CN113005026B - 一种基因检测芯片及检测方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种基因检测芯片及检测方法,该芯片包括相互粘合的上基板、中间层和下基板,下基板上与进样流道贴合的区域铺设有氧化石墨烯,与微腔贴合的区域铺设有多聚赖氨酸;中间层与下基板接触的一面刻有进样流道和与进样流道联通的微腔,进样流道上还连接有出样流道,进样流道上设有进样口,所述出样流道上设有出样口;上基板与中间层接触的一面刻有微腔控制流道和出样控制流道,微腔控制流道上设有微腔控制阀门,出样控制流道上设有出样控制阀门,微腔控制阀门位于进样流道上靠近微腔入口的位置上方,出样控制阀门位于出样流道上方,本发明所公开的芯片及检测方法操作简单,性能稳定,成本低,检测效率高。
Description
技术领域
本发明涉及基因检测技术领域,特别涉及一种基因检测芯片及检测方法。
背景技术
基因检测是指通过血液或其他体液、细胞等对DNA、RNA和蛋白等因子进行检测的技术,在诊断疾病、预测风险疾病等方面具有重要意义。传统的基因检测,例如PCR技术,需要复杂冗长的前处理过程,加样繁琐,且反应需要精准的温度,这些缺点极大的限制了此方法的使用。随着检测技术的发展,基因芯片因体积小、检测迅速,可同时检测多种基因等优点被广泛的应用。
基因芯片的检测原理是杂交测序,即通过已知序列的核酸探针与待测样本的核酸序列杂交测定的原理。目前基因芯片的形式有很多,主要集中在单层PDMS上,对于单层的PDMS基因检测芯片,在内部流道结构上有多种形式,如Y形等,而在玻璃基底方面,只有单一的一种材料,如氧化石墨烯等,未发现将两种材料同时生长于玻璃基底上的基因检测芯片。而对于单层PDMS芯片,单一的玻璃基底,在基因检测时,对于目的基因需要有一定的要求,若通过荧光判断检测结果的好坏时,目的基因上无需荧光基团的修饰。此外,在检测时,还需将多种溶液(包含目的基因)混合在一起后注入到微流道内,因此,在检测时,步骤繁琐,同时在混合的过程中对目的基因产生影响。
发明内容
为解决上述技术问题,本发明提供了一种基因检测芯片及检测方法,以达到操作简单,性能稳定,成本低的目的。
为达到上述目的,本发明的技术方案如下:
一种基因检测芯片,包括相互粘合的上基板、中间层和下基板,所述下基板上与进样流道贴合的区域铺设有氧化石墨烯,与微腔贴合的区域铺设有多聚赖氨酸;所述中间层与下基板接触的一面刻有进样流道和与进样流道联通的微腔,所述进样流道上还连接有出样流道,所述进样流道上设有进样口,所述出样流道上设有出样口;所述上基板与中间层接触的一面刻有微腔控制流道和出样控制流道,所述微腔控制流道上设有微腔控制阀门,所述出样控制流道上设有出样控制阀门,所述微腔控制阀门位于进样流道上靠近微腔入口的位置上方,所述出样控制阀门位于出样流道上方。
上述方案中,所述上基板和中间层为聚二甲基硅氧烷材料,所述下基板为玻璃材料。
上述方案中,所述上基板厚度为5mm,所述中间层厚度为10um。
上述方案中,所述进样口和出样口分别位于中间层的两端。
上述方案中,所述上基板和中间层之间的粘合是靠同种材料之间的相互粘合,所述中间层和下基板之间的粘合是靠上基板和中间层的重力进行粘合。
上述方案中,所述中间层上刻有多组进样流道、微腔和出样流道,所述微腔控制流道上设有多个微腔控制阀门,所述出样控制流道上设有多个出样控制阀门。
一种基因检测芯片的检测方法,包括如下过程:
(1)对上基板中的微腔控制流道和出样控制流道注入液体,以便后期通过氮气来控制微腔控制阀门和出样控制阀门的开启与关闭;
(2)将合成的带有荧光基团的目的基因注入进样口,此时上基板上的微腔控制阀门处于关闭状态,出样控制阀门处于开启状态,采用氮气将进样口中的带有荧光基团的目的基因经进样流道和出样流道吹到出样口处,此时,下基板上的氧化石墨烯表面的正电荷与目的基因表面的负电荷通过正负电相互吸附,带有荧光基团的目的基因被铺设到下基板上进样流道处,同时荧光基团被氧化石墨烯猝灭;
(3)带有荧光基团的目的基因与下基板上提前铺设好的氧化石墨烯孵育一段时间后,从出样口将多余的未被吸附的目的基因吸出,同时在进样口注入缓冲液,从出样口将缓冲液吸出,反复几次,对进样流道进行冲洗,将多余的未被吸附的目的基因彻底清洗干净;
(4)然后将待测基因从进样口注入,此时微腔控制阀门和出样控制阀门处于关闭状态,利用氮气将待测基因吹入到进样流道内,待测基因与原先铺好的带有荧光基团的目的基因结合成双链DNA,由于氧化石墨烯只吸附单链,不吸附双链,因此,双链DNA悬浮于进样流道内,然后微腔控制阀门打开,再利用氮气将双链DNA吹入到微腔中,此时下基板上微腔处铺设好的多聚赖氨酸对双链DNA进行吸附,同时,荧光恢复,可对下基板进行荧光检测。
通过上述技术方案,本发明提供的基因检测芯片及检测方法具有如下有益效果:
1、本发明采用上基板和中间层两层基因芯片分别进行阀门控制和进样,同时对下基板上不同的区域铺设两种功能材料,此芯片在检测时通过控制阀门来控制流道内液体与不同功能材料的接触,可控性强,且前期无需对溶液进行混合,降低了目的基因损害的风险。
2、由于玻璃基底的特殊修饰,使得此芯片应用范围扩大。
3、此芯片上设置多组进样流道、微腔和出样流道,可同时检测多种目的基因,提高检测效率。
4、该检测方法操作简单,性能稳定,成本低。
5、本发明所需的待检测样本的量非常少,只有1ul左右,样本耗量少。
附图说明
为了更清楚地说明本发明实施例或现有技术中的技术方案,下面将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍。
图1为本发明实施例所公开的一种基因检测芯片整体结构示意图;
图2为本发明实施例所公开的上基板结构示意图;
图3为本发明实施例所公开的中间层结构示意图;
图4为本发明实施例所公开的下基板结构示意图。
图中,1、上基板;2、中间层;3、下基板;4、进样流道;5、微腔;6、出样流道;7、进样口;8、出样口;9、微腔控制流道;10、出样控制流道;11、微腔控制阀门;12、出样控制阀门。
具体实施方式
下面将结合本发明实施例中的附图,对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述。
本发明提供了一种基因检测芯片及检测方法,具体实施例如下:
如图1所示的一种基因检测芯片,包括相互粘合的上基板1、中间层2和下基板3。上基板1和中间层2为聚二甲基硅氧烷(PDMS)材料,下基板3为玻璃材料。上基板1和中间层2之间的粘合是靠同种材料之间的相互粘合,中间层2和下基板3之间的粘合是靠上基板1和中间层2的重力进行粘合。上基板1厚度为5mm,中间层2厚度为10um。
如图4所示,下基板3上与进样流道4贴合的区域铺设有氧化石墨烯(GO),与微腔贴合的区域铺设有多聚赖氨酸(PLL)。氧化石墨烯(GO)表面带有正电荷,可与带有荧光基团的目的基因(单链DNA)表面的负电荷相互吸附,从而将目的基因吸附在下基板3的表面。同时,氧化石墨烯(GO)还有荧光猝灭作用,可将目的基因携带的荧光暂时猝灭。多聚赖氨酸(PLL)可以吸附双链DNA。
如图3所示,中间层2与下基板3接触的一面刻有进样流道4和与进样流道4联通的微腔5,进样流道4上还连接有出样流道6,进样流道4上设有进样口7,出样流道6上设有出样口8,进样口7和出样口8分别位于中间层2的两端。进样流道4、微腔和出样流道6均为凹槽结构,不贯穿中间层2。
如图2所示,上基板1与中间层2接触的一面刻有微腔控制流道9和出样控制流道10,微腔控制流道9上设有微腔控制阀门11,出样控制流道10上设有出样控制阀门12,微腔控制阀门11位于进样流道4上靠近微腔5入口的位置上方,出样控制阀门12位于出样流道6上方。微腔控制阀门11和出样控制阀门12为具有一定体积深度的凹槽,当注入一定压力的液体后,凹槽内的液体会下沉,将中间层2的微腔入口处的进样流道4上方的PDMS材料压下,从而将微腔5入口切断;同理,中间层2的出样流道6上方的PDMS材料也会被压下,从而将出样流道6关闭。
本实施例中,中间层2上刻有多组进样流道4、微腔5和出样流道6,微腔控制流道9上设有多个微腔控制阀门11,出样控制流道10上设有多个出样控制阀门12。该芯片可以同时对多组样品进行检测。
一种基因检测芯片的检测方法,包括如下过程:
(1)对上基板1中的微腔控制流道9和出样控制流道10注入液体,以便后期通过氮气来控制微腔控制阀门11和出样控制阀门12的开启与关闭;
(2)将合成的带有荧光基团的目的基因(单链DNA)注入进样口7,此时上基板1上的微腔控制阀门11处于关闭状态,出样控制阀门12处于开启状态,采用氮气将进样口7中的带有荧光基团的目的基因经进样流道4和出样流道6吹到出样口8处,此时,下基板3上的氧化石墨烯(GO)表面的正电荷与目的基因表面的负电荷通过正负电相互吸附,带有荧光基团的目的基因被铺设到下基板3上进样流道4处,同时荧光基团被氧化石墨烯(GO)猝灭;
(3)带有荧光基团的目的基因与下基板3上提前铺设好的氧化石墨烯(GO)孵育一段时间后,从出样口8将多余的未被吸附的目的基因吸出,同时在进样口7注入缓冲液,从出样口8将缓冲液吸出,反复几次,对进样流道4进行冲洗,将多余的未被吸附的目的基因彻底清洗干净;
(4)然后将待测基因(互补miRNA)从进样口7注入,此时微腔控制阀门11和出样控制阀门12处于关闭状态,利用氮气将待测基因(互补miRNA)吹入到进样流道4内,待测基因与原先铺好的带有荧光基团的目的基因结合成双链DNA,由于氧化石墨烯只吸附单链,不吸附双链,因此,双链DNA悬浮于进样流道4内,然后微腔控制阀门11打开,再利用氮气将双链DNA吹入到微腔5中,此时下基板3上微腔5处铺设好的多聚赖氨酸对双链DNA进行吸附,同时,荧光恢复,可对下基板3进行荧光检测。
本发明的基因检测芯片,不仅检测出人体内是否存在此目的基因,同时能判断出所含有的浓度。通过此基因检测芯片,利用合成的目的基因,做出其对应的标准曲线,在后续的检测中,可以通过荧光值的强弱判断出体内含有的目的基因的浓度。对于一种目的基因而言,正常人和患者中都有可能存在,只是在正常人和患者中的含量不同,因此现有技术中单纯的检测有无此目的基因,在判断患病情况时有所欠缺。
对所公开的实施例的上述说明,使本领域专业技术人员能够实现或使用本发明。对这些实施例的多种修改对本领域的专业技术人员来说将是显而易见的,本文中所定义的一般原理可以在不脱离本发明的精神或范围的情况下,在其它实施例中实现。因此,本发明将不会被限制于本文所示的这些实施例,而是要符合与本文所公开的原理和新颖特点相一致的最宽的范围。
Claims (6)
1.一种基因检测芯片的检测方法,其特征在于,该基因检测芯片包括相互粘合的上基板、中间层和下基板,所述下基板上与进样流道贴合的区域铺设有氧化石墨烯,与微腔贴合的区域铺设有多聚赖氨酸;所述中间层与下基板接触的一面刻有进样流道和与进样流道联通的微腔,所述进样流道上还连接有出样流道,所述进样流道上设有进样口,所述出样流道上设有出样口;所述上基板与中间层接触的一面刻有微腔控制流道和出样控制流道,所述微腔控制流道上设有微腔控制阀门,所述出样控制流道上设有出样控制阀门,所述微腔控制阀门位于进样流道上靠近微腔入口的位置上方,所述出样控制阀门位于出样流道上方;
检测方法包括如下过程:
(1)对上基板中的微腔控制流道和出样控制流道注入液体,以便后期通过氮气来控制微腔控制阀门和出样控制阀门的开启与关闭;
(2)将合成的带有荧光基团的目的基因注入进样口,此时上基板上的微腔控制阀门处于关闭状态,出样控制阀门处于开启状态,采用氮气将进样口中的带有荧光基团的目的基因经进样流道和出样流道吹到出样口处,此时,下基板上的氧化石墨烯表面的正电荷与目的基因表面的负电荷通过正负电相互吸附,带有荧光基团的目的基因被铺设到下基板上进样流道处,同时荧光基团被氧化石墨烯猝灭;
(3)带有荧光基团的目的基因与下基板上提前铺设好的氧化石墨烯孵育一段时间后,从出样口将多余的未被吸附的目的基因吸出,同时在进样口注入缓冲液,从出样口将缓冲液吸出,反复几次,对进样流道进行冲洗,将多余的未被吸附的目的基因彻底清洗干净;
(4)然后将待测基因从进样口注入,此时微腔控制阀门和出样控制阀门处于关闭状态,利用氮气将待测基因吹入到进样流道内,待测基因与原先铺好的带有荧光基团的目的基因结合成双链DNA,由于氧化石墨烯只吸附单链,不吸附双链,因此,双链DNA悬浮于进样流道内,然后微腔控制阀门打开,再利用氮气将双链DNA吹入到微腔中,此时下基板上微腔处铺设好的多聚赖氨酸对双链DNA进行吸附,同时,荧光恢复,可对下基板进行荧光检测。
2.根据权利要求1所述的一种基因检测芯片的检测方法,其特征在于,所述上基板和中间层为聚二甲基硅氧烷材料,所述下基板为玻璃材料。
3.根据权利要求1所述的一种基因检测芯片的检测方法,其特征在于,所述上基板厚度为5mm,所述中间层厚度为10 um。
4.根据权利要求1所述的一种基因检测芯片的检测方法,其特征在于,所述进样口和出样口分别位于中间层的两端。
5.根据权利要求2所述的一种基因检测芯片的检测方法,其特征在于,所述上基板和中间层之间的粘合是靠同种材料之间的相互粘合,所述中间层和下基板之间的粘合是靠上基板和中间层的重力进行粘合。
6.根据权利要求1-5任一所述的一种基因检测芯片的检测方法,其特征在于,所述中间层上刻有多组进样流道、微腔和出样流道,所述微腔控制流道上设有多个微腔控制阀门,所述出样控制流道上设有多个出样控制阀门。
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