CN112940999A - 一种厦门链霉菌及其生物合成苯并吡喃类和4-氢喹啉类化合物的方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种厦门链霉菌及其生物合成苯并吡喃类和4‑氢喹啉类化合物的方法。所述厦门链霉菌通过将质粒pIB1884‑xim2转移至菌株Streptomyces xiamenensisΔximΔika中构建得到;所述厦门链霉菌含有厦门霉素合成相关基因,包括ximB、ximC、ximD和ximE基因。通过组成型表达这些基因,同时添加4羟基苯甲酸的类似物,在厦门链霉菌中合成苯并吡喃类化合物和4‑氢喹啉类化合物。苯并吡喃类化合物和4‑氢喹啉类化合物的产量分别为48.9mg/L、27.7mg/L和25.9mg/L。
Description
技术领域
本发明属于合成生物学领域,涉及一种厦门链霉菌及其生物合成苯并吡喃类和4-氢喹啉类化合物的方法。
背景技术
具有苯并吡喃骨架的化合物通常具有重要的生物活性。实验表明,厦门霉素B是厦门链霉菌产生的苯并吡喃类化合物。动物实验表明,其能够抑制纤维原细胞的收缩能力,并且能够很明显的减弱增生性瘢痕(Liu XJ,Xu MJ,Fan ST,et al.Xiamenmycin attenuateshypertrophic scars by suppressing local inflammation and the effects ofmechanical stress.J Invest Dermatol 2013,133(5):1351-60.)。目前,纤维化疾病以及心血管纤维化等已严重危害人类的健康。我们已证实厦门霉素是具有抗纤维化活性的新型小分子药物候选化合物。
在此基础上利用厦门霉素合成所需酶的底物多样性,进一步丰富厦门霉素结构多样性具有潜在的应用价值。
4-氢喹啉类化合物是一类重要的活性天然产物,是具有神经保护作用,具有治疗神经疾病的潜力(Nakagawa,A.,Iwai,Y.,Hashimoto,H.,Miyazaki,N.,Oiwa,R.,Takahashi,Y.,Hirano,A.,Shibukawa,N.,Kojima,Y.,and Omura,S.(1981)Virantmycin,ANew Antiviral Antibiotic Produced by A Strain of Streptomyces,J.Antibiot.(Tokyo)34,1408-1415;Kim,W.G.,Ryoo,I.J.,Park,J.S.,and Yoo,I.D.(2001)Benzastatins H and I,New Benzastatin Derivatives with Neuronal CellProtecting Activity from Streptomyces nitrosporeus,J.Antibiot.(Tokyo)54,513-516),近年来对该类化合物的合成和活性研究已成为热点(Tsutsumi,H.,Katsuyama,Y.,Izumikawa,M.,Takagi,M.,Fujie,M.,Satoh,N.,Shin-ya,K.,and Ohnishi,Y.(2018)Unprecedented Cyclization Catalyzed by a Cytochrome P450in BenzastatinBiosynthesis,J.Am.Chem.Soc.140,6631-6639)。
发明内容
针对现有技术中的缺陷,本发明的目的是一种厦门链霉菌及其生物合成苯并吡喃类和4-氢喹啉类化合物的方法。
本发明的目的是通过以下技术方案来实现的:
第一方面,本发明提供了一种厦门链霉菌,通过将质粒pIB1884-xim2转移至菌株Streptomyces xiamenensisΔximΔika中构建得到;所述厦门链霉菌含有厦门霉素合成相关基因;所述的厦门霉素相关基因包括ximB、ximC、ximD和ximE基因。
所述ximB为将4-羟基苯甲酸的类似物和牻牛儿基焦磷酸缩合为3-香叶草基-4-羟基苯甲酸类似物的基因;所述ximD和ximE为将3-香叶草基-4-羟基苯甲酸类似物转化为苯并吡喃类化合物和4-氢喹啉类化合物的基因;所述ximC为将分支酸裂解为4-羟基苯甲酸的基因。
优选地,所述质粒pIB1884-xim2的序列如SEQ ID NO.1所示。
优选地,所述质粒pIB1884-xim2的构建方法包括以下步骤:
S1、合成含有内源性组成型启动子18840p以及同尾酶的DNA片段,并克隆至pIB139的NsiI/EcoRI位点生成质粒pIB1884;
S2、以Streptomyces xiamenensis 318基因组为模板,扩增含厦门霉素合成基因ximB、ximC、XimD和XimE的目的片段;
S3、将步骤S2得到的目的片段与质粒pIB1884重组,然后转化,即得质粒pIB1884-xim2。
所述质粒pIB1884-xim2以质粒pIB139或pSET152(pIB139为pSET152衍生而来)为骨架,启动子为替换了原来的启动子ermEp*的18840p强启动子,复制子为自带的ColE1复制子,含有ximB、ximC、ximD和ximE基因。
优选地,步骤S2中,所述扩增采用的引物对序列如SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示。
优选地,所述菌株Streptomyces xiamenensisΔximΔika的构建方法包括以下步骤:
A1、以厦门链霉菌基因组DNA为模板,分别PCR扩增厦门霉素生物合成基因簇(xim)上下游的片段,然后通过酶切连接克隆至pJTU1278的XbaI/HindIII酶切位点,获得过渡质粒;然后以pIB139为模板,PCR扩增编码阿泊拉霉素的抗性基因aac(3)IV,克隆至前述过渡质粒的KpnI酶切位点从而获得基因敲除质粒pDxim,将质粒pDxim导入野生型厦门链霉菌318中,筛选得到基因簇xim被同框敲除菌株Δxim;
A2、以厦门链霉菌基因组DNA为模板,分别PCR扩增多环稠合大环内酰胺化合物合成基因簇(ika)上下游的片段以及一段包含attB位点的序列,然后隆至pJTU1278的XbaI/HindIII酶切位点获得过渡质粒;然后将编码阿泊拉霉素的抗性基因aac(3)IV克隆至该过渡质粒的KpnI酶切位点,从而获得基因敲除质粒pKIattB;
A3、将质粒pKIattB通过接合转移导入步骤A1得到的菌株Δxim中,筛选获得基因簇ika被attB替换的突变菌株,即得菌株Streptomyces xiamenensisΔximΔika。
第二方面,本发明提供了一种厦门链霉菌菌株在生产苯并吡喃类化合物和4-氢喹啉类化合物中的应用。
第三方面,本发明提供了一种苯并吡喃类化合物和4-氢喹啉类化合物的生产方法,包括以下步骤:将前述的厦门链霉菌株接入培养基中预培养,然后进行发酵培养并喂养相应4羟基苯甲酸类似物,培养后,萃取即得。
优选地,生产苯并吡喃类化合物时,所述发酵培养过程为:30℃,220rpm培养10天;且在培养1天后加入终浓度为110mg/L的2,4-二羟基苯甲酸或2-氯-4-羟基苯甲酸。
优选地,生产4-氢喹啉类化合物时,所述发酵培养过程为:30℃,220rpm培养10天;且在培养1天后加入终浓度为110mg/L的4-氨基苯甲酸。
优选地,所述预培养采用的培养基为含50μg/mL阿泊拉霉素的TSB培养基,培养36小时。
优选地,所述GYMO培养基的组成为:15g/L葡萄糖、10g/L酵母浸膏和15g/L麦芽浸膏,且包括50μg/mL阿泊拉霉素。
本发明的方法是将厦门霉素合成所需的四个基因,包括异戊烯基转移酶、分支酸裂解酶基因、单加氧酶和环化酶,导入厦门链霉菌ΔximΔika;通过组成型表达这四个基因,并添加4羟基苯甲酸,在厦门链霉菌中合成苯并吡喃类化合物和4-氢喹啉类化合物。本发明利用代谢工程技术构建的厦门链霉菌基因工程菌合成苯并吡喃类化合物和4-氢喹啉类化合物,产量分别为48.9mg/L、27.7mg/L和25.9mg/L。本发明第一次实现了厦门霉素B类似的苯并吡喃类衍生物和4-氢喹啉类化合物在厦门链霉菌中的生物合成。尤其是4-氢喹啉类化合物在厦门链霉菌中的生物合成是未见有任何报道的,而本发明通过构建厦门链霉菌基因工程菌,并采用特定培养方法从而得到了4-氢喹啉类化合物。
与现有技术相比,本发明具有如下的有益效果:
本发明利用了厦门霉素合成途径获得了稳定生产苯并吡喃类化合物和4-氢喹啉类化合物的厦门链霉菌菌株。本发明构建的微生物能够稳定产生苯并吡喃类化合物和4-氢喹啉类化合物,为后续进一步合成利用微生物生产苯并吡喃类化合物和4-氢喹啉类化合物奠定了基础,具有潜在的应用前景。
附图说明
通过阅读参照以下附图对非限制性实施例所作的详细描述,本发明的其它特征、目的和优点将会变得更明显:
图1是苯并吡喃类化合物(1和2)和4-氢喹啉类化合物(3)途径示意图;
图2是质粒pIB1884-xim2示意图;
图3是HPLC检测苯并吡喃类化合物(1和2)和4-氢喹啉类化合物(3)示意图;
图4是苯并吡喃类化合物(1和2)和4-氢喹啉类化合物(3)UPLC-MS检测示意图;其中,图4a为菌株XL01合成苯并吡喃类化合物(1)的MS图;图4b为菌株XL01合成苯并吡喃类化合物(2)的MS图;图4c为菌株XL01合成4-氢喹啉类化合物(3)的MS图;
图5是苯并吡喃类化合物(1和2)和4-氢喹啉类化合物(3)产量图。
具体实施方式
下面结合具体实施例对本发明进行详细说明。以下实施例将有助于本领域的技术人员进一步理解本发明,但不以任何形式限制本发明。应当指出的是,对本领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明构思的前提下,还可以做出若干变化和改进。这些都属于本发明的保护范围。
以下实施例中,所述质粒pIB139(参见文献Wilkinson CJ,Hughes-Thomas ZA,Martin CJ,Bohm I,Mironenko T,Deacon M,Wheatcroft M,Wirtz G,Staunton J,LeadlayPF.2002.Increasing the efficiency of heterologous promoters inactinomycetes.J Mol Microbiol Biotechnol 4:417–426.),大肠杆菌DH5α购买自TAKARA,大肠杆菌ET12567/pUZ8002(参见文献Kieser T,Bibb MJ,Buttner MJ,Chater KF,Hopwood DA.2000.Practical Streptomyces genetics.The John Innes Foundation,Norwich,United Kingdom.)。
实施例1苯并吡喃类化合物(1和2)和4-氢喹啉类化合物(3)合成途径质粒构建
质粒pIB1884-xim2由pIB139改造而来,含有同尾酶Xba I/Spe I酶切位点。质粒pIB1884-xim2(序列如SEQ ID NO.1所示)含有厦门霉素合成基因簇中的四个基因:来源于Streptomyces xiamenensis 318的ximB基因(4-羟基苯甲酸异戊烯基转移酶)、ximC基因(分支酸裂解酶)ximD基因(单加氧酶)和ximE基因(环化酶)。所有基因均以Streptomycesxiamenensis 318基因组为模板通过PCR扩增而来。
本发明所述的厦门霉素合成示意图如图1所示,所述3-香叶草基-4-羟基苯甲酸和厦门霉素异源合成示意图如图2所示。
实施例中构建质粒pIB1884-xim2的引物见表1:
表1引物列表
具体构建方法如下:
(1)质粒pIB1884-xim2的构建
含有内源性组成型启动子18840p以及同尾酶的DNA片段被合成,并且克隆至pIB139的NsiI/EcoRI位点生成pIB1884。然后使用引物pIB1884-xim2_F和pIB1884-xim2_F,以Streptomyces xiamenensis 318基因组为模板,扩增含厦门霉素合成基因ximB、ximC、XimD和XimE目的片段;PCR产物经回收后和线性化后的质粒pIB1884,按照目的片段:载体=1:1的摩尔比,一步克隆法重组后,转化大肠杆菌DH5α,挑取转化子验证后分别得到重组载体pIB1884-xim2(图2)。
实施例2苯并吡喃类化合物(1和2)和4-氢喹啉类化合物(3)生产菌株的构建
直接将质粒pIB1884-xim2转入通过热激钙转化法转至大肠杆菌ET12567/pUZ8002中,然后将含有质粒的大肠杆菌ET12567/pUZ8002和ΔximΔika菌株进行接合转移,将质粒pIB1884-xim2转移至菌株Streptomyces xiamenensisΔximΔika中,质粒pIB1884-xim2整合到菌株的染色体上,获得菌株XL01。
所述菌株Streptomyces xiamenensisΔximΔika的构建过程如下:
以厦门链霉菌基因组DNA为模板,分别PCR扩增厦门霉素生物合成基因簇(xim)上下游的片段作为上游同源臂UHA(1.8kb)和下游同源臂DHA(1.8kb),然后通过酶切连接克隆至pJTU1278(参见文献He Y,Wang Z,Bai L,Liang J,Zhou X,Deng Z.2010.Two pHZ1358-derivative vectors for efficient gene knockout in Streptomyces.J MicrobiolBiotechnol 20:678–682)的XbaI/HindIII酶切位点,获得过渡质粒;然后,以pIB139为模板,PCR扩增编码阿泊拉霉素的抗性基因aac(3)IV,然后克隆至该过渡质粒的KpnI酶切位点从而获得基因敲除质粒pDxim。将该质粒通过接合转移导入野生型厦门链霉菌318中,经过单交换验证,无抗松弛培养,PCR验证,筛选获得基因簇xim被同框敲除菌株Δxim。
再以厦门链霉菌基因组DNA为模板,分别PCR扩增多环稠合大环内酰胺化合物合成基因簇(ika)上下游的片段作为上游同源臂UHA(1571bp)和下游同源臂DHA(1611bp)以及一段包含attB位点的序列;然后,通过一步法克隆至pJTU1278的XbaI/HindIII酶切位点获得过渡质粒,然后将编码阿泊拉霉素的抗性基因aac(3)IV克隆至该过渡质粒的KpnI酶切位点,从而获得基因敲除质粒pKIattB。将该质粒通过接合转移导入突变菌株Δxim中,经过单交换验证,无抗松弛培养,PCR验证,筛选获得基因簇ika被attB替换的突变菌株ΔximΔika,即菌株Streptomyces xiamenensisΔximΔika。
构建基因敲除质粒pDxim所用引物序列如下:
XimUH_F(SEQ ID NO.4):GCTCTAGAgaccgctgcctttcggcgggttc
XimUH_R(SEQ ID NO.5):CGGAATTCCCGGGCAACGTTGCGCCATTATG
XimDH_F(SEQ ID NO.6):CGGAATTCccagacccggcgtacaggccttcg
XimDH_R(SEQ ID NO.7):CCCAAGCTT CGCACCGTCCCGATGATCGGCAC
apra_F(SEQ ID NO.8):GGGGTACCTGGTTCATGTGCAGCTCCATC
apra_R(SEQ ID NO.9):GGGGTACCTGAGCTCAGCCAATCGACTG
质粒pDxim序列如SEQ ID NO.10所示。
构建质粒pKIattB所用引物序列如下所示:
ikaUH_F(SEQ ID NO.11):
ggagctccaccgcggtggcggccgctctagaTGGGGATCATCGAGCCGGGTCTGCT
ikaUH_R(SEQ ID NO.12):GCCCAACACGCTGGCCCTTTCCGCT
ikaDH_F(SEQ ID NO.13):CGTGAGAATCCTTGGGTGATGGCGC
ikaDH_R(SEQ ID NO.14):
ccccctcgaggtcgacggtatcgataagcttGAGCGTCACCGTCAGGGTCAGGGCC
质粒pKIattB序列如SEQ ID NO.15所示。
实施例3摇瓶发酵生产苯并吡喃类化合物(1和2)和4-氢喹啉类化合物(3)
将菌株XL01在含50μg/mL阿泊拉霉素的TSB培养基中进行预培养,36小时后,将培养物以发酵培养基的10%的接种至三瓶100mL发酵培养基GYMO(组成为:15g/L葡萄糖、10g/L酵母浸膏和15g/L麦芽浸膏,且包括50μg/mL阿泊拉霉素。)中。30℃,220rpm培养24小时,添加终浓度为110mg/L的2,4-二羟基苯甲酸或2-氯-4-羟基苯甲酸或4-氨基苯甲酸,然后继续培养9天。取发酵液、乙酸乙酯萃取后HPLC检测。
HPLC条件如下:安捷伦C18反相柱(Extend-C18 reverse phase column Agilent,150x 4.6mm);溶剂A:水,含0.5‰三氟乙酸;溶剂B:乙腈,含0.5‰三氟乙酸;流动相:0-5min,25%乙腈;5-30min,25%-90%乙腈;30-35.1min,100%乙腈;35.1-43min,25%乙腈;流速:1mL/min;检测波长:190-800nm.
经HPLC检测(图3),在图3中,展示了以出发菌株ΔximΔika的发酵液为对照(图中的ΔximΔika),同时在XL01菌株发酵过程中不添加相应的4-羟基苯甲酸类似物作为对照(图中的XL01),当添加相应的4-羟基苯甲酸类似物时可以产生对应的苯并吡喃类化合物和4-氢喹啉类化合物。在培养后的重组菌株XL01中苯并吡喃类化合物(1和2)和4-氢喹啉类化合物(3)的产量分别为48.9mg/L、27.7mg/L和25.9mg/L(图5)。
苯并吡喃类化合物(1和2)和4-氢喹啉类化合物(3)的UPLC-MS检测结果如图4所示,其结果显示,XL01菌株成功合成苯并吡喃类化合物(1和2)和4-氢喹啉类化合物(3)。
结论:
在重组菌株中检测到苯并吡喃类化合物(1和2)和4-氢喹啉类化合物(3),证明利用厦门霉素合成基因簇在厦门链霉菌中合成苯并吡喃类化合物和4-氢喹啉类化合物是可行的。
以上对本发明的具体实施例进行了描述。需要理解的是,本发明并不局限于上述特定实施方式,本领域技术人员可以在权利要求的范围内做出各种变化或修改,这并不影响本发明的实质内容。在不冲突的情况下,本申请的实施例和实施例中的特征可以任意相互组合。
序列表
<110> 上海交通大学
<120> 一种厦门链霉菌及其生物合成苯并吡喃类和4-氢喹啉类化合物的方法
<130> KAG41473
<160> 15
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 10158
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 1
atctacgtct gtcgagaagt ttctgatcga aaagttcgac agcgtctccg acctgatgca 60
gctctcgcag ggcgaagaat ctcgtgcttt cagcttcgat gtaggagggc gtggatatgt 120
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tgacgacgcg ctcgccgccg aattggtcga gctcgcccga tccaccctgt cctggtacaa 1080
ggttccgcag gacgtcgtat ggctggacac actgccccgc aacggcaacg gcaaattgct 1140
gcgcagggta ctccgcgcac agggcgacga gttcatccag ccccatcgtc actatccggc 1200
gtcgaatgcg cctcgaacgt gaacacggtt cggcaaacac cgttaggaca aggcggcgtt 1260
gacgcaacgg cttactgcgc cgccaacgaa tcgatggccc atcaggaaga caccacagcc 1320
gacaaattga ggataacggg acgagatcgg cgcggcgcga acaaacgtgt ccgagatcac 1380
ggggaaaccg tgttagccga ggtgggcttt ctgcaagagt cacaacaata accctcgccc 1440
ggtcaggtga tcgatatttc cgctcaaccc tcgcagcaga gcacgcgata tcggttcgtc 1500
gtgccgagca tcgcggcgtc ggtcgtgccg agtgcgccga aggccgtcct cccctatcta 1560
caactggcgc gtatgcacgc gcccataggc agttggctgt acctcctccc cggcctgtgg 1620
gggatcgcgc tcgcctcggc ggggctgccc gactggcgcc aggtgctgct gttcacggtc 1680
ggtggggtgc tggtgcgcgg cttcggctgc gtcgtcaacg accttgccga ccgcaagttc 1740
gacgcccggg tggcacgtac cgtcgggagg ccgctcgtgg ccggtacggt cacggtcacg 1800
ggagcgcttg tcttcgccgt ggtgcaggcg gtggcggggc tgctcgtgct ggctgcggcc 1860
agcgttccgg cggcggtgtt cgtggccgcc tcctatccgc tcgtggtcgc gtacccgttc 1920
atgaagcgga tcacctactg gccgcaggcc tggctgggga tggtcttcgg ctgctacatc 1980
ctcgcgggtt ggctcgcggt ggccgggagg atcgagactc ccgcgctcct gctcttcgtc 2040
gccggtgtct tctggacgct ggggtacgac acgatctacg cccaccagga caaggcggac 2100
gacgtgcagg tgggggtgaa gtccctcgcg ctgcgcctcg gcagggcgac ccggccctgg 2160
gtcgccgggt tttacggggc gaccgtggtc gggatcgtgg ctgccggagc cgtcgccgat 2220
ctgcactgga cgttctacgc gctgtttctg ccgggcgtgg cacacctgct ctggcaggtg 2280
gtgacggtgg acatcgacag ccctgccgac tgccgggaaa agttcatggc aaaccgtttc 2340
ttcgggtggc tcgtgctcgt cgccatcgtt gcggggagag tcttttgagg cgcggccacg 2400
cggtcgcacc ggagcgacgg cggaggagat acatgtatgc aggcccctgg tccgtgcgca 2460
cggagtcgcg cagcctggcc cagttcgtgg cgctcttgcg ggagccggcg agtttggcca 2520
ccgaggtgct ggaggagtgg tgcggtgctc cggtcaccgc ggagatccgc caccgcgcgg 2580
atggccaatt actcgtcccg ccggctgagc ggacattcgg cgggggttcg gcgcaggcgg 2640
agcgagcccc cttcttaccg ccggagcggg tggccgaact gatgcggctc tcgacgggtg 2700
cccgtgtgca gttccgcacc gtttacctgc gcgccgggac cgaaaaggtc gtcaccgcgg 2760
gcgccgtcgt ggcgctcgag cgcataagcc ccgaggaaca cgccgtgctc agcaccacca 2820
acgcaccgct ggggccggtg ctggccgcgg gcggtggagt gcggcgcgtg atggtcacgt 2880
ccgaaccgac ccgcctcgac cccgccgtgc gaccgccctg cgacgccgac gctcccgtgc 2940
tgaccgtcac cgcgctgctg tgtcgtggaa ccatgcccgt cggcctcgtg cgggaggctt 3000
tcctgccgtg tctcctcgat cgagacgccg tccacgacgc atgagggatc ccatgccgaa 3060
ctctcccgcc gcggtcttcg agcggctcac caccaccgtc ccgccggtcc gcatcgaggt 3120
tcgtctcggc accgcctgcg tgctcggcgg cggcgtcgcc ggcctggtcg cggcccgcgt 3180
actcgcggac cacgccaacc gtgtcgtgat catcgagccc gacctgccgg aagccgcgct 3240
cagcggcgcg gctcgtcccg gcgtcccgca gggctcccag gtgcacctcc tgctgcccgg 3300
cggacgcgcg cagctcgaac gcttcttccc cggtgtcgtg gcagaggccc tcgccggggg 3360
tgctgtgtcg tgcggtccgg agcgcaccgc cacctacctc gacgacatcg agcagatcgc 3420
cacgcccaac gcgcggttcc tggggagcag tcgccccttc ctggagacgc tgatccgtcg 3480
gcgcgcgctc gcactgccca acgtcgagct ggtgagtgga cgcgtcattg ggctgcggta 3540
cgcgcgcggc gccgtcgagt cggtgcgcta cgcggttggc ggcgaccacg tcgtcgcccc 3600
agccgacttc gtcgtcgacg cctccggccg cggcagcagg ctgagtgact ggctggagca 3660
gggcggctgg ccccgaccgg agacgcaacg gctccagacc gacatccgct acttgtctgc 3720
ccgtttcacg cgctcggccg actgggacgg ccccctcagc ggcatctccc gctacagccc 3780
gcatttcccg aaggacatcg ccggagcggc ggtcaacccg atcgagaacc aacagtgggt 3840
ggtgatgctc gcccacttcg gcaacggcgc cgagggccgc acggccgacg agttcgtcgc 3900
ccggtgccgt gagctgccac cgatcttcca ggaagccgtc aagggcgaaa tcgtcggcga 3960
ggttgtcccg taccgccacc ccgacagcag gtggcgccac ttcgaggcgc tcgaccgctt 4020
ccccgcccgc ctggcggtcc tcggcgacgc cgtcgcctcg ttcaaccccc tgtacgggca 4080
aggtatgtcc tcggccgcgc tccacgcctc ctgcctgtcg gagttcctgc gctctggccc 4140
cgacctggac gccccggccc ggcacttcct cgagctggaa aaggtcgtcg tcgaagccgc 4200
gtggcagacg tccacggccg gcgacgccat ccggctgggc ctggcaacgc caccggccac 4260
cgatcagggg cggcggcagg cgtgggccct gcgacaggta cgggaggcag cgggccggga 4320
cgagcaggtc ggcacggccc tgcgggcggt ggggttcatg accgcccatc cggcgtcgct 4380
gatggcaccg gatttggtgc ttcgcgcggc gcgggtcaat ggtgtgccgg aggagcggat 4440
ccggcaggag tacacgatga tggagacgac gtgatgggcc agacgacgca cacagcactc 4500
gaccgctaca tggagctcgc cgaccgcgcc gtgcgggacc cctcggcgct ggcggagctc 4560
cccacgatct tcgcgcccga cgccaccgtg acgctgcgcg acgagccggt gaccggcatg 4620
cccgccatca tggagttcta ccgggtgttc gtggcggcgg tggccgagag caagcactac 4680
tggacaacca cgatcctcga ggacggcacg atcgagtcgc actgggtcgt cgcggcgcgc 4740
cgggccgacg gcagcctgat gaccgcagcc ggggtcgagc acgcgaccgt cgacaccgat 4800
gggttgatca cgaacctgcg caaccggtac acccgtacgc cgggctgaga attcaacttg 4860
aaaaagtggc accgagtcgg tgctaaaaaa aaaccccgcc cctgacaggg cggggttttt 4920
tttccggcct aactagtcgt aatcatgtca tagctgtttc ctgtgtgaaa ttgttatccg 4980
ctcacaattc cacacaacat acgagccgga agcataaagt gtaaagcctg gggtgcctaa 5040
tgagtgagct aactcacatt aattgcgttg cgctcactgc ccgctttcca gtcgggaaac 5100
ctgtcgtgcc agctgcatta atgaatcggc caacgcgcgg ggagaggcgg tttgcgtatt 5160
gggcgctctt ccgcttcctc gctcactgac tcgctgcgct cggtcgttcg gctgcggcga 5220
gcggtatcag ctcactcaaa ggcggtaata cggttatcca cagaatcagg ggataacgca 5280
ggaaagaaca tgtgagcaaa aggccagcaa aaggccagga accgtaaaaa ggccgcgttg 5340
ctggcgtttt tccataggct ccgcccccct gacgagcatc acaaaaatcg acgctcaagt 5400
cagaggtggc gaaacccgac aggactataa agataccagg cgtttccccc tggaagctcc 5460
ctcgtgcgct ctcctgttcc gaccctgccg cttaccggat acctgtccgc ctttctccct 5520
tcgggaagcg tggcgctttc tcatagctca cgctgtaggt atctcagttc ggtgtaggtc 5580
gttcgctcca agctgggctg tgtgcacgaa ccccccgttc agcccgaccg ctgcgcctta 5640
tccggtaact atcgtcttga gtccaacccg gtaagacacg acttatcgcc actggcagca 5700
gccactggta acaggattag cagagcgagg tatgtaggcg gtgctacaga gttcttgaag 5760
tggtggccta actacggcta cactagaaga acagtatttg gtatctgcgc tctgctgaag 5820
ccagttacct tcggaaaaag agttggtagc tcttgatccg gcaaacaaac caccgctggt 5880
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gatcctttga tcttttctac ggggtctgac gctcagtgga acgaaaactc acgttaaggg 6000
attttggtca tgagattatc aaaaaggatc ttcacctaga tccttttggt tcatgtgcag 6060
ctccatcagc aaaaggggat gataagttta tcaccaccga ctatttgcaa cagtgccgtt 6120
gatcgtgcta tgatcgactg atgtcatcag cggtggagtg caatgtcgtg caatacgaat 6180
ggcgaaaagc cgagctcatc ggtcagcttc tcaaccttgg ggttaccccc ggcggtgtgc 6240
tgctggtcca cagctccttc cgtagcgtcc ggcccctcga agatgggcca cttggactga 6300
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cggcagcggg gccacaggca gagcagatca tctctgatcc attgcccctg ccacctcact 6540
cgcctgcaag cccggtcgcc cgtgtccatg aactcgatgg gcaggtactt ctcctcggcg 6600
tgggacacga tgccaacacg acgctgcatc ttgccgagtt gatggcaaag gttccctatg 6660
gggtgccgag acactgcacc attcttcagg atggcaagtt ggtacgcgtc gattatctcg 6720
agaatgacca ctgctgtgag cgctttgcct tggcggacag gtggctcaag gagaagagcc 6780
ttcagaagga aggtccagtc ggtcatgcct ttgctcggtt gatccgctcc cgcgacattg 6840
tggcgacagc cctgggtcaa ctgggccgag atccgttgat cttcctgcat ccgccagagg 6900
cgggatgcga agaatgcgat gccgctcgcc agtcgattgg ctgagctcat gagcggagaa 6960
cgagatgacg ttggaggggc aaggtcgcgc tgattgctgg ggcaacacgt ggagcggatc 7020
ggggattgtc tttcttcagc tcgctgatga tatgctgacg ctcaatgccg tttggcctcc 7080
gactaacgaa aatcccgcat ttggacggct gatccgattg gcacggcgga cggcgaatgg 7140
cggagcagac gctcgtccgg gggcaatgag atatgaaaaa gcctgaactc accgcgacgt 7200
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tgctcgtcgg tgatgtactt caccagctcc gcgaagtcgc tcttcttgat ggagcgcatg 7320
gggacgtgct tggcaatcac gcgcaccccc cggccgtttt agcggctaaa aaagtcatgg 7380
ctctgccctc gggcggacca cgcccatcat gaccttgcca agctcgtcct gcttctcttc 7440
gatcttcgcc agcagggcga ggatcgtggc atcaccgaac cgcgccgtgc gcgggtcgtc 7500
ggtgagccag agtttcagca ggccgcccag gcggcccagg tcgccattga tgcgggccag 7560
ctcgcggacg tgctcatagt ccacgacgcc cgtgattttg tagccctggc cgacggccag 7620
caggtaggcc gacaggctca tgccggccgc cgccgccttt tcctcaatcg ctcttcgttc 7680
gtctggaagg cagtacacct tgataggtgg gctgcccttc ctggttggct tggtttcatc 7740
agccatccgc ttgccctcat ctgttacgcc ggcggtagcc ggccagcctc gcagagcagg 7800
attcccgttg agcaccgcca ggtgcgaata agggacagtg aagaaggaac acccgctcgc 7860
gggtgggcct acttcaccta tcctgcccgg ctgacgccgt tggatacacc aaggaaagtc 7920
tacacgaacc ctttggcaaa atcctgtata tcgtgcgaaa aaggatggat ataccgaaaa 7980
aatcgctata atgaccccga agcagggtta tgcagcggaa aagatccgtc gacctgcagg 8040
catgcaagct ctagcgattc cagacgtccc gaaggcgtgg cgcggcttcc ccgtgccgga 8100
gcaatcgccc tgggtgggtt acacgacgcc cctctatggc ccgtactgac ggacacaccg 8160
aagccccggc ggcaaccctc agcggatgcc ccggggcttc acgttttccc aggtcagaag 8220
cggttttcgg gagtagtgcc ccaactgggg taacctttga gttctctcag ttgggggcgt 8280
agggtcgccg acatgacaca aggggttgtg accggggtgg acacgtacgc gggtgcttac 8340
gaccgtcagt cgcgcgagcg cgagaattaa ttcgagcgca gcaagcccag cgacacagcg 8400
tagcgccaac gaagacaagg cggccgacct tcagcgcgaa gtcgagcgcg acgggggccg 8460
gttcaggttc gtcgggcatt tcagcgaagc gccgggcacg tcggcgttcg ggacggcgga 8520
gcgcccggag ttcgaacgca tcctgaacga atgccgcgcc gggcggctca acatgatcat 8580
tgtctatgac gtgtcgcgct tctcgcgcct gaaggtcatg gacgcgattc cgattgtctc 8640
ggaattgctc gccctgggcg tgacgattgt ttccactcag gaaggcgtct tccggcaggg 8700
aaacgtcatg gacctgattc acctgattat gcggctcgac gcgtcgcaca aagaatcttc 8760
gctgaagtcg gcgaagattc tcgacacgaa gaaccttcag cgcgaattgg gcgggtacgt 8820
cggcgggaag gcgccttacg gcttcgagct tgtttcggag acgaaggaga tcacgcgcaa 8880
cggccgaatg gtcaatgtcg tcatcaacaa gcttgcgcac tcgaccactc cccttaccgg 8940
acccttcgag ttcgagcccg acgtaatccg gtggtggtgg cgtgagatca agacgcacaa 9000
acaccttccc ttcaagccgg gcagtcaagc cgccattcac ccgggcagca tcacggggct 9060
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gggcttcgcc gctgaggtga tctacaagaa gaagccggac ggcacgccga ccacgaagat 9240
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accgatcatc gagcccgctg agtggtatga gcttcaggcg tggttggacg gcagggggcg 9360
cggcaagggg ctttcccggg ggcaagccat tctgtccgcc atggacaagc tgtactgcga 9420
gtgtggcgcc gtcatgactt cgaagcgcgg ggaagaatcg atcaaggact cttaccgctg 9480
ccgtcgccgg aaggtggtcg acccgtccgc acctgggcag cacgaaggca cgtgcaacgt 9540
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cgaaggcgac gaagagacgt tggcgcttct gtgggaagcc gcccgacgct tcggcaagct 9660
cactgaggcg cctgagaaga gcggcgaacg ggcgaacctt gttgcggagc gcgccgacgc 9720
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tggcaggaag cacttccgga agcaacaggc agcgctgacg ctccggcagc aaggggcgga 9840
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ccccgaagac gccgacgctg acccgaccgg ccctaagtcg tggtgggggc gcgcgtcagt 9960
agacgacaag cgcgtgttcg tcgggctctt cgtagacaag atcgttgtca cgaagtcgac 10020
tacgggcagg gggcagggaa cgcccatcga gaagcgcgct tcgatcacgt gggcgaagcc 10080
gccgaccgac gacgacgaag acgacgccca ggacggcacg gaagacgtag cggcgtagcg 10140
agacacccgg gaagcctg 10158
<210> 2
<211> 56
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 2
cggggatggg tggatactcg atggcggatc cggacacgag cctgcgcgcc tacgtc 56
<210> 3
<211> 56
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 3
cgactcggtg ccactttttc aagttgaatt ctcagcccgg cgtacgggtg taccgg 56
<210> 4
<211> 31
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 4
gctctagaga ccgctgcctt tcggcgggtt c 31
<210> 5
<211> 31
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 5
cggaattccc gggcaacgtt gcgccattat g 31
<210> 6
<211> 32
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 6
cggaattccc agacccggcg tacaggcctt cg 32
<210> 7
<211> 32
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 7
cccaagcttc gcaccgtccc gatgatcggc ac 32
<210> 8
<211> 29
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 8
ggggtacctg gttcatgtgc agctccatc 29
<210> 9
<211> 28
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 9
ggggtacctg agctcagcca atcgactg 28
<210> 10
<211> 13716
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 10
aattgcccaa tacgcaaacc gcctctcccc gcgcgttggc cgattcatta atgcagctgg 60
cacgacaggt ttcccgactg gaaagcgggc agtgagcgca acgcaattaa tgtgagttag 120
ctcactcatt aggcacccca ggctttacac tttatgcttc cggctcgtat gttgtgtgga 180
attgtgagcg gataacaatt tcacacagga aacagctatg accatgatta cgccaagcgc 240
gcaattaacc ctcactaaag ggaacaaaag ctggagctcc accgcggtgg cggccgctct 300
agagaccgct gcctttcggc gggttcaagc agtccggcat cggcagggag cacggaaccg 360
aggtcctcga cgcctacacc gagaccaaag ccgtcgtcgt caacctctga gcccggaacc 420
gagcccggcc ccgcggcgcc ccgctgacga agcaacgcca cggtgttccg gcccgcagcc 480
gctctggcgg acggccgcgg gttggaacct gaggggggag ataacagcgg tgccccgtga 540
acgtcggcgc gggctcctgg ccccggtacg cgggggcgaa gtcgcgggtg gcggcggtcc 600
ggcgccagct ggacgacgcg ctcggcccga tgtgcggcgg ctgcgatggc gccctcggcg 660
tcgaggccga tcacgaccac ttcaccgggc tgctacgcag gctcttatcc gaactagtac 720
tccagcagga tttcgctgtc tgagctgcgg gtttcggtga gcggctggag tgtagcgagt 780
ctggaatggt cgggggcggt ctcacggagg ccgcccctcg atcgtgtggc aacgtcgtag 840
tcggtggcag cgcgggggag attcttcgct acgtgatcac tgagagtgct gtcaagcaat 900
gggatcttga actgaacgac ctcttcgtgg ccatcggaca tcggttcggc cgtgtggagc 960
ttcgccgccg catgcgtgac tacgtacgcg ggctgctcgc cccggtgagc cggaagaaca 1020
gctggcagct ggccgagcag gcgggccact ccactcccga cggcctgcag cacctgctcg 1080
ccggcgcgaa gtgggagtcc gacgatatcc gcgatgacct gcaggaatac gtcgccgaca 1140
agctcggcga agacagcggg gtcctcatca tcgacgacac cgggttcatc aagaagggca 1200
cagcctccgc cggggtacag cggcagtact cgggcaccgc cggccgtacg gagaactgcc 1260
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acgatcggga gttcgccacc aagggcgaac tggccagacg catggtgctg cgggccctcg 1440
cctcgccact gcccatccgc tgggtcactg cggatgccgc ctacggacag gagagccgct 1500
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gccagcgccg gggcgggctg ttcacgcaac ggatcctgat tgtcgccgca gggttcgccg 2580
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gcgtgttgtg gtgatcggca gcggggtcat gggcctgtcc gtcgcagtac tgctcgccga 2700
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gggcgaacgt tccacatcct gtcctcgctg gcgtcccagg aacgcagcgg agttcacatg 2880
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ttcgtcgaag cgaccggtgg aggggaggag gcgttgtaca ttttcccgca gtccgacgaa 3300
ggcacggtca tcctcggcgg caccgcctac gagaaccagt ggtcactgac acccgacccg 3360
gcaatcacca agcgcaacat cgaccgctgc gctgagatcc accctgccct cggcgatgcc 3420
cgagtcattg aggagcgggt gggtcttcgc ccctatcgct cccacgtccg ggtcgagcgg 3480
caggacctcc ccgatggtct cgtctgtgtt cactgctacg gccacggagg ctccggtgtc 3540
accgtctcct tggccagcgc cgaagcggca gtccgtctgc tccggcaggc ttagccaacc 3600
cccccttgct ccatcacatt tgggtaggtt ggacccggcg gccgggaggc agtgggcggg 3660
gatggggatc aggctgcggc cctgggcggc cccggtgggg tcggggccgg cctcgggtca 3720
gggcgcggtg ccctgacagg tgacgatggc gtaggccccg ctgctggtgg tcgtggtgac 3780
gacggtgccg tccacggcga tggtgcacgt gatggtgccg tggccctggt tctgggccga 3840
gacgtacagc tggtcgccga tgcccgcggt ggtggtgatg gcggaggtgc cgatcatcgg 3900
gacggtgcga agcttatcga taccgtcgac ctcgaggggg ggcccggtac ctggttcatg 3960
tgcagctcca tcagcaaaag gggatgataa gtttatcacc accgactatt tgcaacagtg 4020
ccgttgatcg tgctatgatc gactgatgtc atcagcggtg gagtgcaatg tcgtgcaata 4080
cgaatggcga aaagccgagc tcatcggtca gcttctcaac cttggggtta cccccggcgg 4140
tgtgctgctg gtccacagct ccttccgtag cgtccggccc ctcgaagatg ggccacttgg 4200
actgatcgag gccctgcgtg ctgcgctggg tccgggaggg acgctcgtca tgccctcgtg 4260
gtcaggtctg gacgacgagc cgttcgatcc tgccacgtcg cccgttacac cggaccttgg 4320
agttgtctct gacacattct ggcgcctgcc aaatgtaaag cgcagcgccc atccatttgc 4380
ctttgcggca gcggggccac aggcagagca gatcatctct gatccattgc ccctgccacc 4440
tcactcgcct gcaagcccgg tcgcccgtgt ccatgaactc gatgggcagg tacttctcct 4500
cggcgtggga cacgatgcca acacgacgct gcatcttgcc gagttgatgg caaaggttcc 4560
ctatggggtg ccgagacact gcaccattct tcaggatggc aagttggtac gcgtcgatta 4620
tctcgagaat gaccactgct gtgagcgctt tgccttggcg gacaggtggc tcaaggagaa 4680
gagccttcag aaggaaggtc cagtcggtca tgcctttgct cggttgatcc gctcccgcga 4740
cattgtggcg acagccctgg gtcaactggg ccgagatccg ttgatcttcc tgcatccgcc 4800
agaggcggga tgcgaagaat gcgatgccgc tcgccagtcg attggctgag ctcaggtacc 4860
caattcgccc tatagtgagt cgtattacgc gcgctcactg gccgtcgttt tacaacgtcg 4920
tgactgggaa aaccctggcg ttacccaact taatcgcctt gcagcacatc cccctttcgc 4980
cagctggcgt aatagcgaag aggcccgcac cgatcgccct tcccaacagt tgcgcagcct 5040
gaatggcgaa tggcaattct tgaagacgaa agggcctcgt gatacgccta tttttatagg 5100
ttaatgtcat gataataatg gtttcttaga cgtcaggtgg cacttttcgg ggaaatgtgc 5160
gcggaacccc tatttgttta tttttctaaa tacattcaaa tatgtatccg ctcatgagac 5220
aataaccctg ataaatgctt caataatatt gaaaaaggaa gagtatgagt attcaacatt 5280
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aactggatct caacagcggt aagatccttg agagttttcg ccccgaagaa cgttttccaa 5460
tgatgagcac ttttaaagtt ctgctatgtg gcgcggtatt atcccgtgtt gacgccgggc 5520
aagagcaact cggtcgccgc atacactatt ctcagaatga cttggttgag tactcaccag 5580
tcacagaaaa gcatcttacg gatggcatga cagtaagaga attatgcagt gctgccataa 5640
ccatgagtga taacactgcg gccaacttac ttctgacaac gatcggagga ccgaaggagc 5700
taaccgcttt tttgcacaac atgggggatc atgtaactcg ccttgatcgt tgggaaccgg 5760
agctgaatga agccatacca aacgacgagc gtgacaccac gatgcctgca gcaatggcaa 5820
caacgttgcg caaactatta actggcgaac tacttactct agcttcccgg caacaattaa 5880
tagactggat ggaggcggat aaagttgcag gaccacttct gcgctcggcc cttccggctg 5940
gctggtttat tgctgataaa tctggagccg gtgagcgtgg gtctcgcggt atcattgcag 6000
cactggggcc agatggtaag ccctcccgta tcgtagttat ctacacgacg gggagtcagg 6060
caactatgga tgaacgaaat agacagatcg ctgagatagg tgcctcactg attaagcatt 6120
ggtaactgtc agaccaagtt tactcatata tactttagat tgatttaaaa cttcattttt 6180
aatttaaaag gatctaggtg aagatccttt ttgataatct catgaccaaa atcccttaac 6240
gtgagttttc gttccactga gcgtcagacc ccgtagaaaa gatcaaagga tcttcttgag 6300
atcctttttt tctgcgcgta atctgctgct tgcaaacaaa aaaaccaccg ctaccagcgg 6360
tggtttgttt gccggatcaa gagctaccaa ctctttttcc gaaggtaact ggcttcagca 6420
gagcgcagat accaaatact gtccttctag tgtagccgta gttaggccac cacttcaaga 6480
actctgtagc accgcctaca tacctcgctc tgctaatcct gttaccagtg gctgctgcca 6540
gtggcgataa gtcgtgtctt accgggttgg actcaagacg atagttaccg gataaggcgc 6600
agcggtcggg ctgaacgggg ggttcgtgca cacagcccag cttggagcga acgacctaca 6660
ccgaactgag atacctacag cgtgagctat gagaaagcgc cacgcttccc gaagggagaa 6720
aggcggacag gtatccggta agcggcaggg tcggaacagg agagcgcacg agggagcttc 6780
cagggggaaa cgcctggtat ctttatagtc ctgtcgggtt tcgccacctc tgacttgagc 6840
gtcgattttt gtgatgctcg tcaggggggc ggagcctatg gaaaaacgcc agcaacgcgg 6900
cctttttacg gttcctggcc ttttgctggc cttttgctgg ccttttgctc acatgttctt 6960
tcctgcgtta tcccctgatt ctgtggataa ccgtattacc gcctttgagt gagctgatac 7020
cgctcgccgc agccgaacga ccgagcgcag cgagtcagtg agcgaggaag cggaagagcg 7080
ctgacttccg cgtttccaga ctttacgaaa cacggaaacc gaagaccatt catgttgttg 7140
ctcaggtcgc agacgttttg cagcagcagt cgcttcacgt tcgctcgcgt atcggtgatt 7200
cattctgcta accagtaagg caaccccgcc agcctagccg ggtcctcaac gacaggagca 7260
cgatcatgcg cacccgtcag atccagacat gataagatac attgatgagt ttggacaaac 7320
cacaactaga atgcagtgaa aaaaatgctt tatttgtgaa atttgtgatg ctattgcttt 7380
atttgtaacc attataagct gcaataaaca agttcccgca cgatcagcgt cccgccgacc 7440
aggagcagtg cggccagcac tgccgctaac gcctggtcct ggtcccggtc ctggtggtgc 7500
atcagtcctc cccgtgatca cttcggcacc caccgtagtg atcacccccg acagcggatc 7560
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tctgggacgg gccggacggc agggggaccg gcggccgggc gagctgcagc cgggggtccg 7680
gcagggccgg agcgggcgga accgtgctct gacctgcggc ccgagtttcg tcacgtgacg 7740
gaatggaagg ctgctgcatt tcgtcacgtg acgtatctcg gcgagcgact gccgacgcca 7800
cggcggacac gatcgcctcg cgctggcgcc gggcctcgta cgcccgctgg cggcaggagc 7860
ggcggcagta gtcccggctc cggccgacgc cggattgctt gatctccgag ccgcaccagg 7920
cgcagagctt cgcgccgtcg gcgtccctgg gggtggtggt gctcatggcc gacgaccgta 7980
cgcggcacgt ctcgtagcga ggcgagtcgg gcgcgagcgc ctgcacgaag tgccggcggg 8040
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tcctcgcggc gctgggcgag ggcggcgagc atgtcggcgt acgcctcggc cacctccccc 8340
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cgcagctccc cgccgtcggc gtcggccgcc aggagcagat cgaggtcgtc ggcctcggtg 8580
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ccccgggttg cccgctcgta ctcgtgccag cgcgagaggt tccactccag cgagccgacc 8700
ccggcggcgt cgtcctcggt catgccgccg gtcaggtccc cgatccgtcc gaggagttcg 8760
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aggctgtcgc ctctcgggct ctccccatcc accccgtccg gagaaaccgc aggtcggagg 9720
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cgcgtcacac gcgcgatcgc ccgcttcgct gccatccggc agcggtctga gcagtagata 9840
cgcggccgtt tgcccggtgt gtgggcaatt gcggtcccgc agtggcagcg gggcccggcg 9900
ggccgatctg gcaatgcctc ggcatcgctc cgtactctgg gcacgagcaa cgttcctgtc 9960
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gttgctcttt ggtctggtgg gaatcctggc accaatcggg ccagaggttc cctccgccac 10080
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cggcggggct ttgacgtgcg gtcagtgcgt gtgtcggcga gcgatggcca cgaggccctg 10200
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ccagccaccg ccgttgtggg tcctggacca ggttcacggt cccctcggtc aggcgtccgt 10320
cgaagtcggt catggtcggt ctcctggtgg gtgggggcgg ggcgccagca cgaagtgccg 10380
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gactgagttg gacaccatcg caaatccgtc cgatcccgcg gtgcagcgga tcatcgatgt 10860
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ttccgtgaag gaactcgggg acaatccgga tcggctggcc ttgctgttcg gcagcgaaaa 11460
gggtgggcct tccgacctgt tcgaggaggc gtcttccgcc tcggtttcca tccccatgat 11520
gagccagacc gagtctctca acgtttccgt ttccctcgga atcgcgctgc acgagaggat 11580
cgacaggaat ctcgcggcca accgataagc gcctctgttc ctcggacgct cggttcctcg 11640
acctcgattc gtcagtgatg atcagacgtc gaaggtgtag tgccgggtgt ggtccagcag 11700
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catcgtgcct ccccactcct gcagatccct gcaggtcgac ggatcttttc cgctgcataa 11820
ccctgcttcg gggtcattat agcgattttt tcggtatatc catccttttt cgcacgatat 11880
acaggatttt gccaaagggt tcgtgtagac tttccttggt gtatccaacg gcgtcagccg 11940
ggcaggatag gtgaagtagg cccacccgcg agcgggtgtt ccttcttcac tgtcccttat 12000
tcgcacctgg cggtgctcaa cgggaatcct gctctgcgag gctggccggc taccgccggc 12060
gtaacagatg agggcaagcg gatggctgat gaaaccaagc caaccaggaa gggcagccca 12120
cctatcaagg tgtactgcct tccagacgaa cgaagagcga ttgaggaaaa ggcggcggcg 12180
gccggcatga gcctgtcggc ctacctgctg gccgtcggcc agggctacaa aatcacgggc 12240
gtcgtggact atgagcacgt ccgcgagctg gcccgcatca atggcgacct gggccgcctg 12300
ggcggcctgc tgaaactctg gctcaccgac gacccgcgca cggcgcggtt cggtgatgcc 12360
acgatcctcg ccctgctggc gaagatcgaa gagaagcagg acgagcttgg caaggtcatg 12420
atgggcgtgg tccgcccgag ggcagagcca tgactttttt agccgctaaa acggccgggg 12480
ggtgcgcgtg attgccaagc acgtccccat gcgctccatc aagaagagcg acttcgcgga 12540
gctggtgaag tacatcaccg acgagcaagg caagaccgat ccccggggac ctgcaggtcg 12600
actctagcta gacacgtctg aagctagctt cgaggaactt tcggcggctt tgctgtgcga 12660
caggctcacg tctaaaagga aataaatcat gggtcataaa attatcacgt tgtccggcgc 12720
ggcgacggat gttctgtatg cgctgttttt ccgtggcgcg ttgctgtctg gtgatctgcc 12780
ttctaaatct ggcacagccg aattgcgcga gcttggtttt gctgaaacca gacacacagc 12840
aactgaatac cagaaagaaa atcactttac ctttctgaca tcagaagggc agaaatttgc 12900
cgttgaacac ctggtcaata cgcgttttgg tgagcagcaa tattgcgctt cgatgacgct 12960
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tcgtgacacc gtctccttcg aacttattcg caatggagtg tcattcatca aggacgccgc 13080
tatcgcaaat ggtgctatcc acgcagcggc aatcgaaaca cctcagccgg tgaccaatat 13140
ctacaacatc agccttggta tccagcgtga tgagccagcg cagaacaagg taaccgtcag 13200
tgccgataag ttcaaagtta aacctggtgt tgataccaac attgaaacgt tgatcgaaaa 13260
cgcgctgaaa aacgctgctg aatgtgcggc gctggatgtc acaaagcaaa tggcagcaga 13320
caagaaagcg atggatgaac tggcttccta tgtccgcacg gccatcatga tggaatgttt 13380
ccccggtggt gttatctggc agcagtgccg tcgatagtat gcaattgata attattatca 13440
tttgcgggtc ctttccggcg atccgccttg ttacggggcg gcgacctcgc gggttttcgc 13500
tatttatgaa aattttccgg tttaaggcgt ttccgttctt cttcgtcata acttaatgtt 13560
tttatttaaa ataccctctg aaaagaaagg aaacgacagg tgctgaaagc gagctttttg 13620
gcctctgtcg tttcctttct ctgtttttgt ccgtggaatg aacaatggaa gtcaacaaaa 13680
agcagagctt atcgatgata agcggtcaaa catgag 13716
<210> 11
<211> 56
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 11
ggagctccac cgcggtggcg gccgctctag atggggatca tcgagccggg tctgct 56
<210> 12
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 12
gcccaacacg ctggcccttt ccgct 25
<210> 13
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 13
cgtgagaatc cttgggtgat ggcgc 25
<210> 14
<211> 56
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 14
ccccctcgag gtcgacggta tcgataagct tgagcgtcac cgtcagggtc agggcc 56
<210> 15
<211> 14441
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 15
aattgcccaa tacgcaaacc gcctctcccc gcgcgttggc cgattcatta atgcagctgg 60
cacgacaggt ttcccgactg gaaagcgggc agtgagcgca acgcaattaa tgtgagttag 120
ctcactcatt aggcacccca ggctttacac tttatgcttc cggctcgtat gttgtgtgga 180
attgtgagcg gataacaatt tcacacagga aacagctatg accatgatta cgccaagcgc 240
gcaattaacc ctcactaaag ggaacaaaag ctggagctcc accgcggtgg cggccgctct 300
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gcgcatgcca cctgtccccc gagcgtccgc gcggtggacc tcgggcatgt cctggttctc 540
atcaactacc gttctggcag ggcacaatgc ctcctgcccg ccgctgcgcc gcggtggtgt 600
gccgcagccc gtaccggcga cctcacccca ctcggagaca cgctcaccag ccgtttgctc 660
gacctgggtc tgattgttcc cacagagcac ccccagccgt ggcccgtccc catcccggcc 720
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gtccctctgc gctctgttgt ccgagcgggc gcggctctcg cccgggtctt catggtcacc 840
agggggactc agggcatgca gcggatcatc tccctgctca actacgccaa caccaatgtc 900
cgctgcaacc gcccggctac cgaggccgaa gccaccgccg ccgtgcaggc ggtccgccgg 960
gcaggctggt actcgccggg cagaaccgcg tgtctggagg agtcggctgc cgccctgctg 1020
ctgctggccg ctcagggccg cagggcccag tggtgtcatg gcgtcgcgcc agacccggtg 1080
cggctccatg cctgggtgca gactgtggac ggcgccaccg tcgccgagcc ggggtccacc 1140
ggcgcctaca cccccgtcct caccatcgga gaccgccatc agcaccccga ctgacccgat 1200
tctgtggctg cgcaacgaga agtgcggcct cggcccgtac cgtaccgacc tcgtcgagac 1260
ctactggcgg tgggagcagg acccagccct catgatcgga tacggccgcc aggcccccga 1320
aagtctcgac gccaggaccg agggcatgcg ccggcagcag ggcggcgaca atatccgctt 1380
caccctctac gacctcacca ccggcggtga gccgacgccg gccggggtgg ccactctgct 1440
gcccgaccac agcgtccgct gtgcggagta tgtcgtcatg ctcggcaacg agttccgcgg 1500
gcacggcctg gggacggccg ccacccggct cgttctggac tacgcctggc acgtcacgaa 1560
cctgcggatg gtctggctct ccgtcctcgc cccgaacgcc gccgcgatcc gcgcctacga 1620
gaacgcgggc ttccaaccgg ccggccgact tcgtcaggcc gggtactggc gaggcaagcc 1680
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cggtcatcca ctgggtgtcg ccgtccttga tgacgccgcc accgccctcg gagtcctggt 1980
ggacgaaggt gccgtccagg aggtacgtga cggtctcgaa gccgcggtgc gggtgccagg 2040
gggtgccctt ggcctcgccg gcggcgtact ccacctcgcc catctggtcc atcatgatga 2100
acgggtcgag gtgccggtag ttgatgcccg cgaaggcgcg gcggaccggg aagccctccc 2160
cttcgaagcc ggtgggcgcg gtggtgacgg tgagcacctt gcgggccggc acgggggtgt 2220
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gcgtcgaatt ccgcgccgga ggagctttcc agctccgcca tttcctcgtc cgacatcatg 2820
ccggtcatgt cgtgcccgcc gtggtccgcc ggctcggcgt cccagtcgga gagccacgac 2880
cggagcgtgt cgatctccgg cccctgggcc tgttcgatga cggcggccag atcccgcacc 2940
gcgtccgagc cggcgcgccc ggcggcgagt tcggacatct cgatggcctg ctcgtggtgc 3000
gggatcatgc cctggacgaa ggcgagatcc gccgcgttga aggcgtcgga gaccggtgcg 3060
ccgccgtgct gggaatgtcc gcccggctca ccggaatcgc tcccgcagcc ggcggtgaac 3120
agcaatgcgg aggtgacggc ggcggcgctg agcgcccgcg ccgcgaaacg gtacgaggtc 3180
atggtggtga aacagctttc tgtgcagtgc tgaggtgtcg gacgcgtcgg tgcacgacgc 3240
gcctatatgc gcagcgactg cagagaactc aaggaaggcg gcgcgccgcc cccagcctcc 3300
ggccgggggt gcccccaggg cgggccgggc ccggcgaact cccgcgcggc gacgaccggc 3360
ggcaccgtga ccccactggt cacccccgcc ccggcgccga ccggggacgg cgccccgccg 3420
accccacccg ccacacagtc cggatcggcg tggtcgagat gcgccgcgcc accggcgtcg 3480
tgcgcgggcg cggcggcctc cgtgtgatgc gcgggggaga tgacgacccc cggcgcgagc 3540
gcgtgcatgg cgaacacccc ggcgagtacc gccaggatca gcagcgcgcc acggacccgg 3600
ttcacgccca ccatcctacg ggggtacccc cggtgggtac ccgagggggg tccgaaggag 3660
cggtaagggg taccgcccac ggtgccgcta tacacggaac gtagagttgt ccgaccgtcc 3720
ggcaggcccg ggcgtggggg agaagacgac cgttccacct gggggggatt cccgttccat 3780
gcgactcaac aagcccgcaa ccgccgtcgc ggcggccctg accctgacgg tgacgctcaa 3840
gcttatcgat accgtcgacc tcgagggggg gcccggtacc tggttcatgt gcagctccat 3900
cagcaaaagg ggatgataag tttatcacca ccgactattt gcaacagtgc cgttgatcgt 3960
gctatgatcg actgatgtca tcagcggtgg agtgcaatgt cgtgcaatac gaatggcgaa 4020
aagccgagct catcggtcag cttctcaacc ttggggttac ccccggcggt gtgctgctgg 4080
tccacagctc cttccgtagc gtccggcccc tcgaagatgg gccacttgga ctgatcgagg 4140
ccctgcgtgc tgcgctgggt ccgggaggga cgctcgtcat gccctcgtgg tcaggtctgg 4200
acgacgagcc gttcgatcct gccacgtcgc ccgttacacc ggaccttgga gttgtctctg 4260
acacattctg gcgcctgcca aatgtaaagc gcagcgccca tccatttgcc tttgcggcag 4320
cggggccaca ggcagagcag atcatctctg atccattgcc cctgccacct cactcgcctg 4380
caagcccggt cgcccgtgtc catgaactcg atgggcaggt acttctcctc ggcgtgggac 4440
acgatgccaa cacgacgctg catcttgccg agttgatggc aaaggttccc tatggggtgc 4500
cgagacactg caccattctt caggatggca agttggtacg cgtcgattat ctcgagaatg 4560
accactgctg tgagcgcttt gccttggcgg acaggtggct caaggagaag agccttcaga 4620
aggaaggtcc agtcggtcat gcctttgctc ggttgatccg ctcccgcgac attgtggcga 4680
cagccctggg tcaactgggc cgagatccgt tgatcttcct gcatccgcca gaggcgggat 4740
gcgaagaatg cgatgccgct cgccagtcga ttggctgagc tcaggtaccc aattcgccct 4800
atagtgagtc gtattacgcg cgctcactgg ccgtcgtttt acaacgtcgt gactgggaaa 4860
accctggcgt tacccaactt aatcgccttg cagcacatcc ccctttcgcc agctggcgta 4920
atagcgaaga ggcccgcacc gatcgccctt cccaacagtt gcgcagcctg aatggcgaat 4980
ggcaattctt gaagacgaaa gggcctcgtg atacgcctat ttttataggt taatgtcatg 5040
ataataatgg tttcttagac gtcaggtggc acttttcggg gaaatgtgcg cggaacccct 5100
atttgtttat ttttctaaat acattcaaat atgtatccgc tcatgagaca ataaccctga 5160
taaatgcttc aataatattg aaaaaggaag agtatgagta ttcaacattt ccgtgtcgcc 5220
cttattccct tttttgcggc attttgcctt cctgtttttg ctcacccaga aacgctggtg 5280
aaagtaaaag atgctgaaga tcagttgggt gcacgagtgg gttacatcga actggatctc 5340
aacagcggta agatccttga gagttttcgc cccgaagaac gttttccaat gatgagcact 5400
tttaaagttc tgctatgtgg cgcggtatta tcccgtgttg acgccgggca agagcaactc 5460
ggtcgccgca tacactattc tcagaatgac ttggttgagt actcaccagt cacagaaaag 5520
catcttacgg atggcatgac agtaagagaa ttatgcagtg ctgccataac catgagtgat 5580
aacactgcgg ccaacttact tctgacaacg atcggaggac cgaaggagct aaccgctttt 5640
ttgcacaaca tgggggatca tgtaactcgc cttgatcgtt gggaaccgga gctgaatgaa 5700
gccataccaa acgacgagcg tgacaccacg atgcctgcag caatggcaac aacgttgcgc 5760
aaactattaa ctggcgaact acttactcta gcttcccggc aacaattaat agactggatg 5820
gaggcggata aagttgcagg accacttctg cgctcggccc ttccggctgg ctggtttatt 5880
gctgataaat ctggagccgg tgagcgtggg tctcgcggta tcattgcagc actggggcca 5940
gatggtaagc cctcccgtat cgtagttatc tacacgacgg ggagtcaggc aactatggat 6000
gaacgaaata gacagatcgc tgagataggt gcctcactga ttaagcattg gtaactgtca 6060
gaccaagttt actcatatat actttagatt gatttaaaac ttcattttta atttaaaagg 6120
atctaggtga agatcctttt tgataatctc atgaccaaaa tcccttaacg tgagttttcg 6180
ttccactgag cgtcagaccc cgtagaaaag atcaaaggat cttcttgaga tccttttttt 6240
ctgcgcgtaa tctgctgctt gcaaacaaaa aaaccaccgc taccagcggt ggtttgtttg 6300
ccggatcaag agctaccaac tctttttccg aaggtaactg gcttcagcag agcgcagata 6360
ccaaatactg tccttctagt gtagccgtag ttaggccacc acttcaagaa ctctgtagca 6420
ccgcctacat acctcgctct gctaatcctg ttaccagtgg ctgctgccag tggcgataag 6480
tcgtgtctta ccgggttgga ctcaagacga tagttaccgg ataaggcgca gcggtcgggc 6540
tgaacggggg gttcgtgcac acagcccagc ttggagcgaa cgacctacac cgaactgaga 6600
tacctacagc gtgagctatg agaaagcgcc acgcttcccg aagggagaaa ggcggacagg 6660
tatccggtaa gcggcagggt cggaacagga gagcgcacga gggagcttcc agggggaaac 6720
gcctggtatc tttatagtcc tgtcgggttt cgccacctct gacttgagcg tcgatttttg 6780
tgatgctcgt caggggggcg gagcctatgg aaaaacgcca gcaacgcggc ctttttacgg 6840
ttcctggcct tttgctggcc ttttgctggc cttttgctca catgttcttt cctgcgttat 6900
cccctgattc tgtggataac cgtattaccg cctttgagtg agctgatacc gctcgccgca 6960
gccgaacgac cgagcgcagc gagtcagtga gcgaggaagc ggaagagcgc tgacttccgc 7020
gtttccagac tttacgaaac acggaaaccg aagaccattc atgttgttgc tcaggtcgca 7080
gacgttttgc agcagcagtc gcttcacgtt cgctcgcgta tcggtgattc attctgctaa 7140
ccagtaaggc aaccccgcca gcctagccgg gtcctcaacg acaggagcac gatcatgcgc 7200
acccgtcaga tccagacatg ataagataca ttgatgagtt tggacaaacc acaactagaa 7260
tgcagtgaaa aaaatgcttt atttgtgaaa tttgtgatgc tattgcttta tttgtaacca 7320
ttataagctg caataaacaa gttcccgcac gatcagcgtc ccgccgacca ggagcagtgc 7380
ggccagcact gccgctaacg cctggtcctg gtcccggtcc tggtggtgca tcagtcctcc 7440
ccgtgatcac ttcggcaccc accgtagtga tcacccccga cagcggatca aggggtttgc 7500
gggtcccggt cggcgccggg cgggggaggc aggagccgcc gacgctgcct ctgggacggg 7560
ccggacggca gggggaccgg cggccgggcg agctgcagcc gggggtccgg cagggccgga 7620
gcgggcggaa ccgtgctctg acctgcggcc cgagtttcgt cacgtgacgg aatggaaggc 7680
tgctgcattt cgtcacgtga cgtatctcgg cgagcgactg ccgacgccac ggcggacacg 7740
atcgcctcgc gctggcgccg ggcctcgtac gcccgctggc ggcaggagcg gcggcagtag 7800
tcccggctcc ggccgacgcc ggattgcttg atctccgagc cgcaccaggc gcagagcttc 7860
gcgccgtcgg cgtccctggg ggtggtggtg ctcatggccg acgaccgtac gcggcacgtc 7920
tcgtagcgag gcgagtcggg cgcgagcgcc tgcacgaagt gccggcgggg ccgaccccgg 7980
gcgagtaatc ccaggattac tcccgcggct tcgaccccgg ccgccgtcgc cgcgtacgtc 8040
accgaccccc gccgtacgtc accgggatga cgtacggcgg gggggagcga gttagtgcga 8100
agtgggccca cttgcgagcc gggcgatgtg ccgggcggcc cgctcctggc ggtcgtcggc 8160
gtcgtcgtcc tggtcgtcgt cctgctctcg ccgtcggcgt gcagttgctt cctcgcggcg 8220
ctgggcgagg gcggcgagca tgtcggcgta cgcctcggcc acctcccccg ccgtgagcac 8280
caccactgtg tcggccgcgt cggccagcgc caggacctcc cgcacccgtt cgcccacggc 8340
cgccgaatcc tcgttgccgt ccttgccttc ggcggcccgg gtcgcctcga ggtcgagggc 8400
gcggcgggtg accgcgtgcc atccgtcctc ggtcacggcg accccggccc gcagctcccc 8460
gccgtcggcg tcggccgcca ggagcagatc gaggtcgtcg gcctcggtgt cgccgccgtc 8520
gagcccgagc atctgccgca ggtagcgggt ccattcgatg gcccggcgtc cccgggttgc 8580
ccgctcgtac tcgtgccagc gcgagaggtt ccactccagc gagccgaccc cggcggcgtc 8640
gtcctcggtc atgccgccgg tcaggtcccc gatccgtccg aggagttcga acggggcgac 8700
gttcccgccg gtcgccgtct tgaggtcggc gcgggcgagt tcgagggcgg gcgccttccc 8760
gtcctgggtc ttggcgatgt actcggcgag gtcgttggcg tcgcgctcgg tctccagccg 8820
cttgaagtcg acgccgtgcc ggtcgtcggg cgtgaaggcg gggttgacct tgcgcagggc 8880
ggcggtccac acggaccgcc agtgcccctg ccactcgtcg agcgcggcgc cggtcggctc 8940
gaaggtggcg acgatctgct tcgcggaccg ctccccctcg gtccggccgc cgaccaggac 9000
gatcgcgtgg atgtgcgggt gccagccgtt gatctgcccc acggtgactt cggtcgcgcg 9060
gatcatgccg acgtacccga tccggtctcg gatgccctcg cggtcggcgg cccggtgccc 9120
gtccttggcc cggcgtccgg cccacgtgcc gcccgtgatc agtcgctggt aggcgcccgg 9180
ccgccggggg ctgtccggcg tcttccgggt gccctggagg gcgtccatga ggtccgcgag 9240
ccggtccgtg tgcccatggc gggccgtgaa ggtgaccagg taggcggtcc ccccgcgctt 9300
gatccactcg accacggcgg cggtgatctc ctcggcccgc ttgtgccgga tcgtggcggc 9360
gcagaccggg cagagccaga tccgcccgca ccgcatcagg cccaggacca cggacgttcc 9420
ggccgccgtc tgggcgacga tcacgccgga ggcagggtcc atcagggcgc ggccgcagcc 9480
cttgcacgcg gcgtccccgc tgatccgcca cagcgtccgg cggcggctgt accgggcggc 9540
tttccgcagt cgggcagcgt cgctccgcga cgtgcttcct acttccgaga ggctgtcgcc 9600
tctcgggctc tccccatcca ccccgtccgg agaaaccgca ggtcggaggg gtgcgggaaa 9660
ctctgttgtt tctttcccaa ggtgttcgct tttgcctcgg gcggcatctc gcgtcacacg 9720
cgcgatcgcc cgcttcgctg ccatccggca gcggtctgag cagtagatac gcggccgttt 9780
gcccggtgtg tgggcaattg cggtcccgca gtggcagcgg ggcccggcgg gccgatctgg 9840
caatgcctcg gcatcgctcc gtactctggg cacgagcaac gttcctgtct cgcccggcta 9900
aggggcgcga gtctgggagc ggacgggtcg gaggtgcgaa gtccggcccg ttgctctttg 9960
gtctggtggg aatcctggca ccaatcgggc cagaggttcc ctccgccact cccgacgccc 10020
cttggggctg gtgtgacttg gagggccgaa gagagccccg ccggtgatcc ggcggggctt 10080
tgacgtgcgg tcagtgcgtg tgtcggcgag cgatggccac gaggccctgg aagccgagcg 10140
gtccggcgaa gtcggcccag tcgcaaccgg gctcagcgca gtgggcggac cagccaccgc 10200
cgttgtgggt cctggaccag gttcacggtc ccctcggtca ggcgtccgtc gaagtcggtc 10260
atggtcggtc tcctggtggg tgggggcggg gcgccagcac gaagtgccgg cgccccgcgg 10320
gggttggtcg ggtcaggcgc cgaaccggcg ggcggcggcg gcgaccaggc cgtcggcggc 10380
ggccatggcg cggtcgcggt cggtggtgag ggcggtgcgg tcggcggcgg cccgcaggtc 10440
gtaggccgct tgggcggcgg cggtcgctgc gggggcgagg gcgggggcga gcaccgacac 10500
ggtggtgagg ggcgcggtga tcgcggagcg ggtgatcaag gcgaatactt catatgcctc 10560
cgtgacgagc cacgcggcgg tgtcgtcggc accgcgctcg acgacgcggg ggacggggat 10620
cggcggggcc tgggacggcg cctcgccgtc gcagaaccag gcggtggcgt acaccgtcgc 10680
ctcggtcggc ccgtagagat tggcgatccc gaccgcagca ccaccgagaa cgtccccgac 10740
gtggccgacc agcccgtcat cgtcaacgcc tgatccgcgg tgcggacagg ccgtgtcgcg 10800
accggccgtg cggaattaag ccggcccgta ccctgtgaat agaggtccgc tgtgacacaa 10860
gaatccctgt tacttctcga ccgtattgat tcggatgatt cctacgcgag cctgcggaac 10920
gaccaggaat tctgggagcc gctggcccgc cgagccctgg aggagctcgg gctgccggtg 10980
ccgccggtgc tgcgggtgcc cggcgagagc accaaccccg tactggtcgg cgagcccggc 11040
ccggtgatca agctgttcgg cgagcactgg tgcggtccgg agagcctcgc gtcggagtcg 11100
gaggcgtacg cggtcctggc ggacgccccg gtgccggtgc cccgcctcct cggccgcggc 11160
gagctgcggc ccggcaccgg agcctggccg tggccctacc tggtgatgag ccggatgacc 11220
ggcaccacct ggcggtccgc gatggacggc acgaccgacc ggaacgcgct gctcgccctg 11280
gcccgcgaac tcggccgggt gctcggccgg ctgcacaggg tgccgctgac cgggaacacc 11340
gtgctcaccc cccattccga ggtcttcccg gaactgctgc gggaacgccg cgcggcgacc 11400
gtcgaggacc accgcgggtg gggctacctc tcgccccggc tgctggaccg cctggaggac 11460
tggctgccgg acgtggacac gctgctggcc ggccgcgaac cccggttcgt ccacggcgac 11520
ctgcacggga ccaacatctt cgtggacctg gccgcgaccg aggtcaccgg gatcgtcgac 11580
ttcaccgacg tctatgcggg agactcccgc tacagcctgg tgcaactgca tctcaacgcc 11640
ttccggggcg accgcgagat cctggccgcg ctgctcgacg gggcgcagtg gaagcggacc 11700
gaggacttcg cccgcgaact gctcgccttc accttcctgc acgacttcga ggtgttcgag 11760
gagaccccgc tggatctctc cggcttcacc gatccggagg aactggcgca gttcctctgg 11820
gggccgccgg acaccgcccc cggcgcctga gatatcgcga gccggcgtgg ggacgtcgtc 11880
gttctcgacg gggtgaagat cgtcgggaac atcggcgcga tagtacgcac gtcgctcgcg 11940
ctcggagcgt cggggatcat cctggtcgac agtgacatca ccagcatcgc ggaccggcgt 12000
ctccaaaggg ccagccgagg ttacgtcttc tcccttcccg tcgttctctc cggtcgcgag 12060
gaggccatcg ccttcattcg ggacagcggt atgcagctga tgacgctcaa ggcggatggc 12120
gacatttccg tgaaggaact cggggacaat ccggatcggc tggccttgct gttcggcagc 12180
gaaaagggtg ggccttccga cctgttcgag gaggcgtctt ccgcctcggt ttccatcccc 12240
atgatgagcc agaccgagtc tctcaacgtt tccgtttccc tcggaatcgc gctgcacgag 12300
aggatcgaca ggaatctcgc ggccaaccga taagcgcctc tgttcctcgg acgctcggtt 12360
cctcgacctc gattcgtcag tgatgatcag acgtcgaagg tgtagtgccg ggtgtggtcc 12420
agcagggccg ccggggtggt gtcgttccac ggcttcatcg tctcgttgag gtcgaccaaa 12480
gcggccatcg tgcctcccca ctcctgcaga tccctgcagg tcgacggatc ttttccgctg 12540
cataaccctg cttcggggtc attatagcga ttttttcggt atatccatcc tttttcgcac 12600
gatatacagg attttgccaa agggttcgtg tagactttcc ttggtgtatc caacggcgtc 12660
agccgggcag gataggtgaa gtaggcccac ccgcgagcgg gtgttccttc ttcactgtcc 12720
cttattcgca cctggcggtg ctcaacggga atcctgctct gcgaggctgg ccggctaccg 12780
ccggcgtaac agatgagggc aagcggatgg ctgatgaaac caagccaacc aggaagggca 12840
gcccacctat caaggtgtac tgccttccag acgaacgaag agcgattgag gaaaaggcgg 12900
cggcggccgg catgagcctg tcggcctacc tgctggccgt cggccagggc tacaaaatca 12960
cgggcgtcgt ggactatgag cacgtccgcg agctggcccg catcaatggc gacctgggcc 13020
gcctgggcgg cctgctgaaa ctctggctca ccgacgaccc gcgcacggcg cggttcggtg 13080
atgccacgat cctcgccctg ctggcgaaga tcgaagagaa gcaggacgag cttggcaagg 13140
tcatgatggg cgtggtccgc ccgagggcag agccatgact tttttagccg ctaaaacggc 13200
cggggggtgc gcgtgattgc caagcacgtc cccatgcgct ccatcaagaa gagcgacttc 13260
gcggagctgg tgaagtacat caccgacgag caaggcaaga ccgatccccg gggacctgca 13320
ggtcgactct agctagacac gtctgaagct agcttcgagg aactttcggc ggctttgctg 13380
tgcgacaggc tcacgtctaa aaggaaataa atcatgggtc ataaaattat cacgttgtcc 13440
ggcgcggcga cggatgttct gtatgcgctg tttttccgtg gcgcgttgct gtctggtgat 13500
ctgccttcta aatctggcac agccgaattg cgcgagcttg gttttgctga aaccagacac 13560
acagcaactg aataccagaa agaaaatcac tttacctttc tgacatcaga agggcagaaa 13620
tttgccgttg aacacctggt caatacgcgt tttggtgagc agcaatattg cgcttcgatg 13680
acgcttggcg ttgagattga tacctctgct gcacaaaagg caatcgacga gctggaccag 13740
cgcattcgtg acaccgtctc cttcgaactt attcgcaatg gagtgtcatt catcaaggac 13800
gccgctatcg caaatggtgc tatccacgca gcggcaatcg aaacacctca gccggtgacc 13860
aatatctaca acatcagcct tggtatccag cgtgatgagc cagcgcagaa caaggtaacc 13920
gtcagtgccg ataagttcaa agttaaacct ggtgttgata ccaacattga aacgttgatc 13980
gaaaacgcgc tgaaaaacgc tgctgaatgt gcggcgctgg atgtcacaaa gcaaatggca 14040
gcagacaaga aagcgatgga tgaactggct tcctatgtcc gcacggccat catgatggaa 14100
tgtttccccg gtggtgttat ctggcagcag tgccgtcgat agtatgcaat tgataattat 14160
tatcatttgc gggtcctttc cggcgatccg ccttgttacg gggcggcgac ctcgcgggtt 14220
ttcgctattt atgaaaattt tccggtttaa ggcgtttccg ttcttcttcg tcataactta 14280
atgtttttat ttaaaatacc ctctgaaaag aaaggaaacg acaggtgctg aaagcgagct 14340
ttttggcctc tgtcgtttcc tttctctgtt tttgtccgtg gaatgaacaa tggaagtcaa 14400
caaaaagcag agcttatcga tgataagcgg tcaaacatga g 14441
Claims (10)
1.一种厦门链霉菌,其特征在于,通过将质粒pIB1884-xim2转移至菌株StreptomycesxiamenensisΔximΔika中构建得到;所述厦门链霉菌含有厦门霉素合成相关基因;所述的厦门霉素相关基因包括ximB、ximC、ximD和ximE基因。
2.根据权利要求1所述的厦门链霉菌菌株,其特征在于,所述质粒pIB1884-xim2的序列如SEQ ID NO.1所示。
3.根据权利要求1所述的厦门链霉菌菌株,其特征在于,所述质粒pIB1884-xim2的构建方法包括以下步骤:
S1、合成含有内源性组成型启动子18840p以及同尾酶的DNA片段,并克隆至pIB139的NsiI/EcoRI位点生成质粒pIB1884;
S2、以Streptomyces xiamenensis 318基因组为模板,扩增含厦门霉素合成基因ximB、ximC、XimD和XimE的目的片段;
S3、将步骤S2得到的目的片段与质粒pIB1884重组,然后转化,即得质粒pIB1884-xim2。
4.根据权利要求3所述的厦门链霉菌菌株,其特征在于,步骤S2中,所述扩增采用的引物对序列如SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示。
5.根据权利要求1所述的厦门链霉菌菌株,其特征在于,所述菌株StreptomycesxiamenensisΔximΔika的构建方法包括以下步骤:
A1、以厦门链霉菌基因组DNA为模板,分别PCR扩增厦门霉素生物合成基因簇(xim)上下游的片段,然后通过酶切连接克隆至pJTU1278的XbaI/HindIII酶切位点,获得过渡质粒;然后以pIB139为模板,PCR扩增编码阿泊拉霉素的抗性基因aac(3)IV,克隆至前述过渡质粒的KpnI酶切位点从而获得基因敲除质粒pDxim,将质粒pDxim导入野生型厦门链霉菌318中,筛选得到基因簇xim被同框敲除菌株Δxim;
A2、以厦门链霉菌基因组DNA为模板,分别PCR扩增多环稠合大环内酰胺化合物合成基因簇(ika)上下游的片段以及一段包含attB位点的序列,然后隆至pJTU1278的XbaI/HindIII酶切位点获得过渡质粒;然后将编码阿泊拉霉素的抗性基因aac(3)IV克隆至该过渡质粒的KpnI酶切位点,从而获得基因敲除质粒pKIattB;
A3、将质粒pKIattB通过接合转移导入步骤A1得到的菌株Δxim中,筛选获得基因簇ika被attB替换的突变菌株,即得菌株Streptomyces xiamenensisΔximΔika。
6.一种根据权利要求1-5任一项所述的厦门链霉菌菌株在生产苯并吡喃类化合物和4-氢喹啉类化合物中的应用。
7.一种苯并吡喃类化合物和4-氢喹啉类化合物的生产方法,其特征在于,包括以下步骤:将权利要求1-5任一项所述的厦门链霉菌株接入培养基中预培养,然后进行发酵培养并喂养相应4羟基苯甲酸类似物,培养后,萃取即得。
8.根据权利要求7所述的生产方法,其特征在于,生产苯并吡喃类化合物时,所述发酵培养过程为:28~30℃之间,200~220rpm之间培养6-10天;且在培养1天后加入终浓度为50~110mg/L的2,4-二羟基苯甲酸或2-氯-4-羟基苯甲酸。
9.根据权利要求7所述的生产方法,其特征在于,生产4-氢喹啉类化合物时,所述发酵培养过程为:28~30℃之间,200~220rpm之间培养6-10天;且在培养1天后加入终浓度为50~110mg/L的4-氨基苯甲酸。
10.根据权利要求7所述的生产方法,其特征在于,所述预培养采用的培养基为含30~50μg/mL阿泊拉霉素的TSB培养基,培养28~36小时。
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CN105969714A (zh) * | 2016-05-27 | 2016-09-28 | 上海交通大学 | 厦门霉素高产菌株及其培养基、用途 |
WO2017151059A1 (en) * | 2016-02-29 | 2017-09-08 | Agency For Science, Technology And Research | Multiplexable activation of silent biosynthetic clusters in native actinomycete hosts for natural product discovery |
CN108865961A (zh) * | 2018-06-05 | 2018-11-23 | 上海交通大学 | 一种利用大肠杆菌合成3-香叶草基-4-羟基苯甲酸和厦门霉素的方法 |
-
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Patent Citations (5)
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---|---|---|---|---|
CN103740734A (zh) * | 2013-07-01 | 2014-04-23 | 上海交通大学 | 厦门霉素生物合成基因簇、用途及菌株 |
CN103508993A (zh) * | 2013-09-13 | 2014-01-15 | 上海交通大学 | 苯并吡喃化合物的制备方法和抗肺纤维化的用途 |
WO2017151059A1 (en) * | 2016-02-29 | 2017-09-08 | Agency For Science, Technology And Research | Multiplexable activation of silent biosynthetic clusters in native actinomycete hosts for natural product discovery |
CN105969714A (zh) * | 2016-05-27 | 2016-09-28 | 上海交通大学 | 厦门霉素高产菌株及其培养基、用途 |
CN108865961A (zh) * | 2018-06-05 | 2018-11-23 | 上海交通大学 | 一种利用大肠杆菌合成3-香叶草基-4-羟基苯甲酸和厦门霉素的方法 |
Non-Patent Citations (3)
Title |
---|
BEI-BEI HE 等: "Combinatory Biosynthesis of Prenylated 4-Hydroxybenzoate Derivatives by Overexpression of the Substrate-Promiscuous Prenyltransferase XimB in Engineered E. coli", 《ACS SYNTH. BIOL.》, vol. 7, no. 9, 13 August 2018 (2018-08-13) * |
徐岷涓: "红树林来源厦门链霉菌及其产生抗纤维化活性厦门霉素的研究进展", 《中国抗生素杂志》, vol. 42, no. 4, 31 December 2017 (2017-12-31) * |
杨勇: "厦门链霉菌318中厦门霉素生物合成机制的研究", 《中国博士学位沦为电子期刊网》, no. 1, 15 January 2016 (2016-01-15) * |
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