6-二氢-9H-嘌呤-9-基)- 1-氰基-5-羟基-2-亚甲基环戊基)甲氧基)(苯氧基)磷酰基)-L-丙氨酸异丙酯。
Figure BDA0003208444450001761
向(1S，3S，5S)-3-(2-氨基-6-氧代-1，6-二氢-9H-嘌呤-9-基)-5-羟基-1-(羟甲基)-2-亚甲基环戊烷-1-甲腈(实施例18，0.016g，0.053mmol)在THF(1.0mL，0.05M)中的冷却至0℃的悬浮液中滴加叔丁基氯化镁(1.0M THF，0.12mL，0.12mmol)。将反应混合物在室温下搅拌30分钟。然后将反应混合物冷却至0℃，滴加(氯(苯氧基)磷酰基)-L-丙氨酸异丙酯(30mg，0.1mmol)在THF(0.13mL)中的溶液。将反应混合物在室温下搅拌2小时，然后真空浓缩，得到白色固体。纯化(反相HPLC，Phenomenex Synergyi 4微米Hydro-RP 80A 250×21.2mm，25分钟内0％-99％，乙腈与TEAA缓冲液的H2O溶液与TEAA缓冲液)得到两种异构体(磷中心处)：((R*)-(((1S，3S，5S)-3-(2-氨基-6-氧代-1，6-二氢-9H-嘌呤-9-基)-1-氰基-5-羟基-2-亚甲基环戊基)甲氧基)(苯氧基)磷酰基)-L-丙氨酸异丙酯：1H NMR(400MHz，CDCl3)：δ7.80(s，1H)，7.30-7.10(m，5H)，5.60(m，1H)，5.53(m，1H)，5.08(m，1H)，4.98(sept，J＝6.0，1H)，4.89(dd，J＝11，4.8，1H)，4.59(d，J＝3.6，1H)，4.42(dd，J＝10，3.6，1H)，3.99(dq，J＝8.8，7.6，1H)，2.84(dd，J＝13，3.6，1H)，2.31(dd，J＝13，8.0，1H)，1.39(m，3H)，1.23(m，6H)。31P NMR(400MHz，CDCl3)：δ4.05。MS，m/Z 572.10[M+1]+；以及((S*)-(((1S，3S，5S)-3-(2-氨基-6-氧代-1，6-二氢-9H-嘌呤-9-基)-1-氰基-5-羟基-2-亚甲基环戊基)甲氧基)(苯氧基)磷酰基)-L-丙氨酸异丙酯(实施例44)。
实施例44.((S*)-(((1S，3S，5S)-3-(2-氨基-6-氧代-1，6-二氢-9H-嘌呤-9-基)- 1-氰基-5-羟基-2-亚甲基环戊基)甲氧基)(苯氧基)磷酰基)-L-丙氨酸异丙酯。
Figure BDA0003208444450001771
将标题化合物作为来自实施例43的其他异构体(纯的但立体化学未知)(磷中心处)分离。1H NMR(400MHz，CDCl3)：δ7.80(s，1H)，7.42-7.22(m，5H)，5.61-5.54(m，2H)，5.15-5.11(m，2H)，5.02(sept，J＝6.0，1H)，4.39(d，J＝4.0，1H)，4.27(dd，J＝11，4，1H)，3.97(dq，J＝10，7.2，1H)，2.90(dd，J＝14，4.0，1H)，2.22(dd，J＝14，8.4，1H)，1.36(m，3H)，1.23(m，6H)。31P NMR(400MHz，CDCl3)：δ3.72。MS，m/Z 572.10[M+1]+。
生物学测定
实施例A.HIV单循环测定
在感染前24小时，将CEM人T淋巴母细胞(ATCC，Manassas，VA)接种于测定培养基(补充有10％FBS、1％青霉素/链霉素(所有均得自Mediatech，Manassas，VA)和1％DMSO(Sigma-Aldrich，St Louis，MO)的MEM)中，其以5×105个细胞/mL(5×104个细胞/孔)的密度接种在白色96孔板中。将逐级稀释的化合物加入细胞中并在37℃，5％CO2下温育过夜。第二天，用VSV-G假型HIV NL4-3感染细胞，其中env和nef的部分是用Renilla-荧光素酶替换的基因，并且将感染的细胞在37℃、5％CO2下温育72小时。滴定病毒种菌，以实现约100倍于背景的Renilla-荧光素酶信号。通过向感染细胞中加入100ul
Figure BDA0003208444450001772
试剂(Promega，Madison，WI)来测量抗病毒活性。在室温下温育10分钟后，在Victor X3多标记读板器(Perkin Elmer，Waltham，MA)上测量发光。通过添加100μL
Figure BDA0003208444450001773
试剂(Promega，Madison，WI)并在室温下温育10分钟来确定未感染的平行培养物的细胞毒性。在Victor X3多标记读板器上测量发光。
实施例B.HIV逆转录酶的抑制
重组全长HIV-1逆转录酶(HIVrt)购自Abcam，目录号ab63979。使用来自Ambion的T7 RNA聚合酶Megascript试剂盒(目录号AM1333)合成与5′非翻译区(c5′UTR)互补的HCV抗基因组的最后385个核苷酸区域。DNA寡核苷酸用作内部起始引物并购自IDT。除非另外指明，否则由20nM c5′UTR RNA、100nM DNA引物和1nM HIVrt组成的反应样品在含有50mMTris pH 7.5、100mM KCl、4mM二硫苏糖醇(DTT)和12.5mM MgCl2的缓冲液中混合在一起。在30℃下通过添加最终体积为50μL的0.1μM三磷酸腺苷(dATP)、0.1μM三磷酸胞苷(dCTP)、1μM三磷酸鸟苷(dGTP)和0.32μM三磷酸3H-胸苷(3H-TTP)来引发反应。在温育40分钟之后，通过添加60μL冷冻的20％(重量/体积)三氯乙酸与500μMATP以沉淀核酸来终止反应。在4℃下温育1小时后，样品在多筛BV 1.2-μm 96孔板(Millipore)上过滤。将40μL Microscint-20(Perkin Elmer)加入孔中，并且样品中的计数通过Trilux Microbeta微板闪烁读数器(Wallac)测定。
所有的数据均利用GraphPad Prism分析。通过将数据拟合至公式Y＝％Min+(％Max-％Min)/(1+×/IC50)来计算酶催化速率降低50％的化合物浓度(IC5o)，其中Y对应于相对酶活性百分比，％Min是饱和化合物浓度下的残余相对活性，％Max是相对最大酶活性，并且X对应于化合物浓度。假设相对于天然dNTP结合的竞争性抑制使用Cheng-Prusoff方程计算Ki：Ki＝IC50/(1+[dNTP]/Km)，其中[dNTP]是天然dNTP的浓度并且Km是dNTP的表观Km。标准HIVrt RNA依赖性DNA聚合(RdDp)测定用于确定IC50值。
实施例C.HBV聚合酶的抑制
重组全长HBV聚合酶(HBVpol)在SF9细胞中表达并根据Lanford等人(在昆虫细胞中表达的乙型肝炎病毒聚合酶的核苷酸引发和逆转录酶活性(Nucleotide priming andreverse transcriptase activity of hepatitis B virus polymerase expressed ininsect cells))进行纯化(Lanford等人，J Virol.1995；69(7)：4431-4439)。使用来自Ambion的T7 RNA聚合酶Megascript试剂盒(目录号AM1333)合成与5′非翻译区(c5′UTR)互补的HCV抗基因组的最后385个核苷酸区域。DNA寡核苷酸用作内部起始引物并购自IDT。除非另外指明，否则由50nM c5′UTR RNA、500nM DNA引物和1uL HIVrt组成的反应样品在含有50mM Tris pH7.5、100mM KCl、4mM二硫苏糖醇(DTT)、10％DMSO和12.5mM MgCl2的缓冲液中混合在一起。在30℃下通过添加最终体积为50μL的46nM三磷酸腺苷(dATP)、17nM三磷酸胞苷(dCTP)、57nM三磷酸鸟苷(dGTP)和0.32μM三磷酸3H-胸苷(3H-TTP)来引发反应。在温育120分钟之后，通过添加60μL冷冻的20％(重量/体积)三氯乙酸与500μM ATP以沉淀核酸来终止反应。在4℃下温育1小时后，样品在多筛BV 1.2-μm 96孔板(Millipore)上过滤。将40μLMicroscint-20(Perkin Elmer)加入孔中，并且样品中的计数通过Trilux Microbeta微板闪烁读数器(Wallac)测定。
所有的数据均利用GraphPad Prism分析。通过将数据拟合至公式Y＝％Min+(％Max-％Min)/(1+×/IC50)来计算酶催化速率降低50％的化合物浓度(IC5o)，其中Y对应于相对酶活性百分比，％Min是饱和化合物浓度下的残余相对活性，％Max是相对最大酶活性，并且X对应于化合物浓度。假设相对于天然dNTP结合的竞争性抑制使用Cheng-Prusoff方程计算Ki：Ki＝IC50/(1+[dNTP]/Km)，其中[dNTP]是天然dNTP的浓度并且Km是dNTP的表观Km。标准HBVpol RNA依赖性DNA聚合(RdDp)测定用于确定IC50值。
实施例D.Hepg2.117细胞中HBV的抑制
将HepG2.117细胞(使用少于25次传代)在具有10％FBS(Corning REF 35-011-CV)、250ug/mL G418硫酸盐(Corning，REF 30-234-CI)、2ug/mL四环素(TEKNOVA，目录号T3325)和1X青霉素/链霉素(Corning，30-002-CI)(Corning，30-002-CI)的DMEM/F12 50/50培养基(Corning，REF 10-092-CM)中培养。对于每次测定，将细胞接种到测定培养基中：DMEM/F12 50/50(Corning，REF 10-092-CM)、2％Tet-系统批准的FBS(Clontech，目录号631106)和1X青霉素/链霉素(Corning，30-002-CI)。
测定抗-HBV活性
通过以下程序进行HepG2.117细胞中化合物的50％抑制浓度(EC50)的确定。在第一天，在胰蛋白酶化细胞之后用PBS洗涤细胞两次。然后用测定培养基洗涤细胞一次。以30,000-35,000个细胞/100μL/孔将细胞接种在Biocoat拼贴涂覆的平底96孔板中。将测试化合物溶解在100％DMSO中，达到100x所需的最终测试浓度。然后，将每种化合物连续稀释(1∶3)至多达9种不同浓度。通过在测定培养基中以1∶10稀释，将溶于100％DMSO的化合物稀释为溶于10％DMSO的化合物。在37℃、5％CO2培养箱中温育细胞4小时之后，将在测定培养基中稀释的10uL测试化合物添加到细胞板中。最终的DMSO浓度为1％。将细胞在37℃下温育96小时。
使用直接测量来自HepG2.117细胞上清液的HBV病毒DNA拷贝数的实时定量聚合酶链反应(RT qPCR)测定来测量抗病毒活性。在qPCR中使用的HBV核心引物和探针：核心正向引物是5′-CTGTGCCTTGGGTGGCTTT-3′(SEQ.ID.NO.1)；核心反向引物是5′-AAGGAAAGAAGTCAGAAGGCAAAA-3′(SEQ.ID.NO.2)；核心探针是5′/FAM/AGCTCCAAA/ZEN/TCCTTTATAAGGGTCGATGTCCATG/31ABKFQ/-3′(SEQ.ID.NO.3)。核心正向探针和核心反向探针以1μM的最终浓度使用，并且核心探针以0.5μM的最终浓度使用。用10μL 2x QuantaPerfecta qPCR ToughMix ROX、0.1μL 200X引物/探针混合物、4.0μL HepG2.117细胞上清液(或对照孔的标准品)和5.9μL dH2O建立RT qPCR测定，总试剂体积为20μL/孔。通过将HBVDNA质粒Psi Check以1∶5的比率以6个浓度1E6、0.2E6、0.04E6、0.008E6、0.0016E6、0.00032E6的病毒DNA拷贝数在10mM TE缓冲液中进行稀释来制备标准品。如下运行RT qPCR(Applied Biosystems和得自Life Technology的″Quant Studio 6Flex″)：对于每个循环，在95℃下5分钟、然后在95℃下15分钟和在60℃下20分钟，总共40个循环。
将HBV病毒DNA拷贝数归一化为在不存在抑制剂的情况下观察到的水平，其被定义为100％。EC50被定义为来自HepG2.117细胞的HBV病毒DNA拷贝数相对于其在不存在化合物的情况下的水平降低50％时的化合物浓度。
HepG2细胞中细胞毒性的确定
使用发光细胞活力测定测量细胞对HepG2细胞的细胞毒性(CC50)，以基于4天温育期之后存在的三磷酸腺苷(ATP)的定量来确定培养物中活细胞的数量。在第一天，将HepG2细胞以15,000/100uL/孔接种在Biocoat拼贴96孔平底板中的含有DEME(Corning，REF 10-013-CV)、3％FBS(Coning REF 35-011-CV)、1X青霉素/链霉素(Coming，30-002-CI)和1X非必需氨基酸的测定培养基中。在化合物给药之前，将细胞在37℃、5％CO2培养箱中温育4小时。化合物稀释和给药程序与关于确定抗HBV活性概述的相同。在温育96小时之后，将细胞活力归一化为在不存在抑制剂的情况下观察到的水平，其被定义为100％。对HepG2细胞没有细胞毒性效应被定义为50％细胞毒性浓度(CC50)＞100μM。
表2
实施例编号 HIV EC<sub>50</sub>(uM) HBV EC<sub>50</sub>(uM)
1 NT 0.0109
2 ＞33.3333 ＞10
3 ＞33.3333 ＞10
4 0.0356 ＜0.0009
5 ＞33.3333 2.4722
6 2.6836 0.0617
7 ＞33.3333 ＞10
8 NT NT
9 ＞33.33 7.4104
10 0.6621 0.166
11 0.9106 9.1782
12 ＞33.33 ＞10
13 5.0227 ＞5.5298
14 1.0784 3.4464
15 ＞33.3333 ＞10
16 5.8324 ＞10
17 2.2094 ＞10
18 0.1203 0.0466
19 0.0665 ＞10
20 0.5475 ＞10
表3
Figure BDA0003208444450001811
Figure BDA0003208444450001821
表4
Figure BDA0003208444450001822
此外，虽然为了清楚和理解的目的，已经通过说明和实施例相当详细地描述了前述内容，但是本领域技术人员将理解，在不脱离本公开的实质的前提下可进行多种和各种修改。因此，应当清楚地理解，本文公开的形式仅为示例性的并且不旨在限制本公开的范围，而是还覆盖与本发明的真实范围和实质一起出现的所有修改和替代形式。
Figure IDA0003208444490000011
Figure IDA0003208444490000021

Claims (97)

1.一种式(I)的化合物、或其药学上可接受的盐，所述式(I)的化合物具有以下结构：
Figure FDA0003208444440000011
其中：
B1为任选取代的C-连接的杂环碱基或任选取代的N-连接的杂环碱基；
R1选自氢、卤素、氰基、任选取代的C1-6烷基、未取代的C2-6烯基和未取代的C2-6炔基，其中当所述C1-6烷基被取代时，所述C1-6烷基被至少一个卤素取代；
R2为氢或氟；
R3为氢或氟；
R4选自氢、卤素、羟基、氰基和任选取代的C1-4烷基，其中当所述C1-4烷基被取代时，所述C1-4烷基被羟基或至少一个卤素取代；
R5为氢或羟基；
R6选自氢、卤素、氰基、任选取代的C1-4烷基、任选取代的C2-4烯基和未取代的C2-4炔基，其中当所述C1-4烷基或所述C2-4烯基被取代时，所述C1-4烷基和所述C2-4烯基独立地被至少一个卤素取代；
R7选自氢、任选取代的酰基、任选取代的O-连接的α-氨基酸、
Figure FDA0003208444440000012
R10和R11独立地选自不存在、氢、
Figure FDA0003208444440000021
Figure FDA0003208444440000022
或者
R10为
Figure FDA0003208444440000023
并且R11不存在或为氢；
R12不存在、为氢、任选取代的芳基或任选取代的杂芳基；
R13为任选取代的N-连接的α-氨基酸或任选取代的N-连接的α-氨基酸酯衍生物；
R14和R15独立地为任选取代的N-连接的α-氨基酸或任选取代的N-连接的α-氨基酸酯衍生物；
R16、R17、R19和R20独立地选自氢、任选取代的C1-24烷基和任选取代的芳基；
R18和R21独立地选自氢、任选取代的C1-24烷基、任选取代的芳基、任选取代的-O-C1-24烷基和任选取代的-O-芳基；
R22选自氢、任选取代的C1-24烷基和任选取代的芳基；
R23、R24和R25独立地不存在或为氢；
R8和R9独立地为氢或卤素；并且
m为0或1；并且
前提条件是式(I)的化合物或其药学上可接受的盐不是(i)、(ii)或(iii)的化合物或其药学上可接受的盐：
(i)当R1为氢；R2为氢或氟；R3为氢或氟；R4为羟基；R5为氢；R6为氢或氟；R8和R9各自为氢，并且B1选自：
Figure FDA0003208444440000024
Figure FDA0003208444440000031
Figure FDA0003208444440000032
时；则R7不选自：(a)氢；(b)
Figure FDA0003208444440000033
其中R10和R11各自为氢或各自不存在；(c)
Figure FDA0003208444440000034
其中R10为
Figure FDA0003208444440000035
R11、R23、R24或R25独立地不存在或为氢，并且m为0或1；以及(d)
Figure FDA0003208444440000036
其中R12为未取代的苯基或未取代的萘基，并且R13为丙氨酸异丙酯、丙氨酸异丁酯或丙氨酸新戊酯；
(ii)当R1为氢；R4为羟基；R5为氢；R6为氢；R8和R9各自为氢；B1选自：
Figure FDA0003208444440000037
Figure FDA0003208444440000041
Figure FDA0003208444440000042
时；
R7选自：(a)
Figure FDA0003208444440000043
其中R10为
Figure FDA0003208444440000044
R11、R23、R24或R25独立地不存在或为氢，并且m为1；以及(b)
Figure FDA0003208444440000045
其中R12为未取代的苯基，并且R13为丙氨酸异丙酯，则(a)当R3为氟时，R2不为氢；并且(b)当R3为氢时，R2不为氟；并且
(iii)当R1为氢；R4为羟基；R5为氢；R6为氢；R7为氢，并且R8和R9各自为氢时；则B1不选自：
Figure FDA0003208444440000046
Figure FDA0003208444440000051
2.根据权利要求1所述的化合物，其中所述式(I)的化合物选自：
Figure FDA0003208444440000052
Figure FDA0003208444440000053
或前述物质中任一种的药学上可接受的盐。
3.根据权利要求1或2所述的化合物，其中B1选自：
Figure FDA0003208444440000061
其中：
RA2选自氢、卤素和NHRJ2，其中RJ2选自氢、-C(＝O)RK2和-C(＝O)ORL2；
RB2为卤素或NHRM2，其中RM2选自氢、未取代的C1-6烷基、未取代的C2-6烯基、未取代的C3-8环烷基、-C(＝O)RN2和-C(＝O)ORO2；
RC2为氢或NHRP2，其中RP2选自氢、-C(＝O)RQ2和-C(＝O)ORR2；
RD2选自氢、卤素、未取代的C1-6烷基、未取代的C2-6烯基和未取代的C2-6炔基；
RE2选自氢、羟基、未取代的C1-6烷基、未取代的C3-8环烷基、-C(＝O)Rs2和-C(＝O)ORT2；
RF2选自氢、卤素、未取代的C1-6烷基、未取代的C2-6烯基和未取代的C2-6炔基；
Y1、Y2和Y4独立地为N或C，前提条件是Y1、Y2和Y4中的至少一者为N；
Y3为N或CRU2，其中RU2选自氢、卤素、未取代的C1-6-烷基、未取代的C2-6-烯基和未取代的C2-6-炔基；
Y5和Y6独立地为N或CH；
每个
Figure FDA0003208444440000062
独立地为单键或双键，前提条件是所述单键和双键位于环中，使得每个环是芳族的；
RG2为未取代的C1-6烷基；
RH2为氢或NHRV2，其中RV2独立地选自氢、-C(＝O)RW2和-C(＝O)ORX2；并且
RK2、RL2、RN2、RO2、RQ2、RR2、RS2、RT2、RW2和RX2独立地选自未取代的C1-6烷基、未取代的C2-6烯基、未取代的C2-6炔基、任选取代的C3-6环烷基、任选取代的C3-6环烯基、任选取代的C6-10芳基、任选取代的杂芳基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基(C1-6烷基)、任选取代的杂芳基(C1-6烷基)和任选取代的杂环基(C1-6烷基)。
4.根据权利要求1或2所述的化合物，其中B1为任选取代的C-连接的杂环碱基。
5.根据权利要求3所述的化合物，其中B1为
Figure FDA0003208444440000071
6.根据权利要求3所述的化合物，其中B1选自：
Figure FDA0003208444440000072
7.根据权利要求4所述的化合物，其中B1选自：
Figure FDA0003208444440000073
8.根据权利要求1或2所述的化合物，其中B1为任选取代的N-连接的杂环碱基。
9.根据权利要求8所述的化合物，其中B1为任选取代的嘌呤。
10.根据权利要求8所述的化合物，其中B1为任选取代的嘧啶。
11.根据权利要求3所述的化合物，其中B1选自：
Figure FDA0003208444440000081
12.根据权利要求8所述的化合物，其中B1选自：
Figure FDA0003208444440000082
13.根据权利要求1-12中任一项所述的化合物，其中R6为卤素。
14.根据权利要求13所述的化合物，其中所述卤素为氟。
15.根据权利要求1-12中任一项所述的化合物，其中R6为氰基。
16.根据权利要求1-12中任一项所述的化合物，其中R6为任选取代的C1-4烷基，其中当所述C1-4烷基被取代时，所述C1-4烷基被卤素取代。
17.根据权利要求1-12中任一项所述的化合物，其中R6为未取代的C1-4烷基。
18.根据权利要求1-12中任一项所述的化合物，其中R6为氟取代的C1-4烷基。
19.根据权利要求1-12中任一项所述的化合物，其中R6为氯取代的C1-4烷基。
20.根据权利要求1-12中任一项所述的化合物，其中R6为任选取代的C2-4烯基，其中当所述C2-4烯基被取代时，所述C2-4烯基被卤素取代。
21.根据权利要求1-12中任一项所述的化合物，其中R6为未取代的C2-4烯基。
22.根据权利要求1-12中任一项所述的化合物，其中R6为氟取代的C2-4烯基。
23.根据权利要求1-12中任一项所述的化合物，其中R6为氯取代的C2-4烯基。
24.根据权利要求1-12中任一项所述的化合物，其中R6为氢。
25.根据权利要求1-24中任一项所述的化合物，其中R5为氢。
26.根据权利要求1-24中任一项所述的化合物，其中R5为羟基。
27.根据权利要求1-26中任一项所述的化合物，其中R4为卤素。
28.根据权利要求1-26中任一项所述的化合物，其中R4为羟基。
29.根据权利要求1-26中任一项所述的化合物，其中R4为氰基。
30.根据权利要求1-26中任一项所述的化合物，其中R4为任选取代的C1-4烷基，其中当所述C1-4烷基被取代时，所述C1-4烷基被羟基或卤素取代。
31.根据权利要求30所述的化合物，其中R4为未取代的C1-4烷基。
32.根据权利要求30所述的化合物，其中R4为氟取代的C1-4烷基。
33.根据权利要求30所述的化合物，其中R4为氯取代的C1-4烷基。
34.根据权利要求30所述的化合物，其中R4为羟基取代的C1-4烷基。
35.根据权利要求1-26中任一项所述的化合物，其中R4为氢。
36.根据权利要求1-35中任一项所述的化合物，其中R1为氢。
37.根据权利要求1-35中任一项所述的化合物，其中R1为卤素。
38.根据权利要求1-35中任一项所述的化合物，其中R1为氰基。
39.根据权利要求1-35中任一项所述的化合物，其中R1为任选取代的C1-6烷基，其中当所述C1-6烷基被取代时，所述C1-6烷基被卤素取代。
40.根据权利要求1-35中任一项所述的化合物，其中R1为未取代的C2-6烯基。
41.根据权利要求1-35中任一项所述的化合物，其中R1为未取代的C2-6炔基。
42.根据权利要求1-41中任一项所述的化合物，其中R2为氢。
43.根据权利要求1-41中任一项所述的化合物，其中R2为氟。
44.根据权利要求1-43中任一项所述的化合物，其中R3为氢。
45.根据权利要求1-43中任一项所述的化合物，其中R3为氟。
46.根据权利要求1-45中任一项所述的化合物，其中R8和R9各自为氢。
47.根据权利要求1-45中任一项所述的化合物，其中R8和R9各自为卤素。
48.根据权利要求1-45中任一项所述的化合物，其中R8和R9为氢，并且R8和R9中的另一者为卤素。
49.根据权利要求1-48中任一项所述的化合物，其中R7为氢。
50.根据权利要求1-48中任一项所述的化合物，其中R7为任选取代的酰基。
51.根据权利要求50所述的化合物，其中R7为未取代的酰基。
52.根据权利要求1-48中任一项所述的化合物，其中R7为任选取代的O-连接的α-氨基酸。
53.根据权利要求1-48中任一项所述的化合物，其中R7为未取代的O-连接的α-氨基酸。
54.根据权利要求53所述的化合物，其中R7选自未取代的O-连接的丙氨酸、未取代的O-连接的缬氨酸、未取代的O-连接的亮氨酸和未取代的O-连接的甘氨酸。
55.根据权利要求1-48中任一项所述的化合物，其中R7为
Figure FDA0003208444440000101
56.根据权利要求55所述的化合物，其中R10和R11各自不存在或为氢。
57.根据权利要求53所述的化合物，其中R10为
Figure FDA0003208444440000102
并且R11不存在或为氢。
58.根据权利要求55所述的化合物，其中m为0；R10、R22和R23独立地不存在或为氢。
59.根据权利要求55所述的化合物，其中m为1；R10、R22、R23和R24独立地不存在或为氢。
60.根据权利要求53所述的化合物，其中R9和R10中的一者不存在、为氢或
Figure FDA0003208444440000111
并且R9和R10中的另一者为
Figure FDA0003208444440000112
61.根据权利要求53所述的化合物，其中R9和R10各自为
Figure FDA0003208444440000113
62.根据权利要求53所述的化合物，其中R9和R10中的一者不存在、为氢或
Figure FDA0003208444440000114
并且R9和R10中的另一者为
Figure FDA0003208444440000115
63.根据权利要求53所述的化合物，其中R9和R10各自为
Figure FDA0003208444440000116
64.根据权利要求53所述的化合物，其中R9和R10中的一者不存在、为氢或
Figure FDA0003208444440000117
并且R9和R10中的另一者为
Figure FDA0003208444440000118
65.根据权利要求53所述的化合物，其中R9和R10各自为
Figure FDA0003208444440000121
66.根据权利要求1-48中任一项所述的化合物，其中R7为
Figure FDA0003208444440000122
67.根据权利要求64所述的化合物，其中R11为任选取代的芳基。
68.根据权利要求65所述的化合物，其中所述任选取代的芳基为任选取代的苯基或任选取代的萘基。
69.根据权利要求66所述的化合物，其中所述任选取代的苯基为未取代的苯基。
70.根据权利要求64所述的化合物，其中R11为任选取代的杂芳基。
71.根据权利要求68所述的化合物，其中R11为任选取代的单环杂芳基。
72.根据权利要求64-69中任一项所述的化合物，其中R12为任选取代的N-连接的α-氨基酸。
73.根据权利要求64-69中任一项所述的化合物，其中R12为任选取代的N-连接的α-氨基酸酯衍生物。
74.根据权利要求70或71所述的化合物，其中R12为N-连接的丙氨酸、N-连接的丙氨酸异丙酯、N-连接的丙氨酸环己酯和N-连接的丙氨酸新戊酯。
75.根据权利要求1-48中任一项所述的化合物，其中R7为
Figure FDA0003208444440000123
76.根据权利要求74所述的化合物，其中R13和R14独立地为任选取代的N-连接的α-氨基酸酯衍生物。
77.根据权利要求74所述的化合物，其中R13和R14独立地为任选取代的N-连接的α-氨基酸酯衍生物。
78.根据权利要求74或75所述的化合物，其中R13和R14独立地选自N-连接的丙氨酸、N-连接的丙氨酸异丙酯、N-连接的丙氨酸环己酯和N-连接的丙氨酸新戊酯。
79.根据权利要求1或2所述的化合物，所述化合物选自：
Figure FDA0003208444440000131
Figure FDA0003208444440000132
或前述物质中任一种的药学上可接受的盐。
80.根据权利要求1或2所述的化合物，所述化合物选自：
Figure FDA0003208444440000141
Figure FDA0003208444440000151
Figure FDA0003208444440000161
Figure FDA0003208444440000171
Figure FDA0003208444440000181
Figure FDA0003208444440000191
Figure FDA0003208444440000201
Figure FDA0003208444440000202
或前述物质中任一种的药学上可接受的盐。
81.一种药物组合物，包含有效量的根据权利要求1-80中任一项所述的化合物、或其药学上可接受的盐以及药学上可接受的载体、稀释剂、赋形剂或它们的组合。
82.根据权利要求1-80中任一项所述的化合物、或其药学上可接受的盐、或根据权利要求81所述的药物组合物的用途，其用于制备用于治疗HBV和/或HDV感染的药物。
83.根据权利要求1-80中任一项所述的化合物、或其药学上可接受的盐、或根据权利要求81所述的药物组合物的用途，其用于制备用于减少HBV和/或HDV感染的复发的药物。
84.根据权利要求1-80中任一项所述的化合物、或其药学上可接受的盐、或根据权利要求81所述的药物组合物的用途，其用于制备用于抑制HBV和/或HDV病毒的复制的药物。
85.根据权利要求82-84中任一项所述的用途，还包括选自以下的一种或多种药剂的使用：HBV和/或HDV聚合酶抑制剂、免疫调节剂、干扰素、聚乙二醇化干扰素、病毒融合/进入抑制剂、病毒成熟抑制剂、衣壳组装调节剂、逆转录酶抑制剂、亲环蛋白/TNF抑制剂、FXR激动剂、TLR激动剂、siRNA或ASO cccDNA抑制剂、基因沉默剂、HBx抑制剂、sAg分泌抑制剂和HBV疫苗、或前述物质中任一种的药学上可接受的盐。
86.一种改善或治疗HBV和/或HDV感染的方法，包括向患有所述HBV和/或HDV感染的受试者施用有效量的根据权利要求1-80中任一项所述的化合物、或其药学上可接受的盐、或根据权利要求81所述的药物组合物。
87.一种改善或治疗HBV和/或HDV感染的方法，包括使感染上HBV和/或HDV的细胞与根据权利要求1-80中任一项所述的化合物、或其药学上可接受的盐、或根据权利要求81所述的药物组合物接触。
88.一种减少HBV和/或HDV感染的复发的方法，包括使感染上HBV和/或HDV的细胞与根据权利要求1-80中任一项所述的化合物、或其药学上可接受的盐、或根据权利要求81所述的药物组合物接触。
89.一种抑制HBV和/或HDV病毒的复制的方法，包括使感染上HBV和/或HDV的细胞与根据权利要求1-80中任一项所述的化合物、或其药学上可接受的盐、或根据权利要求81所述的药物组合物接触。
90.根据权利要求86-89中任一项所述的方法，还包括选自以下的一种或多种药剂的使用：HBV和/或HDV聚合酶抑制剂、免疫调节剂、干扰素、聚乙二醇化干扰素、病毒融合/进入抑制剂、病毒成熟抑制剂、衣壳组装调节剂、逆转录酶抑制剂、亲环蛋白/TNF抑制剂、FXR激动剂、TLR激动剂、siRNA或ASO cccDNA抑制剂、基因沉默剂、HBx抑制剂、sAg分泌抑制剂和HBV疫苗、或前述物质中任一种的药学上可接受的盐。
91.根据权利要求1-80中任一项所述的化合物、或其药学上可接受的盐、或根据权利要求81所述的药物组合物的用途，其用于制备用于改善或治疗HIV感染的药物。
92.根据权利要求1-80中任一项所述的化合物、或其药学上可接受的盐、或根据权利要求81所述的药物组合物的用途，其用于制备用于抑制HIV病毒的复制的药物。
93.根据权利要求91-92中任一项所述的用途，还包括选自以下的一种或多种抗逆转录病毒治疗(ART)药剂的使用：非核苷逆转录酶抑制剂(NNRTI)、核苷逆转录酶抑制剂(NRTI)、蛋白酶抑制剂(PI)、融合/进入抑制剂(也称为CCR5拮抗剂)、整合酶链转移抑制剂(INSTI)和HIV其他抗逆转录病毒治疗剂或前述物质中任一种的药学上可接受的盐。
94.一种改善或治疗HIV感染的方法，包括向患有所述HIV感染的受试者施用有效量的根据权利要求1-80中任一项所述的化合物、或其药学上可接受的盐、或根据权利要求81所述的药物组合物。
95.一种用于抑制HIV病毒的复制的方法，包括使感染上所述HIV病毒的细胞与根据权利要求1-80中任一项所述的化合物、或其药学上可接受的盐、或根据权利要求81所述的药物组合物接触。
96.一种用于改善或治疗HIV感染的方法，包括使感染上所述HIV的细胞与根据权利要求1-80中任一项所述的化合物、或其药学上可接受的盐、或根据权利要求81所述的药物组合物接触。
97.根据权利要求94-96中任一项所述的方法，还包括选自以下的一种或多种抗逆转录病毒治疗(ART)药剂：非核苷逆转录酶抑制剂(NNRTI)、核苷逆转录酶抑制剂(NRTI)、蛋白酶抑制剂(PI)、融合/进入抑制剂(也称为CCR5拮抗剂)、整合酶链转移抑制剂(INSTI)和HIV其他抗逆转录病毒治疗剂、或前述物质中任一种的药学上可接受的盐。
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