CN113329821A - 用于制备、检测和分析流体样品的自动化系统 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及一种用于制备、检测和分析包含生物物种的第一流体样品的自动化系统,所述制备、检测和分析系统包括:‑至少一个流体盒体(2),其包括至少一个浓缩和裂解流体模块(MF1)和包括并行地布置的多个扩增室的网络(30)的检测流体模块(MF2);‑仪器,该仪器尤其包括:机械组合,其包括固定到所述框架的至少一根可动杆(100)并包括设置为与所述浓缩和裂解流体模块(MF1)的柔性膜(203)协作的自由端部;光学测量系统(13),其用于测量穿过所述盒体的检测流体模块(MF2)的一个或更多个扩增室的荧光;控制和处理单元(UC)。
Description
技术领域
本发明涉及一种用于制备、检测和分析样品的自动化系统,所述系统包括完整分析仪器和旨在以可拆除的方式插入分析仪器中的盒体。该制备、检测和分析系统特别适于检测细菌在流体样品中的存在。
背景技术
在工业设施中,例如细菌、真菌、藻类、酵母的微生物组织的生长会具有负面的影响。生物膜的生长可能导致许多损害,包括:腐蚀、堵塞、酸化、影响产品。
因此必须通过在敏感区域实现定期取样,实现跟踪在工业环境中有问题的微生物组织的存在。样品可以以生物膜的形式或以流体(例如来自油箱的采出水)的形式来取样。
在这些流体上实现的微生物组织跟踪和检验分析经常基于培养物。传统地,样品在包含对于所关注的微生物组织的生长最优的养料和物理化学条件的环境中用一系列稀释液接种,并在理想温度下孵育。在生长的情况下,使用pH值指示器或形成有颜色的沉淀物指示存在微生物组织。该方法具有简单、成本不高的优点,并且特别地,它可容易地在工业设施简易检验实验室部署。然而,它具有众多缺陷:
-由于孵育时间造成的长响应时间—实际上,如果孵育时间长,可能会是数天到数周;
-某些微生物组织不能够在实验条件下培养,因此不会被检测到;
-必须有高级教育,以理解无菌和/或厌氧接种技术—由此,在操作员之间可能会有结果变化;
-必须有一定的知识,以解读所获得的结果。
自数年起开发了基于DNA检测的新的分子分析方法。然而,它们要求在分子生物技术方面得到非常高教育的人员,尤其是在对于移液和使用微量移液器方面。提取DNA也是该过程的相当长的步骤,意味着在分析之前的裂解、浓缩和纯化的几个步骤。这样的分析因此一般在工业场地之外,在保存样品和向专业实验室运输样品之后实现。
在专利申请US2011/014606A1中以及以下引用的公开中描述了分析解决方案:
Remco Den Dulk:《flowpad,a generic microfluidics platform for a widerange of applications》,11th EPIZONE Annual meeting《Crossing Barriers》19-21,September 2017,21septembre 2017,XP055608282,Paris,France。
Flaender Mélanie et Al:《Grinding lysis(GL):A microfluidic device forsample enrichment and mechanical lysis in one》,Sensors and Actuators:Chemical,Elsevier BV,NL,vol 258,21novembre 2017,pages 148-155,XP085338438,ISSN:0925-4005,DOI:10.1016/J.SNB.2017.11.082。
为了最接近场地并允许增殖期间快速的反应或所使用的抗菌处理的精确优化,因此需要一种制备、检测和分析系统,该系统:
-完全自动化,以限制人工干预;
-允许可靠且快速地确定存在于样品(即使复杂的样品)中的生物物种的性质和数量;
-不要求合格人员的干预;
-能够容易地运输并能够在工业现场的简易实验室中部署;和
-能够适于待检测目标。
发明内容
该目的通过一种用于制备、检测和分析包含生物物种的第一流体样品的自动化系统来达到,所述制备、检测和分析系统包括:
-至少一个流体盒体,其包括至少一个浓缩和裂解流体模块和包括相对于流体分布通道并行地布置的数个扩增室的网络的检测流体模块,所述浓缩和裂解流体模块包括浓缩和裂解设备,该浓缩和裂解设备包括制备室、实现于所述制备室中的研磨支承表面、过滤器和封闭所述室的可变形的柔性膜,
-包括以下的仪器:
○框架,其设有旨在以可拆除的方式容纳所述流体盒体的至少一个盘;
○机械组合,其包括固定到所述框架的至少一根可动杆并包括设置为与浓缩和裂解流体模块的所述柔性膜协作的自由端部;
○气动系统,其控制为允许流体穿过所述盒体流通;
○至少一个加热单元,其由盘承载并设置为在周期性或等温扩增反应时并行地加热室网络;
○光学测量系统,其用于测量穿过盒体的检测流体模块的扩增室中的一个或更多个的荧光;
○控制和处理单元,其配置为实施至少包括以下步骤的分析序列:
■控制气动系统以穿过浓缩和裂解设备的过滤器来注射第一流体样品,以回收存在于第一样品中的生物物种;
■控制气动系统以在浓缩和裂解流体模块的流体回路中生成干燥气流,所述流体回路穿过浓缩和裂解设备的所述过滤器;
■控制机械组合以致动杆进行使得柔性膜压抵研磨支承表面的运动,以使得包含在第一流体样品中的生物物种裂解;
■控制气动系统以将位于制备室外的第二流体样品排向盒体的所述流体分布通道;
■控制气动系统以同时并行地用第二流体样品填充网络的扩增室;
■控制加热单元以加热存在于网络的每个室中的所述第二流体样品;
■控制光学测量系统以测量包含第二流体样品的一部分的每个扩增室中的荧光;
■保存荧光的测量结果;
■对所获得的测量结果应用分析算法并生成存在于第一流体样品中的生物物种的定性和定量数据。
根据一个特点,控制和处理单元配置为执行:
-配置为将指令发送给浓缩和裂解设备以及气动系统的第一模块;
-配置为将指令发送给加热单元、气动系统以及光学测量系统的第二模块;
-配置为接收来自光学测量系统的图像并处理图像的第三模块。
根据另一特点,所述系统包括存储先前的分析结果的数据库,并在于,第三模块配置为参考所述数据库以生成所检测的每个生物物种的浓度变化曲线。
根据另一特点,每个流体模块可以包括设置在直接连接到气动系统的气动通道上的疏水过滤器。
根据另一特点,浓缩和裂解流体模块和检测流体模块包括可由控制和处理单元控制的多个流体阀门。
根据另一特点,所述系统包括集成n个流体盒体的盒件,其中n大于或等于2。
根据另一特点,所述系统包括:
-n个机械组合,其每个包括至少一根杆并与每个盒体相关联;
-n个加热单元,其每个设置为加热每个盒体的室网络;
-n/2个用于测量荧光的光学测量系统,其配置为在两个位置之间移动以成像所述系统的n个盒体。
本发明还涉及一种用于制备、检测和分析流体样品的方法,其基于如上述权利要求中任一项所述的系统来实施,所述方法包括以下步骤:
-控制气动系统以穿过浓缩和裂解设备的过滤器来注射第一流体样品,以回收存在于第一样品中的生物物种;
-控制气动系统以在浓缩和裂解流体模块的流体回路中生成干燥气流,所述流体回路穿过浓缩和裂解设备的所述过滤器;
-控制机械组合以致动杆进行使得柔性膜压抵研磨支承表面的运动,以使得包含在第一流体样品中的生物物种裂解;
-控制气动系统以将位于制备室外的第二流体样品排向盒体的所述流体分布通道;
-控制气动系统以同时并行地用第二流体样品填充网络的扩增室;
-控制加热单元以加热存在于网络的每个室中的所述第二流体样品;
-控制光学测量系统以测量包含第二流体样品的一部分的每个扩增室中的荧光;
-保存荧光的测量结果;
-对所获得的测量结果应用分析算法并生成存在于第一流体样品中的生物物种的定性和定量数据。
本发明还涉及用于检测生物物种在注射到系统的所述流体盒体中的流体样品中的存在的如上所述的系统的用途。
附图说明
在以下参照以下列出的附图做出的详细说明中,其它特征和优点将显现:
-图1示意性地示出根据本发明的制备、检测和分析系统;
-图2示出示意图,该示意图示出本发明的制备、检测和分析系统的运作原理;
-图3示意性地示出可在根据本发明的制备、检测和分析系统中使用的浓缩和裂解设备;
-图4A至4M示出在本发明的系统中使用的浓缩和裂解流体模块中实施的不同步骤;
-图5A至5G示出在本发明的系统中使用的检测流体模块中实施的不同步骤;
-图6示出本发明的制备、检测和分析系统的一个有利实施变型。
具体实施方式
本发明涉及一种包括生物物种的流体样品的自动化制备、检测和分析系统。
“生物物种”非限制性地指微生物组织、细菌、细胞、孢子、真菌等等。
待检测样品的形式可以是直接在现场取样或在稀释在现场取样的生物膜之后获得的流体。“流体”优选地指液体。
参照图2,传统地,通过遵循以下不同步骤进行对可以包括上述类型的生物物种的液体样品的分析:
-预先制备所取样的样品的步骤E0。可见该步骤不是由本发明的制备、检测和分析系统实施的。它可以涉及例如如果样本是固体,稀释样本。例如当样本是生物膜时,是这样的情况。一旦制备了,样品的形式为体积等于至少1ml的液体。
-第二制备步骤E1,其在于浓缩和裂解。在该步骤期间,在步骤E0期间,制备的样品首先被过滤,以仅保留生物物种。这些生物物种然后用合适的漂洗液体来漂洗和净化。然后,生物物种被机械地裂解,以释放待分析生物材料。再次过滤可允许选择该生物材料并使其与在裂解期间生成的污染物分离。
-检测步骤E2,其可使用Q-PCR(即“定量-聚合酶链反应”)类型或LAMP、RPA、NGS测序(Nanopore)类型的扩增反应来实施。包含在裂解之后获得的生物材料的样品可以与干反应物混合。混合物以液体的形式被注射到通过分布通道供给的并行设置的多个扩增室中。每个室可包含根据待检测目标分开的引物组。室被加热以使得存在于室中的每个样品经历扩增协议流程的一个或更多个相继的热循环,或在LAMP或RPA类型的检测的情况下,将其维持在等温温度。在扩增流程的每个热循环期间拍摄荧光图像并将所述荧光图像保存。
-分析所拍摄的荧光图像的步骤E3。通过考虑到所施加的热循环,算法构建对于存在于室中的每个样品的荧光强度曲线。可由此确定对于所分析的每个样品的目标生物物种的浓度。
根据本发明,为了实施浓缩和裂解步骤E1和检测步骤E2和分析步骤E3,使用自动化制备、检测和分析系统,该系统包括分析仪器1和要插入仪器1中以对其进行分析的至少一个流体盒体2。
该系统的特点在于由仪器1提供某些功能并且其它功能由插入仪器中的盒体2直接提供。换句话说,分析仪器和盒体必须相互协作以使得系统运作,没有这两个个体中的一个或另一个就不能实施分析。
盒体2实现为至少一个流体(甚至微流体)卡的形式。该卡可具有信用卡的格式或其它格式。该卡可由PMMA(聚甲基丙烯酸甲酯)或等同类型的透明材料制成。插入仪器中的盒体2有利地具有总是相同的构造(尤其是流体的)以与仪器的对于实施分析是必需的元件协作。
盒体有利地包括分开的两个流体模块:
-旨在浓缩和裂解存在于待分析样品中的生物物种的第一流体模块MF1;
-专用于检测由第一模块分离的生物物种的第二流体模块MF2。
一般性且非限制性地,盒体2的第一流体模块MF1可尤其包括:
-旨在容纳待分析样品的第一注射点;
-用于注射漂洗液体的第二注射点;
-用于注射洗提液体的第三注射点;
-用于浓缩和裂解存在于样品中的生物物种的流体设备20。非限制性地,该设备20可具有如在图3中所示且已经在专利申请EP3222989A1中描述的架构。它可由此包括样品布置在其中的浓缩和裂解室200、过滤器201、布置在室200中的研磨支承表面202和封闭室的可变形的柔性膜203,生物物种可抵着所述研磨支承表面被磨碎;还在专利申请WO2015/181743A1中描述了另一设备架构。
-用于储存在浓缩和裂解之后获得的样品的容器;
-废弃物容器;
-适于接合模块的各个元件的流体回路;
-包括适于使得元件之间的流体穿过流体回路流通的气动输入/输出的气动回路。
一般性且非限制性地,盒体2的第二流体模块MF2可尤其包括:
-待分析样品的第一注射点,该第一注射点通过流体连接来连接到第一流体模块的存储容器;
-由连接到分析模块的第一注射点的分布通道并行地供给的分别的多个室的网络;
-适于接合模块的各个元件的流体回路;
-包括适于允许模块的流体回路中的流体流通的气动输入/输出的气动回路;
分析仪器则包括以下元件:
-形成用于以可拆卸的方式容纳所述流体盒体2的平坦支承表面的盘14;在布置在盘上之后,盒体2保持固定;
-由通过发动机驱动相对于盒体2旋转的可动杆或抹刀100构成的机械组合10;抹刀100被控制以从外部压抵流体浓缩和裂解设备20的柔性膜203,以使得向室200内部拉伸膜203。抹刀100的端部压在膜上。通过压在膜上以向室200底部拉伸该膜,抹刀的端部达到研磨支承表面202并抵着所述表面研磨生物物种,以释放DNA分子;
-流体室网络的至少一个加热单元12,其集成到盘14并相对于盒体2的承载室网络的区域定位。加热单元12可包括珀尔帖元件、用于均匀化温度的铜片、允许精确地调节温度的热传感器,和可能地用于散热的散热器和通风器;
-包括用于使得流体样品在盒体的每个流体模块MF1、MF2中和两个模块之间流通的一个或更多个抽吸泵的气动系统11。气动系统11还可用于生成穿过浓缩和裂解设备的过滤器201的气流(抽吸力Fvac_1、Fvac_2、Fvac_3),尤其是用于使其干燥。气动系统也可构造为控制在两个流体模块MF1、MF2中使用的每个(气动类型的)阀门;
-设置在盘14上方的用于测量荧光的光学测量系统13,该系统可以包括摄像机、发光二极管和光学滤镜,并构造为测量盒体的网络的每个室中在DNA扩增反应期间的荧光;
-用于控制分析仪器1的人机界面HMI;
-控制和处理单元UC,其可以包括至少一个微处理器和存储装置。控制和处理单元UC旨在执行控制序列。根据待实施的分析类型并根据目标生物物种,控制和处理单元UC配置为选择合适的控制序列。也可使用偏置于系统的每个设备个体附近的单元。控制和处理单元UC还能够处理光学测量系统13拍摄的图像。基于这些图像,由此能够追溯到存在于网络的每个室中的样品的DNA的量和因此初始存在于在现场取样的初始样品中的细菌数量。控制和处理单元UC还配置为将结果存储在本地或远程存储的数据库DB中,并通过借助于不同的选择筛选(取样地点、样品类型、目标等)比较数据实现在时间上的跟踪。
根据图2示出的本发明的一个具体方面,控制和处理单元UC会能够执行多个软件模块M1、M2、M3,所述多个软件模块中的每个旨在实施上述分析方法的步骤E1、E2、E3中的一个。这些软件模块中的每个的功能会在于将指令发送给仪器的各个个体和/或处理接收的数据。参照图2,由此具有以下方案:
-旨在实施包括浓缩和裂解的制备步骤E1的模块M1配置为将指令发送给浓缩和裂解设备10以及气动系统11。
-旨在实施检测步骤E2的模块M2配置为将指令发送给加热单元12、气动系统11,以及光学测量系统13。
-旨在实施分析步骤E3的模块M3配置为接收来自光学测量系统13的图像和处理图像。基于图像,它生成分析结果R。它可尤其使用数据库DB。
-人机界面HMI允许配置分析仪器和选择分析参数。
图4A至4M详细示出在旨在浓缩和裂解的第一流体模块MF1中实施的不同步骤。这些图示出在如上所述的卡上实现的第一流体模块MF1。有利地,如图所示的模块由此包括:
-旨在当盒体被插入仪器中时连接到分析仪器的气动系统的多个气动输入/输出Px;
-多个流体输入Fy;
-浓缩和裂解设备20;
-废弃物容器R1;
-可在执行序列时由控制和处理单元控制的多个双向阀门V1至V6;
-存储容器Rs;
在该模块MF1中,不同流体的流通是通过生成由仪器的气动系统生成的抽吸力Fvac_1或Fvac_2来实现的。
图4A
模块处于初始状态。阀门V1至V6全都关闭。
图4B
这涉及将取样的样本注射到模块中的步骤。样品可以按1ml的体积来注射。
控制和处理单元UC控制阀门V1打开和阀门V6打开。控制和处理单元UC控制气动系统11以穿过输入P1生成抽吸力Fvac_1,以将样品抽吸到流体回路中。样品通过流体输入F1进入回路,然后来到浓缩和裂解设备20的室200,并穿过设备20的过滤器201。样品的没有被过滤器201保留单的部分被排向废弃物容器R1。只要整个样品体积还没有穿过过滤器,就维持抽吸力Fvac_1。
图4C
通过穿过过滤器201流通,样品被过滤器201过滤。多余样品被排向废弃物容器R1。
图4D
整个样品被过滤。存在于样品中并被过滤器保留的生物物种存在于室中。
控制和处理单元UC控制气动系统11和阀门V4的打开。抽吸力Fvac_1由点P1生成,并产生穿过过滤器201的气流以使其干燥。空气由点P2抽吸。
图4E
控制和处理单元控制阀门V1、V4和V6的关闭。所有阀门V1至V6则关闭。
图4F
控制和处理单元UC控制阀门V2的打开和阀门V6的打开。控制和处理单元UC控制气动系统11以穿过点P1生成抽吸力Fvac_1,以由流体点F2抽吸漂洗液体并将其注射到室200中,以净化经过过滤的生物物种。漂洗液体被排到废弃物容器R1中。
图4G
维持漂洗。漂洗液体可以按1ml的体积来供给。
图4H
控制和处理单元控制气动吸气11和阀门V4的打开。抽吸力Fvac_1由点P1生成,并产生穿过过滤器201的气流,以使其干燥。空气由点P2抽吸。
图4I
控制和处理单元控制阀门V2、V4和V6的关闭。所有阀门V1至V6则关闭。
图4J
控制和处理单元UC控制裂解机械组合10以使得抹刀100移动进行抵着研磨支承表面202研磨存在于室200的生物物种的运动。所施加的运动可以是旋转和平移的组合。在该裂解步骤完成时,室200包含污染物和待分析生物材料(DNA分子)。
图4K
控制和处理单元UC控制阀门V3的打开和阀门V5的打开。
控制和处理单元UC控制气动系统以生成穿过点P3的抽吸力Fvac_2,以由流体点F3向室200并穿过过滤器201抽吸洗提液体,以洗提在裂解之后获得的生物材料。
包含目标生物材料的洗提液体被接收在存储容器Rs中。该洗提液体可以按50μl的体积来注射。
图4L
包含目标生物材料的洗提液体被接收在存储容器Rs中。
图4M
控制和处理单元控制阀门V3和V5的关闭。浓缩和裂解过程则终止。
在该第一流体模块MF1中,要指出的是,在回路中布置有疏水过滤器,使得没有任何液体进入仪器。这些过滤器集成到盒体,在气动输入/输出与流体回路的其余部分之间。此外,它们还允许更好地调节通过抽吸对体积的填充。这些过滤器实际上允许让抽吸流体模块中的液体所必需的气体通过,但不让液体通过。
一旦所关注的生物材料被接收在存储容器Rs中,它可以转移或者注射到盒体的第二流体模块MF2中以进行检测。
图5A至5G详细示出在该旨在检测基于初始样本回收的生物物种的第二流体模块MF2中实施的不同步骤。这些图示出在如上所述的卡上实现的第二流体模块MF2。有利地,要指出的是,两个模块MF1、MF2可以实现在同一卡上。有利地,如图所示的模块MF2由此包括:
-旨在当盒体2被插入到仪器中时连接到分析仪器1的气动系统11的多个气动输入/输出Px;
-输入容器R10,其中布置有待分析样品,该容器可以与在第一模块中使用的过程终止的存储容器Rs相同;
-输出容器R20;
-通过中央分布通道并行地供给的六个检测室的网络30;
-可在执行分析序列时由控制和处理单元UC控制的多个三向阀门V10、V20;
在该模块中,不同流体的流通是通过生成由仪器的气动系统11穿过输入P10生成的抽吸力Fvac_3实现的。
图5A
模块处于初始状态。阀门V10和V20两个都关闭。
图5B
包含待分析生物材料的样品布置在输入容器R10中。该容器可以与第一流体模块MF1的存储容器Rs是共同的。
图5C
控制和处理单元UC控制阀门V20的打开。
图5D
控制和处理单元控制阀门V10的打开。
图5E
控制和处理单元UC控制气动系统11以生成穿过点P10的抽吸力Fvac_3,以将流体回路中的样品抽吸到容器R10外。样品进入中央分布通道,并同时地进入网络30的并行室。室网络30的架构允许使得室全都同时被填充。
图5F
一旦网络的所有的室被填充,控制和处理单元UC控制阀门V10关闭和阀门V20关闭。
每个室可包括分别的扩增试剂,以检测不同生物物种的存在。
图5G
控制和处理单元UC可然后控制仪器的加热单元12以使得存在于网络30的每个室中的生物材料经受一个或更多个热循环。
控制和处理单元UC还控制光学测量系统13以拍摄网络30的每个室中的荧光的图像。
一旦拍摄了图像,图像被保存,然后由控制和处理单元UC分析以确定存在哪些生物物种和它们存在的量。控制和处理单元UC也可参照先前实现的分析,以显现向上或向下的趋势。然后由控制和处理单元UC生成结果R。
有利地,流体模块MF1、MF2可使用疏水过滤器,以允许按照准确的体积在抽吸模式下填充。
在第二流体模块MF2中,可在中央分布通道中集成死体积,以困住在填充网络30的室期间生成的气泡。类似地,网络30的每个室可具有有限的高度以避免在输入处形成泡。
有利地,流体模块的每个阀门可使用由EPDM制成的密封件,这是为了改善回路的密封性和避免当阀门关闭时将空气注射到回路中。
根据图6所示的本发明的一个具体方面,仪器可以适于同时处理多个盒体,例如六个盒体2a、2b、2c、2d、2e、2f。这些盒体会装载在布置于仪器的盘14上的盒件15上,仪器由此包含对于所有盒体共用的气动系统11,并带有一定数量的合适的输入/输出,可致动以在每个盒体中进行裂解的六个机械组合10a、10b、10c、10d、10e、10f,六个加热区域12a、12b、12c、12d、12e、12f,和每个在两个位置之间移动的三个摄像机13.1、13.2、13.3,以成像六个盒体。控制和处理单元UC当然允许控制各个个体和接收所拍摄的图像以对其进行处理。
由此,本发明的制备、检测和分析系统具有以下优点:
■它能够容易地在工业环境中运输;
■它允许快速分析样品(不再是多个小时);
■它使用简单,这是因为它允许自动地从样品获得结果,最大地限制操作员的干预;
■它与复杂的样品兼容,例如高盐度的、包含例如溶解的固体,游离或溶解的碳氢化合物,高浓度的阳离子,来自工业设施的酸性pH值;
■它对于具体生物物种群或所关注的代谢功能(例如硫酸盐还原菌),可适于待检测目标,并借助于其结构允许同时分析多个物种/功能或物种/功能群;
■它允许获得定性和定量结果(借助于有标定的Q-PCR);
■它是敏感的,其检测极限小于103cfu/mL;
■借助于数据库,它允许提供随时间推移的所检测的生物物种的定量和定性演变数据。
Claims (9)
1.一种用于制备、检测和分析包含生物物种的第一流体样品的自动化系统,所述制备、检测和分析系统包括:
-至少一个流体盒体(2),其包括至少一个浓缩和裂解流体模块(MF1)和包括相对于流体分布通道并行地布置的多个扩增室的网络(30)的检测流体模块(MF2),所述浓缩和裂解流体模块(MF1)包括浓缩和裂解设备(20),该浓缩和裂解设备包括制备室(200)、实现于所述制备室中的研磨支承表面(202)、过滤器(201)和封闭所述室的可变形的柔性膜(203),
-一种仪器,包括:
o框架,其设有旨在以可拆除的方式容纳所述流体盒体(2)的至少一个盘(14);
o机械组合,其包括固定到所述框架的至少一根可动杆(100)并包括设置为与所述浓缩和裂解流体模块(MF1)的所述柔性膜(203)协作的自由端部;
o气动系统(11),其控制为允许流体穿过所述盒体流通;
o至少一个加热单元(12),其由所述盘承载并设置为在周期性或等温扩增反应时并行地加热所述室网络;
o光学测量系统(13),其用于测量穿过所述盒体的检测流体模块(MF2)的扩增室中的一个或更多个的荧光;
o控制和处理单元(UC),其配置为实施包括至少以下步骤的分析序列:
■控制所述气动系统(11)以穿过所述浓缩和裂解设备的过滤器(201)注射第一流体样品,以回收存在于所述第一样品中的生物物种;
■控制所述气动系统以在浓缩和裂解流体模块(MF1)的流体回路中生成干燥气流,所述流体回路穿过所述浓缩和裂解设备(20)的所述过滤器;
■控制所述机械组合(10)以致动杆进行使得所述柔性膜压抵所述研磨支承表面的运动,以使得包含在所述第一流体样品中的生物物种裂解;
■控制所述气动系统(11)以将位于所述制备室外的第二流体样品排向所述盒体的所述流体分布通道;
■控制所述气动系统(11)以同时并行地用所述第二流体样品填充所述网络(30)的扩增室;
■控制所述加热单元(12)以加热存在于网络(30)的每个室中的所述第二流体样品;
■控制所述光学测量系统(13)以测量包含第二流体样品的一部分的每个扩增室中的荧光;
■保存荧光的测量结果;
■对所获得的测量结果应用分析算法并生成存在于所述第一流体样品中的生物物种的定性和定量数据。
2.根据权利要求1所述的系统,其特征在于,所述控制和处理单元配置为执行:
-第一模块(M1),其配置为将指令发送给所述浓缩和裂解设备(10)以及所述气动系统(11);
-第二模块(M2),其配置为将指令发送给所述加热单元(12)、所述气动系统(11)以及所述光学测量系统(13);
-第三模块(M3),其配置为接收来自所述光学测量系统(13)的图像并处理所述图像。
3.根据权利要求2所述的系统,其特征在于,所述系统包括存储先前的分析结果的数据库,并且所述第三模块配置为参考所述数据库以生成所检测的每个生物物种的浓度变化曲线。
4.根据权利要求1至3之一所述的系统,其特征在于,每个流体模块能够包括设置在直接连接到所述气动系统的气动通道上的疏水过滤器。
5.根据权利要求1至4之一所述的系统,其特征在于,所述浓缩和裂解流体模块(MF1)和检测流体模块(MF2)包括能够由控制和处理单元(UC)控制的多个流体阀门。
6.根据权利要求1至5之一所述的系统,其特征在于,所述系统包括集成n个流体盒体的盒件(15),其中n大于或等于2。
7.根据权利要求6所述的系统,其特征在于,所述系统包括:
-n个机械组合,其每个包括至少一根杆(100)并与每个盒体相关联;
-n个加热单元(12),其每个设置为加热每个盒体的室网络;
-n/2个用于测量荧光的光学测量系统(13),其配置为在两个位置之间移动以成像所述系统的n个盒体。
8.一种用于制备、检测和分析流体样品的方法,其基于根据上述权利要求中任一项所述的系统来实施,其特征在于,所述方法包括以下步骤:
-控制所述气动系统(11)以穿过浓缩和裂解设备的过滤器(201)来注射所述第一流体样品,以回收存在于所述第一样品中的生物物种;
-控制所述气动系统以在所述浓缩和裂解流体模块(MF1)的流体回路中生成干燥气流,所述流体回路穿过浓缩和裂解设备(20)的所述过滤器;
-控制所述机械组合(10)以致动所述杆进行使得柔性膜压抵研磨支承表面的运动,以使得包含在所述第一流体样品中的生物物种裂解;
-控制所述气动系统(11)以将位于制备室外的第二流体样品排向盒体的所述流体分布通道;
-控制所述气动系统(11)以同时并行地用第二流体样品填充所述网络(30)的扩增室;
-控制所述加热单元(12)以加热存在于网络(30)的每个室中的所述第二流体样品;
-控制所述光学测量系统(13)以测量包含第二流体样品的一部分的每个扩增室中的荧光;
-保存荧光的测量结果;
-对所获得的测量结果应用分析算法并生成存在于所述第一流体样品中的生物物种的定性和定量数据。
9.一种根据权利要求1至7之一所述的系统的用于检测生物物种在所述系统的所述流体盒体中的流体样品中的存在的用途。
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Citations (7)
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---|---|---|---|---|
CN1556410A (zh) * | 2003-12-31 | 2004-12-22 | 国家海洋局第一海洋研究所 | 一种鱼类病毒的检测试剂盒及其检测方法 |
CN1973197A (zh) * | 2004-01-28 | 2007-05-30 | 挪其普公司 | 用于进行核酸序列的扩增和检测过程的诊断系统 |
CN104136596A (zh) * | 2011-10-21 | 2014-11-05 | 尹特根埃克斯有限公司 | 样品制备、处理和分析系统 |
CN105543084A (zh) * | 2007-07-23 | 2016-05-04 | 科隆迪亚戈有限公司 | 分析系统 |
CN105828945A (zh) * | 2013-11-29 | 2016-08-03 | 基因波公司 | 用于分子诊断的微流体盒、使用微流体盒的对接站、以及用于分析生物样品的方法 |
CN106795473A (zh) * | 2014-06-11 | 2017-05-31 | 精密公司 | 用于核酸分析的具有集成的测定对照的微流体盒及设备 |
CN108342382A (zh) * | 2018-01-30 | 2018-07-31 | 广东海大畜牧兽医研究院有限公司 | 一种核酸快速提取方法及其试剂盒 |
Family Cites Families (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
ES2309022T3 (es) | 1997-12-24 | 2008-12-16 | Cepheid | Dispositivo y procedimiento para lisis. |
CN109055495A (zh) * | 2006-11-06 | 2018-12-21 | 美艾利尔技术公司 | 使用结合元件用于分析的装置和方法 |
GB2516666B (en) * | 2013-07-29 | 2015-09-09 | Atlas Genetics Ltd | Fluidic cartridge for nucleic acid amplification and detection |
FR3021667B1 (fr) | 2014-05-28 | 2018-01-26 | Commissariat A L'energie Atomique Et Aux Energies Alternatives | Dispositif de lyse d'especes biologiques et procede mis en œuvre par ce dispositif |
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Patent Citations (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN1556410A (zh) * | 2003-12-31 | 2004-12-22 | 国家海洋局第一海洋研究所 | 一种鱼类病毒的检测试剂盒及其检测方法 |
CN1973197A (zh) * | 2004-01-28 | 2007-05-30 | 挪其普公司 | 用于进行核酸序列的扩增和检测过程的诊断系统 |
CN105543084A (zh) * | 2007-07-23 | 2016-05-04 | 科隆迪亚戈有限公司 | 分析系统 |
CN104136596A (zh) * | 2011-10-21 | 2014-11-05 | 尹特根埃克斯有限公司 | 样品制备、处理和分析系统 |
CN105828945A (zh) * | 2013-11-29 | 2016-08-03 | 基因波公司 | 用于分子诊断的微流体盒、使用微流体盒的对接站、以及用于分析生物样品的方法 |
CN106795473A (zh) * | 2014-06-11 | 2017-05-31 | 精密公司 | 用于核酸分析的具有集成的测定对照的微流体盒及设备 |
CN108342382A (zh) * | 2018-01-30 | 2018-07-31 | 广东海大畜牧兽医研究院有限公司 | 一种核酸快速提取方法及其试剂盒 |
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